##gtf
chr11	lncipedia.org	exon	134306469	134306678	.	+	.	gene_id lnc-GLB1L2-1 ; transcript_id lnc-GLB1L2-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_009343 ; transcript_alias_1 TCONS_00019545 ;
chr11	lncipedia.org	exon	134308395	134308558	.	+	.	gene_id lnc-GLB1L2-1 ; transcript_id lnc-GLB1L2-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_009343 ; transcript_alias_1 TCONS_00019545 ;
chrX	lncipedia.org	exon	117973519	117973738	.	+	.	gene_id lnc-ZCCHC12-1 ; transcript_id lnc-ZCCHC12-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000203650 ; gene_alias_2 XLOC_008051 ; gene_alias_3 linc-LONRF3 ; gene_alias_4 RP4-562J12.2 ; gene_alias_5 ENSG00000203650.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000022260.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412422 ; transcript_alias_2 TCONS_00017008 ; transcript_alias_3 ENST00000412422.1 ; transcript_alias_4 RP4-562J12.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000058013.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	117975778	117975828	.	+	.	gene_id lnc-ZCCHC12-1 ; transcript_id lnc-ZCCHC12-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000203650 ; gene_alias_2 XLOC_008051 ; gene_alias_3 linc-LONRF3 ; gene_alias_4 RP4-562J12.2 ; gene_alias_5 ENSG00000203650.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000022260.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412422 ; transcript_alias_2 TCONS_00017008 ; transcript_alias_3 ENST00000412422.1 ; transcript_alias_4 RP4-562J12.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000058013.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	117979204	117979248	.	+	.	gene_id lnc-ZCCHC12-1 ; transcript_id lnc-ZCCHC12-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000203650 ; gene_alias_2 XLOC_008051 ; gene_alias_3 linc-LONRF3 ; gene_alias_4 RP4-562J12.2 ; gene_alias_5 ENSG00000203650.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000022260.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412422 ; transcript_alias_2 TCONS_00017008 ; transcript_alias_3 ENST00000412422.1 ; transcript_alias_4 RP4-562J12.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000058013.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	117979913	117980027	.	+	.	gene_id lnc-ZCCHC12-1 ; transcript_id lnc-ZCCHC12-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000203650 ; gene_alias_2 XLOC_008051 ; gene_alias_3 linc-LONRF3 ; gene_alias_4 RP4-562J12.2 ; gene_alias_5 ENSG00000203650.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000022260.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412422 ; transcript_alias_2 TCONS_00017008 ; transcript_alias_3 ENST00000412422.1 ; transcript_alias_4 RP4-562J12.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000058013.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	117981017	117981093	.	+	.	gene_id lnc-ZCCHC12-1 ; transcript_id lnc-ZCCHC12-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000203650 ; gene_alias_2 XLOC_008051 ; gene_alias_3 linc-LONRF3 ; gene_alias_4 RP4-562J12.2 ; gene_alias_5 ENSG00000203650.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000022260.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412422 ; transcript_alias_2 TCONS_00017008 ; transcript_alias_3 ENST00000412422.1 ; transcript_alias_4 RP4-562J12.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000058013.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	117989427	117989518	.	+	.	gene_id lnc-ZCCHC12-1 ; transcript_id lnc-ZCCHC12-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000203650 ; gene_alias_2 XLOC_008051 ; gene_alias_3 linc-LONRF3 ; gene_alias_4 RP4-562J12.2 ; gene_alias_5 ENSG00000203650.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000022260.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412422 ; transcript_alias_2 TCONS_00017008 ; transcript_alias_3 ENST00000412422.1 ; transcript_alias_4 RP4-562J12.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000058013.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	117990160	117991849	.	+	.	gene_id lnc-ZCCHC12-1 ; transcript_id lnc-ZCCHC12-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000203650 ; gene_alias_2 XLOC_008051 ; gene_alias_3 linc-LONRF3 ; gene_alias_4 RP4-562J12.2 ; gene_alias_5 ENSG00000203650.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000022260.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412422 ; transcript_alias_2 TCONS_00017008 ; transcript_alias_3 ENST00000412422.1 ; transcript_alias_4 RP4-562J12.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000058013.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	12219528	12220071	.	+	.	gene_id lnc-AC130352.1-1 ; transcript_id lnc-AC130352.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000227888 ; gene_alias_2 FAM66A ; gene_alias_3 ENSG00000227888.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165458.1 ; transcript_alias_1 ENST00000525829 ; transcript_alias_2 ENST00000525829.1 ; transcript_alias_3 FAM66A-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000384244.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	12225748	12226124	.	+	.	gene_id lnc-AC130352.1-1 ; transcript_id lnc-AC130352.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000227888 ; gene_alias_2 FAM66A ; gene_alias_3 ENSG00000227888.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165458.1 ; transcript_alias_1 ENST00000525829 ; transcript_alias_2 ENST00000525829.1 ; transcript_alias_3 FAM66A-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000384244.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	18573265	18575973	.	+	.	gene_id lnc-TRIM16L-1 ; transcript_id lnc-TRIM16L-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248683 ; gene_alias_2 AC026271.1 ; transcript_alias_1 ENST00000507743 ;
chr17	lncipedia.org	exon	18576100	18576264	.	+	.	gene_id lnc-TRIM16L-1 ; transcript_id lnc-TRIM16L-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248683 ; gene_alias_2 AC026271.1 ; transcript_alias_1 ENST00000507743 ;
chr19	lncipedia.org	exon	57154523	57154578	.	+	.	gene_id lnc-ZNF71-1 ; transcript_id lnc-ZNF71-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250702 ; transcript_alias_1 ENST00000512081 ;
chr19	lncipedia.org	exon	57156936	57157204	.	+	.	gene_id lnc-ZNF71-1 ; transcript_id lnc-ZNF71-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250702 ; transcript_alias_1 ENST00000512081 ;
chr19	lncipedia.org	exon	57158926	57159002	.	+	.	gene_id lnc-ZNF71-1 ; transcript_id lnc-ZNF71-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250702 ; transcript_alias_1 ENST00000512081 ;
chr19	lncipedia.org	exon	57166471	57166822	.	+	.	gene_id lnc-ZNF71-1 ; transcript_id lnc-ZNF71-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250702 ; transcript_alias_1 ENST00000512081 ;
chr19	lncipedia.org	exon	57167575	57168614	.	+	.	gene_id lnc-ZNF71-1 ; transcript_id lnc-ZNF71-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250702 ; transcript_alias_1 ENST00000512081 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8062558	8064479	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-7 ; transcript_id lnc-KIDINS220-7:3 ; gene_alias_1 XLOC_001973 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-7 ; transcript_alias_1 TCONS_00002742 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8065770	8065887	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-7 ; transcript_id lnc-KIDINS220-7:3 ; gene_alias_1 XLOC_001973 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-7 ; transcript_alias_1 TCONS_00002742 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8108276	8108410	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-7 ; transcript_id lnc-KIDINS220-7:3 ; gene_alias_1 XLOC_001973 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-7 ; transcript_alias_1 TCONS_00002742 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8116840	8116977	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-7 ; transcript_id lnc-KIDINS220-7:3 ; gene_alias_1 XLOC_001973 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-7 ; transcript_alias_1 TCONS_00002742 ;
chr5	lncipedia.org	exon	115150892	115151615	.	+	.	gene_id lnc-AP3S1-1 ; transcript_id lnc-AP3S1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248017 ; gene_alias_2 AC026449.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499037 ;
chr5	lncipedia.org	exon	115152263	115152356	.	+	.	gene_id lnc-AP3S1-1 ; transcript_id lnc-AP3S1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248017 ; gene_alias_2 AC026449.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499037 ;
chr4	lncipedia.org	exon	77829330	77830185	.	-	.	gene_id lnc-ANKRD56-1 ; transcript_id lnc-ANKRD56-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_003991 ; gene_alias_2 linc-ANKRD56-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009076 ;
chr4	lncipedia.org	exon	77831131	77831274	.	-	.	gene_id lnc-ANKRD56-1 ; transcript_id lnc-ANKRD56-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_003991 ; gene_alias_2 linc-ANKRD56-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009076 ;
chr20	lncipedia.org	exon	61734246	61734574	.	+	.	gene_id lnc-BIRC7-2 ; transcript_id lnc-BIRC7-2:3 ; gene_alias_1 XLOC_013607 ; gene_alias_2 linc-BIRC7-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00028262 ;
chr20	lncipedia.org	exon	61734907	61735727	.	+	.	gene_id lnc-BIRC7-2 ; transcript_id lnc-BIRC7-2:3 ; gene_alias_1 XLOC_013607 ; gene_alias_2 linc-BIRC7-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00028262 ;
chr1	lncipedia.org	exon	843465	843762	.	-	.	gene_id lnc-NOC2L-2 ; transcript_id lnc-NOC2L-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_000669 ; gene_alias_2 linc-OR4F16-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00001368 ;
chr1	lncipedia.org	exon	845256	845308	.	-	.	gene_id lnc-NOC2L-2 ; transcript_id lnc-NOC2L-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_000669 ; gene_alias_2 linc-OR4F16-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00001368 ;
chr11	lncipedia.org	exon	12282973	12283019	.	-	.	gene_id lnc-DKK3-1 ; transcript_id lnc-DKK3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254680.1 ; gene_alias_2 RP11-265D17.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000165779.1 ; transcript_alias_1 ENST00000527288.1 ; transcript_alias_2 RP11-265D17.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000386174.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	12284268	12284720	.	-	.	gene_id lnc-DKK3-1 ; transcript_id lnc-DKK3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254680.1 ; gene_alias_2 RP11-265D17.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000165779.1 ; transcript_alias_1 ENST00000527288.1 ; transcript_alias_2 RP11-265D17.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000386174.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	1306989	1307115	.	+	.	gene_id lnc-UNCX-1 ; transcript_id lnc-UNCX-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_005962 ; gene_alias_2 linc-MAFK-2 ; gene_alias_3 ENSG00000233082 ; gene_alias_4 AC073094.4 ; gene_alias_5 ENSG00000233082.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000152023.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00012938 ; transcript_alias_2 ENST00000453798 ; transcript_alias_3 ENST00000453798.1 ; transcript_alias_4 AC073094.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000324911.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	1308598	1308903	.	+	.	gene_id lnc-UNCX-1 ; transcript_id lnc-UNCX-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_005962 ; gene_alias_2 linc-MAFK-2 ; gene_alias_3 ENSG00000233082 ; gene_alias_4 AC073094.4 ; gene_alias_5 ENSG00000233082.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000152023.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00012938 ; transcript_alias_2 ENST00000453798 ; transcript_alias_3 ENST00000453798.1 ; transcript_alias_4 AC073094.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000324911.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	121139338	121139526	.	-	.	gene_id lnc-FCGR1B-3 ; transcript_id lnc-FCGR1B-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230806 ; gene_alias_2 AL358175.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230806.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013093.3 ; transcript_alias_1 ENST00000429055 ; transcript_alias_2 ENST00000429055.1 ; transcript_alias_3 AL358175.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000036740.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	121139623	121139699	.	-	.	gene_id lnc-FCGR1B-3 ; transcript_id lnc-FCGR1B-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230806 ; gene_alias_2 AL358175.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230806.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013093.3 ; transcript_alias_1 ENST00000429055 ; transcript_alias_2 ENST00000429055.1 ; transcript_alias_3 AL358175.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000036740.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	121140525	121140666	.	-	.	gene_id lnc-FCGR1B-3 ; transcript_id lnc-FCGR1B-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230806 ; gene_alias_2 AL358175.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230806.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013093.3 ; transcript_alias_1 ENST00000429055 ; transcript_alias_2 ENST00000429055.1 ; transcript_alias_3 AL358175.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000036740.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	132253271	132253407	.	+	.	gene_id lnc-METTL11A-3 ; transcript_id lnc-METTL11A-3:7 ; gene_alias_1 ENSG00000204054 ; gene_alias_2 RP11-492E3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000204054.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020783.2 ; transcript_alias_1 ENST00000458346 ; transcript_alias_2 ENST00000458346.1 ; transcript_alias_3 RP11-492E3.1-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000106520.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	132255698	132255874	.	+	.	gene_id lnc-METTL11A-3 ; transcript_id lnc-METTL11A-3:7 ; gene_alias_1 ENSG00000204054 ; gene_alias_2 RP11-492E3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000204054.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020783.2 ; transcript_alias_1 ENST00000458346 ; transcript_alias_2 ENST00000458346.1 ; transcript_alias_3 RP11-492E3.1-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000106520.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	132265602	132265853	.	+	.	gene_id lnc-METTL11A-3 ; transcript_id lnc-METTL11A-3:7 ; gene_alias_1 ENSG00000204054 ; gene_alias_2 RP11-492E3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000204054.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020783.2 ; transcript_alias_1 ENST00000458346 ; transcript_alias_2 ENST00000458346.1 ; transcript_alias_3 RP11-492E3.1-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000106520.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	8413248	8413598	.	-	.	gene_id lnc-PRAGMIN.1-4 ; transcript_id lnc-PRAGMIN.1-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000253343 ; gene_alias_2 CTD-3023L14.3 ; gene_alias_3 ENSG00000253343.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163671.1 ; transcript_alias_1 ENST00000524008 ; transcript_alias_2 ENST00000524008.1 ; transcript_alias_3 CTD-3023L14.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000374717.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	8418430	8418475	.	-	.	gene_id lnc-PRAGMIN.1-4 ; transcript_id lnc-PRAGMIN.1-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000253343 ; gene_alias_2 CTD-3023L14.3 ; gene_alias_3 ENSG00000253343.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163671.1 ; transcript_alias_1 ENST00000524008 ; transcript_alias_2 ENST00000524008.1 ; transcript_alias_3 CTD-3023L14.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000374717.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	104177737	104178524	.	-	.	gene_id lnc-C8orf56-1 ; transcript_id lnc-C8orf56-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000247081 ; gene_alias_2 RP11-318M2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247081.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164798.3 ; transcript_alias_1 ENST00000500902 ; transcript_alias_2 ENST00000500902.1 ; transcript_alias_3 RP11-318M2.2-010 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000380364.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	104184164	104184368	.	-	.	gene_id lnc-C8orf56-1 ; transcript_id lnc-C8orf56-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000247081 ; gene_alias_2 RP11-318M2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247081.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164798.3 ; transcript_alias_1 ENST00000500902 ; transcript_alias_2 ENST00000500902.1 ; transcript_alias_3 RP11-318M2.2-010 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000380364.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	87754948	87755164	.	+	.	gene_id lnc-PLGLB2-1 ; transcript_id lnc-PLGLB2-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000222041 ; gene_alias_2 NCRNA00152 ; gene_alias_3 ENSG00000222041.5 ; gene_alias_4 LINC00152 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000130273.9 ; transcript_alias_1 ENST00000409139 ; transcript_alias_2 ENST00000409139.1 ; transcript_alias_3 LINC00152-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330389.2 ;
chr2	lncipedia.org	exon	87882777	87882865	.	+	.	gene_id lnc-PLGLB2-1 ; transcript_id lnc-PLGLB2-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000222041 ; gene_alias_2 NCRNA00152 ; gene_alias_3 ENSG00000222041.5 ; gene_alias_4 LINC00152 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000130273.9 ; transcript_alias_1 ENST00000409139 ; transcript_alias_2 ENST00000409139.1 ; transcript_alias_3 LINC00152-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330389.2 ;
chr2	lncipedia.org	exon	87906112	87906324	.	+	.	gene_id lnc-PLGLB2-1 ; transcript_id lnc-PLGLB2-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000222041 ; gene_alias_2 NCRNA00152 ; gene_alias_3 ENSG00000222041.5 ; gene_alias_4 LINC00152 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000130273.9 ; transcript_alias_1 ENST00000409139 ; transcript_alias_2 ENST00000409139.1 ; transcript_alias_3 LINC00152-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330389.2 ;
chr16	lncipedia.org	exon	74226291	74226625	.	-	.	gene_id lnc-CLEC18B-3 ; transcript_id lnc-CLEC18B-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000249447 ; gene_alias_2 XLOC_012007 ; gene_alias_3 linc-ZFHX3-2 ; gene_alias_4 ENSG00000261404.1 ; gene_alias_5 AC009120.4 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000176255.2 ; transcript_alias_1 ENST00000510251 ; transcript_alias_2 TCONS_00024274 ; transcript_alias_3 ENST00000568137.1 ; transcript_alias_4 AC009120.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000431686.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	74239804	74240064	.	-	.	gene_id lnc-CLEC18B-3 ; transcript_id lnc-CLEC18B-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000249447 ; gene_alias_2 XLOC_012007 ; gene_alias_3 linc-ZFHX3-2 ; gene_alias_4 ENSG00000261404.1 ; gene_alias_5 AC009120.4 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000176255.2 ; transcript_alias_1 ENST00000510251 ; transcript_alias_2 TCONS_00024274 ; transcript_alias_3 ENST00000568137.1 ; transcript_alias_4 AC009120.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000431686.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	74244205	74244404	.	-	.	gene_id lnc-CLEC18B-3 ; transcript_id lnc-CLEC18B-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000249447 ; gene_alias_2 XLOC_012007 ; gene_alias_3 linc-ZFHX3-2 ; gene_alias_4 ENSG00000261404.1 ; gene_alias_5 AC009120.4 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000176255.2 ; transcript_alias_1 ENST00000510251 ; transcript_alias_2 TCONS_00024274 ; transcript_alias_3 ENST00000568137.1 ; transcript_alias_4 AC009120.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000431686.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	74249251	74249420	.	-	.	gene_id lnc-CLEC18B-3 ; transcript_id lnc-CLEC18B-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000249447 ; gene_alias_2 XLOC_012007 ; gene_alias_3 linc-ZFHX3-2 ; gene_alias_4 ENSG00000261404.1 ; gene_alias_5 AC009120.4 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000176255.2 ; transcript_alias_1 ENST00000510251 ; transcript_alias_2 TCONS_00024274 ; transcript_alias_3 ENST00000568137.1 ; transcript_alias_4 AC009120.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000431686.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	128220111	128221962	.	-	.	gene_id lnc-FAM84B-8 ; transcript_id lnc-FAM84B-8:3 ; gene_alias_1 XLOC_007215 ; gene_alias_2 linc-FAM84B-9 ; gene_alias_3 ENSG00000247844 ; gene_alias_4 RP11-255B23.3 ; gene_alias_5 ENSG00000247844.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000165065.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00014531 ; transcript_alias_2 ENST00000500112 ; transcript_alias_3 ENST00000500112.1 ; transcript_alias_4 RP11-255B23.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000381641.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	128231055	128231333	.	-	.	gene_id lnc-FAM84B-8 ; transcript_id lnc-FAM84B-8:3 ; gene_alias_1 XLOC_007215 ; gene_alias_2 linc-FAM84B-9 ; gene_alias_3 ENSG00000247844 ; gene_alias_4 RP11-255B23.3 ; gene_alias_5 ENSG00000247844.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000165065.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00014531 ; transcript_alias_2 ENST00000500112 ; transcript_alias_3 ENST00000500112.1 ; transcript_alias_4 RP11-255B23.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000381641.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	27472414	27472626	.	+	.	gene_id lnc-C5orf17-8 ; transcript_id lnc-C5orf17-8:7 ; gene_alias_1 ENSG00000250337 ; gene_alias_2 RP11-46C20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000250337.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161968.1 ; transcript_alias_1 ENST00000505775 ; transcript_alias_2 ENST00000505775.1 ; transcript_alias_3 RP11-46C20.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000366534.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	27475642	27475802	.	+	.	gene_id lnc-C5orf17-8 ; transcript_id lnc-C5orf17-8:7 ; gene_alias_1 ENSG00000250337 ; gene_alias_2 RP11-46C20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000250337.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161968.1 ; transcript_alias_1 ENST00000505775 ; transcript_alias_2 ENST00000505775.1 ; transcript_alias_3 RP11-46C20.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000366534.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	27477746	27477908	.	+	.	gene_id lnc-C5orf17-8 ; transcript_id lnc-C5orf17-8:7 ; gene_alias_1 ENSG00000250337 ; gene_alias_2 RP11-46C20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000250337.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161968.1 ; transcript_alias_1 ENST00000505775 ; transcript_alias_2 ENST00000505775.1 ; transcript_alias_3 RP11-46C20.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000366534.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	27485033	27485136	.	+	.	gene_id lnc-C5orf17-8 ; transcript_id lnc-C5orf17-8:7 ; gene_alias_1 ENSG00000250337 ; gene_alias_2 RP11-46C20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000250337.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161968.1 ; transcript_alias_1 ENST00000505775 ; transcript_alias_2 ENST00000505775.1 ; transcript_alias_3 RP11-46C20.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000366534.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	27489389	27489493	.	+	.	gene_id lnc-C5orf17-8 ; transcript_id lnc-C5orf17-8:7 ; gene_alias_1 ENSG00000250337 ; gene_alias_2 RP11-46C20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000250337.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161968.1 ; transcript_alias_1 ENST00000505775 ; transcript_alias_2 ENST00000505775.1 ; transcript_alias_3 RP11-46C20.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000366534.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	27494226	27494425	.	+	.	gene_id lnc-C5orf17-8 ; transcript_id lnc-C5orf17-8:7 ; gene_alias_1 ENSG00000250337 ; gene_alias_2 RP11-46C20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000250337.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161968.1 ; transcript_alias_1 ENST00000505775 ; transcript_alias_2 ENST00000505775.1 ; transcript_alias_3 RP11-46C20.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000366534.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	49993609	49994926	.	+	.	gene_id lnc-KCNH3-1 ; transcript_id lnc-KCNH3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250952 ; transcript_alias_1 ENST00000508736 ;
chr12	lncipedia.org	exon	49997960	49998502	.	+	.	gene_id lnc-KCNH3-1 ; transcript_id lnc-KCNH3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250952 ; transcript_alias_1 ENST00000508736 ;
chr3	lncipedia.org	exon	40214646	40216213	.	-	.	gene_id lnc-CX3CR1-2 ; transcript_id lnc-CX3CR1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246446 ; transcript_alias_1 ENST00000501623 ;
chr3	lncipedia.org	exon	40342728	40342887	.	-	.	gene_id lnc-CX3CR1-2 ; transcript_id lnc-CX3CR1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246446 ; transcript_alias_1 ENST00000501623 ;
chr3	lncipedia.org	exon	40350814	40351033	.	-	.	gene_id lnc-CX3CR1-2 ; transcript_id lnc-CX3CR1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246446 ; transcript_alias_1 ENST00000501623 ;
chr19	lncipedia.org	exon	55550479	55551093	.	+	.	gene_id lnc-EPS8L1-1 ; transcript_id lnc-EPS8L1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248481 ; transcript_alias_1 ENST00000509693 ;
chr19	lncipedia.org	exon	55551690	55552397	.	+	.	gene_id lnc-EPS8L1-1 ; transcript_id lnc-EPS8L1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248481 ; transcript_alias_1 ENST00000509693 ;
chr19	lncipedia.org	exon	55552618	55553257	.	+	.	gene_id lnc-EPS8L1-1 ; transcript_id lnc-EPS8L1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248481 ; transcript_alias_1 ENST00000509693 ;
chr18	lncipedia.org	exon	73408038	73409566	.	-	.	gene_id lnc-C18orf62-3 ; transcript_id lnc-C18orf62-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248784 ; gene_alias_2 XLOC_012887 ; gene_alias_3 linc-C18orf62-1 ; transcript_alias_1 ENST00000515252 ; transcript_alias_2 TCONS_00026214 ;
chr18	lncipedia.org	exon	73423971	73424340	.	-	.	gene_id lnc-C18orf62-3 ; transcript_id lnc-C18orf62-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248784 ; gene_alias_2 XLOC_012887 ; gene_alias_3 linc-C18orf62-1 ; transcript_alias_1 ENST00000515252 ; transcript_alias_2 TCONS_00026214 ;
chr19	lncipedia.org	exon	2414241	2414472	.	+	.	gene_id lnc-GADD45B-1 ; transcript_id lnc-GADD45B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247581 ; transcript_alias_1 ENST00000499536 ;
chr19	lncipedia.org	exon	2450460	2450509	.	+	.	gene_id lnc-GADD45B-1 ; transcript_id lnc-GADD45B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247581 ; transcript_alias_1 ENST00000499536 ;
chr19	lncipedia.org	exon	2541518	2541545	.	+	.	gene_id lnc-GADD45B-1 ; transcript_id lnc-GADD45B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247581 ; transcript_alias_1 ENST00000499536 ;
chr19	lncipedia.org	exon	2651988	2654269	.	+	.	gene_id lnc-GADD45B-1 ; transcript_id lnc-GADD45B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247581 ; transcript_alias_1 ENST00000499536 ;
chr17	lncipedia.org	exon	59477258	59477408	.	-	.	gene_id lnc-NACA2-1 ; transcript_id lnc-NACA2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245950 ; transcript_alias_1 ENST00000502172 ;
chr17	lncipedia.org	exon	59482811	59486501	.	-	.	gene_id lnc-NACA2-1 ; transcript_id lnc-NACA2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245950 ; transcript_alias_1 ENST00000502172 ;
chr13	lncipedia.org	exon	50989225	50989338	.	+	.	gene_id lnc-RNASEH2B-3 ; transcript_id lnc-RNASEH2B-3:7 ; gene_alias_1 XLOC_010390 ; gene_alias_2 linc-RNASEH2B-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00021492 ;
chr13	lncipedia.org	exon	51007549	51007686	.	+	.	gene_id lnc-RNASEH2B-3 ; transcript_id lnc-RNASEH2B-3:7 ; gene_alias_1 XLOC_010390 ; gene_alias_2 linc-RNASEH2B-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00021492 ;
chr13	lncipedia.org	exon	51102002	51102200	.	+	.	gene_id lnc-RNASEH2B-3 ; transcript_id lnc-RNASEH2B-3:7 ; gene_alias_1 XLOC_010390 ; gene_alias_2 linc-RNASEH2B-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00021492 ;
chr13	lncipedia.org	exon	51107329	51107996	.	+	.	gene_id lnc-RNASEH2B-3 ; transcript_id lnc-RNASEH2B-3:7 ; gene_alias_1 XLOC_010390 ; gene_alias_2 linc-RNASEH2B-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00021492 ;
chr14	lncipedia.org	exon	19894710	19894790	.	-	.	gene_id lnc-POTEM-2 ; transcript_id lnc-POTEM-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244306 ; gene_alias_2 CTD-2314B22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000244306.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170430.3 ; transcript_alias_1 ENST00000548903 ; transcript_alias_2 ENST00000548903.1 ; transcript_alias_3 CTD-2314B22.3-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409421.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	19919138	19919273	.	-	.	gene_id lnc-POTEM-2 ; transcript_id lnc-POTEM-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244306 ; gene_alias_2 CTD-2314B22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000244306.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170430.3 ; transcript_alias_1 ENST00000548903 ; transcript_alias_2 ENST00000548903.1 ; transcript_alias_3 CTD-2314B22.3-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409421.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	19919492	19919629	.	-	.	gene_id lnc-POTEM-2 ; transcript_id lnc-POTEM-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244306 ; gene_alias_2 CTD-2314B22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000244306.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170430.3 ; transcript_alias_1 ENST00000548903 ; transcript_alias_2 ENST00000548903.1 ; transcript_alias_3 CTD-2314B22.3-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409421.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	19921359	19921470	.	-	.	gene_id lnc-POTEM-2 ; transcript_id lnc-POTEM-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244306 ; gene_alias_2 CTD-2314B22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000244306.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170430.3 ; transcript_alias_1 ENST00000548903 ; transcript_alias_2 ENST00000548903.1 ; transcript_alias_3 CTD-2314B22.3-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409421.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	19925240	19925348	.	-	.	gene_id lnc-POTEM-2 ; transcript_id lnc-POTEM-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244306 ; gene_alias_2 CTD-2314B22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000244306.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170430.3 ; transcript_alias_1 ENST00000548903 ; transcript_alias_2 ENST00000548903.1 ; transcript_alias_3 CTD-2314B22.3-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409421.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	135148356	135148615	.	+	.	gene_id lnc-SLC25A48-2 ; transcript_id lnc-SLC25A48-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_004565 ; gene_alias_2 linc-SLC25A48-1 ; gene_alias_3 ENSG00000250378 ; gene_alias_4 RP11-119J18.1 ; gene_alias_5 ENSG00000250378.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000163102.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00009520 ; transcript_alias_2 ENST00000506592 ; transcript_alias_3 ENST00000506592.1 ; transcript_alias_4 RP11-119J18.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000371685.2 ;
chr5	lncipedia.org	exon	135162155	135162271	.	+	.	gene_id lnc-SLC25A48-2 ; transcript_id lnc-SLC25A48-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_004565 ; gene_alias_2 linc-SLC25A48-1 ; gene_alias_3 ENSG00000250378 ; gene_alias_4 RP11-119J18.1 ; gene_alias_5 ENSG00000250378.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000163102.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00009520 ; transcript_alias_2 ENST00000506592 ; transcript_alias_3 ENST00000506592.1 ; transcript_alias_4 RP11-119J18.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000371685.2 ;
chr10	lncipedia.org	exon	64883698	64883942	.	-	.	gene_id lnc-JMJD1C-1 ; transcript_id lnc-JMJD1C-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_008835 ; gene_alias_2 linc-EGR2 ; gene_alias_3 ENSG00000224301.1 ; gene_alias_4 RP11-144G16.1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000018310.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017988 ; transcript_alias_2 ENST00000433019.1 ; transcript_alias_3 RP11-144G16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000048248.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	64884485	64884631	.	-	.	gene_id lnc-JMJD1C-1 ; transcript_id lnc-JMJD1C-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_008835 ; gene_alias_2 linc-EGR2 ; gene_alias_3 ENSG00000224301.1 ; gene_alias_4 RP11-144G16.1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000018310.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017988 ; transcript_alias_2 ENST00000433019.1 ; transcript_alias_3 RP11-144G16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000048248.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	64885185	64885297	.	-	.	gene_id lnc-JMJD1C-1 ; transcript_id lnc-JMJD1C-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_008835 ; gene_alias_2 linc-EGR2 ; gene_alias_3 ENSG00000224301.1 ; gene_alias_4 RP11-144G16.1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000018310.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017988 ; transcript_alias_2 ENST00000433019.1 ; transcript_alias_3 RP11-144G16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000048248.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143394151	143394211	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-3:20 ; gene_alias_1 ENSG00000238261 ; gene_alias_2 BX004987.5 ; gene_alias_3 ENSG00000238261.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013630.1 ; transcript_alias_1 ENST00000431700 ; transcript_alias_2 ENST00000431700.1 ; transcript_alias_3 BX004987.5-011 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037980.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143398371	143398427	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-3:20 ; gene_alias_1 ENSG00000238261 ; gene_alias_2 BX004987.5 ; gene_alias_3 ENSG00000238261.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013630.1 ; transcript_alias_1 ENST00000431700 ; transcript_alias_2 ENST00000431700.1 ; transcript_alias_3 BX004987.5-011 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037980.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143398836	143398889	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-3:20 ; gene_alias_1 ENSG00000238261 ; gene_alias_2 BX004987.5 ; gene_alias_3 ENSG00000238261.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013630.1 ; transcript_alias_1 ENST00000431700 ; transcript_alias_2 ENST00000431700.1 ; transcript_alias_3 BX004987.5-011 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037980.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143399695	143399814	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-3:20 ; gene_alias_1 ENSG00000238261 ; gene_alias_2 BX004987.5 ; gene_alias_3 ENSG00000238261.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013630.1 ; transcript_alias_1 ENST00000431700 ; transcript_alias_2 ENST00000431700.1 ; transcript_alias_3 BX004987.5-011 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037980.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	149691432	149691646	.	-	.	gene_id lnc-HIST2H2BF-1 ; transcript_id lnc-HIST2H2BF-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234232 ; gene_alias_2 RP11-353N4.5 ; gene_alias_3 ENSG00000234232.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013955.1 ; transcript_alias_1 ENST00000432978 ; transcript_alias_2 ENST00000432978.1 ; transcript_alias_3 RP11-353N4.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000039137.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	149692947	149693081	.	-	.	gene_id lnc-HIST2H2BF-1 ; transcript_id lnc-HIST2H2BF-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234232 ; gene_alias_2 RP11-353N4.5 ; gene_alias_3 ENSG00000234232.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013955.1 ; transcript_alias_1 ENST00000432978 ; transcript_alias_2 ENST00000432978.1 ; transcript_alias_3 RP11-353N4.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000039137.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	149698419	149698605	.	-	.	gene_id lnc-HIST2H2BF-1 ; transcript_id lnc-HIST2H2BF-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234232 ; gene_alias_2 RP11-353N4.5 ; gene_alias_3 ENSG00000234232.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013955.1 ; transcript_alias_1 ENST00000432978 ; transcript_alias_2 ENST00000432978.1 ; transcript_alias_3 RP11-353N4.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000039137.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	16535524	16535568	.	+	.	gene_id lnc-MYCN-5 ; transcript_id lnc-MYCN-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_001368 ; gene_alias_2 linc-VSNL1-5 ; gene_alias_3 ENSG00000224400 ; gene_alias_4 AC010880.1 ; gene_alias_5 ENSG00000224400.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151752.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00002835 ; transcript_alias_2 ENST00000425176 ; transcript_alias_3 ENST00000425176.1 ; transcript_alias_4 AC010880.1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000323751.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	16573521	16573594	.	+	.	gene_id lnc-MYCN-5 ; transcript_id lnc-MYCN-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_001368 ; gene_alias_2 linc-VSNL1-5 ; gene_alias_3 ENSG00000224400 ; gene_alias_4 AC010880.1 ; gene_alias_5 ENSG00000224400.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151752.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00002835 ; transcript_alias_2 ENST00000425176 ; transcript_alias_3 ENST00000425176.1 ; transcript_alias_4 AC010880.1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000323751.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	16613773	16613970	.	+	.	gene_id lnc-MYCN-5 ; transcript_id lnc-MYCN-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_001368 ; gene_alias_2 linc-VSNL1-5 ; gene_alias_3 ENSG00000224400 ; gene_alias_4 AC010880.1 ; gene_alias_5 ENSG00000224400.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151752.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00002835 ; transcript_alias_2 ENST00000425176 ; transcript_alias_3 ENST00000425176.1 ; transcript_alias_4 AC010880.1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000323751.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	15728003	15728077	.	+	.	gene_id lnc-AC006035.2-2 ; transcript_id lnc-AC006035.2-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_005991 ; gene_alias_2 linc-LOC100129335-2 ; gene_alias_3 ENSG00000229108.1 ; gene_alias_4 AC005550.4 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000152388.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00012958 ; transcript_alias_2 ENST00000442176.1 ; transcript_alias_3 AC005550.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000326053.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	15734495	15735116	.	+	.	gene_id lnc-AC006035.2-2 ; transcript_id lnc-AC006035.2-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_005991 ; gene_alias_2 linc-LOC100129335-2 ; gene_alias_3 ENSG00000229108.1 ; gene_alias_4 AC005550.4 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000152388.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00012958 ; transcript_alias_2 ENST00000442176.1 ; transcript_alias_3 AC005550.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000326053.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	16342641	16342728	.	+	.	gene_id lnc-TRPV2-1 ; transcript_id lnc-TRPV2-1:27 ; gene_alias_1 ENSG00000175061 ; gene_alias_2 NCRNA00188 ; transcript_alias_1 ENST00000478103 ;
chr17	lncipedia.org	exon	16343499	16343567	.	+	.	gene_id lnc-TRPV2-1 ; transcript_id lnc-TRPV2-1:27 ; gene_alias_1 ENSG00000175061 ; gene_alias_2 NCRNA00188 ; transcript_alias_1 ENST00000478103 ;
chr17	lncipedia.org	exon	16344388	16344444	.	+	.	gene_id lnc-TRPV2-1 ; transcript_id lnc-TRPV2-1:27 ; gene_alias_1 ENSG00000175061 ; gene_alias_2 NCRNA00188 ; transcript_alias_1 ENST00000478103 ;
chr17	lncipedia.org	exon	16366147	16366255	.	+	.	gene_id lnc-TRPV2-1 ; transcript_id lnc-TRPV2-1:27 ; gene_alias_1 ENSG00000175061 ; gene_alias_2 NCRNA00188 ; transcript_alias_1 ENST00000478103 ;
chr17	lncipedia.org	exon	16366481	16367300	.	+	.	gene_id lnc-TRPV2-1 ; transcript_id lnc-TRPV2-1:27 ; gene_alias_1 ENSG00000175061 ; gene_alias_2 NCRNA00188 ; transcript_alias_1 ENST00000478103 ;
chr11	lncipedia.org	exon	71511587	71511833	.	-	.	gene_id lnc-RP11-849H4.2.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-849H4.2.1-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000254978 ; transcript_alias_1 ENST00000532875 ;
chr11	lncipedia.org	exon	71512826	71512901	.	-	.	gene_id lnc-RP11-849H4.2.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-849H4.2.1-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000254978 ; transcript_alias_1 ENST00000532875 ;
chr11	lncipedia.org	exon	71513904	71514018	.	-	.	gene_id lnc-RP11-849H4.2.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-849H4.2.1-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000254978 ; transcript_alias_1 ENST00000532875 ;
chr11	lncipedia.org	exon	71515576	71515686	.	-	.	gene_id lnc-RP11-849H4.2.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-849H4.2.1-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000254978 ; transcript_alias_1 ENST00000532875 ;
chr8	lncipedia.org	exon	54955553	54955778	.	-	.	gene_id lnc-LYPLA1-1 ; transcript_id lnc-LYPLA1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246352 ; transcript_alias_1 ENST00000501660 ;
chr8	lncipedia.org	exon	54957377	54957513	.	-	.	gene_id lnc-LYPLA1-1 ; transcript_id lnc-LYPLA1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246352 ; transcript_alias_1 ENST00000501660 ;
chr11	lncipedia.org	exon	22868823	22869067	.	-	.	gene_id lnc-RP11-17A1.2.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-17A1.2.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_009393 ; gene_alias_2 linc-SVIP ; transcript_alias_1 TCONS_00020049 ;
chr11	lncipedia.org	exon	22870923	22871023	.	-	.	gene_id lnc-RP11-17A1.2.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-17A1.2.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_009393 ; gene_alias_2 linc-SVIP ; transcript_alias_1 TCONS_00020049 ;
chr11	lncipedia.org	exon	22879468	22879572	.	-	.	gene_id lnc-RP11-17A1.2.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-17A1.2.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_009393 ; gene_alias_2 linc-SVIP ; transcript_alias_1 TCONS_00020049 ;
chr11	lncipedia.org	exon	22880998	22881042	.	-	.	gene_id lnc-RP11-17A1.2.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-17A1.2.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_009393 ; gene_alias_2 linc-SVIP ; transcript_alias_1 TCONS_00020049 ;
chr11	lncipedia.org	exon	22881535	22881663	.	-	.	gene_id lnc-RP11-17A1.2.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-17A1.2.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_009393 ; gene_alias_2 linc-SVIP ; transcript_alias_1 TCONS_00020049 ;
chr11	lncipedia.org	exon	22881923	22882065	.	-	.	gene_id lnc-RP11-17A1.2.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-17A1.2.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_009393 ; gene_alias_2 linc-SVIP ; transcript_alias_1 TCONS_00020049 ;
chr7	lncipedia.org	exon	76264152	76264187	.	+	.	gene_id lnc-AC004980.12.1-1 ; transcript_id lnc-AC004980.12.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_006150 ; gene_alias_2 linc-CCDC146-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00014163 ;
chr7	lncipedia.org	exon	76264253	76264572	.	+	.	gene_id lnc-AC004980.12.1-1 ; transcript_id lnc-AC004980.12.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_006150 ; gene_alias_2 linc-CCDC146-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00014163 ;
chr13	lncipedia.org	exon	112854260	112854422	.	+	.	gene_id lnc-SOX1-3 ; transcript_id lnc-SOX1-3:5 ; gene_alias_1 XLOC_010505 ; gene_alias_2 linc-C13orf28-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00021914 ;
chr13	lncipedia.org	exon	112855110	112855302	.	+	.	gene_id lnc-SOX1-3 ; transcript_id lnc-SOX1-3:5 ; gene_alias_1 XLOC_010505 ; gene_alias_2 linc-C13orf28-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00021914 ;
chr6	lncipedia.org	exon	58778112	58778151	.	-	.	gene_id lnc-RAB23-5 ; transcript_id lnc-RAB23-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_005754 ; gene_alias_2 linc-RAB23-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00012197 ;
chr6	lncipedia.org	exon	58778492	58778756	.	-	.	gene_id lnc-RAB23-5 ; transcript_id lnc-RAB23-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_005754 ; gene_alias_2 linc-RAB23-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00012197 ;
chr10	lncipedia.org	exon	27546619	27546879	.	-	.	gene_id lnc-ACBD5-1 ; transcript_id lnc-ACBD5-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008757 ; gene_alias_2 linc-ACBD5-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00018458 ;
chr10	lncipedia.org	exon	27548287	27548374	.	-	.	gene_id lnc-ACBD5-1 ; transcript_id lnc-ACBD5-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008757 ; gene_alias_2 linc-ACBD5-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00018458 ;
chr12	lncipedia.org	exon	90341471	90341529	.	+	.	gene_id lnc-TMTC3-4 ; transcript_id lnc-TMTC3-4:2 ; gene_alias_1 XLOC_009827 ; gene_alias_2 linc-CLLU1-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00020510 ;
chr12	lncipedia.org	exon	90343252	90343569	.	+	.	gene_id lnc-TMTC3-4 ; transcript_id lnc-TMTC3-4:2 ; gene_alias_1 XLOC_009827 ; gene_alias_2 linc-CLLU1-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00020510 ;
chr13	lncipedia.org	exon	112925472	112925496	.	-	.	gene_id lnc-TUBGCP3-4 ; transcript_id lnc-TUBGCP3-4:4 ; gene_alias_1 XLOC_010732 ; gene_alias_2 linc-ANKRD10-10 ; transcript_alias_1 TCONS_00022317 ;
chr13	lncipedia.org	exon	112925792	112925903	.	-	.	gene_id lnc-TUBGCP3-4 ; transcript_id lnc-TUBGCP3-4:4 ; gene_alias_1 XLOC_010732 ; gene_alias_2 linc-ANKRD10-10 ; transcript_alias_1 TCONS_00022317 ;
chr13	lncipedia.org	exon	112926566	112926760	.	-	.	gene_id lnc-TUBGCP3-4 ; transcript_id lnc-TUBGCP3-4:4 ; gene_alias_1 XLOC_010732 ; gene_alias_2 linc-ANKRD10-10 ; transcript_alias_1 TCONS_00022317 ;
chr1	lncipedia.org	exon	168756179	168756466	.	+	.	gene_id lnc-XCL1-1 ; transcript_id lnc-XCL1-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_000455 ; gene_alias_2 linc-ATP1B1-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00000008 ;
chr1	lncipedia.org	exon	168758019	168758127	.	+	.	gene_id lnc-XCL1-1 ; transcript_id lnc-XCL1-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_000455 ; gene_alias_2 linc-ATP1B1-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00000008 ;
chr1	lncipedia.org	exon	168761569	168762120	.	+	.	gene_id lnc-XCL1-1 ; transcript_id lnc-XCL1-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_000455 ; gene_alias_2 linc-ATP1B1-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00000008 ;
chr6	lncipedia.org	exon	19538728	19538863	.	+	.	gene_id lnc-ID4-2 ; transcript_id lnc-ID4-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_005192 ; gene_alias_2 linc-ID4-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00011714 ;
chr6	lncipedia.org	exon	19539003	19539166	.	+	.	gene_id lnc-ID4-2 ; transcript_id lnc-ID4-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_005192 ; gene_alias_2 linc-ID4-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00011714 ;
chr18	lncipedia.org	exon	76555629	76555817	.	-	.	gene_id lnc-AC068473.1-5 ; transcript_id lnc-AC068473.1-5:3 ; gene_alias_1 XLOC_012899 ; gene_alias_2 linc-MBP-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00026741 ;
chr18	lncipedia.org	exon	76556229	76556404	.	-	.	gene_id lnc-AC068473.1-5 ; transcript_id lnc-AC068473.1-5:3 ; gene_alias_1 XLOC_012899 ; gene_alias_2 linc-MBP-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00026741 ;
chr22	lncipedia.org	exon	38812661	38812987	.	-	.	gene_id lnc-KCNJ4-1 ; transcript_id lnc-KCNJ4-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_014372 ; gene_alias_2 linc-CSNK1E ; transcript_alias_1 TCONS_00029698 ;
chr22	lncipedia.org	exon	38814021	38814171	.	-	.	gene_id lnc-KCNJ4-1 ; transcript_id lnc-KCNJ4-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_014372 ; gene_alias_2 linc-CSNK1E ; transcript_alias_1 TCONS_00029698 ;
chr22	lncipedia.org	exon	38815793	38815963	.	-	.	gene_id lnc-KCNJ4-1 ; transcript_id lnc-KCNJ4-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_014372 ; gene_alias_2 linc-CSNK1E ; transcript_alias_1 TCONS_00029698 ;
chr18	lncipedia.org	exon	76555629	76555817	.	-	.	gene_id lnc-AC068473.1-5 ; transcript_id lnc-AC068473.1-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_012899 ; gene_alias_2 linc-MBP-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00026583 ;
chr18	lncipedia.org	exon	76556480	76556807	.	-	.	gene_id lnc-AC068473.1-5 ; transcript_id lnc-AC068473.1-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_012899 ; gene_alias_2 linc-MBP-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00026583 ;
chr3	lncipedia.org	exon	126011603	126011680	.	+	.	gene_id lnc-CCDC37-1 ; transcript_id lnc-CCDC37-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_002798 ; gene_alias_2 linc-CCDC37-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00006203 ;
chr3	lncipedia.org	exon	126012876	126013479	.	+	.	gene_id lnc-CCDC37-1 ; transcript_id lnc-CCDC37-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_002798 ; gene_alias_2 linc-CCDC37-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00006203 ;
chr5	lncipedia.org	exon	102580709	102580751	.	-	.	gene_id lnc-GIN1-1 ; transcript_id lnc-GIN1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_004942 ; gene_alias_2 linc-GIN1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00010428 ;
chr5	lncipedia.org	exon	102581861	102582041	.	-	.	gene_id lnc-GIN1-1 ; transcript_id lnc-GIN1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_004942 ; gene_alias_2 linc-GIN1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00010428 ;
chr5	lncipedia.org	exon	102589029	102589507	.	-	.	gene_id lnc-GIN1-1 ; transcript_id lnc-GIN1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_004942 ; gene_alias_2 linc-GIN1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00010428 ;
chr7	lncipedia.org	exon	136247	136268	.	-	.	gene_id lnc-AC145676.2.1-4 ; transcript_id lnc-AC145676.2.1-4:6 ; gene_alias_1 XLOC_006326 ; gene_alias_2 linc-VIPR2-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00013665 ;
chr7	lncipedia.org	exon	148532	148618	.	-	.	gene_id lnc-AC145676.2.1-4 ; transcript_id lnc-AC145676.2.1-4:6 ; gene_alias_1 XLOC_006326 ; gene_alias_2 linc-VIPR2-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00013665 ;
chr7	lncipedia.org	exon	149329	149441	.	-	.	gene_id lnc-AC145676.2.1-4 ; transcript_id lnc-AC145676.2.1-4:6 ; gene_alias_1 XLOC_006326 ; gene_alias_2 linc-VIPR2-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00013665 ;
chr10	lncipedia.org	exon	36311805	36312044	.	+	.	gene_id lnc-GJD4-1 ; transcript_id lnc-GJD4-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008450 ; gene_alias_2 linc-ANKRD30A-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00018160 ;
chr10	lncipedia.org	exon	36315120	36315277	.	+	.	gene_id lnc-GJD4-1 ; transcript_id lnc-GJD4-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008450 ; gene_alias_2 linc-ANKRD30A-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00018160 ;
chr1	lncipedia.org	exon	756411	756669	.	+	.	gene_id lnc-AL669831.1-4 ; transcript_id lnc-AL669831.1-4:2 ; gene_alias_1 XLOC_000008 ; gene_alias_2 linc-SAMD11-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00000779 ;
chr1	lncipedia.org	exon	758660	758975	.	+	.	gene_id lnc-AL669831.1-4 ; transcript_id lnc-AL669831.1-4:2 ; gene_alias_1 XLOC_000008 ; gene_alias_2 linc-SAMD11-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00000779 ;
chr1	lncipedia.org	exon	106993298	106993494	.	+	.	gene_id lnc-PRMT6-2 ; transcript_id lnc-PRMT6-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_000329 ; gene_alias_2 linc-PRMT6-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00001086 ;
chr1	lncipedia.org	exon	106994578	106994727	.	+	.	gene_id lnc-PRMT6-2 ; transcript_id lnc-PRMT6-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_000329 ; gene_alias_2 linc-PRMT6-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00001086 ;
chr1	lncipedia.org	exon	106994835	106995113	.	+	.	gene_id lnc-PRMT6-2 ; transcript_id lnc-PRMT6-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_000329 ; gene_alias_2 linc-PRMT6-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00001086 ;
chr19	lncipedia.org	exon	29704189	29704315	.	+	.	gene_id lnc-VSTM2B-5 ; transcript_id lnc-VSTM2B-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_013028 ; gene_alias_2 linc-VSTM2B-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00026977 ;
chr19	lncipedia.org	exon	29706188	29706490	.	+	.	gene_id lnc-VSTM2B-5 ; transcript_id lnc-VSTM2B-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_013028 ; gene_alias_2 linc-VSTM2B-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00026977 ;
chr4	lncipedia.org	exon	118281779	118281965	.	+	.	gene_id lnc-NDST3-5 ; transcript_id lnc-NDST3-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_003658 ; gene_alias_2 linc-NDST3-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00008204 ;
chr4	lncipedia.org	exon	118282557	118282662	.	+	.	gene_id lnc-NDST3-5 ; transcript_id lnc-NDST3-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_003658 ; gene_alias_2 linc-NDST3-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00008204 ;
chr4	lncipedia.org	exon	118292748	118292818	.	+	.	gene_id lnc-NDST3-5 ; transcript_id lnc-NDST3-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_003658 ; gene_alias_2 linc-NDST3-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00008204 ;
chr4	lncipedia.org	exon	118293520	118293627	.	+	.	gene_id lnc-NDST3-5 ; transcript_id lnc-NDST3-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_003658 ; gene_alias_2 linc-NDST3-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00008204 ;
chr4	lncipedia.org	exon	118293752	118293858	.	+	.	gene_id lnc-NDST3-5 ; transcript_id lnc-NDST3-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_003658 ; gene_alias_2 linc-NDST3-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00008204 ;
chrX	lncipedia.org	exon	153025945	153026067	.	-	.	gene_id lnc-IDH3G-1 ; transcript_id lnc-IDH3G-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000232725.1 ; gene_alias_2 U52111.14 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000024213.1 ; transcript_alias_1 ENST00000416854.1 ; transcript_alias_2 U52111.14-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000061039.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	153029248	153029272	.	-	.	gene_id lnc-IDH3G-1 ; transcript_id lnc-IDH3G-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000232725.1 ; gene_alias_2 U52111.14 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000024213.1 ; transcript_alias_1 ENST00000416854.1 ; transcript_alias_2 U52111.14-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000061039.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	153031838	153031933	.	-	.	gene_id lnc-IDH3G-1 ; transcript_id lnc-IDH3G-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000232725.1 ; gene_alias_2 U52111.14 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000024213.1 ; transcript_alias_1 ENST00000416854.1 ; transcript_alias_2 U52111.14-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000061039.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	76762813	76762936	.	-	.	gene_id lnc-DUPD1-2 ; transcript_id lnc-DUPD1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234149.1 ; gene_alias_2 RP11-77G23.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000018510.1 ; transcript_alias_1 ENST00000413431.1 ; transcript_alias_2 RP11-77G23.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000048775.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	76784868	76784932	.	-	.	gene_id lnc-DUPD1-2 ; transcript_id lnc-DUPD1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234149.1 ; gene_alias_2 RP11-77G23.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000018510.1 ; transcript_alias_1 ENST00000413431.1 ; transcript_alias_2 RP11-77G23.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000048775.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	63488230	63488290	.	-	.	gene_id lnc-ZNF680-3 ; transcript_id lnc-ZNF680-3:4 ; gene_alias_1 XLOC_006468 ; gene_alias_2 linc-ZNF479-7 ; gene_alias_3 ENSG00000228564.1 ; gene_alias_4 RP11-3N2.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156482.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013181 ; transcript_alias_2 ENST00000441691.1 ; transcript_alias_3 RP11-3N2.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000344312.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	63488569	63488788	.	-	.	gene_id lnc-ZNF680-3 ; transcript_id lnc-ZNF680-3:4 ; gene_alias_1 XLOC_006468 ; gene_alias_2 linc-ZNF479-7 ; gene_alias_3 ENSG00000228564.1 ; gene_alias_4 RP11-3N2.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156482.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013181 ; transcript_alias_2 ENST00000441691.1 ; transcript_alias_3 RP11-3N2.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000344312.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	63488894	63489152	.	-	.	gene_id lnc-ZNF680-3 ; transcript_id lnc-ZNF680-3:4 ; gene_alias_1 XLOC_006468 ; gene_alias_2 linc-ZNF479-7 ; gene_alias_3 ENSG00000228564.1 ; gene_alias_4 RP11-3N2.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156482.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013181 ; transcript_alias_2 ENST00000441691.1 ; transcript_alias_3 RP11-3N2.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000344312.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	136131053	136131743	.	-	.	gene_id lnc-OBP2B-2 ; transcript_id lnc-OBP2B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000175164 ; gene_alias_2 ABO ; gene_alias_3 ENSG00000175164.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020872.3 ; transcript_alias_1 ENST00000453660 ; transcript_alias_2 ENST00000453660.1 ; transcript_alias_3 ABO-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000054907.3 ;
chr9	lncipedia.org	exon	136132796	136132929	.	-	.	gene_id lnc-OBP2B-2 ; transcript_id lnc-OBP2B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000175164 ; gene_alias_2 ABO ; gene_alias_3 ENSG00000175164.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020872.3 ; transcript_alias_1 ENST00000453660 ; transcript_alias_2 ENST00000453660.1 ; transcript_alias_3 ABO-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000054907.3 ;
chr9	lncipedia.org	exon	136133487	136133522	.	-	.	gene_id lnc-OBP2B-2 ; transcript_id lnc-OBP2B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000175164 ; gene_alias_2 ABO ; gene_alias_3 ENSG00000175164.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020872.3 ; transcript_alias_1 ENST00000453660 ; transcript_alias_2 ENST00000453660.1 ; transcript_alias_3 ABO-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000054907.3 ;
chr9	lncipedia.org	exon	136135223	136135270	.	-	.	gene_id lnc-OBP2B-2 ; transcript_id lnc-OBP2B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000175164 ; gene_alias_2 ABO ; gene_alias_3 ENSG00000175164.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020872.3 ; transcript_alias_1 ENST00000453660 ; transcript_alias_2 ENST00000453660.1 ; transcript_alias_3 ABO-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000054907.3 ;
chr9	lncipedia.org	exon	136136721	136136777	.	-	.	gene_id lnc-OBP2B-2 ; transcript_id lnc-OBP2B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000175164 ; gene_alias_2 ABO ; gene_alias_3 ENSG00000175164.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020872.3 ; transcript_alias_1 ENST00000453660 ; transcript_alias_2 ENST00000453660.1 ; transcript_alias_3 ABO-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000054907.3 ;
chr9	lncipedia.org	exon	136137502	136137571	.	-	.	gene_id lnc-OBP2B-2 ; transcript_id lnc-OBP2B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000175164 ; gene_alias_2 ABO ; gene_alias_3 ENSG00000175164.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020872.3 ; transcript_alias_1 ENST00000453660 ; transcript_alias_2 ENST00000453660.1 ; transcript_alias_3 ABO-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000054907.3 ;
chr9	lncipedia.org	exon	136150578	136150617	.	-	.	gene_id lnc-OBP2B-2 ; transcript_id lnc-OBP2B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000175164 ; gene_alias_2 ABO ; gene_alias_3 ENSG00000175164.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020872.3 ; transcript_alias_1 ENST00000453660 ; transcript_alias_2 ENST00000453660.1 ; transcript_alias_3 ABO-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000054907.3 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27254597	27256985	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-3 ; transcript_id lnc-CRYBA4-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223704 ; gene_alias_2 RP1-90L6.2 ; gene_alias_3 ENSG00000223704.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150979.1 ; transcript_alias_1 ENST00000434868 ; transcript_alias_2 ENST00000434868.1 ; transcript_alias_3 RP1-90L6.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320766.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27257945	27258068	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-3 ; transcript_id lnc-CRYBA4-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223704 ; gene_alias_2 RP1-90L6.2 ; gene_alias_3 ENSG00000223704.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150979.1 ; transcript_alias_1 ENST00000434868 ; transcript_alias_2 ENST00000434868.1 ; transcript_alias_3 RP1-90L6.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320766.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27258220	27261749	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-3 ; transcript_id lnc-CRYBA4-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223704 ; gene_alias_2 RP1-90L6.2 ; gene_alias_3 ENSG00000223704.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150979.1 ; transcript_alias_1 ENST00000434868 ; transcript_alias_2 ENST00000434868.1 ; transcript_alias_3 RP1-90L6.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320766.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	41961615	41962747	.	-	.	gene_id lnc-FAM75A4-3 ; transcript_id lnc-FAM75A4-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204837 ; gene_alias_2 RP11-204M4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000204837.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000067165.1 ; transcript_alias_1 ENST00000454645 ; transcript_alias_2 ENST00000454645.1 ; transcript_alias_3 RP11-204M4.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000143738.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	41963839	41963942	.	-	.	gene_id lnc-FAM75A4-3 ; transcript_id lnc-FAM75A4-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204837 ; gene_alias_2 RP11-204M4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000204837.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000067165.1 ; transcript_alias_1 ENST00000454645 ; transcript_alias_2 ENST00000454645.1 ; transcript_alias_3 RP11-204M4.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000143738.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	42018928	42019580	.	-	.	gene_id lnc-FAM75A4-3 ; transcript_id lnc-FAM75A4-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204837 ; gene_alias_2 RP11-204M4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000204837.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000067165.1 ; transcript_alias_1 ENST00000454645 ; transcript_alias_2 ENST00000454645.1 ; transcript_alias_3 RP11-204M4.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000143738.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	148329	148714	.	-	.	gene_id lnc-AC145676.2.1-4 ; transcript_id lnc-AC145676.2.1-4:7 ; gene_alias_1 XLOC_006326 ; gene_alias_2 linc-VIPR2-4 ; gene_alias_3 ENSG00000242474 ; gene_alias_4 AC093627.9 ; gene_alias_5 ENSG00000242474.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151405.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013114 ; transcript_alias_2 ENST00000487884 ; transcript_alias_3 ENST00000487884.1 ; transcript_alias_4 AC093627.9-004 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000322491.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	149329	149438	.	-	.	gene_id lnc-AC145676.2.1-4 ; transcript_id lnc-AC145676.2.1-4:7 ; gene_alias_1 XLOC_006326 ; gene_alias_2 linc-VIPR2-4 ; gene_alias_3 ENSG00000242474 ; gene_alias_4 AC093627.9 ; gene_alias_5 ENSG00000242474.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151405.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013114 ; transcript_alias_2 ENST00000487884 ; transcript_alias_3 ENST00000487884.1 ; transcript_alias_4 AC093627.9-004 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000322491.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	96087251	96087370	.	+	.	gene_id lnc-TCL1B-3 ; transcript_id lnc-TCL1B-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258927 ; gene_alias_2 RP11-1070N10.5 ; gene_alias_3 ENSG00000258927.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171639.1 ; transcript_alias_1 ENST00000555032 ; transcript_alias_2 ENST00000555032.1 ; transcript_alias_3 RP11-1070N10.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414557.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	96106290	96106485	.	+	.	gene_id lnc-TCL1B-3 ; transcript_id lnc-TCL1B-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258927 ; gene_alias_2 RP11-1070N10.5 ; gene_alias_3 ENSG00000258927.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171639.1 ; transcript_alias_1 ENST00000555032 ; transcript_alias_2 ENST00000555032.1 ; transcript_alias_3 RP11-1070N10.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414557.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	96108078	96108207	.	+	.	gene_id lnc-TCL1B-3 ; transcript_id lnc-TCL1B-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258927 ; gene_alias_2 RP11-1070N10.5 ; gene_alias_3 ENSG00000258927.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171639.1 ; transcript_alias_1 ENST00000555032 ; transcript_alias_2 ENST00000555032.1 ; transcript_alias_3 RP11-1070N10.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414557.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	96108355	96109622	.	+	.	gene_id lnc-TCL1B-3 ; transcript_id lnc-TCL1B-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258927 ; gene_alias_2 RP11-1070N10.5 ; gene_alias_3 ENSG00000258927.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171639.1 ; transcript_alias_1 ENST00000555032 ; transcript_alias_2 ENST00000555032.1 ; transcript_alias_3 RP11-1070N10.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414557.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	1094996	1095060	.	-	.	gene_id lnc-COX19-2 ; transcript_id lnc-COX19-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000244981 ; gene_alias_2 ENSG00000257607.1 ; gene_alias_3 RP11-449P15.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169520.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500070 ; transcript_alias_2 ENST00000549241.1 ; transcript_alias_3 RP11-449P15.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404580.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	1097401	1098897	.	-	.	gene_id lnc-COX19-2 ; transcript_id lnc-COX19-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000244981 ; gene_alias_2 ENSG00000257607.1 ; gene_alias_3 RP11-449P15.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169520.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500070 ; transcript_alias_2 ENST00000549241.1 ; transcript_alias_3 RP11-449P15.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404580.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45015068	45015082	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000316962 ; transcript_alias_2 ENST00000316962.7 ; transcript_alias_3 CEACAM20-201 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45015085	45015213	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000316962 ; transcript_alias_2 ENST00000316962.7 ; transcript_alias_3 CEACAM20-201 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45015695	45015730	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000316962 ; transcript_alias_2 ENST00000316962.7 ; transcript_alias_3 CEACAM20-201 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45016075	45016136	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000316962 ; transcript_alias_2 ENST00000316962.7 ; transcript_alias_3 CEACAM20-201 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45016926	45016989	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000316962 ; transcript_alias_2 ENST00000316962.7 ; transcript_alias_3 CEACAM20-201 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45016991	45017012	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000316962 ; transcript_alias_2 ENST00000316962.7 ; transcript_alias_3 CEACAM20-201 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45017231	45017348	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000316962 ; transcript_alias_2 ENST00000316962.7 ; transcript_alias_3 CEACAM20-201 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45021007	45021285	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000316962 ; transcript_alias_2 ENST00000316962.7 ; transcript_alias_3 CEACAM20-201 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45024508	45024786	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000316962 ; transcript_alias_2 ENST00000316962.7 ; transcript_alias_3 CEACAM20-201 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45026663	45026941	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000316962 ; transcript_alias_2 ENST00000316962.7 ; transcript_alias_3 CEACAM20-201 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45028019	45028294	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000316962 ; transcript_alias_2 ENST00000316962.7 ; transcript_alias_3 CEACAM20-201 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45029134	45029277	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000316962 ; transcript_alias_2 ENST00000316962.7 ; transcript_alias_3 CEACAM20-201 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45033481	45033811	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000316962 ; transcript_alias_2 ENST00000316962.7 ; transcript_alias_3 CEACAM20-201 ;
chr2	lncipedia.org	exon	52721826	52722000	.	-	.	gene_id lnc-ASB3-3 ; transcript_id lnc-ASB3-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_002095 ; gene_alias_2 linc-NRXN1-4 ; gene_alias_3 ENSG00000236837 ; gene_alias_4 AC139712.4 ; gene_alias_5 ENSG00000236837.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000152267.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003283 ; transcript_alias_2 ENST00000443926 ; transcript_alias_3 ENST00000443926.1 ; transcript_alias_4 AC139712.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000325653.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	52722903	52722974	.	-	.	gene_id lnc-ASB3-3 ; transcript_id lnc-ASB3-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_002095 ; gene_alias_2 linc-NRXN1-4 ; gene_alias_3 ENSG00000236837 ; gene_alias_4 AC139712.4 ; gene_alias_5 ENSG00000236837.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000152267.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003283 ; transcript_alias_2 ENST00000443926 ; transcript_alias_3 ENST00000443926.1 ; transcript_alias_4 AC139712.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000325653.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	52725741	52725923	.	-	.	gene_id lnc-ASB3-3 ; transcript_id lnc-ASB3-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_002095 ; gene_alias_2 linc-NRXN1-4 ; gene_alias_3 ENSG00000236837 ; gene_alias_4 AC139712.4 ; gene_alias_5 ENSG00000236837.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000152267.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003283 ; transcript_alias_2 ENST00000443926 ; transcript_alias_3 ENST00000443926.1 ; transcript_alias_4 AC139712.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000325653.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	52727682	52727890	.	-	.	gene_id lnc-ASB3-3 ; transcript_id lnc-ASB3-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_002095 ; gene_alias_2 linc-NRXN1-4 ; gene_alias_3 ENSG00000236837 ; gene_alias_4 AC139712.4 ; gene_alias_5 ENSG00000236837.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000152267.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003283 ; transcript_alias_2 ENST00000443926 ; transcript_alias_3 ENST00000443926.1 ; transcript_alias_4 AC139712.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000325653.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	132251379	132251578	.	+	.	gene_id lnc-METTL11A-3 ; transcript_id lnc-METTL11A-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000204054 ; gene_alias_2 RP11-492E3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000204054.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020783.2 ; transcript_alias_1 ENST00000419300 ; transcript_alias_2 ENST00000419300.1 ; transcript_alias_3 RP11-492E3.1-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000106519.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	132265602	132267360	.	+	.	gene_id lnc-METTL11A-3 ; transcript_id lnc-METTL11A-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000204054 ; gene_alias_2 RP11-492E3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000204054.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020783.2 ; transcript_alias_1 ENST00000419300 ; transcript_alias_2 ENST00000419300.1 ; transcript_alias_3 RP11-492E3.1-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000106519.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	130336753	130338354	.	-	.	gene_id lnc-RIMBP2-5 ; transcript_id lnc-RIMBP2-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251536 ; gene_alias_2 RP11-572C21.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251536.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168394.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502221 ; transcript_alias_2 ENST00000502221.2 ; transcript_alias_3 RP11-572C21.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399541.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	130339106	130339489	.	-	.	gene_id lnc-RIMBP2-5 ; transcript_id lnc-RIMBP2-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251536 ; gene_alias_2 RP11-572C21.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251536.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168394.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502221 ; transcript_alias_2 ENST00000502221.2 ; transcript_alias_3 RP11-572C21.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399541.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	69146939	69147202	.	+	.	gene_id lnc-BX255923.1-1 ; transcript_id lnc-BX255923.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000237543 ; gene_alias_2 RP11-58A12.3 ; gene_alias_3 ENSG00000237543.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000058670.1 ; transcript_alias_1 ENST00000416700 ; transcript_alias_2 ENST00000416700.1 ; transcript_alias_3 RP11-58A12.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000129825.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	69149205	69149621	.	+	.	gene_id lnc-BX255923.1-1 ; transcript_id lnc-BX255923.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000237543 ; gene_alias_2 RP11-58A12.3 ; gene_alias_3 ENSG00000237543.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000058670.1 ; transcript_alias_1 ENST00000416700 ; transcript_alias_2 ENST00000416700.1 ; transcript_alias_3 RP11-58A12.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000129825.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	140713994	140714371	.	+	.	gene_id lnc-SPANXA2-1 ; transcript_id lnc-SPANXA2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223438 ; gene_alias_2 RP1-171K16.5 ; gene_alias_3 ENSG00000223438.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022567.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412163 ; transcript_alias_2 ENST00000412163.1 ; transcript_alias_3 RP1-171K16.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058602.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	140714561	140714863	.	+	.	gene_id lnc-SPANXA2-1 ; transcript_id lnc-SPANXA2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223438 ; gene_alias_2 RP1-171K16.5 ; gene_alias_3 ENSG00000223438.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022567.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412163 ; transcript_alias_2 ENST00000412163.1 ; transcript_alias_3 RP1-171K16.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058602.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	29119930	29120266	.	+	.	gene_id lnc-PCDH7-9 ; transcript_id lnc-PCDH7-9:2 ; gene_alias_1 XLOC_003491 ; gene_alias_2 linc-PCDH7-2 ; gene_alias_3 ENSG00000248176 ; gene_alias_4 RP11-472K22.1 ; gene_alias_5 ENSG00000248176.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000161694.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00007500 ; transcript_alias_2 ENST00000503299 ; transcript_alias_3 ENST00000503299.1 ; transcript_alias_4 RP11-472K22.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000365734.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	29120354	29120484	.	+	.	gene_id lnc-PCDH7-9 ; transcript_id lnc-PCDH7-9:2 ; gene_alias_1 XLOC_003491 ; gene_alias_2 linc-PCDH7-2 ; gene_alias_3 ENSG00000248176 ; gene_alias_4 RP11-472K22.1 ; gene_alias_5 ENSG00000248176.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000161694.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00007500 ; transcript_alias_2 ENST00000503299 ; transcript_alias_3 ENST00000503299.1 ; transcript_alias_4 RP11-472K22.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000365734.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	29204103	29204392	.	+	.	gene_id lnc-PCDH7-9 ; transcript_id lnc-PCDH7-9:2 ; gene_alias_1 XLOC_003491 ; gene_alias_2 linc-PCDH7-2 ; gene_alias_3 ENSG00000248176 ; gene_alias_4 RP11-472K22.1 ; gene_alias_5 ENSG00000248176.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000161694.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00007500 ; transcript_alias_2 ENST00000503299 ; transcript_alias_3 ENST00000503299.1 ; transcript_alias_4 RP11-472K22.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000365734.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	10493639	10494204	.	-	.	gene_id lnc-RP11-1C1.5.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-1C1.5.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_004734 ; gene_alias_2 linc-CMBL-1 ; gene_alias_3 ENSG00000249396 ; gene_alias_4 RP11-1C1.4 ; gene_alias_5 ENSG00000249396.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000162051.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009604 ; transcript_alias_2 ENST00000515243 ; transcript_alias_3 ENST00000515243.1 ; transcript_alias_4 RP11-1C1.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000367039.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	10495386	10495425	.	-	.	gene_id lnc-RP11-1C1.5.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-1C1.5.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_004734 ; gene_alias_2 linc-CMBL-1 ; gene_alias_3 ENSG00000249396 ; gene_alias_4 RP11-1C1.4 ; gene_alias_5 ENSG00000249396.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000162051.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009604 ; transcript_alias_2 ENST00000515243 ; transcript_alias_3 ENST00000515243.1 ; transcript_alias_4 RP11-1C1.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000367039.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	10501317	10502840	.	-	.	gene_id lnc-RP11-1C1.5.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-1C1.5.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_004734 ; gene_alias_2 linc-CMBL-1 ; gene_alias_3 ENSG00000249396 ; gene_alias_4 RP11-1C1.4 ; gene_alias_5 ENSG00000249396.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000162051.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009604 ; transcript_alias_2 ENST00000515243 ; transcript_alias_3 ENST00000515243.1 ; transcript_alias_4 RP11-1C1.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000367039.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	20551156	20551882	.	-	.	gene_id lnc-HSFY2-4 ; transcript_id lnc-HSFY2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226362 ; gene_alias_2 FAM41AY2 ; gene_alias_3 ENSG00000226362.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000041973.1 ; transcript_alias_1 ENST00000458627 ; transcript_alias_2 ENST00000458627.1 ; transcript_alias_3 FAM41AY2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000100029.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	20551965	20552186	.	-	.	gene_id lnc-HSFY2-4 ; transcript_id lnc-HSFY2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226362 ; gene_alias_2 FAM41AY2 ; gene_alias_3 ENSG00000226362.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000041973.1 ; transcript_alias_1 ENST00000458627 ; transcript_alias_2 ENST00000458627.1 ; transcript_alias_3 FAM41AY2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000100029.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	20552399	20552586	.	-	.	gene_id lnc-HSFY2-4 ; transcript_id lnc-HSFY2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226362 ; gene_alias_2 FAM41AY2 ; gene_alias_3 ENSG00000226362.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000041973.1 ; transcript_alias_1 ENST00000458627 ; transcript_alias_2 ENST00000458627.1 ; transcript_alias_3 FAM41AY2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000100029.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	20552880	20553089	.	-	.	gene_id lnc-HSFY2-4 ; transcript_id lnc-HSFY2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226362 ; gene_alias_2 FAM41AY2 ; gene_alias_3 ENSG00000226362.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000041973.1 ; transcript_alias_1 ENST00000458627 ; transcript_alias_2 ENST00000458627.1 ; transcript_alias_3 FAM41AY2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000100029.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	20553364	20553457	.	-	.	gene_id lnc-HSFY2-4 ; transcript_id lnc-HSFY2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226362 ; gene_alias_2 FAM41AY2 ; gene_alias_3 ENSG00000226362.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000041973.1 ; transcript_alias_1 ENST00000458627 ; transcript_alias_2 ENST00000458627.1 ; transcript_alias_3 FAM41AY2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000100029.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	20553567	20553737	.	-	.	gene_id lnc-HSFY2-4 ; transcript_id lnc-HSFY2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226362 ; gene_alias_2 FAM41AY2 ; gene_alias_3 ENSG00000226362.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000041973.1 ; transcript_alias_1 ENST00000458627 ; transcript_alias_2 ENST00000458627.1 ; transcript_alias_3 FAM41AY2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000100029.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	20554331	20554424	.	-	.	gene_id lnc-HSFY2-4 ; transcript_id lnc-HSFY2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226362 ; gene_alias_2 FAM41AY2 ; gene_alias_3 ENSG00000226362.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000041973.1 ; transcript_alias_1 ENST00000458627 ; transcript_alias_2 ENST00000458627.1 ; transcript_alias_3 FAM41AY2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000100029.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	20554672	20554800	.	-	.	gene_id lnc-HSFY2-4 ; transcript_id lnc-HSFY2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226362 ; gene_alias_2 FAM41AY2 ; gene_alias_3 ENSG00000226362.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000041973.1 ; transcript_alias_1 ENST00000458627 ; transcript_alias_2 ENST00000458627.1 ; transcript_alias_3 FAM41AY2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000100029.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	20566130	20566179	.	-	.	gene_id lnc-HSFY2-4 ; transcript_id lnc-HSFY2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226362 ; gene_alias_2 FAM41AY2 ; gene_alias_3 ENSG00000226362.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000041973.1 ; transcript_alias_1 ENST00000458627 ; transcript_alias_2 ENST00000458627.1 ; transcript_alias_3 FAM41AY2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000100029.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	20566775	20566932	.	-	.	gene_id lnc-HSFY2-4 ; transcript_id lnc-HSFY2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226362 ; gene_alias_2 FAM41AY2 ; gene_alias_3 ENSG00000226362.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000041973.1 ; transcript_alias_1 ENST00000458627 ; transcript_alias_2 ENST00000458627.1 ; transcript_alias_3 FAM41AY2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000100029.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	134541320	134541650	.	-	.	gene_id lnc-B3GAT1-1 ; transcript_id lnc-B3GAT1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254989 ; gene_alias_2 RP11-469N6.3 ; gene_alias_3 ENSG00000254989.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167182.1 ; transcript_alias_1 ENST00000529417 ; transcript_alias_2 ENST00000529417.1 ; transcript_alias_3 RP11-469N6.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393645.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	134541861	134541918	.	-	.	gene_id lnc-B3GAT1-1 ; transcript_id lnc-B3GAT1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254989 ; gene_alias_2 RP11-469N6.3 ; gene_alias_3 ENSG00000254989.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167182.1 ; transcript_alias_1 ENST00000529417 ; transcript_alias_2 ENST00000529417.1 ; transcript_alias_3 RP11-469N6.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393645.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	22352027	22352136	.	+	.	gene_id lnc-CELA3A-1 ; transcript_id lnc-CELA3A-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000218510 ; gene_alias_2 NCRNA00339 ; gene_alias_3 ENSG00000218510.3 ; gene_alias_4 LINC00339 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000002757.2 ; transcript_alias_1 ENST00000404210 ; transcript_alias_2 ENST00000404210.2 ; transcript_alias_3 LINC00339-201 ;
chr1	lncipedia.org	exon	22356773	22357187	.	+	.	gene_id lnc-CELA3A-1 ; transcript_id lnc-CELA3A-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000218510 ; gene_alias_2 NCRNA00339 ; gene_alias_3 ENSG00000218510.3 ; gene_alias_4 LINC00339 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000002757.2 ; transcript_alias_1 ENST00000404210 ; transcript_alias_2 ENST00000404210.2 ; transcript_alias_3 LINC00339-201 ;
chr1	lncipedia.org	exon	22357190	22357435	.	+	.	gene_id lnc-CELA3A-1 ; transcript_id lnc-CELA3A-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000218510 ; gene_alias_2 NCRNA00339 ; gene_alias_3 ENSG00000218510.3 ; gene_alias_4 LINC00339 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000002757.2 ; transcript_alias_1 ENST00000404210 ; transcript_alias_2 ENST00000404210.2 ; transcript_alias_3 LINC00339-201 ;
chr1	lncipedia.org	exon	22357440	22357713	.	+	.	gene_id lnc-CELA3A-1 ; transcript_id lnc-CELA3A-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000218510 ; gene_alias_2 NCRNA00339 ; gene_alias_3 ENSG00000218510.3 ; gene_alias_4 LINC00339 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000002757.2 ; transcript_alias_1 ENST00000404210 ; transcript_alias_2 ENST00000404210.2 ; transcript_alias_3 LINC00339-201 ;
chr1	lncipedia.org	exon	159931014	159931195	.	+	.	gene_id lnc-KCNJ9-2 ; transcript_id lnc-KCNJ9-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000224259 ; gene_alias_2 RP11-48O20.4 ; gene_alias_3 ENSG00000224259.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000024077.1 ; transcript_alias_1 ENST00000423943 ; transcript_alias_2 ENST00000423943.1 ; transcript_alias_3 RP11-48O20.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000060638.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	159946434	159946902	.	+	.	gene_id lnc-KCNJ9-2 ; transcript_id lnc-KCNJ9-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000224259 ; gene_alias_2 RP11-48O20.4 ; gene_alias_3 ENSG00000224259.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000024077.1 ; transcript_alias_1 ENST00000423943 ; transcript_alias_2 ENST00000423943.1 ; transcript_alias_3 RP11-48O20.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000060638.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	159948390	159948851	.	+	.	gene_id lnc-KCNJ9-2 ; transcript_id lnc-KCNJ9-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000224259 ; gene_alias_2 RP11-48O20.4 ; gene_alias_3 ENSG00000224259.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000024077.1 ; transcript_alias_1 ENST00000423943 ; transcript_alias_2 ENST00000423943.1 ; transcript_alias_3 RP11-48O20.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000060638.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	231499503	231499958	.	+	.	gene_id lnc-C1orf124-2 ; transcript_id lnc-C1orf124-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245850 ; transcript_alias_1 ENST00000499207 ;
chr1	lncipedia.org	exon	231503542	231504855	.	+	.	gene_id lnc-C1orf124-2 ; transcript_id lnc-C1orf124-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245850 ; transcript_alias_1 ENST00000499207 ;
chr3	lncipedia.org	exon	58277993	58279527	.	-	.	gene_id lnc-DNASE1L3-2 ; transcript_id lnc-DNASE1L3-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248224 ; transcript_alias_1 ENST00000511761 ;
chr3	lncipedia.org	exon	58279914	58280451	.	-	.	gene_id lnc-DNASE1L3-2 ; transcript_id lnc-DNASE1L3-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248224 ; transcript_alias_1 ENST00000511761 ;
chr16	lncipedia.org	exon	1722898	1725399	.	-	.	gene_id lnc-IFT140-2 ; transcript_id lnc-IFT140-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245096 ; transcript_alias_1 ENST00000500567 ;
chr16	lncipedia.org	exon	1727196	1727907	.	-	.	gene_id lnc-IFT140-2 ; transcript_id lnc-IFT140-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245096 ; transcript_alias_1 ENST00000500567 ;
chr1	lncipedia.org	exon	20010584	20011363	.	-	.	gene_id lnc-RNF186-1 ; transcript_id lnc-RNF186-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250744 ; transcript_alias_1 ENST00000512048 ;
chr1	lncipedia.org	exon	20014250	20016242	.	-	.	gene_id lnc-RNF186-1 ; transcript_id lnc-RNF186-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250744 ; transcript_alias_1 ENST00000512048 ;
chr1	lncipedia.org	exon	20016321	20016628	.	-	.	gene_id lnc-RNF186-1 ; transcript_id lnc-RNF186-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250744 ; transcript_alias_1 ENST00000512048 ;
chr19	lncipedia.org	exon	19017011	19018999	.	+	.	gene_id lnc-DDX49-1 ; transcript_id lnc-DDX49-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248819 ; transcript_alias_1 ENST00000513244 ;
chr19	lncipedia.org	exon	19019595	19020282	.	+	.	gene_id lnc-DDX49-1 ; transcript_id lnc-DDX49-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248819 ; transcript_alias_1 ENST00000513244 ;
chr11	lncipedia.org	exon	111381325	111381597	.	+	.	gene_id lnc-C11orf88-1 ; transcript_id lnc-C11orf88-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256523 ; gene_alias_2 AP002008.1 ; transcript_alias_1 ENST00000540312 ;
chr11	lncipedia.org	exon	111383743	111384610	.	+	.	gene_id lnc-C11orf88-1 ; transcript_id lnc-C11orf88-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256523 ; gene_alias_2 AP002008.1 ; transcript_alias_1 ENST00000540312 ;
chr5	lncipedia.org	exon	140797766	140798435	.	-	.	gene_id lnc-DIAPH1-2 ; transcript_id lnc-DIAPH1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248581 ; transcript_alias_1 ENST00000504978 ;
chr5	lncipedia.org	exon	140891228	140891866	.	-	.	gene_id lnc-DIAPH1-2 ; transcript_id lnc-DIAPH1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248581 ; transcript_alias_1 ENST00000504978 ;
chr5	lncipedia.org	exon	140892104	140892510	.	-	.	gene_id lnc-DIAPH1-2 ; transcript_id lnc-DIAPH1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248581 ; transcript_alias_1 ENST00000504978 ;
chr19	lncipedia.org	exon	35307061	35308394	.	-	.	gene_id lnc-ZNF599-2 ; transcript_id lnc-ZNF599-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246294 ; transcript_alias_1 ENST00000502044 ;
chr19	lncipedia.org	exon	35309491	35309670	.	-	.	gene_id lnc-ZNF599-2 ; transcript_id lnc-ZNF599-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246294 ; transcript_alias_1 ENST00000502044 ;
chr19	lncipedia.org	exon	35320068	35320157	.	-	.	gene_id lnc-ZNF599-2 ; transcript_id lnc-ZNF599-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246294 ; transcript_alias_1 ENST00000502044 ;
chr19	lncipedia.org	exon	35321310	35321430	.	-	.	gene_id lnc-ZNF599-2 ; transcript_id lnc-ZNF599-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246294 ; transcript_alias_1 ENST00000502044 ;
chr19	lncipedia.org	exon	35323234	35323440	.	-	.	gene_id lnc-ZNF599-2 ; transcript_id lnc-ZNF599-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246294 ; transcript_alias_1 ENST00000502044 ;
chr19	lncipedia.org	exon	35323629	35323773	.	-	.	gene_id lnc-ZNF599-2 ; transcript_id lnc-ZNF599-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246294 ; transcript_alias_1 ENST00000502044 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101536824	101537076	.	-	.	gene_id lnc-RTL1-2 ; transcript_id lnc-RTL1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000248952 ; gene_alias_2 XLOC_011130 ; gene_alias_3 linc-RTL1-6 ; transcript_alias_1 ENST00000514741 ; transcript_alias_2 TCONS_00022413 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101537120	101539261	.	-	.	gene_id lnc-RTL1-2 ; transcript_id lnc-RTL1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000248952 ; gene_alias_2 XLOC_011130 ; gene_alias_3 linc-RTL1-6 ; transcript_alias_1 ENST00000514741 ; transcript_alias_2 TCONS_00022413 ;
chr12	lncipedia.org	exon	117147983	117149097	.	+	.	gene_id lnc-RNFT2-1 ; transcript_id lnc-RNFT2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250553 ; gene_alias_2 XLOC_009900 ; gene_alias_3 linc-RNFT2-1 ; transcript_alias_1 ENST00000509590 ; transcript_alias_2 TCONS_00020237 ;
chr12	lncipedia.org	exon	117149742	117150681	.	+	.	gene_id lnc-RNFT2-1 ; transcript_id lnc-RNFT2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250553 ; gene_alias_2 XLOC_009900 ; gene_alias_3 linc-RNFT2-1 ; transcript_alias_1 ENST00000509590 ; transcript_alias_2 TCONS_00020237 ;
chr6	lncipedia.org	exon	2244111	2245348	.	+	.	gene_id lnc-WRNIP1-3 ; transcript_id lnc-WRNIP1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246005 ; gene_alias_2 AL158139.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500716 ;
chr6	lncipedia.org	exon	2245771	2245808	.	+	.	gene_id lnc-WRNIP1-3 ; transcript_id lnc-WRNIP1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246005 ; gene_alias_2 AL158139.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500716 ;
chr15	lncipedia.org	exon	66614820	66616781	.	-	.	gene_id lnc-TIPIN-1 ; transcript_id lnc-TIPIN-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247991 ; transcript_alias_1 ENST00000499718 ;
chr15	lncipedia.org	exon	66617976	66618897	.	-	.	gene_id lnc-TIPIN-1 ; transcript_id lnc-TIPIN-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247991 ; transcript_alias_1 ENST00000499718 ;
chr7	lncipedia.org	exon	4807257	4807749	.	-	.	gene_id lnc-RADIL-1 ; transcript_id lnc-RADIL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251104 ; transcript_alias_1 ENST00000515163 ;
chr7	lncipedia.org	exon	4808070	4809064	.	-	.	gene_id lnc-RADIL-1 ; transcript_id lnc-RADIL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251104 ; transcript_alias_1 ENST00000515163 ;
chr7	lncipedia.org	exon	4810155	4811074	.	-	.	gene_id lnc-RADIL-1 ; transcript_id lnc-RADIL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251104 ; transcript_alias_1 ENST00000515163 ;
chrX	lncipedia.org	exon	120181438	120181533	.	-	.	gene_id lnc-CT47A1-1 ; transcript_id lnc-CT47A1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251641 ; transcript_alias_1 ENST00000513510 ;
chrX	lncipedia.org	exon	120181712	120183374	.	-	.	gene_id lnc-CT47A1-1 ; transcript_id lnc-CT47A1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251641 ; transcript_alias_1 ENST00000513510 ;
chr20	lncipedia.org	exon	306269	306497	.	-	.	gene_id lnc-C20orf96-3 ; transcript_id lnc-C20orf96-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246892 ; gene_alias_2 AL034548.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500146 ;
chr20	lncipedia.org	exon	307819	309372	.	-	.	gene_id lnc-C20orf96-3 ; transcript_id lnc-C20orf96-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246892 ; gene_alias_2 AL034548.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500146 ;
chr16	lncipedia.org	exon	30538239	30539615	.	+	.	gene_id lnc-ITGAL-1 ; transcript_id lnc-ITGAL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245600 ; gene_alias_2 AC002310.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501009 ;
chr16	lncipedia.org	exon	30541404	30541977	.	+	.	gene_id lnc-ITGAL-1 ; transcript_id lnc-ITGAL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245600 ; gene_alias_2 AC002310.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501009 ;
chr3	lncipedia.org	exon	185337709	185337809	.	+	.	gene_id lnc-C3orf65-1 ; transcript_id lnc-C3orf65-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249214 ; transcript_alias_1 ENST00000502700 ;
chr3	lncipedia.org	exon	185426461	185426476	.	+	.	gene_id lnc-C3orf65-1 ; transcript_id lnc-C3orf65-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249214 ; transcript_alias_1 ENST00000502700 ;
chr3	lncipedia.org	exon	185506805	185508293	.	+	.	gene_id lnc-C3orf65-1 ; transcript_id lnc-C3orf65-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249214 ; transcript_alias_1 ENST00000502700 ;
chr3	lncipedia.org	exon	190023503	190024560	.	+	.	gene_id lnc-CLDN16-1 ; transcript_id lnc-CLDN16-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247017 ; transcript_alias_1 ENST00000499321 ;
chr3	lncipedia.org	exon	190039080	190040232	.	+	.	gene_id lnc-CLDN16-1 ; transcript_id lnc-CLDN16-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247017 ; transcript_alias_1 ENST00000499321 ;
chr15	lncipedia.org	exon	35838396	35838674	.	+	.	gene_id lnc-C15orf41-8 ; transcript_id lnc-C15orf41-8:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248079 ; gene_alias_2 AC015994.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501169 ;
chr15	lncipedia.org	exon	36003908	36004090	.	+	.	gene_id lnc-C15orf41-8 ; transcript_id lnc-C15orf41-8:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248079 ; gene_alias_2 AC015994.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501169 ;
chr15	lncipedia.org	exon	36150188	36151200	.	+	.	gene_id lnc-C15orf41-8 ; transcript_id lnc-C15orf41-8:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248079 ; gene_alias_2 AC015994.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501169 ;
chr2	lncipedia.org	exon	97584843	97585180	.	+	.	gene_id lnc-CNNM3-1 ; transcript_id lnc-CNNM3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246515 ; gene_alias_2 AC092636.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500585 ;
chr2	lncipedia.org	exon	97585512	97585639	.	+	.	gene_id lnc-CNNM3-1 ; transcript_id lnc-CNNM3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246515 ; gene_alias_2 AC092636.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500585 ;
chr2	lncipedia.org	exon	97589781	97591573	.	+	.	gene_id lnc-CNNM3-1 ; transcript_id lnc-CNNM3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246515 ; gene_alias_2 AC092636.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500585 ;
chr12	lncipedia.org	exon	58263618	58264164	.	-	.	gene_id lnc-CTDSP2-1 ; transcript_id lnc-CTDSP2-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245651 ; transcript_alias_1 ENST00000499481 ;
chr12	lncipedia.org	exon	58263619	58264164	.	-	.	gene_id lnc-CTDSP2-1 ; transcript_id lnc-CTDSP2-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245651 ; transcript_alias_1 ENST00000499481 ;
chr12	lncipedia.org	exon	58265779	58265871	.	-	.	gene_id lnc-CTDSP2-1 ; transcript_id lnc-CTDSP2-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245651 ; transcript_alias_1 ENST00000499481 ;
chr12	lncipedia.org	exon	58266636	58266759	.	-	.	gene_id lnc-CTDSP2-1 ; transcript_id lnc-CTDSP2-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245651 ; transcript_alias_1 ENST00000499481 ;
chr12	lncipedia.org	exon	58287523	58290265	.	-	.	gene_id lnc-CTDSP2-1 ; transcript_id lnc-CTDSP2-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245651 ; transcript_alias_1 ENST00000499481 ;
chr11	lncipedia.org	exon	126210853	126212217	.	-	.	gene_id lnc-RP11-712L6.5.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-712L6.5.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247445 ; gene_alias_2 AP001318.3 ; transcript_alias_1 ENST00000501321 ;
chr11	lncipedia.org	exon	126225337	126225431	.	-	.	gene_id lnc-RP11-712L6.5.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-712L6.5.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247445 ; gene_alias_2 AP001318.3 ; transcript_alias_1 ENST00000501321 ;
chr6	lncipedia.org	exon	33599094	33600790	.	-	.	gene_id lnc-BAK1-2 ; transcript_id lnc-BAK1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246981 ; gene_alias_2 AL139044.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500794 ;
chr6	lncipedia.org	exon	33601141	33601413	.	-	.	gene_id lnc-BAK1-2 ; transcript_id lnc-BAK1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246981 ; gene_alias_2 AL139044.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500794 ;
chr14	lncipedia.org	exon	45431442	45431518	.	-	.	gene_id lnc-FKBP3-3 ; transcript_id lnc-FKBP3-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249511 ; transcript_alias_1 ENST00000513198 ;
chr14	lncipedia.org	exon	45431673	45433580	.	-	.	gene_id lnc-FKBP3-3 ; transcript_id lnc-FKBP3-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249511 ; transcript_alias_1 ENST00000513198 ;
chr9	lncipedia.org	exon	79808708	79810198	.	-	.	gene_id lnc-GNA14-1 ; transcript_id lnc-GNA14-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248731 ; transcript_alias_1 ENST00000505936 ;
chr9	lncipedia.org	exon	79810393	79810652	.	-	.	gene_id lnc-GNA14-1 ; transcript_id lnc-GNA14-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248731 ; transcript_alias_1 ENST00000505936 ;
chr22	lncipedia.org	exon	24526825	24527896	.	-	.	gene_id lnc-GGT5-1 ; transcript_id lnc-GGT5-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225686 ; transcript_alias_1 ENST00000452954 ;
chr22	lncipedia.org	exon	24528770	24530592	.	-	.	gene_id lnc-GGT5-1 ; transcript_id lnc-GGT5-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225686 ; transcript_alias_1 ENST00000452954 ;
chr22	lncipedia.org	exon	24535128	24535705	.	-	.	gene_id lnc-GGT5-1 ; transcript_id lnc-GGT5-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225686 ; transcript_alias_1 ENST00000452954 ;
chr10	lncipedia.org	exon	13724521	13724785	.	+	.	gene_id lnc-PRPF18-2 ; transcript_id lnc-PRPF18-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248372 ; transcript_alias_1 ENST00000514038 ;
chr10	lncipedia.org	exon	13725162	13726874	.	+	.	gene_id lnc-PRPF18-2 ; transcript_id lnc-PRPF18-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248372 ; transcript_alias_1 ENST00000514038 ;
chr16	lncipedia.org	exon	31711911	31712059	.	+	.	gene_id lnc-ZNF720-1 ; transcript_id lnc-ZNF720-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000131797 ; gene_alias_2 KIAA0664L3 ; transcript_alias_1 ENST00000254109 ;
chr16	lncipedia.org	exon	31712984	31713179	.	+	.	gene_id lnc-ZNF720-1 ; transcript_id lnc-ZNF720-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000131797 ; gene_alias_2 KIAA0664L3 ; transcript_alias_1 ENST00000254109 ;
chr16	lncipedia.org	exon	31713856	31714002	.	+	.	gene_id lnc-ZNF720-1 ; transcript_id lnc-ZNF720-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000131797 ; gene_alias_2 KIAA0664L3 ; transcript_alias_1 ENST00000254109 ;
chr16	lncipedia.org	exon	31714477	31714688	.	+	.	gene_id lnc-ZNF720-1 ; transcript_id lnc-ZNF720-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000131797 ; gene_alias_2 KIAA0664L3 ; transcript_alias_1 ENST00000254109 ;
chr16	lncipedia.org	exon	31715541	31715711	.	+	.	gene_id lnc-ZNF720-1 ; transcript_id lnc-ZNF720-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000131797 ; gene_alias_2 KIAA0664L3 ; transcript_alias_1 ENST00000254109 ;
chr16	lncipedia.org	exon	31716670	31716793	.	+	.	gene_id lnc-ZNF720-1 ; transcript_id lnc-ZNF720-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000131797 ; gene_alias_2 KIAA0664L3 ; transcript_alias_1 ENST00000254109 ;
chr16	lncipedia.org	exon	31716993	31717113	.	+	.	gene_id lnc-ZNF720-1 ; transcript_id lnc-ZNF720-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000131797 ; gene_alias_2 KIAA0664L3 ; transcript_alias_1 ENST00000254109 ;
chr16	lncipedia.org	exon	31717211	31717355	.	+	.	gene_id lnc-ZNF720-1 ; transcript_id lnc-ZNF720-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000131797 ; gene_alias_2 KIAA0664L3 ; transcript_alias_1 ENST00000254109 ;
chr16	lncipedia.org	exon	31718212	31718758	.	+	.	gene_id lnc-ZNF720-1 ; transcript_id lnc-ZNF720-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000131797 ; gene_alias_2 KIAA0664L3 ; transcript_alias_1 ENST00000254109 ;
chr6	lncipedia.org	exon	27729282	27730265	.	+	.	gene_id lnc-HIST1H2AI-1 ; transcript_id lnc-HIST1H2AI-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000248841 ; gene_alias_2 XLOC_005221 ; gene_alias_3 linc-HIST1H2AI-1 ; gene_alias_4 AL009179.2 ; transcript_alias_1 ENST00000508489 ; transcript_alias_2 TCONS_00011277 ;
chr6	lncipedia.org	exon	27730517	27731046	.	+	.	gene_id lnc-HIST1H2AI-1 ; transcript_id lnc-HIST1H2AI-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000248841 ; gene_alias_2 XLOC_005221 ; gene_alias_3 linc-HIST1H2AI-1 ; gene_alias_4 AL009179.2 ; transcript_alias_1 ENST00000508489 ; transcript_alias_2 TCONS_00011277 ;
chr12	lncipedia.org	exon	129594174	129596214	.	+	.	gene_id lnc-GLT1D1-1 ; transcript_id lnc-GLT1D1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249196 ; transcript_alias_1 ENST00000512133 ;
chr12	lncipedia.org	exon	129594230	129596214	.	+	.	gene_id lnc-GLT1D1-1 ; transcript_id lnc-GLT1D1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249196 ; transcript_alias_1 ENST00000512133 ;
chr12	lncipedia.org	exon	129597610	129597839	.	+	.	gene_id lnc-GLT1D1-1 ; transcript_id lnc-GLT1D1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249196 ; transcript_alias_1 ENST00000512133 ;
chr12	lncipedia.org	exon	12628831	12630608	.	+	.	gene_id lnc-LOH12CR1-1 ; transcript_id lnc-LOH12CR1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249457 ; transcript_alias_1 ENST00000513126 ;
chr12	lncipedia.org	exon	12630696	12630834	.	+	.	gene_id lnc-LOH12CR1-1 ; transcript_id lnc-LOH12CR1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249457 ; transcript_alias_1 ENST00000513126 ;
chr8	lncipedia.org	exon	143739819	143740810	.	+	.	gene_id lnc-PSCA-1 ; transcript_id lnc-PSCA-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247396 ; transcript_alias_1 ENST00000501891 ;
chr8	lncipedia.org	exon	143743944	143747183	.	+	.	gene_id lnc-PSCA-1 ; transcript_id lnc-PSCA-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247396 ; transcript_alias_1 ENST00000501891 ;
chr16	lncipedia.org	exon	29756600	29756706	.	+	.	gene_id lnc-ZG16-2 ; transcript_id lnc-ZG16-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246710 ; gene_alias_2 AC009133.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501801 ;
chr16	lncipedia.org	exon	29759297	29761151	.	+	.	gene_id lnc-ZG16-2 ; transcript_id lnc-ZG16-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246710 ; gene_alias_2 AC009133.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501801 ;
chr16	lncipedia.org	exon	29761654	29761818	.	+	.	gene_id lnc-ZG16-2 ; transcript_id lnc-ZG16-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246710 ; gene_alias_2 AC009133.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501801 ;
chr4	lncipedia.org	exon	37612257	37613693	.	+	.	gene_id lnc-KIAA1239-1 ; transcript_id lnc-KIAA1239-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245325 ; transcript_alias_1 ENST00000499638 ;
chr4	lncipedia.org	exon	37614018	37614165	.	+	.	gene_id lnc-KIAA1239-1 ; transcript_id lnc-KIAA1239-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245325 ; transcript_alias_1 ENST00000499638 ;
chr4	lncipedia.org	exon	37614325	37614793	.	+	.	gene_id lnc-KIAA1239-1 ; transcript_id lnc-KIAA1239-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245325 ; transcript_alias_1 ENST00000499638 ;
chr14	lncipedia.org	exon	24912178	24912347	.	+	.	gene_id lnc-RP11-80A15.1.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-80A15.1.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251021 ; transcript_alias_1 ENST00000502977 ;
chr14	lncipedia.org	exon	24913490	24914778	.	+	.	gene_id lnc-RP11-80A15.1.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-80A15.1.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251021 ; transcript_alias_1 ENST00000502977 ;
chr14	lncipedia.org	exon	24970766	24971403	.	+	.	gene_id lnc-RP11-80A15.1.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-80A15.1.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251021 ; transcript_alias_1 ENST00000502977 ;
chr2	lncipedia.org	exon	89065324	89065713	.	+	.	gene_id lnc-RPIA-1 ; transcript_id lnc-RPIA-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230006 ; gene_alias_2 ANKRD36BP2 ; transcript_alias_1 ENST00000421951 ;
chr2	lncipedia.org	exon	89072490	89072561	.	+	.	gene_id lnc-RPIA-1 ; transcript_id lnc-RPIA-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230006 ; gene_alias_2 ANKRD36BP2 ; transcript_alias_1 ENST00000421951 ;
chr2	lncipedia.org	exon	89076018	89076090	.	+	.	gene_id lnc-RPIA-1 ; transcript_id lnc-RPIA-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230006 ; gene_alias_2 ANKRD36BP2 ; transcript_alias_1 ENST00000421951 ;
chr2	lncipedia.org	exon	89077719	89079082	.	+	.	gene_id lnc-RPIA-1 ; transcript_id lnc-RPIA-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230006 ; gene_alias_2 ANKRD36BP2 ; transcript_alias_1 ENST00000421951 ;
chr5	lncipedia.org	exon	140474238	140475654	.	-	.	gene_id lnc-SLC25A2-4 ; transcript_id lnc-SLC25A2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248756 ; transcript_alias_1 ENST00000510498 ;
chr5	lncipedia.org	exon	140476464	140476962	.	-	.	gene_id lnc-SLC25A2-4 ; transcript_id lnc-SLC25A2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248756 ; transcript_alias_1 ENST00000510498 ;
chr6	lncipedia.org	exon	28089595	28090989	.	-	.	gene_id lnc-ZKSCAN4-1 ; transcript_id lnc-ZKSCAN4-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000224024 ; transcript_alias_1 ENST00000510652 ;
chr6	lncipedia.org	exon	28104523	28104644	.	-	.	gene_id lnc-ZKSCAN4-1 ; transcript_id lnc-ZKSCAN4-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000224024 ; transcript_alias_1 ENST00000510652 ;
chr19	lncipedia.org	exon	46969762	46971798	.	+	.	gene_id lnc-AC011484.1-1 ; transcript_id lnc-AC011484.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248985 ; transcript_alias_1 ENST00000503237 ;
chr19	lncipedia.org	exon	46973212	46973693	.	+	.	gene_id lnc-AC011484.1-1 ; transcript_id lnc-AC011484.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248985 ; transcript_alias_1 ENST00000503237 ;
chr2	lncipedia.org	exon	232263067	232263503	.	-	.	gene_id lnc-NCL-2 ; transcript_id lnc-NCL-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245519 ; transcript_alias_1 ENST00000500270 ;
chr2	lncipedia.org	exon	232264448	232265873	.	-	.	gene_id lnc-NCL-2 ; transcript_id lnc-NCL-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245519 ; transcript_alias_1 ENST00000500270 ;
chr8	lncipedia.org	exon	19134	19642	.	-	.	gene_id lnc-OR4F21-1 ; transcript_id lnc-OR4F21-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_006964 ; gene_alias_2 linc-ZNF16 ; transcript_alias_1 TCONS_00014550 ;
chr8	lncipedia.org	exon	19997	20808	.	-	.	gene_id lnc-OR4F21-1 ; transcript_id lnc-OR4F21-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_006964 ; gene_alias_2 linc-ZNF16 ; transcript_alias_1 TCONS_00014550 ;
chr1	lncipedia.org	exon	2481359	2481713	.	-	.	gene_id lnc-HES5-1 ; transcript_id lnc-HES5-1:5 ; gene_alias_1 XLOC_000678 ; gene_alias_2 linc-HES5-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00000015 ;
chr1	lncipedia.org	exon	2482431	2484284	.	-	.	gene_id lnc-HES5-1 ; transcript_id lnc-HES5-1:5 ; gene_alias_1 XLOC_000678 ; gene_alias_2 linc-HES5-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00000015 ;
chr12	lncipedia.org	exon	54556923	54556992	.	+	.	gene_id lnc-HOXC4-5 ; transcript_id lnc-HOXC4-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_009766 ; gene_alias_2 linc-HNRNPA1-2 ; gene_alias_3 ENSG00000248576.1 ; gene_alias_4 RP11-834C11.8 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000160022.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00020234 ; transcript_alias_2 ENST00000504210.1 ; transcript_alias_3 RP11-834C11.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000358930.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	54558783	54558805	.	+	.	gene_id lnc-HOXC4-5 ; transcript_id lnc-HOXC4-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_009766 ; gene_alias_2 linc-HNRNPA1-2 ; gene_alias_3 ENSG00000248576.1 ; gene_alias_4 RP11-834C11.8 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000160022.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00020234 ; transcript_alias_2 ENST00000504210.1 ; transcript_alias_3 RP11-834C11.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000358930.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	54562070	54562379	.	+	.	gene_id lnc-HOXC4-5 ; transcript_id lnc-HOXC4-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_009766 ; gene_alias_2 linc-HNRNPA1-2 ; gene_alias_3 ENSG00000248576.1 ; gene_alias_4 RP11-834C11.8 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000160022.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00020234 ; transcript_alias_2 ENST00000504210.1 ; transcript_alias_3 RP11-834C11.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000358930.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	42523360	42523437	.	+	.	gene_id lnc-TOX2-1 ; transcript_id lnc-TOX2-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_013528 ; gene_alias_2 linc-TOX2 ; gene_alias_3 ENSG00000233277 ; gene_alias_4 RP5-1030M6.3 ; gene_alias_5 ENSG00000233277.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000032515.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00027934 ; transcript_alias_2 ENST00000428529 ; transcript_alias_3 ENST00000428529.1 ; transcript_alias_4 RP5-1030M6.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000079327.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	42523663	42524108	.	+	.	gene_id lnc-TOX2-1 ; transcript_id lnc-TOX2-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_013528 ; gene_alias_2 linc-TOX2 ; gene_alias_3 ENSG00000233277 ; gene_alias_4 RP5-1030M6.3 ; gene_alias_5 ENSG00000233277.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000032515.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00027934 ; transcript_alias_2 ENST00000428529 ; transcript_alias_3 ENST00000428529.1 ; transcript_alias_4 RP5-1030M6.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000079327.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	7811735	7812038	.	-	.	gene_id lnc-CMPK2-10 ; transcript_id lnc-CMPK2-10:1 ; gene_alias_1 XLOC_001970 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-6 ; gene_alias_3 ENSG00000230515 ; gene_alias_4 AC092580.3 ; gene_alias_5 ENSG00000230515.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151592.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003190 ; transcript_alias_2 ENST00000414654 ; transcript_alias_3 ENST00000414654.1 ; transcript_alias_4 AC092580.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000323246.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	7812213	7812377	.	-	.	gene_id lnc-CMPK2-10 ; transcript_id lnc-CMPK2-10:1 ; gene_alias_1 XLOC_001970 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-6 ; gene_alias_3 ENSG00000230515 ; gene_alias_4 AC092580.3 ; gene_alias_5 ENSG00000230515.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151592.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003190 ; transcript_alias_2 ENST00000414654 ; transcript_alias_3 ENST00000414654.1 ; transcript_alias_4 AC092580.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000323246.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	1594879	1595093	.	+	.	gene_id lnc-KRTAP5-5-1 ; transcript_id lnc-KRTAP5-5-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000233930 ; gene_alias_2 RP13-25N22.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233930.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165546.3 ; transcript_alias_1 ENST00000534077 ; transcript_alias_2 ENST00000534077.1 ; transcript_alias_3 RP13-25N22.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000384774.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	1618478	1618671	.	+	.	gene_id lnc-KRTAP5-5-1 ; transcript_id lnc-KRTAP5-5-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000233930 ; gene_alias_2 RP13-25N22.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233930.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165546.3 ; transcript_alias_1 ENST00000534077 ; transcript_alias_2 ENST00000534077.1 ; transcript_alias_3 RP13-25N22.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000384774.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	64430158	64430244	.	-	.	gene_id lnc-PRICKLE2-1 ; transcript_id lnc-PRICKLE2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000243993 ; gene_alias_2 RP11-14D22.2 ; gene_alias_3 ENSG00000243993.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158710.1 ; transcript_alias_1 ENST00000485770 ; transcript_alias_2 ENST00000485770.1 ; transcript_alias_3 RP11-14D22.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351830.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	64430899	64431152	.	-	.	gene_id lnc-PRICKLE2-1 ; transcript_id lnc-PRICKLE2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000243993 ; gene_alias_2 RP11-14D22.2 ; gene_alias_3 ENSG00000243993.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158710.1 ; transcript_alias_1 ENST00000485770 ; transcript_alias_2 ENST00000485770.1 ; transcript_alias_3 RP11-14D22.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351830.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	119312343	119312411	.	-	.	gene_id lnc-FAM70A-1 ; transcript_id lnc-FAM70A-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233382 ; gene_alias_2 NKAPP1 ; gene_alias_3 ENSG00000233382.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022295.3 ; transcript_alias_1 ENST00000554109 ; transcript_alias_2 ENST00000554109.1 ; transcript_alias_3 NKAPP1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000411975.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	119378619	119379122	.	-	.	gene_id lnc-FAM70A-1 ; transcript_id lnc-FAM70A-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233382 ; gene_alias_2 NKAPP1 ; gene_alias_3 ENSG00000233382.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022295.3 ; transcript_alias_1 ENST00000554109 ; transcript_alias_2 ENST00000554109.1 ; transcript_alias_3 NKAPP1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000411975.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	130165972	130166142	.	-	.	gene_id lnc-RIMBP2-6 ; transcript_id lnc-RIMBP2-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256137 ; gene_alias_2 RP11-174M13.2 ; gene_alias_3 ENSG00000256137.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168405.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544036 ; transcript_alias_2 ENST00000544036.1 ; transcript_alias_3 RP11-174M13.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399603.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	130167437	130167613	.	-	.	gene_id lnc-RIMBP2-6 ; transcript_id lnc-RIMBP2-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256137 ; gene_alias_2 RP11-174M13.2 ; gene_alias_3 ENSG00000256137.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168405.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544036 ; transcript_alias_2 ENST00000544036.1 ; transcript_alias_3 RP11-174M13.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399603.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	130182729	130182772	.	-	.	gene_id lnc-RIMBP2-6 ; transcript_id lnc-RIMBP2-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256137 ; gene_alias_2 RP11-174M13.2 ; gene_alias_3 ENSG00000256137.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168405.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544036 ; transcript_alias_2 ENST00000544036.1 ; transcript_alias_3 RP11-174M13.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399603.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	111807086	111807124	.	+	.	gene_id lnc-SH2B3-1 ; transcript_id lnc-SH2B3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000257595 ; gene_alias_2 RP3-473L9.4 ; gene_alias_3 ENSG00000257595.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169548.1 ; transcript_alias_1 ENST00000552663 ; transcript_alias_2 ENST00000552663.1 ; transcript_alias_3 RP3-473L9.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404776.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	111809773	111809874	.	+	.	gene_id lnc-SH2B3-1 ; transcript_id lnc-SH2B3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000257595 ; gene_alias_2 RP3-473L9.4 ; gene_alias_3 ENSG00000257595.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169548.1 ; transcript_alias_1 ENST00000552663 ; transcript_alias_2 ENST00000552663.1 ; transcript_alias_3 RP3-473L9.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404776.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	111840942	111841114	.	+	.	gene_id lnc-SH2B3-1 ; transcript_id lnc-SH2B3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000257595 ; gene_alias_2 RP3-473L9.4 ; gene_alias_3 ENSG00000257595.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169548.1 ; transcript_alias_1 ENST00000552663 ; transcript_alias_2 ENST00000552663.1 ; transcript_alias_3 RP3-473L9.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404776.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	63348578	63348817	.	-	.	gene_id lnc-ZNF680-4 ; transcript_id lnc-ZNF680-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236299 ; gene_alias_2 RP11-340I6.7 ; gene_alias_3 ENSG00000236299.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000156552.2 ; transcript_alias_1 ENST00000433918 ; transcript_alias_2 ENST00000433918.1 ; transcript_alias_3 RP11-340I6.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000344582.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	63353543	63353664	.	-	.	gene_id lnc-ZNF680-4 ; transcript_id lnc-ZNF680-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236299 ; gene_alias_2 RP11-340I6.7 ; gene_alias_3 ENSG00000236299.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000156552.2 ; transcript_alias_1 ENST00000433918 ; transcript_alias_2 ENST00000433918.1 ; transcript_alias_3 RP11-340I6.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000344582.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	63359140	63359219	.	-	.	gene_id lnc-ZNF680-4 ; transcript_id lnc-ZNF680-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236299 ; gene_alias_2 RP11-340I6.7 ; gene_alias_3 ENSG00000236299.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000156552.2 ; transcript_alias_1 ENST00000433918 ; transcript_alias_2 ENST00000433918.1 ; transcript_alias_3 RP11-340I6.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000344582.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	111014434	111014548	.	-	.	gene_id lnc-AL162389.1-2 ; transcript_id lnc-AL162389.1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_007826 ; gene_alias_2 linc-KLF4-3 ; gene_alias_3 ENSG00000230030 ; gene_alias_4 RP11-505C13.1 ; gene_alias_5 ENSG00000230030.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000020457.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015868 ; transcript_alias_2 ENST00000453455 ; transcript_alias_3 ENST00000453455.1 ; transcript_alias_4 RP11-505C13.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000053566.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	111016992	111017100	.	-	.	gene_id lnc-AL162389.1-2 ; transcript_id lnc-AL162389.1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_007826 ; gene_alias_2 linc-KLF4-3 ; gene_alias_3 ENSG00000230030 ; gene_alias_4 RP11-505C13.1 ; gene_alias_5 ENSG00000230030.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000020457.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015868 ; transcript_alias_2 ENST00000453455 ; transcript_alias_3 ENST00000453455.1 ; transcript_alias_4 RP11-505C13.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000053566.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	72587612	72587770	.	+	.	gene_id lnc-RP11-383H13.1.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-383H13.1.1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000254277 ; gene_alias_2 RP11-1144P22.1 ; gene_alias_3 ENSG00000254277.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164487.1 ; transcript_alias_1 ENST00000521131 ; transcript_alias_2 ENST00000521131.1 ; transcript_alias_3 RP11-1144P22.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000378972.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	72608176	72608268	.	+	.	gene_id lnc-RP11-383H13.1.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-383H13.1.1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000254277 ; gene_alias_2 RP11-1144P22.1 ; gene_alias_3 ENSG00000254277.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164487.1 ; transcript_alias_1 ENST00000521131 ; transcript_alias_2 ENST00000521131.1 ; transcript_alias_3 RP11-1144P22.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000378972.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	72614450	72614670	.	+	.	gene_id lnc-RP11-383H13.1.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-383H13.1.1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000254277 ; gene_alias_2 RP11-1144P22.1 ; gene_alias_3 ENSG00000254277.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164487.1 ; transcript_alias_1 ENST00000521131 ; transcript_alias_2 ENST00000521131.1 ; transcript_alias_3 RP11-1144P22.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000378972.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	136131053	136131743	.	-	.	gene_id lnc-OBP2B-2 ; transcript_id lnc-OBP2B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000175164 ; gene_alias_2 ABO ; gene_alias_3 ENSG00000175164.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020872.3 ; transcript_alias_1 ENST00000538324 ; transcript_alias_2 ENST00000538324.1 ; transcript_alias_3 ABO-201 ;
chr9	lncipedia.org	exon	136132796	136132929	.	-	.	gene_id lnc-OBP2B-2 ; transcript_id lnc-OBP2B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000175164 ; gene_alias_2 ABO ; gene_alias_3 ENSG00000175164.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020872.3 ; transcript_alias_1 ENST00000538324 ; transcript_alias_2 ENST00000538324.1 ; transcript_alias_3 ABO-201 ;
chr9	lncipedia.org	exon	136133487	136133522	.	-	.	gene_id lnc-OBP2B-2 ; transcript_id lnc-OBP2B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000175164 ; gene_alias_2 ABO ; gene_alias_3 ENSG00000175164.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020872.3 ; transcript_alias_1 ENST00000538324 ; transcript_alias_2 ENST00000538324.1 ; transcript_alias_3 ABO-201 ;
chr9	lncipedia.org	exon	136135223	136135270	.	-	.	gene_id lnc-OBP2B-2 ; transcript_id lnc-OBP2B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000175164 ; gene_alias_2 ABO ; gene_alias_3 ENSG00000175164.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020872.3 ; transcript_alias_1 ENST00000538324 ; transcript_alias_2 ENST00000538324.1 ; transcript_alias_3 ABO-201 ;
chr9	lncipedia.org	exon	136150578	136150605	.	-	.	gene_id lnc-OBP2B-2 ; transcript_id lnc-OBP2B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000175164 ; gene_alias_2 ABO ; gene_alias_3 ENSG00000175164.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020872.3 ; transcript_alias_1 ENST00000538324 ; transcript_alias_2 ENST00000538324.1 ; transcript_alias_3 ABO-201 ;
chr14	lncipedia.org	exon	22931900	22932227	.	-	.	gene_id lnc-DAD1-2 ; transcript_id lnc-DAD1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000251002 ; gene_alias_2 AE000661.37 ; gene_alias_3 ENSG00000251002.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168895.2 ; transcript_alias_1 ENST00000556777 ; transcript_alias_2 ENST00000556777.1 ; transcript_alias_3 AE000661.37-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000410932.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	22934236	22934278	.	-	.	gene_id lnc-DAD1-2 ; transcript_id lnc-DAD1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000251002 ; gene_alias_2 AE000661.37 ; gene_alias_3 ENSG00000251002.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168895.2 ; transcript_alias_1 ENST00000556777 ; transcript_alias_2 ENST00000556777.1 ; transcript_alias_3 AE000661.37-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000410932.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	22950230	22950278	.	-	.	gene_id lnc-DAD1-2 ; transcript_id lnc-DAD1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000251002 ; gene_alias_2 AE000661.37 ; gene_alias_3 ENSG00000251002.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168895.2 ; transcript_alias_1 ENST00000556777 ; transcript_alias_2 ENST00000556777.1 ; transcript_alias_3 AE000661.37-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000410932.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	7975419	7975490	.	+	.	gene_id lnc-VCX-1 ; transcript_id lnc-VCX-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230394 ; gene_alias_2 RP11-692P14.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230394.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021104.1 ; transcript_alias_1 ENST00000422160 ; transcript_alias_2 ENST00000422160.1 ; transcript_alias_3 RP11-692P14.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000055689.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	7986097	7986201	.	+	.	gene_id lnc-VCX-1 ; transcript_id lnc-VCX-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230394 ; gene_alias_2 RP11-692P14.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230394.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021104.1 ; transcript_alias_1 ENST00000422160 ; transcript_alias_2 ENST00000422160.1 ; transcript_alias_3 RP11-692P14.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000055689.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	141167095	141167441	.	-	.	gene_id lnc-NMBR-2 ; transcript_id lnc-NMBR-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234147 ; gene_alias_2 RP3-460G2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000234147.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015700.1 ; transcript_alias_1 ENST00000455011 ; transcript_alias_2 ENST00000455011.1 ; transcript_alias_3 RP3-460G2.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000042475.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	141173956	141174061	.	-	.	gene_id lnc-NMBR-2 ; transcript_id lnc-NMBR-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234147 ; gene_alias_2 RP3-460G2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000234147.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015700.1 ; transcript_alias_1 ENST00000455011 ; transcript_alias_2 ENST00000455011.1 ; transcript_alias_3 RP3-460G2.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000042475.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	1465320	1465541	.	-	.	gene_id lnc-SRY-5 ; transcript_id lnc-SRY-5:2 ; gene_alias_1 XLOC_008306 ; gene_alias_2 linc-SLC25A6-1 ; gene_alias_3 ENSGR0000236871.1 ; gene_alias_4 LINC00106 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000021061.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017617 ; transcript_alias_2 ENSTR0000434938.1 ; transcript_alias_3 LINC00106-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000337679.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	1467718	1467852	.	-	.	gene_id lnc-SRY-5 ; transcript_id lnc-SRY-5:2 ; gene_alias_1 XLOC_008306 ; gene_alias_2 linc-SLC25A6-1 ; gene_alias_3 ENSGR0000236871.1 ; gene_alias_4 LINC00106 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000021061.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017617 ; transcript_alias_2 ENSTR0000434938.1 ; transcript_alias_3 LINC00106-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000337679.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	45001907	45002229	.	-	.	gene_id lnc-FAM75A6-4 ; transcript_id lnc-FAM75A6-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235659 ; gene_alias_2 RP11-374M1.5 ; gene_alias_3 ENSG00000235659.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013244.1 ; transcript_alias_1 ENST00000377547 ; transcript_alias_2 ENST00000377547.3 ; transcript_alias_3 RP11-374M1.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037012.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	45003002	45003117	.	-	.	gene_id lnc-FAM75A6-4 ; transcript_id lnc-FAM75A6-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235659 ; gene_alias_2 RP11-374M1.5 ; gene_alias_3 ENSG00000235659.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013244.1 ; transcript_alias_1 ENST00000377547 ; transcript_alias_2 ENST00000377547.3 ; transcript_alias_3 RP11-374M1.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037012.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	3904538	3904761	.	+	.	gene_id lnc-TGIF2LY-1 ; transcript_id lnc-TGIF2LY-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008278 ; gene_alias_2 linc-PCDH11Y ; gene_alias_3 ENSG00000229308 ; gene_alias_4 AC010084.1 ; gene_alias_5 ENSG00000229308.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000036214.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017608 ; transcript_alias_2 ENST00000426699 ; transcript_alias_3 ENST00000426699.1 ; transcript_alias_4 AC010084.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000088134.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	3968027	3968361	.	+	.	gene_id lnc-TGIF2LY-1 ; transcript_id lnc-TGIF2LY-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008278 ; gene_alias_2 linc-PCDH11Y ; gene_alias_3 ENSG00000229308 ; gene_alias_4 AC010084.1 ; gene_alias_5 ENSG00000229308.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000036214.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017608 ; transcript_alias_2 ENST00000426699 ; transcript_alias_3 ENST00000426699.1 ; transcript_alias_4 AC010084.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000088134.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	137029676	137029876	.	-	.	gene_id lnc-PTN-1 ; transcript_id lnc-PTN-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_006620 ; gene_alias_2 linc-PTN ; gene_alias_3 ENSG00000228031 ; gene_alias_4 AC078842.3 ; gene_alias_5 ENSG00000228031.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000155708.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013265 ; transcript_alias_2 ENST00000438969 ; transcript_alias_3 ENST00000438969.1 ; transcript_alias_4 AC078842.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000341338.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	137035115	137035216	.	-	.	gene_id lnc-PTN-1 ; transcript_id lnc-PTN-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_006620 ; gene_alias_2 linc-PTN ; gene_alias_3 ENSG00000228031 ; gene_alias_4 AC078842.3 ; gene_alias_5 ENSG00000228031.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000155708.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013265 ; transcript_alias_2 ENST00000438969 ; transcript_alias_3 ENST00000438969.1 ; transcript_alias_4 AC078842.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000341338.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	137037223	137037354	.	-	.	gene_id lnc-PTN-1 ; transcript_id lnc-PTN-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_006620 ; gene_alias_2 linc-PTN ; gene_alias_3 ENSG00000228031 ; gene_alias_4 AC078842.3 ; gene_alias_5 ENSG00000228031.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000155708.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013265 ; transcript_alias_2 ENST00000438969 ; transcript_alias_3 ENST00000438969.1 ; transcript_alias_4 AC078842.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000341338.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	137039108	137039229	.	-	.	gene_id lnc-PTN-1 ; transcript_id lnc-PTN-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_006620 ; gene_alias_2 linc-PTN ; gene_alias_3 ENSG00000228031 ; gene_alias_4 AC078842.3 ; gene_alias_5 ENSG00000228031.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000155708.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013265 ; transcript_alias_2 ENST00000438969 ; transcript_alias_3 ENST00000438969.1 ; transcript_alias_4 AC078842.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000341338.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	18704542	18704603	.	-	.	gene_id lnc-CDH18-5 ; transcript_id lnc-CDH18-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_004747 ; gene_alias_2 linc-MYO10-3 ; gene_alias_3 ENSG00000248693 ; gene_alias_4 CTD-2023M8.1 ; gene_alias_5 ENSG00000248693.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000161873.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009612 ; transcript_alias_2 ENST00000512978 ; transcript_alias_3 ENST00000512978.1 ; transcript_alias_4 CTD-2023M8.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000366267.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	18746107	18746282	.	-	.	gene_id lnc-CDH18-5 ; transcript_id lnc-CDH18-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_004747 ; gene_alias_2 linc-MYO10-3 ; gene_alias_3 ENSG00000248693 ; gene_alias_4 CTD-2023M8.1 ; gene_alias_5 ENSG00000248693.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000161873.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009612 ; transcript_alias_2 ENST00000512978 ; transcript_alias_3 ENST00000512978.1 ; transcript_alias_4 CTD-2023M8.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000366267.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	142808	143011	.	-	.	gene_id lnc-FAM138A-3 ; transcript_id lnc-FAM138A-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_000659 ; gene_alias_2 linc-ZNF692-5 ; gene_alias_3 ENSG00000241860.1 ; gene_alias_4 RP11-34P13.12 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000002479.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000439 ; transcript_alias_2 ENST00000490997.1 ; transcript_alias_3 RP11-34P13.12-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000007036.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	146386	146509	.	-	.	gene_id lnc-FAM138A-3 ; transcript_id lnc-FAM138A-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_000659 ; gene_alias_2 linc-ZNF692-5 ; gene_alias_3 ENSG00000241860.1 ; gene_alias_4 RP11-34P13.12 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000002479.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000439 ; transcript_alias_2 ENST00000490997.1 ; transcript_alias_3 RP11-34P13.12-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000007036.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	146642	146831	.	-	.	gene_id lnc-FAM138A-3 ; transcript_id lnc-FAM138A-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_000659 ; gene_alias_2 linc-ZNF692-5 ; gene_alias_3 ENSG00000241860.1 ; gene_alias_4 RP11-34P13.12 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000002479.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000439 ; transcript_alias_2 ENST00000490997.1 ; transcript_alias_3 RP11-34P13.12-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000007036.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	111807086	111807124	.	+	.	gene_id lnc-SH2B3-1 ; transcript_id lnc-SH2B3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257595 ; gene_alias_2 RP3-473L9.4 ; gene_alias_3 ENSG00000257595.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169548.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548006 ; transcript_alias_2 ENST00000548006.1 ; transcript_alias_3 RP3-473L9.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404775.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	111809773	111809827	.	+	.	gene_id lnc-SH2B3-1 ; transcript_id lnc-SH2B3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257595 ; gene_alias_2 RP3-473L9.4 ; gene_alias_3 ENSG00000257595.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169548.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548006 ; transcript_alias_2 ENST00000548006.1 ; transcript_alias_3 RP3-473L9.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404775.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	111834635	111834903	.	+	.	gene_id lnc-SH2B3-1 ; transcript_id lnc-SH2B3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257595 ; gene_alias_2 RP3-473L9.4 ; gene_alias_3 ENSG00000257595.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169548.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548006 ; transcript_alias_2 ENST00000548006.1 ; transcript_alias_3 RP3-473L9.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404775.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143361991	143362058	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-3:9 ; gene_alias_1 ENSG00000242569 ; gene_alias_2 BX004987.3 ; gene_alias_3 ENSG00000242569.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000442663 ; transcript_alias_2 ENST00000442663.1 ; transcript_alias_3 BX004987.3-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037550.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143364849	143364877	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-3:9 ; gene_alias_1 ENSG00000242569 ; gene_alias_2 BX004987.3 ; gene_alias_3 ENSG00000242569.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000442663 ; transcript_alias_2 ENST00000442663.1 ; transcript_alias_3 BX004987.3-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037550.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143364969	143365041	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-3:9 ; gene_alias_1 ENSG00000242569 ; gene_alias_2 BX004987.3 ; gene_alias_3 ENSG00000242569.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000442663 ; transcript_alias_2 ENST00000442663.1 ; transcript_alias_3 BX004987.3-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037550.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143368082	143368190	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-3:9 ; gene_alias_1 ENSG00000242569 ; gene_alias_2 BX004987.3 ; gene_alias_3 ENSG00000242569.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000442663 ; transcript_alias_2 ENST00000442663.1 ; transcript_alias_3 BX004987.3-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037550.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26092262	26092439	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; gene_alias_2 RP11-877E17.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246695.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169126.2 ; transcript_alias_1 ENST00000545729 ; transcript_alias_2 ENST00000545729.1 ; transcript_alias_3 RP11-877E17.2-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402340.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26109160	26109280	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; gene_alias_2 RP11-877E17.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246695.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169126.2 ; transcript_alias_1 ENST00000545729 ; transcript_alias_2 ENST00000545729.1 ; transcript_alias_3 RP11-877E17.2-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402340.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26109572	26109697	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; gene_alias_2 RP11-877E17.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246695.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169126.2 ; transcript_alias_1 ENST00000545729 ; transcript_alias_2 ENST00000545729.1 ; transcript_alias_3 RP11-877E17.2-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402340.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26112259	26112375	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; gene_alias_2 RP11-877E17.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246695.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169126.2 ; transcript_alias_1 ENST00000545729 ; transcript_alias_2 ENST00000545729.1 ; transcript_alias_3 RP11-877E17.2-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402340.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	6182796	6182835	.	-	.	gene_id lnc-AMELY-4 ; transcript_id lnc-AMELY-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_008311 ; gene_alias_2 linc-SRY-5 ; gene_alias_3 ENSG00000234659 ; gene_alias_4 AC006335.12 ; gene_alias_5 ENSG00000234659.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000040952.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017621 ; transcript_alias_2 ENST00000417585 ; transcript_alias_3 ENST00000417585.1 ; transcript_alias_4 AC006335.12-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000098308.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	6183334	6183506	.	-	.	gene_id lnc-AMELY-4 ; transcript_id lnc-AMELY-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_008311 ; gene_alias_2 linc-SRY-5 ; gene_alias_3 ENSG00000234659 ; gene_alias_4 AC006335.12 ; gene_alias_5 ENSG00000234659.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000040952.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017621 ; transcript_alias_2 ENST00000417585 ; transcript_alias_3 ENST00000417585.1 ; transcript_alias_4 AC006335.12-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000098308.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	6184086	6184282	.	-	.	gene_id lnc-AMELY-4 ; transcript_id lnc-AMELY-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_008311 ; gene_alias_2 linc-SRY-5 ; gene_alias_3 ENSG00000234659 ; gene_alias_4 AC006335.12 ; gene_alias_5 ENSG00000234659.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000040952.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017621 ; transcript_alias_2 ENST00000417585 ; transcript_alias_3 ENST00000417585.1 ; transcript_alias_4 AC006335.12-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000098308.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	147767899	147768020	.	-	.	gene_id lnc-NBPF24-4 ; transcript_id lnc-NBPF24-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244252 ; gene_alias_2 RP11-495P10.7 ; gene_alias_3 ENSG00000244252.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014092.1 ; transcript_alias_1 ENST00000445201 ; transcript_alias_2 ENST00000445201.1 ; transcript_alias_3 RP11-495P10.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000039545.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	147768231	147768289	.	-	.	gene_id lnc-NBPF24-4 ; transcript_id lnc-NBPF24-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244252 ; gene_alias_2 RP11-495P10.7 ; gene_alias_3 ENSG00000244252.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014092.1 ; transcript_alias_1 ENST00000445201 ; transcript_alias_2 ENST00000445201.1 ; transcript_alias_3 RP11-495P10.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000039545.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	147768380	147768606	.	-	.	gene_id lnc-NBPF24-4 ; transcript_id lnc-NBPF24-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244252 ; gene_alias_2 RP11-495P10.7 ; gene_alias_3 ENSG00000244252.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014092.1 ; transcript_alias_1 ENST00000445201 ; transcript_alias_2 ENST00000445201.1 ; transcript_alias_3 RP11-495P10.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000039545.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	147769236	147769378	.	-	.	gene_id lnc-NBPF24-4 ; transcript_id lnc-NBPF24-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244252 ; gene_alias_2 RP11-495P10.7 ; gene_alias_3 ENSG00000244252.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014092.1 ; transcript_alias_1 ENST00000445201 ; transcript_alias_2 ENST00000445201.1 ; transcript_alias_3 RP11-495P10.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000039545.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101538144	101538328	.	+	.	gene_id lnc-DLK1-11 ; transcript_id lnc-DLK1-11:4 ; gene_alias_1 ENSG00000223403 ; gene_alias_2 AL132709.7 ; gene_alias_3 ENSG00000223403.2 ; gene_alias_4 MEG9 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000029067.3 ; transcript_alias_1 ENST00000452349 ; transcript_alias_2 ENST00000452349.1 ; transcript_alias_3 MEG9-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000072601.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101538696	101538895	.	+	.	gene_id lnc-DLK1-11 ; transcript_id lnc-DLK1-11:4 ; gene_alias_1 ENSG00000223403 ; gene_alias_2 AL132709.7 ; gene_alias_3 ENSG00000223403.2 ; gene_alias_4 MEG9 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000029067.3 ; transcript_alias_1 ENST00000452349 ; transcript_alias_2 ENST00000452349.1 ; transcript_alias_3 MEG9-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000072601.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	20378938	20378960	.	+	.	gene_id lnc-AC007663.1-4 ; transcript_id lnc-AC007663.1-4:4 ; gene_alias_1 ENSG00000206176 ; gene_alias_2 AC023490.1 ; gene_alias_3 ENSG00000206176.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152507.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436846 ; transcript_alias_2 ENST00000436846.1 ; transcript_alias_3 AC023490.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000319426.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	20379308	20379364	.	+	.	gene_id lnc-AC007663.1-4 ; transcript_id lnc-AC007663.1-4:4 ; gene_alias_1 ENSG00000206176 ; gene_alias_2 AC023490.1 ; gene_alias_3 ENSG00000206176.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152507.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436846 ; transcript_alias_2 ENST00000436846.1 ; transcript_alias_3 AC023490.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000319426.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	20379473	20379591	.	+	.	gene_id lnc-AC007663.1-4 ; transcript_id lnc-AC007663.1-4:4 ; gene_alias_1 ENSG00000206176 ; gene_alias_2 AC023490.1 ; gene_alias_3 ENSG00000206176.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152507.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436846 ; transcript_alias_2 ENST00000436846.1 ; transcript_alias_3 AC023490.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000319426.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	20379803	20379875	.	+	.	gene_id lnc-AC007663.1-4 ; transcript_id lnc-AC007663.1-4:4 ; gene_alias_1 ENSG00000206176 ; gene_alias_2 AC023490.1 ; gene_alias_3 ENSG00000206176.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152507.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436846 ; transcript_alias_2 ENST00000436846.1 ; transcript_alias_3 AC023490.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000319426.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	20380023	20380071	.	+	.	gene_id lnc-AC007663.1-4 ; transcript_id lnc-AC007663.1-4:4 ; gene_alias_1 ENSG00000206176 ; gene_alias_2 AC023490.1 ; gene_alias_3 ENSG00000206176.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152507.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436846 ; transcript_alias_2 ENST00000436846.1 ; transcript_alias_3 AC023490.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000319426.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	229359208	229359697	.	-	.	gene_id lnc-C1orf96-2 ; transcript_id lnc-C1orf96-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_001244 ; gene_alias_2 linc-HIST3H2A-4 ; gene_alias_3 ENSG00000233920.1 ; gene_alias_4 RP5-1061H20.5 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000037661.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000750 ; transcript_alias_2 ENST00000430677.1 ; transcript_alias_3 RP5-1061H20.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000091837.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	229363008	229363309	.	-	.	gene_id lnc-C1orf96-2 ; transcript_id lnc-C1orf96-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_001244 ; gene_alias_2 linc-HIST3H2A-4 ; gene_alias_3 ENSG00000233920.1 ; gene_alias_4 RP5-1061H20.5 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000037661.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000750 ; transcript_alias_2 ENST00000430677.1 ; transcript_alias_3 RP5-1061H20.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000091837.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101323961	101324134	.	+	.	gene_id lnc-DLK1-4 ; transcript_id lnc-DLK1-4:28 ; gene_alias_1 ENSG00000214548 ; gene_alias_2 MEG3 ; gene_alias_3 ENSG00000214548.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000029052.7 ; transcript_alias_1 ENST00000521256 ; transcript_alias_2 ENST00000521256.1 ; transcript_alias_3 MEG3-024 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381144.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101327028	101327358	.	+	.	gene_id lnc-DLK1-4 ; transcript_id lnc-DLK1-4:28 ; gene_alias_1 ENSG00000214548 ; gene_alias_2 MEG3 ; gene_alias_3 ENSG00000214548.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000029052.7 ; transcript_alias_1 ENST00000521256 ; transcript_alias_2 ENST00000521256.1 ; transcript_alias_3 MEG3-024 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381144.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	111953540	111953661	.	+	.	gene_id lnc-BCL2L11-1 ; transcript_id lnc-BCL2L11-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230499 ; gene_alias_2 AC108463.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230499.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153644.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451230 ; transcript_alias_2 ENST00000451230.1 ; transcript_alias_3 AC108463.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000331955.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	111963782	111964071	.	+	.	gene_id lnc-BCL2L11-1 ; transcript_id lnc-BCL2L11-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230499 ; gene_alias_2 AC108463.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230499.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153644.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451230 ; transcript_alias_2 ENST00000451230.1 ; transcript_alias_3 AC108463.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000331955.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21673559	21673645	.	-	.	gene_id lnc-GGT2-2 ; transcript_id lnc-GGT2-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000206142 ; gene_alias_2 KB-1183D5.13 ; gene_alias_3 ENSG00000206142.4 ; gene_alias_4 LINC00281 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000150795.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451574 ; transcript_alias_2 ENST00000451574.1 ; transcript_alias_3 LINC00281-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320112.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21676484	21676616	.	-	.	gene_id lnc-GGT2-2 ; transcript_id lnc-GGT2-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000206142 ; gene_alias_2 KB-1183D5.13 ; gene_alias_3 ENSG00000206142.4 ; gene_alias_4 LINC00281 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000150795.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451574 ; transcript_alias_2 ENST00000451574.1 ; transcript_alias_3 LINC00281-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320112.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21677085	21677143	.	-	.	gene_id lnc-GGT2-2 ; transcript_id lnc-GGT2-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000206142 ; gene_alias_2 KB-1183D5.13 ; gene_alias_3 ENSG00000206142.4 ; gene_alias_4 LINC00281 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000150795.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451574 ; transcript_alias_2 ENST00000451574.1 ; transcript_alias_3 LINC00281-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320112.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21679120	21679256	.	-	.	gene_id lnc-GGT2-2 ; transcript_id lnc-GGT2-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000206142 ; gene_alias_2 KB-1183D5.13 ; gene_alias_3 ENSG00000206142.4 ; gene_alias_4 LINC00281 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000150795.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451574 ; transcript_alias_2 ENST00000451574.1 ; transcript_alias_3 LINC00281-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320112.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	11539128	11539344	.	+	.	gene_id lnc-GREB1-4 ; transcript_id lnc-GREB1-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000224177 ; gene_alias_2 AC099344.4 ; gene_alias_3 ENSG00000224177.2 ; gene_alias_4 LINC00570 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000151818.2 ; transcript_alias_1 ENST00000437795 ; transcript_alias_2 ENST00000437795.1 ; transcript_alias_3 LINC00570-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000324046.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	11539798	11539900	.	+	.	gene_id lnc-GREB1-4 ; transcript_id lnc-GREB1-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000224177 ; gene_alias_2 AC099344.4 ; gene_alias_3 ENSG00000224177.2 ; gene_alias_4 LINC00570 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000151818.2 ; transcript_alias_1 ENST00000437795 ; transcript_alias_2 ENST00000437795.1 ; transcript_alias_3 LINC00570-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000324046.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	11540498	11540583	.	+	.	gene_id lnc-GREB1-4 ; transcript_id lnc-GREB1-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000224177 ; gene_alias_2 AC099344.4 ; gene_alias_3 ENSG00000224177.2 ; gene_alias_4 LINC00570 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000151818.2 ; transcript_alias_1 ENST00000437795 ; transcript_alias_2 ENST00000437795.1 ; transcript_alias_3 LINC00570-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000324046.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	11542151	11542234	.	+	.	gene_id lnc-GREB1-4 ; transcript_id lnc-GREB1-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000224177 ; gene_alias_2 AC099344.4 ; gene_alias_3 ENSG00000224177.2 ; gene_alias_4 LINC00570 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000151818.2 ; transcript_alias_1 ENST00000437795 ; transcript_alias_2 ENST00000437795.1 ; transcript_alias_3 LINC00570-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000324046.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	56999943	57000354	.	+	.	gene_id lnc-FAAH2-3 ; transcript_id lnc-FAAH2-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_007995 ; gene_alias_2 linc-FAAH2-3 ; gene_alias_3 ENSG00000224799.1 ; gene_alias_4 RP11-445O16.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000021679.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00016987 ; transcript_alias_2 ENST00000430456.1 ; transcript_alias_3 RP11-445O16.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000056910.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	57000998	57001229	.	+	.	gene_id lnc-FAAH2-3 ; transcript_id lnc-FAAH2-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_007995 ; gene_alias_2 linc-FAAH2-3 ; gene_alias_3 ENSG00000224799.1 ; gene_alias_4 RP11-445O16.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000021679.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00016987 ; transcript_alias_2 ENST00000430456.1 ; transcript_alias_3 RP11-445O16.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000056910.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	121444211	121444332	.	-	.	gene_id lnc-TMEM185B-4 ; transcript_id lnc-TMEM185B-4:2 ; gene_alias_1 XLOC_002298 ; gene_alias_2 linc-SCTR-2 ; gene_alias_3 ENSG00000229774 ; gene_alias_4 AC018866.1 ; gene_alias_5 ENSG00000229774.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000154317.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003392 ; transcript_alias_2 ENST00000444963 ; transcript_alias_3 ENST00000444963.1 ; transcript_alias_4 AC018866.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000334823.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	121467840	121468041	.	-	.	gene_id lnc-TMEM185B-4 ; transcript_id lnc-TMEM185B-4:2 ; gene_alias_1 XLOC_002298 ; gene_alias_2 linc-SCTR-2 ; gene_alias_3 ENSG00000229774 ; gene_alias_4 AC018866.1 ; gene_alias_5 ENSG00000229774.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000154317.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003392 ; transcript_alias_2 ENST00000444963 ; transcript_alias_3 ENST00000444963.1 ; transcript_alias_4 AC018866.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000334823.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	89065398	89065713	.	+	.	gene_id lnc-RPIA-1 ; transcript_id lnc-RPIA-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000230006 ; gene_alias_2 ANKRD36BP2 ; transcript_alias_1 ENST00000427055 ;
