##gtf
chr8	lncipedia.org	exon	104203457	104203674	.	-	.	gene_id lnc-C8orf56-1 ; transcript_id lnc-C8orf56-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000247081 ; gene_alias_2 RP11-318M2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247081.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164798.3 ; gene_alias_5 ENSG00000247081.3 ; transcript_alias_1 ENST00000523915 ; transcript_alias_2 ENST00000523915.1 ; transcript_alias_3 RP11-318M2.2-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000380358.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128163 ;
chr8	lncipedia.org	exon	104215026	104215098	.	-	.	gene_id lnc-C8orf56-1 ; transcript_id lnc-C8orf56-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000247081 ; gene_alias_2 RP11-318M2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247081.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164798.3 ; gene_alias_5 ENSG00000247081.3 ; transcript_alias_1 ENST00000523915 ; transcript_alias_2 ENST00000523915.1 ; transcript_alias_3 RP11-318M2.2-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000380358.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128163 ;
chr1	lncipedia.org	exon	84267199	84268934	.	-	.	gene_id lnc-TTLL7-2 ; transcript_id lnc-TTLL7-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000233008 ; gene_alias_2 RP11-475O6.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233008.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009930.1 ; transcript_alias_1 ENST00000457273 ; transcript_alias_2 ENST00000457273.1 ; transcript_alias_3 RP11-475O6.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000027496.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT004171 ; transcript_alias_6 NR_119374 ;
chr1	lncipedia.org	exon	84315590	84315705	.	-	.	gene_id lnc-TTLL7-2 ; transcript_id lnc-TTLL7-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000233008 ; gene_alias_2 RP11-475O6.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233008.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009930.1 ; transcript_alias_1 ENST00000457273 ; transcript_alias_2 ENST00000457273.1 ; transcript_alias_3 RP11-475O6.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000027496.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT004171 ; transcript_alias_6 NR_119374 ;
chr1	lncipedia.org	exon	84326091	84326229	.	-	.	gene_id lnc-TTLL7-2 ; transcript_id lnc-TTLL7-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000233008 ; gene_alias_2 RP11-475O6.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233008.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009930.1 ; transcript_alias_1 ENST00000457273 ; transcript_alias_2 ENST00000457273.1 ; transcript_alias_3 RP11-475O6.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000027496.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT004171 ; transcript_alias_6 NR_119374 ;
chr16	lncipedia.org	exon	74226291	74226625	.	-	.	gene_id lnc-CLEC18B-3 ; transcript_id lnc-CLEC18B-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000249447 ; gene_alias_2 XLOC_012007 ; gene_alias_3 linc-ZFHX3-2 ; gene_alias_4 ENSG00000261404.1 ; gene_alias_5 AC009120.4 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000176255.2 ; transcript_alias_1 ENST00000510251 ; transcript_alias_2 TCONS_00024274 ; transcript_alias_3 ENST00000568137.1 ; transcript_alias_4 AC009120.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000431686.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT143655 ; transcript_alias_7 NR_104657 ;
chr16	lncipedia.org	exon	74239804	74240064	.	-	.	gene_id lnc-CLEC18B-3 ; transcript_id lnc-CLEC18B-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000249447 ; gene_alias_2 XLOC_012007 ; gene_alias_3 linc-ZFHX3-2 ; gene_alias_4 ENSG00000261404.1 ; gene_alias_5 AC009120.4 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000176255.2 ; transcript_alias_1 ENST00000510251 ; transcript_alias_2 TCONS_00024274 ; transcript_alias_3 ENST00000568137.1 ; transcript_alias_4 AC009120.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000431686.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT143655 ; transcript_alias_7 NR_104657 ;
chr16	lncipedia.org	exon	74244205	74244404	.	-	.	gene_id lnc-CLEC18B-3 ; transcript_id lnc-CLEC18B-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000249447 ; gene_alias_2 XLOC_012007 ; gene_alias_3 linc-ZFHX3-2 ; gene_alias_4 ENSG00000261404.1 ; gene_alias_5 AC009120.4 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000176255.2 ; transcript_alias_1 ENST00000510251 ; transcript_alias_2 TCONS_00024274 ; transcript_alias_3 ENST00000568137.1 ; transcript_alias_4 AC009120.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000431686.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT143655 ; transcript_alias_7 NR_104657 ;
chr16	lncipedia.org	exon	74249251	74249420	.	-	.	gene_id lnc-CLEC18B-3 ; transcript_id lnc-CLEC18B-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000249447 ; gene_alias_2 XLOC_012007 ; gene_alias_3 linc-ZFHX3-2 ; gene_alias_4 ENSG00000261404.1 ; gene_alias_5 AC009120.4 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000176255.2 ; transcript_alias_1 ENST00000510251 ; transcript_alias_2 TCONS_00024274 ; transcript_alias_3 ENST00000568137.1 ; transcript_alias_4 AC009120.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000431686.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT143655 ; transcript_alias_7 NR_104657 ;
chrX	lncipedia.org	exon	129611043	129611223	.	-	.	gene_id lnc-GPR119-1 ; transcript_id lnc-GPR119-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229702 ; gene_alias_2 RP1-274L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229702.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022398.1 ; transcript_alias_1 ENST00000458525 ; transcript_alias_2 ENST00000458525.1 ; transcript_alias_3 RP1-274L7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058271.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT138520 ;
chrX	lncipedia.org	exon	129619545	129619605	.	-	.	gene_id lnc-GPR119-1 ; transcript_id lnc-GPR119-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229702 ; gene_alias_2 RP1-274L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229702.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022398.1 ; transcript_alias_1 ENST00000458525 ; transcript_alias_2 ENST00000458525.1 ; transcript_alias_3 RP1-274L7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058271.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT138520 ;
chrX	lncipedia.org	exon	129621440	129621531	.	-	.	gene_id lnc-GPR119-1 ; transcript_id lnc-GPR119-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229702 ; gene_alias_2 RP1-274L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229702.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022398.1 ; transcript_alias_1 ENST00000458525 ; transcript_alias_2 ENST00000458525.1 ; transcript_alias_3 RP1-274L7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058271.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT138520 ;
chrX	lncipedia.org	exon	129625306	129625428	.	-	.	gene_id lnc-GPR119-1 ; transcript_id lnc-GPR119-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229702 ; gene_alias_2 RP1-274L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229702.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022398.1 ; transcript_alias_1 ENST00000458525 ; transcript_alias_2 ENST00000458525.1 ; transcript_alias_3 RP1-274L7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058271.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT138520 ;
chrX	lncipedia.org	exon	129627709	129627804	.	-	.	gene_id lnc-GPR119-1 ; transcript_id lnc-GPR119-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229702 ; gene_alias_2 RP1-274L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229702.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022398.1 ; transcript_alias_1 ENST00000458525 ; transcript_alias_2 ENST00000458525.1 ; transcript_alias_3 RP1-274L7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058271.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT138520 ;
chrX	lncipedia.org	exon	129629103	129629180	.	-	.	gene_id lnc-GPR119-1 ; transcript_id lnc-GPR119-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229702 ; gene_alias_2 RP1-274L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229702.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022398.1 ; transcript_alias_1 ENST00000458525 ; transcript_alias_2 ENST00000458525.1 ; transcript_alias_3 RP1-274L7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058271.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT138520 ;
chrX	lncipedia.org	exon	129644389	129644815	.	-	.	gene_id lnc-GPR119-1 ; transcript_id lnc-GPR119-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229702 ; gene_alias_2 RP1-274L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229702.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022398.1 ; transcript_alias_1 ENST00000458525 ; transcript_alias_2 ENST00000458525.1 ; transcript_alias_3 RP1-274L7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058271.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT138520 ;
chrX	lncipedia.org	exon	129645263	129645362	.	-	.	gene_id lnc-GPR119-1 ; transcript_id lnc-GPR119-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229702 ; gene_alias_2 RP1-274L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229702.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022398.1 ; transcript_alias_1 ENST00000458525 ; transcript_alias_2 ENST00000458525.1 ; transcript_alias_3 RP1-274L7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058271.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT138520 ;
chrX	lncipedia.org	exon	129646340	129646453	.	-	.	gene_id lnc-GPR119-1 ; transcript_id lnc-GPR119-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229702 ; gene_alias_2 RP1-274L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229702.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022398.1 ; transcript_alias_1 ENST00000458525 ; transcript_alias_2 ENST00000458525.1 ; transcript_alias_3 RP1-274L7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058271.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT138520 ;
chrX	lncipedia.org	exon	129647700	129647776	.	-	.	gene_id lnc-GPR119-1 ; transcript_id lnc-GPR119-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229702 ; gene_alias_2 RP1-274L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229702.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022398.1 ; transcript_alias_1 ENST00000458525 ; transcript_alias_2 ENST00000458525.1 ; transcript_alias_3 RP1-274L7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058271.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT138520 ;
chrX	lncipedia.org	exon	129649734	129649823	.	-	.	gene_id lnc-GPR119-1 ; transcript_id lnc-GPR119-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229702 ; gene_alias_2 RP1-274L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229702.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022398.1 ; transcript_alias_1 ENST00000458525 ; transcript_alias_2 ENST00000458525.1 ; transcript_alias_3 RP1-274L7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058271.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT138520 ;
chrX	lncipedia.org	exon	129658025	129658231	.	-	.	gene_id lnc-GPR119-1 ; transcript_id lnc-GPR119-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229702 ; gene_alias_2 RP1-274L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229702.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022398.1 ; transcript_alias_1 ENST00000458525 ; transcript_alias_2 ENST00000458525.1 ; transcript_alias_3 RP1-274L7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058271.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT138520 ;
chr17	lncipedia.org	exon	48634535	48634819	.	-	.	gene_id lnc-CHAD-4 ; transcript_id lnc-CHAD-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000250107 ; gene_alias_2 RP11-94C24.10 ; gene_alias_3 ENSG00000250107.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162163.1 ; gene_alias_5 CACNA1G-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000508920 ; transcript_alias_2 ENST00000508920.1 ; transcript_alias_3 RP11-94C24.10-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000367678.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT054703 ;
chr17	lncipedia.org	exon	48636689	48636771	.	-	.	gene_id lnc-CHAD-4 ; transcript_id lnc-CHAD-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000250107 ; gene_alias_2 RP11-94C24.10 ; gene_alias_3 ENSG00000250107.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162163.1 ; gene_alias_5 CACNA1G-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000508920 ; transcript_alias_2 ENST00000508920.1 ; transcript_alias_3 RP11-94C24.10-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000367678.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT054703 ;
chr1	lncipedia.org	exon	2481359	2481558	.	-	.	gene_id lnc-HES5-1 ; transcript_id lnc-HES5-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000238164 ; gene_alias_2 RP3-395M20.8 ; gene_alias_3 ENSG00000238164.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000000818.3 ; transcript_alias_1 ENST00000416860 ; transcript_alias_2 ENST00000416860.2 ; transcript_alias_3 RP3-395M20.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000002185.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT000448 ;
chr1	lncipedia.org	exon	2483214	2484142	.	-	.	gene_id lnc-HES5-1 ; transcript_id lnc-HES5-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000238164 ; gene_alias_2 RP3-395M20.8 ; gene_alias_3 ENSG00000238164.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000000818.3 ; transcript_alias_1 ENST00000416860 ; transcript_alias_2 ENST00000416860.2 ; transcript_alias_3 RP3-395M20.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000002185.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT000448 ;
chr1	lncipedia.org	exon	2485065	2485253	.	-	.	gene_id lnc-HES5-1 ; transcript_id lnc-HES5-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000238164 ; gene_alias_2 RP3-395M20.8 ; gene_alias_3 ENSG00000238164.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000000818.3 ; transcript_alias_1 ENST00000416860 ; transcript_alias_2 ENST00000416860.2 ; transcript_alias_3 RP3-395M20.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000002185.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT000448 ;
chr1	lncipedia.org	exon	2485540	2485735	.	-	.	gene_id lnc-HES5-1 ; transcript_id lnc-HES5-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000238164 ; gene_alias_2 RP3-395M20.8 ; gene_alias_3 ENSG00000238164.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000000818.3 ; transcript_alias_1 ENST00000416860 ; transcript_alias_2 ENST00000416860.2 ; transcript_alias_3 RP3-395M20.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000002185.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT000448 ;
chr1	lncipedia.org	exon	2486163	2488135	.	-	.	gene_id lnc-HES5-1 ; transcript_id lnc-HES5-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000238164 ; gene_alias_2 RP3-395M20.8 ; gene_alias_3 ENSG00000238164.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000000818.3 ; transcript_alias_1 ENST00000416860 ; transcript_alias_2 ENST00000416860.2 ; transcript_alias_3 RP3-395M20.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000002185.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT000448 ;
chr1	lncipedia.org	exon	2488416	2488450	.	-	.	gene_id lnc-HES5-1 ; transcript_id lnc-HES5-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000238164 ; gene_alias_2 RP3-395M20.8 ; gene_alias_3 ENSG00000238164.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000000818.3 ; transcript_alias_1 ENST00000416860 ; transcript_alias_2 ENST00000416860.2 ; transcript_alias_3 RP3-395M20.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000002185.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT000448 ;
chr1	lncipedia.org	exon	9739858	9740176	.	-	.	gene_id lnc-C1orf200-1 ; transcript_id lnc-C1orf200-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231789 ; gene_alias_2 RP11-558F24.4 ; gene_alias_3 ENSG00000231789.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000001449.1 ; transcript_alias_1 ENST00000415330 ; transcript_alias_2 ENST00000415330.1 ; transcript_alias_3 RP11-558F24.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000004234.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT000816 ;
chr1	lncipedia.org	exon	9740770	9741193	.	-	.	gene_id lnc-C1orf200-1 ; transcript_id lnc-C1orf200-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231789 ; gene_alias_2 RP11-558F24.4 ; gene_alias_3 ENSG00000231789.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000001449.1 ; transcript_alias_1 ENST00000415330 ; transcript_alias_2 ENST00000415330.1 ; transcript_alias_3 RP11-558F24.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000004234.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT000816 ;
chr1	lncipedia.org	exon	9747393	9747632	.	-	.	gene_id lnc-C1orf200-1 ; transcript_id lnc-C1orf200-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231789 ; gene_alias_2 RP11-558F24.4 ; gene_alias_3 ENSG00000231789.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000001449.1 ; transcript_alias_1 ENST00000415330 ; transcript_alias_2 ENST00000415330.1 ; transcript_alias_3 RP11-558F24.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000004234.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT000816 ;
chr15	lncipedia.org	exon	83626882	83628060	.	-	.	gene_id lnc-C15orf40-2 ; transcript_id lnc-C15orf40-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245763 ; gene_alias_2 XLOC_011554 ; gene_alias_3 linc-HOMER2 ; gene_alias_4 AC022558.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500334 ; transcript_alias_2 TCONS_00023251 ; transcript_alias_3 NONHSAT047876 ;
chr15	lncipedia.org	exon	83654539	83654620	.	-	.	gene_id lnc-C15orf40-2 ; transcript_id lnc-C15orf40-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245763 ; gene_alias_2 XLOC_011554 ; gene_alias_3 linc-HOMER2 ; gene_alias_4 AC022558.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500334 ; transcript_alias_2 TCONS_00023251 ; transcript_alias_3 NONHSAT047876 ;
chr16	lncipedia.org	exon	65318927	65319342	.	-	.	gene_id lnc-CDH11-3 ; transcript_id lnc-CDH11-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000250685 ; gene_alias_2 XLOC_011977 ; gene_alias_3 linc-CDH11-7 ; gene_alias_4 ENSG00000261742.1 ; gene_alias_5 RP11-256I9.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000172812.2 ; gene_alias_7 LINC00922 ; transcript_alias_1 ENST00000502378 ; transcript_alias_2 TCONS_00024303 ; transcript_alias_3 ENST00000564041.1 ; transcript_alias_4 RP11-256I9.1-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000420602.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT142981 ;
chr16	lncipedia.org	exon	65345317	65345450	.	-	.	gene_id lnc-CDH11-3 ; transcript_id lnc-CDH11-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000250685 ; gene_alias_2 XLOC_011977 ; gene_alias_3 linc-CDH11-7 ; gene_alias_4 ENSG00000261742.1 ; gene_alias_5 RP11-256I9.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000172812.2 ; gene_alias_7 LINC00922 ; transcript_alias_1 ENST00000502378 ; transcript_alias_2 TCONS_00024303 ; transcript_alias_3 ENST00000564041.1 ; transcript_alias_4 RP11-256I9.1-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000420602.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT142981 ;
chr16	lncipedia.org	exon	65388146	65388204	.	-	.	gene_id lnc-CDH11-3 ; transcript_id lnc-CDH11-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000250685 ; gene_alias_2 XLOC_011977 ; gene_alias_3 linc-CDH11-7 ; gene_alias_4 ENSG00000261742.1 ; gene_alias_5 RP11-256I9.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000172812.2 ; gene_alias_7 LINC00922 ; transcript_alias_1 ENST00000502378 ; transcript_alias_2 TCONS_00024303 ; transcript_alias_3 ENST00000564041.1 ; transcript_alias_4 RP11-256I9.1-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000420602.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT142981 ;
chr16	lncipedia.org	exon	65390334	65390392	.	-	.	gene_id lnc-CDH11-3 ; transcript_id lnc-CDH11-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000250685 ; gene_alias_2 XLOC_011977 ; gene_alias_3 linc-CDH11-7 ; gene_alias_4 ENSG00000261742.1 ; gene_alias_5 RP11-256I9.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000172812.2 ; gene_alias_7 LINC00922 ; transcript_alias_1 ENST00000502378 ; transcript_alias_2 TCONS_00024303 ; transcript_alias_3 ENST00000564041.1 ; transcript_alias_4 RP11-256I9.1-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000420602.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT142981 ;
chr16	lncipedia.org	exon	65397114	65397194	.	-	.	gene_id lnc-CDH11-3 ; transcript_id lnc-CDH11-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000250685 ; gene_alias_2 XLOC_011977 ; gene_alias_3 linc-CDH11-7 ; gene_alias_4 ENSG00000261742.1 ; gene_alias_5 RP11-256I9.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000172812.2 ; gene_alias_7 LINC00922 ; transcript_alias_1 ENST00000502378 ; transcript_alias_2 TCONS_00024303 ; transcript_alias_3 ENST00000564041.1 ; transcript_alias_4 RP11-256I9.1-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000420602.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT142981 ;
chr16	lncipedia.org	exon	65397566	65397711	.	-	.	gene_id lnc-CDH11-3 ; transcript_id lnc-CDH11-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000250685 ; gene_alias_2 XLOC_011977 ; gene_alias_3 linc-CDH11-7 ; gene_alias_4 ENSG00000261742.1 ; gene_alias_5 RP11-256I9.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000172812.2 ; gene_alias_7 LINC00922 ; transcript_alias_1 ENST00000502378 ; transcript_alias_2 TCONS_00024303 ; transcript_alias_3 ENST00000564041.1 ; transcript_alias_4 RP11-256I9.1-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000420602.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT142981 ;
chr16	lncipedia.org	exon	65404939	65405107	.	-	.	gene_id lnc-CDH11-3 ; transcript_id lnc-CDH11-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000250685 ; gene_alias_2 XLOC_011977 ; gene_alias_3 linc-CDH11-7 ; gene_alias_4 ENSG00000261742.1 ; gene_alias_5 RP11-256I9.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000172812.2 ; gene_alias_7 LINC00922 ; transcript_alias_1 ENST00000502378 ; transcript_alias_2 TCONS_00024303 ; transcript_alias_3 ENST00000564041.1 ; transcript_alias_4 RP11-256I9.1-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000420602.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT142981 ;
chr16	lncipedia.org	exon	65406136	65406172	.	-	.	gene_id lnc-CDH11-3 ; transcript_id lnc-CDH11-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000250685 ; gene_alias_2 XLOC_011977 ; gene_alias_3 linc-CDH11-7 ; gene_alias_4 ENSG00000261742.1 ; gene_alias_5 RP11-256I9.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000172812.2 ; gene_alias_7 LINC00922 ; transcript_alias_1 ENST00000502378 ; transcript_alias_2 TCONS_00024303 ; transcript_alias_3 ENST00000564041.1 ; transcript_alias_4 RP11-256I9.1-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000420602.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT142981 ;
chr16	lncipedia.org	exon	65409107	65409229	.	-	.	gene_id lnc-CDH11-3 ; transcript_id lnc-CDH11-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000250685 ; gene_alias_2 XLOC_011977 ; gene_alias_3 linc-CDH11-7 ; gene_alias_4 ENSG00000261742.1 ; gene_alias_5 RP11-256I9.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000172812.2 ; gene_alias_7 LINC00922 ; transcript_alias_1 ENST00000502378 ; transcript_alias_2 TCONS_00024303 ; transcript_alias_3 ENST00000564041.1 ; transcript_alias_4 RP11-256I9.1-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000420602.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT142981 ;
chr16	lncipedia.org	exon	65605674	65605692	.	-	.	gene_id lnc-CDH11-3 ; transcript_id lnc-CDH11-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000250685 ; gene_alias_2 XLOC_011977 ; gene_alias_3 linc-CDH11-7 ; gene_alias_4 ENSG00000261742.1 ; gene_alias_5 RP11-256I9.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000172812.2 ; gene_alias_7 LINC00922 ; transcript_alias_1 ENST00000502378 ; transcript_alias_2 TCONS_00024303 ; transcript_alias_3 ENST00000564041.1 ; transcript_alias_4 RP11-256I9.1-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000420602.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT142981 ;
chr17	lncipedia.org	exon	7771136	7772886	.	-	.	gene_id lnc-LSMD1-1 ; transcript_id lnc-LSMD1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248291 ; transcript_alias_1 ENST00000507426 ;
chr17	lncipedia.org	exon	7775934	7777031	.	-	.	gene_id lnc-LSMD1-1 ; transcript_id lnc-LSMD1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248291 ; transcript_alias_1 ENST00000507426 ;
chr8	lncipedia.org	exon	102996660	102997604	.	+	.	gene_id lnc-GRHL2-4 ; transcript_id lnc-GRHL2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251530 ; gene_alias_2 AP001206.1 ; transcript_alias_1 ENST00000509445 ;
chr8	lncipedia.org	exon	102999429	103000167	.	+	.	gene_id lnc-GRHL2-4 ; transcript_id lnc-GRHL2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251530 ; gene_alias_2 AP001206.1 ; transcript_alias_1 ENST00000509445 ;
chr8	lncipedia.org	exon	103004263	103004433	.	+	.	gene_id lnc-GRHL2-4 ; transcript_id lnc-GRHL2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251530 ; gene_alias_2 AP001206.1 ; transcript_alias_1 ENST00000509445 ;
chr8	lncipedia.org	exon	103006411	103006905	.	+	.	gene_id lnc-GRHL2-4 ; transcript_id lnc-GRHL2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251530 ; gene_alias_2 AP001206.1 ; transcript_alias_1 ENST00000509445 ;
chr17	lncipedia.org	exon	34897582	34898296	.	-	.	gene_id lnc-MYO19-1 ; transcript_id lnc-MYO19-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245538 ; gene_alias_2 XLOC_012451 ; gene_alias_3 linc-MYO19-2 ; gene_alias_4 AC126327.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499603 ; transcript_alias_2 TCONS_00025223 ; transcript_alias_3 NONHSAT053231 ;
chr17	lncipedia.org	exon	34900029	34900678	.	-	.	gene_id lnc-MYO19-1 ; transcript_id lnc-MYO19-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245538 ; gene_alias_2 XLOC_012451 ; gene_alias_3 linc-MYO19-2 ; gene_alias_4 AC126327.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499603 ; transcript_alias_2 TCONS_00025223 ; transcript_alias_3 NONHSAT053231 ;
chr12	lncipedia.org	exon	111807086	111807124	.	+	.	gene_id lnc-SH2B3-1 ; transcript_id lnc-SH2B3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257595 ; gene_alias_2 RP3-473L9.4 ; gene_alias_3 ENSG00000257595.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169548.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548006 ; transcript_alias_2 ENST00000548006.1 ; transcript_alias_3 RP3-473L9.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404775.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030726 ;
chr12	lncipedia.org	exon	111809773	111809827	.	+	.	gene_id lnc-SH2B3-1 ; transcript_id lnc-SH2B3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257595 ; gene_alias_2 RP3-473L9.4 ; gene_alias_3 ENSG00000257595.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169548.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548006 ; transcript_alias_2 ENST00000548006.1 ; transcript_alias_3 RP3-473L9.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404775.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030726 ;
chr12	lncipedia.org	exon	111834635	111834903	.	+	.	gene_id lnc-SH2B3-1 ; transcript_id lnc-SH2B3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257595 ; gene_alias_2 RP3-473L9.4 ; gene_alias_3 ENSG00000257595.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169548.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548006 ; transcript_alias_2 ENST00000548006.1 ; transcript_alias_3 RP3-473L9.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404775.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030726 ;
chr12	lncipedia.org	exon	123736789	123737089	.	-	.	gene_id lnc-CDK2AP1-1 ; transcript_id lnc-CDK2AP1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000235423.4 ; gene_alias_2 RP11-282O18.3 ; transcript_alias_1 NONHSAT031572 ; transcript_alias_2 ENST00000541002.3 ;
chr12	lncipedia.org	exon	123743590	123743695	.	-	.	gene_id lnc-CDK2AP1-1 ; transcript_id lnc-CDK2AP1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000235423.4 ; gene_alias_2 RP11-282O18.3 ; transcript_alias_1 NONHSAT031572 ; transcript_alias_2 ENST00000541002.3 ;
chr12	lncipedia.org	exon	123744821	123745050	.	-	.	gene_id lnc-CDK2AP1-1 ; transcript_id lnc-CDK2AP1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000235423.4 ; gene_alias_2 RP11-282O18.3 ; transcript_alias_1 NONHSAT031572 ; transcript_alias_2 ENST00000541002.3 ;
chr12	lncipedia.org	exon	123745373	123745490	.	-	.	gene_id lnc-CDK2AP1-1 ; transcript_id lnc-CDK2AP1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000235423.4 ; gene_alias_2 RP11-282O18.3 ; transcript_alias_1 NONHSAT031572 ; transcript_alias_2 ENST00000541002.3 ;
chr12	lncipedia.org	exon	123745676	123746030	.	-	.	gene_id lnc-CDK2AP1-1 ; transcript_id lnc-CDK2AP1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000235423.4 ; gene_alias_2 RP11-282O18.3 ; transcript_alias_1 NONHSAT031572 ; transcript_alias_2 ENST00000541002.3 ;
chr7	lncipedia.org	exon	97937197	97938205	.	+	.	gene_id lnc-BRI3-1 ; transcript_id lnc-BRI3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229811 ; transcript_alias_1 ENST00000439540 ;
chr7	lncipedia.org	exon	97938682	97939753	.	+	.	gene_id lnc-BRI3-1 ; transcript_id lnc-BRI3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229811 ; transcript_alias_1 ENST00000439540 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127355012	127355105	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-11 ; transcript_id lnc-DHX37-11:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249873 ; gene_alias_2 RP11-983C2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000249873.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168453.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544727 ; transcript_alias_2 ENST00000544727.1 ; transcript_alias_3 RP11-983C2.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399785.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031834 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127357872	127358050	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-11 ; transcript_id lnc-DHX37-11:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249873 ; gene_alias_2 RP11-983C2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000249873.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168453.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544727 ; transcript_alias_2 ENST00000544727.1 ; transcript_alias_3 RP11-983C2.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399785.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031834 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127359003	127359211	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-11 ; transcript_id lnc-DHX37-11:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249873 ; gene_alias_2 RP11-983C2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000249873.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168453.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544727 ; transcript_alias_2 ENST00000544727.1 ; transcript_alias_3 RP11-983C2.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399785.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031834 ;
chr4	lncipedia.org	exon	7096298	7096470	.	-	.	gene_id lnc-GRPEL1-1 ; transcript_id lnc-GRPEL1-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000245562 ; gene_alias_2 XLOC_003872 ; gene_alias_3 linc-GRPEL1-1 ; gene_alias_4 RP11-367J11.3 ; gene_alias_5 ENSG00000245562.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000159980.1 ; gene_alias_7 ENSG00000245468.3 ; transcript_alias_1 ENST00000504402 ; transcript_alias_2 TCONS_00007714 ; transcript_alias_3 ENST00000504402.1 ; transcript_alias_4 RP11-367J11.3-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000358684.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	7099050	7099106	.	-	.	gene_id lnc-GRPEL1-1 ; transcript_id lnc-GRPEL1-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000245562 ; gene_alias_2 XLOC_003872 ; gene_alias_3 linc-GRPEL1-1 ; gene_alias_4 RP11-367J11.3 ; gene_alias_5 ENSG00000245562.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000159980.1 ; gene_alias_7 ENSG00000245468.3 ; transcript_alias_1 ENST00000504402 ; transcript_alias_2 TCONS_00007714 ; transcript_alias_3 ENST00000504402.1 ; transcript_alias_4 RP11-367J11.3-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000358684.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	7104995	7105056	.	-	.	gene_id lnc-GRPEL1-1 ; transcript_id lnc-GRPEL1-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000245562 ; gene_alias_2 XLOC_003872 ; gene_alias_3 linc-GRPEL1-1 ; gene_alias_4 RP11-367J11.3 ; gene_alias_5 ENSG00000245562.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000159980.1 ; gene_alias_7 ENSG00000245468.3 ; transcript_alias_1 ENST00000504402 ; transcript_alias_2 TCONS_00007714 ; transcript_alias_3 ENST00000504402.1 ; transcript_alias_4 RP11-367J11.3-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000358684.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	113518425	113518604	.	-	.	gene_id lnc-NAA50-3 ; transcript_id lnc-NAA50-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223613 ; transcript_alias_1 ENST00000425915 ;
chr3	lncipedia.org	exon	113529044	113529901	.	-	.	gene_id lnc-NAA50-3 ; transcript_id lnc-NAA50-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223613 ; transcript_alias_1 ENST00000425915 ;
chr5	lncipedia.org	exon	38559044	38559279	.	+	.	gene_id lnc-EGFLAM-2 ; transcript_id lnc-EGFLAM-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000244968 ; gene_alias_2 CTD-2196P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000244968.2 ; gene_alias_4 LIFR-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162109.1 ; transcript_alias_1 ENST00000514291 ; transcript_alias_2 ENST00000514291.1 ; transcript_alias_3 LIFR-AS1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000367343.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT101100 ;
chr5	lncipedia.org	exon	38579248	38579696	.	+	.	gene_id lnc-EGFLAM-2 ; transcript_id lnc-EGFLAM-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000244968 ; gene_alias_2 CTD-2196P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000244968.2 ; gene_alias_4 LIFR-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162109.1 ; transcript_alias_1 ENST00000514291 ; transcript_alias_2 ENST00000514291.1 ; transcript_alias_3 LIFR-AS1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000367343.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT101100 ;
chr4	lncipedia.org	exon	134061736	134061814	.	-	.	gene_id lnc-RP11-62N21.1.1-5 ; transcript_id lnc-RP11-62N21.1.1-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250241 ; gene_alias_2 RP11-9G1.3 ; gene_alias_3 ENSG00000250241.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161299.2 ; transcript_alias_1 ENST00000509715 ; transcript_alias_2 ENST00000509715.1 ; transcript_alias_3 RP11-9G1.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000367739.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT098346 ; transcript_alias_6 FPKM1_group_24124_transcript_1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	134063761	134063937	.	-	.	gene_id lnc-RP11-62N21.1.1-5 ; transcript_id lnc-RP11-62N21.1.1-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250241 ; gene_alias_2 RP11-9G1.3 ; gene_alias_3 ENSG00000250241.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161299.2 ; transcript_alias_1 ENST00000509715 ; transcript_alias_2 ENST00000509715.1 ; transcript_alias_3 RP11-9G1.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000367739.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT098346 ; transcript_alias_6 FPKM1_group_24124_transcript_1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	134066759	134066900	.	-	.	gene_id lnc-RP11-62N21.1.1-5 ; transcript_id lnc-RP11-62N21.1.1-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250241 ; gene_alias_2 RP11-9G1.3 ; gene_alias_3 ENSG00000250241.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161299.2 ; transcript_alias_1 ENST00000509715 ; transcript_alias_2 ENST00000509715.1 ; transcript_alias_3 RP11-9G1.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000367739.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT098346 ; transcript_alias_6 FPKM1_group_24124_transcript_1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	134068354	134068431	.	-	.	gene_id lnc-RP11-62N21.1.1-5 ; transcript_id lnc-RP11-62N21.1.1-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250241 ; gene_alias_2 RP11-9G1.3 ; gene_alias_3 ENSG00000250241.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161299.2 ; transcript_alias_1 ENST00000509715 ; transcript_alias_2 ENST00000509715.1 ; transcript_alias_3 RP11-9G1.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000367739.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT098346 ; transcript_alias_6 FPKM1_group_24124_transcript_1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	134070184	134070271	.	-	.	gene_id lnc-RP11-62N21.1.1-5 ; transcript_id lnc-RP11-62N21.1.1-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250241 ; gene_alias_2 RP11-9G1.3 ; gene_alias_3 ENSG00000250241.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161299.2 ; transcript_alias_1 ENST00000509715 ; transcript_alias_2 ENST00000509715.1 ; transcript_alias_3 RP11-9G1.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000367739.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT098346 ; transcript_alias_6 FPKM1_group_24124_transcript_1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	35568882	35571935	.	+	.	gene_id lnc-RP11-173D9.3.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-173D9.3.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247658 ; transcript_alias_1 ENST00000502168 ; transcript_alias_2 NONHSAT036362 ;
chr14	lncipedia.org	exon	35575573	35575690	.	+	.	gene_id lnc-RP11-173D9.3.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-173D9.3.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247658 ; transcript_alias_1 ENST00000502168 ; transcript_alias_2 NONHSAT036362 ;
chr14	lncipedia.org	exon	35579101	35579166	.	+	.	gene_id lnc-RP11-173D9.3.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-173D9.3.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247658 ; transcript_alias_1 ENST00000502168 ; transcript_alias_2 NONHSAT036362 ;
chr14	lncipedia.org	exon	35579776	35579932	.	+	.	gene_id lnc-RP11-173D9.3.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-173D9.3.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247658 ; transcript_alias_1 ENST00000502168 ; transcript_alias_2 NONHSAT036362 ;
chr5	lncipedia.org	exon	176865504	176865871	.	-	.	gene_id lnc-DBN1-2 ; transcript_id lnc-DBN1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246334 ; gene_alias_2 RP11-1334A24.4 ; gene_alias_3 ENSG00000246334.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163400.1 ; gene_alias_5 PRR7-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000425316 ; transcript_alias_2 ENST00000425316.3 ; transcript_alias_3 RP11-1334A24.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000373186.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	176866915	176867032	.	-	.	gene_id lnc-DBN1-2 ; transcript_id lnc-DBN1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246334 ; gene_alias_2 RP11-1334A24.4 ; gene_alias_3 ENSG00000246334.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163400.1 ; gene_alias_5 PRR7-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000425316 ; transcript_alias_2 ENST00000425316.3 ; transcript_alias_3 RP11-1334A24.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000373186.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	176871397	176871595	.	-	.	gene_id lnc-DBN1-2 ; transcript_id lnc-DBN1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246334 ; gene_alias_2 RP11-1334A24.4 ; gene_alias_3 ENSG00000246334.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163400.1 ; gene_alias_5 PRR7-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000425316 ; transcript_alias_2 ENST00000425316.3 ; transcript_alias_3 RP11-1334A24.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000373186.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	176874645	176874700	.	-	.	gene_id lnc-DBN1-2 ; transcript_id lnc-DBN1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246334 ; gene_alias_2 RP11-1334A24.4 ; gene_alias_3 ENSG00000246334.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163400.1 ; gene_alias_5 PRR7-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000425316 ; transcript_alias_2 ENST00000425316.3 ; transcript_alias_3 RP11-1334A24.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000373186.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	13001082	13002546	.	-	.	gene_id lnc-BTBD10-3 ; transcript_id lnc-BTBD10-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251381 ; gene_alias_2 XLOC_009378 ; gene_alias_3 linc-DKK3-3 ; gene_alias_4 CTC-497E21.4 ; gene_alias_5 ENSG00000251381.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000165904.2 ; gene_alias_7 LINC00958 ; transcript_alias_1 ENST00000504230 ; transcript_alias_2 TCONS_00019119 ; transcript_alias_3 ENST00000504230.2 ; transcript_alias_4 CTC-497E21.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000386997.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	13011003	13011095	.	-	.	gene_id lnc-BTBD10-3 ; transcript_id lnc-BTBD10-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251381 ; gene_alias_2 XLOC_009378 ; gene_alias_3 linc-DKK3-3 ; gene_alias_4 CTC-497E21.4 ; gene_alias_5 ENSG00000251381.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000165904.2 ; gene_alias_7 LINC00958 ; transcript_alias_1 ENST00000504230 ; transcript_alias_2 TCONS_00019119 ; transcript_alias_3 ENST00000504230.2 ; transcript_alias_4 CTC-497E21.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000386997.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	190742635	190742819	.	-	.	gene_id lnc-FRG2-2 ; transcript_id lnc-FRG2-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000245685 ; gene_alias_2 AF146191.4 ; gene_alias_3 ENSG00000245685.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160585.3 ; transcript_alias_1 ENST00000508156 ; transcript_alias_2 ENST00000508156.1 ; transcript_alias_3 AF146191.4-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000361303.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099801 ;
chr4	lncipedia.org	exon	190816687	190816798	.	-	.	gene_id lnc-FRG2-2 ; transcript_id lnc-FRG2-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000245685 ; gene_alias_2 AF146191.4 ; gene_alias_3 ENSG00000245685.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160585.3 ; transcript_alias_1 ENST00000508156 ; transcript_alias_2 ENST00000508156.1 ; transcript_alias_3 AF146191.4-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000361303.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099801 ;
chr4	lncipedia.org	exon	190858352	190858488	.	-	.	gene_id lnc-FRG2-2 ; transcript_id lnc-FRG2-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000245685 ; gene_alias_2 AF146191.4 ; gene_alias_3 ENSG00000245685.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160585.3 ; transcript_alias_1 ENST00000508156 ; transcript_alias_2 ENST00000508156.1 ; transcript_alias_3 AF146191.4-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000361303.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099801 ;
chr4	lncipedia.org	exon	190860814	190860896	.	-	.	gene_id lnc-FRG2-2 ; transcript_id lnc-FRG2-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000245685 ; gene_alias_2 AF146191.4 ; gene_alias_3 ENSG00000245685.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160585.3 ; transcript_alias_1 ENST00000508156 ; transcript_alias_2 ENST00000508156.1 ; transcript_alias_3 AF146191.4-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000361303.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099801 ;
chrX	lncipedia.org	exon	46404928	46405062	.	+	.	gene_id lnc-CHST7-1 ; transcript_id lnc-CHST7-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230844 ; gene_alias_2 RP1-71L16.2 ; gene_alias_3 ENSG00000230844.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021424.1 ; transcript_alias_1 ENST00000421685 ; transcript_alias_2 ENST00000421685.1 ; transcript_alias_3 RP1-71L16.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000056363.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	46405901	46407671	.	+	.	gene_id lnc-CHST7-1 ; transcript_id lnc-CHST7-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230844 ; gene_alias_2 RP1-71L16.2 ; gene_alias_3 ENSG00000230844.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021424.1 ; transcript_alias_1 ENST00000421685 ; transcript_alias_2 ENST00000421685.1 ; transcript_alias_3 RP1-71L16.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000056363.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	72647288	72652020	.	-	.	gene_id lnc-ZFC3H1-6 ; transcript_id lnc-ZFC3H1-6:6 ; gene_alias_1 ENSG00000236333 ; gene_alias_2 AC087886.1 ; gene_alias_3 ENSG00000236333.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150370.2 ; gene_alias_5 ENSG00000236333.3 ; gene_alias_6 TRHDE-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000549957 ; transcript_alias_2 ENST00000549957.1 ; transcript_alias_3 AC087886.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405386.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029459 ;
chr12	lncipedia.org	exon	93397191	93397749	.	+	.	gene_id lnc-RP11-511B23.3.1-3 ; transcript_id lnc-RP11-511B23.3.1-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000257345 ; gene_alias_2 RP11-511B23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257345.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170111.1 ; gene_alias_5 ENSG00000257345.2 ; transcript_alias_1 ENST00000549914 ; transcript_alias_2 ENST00000549914.1 ; transcript_alias_3 RP11-511B23.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407310.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029906 ;
chr12	lncipedia.org	exon	93399870	93400033	.	+	.	gene_id lnc-RP11-511B23.3.1-3 ; transcript_id lnc-RP11-511B23.3.1-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000257345 ; gene_alias_2 RP11-511B23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257345.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170111.1 ; gene_alias_5 ENSG00000257345.2 ; transcript_alias_1 ENST00000549914 ; transcript_alias_2 ENST00000549914.1 ; transcript_alias_3 RP11-511B23.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407310.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029906 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27043192	27043304	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 MIAT ; gene_alias_5 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000430483 ; transcript_alias_2 TCONS_00029376 ; transcript_alias_3 ENST00000430483.1 ; transcript_alias_4 MIAT-009 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320804.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084510 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27056663	27056780	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 MIAT ; gene_alias_5 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000430483 ; transcript_alias_2 TCONS_00029376 ; transcript_alias_3 ENST00000430483.1 ; transcript_alias_4 MIAT-009 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320804.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084510 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27059280	27059362	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 MIAT ; gene_alias_5 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000430483 ; transcript_alias_2 TCONS_00029376 ; transcript_alias_3 ENST00000430483.1 ; transcript_alias_4 MIAT-009 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320804.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084510 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27061495	27061773	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 MIAT ; gene_alias_5 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000430483 ; transcript_alias_2 TCONS_00029376 ; transcript_alias_3 ENST00000430483.1 ; transcript_alias_4 MIAT-009 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320804.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084510 ;
chr15	lncipedia.org	exon	52205351	52206647	.	+	.	gene_id lnc-MAPK6-3 ; transcript_id lnc-MAPK6-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248241 ; transcript_alias_1 ENST00000503512 ;
chr15	lncipedia.org	exon	52207144	52207919	.	+	.	gene_id lnc-MAPK6-3 ; transcript_id lnc-MAPK6-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248241 ; transcript_alias_1 ENST00000503512 ;
chr15	lncipedia.org	exon	62488373	62488963	.	-	.	gene_id lnc-C2CD4B-2 ; transcript_id lnc-C2CD4B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250975 ; transcript_alias_1 ENST00000514405 ;
chr15	lncipedia.org	exon	62489130	62489245	.	-	.	gene_id lnc-C2CD4B-2 ; transcript_id lnc-C2CD4B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250975 ; transcript_alias_1 ENST00000514405 ;
chr15	lncipedia.org	exon	62491003	62491073	.	-	.	gene_id lnc-C2CD4B-2 ; transcript_id lnc-C2CD4B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250975 ; transcript_alias_1 ENST00000514405 ;
chr15	lncipedia.org	exon	62493956	62495517	.	-	.	gene_id lnc-C2CD4B-2 ; transcript_id lnc-C2CD4B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250975 ; transcript_alias_1 ENST00000514405 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47602203	47604544	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500365 ; transcript_alias_2 ENST00000500365.2 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405097.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47609948	47610047	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500365 ; transcript_alias_2 ENST00000500365.2 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405097.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47610167	47610218	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500365 ; transcript_alias_2 ENST00000500365.2 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405097.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	125226304	125227028	.	+	.	gene_id lnc-OR1J2-2 ; transcript_id lnc-OR1J2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248142 ; gene_alias_2 AL359636.1 ; transcript_alias_1 ENST00000509547 ; transcript_alias_2 NONHSAT134585 ;
chr9	lncipedia.org	exon	125230840	125231465	.	+	.	gene_id lnc-OR1J2-2 ; transcript_id lnc-OR1J2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248142 ; gene_alias_2 AL359636.1 ; transcript_alias_1 ENST00000509547 ; transcript_alias_2 NONHSAT134585 ;
chr11	lncipedia.org	exon	68638132	68638383	.	+	.	gene_id lnc-IGHMBP2-1 ; transcript_id lnc-IGHMBP2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250508 ; gene_alias_2 XLOC_009186 ; gene_alias_3 linc-IGHMBP2 ; gene_alias_4 AP000808.1 ; gene_alias_5 ENSG00000250508.1 ; gene_alias_6 RP11-757G1.6 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000173014.1 ; transcript_alias_1 ENST00000512200 ; transcript_alias_2 TCONS_00019150 ; transcript_alias_3 ENST00000512200.1 ; transcript_alias_4 RP11-757G1.6-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000421713.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT022548 ;
chr11	lncipedia.org	exon	68639011	68642010	.	+	.	gene_id lnc-IGHMBP2-1 ; transcript_id lnc-IGHMBP2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250508 ; gene_alias_2 XLOC_009186 ; gene_alias_3 linc-IGHMBP2 ; gene_alias_4 AP000808.1 ; gene_alias_5 ENSG00000250508.1 ; gene_alias_6 RP11-757G1.6 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000173014.1 ; transcript_alias_1 ENST00000512200 ; transcript_alias_2 TCONS_00019150 ; transcript_alias_3 ENST00000512200.1 ; transcript_alias_4 RP11-757G1.6-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000421713.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT022548 ;
chr12	lncipedia.org	exon	93936240	93937081	.	-	.	gene_id lnc-UBE2N-2 ; transcript_id lnc-UBE2N-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000246985 ; gene_alias_2 RP11-887P2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246985.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170159.1 ; gene_alias_5 ENSG00000246985.3 ; gene_alias_6 SOCS2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500986 ; transcript_alias_2 ENST00000500986.1 ; transcript_alias_3 RP11-887P2.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407727.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029954 ;
chr12	lncipedia.org	exon	93938847	93939134	.	-	.	gene_id lnc-UBE2N-2 ; transcript_id lnc-UBE2N-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000246985 ; gene_alias_2 RP11-887P2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246985.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170159.1 ; gene_alias_5 ENSG00000246985.3 ; gene_alias_6 SOCS2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500986 ; transcript_alias_2 ENST00000500986.1 ; transcript_alias_3 RP11-887P2.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407727.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029954 ;
chr12	lncipedia.org	exon	93960520	93960746	.	-	.	gene_id lnc-UBE2N-2 ; transcript_id lnc-UBE2N-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000246985 ; gene_alias_2 RP11-887P2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246985.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170159.1 ; gene_alias_5 ENSG00000246985.3 ; gene_alias_6 SOCS2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500986 ; transcript_alias_2 ENST00000500986.1 ; transcript_alias_3 RP11-887P2.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407727.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029954 ;
chr12	lncipedia.org	exon	93960840	93960935	.	-	.	gene_id lnc-UBE2N-2 ; transcript_id lnc-UBE2N-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000246985 ; gene_alias_2 RP11-887P2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246985.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170159.1 ; gene_alias_5 ENSG00000246985.3 ; gene_alias_6 SOCS2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500986 ; transcript_alias_2 ENST00000500986.1 ; transcript_alias_3 RP11-887P2.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407727.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029954 ;
chr12	lncipedia.org	exon	93965343	93965544	.	-	.	gene_id lnc-UBE2N-2 ; transcript_id lnc-UBE2N-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000246985 ; gene_alias_2 RP11-887P2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246985.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170159.1 ; gene_alias_5 ENSG00000246985.3 ; gene_alias_6 SOCS2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500986 ; transcript_alias_2 ENST00000500986.1 ; transcript_alias_3 RP11-887P2.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407727.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029954 ;
chr10	lncipedia.org	exon	1205708	1205930	.	+	.	gene_id lnc-WDR37-1 ; transcript_id lnc-WDR37-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229205 ; gene_alias_2 XLOC_008338 ; gene_alias_3 linc-PFKP-7 ; gene_alias_4 NCRNA00200 ; gene_alias_5 ENSG00000229205.2 ; gene_alias_6 LINC00200 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000017539.3 ; transcript_alias_1 ENST00000425630 ; transcript_alias_2 TCONS_00017666 ; transcript_alias_3 ENST00000425630.1 ; transcript_alias_4 LINC00200-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000046417.2 ; transcript_alias_6 NONHSAT010909 ; transcript_alias_7 NR_015376 ;
chr10	lncipedia.org	exon	1206493	1206577	.	+	.	gene_id lnc-WDR37-1 ; transcript_id lnc-WDR37-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229205 ; gene_alias_2 XLOC_008338 ; gene_alias_3 linc-PFKP-7 ; gene_alias_4 NCRNA00200 ; gene_alias_5 ENSG00000229205.2 ; gene_alias_6 LINC00200 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000017539.3 ; transcript_alias_1 ENST00000425630 ; transcript_alias_2 TCONS_00017666 ; transcript_alias_3 ENST00000425630.1 ; transcript_alias_4 LINC00200-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000046417.2 ; transcript_alias_6 NONHSAT010909 ; transcript_alias_7 NR_015376 ;
chr10	lncipedia.org	exon	1208487	1210612	.	+	.	gene_id lnc-WDR37-1 ; transcript_id lnc-WDR37-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229205 ; gene_alias_2 XLOC_008338 ; gene_alias_3 linc-PFKP-7 ; gene_alias_4 NCRNA00200 ; gene_alias_5 ENSG00000229205.2 ; gene_alias_6 LINC00200 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000017539.3 ; transcript_alias_1 ENST00000425630 ; transcript_alias_2 TCONS_00017666 ; transcript_alias_3 ENST00000425630.1 ; transcript_alias_4 LINC00200-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000046417.2 ; transcript_alias_6 NONHSAT010909 ; transcript_alias_7 NR_015376 ;
chr11	lncipedia.org	exon	68779899	68780016	.	+	.	gene_id lnc-TPCN2-2 ; transcript_id lnc-TPCN2-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000256508 ; gene_alias_2 AP003071.1 ; transcript_alias_1 ENST00000538407 ;
chr11	lncipedia.org	exon	68781259	68781372	.	+	.	gene_id lnc-TPCN2-2 ; transcript_id lnc-TPCN2-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000256508 ; gene_alias_2 AP003071.1 ; transcript_alias_1 ENST00000538407 ;
chr11	lncipedia.org	exon	68781599	68781784	.	+	.	gene_id lnc-TPCN2-2 ; transcript_id lnc-TPCN2-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000256508 ; gene_alias_2 AP003071.1 ; transcript_alias_1 ENST00000538407 ;
chr11	lncipedia.org	exon	68781909	68782059	.	+	.	gene_id lnc-TPCN2-2 ; transcript_id lnc-TPCN2-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000256508 ; gene_alias_2 AP003071.1 ; transcript_alias_1 ENST00000538407 ;
chr11	lncipedia.org	exon	68783079	68783187	.	+	.	gene_id lnc-TPCN2-2 ; transcript_id lnc-TPCN2-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000256508 ; gene_alias_2 AP003071.1 ; transcript_alias_1 ENST00000538407 ;
chr11	lncipedia.org	exon	68785104	68785913	.	+	.	gene_id lnc-TPCN2-2 ; transcript_id lnc-TPCN2-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000256508 ; gene_alias_2 AP003071.1 ; transcript_alias_1 ENST00000538407 ;
chr10	lncipedia.org	exon	118918167	118920351	.	-	.	gene_id lnc-VAX1-1 ; transcript_id lnc-VAX1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234474 ; gene_alias_2 XLOC_008959 ; gene_alias_3 linc-VAX1-2 ; gene_alias_4 RP11-501J20.2 ; gene_alias_5 ENSG00000234474.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000019116.1 ; transcript_alias_1 ENST00000419373 ; transcript_alias_2 TCONS_00018052 ; transcript_alias_3 ENST00000419373.1 ; transcript_alias_4 RP11-501J20.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000050558.1 ; transcript_alias_6 NR_121650 ;
chr10	lncipedia.org	exon	118928371	118928566	.	-	.	gene_id lnc-VAX1-1 ; transcript_id lnc-VAX1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234474 ; gene_alias_2 XLOC_008959 ; gene_alias_3 linc-VAX1-2 ; gene_alias_4 RP11-501J20.2 ; gene_alias_5 ENSG00000234474.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000019116.1 ; transcript_alias_1 ENST00000419373 ; transcript_alias_2 TCONS_00018052 ; transcript_alias_3 ENST00000419373.1 ; transcript_alias_4 RP11-501J20.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000050558.1 ; transcript_alias_6 NR_121650 ;
chr20	lncipedia.org	exon	10084789	10085042	.	-	.	gene_id lnc-MKKS-3 ; transcript_id lnc-MKKS-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000227906 ; gene_alias_2 RP5-839B4.7 ; gene_alias_3 ENSG00000227906.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031867.1 ; gene_alias_5 ENSG00000227906.3 ; gene_alias_6 SNAP25-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000451151 ; transcript_alias_2 ENST00000451151.1 ; transcript_alias_3 RP5-839B4.7-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000077990.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT078577 ;
chr20	lncipedia.org	exon	10177466	10177585	.	-	.	gene_id lnc-MKKS-3 ; transcript_id lnc-MKKS-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000227906 ; gene_alias_2 RP5-839B4.7 ; gene_alias_3 ENSG00000227906.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031867.1 ; gene_alias_5 ENSG00000227906.3 ; gene_alias_6 SNAP25-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000451151 ; transcript_alias_2 ENST00000451151.1 ; transcript_alias_3 RP5-839B4.7-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000077990.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT078577 ;
chr20	lncipedia.org	exon	10199885	10199963	.	-	.	gene_id lnc-MKKS-3 ; transcript_id lnc-MKKS-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000227906 ; gene_alias_2 RP5-839B4.7 ; gene_alias_3 ENSG00000227906.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031867.1 ; gene_alias_5 ENSG00000227906.3 ; gene_alias_6 SNAP25-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000451151 ; transcript_alias_2 ENST00000451151.1 ; transcript_alias_3 RP5-839B4.7-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000077990.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT078577 ;
chr1	lncipedia.org	exon	91297082	91297753	.	-	.	gene_id lnc-ZNF644-1 ; transcript_id lnc-ZNF644-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000233593 ; gene_alias_2 RP4-665J23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233593.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000010018.1 ; transcript_alias_1 ENST00000435649 ; transcript_alias_2 ENST00000435649.1 ; transcript_alias_3 RP4-665J23.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000027725.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	91317040	91317175	.	-	.	gene_id lnc-ZNF644-1 ; transcript_id lnc-ZNF644-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000233593 ; gene_alias_2 RP4-665J23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233593.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000010018.1 ; transcript_alias_1 ENST00000435649 ; transcript_alias_2 ENST00000435649.1 ; transcript_alias_3 RP4-665J23.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000027725.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	209602165	209605170	.	+	.	gene_id lnc-CAMK1G-1 ; transcript_id lnc-CAMK1G-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000230937 ; gene_alias_2 CTA-55I10.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230937.3 ; gene_alias_4 MIR205HG ; gene_alias_5 OTTHUMG00000036267.3 ; gene_alias_6 ENSG00000230937.5 ; transcript_alias_1 ENST00000433108 ; transcript_alias_2 ENST00000433108.1 ; transcript_alias_3 MIR205HG-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000088231.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT009207 ;
chr1	lncipedia.org	exon	209605549	209605890	.	+	.	gene_id lnc-CAMK1G-1 ; transcript_id lnc-CAMK1G-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000230937 ; gene_alias_2 CTA-55I10.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230937.3 ; gene_alias_4 MIR205HG ; gene_alias_5 OTTHUMG00000036267.3 ; gene_alias_6 ENSG00000230937.5 ; transcript_alias_1 ENST00000433108 ; transcript_alias_2 ENST00000433108.1 ; transcript_alias_3 MIR205HG-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000088231.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT009207 ;
chr5	lncipedia.org	exon	139483418	139483751	.	-	.	gene_id lnc-NRG2-1 ; transcript_id lnc-NRG2-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000245146 ; gene_alias_2 CTB-131B5.4 ; gene_alias_3 ENSG00000245146.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163537.2 ; gene_alias_5 LINC01024 ; transcript_alias_1 ENST00000522747 ; transcript_alias_2 ENST00000522747.1 ; transcript_alias_3 CTB-131B5.4-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000374059.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	139485172	139485347	.	-	.	gene_id lnc-NRG2-1 ; transcript_id lnc-NRG2-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000245146 ; gene_alias_2 CTB-131B5.4 ; gene_alias_3 ENSG00000245146.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163537.2 ; gene_alias_5 LINC01024 ; transcript_alias_1 ENST00000522747 ; transcript_alias_2 ENST00000522747.1 ; transcript_alias_3 CTB-131B5.4-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000374059.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	139485881	139486046	.	-	.	gene_id lnc-NRG2-1 ; transcript_id lnc-NRG2-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000245146 ; gene_alias_2 CTB-131B5.4 ; gene_alias_3 ENSG00000245146.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163537.2 ; gene_alias_5 LINC01024 ; transcript_alias_1 ENST00000522747 ; transcript_alias_2 ENST00000522747.1 ; transcript_alias_3 CTB-131B5.4-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000374059.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	139486684	139487051	.	-	.	gene_id lnc-NRG2-1 ; transcript_id lnc-NRG2-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000245146 ; gene_alias_2 CTB-131B5.4 ; gene_alias_3 ENSG00000245146.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163537.2 ; gene_alias_5 LINC01024 ; transcript_alias_1 ENST00000522747 ; transcript_alias_2 ENST00000522747.1 ; transcript_alias_3 CTB-131B5.4-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000374059.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	68383236	68383359	.	+	.	gene_id lnc-DYRK2-4 ; transcript_id lnc-DYRK2-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000255733 ; gene_alias_2 GS1-410F4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000255733.1 ; gene_alias_4 IFNG-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000169108.1 ; transcript_alias_1 ENST00000541715 ; transcript_alias_2 ENST00000541715.1 ; transcript_alias_3 IFNG-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402295.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029278 ;
chr12	lncipedia.org	exon	68389721	68389853	.	+	.	gene_id lnc-DYRK2-4 ; transcript_id lnc-DYRK2-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000255733 ; gene_alias_2 GS1-410F4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000255733.1 ; gene_alias_4 IFNG-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000169108.1 ; transcript_alias_1 ENST00000541715 ; transcript_alias_2 ENST00000541715.1 ; transcript_alias_3 IFNG-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402295.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029278 ;
chr12	lncipedia.org	exon	68399870	68399926	.	+	.	gene_id lnc-DYRK2-4 ; transcript_id lnc-DYRK2-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000255733 ; gene_alias_2 GS1-410F4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000255733.1 ; gene_alias_4 IFNG-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000169108.1 ; transcript_alias_1 ENST00000541715 ; transcript_alias_2 ENST00000541715.1 ; transcript_alias_3 IFNG-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402295.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029278 ;
chr12	lncipedia.org	exon	68407311	68407428	.	+	.	gene_id lnc-DYRK2-4 ; transcript_id lnc-DYRK2-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000255733 ; gene_alias_2 GS1-410F4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000255733.1 ; gene_alias_4 IFNG-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000169108.1 ; transcript_alias_1 ENST00000541715 ; transcript_alias_2 ENST00000541715.1 ; transcript_alias_3 IFNG-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402295.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029278 ;
chr12	lncipedia.org	exon	68413642	68414111	.	+	.	gene_id lnc-DYRK2-4 ; transcript_id lnc-DYRK2-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000255733 ; gene_alias_2 GS1-410F4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000255733.1 ; gene_alias_4 IFNG-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000169108.1 ; transcript_alias_1 ENST00000541715 ; transcript_alias_2 ENST00000541715.1 ; transcript_alias_3 IFNG-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402295.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029278 ;
chr10	lncipedia.org	exon	7527347	7527611	.	+	.	gene_id lnc-ITIH2-3 ; transcript_id lnc-ITIH2-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256497 ; gene_alias_2 AL139125.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535221 ; transcript_alias_2 NONHSAT011284 ;
chr10	lncipedia.org	exon	7530498	7530643	.	+	.	gene_id lnc-ITIH2-3 ; transcript_id lnc-ITIH2-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256497 ; gene_alias_2 AL139125.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535221 ; transcript_alias_2 NONHSAT011284 ;
chr10	lncipedia.org	exon	7533656	7534658	.	+	.	gene_id lnc-ITIH2-3 ; transcript_id lnc-ITIH2-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256497 ; gene_alias_2 AL139125.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535221 ; transcript_alias_2 NONHSAT011284 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114292659	114292939	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:5 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000521888 ; transcript_alias_2 ENST00000521888.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-016 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379845.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114589 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114313057	114313351	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:5 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000521888 ; transcript_alias_2 ENST00000521888.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-016 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379845.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114589 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114314507	114314520	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:5 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000521888 ; transcript_alias_2 ENST00000521888.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-016 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379845.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114589 ;
chr15	lncipedia.org	exon	37090798	37092029	.	-	.	gene_id lnc-MEIS2-2 ; transcript_id lnc-MEIS2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223518 ; gene_alias_2 AC019016.1 ; transcript_alias_1 ENST00000430593 ;
chr15	lncipedia.org	exon	37096779	37096847	.	-	.	gene_id lnc-MEIS2-2 ; transcript_id lnc-MEIS2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223518 ; gene_alias_2 AC019016.1 ; transcript_alias_1 ENST00000430593 ;
chr15	lncipedia.org	exon	37109378	37109489	.	-	.	gene_id lnc-MEIS2-2 ; transcript_id lnc-MEIS2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223518 ; gene_alias_2 AC019016.1 ; transcript_alias_1 ENST00000430593 ;
chr15	lncipedia.org	exon	37110137	37110707	.	-	.	gene_id lnc-MEIS2-2 ; transcript_id lnc-MEIS2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223518 ; gene_alias_2 AC019016.1 ; transcript_alias_1 ENST00000430593 ;
chr6	lncipedia.org	exon	147182942	147183155	.	-	.	gene_id lnc-SHPRH-2 ; transcript_id lnc-SHPRH-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000233452 ; gene_alias_2 RP11-497D6.4 ; gene_alias_3 ENSG00000233452.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015762.3 ; gene_alias_5 ENSG00000233452.2 ; gene_alias_6 STXBP5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000458125 ; transcript_alias_2 ENST00000458125.1 ; transcript_alias_3 RP11-497D6.4-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000042595.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT115440 ;
chr6	lncipedia.org	exon	147185606	147185738	.	-	.	gene_id lnc-SHPRH-2 ; transcript_id lnc-SHPRH-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000233452 ; gene_alias_2 RP11-497D6.4 ; gene_alias_3 ENSG00000233452.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015762.3 ; gene_alias_5 ENSG00000233452.2 ; gene_alias_6 STXBP5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000458125 ; transcript_alias_2 ENST00000458125.1 ; transcript_alias_3 RP11-497D6.4-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000042595.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT115440 ;
chr6	lncipedia.org	exon	147293181	147293206	.	-	.	gene_id lnc-SHPRH-2 ; transcript_id lnc-SHPRH-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000233452 ; gene_alias_2 RP11-497D6.4 ; gene_alias_3 ENSG00000233452.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015762.3 ; gene_alias_5 ENSG00000233452.2 ; gene_alias_6 STXBP5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000458125 ; transcript_alias_2 ENST00000458125.1 ; transcript_alias_3 RP11-497D6.4-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000042595.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT115440 ;
chr6	lncipedia.org	exon	147322577	147322679	.	-	.	gene_id lnc-SHPRH-2 ; transcript_id lnc-SHPRH-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000233452 ; gene_alias_2 RP11-497D6.4 ; gene_alias_3 ENSG00000233452.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015762.3 ; gene_alias_5 ENSG00000233452.2 ; gene_alias_6 STXBP5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000458125 ; transcript_alias_2 ENST00000458125.1 ; transcript_alias_3 RP11-497D6.4-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000042595.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT115440 ;
chr6	lncipedia.org	exon	147395941	147395983	.	-	.	gene_id lnc-SHPRH-2 ; transcript_id lnc-SHPRH-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000233452 ; gene_alias_2 RP11-497D6.4 ; gene_alias_3 ENSG00000233452.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015762.3 ; gene_alias_5 ENSG00000233452.2 ; gene_alias_6 STXBP5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000458125 ; transcript_alias_2 ENST00000458125.1 ; transcript_alias_3 RP11-497D6.4-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000042595.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT115440 ;
chr6	lncipedia.org	exon	147440553	147440599	.	-	.	gene_id lnc-SHPRH-2 ; transcript_id lnc-SHPRH-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000233452 ; gene_alias_2 RP11-497D6.4 ; gene_alias_3 ENSG00000233452.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015762.3 ; gene_alias_5 ENSG00000233452.2 ; gene_alias_6 STXBP5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000458125 ; transcript_alias_2 ENST00000458125.1 ; transcript_alias_3 RP11-497D6.4-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000042595.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT115440 ;
chr19	lncipedia.org	exon	24101883	24103000	.	-	.	gene_id lnc-ZNF681-2 ; transcript_id lnc-ZNF681-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000104777 ; gene_alias_2 ENSG00000269289.1 ; gene_alias_3 CTB-92J24.3 ; transcript_alias_1 ENST00000300996 ; transcript_alias_2 NONHSAT063943 ; transcript_alias_3 ENST00000596326.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	24134972	24135238	.	-	.	gene_id lnc-ZNF681-2 ; transcript_id lnc-ZNF681-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000104777 ; gene_alias_2 ENSG00000269289.1 ; gene_alias_3 CTB-92J24.3 ; transcript_alias_1 ENST00000300996 ; transcript_alias_2 NONHSAT063943 ; transcript_alias_3 ENST00000596326.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	24140533	24140732	.	-	.	gene_id lnc-ZNF681-2 ; transcript_id lnc-ZNF681-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000104777 ; gene_alias_2 ENSG00000269289.1 ; gene_alias_3 CTB-92J24.3 ; transcript_alias_1 ENST00000300996 ; transcript_alias_2 NONHSAT063943 ; transcript_alias_3 ENST00000596326.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	179278750	179278840	.	+	.	gene_id lnc-OSBPL6-2 ; transcript_id lnc-OSBPL6-2:7 ; gene_alias_1 ENSG00000223960 ; gene_alias_2 AC009948.5 ; gene_alias_3 ENSG00000223960.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154423.1 ; gene_alias_5 ENSG00000223960.2 ; transcript_alias_1 ENST00000415236 ; transcript_alias_2 ENST00000415236.1 ; transcript_alias_3 AC009948.5-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000335156.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075753 ;
chr2	lncipedia.org	exon	179291093	179291430	.	+	.	gene_id lnc-OSBPL6-2 ; transcript_id lnc-OSBPL6-2:7 ; gene_alias_1 ENSG00000223960 ; gene_alias_2 AC009948.5 ; gene_alias_3 ENSG00000223960.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154423.1 ; gene_alias_5 ENSG00000223960.2 ; transcript_alias_1 ENST00000415236 ; transcript_alias_2 ENST00000415236.1 ; transcript_alias_3 AC009948.5-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000335156.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075753 ;
chr2	lncipedia.org	exon	179295497	179295616	.	+	.	gene_id lnc-OSBPL6-2 ; transcript_id lnc-OSBPL6-2:7 ; gene_alias_1 ENSG00000223960 ; gene_alias_2 AC009948.5 ; gene_alias_3 ENSG00000223960.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154423.1 ; gene_alias_5 ENSG00000223960.2 ; transcript_alias_1 ENST00000415236 ; transcript_alias_2 ENST00000415236.1 ; transcript_alias_3 AC009948.5-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000335156.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075753 ;
chr2	lncipedia.org	exon	179296897	179297009	.	+	.	gene_id lnc-OSBPL6-2 ; transcript_id lnc-OSBPL6-2:7 ; gene_alias_1 ENSG00000223960 ; gene_alias_2 AC009948.5 ; gene_alias_3 ENSG00000223960.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154423.1 ; gene_alias_5 ENSG00000223960.2 ; transcript_alias_1 ENST00000415236 ; transcript_alias_2 ENST00000415236.1 ; transcript_alias_3 AC009948.5-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000335156.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075753 ;
chr9	lncipedia.org	exon	95770397	95772719	.	-	.	gene_id lnc-NINJ1-2 ; transcript_id lnc-NINJ1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248502 ; transcript_alias_1 ENST00000513278 ; transcript_alias_2 NONHSAT133226 ; transcript_alias_3 NR_121565 ;
chr9	lncipedia.org	exon	95775473	95776776	.	-	.	gene_id lnc-NINJ1-2 ; transcript_id lnc-NINJ1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248502 ; transcript_alias_1 ENST00000513278 ; transcript_alias_2 NONHSAT133226 ; transcript_alias_3 NR_121565 ;
chr9	lncipedia.org	exon	95777209	95777226	.	-	.	gene_id lnc-NINJ1-2 ; transcript_id lnc-NINJ1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248502 ; transcript_alias_1 ENST00000513278 ; transcript_alias_2 NONHSAT133226 ; transcript_alias_3 NR_121565 ;
chr19	lncipedia.org	exon	46893715	46893826	.	-	.	gene_id lnc-CCDC8-1 ; transcript_id lnc-CCDC8-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246156 ; transcript_alias_1 ENST00000499483 ; transcript_alias_2 NONHSAT066885 ;
chr19	lncipedia.org	exon	46894068	46896666	.	-	.	gene_id lnc-CCDC8-1 ; transcript_id lnc-CCDC8-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246156 ; transcript_alias_1 ENST00000499483 ; transcript_alias_2 NONHSAT066885 ;
chr2	lncipedia.org	exon	171496884	171497676	.	-	.	gene_id lnc-AC007405.2.1-2 ; transcript_id lnc-AC007405.2.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000213981 ; gene_alias_2 AC007277.3 ; gene_alias_3 ENSG00000213981.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154056.1 ; gene_alias_5 ENSG00000213981.4 ; transcript_alias_1 ENST00000428156 ; transcript_alias_2 ENST00000428156.1 ; transcript_alias_3 AC007277.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333674.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075414 ;
chr2	lncipedia.org	exon	171497940	171497973	.	-	.	gene_id lnc-AC007405.2.1-2 ; transcript_id lnc-AC007405.2.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000213981 ; gene_alias_2 AC007277.3 ; gene_alias_3 ENSG00000213981.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154056.1 ; gene_alias_5 ENSG00000213981.4 ; transcript_alias_1 ENST00000428156 ; transcript_alias_2 ENST00000428156.1 ; transcript_alias_3 AC007277.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333674.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075414 ;
chr2	lncipedia.org	exon	171500227	171500454	.	-	.	gene_id lnc-AC007405.2.1-2 ; transcript_id lnc-AC007405.2.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000213981 ; gene_alias_2 AC007277.3 ; gene_alias_3 ENSG00000213981.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154056.1 ; gene_alias_5 ENSG00000213981.4 ; transcript_alias_1 ENST00000428156 ; transcript_alias_2 ENST00000428156.1 ; transcript_alias_3 AC007277.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333674.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075414 ;
chr2	lncipedia.org	exon	171500996	171501153	.	-	.	gene_id lnc-AC007405.2.1-2 ; transcript_id lnc-AC007405.2.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000213981 ; gene_alias_2 AC007277.3 ; gene_alias_3 ENSG00000213981.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154056.1 ; gene_alias_5 ENSG00000213981.4 ; transcript_alias_1 ENST00000428156 ; transcript_alias_2 ENST00000428156.1 ; transcript_alias_3 AC007277.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333674.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075414 ;
chr2	lncipedia.org	exon	171504467	171504576	.	-	.	gene_id lnc-AC007405.2.1-2 ; transcript_id lnc-AC007405.2.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000213981 ; gene_alias_2 AC007277.3 ; gene_alias_3 ENSG00000213981.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154056.1 ; gene_alias_5 ENSG00000213981.4 ; transcript_alias_1 ENST00000428156 ; transcript_alias_2 ENST00000428156.1 ; transcript_alias_3 AC007277.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333674.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075414 ;
chr2	lncipedia.org	exon	171506432	171506485	.	-	.	gene_id lnc-AC007405.2.1-2 ; transcript_id lnc-AC007405.2.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000213981 ; gene_alias_2 AC007277.3 ; gene_alias_3 ENSG00000213981.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154056.1 ; gene_alias_5 ENSG00000213981.4 ; transcript_alias_1 ENST00000428156 ; transcript_alias_2 ENST00000428156.1 ; transcript_alias_3 AC007277.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333674.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075414 ;
chr2	lncipedia.org	exon	171524835	171524998	.	-	.	gene_id lnc-AC007405.2.1-2 ; transcript_id lnc-AC007405.2.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000213981 ; gene_alias_2 AC007277.3 ; gene_alias_3 ENSG00000213981.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154056.1 ; gene_alias_5 ENSG00000213981.4 ; transcript_alias_1 ENST00000428156 ; transcript_alias_2 ENST00000428156.1 ; transcript_alias_3 AC007277.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333674.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075414 ;
chr2	lncipedia.org	exon	171538905	171539000	.	-	.	gene_id lnc-AC007405.2.1-2 ; transcript_id lnc-AC007405.2.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000213981 ; gene_alias_2 AC007277.3 ; gene_alias_3 ENSG00000213981.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154056.1 ; gene_alias_5 ENSG00000213981.4 ; transcript_alias_1 ENST00000428156 ; transcript_alias_2 ENST00000428156.1 ; transcript_alias_3 AC007277.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333674.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075414 ;
chr2	lncipedia.org	exon	171539406	171539569	.	-	.	gene_id lnc-AC007405.2.1-2 ; transcript_id lnc-AC007405.2.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000213981 ; gene_alias_2 AC007277.3 ; gene_alias_3 ENSG00000213981.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154056.1 ; gene_alias_5 ENSG00000213981.4 ; transcript_alias_1 ENST00000428156 ; transcript_alias_2 ENST00000428156.1 ; transcript_alias_3 AC007277.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333674.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075414 ;
chr2	lncipedia.org	exon	171551497	171551884	.	-	.	gene_id lnc-AC007405.2.1-2 ; transcript_id lnc-AC007405.2.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000213981 ; gene_alias_2 AC007277.3 ; gene_alias_3 ENSG00000213981.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154056.1 ; gene_alias_5 ENSG00000213981.4 ; transcript_alias_1 ENST00000428156 ; transcript_alias_2 ENST00000428156.1 ; transcript_alias_3 AC007277.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333674.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075414 ;
chr12	lncipedia.org	exon	69079349	69079797	.	-	.	gene_id lnc-CPM-2 ; transcript_id lnc-CPM-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000247363 ; gene_alias_2 RP11-637A17.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247363.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169264.1 ; transcript_alias_1 ENST00000433116 ; transcript_alias_2 ENST00000433116.2 ; transcript_alias_3 RP11-637A17.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000403194.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029325 ;
chr12	lncipedia.org	exon	69080517	69080617	.	-	.	gene_id lnc-CPM-2 ; transcript_id lnc-CPM-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000247363 ; gene_alias_2 RP11-637A17.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247363.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169264.1 ; transcript_alias_1 ENST00000433116 ; transcript_alias_2 ENST00000433116.2 ; transcript_alias_3 RP11-637A17.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000403194.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029325 ;
chr4	lncipedia.org	exon	174087220	174087450	.	-	.	gene_id lnc-HMGB2-3 ; transcript_id lnc-HMGB2-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000245213 ; gene_alias_2 RP11-10K16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245213.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160808.1 ; transcript_alias_1 ENST00000510523 ; transcript_alias_2 ENST00000510523.1 ; transcript_alias_3 RP11-10K16.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000362410.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	174087796	174087941	.	-	.	gene_id lnc-HMGB2-3 ; transcript_id lnc-HMGB2-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000245213 ; gene_alias_2 RP11-10K16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245213.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160808.1 ; transcript_alias_1 ENST00000510523 ; transcript_alias_2 ENST00000510523.1 ; transcript_alias_3 RP11-10K16.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000362410.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	174089113	174089264	.	-	.	gene_id lnc-HMGB2-3 ; transcript_id lnc-HMGB2-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000245213 ; gene_alias_2 RP11-10K16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245213.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160808.1 ; transcript_alias_1 ENST00000510523 ; transcript_alias_2 ENST00000510523.1 ; transcript_alias_3 RP11-10K16.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000362410.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	174090015	174090078	.	-	.	gene_id lnc-HMGB2-3 ; transcript_id lnc-HMGB2-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000245213 ; gene_alias_2 RP11-10K16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245213.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160808.1 ; transcript_alias_1 ENST00000510523 ; transcript_alias_2 ENST00000510523.1 ; transcript_alias_3 RP11-10K16.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000362410.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	119825796	119826133	.	-	.	gene_id lnc-CIT-1 ; transcript_id lnc-CIT-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248636 ; gene_alias_2 RP11-768F21.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248636.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168955.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535511 ; transcript_alias_2 ENST00000535511.1 ; transcript_alias_3 RP11-768F21.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401744.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031081 ;
chr12	lncipedia.org	exon	119991353	119991450	.	-	.	gene_id lnc-CIT-1 ; transcript_id lnc-CIT-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248636 ; gene_alias_2 RP11-768F21.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248636.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168955.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535511 ; transcript_alias_2 ENST00000535511.1 ; transcript_alias_3 RP11-768F21.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401744.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031081 ;
chr12	lncipedia.org	exon	120031987	120032045	.	-	.	gene_id lnc-CIT-1 ; transcript_id lnc-CIT-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248636 ; gene_alias_2 RP11-768F21.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248636.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168955.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535511 ; transcript_alias_2 ENST00000535511.1 ; transcript_alias_3 RP11-768F21.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401744.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031081 ;
chr2	lncipedia.org	exon	74612651	74612877	.	+	.	gene_id lnc-WDR54-1 ; transcript_id lnc-WDR54-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000237737 ; gene_alias_2 AC005041.9 ; gene_alias_3 ENSG00000237737.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152826.1 ; gene_alias_5 DCTN1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000412957 ; transcript_alias_2 ENST00000412957.1 ; transcript_alias_3 AC005041.9-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000328162.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT071690 ;
chr2	lncipedia.org	exon	74618605	74618742	.	+	.	gene_id lnc-WDR54-1 ; transcript_id lnc-WDR54-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000237737 ; gene_alias_2 AC005041.9 ; gene_alias_3 ENSG00000237737.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152826.1 ; gene_alias_5 DCTN1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000412957 ; transcript_alias_2 ENST00000412957.1 ; transcript_alias_3 AC005041.9-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000328162.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT071690 ;
chr2	lncipedia.org	exon	74619116	74620023	.	+	.	gene_id lnc-WDR54-1 ; transcript_id lnc-WDR54-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000237737 ; gene_alias_2 AC005041.9 ; gene_alias_3 ENSG00000237737.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152826.1 ; gene_alias_5 DCTN1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000412957 ; transcript_alias_2 ENST00000412957.1 ; transcript_alias_3 AC005041.9-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000328162.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT071690 ;
chr8	lncipedia.org	exon	77523909	77524262	.	-	.	gene_id lnc-PEX2-1 ; transcript_id lnc-PEX2-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000253661 ; gene_alias_2 RP11-65D13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000253661.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164554.1 ; gene_alias_5 ZFHX4-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000522357 ; transcript_alias_2 ENST00000522357.1 ; transcript_alias_3 RP11-65D13.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379193.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127339 ;
chr8	lncipedia.org	exon	77527028	77527263	.	-	.	gene_id lnc-PEX2-1 ; transcript_id lnc-PEX2-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000253661 ; gene_alias_2 RP11-65D13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000253661.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164554.1 ; gene_alias_5 ZFHX4-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000522357 ; transcript_alias_2 ENST00000522357.1 ; transcript_alias_3 RP11-65D13.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379193.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127339 ;
chr5	lncipedia.org	exon	88179234	88179302	.	+	.	gene_id lnc-RASA1-7 ; transcript_id lnc-RASA1-7:3 ; gene_alias_1 ENSG00000248309 ; gene_alias_2 CTC-454M9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248309.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162630.2 ; gene_alias_5 MEF2C-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000512585 ; transcript_alias_2 ENST00000512585.1 ; transcript_alias_3 CTC-454M9.1-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000370006.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102692 ;
chr5	lncipedia.org	exon	88201026	88201087	.	+	.	gene_id lnc-RASA1-7 ; transcript_id lnc-RASA1-7:3 ; gene_alias_1 ENSG00000248309 ; gene_alias_2 CTC-454M9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248309.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162630.2 ; gene_alias_5 MEF2C-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000512585 ; transcript_alias_2 ENST00000512585.1 ; transcript_alias_3 CTC-454M9.1-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000370006.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102692 ;
chr5	lncipedia.org	exon	88390776	88390846	.	+	.	gene_id lnc-RASA1-7 ; transcript_id lnc-RASA1-7:3 ; gene_alias_1 ENSG00000248309 ; gene_alias_2 CTC-454M9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248309.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162630.2 ; gene_alias_5 MEF2C-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000512585 ; transcript_alias_2 ENST00000512585.1 ; transcript_alias_3 CTC-454M9.1-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000370006.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102692 ;
chr5	lncipedia.org	exon	88446350	88446412	.	+	.	gene_id lnc-RASA1-7 ; transcript_id lnc-RASA1-7:3 ; gene_alias_1 ENSG00000248309 ; gene_alias_2 CTC-454M9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248309.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162630.2 ; gene_alias_5 MEF2C-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000512585 ; transcript_alias_2 ENST00000512585.1 ; transcript_alias_3 CTC-454M9.1-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000370006.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102692 ;
chr5	lncipedia.org	exon	88446541	88446594	.	+	.	gene_id lnc-RASA1-7 ; transcript_id lnc-RASA1-7:3 ; gene_alias_1 ENSG00000248309 ; gene_alias_2 CTC-454M9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248309.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162630.2 ; gene_alias_5 MEF2C-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000512585 ; transcript_alias_2 ENST00000512585.1 ; transcript_alias_3 CTC-454M9.1-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000370006.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102692 ;
chr5	lncipedia.org	exon	88600567	88600988	.	+	.	gene_id lnc-RASA1-7 ; transcript_id lnc-RASA1-7:3 ; gene_alias_1 ENSG00000248309 ; gene_alias_2 CTC-454M9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248309.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162630.2 ; gene_alias_5 MEF2C-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000512585 ; transcript_alias_2 ENST00000512585.1 ; transcript_alias_3 CTC-454M9.1-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000370006.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102692 ;
chr21	lncipedia.org	exon	26758133	26758651	.	-	.	gene_id lnc-MRPL39-5 ; transcript_id lnc-MRPL39-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000185433 ; gene_alias_2 NCRNA00158 ; gene_alias_3 ENSG00000185433.4 ; gene_alias_4 LINC00158 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000078368.1 ; transcript_alias_1 ENST00000441013 ; transcript_alias_2 ENST00000441013.1 ; transcript_alias_3 LINC00158-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000171188.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT081477 ;
chr21	lncipedia.org	exon	26793020	26793112	.	-	.	gene_id lnc-MRPL39-5 ; transcript_id lnc-MRPL39-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000185433 ; gene_alias_2 NCRNA00158 ; gene_alias_3 ENSG00000185433.4 ; gene_alias_4 LINC00158 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000078368.1 ; transcript_alias_1 ENST00000441013 ; transcript_alias_2 ENST00000441013.1 ; transcript_alias_3 LINC00158-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000171188.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT081477 ;
chr21	lncipedia.org	exon	26802078	26802321	.	-	.	gene_id lnc-MRPL39-5 ; transcript_id lnc-MRPL39-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000185433 ; gene_alias_2 NCRNA00158 ; gene_alias_3 ENSG00000185433.4 ; gene_alias_4 LINC00158 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000078368.1 ; transcript_alias_1 ENST00000441013 ; transcript_alias_2 ENST00000441013.1 ; transcript_alias_3 LINC00158-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000171188.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT081477 ;
chr21	lncipedia.org	exon	26803490	26804013	.	-	.	gene_id lnc-MRPL39-5 ; transcript_id lnc-MRPL39-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000185433 ; gene_alias_2 NCRNA00158 ; gene_alias_3 ENSG00000185433.4 ; gene_alias_4 LINC00158 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000078368.1 ; transcript_alias_1 ENST00000441013 ; transcript_alias_2 ENST00000441013.1 ; transcript_alias_3 LINC00158-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000171188.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT081477 ;
chr4	lncipedia.org	exon	7099795	7101181	.	-	.	gene_id lnc-GRPEL1-1 ; transcript_id lnc-GRPEL1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000245562 ; gene_alias_2 RP11-367J11.3 ; gene_alias_3 ENSG00000245562.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159980.1 ; gene_alias_5 ENSG00000245468.3 ; transcript_alias_1 ENST00000499242 ; transcript_alias_2 ENST00000499242.2 ; transcript_alias_3 RP11-367J11.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000358683.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	7104995	7105107	.	-	.	gene_id lnc-GRPEL1-1 ; transcript_id lnc-GRPEL1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000245562 ; gene_alias_2 RP11-367J11.3 ; gene_alias_3 ENSG00000245562.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159980.1 ; gene_alias_5 ENSG00000245468.3 ; transcript_alias_1 ENST00000499242 ; transcript_alias_2 ENST00000499242.2 ; transcript_alias_3 RP11-367J11.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000358683.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	65893667	65893864	.	-	.	gene_id lnc-RP11-366L20.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-366L20.2.1-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000250748 ; gene_alias_2 RP11-230G5.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250748.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168872.1 ; transcript_alias_1 ENST00000540652 ; transcript_alias_2 ENST00000540652.1 ; transcript_alias_3 RP11-230G5.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401442.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029188 ;
chr12	lncipedia.org	exon	65950538	65950777	.	-	.	gene_id lnc-RP11-366L20.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-366L20.2.1-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000250748 ; gene_alias_2 RP11-230G5.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250748.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168872.1 ; transcript_alias_1 ENST00000540652 ; transcript_alias_2 ENST00000540652.1 ; transcript_alias_3 RP11-230G5.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401442.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029188 ;