chr2	lncipedia.org	exon	89076018	89076092	.	+	.	gene_id lnc-RPIA-1 ; transcript_id lnc-RPIA-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000230006 ; gene_alias_2 ANKRD36BP2 ; transcript_alias_1 ENST00000427055 ;
chr19	lncipedia.org	exon	41961601	41962392	.	-	.	gene_id lnc-ATP5SL-1 ; transcript_id lnc-ATP5SL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249527 ; transcript_alias_1 ENST00000507129 ;
chr19	lncipedia.org	exon	41984989	41985192	.	-	.	gene_id lnc-ATP5SL-1 ; transcript_id lnc-ATP5SL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249527 ; transcript_alias_1 ENST00000507129 ;
chr19	lncipedia.org	exon	42006494	42006559	.	-	.	gene_id lnc-ATP5SL-1 ; transcript_id lnc-ATP5SL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249527 ; transcript_alias_1 ENST00000507129 ;
chr2	lncipedia.org	exon	113993117	113993147	.	+	.	gene_id lnc-PSD4-1 ; transcript_id lnc-PSD4-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000189223 ; transcript_alias_1 ENST00000431844 ;
chr2	lncipedia.org	exon	113993369	113993921	.	+	.	gene_id lnc-PSD4-1 ; transcript_id lnc-PSD4-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000189223 ; transcript_alias_1 ENST00000431844 ;
chr8	lncipedia.org	exon	71032123	71032704	.	-	.	gene_id lnc-PRDM14-1 ; transcript_id lnc-PRDM14-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000242567 ; transcript_alias_1 ENST00000495409 ;
chr8	lncipedia.org	exon	71037790	71037863	.	-	.	gene_id lnc-PRDM14-1 ; transcript_id lnc-PRDM14-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000242567 ; transcript_alias_1 ENST00000495409 ;
chr6	lncipedia.org	exon	5030206	5030429	.	+	.	gene_id lnc-PPP1R3G-2 ; transcript_id lnc-PPP1R3G-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250255 ; gene_alias_2 XLOC_005143 ; gene_alias_3 linc-PPP1R3G ; transcript_alias_1 ENST00000502507 ; transcript_alias_2 TCONS_00011155 ;
chr6	lncipedia.org	exon	5042822	5043682	.	+	.	gene_id lnc-PPP1R3G-2 ; transcript_id lnc-PPP1R3G-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250255 ; gene_alias_2 XLOC_005143 ; gene_alias_3 linc-PPP1R3G ; transcript_alias_1 ENST00000502507 ; transcript_alias_2 TCONS_00011155 ;
chr9	lncipedia.org	exon	138900082	138900955	.	+	.	gene_id lnc-KCNT1-2 ; transcript_id lnc-KCNT1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251337 ; gene_alias_2 AL355574.1 ; transcript_alias_1 ENST00000509235 ;
chr9	lncipedia.org	exon	138901384	138901544	.	+	.	gene_id lnc-KCNT1-2 ; transcript_id lnc-KCNT1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251337 ; gene_alias_2 AL355574.1 ; transcript_alias_1 ENST00000509235 ;
chr12	lncipedia.org	exon	129594240	129594302	.	+	.	gene_id lnc-GLT1D1-1 ; transcript_id lnc-GLT1D1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249196 ; transcript_alias_1 ENST00000510001 ;
chr12	lncipedia.org	exon	129597610	129597839	.	+	.	gene_id lnc-GLT1D1-1 ; transcript_id lnc-GLT1D1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249196 ; transcript_alias_1 ENST00000510001 ;
chr19	lncipedia.org	exon	41285685	41285796	.	-	.	gene_id lnc-C19orf54-1 ; transcript_id lnc-C19orf54-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249523 ; gene_alias_2 AC008537.3 ; transcript_alias_1 ENST00000511958 ;
chr19	lncipedia.org	exon	41300431	41300704	.	-	.	gene_id lnc-C19orf54-1 ; transcript_id lnc-C19orf54-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249523 ; gene_alias_2 AC008537.3 ; transcript_alias_1 ENST00000511958 ;
chr19	lncipedia.org	exon	41302132	41302848	.	-	.	gene_id lnc-C19orf54-1 ; transcript_id lnc-C19orf54-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249523 ; gene_alias_2 AC008537.3 ; transcript_alias_1 ENST00000511958 ;
chr14	lncipedia.org	exon	97925207	97925264	.	+	.	gene_id lnc-VRK1-5 ; transcript_id lnc-VRK1-5:3 ; gene_alias_1 ENSG00000246084 ; transcript_alias_1 ENST00000499910 ;
chr14	lncipedia.org	exon	97928141	97928669	.	+	.	gene_id lnc-VRK1-5 ; transcript_id lnc-VRK1-5:3 ; gene_alias_1 ENSG00000246084 ; transcript_alias_1 ENST00000499910 ;
chr14	lncipedia.org	exon	97929969	97930493	.	+	.	gene_id lnc-VRK1-5 ; transcript_id lnc-VRK1-5:3 ; gene_alias_1 ENSG00000246084 ; transcript_alias_1 ENST00000499910 ;
chr1	lncipedia.org	exon	1335799	1335852	.	+	.	gene_id lnc-TMEM88B-3 ; transcript_id lnc-TMEM88B-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000239298 ; gene_alias_2 RP4-758J18.3 ; transcript_alias_1 ENST00000453521 ;
chr1	lncipedia.org	exon	1336623	1337426	.	+	.	gene_id lnc-TMEM88B-3 ; transcript_id lnc-TMEM88B-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000239298 ; gene_alias_2 RP4-758J18.3 ; transcript_alias_1 ENST00000453521 ;
chr19	lncipedia.org	exon	46714857	46714935	.	-	.	gene_id lnc-IGFL3-3 ; transcript_id lnc-IGFL3-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236057 ; transcript_alias_1 ENST00000537266 ;
chr19	lncipedia.org	exon	46715373	46715491	.	-	.	gene_id lnc-IGFL3-3 ; transcript_id lnc-IGFL3-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236057 ; transcript_alias_1 ENST00000537266 ;
chr19	lncipedia.org	exon	46716047	46716267	.	-	.	gene_id lnc-IGFL3-3 ; transcript_id lnc-IGFL3-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236057 ; transcript_alias_1 ENST00000537266 ;
chr19	lncipedia.org	exon	46716586	46716740	.	-	.	gene_id lnc-IGFL3-3 ; transcript_id lnc-IGFL3-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236057 ; transcript_alias_1 ENST00000537266 ;
chr19	lncipedia.org	exon	46717054	46718095	.	-	.	gene_id lnc-IGFL3-3 ; transcript_id lnc-IGFL3-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236057 ; transcript_alias_1 ENST00000537266 ;
chr12	lncipedia.org	exon	110318481	110318533	.	-	.	gene_id lnc-GLTP-1 ; transcript_id lnc-GLTP-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249094 ; transcript_alias_1 ENST00000446473 ;
chr12	lncipedia.org	exon	110325598	110326272	.	-	.	gene_id lnc-GLTP-1 ; transcript_id lnc-GLTP-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249094 ; transcript_alias_1 ENST00000446473 ;
chr11	lncipedia.org	exon	4099132	4099756	.	+	.	gene_id lnc-RRM1-1 ; transcript_id lnc-RRM1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248835 ; transcript_alias_1 ENST00000512808 ;
chr11	lncipedia.org	exon	4100490	4100803	.	+	.	gene_id lnc-RRM1-1 ; transcript_id lnc-RRM1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248835 ; transcript_alias_1 ENST00000512808 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26107854	26108174	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:11 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; transcript_alias_1 ENST00000500102 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26107892	26108174	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:11 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; transcript_alias_1 ENST00000500102 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26109160	26109280	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:11 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; transcript_alias_1 ENST00000500102 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26109572	26109694	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:11 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; transcript_alias_1 ENST00000500102 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26110386	26110518	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:11 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; transcript_alias_1 ENST00000500102 ;
chr3	lncipedia.org	exon	12548553	12548867	.	-	.	gene_id lnc-MKRN2-AS1-1 ; transcript_id lnc-MKRN2-AS1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236001 ; transcript_alias_1 ENST00000431680 ;
chr3	lncipedia.org	exon	12580882	12581122	.	-	.	gene_id lnc-MKRN2-AS1-1 ; transcript_id lnc-MKRN2-AS1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236001 ; transcript_alias_1 ENST00000431680 ;
chr2	lncipedia.org	exon	151485945	151486096	.	+	.	gene_id lnc-TNFAIP6-2 ; transcript_id lnc-TNFAIP6-2:9 ; gene_alias_1 XLOC_001707 ; gene_alias_2 linc-TNFAIP6-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00004921 ;
chr2	lncipedia.org	exon	151488781	151488910	.	+	.	gene_id lnc-TNFAIP6-2 ; transcript_id lnc-TNFAIP6-2:9 ; gene_alias_1 XLOC_001707 ; gene_alias_2 linc-TNFAIP6-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00004921 ;
chr2	lncipedia.org	exon	151491150	151491253	.	+	.	gene_id lnc-TNFAIP6-2 ; transcript_id lnc-TNFAIP6-2:9 ; gene_alias_1 XLOC_001707 ; gene_alias_2 linc-TNFAIP6-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00004921 ;
chr2	lncipedia.org	exon	151491749	151492179	.	+	.	gene_id lnc-TNFAIP6-2 ; transcript_id lnc-TNFAIP6-2:9 ; gene_alias_1 XLOC_001707 ; gene_alias_2 linc-TNFAIP6-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00004921 ;
chr3	lncipedia.org	exon	125985645	125985701	.	+	.	gene_id lnc-CCDC37-2 ; transcript_id lnc-CCDC37-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_002797 ; gene_alias_2 linc-CCDC37-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00006201 ;
chr3	lncipedia.org	exon	126009796	126010400	.	+	.	gene_id lnc-CCDC37-2 ; transcript_id lnc-CCDC37-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_002797 ; gene_alias_2 linc-CCDC37-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00006201 ;
chr7	lncipedia.org	exon	25870914	25871179	.	-	.	gene_id lnc-HNRNPA2B1-4 ; transcript_id lnc-HNRNPA2B1-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_006383 ; gene_alias_2 linc-NPVF-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00014275 ;
chr7	lncipedia.org	exon	25871321	25871569	.	-	.	gene_id lnc-HNRNPA2B1-4 ; transcript_id lnc-HNRNPA2B1-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_006383 ; gene_alias_2 linc-NPVF-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00014275 ;
chr7	lncipedia.org	exon	25872530	25872690	.	-	.	gene_id lnc-HNRNPA2B1-4 ; transcript_id lnc-HNRNPA2B1-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_006383 ; gene_alias_2 linc-NPVF-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00014275 ;
chr16	lncipedia.org	exon	80547387	80547502	.	-	.	gene_id lnc-CDYL2-5 ; transcript_id lnc-CDYL2-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_012018 ; gene_alias_2 linc-MAF-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00024738 ;
chr16	lncipedia.org	exon	80555129	80555350	.	-	.	gene_id lnc-CDYL2-5 ; transcript_id lnc-CDYL2-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_012018 ; gene_alias_2 linc-MAF-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00024738 ;
chr9	lncipedia.org	exon	69174214	69174523	.	-	.	gene_id lnc-FOXD4L6-1 ; transcript_id lnc-FOXD4L6-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007714 ; gene_alias_2 linc-FAM75A7-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00015602 ;
chr9	lncipedia.org	exon	69175960	69176070	.	-	.	gene_id lnc-FOXD4L6-1 ; transcript_id lnc-FOXD4L6-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007714 ; gene_alias_2 linc-FAM75A7-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00015602 ;
chr9	lncipedia.org	exon	69177697	69178388	.	-	.	gene_id lnc-FOXD4L6-1 ; transcript_id lnc-FOXD4L6-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007714 ; gene_alias_2 linc-FAM75A7-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00015602 ;
chr9	lncipedia.org	exon	69179394	69179617	.	-	.	gene_id lnc-FOXD4L6-1 ; transcript_id lnc-FOXD4L6-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007714 ; gene_alias_2 linc-FAM75A7-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00015602 ;
chr9	lncipedia.org	exon	69180823	69180970	.	-	.	gene_id lnc-FOXD4L6-1 ; transcript_id lnc-FOXD4L6-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007714 ; gene_alias_2 linc-FAM75A7-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00015602 ;
chr9	lncipedia.org	exon	69192724	69192879	.	-	.	gene_id lnc-FOXD4L6-1 ; transcript_id lnc-FOXD4L6-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007714 ; gene_alias_2 linc-FAM75A7-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00015602 ;
chr1	lncipedia.org	exon	5058062	5058232	.	-	.	gene_id lnc-NPHP4-3 ; transcript_id lnc-NPHP4-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_000686 ; gene_alias_2 linc-C1orf174-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00001382 ;
chr1	lncipedia.org	exon	5058681	5058786	.	-	.	gene_id lnc-NPHP4-3 ; transcript_id lnc-NPHP4-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_000686 ; gene_alias_2 linc-C1orf174-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00001382 ;
chr16	lncipedia.org	exon	52305507	52305782	.	+	.	gene_id lnc-CHD9-5 ; transcript_id lnc-CHD9-5:6 ; gene_alias_1 XLOC_011724 ; gene_alias_2 linc-CHD9-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00024843 ;
chr16	lncipedia.org	exon	52307024	52307131	.	+	.	gene_id lnc-CHD9-5 ; transcript_id lnc-CHD9-5:6 ; gene_alias_1 XLOC_011724 ; gene_alias_2 linc-CHD9-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00024843 ;
chr16	lncipedia.org	exon	52313521	52313602	.	+	.	gene_id lnc-CHD9-5 ; transcript_id lnc-CHD9-5:6 ; gene_alias_1 XLOC_011724 ; gene_alias_2 linc-CHD9-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00024843 ;
chr16	lncipedia.org	exon	52313928	52314051	.	+	.	gene_id lnc-CHD9-5 ; transcript_id lnc-CHD9-5:6 ; gene_alias_1 XLOC_011724 ; gene_alias_2 linc-CHD9-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00024843 ;
chr14	lncipedia.org	exon	95024730	95024917	.	-	.	gene_id lnc-SERPINA12-1 ; transcript_id lnc-SERPINA12-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_011107 ; gene_alias_2 linc-SERPINA12 ; transcript_alias_1 TCONS_00022841 ;
chr14	lncipedia.org	exon	95026876	95027008	.	-	.	gene_id lnc-SERPINA12-1 ; transcript_id lnc-SERPINA12-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_011107 ; gene_alias_2 linc-SERPINA12 ; transcript_alias_1 TCONS_00022841 ;
chr10	lncipedia.org	exon	125242497	125242687	.	+	.	gene_id lnc-GPR26-4 ; transcript_id lnc-GPR26-4:8 ; gene_alias_1 XLOC_008652 ; gene_alias_2 linc-GPR26-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00018845 ;
chr10	lncipedia.org	exon	125248439	125248526	.	+	.	gene_id lnc-GPR26-4 ; transcript_id lnc-GPR26-4:8 ; gene_alias_1 XLOC_008652 ; gene_alias_2 linc-GPR26-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00018845 ;
chr10	lncipedia.org	exon	125283368	125283920	.	+	.	gene_id lnc-GPR26-4 ; transcript_id lnc-GPR26-4:8 ; gene_alias_1 XLOC_008652 ; gene_alias_2 linc-GPR26-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00018845 ;
chr10	lncipedia.org	exon	125312053	125312248	.	+	.	gene_id lnc-GPR26-4 ; transcript_id lnc-GPR26-4:8 ; gene_alias_1 XLOC_008652 ; gene_alias_2 linc-GPR26-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00018845 ;
chr2	lncipedia.org	exon	65955408	65955515	.	+	.	gene_id lnc-ACTR2-3 ; transcript_id lnc-ACTR2-3:6 ; gene_alias_1 XLOC_001504 ; gene_alias_2 linc-MEIS1-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00002703 ;
chr2	lncipedia.org	exon	65957633	65958027	.	+	.	gene_id lnc-ACTR2-3 ; transcript_id lnc-ACTR2-3:6 ; gene_alias_1 XLOC_001504 ; gene_alias_2 linc-MEIS1-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00002703 ;
chr7	lncipedia.org	exon	119866353	119866543	.	-	.	gene_id lnc-TSPAN12-2 ; transcript_id lnc-TSPAN12-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_006582 ; gene_alias_2 linc-CTTNBP2-6 ; transcript_alias_1 TCONS_00013939 ;
chr7	lncipedia.org	exon	119867133	119867454	.	-	.	gene_id lnc-TSPAN12-2 ; transcript_id lnc-TSPAN12-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_006582 ; gene_alias_2 linc-CTTNBP2-6 ; transcript_alias_1 TCONS_00013939 ;
chr4	lncipedia.org	exon	4567821	4567914	.	-	.	gene_id lnc-STX18-1 ; transcript_id lnc-STX18-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_003863 ; gene_alias_2 linc-STX18-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009018 ;
chr4	lncipedia.org	exon	4570546	4570673	.	-	.	gene_id lnc-STX18-1 ; transcript_id lnc-STX18-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_003863 ; gene_alias_2 linc-STX18-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009018 ;
chr4	lncipedia.org	exon	4577761	4577798	.	-	.	gene_id lnc-STX18-1 ; transcript_id lnc-STX18-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_003863 ; gene_alias_2 linc-STX18-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009018 ;
chr14	lncipedia.org	exon	24344929	24345799	.	-	.	gene_id lnc-NRL-3 ; transcript_id lnc-NRL-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_010972 ; gene_alias_2 linc-JPH4-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00022677 ;
chr14	lncipedia.org	exon	24347876	24347913	.	-	.	gene_id lnc-NRL-3 ; transcript_id lnc-NRL-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_010972 ; gene_alias_2 linc-JPH4-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00022677 ;
chr4	lncipedia.org	exon	171961724	171961985	.	+	.	gene_id lnc-GALNTL6-2 ; transcript_id lnc-GALNTL6-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_003777 ; gene_alias_2 linc-GALNTL6-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00008321 ;
chr4	lncipedia.org	exon	171976506	171976568	.	+	.	gene_id lnc-GALNTL6-2 ; transcript_id lnc-GALNTL6-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_003777 ; gene_alias_2 linc-GALNTL6-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00008321 ;
chr4	lncipedia.org	exon	171976979	171977049	.	+	.	gene_id lnc-GALNTL6-2 ; transcript_id lnc-GALNTL6-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_003777 ; gene_alias_2 linc-GALNTL6-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00008321 ;
chr4	lncipedia.org	exon	171977326	171977347	.	+	.	gene_id lnc-GALNTL6-2 ; transcript_id lnc-GALNTL6-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_003777 ; gene_alias_2 linc-GALNTL6-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00008321 ;
chr6	lncipedia.org	exon	1321763	1322221	.	-	.	gene_id lnc-GMDS-3 ; transcript_id lnc-GMDS-3:3 ; gene_alias_1 XLOC_005575 ; gene_alias_2 linc-HUS1B-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00012639 ;
chr6	lncipedia.org	exon	1324134	1324276	.	-	.	gene_id lnc-GMDS-3 ; transcript_id lnc-GMDS-3:3 ; gene_alias_1 XLOC_005575 ; gene_alias_2 linc-HUS1B-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00012639 ;
chr9	lncipedia.org	exon	117420281	117420493	.	+	.	gene_id lnc-C9orf91-1 ; transcript_id lnc-C9orf91-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_007528 ; gene_alias_2 linc-DEC1 ; transcript_alias_1 TCONS_00016674 ;
chr9	lncipedia.org	exon	117421271	117421636	.	+	.	gene_id lnc-C9orf91-1 ; transcript_id lnc-C9orf91-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_007528 ; gene_alias_2 linc-DEC1 ; transcript_alias_1 TCONS_00016674 ;
chr12	lncipedia.org	exon	90970004	90970142	.	+	.	gene_id lnc-CLLU1.1-10 ; transcript_id lnc-CLLU1.1-10:1 ; gene_alias_1 XLOC_009830 ; gene_alias_2 linc-CLLU1-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00020513 ;
chr12	lncipedia.org	exon	90970262	90970358	.	+	.	gene_id lnc-CLLU1.1-10 ; transcript_id lnc-CLLU1.1-10:1 ; gene_alias_1 XLOC_009830 ; gene_alias_2 linc-CLLU1-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00020513 ;
chr12	lncipedia.org	exon	90987346	90987585	.	+	.	gene_id lnc-CLLU1.1-10 ; transcript_id lnc-CLLU1.1-10:1 ; gene_alias_1 XLOC_009830 ; gene_alias_2 linc-CLLU1-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00020513 ;
chr22	lncipedia.org	exon	19543859	19544183	.	-	.	gene_id lnc-CLDN5-1 ; transcript_id lnc-CLDN5-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_014297 ; gene_alias_2 linc-CLDN5-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00029855 ;
chr22	lncipedia.org	exon	19552389	19552723	.	-	.	gene_id lnc-CLDN5-1 ; transcript_id lnc-CLDN5-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_014297 ; gene_alias_2 linc-CLDN5-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00029855 ;
chr13	lncipedia.org	exon	111474475	111474894	.	+	.	gene_id lnc-ING1-1 ; transcript_id lnc-ING1-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_010500 ; gene_alias_2 linc-ARHGEF7-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00021505 ;
chr13	lncipedia.org	exon	111477210	111477338	.	+	.	gene_id lnc-ING1-1 ; transcript_id lnc-ING1-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_010500 ; gene_alias_2 linc-ARHGEF7-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00021505 ;
chr13	lncipedia.org	exon	111490563	111491472	.	+	.	gene_id lnc-ING1-1 ; transcript_id lnc-ING1-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_010500 ; gene_alias_2 linc-ARHGEF7-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00021505 ;
chr14	lncipedia.org	exon	86378385	86378578	.	+	.	gene_id lnc-FLRT2-2 ; transcript_id lnc-FLRT2-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_010891 ; gene_alias_2 linc-GPR65-6 ; transcript_alias_1 TCONS_00022572 ;
chr14	lncipedia.org	exon	86537207	86537310	.	+	.	gene_id lnc-FLRT2-2 ; transcript_id lnc-FLRT2-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_010891 ; gene_alias_2 linc-GPR65-6 ; transcript_alias_1 TCONS_00022572 ;
chr6	lncipedia.org	exon	138144831	138145714	.	-	.	gene_id lnc-PERP-3 ; transcript_id lnc-PERP-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_005849 ; gene_alias_2 linc-OLIG3-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00012793 ;
chr6	lncipedia.org	exon	138148058	138148172	.	-	.	gene_id lnc-PERP-3 ; transcript_id lnc-PERP-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_005849 ; gene_alias_2 linc-OLIG3-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00012793 ;
chr2	lncipedia.org	exon	242836153	242836490	.	-	.	gene_id lnc-AC131097.4.1-1 ; transcript_id lnc-AC131097.4.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_002558 ; gene_alias_2 linc-PDCD1-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00004647 ;
chr2	lncipedia.org	exon	242839337	242839485	.	-	.	gene_id lnc-AC131097.4.1-1 ; transcript_id lnc-AC131097.4.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_002558 ; gene_alias_2 linc-PDCD1-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00004647 ;
chr2	lncipedia.org	exon	242844648	242844846	.	-	.	gene_id lnc-AC131097.4.1-1 ; transcript_id lnc-AC131097.4.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_002558 ; gene_alias_2 linc-PDCD1-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00004647 ;
chr9	lncipedia.org	exon	25780054	25780166	.	+	.	gene_id lnc-IFT74-3 ; transcript_id lnc-IFT74-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_007306 ; gene_alias_2 linc-IFT74-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015572 ;
chr9	lncipedia.org	exon	25780414	25780615	.	+	.	gene_id lnc-IFT74-3 ; transcript_id lnc-IFT74-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_007306 ; gene_alias_2 linc-IFT74-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015572 ;
chr9	lncipedia.org	exon	25784413	25784614	.	+	.	gene_id lnc-IFT74-3 ; transcript_id lnc-IFT74-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_007306 ; gene_alias_2 linc-IFT74-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015572 ;
chr9	lncipedia.org	exon	25798032	25798204	.	+	.	gene_id lnc-IFT74-3 ; transcript_id lnc-IFT74-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_007306 ; gene_alias_2 linc-IFT74-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015572 ;
chr9	lncipedia.org	exon	25798743	25798941	.	+	.	gene_id lnc-IFT74-3 ; transcript_id lnc-IFT74-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_007306 ; gene_alias_2 linc-IFT74-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015572 ;
chr9	lncipedia.org	exon	25812619	25812963	.	+	.	gene_id lnc-IFT74-3 ; transcript_id lnc-IFT74-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_007306 ; gene_alias_2 linc-IFT74-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015572 ;
chr1	lncipedia.org	exon	59597610	59598418	.	-	.	gene_id lnc-JUN-5 ; transcript_id lnc-JUN-5:3 ; gene_alias_1 XLOC_000851 ; gene_alias_2 linc-JUN-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000017 ;
chr1	lncipedia.org	exon	59598903	59599002	.	-	.	gene_id lnc-JUN-5 ; transcript_id lnc-JUN-5:3 ; gene_alias_1 XLOC_000851 ; gene_alias_2 linc-JUN-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000017 ;
chr1	lncipedia.org	exon	59612348	59612479	.	-	.	gene_id lnc-JUN-5 ; transcript_id lnc-JUN-5:3 ; gene_alias_1 XLOC_000851 ; gene_alias_2 linc-JUN-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000017 ;
chr5	lncipedia.org	exon	171165001	171165473	.	+	.	gene_id lnc-CTB-78H18.1.1-1 ; transcript_id lnc-CTB-78H18.1.1-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_004629 ; gene_alias_2 linc-EFCAB9-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00010166 ;
chr5	lncipedia.org	exon	171171229	171172081	.	+	.	gene_id lnc-CTB-78H18.1.1-1 ; transcript_id lnc-CTB-78H18.1.1-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_004629 ; gene_alias_2 linc-EFCAB9-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00010166 ;
chr5	lncipedia.org	exon	159003428	159003439	.	+	.	gene_id lnc-UBLCP1-8 ; transcript_id lnc-UBLCP1-8:1 ; gene_alias_1 XLOC_004621 ; gene_alias_2 linc-ADRA1B-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00010155 ;
chr5	lncipedia.org	exon	159003854	159004054	.	+	.	gene_id lnc-UBLCP1-8 ; transcript_id lnc-UBLCP1-8:1 ; gene_alias_1 XLOC_004621 ; gene_alias_2 linc-ADRA1B-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00010155 ;
chr5	lncipedia.org	exon	159007322	159007443	.	+	.	gene_id lnc-UBLCP1-8 ; transcript_id lnc-UBLCP1-8:1 ; gene_alias_1 XLOC_004621 ; gene_alias_2 linc-ADRA1B-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00010155 ;
chr5	lncipedia.org	exon	159010607	159010724	.	+	.	gene_id lnc-UBLCP1-8 ; transcript_id lnc-UBLCP1-8:1 ; gene_alias_1 XLOC_004621 ; gene_alias_2 linc-ADRA1B-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00010155 ;
chr5	lncipedia.org	exon	159012748	159012901	.	+	.	gene_id lnc-UBLCP1-8 ; transcript_id lnc-UBLCP1-8:1 ; gene_alias_1 XLOC_004621 ; gene_alias_2 linc-ADRA1B-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00010155 ;
chr21	lncipedia.org	exon	32333642	32333969	.	-	.	gene_id lnc-TIAM1-1 ; transcript_id lnc-TIAM1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_014050 ; gene_alias_2 linc-KRTAP11-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00029109 ;
chr21	lncipedia.org	exon	32361380	32361437	.	-	.	gene_id lnc-TIAM1-1 ; transcript_id lnc-TIAM1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_014050 ; gene_alias_2 linc-KRTAP11-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00029109 ;
chr21	lncipedia.org	exon	32361734	32361891	.	-	.	gene_id lnc-TIAM1-1 ; transcript_id lnc-TIAM1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_014050 ; gene_alias_2 linc-KRTAP11-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00029109 ;
chr10	lncipedia.org	exon	47693888	47693947	.	+	.	gene_id lnc-ANTXRL-1 ; transcript_id lnc-ANTXRL-1:10 ; gene_alias_1 XLOC_008480 ; gene_alias_2 linc-ANXA8L2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00018728 ;
chr10	lncipedia.org	exon	47700835	47701462	.	+	.	gene_id lnc-ANTXRL-1 ; transcript_id lnc-ANTXRL-1:10 ; gene_alias_1 XLOC_008480 ; gene_alias_2 linc-ANXA8L2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00018728 ;
chrY	lncipedia.org	exon	231385	232052	.	+	.	gene_id lnc-RPS4Y1-8 ; transcript_id lnc-RPS4Y1-8:1 ; gene_alias_1 XLOC_008270 ; gene_alias_2 linc-SHOX-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00017565 ; transcript_alias_2 TCONS_00017566 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101723698	101723780	.	+	.	gene_id lnc-DIO3.1-4 ; transcript_id lnc-DIO3.1-4:2 ; gene_alias_1 XLOC_010936 ; gene_alias_2 linc-DIO3-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00022635 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101758105	101758324	.	+	.	gene_id lnc-DIO3.1-4 ; transcript_id lnc-DIO3.1-4:2 ; gene_alias_1 XLOC_010936 ; gene_alias_2 linc-DIO3-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00022635 ;
chr8	lncipedia.org	exon	37575097	37575514	.	+	.	gene_id lnc-ERLIN2-1 ; transcript_id lnc-ERLIN2-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_006775 ; gene_alias_2 linc-ERLIN2 ; transcript_alias_1 TCONS_00014488 ;
chr8	lncipedia.org	exon	37584678	37584808	.	+	.	gene_id lnc-ERLIN2-1 ; transcript_id lnc-ERLIN2-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_006775 ; gene_alias_2 linc-ERLIN2 ; transcript_alias_1 TCONS_00014488 ;
chr8	lncipedia.org	exon	37590596	37591011	.	+	.	gene_id lnc-ERLIN2-1 ; transcript_id lnc-ERLIN2-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_006775 ; gene_alias_2 linc-ERLIN2 ; transcript_alias_1 TCONS_00014488 ;
chr8	lncipedia.org	exon	122926094	122926132	.	+	.	gene_id lnc-RP11-785H20.1.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-785H20.1.1-1:8 ; gene_alias_1 XLOC_006911 ; gene_alias_2 linc-ZHX2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015339 ;
chr8	lncipedia.org	exon	123005837	123006051	.	+	.	gene_id lnc-RP11-785H20.1.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-785H20.1.1-1:8 ; gene_alias_1 XLOC_006911 ; gene_alias_2 linc-ZHX2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015339 ;
chr8	lncipedia.org	exon	9009294	9009426	.	+	.	gene_id lnc-ERI1-2 ; transcript_id lnc-ERI1-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_006704 ; gene_alias_2 linc-TNKS-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00014600 ;
chr8	lncipedia.org	exon	9012476	9012586	.	+	.	gene_id lnc-ERI1-2 ; transcript_id lnc-ERI1-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_006704 ; gene_alias_2 linc-TNKS-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00014600 ;
chr8	lncipedia.org	exon	9013662	9013864	.	+	.	gene_id lnc-ERI1-2 ; transcript_id lnc-ERI1-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_006704 ; gene_alias_2 linc-TNKS-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00014600 ;
chrX	lncipedia.org	exon	7896716	7897454	.	+	.	gene_id lnc-VCX-2 ; transcript_id lnc-VCX-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_007925 ; gene_alias_2 linc-VCX3B-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017403 ;
chrX	lncipedia.org	exon	8030652	8030696	.	+	.	gene_id lnc-VCX-2 ; transcript_id lnc-VCX-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_007925 ; gene_alias_2 linc-VCX3B-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017403 ;
chrX	lncipedia.org	exon	45420856	45420938	.	+	.	gene_id lnc-KDM6A-2 ; transcript_id lnc-KDM6A-2:4 ; gene_alias_1 XLOC_007966 ; gene_alias_2 linc-ZNF673-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00017158 ;
chrX	lncipedia.org	exon	45461542	45461792	.	+	.	gene_id lnc-KDM6A-2 ; transcript_id lnc-KDM6A-2:4 ; gene_alias_1 XLOC_007966 ; gene_alias_2 linc-ZNF673-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00017158 ;
chr13	lncipedia.org	exon	54334856	54334931	.	+	.	gene_id lnc-OLFM4-2 ; transcript_id lnc-OLFM4-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_010398 ; gene_alias_2 linc-PRR20A-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00021795 ;
chr13	lncipedia.org	exon	54348953	54349119	.	+	.	gene_id lnc-OLFM4-2 ; transcript_id lnc-OLFM4-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_010398 ; gene_alias_2 linc-PRR20A-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00021795 ;
chr9	lncipedia.org	exon	10096	10126	.	-	.	gene_id lnc-FAM138C-1 ; transcript_id lnc-FAM138C-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007622 ; gene_alias_2 linc-C9orf37-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00016239 ;
chr9	lncipedia.org	exon	10475	10799	.	-	.	gene_id lnc-FAM138C-1 ; transcript_id lnc-FAM138C-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007622 ; gene_alias_2 linc-C9orf37-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00016239 ;
chr8	lncipedia.org	exon	97465313	97465904	.	+	.	gene_id lnc-SDC2-1 ; transcript_id lnc-SDC2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_006876 ; gene_alias_2 linc-SDC2 ; transcript_alias_1 TCONS_00014801 ;
chr8	lncipedia.org	exon	97469517	97469664	.	+	.	gene_id lnc-SDC2-1 ; transcript_id lnc-SDC2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_006876 ; gene_alias_2 linc-SDC2 ; transcript_alias_1 TCONS_00014801 ;
chr6	lncipedia.org	exon	11909099	11909175	.	+	.	gene_id lnc-HIVEP1-3 ; transcript_id lnc-HIVEP1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_005172 ; gene_alias_2 linc-HIVEP1-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00011692 ;
chr6	lncipedia.org	exon	11920596	11920977	.	+	.	gene_id lnc-HIVEP1-3 ; transcript_id lnc-HIVEP1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_005172 ; gene_alias_2 linc-HIVEP1-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00011692 ;
chr3	lncipedia.org	exon	106828781	106828851	.	-	.	gene_id lnc-CBLB-7 ; transcript_id lnc-CBLB-7:7 ; gene_alias_1 XLOC_003204 ; gene_alias_2 linc-CBLB-6 ; transcript_alias_1 TCONS_00006590 ;
chr3	lncipedia.org	exon	106848735	106848839	.	-	.	gene_id lnc-CBLB-7 ; transcript_id lnc-CBLB-7:7 ; gene_alias_1 XLOC_003204 ; gene_alias_2 linc-CBLB-6 ; transcript_alias_1 TCONS_00006590 ;
chr3	lncipedia.org	exon	106928309	106928374	.	-	.	gene_id lnc-CBLB-7 ; transcript_id lnc-CBLB-7:7 ; gene_alias_1 XLOC_003204 ; gene_alias_2 linc-CBLB-6 ; transcript_alias_1 TCONS_00006590 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21408238	21408286	.	+	.	gene_id lnc-P2RX6-1 ; transcript_id lnc-P2RX6-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_014162 ; gene_alias_2 linc-RIMBP3C-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00029522 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21409387	21409465	.	+	.	gene_id lnc-P2RX6-1 ; transcript_id lnc-P2RX6-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_014162 ; gene_alias_2 linc-RIMBP3C-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00029522 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21411225	21411489	.	+	.	gene_id lnc-P2RX6-1 ; transcript_id lnc-P2RX6-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_014162 ; gene_alias_2 linc-RIMBP3C-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00029522 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21414662	21414866	.	+	.	gene_id lnc-P2RX6-1 ; transcript_id lnc-P2RX6-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_014162 ; gene_alias_2 linc-RIMBP3C-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00029522 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21416013	21416630	.	+	.	gene_id lnc-P2RX6-1 ; transcript_id lnc-P2RX6-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_014162 ; gene_alias_2 linc-RIMBP3C-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00029522 ;
chr19	lncipedia.org	exon	56910271	56910601	.	-	.	gene_id lnc-ZNF582-1 ; transcript_id lnc-ZNF582-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_013415 ; gene_alias_2 linc-ZNF582 ; transcript_alias_1 TCONS_00027426 ;
chr19	lncipedia.org	exon	56915271	56915279	.	-	.	gene_id lnc-ZNF582-1 ; transcript_id lnc-ZNF582-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_013415 ; gene_alias_2 linc-ZNF582 ; transcript_alias_1 TCONS_00027426 ;
chr22	lncipedia.org	exon	50984904	50984915	.	+	.	gene_id lnc-KLHDC7B-1 ; transcript_id lnc-KLHDC7B-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_014287 ; gene_alias_2 linc-KLHDC7B ; transcript_alias_1 TCONS_00029630 ;
chr22	lncipedia.org	exon	50985997	50986244	.	+	.	gene_id lnc-KLHDC7B-1 ; transcript_id lnc-KLHDC7B-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_014287 ; gene_alias_2 linc-KLHDC7B ; transcript_alias_1 TCONS_00029630 ;
chr17	lncipedia.org	exon	16886104	16886117	.	+	.	gene_id lnc-AC104024.2.1-1 ; transcript_id lnc-AC104024.2.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_012126 ; gene_alias_2 linc-MPRIP-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00025320 ;
chr17	lncipedia.org	exon	16886356	16886565	.	+	.	gene_id lnc-AC104024.2.1-1 ; transcript_id lnc-AC104024.2.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_012126 ; gene_alias_2 linc-MPRIP-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00025320 ;
chr9	lncipedia.org	exon	136125807	136126539	.	-	.	gene_id lnc-OBP2B-1 ; transcript_id lnc-OBP2B-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007880 ; gene_alias_2 linc-OBP2B ; transcript_alias_1 TCONS_00016890 ;
chr9	lncipedia.org	exon	136126740	136126767	.	-	.	gene_id lnc-OBP2B-1 ; transcript_id lnc-OBP2B-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007880 ; gene_alias_2 linc-OBP2B ; transcript_alias_1 TCONS_00016890 ;
chr15	lncipedia.org	exon	24811309	24811359	.	+	.	gene_id lnc-C15orf2-2 ; transcript_id lnc-C15orf2-2:24 ; gene_alias_1 XLOC_011181 ; gene_alias_2 linc-C15orf2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00023317 ;
chr15	lncipedia.org	exon	24811803	24811947	.	+	.	gene_id lnc-C15orf2-2 ; transcript_id lnc-C15orf2-2:24 ; gene_alias_1 XLOC_011181 ; gene_alias_2 linc-C15orf2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00023317 ;
chr15	lncipedia.org	exon	24814930	24814956	.	+	.	gene_id lnc-C15orf2-2 ; transcript_id lnc-C15orf2-2:24 ; gene_alias_1 XLOC_011181 ; gene_alias_2 linc-C15orf2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00023317 ;
chr15	lncipedia.org	exon	24815179	24815275	.	+	.	gene_id lnc-C15orf2-2 ; transcript_id lnc-C15orf2-2:24 ; gene_alias_1 XLOC_011181 ; gene_alias_2 linc-C15orf2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00023317 ;
chr5	lncipedia.org	exon	171152835	171153260	.	-	.	gene_id lnc-FBXW11-2 ; transcript_id lnc-FBXW11-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_005081 ; gene_alias_2 linc-KCNMB1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00011086 ;
chr5	lncipedia.org	exon	171163018	171163333	.	-	.	gene_id lnc-FBXW11-2 ; transcript_id lnc-FBXW11-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_005081 ; gene_alias_2 linc-KCNMB1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00011086 ;
chr2	lncipedia.org	exon	173162904	173163071	.	+	.	gene_id lnc-ITGA6-1 ; transcript_id lnc-ITGA6-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_001757 ; gene_alias_2 linc-ITGA6-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00004946 ;
chr2	lncipedia.org	exon	173188078	173188161	.	+	.	gene_id lnc-ITGA6-1 ; transcript_id lnc-ITGA6-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_001757 ; gene_alias_2 linc-ITGA6-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00004946 ;
chr1	lncipedia.org	exon	247549931	247549939	.	+	.	gene_id lnc-NLRP3-1 ; transcript_id lnc-NLRP3-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_000647 ; gene_alias_2 linc-NLRP3-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00001362 ;
chr1	lncipedia.org	exon	247556644	247556961	.	+	.	gene_id lnc-NLRP3-1 ; transcript_id lnc-NLRP3-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_000647 ; gene_alias_2 linc-NLRP3-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00001362 ;
chr13	lncipedia.org	exon	64159590	64159812	.	-	.	gene_id lnc-PCDH20-7 ; transcript_id lnc-PCDH20-7:1 ; gene_alias_1 XLOC_010641 ; gene_alias_2 linc-PCDH20-6 ; transcript_alias_1 TCONS_00022041 ;
chr13	lncipedia.org	exon	64159888	64159977	.	-	.	gene_id lnc-PCDH20-7 ; transcript_id lnc-PCDH20-7:1 ; gene_alias_1 XLOC_010641 ; gene_alias_2 linc-PCDH20-6 ; transcript_alias_1 TCONS_00022041 ;
chr1	lncipedia.org	exon	852953	853100	.	-	.	gene_id lnc-NOC2L-1 ; transcript_id lnc-NOC2L-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_000670 ; gene_alias_2 linc-OR4F16-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00000073 ;
chr1	lncipedia.org	exon	853402	853495	.	-	.	gene_id lnc-NOC2L-1 ; transcript_id lnc-NOC2L-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_000670 ; gene_alias_2 linc-OR4F16-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00000073 ;
chr1	lncipedia.org	exon	854205	854295	.	-	.	gene_id lnc-NOC2L-1 ; transcript_id lnc-NOC2L-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_000670 ; gene_alias_2 linc-OR4F16-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00000073 ;
chr1	lncipedia.org	exon	854715	854817	.	-	.	gene_id lnc-NOC2L-1 ; transcript_id lnc-NOC2L-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_000670 ; gene_alias_2 linc-OR4F16-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00000073 ;
chr6	lncipedia.org	exon	45543599	45543823	.	-	.	gene_id lnc-SUPT3H-1 ; transcript_id lnc-SUPT3H-1:6 ; gene_alias_1 XLOC_005737 ; gene_alias_2 linc-SUPT3H ; transcript_alias_1 TCONS_00012739 ;
chr6	lncipedia.org	exon	45544322	45544501	.	-	.	gene_id lnc-SUPT3H-1 ; transcript_id lnc-SUPT3H-1:6 ; gene_alias_1 XLOC_005737 ; gene_alias_2 linc-SUPT3H ; transcript_alias_1 TCONS_00012739 ;
chr13	lncipedia.org	exon	114459242	114459402	.	-	.	gene_id lnc-GAS6-2 ; transcript_id lnc-GAS6-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_010740 ; gene_alias_2 linc-ATP4B-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00022130 ;
chr13	lncipedia.org	exon	114459516	114459561	.	-	.	gene_id lnc-GAS6-2 ; transcript_id lnc-GAS6-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_010740 ; gene_alias_2 linc-ATP4B-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00022130 ;
chrX	lncipedia.org	exon	119371846	119372095	.	-	.	gene_id lnc-FAM70A-1 ; transcript_id lnc-FAM70A-1:8 ; gene_alias_1 XLOC_008225 ; gene_alias_2 linc-RHOXF1-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00017542 ;
chrX	lncipedia.org	exon	119374080	119374209	.	-	.	gene_id lnc-FAM70A-1 ; transcript_id lnc-FAM70A-1:8 ; gene_alias_1 XLOC_008225 ; gene_alias_2 linc-RHOXF1-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00017542 ;
chr11	lncipedia.org	exon	45772392	45772759	.	-	.	gene_id lnc-CHST1-4 ; transcript_id lnc-CHST1-4:2 ; gene_alias_1 XLOC_009434 ; gene_alias_2 linc-CHST1-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00019633 ;
chr11	lncipedia.org	exon	45773062	45773152	.	-	.	gene_id lnc-CHST1-4 ; transcript_id lnc-CHST1-4:2 ; gene_alias_1 XLOC_009434 ; gene_alias_2 linc-CHST1-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00019633 ;
chr9	lncipedia.org	exon	33705087	33705275	.	+	.	gene_id lnc-PRSS3-3 ; transcript_id lnc-PRSS3-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_007324 ; gene_alias_2 linc-PRSS3-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00015947 ;
chr9	lncipedia.org	exon	33707271	33708779	.	+	.	gene_id lnc-PRSS3-3 ; transcript_id lnc-PRSS3-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_007324 ; gene_alias_2 linc-PRSS3-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00015947 ;
chr21	lncipedia.org	exon	9825744	9825878	.	+	.	gene_id lnc-CR381653.1-3 ; transcript_id lnc-CR381653.1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_013852 ; gene_alias_2 linc-POTED-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00029193 ;
chr21	lncipedia.org	exon	9825968	9826389	.	+	.	gene_id lnc-CR381653.1-3 ; transcript_id lnc-CR381653.1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_013852 ; gene_alias_2 linc-POTED-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00029193 ;
chr2	lncipedia.org	exon	242998199	242998510	.	-	.	gene_id lnc-AC131097.4.1-3 ; transcript_id lnc-AC131097.4.1-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_002560 ; gene_alias_2 linc-PDCD1-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00005376 ;
chr2	lncipedia.org	exon	243002448	243002921	.	-	.	gene_id lnc-AC131097.4.1-3 ; transcript_id lnc-AC131097.4.1-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_002560 ; gene_alias_2 linc-PDCD1-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00005376 ;
chr2	lncipedia.org	exon	243026247	243026380	.	-	.	gene_id lnc-AC131097.4.1-3 ; transcript_id lnc-AC131097.4.1-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_002560 ; gene_alias_2 linc-PDCD1-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00005376 ;
chr6	lncipedia.org	exon	171045433	171045482	.	-	.	gene_id lnc-PDCD2-2 ; transcript_id lnc-PDCD2-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_005951 ; gene_alias_2 linc-PDCD2-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00012841 ;
chr6	lncipedia.org	exon	171046589	171046759	.	-	.	gene_id lnc-PDCD2-2 ; transcript_id lnc-PDCD2-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_005951 ; gene_alias_2 linc-PDCD2-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00012841 ;
chr7	lncipedia.org	exon	76312462	76312796	.	+	.	gene_id lnc-AC004980.12.1-2 ; transcript_id lnc-AC004980.12.1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_006151 ; gene_alias_2 linc-CCDC146-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00013502 ;
chr7	lncipedia.org	exon	76313828	76313967	.	+	.	gene_id lnc-AC004980.12.1-2 ; transcript_id lnc-AC004980.12.1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_006151 ; gene_alias_2 linc-CCDC146-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00013502 ;
chr7	lncipedia.org	exon	76316549	76316628	.	+	.	gene_id lnc-AC004980.12.1-2 ; transcript_id lnc-AC004980.12.1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_006151 ; gene_alias_2 linc-CCDC146-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00013502 ;
chr7	lncipedia.org	exon	76318445	76318469	.	+	.	gene_id lnc-AC004980.12.1-2 ; transcript_id lnc-AC004980.12.1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_006151 ; gene_alias_2 linc-CCDC146-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00013502 ;
chr4	lncipedia.org	exon	1352267	1352351	.	+	.	gene_id lnc-MAEA-2 ; transcript_id lnc-MAEA-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000253399.1 ; gene_alias_2 AC078852.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000163526.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515842.1 ; transcript_alias_2 AC078852.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000373985.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	1352894	1353249	.	+	.	gene_id lnc-MAEA-2 ; transcript_id lnc-MAEA-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000253399.1 ; gene_alias_2 AC078852.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000163526.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515842.1 ; transcript_alias_2 AC078852.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000373985.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	19601977	19602048	.	+	.	gene_id lnc-RP11-408E5.4.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-408E5.4.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226619.1 ; gene_alias_2 RP11-301J16.7 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000016476.1 ; transcript_alias_1 ENST00000450212.1 ; transcript_alias_2 RP11-301J16.7-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000044000.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	19602715	19602841	.	+	.	gene_id lnc-RP11-408E5.4.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-408E5.4.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226619.1 ; gene_alias_2 RP11-301J16.7 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000016476.1 ; transcript_alias_1 ENST00000450212.1 ; transcript_alias_2 RP11-301J16.7-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000044000.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	3631182	3631379	.	+	.	gene_id lnc-CLUAP1-2 ; transcript_id lnc-CLUAP1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000261938.1 ; gene_alias_2 RP11-461A8.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000177599.1 ; transcript_alias_1 ENST00000573982.1 ; transcript_alias_2 RP11-461A8.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000437988.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	3633137	3633267	.	+	.	gene_id lnc-CLUAP1-2 ; transcript_id lnc-CLUAP1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000261938.1 ; gene_alias_2 RP11-461A8.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000177599.1 ; transcript_alias_1 ENST00000573982.1 ; transcript_alias_2 RP11-461A8.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000437988.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	46137745	46137822	.	-	.	gene_id lnc-CBX1-1 ; transcript_id lnc-CBX1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000266341.1 ; gene_alias_2 RP5-890E16.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000178707.1 ; transcript_alias_1 ENST00000583349.1 ; transcript_alias_2 RP5-890E16.4-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000443041.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	46137918	46138031	.	-	.	gene_id lnc-CBX1-1 ; transcript_id lnc-CBX1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000266341.1 ; gene_alias_2 RP5-890E16.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000178707.1 ; transcript_alias_1 ENST00000583349.1 ; transcript_alias_2 RP5-890E16.4-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000443041.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	29952206	29952361	.	+	.	gene_id lnc-TMEM219-1 ; transcript_id lnc-TMEM219-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000260358.1 ; gene_alias_2 CTD-2574D22.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000177149.1 ; transcript_alias_1 ENST00000563882.1 ; transcript_alias_2 CTD-2574D22.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000435619.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	196730003	196730077	.	+	.	gene_id lnc-SENP5-2 ; transcript_id lnc-SENP5-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000228109.1 ; gene_alias_2 MFI2-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000155519.1 ; transcript_alias_1 ENST00000446695.1 ; transcript_alias_2 MFI2-AS1-005 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000340469.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	196730473	196730601	.	+	.	gene_id lnc-SENP5-2 ; transcript_id lnc-SENP5-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000228109.1 ; gene_alias_2 MFI2-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000155519.1 ; transcript_alias_1 ENST00000446695.1 ; transcript_alias_2 MFI2-AS1-005 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000340469.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	78772399	78772602	.	-	.	gene_id lnc-CHRNA3-2 ; transcript_id lnc-CHRNA3-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000259474.1 ; gene_alias_2 RP11-650L12.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172564.1 ; transcript_alias_1 ENST00000560094.1 ; transcript_alias_2 RP11-650L12.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000419129.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	78774042	78774162	.	-	.	gene_id lnc-CHRNA3-2 ; transcript_id lnc-CHRNA3-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000259474.1 ; gene_alias_2 RP11-650L12.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172564.1 ; transcript_alias_1 ENST00000560094.1 ; transcript_alias_2 RP11-650L12.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000419129.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	98262521	98262628	.	+	.	gene_id lnc-SNX7-2 ; transcript_id lnc-SNX7-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000235777.1 ; gene_alias_2 DPYD-AS2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000039680.1 ; transcript_alias_1 ENST00000422259.1 ; transcript_alias_2 DPYD-AS2-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000095695.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	98262771	98262851	.	+	.	gene_id lnc-SNX7-2 ; transcript_id lnc-SNX7-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000235777.1 ; gene_alias_2 DPYD-AS2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000039680.1 ; transcript_alias_1 ENST00000422259.1 ; transcript_alias_2 DPYD-AS2-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000095695.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	98263024	98263622	.	+	.	gene_id lnc-SNX7-2 ; transcript_id lnc-SNX7-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000235777.1 ; gene_alias_2 DPYD-AS2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000039680.1 ; transcript_alias_1 ENST00000422259.1 ; transcript_alias_2 DPYD-AS2-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000095695.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	30408759	30408919	.	-	.	gene_id lnc-AC090616.2.1-1 ; transcript_id lnc-AC090616.2.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000265652.1 ; gene_alias_2 RP11-640N20.7 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000179559.1 ; transcript_alias_1 ENST00000583679.1 ; transcript_alias_2 RP11-640N20.7-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000447089.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	30408944	30409016	.	-	.	gene_id lnc-AC090616.2.1-1 ; transcript_id lnc-AC090616.2.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000265652.1 ; gene_alias_2 RP11-640N20.7 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000179559.1 ; transcript_alias_1 ENST00000583679.1 ; transcript_alias_2 RP11-640N20.7-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000447089.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	75761107	75761244	.	+	.	gene_id lnc-FOS-2 ; transcript_id lnc-FOS-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000259687.1 ; gene_alias_2 RP11-293M10.5 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000171867.1 ; transcript_alias_1 ENST00000561000.1 ; transcript_alias_2 RP11-293M10.5-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000415497.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	75762823	75762843	.	+	.	gene_id lnc-FOS-2 ; transcript_id lnc-FOS-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000259687.1 ; gene_alias_2 RP11-293M10.5 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000171867.1 ; transcript_alias_1 ENST00000561000.1 ; transcript_alias_2 RP11-293M10.5-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000415497.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	140927043	140927138	.	+	.	gene_id lnc-C8orf17-1 ; transcript_id lnc-C8orf17-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000253574.1 ; gene_alias_2 RP11-284H18.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000164204.1 ; transcript_alias_1 ENST00000521883.1 ; transcript_alias_2 RP11-284H18.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000377785.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	140928642	140928864	.	+	.	gene_id lnc-C8orf17-1 ; transcript_id lnc-C8orf17-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000253574.1 ; gene_alias_2 RP11-284H18.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000164204.1 ; transcript_alias_1 ENST00000521883.1 ; transcript_alias_2 RP11-284H18.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000377785.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	222988417	222988513	.	+	.	gene_id lnc-DISP1-1 ; transcript_id lnc-DISP1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000228106.1 ; gene_alias_2 RP11-452F19.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000037767.3 ; transcript_alias_1 ENST00000448808.1 ; transcript_alias_2 RP11-452F19.3-012 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000100398.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	223000621	223000653	.	+	.	gene_id lnc-DISP1-1 ; transcript_id lnc-DISP1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000228106.1 ; gene_alias_2 RP11-452F19.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000037767.3 ; transcript_alias_1 ENST00000448808.1 ; transcript_alias_2 RP11-452F19.3-012 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000100398.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	122288457	122288583	.	+	.	gene_id lnc-TSN-3 ; transcript_id lnc-TSN-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000264229.1 ; gene_alias_2 RNU4ATAC ; gene_alias_3 OTTHUMG00000179706.1 ; transcript_alias_1 ENST00000580972.1 ; transcript_alias_2 RNU4ATAC-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000447742.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	81811235	81811249	.	-	.	gene_id lnc-FAM181B-2 ; transcript_id lnc-FAM181B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245832 ; gene_alias_2 RP11-179A16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245832.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166867.1 ; transcript_alias_1 ENST00000532217 ; transcript_alias_2 ENST00000532217.1 ; transcript_alias_3 RP11-179A16.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391623.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	82067554	82067670	.	-	.	gene_id lnc-FAM181B-2 ; transcript_id lnc-FAM181B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245832 ; gene_alias_2 RP11-179A16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245832.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166867.1 ; transcript_alias_1 ENST00000532217 ; transcript_alias_2 ENST00000532217.1 ; transcript_alias_3 RP11-179A16.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391623.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	82384134	82384229	.	-	.	gene_id lnc-FAM181B-2 ; transcript_id lnc-FAM181B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245832 ; gene_alias_2 RP11-179A16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245832.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166867.1 ; transcript_alias_1 ENST00000532217 ; transcript_alias_2 ENST00000532217.1 ; transcript_alias_3 RP11-179A16.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391623.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	82424111	82424160	.	-	.	gene_id lnc-FAM181B-2 ; transcript_id lnc-FAM181B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245832 ; gene_alias_2 RP11-179A16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245832.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166867.1 ; transcript_alias_1 ENST00000532217 ; transcript_alias_2 ENST00000532217.1 ; transcript_alias_3 RP11-179A16.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391623.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	82428831	82429124	.	-	.	gene_id lnc-FAM181B-2 ; transcript_id lnc-FAM181B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245832 ; gene_alias_2 RP11-179A16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245832.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166867.1 ; transcript_alias_1 ENST00000532217 ; transcript_alias_2 ENST00000532217.1 ; transcript_alias_3 RP11-179A16.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391623.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	43157495	43158174	.	+	.	gene_id lnc-MRPL32-1 ; transcript_id lnc-MRPL32-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000181211.1 ; gene_alias_2 HECW1-IT1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000155204.1 ; transcript_alias_1 ENST00000322220.1 ; transcript_alias_2 HECW1-IT1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000338770.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	43158546	43158794	.	+	.	gene_id lnc-MRPL32-1 ; transcript_id lnc-MRPL32-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000181211.1 ; gene_alias_2 HECW1-IT1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000155204.1 ; transcript_alias_1 ENST00000322220.1 ; transcript_alias_2 HECW1-IT1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000338770.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	43161402	43161618	.	+	.	gene_id lnc-MRPL32-1 ; transcript_id lnc-MRPL32-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000181211.1 ; gene_alias_2 HECW1-IT1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000155204.1 ; transcript_alias_1 ENST00000322220.1 ; transcript_alias_2 HECW1-IT1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000338770.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	43187047	43187184	.	+	.	gene_id lnc-MRPL32-1 ; transcript_id lnc-MRPL32-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000181211.1 ; gene_alias_2 HECW1-IT1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000155204.1 ; transcript_alias_1 ENST00000322220.1 ; transcript_alias_2 HECW1-IT1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000338770.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	43188240	43188426	.	+	.	gene_id lnc-MRPL32-1 ; transcript_id lnc-MRPL32-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000181211.1 ; gene_alias_2 HECW1-IT1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000155204.1 ; transcript_alias_1 ENST00000322220.1 ; transcript_alias_2 HECW1-IT1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000338770.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	43201209	43201314	.	+	.	gene_id lnc-MRPL32-1 ; transcript_id lnc-MRPL32-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000181211.1 ; gene_alias_2 HECW1-IT1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000155204.1 ; transcript_alias_1 ENST00000322220.1 ; transcript_alias_2 HECW1-IT1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000338770.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	43202525	43202786	.	+	.	gene_id lnc-MRPL32-1 ; transcript_id lnc-MRPL32-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000181211.1 ; gene_alias_2 HECW1-IT1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000155204.1 ; transcript_alias_1 ENST00000322220.1 ; transcript_alias_2 HECW1-IT1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000338770.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	99872798	99873774	.	+	.	gene_id lnc-PRDM13-2 ; transcript_id lnc-PRDM13-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228506.1 ; gene_alias_2 RP11-98I9.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000015263.1 ; transcript_alias_1 ENST00000418945.1 ; transcript_alias_2 RP11-98I9.4-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000041601.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	99878589	99879249	.	+	.	gene_id lnc-PRDM13-2 ; transcript_id lnc-PRDM13-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228506.1 ; gene_alias_2 RP11-98I9.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000015263.1 ; transcript_alias_1 ENST00000418945.1 ; transcript_alias_2 RP11-98I9.4-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000041601.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	1801477	1801616	.	+	.	gene_id lnc-RPS4Y1-4 ; transcript_id lnc-RPS4Y1-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_008272 ; gene_alias_2 linc-CD99-8 ; gene_alias_3 ENSGR0000223511.1 ; gene_alias_4 RP13-297E16.4 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000021062.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017601 ; transcript_alias_2 ENSTR0000427886.1 ; transcript_alias_3 RP13-297E16.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000055605.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	1802843	1803089	.	+	.	gene_id lnc-RPS4Y1-4 ; transcript_id lnc-RPS4Y1-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_008272 ; gene_alias_2 linc-CD99-8 ; gene_alias_3 ENSGR0000223511.1 ; gene_alias_4 RP13-297E16.4 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000021062.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017601 ; transcript_alias_2 ENSTR0000427886.1 ; transcript_alias_3 RP13-297E16.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000055605.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	1810824	1810881	.	+	.	gene_id lnc-RPS4Y1-4 ; transcript_id lnc-RPS4Y1-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_008272 ; gene_alias_2 linc-CD99-8 ; gene_alias_3 ENSGR0000223511.1 ; gene_alias_4 RP13-297E16.4 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000021062.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017601 ; transcript_alias_2 ENSTR0000427886.1 ; transcript_alias_3 RP13-297E16.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000055605.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	69174213	69174523	.	-	.	gene_id lnc-FOXD4L6-1 ; transcript_id lnc-FOXD4L6-1:9 ; gene_alias_1 XLOC_007714 ; gene_alias_2 linc-FAM75A7-8 ; gene_alias_3 ENSG00000240907.1 ; gene_alias_4 BX255923.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000066918.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015826 ; transcript_alias_2 ENST00000423390.1 ; transcript_alias_3 BX255923.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000143430.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	69175692	69175760	.	-	.	gene_id lnc-FOXD4L6-1 ; transcript_id lnc-FOXD4L6-1:9 ; gene_alias_1 XLOC_007714 ; gene_alias_2 linc-FAM75A7-8 ; gene_alias_3 ENSG00000240907.1 ; gene_alias_4 BX255923.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000066918.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015826 ; transcript_alias_2 ENST00000423390.1 ; transcript_alias_3 BX255923.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000143430.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	69175960	69178388	.	-	.	gene_id lnc-FOXD4L6-1 ; transcript_id lnc-FOXD4L6-1:9 ; gene_alias_1 XLOC_007714 ; gene_alias_2 linc-FAM75A7-8 ; gene_alias_3 ENSG00000240907.1 ; gene_alias_4 BX255923.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000066918.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015826 ; transcript_alias_2 ENST00000423390.1 ; transcript_alias_3 BX255923.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000143430.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	69179394	69179458	.	-	.	gene_id lnc-FOXD4L6-1 ; transcript_id lnc-FOXD4L6-1:9 ; gene_alias_1 XLOC_007714 ; gene_alias_2 linc-FAM75A7-8 ; gene_alias_3 ENSG00000240907.1 ; gene_alias_4 BX255923.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000066918.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015826 ; transcript_alias_2 ENST00000423390.1 ; transcript_alias_3 BX255923.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000143430.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	562757	563203	.	-	.	gene_id lnc-OR4F16-2 ; transcript_id lnc-OR4F16-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223659 ; gene_alias_2 RP5-857K21.5 ; gene_alias_3 ENSG00000223659.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002332.1 ; transcript_alias_1 ENST00000452176 ; transcript_alias_2 ENST00000452176.1 ; transcript_alias_3 RP5-857K21.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000006714.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	563341	563603	.	-	.	gene_id lnc-OR4F16-2 ; transcript_id lnc-OR4F16-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223659 ; gene_alias_2 RP5-857K21.5 ; gene_alias_3 ENSG00000223659.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002332.1 ; transcript_alias_1 ENST00000452176 ; transcript_alias_2 ENST00000452176.1 ; transcript_alias_3 RP5-857K21.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000006714.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	564299	564390	.	-	.	gene_id lnc-OR4F16-2 ; transcript_id lnc-OR4F16-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223659 ; gene_alias_2 RP5-857K21.5 ; gene_alias_3 ENSG00000223659.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002332.1 ; transcript_alias_1 ENST00000452176 ; transcript_alias_2 ENST00000452176.1 ; transcript_alias_3 RP5-857K21.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000006714.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	155135	155395	.	+	.	gene_id lnc-AL035696.1-5 ; transcript_id lnc-AL035696.1-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_005116 ; gene_alias_2 linc-DUSP22-4 ; gene_alias_3 ENSG00000234823 ; gene_alias_4 RP3-416J7.3 ; gene_alias_5 ENSG00000234823.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000014111.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00011249 ; transcript_alias_2 ENST00000458006 ; transcript_alias_3 ENST00000458006.1 ; transcript_alias_4 RP3-416J7.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000039619.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	156119	156514	.	+	.	gene_id lnc-AL035696.1-5 ; transcript_id lnc-AL035696.1-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_005116 ; gene_alias_2 linc-DUSP22-4 ; gene_alias_3 ENSG00000234823 ; gene_alias_4 RP3-416J7.3 ; gene_alias_5 ENSG00000234823.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000014111.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00011249 ; transcript_alias_2 ENST00000458006 ; transcript_alias_3 ENST00000458006.1 ; transcript_alias_4 RP3-416J7.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000039619.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	156546	156639	.	+	.	gene_id lnc-AL035696.1-5 ; transcript_id lnc-AL035696.1-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_005116 ; gene_alias_2 linc-DUSP22-4 ; gene_alias_3 ENSG00000234823 ; gene_alias_4 RP3-416J7.3 ; gene_alias_5 ENSG00000234823.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000014111.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00011249 ; transcript_alias_2 ENST00000458006 ; transcript_alias_3 ENST00000458006.1 ; transcript_alias_4 RP3-416J7.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000039619.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	1853010	1853089	.	+	.	gene_id lnc-ASMT-3 ; transcript_id lnc-ASMT-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000223511 ; gene_alias_2 RP13-297E16.4 ; gene_alias_3 ENSG00000223511.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021062.2 ; transcript_alias_1 ENST00000432272 ; transcript_alias_2 ENST00000432272.1 ; transcript_alias_3 RP13-297E16.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000055606.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	1874577	1874878	.	+	.	gene_id lnc-ASMT-3 ; transcript_id lnc-ASMT-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000223511 ; gene_alias_2 RP13-297E16.4 ; gene_alias_3 ENSG00000223511.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021062.2 ; transcript_alias_1 ENST00000432272 ; transcript_alias_2 ENST00000432272.1 ; transcript_alias_3 RP13-297E16.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000055606.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	19292907	19293290	.	-	.	gene_id lnc-TUBA3C-3 ; transcript_id lnc-TUBA3C-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_010520 ; gene_alias_2 linc-RASA3-7 ; gene_alias_3 ENSG00000236169 ; gene_alias_4 RP11-38M15.3 ; gene_alias_5 ENSG00000236169.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000016461.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00021607 ; transcript_alias_2 ENST00000444605 ; transcript_alias_3 ENST00000444605.1 ; transcript_alias_4 RP11-38M15.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000043984.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	19293824	19293869	.	-	.	gene_id lnc-TUBA3C-3 ; transcript_id lnc-TUBA3C-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_010520 ; gene_alias_2 linc-RASA3-7 ; gene_alias_3 ENSG00000236169 ; gene_alias_4 RP11-38M15.3 ; gene_alias_5 ENSG00000236169.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000016461.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00021607 ; transcript_alias_2 ENST00000444605 ; transcript_alias_3 ENST00000444605.1 ; transcript_alias_4 RP11-38M15.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000043984.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	118349552	118349639	.	+	.	gene_id lnc-NDST3-4 ; transcript_id lnc-NDST3-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236922 ; gene_alias_2 AC092661.1 ; gene_alias_3 ENSG00000236922.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000059450.3 ; transcript_alias_1 ENST00000422145 ; transcript_alias_2 ENST00000422145.2 ; transcript_alias_3 AC092661.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000291362.2 ;
chr4	lncipedia.org	exon	118349853	118349923	.	+	.	gene_id lnc-NDST3-4 ; transcript_id lnc-NDST3-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236922 ; gene_alias_2 AC092661.1 ; gene_alias_3 ENSG00000236922.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000059450.3 ; transcript_alias_1 ENST00000422145 ; transcript_alias_2 ENST00000422145.2 ; transcript_alias_3 AC092661.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000291362.2 ;
chr4	lncipedia.org	exon	118575962	118576065	.	+	.	gene_id lnc-NDST3-4 ; transcript_id lnc-NDST3-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236922 ; gene_alias_2 AC092661.1 ; gene_alias_3 ENSG00000236922.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000059450.3 ; transcript_alias_1 ENST00000422145 ; transcript_alias_2 ENST00000422145.2 ; transcript_alias_3 AC092661.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000291362.2 ;
chr4	lncipedia.org	exon	118610091	118612180	.	+	.	gene_id lnc-NDST3-4 ; transcript_id lnc-NDST3-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236922 ; gene_alias_2 AC092661.1 ; gene_alias_3 ENSG00000236922.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000059450.3 ; transcript_alias_1 ENST00000422145 ; transcript_alias_2 ENST00000422145.2 ; transcript_alias_3 AC092661.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000291362.2 ;
chr12	lncipedia.org	exon	50222326	50222527	.	+	.	gene_id lnc-TMBIM6-1 ; transcript_id lnc-TMBIM6-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245407 ; transcript_alias_1 ENST00000500755 ;
chr12	lncipedia.org	exon	50222718	50222866	.	+	.	gene_id lnc-TMBIM6-1 ; transcript_id lnc-TMBIM6-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245407 ; transcript_alias_1 ENST00000500755 ;
chr12	lncipedia.org	exon	50232205	50232423	.	+	.	gene_id lnc-TMBIM6-1 ; transcript_id lnc-TMBIM6-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245407 ; transcript_alias_1 ENST00000500755 ;
chr12	lncipedia.org	exon	50233910	50234936	.	+	.	gene_id lnc-TMBIM6-1 ; transcript_id lnc-TMBIM6-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245407 ; transcript_alias_1 ENST00000500755 ;
chr5	lncipedia.org	exon	176909864	176912754	.	+	.	gene_id lnc-PRR7-1 ; transcript_id lnc-PRR7-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245859 ; transcript_alias_1 ENST00000499364 ;
chr5	lncipedia.org	exon	176913183	176913252	.	+	.	gene_id lnc-PRR7-1 ; transcript_id lnc-PRR7-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245859 ; transcript_alias_1 ENST00000499364 ;
chr19	lncipedia.org	exon	23237629	23238132	.	-	.	gene_id lnc-ZNF724P-1 ; transcript_id lnc-ZNF724P-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251233 ; transcript_alias_1 ENST00000507983 ;
chr19	lncipedia.org	exon	23238284	23238592	.	-	.	gene_id lnc-ZNF724P-1 ; transcript_id lnc-ZNF724P-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251233 ; transcript_alias_1 ENST00000507983 ;
chr19	lncipedia.org	exon	23239105	23239211	.	-	.	gene_id lnc-ZNF724P-1 ; transcript_id lnc-ZNF724P-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251233 ; transcript_alias_1 ENST00000507983 ;
chr19	lncipedia.org	exon	23239814	23240022	.	-	.	gene_id lnc-ZNF724P-1 ; transcript_id lnc-ZNF724P-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251233 ; transcript_alias_1 ENST00000507983 ;
chr19	lncipedia.org	exon	23241267	23241381	.	-	.	gene_id lnc-ZNF724P-1 ; transcript_id lnc-ZNF724P-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251233 ; transcript_alias_1 ENST00000507983 ;
chr19	lncipedia.org	exon	23242976	23243120	.	-	.	gene_id lnc-ZNF724P-1 ; transcript_id lnc-ZNF724P-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251233 ; transcript_alias_1 ENST00000507983 ;
chr19	lncipedia.org	exon	23243449	23243800	.	-	.	gene_id lnc-ZNF724P-1 ; transcript_id lnc-ZNF724P-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251233 ; transcript_alias_1 ENST00000507983 ;
chr19	lncipedia.org	exon	23243975	23244067	.	-	.	gene_id lnc-ZNF724P-1 ; transcript_id lnc-ZNF724P-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251233 ; transcript_alias_1 ENST00000507983 ;
chr16	lncipedia.org	exon	29938657	29939003	.	+	.	gene_id lnc-ASPHD1-1 ; transcript_id lnc-ASPHD1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247735 ; gene_alias_2 AC120114.3 ; transcript_alias_1 ENST00000450909 ;
chr16	lncipedia.org	exon	29939088	29939252	.	+	.	gene_id lnc-ASPHD1-1 ; transcript_id lnc-ASPHD1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247735 ; gene_alias_2 AC120114.3 ; transcript_alias_1 ENST00000450909 ;
chr16	lncipedia.org	exon	29939589	29939994	.	+	.	gene_id lnc-ASPHD1-1 ; transcript_id lnc-ASPHD1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247735 ; gene_alias_2 AC120114.3 ; transcript_alias_1 ENST00000450909 ;
chr16	lncipedia.org	exon	29940462	29940791	.	+	.	gene_id lnc-ASPHD1-1 ; transcript_id lnc-ASPHD1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247735 ; gene_alias_2 AC120114.3 ; transcript_alias_1 ENST00000450909 ;
chr16	lncipedia.org	exon	10556543	10558778	.	-	.	gene_id lnc-EMP2-2 ; transcript_id lnc-EMP2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249560 ; transcript_alias_1 ENST00000515579 ;
chr16	lncipedia.org	exon	10559495	10559801	.	-	.	gene_id lnc-EMP2-2 ; transcript_id lnc-EMP2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249560 ; transcript_alias_1 ENST00000515579 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45632292	45632803	.	-	.	gene_id lnc-NKPD1-1 ; transcript_id lnc-NKPD1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250044 ; gene_alias_2 AC011489.1 ; transcript_alias_1 ENST00000507442 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45636076	45638227	.	-	.	gene_id lnc-NKPD1-1 ; transcript_id lnc-NKPD1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250044 ; gene_alias_2 AC011489.1 ; transcript_alias_1 ENST00000507442 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45639307	45641075	.	-	.	gene_id lnc-NKPD1-1 ; transcript_id lnc-NKPD1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250044 ; gene_alias_2 AC011489.1 ; transcript_alias_1 ENST00000507442 ;
chr4	lncipedia.org	exon	103698194	103698380	.	+	.	gene_id lnc-CISD2-2 ; transcript_id lnc-CISD2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250009 ; gene_alias_2 AC018797.1 ; transcript_alias_1 ENST00000509494 ;
chr4	lncipedia.org	exon	103699054	103699578	.	+	.	gene_id lnc-CISD2-2 ; transcript_id lnc-CISD2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250009 ; gene_alias_2 AC018797.1 ; transcript_alias_1 ENST00000509494 ;
chr4	lncipedia.org	exon	103699965	103700502	.	+	.	gene_id lnc-CISD2-2 ; transcript_id lnc-CISD2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250009 ; gene_alias_2 AC018797.1 ; transcript_alias_1 ENST00000509494 ;
chr4	lncipedia.org	exon	103700931	103701038	.	+	.	gene_id lnc-CISD2-2 ; transcript_id lnc-CISD2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250009 ; gene_alias_2 AC018797.1 ; transcript_alias_1 ENST00000509494 ;
chr4	lncipedia.org	exon	103720585	103720732	.	+	.	gene_id lnc-CISD2-2 ; transcript_id lnc-CISD2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250009 ; gene_alias_2 AC018797.1 ; transcript_alias_1 ENST00000509494 ;
chr7	lncipedia.org	exon	75636113	75636127	.	-	.	gene_id lnc-STYXL1-1 ; transcript_id lnc-STYXL1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248661 ; transcript_alias_1 ENST00000514862 ;
chr7	lncipedia.org	exon	75783896	75783925	.	-	.	gene_id lnc-STYXL1-1 ; transcript_id lnc-STYXL1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248661 ; transcript_alias_1 ENST00000514862 ;
chr7	lncipedia.org	exon	75907057	75908576	.	-	.	gene_id lnc-STYXL1-1 ; transcript_id lnc-STYXL1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248661 ; transcript_alias_1 ENST00000514862 ;
chr2	lncipedia.org	exon	128317620	128319553	.	-	.	gene_id lnc-IWS1-1 ; transcript_id lnc-IWS1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250457 ; gene_alias_2 AC010976.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502946 ;
chr2	lncipedia.org	exon	128322263	128322364	.	-	.	gene_id lnc-IWS1-1 ; transcript_id lnc-IWS1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250457 ; gene_alias_2 AC010976.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502946 ;
chr10	lncipedia.org	exon	15211104	15213418	.	+	.	gene_id lnc-RPP38-2 ; transcript_id lnc-RPP38-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248743 ; gene_alias_2 AL590365.1 ; transcript_alias_1 ENST00000512032 ;
chr10	lncipedia.org	exon	15221268	15221737	.	+	.	gene_id lnc-RPP38-2 ; transcript_id lnc-RPP38-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248743 ; gene_alias_2 AL590365.1 ; transcript_alias_1 ENST00000512032 ;
chr19	lncipedia.org	exon	48758932	48759051	.	+	.	gene_id lnc-ZNF114-1 ; transcript_id lnc-ZNF114-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247217 ; gene_alias_2 AC008392.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499475 ;
chr19	lncipedia.org	exon	48759608	48761452	.	+	.	gene_id lnc-ZNF114-1 ; transcript_id lnc-ZNF114-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247217 ; gene_alias_2 AC008392.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499475 ;
chr9	lncipedia.org	exon	139155771	139156100	.	+	.	gene_id lnc-CR392000.1-1 ; transcript_id lnc-CR392000.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246129 ; gene_alias_2 XLOC_007612 ; gene_alias_3 linc-GPSM1 ; gene_alias_4 CR392000.2 ; transcript_alias_1 ENST00000498977 ; transcript_alias_2 TCONS_00015778 ;
chr9	lncipedia.org	exon	139157420	139159083	.	+	.	gene_id lnc-CR392000.1-1 ; transcript_id lnc-CR392000.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246129 ; gene_alias_2 XLOC_007612 ; gene_alias_3 linc-GPSM1 ; gene_alias_4 CR392000.2 ; transcript_alias_1 ENST00000498977 ; transcript_alias_2 TCONS_00015778 ;
chr1	lncipedia.org	exon	165614898	165617127	.	-	.	gene_id lnc-ALDH9A1-1 ; transcript_id lnc-ALDH9A1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250899 ; transcript_alias_1 ENST00000513358 ;
chr1	lncipedia.org	exon	165617682	165617895	.	-	.	gene_id lnc-ALDH9A1-1 ; transcript_id lnc-ALDH9A1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250899 ; transcript_alias_1 ENST00000513358 ;
chr19	lncipedia.org	exon	9732181	9732321	.	+	.	gene_id lnc-UBL5-2 ; transcript_id lnc-UBL5-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245884 ; gene_alias_2 AC008759.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501797 ;
chr19	lncipedia.org	exon	9742904	9743093	.	+	.	gene_id lnc-UBL5-2 ; transcript_id lnc-UBL5-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245884 ; gene_alias_2 AC008759.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501797 ;
chr19	lncipedia.org	exon	9744136	9745397	.	+	.	gene_id lnc-UBL5-2 ; transcript_id lnc-UBL5-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245884 ; gene_alias_2 AC008759.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501797 ;
chr9	lncipedia.org	exon	140118567	140118695	.	-	.	gene_id lnc-RNF208-1 ; transcript_id lnc-RNF208-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244769 ; gene_alias_2 BX255925.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501337 ;
chr9	lncipedia.org	exon	140119488	140122265	.	-	.	gene_id lnc-RNF208-1 ; transcript_id lnc-RNF208-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244769 ; gene_alias_2 BX255925.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501337 ;
chr15	lncipedia.org	exon	59211128	59211697	.	-	.	gene_id lnc-SLTM-2 ; transcript_id lnc-SLTM-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247934 ; transcript_alias_1 ENST00000433570 ;
chr15	lncipedia.org	exon	59219077	59219556	.	-	.	gene_id lnc-SLTM-2 ; transcript_id lnc-SLTM-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247934 ; transcript_alias_1 ENST00000433570 ;
chr15	lncipedia.org	exon	59256079	59256149	.	-	.	gene_id lnc-SLTM-2 ; transcript_id lnc-SLTM-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247934 ; transcript_alias_1 ENST00000433570 ;
chr15	lncipedia.org	exon	59285612	59285655	.	-	.	gene_id lnc-SLTM-2 ; transcript_id lnc-SLTM-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247934 ; transcript_alias_1 ENST00000433570 ;
chr15	lncipedia.org	exon	59363416	59363513	.	-	.	gene_id lnc-SLTM-2 ; transcript_id lnc-SLTM-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247934 ; transcript_alias_1 ENST00000433570 ;
chr15	lncipedia.org	exon	59394165	59394178	.	-	.	gene_id lnc-SLTM-2 ; transcript_id lnc-SLTM-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247934 ; transcript_alias_1 ENST00000433570 ;
chr12	lncipedia.org	exon	133609245	133609890	.	-	.	gene_id lnc-ZNF605-1 ; transcript_id lnc-ZNF605-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246394 ; transcript_alias_1 ENST00000443154 ;
chr12	lncipedia.org	exon	133609249	133609890	.	-	.	gene_id lnc-ZNF605-1 ; transcript_id lnc-ZNF605-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246394 ; transcript_alias_1 ENST00000443154 ;
chr12	lncipedia.org	exon	133610639	133610689	.	-	.	gene_id lnc-ZNF605-1 ; transcript_id lnc-ZNF605-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246394 ; transcript_alias_1 ENST00000443154 ;
chr12	lncipedia.org	exon	133613355	133613808	.	-	.	gene_id lnc-ZNF605-1 ; transcript_id lnc-ZNF605-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246394 ; transcript_alias_1 ENST00000443154 ;
chr7	lncipedia.org	exon	64600749	64601405	.	-	.	gene_id lnc-GUSB-5 ; transcript_id lnc-GUSB-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248460 ; transcript_alias_1 ENST00000509603 ;
chr7	lncipedia.org	exon	64712675	64712708	.	-	.	gene_id lnc-GUSB-5 ; transcript_id lnc-GUSB-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248460 ; transcript_alias_1 ENST00000509603 ;
chr7	lncipedia.org	exon	65112575	65112954	.	-	.	gene_id lnc-GUSB-5 ; transcript_id lnc-GUSB-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248460 ; transcript_alias_1 ENST00000509603 ;
chr7	lncipedia.org	exon	65113248	65113333	.	-	.	gene_id lnc-GUSB-5 ; transcript_id lnc-GUSB-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248460 ; transcript_alias_1 ENST00000509603 ;
chr7	lncipedia.org	exon	65113758	65113894	.	-	.	gene_id lnc-GUSB-5 ; transcript_id lnc-GUSB-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248460 ; transcript_alias_1 ENST00000509603 ;
chr7	lncipedia.org	exon	65114330	65114462	.	-	.	gene_id lnc-GUSB-5 ; transcript_id lnc-GUSB-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248460 ; transcript_alias_1 ENST00000509603 ;
chr7	lncipedia.org	exon	65136099	65136187	.	-	.	gene_id lnc-GUSB-5 ; transcript_id lnc-GUSB-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248460 ; transcript_alias_1 ENST00000509603 ;
chr7	lncipedia.org	exon	65192028	65192081	.	-	.	gene_id lnc-GUSB-5 ; transcript_id lnc-GUSB-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248460 ; transcript_alias_1 ENST00000509603 ;
chr7	lncipedia.org	exon	65227918	65228004	.	-	.	gene_id lnc-GUSB-5 ; transcript_id lnc-GUSB-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248460 ; transcript_alias_1 ENST00000509603 ;
chr7	lncipedia.org	exon	65235454	65235797	.	-	.	gene_id lnc-GUSB-5 ; transcript_id lnc-GUSB-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248460 ; transcript_alias_1 ENST00000509603 ;
chr1	lncipedia.org	exon	160743317	160745088	.	+	.	gene_id lnc-SLAMF7-1 ; transcript_id lnc-SLAMF7-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250225 ; transcript_alias_1 ENST00000503092 ;
chr1	lncipedia.org	exon	160745416	160746080	.	+	.	gene_id lnc-SLAMF7-1 ; transcript_id lnc-SLAMF7-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250225 ; transcript_alias_1 ENST00000503092 ;
chr16	lncipedia.org	exon	75507023	75507828	.	+	.	gene_id lnc-GABARAPL2-1 ; transcript_id lnc-GABARAPL2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000203472 ; gene_alias_2 AC009163.1 ; transcript_alias_1 ENST00000530512 ;
chr16	lncipedia.org	exon	75508963	75510218	.	+	.	gene_id lnc-GABARAPL2-1 ; transcript_id lnc-GABARAPL2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000203472 ; gene_alias_2 AC009163.1 ; transcript_alias_1 ENST00000530512 ;
chr16	lncipedia.org	exon	75529158	75529305	.	+	.	gene_id lnc-GABARAPL2-1 ; transcript_id lnc-GABARAPL2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000203472 ; gene_alias_2 AC009163.1 ; transcript_alias_1 ENST00000530512 ;
chr18	lncipedia.org	exon	3603736	3604213	.	+	.	gene_id lnc-AP002478.1-1 ; transcript_id lnc-AP002478.1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000238060 ; gene_alias_2 AP002478.2 ; transcript_alias_1 ENST00000445581 ;
chr18	lncipedia.org	exon	3606552	3608312	.	+	.	gene_id lnc-AP002478.1-1 ; transcript_id lnc-AP002478.1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000238060 ; gene_alias_2 AP002478.2 ; transcript_alias_1 ENST00000445581 ;
chr6	lncipedia.org	exon	33646893	33648500	.	-	.	gene_id lnc-C6orf125-1 ; transcript_id lnc-C6orf125-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248398 ; transcript_alias_1 ENST00000511225 ;
chr6	lncipedia.org	exon	33650151	33652467	.	-	.	gene_id lnc-C6orf125-1 ; transcript_id lnc-C6orf125-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248398 ; transcript_alias_1 ENST00000511225 ;
chr19	lncipedia.org	exon	56979088	56980304	.	-	.	gene_id lnc-ZNF582-2 ; transcript_id lnc-ZNF582-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250660 ; transcript_alias_1 ENST00000504904 ;
chr19	lncipedia.org	exon	56983068	56983553	.	-	.	gene_id lnc-ZNF582-2 ; transcript_id lnc-ZNF582-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250660 ; transcript_alias_1 ENST00000504904 ;
chr19	lncipedia.org	exon	56985381	56987270	.	-	.	gene_id lnc-ZNF582-2 ; transcript_id lnc-ZNF582-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250660 ; transcript_alias_1 ENST00000504904 ;
chr13	lncipedia.org	exon	24765539	24765926	.	+	.	gene_id lnc-C1QTNF9-3 ; transcript_id lnc-C1QTNF9-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249940 ; transcript_alias_1 ENST00000511001 ;
chr13	lncipedia.org	exon	24767255	24768436	.	+	.	gene_id lnc-C1QTNF9-3 ; transcript_id lnc-C1QTNF9-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249940 ; transcript_alias_1 ENST00000511001 ;
chr10	lncipedia.org	exon	50532231	50532343	.	-	.	gene_id lnc-DRGX-1 ; transcript_id lnc-DRGX-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248534 ; transcript_alias_1 ENST00000399384 ;
chr10	lncipedia.org	exon	50532491	50533705	.	-	.	gene_id lnc-DRGX-1 ; transcript_id lnc-DRGX-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248534 ; transcript_alias_1 ENST00000399384 ;
chr10	lncipedia.org	exon	50534758	50535535	.	-	.	gene_id lnc-DRGX-1 ; transcript_id lnc-DRGX-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248534 ; transcript_alias_1 ENST00000399384 ;
chr10	lncipedia.org	exon	104209595	104209779	.	+	.	gene_id lnc-TMEM180-1 ; transcript_id lnc-TMEM180-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245773 ; gene_alias_2 AL121928.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501575 ;
chr10	lncipedia.org	exon	104209944	104210087	.	+	.	gene_id lnc-TMEM180-1 ; transcript_id lnc-TMEM180-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245773 ; gene_alias_2 AL121928.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501575 ;
chr10	lncipedia.org	exon	104215094	104216051	.	+	.	gene_id lnc-TMEM180-1 ; transcript_id lnc-TMEM180-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245773 ; gene_alias_2 AL121928.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501575 ;
chr17	lncipedia.org	exon	45099553	45100857	.	-	.	gene_id lnc-CDC27-1 ; transcript_id lnc-CDC27-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249029 ; transcript_alias_1 ENST00000504741 ;
chr17	lncipedia.org	exon	45281305	45281324	.	-	.	gene_id lnc-CDC27-1 ; transcript_id lnc-CDC27-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249029 ; transcript_alias_1 ENST00000504741 ;
chr6	lncipedia.org	exon	119773712	119776358	.	-	.	gene_id lnc-MAN1A1-1 ; transcript_id lnc-MAN1A1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249211 ; gene_alias_2 XLOC_005819 ; gene_alias_3 linc-MAN1A1 ; transcript_alias_1 ENST00000510677 ; transcript_alias_2 TCONS_00011551 ;
chr6	lncipedia.org	exon	119777275	119777540	.	-	.	gene_id lnc-MAN1A1-1 ; transcript_id lnc-MAN1A1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249211 ; gene_alias_2 XLOC_005819 ; gene_alias_3 linc-MAN1A1 ; transcript_alias_1 ENST00000510677 ; transcript_alias_2 TCONS_00011551 ;
chr6	lncipedia.org	exon	119778083	119778349	.	-	.	gene_id lnc-MAN1A1-1 ; transcript_id lnc-MAN1A1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249211 ; gene_alias_2 XLOC_005819 ; gene_alias_3 linc-MAN1A1 ; transcript_alias_1 ENST00000510677 ; transcript_alias_2 TCONS_00011551 ;
chr6	lncipedia.org	exon	119790762	119790879	.	-	.	gene_id lnc-MAN1A1-1 ; transcript_id lnc-MAN1A1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249211 ; gene_alias_2 XLOC_005819 ; gene_alias_3 linc-MAN1A1 ; transcript_alias_1 ENST00000510677 ; transcript_alias_2 TCONS_00011551 ;
chr20	lncipedia.org	exon	56130115	56132031	.	-	.	gene_id lnc-CTCFL-1 ; transcript_id lnc-CTCFL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251422 ; gene_alias_2 XLOC_013814 ; gene_alias_3 linc-CTCFL-1 ; gene_alias_4 AL035541.1 ; transcript_alias_1 ENST00000503777 ; transcript_alias_2 TCONS_00028072 ;
chr20	lncipedia.org	exon	56133904	56134053	.	-	.	gene_id lnc-CTCFL-1 ; transcript_id lnc-CTCFL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251422 ; gene_alias_2 XLOC_013814 ; gene_alias_3 linc-CTCFL-1 ; gene_alias_4 AL035541.1 ; transcript_alias_1 ENST00000503777 ; transcript_alias_2 TCONS_00028072 ;
chr13	lncipedia.org	exon	112911042	112911184	.	-	.	gene_id lnc-TUBGCP3-4 ; transcript_id lnc-TUBGCP3-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000251004 ; gene_alias_2 XLOC_010732 ; gene_alias_3 linc-ANKRD10-10 ; transcript_alias_1 ENST00000503344 ; transcript_alias_2 TCONS_00021698 ;
chr13	lncipedia.org	exon	112911313	112911492	.	-	.	gene_id lnc-TUBGCP3-4 ; transcript_id lnc-TUBGCP3-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000251004 ; gene_alias_2 XLOC_010732 ; gene_alias_3 linc-ANKRD10-10 ; transcript_alias_1 ENST00000503344 ; transcript_alias_2 TCONS_00021698 ;
chr13	lncipedia.org	exon	112913940	112914128	.	-	.	gene_id lnc-TUBGCP3-4 ; transcript_id lnc-TUBGCP3-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000251004 ; gene_alias_2 XLOC_010732 ; gene_alias_3 linc-ANKRD10-10 ; transcript_alias_1 ENST00000503344 ; transcript_alias_2 TCONS_00021698 ;
chr13	lncipedia.org	exon	112916237	112916339	.	-	.	gene_id lnc-TUBGCP3-4 ; transcript_id lnc-TUBGCP3-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000251004 ; gene_alias_2 XLOC_010732 ; gene_alias_3 linc-ANKRD10-10 ; transcript_alias_1 ENST00000503344 ; transcript_alias_2 TCONS_00021698 ;
chr13	lncipedia.org	exon	112916470	112916630	.	-	.	gene_id lnc-TUBGCP3-4 ; transcript_id lnc-TUBGCP3-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000251004 ; gene_alias_2 XLOC_010732 ; gene_alias_3 linc-ANKRD10-10 ; transcript_alias_1 ENST00000503344 ; transcript_alias_2 TCONS_00021698 ;
chr13	lncipedia.org	exon	112917278	112917500	.	-	.	gene_id lnc-TUBGCP3-4 ; transcript_id lnc-TUBGCP3-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000251004 ; gene_alias_2 XLOC_010732 ; gene_alias_3 linc-ANKRD10-10 ; transcript_alias_1 ENST00000503344 ; transcript_alias_2 TCONS_00021698 ;
chr13	lncipedia.org	exon	112925422	112925496	.	-	.	gene_id lnc-TUBGCP3-4 ; transcript_id lnc-TUBGCP3-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000251004 ; gene_alias_2 XLOC_010732 ; gene_alias_3 linc-ANKRD10-10 ; transcript_alias_1 ENST00000503344 ; transcript_alias_2 TCONS_00021698 ;
chr13	lncipedia.org	exon	112925792	112925903	.	-	.	gene_id lnc-TUBGCP3-4 ; transcript_id lnc-TUBGCP3-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000251004 ; gene_alias_2 XLOC_010732 ; gene_alias_3 linc-ANKRD10-10 ; transcript_alias_1 ENST00000503344 ; transcript_alias_2 TCONS_00021698 ;
chr13	lncipedia.org	exon	112926566	112927314	.	-	.	gene_id lnc-TUBGCP3-4 ; transcript_id lnc-TUBGCP3-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000251004 ; gene_alias_2 XLOC_010732 ; gene_alias_3 linc-ANKRD10-10 ; transcript_alias_1 ENST00000503344 ; transcript_alias_2 TCONS_00021698 ;
chr20	lncipedia.org	exon	278214	278371	.	-	.	gene_id lnc-C20orf96-1 ; transcript_id lnc-C20orf96-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247315 ; transcript_alias_1 ENST00000500893 ;
chr20	lncipedia.org	exon	278867	280961	.	-	.	gene_id lnc-C20orf96-1 ; transcript_id lnc-C20orf96-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247315 ; transcript_alias_1 ENST00000500893 ;
chr3	lncipedia.org	exon	127217322	127218090	.	-	.	gene_id lnc-TPRA1-1 ; transcript_id lnc-TPRA1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_003240 ; gene_alias_2 linc-TXNRD3-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00006648 ;
chr3	lncipedia.org	exon	127218528	127218585	.	-	.	gene_id lnc-TPRA1-1 ; transcript_id lnc-TPRA1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_003240 ; gene_alias_2 linc-TXNRD3-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00006648 ;
chr3	lncipedia.org	exon	127251228	127251286	.	-	.	gene_id lnc-TPRA1-1 ; transcript_id lnc-TPRA1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_003240 ; gene_alias_2 linc-TXNRD3-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00006648 ;
chr3	lncipedia.org	exon	127251642	127251756	.	-	.	gene_id lnc-TPRA1-1 ; transcript_id lnc-TPRA1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_003240 ; gene_alias_2 linc-TXNRD3-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00006648 ;
chr3	lncipedia.org	exon	127252420	127252612	.	-	.	gene_id lnc-TPRA1-1 ; transcript_id lnc-TPRA1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_003240 ; gene_alias_2 linc-TXNRD3-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00006648 ;
chr3	lncipedia.org	exon	127252960	127253249	.	-	.	gene_id lnc-TPRA1-1 ; transcript_id lnc-TPRA1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_003240 ; gene_alias_2 linc-TXNRD3-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00006648 ;
chr3	lncipedia.org	exon	127255327	127257825	.	-	.	gene_id lnc-TPRA1-1 ; transcript_id lnc-TPRA1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_003240 ; gene_alias_2 linc-TXNRD3-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00006648 ;
chr1	lncipedia.org	exon	2481359	2481713	.	-	.	gene_id lnc-HES5-1 ; transcript_id lnc-HES5-1:6 ; gene_alias_1 XLOC_000678 ; gene_alias_2 linc-HES5-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00000075 ;
chr1	lncipedia.org	exon	2482012	2482170	.	-	.	gene_id lnc-HES5-1 ; transcript_id lnc-HES5-1:6 ; gene_alias_1 XLOC_000678 ; gene_alias_2 linc-HES5-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00000075 ;
chr1	lncipedia.org	exon	2482431	2484284	.	-	.	gene_id lnc-HES5-1 ; transcript_id lnc-HES5-1:6 ; gene_alias_1 XLOC_000678 ; gene_alias_2 linc-HES5-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00000075 ;
chr19	lncipedia.org	exon	46560932	46563551	.	-	.	gene_id lnc-IGFL4-1 ; transcript_id lnc-IGFL4-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_013363 ; gene_alias_2 linc-IGFL4 ; transcript_alias_1 TCONS_00026818 ;
chr19	lncipedia.org	exon	46580278	46580887	.	-	.	gene_id lnc-IGFL4-1 ; transcript_id lnc-IGFL4-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_013363 ; gene_alias_2 linc-IGFL4 ; transcript_alias_1 TCONS_00026818 ;
chr22	lncipedia.org	exon	34587063	34591271	.	-	.	gene_id lnc-LARGE-1 ; transcript_id lnc-LARGE-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_014354 ; gene_alias_2 linc-LARGE-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00029685 ;
chr22	lncipedia.org	exon	34605181	34605342	.	-	.	gene_id lnc-LARGE-1 ; transcript_id lnc-LARGE-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_014354 ; gene_alias_2 linc-LARGE-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00029685 ;
chr22	lncipedia.org	exon	34606219	34606437	.	-	.	gene_id lnc-LARGE-1 ; transcript_id lnc-LARGE-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_014354 ; gene_alias_2 linc-LARGE-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00029685 ;
chr12	lncipedia.org	exon	50305736	50305866	.	+	.	gene_id lnc-AQP2-1 ; transcript_id lnc-AQP2-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_009748 ; gene_alias_2 linc-AQP2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00020187 ;
chr12	lncipedia.org	exon	50315709	50317464	.	+	.	gene_id lnc-AQP2-1 ; transcript_id lnc-AQP2-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_009748 ; gene_alias_2 linc-AQP2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00020187 ;
chr12	lncipedia.org	exon	50317565	50318296	.	+	.	gene_id lnc-AQP2-1 ; transcript_id lnc-AQP2-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_009748 ; gene_alias_2 linc-AQP2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00020187 ;
chr12	lncipedia.org	exon	50318719	50318870	.	+	.	gene_id lnc-AQP2-1 ; transcript_id lnc-AQP2-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_009748 ; gene_alias_2 linc-AQP2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00020187 ;
chr12	lncipedia.org	exon	50319045	50319171	.	+	.	gene_id lnc-AQP2-1 ; transcript_id lnc-AQP2-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_009748 ; gene_alias_2 linc-AQP2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00020187 ;
chr12	lncipedia.org	exon	50319864	50320118	.	+	.	gene_id lnc-AQP2-1 ; transcript_id lnc-AQP2-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_009748 ; gene_alias_2 linc-AQP2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00020187 ;
chr20	lncipedia.org	exon	48910099	48910265	.	+	.	gene_id lnc-CEBPB-7 ; transcript_id lnc-CEBPB-7:4 ; gene_alias_1 XLOC_013560 ; gene_alias_2 linc-PTPN1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00028215 ;
chr20	lncipedia.org	exon	48914693	48914950	.	+	.	gene_id lnc-CEBPB-7 ; transcript_id lnc-CEBPB-7:4 ; gene_alias_1 XLOC_013560 ; gene_alias_2 linc-PTPN1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00028215 ;
chr20	lncipedia.org	exon	48928342	48928967	.	+	.	gene_id lnc-CEBPB-7 ; transcript_id lnc-CEBPB-7:4 ; gene_alias_1 XLOC_013560 ; gene_alias_2 linc-PTPN1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00028215 ;
chr20	lncipedia.org	exon	48929837	48931457	.	+	.	gene_id lnc-CEBPB-7 ; transcript_id lnc-CEBPB-7:4 ; gene_alias_1 XLOC_013560 ; gene_alias_2 linc-PTPN1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00028215 ;
chr1	lncipedia.org	exon	106144776	106146180	.	-	.	gene_id lnc-AMY1B-3 ; transcript_id lnc-AMY1B-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_000948 ; gene_alias_2 linc-AMY1A-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00000093 ;
chr1	lncipedia.org	exon	106146785	106146887	.	-	.	gene_id lnc-AMY1B-3 ; transcript_id lnc-AMY1B-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_000948 ; gene_alias_2 linc-AMY1A-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00000093 ;
chr1	lncipedia.org	exon	106148557	106148711	.	-	.	gene_id lnc-AMY1B-3 ; transcript_id lnc-AMY1B-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_000948 ; gene_alias_2 linc-AMY1A-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00000093 ;
chr1	lncipedia.org	exon	106161397	106161557	.	-	.	gene_id lnc-AMY1B-3 ; transcript_id lnc-AMY1B-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_000948 ; gene_alias_2 linc-AMY1A-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00000093 ;
chr9	lncipedia.org	exon	33730335	33730477	.	+	.	gene_id lnc-PRSS3-1 ; transcript_id lnc-PRSS3-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_007326 ; gene_alias_2 linc-PRSS3-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00016565 ;
chr9	lncipedia.org	exon	33731149	33731298	.	+	.	gene_id lnc-PRSS3-1 ; transcript_id lnc-PRSS3-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_007326 ; gene_alias_2 linc-PRSS3-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00016565 ;
chr9	lncipedia.org	exon	33731762	33731892	.	+	.	gene_id lnc-PRSS3-1 ; transcript_id lnc-PRSS3-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_007326 ; gene_alias_2 linc-PRSS3-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00016565 ;
chr9	lncipedia.org	exon	33733126	33733252	.	+	.	gene_id lnc-PRSS3-1 ; transcript_id lnc-PRSS3-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_007326 ; gene_alias_2 linc-PRSS3-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00016565 ;
chr9	lncipedia.org	exon	33748511	33749410	.	+	.	gene_id lnc-PRSS3-1 ; transcript_id lnc-PRSS3-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_007326 ; gene_alias_2 linc-PRSS3-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00016565 ;
chr2	lncipedia.org	exon	4675808	4677980	.	-	.	gene_id lnc-RNASEH1-6 ; transcript_id lnc-RNASEH1-6:1 ; gene_alias_1 XLOC_001956 ; gene_alias_2 linc-RNASEH1-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00002658 ;
chr2	lncipedia.org	exon	4682484	4682649	.	-	.	gene_id lnc-RNASEH1-6 ; transcript_id lnc-RNASEH1-6:1 ; gene_alias_1 XLOC_001956 ; gene_alias_2 linc-RNASEH1-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00002658 ;
chr2	lncipedia.org	exon	4698903	4699119	.	-	.	gene_id lnc-RNASEH1-6 ; transcript_id lnc-RNASEH1-6:1 ; gene_alias_1 XLOC_001956 ; gene_alias_2 linc-RNASEH1-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00002658 ;
chr2	lncipedia.org	exon	4700103	4700163	.	-	.	gene_id lnc-RNASEH1-6 ; transcript_id lnc-RNASEH1-6:1 ; gene_alias_1 XLOC_001956 ; gene_alias_2 linc-RNASEH1-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00002658 ;
chr2	lncipedia.org	exon	4703756	4703812	.	-	.	gene_id lnc-RNASEH1-6 ; transcript_id lnc-RNASEH1-6:1 ; gene_alias_1 XLOC_001956 ; gene_alias_2 linc-RNASEH1-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00002658 ;
chrX	lncipedia.org	exon	390760	391224	.	+	.	gene_id lnc-PLCXD1-3 ; transcript_id lnc-PLCXD1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_007909 ; gene_alias_2 linc-SHOX-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017111 ;
chrX	lncipedia.org	exon	394732	394829	.	+	.	gene_id lnc-PLCXD1-3 ; transcript_id lnc-PLCXD1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_007909 ; gene_alias_2 linc-SHOX-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017111 ;
chrX	lncipedia.org	exon	396312	396426	.	+	.	gene_id lnc-PLCXD1-3 ; transcript_id lnc-PLCXD1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_007909 ; gene_alias_2 linc-SHOX-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017111 ;
chrX	lncipedia.org	exon	398339	398431	.	+	.	gene_id lnc-PLCXD1-3 ; transcript_id lnc-PLCXD1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_007909 ; gene_alias_2 linc-SHOX-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017111 ;
chr1	lncipedia.org	exon	223564509	223564656	.	-	.	gene_id lnc-SUSD4-1 ; transcript_id lnc-SUSD4-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_001220 ; gene_alias_2 linc-SUSD4 ; transcript_alias_1 TCONS_00001834 ;
chr1	lncipedia.org	exon	223565002	223566572	.	-	.	gene_id lnc-SUSD4-1 ; transcript_id lnc-SUSD4-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_001220 ; gene_alias_2 linc-SUSD4 ; transcript_alias_1 TCONS_00001834 ;
chr21	lncipedia.org	exon	9517795	9518516	.	-	.	gene_id lnc-TPTE-4 ; transcript_id lnc-TPTE-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_013993 ; gene_alias_2 linc-S100B-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00029067 ;
chr21	lncipedia.org	exon	9540497	9540519	.	-	.	gene_id lnc-TPTE-4 ; transcript_id lnc-TPTE-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_013993 ; gene_alias_2 linc-S100B-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00029067 ;
chr12	lncipedia.org	exon	129594240	129594302	.	+	.	gene_id lnc-GLT1D1-1 ; transcript_id lnc-GLT1D1-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000249196 ; gene_alias_2 RP11-669N7.2 ; gene_alias_3 ENSG00000249196.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168401.1 ; transcript_alias_1 ENST00000510001 ; transcript_alias_2 ENST00000510001.2 ; transcript_alias_3 RP11-669N7.2-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399596.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	129597610	129597839	.	+	.	gene_id lnc-GLT1D1-1 ; transcript_id lnc-GLT1D1-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000249196 ; gene_alias_2 RP11-669N7.2 ; gene_alias_3 ENSG00000249196.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168401.1 ; transcript_alias_1 ENST00000510001 ; transcript_alias_2 ENST00000510001.2 ; transcript_alias_3 RP11-669N7.2-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399596.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	165889	165942	.	-	.	gene_id lnc-FAM138A-4 ; transcript_id lnc-FAM138A-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000239368 ; gene_alias_2 RP11-34P13.13 ; gene_alias_3 ENSG00000239368.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002480.2 ; transcript_alias_1 ENST00000491962 ; transcript_alias_2 ENST00000491962.1 ; transcript_alias_3 RP11-34P13.13-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000007168.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	168100	168165	.	-	.	gene_id lnc-FAM138A-4 ; transcript_id lnc-FAM138A-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000239368 ; gene_alias_2 RP11-34P13.13 ; gene_alias_3 ENSG00000239368.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002480.2 ; transcript_alias_1 ENST00000491962 ; transcript_alias_2 ENST00000491962.1 ; transcript_alias_3 RP11-34P13.13-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000007168.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	168610	168767	.	-	.	gene_id lnc-FAM138A-4 ; transcript_id lnc-FAM138A-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000239368 ; gene_alias_2 RP11-34P13.13 ; gene_alias_3 ENSG00000239368.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002480.2 ; transcript_alias_1 ENST00000491962 ; transcript_alias_2 ENST00000491962.1 ; transcript_alias_3 RP11-34P13.13-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000007168.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	115095034	115095320	.	-	.	gene_id lnc-RASA3-1 ; transcript_id lnc-RASA3-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_010746 ; gene_alias_2 linc-RASA3-3 ; gene_alias_3 ENSG00000229723.1 ; gene_alias_4 AL845154.2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000017405.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00021703 ; transcript_alias_2 ENST00000446989.1 ; transcript_alias_3 AL845154.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000045980.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	115096141	115096253	.	-	.	gene_id lnc-RASA3-1 ; transcript_id lnc-RASA3-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_010746 ; gene_alias_2 linc-RASA3-3 ; gene_alias_3 ENSG00000229723.1 ; gene_alias_4 AL845154.2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000017405.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00021703 ; transcript_alias_2 ENST00000446989.1 ; transcript_alias_3 AL845154.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000045980.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	115099310	115099423	.	-	.	gene_id lnc-RASA3-1 ; transcript_id lnc-RASA3-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_010746 ; gene_alias_2 linc-RASA3-3 ; gene_alias_3 ENSG00000229723.1 ; gene_alias_4 AL845154.2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000017405.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00021703 ; transcript_alias_2 ENST00000446989.1 ; transcript_alias_3 AL845154.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000045980.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	148928322	148928385	.	+	.	gene_id lnc-NBPF16-3 ; transcript_id lnc-NBPF16-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000232527 ; gene_alias_2 RP11-14N7.2 ; gene_alias_3 ENSG00000232527.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000017423.2 ; transcript_alias_1 ENST00000420597 ; transcript_alias_2 ENST00000420597.1 ; transcript_alias_3 RP11-14N7.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000046023.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	148932786	148932920	.	+	.	gene_id lnc-NBPF16-3 ; transcript_id lnc-NBPF16-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000232527 ; gene_alias_2 RP11-14N7.2 ; gene_alias_3 ENSG00000232527.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000017423.2 ; transcript_alias_1 ENST00000420597 ; transcript_alias_2 ENST00000420597.1 ; transcript_alias_3 RP11-14N7.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000046023.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	61263912	61264151	.	+	.	gene_id lnc-PPP1R32-1 ; transcript_id lnc-PPP1R32-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255931 ; gene_alias_2 RP11-286N22.10 ; gene_alias_3 ENSG00000255931.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168177.1 ; transcript_alias_1 ENST00000534856 ; transcript_alias_2 ENST00000534856.1 ; transcript_alias_3 RP11-286N22.10-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000398622.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	61267235	61267548	.	+	.	gene_id lnc-PPP1R32-1 ; transcript_id lnc-PPP1R32-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255931 ; gene_alias_2 RP11-286N22.10 ; gene_alias_3 ENSG00000255931.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168177.1 ; transcript_alias_1 ENST00000534856 ; transcript_alias_2 ENST00000534856.1 ; transcript_alias_3 RP11-286N22.10-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000398622.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	179085266	179085482	.	+	.	gene_id lnc-AC136604.1-1 ; transcript_id lnc-AC136604.1-1:4 ; gene_alias_1 XLOC_004677 ; gene_alias_2 linc-CANX-1 ; gene_alias_3 ENSG00000250999.1 ; gene_alias_4 RP11-1379J22.5 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000163211.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00009561 ; transcript_alias_2 ENST00000503428.1 ; transcript_alias_3 RP11-1379J22.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000372095.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	179091324	179091431	.	+	.	gene_id lnc-AC136604.1-1 ; transcript_id lnc-AC136604.1-1:4 ; gene_alias_1 XLOC_004677 ; gene_alias_2 linc-CANX-1 ; gene_alias_3 ENSG00000250999.1 ; gene_alias_4 RP11-1379J22.5 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000163211.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00009561 ; transcript_alias_2 ENST00000503428.1 ; transcript_alias_3 RP11-1379J22.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000372095.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	29945244	29945280	.	+	.	gene_id lnc-HLA-A-1 ; transcript_id lnc-HLA-A-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000204625 ; gene_alias_2 HCG9 ; gene_alias_3 ENSG00000204625.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031119.4 ; transcript_alias_1 ENST00000463275 ; transcript_alias_2 ENST00000463275.1 ; transcript_alias_3 HCG9-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000356285.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	29945431	29945494	.	+	.	gene_id lnc-HLA-A-1 ; transcript_id lnc-HLA-A-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000204625 ; gene_alias_2 HCG9 ; gene_alias_3 ENSG00000204625.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031119.4 ; transcript_alias_1 ENST00000463275 ; transcript_alias_2 ENST00000463275.1 ; transcript_alias_3 HCG9-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000356285.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	740179	740346	.	+	.	gene_id lnc-AL669831.1-1 ; transcript_id lnc-AL669831.1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000241768 ; gene_alias_2 RP11-206L10.9 ; gene_alias_3 ENSG00000241768.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002404.2 ; transcript_alias_1 ENST00000443772 ; transcript_alias_2 ENST00000443772.1 ; transcript_alias_3 RP11-206L10.9-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000006887.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	742597	742845	.	+	.	gene_id lnc-AL669831.1-1 ; transcript_id lnc-AL669831.1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000241768 ; gene_alias_2 RP11-206L10.9 ; gene_alias_3 ENSG00000241768.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002404.2 ; transcript_alias_1 ENST00000443772 ; transcript_alias_2 ENST00000443772.1 ; transcript_alias_3 RP11-206L10.9-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000006887.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	47279192	47279522	.	-	.	gene_id lnc-AGAP10-2 ; transcript_id lnc-AGAP10-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_008808 ; gene_alias_2 linc-AGAP9-3 ; gene_alias_3 ENSG00000227310 ; gene_alias_4 RP11-144G6.10 ; gene_alias_5 ENSG00000227310.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000018120.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017972 ; transcript_alias_2 ENST00000456034 ; transcript_alias_3 ENST00000456034.1 ; transcript_alias_4 RP11-144G6.10-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000047852.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	47280176	47280335	.	-	.	gene_id lnc-AGAP10-2 ; transcript_id lnc-AGAP10-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_008808 ; gene_alias_2 linc-AGAP9-3 ; gene_alias_3 ENSG00000227310 ; gene_alias_4 RP11-144G6.10 ; gene_alias_5 ENSG00000227310.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000018120.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017972 ; transcript_alias_2 ENST00000456034 ; transcript_alias_3 ENST00000456034.1 ; transcript_alias_4 RP11-144G6.10-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000047852.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	1856084	1856410	.	-	.	gene_id lnc-IRX4-1 ; transcript_id lnc-IRX4-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_004706 ; gene_alias_2 linc-MRPL36 ; gene_alias_3 ENSG00000250417 ; gene_alias_4 CTD-2194D22.2 ; gene_alias_5 ENSG00000250417.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000161601.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009581 ; transcript_alias_2 ENST00000509455 ; transcript_alias_3 ENST00000509455.1 ; transcript_alias_4 CTD-2194D22.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000365492.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	1856517	1856682	.	-	.	gene_id lnc-IRX4-1 ; transcript_id lnc-IRX4-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_004706 ; gene_alias_2 linc-MRPL36 ; gene_alias_3 ENSG00000250417 ; gene_alias_4 CTD-2194D22.2 ; gene_alias_5 ENSG00000250417.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000161601.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009581 ; transcript_alias_2 ENST00000509455 ; transcript_alias_3 ENST00000509455.1 ; transcript_alias_4 CTD-2194D22.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000365492.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	121466839	121467054	.	-	.	gene_id lnc-TMEM185B-4 ; transcript_id lnc-TMEM185B-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_002298 ; gene_alias_2 linc-SCTR-2 ; gene_alias_3 ENSG00000229774 ; gene_alias_4 AC018866.1 ; gene_alias_5 ENSG00000229774.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000154317.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003393 ; transcript_alias_2 ENST00000421820 ; transcript_alias_3 ENST00000421820.1 ; transcript_alias_4 AC018866.1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000334824.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	121467840	121468093	.	-	.	gene_id lnc-TMEM185B-4 ; transcript_id lnc-TMEM185B-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_002298 ; gene_alias_2 linc-SCTR-2 ; gene_alias_3 ENSG00000229774 ; gene_alias_4 AC018866.1 ; gene_alias_5 ENSG00000229774.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000154317.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003393 ; transcript_alias_2 ENST00000421820 ; transcript_alias_3 ENST00000421820.1 ; transcript_alias_4 AC018866.1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000334824.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	46686629	46686829	.	-	.	gene_id lnc-FAM27E1.1-5 ; transcript_id lnc-FAM27E1.1-5:4 ; gene_alias_1 ENSG00000204802 ; gene_alias_2 RP11-111F5.4 ; gene_alias_3 ENSG00000204802.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013301.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412631 ; transcript_alias_2 ENST00000412631.1 ; transcript_alias_3 RP11-111F5.4-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037090.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	46687373	46687427	.	-	.	gene_id lnc-FAM27E1.1-5 ; transcript_id lnc-FAM27E1.1-5:4 ; gene_alias_1 ENSG00000204802 ; gene_alias_2 RP11-111F5.4 ; gene_alias_3 ENSG00000204802.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013301.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412631 ; transcript_alias_2 ENST00000412631.1 ; transcript_alias_3 RP11-111F5.4-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037090.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	70939766	70939816	.	+	.	gene_id lnc-ACRC-2 ; transcript_id lnc-ACRC-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000238106 ; gene_alias_2 RP11-402P6.7 ; gene_alias_3 ENSG00000238106.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022687.1 ; transcript_alias_1 ENST00000457716 ; transcript_alias_2 ENST00000457716.1 ; transcript_alias_3 RP11-402P6.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058868.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	70940376	70940417	.	+	.	gene_id lnc-ACRC-2 ; transcript_id lnc-ACRC-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000238106 ; gene_alias_2 RP11-402P6.7 ; gene_alias_3 ENSG00000238106.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022687.1 ; transcript_alias_1 ENST00000457716 ; transcript_alias_2 ENST00000457716.1 ; transcript_alias_3 RP11-402P6.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058868.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	70940524	70940650	.	+	.	gene_id lnc-ACRC-2 ; transcript_id lnc-ACRC-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000238106 ; gene_alias_2 RP11-402P6.7 ; gene_alias_3 ENSG00000238106.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022687.1 ; transcript_alias_1 ENST00000457716 ; transcript_alias_2 ENST00000457716.1 ; transcript_alias_3 RP11-402P6.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058868.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	119251552	119251619	.	-	.	gene_id lnc-RHOXF1-1 ; transcript_id lnc-RHOXF1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008222 ; gene_alias_2 linc-RHOXF1-1 ; gene_alias_3 ENSG00000228139 ; gene_alias_4 GS1-421I3.4 ; gene_alias_5 ENSG00000228139.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000022291.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017087 ; transcript_alias_2 ENST00000422226 ; transcript_alias_3 ENST00000422226.1 ; transcript_alias_4 GS1-421I3.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000058084.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	119251772	119251821	.	-	.	gene_id lnc-RHOXF1-1 ; transcript_id lnc-RHOXF1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008222 ; gene_alias_2 linc-RHOXF1-1 ; gene_alias_3 ENSG00000228139 ; gene_alias_4 GS1-421I3.4 ; gene_alias_5 ENSG00000228139.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000022291.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017087 ; transcript_alias_2 ENST00000422226 ; transcript_alias_3 ENST00000422226.1 ; transcript_alias_4 GS1-421I3.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000058084.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	119253450	119253610	.	-	.	gene_id lnc-RHOXF1-1 ; transcript_id lnc-RHOXF1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008222 ; gene_alias_2 linc-RHOXF1-1 ; gene_alias_3 ENSG00000228139 ; gene_alias_4 GS1-421I3.4 ; gene_alias_5 ENSG00000228139.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000022291.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017087 ; transcript_alias_2 ENST00000422226 ; transcript_alias_3 ENST00000422226.1 ; transcript_alias_4 GS1-421I3.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000058084.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	70843567	70843647	.	+	.	gene_id lnc-CBWD3-1 ; transcript_id lnc-CBWD3-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007388 ; gene_alias_2 linc-CBWD3-3 ; gene_alias_3 ENSG00000226904.1 ; gene_alias_4 RP11-561O23.8 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000019963.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015686 ; transcript_alias_2 ENST00000425587.1 ; transcript_alias_3 RP11-561O23.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000052545.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	70843970	70844228	.	+	.	gene_id lnc-CBWD3-1 ; transcript_id lnc-CBWD3-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007388 ; gene_alias_2 linc-CBWD3-3 ; gene_alias_3 ENSG00000226904.1 ; gene_alias_4 RP11-561O23.8 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000019963.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015686 ; transcript_alias_2 ENST00000425587.1 ; transcript_alias_3 RP11-561O23.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000052545.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	150085636	150085756	.	+	.	gene_id lnc-HMGB3-1 ; transcript_id lnc-HMGB3-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_008084 ; gene_alias_2 linc-HMGB3 ; gene_alias_3 ENSG00000230153 ; gene_alias_4 AF003626.1 ; gene_alias_5 ENSG00000230153.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000024161.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017025 ; transcript_alias_2 ENST00000424539 ; transcript_alias_3 ENST00000424539.1 ; transcript_alias_4 AF003626.1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000060866.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	150088242	150088409	.	+	.	gene_id lnc-HMGB3-1 ; transcript_id lnc-HMGB3-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_008084 ; gene_alias_2 linc-HMGB3 ; gene_alias_3 ENSG00000230153 ; gene_alias_4 AF003626.1 ; gene_alias_5 ENSG00000230153.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000024161.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017025 ; transcript_alias_2 ENST00000424539 ; transcript_alias_3 ENST00000424539.1 ; transcript_alias_4 AF003626.1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000060866.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	150089259	150089411	.	+	.	gene_id lnc-HMGB3-1 ; transcript_id lnc-HMGB3-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_008084 ; gene_alias_2 linc-HMGB3 ; gene_alias_3 ENSG00000230153 ; gene_alias_4 AF003626.1 ; gene_alias_5 ENSG00000230153.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000024161.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017025 ; transcript_alias_2 ENST00000424539 ; transcript_alias_3 ENST00000424539.1 ; transcript_alias_4 AF003626.1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000060866.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	79486066	79486128	.	+	.	gene_id lnc-FSCN2-1 ; transcript_id lnc-FSCN2-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_012338 ; gene_alias_2 linc-FSCN2-1 ; gene_alias_3 ENSG00000229848.1 ; gene_alias_4 RP13-766D20.2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156171.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00025202 ; transcript_alias_2 ENST00000442532.1 ; transcript_alias_3 RP13-766D20.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000343245.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	79494083	79494802	.	+	.	gene_id lnc-FSCN2-1 ; transcript_id lnc-FSCN2-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_012338 ; gene_alias_2 linc-FSCN2-1 ; gene_alias_3 ENSG00000229848.1 ; gene_alias_4 RP13-766D20.2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156171.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00025202 ; transcript_alias_2 ENST00000442532.1 ; transcript_alias_3 RP13-766D20.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000343245.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	103070775	103070997	.	+	.	gene_id lnc-BTRC-1 ; transcript_id lnc-BTRC-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008587 ; gene_alias_2 linc-BTRC-1 ; gene_alias_3 ENSG00000225208 ; gene_alias_4 RP11-107I14.2 ; gene_alias_5 ENSG00000225208.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000018929.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017859 ; transcript_alias_2 ENST00000442188 ; transcript_alias_3 ENST00000442188.1 ; transcript_alias_4 RP11-107I14.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000049933.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	103071104	103071262	.	+	.	gene_id lnc-BTRC-1 ; transcript_id lnc-BTRC-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008587 ; gene_alias_2 linc-BTRC-1 ; gene_alias_3 ENSG00000225208 ; gene_alias_4 RP11-107I14.2 ; gene_alias_5 ENSG00000225208.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000018929.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017859 ; transcript_alias_2 ENST00000442188 ; transcript_alias_3 ENST00000442188.1 ; transcript_alias_4 RP11-107I14.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000049933.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	121279	121426	.	-	.	gene_id lnc-BET1L-2 ; transcript_id lnc-BET1L-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254468 ; gene_alias_2 RP11-304M2.6 ; gene_alias_3 ENSG00000254468.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165812.1 ; transcript_alias_1 ENST00000529266 ; transcript_alias_2 ENST00000529266.1 ; transcript_alias_3 RP11-304M2.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000386324.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	125578	125784	.	-	.	gene_id lnc-BET1L-2 ; transcript_id lnc-BET1L-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254468 ; gene_alias_2 RP11-304M2.6 ; gene_alias_3 ENSG00000254468.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165812.1 ; transcript_alias_1 ENST00000529266 ; transcript_alias_2 ENST00000529266.1 ; transcript_alias_3 RP11-304M2.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000386324.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101542642	101542670	.	-	.	gene_id lnc-RTL1-3 ; transcript_id lnc-RTL1-3:6 ; gene_alias_1 ENSG00000230805 ; gene_alias_2 AL132709.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230805.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000045024.2 ; transcript_alias_1 ENST00000556035 ; transcript_alias_2 ENST00000556035.1 ; transcript_alias_3 AL132709.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414543.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101542871	101543106	.	-	.	gene_id lnc-RTL1-3 ; transcript_id lnc-RTL1-3:6 ; gene_alias_1 ENSG00000230805 ; gene_alias_2 AL132709.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230805.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000045024.2 ; transcript_alias_1 ENST00000556035 ; transcript_alias_2 ENST00000556035.1 ; transcript_alias_3 AL132709.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414543.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	96811341	96811395	.	-	.	gene_id lnc-DUSP2-1 ; transcript_id lnc-DUSP2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228873 ; gene_alias_2 AC012307.2 ; gene_alias_3 ENSG00000228873.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000155213.1 ; transcript_alias_1 ENST00000449242 ; transcript_alias_2 ENST00000449242.1 ; transcript_alias_3 AC012307.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000338812.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	96812610	96812751	.	-	.	gene_id lnc-DUSP2-1 ; transcript_id lnc-DUSP2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228873 ; gene_alias_2 AC012307.2 ; gene_alias_3 ENSG00000228873.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000155213.1 ; transcript_alias_1 ENST00000449242 ; transcript_alias_2 ENST00000449242.1 ; transcript_alias_3 AC012307.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000338812.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	142288327	142288451	.	+	.	gene_id lnc-RP11-10J21.3.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-10J21.3.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254197 ; gene_alias_2 RP11-10J21.5 ; gene_alias_3 ENSG00000254197.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164480.1 ; transcript_alias_1 ENST00000520606 ; transcript_alias_2 ENST00000520606.1 ; transcript_alias_3 RP11-10J21.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000378944.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	142302793	142302961	.	+	.	gene_id lnc-RP11-10J21.3.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-10J21.3.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254197 ; gene_alias_2 RP11-10J21.5 ; gene_alias_3 ENSG00000254197.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164480.1 ; transcript_alias_1 ENST00000520606 ; transcript_alias_2 ENST00000520606.1 ; transcript_alias_3 RP11-10J21.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000378944.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	27810419	27810724	.	-	.	gene_id lnc-USP12-4 ; transcript_id lnc-USP12-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_010543 ; gene_alias_2 linc-USP12-2 ; gene_alias_3 ENSG00000234772.1 ; gene_alias_4 RP11-428O18.4 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000016629.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00021615 ; transcript_alias_2 ENST00000444744.1 ; transcript_alias_3 RP11-428O18.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000044269.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	27810835	27810948	.	-	.	gene_id lnc-USP12-4 ; transcript_id lnc-USP12-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_010543 ; gene_alias_2 linc-USP12-2 ; gene_alias_3 ENSG00000234772.1 ; gene_alias_4 RP11-428O18.4 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000016629.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00021615 ; transcript_alias_2 ENST00000444744.1 ; transcript_alias_3 RP11-428O18.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000044269.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	19894369	19894691	.	+	.	gene_id lnc-OR4N2-4 ; transcript_id lnc-OR4N2-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000215394 ; gene_alias_2 C14orf17 ; gene_alias_3 ENSG00000215394.4 ; gene_alias_4 LINC00516 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000170508.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551545 ; transcript_alias_2 ENST00000551545.1 ; transcript_alias_3 LINC00516-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409429.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	19896785	19896872	.	+	.	gene_id lnc-OR4N2-4 ; transcript_id lnc-OR4N2-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000215394 ; gene_alias_2 C14orf17 ; gene_alias_3 ENSG00000215394.4 ; gene_alias_4 LINC00516 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000170508.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551545 ; transcript_alias_2 ENST00000551545.1 ; transcript_alias_3 LINC00516-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409429.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	19904259	19904572	.	+	.	gene_id lnc-OR4N2-4 ; transcript_id lnc-OR4N2-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000215394 ; gene_alias_2 C14orf17 ; gene_alias_3 ENSG00000215394.4 ; gene_alias_4 LINC00516 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000170508.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551545 ; transcript_alias_2 ENST00000551545.1 ; transcript_alias_3 LINC00516-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409429.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	147668281	147668558	.	-	.	gene_id lnc-NBPF24-1 ; transcript_id lnc-NBPF24-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226335 ; gene_alias_2 XXyac-YX155B6.6 ; gene_alias_3 ENSG00000226335.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000043432.1 ; transcript_alias_1 ENST00000443671 ; transcript_alias_2 ENST00000443671.1 ; transcript_alias_3 XXyac-YX155B6.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000101758.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	147672272	147672361	.	-	.	gene_id lnc-NBPF24-1 ; transcript_id lnc-NBPF24-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226335 ; gene_alias_2 XXyac-YX155B6.6 ; gene_alias_3 ENSG00000226335.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000043432.1 ; transcript_alias_1 ENST00000443671 ; transcript_alias_2 ENST00000443671.1 ; transcript_alias_3 XXyac-YX155B6.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000101758.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	89117788	89117943	.	-	.	gene_id lnc-EIF2AK3-3 ; transcript_id lnc-EIF2AK3-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000240040 ; gene_alias_2 AC096579.13 ; gene_alias_3 ENSG00000240040.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151694.1 ; transcript_alias_1 ENST00000434790 ; transcript_alias_2 ENST00000434790.1 ; transcript_alias_3 AC096579.13-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323494.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	89124489	89124720	.	-	.	gene_id lnc-EIF2AK3-3 ; transcript_id lnc-EIF2AK3-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000240040 ; gene_alias_2 AC096579.13 ; gene_alias_3 ENSG00000240040.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151694.1 ; transcript_alias_1 ENST00000434790 ; transcript_alias_2 ENST00000434790.1 ; transcript_alias_3 AC096579.13-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323494.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	242913429	242913613	.	+	.	gene_id lnc-CXXC11-2 ; transcript_id lnc-CXXC11-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000237940 ; gene_alias_2 AC093642.3 ; gene_alias_3 ENSG00000237940.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151373.1 ; transcript_alias_1 ENST00000426962 ; transcript_alias_2 ENST00000426962.1 ; transcript_alias_3 AC093642.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000322413.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	242913831	242914075	.	+	.	gene_id lnc-CXXC11-2 ; transcript_id lnc-CXXC11-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000237940 ; gene_alias_2 AC093642.3 ; gene_alias_3 ENSG00000237940.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151373.1 ; transcript_alias_1 ENST00000426962 ; transcript_alias_2 ENST00000426962.1 ; transcript_alias_3 AC093642.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000322413.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	87808733	87808846	.	+	.	gene_id lnc-PLGLB2-1 ; transcript_id lnc-PLGLB2-1:11 ; gene_alias_1 ENSG00000222041 ; gene_alias_2 NCRNA00152 ; gene_alias_3 ENSG00000222041.5 ; gene_alias_4 LINC00152 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000130273.9 ; transcript_alias_1 ENST00000413202 ; transcript_alias_2 ENST00000413202.1 ; transcript_alias_3 LINC00152-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330386.4 ;
chr2	lncipedia.org	exon	87820726	87821033	.	+	.	gene_id lnc-PLGLB2-1 ; transcript_id lnc-PLGLB2-1:11 ; gene_alias_1 ENSG00000222041 ; gene_alias_2 NCRNA00152 ; gene_alias_3 ENSG00000222041.5 ; gene_alias_4 LINC00152 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000130273.9 ; transcript_alias_1 ENST00000413202 ; transcript_alias_2 ENST00000413202.1 ; transcript_alias_3 LINC00152-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330386.4 ;
chr22	lncipedia.org	exon	20330726	20331038	.	-	.	gene_id lnc-DGCR6L-1 ; transcript_id lnc-DGCR6L-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_014300 ; gene_alias_2 linc-DGCR6L ; gene_alias_3 ENSG00000235578 ; gene_alias_4 XXbac-B33L19.4 ; gene_alias_5 ENSG00000235578.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150605.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00029446 ; transcript_alias_2 ENST00000458154 ; transcript_alias_3 ENST00000458154.1 ; transcript_alias_4 XXbac-B33L19.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000319056.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	20331756	20331888	.	-	.	gene_id lnc-DGCR6L-1 ; transcript_id lnc-DGCR6L-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_014300 ; gene_alias_2 linc-DGCR6L ; gene_alias_3 ENSG00000235578 ; gene_alias_4 XXbac-B33L19.4 ; gene_alias_5 ENSG00000235578.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150605.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00029446 ; transcript_alias_2 ENST00000458154 ; transcript_alias_3 ENST00000458154.1 ; transcript_alias_4 XXbac-B33L19.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000319056.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21666029	21666062	.	-	.	gene_id lnc-GGT2-2 ; transcript_id lnc-GGT2-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000206142 ; gene_alias_2 KB-1183D5.13 ; gene_alias_3 ENSG00000206142.4 ; gene_alias_4 LINC00281 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000150795.1 ; transcript_alias_1 ENST00000453273 ; transcript_alias_2 ENST00000453273.1 ; transcript_alias_3 LINC00281-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320111.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21666528	21666589	.	-	.	gene_id lnc-GGT2-2 ; transcript_id lnc-GGT2-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000206142 ; gene_alias_2 KB-1183D5.13 ; gene_alias_3 ENSG00000206142.4 ; gene_alias_4 LINC00281 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000150795.1 ; transcript_alias_1 ENST00000453273 ; transcript_alias_2 ENST00000453273.1 ; transcript_alias_3 LINC00281-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320111.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21668589	21668654	.	-	.	gene_id lnc-GGT2-2 ; transcript_id lnc-GGT2-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000206142 ; gene_alias_2 KB-1183D5.13 ; gene_alias_3 ENSG00000206142.4 ; gene_alias_4 LINC00281 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000150795.1 ; transcript_alias_1 ENST00000453273 ; transcript_alias_2 ENST00000453273.1 ; transcript_alias_3 LINC00281-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320111.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21673559	21673645	.	-	.	gene_id lnc-GGT2-2 ; transcript_id lnc-GGT2-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000206142 ; gene_alias_2 KB-1183D5.13 ; gene_alias_3 ENSG00000206142.4 ; gene_alias_4 LINC00281 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000150795.1 ; transcript_alias_1 ENST00000453273 ; transcript_alias_2 ENST00000453273.1 ; transcript_alias_3 LINC00281-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320111.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21676592	21676616	.	-	.	gene_id lnc-GGT2-2 ; transcript_id lnc-GGT2-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000206142 ; gene_alias_2 KB-1183D5.13 ; gene_alias_3 ENSG00000206142.4 ; gene_alias_4 LINC00281 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000150795.1 ; transcript_alias_1 ENST00000453273 ; transcript_alias_2 ENST00000453273.1 ; transcript_alias_3 LINC00281-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320111.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21677085	21677273	.	-	.	gene_id lnc-GGT2-2 ; transcript_id lnc-GGT2-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000206142 ; gene_alias_2 KB-1183D5.13 ; gene_alias_3 ENSG00000206142.4 ; gene_alias_4 LINC00281 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000150795.1 ; transcript_alias_1 ENST00000453273 ; transcript_alias_2 ENST00000453273.1 ; transcript_alias_3 LINC00281-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320111.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21679120	21679226	.	-	.	gene_id lnc-GGT2-2 ; transcript_id lnc-GGT2-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000206142 ; gene_alias_2 KB-1183D5.13 ; gene_alias_3 ENSG00000206142.4 ; gene_alias_4 LINC00281 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000150795.1 ; transcript_alias_1 ENST00000453273 ; transcript_alias_2 ENST00000453273.1 ; transcript_alias_3 LINC00281-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320111.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	152874300	152874492	.	-	.	gene_id lnc-TMEM14E-2 ; transcript_id lnc-TMEM14E-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_003291 ; gene_alias_2 linc-TMEM14E-4 ; gene_alias_3 ENSG00000244268.1 ; gene_alias_4 RP11-529G21.2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000159656.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005850 ; transcript_alias_2 ENST00000487827.1 ; transcript_alias_3 RP11-529G21.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000356712.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	152879435	152879564	.	-	.	gene_id lnc-TMEM14E-2 ; transcript_id lnc-TMEM14E-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_003291 ; gene_alias_2 linc-TMEM14E-4 ; gene_alias_3 ENSG00000244268.1 ; gene_alias_4 RP11-529G21.2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000159656.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005850 ; transcript_alias_2 ENST00000487827.1 ; transcript_alias_3 RP11-529G21.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000356712.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	166304121	166304200	.	+	.	gene_id lnc-UCK2-3 ; transcript_id lnc-UCK2-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_000451 ; gene_alias_2 linc-POGK-1 ; gene_alias_3 ENSG00000229588 ; gene_alias_4 RP11-479J7.2 ; gene_alias_5 ENSG00000229588.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000034556.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00000328 ; transcript_alias_2 ENST00000425271 ; transcript_alias_3 ENST00000425271.1 ; transcript_alias_4 RP11-479J7.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000096761.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	166304565	166304702	.	+	.	gene_id lnc-UCK2-3 ; transcript_id lnc-UCK2-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_000451 ; gene_alias_2 linc-POGK-1 ; gene_alias_3 ENSG00000229588 ; gene_alias_4 RP11-479J7.2 ; gene_alias_5 ENSG00000229588.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000034556.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00000328 ; transcript_alias_2 ENST00000425271 ; transcript_alias_3 ENST00000425271.1 ; transcript_alias_4 RP11-479J7.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000096761.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	166304795	166304999	.	+	.	gene_id lnc-UCK2-3 ; transcript_id lnc-UCK2-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_000451 ; gene_alias_2 linc-POGK-1 ; gene_alias_3 ENSG00000229588 ; gene_alias_4 RP11-479J7.2 ; gene_alias_5 ENSG00000229588.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000034556.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00000328 ; transcript_alias_2 ENST00000425271 ; transcript_alias_3 ENST00000425271.1 ; transcript_alias_4 RP11-479J7.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000096761.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	31097762	31098471	.	+	.	gene_id lnc-RP11-410N8.4.1-3 ; transcript_id lnc-RP11-410N8.4.1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245977 ; transcript_alias_1 ENST00000498926 ;
chr20	lncipedia.org	exon	31099018	31099191	.	+	.	gene_id lnc-RP11-410N8.4.1-3 ; transcript_id lnc-RP11-410N8.4.1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245977 ; transcript_alias_1 ENST00000498926 ;
chr20	lncipedia.org	exon	31107202	31108015	.	+	.	gene_id lnc-RP11-410N8.4.1-3 ; transcript_id lnc-RP11-410N8.4.1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245977 ; transcript_alias_1 ENST00000498926 ;
chr20	lncipedia.org	exon	31142049	31142122	.	+	.	gene_id lnc-RP11-410N8.4.1-3 ; transcript_id lnc-RP11-410N8.4.1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245977 ; transcript_alias_1 ENST00000498926 ;
chr17	lncipedia.org	exon	30831585	30832666	.	+	.	gene_id lnc-CDK5R1-3 ; transcript_id lnc-CDK5R1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250818 ; transcript_alias_1 ENST00000511192 ;
chr17	lncipedia.org	exon	30930937	30930965	.	+	.	gene_id lnc-CDK5R1-3 ; transcript_id lnc-CDK5R1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250818 ; transcript_alias_1 ENST00000511192 ;
chr9	lncipedia.org	exon	139008632	139008870	.	-	.	gene_id lnc-C9orf69-1 ; transcript_id lnc-C9orf69-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000238227 ; gene_alias_2 C9orf69 ; transcript_alias_1 ENST00000447934 ;
chr9	lncipedia.org	exon	139009712	139010120	.	-	.	gene_id lnc-C9orf69-1 ; transcript_id lnc-C9orf69-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000238227 ; gene_alias_2 C9orf69 ; transcript_alias_1 ENST00000447934 ;
chr5	lncipedia.org	exon	180256956	180257430	.	+	.	gene_id lnc-BTNL8-3 ; transcript_id lnc-BTNL8-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249705 ; transcript_alias_1 ENST00000545462 ;
chr5	lncipedia.org	exon	180257672	180258618	.	+	.	gene_id lnc-BTNL8-3 ; transcript_id lnc-BTNL8-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249705 ; transcript_alias_1 ENST00000545462 ;
chr22	lncipedia.org	exon	39867799	39867929	.	+	.	gene_id lnc-SMCR7L-1 ; transcript_id lnc-SMCR7L-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250953 ; transcript_alias_1 ENST00000514789 ;
chr22	lncipedia.org	exon	39868119	39868646	.	+	.	gene_id lnc-SMCR7L-1 ; transcript_id lnc-SMCR7L-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250953 ; transcript_alias_1 ENST00000514789 ;
chr11	lncipedia.org	exon	71511709	71511835	.	-	.	gene_id lnc-RP11-849H4.2.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-849H4.2.1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000254978 ; transcript_alias_1 ENST00000525656 ;
chr11	lncipedia.org	exon	71512832	71512910	.	-	.	gene_id lnc-RP11-849H4.2.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-849H4.2.1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000254978 ; transcript_alias_1 ENST00000525656 ;
chr11	lncipedia.org	exon	71513912	71514020	.	-	.	gene_id lnc-RP11-849H4.2.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-849H4.2.1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000254978 ; transcript_alias_1 ENST00000525656 ;
chr11	lncipedia.org	exon	71515580	71515691	.	-	.	gene_id lnc-RP11-849H4.2.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-849H4.2.1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000254978 ; transcript_alias_1 ENST00000525656 ;
chr12	lncipedia.org	exon	129595538	129595684	.	+	.	gene_id lnc-GLT1D1-1 ; transcript_id lnc-GLT1D1-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000249196 ; transcript_alias_1 ENST00000508925 ;
chr12	lncipedia.org	exon	129595572	129595684	.	+	.	gene_id lnc-GLT1D1-1 ; transcript_id lnc-GLT1D1-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000249196 ; transcript_alias_1 ENST00000508925 ;
chr12	lncipedia.org	exon	129595965	129596214	.	+	.	gene_id lnc-GLT1D1-1 ; transcript_id lnc-GLT1D1-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000249196 ; transcript_alias_1 ENST00000508925 ;
chr12	lncipedia.org	exon	129597610	129597839	.	+	.	gene_id lnc-GLT1D1-1 ; transcript_id lnc-GLT1D1-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000249196 ; transcript_alias_1 ENST00000508925 ;
chr2	lncipedia.org	exon	89065460	89065713	.	+	.	gene_id lnc-RPIA-1 ; transcript_id lnc-RPIA-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000230006 ; gene_alias_2 ANKRD36BP2 ; transcript_alias_1 ENST00000443770 ;
chr2	lncipedia.org	exon	89072490	89072561	.	+	.	gene_id lnc-RPIA-1 ; transcript_id lnc-RPIA-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000230006 ; gene_alias_2 ANKRD36BP2 ; transcript_alias_1 ENST00000443770 ;
chr2	lncipedia.org	exon	89072909	89073085	.	+	.	gene_id lnc-RPIA-1 ; transcript_id lnc-RPIA-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000230006 ; gene_alias_2 ANKRD36BP2 ; transcript_alias_1 ENST00000443770 ;
chr15	lncipedia.org	exon	77952394	77952525	.	+	.	gene_id lnc-HMG20A-4 ; transcript_id lnc-HMG20A-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248960 ; transcript_alias_1 ENST00000512414 ;
chr15	lncipedia.org	exon	77959302	77959428	.	+	.	gene_id lnc-HMG20A-4 ; transcript_id lnc-HMG20A-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248960 ; transcript_alias_1 ENST00000512414 ;
chr15	lncipedia.org	exon	77960013	77960415	.	+	.	gene_id lnc-HMG20A-4 ; transcript_id lnc-HMG20A-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248960 ; transcript_alias_1 ENST00000512414 ;
chr15	lncipedia.org	exon	75247653	75247820	.	+	.	gene_id lnc-SCAMP5-1 ; transcript_id lnc-SCAMP5-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247368 ; transcript_alias_1 ENST00000499788 ;
chr15	lncipedia.org	exon	75247946	75249775	.	+	.	gene_id lnc-SCAMP5-1 ; transcript_id lnc-SCAMP5-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247368 ; transcript_alias_1 ENST00000499788 ;
chr19	lncipedia.org	exon	37288465	37288713	.	+	.	gene_id lnc-ZNF345-1 ; transcript_id lnc-ZNF345-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247207 ; gene_alias_2 AC020928.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501367 ;
chr19	lncipedia.org	exon	37292778	37292835	.	+	.	gene_id lnc-ZNF345-1 ; transcript_id lnc-ZNF345-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247207 ; gene_alias_2 AC020928.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501367 ;
chr19	lncipedia.org	exon	37314633	37314723	.	+	.	gene_id lnc-ZNF345-1 ; transcript_id lnc-ZNF345-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247207 ; gene_alias_2 AC020928.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501367 ;
chr19	lncipedia.org	exon	37318552	37319003	.	+	.	gene_id lnc-ZNF345-1 ; transcript_id lnc-ZNF345-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247207 ; gene_alias_2 AC020928.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501367 ;
chr2	lncipedia.org	exon	106509525	106510033	.	-	.	gene_id lnc-UXS1-3 ; transcript_id lnc-UXS1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245580 ; transcript_alias_1 ENST00000501731 ;
chr2	lncipedia.org	exon	106510079	106510705	.	-	.	gene_id lnc-UXS1-3 ; transcript_id lnc-UXS1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245580 ; transcript_alias_1 ENST00000501731 ;
chr1	lncipedia.org	exon	45769863	45770750	.	-	.	gene_id lnc-MUTYH-1 ; transcript_id lnc-MUTYH-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246279 ; gene_alias_2 XLOC_000816 ; gene_alias_3 linc-ZSWIM5 ; gene_alias_4 AL359540.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501044 ; transcript_alias_2 TCONS_00000513 ;
chr1	lncipedia.org	exon	45770979	45771290	.	-	.	gene_id lnc-MUTYH-1 ; transcript_id lnc-MUTYH-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246279 ; gene_alias_2 XLOC_000816 ; gene_alias_3 linc-ZSWIM5 ; gene_alias_4 AL359540.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501044 ; transcript_alias_2 TCONS_00000513 ;
chr15	lncipedia.org	exon	95822521	95823325	.	-	.	gene_id lnc-AC016251.1-8 ; transcript_id lnc-AC016251.1-8:6 ; gene_alias_1 ENSG00000248441 ; gene_alias_2 XLOC_011592 ; gene_alias_3 linc-RGMA-7 ; transcript_alias_1 ENST00000508732 ; transcript_alias_2 TCONS_00023208 ;
chr15	lncipedia.org	exon	95831531	95831697	.	-	.	gene_id lnc-AC016251.1-8 ; transcript_id lnc-AC016251.1-8:6 ; gene_alias_1 ENSG00000248441 ; gene_alias_2 XLOC_011592 ; gene_alias_3 linc-RGMA-7 ; transcript_alias_1 ENST00000508732 ; transcript_alias_2 TCONS_00023208 ;
chr15	lncipedia.org	exon	95832651	95832783	.	-	.	gene_id lnc-AC016251.1-8 ; transcript_id lnc-AC016251.1-8:6 ; gene_alias_1 ENSG00000248441 ; gene_alias_2 XLOC_011592 ; gene_alias_3 linc-RGMA-7 ; transcript_alias_1 ENST00000508732 ; transcript_alias_2 TCONS_00023208 ;
chr15	lncipedia.org	exon	95870059	95870329	.	-	.	gene_id lnc-AC016251.1-8 ; transcript_id lnc-AC016251.1-8:6 ; gene_alias_1 ENSG00000248441 ; gene_alias_2 XLOC_011592 ; gene_alias_3 linc-RGMA-7 ; transcript_alias_1 ENST00000508732 ; transcript_alias_2 TCONS_00023208 ;
chr16	lncipedia.org	exon	3160462	3160955	.	-	.	gene_id lnc-ZSCAN10-2 ; transcript_id lnc-ZSCAN10-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249402 ; gene_alias_2 AC108134.5 ; transcript_alias_1 ENST00000506353 ;
chr16	lncipedia.org	exon	3164796	3164888	.	-	.	gene_id lnc-ZSCAN10-2 ; transcript_id lnc-ZSCAN10-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249402 ; gene_alias_2 AC108134.5 ; transcript_alias_1 ENST00000506353 ;
chr16	lncipedia.org	exon	3164969	3165599	.	-	.	gene_id lnc-ZSCAN10-2 ; transcript_id lnc-ZSCAN10-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249402 ; gene_alias_2 AC108134.5 ; transcript_alias_1 ENST00000506353 ;
chr9	lncipedia.org	exon	139008650	139008870	.	-	.	gene_id lnc-C9orf69-1 ; transcript_id lnc-C9orf69-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000238227 ; gene_alias_2 C9orf69 ; transcript_alias_1 ENST00000448040 ;
chr9	lncipedia.org	exon	139009918	139010277	.	-	.	gene_id lnc-C9orf69-1 ; transcript_id lnc-C9orf69-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000238227 ; gene_alias_2 C9orf69 ; transcript_alias_1 ENST00000448040 ;
chr10	lncipedia.org	exon	131910186	131910380	.	+	.	gene_id lnc-GLRX3-2 ; transcript_id lnc-GLRX3-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244919 ; gene_alias_2 AL139123.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502243 ;
chr10	lncipedia.org	exon	131918330	131919006	.	+	.	gene_id lnc-GLRX3-2 ; transcript_id lnc-GLRX3-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244919 ; gene_alias_2 AL139123.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502243 ;
chr2	lncipedia.org	exon	106544669	106545060	.	-	.	gene_id lnc-UXS1-2 ; transcript_id lnc-UXS1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_002247 ; gene_alias_2 linc-FHL2-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00004368 ;
chr2	lncipedia.org	exon	106545171	106545197	.	-	.	gene_id lnc-UXS1-2 ; transcript_id lnc-UXS1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_002247 ; gene_alias_2 linc-FHL2-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00004368 ;
chr14	lncipedia.org	exon	65170511	65170621	.	-	.	gene_id lnc-SPTB-1 ; transcript_id lnc-SPTB-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_011052 ; gene_alias_2 linc-ZBTB25 ; transcript_alias_1 TCONS_00022769 ;
chr14	lncipedia.org	exon	65170749	65170923	.	-	.	gene_id lnc-SPTB-1 ; transcript_id lnc-SPTB-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_011052 ; gene_alias_2 linc-ZBTB25 ; transcript_alias_1 TCONS_00022769 ;
chr7	lncipedia.org	exon	155061986	155062157	.	-	.	gene_id lnc-AC099552.4.1-3 ; transcript_id lnc-AC099552.4.1-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_006664 ; gene_alias_2 linc-PAXIP1-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00014447 ;
chr7	lncipedia.org	exon	155064912	155065006	.	-	.	gene_id lnc-AC099552.4.1-3 ; transcript_id lnc-AC099552.4.1-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_006664 ; gene_alias_2 linc-PAXIP1-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00014447 ;
chr1	lncipedia.org	exon	234852398	234853100	.	+	.	gene_id lnc-C1orf31-7 ; transcript_id lnc-C1orf31-7:4 ; gene_alias_1 XLOC_000625 ; gene_alias_2 linc-GGPS1-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00001332 ;
chr1	lncipedia.org	exon	234855038	234855058	.	+	.	gene_id lnc-C1orf31-7 ; transcript_id lnc-C1orf31-7:4 ; gene_alias_1 XLOC_000625 ; gene_alias_2 linc-GGPS1-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00001332 ;
chr8	lncipedia.org	exon	129111755	129111819	.	+	.	gene_id lnc-MYC-2 ; transcript_id lnc-MYC-2:38 ; gene_alias_1 XLOC_006925 ; gene_alias_2 linc-EFR3A-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00014856 ;
chr8	lncipedia.org	exon	129113226	129113486	.	+	.	gene_id lnc-MYC-2 ; transcript_id lnc-MYC-2:38 ; gene_alias_1 XLOC_006925 ; gene_alias_2 linc-EFR3A-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00014856 ;
chr10	lncipedia.org	exon	121945392	121945635	.	+	.	gene_id lnc-SEC23IP-1 ; transcript_id lnc-SEC23IP-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_008642 ; gene_alias_2 linc-PPAPDC1A ; transcript_alias_1 TCONS_00018356 ;
chr10	lncipedia.org	exon	121946630	121946649	.	+	.	gene_id lnc-SEC23IP-1 ; transcript_id lnc-SEC23IP-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_008642 ; gene_alias_2 linc-PPAPDC1A ; transcript_alias_1 TCONS_00018356 ;
chr16	lncipedia.org	exon	87537321	87537593	.	+	.	gene_id lnc-JPH3-3 ; transcript_id lnc-JPH3-3:7 ; gene_alias_1 XLOC_011821 ; gene_alias_2 linc-JPH3-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00024502 ;
chr16	lncipedia.org	exon	87549122	87549539	.	+	.	gene_id lnc-JPH3-3 ; transcript_id lnc-JPH3-3:7 ; gene_alias_1 XLOC_011821 ; gene_alias_2 linc-JPH3-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00024502 ;
chr11	lncipedia.org	exon	94820008	94820050	.	-	.	gene_id lnc-SESN3-1 ; transcript_id lnc-SESN3-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_009526 ; gene_alias_2 linc-CWC15 ; transcript_alias_1 TCONS_00019734 ;
chr11	lncipedia.org	exon	94820982	94821880	.	-	.	gene_id lnc-SESN3-1 ; transcript_id lnc-SESN3-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_009526 ; gene_alias_2 linc-CWC15 ; transcript_alias_1 TCONS_00019734 ;
chrY	lncipedia.org	exon	26716349	26716509	.	+	.	gene_id lnc-BPY2B-1 ; transcript_id lnc-BPY2B-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008302 ; gene_alias_2 linc-BPY2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017581 ;
chrY	lncipedia.org	exon	26743516	26743591	.	+	.	gene_id lnc-BPY2B-1 ; transcript_id lnc-BPY2B-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008302 ; gene_alias_2 linc-BPY2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017581 ;
chrY	lncipedia.org	exon	26745396	26745503	.	+	.	gene_id lnc-BPY2B-1 ; transcript_id lnc-BPY2B-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008302 ; gene_alias_2 linc-BPY2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017581 ;
chrY	lncipedia.org	exon	26752172	26753171	.	+	.	gene_id lnc-BPY2B-1 ; transcript_id lnc-BPY2B-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008302 ; gene_alias_2 linc-BPY2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017581 ;
chr19	lncipedia.org	exon	53727166	53727793	.	+	.	gene_id lnc-VN1R2-1 ; transcript_id lnc-VN1R2-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_013142 ; gene_alias_2 linc-VN1R2 ; transcript_alias_1 TCONS_00027619 ;
chr19	lncipedia.org	exon	53727857	53727904	.	+	.	gene_id lnc-VN1R2-1 ; transcript_id lnc-VN1R2-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_013142 ; gene_alias_2 linc-VN1R2 ; transcript_alias_1 TCONS_00027619 ;
chr2	lncipedia.org	exon	10145573	10146051	.	-	.	gene_id lnc-CYS1-3 ; transcript_id lnc-CYS1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_001983 ; gene_alias_2 linc-YWHAQ-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00004139 ;
chr2	lncipedia.org	exon	10149520	10149991	.	-	.	gene_id lnc-CYS1-3 ; transcript_id lnc-CYS1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_001983 ; gene_alias_2 linc-YWHAQ-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00004139 ;
chr14	lncipedia.org	exon	37125439	37125594	.	+	.	gene_id lnc-PAX9-1 ; transcript_id lnc-PAX9-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_010803 ; gene_alias_2 linc-PAX9-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00022475 ;
chr14	lncipedia.org	exon	37125942	37126057	.	+	.	gene_id lnc-PAX9-1 ; transcript_id lnc-PAX9-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_010803 ; gene_alias_2 linc-PAX9-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00022475 ;
chr20	lncipedia.org	exon	26167632	26168219	.	-	.	gene_id lnc-FAM182B-6 ; transcript_id lnc-FAM182B-6:4 ; gene_alias_1 XLOC_013715 ; gene_alias_2 linc-ZNF337-9 ; transcript_alias_1 TCONS_00028360 ;
chr20	lncipedia.org	exon	26172429	26172536	.	-	.	gene_id lnc-FAM182B-6 ; transcript_id lnc-FAM182B-6:4 ; gene_alias_1 XLOC_013715 ; gene_alias_2 linc-ZNF337-9 ; transcript_alias_1 TCONS_00028360 ;
chr20	lncipedia.org	exon	26172769	26172868	.	-	.	gene_id lnc-FAM182B-6 ; transcript_id lnc-FAM182B-6:4 ; gene_alias_1 XLOC_013715 ; gene_alias_2 linc-ZNF337-9 ; transcript_alias_1 TCONS_00028360 ;
chr20	lncipedia.org	exon	26174934	26174953	.	-	.	gene_id lnc-FAM182B-6 ; transcript_id lnc-FAM182B-6:4 ; gene_alias_1 XLOC_013715 ; gene_alias_2 linc-ZNF337-9 ; transcript_alias_1 TCONS_00028360 ;
chr2	lncipedia.org	exon	62683442	62683886	.	-	.	gene_id lnc-TMEM17-1 ; transcript_id lnc-TMEM17-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_002116 ; gene_alias_2 linc-CCT4 ; transcript_alias_1 TCONS_00004274 ;
chr2	lncipedia.org	exon	62686455	62686615	.	-	.	gene_id lnc-TMEM17-1 ; transcript_id lnc-TMEM17-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_002116 ; gene_alias_2 linc-CCT4 ; transcript_alias_1 TCONS_00004274 ;
chr2	lncipedia.org	exon	62688206	62688298	.	-	.	gene_id lnc-TMEM17-1 ; transcript_id lnc-TMEM17-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_002116 ; gene_alias_2 linc-CCT4 ; transcript_alias_1 TCONS_00004274 ;
chr2	lncipedia.org	exon	62688863	62688910	.	-	.	gene_id lnc-TMEM17-1 ; transcript_id lnc-TMEM17-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_002116 ; gene_alias_2 linc-CCT4 ; transcript_alias_1 TCONS_00004274 ;
chr5	lncipedia.org	exon	29363459	29363489	.	-	.	gene_id lnc-DROSHA-7 ; transcript_id lnc-DROSHA-7:1 ; gene_alias_1 XLOC_004765 ; gene_alias_2 linc-CDH9-6 ; transcript_alias_1 TCONS_00010291 ;
chr5	lncipedia.org	exon	29381960	29382069	.	-	.	gene_id lnc-DROSHA-7 ; transcript_id lnc-DROSHA-7:1 ; gene_alias_1 XLOC_004765 ; gene_alias_2 linc-CDH9-6 ; transcript_alias_1 TCONS_00010291 ;
chr5	lncipedia.org	exon	29384404	29384499	.	-	.	gene_id lnc-DROSHA-7 ; transcript_id lnc-DROSHA-7:1 ; gene_alias_1 XLOC_004765 ; gene_alias_2 linc-CDH9-6 ; transcript_alias_1 TCONS_00010291 ;
chr5	lncipedia.org	exon	29395961	29396100	.	-	.	gene_id lnc-DROSHA-7 ; transcript_id lnc-DROSHA-7:1 ; gene_alias_1 XLOC_004765 ; gene_alias_2 linc-CDH9-6 ; transcript_alias_1 TCONS_00010291 ;
chr6	lncipedia.org	exon	45530215	45530404	.	-	.	gene_id lnc-SUPT3H-1 ; transcript_id lnc-SUPT3H-1:7 ; gene_alias_1 XLOC_005737 ; gene_alias_2 linc-SUPT3H ; transcript_alias_1 TCONS_00012737 ;
chr6	lncipedia.org	exon	45541116	45542183	.	-	.	gene_id lnc-SUPT3H-1 ; transcript_id lnc-SUPT3H-1:7 ; gene_alias_1 XLOC_005737 ; gene_alias_2 linc-SUPT3H ; transcript_alias_1 TCONS_00012737 ;
chr6	lncipedia.org	exon	45544322	45544501	.	-	.	gene_id lnc-SUPT3H-1 ; transcript_id lnc-SUPT3H-1:7 ; gene_alias_1 XLOC_005737 ; gene_alias_2 linc-SUPT3H ; transcript_alias_1 TCONS_00012737 ;
chr8	lncipedia.org	exon	1200380	1200572	.	+	.	gene_id lnc-FBXO25-5 ; transcript_id lnc-FBXO25-5:8 ; gene_alias_1 XLOC_006683 ; gene_alias_2 linc-DLGAP2-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00015204 ;
chr8	lncipedia.org	exon	1208851	1208883	.	+	.	gene_id lnc-FBXO25-5 ; transcript_id lnc-FBXO25-5:8 ; gene_alias_1 XLOC_006683 ; gene_alias_2 linc-DLGAP2-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00015204 ;
chr2	lncipedia.org	exon	173117101	173117361	.	+	.	gene_id lnc-ITGA6-2 ; transcript_id lnc-ITGA6-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_001756 ; gene_alias_2 linc-ITGA6-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00003940 ;
chr2	lncipedia.org	exon	173145465	173145603	.	+	.	gene_id lnc-ITGA6-2 ; transcript_id lnc-ITGA6-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_001756 ; gene_alias_2 linc-ITGA6-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00003940 ;
chr4	lncipedia.org	exon	188626502	188626577	.	+	.	gene_id lnc-ZFP42-2 ; transcript_id lnc-ZFP42-2:10 ; gene_alias_1 XLOC_003829 ; gene_alias_2 linc-ZFP42-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00008977 ;
chr4	lncipedia.org	exon	188632898	188633228	.	+	.	gene_id lnc-ZFP42-2 ; transcript_id lnc-ZFP42-2:10 ; gene_alias_1 XLOC_003829 ; gene_alias_2 linc-ZFP42-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00008977 ;
chrX	lncipedia.org	exon	154697947	154698035	.	+	.	gene_id lnc-F8A2-1 ; transcript_id lnc-F8A2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008094 ; gene_alias_2 linc-SPRY3-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00016944 ;
chrX	lncipedia.org	exon	154716244	154716706	.	+	.	gene_id lnc-F8A2-1 ; transcript_id lnc-F8A2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008094 ; gene_alias_2 linc-SPRY3-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00016944 ;
chr2	lncipedia.org	exon	241625751	241625759	.	+	.	gene_id lnc-AC011298.2.1-1 ; transcript_id lnc-AC011298.2.1-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_001920 ; gene_alias_2 linc-AQP12A ; transcript_alias_1 TCONS_00004072 ;
chr2	lncipedia.org	exon	241625855	241625943	.	+	.	gene_id lnc-AC011298.2.1-1 ; transcript_id lnc-AC011298.2.1-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_001920 ; gene_alias_2 linc-AQP12A ; transcript_alias_1 TCONS_00004072 ;
chr2	lncipedia.org	exon	241626409	241626757	.	+	.	gene_id lnc-AC011298.2.1-1 ; transcript_id lnc-AC011298.2.1-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_001920 ; gene_alias_2 linc-AQP12A ; transcript_alias_1 TCONS_00004072 ;
chr6	lncipedia.org	exon	125633313	125633364	.	-	.	gene_id lnc-HDDC2-1 ; transcript_id lnc-HDDC2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_005826 ; gene_alias_2 linc-HDDC2-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00012271 ;
chr6	lncipedia.org	exon	125634470	125634852	.	-	.	gene_id lnc-HDDC2-1 ; transcript_id lnc-HDDC2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_005826 ; gene_alias_2 linc-HDDC2-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00012271 ;
chr2	lncipedia.org	exon	123260348	123260425	.	-	.	gene_id lnc-MKI67IP-1 ; transcript_id lnc-MKI67IP-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_002301 ; gene_alias_2 linc-MKI67IP-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00005245 ;
chr2	lncipedia.org	exon	123260716	123261082	.	-	.	gene_id lnc-MKI67IP-1 ; transcript_id lnc-MKI67IP-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_002301 ; gene_alias_2 linc-MKI67IP-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00005245 ;
chr11	lncipedia.org	exon	67326816	67326869	.	-	.	gene_id lnc-CABP2-1 ; transcript_id lnc-CABP2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_009480 ; gene_alias_2 linc-CABP2 ; transcript_alias_1 TCONS_00019680 ;
chr11	lncipedia.org	exon	67330535	67330635	.	-	.	gene_id lnc-CABP2-1 ; transcript_id lnc-CABP2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_009480 ; gene_alias_2 linc-CABP2 ; transcript_alias_1 TCONS_00019680 ;
chr11	lncipedia.org	exon	67330836	67330888	.	-	.	gene_id lnc-CABP2-1 ; transcript_id lnc-CABP2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_009480 ; gene_alias_2 linc-CABP2 ; transcript_alias_1 TCONS_00019680 ;
chr6	lncipedia.org	exon	11865833	11865892	.	-	.	gene_id lnc-C6orf105-1 ; transcript_id lnc-C6orf105-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_005607 ; gene_alias_2 linc-C6orf105-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00012082 ;
chr6	lncipedia.org	exon	11868339	11868724	.	-	.	gene_id lnc-C6orf105-1 ; transcript_id lnc-C6orf105-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_005607 ; gene_alias_2 linc-C6orf105-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00012082 ;
chr8	lncipedia.org	exon	75522030	75522275	.	-	.	gene_id lnc-JPH1-2 ; transcript_id lnc-JPH1-2:4 ; gene_alias_1 XLOC_007121 ; gene_alias_2 linc-JPH1-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00015452 ;
chr8	lncipedia.org	exon	75524689	75524722	.	-	.	gene_id lnc-JPH1-2 ; transcript_id lnc-JPH1-2:4 ; gene_alias_1 XLOC_007121 ; gene_alias_2 linc-JPH1-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00015452 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26097803	26099068	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:12 ; gene_alias_1 XLOC_010032 ; gene_alias_2 linc-IFLTD1 ; transcript_alias_1 TCONS_00020736 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26103306	26103421	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:12 ; gene_alias_1 XLOC_010032 ; gene_alias_2 linc-IFLTD1 ; transcript_alias_1 TCONS_00020736 ;
chrX	lncipedia.org	exon	37748183	37748411	.	+	.	gene_id lnc-CYBB-1 ; transcript_id lnc-CYBB-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007952 ; gene_alias_2 linc-CXorf27-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017415 ;
chrX	lncipedia.org	exon	37755653	37756084	.	+	.	gene_id lnc-CYBB-1 ; transcript_id lnc-CYBB-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007952 ; gene_alias_2 linc-CXorf27-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017415 ;
chr5	lncipedia.org	exon	139548158	139548327	.	+	.	gene_id lnc-C5orf32-1 ; transcript_id lnc-C5orf32-1:13 ; gene_alias_1 XLOC_004577 ; gene_alias_2 linc-C5orf32-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00010113 ;
chr5	lncipedia.org	exon	139552333	139552555	.	+	.	gene_id lnc-C5orf32-1 ; transcript_id lnc-C5orf32-1:13 ; gene_alias_1 XLOC_004577 ; gene_alias_2 linc-C5orf32-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00010113 ;
chr5	lncipedia.org	exon	139552892	139553570	.	+	.	gene_id lnc-C5orf32-1 ; transcript_id lnc-C5orf32-1:13 ; gene_alias_1 XLOC_004577 ; gene_alias_2 linc-C5orf32-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00010113 ;
chr2	lncipedia.org	exon	65158445	65158978	.	+	.	gene_id lnc-SLC1A4-1 ; transcript_id lnc-SLC1A4-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_001499 ; gene_alias_2 linc-SLC1A4-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003711 ;
chr2	lncipedia.org	exon	65161583	65161625	.	+	.	gene_id lnc-SLC1A4-1 ; transcript_id lnc-SLC1A4-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_001499 ; gene_alias_2 linc-SLC1A4-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003711 ;
chr15	lncipedia.org	exon	79000343	79000447	.	-	.	gene_id lnc-ADAMTS7-1 ; transcript_id lnc-ADAMTS7-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_011540 ; gene_alias_2 linc-CHRNB4 ; transcript_alias_1 TCONS_00023747 ;
chr15	lncipedia.org	exon	79010710	79010807	.	-	.	gene_id lnc-ADAMTS7-1 ; transcript_id lnc-ADAMTS7-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_011540 ; gene_alias_2 linc-CHRNB4 ; transcript_alias_1 TCONS_00023747 ;
chr21	lncipedia.org	exon	46398652	46398667	.	-	.	gene_id lnc-C21orf67-1 ; transcript_id lnc-C21orf67-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_014119 ; gene_alias_2 linc-ITGB2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00029181 ;
chr21	lncipedia.org	exon	46398745	46399133	.	-	.	gene_id lnc-C21orf67-1 ; transcript_id lnc-C21orf67-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_014119 ; gene_alias_2 linc-ITGB2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00029181 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175399604	175399671	.	+	.	gene_id lnc-FAM153B-3 ; transcript_id lnc-FAM153B-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_004653 ; gene_alias_2 linc-FAM153B ; transcript_alias_1 TCONS_00010185 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175414056	175414364	.	+	.	gene_id lnc-FAM153B-3 ; transcript_id lnc-FAM153B-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_004653 ; gene_alias_2 linc-FAM153B ; transcript_alias_1 TCONS_00010185 ;
chr1	lncipedia.org	exon	149230539	149230773	.	+	.	gene_id lnc-PPIAL4C-5 ; transcript_id lnc-PPIAL4C-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_000393 ; gene_alias_2 linc-PPIAL4A-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00001142 ;
chr1	lncipedia.org	exon	149231543	149231759	.	+	.	gene_id lnc-PPIAL4C-5 ; transcript_id lnc-PPIAL4C-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_000393 ; gene_alias_2 linc-PPIAL4A-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00001142 ;
chr6	lncipedia.org	exon	141724594	141724626	.	+	.	gene_id lnc-GJE1-3 ; transcript_id lnc-GJE1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_005486 ; gene_alias_2 linc-VTA1-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00011974 ;
chr6	lncipedia.org	exon	141724707	141724930	.	+	.	gene_id lnc-GJE1-3 ; transcript_id lnc-GJE1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_005486 ; gene_alias_2 linc-VTA1-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00011974 ;
chr4	lncipedia.org	exon	133452275	133452325	.	+	.	gene_id lnc-PCDH10-2 ; transcript_id lnc-PCDH10-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_003691 ; gene_alias_2 linc-PCDH10-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00008254 ;
chr4	lncipedia.org	exon	133467373	133467632	.	+	.	gene_id lnc-PCDH10-2 ; transcript_id lnc-PCDH10-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_003691 ; gene_alias_2 linc-PCDH10-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00008254 ;
chr14	lncipedia.org	exon	44862209	44862941	.	-	.	gene_id lnc-FSCB-1 ; transcript_id lnc-FSCB-1:6 ; gene_alias_1 XLOC_011006 ; gene_alias_2 linc-FBXO33-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00022727 ;
chr14	lncipedia.org	exon	44913910	44914002	.	-	.	gene_id lnc-FSCB-1 ; transcript_id lnc-FSCB-1:6 ; gene_alias_1 XLOC_011006 ; gene_alias_2 linc-FBXO33-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00022727 ;
chr11	lncipedia.org	exon	67655621	67655795	.	+	.	gene_id lnc-NDUFS8-2 ; transcript_id lnc-NDUFS8-2:6 ; gene_alias_1 XLOC_009181 ; gene_alias_2 linc-ALDH3B1-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00019353 ;
chr11	lncipedia.org	exon	67661350	67661552	.	+	.	gene_id lnc-NDUFS8-2 ; transcript_id lnc-NDUFS8-2:6 ; gene_alias_1 XLOC_009181 ; gene_alias_2 linc-ALDH3B1-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00019353 ;
chr8	lncipedia.org	exon	50137497	50137609	.	+	.	gene_id lnc-C8orf22-2 ; transcript_id lnc-C8orf22-2:5 ; gene_alias_1 XLOC_006794 ; gene_alias_2 linc-SNTG1-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00014697 ;
chr8	lncipedia.org	exon	50140699	50140944	.	+	.	gene_id lnc-C8orf22-2 ; transcript_id lnc-C8orf22-2:5 ; gene_alias_1 XLOC_006794 ; gene_alias_2 linc-SNTG1-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00014697 ;
chr8	lncipedia.org	exon	142121974	142122009	.	+	.	gene_id lnc-DENND3-1 ; transcript_id lnc-DENND3-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_006944 ; gene_alias_2 linc-DENND3-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00014876 ;
chr8	lncipedia.org	exon	142122783	142123085	.	+	.	gene_id lnc-DENND3-1 ; transcript_id lnc-DENND3-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_006944 ; gene_alias_2 linc-DENND3-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00014876 ;
chr2	lncipedia.org	exon	171627646	171627697	.	+	.	gene_id lnc-AC007405.7.1-1 ; transcript_id lnc-AC007405.7.1-1:6 ; gene_alias_1 XLOC_001748 ; gene_alias_2 linc-GAD1-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003935 ;
chr2	lncipedia.org	exon	171633887	171633935	.	+	.	gene_id lnc-AC007405.7.1-1 ; transcript_id lnc-AC007405.7.1-1:6 ; gene_alias_1 XLOC_001748 ; gene_alias_2 linc-GAD1-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003935 ;
chr2	lncipedia.org	exon	171634154	171634190	.	+	.	gene_id lnc-AC007405.7.1-1 ; transcript_id lnc-AC007405.7.1-1:6 ; gene_alias_1 XLOC_001748 ; gene_alias_2 linc-GAD1-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003935 ;
chr2	lncipedia.org	exon	171638751	171638903	.	+	.	gene_id lnc-AC007405.7.1-1 ; transcript_id lnc-AC007405.7.1-1:6 ; gene_alias_1 XLOC_001748 ; gene_alias_2 linc-GAD1-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003935 ;
chr1	lncipedia.org	exon	45282505	45282510	.	+	.	gene_id lnc-BTBD19-1 ; transcript_id lnc-BTBD19-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_000166 ; gene_alias_2 linc-UROD ; transcript_alias_1 TCONS_00002016 ;
chr1	lncipedia.org	exon	45282569	45283445	.	+	.	gene_id lnc-BTBD19-1 ; transcript_id lnc-BTBD19-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_000166 ; gene_alias_2 linc-UROD ; transcript_alias_1 TCONS_00002016 ;
chr10	lncipedia.org	exon	81426568	81426614	.	+	.	gene_id lnc-FAM22B-1 ; transcript_id lnc-FAM22B-1:5 ; gene_alias_1 XLOC_008528 ; gene_alias_2 linc-C10orf57-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00018767 ;
chr10	lncipedia.org	exon	81429244	81429330	.	+	.	gene_id lnc-FAM22B-1 ; transcript_id lnc-FAM22B-1:5 ; gene_alias_1 XLOC_008528 ; gene_alias_2 linc-C10orf57-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00018767 ;
chr10	lncipedia.org	exon	81430847	81430889	.	+	.	gene_id lnc-FAM22B-1 ; transcript_id lnc-FAM22B-1:5 ; gene_alias_1 XLOC_008528 ; gene_alias_2 linc-C10orf57-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00018767 ;
chr10	lncipedia.org	exon	81436224	81436466	.	+	.	gene_id lnc-FAM22B-1 ; transcript_id lnc-FAM22B-1:5 ; gene_alias_1 XLOC_008528 ; gene_alias_2 linc-C10orf57-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00018767 ;
chr17	lncipedia.org	exon	21383658	21383751	.	-	.	gene_id lnc-C17orf51-2 ; transcript_id lnc-C17orf51-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_012421 ; gene_alias_2 linc-C17orf103 ; transcript_alias_1 TCONS_00025591 ;
chr17	lncipedia.org	exon	21405059	21405497	.	-	.	gene_id lnc-C17orf51-2 ; transcript_id lnc-C17orf51-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_012421 ; gene_alias_2 linc-C17orf103 ; transcript_alias_1 TCONS_00025591 ;
chr12	lncipedia.org	exon	48672796	48673234	.	-	.	gene_id lnc-ZNF641-1 ; transcript_id lnc-ZNF641-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_010064 ; gene_alias_2 linc-OR10AD1 ; transcript_alias_1 TCONS_00020776 ;
chr12	lncipedia.org	exon	48677933	48677977	.	-	.	gene_id lnc-ZNF641-1 ; transcript_id lnc-ZNF641-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_010064 ; gene_alias_2 linc-OR10AD1 ; transcript_alias_1 TCONS_00020776 ;
chr4	lncipedia.org	exon	184254816	184255529	.	-	.	gene_id lnc-CLDN24-2 ; transcript_id lnc-CLDN24-2:3 ; gene_alias_1 XLOC_004198 ; gene_alias_2 linc-CLDN24-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009184 ;
chr4	lncipedia.org	exon	184255623	184255706	.	-	.	gene_id lnc-CLDN24-2 ; transcript_id lnc-CLDN24-2:3 ; gene_alias_1 XLOC_004198 ; gene_alias_2 linc-CLDN24-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009184 ;
chr15	lncipedia.org	exon	99557907	99558042	.	+	.	gene_id lnc-IGF1R-1 ; transcript_id lnc-IGF1R-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_011378 ; gene_alias_2 linc-SYNM-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00023545 ;
chr15	lncipedia.org	exon	99560734	99561165	.	+	.	gene_id lnc-IGF1R-1 ; transcript_id lnc-IGF1R-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_011378 ; gene_alias_2 linc-SYNM-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00023545 ;
chr4	lncipedia.org	exon	188553703	188553988	.	+	.	gene_id lnc-ZFP42-2 ; transcript_id lnc-ZFP42-2:4 ; gene_alias_1 XLOC_003829 ; gene_alias_2 linc-ZFP42-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00008374 ;
chr4	lncipedia.org	exon	188581291	188581337	.	+	.	gene_id lnc-ZFP42-2 ; transcript_id lnc-ZFP42-2:4 ; gene_alias_1 XLOC_003829 ; gene_alias_2 linc-ZFP42-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00008374 ;
chr7	lncipedia.org	exon	63496665	63496868	.	-	.	gene_id lnc-ZNF680-2 ; transcript_id lnc-ZNF680-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_006469 ; gene_alias_2 linc-ZNF479-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00014311 ;
chr7	lncipedia.org	exon	63498717	63498931	.	-	.	gene_id lnc-ZNF680-2 ; transcript_id lnc-ZNF680-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_006469 ; gene_alias_2 linc-ZNF479-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00014311 ;
chr21	lncipedia.org	exon	31456109	31456213	.	+	.	gene_id lnc-KRTAP13-1-1 ; transcript_id lnc-KRTAP13-1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_013909 ; gene_alias_2 linc-KRTAP13-1-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00028991 ;
chr21	lncipedia.org	exon	31462086	31462294	.	+	.	gene_id lnc-KRTAP13-1-1 ; transcript_id lnc-KRTAP13-1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_013909 ; gene_alias_2 linc-KRTAP13-1-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00028991 ;
chr20	lncipedia.org	exon	23046042	23046166	.	-	.	gene_id lnc-CD93-1 ; transcript_id lnc-CD93-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_013688 ; gene_alias_2 linc-THBD ; transcript_alias_1 TCONS_00028340 ;
chr20	lncipedia.org	exon	23049873	23049952	.	-	.	gene_id lnc-CD93-1 ; transcript_id lnc-CD93-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_013688 ; gene_alias_2 linc-THBD ; transcript_alias_1 TCONS_00028340 ;
chr20	lncipedia.org	exon	23051887	23052105	.	-	.	gene_id lnc-CD93-1 ; transcript_id lnc-CD93-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_013688 ; gene_alias_2 linc-THBD ; transcript_alias_1 TCONS_00028340 ;
chrY	lncipedia.org	exon	23313362	23313528	.	+	.	gene_id lnc-RBMY1B-1 ; transcript_id lnc-RBMY1B-1:5 ; gene_alias_1 XLOC_008299 ; gene_alias_2 linc-RBMY1B ; transcript_alias_1 TCONS_00017642 ;
chrY	lncipedia.org	exon	23314725	23314814	.	+	.	gene_id lnc-RBMY1B-1 ; transcript_id lnc-RBMY1B-1:5 ; gene_alias_1 XLOC_008299 ; gene_alias_2 linc-RBMY1B ; transcript_alias_1 TCONS_00017642 ;
chr1	lncipedia.org	exon	22350720	22350938	.	-	.	gene_id lnc-HSPG2-1 ; transcript_id lnc-HSPG2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_000732 ; gene_alias_2 linc-HSPG2 ; transcript_alias_1 TCONS_00001413 ;
chr1	lncipedia.org	exon	22352457	22352724	.	-	.	gene_id lnc-HSPG2-1 ; transcript_id lnc-HSPG2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_000732 ; gene_alias_2 linc-HSPG2 ; transcript_alias_1 TCONS_00001413 ;
chr15	lncipedia.org	exon	24415175	24415308	.	+	.	gene_id lnc-C15orf2-11 ; transcript_id lnc-C15orf2-11:1 ; gene_alias_1 XLOC_011172 ; gene_alias_2 linc-C15orf2-10 ; transcript_alias_1 TCONS_00023303 ;
chr15	lncipedia.org	exon	24422953	24423086	.	+	.	gene_id lnc-C15orf2-11 ; transcript_id lnc-C15orf2-11:1 ; gene_alias_1 XLOC_011172 ; gene_alias_2 linc-C15orf2-10 ; transcript_alias_1 TCONS_00023303 ;
chr9	lncipedia.org	exon	110267577	110267635	.	+	.	gene_id lnc-RAD23B-5 ; transcript_id lnc-RAD23B-5:3 ; gene_alias_1 XLOC_007507 ; gene_alias_2 linc-ACTL7A-9 ; transcript_alias_1 TCONS_00016122 ;
chr9	lncipedia.org	exon	110276945	110277663	.	+	.	gene_id lnc-RAD23B-5 ; transcript_id lnc-RAD23B-5:3 ; gene_alias_1 XLOC_007507 ; gene_alias_2 linc-ACTL7A-9 ; transcript_alias_1 TCONS_00016122 ;
chr22	lncipedia.org	exon	20850295	20850323	.	+	.	gene_id lnc-ZNF74-1 ; transcript_id lnc-ZNF74-1:6 ; gene_alias_1 XLOC_014159 ; gene_alias_2 linc-MED15 ; transcript_alias_1 TCONS_00029519 ;
chr22	lncipedia.org	exon	20852954	20853078	.	+	.	gene_id lnc-ZNF74-1 ; transcript_id lnc-ZNF74-1:6 ; gene_alias_1 XLOC_014159 ; gene_alias_2 linc-MED15 ; transcript_alias_1 TCONS_00029519 ;
chr22	lncipedia.org	exon	20855028	20855116	.	+	.	gene_id lnc-ZNF74-1 ; transcript_id lnc-ZNF74-1:6 ; gene_alias_1 XLOC_014159 ; gene_alias_2 linc-MED15 ; transcript_alias_1 TCONS_00029519 ;
chr13	lncipedia.org	exon	85470379	85470499	.	-	.	gene_id lnc-SLITRK6-5 ; transcript_id lnc-SLITRK6-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_010677 ; gene_alias_2 linc-SLITRK1-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00022074 ;
chr13	lncipedia.org	exon	85476481	85476607	.	-	.	gene_id lnc-SLITRK6-5 ; transcript_id lnc-SLITRK6-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_010677 ; gene_alias_2 linc-SLITRK1-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00022074 ;
chr9	lncipedia.org	exon	139151965	139152110	.	-	.	gene_id lnc-QSOX2-1 ; transcript_id lnc-QSOX2-1:12 ; gene_alias_1 XLOC_007895 ; gene_alias_2 linc-QSOX2 ; transcript_alias_1 TCONS_00016899 ;
chr9	lncipedia.org	exon	139154157	139154308	.	-	.	gene_id lnc-QSOX2-1 ; transcript_id lnc-QSOX2-1:12 ; gene_alias_1 XLOC_007895 ; gene_alias_2 linc-QSOX2 ; transcript_alias_1 TCONS_00016899 ;
chr9	lncipedia.org	exon	139155468	139155644	.	-	.	gene_id lnc-QSOX2-1 ; transcript_id lnc-QSOX2-1:12 ; gene_alias_1 XLOC_007895 ; gene_alias_2 linc-QSOX2 ; transcript_alias_1 TCONS_00016899 ;
chr9	lncipedia.org	exon	139157802	139157976	.	-	.	gene_id lnc-QSOX2-1 ; transcript_id lnc-QSOX2-1:12 ; gene_alias_1 XLOC_007895 ; gene_alias_2 linc-QSOX2 ; transcript_alias_1 TCONS_00016899 ;
chr1	lncipedia.org	exon	212398619	212398855	.	-	.	gene_id lnc-TMEM206-5 ; transcript_id lnc-TMEM206-5:6 ; gene_alias_1 XLOC_001191 ; gene_alias_2 linc-INTS7 ; transcript_alias_1 TCONS_00001802 ;
chr1	lncipedia.org	exon	212403545	212403601	.	-	.	gene_id lnc-TMEM206-5 ; transcript_id lnc-TMEM206-5:6 ; gene_alias_1 XLOC_001191 ; gene_alias_2 linc-INTS7 ; transcript_alias_1 TCONS_00001802 ;
chr1	lncipedia.org	exon	212406670	212406704	.	-	.	gene_id lnc-TMEM206-5 ; transcript_id lnc-TMEM206-5:6 ; gene_alias_1 XLOC_001191 ; gene_alias_2 linc-INTS7 ; transcript_alias_1 TCONS_00001802 ;
chr14	lncipedia.org	exon	46175495	46175705	.	-	.	gene_id lnc-MIS18BP1-1 ; transcript_id lnc-MIS18BP1-1:6 ; gene_alias_1 XLOC_011012 ; gene_alias_2 linc-C14orf106 ; transcript_alias_1 TCONS_00022737 ;
chr14	lncipedia.org	exon	46181102	46181226	.	-	.	gene_id lnc-MIS18BP1-1 ; transcript_id lnc-MIS18BP1-1:6 ; gene_alias_1 XLOC_011012 ; gene_alias_2 linc-C14orf106 ; transcript_alias_1 TCONS_00022737 ;
chr19	lncipedia.org	exon	29709834	29709885	.	+	.	gene_id lnc-VSTM2B-4 ; transcript_id lnc-VSTM2B-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_013029 ; gene_alias_2 linc-VSTM2B-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00026980 ;
chr19	lncipedia.org	exon	29710360	29710603	.	+	.	gene_id lnc-VSTM2B-4 ; transcript_id lnc-VSTM2B-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_013029 ; gene_alias_2 linc-VSTM2B-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00026980 ;
chr9	lncipedia.org	exon	35913972	35914066	.	+	.	gene_id lnc-HRCT1-2 ; transcript_id lnc-HRCT1-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_007341 ; gene_alias_2 linc-RECK-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00015969 ;
chr9	lncipedia.org	exon	35914178	35914407	.	+	.	gene_id lnc-HRCT1-2 ; transcript_id lnc-HRCT1-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_007341 ; gene_alias_2 linc-RECK-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00015969 ;
chr16	lncipedia.org	exon	73846493	73846539	.	+	.	gene_id lnc-RP11-44L9.1.1-9 ; transcript_id lnc-RP11-44L9.1.1-9:1 ; gene_alias_1 XLOC_011787 ; gene_alias_2 linc-PSMD7-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00024465 ;
chr16	lncipedia.org	exon	73849487	73849940	.	+	.	gene_id lnc-RP11-44L9.1.1-9 ; transcript_id lnc-RP11-44L9.1.1-9:1 ; gene_alias_1 XLOC_011787 ; gene_alias_2 linc-PSMD7-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00024465 ;
chr6	lncipedia.org	exon	143845464	143845529	.	+	.	gene_id lnc-PHACTR2-1 ; transcript_id lnc-PHACTR2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_005490 ; gene_alias_2 linc-PHACTR2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00011980 ;
chr6	lncipedia.org	exon	143855680	143855908	.	+	.	gene_id lnc-PHACTR2-1 ; transcript_id lnc-PHACTR2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_005490 ; gene_alias_2 linc-PHACTR2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00011980 ;
chr9	lncipedia.org	exon	68995847	68996129	.	+	.	gene_id lnc-BX255923.1-2 ; transcript_id lnc-BX255923.1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_007383 ; gene_alias_2 linc-ANKRD20A4-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00015999 ;
chr9	lncipedia.org	exon	68997753	68998913	.	+	.	gene_id lnc-BX255923.1-2 ; transcript_id lnc-BX255923.1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_007383 ; gene_alias_2 linc-ANKRD20A4-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00015999 ;
chr15	lncipedia.org	exon	24585971	24586037	.	-	.	gene_id lnc-NDN-3 ; transcript_id lnc-NDN-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_011403 ; gene_alias_2 linc-NDN-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00023589 ;
chr15	lncipedia.org	exon	24586778	24586842	.	-	.	gene_id lnc-NDN-3 ; transcript_id lnc-NDN-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_011403 ; gene_alias_2 linc-NDN-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00023589 ;
chr15	lncipedia.org	exon	24588485	24588620	.	-	.	gene_id lnc-NDN-3 ; transcript_id lnc-NDN-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_011403 ; gene_alias_2 linc-NDN-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00023589 ;
chr13	lncipedia.org	exon	63609109	63609165	.	+	.	gene_id lnc-AL445989.1-3 ; transcript_id lnc-AL445989.1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_010410 ; gene_alias_2 linc-C13orf34-15 ; transcript_alias_1 TCONS_00021810 ;
chr13	lncipedia.org	exon	63671473	63671829	.	+	.	gene_id lnc-AL445989.1-3 ; transcript_id lnc-AL445989.1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_010410 ; gene_alias_2 linc-C13orf34-15 ; transcript_alias_1 TCONS_00021810 ;
chr2	lncipedia.org	exon	16061644	16061819	.	+	.	gene_id lnc-MYCN-1 ; transcript_id lnc-MYCN-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_001364 ; gene_alias_2 linc-MYCN-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00004703 ;
chr2	lncipedia.org	exon	16075896	16076286	.	+	.	gene_id lnc-MYCN-1 ; transcript_id lnc-MYCN-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_001364 ; gene_alias_2 linc-MYCN-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00004703 ;
chr6	lncipedia.org	exon	170920275	170920448	.	-	.	gene_id lnc-PDCD2-1 ; transcript_id lnc-PDCD2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_005950 ; gene_alias_2 linc-PDCD2-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00012383 ;
chr6	lncipedia.org	exon	170921684	170921789	.	-	.	gene_id lnc-PDCD2-1 ; transcript_id lnc-PDCD2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_005950 ; gene_alias_2 linc-PDCD2-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00012383 ;
chr12	lncipedia.org	exon	18906533	18906704	.	+	.	gene_id lnc-CAPZA3-2 ; transcript_id lnc-CAPZA3-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_009679 ; gene_alias_2 linc-PLEKHA5-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00020348 ;
chr12	lncipedia.org	exon	18926282	18926324	.	+	.	gene_id lnc-CAPZA3-2 ; transcript_id lnc-CAPZA3-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_009679 ; gene_alias_2 linc-PLEKHA5-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00020348 ;
chr7	lncipedia.org	exon	88983550	88983599	.	+	.	gene_id lnc-ZNF804B-2 ; transcript_id lnc-ZNF804B-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_006163 ; gene_alias_2 linc-STEAP1-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00013521 ;
chr7	lncipedia.org	exon	89125948	89126209	.	+	.	gene_id lnc-ZNF804B-2 ; transcript_id lnc-ZNF804B-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_006163 ; gene_alias_2 linc-STEAP1-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00013521 ;
chrX	lncipedia.org	exon	47531909	47531992	.	+	.	gene_id lnc-TIMP1-1 ; transcript_id lnc-TIMP1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007974 ; gene_alias_2 linc-ZNF81-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017163 ;
chrX	lncipedia.org	exon	47544715	47544867	.	+	.	gene_id lnc-TIMP1-1 ; transcript_id lnc-TIMP1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007974 ; gene_alias_2 linc-ZNF81-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017163 ;
chrX	lncipedia.org	exon	57148380	57148400	.	+	.	gene_id lnc-FAAH2-2 ; transcript_id lnc-FAAH2-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_007996 ; gene_alias_2 linc-FAAH2-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017182 ;
chrX	lncipedia.org	exon	57153318	57153491	.	+	.	gene_id lnc-FAAH2-2 ; transcript_id lnc-FAAH2-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_007996 ; gene_alias_2 linc-FAAH2-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017182 ;
chrX	lncipedia.org	exon	57154177	57154235	.	+	.	gene_id lnc-FAAH2-2 ; transcript_id lnc-FAAH2-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_007996 ; gene_alias_2 linc-FAAH2-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017182 ;
chr15	lncipedia.org	exon	93632685	93632718	.	+	.	gene_id lnc-CHD2-2 ; transcript_id lnc-CHD2-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_011359 ; gene_alias_2 linc-MCTP2-6 ; transcript_alias_1 TCONS_00023516 ;
chr15	lncipedia.org	exon	93649434	93649529	.	+	.	gene_id lnc-CHD2-2 ; transcript_id lnc-CHD2-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_011359 ; gene_alias_2 linc-MCTP2-6 ; transcript_alias_1 TCONS_00023516 ;
chr15	lncipedia.org	exon	93650602	93650746	.	+	.	gene_id lnc-CHD2-2 ; transcript_id lnc-CHD2-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_011359 ; gene_alias_2 linc-MCTP2-6 ; transcript_alias_1 TCONS_00023516 ;
chr15	lncipedia.org	exon	93684687	93684750	.	+	.	gene_id lnc-CHD2-2 ; transcript_id lnc-CHD2-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_011359 ; gene_alias_2 linc-MCTP2-6 ; transcript_alias_1 TCONS_00023516 ;
chr15	lncipedia.org	exon	21912351	21912380	.	-	.	gene_id lnc-POTEB-2 ; transcript_id lnc-POTEB-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_011393 ; gene_alias_2 linc-POTEB-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00023571 ;
chr15	lncipedia.org	exon	21913679	21913857	.	-	.	gene_id lnc-POTEB-2 ; transcript_id lnc-POTEB-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_011393 ; gene_alias_2 linc-POTEB-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00023571 ;
chr11	lncipedia.org	exon	80471540	80471617	.	-	.	gene_id lnc-ODZ4-4 ; transcript_id lnc-ODZ4-4:3 ; gene_alias_1 XLOC_009515 ; gene_alias_2 linc-ODZ4-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00020108 ;
chr11	lncipedia.org	exon	80473021	80473367	.	-	.	gene_id lnc-ODZ4-4 ; transcript_id lnc-ODZ4-4:3 ; gene_alias_1 XLOC_009515 ; gene_alias_2 linc-ODZ4-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00020108 ;
chr1	lncipedia.org	exon	147209596	147209751	.	-	.	gene_id lnc-GJA5-1 ; transcript_id lnc-GJA5-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_001006 ; gene_alias_2 linc-ACP6 ; transcript_alias_1 TCONS_00001668 ;
chr1	lncipedia.org	exon	147210816	147210939	.	-	.	gene_id lnc-GJA5-1 ; transcript_id lnc-GJA5-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_001006 ; gene_alias_2 linc-ACP6 ; transcript_alias_1 TCONS_00001668 ;
chr5	lncipedia.org	exon	95179752	95180339	.	+	.	gene_id lnc-C5orf27-1 ; transcript_id lnc-C5orf27-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_004478 ; gene_alias_2 linc-CAST-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00010747 ;
chr5	lncipedia.org	exon	95183761	95183829	.	+	.	gene_id lnc-C5orf27-1 ; transcript_id lnc-C5orf27-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_004478 ; gene_alias_2 linc-CAST-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00010747 ;
chr8	lncipedia.org	exon	12053532	12053747	.	+	.	gene_id lnc-ZNF705D-2 ; transcript_id lnc-ZNF705D-2:4 ; gene_alias_1 XLOC_006719 ; gene_alias_2 linc-C8orf79-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00015224 ;
chr8	lncipedia.org	exon	12056213	12056305	.	+	.	gene_id lnc-ZNF705D-2 ; transcript_id lnc-ZNF705D-2:4 ; gene_alias_1 XLOC_006719 ; gene_alias_2 linc-C8orf79-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00015224 ;
chr8	lncipedia.org	exon	12056832	12056929	.	+	.	gene_id lnc-ZNF705D-2 ; transcript_id lnc-ZNF705D-2:4 ; gene_alias_1 XLOC_006719 ; gene_alias_2 linc-C8orf79-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00015224 ;
chr4	lncipedia.org	exon	188553805	188553988	.	+	.	gene_id lnc-ZFP42-2 ; transcript_id lnc-ZFP42-2:5 ; gene_alias_1 XLOC_003829 ; gene_alias_2 linc-ZFP42-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00008974 ;
chr4	lncipedia.org	exon	188626118	188626433	.	+	.	gene_id lnc-ZFP42-2 ; transcript_id lnc-ZFP42-2:5 ; gene_alias_1 XLOC_003829 ; gene_alias_2 linc-ZFP42-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00008974 ;
chr14	lncipedia.org	exon	65019414	65019606	.	-	.	gene_id lnc-ZBTB25-4 ; transcript_id lnc-ZBTB25-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000259076.1 ; gene_alias_2 RP11-973N13.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000171563.1 ; transcript_alias_1 ENST00000554454.1 ; transcript_alias_2 RP11-973N13.3-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000414204.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	65063180	65063254	.	-	.	gene_id lnc-ZBTB25-4 ; transcript_id lnc-ZBTB25-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000259076.1 ; gene_alias_2 RP11-973N13.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000171563.1 ; transcript_alias_1 ENST00000554454.1 ; transcript_alias_2 RP11-973N13.3-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000414204.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	46694608	46694865	.	-	.	gene_id lnc-SHCBP1-2 ; transcript_id lnc-SHCBP1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000261131.1 ; gene_alias_2 RP11-93O14.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000175600.1 ; transcript_alias_1 ENST00000569353.1 ; transcript_alias_2 RP11-93O14.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000430601.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	46695441	46695503	.	-	.	gene_id lnc-SHCBP1-2 ; transcript_id lnc-SHCBP1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000261131.1 ; gene_alias_2 RP11-93O14.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000175600.1 ; transcript_alias_1 ENST00000569353.1 ; transcript_alias_2 RP11-93O14.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000430601.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	14024534	14024710	.	-	.	gene_id lnc-PARN-7 ; transcript_id lnc-PARN-7:1 ; gene_alias_1 ENSG00000262732.1 ; gene_alias_2 CTD-2135D7.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000177375.1 ; transcript_alias_1 ENST00000570663.1 ; transcript_alias_2 CTD-2135D7.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000436614.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	14029274	14029492	.	-	.	gene_id lnc-PARN-7 ; transcript_id lnc-PARN-7:1 ; gene_alias_1 ENSG00000262732.1 ; gene_alias_2 CTD-2135D7.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000177375.1 ; transcript_alias_1 ENST00000570663.1 ; transcript_alias_2 CTD-2135D7.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000436614.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	287305	287334	.	+	.	gene_id lnc-ATHL1-1 ; transcript_id lnc-ATHL1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255026.1 ; gene_alias_2 RP11-326C3.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000165353.1 ; transcript_alias_1 ENST00000533924.1 ; transcript_alias_2 RP11-326C3.2-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000383581.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	288020	288298	.	+	.	gene_id lnc-ATHL1-1 ; transcript_id lnc-ATHL1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255026.1 ; gene_alias_2 RP11-326C3.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000165353.1 ; transcript_alias_1 ENST00000533924.1 ; transcript_alias_2 RP11-326C3.2-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000383581.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	155679889	155680019	.	-	.	gene_id lnc-YY1AP1-1 ; transcript_id lnc-YY1AP1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227673.1 ; gene_alias_2 RP11-243J18.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000035438.1 ; transcript_alias_1 ENST00000432858.1 ; transcript_alias_2 RP11-243J18.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000086041.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	155680329	155680354	.	-	.	gene_id lnc-YY1AP1-1 ; transcript_id lnc-YY1AP1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227673.1 ; gene_alias_2 RP11-243J18.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000035438.1 ; transcript_alias_1 ENST00000432858.1 ; transcript_alias_2 RP11-243J18.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000086041.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	43810719	43810892	.	-	.	gene_id lnc-AC091132.2-2 ; transcript_id lnc-AC091132.2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000265964.1 ; gene_alias_2 RP11-293E1.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000178245.1 ; transcript_alias_1 ENST00000580347.1 ; transcript_alias_2 RP11-293E1.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000441152.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	43811650	43812035	.	-	.	gene_id lnc-AC091132.2-2 ; transcript_id lnc-AC091132.2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000265964.1 ; gene_alias_2 RP11-293E1.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000178245.1 ; transcript_alias_1 ENST00000580347.1 ; transcript_alias_2 RP11-293E1.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000441152.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	147930762	147930816	.	-	.	gene_id lnc-PPIAL4A-1 ; transcript_id lnc-PPIAL4A-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000215863 ; gene_alias_2 RP11-495P10.2 ; gene_alias_3 ENSG00000215863.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014086.1 ; transcript_alias_1 ENST00000417554 ; transcript_alias_2 ENST00000417554.1 ; transcript_alias_3 RP11-495P10.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000039539.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	147931724	147931881	.	-	.	gene_id lnc-PPIAL4A-1 ; transcript_id lnc-PPIAL4A-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000215863 ; gene_alias_2 RP11-495P10.2 ; gene_alias_3 ENSG00000215863.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014086.1 ; transcript_alias_1 ENST00000417554 ; transcript_alias_2 ENST00000417554.1 ; transcript_alias_3 RP11-495P10.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000039539.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	1575778	1576057	.	-	.	gene_id lnc-FAM53A-1 ; transcript_id lnc-FAM53A-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_003853 ; gene_alias_2 linc-CTBP1-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00008408 ;
chr4	lncipedia.org	exon	1581885	1582000	.	-	.	gene_id lnc-FAM53A-1 ; transcript_id lnc-FAM53A-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_003853 ; gene_alias_2 linc-CTBP1-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00008408 ;
chrX	lncipedia.org	exon	151972983	151973012	.	+	.	gene_id lnc-NSDHL-1 ; transcript_id lnc-NSDHL-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008087 ; gene_alias_2 linc-NSDHL ; transcript_alias_1 TCONS_00017273 ;
chrX	lncipedia.org	exon	151974143	151974329	.	+	.	gene_id lnc-NSDHL-1 ; transcript_id lnc-NSDHL-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008087 ; gene_alias_2 linc-NSDHL ; transcript_alias_1 TCONS_00017273 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8383749	8383771	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-6 ; transcript_id lnc-KIDINS220-6:8 ; gene_alias_1 XLOC_001974 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00004129 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8427468	8427688	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-6 ; transcript_id lnc-KIDINS220-6:8 ; gene_alias_1 XLOC_001974 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00004129 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8434742	8434817	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-6 ; transcript_id lnc-KIDINS220-6:8 ; gene_alias_1 XLOC_001974 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00004129 ;
chr17	lncipedia.org	exon	75544113	75544240	.	+	.	gene_id lnc-SEPT9-3 ; transcript_id lnc-SEPT9-3:3 ; gene_alias_1 XLOC_012317 ; gene_alias_2 linc-TNRC6C-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00025505 ;
chr17	lncipedia.org	exon	75556552	75556671	.	+	.	gene_id lnc-SEPT9-3 ; transcript_id lnc-SEPT9-3:3 ; gene_alias_1 XLOC_012317 ; gene_alias_2 linc-TNRC6C-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00025505 ;
chrX	lncipedia.org	exon	114999954	114999998	.	+	.	gene_id lnc-PLS3-2 ; transcript_id lnc-PLS3-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_008050 ; gene_alias_2 linc-AGTR2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017455 ;
chrX	lncipedia.org	exon	115005066	115005243	.	+	.	gene_id lnc-PLS3-2 ; transcript_id lnc-PLS3-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_008050 ; gene_alias_2 linc-AGTR2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017455 ;
chr8	lncipedia.org	exon	9009253	9009426	.	+	.	gene_id lnc-ERI1-2 ; transcript_id lnc-ERI1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_006704 ; gene_alias_2 linc-TNKS-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00014599 ;
chr8	lncipedia.org	exon	9012476	9012586	.	+	.	gene_id lnc-ERI1-2 ; transcript_id lnc-ERI1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_006704 ; gene_alias_2 linc-TNKS-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00014599 ;
chr8	lncipedia.org	exon	9013662	9013814	.	+	.	gene_id lnc-ERI1-2 ; transcript_id lnc-ERI1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_006704 ; gene_alias_2 linc-TNKS-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00014599 ;
chr8	lncipedia.org	exon	9014281	9014393	.	+	.	gene_id lnc-ERI1-2 ; transcript_id lnc-ERI1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_006704 ; gene_alias_2 linc-TNKS-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00014599 ;
chr3	lncipedia.org	exon	42653782	42653859	.	-	.	gene_id lnc-SEC22C-2 ; transcript_id lnc-SEC22C-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230084.1 ; gene_alias_2 RP4-613B23.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000156209.1 ; transcript_alias_1 ENST00000445452.1 ; transcript_alias_2 RP4-613B23.1-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000343488.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	42695486	42695880	.	-	.	gene_id lnc-SEC22C-2 ; transcript_id lnc-SEC22C-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230084.1 ; gene_alias_2 RP4-613B23.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000156209.1 ; transcript_alias_1 ENST00000445452.1 ; transcript_alias_2 RP4-613B23.1-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000343488.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	74261504	74261544	.	+	.	gene_id lnc-MCU-1 ; transcript_id lnc-MCU-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226163.1 ; gene_alias_2 RP11-167P22.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000018439.1 ; transcript_alias_1 ENST00000431638.1 ; transcript_alias_2 RP11-167P22.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000048589.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	74262594	74262714	.	+	.	gene_id lnc-MCU-1 ; transcript_id lnc-MCU-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226163.1 ; gene_alias_2 RP11-167P22.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000018439.1 ; transcript_alias_1 ENST00000431638.1 ; transcript_alias_2 RP11-167P22.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000048589.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	140013903	140014025	.	+	.	gene_id lnc-SPANXB2-1 ; transcript_id lnc-SPANXB2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008080 ; gene_alias_2 linc-SPANXB1-1 ; gene_alias_3 ENSG00000229269 ; gene_alias_4 RP11-298A8.2 ; gene_alias_5 ENSG00000229269.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000022550.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017017 ; transcript_alias_2 ENST00000413328 ; transcript_alias_3 ENST00000413328.1 ; transcript_alias_4 RP11-298A8.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000058584.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	140078814	140078853	.	+	.	gene_id lnc-SPANXB2-1 ; transcript_id lnc-SPANXB2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008080 ; gene_alias_2 linc-SPANXB1-1 ; gene_alias_3 ENSG00000229269 ; gene_alias_4 RP11-298A8.2 ; gene_alias_5 ENSG00000229269.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000022550.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017017 ; transcript_alias_2 ENST00000413328 ; transcript_alias_3 ENST00000413328.1 ; transcript_alias_4 RP11-298A8.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000058584.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	140079560	140079613	.	+	.	gene_id lnc-SPANXB2-1 ; transcript_id lnc-SPANXB2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008080 ; gene_alias_2 linc-SPANXB1-1 ; gene_alias_3 ENSG00000229269 ; gene_alias_4 RP11-298A8.2 ; gene_alias_5 ENSG00000229269.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000022550.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017017 ; transcript_alias_2 ENST00000413328 ; transcript_alias_3 ENST00000413328.1 ; transcript_alias_4 RP11-298A8.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000058584.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	62849186	62849429	.	-	.	gene_id lnc-ZNF680-6 ; transcript_id lnc-ZNF680-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000232817 ; gene_alias_2 RP11-73B2.4 ; gene_alias_3 ENSG00000232817.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000156386.1 ; transcript_alias_1 ENST00000450077 ; transcript_alias_2 ENST00000450077.1 ; transcript_alias_3 RP11-73B2.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000344029.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	62853183	62853347	.	-	.	gene_id lnc-ZNF680-6 ; transcript_id lnc-ZNF680-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000232817 ; gene_alias_2 RP11-73B2.4 ; gene_alias_3 ENSG00000232817.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000156386.1 ; transcript_alias_1 ENST00000450077 ; transcript_alias_2 ENST00000450077.1 ; transcript_alias_3 RP11-73B2.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000344029.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	62853917	62854035	.	-	.	gene_id lnc-ZNF680-6 ; transcript_id lnc-ZNF680-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000232817 ; gene_alias_2 RP11-73B2.4 ; gene_alias_3 ENSG00000232817.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000156386.1 ; transcript_alias_1 ENST00000450077 ; transcript_alias_2 ENST00000450077.1 ; transcript_alias_3 RP11-73B2.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000344029.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	47679754	47679902	.	+	.	gene_id lnc-ANTXRL-1 ; transcript_id lnc-ANTXRL-1:9 ; gene_alias_1 XLOC_008480 ; gene_alias_2 linc-ANXA8L2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00018198 ;
chr10	lncipedia.org	exon	47680349	47680438	.	+	.	gene_id lnc-ANTXRL-1 ; transcript_id lnc-ANTXRL-1:9 ; gene_alias_1 XLOC_008480 ; gene_alias_2 linc-ANXA8L2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00018198 ;
chr10	lncipedia.org	exon	47681697	47681735	.	+	.	gene_id lnc-ANTXRL-1 ; transcript_id lnc-ANTXRL-1:9 ; gene_alias_1 XLOC_008480 ; gene_alias_2 linc-ANXA8L2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00018198 ;
chr10	lncipedia.org	exon	47682746	47682901	.	+	.	gene_id lnc-ANTXRL-1 ; transcript_id lnc-ANTXRL-1:9 ; gene_alias_1 XLOC_008480 ; gene_alias_2 linc-ANXA8L2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00018198 ;
chr10	lncipedia.org	exon	47700835	47701642	.	+	.	gene_id lnc-ANTXRL-1 ; transcript_id lnc-ANTXRL-1:9 ; gene_alias_1 XLOC_008480 ; gene_alias_2 linc-ANXA8L2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00018198 ;
chr6	lncipedia.org	exon	138178837	138179103	.	-	.	gene_id lnc-PERP-2 ; transcript_id lnc-PERP-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237499 ; gene_alias_2 RP11-356I2.4 ; gene_alias_3 ENSG00000237499.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015663.1 ; transcript_alias_1 ENST00000431144 ; transcript_alias_2 ENST00000431144.1 ; transcript_alias_3 RP11-356I2.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000042413.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	138182119	138182628	.	-	.	gene_id lnc-PERP-2 ; transcript_id lnc-PERP-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237499 ; gene_alias_2 RP11-356I2.4 ; gene_alias_3 ENSG00000237499.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015663.1 ; transcript_alias_1 ENST00000431144 ; transcript_alias_2 ENST00000431144.1 ; transcript_alias_3 RP11-356I2.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000042413.1 ;
chr18	lncipedia.org	exon	14195	14653	.	-	.	gene_id lnc-RP11-683L23.1.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-683L23.1.1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000263305.1 ; gene_alias_2 AP005530.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000177911.1 ; transcript_alias_1 ENST00000572608.1 ; transcript_alias_2 AP005530.2-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000439670.1 ;
chr18	lncipedia.org	exon	14851	14958	.	-	.	gene_id lnc-RP11-683L23.1.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-683L23.1.1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000263305.1 ; gene_alias_2 AP005530.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000177911.1 ; transcript_alias_1 ENST00000572608.1 ; transcript_alias_2 AP005530.2-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000439670.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	12920936	12922104	.	-	.	gene_id lnc-FAM9C-1 ; transcript_id lnc-FAM9C-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233338.1 ; gene_alias_2 TLR8-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000021142.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451564.1 ; transcript_alias_2 TLR8-AS1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000055776.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	12924309	12924370	.	-	.	gene_id lnc-FAM9C-1 ; transcript_id lnc-FAM9C-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233338.1 ; gene_alias_2 TLR8-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000021142.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451564.1 ; transcript_alias_2 TLR8-AS1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000055776.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	12926335	12926452	.	-	.	gene_id lnc-FAM9C-1 ; transcript_id lnc-FAM9C-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233338.1 ; gene_alias_2 TLR8-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000021142.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451564.1 ; transcript_alias_2 TLR8-AS1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000055776.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	12219527	12220071	.	+	.	gene_id lnc-AC130352.1-1 ; transcript_id lnc-AC130352.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227888 ; gene_alias_2 FAM66A ; gene_alias_3 ENSG00000227888.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165458.1 ; transcript_alias_1 ENST00000433621 ; transcript_alias_2 ENST00000433621.1 ; transcript_alias_3 FAM66A-201 ;
chr8	lncipedia.org	exon	12225748	12225811	.	+	.	gene_id lnc-AC130352.1-1 ; transcript_id lnc-AC130352.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227888 ; gene_alias_2 FAM66A ; gene_alias_3 ENSG00000227888.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165458.1 ; transcript_alias_1 ENST00000433621 ; transcript_alias_2 ENST00000433621.1 ; transcript_alias_3 FAM66A-201 ;
chr8	lncipedia.org	exon	12245467	12245528	.	+	.	gene_id lnc-AC130352.1-1 ; transcript_id lnc-AC130352.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227888 ; gene_alias_2 FAM66A ; gene_alias_3 ENSG00000227888.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165458.1 ; transcript_alias_1 ENST00000433621 ; transcript_alias_2 ENST00000433621.1 ; transcript_alias_3 FAM66A-201 ;
chr8	lncipedia.org	exon	12245776	12245843	.	+	.	gene_id lnc-AC130352.1-1 ; transcript_id lnc-AC130352.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227888 ; gene_alias_2 FAM66A ; gene_alias_3 ENSG00000227888.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165458.1 ; transcript_alias_1 ENST00000433621 ; transcript_alias_2 ENST00000433621.1 ; transcript_alias_3 FAM66A-201 ;
chr8	lncipedia.org	exon	12268474	12268510	.	+	.	gene_id lnc-AC130352.1-1 ; transcript_id lnc-AC130352.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227888 ; gene_alias_2 FAM66A ; gene_alias_3 ENSG00000227888.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165458.1 ; transcript_alias_1 ENST00000433621 ; transcript_alias_2 ENST00000433621.1 ; transcript_alias_3 FAM66A-201 ;
chr1	lncipedia.org	exon	149590752	149590973	.	-	.	gene_id lnc-FAM72C-2 ; transcript_id lnc-FAM72C-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_001011 ; gene_alias_2 linc-HIST2H2BF-2 ; gene_alias_3 ENSG00000229801 ; gene_alias_4 RP11-353N4.1 ; gene_alias_5 ENSG00000229801.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000013950.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000639 ; transcript_alias_2 ENST00000428508 ; transcript_alias_3 ENST00000428508.1 ; transcript_alias_4 RP11-353N4.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000039132.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	149591587	149591762	.	-	.	gene_id lnc-FAM72C-2 ; transcript_id lnc-FAM72C-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_001011 ; gene_alias_2 linc-HIST2H2BF-2 ; gene_alias_3 ENSG00000229801 ; gene_alias_4 RP11-353N4.1 ; gene_alias_5 ENSG00000229801.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000013950.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000639 ; transcript_alias_2 ENST00000428508 ; transcript_alias_3 ENST00000428508.1 ; transcript_alias_4 RP11-353N4.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000039132.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	1470704	1471118	.	+	.	gene_id lnc-RPS4Y1-6 ; transcript_id lnc-RPS4Y1-6:2 ; gene_alias_1 ENSGR0000236017.2 ; gene_alias_2 ASMTL-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000021056.2 ; transcript_alias_1 ENSTR0000425740.2 ; transcript_alias_2 ASMTL-AS1-004 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000313734.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	1472354	1472478	.	+	.	gene_id lnc-RPS4Y1-6 ; transcript_id lnc-RPS4Y1-6:2 ; gene_alias_1 ENSGR0000236017.2 ; gene_alias_2 ASMTL-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000021056.2 ; transcript_alias_1 ENSTR0000425740.2 ; transcript_alias_2 ASMTL-AS1-004 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000313734.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	1481636	1481781	.	+	.	gene_id lnc-RPS4Y1-6 ; transcript_id lnc-RPS4Y1-6:2 ; gene_alias_1 ENSGR0000236017.2 ; gene_alias_2 ASMTL-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000021056.2 ; transcript_alias_1 ENSTR0000425740.2 ; transcript_alias_2 ASMTL-AS1-004 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000313734.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	1482655	1482808	.	+	.	gene_id lnc-RPS4Y1-6 ; transcript_id lnc-RPS4Y1-6:2 ; gene_alias_1 ENSGR0000236017.2 ; gene_alias_2 ASMTL-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000021056.2 ; transcript_alias_1 ENSTR0000425740.2 ; transcript_alias_2 ASMTL-AS1-004 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000313734.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	111486089	111487782	.	+	.	gene_id lnc-CD53-1 ; transcript_id lnc-CD53-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000232811.1 ; gene_alias_2 RP11-96K19.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000034494.1 ; transcript_alias_1 ENST00000440689.1 ; transcript_alias_2 RP11-96K19.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000083392.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	111494806	111495470	.	+	.	gene_id lnc-CD53-1 ; transcript_id lnc-CD53-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000232811.1 ; gene_alias_2 RP11-96K19.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000034494.1 ; transcript_alias_1 ENST00000440689.1 ; transcript_alias_2 RP11-96K19.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000083392.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	78918237	78919907	.	+	.	gene_id lnc-CHRNA5-1 ; transcript_id lnc-CHRNA5-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000259555.1 ; gene_alias_2 RP11-335K5.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172513.1 ; transcript_alias_1 ENST00000559120.1 ; transcript_alias_2 RP11-335K5.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000418872.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	78920227	78920535	.	+	.	gene_id lnc-CHRNA5-1 ; transcript_id lnc-CHRNA5-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000259555.1 ; gene_alias_2 RP11-335K5.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172513.1 ; transcript_alias_1 ENST00000559120.1 ; transcript_alias_2 RP11-335K5.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000418872.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	1515320	1515541	.	-	.	gene_id lnc-SLC25A6-1 ; transcript_id lnc-SLC25A6-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_008099 ; gene_alias_2 linc-SLC25A6-2 ; gene_alias_3 ENSG00000236871 ; gene_alias_4 NCRNA00106 ; gene_alias_5 ENSG00000236871.1 ; gene_alias_6 LINC00106 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000021061.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017028 ; transcript_alias_2 ENST00000434938 ; transcript_alias_3 ENST00000434938.1 ; transcript_alias_4 LINC00106-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000337679.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	1517718	1517852	.	-	.	gene_id lnc-SLC25A6-1 ; transcript_id lnc-SLC25A6-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_008099 ; gene_alias_2 linc-SLC25A6-2 ; gene_alias_3 ENSG00000236871 ; gene_alias_4 NCRNA00106 ; gene_alias_5 ENSG00000236871.1 ; gene_alias_6 LINC00106 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000021061.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017028 ; transcript_alias_2 ENST00000434938 ; transcript_alias_3 ENST00000434938.1 ; transcript_alias_4 LINC00106-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000337679.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	60001	60239	.	-	.	gene_id lnc-TUBB8-1 ; transcript_id lnc-TUBB8-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008681 ; gene_alias_2 linc-FRG2B ; gene_alias_3 ENSG00000224285 ; gene_alias_4 RP11-631M21.1 ; gene_alias_5 ENSG00000224285.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000017523.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017894 ; transcript_alias_2 ENST00000449585 ; transcript_alias_3 ENST00000449585.1 ; transcript_alias_4 RP11-631M21.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000046373.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	60437	60544	.	-	.	gene_id lnc-TUBB8-1 ; transcript_id lnc-TUBB8-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008681 ; gene_alias_2 linc-FRG2B ; gene_alias_3 ENSG00000224285 ; gene_alias_4 RP11-631M21.1 ; gene_alias_5 ENSG00000224285.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000017523.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017894 ; transcript_alias_2 ENST00000449585 ; transcript_alias_3 ENST00000449585.1 ; transcript_alias_4 RP11-631M21.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000046373.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	153102723	153103179	.	-	.	gene_id lnc-DHX36-2 ; transcript_id lnc-DHX36-2:4 ; gene_alias_1 XLOC_003292 ; gene_alias_2 linc-TMEM14E-2 ; gene_alias_3 ENSG00000238755 ; gene_alias_4 RP11-292E2.3 ; gene_alias_5 ENSG00000238755.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000159627.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005471 ; transcript_alias_2 ENST00000492569 ; transcript_alias_3 ENST00000492569.1 ; transcript_alias_4 RP11-292E2.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000356568.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	153103657	153105157	.	-	.	gene_id lnc-DHX36-2 ; transcript_id lnc-DHX36-2:4 ; gene_alias_1 XLOC_003292 ; gene_alias_2 linc-TMEM14E-2 ; gene_alias_3 ENSG00000238755 ; gene_alias_4 RP11-292E2.3 ; gene_alias_5 ENSG00000238755.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000159627.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005471 ; transcript_alias_2 ENST00000492569 ; transcript_alias_3 ENST00000492569.1 ; transcript_alias_4 RP11-292E2.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000356568.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	86901752	86901882	.	+	.	gene_id lnc-ATP6V0D2-2 ; transcript_id lnc-ATP6V0D2-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000253154 ; gene_alias_2 CTA-392E5.1 ; gene_alias_3 ENSG00000253154.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163604.2 ; transcript_alias_1 ENST00000518266 ; transcript_alias_2 ENST00000518266.1 ; transcript_alias_3 CTA-392E5.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000374499.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	86963073	86963312	.	+	.	gene_id lnc-ATP6V0D2-2 ; transcript_id lnc-ATP6V0D2-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000253154 ; gene_alias_2 CTA-392E5.1 ; gene_alias_3 ENSG00000253154.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163604.2 ; transcript_alias_1 ENST00000518266 ; transcript_alias_2 ENST00000518266.1 ; transcript_alias_3 CTA-392E5.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000374499.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	30749735	30749903	.	+	.	gene_id lnc-TUBB-13 ; transcript_id lnc-TUBB-13:2 ; gene_alias_1 ENSG00000228022 ; gene_alias_2 HCG20 ; gene_alias_3 ENSG00000228022.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031193.2 ; transcript_alias_1 ENST00000422944 ; transcript_alias_2 ENST00000422944.1 ; transcript_alias_3 HCG20-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000257580.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	30756468	30756649	.	+	.	gene_id lnc-TUBB-13 ; transcript_id lnc-TUBB-13:2 ; gene_alias_1 ENSG00000228022 ; gene_alias_2 HCG20 ; gene_alias_3 ENSG00000228022.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031193.2 ; transcript_alias_1 ENST00000422944 ; transcript_alias_2 ENST00000422944.1 ; transcript_alias_3 HCG20-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000257580.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	30759203	30760027	.	+	.	gene_id lnc-TUBB-13 ; transcript_id lnc-TUBB-13:2 ; gene_alias_1 ENSG00000228022 ; gene_alias_2 HCG20 ; gene_alias_3 ENSG00000228022.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031193.2 ; transcript_alias_1 ENST00000422944 ; transcript_alias_2 ENST00000422944.1 ; transcript_alias_3 HCG20-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000257580.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	180846763	180846853	.	+	.	gene_id lnc-OR4F3-2 ; transcript_id lnc-OR4F3-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_004690 ; transcript_alias_1 TCONS_00009271 ;
chr5	lncipedia.org	exon	180847549	180847815	.	+	.	gene_id lnc-OR4F3-2 ; transcript_id lnc-OR4F3-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_004690 ; transcript_alias_1 TCONS_00009271 ;
chr5	lncipedia.org	exon	180847953	180848396	.	+	.	gene_id lnc-OR4F3-2 ; transcript_id lnc-OR4F3-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_004690 ; transcript_alias_1 TCONS_00009271 ;
chr5	lncipedia.org	exon	43065761	43067736	.	+	.	gene_id lnc-AC114947.1.1-2 ; transcript_id lnc-AC114947.1.1-2:3 ; gene_alias_1 XLOC_004366 ; gene_alias_2 linc-ZNF131-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009943 ;
chr5	lncipedia.org	exon	43068072	43068319	.	+	.	gene_id lnc-AC114947.1.1-2 ; transcript_id lnc-AC114947.1.1-2:3 ; gene_alias_1 XLOC_004366 ; gene_alias_2 linc-ZNF131-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009943 ;
chr5	lncipedia.org	exon	43080002	43082165	.	+	.	gene_id lnc-AC114947.1.1-2 ; transcript_id lnc-AC114947.1.1-2:3 ; gene_alias_1 XLOC_004366 ; gene_alias_2 linc-ZNF131-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009943 ;
chrX	lncipedia.org	exon	2484070	2485333	.	-	.	gene_id lnc-DHRSX-1 ; transcript_id lnc-DHRSX-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008100 ; gene_alias_2 linc-ZBED1-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00017281 ;
chrX	lncipedia.org	exon	2527147	2527190	.	-	.	gene_id lnc-DHRSX-1 ; transcript_id lnc-DHRSX-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008100 ; gene_alias_2 linc-ZBED1-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00017281 ;
chr17	lncipedia.org	exon	66179205	66179640	.	+	.	gene_id lnc-AMZ2-1 ; transcript_id lnc-AMZ2-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_012288 ; gene_alias_2 linc-AMZ2-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00025471 ;
chr17	lncipedia.org	exon	66182884	66185240	.	+	.	gene_id lnc-AMZ2-1 ; transcript_id lnc-AMZ2-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_012288 ; gene_alias_2 linc-AMZ2-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00025471 ;
chrX	lncipedia.org	exon	70980625	70980751	.	-	.	gene_id lnc-CXCR3-3 ; transcript_id lnc-CXCR3-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_008181 ; gene_alias_2 linc-CXorf49B-3 ; gene_alias_3 ENSG00000231774 ; gene_alias_4 RP11-402P6.11 ; gene_alias_5 ENSG00000231774.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021805.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017067 ; transcript_alias_2 ENST00000439926 ; transcript_alias_3 ENST00000439926.1 ; transcript_alias_4 RP11-402P6.11-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000057168.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	70980858	70980899	.	-	.	gene_id lnc-CXCR3-3 ; transcript_id lnc-CXCR3-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_008181 ; gene_alias_2 linc-CXorf49B-3 ; gene_alias_3 ENSG00000231774 ; gene_alias_4 RP11-402P6.11 ; gene_alias_5 ENSG00000231774.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021805.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017067 ; transcript_alias_2 ENST00000439926 ; transcript_alias_3 ENST00000439926.1 ; transcript_alias_4 RP11-402P6.11-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000057168.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	70981459	70981509	.	-	.	gene_id lnc-CXCR3-3 ; transcript_id lnc-CXCR3-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_008181 ; gene_alias_2 linc-CXorf49B-3 ; gene_alias_3 ENSG00000231774 ; gene_alias_4 RP11-402P6.11 ; gene_alias_5 ENSG00000231774.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021805.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017067 ; transcript_alias_2 ENST00000439926 ; transcript_alias_3 ENST00000439926.1 ; transcript_alias_4 RP11-402P6.11-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000057168.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	149731	150132	.	+	.	gene_id lnc-FAM20C-3 ; transcript_id lnc-FAM20C-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000240859 ; gene_alias_2 XLOC_005953 ; gene_alias_3 linc-FAM20C-2 ; gene_alias_4 AC093627.10 ; gene_alias_5 ENSG00000240859.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151398.1 ; transcript_alias_1 ENST00000479592 ; transcript_alias_2 TCONS_00012932 ; transcript_alias_3 ENST00000479592.1 ; transcript_alias_4 AC093627.10-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000322470.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	152441	152547	.	+	.	gene_id lnc-FAM20C-3 ; transcript_id lnc-FAM20C-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000240859 ; gene_alias_2 XLOC_005953 ; gene_alias_3 linc-FAM20C-2 ; gene_alias_4 AC093627.10 ; gene_alias_5 ENSG00000240859.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151398.1 ; transcript_alias_1 ENST00000479592 ; transcript_alias_2 TCONS_00012932 ; transcript_alias_3 ENST00000479592.1 ; transcript_alias_4 AC093627.10-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000322470.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	153409	153490	.	+	.	gene_id lnc-FAM20C-3 ; transcript_id lnc-FAM20C-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000240859 ; gene_alias_2 XLOC_005953 ; gene_alias_3 linc-FAM20C-2 ; gene_alias_4 AC093627.10 ; gene_alias_5 ENSG00000240859.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151398.1 ; transcript_alias_1 ENST00000479592 ; transcript_alias_2 TCONS_00012932 ; transcript_alias_3 ENST00000479592.1 ; transcript_alias_4 AC093627.10-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000322470.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	20554571	20554704	.	+	.	gene_id lnc-OR4M2-6 ; transcript_id lnc-OR4M2-6:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258654 ; gene_alias_2 RP11-509A17.3 ; gene_alias_3 ENSG00000258654.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171661.1 ; transcript_alias_1 ENST00000554815 ; transcript_alias_2 ENST00000554815.1 ; transcript_alias_3 RP11-509A17.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414657.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	20564127	20564419	.	+	.	gene_id lnc-OR4M2-6 ; transcript_id lnc-OR4M2-6:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258654 ; gene_alias_2 RP11-509A17.3 ; gene_alias_3 ENSG00000258654.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171661.1 ; transcript_alias_1 ENST00000554815 ; transcript_alias_2 ENST00000554815.1 ; transcript_alias_3 RP11-509A17.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414657.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	5742637	5742802	.	-	.	gene_id lnc-CMPK2-13 ; transcript_id lnc-CMPK2-13:2 ; gene_alias_1 XLOC_001958 ; gene_alias_2 linc-RNASEH1-2 ; gene_alias_3 ENSG00000224128.1 ; gene_alias_4 AC107057.2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000151424.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003170 ; transcript_alias_2 ENST00000458264.1 ; transcript_alias_3 AC107057.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000322563.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	5831319	5831620	.	-	.	gene_id lnc-CMPK2-13 ; transcript_id lnc-CMPK2-13:2 ; gene_alias_1 XLOC_001958 ; gene_alias_2 linc-RNASEH1-2 ; gene_alias_3 ENSG00000224128.1 ; gene_alias_4 AC107057.2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000151424.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003170 ; transcript_alias_2 ENST00000458264.1 ; transcript_alias_3 AC107057.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000322563.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	24585887	24585978	.	-	.	gene_id lnc-RBMY1F-2 ; transcript_id lnc-RBMY1F-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000131538 ; gene_alias_2 TTTY6 ; gene_alias_3 ENSG00000131538.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000046220.1 ; transcript_alias_1 ENST00000538537 ; transcript_alias_2 ENST00000538537.1 ; transcript_alias_3 TTTY6-201 ;
chrY	lncipedia.org	exon	24586927	24587025	.	-	.	gene_id lnc-RBMY1F-2 ; transcript_id lnc-RBMY1F-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000131538 ; gene_alias_2 TTTY6 ; gene_alias_3 ENSG00000131538.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000046220.1 ; transcript_alias_1 ENST00000538537 ; transcript_alias_2 ENST00000538537.1 ; transcript_alias_3 TTTY6-201 ;
chrY	lncipedia.org	exon	24587136	24587273	.	-	.	gene_id lnc-RBMY1F-2 ; transcript_id lnc-RBMY1F-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000131538 ; gene_alias_2 TTTY6 ; gene_alias_3 ENSG00000131538.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000046220.1 ; transcript_alias_1 ENST00000538537 ; transcript_alias_2 ENST00000538537.1 ; transcript_alias_3 TTTY6-201 ;
chrY	lncipedia.org	exon	24587492	24587549	.	-	.	gene_id lnc-RBMY1F-2 ; transcript_id lnc-RBMY1F-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000131538 ; gene_alias_2 TTTY6 ; gene_alias_3 ENSG00000131538.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000046220.1 ; transcript_alias_1 ENST00000538537 ; transcript_alias_2 ENST00000538537.1 ; transcript_alias_3 TTTY6-201 ;
chr7	lncipedia.org	exon	154995857	154996073	.	+	.	gene_id lnc-INSIG1-3 ; transcript_id lnc-INSIG1-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_006302 ; gene_alias_2 linc-INSIG1-3 ; gene_alias_3 ENSG00000228521 ; gene_alias_4 AC099552.3 ; gene_alias_5 ENSG00000228521.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151323.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013100 ; transcript_alias_2 ENST00000454149 ; transcript_alias_3 ENST00000454149.2 ; transcript_alias_4 AC099552.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000322232.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	154996750	154996899	.	+	.	gene_id lnc-INSIG1-3 ; transcript_id lnc-INSIG1-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_006302 ; gene_alias_2 linc-INSIG1-3 ; gene_alias_3 ENSG00000228521 ; gene_alias_4 AC099552.3 ; gene_alias_5 ENSG00000228521.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151323.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013100 ; transcript_alias_2 ENST00000454149 ; transcript_alias_3 ENST00000454149.2 ; transcript_alias_4 AC099552.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000322232.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	2730997	2731253	.	-	.	gene_id lnc-TTC34-2 ; transcript_id lnc-TTC34-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_000681 ; gene_alias_2 linc-MMEL1-2 ; gene_alias_3 ENSG00000231630 ; gene_alias_4 RP11-740P5.3 ; gene_alias_5 ENSG00000231630.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000000565.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000458 ; transcript_alias_2 ENST00000429389 ; transcript_alias_3 ENST00000429389.1 ; transcript_alias_4 RP11-740P5.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000001338.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	2731392	2731563	.	-	.	gene_id lnc-TTC34-2 ; transcript_id lnc-TTC34-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_000681 ; gene_alias_2 linc-MMEL1-2 ; gene_alias_3 ENSG00000231630 ; gene_alias_4 RP11-740P5.3 ; gene_alias_5 ENSG00000231630.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000000565.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000458 ; transcript_alias_2 ENST00000429389 ; transcript_alias_3 ENST00000429389.1 ; transcript_alias_4 RP11-740P5.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000001338.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	148928331	148928385	.	+	.	gene_id lnc-NBPF16-3 ; transcript_id lnc-NBPF16-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000232527 ; gene_alias_2 RP11-14N7.2 ; gene_alias_3 ENSG00000232527.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000017423.2 ; transcript_alias_1 ENST00000294715 ; transcript_alias_2 ENST00000294715.2 ; transcript_alias_3 RP11-14N7.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000046025.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	148932786	148932920	.	+	.	gene_id lnc-NBPF16-3 ; transcript_id lnc-NBPF16-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000232527 ; gene_alias_2 RP11-14N7.2 ; gene_alias_3 ENSG00000232527.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000017423.2 ; transcript_alias_1 ENST00000294715 ; transcript_alias_2 ENST00000294715.2 ; transcript_alias_3 RP11-14N7.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000046025.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	148933291	148933368	.	+	.	gene_id lnc-NBPF16-3 ; transcript_id lnc-NBPF16-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000232527 ; gene_alias_2 RP11-14N7.2 ; gene_alias_3 ENSG00000232527.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000017423.2 ; transcript_alias_1 ENST00000294715 ; transcript_alias_2 ENST00000294715.2 ; transcript_alias_3 RP11-14N7.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000046025.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	143073635	143073767	.	+	.	gene_id lnc-BAI1-4 ; transcript_id lnc-BAI1-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_006949 ; gene_alias_2 linc-BAI1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00014881 ;
chr8	lncipedia.org	exon	143078529	143078899	.	+	.	gene_id lnc-BAI1-4 ; transcript_id lnc-BAI1-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_006949 ; gene_alias_2 linc-BAI1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00014881 ;
chr2	lncipedia.org	exon	88045926	88046000	.	+	.	gene_id lnc-SMYD1-1 ; transcript_id lnc-SMYD1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_001560 ; gene_alias_2 linc-PLGLB2 ; transcript_alias_1 TCONS_00003759 ;
chr2	lncipedia.org	exon	88047115	88047354	.	+	.	gene_id lnc-SMYD1-1 ; transcript_id lnc-SMYD1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_001560 ; gene_alias_2 linc-PLGLB2 ; transcript_alias_1 TCONS_00003759 ;
chr17	lncipedia.org	exon	20479866	20480107	.	-	.	gene_id lnc-LGALS9B-2 ; transcript_id lnc-LGALS9B-2:3 ; gene_alias_1 XLOC_012419 ; gene_alias_2 linc-LGALS9B-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00026047 ;
chr17	lncipedia.org	exon	20481940	20482149	.	-	.	gene_id lnc-LGALS9B-2 ; transcript_id lnc-LGALS9B-2:3 ; gene_alias_1 XLOC_012419 ; gene_alias_2 linc-LGALS9B-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00026047 ;
chr8	lncipedia.org	exon	129573280	129573372	.	-	.	gene_id lnc-TMEM75-2 ; transcript_id lnc-TMEM75-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_007219 ; gene_alias_2 linc-FAM84B-11 ; transcript_alias_1 TCONS_00015175 ;
chr8	lncipedia.org	exon	129576475	129576800	.	-	.	gene_id lnc-TMEM75-2 ; transcript_id lnc-TMEM75-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_007219 ; gene_alias_2 linc-FAM84B-11 ; transcript_alias_1 TCONS_00015175 ;
chr7	lncipedia.org	exon	80303	80438	.	+	.	gene_id lnc-FAM20C-5 ; transcript_id lnc-FAM20C-5:2 ; gene_alias_1 XLOC_005952 ; gene_alias_2 linc-FAM20C-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00013285 ;
chr7	lncipedia.org	exon	80778	80886	.	+	.	gene_id lnc-FAM20C-5 ; transcript_id lnc-FAM20C-5:2 ; gene_alias_1 XLOC_005952 ; gene_alias_2 linc-FAM20C-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00013285 ;
chr7	lncipedia.org	exon	155000028	155000052	.	-	.	gene_id lnc-AC099552.4.1-1 ; transcript_id lnc-AC099552.4.1-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_006661 ; gene_alias_2 linc-PAXIP1-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00014014 ;
chr7	lncipedia.org	exon	155000677	155000985	.	-	.	gene_id lnc-AC099552.4.1-1 ; transcript_id lnc-AC099552.4.1-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_006661 ; gene_alias_2 linc-PAXIP1-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00014014 ;
chr2	lncipedia.org	exon	78176532	78176551	.	-	.	gene_id lnc-LRRTM4-2 ; transcript_id lnc-LRRTM4-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_002173 ; gene_alias_2 linc-LRRTM4-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00004315 ;
chr2	lncipedia.org	exon	78178164	78178621	.	-	.	gene_id lnc-LRRTM4-2 ; transcript_id lnc-LRRTM4-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_002173 ; gene_alias_2 linc-LRRTM4-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00004315 ;
chr1	lncipedia.org	exon	110626180	110626298	.	+	.	gene_id lnc-UBL4B-1 ; transcript_id lnc-UBL4B-1:5 ; gene_alias_1 XLOC_000340 ; gene_alias_2 linc-UBL4B ; transcript_alias_1 TCONS_00001094 ;
chr1	lncipedia.org	exon	110627540	110627797	.	+	.	gene_id lnc-UBL4B-1 ; transcript_id lnc-UBL4B-1:5 ; gene_alias_1 XLOC_000340 ; gene_alias_2 linc-UBL4B ; transcript_alias_1 TCONS_00001094 ;
chr1	lncipedia.org	exon	121484424	121484972	.	-	.	gene_id lnc-FCGR1B-6 ; transcript_id lnc-FCGR1B-6:2 ; gene_alias_1 XLOC_000992 ; gene_alias_2 linc-FCGR1B-7 ; transcript_alias_1 TCONS_00001652 ;
chr1	lncipedia.org	exon	121485312	121485429	.	-	.	gene_id lnc-FCGR1B-6 ; transcript_id lnc-FCGR1B-6:2 ; gene_alias_1 XLOC_000992 ; gene_alias_2 linc-FCGR1B-7 ; transcript_alias_1 TCONS_00001652 ;
chr3	lncipedia.org	exon	151791249	151791505	.	+	.	gene_id lnc-MBNL1-1 ; transcript_id lnc-MBNL1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_002876 ; gene_alias_2 linc-MBNL1 ; transcript_alias_1 TCONS_00006275 ;
chr3	lncipedia.org	exon	151831059	151831224	.	+	.	gene_id lnc-MBNL1-1 ; transcript_id lnc-MBNL1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_002876 ; gene_alias_2 linc-MBNL1 ; transcript_alias_1 TCONS_00006275 ;
chr11	lncipedia.org	exon	44545397	44545588	.	-	.	gene_id lnc-ALX4-2 ; transcript_id lnc-ALX4-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_009427 ; gene_alias_2 linc-ALX4-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00019626 ;
chr11	lncipedia.org	exon	44547380	44547608	.	-	.	gene_id lnc-ALX4-2 ; transcript_id lnc-ALX4-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_009427 ; gene_alias_2 linc-ALX4-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00019626 ;
chr15	lncipedia.org	exon	24630696	24630851	.	+	.	gene_id lnc-C15orf2-6 ; transcript_id lnc-C15orf2-6:4 ; gene_alias_1 XLOC_011178 ; gene_alias_2 linc-C15orf2-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00023869 ;
chr15	lncipedia.org	exon	24638619	24638802	.	+	.	gene_id lnc-C15orf2-6 ; transcript_id lnc-C15orf2-6:4 ; gene_alias_1 XLOC_011178 ; gene_alias_2 linc-C15orf2-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00023869 ;
chrX	lncipedia.org	exon	1780739	1780945	.	+	.	gene_id lnc-ASMT-1 ; transcript_id lnc-ASMT-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007914 ; gene_alias_2 linc-CD99-9 ; transcript_alias_1 TCONS_00017121 ;
chrX	lncipedia.org	exon	1781054	1781265	.	+	.	gene_id lnc-ASMT-1 ; transcript_id lnc-ASMT-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007914 ; gene_alias_2 linc-CD99-9 ; transcript_alias_1 TCONS_00017121 ;
chr7	lncipedia.org	exon	50292780	50293016	.	-	.	gene_id lnc-ZPBP-3 ; transcript_id lnc-ZPBP-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_006439 ; gene_alias_2 linc-ZPBP-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00014296 ;
chr7	lncipedia.org	exon	50293894	50294206	.	-	.	gene_id lnc-ZPBP-3 ; transcript_id lnc-ZPBP-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_006439 ; gene_alias_2 linc-ZPBP-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00014296 ;
chrX	lncipedia.org	exon	37748183	37748411	.	+	.	gene_id lnc-CYBB-1 ; transcript_id lnc-CYBB-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_007952 ; gene_alias_2 linc-CXorf27-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017416 ;
chrX	lncipedia.org	exon	37758102	37758208	.	+	.	gene_id lnc-CYBB-1 ; transcript_id lnc-CYBB-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_007952 ; gene_alias_2 linc-CXorf27-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017416 ;
chr15	lncipedia.org	exon	21365491	21365708	.	+	.	gene_id lnc-OR4M2-2 ; transcript_id lnc-OR4M2-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_011160 ; gene_alias_2 linc-OR4M2-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00023293 ;
chr15	lncipedia.org	exon	21366354	21366478	.	+	.	gene_id lnc-OR4M2-2 ; transcript_id lnc-OR4M2-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_011160 ; gene_alias_2 linc-OR4M2-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00023293 ;
chr22	lncipedia.org	exon	34745820	34746118	.	-	.	gene_id lnc-LARGE-3 ; transcript_id lnc-LARGE-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_014356 ; gene_alias_2 linc-LARGE-6 ; transcript_alias_1 TCONS_00029688 ;
chr22	lncipedia.org	exon	34756103	34756219	.	-	.	gene_id lnc-LARGE-3 ; transcript_id lnc-LARGE-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_014356 ; gene_alias_2 linc-LARGE-6 ; transcript_alias_1 TCONS_00029688 ;
chr10	lncipedia.org	exon	47679748	47679902	.	+	.	gene_id lnc-ANTXRL-1 ; transcript_id lnc-ANTXRL-1:7 ; gene_alias_1 XLOC_008480 ; gene_alias_2 linc-ANXA8L2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00018726 ;
chr10	lncipedia.org	exon	47680349	47680438	.	+	.	gene_id lnc-ANTXRL-1 ; transcript_id lnc-ANTXRL-1:7 ; gene_alias_1 XLOC_008480 ; gene_alias_2 linc-ANXA8L2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00018726 ;
chr10	lncipedia.org	exon	47681697	47681735	.	+	.	gene_id lnc-ANTXRL-1 ; transcript_id lnc-ANTXRL-1:7 ; gene_alias_1 XLOC_008480 ; gene_alias_2 linc-ANXA8L2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00018726 ;
chr10	lncipedia.org	exon	47682746	47682901	.	+	.	gene_id lnc-ANTXRL-1 ; transcript_id lnc-ANTXRL-1:7 ; gene_alias_1 XLOC_008480 ; gene_alias_2 linc-ANXA8L2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00018726 ;
chr10	lncipedia.org	exon	47684472	47684552	.	+	.	gene_id lnc-ANTXRL-1 ; transcript_id lnc-ANTXRL-1:7 ; gene_alias_1 XLOC_008480 ; gene_alias_2 linc-ANXA8L2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00018726 ;
chr10	lncipedia.org	exon	47696456	47696620	.	+	.	gene_id lnc-ANTXRL-1 ; transcript_id lnc-ANTXRL-1:7 ; gene_alias_1 XLOC_008480 ; gene_alias_2 linc-ANXA8L2-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00018726 ;
chr11	lncipedia.org	exon	134350719	134350805	.	+	.	gene_id lnc-GLB1L2-1 ; transcript_id lnc-GLB1L2-1:10 ; gene_alias_1 XLOC_009344 ; transcript_alias_1 TCONS_00020028 ;
chr11	lncipedia.org	exon	134352521	134352624	.	+	.	gene_id lnc-GLB1L2-1 ; transcript_id lnc-GLB1L2-1:10 ; gene_alias_1 XLOC_009344 ; transcript_alias_1 TCONS_00020028 ;
chr11	lncipedia.org	exon	134372838	134372941	.	+	.	gene_id lnc-GLB1L2-1 ; transcript_id lnc-GLB1L2-1:10 ; gene_alias_1 XLOC_009344 ; transcript_alias_1 TCONS_00020028 ;
chrX	lncipedia.org	exon	119264664	119264907	.	-	.	gene_id lnc-FAM70A-1 ; transcript_id lnc-FAM70A-1:10 ; gene_alias_1 XLOC_008223 ; gene_alias_2 linc-RHOXF1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017539 ;
chrX	lncipedia.org	exon	119269833	119269975	.	-	.	gene_id lnc-FAM70A-1 ; transcript_id lnc-FAM70A-1:10 ; gene_alias_1 XLOC_008223 ; gene_alias_2 linc-RHOXF1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017539 ;
chr6	lncipedia.org	exon	171030442	171030573	.	+	.	gene_id lnc-TBP-2 ; transcript_id lnc-TBP-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_005566 ; transcript_alias_1 TCONS_00012033 ;
chr6	lncipedia.org	exon	171037019	171037146	.	+	.	gene_id lnc-TBP-2 ; transcript_id lnc-TBP-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_005566 ; transcript_alias_1 TCONS_00012033 ;
chr6	lncipedia.org	exon	171044839	171044890	.	+	.	gene_id lnc-TBP-2 ; transcript_id lnc-TBP-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_005566 ; transcript_alias_1 TCONS_00012033 ;
chr1	lncipedia.org	exon	229027198	229027411	.	-	.	gene_id lnc-RP5-915N17.9.1-1 ; transcript_id lnc-RP5-915N17.9.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_001242 ; gene_alias_2 linc-HIST3H2A-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00001854 ;
chr1	lncipedia.org	exon	229033535	229033564	.	-	.	gene_id lnc-RP5-915N17.9.1-1 ; transcript_id lnc-RP5-915N17.9.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_001242 ; gene_alias_2 linc-HIST3H2A-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00001854 ;
chr4	lncipedia.org	exon	191028242	191028512	.	-	.	gene_id lnc-FRG2-1 ; transcript_id lnc-FRG2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_004234 ; gene_alias_2 linc-LOC100288255-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00008726 ;
chr4	lncipedia.org	exon	191030004	191030033	.	-	.	gene_id lnc-FRG2-1 ; transcript_id lnc-FRG2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_004234 ; gene_alias_2 linc-LOC100288255-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00008726 ;
chr21	lncipedia.org	exon	34402769	34402993	.	-	.	gene_id lnc-C21orf54-3 ; transcript_id lnc-C21orf54-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_014057 ; gene_alias_2 linc-C21orf62-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00029274 ;
chr21	lncipedia.org	exon	34406684	34406690	.	-	.	gene_id lnc-C21orf54-3 ; transcript_id lnc-C21orf54-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_014057 ; gene_alias_2 linc-C21orf62-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00029274 ;
chr9	lncipedia.org	exon	46122189	46122447	.	-	.	gene_id lnc-FAM27E1.1-3 ; transcript_id lnc-FAM27E1.1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_007698 ; gene_alias_2 linc-FAM75A6-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00016324 ;
chr9	lncipedia.org	exon	46123572	46123597	.	-	.	gene_id lnc-FAM27E1.1-3 ; transcript_id lnc-FAM27E1.1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_007698 ; gene_alias_2 linc-FAM75A6-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00016324 ;
chr11	lncipedia.org	exon	60943361	60943639	.	+	.	gene_id lnc-PGA3-1 ; transcript_id lnc-PGA3-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_009144 ; gene_alias_2 linc-PGA3 ; transcript_alias_1 TCONS_00019311 ;
chr11	lncipedia.org	exon	60944023	60944048	.	+	.	gene_id lnc-PGA3-1 ; transcript_id lnc-PGA3-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_009144 ; gene_alias_2 linc-PGA3 ; transcript_alias_1 TCONS_00019311 ;
chr1	lncipedia.org	exon	149615886	149616111	.	+	.	gene_id lnc-AL358813.2-2 ; transcript_id lnc-AL358813.2-2:13 ; gene_alias_1 XLOC_000398 ; gene_alias_2 linc-FCGR1A-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00002157 ;
chr1	lncipedia.org	exon	149616549	149616643	.	+	.	gene_id lnc-AL358813.2-2 ; transcript_id lnc-AL358813.2-2:13 ; gene_alias_1 XLOC_000398 ; gene_alias_2 linc-FCGR1A-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00002157 ;
chr4	lncipedia.org	exon	187653484	187653524	.	+	.	gene_id lnc-F11-1 ; transcript_id lnc-F11-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_003822 ; gene_alias_2 linc-ZFP42-10 ; transcript_alias_1 TCONS_00008367 ;
chr4	lncipedia.org	exon	187658637	187659015	.	+	.	gene_id lnc-F11-1 ; transcript_id lnc-F11-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_003822 ; gene_alias_2 linc-ZFP42-10 ; transcript_alias_1 TCONS_00008367 ;
chr3	lncipedia.org	exon	184096018	184096165	.	-	.	gene_id lnc-THPO-1 ; transcript_id lnc-THPO-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_003354 ; gene_alias_2 linc-THPO-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00007321 ;
chr3	lncipedia.org	exon	184097379	184097565	.	-	.	gene_id lnc-THPO-1 ; transcript_id lnc-THPO-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_003354 ; gene_alias_2 linc-THPO-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00007321 ;
chr8	lncipedia.org	exon	7333626	7334120	.	-	.	gene_id lnc-DEFB104B-1 ; transcript_id lnc-DEFB104B-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_006991 ; gene_alias_2 linc-DEFB104B ; transcript_alias_1 TCONS_00015398 ;
chr8	lncipedia.org	exon	7334999	7335170	.	-	.	gene_id lnc-DEFB104B-1 ; transcript_id lnc-DEFB104B-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_006991 ; gene_alias_2 linc-DEFB104B ; transcript_alias_1 TCONS_00015398 ;
chr20	lncipedia.org	exon	62959556	62959733	.	+	.	gene_id lnc-PCMTD2-2 ; transcript_id lnc-PCMTD2-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_013617 ; transcript_alias_1 TCONS_00028271 ;
chr20	lncipedia.org	exon	62961031	62961294	.	+	.	gene_id lnc-PCMTD2-2 ; transcript_id lnc-PCMTD2-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_013617 ; transcript_alias_1 TCONS_00028271 ;
chr9	lncipedia.org	exon	110570350	110570412	.	+	.	gene_id lnc-RAD23B-10 ; transcript_id lnc-RAD23B-10:1 ; gene_alias_1 XLOC_007511 ; gene_alias_2 linc-ACTL7A-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00016126 ;
chr9	lncipedia.org	exon	110572655	110572805	.	+	.	gene_id lnc-RAD23B-10 ; transcript_id lnc-RAD23B-10:1 ; gene_alias_1 XLOC_007511 ; gene_alias_2 linc-ACTL7A-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00016126 ;
chr9	lncipedia.org	exon	110574028	110574037	.	+	.	gene_id lnc-RAD23B-10 ; transcript_id lnc-RAD23B-10:1 ; gene_alias_1 XLOC_007511 ; gene_alias_2 linc-ACTL7A-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00016126 ;
chrX	lncipedia.org	exon	8196412	8196446	.	+	.	gene_id lnc-VCX3B-1 ; transcript_id lnc-VCX3B-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007926 ; gene_alias_2 linc-VCX3B-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017137 ;
chrX	lncipedia.org	exon	8422856	8422964	.	+	.	gene_id lnc-VCX3B-1 ; transcript_id lnc-VCX3B-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007926 ; gene_alias_2 linc-VCX3B-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017137 ;
chrX	lncipedia.org	exon	8423675	8423740	.	+	.	gene_id lnc-VCX3B-1 ; transcript_id lnc-VCX3B-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007926 ; gene_alias_2 linc-VCX3B-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017137 ;
chr8	lncipedia.org	exon	7334988	7335170	.	-	.	gene_id lnc-DEFB104B-1 ; transcript_id lnc-DEFB104B-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_006991 ; gene_alias_2 linc-DEFB104B ; transcript_alias_1 TCONS_00015399 ;
chr8	lncipedia.org	exon	7337502	7337622	.	-	.	gene_id lnc-DEFB104B-1 ; transcript_id lnc-DEFB104B-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_006991 ; gene_alias_2 linc-DEFB104B ; transcript_alias_1 TCONS_00015399 ;
chr13	lncipedia.org	exon	64196102	64196320	.	-	.	gene_id lnc-PCDH20-8 ; transcript_id lnc-PCDH20-8:1 ; gene_alias_1 XLOC_010642 ; gene_alias_2 linc-PCDH20-9 ; transcript_alias_1 TCONS_00022042 ;
chr13	lncipedia.org	exon	64204770	64204813	.	-	.	gene_id lnc-PCDH20-8 ; transcript_id lnc-PCDH20-8:1 ; gene_alias_1 XLOC_010642 ; gene_alias_2 linc-PCDH20-9 ; transcript_alias_1 TCONS_00022042 ;
chr2	lncipedia.org	exon	243001271	243001371	.	+	.	gene_id lnc-CXXC11-3 ; transcript_id lnc-CXXC11-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_001924 ; transcript_alias_1 TCONS_00005049 ;
chr2	lncipedia.org	exon	243002448	243002921	.	+	.	gene_id lnc-CXXC11-3 ; transcript_id lnc-CXXC11-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_001924 ; transcript_alias_1 TCONS_00005049 ;
chr15	lncipedia.org	exon	20100335	20100342	.	+	.	gene_id lnc-OR4M2-8 ; transcript_id lnc-OR4M2-8:1 ; gene_alias_1 XLOC_011155 ; gene_alias_2 linc-OR4M2-7 ; transcript_alias_1 TCONS_00023286 ;
chr15	lncipedia.org	exon	20144898	20145193	.	+	.	gene_id lnc-OR4M2-8 ; transcript_id lnc-OR4M2-8:1 ; gene_alias_1 XLOC_011155 ; gene_alias_2 linc-OR4M2-7 ; transcript_alias_1 TCONS_00023286 ;
chr9	lncipedia.org	exon	35929917	35930131	.	+	.	gene_id lnc-HRCT1-3 ; transcript_id lnc-HRCT1-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_007342 ; gene_alias_2 linc-RECK-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00015971 ;
chr9	lncipedia.org	exon	35937014	35937121	.	+	.	gene_id lnc-HRCT1-3 ; transcript_id lnc-HRCT1-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_007342 ; gene_alias_2 linc-RECK-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00015971 ;
chrY	lncipedia.org	exon	58883380	58883510	.	+	.	gene_id lnc-PRYP4-3 ; transcript_id lnc-PRYP4-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_008304 ; gene_alias_2 linc-SPRY3-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00017658 ;
chrY	lncipedia.org	exon	58887085	58887164	.	+	.	gene_id lnc-PRYP4-3 ; transcript_id lnc-PRYP4-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_008304 ; gene_alias_2 linc-SPRY3-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00017658 ;
chr9	lncipedia.org	exon	69179560	69179617	.	-	.	gene_id lnc-FOXD4L6-1 ; transcript_id lnc-FOXD4L6-1:7 ; gene_alias_1 XLOC_007714 ; gene_alias_2 linc-FAM75A7-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00016791 ;
chr9	lncipedia.org	exon	69180823	69181020	.	-	.	gene_id lnc-FOXD4L6-1 ; transcript_id lnc-FOXD4L6-1:7 ; gene_alias_1 XLOC_007714 ; gene_alias_2 linc-FAM75A7-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00016791 ;
chrX	lncipedia.org	exon	119251705	119251821	.	-	.	gene_id lnc-RHOXF1-1 ; transcript_id lnc-RHOXF1-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_008222 ; gene_alias_2 linc-RHOXF1-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017537 ;
chrX	lncipedia.org	exon	119253450	119253591	.	-	.	gene_id lnc-RHOXF1-1 ; transcript_id lnc-RHOXF1-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_008222 ; gene_alias_2 linc-RHOXF1-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017537 ;
chr9	lncipedia.org	exon	111034533	111034562	.	+	.	gene_id lnc-ACTL7A-2 ; transcript_id lnc-ACTL7A-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_007514 ; gene_alias_2 linc-ACTL7A-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00016128 ;
chr9	lncipedia.org	exon	111035529	111035976	.	+	.	gene_id lnc-ACTL7A-2 ; transcript_id lnc-ACTL7A-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_007514 ; gene_alias_2 linc-ACTL7A-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00016128 ;
chr2	lncipedia.org	exon	43415402	43415588	.	+	.	gene_id lnc-PLEKHH2-2 ; transcript_id lnc-PLEKHH2-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_001449 ; gene_alias_2 linc-PLEKHH2-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00003662 ;
chr2	lncipedia.org	exon	43433712	43433742	.	+	.	gene_id lnc-PLEKHH2-2 ; transcript_id lnc-PLEKHH2-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_001449 ; gene_alias_2 linc-PLEKHH2-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00003662 ;
chr15	lncipedia.org	exon	20505643	20505803	.	+	.	gene_id lnc-OR4M2-7 ; transcript_id lnc-OR4M2-7:2 ; gene_alias_1 XLOC_011157 ; gene_alias_2 linc-OR4M2-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00023847 ;
chr15	lncipedia.org	exon	20506666	20506793	.	+	.	gene_id lnc-OR4M2-7 ; transcript_id lnc-OR4M2-7:2 ; gene_alias_1 XLOC_011157 ; gene_alias_2 linc-OR4M2-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00023847 ;
chr15	lncipedia.org	exon	20529998	20530104	.	+	.	gene_id lnc-OR4M2-7 ; transcript_id lnc-OR4M2-7:2 ; gene_alias_1 XLOC_011157 ; gene_alias_2 linc-OR4M2-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00023847 ;
chr15	lncipedia.org	exon	20530991	20531084	.	+	.	gene_id lnc-OR4M2-7 ; transcript_id lnc-OR4M2-7:2 ; gene_alias_1 XLOC_011157 ; gene_alias_2 linc-OR4M2-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00023847 ;
chr9	lncipedia.org	exon	67051145	67051266	.	+	.	gene_id lnc-RP11-262H14.4.1-4 ; transcript_id lnc-RP11-262H14.4.1-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_007374 ; gene_alias_2 linc-ANKRD20A1-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00016583 ;
chr9	lncipedia.org	exon	67269152	67269646	.	+	.	gene_id lnc-RP11-262H14.4.1-4 ; transcript_id lnc-RP11-262H14.4.1-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_007374 ; gene_alias_2 linc-ANKRD20A1-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00016583 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101586897	101587101	.	-	.	gene_id lnc-RTL1-4 ; transcript_id lnc-RTL1-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_011132 ; gene_alias_2 linc-RTL1-7 ; transcript_alias_1 TCONS_00022877 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101587365	101587425	.	-	.	gene_id lnc-RTL1-4 ; transcript_id lnc-RTL1-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_011132 ; gene_alias_2 linc-RTL1-7 ; transcript_alias_1 TCONS_00022877 ;
chr8	lncipedia.org	exon	75522030	75522275	.	-	.	gene_id lnc-JPH1-2 ; transcript_id lnc-JPH1-2:3 ; gene_alias_1 XLOC_007121 ; gene_alias_2 linc-JPH1-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00015040 ;
chr8	lncipedia.org	exon	75524689	75524801	.	-	.	gene_id lnc-JPH1-2 ; transcript_id lnc-JPH1-2:3 ; gene_alias_1 XLOC_007121 ; gene_alias_2 linc-JPH1-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00015040 ;
chr8	lncipedia.org	exon	75528995	75529029	.	-	.	gene_id lnc-JPH1-2 ; transcript_id lnc-JPH1-2:3 ; gene_alias_1 XLOC_007121 ; gene_alias_2 linc-JPH1-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00015040 ;
chrX	lncipedia.org	exon	396167	396426	.	+	.	gene_id lnc-PLCXD1-3 ; transcript_id lnc-PLCXD1-3:3 ; gene_alias_1 XLOC_007909 ; gene_alias_2 linc-SHOX-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017113 ;
chrX	lncipedia.org	exon	398339	398438	.	+	.	gene_id lnc-PLCXD1-3 ; transcript_id lnc-PLCXD1-3:3 ; gene_alias_1 XLOC_007909 ; gene_alias_2 linc-SHOX-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017113 ;
chr16	lncipedia.org	exon	90281181	90281239	.	+	.	gene_id lnc-GAS8-1 ; transcript_id lnc-GAS8-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000260923.1 ; gene_alias_2 AC137934.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172851.2 ; transcript_alias_1 ENST00000568947.1 ; transcript_alias_2 AC137934.1-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000420877.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	90281701	90281770	.	+	.	gene_id lnc-GAS8-1 ; transcript_id lnc-GAS8-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000260923.1 ; gene_alias_2 AC137934.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172851.2 ; transcript_alias_1 ENST00000568947.1 ; transcript_alias_2 AC137934.1-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000420877.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	193025033	193025189	.	+	.	gene_id lnc-HRASLS-1 ; transcript_id lnc-HRASLS-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236508.1 ; gene_alias_2 ATP13A5-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000156106.1 ; transcript_alias_1 ENST00000414634.1 ; transcript_alias_2 ATP13A5-AS1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000343028.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	193031833	193032151	.	+	.	gene_id lnc-HRASLS-1 ; transcript_id lnc-HRASLS-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236508.1 ; gene_alias_2 ATP13A5-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000156106.1 ; transcript_alias_1 ENST00000414634.1 ; transcript_alias_2 ATP13A5-AS1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000343028.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	93454679	93455031	.	+	.	gene_id lnc-C11orf54-1 ; transcript_id lnc-C11orf54-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254911.1 ; gene_alias_2 SCARNA9 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000167450.2 ; transcript_alias_1 ENST00000530422.1 ; transcript_alias_2 SCARNA9-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000394646.2 ;
chr10	lncipedia.org	exon	47186203	47186289	.	+	.	gene_id lnc-PPYR1-1 ; transcript_id lnc-PPYR1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224919.1 ; gene_alias_2 RP11-144G6.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000018119.1 ; transcript_alias_1 ENST00000434533.1 ; transcript_alias_2 RP11-144G6.4-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000047850.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	47192039	47192185	.	+	.	gene_id lnc-PPYR1-1 ; transcript_id lnc-PPYR1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224919.1 ; gene_alias_2 RP11-144G6.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000018119.1 ; transcript_alias_1 ENST00000434533.1 ; transcript_alias_2 RP11-144G6.4-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000047850.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	33038735	33038804	.	+	.	gene_id lnc-DYNLRB1-1 ; transcript_id lnc-DYNLRB1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231795.1 ; gene_alias_2 ITCH-IT1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000046196.1 ; transcript_alias_1 ENST00000418598.1 ; transcript_alias_2 ITCH-IT1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000106506.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	33042220	33042357	.	+	.	gene_id lnc-DYNLRB1-1 ; transcript_id lnc-DYNLRB1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231795.1 ; gene_alias_2 ITCH-IT1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000046196.1 ; transcript_alias_1 ENST00000418598.1 ; transcript_alias_2 ITCH-IT1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000106506.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	159239043	159239137	.	+	.	gene_id lnc-C6orf99-1 ; transcript_id lnc-C6orf99-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233893.1 ; gene_alias_2 EZR-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000015915.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451712.1 ; transcript_alias_2 EZR-AS1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000042875.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	159241504	159241625	.	+	.	gene_id lnc-C6orf99-1 ; transcript_id lnc-C6orf99-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233893.1 ; gene_alias_2 EZR-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000015915.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451712.1 ; transcript_alias_2 EZR-AS1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000042875.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	50378537	50378659	.	+	.	gene_id lnc-CYB561D2-1 ; transcript_id lnc-CYB561D2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235058.1 ; gene_alias_2 ZMYND10-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000156875.1 ; transcript_alias_1 ENST00000440013.1 ; transcript_alias_2 ZMYND10-AS1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000346386.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	50383002	50383128	.	+	.	gene_id lnc-CYB561D2-1 ; transcript_id lnc-CYB561D2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235058.1 ; gene_alias_2 ZMYND10-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000156875.1 ; transcript_alias_1 ENST00000440013.1 ; transcript_alias_2 ZMYND10-AS1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000346386.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	781645	781750	.	+	.	gene_id lnc-TALDO1-1 ; transcript_id lnc-TALDO1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255142.1 ; gene_alias_2 AP006621.6 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000165233.1 ; transcript_alias_1 ENST00000533938.1 ; transcript_alias_2 AP006621.6-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000382844.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	781928	782105	.	+	.	gene_id lnc-TALDO1-1 ; transcript_id lnc-TALDO1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255142.1 ; gene_alias_2 AP006621.6 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000165233.1 ; transcript_alias_1 ENST00000533938.1 ; transcript_alias_2 AP006621.6-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000382844.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	80753362	80753635	.	-	.	gene_id lnc-ZNF750-1 ; transcript_id lnc-ZNF750-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000263098.1 ; gene_alias_2 RP11-567O16.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000177811.1 ; transcript_alias_1 ENST00000576836.1 ; transcript_alias_2 RP11-567O16.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000439023.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	80753833	80753971	.	-	.	gene_id lnc-ZNF750-1 ; transcript_id lnc-ZNF750-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000263098.1 ; gene_alias_2 RP11-567O16.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000177811.1 ; transcript_alias_1 ENST00000576836.1 ; transcript_alias_2 RP11-567O16.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000439023.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	42572388	42572450	.	-	.	gene_id lnc-SEC22C-1 ; transcript_id lnc-SEC22C-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000232354.1 ; gene_alias_2 VIPR1-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000156181.2 ; transcript_alias_1 ENST00000452639.1 ; transcript_alias_2 VIPR1-AS1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000343415.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	42573513	42573587	.	-	.	gene_id lnc-SEC22C-1 ; transcript_id lnc-SEC22C-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000232354.1 ; gene_alias_2 VIPR1-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000156181.2 ; transcript_alias_1 ENST00000452639.1 ; transcript_alias_2 VIPR1-AS1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000343415.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	42574056	42574098	.	-	.	gene_id lnc-SEC22C-1 ; transcript_id lnc-SEC22C-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000232354.1 ; gene_alias_2 VIPR1-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000156181.2 ; transcript_alias_1 ENST00000452639.1 ; transcript_alias_2 VIPR1-AS1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000343415.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	160446	160690	.	+	.	gene_id lnc-OR4F5-2 ; transcript_id lnc-OR4F5-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_000001 ; gene_alias_2 linc-OR4F16-10 ; gene_alias_3 ENSG00000241599 ; gene_alias_4 RP11-34P13.9 ; gene_alias_5 ENSG00000241599.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000002525.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000119 ; transcript_alias_2 ENST00000496488 ; transcript_alias_3 ENST00000496488.1 ; transcript_alias_4 RP11-34P13.9-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000007169.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	161314	161525	.	+	.	gene_id lnc-OR4F5-2 ; transcript_id lnc-OR4F5-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_000001 ; gene_alias_2 linc-OR4F16-10 ; gene_alias_3 ENSG00000241599 ; gene_alias_4 RP11-34P13.9 ; gene_alias_5 ENSG00000241599.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000002525.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000119 ; transcript_alias_2 ENST00000496488 ; transcript_alias_3 ENST00000496488.1 ; transcript_alias_4 RP11-34P13.9-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000007169.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	45034957	45035091	.	-	.	gene_id lnc-FAM27E1.1-8 ; transcript_id lnc-FAM27E1.1-8:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229697 ; gene_alias_2 RP11-374M1.3 ; gene_alias_3 ENSG00000229697.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013242.1 ; transcript_alias_1 ENST00000441101 ; transcript_alias_2 ENST00000441101.1 ; transcript_alias_3 RP11-374M1.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037010.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	45035672	45035970	.	-	.	gene_id lnc-FAM27E1.1-8 ; transcript_id lnc-FAM27E1.1-8:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229697 ; gene_alias_2 RP11-374M1.3 ; gene_alias_3 ENSG00000229697.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013242.1 ; transcript_alias_1 ENST00000441101 ; transcript_alias_2 ENST00000441101.1 ; transcript_alias_3 RP11-374M1.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037010.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	45042556	45042707	.	-	.	gene_id lnc-FAM27E1.1-8 ; transcript_id lnc-FAM27E1.1-8:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229697 ; gene_alias_2 RP11-374M1.3 ; gene_alias_3 ENSG00000229697.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013242.1 ; transcript_alias_1 ENST00000441101 ; transcript_alias_2 ENST00000441101.1 ; transcript_alias_3 RP11-374M1.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037010.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	45047013	45047145	.	-	.	gene_id lnc-FAM27E1.1-8 ; transcript_id lnc-FAM27E1.1-8:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229697 ; gene_alias_2 RP11-374M1.3 ; gene_alias_3 ENSG00000229697.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013242.1 ; transcript_alias_1 ENST00000441101 ; transcript_alias_2 ENST00000441101.1 ; transcript_alias_3 RP11-374M1.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037010.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8062556	8064479	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-7 ; transcript_id lnc-KIDINS220-7:2 ; gene_alias_1 XLOC_001973 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-7 ; gene_alias_3 ENSG00000235665 ; gene_alias_4 AC007464.1 ; gene_alias_5 ENSG00000235665.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151595.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003193 ; transcript_alias_2 ENST00000426969 ; transcript_alias_3 ENST00000426969.1 ; transcript_alias_4 AC007464.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000323254.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8108276	8108410	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-7 ; transcript_id lnc-KIDINS220-7:2 ; gene_alias_1 XLOC_001973 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-7 ; gene_alias_3 ENSG00000235665 ; gene_alias_4 AC007464.1 ; gene_alias_5 ENSG00000235665.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151595.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003193 ; transcript_alias_2 ENST00000426969 ; transcript_alias_3 ENST00000426969.1 ; transcript_alias_4 AC007464.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000323254.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8116840	8116977	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-7 ; transcript_id lnc-KIDINS220-7:2 ; gene_alias_1 XLOC_001973 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-7 ; gene_alias_3 ENSG00000235665 ; gene_alias_4 AC007464.1 ; gene_alias_5 ENSG00000235665.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151595.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003193 ; transcript_alias_2 ENST00000426969 ; transcript_alias_3 ENST00000426969.1 ; transcript_alias_4 AC007464.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000323254.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8119403	8119441	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-7 ; transcript_id lnc-KIDINS220-7:2 ; gene_alias_1 XLOC_001973 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-7 ; gene_alias_3 ENSG00000235665 ; gene_alias_4 AC007464.1 ; gene_alias_5 ENSG00000235665.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151595.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003193 ; transcript_alias_2 ENST00000426969 ; transcript_alias_3 ENST00000426969.1 ; transcript_alias_4 AC007464.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000323254.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45010211	45010266	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000424903 ; transcript_alias_2 ENST00000424903.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-203 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45015088	45015213	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000424903 ; transcript_alias_2 ENST00000424903.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-203 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45015695	45015730	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000424903 ; transcript_alias_2 ENST00000424903.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-203 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45016075	45016136	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000424903 ; transcript_alias_2 ENST00000424903.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-203 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45016926	45016989	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000424903 ; transcript_alias_2 ENST00000424903.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-203 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45016991	45017012	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000424903 ; transcript_alias_2 ENST00000424903.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-203 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45017231	45017348	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000424903 ; transcript_alias_2 ENST00000424903.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-203 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45024508	45024786	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000424903 ; transcript_alias_2 ENST00000424903.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-203 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45026663	45026941	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000424903 ; transcript_alias_2 ENST00000424903.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-203 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45028019	45028294	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000424903 ; transcript_alias_2 ENST00000424903.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-203 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45029134	45029277	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000424903 ; transcript_alias_2 ENST00000424903.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-203 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45033481	45033548	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000424903 ; transcript_alias_2 ENST00000424903.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-203 ;
chr11	lncipedia.org	exon	134306367	134306678	.	+	.	gene_id lnc-GLB1L2-1 ; transcript_id lnc-GLB1L2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255545 ; gene_alias_2 RP11-627G23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255545.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167181.2 ; transcript_alias_1 ENST00000531319 ; transcript_alias_2 ENST00000531319.1 ; transcript_alias_3 RP11-627G23.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393641.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	134336080	134337169	.	+	.	gene_id lnc-GLB1L2-1 ; transcript_id lnc-GLB1L2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255545 ; gene_alias_2 RP11-627G23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255545.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167181.2 ; transcript_alias_1 ENST00000531319 ; transcript_alias_2 ENST00000531319.1 ; transcript_alias_3 RP11-627G23.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393641.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	46661242	46661548	.	-	.	gene_id lnc-FAM27E1.1-4 ; transcript_id lnc-FAM27E1.1-4:2 ; gene_alias_1 XLOC_007701 ; gene_alias_2 linc-FAM75A6-7 ; gene_alias_3 ENSG00000231212 ; gene_alias_4 RP11-111F5.3 ; gene_alias_5 ENSG00000231212.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000013300.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015819 ; transcript_alias_2 ENST00000438072 ; transcript_alias_3 ENST00000438072.1 ; transcript_alias_4 RP11-111F5.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000037086.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	46661771	46661860	.	-	.	gene_id lnc-FAM27E1.1-4 ; transcript_id lnc-FAM27E1.1-4:2 ; gene_alias_1 XLOC_007701 ; gene_alias_2 linc-FAM75A6-7 ; gene_alias_3 ENSG00000231212 ; gene_alias_4 RP11-111F5.3 ; gene_alias_5 ENSG00000231212.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000013300.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015819 ; transcript_alias_2 ENST00000438072 ; transcript_alias_3 ENST00000438072.1 ; transcript_alias_4 RP11-111F5.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000037086.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	46662448	46662593	.	-	.	gene_id lnc-FAM27E1.1-4 ; transcript_id lnc-FAM27E1.1-4:2 ; gene_alias_1 XLOC_007701 ; gene_alias_2 linc-FAM75A6-7 ; gene_alias_3 ENSG00000231212 ; gene_alias_4 RP11-111F5.3 ; gene_alias_5 ENSG00000231212.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000013300.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015819 ; transcript_alias_2 ENST00000438072 ; transcript_alias_3 ENST00000438072.1 ; transcript_alias_4 RP11-111F5.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000037086.1 ;
chr18	lncipedia.org	exon	11124	11450	.	+	.	gene_id lnc-USP14-5 ; transcript_id lnc-USP14-5:2 ; gene_alias_1 XLOC_012598 ; gene_alias_2 linc-USP14-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00026589 ;
chr18	lncipedia.org	exon	13146	13354	.	+	.	gene_id lnc-USP14-5 ; transcript_id lnc-USP14-5:2 ; gene_alias_1 XLOC_012598 ; gene_alias_2 linc-USP14-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00026589 ;
chr18	lncipedia.org	exon	15617	15867	.	+	.	gene_id lnc-USP14-5 ; transcript_id lnc-USP14-5:2 ; gene_alias_1 XLOC_012598 ; gene_alias_2 linc-USP14-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00026589 ;
chrX	lncipedia.org	exon	394513	394829	.	+	.	gene_id lnc-PLCXD1-3 ; transcript_id lnc-PLCXD1-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_007909 ; gene_alias_2 linc-SHOX-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017112 ;
chrX	lncipedia.org	exon	396312	396426	.	+	.	gene_id lnc-PLCXD1-3 ; transcript_id lnc-PLCXD1-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_007909 ; gene_alias_2 linc-SHOX-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017112 ;
chrX	lncipedia.org	exon	398339	398350	.	+	.	gene_id lnc-PLCXD1-3 ; transcript_id lnc-PLCXD1-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_007909 ; gene_alias_2 linc-SHOX-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017112 ;
chr8	lncipedia.org	exon	86864119	86865001	.	-	.	gene_id lnc-REXO1L2P-2 ; transcript_id lnc-REXO1L2P-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_007141 ; gene_alias_2 linc-REXO1L1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015064 ;
chr8	lncipedia.org	exon	86866739	86866829	.	-	.	gene_id lnc-REXO1L2P-2 ; transcript_id lnc-REXO1L2P-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_007141 ; gene_alias_2 linc-REXO1L1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015064 ;
chr14	lncipedia.org	exon	24161843	24162555	.	+	.	gene_id lnc-DHRS2-3 ; transcript_id lnc-DHRS2-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_010769 ; gene_alias_2 linc-DHRS4-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00022430 ;
chr14	lncipedia.org	exon	24166066	24168143	.	+	.	gene_id lnc-DHRS2-3 ; transcript_id lnc-DHRS2-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_010769 ; gene_alias_2 linc-DHRS4-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00022430 ;
chrX	lncipedia.org	exon	2484084	2485333	.	-	.	gene_id lnc-DHRSX-1 ; transcript_id lnc-DHRSX-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_008100 ; gene_alias_2 linc-ZBED1-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00017282 ;
chrX	lncipedia.org	exon	2488052	2488088	.	-	.	gene_id lnc-DHRSX-1 ; transcript_id lnc-DHRSX-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_008100 ; gene_alias_2 linc-ZBED1-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00017282 ;
chr19	lncipedia.org	exon	60951	61894	.	-	.	gene_id lnc-AC008993.1-1 ; transcript_id lnc-AC008993.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_013188 ; gene_alias_2 linc-MZF1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00026757 ;
chr19	lncipedia.org	exon	66346	66499	.	-	.	gene_id lnc-AC008993.1-1 ; transcript_id lnc-AC008993.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_013188 ; gene_alias_2 linc-MZF1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00026757 ;
chr19	lncipedia.org	exon	70928	70966	.	-	.	gene_id lnc-AC008993.1-1 ; transcript_id lnc-AC008993.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_013188 ; gene_alias_2 linc-MZF1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00026757 ;
chrX	lncipedia.org	exon	149184313	149184371	.	+	.	gene_id lnc-MAGEA8-2 ; transcript_id lnc-MAGEA8-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000235703 ; gene_alias_2 RP13-507I23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000235703.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022638.4 ; transcript_alias_1 ENST00000413076 ; transcript_alias_2 ENST00000413076.1 ; transcript_alias_3 RP13-507I23.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058736.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	149184568	149184731	.	+	.	gene_id lnc-MAGEA8-2 ; transcript_id lnc-MAGEA8-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000235703 ; gene_alias_2 RP13-507I23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000235703.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022638.4 ; transcript_alias_1 ENST00000413076 ; transcript_alias_2 ENST00000413076.1 ; transcript_alias_3 RP13-507I23.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058736.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	149184842	149184875	.	+	.	gene_id lnc-MAGEA8-2 ; transcript_id lnc-MAGEA8-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000235703 ; gene_alias_2 RP13-507I23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000235703.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022638.4 ; transcript_alias_1 ENST00000413076 ; transcript_alias_2 ENST00000413076.1 ; transcript_alias_3 RP13-507I23.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058736.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	149185730	149185875	.	+	.	gene_id lnc-MAGEA8-2 ; transcript_id lnc-MAGEA8-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000235703 ; gene_alias_2 RP13-507I23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000235703.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022638.4 ; transcript_alias_1 ENST00000413076 ; transcript_alias_2 ENST00000413076.1 ; transcript_alias_3 RP13-507I23.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058736.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	281725	281983	.	+	.	gene_id lnc-PLCXD1-1 ; transcript_id lnc-PLCXD1-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_007907 ; gene_alias_2 linc-SHOX-4 ; gene_alias_3 ENSG00000226179.1 ; gene_alias_4 PPP2R3B-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000021049.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00016957 ; transcript_alias_2 ENST00000391707.2 ; transcript_alias_3 PPP2R3B-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000055574.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	282418	282586	.	+	.	gene_id lnc-PLCXD1-1 ; transcript_id lnc-PLCXD1-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_007907 ; gene_alias_2 linc-SHOX-4 ; gene_alias_3 ENSG00000226179.1 ; gene_alias_4 PPP2R3B-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000021049.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00016957 ; transcript_alias_2 ENST00000391707.2 ; transcript_alias_3 PPP2R3B-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000055574.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	148338558	148338701	.	-	.	gene_id lnc-ZC3H12D-7 ; transcript_id lnc-ZC3H12D-7:1 ; gene_alias_1 XLOC_005869 ; gene_alias_2 linc-SHPRH-2 ; gene_alias_3 ENSG00000234675 ; gene_alias_4 RP11-242F11.2 ; gene_alias_5 ENSG00000234675.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000015770.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00011590 ; transcript_alias_2 ENST00000422023 ; transcript_alias_3 ENST00000422023.1 ; transcript_alias_4 RP11-242F11.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000042616.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	148339929	148340091	.	-	.	gene_id lnc-ZC3H12D-7 ; transcript_id lnc-ZC3H12D-7:1 ; gene_alias_1 XLOC_005869 ; gene_alias_2 linc-SHPRH-2 ; gene_alias_3 ENSG00000234675 ; gene_alias_4 RP11-242F11.2 ; gene_alias_5 ENSG00000234675.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000015770.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00011590 ; transcript_alias_2 ENST00000422023 ; transcript_alias_3 ENST00000422023.1 ; transcript_alias_4 RP11-242F11.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000042616.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	148341972	148342110	.	-	.	gene_id lnc-ZC3H12D-7 ; transcript_id lnc-ZC3H12D-7:1 ; gene_alias_1 XLOC_005869 ; gene_alias_2 linc-SHPRH-2 ; gene_alias_3 ENSG00000234675 ; gene_alias_4 RP11-242F11.2 ; gene_alias_5 ENSG00000234675.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000015770.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00011590 ; transcript_alias_2 ENST00000422023 ; transcript_alias_3 ENST00000422023.1 ; transcript_alias_4 RP11-242F11.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000042616.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175399618	175399955	.	+	.	gene_id lnc-FAM153B-3 ; transcript_id lnc-FAM153B-3:3 ; gene_alias_1 XLOC_004653 ; gene_alias_2 linc-FAM153B ; gene_alias_3 ENSG00000250801.1 ; gene_alias_4 RP11-91H12.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000163180.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009549 ; transcript_alias_2 ENST00000502354.1 ; transcript_alias_3 RP11-91H12.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371918.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175412651	175412859	.	+	.	gene_id lnc-FAM153B-3 ; transcript_id lnc-FAM153B-3:3 ; gene_alias_1 XLOC_004653 ; gene_alias_2 linc-FAM153B ; gene_alias_3 ENSG00000250801.1 ; gene_alias_4 RP11-91H12.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000163180.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009549 ; transcript_alias_2 ENST00000502354.1 ; transcript_alias_3 RP11-91H12.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371918.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	129672948	129673061	.	-	.	gene_id lnc-TMCC1-1 ; transcript_id lnc-TMCC1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_003248 ; gene_alias_2 linc-TMCC1-3 ; gene_alias_3 ENSG00000250643.1 ; gene_alias_4 RP11-93K22.6 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000159635.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005827 ; transcript_alias_2 ENST00000509201.1 ; transcript_alias_3 RP11-93K22.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000356594.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	129680964	129681115	.	-	.	gene_id lnc-TMCC1-1 ; transcript_id lnc-TMCC1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_003248 ; gene_alias_2 linc-TMCC1-3 ; gene_alias_3 ENSG00000250643.1 ; gene_alias_4 RP11-93K22.6 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000159635.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005827 ; transcript_alias_2 ENST00000509201.1 ; transcript_alias_3 RP11-93K22.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000356594.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	129684544	129684646	.	-	.	gene_id lnc-TMCC1-1 ; transcript_id lnc-TMCC1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_003248 ; gene_alias_2 linc-TMCC1-3 ; gene_alias_3 ENSG00000250643.1 ; gene_alias_4 RP11-93K22.6 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000159635.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005827 ; transcript_alias_2 ENST00000509201.1 ; transcript_alias_3 RP11-93K22.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000356594.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	129688041	129688137	.	-	.	gene_id lnc-TMCC1-1 ; transcript_id lnc-TMCC1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_003248 ; gene_alias_2 linc-TMCC1-3 ; gene_alias_3 ENSG00000250643.1 ; gene_alias_4 RP11-93K22.6 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000159635.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005827 ; transcript_alias_2 ENST00000509201.1 ; transcript_alias_3 RP11-93K22.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000356594.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101542927	101543043	.	-	.	gene_id lnc-RTL1-3 ; transcript_id lnc-RTL1-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000230805 ; gene_alias_2 AL132709.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230805.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000045024.2 ; transcript_alias_1 ENST00000556136 ; transcript_alias_2 ENST00000556136.1 ; transcript_alias_3 AL132709.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414544.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101543443	101543876	.	-	.	gene_id lnc-RTL1-3 ; transcript_id lnc-RTL1-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000230805 ; gene_alias_2 AL132709.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230805.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000045024.2 ; transcript_alias_1 ENST00000556136 ; transcript_alias_2 ENST00000556136.1 ; transcript_alias_3 AL132709.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414544.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	20549989	20550232	.	+	.	gene_id lnc-OR4M2-6 ; transcript_id lnc-OR4M2-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258654 ; gene_alias_2 RP11-509A17.3 ; gene_alias_3 ENSG00000258654.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171661.1 ; transcript_alias_1 ENST00000556397 ; transcript_alias_2 ENST00000556397.1 ; transcript_alias_3 RP11-509A17.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414656.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	20564127	20564412	.	+	.	gene_id lnc-OR4M2-6 ; transcript_id lnc-OR4M2-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258654 ; gene_alias_2 RP11-509A17.3 ; gene_alias_3 ENSG00000258654.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171661.1 ; transcript_alias_1 ENST00000556397 ; transcript_alias_2 ENST00000556397.1 ; transcript_alias_3 RP11-509A17.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414656.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	62854655	62855149	.	+	.	gene_id lnc-AC006455.1-3 ; transcript_id lnc-AC006455.1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_006116 ; gene_alias_2 linc-ZNF727-7 ; gene_alias_3 ENSG00000234387 ; gene_alias_4 RP11-340I6.1 ; gene_alias_5 ENSG00000234387.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000156380.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013017 ; transcript_alias_2 ENST00000451103 ; transcript_alias_3 ENST00000451103.1 ; transcript_alias_4 RP11-340I6.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000344023.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	62855640	62855817	.	+	.	gene_id lnc-AC006455.1-3 ; transcript_id lnc-AC006455.1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_006116 ; gene_alias_2 linc-ZNF727-7 ; gene_alias_3 ENSG00000234387 ; gene_alias_4 RP11-340I6.1 ; gene_alias_5 ENSG00000234387.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000156380.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013017 ; transcript_alias_2 ENST00000451103 ; transcript_alias_3 ENST00000451103.1 ; transcript_alias_4 RP11-340I6.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000344023.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	46359242	46359721	.	-	.	gene_id lnc-FAM27E1.1-1 ; transcript_id lnc-FAM27E1.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007700 ; gene_alias_2 linc-FAM75A6-6 ; gene_alias_3 ENSG00000231481.1 ; gene_alias_4 RP11-292F9.2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000013262.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015818 ; transcript_alias_2 ENST00000452477.1 ; transcript_alias_3 RP11-292F9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037031.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	46380210	46380257	.	-	.	gene_id lnc-FAM27E1.1-1 ; transcript_id lnc-FAM27E1.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007700 ; gene_alias_2 linc-FAM75A6-6 ; gene_alias_3 ENSG00000231481.1 ; gene_alias_4 RP11-292F9.2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000013262.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015818 ; transcript_alias_2 ENST00000452477.1 ; transcript_alias_3 RP11-292F9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037031.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	41285357	41285419	.	+	.	gene_id lnc-FAM75A5-3 ; transcript_id lnc-FAM75A5-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_007358 ; gene_alias_2 linc-FAM75A7-16 ; gene_alias_3 ENSG00000228858.1 ; gene_alias_4 RP11-95K23.5 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000066734.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015672 ; transcript_alias_2 ENST00000450779.1 ; transcript_alias_3 RP11-95K23.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000143045.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	41286244	41287306	.	+	.	gene_id lnc-FAM75A5-3 ; transcript_id lnc-FAM75A5-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_007358 ; gene_alias_2 linc-FAM75A7-16 ; gene_alias_3 ENSG00000228858.1 ; gene_alias_4 RP11-95K23.5 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000066734.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015672 ; transcript_alias_2 ENST00000450779.1 ; transcript_alias_3 RP11-95K23.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000143045.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	161607438	161607725	.	-	.	gene_id lnc-FCGR3B-1 ; transcript_id lnc-FCGR3B-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_001068 ; gene_alias_2 linc-FCGR3B-2 ; gene_alias_3 ENSG00000231813.1 ; gene_alias_4 RP11-474I16.1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000034467.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000653 ; transcript_alias_2 ENST00000449604.1 ; transcript_alias_3 RP11-474I16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000083315.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	161608045	161608218	.	-	.	gene_id lnc-FCGR3B-1 ; transcript_id lnc-FCGR3B-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_001068 ; gene_alias_2 linc-FCGR3B-2 ; gene_alias_3 ENSG00000231813.1 ; gene_alias_4 RP11-474I16.1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000034467.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000653 ; transcript_alias_2 ENST00000449604.1 ; transcript_alias_3 RP11-474I16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000083315.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175399625	175399955	.	+	.	gene_id lnc-FAM153B-3 ; transcript_id lnc-FAM153B-3:4 ; gene_alias_1 XLOC_004653 ; gene_alias_2 linc-FAM153B ; gene_alias_3 ENSG00000250801.1 ; gene_alias_4 RP11-91H12.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000163180.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009550 ; transcript_alias_2 ENST00000511796.1 ; transcript_alias_3 RP11-91H12.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371919.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175406170	175406239	.	+	.	gene_id lnc-FAM153B-3 ; transcript_id lnc-FAM153B-3:4 ; gene_alias_1 XLOC_004653 ; gene_alias_2 linc-FAM153B ; gene_alias_3 ENSG00000250801.1 ; gene_alias_4 RP11-91H12.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000163180.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009550 ; transcript_alias_2 ENST00000511796.1 ; transcript_alias_3 RP11-91H12.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371919.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	3051335	3051485	.	-	.	gene_id lnc-SERPINB6-2 ; transcript_id lnc-SERPINB6-2:3 ; gene_alias_1 XLOC_005582 ; gene_alias_2 linc-SERPINB6-2 ; gene_alias_3 ENSG00000233763.1 ; gene_alias_4 RP1-40E16.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000014138.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00011430 ; transcript_alias_2 ENST00000423062.1 ; transcript_alias_3 RP1-40E16.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000039667.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	3052197	3052317	.	-	.	gene_id lnc-SERPINB6-2 ; transcript_id lnc-SERPINB6-2:3 ; gene_alias_1 XLOC_005582 ; gene_alias_2 linc-SERPINB6-2 ; gene_alias_3 ENSG00000233763.1 ; gene_alias_4 RP1-40E16.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000014138.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00011430 ; transcript_alias_2 ENST00000423062.1 ; transcript_alias_3 RP1-40E16.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000039667.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	20378933	20378960	.	+	.	gene_id lnc-AC007663.1-4 ; transcript_id lnc-AC007663.1-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000206176 ; gene_alias_2 AC023490.1 ; gene_alias_3 ENSG00000206176.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152507.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412928 ; transcript_alias_2 ENST00000412928.1 ; transcript_alias_3 AC023490.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000319430.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	20379308	20379364	.	+	.	gene_id lnc-AC007663.1-4 ; transcript_id lnc-AC007663.1-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000206176 ; gene_alias_2 AC023490.1 ; gene_alias_3 ENSG00000206176.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152507.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412928 ; transcript_alias_2 ENST00000412928.1 ; transcript_alias_3 AC023490.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000319430.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	20379473	20379591	.	+	.	gene_id lnc-AC007663.1-4 ; transcript_id lnc-AC007663.1-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000206176 ; gene_alias_2 AC023490.1 ; gene_alias_3 ENSG00000206176.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152507.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412928 ; transcript_alias_2 ENST00000412928.1 ; transcript_alias_3 AC023490.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000319430.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	20379803	20380071	.	+	.	gene_id lnc-AC007663.1-4 ; transcript_id lnc-AC007663.1-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000206176 ; gene_alias_2 AC023490.1 ; gene_alias_3 ENSG00000206176.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152507.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412928 ; transcript_alias_2 ENST00000412928.1 ; transcript_alias_3 AC023490.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000319430.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	111834639	111834677	.	+	.	gene_id lnc-SH2B3-1 ; transcript_id lnc-SH2B3-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000257595 ; gene_alias_2 RP3-473L9.4 ; gene_alias_3 ENSG00000257595.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169548.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548846 ; transcript_alias_2 ENST00000548846.1 ; transcript_alias_3 RP3-473L9.4-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404777.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	111840942	111841111	.	+	.	gene_id lnc-SH2B3-1 ; transcript_id lnc-SH2B3-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000257595 ; gene_alias_2 RP3-473L9.4 ; gene_alias_3 ENSG00000257595.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169548.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548846 ; transcript_alias_2 ENST00000548846.1 ; transcript_alias_3 RP3-473L9.4-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404777.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	142569266	142569311	.	-	.	gene_id lnc-PPIAL4G-10 ; transcript_id lnc-PPIAL4G-10:1 ; gene_alias_1 XLOC_000993 ; gene_alias_2 linc-FCGR1B-8 ; gene_alias_3 ENSG00000233798 ; gene_alias_4 AL583842.2 ; gene_alias_5 ENSG00000233798.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000013378.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000628 ; transcript_alias_2 ENST00000415979 ; transcript_alias_3 ENST00000415979.1 ; transcript_alias_4 AL583842.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000037256.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	142569981	142570081	.	-	.	gene_id lnc-PPIAL4G-10 ; transcript_id lnc-PPIAL4G-10:1 ; gene_alias_1 XLOC_000993 ; gene_alias_2 linc-FCGR1B-8 ; gene_alias_3 ENSG00000233798 ; gene_alias_4 AL583842.2 ; gene_alias_5 ENSG00000233798.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000013378.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000628 ; transcript_alias_2 ENST00000415979 ; transcript_alias_3 ENST00000415979.1 ; transcript_alias_4 AL583842.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000037256.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	142577487	142577534	.	-	.	gene_id lnc-PPIAL4G-10 ; transcript_id lnc-PPIAL4G-10:1 ; gene_alias_1 XLOC_000993 ; gene_alias_2 linc-FCGR1B-8 ; gene_alias_3 ENSG00000233798 ; gene_alias_4 AL583842.2 ; gene_alias_5 ENSG00000233798.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000013378.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000628 ; transcript_alias_2 ENST00000415979 ; transcript_alias_3 ENST00000415979.1 ; transcript_alias_4 AL583842.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000037256.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	142588067	142588234	.	-	.	gene_id lnc-PPIAL4G-10 ; transcript_id lnc-PPIAL4G-10:1 ; gene_alias_1 XLOC_000993 ; gene_alias_2 linc-FCGR1B-8 ; gene_alias_3 ENSG00000233798 ; gene_alias_4 AL583842.2 ; gene_alias_5 ENSG00000233798.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000013378.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000628 ; transcript_alias_2 ENST00000415979 ; transcript_alias_3 ENST00000415979.1 ; transcript_alias_4 AL583842.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000037256.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	24246961	24247202	.	-	.	gene_id lnc-PRY2-1 ; transcript_id lnc-PRY2-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000236951 ; gene_alias_2 AC007359.6 ; gene_alias_3 ENSG00000236951.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000043574.1 ; transcript_alias_1 ENST00000417910 ; transcript_alias_2 ENST00000417910.1 ; transcript_alias_3 AC007359.6-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000101913.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	24248252	24248516	.	-	.	gene_id lnc-PRY2-1 ; transcript_id lnc-PRY2-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000236951 ; gene_alias_2 AC007359.6 ; gene_alias_3 ENSG00000236951.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000043574.1 ; transcript_alias_1 ENST00000417910 ; transcript_alias_2 ENST00000417910.1 ; transcript_alias_3 AC007359.6-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000101913.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	24249032	24249149	.	-	.	gene_id lnc-PRY2-1 ; transcript_id lnc-PRY2-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000236951 ; gene_alias_2 AC007359.6 ; gene_alias_3 ENSG00000236951.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000043574.1 ; transcript_alias_1 ENST00000417910 ; transcript_alias_2 ENST00000417910.1 ; transcript_alias_3 AC007359.6-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000101913.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	24251897	24252016	.	-	.	gene_id lnc-PRY2-1 ; transcript_id lnc-PRY2-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000236951 ; gene_alias_2 AC007359.6 ; gene_alias_3 ENSG00000236951.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000043574.1 ; transcript_alias_1 ENST00000417910 ; transcript_alias_2 ENST00000417910.1 ; transcript_alias_3 AC007359.6-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000101913.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	75558526	75558781	.	+	.	gene_id lnc-SEPT9-3 ; transcript_id lnc-SEPT9-3:7 ; gene_alias_1 XLOC_012317 ; gene_alias_2 linc-TNRC6C-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00025507 ;