chr12	lncipedia.org	exon	65952182	65952469	.	-	.	gene_id lnc-RP11-366L20.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-366L20.2.1-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000250748 ; gene_alias_2 RP11-230G5.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250748.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168872.1 ; transcript_alias_1 ENST00000540652 ; transcript_alias_2 ENST00000540652.1 ; transcript_alias_3 RP11-230G5.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401442.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029188 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114602976	114603172	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:15 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000518470 ; transcript_alias_2 ENST00000518470.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379769.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114606 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114661686	114661779	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:15 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000518470 ; transcript_alias_2 ENST00000518470.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379769.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114606 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114692756	114692856	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:15 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000518470 ; transcript_alias_2 ENST00000518470.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379769.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114606 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114727807	114727832	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:15 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000518470 ; transcript_alias_2 ENST00000518470.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379769.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114606 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114770131	114770195	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:15 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000518470 ; transcript_alias_2 ENST00000518470.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379769.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114606 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114789659	114789738	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:15 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000518470 ; transcript_alias_2 ENST00000518470.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379769.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114606 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127112718	127112768	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-9 ; transcript_id lnc-DHX37-9:4 ; gene_alias_1 ENSG00000255944 ; gene_alias_2 RP11-407A16.4 ; gene_alias_3 ENSG00000255944.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168475.1 ; transcript_alias_1 ENST00000541769 ; transcript_alias_2 ENST00000541769.1 ; transcript_alias_3 RP11-407A16.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399858.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031788 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127131916	127131995	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-9 ; transcript_id lnc-DHX37-9:4 ; gene_alias_1 ENSG00000255944 ; gene_alias_2 RP11-407A16.4 ; gene_alias_3 ENSG00000255944.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168475.1 ; transcript_alias_1 ENST00000541769 ; transcript_alias_2 ENST00000541769.1 ; transcript_alias_3 RP11-407A16.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399858.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031788 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127174581	127174868	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-9 ; transcript_id lnc-DHX37-9:4 ; gene_alias_1 ENSG00000255944 ; gene_alias_2 RP11-407A16.4 ; gene_alias_3 ENSG00000255944.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168475.1 ; transcript_alias_1 ENST00000541769 ; transcript_alias_2 ENST00000541769.1 ; transcript_alias_3 RP11-407A16.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399858.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031788 ;
chr10	lncipedia.org	exon	130084199	130084289	.	+	.	gene_id lnc-PTPRE-1 ; transcript_id lnc-PTPRE-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000256413 ; gene_alias_2 AL390763.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536791 ;
chr10	lncipedia.org	exon	130085587	130085777	.	+	.	gene_id lnc-PTPRE-1 ; transcript_id lnc-PTPRE-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000256413 ; gene_alias_2 AL390763.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536791 ;
chr10	lncipedia.org	exon	130104305	130105786	.	+	.	gene_id lnc-PTPRE-1 ; transcript_id lnc-PTPRE-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000256413 ; gene_alias_2 AL390763.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536791 ;
chr10	lncipedia.org	exon	130112693	130112861	.	+	.	gene_id lnc-PTPRE-1 ; transcript_id lnc-PTPRE-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000256413 ; gene_alias_2 AL390763.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536791 ;
chr10	lncipedia.org	exon	130113457	130113745	.	+	.	gene_id lnc-PTPRE-1 ; transcript_id lnc-PTPRE-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000256413 ; gene_alias_2 AL390763.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536791 ;
chr10	lncipedia.org	exon	130115187	130115983	.	+	.	gene_id lnc-PTPRE-1 ; transcript_id lnc-PTPRE-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000256413 ; gene_alias_2 AL390763.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536791 ;
chr13	lncipedia.org	exon	88096247	88097385	.	-	.	gene_id lnc-SLITRK6-9 ; transcript_id lnc-SLITRK6-9:4 ; gene_alias_1 ENSG00000228824 ; gene_alias_2 RP11-342C20.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228824.1 ; gene_alias_4 MIR4500HG ; gene_alias_5 OTTHUMG00000017166.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436290 ; transcript_alias_2 ENST00000436290.1 ; transcript_alias_3 MIR4500HG-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000045413.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	88099351	88099488	.	-	.	gene_id lnc-SLITRK6-9 ; transcript_id lnc-SLITRK6-9:4 ; gene_alias_1 ENSG00000228824 ; gene_alias_2 RP11-342C20.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228824.1 ; gene_alias_4 MIR4500HG ; gene_alias_5 OTTHUMG00000017166.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436290 ; transcript_alias_2 ENST00000436290.1 ; transcript_alias_3 MIR4500HG-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000045413.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	88113179	88113224	.	-	.	gene_id lnc-SLITRK6-9 ; transcript_id lnc-SLITRK6-9:4 ; gene_alias_1 ENSG00000228824 ; gene_alias_2 RP11-342C20.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228824.1 ; gene_alias_4 MIR4500HG ; gene_alias_5 OTTHUMG00000017166.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436290 ; transcript_alias_2 ENST00000436290.1 ; transcript_alias_3 MIR4500HG-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000045413.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	88125695	88125808	.	-	.	gene_id lnc-SLITRK6-9 ; transcript_id lnc-SLITRK6-9:4 ; gene_alias_1 ENSG00000228824 ; gene_alias_2 RP11-342C20.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228824.1 ; gene_alias_4 MIR4500HG ; gene_alias_5 OTTHUMG00000017166.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436290 ; transcript_alias_2 ENST00000436290.1 ; transcript_alias_3 MIR4500HG-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000045413.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	88163621	88163725	.	-	.	gene_id lnc-SLITRK6-9 ; transcript_id lnc-SLITRK6-9:4 ; gene_alias_1 ENSG00000228824 ; gene_alias_2 RP11-342C20.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228824.1 ; gene_alias_4 MIR4500HG ; gene_alias_5 OTTHUMG00000017166.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436290 ; transcript_alias_2 ENST00000436290.1 ; transcript_alias_3 MIR4500HG-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000045413.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	88323091	88323218	.	-	.	gene_id lnc-SLITRK6-9 ; transcript_id lnc-SLITRK6-9:4 ; gene_alias_1 ENSG00000228824 ; gene_alias_2 RP11-342C20.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228824.1 ; gene_alias_4 MIR4500HG ; gene_alias_5 OTTHUMG00000017166.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436290 ; transcript_alias_2 ENST00000436290.1 ; transcript_alias_3 MIR4500HG-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000045413.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	133902167	133902755	.	+	.	gene_id lnc-JAM3-3 ; transcript_id lnc-JAM3-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204241 ; gene_alias_2 RP11-713P17.3 ; gene_alias_3 ENSG00000204241.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167125.1 ; transcript_alias_1 ENST00000533922 ; transcript_alias_2 ENST00000533922.1 ; transcript_alias_3 RP11-713P17.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393290.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	133907407	133907536	.	+	.	gene_id lnc-JAM3-3 ; transcript_id lnc-JAM3-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204241 ; gene_alias_2 RP11-713P17.3 ; gene_alias_3 ENSG00000204241.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167125.1 ; transcript_alias_1 ENST00000533922 ; transcript_alias_2 ENST00000533922.1 ; transcript_alias_3 RP11-713P17.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393290.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	133909657	133911143	.	+	.	gene_id lnc-JAM3-3 ; transcript_id lnc-JAM3-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204241 ; gene_alias_2 RP11-713P17.3 ; gene_alias_3 ENSG00000204241.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167125.1 ; transcript_alias_1 ENST00000533922 ; transcript_alias_2 ENST00000533922.1 ; transcript_alias_3 RP11-713P17.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393290.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	74920345	74920541	.	+	.	gene_id lnc-GDA-2 ; transcript_id lnc-GDA-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225434 ; gene_alias_2 RP11-63P12.6 ; gene_alias_3 ENSG00000225434.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020007.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451596 ; transcript_alias_2 ENST00000451596.1 ; transcript_alias_3 RP11-63P12.6-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000052642.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT131857 ;
chr9	lncipedia.org	exon	74929906	74930380	.	+	.	gene_id lnc-GDA-2 ; transcript_id lnc-GDA-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225434 ; gene_alias_2 RP11-63P12.6 ; gene_alias_3 ENSG00000225434.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020007.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451596 ; transcript_alias_2 ENST00000451596.1 ; transcript_alias_3 RP11-63P12.6-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000052642.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT131857 ;
chr5	lncipedia.org	exon	147647870	147648567	.	-	.	gene_id lnc-HTR4-1 ; transcript_id lnc-HTR4-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247199 ; gene_alias_2 RP11-373N22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000247199.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163558.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501695 ; transcript_alias_2 ENST00000501695.3 ; transcript_alias_3 RP11-373N22.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000374175.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT104441 ;
chr5	lncipedia.org	exon	147669815	147670558	.	-	.	gene_id lnc-HTR4-1 ; transcript_id lnc-HTR4-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247199 ; gene_alias_2 RP11-373N22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000247199.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163558.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501695 ; transcript_alias_2 ENST00000501695.3 ; transcript_alias_3 RP11-373N22.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000374175.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT104441 ;
chr5	lncipedia.org	exon	147687567	147687728	.	-	.	gene_id lnc-HTR4-1 ; transcript_id lnc-HTR4-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247199 ; gene_alias_2 RP11-373N22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000247199.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163558.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501695 ; transcript_alias_2 ENST00000501695.3 ; transcript_alias_3 RP11-373N22.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000374175.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT104441 ;
chr5	lncipedia.org	exon	147758265	147758408	.	-	.	gene_id lnc-HTR4-1 ; transcript_id lnc-HTR4-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247199 ; gene_alias_2 RP11-373N22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000247199.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163558.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501695 ; transcript_alias_2 ENST00000501695.3 ; transcript_alias_3 RP11-373N22.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000374175.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT104441 ;
chr5	lncipedia.org	exon	147763062	147763346	.	-	.	gene_id lnc-HTR4-1 ; transcript_id lnc-HTR4-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247199 ; gene_alias_2 RP11-373N22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000247199.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163558.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501695 ; transcript_alias_2 ENST00000501695.3 ; transcript_alias_3 RP11-373N22.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000374175.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT104441 ;
chr2	lncipedia.org	exon	178165328	178165544	.	+	.	gene_id lnc-HNRNPA3-7 ; transcript_id lnc-HNRNPA3-7:1 ; gene_alias_1 ENSG00000271825.1 ; gene_alias_2 RP11-337N6.2 ; transcript_alias_1 ENST00000606180.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	178166508	178166734	.	+	.	gene_id lnc-HNRNPA3-7 ; transcript_id lnc-HNRNPA3-7:1 ; gene_alias_1 ENSG00000271825.1 ; gene_alias_2 RP11-337N6.2 ; transcript_alias_1 ENST00000606180.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	6766241	6766370	.	-	.	gene_id lnc-CMPK2-5 ; transcript_id lnc-CMPK2-5:51 ; transcript_alias_1 NR_110498 ;
chr2	lncipedia.org	exon	6773801	6774101	.	-	.	gene_id lnc-CMPK2-5 ; transcript_id lnc-CMPK2-5:51 ; transcript_alias_1 NR_110498 ;
chr2	lncipedia.org	exon	6774727	6774838	.	-	.	gene_id lnc-CMPK2-5 ; transcript_id lnc-CMPK2-5:51 ; transcript_alias_1 NR_110498 ;
chr8	lncipedia.org	exon	145660551	145660553	.	+	.	gene_id lnc-CTD-2517M22.16.1-2 ; transcript_id lnc-CTD-2517M22.16.1-2:5 ; transcript_alias_1 NONHSAT129752 ;
chr8	lncipedia.org	exon	145660857	145660933	.	+	.	gene_id lnc-CTD-2517M22.16.1-2 ; transcript_id lnc-CTD-2517M22.16.1-2:5 ; transcript_alias_1 NONHSAT129752 ;
chr8	lncipedia.org	exon	145661041	145661801	.	+	.	gene_id lnc-CTD-2517M22.16.1-2 ; transcript_id lnc-CTD-2517M22.16.1-2:5 ; transcript_alias_1 NONHSAT129752 ;
chr8	lncipedia.org	exon	145661941	145662064	.	+	.	gene_id lnc-CTD-2517M22.16.1-2 ; transcript_id lnc-CTD-2517M22.16.1-2:5 ; transcript_alias_1 NONHSAT129752 ;
chr8	lncipedia.org	exon	145663082	145663129	.	+	.	gene_id lnc-CTD-2517M22.16.1-2 ; transcript_id lnc-CTD-2517M22.16.1-2:5 ; transcript_alias_1 NONHSAT129752 ;
chr8	lncipedia.org	exon	145664859	145665276	.	+	.	gene_id lnc-CTD-2517M22.16.1-2 ; transcript_id lnc-CTD-2517M22.16.1-2:5 ; transcript_alias_1 NONHSAT129752 ;
chr17	lncipedia.org	exon	9756065	9756623	.	-	.	gene_id lnc-AC027045.1-2 ; transcript_id lnc-AC027045.1-2:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT145600 ;
chr16	lncipedia.org	exon	24550906	24551322	.	+	.	gene_id lnc-CACNG3-3 ; transcript_id lnc-CACNG3-3:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT141160 ;
chr16	lncipedia.org	exon	24551467	24551605	.	+	.	gene_id lnc-CACNG3-3 ; transcript_id lnc-CACNG3-3:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT141160 ;
chr10	lncipedia.org	exon	116569134	116569386	.	+	.	gene_id lnc-FAM160B1-3 ; transcript_id lnc-FAM160B1-3:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT016465 ;
chr10	lncipedia.org	exon	116570684	116570929	.	+	.	gene_id lnc-FAM160B1-3 ; transcript_id lnc-FAM160B1-3:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT016465 ;
chr10	lncipedia.org	exon	119481929	119481955	.	+	.	gene_id lnc-EMX2-6 ; transcript_id lnc-EMX2-6:2 ; transcript_alias_1 NONHSAT016533 ;
chr10	lncipedia.org	exon	119483440	119483902	.	+	.	gene_id lnc-EMX2-6 ; transcript_id lnc-EMX2-6:2 ; transcript_alias_1 NONHSAT016533 ;
chr17	lncipedia.org	exon	3481249	3481518	.	-	.	gene_id lnc-TRPV3-1 ; transcript_id lnc-TRPV3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000263338.1 ; gene_alias_2 RP11-235E17.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000177651.1 ; transcript_alias_1 ENST00000573568.1 ; transcript_alias_2 RP11-235E17.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000438263.1 ; transcript_alias_4 NONHSAT145008 ;
chr17	lncipedia.org	exon	3481858	3482147	.	-	.	gene_id lnc-TRPV3-1 ; transcript_id lnc-TRPV3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000263338.1 ; gene_alias_2 RP11-235E17.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000177651.1 ; transcript_alias_1 ENST00000573568.1 ; transcript_alias_2 RP11-235E17.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000438263.1 ; transcript_alias_4 NONHSAT145008 ;
chr6	lncipedia.org	exon	58243374	58243434	.	+	.	gene_id lnc-BAG2-5 ; transcript_id lnc-BAG2-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236143.1 ; gene_alias_2 XXbac-BPG55C20.6 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000014929.1 ; transcript_alias_1 ENST00000440989.1 ; transcript_alias_2 XXbac-BPG55C20.6-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000041059.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	58243460	58243544	.	+	.	gene_id lnc-BAG2-5 ; transcript_id lnc-BAG2-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236143.1 ; gene_alias_2 XXbac-BPG55C20.6 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000014929.1 ; transcript_alias_1 ENST00000440989.1 ; transcript_alias_2 XXbac-BPG55C20.6-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000041059.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	115267569	115268246	.	+	.	gene_id lnc-FAM55B-4 ; transcript_id lnc-FAM55B-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000256315 ; gene_alias_2 AP000462.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256315.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168236.1 ; transcript_alias_1 ENST00000540545 ; transcript_alias_2 ENST00000540545.1 ; transcript_alias_3 AP000462.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000398931.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT024306 ;
chr11	lncipedia.org	exon	115268301	115268337	.	+	.	gene_id lnc-FAM55B-4 ; transcript_id lnc-FAM55B-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000256315 ; gene_alias_2 AP000462.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256315.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168236.1 ; transcript_alias_1 ENST00000540545 ; transcript_alias_2 ENST00000540545.1 ; transcript_alias_3 AP000462.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000398931.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT024306 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27053552	27053618	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:23 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 MIAT ; gene_alias_5 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000458302 ; transcript_alias_2 TCONS_00029383 ; transcript_alias_3 ENST00000458302.1 ; transcript_alias_4 MIAT-020 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320815.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084526 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27056663	27056780	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:23 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 MIAT ; gene_alias_5 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000458302 ; transcript_alias_2 TCONS_00029383 ; transcript_alias_3 ENST00000458302.1 ; transcript_alias_4 MIAT-020 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320815.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084526 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27059280	27059362	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:23 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 MIAT ; gene_alias_5 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000458302 ; transcript_alias_2 TCONS_00029383 ; transcript_alias_3 ENST00000458302.1 ; transcript_alias_4 MIAT-020 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320815.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084526 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27061495	27061816	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:23 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 MIAT ; gene_alias_5 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000458302 ; transcript_alias_2 TCONS_00029383 ; transcript_alias_3 ENST00000458302.1 ; transcript_alias_4 MIAT-020 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320815.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084526 ;
chr1	lncipedia.org	exon	202590423	202593256	.	+	.	gene_id lnc-PPP1R12B-2 ; transcript_id lnc-PPP1R12B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249227 ; transcript_alias_1 ENST00000513983 ;
chr1	lncipedia.org	exon	202593667	202594004	.	+	.	gene_id lnc-PPP1R12B-2 ; transcript_id lnc-PPP1R12B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249227 ; transcript_alias_1 ENST00000513983 ;
chr1	lncipedia.org	exon	202594255	202594367	.	+	.	gene_id lnc-PPP1R12B-2 ; transcript_id lnc-PPP1R12B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249227 ; transcript_alias_1 ENST00000513983 ;
chr2	lncipedia.org	exon	74612845	74612877	.	+	.	gene_id lnc-WDR54-1 ; transcript_id lnc-WDR54-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000237737 ; gene_alias_2 AC005041.9 ; gene_alias_3 ENSG00000237737.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152826.1 ; gene_alias_5 DCTN1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000437991 ; transcript_alias_2 ENST00000437991.1 ; transcript_alias_3 AC005041.9-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000328161.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT071693 ;
chr2	lncipedia.org	exon	74618286	74618370	.	+	.	gene_id lnc-WDR54-1 ; transcript_id lnc-WDR54-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000237737 ; gene_alias_2 AC005041.9 ; gene_alias_3 ENSG00000237737.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152826.1 ; gene_alias_5 DCTN1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000437991 ; transcript_alias_2 ENST00000437991.1 ; transcript_alias_3 AC005041.9-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000328161.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT071693 ;
chr2	lncipedia.org	exon	74618605	74618742	.	+	.	gene_id lnc-WDR54-1 ; transcript_id lnc-WDR54-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000237737 ; gene_alias_2 AC005041.9 ; gene_alias_3 ENSG00000237737.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152826.1 ; gene_alias_5 DCTN1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000437991 ; transcript_alias_2 ENST00000437991.1 ; transcript_alias_3 AC005041.9-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000328161.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT071693 ;
chr2	lncipedia.org	exon	74619121	74621009	.	+	.	gene_id lnc-WDR54-1 ; transcript_id lnc-WDR54-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000237737 ; gene_alias_2 AC005041.9 ; gene_alias_3 ENSG00000237737.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152826.1 ; gene_alias_5 DCTN1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000437991 ; transcript_alias_2 ENST00000437991.1 ; transcript_alias_3 AC005041.9-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000328161.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT071693 ;
chr15	lncipedia.org	exon	65903570	65903988	.	-	.	gene_id lnc-C15orf44-1 ; transcript_id lnc-C15orf44-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248997 ; transcript_alias_1 ENST00000505666 ;
chr15	lncipedia.org	exon	65947230	65948184	.	-	.	gene_id lnc-C15orf44-1 ; transcript_id lnc-C15orf44-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248997 ; transcript_alias_1 ENST00000505666 ;
chr4	lncipedia.org	exon	152044022	152045333	.	-	.	gene_id lnc-LRBA-1 ; transcript_id lnc-LRBA-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248759 ; transcript_alias_1 ENST00000504680 ;
chr4	lncipedia.org	exon	152045835	152046413	.	-	.	gene_id lnc-LRBA-1 ; transcript_id lnc-LRBA-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248759 ; transcript_alias_1 ENST00000504680 ;
chr11	lncipedia.org	exon	567083	567684	.	-	.	gene_id lnc-C11orf35-2 ; transcript_id lnc-C11orf35-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000247095 ; gene_alias_2 MIR210HG ; gene_alias_3 ENSG00000247095.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165284.1 ; transcript_alias_1 ENST00000528245 ; transcript_alias_2 ENST00000528245.1 ; transcript_alias_3 MIR210HG-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000383232.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017281 ;
chr11	lncipedia.org	exon	568352	568408	.	-	.	gene_id lnc-C11orf35-2 ; transcript_id lnc-C11orf35-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000247095 ; gene_alias_2 MIR210HG ; gene_alias_3 ENSG00000247095.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165284.1 ; transcript_alias_1 ENST00000528245 ; transcript_alias_2 ENST00000528245.1 ; transcript_alias_3 MIR210HG-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000383232.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017281 ;
chr16	lncipedia.org	exon	30546394	30546801	.	+	.	gene_id lnc-ITGAL-2 ; transcript_id lnc-ITGAL-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000235560 ; gene_alias_2 AC002310.1 ; transcript_alias_1 ENST00000457283 ;
chr16	lncipedia.org	exon	30547750	30548465	.	+	.	gene_id lnc-ITGAL-2 ; transcript_id lnc-ITGAL-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000235560 ; gene_alias_2 AC002310.1 ; transcript_alias_1 ENST00000457283 ;
chr7	lncipedia.org	exon	8343371	8343426	.	+	.	gene_id lnc-GLCCI1-2 ; transcript_id lnc-GLCCI1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000229970 ; gene_alias_2 AC007128.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229970.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151948.2 ; gene_alias_5 ENSG00000272328.1 ; gene_alias_6 RP4-594A5.1 ; transcript_alias_1 ENST00000435967 ; transcript_alias_2 ENST00000435967.1 ; transcript_alias_3 AC007128.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000324671.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT119156 ;
chr7	lncipedia.org	exon	8380013	8380186	.	+	.	gene_id lnc-GLCCI1-2 ; transcript_id lnc-GLCCI1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000229970 ; gene_alias_2 AC007128.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229970.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151948.2 ; gene_alias_5 ENSG00000272328.1 ; gene_alias_6 RP4-594A5.1 ; transcript_alias_1 ENST00000435967 ; transcript_alias_2 ENST00000435967.1 ; transcript_alias_3 AC007128.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000324671.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT119156 ;
chr7	lncipedia.org	exon	8380647	8380973	.	+	.	gene_id lnc-GLCCI1-2 ; transcript_id lnc-GLCCI1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000229970 ; gene_alias_2 AC007128.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229970.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151948.2 ; gene_alias_5 ENSG00000272328.1 ; gene_alias_6 RP4-594A5.1 ; transcript_alias_1 ENST00000435967 ; transcript_alias_2 ENST00000435967.1 ; transcript_alias_3 AC007128.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000324671.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT119156 ;
chr5	lncipedia.org	exon	169758434	169758581	.	+	.	gene_id lnc-KCNIP1-1 ; transcript_id lnc-KCNIP1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000235172 ; gene_alias_2 CTB-114C7.3 ; gene_alias_3 ENSG00000235172.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163120.1 ; transcript_alias_1 ENST00000518357 ; transcript_alias_2 ENST00000518357.1 ; transcript_alias_3 CTB-114C7.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371726.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT105049 ;
chr5	lncipedia.org	exon	169760138	169760714	.	+	.	gene_id lnc-KCNIP1-1 ; transcript_id lnc-KCNIP1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000235172 ; gene_alias_2 CTB-114C7.3 ; gene_alias_3 ENSG00000235172.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163120.1 ; transcript_alias_1 ENST00000518357 ; transcript_alias_2 ENST00000518357.1 ; transcript_alias_3 CTB-114C7.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371726.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT105049 ;
chr5	lncipedia.org	exon	178949497	178950926	.	-	.	gene_id lnc-HNRNPH1-2 ; transcript_id lnc-HNRNPH1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251657 ; transcript_alias_1 ENST00000506689 ;
chr5	lncipedia.org	exon	178951450	178952173	.	-	.	gene_id lnc-HNRNPH1-2 ; transcript_id lnc-HNRNPH1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251657 ; transcript_alias_1 ENST00000506689 ;
chr1	lncipedia.org	exon	84297304	84297533	.	-	.	gene_id lnc-TTLL7-2 ; transcript_id lnc-TTLL7-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233008 ; gene_alias_2 RP11-475O6.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233008.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009930.1 ; transcript_alias_1 ENST00000419733 ; transcript_alias_2 ENST00000419733.1 ; transcript_alias_3 RP11-475O6.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000027495.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT004174 ;
chr1	lncipedia.org	exon	84315590	84315705	.	-	.	gene_id lnc-TTLL7-2 ; transcript_id lnc-TTLL7-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233008 ; gene_alias_2 RP11-475O6.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233008.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009930.1 ; transcript_alias_1 ENST00000419733 ; transcript_alias_2 ENST00000419733.1 ; transcript_alias_3 RP11-475O6.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000027495.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT004174 ;
chr1	lncipedia.org	exon	84326653	84326706	.	-	.	gene_id lnc-TTLL7-2 ; transcript_id lnc-TTLL7-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233008 ; gene_alias_2 RP11-475O6.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233008.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009930.1 ; transcript_alias_1 ENST00000419733 ; transcript_alias_2 ENST00000419733.1 ; transcript_alias_3 RP11-475O6.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000027495.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT004174 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37075359	37075495	.	+	.	gene_id lnc-RALGAPB-1 ; transcript_id lnc-RALGAPB-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000174365 ; gene_alias_2 SNHG11 ; gene_alias_3 ENSG00000174365.14 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032449.1 ; gene_alias_5 ENSG00000174365.15 ; transcript_alias_1 ENST00000440918 ; transcript_alias_2 ENST00000440918.1 ; transcript_alias_3 SNHG11-012 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079187.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT079680 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37076109	37076266	.	+	.	gene_id lnc-RALGAPB-1 ; transcript_id lnc-RALGAPB-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000174365 ; gene_alias_2 SNHG11 ; gene_alias_3 ENSG00000174365.14 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032449.1 ; gene_alias_5 ENSG00000174365.15 ; transcript_alias_1 ENST00000440918 ; transcript_alias_2 ENST00000440918.1 ; transcript_alias_3 SNHG11-012 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079187.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT079680 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37076573	37076736	.	+	.	gene_id lnc-RALGAPB-1 ; transcript_id lnc-RALGAPB-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000174365 ; gene_alias_2 SNHG11 ; gene_alias_3 ENSG00000174365.14 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032449.1 ; gene_alias_5 ENSG00000174365.15 ; transcript_alias_1 ENST00000440918 ; transcript_alias_2 ENST00000440918.1 ; transcript_alias_3 SNHG11-012 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079187.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT079680 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37077305	37077373	.	+	.	gene_id lnc-RALGAPB-1 ; transcript_id lnc-RALGAPB-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000174365 ; gene_alias_2 SNHG11 ; gene_alias_3 ENSG00000174365.14 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032449.1 ; gene_alias_5 ENSG00000174365.15 ; transcript_alias_1 ENST00000440918 ; transcript_alias_2 ENST00000440918.1 ; transcript_alias_3 SNHG11-012 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079187.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT079680 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37078979	37079006	.	+	.	gene_id lnc-RALGAPB-1 ; transcript_id lnc-RALGAPB-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000174365 ; gene_alias_2 SNHG11 ; gene_alias_3 ENSG00000174365.14 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032449.1 ; gene_alias_5 ENSG00000174365.15 ; transcript_alias_1 ENST00000440918 ; transcript_alias_2 ENST00000440918.1 ; transcript_alias_3 SNHG11-012 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079187.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT079680 ;
chr11	lncipedia.org	exon	133902547	133902755	.	+	.	gene_id lnc-JAM3-3 ; transcript_id lnc-JAM3-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000204241 ; gene_alias_2 RP11-713P17.3 ; gene_alias_3 ENSG00000204241.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167125.1 ; transcript_alias_1 ENST00000529070 ; transcript_alias_2 ENST00000529070.1 ; transcript_alias_3 RP11-713P17.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393292.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT025225 ;
chr11	lncipedia.org	exon	133907407	133908870	.	+	.	gene_id lnc-JAM3-3 ; transcript_id lnc-JAM3-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000204241 ; gene_alias_2 RP11-713P17.3 ; gene_alias_3 ENSG00000204241.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167125.1 ; transcript_alias_1 ENST00000529070 ; transcript_alias_2 ENST00000529070.1 ; transcript_alias_3 RP11-713P17.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393292.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT025225 ;
chr15	lncipedia.org	exon	69689243	69690087	.	-	.	gene_id lnc-ANP32A-3 ; transcript_id lnc-ANP32A-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245371 ; gene_alias_2 ENSG00000259426.1 ; gene_alias_3 RP11-253M7.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000172061.2 ; transcript_alias_1 ENST00000500759 ; transcript_alias_2 ENST00000558617.1 ; transcript_alias_3 RP11-253M7.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000416786.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT046943 ;
chr15	lncipedia.org	exon	69693312	69693366	.	-	.	gene_id lnc-ANP32A-3 ; transcript_id lnc-ANP32A-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245371 ; gene_alias_2 ENSG00000259426.1 ; gene_alias_3 RP11-253M7.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000172061.2 ; transcript_alias_1 ENST00000500759 ; transcript_alias_2 ENST00000558617.1 ; transcript_alias_3 RP11-253M7.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000416786.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT046943 ;
chr15	lncipedia.org	exon	69706491	69707368	.	-	.	gene_id lnc-ANP32A-3 ; transcript_id lnc-ANP32A-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245371 ; gene_alias_2 ENSG00000259426.1 ; gene_alias_3 RP11-253M7.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000172061.2 ; transcript_alias_1 ENST00000500759 ; transcript_alias_2 ENST00000558617.1 ; transcript_alias_3 RP11-253M7.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000416786.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT046943 ;
chr5	lncipedia.org	exon	59784034	59784250	.	+	.	gene_id lnc-AC109486.1-1 ; transcript_id lnc-AC109486.1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000152931 ; gene_alias_2 XLOC_004399 ; gene_alias_3 linc-NDUFAF2-3 ; gene_alias_4 PART1 ; gene_alias_5 ENSG00000152931.6 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000162213.2 ; transcript_alias_1 ENST00000504876 ; transcript_alias_2 TCONS_00009408 ; transcript_alias_3 ENST00000504876.1 ; transcript_alias_4 PART1-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000368803.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	59816847	59817221	.	+	.	gene_id lnc-AC109486.1-1 ; transcript_id lnc-AC109486.1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000152931 ; gene_alias_2 XLOC_004399 ; gene_alias_3 linc-NDUFAF2-3 ; gene_alias_4 PART1 ; gene_alias_5 ENSG00000152931.6 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000162213.2 ; transcript_alias_1 ENST00000504876 ; transcript_alias_2 TCONS_00009408 ; transcript_alias_3 ENST00000504876.1 ; transcript_alias_4 PART1-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000368803.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	2246002	2246164	.	+	.	gene_id lnc-WRNIP1-2 ; transcript_id lnc-WRNIP1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000250903 ; gene_alias_2 RP1-80B9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250903.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014120.3 ; gene_alias_5 ENSG00000250903.4 ; gene_alias_6 GMDS-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000524770 ; transcript_alias_2 ENST00000524770.1 ; transcript_alias_3 RP1-80B9.2-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000389166.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT106623 ;
chr6	lncipedia.org	exon	2249071	2249160	.	+	.	gene_id lnc-WRNIP1-2 ; transcript_id lnc-WRNIP1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000250903 ; gene_alias_2 RP1-80B9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250903.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014120.3 ; gene_alias_5 ENSG00000250903.4 ; gene_alias_6 GMDS-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000524770 ; transcript_alias_2 ENST00000524770.1 ; transcript_alias_3 RP1-80B9.2-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000389166.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT106623 ;
chr6	lncipedia.org	exon	2263835	2263918	.	+	.	gene_id lnc-WRNIP1-2 ; transcript_id lnc-WRNIP1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000250903 ; gene_alias_2 RP1-80B9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250903.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014120.3 ; gene_alias_5 ENSG00000250903.4 ; gene_alias_6 GMDS-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000524770 ; transcript_alias_2 ENST00000524770.1 ; transcript_alias_3 RP1-80B9.2-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000389166.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT106623 ;
chr6	lncipedia.org	exon	2269932	2270033	.	+	.	gene_id lnc-WRNIP1-2 ; transcript_id lnc-WRNIP1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000250903 ; gene_alias_2 RP1-80B9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250903.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014120.3 ; gene_alias_5 ENSG00000250903.4 ; gene_alias_6 GMDS-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000524770 ; transcript_alias_2 ENST00000524770.1 ; transcript_alias_3 RP1-80B9.2-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000389166.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT106623 ;
chr6	lncipedia.org	exon	2397455	2397580	.	+	.	gene_id lnc-WRNIP1-2 ; transcript_id lnc-WRNIP1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000250903 ; gene_alias_2 RP1-80B9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250903.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014120.3 ; gene_alias_5 ENSG00000250903.4 ; gene_alias_6 GMDS-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000524770 ; transcript_alias_2 ENST00000524770.1 ; transcript_alias_3 RP1-80B9.2-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000389166.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT106623 ;
chr3	lncipedia.org	exon	181328151	181328533	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:11 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000492337 ; transcript_alias_2 ENST00000492337.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350427.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	181328649	181328717	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:11 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000492337 ; transcript_alias_2 ENST00000492337.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350427.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	181417386	181417671	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:11 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000492337 ; transcript_alias_2 ENST00000492337.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350427.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	181432973	181433080	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:11 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000492337 ; transcript_alias_2 ENST00000492337.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350427.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	181457357	181459018	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:11 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000492337 ; transcript_alias_2 ENST00000492337.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350427.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	62262450	62262679	.	-	.	gene_id lnc-FEZF2-1 ; transcript_id lnc-FEZF2-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000241472 ; gene_alias_2 RP11-204J18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241472.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158657.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241472.2 ; gene_alias_6 PTPRG-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000490916 ; transcript_alias_2 ENST00000490916.1 ; transcript_alias_3 RP11-204J18.3-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351670.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090183 ;
chr3	lncipedia.org	exon	62302781	62302867	.	-	.	gene_id lnc-FEZF2-1 ; transcript_id lnc-FEZF2-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000241472 ; gene_alias_2 RP11-204J18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241472.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158657.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241472.2 ; gene_alias_6 PTPRG-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000490916 ; transcript_alias_2 ENST00000490916.1 ; transcript_alias_3 RP11-204J18.3-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351670.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090183 ;
chr3	lncipedia.org	exon	62303483	62303575	.	-	.	gene_id lnc-FEZF2-1 ; transcript_id lnc-FEZF2-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000241472 ; gene_alias_2 RP11-204J18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241472.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158657.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241472.2 ; gene_alias_6 PTPRG-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000490916 ; transcript_alias_2 ENST00000490916.1 ; transcript_alias_3 RP11-204J18.3-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351670.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090183 ;
chr3	lncipedia.org	exon	62354867	62355001	.	-	.	gene_id lnc-FEZF2-1 ; transcript_id lnc-FEZF2-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000241472 ; gene_alias_2 RP11-204J18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241472.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158657.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241472.2 ; gene_alias_6 PTPRG-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000490916 ; transcript_alias_2 ENST00000490916.1 ; transcript_alias_3 RP11-204J18.3-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351670.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090183 ;
chr5	lncipedia.org	exon	115150892	115151615	.	+	.	gene_id lnc-AP3S1-1 ; transcript_id lnc-AP3S1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248017 ; gene_alias_2 AC026449.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499037 ; transcript_alias_2 NONHSAT103326 ;
chr5	lncipedia.org	exon	115152263	115152356	.	+	.	gene_id lnc-AP3S1-1 ; transcript_id lnc-AP3S1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248017 ; gene_alias_2 AC026449.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499037 ; transcript_alias_2 NONHSAT103326 ;
chr12	lncipedia.org	exon	62876131	62876812	.	-	.	gene_id lnc-C12orf61-1 ; transcript_id lnc-C12orf61-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246324 ; transcript_alias_1 ENST00000438625 ;
chr12	lncipedia.org	exon	62878549	62878722	.	-	.	gene_id lnc-C12orf61-1 ; transcript_id lnc-C12orf61-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246324 ; transcript_alias_1 ENST00000438625 ;
chr7	lncipedia.org	exon	141420595	141420848	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1147-2 ; transcript_id lnc-KIAA1147-2:10 ; gene_alias_1 ENSG00000228775 ; gene_alias_2 RP5-894A10.5 ; gene_alias_3 ENSG00000228775.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000157538.1 ; gene_alias_5 WEE2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000484172 ; transcript_alias_2 ENST00000484172.1 ; transcript_alias_3 RP5-894A10.5-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000349102.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123740 ;
chr7	lncipedia.org	exon	141423716	141423824	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1147-2 ; transcript_id lnc-KIAA1147-2:10 ; gene_alias_1 ENSG00000228775 ; gene_alias_2 RP5-894A10.5 ; gene_alias_3 ENSG00000228775.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000157538.1 ; gene_alias_5 WEE2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000484172 ; transcript_alias_2 ENST00000484172.1 ; transcript_alias_3 RP5-894A10.5-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000349102.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123740 ;
chr7	lncipedia.org	exon	141427792	141427945	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1147-2 ; transcript_id lnc-KIAA1147-2:10 ; gene_alias_1 ENSG00000228775 ; gene_alias_2 RP5-894A10.5 ; gene_alias_3 ENSG00000228775.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000157538.1 ; gene_alias_5 WEE2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000484172 ; transcript_alias_2 ENST00000484172.1 ; transcript_alias_3 RP5-894A10.5-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000349102.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123740 ;
chr7	lncipedia.org	exon	141437183	141437341	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1147-2 ; transcript_id lnc-KIAA1147-2:10 ; gene_alias_1 ENSG00000228775 ; gene_alias_2 RP5-894A10.5 ; gene_alias_3 ENSG00000228775.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000157538.1 ; gene_alias_5 WEE2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000484172 ; transcript_alias_2 ENST00000484172.1 ; transcript_alias_3 RP5-894A10.5-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000349102.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123740 ;
chr17	lncipedia.org	exon	70399469	70400957	.	-	.	gene_id lnc-SLC39A11-1 ; transcript_id lnc-SLC39A11-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000227036 ; gene_alias_2 XLOC_012568 ; gene_alias_3 linc-ABCA5-3 ; gene_alias_4 AC007639.1 ; transcript_alias_1 ENST00000457958 ; transcript_alias_2 TCONS_00025253 ; transcript_alias_3 NONHSAT055689 ;
chr17	lncipedia.org	exon	70424377	70424439	.	-	.	gene_id lnc-SLC39A11-1 ; transcript_id lnc-SLC39A11-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000227036 ; gene_alias_2 XLOC_012568 ; gene_alias_3 linc-ABCA5-3 ; gene_alias_4 AC007639.1 ; transcript_alias_1 ENST00000457958 ; transcript_alias_2 TCONS_00025253 ; transcript_alias_3 NONHSAT055689 ;
chr17	lncipedia.org	exon	70427269	70427365	.	-	.	gene_id lnc-SLC39A11-1 ; transcript_id lnc-SLC39A11-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000227036 ; gene_alias_2 XLOC_012568 ; gene_alias_3 linc-ABCA5-3 ; gene_alias_4 AC007639.1 ; transcript_alias_1 ENST00000457958 ; transcript_alias_2 TCONS_00025253 ; transcript_alias_3 NONHSAT055689 ;
chr17	lncipedia.org	exon	70588342	70588502	.	-	.	gene_id lnc-SLC39A11-1 ; transcript_id lnc-SLC39A11-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000227036 ; gene_alias_2 XLOC_012568 ; gene_alias_3 linc-ABCA5-3 ; gene_alias_4 AC007639.1 ; transcript_alias_1 ENST00000457958 ; transcript_alias_2 TCONS_00025253 ; transcript_alias_3 NONHSAT055689 ;
chr17	lncipedia.org	exon	70588796	70588941	.	-	.	gene_id lnc-SLC39A11-1 ; transcript_id lnc-SLC39A11-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000227036 ; gene_alias_2 XLOC_012568 ; gene_alias_3 linc-ABCA5-3 ; gene_alias_4 AC007639.1 ; transcript_alias_1 ENST00000457958 ; transcript_alias_2 TCONS_00025253 ; transcript_alias_3 NONHSAT055689 ;
chr18	lncipedia.org	exon	6919495	6920931	.	-	.	gene_id lnc-LAMA1-1 ; transcript_id lnc-LAMA1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000248723 ; gene_alias_2 ENSG00000265933.1 ; gene_alias_3 RP11-146G7.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000178875.1 ; gene_alias_5 LINC00668 ; transcript_alias_1 ENST00000507671 ; transcript_alias_2 ENST00000581725.1 ; transcript_alias_3 RP11-146G7.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000443721.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT057124 ;
chr18	lncipedia.org	exon	6925264	6925324	.	-	.	gene_id lnc-LAMA1-1 ; transcript_id lnc-LAMA1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000248723 ; gene_alias_2 ENSG00000265933.1 ; gene_alias_3 RP11-146G7.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000178875.1 ; gene_alias_5 LINC00668 ; transcript_alias_1 ENST00000507671 ; transcript_alias_2 ENST00000581725.1 ; transcript_alias_3 RP11-146G7.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000443721.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT057124 ;
chr18	lncipedia.org	exon	6926439	6926557	.	-	.	gene_id lnc-LAMA1-1 ; transcript_id lnc-LAMA1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000248723 ; gene_alias_2 ENSG00000265933.1 ; gene_alias_3 RP11-146G7.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000178875.1 ; gene_alias_5 LINC00668 ; transcript_alias_1 ENST00000507671 ; transcript_alias_2 ENST00000581725.1 ; transcript_alias_3 RP11-146G7.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000443721.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT057124 ;
chr18	lncipedia.org	exon	6928119	6928218	.	-	.	gene_id lnc-LAMA1-1 ; transcript_id lnc-LAMA1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000248723 ; gene_alias_2 ENSG00000265933.1 ; gene_alias_3 RP11-146G7.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000178875.1 ; gene_alias_5 LINC00668 ; transcript_alias_1 ENST00000507671 ; transcript_alias_2 ENST00000581725.1 ; transcript_alias_3 RP11-146G7.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000443721.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT057124 ;
chr18	lncipedia.org	exon	6928850	6928967	.	-	.	gene_id lnc-LAMA1-1 ; transcript_id lnc-LAMA1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000248723 ; gene_alias_2 ENSG00000265933.1 ; gene_alias_3 RP11-146G7.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000178875.1 ; gene_alias_5 LINC00668 ; transcript_alias_1 ENST00000507671 ; transcript_alias_2 ENST00000581725.1 ; transcript_alias_3 RP11-146G7.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000443721.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT057124 ;
chr18	lncipedia.org	exon	6929738	6929804	.	-	.	gene_id lnc-LAMA1-1 ; transcript_id lnc-LAMA1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000248723 ; gene_alias_2 ENSG00000265933.1 ; gene_alias_3 RP11-146G7.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000178875.1 ; gene_alias_5 LINC00668 ; transcript_alias_1 ENST00000507671 ; transcript_alias_2 ENST00000581725.1 ; transcript_alias_3 RP11-146G7.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000443721.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT057124 ;
chr7	lncipedia.org	exon	27495996	27496998	.	+	.	gene_id lnc-EVX1-15 ; transcript_id lnc-EVX1-15:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248357 ; transcript_alias_1 ENST00000506075 ;
chr7	lncipedia.org	exon	27497304	27498410	.	+	.	gene_id lnc-EVX1-15 ; transcript_id lnc-EVX1-15:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248357 ; transcript_alias_1 ENST00000506075 ;
chr11	lncipedia.org	exon	112151209	112151448	.	+	.	gene_id lnc-PTS-1 ; transcript_id lnc-PTS-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250303 ; gene_alias_2 RP11-356J5.12 ; gene_alias_3 ENSG00000250303.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167191.1 ; transcript_alias_1 ENST00000532168 ; transcript_alias_2 ENST00000532168.1 ; transcript_alias_3 RP11-356J5.12-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393661.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT024204 ;
chr11	lncipedia.org	exon	112162043	112162495	.	+	.	gene_id lnc-PTS-1 ; transcript_id lnc-PTS-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250303 ; gene_alias_2 RP11-356J5.12 ; gene_alias_3 ENSG00000250303.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167191.1 ; transcript_alias_1 ENST00000532168 ; transcript_alias_2 ENST00000532168.1 ; transcript_alias_3 RP11-356J5.12-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393661.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT024204 ;
chr17	lncipedia.org	exon	73792290	73794124	.	-	.	gene_id lnc-SRP68-1 ; transcript_id lnc-SRP68-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247689 ; transcript_alias_1 ENST00000501755 ;
chr17	lncipedia.org	exon	73923119	73923138	.	-	.	gene_id lnc-SRP68-1 ; transcript_id lnc-SRP68-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247689 ; transcript_alias_1 ENST00000501755 ;
chr17	lncipedia.org	exon	74069372	74069495	.	-	.	gene_id lnc-SRP68-1 ; transcript_id lnc-SRP68-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247689 ; transcript_alias_1 ENST00000501755 ;
chr6	lncipedia.org	exon	111804753	111804868	.	+	.	gene_id lnc-KIAA1919-3 ; transcript_id lnc-KIAA1919-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000231889 ; gene_alias_2 TRAF3IP2-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000231889.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015378.2 ; gene_alias_5 ENSG00000231889.3 ; transcript_alias_1 ENST00000442928 ; transcript_alias_2 ENST00000442928.2 ; transcript_alias_3 TRAF3IP2-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000041834.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT114470 ;
chr6	lncipedia.org	exon	111895824	111896005	.	+	.	gene_id lnc-KIAA1919-3 ; transcript_id lnc-KIAA1919-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000231889 ; gene_alias_2 TRAF3IP2-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000231889.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015378.2 ; gene_alias_5 ENSG00000231889.3 ; transcript_alias_1 ENST00000442928 ; transcript_alias_2 ENST00000442928.2 ; transcript_alias_3 TRAF3IP2-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000041834.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT114470 ;
chr6	lncipedia.org	exon	111897565	111897673	.	+	.	gene_id lnc-KIAA1919-3 ; transcript_id lnc-KIAA1919-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000231889 ; gene_alias_2 TRAF3IP2-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000231889.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015378.2 ; gene_alias_5 ENSG00000231889.3 ; transcript_alias_1 ENST00000442928 ; transcript_alias_2 ENST00000442928.2 ; transcript_alias_3 TRAF3IP2-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000041834.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT114470 ;
chr6	lncipedia.org	exon	111908196	111908336	.	+	.	gene_id lnc-KIAA1919-3 ; transcript_id lnc-KIAA1919-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000231889 ; gene_alias_2 TRAF3IP2-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000231889.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015378.2 ; gene_alias_5 ENSG00000231889.3 ; transcript_alias_1 ENST00000442928 ; transcript_alias_2 ENST00000442928.2 ; transcript_alias_3 TRAF3IP2-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000041834.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT114470 ;
chr12	lncipedia.org	exon	123198838	123199340	.	+	.	gene_id lnc-DENR-2 ; transcript_id lnc-DENR-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000256249 ; gene_alias_2 RP11-324E6.6 ; gene_alias_3 ENSG00000256249.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168862.1 ; transcript_alias_1 ENST00000545293 ; transcript_alias_2 ENST00000545293.1 ; transcript_alias_3 RP11-324E6.6-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401414.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031530 ;
chr12	lncipedia.org	exon	123200008	123200255	.	+	.	gene_id lnc-DENR-2 ; transcript_id lnc-DENR-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000256249 ; gene_alias_2 RP11-324E6.6 ; gene_alias_3 ENSG00000256249.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168862.1 ; transcript_alias_1 ENST00000545293 ; transcript_alias_2 ENST00000545293.1 ; transcript_alias_3 RP11-324E6.6-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401414.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031530 ;
chr18	lncipedia.org	exon	52961195	52962884	.	-	.	gene_id lnc-CCDC68-2 ; transcript_id lnc-CCDC68-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251494 ; transcript_alias_1 ENST00000507267 ;
chr18	lncipedia.org	exon	53007718	53007777	.	-	.	gene_id lnc-CCDC68-2 ; transcript_id lnc-CCDC68-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251494 ; transcript_alias_1 ENST00000507267 ;
chr18	lncipedia.org	exon	53230437	53230487	.	-	.	gene_id lnc-CCDC68-2 ; transcript_id lnc-CCDC68-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251494 ; transcript_alias_1 ENST00000507267 ;
chr7	lncipedia.org	exon	12628112	12628690	.	-	.	gene_id lnc-VWDE-2 ; transcript_id lnc-VWDE-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248523 ; transcript_alias_1 ENST00000506049 ;
chr7	lncipedia.org	exon	12632501	12632676	.	-	.	gene_id lnc-VWDE-2 ; transcript_id lnc-VWDE-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248523 ; transcript_alias_1 ENST00000506049 ;
chr7	lncipedia.org	exon	12634585	12634824	.	-	.	gene_id lnc-VWDE-2 ; transcript_id lnc-VWDE-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248523 ; transcript_alias_1 ENST00000506049 ;
chr10	lncipedia.org	exon	102850065	102850459	.	-	.	gene_id lnc-PDZD7-4 ; transcript_id lnc-PDZD7-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000236311 ; gene_alias_2 RP11-108L7.11 ; gene_alias_3 ENSG00000236311.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018925.3 ; transcript_alias_1 ENST00000425505 ; transcript_alias_2 ENST00000425505.1 ; transcript_alias_3 RP11-108L7.11-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000049926.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT016012 ;
chr10	lncipedia.org	exon	102886717	102886855	.	-	.	gene_id lnc-PDZD7-4 ; transcript_id lnc-PDZD7-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000236311 ; gene_alias_2 RP11-108L7.11 ; gene_alias_3 ENSG00000236311.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018925.3 ; transcript_alias_1 ENST00000425505 ; transcript_alias_2 ENST00000425505.1 ; transcript_alias_3 RP11-108L7.11-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000049926.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT016012 ;
chr10	lncipedia.org	exon	102890514	102890883	.	-	.	gene_id lnc-PDZD7-4 ; transcript_id lnc-PDZD7-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000236311 ; gene_alias_2 RP11-108L7.11 ; gene_alias_3 ENSG00000236311.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018925.3 ; transcript_alias_1 ENST00000425505 ; transcript_alias_2 ENST00000425505.1 ; transcript_alias_3 RP11-108L7.11-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000049926.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT016012 ;
chr21	lncipedia.org	exon	26768506	26768996	.	-	.	gene_id lnc-MRPL39-5 ; transcript_id lnc-MRPL39-5:4 ; gene_alias_1 ENSG00000185433 ; gene_alias_2 NCRNA00158 ; gene_alias_3 ENSG00000185433.4 ; gene_alias_4 LINC00158 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000078368.1 ; transcript_alias_1 ENST00000440205 ; transcript_alias_2 ENST00000440205.1 ; transcript_alias_3 LINC00158-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000171191.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT081481 ;
chr21	lncipedia.org	exon	26793020	26793112	.	-	.	gene_id lnc-MRPL39-5 ; transcript_id lnc-MRPL39-5:4 ; gene_alias_1 ENSG00000185433 ; gene_alias_2 NCRNA00158 ; gene_alias_3 ENSG00000185433.4 ; gene_alias_4 LINC00158 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000078368.1 ; transcript_alias_1 ENST00000440205 ; transcript_alias_2 ENST00000440205.1 ; transcript_alias_3 LINC00158-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000171191.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT081481 ;
chr21	lncipedia.org	exon	26796866	26797021	.	-	.	gene_id lnc-MRPL39-5 ; transcript_id lnc-MRPL39-5:4 ; gene_alias_1 ENSG00000185433 ; gene_alias_2 NCRNA00158 ; gene_alias_3 ENSG00000185433.4 ; gene_alias_4 LINC00158 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000078368.1 ; transcript_alias_1 ENST00000440205 ; transcript_alias_2 ENST00000440205.1 ; transcript_alias_3 LINC00158-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000171191.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT081481 ;
chr20	lncipedia.org	exon	25123876	25124149	.	-	.	gene_id lnc-VSX1-1 ; transcript_id lnc-VSX1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230725 ; gene_alias_2 XLOC_013704 ; gene_alias_3 linc-VSX1-2 ; gene_alias_4 RP4-738P15.1 ; gene_alias_5 ENSG00000230725.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000032113.1 ; transcript_alias_1 ENST00000438287 ; transcript_alias_2 TCONS_00028029 ; transcript_alias_3 ENST00000438287.1 ; transcript_alias_4 RP4-738P15.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000078389.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	25124933	25125059	.	-	.	gene_id lnc-VSX1-1 ; transcript_id lnc-VSX1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230725 ; gene_alias_2 XLOC_013704 ; gene_alias_3 linc-VSX1-2 ; gene_alias_4 RP4-738P15.1 ; gene_alias_5 ENSG00000230725.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000032113.1 ; transcript_alias_1 ENST00000438287 ; transcript_alias_2 TCONS_00028029 ; transcript_alias_3 ENST00000438287.1 ; transcript_alias_4 RP4-738P15.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000078389.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	25129828	25129894	.	-	.	gene_id lnc-VSX1-1 ; transcript_id lnc-VSX1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230725 ; gene_alias_2 XLOC_013704 ; gene_alias_3 linc-VSX1-2 ; gene_alias_4 RP4-738P15.1 ; gene_alias_5 ENSG00000230725.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000032113.1 ; transcript_alias_1 ENST00000438287 ; transcript_alias_2 TCONS_00028029 ; transcript_alias_3 ENST00000438287.1 ; transcript_alias_4 RP4-738P15.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000078389.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	23334268	23335557	.	-	.	gene_id lnc-SOX5-1 ; transcript_id lnc-SOX5-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000115934 ; gene_alias_2 RP11-153K16.2 ; gene_alias_3 ENSG00000115934.11 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169041.1 ; transcript_alias_1 ENST00000538297 ; transcript_alias_2 ENST00000538297.1 ; transcript_alias_3 RP11-153K16.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402056.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027304 ;
chr12	lncipedia.org	exon	23404395	23404433	.	-	.	gene_id lnc-SOX5-1 ; transcript_id lnc-SOX5-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000115934 ; gene_alias_2 RP11-153K16.2 ; gene_alias_3 ENSG00000115934.11 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169041.1 ; transcript_alias_1 ENST00000538297 ; transcript_alias_2 ENST00000538297.1 ; transcript_alias_3 RP11-153K16.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402056.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027304 ;
chr18	lncipedia.org	exon	36786888	36788753	.	-	.	gene_id lnc-CELF4-7 ; transcript_id lnc-CELF4-7:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249862 ; gene_alias_2 AC016205.1 ; gene_alias_3 ENSG00000267374.1 ; gene_alias_4 LINC00669 ; transcript_alias_1 ENST00000510201 ; transcript_alias_2 NONHSAT059016 ; transcript_alias_3 ENST00000591629.1 ;
chr18	lncipedia.org	exon	37115422	37115579	.	-	.	gene_id lnc-CELF4-7 ; transcript_id lnc-CELF4-7:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249862 ; gene_alias_2 AC016205.1 ; gene_alias_3 ENSG00000267374.1 ; gene_alias_4 LINC00669 ; transcript_alias_1 ENST00000510201 ; transcript_alias_2 NONHSAT059016 ; transcript_alias_3 ENST00000591629.1 ;
chr18	lncipedia.org	exon	37331293	37331324	.	-	.	gene_id lnc-CELF4-7 ; transcript_id lnc-CELF4-7:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249862 ; gene_alias_2 AC016205.1 ; gene_alias_3 ENSG00000267374.1 ; gene_alias_4 LINC00669 ; transcript_alias_1 ENST00000510201 ; transcript_alias_2 NONHSAT059016 ; transcript_alias_3 ENST00000591629.1 ;
chr18	lncipedia.org	exon	37380033	37380282	.	-	.	gene_id lnc-CELF4-7 ; transcript_id lnc-CELF4-7:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249862 ; gene_alias_2 AC016205.1 ; gene_alias_3 ENSG00000267374.1 ; gene_alias_4 LINC00669 ; transcript_alias_1 ENST00000510201 ; transcript_alias_2 NONHSAT059016 ; transcript_alias_3 ENST00000591629.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	182795591	182795698	.	-	.	gene_id lnc-DCTD-4 ; transcript_id lnc-DCTD-4:4 ; gene_alias_1 ENSG00000177822 ; gene_alias_2 AC108142.1 ; gene_alias_3 ENSG00000177822.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000133641.2 ; transcript_alias_1 ENST00000509012 ; transcript_alias_2 ENST00000509012.1 ; transcript_alias_3 AC108142.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000361744.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099424 ;
chr4	lncipedia.org	exon	182798197	182798274	.	-	.	gene_id lnc-DCTD-4 ; transcript_id lnc-DCTD-4:4 ; gene_alias_1 ENSG00000177822 ; gene_alias_2 AC108142.1 ; gene_alias_3 ENSG00000177822.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000133641.2 ; transcript_alias_1 ENST00000509012 ; transcript_alias_2 ENST00000509012.1 ; transcript_alias_3 AC108142.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000361744.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099424 ;
chr4	lncipedia.org	exon	182933815	182933972	.	-	.	gene_id lnc-DCTD-4 ; transcript_id lnc-DCTD-4:4 ; gene_alias_1 ENSG00000177822 ; gene_alias_2 AC108142.1 ; gene_alias_3 ENSG00000177822.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000133641.2 ; transcript_alias_1 ENST00000509012 ; transcript_alias_2 ENST00000509012.1 ; transcript_alias_3 AC108142.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000361744.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099424 ;
chr4	lncipedia.org	exon	183002909	183002979	.	-	.	gene_id lnc-DCTD-4 ; transcript_id lnc-DCTD-4:4 ; gene_alias_1 ENSG00000177822 ; gene_alias_2 AC108142.1 ; gene_alias_3 ENSG00000177822.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000133641.2 ; transcript_alias_1 ENST00000509012 ; transcript_alias_2 ENST00000509012.1 ; transcript_alias_3 AC108142.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000361744.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099424 ;
chr4	lncipedia.org	exon	183065200	183065348	.	-	.	gene_id lnc-DCTD-4 ; transcript_id lnc-DCTD-4:4 ; gene_alias_1 ENSG00000177822 ; gene_alias_2 AC108142.1 ; gene_alias_3 ENSG00000177822.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000133641.2 ; transcript_alias_1 ENST00000509012 ; transcript_alias_2 ENST00000509012.1 ; transcript_alias_3 AC108142.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000361744.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099424 ;
chr4	lncipedia.org	exon	129376324	129376437	.	+	.	gene_id lnc-LARP1B-1 ; transcript_id lnc-LARP1B-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000251432 ; gene_alias_2 RP11-420A23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251432.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161321.3 ; transcript_alias_1 ENST00000504984 ; transcript_alias_2 ENST00000504984.1 ; transcript_alias_3 RP11-420A23.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364521.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT098269 ;
chr4	lncipedia.org	exon	129387763	129387927	.	+	.	gene_id lnc-LARP1B-1 ; transcript_id lnc-LARP1B-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000251432 ; gene_alias_2 RP11-420A23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251432.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161321.3 ; transcript_alias_1 ENST00000504984 ; transcript_alias_2 ENST00000504984.1 ; transcript_alias_3 RP11-420A23.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364521.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT098269 ;
chr4	lncipedia.org	exon	129391205	129391371	.	+	.	gene_id lnc-LARP1B-1 ; transcript_id lnc-LARP1B-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000251432 ; gene_alias_2 RP11-420A23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251432.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161321.3 ; transcript_alias_1 ENST00000504984 ; transcript_alias_2 ENST00000504984.1 ; transcript_alias_3 RP11-420A23.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364521.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT098269 ;
chr4	lncipedia.org	exon	129391507	129391802	.	+	.	gene_id lnc-LARP1B-1 ; transcript_id lnc-LARP1B-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000251432 ; gene_alias_2 RP11-420A23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251432.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161321.3 ; transcript_alias_1 ENST00000504984 ; transcript_alias_2 ENST00000504984.1 ; transcript_alias_3 RP11-420A23.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364521.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT098269 ;
chr18	lncipedia.org	exon	6925477	6925717	.	-	.	gene_id lnc-LAMA1-1 ; transcript_id lnc-LAMA1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248723 ; transcript_alias_1 ENST00000513218 ;
chr18	lncipedia.org	exon	6926071	6926224	.	-	.	gene_id lnc-LAMA1-1 ; transcript_id lnc-LAMA1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248723 ; transcript_alias_1 ENST00000513218 ;
chr18	lncipedia.org	exon	6926439	6926557	.	-	.	gene_id lnc-LAMA1-1 ; transcript_id lnc-LAMA1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248723 ; transcript_alias_1 ENST00000513218 ;
chr18	lncipedia.org	exon	6926656	6927583	.	-	.	gene_id lnc-LAMA1-1 ; transcript_id lnc-LAMA1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248723 ; transcript_alias_1 ENST00000513218 ;
chr18	lncipedia.org	exon	6928119	6928218	.	-	.	gene_id lnc-LAMA1-1 ; transcript_id lnc-LAMA1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248723 ; transcript_alias_1 ENST00000513218 ;
chr18	lncipedia.org	exon	6928850	6928967	.	-	.	gene_id lnc-LAMA1-1 ; transcript_id lnc-LAMA1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248723 ; transcript_alias_1 ENST00000513218 ;
chr18	lncipedia.org	exon	6929782	6929868	.	-	.	gene_id lnc-LAMA1-1 ; transcript_id lnc-LAMA1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000248723 ; transcript_alias_1 ENST00000513218 ;
chr7	lncipedia.org	exon	149564861	149566947	.	-	.	gene_id lnc-ZNF467-1 ; transcript_id lnc-ZNF467-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000204934 ; gene_alias_2 RP4-751H13.6 ; gene_alias_3 ENSG00000204934.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158095.1 ; gene_alias_5 ATP6V0E2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000461019 ; transcript_alias_2 ENST00000461019.1 ; transcript_alias_3 RP4-751H13.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350180.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	149567331	149567440	.	-	.	gene_id lnc-ZNF467-1 ; transcript_id lnc-ZNF467-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000204934 ; gene_alias_2 RP4-751H13.6 ; gene_alias_3 ENSG00000204934.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158095.1 ; gene_alias_5 ATP6V0E2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000461019 ; transcript_alias_2 ENST00000461019.1 ; transcript_alias_3 RP4-751H13.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350180.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	149568731	149568885	.	-	.	gene_id lnc-ZNF467-1 ; transcript_id lnc-ZNF467-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000204934 ; gene_alias_2 RP4-751H13.6 ; gene_alias_3 ENSG00000204934.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158095.1 ; gene_alias_5 ATP6V0E2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000461019 ; transcript_alias_2 ENST00000461019.1 ; transcript_alias_3 RP4-751H13.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350180.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	149570313	149570934	.	-	.	gene_id lnc-ZNF467-1 ; transcript_id lnc-ZNF467-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000204934 ; gene_alias_2 RP4-751H13.6 ; gene_alias_3 ENSG00000204934.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158095.1 ; gene_alias_5 ATP6V0E2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000461019 ; transcript_alias_2 ENST00000461019.1 ; transcript_alias_3 RP4-751H13.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350180.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	177040914	177041420	.	-	.	gene_id lnc-AC009336.1-2 ; transcript_id lnc-AC009336.1-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000224189 ; gene_alias_2 AC009336.23 ; gene_alias_3 ENSG00000224189.2 ; gene_alias_4 HOXD-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000154172.2 ; transcript_alias_1 ENST00000436126 ; transcript_alias_2 ENST00000436126.1 ; transcript_alias_3 HOXD-AS1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000334220.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075640 ;
chr2	lncipedia.org	exon	177042060	177042222	.	-	.	gene_id lnc-AC009336.1-2 ; transcript_id lnc-AC009336.1-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000224189 ; gene_alias_2 AC009336.23 ; gene_alias_3 ENSG00000224189.2 ; gene_alias_4 HOXD-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000154172.2 ; transcript_alias_1 ENST00000436126 ; transcript_alias_2 ENST00000436126.1 ; transcript_alias_3 HOXD-AS1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000334220.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075640 ;
chr2	lncipedia.org	exon	177043757	177043826	.	-	.	gene_id lnc-AC009336.1-2 ; transcript_id lnc-AC009336.1-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000224189 ; gene_alias_2 AC009336.23 ; gene_alias_3 ENSG00000224189.2 ; gene_alias_4 HOXD-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000154172.2 ; transcript_alias_1 ENST00000436126 ; transcript_alias_2 ENST00000436126.1 ; transcript_alias_3 HOXD-AS1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000334220.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075640 ;
chr2	lncipedia.org	exon	177052793	177052997	.	-	.	gene_id lnc-AC009336.1-2 ; transcript_id lnc-AC009336.1-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000224189 ; gene_alias_2 AC009336.23 ; gene_alias_3 ENSG00000224189.2 ; gene_alias_4 HOXD-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000154172.2 ; transcript_alias_1 ENST00000436126 ; transcript_alias_2 ENST00000436126.1 ; transcript_alias_3 HOXD-AS1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000334220.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075640 ;
chr7	lncipedia.org	exon	15707572	15707921	.	+	.	gene_id lnc-AC006035.2-3 ; transcript_id lnc-AC006035.2-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000237070 ; gene_alias_2 AC005550.3 ; gene_alias_3 ENSG00000237070.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152391.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451240 ; transcript_alias_2 ENST00000451240.1 ; transcript_alias_3 AC005550.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000326059.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT119280 ;
chr7	lncipedia.org	exon	15715645	15715785	.	+	.	gene_id lnc-AC006035.2-3 ; transcript_id lnc-AC006035.2-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000237070 ; gene_alias_2 AC005550.3 ; gene_alias_3 ENSG00000237070.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152391.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451240 ; transcript_alias_2 ENST00000451240.1 ; transcript_alias_3 AC005550.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000326059.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT119280 ;
chr7	lncipedia.org	exon	15717088	15717272	.	+	.	gene_id lnc-AC006035.2-3 ; transcript_id lnc-AC006035.2-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000237070 ; gene_alias_2 AC005550.3 ; gene_alias_3 ENSG00000237070.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152391.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451240 ; transcript_alias_2 ENST00000451240.1 ; transcript_alias_3 AC005550.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000326059.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT119280 ;
chr7	lncipedia.org	exon	15718539	15721605	.	+	.	gene_id lnc-AC006035.2-3 ; transcript_id lnc-AC006035.2-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000237070 ; gene_alias_2 AC005550.3 ; gene_alias_3 ENSG00000237070.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152391.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451240 ; transcript_alias_2 ENST00000451240.1 ; transcript_alias_3 AC005550.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000326059.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT119280 ;
chr4	lncipedia.org	exon	4543870	4544202	.	+	.	gene_id lnc-NSG1.1-1 ; transcript_id lnc-NSG1.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247708 ; gene_alias_2 RP11-323F5.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247708.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159923.1 ; gene_alias_5 ENSG00000247708.3 ; gene_alias_6 STX18-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000507244 ; transcript_alias_2 ENST00000507244.1 ; transcript_alias_3 RP11-323F5.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000358301.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT094935 ;
chr4	lncipedia.org	exon	4546465	4546634	.	+	.	gene_id lnc-NSG1.1-1 ; transcript_id lnc-NSG1.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247708 ; gene_alias_2 RP11-323F5.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247708.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159923.1 ; gene_alias_5 ENSG00000247708.3 ; gene_alias_6 STX18-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000507244 ; transcript_alias_2 ENST00000507244.1 ; transcript_alias_3 RP11-323F5.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000358301.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT094935 ;
chr4	lncipedia.org	exon	4562121	4562286	.	+	.	gene_id lnc-NSG1.1-1 ; transcript_id lnc-NSG1.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247708 ; gene_alias_2 RP11-323F5.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247708.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159923.1 ; gene_alias_5 ENSG00000247708.3 ; gene_alias_6 STX18-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000507244 ; transcript_alias_2 ENST00000507244.1 ; transcript_alias_3 RP11-323F5.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000358301.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT094935 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105050824	105050981	.	+	.	gene_id lnc-POU3F3-4 ; transcript_id lnc-POU3F3-4:6 ; gene_alias_1 ENSG00000235597 ; gene_alias_2 XLOC_001602 ; gene_alias_3 linc-POU3F3-5 ; gene_alias_4 AC013402.2 ; gene_alias_5 ENSG00000235597.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000153050.1 ; gene_alias_7 LINC01102 ; transcript_alias_1 ENST00000414442 ; transcript_alias_2 TCONS_00002959 ; transcript_alias_3 ENST00000414442.1 ; transcript_alias_4 AC013402.2-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000329243.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT072916 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105052398	105052577	.	+	.	gene_id lnc-POU3F3-4 ; transcript_id lnc-POU3F3-4:6 ; gene_alias_1 ENSG00000235597 ; gene_alias_2 XLOC_001602 ; gene_alias_3 linc-POU3F3-5 ; gene_alias_4 AC013402.2 ; gene_alias_5 ENSG00000235597.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000153050.1 ; gene_alias_7 LINC01102 ; transcript_alias_1 ENST00000414442 ; transcript_alias_2 TCONS_00002959 ; transcript_alias_3 ENST00000414442.1 ; transcript_alias_4 AC013402.2-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000329243.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT072916 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105122324	105122563	.	+	.	gene_id lnc-POU3F3-4 ; transcript_id lnc-POU3F3-4:6 ; gene_alias_1 ENSG00000235597 ; gene_alias_2 XLOC_001602 ; gene_alias_3 linc-POU3F3-5 ; gene_alias_4 AC013402.2 ; gene_alias_5 ENSG00000235597.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000153050.1 ; gene_alias_7 LINC01102 ; transcript_alias_1 ENST00000414442 ; transcript_alias_2 TCONS_00002959 ; transcript_alias_3 ENST00000414442.1 ; transcript_alias_4 AC013402.2-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000329243.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT072916 ;
chr6	lncipedia.org	exon	72124149	72126262	.	-	.	gene_id lnc-B3GAT2-3 ; transcript_id lnc-B3GAT2-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000233237 ; gene_alias_2 C6orf155 ; gene_alias_3 ENSG00000233237.1 ; gene_alias_4 LINC00472 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000015006.2 ; transcript_alias_1 ENST00000426635 ; transcript_alias_2 ENST00000426635.1 ; transcript_alias_3 LINC00472-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000041168.2 ;
chr6	lncipedia.org	exon	72127023	72127095	.	-	.	gene_id lnc-B3GAT2-3 ; transcript_id lnc-B3GAT2-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000233237 ; gene_alias_2 C6orf155 ; gene_alias_3 ENSG00000233237.1 ; gene_alias_4 LINC00472 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000015006.2 ; transcript_alias_1 ENST00000426635 ; transcript_alias_2 ENST00000426635.1 ; transcript_alias_3 LINC00472-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000041168.2 ;
chr6	lncipedia.org	exon	72128392	72128457	.	-	.	gene_id lnc-B3GAT2-3 ; transcript_id lnc-B3GAT2-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000233237 ; gene_alias_2 C6orf155 ; gene_alias_3 ENSG00000233237.1 ; gene_alias_4 LINC00472 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000015006.2 ; transcript_alias_1 ENST00000426635 ; transcript_alias_2 ENST00000426635.1 ; transcript_alias_3 LINC00472-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000041168.2 ;
chr6	lncipedia.org	exon	72129769	72130472	.	-	.	gene_id lnc-B3GAT2-3 ; transcript_id lnc-B3GAT2-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000233237 ; gene_alias_2 C6orf155 ; gene_alias_3 ENSG00000233237.1 ; gene_alias_4 LINC00472 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000015006.2 ; transcript_alias_1 ENST00000426635 ; transcript_alias_2 ENST00000426635.1 ; transcript_alias_3 LINC00472-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000041168.2 ;
chr12	lncipedia.org	exon	115059566	115059816	.	+	.	gene_id lnc-RP11-116D17.1.1-12 ; transcript_id lnc-RP11-116D17.1.1-12:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258254 ; gene_alias_2 RP11-162N7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258254.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169480.1 ; transcript_alias_1 ENST00000547819 ; transcript_alias_2 ENST00000547819.1 ; transcript_alias_3 RP11-162N7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404254.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030885 ;
chr12	lncipedia.org	exon	115060613	115060727	.	+	.	gene_id lnc-RP11-116D17.1.1-12 ; transcript_id lnc-RP11-116D17.1.1-12:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258254 ; gene_alias_2 RP11-162N7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258254.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169480.1 ; transcript_alias_1 ENST00000547819 ; transcript_alias_2 ENST00000547819.1 ; transcript_alias_3 RP11-162N7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404254.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030885 ;
chr10	lncipedia.org	exon	101286838	101286961	.	+	.	gene_id lnc-NKX2-3-1 ; transcript_id lnc-NKX2-3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000228778 ; gene_alias_2 RP11-129J12.1 ; gene_alias_3 ENSG00000228778.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018885.1 ; transcript_alias_1 ENST00000452494 ; transcript_alias_2 ENST00000452494.1 ; transcript_alias_3 RP11-129J12.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000049800.1 ; transcript_alias_5 FPKM1_group_3802_transcript_1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	101287751	101288018	.	+	.	gene_id lnc-NKX2-3-1 ; transcript_id lnc-NKX2-3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000228778 ; gene_alias_2 RP11-129J12.1 ; gene_alias_3 ENSG00000228778.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018885.1 ; transcript_alias_1 ENST00000452494 ; transcript_alias_2 ENST00000452494.1 ; transcript_alias_3 RP11-129J12.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000049800.1 ; transcript_alias_5 FPKM1_group_3802_transcript_1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	211813150	211813231	.	+	.	gene_id lnc-TRAF5-5 ; transcript_id lnc-TRAF5-5:2 ; gene_alias_1 ENSG00000227764 ; gene_alias_2 RP11-354K1.1 ; gene_alias_3 ENSG00000227764.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000036999.1 ; transcript_alias_1 ENST00000430123 ; transcript_alias_2 ENST00000430123.1 ; transcript_alias_3 RP11-354K1.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000089834.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT009308 ;
chr1	lncipedia.org	exon	211813561	211813702	.	+	.	gene_id lnc-TRAF5-5 ; transcript_id lnc-TRAF5-5:2 ; gene_alias_1 ENSG00000227764 ; gene_alias_2 RP11-354K1.1 ; gene_alias_3 ENSG00000227764.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000036999.1 ; transcript_alias_1 ENST00000430123 ; transcript_alias_2 ENST00000430123.1 ; transcript_alias_3 RP11-354K1.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000089834.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT009308 ;
chr1	lncipedia.org	exon	211827386	211827518	.	+	.	gene_id lnc-TRAF5-5 ; transcript_id lnc-TRAF5-5:2 ; gene_alias_1 ENSG00000227764 ; gene_alias_2 RP11-354K1.1 ; gene_alias_3 ENSG00000227764.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000036999.1 ; transcript_alias_1 ENST00000430123 ; transcript_alias_2 ENST00000430123.1 ; transcript_alias_3 RP11-354K1.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000089834.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT009308 ;
chr5	lncipedia.org	exon	88185277	88185297	.	+	.	gene_id lnc-RASA1-7 ; transcript_id lnc-RASA1-7:10 ; gene_alias_1 ENSG00000248309 ; gene_alias_2 CTC-454M9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248309.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162630.2 ; gene_alias_5 MEF2C-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000514158 ; transcript_alias_2 ENST00000514158.1 ; transcript_alias_3 CTC-454M9.1-010 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000370010.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102700 ;
chr5	lncipedia.org	exon	88201026	88201087	.	+	.	gene_id lnc-RASA1-7 ; transcript_id lnc-RASA1-7:10 ; gene_alias_1 ENSG00000248309 ; gene_alias_2 CTC-454M9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248309.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162630.2 ; gene_alias_5 MEF2C-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000514158 ; transcript_alias_2 ENST00000514158.1 ; transcript_alias_3 CTC-454M9.1-010 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000370010.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102700 ;
chr5	lncipedia.org	exon	88201519	88201590	.	+	.	gene_id lnc-RASA1-7 ; transcript_id lnc-RASA1-7:10 ; gene_alias_1 ENSG00000248309 ; gene_alias_2 CTC-454M9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248309.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162630.2 ; gene_alias_5 MEF2C-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000514158 ; transcript_alias_2 ENST00000514158.1 ; transcript_alias_3 CTC-454M9.1-010 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000370010.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102700 ;
chr5	lncipedia.org	exon	88236630	88237187	.	+	.	gene_id lnc-RASA1-7 ; transcript_id lnc-RASA1-7:10 ; gene_alias_1 ENSG00000248309 ; gene_alias_2 CTC-454M9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248309.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162630.2 ; gene_alias_5 MEF2C-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000514158 ; transcript_alias_2 ENST00000514158.1 ; transcript_alias_3 CTC-454M9.1-010 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000370010.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102700 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27053220	27053318	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 MIAT ; gene_alias_3 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000422403 ; transcript_alias_2 ENST00000422403.1 ; transcript_alias_3 MIAT-012 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320807.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT084513 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27053446	27053618	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 MIAT ; gene_alias_3 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000422403 ; transcript_alias_2 ENST00000422403.1 ; transcript_alias_3 MIAT-012 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320807.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT084513 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27059280	27059362	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 MIAT ; gene_alias_3 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000422403 ; transcript_alias_2 ENST00000422403.1 ; transcript_alias_3 MIAT-012 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320807.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT084513 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27061495	27061733	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 MIAT ; gene_alias_3 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000422403 ; transcript_alias_2 ENST00000422403.1 ; transcript_alias_3 MIAT-012 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320807.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT084513 ;
chr15	lncipedia.org	exon	48622289	48623260	.	-	.	gene_id lnc-FBN1-3 ; transcript_id lnc-FBN1-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246076 ; transcript_alias_1 ENST00000500769 ;
chr15	lncipedia.org	exon	48623300	48624043	.	-	.	gene_id lnc-FBN1-3 ; transcript_id lnc-FBN1-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246076 ; transcript_alias_1 ENST00000500769 ;
chr12	lncipedia.org	exon	81672968	81673084	.	+	.	gene_id lnc-ACSS3-1 ; transcript_id lnc-ACSS3-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000257467 ; gene_alias_2 RP11-121G22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257467.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170246.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551699 ; transcript_alias_2 ENST00000551699.1 ; transcript_alias_3 RP11-121G22.3-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408173.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029696 ;
chr12	lncipedia.org	exon	81676466	81676573	.	+	.	gene_id lnc-ACSS3-1 ; transcript_id lnc-ACSS3-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000257467 ; gene_alias_2 RP11-121G22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257467.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170246.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551699 ; transcript_alias_2 ENST00000551699.1 ; transcript_alias_3 RP11-121G22.3-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408173.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029696 ;
chr12	lncipedia.org	exon	81686101	81686676	.	+	.	gene_id lnc-ACSS3-1 ; transcript_id lnc-ACSS3-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000257467 ; gene_alias_2 RP11-121G22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257467.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170246.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551699 ; transcript_alias_2 ENST00000551699.1 ; transcript_alias_3 RP11-121G22.3-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408173.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029696 ;
chr4	lncipedia.org	exon	66535679	66536391	.	+	.	gene_id lnc-STAP1-6 ; transcript_id lnc-STAP1-6:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250846 ; gene_alias_2 RP11-807H7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000250846.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161982.1 ; transcript_alias_1 ENST00000509473 ; transcript_alias_2 ENST00000509473.1 ; transcript_alias_3 RP11-807H7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000361851.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT096664 ; transcript_alias_6 NR_034138 ;
chr4	lncipedia.org	exon	66537494	66537599	.	+	.	gene_id lnc-STAP1-6 ; transcript_id lnc-STAP1-6:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250846 ; gene_alias_2 RP11-807H7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000250846.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161982.1 ; transcript_alias_1 ENST00000509473 ; transcript_alias_2 ENST00000509473.1 ; transcript_alias_3 RP11-807H7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000361851.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT096664 ; transcript_alias_6 NR_034138 ;
chr4	lncipedia.org	exon	66546986	66547065	.	+	.	gene_id lnc-STAP1-6 ; transcript_id lnc-STAP1-6:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250846 ; gene_alias_2 RP11-807H7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000250846.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161982.1 ; transcript_alias_1 ENST00000509473 ; transcript_alias_2 ENST00000509473.1 ; transcript_alias_3 RP11-807H7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000361851.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT096664 ; transcript_alias_6 NR_034138 ;
chr4	lncipedia.org	exon	66558827	66559104	.	+	.	gene_id lnc-STAP1-6 ; transcript_id lnc-STAP1-6:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250846 ; gene_alias_2 RP11-807H7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000250846.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161982.1 ; transcript_alias_1 ENST00000509473 ; transcript_alias_2 ENST00000509473.1 ; transcript_alias_3 RP11-807H7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000361851.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT096664 ; transcript_alias_6 NR_034138 ;
chr18	lncipedia.org	exon	43087167	43087379	.	+	.	gene_id lnc-SLC14A2-1 ; transcript_id lnc-SLC14A2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250270 ; transcript_alias_1 ENST00000513717 ;
chr18	lncipedia.org	exon	43095408	43095566	.	+	.	gene_id lnc-SLC14A2-1 ; transcript_id lnc-SLC14A2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250270 ; transcript_alias_1 ENST00000513717 ;
chr18	lncipedia.org	exon	43122185	43122348	.	+	.	gene_id lnc-SLC14A2-1 ; transcript_id lnc-SLC14A2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250270 ; transcript_alias_1 ENST00000513717 ;
chr18	lncipedia.org	exon	43129959	43130146	.	+	.	gene_id lnc-SLC14A2-1 ; transcript_id lnc-SLC14A2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250270 ; transcript_alias_1 ENST00000513717 ;
chr11	lncipedia.org	exon	10879815	10880489	.	+	.	gene_id lnc-CTR9-3 ; transcript_id lnc-CTR9-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000247271 ; gene_alias_2 CTD-2003C8.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247271.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165888.1 ; gene_alias_5 ZBED5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000529014 ; transcript_alias_2 ENST00000529014.1 ; transcript_alias_3 CTD-2003C8.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000386899.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT018003 ;
chr11	lncipedia.org	exon	10886808	10886874	.	+	.	gene_id lnc-CTR9-3 ; transcript_id lnc-CTR9-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000247271 ; gene_alias_2 CTD-2003C8.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247271.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165888.1 ; gene_alias_5 ZBED5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000529014 ; transcript_alias_2 ENST00000529014.1 ; transcript_alias_3 CTD-2003C8.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000386899.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT018003 ;
chr11	lncipedia.org	exon	10899928	10899956	.	+	.	gene_id lnc-CTR9-3 ; transcript_id lnc-CTR9-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000247271 ; gene_alias_2 CTD-2003C8.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247271.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165888.1 ; gene_alias_5 ZBED5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000529014 ; transcript_alias_2 ENST00000529014.1 ; transcript_alias_3 CTD-2003C8.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000386899.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT018003 ;
chr1	lncipedia.org	exon	98676303	98676366	.	+	.	gene_id lnc-SNX7-1 ; transcript_id lnc-SNX7-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226053 ; gene_alias_2 RP5-1070A16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000226053.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000010681.1 ; transcript_alias_1 ENST00000418344 ; transcript_alias_2 ENST00000418344.1 ; transcript_alias_3 RP5-1070A16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000029438.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	98715002	98715102	.	+	.	gene_id lnc-SNX7-1 ; transcript_id lnc-SNX7-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226053 ; gene_alias_2 RP5-1070A16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000226053.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000010681.1 ; transcript_alias_1 ENST00000418344 ; transcript_alias_2 ENST00000418344.1 ; transcript_alias_3 RP5-1070A16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000029438.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	98736151	98738214	.	+	.	gene_id lnc-SNX7-1 ; transcript_id lnc-SNX7-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226053 ; gene_alias_2 RP5-1070A16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000226053.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000010681.1 ; transcript_alias_1 ENST00000418344 ; transcript_alias_2 ENST00000418344.1 ; transcript_alias_3 RP5-1070A16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000029438.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	65893679	65893864	.	-	.	gene_id lnc-RP11-366L20.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-366L20.2.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250748 ; gene_alias_2 RP11-230G5.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250748.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168872.1 ; transcript_alias_1 ENST00000539653 ; transcript_alias_2 ENST00000539653.1 ; transcript_alias_3 RP11-230G5.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401443.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029189 ;
chr12	lncipedia.org	exon	65932464	65932541	.	-	.	gene_id lnc-RP11-366L20.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-366L20.2.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250748 ; gene_alias_2 RP11-230G5.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250748.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168872.1 ; transcript_alias_1 ENST00000539653 ; transcript_alias_2 ENST00000539653.1 ; transcript_alias_3 RP11-230G5.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401443.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029189 ;
chr12	lncipedia.org	exon	65963771	65963828	.	-	.	gene_id lnc-RP11-366L20.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-366L20.2.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250748 ; gene_alias_2 RP11-230G5.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250748.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168872.1 ; transcript_alias_1 ENST00000539653 ; transcript_alias_2 ENST00000539653.1 ; transcript_alias_3 RP11-230G5.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401443.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029189 ;
chr12	lncipedia.org	exon	66006959	66007057	.	-	.	gene_id lnc-RP11-366L20.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-366L20.2.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250748 ; gene_alias_2 RP11-230G5.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250748.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168872.1 ; transcript_alias_1 ENST00000539653 ; transcript_alias_2 ENST00000539653.1 ; transcript_alias_3 RP11-230G5.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401443.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029189 ;
chr12	lncipedia.org	exon	66035819	66036142	.	-	.	gene_id lnc-RP11-366L20.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-366L20.2.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250748 ; gene_alias_2 RP11-230G5.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250748.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168872.1 ; transcript_alias_1 ENST00000539653 ; transcript_alias_2 ENST00000539653.1 ; transcript_alias_3 RP11-230G5.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401443.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029189 ;
chr8	lncipedia.org	exon	104203192	104203674	.	-	.	gene_id lnc-C8orf56-1 ; transcript_id lnc-C8orf56-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000247081 ; gene_alias_2 RP11-318M2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247081.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164798.3 ; transcript_alias_1 ENST00000523614 ; transcript_alias_2 ENST00000523614.1 ; transcript_alias_3 RP11-318M2.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000380350.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128162 ;
chr8	lncipedia.org	exon	104298066	104298133	.	-	.	gene_id lnc-C8orf56-1 ; transcript_id lnc-C8orf56-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000247081 ; gene_alias_2 RP11-318M2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247081.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164798.3 ; transcript_alias_1 ENST00000523614 ; transcript_alias_2 ENST00000523614.1 ; transcript_alias_3 RP11-318M2.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000380350.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128162 ;
chr18	lncipedia.org	exon	36787591	36788753	.	-	.	gene_id lnc-CELF4-7 ; transcript_id lnc-CELF4-7:3 ; gene_alias_1 ENSG00000249862 ; gene_alias_2 AC016205.1 ; gene_alias_3 ENSG00000267374.1 ; gene_alias_4 LINC00669 ; transcript_alias_1 ENST00000502335 ; transcript_alias_2 ENST00000591469.1 ;
chr18	lncipedia.org	exon	36794092	36794233	.	-	.	gene_id lnc-CELF4-7 ; transcript_id lnc-CELF4-7:3 ; gene_alias_1 ENSG00000249862 ; gene_alias_2 AC016205.1 ; gene_alias_3 ENSG00000267374.1 ; gene_alias_4 LINC00669 ; transcript_alias_1 ENST00000502335 ; transcript_alias_2 ENST00000591469.1 ;
chr18	lncipedia.org	exon	36907730	36907915	.	-	.	gene_id lnc-CELF4-7 ; transcript_id lnc-CELF4-7:3 ; gene_alias_1 ENSG00000249862 ; gene_alias_2 AC016205.1 ; gene_alias_3 ENSG00000267374.1 ; gene_alias_4 LINC00669 ; transcript_alias_1 ENST00000502335 ; transcript_alias_2 ENST00000591469.1 ;
chr18	lncipedia.org	exon	36920455	36920602	.	-	.	gene_id lnc-CELF4-7 ; transcript_id lnc-CELF4-7:3 ; gene_alias_1 ENSG00000249862 ; gene_alias_2 AC016205.1 ; gene_alias_3 ENSG00000267374.1 ; gene_alias_4 LINC00669 ; transcript_alias_1 ENST00000502335 ; transcript_alias_2 ENST00000591469.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126443236	126443498	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-3 ; transcript_id lnc-DHX37-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249267 ; gene_alias_2 RP5-916L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000249267.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168492.1 ; gene_alias_5 LINC00939 ; transcript_alias_1 ENST00000507313 ; transcript_alias_2 ENST00000507313.1 ; transcript_alias_3 RP5-916L7.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399908.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126446288	126447629	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-3 ; transcript_id lnc-DHX37-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249267 ; gene_alias_2 RP5-916L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000249267.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168492.1 ; gene_alias_5 LINC00939 ; transcript_alias_1 ENST00000507313 ; transcript_alias_2 ENST00000507313.1 ; transcript_alias_3 RP5-916L7.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399908.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126450746	126451454	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-3 ; transcript_id lnc-DHX37-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249267 ; gene_alias_2 RP5-916L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000249267.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168492.1 ; gene_alias_5 LINC00939 ; transcript_alias_1 ENST00000507313 ; transcript_alias_2 ENST00000507313.1 ; transcript_alias_3 RP5-916L7.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399908.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126451740	126451888	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-3 ; transcript_id lnc-DHX37-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249267 ; gene_alias_2 RP5-916L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000249267.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168492.1 ; gene_alias_5 LINC00939 ; transcript_alias_1 ENST00000507313 ; transcript_alias_2 ENST00000507313.1 ; transcript_alias_3 RP5-916L7.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399908.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126454357	126454542	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-3 ; transcript_id lnc-DHX37-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249267 ; gene_alias_2 RP5-916L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000249267.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168492.1 ; gene_alias_5 LINC00939 ; transcript_alias_1 ENST00000507313 ; transcript_alias_2 ENST00000507313.1 ; transcript_alias_3 RP5-916L7.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399908.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126467750	126467919	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-3 ; transcript_id lnc-DHX37-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249267 ; gene_alias_2 RP5-916L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000249267.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168492.1 ; gene_alias_5 LINC00939 ; transcript_alias_1 ENST00000507313 ; transcript_alias_2 ENST00000507313.1 ; transcript_alias_3 RP5-916L7.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399908.1 ;
chr18	lncipedia.org	exon	3983130	3984259	.	-	.	gene_id lnc-DLGAP1-2 ; transcript_id lnc-DLGAP1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250093 ; transcript_alias_1 ENST00000515196 ;
chr18	lncipedia.org	exon	3986120	3986216	.	-	.	gene_id lnc-DLGAP1-2 ; transcript_id lnc-DLGAP1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250093 ; transcript_alias_1 ENST00000515196 ;
chr18	lncipedia.org	exon	4005116	4005201	.	-	.	gene_id lnc-DLGAP1-2 ; transcript_id lnc-DLGAP1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250093 ; transcript_alias_1 ENST00000515196 ;
chr18	lncipedia.org	exon	4151180	4151287	.	-	.	gene_id lnc-DLGAP1-2 ; transcript_id lnc-DLGAP1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250093 ; transcript_alias_1 ENST00000515196 ;
chr18	lncipedia.org	exon	4248569	4248697	.	-	.	gene_id lnc-DLGAP1-2 ; transcript_id lnc-DLGAP1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250093 ; transcript_alias_1 ENST00000515196 ;
chr11	lncipedia.org	exon	85718321	85719570	.	+	.	gene_id lnc-CCDC83-1 ; transcript_id lnc-CCDC83-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247103 ; transcript_alias_1 ENST00000499589 ;
chr11	lncipedia.org	exon	85723166	85725382	.	+	.	gene_id lnc-CCDC83-1 ; transcript_id lnc-CCDC83-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247103 ; transcript_alias_1 ENST00000499589 ;
chr13	lncipedia.org	exon	36470761	36470886	.	+	.	gene_id lnc-NBEA-2 ; transcript_id lnc-NBEA-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250353 ; transcript_alias_1 ENST00000509610 ;
chr13	lncipedia.org	exon	36475790	36477094	.	+	.	gene_id lnc-NBEA-2 ; transcript_id lnc-NBEA-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250353 ; transcript_alias_1 ENST00000509610 ;
chr4	lncipedia.org	exon	90757559	90757885	.	+	.	gene_id lnc-MMRN1-1 ; transcript_id lnc-MMRN1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247775 ; gene_alias_2 RP11-67M1.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247775.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161186.1 ; transcript_alias_1 ENST00000513653 ; transcript_alias_2 ENST00000513653.1 ; transcript_alias_3 RP11-67M1.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364075.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	90759412	90759557	.	+	.	gene_id lnc-MMRN1-1 ; transcript_id lnc-MMRN1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247775 ; gene_alias_2 RP11-67M1.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247775.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161186.1 ; transcript_alias_1 ENST00000513653 ; transcript_alias_2 ENST00000513653.1 ; transcript_alias_3 RP11-67M1.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364075.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	90762492	90762551	.	+	.	gene_id lnc-MMRN1-1 ; transcript_id lnc-MMRN1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247775 ; gene_alias_2 RP11-67M1.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247775.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161186.1 ; transcript_alias_1 ENST00000513653 ; transcript_alias_2 ENST00000513653.1 ; transcript_alias_3 RP11-67M1.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364075.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	90762862	90763129	.	+	.	gene_id lnc-MMRN1-1 ; transcript_id lnc-MMRN1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247775 ; gene_alias_2 RP11-67M1.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247775.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161186.1 ; transcript_alias_1 ENST00000513653 ; transcript_alias_2 ENST00000513653.1 ; transcript_alias_3 RP11-67M1.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364075.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	130568868	130569155	.	-	.	gene_id lnc-KLF14-1 ; transcript_id lnc-KLF14-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000226380 ; gene_alias_2 AC058791.1 ; gene_alias_3 ENSG00000226380.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000043895.6 ; gene_alias_5 ENSG00000226380.3 ; gene_alias_6 MIR29A ; transcript_alias_1 ENST00000418546 ; transcript_alias_2 ENST00000418546.1 ; transcript_alias_3 AC058791.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000338045.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123374 ;
chr7	lncipedia.org	exon	130596869	130596911	.	-	.	gene_id lnc-KLF14-1 ; transcript_id lnc-KLF14-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000226380 ; gene_alias_2 AC058791.1 ; gene_alias_3 ENSG00000226380.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000043895.6 ; gene_alias_5 ENSG00000226380.3 ; gene_alias_6 MIR29A ; transcript_alias_1 ENST00000418546 ; transcript_alias_2 ENST00000418546.1 ; transcript_alias_3 AC058791.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000338045.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123374 ;
chr7	lncipedia.org	exon	130597710	130597956	.	-	.	gene_id lnc-KLF14-1 ; transcript_id lnc-KLF14-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000226380 ; gene_alias_2 AC058791.1 ; gene_alias_3 ENSG00000226380.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000043895.6 ; gene_alias_5 ENSG00000226380.3 ; gene_alias_6 MIR29A ; transcript_alias_1 ENST00000418546 ; transcript_alias_2 ENST00000418546.1 ; transcript_alias_3 AC058791.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000338045.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123374 ;
chr12	lncipedia.org	exon	49993609	49994926	.	+	.	gene_id lnc-KCNH3-1 ; transcript_id lnc-KCNH3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250952 ; transcript_alias_1 ENST00000508736 ; transcript_alias_2 NONHSAT028123 ;
chr12	lncipedia.org	exon	49997960	49998502	.	+	.	gene_id lnc-KCNH3-1 ; transcript_id lnc-KCNH3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250952 ; transcript_alias_1 ENST00000508736 ; transcript_alias_2 NONHSAT028123 ;
chr19	lncipedia.org	exon	55728028	55728077	.	+	.	gene_id lnc-BRSK1-1 ; transcript_id lnc-BRSK1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249969 ; gene_alias_2 XLOC_013154 ; gene_alias_3 linc-BRSK1-2 ; gene_alias_4 AC010327.1 ; gene_alias_5 ENSG00000267649.1 ; gene_alias_6 CTD-2587H24.10 ; transcript_alias_1 ENST00000511136 ; transcript_alias_2 TCONS_00026835 ; transcript_alias_3 NONHSAT068005 ; transcript_alias_4 ENST00000585911.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	55732178	55732984	.	+	.	gene_id lnc-BRSK1-1 ; transcript_id lnc-BRSK1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249969 ; gene_alias_2 XLOC_013154 ; gene_alias_3 linc-BRSK1-2 ; gene_alias_4 AC010327.1 ; gene_alias_5 ENSG00000267649.1 ; gene_alias_6 CTD-2587H24.10 ; transcript_alias_1 ENST00000511136 ; transcript_alias_2 TCONS_00026835 ; transcript_alias_3 NONHSAT068005 ; transcript_alias_4 ENST00000585911.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	2121264	2122968	.	-	.	gene_id lnc-AL590822.1-2 ; transcript_id lnc-AL590822.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000215059 ; transcript_alias_1 ENST00000414104 ;
chr1	lncipedia.org	exon	2166695	2166793	.	-	.	gene_id lnc-AL590822.1-2 ; transcript_id lnc-AL590822.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000215059 ; transcript_alias_1 ENST00000414104 ;
chr8	lncipedia.org	exon	144823268	144828506	.	+	.	gene_id lnc-MAPK15-1 ; transcript_id lnc-MAPK15-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000203499 ; gene_alias_2 RP11-429J17.6 ; gene_alias_3 ENSG00000203499.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165151.1 ; gene_alias_5 FAM83H-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000435097 ; transcript_alias_2 ENST00000435097.2 ; transcript_alias_3 RP11-429J17.6-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT129651 ;
chr15	lncipedia.org	exon	41316067	41317661	.	-	.	gene_id lnc-RHOV-1 ; transcript_id lnc-RHOV-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251290 ; transcript_alias_1 ENST00000511636 ;
chr15	lncipedia.org	exon	41320640	41322414	.	-	.	gene_id lnc-RHOV-1 ; transcript_id lnc-RHOV-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251290 ; transcript_alias_1 ENST00000511636 ;
chr13	lncipedia.org	exon	100139216	100140070	.	-	.	gene_id lnc-GPR183-2 ; transcript_id lnc-GPR183-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000233552 ; gene_alias_2 XLOC_010706 ; gene_alias_3 linc-GPR183-2 ; gene_alias_4 AL139035.1 ; transcript_alias_1 ENST00000441924 ; transcript_alias_2 TCONS_00021692 ; transcript_alias_3 NONHSAT034919 ;
chr13	lncipedia.org	exon	100148389	100148471	.	-	.	gene_id lnc-GPR183-2 ; transcript_id lnc-GPR183-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000233552 ; gene_alias_2 XLOC_010706 ; gene_alias_3 linc-GPR183-2 ; gene_alias_4 AL139035.1 ; transcript_alias_1 ENST00000441924 ; transcript_alias_2 TCONS_00021692 ; transcript_alias_3 NONHSAT034919 ;
chr13	lncipedia.org	exon	100148963	100149026	.	-	.	gene_id lnc-GPR183-2 ; transcript_id lnc-GPR183-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000233552 ; gene_alias_2 XLOC_010706 ; gene_alias_3 linc-GPR183-2 ; gene_alias_4 AL139035.1 ; transcript_alias_1 ENST00000441924 ; transcript_alias_2 TCONS_00021692 ; transcript_alias_3 NONHSAT034919 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47599684	47599928	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000551898 ; transcript_alias_2 ENST00000551898.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405092.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027903 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47600294	47600371	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000551898 ; transcript_alias_2 ENST00000551898.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405092.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027903 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47609948	47609983	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000551898 ; transcript_alias_2 ENST00000551898.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405092.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027903 ;
chr1	lncipedia.org	exon	101538216	101538386	.	+	.	gene_id lnc-SLC30A7-2 ; transcript_id lnc-SLC30A7-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000233184 ; gene_alias_2 RP11-421L21.3 ; gene_alias_3 ENSG00000233184.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000010831.1 ; gene_alias_5 ENSG00000233184.2 ; transcript_alias_1 ENST00000454721 ; transcript_alias_2 ENST00000454721.1 ; transcript_alias_3 RP11-421L21.3-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000029902.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT004833 ;
chr1	lncipedia.org	exon	101540951	101541272	.	+	.	gene_id lnc-SLC30A7-2 ; transcript_id lnc-SLC30A7-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000233184 ; gene_alias_2 RP11-421L21.3 ; gene_alias_3 ENSG00000233184.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000010831.1 ; gene_alias_5 ENSG00000233184.2 ; transcript_alias_1 ENST00000454721 ; transcript_alias_2 ENST00000454721.1 ; transcript_alias_3 RP11-421L21.3-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000029902.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT004833 ;
chr1	lncipedia.org	exon	101542919	101543064	.	+	.	gene_id lnc-SLC30A7-2 ; transcript_id lnc-SLC30A7-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000233184 ; gene_alias_2 RP11-421L21.3 ; gene_alias_3 ENSG00000233184.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000010831.1 ; gene_alias_5 ENSG00000233184.2 ; transcript_alias_1 ENST00000454721 ; transcript_alias_2 ENST00000454721.1 ; transcript_alias_3 RP11-421L21.3-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000029902.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT004833 ;
chr1	lncipedia.org	exon	101549017	101549130	.	+	.	gene_id lnc-SLC30A7-2 ; transcript_id lnc-SLC30A7-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000233184 ; gene_alias_2 RP11-421L21.3 ; gene_alias_3 ENSG00000233184.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000010831.1 ; gene_alias_5 ENSG00000233184.2 ; transcript_alias_1 ENST00000454721 ; transcript_alias_2 ENST00000454721.1 ; transcript_alias_3 RP11-421L21.3-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000029902.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT004833 ;
chr1	lncipedia.org	exon	211813037	211813702	.	+	.	gene_id lnc-TRAF5-5 ; transcript_id lnc-TRAF5-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227764 ; gene_alias_2 RP11-354K1.1 ; gene_alias_3 ENSG00000227764.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000036999.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412871 ; transcript_alias_2 ENST00000412871.1 ; transcript_alias_3 RP11-354K1.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000089833.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT009307 ;
chr1	lncipedia.org	exon	211827386	211827923	.	+	.	gene_id lnc-TRAF5-5 ; transcript_id lnc-TRAF5-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227764 ; gene_alias_2 RP11-354K1.1 ; gene_alias_3 ENSG00000227764.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000036999.1 ; transcript_alias_1 ENST00000412871 ; transcript_alias_2 ENST00000412871.1 ; transcript_alias_3 RP11-354K1.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000089833.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT009307 ;
chr10	lncipedia.org	exon	122521324	122523187	.	-	.	gene_id lnc-FGFR2-4 ; transcript_id lnc-FGFR2-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000227165 ; gene_alias_2 RP11-323P17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000227165.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000019169.1 ; gene_alias_5 ENSG00000227165.3 ; gene_alias_6 WDR11-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000456120 ; transcript_alias_2 ENST00000456120.1 ; transcript_alias_3 RP11-323P17.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000050704.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	122536247	122536396	.	-	.	gene_id lnc-FGFR2-4 ; transcript_id lnc-FGFR2-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000227165 ; gene_alias_2 RP11-323P17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000227165.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000019169.1 ; gene_alias_5 ENSG00000227165.3 ; gene_alias_6 WDR11-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000456120 ; transcript_alias_2 ENST00000456120.1 ; transcript_alias_3 RP11-323P17.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000050704.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	109056665	109056827	.	+	.	gene_id lnc-TRAT1-4 ; transcript_id lnc-TRAT1-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249508 ; gene_alias_2 AC124945.1 ; transcript_alias_1 ENST00000508178 ; transcript_alias_2 NONHSAT091116 ;
chr3	lncipedia.org	exon	109062354	109062497	.	+	.	gene_id lnc-TRAT1-4 ; transcript_id lnc-TRAT1-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249508 ; gene_alias_2 AC124945.1 ; transcript_alias_1 ENST00000508178 ; transcript_alias_2 NONHSAT091116 ;
chr3	lncipedia.org	exon	109101330	109101875	.	+	.	gene_id lnc-TRAT1-4 ; transcript_id lnc-TRAT1-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249508 ; gene_alias_2 AC124945.1 ; transcript_alias_1 ENST00000508178 ; transcript_alias_2 NONHSAT091116 ;
chr12	lncipedia.org	exon	68383309	68383359	.	+	.	gene_id lnc-DYRK2-4 ; transcript_id lnc-DYRK2-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000255733 ; gene_alias_2 GS1-410F4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000255733.1 ; gene_alias_4 IFNG-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000169108.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536914 ; transcript_alias_2 ENST00000536914.1 ; transcript_alias_3 IFNG-AS1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402296.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029279 ;
chr12	lncipedia.org	exon	68389721	68389853	.	+	.	gene_id lnc-DYRK2-4 ; transcript_id lnc-DYRK2-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000255733 ; gene_alias_2 GS1-410F4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000255733.1 ; gene_alias_4 IFNG-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000169108.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536914 ; transcript_alias_2 ENST00000536914.1 ; transcript_alias_3 IFNG-AS1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402296.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029279 ;
chr12	lncipedia.org	exon	68399870	68399926	.	+	.	gene_id lnc-DYRK2-4 ; transcript_id lnc-DYRK2-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000255733 ; gene_alias_2 GS1-410F4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000255733.1 ; gene_alias_4 IFNG-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000169108.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536914 ; transcript_alias_2 ENST00000536914.1 ; transcript_alias_3 IFNG-AS1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402296.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029279 ;
chr12	lncipedia.org	exon	68413642	68413678	.	+	.	gene_id lnc-DYRK2-4 ; transcript_id lnc-DYRK2-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000255733 ; gene_alias_2 GS1-410F4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000255733.1 ; gene_alias_4 IFNG-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000169108.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536914 ; transcript_alias_2 ENST00000536914.1 ; transcript_alias_3 IFNG-AS1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402296.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029279 ;
chr12	lncipedia.org	exon	68420431	68420488	.	+	.	gene_id lnc-DYRK2-4 ; transcript_id lnc-DYRK2-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000255733 ; gene_alias_2 GS1-410F4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000255733.1 ; gene_alias_4 IFNG-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000169108.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536914 ; transcript_alias_2 ENST00000536914.1 ; transcript_alias_3 IFNG-AS1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402296.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029279 ;
chr12	lncipedia.org	exon	68628309	68628466	.	+	.	gene_id lnc-DYRK2-4 ; transcript_id lnc-DYRK2-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000255733 ; gene_alias_2 GS1-410F4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000255733.1 ; gene_alias_4 IFNG-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000169108.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536914 ; transcript_alias_2 ENST00000536914.1 ; transcript_alias_3 IFNG-AS1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402296.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029279 ;
chr4	lncipedia.org	exon	39599081	39601884	.	-	.	gene_id lnc-UGDH-1 ; transcript_id lnc-UGDH-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248948 ; transcript_alias_1 ENST00000505439 ;
chr4	lncipedia.org	exon	39603374	39604927	.	-	.	gene_id lnc-UGDH-1 ; transcript_id lnc-UGDH-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248948 ; transcript_alias_1 ENST00000505439 ;
chr17	lncipedia.org	exon	73970256	73970862	.	-	.	gene_id lnc-EVPL-1 ; transcript_id lnc-EVPL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251043 ; transcript_alias_1 ENST00000505288 ;
chr17	lncipedia.org	exon	73971542	73972463	.	-	.	gene_id lnc-EVPL-1 ; transcript_id lnc-EVPL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251043 ; transcript_alias_1 ENST00000505288 ;
chr11	lncipedia.org	exon	43933812	43934034	.	-	.	gene_id lnc-ALX4-4 ; transcript_id lnc-ALX4-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244926 ; gene_alias_2 ENSG00000244926.2 ; gene_alias_3 RP11-613D13.7 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166553.1 ; gene_alias_5 ALKBH3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000528285 ; transcript_alias_2 ENST00000528285.1 ; transcript_alias_3 RP11-613D13.7-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000390393.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT018964 ;
chr11	lncipedia.org	exon	43941136	43941212	.	-	.	gene_id lnc-ALX4-4 ; transcript_id lnc-ALX4-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244926 ; gene_alias_2 ENSG00000244926.2 ; gene_alias_3 RP11-613D13.7 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166553.1 ; gene_alias_5 ALKBH3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000528285 ; transcript_alias_2 ENST00000528285.1 ; transcript_alias_3 RP11-613D13.7-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000390393.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT018964 ;
chr11	lncipedia.org	exon	43941936	43942014	.	-	.	gene_id lnc-ALX4-4 ; transcript_id lnc-ALX4-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244926 ; gene_alias_2 ENSG00000244926.2 ; gene_alias_3 RP11-613D13.7 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166553.1 ; gene_alias_5 ALKBH3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000528285 ; transcript_alias_2 ENST00000528285.1 ; transcript_alias_3 RP11-613D13.7-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000390393.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT018964 ;
chr11	lncipedia.org	exon	43942424	43942494	.	-	.	gene_id lnc-ALX4-4 ; transcript_id lnc-ALX4-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244926 ; gene_alias_2 ENSG00000244926.2 ; gene_alias_3 RP11-613D13.7 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166553.1 ; gene_alias_5 ALKBH3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000528285 ; transcript_alias_2 ENST00000528285.1 ; transcript_alias_3 RP11-613D13.7-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000390393.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT018964 ;
chr9	lncipedia.org	exon	109737114	109738935	.	-	.	gene_id lnc-KLF4-4 ; transcript_id lnc-KLF4-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230782 ; gene_alias_2 RP11-508N12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000230782.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020444.1 ; transcript_alias_1 ENST00000439901 ; transcript_alias_2 ENST00000439901.1 ; transcript_alias_3 RP11-508N12.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000053545.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT133856 ; transcript_alias_6 NR_126029 ;
chr9	lncipedia.org	exon	109823431	109823505	.	-	.	gene_id lnc-KLF4-4 ; transcript_id lnc-KLF4-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230782 ; gene_alias_2 RP11-508N12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000230782.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020444.1 ; transcript_alias_1 ENST00000439901 ; transcript_alias_2 ENST00000439901.1 ; transcript_alias_3 RP11-508N12.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000053545.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT133856 ; transcript_alias_6 NR_126029 ;
chr9	lncipedia.org	exon	109859456	109859540	.	-	.	gene_id lnc-KLF4-4 ; transcript_id lnc-KLF4-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230782 ; gene_alias_2 RP11-508N12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000230782.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020444.1 ; transcript_alias_1 ENST00000439901 ; transcript_alias_2 ENST00000439901.1 ; transcript_alias_3 RP11-508N12.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000053545.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT133856 ; transcript_alias_6 NR_126029 ;
chr9	lncipedia.org	exon	109864650	109864729	.	-	.	gene_id lnc-KLF4-4 ; transcript_id lnc-KLF4-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230782 ; gene_alias_2 RP11-508N12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000230782.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020444.1 ; transcript_alias_1 ENST00000439901 ; transcript_alias_2 ENST00000439901.1 ; transcript_alias_3 RP11-508N12.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000053545.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT133856 ; transcript_alias_6 NR_126029 ;
chr9	lncipedia.org	exon	109865055	109865269	.	-	.	gene_id lnc-KLF4-4 ; transcript_id lnc-KLF4-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230782 ; gene_alias_2 RP11-508N12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000230782.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020444.1 ; transcript_alias_1 ENST00000439901 ; transcript_alias_2 ENST00000439901.1 ; transcript_alias_3 RP11-508N12.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000053545.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT133856 ; transcript_alias_6 NR_126029 ;
chr2	lncipedia.org	exon	28607276	28610000	.	-	.	gene_id lnc-TRMT61B-5 ; transcript_id lnc-TRMT61B-5:2 ; gene_alias_1 ENSG00000229951 ; gene_alias_2 AC104695.3 ; gene_alias_3 ENSG00000229951.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151946.1 ; transcript_alias_1 ENST00000445878 ; transcript_alias_2 ENST00000445878.1 ; transcript_alias_3 AC104695.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000324560.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT069820 ;
chr2	lncipedia.org	exon	28610628	28610778	.	-	.	gene_id lnc-TRMT61B-5 ; transcript_id lnc-TRMT61B-5:2 ; gene_alias_1 ENSG00000229951 ; gene_alias_2 AC104695.3 ; gene_alias_3 ENSG00000229951.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151946.1 ; transcript_alias_1 ENST00000445878 ; transcript_alias_2 ENST00000445878.1 ; transcript_alias_3 AC104695.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000324560.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT069820 ;
chr2	lncipedia.org	exon	28617415	28617539	.	-	.	gene_id lnc-TRMT61B-5 ; transcript_id lnc-TRMT61B-5:2 ; gene_alias_1 ENSG00000229951 ; gene_alias_2 AC104695.3 ; gene_alias_3 ENSG00000229951.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151946.1 ; transcript_alias_1 ENST00000445878 ; transcript_alias_2 ENST00000445878.1 ; transcript_alias_3 AC104695.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000324560.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT069820 ;
chr18	lncipedia.org	exon	66401969	66402003	.	+	.	gene_id lnc-CCDC102B-1 ; transcript_id lnc-CCDC102B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249983 ; transcript_alias_1 ENST00000509396 ;
chr18	lncipedia.org	exon	66420533	66422236	.	+	.	gene_id lnc-CCDC102B-1 ; transcript_id lnc-CCDC102B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249983 ; transcript_alias_1 ENST00000509396 ;
chr8	lncipedia.org	exon	9760677	9760987	.	-	.	gene_id lnc-RP1L1-5 ; transcript_id lnc-RP1L1-5:2 ; gene_alias_1 ENSG00000253230 ; gene_alias_2 RP11-403C10.2 ; gene_alias_3 ENSG00000253230.1 ; gene_alias_4 LINC00599 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000163734.2 ; gene_alias_6 ENSG00000253230.2 ; transcript_alias_1 ENST00000521863 ; transcript_alias_2 ENST00000521863.1 ; transcript_alias_3 LINC00599-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000376963.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT124974 ;
chr8	lncipedia.org	exon	9761171	9761263	.	-	.	gene_id lnc-RP1L1-5 ; transcript_id lnc-RP1L1-5:2 ; gene_alias_1 ENSG00000253230 ; gene_alias_2 RP11-403C10.2 ; gene_alias_3 ENSG00000253230.1 ; gene_alias_4 LINC00599 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000163734.2 ; gene_alias_6 ENSG00000253230.2 ; transcript_alias_1 ENST00000521863 ; transcript_alias_2 ENST00000521863.1 ; transcript_alias_3 LINC00599-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000376963.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT124974 ;
chr8	lncipedia.org	exon	9761580	9761720	.	-	.	gene_id lnc-RP1L1-5 ; transcript_id lnc-RP1L1-5:2 ; gene_alias_1 ENSG00000253230 ; gene_alias_2 RP11-403C10.2 ; gene_alias_3 ENSG00000253230.1 ; gene_alias_4 LINC00599 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000163734.2 ; gene_alias_6 ENSG00000253230.2 ; transcript_alias_1 ENST00000521863 ; transcript_alias_2 ENST00000521863.1 ; transcript_alias_3 LINC00599-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000376963.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT124974 ;
chr17	lncipedia.org	exon	45128639	45128968	.	-	.	gene_id lnc-CDC27-2 ; transcript_id lnc-CDC27-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250104 ; transcript_alias_1 ENST00000508811 ;
chr17	lncipedia.org	exon	45129070	45129168	.	-	.	gene_id lnc-CDC27-2 ; transcript_id lnc-CDC27-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250104 ; transcript_alias_1 ENST00000508811 ;
chr22	lncipedia.org	exon	31366663	31367765	.	+	.	gene_id lnc-OSBP2-2 ; transcript_id lnc-OSBP2-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000253352 ; gene_alias_2 TUG1 ; gene_alias_3 ENSG00000253352.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000030444.3 ; gene_alias_5 ENSG00000253352.4 ; transcript_alias_1 ENST00000540687 ; transcript_alias_2 ENST00000540687.1 ; transcript_alias_3 TUG1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000431950.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	31368841	31369587	.	+	.	gene_id lnc-OSBP2-2 ; transcript_id lnc-OSBP2-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000253352 ; gene_alias_2 TUG1 ; gene_alias_3 ENSG00000253352.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000030444.3 ; gene_alias_5 ENSG00000253352.4 ; transcript_alias_1 ENST00000540687 ; transcript_alias_2 ENST00000540687.1 ; transcript_alias_3 TUG1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000431950.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	31371156	31372049	.	+	.	gene_id lnc-OSBP2-2 ; transcript_id lnc-OSBP2-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000253352 ; gene_alias_2 TUG1 ; gene_alias_3 ENSG00000253352.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000030444.3 ; gene_alias_5 ENSG00000253352.4 ; transcript_alias_1 ENST00000540687 ; transcript_alias_2 ENST00000540687.1 ; transcript_alias_3 TUG1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000431950.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	104241218	104241408	.	+	.	gene_id lnc-ALCAM-2 ; transcript_id lnc-ALCAM-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256575 ; gene_alias_2 AC091804.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544164 ; transcript_alias_2 NONHSAT090959 ;
chr3	lncipedia.org	exon	104242056	104242131	.	+	.	gene_id lnc-ALCAM-2 ; transcript_id lnc-ALCAM-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256575 ; gene_alias_2 AC091804.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544164 ; transcript_alias_2 NONHSAT090959 ;
chr3	lncipedia.org	exon	104288595	104288981	.	+	.	gene_id lnc-ALCAM-2 ; transcript_id lnc-ALCAM-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256575 ; gene_alias_2 AC091804.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544164 ; transcript_alias_2 NONHSAT090959 ;
chr3	lncipedia.org	exon	104330774	104331339	.	+	.	gene_id lnc-ALCAM-2 ; transcript_id lnc-ALCAM-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256575 ; gene_alias_2 AC091804.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544164 ; transcript_alias_2 NONHSAT090959 ;
chr10	lncipedia.org	exon	80703085	80704504	.	-	.	gene_id lnc-ZCCHC24-3 ; transcript_id lnc-ZCCHC24-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000224596 ; gene_alias_2 RP11-202P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000224596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018559.1 ; gene_alias_5 ENSG00000224596.3 ; gene_alias_6 ZMIZ1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000456353 ; transcript_alias_2 ENST00000456353.1 ; transcript_alias_3 RP11-202P11.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000048940.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT015089 ;
chr10	lncipedia.org	exon	80705669	80705746	.	-	.	gene_id lnc-ZCCHC24-3 ; transcript_id lnc-ZCCHC24-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000224596 ; gene_alias_2 RP11-202P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000224596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018559.1 ; gene_alias_5 ENSG00000224596.3 ; gene_alias_6 ZMIZ1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000456353 ; transcript_alias_2 ENST00000456353.1 ; transcript_alias_3 RP11-202P11.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000048940.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT015089 ;
chr10	lncipedia.org	exon	80721011	80721164	.	-	.	gene_id lnc-ZCCHC24-3 ; transcript_id lnc-ZCCHC24-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000224596 ; gene_alias_2 RP11-202P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000224596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018559.1 ; gene_alias_5 ENSG00000224596.3 ; gene_alias_6 ZMIZ1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000456353 ; transcript_alias_2 ENST00000456353.1 ; transcript_alias_3 RP11-202P11.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000048940.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT015089 ;
chr10	lncipedia.org	exon	80721656	80721806	.	-	.	gene_id lnc-ZCCHC24-3 ; transcript_id lnc-ZCCHC24-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000224596 ; gene_alias_2 RP11-202P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000224596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018559.1 ; gene_alias_5 ENSG00000224596.3 ; gene_alias_6 ZMIZ1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000456353 ; transcript_alias_2 ENST00000456353.1 ; transcript_alias_3 RP11-202P11.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000048940.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT015089 ;
chr10	lncipedia.org	exon	80722581	80722643	.	-	.	gene_id lnc-ZCCHC24-3 ; transcript_id lnc-ZCCHC24-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000224596 ; gene_alias_2 RP11-202P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000224596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018559.1 ; gene_alias_5 ENSG00000224596.3 ; gene_alias_6 ZMIZ1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000456353 ; transcript_alias_2 ENST00000456353.1 ; transcript_alias_3 RP11-202P11.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000048940.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT015089 ;
chr10	lncipedia.org	exon	80808531	80808689	.	-	.	gene_id lnc-ZCCHC24-3 ; transcript_id lnc-ZCCHC24-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000224596 ; gene_alias_2 RP11-202P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000224596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018559.1 ; gene_alias_5 ENSG00000224596.3 ; gene_alias_6 ZMIZ1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000456353 ; transcript_alias_2 ENST00000456353.1 ; transcript_alias_3 RP11-202P11.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000048940.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT015089 ;
chr10	lncipedia.org	exon	80814353	80814485	.	-	.	gene_id lnc-ZCCHC24-3 ; transcript_id lnc-ZCCHC24-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000224596 ; gene_alias_2 RP11-202P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000224596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018559.1 ; gene_alias_5 ENSG00000224596.3 ; gene_alias_6 ZMIZ1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000456353 ; transcript_alias_2 ENST00000456353.1 ; transcript_alias_3 RP11-202P11.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000048940.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT015089 ;
chr10	lncipedia.org	exon	80825504	80825576	.	-	.	gene_id lnc-ZCCHC24-3 ; transcript_id lnc-ZCCHC24-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000224596 ; gene_alias_2 RP11-202P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000224596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018559.1 ; gene_alias_5 ENSG00000224596.3 ; gene_alias_6 ZMIZ1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000456353 ; transcript_alias_2 ENST00000456353.1 ; transcript_alias_3 RP11-202P11.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000048940.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT015089 ;
chr10	lncipedia.org	exon	80826205	80826343	.	-	.	gene_id lnc-ZCCHC24-3 ; transcript_id lnc-ZCCHC24-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000224596 ; gene_alias_2 RP11-202P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000224596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018559.1 ; gene_alias_5 ENSG00000224596.3 ; gene_alias_6 ZMIZ1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000456353 ; transcript_alias_2 ENST00000456353.1 ; transcript_alias_3 RP11-202P11.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000048940.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT015089 ;
chr10	lncipedia.org	exon	80827145	80827652	.	-	.	gene_id lnc-ZCCHC24-3 ; transcript_id lnc-ZCCHC24-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000224596 ; gene_alias_2 RP11-202P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000224596.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018559.1 ; gene_alias_5 ENSG00000224596.3 ; gene_alias_6 ZMIZ1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000456353 ; transcript_alias_2 ENST00000456353.1 ; transcript_alias_3 RP11-202P11.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000048940.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT015089 ;
chr17	lncipedia.org	exon	26256574	26257501	.	-	.	gene_id lnc-C17orf108-1 ; transcript_id lnc-C17orf108-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249243 ; gene_alias_2 ENSG00000260019.1 ; gene_alias_3 RP11-218F4.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000175990.1 ; transcript_alias_1 ENST00000510249 ; transcript_alias_2 ENST00000567574.1 ; transcript_alias_3 RP11-218F4.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000431352.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	26257633	26257751	.	-	.	gene_id lnc-C17orf108-1 ; transcript_id lnc-C17orf108-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249243 ; gene_alias_2 ENSG00000260019.1 ; gene_alias_3 RP11-218F4.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000175990.1 ; transcript_alias_1 ENST00000510249 ; transcript_alias_2 ENST00000567574.1 ; transcript_alias_3 RP11-218F4.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000431352.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	26258563	26258719	.	-	.	gene_id lnc-C17orf108-1 ; transcript_id lnc-C17orf108-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249243 ; gene_alias_2 ENSG00000260019.1 ; gene_alias_3 RP11-218F4.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000175990.1 ; transcript_alias_1 ENST00000510249 ; transcript_alias_2 ENST00000567574.1 ; transcript_alias_3 RP11-218F4.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000431352.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	26301114	26301249	.	-	.	gene_id lnc-C17orf108-1 ; transcript_id lnc-C17orf108-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249243 ; gene_alias_2 ENSG00000260019.1 ; gene_alias_3 RP11-218F4.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000175990.1 ; transcript_alias_1 ENST00000510249 ; transcript_alias_2 ENST00000567574.1 ; transcript_alias_3 RP11-218F4.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000431352.1 ;
chr18	lncipedia.org	exon	60249038	60249129	.	+	.	gene_id lnc-ZCCHC2-1 ; transcript_id lnc-ZCCHC2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249546 ; transcript_alias_1 ENST00000505963 ; transcript_alias_2 NONHSAT059645 ;
chr18	lncipedia.org	exon	60251679	60253962	.	+	.	gene_id lnc-ZCCHC2-1 ; transcript_id lnc-ZCCHC2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249546 ; transcript_alias_1 ENST00000505963 ; transcript_alias_2 NONHSAT059645 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27068740	27068950	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:32 ; gene_alias_1 ENSG00000244625 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 CTA-211A9.5 ; gene_alias_5 ENSG00000244625.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150981.2 ; transcript_alias_1 ENST00000450963 ; transcript_alias_2 TCONS_00029388 ; transcript_alias_3 ENST00000450963.1 ; transcript_alias_4 CTA-211A9.5-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320768.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084538 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27089644	27089799	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:32 ; gene_alias_1 ENSG00000244625 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 CTA-211A9.5 ; gene_alias_5 ENSG00000244625.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150981.2 ; transcript_alias_1 ENST00000450963 ; transcript_alias_2 TCONS_00029388 ; transcript_alias_3 ENST00000450963.1 ; transcript_alias_4 CTA-211A9.5-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320768.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084538 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27113216	27113422	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:32 ; gene_alias_1 ENSG00000244625 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 CTA-211A9.5 ; gene_alias_5 ENSG00000244625.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150981.2 ; transcript_alias_1 ENST00000450963 ; transcript_alias_2 TCONS_00029388 ; transcript_alias_3 ENST00000450963.1 ; transcript_alias_4 CTA-211A9.5-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320768.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084538 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27170119	27170180	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:32 ; gene_alias_1 ENSG00000244625 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 CTA-211A9.5 ; gene_alias_5 ENSG00000244625.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150981.2 ; transcript_alias_1 ENST00000450963 ; transcript_alias_2 TCONS_00029388 ; transcript_alias_3 ENST00000450963.1 ; transcript_alias_4 CTA-211A9.5-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320768.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084538 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27172790	27172811	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:32 ; gene_alias_1 ENSG00000244625 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 CTA-211A9.5 ; gene_alias_5 ENSG00000244625.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150981.2 ; transcript_alias_1 ENST00000450963 ; transcript_alias_2 TCONS_00029388 ; transcript_alias_3 ENST00000450963.1 ; transcript_alias_4 CTA-211A9.5-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320768.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084538 ;
chr21	lncipedia.org	exon	34100426	34102972	.	+	.	gene_id lnc-C21orf49-1 ; transcript_id lnc-C21orf49-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000238197 ; gene_alias_2 GCFC1-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000238197.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000064979.3 ; gene_alias_5 PAXBP1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000458479 ; transcript_alias_2 ENST00000458479.1 ; transcript_alias_3 GCFC1-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000139562.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT081742 ;
chr21	lncipedia.org	exon	34104830	34105227	.	+	.	gene_id lnc-C21orf49-1 ; transcript_id lnc-C21orf49-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000238197 ; gene_alias_2 GCFC1-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000238197.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000064979.3 ; gene_alias_5 PAXBP1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000458479 ; transcript_alias_2 ENST00000458479.1 ; transcript_alias_3 GCFC1-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000139562.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT081742 ;
chr12	lncipedia.org	exon	66267593	66267969	.	-	.	gene_id lnc-LLPH-2 ; transcript_id lnc-LLPH-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248947 ; transcript_alias_1 ENST00000504038 ;
chr12	lncipedia.org	exon	66270655	66270912	.	-	.	gene_id lnc-LLPH-2 ; transcript_id lnc-LLPH-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248947 ; transcript_alias_1 ENST00000504038 ;
chr12	lncipedia.org	exon	66275018	66275358	.	-	.	gene_id lnc-LLPH-2 ; transcript_id lnc-LLPH-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248947 ; transcript_alias_1 ENST00000504038 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73501540	73501683	.	-	.	gene_id lnc-RLIM-2 ; transcript_id lnc-RLIM-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000230590 ; gene_alias_2 FTX ; gene_alias_3 ENSG00000230590.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021850.1 ; transcript_alias_1 ENST00000423992 ; transcript_alias_2 ENST00000423992.1 ; transcript_alias_3 FTX-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057259.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT147739 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73504578	73504697	.	-	.	gene_id lnc-RLIM-2 ; transcript_id lnc-RLIM-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000230590 ; gene_alias_2 FTX ; gene_alias_3 ENSG00000230590.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021850.1 ; transcript_alias_1 ENST00000423992 ; transcript_alias_2 ENST00000423992.1 ; transcript_alias_3 FTX-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057259.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT147739 ;
chr10	lncipedia.org	exon	54011725	54012596	.	-	.	gene_id lnc-MBL2-5 ; transcript_id lnc-MBL2-5:3 ; gene_alias_1 ENSG00000236671 ; gene_alias_2 RP11-573I11.2 ; gene_alias_3 ENSG00000236671.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018251.1 ; transcript_alias_1 ENST00000426785 ; transcript_alias_2 ENST00000426785.1 ; transcript_alias_3 RP11-573I11.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000048109.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT013420 ;
chr10	lncipedia.org	exon	54013131	54013200	.	-	.	gene_id lnc-MBL2-5 ; transcript_id lnc-MBL2-5:3 ; gene_alias_1 ENSG00000236671 ; gene_alias_2 RP11-573I11.2 ; gene_alias_3 ENSG00000236671.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018251.1 ; transcript_alias_1 ENST00000426785 ; transcript_alias_2 ENST00000426785.1 ; transcript_alias_3 RP11-573I11.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000048109.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT013420 ;
chr10	lncipedia.org	exon	54053675	54053726	.	-	.	gene_id lnc-MBL2-5 ; transcript_id lnc-MBL2-5:3 ; gene_alias_1 ENSG00000236671 ; gene_alias_2 RP11-573I11.2 ; gene_alias_3 ENSG00000236671.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018251.1 ; transcript_alias_1 ENST00000426785 ; transcript_alias_2 ENST00000426785.1 ; transcript_alias_3 RP11-573I11.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000048109.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT013420 ;
chr10	lncipedia.org	exon	54057560	54057675	.	-	.	gene_id lnc-MBL2-5 ; transcript_id lnc-MBL2-5:3 ; gene_alias_1 ENSG00000236671 ; gene_alias_2 RP11-573I11.2 ; gene_alias_3 ENSG00000236671.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018251.1 ; transcript_alias_1 ENST00000426785 ; transcript_alias_2 ENST00000426785.1 ; transcript_alias_3 RP11-573I11.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000048109.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT013420 ;
chr19	lncipedia.org	exon	20326955	20328125	.	-	.	gene_id lnc-ZNF682-1 ; transcript_id lnc-ZNF682-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251268 ; gene_alias_2 XLOC_013256 ; gene_alias_3 linc-ZNF682-1 ; gene_alias_4 ENSG00000267383.2 ; gene_alias_5 CTC-260E6.6 ; transcript_alias_1 ENST00000502602 ; transcript_alias_2 TCONS_00026840 ; transcript_alias_3 NONHSAT063638 ; transcript_alias_4 ENST00000592022.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	20331132	20331228	.	-	.	gene_id lnc-ZNF682-1 ; transcript_id lnc-ZNF682-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251268 ; gene_alias_2 XLOC_013256 ; gene_alias_3 linc-ZNF682-1 ; gene_alias_4 ENSG00000267383.2 ; gene_alias_5 CTC-260E6.6 ; transcript_alias_1 ENST00000502602 ; transcript_alias_2 TCONS_00026840 ; transcript_alias_3 NONHSAT063638 ; transcript_alias_4 ENST00000592022.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	71172136	71172214	.	+	.	gene_id lnc-CTH-1 ; transcript_id lnc-CTH-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229051 ; gene_alias_2 RP5-952N6.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229051.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009349.1 ; transcript_alias_1 ENST00000419450 ; transcript_alias_2 ENST00000419450.1 ; transcript_alias_3 RP5-952N6.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000025915.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003865 ; transcript_alias_6 NR_125938 ;
chr1	lncipedia.org	exon	71173411	71173664	.	+	.	gene_id lnc-CTH-1 ; transcript_id lnc-CTH-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229051 ; gene_alias_2 RP5-952N6.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229051.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009349.1 ; transcript_alias_1 ENST00000419450 ; transcript_alias_2 ENST00000419450.1 ; transcript_alias_3 RP5-952N6.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000025915.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003865 ; transcript_alias_6 NR_125938 ;
chr1	lncipedia.org	exon	71174404	71174453	.	+	.	gene_id lnc-CTH-1 ; transcript_id lnc-CTH-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229051 ; gene_alias_2 RP5-952N6.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229051.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009349.1 ; transcript_alias_1 ENST00000419450 ; transcript_alias_2 ENST00000419450.1 ; transcript_alias_3 RP5-952N6.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000025915.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003865 ; transcript_alias_6 NR_125938 ;
chr1	lncipedia.org	exon	71177740	71177814	.	+	.	gene_id lnc-CTH-1 ; transcript_id lnc-CTH-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229051 ; gene_alias_2 RP5-952N6.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229051.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009349.1 ; transcript_alias_1 ENST00000419450 ; transcript_alias_2 ENST00000419450.1 ; transcript_alias_3 RP5-952N6.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000025915.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003865 ; transcript_alias_6 NR_125938 ;
chr1	lncipedia.org	exon	71178812	71178990	.	+	.	gene_id lnc-CTH-1 ; transcript_id lnc-CTH-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229051 ; gene_alias_2 RP5-952N6.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229051.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009349.1 ; transcript_alias_1 ENST00000419450 ; transcript_alias_2 ENST00000419450.1 ; transcript_alias_3 RP5-952N6.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000025915.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003865 ; transcript_alias_6 NR_125938 ;
chr1	lncipedia.org	exon	71243213	71243378	.	+	.	gene_id lnc-CTH-1 ; transcript_id lnc-CTH-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229051 ; gene_alias_2 RP5-952N6.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229051.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009349.1 ; transcript_alias_1 ENST00000419450 ; transcript_alias_2 ENST00000419450.1 ; transcript_alias_3 RP5-952N6.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000025915.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003865 ; transcript_alias_6 NR_125938 ;
chr1	lncipedia.org	exon	71250869	71252151	.	+	.	gene_id lnc-CTH-1 ; transcript_id lnc-CTH-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229051 ; gene_alias_2 RP5-952N6.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229051.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009349.1 ; transcript_alias_1 ENST00000419450 ; transcript_alias_2 ENST00000419450.1 ; transcript_alias_3 RP5-952N6.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000025915.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003865 ; transcript_alias_6 NR_125938 ;
chr7	lncipedia.org	exon	141405496	141405557	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1147-2 ; transcript_id lnc-KIAA1147-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000228775 ; gene_alias_2 RP5-894A10.5 ; gene_alias_3 ENSG00000228775.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000157538.1 ; gene_alias_5 WEE2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000459753 ; transcript_alias_2 ENST00000459753.1 ; transcript_alias_3 RP5-894A10.5-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000349099.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123738 ;
chr7	lncipedia.org	exon	141423716	141423824	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1147-2 ; transcript_id lnc-KIAA1147-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000228775 ; gene_alias_2 RP5-894A10.5 ; gene_alias_3 ENSG00000228775.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000157538.1 ; gene_alias_5 WEE2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000459753 ; transcript_alias_2 ENST00000459753.1 ; transcript_alias_3 RP5-894A10.5-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000349099.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123738 ;
chr7	lncipedia.org	exon	141427792	141427945	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1147-2 ; transcript_id lnc-KIAA1147-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000228775 ; gene_alias_2 RP5-894A10.5 ; gene_alias_3 ENSG00000228775.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000157538.1 ; gene_alias_5 WEE2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000459753 ; transcript_alias_2 ENST00000459753.1 ; transcript_alias_3 RP5-894A10.5-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000349099.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123738 ;
chr7	lncipedia.org	exon	141437183	141437367	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1147-2 ; transcript_id lnc-KIAA1147-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000228775 ; gene_alias_2 RP5-894A10.5 ; gene_alias_3 ENSG00000228775.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000157538.1 ; gene_alias_5 WEE2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000459753 ; transcript_alias_2 ENST00000459753.1 ; transcript_alias_3 RP5-894A10.5-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000349099.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123738 ;
chr7	lncipedia.org	exon	141437998	141438052	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1147-2 ; transcript_id lnc-KIAA1147-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000228775 ; gene_alias_2 RP5-894A10.5 ; gene_alias_3 ENSG00000228775.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000157538.1 ; gene_alias_5 WEE2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000459753 ; transcript_alias_2 ENST00000459753.1 ; transcript_alias_3 RP5-894A10.5-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000349099.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123738 ;
chr10	lncipedia.org	exon	80288508	80288571	.	+	.	gene_id lnc-RPS24-3 ; transcript_id lnc-RPS24-3:7 ; gene_alias_1 ENSG00000230417 ; gene_alias_2 RP11-90J7.3 ; gene_alias_3 ENSG00000230417.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018555.2 ; gene_alias_5 ENSG00000230417.6 ; gene_alias_6 LINC00856 ; transcript_alias_1 ENST00000421324 ; transcript_alias_2 ENST00000421324.1 ; transcript_alias_3 RP11-90J7.3-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000363547.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT015078 ;
chr10	lncipedia.org	exon	80434446	80434724	.	+	.	gene_id lnc-RPS24-3 ; transcript_id lnc-RPS24-3:7 ; gene_alias_1 ENSG00000230417 ; gene_alias_2 RP11-90J7.3 ; gene_alias_3 ENSG00000230417.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018555.2 ; gene_alias_5 ENSG00000230417.6 ; gene_alias_6 LINC00856 ; transcript_alias_1 ENST00000421324 ; transcript_alias_2 ENST00000421324.1 ; transcript_alias_3 RP11-90J7.3-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000363547.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT015078 ;
chr3	lncipedia.org	exon	62247498	62249817	.	-	.	gene_id lnc-FEZF2-1 ; transcript_id lnc-FEZF2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000241472 ; gene_alias_2 RP11-204J18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241472.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158657.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241472.2 ; gene_alias_6 PTPRG-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000474795 ; transcript_alias_2 ENST00000474795.1 ; transcript_alias_3 RP11-204J18.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351663.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090179 ;
chr3	lncipedia.org	exon	62280375	62280453	.	-	.	gene_id lnc-FEZF2-1 ; transcript_id lnc-FEZF2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000241472 ; gene_alias_2 RP11-204J18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241472.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158657.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241472.2 ; gene_alias_6 PTPRG-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000474795 ; transcript_alias_2 ENST00000474795.1 ; transcript_alias_3 RP11-204J18.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351663.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090179 ;
chr3	lncipedia.org	exon	62302781	62302867	.	-	.	gene_id lnc-FEZF2-1 ; transcript_id lnc-FEZF2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000241472 ; gene_alias_2 RP11-204J18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241472.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158657.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241472.2 ; gene_alias_6 PTPRG-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000474795 ; transcript_alias_2 ENST00000474795.1 ; transcript_alias_3 RP11-204J18.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351663.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090179 ;
chr3	lncipedia.org	exon	62303483	62303575	.	-	.	gene_id lnc-FEZF2-1 ; transcript_id lnc-FEZF2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000241472 ; gene_alias_2 RP11-204J18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241472.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158657.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241472.2 ; gene_alias_6 PTPRG-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000474795 ; transcript_alias_2 ENST00000474795.1 ; transcript_alias_3 RP11-204J18.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351663.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090179 ;
chr3	lncipedia.org	exon	62304541	62304622	.	-	.	gene_id lnc-FEZF2-1 ; transcript_id lnc-FEZF2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000241472 ; gene_alias_2 RP11-204J18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241472.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158657.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241472.2 ; gene_alias_6 PTPRG-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000474795 ; transcript_alias_2 ENST00000474795.1 ; transcript_alias_3 RP11-204J18.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351663.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090179 ;
chr1	lncipedia.org	exon	213025450	213027653	.	-	.	gene_id lnc-C1orf227-1 ; transcript_id lnc-C1orf227-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000198468 ; gene_alias_2 NCRNA00292 ; gene_alias_3 ENSG00000198468.2 ; gene_alias_4 FLVCR1-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000036923.1 ; transcript_alias_1 ENST00000356684 ; transcript_alias_2 ENST00000356684.2 ; transcript_alias_3 FLVCR1-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000089675.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT009404 ;
chr1	lncipedia.org	exon	213031108	213031430	.	-	.	gene_id lnc-C1orf227-1 ; transcript_id lnc-C1orf227-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000198468 ; gene_alias_2 NCRNA00292 ; gene_alias_3 ENSG00000198468.2 ; gene_alias_4 FLVCR1-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000036923.1 ; transcript_alias_1 ENST00000356684 ; transcript_alias_2 ENST00000356684.2 ; transcript_alias_3 FLVCR1-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000089675.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT009404 ;
chr8	lncipedia.org	exon	90733132	90733602	.	-	.	gene_id lnc-NBN-1 ; transcript_id lnc-NBN-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000251136 ; gene_alias_2 RP11-37B2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251136.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163788.2 ; gene_alias_5 ENSG00000251136.4 ; transcript_alias_1 ENST00000521996 ; transcript_alias_2 ENST00000521996.1 ; transcript_alias_3 RP11-37B2.1-010 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000375685.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127623 ;
chr8	lncipedia.org	exon	90734243	90734384	.	-	.	gene_id lnc-NBN-1 ; transcript_id lnc-NBN-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000251136 ; gene_alias_2 RP11-37B2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251136.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163788.2 ; gene_alias_5 ENSG00000251136.4 ; transcript_alias_1 ENST00000521996 ; transcript_alias_2 ENST00000521996.1 ; transcript_alias_3 RP11-37B2.1-010 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000375685.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127623 ;
chr8	lncipedia.org	exon	90736857	90737158	.	-	.	gene_id lnc-NBN-1 ; transcript_id lnc-NBN-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000251136 ; gene_alias_2 RP11-37B2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251136.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163788.2 ; gene_alias_5 ENSG00000251136.4 ; transcript_alias_1 ENST00000521996 ; transcript_alias_2 ENST00000521996.1 ; transcript_alias_3 RP11-37B2.1-010 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000375685.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127623 ;
chr8	lncipedia.org	exon	91658669	91658861	.	+	.	gene_id lnc-NECAB1-1 ; transcript_id lnc-NECAB1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246792 ; gene_alias_2 RP11-68L18.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246792.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164007.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501194 ; transcript_alias_2 ENST00000501194.2 ; transcript_alias_3 RP11-68L18.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000376723.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127657 ;
chr8	lncipedia.org	exon	91660706	91663985	.	+	.	gene_id lnc-NECAB1-1 ; transcript_id lnc-NECAB1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246792 ; gene_alias_2 RP11-68L18.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246792.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164007.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501194 ; transcript_alias_2 ENST00000501194.2 ; transcript_alias_3 RP11-68L18.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000376723.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127657 ;
chr3	lncipedia.org	exon	193727965	193728366	.	-	.	gene_id lnc-CPN2-4 ; transcript_id lnc-CPN2-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000230102 ; gene_alias_2 RP11-407B7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230102.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000155989.1 ; transcript_alias_1 ENST00000449350 ; transcript_alias_2 ENST00000449350.1 ; transcript_alias_3 RP11-407B7.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000342640.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	193733340	193733424	.	-	.	gene_id lnc-CPN2-4 ; transcript_id lnc-CPN2-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000230102 ; gene_alias_2 RP11-407B7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230102.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000155989.1 ; transcript_alias_1 ENST00000449350 ; transcript_alias_2 ENST00000449350.1 ; transcript_alias_3 RP11-407B7.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000342640.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	193770149	193770231	.	-	.	gene_id lnc-CPN2-4 ; transcript_id lnc-CPN2-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000230102 ; gene_alias_2 RP11-407B7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230102.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000155989.1 ; transcript_alias_1 ENST00000449350 ; transcript_alias_2 ENST00000449350.1 ; transcript_alias_3 RP11-407B7.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000342640.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	193788611	193788741	.	-	.	gene_id lnc-CPN2-4 ; transcript_id lnc-CPN2-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000230102 ; gene_alias_2 RP11-407B7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230102.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000155989.1 ; transcript_alias_1 ENST00000449350 ; transcript_alias_2 ENST00000449350.1 ; transcript_alias_3 RP11-407B7.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000342640.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	186173328	186173436	.	-	.	gene_id lnc-CRYGS-1 ; transcript_id lnc-CRYGS-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000224406 ; gene_alias_2 XLOC_003358 ; gene_alias_3 linc-DGKG ; gene_alias_4 RP11-48F14.1 ; gene_alias_5 ENSG00000224406.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000156618.1 ; transcript_alias_1 ENST00000458099 ; transcript_alias_2 TCONS_00005906 ; transcript_alias_3 ENST00000458099.1 ; transcript_alias_4 RP11-48F14.1-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000344805.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT093822 ;
chr3	lncipedia.org	exon	186173511	186173562	.	-	.	gene_id lnc-CRYGS-1 ; transcript_id lnc-CRYGS-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000224406 ; gene_alias_2 XLOC_003358 ; gene_alias_3 linc-DGKG ; gene_alias_4 RP11-48F14.1 ; gene_alias_5 ENSG00000224406.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000156618.1 ; transcript_alias_1 ENST00000458099 ; transcript_alias_2 TCONS_00005906 ; transcript_alias_3 ENST00000458099.1 ; transcript_alias_4 RP11-48F14.1-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000344805.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT093822 ;
chr3	lncipedia.org	exon	186173777	186173834	.	-	.	gene_id lnc-CRYGS-1 ; transcript_id lnc-CRYGS-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000224406 ; gene_alias_2 XLOC_003358 ; gene_alias_3 linc-DGKG ; gene_alias_4 RP11-48F14.1 ; gene_alias_5 ENSG00000224406.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000156618.1 ; transcript_alias_1 ENST00000458099 ; transcript_alias_2 TCONS_00005906 ; transcript_alias_3 ENST00000458099.1 ; transcript_alias_4 RP11-48F14.1-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000344805.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT093822 ;
chr3	lncipedia.org	exon	186174186	186174335	.	-	.	gene_id lnc-CRYGS-1 ; transcript_id lnc-CRYGS-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000224406 ; gene_alias_2 XLOC_003358 ; gene_alias_3 linc-DGKG ; gene_alias_4 RP11-48F14.1 ; gene_alias_5 ENSG00000224406.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000156618.1 ; transcript_alias_1 ENST00000458099 ; transcript_alias_2 TCONS_00005906 ; transcript_alias_3 ENST00000458099.1 ; transcript_alias_4 RP11-48F14.1-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000344805.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT093822 ;
chr3	lncipedia.org	exon	186175130	186175194	.	-	.	gene_id lnc-CRYGS-1 ; transcript_id lnc-CRYGS-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000224406 ; gene_alias_2 XLOC_003358 ; gene_alias_3 linc-DGKG ; gene_alias_4 RP11-48F14.1 ; gene_alias_5 ENSG00000224406.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000156618.1 ; transcript_alias_1 ENST00000458099 ; transcript_alias_2 TCONS_00005906 ; transcript_alias_3 ENST00000458099.1 ; transcript_alias_4 RP11-48F14.1-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000344805.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT093822 ;
chr7	lncipedia.org	exon	131582400	131582484	.	+	.	gene_id lnc-MKLN1-2 ; transcript_id lnc-MKLN1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000243416 ; gene_alias_2 AC009518.4 ; gene_alias_3 ENSG00000243416.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000155053.2 ; gene_alias_5 ENSG00000224865.3 ; transcript_alias_1 ENST00000452219 ; transcript_alias_2 ENST00000452219.1 ; transcript_alias_3 AC009518.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000338247.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123422 ;
chr7	lncipedia.org	exon	131616882	131617068	.	+	.	gene_id lnc-MKLN1-2 ; transcript_id lnc-MKLN1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000243416 ; gene_alias_2 AC009518.4 ; gene_alias_3 ENSG00000243416.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000155053.2 ; gene_alias_5 ENSG00000224865.3 ; transcript_alias_1 ENST00000452219 ; transcript_alias_2 ENST00000452219.1 ; transcript_alias_3 AC009518.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000338247.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123422 ;
chr7	lncipedia.org	exon	131617784	131618070	.	+	.	gene_id lnc-MKLN1-2 ; transcript_id lnc-MKLN1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000243416 ; gene_alias_2 AC009518.4 ; gene_alias_3 ENSG00000243416.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000155053.2 ; gene_alias_5 ENSG00000224865.3 ; transcript_alias_1 ENST00000452219 ; transcript_alias_2 ENST00000452219.1 ; transcript_alias_3 AC009518.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000338247.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123422 ;
chr12	lncipedia.org	exon	111374389	111374502	.	+	.	gene_id lnc-CCDC63-2 ; transcript_id lnc-CCDC63-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000185847 ; gene_alias_2 RP1-46F2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000185847.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169536.1 ; transcript_alias_1 ENST00000553177 ; transcript_alias_2 ENST00000553177.1 ; transcript_alias_3 RP1-46F2.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404683.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030710 ;
chr12	lncipedia.org	exon	111376094	111376316	.	+	.	gene_id lnc-CCDC63-2 ; transcript_id lnc-CCDC63-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000185847 ; gene_alias_2 RP1-46F2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000185847.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169536.1 ; transcript_alias_1 ENST00000553177 ; transcript_alias_2 ENST00000553177.1 ; transcript_alias_3 RP1-46F2.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404683.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030710 ;
chr12	lncipedia.org	exon	111395826	111396012	.	+	.	gene_id lnc-CCDC63-2 ; transcript_id lnc-CCDC63-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000185847 ; gene_alias_2 RP1-46F2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000185847.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169536.1 ; transcript_alias_1 ENST00000553177 ; transcript_alias_2 ENST00000553177.1 ; transcript_alias_3 RP1-46F2.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404683.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030710 ;
chr6	lncipedia.org	exon	52442283	52442449	.	+	.	gene_id lnc-EFHC1-2 ; transcript_id lnc-EFHC1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225791 ; gene_alias_2 RP1-180E22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000225791.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014849.1 ; gene_alias_5 ENSG00000225791.2 ; gene_alias_6 TRAM2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000453216 ; transcript_alias_2 ENST00000453216.1 ; transcript_alias_3 RP1-180E22.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000040909.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT113131 ;
chr6	lncipedia.org	exon	52442848	52443191	.	+	.	gene_id lnc-EFHC1-2 ; transcript_id lnc-EFHC1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225791 ; gene_alias_2 RP1-180E22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000225791.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014849.1 ; gene_alias_5 ENSG00000225791.2 ; gene_alias_6 TRAM2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000453216 ; transcript_alias_2 ENST00000453216.1 ; transcript_alias_3 RP1-180E22.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000040909.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT113131 ;
chr6	lncipedia.org	exon	52444173	52444325	.	+	.	gene_id lnc-EFHC1-2 ; transcript_id lnc-EFHC1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225791 ; gene_alias_2 RP1-180E22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000225791.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014849.1 ; gene_alias_5 ENSG00000225791.2 ; gene_alias_6 TRAM2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000453216 ; transcript_alias_2 ENST00000453216.1 ; transcript_alias_3 RP1-180E22.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000040909.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT113131 ;
chr17	lncipedia.org	exon	46694460	46696607	.	+	.	gene_id lnc-CALCOCO2-6 ; transcript_id lnc-CALCOCO2-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248304 ; gene_alias_2 AC103702.1 ; transcript_alias_1 ENST00000510789 ;
chr17	lncipedia.org	exon	46699848	46699890	.	+	.	gene_id lnc-CALCOCO2-6 ; transcript_id lnc-CALCOCO2-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248304 ; gene_alias_2 AC103702.1 ; transcript_alias_1 ENST00000510789 ;
chr3	lncipedia.org	exon	62249717	62249817	.	-	.	gene_id lnc-FEZF2-1 ; transcript_id lnc-FEZF2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000241472 ; gene_alias_2 RP11-204J18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241472.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158657.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241472.2 ; gene_alias_6 PTPRG-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000495542 ; transcript_alias_2 ENST00000495542.1 ; transcript_alias_3 RP11-204J18.3-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351669.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090181 ;
chr3	lncipedia.org	exon	62280375	62280453	.	-	.	gene_id lnc-FEZF2-1 ; transcript_id lnc-FEZF2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000241472 ; gene_alias_2 RP11-204J18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241472.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158657.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241472.2 ; gene_alias_6 PTPRG-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000495542 ; transcript_alias_2 ENST00000495542.1 ; transcript_alias_3 RP11-204J18.3-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351669.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090181 ;
chr3	lncipedia.org	exon	62302781	62302867	.	-	.	gene_id lnc-FEZF2-1 ; transcript_id lnc-FEZF2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000241472 ; gene_alias_2 RP11-204J18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241472.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158657.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241472.2 ; gene_alias_6 PTPRG-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000495542 ; transcript_alias_2 ENST00000495542.1 ; transcript_alias_3 RP11-204J18.3-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351669.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090181 ;
chr3	lncipedia.org	exon	62303483	62303578	.	-	.	gene_id lnc-FEZF2-1 ; transcript_id lnc-FEZF2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000241472 ; gene_alias_2 RP11-204J18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241472.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158657.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241472.2 ; gene_alias_6 PTPRG-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000495542 ; transcript_alias_2 ENST00000495542.1 ; transcript_alias_3 RP11-204J18.3-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351669.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090181 ;
chr3	lncipedia.org	exon	62354867	62355005	.	-	.	gene_id lnc-FEZF2-1 ; transcript_id lnc-FEZF2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000241472 ; gene_alias_2 RP11-204J18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241472.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158657.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241472.2 ; gene_alias_6 PTPRG-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000495542 ; transcript_alias_2 ENST00000495542.1 ; transcript_alias_3 RP11-204J18.3-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351669.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090181 ;
chr15	lncipedia.org	exon	40213243	40213859	.	+	.	gene_id lnc-EIF2AK4-1 ; transcript_id lnc-EIF2AK4-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000246863 ; gene_alias_2 XLOC_011218 ; gene_alias_3 linc-EIF2AK4 ; gene_alias_4 AC012377.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499797 ; transcript_alias_2 TCONS_00023260 ;
chr15	lncipedia.org	exon	40214988	40217099	.	+	.	gene_id lnc-EIF2AK4-1 ; transcript_id lnc-EIF2AK4-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000246863 ; gene_alias_2 XLOC_011218 ; gene_alias_3 linc-EIF2AK4 ; gene_alias_4 AC012377.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499797 ; transcript_alias_2 TCONS_00023260 ;
chr12	lncipedia.org	exon	24366190	24366351	.	-	.	gene_id lnc-BCAT1-2 ; transcript_id lnc-BCAT1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255864 ; gene_alias_2 RP11-444D3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255864.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169057.3 ; transcript_alias_1 ENST00000540811 ; transcript_alias_2 ENST00000540811.1 ; transcript_alias_3 RP11-444D3.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402098.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027312 ;
chr12	lncipedia.org	exon	24430150	24430246	.	-	.	gene_id lnc-BCAT1-2 ; transcript_id lnc-BCAT1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255864 ; gene_alias_2 RP11-444D3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255864.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169057.3 ; transcript_alias_1 ENST00000540811 ; transcript_alias_2 ENST00000540811.1 ; transcript_alias_3 RP11-444D3.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402098.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027312 ;
chr12	lncipedia.org	exon	24521497	24521573	.	-	.	gene_id lnc-BCAT1-2 ; transcript_id lnc-BCAT1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255864 ; gene_alias_2 RP11-444D3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255864.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169057.3 ; transcript_alias_1 ENST00000540811 ; transcript_alias_2 ENST00000540811.1 ; transcript_alias_3 RP11-444D3.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402098.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027312 ;
chr12	lncipedia.org	exon	24560419	24560500	.	-	.	gene_id lnc-BCAT1-2 ; transcript_id lnc-BCAT1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255864 ; gene_alias_2 RP11-444D3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255864.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169057.3 ; transcript_alias_1 ENST00000540811 ; transcript_alias_2 ENST00000540811.1 ; transcript_alias_3 RP11-444D3.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402098.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027312 ;
chr12	lncipedia.org	exon	24715267	24715524	.	-	.	gene_id lnc-BCAT1-2 ; transcript_id lnc-BCAT1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255864 ; gene_alias_2 RP11-444D3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255864.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169057.3 ; transcript_alias_1 ENST00000540811 ; transcript_alias_2 ENST00000540811.1 ; transcript_alias_3 RP11-444D3.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402098.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027312 ;
chr19	lncipedia.org	exon	9649409	9649674	.	+	.	gene_id lnc-ZNF177-2 ; transcript_id lnc-ZNF177-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247585 ; gene_alias_2 AC008567.1 ; transcript_alias_1 ENST00000455223 ;
chr19	lncipedia.org	exon	9650082	9650402	.	+	.	gene_id lnc-ZNF177-2 ; transcript_id lnc-ZNF177-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247585 ; gene_alias_2 AC008567.1 ; transcript_alias_1 ENST00000455223 ;
chr4	lncipedia.org	exon	14978524	14978632	.	-	.	gene_id lnc-FBXL5-3 ; transcript_id lnc-FBXL5-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247624 ; gene_alias_2 AC006296.3 ; gene_alias_3 ENSG00000247624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160381.3 ; gene_alias_5 CPEB2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000501916 ; transcript_alias_2 ENST00000501916.1 ; transcript_alias_3 AC006296.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000360417.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT095612 ;
chr4	lncipedia.org	exon	14979008	14979180	.	-	.	gene_id lnc-FBXL5-3 ; transcript_id lnc-FBXL5-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247624 ; gene_alias_2 AC006296.3 ; gene_alias_3 ENSG00000247624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160381.3 ; gene_alias_5 CPEB2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000501916 ; transcript_alias_2 ENST00000501916.1 ; transcript_alias_3 AC006296.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000360417.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT095612 ;
chr4	lncipedia.org	exon	14986845	14987000	.	-	.	gene_id lnc-FBXL5-3 ; transcript_id lnc-FBXL5-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247624 ; gene_alias_2 AC006296.3 ; gene_alias_3 ENSG00000247624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160381.3 ; gene_alias_5 CPEB2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000501916 ; transcript_alias_2 ENST00000501916.1 ; transcript_alias_3 AC006296.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000360417.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT095612 ;
chr4	lncipedia.org	exon	14994336	14994526	.	-	.	gene_id lnc-FBXL5-3 ; transcript_id lnc-FBXL5-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247624 ; gene_alias_2 AC006296.3 ; gene_alias_3 ENSG00000247624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160381.3 ; gene_alias_5 CPEB2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000501916 ; transcript_alias_2 ENST00000501916.1 ; transcript_alias_3 AC006296.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000360417.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT095612 ;
chr4	lncipedia.org	exon	14994953	14996129	.	-	.	gene_id lnc-FBXL5-3 ; transcript_id lnc-FBXL5-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247624 ; gene_alias_2 AC006296.3 ; gene_alias_3 ENSG00000247624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160381.3 ; gene_alias_5 CPEB2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000501916 ; transcript_alias_2 ENST00000501916.1 ; transcript_alias_3 AC006296.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000360417.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT095612 ;
chr15	lncipedia.org	exon	50647664	50647742	.	+	.	gene_id lnc-USP8-2 ; transcript_id lnc-USP8-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000244879 ; gene_alias_2 AC022087.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499624 ;
chr15	lncipedia.org	exon	50648297	50650501	.	+	.	gene_id lnc-USP8-2 ; transcript_id lnc-USP8-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000244879 ; gene_alias_2 AC022087.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499624 ;
chr12	lncipedia.org	exon	130521159	130521562	.	-	.	gene_id lnc-TMEM132D-1 ; transcript_id lnc-TMEM132D-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000214039 ; gene_alias_2 RP11-474D1.4 ; transcript_alias_1 ENST00000291374 ;
chr12	lncipedia.org	exon	130526772	130526887	.	-	.	gene_id lnc-TMEM132D-1 ; transcript_id lnc-TMEM132D-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000214039 ; gene_alias_2 RP11-474D1.4 ; transcript_alias_1 ENST00000291374 ;
chrX	lncipedia.org	exon	146990949	146992513	.	-	.	gene_id lnc-IDS-4 ; transcript_id lnc-IDS-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000224191 ; gene_alias_2 FMR1-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000268066.1 ; transcript_alias_1 ENST00000545310 ; transcript_alias_2 NONHSAT147763 ; transcript_alias_3 ENST00000598667.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	146993160	146993335	.	-	.	gene_id lnc-IDS-4 ; transcript_id lnc-IDS-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000224191 ; gene_alias_2 FMR1-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000268066.1 ; transcript_alias_1 ENST00000545310 ; transcript_alias_2 NONHSAT147763 ; transcript_alias_3 ENST00000598667.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	2771262	2771401	.	+	.	gene_id lnc-NQO2-5 ; transcript_id lnc-NQO2-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248974 ; transcript_alias_1 ENST00000506356 ;
chr6	lncipedia.org	exon	2781635	2783599	.	+	.	gene_id lnc-NQO2-5 ; transcript_id lnc-NQO2-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248974 ; transcript_alias_1 ENST00000506356 ;
chr8	lncipedia.org	exon	90729656	90729956	.	-	.	gene_id lnc-NBN-1 ; transcript_id lnc-NBN-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000251136 ; gene_alias_2 RP11-37B2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251136.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163788.2 ; gene_alias_5 ENSG00000251136.4 ; transcript_alias_1 ENST00000504145 ; transcript_alias_2 ENST00000504145.1 ; transcript_alias_3 RP11-37B2.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000375482.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127621 ;
chr8	lncipedia.org	exon	90734243	90734384	.	-	.	gene_id lnc-NBN-1 ; transcript_id lnc-NBN-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000251136 ; gene_alias_2 RP11-37B2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251136.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163788.2 ; gene_alias_5 ENSG00000251136.4 ; transcript_alias_1 ENST00000504145 ; transcript_alias_2 ENST00000504145.1 ; transcript_alias_3 RP11-37B2.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000375482.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127621 ;
chr8	lncipedia.org	exon	90736857	90737194	.	-	.	gene_id lnc-NBN-1 ; transcript_id lnc-NBN-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000251136 ; gene_alias_2 RP11-37B2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251136.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163788.2 ; gene_alias_5 ENSG00000251136.4 ; transcript_alias_1 ENST00000504145 ; transcript_alias_2 ENST00000504145.1 ; transcript_alias_3 RP11-37B2.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000375482.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127621 ;
chr8	lncipedia.org	exon	90737746	90737869	.	-	.	gene_id lnc-NBN-1 ; transcript_id lnc-NBN-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000251136 ; gene_alias_2 RP11-37B2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251136.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163788.2 ; gene_alias_5 ENSG00000251136.4 ; transcript_alias_1 ENST00000504145 ; transcript_alias_2 ENST00000504145.1 ; transcript_alias_3 RP11-37B2.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000375482.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127621 ;
chr8	lncipedia.org	exon	90769273	90769939	.	-	.	gene_id lnc-NBN-1 ; transcript_id lnc-NBN-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000251136 ; gene_alias_2 RP11-37B2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251136.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163788.2 ; gene_alias_5 ENSG00000251136.4 ; transcript_alias_1 ENST00000504145 ; transcript_alias_2 ENST00000504145.1 ; transcript_alias_3 RP11-37B2.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000375482.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127621 ;
chr14	lncipedia.org	exon	36539633	36539891	.	+	.	gene_id lnc-BRMS1L-2 ; transcript_id lnc-BRMS1L-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257585 ; gene_alias_2 RP11-259K15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257585.1 ; gene_alias_4 LINC00609 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000170616.1 ; transcript_alias_1 ENST00000546508 ; transcript_alias_2 ENST00000546508.1 ; transcript_alias_3 LINC00609-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409825.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036408 ; transcript_alias_6 NR_073454 ;
chr14	lncipedia.org	exon	36633326	36633472	.	+	.	gene_id lnc-BRMS1L-2 ; transcript_id lnc-BRMS1L-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257585 ; gene_alias_2 RP11-259K15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257585.1 ; gene_alias_4 LINC00609 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000170616.1 ; transcript_alias_1 ENST00000546508 ; transcript_alias_2 ENST00000546508.1 ; transcript_alias_3 LINC00609-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409825.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036408 ; transcript_alias_6 NR_073454 ;
chr14	lncipedia.org	exon	36634318	36634494	.	+	.	gene_id lnc-BRMS1L-2 ; transcript_id lnc-BRMS1L-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257585 ; gene_alias_2 RP11-259K15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257585.1 ; gene_alias_4 LINC00609 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000170616.1 ; transcript_alias_1 ENST00000546508 ; transcript_alias_2 ENST00000546508.1 ; transcript_alias_3 LINC00609-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409825.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036408 ; transcript_alias_6 NR_073454 ;
chr14	lncipedia.org	exon	77507407	77507620	.	+	.	gene_id lnc-KIAA1737-1 ; transcript_id lnc-KIAA1737-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246548 ; gene_alias_2 XLOC_010882 ; gene_alias_3 linc-KIAA1737-1 ; gene_alias_4 ENSG00000246548.3 ; gene_alias_5 RP11-7F17.5 ; transcript_alias_1 ENST00000500215 ; transcript_alias_2 TCONS_00022395 ; transcript_alias_3 NONHSAT037949 ; transcript_alias_4 ENST00000500215.3 ;
chr14	lncipedia.org	exon	77525881	77526071	.	+	.	gene_id lnc-KIAA1737-1 ; transcript_id lnc-KIAA1737-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246548 ; gene_alias_2 XLOC_010882 ; gene_alias_3 linc-KIAA1737-1 ; gene_alias_4 ENSG00000246548.3 ; gene_alias_5 RP11-7F17.5 ; transcript_alias_1 ENST00000500215 ; transcript_alias_2 TCONS_00022395 ; transcript_alias_3 NONHSAT037949 ; transcript_alias_4 ENST00000500215.3 ;
chr14	lncipedia.org	exon	77532414	77532537	.	+	.	gene_id lnc-KIAA1737-1 ; transcript_id lnc-KIAA1737-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246548 ; gene_alias_2 XLOC_010882 ; gene_alias_3 linc-KIAA1737-1 ; gene_alias_4 ENSG00000246548.3 ; gene_alias_5 RP11-7F17.5 ; transcript_alias_1 ENST00000500215 ; transcript_alias_2 TCONS_00022395 ; transcript_alias_3 NONHSAT037949 ; transcript_alias_4 ENST00000500215.3 ;
chr14	lncipedia.org	exon	77533452	77535846	.	+	.	gene_id lnc-KIAA1737-1 ; transcript_id lnc-KIAA1737-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246548 ; gene_alias_2 XLOC_010882 ; gene_alias_3 linc-KIAA1737-1 ; gene_alias_4 ENSG00000246548.3 ; gene_alias_5 RP11-7F17.5 ; transcript_alias_1 ENST00000500215 ; transcript_alias_2 TCONS_00022395 ; transcript_alias_3 NONHSAT037949 ; transcript_alias_4 ENST00000500215.3 ;
chr12	lncipedia.org	exon	81664463	81664628	.	+	.	gene_id lnc-ACSS3-1 ; transcript_id lnc-ACSS3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000257467 ; gene_alias_2 RP11-121G22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257467.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170246.1 ; transcript_alias_1 ENST00000550138 ; transcript_alias_2 ENST00000550138.1 ; transcript_alias_3 RP11-121G22.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408171.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029694 ;
chr12	lncipedia.org	exon	81676466	81676573	.	+	.	gene_id lnc-ACSS3-1 ; transcript_id lnc-ACSS3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000257467 ; gene_alias_2 RP11-121G22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257467.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170246.1 ; transcript_alias_1 ENST00000550138 ; transcript_alias_2 ENST00000550138.1 ; transcript_alias_3 RP11-121G22.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408171.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029694 ;
chr12	lncipedia.org	exon	81686173	81686303	.	+	.	gene_id lnc-ACSS3-1 ; transcript_id lnc-ACSS3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000257467 ; gene_alias_2 RP11-121G22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257467.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170246.1 ; transcript_alias_1 ENST00000550138 ; transcript_alias_2 ENST00000550138.1 ; transcript_alias_3 RP11-121G22.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408171.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029694 ;
chr12	lncipedia.org	exon	81690413	81690548	.	+	.	gene_id lnc-ACSS3-1 ; transcript_id lnc-ACSS3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000257467 ; gene_alias_2 RP11-121G22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257467.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170246.1 ; transcript_alias_1 ENST00000550138 ; transcript_alias_2 ENST00000550138.1 ; transcript_alias_3 RP11-121G22.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408171.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029694 ;
chr12	lncipedia.org	exon	81691842	81691888	.	+	.	gene_id lnc-ACSS3-1 ; transcript_id lnc-ACSS3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000257467 ; gene_alias_2 RP11-121G22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257467.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170246.1 ; transcript_alias_1 ENST00000550138 ; transcript_alias_2 ENST00000550138.1 ; transcript_alias_3 RP11-121G22.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408171.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029694 ;
chr1	lncipedia.org	exon	43424720	43425248	.	+	.	gene_id lnc-ZNF691-1 ; transcript_id lnc-ZNF691-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227533 ; gene_alias_2 RP5-848E13.3 ; gene_alias_3 ENSG00000227533.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000007699.1 ; gene_alias_5 SLC2A1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000431759 ; transcript_alias_2 ENST00000431759.1 ; transcript_alias_3 RP5-848E13.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000020688.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT002769 ; transcript_alias_6 NR_033967 ;
chr1	lncipedia.org	exon	43435920	43436065	.	+	.	gene_id lnc-ZNF691-1 ; transcript_id lnc-ZNF691-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227533 ; gene_alias_2 RP5-848E13.3 ; gene_alias_3 ENSG00000227533.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000007699.1 ; gene_alias_5 SLC2A1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000431759 ; transcript_alias_2 ENST00000431759.1 ; transcript_alias_3 RP5-848E13.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000020688.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT002769 ; transcript_alias_6 NR_033967 ;
chr1	lncipedia.org	exon	43439645	43439859	.	+	.	gene_id lnc-ZNF691-1 ; transcript_id lnc-ZNF691-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227533 ; gene_alias_2 RP5-848E13.3 ; gene_alias_3 ENSG00000227533.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000007699.1 ; gene_alias_5 SLC2A1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000431759 ; transcript_alias_2 ENST00000431759.1 ; transcript_alias_3 RP5-848E13.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000020688.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT002769 ; transcript_alias_6 NR_033967 ;
chr1	lncipedia.org	exon	43448796	43449029	.	+	.	gene_id lnc-ZNF691-1 ; transcript_id lnc-ZNF691-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227533 ; gene_alias_2 RP5-848E13.3 ; gene_alias_3 ENSG00000227533.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000007699.1 ; gene_alias_5 SLC2A1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000431759 ; transcript_alias_2 ENST00000431759.1 ; transcript_alias_3 RP5-848E13.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000020688.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT002769 ; transcript_alias_6 NR_033967 ;