chr17	lncipedia.org	exon	75558835	75558871	.	+	.	gene_id lnc-SEPT9-3 ; transcript_id lnc-SEPT9-3:7 ; gene_alias_1 XLOC_012317 ; gene_alias_2 linc-TNRC6C-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00025507 ;
chr12	lncipedia.org	exon	48849393	48849557	.	+	.	gene_id lnc-ANP32D-1 ; transcript_id lnc-ANP32D-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_009736 ; gene_alias_2 linc-ANP32D-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00020409 ;
chr12	lncipedia.org	exon	48852968	48853108	.	+	.	gene_id lnc-ANP32D-1 ; transcript_id lnc-ANP32D-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_009736 ; gene_alias_2 linc-ANP32D-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00020409 ;
chr12	lncipedia.org	exon	48853239	48853296	.	+	.	gene_id lnc-ANP32D-1 ; transcript_id lnc-ANP32D-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_009736 ; gene_alias_2 linc-ANP32D-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00020409 ;
chr1	lncipedia.org	exon	106993298	106993494	.	+	.	gene_id lnc-PRMT6-2 ; transcript_id lnc-PRMT6-2:3 ; gene_alias_1 XLOC_000329 ; gene_alias_2 linc-PRMT6-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00002109 ;
chr1	lncipedia.org	exon	106994578	106994678	.	+	.	gene_id lnc-PRMT6-2 ; transcript_id lnc-PRMT6-2:3 ; gene_alias_1 XLOC_000329 ; gene_alias_2 linc-PRMT6-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00002109 ;
chr10	lncipedia.org	exon	64883695	64883942	.	-	.	gene_id lnc-JMJD1C-1 ; transcript_id lnc-JMJD1C-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_008835 ; gene_alias_2 linc-EGR2 ; transcript_alias_1 TCONS_00018939 ;
chr10	lncipedia.org	exon	64884485	64884619	.	-	.	gene_id lnc-JMJD1C-1 ; transcript_id lnc-JMJD1C-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_008835 ; gene_alias_2 linc-EGR2 ; transcript_alias_1 TCONS_00018939 ;
chr17	lncipedia.org	exon	81189540	81189657	.	+	.	gene_id lnc-AC139099.1-1 ; transcript_id lnc-AC139099.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_012351 ; transcript_alias_1 TCONS_00025203 ;
chr17	lncipedia.org	exon	81190396	81190888	.	+	.	gene_id lnc-AC139099.1-1 ; transcript_id lnc-AC139099.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_012351 ; transcript_alias_1 TCONS_00025203 ;
chr9	lncipedia.org	exon	67340517	67340724	.	+	.	gene_id lnc-ANKRD20A1-2 ; transcript_id lnc-ANKRD20A1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_007377 ; gene_alias_2 linc-ANKRD20A1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00015993 ;
chr9	lncipedia.org	exon	67342453	67342623	.	+	.	gene_id lnc-ANKRD20A1-2 ; transcript_id lnc-ANKRD20A1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_007377 ; gene_alias_2 linc-ANKRD20A1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00015993 ;
chr9	lncipedia.org	exon	67343487	67343501	.	+	.	gene_id lnc-ANKRD20A1-2 ; transcript_id lnc-ANKRD20A1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_007377 ; gene_alias_2 linc-ANKRD20A1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00015993 ;
chr16	lncipedia.org	exon	74226304	74226625	.	-	.	gene_id lnc-CLEC18B-3 ; transcript_id lnc-CLEC18B-3:7 ; gene_alias_1 XLOC_012007 ; gene_alias_2 linc-ZFHX3-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00025050 ;
chr16	lncipedia.org	exon	74239804	74240064	.	-	.	gene_id lnc-CLEC18B-3 ; transcript_id lnc-CLEC18B-3:7 ; gene_alias_1 XLOC_012007 ; gene_alias_2 linc-ZFHX3-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00025050 ;
chr16	lncipedia.org	exon	74244205	74244404	.	-	.	gene_id lnc-CLEC18B-3 ; transcript_id lnc-CLEC18B-3:7 ; gene_alias_1 XLOC_012007 ; gene_alias_2 linc-ZFHX3-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00025050 ;
chr18	lncipedia.org	exon	8559865	8560160	.	-	.	gene_id lnc-PPP4R1-9 ; transcript_id lnc-PPP4R1-9:1 ; gene_alias_1 XLOC_012750 ; gene_alias_2 linc-LAMA1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00026399 ;
chr18	lncipedia.org	exon	8563150	8563192	.	-	.	gene_id lnc-PPP4R1-9 ; transcript_id lnc-PPP4R1-9:1 ; gene_alias_1 XLOC_012750 ; gene_alias_2 linc-LAMA1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00026399 ;
chr9	lncipedia.org	exon	69174514	69174523	.	-	.	gene_id lnc-FOXD4L6-1 ; transcript_id lnc-FOXD4L6-1:13 ; gene_alias_1 XLOC_007714 ; gene_alias_2 linc-FAM75A7-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00016787 ;
chr9	lncipedia.org	exon	69175692	69175760	.	-	.	gene_id lnc-FOXD4L6-1 ; transcript_id lnc-FOXD4L6-1:13 ; gene_alias_1 XLOC_007714 ; gene_alias_2 linc-FAM75A7-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00016787 ;
chr9	lncipedia.org	exon	69175960	69176070	.	-	.	gene_id lnc-FOXD4L6-1 ; transcript_id lnc-FOXD4L6-1:13 ; gene_alias_1 XLOC_007714 ; gene_alias_2 linc-FAM75A7-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00016787 ;
chr9	lncipedia.org	exon	69177532	69177559	.	-	.	gene_id lnc-FOXD4L6-1 ; transcript_id lnc-FOXD4L6-1:13 ; gene_alias_1 XLOC_007714 ; gene_alias_2 linc-FAM75A7-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00016787 ;
chr21	lncipedia.org	exon	10164261	10164656	.	+	.	gene_id lnc-CR381653.1-1 ; transcript_id lnc-CR381653.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_013853 ; gene_alias_2 linc-POTED-7 ; transcript_alias_1 TCONS_00028962 ;
chr21	lncipedia.org	exon	10166073	10166109	.	+	.	gene_id lnc-CR381653.1-1 ; transcript_id lnc-CR381653.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_013853 ; gene_alias_2 linc-POTED-7 ; transcript_alias_1 TCONS_00028962 ;
chrX	lncipedia.org	exon	119269717	119269969	.	-	.	gene_id lnc-FAM70A-1 ; transcript_id lnc-FAM70A-1:9 ; gene_alias_1 XLOC_008223 ; gene_alias_2 linc-RHOXF1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017540 ;
chrX	lncipedia.org	exon	119270952	119270963	.	-	.	gene_id lnc-FAM70A-1 ; transcript_id lnc-FAM70A-1:9 ; gene_alias_1 XLOC_008223 ; gene_alias_2 linc-RHOXF1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017540 ;
chr9	lncipedia.org	exon	47162727	47162747	.	+	.	gene_id lnc-FAM27D1.1-3 ; transcript_id lnc-FAM27D1.1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_007368 ; gene_alias_2 linc-ANKRD20A1-11 ; transcript_alias_1 TCONS_00015989 ;
chr9	lncipedia.org	exon	47163833	47164029	.	+	.	gene_id lnc-FAM27D1.1-3 ; transcript_id lnc-FAM27D1.1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_007368 ; gene_alias_2 linc-ANKRD20A1-11 ; transcript_alias_1 TCONS_00015989 ;
chr19	lncipedia.org	exon	29931964	29932262	.	+	.	gene_id lnc-VSTM2B-3 ; transcript_id lnc-VSTM2B-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_013030 ; gene_alias_2 linc-VSTM2B-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00026981 ;
chr19	lncipedia.org	exon	29934310	29934368	.	+	.	gene_id lnc-VSTM2B-3 ; transcript_id lnc-VSTM2B-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_013030 ; gene_alias_2 linc-VSTM2B-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00026981 ;
chr2	lncipedia.org	exon	242998199	242998510	.	-	.	gene_id lnc-AC131097.4.1-3 ; transcript_id lnc-AC131097.4.1-3:3 ; gene_alias_1 XLOC_002560 ; gene_alias_2 linc-PDCD1-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00005375 ;
chr2	lncipedia.org	exon	243002448	243002670	.	-	.	gene_id lnc-AC131097.4.1-3 ; transcript_id lnc-AC131097.4.1-3:3 ; gene_alias_1 XLOC_002560 ; gene_alias_2 linc-PDCD1-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00005375 ;
chr2	lncipedia.org	exon	243026247	243026380	.	-	.	gene_id lnc-AC131097.4.1-3 ; transcript_id lnc-AC131097.4.1-3:3 ; gene_alias_1 XLOC_002560 ; gene_alias_2 linc-PDCD1-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00005375 ;
chrY	lncipedia.org	exon	58912269	58912298	.	+	.	gene_id lnc-PRYP4-4 ; transcript_id lnc-PRYP4-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_008305 ; gene_alias_2 linc-SPRY3-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017659 ;
chrY	lncipedia.org	exon	58914294	58915039	.	+	.	gene_id lnc-PRYP4-4 ; transcript_id lnc-PRYP4-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_008305 ; gene_alias_2 linc-SPRY3-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017659 ;
chr8	lncipedia.org	exon	30593693	30593937	.	-	.	gene_id lnc-GSR-1 ; transcript_id lnc-GSR-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007047 ; gene_alias_2 linc-GSR-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00014964 ;
chr8	lncipedia.org	exon	30594110	30594132	.	-	.	gene_id lnc-GSR-1 ; transcript_id lnc-GSR-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007047 ; gene_alias_2 linc-GSR-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00014964 ;
chr20	lncipedia.org	exon	49012776	49012990	.	+	.	gene_id lnc-PTPN1-2 ; transcript_id lnc-PTPN1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_013562 ; gene_alias_2 linc-PTPN1-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00028216 ;
chr20	lncipedia.org	exon	49013527	49013558	.	+	.	gene_id lnc-PTPN1-2 ; transcript_id lnc-PTPN1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_013562 ; gene_alias_2 linc-PTPN1-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00028216 ;
chr18	lncipedia.org	exon	14145	14653	.	-	.	gene_id lnc-RP11-683L23.1.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-683L23.1.1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_012737 ; gene_alias_2 linc-PARD6G-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00026387 ;
chr18	lncipedia.org	exon	16856	16900	.	-	.	gene_id lnc-RP11-683L23.1.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-683L23.1.1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_012737 ; gene_alias_2 linc-PARD6G-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00026387 ;
chr15	lncipedia.org	exon	99635728	99635884	.	-	.	gene_id lnc-PGPEP1L-1 ; transcript_id lnc-PGPEP1L-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_011607 ; gene_alias_2 linc-PGPEP1L ; transcript_alias_1 TCONS_00023831 ;
chr15	lncipedia.org	exon	99640583	99640901	.	-	.	gene_id lnc-PGPEP1L-1 ; transcript_id lnc-PGPEP1L-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_011607 ; gene_alias_2 linc-PGPEP1L ; transcript_alias_1 TCONS_00023831 ;
chr9	lncipedia.org	exon	33731117	33731298	.	+	.	gene_id lnc-PRSS3-1 ; transcript_id lnc-PRSS3-1:5 ; gene_alias_1 XLOC_007326 ; gene_alias_2 linc-PRSS3-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00016567 ;
chr9	lncipedia.org	exon	33731762	33731892	.	+	.	gene_id lnc-PRSS3-1 ; transcript_id lnc-PRSS3-1:5 ; gene_alias_1 XLOC_007326 ; gene_alias_2 linc-PRSS3-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00016567 ;
chr9	lncipedia.org	exon	33733126	33733252	.	+	.	gene_id lnc-PRSS3-1 ; transcript_id lnc-PRSS3-1:5 ; gene_alias_1 XLOC_007326 ; gene_alias_2 linc-PRSS3-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00016567 ;
chr9	lncipedia.org	exon	33742229	33742281	.	+	.	gene_id lnc-PRSS3-1 ; transcript_id lnc-PRSS3-1:5 ; gene_alias_1 XLOC_007326 ; gene_alias_2 linc-PRSS3-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00016567 ;
chr4	lncipedia.org	exon	1553726	1553749	.	-	.	gene_id lnc-FAM53A-2 ; transcript_id lnc-FAM53A-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_003852 ; gene_alias_2 linc-CTBP1-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00008407 ;
chr4	lncipedia.org	exon	1553894	1554076	.	-	.	gene_id lnc-FAM53A-2 ; transcript_id lnc-FAM53A-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_003852 ; gene_alias_2 linc-CTBP1-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00008407 ;
chr19	lncipedia.org	exon	34286903	34287008	.	+	.	gene_id lnc-KCTD15-1 ; transcript_id lnc-KCTD15-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_013044 ; gene_alias_2 linc-KCTD15 ; transcript_alias_1 TCONS_00026997 ;
chr19	lncipedia.org	exon	34287334	34287633	.	+	.	gene_id lnc-KCTD15-1 ; transcript_id lnc-KCTD15-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_013044 ; gene_alias_2 linc-KCTD15 ; transcript_alias_1 TCONS_00026997 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21401645	21401787	.	+	.	gene_id lnc-P2RX6-1 ; transcript_id lnc-P2RX6-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_014162 ; gene_alias_2 linc-RIMBP3C-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00029767 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21402173	21403179	.	+	.	gene_id lnc-P2RX6-1 ; transcript_id lnc-P2RX6-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_014162 ; gene_alias_2 linc-RIMBP3C-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00029767 ;
chr15	lncipedia.org	exon	99635728	99635884	.	-	.	gene_id lnc-PGPEP1L-1 ; transcript_id lnc-PGPEP1L-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_011607 ; gene_alias_2 linc-PGPEP1L ; transcript_alias_1 TCONS_00024220 ;
chr15	lncipedia.org	exon	99640926	99641040	.	-	.	gene_id lnc-PGPEP1L-1 ; transcript_id lnc-PGPEP1L-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_011607 ; gene_alias_2 linc-PGPEP1L ; transcript_alias_1 TCONS_00024220 ;
chr1	lncipedia.org	exon	212840987	212841090	.	+	.	gene_id lnc-FAM71A-1 ; transcript_id lnc-FAM71A-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_000556 ; gene_alias_2 linc-TATDN3 ; transcript_alias_1 TCONS_00001269 ;
chr1	lncipedia.org	exon	212847267	212847401	.	+	.	gene_id lnc-FAM71A-1 ; transcript_id lnc-FAM71A-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_000556 ; gene_alias_2 linc-TATDN3 ; transcript_alias_1 TCONS_00001269 ;
chr1	lncipedia.org	exon	684693	684761	.	-	.	gene_id lnc-OR4F16-3 ; transcript_id lnc-OR4F16-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_000664 ; gene_alias_2 linc-OR4F16-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00002275 ;
chr1	lncipedia.org	exon	689043	689194	.	-	.	gene_id lnc-OR4F16-3 ; transcript_id lnc-OR4F16-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_000664 ; gene_alias_2 linc-OR4F16-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00002275 ;
chrY	lncipedia.org	exon	58838501	58838625	.	+	.	gene_id lnc-PRYP4-2 ; transcript_id lnc-PRYP4-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_008303 ; gene_alias_2 linc-SPRY3-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00017657 ;
chrY	lncipedia.org	exon	58841999	58842077	.	+	.	gene_id lnc-PRYP4-2 ; transcript_id lnc-PRYP4-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_008303 ; gene_alias_2 linc-SPRY3-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00017657 ;
chr7	lncipedia.org	exon	150040716	150040730	.	+	.	gene_id lnc-LRRC61-2 ; transcript_id lnc-LRRC61-2:3 ; gene_alias_1 XLOC_006291 ; gene_alias_2 linc-REPIN1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013628 ;
chr7	lncipedia.org	exon	150054392	150055006	.	+	.	gene_id lnc-LRRC61-2 ; transcript_id lnc-LRRC61-2:3 ; gene_alias_1 XLOC_006291 ; gene_alias_2 linc-REPIN1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013628 ;
chr1	lncipedia.org	exon	149615886	149616111	.	+	.	gene_id lnc-AL358813.2-2 ; transcript_id lnc-AL358813.2-2:14 ; gene_alias_1 XLOC_000398 ; gene_alias_2 linc-FCGR1A-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00002158 ;
chr1	lncipedia.org	exon	149616546	149616643	.	+	.	gene_id lnc-AL358813.2-2 ; transcript_id lnc-AL358813.2-2:14 ; gene_alias_1 XLOC_000398 ; gene_alias_2 linc-FCGR1A-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00002158 ;
chr7	lncipedia.org	exon	62855028	62855250	.	+	.	gene_id lnc-AC006455.1-3 ; transcript_id lnc-AC006455.1-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_006116 ; gene_alias_2 linc-ZNF727-7 ; transcript_alias_1 TCONS_00014146 ;
chr7	lncipedia.org	exon	62855640	62855744	.	+	.	gene_id lnc-AC006455.1-3 ; transcript_id lnc-AC006455.1-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_006116 ; gene_alias_2 linc-ZNF727-7 ; transcript_alias_1 TCONS_00014146 ;
chrX	lncipedia.org	exon	119277416	119277818	.	-	.	gene_id lnc-RHOXF1-2 ; transcript_id lnc-RHOXF1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_008224 ; gene_alias_2 linc-RHOXF1-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00017541 ;
chrX	lncipedia.org	exon	119279257	119279301	.	-	.	gene_id lnc-RHOXF1-2 ; transcript_id lnc-RHOXF1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_008224 ; gene_alias_2 linc-RHOXF1-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00017541 ;
chr21	lncipedia.org	exon	9698812	9698992	.	+	.	gene_id lnc-CR381653.1-4 ; transcript_id lnc-CR381653.1-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_013851 ; gene_alias_2 linc-POTED-9 ; transcript_alias_1 TCONS_00029192 ;
chr21	lncipedia.org	exon	9699140	9699252	.	+	.	gene_id lnc-CR381653.1-4 ; transcript_id lnc-CR381653.1-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_013851 ; gene_alias_2 linc-POTED-9 ; transcript_alias_1 TCONS_00029192 ;
chr14	lncipedia.org	exon	34596274	34596350	.	-	.	gene_id lnc-SPTSSA-1 ; transcript_id lnc-SPTSSA-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_010990 ; gene_alias_2 linc-EGLN3 ; transcript_alias_1 TCONS_00022702 ;
chr14	lncipedia.org	exon	34638697	34638853	.	-	.	gene_id lnc-SPTSSA-1 ; transcript_id lnc-SPTSSA-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_010990 ; gene_alias_2 linc-EGLN3 ; transcript_alias_1 TCONS_00022702 ;
chr1	lncipedia.org	exon	2482706	2482729	.	+	.	gene_id lnc-TNFRSF14-1 ; transcript_id lnc-TNFRSF14-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_000022 ; gene_alias_2 linc-TNFRSF14 ; transcript_alias_1 TCONS_00001917 ;
chr1	lncipedia.org	exon	2482826	2483281	.	+	.	gene_id lnc-TNFRSF14-1 ; transcript_id lnc-TNFRSF14-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_000022 ; gene_alias_2 linc-TNFRSF14 ; transcript_alias_1 TCONS_00001917 ;
chr20	lncipedia.org	exon	42523354	42523437	.	+	.	gene_id lnc-TOX2-1 ; transcript_id lnc-TOX2-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_013528 ; gene_alias_2 linc-TOX2 ; transcript_alias_1 TCONS_00028164 ;
chr20	lncipedia.org	exon	42523683	42523925	.	+	.	gene_id lnc-TOX2-1 ; transcript_id lnc-TOX2-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_013528 ; gene_alias_2 linc-TOX2 ; transcript_alias_1 TCONS_00028164 ;
chr21	lncipedia.org	exon	9826394	9826400	.	-	.	gene_id lnc-TPTE-3 ; transcript_id lnc-TPTE-3:3 ; gene_alias_1 XLOC_013994 ; gene_alias_2 linc-S100B-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00029068 ;
chr21	lncipedia.org	exon	9827280	9827584	.	-	.	gene_id lnc-TPTE-3 ; transcript_id lnc-TPTE-3:3 ; gene_alias_1 XLOC_013994 ; gene_alias_2 linc-S100B-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00029068 ;
chr12	lncipedia.org	exon	111834639	111834677	.	+	.	gene_id lnc-SH2B3-1 ; transcript_id lnc-SH2B3-1:4 ; gene_alias_1 XLOC_009880 ; gene_alias_2 linc-SH2B3 ; transcript_alias_1 TCONS_00020562 ;
chr12	lncipedia.org	exon	111840942	111841107	.	+	.	gene_id lnc-SH2B3-1 ; transcript_id lnc-SH2B3-1:4 ; gene_alias_1 XLOC_009880 ; gene_alias_2 linc-SH2B3 ; transcript_alias_1 TCONS_00020562 ;
chr22	lncipedia.org	exon	34609872	34609908	.	+	.	gene_id lnc-ISX-2 ; transcript_id lnc-ISX-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_014217 ; gene_alias_2 linc-ISX-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00029583 ;
chr22	lncipedia.org	exon	34614497	34614763	.	+	.	gene_id lnc-ISX-2 ; transcript_id lnc-ISX-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_014217 ; gene_alias_2 linc-ISX-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00029583 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143231332	143231561	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-6 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-6:6 ; gene_alias_1 XLOC_000380 ; gene_alias_2 linc-NBPF9-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00001137 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143232047	143232085	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-6 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-6:6 ; gene_alias_1 XLOC_000380 ; gene_alias_2 linc-NBPF9-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00001137 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8385243	8385270	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-6 ; transcript_id lnc-KIDINS220-6:10 ; gene_alias_1 XLOC_001974 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00005085 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8427468	8427688	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-6 ; transcript_id lnc-KIDINS220-6:10 ; gene_alias_1 XLOC_001974 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00005085 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8431385	8431429	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-6 ; transcript_id lnc-KIDINS220-6:10 ; gene_alias_1 XLOC_001974 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00005085 ;
chrX	lncipedia.org	exon	119251428	119251619	.	-	.	gene_id lnc-RHOXF1-1 ; transcript_id lnc-RHOXF1-1:4 ; gene_alias_1 XLOC_008222 ; gene_alias_2 linc-RHOXF1-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017536 ;
chrX	lncipedia.org	exon	119253450	119253591	.	-	.	gene_id lnc-RHOXF1-1 ; transcript_id lnc-RHOXF1-1:4 ; gene_alias_1 XLOC_008222 ; gene_alias_2 linc-RHOXF1-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017536 ;
chr9	lncipedia.org	exon	110381806	110382134	.	+	.	gene_id lnc-RAD23B-8 ; transcript_id lnc-RAD23B-8:1 ; gene_alias_1 XLOC_007510 ; gene_alias_2 linc-ACTL7A-6 ; transcript_alias_1 TCONS_00016125 ;
chr9	lncipedia.org	exon	110382457	110382642	.	+	.	gene_id lnc-RAD23B-8 ; transcript_id lnc-RAD23B-8:1 ; gene_alias_1 XLOC_007510 ; gene_alias_2 linc-ACTL7A-6 ; transcript_alias_1 TCONS_00016125 ;
chr2	lncipedia.org	exon	5789971	5790043	.	-	.	gene_id lnc-CMPK2-13 ; transcript_id lnc-CMPK2-13:4 ; gene_alias_1 XLOC_001958 ; gene_alias_2 linc-RNASEH1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00005067 ;
chr2	lncipedia.org	exon	5824558	5824671	.	-	.	gene_id lnc-CMPK2-13 ; transcript_id lnc-CMPK2-13:4 ; gene_alias_1 XLOC_001958 ; gene_alias_2 linc-RNASEH1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00005067 ;
chr2	lncipedia.org	exon	5831319	5831457	.	-	.	gene_id lnc-CMPK2-13 ; transcript_id lnc-CMPK2-13:4 ; gene_alias_1 XLOC_001958 ; gene_alias_2 linc-RNASEH1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00005067 ;
chr1	lncipedia.org	exon	59761066	59761436	.	-	.	gene_id lnc-JUN-6 ; transcript_id lnc-JUN-6:2 ; gene_alias_1 XLOC_000852 ; gene_alias_2 linc-JUN-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00001509 ;
chr1	lncipedia.org	exon	59761542	59761673	.	-	.	gene_id lnc-JUN-6 ; transcript_id lnc-JUN-6:2 ; gene_alias_1 XLOC_000852 ; gene_alias_2 linc-JUN-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00001509 ;
chr6	lncipedia.org	exon	171004402	171004492	.	+	.	gene_id lnc-TBP-1 ; transcript_id lnc-TBP-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_005565 ; transcript_alias_1 TCONS_00011200 ;
chr6	lncipedia.org	exon	171005188	171005454	.	+	.	gene_id lnc-TBP-1 ; transcript_id lnc-TBP-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_005565 ; transcript_alias_1 TCONS_00011200 ;
chr6	lncipedia.org	exon	171005592	171006035	.	+	.	gene_id lnc-TBP-1 ; transcript_id lnc-TBP-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_005565 ; transcript_alias_1 TCONS_00011200 ;
chr2	lncipedia.org	exon	7469792	7470027	.	-	.	gene_id lnc-CMPK2-7 ; transcript_id lnc-CMPK2-7:1 ; gene_alias_1 XLOC_001969 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-11 ; transcript_alias_1 TCONS_00004124 ;
chr2	lncipedia.org	exon	7472544	7472585	.	-	.	gene_id lnc-CMPK2-7 ; transcript_id lnc-CMPK2-7:1 ; gene_alias_1 XLOC_001969 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-11 ; transcript_alias_1 TCONS_00004124 ;
chr9	lncipedia.org	exon	69174223	69174523	.	-	.	gene_id lnc-FOXD4L6-1 ; transcript_id lnc-FOXD4L6-1:15 ; gene_alias_1 XLOC_007714 ; gene_alias_2 linc-FAM75A7-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00016333 ;
chr9	lncipedia.org	exon	69175692	69175754	.	-	.	gene_id lnc-FOXD4L6-1 ; transcript_id lnc-FOXD4L6-1:15 ; gene_alias_1 XLOC_007714 ; gene_alias_2 linc-FAM75A7-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00016333 ;
chr15	lncipedia.org	exon	79000312	79000447	.	-	.	gene_id lnc-ADAMTS7-1 ; transcript_id lnc-ADAMTS7-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_011540 ; gene_alias_2 linc-CHRNB4 ; transcript_alias_1 TCONS_00023746 ;
chr15	lncipedia.org	exon	79019910	79020109	.	-	.	gene_id lnc-ADAMTS7-1 ; transcript_id lnc-ADAMTS7-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_011540 ; gene_alias_2 linc-CHRNB4 ; transcript_alias_1 TCONS_00023746 ;
chr2	lncipedia.org	exon	79107908	79108018	.	-	.	gene_id lnc-REG1B-2 ; transcript_id lnc-REG1B-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_002177 ; gene_alias_2 linc-LRRTM4-6 ; transcript_alias_1 TCONS_00004317 ;
chr2	lncipedia.org	exon	79108611	79108749	.	-	.	gene_id lnc-REG1B-2 ; transcript_id lnc-REG1B-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_002177 ; gene_alias_2 linc-LRRTM4-6 ; transcript_alias_1 TCONS_00004317 ;
chr8	lncipedia.org	exon	19780259	19780459	.	-	.	gene_id lnc-CSGALNACT1-2 ; transcript_id lnc-CSGALNACT1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_007017 ; gene_alias_2 linc-CSGALNACT1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00014943 ;
chr8	lncipedia.org	exon	19782569	19782680	.	-	.	gene_id lnc-CSGALNACT1-2 ; transcript_id lnc-CSGALNACT1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_007017 ; gene_alias_2 linc-CSGALNACT1-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00014943 ;
chrX	lncipedia.org	exon	149391378	149391480	.	+	.	gene_id lnc-MAGEA8-2 ; transcript_id lnc-MAGEA8-2:10 ; gene_alias_1 XLOC_008083 ; gene_alias_2 linc-MAMLD1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017270 ;
chrX	lncipedia.org	exon	149391702	149391818	.	+	.	gene_id lnc-MAGEA8-2 ; transcript_id lnc-MAGEA8-2:10 ; gene_alias_1 XLOC_008083 ; gene_alias_2 linc-MAMLD1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017270 ;
chr11	lncipedia.org	exon	67653917	67654160	.	+	.	gene_id lnc-NDUFS8-2 ; transcript_id lnc-NDUFS8-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_009181 ; gene_alias_2 linc-ALDH3B1-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00019351 ;
chr11	lncipedia.org	exon	67654932	67654973	.	+	.	gene_id lnc-NDUFS8-2 ; transcript_id lnc-NDUFS8-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_009181 ; gene_alias_2 linc-ALDH3B1-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00019351 ;
chr1	lncipedia.org	exon	169279903	169280009	.	+	.	gene_id lnc-BLZF1-1 ; transcript_id lnc-BLZF1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235575.1 ; gene_alias_2 RP4-800F24.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000035451.1 ; transcript_alias_1 ENST00000432081.1 ; transcript_alias_2 RP4-800F24.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000086105.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	169291457	169291717	.	+	.	gene_id lnc-BLZF1-1 ; transcript_id lnc-BLZF1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235575.1 ; gene_alias_2 RP4-800F24.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000035451.1 ; transcript_alias_1 ENST00000432081.1 ; transcript_alias_2 RP4-800F24.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000086105.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	47915699	47915821	.	+	.	gene_id lnc-SSX6-1 ; transcript_id lnc-SSX6-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000238068.1 ; gene_alias_2 ZNF630-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000021461.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436124.1 ; transcript_alias_2 ZNF630-AS1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000056454.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	47925699	47925971	.	+	.	gene_id lnc-SSX6-1 ; transcript_id lnc-SSX6-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000238068.1 ; gene_alias_2 ZNF630-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000021461.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436124.1 ; transcript_alias_2 ZNF630-AS1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000056454.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	132695815	132695881	.	+	.	gene_id lnc-USP20-2 ; transcript_id lnc-USP20-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230684.1 ; gene_alias_2 RP11-409K20.6 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000020797.1 ; transcript_alias_1 ENST00000414926.1 ; transcript_alias_2 RP11-409K20.6-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000054626.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	132698622	132698820	.	+	.	gene_id lnc-USP20-2 ; transcript_id lnc-USP20-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230684.1 ; gene_alias_2 RP11-409K20.6 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000020797.1 ; transcript_alias_1 ENST00000414926.1 ; transcript_alias_2 RP11-409K20.6-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000054626.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	23719814	23719888	.	-	.	gene_id lnc-TRA2A-1 ; transcript_id lnc-TRA2A-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234286.1 ; gene_alias_2 AC006026.13 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000152691.1 ; transcript_alias_1 ENST00000454029.1 ; transcript_alias_2 AC006026.13-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000327406.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	23720338	23720405	.	-	.	gene_id lnc-TRA2A-1 ; transcript_id lnc-TRA2A-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234286.1 ; gene_alias_2 AC006026.13 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000152691.1 ; transcript_alias_1 ENST00000454029.1 ; transcript_alias_2 AC006026.13-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000327406.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	48615723	48615843	.	+	.	gene_id lnc-C12orf68-1 ; transcript_id lnc-C12orf68-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_009734 ; gene_alias_2 linc-H1FNT ; transcript_alias_1 TCONS_00020407 ;
chr12	lncipedia.org	exon	48627394	48627450	.	+	.	gene_id lnc-C12orf68-1 ; transcript_id lnc-C12orf68-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_009734 ; gene_alias_2 linc-H1FNT ; transcript_alias_1 TCONS_00020407 ;
chr12	lncipedia.org	exon	48637284	48639062	.	+	.	gene_id lnc-C12orf68-1 ; transcript_id lnc-C12orf68-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_009734 ; gene_alias_2 linc-H1FNT ; transcript_alias_1 TCONS_00020407 ;
chr11	lncipedia.org	exon	128960	129752	.	-	.	gene_id lnc-BET1L-1 ; transcript_id lnc-BET1L-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000230724 ; gene_alias_2 RP11-304M2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000230724.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165114.2 ; transcript_alias_1 ENST00000457006 ; transcript_alias_2 ENST00000457006.1 ; transcript_alias_3 RP11-304M2.2-201 ;
chr11	lncipedia.org	exon	130933	131297	.	-	.	gene_id lnc-BET1L-1 ; transcript_id lnc-BET1L-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000230724 ; gene_alias_2 RP11-304M2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000230724.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165114.2 ; transcript_alias_1 ENST00000457006 ; transcript_alias_2 ENST00000457006.1 ; transcript_alias_3 RP11-304M2.2-201 ;
chr1	lncipedia.org	exon	529839	530136	.	+	.	gene_id lnc-OR4F29-3 ; transcript_id lnc-OR4F29-3:4 ; gene_alias_1 XLOC_000004 ; gene_alias_2 linc-SAMD11-8 ; gene_alias_3 ENSG00000239664 ; gene_alias_4 RP5-857K21.3 ; gene_alias_5 ENSG00000239664.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000002330.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000125 ; transcript_alias_2 ENST00000357876 ; transcript_alias_3 ENST00000357876.4 ; transcript_alias_4 RP5-857K21.3-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000006709.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	532679	532878	.	+	.	gene_id lnc-OR4F29-3 ; transcript_id lnc-OR4F29-3:4 ; gene_alias_1 XLOC_000004 ; gene_alias_2 linc-SAMD11-8 ; gene_alias_3 ENSG00000239664 ; gene_alias_4 RP5-857K21.3 ; gene_alias_5 ENSG00000239664.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000002330.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000125 ; transcript_alias_2 ENST00000357876 ; transcript_alias_3 ENST00000357876.4 ; transcript_alias_4 RP5-857K21.3-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000006709.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	453633	454166	.	-	.	gene_id lnc-OR4F16-7 ; transcript_id lnc-OR4F16-7:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236601 ; gene_alias_2 RP4-669L17.2 ; gene_alias_3 ENSG00000236601.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002855.2 ; transcript_alias_1 ENST00000450983 ; transcript_alias_2 ENST00000450983.1 ; transcript_alias_3 RP4-669L17.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000007988.2 ;
chr1	lncipedia.org	exon	460408	460480	.	-	.	gene_id lnc-OR4F16-7 ; transcript_id lnc-OR4F16-7:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236601 ; gene_alias_2 RP4-669L17.2 ; gene_alias_3 ENSG00000236601.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002855.2 ; transcript_alias_1 ENST00000450983 ; transcript_alias_2 ENST00000450983.1 ; transcript_alias_3 RP4-669L17.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000007988.2 ;
chr11	lncipedia.org	exon	56616044	56616091	.	+	.	gene_id lnc-OR5AK2-1 ; transcript_id lnc-OR5AK2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000255433 ; gene_alias_2 AP000479.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255433.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166934.3 ; transcript_alias_1 ENST00000526436 ; transcript_alias_2 ENST00000526436.1 ; transcript_alias_3 AP000479.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391947.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	56638567	56638727	.	+	.	gene_id lnc-OR5AK2-1 ; transcript_id lnc-OR5AK2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000255433 ; gene_alias_2 AP000479.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255433.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166934.3 ; transcript_alias_1 ENST00000526436 ; transcript_alias_2 ENST00000526436.1 ; transcript_alias_3 AP000479.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391947.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	56643073	56645554	.	+	.	gene_id lnc-OR5AK2-1 ; transcript_id lnc-OR5AK2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000255433 ; gene_alias_2 AP000479.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255433.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166934.3 ; transcript_alias_1 ENST00000526436 ; transcript_alias_2 ENST00000526436.1 ; transcript_alias_3 AP000479.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391947.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	1515918	1516117	.	-	.	gene_id lnc-SLC25A6-1 ; transcript_id lnc-SLC25A6-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008099 ; gene_alias_2 linc-SLC25A6-2 ; gene_alias_3 ENSG00000236871 ; gene_alias_4 NCRNA00106 ; gene_alias_5 ENSG00000236871.1 ; gene_alias_6 LINC00106 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000021061.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017029 ; transcript_alias_2 ENST00000430235 ; transcript_alias_3 ENST00000430235.1 ; transcript_alias_4 LINC00106-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000055604.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	1517718	1517851	.	-	.	gene_id lnc-SLC25A6-1 ; transcript_id lnc-SLC25A6-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008099 ; gene_alias_2 linc-SLC25A6-2 ; gene_alias_3 ENSG00000236871 ; gene_alias_4 NCRNA00106 ; gene_alias_5 ENSG00000236871.1 ; gene_alias_6 LINC00106 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000021061.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017029 ; transcript_alias_2 ENST00000430235 ; transcript_alias_3 ENST00000430235.1 ; transcript_alias_4 LINC00106-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000055604.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	1518260	1518295	.	-	.	gene_id lnc-SLC25A6-1 ; transcript_id lnc-SLC25A6-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008099 ; gene_alias_2 linc-SLC25A6-2 ; gene_alias_3 ENSG00000236871 ; gene_alias_4 NCRNA00106 ; gene_alias_5 ENSG00000236871.1 ; gene_alias_6 LINC00106 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000021061.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017029 ; transcript_alias_2 ENST00000430235 ; transcript_alias_3 ENST00000430235.1 ; transcript_alias_4 LINC00106-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000055604.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	46270786	46271163	.	-	.	gene_id lnc-FAM27E1.1-2 ; transcript_id lnc-FAM27E1.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225353 ; gene_alias_2 RP11-292F9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000225353.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013261.1 ; transcript_alias_1 ENST00000418666 ; transcript_alias_2 ENST00000418666.1 ; transcript_alias_3 RP11-292F9.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037029.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	46271254	46271375	.	-	.	gene_id lnc-FAM27E1.1-2 ; transcript_id lnc-FAM27E1.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225353 ; gene_alias_2 RP11-292F9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000225353.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013261.1 ; transcript_alias_1 ENST00000418666 ; transcript_alias_2 ENST00000418666.1 ; transcript_alias_3 RP11-292F9.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037029.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	46274498	46274928	.	-	.	gene_id lnc-FAM27E1.1-2 ; transcript_id lnc-FAM27E1.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225353 ; gene_alias_2 RP11-292F9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000225353.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013261.1 ; transcript_alias_1 ENST00000418666 ; transcript_alias_2 ENST00000418666.1 ; transcript_alias_3 RP11-292F9.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037029.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	46661444	46661548	.	-	.	gene_id lnc-FAM27E1.1-4 ; transcript_id lnc-FAM27E1.1-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_007701 ; gene_alias_2 linc-FAM75A6-7 ; gene_alias_3 ENSG00000231212 ; gene_alias_4 RP11-111F5.3 ; gene_alias_5 ENSG00000231212.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000013300.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015820 ; transcript_alias_2 ENST00000448491 ; transcript_alias_3 ENST00000448491.1 ; transcript_alias_4 RP11-111F5.3-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000037087.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	46662448	46662837	.	-	.	gene_id lnc-FAM27E1.1-4 ; transcript_id lnc-FAM27E1.1-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_007701 ; gene_alias_2 linc-FAM75A6-7 ; gene_alias_3 ENSG00000231212 ; gene_alias_4 RP11-111F5.3 ; gene_alias_5 ENSG00000231212.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000013300.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015820 ; transcript_alias_2 ENST00000448491 ; transcript_alias_3 ENST00000448491.1 ; transcript_alias_4 RP11-111F5.3-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000037087.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	1851477	1851616	.	+	.	gene_id lnc-ASMT-3 ; transcript_id lnc-ASMT-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223511 ; gene_alias_2 RP13-297E16.4 ; gene_alias_3 ENSG00000223511.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021062.2 ; transcript_alias_1 ENST00000427886 ; transcript_alias_2 ENST00000427886.1 ; transcript_alias_3 RP13-297E16.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000055605.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	1852843	1853089	.	+	.	gene_id lnc-ASMT-3 ; transcript_id lnc-ASMT-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223511 ; gene_alias_2 RP13-297E16.4 ; gene_alias_3 ENSG00000223511.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021062.2 ; transcript_alias_1 ENST00000427886 ; transcript_alias_2 ENST00000427886.1 ; transcript_alias_3 RP13-297E16.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000055605.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	1860824	1860881	.	+	.	gene_id lnc-ASMT-3 ; transcript_id lnc-ASMT-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223511 ; gene_alias_2 RP13-297E16.4 ; gene_alias_3 ENSG00000223511.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021062.2 ; transcript_alias_1 ENST00000427886 ; transcript_alias_2 ENST00000427886.1 ; transcript_alias_3 RP13-297E16.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000055605.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	180918835	180920054	.	-	.	gene_id lnc-STX6-1 ; transcript_id lnc-STX6-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000232586 ; gene_alias_2 RP11-46A10.4 ; gene_alias_3 ENSG00000232586.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000035173.1 ; transcript_alias_1 ENST00000415647 ; transcript_alias_2 ENST00000415647.1 ; transcript_alias_3 RP11-46A10.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000085132.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	180923804	180924023	.	-	.	gene_id lnc-STX6-1 ; transcript_id lnc-STX6-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000232586 ; gene_alias_2 RP11-46A10.4 ; gene_alias_3 ENSG00000232586.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000035173.1 ; transcript_alias_1 ENST00000415647 ; transcript_alias_2 ENST00000415647.1 ; transcript_alias_3 RP11-46A10.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000085132.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	1836240	1836445	.	+	.	gene_id lnc-RPS4Y1-3 ; transcript_id lnc-RPS4Y1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_008273 ; gene_alias_2 linc-CD99-7 ; gene_alias_3 ENSGR0000234622.1 ; gene_alias_4 RP13-297E16.5 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000021064.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017603 ; transcript_alias_2 ENSTR0000453953.1 ; transcript_alias_3 RP13-297E16.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000055610.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	1837328	1837669	.	+	.	gene_id lnc-RPS4Y1-3 ; transcript_id lnc-RPS4Y1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_008273 ; gene_alias_2 linc-CD99-7 ; gene_alias_3 ENSGR0000234622.1 ; gene_alias_4 RP13-297E16.5 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000021064.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017603 ; transcript_alias_2 ENSTR0000453953.1 ; transcript_alias_3 RP13-297E16.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000055610.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	129279	129513	.	+	.	gene_id lnc-SCGB1C1-1 ; transcript_id lnc-SCGB1C1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255229 ; gene_alias_2 RP11-304M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000255229.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165538.1 ; transcript_alias_1 ENST00000527297 ; transcript_alias_2 ENST00000527297.1 ; transcript_alias_3 RP11-304M2.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000384758.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	171598	171716	.	+	.	gene_id lnc-SCGB1C1-1 ; transcript_id lnc-SCGB1C1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255229 ; gene_alias_2 RP11-304M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000255229.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165538.1 ; transcript_alias_1 ENST00000527297 ; transcript_alias_2 ENST00000527297.1 ; transcript_alias_3 RP11-304M2.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000384758.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	185902	186136	.	+	.	gene_id lnc-SCGB1C1-1 ; transcript_id lnc-SCGB1C1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255229 ; gene_alias_2 RP11-304M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000255229.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165538.1 ; transcript_alias_1 ENST00000527297 ; transcript_alias_2 ENST00000527297.1 ; transcript_alias_3 RP11-304M2.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000384758.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	70970105	70970521	.	-	.	gene_id lnc-AL353608.1-2 ; transcript_id lnc-AL353608.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000224958 ; gene_alias_2 RP11-561O23.6 ; gene_alias_3 ENSG00000224958.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000019962.1 ; transcript_alias_1 ENST00000420855 ; transcript_alias_2 ENST00000420855.1 ; transcript_alias_3 RP11-561O23.6-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000052544.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	70971206	70971262	.	-	.	gene_id lnc-AL353608.1-2 ; transcript_id lnc-AL353608.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000224958 ; gene_alias_2 RP11-561O23.6 ; gene_alias_3 ENSG00000224958.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000019962.1 ; transcript_alias_1 ENST00000420855 ; transcript_alias_2 ENST00000420855.1 ; transcript_alias_3 RP11-561O23.6-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000052544.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	70972639	70972736	.	-	.	gene_id lnc-AL353608.1-2 ; transcript_id lnc-AL353608.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000224958 ; gene_alias_2 RP11-561O23.6 ; gene_alias_3 ENSG00000224958.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000019962.1 ; transcript_alias_1 ENST00000420855 ; transcript_alias_2 ENST00000420855.1 ; transcript_alias_3 RP11-561O23.6-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000052544.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143394094	143394211	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-3:19 ; gene_alias_1 ENSG00000238261 ; gene_alias_2 BX004987.5 ; gene_alias_3 ENSG00000238261.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013630.1 ; transcript_alias_1 ENST00000433980 ; transcript_alias_2 ENST00000433980.1 ; transcript_alias_3 BX004987.5-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037972.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143399695	143399814	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-3:19 ; gene_alias_1 ENSG00000238261 ; gene_alias_2 BX004987.5 ; gene_alias_3 ENSG00000238261.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013630.1 ; transcript_alias_1 ENST00000433980 ; transcript_alias_2 ENST00000433980.1 ; transcript_alias_3 BX004987.5-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037972.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143401359	143401534	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-3:19 ; gene_alias_1 ENSG00000238261 ; gene_alias_2 BX004987.5 ; gene_alias_3 ENSG00000238261.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013630.1 ; transcript_alias_1 ENST00000433980 ; transcript_alias_2 ENST00000433980.1 ; transcript_alias_3 BX004987.5-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037972.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143401688	143402134	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-3:19 ; gene_alias_1 ENSG00000238261 ; gene_alias_2 BX004987.5 ; gene_alias_3 ENSG00000238261.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013630.1 ; transcript_alias_1 ENST00000433980 ; transcript_alias_2 ENST00000433980.1 ; transcript_alias_3 BX004987.5-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037972.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143403390	143404415	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-3:19 ; gene_alias_1 ENSG00000238261 ; gene_alias_2 BX004987.5 ; gene_alias_3 ENSG00000238261.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013630.1 ; transcript_alias_1 ENST00000433980 ; transcript_alias_2 ENST00000433980.1 ; transcript_alias_3 BX004987.5-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037972.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	21668620	21670092	.	-	.	gene_id lnc-HNRNPC-1 ; transcript_id lnc-HNRNPC-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258441 ; gene_alias_2 CTD-2552B11.4 ; gene_alias_3 ENSG00000258441.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170756.1 ; transcript_alias_1 ENST00000555688 ; transcript_alias_2 ENST00000555688.1 ; transcript_alias_3 CTD-2552B11.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000410217.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	21674770	21675059	.	-	.	gene_id lnc-HNRNPC-1 ; transcript_id lnc-HNRNPC-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258441 ; gene_alias_2 CTD-2552B11.4 ; gene_alias_3 ENSG00000258441.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170756.1 ; transcript_alias_1 ENST00000555688 ; transcript_alias_2 ENST00000555688.1 ; transcript_alias_3 CTD-2552B11.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000410217.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	75721542	75721920	.	+	.	gene_id lnc-FRG2C-1 ; transcript_id lnc-FRG2C-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000242516 ; gene_alias_2 RP11-413E6.8 ; gene_alias_3 ENSG00000242516.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158961.1 ; transcript_alias_1 ENST00000463183 ; transcript_alias_2 ENST00000463183.1 ; transcript_alias_3 RP11-413E6.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352691.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	75722345	75722389	.	+	.	gene_id lnc-FRG2C-1 ; transcript_id lnc-FRG2C-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000242516 ; gene_alias_2 RP11-413E6.8 ; gene_alias_3 ENSG00000242516.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158961.1 ; transcript_alias_1 ENST00000463183 ; transcript_alias_2 ENST00000463183.1 ; transcript_alias_3 RP11-413E6.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352691.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	75722998	75723157	.	+	.	gene_id lnc-FRG2C-1 ; transcript_id lnc-FRG2C-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000242516 ; gene_alias_2 RP11-413E6.8 ; gene_alias_3 ENSG00000242516.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158961.1 ; transcript_alias_1 ENST00000463183 ; transcript_alias_2 ENST00000463183.1 ; transcript_alias_3 RP11-413E6.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352691.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	75724915	75725031	.	+	.	gene_id lnc-FRG2C-1 ; transcript_id lnc-FRG2C-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000242516 ; gene_alias_2 RP11-413E6.8 ; gene_alias_3 ENSG00000242516.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158961.1 ; transcript_alias_1 ENST00000463183 ; transcript_alias_2 ENST00000463183.1 ; transcript_alias_3 RP11-413E6.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352691.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	75725119	75725279	.	+	.	gene_id lnc-FRG2C-1 ; transcript_id lnc-FRG2C-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000242516 ; gene_alias_2 RP11-413E6.8 ; gene_alias_3 ENSG00000242516.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158961.1 ; transcript_alias_1 ENST00000463183 ; transcript_alias_2 ENST00000463183.1 ; transcript_alias_3 RP11-413E6.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352691.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	75727984	75728454	.	+	.	gene_id lnc-FRG2C-1 ; transcript_id lnc-FRG2C-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000242516 ; gene_alias_2 RP11-413E6.8 ; gene_alias_3 ENSG00000242516.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158961.1 ; transcript_alias_1 ENST00000463183 ; transcript_alias_2 ENST00000463183.1 ; transcript_alias_3 RP11-413E6.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352691.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	27874637	27874740	.	+	.	gene_id lnc-CDY1-1 ; transcript_id lnc-CDY1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231141 ; gene_alias_2 TTTY3 ; gene_alias_3 ENSG00000231141.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000045256.1 ; transcript_alias_1 ENST00000417334 ; transcript_alias_2 ENST00000417334.1 ; transcript_alias_3 TTTY3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000105011.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	27876939	27877073	.	+	.	gene_id lnc-CDY1-1 ; transcript_id lnc-CDY1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231141 ; gene_alias_2 TTTY3 ; gene_alias_3 ENSG00000231141.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000045256.1 ; transcript_alias_1 ENST00000417334 ; transcript_alias_2 ENST00000417334.1 ; transcript_alias_3 TTTY3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000105011.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	27879431	27879535	.	+	.	gene_id lnc-CDY1-1 ; transcript_id lnc-CDY1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231141 ; gene_alias_2 TTTY3 ; gene_alias_3 ENSG00000231141.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000045256.1 ; transcript_alias_1 ENST00000417334 ; transcript_alias_2 ENST00000417334.1 ; transcript_alias_3 TTTY3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000105011.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	45108581	45108715	.	+	.	gene_id lnc-FAM27C-2 ; transcript_id lnc-FAM27C-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000231527 ; gene_alias_2 RP11-374M1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000231527.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013241.1 ; transcript_alias_1 ENST00000439760 ; transcript_alias_2 ENST00000439760.1 ; transcript_alias_3 RP11-374M1.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037008.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	45109655	45109831	.	+	.	gene_id lnc-FAM27C-2 ; transcript_id lnc-FAM27C-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000231527 ; gene_alias_2 RP11-374M1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000231527.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013241.1 ; transcript_alias_1 ENST00000439760 ; transcript_alias_2 ENST00000439760.1 ; transcript_alias_3 RP11-374M1.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037008.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	45111943	45112064	.	+	.	gene_id lnc-FAM27C-2 ; transcript_id lnc-FAM27C-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000231527 ; gene_alias_2 RP11-374M1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000231527.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013241.1 ; transcript_alias_1 ENST00000439760 ; transcript_alias_2 ENST00000439760.1 ; transcript_alias_3 RP11-374M1.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037008.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	45112155	45112467	.	+	.	gene_id lnc-FAM27C-2 ; transcript_id lnc-FAM27C-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000231527 ; gene_alias_2 RP11-374M1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000231527.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013241.1 ; transcript_alias_1 ENST00000439760 ; transcript_alias_2 ENST00000439760.1 ; transcript_alias_3 RP11-374M1.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037008.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	3891774	3892232	.	+	.	gene_id lnc-DCDC2C-1 ; transcript_id lnc-DCDC2C-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227363 ; gene_alias_2 AC019172.2 ; gene_alias_3 ENSG00000227363.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151491.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451101 ; transcript_alias_2 ENST00000451101.1 ; transcript_alias_3 AC019172.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000322867.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	3894744	3895001	.	+	.	gene_id lnc-DCDC2C-1 ; transcript_id lnc-DCDC2C-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227363 ; gene_alias_2 AC019172.2 ; gene_alias_3 ENSG00000227363.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151491.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451101 ; transcript_alias_2 ENST00000451101.1 ; transcript_alias_3 AC019172.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000322867.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	144614388	144614998	.	+	.	gene_id lnc-AL592284.1-1 ; transcript_id lnc-AL592284.1-1:13 ; gene_alias_1 ENSG00000225241 ; gene_alias_2 NBPF8 ; gene_alias_3 ENSG00000225241.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000428366 ; transcript_alias_2 ENST00000428366.1 ; transcript_alias_3 NBPF8-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000038361.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	144615096	144615303	.	+	.	gene_id lnc-AL592284.1-1 ; transcript_id lnc-AL592284.1-1:13 ; gene_alias_1 ENSG00000225241 ; gene_alias_2 NBPF8 ; gene_alias_3 ENSG00000225241.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000428366 ; transcript_alias_2 ENST00000428366.1 ; transcript_alias_3 NBPF8-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000038361.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	144618082	144618296	.	+	.	gene_id lnc-AL592284.1-1 ; transcript_id lnc-AL592284.1-1:13 ; gene_alias_1 ENSG00000225241 ; gene_alias_2 NBPF8 ; gene_alias_3 ENSG00000225241.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000428366 ; transcript_alias_2 ENST00000428366.1 ; transcript_alias_3 NBPF8-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000038361.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	144619347	144619419	.	+	.	gene_id lnc-AL592284.1-1 ; transcript_id lnc-AL592284.1-1:13 ; gene_alias_1 ENSG00000225241 ; gene_alias_2 NBPF8 ; gene_alias_3 ENSG00000225241.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000428366 ; transcript_alias_2 ENST00000428366.1 ; transcript_alias_3 NBPF8-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000038361.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	144619883	144620094	.	+	.	gene_id lnc-AL592284.1-1 ; transcript_id lnc-AL592284.1-1:13 ; gene_alias_1 ENSG00000225241 ; gene_alias_2 NBPF8 ; gene_alias_3 ENSG00000225241.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000428366 ; transcript_alias_2 ENST00000428366.1 ; transcript_alias_3 NBPF8-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000038361.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	144621447	144621656	.	+	.	gene_id lnc-AL592284.1-1 ; transcript_id lnc-AL592284.1-1:13 ; gene_alias_1 ENSG00000225241 ; gene_alias_2 NBPF8 ; gene_alias_3 ENSG00000225241.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000428366 ; transcript_alias_2 ENST00000428366.1 ; transcript_alias_3 NBPF8-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000038361.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	81590896	81591209	.	-	.	gene_id lnc-FAM181B-2 ; transcript_id lnc-FAM181B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245832 ; gene_alias_2 RP11-179A16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245832.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166867.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500502 ; transcript_alias_2 ENST00000500502.1 ; transcript_alias_3 RP11-179A16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391561.2 ;
chr11	lncipedia.org	exon	81593196	81593338	.	-	.	gene_id lnc-FAM181B-2 ; transcript_id lnc-FAM181B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245832 ; gene_alias_2 RP11-179A16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245832.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166867.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500502 ; transcript_alias_2 ENST00000500502.1 ; transcript_alias_3 RP11-179A16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391561.2 ;
chr11	lncipedia.org	exon	81726650	81726776	.	-	.	gene_id lnc-FAM181B-2 ; transcript_id lnc-FAM181B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245832 ; gene_alias_2 RP11-179A16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245832.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166867.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500502 ; transcript_alias_2 ENST00000500502.1 ; transcript_alias_3 RP11-179A16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391561.2 ;
chr11	lncipedia.org	exon	81807503	81807650	.	-	.	gene_id lnc-FAM181B-2 ; transcript_id lnc-FAM181B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245832 ; gene_alias_2 RP11-179A16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245832.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166867.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500502 ; transcript_alias_2 ENST00000500502.1 ; transcript_alias_3 RP11-179A16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391561.2 ;
chr11	lncipedia.org	exon	81811016	81811249	.	-	.	gene_id lnc-FAM181B-2 ; transcript_id lnc-FAM181B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245832 ; gene_alias_2 RP11-179A16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245832.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166867.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500502 ; transcript_alias_2 ENST00000500502.1 ; transcript_alias_3 RP11-179A16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391561.2 ;
chr11	lncipedia.org	exon	82060968	82061046	.	-	.	gene_id lnc-FAM181B-2 ; transcript_id lnc-FAM181B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245832 ; gene_alias_2 RP11-179A16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245832.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166867.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500502 ; transcript_alias_2 ENST00000500502.1 ; transcript_alias_3 RP11-179A16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391561.2 ;
chr11	lncipedia.org	exon	82067554	82067670	.	-	.	gene_id lnc-FAM181B-2 ; transcript_id lnc-FAM181B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245832 ; gene_alias_2 RP11-179A16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245832.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166867.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500502 ; transcript_alias_2 ENST00000500502.1 ; transcript_alias_3 RP11-179A16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391561.2 ;
chr11	lncipedia.org	exon	82114721	82114955	.	-	.	gene_id lnc-FAM181B-2 ; transcript_id lnc-FAM181B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245832 ; gene_alias_2 RP11-179A16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245832.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166867.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500502 ; transcript_alias_2 ENST00000500502.1 ; transcript_alias_3 RP11-179A16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391561.2 ;
chr15	lncipedia.org	exon	94406338	94406445	.	+	.	gene_id lnc-MCTP2-6 ; transcript_id lnc-MCTP2-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258476 ; gene_alias_2 RP11-76E17.3 ; gene_alias_3 ENSG00000258476.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171799.1 ; transcript_alias_1 ENST00000554530 ; transcript_alias_2 ENST00000554530.1 ; transcript_alias_3 RP11-76E17.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000415171.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	94406971	94407384	.	+	.	gene_id lnc-MCTP2-6 ; transcript_id lnc-MCTP2-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258476 ; gene_alias_2 RP11-76E17.3 ; gene_alias_3 ENSG00000258476.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171799.1 ; transcript_alias_1 ENST00000554530 ; transcript_alias_2 ENST00000554530.1 ; transcript_alias_3 RP11-76E17.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000415171.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	94408610	94408877	.	+	.	gene_id lnc-MCTP2-6 ; transcript_id lnc-MCTP2-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258476 ; gene_alias_2 RP11-76E17.3 ; gene_alias_3 ENSG00000258476.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171799.1 ; transcript_alias_1 ENST00000554530 ; transcript_alias_2 ENST00000554530.1 ; transcript_alias_3 RP11-76E17.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000415171.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	94412920	94413062	.	+	.	gene_id lnc-MCTP2-6 ; transcript_id lnc-MCTP2-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258476 ; gene_alias_2 RP11-76E17.3 ; gene_alias_3 ENSG00000258476.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171799.1 ; transcript_alias_1 ENST00000554530 ; transcript_alias_2 ENST00000554530.1 ; transcript_alias_3 RP11-76E17.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000415171.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	94421263	94421585	.	+	.	gene_id lnc-MCTP2-6 ; transcript_id lnc-MCTP2-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258476 ; gene_alias_2 RP11-76E17.3 ; gene_alias_3 ENSG00000258476.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171799.1 ; transcript_alias_1 ENST00000554530 ; transcript_alias_2 ENST00000554530.1 ; transcript_alias_3 RP11-76E17.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000415171.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	1886240	1886445	.	+	.	gene_id lnc-ASMT-4 ; transcript_id lnc-ASMT-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_007917 ; gene_alias_2 linc-CD99-4 ; gene_alias_3 ENSG00000234622 ; gene_alias_4 RP13-297E16.5 ; gene_alias_5 ENSG00000234622.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021064.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00016961 ; transcript_alias_2 ENST00000453953 ; transcript_alias_3 ENST00000453953.1 ; transcript_alias_4 RP13-297E16.5-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000055610.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	1887328	1887669	.	+	.	gene_id lnc-ASMT-4 ; transcript_id lnc-ASMT-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_007917 ; gene_alias_2 linc-CD99-4 ; gene_alias_3 ENSG00000234622 ; gene_alias_4 RP13-297E16.5 ; gene_alias_5 ENSG00000234622.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021064.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00016961 ; transcript_alias_2 ENST00000453953 ; transcript_alias_3 ENST00000453953.1 ; transcript_alias_4 RP13-297E16.5-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000055610.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	523009	523081	.	+	.	gene_id lnc-OR4F29-3 ; transcript_id lnc-OR4F29-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_000004 ; gene_alias_2 linc-SAMD11-8 ; gene_alias_3 ENSG00000235146 ; gene_alias_4 RP5-857K21.2 ; gene_alias_5 ENSG00000235146.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000002329.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000122 ; transcript_alias_2 ENST00000423796 ; transcript_alias_3 ENST00000423796.1 ; transcript_alias_4 RP5-857K21.2-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000006707.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	529615	530148	.	+	.	gene_id lnc-OR4F29-3 ; transcript_id lnc-OR4F29-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_000004 ; gene_alias_2 linc-SAMD11-8 ; gene_alias_3 ENSG00000235146 ; gene_alias_4 RP5-857K21.2 ; gene_alias_5 ENSG00000235146.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000002329.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000122 ; transcript_alias_2 ENST00000423796 ; transcript_alias_3 ENST00000423796.1 ; transcript_alias_4 RP5-857K21.2-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000006707.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	42701325	42702091	.	-	.	gene_id lnc-RP11-111K18.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP11-111K18.1.1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000238284 ; gene_alias_2 AC027269.2 ; gene_alias_3 ENSG00000238284.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000155126.1 ; transcript_alias_1 ENST00000455947 ; transcript_alias_2 ENST00000455947.1 ; transcript_alias_3 AC027269.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000338493.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	42712384	42712570	.	-	.	gene_id lnc-RP11-111K18.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP11-111K18.1.1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000238284 ; gene_alias_2 AC027269.2 ; gene_alias_3 ENSG00000238284.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000155126.1 ; transcript_alias_1 ENST00000455947 ; transcript_alias_2 ENST00000455947.1 ; transcript_alias_3 AC027269.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000338493.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	42745830	42746046	.	-	.	gene_id lnc-RP11-111K18.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP11-111K18.1.1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000238284 ; gene_alias_2 AC027269.2 ; gene_alias_3 ENSG00000238284.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000155126.1 ; transcript_alias_1 ENST00000455947 ; transcript_alias_2 ENST00000455947.1 ; transcript_alias_3 AC027269.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000338493.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	118281781	118281965	.	+	.	gene_id lnc-NDST3-5 ; transcript_id lnc-NDST3-5:2 ; gene_alias_1 XLOC_003658 ; gene_alias_2 linc-NDST3-3 ; gene_alias_3 ENSG00000228358 ; gene_alias_4 AC113617.1 ; gene_alias_5 ENSG00000228358.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000059445.4 ; transcript_alias_1 TCONS_00007596 ; transcript_alias_2 ENST00000420701 ; transcript_alias_3 ENST00000420701.1 ; transcript_alias_4 AC113617.1-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000132191.4 ;
chr4	lncipedia.org	exon	118282557	118282662	.	+	.	gene_id lnc-NDST3-5 ; transcript_id lnc-NDST3-5:2 ; gene_alias_1 XLOC_003658 ; gene_alias_2 linc-NDST3-3 ; gene_alias_3 ENSG00000228358 ; gene_alias_4 AC113617.1 ; gene_alias_5 ENSG00000228358.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000059445.4 ; transcript_alias_1 TCONS_00007596 ; transcript_alias_2 ENST00000420701 ; transcript_alias_3 ENST00000420701.1 ; transcript_alias_4 AC113617.1-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000132191.4 ;
chr4	lncipedia.org	exon	118292748	118292818	.	+	.	gene_id lnc-NDST3-5 ; transcript_id lnc-NDST3-5:2 ; gene_alias_1 XLOC_003658 ; gene_alias_2 linc-NDST3-3 ; gene_alias_3 ENSG00000228358 ; gene_alias_4 AC113617.1 ; gene_alias_5 ENSG00000228358.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000059445.4 ; transcript_alias_1 TCONS_00007596 ; transcript_alias_2 ENST00000420701 ; transcript_alias_3 ENST00000420701.1 ; transcript_alias_4 AC113617.1-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000132191.4 ;
chr4	lncipedia.org	exon	118293520	118293754	.	+	.	gene_id lnc-NDST3-5 ; transcript_id lnc-NDST3-5:2 ; gene_alias_1 XLOC_003658 ; gene_alias_2 linc-NDST3-3 ; gene_alias_3 ENSG00000228358 ; gene_alias_4 AC113617.1 ; gene_alias_5 ENSG00000228358.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000059445.4 ; transcript_alias_1 TCONS_00007596 ; transcript_alias_2 ENST00000420701 ; transcript_alias_3 ENST00000420701.1 ; transcript_alias_4 AC113617.1-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000132191.4 ;
chr2	lncipedia.org	exon	242914189	242914707	.	+	.	gene_id lnc-CXXC11-2 ; transcript_id lnc-CXXC11-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000237940 ; gene_alias_2 AC093642.3 ; gene_alias_3 ENSG00000237940.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151373.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451070 ; transcript_alias_2 ENST00000451070.1 ; transcript_alias_3 AC093642.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000322414.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	242916601	242916680	.	+	.	gene_id lnc-CXXC11-2 ; transcript_id lnc-CXXC11-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000237940 ; gene_alias_2 AC093642.3 ; gene_alias_3 ENSG00000237940.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151373.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451070 ; transcript_alias_2 ENST00000451070.1 ; transcript_alias_3 AC093642.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000322414.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	78804344	78804396	.	+	.	gene_id lnc-USP35-6 ; transcript_id lnc-USP35-6:3 ; gene_alias_1 ENSG00000255345 ; gene_alias_2 CTD-2337I7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255345.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166784.1 ; transcript_alias_1 ENST00000526091 ; transcript_alias_2 ENST00000526091.1 ; transcript_alias_3 CTD-2337I7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391457.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	78807056	78808899	.	+	.	gene_id lnc-USP35-6 ; transcript_id lnc-USP35-6:3 ; gene_alias_1 ENSG00000255345 ; gene_alias_2 CTD-2337I7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255345.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166784.1 ; transcript_alias_1 ENST00000526091 ; transcript_alias_2 ENST00000526091.1 ; transcript_alias_3 CTD-2337I7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391457.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	523048	523109	.	+	.	gene_id lnc-OR4F29-3 ; transcript_id lnc-OR4F29-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_000004 ; gene_alias_2 linc-SAMD11-8 ; gene_alias_3 ENSG00000235146 ; gene_alias_4 RP5-857K21.2 ; gene_alias_5 ENSG00000235146.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000002329.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000123 ; transcript_alias_2 ENST00000450696 ; transcript_alias_3 ENST00000450696.1 ; transcript_alias_4 RP5-857K21.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000006706.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	529615	529954	.	+	.	gene_id lnc-OR4F29-3 ; transcript_id lnc-OR4F29-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_000004 ; gene_alias_2 linc-SAMD11-8 ; gene_alias_3 ENSG00000235146 ; gene_alias_4 RP5-857K21.2 ; gene_alias_5 ENSG00000235146.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000002329.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000123 ; transcript_alias_2 ENST00000450696 ; transcript_alias_3 ENST00000450696.1 ; transcript_alias_4 RP5-857K21.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000006706.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	220253218	220253770	.	+	.	gene_id lnc-DES-1 ; transcript_id lnc-DES-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229525 ; gene_alias_2 AC053503.4 ; gene_alias_3 ENSG00000229525.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000058921.1 ; transcript_alias_1 ENST00000420563 ; transcript_alias_2 ENST00000420563.1 ; transcript_alias_3 AC053503.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000130227.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	220267311	220268355	.	+	.	gene_id lnc-DES-1 ; transcript_id lnc-DES-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229525 ; gene_alias_2 AC053503.4 ; gene_alias_3 ENSG00000229525.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000058921.1 ; transcript_alias_1 ENST00000420563 ; transcript_alias_2 ENST00000420563.1 ; transcript_alias_3 AC053503.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000130227.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	25801054	25801218	.	+	.	gene_id lnc-JAM2-6 ; transcript_id lnc-JAM2-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000237484 ; gene_alias_2 AP000476.1 ; gene_alias_3 ENSG00000237484.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000078326.1 ; transcript_alias_1 ENST00000453784 ; transcript_alias_2 ENST00000453784.1 ; transcript_alias_3 AP000476.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000171137.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	25810567	25810747	.	+	.	gene_id lnc-JAM2-6 ; transcript_id lnc-JAM2-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000237484 ; gene_alias_2 AP000476.1 ; gene_alias_3 ENSG00000237484.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000078326.1 ; transcript_alias_1 ENST00000453784 ; transcript_alias_2 ENST00000453784.1 ; transcript_alias_3 AP000476.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000171137.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	25813483	25813667	.	+	.	gene_id lnc-JAM2-6 ; transcript_id lnc-JAM2-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000237484 ; gene_alias_2 AP000476.1 ; gene_alias_3 ENSG00000237484.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000078326.1 ; transcript_alias_1 ENST00000453784 ; transcript_alias_2 ENST00000453784.1 ; transcript_alias_3 AP000476.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000171137.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	25814109	25814228	.	+	.	gene_id lnc-JAM2-6 ; transcript_id lnc-JAM2-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000237484 ; gene_alias_2 AP000476.1 ; gene_alias_3 ENSG00000237484.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000078326.1 ; transcript_alias_1 ENST00000453784 ; transcript_alias_2 ENST00000453784.1 ; transcript_alias_3 AP000476.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000171137.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	25857937	25857999	.	+	.	gene_id lnc-JAM2-6 ; transcript_id lnc-JAM2-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000237484 ; gene_alias_2 AP000476.1 ; gene_alias_3 ENSG00000237484.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000078326.1 ; transcript_alias_1 ENST00000453784 ; transcript_alias_2 ENST00000453784.1 ; transcript_alias_3 AP000476.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000171137.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	25860427	25862621	.	+	.	gene_id lnc-JAM2-6 ; transcript_id lnc-JAM2-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000237484 ; gene_alias_2 AP000476.1 ; gene_alias_3 ENSG00000237484.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000078326.1 ; transcript_alias_1 ENST00000453784 ; transcript_alias_2 ENST00000453784.1 ; transcript_alias_3 AP000476.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000171137.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	33719688	33719866	.	+	.	gene_id lnc-PRSS3-2 ; transcript_id lnc-PRSS3-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_007325 ; gene_alias_2 linc-PRSS3-2 ; gene_alias_3 ENSG00000227301 ; gene_alias_4 RP11-384P7.5 ; gene_alias_5 ENSG00000227301.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000000412.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015660 ; transcript_alias_2 ENST00000449144 ; transcript_alias_3 ENST00000449144.1 ; transcript_alias_4 RP11-384P7.5-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000001049.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	33721589	33722553	.	+	.	gene_id lnc-PRSS3-2 ; transcript_id lnc-PRSS3-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_007325 ; gene_alias_2 linc-PRSS3-2 ; gene_alias_3 ENSG00000227301 ; gene_alias_4 RP11-384P7.5 ; gene_alias_5 ENSG00000227301.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000000412.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015660 ; transcript_alias_2 ENST00000449144 ; transcript_alias_3 ENST00000449144.1 ; transcript_alias_4 RP11-384P7.5-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000001049.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	39925026	39926087	.	-	.	gene_id lnc-CNTNAP3-3 ; transcript_id lnc-CNTNAP3-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_007688 ; gene_alias_2 linc-CNTNAP3-3 ; gene_alias_3 ENSG00000228534 ; gene_alias_4 RP11-95H8.5 ; gene_alias_5 ENSG00000228534.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000067142.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015809 ; transcript_alias_2 ENST00000433614 ; transcript_alias_3 ENST00000433614.1 ; transcript_alias_4 RP11-95H8.5-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000143679.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	39926908	39926970	.	-	.	gene_id lnc-CNTNAP3-3 ; transcript_id lnc-CNTNAP3-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_007688 ; gene_alias_2 linc-CNTNAP3-3 ; gene_alias_3 ENSG00000228534 ; gene_alias_4 RP11-95H8.5 ; gene_alias_5 ENSG00000228534.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000067142.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015809 ; transcript_alias_2 ENST00000433614 ; transcript_alias_3 ENST00000433614.1 ; transcript_alias_4 RP11-95H8.5-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000143679.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	87754948	87755164	.	+	.	gene_id lnc-PLGLB2-1 ; transcript_id lnc-PLGLB2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000222041 ; gene_alias_2 NCRNA00152 ; gene_alias_3 ENSG00000222041.5 ; gene_alias_4 LINC00152 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000130273.9 ; transcript_alias_1 ENST00000331944 ; transcript_alias_2 ENST00000331944.6 ; transcript_alias_3 LINC00152-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000252606.5 ;
chr2	lncipedia.org	exon	87820726	87821037	.	+	.	gene_id lnc-PLGLB2-1 ; transcript_id lnc-PLGLB2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000222041 ; gene_alias_2 NCRNA00152 ; gene_alias_3 ENSG00000222041.5 ; gene_alias_4 LINC00152 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000130273.9 ; transcript_alias_1 ENST00000331944 ; transcript_alias_2 ENST00000331944.6 ; transcript_alias_3 LINC00152-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000252606.5 ;
chr21	lncipedia.org	exon	40346355	40347773	.	-	.	gene_id lnc-PSMG1-8 ; transcript_id lnc-PSMG1-8:1 ; gene_alias_1 XLOC_014078 ; gene_alias_2 linc-ERG-1 ; gene_alias_3 ENSG00000232837 ; gene_alias_4 AF064858.7 ; gene_alias_5 ENSG00000232837.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000066032.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00028933 ; transcript_alias_2 ENST00000433952 ; transcript_alias_3 ENST00000433952.1 ; transcript_alias_4 AF064858.7-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000141402.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	40349379	40349493	.	-	.	gene_id lnc-PSMG1-8 ; transcript_id lnc-PSMG1-8:1 ; gene_alias_1 XLOC_014078 ; gene_alias_2 linc-ERG-1 ; gene_alias_3 ENSG00000232837 ; gene_alias_4 AF064858.7 ; gene_alias_5 ENSG00000232837.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000066032.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00028933 ; transcript_alias_2 ENST00000433952 ; transcript_alias_3 ENST00000433952.1 ; transcript_alias_4 AF064858.7-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000141402.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	40349637	40349700	.	-	.	gene_id lnc-PSMG1-8 ; transcript_id lnc-PSMG1-8:1 ; gene_alias_1 XLOC_014078 ; gene_alias_2 linc-ERG-1 ; gene_alias_3 ENSG00000232837 ; gene_alias_4 AF064858.7 ; gene_alias_5 ENSG00000232837.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000066032.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00028933 ; transcript_alias_2 ENST00000433952 ; transcript_alias_3 ENST00000433952.1 ; transcript_alias_4 AF064858.7-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000141402.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	1656054	1656202	.	+	.	gene_id lnc-MMP23B-1 ; transcript_id lnc-MMP23B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227775 ; gene_alias_2 RP1-283E3.3 ; transcript_alias_1 ENST00000417099 ;
chr1	lncipedia.org	exon	1661685	1663343	.	+	.	gene_id lnc-MMP23B-1 ; transcript_id lnc-MMP23B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227775 ; gene_alias_2 RP1-283E3.3 ; transcript_alias_1 ENST00000417099 ;
chr17	lncipedia.org	exon	49517014	49517789	.	+	.	gene_id lnc-UTP18-4 ; transcript_id lnc-UTP18-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250533 ; gene_alias_2 RP11-1018N14.5 ; transcript_alias_1 ENST00000514147 ;
chr17	lncipedia.org	exon	49521095	49523163	.	+	.	gene_id lnc-UTP18-4 ; transcript_id lnc-UTP18-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250533 ; gene_alias_2 RP11-1018N14.5 ; transcript_alias_1 ENST00000514147 ;
chr5	lncipedia.org	exon	68927362	68928538	.	-	.	gene_id lnc-TAF9-2 ; transcript_id lnc-TAF9-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250552 ; gene_alias_2 AC139495.1 ; transcript_alias_1 ENST00000509065 ;
chr5	lncipedia.org	exon	68931794	68932778	.	-	.	gene_id lnc-TAF9-2 ; transcript_id lnc-TAF9-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250552 ; gene_alias_2 AC139495.1 ; transcript_alias_1 ENST00000509065 ;
chr17	lncipedia.org	exon	29061081	29061961	.	+	.	gene_id lnc-ATAD5-3 ; transcript_id lnc-ATAD5-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000247185 ; gene_alias_2 SUZ12P ; transcript_alias_1 ENST00000502024 ;
chr17	lncipedia.org	exon	29062051	29062115	.	+	.	gene_id lnc-ATAD5-3 ; transcript_id lnc-ATAD5-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000247185 ; gene_alias_2 SUZ12P ; transcript_alias_1 ENST00000502024 ;
chr17	lncipedia.org	exon	29070319	29070387	.	+	.	gene_id lnc-ATAD5-3 ; transcript_id lnc-ATAD5-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000247185 ; gene_alias_2 SUZ12P ; transcript_alias_1 ENST00000502024 ;
chr17	lncipedia.org	exon	29086509	29086557	.	+	.	gene_id lnc-ATAD5-3 ; transcript_id lnc-ATAD5-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000247185 ; gene_alias_2 SUZ12P ; transcript_alias_1 ENST00000502024 ;
chr17	lncipedia.org	exon	29093521	29093606	.	+	.	gene_id lnc-ATAD5-3 ; transcript_id lnc-ATAD5-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000247185 ; gene_alias_2 SUZ12P ; transcript_alias_1 ENST00000502024 ;
chr17	lncipedia.org	exon	29095852	29096082	.	+	.	gene_id lnc-ATAD5-3 ; transcript_id lnc-ATAD5-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000247185 ; gene_alias_2 SUZ12P ; transcript_alias_1 ENST00000502024 ;
chr17	lncipedia.org	exon	29096890	29097067	.	+	.	gene_id lnc-ATAD5-3 ; transcript_id lnc-ATAD5-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000247185 ; gene_alias_2 SUZ12P ; transcript_alias_1 ENST00000502024 ;
chr7	lncipedia.org	exon	143947138	143950050	.	-	.	gene_id lnc-ARHGEF35-1 ; transcript_id lnc-ARHGEF35-1:18 ; gene_alias_1 ENSG00000170356 ; gene_alias_2 OR2A20P ; transcript_alias_1 ENST00000479887 ;
chr9	lncipedia.org	exon	66692393	66692727	.	+	.	gene_id lnc-RP11-262H14.4.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-262H14.4.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256208 ; gene_alias_2 AL353626.2 ; transcript_alias_1 ENST00000542122 ;
chr9	lncipedia.org	exon	66695202	66697346	.	+	.	gene_id lnc-RP11-262H14.4.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-262H14.4.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256208 ; gene_alias_2 AL353626.2 ; transcript_alias_1 ENST00000542122 ;
chr9	lncipedia.org	exon	66697382	66697441	.	+	.	gene_id lnc-RP11-262H14.4.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-262H14.4.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256208 ; gene_alias_2 AL353626.2 ; transcript_alias_1 ENST00000542122 ;
chr1	lncipedia.org	exon	16973894	16975179	.	-	.	gene_id lnc-MST1P9-1 ; transcript_id lnc-MST1P9-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256048 ; gene_alias_2 AL137798.3 ; transcript_alias_1 ENST00000535991 ;
chr1	lncipedia.org	exon	16975271	16975897	.	-	.	gene_id lnc-MST1P9-1 ; transcript_id lnc-MST1P9-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256048 ; gene_alias_2 AL137798.3 ; transcript_alias_1 ENST00000535991 ;
chr9	lncipedia.org	exon	139006434	139008857	.	+	.	gene_id lnc-CR392000.1-2 ; transcript_id lnc-CR392000.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246044 ; gene_alias_2 AL138781.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501184 ;
chr9	lncipedia.org	exon	139010425	139010514	.	+	.	gene_id lnc-CR392000.1-2 ; transcript_id lnc-CR392000.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246044 ; gene_alias_2 AL138781.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501184 ;
chr7	lncipedia.org	exon	27655593	27656414	.	+	.	gene_id lnc-TAX1BP1-1 ; transcript_id lnc-TAX1BP1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233400 ; gene_alias_2 AC007130.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436543 ;
chr7	lncipedia.org	exon	27657088	27657307	.	+	.	gene_id lnc-TAX1BP1-1 ; transcript_id lnc-TAX1BP1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233400 ; gene_alias_2 AC007130.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436543 ;
chr7	lncipedia.org	exon	27666842	27667109	.	+	.	gene_id lnc-TAX1BP1-1 ; transcript_id lnc-TAX1BP1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233400 ; gene_alias_2 AC007130.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436543 ;
chr9	lncipedia.org	exon	70645650	70645941	.	-	.	gene_id lnc-CBWD5-2 ; transcript_id lnc-CBWD5-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227003 ; gene_alias_2 AL591479.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436889 ;
chr9	lncipedia.org	exon	70645993	70648248	.	-	.	gene_id lnc-CBWD5-2 ; transcript_id lnc-CBWD5-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227003 ; gene_alias_2 AL591479.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436889 ;
chr17	lncipedia.org	exon	29036657	29036829	.	+	.	gene_id lnc-ATAD5-3 ; transcript_id lnc-ATAD5-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247185 ; gene_alias_2 SUZ12P ; transcript_alias_1 ENST00000499895 ;
chr17	lncipedia.org	exon	29061915	29061961	.	+	.	gene_id lnc-ATAD5-3 ; transcript_id lnc-ATAD5-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247185 ; gene_alias_2 SUZ12P ; transcript_alias_1 ENST00000499895 ;
chr17	lncipedia.org	exon	29062051	29062115	.	+	.	gene_id lnc-ATAD5-3 ; transcript_id lnc-ATAD5-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247185 ; gene_alias_2 SUZ12P ; transcript_alias_1 ENST00000499895 ;
chr17	lncipedia.org	exon	29086509	29086557	.	+	.	gene_id lnc-ATAD5-3 ; transcript_id lnc-ATAD5-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247185 ; gene_alias_2 SUZ12P ; transcript_alias_1 ENST00000499895 ;
chr17	lncipedia.org	exon	29093521	29093606	.	+	.	gene_id lnc-ATAD5-3 ; transcript_id lnc-ATAD5-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247185 ; gene_alias_2 SUZ12P ; transcript_alias_1 ENST00000499895 ;
chr17	lncipedia.org	exon	29095852	29097042	.	+	.	gene_id lnc-ATAD5-3 ; transcript_id lnc-ATAD5-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247185 ; gene_alias_2 SUZ12P ; transcript_alias_1 ENST00000499895 ;
chr19	lncipedia.org	exon	8374177	8375658	.	+	.	gene_id lnc-RPS28-1 ; transcript_id lnc-RPS28-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246974 ; gene_alias_2 AC010323.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499780 ;
chr19	lncipedia.org	exon	8384187	8384444	.	+	.	gene_id lnc-RPS28-1 ; transcript_id lnc-RPS28-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246974 ; gene_alias_2 AC010323.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499780 ;
chr22	lncipedia.org	exon	34121000	34121087	.	+	.	gene_id lnc-TIMP3-6 ; transcript_id lnc-TIMP3-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224973.1 ; gene_alias_2 CTA-282F2.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000150916.3 ; transcript_alias_1 ENST00000453336.1 ; transcript_alias_2 CTA-282F2.3-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000320520.2 ;
chr22	lncipedia.org	exon	34121598	34121742	.	+	.	gene_id lnc-TIMP3-6 ; transcript_id lnc-TIMP3-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224973.1 ; gene_alias_2 CTA-282F2.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000150916.3 ; transcript_alias_1 ENST00000453336.1 ; transcript_alias_2 CTA-282F2.3-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000320520.2 ;
chr22	lncipedia.org	exon	34122102	34122183	.	+	.	gene_id lnc-TIMP3-6 ; transcript_id lnc-TIMP3-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224973.1 ; gene_alias_2 CTA-282F2.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000150916.3 ; transcript_alias_1 ENST00000453336.1 ; transcript_alias_2 CTA-282F2.3-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000320520.2 ;
chr22	lncipedia.org	exon	34123477	34123574	.	+	.	gene_id lnc-TIMP3-6 ; transcript_id lnc-TIMP3-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224973.1 ; gene_alias_2 CTA-282F2.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000150916.3 ; transcript_alias_1 ENST00000453336.1 ; transcript_alias_2 CTA-282F2.3-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000320520.2 ;
chr22	lncipedia.org	exon	34128242	34129671	.	+	.	gene_id lnc-TIMP3-6 ; transcript_id lnc-TIMP3-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224973.1 ; gene_alias_2 CTA-282F2.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000150916.3 ; transcript_alias_1 ENST00000453336.1 ; transcript_alias_2 CTA-282F2.3-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000320520.2 ;
chr22	lncipedia.org	exon	34133550	34133761	.	+	.	gene_id lnc-TIMP3-6 ; transcript_id lnc-TIMP3-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224973.1 ; gene_alias_2 CTA-282F2.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000150916.3 ; transcript_alias_1 ENST00000453336.1 ; transcript_alias_2 CTA-282F2.3-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000320520.2 ;
chrX	lncipedia.org	exon	144314449	144314530	.	-	.	gene_id lnc-SPANXN2-1 ; transcript_id lnc-SPANXN2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008251 ; gene_alias_2 linc-SPANXN2 ; gene_alias_3 ENSG00000234712.1 ; gene_alias_4 RP11-143G3.1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000022592.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017098 ; transcript_alias_2 ENST00000414071.1 ; transcript_alias_3 RP11-143G3.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058630.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	144314844	144315139	.	-	.	gene_id lnc-SPANXN2-1 ; transcript_id lnc-SPANXN2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008251 ; gene_alias_2 linc-SPANXN2 ; gene_alias_3 ENSG00000234712.1 ; gene_alias_4 RP11-143G3.1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000022592.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017098 ; transcript_alias_2 ENST00000414071.1 ; transcript_alias_3 RP11-143G3.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058630.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143743240	143743293	.	-	.	gene_id lnc-PPIAL4G-2 ; transcript_id lnc-PPIAL4G-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000223804 ; gene_alias_2 BX284650.1 ; gene_alias_3 ENSG00000223804.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013625.1 ; transcript_alias_1 ENST00000418192 ; transcript_alias_2 ENST00000418192.1 ; transcript_alias_3 BX284650.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037958.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143744201	143744355	.	-	.	gene_id lnc-PPIAL4G-2 ; transcript_id lnc-PPIAL4G-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000223804 ; gene_alias_2 BX284650.1 ; gene_alias_3 ENSG00000223804.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013625.1 ; transcript_alias_1 ENST00000418192 ; transcript_alias_2 ENST00000418192.1 ; transcript_alias_3 BX284650.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037958.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	132044737	132044971	.	+	.	gene_id lnc-PPP2R4-3 ; transcript_id lnc-PPP2R4-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224307 ; gene_alias_2 RP11-344B5.2 ; gene_alias_3 ENSG00000224307.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020775.2 ; transcript_alias_1 ENST00000455981 ; transcript_alias_2 ENST00000455981.1 ; transcript_alias_3 RP11-344B5.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000054569.2 ;
chr9	lncipedia.org	exon	132045209	132045337	.	+	.	gene_id lnc-PPP2R4-3 ; transcript_id lnc-PPP2R4-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224307 ; gene_alias_2 RP11-344B5.2 ; gene_alias_3 ENSG00000224307.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020775.2 ; transcript_alias_1 ENST00000455981 ; transcript_alias_2 ENST00000455981.1 ; transcript_alias_3 RP11-344B5.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000054569.2 ;
chr9	lncipedia.org	exon	132047789	132048007	.	+	.	gene_id lnc-PPP2R4-3 ; transcript_id lnc-PPP2R4-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224307 ; gene_alias_2 RP11-344B5.2 ; gene_alias_3 ENSG00000224307.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020775.2 ; transcript_alias_1 ENST00000455981 ; transcript_alias_2 ENST00000455981.1 ; transcript_alias_3 RP11-344B5.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000054569.2 ;
chrX	lncipedia.org	exon	103356822	103356874	.	+	.	gene_id lnc-FAM199X-1 ; transcript_id lnc-FAM199X-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000166707 ; gene_alias_2 LL0XNC01-46H11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000166707.4 ; gene_alias_4 ZCCHC18 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000022123.1 ; transcript_alias_1 ENST00000423478 ; transcript_alias_2 ENST00000423478.1 ; transcript_alias_3 ZCCHC18-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057760.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	103357422	103357563	.	+	.	gene_id lnc-FAM199X-1 ; transcript_id lnc-FAM199X-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000166707 ; gene_alias_2 LL0XNC01-46H11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000166707.4 ; gene_alias_4 ZCCHC18 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000022123.1 ; transcript_alias_1 ENST00000423478 ; transcript_alias_2 ENST00000423478.1 ; transcript_alias_3 ZCCHC18-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057760.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	87755061	87755164	.	+	.	gene_id lnc-PLGLB2-1 ; transcript_id lnc-PLGLB2-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000222041 ; gene_alias_2 NCRNA00152 ; gene_alias_3 ENSG00000222041.5 ; gene_alias_4 LINC00152 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000130273.9 ; transcript_alias_1 ENST00000423846 ; transcript_alias_2 ENST00000423846.1 ; transcript_alias_3 LINC00152-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330384.3 ;
chr2	lncipedia.org	exon	87772259	87772404	.	+	.	gene_id lnc-PLGLB2-1 ; transcript_id lnc-PLGLB2-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000222041 ; gene_alias_2 NCRNA00152 ; gene_alias_3 ENSG00000222041.5 ; gene_alias_4 LINC00152 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000130273.9 ; transcript_alias_1 ENST00000423846 ; transcript_alias_2 ENST00000423846.1 ; transcript_alias_3 LINC00152-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330384.3 ;
chr2	lncipedia.org	exon	87820726	87820932	.	+	.	gene_id lnc-PLGLB2-1 ; transcript_id lnc-PLGLB2-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000222041 ; gene_alias_2 NCRNA00152 ; gene_alias_3 ENSG00000222041.5 ; gene_alias_4 LINC00152 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000130273.9 ; transcript_alias_1 ENST00000423846 ; transcript_alias_2 ENST00000423846.1 ; transcript_alias_3 LINC00152-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330384.3 ;
chr7	lncipedia.org	exon	44888658	44888831	.	+	.	gene_id lnc-PPIA-1 ; transcript_id lnc-PPIA-1:4 ; gene_alias_1 XLOC_006069 ; gene_alias_2 linc-CCM2-2 ; gene_alias_3 ENSG00000234183.1 ; gene_alias_4 AC004854.4 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000155819.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013001 ; transcript_alias_2 ENST00000450016.1 ; transcript_alias_3 AC004854.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000341812.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	44889058	44889164	.	+	.	gene_id lnc-PPIA-1 ; transcript_id lnc-PPIA-1:4 ; gene_alias_1 XLOC_006069 ; gene_alias_2 linc-CCM2-2 ; gene_alias_3 ENSG00000234183.1 ; gene_alias_4 AC004854.4 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000155819.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013001 ; transcript_alias_2 ENST00000450016.1 ; transcript_alias_3 AC004854.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000341812.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	5571464	5571744	.	-	.	gene_id lnc-NLGN4X-1 ; transcript_id lnc-NLGN4X-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000236120 ; gene_alias_2 RP11-733O18.1 ; gene_alias_3 ENSG00000236120.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021092.1 ; transcript_alias_1 ENST00000456559 ; transcript_alias_2 ENST00000456559.1 ; transcript_alias_3 RP11-733O18.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000055669.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	5587447	5587560	.	-	.	gene_id lnc-NLGN4X-1 ; transcript_id lnc-NLGN4X-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000236120 ; gene_alias_2 RP11-733O18.1 ; gene_alias_3 ENSG00000236120.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021092.1 ; transcript_alias_1 ENST00000456559 ; transcript_alias_2 ENST00000456559.1 ; transcript_alias_3 RP11-733O18.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000055669.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	5644071	5644121	.	-	.	gene_id lnc-NLGN4X-1 ; transcript_id lnc-NLGN4X-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000236120 ; gene_alias_2 RP11-733O18.1 ; gene_alias_3 ENSG00000236120.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021092.1 ; transcript_alias_1 ENST00000456559 ; transcript_alias_2 ENST00000456559.1 ; transcript_alias_3 RP11-733O18.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000055669.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	41277733	41278000	.	+	.	gene_id lnc-FAM75A5-4 ; transcript_id lnc-FAM75A5-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_007357 ; gene_alias_2 linc-FAM75A7-17 ; gene_alias_3 ENSG00000223781.1 ; gene_alias_4 RP11-95K23.6 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000066730.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015671 ; transcript_alias_2 ENST00000411776.1 ; transcript_alias_3 RP11-95K23.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000143041.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	41297525	41297631	.	+	.	gene_id lnc-FAM75A5-4 ; transcript_id lnc-FAM75A5-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_007357 ; gene_alias_2 linc-FAM75A7-17 ; gene_alias_3 ENSG00000223781.1 ; gene_alias_4 RP11-95K23.6 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000066730.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015671 ; transcript_alias_2 ENST00000411776.1 ; transcript_alias_3 RP11-95K23.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000143041.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	41298438	41298538	.	+	.	gene_id lnc-FAM75A5-4 ; transcript_id lnc-FAM75A5-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_007357 ; gene_alias_2 linc-FAM75A7-17 ; gene_alias_3 ENSG00000223781.1 ; gene_alias_4 RP11-95K23.6 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000066730.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015671 ; transcript_alias_2 ENST00000411776.1 ; transcript_alias_3 RP11-95K23.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000143041.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	3051335	3051485	.	-	.	gene_id lnc-SERPINB6-2 ; transcript_id lnc-SERPINB6-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_005582 ; gene_alias_2 linc-SERPINB6-2 ; gene_alias_3 ENSG00000233763.1 ; gene_alias_4 RP1-40E16.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000014138.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00011431 ; transcript_alias_2 ENST00000455327.1 ; transcript_alias_3 RP1-40E16.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000039668.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	3053804	3053987	.	-	.	gene_id lnc-SERPINB6-2 ; transcript_id lnc-SERPINB6-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_005582 ; gene_alias_2 linc-SERPINB6-2 ; gene_alias_3 ENSG00000233763.1 ; gene_alias_4 RP1-40E16.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000014138.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00011431 ; transcript_alias_2 ENST00000455327.1 ; transcript_alias_3 RP1-40E16.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000039668.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	320162	320653	.	+	.	gene_id lnc-OR4F29-1 ; transcript_id lnc-OR4F29-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_000002 ; gene_alias_2 linc-OR4F16-9 ; gene_alias_3 ENSG00000237094.3 ; gene_alias_4 RP4-669L17.10 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156968.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000120 ; transcript_alias_2 ENST00000432964.1 ; transcript_alias_3 RP4-669L17.10-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000346878.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	320881	320938	.	+	.	gene_id lnc-OR4F29-1 ; transcript_id lnc-OR4F29-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_000002 ; gene_alias_2 linc-OR4F16-9 ; gene_alias_3 ENSG00000237094.3 ; gene_alias_4 RP4-669L17.10 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156968.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000120 ; transcript_alias_2 ENST00000432964.1 ; transcript_alias_3 RP4-669L17.10-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000346878.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	321032	321056	.	+	.	gene_id lnc-OR4F29-1 ; transcript_id lnc-OR4F29-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_000002 ; gene_alias_2 linc-OR4F16-9 ; gene_alias_3 ENSG00000237094.3 ; gene_alias_4 RP4-669L17.10 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156968.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000120 ; transcript_alias_2 ENST00000432964.1 ; transcript_alias_3 RP4-669L17.10-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000346878.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	46844359	46844414	.	+	.	gene_id lnc-FAM27D1.1-2 ; transcript_id lnc-FAM27D1.1-2:3 ; gene_alias_1 XLOC_007367 ; gene_alias_2 linc-ANKRD20A1-12 ; gene_alias_3 ENSG00000226007 ; gene_alias_4 RP11-211N8.2 ; gene_alias_5 ENSG00000226007.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000013217.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015681 ; transcript_alias_2 ENST00000420615 ; transcript_alias_3 ENST00000420615.1 ; transcript_alias_4 RP11-211N8.2-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000036980.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	46844959	46845159	.	+	.	gene_id lnc-FAM27D1.1-2 ; transcript_id lnc-FAM27D1.1-2:3 ; gene_alias_1 XLOC_007367 ; gene_alias_2 linc-ANKRD20A1-12 ; gene_alias_3 ENSG00000226007 ; gene_alias_4 RP11-211N8.2 ; gene_alias_5 ENSG00000226007.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000013217.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015681 ; transcript_alias_2 ENST00000420615 ; transcript_alias_3 ENST00000420615.1 ; transcript_alias_4 RP11-211N8.2-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000036980.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	3052197	3052317	.	-	.	gene_id lnc-SERPINB6-2 ; transcript_id lnc-SERPINB6-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_005582 ; gene_alias_2 linc-SERPINB6-2 ; gene_alias_3 ENSG00000233763.1 ; gene_alias_4 RP1-40E16.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000014138.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00011432 ; transcript_alias_2 ENST00000423429.1 ; transcript_alias_3 RP1-40E16.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000039666.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	3053804	3053998	.	-	.	gene_id lnc-SERPINB6-2 ; transcript_id lnc-SERPINB6-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_005582 ; gene_alias_2 linc-SERPINB6-2 ; gene_alias_3 ENSG00000233763.1 ; gene_alias_4 RP1-40E16.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000014138.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00011432 ; transcript_alias_2 ENST00000423429.1 ; transcript_alias_3 RP1-40E16.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000039666.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	104741726	104741747	.	-	.	gene_id lnc-TGFBRAP1-12 ; transcript_id lnc-TGFBRAP1-12:1 ; gene_alias_1 XLOC_002235 ; gene_alias_2 linc-MFSD9-7 ; gene_alias_3 ENSG00000228968 ; gene_alias_4 AC096554.1 ; gene_alias_5 ENSG00000228968.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000153044.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003348 ; transcript_alias_2 ENST00000458182 ; transcript_alias_3 ENST00000458182.1 ; transcript_alias_4 AC096554.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000329210.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	104742575	104742647	.	-	.	gene_id lnc-TGFBRAP1-12 ; transcript_id lnc-TGFBRAP1-12:1 ; gene_alias_1 XLOC_002235 ; gene_alias_2 linc-MFSD9-7 ; gene_alias_3 ENSG00000228968 ; gene_alias_4 AC096554.1 ; gene_alias_5 ENSG00000228968.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000153044.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003348 ; transcript_alias_2 ENST00000458182 ; transcript_alias_3 ENST00000458182.1 ; transcript_alias_4 AC096554.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000329210.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	104760554	104760768	.	-	.	gene_id lnc-TGFBRAP1-12 ; transcript_id lnc-TGFBRAP1-12:1 ; gene_alias_1 XLOC_002235 ; gene_alias_2 linc-MFSD9-7 ; gene_alias_3 ENSG00000228968 ; gene_alias_4 AC096554.1 ; gene_alias_5 ENSG00000228968.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000153044.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003348 ; transcript_alias_2 ENST00000458182 ; transcript_alias_3 ENST00000458182.1 ; transcript_alias_4 AC096554.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000329210.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	104762262	104762408	.	-	.	gene_id lnc-TGFBRAP1-12 ; transcript_id lnc-TGFBRAP1-12:1 ; gene_alias_1 XLOC_002235 ; gene_alias_2 linc-MFSD9-7 ; gene_alias_3 ENSG00000228968 ; gene_alias_4 AC096554.1 ; gene_alias_5 ENSG00000228968.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000153044.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003348 ; transcript_alias_2 ENST00000458182 ; transcript_alias_3 ENST00000458182.1 ; transcript_alias_4 AC096554.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000329210.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	104763616	104763687	.	-	.	gene_id lnc-TGFBRAP1-12 ; transcript_id lnc-TGFBRAP1-12:1 ; gene_alias_1 XLOC_002235 ; gene_alias_2 linc-MFSD9-7 ; gene_alias_3 ENSG00000228968 ; gene_alias_4 AC096554.1 ; gene_alias_5 ENSG00000228968.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000153044.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003348 ; transcript_alias_2 ENST00000458182 ; transcript_alias_3 ENST00000458182.1 ; transcript_alias_4 AC096554.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000329210.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101417781	101417831	.	+	.	gene_id lnc-DLK1-8 ; transcript_id lnc-DLK1-8:8 ; gene_alias_1 ENSG00000225746 ; gene_alias_2 AL132709.5 ; gene_alias_3 ENSG00000225746.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000029060.3 ; transcript_alias_1 ENST00000554369 ; transcript_alias_2 ENST00000554369.1 ; transcript_alias_3 AL132709.5-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414509.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101420301	101420383	.	+	.	gene_id lnc-DLK1-8 ; transcript_id lnc-DLK1-8:8 ; gene_alias_1 ENSG00000225746 ; gene_alias_2 AL132709.5 ; gene_alias_3 ENSG00000225746.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000029060.3 ; transcript_alias_1 ENST00000554369 ; transcript_alias_2 ENST00000554369.1 ; transcript_alias_3 AL132709.5-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414509.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101421259	101421343	.	+	.	gene_id lnc-DLK1-8 ; transcript_id lnc-DLK1-8:8 ; gene_alias_1 ENSG00000225746 ; gene_alias_2 AL132709.5 ; gene_alias_3 ENSG00000225746.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000029060.3 ; transcript_alias_1 ENST00000554369 ; transcript_alias_2 ENST00000554369.1 ; transcript_alias_3 AL132709.5-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414509.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101422222	101422286	.	+	.	gene_id lnc-DLK1-8 ; transcript_id lnc-DLK1-8:8 ; gene_alias_1 ENSG00000225746 ; gene_alias_2 AL132709.5 ; gene_alias_3 ENSG00000225746.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000029060.3 ; transcript_alias_1 ENST00000554369 ; transcript_alias_2 ENST00000554369.1 ; transcript_alias_3 AL132709.5-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414509.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101424599	101424680	.	+	.	gene_id lnc-DLK1-8 ; transcript_id lnc-DLK1-8:8 ; gene_alias_1 ENSG00000225746 ; gene_alias_2 AL132709.5 ; gene_alias_3 ENSG00000225746.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000029060.3 ; transcript_alias_1 ENST00000554369 ; transcript_alias_2 ENST00000554369.1 ; transcript_alias_3 AL132709.5-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414509.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101426398	101426516	.	+	.	gene_id lnc-DLK1-8 ; transcript_id lnc-DLK1-8:8 ; gene_alias_1 ENSG00000225746 ; gene_alias_2 AL132709.5 ; gene_alias_3 ENSG00000225746.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000029060.3 ; transcript_alias_1 ENST00000554369 ; transcript_alias_2 ENST00000554369.1 ; transcript_alias_3 AL132709.5-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414509.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	149107957	149108329	.	+	.	gene_id lnc-MAGEA8-2 ; transcript_id lnc-MAGEA8-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000235703 ; gene_alias_2 RP13-507I23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000235703.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022638.4 ; transcript_alias_1 ENST00000458274 ; transcript_alias_2 ENST00000458274.1 ; transcript_alias_3 RP13-507I23.1-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000082894.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	149108877	149109050	.	+	.	gene_id lnc-MAGEA8-2 ; transcript_id lnc-MAGEA8-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000235703 ; gene_alias_2 RP13-507I23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000235703.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022638.4 ; transcript_alias_1 ENST00000458274 ; transcript_alias_2 ENST00000458274.1 ; transcript_alias_3 RP13-507I23.1-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000082894.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	37188190	37188684	.	-	.	gene_id lnc-RP11-150O12.1.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-150O12.1.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000253123 ; gene_alias_2 RP11-527N22.1 ; gene_alias_3 ENSG00000253123.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163995.1 ; transcript_alias_1 ENST00000518765 ; transcript_alias_2 ENST00000518765.1 ; transcript_alias_3 RP11-527N22.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000376673.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	37189285	37189502	.	-	.	gene_id lnc-RP11-150O12.1.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-150O12.1.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000253123 ; gene_alias_2 RP11-527N22.1 ; gene_alias_3 ENSG00000253123.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163995.1 ; transcript_alias_1 ENST00000518765 ; transcript_alias_2 ENST00000518765.1 ; transcript_alias_3 RP11-527N22.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000376673.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	151889195	151889841	.	-	.	gene_id lnc-MAGEA12-1 ; transcript_id lnc-MAGEA12-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008259 ; gene_alias_2 linc-CSAG2 ; gene_alias_3 ENSG00000231447.1 ; gene_alias_4 RP1-14D6.7 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000022647.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017102 ; transcript_alias_2 ENST00000437309.1 ; transcript_alias_3 RP1-14D6.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058759.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	151889940	151890140	.	-	.	gene_id lnc-MAGEA12-1 ; transcript_id lnc-MAGEA12-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008259 ; gene_alias_2 linc-CSAG2 ; gene_alias_3 ENSG00000231447.1 ; gene_alias_4 RP1-14D6.7 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000022647.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017102 ; transcript_alias_2 ENST00000437309.1 ; transcript_alias_3 RP1-14D6.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058759.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	9183618	9183813	.	+	.	gene_id lnc-RP11-10A14.4.1-4 ; transcript_id lnc-RP11-10A14.4.1-4:5 ; gene_alias_1 ENSG00000254235 ; gene_alias_2 RP11-115J16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000254235.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163665.2 ; transcript_alias_1 ENST00000518619 ; transcript_alias_2 ENST00000518619.1 ; transcript_alias_3 RP11-115J16.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000375032.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	9218876	9218933	.	+	.	gene_id lnc-RP11-10A14.4.1-4 ; transcript_id lnc-RP11-10A14.4.1-4:5 ; gene_alias_1 ENSG00000254235 ; gene_alias_2 RP11-115J16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000254235.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163665.2 ; transcript_alias_1 ENST00000518619 ; transcript_alias_2 ENST00000518619.1 ; transcript_alias_3 RP11-115J16.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000375032.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	9220772	9220892	.	+	.	gene_id lnc-RP11-10A14.4.1-4 ; transcript_id lnc-RP11-10A14.4.1-4:5 ; gene_alias_1 ENSG00000254235 ; gene_alias_2 RP11-115J16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000254235.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163665.2 ; transcript_alias_1 ENST00000518619 ; transcript_alias_2 ENST00000518619.1 ; transcript_alias_3 RP11-115J16.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000375032.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	9224971	9225402	.	+	.	gene_id lnc-RP11-10A14.4.1-4 ; transcript_id lnc-RP11-10A14.4.1-4:5 ; gene_alias_1 ENSG00000254235 ; gene_alias_2 RP11-115J16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000254235.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163665.2 ; transcript_alias_1 ENST00000518619 ; transcript_alias_2 ENST00000518619.1 ; transcript_alias_3 RP11-115J16.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000375032.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	132094579	132094752	.	+	.	gene_id lnc-PPP2R4-5 ; transcript_id lnc-PPP2R4-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233901 ; gene_alias_2 RP11-65J3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233901.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020778.5 ; transcript_alias_1 ENST00000427109 ; transcript_alias_2 ENST00000427109.1 ; transcript_alias_3 RP11-65J3.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000106362.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	132096254	132096477	.	+	.	gene_id lnc-PPP2R4-5 ; transcript_id lnc-PPP2R4-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233901 ; gene_alias_2 RP11-65J3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233901.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020778.5 ; transcript_alias_1 ENST00000427109 ; transcript_alias_2 ENST00000427109.1 ; transcript_alias_3 RP11-65J3.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000106362.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	132101071	132101180	.	+	.	gene_id lnc-PPP2R4-5 ; transcript_id lnc-PPP2R4-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233901 ; gene_alias_2 RP11-65J3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233901.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020778.5 ; transcript_alias_1 ENST00000427109 ; transcript_alias_2 ENST00000427109.1 ; transcript_alias_3 RP11-65J3.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000106362.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	171612226	171612313	.	+	.	gene_id lnc-FNDC3B-1 ; transcript_id lnc-FNDC3B-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_002922 ; gene_alias_2 linc-FNDC3B ; gene_alias_3 ENSG00000235943.1 ; gene_alias_4 TMEM212-IT1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156878.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005659 ; transcript_alias_2 ENST00000456146.1 ; transcript_alias_3 TMEM212-IT1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000346407.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	171612649	171613030	.	+	.	gene_id lnc-FNDC3B-1 ; transcript_id lnc-FNDC3B-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_002922 ; gene_alias_2 linc-FNDC3B ; gene_alias_3 ENSG00000235943.1 ; gene_alias_4 TMEM212-IT1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156878.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005659 ; transcript_alias_2 ENST00000456146.1 ; transcript_alias_3 TMEM212-IT1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000346407.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	12561749	12562116	.	+	.	gene_id lnc-ZNF791-2 ; transcript_id lnc-ZNF791-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_012971 ; gene_alias_2 linc-ZNF791-2 ; gene_alias_3 ENSG00000234848.1 ; gene_alias_4 CTD-3105H18.7 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156423.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00026825 ; transcript_alias_2 ENST00000420038.1 ; transcript_alias_3 CTD-3105H18.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000344130.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	12565617	12565796	.	+	.	gene_id lnc-ZNF791-2 ; transcript_id lnc-ZNF791-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_012971 ; gene_alias_2 linc-ZNF791-2 ; gene_alias_3 ENSG00000234848.1 ; gene_alias_4 CTD-3105H18.7 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156423.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00026825 ; transcript_alias_2 ENST00000420038.1 ; transcript_alias_3 CTD-3105H18.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000344130.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	12571373	12571519	.	+	.	gene_id lnc-ZNF791-2 ; transcript_id lnc-ZNF791-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_012971 ; gene_alias_2 linc-ZNF791-2 ; gene_alias_3 ENSG00000234848.1 ; gene_alias_4 CTD-3105H18.7 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156423.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00026825 ; transcript_alias_2 ENST00000420038.1 ; transcript_alias_3 CTD-3105H18.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000344130.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	249153363	249153445	.	+	.	gene_id lnc-ZNF672-1 ; transcript_id lnc-ZNF672-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_000653 ; gene_alias_2 linc-PGBD2 ; gene_alias_3 ENSG00000227237.1 ; gene_alias_4 AL672294.1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000040425.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000435 ; transcript_alias_2 ENST00000417047.1 ; transcript_alias_3 AL672294.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000097321.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	249156828	249156986	.	+	.	gene_id lnc-ZNF672-1 ; transcript_id lnc-ZNF672-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_000653 ; gene_alias_2 linc-PGBD2 ; gene_alias_3 ENSG00000227237.1 ; gene_alias_4 AL672294.1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000040425.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000435 ; transcript_alias_2 ENST00000417047.1 ; transcript_alias_3 AL672294.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000097321.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	249158776	249158995	.	+	.	gene_id lnc-ZNF672-1 ; transcript_id lnc-ZNF672-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_000653 ; gene_alias_2 linc-PGBD2 ; gene_alias_3 ENSG00000227237.1 ; gene_alias_4 AL672294.1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000040425.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000435 ; transcript_alias_2 ENST00000417047.1 ; transcript_alias_3 AL672294.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000097321.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	106623783	106624046	.	+	.	gene_id lnc-PRMT6-3 ; transcript_id lnc-PRMT6-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237480 ; gene_alias_2 RP5-947P14.1 ; gene_alias_3 ENSG00000237480.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000011035.1 ; transcript_alias_1 ENST00000429608 ; transcript_alias_2 ENST00000429608.1 ; transcript_alias_3 RP5-947P14.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000030362.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	106627052	106627118	.	+	.	gene_id lnc-PRMT6-3 ; transcript_id lnc-PRMT6-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237480 ; gene_alias_2 RP5-947P14.1 ; gene_alias_3 ENSG00000237480.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000011035.1 ; transcript_alias_1 ENST00000429608 ; transcript_alias_2 ENST00000429608.1 ; transcript_alias_3 RP5-947P14.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000030362.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	2515065	2515462	.	-	.	gene_id lnc-BRAT1-1 ; transcript_id lnc-BRAT1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236734 ; gene_alias_2 GRIFIN ; gene_alias_3 ENSG00000236734.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152042.2 ; transcript_alias_1 ENST00000417742 ; transcript_alias_2 ENST00000417742.1 ; transcript_alias_3 GRIFIN-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000325020.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	2515554	2515633	.	-	.	gene_id lnc-BRAT1-1 ; transcript_id lnc-BRAT1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236734 ; gene_alias_2 GRIFIN ; gene_alias_3 ENSG00000236734.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152042.2 ; transcript_alias_1 ENST00000417742 ; transcript_alias_2 ENST00000417742.1 ; transcript_alias_3 GRIFIN-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000325020.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	2516359	2516528	.	-	.	gene_id lnc-BRAT1-1 ; transcript_id lnc-BRAT1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236734 ; gene_alias_2 GRIFIN ; gene_alias_3 ENSG00000236734.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152042.2 ; transcript_alias_1 ENST00000417742 ; transcript_alias_2 ENST00000417742.1 ; transcript_alias_3 GRIFIN-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000325020.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	50053297	50053596	.	+	.	gene_id lnc-LRR1-1 ; transcript_id lnc-LRR1-1:1 ; gene_alias_1 7SL ; gene_alias_2 7S RNA ; gene_alias_3 SRP RNA ; gene_alias_4 4.5S SRP RNA ; gene_alias_5 4.5S RNA ; gene_alias_6 RN7SL1 RNA ; gene_alias_7 ENSG00000258486.1 ; gene_alias_8 RN7SL1 ; gene_alias_9 OTTHUMG00000171559.1 ; transcript_alias_1 ENST00000553637.1 ; transcript_alias_2 RN7SL1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000414196.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	24997731	24997790	.	+	.	gene_id lnc-BPY2-2 ; transcript_id lnc-BPY2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228240 ; gene_alias_2 TTTY17A ; gene_alias_3 ENSG00000228240.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000043854.1 ; transcript_alias_1 ENST00000416110 ; transcript_alias_2 ENST00000416110.1 ; transcript_alias_3 TTTY17A-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000102242.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	24998757	24998862	.	+	.	gene_id lnc-BPY2-2 ; transcript_id lnc-BPY2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228240 ; gene_alias_2 TTTY17A ; gene_alias_3 ENSG00000228240.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000043854.1 ; transcript_alias_1 ENST00000416110 ; transcript_alias_2 ENST00000416110.1 ; transcript_alias_3 TTTY17A-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000102242.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	17215037	17215277	.	-	.	gene_id lnc-BX284668.1-1 ; transcript_id lnc-BX284668.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000238142 ; gene_alias_2 RP11-108M9.4 ; gene_alias_3 ENSG00000238142.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002204.1 ; transcript_alias_1 ENST00000416869 ; transcript_alias_2 ENST00000416869.1 ; transcript_alias_3 RP11-108M9.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000006259.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	17216043	17216137	.	-	.	gene_id lnc-BX284668.1-1 ; transcript_id lnc-BX284668.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000238142 ; gene_alias_2 RP11-108M9.4 ; gene_alias_3 ENSG00000238142.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002204.1 ; transcript_alias_1 ENST00000416869 ; transcript_alias_2 ENST00000416869.1 ; transcript_alias_3 RP11-108M9.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000006259.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	132208911	132209333	.	-	.	gene_id lnc-C9orf50-4 ; transcript_id lnc-C9orf50-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_007867 ; gene_alias_2 linc-IER5L-4 ; gene_alias_3 ENSG00000230676 ; gene_alias_4 RP11-65J3.3 ; gene_alias_5 ENSG00000230676.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000020780.3 ; transcript_alias_1 TCONS_00015889 ; transcript_alias_2 ENST00000454408 ; transcript_alias_3 ENST00000454408.1 ; transcript_alias_4 RP11-65J3.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000054575.2 ;
chr9	lncipedia.org	exon	132213666	132213701	.	-	.	gene_id lnc-C9orf50-4 ; transcript_id lnc-C9orf50-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_007867 ; gene_alias_2 linc-IER5L-4 ; gene_alias_3 ENSG00000230676 ; gene_alias_4 RP11-65J3.3 ; gene_alias_5 ENSG00000230676.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000020780.3 ; transcript_alias_1 TCONS_00015889 ; transcript_alias_2 ENST00000454408 ; transcript_alias_3 ENST00000454408.1 ; transcript_alias_4 RP11-65J3.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000054575.2 ;
chr1	lncipedia.org	exon	9242271	9242375	.	+	.	gene_id lnc-H6PD-1 ; transcript_id lnc-H6PD-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234546 ; gene_alias_2 RP3-510D11.2 ; gene_alias_3 ENSG00000234546.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000001764.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412639 ; transcript_alias_2 ENST00000412639.1 ; transcript_alias_3 RP3-510D11.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000004915.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	9243692	9243855	.	+	.	gene_id lnc-H6PD-1 ; transcript_id lnc-H6PD-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234546 ; gene_alias_2 RP3-510D11.2 ; gene_alias_3 ENSG00000234546.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000001764.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412639 ; transcript_alias_2 ENST00000412639.1 ; transcript_alias_3 RP3-510D11.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000004915.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101372381	101372500	.	+	.	gene_id lnc-DLK1-6 ; transcript_id lnc-DLK1-6:6 ; gene_alias_1 ENSG00000258399 ; gene_alias_2 RP11-909M7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258399.1 ; gene_alias_4 MEG8 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000171625.1 ; transcript_alias_1 ENST00000554323 ; transcript_alias_2 ENST00000554323.1 ; transcript_alias_3 MEG8-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414502.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101373273	101373438	.	+	.	gene_id lnc-DLK1-6 ; transcript_id lnc-DLK1-6:6 ; gene_alias_1 ENSG00000258399 ; gene_alias_2 RP11-909M7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258399.1 ; gene_alias_4 MEG8 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000171625.1 ; transcript_alias_1 ENST00000554323 ; transcript_alias_2 ENST00000554323.1 ; transcript_alias_3 MEG8-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414502.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	32806353	32806526	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132E-1 ; transcript_id lnc-TMEM132E-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_012176 ; gene_alias_2 linc-TMEM132E-1 ; gene_alias_3 ENSG00000225582 ; gene_alias_4 AC011193.1 ; gene_alias_5 ENSG00000225582.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000132738.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00025168 ; transcript_alias_2 ENST00000441287 ; transcript_alias_3 ENST00000441287.1 ; transcript_alias_4 AC011193.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000256095.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	32806828	32806976	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132E-1 ; transcript_id lnc-TMEM132E-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_012176 ; gene_alias_2 linc-TMEM132E-1 ; gene_alias_3 ENSG00000225582 ; gene_alias_4 AC011193.1 ; gene_alias_5 ENSG00000225582.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000132738.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00025168 ; transcript_alias_2 ENST00000441287 ; transcript_alias_3 ENST00000441287.1 ; transcript_alias_4 AC011193.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000256095.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	152679	152819	.	+	.	gene_id lnc-FAM20C-3 ; transcript_id lnc-FAM20C-3:7 ; gene_alias_1 ENSG00000240859 ; gene_alias_2 XLOC_005953 ; gene_alias_3 linc-FAM20C-2 ; gene_alias_4 AC093627.10 ; gene_alias_5 ENSG00000240859.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151398.1 ; transcript_alias_1 ENST00000492208 ; transcript_alias_2 TCONS_00012933 ; transcript_alias_3 ENST00000492208.1 ; transcript_alias_4 AC093627.10-004 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000322472.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	153412	153823	.	+	.	gene_id lnc-FAM20C-3 ; transcript_id lnc-FAM20C-3:7 ; gene_alias_1 ENSG00000240859 ; gene_alias_2 XLOC_005953 ; gene_alias_3 linc-FAM20C-2 ; gene_alias_4 AC093627.10 ; gene_alias_5 ENSG00000240859.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151398.1 ; transcript_alias_1 ENST00000492208 ; transcript_alias_2 TCONS_00012933 ; transcript_alias_3 ENST00000492208.1 ; transcript_alias_4 AC093627.10-004 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000322472.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	87754998	87755164	.	+	.	gene_id lnc-PLGLB2-1 ; transcript_id lnc-PLGLB2-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000222041 ; gene_alias_2 NCRNA00152 ; gene_alias_3 ENSG00000222041.5 ; gene_alias_4 LINC00152 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000130273.9 ; transcript_alias_1 ENST00000419680 ; transcript_alias_2 ENST00000419680.2 ; transcript_alias_3 LINC00152-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330390.3 ;
chr2	lncipedia.org	exon	87769669	87769823	.	+	.	gene_id lnc-PLGLB2-1 ; transcript_id lnc-PLGLB2-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000222041 ; gene_alias_2 NCRNA00152 ; gene_alias_3 ENSG00000222041.5 ; gene_alias_4 LINC00152 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000130273.9 ; transcript_alias_1 ENST00000419680 ; transcript_alias_2 ENST00000419680.2 ; transcript_alias_3 LINC00152-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330390.3 ;
chr2	lncipedia.org	exon	87772259	87772404	.	+	.	gene_id lnc-PLGLB2-1 ; transcript_id lnc-PLGLB2-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000222041 ; gene_alias_2 NCRNA00152 ; gene_alias_3 ENSG00000222041.5 ; gene_alias_4 LINC00152 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000130273.9 ; transcript_alias_1 ENST00000419680 ; transcript_alias_2 ENST00000419680.2 ; transcript_alias_3 LINC00152-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330390.3 ;
chr2	lncipedia.org	exon	87820726	87820932	.	+	.	gene_id lnc-PLGLB2-1 ; transcript_id lnc-PLGLB2-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000222041 ; gene_alias_2 NCRNA00152 ; gene_alias_3 ENSG00000222041.5 ; gene_alias_4 LINC00152 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000130273.9 ; transcript_alias_1 ENST00000419680 ; transcript_alias_2 ENST00000419680.2 ; transcript_alias_3 LINC00152-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330390.3 ;
chr1	lncipedia.org	exon	139790	139847	.	-	.	gene_id lnc-FAM138A-2 ; transcript_id lnc-FAM138A-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_000658 ; gene_alias_2 linc-ZNF692-6 ; gene_alias_3 ENSG00000239906.1 ; gene_alias_4 RP11-34P13.14 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000002481.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000437 ; transcript_alias_2 ENST00000493797.1 ; transcript_alias_3 RP11-34P13.14-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000007038.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	140075	140339	.	-	.	gene_id lnc-FAM138A-2 ; transcript_id lnc-FAM138A-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_000658 ; gene_alias_2 linc-ZNF692-6 ; gene_alias_3 ENSG00000239906.1 ; gene_alias_4 RP11-34P13.14 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000002481.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000437 ; transcript_alias_2 ENST00000493797.1 ; transcript_alias_3 RP11-34P13.14-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000007038.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	217384053	217384113	.	+	.	gene_id lnc-SMARCAL1-2 ; transcript_id lnc-SMARCAL1-2:4 ; gene_alias_1 XLOC_001856 ; gene_alias_2 linc-IGFBP2-3 ; gene_alias_3 ENSG00000241836.1 ; gene_alias_4 AC073321.5 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000155342.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003107 ; transcript_alias_2 ENST00000427280.1 ; transcript_alias_3 AC073321.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000339545.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	217385437	217385497	.	+	.	gene_id lnc-SMARCAL1-2 ; transcript_id lnc-SMARCAL1-2:4 ; gene_alias_1 XLOC_001856 ; gene_alias_2 linc-IGFBP2-3 ; gene_alias_3 ENSG00000241836.1 ; gene_alias_4 AC073321.5 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000155342.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003107 ; transcript_alias_2 ENST00000427280.1 ; transcript_alias_3 AC073321.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000339545.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	217393993	217394177	.	+	.	gene_id lnc-SMARCAL1-2 ; transcript_id lnc-SMARCAL1-2:4 ; gene_alias_1 XLOC_001856 ; gene_alias_2 linc-IGFBP2-3 ; gene_alias_3 ENSG00000241836.1 ; gene_alias_4 AC073321.5 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000155342.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003107 ; transcript_alias_2 ENST00000427280.1 ; transcript_alias_3 AC073321.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000339545.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	1465918	1466117	.	-	.	gene_id lnc-SRY-5 ; transcript_id lnc-SRY-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_008306 ; gene_alias_2 linc-SLC25A6-1 ; gene_alias_3 ENSGR0000236871.1 ; gene_alias_4 LINC00106 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000021061.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017618 ; transcript_alias_2 ENSTR0000430235.1 ; transcript_alias_3 LINC00106-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000055604.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	1467718	1467851	.	-	.	gene_id lnc-SRY-5 ; transcript_id lnc-SRY-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_008306 ; gene_alias_2 linc-SLC25A6-1 ; gene_alias_3 ENSGR0000236871.1 ; gene_alias_4 LINC00106 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000021061.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017618 ; transcript_alias_2 ENSTR0000430235.1 ; transcript_alias_3 LINC00106-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000055604.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	1468260	1468295	.	-	.	gene_id lnc-SRY-5 ; transcript_id lnc-SRY-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_008306 ; gene_alias_2 linc-SLC25A6-1 ; gene_alias_3 ENSGR0000236871.1 ; gene_alias_4 LINC00106 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000021061.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017618 ; transcript_alias_2 ENSTR0000430235.1 ; transcript_alias_3 LINC00106-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000055604.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	241894441	241894732	.	-	.	gene_id lnc-C2orf54-1 ; transcript_id lnc-C2orf54-1:4 ; gene_alias_1 XLOC_002548 ; gene_alias_2 linc-C2orf54-1 ; gene_alias_3 ENSG00000233392.1 ; gene_alias_4 AC104809.4 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000151847.3 ; transcript_alias_1 TCONS_00003522 ; transcript_alias_2 ENST00000457369.1 ; transcript_alias_3 AC104809.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000324172.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	241895787	241895877	.	-	.	gene_id lnc-C2orf54-1 ; transcript_id lnc-C2orf54-1:4 ; gene_alias_1 XLOC_002548 ; gene_alias_2 linc-C2orf54-1 ; gene_alias_3 ENSG00000233392.1 ; gene_alias_4 AC104809.4 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000151847.3 ; transcript_alias_1 TCONS_00003522 ; transcript_alias_2 ENST00000457369.1 ; transcript_alias_3 AC104809.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000324172.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	241896779	241897034	.	-	.	gene_id lnc-C2orf54-1 ; transcript_id lnc-C2orf54-1:4 ; gene_alias_1 XLOC_002548 ; gene_alias_2 linc-C2orf54-1 ; gene_alias_3 ENSG00000233392.1 ; gene_alias_4 AC104809.4 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000151847.3 ; transcript_alias_1 TCONS_00003522 ; transcript_alias_2 ENST00000457369.1 ; transcript_alias_3 AC104809.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000324172.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	241898494	241898539	.	-	.	gene_id lnc-C2orf54-1 ; transcript_id lnc-C2orf54-1:4 ; gene_alias_1 XLOC_002548 ; gene_alias_2 linc-C2orf54-1 ; gene_alias_3 ENSG00000233392.1 ; gene_alias_4 AC104809.4 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000151847.3 ; transcript_alias_1 TCONS_00003522 ; transcript_alias_2 ENST00000457369.1 ; transcript_alias_3 AC104809.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000324172.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	241898657	241898771	.	-	.	gene_id lnc-C2orf54-1 ; transcript_id lnc-C2orf54-1:4 ; gene_alias_1 XLOC_002548 ; gene_alias_2 linc-C2orf54-1 ; gene_alias_3 ENSG00000233392.1 ; gene_alias_4 AC104809.4 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000151847.3 ; transcript_alias_1 TCONS_00003522 ; transcript_alias_2 ENST00000457369.1 ; transcript_alias_3 AC104809.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000324172.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	104689921	104690153	.	+	.	gene_id lnc-C14orf144-1 ; transcript_id lnc-C14orf144-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258913 ; gene_alias_2 RP11-260M19.2 ; gene_alias_3 ENSG00000258913.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170825.2 ; transcript_alias_1 ENST00000553757 ; transcript_alias_2 ENST00000553757.1 ; transcript_alias_3 RP11-260M19.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000410577.2 ;
chr14	lncipedia.org	exon	104753823	104753890	.	+	.	gene_id lnc-C14orf144-1 ; transcript_id lnc-C14orf144-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258913 ; gene_alias_2 RP11-260M19.2 ; gene_alias_3 ENSG00000258913.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170825.2 ; transcript_alias_1 ENST00000553757 ; transcript_alias_2 ENST00000553757.1 ; transcript_alias_3 RP11-260M19.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000410577.2 ;
chr14	lncipedia.org	exon	104754171	104754406	.	+	.	gene_id lnc-C14orf144-1 ; transcript_id lnc-C14orf144-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258913 ; gene_alias_2 RP11-260M19.2 ; gene_alias_3 ENSG00000258913.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170825.2 ; transcript_alias_1 ENST00000553757 ; transcript_alias_2 ENST00000553757.1 ; transcript_alias_3 RP11-260M19.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000410577.2 ;
chr12	lncipedia.org	exon	49183359	49183473	.	+	.	gene_id lnc-CACNB3-1 ; transcript_id lnc-CACNB3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000257660 ; gene_alias_2 RP11-579D7.4 ; gene_alias_3 ENSG00000257660.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170397.1 ; transcript_alias_1 ENST00000549864 ; transcript_alias_2 ENST00000549864.1 ; transcript_alias_3 RP11-579D7.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408870.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	49183768	49183902	.	+	.	gene_id lnc-CACNB3-1 ; transcript_id lnc-CACNB3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000257660 ; gene_alias_2 RP11-579D7.4 ; gene_alias_3 ENSG00000257660.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170397.1 ; transcript_alias_1 ENST00000549864 ; transcript_alias_2 ENST00000549864.1 ; transcript_alias_3 RP11-579D7.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408870.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	49184096	49184318	.	+	.	gene_id lnc-CACNB3-1 ; transcript_id lnc-CACNB3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000257660 ; gene_alias_2 RP11-579D7.4 ; gene_alias_3 ENSG00000257660.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170397.1 ; transcript_alias_1 ENST00000549864 ; transcript_alias_2 ENST00000549864.1 ; transcript_alias_3 RP11-579D7.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408870.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	147496676	147496959	.	+	.	gene_id lnc-GPR89B-1 ; transcript_id lnc-GPR89B-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_000388 ; gene_alias_2 linc-NBPF15-3 ; gene_alias_3 ENSG00000229952 ; gene_alias_4 RP6-74O6.3 ; gene_alias_5 ENSG00000229952.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000043433.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000299 ; transcript_alias_2 ENST00000422157 ; transcript_alias_3 ENST00000422157.1 ; transcript_alias_4 RP6-74O6.3-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000101760.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	147498018	147498172	.	+	.	gene_id lnc-GPR89B-1 ; transcript_id lnc-GPR89B-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_000388 ; gene_alias_2 linc-NBPF15-3 ; gene_alias_3 ENSG00000229952 ; gene_alias_4 RP6-74O6.3 ; gene_alias_5 ENSG00000229952.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000043433.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000299 ; transcript_alias_2 ENST00000422157 ; transcript_alias_3 ENST00000422157.1 ; transcript_alias_4 RP6-74O6.3-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000101760.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	147635092	147635271	.	+	.	gene_id lnc-GPR89B-3 ; transcript_id lnc-GPR89B-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000232265 ; gene_alias_2 XXyac-YX155B6.5 ; gene_alias_3 ENSG00000232265.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000043431.1 ; transcript_alias_1 ENST00000411978 ; transcript_alias_2 ENST00000411978.1 ; transcript_alias_3 XXyac-YX155B6.5-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000101757.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	147635421	147635692	.	+	.	gene_id lnc-GPR89B-3 ; transcript_id lnc-GPR89B-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000232265 ; gene_alias_2 XXyac-YX155B6.5 ; gene_alias_3 ENSG00000232265.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000043431.1 ; transcript_alias_1 ENST00000411978 ; transcript_alias_2 ENST00000411978.1 ; transcript_alias_3 XXyac-YX155B6.5-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000101757.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	19740408	19740469	.	-	.	gene_id lnc-MBOAT1-3 ; transcript_id lnc-MBOAT1-3:5 ; gene_alias_1 XLOC_005633 ; gene_alias_2 linc-DEK-3 ; gene_alias_3 ENSG00000237404 ; gene_alias_4 RP3-471C18.2 ; gene_alias_5 ENSG00000237404.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000014332.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00011461 ; transcript_alias_2 ENST00000424083 ; transcript_alias_3 ENST00000424083.1 ; transcript_alias_4 RP3-471C18.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000039977.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	19744262	19744365	.	-	.	gene_id lnc-MBOAT1-3 ; transcript_id lnc-MBOAT1-3:5 ; gene_alias_1 XLOC_005633 ; gene_alias_2 linc-DEK-3 ; gene_alias_3 ENSG00000237404 ; gene_alias_4 RP3-471C18.2 ; gene_alias_5 ENSG00000237404.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000014332.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00011461 ; transcript_alias_2 ENST00000424083 ; transcript_alias_3 ENST00000424083.1 ; transcript_alias_4 RP3-471C18.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000039977.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	19749879	19749924	.	-	.	gene_id lnc-MBOAT1-3 ; transcript_id lnc-MBOAT1-3:5 ; gene_alias_1 XLOC_005633 ; gene_alias_2 linc-DEK-3 ; gene_alias_3 ENSG00000237404 ; gene_alias_4 RP3-471C18.2 ; gene_alias_5 ENSG00000237404.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000014332.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00011461 ; transcript_alias_2 ENST00000424083 ; transcript_alias_3 ENST00000424083.1 ; transcript_alias_4 RP3-471C18.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000039977.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	161526080	161526367	.	-	.	gene_id lnc-FCGR3B-3 ; transcript_id lnc-FCGR3B-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_001067 ; gene_alias_2 linc-FCGR3A ; gene_alias_3 ENSG00000224515.1 ; gene_alias_4 RP11-5K23.5 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000043773.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000652 ; transcript_alias_2 ENST00000419446.1 ; transcript_alias_3 RP11-5K23.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000102153.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	161526695	161526868	.	-	.	gene_id lnc-FCGR3B-3 ; transcript_id lnc-FCGR3B-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_001067 ; gene_alias_2 linc-FCGR3A ; gene_alias_3 ENSG00000224515.1 ; gene_alias_4 RP11-5K23.5 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000043773.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000652 ; transcript_alias_2 ENST00000419446.1 ; transcript_alias_3 RP11-5K23.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000102153.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	85068260	85068373	.	+	.	gene_id lnc-FAM75D1-4 ; transcript_id lnc-FAM75D1-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_007422 ; gene_alias_2 linc-C9orf103-3 ; gene_alias_3 ENSG00000232749 ; gene_alias_4 RP11-15B24.4 ; gene_alias_5 ENSG00000232749.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000020097.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015701 ; transcript_alias_2 ENST00000422010 ; transcript_alias_3 ENST00000422010.1 ; transcript_alias_4 RP11-15B24.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000052822.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	85068553	85068718	.	+	.	gene_id lnc-FAM75D1-4 ; transcript_id lnc-FAM75D1-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_007422 ; gene_alias_2 linc-C9orf103-3 ; gene_alias_3 ENSG00000232749 ; gene_alias_4 RP11-15B24.4 ; gene_alias_5 ENSG00000232749.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000020097.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015701 ; transcript_alias_2 ENST00000422010 ; transcript_alias_3 ENST00000422010.1 ; transcript_alias_4 RP11-15B24.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000052822.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	85069822	85070140	.	+	.	gene_id lnc-FAM75D1-4 ; transcript_id lnc-FAM75D1-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_007422 ; gene_alias_2 linc-C9orf103-3 ; gene_alias_3 ENSG00000232749 ; gene_alias_4 RP11-15B24.4 ; gene_alias_5 ENSG00000232749.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000020097.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015701 ; transcript_alias_2 ENST00000422010 ; transcript_alias_3 ENST00000422010.1 ; transcript_alias_4 RP11-15B24.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000052822.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175399614	175399671	.	+	.	gene_id lnc-FAM153B-3 ; transcript_id lnc-FAM153B-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_004653 ; gene_alias_2 linc-FAM153B ; gene_alias_3 ENSG00000250801.1 ; gene_alias_4 RP11-91H12.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000163180.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009548 ; transcript_alias_2 ENST00000509329.1 ; transcript_alias_3 RP11-91H12.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371917.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175399908	175399955	.	+	.	gene_id lnc-FAM153B-3 ; transcript_id lnc-FAM153B-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_004653 ; gene_alias_2 linc-FAM153B ; gene_alias_3 ENSG00000250801.1 ; gene_alias_4 RP11-91H12.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000163180.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009548 ; transcript_alias_2 ENST00000509329.1 ; transcript_alias_3 RP11-91H12.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371917.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175406170	175406411	.	+	.	gene_id lnc-FAM153B-3 ; transcript_id lnc-FAM153B-3:2 ; gene_alias_1 XLOC_004653 ; gene_alias_2 linc-FAM153B ; gene_alias_3 ENSG00000250801.1 ; gene_alias_4 RP11-91H12.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000163180.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009548 ; transcript_alias_2 ENST00000509329.1 ; transcript_alias_3 RP11-91H12.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371917.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143465380	143465438	.	-	.	gene_id lnc-PPIAL4G-4 ; transcript_id lnc-PPIAL4G-4:5 ; gene_alias_1 ENSG00000185044 ; gene_alias_2 BX004987.4 ; gene_alias_3 ENSG00000185044.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013470.1 ; transcript_alias_1 ENST00000329536 ; transcript_alias_2 ENST00000329536.8 ; transcript_alias_3 BX004987.4-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037556.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143467364	143467604	.	-	.	gene_id lnc-PPIAL4G-4 ; transcript_id lnc-PPIAL4G-4:5 ; gene_alias_1 ENSG00000185044 ; gene_alias_2 BX004987.4 ; gene_alias_3 ENSG00000185044.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013470.1 ; transcript_alias_1 ENST00000329536 ; transcript_alias_2 ENST00000329536.8 ; transcript_alias_3 BX004987.4-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037556.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	47570513	47570610	.	-	.	gene_id lnc-AGAP10-3 ; transcript_id lnc-AGAP10-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226667 ; gene_alias_2 RP11-292F22.5 ; gene_alias_3 ENSG00000226667.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018126.1 ; transcript_alias_1 ENST00000418196 ; transcript_alias_2 ENST00000418196.1 ; transcript_alias_3 RP11-292F22.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000047858.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	47573787	47573855	.	-	.	gene_id lnc-AGAP10-3 ; transcript_id lnc-AGAP10-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226667 ; gene_alias_2 RP11-292F22.5 ; gene_alias_3 ENSG00000226667.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018126.1 ; transcript_alias_1 ENST00000418196 ; transcript_alias_2 ENST00000418196.1 ; transcript_alias_3 RP11-292F22.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000047858.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	75018884	75019116	.	+	.	gene_id lnc-ISCA2-2 ; transcript_id lnc-ISCA2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258425 ; gene_alias_2 CTD-2207P18.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258425.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171477.1 ; transcript_alias_1 ENST00000554552 ; transcript_alias_2 ENST00000554552.1 ; transcript_alias_3 CTD-2207P18.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000413602.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	75026467	75026751	.	+	.	gene_id lnc-ISCA2-2 ; transcript_id lnc-ISCA2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258425 ; gene_alias_2 CTD-2207P18.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258425.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171477.1 ; transcript_alias_1 ENST00000554552 ; transcript_alias_2 ENST00000554552.1 ; transcript_alias_3 CTD-2207P18.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000413602.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	134820602	134821191	.	+	.	gene_id lnc-GLB1L2-5 ; transcript_id lnc-GLB1L2-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255327 ; gene_alias_2 RP11-555G19.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255327.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167185.1 ; transcript_alias_1 ENST00000528497 ; transcript_alias_2 ENST00000528497.1 ; transcript_alias_3 RP11-555G19.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393648.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	134821291	134821462	.	+	.	gene_id lnc-GLB1L2-5 ; transcript_id lnc-GLB1L2-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255327 ; gene_alias_2 RP11-555G19.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255327.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167185.1 ; transcript_alias_1 ENST00000528497 ; transcript_alias_2 ENST00000528497.1 ; transcript_alias_3 RP11-555G19.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393648.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	149576591	149576771	.	-	.	gene_id lnc-FAM72C-1 ; transcript_id lnc-FAM72C-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233368 ; gene_alias_2 RP11-277L2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000233368.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013949.1 ; transcript_alias_1 ENST00000447883 ; transcript_alias_2 ENST00000447883.1 ; transcript_alias_3 RP11-277L2.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000039131.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	149576917	149577296	.	-	.	gene_id lnc-FAM72C-1 ; transcript_id lnc-FAM72C-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233368 ; gene_alias_2 RP11-277L2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000233368.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013949.1 ; transcript_alias_1 ENST00000447883 ; transcript_alias_2 ENST00000447883.1 ; transcript_alias_3 RP11-277L2.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000039131.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	89441964	89442119	.	-	.	gene_id lnc-DUSP6-1 ; transcript_id lnc-DUSP6-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257156 ; gene_alias_2 RP11-13A1.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257156.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169910.1 ; transcript_alias_1 ENST00000549278 ; transcript_alias_2 ENST00000549278.1 ; transcript_alias_3 RP11-13A1.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000406532.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	89444884	89445044	.	-	.	gene_id lnc-DUSP6-1 ; transcript_id lnc-DUSP6-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257156 ; gene_alias_2 RP11-13A1.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257156.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169910.1 ; transcript_alias_1 ENST00000549278 ; transcript_alias_2 ENST00000549278.1 ; transcript_alias_3 RP11-13A1.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000406532.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	89516715	89516852	.	-	.	gene_id lnc-DUSP6-1 ; transcript_id lnc-DUSP6-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257156 ; gene_alias_2 RP11-13A1.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257156.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169910.1 ; transcript_alias_1 ENST00000549278 ; transcript_alias_2 ENST00000549278.1 ; transcript_alias_3 RP11-13A1.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000406532.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	89703187	89703330	.	-	.	gene_id lnc-DUSP6-1 ; transcript_id lnc-DUSP6-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257156 ; gene_alias_2 RP11-13A1.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257156.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169910.1 ; transcript_alias_1 ENST00000549278 ; transcript_alias_2 ENST00000549278.1 ; transcript_alias_3 RP11-13A1.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000406532.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	80083924	80084176	.	+	.	gene_id lnc-SYT1-4 ; transcript_id lnc-SYT1-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258048 ; gene_alias_2 RP11-530C5.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258048.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170081.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551995 ; transcript_alias_2 ENST00000551995.1 ; transcript_alias_3 RP11-530C5.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407185.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	80172131	80172231	.	+	.	gene_id lnc-SYT1-4 ; transcript_id lnc-SYT1-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258048 ; gene_alias_2 RP11-530C5.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258048.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170081.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551995 ; transcript_alias_2 ENST00000551995.1 ; transcript_alias_3 RP11-530C5.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407185.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	148328	148618	.	-	.	gene_id lnc-AC145676.2.1-4 ; transcript_id lnc-AC145676.2.1-4:5 ; gene_alias_1 XLOC_006326 ; gene_alias_2 linc-VIPR2-4 ; gene_alias_3 ENSG00000242474 ; gene_alias_4 AC093627.9 ; gene_alias_5 ENSG00000242474.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151405.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013113 ; transcript_alias_2 ENST00000497320 ; transcript_alias_3 ENST00000497320.1 ; transcript_alias_4 AC093627.9-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000322490.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	149329	149466	.	-	.	gene_id lnc-AC145676.2.1-4 ; transcript_id lnc-AC145676.2.1-4:5 ; gene_alias_1 XLOC_006326 ; gene_alias_2 linc-VIPR2-4 ; gene_alias_3 ENSG00000242474 ; gene_alias_4 AC093627.9 ; gene_alias_5 ENSG00000242474.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151405.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013113 ; transcript_alias_2 ENST00000497320 ; transcript_alias_3 ENST00000497320.1 ; transcript_alias_4 AC093627.9-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000322490.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	70882848	70883018	.	-	.	gene_id lnc-CXCR3-1 ; transcript_id lnc-CXCR3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237265 ; gene_alias_2 RP11-402P6.9 ; gene_alias_3 ENSG00000237265.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022722.1 ; transcript_alias_1 ENST00000433410 ; transcript_alias_2 ENST00000433410.1 ; transcript_alias_3 RP11-402P6.9-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058988.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	70883125	70883166	.	-	.	gene_id lnc-CXCR3-1 ; transcript_id lnc-CXCR3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237265 ; gene_alias_2 RP11-402P6.9 ; gene_alias_3 ENSG00000237265.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022722.1 ; transcript_alias_1 ENST00000433410 ; transcript_alias_2 ENST00000433410.1 ; transcript_alias_3 RP11-402P6.9-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058988.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	70883712	70884121	.	-	.	gene_id lnc-CXCR3-1 ; transcript_id lnc-CXCR3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237265 ; gene_alias_2 RP11-402P6.9 ; gene_alias_3 ENSG00000237265.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022722.1 ; transcript_alias_1 ENST00000433410 ; transcript_alias_2 ENST00000433410.1 ; transcript_alias_3 RP11-402P6.9-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058988.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	176865504	176865871	.	-	.	gene_id lnc-DBN1-2 ; transcript_id lnc-DBN1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246334 ; gene_alias_2 RP11-1334A24.4 ; gene_alias_3 ENSG00000246334.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163400.1 ; transcript_alias_1 ENST00000425316 ; transcript_alias_2 ENST00000425316.3 ; transcript_alias_3 RP11-1334A24.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000373186.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	176866915	176867032	.	-	.	gene_id lnc-DBN1-2 ; transcript_id lnc-DBN1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246334 ; gene_alias_2 RP11-1334A24.4 ; gene_alias_3 ENSG00000246334.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163400.1 ; transcript_alias_1 ENST00000425316 ; transcript_alias_2 ENST00000425316.3 ; transcript_alias_3 RP11-1334A24.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000373186.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	176871397	176871595	.	-	.	gene_id lnc-DBN1-2 ; transcript_id lnc-DBN1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246334 ; gene_alias_2 RP11-1334A24.4 ; gene_alias_3 ENSG00000246334.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163400.1 ; transcript_alias_1 ENST00000425316 ; transcript_alias_2 ENST00000425316.3 ; transcript_alias_3 RP11-1334A24.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000373186.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	176874645	176874700	.	-	.	gene_id lnc-DBN1-2 ; transcript_id lnc-DBN1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246334 ; gene_alias_2 RP11-1334A24.4 ; gene_alias_3 ENSG00000246334.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163400.1 ; transcript_alias_1 ENST00000425316 ; transcript_alias_2 ENST00000425316.3 ; transcript_alias_3 RP11-1334A24.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000373186.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21676430	21676616	.	-	.	gene_id lnc-GGT2-2 ; transcript_id lnc-GGT2-2:7 ; gene_alias_1 ENSG00000206142 ; gene_alias_2 KB-1183D5.13 ; gene_alias_3 ENSG00000206142.4 ; gene_alias_4 LINC00281 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000150795.1 ; transcript_alias_1 ENST00000411581 ; transcript_alias_2 ENST00000411581.1 ; transcript_alias_3 LINC00281-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320114.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21677085	21677224	.	-	.	gene_id lnc-GGT2-2 ; transcript_id lnc-GGT2-2:7 ; gene_alias_1 ENSG00000206142 ; gene_alias_2 KB-1183D5.13 ; gene_alias_3 ENSG00000206142.4 ; gene_alias_4 LINC00281 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000150795.1 ; transcript_alias_1 ENST00000411581 ; transcript_alias_2 ENST00000411581.1 ; transcript_alias_3 LINC00281-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320114.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	87755024	87755164	.	+	.	gene_id lnc-PLGLB2-1 ; transcript_id lnc-PLGLB2-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000222041 ; gene_alias_2 NCRNA00152 ; gene_alias_3 ENSG00000222041.5 ; gene_alias_4 LINC00152 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000130273.9 ; transcript_alias_1 ENST00000455131 ; transcript_alias_2 ENST00000455131.1 ; transcript_alias_3 LINC00152-011 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330393.4 ;