chr11	lncipedia.org	exon	77850817	77851118	.	+	.	gene_id lnc-USP35-1 ; transcript_id lnc-USP35-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246174 ; gene_alias_2 RP11-705O3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246174.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166595.1 ; gene_alias_5 ENSG00000246174.3 ; gene_alias_6 KCTD21-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000532831 ; transcript_alias_2 ENST00000532831.1 ; transcript_alias_3 RP11-705O3.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000390646.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT023255 ;
chr11	lncipedia.org	exon	77852552	77853105	.	+	.	gene_id lnc-USP35-1 ; transcript_id lnc-USP35-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246174 ; gene_alias_2 RP11-705O3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246174.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166595.1 ; gene_alias_5 ENSG00000246174.3 ; gene_alias_6 KCTD21-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000532831 ; transcript_alias_2 ENST00000532831.1 ; transcript_alias_3 RP11-705O3.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000390646.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT023255 ;
chr14	lncipedia.org	exon	105561662	105561779	.	+	.	gene_id lnc-C14orf79-2 ; transcript_id lnc-C14orf79-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000257556 ; gene_alias_2 RP11-44N21.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257556.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170462.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548361 ; transcript_alias_2 ENST00000548361.1 ; transcript_alias_3 RP11-44N21.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409287.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT140180 ;
chr14	lncipedia.org	exon	105561877	105562104	.	+	.	gene_id lnc-C14orf79-2 ; transcript_id lnc-C14orf79-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000257556 ; gene_alias_2 RP11-44N21.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257556.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170462.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548361 ; transcript_alias_2 ENST00000548361.1 ; transcript_alias_3 RP11-44N21.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409287.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT140180 ;
chr12	lncipedia.org	exon	128596774	128596968	.	-	.	gene_id lnc-SLC15A4-2 ; transcript_id lnc-SLC15A4-2:7 ; gene_alias_1 ENSG00000256551 ; gene_alias_2 RP13-653N12.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256551.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168428.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536341 ; transcript_alias_2 ENST00000536341.1 ; transcript_alias_3 RP13-653N12.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399707.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031901 ;
chr12	lncipedia.org	exon	128597256	128597389	.	-	.	gene_id lnc-SLC15A4-2 ; transcript_id lnc-SLC15A4-2:7 ; gene_alias_1 ENSG00000256551 ; gene_alias_2 RP13-653N12.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256551.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168428.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536341 ; transcript_alias_2 ENST00000536341.1 ; transcript_alias_3 RP13-653N12.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399707.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031901 ;
chr12	lncipedia.org	exon	128602459	128602675	.	-	.	gene_id lnc-SLC15A4-2 ; transcript_id lnc-SLC15A4-2:7 ; gene_alias_1 ENSG00000256551 ; gene_alias_2 RP13-653N12.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256551.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168428.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536341 ; transcript_alias_2 ENST00000536341.1 ; transcript_alias_3 RP13-653N12.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399707.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031901 ;
chr1	lncipedia.org	exon	65437908	65438795	.	-	.	gene_id lnc-JAK1-1 ; transcript_id lnc-JAK1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000226891 ; gene_alias_2 RP11-182I10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000226891.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009307.1 ; gene_alias_5 ENSG00000226891.2 ; transcript_alias_1 ENST00000447748 ; transcript_alias_2 ENST00000447748.1 ; transcript_alias_3 RP11-182I10.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000025780.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003716 ;
chr1	lncipedia.org	exon	65440258	65440398	.	-	.	gene_id lnc-JAK1-1 ; transcript_id lnc-JAK1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000226891 ; gene_alias_2 RP11-182I10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000226891.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009307.1 ; gene_alias_5 ENSG00000226891.2 ; transcript_alias_1 ENST00000447748 ; transcript_alias_2 ENST00000447748.1 ; transcript_alias_3 RP11-182I10.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000025780.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003716 ;
chr1	lncipedia.org	exon	65455118	65455177	.	-	.	gene_id lnc-JAK1-1 ; transcript_id lnc-JAK1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000226891 ; gene_alias_2 RP11-182I10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000226891.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009307.1 ; gene_alias_5 ENSG00000226891.2 ; transcript_alias_1 ENST00000447748 ; transcript_alias_2 ENST00000447748.1 ; transcript_alias_3 RP11-182I10.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000025780.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003716 ;
chr1	lncipedia.org	exon	65456981	65458695	.	-	.	gene_id lnc-JAK1-1 ; transcript_id lnc-JAK1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000226891 ; gene_alias_2 RP11-182I10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000226891.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009307.1 ; gene_alias_5 ENSG00000226891.2 ; transcript_alias_1 ENST00000447748 ; transcript_alias_2 ENST00000447748.1 ; transcript_alias_3 RP11-182I10.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000025780.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003716 ;
chr6	lncipedia.org	exon	170190417	170190512	.	+	.	gene_id lnc-C6orf70-1 ; transcript_id lnc-C6orf70-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231690 ; gene_alias_2 C6orf208 ; gene_alias_3 ENSG00000231690.2 ; gene_alias_4 LINC00574 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000016071.2 ; transcript_alias_1 ENST00000420557 ; transcript_alias_2 ENST00000420557.2 ; transcript_alias_3 LINC00574-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000043246.2 ;
chr6	lncipedia.org	exon	170195280	170195458	.	+	.	gene_id lnc-C6orf70-1 ; transcript_id lnc-C6orf70-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231690 ; gene_alias_2 C6orf208 ; gene_alias_3 ENSG00000231690.2 ; gene_alias_4 LINC00574 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000016071.2 ; transcript_alias_1 ENST00000420557 ; transcript_alias_2 ENST00000420557.2 ; transcript_alias_3 LINC00574-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000043246.2 ;
chr6	lncipedia.org	exon	170200927	170202969	.	+	.	gene_id lnc-C6orf70-1 ; transcript_id lnc-C6orf70-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231690 ; gene_alias_2 C6orf208 ; gene_alias_3 ENSG00000231690.2 ; gene_alias_4 LINC00574 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000016071.2 ; transcript_alias_1 ENST00000420557 ; transcript_alias_2 ENST00000420557.2 ; transcript_alias_3 LINC00574-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000043246.2 ;
chr4	lncipedia.org	exon	129214088	129214277	.	+	.	gene_id lnc-LARP1B-1 ; transcript_id lnc-LARP1B-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000251432 ; gene_alias_2 RP11-420A23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251432.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161321.3 ; transcript_alias_1 ENST00000509834 ; transcript_alias_2 ENST00000509834.2 ; transcript_alias_3 RP11-420A23.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364523.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT098264 ;
chr4	lncipedia.org	exon	129221293	129221376	.	+	.	gene_id lnc-LARP1B-1 ; transcript_id lnc-LARP1B-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000251432 ; gene_alias_2 RP11-420A23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251432.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161321.3 ; transcript_alias_1 ENST00000509834 ; transcript_alias_2 ENST00000509834.2 ; transcript_alias_3 RP11-420A23.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364523.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT098264 ;
chr4	lncipedia.org	exon	129224117	129224190	.	+	.	gene_id lnc-LARP1B-1 ; transcript_id lnc-LARP1B-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000251432 ; gene_alias_2 RP11-420A23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251432.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161321.3 ; transcript_alias_1 ENST00000509834 ; transcript_alias_2 ENST00000509834.2 ; transcript_alias_3 RP11-420A23.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364523.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT098264 ;
chr4	lncipedia.org	exon	129391205	129391371	.	+	.	gene_id lnc-LARP1B-1 ; transcript_id lnc-LARP1B-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000251432 ; gene_alias_2 RP11-420A23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251432.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161321.3 ; transcript_alias_1 ENST00000509834 ; transcript_alias_2 ENST00000509834.2 ; transcript_alias_3 RP11-420A23.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364523.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT098264 ;
chr4	lncipedia.org	exon	129395924	129396151	.	+	.	gene_id lnc-LARP1B-1 ; transcript_id lnc-LARP1B-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000251432 ; gene_alias_2 RP11-420A23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251432.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161321.3 ; transcript_alias_1 ENST00000509834 ; transcript_alias_2 ENST00000509834.2 ; transcript_alias_3 RP11-420A23.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364523.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT098264 ;
chr12	lncipedia.org	exon	13683589	13683707	.	+	.	gene_id lnc-EMP1-1 ; transcript_id lnc-EMP1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000256306 ; gene_alias_2 RP11-4N23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256306.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168642.1 ; transcript_alias_1 ENST00000543347 ; transcript_alias_2 ENST00000543347.1 ; transcript_alias_3 RP11-4N23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000400472.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027044 ;
chr12	lncipedia.org	exon	13700254	13700516	.	+	.	gene_id lnc-EMP1-1 ; transcript_id lnc-EMP1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000256306 ; gene_alias_2 RP11-4N23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256306.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168642.1 ; transcript_alias_1 ENST00000543347 ; transcript_alias_2 ENST00000543347.1 ; transcript_alias_3 RP11-4N23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000400472.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027044 ;
chr11	lncipedia.org	exon	7458858	7462950	.	-	.	gene_id lnc-CYB5R2-3 ; transcript_id lnc-CYB5R2-3:6 ; gene_alias_1 ENSG00000251364 ; gene_alias_2 ENSG00000251364.2 ; gene_alias_3 CTD-2516F10.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165526.1 ; transcript_alias_1 ENST00000504206 ; transcript_alias_2 ENST00000504206.2 ; transcript_alias_3 CTD-2516F10.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000384650.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017778 ;
chr11	lncipedia.org	exon	7471604	7471673	.	-	.	gene_id lnc-CYB5R2-3 ; transcript_id lnc-CYB5R2-3:6 ; gene_alias_1 ENSG00000251364 ; gene_alias_2 ENSG00000251364.2 ; gene_alias_3 CTD-2516F10.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165526.1 ; transcript_alias_1 ENST00000504206 ; transcript_alias_2 ENST00000504206.2 ; transcript_alias_3 CTD-2516F10.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000384650.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017778 ;
chr11	lncipedia.org	exon	7479027	7479190	.	-	.	gene_id lnc-CYB5R2-3 ; transcript_id lnc-CYB5R2-3:6 ; gene_alias_1 ENSG00000251364 ; gene_alias_2 ENSG00000251364.2 ; gene_alias_3 CTD-2516F10.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165526.1 ; transcript_alias_1 ENST00000504206 ; transcript_alias_2 ENST00000504206.2 ; transcript_alias_3 CTD-2516F10.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000384650.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017778 ;
chr11	lncipedia.org	exon	7482470	7482575	.	-	.	gene_id lnc-CYB5R2-3 ; transcript_id lnc-CYB5R2-3:6 ; gene_alias_1 ENSG00000251364 ; gene_alias_2 ENSG00000251364.2 ; gene_alias_3 CTD-2516F10.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165526.1 ; transcript_alias_1 ENST00000504206 ; transcript_alias_2 ENST00000504206.2 ; transcript_alias_3 CTD-2516F10.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000384650.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017778 ;
chr4	lncipedia.org	exon	23004776	23004866	.	+	.	gene_id lnc-SOD3-6 ; transcript_id lnc-SOD3-6:3 ; gene_alias_1 ENSG00000248837 ; gene_alias_2 RP11-412P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248837.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160256.1 ; transcript_alias_1 ENST00000506425 ; transcript_alias_2 ENST00000506425.1 ; transcript_alias_3 RP11-412P11.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000359923.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT095772 ;
chr4	lncipedia.org	exon	23034455	23034491	.	+	.	gene_id lnc-SOD3-6 ; transcript_id lnc-SOD3-6:3 ; gene_alias_1 ENSG00000248837 ; gene_alias_2 RP11-412P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248837.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160256.1 ; transcript_alias_1 ENST00000506425 ; transcript_alias_2 ENST00000506425.1 ; transcript_alias_3 RP11-412P11.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000359923.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT095772 ;
chr4	lncipedia.org	exon	23042313	23043141	.	+	.	gene_id lnc-SOD3-6 ; transcript_id lnc-SOD3-6:3 ; gene_alias_1 ENSG00000248837 ; gene_alias_2 RP11-412P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248837.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160256.1 ; transcript_alias_1 ENST00000506425 ; transcript_alias_2 ENST00000506425.1 ; transcript_alias_3 RP11-412P11.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000359923.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT095772 ;
chr20	lncipedia.org	exon	21106725	21106845	.	+	.	gene_id lnc-XRN2-2 ; transcript_id lnc-XRN2-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000088970 ; gene_alias_2 PLK1S1 ; gene_alias_3 ENSG00000088970.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032020.2 ; transcript_alias_1 ENST00000537654 ; transcript_alias_2 ENST00000537654.1 ; transcript_alias_3 PLK1S1-205 ;
chr20	lncipedia.org	exon	21112738	21112800	.	+	.	gene_id lnc-XRN2-2 ; transcript_id lnc-XRN2-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000088970 ; gene_alias_2 PLK1S1 ; gene_alias_3 ENSG00000088970.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032020.2 ; transcript_alias_1 ENST00000537654 ; transcript_alias_2 ENST00000537654.1 ; transcript_alias_3 PLK1S1-205 ;
chr20	lncipedia.org	exon	21126206	21126295	.	+	.	gene_id lnc-XRN2-2 ; transcript_id lnc-XRN2-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000088970 ; gene_alias_2 PLK1S1 ; gene_alias_3 ENSG00000088970.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032020.2 ; transcript_alias_1 ENST00000537654 ; transcript_alias_2 ENST00000537654.1 ; transcript_alias_3 PLK1S1-205 ;
chr20	lncipedia.org	exon	21142512	21143148	.	+	.	gene_id lnc-XRN2-2 ; transcript_id lnc-XRN2-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000088970 ; gene_alias_2 PLK1S1 ; gene_alias_3 ENSG00000088970.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032020.2 ; transcript_alias_1 ENST00000537654 ; transcript_alias_2 ENST00000537654.1 ; transcript_alias_3 PLK1S1-205 ;
chr20	lncipedia.org	exon	21143491	21143729	.	+	.	gene_id lnc-XRN2-2 ; transcript_id lnc-XRN2-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000088970 ; gene_alias_2 PLK1S1 ; gene_alias_3 ENSG00000088970.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032020.2 ; transcript_alias_1 ENST00000537654 ; transcript_alias_2 ENST00000537654.1 ; transcript_alias_3 PLK1S1-205 ;
chr20	lncipedia.org	exon	21143732	21143800	.	+	.	gene_id lnc-XRN2-2 ; transcript_id lnc-XRN2-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000088970 ; gene_alias_2 PLK1S1 ; gene_alias_3 ENSG00000088970.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032020.2 ; transcript_alias_1 ENST00000537654 ; transcript_alias_2 ENST00000537654.1 ; transcript_alias_3 PLK1S1-205 ;
chr20	lncipedia.org	exon	21186130	21186222	.	+	.	gene_id lnc-XRN2-2 ; transcript_id lnc-XRN2-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000088970 ; gene_alias_2 PLK1S1 ; gene_alias_3 ENSG00000088970.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032020.2 ; transcript_alias_1 ENST00000537654 ; transcript_alias_2 ENST00000537654.1 ; transcript_alias_3 PLK1S1-205 ;
chr20	lncipedia.org	exon	21195173	21195338	.	+	.	gene_id lnc-XRN2-2 ; transcript_id lnc-XRN2-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000088970 ; gene_alias_2 PLK1S1 ; gene_alias_3 ENSG00000088970.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032020.2 ; transcript_alias_1 ENST00000537654 ; transcript_alias_2 ENST00000537654.1 ; transcript_alias_3 PLK1S1-205 ;
chr20	lncipedia.org	exon	21196221	21196286	.	+	.	gene_id lnc-XRN2-2 ; transcript_id lnc-XRN2-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000088970 ; gene_alias_2 PLK1S1 ; gene_alias_3 ENSG00000088970.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032020.2 ; transcript_alias_1 ENST00000537654 ; transcript_alias_2 ENST00000537654.1 ; transcript_alias_3 PLK1S1-205 ;
chr20	lncipedia.org	exon	21209649	21209753	.	+	.	gene_id lnc-XRN2-2 ; transcript_id lnc-XRN2-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000088970 ; gene_alias_2 PLK1S1 ; gene_alias_3 ENSG00000088970.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032020.2 ; transcript_alias_1 ENST00000537654 ; transcript_alias_2 ENST00000537654.1 ; transcript_alias_3 PLK1S1-205 ;
chr20	lncipedia.org	exon	21213372	21213468	.	+	.	gene_id lnc-XRN2-2 ; transcript_id lnc-XRN2-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000088970 ; gene_alias_2 PLK1S1 ; gene_alias_3 ENSG00000088970.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032020.2 ; transcript_alias_1 ENST00000537654 ; transcript_alias_2 ENST00000537654.1 ; transcript_alias_3 PLK1S1-205 ;
chr20	lncipedia.org	exon	21224883	21224926	.	+	.	gene_id lnc-XRN2-2 ; transcript_id lnc-XRN2-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000088970 ; gene_alias_2 PLK1S1 ; gene_alias_3 ENSG00000088970.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032020.2 ; transcript_alias_1 ENST00000537654 ; transcript_alias_2 ENST00000537654.1 ; transcript_alias_3 PLK1S1-205 ;
chr20	lncipedia.org	exon	21227117	21227256	.	+	.	gene_id lnc-XRN2-2 ; transcript_id lnc-XRN2-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000088970 ; gene_alias_2 PLK1S1 ; gene_alias_3 ENSG00000088970.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032020.2 ; transcript_alias_1 ENST00000537654 ; transcript_alias_2 ENST00000537654.1 ; transcript_alias_3 PLK1S1-205 ;
chr12	lncipedia.org	exon	20273914	20274092	.	-	.	gene_id lnc-SLCO1A2-3 ; transcript_id lnc-SLCO1A2-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000256499 ; gene_alias_2 CTC-465D4.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256499.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168914.1 ; transcript_alias_1 ENST00000543778 ; transcript_alias_2 ENST00000543778.1 ; transcript_alias_3 CTC-465D4.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401586.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027225 ;
chr12	lncipedia.org	exon	20277379	20277433	.	-	.	gene_id lnc-SLCO1A2-3 ; transcript_id lnc-SLCO1A2-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000256499 ; gene_alias_2 CTC-465D4.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256499.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168914.1 ; transcript_alias_1 ENST00000543778 ; transcript_alias_2 ENST00000543778.1 ; transcript_alias_3 CTC-465D4.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401586.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027225 ;
chr12	lncipedia.org	exon	20278673	20278769	.	-	.	gene_id lnc-SLCO1A2-3 ; transcript_id lnc-SLCO1A2-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000256499 ; gene_alias_2 CTC-465D4.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256499.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168914.1 ; transcript_alias_1 ENST00000543778 ; transcript_alias_2 ENST00000543778.1 ; transcript_alias_3 CTC-465D4.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401586.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027225 ;
chr12	lncipedia.org	exon	20280750	20280892	.	-	.	gene_id lnc-SLCO1A2-3 ; transcript_id lnc-SLCO1A2-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000256499 ; gene_alias_2 CTC-465D4.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256499.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168914.1 ; transcript_alias_1 ENST00000543778 ; transcript_alias_2 ENST00000543778.1 ; transcript_alias_3 CTC-465D4.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401586.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027225 ;
chr12	lncipedia.org	exon	20282589	20282747	.	-	.	gene_id lnc-SLCO1A2-3 ; transcript_id lnc-SLCO1A2-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000256499 ; gene_alias_2 CTC-465D4.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256499.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168914.1 ; transcript_alias_1 ENST00000543778 ; transcript_alias_2 ENST00000543778.1 ; transcript_alias_3 CTC-465D4.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401586.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027225 ;
chr6	lncipedia.org	exon	57125332	57126515	.	-	.	gene_id lnc-RAB23-1 ; transcript_id lnc-RAB23-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250335 ; gene_alias_2 XLOC_005751 ; gene_alias_3 linc-RAB23-3 ; transcript_alias_1 ENST00000513979 ; transcript_alias_2 TCONS_00011511 ; transcript_alias_3 NONHSAT113289 ;
chr6	lncipedia.org	exon	57127244	57127476	.	-	.	gene_id lnc-RAB23-1 ; transcript_id lnc-RAB23-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250335 ; gene_alias_2 XLOC_005751 ; gene_alias_3 linc-RAB23-3 ; transcript_alias_1 ENST00000513979 ; transcript_alias_2 TCONS_00011511 ; transcript_alias_3 NONHSAT113289 ;
chr2	lncipedia.org	exon	113993104	113993147	.	+	.	gene_id lnc-PSD4-1 ; transcript_id lnc-PSD4-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000189223 ; gene_alias_2 AC016683.6 ; gene_alias_3 ENSG00000189223.7 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153340.3 ; gene_alias_5 ENSG00000189223.9 ; gene_alias_6 PAX8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000437551 ; transcript_alias_2 ENST00000437551.1 ; transcript_alias_3 AC016683.6-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330810.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	113995667	113995789	.	+	.	gene_id lnc-PSD4-1 ; transcript_id lnc-PSD4-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000189223 ; gene_alias_2 AC016683.6 ; gene_alias_3 ENSG00000189223.7 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153340.3 ; gene_alias_5 ENSG00000189223.9 ; gene_alias_6 PAX8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000437551 ; transcript_alias_2 ENST00000437551.1 ; transcript_alias_3 AC016683.6-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330810.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	113996666	113998402	.	+	.	gene_id lnc-PSD4-1 ; transcript_id lnc-PSD4-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000189223 ; gene_alias_2 AC016683.6 ; gene_alias_3 ENSG00000189223.7 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153340.3 ; gene_alias_5 ENSG00000189223.9 ; gene_alias_6 PAX8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000437551 ; transcript_alias_2 ENST00000437551.1 ; transcript_alias_3 AC016683.6-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330810.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	70048728	70048771	.	+	.	gene_id lnc-MITF-1 ; transcript_id lnc-MITF-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000240405 ; gene_alias_2 XLOC_002696 ; gene_alias_3 linc-GPR27-4 ; gene_alias_4 RP11-460N16.1 ; gene_alias_5 ENSG00000240405.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000159017.1 ; transcript_alias_1 ENST00000488861 ; transcript_alias_2 TCONS_00005539 ; transcript_alias_3 ENST00000488861.1 ; transcript_alias_4 RP11-460N16.1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000352920.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT090372 ;
chr3	lncipedia.org	exon	70061508	70061749	.	+	.	gene_id lnc-MITF-1 ; transcript_id lnc-MITF-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000240405 ; gene_alias_2 XLOC_002696 ; gene_alias_3 linc-GPR27-4 ; gene_alias_4 RP11-460N16.1 ; gene_alias_5 ENSG00000240405.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000159017.1 ; transcript_alias_1 ENST00000488861 ; transcript_alias_2 TCONS_00005539 ; transcript_alias_3 ENST00000488861.1 ; transcript_alias_4 RP11-460N16.1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000352920.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT090372 ;
chr3	lncipedia.org	exon	70062671	70062823	.	+	.	gene_id lnc-MITF-1 ; transcript_id lnc-MITF-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000240405 ; gene_alias_2 XLOC_002696 ; gene_alias_3 linc-GPR27-4 ; gene_alias_4 RP11-460N16.1 ; gene_alias_5 ENSG00000240405.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000159017.1 ; transcript_alias_1 ENST00000488861 ; transcript_alias_2 TCONS_00005539 ; transcript_alias_3 ENST00000488861.1 ; transcript_alias_4 RP11-460N16.1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000352920.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT090372 ;
chr3	lncipedia.org	exon	70062945	70063018	.	+	.	gene_id lnc-MITF-1 ; transcript_id lnc-MITF-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000240405 ; gene_alias_2 XLOC_002696 ; gene_alias_3 linc-GPR27-4 ; gene_alias_4 RP11-460N16.1 ; gene_alias_5 ENSG00000240405.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000159017.1 ; transcript_alias_1 ENST00000488861 ; transcript_alias_2 TCONS_00005539 ; transcript_alias_3 ENST00000488861.1 ; transcript_alias_4 RP11-460N16.1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000352920.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT090372 ;
chr19	lncipedia.org	exon	19375871	19376524	.	+	.	gene_id lnc-NCAN-1 ; transcript_id lnc-NCAN-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250450 ; transcript_alias_1 ENST00000513173 ;
chr19	lncipedia.org	exon	19376595	19377728	.	+	.	gene_id lnc-NCAN-1 ; transcript_id lnc-NCAN-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250450 ; transcript_alias_1 ENST00000513173 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126580538	126580646	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-3 ; transcript_id lnc-TMEM132B-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000256342 ; gene_alias_2 RP3-446N13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256342.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168496.1 ; transcript_alias_1 ENST00000545642 ; transcript_alias_2 ENST00000545642.1 ; transcript_alias_3 RP3-446N13.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399913.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031748 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126580786	126580912	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-3 ; transcript_id lnc-TMEM132B-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000256342 ; gene_alias_2 RP3-446N13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256342.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168496.1 ; transcript_alias_1 ENST00000545642 ; transcript_alias_2 ENST00000545642.1 ; transcript_alias_3 RP3-446N13.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399913.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031748 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126585235	126585351	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-3 ; transcript_id lnc-TMEM132B-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000256342 ; gene_alias_2 RP3-446N13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256342.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168496.1 ; transcript_alias_1 ENST00000545642 ; transcript_alias_2 ENST00000545642.1 ; transcript_alias_3 RP3-446N13.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399913.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031748 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126586761	126586859	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-3 ; transcript_id lnc-TMEM132B-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000256342 ; gene_alias_2 RP3-446N13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256342.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168496.1 ; transcript_alias_1 ENST00000545642 ; transcript_alias_2 ENST00000545642.1 ; transcript_alias_3 RP3-446N13.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399913.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031748 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126588291	126588481	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-3 ; transcript_id lnc-TMEM132B-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000256342 ; gene_alias_2 RP3-446N13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256342.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168496.1 ; transcript_alias_1 ENST00000545642 ; transcript_alias_2 ENST00000545642.1 ; transcript_alias_3 RP3-446N13.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399913.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031748 ;
chr16	lncipedia.org	exon	56217642	56218074	.	-	.	gene_id lnc-AMFR-3 ; transcript_id lnc-AMFR-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248153 ; transcript_alias_1 ENST00000508219 ;
chr16	lncipedia.org	exon	56219861	56220218	.	-	.	gene_id lnc-AMFR-3 ; transcript_id lnc-AMFR-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248153 ; transcript_alias_1 ENST00000508219 ;
chr1	lncipedia.org	exon	28905053	28905192	.	-	.	gene_id lnc-TAF12-1 ; transcript_id lnc-TAF12-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000197989 ; gene_alias_2 SNHG12 ; gene_alias_3 ENSG00000197989.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000003654.2 ; gene_alias_5 ENSG00000197989.9 ; transcript_alias_1 ENST00000488745 ; transcript_alias_2 ENST00000488745.1 ; transcript_alias_3 SNHG12-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000010357.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT001975 ;
chr1	lncipedia.org	exon	28906045	28906099	.	-	.	gene_id lnc-TAF12-1 ; transcript_id lnc-TAF12-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000197989 ; gene_alias_2 SNHG12 ; gene_alias_3 ENSG00000197989.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000003654.2 ; gene_alias_5 ENSG00000197989.9 ; transcript_alias_1 ENST00000488745 ; transcript_alias_2 ENST00000488745.1 ; transcript_alias_3 SNHG12-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000010357.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT001975 ;
chr1	lncipedia.org	exon	28906424	28906493	.	-	.	gene_id lnc-TAF12-1 ; transcript_id lnc-TAF12-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000197989 ; gene_alias_2 SNHG12 ; gene_alias_3 ENSG00000197989.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000003654.2 ; gene_alias_5 ENSG00000197989.9 ; transcript_alias_1 ENST00000488745 ; transcript_alias_2 ENST00000488745.1 ; transcript_alias_3 SNHG12-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000010357.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT001975 ;
chr1	lncipedia.org	exon	28907072	28907158	.	-	.	gene_id lnc-TAF12-1 ; transcript_id lnc-TAF12-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000197989 ; gene_alias_2 SNHG12 ; gene_alias_3 ENSG00000197989.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000003654.2 ; gene_alias_5 ENSG00000197989.9 ; transcript_alias_1 ENST00000488745 ; transcript_alias_2 ENST00000488745.1 ; transcript_alias_3 SNHG12-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000010357.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT001975 ;
chr1	lncipedia.org	exon	28907623	28907741	.	-	.	gene_id lnc-TAF12-1 ; transcript_id lnc-TAF12-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000197989 ; gene_alias_2 SNHG12 ; gene_alias_3 ENSG00000197989.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000003654.2 ; gene_alias_5 ENSG00000197989.9 ; transcript_alias_1 ENST00000488745 ; transcript_alias_2 ENST00000488745.1 ; transcript_alias_3 SNHG12-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000010357.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT001975 ;
chr1	lncipedia.org	exon	28908602	28909495	.	-	.	gene_id lnc-TAF12-1 ; transcript_id lnc-TAF12-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000197989 ; gene_alias_2 SNHG12 ; gene_alias_3 ENSG00000197989.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000003654.2 ; gene_alias_5 ENSG00000197989.9 ; transcript_alias_1 ENST00000488745 ; transcript_alias_2 ENST00000488745.1 ; transcript_alias_3 SNHG12-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000010357.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT001975 ;
chr6	lncipedia.org	exon	147171295	147171732	.	-	.	gene_id lnc-SHPRH-2 ; transcript_id lnc-SHPRH-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000233452 ; gene_alias_2 RP11-497D6.4 ; gene_alias_3 ENSG00000233452.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015762.3 ; gene_alias_5 ENSG00000233452.2 ; gene_alias_6 STXBP5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000433308 ; transcript_alias_2 ENST00000433308.1 ; transcript_alias_3 RP11-497D6.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000042592.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT115437 ;
chr6	lncipedia.org	exon	147171961	147172141	.	-	.	gene_id lnc-SHPRH-2 ; transcript_id lnc-SHPRH-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000233452 ; gene_alias_2 RP11-497D6.4 ; gene_alias_3 ENSG00000233452.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015762.3 ; gene_alias_5 ENSG00000233452.2 ; gene_alias_6 STXBP5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000433308 ; transcript_alias_2 ENST00000433308.1 ; transcript_alias_3 RP11-497D6.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000042592.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT115437 ;
chr6	lncipedia.org	exon	111804761	111804868	.	+	.	gene_id lnc-KIAA1919-3 ; transcript_id lnc-KIAA1919-3:6 ; gene_alias_1 ENSG00000231889 ; gene_alias_2 TRAF3IP2-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000231889.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015378.2 ; gene_alias_5 ENSG00000231889.3 ; transcript_alias_1 ENST00000420651 ; transcript_alias_2 ENST00000420651.2 ; transcript_alias_3 TRAF3IP2-AS1-010 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000382630.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114471 ;
chr6	lncipedia.org	exon	111824499	111824714	.	+	.	gene_id lnc-KIAA1919-3 ; transcript_id lnc-KIAA1919-3:6 ; gene_alias_1 ENSG00000231889 ; gene_alias_2 TRAF3IP2-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000231889.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015378.2 ; gene_alias_5 ENSG00000231889.3 ; transcript_alias_1 ENST00000420651 ; transcript_alias_2 ENST00000420651.2 ; transcript_alias_3 TRAF3IP2-AS1-010 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000382630.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114471 ;
chr12	lncipedia.org	exon	114175253	114175817	.	-	.	gene_id lnc-RBM19-1 ; transcript_id lnc-RBM19-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000249550 ; gene_alias_2 RP11-438N16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000249550.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169644.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551982 ; transcript_alias_2 ENST00000551982.1 ; transcript_alias_3 RP11-438N16.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405245.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030853 ;
chr12	lncipedia.org	exon	114204880	114205014	.	-	.	gene_id lnc-RBM19-1 ; transcript_id lnc-RBM19-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000249550 ; gene_alias_2 RP11-438N16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000249550.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169644.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551982 ; transcript_alias_2 ENST00000551982.1 ; transcript_alias_3 RP11-438N16.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405245.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030853 ;
chr13	lncipedia.org	exon	74862164	74862215	.	+	.	gene_id lnc-UCHL3-9 ; transcript_id lnc-UCHL3-9:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256370 ; gene_alias_2 AL353660.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535519 ; transcript_alias_2 NONHSAT034323 ;
chr13	lncipedia.org	exon	74980591	74982939	.	+	.	gene_id lnc-UCHL3-9 ; transcript_id lnc-UCHL3-9:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256370 ; gene_alias_2 AL353660.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535519 ; transcript_alias_2 NONHSAT034323 ;
chr2	lncipedia.org	exon	134023767	134023868	.	+	.	gene_id lnc-GPR39-4 ; transcript_id lnc-GPR39-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000226953 ; gene_alias_2 AC010890.1 ; gene_alias_3 ENSG00000226953.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153495.2 ; gene_alias_5 ENSG00000226953.3 ; transcript_alias_1 ENST00000432414 ; transcript_alias_2 ENST00000432414.1 ; transcript_alias_3 AC010890.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000331998.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT074544 ;
chr2	lncipedia.org	exon	134024845	134024996	.	+	.	gene_id lnc-GPR39-4 ; transcript_id lnc-GPR39-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000226953 ; gene_alias_2 AC010890.1 ; gene_alias_3 ENSG00000226953.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153495.2 ; gene_alias_5 ENSG00000226953.3 ; transcript_alias_1 ENST00000432414 ; transcript_alias_2 ENST00000432414.1 ; transcript_alias_3 AC010890.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000331998.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT074544 ;
chr2	lncipedia.org	exon	134025928	134026014	.	+	.	gene_id lnc-GPR39-4 ; transcript_id lnc-GPR39-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000226953 ; gene_alias_2 AC010890.1 ; gene_alias_3 ENSG00000226953.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153495.2 ; gene_alias_5 ENSG00000226953.3 ; transcript_alias_1 ENST00000432414 ; transcript_alias_2 ENST00000432414.1 ; transcript_alias_3 AC010890.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000331998.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT074544 ;
chr2	lncipedia.org	exon	134026488	134026613	.	+	.	gene_id lnc-GPR39-4 ; transcript_id lnc-GPR39-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000226953 ; gene_alias_2 AC010890.1 ; gene_alias_3 ENSG00000226953.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153495.2 ; gene_alias_5 ENSG00000226953.3 ; transcript_alias_1 ENST00000432414 ; transcript_alias_2 ENST00000432414.1 ; transcript_alias_3 AC010890.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000331998.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT074544 ;
chr2	lncipedia.org	exon	134042267	134042334	.	+	.	gene_id lnc-GPR39-4 ; transcript_id lnc-GPR39-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000226953 ; gene_alias_2 AC010890.1 ; gene_alias_3 ENSG00000226953.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153495.2 ; gene_alias_5 ENSG00000226953.3 ; transcript_alias_1 ENST00000432414 ; transcript_alias_2 ENST00000432414.1 ; transcript_alias_3 AC010890.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000331998.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT074544 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26097790	26099068	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; gene_alias_2 RP11-877E17.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246695.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169126.2 ; gene_alias_5 RASSF8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500276 ; transcript_alias_2 ENST00000500276.2 ; transcript_alias_3 RP11-877E17.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402341.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT027367 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26100452	26100555	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; gene_alias_2 RP11-877E17.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246695.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169126.2 ; gene_alias_5 RASSF8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500276 ; transcript_alias_2 ENST00000500276.2 ; transcript_alias_3 RP11-877E17.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402341.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT027367 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26105691	26106009	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; gene_alias_2 RP11-877E17.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246695.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169126.2 ; gene_alias_5 RASSF8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500276 ; transcript_alias_2 ENST00000500276.2 ; transcript_alias_3 RP11-877E17.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402341.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT027367 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26108071	26108174	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; gene_alias_2 RP11-877E17.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246695.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169126.2 ; gene_alias_5 RASSF8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500276 ; transcript_alias_2 ENST00000500276.2 ; transcript_alias_3 RP11-877E17.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402341.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT027367 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26109160	26109280	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; gene_alias_2 RP11-877E17.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246695.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169126.2 ; gene_alias_5 RASSF8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500276 ; transcript_alias_2 ENST00000500276.2 ; transcript_alias_3 RP11-877E17.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402341.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT027367 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26109572	26109694	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; gene_alias_2 RP11-877E17.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246695.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169126.2 ; gene_alias_5 RASSF8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500276 ; transcript_alias_2 ENST00000500276.2 ; transcript_alias_3 RP11-877E17.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402341.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT027367 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26110952	26111511	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; gene_alias_2 RP11-877E17.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246695.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169126.2 ; gene_alias_5 RASSF8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500276 ; transcript_alias_2 ENST00000500276.2 ; transcript_alias_3 RP11-877E17.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402341.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT027367 ;
chr3	lncipedia.org	exon	40214646	40216213	.	-	.	gene_id lnc-CX3CR1-2 ; transcript_id lnc-CX3CR1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246446 ; transcript_alias_1 ENST00000501623 ;
chr3	lncipedia.org	exon	40342728	40342887	.	-	.	gene_id lnc-CX3CR1-2 ; transcript_id lnc-CX3CR1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246446 ; transcript_alias_1 ENST00000501623 ;
chr3	lncipedia.org	exon	40350814	40351033	.	-	.	gene_id lnc-CX3CR1-2 ; transcript_id lnc-CX3CR1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246446 ; transcript_alias_1 ENST00000501623 ;
chr12	lncipedia.org	exon	92815307	92815611	.	+	.	gene_id lnc-CLLU1.1-1 ; transcript_id lnc-CLLU1.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000205056 ; gene_alias_2 CLLU1 ; gene_alias_3 ENSG00000205056.6 ; gene_alias_4 RP11-693J15.4 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000159784.3 ; gene_alias_6 ENSG00000266923.1 ; transcript_alias_1 ENST00000508671 ; transcript_alias_2 ENST00000508671.1 ; transcript_alias_3 RP11-693J15.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000366644.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029888 ;
chr12	lncipedia.org	exon	92875794	92877456	.	+	.	gene_id lnc-CLLU1.1-1 ; transcript_id lnc-CLLU1.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000205056 ; gene_alias_2 CLLU1 ; gene_alias_3 ENSG00000205056.6 ; gene_alias_4 RP11-693J15.4 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000159784.3 ; gene_alias_6 ENSG00000266923.1 ; transcript_alias_1 ENST00000508671 ; transcript_alias_2 ENST00000508671.1 ; transcript_alias_3 RP11-693J15.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000366644.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029888 ;
chr19	lncipedia.org	exon	47164735	47165694	.	+	.	gene_id lnc-CALM3-1 ; transcript_id lnc-CALM3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245598 ; gene_alias_2 CTB-12A17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245598.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165987.1 ; gene_alias_5 DACT3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500689 ; transcript_alias_2 ENST00000500689.1 ; transcript_alias_3 CTB-12A17.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000387312.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT066908 ; transcript_alias_6 NR_040041 ;
chr19	lncipedia.org	exon	47172425	47172567	.	+	.	gene_id lnc-CALM3-1 ; transcript_id lnc-CALM3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245598 ; gene_alias_2 CTB-12A17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245598.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165987.1 ; gene_alias_5 DACT3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500689 ; transcript_alias_2 ENST00000500689.1 ; transcript_alias_3 CTB-12A17.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000387312.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT066908 ; transcript_alias_6 NR_040041 ;
chr19	lncipedia.org	exon	47174398	47174598	.	+	.	gene_id lnc-CALM3-1 ; transcript_id lnc-CALM3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245598 ; gene_alias_2 CTB-12A17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245598.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165987.1 ; gene_alias_5 DACT3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500689 ; transcript_alias_2 ENST00000500689.1 ; transcript_alias_3 CTB-12A17.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000387312.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT066908 ; transcript_alias_6 NR_040041 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73040491	73040864	.	-	.	gene_id lnc-NAP1L2-1 ; transcript_id lnc-NAP1L2-1:16 ; gene_alias_1 ENSG00000229807 ; gene_alias_2 XLOC_008185 ; gene_alias_3 linc-NAP1L2-4 ; gene_alias_4 XIST ; gene_alias_5 ENSG00000229807.3 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021839.3 ; gene_alias_7 ENSG00000229807.5 ; transcript_alias_1 ENST00000417942 ; transcript_alias_2 TCONS_00017072 ; transcript_alias_3 ENST00000417942.1 ; transcript_alias_4 XIST-006 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000083629.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT137542 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73041906	73042068	.	-	.	gene_id lnc-NAP1L2-1 ; transcript_id lnc-NAP1L2-1:16 ; gene_alias_1 ENSG00000229807 ; gene_alias_2 XLOC_008185 ; gene_alias_3 linc-NAP1L2-4 ; gene_alias_4 XIST ; gene_alias_5 ENSG00000229807.3 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021839.3 ; gene_alias_7 ENSG00000229807.5 ; transcript_alias_1 ENST00000417942 ; transcript_alias_2 TCONS_00017072 ; transcript_alias_3 ENST00000417942.1 ; transcript_alias_4 XIST-006 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000083629.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT137542 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73045950	73046136	.	-	.	gene_id lnc-NAP1L2-1 ; transcript_id lnc-NAP1L2-1:16 ; gene_alias_1 ENSG00000229807 ; gene_alias_2 XLOC_008185 ; gene_alias_3 linc-NAP1L2-4 ; gene_alias_4 XIST ; gene_alias_5 ENSG00000229807.3 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021839.3 ; gene_alias_7 ENSG00000229807.5 ; transcript_alias_1 ENST00000417942 ; transcript_alias_2 TCONS_00017072 ; transcript_alias_3 ENST00000417942.1 ; transcript_alias_4 XIST-006 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000083629.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT137542 ;
chr19	lncipedia.org	exon	58377136	58377246	.	-	.	gene_id lnc-ZNF814-1 ; transcript_id lnc-ZNF814-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225702 ; transcript_alias_1 ENST00000416025 ;
chr19	lncipedia.org	exon	58377309	58378762	.	-	.	gene_id lnc-ZNF814-1 ; transcript_id lnc-ZNF814-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225702 ; transcript_alias_1 ENST00000416025 ;
chr19	lncipedia.org	exon	58379219	58379953	.	-	.	gene_id lnc-ZNF814-1 ; transcript_id lnc-ZNF814-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225702 ; transcript_alias_1 ENST00000416025 ;
chr22	lncipedia.org	exon	48027439	48027635	.	+	.	gene_id lnc-TBC1D22A-4 ; transcript_id lnc-TBC1D22A-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000224271 ; gene_alias_2 RP11-191L9.4 ; gene_alias_3 ENSG00000224271.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150321.1 ; transcript_alias_1 ENST00000426452 ; transcript_alias_2 ENST00000426452.1 ; transcript_alias_3 RP11-191L9.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000317557.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT087354 ;
chr22	lncipedia.org	exon	48030929	48031373	.	+	.	gene_id lnc-TBC1D22A-4 ; transcript_id lnc-TBC1D22A-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000224271 ; gene_alias_2 RP11-191L9.4 ; gene_alias_3 ENSG00000224271.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150321.1 ; transcript_alias_1 ENST00000426452 ; transcript_alias_2 ENST00000426452.1 ; transcript_alias_3 RP11-191L9.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000317557.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT087354 ;
chr1	lncipedia.org	exon	173833040	173833213	.	-	.	gene_id lnc-SERPINC1-1 ; transcript_id lnc-SERPINC1-1:29 ; gene_alias_1 ENSG00000234741 ; gene_alias_2 GAS5 ; gene_alias_3 ENSG00000234741.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037216.2 ; gene_alias_5 ENSG00000234741.3 ; transcript_alias_1 ENST00000454813 ; transcript_alias_2 ENST00000454813.1 ; transcript_alias_3 GAS5-026 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000090602.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT007672 ;
chr1	lncipedia.org	exon	173833395	173833644	.	-	.	gene_id lnc-SERPINC1-1 ; transcript_id lnc-SERPINC1-1:29 ; gene_alias_1 ENSG00000234741 ; gene_alias_2 GAS5 ; gene_alias_3 ENSG00000234741.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037216.2 ; gene_alias_5 ENSG00000234741.3 ; transcript_alias_1 ENST00000454813 ; transcript_alias_2 ENST00000454813.1 ; transcript_alias_3 GAS5-026 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000090602.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT007672 ;
chr1	lncipedia.org	exon	173833813	173834009	.	-	.	gene_id lnc-SERPINC1-1 ; transcript_id lnc-SERPINC1-1:29 ; gene_alias_1 ENSG00000234741 ; gene_alias_2 GAS5 ; gene_alias_3 ENSG00000234741.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037216.2 ; gene_alias_5 ENSG00000234741.3 ; transcript_alias_1 ENST00000454813 ; transcript_alias_2 ENST00000454813.1 ; transcript_alias_3 GAS5-026 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000090602.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT007672 ;
chr20	lncipedia.org	exon	25124001	25124149	.	-	.	gene_id lnc-VSX1-1 ; transcript_id lnc-VSX1-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000230725 ; gene_alias_2 XLOC_013704 ; gene_alias_3 linc-VSX1-2 ; gene_alias_4 RP4-738P15.1 ; gene_alias_5 ENSG00000230725.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000032113.1 ; transcript_alias_1 ENST00000426854 ; transcript_alias_2 TCONS_00028030 ; transcript_alias_3 ENST00000426854.1 ; transcript_alias_4 RP4-738P15.1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000078390.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT079136 ;
chr20	lncipedia.org	exon	25124933	25125059	.	-	.	gene_id lnc-VSX1-1 ; transcript_id lnc-VSX1-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000230725 ; gene_alias_2 XLOC_013704 ; gene_alias_3 linc-VSX1-2 ; gene_alias_4 RP4-738P15.1 ; gene_alias_5 ENSG00000230725.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000032113.1 ; transcript_alias_1 ENST00000426854 ; transcript_alias_2 TCONS_00028030 ; transcript_alias_3 ENST00000426854.1 ; transcript_alias_4 RP4-738P15.1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000078390.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT079136 ;
chr20	lncipedia.org	exon	25128085	25128100	.	-	.	gene_id lnc-VSX1-1 ; transcript_id lnc-VSX1-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000230725 ; gene_alias_2 XLOC_013704 ; gene_alias_3 linc-VSX1-2 ; gene_alias_4 RP4-738P15.1 ; gene_alias_5 ENSG00000230725.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000032113.1 ; transcript_alias_1 ENST00000426854 ; transcript_alias_2 TCONS_00028030 ; transcript_alias_3 ENST00000426854.1 ; transcript_alias_4 RP4-738P15.1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000078390.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT079136 ;
chr8	lncipedia.org	exon	90733172	90733602	.	-	.	gene_id lnc-NBN-1 ; transcript_id lnc-NBN-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000251136 ; gene_alias_2 RP11-37B2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251136.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163788.2 ; gene_alias_5 ENSG00000251136.4 ; transcript_alias_1 ENST00000523995 ; transcript_alias_2 ENST00000523995.1 ; transcript_alias_3 RP11-37B2.1-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000375483.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127624 ;
chr8	lncipedia.org	exon	90734243	90734578	.	-	.	gene_id lnc-NBN-1 ; transcript_id lnc-NBN-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000251136 ; gene_alias_2 RP11-37B2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251136.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163788.2 ; gene_alias_5 ENSG00000251136.4 ; transcript_alias_1 ENST00000523995 ; transcript_alias_2 ENST00000523995.1 ; transcript_alias_3 RP11-37B2.1-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000375483.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127624 ;
chr2	lncipedia.org	exon	197015987	197016232	.	+	.	gene_id lnc-SLC39A10-3 ; transcript_id lnc-SLC39A10-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245478 ; gene_alias_2 ENSG00000272211.1 ; gene_alias_3 RP11-347P5.1 ; transcript_alias_1 ENST00000428549 ; transcript_alias_2 ENST00000606818.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	197017787	197019605	.	+	.	gene_id lnc-SLC39A10-3 ; transcript_id lnc-SLC39A10-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245478 ; gene_alias_2 ENSG00000272211.1 ; gene_alias_3 RP11-347P5.1 ; transcript_alias_1 ENST00000428549 ; transcript_alias_2 ENST00000606818.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	32875249	32875810	.	-	.	gene_id lnc-CCDC73-1 ; transcript_id lnc-CCDC73-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248689 ; transcript_alias_1 ENST00000503260 ;
chr11	lncipedia.org	exon	32878982	32879665	.	-	.	gene_id lnc-CCDC73-1 ; transcript_id lnc-CCDC73-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248689 ; transcript_alias_1 ENST00000503260 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127094580	127094809	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-9 ; transcript_id lnc-DHX37-9:11 ; gene_alias_1 ENSG00000256732 ; gene_alias_2 RP11-407A16.3 ; gene_alias_3 ENSG00000256732.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168473.1 ; transcript_alias_1 ENST00000545853 ; transcript_alias_2 ENST00000545853.1 ; transcript_alias_3 RP11-407A16.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399853.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031786 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127174581	127174806	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-9 ; transcript_id lnc-DHX37-9:11 ; gene_alias_1 ENSG00000256732 ; gene_alias_2 RP11-407A16.3 ; gene_alias_3 ENSG00000256732.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168473.1 ; transcript_alias_1 ENST00000545853 ; transcript_alias_2 ENST00000545853.1 ; transcript_alias_3 RP11-407A16.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399853.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031786 ;
chr12	lncipedia.org	exon	24520869	24521573	.	-	.	gene_id lnc-BCAT1-2 ; transcript_id lnc-BCAT1-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000255864 ; gene_alias_2 RP11-444D3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255864.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169057.3 ; transcript_alias_1 ENST00000538905 ; transcript_alias_2 ENST00000538905.1 ; transcript_alias_3 RP11-444D3.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402100.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027322 ;
chr12	lncipedia.org	exon	24560419	24560500	.	-	.	gene_id lnc-BCAT1-2 ; transcript_id lnc-BCAT1-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000255864 ; gene_alias_2 RP11-444D3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255864.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169057.3 ; transcript_alias_1 ENST00000538905 ; transcript_alias_2 ENST00000538905.1 ; transcript_alias_3 RP11-444D3.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402100.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027322 ;
chr12	lncipedia.org	exon	24715272	24715316	.	-	.	gene_id lnc-BCAT1-2 ; transcript_id lnc-BCAT1-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000255864 ; gene_alias_2 RP11-444D3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255864.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169057.3 ; transcript_alias_1 ENST00000538905 ; transcript_alias_2 ENST00000538905.1 ; transcript_alias_3 RP11-444D3.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402100.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027322 ;
chr3	lncipedia.org	exon	180892932	180893055	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000469278 ; transcript_alias_2 ENST00000469278.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350420.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	180893302	180893371	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000469278 ; transcript_alias_2 ENST00000469278.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350420.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	181281508	181281716	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000469278 ; transcript_alias_2 ENST00000469278.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350420.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	181328649	181328717	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000469278 ; transcript_alias_2 ENST00000469278.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350420.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	181457357	181457445	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000469278 ; transcript_alias_2 ENST00000469278.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350420.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	3624404	3624458	.	+	.	gene_id lnc-GSG2-2 ; transcript_id lnc-GSG2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244779 ; transcript_alias_1 ENST00000500236 ;
chr17	lncipedia.org	exon	3638389	3638430	.	+	.	gene_id lnc-GSG2-2 ; transcript_id lnc-GSG2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244779 ; transcript_alias_1 ENST00000500236 ;
chr17	lncipedia.org	exon	3837655	3837739	.	+	.	gene_id lnc-GSG2-2 ; transcript_id lnc-GSG2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244779 ; transcript_alias_1 ENST00000500236 ;
chr17	lncipedia.org	exon	3872164	3872174	.	+	.	gene_id lnc-GSG2-2 ; transcript_id lnc-GSG2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244779 ; transcript_alias_1 ENST00000500236 ;
chr17	lncipedia.org	exon	3988208	3988220	.	+	.	gene_id lnc-GSG2-2 ; transcript_id lnc-GSG2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244779 ; transcript_alias_1 ENST00000500236 ;
chr17	lncipedia.org	exon	4194101	4195024	.	+	.	gene_id lnc-GSG2-2 ; transcript_id lnc-GSG2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244779 ; transcript_alias_1 ENST00000500236 ;
chr15	lncipedia.org	exon	42264961	42265196	.	+	.	gene_id lnc-JMJD7-PLA2G4B-4 ; transcript_id lnc-JMJD7-PLA2G4B-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246740 ; gene_alias_2 CTD-2382E5.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246740.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169509.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499478 ; transcript_alias_2 ENST00000499478.2 ; transcript_alias_3 CTD-2382E5.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404539.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT041988 ; transcript_alias_6 NR_120334 ;
chr15	lncipedia.org	exon	42266002	42266156	.	+	.	gene_id lnc-JMJD7-PLA2G4B-4 ; transcript_id lnc-JMJD7-PLA2G4B-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246740 ; gene_alias_2 CTD-2382E5.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246740.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169509.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499478 ; transcript_alias_2 ENST00000499478.2 ; transcript_alias_3 CTD-2382E5.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404539.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT041988 ; transcript_alias_6 NR_120334 ;
chr15	lncipedia.org	exon	42273503	42273654	.	+	.	gene_id lnc-JMJD7-PLA2G4B-4 ; transcript_id lnc-JMJD7-PLA2G4B-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246740 ; gene_alias_2 CTD-2382E5.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246740.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169509.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499478 ; transcript_alias_2 ENST00000499478.2 ; transcript_alias_3 CTD-2382E5.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404539.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT041988 ; transcript_alias_6 NR_120334 ;
chr15	lncipedia.org	exon	42289337	42291292	.	+	.	gene_id lnc-JMJD7-PLA2G4B-4 ; transcript_id lnc-JMJD7-PLA2G4B-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246740 ; gene_alias_2 CTD-2382E5.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246740.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169509.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499478 ; transcript_alias_2 ENST00000499478.2 ; transcript_alias_3 CTD-2382E5.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404539.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT041988 ; transcript_alias_6 NR_120334 ;
chr20	lncipedia.org	exon	5971589	5972114	.	-	.	gene_id lnc-LRRN4-1 ; transcript_id lnc-LRRN4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247862 ; gene_alias_2 AL035461.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500193 ; transcript_alias_2 NONHSAT078516 ;
chr20	lncipedia.org	exon	5974440	5974570	.	-	.	gene_id lnc-LRRN4-1 ; transcript_id lnc-LRRN4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247862 ; gene_alias_2 AL035461.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500193 ; transcript_alias_2 NONHSAT078516 ;
chr20	lncipedia.org	exon	5981167	5981321	.	-	.	gene_id lnc-LRRN4-1 ; transcript_id lnc-LRRN4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247862 ; gene_alias_2 AL035461.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500193 ; transcript_alias_2 NONHSAT078516 ;
chr20	lncipedia.org	exon	5981922	5982043	.	-	.	gene_id lnc-LRRN4-1 ; transcript_id lnc-LRRN4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247862 ; gene_alias_2 AL035461.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500193 ; transcript_alias_2 NONHSAT078516 ;
chr20	lncipedia.org	exon	5986419	5986467	.	-	.	gene_id lnc-LRRN4-1 ; transcript_id lnc-LRRN4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247862 ; gene_alias_2 AL035461.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500193 ; transcript_alias_2 NONHSAT078516 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87836546	87836859	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:10 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; gene_alias_6 ENSG00000245526.4 ; transcript_alias_1 ENST00000502301 ; transcript_alias_2 ENST00000502301.1 ; transcript_alias_3 LINC00461-010 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369808.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102661 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87837853	87837888	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:10 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; gene_alias_6 ENSG00000245526.4 ; transcript_alias_1 ENST00000502301 ; transcript_alias_2 ENST00000502301.1 ; transcript_alias_3 LINC00461-010 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369808.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102661 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87966854	87966903	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:10 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; gene_alias_6 ENSG00000245526.4 ; transcript_alias_1 ENST00000502301 ; transcript_alias_2 ENST00000502301.1 ; transcript_alias_3 LINC00461-010 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369808.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102661 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87968783	87968846	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:10 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; gene_alias_6 ENSG00000245526.4 ; transcript_alias_1 ENST00000502301 ; transcript_alias_2 ENST00000502301.1 ; transcript_alias_3 LINC00461-010 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369808.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102661 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87974165	87974262	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:10 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; gene_alias_6 ENSG00000245526.4 ; transcript_alias_1 ENST00000502301 ; transcript_alias_2 ENST00000502301.1 ; transcript_alias_3 LINC00461-010 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369808.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102661 ;
chr2	lncipedia.org	exon	65663864	65664016	.	+	.	gene_id lnc-ACTR2-2 ; transcript_id lnc-ACTR2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204929 ; gene_alias_2 AC074391.1 ; gene_alias_3 ENSG00000204929.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152768.5 ; gene_alias_5 ENSG00000204929.7 ; transcript_alias_1 ENST00000536804 ; transcript_alias_2 ENST00000536804.1 ; transcript_alias_3 AC074391.1-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT147094 ;
chr2	lncipedia.org	exon	65696648	65696745	.	+	.	gene_id lnc-ACTR2-2 ; transcript_id lnc-ACTR2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204929 ; gene_alias_2 AC074391.1 ; gene_alias_3 ENSG00000204929.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152768.5 ; gene_alias_5 ENSG00000204929.7 ; transcript_alias_1 ENST00000536804 ; transcript_alias_2 ENST00000536804.1 ; transcript_alias_3 AC074391.1-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT147094 ;
chr2	lncipedia.org	exon	65703392	65703483	.	+	.	gene_id lnc-ACTR2-2 ; transcript_id lnc-ACTR2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204929 ; gene_alias_2 AC074391.1 ; gene_alias_3 ENSG00000204929.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152768.5 ; gene_alias_5 ENSG00000204929.7 ; transcript_alias_1 ENST00000536804 ; transcript_alias_2 ENST00000536804.1 ; transcript_alias_3 AC074391.1-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT147094 ;
chr2	lncipedia.org	exon	65710194	65710280	.	+	.	gene_id lnc-ACTR2-2 ; transcript_id lnc-ACTR2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204929 ; gene_alias_2 AC074391.1 ; gene_alias_3 ENSG00000204929.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152768.5 ; gene_alias_5 ENSG00000204929.7 ; transcript_alias_1 ENST00000536804 ; transcript_alias_2 ENST00000536804.1 ; transcript_alias_3 AC074391.1-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT147094 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37075334	37075655	.	+	.	gene_id lnc-RALGAPB-1 ; transcript_id lnc-RALGAPB-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000174365 ; gene_alias_2 SNHG11 ; gene_alias_3 ENSG00000174365.14 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032449.1 ; gene_alias_5 ENSG00000174365.15 ; transcript_alias_1 ENST00000421599 ; transcript_alias_2 ENST00000421599.1 ; transcript_alias_3 SNHG11-014 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079189.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT079676 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37076109	37076266	.	+	.	gene_id lnc-RALGAPB-1 ; transcript_id lnc-RALGAPB-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000174365 ; gene_alias_2 SNHG11 ; gene_alias_3 ENSG00000174365.14 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032449.1 ; gene_alias_5 ENSG00000174365.15 ; transcript_alias_1 ENST00000421599 ; transcript_alias_2 ENST00000421599.1 ; transcript_alias_3 SNHG11-014 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079189.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT079676 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37077309	37077373	.	+	.	gene_id lnc-RALGAPB-1 ; transcript_id lnc-RALGAPB-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000174365 ; gene_alias_2 SNHG11 ; gene_alias_3 ENSG00000174365.14 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032449.1 ; gene_alias_5 ENSG00000174365.15 ; transcript_alias_1 ENST00000421599 ; transcript_alias_2 ENST00000421599.1 ; transcript_alias_3 SNHG11-014 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079189.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT079676 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37078979	37079090	.	+	.	gene_id lnc-RALGAPB-1 ; transcript_id lnc-RALGAPB-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000174365 ; gene_alias_2 SNHG11 ; gene_alias_3 ENSG00000174365.14 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032449.1 ; gene_alias_5 ENSG00000174365.15 ; transcript_alias_1 ENST00000421599 ; transcript_alias_2 ENST00000421599.1 ; transcript_alias_3 SNHG11-014 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079189.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT079676 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37079176	37079564	.	+	.	gene_id lnc-RALGAPB-1 ; transcript_id lnc-RALGAPB-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000174365 ; gene_alias_2 SNHG11 ; gene_alias_3 ENSG00000174365.14 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032449.1 ; gene_alias_5 ENSG00000174365.15 ; transcript_alias_1 ENST00000421599 ; transcript_alias_2 ENST00000421599.1 ; transcript_alias_3 SNHG11-014 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079189.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT079676 ;
chr4	lncipedia.org	exon	183062339	183062637	.	-	.	gene_id lnc-DCTD-4 ; transcript_id lnc-DCTD-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000177822 ; gene_alias_2 AC108142.1 ; gene_alias_3 ENSG00000177822.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000133641.2 ; transcript_alias_1 ENST00000513752 ; transcript_alias_2 ENST00000513752.1 ; transcript_alias_3 AC108142.1-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000361748.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099432 ;
chr4	lncipedia.org	exon	183064591	183064698	.	-	.	gene_id lnc-DCTD-4 ; transcript_id lnc-DCTD-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000177822 ; gene_alias_2 AC108142.1 ; gene_alias_3 ENSG00000177822.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000133641.2 ; transcript_alias_1 ENST00000513752 ; transcript_alias_2 ENST00000513752.1 ; transcript_alias_3 AC108142.1-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000361748.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099432 ;
chr4	lncipedia.org	exon	183064856	183064997	.	-	.	gene_id lnc-DCTD-4 ; transcript_id lnc-DCTD-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000177822 ; gene_alias_2 AC108142.1 ; gene_alias_3 ENSG00000177822.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000133641.2 ; transcript_alias_1 ENST00000513752 ; transcript_alias_2 ENST00000513752.1 ; transcript_alias_3 AC108142.1-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000361748.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099432 ;
chr4	lncipedia.org	exon	183065200	183065293	.	-	.	gene_id lnc-DCTD-4 ; transcript_id lnc-DCTD-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000177822 ; gene_alias_2 AC108142.1 ; gene_alias_3 ENSG00000177822.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000133641.2 ; transcript_alias_1 ENST00000513752 ; transcript_alias_2 ENST00000513752.1 ; transcript_alias_3 AC108142.1-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000361748.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099432 ;
chr4	lncipedia.org	exon	183065492	183065653	.	-	.	gene_id lnc-DCTD-4 ; transcript_id lnc-DCTD-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000177822 ; gene_alias_2 AC108142.1 ; gene_alias_3 ENSG00000177822.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000133641.2 ; transcript_alias_1 ENST00000513752 ; transcript_alias_2 ENST00000513752.1 ; transcript_alias_3 AC108142.1-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000361748.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099432 ;
chr14	lncipedia.org	exon	27312658	27312862	.	+	.	gene_id lnc-FOXG1-4 ; transcript_id lnc-FOXG1-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258081 ; gene_alias_2 RP11-384J4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000258081.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170435.2 ; gene_alias_5 ENSG00000258081.3 ; transcript_alias_1 ENST00000552303 ; transcript_alias_2 ENST00000552303.1 ; transcript_alias_3 RP11-384J4.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409120.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036126 ;
chr14	lncipedia.org	exon	27546444	27546506	.	+	.	gene_id lnc-FOXG1-4 ; transcript_id lnc-FOXG1-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258081 ; gene_alias_2 RP11-384J4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000258081.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170435.2 ; gene_alias_5 ENSG00000258081.3 ; transcript_alias_1 ENST00000552303 ; transcript_alias_2 ENST00000552303.1 ; transcript_alias_3 RP11-384J4.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409120.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036126 ;
chr14	lncipedia.org	exon	27574917	27574979	.	+	.	gene_id lnc-FOXG1-4 ; transcript_id lnc-FOXG1-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258081 ; gene_alias_2 RP11-384J4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000258081.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170435.2 ; gene_alias_5 ENSG00000258081.3 ; transcript_alias_1 ENST00000552303 ; transcript_alias_2 ENST00000552303.1 ; transcript_alias_3 RP11-384J4.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409120.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036126 ;
chr14	lncipedia.org	exon	27601454	27601477	.	+	.	gene_id lnc-FOXG1-4 ; transcript_id lnc-FOXG1-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258081 ; gene_alias_2 RP11-384J4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000258081.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170435.2 ; gene_alias_5 ENSG00000258081.3 ; transcript_alias_1 ENST00000552303 ; transcript_alias_2 ENST00000552303.1 ; transcript_alias_3 RP11-384J4.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409120.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036126 ;
chr14	lncipedia.org	exon	27603176	27603244	.	+	.	gene_id lnc-FOXG1-4 ; transcript_id lnc-FOXG1-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258081 ; gene_alias_2 RP11-384J4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000258081.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170435.2 ; gene_alias_5 ENSG00000258081.3 ; transcript_alias_1 ENST00000552303 ; transcript_alias_2 ENST00000552303.1 ; transcript_alias_3 RP11-384J4.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409120.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036126 ;
chr14	lncipedia.org	exon	27629483	27629626	.	+	.	gene_id lnc-FOXG1-4 ; transcript_id lnc-FOXG1-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258081 ; gene_alias_2 RP11-384J4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000258081.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170435.2 ; gene_alias_5 ENSG00000258081.3 ; transcript_alias_1 ENST00000552303 ; transcript_alias_2 ENST00000552303.1 ; transcript_alias_3 RP11-384J4.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409120.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036126 ;
chr9	lncipedia.org	exon	98632565	98632723	.	-	.	gene_id lnc-PTCH1-3 ; transcript_id lnc-PTCH1-3:6 ; gene_alias_1 ENSG00000175611 ; gene_alias_2 C9orf130 ; gene_alias_3 ENSG00000175611.6 ; gene_alias_4 LINC00476 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000020286.2 ; gene_alias_6 ENSG00000175611.7 ; transcript_alias_1 ENST00000448465 ; transcript_alias_2 ENST00000448465.1 ; transcript_alias_3 LINC00476-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000053244.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT133401 ;
chr9	lncipedia.org	exon	98636791	98636830	.	-	.	gene_id lnc-PTCH1-3 ; transcript_id lnc-PTCH1-3:6 ; gene_alias_1 ENSG00000175611 ; gene_alias_2 C9orf130 ; gene_alias_3 ENSG00000175611.6 ; gene_alias_4 LINC00476 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000020286.2 ; gene_alias_6 ENSG00000175611.7 ; transcript_alias_1 ENST00000448465 ; transcript_alias_2 ENST00000448465.1 ; transcript_alias_3 LINC00476-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000053244.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT133401 ;
chr9	lncipedia.org	exon	98637262	98637352	.	-	.	gene_id lnc-PTCH1-3 ; transcript_id lnc-PTCH1-3:6 ; gene_alias_1 ENSG00000175611 ; gene_alias_2 C9orf130 ; gene_alias_3 ENSG00000175611.6 ; gene_alias_4 LINC00476 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000020286.2 ; gene_alias_6 ENSG00000175611.7 ; transcript_alias_1 ENST00000448465 ; transcript_alias_2 ENST00000448465.1 ; transcript_alias_3 LINC00476-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000053244.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT133401 ;
chr12	lncipedia.org	exon	48401764	48401844	.	-	.	gene_id lnc-COL2A1-1 ; transcript_id lnc-COL2A1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258203 ; gene_alias_2 RP1-228P16.3 ; gene_alias_3 ENSG00000258203.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169893.1 ; transcript_alias_1 ENST00000546804 ; transcript_alias_2 ENST00000546804.1 ; transcript_alias_3 RP1-228P16.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000406465.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027972 ;
chr12	lncipedia.org	exon	48402330	48402433	.	-	.	gene_id lnc-COL2A1-1 ; transcript_id lnc-COL2A1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258203 ; gene_alias_2 RP1-228P16.3 ; gene_alias_3 ENSG00000258203.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169893.1 ; transcript_alias_1 ENST00000546804 ; transcript_alias_2 ENST00000546804.1 ; transcript_alias_3 RP1-228P16.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000406465.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027972 ;
chr12	lncipedia.org	exon	48403144	48403308	.	-	.	gene_id lnc-COL2A1-1 ; transcript_id lnc-COL2A1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258203 ; gene_alias_2 RP1-228P16.3 ; gene_alias_3 ENSG00000258203.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169893.1 ; transcript_alias_1 ENST00000546804 ; transcript_alias_2 ENST00000546804.1 ; transcript_alias_3 RP1-228P16.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000406465.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027972 ;
chr12	lncipedia.org	exon	48404210	48404353	.	-	.	gene_id lnc-COL2A1-1 ; transcript_id lnc-COL2A1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258203 ; gene_alias_2 RP1-228P16.3 ; gene_alias_3 ENSG00000258203.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169893.1 ; transcript_alias_1 ENST00000546804 ; transcript_alias_2 ENST00000546804.1 ; transcript_alias_3 RP1-228P16.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000406465.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027972 ;
chr12	lncipedia.org	exon	48404975	48405010	.	-	.	gene_id lnc-COL2A1-1 ; transcript_id lnc-COL2A1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000258203 ; gene_alias_2 RP1-228P16.3 ; gene_alias_3 ENSG00000258203.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169893.1 ; transcript_alias_1 ENST00000546804 ; transcript_alias_2 ENST00000546804.1 ; transcript_alias_3 RP1-228P16.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000406465.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027972 ;
chr14	lncipedia.org	exon	105559946	105560157	.	+	.	gene_id lnc-C14orf79-2 ; transcript_id lnc-C14orf79-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000257556 ; gene_alias_2 RP11-44N21.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257556.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170462.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548104 ; transcript_alias_2 ENST00000548104.1 ; transcript_alias_3 RP11-44N21.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409285.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT040326 ;
chr14	lncipedia.org	exon	105561877	105562036	.	+	.	gene_id lnc-C14orf79-2 ; transcript_id lnc-C14orf79-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000257556 ; gene_alias_2 RP11-44N21.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257556.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170462.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548104 ; transcript_alias_2 ENST00000548104.1 ; transcript_alias_3 RP11-44N21.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409285.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT040326 ;
chr4	lncipedia.org	exon	109477257	109478220	.	-	.	gene_id lnc-AGXT2L1-1 ; transcript_id lnc-AGXT2L1-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000234492 ; gene_alias_2 RP11-462C24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000234492.3 ; gene_alias_4 RPL34-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000161030.1 ; gene_alias_6 ENSG00000234492.4 ; transcript_alias_1 ENST00000509984 ; transcript_alias_2 ENST00000509984.1 ; transcript_alias_3 RPL34-AS1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000363483.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT097758 ;
chr4	lncipedia.org	exon	109529679	109529806	.	-	.	gene_id lnc-AGXT2L1-1 ; transcript_id lnc-AGXT2L1-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000234492 ; gene_alias_2 RP11-462C24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000234492.3 ; gene_alias_4 RPL34-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000161030.1 ; gene_alias_6 ENSG00000234492.4 ; transcript_alias_1 ENST00000509984 ; transcript_alias_2 ENST00000509984.1 ; transcript_alias_3 RPL34-AS1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000363483.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT097758 ;
chr4	lncipedia.org	exon	109541464	109541551	.	-	.	gene_id lnc-AGXT2L1-1 ; transcript_id lnc-AGXT2L1-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000234492 ; gene_alias_2 RP11-462C24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000234492.3 ; gene_alias_4 RPL34-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000161030.1 ; gene_alias_6 ENSG00000234492.4 ; transcript_alias_1 ENST00000509984 ; transcript_alias_2 ENST00000509984.1 ; transcript_alias_3 RPL34-AS1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000363483.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT097758 ;
chr10	lncipedia.org	exon	119809125	119809128	.	+	.	gene_id lnc-EMX2-4 ; transcript_id lnc-EMX2-4:6 ; gene_alias_1 ENSG00000177640 ; gene_alias_2 CASC2 ; gene_alias_3 ENSG00000177640.11 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000019127.5 ; transcript_alias_1 ENST00000439517 ; transcript_alias_2 ENST00000439517.1 ; transcript_alias_3 CASC2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000050580.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT016556 ;
chr10	lncipedia.org	exon	119811642	119811707	.	+	.	gene_id lnc-EMX2-4 ; transcript_id lnc-EMX2-4:6 ; gene_alias_1 ENSG00000177640 ; gene_alias_2 CASC2 ; gene_alias_3 ENSG00000177640.11 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000019127.5 ; transcript_alias_1 ENST00000439517 ; transcript_alias_2 ENST00000439517.1 ; transcript_alias_3 CASC2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000050580.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT016556 ;
chr10	lncipedia.org	exon	119966948	119967332	.	+	.	gene_id lnc-EMX2-4 ; transcript_id lnc-EMX2-4:6 ; gene_alias_1 ENSG00000177640 ; gene_alias_2 CASC2 ; gene_alias_3 ENSG00000177640.11 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000019127.5 ; transcript_alias_1 ENST00000439517 ; transcript_alias_2 ENST00000439517.1 ; transcript_alias_3 CASC2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000050580.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT016556 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47599684	47599852	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000552990 ; transcript_alias_2 ENST00000552990.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405093.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027904 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47603064	47603265	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000552990 ; transcript_alias_2 ENST00000552990.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405093.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027904 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47604423	47604544	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000552990 ; transcript_alias_2 ENST00000552990.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405093.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027904 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47609948	47610047	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000552990 ; transcript_alias_2 ENST00000552990.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405093.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027904 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47610167	47610227	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000552990 ; transcript_alias_2 ENST00000552990.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405093.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027904 ;
chr14	lncipedia.org	exon	29299456	29299708	.	+	.	gene_id lnc-C14orf23-1 ; transcript_id lnc-C14orf23-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000258038 ; gene_alias_2 CTD-2384A14.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258038.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170368.1 ; transcript_alias_1 ENST00000550122 ; transcript_alias_2 ENST00000550122.1 ; transcript_alias_3 CTD-2384A14.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408708.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036170 ;
chr14	lncipedia.org	exon	29301212	29301266	.	+	.	gene_id lnc-C14orf23-1 ; transcript_id lnc-C14orf23-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000258038 ; gene_alias_2 CTD-2384A14.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258038.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170368.1 ; transcript_alias_1 ENST00000550122 ; transcript_alias_2 ENST00000550122.1 ; transcript_alias_3 CTD-2384A14.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408708.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036170 ;
chr14	lncipedia.org	exon	29304003	29304026	.	+	.	gene_id lnc-C14orf23-1 ; transcript_id lnc-C14orf23-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000258038 ; gene_alias_2 CTD-2384A14.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258038.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170368.1 ; transcript_alias_1 ENST00000550122 ; transcript_alias_2 ENST00000550122.1 ; transcript_alias_3 CTD-2384A14.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408708.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036170 ;
chr14	lncipedia.org	exon	29306459	29306864	.	+	.	gene_id lnc-C14orf23-1 ; transcript_id lnc-C14orf23-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000258038 ; gene_alias_2 CTD-2384A14.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258038.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170368.1 ; transcript_alias_1 ENST00000550122 ; transcript_alias_2 ENST00000550122.1 ; transcript_alias_3 CTD-2384A14.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408708.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036170 ;
chr12	lncipedia.org	exon	110172217	110172398	.	-	.	gene_id lnc-TRPV4-1 ; transcript_id lnc-TRPV4-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000255650 ; gene_alias_2 AC007834.3 ; gene_alias_3 ENSG00000255650.1 ; gene_alias_4 FAM222A-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000169261.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536474 ; transcript_alias_2 ENST00000536474.1 ; transcript_alias_3 FAM222A-AS1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000403181.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030620 ;
chr12	lncipedia.org	exon	110173396	110173762	.	-	.	gene_id lnc-TRPV4-1 ; transcript_id lnc-TRPV4-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000255650 ; gene_alias_2 AC007834.3 ; gene_alias_3 ENSG00000255650.1 ; gene_alias_4 FAM222A-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000169261.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536474 ; transcript_alias_2 ENST00000536474.1 ; transcript_alias_3 FAM222A-AS1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000403181.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030620 ;
chr1	lncipedia.org	exon	89005986	89006342	.	-	.	gene_id lnc-GTF2B-1 ; transcript_id lnc-GTF2B-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237505 ; gene_alias_2 RP11-76N22.2 ; gene_alias_3 ENSG00000237505.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000010024.1 ; transcript_alias_1 ENST00000425750 ; transcript_alias_2 ENST00000425750.1 ; transcript_alias_3 RP11-76N22.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000027734.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT004327 ;
chr1	lncipedia.org	exon	89022587	89022731	.	-	.	gene_id lnc-GTF2B-1 ; transcript_id lnc-GTF2B-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237505 ; gene_alias_2 RP11-76N22.2 ; gene_alias_3 ENSG00000237505.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000010024.1 ; transcript_alias_1 ENST00000425750 ; transcript_alias_2 ENST00000425750.1 ; transcript_alias_3 RP11-76N22.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000027734.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT004327 ;
chr1	lncipedia.org	exon	89035670	89035878	.	-	.	gene_id lnc-GTF2B-1 ; transcript_id lnc-GTF2B-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237505 ; gene_alias_2 RP11-76N22.2 ; gene_alias_3 ENSG00000237505.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000010024.1 ; transcript_alias_1 ENST00000425750 ; transcript_alias_2 ENST00000425750.1 ; transcript_alias_3 RP11-76N22.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000027734.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT004327 ;
chr1	lncipedia.org	exon	89036493	89036542	.	-	.	gene_id lnc-GTF2B-1 ; transcript_id lnc-GTF2B-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237505 ; gene_alias_2 RP11-76N22.2 ; gene_alias_3 ENSG00000237505.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000010024.1 ; transcript_alias_1 ENST00000425750 ; transcript_alias_2 ENST00000425750.1 ; transcript_alias_3 RP11-76N22.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000027734.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT004327 ;
chr1	lncipedia.org	exon	89150547	89150635	.	-	.	gene_id lnc-GTF2B-1 ; transcript_id lnc-GTF2B-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237505 ; gene_alias_2 RP11-76N22.2 ; gene_alias_3 ENSG00000237505.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000010024.1 ; transcript_alias_1 ENST00000425750 ; transcript_alias_2 ENST00000425750.1 ; transcript_alias_3 RP11-76N22.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000027734.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT004327 ;
chr2	lncipedia.org	exon	173541869	173542310	.	-	.	gene_id lnc-DLX2-5 ; transcript_id lnc-DLX2-5:3 ; gene_alias_1 ENSG00000228016 ; gene_alias_2 AC018712.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228016.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154091.1 ; gene_alias_5 RAPGEF4-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000430128 ; transcript_alias_2 ENST00000430128.1 ; transcript_alias_3 AC018712.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333856.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075518 ;
chr2	lncipedia.org	exon	173543606	173543755	.	-	.	gene_id lnc-DLX2-5 ; transcript_id lnc-DLX2-5:3 ; gene_alias_1 ENSG00000228016 ; gene_alias_2 AC018712.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228016.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154091.1 ; gene_alias_5 RAPGEF4-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000430128 ; transcript_alias_2 ENST00000430128.1 ; transcript_alias_3 AC018712.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333856.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075518 ;
chr3	lncipedia.org	exon	62936133	62936193	.	+	.	gene_id lnc-SYNPR-2 ; transcript_id lnc-SYNPR-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000244342 ; gene_alias_2 RP11-129K20.2 ; gene_alias_3 ENSG00000244342.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158701.1 ; gene_alias_5 LINC00698 ; transcript_alias_1 ENST00000465684 ; transcript_alias_2 ENST00000465684.1 ; transcript_alias_3 RP11-129K20.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351801.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090196 ;
chr3	lncipedia.org	exon	62937682	62937758	.	+	.	gene_id lnc-SYNPR-2 ; transcript_id lnc-SYNPR-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000244342 ; gene_alias_2 RP11-129K20.2 ; gene_alias_3 ENSG00000244342.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158701.1 ; gene_alias_5 LINC00698 ; transcript_alias_1 ENST00000465684 ; transcript_alias_2 ENST00000465684.1 ; transcript_alias_3 RP11-129K20.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351801.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090196 ;
chr3	lncipedia.org	exon	63091979	63092098	.	+	.	gene_id lnc-SYNPR-2 ; transcript_id lnc-SYNPR-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000244342 ; gene_alias_2 RP11-129K20.2 ; gene_alias_3 ENSG00000244342.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158701.1 ; gene_alias_5 LINC00698 ; transcript_alias_1 ENST00000465684 ; transcript_alias_2 ENST00000465684.1 ; transcript_alias_3 RP11-129K20.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351801.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090196 ;
chr3	lncipedia.org	exon	63107932	63107995	.	+	.	gene_id lnc-SYNPR-2 ; transcript_id lnc-SYNPR-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000244342 ; gene_alias_2 RP11-129K20.2 ; gene_alias_3 ENSG00000244342.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158701.1 ; gene_alias_5 LINC00698 ; transcript_alias_1 ENST00000465684 ; transcript_alias_2 ENST00000465684.1 ; transcript_alias_3 RP11-129K20.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351801.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090196 ;
chr3	lncipedia.org	exon	63108999	63109124	.	+	.	gene_id lnc-SYNPR-2 ; transcript_id lnc-SYNPR-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000244342 ; gene_alias_2 RP11-129K20.2 ; gene_alias_3 ENSG00000244342.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158701.1 ; gene_alias_5 LINC00698 ; transcript_alias_1 ENST00000465684 ; transcript_alias_2 ENST00000465684.1 ; transcript_alias_3 RP11-129K20.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351801.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090196 ;
chr3	lncipedia.org	exon	63109759	63110738	.	+	.	gene_id lnc-SYNPR-2 ; transcript_id lnc-SYNPR-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000244342 ; gene_alias_2 RP11-129K20.2 ; gene_alias_3 ENSG00000244342.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158701.1 ; gene_alias_5 LINC00698 ; transcript_alias_1 ENST00000465684 ; transcript_alias_2 ENST00000465684.1 ; transcript_alias_3 RP11-129K20.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351801.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090196 ;
chr11	lncipedia.org	exon	115628435	115628970	.	-	.	gene_id lnc-CADM1-2 ; transcript_id lnc-CADM1-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000246100 ; gene_alias_2 CTC-774J1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246100.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168216.1 ; gene_alias_5 ENSG00000246100.3 ; gene_alias_6 LINC00900 ; transcript_alias_1 ENST00000537070 ; transcript_alias_2 ENST00000537070.1 ; transcript_alias_3 CTC-774J1.2-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000398861.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	115630748	115630904	.	-	.	gene_id lnc-CADM1-2 ; transcript_id lnc-CADM1-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000246100 ; gene_alias_2 CTC-774J1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246100.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168216.1 ; gene_alias_5 ENSG00000246100.3 ; gene_alias_6 LINC00900 ; transcript_alias_1 ENST00000537070 ; transcript_alias_2 ENST00000537070.1 ; transcript_alias_3 CTC-774J1.2-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000398861.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	565660	567555	.	-	.	gene_id lnc-C11orf35-2 ; transcript_id lnc-C11orf35-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247095 ; gene_alias_2 MIR210HG ; gene_alias_3 ENSG00000247095.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165284.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500447 ; transcript_alias_2 ENST00000500447.1 ; transcript_alias_3 MIR210HG-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000383231.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017280 ;
chr11	lncipedia.org	exon	568352	568420	.	-	.	gene_id lnc-C11orf35-2 ; transcript_id lnc-C11orf35-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247095 ; gene_alias_2 MIR210HG ; gene_alias_3 ENSG00000247095.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165284.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500447 ; transcript_alias_2 ENST00000500447.1 ; transcript_alias_3 MIR210HG-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000383231.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017280 ;
chr12	lncipedia.org	exon	10705962	10706115	.	+	.	gene_id lnc-EIF2S3L.1-1 ; transcript_id lnc-EIF2S3L.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256039 ; gene_alias_2 RP11-291B21.2 ; gene_alias_3 ENSG00000256039.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168797.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544591 ; transcript_alias_2 ENST00000544591.1 ; transcript_alias_3 RP11-291B21.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401139.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	10709935	10710648	.	+	.	gene_id lnc-EIF2S3L.1-1 ; transcript_id lnc-EIF2S3L.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256039 ; gene_alias_2 RP11-291B21.2 ; gene_alias_3 ENSG00000256039.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168797.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544591 ; transcript_alias_2 ENST00000544591.1 ; transcript_alias_3 RP11-291B21.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401139.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	22541191	22545754	.	-	.	gene_id lnc-FOXA2-2 ; transcript_id lnc-FOXA2-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000225074 ; gene_alias_2 NCRNA00261 ; gene_alias_3 ENSG00000259974.1 ; gene_alias_4 LINC00261 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000046240.1 ; gene_alias_6 ENSG00000259974.2 ; transcript_alias_1 ENST00000450346 ; transcript_alias_2 ENST00000564492.1 ; transcript_alias_3 LINC00261-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000106574.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT078992 ;
chr20	lncipedia.org	exon	22547321	22547443	.	-	.	gene_id lnc-FOXA2-2 ; transcript_id lnc-FOXA2-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000225074 ; gene_alias_2 NCRNA00261 ; gene_alias_3 ENSG00000259974.1 ; gene_alias_4 LINC00261 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000046240.1 ; gene_alias_6 ENSG00000259974.2 ; transcript_alias_1 ENST00000450346 ; transcript_alias_2 ENST00000564492.1 ; transcript_alias_3 LINC00261-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000106574.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT078992 ;
chr20	lncipedia.org	exon	22548432	22548523	.	-	.	gene_id lnc-FOXA2-2 ; transcript_id lnc-FOXA2-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000225074 ; gene_alias_2 NCRNA00261 ; gene_alias_3 ENSG00000259974.1 ; gene_alias_4 LINC00261 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000046240.1 ; gene_alias_6 ENSG00000259974.2 ; transcript_alias_1 ENST00000450346 ; transcript_alias_2 ENST00000564492.1 ; transcript_alias_3 LINC00261-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000106574.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT078992 ;
chr20	lncipedia.org	exon	22559148	22559280	.	-	.	gene_id lnc-FOXA2-2 ; transcript_id lnc-FOXA2-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000225074 ; gene_alias_2 NCRNA00261 ; gene_alias_3 ENSG00000259974.1 ; gene_alias_4 LINC00261 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000046240.1 ; gene_alias_6 ENSG00000259974.2 ; transcript_alias_1 ENST00000450346 ; transcript_alias_2 ENST00000564492.1 ; transcript_alias_3 LINC00261-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000106574.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT078992 ;
chr6	lncipedia.org	exon	107219993	107220236	.	-	.	gene_id lnc-RTN4IP1-2 ; transcript_id lnc-RTN4IP1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235142 ; gene_alias_2 RP1-60O19.1 ; gene_alias_3 ENSG00000235142.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015305.1 ; gene_alias_5 ENSG00000235142.3 ; transcript_alias_1 ENST00000430094 ; transcript_alias_2 ENST00000430094.1 ; transcript_alias_3 RP1-60O19.1-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000041681.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114271 ;
chr6	lncipedia.org	exon	107222652	107222668	.	-	.	gene_id lnc-RTN4IP1-2 ; transcript_id lnc-RTN4IP1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235142 ; gene_alias_2 RP1-60O19.1 ; gene_alias_3 ENSG00000235142.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015305.1 ; gene_alias_5 ENSG00000235142.3 ; transcript_alias_1 ENST00000430094 ; transcript_alias_2 ENST00000430094.1 ; transcript_alias_3 RP1-60O19.1-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000041681.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114271 ;
chr6	lncipedia.org	exon	107222730	107222875	.	-	.	gene_id lnc-RTN4IP1-2 ; transcript_id lnc-RTN4IP1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235142 ; gene_alias_2 RP1-60O19.1 ; gene_alias_3 ENSG00000235142.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015305.1 ; gene_alias_5 ENSG00000235142.3 ; transcript_alias_1 ENST00000430094 ; transcript_alias_2 ENST00000430094.1 ; transcript_alias_3 RP1-60O19.1-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000041681.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114271 ;
chr6	lncipedia.org	exon	107235134	107235354	.	-	.	gene_id lnc-RTN4IP1-2 ; transcript_id lnc-RTN4IP1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235142 ; gene_alias_2 RP1-60O19.1 ; gene_alias_3 ENSG00000235142.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015305.1 ; gene_alias_5 ENSG00000235142.3 ; transcript_alias_1 ENST00000430094 ; transcript_alias_2 ENST00000430094.1 ; transcript_alias_3 RP1-60O19.1-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000041681.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114271 ;
chr20	lncipedia.org	exon	21126230	21126295	.	+	.	gene_id lnc-XRN2-2 ; transcript_id lnc-XRN2-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000088970 ; gene_alias_2 PLK1S1 ; gene_alias_3 ENSG00000088970.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032020.2 ; gene_alias_5 ENSG00000088970.11 ; transcript_alias_1 ENST00000447448 ; transcript_alias_2 ENST00000447448.1 ; transcript_alias_3 PLK1S1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000078261.2 ;
chr20	lncipedia.org	exon	21142512	21143148	.	+	.	gene_id lnc-XRN2-2 ; transcript_id lnc-XRN2-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000088970 ; gene_alias_2 PLK1S1 ; gene_alias_3 ENSG00000088970.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032020.2 ; gene_alias_5 ENSG00000088970.11 ; transcript_alias_1 ENST00000447448 ; transcript_alias_2 ENST00000447448.1 ; transcript_alias_3 PLK1S1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000078261.2 ;
chr20	lncipedia.org	exon	21143491	21143800	.	+	.	gene_id lnc-XRN2-2 ; transcript_id lnc-XRN2-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000088970 ; gene_alias_2 PLK1S1 ; gene_alias_3 ENSG00000088970.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032020.2 ; gene_alias_5 ENSG00000088970.11 ; transcript_alias_1 ENST00000447448 ; transcript_alias_2 ENST00000447448.1 ; transcript_alias_3 PLK1S1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000078261.2 ;
chr20	lncipedia.org	exon	21186130	21186222	.	+	.	gene_id lnc-XRN2-2 ; transcript_id lnc-XRN2-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000088970 ; gene_alias_2 PLK1S1 ; gene_alias_3 ENSG00000088970.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032020.2 ; gene_alias_5 ENSG00000088970.11 ; transcript_alias_1 ENST00000447448 ; transcript_alias_2 ENST00000447448.1 ; transcript_alias_3 PLK1S1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000078261.2 ;
chr20	lncipedia.org	exon	21195173	21195338	.	+	.	gene_id lnc-XRN2-2 ; transcript_id lnc-XRN2-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000088970 ; gene_alias_2 PLK1S1 ; gene_alias_3 ENSG00000088970.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032020.2 ; gene_alias_5 ENSG00000088970.11 ; transcript_alias_1 ENST00000447448 ; transcript_alias_2 ENST00000447448.1 ; transcript_alias_3 PLK1S1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000078261.2 ;
chr20	lncipedia.org	exon	21209649	21209753	.	+	.	gene_id lnc-XRN2-2 ; transcript_id lnc-XRN2-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000088970 ; gene_alias_2 PLK1S1 ; gene_alias_3 ENSG00000088970.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032020.2 ; gene_alias_5 ENSG00000088970.11 ; transcript_alias_1 ENST00000447448 ; transcript_alias_2 ENST00000447448.1 ; transcript_alias_3 PLK1S1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000078261.2 ;
chr20	lncipedia.org	exon	21213372	21213468	.	+	.	gene_id lnc-XRN2-2 ; transcript_id lnc-XRN2-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000088970 ; gene_alias_2 PLK1S1 ; gene_alias_3 ENSG00000088970.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032020.2 ; gene_alias_5 ENSG00000088970.11 ; transcript_alias_1 ENST00000447448 ; transcript_alias_2 ENST00000447448.1 ; transcript_alias_3 PLK1S1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000078261.2 ;
chr20	lncipedia.org	exon	21224883	21224926	.	+	.	gene_id lnc-XRN2-2 ; transcript_id lnc-XRN2-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000088970 ; gene_alias_2 PLK1S1 ; gene_alias_3 ENSG00000088970.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032020.2 ; gene_alias_5 ENSG00000088970.11 ; transcript_alias_1 ENST00000447448 ; transcript_alias_2 ENST00000447448.1 ; transcript_alias_3 PLK1S1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000078261.2 ;
chr20	lncipedia.org	exon	21227117	21227260	.	+	.	gene_id lnc-XRN2-2 ; transcript_id lnc-XRN2-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000088970 ; gene_alias_2 PLK1S1 ; gene_alias_3 ENSG00000088970.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032020.2 ; gene_alias_5 ENSG00000088970.11 ; transcript_alias_1 ENST00000447448 ; transcript_alias_2 ENST00000447448.1 ; transcript_alias_3 PLK1S1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000078261.2 ;
chr15	lncipedia.org	exon	72583909	72583948	.	-	.	gene_id lnc-HEXA-1 ; transcript_id lnc-HEXA-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247056 ; transcript_alias_1 ENST00000501211 ;
chr15	lncipedia.org	exon	72774019	72776168	.	-	.	gene_id lnc-HEXA-1 ; transcript_id lnc-HEXA-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247056 ; transcript_alias_1 ENST00000501211 ;
chr11	lncipedia.org	exon	81811235	81811249	.	-	.	gene_id lnc-FAM181B-2 ; transcript_id lnc-FAM181B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245832 ; gene_alias_2 RP11-179A16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245832.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166867.1 ; transcript_alias_1 ENST00000532217 ; transcript_alias_2 ENST00000532217.1 ; transcript_alias_3 RP11-179A16.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391623.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT023344 ;
chr11	lncipedia.org	exon	82067554	82067670	.	-	.	gene_id lnc-FAM181B-2 ; transcript_id lnc-FAM181B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245832 ; gene_alias_2 RP11-179A16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245832.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166867.1 ; transcript_alias_1 ENST00000532217 ; transcript_alias_2 ENST00000532217.1 ; transcript_alias_3 RP11-179A16.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391623.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT023344 ;
chr11	lncipedia.org	exon	82384134	82384229	.	-	.	gene_id lnc-FAM181B-2 ; transcript_id lnc-FAM181B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245832 ; gene_alias_2 RP11-179A16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245832.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166867.1 ; transcript_alias_1 ENST00000532217 ; transcript_alias_2 ENST00000532217.1 ; transcript_alias_3 RP11-179A16.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391623.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT023344 ;
chr11	lncipedia.org	exon	82424111	82424160	.	-	.	gene_id lnc-FAM181B-2 ; transcript_id lnc-FAM181B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245832 ; gene_alias_2 RP11-179A16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245832.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166867.1 ; transcript_alias_1 ENST00000532217 ; transcript_alias_2 ENST00000532217.1 ; transcript_alias_3 RP11-179A16.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391623.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT023344 ;
chr11	lncipedia.org	exon	82428831	82429124	.	-	.	gene_id lnc-FAM181B-2 ; transcript_id lnc-FAM181B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245832 ; gene_alias_2 RP11-179A16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245832.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166867.1 ; transcript_alias_1 ENST00000532217 ; transcript_alias_2 ENST00000532217.1 ; transcript_alias_3 RP11-179A16.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391623.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT023344 ;
chr8	lncipedia.org	exon	90768463	90768838	.	-	.	gene_id lnc-NBN-1 ; transcript_id lnc-NBN-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000251136 ; gene_alias_2 RP11-37B2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251136.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163788.2 ; gene_alias_5 ENSG00000251136.4 ; transcript_alias_1 ENST00000523859 ; transcript_alias_2 ENST00000523859.1 ; transcript_alias_3 RP11-37B2.1-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000375485.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127625 ;
chr8	lncipedia.org	exon	90769273	90769592	.	-	.	gene_id lnc-NBN-1 ; transcript_id lnc-NBN-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000251136 ; gene_alias_2 RP11-37B2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251136.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163788.2 ; gene_alias_5 ENSG00000251136.4 ; transcript_alias_1 ENST00000523859 ; transcript_alias_2 ENST00000523859.1 ; transcript_alias_3 RP11-37B2.1-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000375485.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127625 ;
chr12	lncipedia.org	exon	111374393	111374502	.	+	.	gene_id lnc-CCDC63-2 ; transcript_id lnc-CCDC63-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000185847 ; gene_alias_2 RP1-46F2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000185847.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169536.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548368 ; transcript_alias_2 ENST00000548368.1 ; transcript_alias_3 RP1-46F2.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404684.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030712 ;
chr12	lncipedia.org	exon	111376094	111376316	.	+	.	gene_id lnc-CCDC63-2 ; transcript_id lnc-CCDC63-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000185847 ; gene_alias_2 RP1-46F2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000185847.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169536.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548368 ; transcript_alias_2 ENST00000548368.1 ; transcript_alias_3 RP1-46F2.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404684.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030712 ;
chr12	lncipedia.org	exon	111381128	111381499	.	+	.	gene_id lnc-CCDC63-2 ; transcript_id lnc-CCDC63-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000185847 ; gene_alias_2 RP1-46F2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000185847.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169536.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548368 ; transcript_alias_2 ENST00000548368.1 ; transcript_alias_3 RP1-46F2.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404684.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030712 ;
chr5	lncipedia.org	exon	88185152	88185297	.	+	.	gene_id lnc-RASA1-7 ; transcript_id lnc-RASA1-7:5 ; gene_alias_1 ENSG00000248309 ; gene_alias_2 CTC-454M9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248309.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162630.2 ; gene_alias_5 MEF2C-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000514011 ; transcript_alias_2 ENST00000514011.1 ; transcript_alias_3 CTC-454M9.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369795.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102695 ;
chr5	lncipedia.org	exon	88201026	88201087	.	+	.	gene_id lnc-RASA1-7 ; transcript_id lnc-RASA1-7:5 ; gene_alias_1 ENSG00000248309 ; gene_alias_2 CTC-454M9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248309.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162630.2 ; gene_alias_5 MEF2C-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000514011 ; transcript_alias_2 ENST00000514011.1 ; transcript_alias_3 CTC-454M9.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369795.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102695 ;
chr5	lncipedia.org	exon	88238833	88238939	.	+	.	gene_id lnc-RASA1-7 ; transcript_id lnc-RASA1-7:5 ; gene_alias_1 ENSG00000248309 ; gene_alias_2 CTC-454M9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248309.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162630.2 ; gene_alias_5 MEF2C-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000514011 ; transcript_alias_2 ENST00000514011.1 ; transcript_alias_3 CTC-454M9.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369795.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102695 ;
chr5	lncipedia.org	exon	88261658	88263096	.	+	.	gene_id lnc-RASA1-7 ; transcript_id lnc-RASA1-7:5 ; gene_alias_1 ENSG00000248309 ; gene_alias_2 CTC-454M9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248309.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162630.2 ; gene_alias_5 MEF2C-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000514011 ; transcript_alias_2 ENST00000514011.1 ; transcript_alias_3 CTC-454M9.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369795.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102695 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105049725	105050981	.	+	.	gene_id lnc-POU3F3-4 ; transcript_id lnc-POU3F3-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235597 ; gene_alias_2 AC013402.2 ; gene_alias_3 ENSG00000235597.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153050.1 ; gene_alias_5 LINC01102 ; transcript_alias_1 ENST00000451400 ; transcript_alias_2 ENST00000451400.1 ; transcript_alias_3 AC013402.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000329242.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT072912 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105122324	105123864	.	+	.	gene_id lnc-POU3F3-4 ; transcript_id lnc-POU3F3-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235597 ; gene_alias_2 AC013402.2 ; gene_alias_3 ENSG00000235597.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153050.1 ; gene_alias_5 LINC01102 ; transcript_alias_1 ENST00000451400 ; transcript_alias_2 ENST00000451400.1 ; transcript_alias_3 AC013402.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000329242.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT072912 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105134517	105134859	.	+	.	gene_id lnc-POU3F3-4 ; transcript_id lnc-POU3F3-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235597 ; gene_alias_2 AC013402.2 ; gene_alias_3 ENSG00000235597.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153050.1 ; gene_alias_5 LINC01102 ; transcript_alias_1 ENST00000451400 ; transcript_alias_2 ENST00000451400.1 ; transcript_alias_3 AC013402.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000329242.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT072912 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105136654	105137290	.	+	.	gene_id lnc-POU3F3-4 ; transcript_id lnc-POU3F3-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235597 ; gene_alias_2 AC013402.2 ; gene_alias_3 ENSG00000235597.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153050.1 ; gene_alias_5 LINC01102 ; transcript_alias_1 ENST00000451400 ; transcript_alias_2 ENST00000451400.1 ; transcript_alias_3 AC013402.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000329242.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT072912 ;
chr12	lncipedia.org	exon	13133564	13133586	.	+	.	gene_id lnc-GPRC5A-2 ; transcript_id lnc-GPRC5A-2:10 ; gene_alias_1 ENSG00000247498 ; transcript_alias_1 ENST00000500905 ;
chr12	lncipedia.org	exon	13133899	13136375	.	+	.	gene_id lnc-GPRC5A-2 ; transcript_id lnc-GPRC5A-2:10 ; gene_alias_1 ENSG00000247498 ; transcript_alias_1 ENST00000500905 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26107968	26108174	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; gene_alias_2 RP11-877E17.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246695.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169126.2 ; gene_alias_5 RASSF8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000537801 ; transcript_alias_2 ENST00000537801.1 ; transcript_alias_3 RP11-877E17.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402421.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027383 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26109160	26109280	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; gene_alias_2 RP11-877E17.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246695.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169126.2 ; gene_alias_5 RASSF8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000537801 ; transcript_alias_2 ENST00000537801.1 ; transcript_alias_3 RP11-877E17.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402421.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027383 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26109572	26109697	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; gene_alias_2 RP11-877E17.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246695.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169126.2 ; gene_alias_5 RASSF8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000537801 ; transcript_alias_2 ENST00000537801.1 ; transcript_alias_3 RP11-877E17.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402421.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027383 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26111865	26111998	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; gene_alias_2 RP11-877E17.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246695.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169126.2 ; gene_alias_5 RASSF8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000537801 ; transcript_alias_2 ENST00000537801.1 ; transcript_alias_3 RP11-877E17.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402421.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027383 ;
chr14	lncipedia.org	exon	29406095	29406201	.	+	.	gene_id lnc-C14orf23-2 ; transcript_id lnc-C14orf23-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258028 ; gene_alias_2 RP11-148E17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258028.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170370.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551227 ; transcript_alias_2 ENST00000551227.1 ; transcript_alias_3 RP11-148E17.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408712.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036178 ;
chr14	lncipedia.org	exon	29455606	29455742	.	+	.	gene_id lnc-C14orf23-2 ; transcript_id lnc-C14orf23-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258028 ; gene_alias_2 RP11-148E17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258028.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170370.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551227 ; transcript_alias_2 ENST00000551227.1 ; transcript_alias_3 RP11-148E17.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408712.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036178 ;
chr14	lncipedia.org	exon	29476887	29477060	.	+	.	gene_id lnc-C14orf23-2 ; transcript_id lnc-C14orf23-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258028 ; gene_alias_2 RP11-148E17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258028.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170370.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551227 ; transcript_alias_2 ENST00000551227.1 ; transcript_alias_3 RP11-148E17.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408712.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036178 ;
chr14	lncipedia.org	exon	29488159	29488293	.	+	.	gene_id lnc-C14orf23-2 ; transcript_id lnc-C14orf23-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258028 ; gene_alias_2 RP11-148E17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258028.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170370.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551227 ; transcript_alias_2 ENST00000551227.1 ; transcript_alias_3 RP11-148E17.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408712.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036178 ;
chr14	lncipedia.org	exon	29490486	29490558	.	+	.	gene_id lnc-C14orf23-2 ; transcript_id lnc-C14orf23-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258028 ; gene_alias_2 RP11-148E17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258028.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170370.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551227 ; transcript_alias_2 ENST00000551227.1 ; transcript_alias_3 RP11-148E17.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408712.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036178 ;
chr14	lncipedia.org	exon	29497855	29497969	.	+	.	gene_id lnc-C14orf23-2 ; transcript_id lnc-C14orf23-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258028 ; gene_alias_2 RP11-148E17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258028.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170370.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551227 ; transcript_alias_2 ENST00000551227.1 ; transcript_alias_3 RP11-148E17.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408712.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036178 ;
chr16	lncipedia.org	exon	25078258	25078967	.	+	.	gene_id lnc-LCMT1-1 ; transcript_id lnc-LCMT1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245776 ; gene_alias_2 XLOC_011678 ; gene_alias_3 linc-LCMT1 ; gene_alias_4 AC133552.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500478 ; transcript_alias_2 TCONS_00024286 ;
chr16	lncipedia.org	exon	25079100	25080246	.	+	.	gene_id lnc-LCMT1-1 ; transcript_id lnc-LCMT1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245776 ; gene_alias_2 XLOC_011678 ; gene_alias_3 linc-LCMT1 ; gene_alias_4 AC133552.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500478 ; transcript_alias_2 TCONS_00024286 ;
chr5	lncipedia.org	exon	148786527	148786641	.	+	.	gene_id lnc-PCYOX1L-2 ; transcript_id lnc-PCYOX1L-2:11 ; gene_alias_1 ENSG00000249669 ; gene_alias_2 XLOC_004598 ; gene_alias_3 linc-ARHGEF37-2 ; gene_alias_4 RP11-394O4.2 ; gene_alias_5 ENSG00000249669.2 ; gene_alias_6 MIR143HG ; gene_alias_7 OTTHUMG00000163464.3 ; gene_alias_8 ENSG00000249669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000509909 ; transcript_alias_2 TCONS_00009540 ; transcript_alias_3 ENST00000509909.1 ; transcript_alias_4 MIR143HG-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000373589.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT104500 ;
chr5	lncipedia.org	exon	148800044	148800107	.	+	.	gene_id lnc-PCYOX1L-2 ; transcript_id lnc-PCYOX1L-2:11 ; gene_alias_1 ENSG00000249669 ; gene_alias_2 XLOC_004598 ; gene_alias_3 linc-ARHGEF37-2 ; gene_alias_4 RP11-394O4.2 ; gene_alias_5 ENSG00000249669.2 ; gene_alias_6 MIR143HG ; gene_alias_7 OTTHUMG00000163464.3 ; gene_alias_8 ENSG00000249669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000509909 ; transcript_alias_2 TCONS_00009540 ; transcript_alias_3 ENST00000509909.1 ; transcript_alias_4 MIR143HG-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000373589.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT104500 ;
chr5	lncipedia.org	exon	148801044	148801164	.	+	.	gene_id lnc-PCYOX1L-2 ; transcript_id lnc-PCYOX1L-2:11 ; gene_alias_1 ENSG00000249669 ; gene_alias_2 XLOC_004598 ; gene_alias_3 linc-ARHGEF37-2 ; gene_alias_4 RP11-394O4.2 ; gene_alias_5 ENSG00000249669.2 ; gene_alias_6 MIR143HG ; gene_alias_7 OTTHUMG00000163464.3 ; gene_alias_8 ENSG00000249669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000509909 ; transcript_alias_2 TCONS_00009540 ; transcript_alias_3 ENST00000509909.1 ; transcript_alias_4 MIR143HG-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000373589.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT104500 ;
chr5	lncipedia.org	exon	148803653	148803902	.	+	.	gene_id lnc-PCYOX1L-2 ; transcript_id lnc-PCYOX1L-2:11 ; gene_alias_1 ENSG00000249669 ; gene_alias_2 XLOC_004598 ; gene_alias_3 linc-ARHGEF37-2 ; gene_alias_4 RP11-394O4.2 ; gene_alias_5 ENSG00000249669.2 ; gene_alias_6 MIR143HG ; gene_alias_7 OTTHUMG00000163464.3 ; gene_alias_8 ENSG00000249669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000509909 ; transcript_alias_2 TCONS_00009540 ; transcript_alias_3 ENST00000509909.1 ; transcript_alias_4 MIR143HG-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000373589.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT104500 ;
chr16	lncipedia.org	exon	76668895	76669046	.	+	.	gene_id lnc-RP11-58C22.1.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-58C22.1.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250514 ; gene_alias_2 AC108125.1 ; gene_alias_3 ENSG00000250514.1 ; gene_alias_4 RP11-96P7.1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000173062.1 ; transcript_alias_1 ENST00000512279 ; transcript_alias_2 ENST00000512279.1 ; transcript_alias_3 RP11-96P7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000421972.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT143783 ; transcript_alias_6 NR_110934 ;
chr16	lncipedia.org	exon	76669394	76669520	.	+	.	gene_id lnc-RP11-58C22.1.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-58C22.1.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250514 ; gene_alias_2 AC108125.1 ; gene_alias_3 ENSG00000250514.1 ; gene_alias_4 RP11-96P7.1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000173062.1 ; transcript_alias_1 ENST00000512279 ; transcript_alias_2 ENST00000512279.1 ; transcript_alias_3 RP11-96P7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000421972.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT143783 ; transcript_alias_6 NR_110934 ;
chr16	lncipedia.org	exon	76689454	76689561	.	+	.	gene_id lnc-RP11-58C22.1.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-58C22.1.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250514 ; gene_alias_2 AC108125.1 ; gene_alias_3 ENSG00000250514.1 ; gene_alias_4 RP11-96P7.1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000173062.1 ; transcript_alias_1 ENST00000512279 ; transcript_alias_2 ENST00000512279.1 ; transcript_alias_3 RP11-96P7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000421972.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT143783 ; transcript_alias_6 NR_110934 ;
chr16	lncipedia.org	exon	76690565	76692375	.	+	.	gene_id lnc-RP11-58C22.1.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-58C22.1.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250514 ; gene_alias_2 AC108125.1 ; gene_alias_3 ENSG00000250514.1 ; gene_alias_4 RP11-96P7.1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000173062.1 ; transcript_alias_1 ENST00000512279 ; transcript_alias_2 ENST00000512279.1 ; transcript_alias_3 RP11-96P7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000421972.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT143783 ; transcript_alias_6 NR_110934 ;
chr3	lncipedia.org	exon	181281509	181281716	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000498731 ; transcript_alias_2 ENST00000498731.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350426.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT093491 ;
chr3	lncipedia.org	exon	181328649	181328717	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000498731 ; transcript_alias_2 ENST00000498731.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350426.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT093491 ;
chr3	lncipedia.org	exon	181417386	181417671	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000498731 ; transcript_alias_2 ENST00000498731.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350426.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT093491 ;
chr3	lncipedia.org	exon	181432973	181433080	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000498731 ; transcript_alias_2 ENST00000498731.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350426.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT093491 ;
chr3	lncipedia.org	exon	181457357	181460261	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000498731 ; transcript_alias_2 ENST00000498731.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350426.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT093491 ;
chr19	lncipedia.org	exon	42656721	42656858	.	+	.	gene_id lnc-ZNF526-1 ; transcript_id lnc-ZNF526-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249075 ; gene_alias_2 XLOC_013083 ; gene_alias_3 linc-ZNF526-1 ; gene_alias_4 ENSG00000259436.1 ; gene_alias_5 CTC-378H22.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000171961.1 ; transcript_alias_1 ENST00000510388 ; transcript_alias_2 TCONS_00026792 ; transcript_alias_3 ENST00000559786.1 ; transcript_alias_4 CTC-378H22.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000416146.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT066523 ;
chr19	lncipedia.org	exon	42659859	42661675	.	+	.	gene_id lnc-ZNF526-1 ; transcript_id lnc-ZNF526-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249075 ; gene_alias_2 XLOC_013083 ; gene_alias_3 linc-ZNF526-1 ; gene_alias_4 ENSG00000259436.1 ; gene_alias_5 CTC-378H22.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000171961.1 ; transcript_alias_1 ENST00000510388 ; transcript_alias_2 TCONS_00026792 ; transcript_alias_3 ENST00000559786.1 ; transcript_alias_4 CTC-378H22.2-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000416146.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT066523 ;
chr21	lncipedia.org	exon	17566788	17566953	.	+	.	gene_id lnc-USP25-2 ; transcript_id lnc-USP25-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000215386 ; gene_alias_2 C21orf34 ; gene_alias_3 ENSG00000215386.5 ; gene_alias_4 LINC00478 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000074377.1 ; transcript_alias_1 ENST00000445461 ; transcript_alias_2 ENST00000445461.1 ; transcript_alias_3 LINC00478-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000158034.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	17603376	17603435	.	+	.	gene_id lnc-USP25-2 ; transcript_id lnc-USP25-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000215386 ; gene_alias_2 C21orf34 ; gene_alias_3 ENSG00000215386.5 ; gene_alias_4 LINC00478 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000074377.1 ; transcript_alias_1 ENST00000445461 ; transcript_alias_2 ENST00000445461.1 ; transcript_alias_3 LINC00478-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000158034.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	17763934	17764005	.	+	.	gene_id lnc-USP25-2 ; transcript_id lnc-USP25-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000215386 ; gene_alias_2 C21orf34 ; gene_alias_3 ENSG00000215386.5 ; gene_alias_4 LINC00478 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000074377.1 ; transcript_alias_1 ENST00000445461 ; transcript_alias_2 ENST00000445461.1 ; transcript_alias_3 LINC00478-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000158034.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	17859810	17859858	.	+	.	gene_id lnc-USP25-2 ; transcript_id lnc-USP25-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000215386 ; gene_alias_2 C21orf34 ; gene_alias_3 ENSG00000215386.5 ; gene_alias_4 LINC00478 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000074377.1 ; transcript_alias_1 ENST00000445461 ; transcript_alias_2 ENST00000445461.1 ; transcript_alias_3 LINC00478-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000158034.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	17909699	17909759	.	+	.	gene_id lnc-USP25-2 ; transcript_id lnc-USP25-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000215386 ; gene_alias_2 C21orf34 ; gene_alias_3 ENSG00000215386.5 ; gene_alias_4 LINC00478 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000074377.1 ; transcript_alias_1 ENST00000445461 ; transcript_alias_2 ENST00000445461.1 ; transcript_alias_3 LINC00478-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000158034.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	17979314	17979542	.	+	.	gene_id lnc-USP25-2 ; transcript_id lnc-USP25-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000215386 ; gene_alias_2 C21orf34 ; gene_alias_3 ENSG00000215386.5 ; gene_alias_4 LINC00478 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000074377.1 ; transcript_alias_1 ENST00000445461 ; transcript_alias_2 ENST00000445461.1 ; transcript_alias_3 LINC00478-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000158034.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	64663186	64663742	.	+	.	gene_id lnc-TRIP4-2 ; transcript_id lnc-TRIP4-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247333 ; gene_alias_2 AC087632.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499528 ; transcript_alias_2 NONHSAT046663 ;
chr15	lncipedia.org	exon	64665490	64666601	.	+	.	gene_id lnc-TRIP4-2 ; transcript_id lnc-TRIP4-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247333 ; gene_alias_2 AC087632.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499528 ; transcript_alias_2 NONHSAT046663 ;
chr15	lncipedia.org	exon	64667517	64667537	.	+	.	gene_id lnc-TRIP4-2 ; transcript_id lnc-TRIP4-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247333 ; gene_alias_2 AC087632.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499528 ; transcript_alias_2 NONHSAT046663 ;
chr4	lncipedia.org	exon	183063536	183064292	.	-	.	gene_id lnc-DCTD-4 ; transcript_id lnc-DCTD-4:6 ; gene_alias_1 ENSG00000177822 ; gene_alias_2 AC108142.1 ; gene_alias_3 ENSG00000177822.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000133641.2 ; transcript_alias_1 ENST00000505873 ; transcript_alias_2 ENST00000505873.1 ; transcript_alias_3 AC108142.1-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000361750.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099433 ;
chr4	lncipedia.org	exon	183064591	183064698	.	-	.	gene_id lnc-DCTD-4 ; transcript_id lnc-DCTD-4:6 ; gene_alias_1 ENSG00000177822 ; gene_alias_2 AC108142.1 ; gene_alias_3 ENSG00000177822.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000133641.2 ; transcript_alias_1 ENST00000505873 ; transcript_alias_2 ENST00000505873.1 ; transcript_alias_3 AC108142.1-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000361750.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099433 ;
chr4	lncipedia.org	exon	183064856	183064929	.	-	.	gene_id lnc-DCTD-4 ; transcript_id lnc-DCTD-4:6 ; gene_alias_1 ENSG00000177822 ; gene_alias_2 AC108142.1 ; gene_alias_3 ENSG00000177822.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000133641.2 ; transcript_alias_1 ENST00000505873 ; transcript_alias_2 ENST00000505873.1 ; transcript_alias_3 AC108142.1-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000361750.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099433 ;
chr11	lncipedia.org	exon	133907004	133907536	.	+	.	gene_id lnc-JAM3-3 ; transcript_id lnc-JAM3-3:7 ; gene_alias_1 ENSG00000204241 ; gene_alias_2 RP11-713P17.3 ; gene_alias_3 ENSG00000204241.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167125.1 ; transcript_alias_1 ENST00000531938 ; transcript_alias_2 ENST00000531938.1 ; transcript_alias_3 RP11-713P17.3-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393295.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT025230 ;
chr11	lncipedia.org	exon	133909657	133909834	.	+	.	gene_id lnc-JAM3-3 ; transcript_id lnc-JAM3-3:7 ; gene_alias_1 ENSG00000204241 ; gene_alias_2 RP11-713P17.3 ; gene_alias_3 ENSG00000204241.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167125.1 ; transcript_alias_1 ENST00000531938 ; transcript_alias_2 ENST00000531938.1 ; transcript_alias_3 RP11-713P17.3-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393295.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT025230 ;
chr17	lncipedia.org	exon	48840212	48840918	.	-	.	gene_id lnc-ANKRD40-1 ; transcript_id lnc-ANKRD40-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000167117 ; gene_alias_2 C17orf73 ; gene_alias_3 ENSG00000167117.4 ; gene_alias_4 LINC00483 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000132429.5 ; transcript_alias_1 ENST00000502517 ; transcript_alias_2 ENST00000502517.1 ; transcript_alias_3 LINC00483-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000368129.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT054721 ;
chr17	lncipedia.org	exon	48844235	48844372	.	-	.	gene_id lnc-ANKRD40-1 ; transcript_id lnc-ANKRD40-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000167117 ; gene_alias_2 C17orf73 ; gene_alias_3 ENSG00000167117.4 ; gene_alias_4 LINC00483 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000132429.5 ; transcript_alias_1 ENST00000502517 ; transcript_alias_2 ENST00000502517.1 ; transcript_alias_3 LINC00483-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000368129.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT054721 ;
chr17	lncipedia.org	exon	48844824	48844918	.	-	.	gene_id lnc-ANKRD40-1 ; transcript_id lnc-ANKRD40-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000167117 ; gene_alias_2 C17orf73 ; gene_alias_3 ENSG00000167117.4 ; gene_alias_4 LINC00483 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000132429.5 ; transcript_alias_1 ENST00000502517 ; transcript_alias_2 ENST00000502517.1 ; transcript_alias_3 LINC00483-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000368129.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT054721 ;
chr15	lncipedia.org	exon	88795961	88796709	.	+	.	gene_id lnc-MRPS11-1 ; transcript_id lnc-MRPS11-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250429 ; gene_alias_2 ENSG00000260305.1 ; gene_alias_3 RP11-356B18.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000173016.1 ; gene_alias_5 NTRK3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000506711 ; transcript_alias_2 ENST00000569588.1 ; transcript_alias_3 RP11-356B18.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000421716.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT048163 ; transcript_alias_6 NR_038229 ;
chr15	lncipedia.org	exon	88810012	88810103	.	+	.	gene_id lnc-MRPS11-1 ; transcript_id lnc-MRPS11-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250429 ; gene_alias_2 ENSG00000260305.1 ; gene_alias_3 RP11-356B18.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000173016.1 ; gene_alias_5 NTRK3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000506711 ; transcript_alias_2 ENST00000569588.1 ; transcript_alias_3 RP11-356B18.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000421716.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT048163 ; transcript_alias_6 NR_038229 ;
chr15	lncipedia.org	exon	88811098	88811317	.	+	.	gene_id lnc-MRPS11-1 ; transcript_id lnc-MRPS11-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250429 ; gene_alias_2 ENSG00000260305.1 ; gene_alias_3 RP11-356B18.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000173016.1 ; gene_alias_5 NTRK3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000506711 ; transcript_alias_2 ENST00000569588.1 ; transcript_alias_3 RP11-356B18.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000421716.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT048163 ; transcript_alias_6 NR_038229 ;
chr15	lncipedia.org	exon	88812696	88814297	.	+	.	gene_id lnc-MRPS11-1 ; transcript_id lnc-MRPS11-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250429 ; gene_alias_2 ENSG00000260305.1 ; gene_alias_3 RP11-356B18.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000173016.1 ; gene_alias_5 NTRK3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000506711 ; transcript_alias_2 ENST00000569588.1 ; transcript_alias_3 RP11-356B18.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000421716.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT048163 ; transcript_alias_6 NR_038229 ;
chr21	lncipedia.org	exon	26943332	26943358	.	+	.	gene_id lnc-JAM2-1 ; transcript_id lnc-JAM2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251052 ; transcript_alias_1 ENST00000509807 ;
chr21	lncipedia.org	exon	26961775	26961839	.	+	.	gene_id lnc-JAM2-1 ; transcript_id lnc-JAM2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251052 ; transcript_alias_1 ENST00000509807 ;
chr21	lncipedia.org	exon	27097864	27097954	.	+	.	gene_id lnc-JAM2-1 ; transcript_id lnc-JAM2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251052 ; transcript_alias_1 ENST00000509807 ;
chr21	lncipedia.org	exon	27227450	27227523	.	+	.	gene_id lnc-JAM2-1 ; transcript_id lnc-JAM2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251052 ; transcript_alias_1 ENST00000509807 ;
chr21	lncipedia.org	exon	27415090	27416048	.	+	.	gene_id lnc-JAM2-1 ; transcript_id lnc-JAM2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251052 ; transcript_alias_1 ENST00000509807 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27042392	27042923	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 MIAT ; gene_alias_5 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000421867 ; transcript_alias_2 TCONS_00029372 ; transcript_alias_3 ENST00000421867.1 ; transcript_alias_4 MIAT-005 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320800.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT147216 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27059280	27059362	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 MIAT ; gene_alias_5 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000421867 ; transcript_alias_2 TCONS_00029372 ; transcript_alias_3 ENST00000421867.1 ; transcript_alias_4 MIAT-005 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320800.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT147216 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27061495	27061841	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 MIAT ; gene_alias_5 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000421867 ; transcript_alias_2 TCONS_00029372 ; transcript_alias_3 ENST00000421867.1 ; transcript_alias_4 MIAT-005 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320800.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT147216 ;
chr15	lncipedia.org	exon	74209942	74211724	.	-	.	gene_id lnc-STOML1-1 ; transcript_id lnc-STOML1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244984 ; gene_alias_2 ENSG00000261801.1 ; gene_alias_3 RP11-941F15.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000172711.2 ; gene_alias_5 LOXL1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500369 ; transcript_alias_2 ENST00000564194.1 ; transcript_alias_3 RP11-941F15.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000420130.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	74212179	74212379	.	-	.	gene_id lnc-STOML1-1 ; transcript_id lnc-STOML1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244984 ; gene_alias_2 ENSG00000261801.1 ; gene_alias_3 RP11-941F15.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000172711.2 ; gene_alias_5 LOXL1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500369 ; transcript_alias_2 ENST00000564194.1 ; transcript_alias_3 RP11-941F15.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000420130.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	74220406	74220589	.	-	.	gene_id lnc-STOML1-1 ; transcript_id lnc-STOML1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244984 ; gene_alias_2 ENSG00000261801.1 ; gene_alias_3 RP11-941F15.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000172711.2 ; gene_alias_5 LOXL1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500369 ; transcript_alias_2 ENST00000564194.1 ; transcript_alias_3 RP11-941F15.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000420130.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	6532166	6532359	.	+	.	gene_id lnc-GRM7-4 ; transcript_id lnc-GRM7-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000189229 ; gene_alias_2 AC069277.2 ; gene_alias_3 ENSG00000189229.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154923.2 ; transcript_alias_1 ENST00000433639 ; transcript_alias_2 ENST00000433639.1 ; transcript_alias_3 AC069277.2-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000337644.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT087673 ;
chr3	lncipedia.org	exon	6759256	6759354	.	+	.	gene_id lnc-GRM7-4 ; transcript_id lnc-GRM7-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000189229 ; gene_alias_2 AC069277.2 ; gene_alias_3 ENSG00000189229.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154923.2 ; transcript_alias_1 ENST00000433639 ; transcript_alias_2 ENST00000433639.1 ; transcript_alias_3 AC069277.2-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000337644.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT087673 ;
chr3	lncipedia.org	exon	6766137	6766233	.	+	.	gene_id lnc-GRM7-4 ; transcript_id lnc-GRM7-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000189229 ; gene_alias_2 AC069277.2 ; gene_alias_3 ENSG00000189229.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154923.2 ; transcript_alias_1 ENST00000433639 ; transcript_alias_2 ENST00000433639.1 ; transcript_alias_3 AC069277.2-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000337644.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT087673 ;
chr3	lncipedia.org	exon	6773958	6774182	.	+	.	gene_id lnc-GRM7-4 ; transcript_id lnc-GRM7-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000189229 ; gene_alias_2 AC069277.2 ; gene_alias_3 ENSG00000189229.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154923.2 ; transcript_alias_1 ENST00000433639 ; transcript_alias_2 ENST00000433639.1 ; transcript_alias_3 AC069277.2-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000337644.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT087673 ;
chr3	lncipedia.org	exon	6777349	6777816	.	+	.	gene_id lnc-GRM7-4 ; transcript_id lnc-GRM7-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000189229 ; gene_alias_2 AC069277.2 ; gene_alias_3 ENSG00000189229.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154923.2 ; transcript_alias_1 ENST00000433639 ; transcript_alias_2 ENST00000433639.1 ; transcript_alias_3 AC069277.2-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000337644.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT087673 ;
chr12	lncipedia.org	exon	106100552	106100634	.	+	.	gene_id lnc-C12orf75-2 ; transcript_id lnc-C12orf75-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000257859 ; gene_alias_2 RP11-266E14.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257859.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169725.1 ; gene_alias_5 CASC18 ; transcript_alias_1 ENST00000547465 ; transcript_alias_2 ENST00000547465.1 ; transcript_alias_3 RP11-266E14.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405600.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030460 ;
chr12	lncipedia.org	exon	106135534	106136007	.	+	.	gene_id lnc-C12orf75-2 ; transcript_id lnc-C12orf75-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000257859 ; gene_alias_2 RP11-266E14.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257859.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169725.1 ; gene_alias_5 CASC18 ; transcript_alias_1 ENST00000547465 ; transcript_alias_2 ENST00000547465.1 ; transcript_alias_3 RP11-266E14.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405600.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030460 ;
chr7	lncipedia.org	exon	27162787	27162844	.	+	.	gene_id lnc-EVX1-10 ; transcript_id lnc-EVX1-10:10 ; gene_alias_1 ENSG00000253552 ; gene_alias_2 AC004080.12 ; gene_alias_3 ENSG00000253552.2 ; gene_alias_4 HOXA-AS2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000063274.3 ; gene_alias_6 ENSG00000253552.3 ; transcript_alias_1 ENST00000524048 ; transcript_alias_2 ENST00000524048.1 ; transcript_alias_3 HOXA-AS2-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407130.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT119680 ;
chr7	lncipedia.org	exon	27163079	27163257	.	+	.	gene_id lnc-EVX1-10 ; transcript_id lnc-EVX1-10:10 ; gene_alias_1 ENSG00000253552 ; gene_alias_2 AC004080.12 ; gene_alias_3 ENSG00000253552.2 ; gene_alias_4 HOXA-AS2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000063274.3 ; gene_alias_6 ENSG00000253552.3 ; transcript_alias_1 ENST00000524048 ; transcript_alias_2 ENST00000524048.1 ; transcript_alias_3 HOXA-AS2-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407130.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT119680 ;
chr7	lncipedia.org	exon	27163631	27163886	.	+	.	gene_id lnc-EVX1-10 ; transcript_id lnc-EVX1-10:10 ; gene_alias_1 ENSG00000253552 ; gene_alias_2 AC004080.12 ; gene_alias_3 ENSG00000253552.2 ; gene_alias_4 HOXA-AS2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000063274.3 ; gene_alias_6 ENSG00000253552.3 ; transcript_alias_1 ENST00000524048 ; transcript_alias_2 ENST00000524048.1 ; transcript_alias_3 HOXA-AS2-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407130.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT119680 ;
chr16	lncipedia.org	exon	70192860	70193983	.	-	.	gene_id lnc-EXOSC6-2 ; transcript_id lnc-EXOSC6-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247228 ; gene_alias_2 AC009060.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247228.2 ; gene_alias_4 RP11-296I10.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000176981.2 ; transcript_alias_1 ENST00000502126 ; transcript_alias_2 ENST00000502126.1 ; transcript_alias_3 RP11-296I10.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000434586.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT143401 ;
chr16	lncipedia.org	exon	70194075	70194214	.	-	.	gene_id lnc-EXOSC6-2 ; transcript_id lnc-EXOSC6-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247228 ; gene_alias_2 AC009060.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247228.2 ; gene_alias_4 RP11-296I10.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000176981.2 ; transcript_alias_1 ENST00000502126 ; transcript_alias_2 ENST00000502126.1 ; transcript_alias_3 RP11-296I10.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000434586.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT143401 ;
chr16	lncipedia.org	exon	70194638	70194844	.	-	.	gene_id lnc-EXOSC6-2 ; transcript_id lnc-EXOSC6-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247228 ; gene_alias_2 AC009060.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247228.2 ; gene_alias_4 RP11-296I10.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000176981.2 ; transcript_alias_1 ENST00000502126 ; transcript_alias_2 ENST00000502126.1 ; transcript_alias_3 RP11-296I10.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000434586.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT143401 ;
chr16	lncipedia.org	exon	70195347	70195796	.	-	.	gene_id lnc-EXOSC6-2 ; transcript_id lnc-EXOSC6-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247228 ; gene_alias_2 AC009060.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247228.2 ; gene_alias_4 RP11-296I10.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000176981.2 ; transcript_alias_1 ENST00000502126 ; transcript_alias_2 ENST00000502126.1 ; transcript_alias_3 RP11-296I10.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000434586.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT143401 ;
chr16	lncipedia.org	exon	70207031	70207351	.	-	.	gene_id lnc-EXOSC6-2 ; transcript_id lnc-EXOSC6-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247228 ; gene_alias_2 AC009060.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247228.2 ; gene_alias_4 RP11-296I10.3 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000176981.2 ; transcript_alias_1 ENST00000502126 ; transcript_alias_2 ENST00000502126.1 ; transcript_alias_3 RP11-296I10.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000434586.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT143401 ;
chr2	lncipedia.org	exon	173587914	173592161	.	-	.	gene_id lnc-DLX2-5 ; transcript_id lnc-DLX2-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228016 ; gene_alias_2 AC018712.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228016.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154091.1 ; gene_alias_5 RAPGEF4-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000435328 ; transcript_alias_2 ENST00000435328.1 ; transcript_alias_3 AC018712.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333857.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075521 ;
chr2	lncipedia.org	exon	173599033	173599161	.	-	.	gene_id lnc-DLX2-5 ; transcript_id lnc-DLX2-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228016 ; gene_alias_2 AC018712.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228016.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154091.1 ; gene_alias_5 RAPGEF4-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000435328 ; transcript_alias_2 ENST00000435328.1 ; transcript_alias_3 AC018712.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333857.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075521 ;
chr2	lncipedia.org	exon	173600023	173600189	.	-	.	gene_id lnc-DLX2-5 ; transcript_id lnc-DLX2-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228016 ; gene_alias_2 AC018712.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228016.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154091.1 ; gene_alias_5 RAPGEF4-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000435328 ; transcript_alias_2 ENST00000435328.1 ; transcript_alias_3 AC018712.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333857.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075521 ;
chr2	lncipedia.org	exon	173600854	173600934	.	-	.	gene_id lnc-DLX2-5 ; transcript_id lnc-DLX2-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228016 ; gene_alias_2 AC018712.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228016.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154091.1 ; gene_alias_5 RAPGEF4-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000435328 ; transcript_alias_2 ENST00000435328.1 ; transcript_alias_3 AC018712.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333857.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075521 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27053336	27053618	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:14 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 MIAT ; gene_alias_3 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000423278 ; transcript_alias_2 ENST00000423278.1 ; transcript_alias_3 MIAT-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320796.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT084521 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27059280	27059362	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:14 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 MIAT ; gene_alias_3 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000423278 ; transcript_alias_2 ENST00000423278.1 ; transcript_alias_3 MIAT-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320796.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT084521 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27061495	27062900	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:14 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 MIAT ; gene_alias_3 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000423278 ; transcript_alias_2 ENST00000423278.1 ; transcript_alias_3 MIAT-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320796.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT084521 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27063148	27063273	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:14 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 MIAT ; gene_alias_3 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000423278 ; transcript_alias_2 ENST00000423278.1 ; transcript_alias_3 MIAT-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320796.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT084521 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27064121	27072438	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:14 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 MIAT ; gene_alias_3 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000423278 ; transcript_alias_2 ENST00000423278.1 ; transcript_alias_3 MIAT-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000320796.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT084521 ;
chr2	lncipedia.org	exon	58236367	58240741	.	-	.	gene_id lnc-FANCL-1 ; transcript_id lnc-FANCL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250445 ; transcript_alias_1 ENST00000508028 ;
chr2	lncipedia.org	exon	58243792	58245216	.	-	.	gene_id lnc-FANCL-1 ; transcript_id lnc-FANCL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250445 ; transcript_alias_1 ENST00000508028 ;
chr11	lncipedia.org	exon	43896109	43896479	.	-	.	gene_id lnc-ALX4-5 ; transcript_id lnc-ALX4-5:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246250 ; gene_alias_2 ENSG00000246250.2 ; gene_alias_3 RP11-613D13.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166552.1 ; transcript_alias_1 ENST00000528765 ; transcript_alias_2 ENST00000528765.1 ; transcript_alias_3 RP11-613D13.5-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000390391.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT018959 ;
chr11	lncipedia.org	exon	43899533	43899623	.	-	.	gene_id lnc-ALX4-5 ; transcript_id lnc-ALX4-5:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246250 ; gene_alias_2 ENSG00000246250.2 ; gene_alias_3 RP11-613D13.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166552.1 ; transcript_alias_1 ENST00000528765 ; transcript_alias_2 ENST00000528765.1 ; transcript_alias_3 RP11-613D13.5-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000390391.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT018959 ;
chr18	lncipedia.org	exon	73408038	73409566	.	-	.	gene_id lnc-C18orf62-3 ; transcript_id lnc-C18orf62-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248784 ; gene_alias_2 XLOC_012887 ; gene_alias_3 linc-C18orf62-1 ; transcript_alias_1 ENST00000515252 ; transcript_alias_2 TCONS_00026214 ;
chr18	lncipedia.org	exon	73423971	73424340	.	-	.	gene_id lnc-C18orf62-3 ; transcript_id lnc-C18orf62-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248784 ; gene_alias_2 XLOC_012887 ; gene_alias_3 linc-C18orf62-1 ; transcript_alias_1 ENST00000515252 ; transcript_alias_2 TCONS_00026214 ;
chr1	lncipedia.org	exon	190449509	190449554	.	+	.	gene_id lnc-RGS18-5 ; transcript_id lnc-RGS18-5:9 ; gene_alias_1 ENSG00000241505 ; gene_alias_2 XLOC_000505 ; gene_alias_3 linc-RGS18-3 ; gene_alias_4 RP11-161I10.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241505.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000040635.1 ; transcript_alias_1 ENST00000417409 ; transcript_alias_2 TCONS_00000358 ; transcript_alias_3 ENST00000417409.1 ; transcript_alias_4 RP11-161I10.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000097707.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT008507 ;
chr1	lncipedia.org	exon	190462968	190463427	.	+	.	gene_id lnc-RGS18-5 ; transcript_id lnc-RGS18-5:9 ; gene_alias_1 ENSG00000241505 ; gene_alias_2 XLOC_000505 ; gene_alias_3 linc-RGS18-3 ; gene_alias_4 RP11-161I10.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241505.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000040635.1 ; transcript_alias_1 ENST00000417409 ; transcript_alias_2 TCONS_00000358 ; transcript_alias_3 ENST00000417409.1 ; transcript_alias_4 RP11-161I10.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000097707.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT008507 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26107738	26108174	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; gene_alias_2 RP11-877E17.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246695.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169126.2 ; gene_alias_5 RASSF8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000542086 ; transcript_alias_2 ENST00000542086.1 ; transcript_alias_3 RP11-877E17.2-010 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402420.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027379 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26109160	26109280	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; gene_alias_2 RP11-877E17.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246695.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169126.2 ; gene_alias_5 RASSF8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000542086 ; transcript_alias_2 ENST00000542086.1 ; transcript_alias_3 RP11-877E17.2-010 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402420.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027379 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26109572	26109694	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; gene_alias_2 RP11-877E17.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246695.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169126.2 ; gene_alias_5 RASSF8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000542086 ; transcript_alias_2 ENST00000542086.1 ; transcript_alias_3 RP11-877E17.2-010 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402420.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027379 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26111865	26111998	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; gene_alias_2 RP11-877E17.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246695.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169126.2 ; gene_alias_5 RASSF8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000542086 ; transcript_alias_2 ENST00000542086.1 ; transcript_alias_3 RP11-877E17.2-010 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402420.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027379 ;
chr11	lncipedia.org	exon	7449177	7449275	.	-	.	gene_id lnc-CYB5R2-3 ; transcript_id lnc-CYB5R2-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000251364 ; gene_alias_2 ENSG00000251364.2 ; gene_alias_3 CTD-2516F10.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165526.1 ; transcript_alias_1 ENST00000530169 ; transcript_alias_2 ENST00000530169.1 ; transcript_alias_3 CTD-2516F10.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000384647.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017775 ;
chr11	lncipedia.org	exon	7471604	7471673	.	-	.	gene_id lnc-CYB5R2-3 ; transcript_id lnc-CYB5R2-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000251364 ; gene_alias_2 ENSG00000251364.2 ; gene_alias_3 CTD-2516F10.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165526.1 ; transcript_alias_1 ENST00000530169 ; transcript_alias_2 ENST00000530169.1 ; transcript_alias_3 CTD-2516F10.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000384647.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017775 ;
chr11	lncipedia.org	exon	7479027	7479190	.	-	.	gene_id lnc-CYB5R2-3 ; transcript_id lnc-CYB5R2-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000251364 ; gene_alias_2 ENSG00000251364.2 ; gene_alias_3 CTD-2516F10.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165526.1 ; transcript_alias_1 ENST00000530169 ; transcript_alias_2 ENST00000530169.1 ; transcript_alias_3 CTD-2516F10.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000384647.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017775 ;
chr11	lncipedia.org	exon	7482470	7482567	.	-	.	gene_id lnc-CYB5R2-3 ; transcript_id lnc-CYB5R2-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000251364 ; gene_alias_2 ENSG00000251364.2 ; gene_alias_3 CTD-2516F10.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165526.1 ; transcript_alias_1 ENST00000530169 ; transcript_alias_2 ENST00000530169.1 ; transcript_alias_3 CTD-2516F10.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000384647.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017775 ;
chr11	lncipedia.org	exon	7486984	7487053	.	-	.	gene_id lnc-CYB5R2-3 ; transcript_id lnc-CYB5R2-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000251364 ; gene_alias_2 ENSG00000251364.2 ; gene_alias_3 CTD-2516F10.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165526.1 ; transcript_alias_1 ENST00000530169 ; transcript_alias_2 ENST00000530169.1 ; transcript_alias_3 CTD-2516F10.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000384647.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017775 ;
chr1	lncipedia.org	exon	98453556	98455125	.	-	.	gene_id lnc-DPYD-4 ; transcript_id lnc-DPYD-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231269 ; gene_alias_2 RP11-490G2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000231269.1 ; gene_alias_4 MIR137HG ; gene_alias_5 OTTHUMG00000010680.1 ; transcript_alias_1 ENST00000424528 ; transcript_alias_2 ENST00000424528.1 ; transcript_alias_3 MIR137HG-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000029437.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	98460472	98460556	.	-	.	gene_id lnc-DPYD-4 ; transcript_id lnc-DPYD-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231269 ; gene_alias_2 RP11-490G2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000231269.1 ; gene_alias_4 MIR137HG ; gene_alias_5 OTTHUMG00000010680.1 ; transcript_alias_1 ENST00000424528 ; transcript_alias_2 ENST00000424528.1 ; transcript_alias_3 MIR137HG-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000029437.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	98511564	98511952	.	-	.	gene_id lnc-DPYD-4 ; transcript_id lnc-DPYD-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231269 ; gene_alias_2 RP11-490G2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000231269.1 ; gene_alias_4 MIR137HG ; gene_alias_5 OTTHUMG00000010680.1 ; transcript_alias_1 ENST00000424528 ; transcript_alias_2 ENST00000424528.1 ; transcript_alias_3 MIR137HG-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000029437.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	98512075	98512183	.	-	.	gene_id lnc-DPYD-4 ; transcript_id lnc-DPYD-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231269 ; gene_alias_2 RP11-490G2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000231269.1 ; gene_alias_4 MIR137HG ; gene_alias_5 OTTHUMG00000010680.1 ; transcript_alias_1 ENST00000424528 ; transcript_alias_2 ENST00000424528.1 ; transcript_alias_3 MIR137HG-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000029437.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	98514934	98515161	.	-	.	gene_id lnc-DPYD-4 ; transcript_id lnc-DPYD-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231269 ; gene_alias_2 RP11-490G2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000231269.1 ; gene_alias_4 MIR137HG ; gene_alias_5 OTTHUMG00000010680.1 ; transcript_alias_1 ENST00000424528 ; transcript_alias_2 ENST00000424528.1 ; transcript_alias_3 MIR137HG-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000029437.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87836665	87836941	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; gene_alias_6 ENSG00000245526.4 ; transcript_alias_1 ENST00000509405 ; transcript_alias_2 ENST00000509405.1 ; transcript_alias_3 LINC00461-014 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369812.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102664 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87837853	87837888	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; gene_alias_6 ENSG00000245526.4 ; transcript_alias_1 ENST00000509405 ; transcript_alias_2 ENST00000509405.1 ; transcript_alias_3 LINC00461-014 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369812.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102664 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87966854	87966903	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; gene_alias_6 ENSG00000245526.4 ; transcript_alias_1 ENST00000509405 ; transcript_alias_2 ENST00000509405.1 ; transcript_alias_3 LINC00461-014 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369812.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102664 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87980475	87980622	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; gene_alias_6 ENSG00000245526.4 ; transcript_alias_1 ENST00000509405 ; transcript_alias_2 ENST00000509405.1 ; transcript_alias_3 LINC00461-014 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369812.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102664 ;
chr15	lncipedia.org	exon	66952560	66955175	.	+	.	gene_id lnc-SMAD6-1 ; transcript_id lnc-SMAD6-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250434 ; gene_alias_2 AC013564.1 ; transcript_alias_1 ENST00000511020 ; transcript_alias_2 NONHSAT046810 ;
chr15	lncipedia.org	exon	66955328	66955370	.	+	.	gene_id lnc-SMAD6-1 ; transcript_id lnc-SMAD6-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250434 ; gene_alias_2 AC013564.1 ; transcript_alias_1 ENST00000511020 ; transcript_alias_2 NONHSAT046810 ;
chr15	lncipedia.org	exon	66956700	66956790	.	+	.	gene_id lnc-SMAD6-1 ; transcript_id lnc-SMAD6-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250434 ; gene_alias_2 AC013564.1 ; transcript_alias_1 ENST00000511020 ; transcript_alias_2 NONHSAT046810 ;
chr15	lncipedia.org	exon	66960679	66960792	.	+	.	gene_id lnc-SMAD6-1 ; transcript_id lnc-SMAD6-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250434 ; gene_alias_2 AC013564.1 ; transcript_alias_1 ENST00000511020 ; transcript_alias_2 NONHSAT046810 ;
chr15	lncipedia.org	exon	66973928	66974114	.	+	.	gene_id lnc-SMAD6-1 ; transcript_id lnc-SMAD6-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250434 ; gene_alias_2 AC013564.1 ; transcript_alias_1 ENST00000511020 ; transcript_alias_2 NONHSAT046810 ;
chr5	lncipedia.org	exon	180258024	180258229	.	+	.	gene_id lnc-BTNL8-3 ; transcript_id lnc-BTNL8-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000245060 ; gene_alias_2 CTC-205M6.2 ; gene_alias_3 ENSG00000245060.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162270.1 ; gene_alias_5 LINC00847 ; transcript_alias_1 ENST00000502162 ; transcript_alias_2 ENST00000502162.2 ; transcript_alias_3 CTC-205M6.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000368346.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	180259673	180259860	.	+	.	gene_id lnc-BTNL8-3 ; transcript_id lnc-BTNL8-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000245060 ; gene_alias_2 CTC-205M6.2 ; gene_alias_3 ENSG00000245060.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162270.1 ; gene_alias_5 LINC00847 ; transcript_alias_1 ENST00000502162 ; transcript_alias_2 ENST00000502162.2 ; transcript_alias_3 CTC-205M6.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000368346.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	180261312	180262726	.	+	.	gene_id lnc-BTNL8-3 ; transcript_id lnc-BTNL8-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000245060 ; gene_alias_2 CTC-205M6.2 ; gene_alias_3 ENSG00000245060.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162270.1 ; gene_alias_5 LINC00847 ; transcript_alias_1 ENST00000502162 ; transcript_alias_2 ENST00000502162.2 ; transcript_alias_3 CTC-205M6.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000368346.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	98674417	98675903	.	-	.	gene_id lnc-RNF113B-2 ; transcript_id lnc-RNF113B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247365 ; transcript_alias_1 ENST00000502000 ;
chr13	lncipedia.org	exon	98676013	98676530	.	-	.	gene_id lnc-RNF113B-2 ; transcript_id lnc-RNF113B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247365 ; transcript_alias_1 ENST00000502000 ;
chr4	lncipedia.org	exon	175018906	175018980	.	-	.	gene_id lnc-FBXO8-4 ; transcript_id lnc-FBXO8-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000248174 ; gene_alias_2 RP11-148L24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248174.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160745.2 ; transcript_alias_1 ENST00000503140 ; transcript_alias_2 ENST00000503140.1 ; transcript_alias_3 RP11-148L24.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000362084.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099312 ;
chr4	lncipedia.org	exon	175035192	175035423	.	-	.	gene_id lnc-FBXO8-4 ; transcript_id lnc-FBXO8-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000248174 ; gene_alias_2 RP11-148L24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248174.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160745.2 ; transcript_alias_1 ENST00000503140 ; transcript_alias_2 ENST00000503140.1 ; transcript_alias_3 RP11-148L24.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000362084.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099312 ;
chr4	lncipedia.org	exon	175041048	175041237	.	-	.	gene_id lnc-FBXO8-4 ; transcript_id lnc-FBXO8-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000248174 ; gene_alias_2 RP11-148L24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248174.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160745.2 ; transcript_alias_1 ENST00000503140 ; transcript_alias_2 ENST00000503140.1 ; transcript_alias_3 RP11-148L24.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000362084.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099312 ;
chr4	lncipedia.org	exon	175041570	175041668	.	-	.	gene_id lnc-FBXO8-4 ; transcript_id lnc-FBXO8-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000248174 ; gene_alias_2 RP11-148L24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248174.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160745.2 ; transcript_alias_1 ENST00000503140 ; transcript_alias_2 ENST00000503140.1 ; transcript_alias_3 RP11-148L24.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000362084.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099312 ;
chr12	lncipedia.org	exon	67708478	67708952	.	+	.	gene_id lnc-DYRK2-3 ; transcript_id lnc-DYRK2-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247008 ; transcript_alias_1 ENST00000501254 ;
chr12	lncipedia.org	exon	67711527	67713730	.	+	.	gene_id lnc-DYRK2-3 ; transcript_id lnc-DYRK2-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247008 ; transcript_alias_1 ENST00000501254 ;
chr11	lncipedia.org	exon	7448497	7448885	.	-	.	gene_id lnc-CYB5R2-3 ; transcript_id lnc-CYB5R2-3:8 ; gene_alias_1 ENSG00000251364 ; gene_alias_2 ENSG00000251364.2 ; gene_alias_3 CTD-2516F10.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165526.1 ; transcript_alias_1 ENST00000514126 ; transcript_alias_2 ENST00000514126.2 ; transcript_alias_3 CTD-2516F10.2-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000384644.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017772 ;
chr11	lncipedia.org	exon	7449104	7449275	.	-	.	gene_id lnc-CYB5R2-3 ; transcript_id lnc-CYB5R2-3:8 ; gene_alias_1 ENSG00000251364 ; gene_alias_2 ENSG00000251364.2 ; gene_alias_3 CTD-2516F10.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165526.1 ; transcript_alias_1 ENST00000514126 ; transcript_alias_2 ENST00000514126.2 ; transcript_alias_3 CTD-2516F10.2-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000384644.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017772 ;
chr11	lncipedia.org	exon	7461358	7461491	.	-	.	gene_id lnc-CYB5R2-3 ; transcript_id lnc-CYB5R2-3:8 ; gene_alias_1 ENSG00000251364 ; gene_alias_2 ENSG00000251364.2 ; gene_alias_3 CTD-2516F10.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165526.1 ; transcript_alias_1 ENST00000514126 ; transcript_alias_2 ENST00000514126.2 ; transcript_alias_3 CTD-2516F10.2-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000384644.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017772 ;
chr11	lncipedia.org	exon	7461725	7461756	.	-	.	gene_id lnc-CYB5R2-3 ; transcript_id lnc-CYB5R2-3:8 ; gene_alias_1 ENSG00000251364 ; gene_alias_2 ENSG00000251364.2 ; gene_alias_3 CTD-2516F10.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165526.1 ; transcript_alias_1 ENST00000514126 ; transcript_alias_2 ENST00000514126.2 ; transcript_alias_3 CTD-2516F10.2-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000384644.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017772 ;
chr15	lncipedia.org	exon	101433945	101436271	.	-	.	gene_id lnc-CHSY1-5 ; transcript_id lnc-CHSY1-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247392 ; gene_alias_2 ENSG00000259583.1 ; gene_alias_3 RP11-66B24.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000172067.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501269 ; transcript_alias_2 ENST00000560351.1 ; transcript_alias_3 RP11-66B24.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000416700.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT051139 ;
chr15	lncipedia.org	exon	101459009	101459488	.	-	.	gene_id lnc-CHSY1-5 ; transcript_id lnc-CHSY1-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247392 ; gene_alias_2 ENSG00000259583.1 ; gene_alias_3 RP11-66B24.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000172067.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501269 ; transcript_alias_2 ENST00000560351.1 ; transcript_alias_3 RP11-66B24.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000416700.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT051139 ;
chr2	lncipedia.org	exon	66124756	66124857	.	+	.	gene_id lnc-MEIS1-6 ; transcript_id lnc-MEIS1-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204929 ; gene_alias_2 XLOC_001505 ; gene_alias_3 linc-MEIS1-3 ; gene_alias_4 AC074391.1 ; gene_alias_5 ENSG00000204929.6 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000152768.5 ; gene_alias_7 ENSG00000204929.7 ; transcript_alias_1 ENST00000412986 ; transcript_alias_2 TCONS_00002915 ; transcript_alias_3 ENST00000412986.1 ; transcript_alias_4 AC074391.1-008 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000327987.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT071205 ;
chr2	lncipedia.org	exon	66126326	66126649	.	+	.	gene_id lnc-MEIS1-6 ; transcript_id lnc-MEIS1-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000204929 ; gene_alias_2 XLOC_001505 ; gene_alias_3 linc-MEIS1-3 ; gene_alias_4 AC074391.1 ; gene_alias_5 ENSG00000204929.6 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000152768.5 ; gene_alias_7 ENSG00000204929.7 ; transcript_alias_1 ENST00000412986 ; transcript_alias_2 TCONS_00002915 ; transcript_alias_3 ENST00000412986.1 ; transcript_alias_4 AC074391.1-008 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000327987.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT071205 ;
chr19	lncipedia.org	exon	2414241	2414472	.	+	.	gene_id lnc-GADD45B-1 ; transcript_id lnc-GADD45B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247581 ; transcript_alias_1 ENST00000499536 ;
chr19	lncipedia.org	exon	2450460	2450509	.	+	.	gene_id lnc-GADD45B-1 ; transcript_id lnc-GADD45B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247581 ; transcript_alias_1 ENST00000499536 ;
chr19	lncipedia.org	exon	2541518	2541545	.	+	.	gene_id lnc-GADD45B-1 ; transcript_id lnc-GADD45B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247581 ; transcript_alias_1 ENST00000499536 ;
chr19	lncipedia.org	exon	2651988	2654269	.	+	.	gene_id lnc-GADD45B-1 ; transcript_id lnc-GADD45B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247581 ; transcript_alias_1 ENST00000499536 ;
chr20	lncipedia.org	exon	58662912	58663055	.	+	.	gene_id lnc-C20orf197-3 ; transcript_id lnc-C20orf197-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000228340 ; gene_alias_2 RP5-1043L13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000228340.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032883.1 ; transcript_alias_1 ENST00000428772 ; transcript_alias_2 ENST00000428772.1 ; transcript_alias_3 RP5-1043L13.1-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079954.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT080639 ;
chr20	lncipedia.org	exon	58675226	58675274	.	+	.	gene_id lnc-C20orf197-3 ; transcript_id lnc-C20orf197-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000228340 ; gene_alias_2 RP5-1043L13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000228340.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032883.1 ; transcript_alias_1 ENST00000428772 ; transcript_alias_2 ENST00000428772.1 ; transcript_alias_3 RP5-1043L13.1-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079954.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT080639 ;
chr20	lncipedia.org	exon	58676150	58676427	.	+	.	gene_id lnc-C20orf197-3 ; transcript_id lnc-C20orf197-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000228340 ; gene_alias_2 RP5-1043L13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000228340.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032883.1 ; transcript_alias_1 ENST00000428772 ; transcript_alias_2 ENST00000428772.1 ; transcript_alias_3 RP5-1043L13.1-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079954.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT080639 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127137496	127137633	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-9 ; transcript_id lnc-DHX37-9:9 ; gene_alias_1 ENSG00000256732 ; gene_alias_2 RP11-407A16.3 ; gene_alias_3 ENSG00000256732.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168473.1 ; transcript_alias_1 ENST00000540814 ; transcript_alias_2 ENST00000540814.1 ; transcript_alias_3 RP11-407A16.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399854.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127174581	127174852	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-9 ; transcript_id lnc-DHX37-9:9 ; gene_alias_1 ENSG00000256732 ; gene_alias_2 RP11-407A16.3 ; gene_alias_3 ENSG00000256732.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168473.1 ; transcript_alias_1 ENST00000540814 ; transcript_alias_2 ENST00000540814.1 ; transcript_alias_3 RP11-407A16.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399854.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	54955553	54955778	.	-	.	gene_id lnc-LYPLA1-1 ; transcript_id lnc-LYPLA1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246352 ; transcript_alias_1 ENST00000501660 ;
chr8	lncipedia.org	exon	54957377	54957513	.	-	.	gene_id lnc-LYPLA1-1 ; transcript_id lnc-LYPLA1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246352 ; transcript_alias_1 ENST00000501660 ;
chr7	lncipedia.org	exon	130566536	130566720	.	-	.	gene_id lnc-KLF14-1 ; transcript_id lnc-KLF14-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000226380 ; gene_alias_2 AC058791.1 ; gene_alias_3 ENSG00000226380.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000043895.6 ; transcript_alias_1 ENST00000444003 ; transcript_alias_2 ENST00000444003.1 ; transcript_alias_3 AC058791.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000338047.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123373 ;
chr7	lncipedia.org	exon	130567405	130567582	.	-	.	gene_id lnc-KLF14-1 ; transcript_id lnc-KLF14-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000226380 ; gene_alias_2 AC058791.1 ; gene_alias_3 ENSG00000226380.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000043895.6 ; transcript_alias_1 ENST00000444003 ; transcript_alias_2 ENST00000444003.1 ; transcript_alias_3 AC058791.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000338047.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123373 ;
chr7	lncipedia.org	exon	152679	152819	.	+	.	gene_id lnc-FAM20C-3 ; transcript_id lnc-FAM20C-3:7 ; gene_alias_1 ENSG00000240859 ; gene_alias_2 XLOC_005953 ; gene_alias_3 linc-FAM20C-2 ; gene_alias_4 AC093627.10 ; gene_alias_5 ENSG00000240859.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151398.1 ; transcript_alias_1 ENST00000492208 ; transcript_alias_2 TCONS_00012933 ; transcript_alias_3 ENST00000492208.1 ; transcript_alias_4 AC093627.10-004 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000322472.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT118605 ;
chr7	lncipedia.org	exon	153412	153823	.	+	.	gene_id lnc-FAM20C-3 ; transcript_id lnc-FAM20C-3:7 ; gene_alias_1 ENSG00000240859 ; gene_alias_2 XLOC_005953 ; gene_alias_3 linc-FAM20C-2 ; gene_alias_4 AC093627.10 ; gene_alias_5 ENSG00000240859.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000151398.1 ; transcript_alias_1 ENST00000492208 ; transcript_alias_2 TCONS_00012933 ; transcript_alias_3 ENST00000492208.1 ; transcript_alias_4 AC093627.10-004 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000322472.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT118605 ;
chrX	lncipedia.org	exon	396167	396426	.	+	.	gene_id lnc-PLCXD1-3 ; transcript_id lnc-PLCXD1-3:3 ; gene_alias_1 XLOC_007909 ; gene_alias_2 linc-SHOX-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017113 ; transcript_alias_2 NONHSAT136032 ;
chrX	lncipedia.org	exon	398339	398438	.	+	.	gene_id lnc-PLCXD1-3 ; transcript_id lnc-PLCXD1-3:3 ; gene_alias_1 XLOC_007909 ; gene_alias_2 linc-SHOX-2 ; transcript_alias_1 TCONS_00017113 ; transcript_alias_2 NONHSAT136032 ;
chr10	lncipedia.org	exon	11931618	11933761	.	-	.	gene_id lnc-UPF2-3 ; transcript_id lnc-UPF2-3:1 ; transcript_alias_1 ucscGeneNc_uc001iky_1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	11939270	11939390	.	-	.	gene_id lnc-UPF2-3 ; transcript_id lnc-UPF2-3:1 ; transcript_alias_1 ucscGeneNc_uc001iky_1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	11944822	11944935	.	-	.	gene_id lnc-UPF2-3 ; transcript_id lnc-UPF2-3:1 ; transcript_alias_1 ucscGeneNc_uc001iky_1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	11951371	11951506	.	-	.	gene_id lnc-UPF2-3 ; transcript_id lnc-UPF2-3:1 ; transcript_alias_1 ucscGeneNc_uc001iky_1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	11969852	11969958	.	-	.	gene_id lnc-UPF2-3 ; transcript_id lnc-UPF2-3:1 ; transcript_alias_1 ucscGeneNc_uc001iky_1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	11976187	11976705	.	-	.	gene_id lnc-UPF2-3 ; transcript_id lnc-UPF2-3:1 ; transcript_alias_1 ucscGeneNc_uc001iky_1 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101055684	101056009	.	-	.	gene_id lnc-BEGAIN-3 ; transcript_id lnc-BEGAIN-3:1 ; transcript_alias_1 l_1065_chr14:101055683-101059393_ovary ;
chr14	lncipedia.org	exon	101056017	101058899	.	-	.	gene_id lnc-BEGAIN-3 ; transcript_id lnc-BEGAIN-3:1 ; transcript_alias_1 l_1065_chr14:101055683-101059393_ovary ;
chr14	lncipedia.org	exon	101059309	101059393	.	-	.	gene_id lnc-BEGAIN-3 ; transcript_id lnc-BEGAIN-3:1 ; transcript_alias_1 l_1065_chr14:101055683-101059393_ovary ;
chr17	lncipedia.org	exon	4934624	4934964	.	+	.	gene_id lnc-KIF1C-3 ; transcript_id lnc-KIF1C-3:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT145152 ;
chr17	lncipedia.org	exon	4935217	4935463	.	+	.	gene_id lnc-KIF1C-3 ; transcript_id lnc-KIF1C-3:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT145152 ;
chr19	lncipedia.org	exon	17003765	17007137	.	-	.	gene_id lnc-HAUS8-4 ; transcript_id lnc-HAUS8-4:3 ; transcript_alias_1 NONHSAT062823 ;
chr19	lncipedia.org	exon	17007672	17007784	.	-	.	gene_id lnc-HAUS8-4 ; transcript_id lnc-HAUS8-4:3 ; transcript_alias_1 NONHSAT062823 ;
chr20	lncipedia.org	exon	5037309	5037872	.	+	.	gene_id lnc-CDS2-7 ; transcript_id lnc-CDS2-7:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT078295 ; transcript_alias_2 FPKM1_group_18768_transcript_4 ;
chr9	lncipedia.org	exon	4860454	4860901	.	+	.	gene_id lnc-RCL1-1 ; transcript_id lnc-RCL1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000243754.1 ; gene_alias_2 RP11-125K10.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000019476.1 ; transcript_alias_1 ENST00000445485.1 ; transcript_alias_2 RP11-125K10.4-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000051595.1 ; transcript_alias_4 NONHSAT130073 ;
chr9	lncipedia.org	exon	4884488	4885917	.	+	.	gene_id lnc-RCL1-1 ; transcript_id lnc-RCL1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000243754.1 ; gene_alias_2 RP11-125K10.4 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000019476.1 ; transcript_alias_1 ENST00000445485.1 ; transcript_alias_2 RP11-125K10.4-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000051595.1 ; transcript_alias_4 NONHSAT130073 ;
chr19	lncipedia.org	exon	48349505	48349603	.	+	.	gene_id lnc-SEPW1-5 ; transcript_id lnc-SEPW1-5:2 ; transcript_alias_1 NONHSAT067014 ;
chr19	lncipedia.org	exon	48350703	48351151	.	+	.	gene_id lnc-SEPW1-5 ; transcript_id lnc-SEPW1-5:2 ; transcript_alias_1 NONHSAT067014 ;
chrY	lncipedia.org	exon	3719265	3720910	.	-	.	gene_id lnc-SRY-13 ; transcript_id lnc-SRY-13:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT139310 ;
chr7	lncipedia.org	exon	149535464	149535550	.	+	.	gene_id lnc-ATP6V0E2-6 ; transcript_id lnc-ATP6V0E2-6:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT124069 ;
chr7	lncipedia.org	exon	149541714	149542180	.	+	.	gene_id lnc-ATP6V0E2-6 ; transcript_id lnc-ATP6V0E2-6:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT124069 ;
chr22	lncipedia.org	exon	18049772	18049861	.	+	.	gene_id lnc-CECR2-5 ; transcript_id lnc-CECR2-5:3 ; transcript_alias_1 NONHSAT083217 ;
chr22	lncipedia.org	exon	18049989	18050458	.	+	.	gene_id lnc-CECR2-5 ; transcript_id lnc-CECR2-5:3 ; transcript_alias_1 NONHSAT083217 ;
chr19	lncipedia.org	exon	48824724	48824776	.	+	.	gene_id lnc-EMP3-1 ; transcript_id lnc-EMP3-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_013108 ; gene_alias_2 linc-EMP3-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00027590 ; transcript_alias_2 NONHSAT067062 ;
chr19	lncipedia.org	exon	48825071	48825234	.	+	.	gene_id lnc-EMP3-1 ; transcript_id lnc-EMP3-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_013108 ; gene_alias_2 linc-EMP3-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00027590 ; transcript_alias_2 NONHSAT067062 ;
chr19	lncipedia.org	exon	48826047	48826128	.	+	.	gene_id lnc-EMP3-1 ; transcript_id lnc-EMP3-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_013108 ; gene_alias_2 linc-EMP3-1 ; transcript_alias_1 TCONS_00027590 ; transcript_alias_2 NONHSAT067062 ;
chr16	lncipedia.org	exon	83754724	83755255	.	-	.	gene_id lnc-SLC38A8-4 ; transcript_id lnc-SLC38A8-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000260788.1 ; gene_alias_2 RP11-298D21.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000176641.1 ; transcript_alias_1 ENST00000563981.1 ; transcript_alias_2 RP11-298D21.1-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000432939.1 ; transcript_alias_4 NONHSAT144005 ;
chr16	lncipedia.org	exon	83759080	83759193	.	-	.	gene_id lnc-SLC38A8-4 ; transcript_id lnc-SLC38A8-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000260788.1 ; gene_alias_2 RP11-298D21.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000176641.1 ; transcript_alias_1 ENST00000563981.1 ; transcript_alias_2 RP11-298D21.1-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000432939.1 ; transcript_alias_4 NONHSAT144005 ;
chr16	lncipedia.org	exon	83762473	83762604	.	-	.	gene_id lnc-SLC38A8-4 ; transcript_id lnc-SLC38A8-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000260788.1 ; gene_alias_2 RP11-298D21.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000176641.1 ; transcript_alias_1 ENST00000563981.1 ; transcript_alias_2 RP11-298D21.1-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000432939.1 ; transcript_alias_4 NONHSAT144005 ;
chr16	lncipedia.org	exon	83806414	83806541	.	-	.	gene_id lnc-SLC38A8-4 ; transcript_id lnc-SLC38A8-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000260788.1 ; gene_alias_2 RP11-298D21.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000176641.1 ; transcript_alias_1 ENST00000563981.1 ; transcript_alias_2 RP11-298D21.1-002 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000432939.1 ; transcript_alias_4 NONHSAT144005 ;
chr1	lncipedia.org	exon	212205860	212206250	.	+	.	gene_id lnc-DTL-4 ; transcript_id lnc-DTL-4:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT009340 ;
chr1	lncipedia.org	exon	212226035	212226119	.	+	.	gene_id lnc-DTL-4 ; transcript_id lnc-DTL-4:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT009340 ;
chr1	lncipedia.org	exon	212820638	212821097	.	+	.	gene_id lnc-FAM71A-2 ; transcript_id lnc-FAM71A-2:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT009390 ;
chr9	lncipedia.org	exon	10948366	10948481	.	-	.	gene_id lnc-PTPRD-7 ; transcript_id lnc-PTPRD-7:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT130207 ; transcript_alias_2 FPKM1_group_32667_transcript_1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	10958410	10958540	.	-	.	gene_id lnc-PTPRD-7 ; transcript_id lnc-PTPRD-7:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT130207 ; transcript_alias_2 FPKM1_group_32667_transcript_1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	16111131	16111233	.	+	.	gene_id lnc-C9orf93-4 ; transcript_id lnc-C9orf93-4:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT130283 ;
chr9	lncipedia.org	exon	16112224	16112432	.	+	.	gene_id lnc-C9orf93-4 ; transcript_id lnc-C9orf93-4:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT130283 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114746776	114746836	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:18 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000522697 ; transcript_alias_2 ENST00000522697.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379770.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114613 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114759133	114759230	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:18 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000522697 ; transcript_alias_2 ENST00000522697.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379770.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114613 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114770131	114770195	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:18 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000522697 ; transcript_alias_2 ENST00000522697.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379770.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114613 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114789659	114789775	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:18 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000522697 ; transcript_alias_2 ENST00000522697.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379770.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114613 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114790310	114790463	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:18 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000522697 ; transcript_alias_2 ENST00000522697.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379770.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114613 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114792579	114792869	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:18 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000522697 ; transcript_alias_2 ENST00000522697.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379770.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114613 ;
chr3	lncipedia.org	exon	180774468	180774574	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000493521 ; transcript_alias_2 ENST00000493521.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350421.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	180806665	180806705	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000493521 ; transcript_alias_2 ENST00000493521.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350421.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	180893302	180893371	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000493521 ; transcript_alias_2 ENST00000493521.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350421.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	181281508	181281716	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000493521 ; transcript_alias_2 ENST00000493521.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350421.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	181328649	181328717	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000493521 ; transcript_alias_2 ENST00000493521.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350421.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	181417386	181417671	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000493521 ; transcript_alias_2 ENST00000493521.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350421.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	181457357	181457813	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000493521 ; transcript_alias_2 ENST00000493521.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350421.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	179831573	179832371	.	+	.	gene_id lnc-TOR1AIP1-2 ; transcript_id lnc-TOR1AIP1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245075 ; transcript_alias_1 ENST00000501063 ;
chr1	lncipedia.org	exon	179832815	179833589	.	+	.	gene_id lnc-TOR1AIP1-2 ; transcript_id lnc-TOR1AIP1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245075 ; transcript_alias_1 ENST00000501063 ;