chr2	lncipedia.org	exon	87779742	87780126	.	+	.	gene_id lnc-PLGLB2-1 ; transcript_id lnc-PLGLB2-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000222041 ; gene_alias_2 NCRNA00152 ; gene_alias_3 ENSG00000222041.5 ; gene_alias_4 LINC00152 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000130273.9 ; transcript_alias_1 ENST00000455131 ; transcript_alias_2 ENST00000455131.1 ; transcript_alias_3 LINC00152-011 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330393.4 ;
chr2	lncipedia.org	exon	87820726	87820932	.	+	.	gene_id lnc-PLGLB2-1 ; transcript_id lnc-PLGLB2-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000222041 ; gene_alias_2 NCRNA00152 ; gene_alias_3 ENSG00000222041.5 ; gene_alias_4 LINC00152 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000130273.9 ; transcript_alias_1 ENST00000455131 ; transcript_alias_2 ENST00000455131.1 ; transcript_alias_3 LINC00152-011 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330393.4 ;
chrX	lncipedia.org	exon	114957343	114957411	.	+	.	gene_id lnc-PLS3-1 ; transcript_id lnc-PLS3-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_008049 ; gene_alias_2 linc-AGTR2-2 ; gene_alias_3 ENSG00000229335.1 ; gene_alias_4 RP1-241P17.1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000033102.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017007 ; transcript_alias_2 ENST00000415394.1 ; transcript_alias_3 RP1-241P17.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000080579.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	114959173	114959383	.	+	.	gene_id lnc-PLS3-1 ; transcript_id lnc-PLS3-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_008049 ; gene_alias_2 linc-AGTR2-2 ; gene_alias_3 ENSG00000229335.1 ; gene_alias_4 RP1-241P17.1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000033102.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017007 ; transcript_alias_2 ENST00000415394.1 ; transcript_alias_3 RP1-241P17.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000080579.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	900956	901162	.	+	.	gene_id lnc-RPS4Y1-7 ; transcript_id lnc-RPS4Y1-7:1 ; gene_alias_1 XLOC_008271 ; gene_alias_2 linc-CSF2RA-2 ; gene_alias_3 ENSGR0000237531.1 ; gene_alias_4 RP11-309M23.1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000021054.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017600 ; transcript_alias_2 ENSTR0000420865.1 ; transcript_alias_3 RP11-309M23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000055588.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	904720	905100	.	+	.	gene_id lnc-RPS4Y1-7 ; transcript_id lnc-RPS4Y1-7:1 ; gene_alias_1 XLOC_008271 ; gene_alias_2 linc-CSF2RA-2 ; gene_alias_3 ENSGR0000237531.1 ; gene_alias_4 RP11-309M23.1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000021054.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017600 ; transcript_alias_2 ENSTR0000420865.1 ; transcript_alias_3 RP11-309M23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000055588.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	48193110	48193199	.	-	.	gene_id lnc-SSX3-1 ; transcript_id lnc-SSX3-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008157 ; gene_alias_2 linc-SSX5-1 ; gene_alias_3 ENSG00000230100 ; gene_alias_4 RP11-344N17.8 ; gene_alias_5 ENSG00000230100.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021486.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017057 ; transcript_alias_2 ENST00000422410 ; transcript_alias_3 ENST00000422410.1 ; transcript_alias_4 RP11-344N17.8-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000056483.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	48193695	48193874	.	-	.	gene_id lnc-SSX3-1 ; transcript_id lnc-SSX3-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008157 ; gene_alias_2 linc-SSX5-1 ; gene_alias_3 ENSG00000230100 ; gene_alias_4 RP11-344N17.8 ; gene_alias_5 ENSG00000230100.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021486.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017057 ; transcript_alias_2 ENST00000422410 ; transcript_alias_3 ENST00000422410.1 ; transcript_alias_4 RP11-344N17.8-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000056483.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	187981253	187981417	.	+	.	gene_id lnc-F11-4 ; transcript_id lnc-F11-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_003824 ; gene_alias_2 linc-ZFP42-8 ; gene_alias_3 ENSG00000250971 ; gene_alias_4 RP11-696F12.1 ; gene_alias_5 ENSG00000250971.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000160313.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00007691 ; transcript_alias_2 ENST00000507776 ; transcript_alias_3 ENST00000507776.1 ; transcript_alias_4 RP11-696F12.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000360171.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	187981829	187982084	.	+	.	gene_id lnc-F11-4 ; transcript_id lnc-F11-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_003824 ; gene_alias_2 linc-ZFP42-8 ; gene_alias_3 ENSG00000250971 ; gene_alias_4 RP11-696F12.1 ; gene_alias_5 ENSG00000250971.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000160313.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00007691 ; transcript_alias_2 ENST00000507776 ; transcript_alias_3 ENST00000507776.1 ; transcript_alias_4 RP11-696F12.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000360171.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	62814835	62814953	.	+	.	gene_id lnc-AC006455.1-2 ; transcript_id lnc-AC006455.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229301 ; gene_alias_2 RP5-905H7.8 ; gene_alias_3 ENSG00000229301.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000156273.1 ; transcript_alias_1 ENST00000418297 ; transcript_alias_2 ENST00000418297.1 ; transcript_alias_3 RP5-905H7.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000343682.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	62815523	62815687	.	+	.	gene_id lnc-AC006455.1-2 ; transcript_id lnc-AC006455.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229301 ; gene_alias_2 RP5-905H7.8 ; gene_alias_3 ENSG00000229301.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000156273.1 ; transcript_alias_1 ENST00000418297 ; transcript_alias_2 ENST00000418297.1 ; transcript_alias_3 RP5-905H7.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000343682.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	62819441	62819684	.	+	.	gene_id lnc-AC006455.1-2 ; transcript_id lnc-AC006455.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229301 ; gene_alias_2 RP5-905H7.8 ; gene_alias_3 ENSG00000229301.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000156273.1 ; transcript_alias_1 ENST00000418297 ; transcript_alias_2 ENST00000418297.1 ; transcript_alias_3 RP5-905H7.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000343682.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	90562780	90562931	.	+	.	gene_id lnc-PABPC5-1 ; transcript_id lnc-PABPC5-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000206062 ; gene_alias_2 RP13-212L9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000206062.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021958.1 ; transcript_alias_1 ENST00000418369 ; transcript_alias_2 ENST00000418369.1 ; transcript_alias_3 RP13-212L9.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057428.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	90563289	90563877	.	+	.	gene_id lnc-PABPC5-1 ; transcript_id lnc-PABPC5-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000206062 ; gene_alias_2 RP13-212L9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000206062.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021958.1 ; transcript_alias_1 ENST00000418369 ; transcript_alias_2 ENST00000418369.1 ; transcript_alias_3 RP13-212L9.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057428.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	64241814	64241972	.	-	.	gene_id lnc-PCDH20-9 ; transcript_id lnc-PCDH20-9:3 ; gene_alias_1 XLOC_010643 ; gene_alias_2 linc-PCDH20-8 ; gene_alias_3 ENSG00000231061.1 ; gene_alias_4 LINC00395 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000017022.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00021666 ; transcript_alias_2 ENST00000444536.1 ; transcript_alias_3 LINC00395-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000045196.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	64261535	64261688	.	-	.	gene_id lnc-PCDH20-9 ; transcript_id lnc-PCDH20-9:3 ; gene_alias_1 XLOC_010643 ; gene_alias_2 linc-PCDH20-8 ; gene_alias_3 ENSG00000231061.1 ; gene_alias_4 LINC00395 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000017022.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00021666 ; transcript_alias_2 ENST00000444536.1 ; transcript_alias_3 LINC00395-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000045196.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	64288485	64288508	.	-	.	gene_id lnc-PCDH20-9 ; transcript_id lnc-PCDH20-9:3 ; gene_alias_1 XLOC_010643 ; gene_alias_2 linc-PCDH20-8 ; gene_alias_3 ENSG00000231061.1 ; gene_alias_4 LINC00395 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000017022.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00021666 ; transcript_alias_2 ENST00000444536.1 ; transcript_alias_3 LINC00395-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000045196.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	64291083	64291151	.	-	.	gene_id lnc-PCDH20-9 ; transcript_id lnc-PCDH20-9:3 ; gene_alias_1 XLOC_010643 ; gene_alias_2 linc-PCDH20-8 ; gene_alias_3 ENSG00000231061.1 ; gene_alias_4 LINC00395 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000017022.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00021666 ; transcript_alias_2 ENST00000444536.1 ; transcript_alias_3 LINC00395-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000045196.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101379721	101379858	.	+	.	gene_id lnc-DLK1-6 ; transcript_id lnc-DLK1-6:8 ; gene_alias_1 ENSG00000258399 ; gene_alias_2 RP11-909M7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258399.1 ; gene_alias_4 MEG8 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000171625.1 ; transcript_alias_1 ENST00000553421 ; transcript_alias_2 ENST00000553421.1 ; transcript_alias_3 MEG8-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414504.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101381009	101381309	.	+	.	gene_id lnc-DLK1-6 ; transcript_id lnc-DLK1-6:8 ; gene_alias_1 ENSG00000258399 ; gene_alias_2 RP11-909M7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258399.1 ; gene_alias_4 MEG8 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000171625.1 ; transcript_alias_1 ENST00000553421 ; transcript_alias_2 ENST00000553421.1 ; transcript_alias_3 MEG8-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414504.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	50257750	50258088	.	+	.	gene_id lnc-OR4C13-1 ; transcript_id lnc-OR4C13-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254518 ; gene_alias_2 RP11-347H15.4 ; gene_alias_3 ENSG00000254518.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166692.1 ; transcript_alias_1 ENST00000525654 ; transcript_alias_2 ENST00000525654.1 ; transcript_alias_3 RP11-347H15.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391114.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	50261115	50261299	.	+	.	gene_id lnc-OR4C13-1 ; transcript_id lnc-OR4C13-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254518 ; gene_alias_2 RP11-347H15.4 ; gene_alias_3 ENSG00000254518.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166692.1 ; transcript_alias_1 ENST00000525654 ; transcript_alias_2 ENST00000525654.1 ; transcript_alias_3 RP11-347H15.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391114.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	86118038	86118328	.	+	.	gene_id lnc-ATOH8-2 ; transcript_id lnc-ATOH8-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000232504 ; gene_alias_2 AC105053.4 ; gene_alias_3 ENSG00000232504.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153169.4 ; transcript_alias_1 ENST00000524693 ; transcript_alias_2 ENST00000524693.1 ; transcript_alias_3 AC105053.4-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000388865.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	86118814	86118990	.	+	.	gene_id lnc-ATOH8-2 ; transcript_id lnc-ATOH8-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000232504 ; gene_alias_2 AC105053.4 ; gene_alias_3 ENSG00000232504.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153169.4 ; transcript_alias_1 ENST00000524693 ; transcript_alias_2 ENST00000524693.1 ; transcript_alias_3 AC105053.4-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000388865.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	149114564	149114817	.	+	.	gene_id lnc-MAGEA8-2 ; transcript_id lnc-MAGEA8-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000235703 ; gene_alias_2 RP13-507I23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000235703.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022638.4 ; transcript_alias_1 ENST00000432696 ; transcript_alias_2 ENST00000432696.1 ; transcript_alias_3 RP13-507I23.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000080679.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	149115392	149115435	.	+	.	gene_id lnc-MAGEA8-2 ; transcript_id lnc-MAGEA8-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000235703 ; gene_alias_2 RP13-507I23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000235703.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022638.4 ; transcript_alias_1 ENST00000432696 ; transcript_alias_2 ENST00000432696.1 ; transcript_alias_3 RP13-507I23.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000080679.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	35930009	35930131	.	+	.	gene_id lnc-HRCT1-3 ; transcript_id lnc-HRCT1-3:3 ; gene_alias_1 XLOC_007342 ; gene_alias_2 linc-RECK-2 ; gene_alias_3 ENSG00000231518.1 ; gene_alias_4 RP11-327L3.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000019888.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015665 ; transcript_alias_2 ENST00000433838.1 ; transcript_alias_3 RP11-327L3.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000052397.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	35935704	35935802	.	+	.	gene_id lnc-HRCT1-3 ; transcript_id lnc-HRCT1-3:3 ; gene_alias_1 XLOC_007342 ; gene_alias_2 linc-RECK-2 ; gene_alias_3 ENSG00000231518.1 ; gene_alias_4 RP11-327L3.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000019888.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015665 ; transcript_alias_2 ENST00000433838.1 ; transcript_alias_3 RP11-327L3.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000052397.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	35937014	35937148	.	+	.	gene_id lnc-HRCT1-3 ; transcript_id lnc-HRCT1-3:3 ; gene_alias_1 XLOC_007342 ; gene_alias_2 linc-RECK-2 ; gene_alias_3 ENSG00000231518.1 ; gene_alias_4 RP11-327L3.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000019888.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015665 ; transcript_alias_2 ENST00000433838.1 ; transcript_alias_3 RP11-327L3.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000052397.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	26631479	26631538	.	+	.	gene_id lnc-BPY2B-2 ; transcript_id lnc-BPY2B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227439 ; gene_alias_2 TTTY17B ; gene_alias_3 ENSG00000227439.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000046228.1 ; transcript_alias_1 ENST00000441906 ; transcript_alias_2 ENST00000441906.1 ; transcript_alias_3 TTTY17B-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000106564.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	26632505	26632610	.	+	.	gene_id lnc-BPY2B-2 ; transcript_id lnc-BPY2B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227439 ; gene_alias_2 TTTY17B ; gene_alias_3 ENSG00000227439.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000046228.1 ; transcript_alias_1 ENST00000441906 ; transcript_alias_2 ENST00000441906.1 ; transcript_alias_3 TTTY17B-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000106564.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	49144775	49144977	.	-	.	gene_id lnc-RCBTB2-2 ; transcript_id lnc-RCBTB2-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_010606 ; gene_alias_2 linc-RCBTB2-2 ; gene_alias_3 ENSG00000233456 ; gene_alias_4 RP11-165D7.3 ; gene_alias_5 ENSG00000233456.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000016904.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00021650 ; transcript_alias_2 ENST00000452288 ; transcript_alias_3 ENST00000452288.1 ; transcript_alias_4 RP11-165D7.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000044892.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	49147244	49147453	.	-	.	gene_id lnc-RCBTB2-2 ; transcript_id lnc-RCBTB2-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_010606 ; gene_alias_2 linc-RCBTB2-2 ; gene_alias_3 ENSG00000233456 ; gene_alias_4 RP11-165D7.3 ; gene_alias_5 ENSG00000233456.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000016904.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00021650 ; transcript_alias_2 ENST00000452288 ; transcript_alias_3 ENST00000452288.1 ; transcript_alias_4 RP11-165D7.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000044892.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	35923859	35924004	.	-	.	gene_id lnc-KRTDAP-1 ; transcript_id lnc-KRTDAP-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_013318 ; gene_alias_2 linc-FAM187B-2 ; gene_alias_3 ENSG00000232680.1 ; gene_alias_4 AC002511.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000048097.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00026848 ; transcript_alias_2 ENST00000428426.1 ; transcript_alias_3 AC002511.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000109455.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	35924491	35924720	.	-	.	gene_id lnc-KRTDAP-1 ; transcript_id lnc-KRTDAP-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_013318 ; gene_alias_2 linc-FAM187B-2 ; gene_alias_3 ENSG00000232680.1 ; gene_alias_4 AC002511.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000048097.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00026848 ; transcript_alias_2 ENST00000428426.1 ; transcript_alias_3 AC002511.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000109455.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	73374546	73374639	.	+	.	gene_id lnc-KCNB2-2 ; transcript_id lnc-KCNB2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254347 ; gene_alias_2 RP11-351E7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000254347.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164459.1 ; transcript_alias_1 ENST00000521224 ; transcript_alias_2 ENST00000521224.1 ; transcript_alias_3 RP11-351E7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000378872.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	73383050	73383207	.	+	.	gene_id lnc-KCNB2-2 ; transcript_id lnc-KCNB2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254347 ; gene_alias_2 RP11-351E7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000254347.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164459.1 ; transcript_alias_1 ENST00000521224 ; transcript_alias_2 ENST00000521224.1 ; transcript_alias_3 RP11-351E7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000378872.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	63488443	63488788	.	-	.	gene_id lnc-ZNF680-3 ; transcript_id lnc-ZNF680-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_006468 ; gene_alias_2 linc-ZNF479-7 ; gene_alias_3 ENSG00000228564.1 ; gene_alias_4 RP11-3N2.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156482.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013182 ; transcript_alias_2 ENST00000451440.1 ; transcript_alias_3 RP11-3N2.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000344313.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	63489664	63489739	.	-	.	gene_id lnc-ZNF680-3 ; transcript_id lnc-ZNF680-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_006468 ; gene_alias_2 linc-ZNF479-7 ; gene_alias_3 ENSG00000228564.1 ; gene_alias_4 RP11-3N2.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156482.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013182 ; transcript_alias_2 ENST00000451440.1 ; transcript_alias_3 RP11-3N2.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000344313.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	63490375	63490483	.	-	.	gene_id lnc-ZNF680-3 ; transcript_id lnc-ZNF680-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_006468 ; gene_alias_2 linc-ZNF479-7 ; gene_alias_3 ENSG00000228564.1 ; gene_alias_4 RP11-3N2.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156482.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013182 ; transcript_alias_2 ENST00000451440.1 ; transcript_alias_3 RP11-3N2.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000344313.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	123184411	123184501	.	-	.	gene_id lnc-CLMP-2 ; transcript_id lnc-CLMP-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000254823 ; gene_alias_2 RP11-109E10.1 ; gene_alias_3 ENSG00000254823.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166000.1 ; transcript_alias_1 ENST00000527774 ; transcript_alias_2 ENST00000527774.1 ; transcript_alias_3 RP11-109E10.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000387399.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	123185029	123185106	.	-	.	gene_id lnc-CLMP-2 ; transcript_id lnc-CLMP-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000254823 ; gene_alias_2 RP11-109E10.1 ; gene_alias_3 ENSG00000254823.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166000.1 ; transcript_alias_1 ENST00000527774 ; transcript_alias_2 ENST00000527774.1 ; transcript_alias_3 RP11-109E10.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000387399.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	123185200	123185475	.	-	.	gene_id lnc-CLMP-2 ; transcript_id lnc-CLMP-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000254823 ; gene_alias_2 RP11-109E10.1 ; gene_alias_3 ENSG00000254823.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166000.1 ; transcript_alias_1 ENST00000527774 ; transcript_alias_2 ENST00000527774.1 ; transcript_alias_3 RP11-109E10.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000387399.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	111463650	111463721	.	+	.	gene_id lnc-ACTL7A-1 ; transcript_id lnc-ACTL7A-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007515 ; gene_alias_2 linc-ACTL7A-1 ; gene_alias_3 ENSG00000231678 ; gene_alias_4 RP11-339N8.1 ; gene_alias_5 ENSG00000231678.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000020459.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015734 ; transcript_alias_2 ENST00000415465 ; transcript_alias_3 ENST00000415465.1 ; transcript_alias_4 RP11-339N8.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000053568.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	111465048	111465372	.	+	.	gene_id lnc-ACTL7A-1 ; transcript_id lnc-ACTL7A-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007515 ; gene_alias_2 linc-ACTL7A-1 ; gene_alias_3 ENSG00000231678 ; gene_alias_4 RP11-339N8.1 ; gene_alias_5 ENSG00000231678.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000020459.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015734 ; transcript_alias_2 ENST00000415465 ; transcript_alias_3 ENST00000415465.1 ; transcript_alias_4 RP11-339N8.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000053568.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	102024890	102025171	.	-	.	gene_id lnc-HSP90AA1-9 ; transcript_id lnc-HSP90AA1-9:9 ; gene_alias_1 ENSG00000258498 ; gene_alias_2 DIO3OS ; gene_alias_3 ENSG00000258498.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171682.1 ; transcript_alias_1 ENST00000555882 ; transcript_alias_2 ENST00000555882.1 ; transcript_alias_3 DIO3OS-015 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414735.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	102026137	102026643	.	-	.	gene_id lnc-HSP90AA1-9 ; transcript_id lnc-HSP90AA1-9:9 ; gene_alias_1 ENSG00000258498 ; gene_alias_2 DIO3OS ; gene_alias_3 ENSG00000258498.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171682.1 ; transcript_alias_1 ENST00000555882 ; transcript_alias_2 ENST00000555882.1 ; transcript_alias_3 DIO3OS-015 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414735.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	231725	231983	.	+	.	gene_id lnc-RPS4Y1-8 ; transcript_id lnc-RPS4Y1-8:2 ; gene_alias_1 XLOC_008270 ; gene_alias_2 linc-SHOX-5 ; gene_alias_3 ENSGR0000226179.1 ; gene_alias_4 PPP2R3B-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000021049.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017599 ; transcript_alias_2 ENSTR0000391707.2 ; transcript_alias_3 PPP2R3B-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000055574.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	232418	232586	.	+	.	gene_id lnc-RPS4Y1-8 ; transcript_id lnc-RPS4Y1-8:2 ; gene_alias_1 XLOC_008270 ; gene_alias_2 linc-SHOX-5 ; gene_alias_3 ENSGR0000226179.1 ; gene_alias_4 PPP2R3B-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000021049.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017599 ; transcript_alias_2 ENSTR0000391707.2 ; transcript_alias_3 PPP2R3B-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000055574.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	27329790	27329895	.	-	.	gene_id lnc-BPY2C-2 ; transcript_id lnc-BPY2C-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223641 ; gene_alias_2 TTTY17C ; gene_alias_3 ENSG00000223641.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000045207.1 ; transcript_alias_1 ENST00000421387 ; transcript_alias_2 ENST00000421387.1 ; transcript_alias_3 TTTY17C-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000104952.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	27330861	27330920	.	-	.	gene_id lnc-BPY2C-2 ; transcript_id lnc-BPY2C-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223641 ; gene_alias_2 TTTY17C ; gene_alias_3 ENSG00000223641.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000045207.1 ; transcript_alias_1 ENST00000421387 ; transcript_alias_2 ENST00000421387.1 ; transcript_alias_3 TTTY17C-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000104952.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101798853	101799200	.	-	.	gene_id lnc-RTL1-5 ; transcript_id lnc-RTL1-5:3 ; gene_alias_1 ENSG00000258460 ; gene_alias_2 RP11-168L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258460.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171678.1 ; transcript_alias_1 ENST00000553561 ; transcript_alias_2 ENST00000553561.1 ; transcript_alias_3 RP11-168L7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414716.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101800570	101800668	.	-	.	gene_id lnc-RTL1-5 ; transcript_id lnc-RTL1-5:3 ; gene_alias_1 ENSG00000258460 ; gene_alias_2 RP11-168L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258460.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171678.1 ; transcript_alias_1 ENST00000553561 ; transcript_alias_2 ENST00000553561.1 ; transcript_alias_3 RP11-168L7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414716.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	78902603	78902837	.	+	.	gene_id lnc-USP35-7 ; transcript_id lnc-USP35-7:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254885 ; gene_alias_2 RP11-802F5.1 ; gene_alias_3 ENSG00000254885.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166785.1 ; transcript_alias_1 ENST00000527440 ; transcript_alias_2 ENST00000527440.1 ; transcript_alias_3 RP11-802F5.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391458.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	78904067	78904205	.	+	.	gene_id lnc-USP35-7 ; transcript_id lnc-USP35-7:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254885 ; gene_alias_2 RP11-802F5.1 ; gene_alias_3 ENSG00000254885.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166785.1 ; transcript_alias_1 ENST00000527440 ; transcript_alias_2 ENST00000527440.1 ; transcript_alias_3 RP11-802F5.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391458.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	87769469	87769561	.	+	.	gene_id lnc-PLGLB2-1 ; transcript_id lnc-PLGLB2-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000222041 ; gene_alias_2 NCRNA00152 ; gene_alias_3 ENSG00000222041.5 ; gene_alias_4 LINC00152 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000130273.9 ; transcript_alias_1 ENST00000437561 ; transcript_alias_2 ENST00000437561.1 ; transcript_alias_3 LINC00152-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330391.2 ;
chr2	lncipedia.org	exon	87769669	87769823	.	+	.	gene_id lnc-PLGLB2-1 ; transcript_id lnc-PLGLB2-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000222041 ; gene_alias_2 NCRNA00152 ; gene_alias_3 ENSG00000222041.5 ; gene_alias_4 LINC00152 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000130273.9 ; transcript_alias_1 ENST00000437561 ; transcript_alias_2 ENST00000437561.1 ; transcript_alias_3 LINC00152-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330391.2 ;
chr2	lncipedia.org	exon	87820726	87820932	.	+	.	gene_id lnc-PLGLB2-1 ; transcript_id lnc-PLGLB2-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000222041 ; gene_alias_2 NCRNA00152 ; gene_alias_3 ENSG00000222041.5 ; gene_alias_4 LINC00152 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000130273.9 ; transcript_alias_1 ENST00000437561 ; transcript_alias_2 ENST00000437561.1 ; transcript_alias_3 LINC00152-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330391.2 ;
chr2	lncipedia.org	exon	242989846	242989914	.	-	.	gene_id lnc-AC131097.4.1-3 ; transcript_id lnc-AC131097.4.1-3:6 ; gene_alias_1 XLOC_002560 ; gene_alias_2 linc-PDCD1-4 ; gene_alias_3 ENSG00000232002 ; gene_alias_4 AC093642.6 ; gene_alias_5 ENSG00000232002.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151385.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003524 ; transcript_alias_2 ENST00000446593 ; transcript_alias_3 ENST00000446593.1 ; transcript_alias_4 AC093642.6-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000322442.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	242990209	242990434	.	-	.	gene_id lnc-AC131097.4.1-3 ; transcript_id lnc-AC131097.4.1-3:6 ; gene_alias_1 XLOC_002560 ; gene_alias_2 linc-PDCD1-4 ; gene_alias_3 ENSG00000232002 ; gene_alias_4 AC093642.6 ; gene_alias_5 ENSG00000232002.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151385.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003524 ; transcript_alias_2 ENST00000446593 ; transcript_alias_3 ENST00000446593.1 ; transcript_alias_4 AC093642.6-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000322442.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	243002448	243002670	.	-	.	gene_id lnc-AC131097.4.1-3 ; transcript_id lnc-AC131097.4.1-3:6 ; gene_alias_1 XLOC_002560 ; gene_alias_2 linc-PDCD1-4 ; gene_alias_3 ENSG00000232002 ; gene_alias_4 AC093642.6 ; gene_alias_5 ENSG00000232002.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151385.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003524 ; transcript_alias_2 ENST00000446593 ; transcript_alias_3 ENST00000446593.1 ; transcript_alias_4 AC093642.6-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000322442.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	243026247	243026289	.	-	.	gene_id lnc-AC131097.4.1-3 ; transcript_id lnc-AC131097.4.1-3:6 ; gene_alias_1 XLOC_002560 ; gene_alias_2 linc-PDCD1-4 ; gene_alias_3 ENSG00000232002 ; gene_alias_4 AC093642.6 ; gene_alias_5 ENSG00000232002.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151385.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003524 ; transcript_alias_2 ENST00000446593 ; transcript_alias_3 ENST00000446593.1 ; transcript_alias_4 AC093642.6-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000322442.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	33769904	33770230	.	-	.	gene_id lnc-RP9-1 ; transcript_id lnc-RP9-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_006403 ; gene_alias_2 linc-RP9-1 ; gene_alias_3 ENSG00000227481.1 ; gene_alias_4 RP11-89N17.2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156242.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013151 ; transcript_alias_2 ENST00000455149.1 ; transcript_alias_3 RP11-89N17.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000343604.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	33771427	33771676	.	-	.	gene_id lnc-RP9-1 ; transcript_id lnc-RP9-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_006403 ; gene_alias_2 linc-RP9-1 ; gene_alias_3 ENSG00000227481.1 ; gene_alias_4 RP11-89N17.2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156242.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013151 ; transcript_alias_2 ENST00000455149.1 ; transcript_alias_3 RP11-89N17.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000343604.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	155059009	155059070	.	+	.	gene_id lnc-INSIG1-1 ; transcript_id lnc-INSIG1-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_006304 ; gene_alias_2 linc-INSIG1-1 ; gene_alias_3 ENSG00000225612 ; gene_alias_4 AC099552.2 ; gene_alias_5 ENSG00000225612.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151328.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013101 ; transcript_alias_2 ENST00000418523 ; transcript_alias_3 ENST00000418523.1 ; transcript_alias_4 AC099552.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000322242.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	155059238	155059499	.	+	.	gene_id lnc-INSIG1-1 ; transcript_id lnc-INSIG1-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_006304 ; gene_alias_2 linc-INSIG1-1 ; gene_alias_3 ENSG00000225612 ; gene_alias_4 AC099552.2 ; gene_alias_5 ENSG00000225612.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151328.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013101 ; transcript_alias_2 ENST00000418523 ; transcript_alias_3 ENST00000418523.1 ; transcript_alias_4 AC099552.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000322242.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	155059631	155059762	.	+	.	gene_id lnc-INSIG1-1 ; transcript_id lnc-INSIG1-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_006304 ; gene_alias_2 linc-INSIG1-1 ; gene_alias_3 ENSG00000225612 ; gene_alias_4 AC099552.2 ; gene_alias_5 ENSG00000225612.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151328.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013101 ; transcript_alias_2 ENST00000418523 ; transcript_alias_3 ENST00000418523.1 ; transcript_alias_4 AC099552.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000322242.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	22716574	22716681	.	+	.	gene_id lnc-DDX53-1 ; transcript_id lnc-DDX53-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007943 ; gene_alias_2 linc-DDX53 ; gene_alias_3 ENSG00000237019 ; gene_alias_4 GS1-433O24.1 ; gene_alias_5 ENSG00000237019.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021246.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00016972 ; transcript_alias_2 ENST00000442155 ; transcript_alias_3 ENST00000442155.1 ; transcript_alias_4 GS1-433O24.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000056041.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	22786810	22787083	.	+	.	gene_id lnc-DDX53-1 ; transcript_id lnc-DDX53-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007943 ; gene_alias_2 linc-DDX53 ; gene_alias_3 ENSG00000237019 ; gene_alias_4 GS1-433O24.1 ; gene_alias_5 ENSG00000237019.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021246.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00016972 ; transcript_alias_2 ENST00000442155 ; transcript_alias_3 ENST00000442155.1 ; transcript_alias_4 GS1-433O24.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000056041.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	81564241	81564283	.	-	.	gene_id lnc-SFTPD-2 ; transcript_id lnc-SFTPD-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000225484 ; gene_alias_2 RP11-773D16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000225484.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018585.1 ; transcript_alias_1 ENST00000488805 ; transcript_alias_2 ENST00000488805.1 ; transcript_alias_3 RP11-773D16.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000048999.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	81568515	81568588	.	-	.	gene_id lnc-SFTPD-2 ; transcript_id lnc-SFTPD-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000225484 ; gene_alias_2 RP11-773D16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000225484.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018585.1 ; transcript_alias_1 ENST00000488805 ; transcript_alias_2 ENST00000488805.1 ; transcript_alias_3 RP11-773D16.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000048999.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	81574369	81574472	.	-	.	gene_id lnc-SFTPD-2 ; transcript_id lnc-SFTPD-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000225484 ; gene_alias_2 RP11-773D16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000225484.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018585.1 ; transcript_alias_1 ENST00000488805 ; transcript_alias_2 ENST00000488805.1 ; transcript_alias_3 RP11-773D16.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000048999.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	81585954	81586160	.	-	.	gene_id lnc-SFTPD-2 ; transcript_id lnc-SFTPD-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000225484 ; gene_alias_2 RP11-773D16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000225484.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018585.1 ; transcript_alias_1 ENST00000488805 ; transcript_alias_2 ENST00000488805.1 ; transcript_alias_3 RP11-773D16.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000048999.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	144362882	144363167	.	-	.	gene_id lnc-TOP1MT-2 ; transcript_id lnc-TOP1MT-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_007249 ; gene_alias_2 linc-LY6H ; transcript_alias_1 TCONS_00015190 ;
chr8	lncipedia.org	exon	144363652	144363898	.	-	.	gene_id lnc-TOP1MT-2 ; transcript_id lnc-TOP1MT-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_007249 ; gene_alias_2 linc-LY6H ; transcript_alias_1 TCONS_00015190 ;
chr16	lncipedia.org	exon	73798065	73798086	.	+	.	gene_id lnc-RP11-44L9.1.1-7 ; transcript_id lnc-RP11-44L9.1.1-7:1 ; gene_alias_1 XLOC_011785 ; gene_alias_2 linc-PSMD7-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00024463 ;
chr16	lncipedia.org	exon	73800298	73800568	.	+	.	gene_id lnc-RP11-44L9.1.1-7 ; transcript_id lnc-RP11-44L9.1.1-7:1 ; gene_alias_1 XLOC_011785 ; gene_alias_2 linc-PSMD7-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00024463 ;
chr16	lncipedia.org	exon	73802144	73802501	.	+	.	gene_id lnc-RP11-44L9.1.1-7 ; transcript_id lnc-RP11-44L9.1.1-7:1 ; gene_alias_1 XLOC_011785 ; gene_alias_2 linc-PSMD7-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00024463 ;
chr11	lncipedia.org	exon	44540875	44540981	.	-	.	gene_id lnc-ALX4-1 ; transcript_id lnc-ALX4-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_009426 ; gene_alias_2 linc-ALX4-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00019625 ;
chr11	lncipedia.org	exon	44542221	44542479	.	-	.	gene_id lnc-ALX4-1 ; transcript_id lnc-ALX4-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_009426 ; gene_alias_2 linc-ALX4-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00019625 ;
chr10	lncipedia.org	exon	77039484	77039669	.	-	.	gene_id lnc-ZNF503-1 ; transcript_id lnc-ZNF503-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008859 ; gene_alias_2 linc-COMTD1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017997 ;
chr10	lncipedia.org	exon	77039816	77039878	.	-	.	gene_id lnc-ZNF503-1 ; transcript_id lnc-ZNF503-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008859 ; gene_alias_2 linc-COMTD1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017997 ;
chr10	lncipedia.org	exon	77043031	77043129	.	-	.	gene_id lnc-ZNF503-1 ; transcript_id lnc-ZNF503-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008859 ; gene_alias_2 linc-COMTD1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017997 ;
chr1	lncipedia.org	exon	116473512	116473604	.	+	.	gene_id lnc-SLC22A15-1 ; transcript_id lnc-SLC22A15-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_000361 ; gene_alias_2 linc-SLC22A15-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00001115 ;
chr1	lncipedia.org	exon	116473936	116474136	.	+	.	gene_id lnc-SLC22A15-1 ; transcript_id lnc-SLC22A15-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_000361 ; gene_alias_2 linc-SLC22A15-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00001115 ;
chr10	lncipedia.org	exon	47571665	47571885	.	+	.	gene_id lnc-ANTXRL-3 ; transcript_id lnc-ANTXRL-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_008479 ; gene_alias_2 linc-ANXA8L2-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00018197 ;
chr10	lncipedia.org	exon	47575601	47575852	.	+	.	gene_id lnc-ANTXRL-3 ; transcript_id lnc-ANTXRL-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_008479 ; gene_alias_2 linc-ANXA8L2-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00018197 ;
chr17	lncipedia.org	exon	75663172	75663270	.	+	.	gene_id lnc-SEPT9-4 ; transcript_id lnc-SEPT9-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_012318 ; gene_alias_2 linc-TNRC6C-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00025508 ;
chr17	lncipedia.org	exon	75663542	75663808	.	+	.	gene_id lnc-SEPT9-4 ; transcript_id lnc-SEPT9-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_012318 ; gene_alias_2 linc-TNRC6C-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00025508 ;
chr2	lncipedia.org	exon	20725917	20726231	.	-	.	gene_id lnc-HS1BP3-1 ; transcript_id lnc-HS1BP3-1:10 ; gene_alias_1 XLOC_002010 ; gene_alias_2 linc-PUM2-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00005099 ;
chr2	lncipedia.org	exon	20728437	20728507	.	-	.	gene_id lnc-HS1BP3-1 ; transcript_id lnc-HS1BP3-1:10 ; gene_alias_1 XLOC_002010 ; gene_alias_2 linc-PUM2-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00005099 ;
chr15	lncipedia.org	exon	20505566	20505803	.	+	.	gene_id lnc-OR4M2-7 ; transcript_id lnc-OR4M2-7:1 ; gene_alias_1 XLOC_011157 ; gene_alias_2 linc-OR4M2-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00023846 ;
chr15	lncipedia.org	exon	20506666	20506793	.	+	.	gene_id lnc-OR4M2-7 ; transcript_id lnc-OR4M2-7:1 ; gene_alias_1 XLOC_011157 ; gene_alias_2 linc-OR4M2-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00023846 ;
chr15	lncipedia.org	exon	20529998	20530156	.	+	.	gene_id lnc-OR4M2-7 ; transcript_id lnc-OR4M2-7:1 ; gene_alias_1 XLOC_011157 ; gene_alias_2 linc-OR4M2-5 ; transcript_alias_1 TCONS_00023846 ;
chr9	lncipedia.org	exon	69174514	69174523	.	-	.	gene_id lnc-FOXD4L6-1 ; transcript_id lnc-FOXD4L6-1:14 ; gene_alias_1 XLOC_007714 ; gene_alias_2 linc-FAM75A7-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00016786 ;
chr9	lncipedia.org	exon	69175692	69175760	.	-	.	gene_id lnc-FOXD4L6-1 ; transcript_id lnc-FOXD4L6-1:14 ; gene_alias_1 XLOC_007714 ; gene_alias_2 linc-FAM75A7-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00016786 ;
chr9	lncipedia.org	exon	69175960	69176070	.	-	.	gene_id lnc-FOXD4L6-1 ; transcript_id lnc-FOXD4L6-1:14 ; gene_alias_1 XLOC_007714 ; gene_alias_2 linc-FAM75A7-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00016786 ;
chr9	lncipedia.org	exon	69176914	69177107	.	-	.	gene_id lnc-FOXD4L6-1 ; transcript_id lnc-FOXD4L6-1:14 ; gene_alias_1 XLOC_007714 ; gene_alias_2 linc-FAM75A7-8 ; transcript_alias_1 TCONS_00016786 ;
chr21	lncipedia.org	exon	16049036	16049401	.	-	.	gene_id lnc-AF165138.7.1-2 ; transcript_id lnc-AF165138.7.1-2:3 ; gene_alias_1 XLOC_014001 ; gene_alias_2 linc-SAMSN1-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00029078 ;
chr21	lncipedia.org	exon	16125645	16125734	.	-	.	gene_id lnc-AF165138.7.1-2 ; transcript_id lnc-AF165138.7.1-2:3 ; gene_alias_1 XLOC_014001 ; gene_alias_2 linc-SAMSN1-4 ; transcript_alias_1 TCONS_00029078 ;
chr7	lncipedia.org	exon	63488182	63488290	.	-	.	gene_id lnc-ZNF680-3 ; transcript_id lnc-ZNF680-3:3 ; gene_alias_1 XLOC_006468 ; gene_alias_2 linc-ZNF479-7 ; transcript_alias_1 TCONS_00013825 ;
chr7	lncipedia.org	exon	63488569	63488788	.	-	.	gene_id lnc-ZNF680-3 ; transcript_id lnc-ZNF680-3:3 ; gene_alias_1 XLOC_006468 ; gene_alias_2 linc-ZNF479-7 ; transcript_alias_1 TCONS_00013825 ;
chr7	lncipedia.org	exon	63489664	63489756	.	-	.	gene_id lnc-ZNF680-3 ; transcript_id lnc-ZNF680-3:3 ; gene_alias_1 XLOC_006468 ; gene_alias_2 linc-ZNF479-7 ; transcript_alias_1 TCONS_00013825 ;
chr7	lncipedia.org	exon	154995524	154995645	.	+	.	gene_id lnc-INSIG1-3 ; transcript_id lnc-INSIG1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_006302 ; gene_alias_2 linc-INSIG1-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00013648 ;
chr7	lncipedia.org	exon	154995947	154996073	.	+	.	gene_id lnc-INSIG1-3 ; transcript_id lnc-INSIG1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_006302 ; gene_alias_2 linc-INSIG1-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00013648 ;
chr7	lncipedia.org	exon	154996750	154996760	.	+	.	gene_id lnc-INSIG1-3 ; transcript_id lnc-INSIG1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_006302 ; gene_alias_2 linc-INSIG1-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00013648 ;
chr12	lncipedia.org	exon	32111689	32111738	.	-	.	gene_id lnc-H3F3C-3 ; transcript_id lnc-H3F3C-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_010047 ; gene_alias_2 linc-H3F3C-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00021299 ;
chr12	lncipedia.org	exon	32112062	32112260	.	-	.	gene_id lnc-H3F3C-3 ; transcript_id lnc-H3F3C-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_010047 ; gene_alias_2 linc-H3F3C-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00021299 ;
chr15	lncipedia.org	exon	77991686	77991763	.	+	.	gene_id lnc-HMG20A-5 ; transcript_id lnc-HMG20A-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_011316 ; gene_alias_2 linc-SH2D7-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00023984 ;
chr15	lncipedia.org	exon	77991916	77991946	.	+	.	gene_id lnc-HMG20A-5 ; transcript_id lnc-HMG20A-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_011316 ; gene_alias_2 linc-SH2D7-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00023984 ;
chr15	lncipedia.org	exon	77992011	77992117	.	+	.	gene_id lnc-HMG20A-5 ; transcript_id lnc-HMG20A-5:1 ; gene_alias_1 XLOC_011316 ; gene_alias_2 linc-SH2D7-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00023984 ;
chr21	lncipedia.org	exon	46419362	46419571	.	-	.	gene_id lnc-C21orf67-4 ; transcript_id lnc-C21orf67-4:3 ; gene_alias_1 XLOC_014121 ; gene_alias_2 linc-ITGB2-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00029315 ;
chr21	lncipedia.org	exon	46420306	46420332	.	-	.	gene_id lnc-C21orf67-4 ; transcript_id lnc-C21orf67-4:3 ; gene_alias_1 XLOC_014121 ; gene_alias_2 linc-ITGB2-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00029315 ;
chrX	lncipedia.org	exon	1691556	1691741	.	+	.	gene_id lnc-AKAP17A-1 ; transcript_id lnc-AKAP17A-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007913 ; gene_alias_2 linc-AKAP17A-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017120 ;
chrX	lncipedia.org	exon	1704576	1704599	.	+	.	gene_id lnc-AKAP17A-1 ; transcript_id lnc-AKAP17A-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007913 ; gene_alias_2 linc-AKAP17A-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017120 ;
chrX	lncipedia.org	exon	52942044	52942220	.	+	.	gene_id lnc-FAM156B-1 ; transcript_id lnc-FAM156B-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007985 ; gene_alias_2 linc-GPR173-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017174 ;
chrX	lncipedia.org	exon	52944007	52944043	.	+	.	gene_id lnc-FAM156B-1 ; transcript_id lnc-FAM156B-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007985 ; gene_alias_2 linc-GPR173-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017174 ;
chr15	lncipedia.org	exon	93325362	93325374	.	-	.	gene_id lnc-RGMA-2 ; transcript_id lnc-RGMA-2:3 ; gene_alias_1 XLOC_011586 ; gene_alias_2 linc-FAM174B ; transcript_alias_1 TCONS_00023792 ;
chr15	lncipedia.org	exon	93331194	93331758	.	-	.	gene_id lnc-RGMA-2 ; transcript_id lnc-RGMA-2:3 ; gene_alias_1 XLOC_011586 ; gene_alias_2 linc-FAM174B ; transcript_alias_1 TCONS_00023792 ;
chr4	lncipedia.org	exon	118282495	118282662	.	+	.	gene_id lnc-NDST3-5 ; transcript_id lnc-NDST3-5:4 ; gene_alias_1 XLOC_003658 ; gene_alias_2 linc-NDST3-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00008873 ;
chr4	lncipedia.org	exon	118292748	118292818	.	+	.	gene_id lnc-NDST3-5 ; transcript_id lnc-NDST3-5:4 ; gene_alias_1 XLOC_003658 ; gene_alias_2 linc-NDST3-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00008873 ;
chr4	lncipedia.org	exon	118293520	118293627	.	+	.	gene_id lnc-NDST3-5 ; transcript_id lnc-NDST3-5:4 ; gene_alias_1 XLOC_003658 ; gene_alias_2 linc-NDST3-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00008873 ;
chr4	lncipedia.org	exon	118293914	118293973	.	+	.	gene_id lnc-NDST3-5 ; transcript_id lnc-NDST3-5:4 ; gene_alias_1 XLOC_003658 ; gene_alias_2 linc-NDST3-3 ; transcript_alias_1 TCONS_00008873 ;
chr2	lncipedia.org	exon	78339185	78339226	.	+	.	gene_id lnc-REG3G-3 ; transcript_id lnc-REG3G-3:3 ; gene_alias_1 XLOC_001543 ; gene_alias_2 linc-REG3G-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00003746 ;
chr2	lncipedia.org	exon	78354625	78354877	.	+	.	gene_id lnc-REG3G-3 ; transcript_id lnc-REG3G-3:3 ; gene_alias_1 XLOC_001543 ; gene_alias_2 linc-REG3G-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00003746 ;
chr13	lncipedia.org	exon	50989225	50989338	.	+	.	gene_id lnc-RNASEH2B-3 ; transcript_id lnc-RNASEH2B-3:8 ; gene_alias_1 XLOC_010390 ; gene_alias_2 linc-RNASEH2B-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00021491 ;
chr13	lncipedia.org	exon	51007549	51007686	.	+	.	gene_id lnc-RNASEH2B-3 ; transcript_id lnc-RNASEH2B-3:8 ; gene_alias_1 XLOC_010390 ; gene_alias_2 linc-RNASEH2B-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00021491 ;
chr13	lncipedia.org	exon	51066787	51066897	.	+	.	gene_id lnc-RNASEH2B-3 ; transcript_id lnc-RNASEH2B-3:8 ; gene_alias_1 XLOC_010390 ; gene_alias_2 linc-RNASEH2B-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00021491 ;
chr13	lncipedia.org	exon	51107329	51107996	.	+	.	gene_id lnc-RNASEH2B-3 ; transcript_id lnc-RNASEH2B-3:8 ; gene_alias_1 XLOC_010390 ; gene_alias_2 linc-RNASEH2B-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00021491 ;
chrY	lncipedia.org	exon	27209231	27210230	.	-	.	gene_id lnc-BPY2C-1 ; transcript_id lnc-BPY2C-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008332 ; gene_alias_2 linc-BPY2C ; transcript_alias_1 TCONS_00017595 ;
chrY	lncipedia.org	exon	27216881	27216988	.	-	.	gene_id lnc-BPY2C-1 ; transcript_id lnc-BPY2C-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008332 ; gene_alias_2 linc-BPY2C ; transcript_alias_1 TCONS_00017595 ;
chrY	lncipedia.org	exon	27218793	27218868	.	-	.	gene_id lnc-BPY2C-1 ; transcript_id lnc-BPY2C-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008332 ; gene_alias_2 linc-BPY2C ; transcript_alias_1 TCONS_00017595 ;
chrY	lncipedia.org	exon	27245879	27246039	.	-	.	gene_id lnc-BPY2C-1 ; transcript_id lnc-BPY2C-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008332 ; gene_alias_2 linc-BPY2C ; transcript_alias_1 TCONS_00017595 ;
chr11	lncipedia.org	exon	128490599	128490669	.	-	.	gene_id lnc-ETS1-1 ; transcript_id lnc-ETS1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000255465 ; gene_alias_2 RP11-264E20.1 ; transcript_alias_1 ENST00000532563 ;
chr11	lncipedia.org	exon	128490777	128490881	.	-	.	gene_id lnc-ETS1-1 ; transcript_id lnc-ETS1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000255465 ; gene_alias_2 RP11-264E20.1 ; transcript_alias_1 ENST00000532563 ;
chr11	lncipedia.org	exon	128491600	128491711	.	-	.	gene_id lnc-ETS1-1 ; transcript_id lnc-ETS1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000255465 ; gene_alias_2 RP11-264E20.1 ; transcript_alias_1 ENST00000532563 ;
chr19	lncipedia.org	exon	50837053	50837358	.	-	.	gene_id lnc-KCNC3-1 ; transcript_id lnc-KCNC3-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000131401 ; gene_alias_2 NAPSB ; transcript_alias_1 ENST00000531692 ;
chr19	lncipedia.org	exon	50837564	50837818	.	-	.	gene_id lnc-KCNC3-1 ; transcript_id lnc-KCNC3-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000131401 ; gene_alias_2 NAPSB ; transcript_alias_1 ENST00000531692 ;
chr9	lncipedia.org	exon	126769954	126770370	.	-	.	gene_id lnc-DENND1A-3 ; transcript_id lnc-DENND1A-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000236668 ; gene_alias_2 RP11-85O21.2 ; transcript_alias_1 ENST00000453529 ;
chr9	lncipedia.org	exon	126771345	126771516	.	-	.	gene_id lnc-DENND1A-3 ; transcript_id lnc-DENND1A-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000236668 ; gene_alias_2 RP11-85O21.2 ; transcript_alias_1 ENST00000453529 ;
chr13	lncipedia.org	exon	51659560	51659695	.	-	.	gene_id lnc-DLEU7-3 ; transcript_id lnc-DLEU7-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000226792 ; gene_alias_2 RP11-547C18.3 ; transcript_alias_1 ENST00000433280 ;
chr13	lncipedia.org	exon	51662064	51662211	.	-	.	gene_id lnc-DLEU7-3 ; transcript_id lnc-DLEU7-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000226792 ; gene_alias_2 RP11-547C18.3 ; transcript_alias_1 ENST00000433280 ;
chr13	lncipedia.org	exon	51684932	51685078	.	-	.	gene_id lnc-DLEU7-3 ; transcript_id lnc-DLEU7-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000226792 ; gene_alias_2 RP11-547C18.3 ; transcript_alias_1 ENST00000433280 ;
chr16	lncipedia.org	exon	32264662	32265036	.	+	.	gene_id lnc-AC142381.1-2 ; transcript_id lnc-AC142381.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000205456 ; gene_alias_2 AC133485.1 ; transcript_alias_1 ENST00000354614 ;
chr16	lncipedia.org	exon	32265142	32265178	.	+	.	gene_id lnc-AC142381.1-2 ; transcript_id lnc-AC142381.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000205456 ; gene_alias_2 AC133485.1 ; transcript_alias_1 ENST00000354614 ;
chr10	lncipedia.org	exon	39010984	39011260	.	+	.	gene_id lnc-ZNF37A-5 ; transcript_id lnc-ZNF37A-5:2 ; gene_alias_1 ENSG00000234541 ; gene_alias_2 RP11-453N3.2 ; transcript_alias_1 ENST00000456744 ;
chr10	lncipedia.org	exon	39012283	39012507	.	+	.	gene_id lnc-ZNF37A-5 ; transcript_id lnc-ZNF37A-5:2 ; gene_alias_1 ENSG00000234541 ; gene_alias_2 RP11-453N3.2 ; transcript_alias_1 ENST00000456744 ;
chrX	lncipedia.org	exon	134230877	134231151	.	-	.	gene_id lnc-FAM127B-1 ; transcript_id lnc-FAM127B-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000196972 ; gene_alias_2 NCRNA00087 ; transcript_alias_1 ENST00000433425 ;
chrX	lncipedia.org	exon	134232063	134232654	.	-	.	gene_id lnc-FAM127B-1 ; transcript_id lnc-FAM127B-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000196972 ; gene_alias_2 NCRNA00087 ; transcript_alias_1 ENST00000433425 ;
chrX	lncipedia.org	exon	134229015	134229254	.	-	.	gene_id lnc-FAM127B-1 ; transcript_id lnc-FAM127B-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000196972 ; gene_alias_2 NCRNA00087 ; transcript_alias_1 ENST00000437661 ;
chrX	lncipedia.org	exon	134229530	134229594	.	-	.	gene_id lnc-FAM127B-1 ; transcript_id lnc-FAM127B-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000196972 ; gene_alias_2 NCRNA00087 ; transcript_alias_1 ENST00000437661 ;
chr5	lncipedia.org	exon	149829002	149829258	.	+	.	gene_id lnc-NDST1-1 ; transcript_id lnc-NDST1-1:2 ; gene_alias_1 Alpha-250/Alpha-280 ; transcript_alias_1 Alpha-250 ;
chr11	lncipedia.org	exon	65273587	65273645	.	+	.	gene_id lnc-SCYL1-1 ; transcript_id lnc-SCYL1-1:5 ; gene_alias_1 mascRNA ; transcript_alias_1 FJ209302.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	54067909	54068023	.	-	.	gene_id lnc-RP11-324D17.1.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-324D17.1.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000261049.2 ; gene_alias_2 RP11-357N13.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000173130.1 ; transcript_alias_1 ENST00000563879.2 ; transcript_alias_2 RP11-357N13.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000422201.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	54086462	54086571	.	-	.	gene_id lnc-RP11-324D17.1.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-324D17.1.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000261049.2 ; gene_alias_2 RP11-357N13.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000173130.1 ; transcript_alias_1 ENST00000563879.2 ; transcript_alias_2 RP11-357N13.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000422201.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	54088440	54088495	.	-	.	gene_id lnc-RP11-324D17.1.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-324D17.1.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000261049.2 ; gene_alias_2 RP11-357N13.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000173130.1 ; transcript_alias_1 ENST00000563879.2 ; transcript_alias_2 RP11-357N13.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000422201.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	37333472	37333530	.	-	.	gene_id lnc-RP11-150O12.6.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-150O12.6.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000253161.1 ; gene_alias_2 RP11-150O12.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000163996.2 ; transcript_alias_1 ENST00000517363.1 ; transcript_alias_2 RP11-150O12.1-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000376677.2 ;
chr8	lncipedia.org	exon	37386615	37386708	.	-	.	gene_id lnc-RP11-150O12.6.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-150O12.6.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000253161.1 ; gene_alias_2 RP11-150O12.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000163996.2 ; transcript_alias_1 ENST00000517363.1 ; transcript_alias_2 RP11-150O12.1-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000376677.2 ;
chr8	lncipedia.org	exon	37411540	37411585	.	-	.	gene_id lnc-RP11-150O12.6.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-150O12.6.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000253161.1 ; gene_alias_2 RP11-150O12.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000163996.2 ; transcript_alias_1 ENST00000517363.1 ; transcript_alias_2 RP11-150O12.1-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000376677.2 ;
chr20	lncipedia.org	exon	20194943	20195022	.	-	.	gene_id lnc-CRNKL1-2 ; transcript_id lnc-CRNKL1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225417.1 ; gene_alias_2 RP5-1178H5.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000032002.1 ; transcript_alias_1 ENST00000443692.1 ; transcript_alias_2 RP5-1178H5.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000078221.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	20195705	20195906	.	-	.	gene_id lnc-CRNKL1-2 ; transcript_id lnc-CRNKL1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225417.1 ; gene_alias_2 RP5-1178H5.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000032002.1 ; transcript_alias_1 ENST00000443692.1 ; transcript_alias_2 RP5-1178H5.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000078221.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	246274628	246274831	.	+	.	gene_id lnc-KIF26B-2 ; transcript_id lnc-KIF26B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000226876.1 ; gene_alias_2 RP11-36N20.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000040511.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451926.1 ; transcript_alias_2 RP11-36N20.1-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000097501.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	246276989	246277108	.	+	.	gene_id lnc-KIF26B-2 ; transcript_id lnc-KIF26B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000226876.1 ; gene_alias_2 RP11-36N20.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000040511.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451926.1 ; transcript_alias_2 RP11-36N20.1-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000097501.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	116706833	116706955	.	+	.	gene_id lnc-APOC3-1 ; transcript_id lnc-APOC3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235910.1 ; gene_alias_2 AP006216.12 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000150649.1 ; transcript_alias_1 ENST00000444200.1 ; transcript_alias_2 AP006216.12-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000319394.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	116726006	116726445	.	+	.	gene_id lnc-APOC3-1 ; transcript_id lnc-APOC3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235910.1 ; gene_alias_2 AP006216.12 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000150649.1 ; transcript_alias_1 ENST00000444200.1 ; transcript_alias_2 AP006216.12-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000319394.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	47241769	47242316	.	-	.	gene_id lnc-ACP2-1 ; transcript_id lnc-ACP2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256897.1 ; gene_alias_2 RP11-17G12.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000167883.1 ; transcript_alias_1 ENST00000540410.1 ; transcript_alias_2 RP11-17G12.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000396809.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	47243241	47243302	.	-	.	gene_id lnc-ACP2-1 ; transcript_id lnc-ACP2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256897.1 ; gene_alias_2 RP11-17G12.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000167883.1 ; transcript_alias_1 ENST00000540410.1 ; transcript_alias_2 RP11-17G12.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000396809.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	61405480	61405921	.	-	.	gene_id lnc-TCFL5-3 ; transcript_id lnc-TCFL5-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000228705.1 ; gene_alias_2 RP5-885L7.10 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000032931.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412500.1 ; transcript_alias_2 RP5-885L7.10-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000080060.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	61406667	61406764	.	-	.	gene_id lnc-TCFL5-3 ; transcript_id lnc-TCFL5-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000228705.1 ; gene_alias_2 RP5-885L7.10 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000032931.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412500.1 ; transcript_alias_2 RP5-885L7.10-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000080060.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	47082093	47082168	.	-	.	gene_id lnc-GIP-2 ; transcript_id lnc-GIP-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251461.1 ; gene_alias_2 RP11-501C14.6 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000161175.1 ; transcript_alias_1 ENST00000504865.1 ; transcript_alias_2 RP11-501C14.6-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000364055.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	47089805	47089888	.	-	.	gene_id lnc-GIP-2 ; transcript_id lnc-GIP-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251461.1 ; gene_alias_2 RP11-501C14.6 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000161175.1 ; transcript_alias_1 ENST00000504865.1 ; transcript_alias_2 RP11-501C14.6-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000364055.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	47090298	47090388	.	-	.	gene_id lnc-GIP-2 ; transcript_id lnc-GIP-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251461.1 ; gene_alias_2 RP11-501C14.6 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000161175.1 ; transcript_alias_1 ENST00000504865.1 ; transcript_alias_2 RP11-501C14.6-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000364055.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	47090907	47091087	.	-	.	gene_id lnc-GIP-2 ; transcript_id lnc-GIP-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251461.1 ; gene_alias_2 RP11-501C14.6 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000161175.1 ; transcript_alias_1 ENST00000504865.1 ; transcript_alias_2 RP11-501C14.6-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000364055.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	48357926	48358052	.	+	.	gene_id lnc-AL591684.1-1 ; transcript_id lnc-AL591684.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228865.1 ; gene_alias_2 RP11-463P17.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000018146.1 ; transcript_alias_1 ENST00000431774.1 ; transcript_alias_2 RP11-463P17.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000047887.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	48358501	48358600	.	+	.	gene_id lnc-AL591684.1-1 ; transcript_id lnc-AL591684.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228865.1 ; gene_alias_2 RP11-463P17.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000018146.1 ; transcript_alias_1 ENST00000431774.1 ; transcript_alias_2 RP11-463P17.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000047887.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	124753587	124754259	.	+	.	gene_id lnc-ROBO3-1 ; transcript_id lnc-ROBO3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254568.1 ; gene_alias_2 RP11-664I21.5 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000165935.1 ; transcript_alias_1 ENST00000524453.1 ; transcript_alias_2 RP11-664I21.5-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000387110.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	124757615	124757685	.	+	.	gene_id lnc-ROBO3-1 ; transcript_id lnc-ROBO3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254568.1 ; gene_alias_2 RP11-664I21.5 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000165935.1 ; transcript_alias_1 ENST00000524453.1 ; transcript_alias_2 RP11-664I21.5-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000387110.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	180625202	180625271	.	+	.	gene_id lnc-TRIM41-1 ; transcript_id lnc-TRIM41-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000250900.2 ; gene_alias_2 CTC-338M12.6 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000163005.3 ; transcript_alias_1 ENST00000502812.2 ; transcript_alias_2 CTC-338M12.6-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000371333.2 ;
chr5	lncipedia.org	exon	180629588	180630100	.	+	.	gene_id lnc-TRIM41-1 ; transcript_id lnc-TRIM41-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000250900.2 ; gene_alias_2 CTC-338M12.6 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000163005.3 ; transcript_alias_1 ENST00000502812.2 ; transcript_alias_2 CTC-338M12.6-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000371333.2 ;
chr6	lncipedia.org	exon	125329901	125330068	.	-	.	gene_id lnc-HDDC2-3 ; transcript_id lnc-HDDC2-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229819.1 ; gene_alias_2 RP11-510H23.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000015503.1 ; transcript_alias_1 ENST00000431104.1 ; transcript_alias_2 RP11-510H23.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000042061.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	125330320	125330635	.	-	.	gene_id lnc-HDDC2-3 ; transcript_id lnc-HDDC2-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229819.1 ; gene_alias_2 RP11-510H23.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000015503.1 ; transcript_alias_1 ENST00000431104.1 ; transcript_alias_2 RP11-510H23.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000042061.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	21980144	21980358	.	+	.	gene_id lnc-CMAS-1 ; transcript_id lnc-CMAS-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257022.1 ; gene_alias_2 RP11-729I10.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000169095.1 ; transcript_alias_1 ENST00000539874.1 ; transcript_alias_2 RP11-729I10.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000402233.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	21984013	21984128	.	+	.	gene_id lnc-CMAS-1 ; transcript_id lnc-CMAS-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257022.1 ; gene_alias_2 RP11-729I10.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000169095.1 ; transcript_alias_1 ENST00000539874.1 ; transcript_alias_2 RP11-729I10.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000402233.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	22022516	22022596	.	+	.	gene_id lnc-CMAS-1 ; transcript_id lnc-CMAS-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257022.1 ; gene_alias_2 RP11-729I10.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000169095.1 ; transcript_alias_1 ENST00000539874.1 ; transcript_alias_2 RP11-729I10.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000402233.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	22040782	22040891	.	+	.	gene_id lnc-CMAS-1 ; transcript_id lnc-CMAS-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257022.1 ; gene_alias_2 RP11-729I10.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000169095.1 ; transcript_alias_1 ENST00000539874.1 ; transcript_alias_2 RP11-729I10.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000402233.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	34064199	34064500	.	-	.	gene_id lnc-GDF5-1 ; transcript_id lnc-GDF5-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000230155.1 ; gene_alias_2 RP3-477O4.14 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000055986.3 ; transcript_alias_1 ENST00000416903.1 ; transcript_alias_2 RP3-477O4.14-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000156150.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	34065651	34065770	.	-	.	gene_id lnc-GDF5-1 ; transcript_id lnc-GDF5-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000230155.1 ; gene_alias_2 RP3-477O4.14 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000055986.3 ; transcript_alias_1 ENST00000416903.1 ; transcript_alias_2 RP3-477O4.14-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000156150.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	34068958	34069012	.	-	.	gene_id lnc-GDF5-1 ; transcript_id lnc-GDF5-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000230155.1 ; gene_alias_2 RP3-477O4.14 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000055986.3 ; transcript_alias_1 ENST00000416903.1 ; transcript_alias_2 RP3-477O4.14-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000156150.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175333942	175334422	.	-	.	gene_id lnc-THOC3-1 ; transcript_id lnc-THOC3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250820.1 ; gene_alias_2 RP11-91H12.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000163190.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502813.1 ; transcript_alias_2 RP11-91H12.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000371985.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175385455	175385541	.	-	.	gene_id lnc-THOC3-1 ; transcript_id lnc-THOC3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250820.1 ; gene_alias_2 RP11-91H12.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000163190.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502813.1 ; transcript_alias_2 RP11-91H12.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000371985.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	21912914	21913019	.	+	.	gene_id lnc-C12orf39-1 ; transcript_id lnc-C12orf39-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000255644.1 ; gene_alias_2 RP11-59N23.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000169092.1 ; transcript_alias_1 ENST00000542489.1 ; transcript_alias_2 RP11-59N23.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000402225.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	21919290	21919639	.	+	.	gene_id lnc-C12orf39-1 ; transcript_id lnc-C12orf39-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000255644.1 ; gene_alias_2 RP11-59N23.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000169092.1 ; transcript_alias_1 ENST00000542489.1 ; transcript_alias_2 RP11-59N23.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000402225.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	21469833	21469968	.	-	.	gene_id lnc-C17orf51-1 ; transcript_id lnc-C17orf51-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000266050.1 ; gene_alias_2 AC113144.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000179817.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536958.2 ; transcript_alias_2 AC113144.2-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000395739.3 ;
chr17	lncipedia.org	exon	21476490	21476999	.	-	.	gene_id lnc-C17orf51-1 ; transcript_id lnc-C17orf51-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000266050.1 ; gene_alias_2 AC113144.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000179817.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536958.2 ; transcript_alias_2 AC113144.2-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000395739.3 ;
chr17	lncipedia.org	exon	21477504	21477781	.	-	.	gene_id lnc-C17orf51-1 ; transcript_id lnc-C17orf51-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000266050.1 ; gene_alias_2 AC113144.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000179817.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536958.2 ; transcript_alias_2 AC113144.2-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000395739.3 ;
chr2	lncipedia.org	exon	110720966	110721127	.	+	.	gene_id lnc-LIMS3.1-1 ; transcript_id lnc-LIMS3.1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000186148.6 ; gene_alias_2 AC013271.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000153222.1 ; transcript_alias_1 ENST00000425917.1 ; transcript_alias_2 AC013271.3-005 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000330198.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	110722265	110722701	.	+	.	gene_id lnc-LIMS3.1-1 ; transcript_id lnc-LIMS3.1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000186148.6 ; gene_alias_2 AC013271.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000153222.1 ; transcript_alias_1 ENST00000425917.1 ; transcript_alias_2 AC013271.3-005 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000330198.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	21055803	21056520	.	+	.	gene_id lnc-RNASE10-2 ; transcript_id lnc-RNASE10-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258573.1 ; gene_alias_2 RP11-14J7.6 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000171009.1 ; transcript_alias_1 ENST00000554006.1 ; transcript_alias_2 RP11-14J7.6-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000411222.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	21058343	21058417	.	+	.	gene_id lnc-RNASE10-2 ; transcript_id lnc-RNASE10-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258573.1 ; gene_alias_2 RP11-14J7.6 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000171009.1 ; transcript_alias_1 ENST00000554006.1 ; transcript_alias_2 RP11-14J7.6-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000411222.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	196158256	196158312	.	+	.	gene_id lnc-FBXO45-2 ; transcript_id lnc-FBXO45-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225822.2 ; gene_alias_2 UBXN7-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000155674.1 ; transcript_alias_1 ENST00000442941.1 ; transcript_alias_2 UBXN7-AS1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000341173.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	196159073	196159401	.	+	.	gene_id lnc-FBXO45-2 ; transcript_id lnc-FBXO45-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225822.2 ; gene_alias_2 UBXN7-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000155674.1 ; transcript_alias_1 ENST00000442941.1 ; transcript_alias_2 UBXN7-AS1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000341173.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	48216825	48216946	.	-	.	gene_id lnc-SAMD14-2 ; transcript_id lnc-SAMD14-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000108819.9 ; gene_alias_2 PPP1R9B ; gene_alias_3 OTTHUMG00000162008.2 ; transcript_alias_1 ENST00000513579.1 ; transcript_alias_2 PPP1R9B-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000366735.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	48217458	48217724	.	-	.	gene_id lnc-SAMD14-2 ; transcript_id lnc-SAMD14-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000108819.9 ; gene_alias_2 PPP1R9B ; gene_alias_3 OTTHUMG00000162008.2 ; transcript_alias_1 ENST00000513579.1 ; transcript_alias_2 PPP1R9B-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000366735.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	48218634	48218738	.	-	.	gene_id lnc-SAMD14-2 ; transcript_id lnc-SAMD14-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000108819.9 ; gene_alias_2 PPP1R9B ; gene_alias_3 OTTHUMG00000162008.2 ; transcript_alias_1 ENST00000513579.1 ; transcript_alias_2 PPP1R9B-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000366735.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	48220963	48221083	.	-	.	gene_id lnc-SAMD14-2 ; transcript_id lnc-SAMD14-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000108819.9 ; gene_alias_2 PPP1R9B ; gene_alias_3 OTTHUMG00000162008.2 ; transcript_alias_1 ENST00000513579.1 ; transcript_alias_2 PPP1R9B-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000366735.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	48222478	48222517	.	-	.	gene_id lnc-SAMD14-2 ; transcript_id lnc-SAMD14-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000108819.9 ; gene_alias_2 PPP1R9B ; gene_alias_3 OTTHUMG00000162008.2 ; transcript_alias_1 ENST00000513579.1 ; transcript_alias_2 PPP1R9B-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000366735.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	119252488	119252618	.	+	.	gene_id lnc-RP11-305N23.1.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-305N23.1.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245248.3 ; gene_alias_2 RP11-305N23.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000166173.3 ; transcript_alias_1 ENST00000577297.1 ; transcript_alias_2 RP11-305N23.1-004 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000447242.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	119265691	119265864	.	+	.	gene_id lnc-RP11-305N23.1.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-305N23.1.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245248.3 ; gene_alias_2 RP11-305N23.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000166173.3 ; transcript_alias_1 ENST00000577297.1 ; transcript_alias_2 RP11-305N23.1-004 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000447242.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	119266252	119266373	.	+	.	gene_id lnc-RP11-305N23.1.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-305N23.1.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245248.3 ; gene_alias_2 RP11-305N23.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000166173.3 ; transcript_alias_1 ENST00000577297.1 ; transcript_alias_2 RP11-305N23.1-004 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000447242.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	119280211	119280472	.	+	.	gene_id lnc-RP11-305N23.1.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-305N23.1.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245248.3 ; gene_alias_2 RP11-305N23.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000166173.3 ; transcript_alias_1 ENST00000577297.1 ; transcript_alias_2 RP11-305N23.1-004 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000447242.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	1615874	1616198	.	-	.	gene_id lnc-TLCD2-1 ; transcript_id lnc-TLCD2-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000186594.6 ; gene_alias_2 MIR22HG ; gene_alias_3 OTTHUMG00000132197.4 ; transcript_alias_1 ENST00000576489.1 ; transcript_alias_2 MIR22HG-009 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000438377.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	1617150	1617308	.	-	.	gene_id lnc-TLCD2-1 ; transcript_id lnc-TLCD2-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000186594.6 ; gene_alias_2 MIR22HG ; gene_alias_3 OTTHUMG00000132197.4 ; transcript_alias_1 ENST00000576489.1 ; transcript_alias_2 MIR22HG-009 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000438377.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	1617665	1617747	.	-	.	gene_id lnc-TLCD2-1 ; transcript_id lnc-TLCD2-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000186594.6 ; gene_alias_2 MIR22HG ; gene_alias_3 OTTHUMG00000132197.4 ; transcript_alias_1 ENST00000576489.1 ; transcript_alias_2 MIR22HG-009 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000438377.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	1619424	1619504	.	-	.	gene_id lnc-TLCD2-1 ; transcript_id lnc-TLCD2-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000186594.6 ; gene_alias_2 MIR22HG ; gene_alias_3 OTTHUMG00000132197.4 ; transcript_alias_1 ENST00000576489.1 ; transcript_alias_2 MIR22HG-009 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000438377.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	4871290	4871461	.	+	.	gene_id lnc-ENO3-1 ; transcript_id lnc-ENO3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000262429.1 ; gene_alias_2 RP5-1050D4.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000177764.1 ; transcript_alias_1 ENST00000576752.1 ; transcript_alias_2 RP5-1050D4.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000438879.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	4871816	4872117	.	+	.	gene_id lnc-ENO3-1 ; transcript_id lnc-ENO3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000262429.1 ; gene_alias_2 RP5-1050D4.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000177764.1 ; transcript_alias_1 ENST00000576752.1 ; transcript_alias_2 RP5-1050D4.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000438879.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	3108457	3108703	.	-	.	gene_id lnc-CCDC64B-1 ; transcript_id lnc-CCDC64B-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000261971.1 ; gene_alias_2 RP11-473M20.7 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000177474.1 ; transcript_alias_1 ENST00000572427.1 ; transcript_alias_2 RP11-473M20.7-005 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000437115.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	3108997	3109309	.	-	.	gene_id lnc-CCDC64B-1 ; transcript_id lnc-CCDC64B-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000261971.1 ; gene_alias_2 RP11-473M20.7 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000177474.1 ; transcript_alias_1 ENST00000572427.1 ; transcript_alias_2 RP11-473M20.7-005 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000437115.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	100748833	100749097	.	-	.	gene_id lnc-HEMGN-1 ; transcript_id lnc-HEMGN-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236896.1 ; gene_alias_2 RP11-535C21.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000020337.1 ; transcript_alias_1 ENST00000411981.1 ; transcript_alias_2 RP11-535C21.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000053345.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	100749802	100749938	.	-	.	gene_id lnc-HEMGN-1 ; transcript_id lnc-HEMGN-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236896.1 ; gene_alias_2 RP11-535C21.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000020337.1 ; transcript_alias_1 ENST00000411981.1 ; transcript_alias_2 RP11-535C21.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000053345.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	3107140	3107205	.	-	.	gene_id lnc-CCDC64B-1 ; transcript_id lnc-CCDC64B-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000261971.1 ; gene_alias_2 RP11-473M20.7 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000177474.1 ; transcript_alias_1 ENST00000573953.1 ; transcript_alias_2 RP11-473M20.7-006 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000437113.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	3107514	3108448	.	-	.	gene_id lnc-CCDC64B-1 ; transcript_id lnc-CCDC64B-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000261971.1 ; gene_alias_2 RP11-473M20.7 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000177474.1 ; transcript_alias_1 ENST00000573953.1 ; transcript_alias_2 RP11-473M20.7-006 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000437113.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	60994640	60994791	.	+	.	gene_id lnc-PGA5-1 ; transcript_id lnc-PGA5-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256220.1 ; gene_alias_2 CTD-2331C18.5 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000168074.1 ; transcript_alias_1 ENST00000537594.1 ; transcript_alias_2 CTD-2331C18.5-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000397971.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	61015891	61016005	.	+	.	gene_id lnc-PGA5-1 ; transcript_id lnc-PGA5-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256220.1 ; gene_alias_2 CTD-2331C18.5 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000168074.1 ; transcript_alias_1 ENST00000537594.1 ; transcript_alias_2 CTD-2331C18.5-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000397971.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	103973720	103973762	.	+	.	gene_id lnc-ELOVL3-1 ; transcript_id lnc-ELOVL3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000259127.1 ; gene_alias_2 RP11-242B12.5 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000171145.1 ; transcript_alias_1 ENST00000556056.1 ; transcript_alias_2 RP11-242B12.5-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000411898.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	104016703	104016874	.	+	.	gene_id lnc-ELOVL3-1 ; transcript_id lnc-ELOVL3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000259127.1 ; gene_alias_2 RP11-242B12.5 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000171145.1 ; transcript_alias_1 ENST00000556056.1 ; transcript_alias_2 RP11-242B12.5-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000411898.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	18151816	18151977	.	-	.	gene_id lnc-PTPLA-3 ; transcript_id lnc-PTPLA-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235637.1 ; gene_alias_2 RP11-457D2.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000017756.1 ; transcript_alias_1 ENST00000442231.1 ; transcript_alias_2 RP11-457D2.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000047056.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	18154342	18154400	.	-	.	gene_id lnc-PTPLA-3 ; transcript_id lnc-PTPLA-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235637.1 ; gene_alias_2 RP11-457D2.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000017756.1 ; transcript_alias_1 ENST00000442231.1 ; transcript_alias_2 RP11-457D2.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000047056.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143236905	143237080	.	-	.	gene_id lnc-PPIAL4G-5 ; transcript_id lnc-PPIAL4G-5:6 ; gene_alias_1 ENSG00000225278.1 ; gene_alias_2 BX571672.5 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000013475.1 ; transcript_alias_1 ENST00000456568.1 ; transcript_alias_2 BX571672.5-011 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000037584.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143237680	143237715	.	-	.	gene_id lnc-PPIAL4G-5 ; transcript_id lnc-PPIAL4G-5:6 ; gene_alias_1 ENSG00000225278.1 ; gene_alias_2 BX571672.5 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000013475.1 ; transcript_alias_1 ENST00000456568.1 ; transcript_alias_2 BX571672.5-011 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000037584.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	73116342	73116429	.	+	.	gene_id lnc-RELT-1 ; transcript_id lnc-RELT-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000256448.1 ; gene_alias_2 RP11-809N8.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000167996.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536855.1 ; transcript_alias_2 RP11-809N8.4-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000397429.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	73121531	73121727	.	+	.	gene_id lnc-RELT-1 ; transcript_id lnc-RELT-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000256448.1 ; gene_alias_2 RP11-809N8.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000167996.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536855.1 ; transcript_alias_2 RP11-809N8.4-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000397429.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	103019889	103019991	.	+	.	gene_id lnc-TPP2-1 ; transcript_id lnc-TPP2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234445.1 ; gene_alias_2 FGF14-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000017302.1 ; transcript_alias_1 ENST00000444686.1 ; transcript_alias_2 FGF14-AS1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000045677.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	103020205	103020395	.	+	.	gene_id lnc-TPP2-1 ; transcript_id lnc-TPP2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234445.1 ; gene_alias_2 FGF14-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000017302.1 ; transcript_alias_1 ENST00000444686.1 ; transcript_alias_2 FGF14-AS1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000045677.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	202005007	202005168	.	-	.	gene_id lnc-FAM126B-2 ; transcript_id lnc-FAM126B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000226312.2 ; gene_alias_2 CFLAR-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000154713.2 ; transcript_alias_1 ENST00000474886.2 ; transcript_alias_2 CFLAR-AS1-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000336735.2 ;
chr2	lncipedia.org	exon	202008859	202008919	.	-	.	gene_id lnc-FAM126B-2 ; transcript_id lnc-FAM126B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000226312.2 ; gene_alias_2 CFLAR-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000154713.2 ; transcript_alias_1 ENST00000474886.2 ; transcript_alias_2 CFLAR-AS1-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000336735.2 ;
chr20	lncipedia.org	exon	32668955	32669033	.	+	.	gene_id lnc-ASIP-1 ; transcript_id lnc-ASIP-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229472.1 ; gene_alias_2 RP1-64K7.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000032288.1 ; transcript_alias_1 ENST00000434926.1 ; transcript_alias_2 RP1-64K7.4-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000078766.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	32669604	32669754	.	+	.	gene_id lnc-ASIP-1 ; transcript_id lnc-ASIP-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229472.1 ; gene_alias_2 RP1-64K7.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000032288.1 ; transcript_alias_1 ENST00000434926.1 ; transcript_alias_2 RP1-64K7.4-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000078766.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	38702384	38702488	.	-	.	gene_id lnc-TM2D2-3 ; transcript_id lnc-TM2D2-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000253829.1 ; gene_alias_2 RP11-723D22.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000164087.1 ; transcript_alias_1 ENST00000459965.2 ; transcript_alias_2 RP11-723D22.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000377184.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	38703676	38703957	.	-	.	gene_id lnc-TM2D2-3 ; transcript_id lnc-TM2D2-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000253829.1 ; gene_alias_2 RP11-723D22.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000164087.1 ; transcript_alias_1 ENST00000459965.2 ; transcript_alias_2 RP11-723D22.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000377184.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	86632964	86633140	.	-	.	gene_id lnc-FZD4-1 ; transcript_id lnc-FZD4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255471.1 ; gene_alias_2 RP11-736K20.5 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000167229.1 ; transcript_alias_1 ENST00000533672.1 ; transcript_alias_2 RP11-736K20.5-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000393816.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	86636018	86636079	.	-	.	gene_id lnc-FZD4-1 ; transcript_id lnc-FZD4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255471.1 ; gene_alias_2 RP11-736K20.5 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000167229.1 ; transcript_alias_1 ENST00000533672.1 ; transcript_alias_2 RP11-736K20.5-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000393816.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	100940080	100940130	.	+	.	gene_id lnc-ASB7-3 ; transcript_id lnc-ASB7-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000259430.1 ; gene_alias_2 RP11-168G16.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172308.1 ; transcript_alias_1 ENST00000560643.1 ; transcript_alias_2 RP11-168G16.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000417772.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	100948772	100948863	.	+	.	gene_id lnc-ASB7-3 ; transcript_id lnc-ASB7-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000259430.1 ; gene_alias_2 RP11-168G16.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172308.1 ; transcript_alias_1 ENST00000560643.1 ; transcript_alias_2 RP11-168G16.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000417772.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	100966197	100966288	.	+	.	gene_id lnc-ASB7-3 ; transcript_id lnc-ASB7-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000259430.1 ; gene_alias_2 RP11-168G16.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172308.1 ; transcript_alias_1 ENST00000560643.1 ; transcript_alias_2 RP11-168G16.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000417772.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	100977983	100978119	.	+	.	gene_id lnc-ASB7-3 ; transcript_id lnc-ASB7-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000259430.1 ; gene_alias_2 RP11-168G16.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172308.1 ; transcript_alias_1 ENST00000560643.1 ; transcript_alias_2 RP11-168G16.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000417772.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	55989725	55989842	.	+	.	gene_id lnc-DYNLL2-2 ; transcript_id lnc-DYNLL2-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000264914.1 ; gene_alias_2 RP11-343K8.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000178776.2 ; transcript_alias_1 ENST00000580184.1 ; transcript_alias_2 RP11-343K8.3-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000445407.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	55992377	55992500	.	+	.	gene_id lnc-DYNLL2-2 ; transcript_id lnc-DYNLL2-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000264914.1 ; gene_alias_2 RP11-343K8.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000178776.2 ; transcript_alias_1 ENST00000580184.1 ; transcript_alias_2 RP11-343K8.3-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000445407.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	53259593	53259678	.	-	.	gene_id lnc-GNPNAT1-1 ; transcript_id lnc-GNPNAT1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258698.1 ; gene_alias_2 RP11-589M4.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000171150.1 ; transcript_alias_1 ENST00000554548.1 ; transcript_alias_2 RP11-589M4.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000411943.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	53286643	53286752	.	-	.	gene_id lnc-GNPNAT1-1 ; transcript_id lnc-GNPNAT1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258698.1 ; gene_alias_2 RP11-589M4.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000171150.1 ; transcript_alias_1 ENST00000554548.1 ; transcript_alias_2 RP11-589M4.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000411943.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	154718984	154719050	.	+	.	gene_id lnc-F8A2-2 ; transcript_id lnc-F8A2-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000224533.3 ; gene_alias_2 RP11-954J6.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000022672.1 ; transcript_alias_1 ENST00000452506.1 ; transcript_alias_2 RP11-954J6.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000058814.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	154841135	154841277	.	+	.	gene_id lnc-F8A2-2 ; transcript_id lnc-F8A2-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000224533.3 ; gene_alias_2 RP11-954J6.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000022672.1 ; transcript_alias_1 ENST00000452506.1 ; transcript_alias_2 RP11-954J6.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000058814.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	234263220	234263320	.	+	.	gene_id lnc-SAG-1 ; transcript_id lnc-SAG-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000243637.1 ; gene_alias_2 AC019221.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000150257.1 ; transcript_alias_1 ENST00000442524.1 ; transcript_alias_2 AC019221.4-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000317151.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	234296903	234297013	.	+	.	gene_id lnc-SAG-1 ; transcript_id lnc-SAG-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000243637.1 ; gene_alias_2 AC019221.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000150257.1 ; transcript_alias_1 ENST00000442524.1 ; transcript_alias_2 AC019221.4-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000317151.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	234299049	234299129	.	+	.	gene_id lnc-SAG-1 ; transcript_id lnc-SAG-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000243637.1 ; gene_alias_2 AC019221.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000150257.1 ; transcript_alias_1 ENST00000442524.1 ; transcript_alias_2 AC019221.4-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000317151.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	234300716	234301045	.	+	.	gene_id lnc-SAG-1 ; transcript_id lnc-SAG-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000243637.1 ; gene_alias_2 AC019221.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000150257.1 ; transcript_alias_1 ENST00000442524.1 ; transcript_alias_2 AC019221.4-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000317151.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	100297573	100297835	.	+	.	gene_id lnc-TMEM35-1 ; transcript_id lnc-TMEM35-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225839.1 ; gene_alias_2 TRMT2B-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000022015.1 ; transcript_alias_1 ENST00000443801.1 ; transcript_alias_2 TRMT2B-AS1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000057507.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	100298557	100298694	.	+	.	gene_id lnc-TMEM35-1 ; transcript_id lnc-TMEM35-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225839.1 ; gene_alias_2 TRMT2B-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000022015.1 ; transcript_alias_1 ENST00000443801.1 ; transcript_alias_2 TRMT2B-AS1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000057507.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	113567881	113568124	.	-	.	gene_id lnc-C4orf21-1 ; transcript_id lnc-C4orf21-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249532.1 ; gene_alias_2 RP11-148B6.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000161565.1 ; transcript_alias_1 ENST00000505215.1 ; transcript_alias_2 RP11-148B6.1-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000365318.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	113569810	113569859	.	-	.	gene_id lnc-C4orf21-1 ; transcript_id lnc-C4orf21-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249532.1 ; gene_alias_2 RP11-148B6.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000161565.1 ; transcript_alias_1 ENST00000505215.1 ; transcript_alias_2 RP11-148B6.1-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000365318.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	63998695	63998762	.	-	.	gene_id lnc-TRPT1-1 ; transcript_id lnc-TRPT1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256116.1 ; gene_alias_2 RP11-783K16.14 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000167845.2 ; transcript_alias_1 ENST00000539963.1 ; transcript_alias_2 RP11-783K16.14-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000396583.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	64001666	64001824	.	-	.	gene_id lnc-TRPT1-1 ; transcript_id lnc-TRPT1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256116.1 ; gene_alias_2 RP11-783K16.14 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000167845.2 ; transcript_alias_1 ENST00000539963.1 ; transcript_alias_2 RP11-783K16.14-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000396583.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	20226371	20226650	.	+	.	gene_id lnc-SPECC1-2 ; transcript_id lnc-SPECC1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000266839.1 ; gene_alias_2 RP11-121A13.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000178568.2 ; transcript_alias_1 ENST00000580993.1 ; transcript_alias_2 RP11-121A13.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000442507.2 ;
chr4	lncipedia.org	exon	88578245	88578561	.	-	.	gene_id lnc-SPARCL1-1 ; transcript_id lnc-SPARCL1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000249001.1 ; gene_alias_2 RP11-742B18.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000161060.1 ; transcript_alias_1 ENST00000507894.1 ; transcript_alias_2 RP11-742B18.1-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000363600.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	88594142	88594191	.	-	.	gene_id lnc-SPARCL1-1 ; transcript_id lnc-SPARCL1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000249001.1 ; gene_alias_2 RP11-742B18.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000161060.1 ; transcript_alias_1 ENST00000507894.1 ; transcript_alias_2 RP11-742B18.1-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000363600.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	24233601	24233671	.	-	.	gene_id lnc-FUCA1-1 ; transcript_id lnc-FUCA1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000232557.1 ; gene_alias_2 RP11-4M23.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000013895.1 ; transcript_alias_1 ENST00000411815.1 ; transcript_alias_2 RP11-4M23.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000038965.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	24234237	24234375	.	-	.	gene_id lnc-FUCA1-1 ; transcript_id lnc-FUCA1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000232557.1 ; gene_alias_2 RP11-4M23.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000013895.1 ; transcript_alias_1 ENST00000411815.1 ; transcript_alias_2 RP11-4M23.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000038965.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	91425707	91425788	.	-	.	gene_id lnc-HDDC3-3 ; transcript_id lnc-HDDC3-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000259260.1 ; gene_alias_2 CTD-3094K11.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172401.1 ; transcript_alias_1 ENST00000561165.1 ; transcript_alias_2 CTD-3094K11.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000418388.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	91426505	91426688	.	-	.	gene_id lnc-HDDC3-3 ; transcript_id lnc-HDDC3-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000259260.1 ; gene_alias_2 CTD-3094K11.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172401.1 ; transcript_alias_1 ENST00000561165.1 ; transcript_alias_2 CTD-3094K11.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000418388.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	16044736	16044839	.	+	.	gene_id lnc-C11orf58-1 ; transcript_id lnc-C11orf58-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254878.1 ; gene_alias_2 CTD-3096P4.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000165846.1 ; transcript_alias_1 ENST00000531763.1 ; transcript_alias_2 CTD-3096P4.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000386626.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	16052969	16053061	.	+	.	gene_id lnc-C11orf58-1 ; transcript_id lnc-C11orf58-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254878.1 ; gene_alias_2 CTD-3096P4.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000165846.1 ; transcript_alias_1 ENST00000531763.1 ; transcript_alias_2 CTD-3096P4.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000386626.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	41130749	41130884	.	-	.	gene_id lnc-PPP1R14D-1 ; transcript_id lnc-PPP1R14D-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000261183.1 ; gene_alias_2 RP11-532F12.5 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172899.1 ; transcript_alias_1 ENST00000563217.1 ; transcript_alias_2 RP11-532F12.5-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000421225.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	41132578	41132691	.	-	.	gene_id lnc-PPP1R14D-1 ; transcript_id lnc-PPP1R14D-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000261183.1 ; gene_alias_2 RP11-532F12.5 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172899.1 ; transcript_alias_1 ENST00000563217.1 ; transcript_alias_2 RP11-532F12.5-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000421225.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	9450615	9450744	.	+	.	gene_id lnc-WDR16-1 ; transcript_id lnc-WDR16-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000263051.1 ; gene_alias_2 RP11-565F19.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000177985.1 ; transcript_alias_1 ENST00000574460.1 ; transcript_alias_2 RP11-565F19.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000440119.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	9451754	9451858	.	+	.	gene_id lnc-WDR16-1 ; transcript_id lnc-WDR16-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000263051.1 ; gene_alias_2 RP11-565F19.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000177985.1 ; transcript_alias_1 ENST00000574460.1 ; transcript_alias_2 RP11-565F19.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000440119.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	131498980	131499028	.	-	.	gene_id lnc-EBF3-1 ; transcript_id lnc-EBF3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000237224.1 ; gene_alias_2 RP11-109A6.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000019262.1 ; transcript_alias_1 ENST00000428178.1 ; transcript_alias_2 RP11-109A6.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000051012.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	131499143	131499277	.	-	.	gene_id lnc-EBF3-1 ; transcript_id lnc-EBF3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000237224.1 ; gene_alias_2 RP11-109A6.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000019262.1 ; transcript_alias_1 ENST00000428178.1 ; transcript_alias_2 RP11-109A6.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000051012.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	131499394	131499526	.	-	.	gene_id lnc-EBF3-1 ; transcript_id lnc-EBF3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000237224.1 ; gene_alias_2 RP11-109A6.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000019262.1 ; transcript_alias_1 ENST00000428178.1 ; transcript_alias_2 RP11-109A6.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000051012.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	56643413	56643796	.	-	.	gene_id lnc-MT1G-1 ; transcript_id lnc-MT1G-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000260823.1 ; gene_alias_2 RP11-249C24.10 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000176939.1 ; transcript_alias_1 ENST00000569778.1 ; transcript_alias_2 RP11-249C24.10-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000434361.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	56645228	56645287	.	-	.	gene_id lnc-MT1G-1 ; transcript_id lnc-MT1G-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000260823.1 ; gene_alias_2 RP11-249C24.10 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000176939.1 ; transcript_alias_1 ENST00000569778.1 ; transcript_alias_2 RP11-249C24.10-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000434361.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	74862851	74862937	.	+	.	gene_id lnc-GTF2IRD2B-1 ; transcript_id lnc-GTF2IRD2B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254977.1 ; gene_alias_2 AC004878.8 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000162597.1 ; transcript_alias_1 ENST00000448088.1 ; transcript_alias_2 AC004878.8-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000342384.2 ;
chr7	lncipedia.org	exon	74863655	74863847	.	+	.	gene_id lnc-GTF2IRD2B-1 ; transcript_id lnc-GTF2IRD2B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254977.1 ; gene_alias_2 AC004878.8 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000162597.1 ; transcript_alias_1 ENST00000448088.1 ; transcript_alias_2 AC004878.8-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000342384.2 ;
chr11	lncipedia.org	exon	22382759	22382851	.	-	.	gene_id lnc-FANCF-2 ; transcript_id lnc-FANCF-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254540.1 ; gene_alias_2 CTD-2140G10.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000166064.1 ; transcript_alias_1 ENST00000534543.1 ; transcript_alias_2 CTD-2140G10.4-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000387675.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	22383762	22383840	.	-	.	gene_id lnc-FANCF-2 ; transcript_id lnc-FANCF-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254540.1 ; gene_alias_2 CTD-2140G10.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000166064.1 ; transcript_alias_1 ENST00000534543.1 ; transcript_alias_2 CTD-2140G10.4-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000387675.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	77679707	77679745	.	-	.	gene_id lnc-ANKRD56-2 ; transcript_id lnc-ANKRD56-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224218.1 ; gene_alias_2 RP11-359D14.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000157073.1 ; transcript_alias_1 ENST00000449007.1 ; transcript_alias_2 RP11-359D14.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000347366.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	77723047	77723117	.	-	.	gene_id lnc-ANKRD56-2 ; transcript_id lnc-ANKRD56-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224218.1 ; gene_alias_2 RP11-359D14.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000157073.1 ; transcript_alias_1 ENST00000449007.1 ; transcript_alias_2 RP11-359D14.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000347366.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	53757463	53757589	.	-	.	gene_id lnc-MAGOH-1 ; transcript_id lnc-MAGOH-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225030.1 ; gene_alias_2 RP4-784A16.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000008933.1 ; transcript_alias_1 ENST00000450469.1 ; transcript_alias_2 RP4-784A16.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000024734.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	53757701	53757810	.	-	.	gene_id lnc-MAGOH-1 ; transcript_id lnc-MAGOH-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225030.1 ; gene_alias_2 RP4-784A16.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000008933.1 ; transcript_alias_1 ENST00000450469.1 ; transcript_alias_2 RP4-784A16.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000024734.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	113307595	113307652	.	-	.	gene_id lnc-KIAA2018-1 ; transcript_id lnc-KIAA2018-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000239453.1 ; gene_alias_2 SIDT1-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000150326.7 ; transcript_alias_1 ENST00000462180.1 ; transcript_alias_2 SIDT1-AS1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000354235.2 ;
chr3	lncipedia.org	exon	113308630	113309036	.	-	.	gene_id lnc-KIAA2018-1 ; transcript_id lnc-KIAA2018-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000239453.1 ; gene_alias_2 SIDT1-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000150326.7 ; transcript_alias_1 ENST00000462180.1 ; transcript_alias_2 SIDT1-AS1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000354235.2 ;
chr1	lncipedia.org	exon	145827205	145827242	.	+	.	gene_id lnc-GPR89C-2 ; transcript_id lnc-GPR89C-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235702.1 ; gene_alias_2 WI2-925H4.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000078079.1 ; transcript_alias_1 ENST00000437377.1 ; transcript_alias_2 WI2-925H4.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000170869.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	145833025	145833118	.	+	.	gene_id lnc-GPR89C-2 ; transcript_id lnc-GPR89C-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235702.1 ; gene_alias_2 WI2-925H4.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000078079.1 ; transcript_alias_1 ENST00000437377.1 ; transcript_alias_2 WI2-925H4.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000170869.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	205904256	205904324	.	+	.	gene_id lnc-FAM72A-2 ; transcript_id lnc-FAM72A-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227687.1 ; gene_alias_2 RP4-681L3.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000041669.1 ; transcript_alias_1 ENST00000421166.1 ; transcript_alias_2 RP4-681L3.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000099672.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	205904736	205904896	.	+	.	gene_id lnc-FAM72A-2 ; transcript_id lnc-FAM72A-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227687.1 ; gene_alias_2 RP4-681L3.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000041669.1 ; transcript_alias_1 ENST00000421166.1 ; transcript_alias_2 RP4-681L3.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000099672.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	3868886	3869196	.	-	.	gene_id lnc-RNF24-2 ; transcript_id lnc-RNF24-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229539.1 ; gene_alias_2 RP11-119B16.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000031766.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451507.1 ; transcript_alias_2 RP11-119B16.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000077785.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	3869386	3869515	.	-	.	gene_id lnc-RNF24-2 ; transcript_id lnc-RNF24-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229539.1 ; gene_alias_2 RP11-119B16.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000031766.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451507.1 ; transcript_alias_2 RP11-119B16.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000077785.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	88769542	88769688	.	-	.	gene_id lnc-GLUD1-2 ; transcript_id lnc-GLUD1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229969.1 ; gene_alias_2 RP11-96C23.10 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000018659.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451760.1 ; transcript_alias_2 RP11-96C23.10-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000049174.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	88775453	88775539	.	-	.	gene_id lnc-GLUD1-2 ; transcript_id lnc-GLUD1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229969.1 ; gene_alias_2 RP11-96C23.10 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000018659.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451760.1 ; transcript_alias_2 RP11-96C23.10-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000049174.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	3875584	3875618	.	+	.	gene_id lnc-SLC1A1-3 ; transcript_id lnc-SLC1A1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236724.1 ; gene_alias_2 RP11-252M18.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000153514.1 ; transcript_alias_1 ENST00000422150.1 ; transcript_alias_2 RP11-252M18.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000331458.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	3878602	3878809	.	+	.	gene_id lnc-SLC1A1-3 ; transcript_id lnc-SLC1A1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236724.1 ; gene_alias_2 RP11-252M18.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000153514.1 ; transcript_alias_1 ENST00000422150.1 ; transcript_alias_2 RP11-252M18.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000331458.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	33179163	33179223	.	+	.	gene_id lnc-TIMP3-1 ; transcript_id lnc-TIMP3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229673.1 ; gene_alias_2 LL22NC01-116C6.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000058268.1 ; transcript_alias_1 ENST00000444982.1 ; transcript_alias_2 LL22NC01-116C6.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000129023.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	33180883	33180968	.	+	.	gene_id lnc-TIMP3-1 ; transcript_id lnc-TIMP3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229673.1 ; gene_alias_2 LL22NC01-116C6.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000058268.1 ; transcript_alias_1 ENST00000444982.1 ; transcript_alias_2 LL22NC01-116C6.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000129023.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	67576207	67576331	.	-	.	gene_id lnc-AGRP-3 ; transcript_id lnc-AGRP-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000260894.1 ; gene_alias_2 CTD-2012K14.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172865.1 ; transcript_alias_1 ENST00000564717.1 ; transcript_alias_2 CTD-2012K14.4-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000420961.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	67576394	67576475	.	-	.	gene_id lnc-AGRP-3 ; transcript_id lnc-AGRP-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000260894.1 ; gene_alias_2 CTD-2012K14.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172865.1 ; transcript_alias_1 ENST00000564717.1 ; transcript_alias_2 CTD-2012K14.4-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000420961.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	21034389	21034720	.	-	.	gene_id lnc-HSFY2-3 ; transcript_id lnc-HSFY2-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000176728.3 ; gene_alias_2 TTTY14 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000036505.2 ; transcript_alias_1 ENST00000454875.1 ; transcript_alias_2 TTTY14-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000088785.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	21038954	21039091	.	-	.	gene_id lnc-HSFY2-3 ; transcript_id lnc-HSFY2-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000176728.3 ; gene_alias_2 TTTY14 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000036505.2 ; transcript_alias_1 ENST00000454875.1 ; transcript_alias_2 TTTY14-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000088785.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	21238931	21239004	.	-	.	gene_id lnc-HSFY2-3 ; transcript_id lnc-HSFY2-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000176728.3 ; gene_alias_2 TTTY14 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000036505.2 ; transcript_alias_1 ENST00000454875.1 ; transcript_alias_2 TTTY14-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000088785.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	139185272	139185321	.	+	.	gene_id lnc-MRPS22-2 ; transcript_id lnc-MRPS22-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248790.1 ; gene_alias_2 RP11-319G6.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000159957.1 ; transcript_alias_1 ENST00000512398.1 ; transcript_alias_2 RP11-319G6.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000358493.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	139185415	139185637	.	+	.	gene_id lnc-MRPS22-2 ; transcript_id lnc-MRPS22-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248790.1 ; gene_alias_2 RP11-319G6.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000159957.1 ; transcript_alias_1 ENST00000512398.1 ; transcript_alias_2 RP11-319G6.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000358493.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	2526559	2527062	.	+	.	gene_id lnc-NTN3-1 ; transcript_id lnc-NTN3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000260293.1 ; gene_alias_2 RP11-715J22.6 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000177151.1 ; transcript_alias_1 ENST00000561847.1 ; transcript_alias_2 RP11-715J22.6-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000435642.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	72701	72816	.	+	.	gene_id lnc-DOCK8-3 ; transcript_id lnc-DOCK8-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225655.1 ; gene_alias_2 RP11-143M1.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000019423.1 ; transcript_alias_1 ENST00000429980.1 ; transcript_alias_2 RP11-143M1.2-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000051453.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	79345	79537	.	+	.	gene_id lnc-DOCK8-3 ; transcript_id lnc-DOCK8-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225655.1 ; gene_alias_2 RP11-143M1.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000019423.1 ; transcript_alias_1 ENST00000429980.1 ; transcript_alias_2 RP11-143M1.2-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000051453.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	88742	88826	.	+	.	gene_id lnc-DOCK8-3 ; transcript_id lnc-DOCK8-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225655.1 ; gene_alias_2 RP11-143M1.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000019423.1 ; transcript_alias_1 ENST00000429980.1 ; transcript_alias_2 RP11-143M1.2-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000051453.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	37562797	37563004	.	+	.	gene_id lnc-CYTH4-1 ; transcript_id lnc-CYTH4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235237.1 ; gene_alias_2 RP1-151B14.6 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000150530.1 ; transcript_alias_1 ENST00000419128.1 ; transcript_alias_2 RP1-151B14.6-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000318775.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	37578469	37578890	.	+	.	gene_id lnc-CYTH4-1 ; transcript_id lnc-CYTH4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235237.1 ; gene_alias_2 RP1-151B14.6 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000150530.1 ; transcript_alias_1 ENST00000419128.1 ; transcript_alias_2 RP1-151B14.6-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000318775.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	639065	639169	.	-	.	gene_id lnc-OR4F16-1 ; transcript_id lnc-OR4F16-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000230021.1 ; gene_alias_2 RP5-857K21.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000002331.3 ; transcript_alias_1 ENST00000448605.1 ; transcript_alias_2 RP5-857K21.4-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000006712.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	655412	655580	.	-	.	gene_id lnc-OR4F16-1 ; transcript_id lnc-OR4F16-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000230021.1 ; gene_alias_2 RP5-857K21.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000002331.3 ; transcript_alias_1 ENST00000448605.1 ; transcript_alias_2 RP5-857K21.4-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000006712.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	53902047	53902247	.	+	.	gene_id lnc-TARBP2-1 ; transcript_id lnc-TARBP2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257117.1 ; gene_alias_2 RP11-793H13.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000169857.1 ; transcript_alias_1 ENST00000546894.1 ; transcript_alias_2 RP11-793H13.4-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000406304.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	53902608	53902749	.	+	.	gene_id lnc-TARBP2-1 ; transcript_id lnc-TARBP2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257117.1 ; gene_alias_2 RP11-793H13.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000169857.1 ; transcript_alias_1 ENST00000546894.1 ; transcript_alias_2 RP11-793H13.4-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000406304.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	127431666	127431731	.	-	.	gene_id lnc-NR5A1-1 ; transcript_id lnc-NR5A1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229850.1 ; gene_alias_2 RP11-348K2.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000020658.1 ; transcript_alias_1 ENST00000446468.1 ; transcript_alias_2 RP11-348K2.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000054034.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	127432303	127432491	.	-	.	gene_id lnc-NR5A1-1 ; transcript_id lnc-NR5A1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229850.1 ; gene_alias_2 RP11-348K2.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000020658.1 ; transcript_alias_1 ENST00000446468.1 ; transcript_alias_2 RP11-348K2.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000054034.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	118390331	118390411	.	-	.	gene_id lnc-IFT46-1 ; transcript_id lnc-IFT46-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255435.2 ; gene_alias_2 RP11-770J1.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000166407.2 ; transcript_alias_1 ENST00000556583.1 ; transcript_alias_2 RP11-770J1.3-004 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000411263.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	118391981	118392029	.	-	.	gene_id lnc-IFT46-1 ; transcript_id lnc-IFT46-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255435.2 ; gene_alias_2 RP11-770J1.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000166407.2 ; transcript_alias_1 ENST00000556583.1 ; transcript_alias_2 RP11-770J1.3-004 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000411263.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	118401706	118401809	.	-	.	gene_id lnc-IFT46-1 ; transcript_id lnc-IFT46-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255435.2 ; gene_alias_2 RP11-770J1.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000166407.2 ; transcript_alias_1 ENST00000556583.1 ; transcript_alias_2 RP11-770J1.3-004 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000411263.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	20252830	20252922	.	+	.	gene_id lnc-MPHOSPH8-1 ; transcript_id lnc-MPHOSPH8-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000237644.1 ; gene_alias_2 PSPC1-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000016500.1 ; transcript_alias_1 ENST00000426340.1 ; transcript_alias_2 PSPC1-AS1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000044034.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	20253668	20253837	.	+	.	gene_id lnc-MPHOSPH8-1 ; transcript_id lnc-MPHOSPH8-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000237644.1 ; gene_alias_2 PSPC1-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000016500.1 ; transcript_alias_1 ENST00000426340.1 ; transcript_alias_2 PSPC1-AS1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000044034.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	2637585	2637656	.	+	.	gene_id lnc-TMC2-2 ; transcript_id lnc-TMC2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226572.1 ; gene_alias_2 SNORD57 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000031705.1 ; transcript_alias_1 ENST00000448188.1 ; transcript_alias_2 SNORD57-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000077642.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	59936497	59936525	.	-	.	gene_id lnc-GTF2A2-1 ; transcript_id lnc-GTF2A2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227161.1 ; gene_alias_2 AC092755.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000152880.1 ; transcript_alias_1 ENST00000441746.1 ; transcript_alias_2 AC092755.4-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000328345.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	59964434	59964501	.	-	.	gene_id lnc-GTF2A2-1 ; transcript_id lnc-GTF2A2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227161.1 ; gene_alias_2 AC092755.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000152880.1 ; transcript_alias_1 ENST00000441746.1 ; transcript_alias_2 AC092755.4-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000328345.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	2637270	2637340	.	+	.	gene_id lnc-TMC2-1 ; transcript_id lnc-TMC2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229686.1 ; gene_alias_2 SNORD56 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000031704.1 ; transcript_alias_1 ENST00000413522.1 ; transcript_alias_2 SNORD56-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000077641.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	20646835	20647237	.	-	.	gene_id lnc-PUM2-1 ; transcript_id lnc-PUM2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247111 ; transcript_alias_1 ENST00000500120 ;
chr2	lncipedia.org	exon	20647622	20648681	.	-	.	gene_id lnc-PUM2-1 ; transcript_id lnc-PUM2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247111 ; transcript_alias_1 ENST00000500120 ;
chr6	lncipedia.org	exon	112475967	112476116	.	+	.	gene_id lnc-C6orf225-1 ; transcript_id lnc-C6orf225-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000237234.1 ; gene_alias_2 RP1-142L7.5 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000015384.1 ; transcript_alias_1 ENST00000425503.1 ; transcript_alias_2 RP1-142L7.5-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000041871.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	112476522	112476738	.	+	.	gene_id lnc-C6orf225-1 ; transcript_id lnc-C6orf225-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000237234.1 ; gene_alias_2 RP1-142L7.5 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000015384.1 ; transcript_alias_1 ENST00000425503.1 ; transcript_alias_2 RP1-142L7.5-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000041871.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	112479120	112479166	.	+	.	gene_id lnc-C6orf225-1 ; transcript_id lnc-C6orf225-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000237234.1 ; gene_alias_2 RP1-142L7.5 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000015384.1 ; transcript_alias_1 ENST00000425503.1 ; transcript_alias_2 RP1-142L7.5-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000041871.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	112479405	112479534	.	+	.	gene_id lnc-C6orf225-1 ; transcript_id lnc-C6orf225-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000237234.1 ; gene_alias_2 RP1-142L7.5 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000015384.1 ; transcript_alias_1 ENST00000425503.1 ; transcript_alias_2 RP1-142L7.5-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000041871.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	9181486	9182046	.	-	.	gene_id lnc-RP11-1396O13.13.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-1396O13.13.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000226350 ; gene_alias_2 AC108519.1 ; transcript_alias_1 ENST00000429096 ;
chr4	lncipedia.org	exon	9203759	9203823	.	-	.	gene_id lnc-RP11-1396O13.13.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-1396O13.13.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000226350 ; gene_alias_2 AC108519.1 ; transcript_alias_1 ENST00000429096 ;
chr4	lncipedia.org	exon	9204287	9204354	.	-	.	gene_id lnc-RP11-1396O13.13.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-1396O13.13.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000226350 ; gene_alias_2 AC108519.1 ; transcript_alias_1 ENST00000429096 ;
chr4	lncipedia.org	exon	9204622	9204689	.	-	.	gene_id lnc-RP11-1396O13.13.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-1396O13.13.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000226350 ; gene_alias_2 AC108519.1 ; transcript_alias_1 ENST00000429096 ;
chr4	lncipedia.org	exon	9204937	9204998	.	-	.	gene_id lnc-RP11-1396O13.13.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-1396O13.13.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000226350 ; gene_alias_2 AC108519.1 ; transcript_alias_1 ENST00000429096 ;
chr4	lncipedia.org	exon	9376813	9376876	.	-	.	gene_id lnc-RP11-1396O13.13.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-1396O13.13.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000226350 ; gene_alias_2 AC108519.1 ; transcript_alias_1 ENST00000429096 ;
chr4	lncipedia.org	exon	9382574	9383121	.	-	.	gene_id lnc-RP11-1396O13.13.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-1396O13.13.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000226350 ; gene_alias_2 AC108519.1 ; transcript_alias_1 ENST00000429096 ;
chr1	lncipedia.org	exon	2482415	2483226	.	+	.	gene_id lnc-TNFRSF14-1 ; transcript_id lnc-TNFRSF14-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_000022 ; gene_alias_2 linc-TNFRSF14 ; transcript_alias_1 TCONS_00000807 ;
chr1	lncipedia.org	exon	2483442	2486841	.	+	.	gene_id lnc-TNFRSF14-1 ; transcript_id lnc-TNFRSF14-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_000022 ; gene_alias_2 linc-TNFRSF14 ; transcript_alias_1 TCONS_00000807 ;
chrY	lncipedia.org	exon	1803010	1803089	.	+	.	gene_id lnc-RPS4Y1-4 ; transcript_id lnc-RPS4Y1-4:2 ; gene_alias_1 XLOC_008272 ; gene_alias_2 linc-CD99-8 ; gene_alias_3 ENSGR0000223511.1 ; gene_alias_4 RP13-297E16.4 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000021062.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017602 ; transcript_alias_2 ENSTR0000432272.1 ; transcript_alias_3 RP13-297E16.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000055606.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	1824577	1824878	.	+	.	gene_id lnc-RPS4Y1-4 ; transcript_id lnc-RPS4Y1-4:2 ; gene_alias_1 XLOC_008272 ; gene_alias_2 linc-CD99-8 ; gene_alias_3 ENSGR0000223511.1 ; gene_alias_4 RP13-297E16.4 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000021062.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017602 ; transcript_alias_2 ENSTR0000432272.1 ; transcript_alias_3 RP13-297E16.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000055606.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	45396446	45397167	.	-	.	gene_id lnc-KIAA0930-3 ; transcript_id lnc-KIAA0930-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230922.1 ; gene_alias_2 RP4-753M9.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000153503.1 ; transcript_alias_1 ENST00000424580.1 ; transcript_alias_2 RP4-753M9.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000331388.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	45397748	45397903	.	-	.	gene_id lnc-KIAA0930-3 ; transcript_id lnc-KIAA0930-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230922.1 ; gene_alias_2 RP4-753M9.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000153503.1 ; transcript_alias_1 ENST00000424580.1 ; transcript_alias_2 RP4-753M9.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000331388.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	45398746	45399500	.	-	.	gene_id lnc-KIAA0930-3 ; transcript_id lnc-KIAA0930-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230922.1 ; gene_alias_2 RP4-753M9.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000153503.1 ; transcript_alias_1 ENST00000424580.1 ; transcript_alias_2 RP4-753M9.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000331388.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	5361768	5362592	.	-	.	gene_id lnc-HBE1-1 ; transcript_id lnc-HBE1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000167355.3 ; gene_alias_2 AC104389.28 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000066670.2 ; transcript_alias_1 ENST00000415970.1 ; transcript_alias_2 AC104389.28-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000142962.2 ;
chr11	lncipedia.org	exon	5367003	5367129	.	-	.	gene_id lnc-HBE1-1 ; transcript_id lnc-HBE1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000167355.3 ; gene_alias_2 AC104389.28 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000066670.2 ; transcript_alias_1 ENST00000415970.1 ; transcript_alias_2 AC104389.28-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000142962.2 ;
chr11	lncipedia.org	exon	5367492	5367583	.	-	.	gene_id lnc-HBE1-1 ; transcript_id lnc-HBE1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000167355.3 ; gene_alias_2 AC104389.28 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000066670.2 ; transcript_alias_1 ENST00000415970.1 ; transcript_alias_2 AC104389.28-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000142962.2 ;
chr11	lncipedia.org	exon	5368106	5368140	.	-	.	gene_id lnc-HBE1-1 ; transcript_id lnc-HBE1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000167355.3 ; gene_alias_2 AC104389.28 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000066670.2 ; transcript_alias_1 ENST00000415970.1 ; transcript_alias_2 AC104389.28-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000142962.2 ;
chr11	lncipedia.org	exon	5526799	5526882	.	-	.	gene_id lnc-HBE1-1 ; transcript_id lnc-HBE1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000167355.3 ; gene_alias_2 AC104389.28 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000066670.2 ; transcript_alias_1 ENST00000415970.1 ; transcript_alias_2 AC104389.28-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000142962.2 ;
chr2	lncipedia.org	exon	243029505	243030608	.	-	.	gene_id lnc-AC131097.4.1-4 ; transcript_id lnc-AC131097.4.1-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000261186.1 ; gene_alias_2 RP11-341N2.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000176311.1 ; transcript_alias_1 ENST00000567549.1 ; transcript_alias_2 RP11-341N2.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000431748.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	134605490	134606436	.	+	.	gene_id lnc-GLB1L2-4 ; transcript_id lnc-GLB1L2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251226 ; gene_alias_2 RP11-469N6.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251226.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165126.2 ; transcript_alias_1 ENST00000513405 ; transcript_alias_2 ENST00000513405.1 ; transcript_alias_3 RP11-469N6.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000382010.2 ;
chr11	lncipedia.org	exon	134630968	134633704	.	+	.	gene_id lnc-GLB1L2-4 ; transcript_id lnc-GLB1L2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251226 ; gene_alias_2 RP11-469N6.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251226.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165126.2 ; transcript_alias_1 ENST00000513405 ; transcript_alias_2 ENST00000513405.1 ; transcript_alias_3 RP11-469N6.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000382010.2 ;
chr1	lncipedia.org	exon	529833	530136	.	+	.	gene_id lnc-OR4F29-3 ; transcript_id lnc-OR4F29-3:3 ; gene_alias_1 XLOC_000004 ; gene_alias_2 linc-SAMD11-8 ; gene_alias_3 ENSG00000239664 ; gene_alias_4 RP5-857K21.3 ; gene_alias_5 ENSG00000239664.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000002330.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000124 ; transcript_alias_2 ENST00000440196 ; transcript_alias_3 ENST00000440196.1 ; transcript_alias_4 RP5-857K21.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000006708.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	530463	530595	.	+	.	gene_id lnc-OR4F29-3 ; transcript_id lnc-OR4F29-3:3 ; gene_alias_1 XLOC_000004 ; gene_alias_2 linc-SAMD11-8 ; gene_alias_3 ENSG00000239664 ; gene_alias_4 RP5-857K21.3 ; gene_alias_5 ENSG00000239664.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000002330.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000124 ; transcript_alias_2 ENST00000440196 ; transcript_alias_3 ENST00000440196.1 ; transcript_alias_4 RP5-857K21.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000006708.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	30003207	30003760	.	-	.	gene_id lnc-RNF39-4 ; transcript_id lnc-RNF39-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000204623 ; gene_alias_2 ZNRD1-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000204623.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031109.3 ; transcript_alias_1 ENST00000421692 ; transcript_alias_2 ENST00000421692.1 ; transcript_alias_3 ZNRD1-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000076180.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	30024868	30025494	.	-	.	gene_id lnc-RNF39-4 ; transcript_id lnc-RNF39-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000204623 ; gene_alias_2 ZNRD1-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000204623.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031109.3 ; transcript_alias_1 ENST00000421692 ; transcript_alias_2 ENST00000421692.1 ; transcript_alias_3 ZNRD1-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000076180.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	30025892	30025967	.	-	.	gene_id lnc-RNF39-4 ; transcript_id lnc-RNF39-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000204623 ; gene_alias_2 ZNRD1-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000204623.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031109.3 ; transcript_alias_1 ENST00000421692 ; transcript_alias_2 ENST00000421692.1 ; transcript_alias_3 ZNRD1-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000076180.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	30028518	30028966	.	-	.	gene_id lnc-RNF39-4 ; transcript_id lnc-RNF39-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000204623 ; gene_alias_2 ZNRD1-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000204623.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031109.3 ; transcript_alias_1 ENST00000421692 ; transcript_alias_2 ENST00000421692.1 ; transcript_alias_3 ZNRD1-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000076180.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	28814097	28814333	.	+	.	gene_id lnc-ATXN2L-1 ; transcript_id lnc-ATXN2L-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251417 ; gene_alias_2 AC145285.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251417.1 ; gene_alias_4 RP11-1348G14.4 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000175740.1 ; transcript_alias_1 ENST00000507031 ; transcript_alias_2 ENST00000507031.1 ; transcript_alias_3 RP11-1348G14.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000431010.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	28827457	28829149	.	+	.	gene_id lnc-ATXN2L-1 ; transcript_id lnc-ATXN2L-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251417 ; gene_alias_2 AC145285.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251417.1 ; gene_alias_4 RP11-1348G14.4 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000175740.1 ; transcript_alias_1 ENST00000507031 ; transcript_alias_2 ENST00000507031.1 ; transcript_alias_3 RP11-1348G14.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000431010.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	67653967	67654160	.	+	.	gene_id lnc-NDUFS8-2 ; transcript_id lnc-NDUFS8-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000251637 ; gene_alias_2 XLOC_009181 ; gene_alias_3 linc-ALDH3B1-1 ; gene_alias_4 RP11-119D9.1 ; gene_alias_5 ENSG00000251637.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000167223.1 ; transcript_alias_1 ENST00000511677 ; transcript_alias_2 TCONS_00019099 ; transcript_alias_3 ENST00000511677.1 ; transcript_alias_4 RP11-119D9.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000393800.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	67655624	67658816	.	+	.	gene_id lnc-NDUFS8-2 ; transcript_id lnc-NDUFS8-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000251637 ; gene_alias_2 XLOC_009181 ; gene_alias_3 linc-ALDH3B1-1 ; gene_alias_4 RP11-119D9.1 ; gene_alias_5 ENSG00000251637.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000167223.1 ; transcript_alias_1 ENST00000511677 ; transcript_alias_2 TCONS_00019099 ; transcript_alias_3 ENST00000511677.1 ; transcript_alias_4 RP11-119D9.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000393800.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45010211	45010266	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000448350 ; transcript_alias_2 ENST00000448350.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323034.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45015088	45015213	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000448350 ; transcript_alias_2 ENST00000448350.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323034.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45015695	45015730	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000448350 ; transcript_alias_2 ENST00000448350.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323034.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45016075	45016136	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000448350 ; transcript_alias_2 ENST00000448350.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323034.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45016926	45017012	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000448350 ; transcript_alias_2 ENST00000448350.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323034.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45017231	45017348	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000448350 ; transcript_alias_2 ENST00000448350.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323034.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45024508	45024786	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000448350 ; transcript_alias_2 ENST00000448350.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323034.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45026663	45026941	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000448350 ; transcript_alias_2 ENST00000448350.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323034.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45028019	45028294	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000448350 ; transcript_alias_2 ENST00000448350.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323034.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45029134	45029277	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000448350 ; transcript_alias_2 ENST00000448350.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323034.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45033481	45033548	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000448350 ; transcript_alias_2 ENST00000448350.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323034.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	97889472	97889749	.	+	.	gene_id lnc-CCNJ-1 ; transcript_id lnc-CCNJ-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000177853 ; gene_alias_2 ZNF518A ; gene_alias_3 ENSG00000177853.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018828.3 ; transcript_alias_1 ENST00000534948 ; transcript_alias_2 ENST00000534948.1 ; transcript_alias_3 ZNF518A-202 ;
chr10	lncipedia.org	exon	97892343	97892427	.	+	.	gene_id lnc-CCNJ-1 ; transcript_id lnc-CCNJ-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000177853 ; gene_alias_2 ZNF518A ; gene_alias_3 ENSG00000177853.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018828.3 ; transcript_alias_1 ENST00000534948 ; transcript_alias_2 ENST00000534948.1 ; transcript_alias_3 ZNF518A-202 ;
chr10	lncipedia.org	exon	97893313	97893405	.	+	.	gene_id lnc-CCNJ-1 ; transcript_id lnc-CCNJ-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000177853 ; gene_alias_2 ZNF518A ; gene_alias_3 ENSG00000177853.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018828.3 ; transcript_alias_1 ENST00000534948 ; transcript_alias_2 ENST00000534948.1 ; transcript_alias_3 ZNF518A-202 ;
chr10	lncipedia.org	exon	97911173	97911323	.	+	.	gene_id lnc-CCNJ-1 ; transcript_id lnc-CCNJ-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000177853 ; gene_alias_2 ZNF518A ; gene_alias_3 ENSG00000177853.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018828.3 ; transcript_alias_1 ENST00000534948 ; transcript_alias_2 ENST00000534948.1 ; transcript_alias_3 ZNF518A-202 ;
chr10	lncipedia.org	exon	97915681	97915804	.	+	.	gene_id lnc-CCNJ-1 ; transcript_id lnc-CCNJ-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000177853 ; gene_alias_2 ZNF518A ; gene_alias_3 ENSG00000177853.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018828.3 ; transcript_alias_1 ENST00000534948 ; transcript_alias_2 ENST00000534948.1 ; transcript_alias_3 ZNF518A-202 ;
chr10	lncipedia.org	exon	97915954	97920099	.	+	.	gene_id lnc-CCNJ-1 ; transcript_id lnc-CCNJ-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000177853 ; gene_alias_2 ZNF518A ; gene_alias_3 ENSG00000177853.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018828.3 ; transcript_alias_1 ENST00000534948 ; transcript_alias_2 ENST00000534948.1 ; transcript_alias_3 ZNF518A-202 ;
chr10	lncipedia.org	exon	97920102	97923508	.	+	.	gene_id lnc-CCNJ-1 ; transcript_id lnc-CCNJ-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000177853 ; gene_alias_2 ZNF518A ; gene_alias_3 ENSG00000177853.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018828.3 ; transcript_alias_1 ENST00000534948 ; transcript_alias_2 ENST00000534948.1 ; transcript_alias_3 ZNF518A-202 ;