chr4	lncipedia.org	exon	109459346	109461970	.	-	.	gene_id lnc-AGXT2L1-1 ; transcript_id lnc-AGXT2L1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000234492 ; gene_alias_2 RP11-462C24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000234492.3 ; gene_alias_4 RPL34-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000161030.1 ; gene_alias_6 ENSG00000234492.4 ; transcript_alias_1 ENST00000507248 ; transcript_alias_2 ENST00000507248.1 ; transcript_alias_3 RPL34-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000363481.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	109463175	109463372	.	-	.	gene_id lnc-AGXT2L1-1 ; transcript_id lnc-AGXT2L1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000234492 ; gene_alias_2 RP11-462C24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000234492.3 ; gene_alias_4 RPL34-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000161030.1 ; gene_alias_6 ENSG00000234492.4 ; transcript_alias_1 ENST00000507248 ; transcript_alias_2 ENST00000507248.1 ; transcript_alias_3 RPL34-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000363481.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	109477421	109478220	.	-	.	gene_id lnc-AGXT2L1-1 ; transcript_id lnc-AGXT2L1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000234492 ; gene_alias_2 RP11-462C24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000234492.3 ; gene_alias_4 RPL34-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000161030.1 ; gene_alias_6 ENSG00000234492.4 ; transcript_alias_1 ENST00000507248 ; transcript_alias_2 ENST00000507248.1 ; transcript_alias_3 RPL34-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000363481.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	109541464	109541553	.	-	.	gene_id lnc-AGXT2L1-1 ; transcript_id lnc-AGXT2L1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000234492 ; gene_alias_2 RP11-462C24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000234492.3 ; gene_alias_4 RPL34-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000161030.1 ; gene_alias_6 ENSG00000234492.4 ; transcript_alias_1 ENST00000507248 ; transcript_alias_2 ENST00000507248.1 ; transcript_alias_3 RPL34-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000363481.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114191162	114191508	.	-	.	gene_id lnc-HDAC2-1 ; transcript_id lnc-HDAC2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000227502 ; gene_alias_2 XLOC_005811 ; gene_alias_3 linc-LAMA4-3 ; gene_alias_4 RP1-249H1.4 ; gene_alias_5 ENSG00000227502.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000015405.1 ; transcript_alias_1 ENST00000434296 ; transcript_alias_2 TCONS_00011545 ; transcript_alias_3 ENST00000434296.1 ; transcript_alias_4 RP1-249H1.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000041902.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT147427 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114191834	114191899	.	-	.	gene_id lnc-HDAC2-1 ; transcript_id lnc-HDAC2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000227502 ; gene_alias_2 XLOC_005811 ; gene_alias_3 linc-LAMA4-3 ; gene_alias_4 RP1-249H1.4 ; gene_alias_5 ENSG00000227502.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000015405.1 ; transcript_alias_1 ENST00000434296 ; transcript_alias_2 TCONS_00011545 ; transcript_alias_3 ENST00000434296.1 ; transcript_alias_4 RP1-249H1.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000041902.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT147427 ;
chr14	lncipedia.org	exon	104146166	104147812	.	-	.	gene_id lnc-XRCC3-1 ; transcript_id lnc-XRCC3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246451 ; transcript_alias_1 ENST00000498989 ; transcript_alias_2 NONHSAT040192 ;
chr14	lncipedia.org	exon	104148693	104148944	.	-	.	gene_id lnc-XRCC3-1 ; transcript_id lnc-XRCC3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246451 ; transcript_alias_1 ENST00000498989 ; transcript_alias_2 NONHSAT040192 ;
chr14	lncipedia.org	exon	104149195	104150352	.	-	.	gene_id lnc-XRCC3-1 ; transcript_id lnc-XRCC3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246451 ; transcript_alias_1 ENST00000498989 ; transcript_alias_2 NONHSAT040192 ;
chr13	lncipedia.org	exon	88267818	88268010	.	-	.	gene_id lnc-SLITRK6-9 ; transcript_id lnc-SLITRK6-9:3 ; gene_alias_1 ENSG00000228824 ; gene_alias_2 XLOC_010683 ; gene_alias_3 linc-SLITRK6-6 ; gene_alias_4 RP11-342C20.3 ; gene_alias_5 ENSG00000228824.1 ; gene_alias_6 MIR4500HG ; gene_alias_7 OTTHUMG00000017166.1 ; transcript_alias_1 ENST00000453832 ; transcript_alias_2 TCONS_00021679 ; transcript_alias_3 ENST00000453832.1 ; transcript_alias_4 MIR4500HG-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000045415.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT034593 ;
chr13	lncipedia.org	exon	88273263	88273413	.	-	.	gene_id lnc-SLITRK6-9 ; transcript_id lnc-SLITRK6-9:3 ; gene_alias_1 ENSG00000228824 ; gene_alias_2 XLOC_010683 ; gene_alias_3 linc-SLITRK6-6 ; gene_alias_4 RP11-342C20.3 ; gene_alias_5 ENSG00000228824.1 ; gene_alias_6 MIR4500HG ; gene_alias_7 OTTHUMG00000017166.1 ; transcript_alias_1 ENST00000453832 ; transcript_alias_2 TCONS_00021679 ; transcript_alias_3 ENST00000453832.1 ; transcript_alias_4 MIR4500HG-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000045415.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT034593 ;
chr13	lncipedia.org	exon	88323091	88323361	.	-	.	gene_id lnc-SLITRK6-9 ; transcript_id lnc-SLITRK6-9:3 ; gene_alias_1 ENSG00000228824 ; gene_alias_2 XLOC_010683 ; gene_alias_3 linc-SLITRK6-6 ; gene_alias_4 RP11-342C20.3 ; gene_alias_5 ENSG00000228824.1 ; gene_alias_6 MIR4500HG ; gene_alias_7 OTTHUMG00000017166.1 ; transcript_alias_1 ENST00000453832 ; transcript_alias_2 TCONS_00021679 ; transcript_alias_3 ENST00000453832.1 ; transcript_alias_4 MIR4500HG-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000045415.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT034593 ;
chr21	lncipedia.org	exon	46286280	46286338	.	-	.	gene_id lnc-ITGB2-1 ; transcript_id lnc-ITGB2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250713 ; transcript_alias_1 ENST00000504556 ;
chr21	lncipedia.org	exon	46286389	46288992	.	-	.	gene_id lnc-ITGB2-1 ; transcript_id lnc-ITGB2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250713 ; transcript_alias_1 ENST00000504556 ;
chr19	lncipedia.org	exon	1257245	1258646	.	-	.	gene_id lnc-C19orf26-2 ; transcript_id lnc-C19orf26-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247073 ; transcript_alias_1 ENST00000499925 ;
chr19	lncipedia.org	exon	1259059	1259141	.	-	.	gene_id lnc-C19orf26-2 ; transcript_id lnc-C19orf26-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247073 ; transcript_alias_1 ENST00000499925 ;
chr8	lncipedia.org	exon	10587088	10587140	.	+	.	gene_id lnc-C8orf74-1 ; transcript_id lnc-C8orf74-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000248896 ; gene_alias_2 CTD-2135J3.3 ; gene_alias_3 ENSG00000248896.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163821.1 ; transcript_alias_1 ENST00000519568 ; transcript_alias_2 ENST00000519568.1 ; transcript_alias_3 CTD-2135J3.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000375783.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT125015 ;
chr8	lncipedia.org	exon	10628705	10628902	.	+	.	gene_id lnc-C8orf74-1 ; transcript_id lnc-C8orf74-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000248896 ; gene_alias_2 CTD-2135J3.3 ; gene_alias_3 ENSG00000248896.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163821.1 ; transcript_alias_1 ENST00000519568 ; transcript_alias_2 ENST00000519568.1 ; transcript_alias_3 CTD-2135J3.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000375783.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT125015 ;
chr1	lncipedia.org	exon	150565059	150566262	.	+	.	gene_id lnc-ADAMTSL4-2 ; transcript_id lnc-ADAMTSL4-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248003 ; gene_alias_2 AL356356.4 ; transcript_alias_1 ENST00000500237 ; transcript_alias_2 NONHSAT006317 ;
chr1	lncipedia.org	exon	150588779	150588921	.	+	.	gene_id lnc-ADAMTSL4-2 ; transcript_id lnc-ADAMTSL4-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248003 ; gene_alias_2 AL356356.4 ; transcript_alias_1 ENST00000500237 ; transcript_alias_2 NONHSAT006317 ;
chr1	lncipedia.org	exon	150589415	150590027	.	+	.	gene_id lnc-ADAMTSL4-2 ; transcript_id lnc-ADAMTSL4-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248003 ; gene_alias_2 AL356356.4 ; transcript_alias_1 ENST00000500237 ; transcript_alias_2 NONHSAT006317 ;
chr2	lncipedia.org	exon	64834109	64834315	.	+	.	gene_id lnc-AFTPH-1 ; transcript_id lnc-AFTPH-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233694 ; gene_alias_2 XLOC_001498 ; gene_alias_3 linc-SLC1A4-2 ; gene_alias_4 AC007365.1 ; gene_alias_5 ENSG00000233694.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000152679.1 ; transcript_alias_1 ENST00000445738 ; transcript_alias_2 TCONS_00002908 ; transcript_alias_3 ENST00000445738.1 ; transcript_alias_4 AC007365.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000327323.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT071124 ;
chr2	lncipedia.org	exon	64839900	64840219	.	+	.	gene_id lnc-AFTPH-1 ; transcript_id lnc-AFTPH-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233694 ; gene_alias_2 XLOC_001498 ; gene_alias_3 linc-SLC1A4-2 ; gene_alias_4 AC007365.1 ; gene_alias_5 ENSG00000233694.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000152679.1 ; transcript_alias_1 ENST00000445738 ; transcript_alias_2 TCONS_00002908 ; transcript_alias_3 ENST00000445738.1 ; transcript_alias_4 AC007365.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000327323.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT071124 ;
chr2	lncipedia.org	exon	64840312	64840424	.	+	.	gene_id lnc-AFTPH-1 ; transcript_id lnc-AFTPH-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233694 ; gene_alias_2 XLOC_001498 ; gene_alias_3 linc-SLC1A4-2 ; gene_alias_4 AC007365.1 ; gene_alias_5 ENSG00000233694.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000152679.1 ; transcript_alias_1 ENST00000445738 ; transcript_alias_2 TCONS_00002908 ; transcript_alias_3 ENST00000445738.1 ; transcript_alias_4 AC007365.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000327323.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT071124 ;
chr2	lncipedia.org	exon	64842388	64843133	.	+	.	gene_id lnc-AFTPH-1 ; transcript_id lnc-AFTPH-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233694 ; gene_alias_2 XLOC_001498 ; gene_alias_3 linc-SLC1A4-2 ; gene_alias_4 AC007365.1 ; gene_alias_5 ENSG00000233694.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000152679.1 ; transcript_alias_1 ENST00000445738 ; transcript_alias_2 TCONS_00002908 ; transcript_alias_3 ENST00000445738.1 ; transcript_alias_4 AC007365.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000327323.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT071124 ;
chr13	lncipedia.org	exon	99155296	99156188	.	-	.	gene_id lnc-SLC15A1-1 ; transcript_id lnc-SLC15A1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250780 ; gene_alias_2 AL356423.1 ; transcript_alias_1 ENST00000512054 ; transcript_alias_2 NONHSAT034884 ;
chr13	lncipedia.org	exon	99157357	99158256	.	-	.	gene_id lnc-SLC15A1-1 ; transcript_id lnc-SLC15A1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250780 ; gene_alias_2 AL356423.1 ; transcript_alias_1 ENST00000512054 ; transcript_alias_2 NONHSAT034884 ;
chr8	lncipedia.org	exon	18578415	18578703	.	+	.	gene_id lnc-NAT2-1 ; transcript_id lnc-NAT2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000187229 ; gene_alias_2 RP11-161I2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000187229.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163712.1 ; transcript_alias_1 ENST00000524252 ; transcript_alias_2 ENST00000524252.1 ; transcript_alias_3 RP11-161I2.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000374886.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT125344 ;
chr8	lncipedia.org	exon	18587650	18587851	.	+	.	gene_id lnc-NAT2-1 ; transcript_id lnc-NAT2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000187229 ; gene_alias_2 RP11-161I2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000187229.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163712.1 ; transcript_alias_1 ENST00000524252 ; transcript_alias_2 ENST00000524252.1 ; transcript_alias_3 RP11-161I2.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000374886.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT125344 ;
chr8	lncipedia.org	exon	18590353	18591915	.	+	.	gene_id lnc-NAT2-1 ; transcript_id lnc-NAT2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000187229 ; gene_alias_2 RP11-161I2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000187229.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163712.1 ; transcript_alias_1 ENST00000524252 ; transcript_alias_2 ENST00000524252.1 ; transcript_alias_3 RP11-161I2.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000374886.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT125344 ;
chr11	lncipedia.org	exon	58902763	58903061	.	-	.	gene_id lnc-MPEG1-2 ; transcript_id lnc-MPEG1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245571 ; gene_alias_2 AP001258.4 ; gene_alias_3 ENSG00000245571.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167435.1 ; transcript_alias_1 ENST00000531708 ; transcript_alias_2 ENST00000531708.1 ; transcript_alias_3 AP001258.4-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000394607.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT021506 ;
chr11	lncipedia.org	exon	58903530	58903754	.	-	.	gene_id lnc-MPEG1-2 ; transcript_id lnc-MPEG1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245571 ; gene_alias_2 AP001258.4 ; gene_alias_3 ENSG00000245571.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167435.1 ; transcript_alias_1 ENST00000531708 ; transcript_alias_2 ENST00000531708.1 ; transcript_alias_3 AP001258.4-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000394607.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT021506 ;
chr11	lncipedia.org	exon	58907430	58907640	.	-	.	gene_id lnc-MPEG1-2 ; transcript_id lnc-MPEG1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245571 ; gene_alias_2 AP001258.4 ; gene_alias_3 ENSG00000245571.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167435.1 ; transcript_alias_1 ENST00000531708 ; transcript_alias_2 ENST00000531708.1 ; transcript_alias_3 AP001258.4-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000394607.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT021506 ;
chr11	lncipedia.org	exon	58910344	58910488	.	-	.	gene_id lnc-MPEG1-2 ; transcript_id lnc-MPEG1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245571 ; gene_alias_2 AP001258.4 ; gene_alias_3 ENSG00000245571.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167435.1 ; transcript_alias_1 ENST00000531708 ; transcript_alias_2 ENST00000531708.1 ; transcript_alias_3 AP001258.4-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000394607.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT021506 ;
chr18	lncipedia.org	exon	53443958	53447261	.	-	.	gene_id lnc-TCF4-1 ; transcript_id lnc-TCF4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246990 ; gene_alias_2 XLOC_012849 ; gene_alias_3 linc-TCF4-1 ; gene_alias_4 AC022031.1 ; gene_alias_5 ENSG00000267325.1 ; gene_alias_6 RP11-397A16.2 ; transcript_alias_1 ENST00000498862 ; transcript_alias_2 TCONS_00026208 ; transcript_alias_3 NONHSAT059379 ; transcript_alias_4 ENST00000587320.1 ;
chr18	lncipedia.org	exon	53448186	53448952	.	-	.	gene_id lnc-TCF4-1 ; transcript_id lnc-TCF4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246990 ; gene_alias_2 XLOC_012849 ; gene_alias_3 linc-TCF4-1 ; gene_alias_4 AC022031.1 ; gene_alias_5 ENSG00000267325.1 ; gene_alias_6 RP11-397A16.2 ; transcript_alias_1 ENST00000498862 ; transcript_alias_2 TCONS_00026208 ; transcript_alias_3 NONHSAT059379 ; transcript_alias_4 ENST00000587320.1 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27042604	27042923	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 MIAT ; gene_alias_5 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000418918 ; transcript_alias_2 TCONS_00029373 ; transcript_alias_3 ENST00000418918.1 ; transcript_alias_4 MIAT-006 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320801.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084505 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27059280	27059362	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 MIAT ; gene_alias_5 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000418918 ; transcript_alias_2 TCONS_00029373 ; transcript_alias_3 ENST00000418918.1 ; transcript_alias_4 MIAT-006 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320801.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084505 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27061421	27061603	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 MIAT ; gene_alias_5 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000418918 ; transcript_alias_2 TCONS_00029373 ; transcript_alias_3 ENST00000418918.1 ; transcript_alias_4 MIAT-006 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320801.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084505 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105481955	105484850	.	-	.	gene_id lnc-TGFBRAP1-5 ; transcript_id lnc-TGFBRAP1-5:2 ; gene_alias_1 ENSG00000229743 ; gene_alias_2 AC018730.3 ; gene_alias_3 ENSG00000229743.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153064.1 ; gene_alias_5 LINC01159 ; transcript_alias_1 ENST00000433433 ; transcript_alias_2 ENST00000433433.1 ; transcript_alias_3 AC018730.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000329325.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT072964 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105488704	105488910	.	-	.	gene_id lnc-TGFBRAP1-5 ; transcript_id lnc-TGFBRAP1-5:2 ; gene_alias_1 ENSG00000229743 ; gene_alias_2 AC018730.3 ; gene_alias_3 ENSG00000229743.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153064.1 ; gene_alias_5 LINC01159 ; transcript_alias_1 ENST00000433433 ; transcript_alias_2 ENST00000433433.1 ; transcript_alias_3 AC018730.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000329325.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT072964 ;
chr10	lncipedia.org	exon	80008497	80008770	.	+	.	gene_id lnc-RPS24-3 ; transcript_id lnc-RPS24-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230417 ; gene_alias_2 RP11-90J7.3 ; gene_alias_3 ENSG00000230417.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018555.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546103 ; transcript_alias_2 ENST00000546103.1 ; transcript_alias_3 RP11-90J7.3-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT015059 ;
chr10	lncipedia.org	exon	80110144	80110168	.	+	.	gene_id lnc-RPS24-3 ; transcript_id lnc-RPS24-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230417 ; gene_alias_2 RP11-90J7.3 ; gene_alias_3 ENSG00000230417.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018555.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546103 ; transcript_alias_2 ENST00000546103.1 ; transcript_alias_3 RP11-90J7.3-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT015059 ;
chr10	lncipedia.org	exon	80285056	80285241	.	+	.	gene_id lnc-RPS24-3 ; transcript_id lnc-RPS24-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230417 ; gene_alias_2 RP11-90J7.3 ; gene_alias_3 ENSG00000230417.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018555.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546103 ; transcript_alias_2 ENST00000546103.1 ; transcript_alias_3 RP11-90J7.3-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT015059 ;
chr10	lncipedia.org	exon	80288508	80288571	.	+	.	gene_id lnc-RPS24-3 ; transcript_id lnc-RPS24-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230417 ; gene_alias_2 RP11-90J7.3 ; gene_alias_3 ENSG00000230417.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018555.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546103 ; transcript_alias_2 ENST00000546103.1 ; transcript_alias_3 RP11-90J7.3-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT015059 ;
chr10	lncipedia.org	exon	80310395	80311112	.	+	.	gene_id lnc-RPS24-3 ; transcript_id lnc-RPS24-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230417 ; gene_alias_2 RP11-90J7.3 ; gene_alias_3 ENSG00000230417.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018555.2 ; transcript_alias_1 ENST00000546103 ; transcript_alias_2 ENST00000546103.1 ; transcript_alias_3 RP11-90J7.3-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT015059 ;
chr9	lncipedia.org	exon	134065297	134068074	.	-	.	gene_id lnc-FAM78A-1 ; transcript_id lnc-FAM78A-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246851 ; gene_alias_2 ENSG00000246851.1 ; gene_alias_3 RP11-544A12.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165429.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502188 ; transcript_alias_2 ENST00000502188.1 ; transcript_alias_3 RP11-544A12.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000383982.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT135197 ;
chr9	lncipedia.org	exon	134069287	134069592	.	-	.	gene_id lnc-FAM78A-1 ; transcript_id lnc-FAM78A-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246851 ; gene_alias_2 ENSG00000246851.1 ; gene_alias_3 RP11-544A12.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165429.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502188 ; transcript_alias_2 ENST00000502188.1 ; transcript_alias_3 RP11-544A12.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000383982.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT135197 ;
chr19	lncipedia.org	exon	48586089	48586115	.	+	.	gene_id lnc-ELSPBP1-1 ; transcript_id lnc-ELSPBP1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250291 ; transcript_alias_1 ENST00000503308 ;
chr19	lncipedia.org	exon	48602211	48604226	.	+	.	gene_id lnc-ELSPBP1-1 ; transcript_id lnc-ELSPBP1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250291 ; transcript_alias_1 ENST00000503308 ;
chr2	lncipedia.org	exon	16061159	16061244	.	-	.	gene_id lnc-NBAS-4 ; transcript_id lnc-NBAS-4:4 ; gene_alias_1 ENSG00000233718 ; gene_alias_2 MYCNOS ; gene_alias_3 ENSG00000233718.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151741.1 ; transcript_alias_1 ENST00000453400 ; transcript_alias_2 ENST00000453400.1 ; transcript_alias_3 MYCNOS-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000267899.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT069302 ;
chr2	lncipedia.org	exon	16062143	16062312	.	-	.	gene_id lnc-NBAS-4 ; transcript_id lnc-NBAS-4:4 ; gene_alias_1 ENSG00000233718 ; gene_alias_2 MYCNOS ; gene_alias_3 ENSG00000233718.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151741.1 ; transcript_alias_1 ENST00000453400 ; transcript_alias_2 ENST00000453400.1 ; transcript_alias_3 MYCNOS-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000267899.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT069302 ;
chr2	lncipedia.org	exon	16081096	16081370	.	-	.	gene_id lnc-NBAS-4 ; transcript_id lnc-NBAS-4:4 ; gene_alias_1 ENSG00000233718 ; gene_alias_2 MYCNOS ; gene_alias_3 ENSG00000233718.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151741.1 ; transcript_alias_1 ENST00000453400 ; transcript_alias_2 ENST00000453400.1 ; transcript_alias_3 MYCNOS-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000267899.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT069302 ;
chr10	lncipedia.org	exon	29743271	29744674	.	-	.	gene_id lnc-SVIL-1 ; transcript_id lnc-SVIL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249968 ; transcript_alias_1 ENST00000507250 ;
chr10	lncipedia.org	exon	29745065	29746228	.	-	.	gene_id lnc-SVIL-1 ; transcript_id lnc-SVIL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249968 ; transcript_alias_1 ENST00000507250 ;
chr4	lncipedia.org	exon	10069715	10071448	.	-	.	gene_id lnc-WDR1-1 ; transcript_id lnc-WDR1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249822 ; transcript_alias_1 ENST00000513305 ;
chr4	lncipedia.org	exon	10072870	10074643	.	-	.	gene_id lnc-WDR1-1 ; transcript_id lnc-WDR1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249822 ; transcript_alias_1 ENST00000513305 ;
chr17	lncipedia.org	exon	80200543	80202800	.	+	.	gene_id lnc-SLC16A3-1 ; transcript_id lnc-SLC16A3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245410 ; gene_alias_2 AC132872.3 ; transcript_alias_1 ENST00000499503 ; transcript_alias_2 NONHSAT056662 ;
chr17	lncipedia.org	exon	80202849	80203317	.	+	.	gene_id lnc-SLC16A3-1 ; transcript_id lnc-SLC16A3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245410 ; gene_alias_2 AC132872.3 ; transcript_alias_1 ENST00000499503 ; transcript_alias_2 NONHSAT056662 ;
chr4	lncipedia.org	exon	75144014	75144495	.	-	.	gene_id lnc-CXCL2-1 ; transcript_id lnc-CXCL2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251531 ; gene_alias_2 AC097470.1 ; transcript_alias_1 ENST00000513776 ; transcript_alias_2 NONHSAT096887 ;
chr4	lncipedia.org	exon	75195915	75196255	.	-	.	gene_id lnc-CXCL2-1 ; transcript_id lnc-CXCL2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251531 ; gene_alias_2 AC097470.1 ; transcript_alias_1 ENST00000513776 ; transcript_alias_2 NONHSAT096887 ;
chr14	lncipedia.org	exon	61228128	61229310	.	+	.	gene_id lnc-SLC38A6-1 ; transcript_id lnc-SLC38A6-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236622 ; transcript_alias_1 ENST00000510874 ;
chr14	lncipedia.org	exon	61236109	61236361	.	+	.	gene_id lnc-SLC38A6-1 ; transcript_id lnc-SLC38A6-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236622 ; transcript_alias_1 ENST00000510874 ;
chr5	lncipedia.org	exon	80700876	80702113	.	+	.	gene_id lnc-ZCCHC9-1 ; transcript_id lnc-ZCCHC9-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249445 ; transcript_alias_1 ENST00000512252 ;
chr5	lncipedia.org	exon	80702729	80703566	.	+	.	gene_id lnc-ZCCHC9-1 ; transcript_id lnc-ZCCHC9-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249445 ; transcript_alias_1 ENST00000512252 ;
chr15	lncipedia.org	exon	59060273	59061078	.	-	.	gene_id lnc-ADAM10-1 ; transcript_id lnc-ADAM10-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245975 ; gene_alias_2 XLOC_011488 ; gene_alias_3 linc-ADAM10-1 ; gene_alias_4 AC090515.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500929 ; transcript_alias_2 TCONS_00023279 ;
chr15	lncipedia.org	exon	59062586	59063173	.	-	.	gene_id lnc-ADAM10-1 ; transcript_id lnc-ADAM10-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245975 ; gene_alias_2 XLOC_011488 ; gene_alias_3 linc-ADAM10-1 ; gene_alias_4 AC090515.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500929 ; transcript_alias_2 TCONS_00023279 ;
chr11	lncipedia.org	exon	82903315	82903583	.	-	.	gene_id lnc-CCDC90B-2 ; transcript_id lnc-CCDC90B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247137 ; gene_alias_2 RP11-727A23.5 ; gene_alias_3 ENSG00000247137.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167033.1 ; gene_alias_5 ENSG00000247137.4 ; transcript_alias_1 ENST00000528083 ; transcript_alias_2 ENST00000528083.1 ; transcript_alias_3 RP11-727A23.5-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000392562.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	82903778	82903858	.	-	.	gene_id lnc-CCDC90B-2 ; transcript_id lnc-CCDC90B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247137 ; gene_alias_2 RP11-727A23.5 ; gene_alias_3 ENSG00000247137.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167033.1 ; gene_alias_5 ENSG00000247137.4 ; transcript_alias_1 ENST00000528083 ; transcript_alias_2 ENST00000528083.1 ; transcript_alias_3 RP11-727A23.5-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000392562.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	82904509	82904705	.	-	.	gene_id lnc-CCDC90B-2 ; transcript_id lnc-CCDC90B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247137 ; gene_alias_2 RP11-727A23.5 ; gene_alias_3 ENSG00000247137.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167033.1 ; gene_alias_5 ENSG00000247137.4 ; transcript_alias_1 ENST00000528083 ; transcript_alias_2 ENST00000528083.1 ; transcript_alias_3 RP11-727A23.5-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000392562.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	129211891	129211909	.	-	.	gene_id lnc-ANGPTL2-3 ; transcript_id lnc-ANGPTL2-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248193 ; transcript_alias_1 ENST00000512935 ;
chr9	lncipedia.org	exon	129249185	129251281	.	-	.	gene_id lnc-ANGPTL2-3 ; transcript_id lnc-ANGPTL2-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248193 ; transcript_alias_1 ENST00000512935 ;
chr2	lncipedia.org	exon	175190755	175192138	.	+	.	gene_id lnc-SP9-1 ; transcript_id lnc-SP9-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231453 ; gene_alias_2 XLOC_001759 ; gene_alias_3 linc-SP9-1 ; gene_alias_4 AC018470.4 ; gene_alias_5 ENSG00000231453.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000154148.1 ; transcript_alias_1 ENST00000420866 ; transcript_alias_2 TCONS_00003051 ; transcript_alias_3 ENST00000420866.1 ; transcript_alias_4 AC018470.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000334113.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT075555 ;
chr2	lncipedia.org	exon	175193185	175193564	.	+	.	gene_id lnc-SP9-1 ; transcript_id lnc-SP9-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231453 ; gene_alias_2 XLOC_001759 ; gene_alias_3 linc-SP9-1 ; gene_alias_4 AC018470.4 ; gene_alias_5 ENSG00000231453.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000154148.1 ; transcript_alias_1 ENST00000420866 ; transcript_alias_2 TCONS_00003051 ; transcript_alias_3 ENST00000420866.1 ; transcript_alias_4 AC018470.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000334113.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT075555 ;
chr2	lncipedia.org	exon	175194013	175195371	.	+	.	gene_id lnc-SP9-1 ; transcript_id lnc-SP9-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231453 ; gene_alias_2 XLOC_001759 ; gene_alias_3 linc-SP9-1 ; gene_alias_4 AC018470.4 ; gene_alias_5 ENSG00000231453.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000154148.1 ; transcript_alias_1 ENST00000420866 ; transcript_alias_2 TCONS_00003051 ; transcript_alias_3 ENST00000420866.1 ; transcript_alias_4 AC018470.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000334113.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT075555 ;
chr10	lncipedia.org	exon	81967965	81967997	.	+	.	gene_id lnc-AL359195.1-1 ; transcript_id lnc-AL359195.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237523 ; gene_alias_2 RP11-40F6.2 ; gene_alias_3 ENSG00000237523.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018605.1 ; gene_alias_5 LINC00857 ; transcript_alias_1 ENST00000432308 ; transcript_alias_2 ENST00000432308.1 ; transcript_alias_3 RP11-40F6.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000049055.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT015238 ;
chr10	lncipedia.org	exon	81977775	81978370	.	+	.	gene_id lnc-AL359195.1-1 ; transcript_id lnc-AL359195.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237523 ; gene_alias_2 RP11-40F6.2 ; gene_alias_3 ENSG00000237523.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018605.1 ; gene_alias_5 LINC00857 ; transcript_alias_1 ENST00000432308 ; transcript_alias_2 ENST00000432308.1 ; transcript_alias_3 RP11-40F6.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000049055.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT015238 ;
chr12	lncipedia.org	exon	123567337	123567506	.	+	.	gene_id lnc-ARL6IP4-1 ; transcript_id lnc-ARL6IP4-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000251497 ; gene_alias_2 RP11-197N18.7 ; gene_alias_3 ENSG00000251497.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168847.1 ; transcript_alias_1 ENST00000537292 ; transcript_alias_2 ENST00000537292.1 ; transcript_alias_3 RP11-197N18.7-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401351.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031563 ;
chr12	lncipedia.org	exon	123567782	123568676	.	+	.	gene_id lnc-ARL6IP4-1 ; transcript_id lnc-ARL6IP4-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000251497 ; gene_alias_2 RP11-197N18.7 ; gene_alias_3 ENSG00000251497.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168847.1 ; transcript_alias_1 ENST00000537292 ; transcript_alias_2 ENST00000537292.1 ; transcript_alias_3 RP11-197N18.7-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401351.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031563 ;
chr3	lncipedia.org	exon	72146879	72148162	.	-	.	gene_id lnc-RYBP-4 ; transcript_id lnc-RYBP-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000241163 ; gene_alias_2 RP11-398A8.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241163.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158784.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241163.3 ; gene_alias_6 LINC00877 ; transcript_alias_1 ENST00000488545 ; transcript_alias_2 ENST00000488545.1 ; transcript_alias_3 RP11-398A8.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352210.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090442 ;
chr3	lncipedia.org	exon	72149055	72149161	.	-	.	gene_id lnc-RYBP-4 ; transcript_id lnc-RYBP-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000241163 ; gene_alias_2 RP11-398A8.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241163.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158784.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241163.3 ; gene_alias_6 LINC00877 ; transcript_alias_1 ENST00000488545 ; transcript_alias_2 ENST00000488545.1 ; transcript_alias_3 RP11-398A8.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352210.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090442 ;
chr3	lncipedia.org	exon	72149939	72150108	.	-	.	gene_id lnc-RYBP-4 ; transcript_id lnc-RYBP-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000241163 ; gene_alias_2 RP11-398A8.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241163.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158784.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241163.3 ; gene_alias_6 LINC00877 ; transcript_alias_1 ENST00000488545 ; transcript_alias_2 ENST00000488545.1 ; transcript_alias_3 RP11-398A8.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352210.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090442 ;
chr11	lncipedia.org	exon	13002176	13002456	.	-	.	gene_id lnc-BTBD10-3 ; transcript_id lnc-BTBD10-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000251381 ; gene_alias_2 CTC-497E21.4 ; gene_alias_3 ENSG00000251381.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165904.2 ; gene_alias_5 LINC00958 ; transcript_alias_1 ENST00000531402 ; transcript_alias_2 ENST00000531402.1 ; transcript_alias_3 CTC-497E21.4-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000387316.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT018089 ;
chr11	lncipedia.org	exon	13005773	13005885	.	-	.	gene_id lnc-BTBD10-3 ; transcript_id lnc-BTBD10-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000251381 ; gene_alias_2 CTC-497E21.4 ; gene_alias_3 ENSG00000251381.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165904.2 ; gene_alias_5 LINC00958 ; transcript_alias_1 ENST00000531402 ; transcript_alias_2 ENST00000531402.1 ; transcript_alias_3 CTC-497E21.4-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000387316.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT018089 ;
chr11	lncipedia.org	exon	13007587	13007691	.	-	.	gene_id lnc-BTBD10-3 ; transcript_id lnc-BTBD10-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000251381 ; gene_alias_2 CTC-497E21.4 ; gene_alias_3 ENSG00000251381.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165904.2 ; gene_alias_5 LINC00958 ; transcript_alias_1 ENST00000531402 ; transcript_alias_2 ENST00000531402.1 ; transcript_alias_3 CTC-497E21.4-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000387316.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT018089 ;
chr11	lncipedia.org	exon	13011003	13011093	.	-	.	gene_id lnc-BTBD10-3 ; transcript_id lnc-BTBD10-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000251381 ; gene_alias_2 CTC-497E21.4 ; gene_alias_3 ENSG00000251381.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165904.2 ; gene_alias_5 LINC00958 ; transcript_alias_1 ENST00000531402 ; transcript_alias_2 ENST00000531402.1 ; transcript_alias_3 CTC-497E21.4-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000387316.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT018089 ;
chr7	lncipedia.org	exon	86954666	86954760	.	-	.	gene_id lnc-ABCB4-1 ; transcript_id lnc-ABCB4-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000182165 ; gene_alias_2 TP53TG1 ; gene_alias_3 ENSG00000182165.12 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000130822.4 ; gene_alias_5 ENSG00000182165.13 ; transcript_alias_1 ENST00000421293 ; transcript_alias_2 ENST00000421293.1 ; transcript_alias_3 TP53TG1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000253376.3 ;
chr7	lncipedia.org	exon	86970839	86971000	.	-	.	gene_id lnc-ABCB4-1 ; transcript_id lnc-ABCB4-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000182165 ; gene_alias_2 TP53TG1 ; gene_alias_3 ENSG00000182165.12 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000130822.4 ; gene_alias_5 ENSG00000182165.13 ; transcript_alias_1 ENST00000421293 ; transcript_alias_2 ENST00000421293.1 ; transcript_alias_3 TP53TG1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000253376.3 ;
chr7	lncipedia.org	exon	86974621	86974802	.	-	.	gene_id lnc-ABCB4-1 ; transcript_id lnc-ABCB4-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000182165 ; gene_alias_2 TP53TG1 ; gene_alias_3 ENSG00000182165.12 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000130822.4 ; gene_alias_5 ENSG00000182165.13 ; transcript_alias_1 ENST00000421293 ; transcript_alias_2 ENST00000421293.1 ; transcript_alias_3 TP53TG1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000253376.3 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73040491	73040864	.	-	.	gene_id lnc-NAP1L2-1 ; transcript_id lnc-NAP1L2-1:15 ; gene_alias_1 ENSG00000229807 ; gene_alias_2 XLOC_008185 ; gene_alias_3 linc-NAP1L2-4 ; gene_alias_4 XIST ; gene_alias_5 ENSG00000229807.3 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021839.3 ; gene_alias_7 ENSG00000229807.5 ; transcript_alias_1 ENST00000416330 ; transcript_alias_2 TCONS_00017073 ; transcript_alias_3 ENST00000416330.1 ; transcript_alias_4 XIST-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000057240.3 ; transcript_alias_6 NONHSAT147736 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73041906	73042051	.	-	.	gene_id lnc-NAP1L2-1 ; transcript_id lnc-NAP1L2-1:15 ; gene_alias_1 ENSG00000229807 ; gene_alias_2 XLOC_008185 ; gene_alias_3 linc-NAP1L2-4 ; gene_alias_4 XIST ; gene_alias_5 ENSG00000229807.3 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021839.3 ; gene_alias_7 ENSG00000229807.5 ; transcript_alias_1 ENST00000416330 ; transcript_alias_2 TCONS_00017073 ; transcript_alias_3 ENST00000416330.1 ; transcript_alias_4 XIST-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000057240.3 ; transcript_alias_6 NONHSAT147736 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73045950	73046179	.	-	.	gene_id lnc-NAP1L2-1 ; transcript_id lnc-NAP1L2-1:15 ; gene_alias_1 ENSG00000229807 ; gene_alias_2 XLOC_008185 ; gene_alias_3 linc-NAP1L2-4 ; gene_alias_4 XIST ; gene_alias_5 ENSG00000229807.3 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021839.3 ; gene_alias_7 ENSG00000229807.5 ; transcript_alias_1 ENST00000416330 ; transcript_alias_2 TCONS_00017073 ; transcript_alias_3 ENST00000416330.1 ; transcript_alias_4 XIST-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000057240.3 ; transcript_alias_6 NONHSAT147736 ;
chr17	lncipedia.org	exon	48838390	48838867	.	-	.	gene_id lnc-ANKRD40-1 ; transcript_id lnc-ANKRD40-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000167117 ; gene_alias_2 C17orf73 ; gene_alias_3 ENSG00000167117.4 ; gene_alias_4 LINC00483 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000132429.5 ; transcript_alias_1 ENST00000300458 ; transcript_alias_2 ENST00000300458.1 ; transcript_alias_3 LINC00483-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000255568.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT054719 ;
chr17	lncipedia.org	exon	48840758	48842397	.	-	.	gene_id lnc-ANKRD40-1 ; transcript_id lnc-ANKRD40-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000167117 ; gene_alias_2 C17orf73 ; gene_alias_3 ENSG00000167117.4 ; gene_alias_4 LINC00483 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000132429.5 ; transcript_alias_1 ENST00000300458 ; transcript_alias_2 ENST00000300458.1 ; transcript_alias_3 LINC00483-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000255568.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT054719 ;
chr17	lncipedia.org	exon	48844235	48844879	.	-	.	gene_id lnc-ANKRD40-1 ; transcript_id lnc-ANKRD40-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000167117 ; gene_alias_2 C17orf73 ; gene_alias_3 ENSG00000167117.4 ; gene_alias_4 LINC00483 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000132429.5 ; transcript_alias_1 ENST00000300458 ; transcript_alias_2 ENST00000300458.1 ; transcript_alias_3 LINC00483-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000255568.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT054719 ;
chr1	lncipedia.org	exon	44516787	44517166	.	+	.	gene_id lnc-KLF17-1 ; transcript_id lnc-KLF17-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000230615 ; gene_alias_2 RP5-1198O20.4 ; gene_alias_3 ENSG00000230615.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000008300.1 ; gene_alias_5 ENSG00000230615.2 ; transcript_alias_1 ENST00000447959 ; transcript_alias_2 ENST00000447959.1 ; transcript_alias_3 RP5-1198O20.4-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000022877.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT002859 ;
chr1	lncipedia.org	exon	44541763	44542142	.	+	.	gene_id lnc-KLF17-1 ; transcript_id lnc-KLF17-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000230615 ; gene_alias_2 RP5-1198O20.4 ; gene_alias_3 ENSG00000230615.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000008300.1 ; gene_alias_5 ENSG00000230615.2 ; transcript_alias_1 ENST00000447959 ; transcript_alias_2 ENST00000447959.1 ; transcript_alias_3 RP5-1198O20.4-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000022877.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT002859 ;
chr16	lncipedia.org	exon	23681332	23683518	.	+	.	gene_id lnc-PLK1-1 ; transcript_id lnc-PLK1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250707 ; gene_alias_2 ENSG00000260482.1 ; gene_alias_3 CTD-2196E14.9 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000177265.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502891 ; transcript_alias_2 ENST00000566996.1 ; transcript_alias_3 CTD-2196E14.9-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000436065.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT141136 ;
chr16	lncipedia.org	exon	23684173	23684448	.	+	.	gene_id lnc-PLK1-1 ; transcript_id lnc-PLK1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250707 ; gene_alias_2 ENSG00000260482.1 ; gene_alias_3 CTD-2196E14.9 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000177265.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502891 ; transcript_alias_2 ENST00000566996.1 ; transcript_alias_3 CTD-2196E14.9-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000436065.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT141136 ;
chr17	lncipedia.org	exon	34220711	34221327	.	-	.	gene_id lnc-RDM1-1 ; transcript_id lnc-RDM1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248695 ; transcript_alias_1 ENST00000506920 ;
chr17	lncipedia.org	exon	34233172	34236953	.	-	.	gene_id lnc-RDM1-1 ; transcript_id lnc-RDM1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248695 ; transcript_alias_1 ENST00000506920 ;
chrX	lncipedia.org	exon	39868529	39869054	.	+	.	gene_id lnc-ATP6AP2-4 ; transcript_id lnc-ATP6AP2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223486 ; gene_alias_2 XLOC_007959 ; gene_alias_3 linc-ATP6AP2-2 ; gene_alias_4 AC092198.1 ; gene_alias_5 ENSG00000223486.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000024099.2 ; transcript_alias_1 ENST00000447651 ; transcript_alias_2 TCONS_00016930 ; transcript_alias_3 ENST00000447651.1 ; transcript_alias_4 AC092198.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000060663.2 ; transcript_alias_6 NONHSAT136682 ;
chrX	lncipedia.org	exon	39869271	39871435	.	+	.	gene_id lnc-ATP6AP2-4 ; transcript_id lnc-ATP6AP2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223486 ; gene_alias_2 XLOC_007959 ; gene_alias_3 linc-ATP6AP2-2 ; gene_alias_4 AC092198.1 ; gene_alias_5 ENSG00000223486.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000024099.2 ; transcript_alias_1 ENST00000447651 ; transcript_alias_2 TCONS_00016930 ; transcript_alias_3 ENST00000447651.1 ; transcript_alias_4 AC092198.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000060663.2 ; transcript_alias_6 NONHSAT136682 ;
chr12	lncipedia.org	exon	104852873	104854222	.	-	.	gene_id lnc-NFYB-2 ; transcript_id lnc-NFYB-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245335 ; gene_alias_2 AC079316.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502037 ; transcript_alias_2 NONHSAT030427 ;
chr12	lncipedia.org	exon	104859855	104862733	.	-	.	gene_id lnc-NFYB-2 ; transcript_id lnc-NFYB-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245335 ; gene_alias_2 AC079316.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502037 ; transcript_alias_2 NONHSAT030427 ;
chr2	lncipedia.org	exon	113993107	113993147	.	+	.	gene_id lnc-PSD4-1 ; transcript_id lnc-PSD4-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000189223 ; gene_alias_2 AC016683.6 ; gene_alias_3 ENSG00000189223.7 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153340.3 ; gene_alias_5 ENSG00000189223.9 ; gene_alias_6 PAX8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000451179 ; transcript_alias_2 ENST00000451179.1 ; transcript_alias_3 AC016683.6-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330809.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT073762 ;
chr2	lncipedia.org	exon	113995667	113995789	.	+	.	gene_id lnc-PSD4-1 ; transcript_id lnc-PSD4-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000189223 ; gene_alias_2 AC016683.6 ; gene_alias_3 ENSG00000189223.7 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153340.3 ; gene_alias_5 ENSG00000189223.9 ; gene_alias_6 PAX8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000451179 ; transcript_alias_2 ENST00000451179.1 ; transcript_alias_3 AC016683.6-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330809.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT073762 ;
chr2	lncipedia.org	exon	114012967	114013126	.	+	.	gene_id lnc-PSD4-1 ; transcript_id lnc-PSD4-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000189223 ; gene_alias_2 AC016683.6 ; gene_alias_3 ENSG00000189223.7 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153340.3 ; gene_alias_5 ENSG00000189223.9 ; gene_alias_6 PAX8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000451179 ; transcript_alias_2 ENST00000451179.1 ; transcript_alias_3 AC016683.6-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330809.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT073762 ;
chr2	lncipedia.org	exon	114020855	114021031	.	+	.	gene_id lnc-PSD4-1 ; transcript_id lnc-PSD4-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000189223 ; gene_alias_2 AC016683.6 ; gene_alias_3 ENSG00000189223.7 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153340.3 ; gene_alias_5 ENSG00000189223.9 ; gene_alias_6 PAX8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000451179 ; transcript_alias_2 ENST00000451179.1 ; transcript_alias_3 AC016683.6-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330809.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT073762 ;
chr2	lncipedia.org	exon	114023053	114023747	.	+	.	gene_id lnc-PSD4-1 ; transcript_id lnc-PSD4-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000189223 ; gene_alias_2 AC016683.6 ; gene_alias_3 ENSG00000189223.7 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153340.3 ; gene_alias_5 ENSG00000189223.9 ; gene_alias_6 PAX8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000451179 ; transcript_alias_2 ENST00000451179.1 ; transcript_alias_3 AC016683.6-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000330809.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT073762 ;
chr8	lncipedia.org	exon	82608603	82609137	.	-	.	gene_id lnc-SLC10A5-1 ; transcript_id lnc-SLC10A5-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250373 ; gene_alias_2 XLOC_007135 ; gene_alias_3 linc-SLC10A5 ; transcript_alias_1 ENST00000507690 ; transcript_alias_2 TCONS_00014559 ; transcript_alias_3 NONHSAT127466 ;
chr8	lncipedia.org	exon	82609330	82610929	.	-	.	gene_id lnc-SLC10A5-1 ; transcript_id lnc-SLC10A5-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250373 ; gene_alias_2 XLOC_007135 ; gene_alias_3 linc-SLC10A5 ; transcript_alias_1 ENST00000507690 ; transcript_alias_2 TCONS_00014559 ; transcript_alias_3 NONHSAT127466 ;
chr12	lncipedia.org	exon	130640279	130640327	.	-	.	gene_id lnc-TMEM132D-3 ; transcript_id lnc-TMEM132D-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250208 ; gene_alias_2 RP11-143E21.7 ; gene_alias_3 ENSG00000250208.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168379.1 ; gene_alias_5 FZD10-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000537095 ; transcript_alias_2 ENST00000537095.1 ; transcript_alias_3 RP11-143E21.7-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399507.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031962 ;
chr12	lncipedia.org	exon	130641589	130641755	.	-	.	gene_id lnc-TMEM132D-3 ; transcript_id lnc-TMEM132D-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250208 ; gene_alias_2 RP11-143E21.7 ; gene_alias_3 ENSG00000250208.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168379.1 ; gene_alias_5 FZD10-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000537095 ; transcript_alias_2 ENST00000537095.1 ; transcript_alias_3 RP11-143E21.7-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399507.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031962 ;
chr12	lncipedia.org	exon	130646507	130646801	.	-	.	gene_id lnc-TMEM132D-3 ; transcript_id lnc-TMEM132D-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250208 ; gene_alias_2 RP11-143E21.7 ; gene_alias_3 ENSG00000250208.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168379.1 ; gene_alias_5 FZD10-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000537095 ; transcript_alias_2 ENST00000537095.1 ; transcript_alias_3 RP11-143E21.7-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399507.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031962 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47599681	47599852	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000547600 ; transcript_alias_2 ENST00000547600.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405089.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027899 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47600294	47600371	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000547600 ; transcript_alias_2 ENST00000547600.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405089.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027899 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47604423	47604544	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000547600 ; transcript_alias_2 ENST00000547600.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405089.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027899 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47609948	47610047	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000547600 ; transcript_alias_2 ENST00000547600.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405089.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027899 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47610167	47610217	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000547600 ; transcript_alias_2 ENST00000547600.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405089.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027899 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45976341	45978293	.	-	.	gene_id lnc-RTN2-1 ; transcript_id lnc-RTN2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248000 ; gene_alias_2 AC138128.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501583 ; transcript_alias_2 NONHSAT066781 ;
chr19	lncipedia.org	exon	45978387	45978414	.	-	.	gene_id lnc-RTN2-1 ; transcript_id lnc-RTN2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248000 ; gene_alias_2 AC138128.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501583 ; transcript_alias_2 NONHSAT066781 ;
chr7	lncipedia.org	exon	129959373	129960371	.	-	.	gene_id lnc-CEP41-1 ; transcript_id lnc-CEP41-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248239 ; transcript_alias_1 ENST00000504316 ;
chr7	lncipedia.org	exon	129960476	129960605	.	-	.	gene_id lnc-CEP41-1 ; transcript_id lnc-CEP41-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248239 ; transcript_alias_1 ENST00000504316 ;
chr7	lncipedia.org	exon	129964184	129964409	.	-	.	gene_id lnc-CEP41-1 ; transcript_id lnc-CEP41-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248239 ; transcript_alias_1 ENST00000504316 ;
chr7	lncipedia.org	exon	129978359	129978447	.	-	.	gene_id lnc-CEP41-1 ; transcript_id lnc-CEP41-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248239 ; transcript_alias_1 ENST00000504316 ;
chr7	lncipedia.org	exon	129982654	129982742	.	-	.	gene_id lnc-CEP41-1 ; transcript_id lnc-CEP41-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248239 ; transcript_alias_1 ENST00000504316 ;
chr1	lncipedia.org	exon	234782035	234782251	.	+	.	gene_id lnc-C1orf31-6 ; transcript_id lnc-C1orf31-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228044 ; gene_alias_2 RP4-781K5.4 ; gene_alias_3 ENSG00000228044.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037980.1 ; transcript_alias_1 ENST00000417805 ; transcript_alias_2 ENST00000417805.1 ; transcript_alias_3 RP4-781K5.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000092701.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT010295 ; transcript_alias_6 NR_125944 ;
chr1	lncipedia.org	exon	234790972	234791210	.	+	.	gene_id lnc-C1orf31-6 ; transcript_id lnc-C1orf31-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228044 ; gene_alias_2 RP4-781K5.4 ; gene_alias_3 ENSG00000228044.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037980.1 ; transcript_alias_1 ENST00000417805 ; transcript_alias_2 ENST00000417805.1 ; transcript_alias_3 RP4-781K5.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000092701.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT010295 ; transcript_alias_6 NR_125944 ;
chr1	lncipedia.org	exon	234791854	234791979	.	+	.	gene_id lnc-C1orf31-6 ; transcript_id lnc-C1orf31-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228044 ; gene_alias_2 RP4-781K5.4 ; gene_alias_3 ENSG00000228044.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037980.1 ; transcript_alias_1 ENST00000417805 ; transcript_alias_2 ENST00000417805.1 ; transcript_alias_3 RP4-781K5.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000092701.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT010295 ; transcript_alias_6 NR_125944 ;
chr1	lncipedia.org	exon	234795880	234796670	.	+	.	gene_id lnc-C1orf31-6 ; transcript_id lnc-C1orf31-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228044 ; gene_alias_2 RP4-781K5.4 ; gene_alias_3 ENSG00000228044.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037980.1 ; transcript_alias_1 ENST00000417805 ; transcript_alias_2 ENST00000417805.1 ; transcript_alias_3 RP4-781K5.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000092701.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT010295 ; transcript_alias_6 NR_125944 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47599681	47599928	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000552269 ; transcript_alias_2 ENST00000552269.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405088.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027898 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47603064	47603241	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000552269 ; transcript_alias_2 ENST00000552269.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405088.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027898 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47604423	47604544	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000552269 ; transcript_alias_2 ENST00000552269.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405088.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027898 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47609948	47610047	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000552269 ; transcript_alias_2 ENST00000552269.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405088.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027898 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47610167	47610191	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000552269 ; transcript_alias_2 ENST00000552269.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405088.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027898 ;
chr8	lncipedia.org	exon	23583844	23584124	.	-	.	gene_id lnc-NKX2-6-1 ; transcript_id lnc-NKX2-6-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254002 ; gene_alias_2 RP11-213G6.2 ; gene_alias_3 ENSG00000254002.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163869.1 ; transcript_alias_1 ENST00000520375 ; transcript_alias_2 ENST00000520375.1 ; transcript_alias_3 RP11-213G6.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000376059.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT125587 ;
chr8	lncipedia.org	exon	23590062	23590173	.	-	.	gene_id lnc-NKX2-6-1 ; transcript_id lnc-NKX2-6-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254002 ; gene_alias_2 RP11-213G6.2 ; gene_alias_3 ENSG00000254002.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163869.1 ; transcript_alias_1 ENST00000520375 ; transcript_alias_2 ENST00000520375.1 ; transcript_alias_3 RP11-213G6.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000376059.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT125587 ;
chr8	lncipedia.org	exon	23600506	23600555	.	-	.	gene_id lnc-NKX2-6-1 ; transcript_id lnc-NKX2-6-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000254002 ; gene_alias_2 RP11-213G6.2 ; gene_alias_3 ENSG00000254002.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163869.1 ; transcript_alias_1 ENST00000520375 ; transcript_alias_2 ENST00000520375.1 ; transcript_alias_3 RP11-213G6.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000376059.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT125587 ;
chr12	lncipedia.org	exon	65938018	65938271	.	-	.	gene_id lnc-RP11-366L20.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-366L20.2.1-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000250748 ; transcript_alias_1 ENST00000511935 ;
chr12	lncipedia.org	exon	65938019	65938271	.	-	.	gene_id lnc-RP11-366L20.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-366L20.2.1-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000250748 ; transcript_alias_1 ENST00000511935 ;
chr12	lncipedia.org	exon	65950538	65950777	.	-	.	gene_id lnc-RP11-366L20.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-366L20.2.1-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000250748 ; transcript_alias_1 ENST00000511935 ;
chr12	lncipedia.org	exon	65950861	65951091	.	-	.	gene_id lnc-RP11-366L20.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-366L20.2.1-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000250748 ; transcript_alias_1 ENST00000511935 ;
chr12	lncipedia.org	exon	13679788	13679881	.	+	.	gene_id lnc-EMP1-1 ; transcript_id lnc-EMP1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256306 ; gene_alias_2 RP11-4N23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256306.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168642.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535528 ; transcript_alias_2 ENST00000535528.1 ; transcript_alias_3 RP11-4N23.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000400471.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027043 ;
chr12	lncipedia.org	exon	13683591	13683809	.	+	.	gene_id lnc-EMP1-1 ; transcript_id lnc-EMP1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256306 ; gene_alias_2 RP11-4N23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256306.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168642.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535528 ; transcript_alias_2 ENST00000535528.1 ; transcript_alias_3 RP11-4N23.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000400471.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027043 ;
chr1	lncipedia.org	exon	68604040	68604133	.	+	.	gene_id lnc-GADD45A-1 ; transcript_id lnc-GADD45A-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000232284 ; gene_alias_2 RP11-518D3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000232284.2 ; gene_alias_4 GNG12-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000009150.1 ; gene_alias_6 ENSG00000232284.3 ; transcript_alias_1 ENST00000434072 ; transcript_alias_2 ENST00000434072.1 ; transcript_alias_3 GNG12-AS1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000025357.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003817 ;
chr1	lncipedia.org	exon	68607108	68607471	.	+	.	gene_id lnc-GADD45A-1 ; transcript_id lnc-GADD45A-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000232284 ; gene_alias_2 RP11-518D3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000232284.2 ; gene_alias_4 GNG12-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000009150.1 ; gene_alias_6 ENSG00000232284.3 ; transcript_alias_1 ENST00000434072 ; transcript_alias_2 ENST00000434072.1 ; transcript_alias_3 GNG12-AS1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000025357.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003817 ;
chr15	lncipedia.org	exon	90816233	90818138	.	-	.	gene_id lnc-CIB1-1 ; transcript_id lnc-CIB1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246567 ; transcript_alias_1 ENST00000500321 ;
chr15	lncipedia.org	exon	90820109	90821105	.	-	.	gene_id lnc-CIB1-1 ; transcript_id lnc-CIB1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246567 ; transcript_alias_1 ENST00000500321 ;
chr15	lncipedia.org	exon	101453413	101456185	.	-	.	gene_id lnc-CHSY1-5 ; transcript_id lnc-CHSY1-5:3 ; gene_alias_1 ENSG00000247392 ; transcript_alias_1 ENST00000499063 ;
chr15	lncipedia.org	exon	101459009	101459443	.	-	.	gene_id lnc-CHSY1-5 ; transcript_id lnc-CHSY1-5:3 ; gene_alias_1 ENSG00000247392 ; transcript_alias_1 ENST00000499063 ;
chr1	lncipedia.org	exon	67863729	67864788	.	+	.	gene_id lnc-IL12RB2-1 ; transcript_id lnc-IL12RB2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249294 ; transcript_alias_1 ENST00000506150 ; transcript_alias_2 NONHSAT003786 ;
chr1	lncipedia.org	exon	67865109	67866317	.	+	.	gene_id lnc-IL12RB2-1 ; transcript_id lnc-IL12RB2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249294 ; transcript_alias_1 ENST00000506150 ; transcript_alias_2 NONHSAT003786 ;
chr16	lncipedia.org	exon	23886563	23888535	.	+	.	gene_id lnc-CHP2.1-1 ; transcript_id lnc-CHP2.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249591 ; transcript_alias_1 ENST00000514276 ;
chr16	lncipedia.org	exon	23888752	23889255	.	+	.	gene_id lnc-CHP2.1-1 ; transcript_id lnc-CHP2.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249591 ; transcript_alias_1 ENST00000514276 ;
chr16	lncipedia.org	exon	23889391	23889817	.	+	.	gene_id lnc-CHP2.1-1 ; transcript_id lnc-CHP2.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249591 ; transcript_alias_1 ENST00000514276 ;
chr11	lncipedia.org	exon	10886808	10886874	.	+	.	gene_id lnc-CTR9-3 ; transcript_id lnc-CTR9-3:7 ; gene_alias_1 ENSG00000247271 ; gene_alias_2 CTD-2003C8.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247271.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165888.1 ; gene_alias_5 ZBED5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000530344 ; transcript_alias_2 ENST00000530344.1 ; transcript_alias_3 CTD-2003C8.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000386900.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	10928002	10928349	.	+	.	gene_id lnc-CTR9-3 ; transcript_id lnc-CTR9-3:7 ; gene_alias_1 ENSG00000247271 ; gene_alias_2 CTD-2003C8.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247271.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165888.1 ; gene_alias_5 ZBED5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000530344 ; transcript_alias_2 ENST00000530344.1 ; transcript_alias_3 CTD-2003C8.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000386900.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	4544145	4544352	.	+	.	gene_id lnc-NSG1.1-1 ; transcript_id lnc-NSG1.1-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000247708 ; gene_alias_2 RP11-323F5.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247708.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159923.1 ; gene_alias_5 ENSG00000247708.3 ; gene_alias_6 STX18-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000514763 ; transcript_alias_2 ENST00000514763.1 ; transcript_alias_3 RP11-323F5.2-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000358305.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	4546465	4546787	.	+	.	gene_id lnc-NSG1.1-1 ; transcript_id lnc-NSG1.1-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000247708 ; gene_alias_2 RP11-323F5.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247708.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000159923.1 ; gene_alias_5 ENSG00000247708.3 ; gene_alias_6 STX18-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000514763 ; transcript_alias_2 ENST00000514763.1 ; transcript_alias_3 RP11-323F5.2-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000358305.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	90621629	90621723	.	-	.	gene_id lnc-NBN-1 ; transcript_id lnc-NBN-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251136 ; gene_alias_2 RP11-37B2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251136.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163788.2 ; transcript_alias_1 ENST00000519655 ; transcript_alias_2 ENST00000519655.1 ; transcript_alias_3 RP11-37B2.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000375476.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127611 ;
chr8	lncipedia.org	exon	90623663	90623699	.	-	.	gene_id lnc-NBN-1 ; transcript_id lnc-NBN-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251136 ; gene_alias_2 RP11-37B2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251136.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163788.2 ; transcript_alias_1 ENST00000519655 ; transcript_alias_2 ENST00000519655.1 ; transcript_alias_3 RP11-37B2.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000375476.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127611 ;
chr8	lncipedia.org	exon	90624013	90624218	.	-	.	gene_id lnc-NBN-1 ; transcript_id lnc-NBN-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251136 ; gene_alias_2 RP11-37B2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251136.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163788.2 ; transcript_alias_1 ENST00000519655 ; transcript_alias_2 ENST00000519655.1 ; transcript_alias_3 RP11-37B2.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000375476.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127611 ;
chr8	lncipedia.org	exon	90627412	90627534	.	-	.	gene_id lnc-NBN-1 ; transcript_id lnc-NBN-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251136 ; gene_alias_2 RP11-37B2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251136.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163788.2 ; transcript_alias_1 ENST00000519655 ; transcript_alias_2 ENST00000519655.1 ; transcript_alias_3 RP11-37B2.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000375476.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127611 ;
chr8	lncipedia.org	exon	90640384	90640528	.	-	.	gene_id lnc-NBN-1 ; transcript_id lnc-NBN-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251136 ; gene_alias_2 RP11-37B2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251136.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163788.2 ; transcript_alias_1 ENST00000519655 ; transcript_alias_2 ENST00000519655.1 ; transcript_alias_3 RP11-37B2.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000375476.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127611 ;
chr8	lncipedia.org	exon	90641382	90641499	.	-	.	gene_id lnc-NBN-1 ; transcript_id lnc-NBN-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251136 ; gene_alias_2 RP11-37B2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251136.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163788.2 ; transcript_alias_1 ENST00000519655 ; transcript_alias_2 ENST00000519655.1 ; transcript_alias_3 RP11-37B2.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000375476.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127611 ;
chr8	lncipedia.org	exon	90769273	90769955	.	-	.	gene_id lnc-NBN-1 ; transcript_id lnc-NBN-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251136 ; gene_alias_2 RP11-37B2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251136.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163788.2 ; transcript_alias_1 ENST00000519655 ; transcript_alias_2 ENST00000519655.1 ; transcript_alias_3 RP11-37B2.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000375476.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127611 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87962139	87963409	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; transcript_alias_1 ENST00000511014 ; transcript_alias_2 ENST00000511014.1 ; transcript_alias_3 LINC00461-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369799.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87966854	87966903	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; transcript_alias_1 ENST00000511014 ; transcript_alias_2 ENST00000511014.1 ; transcript_alias_3 LINC00461-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369799.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87968783	87968846	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; transcript_alias_1 ENST00000511014 ; transcript_alias_2 ENST00000511014.1 ; transcript_alias_3 LINC00461-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369799.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87980475	87980753	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; transcript_alias_1 ENST00000511014 ; transcript_alias_2 ENST00000511014.1 ; transcript_alias_3 LINC00461-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369799.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73040486	73040864	.	-	.	gene_id lnc-NAP1L2-1 ; transcript_id lnc-NAP1L2-1:14 ; gene_alias_1 ENSG00000229807 ; gene_alias_2 XLOC_008185 ; gene_alias_3 linc-NAP1L2-4 ; gene_alias_4 XIST ; gene_alias_5 ENSG00000229807.3 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021839.3 ; gene_alias_7 ENSG00000229807.5 ; transcript_alias_1 ENST00000434839 ; transcript_alias_2 TCONS_00017070 ; transcript_alias_3 ENST00000434839.1 ; transcript_alias_4 XIST-005 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000083628.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT147734 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73045950	73046290	.	-	.	gene_id lnc-NAP1L2-1 ; transcript_id lnc-NAP1L2-1:14 ; gene_alias_1 ENSG00000229807 ; gene_alias_2 XLOC_008185 ; gene_alias_3 linc-NAP1L2-4 ; gene_alias_4 XIST ; gene_alias_5 ENSG00000229807.3 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021839.3 ; gene_alias_7 ENSG00000229807.5 ; transcript_alias_1 ENST00000434839 ; transcript_alias_2 TCONS_00017070 ; transcript_alias_3 ENST00000434839.1 ; transcript_alias_4 XIST-005 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000083628.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT147734 ;
chr5	lncipedia.org	exon	96364997	96365278	.	-	.	gene_id lnc-LIX1-1 ; transcript_id lnc-LIX1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249716 ; transcript_alias_1 ENST00000507263 ;
chr5	lncipedia.org	exon	96365384	96367586	.	-	.	gene_id lnc-LIX1-1 ; transcript_id lnc-LIX1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249716 ; transcript_alias_1 ENST00000507263 ;
chr2	lncipedia.org	exon	65958809	65959084	.	+	.	gene_id lnc-ACTR2-3 ; transcript_id lnc-ACTR2-3:7 ; gene_alias_1 ENSG00000204929 ; gene_alias_2 XLOC_001504 ; gene_alias_3 linc-MEIS1-4 ; gene_alias_4 AC074391.1 ; gene_alias_5 ENSG00000204929.6 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000152768.5 ; gene_alias_7 ENSG00000204929.7 ; transcript_alias_1 ENST00000414811 ; transcript_alias_2 TCONS_00002913 ; transcript_alias_3 ENST00000414811.1 ; transcript_alias_4 AC074391.1-006 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000327985.2 ; transcript_alias_6 NONHSAT071199 ;
chr2	lncipedia.org	exon	65960027	65960068	.	+	.	gene_id lnc-ACTR2-3 ; transcript_id lnc-ACTR2-3:7 ; gene_alias_1 ENSG00000204929 ; gene_alias_2 XLOC_001504 ; gene_alias_3 linc-MEIS1-4 ; gene_alias_4 AC074391.1 ; gene_alias_5 ENSG00000204929.6 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000152768.5 ; gene_alias_7 ENSG00000204929.7 ; transcript_alias_1 ENST00000414811 ; transcript_alias_2 TCONS_00002913 ; transcript_alias_3 ENST00000414811.1 ; transcript_alias_4 AC074391.1-006 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000327985.2 ; transcript_alias_6 NONHSAT071199 ;
chr2	lncipedia.org	exon	65961007	65961117	.	+	.	gene_id lnc-ACTR2-3 ; transcript_id lnc-ACTR2-3:7 ; gene_alias_1 ENSG00000204929 ; gene_alias_2 XLOC_001504 ; gene_alias_3 linc-MEIS1-4 ; gene_alias_4 AC074391.1 ; gene_alias_5 ENSG00000204929.6 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000152768.5 ; gene_alias_7 ENSG00000204929.7 ; transcript_alias_1 ENST00000414811 ; transcript_alias_2 TCONS_00002913 ; transcript_alias_3 ENST00000414811.1 ; transcript_alias_4 AC074391.1-006 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000327985.2 ; transcript_alias_6 NONHSAT071199 ;
chr2	lncipedia.org	exon	65981883	65981917	.	+	.	gene_id lnc-ACTR2-3 ; transcript_id lnc-ACTR2-3:7 ; gene_alias_1 ENSG00000204929 ; gene_alias_2 XLOC_001504 ; gene_alias_3 linc-MEIS1-4 ; gene_alias_4 AC074391.1 ; gene_alias_5 ENSG00000204929.6 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000152768.5 ; gene_alias_7 ENSG00000204929.7 ; transcript_alias_1 ENST00000414811 ; transcript_alias_2 TCONS_00002913 ; transcript_alias_3 ENST00000414811.1 ; transcript_alias_4 AC074391.1-006 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000327985.2 ; transcript_alias_6 NONHSAT071199 ;
chr2	lncipedia.org	exon	65997147	65997238	.	+	.	gene_id lnc-ACTR2-3 ; transcript_id lnc-ACTR2-3:7 ; gene_alias_1 ENSG00000204929 ; gene_alias_2 XLOC_001504 ; gene_alias_3 linc-MEIS1-4 ; gene_alias_4 AC074391.1 ; gene_alias_5 ENSG00000204929.6 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000152768.5 ; gene_alias_7 ENSG00000204929.7 ; transcript_alias_1 ENST00000414811 ; transcript_alias_2 TCONS_00002913 ; transcript_alias_3 ENST00000414811.1 ; transcript_alias_4 AC074391.1-006 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000327985.2 ; transcript_alias_6 NONHSAT071199 ;
chr11	lncipedia.org	exon	3050624	3052806	.	+	.	gene_id lnc-AC131971.1-1 ; transcript_id lnc-AC131971.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247473 ; gene_alias_2 ENSG00000247473.1 ; gene_alias_3 CARS-AS1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165360.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499962 ; transcript_alias_2 ENST00000499962.1 ; transcript_alias_3 CARS-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000383601.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017551 ;
chr11	lncipedia.org	exon	3062010	3062490	.	+	.	gene_id lnc-AC131971.1-1 ; transcript_id lnc-AC131971.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247473 ; gene_alias_2 ENSG00000247473.1 ; gene_alias_3 CARS-AS1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165360.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499962 ; transcript_alias_2 ENST00000499962.1 ; transcript_alias_3 CARS-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000383601.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017551 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127214333	127214512	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-10 ; transcript_id lnc-DHX37-10:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256128 ; gene_alias_2 RP11-173C20.2 ; gene_alias_3 ENSG00000256128.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168480.1 ; gene_alias_5 LINC00944 ; transcript_alias_1 ENST00000540684 ; transcript_alias_2 ENST00000540684.1 ; transcript_alias_3 RP11-173C20.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399870.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031806 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127215309	127215349	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-10 ; transcript_id lnc-DHX37-10:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256128 ; gene_alias_2 RP11-173C20.2 ; gene_alias_3 ENSG00000256128.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168480.1 ; gene_alias_5 LINC00944 ; transcript_alias_1 ENST00000540684 ; transcript_alias_2 ENST00000540684.1 ; transcript_alias_3 RP11-173C20.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399870.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031806 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127216889	127216953	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-10 ; transcript_id lnc-DHX37-10:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256128 ; gene_alias_2 RP11-173C20.2 ; gene_alias_3 ENSG00000256128.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168480.1 ; gene_alias_5 LINC00944 ; transcript_alias_1 ENST00000540684 ; transcript_alias_2 ENST00000540684.1 ; transcript_alias_3 RP11-173C20.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399870.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031806 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127230807	127230878	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-10 ; transcript_id lnc-DHX37-10:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256128 ; gene_alias_2 RP11-173C20.2 ; gene_alias_3 ENSG00000256128.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168480.1 ; gene_alias_5 LINC00944 ; transcript_alias_1 ENST00000540684 ; transcript_alias_2 ENST00000540684.1 ; transcript_alias_3 RP11-173C20.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399870.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031806 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127232477	127232673	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-10 ; transcript_id lnc-DHX37-10:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256128 ; gene_alias_2 RP11-173C20.2 ; gene_alias_3 ENSG00000256128.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168480.1 ; gene_alias_5 LINC00944 ; transcript_alias_1 ENST00000540684 ; transcript_alias_2 ENST00000540684.1 ; transcript_alias_3 RP11-173C20.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399870.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031806 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127256625	127256957	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-10 ; transcript_id lnc-DHX37-10:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256128 ; gene_alias_2 RP11-173C20.2 ; gene_alias_3 ENSG00000256128.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168480.1 ; gene_alias_5 LINC00944 ; transcript_alias_1 ENST00000540684 ; transcript_alias_2 ENST00000540684.1 ; transcript_alias_3 RP11-173C20.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399870.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031806 ;
chr1	lncipedia.org	exon	173833039	173833213	.	-	.	gene_id lnc-SERPINC1-1 ; transcript_id lnc-SERPINC1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000234741 ; gene_alias_2 GAS5 ; gene_alias_3 ENSG00000234741.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037216.2 ; gene_alias_5 ENSG00000234741.3 ; transcript_alias_1 ENST00000431268 ; transcript_alias_2 ENST00000431268.1 ; transcript_alias_3 GAS5-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000090578.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT007664 ;
chr1	lncipedia.org	exon	173833395	173834420	.	-	.	gene_id lnc-SERPINC1-1 ; transcript_id lnc-SERPINC1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000234741 ; gene_alias_2 GAS5 ; gene_alias_3 ENSG00000234741.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037216.2 ; gene_alias_5 ENSG00000234741.3 ; transcript_alias_1 ENST00000431268 ; transcript_alias_2 ENST00000431268.1 ; transcript_alias_3 GAS5-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000090578.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT007664 ;
chr1	lncipedia.org	exon	173834609	173834685	.	-	.	gene_id lnc-SERPINC1-1 ; transcript_id lnc-SERPINC1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000234741 ; gene_alias_2 GAS5 ; gene_alias_3 ENSG00000234741.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037216.2 ; gene_alias_5 ENSG00000234741.3 ; transcript_alias_1 ENST00000431268 ; transcript_alias_2 ENST00000431268.1 ; transcript_alias_3 GAS5-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000090578.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT007664 ;
chr1	lncipedia.org	exon	173834995	173835032	.	-	.	gene_id lnc-SERPINC1-1 ; transcript_id lnc-SERPINC1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000234741 ; gene_alias_2 GAS5 ; gene_alias_3 ENSG00000234741.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037216.2 ; gene_alias_5 ENSG00000234741.3 ; transcript_alias_1 ENST00000431268 ; transcript_alias_2 ENST00000431268.1 ; transcript_alias_3 GAS5-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000090578.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT007664 ;
chr1	lncipedia.org	exon	173835315	173835344	.	-	.	gene_id lnc-SERPINC1-1 ; transcript_id lnc-SERPINC1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000234741 ; gene_alias_2 GAS5 ; gene_alias_3 ENSG00000234741.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037216.2 ; gene_alias_5 ENSG00000234741.3 ; transcript_alias_1 ENST00000431268 ; transcript_alias_2 ENST00000431268.1 ; transcript_alias_3 GAS5-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000090578.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT007664 ;
chr1	lncipedia.org	exon	173835666	173835934	.	-	.	gene_id lnc-SERPINC1-1 ; transcript_id lnc-SERPINC1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000234741 ; gene_alias_2 GAS5 ; gene_alias_3 ENSG00000234741.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037216.2 ; gene_alias_5 ENSG00000234741.3 ; transcript_alias_1 ENST00000431268 ; transcript_alias_2 ENST00000431268.1 ; transcript_alias_3 GAS5-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000090578.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT007664 ;
chr1	lncipedia.org	exon	173836129	173836181	.	-	.	gene_id lnc-SERPINC1-1 ; transcript_id lnc-SERPINC1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000234741 ; gene_alias_2 GAS5 ; gene_alias_3 ENSG00000234741.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037216.2 ; gene_alias_5 ENSG00000234741.3 ; transcript_alias_1 ENST00000431268 ; transcript_alias_2 ENST00000431268.1 ; transcript_alias_3 GAS5-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000090578.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT007664 ;
chr1	lncipedia.org	exon	173837098	173837127	.	-	.	gene_id lnc-SERPINC1-1 ; transcript_id lnc-SERPINC1-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000234741 ; gene_alias_2 GAS5 ; gene_alias_3 ENSG00000234741.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037216.2 ; gene_alias_5 ENSG00000234741.3 ; transcript_alias_1 ENST00000431268 ; transcript_alias_2 ENST00000431268.1 ; transcript_alias_3 GAS5-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000090578.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT007664 ;
chr2	lncipedia.org	exon	175412102	175412205	.	+	.	gene_id lnc-SCRN3-3 ; transcript_id lnc-SCRN3-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000236449 ; gene_alias_2 AC018890.6 ; gene_alias_3 ENSG00000236449.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154592.2 ; transcript_alias_1 ENST00000412835 ; transcript_alias_2 ENST00000412835.1 ; transcript_alias_3 AC018890.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000334129.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075571 ;
chr2	lncipedia.org	exon	175520226	175521013	.	+	.	gene_id lnc-SCRN3-3 ; transcript_id lnc-SCRN3-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000236449 ; gene_alias_2 AC018890.6 ; gene_alias_3 ENSG00000236449.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154592.2 ; transcript_alias_1 ENST00000412835 ; transcript_alias_2 ENST00000412835.1 ; transcript_alias_3 AC018890.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000334129.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075571 ;
chr2	lncipedia.org	exon	175529905	175530417	.	+	.	gene_id lnc-SCRN3-3 ; transcript_id lnc-SCRN3-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000236449 ; gene_alias_2 AC018890.6 ; gene_alias_3 ENSG00000236449.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154592.2 ; transcript_alias_1 ENST00000412835 ; transcript_alias_2 ENST00000412835.1 ; transcript_alias_3 AC018890.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000334129.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075571 ;
chr11	lncipedia.org	exon	133902282	133902755	.	+	.	gene_id lnc-JAM3-3 ; transcript_id lnc-JAM3-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000204241 ; gene_alias_2 RP11-713P17.3 ; gene_alias_3 ENSG00000204241.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167125.1 ; transcript_alias_1 ENST00000532706 ; transcript_alias_2 ENST00000532706.1 ; transcript_alias_3 RP11-713P17.3-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393291.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	133909657	133909725	.	+	.	gene_id lnc-JAM3-3 ; transcript_id lnc-JAM3-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000204241 ; gene_alias_2 RP11-713P17.3 ; gene_alias_3 ENSG00000204241.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167125.1 ; transcript_alias_1 ENST00000532706 ; transcript_alias_2 ENST00000532706.1 ; transcript_alias_3 RP11-713P17.3-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393291.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	125958238	125958401	.	+	.	gene_id lnc-ZNF572-1 ; transcript_id lnc-ZNF572-1:19 ; gene_alias_1 ENSG00000249816 ; gene_alias_2 ENSG00000249816.2 ; gene_alias_3 RP11-6D1.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165101.1 ; gene_alias_5 LINC00964 ; transcript_alias_1 ENST00000530549 ; transcript_alias_2 ENST00000530549.1 ; transcript_alias_3 RP11-6D1.6-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381828.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128947 ;
chr8	lncipedia.org	exon	125963058	125963336	.	+	.	gene_id lnc-ZNF572-1 ; transcript_id lnc-ZNF572-1:19 ; gene_alias_1 ENSG00000249816 ; gene_alias_2 ENSG00000249816.2 ; gene_alias_3 RP11-6D1.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165101.1 ; gene_alias_5 LINC00964 ; transcript_alias_1 ENST00000530549 ; transcript_alias_2 ENST00000530549.1 ; transcript_alias_3 RP11-6D1.6-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381828.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128947 ;
chr5	lncipedia.org	exon	153822557	153823040	.	-	.	gene_id lnc-HAND1-2 ; transcript_id lnc-HAND1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245275 ; gene_alias_2 CTB-157D17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245275.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163570.1 ; gene_alias_5 ENSG00000245275.3 ; gene_alias_6 SAP30L-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000522312 ; transcript_alias_2 ENST00000522312.1 ; transcript_alias_3 CTB-157D17.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000374280.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT104697 ;
chr5	lncipedia.org	exon	153825298	153825382	.	-	.	gene_id lnc-HAND1-2 ; transcript_id lnc-HAND1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245275 ; gene_alias_2 CTB-157D17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245275.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163570.1 ; gene_alias_5 ENSG00000245275.3 ; gene_alias_6 SAP30L-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000522312 ; transcript_alias_2 ENST00000522312.1 ; transcript_alias_3 CTB-157D17.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000374280.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT104697 ;
chr8	lncipedia.org	exon	70746346	70746441	.	+	.	gene_id lnc-SULF1-3 ; transcript_id lnc-SULF1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246528 ; gene_alias_2 RP11-159H10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000246528.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165122.2 ; gene_alias_5 ENSG00000246528.3 ; transcript_alias_1 ENST00000501104 ; transcript_alias_2 ENST00000501104.2 ; transcript_alias_3 RP11-159H10.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000382013.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127140 ;
chr8	lncipedia.org	exon	70748874	70749605	.	+	.	gene_id lnc-SULF1-3 ; transcript_id lnc-SULF1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246528 ; gene_alias_2 RP11-159H10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000246528.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165122.2 ; gene_alias_5 ENSG00000246528.3 ; transcript_alias_1 ENST00000501104 ; transcript_alias_2 ENST00000501104.2 ; transcript_alias_3 RP11-159H10.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000382013.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127140 ;
chr20	lncipedia.org	exon	34738335	34740573	.	-	.	gene_id lnc-SCAND1-3 ; transcript_id lnc-SCAND1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000232406 ; gene_alias_2 RP11-234K24.3 ; gene_alias_3 ENSG00000232406.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032377.1 ; gene_alias_5 ENSG00000232406.2 ; transcript_alias_1 ENST00000441208 ; transcript_alias_2 ENST00000441208.1 ; transcript_alias_3 RP11-234K24.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000078970.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT079558 ;
chr20	lncipedia.org	exon	34740877	34741008	.	-	.	gene_id lnc-SCAND1-3 ; transcript_id lnc-SCAND1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000232406 ; gene_alias_2 RP11-234K24.3 ; gene_alias_3 ENSG00000232406.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032377.1 ; gene_alias_5 ENSG00000232406.2 ; transcript_alias_1 ENST00000441208 ; transcript_alias_2 ENST00000441208.1 ; transcript_alias_3 RP11-234K24.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000078970.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT079558 ;
chr20	lncipedia.org	exon	34742985	34743176	.	-	.	gene_id lnc-SCAND1-3 ; transcript_id lnc-SCAND1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000232406 ; gene_alias_2 RP11-234K24.3 ; gene_alias_3 ENSG00000232406.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032377.1 ; gene_alias_5 ENSG00000232406.2 ; transcript_alias_1 ENST00000441208 ; transcript_alias_2 ENST00000441208.1 ; transcript_alias_3 RP11-234K24.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000078970.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT079558 ;
chr20	lncipedia.org	exon	34743518	34743655	.	-	.	gene_id lnc-SCAND1-3 ; transcript_id lnc-SCAND1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000232406 ; gene_alias_2 RP11-234K24.3 ; gene_alias_3 ENSG00000232406.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032377.1 ; gene_alias_5 ENSG00000232406.2 ; transcript_alias_1 ENST00000441208 ; transcript_alias_2 ENST00000441208.1 ; transcript_alias_3 RP11-234K24.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000078970.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT079558 ;
chr11	lncipedia.org	exon	7490918	7490997	.	-	.	gene_id lnc-CYB5R2-2 ; transcript_id lnc-CYB5R2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251364 ; gene_alias_2 ENSG00000251364.2 ; gene_alias_3 CTD-2516F10.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165526.1 ; transcript_alias_1 ENST00000530201 ; transcript_alias_2 ENST00000530201.1 ; transcript_alias_3 CTD-2516F10.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000384654.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017786 ;
chr11	lncipedia.org	exon	7533354	7533746	.	-	.	gene_id lnc-CYB5R2-2 ; transcript_id lnc-CYB5R2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251364 ; gene_alias_2 ENSG00000251364.2 ; gene_alias_3 CTD-2516F10.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165526.1 ; transcript_alias_1 ENST00000530201 ; transcript_alias_2 ENST00000530201.1 ; transcript_alias_3 CTD-2516F10.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000384654.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017786 ;
chr19	lncipedia.org	exon	12305830	12305958	.	+	.	gene_id lnc-ZNF136-1 ; transcript_id lnc-ZNF136-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234773 ; gene_alias_2 CTD-2666L21.1 ; gene_alias_3 ENSG00000234773.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000156425.1 ; gene_alias_5 ENSG00000234773.2 ; transcript_alias_1 ENST00000440004 ; transcript_alias_2 ENST00000440004.1 ; transcript_alias_3 CTD-2666L21.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000344137.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	12347905	12348247	.	+	.	gene_id lnc-ZNF136-1 ; transcript_id lnc-ZNF136-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234773 ; gene_alias_2 CTD-2666L21.1 ; gene_alias_3 ENSG00000234773.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000156425.1 ; gene_alias_5 ENSG00000234773.2 ; transcript_alias_1 ENST00000440004 ; transcript_alias_2 ENST00000440004.1 ; transcript_alias_3 CTD-2666L21.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000344137.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	133485301	133485734	.	+	.	gene_id lnc-ZNF26-1 ; transcript_id lnc-ZNF26-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247077 ; transcript_alias_1 ENST00000499045 ;
chr12	lncipedia.org	exon	133487580	133487793	.	+	.	gene_id lnc-ZNF26-1 ; transcript_id lnc-ZNF26-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247077 ; transcript_alias_1 ENST00000499045 ;
chr12	lncipedia.org	exon	133489798	133490880	.	+	.	gene_id lnc-ZNF26-1 ; transcript_id lnc-ZNF26-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247077 ; transcript_alias_1 ENST00000499045 ;
chr4	lncipedia.org	exon	95038943	95039252	.	-	.	gene_id lnc-HPGDS-1 ; transcript_id lnc-HPGDS-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246541 ; gene_alias_2 RP11-363G15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246541.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161244.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501965 ; transcript_alias_2 ENST00000501965.2 ; transcript_alias_3 RP11-363G15.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364267.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT097441 ;
chr4	lncipedia.org	exon	95039932	95040062	.	-	.	gene_id lnc-HPGDS-1 ; transcript_id lnc-HPGDS-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246541 ; gene_alias_2 RP11-363G15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246541.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161244.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501965 ; transcript_alias_2 ENST00000501965.2 ; transcript_alias_3 RP11-363G15.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364267.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT097441 ;
chr4	lncipedia.org	exon	95046052	95046193	.	-	.	gene_id lnc-HPGDS-1 ; transcript_id lnc-HPGDS-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246541 ; gene_alias_2 RP11-363G15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246541.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161244.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501965 ; transcript_alias_2 ENST00000501965.2 ; transcript_alias_3 RP11-363G15.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364267.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT097441 ;
chr4	lncipedia.org	exon	95057175	95057310	.	-	.	gene_id lnc-HPGDS-1 ; transcript_id lnc-HPGDS-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246541 ; gene_alias_2 RP11-363G15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246541.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161244.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501965 ; transcript_alias_2 ENST00000501965.2 ; transcript_alias_3 RP11-363G15.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364267.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT097441 ;
chr4	lncipedia.org	exon	95083748	95083872	.	-	.	gene_id lnc-HPGDS-1 ; transcript_id lnc-HPGDS-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246541 ; gene_alias_2 RP11-363G15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246541.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161244.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501965 ; transcript_alias_2 ENST00000501965.2 ; transcript_alias_3 RP11-363G15.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364267.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT097441 ;
chr4	lncipedia.org	exon	95085049	95085080	.	-	.	gene_id lnc-HPGDS-1 ; transcript_id lnc-HPGDS-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246541 ; gene_alias_2 RP11-363G15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246541.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161244.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501965 ; transcript_alias_2 ENST00000501965.2 ; transcript_alias_3 RP11-363G15.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364267.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT097441 ;
chr4	lncipedia.org	exon	95086287	95086347	.	-	.	gene_id lnc-HPGDS-1 ; transcript_id lnc-HPGDS-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246541 ; gene_alias_2 RP11-363G15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246541.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161244.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501965 ; transcript_alias_2 ENST00000501965.2 ; transcript_alias_3 RP11-363G15.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364267.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT097441 ;
chr4	lncipedia.org	exon	95086999	95087076	.	-	.	gene_id lnc-HPGDS-1 ; transcript_id lnc-HPGDS-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246541 ; gene_alias_2 RP11-363G15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246541.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161244.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501965 ; transcript_alias_2 ENST00000501965.2 ; transcript_alias_3 RP11-363G15.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364267.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT097441 ;
chr4	lncipedia.org	exon	95128681	95128707	.	-	.	gene_id lnc-HPGDS-1 ; transcript_id lnc-HPGDS-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246541 ; gene_alias_2 RP11-363G15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246541.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161244.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501965 ; transcript_alias_2 ENST00000501965.2 ; transcript_alias_3 RP11-363G15.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364267.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT097441 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47599681	47599928	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000550426 ; transcript_alias_2 ENST00000550426.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-011 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405087.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027900 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47600294	47600368	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000550426 ; transcript_alias_2 ENST00000550426.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-011 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405087.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027900 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47603064	47603265	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000550426 ; transcript_alias_2 ENST00000550426.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-011 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405087.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027900 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47604423	47604544	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000550426 ; transcript_alias_2 ENST00000550426.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-011 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405087.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027900 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47609948	47609983	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:9 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000550426 ; transcript_alias_2 ENST00000550426.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-011 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405087.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027900 ;
chr5	lncipedia.org	exon	12574969	12575164	.	+	.	gene_id lnc-TRIO-4 ; transcript_id lnc-TRIO-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000248131 ; gene_alias_2 RP11-308B16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248131.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161760.1 ; gene_alias_5 CT49 ; transcript_alias_1 ENST00000505877 ; transcript_alias_2 ENST00000505877.1 ; transcript_alias_3 RP11-308B16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000366008.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT100515 ;
chr5	lncipedia.org	exon	12595809	12595890	.	+	.	gene_id lnc-TRIO-4 ; transcript_id lnc-TRIO-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000248131 ; gene_alias_2 RP11-308B16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248131.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161760.1 ; gene_alias_5 CT49 ; transcript_alias_1 ENST00000505877 ; transcript_alias_2 ENST00000505877.1 ; transcript_alias_3 RP11-308B16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000366008.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT100515 ;
chr5	lncipedia.org	exon	12654759	12655799	.	+	.	gene_id lnc-TRIO-4 ; transcript_id lnc-TRIO-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000248131 ; gene_alias_2 RP11-308B16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248131.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161760.1 ; gene_alias_5 CT49 ; transcript_alias_1 ENST00000505877 ; transcript_alias_2 ENST00000505877.1 ; transcript_alias_3 RP11-308B16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000366008.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT100515 ;
chr2	lncipedia.org	exon	61370703	61371080	.	-	.	gene_id lnc-USP34-1 ; transcript_id lnc-USP34-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000212978 ; gene_alias_2 XLOC_002111 ; gene_alias_3 linc-PUS10 ; gene_alias_4 AC016747.3 ; gene_alias_5 ENSG00000212978.4 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000152156.3 ; gene_alias_7 ENSG00000212978.5 ; transcript_alias_1 ENST00000422740 ; transcript_alias_2 TCONS_00003298 ; transcript_alias_3 ENST00000422740.1 ; transcript_alias_4 AC016747.3-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000325687.2 ; transcript_alias_6 NONHSAT070931 ;
chr2	lncipedia.org	exon	61371304	61371401	.	-	.	gene_id lnc-USP34-1 ; transcript_id lnc-USP34-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000212978 ; gene_alias_2 XLOC_002111 ; gene_alias_3 linc-PUS10 ; gene_alias_4 AC016747.3 ; gene_alias_5 ENSG00000212978.4 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000152156.3 ; gene_alias_7 ENSG00000212978.5 ; transcript_alias_1 ENST00000422740 ; transcript_alias_2 TCONS_00003298 ; transcript_alias_3 ENST00000422740.1 ; transcript_alias_4 AC016747.3-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000325687.2 ; transcript_alias_6 NONHSAT070931 ;
chr2	lncipedia.org	exon	61371908	61372026	.	-	.	gene_id lnc-USP34-1 ; transcript_id lnc-USP34-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000212978 ; gene_alias_2 XLOC_002111 ; gene_alias_3 linc-PUS10 ; gene_alias_4 AC016747.3 ; gene_alias_5 ENSG00000212978.4 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000152156.3 ; gene_alias_7 ENSG00000212978.5 ; transcript_alias_1 ENST00000422740 ; transcript_alias_2 TCONS_00003298 ; transcript_alias_3 ENST00000422740.1 ; transcript_alias_4 AC016747.3-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000325687.2 ; transcript_alias_6 NONHSAT070931 ;
chr12	lncipedia.org	exon	111374411	111374502	.	+	.	gene_id lnc-CCDC63-2 ; transcript_id lnc-CCDC63-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000185847 ; gene_alias_2 RP1-46F2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000185847.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169536.1 ; transcript_alias_1 ENST00000547607 ; transcript_alias_2 ENST00000547607.1 ; transcript_alias_3 RP1-46F2.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404686.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030713 ;
chr12	lncipedia.org	exon	111376094	111376316	.	+	.	gene_id lnc-CCDC63-2 ; transcript_id lnc-CCDC63-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000185847 ; gene_alias_2 RP1-46F2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000185847.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169536.1 ; transcript_alias_1 ENST00000547607 ; transcript_alias_2 ENST00000547607.1 ; transcript_alias_3 RP1-46F2.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404686.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030713 ;
chr12	lncipedia.org	exon	111394278	111394636	.	+	.	gene_id lnc-CCDC63-2 ; transcript_id lnc-CCDC63-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000185847 ; gene_alias_2 RP1-46F2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000185847.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169536.1 ; transcript_alias_1 ENST00000547607 ; transcript_alias_2 ENST00000547607.1 ; transcript_alias_3 RP1-46F2.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404686.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030713 ;
chr2	lncipedia.org	exon	178107103	178109023	.	+	.	gene_id lnc-HNRNPA3-1 ; transcript_id lnc-HNRNPA3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245460 ; transcript_alias_1 ENST00000469031 ;
chr2	lncipedia.org	exon	178110372	178111509	.	+	.	gene_id lnc-HNRNPA3-1 ; transcript_id lnc-HNRNPA3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245460 ; transcript_alias_1 ENST00000469031 ;
chr7	lncipedia.org	exon	22602956	22603049	.	+	.	gene_id lnc-IL6-3 ; transcript_id lnc-IL6-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000232759 ; gene_alias_2 AC002480.3 ; gene_alias_3 ENSG00000232759.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152530.1 ; transcript_alias_1 ENST00000435127 ; transcript_alias_2 ENST00000435127.1 ; transcript_alias_3 AC002480.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000326621.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	22604585	22604771	.	+	.	gene_id lnc-IL6-3 ; transcript_id lnc-IL6-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000232759 ; gene_alias_2 AC002480.3 ; gene_alias_3 ENSG00000232759.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152530.1 ; transcript_alias_1 ENST00000435127 ; transcript_alias_2 ENST00000435127.1 ; transcript_alias_3 AC002480.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000326621.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	22611394	22611632	.	+	.	gene_id lnc-IL6-3 ; transcript_id lnc-IL6-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000232759 ; gene_alias_2 AC002480.3 ; gene_alias_3 ENSG00000232759.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152530.1 ; transcript_alias_1 ENST00000435127 ; transcript_alias_2 ENST00000435127.1 ; transcript_alias_3 AC002480.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000326621.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	22611704	22613615	.	+	.	gene_id lnc-IL6-3 ; transcript_id lnc-IL6-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000232759 ; gene_alias_2 AC002480.3 ; gene_alias_3 ENSG00000232759.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152530.1 ; transcript_alias_1 ENST00000435127 ; transcript_alias_2 ENST00000435127.1 ; transcript_alias_3 AC002480.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000326621.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	43339558	43339710	.	+	.	gene_id lnc-FMNL1-1 ; transcript_id lnc-FMNL1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000229966 ; transcript_alias_1 ENST00000500316 ; transcript_alias_2 NONHSAT054077 ;
chr17	lncipedia.org	exon	43343617	43343885	.	+	.	gene_id lnc-FMNL1-1 ; transcript_id lnc-FMNL1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000229966 ; transcript_alias_1 ENST00000500316 ; transcript_alias_2 NONHSAT054077 ;
chr17	lncipedia.org	exon	43344480	43344695	.	+	.	gene_id lnc-FMNL1-1 ; transcript_id lnc-FMNL1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000229966 ; transcript_alias_1 ENST00000500316 ; transcript_alias_2 NONHSAT054077 ;
chr17	lncipedia.org	exon	43345376	43345997	.	+	.	gene_id lnc-FMNL1-1 ; transcript_id lnc-FMNL1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000229966 ; transcript_alias_1 ENST00000500316 ; transcript_alias_2 NONHSAT054077 ;
chr19	lncipedia.org	exon	14853928	14854670	.	+	.	gene_id lnc-ZNF333-1 ; transcript_id lnc-ZNF333-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233422 ; transcript_alias_1 ENST00000430444 ;
chr19	lncipedia.org	exon	14856004	14857205	.	+	.	gene_id lnc-ZNF333-1 ; transcript_id lnc-ZNF333-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233422 ; transcript_alias_1 ENST00000430444 ;
chr19	lncipedia.org	exon	14858599	14859558	.	+	.	gene_id lnc-ZNF333-1 ; transcript_id lnc-ZNF333-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233422 ; transcript_alias_1 ENST00000430444 ;
chr8	lncipedia.org	exon	22446386	22446601	.	-	.	gene_id lnc-RP11-582J16.5.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-582J16.5.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251263 ; transcript_alias_1 ENST00000502542 ;
chr8	lncipedia.org	exon	22446664	22451090	.	-	.	gene_id lnc-RP11-582J16.5.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-582J16.5.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251263 ; transcript_alias_1 ENST00000502542 ;
chr3	lncipedia.org	exon	62249550	62249817	.	-	.	gene_id lnc-FEZF2-1 ; transcript_id lnc-FEZF2-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000241472 ; gene_alias_2 RP11-204J18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241472.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158657.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241472.2 ; gene_alias_6 PTPRG-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000475371 ; transcript_alias_2 ENST00000475371.1 ; transcript_alias_3 RP11-204J18.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351665.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090180 ;
chr3	lncipedia.org	exon	62278289	62278392	.	-	.	gene_id lnc-FEZF2-1 ; transcript_id lnc-FEZF2-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000241472 ; gene_alias_2 RP11-204J18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241472.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158657.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241472.2 ; gene_alias_6 PTPRG-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000475371 ; transcript_alias_2 ENST00000475371.1 ; transcript_alias_3 RP11-204J18.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351665.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090180 ;
chr3	lncipedia.org	exon	62280375	62280453	.	-	.	gene_id lnc-FEZF2-1 ; transcript_id lnc-FEZF2-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000241472 ; gene_alias_2 RP11-204J18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241472.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158657.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241472.2 ; gene_alias_6 PTPRG-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000475371 ; transcript_alias_2 ENST00000475371.1 ; transcript_alias_3 RP11-204J18.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351665.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090180 ;
chr3	lncipedia.org	exon	62302781	62302867	.	-	.	gene_id lnc-FEZF2-1 ; transcript_id lnc-FEZF2-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000241472 ; gene_alias_2 RP11-204J18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241472.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158657.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241472.2 ; gene_alias_6 PTPRG-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000475371 ; transcript_alias_2 ENST00000475371.1 ; transcript_alias_3 RP11-204J18.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351665.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090180 ;
chr3	lncipedia.org	exon	62303483	62303575	.	-	.	gene_id lnc-FEZF2-1 ; transcript_id lnc-FEZF2-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000241472 ; gene_alias_2 RP11-204J18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241472.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158657.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241472.2 ; gene_alias_6 PTPRG-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000475371 ; transcript_alias_2 ENST00000475371.1 ; transcript_alias_3 RP11-204J18.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351665.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090180 ;
chr3	lncipedia.org	exon	62304466	62304567	.	-	.	gene_id lnc-FEZF2-1 ; transcript_id lnc-FEZF2-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000241472 ; gene_alias_2 RP11-204J18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241472.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158657.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241472.2 ; gene_alias_6 PTPRG-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000475371 ; transcript_alias_2 ENST00000475371.1 ; transcript_alias_3 RP11-204J18.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351665.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090180 ;
chr8	lncipedia.org	exon	104258006	104258912	.	-	.	gene_id lnc-C8orf56-1 ; transcript_id lnc-C8orf56-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000247081 ; gene_alias_2 RP11-318M2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247081.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164798.3 ; gene_alias_5 ENSG00000247081.3 ; transcript_alias_1 ENST00000519801 ; transcript_alias_2 ENST00000519801.1 ; transcript_alias_3 RP11-318M2.2-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000380351.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128170 ;
chr8	lncipedia.org	exon	104298066	104298135	.	-	.	gene_id lnc-C8orf56-1 ; transcript_id lnc-C8orf56-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000247081 ; gene_alias_2 RP11-318M2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247081.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164798.3 ; gene_alias_5 ENSG00000247081.3 ; transcript_alias_1 ENST00000519801 ; transcript_alias_2 ENST00000519801.1 ; transcript_alias_3 RP11-318M2.2-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000380351.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128170 ;
chr2	lncipedia.org	exon	20068652	20068713	.	+	.	gene_id lnc-RHOB-4 ; transcript_id lnc-RHOB-4:6 ; gene_alias_1 ENSG00000228784 ; gene_alias_2 AC013400.2 ; gene_alias_3 ENSG00000228784.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151773.1 ; gene_alias_5 ENSG00000228784.3 ; gene_alias_6 LINC00954 ; transcript_alias_1 ENST00000433669 ; transcript_alias_2 ENST00000433669.1 ; transcript_alias_3 AC013400.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323863.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT069411 ;
chr2	lncipedia.org	exon	20069257	20069374	.	+	.	gene_id lnc-RHOB-4 ; transcript_id lnc-RHOB-4:6 ; gene_alias_1 ENSG00000228784 ; gene_alias_2 AC013400.2 ; gene_alias_3 ENSG00000228784.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151773.1 ; gene_alias_5 ENSG00000228784.3 ; gene_alias_6 LINC00954 ; transcript_alias_1 ENST00000433669 ; transcript_alias_2 ENST00000433669.1 ; transcript_alias_3 AC013400.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323863.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT069411 ;
chr2	lncipedia.org	exon	20070186	20070307	.	+	.	gene_id lnc-RHOB-4 ; transcript_id lnc-RHOB-4:6 ; gene_alias_1 ENSG00000228784 ; gene_alias_2 AC013400.2 ; gene_alias_3 ENSG00000228784.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151773.1 ; gene_alias_5 ENSG00000228784.3 ; gene_alias_6 LINC00954 ; transcript_alias_1 ENST00000433669 ; transcript_alias_2 ENST00000433669.1 ; transcript_alias_3 AC013400.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323863.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT069411 ;
chr2	lncipedia.org	exon	20072154	20072357	.	+	.	gene_id lnc-RHOB-4 ; transcript_id lnc-RHOB-4:6 ; gene_alias_1 ENSG00000228784 ; gene_alias_2 AC013400.2 ; gene_alias_3 ENSG00000228784.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151773.1 ; gene_alias_5 ENSG00000228784.3 ; gene_alias_6 LINC00954 ; transcript_alias_1 ENST00000433669 ; transcript_alias_2 ENST00000433669.1 ; transcript_alias_3 AC013400.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323863.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT069411 ;
chr2	lncipedia.org	exon	20072893	20073125	.	+	.	gene_id lnc-RHOB-4 ; transcript_id lnc-RHOB-4:6 ; gene_alias_1 ENSG00000228784 ; gene_alias_2 AC013400.2 ; gene_alias_3 ENSG00000228784.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151773.1 ; gene_alias_5 ENSG00000228784.3 ; gene_alias_6 LINC00954 ; transcript_alias_1 ENST00000433669 ; transcript_alias_2 ENST00000433669.1 ; transcript_alias_3 AC013400.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323863.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT069411 ;
chr2	lncipedia.org	exon	20075564	20077296	.	+	.	gene_id lnc-RHOB-4 ; transcript_id lnc-RHOB-4:6 ; gene_alias_1 ENSG00000228784 ; gene_alias_2 AC013400.2 ; gene_alias_3 ENSG00000228784.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151773.1 ; gene_alias_5 ENSG00000228784.3 ; gene_alias_6 LINC00954 ; transcript_alias_1 ENST00000433669 ; transcript_alias_2 ENST00000433669.1 ; transcript_alias_3 AC013400.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323863.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT069411 ;
chr12	lncipedia.org	exon	65952211	65952594	.	-	.	gene_id lnc-RP11-366L20.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-366L20.2.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250748 ; gene_alias_2 RP11-230G5.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250748.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168872.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544557 ; transcript_alias_2 ENST00000544557.1 ; transcript_alias_3 RP11-230G5.2-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401448.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029194 ;
chr12	lncipedia.org	exon	65955644	65955721	.	-	.	gene_id lnc-RP11-366L20.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-366L20.2.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250748 ; gene_alias_2 RP11-230G5.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250748.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168872.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544557 ; transcript_alias_2 ENST00000544557.1 ; transcript_alias_3 RP11-230G5.2-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401448.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029194 ;
chr12	lncipedia.org	exon	65963771	65963828	.	-	.	gene_id lnc-RP11-366L20.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-366L20.2.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250748 ; gene_alias_2 RP11-230G5.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250748.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168872.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544557 ; transcript_alias_2 ENST00000544557.1 ; transcript_alias_3 RP11-230G5.2-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401448.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029194 ;
chr12	lncipedia.org	exon	66035819	66036152	.	-	.	gene_id lnc-RP11-366L20.2.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-366L20.2.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250748 ; gene_alias_2 RP11-230G5.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250748.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168872.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544557 ; transcript_alias_2 ENST00000544557.1 ; transcript_alias_3 RP11-230G5.2-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401448.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029194 ;
chr12	lncipedia.org	exon	108853202	108853361	.	-	.	gene_id lnc-SART3-1 ; transcript_id lnc-SART3-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000247213 ; gene_alias_2 RP11-13G14.4 ; gene_alias_3 ENSG00000247213.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169577.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551889 ; transcript_alias_2 ENST00000551889.1 ; transcript_alias_3 RP11-13G14.4-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404873.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030550 ; transcript_alias_6 NR_120483 ;
chr12	lncipedia.org	exon	108855407	108855471	.	-	.	gene_id lnc-SART3-1 ; transcript_id lnc-SART3-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000247213 ; gene_alias_2 RP11-13G14.4 ; gene_alias_3 ENSG00000247213.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169577.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551889 ; transcript_alias_2 ENST00000551889.1 ; transcript_alias_3 RP11-13G14.4-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404873.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030550 ; transcript_alias_6 NR_120483 ;
chr12	lncipedia.org	exon	108866779	108866963	.	-	.	gene_id lnc-SART3-1 ; transcript_id lnc-SART3-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000247213 ; gene_alias_2 RP11-13G14.4 ; gene_alias_3 ENSG00000247213.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169577.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551889 ; transcript_alias_2 ENST00000551889.1 ; transcript_alias_3 RP11-13G14.4-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404873.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030550 ; transcript_alias_6 NR_120483 ;
chr12	lncipedia.org	exon	108867328	108867466	.	-	.	gene_id lnc-SART3-1 ; transcript_id lnc-SART3-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000247213 ; gene_alias_2 RP11-13G14.4 ; gene_alias_3 ENSG00000247213.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169577.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551889 ; transcript_alias_2 ENST00000551889.1 ; transcript_alias_3 RP11-13G14.4-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404873.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030550 ; transcript_alias_6 NR_120483 ;
chr2	lncipedia.org	exon	10589854	10589997	.	+	.	gene_id lnc-HPCAL1-1 ; transcript_id lnc-HPCAL1-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000257135 ; gene_alias_2 RP11-320M2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257135.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170230.1 ; transcript_alias_1 ENST00000547349 ; transcript_alias_2 ENST00000547349.1 ; transcript_alias_3 RP11-320M2.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408122.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT069113 ;
chr2	lncipedia.org	exon	10590179	10590407	.	+	.	gene_id lnc-HPCAL1-1 ; transcript_id lnc-HPCAL1-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000257135 ; gene_alias_2 RP11-320M2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257135.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170230.1 ; transcript_alias_1 ENST00000547349 ; transcript_alias_2 ENST00000547349.1 ; transcript_alias_3 RP11-320M2.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408122.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT069113 ;
chr2	lncipedia.org	exon	10590562	10590920	.	+	.	gene_id lnc-HPCAL1-1 ; transcript_id lnc-HPCAL1-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000257135 ; gene_alias_2 RP11-320M2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257135.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170230.1 ; transcript_alias_1 ENST00000547349 ; transcript_alias_2 ENST00000547349.1 ; transcript_alias_3 RP11-320M2.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408122.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT069113 ;
chr11	lncipedia.org	exon	61355966	61356087	.	+	.	gene_id lnc-DAGLA-1 ; transcript_id lnc-DAGLA-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250230 ; transcript_alias_1 ENST00000506329 ;
chr11	lncipedia.org	exon	61364365	61364451	.	+	.	gene_id lnc-DAGLA-1 ; transcript_id lnc-DAGLA-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250230 ; transcript_alias_1 ENST00000506329 ;
chr11	lncipedia.org	exon	61369985	61370073	.	+	.	gene_id lnc-DAGLA-1 ; transcript_id lnc-DAGLA-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250230 ; transcript_alias_1 ENST00000506329 ;
chr11	lncipedia.org	exon	61369990	61370073	.	+	.	gene_id lnc-DAGLA-1 ; transcript_id lnc-DAGLA-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250230 ; transcript_alias_1 ENST00000506329 ;
chr11	lncipedia.org	exon	61372967	61375022	.	+	.	gene_id lnc-DAGLA-1 ; transcript_id lnc-DAGLA-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250230 ; transcript_alias_1 ENST00000506329 ;
chr16	lncipedia.org	exon	28897204	28897238	.	+	.	gene_id lnc-ATP2A1-1 ; transcript_id lnc-ATP2A1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245192 ; gene_alias_2 AC109460.2 ; transcript_alias_1 ENST00000499485 ; transcript_alias_2 NONHSAT141542 ;
chr16	lncipedia.org	exon	28932005	28933080	.	+	.	gene_id lnc-ATP2A1-1 ; transcript_id lnc-ATP2A1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245192 ; gene_alias_2 AC109460.2 ; transcript_alias_1 ENST00000499485 ; transcript_alias_2 NONHSAT141542 ;
chr16	lncipedia.org	exon	28936392	28936455	.	+	.	gene_id lnc-ATP2A1-1 ; transcript_id lnc-ATP2A1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245192 ; gene_alias_2 AC109460.2 ; transcript_alias_1 ENST00000499485 ; transcript_alias_2 NONHSAT141542 ;
chr6	lncipedia.org	exon	72126087	72126262	.	-	.	gene_id lnc-B3GAT2-3 ; transcript_id lnc-B3GAT2-3:6 ; gene_alias_1 ENSG00000233237 ; gene_alias_2 XLOC_005764 ; gene_alias_3 linc-B3GAT2-4 ; gene_alias_4 C6orf155 ; gene_alias_5 ENSG00000233237.1 ; gene_alias_6 LINC00472 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000015006.2 ; gene_alias_8 ENSG00000233237.2 ; transcript_alias_1 ENST00000421704 ; transcript_alias_2 TCONS_00011518 ; transcript_alias_3 ENST00000421704.1 ; transcript_alias_4 LINC00472-005 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000041165.2 ; transcript_alias_6 NONHSAT113510 ;
chr6	lncipedia.org	exon	72127023	72127095	.	-	.	gene_id lnc-B3GAT2-3 ; transcript_id lnc-B3GAT2-3:6 ; gene_alias_1 ENSG00000233237 ; gene_alias_2 XLOC_005764 ; gene_alias_3 linc-B3GAT2-4 ; gene_alias_4 C6orf155 ; gene_alias_5 ENSG00000233237.1 ; gene_alias_6 LINC00472 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000015006.2 ; gene_alias_8 ENSG00000233237.2 ; transcript_alias_1 ENST00000421704 ; transcript_alias_2 TCONS_00011518 ; transcript_alias_3 ENST00000421704.1 ; transcript_alias_4 LINC00472-005 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000041165.2 ; transcript_alias_6 NONHSAT113510 ;
chr6	lncipedia.org	exon	72129769	72129970	.	-	.	gene_id lnc-B3GAT2-3 ; transcript_id lnc-B3GAT2-3:6 ; gene_alias_1 ENSG00000233237 ; gene_alias_2 XLOC_005764 ; gene_alias_3 linc-B3GAT2-4 ; gene_alias_4 C6orf155 ; gene_alias_5 ENSG00000233237.1 ; gene_alias_6 LINC00472 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000015006.2 ; gene_alias_8 ENSG00000233237.2 ; transcript_alias_1 ENST00000421704 ; transcript_alias_2 TCONS_00011518 ; transcript_alias_3 ENST00000421704.1 ; transcript_alias_4 LINC00472-005 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000041165.2 ; transcript_alias_6 NONHSAT113510 ;
chr5	lncipedia.org	exon	169758435	169758581	.	+	.	gene_id lnc-KCNIP1-1 ; transcript_id lnc-KCNIP1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000235172 ; gene_alias_2 CTB-114C7.3 ; gene_alias_3 ENSG00000235172.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163120.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436248 ; transcript_alias_2 ENST00000436248.3 ; transcript_alias_3 CTB-114C7.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371724.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	169759852	169759941	.	+	.	gene_id lnc-KCNIP1-1 ; transcript_id lnc-KCNIP1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000235172 ; gene_alias_2 CTB-114C7.3 ; gene_alias_3 ENSG00000235172.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163120.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436248 ; transcript_alias_2 ENST00000436248.3 ; transcript_alias_3 CTB-114C7.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371724.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	169760138	169760883	.	+	.	gene_id lnc-KCNIP1-1 ; transcript_id lnc-KCNIP1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000235172 ; gene_alias_2 CTB-114C7.3 ; gene_alias_3 ENSG00000235172.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163120.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436248 ; transcript_alias_2 ENST00000436248.3 ; transcript_alias_3 CTB-114C7.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000371724.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	133677473	133678029	.	-	.	gene_id lnc-PLAC1-1 ; transcript_id lnc-PLAC1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000223749 ; gene_alias_2 AC004383.4 ; gene_alias_3 ENSG00000223749.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022455.1 ; gene_alias_5 ENSG00000223749.3 ; gene_alias_6 MIR503HG ; transcript_alias_1 ENST00000414769 ; transcript_alias_2 ENST00000414769.1 ; transcript_alias_3 AC004383.4-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058372.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	133678744	133678827	.	-	.	gene_id lnc-PLAC1-1 ; transcript_id lnc-PLAC1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000223749 ; gene_alias_2 AC004383.4 ; gene_alias_3 ENSG00000223749.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022455.1 ; gene_alias_5 ENSG00000223749.3 ; gene_alias_6 MIR503HG ; transcript_alias_1 ENST00000414769 ; transcript_alias_2 ENST00000414769.1 ; transcript_alias_3 AC004383.4-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058372.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	133680582	133680660	.	-	.	gene_id lnc-PLAC1-1 ; transcript_id lnc-PLAC1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000223749 ; gene_alias_2 AC004383.4 ; gene_alias_3 ENSG00000223749.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022455.1 ; gene_alias_5 ENSG00000223749.3 ; gene_alias_6 MIR503HG ; transcript_alias_1 ENST00000414769 ; transcript_alias_2 ENST00000414769.1 ; transcript_alias_3 AC004383.4-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058372.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	89065398	89065713	.	+	.	gene_id lnc-RPIA-1 ; transcript_id lnc-RPIA-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000230006 ; gene_alias_2 ANKRD36BP2 ; transcript_alias_1 ENST00000427055 ; transcript_alias_2 NONHSAT072208 ;
chr2	lncipedia.org	exon	89076018	89076092	.	+	.	gene_id lnc-RPIA-1 ; transcript_id lnc-RPIA-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000230006 ; gene_alias_2 ANKRD36BP2 ; transcript_alias_1 ENST00000427055 ; transcript_alias_2 NONHSAT072208 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27113215	27113422	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:41 ; gene_alias_1 ENSG00000244625 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 CTA-211A9.5 ; gene_alias_5 ENSG00000244625.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150981.2 ; transcript_alias_1 ENST00000446336 ; transcript_alias_2 TCONS_00029394 ; transcript_alias_3 ENST00000446336.1 ; transcript_alias_4 CTA-211A9.5-004 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320771.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084546 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27122607	27122757	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:41 ; gene_alias_1 ENSG00000244625 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 CTA-211A9.5 ; gene_alias_5 ENSG00000244625.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150981.2 ; transcript_alias_1 ENST00000446336 ; transcript_alias_2 TCONS_00029394 ; transcript_alias_3 ENST00000446336.1 ; transcript_alias_4 CTA-211A9.5-004 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320771.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084546 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27138702	27138801	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:41 ; gene_alias_1 ENSG00000244625 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 CTA-211A9.5 ; gene_alias_5 ENSG00000244625.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150981.2 ; transcript_alias_1 ENST00000446336 ; transcript_alias_2 TCONS_00029394 ; transcript_alias_3 ENST00000446336.1 ; transcript_alias_4 CTA-211A9.5-004 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320771.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084546 ;
chr12	lncipedia.org	exon	91311800	91311827	.	+	.	gene_id lnc-CLLU1.1-7 ; transcript_id lnc-CLLU1.1-7:1 ; gene_alias_1 ENSG00000196243 ; gene_alias_2 RP11-916O13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000196243.4 ; gene_alias_4 LINC00615 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000170071.2 ; gene_alias_6 ENSG00000196243.5 ; transcript_alias_1 ENST00000546725 ; transcript_alias_2 ENST00000546725.1 ; transcript_alias_3 LINC00615-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407145.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT029852 ; transcript_alias_6 NR_038868 ;
chr12	lncipedia.org	exon	91332448	91332530	.	+	.	gene_id lnc-CLLU1.1-7 ; transcript_id lnc-CLLU1.1-7:1 ; gene_alias_1 ENSG00000196243 ; gene_alias_2 RP11-916O13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000196243.4 ; gene_alias_4 LINC00615 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000170071.2 ; gene_alias_6 ENSG00000196243.5 ; transcript_alias_1 ENST00000546725 ; transcript_alias_2 ENST00000546725.1 ; transcript_alias_3 LINC00615-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407145.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT029852 ; transcript_alias_6 NR_038868 ;
chr12	lncipedia.org	exon	91333926	91334137	.	+	.	gene_id lnc-CLLU1.1-7 ; transcript_id lnc-CLLU1.1-7:1 ; gene_alias_1 ENSG00000196243 ; gene_alias_2 RP11-916O13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000196243.4 ; gene_alias_4 LINC00615 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000170071.2 ; gene_alias_6 ENSG00000196243.5 ; transcript_alias_1 ENST00000546725 ; transcript_alias_2 ENST00000546725.1 ; transcript_alias_3 LINC00615-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407145.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT029852 ; transcript_alias_6 NR_038868 ;
chr12	lncipedia.org	exon	91340201	91340268	.	+	.	gene_id lnc-CLLU1.1-7 ; transcript_id lnc-CLLU1.1-7:1 ; gene_alias_1 ENSG00000196243 ; gene_alias_2 RP11-916O13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000196243.4 ; gene_alias_4 LINC00615 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000170071.2 ; gene_alias_6 ENSG00000196243.5 ; transcript_alias_1 ENST00000546725 ; transcript_alias_2 ENST00000546725.1 ; transcript_alias_3 LINC00615-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407145.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT029852 ; transcript_alias_6 NR_038868 ;
chr12	lncipedia.org	exon	91341432	91342446	.	+	.	gene_id lnc-CLLU1.1-7 ; transcript_id lnc-CLLU1.1-7:1 ; gene_alias_1 ENSG00000196243 ; gene_alias_2 RP11-916O13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000196243.4 ; gene_alias_4 LINC00615 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000170071.2 ; gene_alias_6 ENSG00000196243.5 ; transcript_alias_1 ENST00000546725 ; transcript_alias_2 ENST00000546725.1 ; transcript_alias_3 LINC00615-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407145.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT029852 ; transcript_alias_6 NR_038868 ;
chrX	lncipedia.org	exon	100258821	100260684	.	+	.	gene_id lnc-ARL13A-1 ; transcript_id lnc-ARL13A-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250499 ; gene_alias_2 XLOC_008024 ; gene_alias_3 linc-TMEM35 ; transcript_alias_1 ENST00000514614 ; transcript_alias_2 TCONS_00017001 ; transcript_alias_3 NONHSAT137909 ;
chrX	lncipedia.org	exon	100261611	100262956	.	+	.	gene_id lnc-ARL13A-1 ; transcript_id lnc-ARL13A-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250499 ; gene_alias_2 XLOC_008024 ; gene_alias_3 linc-TMEM35 ; transcript_alias_1 ENST00000514614 ; transcript_alias_2 TCONS_00017001 ; transcript_alias_3 NONHSAT137909 ;
chr4	lncipedia.org	exon	17484658	17485393	.	+	.	gene_id lnc-CLRN2-1 ; transcript_id lnc-CLRN2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251507 ; gene_alias_2 XLOC_003471 ; gene_alias_3 linc-CLRN2-1 ; transcript_alias_1 ENST00000515087 ; transcript_alias_2 TCONS_00007487 ; transcript_alias_3 NONHSAT095705 ;
chr4	lncipedia.org	exon	17486010	17487209	.	+	.	gene_id lnc-CLRN2-1 ; transcript_id lnc-CLRN2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251507 ; gene_alias_2 XLOC_003471 ; gene_alias_3 linc-CLRN2-1 ; transcript_alias_1 ENST00000515087 ; transcript_alias_2 TCONS_00007487 ; transcript_alias_3 NONHSAT095705 ;
chr4	lncipedia.org	exon	189321890	189321987	.	+	.	gene_id lnc-TRIML1-3 ; transcript_id lnc-TRIML1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249378 ; gene_alias_2 XLOC_003834 ; gene_alias_3 linc-FRG1-10 ; gene_alias_4 RP11-219G10.3 ; gene_alias_5 ENSG00000249378.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000160242.4 ; gene_alias_7 LINC01060 ; transcript_alias_1 ENST00000513313 ; transcript_alias_2 TCONS_00007699 ; transcript_alias_3 ENST00000513313.1 ; transcript_alias_4 RP11-219G10.3-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000359898.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT099741 ;
chr4	lncipedia.org	exon	189357858	189358054	.	+	.	gene_id lnc-TRIML1-3 ; transcript_id lnc-TRIML1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249378 ; gene_alias_2 XLOC_003834 ; gene_alias_3 linc-FRG1-10 ; gene_alias_4 RP11-219G10.3 ; gene_alias_5 ENSG00000249378.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000160242.4 ; gene_alias_7 LINC01060 ; transcript_alias_1 ENST00000513313 ; transcript_alias_2 TCONS_00007699 ; transcript_alias_3 ENST00000513313.1 ; transcript_alias_4 RP11-219G10.3-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000359898.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT099741 ;
chr4	lncipedia.org	exon	189406933	189407019	.	+	.	gene_id lnc-TRIML1-3 ; transcript_id lnc-TRIML1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249378 ; gene_alias_2 XLOC_003834 ; gene_alias_3 linc-FRG1-10 ; gene_alias_4 RP11-219G10.3 ; gene_alias_5 ENSG00000249378.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000160242.4 ; gene_alias_7 LINC01060 ; transcript_alias_1 ENST00000513313 ; transcript_alias_2 TCONS_00007699 ; transcript_alias_3 ENST00000513313.1 ; transcript_alias_4 RP11-219G10.3-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000359898.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT099741 ;
chr7	lncipedia.org	exon	38381216	38381400	.	+	.	gene_id lnc-STARD3NL-1 ; transcript_id lnc-STARD3NL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250924 ; gene_alias_2 AC007245.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515771 ;
chr7	lncipedia.org	exon	38385622	38385728	.	+	.	gene_id lnc-STARD3NL-1 ; transcript_id lnc-STARD3NL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250924 ; gene_alias_2 AC007245.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515771 ;
chr7	lncipedia.org	exon	38389947	38390051	.	+	.	gene_id lnc-STARD3NL-1 ; transcript_id lnc-STARD3NL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250924 ; gene_alias_2 AC007245.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515771 ;
chr7	lncipedia.org	exon	38415158	38418238	.	+	.	gene_id lnc-STARD3NL-1 ; transcript_id lnc-STARD3NL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250924 ; gene_alias_2 AC007245.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515771 ;
chr8	lncipedia.org	exon	120884718	120884763	.	-	.	gene_id lnc-DSCC1-1 ; transcript_id lnc-DSCC1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000253531 ; gene_alias_2 KB-1471A8.2 ; gene_alias_3 ENSG00000253531.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165013.1 ; gene_alias_5 ENSG00000245330.4 ; gene_alias_6 KB-1471A8.1 ; transcript_alias_1 ENST00000523563 ; transcript_alias_2 ENST00000523563.1 ; transcript_alias_3 KB-1471A8.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381450.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128444 ;
chr8	lncipedia.org	exon	120885376	120885551	.	-	.	gene_id lnc-DSCC1-1 ; transcript_id lnc-DSCC1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000253531 ; gene_alias_2 KB-1471A8.2 ; gene_alias_3 ENSG00000253531.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165013.1 ; gene_alias_5 ENSG00000245330.4 ; gene_alias_6 KB-1471A8.1 ; transcript_alias_1 ENST00000523563 ; transcript_alias_2 ENST00000523563.1 ; transcript_alias_3 KB-1471A8.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381450.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128444 ;
chr8	lncipedia.org	exon	120886527	120886723	.	-	.	gene_id lnc-DSCC1-1 ; transcript_id lnc-DSCC1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000253531 ; gene_alias_2 KB-1471A8.2 ; gene_alias_3 ENSG00000253531.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165013.1 ; gene_alias_5 ENSG00000245330.4 ; gene_alias_6 KB-1471A8.1 ; transcript_alias_1 ENST00000523563 ; transcript_alias_2 ENST00000523563.1 ; transcript_alias_3 KB-1471A8.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381450.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128444 ;
chr5	lncipedia.org	exon	75987264	75987538	.	-	.	gene_id lnc-F2RL2-2 ; transcript_id lnc-F2RL2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225407 ; gene_alias_2 CTD-2384B11.2 ; gene_alias_3 ENSG00000225407.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162429.1 ; transcript_alias_1 ENST00000507514 ; transcript_alias_2 ENST00000507514.1 ; transcript_alias_3 CTD-2384B11.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000368873.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102244 ;
chr5	lncipedia.org	exon	75989655	75989799	.	-	.	gene_id lnc-F2RL2-2 ; transcript_id lnc-F2RL2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225407 ; gene_alias_2 CTD-2384B11.2 ; gene_alias_3 ENSG00000225407.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162429.1 ; transcript_alias_1 ENST00000507514 ; transcript_alias_2 ENST00000507514.1 ; transcript_alias_3 CTD-2384B11.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000368873.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102244 ;
chr5	lncipedia.org	exon	75995181	75995321	.	-	.	gene_id lnc-F2RL2-2 ; transcript_id lnc-F2RL2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225407 ; gene_alias_2 CTD-2384B11.2 ; gene_alias_3 ENSG00000225407.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162429.1 ; transcript_alias_1 ENST00000507514 ; transcript_alias_2 ENST00000507514.1 ; transcript_alias_3 CTD-2384B11.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000368873.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102244 ;
chr5	lncipedia.org	exon	76012002	76012040	.	-	.	gene_id lnc-F2RL2-2 ; transcript_id lnc-F2RL2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225407 ; gene_alias_2 CTD-2384B11.2 ; gene_alias_3 ENSG00000225407.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162429.1 ; transcript_alias_1 ENST00000507514 ; transcript_alias_2 ENST00000507514.1 ; transcript_alias_3 CTD-2384B11.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000368873.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102244 ;
chr11	lncipedia.org	exon	10906432	10906671	.	-	.	gene_id lnc-ZBED5-1 ; transcript_id lnc-ZBED5-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250041 ; gene_alias_2 CTD-2003C8.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250041.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165889.1 ; transcript_alias_1 ENST00000503469 ; transcript_alias_2 ENST00000503469.2 ; transcript_alias_3 CTD-2003C8.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000386901.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	10920679	10920869	.	-	.	gene_id lnc-ZBED5-1 ; transcript_id lnc-ZBED5-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250041 ; gene_alias_2 CTD-2003C8.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250041.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165889.1 ; transcript_alias_1 ENST00000503469 ; transcript_alias_2 ENST00000503469.2 ; transcript_alias_3 CTD-2003C8.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000386901.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	80172103	80173498	.	-	.	gene_id lnc-CCDC57-1 ; transcript_id lnc-CCDC57-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248630 ; gene_alias_2 XLOC_012590 ; gene_alias_3 linc-CCDC57 ; gene_alias_4 AC132872.4 ; transcript_alias_1 ENST00000508570 ; transcript_alias_2 TCONS_00025256 ; transcript_alias_3 NONHSAT056651 ;
chr17	lncipedia.org	exon	80173574	80175228	.	-	.	gene_id lnc-CCDC57-1 ; transcript_id lnc-CCDC57-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248630 ; gene_alias_2 XLOC_012590 ; gene_alias_3 linc-CCDC57 ; gene_alias_4 AC132872.4 ; transcript_alias_1 ENST00000508570 ; transcript_alias_2 TCONS_00025256 ; transcript_alias_3 NONHSAT056651 ;
chr15	lncipedia.org	exon	62929373	62930817	.	-	.	gene_id lnc-RP11-625H11.1.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-625H11.1.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248615 ; transcript_alias_1 ENST00000508975 ;
chr15	lncipedia.org	exon	62932359	62932561	.	-	.	gene_id lnc-RP11-625H11.1.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-625H11.1.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248615 ; transcript_alias_1 ENST00000508975 ;
chr15	lncipedia.org	exon	62936716	62937490	.	-	.	gene_id lnc-RP11-625H11.1.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-625H11.1.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248615 ; transcript_alias_1 ENST00000508975 ;
chr7	lncipedia.org	exon	29554385	29554933	.	-	.	gene_id lnc-CPVL-4 ; transcript_id lnc-CPVL-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000223813 ; gene_alias_2 AC007255.8 ; gene_alias_3 ENSG00000223813.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152753.1 ; gene_alias_5 ENSG00000223813.2 ; transcript_alias_1 ENST00000447171 ; transcript_alias_2 ENST00000447171.1 ; transcript_alias_3 AC007255.8-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000327681.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	29601475	29601538	.	-	.	gene_id lnc-CPVL-4 ; transcript_id lnc-CPVL-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000223813 ; gene_alias_2 AC007255.8 ; gene_alias_3 ENSG00000223813.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152753.1 ; gene_alias_5 ENSG00000223813.2 ; transcript_alias_1 ENST00000447171 ; transcript_alias_2 ENST00000447171.1 ; transcript_alias_3 AC007255.8-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000327681.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	29603004	29603279	.	-	.	gene_id lnc-CPVL-4 ; transcript_id lnc-CPVL-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000223813 ; gene_alias_2 AC007255.8 ; gene_alias_3 ENSG00000223813.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152753.1 ; gene_alias_5 ENSG00000223813.2 ; transcript_alias_1 ENST00000447171 ; transcript_alias_2 ENST00000447171.1 ; transcript_alias_3 AC007255.8-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000327681.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	1822088	1823256	.	+	.	gene_id lnc-ONECUT3-1 ; transcript_id lnc-ONECUT3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247727 ; gene_alias_2 ENSG00000267244.1 ; gene_alias_3 CTB-31O20.4 ; transcript_alias_1 ENST00000502061 ; transcript_alias_2 NONHSAT060363 ; transcript_alias_3 NR_034114 ; transcript_alias_4 ENST00000593201.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	1823622	1823715	.	+	.	gene_id lnc-ONECUT3-1 ; transcript_id lnc-ONECUT3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247727 ; gene_alias_2 ENSG00000267244.1 ; gene_alias_3 CTB-31O20.4 ; transcript_alias_1 ENST00000502061 ; transcript_alias_2 NONHSAT060363 ; transcript_alias_3 NR_034114 ; transcript_alias_4 ENST00000593201.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	1824108	1824542	.	+	.	gene_id lnc-ONECUT3-1 ; transcript_id lnc-ONECUT3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247727 ; gene_alias_2 ENSG00000267244.1 ; gene_alias_3 CTB-31O20.4 ; transcript_alias_1 ENST00000502061 ; transcript_alias_2 NONHSAT060363 ; transcript_alias_3 NR_034114 ; transcript_alias_4 ENST00000593201.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	89045155	89047198	.	-	.	gene_id lnc-DET1-1 ; transcript_id lnc-DET1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248072 ; transcript_alias_1 ENST00000501841 ;
chr15	lncipedia.org	exon	89052473	89052959	.	-	.	gene_id lnc-DET1-1 ; transcript_id lnc-DET1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248072 ; transcript_alias_1 ENST00000501841 ;
chr15	lncipedia.org	exon	58813510	58813845	.	+	.	gene_id lnc-FAM63B-2 ; transcript_id lnc-FAM63B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249011 ; transcript_alias_1 ENST00000505948 ;
chr15	lncipedia.org	exon	58814150	58815568	.	+	.	gene_id lnc-FAM63B-2 ; transcript_id lnc-FAM63B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249011 ; transcript_alias_1 ENST00000505948 ;
chr2	lncipedia.org	exon	28607276	28610000	.	-	.	gene_id lnc-TRMT61B-5 ; transcript_id lnc-TRMT61B-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229951 ; gene_alias_2 AC104695.3 ; gene_alias_3 ENSG00000229951.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151946.1 ; transcript_alias_1 ENST00000427929 ; transcript_alias_2 ENST00000427929.1 ; transcript_alias_3 AC104695.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000324559.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT069821 ; transcript_alias_6 NR_103831 ;
chr2	lncipedia.org	exon	28617415	28617539	.	-	.	gene_id lnc-TRMT61B-5 ; transcript_id lnc-TRMT61B-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229951 ; gene_alias_2 AC104695.3 ; gene_alias_3 ENSG00000229951.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151946.1 ; transcript_alias_1 ENST00000427929 ; transcript_alias_2 ENST00000427929.1 ; transcript_alias_3 AC104695.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000324559.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT069821 ; transcript_alias_6 NR_103831 ;
chr12	lncipedia.org	exon	63397459	63398430	.	-	.	gene_id lnc-PPM1H-1 ; transcript_id lnc-PPM1H-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250314 ; transcript_alias_1 ENST00000514535 ;
chr12	lncipedia.org	exon	63398590	63400681	.	-	.	gene_id lnc-PPM1H-1 ; transcript_id lnc-PPM1H-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250314 ; transcript_alias_1 ENST00000514535 ;
chr20	lncipedia.org	exon	47785508	47788103	.	+	.	gene_id lnc-DDX27-3 ; transcript_id lnc-DDX27-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247609 ; transcript_alias_1 ENST00000501864 ;
chr20	lncipedia.org	exon	47789764	47790864	.	+	.	gene_id lnc-DDX27-3 ; transcript_id lnc-DDX27-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247609 ; transcript_alias_1 ENST00000501864 ;
chr12	lncipedia.org	exon	24376221	24376257	.	+	.	gene_id lnc-LRMP-5 ; transcript_id lnc-LRMP-5:2 ; gene_alias_1 ENSG00000256120 ; gene_alias_2 RP11-778H2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256120.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169058.1 ; transcript_alias_1 ENST00000539583 ; transcript_alias_2 ENST00000539583.1 ; transcript_alias_3 RP11-778H2.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402103.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027316 ;
chr12	lncipedia.org	exon	24380095	24380321	.	+	.	gene_id lnc-LRMP-5 ; transcript_id lnc-LRMP-5:2 ; gene_alias_1 ENSG00000256120 ; gene_alias_2 RP11-778H2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256120.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169058.1 ; transcript_alias_1 ENST00000539583 ; transcript_alias_2 ENST00000539583.1 ; transcript_alias_3 RP11-778H2.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402103.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027316 ;
chr12	lncipedia.org	exon	24380645	24380752	.	+	.	gene_id lnc-LRMP-5 ; transcript_id lnc-LRMP-5:2 ; gene_alias_1 ENSG00000256120 ; gene_alias_2 RP11-778H2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256120.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169058.1 ; transcript_alias_1 ENST00000539583 ; transcript_alias_2 ENST00000539583.1 ; transcript_alias_3 RP11-778H2.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402103.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027316 ;
chr12	lncipedia.org	exon	24383493	24383549	.	+	.	gene_id lnc-LRMP-5 ; transcript_id lnc-LRMP-5:2 ; gene_alias_1 ENSG00000256120 ; gene_alias_2 RP11-778H2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256120.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169058.1 ; transcript_alias_1 ENST00000539583 ; transcript_alias_2 ENST00000539583.1 ; transcript_alias_3 RP11-778H2.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402103.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027316 ;
chr12	lncipedia.org	exon	24390756	24390899	.	+	.	gene_id lnc-LRMP-5 ; transcript_id lnc-LRMP-5:2 ; gene_alias_1 ENSG00000256120 ; gene_alias_2 RP11-778H2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256120.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169058.1 ; transcript_alias_1 ENST00000539583 ; transcript_alias_2 ENST00000539583.1 ; transcript_alias_3 RP11-778H2.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402103.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027316 ;
chr5	lncipedia.org	exon	148786441	148786641	.	+	.	gene_id lnc-PCYOX1L-2 ; transcript_id lnc-PCYOX1L-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249669 ; gene_alias_2 RP11-394O4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000249669.2 ; gene_alias_4 MIR143HG ; gene_alias_5 OTTHUMG00000163464.3 ; gene_alias_6 ENSG00000249669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000523269 ; transcript_alias_2 ENST00000523269.1 ; transcript_alias_3 MIR143HG-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381676.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT104495 ;
chr5	lncipedia.org	exon	148800044	148800107	.	+	.	gene_id lnc-PCYOX1L-2 ; transcript_id lnc-PCYOX1L-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249669 ; gene_alias_2 RP11-394O4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000249669.2 ; gene_alias_4 MIR143HG ; gene_alias_5 OTTHUMG00000163464.3 ; gene_alias_6 ENSG00000249669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000523269 ; transcript_alias_2 ENST00000523269.1 ; transcript_alias_3 MIR143HG-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381676.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT104495 ;
chr5	lncipedia.org	exon	148801044	148801189	.	+	.	gene_id lnc-PCYOX1L-2 ; transcript_id lnc-PCYOX1L-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249669 ; gene_alias_2 RP11-394O4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000249669.2 ; gene_alias_4 MIR143HG ; gene_alias_5 OTTHUMG00000163464.3 ; gene_alias_6 ENSG00000249669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000523269 ; transcript_alias_2 ENST00000523269.1 ; transcript_alias_3 MIR143HG-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381676.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT104495 ;
chr1	lncipedia.org	exon	231499503	231499958	.	+	.	gene_id lnc-C1orf124-2 ; transcript_id lnc-C1orf124-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245850 ; transcript_alias_1 ENST00000499207 ;
chr1	lncipedia.org	exon	231503542	231504855	.	+	.	gene_id lnc-C1orf124-2 ; transcript_id lnc-C1orf124-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245850 ; transcript_alias_1 ENST00000499207 ;
chr3	lncipedia.org	exon	58277993	58279527	.	-	.	gene_id lnc-DNASE1L3-2 ; transcript_id lnc-DNASE1L3-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248224 ; transcript_alias_1 ENST00000511761 ;
chr3	lncipedia.org	exon	58279914	58280451	.	-	.	gene_id lnc-DNASE1L3-2 ; transcript_id lnc-DNASE1L3-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248224 ; transcript_alias_1 ENST00000511761 ;
chr1	lncipedia.org	exon	209602857	209602965	.	+	.	gene_id lnc-CAMK1G-1 ; transcript_id lnc-CAMK1G-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000230937 ; gene_alias_2 CTA-55I10.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230937.3 ; gene_alias_4 MIR205HG ; gene_alias_5 OTTHUMG00000036267.3 ; gene_alias_6 ENSG00000230937.5 ; transcript_alias_1 ENST00000419143 ; transcript_alias_2 ENST00000419143.1 ; transcript_alias_3 MIR205HG-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000088521.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT009215 ;
chr1	lncipedia.org	exon	209603770	209604631	.	+	.	gene_id lnc-CAMK1G-1 ; transcript_id lnc-CAMK1G-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000230937 ; gene_alias_2 CTA-55I10.1 ; gene_alias_3 ENSG00000230937.3 ; gene_alias_4 MIR205HG ; gene_alias_5 OTTHUMG00000036267.3 ; gene_alias_6 ENSG00000230937.5 ; transcript_alias_1 ENST00000419143 ; transcript_alias_2 ENST00000419143.1 ; transcript_alias_3 MIR205HG-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000088521.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT009215 ;
chr6	lncipedia.org	exon	2246016	2246164	.	+	.	gene_id lnc-WRNIP1-2 ; transcript_id lnc-WRNIP1-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000250903 ; gene_alias_2 RP1-80B9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250903.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014120.3 ; gene_alias_5 ENSG00000250903.4 ; gene_alias_6 GMDS-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000529893 ; transcript_alias_2 ENST00000529893.1 ; transcript_alias_3 RP1-80B9.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000389169.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT106626 ;
chr6	lncipedia.org	exon	2249071	2249160	.	+	.	gene_id lnc-WRNIP1-2 ; transcript_id lnc-WRNIP1-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000250903 ; gene_alias_2 RP1-80B9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250903.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014120.3 ; gene_alias_5 ENSG00000250903.4 ; gene_alias_6 GMDS-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000529893 ; transcript_alias_2 ENST00000529893.1 ; transcript_alias_3 RP1-80B9.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000389169.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT106626 ;
chr6	lncipedia.org	exon	2263835	2263918	.	+	.	gene_id lnc-WRNIP1-2 ; transcript_id lnc-WRNIP1-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000250903 ; gene_alias_2 RP1-80B9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250903.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014120.3 ; gene_alias_5 ENSG00000250903.4 ; gene_alias_6 GMDS-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000529893 ; transcript_alias_2 ENST00000529893.1 ; transcript_alias_3 RP1-80B9.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000389169.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT106626 ;
chr6	lncipedia.org	exon	2397455	2397860	.	+	.	gene_id lnc-WRNIP1-2 ; transcript_id lnc-WRNIP1-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000250903 ; gene_alias_2 RP1-80B9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250903.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014120.3 ; gene_alias_5 ENSG00000250903.4 ; gene_alias_6 GMDS-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000529893 ; transcript_alias_2 ENST00000529893.1 ; transcript_alias_3 RP1-80B9.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000389169.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT106626 ;
chr6	lncipedia.org	exon	2398811	2398981	.	+	.	gene_id lnc-WRNIP1-2 ; transcript_id lnc-WRNIP1-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000250903 ; gene_alias_2 RP1-80B9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250903.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014120.3 ; gene_alias_5 ENSG00000250903.4 ; gene_alias_6 GMDS-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000529893 ; transcript_alias_2 ENST00000529893.1 ; transcript_alias_3 RP1-80B9.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000389169.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT106626 ;
chr3	lncipedia.org	exon	72110084	72110245	.	-	.	gene_id lnc-RYBP-4 ; transcript_id lnc-RYBP-4:5 ; gene_alias_1 ENSG00000241163 ; gene_alias_2 RP11-398A8.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241163.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158784.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241163.3 ; gene_alias_6 LINC00877 ; transcript_alias_1 ENST00000464271 ; transcript_alias_2 ENST00000464271.1 ; transcript_alias_3 RP11-398A8.3-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352211.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090437 ;
chr3	lncipedia.org	exon	72149055	72149157	.	-	.	gene_id lnc-RYBP-4 ; transcript_id lnc-RYBP-4:5 ; gene_alias_1 ENSG00000241163 ; gene_alias_2 RP11-398A8.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241163.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158784.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241163.3 ; gene_alias_6 LINC00877 ; transcript_alias_1 ENST00000464271 ; transcript_alias_2 ENST00000464271.1 ; transcript_alias_3 RP11-398A8.3-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352211.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090437 ;
chr3	lncipedia.org	exon	72149320	72149606	.	-	.	gene_id lnc-RYBP-4 ; transcript_id lnc-RYBP-4:5 ; gene_alias_1 ENSG00000241163 ; gene_alias_2 RP11-398A8.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241163.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158784.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241163.3 ; gene_alias_6 LINC00877 ; transcript_alias_1 ENST00000464271 ; transcript_alias_2 ENST00000464271.1 ; transcript_alias_3 RP11-398A8.3-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352211.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090437 ;
chr12	lncipedia.org	exon	10485460	10485662	.	-	.	gene_id lnc-RP11-277P12.7.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-277P12.7.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256288 ; gene_alias_2 RP11-277P12.10 ; gene_alias_3 ENSG00000256288.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168572.1 ; transcript_alias_1 ENST00000539009 ; transcript_alias_2 ENST00000539009.1 ; transcript_alias_3 RP11-277P12.10-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000400264.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT026879 ;
chr12	lncipedia.org	exon	10488711	10488908	.	-	.	gene_id lnc-RP11-277P12.7.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-277P12.7.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256288 ; gene_alias_2 RP11-277P12.10 ; gene_alias_3 ENSG00000256288.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168572.1 ; transcript_alias_1 ENST00000539009 ; transcript_alias_2 ENST00000539009.1 ; transcript_alias_3 RP11-277P12.10-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000400264.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT026879 ;
chr12	lncipedia.org	exon	10490644	10490891	.	-	.	gene_id lnc-RP11-277P12.7.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-277P12.7.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256288 ; gene_alias_2 RP11-277P12.10 ; gene_alias_3 ENSG00000256288.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168572.1 ; transcript_alias_1 ENST00000539009 ; transcript_alias_2 ENST00000539009.1 ; transcript_alias_3 RP11-277P12.10-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000400264.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT026879 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105486304	105486408	.	-	.	gene_id lnc-TGFBRAP1-5 ; transcript_id lnc-TGFBRAP1-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229743 ; gene_alias_2 AC018730.3 ; gene_alias_3 ENSG00000229743.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153064.1 ; gene_alias_5 LINC01159 ; transcript_alias_1 ENST00000434764 ; transcript_alias_2 ENST00000434764.1 ; transcript_alias_3 AC018730.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000329326.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	105488704	105489053	.	-	.	gene_id lnc-TGFBRAP1-5 ; transcript_id lnc-TGFBRAP1-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229743 ; gene_alias_2 AC018730.3 ; gene_alias_3 ENSG00000229743.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153064.1 ; gene_alias_5 LINC01159 ; transcript_alias_1 ENST00000434764 ; transcript_alias_2 ENST00000434764.1 ; transcript_alias_3 AC018730.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000329326.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	179278726	179278840	.	+	.	gene_id lnc-OSBPL6-2 ; transcript_id lnc-OSBPL6-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000223960 ; gene_alias_2 AC009948.5 ; gene_alias_3 ENSG00000223960.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154423.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436616 ; transcript_alias_2 ENST00000436616.1 ; transcript_alias_3 AC009948.5-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000335155.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	179295422	179295616	.	+	.	gene_id lnc-OSBPL6-2 ; transcript_id lnc-OSBPL6-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000223960 ; gene_alias_2 AC009948.5 ; gene_alias_3 ENSG00000223960.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154423.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436616 ; transcript_alias_2 ENST00000436616.1 ; transcript_alias_3 AC009948.5-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000335155.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	179298109	179298716	.	+	.	gene_id lnc-OSBPL6-2 ; transcript_id lnc-OSBPL6-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000223960 ; gene_alias_2 AC009948.5 ; gene_alias_3 ENSG00000223960.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154423.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436616 ; transcript_alias_2 ENST00000436616.1 ; transcript_alias_3 AC009948.5-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000335155.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	41881564	41882830	.	-	.	gene_id lnc-PHOX2B-2 ; transcript_id lnc-PHOX2B-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000245870 ; gene_alias_2 RP11-457P14.4 ; gene_alias_3 ENSG00000245870.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160528.2 ; gene_alias_5 LINC00682 ; transcript_alias_1 ENST00000498940 ; transcript_alias_2 ENST00000498940.1 ; transcript_alias_3 RP11-457P14.4-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000361642.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	41883503	41883860	.	-	.	gene_id lnc-PHOX2B-2 ; transcript_id lnc-PHOX2B-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000245870 ; gene_alias_2 RP11-457P14.4 ; gene_alias_3 ENSG00000245870.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160528.2 ; gene_alias_5 LINC00682 ; transcript_alias_1 ENST00000498940 ; transcript_alias_2 ENST00000498940.1 ; transcript_alias_3 RP11-457P14.4-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000361642.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126927027	126927209	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-9 ; transcript_id lnc-TMEM132B-9:1 ; gene_alias_1 ENSG00000214043 ; gene_alias_2 RP5-944M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000214043.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544759 ; transcript_alias_2 ENST00000544759.1 ; transcript_alias_3 RP5-944M2.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399845.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT140099 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126927512	126927573	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-9 ; transcript_id lnc-TMEM132B-9:1 ; gene_alias_1 ENSG00000214043 ; gene_alias_2 RP5-944M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000214043.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544759 ; transcript_alias_2 ENST00000544759.1 ; transcript_alias_3 RP5-944M2.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399845.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT140099 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126929431	126929599	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-9 ; transcript_id lnc-TMEM132B-9:1 ; gene_alias_1 ENSG00000214043 ; gene_alias_2 RP5-944M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000214043.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544759 ; transcript_alias_2 ENST00000544759.1 ; transcript_alias_3 RP5-944M2.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399845.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT140099 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126932525	126932607	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-9 ; transcript_id lnc-TMEM132B-9:1 ; gene_alias_1 ENSG00000214043 ; gene_alias_2 RP5-944M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000214043.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544759 ; transcript_alias_2 ENST00000544759.1 ; transcript_alias_3 RP5-944M2.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399845.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT140099 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126942603	126942847	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-9 ; transcript_id lnc-TMEM132B-9:1 ; gene_alias_1 ENSG00000214043 ; gene_alias_2 RP5-944M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000214043.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544759 ; transcript_alias_2 ENST00000544759.1 ; transcript_alias_3 RP5-944M2.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399845.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT140099 ;
chr12	lncipedia.org	exon	99325460	99325502	.	+	.	gene_id lnc-APAF1-1 ; transcript_id lnc-APAF1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257458 ; gene_alias_2 RP11-473C19.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257458.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170309.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551372 ; transcript_alias_2 ENST00000551372.1 ; transcript_alias_3 RP11-473C19.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408456.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030162 ;
chr12	lncipedia.org	exon	99343497	99343624	.	+	.	gene_id lnc-APAF1-1 ; transcript_id lnc-APAF1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257458 ; gene_alias_2 RP11-473C19.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257458.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170309.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551372 ; transcript_alias_2 ENST00000551372.1 ; transcript_alias_3 RP11-473C19.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408456.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030162 ;
chr12	lncipedia.org	exon	99348122	99348197	.	+	.	gene_id lnc-APAF1-1 ; transcript_id lnc-APAF1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257458 ; gene_alias_2 RP11-473C19.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257458.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170309.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551372 ; transcript_alias_2 ENST00000551372.1 ; transcript_alias_3 RP11-473C19.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408456.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030162 ;
chr12	lncipedia.org	exon	99370170	99370434	.	+	.	gene_id lnc-APAF1-1 ; transcript_id lnc-APAF1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257458 ; gene_alias_2 RP11-473C19.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257458.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170309.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551372 ; transcript_alias_2 ENST00000551372.1 ; transcript_alias_3 RP11-473C19.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408456.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030162 ;
chr12	lncipedia.org	exon	97958127	97958813	.	+	.	gene_id lnc-NEDD1-4 ; transcript_id lnc-NEDD1-4:6 ; gene_alias_1 ENSG00000255794 ; gene_alias_2 RMST ; gene_alias_3 ENSG00000255794.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170148.1 ; transcript_alias_1 ENST00000547946 ; transcript_alias_2 ENST00000547946.1 ; transcript_alias_3 RMST-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407676.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030105 ;
chr12	lncipedia.org	exon	10516368	10516632	.	+	.	gene_id lnc-KLRD1-1 ; transcript_id lnc-KLRD1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245648 ; gene_alias_2 RP11-277P12.20 ; gene_alias_3 ENSG00000245648.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168533.4 ; transcript_alias_1 ENST00000500682 ; transcript_alias_2 ENST00000500682.1 ; transcript_alias_3 RP11-277P12.20-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000400338.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT026882 ; transcript_alias_6 NR_120430 ;
chr12	lncipedia.org	exon	10526634	10526735	.	+	.	gene_id lnc-KLRD1-1 ; transcript_id lnc-KLRD1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245648 ; gene_alias_2 RP11-277P12.20 ; gene_alias_3 ENSG00000245648.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168533.4 ; transcript_alias_1 ENST00000500682 ; transcript_alias_2 ENST00000500682.1 ; transcript_alias_3 RP11-277P12.20-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000400338.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT026882 ; transcript_alias_6 NR_120430 ;
chr12	lncipedia.org	exon	10532301	10532435	.	+	.	gene_id lnc-KLRD1-1 ; transcript_id lnc-KLRD1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245648 ; gene_alias_2 RP11-277P12.20 ; gene_alias_3 ENSG00000245648.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168533.4 ; transcript_alias_1 ENST00000500682 ; transcript_alias_2 ENST00000500682.1 ; transcript_alias_3 RP11-277P12.20-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000400338.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT026882 ; transcript_alias_6 NR_120430 ;
chr12	lncipedia.org	exon	10548778	10551105	.	+	.	gene_id lnc-KLRD1-1 ; transcript_id lnc-KLRD1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245648 ; gene_alias_2 RP11-277P12.20 ; gene_alias_3 ENSG00000245648.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168533.4 ; transcript_alias_1 ENST00000500682 ; transcript_alias_2 ENST00000500682.1 ; transcript_alias_3 RP11-277P12.20-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000400338.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT026882 ; transcript_alias_6 NR_120430 ;
chr10	lncipedia.org	exon	119805790	119806158	.	+	.	gene_id lnc-EMX2-4 ; transcript_id lnc-EMX2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000177640 ; gene_alias_2 CASC2 ; gene_alias_3 ENSG00000177640.11 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000019127.5 ; transcript_alias_1 ENST00000414722 ; transcript_alias_2 ENST00000414722.1 ; transcript_alias_3 CASC2-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000050581.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT016550 ;
chr10	lncipedia.org	exon	119809023	119809128	.	+	.	gene_id lnc-EMX2-4 ; transcript_id lnc-EMX2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000177640 ; gene_alias_2 CASC2 ; gene_alias_3 ENSG00000177640.11 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000019127.5 ; transcript_alias_1 ENST00000414722 ; transcript_alias_2 ENST00000414722.1 ; transcript_alias_3 CASC2-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000050581.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT016550 ;
chr10	lncipedia.org	exon	119811642	119811707	.	+	.	gene_id lnc-EMX2-4 ; transcript_id lnc-EMX2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000177640 ; gene_alias_2 CASC2 ; gene_alias_3 ENSG00000177640.11 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000019127.5 ; transcript_alias_1 ENST00000414722 ; transcript_alias_2 ENST00000414722.1 ; transcript_alias_3 CASC2-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000050581.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT016550 ;
chr10	lncipedia.org	exon	119966034	119966171	.	+	.	gene_id lnc-EMX2-4 ; transcript_id lnc-EMX2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000177640 ; gene_alias_2 CASC2 ; gene_alias_3 ENSG00000177640.11 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000019127.5 ; transcript_alias_1 ENST00000414722 ; transcript_alias_2 ENST00000414722.1 ; transcript_alias_3 CASC2-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000050581.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT016550 ;
chr5	lncipedia.org	exon	6582249	6582714	.	+	.	gene_id lnc-SRD5A1-1 ; transcript_id lnc-SRD5A1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250056 ; gene_alias_2 CTD-2195M18.1 ; gene_alias_3 ENSG00000250056.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161680.1 ; gene_alias_5 LINC01018 ; transcript_alias_1 ENST00000507628 ; transcript_alias_2 ENST00000507628.1 ; transcript_alias_3 CTD-2195M18.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000365711.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT100199 ;
chr5	lncipedia.org	exon	6583716	6583836	.	+	.	gene_id lnc-SRD5A1-1 ; transcript_id lnc-SRD5A1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250056 ; gene_alias_2 CTD-2195M18.1 ; gene_alias_3 ENSG00000250056.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161680.1 ; gene_alias_5 LINC01018 ; transcript_alias_1 ENST00000507628 ; transcript_alias_2 ENST00000507628.1 ; transcript_alias_3 CTD-2195M18.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000365711.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT100199 ;
chr15	lncipedia.org	exon	40978922	40979344	.	-	.	gene_id lnc-FAM82A2-2 ; transcript_id lnc-FAM82A2-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000245849 ; gene_alias_2 CTD-2339L15.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245849.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166119.3 ; gene_alias_5 RAD51-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000533146 ; transcript_alias_2 ENST00000533146.1 ; transcript_alias_3 CTD-2339L15.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000387930.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT041866 ;
chr15	lncipedia.org	exon	40986784	40986993	.	-	.	gene_id lnc-FAM82A2-2 ; transcript_id lnc-FAM82A2-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000245849 ; gene_alias_2 CTD-2339L15.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245849.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166119.3 ; gene_alias_5 RAD51-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000533146 ; transcript_alias_2 ENST00000533146.1 ; transcript_alias_3 CTD-2339L15.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000387930.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT041866 ;
chr15	lncipedia.org	exon	40987210	40987294	.	-	.	gene_id lnc-FAM82A2-2 ; transcript_id lnc-FAM82A2-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000245849 ; gene_alias_2 CTD-2339L15.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245849.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166119.3 ; gene_alias_5 RAD51-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000533146 ; transcript_alias_2 ENST00000533146.1 ; transcript_alias_3 CTD-2339L15.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000387930.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT041866 ;
chr5	lncipedia.org	exon	157213303	157215694	.	+	.	gene_id lnc-LSM11-1 ; transcript_id lnc-LSM11-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245834 ; transcript_alias_1 ENST00000500739 ;
chr5	lncipedia.org	exon	157275967	157277289	.	+	.	gene_id lnc-LSM11-1 ; transcript_id lnc-LSM11-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245834 ; transcript_alias_1 ENST00000500739 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27068730	27068950	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:31 ; gene_alias_1 ENSG00000244625 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 CTA-211A9.5 ; gene_alias_5 ENSG00000244625.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150981.2 ; transcript_alias_1 ENST00000444388 ; transcript_alias_2 TCONS_00029387 ; transcript_alias_3 ENST00000444388.1 ; transcript_alias_4 CTA-211A9.5-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320769.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084537 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27089644	27089799	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:31 ; gene_alias_1 ENSG00000244625 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 CTA-211A9.5 ; gene_alias_5 ENSG00000244625.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150981.2 ; transcript_alias_1 ENST00000444388 ; transcript_alias_2 TCONS_00029387 ; transcript_alias_3 ENST00000444388.1 ; transcript_alias_4 CTA-211A9.5-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320769.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084537 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27113216	27113422	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:31 ; gene_alias_1 ENSG00000244625 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 CTA-211A9.5 ; gene_alias_5 ENSG00000244625.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150981.2 ; transcript_alias_1 ENST00000444388 ; transcript_alias_2 TCONS_00029387 ; transcript_alias_3 ENST00000444388.1 ; transcript_alias_4 CTA-211A9.5-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320769.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084537 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27122607	27122757	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:31 ; gene_alias_1 ENSG00000244625 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 CTA-211A9.5 ; gene_alias_5 ENSG00000244625.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150981.2 ; transcript_alias_1 ENST00000444388 ; transcript_alias_2 TCONS_00029387 ; transcript_alias_3 ENST00000444388.1 ; transcript_alias_4 CTA-211A9.5-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320769.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084537 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27130236	27130418	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:31 ; gene_alias_1 ENSG00000244625 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 CTA-211A9.5 ; gene_alias_5 ENSG00000244625.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150981.2 ; transcript_alias_1 ENST00000444388 ; transcript_alias_2 TCONS_00029387 ; transcript_alias_3 ENST00000444388.1 ; transcript_alias_4 CTA-211A9.5-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320769.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084537 ;
chr19	lncipedia.org	exon	48978357	48979836	.	-	.	gene_id lnc-LMTK3-1 ; transcript_id lnc-LMTK3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246646 ; transcript_alias_1 ENST00000500348 ;
chr19	lncipedia.org	exon	48985029	48985570	.	-	.	gene_id lnc-LMTK3-1 ; transcript_id lnc-LMTK3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246646 ; transcript_alias_1 ENST00000500348 ;
chr11	lncipedia.org	exon	10879806	10879913	.	+	.	gene_id lnc-CTR9-3 ; transcript_id lnc-CTR9-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247271 ; gene_alias_2 CTD-2003C8.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247271.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165888.1 ; gene_alias_5 ZBED5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000501079 ; transcript_alias_2 ENST00000501079.1 ; transcript_alias_3 CTD-2003C8.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000386898.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	10886808	10886874	.	+	.	gene_id lnc-CTR9-3 ; transcript_id lnc-CTR9-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247271 ; gene_alias_2 CTD-2003C8.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247271.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165888.1 ; gene_alias_5 ZBED5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000501079 ; transcript_alias_2 ENST00000501079.1 ; transcript_alias_3 CTD-2003C8.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000386898.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	10899928	10900823	.	+	.	gene_id lnc-CTR9-3 ; transcript_id lnc-CTR9-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247271 ; gene_alias_2 CTD-2003C8.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247271.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165888.1 ; gene_alias_5 ZBED5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000501079 ; transcript_alias_2 ENST00000501079.1 ; transcript_alias_3 CTD-2003C8.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000386898.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	129622179	129622330	.	+	.	gene_id lnc-UGGT1-1 ; transcript_id lnc-UGGT1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250519 ; gene_alias_2 XLOC_001666 ; gene_alias_3 linc-RAB6C-5 ; transcript_alias_1 ENST00000506309 ; transcript_alias_2 TCONS_00002721 ; transcript_alias_3 NONHSAT074231 ;
chr2	lncipedia.org	exon	129623245	129623308	.	+	.	gene_id lnc-UGGT1-1 ; transcript_id lnc-UGGT1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250519 ; gene_alias_2 XLOC_001666 ; gene_alias_3 linc-RAB6C-5 ; transcript_alias_1 ENST00000506309 ; transcript_alias_2 TCONS_00002721 ; transcript_alias_3 NONHSAT074231 ;
chr2	lncipedia.org	exon	129625432	129626301	.	+	.	gene_id lnc-UGGT1-1 ; transcript_id lnc-UGGT1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250519 ; gene_alias_2 XLOC_001666 ; gene_alias_3 linc-RAB6C-5 ; transcript_alias_1 ENST00000506309 ; transcript_alias_2 TCONS_00002721 ; transcript_alias_3 NONHSAT074231 ;
chr12	lncipedia.org	exon	132241511	132242076	.	-	.	gene_id lnc-DDX51-6 ; transcript_id lnc-DDX51-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255933 ; gene_alias_2 RP11-495K9.5 ; gene_alias_3 ENSG00000255933.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168313.1 ; transcript_alias_1 ENST00000537032 ; transcript_alias_2 ENST00000537032.1 ; transcript_alias_3 RP11-495K9.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399236.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT032033 ;
chr12	lncipedia.org	exon	132242493	132242592	.	-	.	gene_id lnc-DDX51-6 ; transcript_id lnc-DDX51-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255933 ; gene_alias_2 RP11-495K9.5 ; gene_alias_3 ENSG00000255933.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168313.1 ; transcript_alias_1 ENST00000537032 ; transcript_alias_2 ENST00000537032.1 ; transcript_alias_3 RP11-495K9.5-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399236.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT032033 ;
chr5	lncipedia.org	exon	158527630	158527846	.	+	.	gene_id lnc-UBLCP1-5 ; transcript_id lnc-UBLCP1-5:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245812 ; gene_alias_2 RP11-175K6.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245812.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163513.1 ; transcript_alias_1 ENST00000523301 ; transcript_alias_2 ENST00000523301.1 ; transcript_alias_3 RP11-175K6.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000373928.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	158533875	158534225	.	+	.	gene_id lnc-UBLCP1-5 ; transcript_id lnc-UBLCP1-5:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245812 ; gene_alias_2 RP11-175K6.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245812.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163513.1 ; transcript_alias_1 ENST00000523301 ; transcript_alias_2 ENST00000523301.1 ; transcript_alias_3 RP11-175K6.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000373928.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37049235	37049547	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1755-5 ; transcript_id lnc-KIAA1755-5:4 ; gene_alias_1 ENSG00000196756 ; gene_alias_2 RP4-564F22.2 ; gene_alias_3 ENSG00000196756.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032442.1 ; gene_alias_5 ENSG00000196756.7 ; gene_alias_6 SNHG17 ; transcript_alias_1 ENST00000436764 ; transcript_alias_2 ENST00000436764.1 ; transcript_alias_3 RP4-564F22.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079161.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT079655 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37049653	37049745	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1755-5 ; transcript_id lnc-KIAA1755-5:4 ; gene_alias_1 ENSG00000196756 ; gene_alias_2 RP4-564F22.2 ; gene_alias_3 ENSG00000196756.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032442.1 ; gene_alias_5 ENSG00000196756.7 ; gene_alias_6 SNHG17 ; transcript_alias_1 ENST00000436764 ; transcript_alias_2 ENST00000436764.1 ; transcript_alias_3 RP4-564F22.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079161.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT079655 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37050739	37050888	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1755-5 ; transcript_id lnc-KIAA1755-5:4 ; gene_alias_1 ENSG00000196756 ; gene_alias_2 RP4-564F22.2 ; gene_alias_3 ENSG00000196756.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032442.1 ; gene_alias_5 ENSG00000196756.7 ; gene_alias_6 SNHG17 ; transcript_alias_1 ENST00000436764 ; transcript_alias_2 ENST00000436764.1 ; transcript_alias_3 RP4-564F22.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079161.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT079655 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37055062	37055146	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1755-5 ; transcript_id lnc-KIAA1755-5:4 ; gene_alias_1 ENSG00000196756 ; gene_alias_2 RP4-564F22.2 ; gene_alias_3 ENSG00000196756.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032442.1 ; gene_alias_5 ENSG00000196756.7 ; gene_alias_6 SNHG17 ; transcript_alias_1 ENST00000436764 ; transcript_alias_2 ENST00000436764.1 ; transcript_alias_3 RP4-564F22.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079161.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT079655 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37059684	37059755	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1755-5 ; transcript_id lnc-KIAA1755-5:4 ; gene_alias_1 ENSG00000196756 ; gene_alias_2 RP4-564F22.2 ; gene_alias_3 ENSG00000196756.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032442.1 ; gene_alias_5 ENSG00000196756.7 ; gene_alias_6 SNHG17 ; transcript_alias_1 ENST00000436764 ; transcript_alias_2 ENST00000436764.1 ; transcript_alias_3 RP4-564F22.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079161.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT079655 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37063147	37063269	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1755-5 ; transcript_id lnc-KIAA1755-5:4 ; gene_alias_1 ENSG00000196756 ; gene_alias_2 RP4-564F22.2 ; gene_alias_3 ENSG00000196756.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032442.1 ; gene_alias_5 ENSG00000196756.7 ; gene_alias_6 SNHG17 ; transcript_alias_1 ENST00000436764 ; transcript_alias_2 ENST00000436764.1 ; transcript_alias_3 RP4-564F22.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079161.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT079655 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37063840	37063976	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1755-5 ; transcript_id lnc-KIAA1755-5:4 ; gene_alias_1 ENSG00000196756 ; gene_alias_2 RP4-564F22.2 ; gene_alias_3 ENSG00000196756.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032442.1 ; gene_alias_5 ENSG00000196756.7 ; gene_alias_6 SNHG17 ; transcript_alias_1 ENST00000436764 ; transcript_alias_2 ENST00000436764.1 ; transcript_alias_3 RP4-564F22.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079161.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT079655 ;
chr5	lncipedia.org	exon	149187140	149188888	.	-	.	gene_id lnc-PDE6A-1 ; transcript_id lnc-PDE6A-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227424 ; transcript_alias_1 ENST00000417016 ;
chr5	lncipedia.org	exon	149188987	149189250	.	-	.	gene_id lnc-PDE6A-1 ; transcript_id lnc-PDE6A-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227424 ; transcript_alias_1 ENST00000417016 ;
chr3	lncipedia.org	exon	178466776	178467024	.	-	.	gene_id lnc-ZMAT3-2 ; transcript_id lnc-ZMAT3-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000237978 ; gene_alias_2 RP11-385J1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000237978.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000157289.1 ; transcript_alias_1 ENST00000421498 ; transcript_alias_2 ENST00000421498.1 ; transcript_alias_3 RP11-385J1.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000348333.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT093380 ;
chr3	lncipedia.org	exon	178519581	178519724	.	-	.	gene_id lnc-ZMAT3-2 ; transcript_id lnc-ZMAT3-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000237978 ; gene_alias_2 RP11-385J1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000237978.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000157289.1 ; transcript_alias_1 ENST00000421498 ; transcript_alias_2 ENST00000421498.1 ; transcript_alias_3 RP11-385J1.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000348333.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT093380 ;
chr12	lncipedia.org	exon	93936239	93939134	.	-	.	gene_id lnc-UBE2N-2 ; transcript_id lnc-UBE2N-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246985 ; transcript_alias_1 ENST00000499137 ;
chr12	lncipedia.org	exon	93936240	93939134	.	-	.	gene_id lnc-UBE2N-2 ; transcript_id lnc-UBE2N-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246985 ; transcript_alias_1 ENST00000499137 ;
chr12	lncipedia.org	exon	93960520	93960746	.	-	.	gene_id lnc-UBE2N-2 ; transcript_id lnc-UBE2N-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246985 ; transcript_alias_1 ENST00000499137 ;
chr12	lncipedia.org	exon	93965343	93965544	.	-	.	gene_id lnc-UBE2N-2 ; transcript_id lnc-UBE2N-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246985 ; transcript_alias_1 ENST00000499137 ;
chr2	lncipedia.org	exon	231849083	231850825	.	-	.	gene_id lnc-GPR55-1 ; transcript_id lnc-GPR55-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000238062 ; gene_alias_2 AC105344.2 ; gene_alias_3 ENSG00000238062.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154076.1 ; gene_alias_5 SPATA3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000414876 ; transcript_alias_2 ENST00000414876.1 ; transcript_alias_3 AC105344.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333737.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	231851699	231852894	.	-	.	gene_id lnc-GPR55-1 ; transcript_id lnc-GPR55-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000238062 ; gene_alias_2 AC105344.2 ; gene_alias_3 ENSG00000238062.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154076.1 ; gene_alias_5 SPATA3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000414876 ; transcript_alias_2 ENST00000414876.1 ; transcript_alias_3 AC105344.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333737.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	231856484	231856690	.	-	.	gene_id lnc-GPR55-1 ; transcript_id lnc-GPR55-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000238062 ; gene_alias_2 AC105344.2 ; gene_alias_3 ENSG00000238062.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154076.1 ; gene_alias_5 SPATA3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000414876 ; transcript_alias_2 ENST00000414876.1 ; transcript_alias_3 AC105344.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333737.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	231857049	231857117	.	-	.	gene_id lnc-GPR55-1 ; transcript_id lnc-GPR55-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000238062 ; gene_alias_2 AC105344.2 ; gene_alias_3 ENSG00000238062.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154076.1 ; gene_alias_5 SPATA3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000414876 ; transcript_alias_2 ENST00000414876.1 ; transcript_alias_3 AC105344.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333737.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	231859992	231860100	.	-	.	gene_id lnc-GPR55-1 ; transcript_id lnc-GPR55-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000238062 ; gene_alias_2 AC105344.2 ; gene_alias_3 ENSG00000238062.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154076.1 ; gene_alias_5 SPATA3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000414876 ; transcript_alias_2 ENST00000414876.1 ; transcript_alias_3 AC105344.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333737.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	231860563	231860746	.	-	.	gene_id lnc-GPR55-1 ; transcript_id lnc-GPR55-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000238062 ; gene_alias_2 AC105344.2 ; gene_alias_3 ENSG00000238062.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154076.1 ; gene_alias_5 SPATA3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000414876 ; transcript_alias_2 ENST00000414876.1 ; transcript_alias_3 AC105344.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333737.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26107741	26108174	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; gene_alias_2 RP11-877E17.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246695.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169126.2 ; gene_alias_5 RASSF8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000535436 ; transcript_alias_2 ENST00000535436.1 ; transcript_alias_3 RP11-877E17.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402345.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT027380 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26109160	26109280	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; gene_alias_2 RP11-877E17.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246695.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169126.2 ; gene_alias_5 RASSF8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000535436 ; transcript_alias_2 ENST00000535436.1 ; transcript_alias_3 RP11-877E17.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402345.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT027380 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26109572	26109697	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; gene_alias_2 RP11-877E17.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246695.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169126.2 ; gene_alias_5 RASSF8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000535436 ; transcript_alias_2 ENST00000535436.1 ; transcript_alias_3 RP11-877E17.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402345.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT027380 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26112259	26112698	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246695 ; gene_alias_2 RP11-877E17.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246695.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169126.2 ; gene_alias_5 RASSF8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000535436 ; transcript_alias_2 ENST00000535436.1 ; transcript_alias_3 RP11-877E17.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402345.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT027380 ;
chrX	lncipedia.org	exon	137793614	137793780	.	+	.	gene_id lnc-SNURFL-1 ; transcript_id lnc-SNURFL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226031 ; gene_alias_2 RP1-260J9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000226031.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000137416.1 ; gene_alias_5 FGF13-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000446383 ; transcript_alias_2 ENST00000446383.1 ; transcript_alias_3 RP1-260J9.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058532.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT138766 ;
chrX	lncipedia.org	exon	137796299	137796427	.	+	.	gene_id lnc-SNURFL-1 ; transcript_id lnc-SNURFL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226031 ; gene_alias_2 RP1-260J9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000226031.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000137416.1 ; gene_alias_5 FGF13-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000446383 ; transcript_alias_2 ENST00000446383.1 ; transcript_alias_3 RP1-260J9.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058532.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT138766 ;
chrX	lncipedia.org	exon	137796886	137796971	.	+	.	gene_id lnc-SNURFL-1 ; transcript_id lnc-SNURFL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226031 ; gene_alias_2 RP1-260J9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000226031.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000137416.1 ; gene_alias_5 FGF13-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000446383 ; transcript_alias_2 ENST00000446383.1 ; transcript_alias_3 RP1-260J9.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058532.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT138766 ;
chrX	lncipedia.org	exon	137798053	137798254	.	+	.	gene_id lnc-SNURFL-1 ; transcript_id lnc-SNURFL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226031 ; gene_alias_2 RP1-260J9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000226031.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000137416.1 ; gene_alias_5 FGF13-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000446383 ; transcript_alias_2 ENST00000446383.1 ; transcript_alias_3 RP1-260J9.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000058532.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT138766 ;
chr16	lncipedia.org	exon	1722898	1725399	.	-	.	gene_id lnc-IFT140-2 ; transcript_id lnc-IFT140-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245096 ; transcript_alias_1 ENST00000500567 ;
chr16	lncipedia.org	exon	1727196	1727907	.	-	.	gene_id lnc-IFT140-2 ; transcript_id lnc-IFT140-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245096 ; transcript_alias_1 ENST00000500567 ;
chr16	lncipedia.org	exon	57477062	57479219	.	+	.	gene_id lnc-COQ9-1 ; transcript_id lnc-COQ9-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250743 ; transcript_alias_1 ENST00000509888 ;
chr16	lncipedia.org	exon	57479995	57481271	.	+	.	gene_id lnc-COQ9-1 ; transcript_id lnc-COQ9-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250743 ; transcript_alias_1 ENST00000509888 ;
chr19	lncipedia.org	exon	44395957	44397292	.	-	.	gene_id lnc-ZNF404-1 ; transcript_id lnc-ZNF404-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247377 ; gene_alias_2 AC006213.1 ; transcript_alias_1 ENST00000498944 ;
chr19	lncipedia.org	exon	44405020	44405106	.	-	.	gene_id lnc-ZNF404-1 ; transcript_id lnc-ZNF404-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247377 ; gene_alias_2 AC006213.1 ; transcript_alias_1 ENST00000498944 ;
chr19	lncipedia.org	exon	44405189	44405957	.	-	.	gene_id lnc-ZNF404-1 ; transcript_id lnc-ZNF404-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247377 ; gene_alias_2 AC006213.1 ; transcript_alias_1 ENST00000498944 ;