chr2	lncipedia.org	exon	19167729	19169146	.	-	.	gene_id lnc-OSR1-3 ; transcript_id lnc-OSR1-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000236204 ; gene_alias_2 AC092594.1 ; gene_alias_3 ENSG00000236204.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151766.2 ; transcript_alias_1 ENST00000424895 ; transcript_alias_2 ENST00000424895.1 ; transcript_alias_3 AC092594.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323831.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	19176593	19176638	.	-	.	gene_id lnc-OSR1-3 ; transcript_id lnc-OSR1-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000236204 ; gene_alias_2 AC092594.1 ; gene_alias_3 ENSG00000236204.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151766.2 ; transcript_alias_1 ENST00000424895 ; transcript_alias_2 ENST00000424895.1 ; transcript_alias_3 AC092594.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323831.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	19203592	19203745	.	-	.	gene_id lnc-OSR1-3 ; transcript_id lnc-OSR1-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000236204 ; gene_alias_2 AC092594.1 ; gene_alias_3 ENSG00000236204.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151766.2 ; transcript_alias_1 ENST00000424895 ; transcript_alias_2 ENST00000424895.1 ; transcript_alias_3 AC092594.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323831.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	19226396	19226726	.	-	.	gene_id lnc-OSR1-3 ; transcript_id lnc-OSR1-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000236204 ; gene_alias_2 AC092594.1 ; gene_alias_3 ENSG00000236204.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151766.2 ; transcript_alias_1 ENST00000424895 ; transcript_alias_2 ENST00000424895.1 ; transcript_alias_3 AC092594.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323831.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	156657489	156660673	.	-	.	gene_id lnc-CRABP2-2 ; transcript_id lnc-CRABP2-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_001047 ; gene_alias_2 linc-NES ; gene_alias_3 ENSG00000237588 ; gene_alias_4 RP11-66D17.3 ; gene_alias_5 ENSG00000237588.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000041297.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000646 ; transcript_alias_2 ENST00000441272 ; transcript_alias_3 ENST00000441272.1 ; transcript_alias_4 RP11-66D17.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000098960.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	156660855	156661789	.	-	.	gene_id lnc-CRABP2-2 ; transcript_id lnc-CRABP2-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_001047 ; gene_alias_2 linc-NES ; gene_alias_3 ENSG00000237588 ; gene_alias_4 RP11-66D17.3 ; gene_alias_5 ENSG00000237588.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000041297.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000646 ; transcript_alias_2 ENST00000441272 ; transcript_alias_3 ENST00000441272.1 ; transcript_alias_4 RP11-66D17.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000098960.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	189376732	189376828	.	+	.	gene_id lnc-TRIML1-3 ; transcript_id lnc-TRIML1-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249378 ; gene_alias_2 RP11-219G10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000249378.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160242.4 ; transcript_alias_1 ENST00000510832 ; transcript_alias_2 ENST00000510832.1 ; transcript_alias_3 RP11-219G10.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000359857.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	189377818	189377916	.	+	.	gene_id lnc-TRIML1-3 ; transcript_id lnc-TRIML1-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249378 ; gene_alias_2 RP11-219G10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000249378.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160242.4 ; transcript_alias_1 ENST00000510832 ; transcript_alias_2 ENST00000510832.1 ; transcript_alias_3 RP11-219G10.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000359857.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	189397852	189397910	.	+	.	gene_id lnc-TRIML1-3 ; transcript_id lnc-TRIML1-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249378 ; gene_alias_2 RP11-219G10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000249378.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160242.4 ; transcript_alias_1 ENST00000510832 ; transcript_alias_2 ENST00000510832.1 ; transcript_alias_3 RP11-219G10.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000359857.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	189398792	189399066	.	+	.	gene_id lnc-TRIML1-3 ; transcript_id lnc-TRIML1-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249378 ; gene_alias_2 RP11-219G10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000249378.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160242.4 ; transcript_alias_1 ENST00000510832 ; transcript_alias_2 ENST00000510832.1 ; transcript_alias_3 RP11-219G10.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000359857.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	189406933	189407019	.	+	.	gene_id lnc-TRIML1-3 ; transcript_id lnc-TRIML1-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249378 ; gene_alias_2 RP11-219G10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000249378.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160242.4 ; transcript_alias_1 ENST00000510832 ; transcript_alias_2 ENST00000510832.1 ; transcript_alias_3 RP11-219G10.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000359857.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	189457889	189459706	.	+	.	gene_id lnc-TRIML1-3 ; transcript_id lnc-TRIML1-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249378 ; gene_alias_2 RP11-219G10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000249378.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160242.4 ; transcript_alias_1 ENST00000510832 ; transcript_alias_2 ENST00000510832.1 ; transcript_alias_3 RP11-219G10.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000359857.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	25676863	25678482	.	-	.	gene_id lnc-MRPL39-9 ; transcript_id lnc-MRPL39-9:1 ; gene_alias_1 XLOC_014030 ; gene_alias_2 linc-TMPRSS15-14 ; gene_alias_3 ENSG00000224832 ; gene_alias_4 AP000469.2 ; gene_alias_5 ENSG00000224832.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000078332.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00028891 ; transcript_alias_2 ENST00000416218 ; transcript_alias_3 ENST00000416218.1 ; transcript_alias_4 AP000469.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000171146.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	25679932	25680072	.	-	.	gene_id lnc-MRPL39-9 ; transcript_id lnc-MRPL39-9:1 ; gene_alias_1 XLOC_014030 ; gene_alias_2 linc-TMPRSS15-14 ; gene_alias_3 ENSG00000224832 ; gene_alias_4 AP000469.2 ; gene_alias_5 ENSG00000224832.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000078332.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00028891 ; transcript_alias_2 ENST00000416218 ; transcript_alias_3 ENST00000416218.1 ; transcript_alias_4 AP000469.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000171146.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	25680529	25680646	.	-	.	gene_id lnc-MRPL39-9 ; transcript_id lnc-MRPL39-9:1 ; gene_alias_1 XLOC_014030 ; gene_alias_2 linc-TMPRSS15-14 ; gene_alias_3 ENSG00000224832 ; gene_alias_4 AP000469.2 ; gene_alias_5 ENSG00000224832.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000078332.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00028891 ; transcript_alias_2 ENST00000416218 ; transcript_alias_3 ENST00000416218.1 ; transcript_alias_4 AP000469.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000171146.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	25693563	25693690	.	-	.	gene_id lnc-MRPL39-9 ; transcript_id lnc-MRPL39-9:1 ; gene_alias_1 XLOC_014030 ; gene_alias_2 linc-TMPRSS15-14 ; gene_alias_3 ENSG00000224832 ; gene_alias_4 AP000469.2 ; gene_alias_5 ENSG00000224832.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000078332.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00028891 ; transcript_alias_2 ENST00000416218 ; transcript_alias_3 ENST00000416218.1 ; transcript_alias_4 AP000469.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000171146.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	151329132	151329224	.	+	.	gene_id lnc-G3BP1-4 ; transcript_id lnc-G3BP1-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_004607 ; gene_alias_2 linc-GRIA1 ; gene_alias_3 ENSG00000254226 ; gene_alias_4 CTB-12O2.1 ; gene_alias_5 ENSG00000254226.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000163523.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009263 ; transcript_alias_2 ENST00000524295 ; transcript_alias_3 ENST00000524295.1 ; transcript_alias_4 CTB-12O2.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000373979.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	151330535	151330597	.	+	.	gene_id lnc-G3BP1-4 ; transcript_id lnc-G3BP1-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_004607 ; gene_alias_2 linc-GRIA1 ; gene_alias_3 ENSG00000254226 ; gene_alias_4 CTB-12O2.1 ; gene_alias_5 ENSG00000254226.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000163523.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009263 ; transcript_alias_2 ENST00000524295 ; transcript_alias_3 ENST00000524295.1 ; transcript_alias_4 CTB-12O2.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000373979.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	151331199	151331241	.	+	.	gene_id lnc-G3BP1-4 ; transcript_id lnc-G3BP1-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_004607 ; gene_alias_2 linc-GRIA1 ; gene_alias_3 ENSG00000254226 ; gene_alias_4 CTB-12O2.1 ; gene_alias_5 ENSG00000254226.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000163523.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009263 ; transcript_alias_2 ENST00000524295 ; transcript_alias_3 ENST00000524295.1 ; transcript_alias_4 CTB-12O2.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000373979.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	151574285	151574365	.	+	.	gene_id lnc-G3BP1-4 ; transcript_id lnc-G3BP1-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_004607 ; gene_alias_2 linc-GRIA1 ; gene_alias_3 ENSG00000254226 ; gene_alias_4 CTB-12O2.1 ; gene_alias_5 ENSG00000254226.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000163523.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009263 ; transcript_alias_2 ENST00000524295 ; transcript_alias_3 ENST00000524295.1 ; transcript_alias_4 CTB-12O2.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000373979.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	151575002	151575091	.	+	.	gene_id lnc-G3BP1-4 ; transcript_id lnc-G3BP1-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_004607 ; gene_alias_2 linc-GRIA1 ; gene_alias_3 ENSG00000254226 ; gene_alias_4 CTB-12O2.1 ; gene_alias_5 ENSG00000254226.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000163523.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009263 ; transcript_alias_2 ENST00000524295 ; transcript_alias_3 ENST00000524295.1 ; transcript_alias_4 CTB-12O2.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000373979.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	151610824	151610860	.	+	.	gene_id lnc-G3BP1-4 ; transcript_id lnc-G3BP1-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_004607 ; gene_alias_2 linc-GRIA1 ; gene_alias_3 ENSG00000254226 ; gene_alias_4 CTB-12O2.1 ; gene_alias_5 ENSG00000254226.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000163523.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009263 ; transcript_alias_2 ENST00000524295 ; transcript_alias_3 ENST00000524295.1 ; transcript_alias_4 CTB-12O2.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000373979.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	151646826	151650009	.	+	.	gene_id lnc-G3BP1-4 ; transcript_id lnc-G3BP1-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_004607 ; gene_alias_2 linc-GRIA1 ; gene_alias_3 ENSG00000254226 ; gene_alias_4 CTB-12O2.1 ; gene_alias_5 ENSG00000254226.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000163523.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009263 ; transcript_alias_2 ENST00000524295 ; transcript_alias_3 ENST00000524295.1 ; transcript_alias_4 CTB-12O2.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000373979.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	144593720	144593936	.	+	.	gene_id lnc-AL592284.1-1 ; transcript_id lnc-AL592284.1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000225241 ; gene_alias_2 NBPF8 ; gene_alias_3 ENSG00000225241.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000447534 ; transcript_alias_2 ENST00000447534.1 ; transcript_alias_3 NBPF8-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000038363.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	144598512	144598780	.	+	.	gene_id lnc-AL592284.1-1 ; transcript_id lnc-AL592284.1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000225241 ; gene_alias_2 NBPF8 ; gene_alias_3 ENSG00000225241.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000447534 ; transcript_alias_2 ENST00000447534.1 ; transcript_alias_3 NBPF8-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000038363.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	144599603	144601500	.	+	.	gene_id lnc-AL592284.1-1 ; transcript_id lnc-AL592284.1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000225241 ; gene_alias_2 NBPF8 ; gene_alias_3 ENSG00000225241.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000447534 ; transcript_alias_2 ENST00000447534.1 ; transcript_alias_3 NBPF8-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000038363.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	144605442	144605701	.	+	.	gene_id lnc-AL592284.1-1 ; transcript_id lnc-AL592284.1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000225241 ; gene_alias_2 NBPF8 ; gene_alias_3 ENSG00000225241.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000447534 ; transcript_alias_2 ENST00000447534.1 ; transcript_alias_3 NBPF8-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000038363.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	109459346	109461970	.	-	.	gene_id lnc-AGXT2L1-1 ; transcript_id lnc-AGXT2L1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000234492 ; gene_alias_2 RP11-462C24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000234492.3 ; gene_alias_4 RPL34-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000161030.1 ; transcript_alias_1 ENST00000450161 ; transcript_alias_2 ENST00000450161.2 ; transcript_alias_3 RPL34-AS1-201 ;
chr4	lncipedia.org	exon	109463175	109463372	.	-	.	gene_id lnc-AGXT2L1-1 ; transcript_id lnc-AGXT2L1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000234492 ; gene_alias_2 RP11-462C24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000234492.3 ; gene_alias_4 RPL34-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000161030.1 ; transcript_alias_1 ENST00000450161 ; transcript_alias_2 ENST00000450161.2 ; transcript_alias_3 RPL34-AS1-201 ;
chr4	lncipedia.org	exon	109477421	109477917	.	-	.	gene_id lnc-AGXT2L1-1 ; transcript_id lnc-AGXT2L1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000234492 ; gene_alias_2 RP11-462C24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000234492.3 ; gene_alias_4 RPL34-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000161030.1 ; transcript_alias_1 ENST00000450161 ; transcript_alias_2 ENST00000450161.2 ; transcript_alias_3 RPL34-AS1-201 ;
chr4	lncipedia.org	exon	109477920	109478220	.	-	.	gene_id lnc-AGXT2L1-1 ; transcript_id lnc-AGXT2L1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000234492 ; gene_alias_2 RP11-462C24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000234492.3 ; gene_alias_4 RPL34-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000161030.1 ; transcript_alias_1 ENST00000450161 ; transcript_alias_2 ENST00000450161.2 ; transcript_alias_3 RPL34-AS1-201 ;
chr4	lncipedia.org	exon	109541464	109541553	.	-	.	gene_id lnc-AGXT2L1-1 ; transcript_id lnc-AGXT2L1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000234492 ; gene_alias_2 RP11-462C24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000234492.3 ; gene_alias_4 RPL34-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000161030.1 ; transcript_alias_1 ENST00000450161 ; transcript_alias_2 ENST00000450161.2 ; transcript_alias_3 RPL34-AS1-201 ;
chr11	lncipedia.org	exon	59036349	59039081	.	-	.	gene_id lnc-MPEG1-1 ; transcript_id lnc-MPEG1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000214797 ; gene_alias_2 RP11-1036E20.9 ; gene_alias_3 ENSG00000214797.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167437.1 ; transcript_alias_1 ENST00000399003 ; transcript_alias_2 ENST00000399003.1 ; transcript_alias_3 RP11-1036E20.9-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000394611.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	59051435	59051506	.	-	.	gene_id lnc-MPEG1-1 ; transcript_id lnc-MPEG1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000214797 ; gene_alias_2 RP11-1036E20.9 ; gene_alias_3 ENSG00000214797.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167437.1 ; transcript_alias_1 ENST00000399003 ; transcript_alias_2 ENST00000399003.1 ; transcript_alias_3 RP11-1036E20.9-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000394611.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105050836	105050981	.	+	.	gene_id lnc-POU3F3-4 ; transcript_id lnc-POU3F3-4:7 ; gene_alias_1 ENSG00000235597 ; gene_alias_2 AC013402.2 ; gene_alias_3 ENSG00000235597.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153050.1 ; transcript_alias_1 ENST00000447380 ; transcript_alias_2 ENST00000447380.1 ; transcript_alias_3 AC013402.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000329244.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105122324	105122761	.	+	.	gene_id lnc-POU3F3-4 ; transcript_id lnc-POU3F3-4:7 ; gene_alias_1 ENSG00000235597 ; gene_alias_2 AC013402.2 ; gene_alias_3 ENSG00000235597.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153050.1 ; transcript_alias_1 ENST00000447380 ; transcript_alias_2 ENST00000447380.1 ; transcript_alias_3 AC013402.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000329244.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105123690	105123864	.	+	.	gene_id lnc-POU3F3-4 ; transcript_id lnc-POU3F3-4:7 ; gene_alias_1 ENSG00000235597 ; gene_alias_2 AC013402.2 ; gene_alias_3 ENSG00000235597.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153050.1 ; transcript_alias_1 ENST00000447380 ; transcript_alias_2 ENST00000447380.1 ; transcript_alias_3 AC013402.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000329244.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105128501	105129215	.	+	.	gene_id lnc-POU3F3-4 ; transcript_id lnc-POU3F3-4:7 ; gene_alias_1 ENSG00000235597 ; gene_alias_2 AC013402.2 ; gene_alias_3 ENSG00000235597.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153050.1 ; transcript_alias_1 ENST00000447380 ; transcript_alias_2 ENST00000447380.1 ; transcript_alias_3 AC013402.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000329244.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	22114913	22116151	.	-	.	gene_id lnc-TMPRSS15-9 ; transcript_id lnc-TMPRSS15-9:8 ; gene_alias_1 ENSG00000224924 ; gene_alias_2 NCRNA00320 ; gene_alias_3 ENSG00000224924.1 ; gene_alias_4 LINC00320 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000078063.1 ; transcript_alias_1 ENST00000437238 ; transcript_alias_2 ENST00000437238.1 ; transcript_alias_3 LINC00320-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000170849.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	22150736	22150865	.	-	.	gene_id lnc-TMPRSS15-9 ; transcript_id lnc-TMPRSS15-9:8 ; gene_alias_1 ENSG00000224924 ; gene_alias_2 NCRNA00320 ; gene_alias_3 ENSG00000224924.1 ; gene_alias_4 LINC00320 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000078063.1 ; transcript_alias_1 ENST00000437238 ; transcript_alias_2 ENST00000437238.1 ; transcript_alias_3 LINC00320-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000170849.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	22150961	22151080	.	-	.	gene_id lnc-TMPRSS15-9 ; transcript_id lnc-TMPRSS15-9:8 ; gene_alias_1 ENSG00000224924 ; gene_alias_2 NCRNA00320 ; gene_alias_3 ENSG00000224924.1 ; gene_alias_4 LINC00320 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000078063.1 ; transcript_alias_1 ENST00000437238 ; transcript_alias_2 ENST00000437238.1 ; transcript_alias_3 LINC00320-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000170849.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	22153667	22153792	.	-	.	gene_id lnc-TMPRSS15-9 ; transcript_id lnc-TMPRSS15-9:8 ; gene_alias_1 ENSG00000224924 ; gene_alias_2 NCRNA00320 ; gene_alias_3 ENSG00000224924.1 ; gene_alias_4 LINC00320 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000078063.1 ; transcript_alias_1 ENST00000437238 ; transcript_alias_2 ENST00000437238.1 ; transcript_alias_3 LINC00320-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000170849.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	22153888	22153979	.	-	.	gene_id lnc-TMPRSS15-9 ; transcript_id lnc-TMPRSS15-9:8 ; gene_alias_1 ENSG00000224924 ; gene_alias_2 NCRNA00320 ; gene_alias_3 ENSG00000224924.1 ; gene_alias_4 LINC00320 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000078063.1 ; transcript_alias_1 ENST00000437238 ; transcript_alias_2 ENST00000437238.1 ; transcript_alias_3 LINC00320-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000170849.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	22154625	22154764	.	-	.	gene_id lnc-TMPRSS15-9 ; transcript_id lnc-TMPRSS15-9:8 ; gene_alias_1 ENSG00000224924 ; gene_alias_2 NCRNA00320 ; gene_alias_3 ENSG00000224924.1 ; gene_alias_4 LINC00320 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000078063.1 ; transcript_alias_1 ENST00000437238 ; transcript_alias_2 ENST00000437238.1 ; transcript_alias_3 LINC00320-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000170849.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	22158354	22158406	.	-	.	gene_id lnc-TMPRSS15-9 ; transcript_id lnc-TMPRSS15-9:8 ; gene_alias_1 ENSG00000224924 ; gene_alias_2 NCRNA00320 ; gene_alias_3 ENSG00000224924.1 ; gene_alias_4 LINC00320 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000078063.1 ; transcript_alias_1 ENST00000437238 ; transcript_alias_2 ENST00000437238.1 ; transcript_alias_3 LINC00320-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000170849.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	22175313	22175416	.	-	.	gene_id lnc-TMPRSS15-9 ; transcript_id lnc-TMPRSS15-9:8 ; gene_alias_1 ENSG00000224924 ; gene_alias_2 NCRNA00320 ; gene_alias_3 ENSG00000224924.1 ; gene_alias_4 LINC00320 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000078063.1 ; transcript_alias_1 ENST00000437238 ; transcript_alias_2 ENST00000437238.1 ; transcript_alias_3 LINC00320-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000170849.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	37504084	37505372	.	-	.	gene_id lnc-SETD4-3 ; transcript_id lnc-SETD4-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000236830 ; gene_alias_2 AP000689.8 ; gene_alias_3 ENSG00000236830.1 ; gene_alias_4 CBR3-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000086607.1 ; transcript_alias_1 ENST00000413862 ; transcript_alias_2 ENST00000413862.1 ; transcript_alias_3 CBR3-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000194620.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	37505985	37506059	.	-	.	gene_id lnc-SETD4-3 ; transcript_id lnc-SETD4-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000236830 ; gene_alias_2 AP000689.8 ; gene_alias_3 ENSG00000236830.1 ; gene_alias_4 CBR3-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000086607.1 ; transcript_alias_1 ENST00000413862 ; transcript_alias_2 ENST00000413862.1 ; transcript_alias_3 CBR3-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000194620.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	37518554	37518653	.	-	.	gene_id lnc-SETD4-3 ; transcript_id lnc-SETD4-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000236830 ; gene_alias_2 AP000689.8 ; gene_alias_3 ENSG00000236830.1 ; gene_alias_4 CBR3-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000086607.1 ; transcript_alias_1 ENST00000413862 ; transcript_alias_2 ENST00000413862.1 ; transcript_alias_3 CBR3-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000194620.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	37528515	37528593	.	-	.	gene_id lnc-SETD4-3 ; transcript_id lnc-SETD4-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000236830 ; gene_alias_2 AP000689.8 ; gene_alias_3 ENSG00000236830.1 ; gene_alias_4 CBR3-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000086607.1 ; transcript_alias_1 ENST00000413862 ; transcript_alias_2 ENST00000413862.1 ; transcript_alias_3 CBR3-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000194620.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	20632132	20632559	.	-	.	gene_id lnc-USP41-1 ; transcript_id lnc-USP41-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000223579 ; gene_alias_2 AC011718.2 ; gene_alias_3 ENSG00000223579.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150683.2 ; transcript_alias_1 ENST00000414550 ; transcript_alias_2 ENST00000414550.1 ; transcript_alias_3 AC011718.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000319604.2 ;
chr22	lncipedia.org	exon	20637203	20638159	.	-	.	gene_id lnc-USP41-1 ; transcript_id lnc-USP41-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000223579 ; gene_alias_2 AC011718.2 ; gene_alias_3 ENSG00000223579.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150683.2 ; transcript_alias_1 ENST00000414550 ; transcript_alias_2 ENST00000414550.1 ; transcript_alias_3 AC011718.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000319604.2 ;
chr22	lncipedia.org	exon	20643225	20643258	.	-	.	gene_id lnc-USP41-1 ; transcript_id lnc-USP41-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000223579 ; gene_alias_2 AC011718.2 ; gene_alias_3 ENSG00000223579.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150683.2 ; transcript_alias_1 ENST00000414550 ; transcript_alias_2 ENST00000414550.1 ; transcript_alias_3 AC011718.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000319604.2 ;
chr22	lncipedia.org	exon	20643724	20643785	.	-	.	gene_id lnc-USP41-1 ; transcript_id lnc-USP41-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000223579 ; gene_alias_2 AC011718.2 ; gene_alias_3 ENSG00000223579.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150683.2 ; transcript_alias_1 ENST00000414550 ; transcript_alias_2 ENST00000414550.1 ; transcript_alias_3 AC011718.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000319604.2 ;
chr22	lncipedia.org	exon	20645786	20645851	.	-	.	gene_id lnc-USP41-1 ; transcript_id lnc-USP41-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000223579 ; gene_alias_2 AC011718.2 ; gene_alias_3 ENSG00000223579.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150683.2 ; transcript_alias_1 ENST00000414550 ; transcript_alias_2 ENST00000414550.1 ; transcript_alias_3 AC011718.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000319604.2 ;
chr22	lncipedia.org	exon	20650758	20650844	.	-	.	gene_id lnc-USP41-1 ; transcript_id lnc-USP41-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000223579 ; gene_alias_2 AC011718.2 ; gene_alias_3 ENSG00000223579.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150683.2 ; transcript_alias_1 ENST00000414550 ; transcript_alias_2 ENST00000414550.1 ; transcript_alias_3 AC011718.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000319604.2 ;
chr22	lncipedia.org	exon	20653789	20653813	.	-	.	gene_id lnc-USP41-1 ; transcript_id lnc-USP41-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000223579 ; gene_alias_2 AC011718.2 ; gene_alias_3 ENSG00000223579.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150683.2 ; transcript_alias_1 ENST00000414550 ; transcript_alias_2 ENST00000414550.1 ; transcript_alias_3 AC011718.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000319604.2 ;
chr22	lncipedia.org	exon	20654282	20654340	.	-	.	gene_id lnc-USP41-1 ; transcript_id lnc-USP41-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000223579 ; gene_alias_2 AC011718.2 ; gene_alias_3 ENSG00000223579.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150683.2 ; transcript_alias_1 ENST00000414550 ; transcript_alias_2 ENST00000414550.1 ; transcript_alias_3 AC011718.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000319604.2 ;
chr22	lncipedia.org	exon	20656688	20656828	.	-	.	gene_id lnc-USP41-1 ; transcript_id lnc-USP41-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000223579 ; gene_alias_2 AC011718.2 ; gene_alias_3 ENSG00000223579.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150683.2 ; transcript_alias_1 ENST00000414550 ; transcript_alias_2 ENST00000414550.1 ; transcript_alias_3 AC011718.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000319604.2 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8347273	8348170	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-6 ; transcript_id lnc-KIDINS220-6:4 ; gene_alias_1 XLOC_001974 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-2 ; gene_alias_3 ENSG00000236790 ; gene_alias_4 NCRNA00299 ; gene_alias_5 ENSG00000236790.1 ; gene_alias_6 LINC00299 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000112455.5 ; transcript_alias_1 TCONS_00002744 ; transcript_alias_2 ENST00000442956 ; transcript_alias_3 ENST00000442956.1 ; transcript_alias_4 LINC00299-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000231926.3 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8383695	8383771	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-6 ; transcript_id lnc-KIDINS220-6:4 ; gene_alias_1 XLOC_001974 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-2 ; gene_alias_3 ENSG00000236790 ; gene_alias_4 NCRNA00299 ; gene_alias_5 ENSG00000236790.1 ; gene_alias_6 LINC00299 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000112455.5 ; transcript_alias_1 TCONS_00002744 ; transcript_alias_2 ENST00000442956 ; transcript_alias_3 ENST00000442956.1 ; transcript_alias_4 LINC00299-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000231926.3 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8427468	8427688	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-6 ; transcript_id lnc-KIDINS220-6:4 ; gene_alias_1 XLOC_001974 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-2 ; gene_alias_3 ENSG00000236790 ; gene_alias_4 NCRNA00299 ; gene_alias_5 ENSG00000236790.1 ; gene_alias_6 LINC00299 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000112455.5 ; transcript_alias_1 TCONS_00002744 ; transcript_alias_2 ENST00000442956 ; transcript_alias_3 ENST00000442956.1 ; transcript_alias_4 LINC00299-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000231926.3 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8434742	8434816	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-6 ; transcript_id lnc-KIDINS220-6:4 ; gene_alias_1 XLOC_001974 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-2 ; gene_alias_3 ENSG00000236790 ; gene_alias_4 NCRNA00299 ; gene_alias_5 ENSG00000236790.1 ; gene_alias_6 LINC00299 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000112455.5 ; transcript_alias_1 TCONS_00002744 ; transcript_alias_2 ENST00000442956 ; transcript_alias_3 ENST00000442956.1 ; transcript_alias_4 LINC00299-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000231926.3 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8434904	8435009	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-6 ; transcript_id lnc-KIDINS220-6:4 ; gene_alias_1 XLOC_001974 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-2 ; gene_alias_3 ENSG00000236790 ; gene_alias_4 NCRNA00299 ; gene_alias_5 ENSG00000236790.1 ; gene_alias_6 LINC00299 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000112455.5 ; transcript_alias_1 TCONS_00002744 ; transcript_alias_2 ENST00000442956 ; transcript_alias_3 ENST00000442956.1 ; transcript_alias_4 LINC00299-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000231926.3 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8436970	8437363	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-6 ; transcript_id lnc-KIDINS220-6:4 ; gene_alias_1 XLOC_001974 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-2 ; gene_alias_3 ENSG00000236790 ; gene_alias_4 NCRNA00299 ; gene_alias_5 ENSG00000236790.1 ; gene_alias_6 LINC00299 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000112455.5 ; transcript_alias_1 TCONS_00002744 ; transcript_alias_2 ENST00000442956 ; transcript_alias_3 ENST00000442956.1 ; transcript_alias_4 LINC00299-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000231926.3 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8439806	8439923	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-6 ; transcript_id lnc-KIDINS220-6:4 ; gene_alias_1 XLOC_001974 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-2 ; gene_alias_3 ENSG00000236790 ; gene_alias_4 NCRNA00299 ; gene_alias_5 ENSG00000236790.1 ; gene_alias_6 LINC00299 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000112455.5 ; transcript_alias_1 TCONS_00002744 ; transcript_alias_2 ENST00000442956 ; transcript_alias_3 ENST00000442956.1 ; transcript_alias_4 LINC00299-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000231926.3 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8452856	8452979	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-6 ; transcript_id lnc-KIDINS220-6:4 ; gene_alias_1 XLOC_001974 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-2 ; gene_alias_3 ENSG00000236790 ; gene_alias_4 NCRNA00299 ; gene_alias_5 ENSG00000236790.1 ; gene_alias_6 LINC00299 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000112455.5 ; transcript_alias_1 TCONS_00002744 ; transcript_alias_2 ENST00000442956 ; transcript_alias_3 ENST00000442956.1 ; transcript_alias_4 LINC00299-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000231926.3 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8464672	8464814	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-6 ; transcript_id lnc-KIDINS220-6:4 ; gene_alias_1 XLOC_001974 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-2 ; gene_alias_3 ENSG00000236790 ; gene_alias_4 NCRNA00299 ; gene_alias_5 ENSG00000236790.1 ; gene_alias_6 LINC00299 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000112455.5 ; transcript_alias_1 TCONS_00002744 ; transcript_alias_2 ENST00000442956 ; transcript_alias_3 ENST00000442956.1 ; transcript_alias_4 LINC00299-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000231926.3 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8468364	8468549	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-6 ; transcript_id lnc-KIDINS220-6:4 ; gene_alias_1 XLOC_001974 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-2 ; gene_alias_3 ENSG00000236790 ; gene_alias_4 NCRNA00299 ; gene_alias_5 ENSG00000236790.1 ; gene_alias_6 LINC00299 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000112455.5 ; transcript_alias_1 TCONS_00002744 ; transcript_alias_2 ENST00000442956 ; transcript_alias_3 ENST00000442956.1 ; transcript_alias_4 LINC00299-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000231926.3 ;
chr5	lncipedia.org	exon	38558932	38559279	.	+	.	gene_id lnc-EGFLAM-2 ; transcript_id lnc-EGFLAM-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000244968 ; gene_alias_2 CTD-2196P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000244968.2 ; gene_alias_4 LIFR-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162109.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500817 ; transcript_alias_2 ENST00000500817.2 ; transcript_alias_3 LIFR-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000367342.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	38595024	38595171	.	+	.	gene_id lnc-EGFLAM-2 ; transcript_id lnc-EGFLAM-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000244968 ; gene_alias_2 CTD-2196P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000244968.2 ; gene_alias_4 LIFR-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162109.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500817 ; transcript_alias_2 ENST00000500817.2 ; transcript_alias_3 LIFR-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000367342.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	38641031	38641131	.	+	.	gene_id lnc-EGFLAM-2 ; transcript_id lnc-EGFLAM-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000244968 ; gene_alias_2 CTD-2196P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000244968.2 ; gene_alias_4 LIFR-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162109.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500817 ; transcript_alias_2 ENST00000500817.2 ; transcript_alias_3 LIFR-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000367342.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	38644452	38644547	.	+	.	gene_id lnc-EGFLAM-2 ; transcript_id lnc-EGFLAM-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000244968 ; gene_alias_2 CTD-2196P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000244968.2 ; gene_alias_4 LIFR-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162109.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500817 ; transcript_alias_2 ENST00000500817.2 ; transcript_alias_3 LIFR-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000367342.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	38646734	38646816	.	+	.	gene_id lnc-EGFLAM-2 ; transcript_id lnc-EGFLAM-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000244968 ; gene_alias_2 CTD-2196P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000244968.2 ; gene_alias_4 LIFR-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162109.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500817 ; transcript_alias_2 ENST00000500817.2 ; transcript_alias_3 LIFR-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000367342.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	38647335	38647537	.	+	.	gene_id lnc-EGFLAM-2 ; transcript_id lnc-EGFLAM-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000244968 ; gene_alias_2 CTD-2196P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000244968.2 ; gene_alias_4 LIFR-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162109.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500817 ; transcript_alias_2 ENST00000500817.2 ; transcript_alias_3 LIFR-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000367342.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	38653179	38653262	.	+	.	gene_id lnc-EGFLAM-2 ; transcript_id lnc-EGFLAM-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000244968 ; gene_alias_2 CTD-2196P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000244968.2 ; gene_alias_4 LIFR-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162109.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500817 ; transcript_alias_2 ENST00000500817.2 ; transcript_alias_3 LIFR-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000367342.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	38653967	38654054	.	+	.	gene_id lnc-EGFLAM-2 ; transcript_id lnc-EGFLAM-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000244968 ; gene_alias_2 CTD-2196P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000244968.2 ; gene_alias_4 LIFR-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162109.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500817 ; transcript_alias_2 ENST00000500817.2 ; transcript_alias_3 LIFR-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000367342.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	38671128	38671318	.	+	.	gene_id lnc-EGFLAM-2 ; transcript_id lnc-EGFLAM-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000244968 ; gene_alias_2 CTD-2196P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000244968.2 ; gene_alias_4 LIFR-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162109.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500817 ; transcript_alias_2 ENST00000500817.2 ; transcript_alias_3 LIFR-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000367342.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37842420	37843461	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1755-7 ; transcript_id lnc-KIAA1755-7:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230324 ; gene_alias_2 RP4-705O1.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230324.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032466.2 ; transcript_alias_1 ENST00000412672 ; transcript_alias_2 ENST00000412672.1 ; transcript_alias_3 RP4-705O1.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079223.2 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37844190	37844305	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1755-7 ; transcript_id lnc-KIAA1755-7:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230324 ; gene_alias_2 RP4-705O1.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230324.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032466.2 ; transcript_alias_1 ENST00000412672 ; transcript_alias_2 ENST00000412672.1 ; transcript_alias_3 RP4-705O1.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079223.2 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37844590	37844755	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1755-7 ; transcript_id lnc-KIAA1755-7:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230324 ; gene_alias_2 RP4-705O1.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230324.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032466.2 ; transcript_alias_1 ENST00000412672 ; transcript_alias_2 ENST00000412672.1 ; transcript_alias_3 RP4-705O1.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079223.2 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37853198	37853391	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1755-7 ; transcript_id lnc-KIAA1755-7:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230324 ; gene_alias_2 RP4-705O1.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230324.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032466.2 ; transcript_alias_1 ENST00000412672 ; transcript_alias_2 ENST00000412672.1 ; transcript_alias_3 RP4-705O1.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079223.2 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8064285	8064479	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-7 ; transcript_id lnc-KIDINS220-7:1 ; gene_alias_1 XLOC_001973 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-7 ; gene_alias_3 ENSG00000235665 ; gene_alias_4 AC007464.1 ; gene_alias_5 ENSG00000235665.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151595.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003194 ; transcript_alias_2 ENST00000456681 ; transcript_alias_3 ENST00000456681.1 ; transcript_alias_4 AC007464.1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000323255.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8116840	8116977	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-7 ; transcript_id lnc-KIDINS220-7:1 ; gene_alias_1 XLOC_001973 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-7 ; gene_alias_3 ENSG00000235665 ; gene_alias_4 AC007464.1 ; gene_alias_5 ENSG00000235665.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151595.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003194 ; transcript_alias_2 ENST00000456681 ; transcript_alias_3 ENST00000456681.1 ; transcript_alias_4 AC007464.1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000323255.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8119391	8119457	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-7 ; transcript_id lnc-KIDINS220-7:1 ; gene_alias_1 XLOC_001973 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-7 ; gene_alias_3 ENSG00000235665 ; gene_alias_4 AC007464.1 ; gene_alias_5 ENSG00000235665.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151595.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003194 ; transcript_alias_2 ENST00000456681 ; transcript_alias_3 ENST00000456681.1 ; transcript_alias_4 AC007464.1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000323255.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	8417869	8418214	.	-	.	gene_id lnc-KIDINS220-7 ; transcript_id lnc-KIDINS220-7:1 ; gene_alias_1 XLOC_001973 ; gene_alias_2 linc-CMPK2-7 ; gene_alias_3 ENSG00000235665 ; gene_alias_4 AC007464.1 ; gene_alias_5 ENSG00000235665.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151595.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003194 ; transcript_alias_2 ENST00000456681 ; transcript_alias_3 ENST00000456681.1 ; transcript_alias_4 AC007464.1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000323255.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	45164578	45164679	.	+	.	gene_id lnc-FAM27C-3 ; transcript_id lnc-FAM27C-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231838 ; gene_alias_2 RP11-449H15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000231838.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000058669.1 ; transcript_alias_1 ENST00000417850 ; transcript_alias_2 ENST00000417850.1 ; transcript_alias_3 RP11-449H15.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000129824.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	45209152	45209262	.	+	.	gene_id lnc-FAM27C-3 ; transcript_id lnc-FAM27C-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231838 ; gene_alias_2 RP11-449H15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000231838.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000058669.1 ; transcript_alias_1 ENST00000417850 ; transcript_alias_2 ENST00000417850.1 ; transcript_alias_3 RP11-449H15.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000129824.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	45211824	45212501	.	+	.	gene_id lnc-FAM27C-3 ; transcript_id lnc-FAM27C-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231838 ; gene_alias_2 RP11-449H15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000231838.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000058669.1 ; transcript_alias_1 ENST00000417850 ; transcript_alias_2 ENST00000417850.1 ; transcript_alias_3 RP11-449H15.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000129824.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	134306629	134306678	.	+	.	gene_id lnc-GLB1L2-1 ; transcript_id lnc-GLB1L2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000255545 ; gene_alias_2 RP11-627G23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255545.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167181.2 ; transcript_alias_1 ENST00000533390 ; transcript_alias_2 ENST00000533390.1 ; transcript_alias_3 RP11-627G23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393642.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	134336234	134337509	.	+	.	gene_id lnc-GLB1L2-1 ; transcript_id lnc-GLB1L2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000255545 ; gene_alias_2 RP11-627G23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255545.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167181.2 ; transcript_alias_1 ENST00000533390 ; transcript_alias_2 ENST00000533390.1 ; transcript_alias_3 RP11-627G23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393642.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	134337759	134337881	.	+	.	gene_id lnc-GLB1L2-1 ; transcript_id lnc-GLB1L2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000255545 ; gene_alias_2 RP11-627G23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255545.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167181.2 ; transcript_alias_1 ENST00000533390 ; transcript_alias_2 ENST00000533390.1 ; transcript_alias_3 RP11-627G23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393642.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	134350739	134350805	.	+	.	gene_id lnc-GLB1L2-1 ; transcript_id lnc-GLB1L2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000255545 ; gene_alias_2 RP11-627G23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255545.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167181.2 ; transcript_alias_1 ENST00000533390 ; transcript_alias_2 ENST00000533390.1 ; transcript_alias_3 RP11-627G23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393642.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	134352521	134352624	.	+	.	gene_id lnc-GLB1L2-1 ; transcript_id lnc-GLB1L2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000255545 ; gene_alias_2 RP11-627G23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255545.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167181.2 ; transcript_alias_1 ENST00000533390 ; transcript_alias_2 ENST00000533390.1 ; transcript_alias_3 RP11-627G23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393642.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	134374692	134374934	.	+	.	gene_id lnc-GLB1L2-1 ; transcript_id lnc-GLB1L2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000255545 ; gene_alias_2 RP11-627G23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255545.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167181.2 ; transcript_alias_1 ENST00000533390 ; transcript_alias_2 ENST00000533390.1 ; transcript_alias_3 RP11-627G23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393642.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	950956	951162	.	+	.	gene_id lnc-SHOX-2 ; transcript_id lnc-SHOX-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_007911 ; gene_alias_2 linc-CSF2RA-1 ; gene_alias_3 ENSG00000237531 ; gene_alias_4 RP11-309M23.1 ; gene_alias_5 ENSG00000237531.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021054.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00016958 ; transcript_alias_2 ENST00000420865 ; transcript_alias_3 ENST00000420865.1 ; transcript_alias_4 RP11-309M23.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000055588.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	954720	955100	.	+	.	gene_id lnc-SHOX-2 ; transcript_id lnc-SHOX-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_007911 ; gene_alias_2 linc-CSF2RA-1 ; gene_alias_3 ENSG00000237531 ; gene_alias_4 RP11-309M23.1 ; gene_alias_5 ENSG00000237531.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021054.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00016958 ; transcript_alias_2 ENST00000420865 ; transcript_alias_3 ENST00000420865.1 ; transcript_alias_4 RP11-309M23.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000055588.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	112282463	112282699	.	+	.	gene_id lnc-DDX20-1 ; transcript_id lnc-DDX20-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227811 ; gene_alias_2 RP4-773A18.4 ; gene_alias_3 ENSG00000227811.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000011954.2 ; transcript_alias_1 ENST00000430373 ; transcript_alias_2 ENST00000430373.1 ; transcript_alias_3 RP4-773A18.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000033061.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	112286997	112287151	.	+	.	gene_id lnc-DDX20-1 ; transcript_id lnc-DDX20-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227811 ; gene_alias_2 RP4-773A18.4 ; gene_alias_3 ENSG00000227811.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000011954.2 ; transcript_alias_1 ENST00000430373 ; transcript_alias_2 ENST00000430373.1 ; transcript_alias_3 RP4-773A18.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000033061.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	112288682	112290420	.	+	.	gene_id lnc-DDX20-1 ; transcript_id lnc-DDX20-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227811 ; gene_alias_2 RP4-773A18.4 ; gene_alias_3 ENSG00000227811.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000011954.2 ; transcript_alias_1 ENST00000430373 ; transcript_alias_2 ENST00000430373.1 ; transcript_alias_3 RP4-773A18.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000033061.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	19246967	19247248	.	+	.	gene_id lnc-RP11-408E5.4.1-8 ; transcript_id lnc-RP11-408E5.4.1-8:1 ; gene_alias_1 XLOC_010284 ; gene_alias_2 linc-MPHOSPH8-8 ; gene_alias_3 ENSG00000231914 ; gene_alias_4 RP11-484H12.5 ; gene_alias_5 ENSG00000231914.1 ; gene_alias_6 LINC00387 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000016454.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00021522 ; transcript_alias_2 ENST00000422609 ; transcript_alias_3 ENST00000422609.1 ; transcript_alias_4 LINC00387-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000043977.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	19250128	19250303	.	+	.	gene_id lnc-RP11-408E5.4.1-8 ; transcript_id lnc-RP11-408E5.4.1-8:1 ; gene_alias_1 XLOC_010284 ; gene_alias_2 linc-MPHOSPH8-8 ; gene_alias_3 ENSG00000231914 ; gene_alias_4 RP11-484H12.5 ; gene_alias_5 ENSG00000231914.1 ; gene_alias_6 LINC00387 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000016454.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00021522 ; transcript_alias_2 ENST00000422609 ; transcript_alias_3 ENST00000422609.1 ; transcript_alias_4 LINC00387-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000043977.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	16062157	16062316	.	+	.	gene_id lnc-IL17RA-9 ; transcript_id lnc-IL17RA-9:1 ; gene_alias_1 XLOC_014134 ; gene_alias_2 linc-IL17RA-7 ; gene_alias_3 ENSG00000233866 ; gene_alias_4 LA16c-4G1.3 ; gene_alias_5 ENSG00000233866.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000140195.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00029356 ; transcript_alias_2 ENST00000424770 ; transcript_alias_3 ENST00000424770.1 ; transcript_alias_4 LA16c-4G1.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000276574.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	16062811	16063236	.	+	.	gene_id lnc-IL17RA-9 ; transcript_id lnc-IL17RA-9:1 ; gene_alias_1 XLOC_014134 ; gene_alias_2 linc-IL17RA-7 ; gene_alias_3 ENSG00000233866 ; gene_alias_4 LA16c-4G1.3 ; gene_alias_5 ENSG00000233866.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000140195.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00029356 ; transcript_alias_2 ENST00000424770 ; transcript_alias_3 ENST00000424770.1 ; transcript_alias_4 LA16c-4G1.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000276574.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	22615114	22615523	.	+	.	gene_id lnc-FGF9-3 ; transcript_id lnc-FGF9-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231330 ; gene_alias_2 AL136962.1 ; transcript_alias_1 ENST00000413646 ;
chr13	lncipedia.org	exon	22848662	22850663	.	+	.	gene_id lnc-FGF9-3 ; transcript_id lnc-FGF9-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231330 ; gene_alias_2 AL136962.1 ; transcript_alias_1 ENST00000413646 ;
chr11	lncipedia.org	exon	65265232	65273940	.	+	.	gene_id lnc-SCYL1-1 ; transcript_id lnc-SCYL1-1:1 ; gene_alias_1 Malat1 ; gene_alias_2 Neat2 ; transcript_alias_1 NR_002819.2 ;
chr15	lncipedia.org	exon	75108564	75108652	.	+	.	gene_id lnc-LMAN1L-1 ; transcript_id lnc-LMAN1L-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000261606.1 ; gene_alias_2 RP11-414J4.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172966.2 ; transcript_alias_1 ENST00000488000.2 ; transcript_alias_2 RP11-414J4.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000421539.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	75108768	75108875	.	+	.	gene_id lnc-LMAN1L-1 ; transcript_id lnc-LMAN1L-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000261606.1 ; gene_alias_2 RP11-414J4.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172966.2 ; transcript_alias_1 ENST00000488000.2 ; transcript_alias_2 RP11-414J4.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000421539.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	75108973	75109031	.	+	.	gene_id lnc-LMAN1L-1 ; transcript_id lnc-LMAN1L-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000261606.1 ; gene_alias_2 RP11-414J4.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172966.2 ; transcript_alias_1 ENST00000488000.2 ; transcript_alias_2 RP11-414J4.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000421539.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	75111059	75111158	.	+	.	gene_id lnc-LMAN1L-1 ; transcript_id lnc-LMAN1L-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000261606.1 ; gene_alias_2 RP11-414J4.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172966.2 ; transcript_alias_1 ENST00000488000.2 ; transcript_alias_2 RP11-414J4.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000421539.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	75111493	75112440	.	+	.	gene_id lnc-LMAN1L-1 ; transcript_id lnc-LMAN1L-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000261606.1 ; gene_alias_2 RP11-414J4.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172966.2 ; transcript_alias_1 ENST00000488000.2 ; transcript_alias_2 RP11-414J4.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000421539.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	75112976	75113108	.	+	.	gene_id lnc-LMAN1L-1 ; transcript_id lnc-LMAN1L-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000261606.1 ; gene_alias_2 RP11-414J4.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172966.2 ; transcript_alias_1 ENST00000488000.2 ; transcript_alias_2 RP11-414J4.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000421539.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	75113416	75113567	.	+	.	gene_id lnc-LMAN1L-1 ; transcript_id lnc-LMAN1L-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000261606.1 ; gene_alias_2 RP11-414J4.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172966.2 ; transcript_alias_1 ENST00000488000.2 ; transcript_alias_2 RP11-414J4.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000421539.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	75114170	75114241	.	+	.	gene_id lnc-LMAN1L-1 ; transcript_id lnc-LMAN1L-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000261606.1 ; gene_alias_2 RP11-414J4.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172966.2 ; transcript_alias_1 ENST00000488000.2 ; transcript_alias_2 RP11-414J4.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000421539.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	75114983	75115050	.	+	.	gene_id lnc-LMAN1L-1 ; transcript_id lnc-LMAN1L-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000261606.1 ; gene_alias_2 RP11-414J4.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172966.2 ; transcript_alias_1 ENST00000488000.2 ; transcript_alias_2 RP11-414J4.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000421539.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	75115900	75116023	.	+	.	gene_id lnc-LMAN1L-1 ; transcript_id lnc-LMAN1L-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000261606.1 ; gene_alias_2 RP11-414J4.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172966.2 ; transcript_alias_1 ENST00000488000.2 ; transcript_alias_2 RP11-414J4.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000421539.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	75116692	75116819	.	+	.	gene_id lnc-LMAN1L-1 ; transcript_id lnc-LMAN1L-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000261606.1 ; gene_alias_2 RP11-414J4.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172966.2 ; transcript_alias_1 ENST00000488000.2 ; transcript_alias_2 RP11-414J4.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000421539.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	75117817	75119208	.	+	.	gene_id lnc-LMAN1L-1 ; transcript_id lnc-LMAN1L-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000261606.1 ; gene_alias_2 RP11-414J4.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172966.2 ; transcript_alias_1 ENST00000488000.2 ; transcript_alias_2 RP11-414J4.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000421539.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	75120375	75120462	.	+	.	gene_id lnc-LMAN1L-1 ; transcript_id lnc-LMAN1L-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000261606.1 ; gene_alias_2 RP11-414J4.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172966.2 ; transcript_alias_1 ENST00000488000.2 ; transcript_alias_2 RP11-414J4.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000421539.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	75122471	75123574	.	+	.	gene_id lnc-LMAN1L-1 ; transcript_id lnc-LMAN1L-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000261606.1 ; gene_alias_2 RP11-414J4.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172966.2 ; transcript_alias_1 ENST00000488000.2 ; transcript_alias_2 RP11-414J4.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000421539.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	16920057	16920248	.	-	.	gene_id lnc-SPATA21-2 ; transcript_id lnc-SPATA21-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000219481 ; gene_alias_2 NBPF1 ; gene_alias_3 ENSG00000219481.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002487.6 ; transcript_alias_1 ENST00000420513 ; transcript_alias_2 ENST00000420513.1 ; transcript_alias_3 NBPF1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000092465.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	16921087	16921156	.	-	.	gene_id lnc-SPATA21-2 ; transcript_id lnc-SPATA21-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000219481 ; gene_alias_2 NBPF1 ; gene_alias_3 ENSG00000219481.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002487.6 ; transcript_alias_1 ENST00000420513 ; transcript_alias_2 ENST00000420513.1 ; transcript_alias_3 NBPF1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000092465.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	16921426	16921508	.	-	.	gene_id lnc-SPATA21-2 ; transcript_id lnc-SPATA21-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000219481 ; gene_alias_2 NBPF1 ; gene_alias_3 ENSG00000219481.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002487.6 ; transcript_alias_1 ENST00000420513 ; transcript_alias_2 ENST00000420513.1 ; transcript_alias_3 NBPF1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000092465.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	16935003	16935145	.	-	.	gene_id lnc-SPATA21-2 ; transcript_id lnc-SPATA21-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000219481 ; gene_alias_2 NBPF1 ; gene_alias_3 ENSG00000219481.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002487.6 ; transcript_alias_1 ENST00000420513 ; transcript_alias_2 ENST00000420513.1 ; transcript_alias_3 NBPF1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000092465.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	136770035	136770552	.	+	.	gene_id lnc-UBXN4-2 ; transcript_id lnc-UBXN4-2:6 ; gene_alias_1 XLOC_001682 ; gene_alias_2 linc-THSD7B-4 ; gene_alias_3 ENSG00000231890.1 ; gene_alias_4 AC093391.2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000153578.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003007 ; transcript_alias_2 ENST00000444649.1 ; transcript_alias_3 AC093391.2-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000331710.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	136774028	136774067	.	+	.	gene_id lnc-UBXN4-2 ; transcript_id lnc-UBXN4-2:6 ; gene_alias_1 XLOC_001682 ; gene_alias_2 linc-THSD7B-4 ; gene_alias_3 ENSG00000231890.1 ; gene_alias_4 AC093391.2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000153578.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003007 ; transcript_alias_2 ENST00000444649.1 ; transcript_alias_3 AC093391.2-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000331710.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	28998146	28998493	.	+	.	gene_id lnc-PCDH7-11 ; transcript_id lnc-PCDH7-11:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250190 ; gene_alias_2 RP11-292B1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250190.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160395.1 ; transcript_alias_1 ENST00000514802 ; transcript_alias_2 ENST00000514802.1 ; transcript_alias_3 RP11-292B1.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000360451.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	29010296	29010369	.	+	.	gene_id lnc-PCDH7-11 ; transcript_id lnc-PCDH7-11:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250190 ; gene_alias_2 RP11-292B1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250190.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160395.1 ; transcript_alias_1 ENST00000514802 ; transcript_alias_2 ENST00000514802.1 ; transcript_alias_3 RP11-292B1.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000360451.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	29015952	29016216	.	+	.	gene_id lnc-PCDH7-11 ; transcript_id lnc-PCDH7-11:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250190 ; gene_alias_2 RP11-292B1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250190.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160395.1 ; transcript_alias_1 ENST00000514802 ; transcript_alias_2 ENST00000514802.1 ; transcript_alias_3 RP11-292B1.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000360451.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	214020530	214020926	.	-	.	gene_id lnc-IKZF2-1 ; transcript_id lnc-IKZF2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_002476 ; gene_alias_2 linc-IKZF2-3 ; gene_alias_3 ENSG00000236193 ; gene_alias_4 AC079610.1 ; gene_alias_5 ENSG00000236193.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000154820.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003490 ; transcript_alias_2 ENST00000426870 ; transcript_alias_3 ENST00000426870.1 ; transcript_alias_4 AC079610.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000337266.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	214032117	214032436	.	-	.	gene_id lnc-IKZF2-1 ; transcript_id lnc-IKZF2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_002476 ; gene_alias_2 linc-IKZF2-3 ; gene_alias_3 ENSG00000236193 ; gene_alias_4 AC079610.1 ; gene_alias_5 ENSG00000236193.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000154820.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003490 ; transcript_alias_2 ENST00000426870 ; transcript_alias_3 ENST00000426870.1 ; transcript_alias_4 AC079610.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000337266.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	45369729	45369840	.	+	.	gene_id lnc-KDM6A-2 ; transcript_id lnc-KDM6A-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000229563 ; gene_alias_2 XLOC_007966 ; gene_alias_3 linc-ZNF673-4 ; gene_alias_4 RP11-245M24.1 ; gene_alias_5 ENSG00000229563.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021406.1 ; transcript_alias_1 ENST00000422047 ; transcript_alias_2 TCONS_00016984 ; transcript_alias_3 ENST00000422047.1 ; transcript_alias_4 RP11-245M24.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000056341.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	45461542	45461684	.	+	.	gene_id lnc-KDM6A-2 ; transcript_id lnc-KDM6A-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000229563 ; gene_alias_2 XLOC_007966 ; gene_alias_3 linc-ZNF673-4 ; gene_alias_4 RP11-245M24.1 ; gene_alias_5 ENSG00000229563.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021406.1 ; transcript_alias_1 ENST00000422047 ; transcript_alias_2 TCONS_00016984 ; transcript_alias_3 ENST00000422047.1 ; transcript_alias_4 RP11-245M24.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000056341.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	45488704	45488879	.	+	.	gene_id lnc-KDM6A-2 ; transcript_id lnc-KDM6A-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000229563 ; gene_alias_2 XLOC_007966 ; gene_alias_3 linc-ZNF673-4 ; gene_alias_4 RP11-245M24.1 ; gene_alias_5 ENSG00000229563.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021406.1 ; transcript_alias_1 ENST00000422047 ; transcript_alias_2 TCONS_00016984 ; transcript_alias_3 ENST00000422047.1 ; transcript_alias_4 RP11-245M24.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000056341.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	45489151	45489228	.	+	.	gene_id lnc-KDM6A-2 ; transcript_id lnc-KDM6A-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000229563 ; gene_alias_2 XLOC_007966 ; gene_alias_3 linc-ZNF673-4 ; gene_alias_4 RP11-245M24.1 ; gene_alias_5 ENSG00000229563.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021406.1 ; transcript_alias_1 ENST00000422047 ; transcript_alias_2 TCONS_00016984 ; transcript_alias_3 ENST00000422047.1 ; transcript_alias_4 RP11-245M24.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000056341.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	45489318	45489447	.	+	.	gene_id lnc-KDM6A-2 ; transcript_id lnc-KDM6A-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000229563 ; gene_alias_2 XLOC_007966 ; gene_alias_3 linc-ZNF673-4 ; gene_alias_4 RP11-245M24.1 ; gene_alias_5 ENSG00000229563.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021406.1 ; transcript_alias_1 ENST00000422047 ; transcript_alias_2 TCONS_00016984 ; transcript_alias_3 ENST00000422047.1 ; transcript_alias_4 RP11-245M24.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000056341.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	154028501	154028620	.	-	.	gene_id lnc-RPRM-2 ; transcript_id lnc-RPRM-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_002358 ; gene_alias_2 linc-PRPF40A ; gene_alias_3 ENSG00000224612 ; gene_alias_4 AC011901.2 ; gene_alias_5 ENSG00000224612.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000153822.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003422 ; transcript_alias_2 ENST00000413043 ; transcript_alias_3 ENST00000413043.1 ; transcript_alias_4 AC011901.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000332582.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	154029730	154029844	.	-	.	gene_id lnc-RPRM-2 ; transcript_id lnc-RPRM-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_002358 ; gene_alias_2 linc-PRPF40A ; gene_alias_3 ENSG00000224612 ; gene_alias_4 AC011901.2 ; gene_alias_5 ENSG00000224612.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000153822.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003422 ; transcript_alias_2 ENST00000413043 ; transcript_alias_3 ENST00000413043.1 ; transcript_alias_4 AC011901.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000332582.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	154043966	154044083	.	-	.	gene_id lnc-RPRM-2 ; transcript_id lnc-RPRM-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_002358 ; gene_alias_2 linc-PRPF40A ; gene_alias_3 ENSG00000224612 ; gene_alias_4 AC011901.2 ; gene_alias_5 ENSG00000224612.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000153822.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003422 ; transcript_alias_2 ENST00000413043 ; transcript_alias_3 ENST00000413043.1 ; transcript_alias_4 AC011901.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000332582.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	154058211	154058240	.	-	.	gene_id lnc-RPRM-2 ; transcript_id lnc-RPRM-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_002358 ; gene_alias_2 linc-PRPF40A ; gene_alias_3 ENSG00000224612 ; gene_alias_4 AC011901.2 ; gene_alias_5 ENSG00000224612.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000153822.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003422 ; transcript_alias_2 ENST00000413043 ; transcript_alias_3 ENST00000413043.1 ; transcript_alias_4 AC011901.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000332582.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	52273316	52273451	.	+	.	gene_id lnc-PPM1M-2 ; transcript_id lnc-PPM1M-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000243224 ; gene_alias_2 XLOC_002652 ; gene_alias_3 linc-PPM1M-2 ; gene_alias_4 RP5-1157M23.2 ; gene_alias_5 ENSG00000243224.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000158107.1 ; transcript_alias_1 ENST00000464958 ; transcript_alias_2 TCONS_00005518 ; transcript_alias_3 ENST00000464958.1 ; transcript_alias_4 RP5-1157M23.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000350204.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	52274194	52275113	.	+	.	gene_id lnc-PPM1M-2 ; transcript_id lnc-PPM1M-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000243224 ; gene_alias_2 XLOC_002652 ; gene_alias_3 linc-PPM1M-2 ; gene_alias_4 RP5-1157M23.2 ; gene_alias_5 ENSG00000243224.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000158107.1 ; transcript_alias_1 ENST00000464958 ; transcript_alias_2 TCONS_00005518 ; transcript_alias_3 ENST00000464958.1 ; transcript_alias_4 RP5-1157M23.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000350204.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	1614272	1614366	.	+	.	gene_id lnc-SIRPA-3 ; transcript_id lnc-SIRPA-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237914 ; gene_alias_2 RP11-77C3.3 ; gene_alias_3 ENSG00000237914.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031675.2 ; transcript_alias_1 ENST00000437384 ; transcript_alias_2 ENST00000437384.1 ; transcript_alias_3 RP11-77C3.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000077554.2 ;
chr20	lncipedia.org	exon	1617852	1617996	.	+	.	gene_id lnc-SIRPA-3 ; transcript_id lnc-SIRPA-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237914 ; gene_alias_2 RP11-77C3.3 ; gene_alias_3 ENSG00000237914.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031675.2 ; transcript_alias_1 ENST00000437384 ; transcript_alias_2 ENST00000437384.1 ; transcript_alias_3 RP11-77C3.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000077554.2 ;
chr20	lncipedia.org	exon	1618264	1618388	.	+	.	gene_id lnc-SIRPA-3 ; transcript_id lnc-SIRPA-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237914 ; gene_alias_2 RP11-77C3.3 ; gene_alias_3 ENSG00000237914.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031675.2 ; transcript_alias_1 ENST00000437384 ; transcript_alias_2 ENST00000437384.1 ; transcript_alias_3 RP11-77C3.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000077554.2 ;
chr20	lncipedia.org	exon	1619056	1619100	.	+	.	gene_id lnc-SIRPA-3 ; transcript_id lnc-SIRPA-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237914 ; gene_alias_2 RP11-77C3.3 ; gene_alias_3 ENSG00000237914.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031675.2 ; transcript_alias_1 ENST00000437384 ; transcript_alias_2 ENST00000437384.1 ; transcript_alias_3 RP11-77C3.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000077554.2 ;
chr5	lncipedia.org	exon	43014838	43015252	.	-	.	gene_id lnc-C5orf39-1 ; transcript_id lnc-C5orf39-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000177738 ; gene_alias_2 CTD-2201E18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000177738.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162133.2 ; transcript_alias_1 ENST00000503152 ; transcript_alias_2 ENST00000503152.1 ; transcript_alias_3 CTD-2201E18.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000368049.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	43067189	43067259	.	-	.	gene_id lnc-C5orf39-1 ; transcript_id lnc-C5orf39-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000177738 ; gene_alias_2 CTD-2201E18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000177738.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162133.2 ; transcript_alias_1 ENST00000503152 ; transcript_alias_2 ENST00000503152.1 ; transcript_alias_3 CTD-2201E18.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000368049.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	43067400	43067521	.	-	.	gene_id lnc-C5orf39-1 ; transcript_id lnc-C5orf39-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000177738 ; gene_alias_2 CTD-2201E18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000177738.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162133.2 ; transcript_alias_1 ENST00000503152 ; transcript_alias_2 ENST00000503152.1 ; transcript_alias_3 CTD-2201E18.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000368049.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	28331149	28331218	.	+	.	gene_id lnc-HSCB-1 ; transcript_id lnc-HSCB-1:17 ; gene_alias_1 ENSG00000235954 ; gene_alias_2 TTC28-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000235954.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150973.1 ; transcript_alias_1 ENST00000417497 ; transcript_alias_2 ENST00000417497.1 ; transcript_alias_3 TTC28-AS1-018 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320733.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	28393399	28393727	.	+	.	gene_id lnc-HSCB-1 ; transcript_id lnc-HSCB-1:17 ; gene_alias_1 ENSG00000235954 ; gene_alias_2 TTC28-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000235954.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150973.1 ; transcript_alias_1 ENST00000417497 ; transcript_alias_2 ENST00000417497.1 ; transcript_alias_3 TTC28-AS1-018 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320733.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	28395418	28395645	.	+	.	gene_id lnc-HSCB-1 ; transcript_id lnc-HSCB-1:17 ; gene_alias_1 ENSG00000235954 ; gene_alias_2 TTC28-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000235954.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150973.1 ; transcript_alias_1 ENST00000417497 ; transcript_alias_2 ENST00000417497.1 ; transcript_alias_3 TTC28-AS1-018 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320733.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73467699	73467758	.	-	.	gene_id lnc-RLIM-2 ; transcript_id lnc-RLIM-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230590 ; gene_alias_2 FTX ; gene_alias_3 ENSG00000230590.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021850.1 ; transcript_alias_1 ENST00000430772 ; transcript_alias_2 ENST00000430772.1 ; transcript_alias_3 FTX-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057256.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73494177	73494245	.	-	.	gene_id lnc-RLIM-2 ; transcript_id lnc-RLIM-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230590 ; gene_alias_2 FTX ; gene_alias_3 ENSG00000230590.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021850.1 ; transcript_alias_1 ENST00000430772 ; transcript_alias_2 ENST00000430772.1 ; transcript_alias_3 FTX-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057256.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73500229	73500329	.	-	.	gene_id lnc-RLIM-2 ; transcript_id lnc-RLIM-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230590 ; gene_alias_2 FTX ; gene_alias_3 ENSG00000230590.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021850.1 ; transcript_alias_1 ENST00000430772 ; transcript_alias_2 ENST00000430772.1 ; transcript_alias_3 FTX-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057256.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73500766	73500920	.	-	.	gene_id lnc-RLIM-2 ; transcript_id lnc-RLIM-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230590 ; gene_alias_2 FTX ; gene_alias_3 ENSG00000230590.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021850.1 ; transcript_alias_1 ENST00000430772 ; transcript_alias_2 ENST00000430772.1 ; transcript_alias_3 FTX-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057256.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73501537	73501683	.	-	.	gene_id lnc-RLIM-2 ; transcript_id lnc-RLIM-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230590 ; gene_alias_2 FTX ; gene_alias_3 ENSG00000230590.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021850.1 ; transcript_alias_1 ENST00000430772 ; transcript_alias_2 ENST00000430772.1 ; transcript_alias_3 FTX-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057256.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73513187	73513362	.	-	.	gene_id lnc-RLIM-2 ; transcript_id lnc-RLIM-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230590 ; gene_alias_2 FTX ; gene_alias_3 ENSG00000230590.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021850.1 ; transcript_alias_1 ENST00000430772 ; transcript_alias_2 ENST00000430772.1 ; transcript_alias_3 FTX-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057256.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	59328572	59328716	.	-	.	gene_id lnc-OSBP-1 ; transcript_id lnc-OSBP-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255008 ; gene_alias_2 AP000442.4 ; gene_alias_3 ENSG00000255008.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167421.1 ; transcript_alias_1 ENST00000533552 ; transcript_alias_2 ENST00000533552.1 ; transcript_alias_3 AP000442.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000394554.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	59329992	59330057	.	-	.	gene_id lnc-OSBP-1 ; transcript_id lnc-OSBP-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255008 ; gene_alias_2 AP000442.4 ; gene_alias_3 ENSG00000255008.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167421.1 ; transcript_alias_1 ENST00000533552 ; transcript_alias_2 ENST00000533552.1 ; transcript_alias_3 AP000442.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000394554.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	59331287	59331379	.	-	.	gene_id lnc-OSBP-1 ; transcript_id lnc-OSBP-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255008 ; gene_alias_2 AP000442.4 ; gene_alias_3 ENSG00000255008.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167421.1 ; transcript_alias_1 ENST00000533552 ; transcript_alias_2 ENST00000533552.1 ; transcript_alias_3 AP000442.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000394554.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	59332488	59332573	.	-	.	gene_id lnc-OSBP-1 ; transcript_id lnc-OSBP-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255008 ; gene_alias_2 AP000442.4 ; gene_alias_3 ENSG00000255008.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167421.1 ; transcript_alias_1 ENST00000533552 ; transcript_alias_2 ENST00000533552.1 ; transcript_alias_3 AP000442.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000394554.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	59332926	59333041	.	-	.	gene_id lnc-OSBP-1 ; transcript_id lnc-OSBP-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255008 ; gene_alias_2 AP000442.4 ; gene_alias_3 ENSG00000255008.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167421.1 ; transcript_alias_1 ENST00000533552 ; transcript_alias_2 ENST00000533552.1 ; transcript_alias_3 AP000442.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000394554.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	59333238	59333547	.	-	.	gene_id lnc-OSBP-1 ; transcript_id lnc-OSBP-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255008 ; gene_alias_2 AP000442.4 ; gene_alias_3 ENSG00000255008.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167421.1 ; transcript_alias_1 ENST00000533552 ; transcript_alias_2 ENST00000533552.1 ; transcript_alias_3 AP000442.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000394554.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105320216	105320265	.	+	.	gene_id lnc-POU3F3-1 ; transcript_id lnc-POU3F3-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_001605 ; gene_alias_2 linc-POU3F3-2 ; gene_alias_3 ENSG00000228528 ; gene_alias_4 AC068057.1 ; gene_alias_5 ENSG00000228528.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000153054.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00002963 ; transcript_alias_2 ENST00000453322 ; transcript_alias_3 ENST00000453322.1 ; transcript_alias_4 AC068057.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000329249.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105321309	105321967	.	+	.	gene_id lnc-POU3F3-1 ; transcript_id lnc-POU3F3-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_001605 ; gene_alias_2 linc-POU3F3-2 ; gene_alias_3 ENSG00000228528 ; gene_alias_4 AC068057.1 ; gene_alias_5 ENSG00000228528.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000153054.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00002963 ; transcript_alias_2 ENST00000453322 ; transcript_alias_3 ENST00000453322.1 ; transcript_alias_4 AC068057.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000329249.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	23745486	23745548	.	-	.	gene_id lnc-CYorf17-1 ; transcript_id lnc-CYorf17-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000184991 ; gene_alias_2 TTTY13 ; gene_alias_3 ENSG00000184991.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000043583.1 ; transcript_alias_1 ENST00000330337 ; transcript_alias_2 ENST00000330337.2 ; transcript_alias_3 TTTY13-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000101923.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	23746669	23746760	.	-	.	gene_id lnc-CYorf17-1 ; transcript_id lnc-CYorf17-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000184991 ; gene_alias_2 TTTY13 ; gene_alias_3 ENSG00000184991.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000043583.1 ; transcript_alias_1 ENST00000330337 ; transcript_alias_2 ENST00000330337.2 ; transcript_alias_3 TTTY13-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000101923.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	23749387	23749548	.	-	.	gene_id lnc-CYorf17-1 ; transcript_id lnc-CYorf17-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000184991 ; gene_alias_2 TTTY13 ; gene_alias_3 ENSG00000184991.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000043583.1 ; transcript_alias_1 ENST00000330337 ; transcript_alias_2 ENST00000330337.2 ; transcript_alias_3 TTTY13-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000101923.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	23751158	23751256	.	-	.	gene_id lnc-CYorf17-1 ; transcript_id lnc-CYorf17-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000184991 ; gene_alias_2 TTTY13 ; gene_alias_3 ENSG00000184991.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000043583.1 ; transcript_alias_1 ENST00000330337 ; transcript_alias_2 ENST00000330337.2 ; transcript_alias_3 TTTY13-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000101923.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	23751852	23752013	.	-	.	gene_id lnc-CYorf17-1 ; transcript_id lnc-CYorf17-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000184991 ; gene_alias_2 TTTY13 ; gene_alias_3 ENSG00000184991.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000043583.1 ; transcript_alias_1 ENST00000330337 ; transcript_alias_2 ENST00000330337.2 ; transcript_alias_3 TTTY13-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000101923.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	23756472	23756552	.	-	.	gene_id lnc-CYorf17-1 ; transcript_id lnc-CYorf17-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000184991 ; gene_alias_2 TTTY13 ; gene_alias_3 ENSG00000184991.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000043583.1 ; transcript_alias_1 ENST00000330337 ; transcript_alias_2 ENST00000330337.2 ; transcript_alias_3 TTTY13-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000101923.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	145564524	145564886	.	-	.	gene_id lnc-ANAPC10-1 ; transcript_id lnc-ANAPC10-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248890 ; gene_alias_2 RP11-291L15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248890.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161429.1 ; transcript_alias_1 ENST00000512359 ; transcript_alias_2 ENST00000512359.1 ; transcript_alias_3 RP11-291L15.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364893.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	145573854	145573928	.	-	.	gene_id lnc-ANAPC10-1 ; transcript_id lnc-ANAPC10-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248890 ; gene_alias_2 RP11-291L15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248890.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161429.1 ; transcript_alias_1 ENST00000512359 ; transcript_alias_2 ENST00000512359.1 ; transcript_alias_3 RP11-291L15.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364893.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	145580767	145580891	.	-	.	gene_id lnc-ANAPC10-1 ; transcript_id lnc-ANAPC10-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248890 ; gene_alias_2 RP11-291L15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248890.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161429.1 ; transcript_alias_1 ENST00000512359 ; transcript_alias_2 ENST00000512359.1 ; transcript_alias_3 RP11-291L15.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364893.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	145582427	145582509	.	-	.	gene_id lnc-ANAPC10-1 ; transcript_id lnc-ANAPC10-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248890 ; gene_alias_2 RP11-291L15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248890.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161429.1 ; transcript_alias_1 ENST00000512359 ; transcript_alias_2 ENST00000512359.1 ; transcript_alias_3 RP11-291L15.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364893.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	5650438	5650694	.	-	.	gene_id lnc-ASB13-2 ; transcript_id lnc-ASB13-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_008712 ; gene_alias_2 linc-CALML5-7 ; gene_alias_3 ENSG00000231483 ; gene_alias_4 RP11-336A10.5 ; gene_alias_5 ENSG00000231483.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000017600.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017913 ; transcript_alias_2 ENST00000425246 ; transcript_alias_3 ENST00000425246.1 ; transcript_alias_4 RP11-336A10.5-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000046558.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	5651650	5651760	.	-	.	gene_id lnc-ASB13-2 ; transcript_id lnc-ASB13-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_008712 ; gene_alias_2 linc-CALML5-7 ; gene_alias_3 ENSG00000231483 ; gene_alias_4 RP11-336A10.5 ; gene_alias_5 ENSG00000231483.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000017600.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017913 ; transcript_alias_2 ENST00000425246 ; transcript_alias_3 ENST00000425246.1 ; transcript_alias_4 RP11-336A10.5-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000046558.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	5652071	5652130	.	-	.	gene_id lnc-ASB13-2 ; transcript_id lnc-ASB13-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_008712 ; gene_alias_2 linc-CALML5-7 ; gene_alias_3 ENSG00000231483 ; gene_alias_4 RP11-336A10.5 ; gene_alias_5 ENSG00000231483.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000017600.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017913 ; transcript_alias_2 ENST00000425246 ; transcript_alias_3 ENST00000425246.1 ; transcript_alias_4 RP11-336A10.5-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000046558.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	5652277	5652399	.	-	.	gene_id lnc-ASB13-2 ; transcript_id lnc-ASB13-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_008712 ; gene_alias_2 linc-CALML5-7 ; gene_alias_3 ENSG00000231483 ; gene_alias_4 RP11-336A10.5 ; gene_alias_5 ENSG00000231483.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000017600.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017913 ; transcript_alias_2 ENST00000425246 ; transcript_alias_3 ENST00000425246.1 ; transcript_alias_4 RP11-336A10.5-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000046558.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	5652695	5652756	.	-	.	gene_id lnc-ASB13-2 ; transcript_id lnc-ASB13-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_008712 ; gene_alias_2 linc-CALML5-7 ; gene_alias_3 ENSG00000231483 ; gene_alias_4 RP11-336A10.5 ; gene_alias_5 ENSG00000231483.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000017600.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017913 ; transcript_alias_2 ENST00000425246 ; transcript_alias_3 ENST00000425246.1 ; transcript_alias_4 RP11-336A10.5-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000046558.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	66720898	66720977	.	+	.	gene_id lnc-RP11-262H14.4.1-3 ; transcript_id lnc-RP11-262H14.4.1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_007372 ; gene_alias_2 linc-ANKRD20A1-7 ; gene_alias_3 ENSG00000230857 ; gene_alias_4 RP11-318K12.2 ; gene_alias_5 ENSG00000230857.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000013297.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015683 ; transcript_alias_2 ENST00000446288 ; transcript_alias_3 ENST00000446288.1 ; transcript_alias_4 RP11-318K12.2-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000037083.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	66729354	66729384	.	+	.	gene_id lnc-RP11-262H14.4.1-3 ; transcript_id lnc-RP11-262H14.4.1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_007372 ; gene_alias_2 linc-ANKRD20A1-7 ; gene_alias_3 ENSG00000230857 ; gene_alias_4 RP11-318K12.2 ; gene_alias_5 ENSG00000230857.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000013297.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015683 ; transcript_alias_2 ENST00000446288 ; transcript_alias_3 ENST00000446288.1 ; transcript_alias_4 RP11-318K12.2-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000037083.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	66742301	66742374	.	+	.	gene_id lnc-RP11-262H14.4.1-3 ; transcript_id lnc-RP11-262H14.4.1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_007372 ; gene_alias_2 linc-ANKRD20A1-7 ; gene_alias_3 ENSG00000230857 ; gene_alias_4 RP11-318K12.2 ; gene_alias_5 ENSG00000230857.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000013297.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015683 ; transcript_alias_2 ENST00000446288 ; transcript_alias_3 ENST00000446288.1 ; transcript_alias_4 RP11-318K12.2-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000037083.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	66752041	66752113	.	+	.	gene_id lnc-RP11-262H14.4.1-3 ; transcript_id lnc-RP11-262H14.4.1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_007372 ; gene_alias_2 linc-ANKRD20A1-7 ; gene_alias_3 ENSG00000230857 ; gene_alias_4 RP11-318K12.2 ; gene_alias_5 ENSG00000230857.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000013297.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015683 ; transcript_alias_2 ENST00000446288 ; transcript_alias_3 ENST00000446288.1 ; transcript_alias_4 RP11-318K12.2-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000037083.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	66759124	66759372	.	+	.	gene_id lnc-RP11-262H14.4.1-3 ; transcript_id lnc-RP11-262H14.4.1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_007372 ; gene_alias_2 linc-ANKRD20A1-7 ; gene_alias_3 ENSG00000230857 ; gene_alias_4 RP11-318K12.2 ; gene_alias_5 ENSG00000230857.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000013297.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015683 ; transcript_alias_2 ENST00000446288 ; transcript_alias_3 ENST00000446288.1 ; transcript_alias_4 RP11-318K12.2-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000037083.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	98150157	98150240	.	+	.	gene_id lnc-KLHL32-3 ; transcript_id lnc-KLHL32-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224849 ; gene_alias_2 RP1-104O17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000224849.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015250.1 ; transcript_alias_1 ENST00000433637 ; transcript_alias_2 ENST00000433637.1 ; transcript_alias_3 RP1-104O17.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000041578.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	98155563	98155979	.	+	.	gene_id lnc-KLHL32-3 ; transcript_id lnc-KLHL32-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224849 ; gene_alias_2 RP1-104O17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000224849.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015250.1 ; transcript_alias_1 ENST00000433637 ; transcript_alias_2 ENST00000433637.1 ; transcript_alias_3 RP1-104O17.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000041578.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	57090599	57090796	.	+	.	gene_id lnc-VAPB-1 ; transcript_id lnc-VAPB-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000231290 ; gene_alias_2 RP5-907D15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000231290.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032847.2 ; transcript_alias_1 ENST00000447767 ; transcript_alias_2 ENST00000447767.1 ; transcript_alias_3 RP5-907D15.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079884.2 ;
chr20	lncipedia.org	exon	57098225	57098337	.	+	.	gene_id lnc-VAPB-1 ; transcript_id lnc-VAPB-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000231290 ; gene_alias_2 RP5-907D15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000231290.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032847.2 ; transcript_alias_1 ENST00000447767 ; transcript_alias_2 ENST00000447767.1 ; transcript_alias_3 RP5-907D15.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079884.2 ;
chr20	lncipedia.org	exon	57098770	57101088	.	+	.	gene_id lnc-VAPB-1 ; transcript_id lnc-VAPB-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000231290 ; gene_alias_2 RP5-907D15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000231290.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032847.2 ; transcript_alias_1 ENST00000447767 ; transcript_alias_2 ENST00000447767.1 ; transcript_alias_3 RP5-907D15.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079884.2 ;
chr7	lncipedia.org	exon	523744	523836	.	-	.	gene_id lnc-PDGFA-1 ; transcript_id lnc-PDGFA-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234471 ; gene_alias_2 AC147651.1 ; gene_alias_3 ENSG00000234471.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151413.1 ; transcript_alias_1 ENST00000434541 ; transcript_alias_2 ENST00000434541.1 ; transcript_alias_3 AC147651.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000322539.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	534481	534593	.	-	.	gene_id lnc-PDGFA-1 ; transcript_id lnc-PDGFA-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234471 ; gene_alias_2 AC147651.1 ; gene_alias_3 ENSG00000234471.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151413.1 ; transcript_alias_1 ENST00000434541 ; transcript_alias_2 ENST00000434541.1 ; transcript_alias_3 AC147651.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000322539.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	535542	535755	.	-	.	gene_id lnc-PDGFA-1 ; transcript_id lnc-PDGFA-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234471 ; gene_alias_2 AC147651.1 ; gene_alias_3 ENSG00000234471.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151413.1 ; transcript_alias_1 ENST00000434541 ; transcript_alias_2 ENST00000434541.1 ; transcript_alias_3 AC147651.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000322539.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	37080204	37080254	.	+	.	gene_id lnc-KIAA1239-2 ; transcript_id lnc-KIAA1239-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247810 ; gene_alias_2 RP11-103J17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247810.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160388.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501725 ; transcript_alias_2 ENST00000501725.2 ; transcript_alias_3 RP11-103J17.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000360427.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	37110902	37110978	.	+	.	gene_id lnc-KIAA1239-2 ; transcript_id lnc-KIAA1239-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247810 ; gene_alias_2 RP11-103J17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247810.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160388.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501725 ; transcript_alias_2 ENST00000501725.2 ; transcript_alias_3 RP11-103J17.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000360427.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	37112364	37112665	.	+	.	gene_id lnc-KIAA1239-2 ; transcript_id lnc-KIAA1239-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247810 ; gene_alias_2 RP11-103J17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247810.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160388.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501725 ; transcript_alias_2 ENST00000501725.2 ; transcript_alias_3 RP11-103J17.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000360427.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	95781666	95782014	.	-	.	gene_id lnc-RP11-167N24.6.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-167N24.6.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258313 ; gene_alias_2 RP11-167N24.5 ; gene_alias_3 ENSG00000258313.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170258.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551656 ; transcript_alias_2 ENST00000551656.1 ; transcript_alias_3 RP11-167N24.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408216.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	95782315	95782334	.	-	.	gene_id lnc-RP11-167N24.6.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-167N24.6.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258313 ; gene_alias_2 RP11-167N24.5 ; gene_alias_3 ENSG00000258313.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170258.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551656 ; transcript_alias_2 ENST00000551656.1 ; transcript_alias_3 RP11-167N24.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408216.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	121450030	121450281	.	-	.	gene_id lnc-DBC1-1 ; transcript_id lnc-DBC1-1:4 ; gene_alias_1 XLOC_007842 ; gene_alias_2 linc-ASTN2-2 ; gene_alias_3 ENSG00000225050 ; gene_alias_4 RP11-349E4.1 ; gene_alias_5 ENSG00000225050.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000020566.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015878 ; transcript_alias_2 ENST00000450292 ; transcript_alias_3 ENST00000450292.1 ; transcript_alias_4 RP11-349E4.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000053812.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	121468105	121468238	.	-	.	gene_id lnc-DBC1-1 ; transcript_id lnc-DBC1-1:4 ; gene_alias_1 XLOC_007842 ; gene_alias_2 linc-ASTN2-2 ; gene_alias_3 ENSG00000225050 ; gene_alias_4 RP11-349E4.1 ; gene_alias_5 ENSG00000225050.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000020566.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015878 ; transcript_alias_2 ENST00000450292 ; transcript_alias_3 ENST00000450292.1 ; transcript_alias_4 RP11-349E4.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000053812.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	149956487	149956617	.	+	.	gene_id lnc-TSC22D2-2 ; transcript_id lnc-TSC22D2-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_002871 ; gene_alias_2 linc-TSC22D2-1 ; gene_alias_3 ENSG00000244541 ; gene_alias_4 RP11-167H9.6 ; gene_alias_5 ENSG00000244541.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000159737.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005622 ; transcript_alias_2 ENST00000498005 ; transcript_alias_3 ENST00000498005.1 ; transcript_alias_4 RP11-167H9.6-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000357110.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	149956722	149956785	.	+	.	gene_id lnc-TSC22D2-2 ; transcript_id lnc-TSC22D2-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_002871 ; gene_alias_2 linc-TSC22D2-1 ; gene_alias_3 ENSG00000244541 ; gene_alias_4 RP11-167H9.6 ; gene_alias_5 ENSG00000244541.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000159737.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005622 ; transcript_alias_2 ENST00000498005 ; transcript_alias_3 ENST00000498005.1 ; transcript_alias_4 RP11-167H9.6-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000357110.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	149957667	149957996	.	+	.	gene_id lnc-TSC22D2-2 ; transcript_id lnc-TSC22D2-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_002871 ; gene_alias_2 linc-TSC22D2-1 ; gene_alias_3 ENSG00000244541 ; gene_alias_4 RP11-167H9.6 ; gene_alias_5 ENSG00000244541.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000159737.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005622 ; transcript_alias_2 ENST00000498005 ; transcript_alias_3 ENST00000498005.1 ; transcript_alias_4 RP11-167H9.6-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000357110.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	180708376	180708613	.	+	.	gene_id lnc-AC138035.1-1 ; transcript_id lnc-AC138035.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248103 ; gene_alias_2 CTC-338M12.9 ; gene_alias_3 ENSG00000248103.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163377.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412295 ; transcript_alias_2 ENST00000412295.2 ; transcript_alias_3 CTC-338M12.9-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000372940.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	180710343	180710653	.	+	.	gene_id lnc-AC138035.1-1 ; transcript_id lnc-AC138035.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248103 ; gene_alias_2 CTC-338M12.9 ; gene_alias_3 ENSG00000248103.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163377.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412295 ; transcript_alias_2 ENST00000412295.2 ; transcript_alias_3 CTC-338M12.9-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000372940.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	76423440	76424230	.	-	.	gene_id lnc-LRRC32-4 ; transcript_id lnc-LRRC32-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254761 ; gene_alias_2 RP11-672A2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000254761.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165236.1 ; transcript_alias_1 ENST00000525328 ; transcript_alias_2 ENST00000525328.1 ; transcript_alias_3 RP11-672A2.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000382866.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	76430612	76430652	.	-	.	gene_id lnc-LRRC32-4 ; transcript_id lnc-LRRC32-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254761 ; gene_alias_2 RP11-672A2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000254761.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165236.1 ; transcript_alias_1 ENST00000525328 ; transcript_alias_2 ENST00000525328.1 ; transcript_alias_3 RP11-672A2.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000382866.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	128208100	128208513	.	+	.	gene_id lnc-EEFSEC-3 ; transcript_id lnc-EEFSEC-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000244300 ; gene_alias_2 RP11-475N22.4 ; gene_alias_3 ENSG00000244300.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159693.1 ; transcript_alias_1 ENST00000473958 ; transcript_alias_2 ENST00000473958.1 ; transcript_alias_3 RP11-475N22.4-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000356939.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	128208622	128208929	.	+	.	gene_id lnc-EEFSEC-3 ; transcript_id lnc-EEFSEC-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000244300 ; gene_alias_2 RP11-475N22.4 ; gene_alias_3 ENSG00000244300.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159693.1 ; transcript_alias_1 ENST00000473958 ; transcript_alias_2 ENST00000473958.1 ; transcript_alias_3 RP11-475N22.4-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000356939.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	106470247	106470336	.	-	.	gene_id lnc-VAV3-2 ; transcript_id lnc-VAV3-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000233047 ; gene_alias_2 RP11-24P14.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233047.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000011006.2 ; transcript_alias_1 ENST00000417385 ; transcript_alias_2 ENST00000417385.1 ; transcript_alias_3 RP11-24P14.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000030261.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	106494830	106494901	.	-	.	gene_id lnc-VAV3-2 ; transcript_id lnc-VAV3-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000233047 ; gene_alias_2 RP11-24P14.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233047.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000011006.2 ; transcript_alias_1 ENST00000417385 ; transcript_alias_2 ENST00000417385.1 ; transcript_alias_3 RP11-24P14.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000030261.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	106495126	106495222	.	-	.	gene_id lnc-VAV3-2 ; transcript_id lnc-VAV3-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000233047 ; gene_alias_2 RP11-24P14.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233047.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000011006.2 ; transcript_alias_1 ENST00000417385 ; transcript_alias_2 ENST00000417385.1 ; transcript_alias_3 RP11-24P14.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000030261.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	106495994	106496111	.	-	.	gene_id lnc-VAV3-2 ; transcript_id lnc-VAV3-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000233047 ; gene_alias_2 RP11-24P14.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233047.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000011006.2 ; transcript_alias_1 ENST00000417385 ; transcript_alias_2 ENST00000417385.1 ; transcript_alias_3 RP11-24P14.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000030261.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	44407892	44407926	.	+	.	gene_id lnc-C10orf136-1 ; transcript_id lnc-C10orf136-1:10 ; gene_alias_1 XLOC_008473 ; gene_alias_2 linc-TMEM72-2 ; gene_alias_3 ENSG00000227029 ; gene_alias_4 RP11-168P8.3 ; gene_alias_5 ENSG00000227029.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000018050.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017822 ; transcript_alias_2 ENST00000446107 ; transcript_alias_3 ENST00000446107.1 ; transcript_alias_4 RP11-168P8.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000047733.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	44409207	44409684	.	+	.	gene_id lnc-C10orf136-1 ; transcript_id lnc-C10orf136-1:10 ; gene_alias_1 XLOC_008473 ; gene_alias_2 linc-TMEM72-2 ; gene_alias_3 ENSG00000227029 ; gene_alias_4 RP11-168P8.3 ; gene_alias_5 ENSG00000227029.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000018050.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017822 ; transcript_alias_2 ENST00000446107 ; transcript_alias_3 ENST00000446107.1 ; transcript_alias_4 RP11-168P8.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000047733.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	9555262	9555366	.	-	.	gene_id lnc-AC006156.1-3 ; transcript_id lnc-AC006156.1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_008320 ; gene_alias_2 linc-AMELY-9 ; gene_alias_3 ENSG00000228890 ; gene_alias_4 TTTY21 ; gene_alias_5 ENSG00000228890.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000046232.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017587 ; transcript_alias_2 ENST00000430228 ; transcript_alias_3 ENST00000430228.1 ; transcript_alias_4 TTTY21-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000106566.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	9558704	9558905	.	-	.	gene_id lnc-AC006156.1-3 ; transcript_id lnc-AC006156.1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_008320 ; gene_alias_2 linc-AMELY-9 ; gene_alias_3 ENSG00000228890 ; gene_alias_4 TTTY21 ; gene_alias_5 ENSG00000228890.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000046232.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017587 ; transcript_alias_2 ENST00000430228 ; transcript_alias_3 ENST00000430228.1 ; transcript_alias_4 TTTY21-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000106566.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101005276	101005548	.	+	.	gene_id lnc-WDR25-1 ; transcript_id lnc-WDR25-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000259031 ; gene_alias_2 CTD-2062F14.3 ; gene_alias_3 ENSG00000259031.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171590.1 ; transcript_alias_1 ENST00000553301 ; transcript_alias_2 ENST00000553301.1 ; transcript_alias_3 CTD-2062F14.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414338.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101006467	101006746	.	+	.	gene_id lnc-WDR25-1 ; transcript_id lnc-WDR25-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000259031 ; gene_alias_2 CTD-2062F14.3 ; gene_alias_3 ENSG00000259031.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171590.1 ; transcript_alias_1 ENST00000553301 ; transcript_alias_2 ENST00000553301.1 ; transcript_alias_3 CTD-2062F14.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414338.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21822577	21822720	.	+	.	gene_id lnc-HIC2-1 ; transcript_id lnc-HIC2-1:10 ; gene_alias_1 ENSG00000206140 ; gene_alias_2 KB-1323B2.6 ; gene_alias_3 ENSG00000206140.5 ; gene_alias_4 TMEM191C ; gene_alias_5 OTTHUMG00000150780.1 ; transcript_alias_1 ENST00000427147 ; transcript_alias_2 ENST00000427147.1 ; transcript_alias_3 TMEM191C-011 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320060.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21823068	21823124	.	+	.	gene_id lnc-HIC2-1 ; transcript_id lnc-HIC2-1:10 ; gene_alias_1 ENSG00000206140 ; gene_alias_2 KB-1323B2.6 ; gene_alias_3 ENSG00000206140.5 ; gene_alias_4 TMEM191C ; gene_alias_5 OTTHUMG00000150780.1 ; transcript_alias_1 ENST00000427147 ; transcript_alias_2 ENST00000427147.1 ; transcript_alias_3 TMEM191C-011 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320060.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21823233	21823351	.	+	.	gene_id lnc-HIC2-1 ; transcript_id lnc-HIC2-1:10 ; gene_alias_1 ENSG00000206140 ; gene_alias_2 KB-1323B2.6 ; gene_alias_3 ENSG00000206140.5 ; gene_alias_4 TMEM191C ; gene_alias_5 OTTHUMG00000150780.1 ; transcript_alias_1 ENST00000427147 ; transcript_alias_2 ENST00000427147.1 ; transcript_alias_3 TMEM191C-011 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320060.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21823563	21823823	.	+	.	gene_id lnc-HIC2-1 ; transcript_id lnc-HIC2-1:10 ; gene_alias_1 ENSG00000206140 ; gene_alias_2 KB-1323B2.6 ; gene_alias_3 ENSG00000206140.5 ; gene_alias_4 TMEM191C ; gene_alias_5 OTTHUMG00000150780.1 ; transcript_alias_1 ENST00000427147 ; transcript_alias_2 ENST00000427147.1 ; transcript_alias_3 TMEM191C-011 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320060.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21823906	21824208	.	+	.	gene_id lnc-HIC2-1 ; transcript_id lnc-HIC2-1:10 ; gene_alias_1 ENSG00000206140 ; gene_alias_2 KB-1323B2.6 ; gene_alias_3 ENSG00000206140.5 ; gene_alias_4 TMEM191C ; gene_alias_5 OTTHUMG00000150780.1 ; transcript_alias_1 ENST00000427147 ; transcript_alias_2 ENST00000427147.1 ; transcript_alias_3 TMEM191C-011 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320060.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	59486260	59486295	.	+	.	gene_id lnc-FGGY-4 ; transcript_id lnc-FGGY-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000230812 ; gene_alias_2 RP4-794H19.4 ; gene_alias_3 ENSG00000230812.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000008373.2 ; transcript_alias_1 ENST00000438195 ; transcript_alias_2 ENST00000438195.1 ; transcript_alias_3 RP4-794H19.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000023038.2 ;
chr1	lncipedia.org	exon	59487160	59487249	.	+	.	gene_id lnc-FGGY-4 ; transcript_id lnc-FGGY-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000230812 ; gene_alias_2 RP4-794H19.4 ; gene_alias_3 ENSG00000230812.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000008373.2 ; transcript_alias_1 ENST00000438195 ; transcript_alias_2 ENST00000438195.1 ; transcript_alias_3 RP4-794H19.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000023038.2 ;
chr1	lncipedia.org	exon	59507844	59507902	.	+	.	gene_id lnc-FGGY-4 ; transcript_id lnc-FGGY-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000230812 ; gene_alias_2 RP4-794H19.4 ; gene_alias_3 ENSG00000230812.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000008373.2 ; transcript_alias_1 ENST00000438195 ; transcript_alias_2 ENST00000438195.1 ; transcript_alias_3 RP4-794H19.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000023038.2 ;
chr1	lncipedia.org	exon	59510166	59510286	.	+	.	gene_id lnc-FGGY-4 ; transcript_id lnc-FGGY-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000230812 ; gene_alias_2 RP4-794H19.4 ; gene_alias_3 ENSG00000230812.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000008373.2 ; transcript_alias_1 ENST00000438195 ; transcript_alias_2 ENST00000438195.1 ; transcript_alias_3 RP4-794H19.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000023038.2 ;
chrX	lncipedia.org	exon	57148095	57148400	.	+	.	gene_id lnc-FAAH2-2 ; transcript_id lnc-FAAH2-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_007996 ; gene_alias_2 linc-FAAH2-2 ; gene_alias_3 ENSG00000226310.1 ; gene_alias_4 RP3-323P24.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000021681.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00016988 ; transcript_alias_2 ENST00000439622.1 ; transcript_alias_3 RP3-323P24.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000056916.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	57153318	57153676	.	+	.	gene_id lnc-FAAH2-2 ; transcript_id lnc-FAAH2-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_007996 ; gene_alias_2 linc-FAAH2-2 ; gene_alias_3 ENSG00000226310.1 ; gene_alias_4 RP3-323P24.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000021681.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00016988 ; transcript_alias_2 ENST00000439622.1 ; transcript_alias_3 RP3-323P24.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000056916.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	151835962	151836456	.	-	.	gene_id lnc-AC106722.1-1 ; transcript_id lnc-AC106722.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_003289 ; gene_alias_2 linc-IGSF10-2 ; gene_alias_3 ENSG00000239941 ; gene_alias_4 RP11-246A10.1 ; gene_alias_5 ENSG00000239941.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000159881.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005849 ; transcript_alias_2 ENST00000482382 ; transcript_alias_3 ENST00000482382.1 ; transcript_alias_4 RP11-246A10.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000357899.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	151869455	151869513	.	-	.	gene_id lnc-AC106722.1-1 ; transcript_id lnc-AC106722.1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_003289 ; gene_alias_2 linc-IGSF10-2 ; gene_alias_3 ENSG00000239941 ; gene_alias_4 RP11-246A10.1 ; gene_alias_5 ENSG00000239941.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000159881.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005849 ; transcript_alias_2 ENST00000482382 ; transcript_alias_3 ENST00000482382.1 ; transcript_alias_4 RP11-246A10.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000357899.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	4456285	4456325	.	+	.	gene_id lnc-PRNP-1 ; transcript_id lnc-PRNP-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000238282 ; gene_alias_2 RP5-1164C1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000238282.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031780.1 ; transcript_alias_1 ENST00000419863 ; transcript_alias_2 ENST00000419863.1 ; transcript_alias_3 RP5-1164C1.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000077813.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	4505720	4505846	.	+	.	gene_id lnc-PRNP-1 ; transcript_id lnc-PRNP-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000238282 ; gene_alias_2 RP5-1164C1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000238282.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031780.1 ; transcript_alias_1 ENST00000419863 ; transcript_alias_2 ENST00000419863.1 ; transcript_alias_3 RP5-1164C1.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000077813.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	81564241	81564283	.	-	.	gene_id lnc-SFTPD-2 ; transcript_id lnc-SFTPD-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000225484 ; gene_alias_2 RP11-773D16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000225484.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018585.1 ; transcript_alias_1 ENST00000484794 ; transcript_alias_2 ENST00000484794.1 ; transcript_alias_3 RP11-773D16.1-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000049004.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	81565795	81565878	.	-	.	gene_id lnc-SFTPD-2 ; transcript_id lnc-SFTPD-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000225484 ; gene_alias_2 RP11-773D16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000225484.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018585.1 ; transcript_alias_1 ENST00000484794 ; transcript_alias_2 ENST00000484794.1 ; transcript_alias_3 RP11-773D16.1-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000049004.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	81568515	81568588	.	-	.	gene_id lnc-SFTPD-2 ; transcript_id lnc-SFTPD-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000225484 ; gene_alias_2 RP11-773D16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000225484.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018585.1 ; transcript_alias_1 ENST00000484794 ; transcript_alias_2 ENST00000484794.1 ; transcript_alias_3 RP11-773D16.1-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000049004.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	81574369	81574400	.	-	.	gene_id lnc-SFTPD-2 ; transcript_id lnc-SFTPD-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000225484 ; gene_alias_2 RP11-773D16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000225484.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018585.1 ; transcript_alias_1 ENST00000484794 ; transcript_alias_2 ENST00000484794.1 ; transcript_alias_3 RP11-773D16.1-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000049004.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	23186446	23186639	.	+	.	gene_id lnc-GAS2-2 ; transcript_id lnc-GAS2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255418 ; gene_alias_2 RP11-266A24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255418.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166075.1 ; transcript_alias_1 ENST00000530576 ; transcript_alias_2 ENST00000530576.1 ; transcript_alias_3 RP11-266A24.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000387733.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	23186736	23186879	.	+	.	gene_id lnc-GAS2-2 ; transcript_id lnc-GAS2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255418 ; gene_alias_2 RP11-266A24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255418.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166075.1 ; transcript_alias_1 ENST00000530576 ; transcript_alias_2 ENST00000530576.1 ; transcript_alias_3 RP11-266A24.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000387733.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	23188039	23188159	.	+	.	gene_id lnc-GAS2-2 ; transcript_id lnc-GAS2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255418 ; gene_alias_2 RP11-266A24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255418.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166075.1 ; transcript_alias_1 ENST00000530576 ; transcript_alias_2 ENST00000530576.1 ; transcript_alias_3 RP11-266A24.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000387733.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	23188282	23188332	.	+	.	gene_id lnc-GAS2-2 ; transcript_id lnc-GAS2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255418 ; gene_alias_2 RP11-266A24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255418.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166075.1 ; transcript_alias_1 ENST00000530576 ; transcript_alias_2 ENST00000530576.1 ; transcript_alias_3 RP11-266A24.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000387733.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	147997211	147997291	.	+	.	gene_id lnc-SAMD5-1 ; transcript_id lnc-SAMD5-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000227681 ; gene_alias_2 RP11-307P5.1 ; gene_alias_3 ENSG00000227681.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015769.1 ; transcript_alias_1 ENST00000442094 ; transcript_alias_2 ENST00000442094.1 ; transcript_alias_3 RP11-307P5.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000042613.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	148054865	148054947	.	+	.	gene_id lnc-SAMD5-1 ; transcript_id lnc-SAMD5-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000227681 ; gene_alias_2 RP11-307P5.1 ; gene_alias_3 ENSG00000227681.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015769.1 ; transcript_alias_1 ENST00000442094 ; transcript_alias_2 ENST00000442094.1 ; transcript_alias_3 RP11-307P5.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000042613.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	148058453	148058692	.	+	.	gene_id lnc-SAMD5-1 ; transcript_id lnc-SAMD5-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000227681 ; gene_alias_2 RP11-307P5.1 ; gene_alias_3 ENSG00000227681.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015769.1 ; transcript_alias_1 ENST00000442094 ; transcript_alias_2 ENST00000442094.1 ; transcript_alias_3 RP11-307P5.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000042613.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47599681	47599852	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; transcript_alias_1 ENST00000547600 ; transcript_alias_2 ENST00000547600.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405089.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47600294	47600371	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; transcript_alias_1 ENST00000547600 ; transcript_alias_2 ENST00000547600.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405089.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47604423	47604544	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; transcript_alias_1 ENST00000547600 ; transcript_alias_2 ENST00000547600.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405089.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47609948	47610047	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; transcript_alias_1 ENST00000547600 ; transcript_alias_2 ENST00000547600.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405089.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47610167	47610217	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; transcript_alias_1 ENST00000547600 ; transcript_alias_2 ENST00000547600.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405089.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	47079159	47079707	.	-	.	gene_id lnc-MCFD2-1 ; transcript_id lnc-MCFD2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_002089 ; gene_alias_2 linc-PIGF-4 ; gene_alias_3 ENSG00000226548.1 ; gene_alias_4 AC016722.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000153084.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003277 ; transcript_alias_2 ENST00000453936.1 ; transcript_alias_3 AC016722.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000329424.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	47080533	47080635	.	-	.	gene_id lnc-MCFD2-1 ; transcript_id lnc-MCFD2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_002089 ; gene_alias_2 linc-PIGF-4 ; gene_alias_3 ENSG00000226548.1 ; gene_alias_4 AC016722.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000153084.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00003277 ; transcript_alias_2 ENST00000453936.1 ; transcript_alias_3 AC016722.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000329424.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143719663	143719955	.	-	.	gene_id lnc-PPIAL4G-1 ; transcript_id lnc-PPIAL4G-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226637 ; gene_alias_2 BX284650.3 ; gene_alias_3 ENSG00000226637.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013627.1 ; transcript_alias_1 ENST00000442423 ; transcript_alias_2 ENST00000442423.1 ; transcript_alias_3 BX284650.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037967.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143721045	143721171	.	-	.	gene_id lnc-PPIAL4G-1 ; transcript_id lnc-PPIAL4G-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226637 ; gene_alias_2 BX284650.3 ; gene_alias_3 ENSG00000226637.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013627.1 ; transcript_alias_1 ENST00000442423 ; transcript_alias_2 ENST00000442423.1 ; transcript_alias_3 BX284650.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037967.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	113465719	113465978	.	-	.	gene_id lnc-NAA50-1 ; transcript_id lnc-NAA50-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000242659 ; gene_alias_2 RP11-271C24.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242659.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159297.1 ; transcript_alias_1 ENST00000492981 ; transcript_alias_2 ENST00000492981.1 ; transcript_alias_3 RP11-271C24.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000354465.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	113466213	113466255	.	-	.	gene_id lnc-NAA50-1 ; transcript_id lnc-NAA50-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000242659 ; gene_alias_2 RP11-271C24.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242659.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159297.1 ; transcript_alias_1 ENST00000492981 ; transcript_alias_2 ENST00000492981.1 ; transcript_alias_3 RP11-271C24.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000354465.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	34528938	34529051	.	+	.	gene_id lnc-IFNAR2-1 ; transcript_id lnc-IFNAR2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_013920 ; gene_alias_2 linc-IFNAR2 ; gene_alias_3 ENSG00000226433.1 ; gene_alias_4 AP000290.7 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000065063.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00028835 ; transcript_alias_2 ENST00000450830.1 ; transcript_alias_3 AP000290.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000139729.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	34531082	34531416	.	+	.	gene_id lnc-IFNAR2-1 ; transcript_id lnc-IFNAR2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_013920 ; gene_alias_2 linc-IFNAR2 ; gene_alias_3 ENSG00000226433.1 ; gene_alias_4 AP000290.7 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000065063.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00028835 ; transcript_alias_2 ENST00000450830.1 ; transcript_alias_3 AP000290.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000139729.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	19654546	19654722	.	+	.	gene_id lnc-SEPT5-1 ; transcript_id lnc-SEPT5-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_014154 ; gene_alias_2 linc-SEPT5 ; gene_alias_3 ENSG00000225007 ; gene_alias_4 AC000067.1 ; gene_alias_5 ENSG00000225007.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150429.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00029361 ; transcript_alias_2 ENST00000452326 ; transcript_alias_3 ENST00000452326.1 ; transcript_alias_4 AC000067.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000318064.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	19654969	19655078	.	+	.	gene_id lnc-SEPT5-1 ; transcript_id lnc-SEPT5-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_014154 ; gene_alias_2 linc-SEPT5 ; gene_alias_3 ENSG00000225007 ; gene_alias_4 AC000067.1 ; gene_alias_5 ENSG00000225007.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150429.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00029361 ; transcript_alias_2 ENST00000452326 ; transcript_alias_3 ENST00000452326.1 ; transcript_alias_4 AC000067.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000318064.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	24585740	24585978	.	-	.	gene_id lnc-RBMY1F-2 ; transcript_id lnc-RBMY1F-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000131538 ; gene_alias_2 TTTY6 ; gene_alias_3 ENSG00000131538.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000046220.1 ; transcript_alias_1 ENST00000253838 ; transcript_alias_2 ENST00000253838.3 ; transcript_alias_3 TTTY6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000106557.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	24587136	24587273	.	-	.	gene_id lnc-RBMY1F-2 ; transcript_id lnc-RBMY1F-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000131538 ; gene_alias_2 TTTY6 ; gene_alias_3 ENSG00000131538.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000046220.1 ; transcript_alias_1 ENST00000253838 ; transcript_alias_2 ENST00000253838.3 ; transcript_alias_3 TTTY6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000106557.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	24587492	24587605	.	-	.	gene_id lnc-RBMY1F-2 ; transcript_id lnc-RBMY1F-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000131538 ; gene_alias_2 TTTY6 ; gene_alias_3 ENSG00000131538.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000046220.1 ; transcript_alias_1 ENST00000253838 ; transcript_alias_2 ENST00000253838.3 ; transcript_alias_3 TTTY6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000106557.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	65488296	65488372	.	-	.	gene_id lnc-FAM75A7-1 ; transcript_id lnc-FAM75A7-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000229746 ; gene_alias_2 FAM74A4 ; gene_alias_3 ENSG00000229746.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000058153.2 ; transcript_alias_1 ENST00000418603 ; transcript_alias_2 ENST00000418603.1 ; transcript_alias_3 FAM74A4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000313670.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	65488701	65488784	.	-	.	gene_id lnc-FAM75A7-1 ; transcript_id lnc-FAM75A7-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000229746 ; gene_alias_2 FAM74A4 ; gene_alias_3 ENSG00000229746.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000058153.2 ; transcript_alias_1 ENST00000418603 ; transcript_alias_2 ENST00000418603.1 ; transcript_alias_3 FAM74A4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000313670.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	65493627	65494240	.	-	.	gene_id lnc-FAM75A7-1 ; transcript_id lnc-FAM75A7-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000229746 ; gene_alias_2 FAM74A4 ; gene_alias_3 ENSG00000229746.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000058153.2 ; transcript_alias_1 ENST00000418603 ; transcript_alias_2 ENST00000418603.1 ; transcript_alias_3 FAM74A4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000313670.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	187166633	187166678	.	+	.	gene_id lnc-RTP4-2 ; transcript_id lnc-RTP4-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_002962 ; gene_alias_2 linc-LPP-5 ; gene_alias_3 ENSG00000228952 ; gene_alias_4 RP11-567G11.1 ; gene_alias_5 ENSG00000228952.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000156460.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005686 ; transcript_alias_2 ENST00000440726 ; transcript_alias_3 ENST00000440726.1 ; transcript_alias_4 RP11-567G11.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000344261.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	187167039	187167238	.	+	.	gene_id lnc-RTP4-2 ; transcript_id lnc-RTP4-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_002962 ; gene_alias_2 linc-LPP-5 ; gene_alias_3 ENSG00000228952 ; gene_alias_4 RP11-567G11.1 ; gene_alias_5 ENSG00000228952.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000156460.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005686 ; transcript_alias_2 ENST00000440726 ; transcript_alias_3 ENST00000440726.1 ; transcript_alias_4 RP11-567G11.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000344261.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	171594142	171594186	.	-	.	gene_id lnc-PLD1-1 ; transcript_id lnc-PLD1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_003326 ; gene_alias_2 linc-PLD1 ; gene_alias_3 ENSG00000234717 ; gene_alias_4 TMEM212-AS1 ; gene_alias_5 ENSG00000234717.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000156879.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005881 ; transcript_alias_2 ENST00000449106 ; transcript_alias_3 ENST00000449106.1 ; transcript_alias_4 TMEM212-AS1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000346408.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	171616964	171617055	.	-	.	gene_id lnc-PLD1-1 ; transcript_id lnc-PLD1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_003326 ; gene_alias_2 linc-PLD1 ; gene_alias_3 ENSG00000234717 ; gene_alias_4 TMEM212-AS1 ; gene_alias_5 ENSG00000234717.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000156879.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005881 ; transcript_alias_2 ENST00000449106 ; transcript_alias_3 ENST00000449106.1 ; transcript_alias_4 TMEM212-AS1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000346408.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	171618241	171618530	.	-	.	gene_id lnc-PLD1-1 ; transcript_id lnc-PLD1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_003326 ; gene_alias_2 linc-PLD1 ; gene_alias_3 ENSG00000234717 ; gene_alias_4 TMEM212-AS1 ; gene_alias_5 ENSG00000234717.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000156879.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005881 ; transcript_alias_2 ENST00000449106 ; transcript_alias_3 ENST00000449106.1 ; transcript_alias_4 TMEM212-AS1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000346408.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	142618766	142618856	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-7 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-7:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230880 ; gene_alias_2 AL583842.3 ; gene_alias_3 ENSG00000230880.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013379.1 ; transcript_alias_1 ENST00000400755 ; transcript_alias_2 ENST00000400755.2 ; transcript_alias_3 AL583842.3-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037262.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	142621001	142621059	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-7 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-7:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230880 ; gene_alias_2 AL583842.3 ; gene_alias_3 ENSG00000230880.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013379.1 ; transcript_alias_1 ENST00000400755 ; transcript_alias_2 ENST00000400755.2 ; transcript_alias_3 AL583842.3-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037262.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	104341392	104341434	.	+	.	gene_id lnc-CTD-2134A5.2.1-2 ; transcript_id lnc-CTD-2134A5.2.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258914 ; gene_alias_2 CTD-2134A5.3 ; gene_alias_3 ENSG00000258914.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171650.1 ; transcript_alias_1 ENST00000556653 ; transcript_alias_2 ENST00000556653.1 ; transcript_alias_3 CTD-2134A5.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414609.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	104343732	104343815	.	+	.	gene_id lnc-CTD-2134A5.2.1-2 ; transcript_id lnc-CTD-2134A5.2.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258914 ; gene_alias_2 CTD-2134A5.3 ; gene_alias_3 ENSG00000258914.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171650.1 ; transcript_alias_1 ENST00000556653 ; transcript_alias_2 ENST00000556653.1 ; transcript_alias_3 CTD-2134A5.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414609.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	121169841	121169924	.	+	.	gene_id lnc-FAM72B-5 ; transcript_id lnc-FAM72B-5:4 ; gene_alias_1 XLOC_000375 ; gene_alias_2 linc-NBPF9-9 ; transcript_alias_1 TCONS_00002147 ;
chr1	lncipedia.org	exon	121201873	121202469	.	+	.	gene_id lnc-FAM72B-5 ; transcript_id lnc-FAM72B-5:4 ; gene_alias_1 XLOC_000375 ; gene_alias_2 linc-NBPF9-9 ; transcript_alias_1 TCONS_00002147 ;
chrX	lncipedia.org	exon	102882033	102882082	.	+	.	gene_id lnc-TCEAL1-1 ; transcript_id lnc-TCEAL1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008037 ; gene_alias_2 linc-TCEAL1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017446 ;
chrX	lncipedia.org	exon	102883334	102883590	.	+	.	gene_id lnc-TCEAL1-1 ; transcript_id lnc-TCEAL1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_008037 ; gene_alias_2 linc-TCEAL1 ; transcript_alias_1 TCONS_00017446 ;
chr9	lncipedia.org	exon	68808991	68809254	.	+	.	gene_id lnc-BX255923.1-3 ; transcript_id lnc-BX255923.1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255999 ; gene_alias_2 AL591385.2 ; transcript_alias_1 ENST00000416011 ;
chr9	lncipedia.org	exon	68811262	68811672	.	+	.	gene_id lnc-BX255923.1-3 ; transcript_id lnc-BX255923.1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255999 ; gene_alias_2 AL591385.2 ; transcript_alias_1 ENST00000416011 ;
chr11	lncipedia.org	exon	65211929	65212028	.	+	.	gene_id lnc-AP000769.1-2 ; transcript_id lnc-AP000769.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000254666 ; gene_alias_2 AP000769.4 ; transcript_alias_1 ENST00000528299 ;
chr8	lncipedia.org	exon	123704460	123704784	.	-	.	gene_id lnc-DERL1-3 ; transcript_id lnc-DERL1-3:1 ; transcript_alias_1 21a ;
chr6	lncipedia.org	exon	52860417	52860749	.	+	.	gene_id lnc-FBXO9-1 ; transcript_id lnc-FBXO9-1:1 ; transcript_alias_1 7SK ; transcript_alias_2 7-3 RNA ; transcript_alias_3 K-RNA ; transcript_alias_4 7SK-RNA ; transcript_alias_5 7SK snRNA ; transcript_alias_6 RN7SK ;
chr5	lncipedia.org	exon	149828968	149829258	.	+	.	gene_id lnc-NDST1-1 ; transcript_id lnc-NDST1-1:1 ; gene_alias_1 Alpha-250/Alpha-280 ; transcript_alias_1 Alpha-280 ;
chr11	lncipedia.org	exon	117162061	117162857	.	+	.	gene_id lnc-RNF214-1 ; transcript_id lnc-RNF214-1:1 ; gene_alias_1 BACE1AS ; transcript_alias_1 CB960709.1  ;
chr2	lncipedia.org	exon	47562453	47562653	.	+	.	gene_id lnc-EPCAM-1 ; transcript_id lnc-EPCAM-1:2 ; gene_alias_1 BC200 ; transcript_alias_1 NR_001568.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	5301818	5302228	.	-	.	gene_id lnc-OR51B4-3 ; transcript_id lnc-OR51B4-3:1 ; gene_alias_1 Beta-globin transcripts ; transcript_alias_1 AY195961.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	148684227	148684340	.	-	.	gene_id lnc-PDIA4-1 ; transcript_id lnc-PDIA4-1:1 ; gene_alias_1 Y_RNAs ; gene_alias_2 YRNA ; gene_alias_3 RNY RNAs ; gene_alias_4 hY RNA (human) ; transcript_alias_1 161087011 ; transcript_alias_2 NR_004391.1| ;
chr22	lncipedia.org	exon	29837244	29837827	.	-	.	gene_id lnc-AP1B1-1 ; transcript_id lnc-AP1B1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000225465.4 ; gene_alias_2 RFPL1-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000030476.4 ; transcript_alias_1 ENST00000539579.1 ; transcript_alias_2 RFPL1-AS1-201 ;
chr11	lncipedia.org	exon	7726175	7726221	.	-	.	gene_id lnc-OR5P3-1 ; transcript_id lnc-OR5P3-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000254951.2 ; gene_alias_2 RP11-494M8.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000165666.2 ; transcript_alias_1 ENST00000527565.1 ; transcript_alias_2 RP11-494M8.4-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000385692.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	7900554	7900630	.	-	.	gene_id lnc-OR5P3-1 ; transcript_id lnc-OR5P3-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000254951.2 ; gene_alias_2 RP11-494M8.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000165666.2 ; transcript_alias_1 ENST00000527565.1 ; transcript_alias_2 RP11-494M8.4-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000385692.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	7901142	7901306	.	-	.	gene_id lnc-OR5P3-1 ; transcript_id lnc-OR5P3-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000254951.2 ; gene_alias_2 RP11-494M8.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000165666.2 ; transcript_alias_1 ENST00000527565.1 ; transcript_alias_2 RP11-494M8.4-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000385692.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	7902636	7902729	.	-	.	gene_id lnc-OR5P3-1 ; transcript_id lnc-OR5P3-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000254951.2 ; gene_alias_2 RP11-494M8.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000165666.2 ; transcript_alias_1 ENST00000527565.1 ; transcript_alias_2 RP11-494M8.4-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000385692.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	7903503	7903620	.	-	.	gene_id lnc-OR5P3-1 ; transcript_id lnc-OR5P3-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000254951.2 ; gene_alias_2 RP11-494M8.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000165666.2 ; transcript_alias_1 ENST00000527565.1 ; transcript_alias_2 RP11-494M8.4-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000385692.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	7904407	7904494	.	-	.	gene_id lnc-OR5P3-1 ; transcript_id lnc-OR5P3-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000254951.2 ; gene_alias_2 RP11-494M8.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000165666.2 ; transcript_alias_1 ENST00000527565.1 ; transcript_alias_2 RP11-494M8.4-003 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000385692.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	38265392	38265841	.	-	.	gene_id lnc-YRDC-1 ; transcript_id lnc-YRDC-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233728.1 ; gene_alias_2 RP11-109P14.9 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000037488.1 ; transcript_alias_1 ENST00000433474.1 ; transcript_alias_2 RP11-109P14.9-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000091275.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	38266302	38266551	.	-	.	gene_id lnc-YRDC-1 ; transcript_id lnc-YRDC-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233728.1 ; gene_alias_2 RP11-109P14.9 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000037488.1 ; transcript_alias_1 ENST00000433474.1 ; transcript_alias_2 RP11-109P14.9-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000091275.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	96932561	96932661	.	-	.	gene_id lnc-ATG2B-1 ; transcript_id lnc-ATG2B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258530.1 ; gene_alias_2 RP11-872J21.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000171439.1 ; transcript_alias_1 ENST00000554004.1 ; transcript_alias_2 RP11-872J21.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000413409.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	96939596	96940208	.	-	.	gene_id lnc-ATG2B-1 ; transcript_id lnc-ATG2B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258530.1 ; gene_alias_2 RP11-872J21.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000171439.1 ; transcript_alias_1 ENST00000554004.1 ; transcript_alias_2 RP11-872J21.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000413409.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	58836741	58836798	.	-	.	gene_id lnc-TIMM9-1 ; transcript_id lnc-TIMM9-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258658.1 ; gene_alias_2 RP11-517O13.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000171230.1 ; transcript_alias_1 ENST00000556390.1 ; transcript_alias_2 RP11-517O13.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000412427.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	58862019	58862359	.	-	.	gene_id lnc-TIMM9-1 ; transcript_id lnc-TIMM9-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258658.1 ; gene_alias_2 RP11-517O13.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000171230.1 ; transcript_alias_1 ENST00000556390.1 ; transcript_alias_2 RP11-517O13.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000412427.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	35831438	35832000	.	-	.	gene_id lnc-NFKBIA-1 ; transcript_id lnc-NFKBIA-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258860.1 ; gene_alias_2 RP11-561B11.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000171062.1 ; transcript_alias_1 ENST00000555024.1 ; transcript_alias_2 RP11-561B11.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000411489.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	35832774	35832834	.	-	.	gene_id lnc-NFKBIA-1 ; transcript_id lnc-NFKBIA-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258860.1 ; gene_alias_2 RP11-561B11.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000171062.1 ; transcript_alias_1 ENST00000555024.1 ; transcript_alias_2 RP11-561B11.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000411489.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	91352504	91352584	.	+	.	gene_id lnc-KIF20B-3 ; transcript_id lnc-KIF20B-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235344.1 ; gene_alias_2 hsa-mir-107 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000018724.1 ; transcript_alias_1 ENST00000425814.1 ; transcript_alias_2 hsa-mir-107.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000049327.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	150946411	150946548	.	+	.	gene_id lnc-CHPF2-1 ; transcript_id lnc-CHPF2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000243018.1 ; gene_alias_2 RP5-1070G24.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000157379.1 ; transcript_alias_1 ENST00000466775.1 ; transcript_alias_2 RP5-1070G24.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000348647.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	150951399	150951476	.	+	.	gene_id lnc-CHPF2-1 ; transcript_id lnc-CHPF2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000243018.1 ; gene_alias_2 RP5-1070G24.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000157379.1 ; transcript_alias_1 ENST00000466775.1 ; transcript_alias_2 RP5-1070G24.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000348647.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	88244916	88245047	.	+	.	gene_id lnc-TYR-1 ; transcript_id lnc-TYR-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000255082.1 ; gene_alias_2 GRM5-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000167293.1 ; transcript_alias_1 ENST00000531994.1 ; transcript_alias_2 GRM5-AS1-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000394044.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	88245420	88245529	.	+	.	gene_id lnc-TYR-1 ; transcript_id lnc-TYR-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000255082.1 ; gene_alias_2 GRM5-AS1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000167293.1 ; transcript_alias_1 ENST00000531994.1 ; transcript_alias_2 GRM5-AS1-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000394044.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	131234662	131234744	.	-	.	gene_id lnc-RAP2C-1 ; transcript_id lnc-RAP2C-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251646.1 ; gene_alias_2 RP1-305B16.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000022422.1 ; transcript_alias_1 ENST00000513703.1 ; transcript_alias_2 RP1-305B16.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000058310.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	131261816	131261900	.	-	.	gene_id lnc-RAP2C-1 ; transcript_id lnc-RAP2C-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251646.1 ; gene_alias_2 RP1-305B16.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000022422.1 ; transcript_alias_1 ENST00000513703.1 ; transcript_alias_2 RP1-305B16.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000058310.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	21059373	21059518	.	+	.	gene_id lnc-PINK1-1 ; transcript_id lnc-PINK1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233069.1 ; gene_alias_2 RP5-930J4.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000002621.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436642.1 ; transcript_alias_2 RP5-930J4.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000007456.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	21060293	21060445	.	+	.	gene_id lnc-PINK1-1 ; transcript_id lnc-PINK1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233069.1 ; gene_alias_2 RP5-930J4.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000002621.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436642.1 ; transcript_alias_2 RP5-930J4.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000007456.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	4850299	4850373	.	-	.	gene_id lnc-AK3-1 ; transcript_id lnc-AK3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228165.1 ; gene_alias_2 RP11-125K10.5 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000019477.1 ; transcript_alias_1 ENST00000443970.1 ; transcript_alias_2 RP11-125K10.5-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000051596.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143236905	143237006	.	-	.	gene_id lnc-PPIAL4G-5 ; transcript_id lnc-PPIAL4G-5:8 ; gene_alias_1 ENSG00000225278.1 ; gene_alias_2 BX571672.5 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000013475.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412196.1 ; transcript_alias_2 BX571672.5-009 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000037582.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143237680	143237715	.	-	.	gene_id lnc-PPIAL4G-5 ; transcript_id lnc-PPIAL4G-5:8 ; gene_alias_1 ENSG00000225278.1 ; gene_alias_2 BX571672.5 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000013475.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412196.1 ; transcript_alias_2 BX571672.5-009 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000037582.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	52262356	52262468	.	+	.	gene_id lnc-EFHC1-1 ; transcript_id lnc-EFHC1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231577.1 ; gene_alias_2 RP1-304B14.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000014847.1 ; transcript_alias_1 ENST00000449181.1 ; transcript_alias_2 RP1-304B14.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000040904.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	52262825	52262946	.	+	.	gene_id lnc-EFHC1-1 ; transcript_id lnc-EFHC1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231577.1 ; gene_alias_2 RP1-304B14.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000014847.1 ; transcript_alias_1 ENST00000449181.1 ; transcript_alias_2 RP1-304B14.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000040904.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	73433394	73433521	.	+	.	gene_id lnc-PLEKHB1-1 ; transcript_id lnc-PLEKHB1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255928.1 ; gene_alias_2 RP11-456I15.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000168035.1 ; transcript_alias_1 ENST00000538624.1 ; transcript_alias_2 RP11-456I15.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000397658.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	73433658	73433739	.	+	.	gene_id lnc-PLEKHB1-1 ; transcript_id lnc-PLEKHB1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255928.1 ; gene_alias_2 RP11-456I15.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000168035.1 ; transcript_alias_1 ENST00000538624.1 ; transcript_alias_2 RP11-456I15.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000397658.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	51314840	51314867	.	+	.	gene_id lnc-ABHD12B-3 ; transcript_id lnc-ABHD12B-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258687.1 ; gene_alias_2 RP11-218E20.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000170981.1 ; transcript_alias_1 ENST00000557152.1 ; transcript_alias_2 RP11-218E20.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000411028.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	51332232	51332377	.	+	.	gene_id lnc-ABHD12B-3 ; transcript_id lnc-ABHD12B-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258687.1 ; gene_alias_2 RP11-218E20.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000170981.1 ; transcript_alias_1 ENST00000557152.1 ; transcript_alias_2 RP11-218E20.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000411028.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	65820615	65820699	.	+	.	gene_id lnc-PACS1-1 ; transcript_id lnc-PACS1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255013.1 ; gene_alias_2 RP11-1167A19.14 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000166762.1 ; transcript_alias_1 ENST00000531031.1 ; transcript_alias_2 RP11-1167A19.14-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000391388.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	13385417	13385672	.	-	.	gene_id lnc-PRAMEF8-1 ; transcript_id lnc-PRAMEF8-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235800 ; gene_alias_2 RP11-219C24.9 ; gene_alias_3 ENSG00000235800.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000008040.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451598 ; transcript_alias_2 ENST00000451598.1 ; transcript_alias_3 RP11-219C24.9-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000022046.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	13385781	13385903	.	-	.	gene_id lnc-PRAMEF8-1 ; transcript_id lnc-PRAMEF8-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235800 ; gene_alias_2 RP11-219C24.9 ; gene_alias_3 ENSG00000235800.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000008040.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451598 ; transcript_alias_2 ENST00000451598.1 ; transcript_alias_3 RP11-219C24.9-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000022046.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	156789623	156790212	.	-	.	gene_id lnc-FNDC9-1 ; transcript_id lnc-FNDC9-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251405.2 ; gene_alias_2 CTB-109A12.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000163480.2 ; transcript_alias_1 ENST00000519499.1 ; transcript_alias_2 CTB-109A12.1-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000373787.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	156791534	156791613	.	-	.	gene_id lnc-FNDC9-1 ; transcript_id lnc-FNDC9-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251405.2 ; gene_alias_2 CTB-109A12.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000163480.2 ; transcript_alias_1 ENST00000519499.1 ; transcript_alias_2 CTB-109A12.1-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000373787.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	156887016	156887086	.	-	.	gene_id lnc-FNDC9-1 ; transcript_id lnc-FNDC9-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251405.2 ; gene_alias_2 CTB-109A12.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000163480.2 ; transcript_alias_1 ENST00000519499.1 ; transcript_alias_2 CTB-109A12.1-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000373787.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	20653626	20653703	.	+	.	gene_id lnc-HSFY1-1 ; transcript_id lnc-HSFY1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251510.1 ; gene_alias_2 AC022486.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000041976.1 ; transcript_alias_1 ENST00000510613.1 ; transcript_alias_2 AC022486.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000100032.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	20662506	20662937	.	+	.	gene_id lnc-HSFY1-1 ; transcript_id lnc-HSFY1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251510.1 ; gene_alias_2 AC022486.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000041976.1 ; transcript_alias_1 ENST00000510613.1 ; transcript_alias_2 AC022486.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000100032.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	20691526	20691723	.	+	.	gene_id lnc-HSFY1-1 ; transcript_id lnc-HSFY1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251510.1 ; gene_alias_2 AC022486.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000041976.1 ; transcript_alias_1 ENST00000510613.1 ; transcript_alias_2 AC022486.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000100032.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	20692374	20692482	.	+	.	gene_id lnc-HSFY1-1 ; transcript_id lnc-HSFY1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251510.1 ; gene_alias_2 AC022486.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000041976.1 ; transcript_alias_1 ENST00000510613.1 ; transcript_alias_2 AC022486.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000100032.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	20708919	20709584	.	+	.	gene_id lnc-HSFY1-1 ; transcript_id lnc-HSFY1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251510.1 ; gene_alias_2 AC022486.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000041976.1 ; transcript_alias_1 ENST00000510613.1 ; transcript_alias_2 AC022486.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000100032.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	125954250	125954966	.	+	.	gene_id lnc-ZNF572-1 ; transcript_id lnc-ZNF572-1:11 ; gene_alias_1 XLOC_006916 ; gene_alias_2 linc-ZNF572 ; transcript_alias_1 TCONS_00014468 ;
chr8	lncipedia.org	exon	125955512	125957988	.	+	.	gene_id lnc-ZNF572-1 ; transcript_id lnc-ZNF572-1:11 ; gene_alias_1 XLOC_006916 ; gene_alias_2 linc-ZNF572 ; transcript_alias_1 TCONS_00014468 ;
chr8	lncipedia.org	exon	125958297	125958401	.	+	.	gene_id lnc-ZNF572-1 ; transcript_id lnc-ZNF572-1:11 ; gene_alias_1 XLOC_006916 ; gene_alias_2 linc-ZNF572 ; transcript_alias_1 TCONS_00014468 ;
chr8	lncipedia.org	exon	125963058	125963337	.	+	.	gene_id lnc-ZNF572-1 ; transcript_id lnc-ZNF572-1:11 ; gene_alias_1 XLOC_006916 ; gene_alias_2 linc-ZNF572 ; transcript_alias_1 TCONS_00014468 ;
chr1	lncipedia.org	exon	202099159	202100553	.	+	.	gene_id lnc-GPR37L1-1 ; transcript_id lnc-GPR37L1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000260800.1 ; gene_alias_2 RP11-294K24.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000176314.1 ; transcript_alias_1 ENST00000565762.1 ; transcript_alias_2 RP11-294K24.4-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000431751.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	50623326	50623798	.	-	.	gene_id lnc-SPRYD7-1 ; transcript_id lnc-SPRYD7-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000231607 ; gene_alias_2 DLEU2 ; gene_alias_3 ENSG00000231607.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000016927.1 ; transcript_alias_1 ENST00000449579 ; transcript_alias_2 ENST00000449579.1 ; transcript_alias_3 DLEU2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000044956.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	50642233	50642299	.	-	.	gene_id lnc-SPRYD7-1 ; transcript_id lnc-SPRYD7-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000231607 ; gene_alias_2 DLEU2 ; gene_alias_3 ENSG00000231607.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000016927.1 ; transcript_alias_1 ENST00000449579 ; transcript_alias_2 ENST00000449579.1 ; transcript_alias_3 DLEU2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000044956.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	50649695	50649789	.	-	.	gene_id lnc-SPRYD7-1 ; transcript_id lnc-SPRYD7-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000231607 ; gene_alias_2 DLEU2 ; gene_alias_3 ENSG00000231607.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000016927.1 ; transcript_alias_1 ENST00000449579 ; transcript_alias_2 ENST00000449579.1 ; transcript_alias_3 DLEU2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000044956.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	50655959	50656114	.	-	.	gene_id lnc-SPRYD7-1 ; transcript_id lnc-SPRYD7-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000231607 ; gene_alias_2 DLEU2 ; gene_alias_3 ENSG00000231607.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000016927.1 ; transcript_alias_1 ENST00000449579 ; transcript_alias_2 ENST00000449579.1 ; transcript_alias_3 DLEU2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000044956.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143378736	143378913	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-3:11 ; gene_alias_1 ENSG00000238261 ; gene_alias_2 BX004987.5 ; gene_alias_3 ENSG00000238261.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013630.1 ; transcript_alias_1 ENST00000423394 ; transcript_alias_2 ENST00000423394.1 ; transcript_alias_3 BX004987.5-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037978.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143380464	143380964	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-3:11 ; gene_alias_1 ENSG00000238261 ; gene_alias_2 BX004987.5 ; gene_alias_3 ENSG00000238261.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013630.1 ; transcript_alias_1 ENST00000423394 ; transcript_alias_2 ENST00000423394.1 ; transcript_alias_3 BX004987.5-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037978.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	27078028	27080486	.	+	.	gene_id lnc-JMJD5-1 ; transcript_id lnc-JMJD5-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234186 ; gene_alias_2 C16orf82 ; gene_alias_3 ENSG00000234186.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161986.1 ; transcript_alias_1 ENST00000505035 ; transcript_alias_2 ENST00000505035.1 ; transcript_alias_3 C16orf82-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000366634.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	22602956	22603049	.	+	.	gene_id lnc-IL6-3 ; transcript_id lnc-IL6-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000232759 ; gene_alias_2 AC002480.3 ; gene_alias_3 ENSG00000232759.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152530.1 ; transcript_alias_1 ENST00000435127 ; transcript_alias_2 ENST00000435127.1 ; transcript_alias_3 AC002480.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000326621.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	22604585	22604771	.	+	.	gene_id lnc-IL6-3 ; transcript_id lnc-IL6-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000232759 ; gene_alias_2 AC002480.3 ; gene_alias_3 ENSG00000232759.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152530.1 ; transcript_alias_1 ENST00000435127 ; transcript_alias_2 ENST00000435127.1 ; transcript_alias_3 AC002480.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000326621.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	22611394	22611632	.	+	.	gene_id lnc-IL6-3 ; transcript_id lnc-IL6-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000232759 ; gene_alias_2 AC002480.3 ; gene_alias_3 ENSG00000232759.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152530.1 ; transcript_alias_1 ENST00000435127 ; transcript_alias_2 ENST00000435127.1 ; transcript_alias_3 AC002480.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000326621.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	22611704	22613615	.	+	.	gene_id lnc-IL6-3 ; transcript_id lnc-IL6-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000232759 ; gene_alias_2 AC002480.3 ; gene_alias_3 ENSG00000232759.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152530.1 ; transcript_alias_1 ENST00000435127 ; transcript_alias_2 ENST00000435127.1 ; transcript_alias_3 AC002480.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000326621.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	9217773	9217824	.	+	.	gene_id lnc-KLRG1-1 ; transcript_id lnc-KLRG1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245105 ; gene_alias_2 RP11-436I9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000245105.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168289.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499762 ; transcript_alias_2 ENST00000499762.1 ; transcript_alias_3 RP11-436I9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399176.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	9218422	9218656	.	+	.	gene_id lnc-KLRG1-1 ; transcript_id lnc-KLRG1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245105 ; gene_alias_2 RP11-436I9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000245105.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168289.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499762 ; transcript_alias_2 ENST00000499762.1 ; transcript_alias_3 RP11-436I9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399176.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	9218752	9220651	.	+	.	gene_id lnc-KLRG1-1 ; transcript_id lnc-KLRG1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245105 ; gene_alias_2 RP11-436I9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000245105.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168289.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499762 ; transcript_alias_2 ENST00000499762.1 ; transcript_alias_3 RP11-436I9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399176.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	96079036	96081463	.	-	.	gene_id lnc-TP53INP1-1 ; transcript_id lnc-TP53INP1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245080 ; gene_alias_2 RP11-320N21.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245080.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164658.3 ; transcript_alias_1 ENST00000501164 ; transcript_alias_2 ENST00000501164.2 ; transcript_alias_3 RP11-320N21.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379662.2 ;
chr8	lncipedia.org	exon	96084945	96085148	.	-	.	gene_id lnc-TP53INP1-1 ; transcript_id lnc-TP53INP1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245080 ; gene_alias_2 RP11-320N21.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245080.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164658.3 ; transcript_alias_1 ENST00000501164 ; transcript_alias_2 ENST00000501164.2 ; transcript_alias_3 RP11-320N21.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379662.2 ;
chr8	lncipedia.org	exon	67331824	67336017	.	-	.	gene_id lnc-MYBL1-1 ; transcript_id lnc-MYBL1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007111 ; gene_alias_2 linc-CRH-3 ; gene_alias_3 ENSG00000246145 ; gene_alias_4 RP11-346I3.4 ; gene_alias_5 ENSG00000246145.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000164956.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00014558 ; transcript_alias_2 ENST00000499642 ; transcript_alias_3 ENST00000499642.1 ; transcript_alias_4 RP11-346I3.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000381156.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	67338277	67338412	.	-	.	gene_id lnc-MYBL1-1 ; transcript_id lnc-MYBL1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007111 ; gene_alias_2 linc-CRH-3 ; gene_alias_3 ENSG00000246145 ; gene_alias_4 RP11-346I3.4 ; gene_alias_5 ENSG00000246145.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000164956.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00014558 ; transcript_alias_2 ENST00000499642 ; transcript_alias_3 ENST00000499642.1 ; transcript_alias_4 RP11-346I3.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000381156.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	67341177	67341212	.	-	.	gene_id lnc-MYBL1-1 ; transcript_id lnc-MYBL1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007111 ; gene_alias_2 linc-CRH-3 ; gene_alias_3 ENSG00000246145 ; gene_alias_4 RP11-346I3.4 ; gene_alias_5 ENSG00000246145.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000164956.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00014558 ; transcript_alias_2 ENST00000499642 ; transcript_alias_3 ENST00000499642.1 ; transcript_alias_4 RP11-346I3.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000381156.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	156358018	156358155	.	+	.	gene_id lnc-RHBG-1 ; transcript_id lnc-RHBG-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000237390 ; gene_alias_2 XLOC_000423 ; gene_alias_3 linc-TTC24-2 ; gene_alias_4 RP11-139I14.2 ; gene_alias_5 ENSG00000237390.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000031021.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451362 ; transcript_alias_2 TCONS_00000317 ; transcript_alias_3 ENST00000451362.1 ; transcript_alias_4 RP11-139I14.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000075987.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	156359954	156365401	.	+	.	gene_id lnc-RHBG-1 ; transcript_id lnc-RHBG-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000237390 ; gene_alias_2 XLOC_000423 ; gene_alias_3 linc-TTC24-2 ; gene_alias_4 RP11-139I14.2 ; gene_alias_5 ENSG00000237390.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000031021.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451362 ; transcript_alias_2 TCONS_00000317 ; transcript_alias_3 ENST00000451362.1 ; transcript_alias_4 RP11-139I14.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000075987.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	161144215	161145445	.	+	.	gene_id lnc-OTOL1-1 ; transcript_id lnc-OTOL1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000240567 ; gene_alias_2 RP11-3P17.4 ; gene_alias_3 ENSG00000240567.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159075.1 ; transcript_alias_1 ENST00000473595 ; transcript_alias_2 ENST00000473595.1 ; transcript_alias_3 RP11-3P17.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000353185.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	161147133	161147251	.	+	.	gene_id lnc-OTOL1-1 ; transcript_id lnc-OTOL1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000240567 ; gene_alias_2 RP11-3P17.4 ; gene_alias_3 ENSG00000240567.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159075.1 ; transcript_alias_1 ENST00000473595 ; transcript_alias_2 ENST00000473595.1 ; transcript_alias_3 RP11-3P17.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000353185.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	161161389	161161484	.	+	.	gene_id lnc-OTOL1-1 ; transcript_id lnc-OTOL1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000240567 ; gene_alias_2 RP11-3P17.4 ; gene_alias_3 ENSG00000240567.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159075.1 ; transcript_alias_1 ENST00000473595 ; transcript_alias_2 ENST00000473595.1 ; transcript_alias_3 RP11-3P17.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000353185.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	161164632	161166030	.	+	.	gene_id lnc-OTOL1-1 ; transcript_id lnc-OTOL1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000240567 ; gene_alias_2 RP11-3P17.4 ; gene_alias_3 ENSG00000240567.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159075.1 ; transcript_alias_1 ENST00000473595 ; transcript_alias_2 ENST00000473595.1 ; transcript_alias_3 RP11-3P17.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000353185.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	108444837	108444979	.	+	.	gene_id lnc-NR2E1-1 ; transcript_id lnc-NR2E1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000225174 ; gene_alias_2 RP3-429G5.3 ; gene_alias_3 ENSG00000225174.1 ; gene_alias_4 OSTM1-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000015320.2 ; transcript_alias_1 ENST00000441184 ; transcript_alias_2 ENST00000441184.1 ; transcript_alias_3 OSTM1-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000041713.2 ;
chr6	lncipedia.org	exon	108477406	108480596	.	+	.	gene_id lnc-NR2E1-1 ; transcript_id lnc-NR2E1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000225174 ; gene_alias_2 RP3-429G5.3 ; gene_alias_3 ENSG00000225174.1 ; gene_alias_4 OSTM1-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000015320.2 ; transcript_alias_1 ENST00000441184 ; transcript_alias_2 ENST00000441184.1 ; transcript_alias_3 OSTM1-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000041713.2 ;
chr14	lncipedia.org	exon	61769739	61773953	.	-	.	gene_id lnc-TMEM30B-1 ; transcript_id lnc-TMEM30B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247287 ; gene_alias_2 RP11-902B17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247287.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500036 ; transcript_alias_2 ENST00000500036.2 ; transcript_alias_3 RP11-902B17.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000413995.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	61789253	61789536	.	-	.	gene_id lnc-TMEM30B-1 ; transcript_id lnc-TMEM30B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247287 ; gene_alias_2 RP11-902B17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247287.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500036 ; transcript_alias_2 ENST00000500036.2 ; transcript_alias_3 RP11-902B17.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000413995.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	101659703	101659869	.	+	.	gene_id lnc-NFKBIZ-1 ; transcript_id lnc-NFKBIZ-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_002741 ; gene_alias_2 linc-ZPLD1 ; gene_alias_3 ENSG00000214407 ; gene_alias_4 RP11-221J22.1 ; gene_alias_5 ENSG00000214407.3 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000159212.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005382 ; transcript_alias_2 ENST00000465215 ; transcript_alias_3 ENST00000465215.1 ; transcript_alias_4 RP11-221J22.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000353854.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	101679206	101679306	.	+	.	gene_id lnc-NFKBIZ-1 ; transcript_id lnc-NFKBIZ-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_002741 ; gene_alias_2 linc-ZPLD1 ; gene_alias_3 ENSG00000214407 ; gene_alias_4 RP11-221J22.1 ; gene_alias_5 ENSG00000214407.3 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000159212.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005382 ; transcript_alias_2 ENST00000465215 ; transcript_alias_3 ENST00000465215.1 ; transcript_alias_4 RP11-221J22.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000353854.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	101713405	101713741	.	+	.	gene_id lnc-NFKBIZ-1 ; transcript_id lnc-NFKBIZ-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_002741 ; gene_alias_2 linc-ZPLD1 ; gene_alias_3 ENSG00000214407 ; gene_alias_4 RP11-221J22.1 ; gene_alias_5 ENSG00000214407.3 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000159212.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005382 ; transcript_alias_2 ENST00000465215 ; transcript_alias_3 ENST00000465215.1 ; transcript_alias_4 RP11-221J22.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000353854.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	101715325	101716770	.	+	.	gene_id lnc-NFKBIZ-1 ; transcript_id lnc-NFKBIZ-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_002741 ; gene_alias_2 linc-ZPLD1 ; gene_alias_3 ENSG00000214407 ; gene_alias_4 RP11-221J22.1 ; gene_alias_5 ENSG00000214407.3 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000159212.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005382 ; transcript_alias_2 ENST00000465215 ; transcript_alias_3 ENST00000465215.1 ; transcript_alias_4 RP11-221J22.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000353854.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	188225237	188225621	.	-	.	gene_id lnc-FAT1-3 ; transcript_id lnc-FAT1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_004217 ; gene_alias_2 linc-FAT1-8 ; gene_alias_3 ENSG00000250658 ; gene_alias_4 RP11-138B4.1 ; gene_alias_5 ENSG00000250658.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000160295.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00007930 ; transcript_alias_2 ENST00000511385 ; transcript_alias_3 ENST00000511385.1 ; transcript_alias_4 RP11-138B4.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000360092.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	188225792	188226855	.	-	.	gene_id lnc-FAT1-3 ; transcript_id lnc-FAT1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_004217 ; gene_alias_2 linc-FAT1-8 ; gene_alias_3 ENSG00000250658 ; gene_alias_4 RP11-138B4.1 ; gene_alias_5 ENSG00000250658.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000160295.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00007930 ; transcript_alias_2 ENST00000511385 ; transcript_alias_3 ENST00000511385.1 ; transcript_alias_4 RP11-138B4.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000360092.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	188228260	188228423	.	-	.	gene_id lnc-FAT1-3 ; transcript_id lnc-FAT1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_004217 ; gene_alias_2 linc-FAT1-8 ; gene_alias_3 ENSG00000250658 ; gene_alias_4 RP11-138B4.1 ; gene_alias_5 ENSG00000250658.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000160295.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00007930 ; transcript_alias_2 ENST00000511385 ; transcript_alias_3 ENST00000511385.1 ; transcript_alias_4 RP11-138B4.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000360092.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	188230336	188230836	.	-	.	gene_id lnc-FAT1-3 ; transcript_id lnc-FAT1-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_004217 ; gene_alias_2 linc-FAT1-8 ; gene_alias_3 ENSG00000250658 ; gene_alias_4 RP11-138B4.1 ; gene_alias_5 ENSG00000250658.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000160295.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00007930 ; transcript_alias_2 ENST00000511385 ; transcript_alias_3 ENST00000511385.1 ; transcript_alias_4 RP11-138B4.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000360092.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	42227219	42229984	.	-	.	gene_id lnc-SHISA8-1 ; transcript_id lnc-SHISA8-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000184068 ; gene_alias_2 RP5-821D11.7 ; gene_alias_3 ENSG00000184068.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151272.1 ; transcript_alias_1 ENST00000333487 ; transcript_alias_2 ENST00000333487.2 ; transcript_alias_3 RP5-821D11.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000322047.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	42230447	42230669	.	-	.	gene_id lnc-SHISA8-1 ; transcript_id lnc-SHISA8-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000184068 ; gene_alias_2 RP5-821D11.7 ; gene_alias_3 ENSG00000184068.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151272.1 ; transcript_alias_1 ENST00000333487 ; transcript_alias_2 ENST00000333487.2 ; transcript_alias_3 RP5-821D11.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000322047.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	10511269	10511528	.	-	.	gene_id lnc-TFAP2A-4 ; transcript_id lnc-TFAP2A-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000237685 ; gene_alias_2 RP11-360O19.4 ; gene_alias_3 ENSG00000237685.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014238.1 ; transcript_alias_1 ENST00000413129 ; transcript_alias_2 ENST00000413129.1 ; transcript_alias_3 RP11-360O19.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000039822.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	10513565	10514779	.	-	.	gene_id lnc-TFAP2A-4 ; transcript_id lnc-TFAP2A-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000237685 ; gene_alias_2 RP11-360O19.4 ; gene_alias_3 ENSG00000237685.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014238.1 ; transcript_alias_1 ENST00000413129 ; transcript_alias_2 ENST00000413129.1 ; transcript_alias_3 RP11-360O19.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000039822.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	96129593	96131413	.	+	.	gene_id lnc-TCL1B-1 ; transcript_id lnc-TCL1B-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000187621 ; gene_alias_2 TCL6 ; gene_alias_3 ENSG00000187621.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000149979.2 ; transcript_alias_1 ENST00000467865 ; transcript_alias_2 ENST00000467865.1 ; transcript_alias_3 TCL6-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000315133.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	96135888	96135954	.	+	.	gene_id lnc-TCL1B-1 ; transcript_id lnc-TCL1B-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000187621 ; gene_alias_2 TCL6 ; gene_alias_3 ENSG00000187621.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000149979.2 ; transcript_alias_1 ENST00000467865 ; transcript_alias_2 ENST00000467865.1 ; transcript_alias_3 TCL6-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000315133.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	96136779	96136914	.	+	.	gene_id lnc-TCL1B-1 ; transcript_id lnc-TCL1B-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000187621 ; gene_alias_2 TCL6 ; gene_alias_3 ENSG00000187621.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000149979.2 ; transcript_alias_1 ENST00000467865 ; transcript_alias_2 ENST00000467865.1 ; transcript_alias_3 TCL6-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000315133.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	96137668	96137824	.	+	.	gene_id lnc-TCL1B-1 ; transcript_id lnc-TCL1B-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000187621 ; gene_alias_2 TCL6 ; gene_alias_3 ENSG00000187621.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000149979.2 ; transcript_alias_1 ENST00000467865 ; transcript_alias_2 ENST00000467865.1 ; transcript_alias_3 TCL6-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000315133.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	96138308	96139789	.	+	.	gene_id lnc-TCL1B-1 ; transcript_id lnc-TCL1B-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000187621 ; gene_alias_2 TCL6 ; gene_alias_3 ENSG00000187621.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000149979.2 ; transcript_alias_1 ENST00000467865 ; transcript_alias_2 ENST00000467865.1 ; transcript_alias_3 TCL6-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000315133.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	53003635	53005211	.	+	.	gene_id lnc-AC021066.1-3 ; transcript_id lnc-AC021066.1-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000248214 ; gene_alias_2 ENSG00000257495.1 ; gene_alias_3 RP11-641A6.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169745.1 ; transcript_alias_1 ENST00000507911 ; transcript_alias_2 ENST00000552364.1 ; transcript_alias_3 RP11-641A6.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405698.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	53006125	53006613	.	+	.	gene_id lnc-AC021066.1-3 ; transcript_id lnc-AC021066.1-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000248214 ; gene_alias_2 ENSG00000257495.1 ; gene_alias_3 RP11-641A6.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169745.1 ; transcript_alias_1 ENST00000507911 ; transcript_alias_2 ENST00000552364.1 ; transcript_alias_3 RP11-641A6.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405698.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	53007348	53009089	.	+	.	gene_id lnc-AC021066.1-3 ; transcript_id lnc-AC021066.1-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000248214 ; gene_alias_2 ENSG00000257495.1 ; gene_alias_3 RP11-641A6.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169745.1 ; transcript_alias_1 ENST00000507911 ; transcript_alias_2 ENST00000552364.1 ; transcript_alias_3 RP11-641A6.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405698.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	120925634	120926696	.	+	.	gene_id lnc-FAM72B-2 ; transcript_id lnc-FAM72B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000233029 ; gene_alias_2 RP11-439A17.9 ; gene_alias_3 ENSG00000233029.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000041038.1 ; transcript_alias_1 ENST00000457996 ; transcript_alias_2 ENST00000457996.1 ; transcript_alias_3 RP11-439A17.9-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000098449.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	120930521	120933000	.	+	.	gene_id lnc-FAM72B-2 ; transcript_id lnc-FAM72B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000233029 ; gene_alias_2 RP11-439A17.9 ; gene_alias_3 ENSG00000233029.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000041038.1 ; transcript_alias_1 ENST00000457996 ; transcript_alias_2 ENST00000457996.1 ; transcript_alias_3 RP11-439A17.9-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000098449.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175570088	175570629	.	-	.	gene_id lnc-RP11-826N14.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-826N14.2.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248596 ; gene_alias_2 RP11-844P9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163191.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515403 ; transcript_alias_2 ENST00000515403.1 ; transcript_alias_3 RP11-844P9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371986.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175572028	175572198	.	-	.	gene_id lnc-RP11-826N14.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-826N14.2.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248596 ; gene_alias_2 RP11-844P9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163191.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515403 ; transcript_alias_2 ENST00000515403.1 ; transcript_alias_3 RP11-844P9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371986.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175573092	175573210	.	-	.	gene_id lnc-RP11-826N14.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-826N14.2.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248596 ; gene_alias_2 RP11-844P9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163191.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515403 ; transcript_alias_2 ENST00000515403.1 ; transcript_alias_3 RP11-844P9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371986.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175573969	175574108	.	-	.	gene_id lnc-RP11-826N14.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-826N14.2.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248596 ; gene_alias_2 RP11-844P9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163191.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515403 ; transcript_alias_2 ENST00000515403.1 ; transcript_alias_3 RP11-844P9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371986.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175574542	175574569	.	-	.	gene_id lnc-RP11-826N14.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-826N14.2.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248596 ; gene_alias_2 RP11-844P9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163191.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515403 ; transcript_alias_2 ENST00000515403.1 ; transcript_alias_3 RP11-844P9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371986.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175574689	175574873	.	-	.	gene_id lnc-RP11-826N14.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-826N14.2.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248596 ; gene_alias_2 RP11-844P9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163191.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515403 ; transcript_alias_2 ENST00000515403.1 ; transcript_alias_3 RP11-844P9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371986.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175575017	175575141	.	-	.	gene_id lnc-RP11-826N14.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-826N14.2.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248596 ; gene_alias_2 RP11-844P9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163191.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515403 ; transcript_alias_2 ENST00000515403.1 ; transcript_alias_3 RP11-844P9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371986.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175581754	175582635	.	-	.	gene_id lnc-RP11-826N14.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-826N14.2.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248596 ; gene_alias_2 RP11-844P9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163191.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515403 ; transcript_alias_2 ENST00000515403.1 ; transcript_alias_3 RP11-844P9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371986.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175583865	175583992	.	-	.	gene_id lnc-RP11-826N14.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-826N14.2.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248596 ; gene_alias_2 RP11-844P9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163191.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515403 ; transcript_alias_2 ENST00000515403.1 ; transcript_alias_3 RP11-844P9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371986.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175585867	175586199	.	-	.	gene_id lnc-RP11-826N14.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-826N14.2.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248596 ; gene_alias_2 RP11-844P9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163191.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515403 ; transcript_alias_2 ENST00000515403.1 ; transcript_alias_3 RP11-844P9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371986.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175594666	175594720	.	-	.	gene_id lnc-RP11-826N14.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-826N14.2.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248596 ; gene_alias_2 RP11-844P9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163191.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515403 ; transcript_alias_2 ENST00000515403.1 ; transcript_alias_3 RP11-844P9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371986.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175598756	175598866	.	-	.	gene_id lnc-RP11-826N14.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-826N14.2.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248596 ; gene_alias_2 RP11-844P9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163191.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515403 ; transcript_alias_2 ENST00000515403.1 ; transcript_alias_3 RP11-844P9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371986.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175600509	175600566	.	-	.	gene_id lnc-RP11-826N14.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-826N14.2.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248596 ; gene_alias_2 RP11-844P9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163191.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515403 ; transcript_alias_2 ENST00000515403.1 ; transcript_alias_3 RP11-844P9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371986.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175601977	175602063	.	-	.	gene_id lnc-RP11-826N14.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-826N14.2.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248596 ; gene_alias_2 RP11-844P9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163191.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515403 ; transcript_alias_2 ENST00000515403.1 ; transcript_alias_3 RP11-844P9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371986.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175602151	175602215	.	-	.	gene_id lnc-RP11-826N14.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-826N14.2.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248596 ; gene_alias_2 RP11-844P9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163191.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515403 ; transcript_alias_2 ENST00000515403.1 ; transcript_alias_3 RP11-844P9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371986.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175602837	175602904	.	-	.	gene_id lnc-RP11-826N14.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-826N14.2.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248596 ; gene_alias_2 RP11-844P9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163191.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515403 ; transcript_alias_2 ENST00000515403.1 ; transcript_alias_3 RP11-844P9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371986.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175603285	175603453	.	-	.	gene_id lnc-RP11-826N14.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-826N14.2.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248596 ; gene_alias_2 RP11-844P9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163191.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515403 ; transcript_alias_2 ENST00000515403.1 ; transcript_alias_3 RP11-844P9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371986.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175603762	175603826	.	-	.	gene_id lnc-RP11-826N14.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-826N14.2.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248596 ; gene_alias_2 RP11-844P9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163191.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515403 ; transcript_alias_2 ENST00000515403.1 ; transcript_alias_3 RP11-844P9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371986.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175607327	175607351	.	-	.	gene_id lnc-RP11-826N14.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-826N14.2.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248596 ; gene_alias_2 RP11-844P9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163191.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515403 ; transcript_alias_2 ENST00000515403.1 ; transcript_alias_3 RP11-844P9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371986.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175607819	175607889	.	-	.	gene_id lnc-RP11-826N14.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-826N14.2.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248596 ; gene_alias_2 RP11-844P9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163191.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515403 ; transcript_alias_2 ENST00000515403.1 ; transcript_alias_3 RP11-844P9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371986.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175609688	175609766	.	-	.	gene_id lnc-RP11-826N14.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-826N14.2.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248596 ; gene_alias_2 RP11-844P9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163191.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515403 ; transcript_alias_2 ENST00000515403.1 ; transcript_alias_3 RP11-844P9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371986.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175610234	175610304	.	-	.	gene_id lnc-RP11-826N14.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-826N14.2.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248596 ; gene_alias_2 RP11-844P9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163191.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515403 ; transcript_alias_2 ENST00000515403.1 ; transcript_alias_3 RP11-844P9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371986.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	175612104	175612158	.	-	.	gene_id lnc-RP11-826N14.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-826N14.2.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248596 ; gene_alias_2 RP11-844P9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163191.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515403 ; transcript_alias_2 ENST00000515403.1 ; transcript_alias_3 RP11-844P9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371986.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	149106846	149107004	.	+	.	gene_id lnc-MAGEA8-2 ; transcript_id lnc-MAGEA8-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235703 ; gene_alias_2 RP13-507I23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000235703.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022638.4 ; transcript_alias_1 ENST00000449111 ; transcript_alias_2 ENST00000449111.1 ; transcript_alias_3 RP13-507I23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058733.2 ;
chrX	lncipedia.org	exon	149108877	149109104	.	+	.	gene_id lnc-MAGEA8-2 ; transcript_id lnc-MAGEA8-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235703 ; gene_alias_2 RP13-507I23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000235703.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022638.4 ; transcript_alias_1 ENST00000449111 ; transcript_alias_2 ENST00000449111.1 ; transcript_alias_3 RP13-507I23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058733.2 ;
chrX	lncipedia.org	exon	149109275	149109457	.	+	.	gene_id lnc-MAGEA8-2 ; transcript_id lnc-MAGEA8-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235703 ; gene_alias_2 RP13-507I23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000235703.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022638.4 ; transcript_alias_1 ENST00000449111 ; transcript_alias_2 ENST00000449111.1 ; transcript_alias_3 RP13-507I23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058733.2 ;
chrX	lncipedia.org	exon	149110008	149110065	.	+	.	gene_id lnc-MAGEA8-2 ; transcript_id lnc-MAGEA8-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235703 ; gene_alias_2 RP13-507I23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000235703.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022638.4 ; transcript_alias_1 ENST00000449111 ; transcript_alias_2 ENST00000449111.1 ; transcript_alias_3 RP13-507I23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058733.2 ;
chrX	lncipedia.org	exon	149110402	149110547	.	+	.	gene_id lnc-MAGEA8-2 ; transcript_id lnc-MAGEA8-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235703 ; gene_alias_2 RP13-507I23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000235703.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022638.4 ; transcript_alias_1 ENST00000449111 ; transcript_alias_2 ENST00000449111.1 ; transcript_alias_3 RP13-507I23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058733.2 ;
chrX	lncipedia.org	exon	149111869	149111980	.	+	.	gene_id lnc-MAGEA8-2 ; transcript_id lnc-MAGEA8-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235703 ; gene_alias_2 RP13-507I23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000235703.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022638.4 ; transcript_alias_1 ENST00000449111 ; transcript_alias_2 ENST00000449111.1 ; transcript_alias_3 RP13-507I23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058733.2 ;
chrX	lncipedia.org	exon	149112236	149112318	.	+	.	gene_id lnc-MAGEA8-2 ; transcript_id lnc-MAGEA8-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235703 ; gene_alias_2 RP13-507I23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000235703.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022638.4 ; transcript_alias_1 ENST00000449111 ; transcript_alias_2 ENST00000449111.1 ; transcript_alias_3 RP13-507I23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058733.2 ;
chrX	lncipedia.org	exon	149114076	149115565	.	+	.	gene_id lnc-MAGEA8-2 ; transcript_id lnc-MAGEA8-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235703 ; gene_alias_2 RP13-507I23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000235703.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022638.4 ; transcript_alias_1 ENST00000449111 ; transcript_alias_2 ENST00000449111.1 ; transcript_alias_3 RP13-507I23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058733.2 ;
chrX	lncipedia.org	exon	149116296	149116393	.	+	.	gene_id lnc-MAGEA8-2 ; transcript_id lnc-MAGEA8-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235703 ; gene_alias_2 RP13-507I23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000235703.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022638.4 ; transcript_alias_1 ENST00000449111 ; transcript_alias_2 ENST00000449111.1 ; transcript_alias_3 RP13-507I23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058733.2 ;
chrX	lncipedia.org	exon	149116524	149116612	.	+	.	gene_id lnc-MAGEA8-2 ; transcript_id lnc-MAGEA8-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235703 ; gene_alias_2 RP13-507I23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000235703.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022638.4 ; transcript_alias_1 ENST00000449111 ; transcript_alias_2 ENST00000449111.1 ; transcript_alias_3 RP13-507I23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058733.2 ;
chrX	lncipedia.org	exon	149128984	149129167	.	+	.	gene_id lnc-MAGEA8-2 ; transcript_id lnc-MAGEA8-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235703 ; gene_alias_2 RP13-507I23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000235703.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022638.4 ; transcript_alias_1 ENST00000449111 ; transcript_alias_2 ENST00000449111.1 ; transcript_alias_3 RP13-507I23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058733.2 ;
chrX	lncipedia.org	exon	149391401	149391480	.	+	.	gene_id lnc-MAGEA8-2 ; transcript_id lnc-MAGEA8-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235703 ; gene_alias_2 RP13-507I23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000235703.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022638.4 ; transcript_alias_1 ENST00000449111 ; transcript_alias_2 ENST00000449111.1 ; transcript_alias_3 RP13-507I23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058733.2 ;
chrX	lncipedia.org	exon	149391702	149391843	.	+	.	gene_id lnc-MAGEA8-2 ; transcript_id lnc-MAGEA8-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235703 ; gene_alias_2 RP13-507I23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000235703.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022638.4 ; transcript_alias_1 ENST00000449111 ; transcript_alias_2 ENST00000449111.1 ; transcript_alias_3 RP13-507I23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058733.2 ;
chrX	lncipedia.org	exon	149392227	149392348	.	+	.	gene_id lnc-MAGEA8-2 ; transcript_id lnc-MAGEA8-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235703 ; gene_alias_2 RP13-507I23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000235703.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022638.4 ; transcript_alias_1 ENST00000449111 ; transcript_alias_2 ENST00000449111.1 ; transcript_alias_3 RP13-507I23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058733.2 ;
chrX	lncipedia.org	exon	149392576	149392815	.	+	.	gene_id lnc-MAGEA8-2 ; transcript_id lnc-MAGEA8-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235703 ; gene_alias_2 RP13-507I23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000235703.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022638.4 ; transcript_alias_1 ENST00000449111 ; transcript_alias_2 ENST00000449111.1 ; transcript_alias_3 RP13-507I23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058733.2 ;
chr12	lncipedia.org	exon	50305736	50305866	.	+	.	gene_id lnc-AQP2-1 ; transcript_id lnc-AQP2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000257771 ; gene_alias_2 RP11-70F11.8 ; gene_alias_3 ENSG00000257771.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169708.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546821 ; transcript_alias_2 ENST00000546821.1 ; transcript_alias_3 RP11-70F11.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405534.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	50315709	50317464	.	+	.	gene_id lnc-AQP2-1 ; transcript_id lnc-AQP2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000257771 ; gene_alias_2 RP11-70F11.8 ; gene_alias_3 ENSG00000257771.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169708.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546821 ; transcript_alias_2 ENST00000546821.1 ; transcript_alias_3 RP11-70F11.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405534.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	50317565	50318296	.	+	.	gene_id lnc-AQP2-1 ; transcript_id lnc-AQP2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000257771 ; gene_alias_2 RP11-70F11.8 ; gene_alias_3 ENSG00000257771.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169708.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546821 ; transcript_alias_2 ENST00000546821.1 ; transcript_alias_3 RP11-70F11.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405534.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	50318719	50318870	.	+	.	gene_id lnc-AQP2-1 ; transcript_id lnc-AQP2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000257771 ; gene_alias_2 RP11-70F11.8 ; gene_alias_3 ENSG00000257771.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169708.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546821 ; transcript_alias_2 ENST00000546821.1 ; transcript_alias_3 RP11-70F11.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405534.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	50319045	50319171	.	+	.	gene_id lnc-AQP2-1 ; transcript_id lnc-AQP2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000257771 ; gene_alias_2 RP11-70F11.8 ; gene_alias_3 ENSG00000257771.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169708.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546821 ; transcript_alias_2 ENST00000546821.1 ; transcript_alias_3 RP11-70F11.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405534.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	50319864	50320122	.	+	.	gene_id lnc-AQP2-1 ; transcript_id lnc-AQP2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000257771 ; gene_alias_2 RP11-70F11.8 ; gene_alias_3 ENSG00000257771.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169708.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546821 ; transcript_alias_2 ENST00000546821.1 ; transcript_alias_3 RP11-70F11.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405534.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	49686414	49687679	.	-	.	gene_id lnc-C1QL4-1 ; transcript_id lnc-C1QL4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246003 ; gene_alias_2 ENSG00000258334.1 ; gene_alias_3 RP11-161H23.9 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169733.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501178 ; transcript_alias_2 ENST00000553259.1 ; transcript_alias_3 RP11-161H23.9-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405659.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	49688231	49688318	.	-	.	gene_id lnc-C1QL4-1 ; transcript_id lnc-C1QL4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246003 ; gene_alias_2 ENSG00000258334.1 ; gene_alias_3 RP11-161H23.9 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169733.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501178 ; transcript_alias_2 ENST00000553259.1 ; transcript_alias_3 RP11-161H23.9-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405659.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	49689043	49690367	.	-	.	gene_id lnc-C1QL4-1 ; transcript_id lnc-C1QL4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246003 ; gene_alias_2 ENSG00000258334.1 ; gene_alias_3 RP11-161H23.9 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169733.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501178 ; transcript_alias_2 ENST00000553259.1 ; transcript_alias_3 RP11-161H23.9-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405659.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	49690499	49691489	.	-	.	gene_id lnc-C1QL4-1 ; transcript_id lnc-C1QL4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246003 ; gene_alias_2 ENSG00000258334.1 ; gene_alias_3 RP11-161H23.9 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169733.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501178 ; transcript_alias_2 ENST00000553259.1 ; transcript_alias_3 RP11-161H23.9-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405659.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	49696883	49697013	.	-	.	gene_id lnc-C1QL4-1 ; transcript_id lnc-C1QL4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246003 ; gene_alias_2 ENSG00000258334.1 ; gene_alias_3 RP11-161H23.9 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169733.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501178 ; transcript_alias_2 ENST00000553259.1 ; transcript_alias_3 RP11-161H23.9-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405659.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	49697589	49697675	.	-	.	gene_id lnc-C1QL4-1 ; transcript_id lnc-C1QL4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246003 ; gene_alias_2 ENSG00000258334.1 ; gene_alias_3 RP11-161H23.9 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169733.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501178 ; transcript_alias_2 ENST00000553259.1 ; transcript_alias_3 RP11-161H23.9-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405659.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	49717930	49718122	.	-	.	gene_id lnc-C1QL4-1 ; transcript_id lnc-C1QL4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246003 ; gene_alias_2 ENSG00000258334.1 ; gene_alias_3 RP11-161H23.9 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169733.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501178 ; transcript_alias_2 ENST00000553259.1 ; transcript_alias_3 RP11-161H23.9-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405659.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	49718275	49718359	.	-	.	gene_id lnc-C1QL4-1 ; transcript_id lnc-C1QL4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246003 ; gene_alias_2 ENSG00000258334.1 ; gene_alias_3 RP11-161H23.9 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169733.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501178 ; transcript_alias_2 ENST00000553259.1 ; transcript_alias_3 RP11-161H23.9-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405659.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	46404928	46405062	.	+	.	gene_id lnc-CHST7-1 ; transcript_id lnc-CHST7-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230844 ; gene_alias_2 RP1-71L16.2 ; gene_alias_3 ENSG00000230844.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021424.1 ; transcript_alias_1 ENST00000421685 ; transcript_alias_2 ENST00000421685.1 ; transcript_alias_3 RP1-71L16.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000056363.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	46405901	46407671	.	+	.	gene_id lnc-CHST7-1 ; transcript_id lnc-CHST7-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230844 ; gene_alias_2 RP1-71L16.2 ; gene_alias_3 ENSG00000230844.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021424.1 ; transcript_alias_1 ENST00000421685 ; transcript_alias_2 ENST00000421685.1 ; transcript_alias_3 RP1-71L16.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000056363.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	107297075	107300651	.	-	.	gene_id lnc-COG5-1 ; transcript_id lnc-COG5-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000233705 ; gene_alias_2 AC078937.4 ; gene_alias_3 ENSG00000233705.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154777.2 ; transcript_alias_1 ENST00000440512 ; transcript_alias_2 ENST00000440512.1 ; transcript_alias_3 AC078937.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000337030.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	107302047	107302156	.	-	.	gene_id lnc-COG5-1 ; transcript_id lnc-COG5-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000233705 ; gene_alias_2 AC078937.4 ; gene_alias_3 ENSG00000233705.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154777.2 ; transcript_alias_1 ENST00000440512 ; transcript_alias_2 ENST00000440512.1 ; transcript_alias_3 AC078937.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000337030.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	64681988	64682403	.	+	.	gene_id lnc-RP11-32K4.2.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-32K4.2.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000253734 ; gene_alias_2 RP11-579E24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000253734.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164399.1 ; transcript_alias_1 ENST00000519550 ; transcript_alias_2 ENST00000519550.1 ; transcript_alias_3 RP11-579E24.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000378601.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	64691006	64693479	.	+	.	gene_id lnc-RP11-32K4.2.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-32K4.2.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000253734 ; gene_alias_2 RP11-579E24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000253734.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164399.1 ; transcript_alias_1 ENST00000519550 ; transcript_alias_2 ENST00000519550.1 ; transcript_alias_3 RP11-579E24.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000378601.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	64697237	64698058	.	+	.	gene_id lnc-RP11-32K4.2.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-32K4.2.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000253734 ; gene_alias_2 RP11-579E24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000253734.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164399.1 ; transcript_alias_1 ENST00000519550 ; transcript_alias_2 ENST00000519550.1 ; transcript_alias_3 RP11-579E24.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000378601.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	46533362	46533419	.	+	.	gene_id lnc-FANCM-6 ; transcript_id lnc-FANCM-6:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258700 ; gene_alias_2 RP11-1A16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258700.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170871.3 ; transcript_alias_1 ENST00000556886 ; transcript_alias_2 ENST00000556886.1 ; transcript_alias_3 RP11-1A16.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000410777.2 ;
chr14	lncipedia.org	exon	46680027	46680142	.	+	.	gene_id lnc-FANCM-6 ; transcript_id lnc-FANCM-6:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258700 ; gene_alias_2 RP11-1A16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258700.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170871.3 ; transcript_alias_1 ENST00000556886 ; transcript_alias_2 ENST00000556886.1 ; transcript_alias_3 RP11-1A16.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000410777.2 ;
chr14	lncipedia.org	exon	46680950	46681007	.	+	.	gene_id lnc-FANCM-6 ; transcript_id lnc-FANCM-6:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258700 ; gene_alias_2 RP11-1A16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258700.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170871.3 ; transcript_alias_1 ENST00000556886 ; transcript_alias_2 ENST00000556886.1 ; transcript_alias_3 RP11-1A16.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000410777.2 ;
chr14	lncipedia.org	exon	46907384	46907453	.	+	.	gene_id lnc-FANCM-6 ; transcript_id lnc-FANCM-6:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258700 ; gene_alias_2 RP11-1A16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258700.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170871.3 ; transcript_alias_1 ENST00000556886 ; transcript_alias_2 ENST00000556886.1 ; transcript_alias_3 RP11-1A16.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000410777.2 ;
chr14	lncipedia.org	exon	46919111	46919157	.	+	.	gene_id lnc-FANCM-6 ; transcript_id lnc-FANCM-6:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258700 ; gene_alias_2 RP11-1A16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258700.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170871.3 ; transcript_alias_1 ENST00000556886 ; transcript_alias_2 ENST00000556886.1 ; transcript_alias_3 RP11-1A16.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000410777.2 ;
chr14	lncipedia.org	exon	46970510	46971026	.	+	.	gene_id lnc-FANCM-6 ; transcript_id lnc-FANCM-6:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258700 ; gene_alias_2 RP11-1A16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258700.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170871.3 ; transcript_alias_1 ENST00000556886 ; transcript_alias_2 ENST00000556886.1 ; transcript_alias_3 RP11-1A16.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000410777.2 ;
chr7	lncipedia.org	exon	157258925	157261240	.	+	.	gene_id lnc-AC006372.1-2 ; transcript_id lnc-AC006372.1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_006315 ; gene_alias_2 linc-WDR60-4 ; gene_alias_3 ENSG00000234210 ; gene_alias_4 AC006372.4 ; gene_alias_5 ENSG00000234210.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000152642.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013104 ; transcript_alias_2 ENST00000444158 ; transcript_alias_3 ENST00000444158.1 ; transcript_alias_4 AC006372.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000327102.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	157263563	157263793	.	+	.	gene_id lnc-AC006372.1-2 ; transcript_id lnc-AC006372.1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_006315 ; gene_alias_2 linc-WDR60-4 ; gene_alias_3 ENSG00000234210 ; gene_alias_4 AC006372.4 ; gene_alias_5 ENSG00000234210.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000152642.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013104 ; transcript_alias_2 ENST00000444158 ; transcript_alias_3 ENST00000444158.1 ; transcript_alias_4 AC006372.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000327102.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	157286027	157286141	.	+	.	gene_id lnc-AC006372.1-2 ; transcript_id lnc-AC006372.1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_006315 ; gene_alias_2 linc-WDR60-4 ; gene_alias_3 ENSG00000234210 ; gene_alias_4 AC006372.4 ; gene_alias_5 ENSG00000234210.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000152642.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013104 ; transcript_alias_2 ENST00000444158 ; transcript_alias_3 ENST00000444158.1 ; transcript_alias_4 AC006372.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000327102.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	157291024	157292410	.	+	.	gene_id lnc-AC006372.1-2 ; transcript_id lnc-AC006372.1-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_006315 ; gene_alias_2 linc-WDR60-4 ; gene_alias_3 ENSG00000234210 ; gene_alias_4 AC006372.4 ; gene_alias_5 ENSG00000234210.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000152642.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00013104 ; transcript_alias_2 ENST00000444158 ; transcript_alias_3 ENST00000444158.1 ; transcript_alias_4 AC006372.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000327102.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	48027423	48027635	.	+	.	gene_id lnc-TBC1D22A-4 ; transcript_id lnc-TBC1D22A-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224271 ; gene_alias_2 RP11-191L9.4 ; gene_alias_3 ENSG00000224271.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150321.1 ; transcript_alias_1 ENST00000423737 ; transcript_alias_2 ENST00000423737.1 ; transcript_alias_3 RP11-191L9.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000317556.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	48030929	48031102	.	+	.	gene_id lnc-TBC1D22A-4 ; transcript_id lnc-TBC1D22A-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224271 ; gene_alias_2 RP11-191L9.4 ; gene_alias_3 ENSG00000224271.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150321.1 ; transcript_alias_1 ENST00000423737 ; transcript_alias_2 ENST00000423737.1 ; transcript_alias_3 RP11-191L9.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000317556.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	48081949	48082061	.	+	.	gene_id lnc-TBC1D22A-4 ; transcript_id lnc-TBC1D22A-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224271 ; gene_alias_2 RP11-191L9.4 ; gene_alias_3 ENSG00000224271.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150321.1 ; transcript_alias_1 ENST00000423737 ; transcript_alias_2 ENST00000423737.1 ; transcript_alias_3 RP11-191L9.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000317556.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	48082324	48082444	.	+	.	gene_id lnc-TBC1D22A-4 ; transcript_id lnc-TBC1D22A-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224271 ; gene_alias_2 RP11-191L9.4 ; gene_alias_3 ENSG00000224271.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150321.1 ; transcript_alias_1 ENST00000423737 ; transcript_alias_2 ENST00000423737.1 ; transcript_alias_3 RP11-191L9.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000317556.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	48082552	48082687	.	+	.	gene_id lnc-TBC1D22A-4 ; transcript_id lnc-TBC1D22A-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224271 ; gene_alias_2 RP11-191L9.4 ; gene_alias_3 ENSG00000224271.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150321.1 ; transcript_alias_1 ENST00000423737 ; transcript_alias_2 ENST00000423737.1 ; transcript_alias_3 RP11-191L9.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000317556.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	48082890	48082955	.	+	.	gene_id lnc-TBC1D22A-4 ; transcript_id lnc-TBC1D22A-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224271 ; gene_alias_2 RP11-191L9.4 ; gene_alias_3 ENSG00000224271.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150321.1 ; transcript_alias_1 ENST00000423737 ; transcript_alias_2 ENST00000423737.1 ; transcript_alias_3 RP11-191L9.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000317556.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	48100338	48100496	.	+	.	gene_id lnc-TBC1D22A-4 ; transcript_id lnc-TBC1D22A-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224271 ; gene_alias_2 RP11-191L9.4 ; gene_alias_3 ENSG00000224271.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150321.1 ; transcript_alias_1 ENST00000423737 ; transcript_alias_2 ENST00000423737.1 ; transcript_alias_3 RP11-191L9.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000317556.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	48134183	48134325	.	+	.	gene_id lnc-TBC1D22A-4 ; transcript_id lnc-TBC1D22A-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224271 ; gene_alias_2 RP11-191L9.4 ; gene_alias_3 ENSG00000224271.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150321.1 ; transcript_alias_1 ENST00000423737 ; transcript_alias_2 ENST00000423737.1 ; transcript_alias_3 RP11-191L9.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000317556.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	48250660	48251349	.	+	.	gene_id lnc-TBC1D22A-4 ; transcript_id lnc-TBC1D22A-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224271 ; gene_alias_2 RP11-191L9.4 ; gene_alias_3 ENSG00000224271.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150321.1 ; transcript_alias_1 ENST00000423737 ; transcript_alias_2 ENST00000423737.1 ; transcript_alias_3 RP11-191L9.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000317556.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	147647870	147648567	.	-	.	gene_id lnc-HTR4-1 ; transcript_id lnc-HTR4-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247199 ; gene_alias_2 RP11-373N22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000247199.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163558.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501695 ; transcript_alias_2 ENST00000501695.3 ; transcript_alias_3 RP11-373N22.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000374175.2 ;
chr5	lncipedia.org	exon	147669815	147670558	.	-	.	gene_id lnc-HTR4-1 ; transcript_id lnc-HTR4-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247199 ; gene_alias_2 RP11-373N22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000247199.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163558.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501695 ; transcript_alias_2 ENST00000501695.3 ; transcript_alias_3 RP11-373N22.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000374175.2 ;
chr5	lncipedia.org	exon	147687567	147687728	.	-	.	gene_id lnc-HTR4-1 ; transcript_id lnc-HTR4-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247199 ; gene_alias_2 RP11-373N22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000247199.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163558.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501695 ; transcript_alias_2 ENST00000501695.3 ; transcript_alias_3 RP11-373N22.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000374175.2 ;
chr5	lncipedia.org	exon	147758265	147758408	.	-	.	gene_id lnc-HTR4-1 ; transcript_id lnc-HTR4-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247199 ; gene_alias_2 RP11-373N22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000247199.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163558.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501695 ; transcript_alias_2 ENST00000501695.3 ; transcript_alias_3 RP11-373N22.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000374175.2 ;
chr5	lncipedia.org	exon	147763062	147763346	.	-	.	gene_id lnc-HTR4-1 ; transcript_id lnc-HTR4-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247199 ; gene_alias_2 RP11-373N22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000247199.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163558.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501695 ; transcript_alias_2 ENST00000501695.3 ; transcript_alias_3 RP11-373N22.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000374175.2 ;
chrY	lncipedia.org	exon	27209230	27210230	.	-	.	gene_id lnc-BPY2C-1 ; transcript_id lnc-BPY2C-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000228296 ; gene_alias_2 TTTY4C ; gene_alias_3 ENSG00000228296.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000045200.1 ; transcript_alias_1 ENST00000456123 ; transcript_alias_2 ENST00000456123.1 ; transcript_alias_3 TTTY4C-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000104945.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	27216881	27216988	.	-	.	gene_id lnc-BPY2C-1 ; transcript_id lnc-BPY2C-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000228296 ; gene_alias_2 TTTY4C ; gene_alias_3 ENSG00000228296.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000045200.1 ; transcript_alias_1 ENST00000456123 ; transcript_alias_2 ENST00000456123.1 ; transcript_alias_3 TTTY4C-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000104945.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	27218793	27218868	.	-	.	gene_id lnc-BPY2C-1 ; transcript_id lnc-BPY2C-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000228296 ; gene_alias_2 TTTY4C ; gene_alias_3 ENSG00000228296.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000045200.1 ; transcript_alias_1 ENST00000456123 ; transcript_alias_2 ENST00000456123.1 ; transcript_alias_3 TTTY4C-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000104945.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	27245879	27246039	.	-	.	gene_id lnc-BPY2C-1 ; transcript_id lnc-BPY2C-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000228296 ; gene_alias_2 TTTY4C ; gene_alias_3 ENSG00000228296.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000045200.1 ; transcript_alias_1 ENST00000456123 ; transcript_alias_2 ENST00000456123.1 ; transcript_alias_3 TTTY4C-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000104945.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	102023641	102024156	.	-	.	gene_id lnc-HSP90AA1-9 ; transcript_id lnc-HSP90AA1-9:8 ; gene_alias_1 ENSG00000258498 ; gene_alias_2 DIO3OS ; gene_alias_3 ENSG00000258498.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171682.1 ; transcript_alias_1 ENST00000554441 ; transcript_alias_2 ENST00000554441.1 ; transcript_alias_3 DIO3OS-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414729.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	102024970	102025171	.	-	.	gene_id lnc-HSP90AA1-9 ; transcript_id lnc-HSP90AA1-9:8 ; gene_alias_1 ENSG00000258498 ; gene_alias_2 DIO3OS ; gene_alias_3 ENSG00000258498.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171682.1 ; transcript_alias_1 ENST00000554441 ; transcript_alias_2 ENST00000554441.1 ; transcript_alias_3 DIO3OS-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414729.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	102026137	102026362	.	-	.	gene_id lnc-HSP90AA1-9 ; transcript_id lnc-HSP90AA1-9:8 ; gene_alias_1 ENSG00000258498 ; gene_alias_2 DIO3OS ; gene_alias_3 ENSG00000258498.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171682.1 ; transcript_alias_1 ENST00000554441 ; transcript_alias_2 ENST00000554441.1 ; transcript_alias_3 DIO3OS-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414729.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	102026589	102026712	.	-	.	gene_id lnc-HSP90AA1-9 ; transcript_id lnc-HSP90AA1-9:8 ; gene_alias_1 ENSG00000258498 ; gene_alias_2 DIO3OS ; gene_alias_3 ENSG00000258498.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171682.1 ; transcript_alias_1 ENST00000554441 ; transcript_alias_2 ENST00000554441.1 ; transcript_alias_3 DIO3OS-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414729.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	29513582	29516811	.	-	.	gene_id lnc-DEFB116-3 ; transcript_id lnc-DEFB116-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000205611 ; gene_alias_2 RP4-610C12.4 ; gene_alias_3 ENSG00000205611.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000133197.1 ; transcript_alias_1 ENST00000380888 ; transcript_alias_2 ENST00000380888.3 ; transcript_alias_3 RP4-610C12.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000256907.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	29521116	29521213	.	-	.	gene_id lnc-DEFB116-3 ; transcript_id lnc-DEFB116-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000205611 ; gene_alias_2 RP4-610C12.4 ; gene_alias_3 ENSG00000205611.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000133197.1 ; transcript_alias_1 ENST00000380888 ; transcript_alias_2 ENST00000380888.3 ; transcript_alias_3 RP4-610C12.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000256907.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	10429488	10430546	.	-	.	gene_id lnc-TFAP2A-2 ; transcript_id lnc-TFAP2A-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000183674 ; gene_alias_2 RP1-290I10.8 ; gene_alias_3 ENSG00000183674.7 ; gene_alias_4 LINC00518 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000159175.1 ; transcript_alias_1 ENST00000496285 ; transcript_alias_2 ENST00000496285.1 ; transcript_alias_3 LINC00518-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000353699.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	10434481	10434659	.	-	.	gene_id lnc-TFAP2A-2 ; transcript_id lnc-TFAP2A-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000183674 ; gene_alias_2 RP1-290I10.8 ; gene_alias_3 ENSG00000183674.7 ; gene_alias_4 LINC00518 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000159175.1 ; transcript_alias_1 ENST00000496285 ; transcript_alias_2 ENST00000496285.1 ; transcript_alias_3 LINC00518-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000353699.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	10434746	10435055	.	-	.	gene_id lnc-TFAP2A-2 ; transcript_id lnc-TFAP2A-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000183674 ; gene_alias_2 RP1-290I10.8 ; gene_alias_3 ENSG00000183674.7 ; gene_alias_4 LINC00518 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000159175.1 ; transcript_alias_1 ENST00000496285 ; transcript_alias_2 ENST00000496285.1 ; transcript_alias_3 LINC00518-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000353699.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	61991340	61991521	.	+	.	gene_id lnc-COL20A1-1 ; transcript_id lnc-COL20A1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000203900 ; gene_alias_2 RP11-261N11.8 ; gene_alias_3 ENSG00000203900.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032958.2 ; transcript_alias_1 ENST00000370257 ; transcript_alias_2 ENST00000370257.1 ; transcript_alias_3 RP11-261N11.8-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000280681.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	61993170	61993293	.	+	.	gene_id lnc-COL20A1-1 ; transcript_id lnc-COL20A1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000203900 ; gene_alias_2 RP11-261N11.8 ; gene_alias_3 ENSG00000203900.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032958.2 ; transcript_alias_1 ENST00000370257 ; transcript_alias_2 ENST00000370257.1 ; transcript_alias_3 RP11-261N11.8-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000280681.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	61995567	61995629	.	+	.	gene_id lnc-COL20A1-1 ; transcript_id lnc-COL20A1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000203900 ; gene_alias_2 RP11-261N11.8 ; gene_alias_3 ENSG00000203900.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032958.2 ; transcript_alias_1 ENST00000370257 ; transcript_alias_2 ENST00000370257.1 ; transcript_alias_3 RP11-261N11.8-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000280681.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	61997835	62000412	.	+	.	gene_id lnc-COL20A1-1 ; transcript_id lnc-COL20A1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000203900 ; gene_alias_2 RP11-261N11.8 ; gene_alias_3 ENSG00000203900.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032958.2 ; transcript_alias_1 ENST00000370257 ; transcript_alias_2 ENST00000370257.1 ; transcript_alias_3 RP11-261N11.8-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000280681.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	62002213	62002529	.	+	.	gene_id lnc-COL20A1-1 ; transcript_id lnc-COL20A1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000203900 ; gene_alias_2 RP11-261N11.8 ; gene_alias_3 ENSG00000203900.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032958.2 ; transcript_alias_1 ENST00000370257 ; transcript_alias_2 ENST00000370257.1 ; transcript_alias_3 RP11-261N11.8-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000280681.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	66523532	66524057	.	-	.	gene_id lnc-FAM75A7-4 ; transcript_id lnc-FAM75A7-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000234665 ; gene_alias_2 RP11-262H14.3 ; gene_alias_3 ENSG00000234665.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013293.1 ; transcript_alias_1 ENST00000438699 ; transcript_alias_2 ENST00000438699.1 ; transcript_alias_3 RP11-262H14.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037076.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	66525014	66525128	.	-	.	gene_id lnc-FAM75A7-4 ; transcript_id lnc-FAM75A7-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000234665 ; gene_alias_2 RP11-262H14.3 ; gene_alias_3 ENSG00000234665.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013293.1 ; transcript_alias_1 ENST00000438699 ; transcript_alias_2 ENST00000438699.1 ; transcript_alias_3 RP11-262H14.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037076.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	66529191	66529391	.	-	.	gene_id lnc-FAM75A7-4 ; transcript_id lnc-FAM75A7-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000234665 ; gene_alias_2 RP11-262H14.3 ; gene_alias_3 ENSG00000234665.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013293.1 ; transcript_alias_1 ENST00000438699 ; transcript_alias_2 ENST00000438699.1 ; transcript_alias_3 RP11-262H14.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037076.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	175190755	175192138	.	+	.	gene_id lnc-SP9-1 ; transcript_id lnc-SP9-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231453 ; gene_alias_2 XLOC_001759 ; gene_alias_3 linc-SP9-1 ; gene_alias_4 AC018470.4 ; gene_alias_5 ENSG00000231453.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000154148.1 ; transcript_alias_1 ENST00000420866 ; transcript_alias_2 TCONS_00003051 ; transcript_alias_3 ENST00000420866.1 ; transcript_alias_4 AC018470.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000334113.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	175193185	175193564	.	+	.	gene_id lnc-SP9-1 ; transcript_id lnc-SP9-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231453 ; gene_alias_2 XLOC_001759 ; gene_alias_3 linc-SP9-1 ; gene_alias_4 AC018470.4 ; gene_alias_5 ENSG00000231453.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000154148.1 ; transcript_alias_1 ENST00000420866 ; transcript_alias_2 TCONS_00003051 ; transcript_alias_3 ENST00000420866.1 ; transcript_alias_4 AC018470.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000334113.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	175194013	175195371	.	+	.	gene_id lnc-SP9-1 ; transcript_id lnc-SP9-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231453 ; gene_alias_2 XLOC_001759 ; gene_alias_3 linc-SP9-1 ; gene_alias_4 AC018470.4 ; gene_alias_5 ENSG00000231453.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000154148.1 ; transcript_alias_1 ENST00000420866 ; transcript_alias_2 TCONS_00003051 ; transcript_alias_3 ENST00000420866.1 ; transcript_alias_4 AC018470.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000334113.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	58747888	58748072	.	+	.	gene_id lnc-VRK2-5 ; transcript_id lnc-VRK2-5:7 ; gene_alias_1 ENSG00000233723 ; gene_alias_2 AC007092.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233723.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152613.3 ; transcript_alias_1 ENST00000427421 ; transcript_alias_2 ENST00000427421.1 ; transcript_alias_3 AC007092.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000327006.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	58883785	58883846	.	+	.	gene_id lnc-VRK2-5 ; transcript_id lnc-VRK2-5:7 ; gene_alias_1 ENSG00000233723 ; gene_alias_2 AC007092.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233723.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152613.3 ; transcript_alias_1 ENST00000427421 ; transcript_alias_2 ENST00000427421.1 ; transcript_alias_3 AC007092.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000327006.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	59077565	59077741	.	+	.	gene_id lnc-VRK2-5 ; transcript_id lnc-VRK2-5:7 ; gene_alias_1 ENSG00000233723 ; gene_alias_2 AC007092.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233723.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152613.3 ; transcript_alias_1 ENST00000427421 ; transcript_alias_2 ENST00000427421.1 ; transcript_alias_3 AC007092.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000327006.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	59139854	59139881	.	+	.	gene_id lnc-VRK2-5 ; transcript_id lnc-VRK2-5:7 ; gene_alias_1 ENSG00000233723 ; gene_alias_2 AC007092.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233723.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152613.3 ; transcript_alias_1 ENST00000427421 ; transcript_alias_2 ENST00000427421.1 ; transcript_alias_3 AC007092.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000327006.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	59151680	59151761	.	+	.	gene_id lnc-VRK2-5 ; transcript_id lnc-VRK2-5:7 ; gene_alias_1 ENSG00000233723 ; gene_alias_2 AC007092.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233723.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152613.3 ; transcript_alias_1 ENST00000427421 ; transcript_alias_2 ENST00000427421.1 ; transcript_alias_3 AC007092.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000327006.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	59152746	59153044	.	+	.	gene_id lnc-VRK2-5 ; transcript_id lnc-VRK2-5:7 ; gene_alias_1 ENSG00000233723 ; gene_alias_2 AC007092.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233723.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152613.3 ; transcript_alias_1 ENST00000427421 ; transcript_alias_2 ENST00000427421.1 ; transcript_alias_3 AC007092.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000327006.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	59231084	59231162	.	+	.	gene_id lnc-VRK2-5 ; transcript_id lnc-VRK2-5:7 ; gene_alias_1 ENSG00000233723 ; gene_alias_2 AC007092.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233723.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152613.3 ; transcript_alias_1 ENST00000427421 ; transcript_alias_2 ENST00000427421.1 ; transcript_alias_3 AC007092.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000327006.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	59241465	59241533	.	+	.	gene_id lnc-VRK2-5 ; transcript_id lnc-VRK2-5:7 ; gene_alias_1 ENSG00000233723 ; gene_alias_2 AC007092.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233723.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152613.3 ; transcript_alias_1 ENST00000427421 ; transcript_alias_2 ENST00000427421.1 ; transcript_alias_3 AC007092.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000327006.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	59246764	59246826	.	+	.	gene_id lnc-VRK2-5 ; transcript_id lnc-VRK2-5:7 ; gene_alias_1 ENSG00000233723 ; gene_alias_2 AC007092.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233723.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152613.3 ; transcript_alias_1 ENST00000427421 ; transcript_alias_2 ENST00000427421.1 ; transcript_alias_3 AC007092.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000327006.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	59250091	59250117	.	+	.	gene_id lnc-VRK2-5 ; transcript_id lnc-VRK2-5:7 ; gene_alias_1 ENSG00000233723 ; gene_alias_2 AC007092.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233723.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152613.3 ; transcript_alias_1 ENST00000427421 ; transcript_alias_2 ENST00000427421.1 ; transcript_alias_3 AC007092.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000327006.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	59251971	59252125	.	+	.	gene_id lnc-VRK2-5 ; transcript_id lnc-VRK2-5:7 ; gene_alias_1 ENSG00000233723 ; gene_alias_2 AC007092.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233723.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152613.3 ; transcript_alias_1 ENST00000427421 ; transcript_alias_2 ENST00000427421.1 ; transcript_alias_3 AC007092.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000327006.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	59260305	59260350	.	+	.	gene_id lnc-VRK2-5 ; transcript_id lnc-VRK2-5:7 ; gene_alias_1 ENSG00000233723 ; gene_alias_2 AC007092.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233723.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152613.3 ; transcript_alias_1 ENST00000427421 ; transcript_alias_2 ENST00000427421.1 ; transcript_alias_3 AC007092.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000327006.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	59285696	59285731	.	+	.	gene_id lnc-VRK2-5 ; transcript_id lnc-VRK2-5:7 ; gene_alias_1 ENSG00000233723 ; gene_alias_2 AC007092.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233723.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152613.3 ; transcript_alias_1 ENST00000427421 ; transcript_alias_2 ENST00000427421.1 ; transcript_alias_3 AC007092.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000327006.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	59287914	59288788	.	+	.	gene_id lnc-VRK2-5 ; transcript_id lnc-VRK2-5:7 ; gene_alias_1 ENSG00000233723 ; gene_alias_2 AC007092.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233723.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152613.3 ; transcript_alias_1 ENST00000427421 ; transcript_alias_2 ENST00000427421.1 ; transcript_alias_3 AC007092.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000327006.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	115915660	115917486	.	-	.	gene_id lnc-TFEC-1 ; transcript_id lnc-TFEC-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237870 ; gene_alias_2 AC073130.1 ; gene_alias_3 ENSG00000237870.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000066051.2 ; transcript_alias_1 ENST00000457033 ; transcript_alias_2 ENST00000457033.1 ; transcript_alias_3 AC073130.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000141445.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	115926166	115926249	.	-	.	gene_id lnc-TFEC-1 ; transcript_id lnc-TFEC-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237870 ; gene_alias_2 AC073130.1 ; gene_alias_3 ENSG00000237870.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000066051.2 ; transcript_alias_1 ENST00000457033 ; transcript_alias_2 ENST00000457033.1 ; transcript_alias_3 AC073130.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000141445.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	115926672	115926718	.	-	.	gene_id lnc-TFEC-1 ; transcript_id lnc-TFEC-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237870 ; gene_alias_2 AC073130.1 ; gene_alias_3 ENSG00000237870.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000066051.2 ; transcript_alias_1 ENST00000457033 ; transcript_alias_2 ENST00000457033.1 ; transcript_alias_3 AC073130.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000141445.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	45484572	45484678	.	+	.	gene_id lnc-FAM27A-1 ; transcript_id lnc-FAM27A-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007365 ; gene_alias_2 linc-ANKRD20A1-14 ; gene_alias_3 ENSG00000232116 ; gene_alias_4 RP11-187C18.2 ; gene_alias_5 ENSG00000232116.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000013250.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015680 ; transcript_alias_2 ENST00000425742 ; transcript_alias_3 ENST00000425742.1 ; transcript_alias_4 RP11-187C18.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000037018.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	45487873	45488153	.	+	.	gene_id lnc-FAM27A-1 ; transcript_id lnc-FAM27A-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007365 ; gene_alias_2 linc-ANKRD20A1-14 ; gene_alias_3 ENSG00000232116 ; gene_alias_4 RP11-187C18.2 ; gene_alias_5 ENSG00000232116.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000013250.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015680 ; transcript_alias_2 ENST00000425742 ; transcript_alias_3 ENST00000425742.1 ; transcript_alias_4 RP11-187C18.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000037018.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	130645326	130646944	.	-	.	gene_id lnc-SCLT1-3 ; transcript_id lnc-SCLT1-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246876 ; gene_alias_2 RP11-519M16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246876.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161199.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500092 ; transcript_alias_2 ENST00000500092.2 ; transcript_alias_3 RP11-519M16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364132.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	130648077	130648188	.	-	.	gene_id lnc-SCLT1-3 ; transcript_id lnc-SCLT1-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246876 ; gene_alias_2 RP11-519M16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246876.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161199.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500092 ; transcript_alias_2 ENST00000500092.2 ; transcript_alias_3 RP11-519M16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364132.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	130665463	130665534	.	-	.	gene_id lnc-SCLT1-3 ; transcript_id lnc-SCLT1-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246876 ; gene_alias_2 RP11-519M16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246876.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161199.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500092 ; transcript_alias_2 ENST00000500092.2 ; transcript_alias_3 RP11-519M16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364132.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	130670783	130670875	.	-	.	gene_id lnc-SCLT1-3 ; transcript_id lnc-SCLT1-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246876 ; gene_alias_2 RP11-519M16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246876.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161199.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500092 ; transcript_alias_2 ENST00000500092.2 ; transcript_alias_3 RP11-519M16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364132.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	130692567	130692633	.	-	.	gene_id lnc-SCLT1-3 ; transcript_id lnc-SCLT1-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246876 ; gene_alias_2 RP11-519M16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246876.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161199.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500092 ; transcript_alias_2 ENST00000500092.2 ; transcript_alias_3 RP11-519M16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364132.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	560028	562953	.	+	.	gene_id lnc-HEATR2-3 ; transcript_id lnc-HEATR2-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223855 ; gene_alias_2 XLOC_005958 ; gene_alias_3 linc-HEATR2-2 ; gene_alias_4 AC147651.3 ; gene_alias_5 ENSG00000223855.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151410.1 ; transcript_alias_1 ENST00000452622 ; transcript_alias_2 TCONS_00012843 ; transcript_alias_3 ENST00000452622.1 ; transcript_alias_4 AC147651.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000322522.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	563717	563917	.	+	.	gene_id lnc-HEATR2-3 ; transcript_id lnc-HEATR2-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223855 ; gene_alias_2 XLOC_005958 ; gene_alias_3 linc-HEATR2-2 ; gene_alias_4 AC147651.3 ; gene_alias_5 ENSG00000223855.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151410.1 ; transcript_alias_1 ENST00000452622 ; transcript_alias_2 TCONS_00012843 ; transcript_alias_3 ENST00000452622.1 ; transcript_alias_4 AC147651.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000322522.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	564491	564869	.	+	.	gene_id lnc-HEATR2-3 ; transcript_id lnc-HEATR2-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223855 ; gene_alias_2 XLOC_005958 ; gene_alias_3 linc-HEATR2-2 ; gene_alias_4 AC147651.3 ; gene_alias_5 ENSG00000223855.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151410.1 ; transcript_alias_1 ENST00000452622 ; transcript_alias_2 TCONS_00012843 ; transcript_alias_3 ENST00000452622.1 ; transcript_alias_4 AC147651.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000322522.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	46270851	46271163	.	-	.	gene_id lnc-FAM27E1.1-2 ; transcript_id lnc-FAM27E1.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000225353 ; gene_alias_2 RP11-292F9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000225353.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013261.1 ; transcript_alias_1 ENST00000416205 ; transcript_alias_2 ENST00000416205.1 ; transcript_alias_3 RP11-292F9.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037030.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	46271254	46271375	.	-	.	gene_id lnc-FAM27E1.1-2 ; transcript_id lnc-FAM27E1.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000225353 ; gene_alias_2 RP11-292F9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000225353.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013261.1 ; transcript_alias_1 ENST00000416205 ; transcript_alias_2 ENST00000416205.1 ; transcript_alias_3 RP11-292F9.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037030.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	46273489	46273665	.	-	.	gene_id lnc-FAM27E1.1-2 ; transcript_id lnc-FAM27E1.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000225353 ; gene_alias_2 RP11-292F9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000225353.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013261.1 ; transcript_alias_1 ENST00000416205 ; transcript_alias_2 ENST00000416205.1 ; transcript_alias_3 RP11-292F9.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037030.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	46274498	46274899	.	-	.	gene_id lnc-FAM27E1.1-2 ; transcript_id lnc-FAM27E1.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000225353 ; gene_alias_2 RP11-292F9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000225353.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013261.1 ; transcript_alias_1 ENST00000416205 ; transcript_alias_2 ENST00000416205.1 ; transcript_alias_3 RP11-292F9.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037030.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143391568	143391849	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-3:14 ; gene_alias_1 ENSG00000238261 ; gene_alias_2 BX004987.5 ; gene_alias_3 ENSG00000238261.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013630.1 ; transcript_alias_1 ENST00000448844 ; transcript_alias_2 ENST00000448844.1 ; transcript_alias_3 BX004987.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037970.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143392443	143392656	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-3:14 ; gene_alias_1 ENSG00000238261 ; gene_alias_2 BX004987.5 ; gene_alias_3 ENSG00000238261.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013630.1 ; transcript_alias_1 ENST00000448844 ; transcript_alias_2 ENST00000448844.1 ; transcript_alias_3 BX004987.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037970.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143393991	143394211	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-3:14 ; gene_alias_1 ENSG00000238261 ; gene_alias_2 BX004987.5 ; gene_alias_3 ENSG00000238261.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013630.1 ; transcript_alias_1 ENST00000448844 ; transcript_alias_2 ENST00000448844.1 ; transcript_alias_3 BX004987.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037970.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143397625	143397670	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-3:14 ; gene_alias_1 ENSG00000238261 ; gene_alias_2 BX004987.5 ; gene_alias_3 ENSG00000238261.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013630.1 ; transcript_alias_1 ENST00000448844 ; transcript_alias_2 ENST00000448844.1 ; transcript_alias_3 BX004987.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037970.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143398836	143398889	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-3:14 ; gene_alias_1 ENSG00000238261 ; gene_alias_2 BX004987.5 ; gene_alias_3 ENSG00000238261.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013630.1 ; transcript_alias_1 ENST00000448844 ; transcript_alias_2 ENST00000448844.1 ; transcript_alias_3 BX004987.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037970.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143399695	143399814	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-3:14 ; gene_alias_1 ENSG00000238261 ; gene_alias_2 BX004987.5 ; gene_alias_3 ENSG00000238261.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013630.1 ; transcript_alias_1 ENST00000448844 ; transcript_alias_2 ENST00000448844.1 ; transcript_alias_3 BX004987.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037970.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143401362	143401533	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-3:14 ; gene_alias_1 ENSG00000238261 ; gene_alias_2 BX004987.5 ; gene_alias_3 ENSG00000238261.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013630.1 ; transcript_alias_1 ENST00000448844 ; transcript_alias_2 ENST00000448844.1 ; transcript_alias_3 BX004987.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037970.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	16947340	16951373	.	-	.	gene_id lnc-MST1P9-2 ; transcript_id lnc-MST1P9-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000215908 ; gene_alias_2 CROCCP2 ; gene_alias_3 ENSG00000215908.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037884.2 ; transcript_alias_1 ENST00000421700 ; transcript_alias_2 ENST00000421700.1 ; transcript_alias_3 CROCCP2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000092472.2 ;
chr1	lncipedia.org	exon	16951874	16952500	.	-	.	gene_id lnc-MST1P9-2 ; transcript_id lnc-MST1P9-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000215908 ; gene_alias_2 CROCCP2 ; gene_alias_3 ENSG00000215908.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037884.2 ; transcript_alias_1 ENST00000421700 ; transcript_alias_2 ENST00000421700.1 ; transcript_alias_3 CROCCP2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000092472.2 ;
chr1	lncipedia.org	exon	16952848	16952994	.	-	.	gene_id lnc-MST1P9-2 ; transcript_id lnc-MST1P9-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000215908 ; gene_alias_2 CROCCP2 ; gene_alias_3 ENSG00000215908.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037884.2 ; transcript_alias_1 ENST00000421700 ; transcript_alias_2 ENST00000421700.1 ; transcript_alias_3 CROCCP2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000092472.2 ;
chr1	lncipedia.org	exon	16953640	16953784	.	-	.	gene_id lnc-MST1P9-2 ; transcript_id lnc-MST1P9-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000215908 ; gene_alias_2 CROCCP2 ; gene_alias_3 ENSG00000215908.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037884.2 ; transcript_alias_1 ENST00000421700 ; transcript_alias_2 ENST00000421700.1 ; transcript_alias_3 CROCCP2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000092472.2 ;
chr1	lncipedia.org	exon	16954963	16955145	.	-	.	gene_id lnc-MST1P9-2 ; transcript_id lnc-MST1P9-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000215908 ; gene_alias_2 CROCCP2 ; gene_alias_3 ENSG00000215908.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037884.2 ; transcript_alias_1 ENST00000421700 ; transcript_alias_2 ENST00000421700.1 ; transcript_alias_3 CROCCP2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000092472.2 ;
chr1	lncipedia.org	exon	16957385	16957604	.	-	.	gene_id lnc-MST1P9-2 ; transcript_id lnc-MST1P9-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000215908 ; gene_alias_2 CROCCP2 ; gene_alias_3 ENSG00000215908.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037884.2 ; transcript_alias_1 ENST00000421700 ; transcript_alias_2 ENST00000421700.1 ; transcript_alias_3 CROCCP2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000092472.2 ;
chr1	lncipedia.org	exon	16958025	16958108	.	-	.	gene_id lnc-MST1P9-2 ; transcript_id lnc-MST1P9-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000215908 ; gene_alias_2 CROCCP2 ; gene_alias_3 ENSG00000215908.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037884.2 ; transcript_alias_1 ENST00000421700 ; transcript_alias_2 ENST00000421700.1 ; transcript_alias_3 CROCCP2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000092472.2 ;
chr1	lncipedia.org	exon	16958770	16958866	.	-	.	gene_id lnc-MST1P9-2 ; transcript_id lnc-MST1P9-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000215908 ; gene_alias_2 CROCCP2 ; gene_alias_3 ENSG00000215908.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037884.2 ; transcript_alias_1 ENST00000421700 ; transcript_alias_2 ENST00000421700.1 ; transcript_alias_3 CROCCP2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000092472.2 ;
chr1	lncipedia.org	exon	16959590	16959841	.	-	.	gene_id lnc-MST1P9-2 ; transcript_id lnc-MST1P9-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000215908 ; gene_alias_2 CROCCP2 ; gene_alias_3 ENSG00000215908.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037884.2 ; transcript_alias_1 ENST00000421700 ; transcript_alias_2 ENST00000421700.1 ; transcript_alias_3 CROCCP2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000092472.2 ;
chr1	lncipedia.org	exon	16969523	16969640	.	-	.	gene_id lnc-MST1P9-2 ; transcript_id lnc-MST1P9-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000215908 ; gene_alias_2 CROCCP2 ; gene_alias_3 ENSG00000215908.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037884.2 ; transcript_alias_1 ENST00000421700 ; transcript_alias_2 ENST00000421700.1 ; transcript_alias_3 CROCCP2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000092472.2 ;
chr1	lncipedia.org	exon	16971141	16971167	.	-	.	gene_id lnc-MST1P9-2 ; transcript_id lnc-MST1P9-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000215908 ; gene_alias_2 CROCCP2 ; gene_alias_3 ENSG00000215908.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037884.2 ; transcript_alias_1 ENST00000421700 ; transcript_alias_2 ENST00000421700.1 ; transcript_alias_3 CROCCP2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000092472.2 ;
chr12	lncipedia.org	exon	72647288	72652020	.	-	.	gene_id lnc-ZFC3H1-6 ; transcript_id lnc-ZFC3H1-6:6 ; gene_alias_1 ENSG00000236333 ; gene_alias_2 AC087886.1 ; gene_alias_3 ENSG00000236333.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150370.2 ; transcript_alias_1 ENST00000549957 ; transcript_alias_2 ENST00000549957.1 ; transcript_alias_3 AC087886.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405386.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	158810099	158810337	.	+	.	gene_id lnc-WDR60-4 ; transcript_id lnc-WDR60-4:7 ; gene_alias_1 ENSG00000231419 ; gene_alias_2 AC004863.6 ; gene_alias_3 ENSG00000231419.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151442.1 ; transcript_alias_1 ENST00000413238 ; transcript_alias_2 ENST00000413238.1 ; transcript_alias_3 AC004863.6-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000322666.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	158813176	158813539	.	+	.	gene_id lnc-WDR60-4 ; transcript_id lnc-WDR60-4:7 ; gene_alias_1 ENSG00000231419 ; gene_alias_2 AC004863.6 ; gene_alias_3 ENSG00000231419.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151442.1 ; transcript_alias_1 ENST00000413238 ; transcript_alias_2 ENST00000413238.1 ; transcript_alias_3 AC004863.6-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000322666.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	158814364	158814488	.	+	.	gene_id lnc-WDR60-4 ; transcript_id lnc-WDR60-4:7 ; gene_alias_1 ENSG00000231419 ; gene_alias_2 AC004863.6 ; gene_alias_3 ENSG00000231419.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151442.1 ; transcript_alias_1 ENST00000413238 ; transcript_alias_2 ENST00000413238.1 ; transcript_alias_3 AC004863.6-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000322666.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	158818931	158822886	.	+	.	gene_id lnc-WDR60-4 ; transcript_id lnc-WDR60-4:7 ; gene_alias_1 ENSG00000231419 ; gene_alias_2 AC004863.6 ; gene_alias_3 ENSG00000231419.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151442.1 ; transcript_alias_1 ENST00000413238 ; transcript_alias_2 ENST00000413238.1 ; transcript_alias_3 AC004863.6-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000322666.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	65437908	65438795	.	-	.	gene_id lnc-JAK1-1 ; transcript_id lnc-JAK1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000226891 ; gene_alias_2 RP11-182I10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000226891.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009307.1 ; transcript_alias_1 ENST00000447748 ; transcript_alias_2 ENST00000447748.1 ; transcript_alias_3 RP11-182I10.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000025780.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	65440258	65440398	.	-	.	gene_id lnc-JAK1-1 ; transcript_id lnc-JAK1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000226891 ; gene_alias_2 RP11-182I10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000226891.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009307.1 ; transcript_alias_1 ENST00000447748 ; transcript_alias_2 ENST00000447748.1 ; transcript_alias_3 RP11-182I10.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000025780.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	65455118	65455177	.	-	.	gene_id lnc-JAK1-1 ; transcript_id lnc-JAK1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000226891 ; gene_alias_2 RP11-182I10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000226891.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009307.1 ; transcript_alias_1 ENST00000447748 ; transcript_alias_2 ENST00000447748.1 ; transcript_alias_3 RP11-182I10.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000025780.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	65456981	65458695	.	-	.	gene_id lnc-JAK1-1 ; transcript_id lnc-JAK1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000226891 ; gene_alias_2 RP11-182I10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000226891.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009307.1 ; transcript_alias_1 ENST00000447748 ; transcript_alias_2 ENST00000447748.1 ; transcript_alias_3 RP11-182I10.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000025780.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	142242283	142242535	.	-	.	gene_id lnc-RNF150-2 ; transcript_id lnc-RNF150-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000248810 ; gene_alias_2 RP11-362F19.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248810.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161381.2 ; transcript_alias_1 ENST00000509161 ; transcript_alias_2 ENST00000509161.1 ; transcript_alias_3 RP11-362F19.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364745.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	142244576	142247161	.	-	.	gene_id lnc-RNF150-2 ; transcript_id lnc-RNF150-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000248810 ; gene_alias_2 RP11-362F19.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248810.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161381.2 ; transcript_alias_1 ENST00000509161 ; transcript_alias_2 ENST00000509161.1 ; transcript_alias_3 RP11-362F19.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364745.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	26522076	26526807	.	+	.	gene_id lnc-BTN1A1-2 ; transcript_id lnc-BTN1A1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228223 ; gene_alias_2 CTA-14H9.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228223.1 ; gene_alias_4 HCG11 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000014456.1 ; transcript_alias_1 ENST00000411553 ; transcript_alias_2 ENST00000411553.1 ; transcript_alias_3 HCG11-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000040121.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	44256189	44256817	.	-	.	gene_id lnc-FAM75A6-3 ; transcript_id lnc-FAM75A6-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233424 ; gene_alias_2 RP11-175I6.5 ; gene_alias_3 ENSG00000233424.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000058152.1 ; transcript_alias_1 ENST00000439824 ; transcript_alias_2 ENST00000439824.1 ; transcript_alias_3 RP11-175I6.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000128846.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	44260052	44260139	.	-	.	gene_id lnc-FAM75A6-3 ; transcript_id lnc-FAM75A6-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233424 ; gene_alias_2 RP11-175I6.5 ; gene_alias_3 ENSG00000233424.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000058152.1 ; transcript_alias_1 ENST00000439824 ; transcript_alias_2 ENST00000439824.1 ; transcript_alias_3 RP11-175I6.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000128846.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	44260422	44263319	.	-	.	gene_id lnc-FAM75A6-3 ; transcript_id lnc-FAM75A6-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233424 ; gene_alias_2 RP11-175I6.5 ; gene_alias_3 ENSG00000233424.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000058152.1 ; transcript_alias_1 ENST00000439824 ; transcript_alias_2 ENST00000439824.1 ; transcript_alias_3 RP11-175I6.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000128846.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	24536208	24539392	.	-	.	gene_id lnc-ARHGAP21-1 ; transcript_id lnc-ARHGAP21-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228508 ; gene_alias_2 RP11-183E9.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228508.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000017822.1 ; transcript_alias_1 ENST00000413666 ; transcript_alias_2 ENST00000413666.1 ; transcript_alias_3 RP11-183E9.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000047218.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	24540120	24540350	.	-	.	gene_id lnc-ARHGAP21-1 ; transcript_id lnc-ARHGAP21-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228508 ; gene_alias_2 RP11-183E9.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228508.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000017822.1 ; transcript_alias_1 ENST00000413666 ; transcript_alias_2 ENST00000413666.1 ; transcript_alias_3 RP11-183E9.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000047218.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	700237	700627	.	-	.	gene_id lnc-OR4F16-4 ; transcript_id lnc-OR4F16-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228327 ; gene_alias_2 RP11-206L10.2 ; gene_alias_3 ENSG00000228327.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002406.1 ; transcript_alias_1 ENST00000428504 ; transcript_alias_2 ENST00000428504.1 ; transcript_alias_3 RP11-206L10.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000006889.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	701709	701767	.	-	.	gene_id lnc-OR4F16-4 ; transcript_id lnc-OR4F16-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228327 ; gene_alias_2 RP11-206L10.2 ; gene_alias_3 ENSG00000228327.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002406.1 ; transcript_alias_1 ENST00000428504 ; transcript_alias_2 ENST00000428504.1 ; transcript_alias_3 RP11-206L10.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000006889.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	703928	703993	.	-	.	gene_id lnc-OR4F16-4 ; transcript_id lnc-OR4F16-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228327 ; gene_alias_2 RP11-206L10.2 ; gene_alias_3 ENSG00000228327.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002406.1 ; transcript_alias_1 ENST00000428504 ; transcript_alias_2 ENST00000428504.1 ; transcript_alias_3 RP11-206L10.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000006889.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	704877	705092	.	-	.	gene_id lnc-OR4F16-4 ; transcript_id lnc-OR4F16-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228327 ; gene_alias_2 RP11-206L10.2 ; gene_alias_3 ENSG00000228327.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002406.1 ; transcript_alias_1 ENST00000428504 ; transcript_alias_2 ENST00000428504.1 ; transcript_alias_3 RP11-206L10.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000006889.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	708356	708487	.	-	.	gene_id lnc-OR4F16-4 ; transcript_id lnc-OR4F16-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228327 ; gene_alias_2 RP11-206L10.2 ; gene_alias_3 ENSG00000228327.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002406.1 ; transcript_alias_1 ENST00000428504 ; transcript_alias_2 ENST00000428504.1 ; transcript_alias_3 RP11-206L10.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000006889.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	709551	709660	.	-	.	gene_id lnc-OR4F16-4 ; transcript_id lnc-OR4F16-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228327 ; gene_alias_2 RP11-206L10.2 ; gene_alias_3 ENSG00000228327.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002406.1 ; transcript_alias_1 ENST00000428504 ; transcript_alias_2 ENST00000428504.1 ; transcript_alias_3 RP11-206L10.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000006889.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	713664	714006	.	-	.	gene_id lnc-OR4F16-4 ; transcript_id lnc-OR4F16-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228327 ; gene_alias_2 RP11-206L10.2 ; gene_alias_3 ENSG00000228327.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002406.1 ; transcript_alias_1 ENST00000428504 ; transcript_alias_2 ENST00000428504.1 ; transcript_alias_3 RP11-206L10.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000006889.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	91658669	91658861	.	+	.	gene_id lnc-NECAB1-1 ; transcript_id lnc-NECAB1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246792 ; gene_alias_2 RP11-68L18.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246792.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164007.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501194 ; transcript_alias_2 ENST00000501194.2 ; transcript_alias_3 RP11-68L18.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000376723.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	91660706	91663985	.	+	.	gene_id lnc-NECAB1-1 ; transcript_id lnc-NECAB1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246792 ; gene_alias_2 RP11-68L18.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246792.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164007.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501194 ; transcript_alias_2 ENST00000501194.2 ; transcript_alias_3 RP11-68L18.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000376723.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	113993117	113993147	.	+	.	gene_id lnc-PSD4-1 ; transcript_id lnc-PSD4-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000189223 ; gene_alias_2 AC016683.6 ; gene_alias_3 ENSG00000189223.7 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153340.3 ; transcript_alias_1 ENST00000333145 ; transcript_alias_2 ENST00000333145.5 ; transcript_alias_3 AC016683.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330807.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	113994090	113994190	.	+	.	gene_id lnc-PSD4-1 ; transcript_id lnc-PSD4-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000189223 ; gene_alias_2 AC016683.6 ; gene_alias_3 ENSG00000189223.7 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153340.3 ; transcript_alias_1 ENST00000333145 ; transcript_alias_2 ENST00000333145.5 ; transcript_alias_3 AC016683.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330807.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	114012967	114013126	.	+	.	gene_id lnc-PSD4-1 ; transcript_id lnc-PSD4-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000189223 ; gene_alias_2 AC016683.6 ; gene_alias_3 ENSG00000189223.7 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153340.3 ; transcript_alias_1 ENST00000333145 ; transcript_alias_2 ENST00000333145.5 ; transcript_alias_3 AC016683.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330807.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	114016841	114017161	.	+	.	gene_id lnc-PSD4-1 ; transcript_id lnc-PSD4-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000189223 ; gene_alias_2 AC016683.6 ; gene_alias_3 ENSG00000189223.7 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153340.3 ; transcript_alias_1 ENST00000333145 ; transcript_alias_2 ENST00000333145.5 ; transcript_alias_3 AC016683.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330807.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	114020855	114021031	.	+	.	gene_id lnc-PSD4-1 ; transcript_id lnc-PSD4-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000189223 ; gene_alias_2 AC016683.6 ; gene_alias_3 ENSG00000189223.7 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153340.3 ; transcript_alias_1 ENST00000333145 ; transcript_alias_2 ENST00000333145.5 ; transcript_alias_3 AC016683.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330807.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	114023053	114024581	.	+	.	gene_id lnc-PSD4-1 ; transcript_id lnc-PSD4-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000189223 ; gene_alias_2 AC016683.6 ; gene_alias_3 ENSG00000189223.7 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153340.3 ; transcript_alias_1 ENST00000333145 ; transcript_alias_2 ENST00000333145.5 ; transcript_alias_3 AC016683.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330807.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	144823268	144828506	.	+	.	gene_id lnc-MAPK15-1 ; transcript_id lnc-MAPK15-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000203499 ; gene_alias_2 RP11-429J17.6 ; gene_alias_3 ENSG00000203499.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165151.1 ; transcript_alias_1 ENST00000435097 ; transcript_alias_2 ENST00000435097.2 ; transcript_alias_3 RP11-429J17.6-201 ;
chr11	lncipedia.org	exon	69240458	69240574	.	+	.	gene_id lnc-MYEOV-4 ; transcript_id lnc-MYEOV-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_009193 ; gene_alias_2 linc-CCND1-2 ; gene_alias_3 ENSG00000255980 ; gene_alias_4 AP000439.1 ; gene_alias_5 ENSG00000255980.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000168000.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00019102 ; transcript_alias_2 ENST00000545202 ; transcript_alias_3 ENST00000545202.1 ; transcript_alias_4 AP000439.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000397433.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	69242131	69244389	.	+	.	gene_id lnc-MYEOV-4 ; transcript_id lnc-MYEOV-4:1 ; gene_alias_1 XLOC_009193 ; gene_alias_2 linc-CCND1-2 ; gene_alias_3 ENSG00000255980 ; gene_alias_4 AP000439.1 ; gene_alias_5 ENSG00000255980.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000168000.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00019102 ; transcript_alias_2 ENST00000545202 ; transcript_alias_3 ENST00000545202.1 ; transcript_alias_4 AP000439.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000397433.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143188795	143189487	.	-	.	gene_id lnc-PPIAL4G-6 ; transcript_id lnc-PPIAL4G-6:2 ; gene_alias_1 ENSG00000232274 ; gene_alias_2 BX571672.2 ; gene_alias_3 ENSG00000232274.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013472.1 ; transcript_alias_1 ENST00000447389 ; transcript_alias_2 ENST00000447389.1 ; transcript_alias_3 BX571672.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037566.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143194122	143194342	.	-	.	gene_id lnc-PPIAL4G-6 ; transcript_id lnc-PPIAL4G-6:2 ; gene_alias_1 ENSG00000232274 ; gene_alias_2 BX571672.2 ; gene_alias_3 ENSG00000232274.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013472.1 ; transcript_alias_1 ENST00000447389 ; transcript_alias_2 ENST00000447389.1 ; transcript_alias_3 BX571672.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037566.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143195680	143195893	.	-	.	gene_id lnc-PPIAL4G-6 ; transcript_id lnc-PPIAL4G-6:2 ; gene_alias_1 ENSG00000232274 ; gene_alias_2 BX571672.2 ; gene_alias_3 ENSG00000232274.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013472.1 ; transcript_alias_1 ENST00000447389 ; transcript_alias_2 ENST00000447389.1 ; transcript_alias_3 BX571672.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037566.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143196522	143196803	.	-	.	gene_id lnc-PPIAL4G-6 ; transcript_id lnc-PPIAL4G-6:2 ; gene_alias_1 ENSG00000232274 ; gene_alias_2 BX571672.2 ; gene_alias_3 ENSG00000232274.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013472.1 ; transcript_alias_1 ENST00000447389 ; transcript_alias_2 ENST00000447389.1 ; transcript_alias_3 BX571672.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037566.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143391568	143391849	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-3:15 ; gene_alias_1 ENSG00000238261 ; gene_alias_2 BX004987.5 ; gene_alias_3 ENSG00000238261.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013630.1 ; transcript_alias_1 ENST00000421640 ; transcript_alias_2 ENST00000421640.1 ; transcript_alias_3 BX004987.5-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037976.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	143393991	143394444	.	+	.	gene_id lnc-RP3-377D14.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP3-377D14.1.1-3:15 ; gene_alias_1 ENSG00000238261 ; gene_alias_2 BX004987.5 ; gene_alias_3 ENSG00000238261.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013630.1 ; transcript_alias_1 ENST00000421640 ; transcript_alias_2 ENST00000421640.1 ; transcript_alias_3 BX004987.5-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037976.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	12860725	12863326	.	-	.	gene_id lnc-RAB28-2 ; transcript_id lnc-RAB28-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_003885 ; gene_alias_2 linc-HS3ST1-5 ; gene_alias_3 ENSG00000250371 ; gene_alias_4 RP11-22A3.2 ; gene_alias_5 ENSG00000250371.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000161598.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00007717 ; transcript_alias_2 ENST00000506899 ; transcript_alias_3 ENST00000506899.1 ; transcript_alias_4 RP11-22A3.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000365489.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	12866494	12866585	.	-	.	gene_id lnc-RAB28-2 ; transcript_id lnc-RAB28-2:1 ; gene_alias_1 XLOC_003885 ; gene_alias_2 linc-HS3ST1-5 ; gene_alias_3 ENSG00000250371 ; gene_alias_4 RP11-22A3.2 ; gene_alias_5 ENSG00000250371.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000161598.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00007717 ; transcript_alias_2 ENST00000506899 ; transcript_alias_3 ENST00000506899.1 ; transcript_alias_4 RP11-22A3.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000365489.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	30258783	30262741	.	-	.	gene_id lnc-TRIM26-2 ; transcript_id lnc-TRIM26-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231074 ; gene_alias_2 HCG18 ; gene_alias_3 ENSG00000231074.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031138.3 ; transcript_alias_1 ENST00000426882 ; transcript_alias_2 ENST00000426882.1 ; transcript_alias_3 HCG18-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000256033.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	30263909	30264014	.	-	.	gene_id lnc-TRIM26-2 ; transcript_id lnc-TRIM26-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231074 ; gene_alias_2 HCG18 ; gene_alias_3 ENSG00000231074.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031138.3 ; transcript_alias_1 ENST00000426882 ; transcript_alias_2 ENST00000426882.1 ; transcript_alias_3 HCG18-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000256033.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	30294131	30294927	.	-	.	gene_id lnc-TRIM26-2 ; transcript_id lnc-TRIM26-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231074 ; gene_alias_2 HCG18 ; gene_alias_3 ENSG00000231074.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031138.3 ; transcript_alias_1 ENST00000426882 ; transcript_alias_2 ENST00000426882.1 ; transcript_alias_3 HCG18-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000256033.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	8858130	8858323	.	+	.	gene_id lnc-KDM4C-8 ; transcript_id lnc-KDM4C-8:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225706 ; gene_alias_2 RP11-75C9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000225706.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000019543.1 ; transcript_alias_1 ENST00000447950 ; transcript_alias_2 ENST00000447950.1 ; transcript_alias_3 RP11-75C9.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000051711.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	8860782	8862255	.	+	.	gene_id lnc-KDM4C-8 ; transcript_id lnc-KDM4C-8:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225706 ; gene_alias_2 RP11-75C9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000225706.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000019543.1 ; transcript_alias_1 ENST00000447950 ; transcript_alias_2 ENST00000447950.1 ; transcript_alias_3 RP11-75C9.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000051711.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	27186782	27187031	.	+	.	gene_id lnc-EVX1-8 ; transcript_id lnc-EVX1-8:3 ; gene_alias_1 ENSG00000254369 ; gene_alias_2 RP1-170O19.2 ; gene_alias_3 ENSG00000254369.2 ; gene_alias_4 HOXA-AS3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158092.3 ; transcript_alias_1 ENST00000518947 ; transcript_alias_2 ENST00000518947.2 ; transcript_alias_3 HOXA-AS3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350162.3 ;
chr7	lncipedia.org	exon	27191194	27191300	.	+	.	gene_id lnc-EVX1-8 ; transcript_id lnc-EVX1-8:3 ; gene_alias_1 ENSG00000254369 ; gene_alias_2 RP1-170O19.2 ; gene_alias_3 ENSG00000254369.2 ; gene_alias_4 HOXA-AS3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158092.3 ; transcript_alias_1 ENST00000518947 ; transcript_alias_2 ENST00000518947.2 ; transcript_alias_3 HOXA-AS3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350162.3 ;
chr7	lncipedia.org	exon	27191913	27195542	.	+	.	gene_id lnc-EVX1-8 ; transcript_id lnc-EVX1-8:3 ; gene_alias_1 ENSG00000254369 ; gene_alias_2 RP1-170O19.2 ; gene_alias_3 ENSG00000254369.2 ; gene_alias_4 HOXA-AS3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158092.3 ; transcript_alias_1 ENST00000518947 ; transcript_alias_2 ENST00000518947.2 ; transcript_alias_3 HOXA-AS3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350162.3 ;
chrY	lncipedia.org	exon	24626684	24626803	.	+	.	gene_id lnc-RBMY1J-1 ; transcript_id lnc-RBMY1J-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_008300 ; gene_alias_2 linc-PRY ; gene_alias_3 ENSG00000235059 ; gene_alias_4 AC008175.1 ; gene_alias_5 ENSG00000235059.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000043582.3 ; transcript_alias_1 TCONS_00017616 ; transcript_alias_2 ENST00000439653 ; transcript_alias_3 ENST00000439653.1 ; transcript_alias_4 AC008175.1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000102216.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	24629551	24629668	.	+	.	gene_id lnc-RBMY1J-1 ; transcript_id lnc-RBMY1J-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_008300 ; gene_alias_2 linc-PRY ; gene_alias_3 ENSG00000235059 ; gene_alias_4 AC008175.1 ; gene_alias_5 ENSG00000235059.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000043582.3 ; transcript_alias_1 TCONS_00017616 ; transcript_alias_2 ENST00000439653 ; transcript_alias_3 ENST00000439653.1 ; transcript_alias_4 AC008175.1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000102216.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	24630184	24630448	.	+	.	gene_id lnc-RBMY1J-1 ; transcript_id lnc-RBMY1J-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_008300 ; gene_alias_2 linc-PRY ; gene_alias_3 ENSG00000235059 ; gene_alias_4 AC008175.1 ; gene_alias_5 ENSG00000235059.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000043582.3 ; transcript_alias_1 TCONS_00017616 ; transcript_alias_2 ENST00000439653 ; transcript_alias_3 ENST00000439653.1 ; transcript_alias_4 AC008175.1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000102216.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	24631498	24631739	.	+	.	gene_id lnc-RBMY1J-1 ; transcript_id lnc-RBMY1J-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_008300 ; gene_alias_2 linc-PRY ; gene_alias_3 ENSG00000235059 ; gene_alias_4 AC008175.1 ; gene_alias_5 ENSG00000235059.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000043582.3 ; transcript_alias_1 TCONS_00017616 ; transcript_alias_2 ENST00000439653 ; transcript_alias_3 ENST00000439653.1 ; transcript_alias_4 AC008175.1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000102216.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	96129593	96131413	.	+	.	gene_id lnc-TCL1B-1 ; transcript_id lnc-TCL1B-1:10 ; gene_alias_1 ENSG00000187621 ; gene_alias_2 TCL6 ; gene_alias_3 ENSG00000187621.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000149979.2 ; transcript_alias_1 ENST00000352367 ; transcript_alias_2 ENST00000352367.6 ; transcript_alias_3 TCL6-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000315130.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	96134463	96134917	.	+	.	gene_id lnc-TCL1B-1 ; transcript_id lnc-TCL1B-1:10 ; gene_alias_1 ENSG00000187621 ; gene_alias_2 TCL6 ; gene_alias_3 ENSG00000187621.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000149979.2 ; transcript_alias_1 ENST00000352367 ; transcript_alias_2 ENST00000352367.6 ; transcript_alias_3 TCL6-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000315130.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	96135888	96135954	.	+	.	gene_id lnc-TCL1B-1 ; transcript_id lnc-TCL1B-1:10 ; gene_alias_1 ENSG00000187621 ; gene_alias_2 TCL6 ; gene_alias_3 ENSG00000187621.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000149979.2 ; transcript_alias_1 ENST00000352367 ; transcript_alias_2 ENST00000352367.6 ; transcript_alias_3 TCL6-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000315130.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	96136779	96136914	.	+	.	gene_id lnc-TCL1B-1 ; transcript_id lnc-TCL1B-1:10 ; gene_alias_1 ENSG00000187621 ; gene_alias_2 TCL6 ; gene_alias_3 ENSG00000187621.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000149979.2 ; transcript_alias_1 ENST00000352367 ; transcript_alias_2 ENST00000352367.6 ; transcript_alias_3 TCL6-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000315130.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	96137668	96137824	.	+	.	gene_id lnc-TCL1B-1 ; transcript_id lnc-TCL1B-1:10 ; gene_alias_1 ENSG00000187621 ; gene_alias_2 TCL6 ; gene_alias_3 ENSG00000187621.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000149979.2 ; transcript_alias_1 ENST00000352367 ; transcript_alias_2 ENST00000352367.6 ; transcript_alias_3 TCL6-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000315130.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	96145409	96146170	.	+	.	gene_id lnc-TCL1B-1 ; transcript_id lnc-TCL1B-1:10 ; gene_alias_1 ENSG00000187621 ; gene_alias_2 TCL6 ; gene_alias_3 ENSG00000187621.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000149979.2 ; transcript_alias_1 ENST00000352367 ; transcript_alias_2 ENST00000352367.6 ; transcript_alias_3 TCL6-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000315130.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	82347498	82347934	.	+	.	gene_id lnc-C12orf26-2 ; transcript_id lnc-C12orf26-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257747 ; gene_alias_2 RP11-362A1.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257747.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170249.1 ; transcript_alias_1 ENST00000550506 ; transcript_alias_2 ENST00000550506.1 ; transcript_alias_3 RP11-362A1.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408183.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	82348027	82348259	.	+	.	gene_id lnc-C12orf26-2 ; transcript_id lnc-C12orf26-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257747 ; gene_alias_2 RP11-362A1.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257747.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170249.1 ; transcript_alias_1 ENST00000550506 ; transcript_alias_2 ENST00000550506.1 ; transcript_alias_3 RP11-362A1.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408183.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	82386211	82386912	.	+	.	gene_id lnc-C12orf26-2 ; transcript_id lnc-C12orf26-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257747 ; gene_alias_2 RP11-362A1.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257747.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170249.1 ; transcript_alias_1 ENST00000550506 ; transcript_alias_2 ENST00000550506.1 ; transcript_alias_3 RP11-362A1.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408183.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87960263	87963409	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:12 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; transcript_alias_1 ENST00000500197 ; transcript_alias_2 ENST00000500197.2 ; transcript_alias_3 LINC00461-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369801.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87966854	87966903	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:12 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; transcript_alias_1 ENST00000500197 ; transcript_alias_2 ENST00000500197.2 ; transcript_alias_3 LINC00461-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369801.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87968783	87968908	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:12 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; transcript_alias_1 ENST00000500197 ; transcript_alias_2 ENST00000500197.2 ; transcript_alias_3 LINC00461-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369801.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87969100	87969157	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:12 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; transcript_alias_1 ENST00000500197 ; transcript_alias_2 ENST00000500197.2 ; transcript_alias_3 LINC00461-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369801.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	234348352	234349853	.	-	.	gene_id lnc-TARBP1-4 ; transcript_id lnc-TARBP1-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233332 ; gene_alias_2 RP4-799P18.2 ; gene_alias_3 ENSG00000233332.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000040084.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412483 ; transcript_alias_2 ENST00000412483.1 ; transcript_alias_3 RP4-799P18.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000096666.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	234350614	234350834	.	-	.	gene_id lnc-TARBP1-4 ; transcript_id lnc-TARBP1-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233332 ; gene_alias_2 RP4-799P18.2 ; gene_alias_3 ENSG00000233332.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000040084.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412483 ; transcript_alias_2 ENST00000412483.1 ; transcript_alias_3 RP4-799P18.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000096666.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	110744640	110744767	.	+	.	gene_id lnc-LIMS3-1 ; transcript_id lnc-LIMS3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204588 ; gene_alias_2 AC013268.5 ; gene_alias_3 ENSG00000204588.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154954.2 ; transcript_alias_1 ENST00000419296 ; transcript_alias_2 ENST00000419296.1 ; transcript_alias_3 AC013268.5-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000337869.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	110745138	110746379	.	+	.	gene_id lnc-LIMS3-1 ; transcript_id lnc-LIMS3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204588 ; gene_alias_2 AC013268.5 ; gene_alias_3 ENSG00000204588.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154954.2 ; transcript_alias_1 ENST00000419296 ; transcript_alias_2 ENST00000419296.1 ; transcript_alias_3 AC013268.5-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000337869.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	110751212	110751396	.	+	.	gene_id lnc-LIMS3-1 ; transcript_id lnc-LIMS3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204588 ; gene_alias_2 AC013268.5 ; gene_alias_3 ENSG00000204588.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154954.2 ; transcript_alias_1 ENST00000419296 ; transcript_alias_2 ENST00000419296.1 ; transcript_alias_3 AC013268.5-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000337869.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	110751978	110752858	.	+	.	gene_id lnc-LIMS3-1 ; transcript_id lnc-LIMS3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204588 ; gene_alias_2 AC013268.5 ; gene_alias_3 ENSG00000204588.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154954.2 ; transcript_alias_1 ENST00000419296 ; transcript_alias_2 ENST00000419296.1 ; transcript_alias_3 AC013268.5-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000337869.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73040491	73047819	.	-	.	gene_id lnc-NAP1L2-1 ; transcript_id lnc-NAP1L2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229807 ; gene_alias_2 XIST ; gene_alias_3 ENSG00000229807.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021839.3 ; transcript_alias_1 ENST00000429829 ; transcript_alias_2 ENST00000429829.1 ; transcript_alias_3 XIST-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057239.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73048903	73049066	.	-	.	gene_id lnc-NAP1L2-1 ; transcript_id lnc-NAP1L2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229807 ; gene_alias_2 XIST ; gene_alias_3 ENSG00000229807.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021839.3 ; transcript_alias_1 ENST00000429829 ; transcript_alias_2 ENST00000429829.1 ; transcript_alias_3 XIST-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057239.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73050901	73051109	.	-	.	gene_id lnc-NAP1L2-1 ; transcript_id lnc-NAP1L2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229807 ; gene_alias_2 XIST ; gene_alias_3 ENSG00000229807.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021839.3 ; transcript_alias_1 ENST00000429829 ; transcript_alias_2 ENST00000429829.1 ; transcript_alias_3 XIST-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057239.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73053073	73053209	.	-	.	gene_id lnc-NAP1L2-1 ; transcript_id lnc-NAP1L2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229807 ; gene_alias_2 XIST ; gene_alias_3 ENSG00000229807.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021839.3 ; transcript_alias_1 ENST00000429829 ; transcript_alias_2 ENST00000429829.1 ; transcript_alias_3 XIST-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057239.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73057275	73057338	.	-	.	gene_id lnc-NAP1L2-1 ; transcript_id lnc-NAP1L2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229807 ; gene_alias_2 XIST ; gene_alias_3 ENSG00000229807.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021839.3 ; transcript_alias_1 ENST00000429829 ; transcript_alias_2 ENST00000429829.1 ; transcript_alias_3 XIST-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057239.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73061217	73072588	.	-	.	gene_id lnc-NAP1L2-1 ; transcript_id lnc-NAP1L2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229807 ; gene_alias_2 XIST ; gene_alias_3 ENSG00000229807.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021839.3 ; transcript_alias_1 ENST00000429829 ; transcript_alias_2 ENST00000429829.1 ; transcript_alias_3 XIST-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057239.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	102094836	102094900	.	+	.	gene_id lnc-BHLHB9-1 ; transcript_id lnc-BHLHB9-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000223546 ; gene_alias_2 LL0XNC01-157D4.1 ; gene_alias_3 ENSG00000223546.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022077.1 ; transcript_alias_1 ENST00000416381 ; transcript_alias_2 ENST00000416381.1 ; transcript_alias_3 LL0XNC01-157D4.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057668.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	102100785	102100948	.	+	.	gene_id lnc-BHLHB9-1 ; transcript_id lnc-BHLHB9-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000223546 ; gene_alias_2 LL0XNC01-157D4.1 ; gene_alias_3 ENSG00000223546.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022077.1 ; transcript_alias_1 ENST00000416381 ; transcript_alias_2 ENST00000416381.1 ; transcript_alias_3 LL0XNC01-157D4.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057668.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	102119970	102121752	.	+	.	gene_id lnc-BHLHB9-1 ; transcript_id lnc-BHLHB9-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000223546 ; gene_alias_2 LL0XNC01-157D4.1 ; gene_alias_3 ENSG00000223546.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022077.1 ; transcript_alias_1 ENST00000416381 ; transcript_alias_2 ENST00000416381.1 ; transcript_alias_3 LL0XNC01-157D4.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057668.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45010211	45010266	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412211 ; transcript_alias_2 ENST00000412211.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-202 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45015088	45015213	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412211 ; transcript_alias_2 ENST00000412211.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-202 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45016075	45016136	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412211 ; transcript_alias_2 ENST00000412211.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-202 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45016926	45016989	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412211 ; transcript_alias_2 ENST00000412211.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-202 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45016991	45017012	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412211 ; transcript_alias_2 ENST00000412211.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-202 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45017231	45017348	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412211 ; transcript_alias_2 ENST00000412211.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-202 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45021007	45021285	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412211 ; transcript_alias_2 ENST00000412211.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-202 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45024508	45024786	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412211 ; transcript_alias_2 ENST00000412211.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-202 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45026663	45026941	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412211 ; transcript_alias_2 ENST00000412211.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-202 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45028019	45028294	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412211 ; transcript_alias_2 ENST00000412211.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-202 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45029134	45029277	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412211 ; transcript_alias_2 ENST00000412211.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-202 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45033481	45033548	.	-	.	gene_id lnc-ZNF180-1 ; transcript_id lnc-ZNF180-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000176395 ; gene_alias_2 CEACAM20 ; gene_alias_3 ENSG00000176395.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151532.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412211 ; transcript_alias_2 ENST00000412211.1 ; transcript_alias_3 CEACAM20-202 ;
chr7	lncipedia.org	exon	16250169	16250228	.	+	.	gene_id lnc-AC006035.2-1 ; transcript_id lnc-AC006035.2-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000229688 ; gene_alias_2 AC004741.3 ; gene_alias_3 ENSG00000229688.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152466.2 ; transcript_alias_1 ENST00000457112 ; transcript_alias_2 ENST00000457112.1 ; transcript_alias_3 AC004741.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000326296.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	16275527	16275604	.	+	.	gene_id lnc-AC006035.2-1 ; transcript_id lnc-AC006035.2-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000229688 ; gene_alias_2 AC004741.3 ; gene_alias_3 ENSG00000229688.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152466.2 ; transcript_alias_1 ENST00000457112 ; transcript_alias_2 ENST00000457112.1 ; transcript_alias_3 AC004741.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000326296.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	16276934	16276977	.	+	.	gene_id lnc-AC006035.2-1 ; transcript_id lnc-AC006035.2-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000229688 ; gene_alias_2 AC004741.3 ; gene_alias_3 ENSG00000229688.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152466.2 ; transcript_alias_1 ENST00000457112 ; transcript_alias_2 ENST00000457112.1 ; transcript_alias_3 AC004741.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000326296.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	16305852	16305936	.	+	.	gene_id lnc-AC006035.2-1 ; transcript_id lnc-AC006035.2-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000229688 ; gene_alias_2 AC004741.3 ; gene_alias_3 ENSG00000229688.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152466.2 ; transcript_alias_1 ENST00000457112 ; transcript_alias_2 ENST00000457112.1 ; transcript_alias_3 AC004741.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000326296.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	16308482	16308872	.	+	.	gene_id lnc-AC006035.2-1 ; transcript_id lnc-AC006035.2-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000229688 ; gene_alias_2 AC004741.3 ; gene_alias_3 ENSG00000229688.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152466.2 ; transcript_alias_1 ENST00000457112 ; transcript_alias_2 ENST00000457112.1 ; transcript_alias_3 AC004741.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000326296.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27706612	27711010	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-8 ; transcript_id lnc-CRYBA4-8:2 ; gene_alias_1 ENSG00000226741 ; gene_alias_2 CTA-929C8.6 ; gene_alias_3 ENSG00000226741.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150947.1 ; transcript_alias_1 ENST00000426467 ; transcript_alias_2 ENST00000426467.1 ; transcript_alias_3 CTA-929C8.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320627.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27712765	27713417	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-8 ; transcript_id lnc-CRYBA4-8:2 ; gene_alias_1 ENSG00000226741 ; gene_alias_2 CTA-929C8.6 ; gene_alias_3 ENSG00000226741.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150947.1 ; transcript_alias_1 ENST00000426467 ; transcript_alias_2 ENST00000426467.1 ; transcript_alias_3 CTA-929C8.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320627.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	21911718	21912388	.	+	.	gene_id lnc-MBTPS2-1 ; transcript_id lnc-MBTPS2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007942 ; gene_alias_2 linc-SMS ; gene_alias_3 ENSG00000231771 ; gene_alias_4 RP11-147O5.1 ; gene_alias_5 ENSG00000231771.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021238.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00016971 ; transcript_alias_2 ENST00000449605 ; transcript_alias_3 ENST00000449605.1 ; transcript_alias_4 RP11-147O5.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000056029.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	21913079	21920026	.	+	.	gene_id lnc-MBTPS2-1 ; transcript_id lnc-MBTPS2-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007942 ; gene_alias_2 linc-SMS ; gene_alias_3 ENSG00000231771 ; gene_alias_4 RP11-147O5.1 ; gene_alias_5 ENSG00000231771.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021238.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00016971 ; transcript_alias_2 ENST00000449605 ; transcript_alias_3 ENST00000449605.1 ; transcript_alias_4 RP11-147O5.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000056029.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21655280	21655713	.	-	.	gene_id lnc-GGT2-2 ; transcript_id lnc-GGT2-2:10 ; gene_alias_1 ENSG00000206142 ; gene_alias_2 KB-1183D5.13 ; gene_alias_3 ENSG00000206142.4 ; gene_alias_4 LINC00281 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000150795.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436681 ; transcript_alias_2 ENST00000436681.1 ; transcript_alias_3 LINC00281-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320109.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21660358	21661314	.	-	.	gene_id lnc-GGT2-2 ; transcript_id lnc-GGT2-2:10 ; gene_alias_1 ENSG00000206142 ; gene_alias_2 KB-1183D5.13 ; gene_alias_3 ENSG00000206142.4 ; gene_alias_4 LINC00281 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000150795.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436681 ; transcript_alias_2 ENST00000436681.1 ; transcript_alias_3 LINC00281-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320109.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21661848	21664170	.	-	.	gene_id lnc-GGT2-2 ; transcript_id lnc-GGT2-2:10 ; gene_alias_1 ENSG00000206142 ; gene_alias_2 KB-1183D5.13 ; gene_alias_3 ENSG00000206142.4 ; gene_alias_4 LINC00281 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000150795.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436681 ; transcript_alias_2 ENST00000436681.1 ; transcript_alias_3 LINC00281-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320109.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	242967334	242967736	.	-	.	gene_id lnc-AC131097.4.1-2 ; transcript_id lnc-AC131097.4.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226423 ; gene_alias_2 AC093642.4 ; gene_alias_3 ENSG00000226423.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151372.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412193 ; transcript_alias_2 ENST00000412193.1 ; transcript_alias_3 AC093642.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000322411.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	242968166	242968327	.	-	.	gene_id lnc-AC131097.4.1-2 ; transcript_id lnc-AC131097.4.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226423 ; gene_alias_2 AC093642.4 ; gene_alias_3 ENSG00000226423.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151372.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412193 ; transcript_alias_2 ENST00000412193.1 ; transcript_alias_3 AC093642.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000322411.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	92539349	92540538	.	+	.	gene_id lnc-CLLU1.1-2 ; transcript_id lnc-CLLU1.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245904 ; gene_alias_2 RP11-796E2.4 ; gene_alias_3 ENSG00000245904.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170094.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501008 ; transcript_alias_2 ENST00000501008.2 ; transcript_alias_3 RP11-796E2.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407231.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	92543073	92543338	.	+	.	gene_id lnc-CLLU1.1-2 ; transcript_id lnc-CLLU1.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245904 ; gene_alias_2 RP11-796E2.4 ; gene_alias_3 ENSG00000245904.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170094.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501008 ; transcript_alias_2 ENST00000501008.2 ; transcript_alias_3 RP11-796E2.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407231.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	92560895	92561336	.	+	.	gene_id lnc-CLLU1.1-2 ; transcript_id lnc-CLLU1.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245904 ; gene_alias_2 RP11-796E2.4 ; gene_alias_3 ENSG00000245904.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170094.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501008 ; transcript_alias_2 ENST00000501008.2 ; transcript_alias_3 RP11-796E2.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407231.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	144604417	144604508	.	+	.	gene_id lnc-AL592284.1-1 ; transcript_id lnc-AL592284.1-1:12 ; gene_alias_1 ENSG00000225241 ; gene_alias_2 NBPF8 ; gene_alias_3 ENSG00000225241.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000446541 ; transcript_alias_2 ENST00000446541.1 ; transcript_alias_3 NBPF8-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000038360.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	144606369	144606510	.	+	.	gene_id lnc-AL592284.1-1 ; transcript_id lnc-AL592284.1-1:12 ; gene_alias_1 ENSG00000225241 ; gene_alias_2 NBPF8 ; gene_alias_3 ENSG00000225241.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000446541 ; transcript_alias_2 ENST00000446541.1 ; transcript_alias_3 NBPF8-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000038360.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	144606938	144607061	.	+	.	gene_id lnc-AL592284.1-1 ; transcript_id lnc-AL592284.1-1:12 ; gene_alias_1 ENSG00000225241 ; gene_alias_2 NBPF8 ; gene_alias_3 ENSG00000225241.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000446541 ; transcript_alias_2 ENST00000446541.1 ; transcript_alias_3 NBPF8-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000038360.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	144614840	144614993	.	+	.	gene_id lnc-AL592284.1-1 ; transcript_id lnc-AL592284.1-1:12 ; gene_alias_1 ENSG00000225241 ; gene_alias_2 NBPF8 ; gene_alias_3 ENSG00000225241.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000446541 ; transcript_alias_2 ENST00000446541.1 ; transcript_alias_3 NBPF8-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000038360.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	144615096	144615303	.	+	.	gene_id lnc-AL592284.1-1 ; transcript_id lnc-AL592284.1-1:12 ; gene_alias_1 ENSG00000225241 ; gene_alias_2 NBPF8 ; gene_alias_3 ENSG00000225241.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000446541 ; transcript_alias_2 ENST00000446541.1 ; transcript_alias_3 NBPF8-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000038360.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	144618082	144618296	.	+	.	gene_id lnc-AL592284.1-1 ; transcript_id lnc-AL592284.1-1:12 ; gene_alias_1 ENSG00000225241 ; gene_alias_2 NBPF8 ; gene_alias_3 ENSG00000225241.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000446541 ; transcript_alias_2 ENST00000446541.1 ; transcript_alias_3 NBPF8-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000038360.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	144619347	144619419	.	+	.	gene_id lnc-AL592284.1-1 ; transcript_id lnc-AL592284.1-1:12 ; gene_alias_1 ENSG00000225241 ; gene_alias_2 NBPF8 ; gene_alias_3 ENSG00000225241.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000446541 ; transcript_alias_2 ENST00000446541.1 ; transcript_alias_3 NBPF8-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000038360.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	144619883	144620094	.	+	.	gene_id lnc-AL592284.1-1 ; transcript_id lnc-AL592284.1-1:12 ; gene_alias_1 ENSG00000225241 ; gene_alias_2 NBPF8 ; gene_alias_3 ENSG00000225241.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000446541 ; transcript_alias_2 ENST00000446541.1 ; transcript_alias_3 NBPF8-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000038360.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	144621447	144621656	.	+	.	gene_id lnc-AL592284.1-1 ; transcript_id lnc-AL592284.1-1:12 ; gene_alias_1 ENSG00000225241 ; gene_alias_2 NBPF8 ; gene_alias_3 ENSG00000225241.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000446541 ; transcript_alias_2 ENST00000446541.1 ; transcript_alias_3 NBPF8-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000038360.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	25801054	25801218	.	+	.	gene_id lnc-JAM2-6 ; transcript_id lnc-JAM2-6:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237484 ; gene_alias_2 AP000476.1 ; gene_alias_3 ENSG00000237484.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000078326.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535533 ; transcript_alias_2 ENST00000535533.1 ; transcript_alias_3 AP000476.1-201 ;
chr21	lncipedia.org	exon	25810567	25810747	.	+	.	gene_id lnc-JAM2-6 ; transcript_id lnc-JAM2-6:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237484 ; gene_alias_2 AP000476.1 ; gene_alias_3 ENSG00000237484.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000078326.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535533 ; transcript_alias_2 ENST00000535533.1 ; transcript_alias_3 AP000476.1-201 ;
chr21	lncipedia.org	exon	25813483	25813667	.	+	.	gene_id lnc-JAM2-6 ; transcript_id lnc-JAM2-6:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237484 ; gene_alias_2 AP000476.1 ; gene_alias_3 ENSG00000237484.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000078326.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535533 ; transcript_alias_2 ENST00000535533.1 ; transcript_alias_3 AP000476.1-201 ;
chr21	lncipedia.org	exon	25814109	25814227	.	+	.	gene_id lnc-JAM2-6 ; transcript_id lnc-JAM2-6:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237484 ; gene_alias_2 AP000476.1 ; gene_alias_3 ENSG00000237484.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000078326.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535533 ; transcript_alias_2 ENST00000535533.1 ; transcript_alias_3 AP000476.1-201 ;
chr21	lncipedia.org	exon	25860368	25862621	.	+	.	gene_id lnc-JAM2-6 ; transcript_id lnc-JAM2-6:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237484 ; gene_alias_2 AP000476.1 ; gene_alias_3 ENSG00000237484.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000078326.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535533 ; transcript_alias_2 ENST00000535533.1 ; transcript_alias_3 AP000476.1-201 ;
chr1	lncipedia.org	exon	4000677	4000758	.	+	.	gene_id lnc-DFFB-2 ; transcript_id lnc-DFFB-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000233304 ; gene_alias_2 RP13-614K11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233304.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000000499.2 ; transcript_alias_1 ENST00000412674 ; transcript_alias_2 ENST00000412674.1 ; transcript_alias_3 RP13-614K11.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000001241.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	4001054	4001203	.	+	.	gene_id lnc-DFFB-2 ; transcript_id lnc-DFFB-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000233304 ; gene_alias_2 RP13-614K11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233304.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000000499.2 ; transcript_alias_1 ENST00000412674 ; transcript_alias_2 ENST00000412674.1 ; transcript_alias_3 RP13-614K11.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000001241.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	4012313	4015322	.	+	.	gene_id lnc-DFFB-2 ; transcript_id lnc-DFFB-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000233304 ; gene_alias_2 RP13-614K11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233304.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000000499.2 ; transcript_alias_1 ENST00000412674 ; transcript_alias_2 ENST00000412674.1 ; transcript_alias_3 RP13-614K11.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000001241.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	57186154	57186253	.	-	.	gene_id lnc-ACTBL2-3 ; transcript_id lnc-ACTBL2-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_004835 ; gene_alias_2 linc-ACTBL2-3 ; gene_alias_3 ENSG00000249584 ; gene_alias_4 RP11-478P10.1 ; gene_alias_5 ENSG00000249584.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000162198.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009672 ; transcript_alias_2 ENST00000510444 ; transcript_alias_3 ENST00000510444.1 ; transcript_alias_4 RP11-478P10.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000367833.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	57190737	57190822	.	-	.	gene_id lnc-ACTBL2-3 ; transcript_id lnc-ACTBL2-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_004835 ; gene_alias_2 linc-ACTBL2-3 ; gene_alias_3 ENSG00000249584 ; gene_alias_4 RP11-478P10.1 ; gene_alias_5 ENSG00000249584.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000162198.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009672 ; transcript_alias_2 ENST00000510444 ; transcript_alias_3 ENST00000510444.1 ; transcript_alias_4 RP11-478P10.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000367833.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	57191107	57194989	.	-	.	gene_id lnc-ACTBL2-3 ; transcript_id lnc-ACTBL2-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_004835 ; gene_alias_2 linc-ACTBL2-3 ; gene_alias_3 ENSG00000249584 ; gene_alias_4 RP11-478P10.1 ; gene_alias_5 ENSG00000249584.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000162198.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00009672 ; transcript_alias_2 ENST00000510444 ; transcript_alias_3 ENST00000510444.1 ; transcript_alias_4 RP11-478P10.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000367833.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	89551	90050	.	-	.	gene_id lnc-FAM138A-1 ; transcript_id lnc-FAM138A-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000239945 ; gene_alias_2 RP11-34P13.8 ; gene_alias_3 ENSG00000239945.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000001097.2 ; transcript_alias_1 ENST00000495576 ; transcript_alias_2 ENST00000495576.1 ; transcript_alias_3 RP11-34P13.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000003226.2 ;
chr1	lncipedia.org	exon	90287	91105	.	-	.	gene_id lnc-FAM138A-1 ; transcript_id lnc-FAM138A-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000239945 ; gene_alias_2 RP11-34P13.8 ; gene_alias_3 ENSG00000239945.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000001097.2 ; transcript_alias_1 ENST00000495576 ; transcript_alias_2 ENST00000495576.1 ; transcript_alias_3 RP11-34P13.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000003226.2 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105104916	105105457	.	-	.	gene_id lnc-TGFBRAP1-9 ; transcript_id lnc-TGFBRAP1-9:2 ; gene_alias_1 ENSG00000234781 ; gene_alias_2 AC068535.4 ; gene_alias_3 ENSG00000234781.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153051.2 ; transcript_alias_1 ENST00000430551 ; transcript_alias_2 ENST00000430551.2 ; transcript_alias_3 AC068535.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000329246.2 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105106089	105106249	.	-	.	gene_id lnc-TGFBRAP1-9 ; transcript_id lnc-TGFBRAP1-9:2 ; gene_alias_1 ENSG00000234781 ; gene_alias_2 AC068535.4 ; gene_alias_3 ENSG00000234781.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153051.2 ; transcript_alias_1 ENST00000430551 ; transcript_alias_2 ENST00000430551.2 ; transcript_alias_3 AC068535.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000329246.2 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105114531	105114661	.	-	.	gene_id lnc-TGFBRAP1-9 ; transcript_id lnc-TGFBRAP1-9:2 ; gene_alias_1 ENSG00000234781 ; gene_alias_2 AC068535.4 ; gene_alias_3 ENSG00000234781.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153051.2 ; transcript_alias_1 ENST00000430551 ; transcript_alias_2 ENST00000430551.2 ; transcript_alias_3 AC068535.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000329246.2 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105117274	105117398	.	-	.	gene_id lnc-TGFBRAP1-9 ; transcript_id lnc-TGFBRAP1-9:2 ; gene_alias_1 ENSG00000234781 ; gene_alias_2 AC068535.4 ; gene_alias_3 ENSG00000234781.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153051.2 ; transcript_alias_1 ENST00000430551 ; transcript_alias_2 ENST00000430551.2 ; transcript_alias_3 AC068535.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000329246.2 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105121326	105121646	.	-	.	gene_id lnc-TGFBRAP1-9 ; transcript_id lnc-TGFBRAP1-9:2 ; gene_alias_1 ENSG00000234781 ; gene_alias_2 AC068535.4 ; gene_alias_3 ENSG00000234781.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153051.2 ; transcript_alias_1 ENST00000430551 ; transcript_alias_2 ENST00000430551.2 ; transcript_alias_3 AC068535.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000329246.2 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105126791	105126967	.	-	.	gene_id lnc-TGFBRAP1-9 ; transcript_id lnc-TGFBRAP1-9:2 ; gene_alias_1 ENSG00000234781 ; gene_alias_2 AC068535.4 ; gene_alias_3 ENSG00000234781.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153051.2 ; transcript_alias_1 ENST00000430551 ; transcript_alias_2 ENST00000430551.2 ; transcript_alias_3 AC068535.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000329246.2 ;
chr2	lncipedia.org	exon	2323004	2323155	.	+	.	gene_id lnc-TPO-6 ; transcript_id lnc-TPO-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225619 ; gene_alias_2 AC009232.2 ; gene_alias_3 ENSG00000225619.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151409.2 ; transcript_alias_1 ENST00000422175 ; transcript_alias_2 ENST00000422175.1 ; transcript_alias_3 AC009232.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000322521.2 ;
chr2	lncipedia.org	exon	2327869	2330882	.	+	.	gene_id lnc-TPO-6 ; transcript_id lnc-TPO-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225619 ; gene_alias_2 AC009232.2 ; gene_alias_3 ENSG00000225619.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151409.2 ; transcript_alias_1 ENST00000422175 ; transcript_alias_2 ENST00000422175.1 ; transcript_alias_3 AC009232.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000322521.2 ;
chr4	lncipedia.org	exon	151500241	151500507	.	+	.	gene_id lnc-MAB21L2-1 ; transcript_id lnc-MAB21L2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249690 ; gene_alias_2 RP11-1336O20.2 ; gene_alias_3 ENSG00000249690.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161447.1 ; transcript_alias_1 ENST00000507934 ; transcript_alias_2 ENST00000507934.1 ; transcript_alias_3 RP11-1336O20.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364976.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	151500756	151502697	.	+	.	gene_id lnc-MAB21L2-1 ; transcript_id lnc-MAB21L2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249690 ; gene_alias_2 RP11-1336O20.2 ; gene_alias_3 ENSG00000249690.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161447.1 ; transcript_alias_1 ENST00000507934 ; transcript_alias_2 ENST00000507934.1 ; transcript_alias_3 RP11-1336O20.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364976.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	115624966	115628010	.	-	.	gene_id lnc-CADM1-2 ; transcript_id lnc-CADM1-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000246100 ; gene_alias_2 CTC-774J1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246100.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168216.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499809 ; transcript_alias_2 ENST00000499809.1 ; transcript_alias_3 CTC-774J1.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000398858.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	115628859	115628970	.	-	.	gene_id lnc-CADM1-2 ; transcript_id lnc-CADM1-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000246100 ; gene_alias_2 CTC-774J1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246100.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168216.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499809 ; transcript_alias_2 ENST00000499809.1 ; transcript_alias_3 CTC-774J1.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000398858.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	115630748	115630912	.	-	.	gene_id lnc-CADM1-2 ; transcript_id lnc-CADM1-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000246100 ; gene_alias_2 CTC-774J1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246100.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168216.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499809 ; transcript_alias_2 ENST00000499809.1 ; transcript_alias_3 CTC-774J1.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000398858.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	22849083	22850808	.	-	.	gene_id lnc-DAD1-2 ; transcript_id lnc-DAD1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251002 ; gene_alias_2 AE000661.37 ; gene_alias_3 ENSG00000251002.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168895.2 ; transcript_alias_1 ENST00000514473 ; transcript_alias_2 ENST00000514473.2 ; transcript_alias_3 AE000661.37-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401530.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	22950230	22950347	.	-	.	gene_id lnc-DAD1-2 ; transcript_id lnc-DAD1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251002 ; gene_alias_2 AE000661.37 ; gene_alias_3 ENSG00000251002.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168895.2 ; transcript_alias_1 ENST00000514473 ; transcript_alias_2 ENST00000514473.2 ; transcript_alias_3 AE000661.37-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401530.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	22951842	22951948	.	-	.	gene_id lnc-DAD1-2 ; transcript_id lnc-DAD1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251002 ; gene_alias_2 AE000661.37 ; gene_alias_3 ENSG00000251002.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168895.2 ; transcript_alias_1 ENST00000514473 ; transcript_alias_2 ENST00000514473.2 ; transcript_alias_3 AE000661.37-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401530.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	99316908	99317343	.	+	.	gene_id lnc-COL8A1-1 ; transcript_id lnc-COL8A1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244464 ; gene_alias_2 RP11-201E8.1 ; gene_alias_3 ENSG00000244464.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159418.1 ; transcript_alias_1 ENST00000462011 ; transcript_alias_2 ENST00000462011.1 ; transcript_alias_3 RP11-201E8.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000355194.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	99340796	99342664	.	+	.	gene_id lnc-COL8A1-1 ; transcript_id lnc-COL8A1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244464 ; gene_alias_2 RP11-201E8.1 ; gene_alias_3 ENSG00000244464.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159418.1 ; transcript_alias_1 ENST00000462011 ; transcript_alias_2 ENST00000462011.1 ; transcript_alias_3 RP11-201E8.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000355194.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	74612845	74612877	.	+	.	gene_id lnc-WDR54-1 ; transcript_id lnc-WDR54-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000237737 ; gene_alias_2 AC005041.9 ; gene_alias_3 ENSG00000237737.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152826.1 ; transcript_alias_1 ENST00000437991 ; transcript_alias_2 ENST00000437991.1 ; transcript_alias_3 AC005041.9-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000328161.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	74618286	74618370	.	+	.	gene_id lnc-WDR54-1 ; transcript_id lnc-WDR54-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000237737 ; gene_alias_2 AC005041.9 ; gene_alias_3 ENSG00000237737.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152826.1 ; transcript_alias_1 ENST00000437991 ; transcript_alias_2 ENST00000437991.1 ; transcript_alias_3 AC005041.9-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000328161.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	74618605	74618742	.	+	.	gene_id lnc-WDR54-1 ; transcript_id lnc-WDR54-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000237737 ; gene_alias_2 AC005041.9 ; gene_alias_3 ENSG00000237737.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152826.1 ; transcript_alias_1 ENST00000437991 ; transcript_alias_2 ENST00000437991.1 ; transcript_alias_3 AC005041.9-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000328161.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	74619121	74621009	.	+	.	gene_id lnc-WDR54-1 ; transcript_id lnc-WDR54-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000237737 ; gene_alias_2 AC005041.9 ; gene_alias_3 ENSG00000237737.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152826.1 ; transcript_alias_1 ENST00000437991 ; transcript_alias_2 ENST00000437991.1 ; transcript_alias_3 AC005041.9-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000328161.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	29078117	29081873	.	-	.	gene_id lnc-MPP7-4 ; transcript_id lnc-MPP7-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000235824 ; gene_alias_2 RP11-478H13.2 ; gene_alias_3 ENSG00000235824.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000017876.1 ; transcript_alias_1 ENST00000443246 ; transcript_alias_2 ENST00000443246.1 ; transcript_alias_3 RP11-478H13.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000047376.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	29084702	29084902	.	-	.	gene_id lnc-MPP7-4 ; transcript_id lnc-MPP7-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000235824 ; gene_alias_2 RP11-478H13.2 ; gene_alias_3 ENSG00000235824.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000017876.1 ; transcript_alias_1 ENST00000443246 ; transcript_alias_2 ENST00000443246.1 ; transcript_alias_3 RP11-478H13.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000047376.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	46409779	46411747	.	-	.	gene_id lnc-C21orf67-2 ; transcript_id lnc-C21orf67-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000234880 ; gene_alias_2 NCRNA00163 ; gene_alias_3 ENSG00000234880.1 ; gene_alias_4 LINC00163 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000090296.1 ; transcript_alias_1 ENST00000439088 ; transcript_alias_2 ENST00000439088.1 ; transcript_alias_3 LINC00163-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000206656.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	46413819	46413984	.	-	.	gene_id lnc-C21orf67-2 ; transcript_id lnc-C21orf67-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000234880 ; gene_alias_2 NCRNA00163 ; gene_alias_3 ENSG00000234880.1 ; gene_alias_4 LINC00163 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000090296.1 ; transcript_alias_1 ENST00000439088 ; transcript_alias_2 ENST00000439088.1 ; transcript_alias_3 LINC00163-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000206656.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	159631189	159632263	.	-	.	gene_id lnc-RP11-432B6.3.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-432B6.3.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000244040 ; gene_alias_2 CTD-2049J23.2 ; gene_alias_3 ENSG00000244040.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158951.1 ; transcript_alias_1 ENST00000497452 ; transcript_alias_2 ENST00000497452.1 ; transcript_alias_3 CTD-2049J23.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352647.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	159706884	159707080	.	-	.	gene_id lnc-RP11-432B6.3.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-432B6.3.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000244040 ; gene_alias_2 CTD-2049J23.2 ; gene_alias_3 ENSG00000244040.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158951.1 ; transcript_alias_1 ENST00000497452 ; transcript_alias_2 ENST00000497452.1 ; transcript_alias_3 CTD-2049J23.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352647.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	159712024	159712092	.	-	.	gene_id lnc-RP11-432B6.3.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-432B6.3.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000244040 ; gene_alias_2 CTD-2049J23.2 ; gene_alias_3 ENSG00000244040.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158951.1 ; transcript_alias_1 ENST00000497452 ; transcript_alias_2 ENST00000497452.1 ; transcript_alias_3 CTD-2049J23.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352647.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	159715631	159715892	.	-	.	gene_id lnc-RP11-432B6.3.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-432B6.3.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000244040 ; gene_alias_2 CTD-2049J23.2 ; gene_alias_3 ENSG00000244040.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158951.1 ; transcript_alias_1 ENST00000497452 ; transcript_alias_2 ENST00000497452.1 ; transcript_alias_3 CTD-2049J23.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352647.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	159725569	159725662	.	-	.	gene_id lnc-RP11-432B6.3.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-432B6.3.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000244040 ; gene_alias_2 CTD-2049J23.2 ; gene_alias_3 ENSG00000244040.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158951.1 ; transcript_alias_1 ENST00000497452 ; transcript_alias_2 ENST00000497452.1 ; transcript_alias_3 CTD-2049J23.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352647.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	159726899	159727044	.	-	.	gene_id lnc-RP11-432B6.3.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-432B6.3.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000244040 ; gene_alias_2 CTD-2049J23.2 ; gene_alias_3 ENSG00000244040.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158951.1 ; transcript_alias_1 ENST00000497452 ; transcript_alias_2 ENST00000497452.1 ; transcript_alias_3 CTD-2049J23.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352647.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	159743257	159743321	.	-	.	gene_id lnc-RP11-432B6.3.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-432B6.3.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000244040 ; gene_alias_2 CTD-2049J23.2 ; gene_alias_3 ENSG00000244040.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158951.1 ; transcript_alias_1 ENST00000497452 ; transcript_alias_2 ENST00000497452.1 ; transcript_alias_3 CTD-2049J23.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352647.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	159904985	159905126	.	-	.	gene_id lnc-RP11-432B6.3.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-432B6.3.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000244040 ; gene_alias_2 CTD-2049J23.2 ; gene_alias_3 ENSG00000244040.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158951.1 ; transcript_alias_1 ENST00000497452 ; transcript_alias_2 ENST00000497452.1 ; transcript_alias_3 CTD-2049J23.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352647.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	159906585	159906721	.	-	.	gene_id lnc-RP11-432B6.3.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-432B6.3.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000244040 ; gene_alias_2 CTD-2049J23.2 ; gene_alias_3 ENSG00000244040.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158951.1 ; transcript_alias_1 ENST00000497452 ; transcript_alias_2 ENST00000497452.1 ; transcript_alias_3 CTD-2049J23.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352647.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	159924642	159924879	.	-	.	gene_id lnc-RP11-432B6.3.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-432B6.3.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000244040 ; gene_alias_2 CTD-2049J23.2 ; gene_alias_3 ENSG00000244040.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158951.1 ; transcript_alias_1 ENST00000497452 ; transcript_alias_2 ENST00000497452.1 ; transcript_alias_3 CTD-2049J23.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352647.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	61665569	61666061	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE23-1 ; transcript_id lnc-BHLHE23-1:4 ; gene_alias_1 XLOC_013840 ; gene_alias_2 linc-BHLHE23-2 ; gene_alias_3 ENSG00000125514 ; gene_alias_4 NCRNA00029 ; gene_alias_5 ENSG00000125514.5 ; gene_alias_6 LINC00029 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000032950.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00028085 ; transcript_alias_2 ENST00000370341 ; transcript_alias_3 ENST00000370341.3 ; transcript_alias_4 LINC00029-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000080099.2 ;
chr20	lncipedia.org	exon	61666917	61667073	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE23-1 ; transcript_id lnc-BHLHE23-1:4 ; gene_alias_1 XLOC_013840 ; gene_alias_2 linc-BHLHE23-2 ; gene_alias_3 ENSG00000125514 ; gene_alias_4 NCRNA00029 ; gene_alias_5 ENSG00000125514.5 ; gene_alias_6 LINC00029 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000032950.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00028085 ; transcript_alias_2 ENST00000370341 ; transcript_alias_3 ENST00000370341.3 ; transcript_alias_4 LINC00029-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000080099.2 ;
chr20	lncipedia.org	exon	61667400	61668380	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE23-1 ; transcript_id lnc-BHLHE23-1:4 ; gene_alias_1 XLOC_013840 ; gene_alias_2 linc-BHLHE23-2 ; gene_alias_3 ENSG00000125514 ; gene_alias_4 NCRNA00029 ; gene_alias_5 ENSG00000125514.5 ; gene_alias_6 LINC00029 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000032950.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00028085 ; transcript_alias_2 ENST00000370341 ; transcript_alias_3 ENST00000370341.3 ; transcript_alias_4 LINC00029-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000080099.2 ;
chr3	lncipedia.org	exon	194208183	194209455	.	+	.	gene_id lnc-FAM43A-8 ; transcript_id lnc-FAM43A-8:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233058 ; gene_alias_2 AC046143.7 ; gene_alias_3 ENSG00000233058.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000156037.1 ; transcript_alias_1 ENST00000448892 ; transcript_alias_2 ENST00000448892.1 ; transcript_alias_3 AC046143.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000342809.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	194218667	194218864	.	+	.	gene_id lnc-FAM43A-8 ; transcript_id lnc-FAM43A-8:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233058 ; gene_alias_2 AC046143.7 ; gene_alias_3 ENSG00000233058.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000156037.1 ; transcript_alias_1 ENST00000448892 ; transcript_alias_2 ENST00000448892.1 ; transcript_alias_3 AC046143.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000342809.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	194237800	194239008	.	+	.	gene_id lnc-FAM43A-8 ; transcript_id lnc-FAM43A-8:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233058 ; gene_alias_2 AC046143.7 ; gene_alias_3 ENSG00000233058.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000156037.1 ; transcript_alias_1 ENST00000448892 ; transcript_alias_2 ENST00000448892.1 ; transcript_alias_3 AC046143.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000342809.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	114719012	114719163	.	+	.	gene_id lnc-MDFIC-1 ; transcript_id lnc-MDFIC-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225535 ; gene_alias_2 AC068610.3 ; gene_alias_3 ENSG00000225535.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000065346.3 ; transcript_alias_1 ENST00000435981 ; transcript_alias_2 ENST00000435981.1 ; transcript_alias_3 AC068610.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000140193.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	114758787	114758879	.	+	.	gene_id lnc-MDFIC-1 ; transcript_id lnc-MDFIC-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225535 ; gene_alias_2 AC068610.3 ; gene_alias_3 ENSG00000225535.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000065346.3 ; transcript_alias_1 ENST00000435981 ; transcript_alias_2 ENST00000435981.1 ; transcript_alias_3 AC068610.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000140193.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	114762232	114762301	.	+	.	gene_id lnc-MDFIC-1 ; transcript_id lnc-MDFIC-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225535 ; gene_alias_2 AC068610.3 ; gene_alias_3 ENSG00000225535.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000065346.3 ; transcript_alias_1 ENST00000435981 ; transcript_alias_2 ENST00000435981.1 ; transcript_alias_3 AC068610.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000140193.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	114765497	114766368	.	+	.	gene_id lnc-MDFIC-1 ; transcript_id lnc-MDFIC-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225535 ; gene_alias_2 AC068610.3 ; gene_alias_3 ENSG00000225535.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000065346.3 ; transcript_alias_1 ENST00000435981 ; transcript_alias_2 ENST00000435981.1 ; transcript_alias_3 AC068610.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000140193.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	130363937	130365226	.	-	.	gene_id lnc-GSDMC-1 ; transcript_id lnc-GSDMC-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000229140 ; gene_alias_2 RP11-3O20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229140.3 ; gene_alias_4 CCDC26 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000164848.1 ; transcript_alias_1 ENST00000523151 ; transcript_alias_2 ENST00000523151.1 ; transcript_alias_3 CCDC26-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000380580.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	130382553	130382623	.	-	.	gene_id lnc-GSDMC-1 ; transcript_id lnc-GSDMC-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000229140 ; gene_alias_2 RP11-3O20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229140.3 ; gene_alias_4 CCDC26 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000164848.1 ; transcript_alias_1 ENST00000523151 ; transcript_alias_2 ENST00000523151.1 ; transcript_alias_3 CCDC26-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000380580.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	130587128	130587262	.	-	.	gene_id lnc-GSDMC-1 ; transcript_id lnc-GSDMC-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000229140 ; gene_alias_2 RP11-3O20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229140.3 ; gene_alias_4 CCDC26 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000164848.1 ; transcript_alias_1 ENST00000523151 ; transcript_alias_2 ENST00000523151.1 ; transcript_alias_3 CCDC26-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000380580.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	27240040	27240140	.	+	.	gene_id lnc-EVX1-3 ; transcript_id lnc-EVX1-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000243766 ; gene_alias_2 HOTTIP ; gene_alias_3 ENSG00000243766.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000063751.5 ; transcript_alias_1 ENST00000521028 ; transcript_alias_2 ENST00000521028.2 ; transcript_alias_3 HOTTIP-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414195.2 ;
chr7	lncipedia.org	exon	27240242	27241306	.	+	.	gene_id lnc-EVX1-3 ; transcript_id lnc-EVX1-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000243766 ; gene_alias_2 HOTTIP ; gene_alias_3 ENSG00000243766.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000063751.5 ; transcript_alias_1 ENST00000521028 ; transcript_alias_2 ENST00000521028.2 ; transcript_alias_3 HOTTIP-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414195.2 ;
chr7	lncipedia.org	exon	27241461	27242257	.	+	.	gene_id lnc-EVX1-3 ; transcript_id lnc-EVX1-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000243766 ; gene_alias_2 HOTTIP ; gene_alias_3 ENSG00000243766.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000063751.5 ; transcript_alias_1 ENST00000521028 ; transcript_alias_2 ENST00000521028.2 ; transcript_alias_3 HOTTIP-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414195.2 ;
chr7	lncipedia.org	exon	27244331	27246878	.	+	.	gene_id lnc-EVX1-3 ; transcript_id lnc-EVX1-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000243766 ; gene_alias_2 HOTTIP ; gene_alias_3 ENSG00000243766.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000063751.5 ; transcript_alias_1 ENST00000521028 ; transcript_alias_2 ENST00000521028.2 ; transcript_alias_3 HOTTIP-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414195.2 ;
chr22	lncipedia.org	exon	28315409	28315533	.	+	.	gene_id lnc-HSCB-1 ; transcript_id lnc-HSCB-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000235954 ; gene_alias_2 TTC28-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000235954.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150973.1 ; transcript_alias_1 ENST00000454741 ; transcript_alias_2 ENST00000454741.1 ; transcript_alias_3 TTC28-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320716.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	28331139	28331218	.	+	.	gene_id lnc-HSCB-1 ; transcript_id lnc-HSCB-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000235954 ; gene_alias_2 TTC28-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000235954.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150973.1 ; transcript_alias_1 ENST00000454741 ; transcript_alias_2 ENST00000454741.1 ; transcript_alias_3 TTC28-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320716.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	28390461	28390641	.	+	.	gene_id lnc-HSCB-1 ; transcript_id lnc-HSCB-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000235954 ; gene_alias_2 TTC28-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000235954.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150973.1 ; transcript_alias_1 ENST00000454741 ; transcript_alias_2 ENST00000454741.1 ; transcript_alias_3 TTC28-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320716.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	28393399	28394826	.	+	.	gene_id lnc-HSCB-1 ; transcript_id lnc-HSCB-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000235954 ; gene_alias_2 TTC28-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000235954.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150973.1 ; transcript_alias_1 ENST00000454741 ; transcript_alias_2 ENST00000454741.1 ; transcript_alias_3 TTC28-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320716.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	28395418	28398667	.	+	.	gene_id lnc-HSCB-1 ; transcript_id lnc-HSCB-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000235954 ; gene_alias_2 TTC28-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000235954.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150973.1 ; transcript_alias_1 ENST00000454741 ; transcript_alias_2 ENST00000454741.1 ; transcript_alias_3 TTC28-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320716.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	23200175	23200930	.	-	.	gene_id lnc-CYorf17-2 ; transcript_id lnc-CYorf17-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254488 ; gene_alias_2 RP11-65G9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000254488.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165821.1 ; transcript_alias_1 ENST00000527562 ; transcript_alias_2 ENST00000527562.1 ; transcript_alias_3 RP11-65G9.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000386379.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	23204155	23204255	.	-	.	gene_id lnc-CYorf17-2 ; transcript_id lnc-CYorf17-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254488 ; gene_alias_2 RP11-65G9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000254488.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165821.1 ; transcript_alias_1 ENST00000527562 ; transcript_alias_2 ENST00000527562.1 ; transcript_alias_3 RP11-65G9.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000386379.1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	23206485	23206610	.	-	.	gene_id lnc-CYorf17-2 ; transcript_id lnc-CYorf17-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254488 ; gene_alias_2 RP11-65G9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000254488.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165821.1 ; transcript_alias_1 ENST00000527562 ; transcript_alias_2 ENST00000527562.1 ; transcript_alias_3 RP11-65G9.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000386379.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	102023641	102025171	.	-	.	gene_id lnc-HSP90AA1-9 ; transcript_id lnc-HSP90AA1-9:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258498 ; gene_alias_2 DIO3OS ; gene_alias_3 ENSG00000258498.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171682.1 ; transcript_alias_1 ENST00000555174 ; transcript_alias_2 ENST00000555174.1 ; transcript_alias_3 DIO3OS-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414731.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	102026589	102026759	.	-	.	gene_id lnc-HSP90AA1-9 ; transcript_id lnc-HSP90AA1-9:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258498 ; gene_alias_2 DIO3OS ; gene_alias_3 ENSG00000258498.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171682.1 ; transcript_alias_1 ENST00000555174 ; transcript_alias_2 ENST00000555174.1 ; transcript_alias_3 DIO3OS-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414731.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	3782439	3783183	.	-	.	gene_id lnc-RP11-706O15.1.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-706O15.1.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234449 ; gene_alias_2 RP11-706O15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000234449.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000067411.3 ; transcript_alias_1 ENST00000438107 ; transcript_alias_2 ENST00000438107.1 ; transcript_alias_3 RP11-706O15.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000144371.2 ;
chrX	lncipedia.org	exon	3784991	3785847	.	-	.	gene_id lnc-RP11-706O15.1.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-706O15.1.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234449 ; gene_alias_2 RP11-706O15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000234449.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000067411.3 ; transcript_alias_1 ENST00000438107 ; transcript_alias_2 ENST00000438107.1 ; transcript_alias_3 RP11-706O15.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000144371.2 ;
chrX	lncipedia.org	exon	3799806	3800358	.	-	.	gene_id lnc-RP11-706O15.1.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-706O15.1.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234449 ; gene_alias_2 RP11-706O15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000234449.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000067411.3 ; transcript_alias_1 ENST00000438107 ; transcript_alias_2 ENST00000438107.1 ; transcript_alias_3 RP11-706O15.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000144371.2 ;
chr14	lncipedia.org	exon	19880059	19884029	.	-	.	gene_id lnc-POTEM-2 ; transcript_id lnc-POTEM-2:10 ; gene_alias_1 ENSG00000244306 ; gene_alias_2 CTD-2314B22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000244306.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170430.3 ; transcript_alias_1 ENST00000552602 ; transcript_alias_2 ENST00000552602.1 ; transcript_alias_3 CTD-2314B22.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409412.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	19894700	19894790	.	-	.	gene_id lnc-POTEM-2 ; transcript_id lnc-POTEM-2:10 ; gene_alias_1 ENSG00000244306 ; gene_alias_2 CTD-2314B22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000244306.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170430.3 ; transcript_alias_1 ENST00000552602 ; transcript_alias_2 ENST00000552602.1 ; transcript_alias_3 CTD-2314B22.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409412.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	19919138	19919273	.	-	.	gene_id lnc-POTEM-2 ; transcript_id lnc-POTEM-2:10 ; gene_alias_1 ENSG00000244306 ; gene_alias_2 CTD-2314B22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000244306.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170430.3 ; transcript_alias_1 ENST00000552602 ; transcript_alias_2 ENST00000552602.1 ; transcript_alias_3 CTD-2314B22.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409412.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	19925240	19925305	.	-	.	gene_id lnc-POTEM-2 ; transcript_id lnc-POTEM-2:10 ; gene_alias_1 ENSG00000244306 ; gene_alias_2 CTD-2314B22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000244306.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170430.3 ; transcript_alias_1 ENST00000552602 ; transcript_alias_2 ENST00000552602.1 ; transcript_alias_3 CTD-2314B22.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409412.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	19562689	19564808	.	-	.	gene_id lnc-POTEM-8 ; transcript_id lnc-POTEM-8:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258252 ; gene_alias_2 CTD-2311B13.5 ; gene_alias_3 ENSG00000258252.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170341.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548748 ; transcript_alias_2 ENST00000548748.1 ; transcript_alias_3 CTD-2311B13.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408580.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	19566286	19566731	.	-	.	gene_id lnc-POTEM-8 ; transcript_id lnc-POTEM-8:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258252 ; gene_alias_2 CTD-2311B13.5 ; gene_alias_3 ENSG00000258252.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170341.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548748 ; transcript_alias_2 ENST00000548748.1 ; transcript_alias_3 CTD-2311B13.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408580.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	19854098	19857070	.	-	.	gene_id lnc-POTEM-2 ; transcript_id lnc-POTEM-2:7 ; gene_alias_1 ENSG00000244306 ; gene_alias_2 CTD-2314B22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000244306.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170430.3 ; transcript_alias_1 ENST00000551334 ; transcript_alias_2 ENST00000551334.1 ; transcript_alias_3 CTD-2314B22.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409410.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	19894700	19894790	.	-	.	gene_id lnc-POTEM-2 ; transcript_id lnc-POTEM-2:7 ; gene_alias_1 ENSG00000244306 ; gene_alias_2 CTD-2314B22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000244306.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170430.3 ; transcript_alias_1 ENST00000551334 ; transcript_alias_2 ENST00000551334.1 ; transcript_alias_3 CTD-2314B22.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409410.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	19919138	19919273	.	-	.	gene_id lnc-POTEM-2 ; transcript_id lnc-POTEM-2:7 ; gene_alias_1 ENSG00000244306 ; gene_alias_2 CTD-2314B22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000244306.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170430.3 ; transcript_alias_1 ENST00000551334 ; transcript_alias_2 ENST00000551334.1 ; transcript_alias_3 CTD-2314B22.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409410.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	19919492	19919629	.	-	.	gene_id lnc-POTEM-2 ; transcript_id lnc-POTEM-2:7 ; gene_alias_1 ENSG00000244306 ; gene_alias_2 CTD-2314B22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000244306.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170430.3 ; transcript_alias_1 ENST00000551334 ; transcript_alias_2 ENST00000551334.1 ; transcript_alias_3 CTD-2314B22.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409410.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	19925240	19925327	.	-	.	gene_id lnc-POTEM-2 ; transcript_id lnc-POTEM-2:7 ; gene_alias_1 ENSG00000244306 ; gene_alias_2 CTD-2314B22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000244306.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170430.3 ; transcript_alias_1 ENST00000551334 ; transcript_alias_2 ENST00000551334.1 ; transcript_alias_3 CTD-2314B22.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409410.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50111897	50112018	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50113425	50113548	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50114723	50114833	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50117970	50118056	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50119023	50119164	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50119757	50119917	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50121097	50121144	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50121147	50121230	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50121576	50121689	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50122625	50122732	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50122979	50123075	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50125494	50125601	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50127166	50127262	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50127718	50127822	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50129356	50129584	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50130552	50130651	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50131525	50131616	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50133326	50133407	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50134435	50134574	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50135339	50135447	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50136150	50136333	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50144035	50144137	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50146059	50146181	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50146489	50146595	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50147047	50147182	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50163401	50163505	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50165444	50165524	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50167246	50167356	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chrX	lncipedia.org	exon	50213033	50213737	.	-	.	gene_id lnc-SHROOM4-1 ; transcript_id lnc-SHROOM4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204466 ; gene_alias_2 DGKK ; gene_alias_3 ENSG00000204466.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021520.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546288 ; transcript_alias_2 ENST00000546288.1 ; transcript_alias_3 DGKK-201 ;
chr14	lncipedia.org	exon	102018560	102020579	.	-	.	gene_id lnc-HSP90AA1-9 ; transcript_id lnc-HSP90AA1-9:12 ; gene_alias_1 ENSG00000251028 ; gene_alias_2 ENSG00000258498 ; gene_alias_3 DIO3OS ; gene_alias_4 ENSG00000258498.1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000171682.1 ; transcript_alias_1 ENST00000506681 ; transcript_alias_2 ENST00000556120 ; transcript_alias_3 ENST00000556120.1 ; transcript_alias_4 DIO3OS-012 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000414722.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	102021561	102022013	.	-	.	gene_id lnc-HSP90AA1-9 ; transcript_id lnc-HSP90AA1-9:12 ; gene_alias_1 ENSG00000251028 ; gene_alias_2 ENSG00000258498 ; gene_alias_3 DIO3OS ; gene_alias_4 ENSG00000258498.1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000171682.1 ; transcript_alias_1 ENST00000506681 ; transcript_alias_2 ENST00000556120 ; transcript_alias_3 ENST00000556120.1 ; transcript_alias_4 DIO3OS-012 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000414722.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	65492117	65492208	.	+	.	gene_id lnc-SREK1-1 ; transcript_id lnc-SREK1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251391 ; gene_alias_2 RP11-305P14.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251391.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164090.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535074 ; transcript_alias_2 ENST00000535074.1 ; transcript_alias_3 RP11-305P14.1-201 ;
chr5	lncipedia.org	exon	65492400	65492515	.	+	.	gene_id lnc-SREK1-1 ; transcript_id lnc-SREK1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251391 ; gene_alias_2 RP11-305P14.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251391.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164090.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535074 ; transcript_alias_2 ENST00000535074.1 ; transcript_alias_3 RP11-305P14.1-201 ;
chr5	lncipedia.org	exon	65498653	65498858	.	+	.	gene_id lnc-SREK1-1 ; transcript_id lnc-SREK1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251391 ; gene_alias_2 RP11-305P14.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251391.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164090.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535074 ; transcript_alias_2 ENST00000535074.1 ; transcript_alias_3 RP11-305P14.1-201 ;
chr5	lncipedia.org	exon	65500100	65500132	.	+	.	gene_id lnc-SREK1-1 ; transcript_id lnc-SREK1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251391 ; gene_alias_2 RP11-305P14.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251391.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164090.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535074 ; transcript_alias_2 ENST00000535074.1 ; transcript_alias_3 RP11-305P14.1-201 ;
chr5	lncipedia.org	exon	65614091	65614254	.	+	.	gene_id lnc-SREK1-1 ; transcript_id lnc-SREK1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251391 ; gene_alias_2 RP11-305P14.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251391.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164090.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535074 ; transcript_alias_2 ENST00000535074.1 ; transcript_alias_3 RP11-305P14.1-201 ;
chr5	lncipedia.org	exon	65762211	65762344	.	+	.	gene_id lnc-SREK1-1 ; transcript_id lnc-SREK1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251391 ; gene_alias_2 RP11-305P14.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251391.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164090.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535074 ; transcript_alias_2 ENST00000535074.1 ; transcript_alias_3 RP11-305P14.1-201 ;
chr5	lncipedia.org	exon	65866144	65867801	.	+	.	gene_id lnc-SREK1-1 ; transcript_id lnc-SREK1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251391 ; gene_alias_2 RP11-305P14.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251391.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164090.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535074 ; transcript_alias_2 ENST00000535074.1 ; transcript_alias_3 RP11-305P14.1-201 ;
chr11	lncipedia.org	exon	82314785	82315143	.	-	.	gene_id lnc-FAM181B-1 ; transcript_id lnc-FAM181B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255246 ; gene_alias_2 RP11-179A16.2 ; gene_alias_3 ENSG00000255246.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166836.2 ; transcript_alias_1 ENST00000527364 ; transcript_alias_2 ENST00000527364.1 ; transcript_alias_3 RP11-179A16.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391625.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	82329563	82329672	.	-	.	gene_id lnc-FAM181B-1 ; transcript_id lnc-FAM181B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255246 ; gene_alias_2 RP11-179A16.2 ; gene_alias_3 ENSG00000255246.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166836.2 ; transcript_alias_1 ENST00000527364 ; transcript_alias_2 ENST00000527364.1 ; transcript_alias_3 RP11-179A16.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391625.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	82353469	82353539	.	-	.	gene_id lnc-FAM181B-1 ; transcript_id lnc-FAM181B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255246 ; gene_alias_2 RP11-179A16.2 ; gene_alias_3 ENSG00000255246.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166836.2 ; transcript_alias_1 ENST00000527364 ; transcript_alias_2 ENST00000527364.1 ; transcript_alias_3 RP11-179A16.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391625.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	82354262	82354461	.	-	.	gene_id lnc-FAM181B-1 ; transcript_id lnc-FAM181B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255246 ; gene_alias_2 RP11-179A16.2 ; gene_alias_3 ENSG00000255246.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166836.2 ; transcript_alias_1 ENST00000527364 ; transcript_alias_2 ENST00000527364.1 ; transcript_alias_3 RP11-179A16.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391625.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	50617572	50618904	.	-	.	gene_id lnc-SPRYD7-1 ; transcript_id lnc-SPRYD7-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000231607 ; gene_alias_2 DLEU2 ; gene_alias_3 ENSG00000231607.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000016927.1 ; transcript_alias_1 ENST00000438752 ; transcript_alias_2 ENST00000438752.1 ; transcript_alias_3 DLEU2-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000044959.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	50619254	50619368	.	-	.	gene_id lnc-SPRYD7-1 ; transcript_id lnc-SPRYD7-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000231607 ; gene_alias_2 DLEU2 ; gene_alias_3 ENSG00000231607.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000016927.1 ; transcript_alias_1 ENST00000438752 ; transcript_alias_2 ENST00000438752.1 ; transcript_alias_3 DLEU2-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000044959.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	50623720	50623798	.	-	.	gene_id lnc-SPRYD7-1 ; transcript_id lnc-SPRYD7-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000231607 ; gene_alias_2 DLEU2 ; gene_alias_3 ENSG00000231607.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000016927.1 ; transcript_alias_1 ENST00000438752 ; transcript_alias_2 ENST00000438752.1 ; transcript_alias_3 DLEU2-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000044959.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	50642233	50642299	.	-	.	gene_id lnc-SPRYD7-1 ; transcript_id lnc-SPRYD7-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000231607 ; gene_alias_2 DLEU2 ; gene_alias_3 ENSG00000231607.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000016927.1 ; transcript_alias_1 ENST00000438752 ; transcript_alias_2 ENST00000438752.1 ; transcript_alias_3 DLEU2-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000044959.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	50649695	50649789	.	-	.	gene_id lnc-SPRYD7-1 ; transcript_id lnc-SPRYD7-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000231607 ; gene_alias_2 DLEU2 ; gene_alias_3 ENSG00000231607.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000016927.1 ; transcript_alias_1 ENST00000438752 ; transcript_alias_2 ENST00000438752.1 ; transcript_alias_3 DLEU2-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000044959.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	50655304	50655548	.	-	.	gene_id lnc-SPRYD7-1 ; transcript_id lnc-SPRYD7-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000231607 ; gene_alias_2 DLEU2 ; gene_alias_3 ENSG00000231607.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000016927.1 ; transcript_alias_1 ENST00000438752 ; transcript_alias_2 ENST00000438752.1 ; transcript_alias_3 DLEU2-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000044959.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	50655959	50656114	.	-	.	gene_id lnc-SPRYD7-1 ; transcript_id lnc-SPRYD7-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000231607 ; gene_alias_2 DLEU2 ; gene_alias_3 ENSG00000231607.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000016927.1 ; transcript_alias_1 ENST00000438752 ; transcript_alias_2 ENST00000438752.1 ; transcript_alias_3 DLEU2-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000044959.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	8357038	8359103	.	-	.	gene_id lnc-ACOX3-1 ; transcript_id lnc-ACOX3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251615 ; gene_alias_2 RP11-774O3.3 ; gene_alias_3 ENSG00000251615.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160053.3 ; transcript_alias_1 ENST00000505448 ; transcript_alias_2 ENST00000505448.1 ; transcript_alias_3 RP11-774O3.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000359029.3 ;
chr5	lncipedia.org	exon	43014516	43015252	.	-	.	gene_id lnc-C5orf39-1 ; transcript_id lnc-C5orf39-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000177738 ; gene_alias_2 CTD-2201E18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000177738.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162133.2 ; transcript_alias_1 ENST00000314957 ; transcript_alias_2 ENST00000314957.3 ; transcript_alias_3 CTD-2201E18.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000367471.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	43017176	43018826	.	-	.	gene_id lnc-C5orf39-1 ; transcript_id lnc-C5orf39-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000177738 ; gene_alias_2 CTD-2201E18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000177738.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162133.2 ; transcript_alias_1 ENST00000314957 ; transcript_alias_2 ENST00000314957.3 ; transcript_alias_3 CTD-2201E18.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000367471.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	47013592	47013622	.	+	.	gene_id lnc-PCBP3-1 ; transcript_id lnc-PCBP3-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_013985 ; gene_alias_2 linc-PCBP3 ; gene_alias_3 ENSG00000233922 ; gene_alias_4 AL133493.2 ; gene_alias_5 ENSG00000233922.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000090408.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00028862 ; transcript_alias_2 ENST00000424569 ; transcript_alias_3 ENST00000424569.1 ; transcript_alias_4 AL133493.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000206833.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	47015487	47015575	.	+	.	gene_id lnc-PCBP3-1 ; transcript_id lnc-PCBP3-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_013985 ; gene_alias_2 linc-PCBP3 ; gene_alias_3 ENSG00000233922 ; gene_alias_4 AL133493.2 ; gene_alias_5 ENSG00000233922.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000090408.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00028862 ; transcript_alias_2 ENST00000424569 ; transcript_alias_3 ENST00000424569.1 ; transcript_alias_4 AL133493.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000206833.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	47016305	47017005	.	+	.	gene_id lnc-PCBP3-1 ; transcript_id lnc-PCBP3-1:2 ; gene_alias_1 XLOC_013985 ; gene_alias_2 linc-PCBP3 ; gene_alias_3 ENSG00000233922 ; gene_alias_4 AL133493.2 ; gene_alias_5 ENSG00000233922.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000090408.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00028862 ; transcript_alias_2 ENST00000424569 ; transcript_alias_3 ENST00000424569.1 ; transcript_alias_4 AL133493.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000206833.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	156465135	156468203	.	-	.	gene_id lnc-SSR3-3 ; transcript_id lnc-SSR3-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000240875 ; gene_alias_2 RP11-392A22.2 ; gene_alias_3 ENSG00000240875.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158647.1 ; transcript_alias_1 ENST00000472943 ; transcript_alias_2 ENST00000472943.1 ; transcript_alias_3 RP11-392A22.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351622.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	156468884	156468972	.	-	.	gene_id lnc-SSR3-3 ; transcript_id lnc-SSR3-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000240875 ; gene_alias_2 RP11-392A22.2 ; gene_alias_3 ENSG00000240875.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158647.1 ; transcript_alias_1 ENST00000472943 ; transcript_alias_2 ENST00000472943.1 ; transcript_alias_3 RP11-392A22.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351622.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	156534676	156534823	.	-	.	gene_id lnc-SSR3-3 ; transcript_id lnc-SSR3-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000240875 ; gene_alias_2 RP11-392A22.2 ; gene_alias_3 ENSG00000240875.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158647.1 ; transcript_alias_1 ENST00000472943 ; transcript_alias_2 ENST00000472943.1 ; transcript_alias_3 RP11-392A22.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351622.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	4938493	4940384	.	-	.	gene_id lnc-AC018816.3.1-3 ; transcript_id lnc-AC018816.3.1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235831 ; gene_alias_2 AC018816.4 ; gene_alias_3 ENSG00000235831.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000155242.1 ; transcript_alias_1 ENST00000434530 ; transcript_alias_2 ENST00000434530.1 ; transcript_alias_3 AC018816.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000338959.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	4942226	4942382	.	-	.	gene_id lnc-AC018816.3.1-3 ; transcript_id lnc-AC018816.3.1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235831 ; gene_alias_2 AC018816.4 ; gene_alias_3 ENSG00000235831.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000155242.1 ; transcript_alias_1 ENST00000434530 ; transcript_alias_2 ENST00000434530.1 ; transcript_alias_3 AC018816.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000338959.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	5021480	5021646	.	-	.	gene_id lnc-AC018816.3.1-3 ; transcript_id lnc-AC018816.3.1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235831 ; gene_alias_2 AC018816.4 ; gene_alias_3 ENSG00000235831.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000155242.1 ; transcript_alias_1 ENST00000434530 ; transcript_alias_2 ENST00000434530.1 ; transcript_alias_3 AC018816.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000338959.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	129916	130430	.	-	.	gene_id lnc-BET1L-1 ; transcript_id lnc-BET1L-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000230724 ; gene_alias_2 RP11-304M2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000230724.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165114.2 ; transcript_alias_1 ENST00000542435 ; transcript_alias_2 ENST00000542435.1 ; transcript_alias_3 RP11-304M2.2-205 ;
chr11	lncipedia.org	exon	130688	131087	.	-	.	gene_id lnc-BET1L-1 ; transcript_id lnc-BET1L-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000230724 ; gene_alias_2 RP11-304M2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000230724.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165114.2 ; transcript_alias_1 ENST00000542435 ; transcript_alias_2 ENST00000542435.1 ; transcript_alias_3 RP11-304M2.2-205 ;
chr11	lncipedia.org	exon	131120	131374	.	-	.	gene_id lnc-BET1L-1 ; transcript_id lnc-BET1L-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000230724 ; gene_alias_2 RP11-304M2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000230724.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165114.2 ; transcript_alias_1 ENST00000542435 ; transcript_alias_2 ENST00000542435.1 ; transcript_alias_3 RP11-304M2.2-205 ;
chr13	lncipedia.org	exon	50618050	50618904	.	-	.	gene_id lnc-SPRYD7-1 ; transcript_id lnc-SPRYD7-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000231607 ; gene_alias_2 DLEU2 ; gene_alias_3 ENSG00000231607.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000016927.1 ; transcript_alias_1 ENST00000235290 ; transcript_alias_2 ENST00000235290.3 ; transcript_alias_3 DLEU2-201 ;
chr13	lncipedia.org	exon	50623720	50623827	.	-	.	gene_id lnc-SPRYD7-1 ; transcript_id lnc-SPRYD7-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000231607 ; gene_alias_2 DLEU2 ; gene_alias_3 ENSG00000231607.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000016927.1 ; transcript_alias_1 ENST00000235290 ; transcript_alias_2 ENST00000235290.3 ; transcript_alias_3 DLEU2-201 ;
chr13	lncipedia.org	exon	50642233	50642299	.	-	.	gene_id lnc-SPRYD7-1 ; transcript_id lnc-SPRYD7-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000231607 ; gene_alias_2 DLEU2 ; gene_alias_3 ENSG00000231607.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000016927.1 ; transcript_alias_1 ENST00000235290 ; transcript_alias_2 ENST00000235290.3 ; transcript_alias_3 DLEU2-201 ;
chr13	lncipedia.org	exon	50649695	50649789	.	-	.	gene_id lnc-SPRYD7-1 ; transcript_id lnc-SPRYD7-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000231607 ; gene_alias_2 DLEU2 ; gene_alias_3 ENSG00000231607.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000016927.1 ; transcript_alias_1 ENST00000235290 ; transcript_alias_2 ENST00000235290.3 ; transcript_alias_3 DLEU2-201 ;
chr13	lncipedia.org	exon	50655959	50656127	.	-	.	gene_id lnc-SPRYD7-1 ; transcript_id lnc-SPRYD7-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000231607 ; gene_alias_2 DLEU2 ; gene_alias_3 ENSG00000231607.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000016927.1 ; transcript_alias_1 ENST00000235290 ; transcript_alias_2 ENST00000235290.3 ; transcript_alias_3 DLEU2-201 ;
chr4	lncipedia.org	exon	124420	124555	.	+	.	gene_id lnc-ZNF595-1 ; transcript_id lnc-ZNF595-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000250312 ; gene_alias_2 ZNF718 ; gene_alias_3 ENSG00000250312.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159873.6 ; transcript_alias_1 ENST00000510175 ; transcript_alias_2 ENST00000510175.1 ; transcript_alias_3 ZNF718-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000357865.3 ;
chr4	lncipedia.org	exon	154702	157779	.	+	.	gene_id lnc-ZNF595-1 ; transcript_id lnc-ZNF595-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000250312 ; gene_alias_2 ZNF718 ; gene_alias_3 ENSG00000250312.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159873.6 ; transcript_alias_1 ENST00000510175 ; transcript_alias_2 ENST00000510175.1 ; transcript_alias_3 ZNF718-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000357865.3 ;
chr2	lncipedia.org	exon	173587914	173592161	.	-	.	gene_id lnc-DLX2-5 ; transcript_id lnc-DLX2-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228016 ; gene_alias_2 AC018712.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228016.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154091.1 ; transcript_alias_1 ENST00000435328 ; transcript_alias_2 ENST00000435328.1 ; transcript_alias_3 AC018712.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333857.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	173599033	173599161	.	-	.	gene_id lnc-DLX2-5 ; transcript_id lnc-DLX2-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228016 ; gene_alias_2 AC018712.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228016.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154091.1 ; transcript_alias_1 ENST00000435328 ; transcript_alias_2 ENST00000435328.1 ; transcript_alias_3 AC018712.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333857.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	173600023	173600189	.	-	.	gene_id lnc-DLX2-5 ; transcript_id lnc-DLX2-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228016 ; gene_alias_2 AC018712.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228016.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154091.1 ; transcript_alias_1 ENST00000435328 ; transcript_alias_2 ENST00000435328.1 ; transcript_alias_3 AC018712.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333857.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	173600854	173600934	.	-	.	gene_id lnc-DLX2-5 ; transcript_id lnc-DLX2-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228016 ; gene_alias_2 AC018712.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228016.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154091.1 ; transcript_alias_1 ENST00000435328 ; transcript_alias_2 ENST00000435328.1 ; transcript_alias_3 AC018712.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333857.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	77248083	77249119	.	-	.	gene_id lnc-ANGEL1-1 ; transcript_id lnc-ANGEL1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258301 ; gene_alias_2 RP11-488C13.5 ; gene_alias_3 ENSG00000258301.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171623.1 ; transcript_alias_1 ENST00000556072 ; transcript_alias_2 ENST00000556072.1 ; transcript_alias_3 RP11-488C13.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414491.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	77252428	77253067	.	-	.	gene_id lnc-ANGEL1-1 ; transcript_id lnc-ANGEL1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258301 ; gene_alias_2 RP11-488C13.5 ; gene_alias_3 ENSG00000258301.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171623.1 ; transcript_alias_1 ENST00000556072 ; transcript_alias_2 ENST00000556072.1 ; transcript_alias_3 RP11-488C13.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000414491.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	47558199	47571656	.	+	.	gene_id lnc-EPCAM-1 ; transcript_id lnc-EPCAM-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236824 ; gene_alias_2 BCYRN1 ; gene_alias_3 ENSG00000236824.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151778.1 ; transcript_alias_1 ENST00000418539 ; transcript_alias_2 ENST00000418539.1 ; transcript_alias_3 BCYRN1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323892.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	171034285	171034484	.	+	.	gene_id lnc-TBP-2 ; transcript_id lnc-TBP-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_005566 ; gene_alias_2 ENSG00000213863 ; gene_alias_3 XX-C2158C12.2 ; gene_alias_4 ENSG00000213863.2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000016089.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00011427 ; transcript_alias_2 ENST00000438217 ; transcript_alias_3 ENST00000438217.1 ; transcript_alias_4 XX-C2158C12.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000043281.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	171037019	171037576	.	+	.	gene_id lnc-TBP-2 ; transcript_id lnc-TBP-2:2 ; gene_alias_1 XLOC_005566 ; gene_alias_2 ENSG00000213863 ; gene_alias_3 XX-C2158C12.2 ; gene_alias_4 ENSG00000213863.2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000016089.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00011427 ; transcript_alias_2 ENST00000438217 ; transcript_alias_3 ENST00000438217.1 ; transcript_alias_4 XX-C2158C12.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000043281.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	128302063	128302305	.	-	.	gene_id lnc-TMEM75-3 ; transcript_id lnc-TMEM75-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000246228 ; gene_alias_2 RP11-382A18.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246228.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165066.1 ; transcript_alias_1 ENST00000523825 ; transcript_alias_2 ENST00000523825.1 ; transcript_alias_3 RP11-382A18.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381644.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	128433074	128433619	.	-	.	gene_id lnc-TMEM75-3 ; transcript_id lnc-TMEM75-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000246228 ; gene_alias_2 RP11-382A18.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246228.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165066.1 ; transcript_alias_1 ENST00000523825 ; transcript_alias_2 ENST00000523825.1 ; transcript_alias_3 RP11-382A18.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381644.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	129999746	130001223	.	-	.	gene_id lnc-POTEF-5 ; transcript_id lnc-POTEF-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204460 ; gene_alias_2 AC079586.1 ; gene_alias_3 ENSG00000204460.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153413.1 ; transcript_alias_1 ENST00000375987 ; transcript_alias_2 ENST00000375987.3 ; transcript_alias_3 AC079586.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000331081.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	130001716	130001922	.	-	.	gene_id lnc-POTEF-5 ; transcript_id lnc-POTEF-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204460 ; gene_alias_2 AC079586.1 ; gene_alias_3 ENSG00000204460.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153413.1 ; transcript_alias_1 ENST00000375987 ; transcript_alias_2 ENST00000375987.3 ; transcript_alias_3 AC079586.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000331081.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	130002726	130002802	.	-	.	gene_id lnc-POTEF-5 ; transcript_id lnc-POTEF-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204460 ; gene_alias_2 AC079586.1 ; gene_alias_3 ENSG00000204460.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153413.1 ; transcript_alias_1 ENST00000375987 ; transcript_alias_2 ENST00000375987.3 ; transcript_alias_3 AC079586.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000331081.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	130007439	130007647	.	-	.	gene_id lnc-POTEF-5 ; transcript_id lnc-POTEF-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204460 ; gene_alias_2 AC079586.1 ; gene_alias_3 ENSG00000204460.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153413.1 ; transcript_alias_1 ENST00000375987 ; transcript_alias_2 ENST00000375987.3 ; transcript_alias_3 AC079586.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000331081.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	130031180	130031421	.	-	.	gene_id lnc-POTEF-5 ; transcript_id lnc-POTEF-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204460 ; gene_alias_2 AC079586.1 ; gene_alias_3 ENSG00000204460.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153413.1 ; transcript_alias_1 ENST00000375987 ; transcript_alias_2 ENST00000375987.3 ; transcript_alias_3 AC079586.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000331081.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	74289262	74290195	.	-	.	gene_id lnc-C14orf43-1 ; transcript_id lnc-C14orf43-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_011072 ; gene_alias_2 linc-C14orf43-2 ; gene_alias_3 ENSG00000258586 ; gene_alias_4 RP5-1021I20.2 ; gene_alias_5 ENSG00000258586.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000171254.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00022375 ; transcript_alias_2 ENST00000555539 ; transcript_alias_3 ENST00000555539.1 ; transcript_alias_4 RP5-1021I20.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000412573.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	74296599	74296838	.	-	.	gene_id lnc-C14orf43-1 ; transcript_id lnc-C14orf43-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_011072 ; gene_alias_2 linc-C14orf43-2 ; gene_alias_3 ENSG00000258586 ; gene_alias_4 RP5-1021I20.2 ; gene_alias_5 ENSG00000258586.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000171254.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00022375 ; transcript_alias_2 ENST00000555539 ; transcript_alias_3 ENST00000555539.1 ; transcript_alias_4 RP5-1021I20.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000412573.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	34247482	34252266	.	+	.	gene_id lnc-HMGA1-2 ; transcript_id lnc-HMGA1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225339 ; gene_alias_2 RP11-513I15.6 ; gene_alias_3 ENSG00000225339.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014542.1 ; transcript_alias_1 ENST00000429998 ; transcript_alias_2 ENST00000429998.1 ; transcript_alias_3 RP11-513I15.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000040220.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	19912015	19913438	.	-	.	gene_id lnc-POTEM-2 ; transcript_id lnc-POTEM-2:15 ; gene_alias_1 ENSG00000244306 ; gene_alias_2 CTD-2314B22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000244306.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170430.3 ; transcript_alias_1 ENST00000548057 ; transcript_alias_2 ENST00000548057.2 ; transcript_alias_3 CTD-2314B22.3-014 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409423.2 ;
chr14	lncipedia.org	exon	19919138	19919158	.	-	.	gene_id lnc-POTEM-2 ; transcript_id lnc-POTEM-2:15 ; gene_alias_1 ENSG00000244306 ; gene_alias_2 CTD-2314B22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000244306.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170430.3 ; transcript_alias_1 ENST00000548057 ; transcript_alias_2 ENST00000548057.2 ; transcript_alias_3 CTD-2314B22.3-014 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409423.2 ;
chr1	lncipedia.org	exon	144598651	144598780	.	+	.	gene_id lnc-AL592284.1-1 ; transcript_id lnc-AL592284.1-1:10 ; gene_alias_1 ENSG00000225241 ; gene_alias_2 NBPF8 ; gene_alias_3 ENSG00000225241.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000437451 ; transcript_alias_2 ENST00000437451.1 ; transcript_alias_3 NBPF8-014 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000038368.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	144606369	144606510	.	+	.	gene_id lnc-AL592284.1-1 ; transcript_id lnc-AL592284.1-1:10 ; gene_alias_1 ENSG00000225241 ; gene_alias_2 NBPF8 ; gene_alias_3 ENSG00000225241.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000437451 ; transcript_alias_2 ENST00000437451.1 ; transcript_alias_3 NBPF8-014 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000038368.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	144607095	144607547	.	+	.	gene_id lnc-AL592284.1-1 ; transcript_id lnc-AL592284.1-1:10 ; gene_alias_1 ENSG00000225241 ; gene_alias_2 NBPF8 ; gene_alias_3 ENSG00000225241.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000437451 ; transcript_alias_2 ENST00000437451.1 ; transcript_alias_3 NBPF8-014 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000038368.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	213992978	213995776	.	-	.	gene_id lnc-PTPN14-3 ; transcript_id lnc-PTPN14-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000230461 ; gene_alias_2 RP11-478J18.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230461.2 ; gene_alias_4 PROX1-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000036947.2 ; transcript_alias_1 ENST00000433082 ; transcript_alias_2 ENST00000433082.1 ; transcript_alias_3 PROX1-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000089728.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	214005865	214005965	.	-	.	gene_id lnc-PTPN14-3 ; transcript_id lnc-PTPN14-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000230461 ; gene_alias_2 RP11-478J18.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230461.2 ; gene_alias_4 PROX1-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000036947.2 ; transcript_alias_1 ENST00000433082 ; transcript_alias_2 ENST00000433082.1 ; transcript_alias_3 PROX1-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000089728.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	214068006	214068086	.	-	.	gene_id lnc-PTPN14-3 ; transcript_id lnc-PTPN14-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000230461 ; gene_alias_2 RP11-478J18.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230461.2 ; gene_alias_4 PROX1-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000036947.2 ; transcript_alias_1 ENST00000433082 ; transcript_alias_2 ENST00000433082.1 ; transcript_alias_3 PROX1-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000089728.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	214068737	214068861	.	-	.	gene_id lnc-PTPN14-3 ; transcript_id lnc-PTPN14-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000230461 ; gene_alias_2 RP11-478J18.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230461.2 ; gene_alias_4 PROX1-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000036947.2 ; transcript_alias_1 ENST00000433082 ; transcript_alias_2 ENST00000433082.1 ; transcript_alias_3 PROX1-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000089728.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	214139414	214139608	.	-	.	gene_id lnc-PTPN14-3 ; transcript_id lnc-PTPN14-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000230461 ; gene_alias_2 RP11-478J18.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230461.2 ; gene_alias_4 PROX1-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000036947.2 ; transcript_alias_1 ENST00000433082 ; transcript_alias_2 ENST00000433082.1 ; transcript_alias_3 PROX1-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000089728.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	24030306	24031082	.	+	.	gene_id lnc-THTPA-1 ; transcript_id lnc-THTPA-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246609 ; gene_alias_2 ENSG00000258727.1 ; gene_alias_3 RP11-66N24.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171522.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502153 ; transcript_alias_2 ENST00000555968.1 ; transcript_alias_3 RP11-66N24.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000413878.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	24033936	24034049	.	+	.	gene_id lnc-THTPA-1 ; transcript_id lnc-THTPA-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246609 ; gene_alias_2 ENSG00000258727.1 ; gene_alias_3 RP11-66N24.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171522.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502153 ; transcript_alias_2 ENST00000555968.1 ; transcript_alias_3 RP11-66N24.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000413878.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	24034665	24036631	.	+	.	gene_id lnc-THTPA-1 ; transcript_id lnc-THTPA-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246609 ; gene_alias_2 ENSG00000258727.1 ; gene_alias_3 RP11-66N24.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171522.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502153 ; transcript_alias_2 ENST00000555968.1 ; transcript_alias_3 RP11-66N24.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000413878.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	24036898	24037282	.	+	.	gene_id lnc-THTPA-1 ; transcript_id lnc-THTPA-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246609 ; gene_alias_2 ENSG00000258727.1 ; gene_alias_3 RP11-66N24.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171522.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502153 ; transcript_alias_2 ENST00000555968.1 ; transcript_alias_3 RP11-66N24.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000413878.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	188477065	188477112	.	-	.	gene_id lnc-TRIML2-4 ; transcript_id lnc-TRIML2-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250590 ; gene_alias_2 RP11-565A3.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250590.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160302.5 ; transcript_alias_1 ENST00000502952 ; transcript_alias_2 ENST00000502952.1 ; transcript_alias_3 RP11-565A3.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000360164.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	188478901	188479074	.	-	.	gene_id lnc-TRIML2-4 ; transcript_id lnc-TRIML2-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250590 ; gene_alias_2 RP11-565A3.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250590.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160302.5 ; transcript_alias_1 ENST00000502952 ; transcript_alias_2 ENST00000502952.1 ; transcript_alias_3 RP11-565A3.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000360164.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	188479231	188479418	.	-	.	gene_id lnc-TRIML2-4 ; transcript_id lnc-TRIML2-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250590 ; gene_alias_2 RP11-565A3.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250590.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160302.5 ; transcript_alias_1 ENST00000502952 ; transcript_alias_2 ENST00000502952.1 ; transcript_alias_3 RP11-565A3.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000360164.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	188503575	188503684	.	-	.	gene_id lnc-TRIML2-4 ; transcript_id lnc-TRIML2-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250590 ; gene_alias_2 RP11-565A3.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250590.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160302.5 ; transcript_alias_1 ENST00000502952 ; transcript_alias_2 ENST00000502952.1 ; transcript_alias_3 RP11-565A3.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000360164.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	188514038	188514081	.	-	.	gene_id lnc-TRIML2-4 ; transcript_id lnc-TRIML2-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250590 ; gene_alias_2 RP11-565A3.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250590.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160302.5 ; transcript_alias_1 ENST00000502952 ; transcript_alias_2 ENST00000502952.1 ; transcript_alias_3 RP11-565A3.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000360164.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	221503422	221507327	.	-	.	gene_id lnc-DUSP10-5 ; transcript_id lnc-DUSP10-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234754 ; gene_alias_2 RP11-421L10.1 ; gene_alias_3 ENSG00000234754.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037427.2 ; transcript_alias_1 ENST00000439004 ; transcript_alias_2 ENST00000439004.1 ; transcript_alias_3 RP11-421L10.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000091116.2 ;
chr1	lncipedia.org	exon	221509205	221509638	.	-	.	gene_id lnc-DUSP10-5 ; transcript_id lnc-DUSP10-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234754 ; gene_alias_2 RP11-421L10.1 ; gene_alias_3 ENSG00000234754.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037427.2 ; transcript_alias_1 ENST00000439004 ; transcript_alias_2 ENST00000439004.1 ; transcript_alias_3 RP11-421L10.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000091116.2 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105363098	105363609	.	-	.	gene_id lnc-TGFBRAP1-7 ; transcript_id lnc-TGFBRAP1-7:2 ; gene_alias_1 ENSG00000234177 ; gene_alias_2 AC068057.2 ; gene_alias_3 ENSG00000234177.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153066.1 ; transcript_alias_1 ENST00000425879 ; transcript_alias_2 ENST00000425879.1 ; transcript_alias_3 AC068057.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000329332.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105365780	105365947	.	-	.	gene_id lnc-TGFBRAP1-7 ; transcript_id lnc-TGFBRAP1-7:2 ; gene_alias_1 ENSG00000234177 ; gene_alias_2 AC068057.2 ; gene_alias_3 ENSG00000234177.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153066.1 ; transcript_alias_1 ENST00000425879 ; transcript_alias_2 ENST00000425879.1 ; transcript_alias_3 AC068057.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000329332.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105370784	105370898	.	-	.	gene_id lnc-TGFBRAP1-7 ; transcript_id lnc-TGFBRAP1-7:2 ; gene_alias_1 ENSG00000234177 ; gene_alias_2 AC068057.2 ; gene_alias_3 ENSG00000234177.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153066.1 ; transcript_alias_1 ENST00000425879 ; transcript_alias_2 ENST00000425879.1 ; transcript_alias_3 AC068057.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000329332.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105372539	105374177	.	-	.	gene_id lnc-TGFBRAP1-7 ; transcript_id lnc-TGFBRAP1-7:2 ; gene_alias_1 ENSG00000234177 ; gene_alias_2 AC068057.2 ; gene_alias_3 ENSG00000234177.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153066.1 ; transcript_alias_1 ENST00000425879 ; transcript_alias_2 ENST00000425879.1 ; transcript_alias_3 AC068057.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000329332.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	127199533	127200217	.	-	.	gene_id lnc-TPRA1-1 ; transcript_id lnc-TPRA1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000239921 ; gene_alias_2 RP11-59J16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000239921.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159643.2 ; transcript_alias_1 ENST00000461398 ; transcript_alias_2 ENST00000461398.2 ; transcript_alias_3 RP11-59J16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000396610.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	127204404	127204542	.	-	.	gene_id lnc-TPRA1-1 ; transcript_id lnc-TPRA1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000239921 ; gene_alias_2 RP11-59J16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000239921.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159643.2 ; transcript_alias_1 ENST00000461398 ; transcript_alias_2 ENST00000461398.2 ; transcript_alias_3 RP11-59J16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000396610.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	127218528	127218573	.	-	.	gene_id lnc-TPRA1-1 ; transcript_id lnc-TPRA1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000239921 ; gene_alias_2 RP11-59J16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000239921.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159643.2 ; transcript_alias_1 ENST00000461398 ; transcript_alias_2 ENST00000461398.2 ; transcript_alias_3 RP11-59J16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000396610.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	127251228	127251286	.	-	.	gene_id lnc-TPRA1-1 ; transcript_id lnc-TPRA1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000239921 ; gene_alias_2 RP11-59J16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000239921.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159643.2 ; transcript_alias_1 ENST00000461398 ; transcript_alias_2 ENST00000461398.2 ; transcript_alias_3 RP11-59J16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000396610.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	127252420	127252612	.	-	.	gene_id lnc-TPRA1-1 ; transcript_id lnc-TPRA1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000239921 ; gene_alias_2 RP11-59J16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000239921.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159643.2 ; transcript_alias_1 ENST00000461398 ; transcript_alias_2 ENST00000461398.2 ; transcript_alias_3 RP11-59J16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000396610.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	127252960	127253249	.	-	.	gene_id lnc-TPRA1-1 ; transcript_id lnc-TPRA1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000239921 ; gene_alias_2 RP11-59J16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000239921.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159643.2 ; transcript_alias_1 ENST00000461398 ; transcript_alias_2 ENST00000461398.2 ; transcript_alias_3 RP11-59J16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000396610.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	127254029	127255655	.	-	.	gene_id lnc-TPRA1-1 ; transcript_id lnc-TPRA1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000239921 ; gene_alias_2 RP11-59J16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000239921.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159643.2 ; transcript_alias_1 ENST00000461398 ; transcript_alias_2 ENST00000461398.2 ; transcript_alias_3 RP11-59J16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000396610.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	61125303	61127142	.	-	.	gene_id lnc-C1orf87-3 ; transcript_id lnc-C1orf87-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_000856 ; gene_alias_2 linc-C1orf87-2 ; gene_alias_3 ENSG00000231252 ; gene_alias_4 RP11-436K8.1 ; gene_alias_5 ENSG00000231252.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000008422.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000081 ; transcript_alias_2 ENST00000423403 ; transcript_alias_3 ENST00000423403.1 ; transcript_alias_4 RP11-436K8.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000023196.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	61128657	61128697	.	-	.	gene_id lnc-C1orf87-3 ; transcript_id lnc-C1orf87-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_000856 ; gene_alias_2 linc-C1orf87-2 ; gene_alias_3 ENSG00000231252 ; gene_alias_4 RP11-436K8.1 ; gene_alias_5 ENSG00000231252.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000008422.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000081 ; transcript_alias_2 ENST00000423403 ; transcript_alias_3 ENST00000423403.1 ; transcript_alias_4 RP11-436K8.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000023196.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	61195247	61195339	.	-	.	gene_id lnc-C1orf87-3 ; transcript_id lnc-C1orf87-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_000856 ; gene_alias_2 linc-C1orf87-2 ; gene_alias_3 ENSG00000231252 ; gene_alias_4 RP11-436K8.1 ; gene_alias_5 ENSG00000231252.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000008422.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000081 ; transcript_alias_2 ENST00000423403 ; transcript_alias_3 ENST00000423403.1 ; transcript_alias_4 RP11-436K8.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000023196.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	61198119	61198180	.	-	.	gene_id lnc-C1orf87-3 ; transcript_id lnc-C1orf87-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_000856 ; gene_alias_2 linc-C1orf87-2 ; gene_alias_3 ENSG00000231252 ; gene_alias_4 RP11-436K8.1 ; gene_alias_5 ENSG00000231252.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000008422.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000081 ; transcript_alias_2 ENST00000423403 ; transcript_alias_3 ENST00000423403.1 ; transcript_alias_4 RP11-436K8.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000023196.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	61199136	61199194	.	-	.	gene_id lnc-C1orf87-3 ; transcript_id lnc-C1orf87-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_000856 ; gene_alias_2 linc-C1orf87-2 ; gene_alias_3 ENSG00000231252 ; gene_alias_4 RP11-436K8.1 ; gene_alias_5 ENSG00000231252.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000008422.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000081 ; transcript_alias_2 ENST00000423403 ; transcript_alias_3 ENST00000423403.1 ; transcript_alias_4 RP11-436K8.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000023196.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	61291008	61291256	.	-	.	gene_id lnc-C1orf87-3 ; transcript_id lnc-C1orf87-3:1 ; gene_alias_1 XLOC_000856 ; gene_alias_2 linc-C1orf87-2 ; gene_alias_3 ENSG00000231252 ; gene_alias_4 RP11-436K8.1 ; gene_alias_5 ENSG00000231252.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000008422.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000081 ; transcript_alias_2 ENST00000423403 ; transcript_alias_3 ENST00000423403.1 ; transcript_alias_4 RP11-436K8.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000023196.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	94463616	94463639	.	+	.	gene_id lnc-OTUB2-1 ; transcript_id lnc-OTUB2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000175699 ; gene_alias_2 C14orf48 ; gene_alias_3 ENSG00000175699.8 ; gene_alias_4 LINC00521 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156974.1 ; transcript_alias_1 ENST00000444118 ; transcript_alias_2 ENST00000444118.1 ; transcript_alias_3 LINC00521-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000346916.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	94464345	94464581	.	+	.	gene_id lnc-OTUB2-1 ; transcript_id lnc-OTUB2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000175699 ; gene_alias_2 C14orf48 ; gene_alias_3 ENSG00000175699.8 ; gene_alias_4 LINC00521 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156974.1 ; transcript_alias_1 ENST00000444118 ; transcript_alias_2 ENST00000444118.1 ; transcript_alias_3 LINC00521-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000346916.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	94465683	94465806	.	+	.	gene_id lnc-OTUB2-1 ; transcript_id lnc-OTUB2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000175699 ; gene_alias_2 C14orf48 ; gene_alias_3 ENSG00000175699.8 ; gene_alias_4 LINC00521 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156974.1 ; transcript_alias_1 ENST00000444118 ; transcript_alias_2 ENST00000444118.1 ; transcript_alias_3 LINC00521-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000346916.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	94465929	94466011	.	+	.	gene_id lnc-OTUB2-1 ; transcript_id lnc-OTUB2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000175699 ; gene_alias_2 C14orf48 ; gene_alias_3 ENSG00000175699.8 ; gene_alias_4 LINC00521 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156974.1 ; transcript_alias_1 ENST00000444118 ; transcript_alias_2 ENST00000444118.1 ; transcript_alias_3 LINC00521-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000346916.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	94467177	94467276	.	+	.	gene_id lnc-OTUB2-1 ; transcript_id lnc-OTUB2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000175699 ; gene_alias_2 C14orf48 ; gene_alias_3 ENSG00000175699.8 ; gene_alias_4 LINC00521 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156974.1 ; transcript_alias_1 ENST00000444118 ; transcript_alias_2 ENST00000444118.1 ; transcript_alias_3 LINC00521-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000346916.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	94467491	94468068	.	+	.	gene_id lnc-OTUB2-1 ; transcript_id lnc-OTUB2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000175699 ; gene_alias_2 C14orf48 ; gene_alias_3 ENSG00000175699.8 ; gene_alias_4 LINC00521 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156974.1 ; transcript_alias_1 ENST00000444118 ; transcript_alias_2 ENST00000444118.1 ; transcript_alias_3 LINC00521-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000346916.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	94469569	94469700	.	+	.	gene_id lnc-OTUB2-1 ; transcript_id lnc-OTUB2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000175699 ; gene_alias_2 C14orf48 ; gene_alias_3 ENSG00000175699.8 ; gene_alias_4 LINC00521 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156974.1 ; transcript_alias_1 ENST00000444118 ; transcript_alias_2 ENST00000444118.1 ; transcript_alias_3 LINC00521-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000346916.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	94471201	94471317	.	+	.	gene_id lnc-OTUB2-1 ; transcript_id lnc-OTUB2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000175699 ; gene_alias_2 C14orf48 ; gene_alias_3 ENSG00000175699.8 ; gene_alias_4 LINC00521 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156974.1 ; transcript_alias_1 ENST00000444118 ; transcript_alias_2 ENST00000444118.1 ; transcript_alias_3 LINC00521-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000346916.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	94473357	94473898	.	+	.	gene_id lnc-OTUB2-1 ; transcript_id lnc-OTUB2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000175699 ; gene_alias_2 C14orf48 ; gene_alias_3 ENSG00000175699.8 ; gene_alias_4 LINC00521 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156974.1 ; transcript_alias_1 ENST00000444118 ; transcript_alias_2 ENST00000444118.1 ; transcript_alias_3 LINC00521-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000346916.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	11470874	11471455	.	+	.	gene_id lnc-DRD5-9 ; transcript_id lnc-DRD5-9:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251152 ; gene_alias_2 RP11-281P23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251152.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160040.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515343 ; transcript_alias_2 ENST00000515343.1 ; transcript_alias_3 RP11-281P23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000358985.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	11476384	11479820	.	+	.	gene_id lnc-DRD5-9 ; transcript_id lnc-DRD5-9:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251152 ; gene_alias_2 RP11-281P23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251152.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160040.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515343 ; transcript_alias_2 ENST00000515343.1 ; transcript_alias_3 RP11-281P23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000358985.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	4005245	4006531	.	-	.	gene_id lnc-RNASEH1-4 ; transcript_id lnc-RNASEH1-4:5 ; gene_alias_1 ENSG00000237401 ; gene_alias_2 AC107070.1 ; gene_alias_3 ENSG00000237401.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151486.1 ; transcript_alias_1 ENST00000454455 ; transcript_alias_2 ENST00000454455.1 ; transcript_alias_3 AC107070.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000322859.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	4007506	4008146	.	-	.	gene_id lnc-RNASEH1-4 ; transcript_id lnc-RNASEH1-4:5 ; gene_alias_1 ENSG00000237401 ; gene_alias_2 AC107070.1 ; gene_alias_3 ENSG00000237401.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151486.1 ; transcript_alias_1 ENST00000454455 ; transcript_alias_2 ENST00000454455.1 ; transcript_alias_3 AC107070.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000322859.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	4021135	4021660	.	-	.	gene_id lnc-RNASEH1-4 ; transcript_id lnc-RNASEH1-4:5 ; gene_alias_1 ENSG00000237401 ; gene_alias_2 AC107070.1 ; gene_alias_3 ENSG00000237401.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151486.1 ; transcript_alias_1 ENST00000454455 ; transcript_alias_2 ENST00000454455.1 ; transcript_alias_3 AC107070.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000322859.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	164405	164791	.	-	.	gene_id lnc-FAM138A-4 ; transcript_id lnc-FAM138A-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000239368 ; gene_alias_2 RP11-34P13.13 ; gene_alias_3 ENSG00000239368.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002480.2 ; transcript_alias_1 ENST00000466557 ; transcript_alias_2 ENST00000466557.1 ; transcript_alias_3 RP11-34P13.13-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000007037.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	165884	165942	.	-	.	gene_id lnc-FAM138A-4 ; transcript_id lnc-FAM138A-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000239368 ; gene_alias_2 RP11-34P13.13 ; gene_alias_3 ENSG00000239368.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002480.2 ; transcript_alias_1 ENST00000466557 ; transcript_alias_2 ENST00000466557.1 ; transcript_alias_3 RP11-34P13.13-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000007037.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	168100	168165	.	-	.	gene_id lnc-FAM138A-4 ; transcript_id lnc-FAM138A-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000239368 ; gene_alias_2 RP11-34P13.13 ; gene_alias_3 ENSG00000239368.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002480.2 ; transcript_alias_1 ENST00000466557 ; transcript_alias_2 ENST00000466557.1 ; transcript_alias_3 RP11-34P13.13-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000007037.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	169049	169264	.	-	.	gene_id lnc-FAM138A-4 ; transcript_id lnc-FAM138A-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000239368 ; gene_alias_2 RP11-34P13.13 ; gene_alias_3 ENSG00000239368.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002480.2 ; transcript_alias_1 ENST00000466557 ; transcript_alias_2 ENST00000466557.1 ; transcript_alias_3 RP11-34P13.13-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000007037.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	172557	172688	.	-	.	gene_id lnc-FAM138A-4 ; transcript_id lnc-FAM138A-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000239368 ; gene_alias_2 RP11-34P13.13 ; gene_alias_3 ENSG00000239368.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002480.2 ; transcript_alias_1 ENST00000466557 ; transcript_alias_2 ENST00000466557.1 ; transcript_alias_3 RP11-34P13.13-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000007037.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	173753	173864	.	-	.	gene_id lnc-FAM138A-4 ; transcript_id lnc-FAM138A-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000239368 ; gene_alias_2 RP11-34P13.13 ; gene_alias_3 ENSG00000239368.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000002480.2 ; transcript_alias_1 ENST00000466557 ; transcript_alias_2 ENST00000466557.1 ; transcript_alias_3 RP11-34P13.13-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000007037.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	43184023	43185553	.	-	.	gene_id lnc-ANKRD20A3-3 ; transcript_id lnc-ANKRD20A3-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236322 ; gene_alias_2 RP11-327I22.8 ; gene_alias_3 ENSG00000236322.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013277.2 ; transcript_alias_1 ENST00000450911 ; transcript_alias_2 ENST00000450911.1 ; transcript_alias_3 RP11-327I22.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037052.2 ;
chr9	lncipedia.org	exon	43187215	43187299	.	-	.	gene_id lnc-ANKRD20A3-3 ; transcript_id lnc-ANKRD20A3-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236322 ; gene_alias_2 RP11-327I22.8 ; gene_alias_3 ENSG00000236322.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013277.2 ; transcript_alias_1 ENST00000450911 ; transcript_alias_2 ENST00000450911.1 ; transcript_alias_3 RP11-327I22.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037052.2 ;
chr9	lncipedia.org	exon	43187959	43188018	.	-	.	gene_id lnc-ANKRD20A3-3 ; transcript_id lnc-ANKRD20A3-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236322 ; gene_alias_2 RP11-327I22.8 ; gene_alias_3 ENSG00000236322.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013277.2 ; transcript_alias_1 ENST00000450911 ; transcript_alias_2 ENST00000450911.1 ; transcript_alias_3 RP11-327I22.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037052.2 ;
chr9	lncipedia.org	exon	43188108	43188149	.	-	.	gene_id lnc-ANKRD20A3-3 ; transcript_id lnc-ANKRD20A3-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236322 ; gene_alias_2 RP11-327I22.8 ; gene_alias_3 ENSG00000236322.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013277.2 ; transcript_alias_1 ENST00000450911 ; transcript_alias_2 ENST00000450911.1 ; transcript_alias_3 RP11-327I22.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037052.2 ;
chr9	lncipedia.org	exon	43189369	43189411	.	-	.	gene_id lnc-ANKRD20A3-3 ; transcript_id lnc-ANKRD20A3-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236322 ; gene_alias_2 RP11-327I22.8 ; gene_alias_3 ENSG00000236322.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013277.2 ; transcript_alias_1 ENST00000450911 ; transcript_alias_2 ENST00000450911.1 ; transcript_alias_3 RP11-327I22.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000037052.2 ;
chr6	lncipedia.org	exon	33868132	33868250	.	+	.	gene_id lnc-ITPR3-1 ; transcript_id lnc-ITPR3-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000233183 ; gene_alias_2 RP3-468B3.2 ; gene_alias_3 ENSG00000233183.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014537.3 ; transcript_alias_1 ENST00000451317 ; transcript_alias_2 ENST00000451317.2 ; transcript_alias_3 RP3-468B3.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000040212.3 ;
chr6	lncipedia.org	exon	33881865	33881988	.	+	.	gene_id lnc-ITPR3-1 ; transcript_id lnc-ITPR3-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000233183 ; gene_alias_2 RP3-468B3.2 ; gene_alias_3 ENSG00000233183.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014537.3 ; transcript_alias_1 ENST00000451317 ; transcript_alias_2 ENST00000451317.2 ; transcript_alias_3 RP3-468B3.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000040212.3 ;
chr6	lncipedia.org	exon	33888703	33888791	.	+	.	gene_id lnc-ITPR3-1 ; transcript_id lnc-ITPR3-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000233183 ; gene_alias_2 RP3-468B3.2 ; gene_alias_3 ENSG00000233183.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014537.3 ; transcript_alias_1 ENST00000451317 ; transcript_alias_2 ENST00000451317.2 ; transcript_alias_3 RP3-468B3.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000040212.3 ;
chr6	lncipedia.org	exon	33892111	33895408	.	+	.	gene_id lnc-ITPR3-1 ; transcript_id lnc-ITPR3-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000233183 ; gene_alias_2 RP3-468B3.2 ; gene_alias_3 ENSG00000233183.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014537.3 ; transcript_alias_1 ENST00000451317 ; transcript_alias_2 ENST00000451317.2 ; transcript_alias_3 RP3-468B3.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000040212.3 ;
chr10	lncipedia.org	exon	54011725	54012596	.	-	.	gene_id lnc-MBL2-5 ; transcript_id lnc-MBL2-5:3 ; gene_alias_1 ENSG00000236671 ; gene_alias_2 RP11-573I11.2 ; gene_alias_3 ENSG00000236671.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018251.1 ; transcript_alias_1 ENST00000426785 ; transcript_alias_2 ENST00000426785.1 ; transcript_alias_3 RP11-573I11.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000048109.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	54013131	54013200	.	-	.	gene_id lnc-MBL2-5 ; transcript_id lnc-MBL2-5:3 ; gene_alias_1 ENSG00000236671 ; gene_alias_2 RP11-573I11.2 ; gene_alias_3 ENSG00000236671.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018251.1 ; transcript_alias_1 ENST00000426785 ; transcript_alias_2 ENST00000426785.1 ; transcript_alias_3 RP11-573I11.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000048109.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	54053675	54053726	.	-	.	gene_id lnc-MBL2-5 ; transcript_id lnc-MBL2-5:3 ; gene_alias_1 ENSG00000236671 ; gene_alias_2 RP11-573I11.2 ; gene_alias_3 ENSG00000236671.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018251.1 ; transcript_alias_1 ENST00000426785 ; transcript_alias_2 ENST00000426785.1 ; transcript_alias_3 RP11-573I11.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000048109.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	54057560	54057675	.	-	.	gene_id lnc-MBL2-5 ; transcript_id lnc-MBL2-5:3 ; gene_alias_1 ENSG00000236671 ; gene_alias_2 RP11-573I11.2 ; gene_alias_3 ENSG00000236671.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018251.1 ; transcript_alias_1 ENST00000426785 ; transcript_alias_2 ENST00000426785.1 ; transcript_alias_3 RP11-573I11.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000048109.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	194018988	194021254	.	-	.	gene_id lnc-CPN2-1 ; transcript_id lnc-CPN2-1:4 ; gene_alias_1 XLOC_003385 ; gene_alias_2 linc-ATP13A4-8 ; gene_alias_3 ENSG00000214145 ; gene_alias_4 RP11-513G11.1 ; gene_alias_5 ENSG00000214145.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000155982.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005924 ; transcript_alias_2 ENST00000414120 ; transcript_alias_3 ENST00000414120.1 ; transcript_alias_4 RP11-513G11.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000342627.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	194021385	194021526	.	-	.	gene_id lnc-CPN2-1 ; transcript_id lnc-CPN2-1:4 ; gene_alias_1 XLOC_003385 ; gene_alias_2 linc-ATP13A4-8 ; gene_alias_3 ENSG00000214145 ; gene_alias_4 RP11-513G11.1 ; gene_alias_5 ENSG00000214145.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000155982.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005924 ; transcript_alias_2 ENST00000414120 ; transcript_alias_3 ENST00000414120.1 ; transcript_alias_4 RP11-513G11.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000342627.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	194023546	194023816	.	-	.	gene_id lnc-CPN2-1 ; transcript_id lnc-CPN2-1:4 ; gene_alias_1 XLOC_003385 ; gene_alias_2 linc-ATP13A4-8 ; gene_alias_3 ENSG00000214145 ; gene_alias_4 RP11-513G11.1 ; gene_alias_5 ENSG00000214145.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000155982.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005924 ; transcript_alias_2 ENST00000414120 ; transcript_alias_3 ENST00000414120.1 ; transcript_alias_4 RP11-513G11.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000342627.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	194030390	194030589	.	-	.	gene_id lnc-CPN2-1 ; transcript_id lnc-CPN2-1:4 ; gene_alias_1 XLOC_003385 ; gene_alias_2 linc-ATP13A4-8 ; gene_alias_3 ENSG00000214145 ; gene_alias_4 RP11-513G11.1 ; gene_alias_5 ENSG00000214145.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000155982.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00005924 ; transcript_alias_2 ENST00000414120 ; transcript_alias_3 ENST00000414120.1 ; transcript_alias_4 RP11-513G11.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000342627.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	30024530	30025494	.	-	.	gene_id lnc-RNF39-4 ; transcript_id lnc-RNF39-4:7 ; gene_alias_1 ENSG00000204623 ; gene_alias_2 ZNRD1-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000204623.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031109.3 ; transcript_alias_1 ENST00000452229 ; transcript_alias_2 ENST00000452229.1 ; transcript_alias_3 ZNRD1-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000076181.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	30025892	30025967	.	-	.	gene_id lnc-RNF39-4 ; transcript_id lnc-RNF39-4:7 ; gene_alias_1 ENSG00000204623 ; gene_alias_2 ZNRD1-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000204623.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031109.3 ; transcript_alias_1 ENST00000452229 ; transcript_alias_2 ENST00000452229.1 ; transcript_alias_3 ZNRD1-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000076181.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	30026145	30028756	.	-	.	gene_id lnc-RNF39-4 ; transcript_id lnc-RNF39-4:7 ; gene_alias_1 ENSG00000204623 ; gene_alias_2 ZNRD1-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000204623.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031109.3 ; transcript_alias_1 ENST00000452229 ; transcript_alias_2 ENST00000452229.1 ; transcript_alias_3 ZNRD1-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000076181.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	13983806	13983850	.	-	.	gene_id lnc-LRRC38-1 ; transcript_id lnc-LRRC38-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_000707 ; gene_alias_2 linc-LRRC38-9 ; gene_alias_3 ENSG00000237445 ; gene_alias_4 CTA-520D8.2 ; gene_alias_5 ENSG00000237445.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000007915.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000470 ; transcript_alias_2 ENST00000441809 ; transcript_alias_3 ENST00000441809.1 ; transcript_alias_4 CTA-520D8.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000021790.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	13986072	13987033	.	-	.	gene_id lnc-LRRC38-1 ; transcript_id lnc-LRRC38-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_000707 ; gene_alias_2 linc-LRRC38-9 ; gene_alias_3 ENSG00000237445 ; gene_alias_4 CTA-520D8.2 ; gene_alias_5 ENSG00000237445.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000007915.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000470 ; transcript_alias_2 ENST00000441809 ; transcript_alias_3 ENST00000441809.1 ; transcript_alias_4 CTA-520D8.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000021790.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	30022378	30025494	.	-	.	gene_id lnc-RNF39-4 ; transcript_id lnc-RNF39-4:4 ; gene_alias_1 ENSG00000204623 ; gene_alias_2 ZNRD1-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000204623.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031109.3 ; transcript_alias_1 ENST00000431012 ; transcript_alias_2 ENST00000431012.1 ; transcript_alias_3 ZNRD1-AS1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000253082.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	30025892	30025967	.	-	.	gene_id lnc-RNF39-4 ; transcript_id lnc-RNF39-4:4 ; gene_alias_1 ENSG00000204623 ; gene_alias_2 ZNRD1-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000204623.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031109.3 ; transcript_alias_1 ENST00000431012 ; transcript_alias_2 ENST00000431012.1 ; transcript_alias_3 ZNRD1-AS1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000253082.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	30028856	30028956	.	-	.	gene_id lnc-RNF39-4 ; transcript_id lnc-RNF39-4:4 ; gene_alias_1 ENSG00000204623 ; gene_alias_2 ZNRD1-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000204623.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031109.3 ; transcript_alias_1 ENST00000431012 ; transcript_alias_2 ENST00000431012.1 ; transcript_alias_3 ZNRD1-AS1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000253082.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	27699983	27702395	.	-	.	gene_id lnc-MANSC4-4 ; transcript_id lnc-MANSC4-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248100 ; gene_alias_2 RP11-709A23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248100.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169208.1 ; transcript_alias_1 ENST00000506925 ; transcript_alias_2 ENST00000506925.2 ; transcript_alias_3 RP11-709A23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402888.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	27705481	27705706	.	-	.	gene_id lnc-MANSC4-4 ; transcript_id lnc-MANSC4-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248100 ; gene_alias_2 RP11-709A23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248100.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169208.1 ; transcript_alias_1 ENST00000506925 ; transcript_alias_2 ENST00000506925.2 ; transcript_alias_3 RP11-709A23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402888.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	6111712	6114374	.	+	.	gene_id lnc-SOX11-3 ; transcript_id lnc-SOX11-3:7 ; gene_alias_1 ENSG00000232044 ; gene_alias_2 AC073479.1 ; gene_alias_3 ENSG00000232044.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151462.2 ; transcript_alias_1 ENST00000391666 ; transcript_alias_2 ENST00000391666.2 ; transcript_alias_3 AC073479.1-201 ;
chr3	lncipedia.org	exon	112769759	112770552	.	-	.	gene_id lnc-C3orf17-1 ; transcript_id lnc-C3orf17-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000241219 ; gene_alias_2 RP11-572M11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000241219.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159262.2 ; transcript_alias_1 ENST00000462010 ; transcript_alias_2 ENST00000462010.1 ; transcript_alias_3 RP11-572M11.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000354183.2 ;
chr3	lncipedia.org	exon	112777793	112777914	.	-	.	gene_id lnc-C3orf17-1 ; transcript_id lnc-C3orf17-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000241219 ; gene_alias_2 RP11-572M11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000241219.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159262.2 ; transcript_alias_1 ENST00000462010 ; transcript_alias_2 ENST00000462010.1 ; transcript_alias_3 RP11-572M11.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000354183.2 ;
chr3	lncipedia.org	exon	112781954	112782290	.	-	.	gene_id lnc-C3orf17-1 ; transcript_id lnc-C3orf17-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000241219 ; gene_alias_2 RP11-572M11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000241219.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159262.2 ; transcript_alias_1 ENST00000462010 ; transcript_alias_2 ENST00000462010.1 ; transcript_alias_3 RP11-572M11.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000354183.2 ;
chr9	lncipedia.org	exon	115875353	115875443	.	+	.	gene_id lnc-SLC31A2-1 ; transcript_id lnc-SLC31A2-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000231528 ; gene_alias_2 NCRNA00256A ; gene_alias_3 ENSG00000231528.2 ; gene_alias_4 LINC00256A ; gene_alias_5 OTTHUMG00000020516.3 ; transcript_alias_1 ENST00000453010 ; transcript_alias_2 ENST00000453010.1 ; transcript_alias_3 LINC00256A-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000053706.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	115875837	115875943	.	+	.	gene_id lnc-SLC31A2-1 ; transcript_id lnc-SLC31A2-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000231528 ; gene_alias_2 NCRNA00256A ; gene_alias_3 ENSG00000231528.2 ; gene_alias_4 LINC00256A ; gene_alias_5 OTTHUMG00000020516.3 ; transcript_alias_1 ENST00000453010 ; transcript_alias_2 ENST00000453010.1 ; transcript_alias_3 LINC00256A-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000053706.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	115876700	115882126	.	+	.	gene_id lnc-SLC31A2-1 ; transcript_id lnc-SLC31A2-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000231528 ; gene_alias_2 NCRNA00256A ; gene_alias_3 ENSG00000231528.2 ; gene_alias_4 LINC00256A ; gene_alias_5 OTTHUMG00000020516.3 ; transcript_alias_1 ENST00000453010 ; transcript_alias_2 ENST00000453010.1 ; transcript_alias_3 LINC00256A-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000053706.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	132251920	132254226	.	+	.	gene_id lnc-METTL11A-3 ; transcript_id lnc-METTL11A-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000204054 ; gene_alias_2 RP11-492E3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000204054.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020783.2 ; transcript_alias_1 ENST00000542697 ; transcript_alias_2 ENST00000542697.1 ; transcript_alias_3 RP11-492E3.1-201 ;
chr9	lncipedia.org	exon	132271018	132271083	.	+	.	gene_id lnc-METTL11A-3 ; transcript_id lnc-METTL11A-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000204054 ; gene_alias_2 RP11-492E3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000204054.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020783.2 ; transcript_alias_1 ENST00000542697 ; transcript_alias_2 ENST00000542697.1 ; transcript_alias_3 RP11-492E3.1-201 ;
chr21	lncipedia.org	exon	37477179	37477421	.	+	.	gene_id lnc-CBR3-1 ; transcript_id lnc-CBR3-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_013931 ; gene_alias_2 linc-CBR3-1 ; gene_alias_3 ENSG00000233393 ; gene_alias_4 AP000688.29 ; gene_alias_5 ENSG00000233393.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000153500.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00028843 ; transcript_alias_2 ENST00000422473 ; transcript_alias_3 ENST00000422473.1 ; transcript_alias_4 AP000688.29-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000331385.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	37479896	37481988	.	+	.	gene_id lnc-CBR3-1 ; transcript_id lnc-CBR3-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_013931 ; gene_alias_2 linc-CBR3-1 ; gene_alias_3 ENSG00000233393 ; gene_alias_4 AP000688.29 ; gene_alias_5 ENSG00000233393.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000153500.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00028843 ; transcript_alias_2 ENST00000422473 ; transcript_alias_3 ENST00000422473.1 ; transcript_alias_4 AP000688.29-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000331385.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	94261771	94264194	.	-	.	gene_id lnc-RGMA-7 ; transcript_id lnc-RGMA-7:4 ; gene_alias_1 ENSG00000258754 ; gene_alias_2 CTD-3049M7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258754.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171808.1 ; transcript_alias_1 ENST00000557481 ; transcript_alias_2 ENST00000557664 ; transcript_alias_3 ENST00000557481.1 ; transcript_alias_4 CTD-3049M7.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000415163.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	94303844	94304356	.	-	.	gene_id lnc-RGMA-7 ; transcript_id lnc-RGMA-7:4 ; gene_alias_1 ENSG00000258754 ; gene_alias_2 CTD-3049M7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258754.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171808.1 ; transcript_alias_1 ENST00000557481 ; transcript_alias_2 ENST00000557664 ; transcript_alias_3 ENST00000557481.1 ; transcript_alias_4 CTD-3049M7.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000415163.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	94364220	94364329	.	-	.	gene_id lnc-RGMA-7 ; transcript_id lnc-RGMA-7:4 ; gene_alias_1 ENSG00000258754 ; gene_alias_2 CTD-3049M7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258754.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171808.1 ; transcript_alias_1 ENST00000557481 ; transcript_alias_2 ENST00000557664 ; transcript_alias_3 ENST00000557481.1 ; transcript_alias_4 CTD-3049M7.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000415163.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	94410166	94410273	.	-	.	gene_id lnc-RGMA-7 ; transcript_id lnc-RGMA-7:4 ; gene_alias_1 ENSG00000258754 ; gene_alias_2 CTD-3049M7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258754.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171808.1 ; transcript_alias_1 ENST00000557481 ; transcript_alias_2 ENST00000557664 ; transcript_alias_3 ENST00000557481.1 ; transcript_alias_4 CTD-3049M7.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000415163.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	94442493	94442565	.	-	.	gene_id lnc-RGMA-7 ; transcript_id lnc-RGMA-7:4 ; gene_alias_1 ENSG00000258754 ; gene_alias_2 CTD-3049M7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258754.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171808.1 ; transcript_alias_1 ENST00000557481 ; transcript_alias_2 ENST00000557664 ; transcript_alias_3 ENST00000557481.1 ; transcript_alias_4 CTD-3049M7.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000415163.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	94443580	94443828	.	-	.	gene_id lnc-RGMA-7 ; transcript_id lnc-RGMA-7:4 ; gene_alias_1 ENSG00000258754 ; gene_alias_2 CTD-3049M7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258754.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000171808.1 ; transcript_alias_1 ENST00000557481 ; transcript_alias_2 ENST00000557664 ; transcript_alias_3 ENST00000557481.1 ; transcript_alias_4 CTD-3049M7.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000415163.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	26329467	26329579	.	+	.	gene_id lnc-HS3ST4-1 ; transcript_id lnc-HS3ST4-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_011679 ; gene_alias_2 linc-C16orf82 ; gene_alias_3 ENSG00000231876 ; gene_alias_4 AC009158.1 ; gene_alias_5 ENSG00000231876.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000060108.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00024287 ; transcript_alias_2 ENST00000452511 ; transcript_alias_3 ENST00000452511.1 ; transcript_alias_4 AC009158.1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000133428.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	26333521	26334302	.	+	.	gene_id lnc-HS3ST4-1 ; transcript_id lnc-HS3ST4-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_011679 ; gene_alias_2 linc-C16orf82 ; gene_alias_3 ENSG00000231876 ; gene_alias_4 AC009158.1 ; gene_alias_5 ENSG00000231876.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000060108.2 ; transcript_alias_1 TCONS_00024287 ; transcript_alias_2 ENST00000452511 ; transcript_alias_3 ENST00000452511.1 ; transcript_alias_4 AC009158.1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000133428.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	69902336	69902641	.	-	.	gene_id lnc-FGF3-2 ; transcript_id lnc-FGF3-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248844 ; gene_alias_2 RP11-626H12.3 ; gene_alias_3 ENSG00000248844.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167161.1 ; transcript_alias_1 ENST00000511013 ; transcript_alias_2 ENST00000511013.2 ; transcript_alias_3 RP11-626H12.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393505.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	69910029	69911477	.	-	.	gene_id lnc-FGF3-2 ; transcript_id lnc-FGF3-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248844 ; gene_alias_2 RP11-626H12.3 ; gene_alias_3 ENSG00000248844.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167161.1 ; transcript_alias_1 ENST00000511013 ; transcript_alias_2 ENST00000511013.2 ; transcript_alias_3 RP11-626H12.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393505.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	106938474	106938644	.	+	.	gene_id lnc-KIAA0125-3 ; transcript_id lnc-KIAA0125-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000187156 ; gene_alias_2 NCRNA00221 ; gene_alias_3 ENSG00000187156.4 ; gene_alias_4 LINC00221 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000152084.1 ; transcript_alias_1 ENST00000334298 ; transcript_alias_2 ENST00000334298.3 ; transcript_alias_3 LINC00221-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000325180.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	106944775	106944968	.	+	.	gene_id lnc-KIAA0125-3 ; transcript_id lnc-KIAA0125-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000187156 ; gene_alias_2 NCRNA00221 ; gene_alias_3 ENSG00000187156.4 ; gene_alias_4 LINC00221 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000152084.1 ; transcript_alias_1 ENST00000334298 ; transcript_alias_2 ENST00000334298.3 ; transcript_alias_3 LINC00221-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000325180.1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	106950171	106951462	.	+	.	gene_id lnc-KIAA0125-3 ; transcript_id lnc-KIAA0125-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000187156 ; gene_alias_2 NCRNA00221 ; gene_alias_3 ENSG00000187156.4 ; gene_alias_4 LINC00221 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000152084.1 ; transcript_alias_1 ENST00000334298 ; transcript_alias_2 ENST00000334298.3 ; transcript_alias_3 LINC00221-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000325180.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	44118054	44120436	.	+	.	gene_id lnc-LACC1-2 ; transcript_id lnc-LACC1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233821 ; gene_alias_2 ENOX1-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000233821.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000016819.1 ; transcript_alias_1 ENST00000444442 ; transcript_alias_2 ENST00000444442.1 ; transcript_alias_3 ENOX1-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000044719.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	44120669	44122192	.	+	.	gene_id lnc-LACC1-2 ; transcript_id lnc-LACC1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233821 ; gene_alias_2 ENOX1-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000233821.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000016819.1 ; transcript_alias_1 ENST00000444442 ; transcript_alias_2 ENST00000444442.1 ; transcript_alias_3 ENOX1-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000044719.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	45004879	45004926	.	+	.	gene_id lnc-FAM27C-1 ; transcript_id lnc-FAM27C-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007362 ; gene_alias_2 linc-ANKRD20A1-17 ; gene_alias_3 ENSG00000223379 ; gene_alias_4 RP11-374M1.4 ; gene_alias_5 ENSG00000223379.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000013243.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015675 ; transcript_alias_2 ENST00000421848 ; transcript_alias_3 ENST00000421848.1 ; transcript_alias_4 RP11-374M1.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000037011.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	45022793	45023236	.	+	.	gene_id lnc-FAM27C-1 ; transcript_id lnc-FAM27C-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_007362 ; gene_alias_2 linc-ANKRD20A1-17 ; gene_alias_3 ENSG00000223379 ; gene_alias_4 RP11-374M1.4 ; gene_alias_5 ENSG00000223379.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000013243.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00015675 ; transcript_alias_2 ENST00000421848 ; transcript_alias_3 ENST00000421848.1 ; transcript_alias_4 RP11-374M1.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000037011.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	132083295	132083325	.	+	.	gene_id lnc-PPP2R4-4 ; transcript_id lnc-PPP2R4-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000179082 ; gene_alias_2 C9orf106 ; gene_alias_3 ENSG00000179082.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020781.2 ; transcript_alias_1 ENST00000316786 ; transcript_alias_2 ENST00000316786.1 ; transcript_alias_3 C9orf106-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000054576.2 ;
chr9	lncipedia.org	exon	132084071	132087184	.	+	.	gene_id lnc-PPP2R4-4 ; transcript_id lnc-PPP2R4-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000179082 ; gene_alias_2 C9orf106 ; gene_alias_3 ENSG00000179082.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020781.2 ; transcript_alias_1 ENST00000316786 ; transcript_alias_2 ENST00000316786.1 ; transcript_alias_3 C9orf106-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000054576.2 ;
chr8	lncipedia.org	exon	64081121	64081460	.	+	.	gene_id lnc-NKAIN3-3 ; transcript_id lnc-NKAIN3-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000185728 ; gene_alias_2 YTHDF3 ; gene_alias_3 ENSG00000185728.11 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164369.2 ; transcript_alias_1 ENST00000539294 ; transcript_alias_2 ENST00000539294.1 ; transcript_alias_3 YTHDF3-203 ;
chr8	lncipedia.org	exon	64081946	64081970	.	+	.	gene_id lnc-NKAIN3-3 ; transcript_id lnc-NKAIN3-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000185728 ; gene_alias_2 YTHDF3 ; gene_alias_3 ENSG00000185728.11 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164369.2 ; transcript_alias_1 ENST00000539294 ; transcript_alias_2 ENST00000539294.1 ; transcript_alias_3 YTHDF3-203 ;
chr8	lncipedia.org	exon	64087890	64087999	.	+	.	gene_id lnc-NKAIN3-3 ; transcript_id lnc-NKAIN3-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000185728 ; gene_alias_2 YTHDF3 ; gene_alias_3 ENSG00000185728.11 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164369.2 ; transcript_alias_1 ENST00000539294 ; transcript_alias_2 ENST00000539294.1 ; transcript_alias_3 YTHDF3-203 ;
chr8	lncipedia.org	exon	64098732	64100303	.	+	.	gene_id lnc-NKAIN3-3 ; transcript_id lnc-NKAIN3-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000185728 ; gene_alias_2 YTHDF3 ; gene_alias_3 ENSG00000185728.11 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164369.2 ; transcript_alias_1 ENST00000539294 ; transcript_alias_2 ENST00000539294.1 ; transcript_alias_3 YTHDF3-203 ;
chr8	lncipedia.org	exon	64122241	64125346	.	+	.	gene_id lnc-NKAIN3-3 ; transcript_id lnc-NKAIN3-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000185728 ; gene_alias_2 YTHDF3 ; gene_alias_3 ENSG00000185728.11 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164369.2 ; transcript_alias_1 ENST00000539294 ; transcript_alias_2 ENST00000539294.1 ; transcript_alias_3 YTHDF3-203 ;
chr3	lncipedia.org	exon	62247498	62249817	.	-	.	gene_id lnc-FEZF2-1 ; transcript_id lnc-FEZF2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000241472 ; gene_alias_2 RP11-204J18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241472.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158657.1 ; transcript_alias_1 ENST00000474795 ; transcript_alias_2 ENST00000474795.1 ; transcript_alias_3 RP11-204J18.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351663.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	62280375	62280453	.	-	.	gene_id lnc-FEZF2-1 ; transcript_id lnc-FEZF2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000241472 ; gene_alias_2 RP11-204J18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241472.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158657.1 ; transcript_alias_1 ENST00000474795 ; transcript_alias_2 ENST00000474795.1 ; transcript_alias_3 RP11-204J18.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351663.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	62302781	62302867	.	-	.	gene_id lnc-FEZF2-1 ; transcript_id lnc-FEZF2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000241472 ; gene_alias_2 RP11-204J18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241472.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158657.1 ; transcript_alias_1 ENST00000474795 ; transcript_alias_2 ENST00000474795.1 ; transcript_alias_3 RP11-204J18.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351663.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	62303483	62303575	.	-	.	gene_id lnc-FEZF2-1 ; transcript_id lnc-FEZF2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000241472 ; gene_alias_2 RP11-204J18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241472.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158657.1 ; transcript_alias_1 ENST00000474795 ; transcript_alias_2 ENST00000474795.1 ; transcript_alias_3 RP11-204J18.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351663.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	62304541	62304622	.	-	.	gene_id lnc-FEZF2-1 ; transcript_id lnc-FEZF2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000241472 ; gene_alias_2 RP11-204J18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241472.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158657.1 ; transcript_alias_1 ENST00000474795 ; transcript_alias_2 ENST00000474795.1 ; transcript_alias_3 RP11-204J18.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351663.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	171961759	171961985	.	+	.	gene_id lnc-GALNTL6-2 ; transcript_id lnc-GALNTL6-2:3 ; gene_alias_1 XLOC_003777 ; gene_alias_2 linc-GALNTL6-2 ; gene_alias_3 ENSG00000248872 ; gene_alias_4 RP11-344G13.1 ; gene_alias_5 ENSG00000248872.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000160875.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00007681 ; transcript_alias_2 ENST00000503929 ; transcript_alias_3 ENST00000503929.1 ; transcript_alias_4 RP11-344G13.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000362756.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	171976506	171976543	.	+	.	gene_id lnc-GALNTL6-2 ; transcript_id lnc-GALNTL6-2:3 ; gene_alias_1 XLOC_003777 ; gene_alias_2 linc-GALNTL6-2 ; gene_alias_3 ENSG00000248872 ; gene_alias_4 RP11-344G13.1 ; gene_alias_5 ENSG00000248872.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000160875.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00007681 ; transcript_alias_2 ENST00000503929 ; transcript_alias_3 ENST00000503929.1 ; transcript_alias_4 RP11-344G13.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000362756.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	171976979	171980314	.	+	.	gene_id lnc-GALNTL6-2 ; transcript_id lnc-GALNTL6-2:3 ; gene_alias_1 XLOC_003777 ; gene_alias_2 linc-GALNTL6-2 ; gene_alias_3 ENSG00000248872 ; gene_alias_4 RP11-344G13.1 ; gene_alias_5 ENSG00000248872.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000160875.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00007681 ; transcript_alias_2 ENST00000503929 ; transcript_alias_3 ENST00000503929.1 ; transcript_alias_4 RP11-344G13.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000362756.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105050820	105050981	.	+	.	gene_id lnc-POU3F3-4 ; transcript_id lnc-POU3F3-4:5 ; gene_alias_1 ENSG00000235597 ; gene_alias_2 AC013402.2 ; gene_alias_3 ENSG00000235597.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153050.1 ; transcript_alias_1 ENST00000429464 ; transcript_alias_2 ENST00000429464.1 ; transcript_alias_3 AC013402.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000329245.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105122324	105124289	.	+	.	gene_id lnc-POU3F3-4 ; transcript_id lnc-POU3F3-4:5 ; gene_alias_1 ENSG00000235597 ; gene_alias_2 AC013402.2 ; gene_alias_3 ENSG00000235597.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153050.1 ; transcript_alias_1 ENST00000429464 ; transcript_alias_2 ENST00000429464.1 ; transcript_alias_3 AC013402.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000329245.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	108827907	108828070	.	-	.	gene_id lnc-SART3-1 ; transcript_id lnc-SART3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247213 ; gene_alias_2 RP11-13G14.4 ; gene_alias_3 ENSG00000247213.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169577.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502160 ; transcript_alias_2 ENST00000502160.2 ; transcript_alias_3 RP11-13G14.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404872.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	108832577	108832676	.	-	.	gene_id lnc-SART3-1 ; transcript_id lnc-SART3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247213 ; gene_alias_2 RP11-13G14.4 ; gene_alias_3 ENSG00000247213.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169577.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502160 ; transcript_alias_2 ENST00000502160.2 ; transcript_alias_3 RP11-13G14.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404872.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	108836326	108836476	.	-	.	gene_id lnc-SART3-1 ; transcript_id lnc-SART3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247213 ; gene_alias_2 RP11-13G14.4 ; gene_alias_3 ENSG00000247213.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169577.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502160 ; transcript_alias_2 ENST00000502160.2 ; transcript_alias_3 RP11-13G14.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404872.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	108837052	108837094	.	-	.	gene_id lnc-SART3-1 ; transcript_id lnc-SART3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247213 ; gene_alias_2 RP11-13G14.4 ; gene_alias_3 ENSG00000247213.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169577.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502160 ; transcript_alias_2 ENST00000502160.2 ; transcript_alias_3 RP11-13G14.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404872.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	108841219	108841297	.	-	.	gene_id lnc-SART3-1 ; transcript_id lnc-SART3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247213 ; gene_alias_2 RP11-13G14.4 ; gene_alias_3 ENSG00000247213.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169577.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502160 ; transcript_alias_2 ENST00000502160.2 ; transcript_alias_3 RP11-13G14.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404872.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	108842163	108842273	.	-	.	gene_id lnc-SART3-1 ; transcript_id lnc-SART3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247213 ; gene_alias_2 RP11-13G14.4 ; gene_alias_3 ENSG00000247213.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169577.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502160 ; transcript_alias_2 ENST00000502160.2 ; transcript_alias_3 RP11-13G14.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404872.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	108842535	108842663	.	-	.	gene_id lnc-SART3-1 ; transcript_id lnc-SART3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247213 ; gene_alias_2 RP11-13G14.4 ; gene_alias_3 ENSG00000247213.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169577.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502160 ; transcript_alias_2 ENST00000502160.2 ; transcript_alias_3 RP11-13G14.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404872.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	108847528	108847608	.	-	.	gene_id lnc-SART3-1 ; transcript_id lnc-SART3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247213 ; gene_alias_2 RP11-13G14.4 ; gene_alias_3 ENSG00000247213.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169577.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502160 ; transcript_alias_2 ENST00000502160.2 ; transcript_alias_3 RP11-13G14.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404872.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	108851573	108851709	.	-	.	gene_id lnc-SART3-1 ; transcript_id lnc-SART3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247213 ; gene_alias_2 RP11-13G14.4 ; gene_alias_3 ENSG00000247213.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169577.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502160 ; transcript_alias_2 ENST00000502160.2 ; transcript_alias_3 RP11-13G14.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404872.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	108852958	108853080	.	-	.	gene_id lnc-SART3-1 ; transcript_id lnc-SART3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247213 ; gene_alias_2 RP11-13G14.4 ; gene_alias_3 ENSG00000247213.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169577.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502160 ; transcript_alias_2 ENST00000502160.2 ; transcript_alias_3 RP11-13G14.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404872.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	108853222	108853361	.	-	.	gene_id lnc-SART3-1 ; transcript_id lnc-SART3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247213 ; gene_alias_2 RP11-13G14.4 ; gene_alias_3 ENSG00000247213.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169577.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502160 ; transcript_alias_2 ENST00000502160.2 ; transcript_alias_3 RP11-13G14.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404872.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	108855407	108855471	.	-	.	gene_id lnc-SART3-1 ; transcript_id lnc-SART3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247213 ; gene_alias_2 RP11-13G14.4 ; gene_alias_3 ENSG00000247213.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169577.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502160 ; transcript_alias_2 ENST00000502160.2 ; transcript_alias_3 RP11-13G14.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404872.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	108858039	108858223	.	-	.	gene_id lnc-SART3-1 ; transcript_id lnc-SART3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247213 ; gene_alias_2 RP11-13G14.4 ; gene_alias_3 ENSG00000247213.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169577.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502160 ; transcript_alias_2 ENST00000502160.2 ; transcript_alias_3 RP11-13G14.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404872.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	108865786	108865880	.	-	.	gene_id lnc-SART3-1 ; transcript_id lnc-SART3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247213 ; gene_alias_2 RP11-13G14.4 ; gene_alias_3 ENSG00000247213.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169577.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502160 ; transcript_alias_2 ENST00000502160.2 ; transcript_alias_3 RP11-13G14.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404872.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	108866779	108866963	.	-	.	gene_id lnc-SART3-1 ; transcript_id lnc-SART3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247213 ; gene_alias_2 RP11-13G14.4 ; gene_alias_3 ENSG00000247213.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169577.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502160 ; transcript_alias_2 ENST00000502160.2 ; transcript_alias_3 RP11-13G14.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404872.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	108873316	108874305	.	-	.	gene_id lnc-SART3-1 ; transcript_id lnc-SART3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247213 ; gene_alias_2 RP11-13G14.4 ; gene_alias_3 ENSG00000247213.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169577.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502160 ; transcript_alias_2 ENST00000502160.2 ; transcript_alias_3 RP11-13G14.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404872.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	108879950	108880019	.	-	.	gene_id lnc-SART3-1 ; transcript_id lnc-SART3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247213 ; gene_alias_2 RP11-13G14.4 ; gene_alias_3 ENSG00000247213.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169577.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502160 ; transcript_alias_2 ENST00000502160.2 ; transcript_alias_3 RP11-13G14.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404872.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	108886227	108886362	.	-	.	gene_id lnc-SART3-1 ; transcript_id lnc-SART3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247213 ; gene_alias_2 RP11-13G14.4 ; gene_alias_3 ENSG00000247213.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169577.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502160 ; transcript_alias_2 ENST00000502160.2 ; transcript_alias_3 RP11-13G14.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404872.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	149672997	149674442	.	+	.	gene_id lnc-AL358813.2-1 ; transcript_id lnc-AL358813.2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223759 ; gene_alias_2 RP11-353N4.4 ; gene_alias_3 ENSG00000223759.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013953.1 ; transcript_alias_1 ENST00000443602 ; transcript_alias_2 ENST00000443602.1 ; transcript_alias_3 RP11-353N4.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000039135.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	149676746	149677287	.	+	.	gene_id lnc-AL358813.2-1 ; transcript_id lnc-AL358813.2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223759 ; gene_alias_2 RP11-353N4.4 ; gene_alias_3 ENSG00000223759.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000013953.1 ; transcript_alias_1 ENST00000443602 ; transcript_alias_2 ENST00000443602.1 ; transcript_alias_3 RP11-353N4.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000039135.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	128302062	128302305	.	-	.	gene_id lnc-TMEM75-3 ; transcript_id lnc-TMEM75-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000246228 ; gene_alias_2 RP11-382A18.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246228.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165066.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501396 ; transcript_alias_2 ENST00000501396.1 ; transcript_alias_3 RP11-382A18.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381642.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	128335260	128335399	.	-	.	gene_id lnc-TMEM75-3 ; transcript_id lnc-TMEM75-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000246228 ; gene_alias_2 RP11-382A18.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246228.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165066.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501396 ; transcript_alias_2 ENST00000501396.1 ; transcript_alias_3 RP11-382A18.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381642.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	128433074	128433619	.	-	.	gene_id lnc-TMEM75-3 ; transcript_id lnc-TMEM75-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000246228 ; gene_alias_2 RP11-382A18.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246228.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165066.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501396 ; transcript_alias_2 ENST00000501396.1 ; transcript_alias_3 RP11-382A18.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381642.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	28388457	28389523	.	+	.	gene_id lnc-HSCB-1 ; transcript_id lnc-HSCB-1:18 ; gene_alias_1 ENSG00000235954 ; gene_alias_2 TTC28-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000235954.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150973.1 ; transcript_alias_1 ENST00000428584 ; transcript_alias_2 ENST00000428584.1 ; transcript_alias_3 TTC28-AS1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320719.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	28390461	28390641	.	+	.	gene_id lnc-HSCB-1 ; transcript_id lnc-HSCB-1:18 ; gene_alias_1 ENSG00000235954 ; gene_alias_2 TTC28-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000235954.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150973.1 ; transcript_alias_1 ENST00000428584 ; transcript_alias_2 ENST00000428584.1 ; transcript_alias_3 TTC28-AS1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320719.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	28393399	28393727	.	+	.	gene_id lnc-HSCB-1 ; transcript_id lnc-HSCB-1:18 ; gene_alias_1 ENSG00000235954 ; gene_alias_2 TTC28-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000235954.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150973.1 ; transcript_alias_1 ENST00000428584 ; transcript_alias_2 ENST00000428584.1 ; transcript_alias_3 TTC28-AS1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320719.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	28395418	28397646	.	+	.	gene_id lnc-HSCB-1 ; transcript_id lnc-HSCB-1:18 ; gene_alias_1 ENSG00000235954 ; gene_alias_2 TTC28-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000235954.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150973.1 ; transcript_alias_1 ENST00000428584 ; transcript_alias_2 ENST00000428584.1 ; transcript_alias_3 TTC28-AS1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320719.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	28402517	28404569	.	+	.	gene_id lnc-HSCB-1 ; transcript_id lnc-HSCB-1:18 ; gene_alias_1 ENSG00000235954 ; gene_alias_2 TTC28-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000235954.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150973.1 ; transcript_alias_1 ENST00000428584 ; transcript_alias_2 ENST00000428584.1 ; transcript_alias_3 TTC28-AS1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320719.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	38674706	38676494	.	-	.	gene_id lnc-POU3F1-1 ; transcript_id lnc-POU3F1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_000788 ; gene_alias_2 linc-POU3F1-2 ; gene_alias_3 ENSG00000237290 ; gene_alias_4 RP11-214L19.1 ; gene_alias_5 ENSG00000237290.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000000479.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000505 ; transcript_alias_2 ENST00000431311 ; transcript_alias_3 ENST00000431311.1 ; transcript_alias_4 RP11-214L19.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000001202.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	38677406	38677494	.	-	.	gene_id lnc-POU3F1-1 ; transcript_id lnc-POU3F1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_000788 ; gene_alias_2 linc-POU3F1-2 ; gene_alias_3 ENSG00000237290 ; gene_alias_4 RP11-214L19.1 ; gene_alias_5 ENSG00000237290.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000000479.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000505 ; transcript_alias_2 ENST00000431311 ; transcript_alias_3 ENST00000431311.1 ; transcript_alias_4 RP11-214L19.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000001202.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	38677770	38678123	.	-	.	gene_id lnc-POU3F1-1 ; transcript_id lnc-POU3F1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_000788 ; gene_alias_2 linc-POU3F1-2 ; gene_alias_3 ENSG00000237290 ; gene_alias_4 RP11-214L19.1 ; gene_alias_5 ENSG00000237290.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000000479.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000505 ; transcript_alias_2 ENST00000431311 ; transcript_alias_3 ENST00000431311.1 ; transcript_alias_4 RP11-214L19.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000001202.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	38680389	38680439	.	-	.	gene_id lnc-POU3F1-1 ; transcript_id lnc-POU3F1-1:1 ; gene_alias_1 XLOC_000788 ; gene_alias_2 linc-POU3F1-2 ; gene_alias_3 ENSG00000237290 ; gene_alias_4 RP11-214L19.1 ; gene_alias_5 ENSG00000237290.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000000479.1 ; transcript_alias_1 TCONS_00000505 ; transcript_alias_2 ENST00000431311 ; transcript_alias_3 ENST00000431311.1 ; transcript_alias_4 RP11-214L19.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000001202.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	35047285	35047422	.	+	.	gene_id lnc-AC114546.1-3 ; transcript_id lnc-AC114546.1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250007 ; gene_alias_2 AC087457.1 ; gene_alias_3 ENSG00000250007.2 ; gene_alias_4 RP11-814P5.1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000172256.1 ; transcript_alias_1 ENST00000503496 ; transcript_alias_2 ENST00000503496.1 ; transcript_alias_3 RP11-814P5.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000417521.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	35069472	35069632	.	+	.	gene_id lnc-AC114546.1-3 ; transcript_id lnc-AC114546.1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250007 ; gene_alias_2 AC087457.1 ; gene_alias_3 ENSG00000250007.2 ; gene_alias_4 RP11-814P5.1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000172256.1 ; transcript_alias_1 ENST00000503496 ; transcript_alias_2 ENST00000503496.1 ; transcript_alias_3 RP11-814P5.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000417521.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	35102697	35105124	.	+	.	gene_