chr4	lncipedia.org	exon	110278435	110278537	.	-	.	gene_id lnc-COL25A1-1 ; transcript_id lnc-COL25A1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247950 ; gene_alias_2 RP11-264J9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247950.2 ; gene_alias_4 SEC24B-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000161048.2 ; transcript_alias_1 ENST00000505895 ; transcript_alias_2 ENST00000505895.1 ; transcript_alias_3 SEC24B-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000363575.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT097777 ;
chr4	lncipedia.org	exon	110283908	110283942	.	-	.	gene_id lnc-COL25A1-1 ; transcript_id lnc-COL25A1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247950 ; gene_alias_2 RP11-264J9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247950.2 ; gene_alias_4 SEC24B-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000161048.2 ; transcript_alias_1 ENST00000505895 ; transcript_alias_2 ENST00000505895.1 ; transcript_alias_3 SEC24B-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000363575.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT097777 ;
chr4	lncipedia.org	exon	110303405	110303575	.	-	.	gene_id lnc-COL25A1-1 ; transcript_id lnc-COL25A1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247950 ; gene_alias_2 RP11-264J9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247950.2 ; gene_alias_4 SEC24B-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000161048.2 ; transcript_alias_1 ENST00000505895 ; transcript_alias_2 ENST00000505895.1 ; transcript_alias_3 SEC24B-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000363575.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT097777 ;
chr4	lncipedia.org	exon	110317350	110317435	.	-	.	gene_id lnc-COL25A1-1 ; transcript_id lnc-COL25A1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247950 ; gene_alias_2 RP11-264J9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247950.2 ; gene_alias_4 SEC24B-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000161048.2 ; transcript_alias_1 ENST00000505895 ; transcript_alias_2 ENST00000505895.1 ; transcript_alias_3 SEC24B-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000363575.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT097777 ;
chr4	lncipedia.org	exon	110326806	110326929	.	-	.	gene_id lnc-COL25A1-1 ; transcript_id lnc-COL25A1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247950 ; gene_alias_2 RP11-264J9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247950.2 ; gene_alias_4 SEC24B-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000161048.2 ; transcript_alias_1 ENST00000505895 ; transcript_alias_2 ENST00000505895.1 ; transcript_alias_3 SEC24B-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000363575.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT097777 ;
chr4	lncipedia.org	exon	110335414	110335589	.	-	.	gene_id lnc-COL25A1-1 ; transcript_id lnc-COL25A1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247950 ; gene_alias_2 RP11-264J9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247950.2 ; gene_alias_4 SEC24B-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000161048.2 ; transcript_alias_1 ENST00000505895 ; transcript_alias_2 ENST00000505895.1 ; transcript_alias_3 SEC24B-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000363575.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT097777 ;
chr4	lncipedia.org	exon	110352848	110352902	.	-	.	gene_id lnc-COL25A1-1 ; transcript_id lnc-COL25A1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247950 ; gene_alias_2 RP11-264J9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247950.2 ; gene_alias_4 SEC24B-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000161048.2 ; transcript_alias_1 ENST00000505895 ; transcript_alias_2 ENST00000505895.1 ; transcript_alias_3 SEC24B-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000363575.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT097777 ;
chr4	lncipedia.org	exon	110354890	110354939	.	-	.	gene_id lnc-COL25A1-1 ; transcript_id lnc-COL25A1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247950 ; gene_alias_2 RP11-264J9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247950.2 ; gene_alias_4 SEC24B-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000161048.2 ; transcript_alias_1 ENST00000505895 ; transcript_alias_2 ENST00000505895.1 ; transcript_alias_3 SEC24B-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000363575.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT097777 ;
chr11	lncipedia.org	exon	9797278	9797312	.	+	.	gene_id lnc-SWAP70-1 ; transcript_id lnc-SWAP70-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000246273 ; gene_alias_2 RP11-540A21.3 ; gene_alias_3 ENSG00000246273.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165875.1 ; gene_alias_5 SBF2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000534671 ; transcript_alias_2 ENST00000534671.1 ; transcript_alias_3 RP11-540A21.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000386806.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017944 ;
chr11	lncipedia.org	exon	9801923	9802122	.	+	.	gene_id lnc-SWAP70-1 ; transcript_id lnc-SWAP70-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000246273 ; gene_alias_2 RP11-540A21.3 ; gene_alias_3 ENSG00000246273.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165875.1 ; gene_alias_5 SBF2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000534671 ; transcript_alias_2 ENST00000534671.1 ; transcript_alias_3 RP11-540A21.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000386806.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017944 ;
chr11	lncipedia.org	exon	9829395	9829926	.	+	.	gene_id lnc-SWAP70-1 ; transcript_id lnc-SWAP70-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000246273 ; gene_alias_2 RP11-540A21.3 ; gene_alias_3 ENSG00000246273.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165875.1 ; gene_alias_5 SBF2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000534671 ; transcript_alias_2 ENST00000534671.1 ; transcript_alias_3 RP11-540A21.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000386806.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017944 ;
chr20	lncipedia.org	exon	57090435	57090796	.	+	.	gene_id lnc-VAPB-1 ; transcript_id lnc-VAPB-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231290 ; gene_alias_2 RP5-907D15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000231290.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032847.2 ; gene_alias_5 APCDD1L-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000427140 ; transcript_alias_2 ENST00000427140.1 ; transcript_alias_3 RP5-907D15.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079883.2 ;
chr20	lncipedia.org	exon	57094560	57094655	.	+	.	gene_id lnc-VAPB-1 ; transcript_id lnc-VAPB-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231290 ; gene_alias_2 RP5-907D15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000231290.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032847.2 ; gene_alias_5 APCDD1L-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000427140 ; transcript_alias_2 ENST00000427140.1 ; transcript_alias_3 RP5-907D15.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079883.2 ;
chr20	lncipedia.org	exon	57096446	57096607	.	+	.	gene_id lnc-VAPB-1 ; transcript_id lnc-VAPB-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231290 ; gene_alias_2 RP5-907D15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000231290.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032847.2 ; gene_alias_5 APCDD1L-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000427140 ; transcript_alias_2 ENST00000427140.1 ; transcript_alias_3 RP5-907D15.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079883.2 ;
chr20	lncipedia.org	exon	57098225	57098337	.	+	.	gene_id lnc-VAPB-1 ; transcript_id lnc-VAPB-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231290 ; gene_alias_2 RP5-907D15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000231290.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032847.2 ; gene_alias_5 APCDD1L-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000427140 ; transcript_alias_2 ENST00000427140.1 ; transcript_alias_3 RP5-907D15.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079883.2 ;
chr20	lncipedia.org	exon	57098770	57098862	.	+	.	gene_id lnc-VAPB-1 ; transcript_id lnc-VAPB-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231290 ; gene_alias_2 RP5-907D15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000231290.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032847.2 ; gene_alias_5 APCDD1L-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000427140 ; transcript_alias_2 ENST00000427140.1 ; transcript_alias_3 RP5-907D15.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079883.2 ;
chr20	lncipedia.org	exon	57122868	57122984	.	+	.	gene_id lnc-VAPB-1 ; transcript_id lnc-VAPB-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231290 ; gene_alias_2 RP5-907D15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000231290.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032847.2 ; gene_alias_5 APCDD1L-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000427140 ; transcript_alias_2 ENST00000427140.1 ; transcript_alias_3 RP5-907D15.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079883.2 ;
chr20	lncipedia.org	exon	57193796	57194944	.	+	.	gene_id lnc-VAPB-1 ; transcript_id lnc-VAPB-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231290 ; gene_alias_2 RP5-907D15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000231290.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032847.2 ; gene_alias_5 APCDD1L-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000427140 ; transcript_alias_2 ENST00000427140.1 ; transcript_alias_3 RP5-907D15.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079883.2 ;
chr21	lncipedia.org	exon	17791838	17792061	.	+	.	gene_id lnc-USP25-2 ; transcript_id lnc-USP25-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000215386 ; gene_alias_2 C21orf34 ; gene_alias_3 ENSG00000215386.5 ; gene_alias_4 LINC00478 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000074377.1 ; gene_alias_6 ENSG00000215386.6 ; transcript_alias_1 ENST00000453910 ; transcript_alias_2 ENST00000453910.1 ; transcript_alias_3 LINC00478-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000158037.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT081241 ;
chr21	lncipedia.org	exon	17859810	17859858	.	+	.	gene_id lnc-USP25-2 ; transcript_id lnc-USP25-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000215386 ; gene_alias_2 C21orf34 ; gene_alias_3 ENSG00000215386.5 ; gene_alias_4 LINC00478 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000074377.1 ; gene_alias_6 ENSG00000215386.6 ; transcript_alias_1 ENST00000453910 ; transcript_alias_2 ENST00000453910.1 ; transcript_alias_3 LINC00478-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000158037.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT081241 ;
chr21	lncipedia.org	exon	17909699	17909759	.	+	.	gene_id lnc-USP25-2 ; transcript_id lnc-USP25-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000215386 ; gene_alias_2 C21orf34 ; gene_alias_3 ENSG00000215386.5 ; gene_alias_4 LINC00478 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000074377.1 ; gene_alias_6 ENSG00000215386.6 ; transcript_alias_1 ENST00000453910 ; transcript_alias_2 ENST00000453910.1 ; transcript_alias_3 LINC00478-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000158037.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT081241 ;
chr21	lncipedia.org	exon	17966660	17966774	.	+	.	gene_id lnc-USP25-2 ; transcript_id lnc-USP25-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000215386 ; gene_alias_2 C21orf34 ; gene_alias_3 ENSG00000215386.5 ; gene_alias_4 LINC00478 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000074377.1 ; gene_alias_6 ENSG00000215386.6 ; transcript_alias_1 ENST00000453910 ; transcript_alias_2 ENST00000453910.1 ; transcript_alias_3 LINC00478-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000158037.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT081241 ;
chr21	lncipedia.org	exon	17979314	17979423	.	+	.	gene_id lnc-USP25-2 ; transcript_id lnc-USP25-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000215386 ; gene_alias_2 C21orf34 ; gene_alias_3 ENSG00000215386.5 ; gene_alias_4 LINC00478 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000074377.1 ; gene_alias_6 ENSG00000215386.6 ; transcript_alias_1 ENST00000453910 ; transcript_alias_2 ENST00000453910.1 ; transcript_alias_3 LINC00478-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000158037.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT081241 ;
chr12	lncipedia.org	exon	114183509	114184400	.	-	.	gene_id lnc-RBM19-1 ; transcript_id lnc-RBM19-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249550 ; gene_alias_2 RP11-438N16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000249550.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169644.1 ; transcript_alias_1 ENST00000550223 ; transcript_alias_2 ENST00000550223.1 ; transcript_alias_3 RP11-438N16.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405247.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030856 ;
chr12	lncipedia.org	exon	114204880	114205013	.	-	.	gene_id lnc-RBM19-1 ; transcript_id lnc-RBM19-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249550 ; gene_alias_2 RP11-438N16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000249550.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169644.1 ; transcript_alias_1 ENST00000550223 ; transcript_alias_2 ENST00000550223.1 ; transcript_alias_3 RP11-438N16.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405247.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030856 ;
chr12	lncipedia.org	exon	114211420	114211468	.	-	.	gene_id lnc-RBM19-1 ; transcript_id lnc-RBM19-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249550 ; gene_alias_2 RP11-438N16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000249550.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169644.1 ; transcript_alias_1 ENST00000550223 ; transcript_alias_2 ENST00000550223.1 ; transcript_alias_3 RP11-438N16.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405247.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030856 ;
chr7	lncipedia.org	exon	38342383	38343224	.	-	.	gene_id lnc-AMPH-2 ; transcript_id lnc-AMPH-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244971 ; transcript_alias_1 ENST00000499120 ;
chr7	lncipedia.org	exon	38343487	38343773	.	-	.	gene_id lnc-AMPH-2 ; transcript_id lnc-AMPH-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244971 ; transcript_alias_1 ENST00000499120 ;
chr7	lncipedia.org	exon	38344265	38345247	.	-	.	gene_id lnc-AMPH-2 ; transcript_id lnc-AMPH-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244971 ; transcript_alias_1 ENST00000499120 ;
chr1	lncipedia.org	exon	101491475	101491617	.	+	.	gene_id lnc-SLC30A7-2 ; transcript_id lnc-SLC30A7-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000233184 ; gene_alias_2 RP11-421L21.3 ; gene_alias_3 ENSG00000233184.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000010831.1 ; gene_alias_5 ENSG00000233184.2 ; transcript_alias_1 ENST00000446527 ; transcript_alias_2 ENST00000446527.1 ; transcript_alias_3 RP11-421L21.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000029899.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	101540951	101541272	.	+	.	gene_id lnc-SLC30A7-2 ; transcript_id lnc-SLC30A7-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000233184 ; gene_alias_2 RP11-421L21.3 ; gene_alias_3 ENSG00000233184.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000010831.1 ; gene_alias_5 ENSG00000233184.2 ; transcript_alias_1 ENST00000446527 ; transcript_alias_2 ENST00000446527.1 ; transcript_alias_3 RP11-421L21.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000029899.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	101542919	101543064	.	+	.	gene_id lnc-SLC30A7-2 ; transcript_id lnc-SLC30A7-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000233184 ; gene_alias_2 RP11-421L21.3 ; gene_alias_3 ENSG00000233184.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000010831.1 ; gene_alias_5 ENSG00000233184.2 ; transcript_alias_1 ENST00000446527 ; transcript_alias_2 ENST00000446527.1 ; transcript_alias_3 RP11-421L21.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000029899.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	101549017	101549130	.	+	.	gene_id lnc-SLC30A7-2 ; transcript_id lnc-SLC30A7-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000233184 ; gene_alias_2 RP11-421L21.3 ; gene_alias_3 ENSG00000233184.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000010831.1 ; gene_alias_5 ENSG00000233184.2 ; transcript_alias_1 ENST00000446527 ; transcript_alias_2 ENST00000446527.1 ; transcript_alias_3 RP11-421L21.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000029899.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	101552408	101552727	.	+	.	gene_id lnc-SLC30A7-2 ; transcript_id lnc-SLC30A7-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000233184 ; gene_alias_2 RP11-421L21.3 ; gene_alias_3 ENSG00000233184.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000010831.1 ; gene_alias_5 ENSG00000233184.2 ; transcript_alias_1 ENST00000446527 ; transcript_alias_2 ENST00000446527.1 ; transcript_alias_3 RP11-421L21.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000029899.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	55841858	55841982	.	+	.	gene_id lnc-SPO11-1 ; transcript_id lnc-SPO11-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000226308 ; gene_alias_2 XLOC_013583 ; gene_alias_3 linc-SPO11-1 ; gene_alias_4 RP4-813D12.3 ; gene_alias_5 ENSG00000226308.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000032811.2 ; transcript_alias_1 ENST00000426580 ; transcript_alias_2 TCONS_00027962 ; transcript_alias_3 ENST00000426580.1 ; transcript_alias_4 RP4-813D12.3-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000079830.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT080493 ;
chr20	lncipedia.org	exon	55847054	55847108	.	+	.	gene_id lnc-SPO11-1 ; transcript_id lnc-SPO11-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000226308 ; gene_alias_2 XLOC_013583 ; gene_alias_3 linc-SPO11-1 ; gene_alias_4 RP4-813D12.3 ; gene_alias_5 ENSG00000226308.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000032811.2 ; transcript_alias_1 ENST00000426580 ; transcript_alias_2 TCONS_00027962 ; transcript_alias_3 ENST00000426580.1 ; transcript_alias_4 RP4-813D12.3-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000079830.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT080493 ;
chr20	lncipedia.org	exon	55855470	55855541	.	+	.	gene_id lnc-SPO11-1 ; transcript_id lnc-SPO11-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000226308 ; gene_alias_2 XLOC_013583 ; gene_alias_3 linc-SPO11-1 ; gene_alias_4 RP4-813D12.3 ; gene_alias_5 ENSG00000226308.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000032811.2 ; transcript_alias_1 ENST00000426580 ; transcript_alias_2 TCONS_00027962 ; transcript_alias_3 ENST00000426580.1 ; transcript_alias_4 RP4-813D12.3-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000079830.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT080493 ;
chr11	lncipedia.org	exon	115628638	115628970	.	-	.	gene_id lnc-CADM1-2 ; transcript_id lnc-CADM1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000246100 ; gene_alias_2 CTC-774J1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246100.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168216.1 ; gene_alias_5 ENSG00000246100.3 ; gene_alias_6 LINC00900 ; transcript_alias_1 ENST00000535683 ; transcript_alias_2 ENST00000535683.1 ; transcript_alias_3 CTC-774J1.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000398862.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	115630748	115630918	.	-	.	gene_id lnc-CADM1-2 ; transcript_id lnc-CADM1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000246100 ; gene_alias_2 CTC-774J1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246100.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168216.1 ; gene_alias_5 ENSG00000246100.3 ; gene_alias_6 LINC00900 ; transcript_alias_1 ENST00000535683 ; transcript_alias_2 ENST00000535683.1 ; transcript_alias_3 CTC-774J1.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000398862.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	117569275	117570310	.	-	.	gene_id lnc-KLHL13-1 ; transcript_id lnc-KLHL13-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250881 ; transcript_alias_1 ENST00000504917 ;
chrX	lncipedia.org	exon	117578255	117578817	.	-	.	gene_id lnc-KLHL13-1 ; transcript_id lnc-KLHL13-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250881 ; transcript_alias_1 ENST00000504917 ;
chrX	lncipedia.org	exon	117579012	117579991	.	-	.	gene_id lnc-KLHL13-1 ; transcript_id lnc-KLHL13-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250881 ; transcript_alias_1 ENST00000504917 ;
chr1	lncipedia.org	exon	231464488	231465677	.	+	.	gene_id lnc-C1orf124-1 ; transcript_id lnc-C1orf124-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249800 ; gene_alias_2 XLOC_000610 ; gene_alias_3 linc-C1orf124-1 ; transcript_alias_1 ENST00000510952 ; transcript_alias_2 TCONS_00000416 ; transcript_alias_3 NONHSAT010166 ;
chr1	lncipedia.org	exon	231466236	231467017	.	+	.	gene_id lnc-C1orf124-1 ; transcript_id lnc-C1orf124-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249800 ; gene_alias_2 XLOC_000610 ; gene_alias_3 linc-C1orf124-1 ; transcript_alias_1 ENST00000510952 ; transcript_alias_2 TCONS_00000416 ; transcript_alias_3 NONHSAT010166 ;
chr6	lncipedia.org	exon	10429488	10430546	.	-	.	gene_id lnc-TFAP2A-2 ; transcript_id lnc-TFAP2A-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000183674 ; gene_alias_2 RP1-290I10.8 ; gene_alias_3 ENSG00000183674.7 ; gene_alias_4 LINC00518 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000159175.1 ; transcript_alias_1 ENST00000496285 ; transcript_alias_2 ENST00000496285.1 ; transcript_alias_3 LINC00518-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000353699.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	10434481	10434659	.	-	.	gene_id lnc-TFAP2A-2 ; transcript_id lnc-TFAP2A-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000183674 ; gene_alias_2 RP1-290I10.8 ; gene_alias_3 ENSG00000183674.7 ; gene_alias_4 LINC00518 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000159175.1 ; transcript_alias_1 ENST00000496285 ; transcript_alias_2 ENST00000496285.1 ; transcript_alias_3 LINC00518-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000353699.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	10434746	10435055	.	-	.	gene_id lnc-TFAP2A-2 ; transcript_id lnc-TFAP2A-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000183674 ; gene_alias_2 RP1-290I10.8 ; gene_alias_3 ENSG00000183674.7 ; gene_alias_4 LINC00518 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000159175.1 ; transcript_alias_1 ENST00000496285 ; transcript_alias_2 ENST00000496285.1 ; transcript_alias_3 LINC00518-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000353699.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	43142312	43142555	.	-	.	gene_id lnc-ALX4-8 ; transcript_id lnc-ALX4-8:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251557 ; transcript_alias_1 ENST00000533565 ; transcript_alias_2 NONHSAT018918 ;
chr11	lncipedia.org	exon	43142735	43142950	.	-	.	gene_id lnc-ALX4-8 ; transcript_id lnc-ALX4-8:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251557 ; transcript_alias_1 ENST00000533565 ; transcript_alias_2 NONHSAT018918 ;
chr11	lncipedia.org	exon	43290815	43290943	.	-	.	gene_id lnc-ALX4-8 ; transcript_id lnc-ALX4-8:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251557 ; transcript_alias_1 ENST00000533565 ; transcript_alias_2 NONHSAT018918 ;
chr10	lncipedia.org	exon	8092439	8092687	.	-	.	gene_id lnc-KIN-2 ; transcript_id lnc-KIN-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000197308 ; gene_alias_2 RP11-379F12.7 ; gene_alias_3 ENSG00000197308.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000156966.1 ; gene_alias_5 GATA3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000438755 ; transcript_alias_2 ENST00000438755.1 ; transcript_alias_3 RP11-379F12.7-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000346866.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT011310 ; transcript_alias_6 NR_104330 ;
chr10	lncipedia.org	exon	8093212	8093541	.	-	.	gene_id lnc-KIN-2 ; transcript_id lnc-KIN-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000197308 ; gene_alias_2 RP11-379F12.7 ; gene_alias_3 ENSG00000197308.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000156966.1 ; gene_alias_5 GATA3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000438755 ; transcript_alias_2 ENST00000438755.1 ; transcript_alias_3 RP11-379F12.7-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000346866.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT011310 ; transcript_alias_6 NR_104330 ;
chr10	lncipedia.org	exon	8094363	8094458	.	-	.	gene_id lnc-KIN-2 ; transcript_id lnc-KIN-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000197308 ; gene_alias_2 RP11-379F12.7 ; gene_alias_3 ENSG00000197308.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000156966.1 ; gene_alias_5 GATA3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000438755 ; transcript_alias_2 ENST00000438755.1 ; transcript_alias_3 RP11-379F12.7-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000346866.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT011310 ; transcript_alias_6 NR_104330 ;
chr12	lncipedia.org	exon	130165972	130166142	.	-	.	gene_id lnc-RIMBP2-6 ; transcript_id lnc-RIMBP2-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256137 ; gene_alias_2 RP11-174M13.2 ; gene_alias_3 ENSG00000256137.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168405.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544036 ; transcript_alias_2 ENST00000544036.1 ; transcript_alias_3 RP11-174M13.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399603.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031937 ;
chr12	lncipedia.org	exon	130167437	130167613	.	-	.	gene_id lnc-RIMBP2-6 ; transcript_id lnc-RIMBP2-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256137 ; gene_alias_2 RP11-174M13.2 ; gene_alias_3 ENSG00000256137.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168405.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544036 ; transcript_alias_2 ENST00000544036.1 ; transcript_alias_3 RP11-174M13.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399603.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031937 ;
chr12	lncipedia.org	exon	130182729	130182772	.	-	.	gene_id lnc-RIMBP2-6 ; transcript_id lnc-RIMBP2-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256137 ; gene_alias_2 RP11-174M13.2 ; gene_alias_3 ENSG00000256137.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168405.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544036 ; transcript_alias_2 ENST00000544036.1 ; transcript_alias_3 RP11-174M13.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399603.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031937 ;
chr8	lncipedia.org	exon	67834253	67834349	.	-	.	gene_id lnc-TCF24-2 ; transcript_id lnc-TCF24-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245910 ; gene_alias_2 SNHG6 ; gene_alias_3 ENSG00000245910.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164743.2 ; gene_alias_5 ENSG00000245910.4 ; transcript_alias_1 ENST00000520619 ; transcript_alias_2 ENST00000520619.1 ; transcript_alias_3 SNHG6-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000380025.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127057 ;
chr8	lncipedia.org	exon	67834559	67834627	.	-	.	gene_id lnc-TCF24-2 ; transcript_id lnc-TCF24-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245910 ; gene_alias_2 SNHG6 ; gene_alias_3 ENSG00000245910.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164743.2 ; gene_alias_5 ENSG00000245910.4 ; transcript_alias_1 ENST00000520619 ; transcript_alias_2 ENST00000520619.1 ; transcript_alias_3 SNHG6-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000380025.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127057 ;
chr8	lncipedia.org	exon	67834849	67834960	.	-	.	gene_id lnc-TCF24-2 ; transcript_id lnc-TCF24-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245910 ; gene_alias_2 SNHG6 ; gene_alias_3 ENSG00000245910.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164743.2 ; gene_alias_5 ENSG00000245910.4 ; transcript_alias_1 ENST00000520619 ; transcript_alias_2 ENST00000520619.1 ; transcript_alias_3 SNHG6-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000380025.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127057 ;
chr8	lncipedia.org	exon	67838433	67838633	.	-	.	gene_id lnc-TCF24-2 ; transcript_id lnc-TCF24-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245910 ; gene_alias_2 SNHG6 ; gene_alias_3 ENSG00000245910.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164743.2 ; gene_alias_5 ENSG00000245910.4 ; transcript_alias_1 ENST00000520619 ; transcript_alias_2 ENST00000520619.1 ; transcript_alias_3 SNHG6-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000380025.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127057 ;
chr1	lncipedia.org	exon	43424775	43425248	.	+	.	gene_id lnc-ZNF691-1 ; transcript_id lnc-ZNF691-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000227533 ; gene_alias_2 RP5-848E13.3 ; gene_alias_3 ENSG00000227533.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000007699.1 ; gene_alias_5 SLC2A1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000416689 ; transcript_alias_2 ENST00000416689.1 ; transcript_alias_3 RP5-848E13.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000020687.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT002771 ;
chr1	lncipedia.org	exon	43435920	43436065	.	+	.	gene_id lnc-ZNF691-1 ; transcript_id lnc-ZNF691-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000227533 ; gene_alias_2 RP5-848E13.3 ; gene_alias_3 ENSG00000227533.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000007699.1 ; gene_alias_5 SLC2A1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000416689 ; transcript_alias_2 ENST00000416689.1 ; transcript_alias_3 RP5-848E13.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000020687.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT002771 ;
chr1	lncipedia.org	exon	43439645	43442099	.	+	.	gene_id lnc-ZNF691-1 ; transcript_id lnc-ZNF691-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000227533 ; gene_alias_2 RP5-848E13.3 ; gene_alias_3 ENSG00000227533.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000007699.1 ; gene_alias_5 SLC2A1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000416689 ; transcript_alias_2 ENST00000416689.1 ; transcript_alias_3 RP5-848E13.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000020687.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT002771 ;
chr3	lncipedia.org	exon	50297829	50300713	.	-	.	gene_id lnc-HYAL3-1 ; transcript_id lnc-HYAL3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250212 ; transcript_alias_1 ENST00000507563 ;
chr3	lncipedia.org	exon	50339166	50339249	.	-	.	gene_id lnc-HYAL3-1 ; transcript_id lnc-HYAL3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250212 ; transcript_alias_1 ENST00000507563 ;
chr8	lncipedia.org	exon	90629222	90629385	.	-	.	gene_id lnc-NBN-1 ; transcript_id lnc-NBN-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000251136 ; gene_alias_2 RP11-37B2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251136.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163788.2 ; gene_alias_5 ENSG00000251136.4 ; transcript_alias_1 ENST00000519854 ; transcript_alias_2 ENST00000519854.1 ; transcript_alias_3 RP11-37B2.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000375479.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127616 ;
chr8	lncipedia.org	exon	90635314	90635433	.	-	.	gene_id lnc-NBN-1 ; transcript_id lnc-NBN-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000251136 ; gene_alias_2 RP11-37B2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251136.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163788.2 ; gene_alias_5 ENSG00000251136.4 ; transcript_alias_1 ENST00000519854 ; transcript_alias_2 ENST00000519854.1 ; transcript_alias_3 RP11-37B2.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000375479.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127616 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73498209	73500329	.	-	.	gene_id lnc-RLIM-2 ; transcript_id lnc-RLIM-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000230590 ; gene_alias_2 FTX ; gene_alias_3 ENSG00000230590.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021850.1 ; gene_alias_5 ENSG00000230590.3 ; transcript_alias_1 ENST00000429124 ; transcript_alias_2 ENST00000429124.1 ; transcript_alias_3 FTX-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057255.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT137627 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73500766	73500920	.	-	.	gene_id lnc-RLIM-2 ; transcript_id lnc-RLIM-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000230590 ; gene_alias_2 FTX ; gene_alias_3 ENSG00000230590.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021850.1 ; gene_alias_5 ENSG00000230590.3 ; transcript_alias_1 ENST00000429124 ; transcript_alias_2 ENST00000429124.1 ; transcript_alias_3 FTX-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057255.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT137627 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73501537	73501683	.	-	.	gene_id lnc-RLIM-2 ; transcript_id lnc-RLIM-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000230590 ; gene_alias_2 FTX ; gene_alias_3 ENSG00000230590.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021850.1 ; gene_alias_5 ENSG00000230590.3 ; transcript_alias_1 ENST00000429124 ; transcript_alias_2 ENST00000429124.1 ; transcript_alias_3 FTX-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057255.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT137627 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73512262	73512435	.	-	.	gene_id lnc-RLIM-2 ; transcript_id lnc-RLIM-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000230590 ; gene_alias_2 FTX ; gene_alias_3 ENSG00000230590.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000021850.1 ; gene_alias_5 ENSG00000230590.3 ; transcript_alias_1 ENST00000429124 ; transcript_alias_2 ENST00000429124.1 ; transcript_alias_3 FTX-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057255.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT137627 ;
chr19	lncipedia.org	exon	15050246	15050308	.	+	.	gene_id lnc-OR7C2-1 ; transcript_id lnc-OR7C2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246896 ; transcript_alias_1 ENST00000499938 ;
chr19	lncipedia.org	exon	15306240	15306255	.	+	.	gene_id lnc-OR7C2-1 ; transcript_id lnc-OR7C2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246896 ; transcript_alias_1 ENST00000499938 ;
chr19	lncipedia.org	exon	15643282	15643316	.	+	.	gene_id lnc-OR7C2-1 ; transcript_id lnc-OR7C2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246896 ; transcript_alias_1 ENST00000499938 ;
chr19	lncipedia.org	exon	15912681	15912689	.	+	.	gene_id lnc-OR7C2-1 ; transcript_id lnc-OR7C2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246896 ; transcript_alias_1 ENST00000499938 ;
chr19	lncipedia.org	exon	16273981	16273983	.	+	.	gene_id lnc-OR7C2-1 ; transcript_id lnc-OR7C2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246896 ; transcript_alias_1 ENST00000499938 ;
chr19	lncipedia.org	exon	16592679	16592689	.	+	.	gene_id lnc-OR7C2-1 ; transcript_id lnc-OR7C2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246896 ; transcript_alias_1 ENST00000499938 ;
chr19	lncipedia.org	exon	16650035	16650088	.	+	.	gene_id lnc-OR7C2-1 ; transcript_id lnc-OR7C2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246896 ; transcript_alias_1 ENST00000499938 ;
chr19	lncipedia.org	exon	16747526	16748905	.	+	.	gene_id lnc-OR7C2-1 ; transcript_id lnc-OR7C2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246896 ; transcript_alias_1 ENST00000499938 ;
chr19	lncipedia.org	exon	16747550	16748905	.	+	.	gene_id lnc-OR7C2-1 ; transcript_id lnc-OR7C2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246896 ; transcript_alias_1 ENST00000499938 ;
chr9	lncipedia.org	exon	118235807	118236059	.	+	.	gene_id lnc-DEC1-1 ; transcript_id lnc-DEC1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000197486 ; gene_alias_2 AL691420.1 ; transcript_alias_1 ENST00000543454 ; transcript_alias_2 NONHSAT134412 ;
chr9	lncipedia.org	exon	118279334	118279475	.	+	.	gene_id lnc-DEC1-1 ; transcript_id lnc-DEC1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000197486 ; gene_alias_2 AL691420.1 ; transcript_alias_1 ENST00000543454 ; transcript_alias_2 NONHSAT134412 ;
chr9	lncipedia.org	exon	118352079	118353358	.	+	.	gene_id lnc-DEC1-1 ; transcript_id lnc-DEC1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000197486 ; gene_alias_2 AL691420.1 ; transcript_alias_1 ENST00000543454 ; transcript_alias_2 NONHSAT134412 ;
chr12	lncipedia.org	exon	116971978	116972144	.	-	.	gene_id lnc-C12orf49-1 ; transcript_id lnc-C12orf49-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247019 ; gene_alias_2 XLOC_010211 ; gene_alias_3 linc-MED13L-2 ; gene_alias_4 AC090670.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502085 ; transcript_alias_2 TCONS_00020258 ; transcript_alias_3 NONHSAT030948 ;
chr12	lncipedia.org	exon	116972209	116973135	.	-	.	gene_id lnc-C12orf49-1 ; transcript_id lnc-C12orf49-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247019 ; gene_alias_2 XLOC_010211 ; gene_alias_3 linc-MED13L-2 ; gene_alias_4 AC090670.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502085 ; transcript_alias_2 TCONS_00020258 ; transcript_alias_3 NONHSAT030948 ;
chr6	lncipedia.org	exon	2306527	2306760	.	+	.	gene_id lnc-WRNIP1-2 ; transcript_id lnc-WRNIP1-2:22 ; gene_alias_1 ENSG00000250903 ; gene_alias_2 RP1-80B9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250903.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014120.3 ; gene_alias_5 ENSG00000250903.4 ; gene_alias_6 GMDS-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000534160 ; transcript_alias_2 ENST00000534160.1 ; transcript_alias_3 RP1-80B9.2-014 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000389404.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT106642 ;
chr6	lncipedia.org	exon	2329517	2329638	.	+	.	gene_id lnc-WRNIP1-2 ; transcript_id lnc-WRNIP1-2:22 ; gene_alias_1 ENSG00000250903 ; gene_alias_2 RP1-80B9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250903.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014120.3 ; gene_alias_5 ENSG00000250903.4 ; gene_alias_6 GMDS-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000534160 ; transcript_alias_2 ENST00000534160.1 ; transcript_alias_3 RP1-80B9.2-014 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000389404.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT106642 ;
chr6	lncipedia.org	exon	2352573	2352936	.	+	.	gene_id lnc-WRNIP1-2 ; transcript_id lnc-WRNIP1-2:22 ; gene_alias_1 ENSG00000250903 ; gene_alias_2 RP1-80B9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250903.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014120.3 ; gene_alias_5 ENSG00000250903.4 ; gene_alias_6 GMDS-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000534160 ; transcript_alias_2 ENST00000534160.1 ; transcript_alias_3 RP1-80B9.2-014 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000389404.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT106642 ;
chr1	lncipedia.org	exon	20010584	20011363	.	-	.	gene_id lnc-RNF186-1 ; transcript_id lnc-RNF186-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250744 ; transcript_alias_1 ENST00000512048 ;
chr1	lncipedia.org	exon	20014250	20016242	.	-	.	gene_id lnc-RNF186-1 ; transcript_id lnc-RNF186-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250744 ; transcript_alias_1 ENST00000512048 ;
chr1	lncipedia.org	exon	20016321	20016628	.	-	.	gene_id lnc-RNF186-1 ; transcript_id lnc-RNF186-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250744 ; transcript_alias_1 ENST00000512048 ;
chr12	lncipedia.org	exon	114182382	114184400	.	-	.	gene_id lnc-RBM19-1 ; transcript_id lnc-RBM19-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249550 ; gene_alias_2 XLOC_010204 ; gene_alias_3 linc-LHX5 ; gene_alias_4 RP11-438N16.1 ; gene_alias_5 ENSG00000249550.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000169644.1 ; transcript_alias_1 ENST00000547963 ; transcript_alias_2 TCONS_00020222 ; transcript_alias_3 ENST00000547963.1 ; transcript_alias_4 RP11-438N16.1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000405246.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT030854 ; transcript_alias_7 NR_110025 ;
chr12	lncipedia.org	exon	114211420	114211488	.	-	.	gene_id lnc-RBM19-1 ; transcript_id lnc-RBM19-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249550 ; gene_alias_2 XLOC_010204 ; gene_alias_3 linc-LHX5 ; gene_alias_4 RP11-438N16.1 ; gene_alias_5 ENSG00000249550.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000169644.1 ; transcript_alias_1 ENST00000547963 ; transcript_alias_2 TCONS_00020222 ; transcript_alias_3 ENST00000547963.1 ; transcript_alias_4 RP11-438N16.1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000405246.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT030854 ; transcript_alias_7 NR_110025 ;
chr1	lncipedia.org	exon	118320271	118320960	.	+	.	gene_id lnc-FAM46C-1 ; transcript_id lnc-FAM46C-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251057 ; gene_alias_2 AL390877.1 ; transcript_alias_1 ENST00000504345 ; transcript_alias_2 NONHSAT005497 ;
chr1	lncipedia.org	exon	118321203	118321523	.	+	.	gene_id lnc-FAM46C-1 ; transcript_id lnc-FAM46C-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251057 ; gene_alias_2 AL390877.1 ; transcript_alias_1 ENST00000504345 ; transcript_alias_2 NONHSAT005497 ;
chr4	lncipedia.org	exon	133996466	133996594	.	-	.	gene_id lnc-RP11-62N21.1.1-5 ; transcript_id lnc-RP11-62N21.1.1-5:3 ; gene_alias_1 ENSG00000250241 ; gene_alias_2 RP11-9G1.3 ; gene_alias_3 ENSG00000250241.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161299.2 ; transcript_alias_1 ENST00000506897 ; transcript_alias_2 ENST00000506897.1 ; transcript_alias_3 RP11-9G1.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364455.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT098342 ;
chr4	lncipedia.org	exon	133998524	133998610	.	-	.	gene_id lnc-RP11-62N21.1.1-5 ; transcript_id lnc-RP11-62N21.1.1-5:3 ; gene_alias_1 ENSG00000250241 ; gene_alias_2 RP11-9G1.3 ; gene_alias_3 ENSG00000250241.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161299.2 ; transcript_alias_1 ENST00000506897 ; transcript_alias_2 ENST00000506897.1 ; transcript_alias_3 RP11-9G1.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364455.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT098342 ;
chr4	lncipedia.org	exon	133999493	133999617	.	-	.	gene_id lnc-RP11-62N21.1.1-5 ; transcript_id lnc-RP11-62N21.1.1-5:3 ; gene_alias_1 ENSG00000250241 ; gene_alias_2 RP11-9G1.3 ; gene_alias_3 ENSG00000250241.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161299.2 ; transcript_alias_1 ENST00000506897 ; transcript_alias_2 ENST00000506897.1 ; transcript_alias_3 RP11-9G1.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364455.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT098342 ;
chr4	lncipedia.org	exon	134017040	134017105	.	-	.	gene_id lnc-RP11-62N21.1.1-5 ; transcript_id lnc-RP11-62N21.1.1-5:3 ; gene_alias_1 ENSG00000250241 ; gene_alias_2 RP11-9G1.3 ; gene_alias_3 ENSG00000250241.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161299.2 ; transcript_alias_1 ENST00000506897 ; transcript_alias_2 ENST00000506897.1 ; transcript_alias_3 RP11-9G1.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364455.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT098342 ;
chr4	lncipedia.org	exon	134017891	134017981	.	-	.	gene_id lnc-RP11-62N21.1.1-5 ; transcript_id lnc-RP11-62N21.1.1-5:3 ; gene_alias_1 ENSG00000250241 ; gene_alias_2 RP11-9G1.3 ; gene_alias_3 ENSG00000250241.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161299.2 ; transcript_alias_1 ENST00000506897 ; transcript_alias_2 ENST00000506897.1 ; transcript_alias_3 RP11-9G1.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364455.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT098342 ;
chr12	lncipedia.org	exon	70107413	70109367	.	-	.	gene_id lnc-BEST3-1 ; transcript_id lnc-BEST3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247131 ; gene_alias_2 RP11-588G21.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247131.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169398.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501387 ; transcript_alias_2 ENST00000501387.1 ; transcript_alias_3 RP11-588G21.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000403871.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029381 ; transcript_alias_6 NR_110072 ;
chr12	lncipedia.org	exon	70119002	70119169	.	-	.	gene_id lnc-BEST3-1 ; transcript_id lnc-BEST3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247131 ; gene_alias_2 RP11-588G21.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247131.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169398.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501387 ; transcript_alias_2 ENST00000501387.1 ; transcript_alias_3 RP11-588G21.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000403871.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029381 ; transcript_alias_6 NR_110072 ;
chr12	lncipedia.org	exon	70124353	70124476	.	-	.	gene_id lnc-BEST3-1 ; transcript_id lnc-BEST3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247131 ; gene_alias_2 RP11-588G21.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247131.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169398.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501387 ; transcript_alias_2 ENST00000501387.1 ; transcript_alias_3 RP11-588G21.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000403871.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029381 ; transcript_alias_6 NR_110072 ;
chr12	lncipedia.org	exon	70132058	70132348	.	-	.	gene_id lnc-BEST3-1 ; transcript_id lnc-BEST3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247131 ; gene_alias_2 RP11-588G21.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247131.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169398.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501387 ; transcript_alias_2 ENST00000501387.1 ; transcript_alias_3 RP11-588G21.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000403871.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029381 ; transcript_alias_6 NR_110072 ;
chr3	lncipedia.org	exon	181328317	181328533	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:13 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000498226 ; transcript_alias_2 ENST00000498226.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-012 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350430.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT093496 ;
chr3	lncipedia.org	exon	181328649	181328717	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:13 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000498226 ; transcript_alias_2 ENST00000498226.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-012 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350430.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT093496 ;
chr3	lncipedia.org	exon	181508461	181508734	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:13 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000498226 ; transcript_alias_2 ENST00000498226.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-012 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350430.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT093496 ;
chr5	lncipedia.org	exon	59783967	59784250	.	+	.	gene_id lnc-AC109486.1-1 ; transcript_id lnc-AC109486.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000152931 ; gene_alias_2 XLOC_004399 ; gene_alias_3 linc-NDUFAF2-3 ; gene_alias_4 PART1 ; gene_alias_5 ENSG00000152931.6 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000162213.2 ; gene_alias_7 ENSG00000152931.7 ; transcript_alias_1 ENST00000506884 ; transcript_alias_2 TCONS_00009407 ; transcript_alias_3 ENST00000506884.1 ; transcript_alias_4 PART1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000368802.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	59825231	59825370	.	+	.	gene_id lnc-AC109486.1-1 ; transcript_id lnc-AC109486.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000152931 ; gene_alias_2 XLOC_004399 ; gene_alias_3 linc-NDUFAF2-3 ; gene_alias_4 PART1 ; gene_alias_5 ENSG00000152931.6 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000162213.2 ; gene_alias_7 ENSG00000152931.7 ; transcript_alias_1 ENST00000506884 ; transcript_alias_2 TCONS_00009407 ; transcript_alias_3 ENST00000506884.1 ; transcript_alias_4 PART1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000368802.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	59829759	59829846	.	+	.	gene_id lnc-AC109486.1-1 ; transcript_id lnc-AC109486.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000152931 ; gene_alias_2 XLOC_004399 ; gene_alias_3 linc-NDUFAF2-3 ; gene_alias_4 PART1 ; gene_alias_5 ENSG00000152931.6 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000162213.2 ; gene_alias_7 ENSG00000152931.7 ; transcript_alias_1 ENST00000506884 ; transcript_alias_2 TCONS_00009407 ; transcript_alias_3 ENST00000506884.1 ; transcript_alias_4 PART1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000368802.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	59841929	59843484	.	+	.	gene_id lnc-AC109486.1-1 ; transcript_id lnc-AC109486.1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000152931 ; gene_alias_2 XLOC_004399 ; gene_alias_3 linc-NDUFAF2-3 ; gene_alias_4 PART1 ; gene_alias_5 ENSG00000152931.6 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000162213.2 ; gene_alias_7 ENSG00000152931.7 ; transcript_alias_1 ENST00000506884 ; transcript_alias_2 TCONS_00009407 ; transcript_alias_3 ENST00000506884.1 ; transcript_alias_4 PART1-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000368802.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	121320405	121320608	.	-	.	gene_id lnc-BLID-3 ; transcript_id lnc-BLID-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246790 ; gene_alias_2 RP11-730K11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246790.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166056.1 ; transcript_alias_1 ENST00000529160 ; transcript_alias_2 ENST00000529160.1 ; transcript_alias_3 RP11-730K11.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000387625.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	121323384	121323628	.	-	.	gene_id lnc-BLID-3 ; transcript_id lnc-BLID-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246790 ; gene_alias_2 RP11-730K11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246790.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166056.1 ; transcript_alias_1 ENST00000529160 ; transcript_alias_2 ENST00000529160.1 ; transcript_alias_3 RP11-730K11.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000387625.1 ;
chr13	lncipedia.org	exon	41792719	41793250	.	+	.	gene_id lnc-NAA16-2 ; transcript_id lnc-NAA16-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247513 ; transcript_alias_1 ENST00000436156 ;
chr13	lncipedia.org	exon	41793286	41794134	.	+	.	gene_id lnc-NAA16-2 ; transcript_id lnc-NAA16-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247513 ; transcript_alias_1 ENST00000436156 ;
chr4	lncipedia.org	exon	189321890	189321987	.	+	.	gene_id lnc-TRIML1-3 ; transcript_id lnc-TRIML1-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249378 ; gene_alias_2 RP11-219G10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000249378.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160242.4 ; gene_alias_5 LINC01060 ; transcript_alias_1 ENST00000512839 ; transcript_alias_2 ENST00000512839.1 ; transcript_alias_3 RP11-219G10.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000359856.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099740 ;
chr4	lncipedia.org	exon	189357858	189358054	.	+	.	gene_id lnc-TRIML1-3 ; transcript_id lnc-TRIML1-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249378 ; gene_alias_2 RP11-219G10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000249378.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160242.4 ; gene_alias_5 LINC01060 ; transcript_alias_1 ENST00000512839 ; transcript_alias_2 ENST00000512839.1 ; transcript_alias_3 RP11-219G10.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000359856.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099740 ;
chr4	lncipedia.org	exon	189397852	189397910	.	+	.	gene_id lnc-TRIML1-3 ; transcript_id lnc-TRIML1-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249378 ; gene_alias_2 RP11-219G10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000249378.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160242.4 ; gene_alias_5 LINC01060 ; transcript_alias_1 ENST00000512839 ; transcript_alias_2 ENST00000512839.1 ; transcript_alias_3 RP11-219G10.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000359856.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099740 ;
chr4	lncipedia.org	exon	189398792	189399066	.	+	.	gene_id lnc-TRIML1-3 ; transcript_id lnc-TRIML1-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249378 ; gene_alias_2 RP11-219G10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000249378.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160242.4 ; gene_alias_5 LINC01060 ; transcript_alias_1 ENST00000512839 ; transcript_alias_2 ENST00000512839.1 ; transcript_alias_3 RP11-219G10.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000359856.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099740 ;
chr4	lncipedia.org	exon	189406933	189407019	.	+	.	gene_id lnc-TRIML1-3 ; transcript_id lnc-TRIML1-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249378 ; gene_alias_2 RP11-219G10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000249378.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160242.4 ; gene_alias_5 LINC01060 ; transcript_alias_1 ENST00000512839 ; transcript_alias_2 ENST00000512839.1 ; transcript_alias_3 RP11-219G10.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000359856.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099740 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87960263	87963409	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:12 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; gene_alias_6 ENSG00000245526.4 ; transcript_alias_1 ENST00000500197 ; transcript_alias_2 ENST00000500197.2 ; transcript_alias_3 LINC00461-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369801.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102668 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87966854	87966903	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:12 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; gene_alias_6 ENSG00000245526.4 ; transcript_alias_1 ENST00000500197 ; transcript_alias_2 ENST00000500197.2 ; transcript_alias_3 LINC00461-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369801.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102668 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87968783	87968908	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:12 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; gene_alias_6 ENSG00000245526.4 ; transcript_alias_1 ENST00000500197 ; transcript_alias_2 ENST00000500197.2 ; transcript_alias_3 LINC00461-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369801.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102668 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87969100	87969157	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:12 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; gene_alias_6 ENSG00000245526.4 ; transcript_alias_1 ENST00000500197 ; transcript_alias_2 ENST00000500197.2 ; transcript_alias_3 LINC00461-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369801.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102668 ;
chr19	lncipedia.org	exon	19867185	19867496	.	-	.	gene_id lnc-ZNF506-1 ; transcript_id lnc-ZNF506-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000228642 ; gene_alias_2 AC011477.1 ; transcript_alias_1 ENST00000434276 ; transcript_alias_2 NONHSAT063581 ;
chr19	lncipedia.org	exon	19867916	19869355	.	-	.	gene_id lnc-ZNF506-1 ; transcript_id lnc-ZNF506-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000228642 ; gene_alias_2 AC011477.1 ; transcript_alias_1 ENST00000434276 ; transcript_alias_2 NONHSAT063581 ;
chr19	lncipedia.org	exon	19872066	19872230	.	-	.	gene_id lnc-ZNF506-1 ; transcript_id lnc-ZNF506-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000228642 ; gene_alias_2 AC011477.1 ; transcript_alias_1 ENST00000434276 ; transcript_alias_2 NONHSAT063581 ;
chr19	lncipedia.org	exon	19873347	19873455	.	-	.	gene_id lnc-ZNF506-1 ; transcript_id lnc-ZNF506-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000228642 ; gene_alias_2 AC011477.1 ; transcript_alias_1 ENST00000434276 ; transcript_alias_2 NONHSAT063581 ;
chr19	lncipedia.org	exon	19887136	19887189	.	-	.	gene_id lnc-ZNF506-1 ; transcript_id lnc-ZNF506-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000228642 ; gene_alias_2 AC011477.1 ; transcript_alias_1 ENST00000434276 ; transcript_alias_2 NONHSAT063581 ;
chr10	lncipedia.org	exon	88708434	88709414	.	-	.	gene_id lnc-GLUD1-1 ; transcript_id lnc-GLUD1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249292 ; transcript_alias_1 ENST00000513247 ;
chr10	lncipedia.org	exon	88807624	88807779	.	-	.	gene_id lnc-GLUD1-1 ; transcript_id lnc-GLUD1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249292 ; transcript_alias_1 ENST00000513247 ;
chr10	lncipedia.org	exon	88857289	88857348	.	-	.	gene_id lnc-GLUD1-1 ; transcript_id lnc-GLUD1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249292 ; transcript_alias_1 ENST00000513247 ;
chr9	lncipedia.org	exon	136890608	136890658	.	+	.	gene_id lnc-WDR5-3 ; transcript_id lnc-WDR5-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000235106 ; gene_alias_2 NCRNA00094 ; gene_alias_3 ENSG00000235106.2 ; gene_alias_4 LINC00094 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000020880.2 ; gene_alias_6 ENSG00000235106.4 ; transcript_alias_1 ENST00000550853 ; transcript_alias_2 ENST00000550853.1 ; transcript_alias_3 LINC00094-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407069.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	136890967	136891212	.	+	.	gene_id lnc-WDR5-3 ; transcript_id lnc-WDR5-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000235106 ; gene_alias_2 NCRNA00094 ; gene_alias_3 ENSG00000235106.2 ; gene_alias_4 LINC00094 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000020880.2 ; gene_alias_6 ENSG00000235106.4 ; transcript_alias_1 ENST00000550853 ; transcript_alias_2 ENST00000550853.1 ; transcript_alias_3 LINC00094-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407069.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	136891330	136891671	.	+	.	gene_id lnc-WDR5-3 ; transcript_id lnc-WDR5-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000235106 ; gene_alias_2 NCRNA00094 ; gene_alias_3 ENSG00000235106.2 ; gene_alias_4 LINC00094 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000020880.2 ; gene_alias_6 ENSG00000235106.4 ; transcript_alias_1 ENST00000550853 ; transcript_alias_2 ENST00000550853.1 ; transcript_alias_3 LINC00094-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407069.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	136893948	136894376	.	+	.	gene_id lnc-WDR5-3 ; transcript_id lnc-WDR5-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000235106 ; gene_alias_2 NCRNA00094 ; gene_alias_3 ENSG00000235106.2 ; gene_alias_4 LINC00094 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000020880.2 ; gene_alias_6 ENSG00000235106.4 ; transcript_alias_1 ENST00000550853 ; transcript_alias_2 ENST00000550853.1 ; transcript_alias_3 LINC00094-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407069.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	91413148	91413171	.	+	.	gene_id lnc-FES-2 ; transcript_id lnc-FES-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000214432 ; transcript_alias_1 ENST00000389283 ; transcript_alias_2 NONHSAT048430 ;
chr15	lncipedia.org	exon	91573353	91573471	.	+	.	gene_id lnc-FES-2 ; transcript_id lnc-FES-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000214432 ; transcript_alias_1 ENST00000389283 ; transcript_alias_2 NONHSAT048430 ;
chr15	lncipedia.org	exon	91575647	91575757	.	+	.	gene_id lnc-FES-2 ; transcript_id lnc-FES-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000214432 ; transcript_alias_1 ENST00000389283 ; transcript_alias_2 NONHSAT048430 ;
chr15	lncipedia.org	exon	91578148	91579841	.	+	.	gene_id lnc-FES-2 ; transcript_id lnc-FES-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000214432 ; transcript_alias_1 ENST00000389283 ; transcript_alias_2 NONHSAT048430 ;
chr8	lncipedia.org	exon	104280496	104280700	.	-	.	gene_id lnc-C8orf56-1 ; transcript_id lnc-C8orf56-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000247081 ; gene_alias_2 RP11-318M2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247081.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164798.3 ; gene_alias_5 ENSG00000247081.3 ; transcript_alias_1 ENST00000520025 ; transcript_alias_2 ENST00000520025.1 ; transcript_alias_3 RP11-318M2.2-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000380354.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128177 ;
chr8	lncipedia.org	exon	104298066	104298133	.	-	.	gene_id lnc-C8orf56-1 ; transcript_id lnc-C8orf56-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000247081 ; gene_alias_2 RP11-318M2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247081.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164798.3 ; gene_alias_5 ENSG00000247081.3 ; transcript_alias_1 ENST00000520025 ; transcript_alias_2 ENST00000520025.1 ; transcript_alias_3 RP11-318M2.2-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000380354.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128177 ;
chr11	lncipedia.org	exon	111381325	111381597	.	+	.	gene_id lnc-C11orf88-1 ; transcript_id lnc-C11orf88-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256523 ; gene_alias_2 AP002008.1 ; transcript_alias_1 ENST00000540312 ;
chr11	lncipedia.org	exon	111383743	111384610	.	+	.	gene_id lnc-C11orf88-1 ; transcript_id lnc-C11orf88-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256523 ; gene_alias_2 AP002008.1 ; transcript_alias_1 ENST00000540312 ;
chr12	lncipedia.org	exon	249799	249969	.	-	.	gene_id lnc-SLC6A12-3 ; transcript_id lnc-SLC6A12-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249695 ; transcript_alias_1 ENST00000508953 ;
chr12	lncipedia.org	exon	250078	250410	.	-	.	gene_id lnc-SLC6A12-3 ; transcript_id lnc-SLC6A12-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249695 ; transcript_alias_1 ENST00000508953 ;
chr12	lncipedia.org	exon	250500	251791	.	-	.	gene_id lnc-SLC6A12-3 ; transcript_id lnc-SLC6A12-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249695 ; transcript_alias_1 ENST00000508953 ;
chr12	lncipedia.org	exon	252405	253735	.	-	.	gene_id lnc-SLC6A12-3 ; transcript_id lnc-SLC6A12-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249695 ; transcript_alias_1 ENST00000508953 ;
chr12	lncipedia.org	exon	256924	258281	.	-	.	gene_id lnc-SLC6A12-3 ; transcript_id lnc-SLC6A12-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249695 ; transcript_alias_1 ENST00000508953 ;
chr3	lncipedia.org	exon	72108973	72109260	.	-	.	gene_id lnc-RYBP-4 ; transcript_id lnc-RYBP-4:8 ; gene_alias_1 ENSG00000241163 ; gene_alias_2 RP11-398A8.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241163.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158784.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241163.3 ; gene_alias_6 LINC00877 ; transcript_alias_1 ENST00000470712 ; transcript_alias_2 ENST00000470712.1 ; transcript_alias_3 RP11-398A8.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352209.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090433 ;
chr3	lncipedia.org	exon	72109954	72110245	.	-	.	gene_id lnc-RYBP-4 ; transcript_id lnc-RYBP-4:8 ; gene_alias_1 ENSG00000241163 ; gene_alias_2 RP11-398A8.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241163.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158784.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241163.3 ; gene_alias_6 LINC00877 ; transcript_alias_1 ENST00000470712 ; transcript_alias_2 ENST00000470712.1 ; transcript_alias_3 RP11-398A8.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352209.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090433 ;
chr3	lncipedia.org	exon	72149055	72149263	.	-	.	gene_id lnc-RYBP-4 ; transcript_id lnc-RYBP-4:8 ; gene_alias_1 ENSG00000241163 ; gene_alias_2 RP11-398A8.3 ; gene_alias_3 ENSG00000241163.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158784.1 ; gene_alias_5 ENSG00000241163.3 ; gene_alias_6 LINC00877 ; transcript_alias_1 ENST00000470712 ; transcript_alias_2 ENST00000470712.1 ; transcript_alias_3 RP11-398A8.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352209.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090433 ;
chr12	lncipedia.org	exon	6301563	6303999	.	+	.	gene_id lnc-CD9-1 ; transcript_id lnc-CD9-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250621 ; gene_alias_2 XLOC_009631 ; gene_alias_3 linc-CD9-1 ; transcript_alias_1 ENST00000504269 ; transcript_alias_2 TCONS_00020230 ; transcript_alias_3 NONHSAT026037 ;
chr12	lncipedia.org	exon	6305978	6307505	.	+	.	gene_id lnc-CD9-1 ; transcript_id lnc-CD9-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250621 ; gene_alias_2 XLOC_009631 ; gene_alias_3 linc-CD9-1 ; transcript_alias_1 ENST00000504269 ; transcript_alias_2 TCONS_00020230 ; transcript_alias_3 NONHSAT026037 ;
chr5	lncipedia.org	exon	8333596	8334565	.	-	.	gene_id lnc-FASTKD3-1 ; transcript_id lnc-FASTKD3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245729 ; gene_alias_2 RP11-480D4.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245729.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161709.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501071 ; transcript_alias_2 ENST00000501071.1 ; transcript_alias_3 RP11-480D4.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000365848.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	8334691	8334839	.	-	.	gene_id lnc-FASTKD3-1 ; transcript_id lnc-FASTKD3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245729 ; gene_alias_2 RP11-480D4.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245729.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161709.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501071 ; transcript_alias_2 ENST00000501071.1 ; transcript_alias_3 RP11-480D4.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000365848.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	8337294	8337408	.	-	.	gene_id lnc-FASTKD3-1 ; transcript_id lnc-FASTKD3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245729 ; gene_alias_2 RP11-480D4.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245729.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161709.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501071 ; transcript_alias_2 ENST00000501071.1 ; transcript_alias_3 RP11-480D4.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000365848.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	8387640	8387822	.	-	.	gene_id lnc-FASTKD3-1 ; transcript_id lnc-FASTKD3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245729 ; gene_alias_2 RP11-480D4.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245729.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161709.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501071 ; transcript_alias_2 ENST00000501071.1 ; transcript_alias_3 RP11-480D4.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000365848.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	8452336	8452393	.	-	.	gene_id lnc-FASTKD3-1 ; transcript_id lnc-FASTKD3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245729 ; gene_alias_2 RP11-480D4.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245729.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161709.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501071 ; transcript_alias_2 ENST00000501071.1 ; transcript_alias_3 RP11-480D4.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000365848.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	8457562	8457671	.	-	.	gene_id lnc-FASTKD3-1 ; transcript_id lnc-FASTKD3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245729 ; gene_alias_2 RP11-480D4.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245729.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161709.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501071 ; transcript_alias_2 ENST00000501071.1 ; transcript_alias_3 RP11-480D4.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000365848.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	47987539	47987781	.	+	.	gene_id lnc-DHX34-2 ; transcript_id lnc-DHX34-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245602 ; gene_alias_2 AC073548.1 ; gene_alias_3 ENSG00000268061.1 ; gene_alias_4 NAPA-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500835 ; transcript_alias_2 NONHSAT066972 ; transcript_alias_3 ENST00000593284.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	47996704	47996858	.	+	.	gene_id lnc-DHX34-2 ; transcript_id lnc-DHX34-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245602 ; gene_alias_2 AC073548.1 ; gene_alias_3 ENSG00000268061.1 ; gene_alias_4 NAPA-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500835 ; transcript_alias_2 NONHSAT066972 ; transcript_alias_3 ENST00000593284.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	47998285	47999639	.	+	.	gene_id lnc-DHX34-2 ; transcript_id lnc-DHX34-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245602 ; gene_alias_2 AC073548.1 ; gene_alias_3 ENSG00000268061.1 ; gene_alias_4 NAPA-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500835 ; transcript_alias_2 NONHSAT066972 ; transcript_alias_3 ENST00000593284.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	43009305	43009764	.	-	.	gene_id lnc-PRICKLE1-1 ; transcript_id lnc-PRICKLE1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257510 ; gene_alias_2 RP11-609L23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257510.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169457.2 ; transcript_alias_1 ENST00000550337 ; transcript_alias_2 ENST00000550337.1 ; transcript_alias_3 RP11-609L23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404160.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT027784 ; transcript_alias_6 NR_110042 ;
chr12	lncipedia.org	exon	43023263	43023488	.	-	.	gene_id lnc-PRICKLE1-1 ; transcript_id lnc-PRICKLE1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257510 ; gene_alias_2 RP11-609L23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257510.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169457.2 ; transcript_alias_1 ENST00000550337 ; transcript_alias_2 ENST00000550337.1 ; transcript_alias_3 RP11-609L23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404160.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT027784 ; transcript_alias_6 NR_110042 ;
chr12	lncipedia.org	exon	43028083	43028203	.	-	.	gene_id lnc-PRICKLE1-1 ; transcript_id lnc-PRICKLE1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257510 ; gene_alias_2 RP11-609L23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257510.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169457.2 ; transcript_alias_1 ENST00000550337 ; transcript_alias_2 ENST00000550337.1 ; transcript_alias_3 RP11-609L23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404160.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT027784 ; transcript_alias_6 NR_110042 ;
chr12	lncipedia.org	exon	43037119	43037226	.	-	.	gene_id lnc-PRICKLE1-1 ; transcript_id lnc-PRICKLE1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257510 ; gene_alias_2 RP11-609L23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257510.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169457.2 ; transcript_alias_1 ENST00000550337 ; transcript_alias_2 ENST00000550337.1 ; transcript_alias_3 RP11-609L23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404160.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT027784 ; transcript_alias_6 NR_110042 ;
chr12	lncipedia.org	exon	43038029	43038096	.	-	.	gene_id lnc-PRICKLE1-1 ; transcript_id lnc-PRICKLE1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257510 ; gene_alias_2 RP11-609L23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257510.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169457.2 ; transcript_alias_1 ENST00000550337 ; transcript_alias_2 ENST00000550337.1 ; transcript_alias_3 RP11-609L23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404160.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT027784 ; transcript_alias_6 NR_110042 ;
chr12	lncipedia.org	exon	43040072	43040300	.	-	.	gene_id lnc-PRICKLE1-1 ; transcript_id lnc-PRICKLE1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257510 ; gene_alias_2 RP11-609L23.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257510.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169457.2 ; transcript_alias_1 ENST00000550337 ; transcript_alias_2 ENST00000550337.1 ; transcript_alias_3 RP11-609L23.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404160.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT027784 ; transcript_alias_6 NR_110042 ;
chr2	lncipedia.org	exon	171494879	171495002	.	-	.	gene_id lnc-AC007405.2.1-2 ; transcript_id lnc-AC007405.2.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000213981 ; gene_alias_2 AC007277.3 ; gene_alias_3 ENSG00000213981.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154056.1 ; transcript_alias_1 ENST00000423519 ; transcript_alias_2 ENST00000423519.1 ; transcript_alias_3 AC007277.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333675.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT147126 ;
chr2	lncipedia.org	exon	171497552	171497676	.	-	.	gene_id lnc-AC007405.2.1-2 ; transcript_id lnc-AC007405.2.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000213981 ; gene_alias_2 AC007277.3 ; gene_alias_3 ENSG00000213981.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154056.1 ; transcript_alias_1 ENST00000423519 ; transcript_alias_2 ENST00000423519.1 ; transcript_alias_3 AC007277.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333675.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT147126 ;
chr2	lncipedia.org	exon	171497940	171497973	.	-	.	gene_id lnc-AC007405.2.1-2 ; transcript_id lnc-AC007405.2.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000213981 ; gene_alias_2 AC007277.3 ; gene_alias_3 ENSG00000213981.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154056.1 ; transcript_alias_1 ENST00000423519 ; transcript_alias_2 ENST00000423519.1 ; transcript_alias_3 AC007277.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333675.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT147126 ;
chr2	lncipedia.org	exon	171500227	171500454	.	-	.	gene_id lnc-AC007405.2.1-2 ; transcript_id lnc-AC007405.2.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000213981 ; gene_alias_2 AC007277.3 ; gene_alias_3 ENSG00000213981.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154056.1 ; transcript_alias_1 ENST00000423519 ; transcript_alias_2 ENST00000423519.1 ; transcript_alias_3 AC007277.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000333675.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT147126 ;
chr4	lncipedia.org	exon	68566998	68567202	.	+	.	gene_id lnc-TMPRSS11E-1 ; transcript_id lnc-TMPRSS11E-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248049 ; gene_alias_2 RP11-453E17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248049.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160769.4 ; gene_alias_5 UBA6-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000498917 ; transcript_alias_2 ENST00000498917.2 ; transcript_alias_3 RP11-453E17.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000362200.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT096694 ;
chr4	lncipedia.org	exon	68586140	68586350	.	+	.	gene_id lnc-TMPRSS11E-1 ; transcript_id lnc-TMPRSS11E-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248049 ; gene_alias_2 RP11-453E17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248049.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160769.4 ; gene_alias_5 UBA6-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000498917 ; transcript_alias_2 ENST00000498917.2 ; transcript_alias_3 RP11-453E17.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000362200.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT096694 ;
chr4	lncipedia.org	exon	68587195	68588223	.	+	.	gene_id lnc-TMPRSS11E-1 ; transcript_id lnc-TMPRSS11E-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248049 ; gene_alias_2 RP11-453E17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248049.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160769.4 ; gene_alias_5 UBA6-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000498917 ; transcript_alias_2 ENST00000498917.2 ; transcript_alias_3 RP11-453E17.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000362200.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT096694 ;
chr10	lncipedia.org	exon	72370073	72370184	.	+	.	gene_id lnc-ADAMTS14-2 ; transcript_id lnc-ADAMTS14-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246025 ; gene_alias_2 XLOC_008507 ; gene_alias_3 linc-ADAMTS14 ; gene_alias_4 AL355344.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500803 ; transcript_alias_2 TCONS_00017839 ; transcript_alias_3 NONHSAT013855 ;
chr10	lncipedia.org	exon	72412068	72412186	.	+	.	gene_id lnc-ADAMTS14-2 ; transcript_id lnc-ADAMTS14-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246025 ; gene_alias_2 XLOC_008507 ; gene_alias_3 linc-ADAMTS14 ; gene_alias_4 AL355344.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500803 ; transcript_alias_2 TCONS_00017839 ; transcript_alias_3 NONHSAT013855 ;
chr10	lncipedia.org	exon	72427259	72428508	.	+	.	gene_id lnc-ADAMTS14-2 ; transcript_id lnc-ADAMTS14-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246025 ; gene_alias_2 XLOC_008507 ; gene_alias_3 linc-ADAMTS14 ; gene_alias_4 AL355344.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500803 ; transcript_alias_2 TCONS_00017839 ; transcript_alias_3 NONHSAT013855 ;
chr12	lncipedia.org	exon	68659963	68660019	.	+	.	gene_id lnc-AC124890.1-1 ; transcript_id lnc-AC124890.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251695 ; transcript_alias_1 ENST00000504589 ;
chr12	lncipedia.org	exon	69046457	69046504	.	+	.	gene_id lnc-AC124890.1-1 ; transcript_id lnc-AC124890.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251695 ; transcript_alias_1 ENST00000504589 ;
chr12	lncipedia.org	exon	69186186	69187743	.	+	.	gene_id lnc-AC124890.1-1 ; transcript_id lnc-AC124890.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251695 ; transcript_alias_1 ENST00000504589 ;
chr7	lncipedia.org	exon	141404432	141405557	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1147-2 ; transcript_id lnc-KIAA1147-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000228775 ; gene_alias_2 RP5-894A10.5 ; gene_alias_3 ENSG00000228775.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000157538.1 ; gene_alias_5 WEE2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000495800 ; transcript_alias_2 ENST00000495800.1 ; transcript_alias_3 RP5-894A10.5-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000349096.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123734 ;
chr7	lncipedia.org	exon	141423716	141423824	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1147-2 ; transcript_id lnc-KIAA1147-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000228775 ; gene_alias_2 RP5-894A10.5 ; gene_alias_3 ENSG00000228775.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000157538.1 ; gene_alias_5 WEE2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000495800 ; transcript_alias_2 ENST00000495800.1 ; transcript_alias_3 RP5-894A10.5-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000349096.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123734 ;
chr7	lncipedia.org	exon	141427792	141427945	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1147-2 ; transcript_id lnc-KIAA1147-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000228775 ; gene_alias_2 RP5-894A10.5 ; gene_alias_3 ENSG00000228775.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000157538.1 ; gene_alias_5 WEE2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000495800 ; transcript_alias_2 ENST00000495800.1 ; transcript_alias_3 RP5-894A10.5-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000349096.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123734 ;
chr7	lncipedia.org	exon	141437998	141438020	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1147-2 ; transcript_id lnc-KIAA1147-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000228775 ; gene_alias_2 RP5-894A10.5 ; gene_alias_3 ENSG00000228775.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000157538.1 ; gene_alias_5 WEE2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000495800 ; transcript_alias_2 ENST00000495800.1 ; transcript_alias_3 RP5-894A10.5-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000349096.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123734 ;
chr5	lncipedia.org	exon	148786479	148786641	.	+	.	gene_id lnc-PCYOX1L-2 ; transcript_id lnc-PCYOX1L-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000249669 ; gene_alias_2 RP11-394O4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000249669.2 ; gene_alias_4 MIR143HG ; gene_alias_5 OTTHUMG00000163464.3 ; gene_alias_6 ENSG00000249669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000519898 ; transcript_alias_2 ENST00000519898.1 ; transcript_alias_3 MIR143HG-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381677.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT104498 ;
chr5	lncipedia.org	exon	148801044	148801164	.	+	.	gene_id lnc-PCYOX1L-2 ; transcript_id lnc-PCYOX1L-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000249669 ; gene_alias_2 RP11-394O4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000249669.2 ; gene_alias_4 MIR143HG ; gene_alias_5 OTTHUMG00000163464.3 ; gene_alias_6 ENSG00000249669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000519898 ; transcript_alias_2 ENST00000519898.1 ; transcript_alias_3 MIR143HG-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381677.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT104498 ;
chr5	lncipedia.org	exon	148803653	148803960	.	+	.	gene_id lnc-PCYOX1L-2 ; transcript_id lnc-PCYOX1L-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000249669 ; gene_alias_2 RP11-394O4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000249669.2 ; gene_alias_4 MIR143HG ; gene_alias_5 OTTHUMG00000163464.3 ; gene_alias_6 ENSG00000249669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000519898 ; transcript_alias_2 ENST00000519898.1 ; transcript_alias_3 MIR143HG-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381677.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT104498 ;
chr5	lncipedia.org	exon	148804660	148805225	.	+	.	gene_id lnc-PCYOX1L-2 ; transcript_id lnc-PCYOX1L-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000249669 ; gene_alias_2 RP11-394O4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000249669.2 ; gene_alias_4 MIR143HG ; gene_alias_5 OTTHUMG00000163464.3 ; gene_alias_6 ENSG00000249669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000519898 ; transcript_alias_2 ENST00000519898.1 ; transcript_alias_3 MIR143HG-007 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381677.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT104498 ;
chr16	lncipedia.org	exon	48390711	48392294	.	+	.	gene_id lnc-PHKB-5 ; transcript_id lnc-PHKB-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248379 ; transcript_alias_1 ENST00000504200 ;
chr16	lncipedia.org	exon	48392349	48392738	.	+	.	gene_id lnc-PHKB-5 ; transcript_id lnc-PHKB-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248379 ; transcript_alias_1 ENST00000504200 ;
chr11	lncipedia.org	exon	129482020	129482341	.	-	.	gene_id lnc-NFRKB-2 ; transcript_id lnc-NFRKB-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249683 ; gene_alias_2 XLOC_009601 ; gene_alias_3 linc-ARHGAP32-2 ; transcript_alias_1 ENST00000511090 ; transcript_alias_2 TCONS_00019178 ; transcript_alias_3 NONHSAT025095 ;
chr11	lncipedia.org	exon	129484220	129484382	.	-	.	gene_id lnc-NFRKB-2 ; transcript_id lnc-NFRKB-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249683 ; gene_alias_2 XLOC_009601 ; gene_alias_3 linc-ARHGAP32-2 ; transcript_alias_1 ENST00000511090 ; transcript_alias_2 TCONS_00019178 ; transcript_alias_3 NONHSAT025095 ;
chr11	lncipedia.org	exon	129485202	129485430	.	-	.	gene_id lnc-NFRKB-2 ; transcript_id lnc-NFRKB-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249683 ; gene_alias_2 XLOC_009601 ; gene_alias_3 linc-ARHGAP32-2 ; transcript_alias_1 ENST00000511090 ; transcript_alias_2 TCONS_00019178 ; transcript_alias_3 NONHSAT025095 ;
chr11	lncipedia.org	exon	129486906	129487164	.	-	.	gene_id lnc-NFRKB-2 ; transcript_id lnc-NFRKB-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249683 ; gene_alias_2 XLOC_009601 ; gene_alias_3 linc-ARHGAP32-2 ; transcript_alias_1 ENST00000511090 ; transcript_alias_2 TCONS_00019178 ; transcript_alias_3 NONHSAT025095 ;
chr7	lncipedia.org	exon	136468822	136470638	.	-	.	gene_id lnc-PTN-2 ; transcript_id lnc-PTN-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234352 ; gene_alias_2 AC009264.1 ; gene_alias_3 ENSG00000234352.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000155657.2 ; gene_alias_5 ENSG00000234352.5 ; gene_alias_6 hsa-mir-490 ; transcript_alias_1 ENST00000439694 ; transcript_alias_2 ENST00000439694.1 ; transcript_alias_3 AC009264.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000341008.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123559 ;
chr7	lncipedia.org	exon	136716652	136716710	.	-	.	gene_id lnc-PTN-2 ; transcript_id lnc-PTN-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234352 ; gene_alias_2 AC009264.1 ; gene_alias_3 ENSG00000234352.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000155657.2 ; gene_alias_5 ENSG00000234352.5 ; gene_alias_6 hsa-mir-490 ; transcript_alias_1 ENST00000439694 ; transcript_alias_2 ENST00000439694.1 ; transcript_alias_3 AC009264.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000341008.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123559 ;
chr7	lncipedia.org	exon	136717541	136717660	.	-	.	gene_id lnc-PTN-2 ; transcript_id lnc-PTN-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234352 ; gene_alias_2 AC009264.1 ; gene_alias_3 ENSG00000234352.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000155657.2 ; gene_alias_5 ENSG00000234352.5 ; gene_alias_6 hsa-mir-490 ; transcript_alias_1 ENST00000439694 ; transcript_alias_2 ENST00000439694.1 ; transcript_alias_3 AC009264.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000341008.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123559 ;
chr7	lncipedia.org	exon	136866355	136866518	.	-	.	gene_id lnc-PTN-2 ; transcript_id lnc-PTN-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234352 ; gene_alias_2 AC009264.1 ; gene_alias_3 ENSG00000234352.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000155657.2 ; gene_alias_5 ENSG00000234352.5 ; gene_alias_6 hsa-mir-490 ; transcript_alias_1 ENST00000439694 ; transcript_alias_2 ENST00000439694.1 ; transcript_alias_3 AC009264.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000341008.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123559 ;
chr14	lncipedia.org	exon	94463642	94463917	.	+	.	gene_id lnc-OTUB2-1 ; transcript_id lnc-OTUB2-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000175699 ; gene_alias_2 C14orf48 ; gene_alias_3 ENSG00000175699.8 ; gene_alias_4 LINC00521 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156974.1 ; transcript_alias_1 ENST00000314629 ; transcript_alias_2 ENST00000314629.5 ; transcript_alias_3 LINC00521-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT039366 ;
chr14	lncipedia.org	exon	94464345	94464581	.	+	.	gene_id lnc-OTUB2-1 ; transcript_id lnc-OTUB2-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000175699 ; gene_alias_2 C14orf48 ; gene_alias_3 ENSG00000175699.8 ; gene_alias_4 LINC00521 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156974.1 ; transcript_alias_1 ENST00000314629 ; transcript_alias_2 ENST00000314629.5 ; transcript_alias_3 LINC00521-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT039366 ;
chr14	lncipedia.org	exon	94465929	94466011	.	+	.	gene_id lnc-OTUB2-1 ; transcript_id lnc-OTUB2-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000175699 ; gene_alias_2 C14orf48 ; gene_alias_3 ENSG00000175699.8 ; gene_alias_4 LINC00521 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156974.1 ; transcript_alias_1 ENST00000314629 ; transcript_alias_2 ENST00000314629.5 ; transcript_alias_3 LINC00521-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT039366 ;
chr14	lncipedia.org	exon	94467491	94467665	.	+	.	gene_id lnc-OTUB2-1 ; transcript_id lnc-OTUB2-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000175699 ; gene_alias_2 C14orf48 ; gene_alias_3 ENSG00000175699.8 ; gene_alias_4 LINC00521 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156974.1 ; transcript_alias_1 ENST00000314629 ; transcript_alias_2 ENST00000314629.5 ; transcript_alias_3 LINC00521-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT039366 ;
chr14	lncipedia.org	exon	94469569	94469700	.	+	.	gene_id lnc-OTUB2-1 ; transcript_id lnc-OTUB2-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000175699 ; gene_alias_2 C14orf48 ; gene_alias_3 ENSG00000175699.8 ; gene_alias_4 LINC00521 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156974.1 ; transcript_alias_1 ENST00000314629 ; transcript_alias_2 ENST00000314629.5 ; transcript_alias_3 LINC00521-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT039366 ;
chr14	lncipedia.org	exon	94471201	94471317	.	+	.	gene_id lnc-OTUB2-1 ; transcript_id lnc-OTUB2-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000175699 ; gene_alias_2 C14orf48 ; gene_alias_3 ENSG00000175699.8 ; gene_alias_4 LINC00521 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156974.1 ; transcript_alias_1 ENST00000314629 ; transcript_alias_2 ENST00000314629.5 ; transcript_alias_3 LINC00521-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT039366 ;
chr14	lncipedia.org	exon	94474839	94474929	.	+	.	gene_id lnc-OTUB2-1 ; transcript_id lnc-OTUB2-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000175699 ; gene_alias_2 C14orf48 ; gene_alias_3 ENSG00000175699.8 ; gene_alias_4 LINC00521 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156974.1 ; transcript_alias_1 ENST00000314629 ; transcript_alias_2 ENST00000314629.5 ; transcript_alias_3 LINC00521-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT039366 ;
chr14	lncipedia.org	exon	94477217	94477439	.	+	.	gene_id lnc-OTUB2-1 ; transcript_id lnc-OTUB2-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000175699 ; gene_alias_2 C14orf48 ; gene_alias_3 ENSG00000175699.8 ; gene_alias_4 LINC00521 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156974.1 ; transcript_alias_1 ENST00000314629 ; transcript_alias_2 ENST00000314629.5 ; transcript_alias_3 LINC00521-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT039366 ;
chr14	lncipedia.org	exon	94477557	94477870	.	+	.	gene_id lnc-OTUB2-1 ; transcript_id lnc-OTUB2-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000175699 ; gene_alias_2 C14orf48 ; gene_alias_3 ENSG00000175699.8 ; gene_alias_4 LINC00521 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156974.1 ; transcript_alias_1 ENST00000314629 ; transcript_alias_2 ENST00000314629.5 ; transcript_alias_3 LINC00521-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT039366 ;
chr14	lncipedia.org	exon	94477968	94478040	.	+	.	gene_id lnc-OTUB2-1 ; transcript_id lnc-OTUB2-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000175699 ; gene_alias_2 C14orf48 ; gene_alias_3 ENSG00000175699.8 ; gene_alias_4 LINC00521 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156974.1 ; transcript_alias_1 ENST00000314629 ; transcript_alias_2 ENST00000314629.5 ; transcript_alias_3 LINC00521-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT039366 ;
chr19	lncipedia.org	exon	35307061	35308394	.	-	.	gene_id lnc-ZNF599-2 ; transcript_id lnc-ZNF599-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246294 ; gene_alias_2 ENSG00000267767.2 ; gene_alias_3 CTC-523E23.4 ; transcript_alias_1 ENST00000502044 ; transcript_alias_2 ENST00000590963.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	35309491	35309670	.	-	.	gene_id lnc-ZNF599-2 ; transcript_id lnc-ZNF599-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246294 ; gene_alias_2 ENSG00000267767.2 ; gene_alias_3 CTC-523E23.4 ; transcript_alias_1 ENST00000502044 ; transcript_alias_2 ENST00000590963.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	35320068	35320157	.	-	.	gene_id lnc-ZNF599-2 ; transcript_id lnc-ZNF599-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246294 ; gene_alias_2 ENSG00000267767.2 ; gene_alias_3 CTC-523E23.4 ; transcript_alias_1 ENST00000502044 ; transcript_alias_2 ENST00000590963.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	35321310	35321430	.	-	.	gene_id lnc-ZNF599-2 ; transcript_id lnc-ZNF599-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246294 ; gene_alias_2 ENSG00000267767.2 ; gene_alias_3 CTC-523E23.4 ; transcript_alias_1 ENST00000502044 ; transcript_alias_2 ENST00000590963.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	35323234	35323440	.	-	.	gene_id lnc-ZNF599-2 ; transcript_id lnc-ZNF599-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246294 ; gene_alias_2 ENSG00000267767.2 ; gene_alias_3 CTC-523E23.4 ; transcript_alias_1 ENST00000502044 ; transcript_alias_2 ENST00000590963.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	35323629	35323773	.	-	.	gene_id lnc-ZNF599-2 ; transcript_id lnc-ZNF599-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246294 ; gene_alias_2 ENSG00000267767.2 ; gene_alias_3 CTC-523E23.4 ; transcript_alias_1 ENST00000502044 ; transcript_alias_2 ENST00000590963.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	72639370	72639523	.	+	.	gene_id lnc-GXYLT2-1 ; transcript_id lnc-GXYLT2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249953 ; transcript_alias_1 ENST00000509224 ;
chr3	lncipedia.org	exon	72767476	72767542	.	+	.	gene_id lnc-GXYLT2-1 ; transcript_id lnc-GXYLT2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249953 ; transcript_alias_1 ENST00000509224 ;
chr3	lncipedia.org	exon	73127900	73127939	.	+	.	gene_id lnc-GXYLT2-1 ; transcript_id lnc-GXYLT2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249953 ; transcript_alias_1 ENST00000509224 ;
chr3	lncipedia.org	exon	73446525	73447965	.	+	.	gene_id lnc-GXYLT2-1 ; transcript_id lnc-GXYLT2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249953 ; transcript_alias_1 ENST00000509224 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126927512	126927573	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-9 ; transcript_id lnc-TMEM132B-9:5 ; gene_alias_1 ENSG00000214043 ; gene_alias_2 RP5-944M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000214043.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000540774 ; transcript_alias_2 ENST00000540774.1 ; transcript_alias_3 RP5-944M2.3-201 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126929431	126929599	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-9 ; transcript_id lnc-TMEM132B-9:5 ; gene_alias_1 ENSG00000214043 ; gene_alias_2 RP5-944M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000214043.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000540774 ; transcript_alias_2 ENST00000540774.1 ; transcript_alias_3 RP5-944M2.3-201 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126932525	126932607	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-9 ; transcript_id lnc-TMEM132B-9:5 ; gene_alias_1 ENSG00000214043 ; gene_alias_2 RP5-944M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000214043.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000540774 ; transcript_alias_2 ENST00000540774.1 ; transcript_alias_3 RP5-944M2.3-201 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126942479	126942676	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-9 ; transcript_id lnc-TMEM132B-9:5 ; gene_alias_1 ENSG00000214043 ; gene_alias_2 RP5-944M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000214043.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000540774 ; transcript_alias_2 ENST00000540774.1 ; transcript_alias_3 RP5-944M2.3-201 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126947264	126947371	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-9 ; transcript_id lnc-TMEM132B-9:5 ; gene_alias_1 ENSG00000214043 ; gene_alias_2 RP5-944M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000214043.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000540774 ; transcript_alias_2 ENST00000540774.1 ; transcript_alias_3 RP5-944M2.3-201 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126950260	126950535	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-9 ; transcript_id lnc-TMEM132B-9:5 ; gene_alias_1 ENSG00000214043 ; gene_alias_2 RP5-944M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000214043.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000540774 ; transcript_alias_2 ENST00000540774.1 ; transcript_alias_3 RP5-944M2.3-201 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126951095	126951273	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-9 ; transcript_id lnc-TMEM132B-9:5 ; gene_alias_1 ENSG00000214043 ; gene_alias_2 RP5-944M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000214043.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000540774 ; transcript_alias_2 ENST00000540774.1 ; transcript_alias_3 RP5-944M2.3-201 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126953304	126953653	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-9 ; transcript_id lnc-TMEM132B-9:5 ; gene_alias_1 ENSG00000214043 ; gene_alias_2 RP5-944M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000214043.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000540774 ; transcript_alias_2 ENST00000540774.1 ; transcript_alias_3 RP5-944M2.3-201 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126954278	126954352	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-9 ; transcript_id lnc-TMEM132B-9:5 ; gene_alias_1 ENSG00000214043 ; gene_alias_2 RP5-944M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000214043.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000540774 ; transcript_alias_2 ENST00000540774.1 ; transcript_alias_3 RP5-944M2.3-201 ;
chr11	lncipedia.org	exon	59036349	59039081	.	-	.	gene_id lnc-MPEG1-1 ; transcript_id lnc-MPEG1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000214797 ; gene_alias_2 RP11-1036E20.9 ; gene_alias_3 ENSG00000214797.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167437.1 ; transcript_alias_1 ENST00000399003 ; transcript_alias_2 ENST00000399003.1 ; transcript_alias_3 RP11-1036E20.9-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000394611.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT021520 ;
chr11	lncipedia.org	exon	59051435	59051506	.	-	.	gene_id lnc-MPEG1-1 ; transcript_id lnc-MPEG1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000214797 ; gene_alias_2 RP11-1036E20.9 ; gene_alias_3 ENSG00000214797.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167437.1 ; transcript_alias_1 ENST00000399003 ; transcript_alias_2 ENST00000399003.1 ; transcript_alias_3 RP11-1036E20.9-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000394611.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT021520 ;
chr20	lncipedia.org	exon	10642578	10643372	.	+	.	gene_id lnc-C20orf94-1 ; transcript_id lnc-C20orf94-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245640 ; gene_alias_2 AL035456.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501369 ; transcript_alias_2 NONHSAT078601 ;
chr20	lncipedia.org	exon	10643460	10643711	.	+	.	gene_id lnc-C20orf94-1 ; transcript_id lnc-C20orf94-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245640 ; gene_alias_2 AL035456.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501369 ; transcript_alias_2 NONHSAT078601 ;
chr11	lncipedia.org	exon	115624966	115628010	.	-	.	gene_id lnc-CADM1-2 ; transcript_id lnc-CADM1-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000246100 ; gene_alias_2 CTC-774J1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246100.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168216.1 ; gene_alias_5 ENSG00000246100.3 ; gene_alias_6 LINC00900 ; transcript_alias_1 ENST00000499809 ; transcript_alias_2 ENST00000499809.1 ; transcript_alias_3 CTC-774J1.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000398858.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT024319 ;
chr11	lncipedia.org	exon	115628859	115628970	.	-	.	gene_id lnc-CADM1-2 ; transcript_id lnc-CADM1-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000246100 ; gene_alias_2 CTC-774J1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246100.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168216.1 ; gene_alias_5 ENSG00000246100.3 ; gene_alias_6 LINC00900 ; transcript_alias_1 ENST00000499809 ; transcript_alias_2 ENST00000499809.1 ; transcript_alias_3 CTC-774J1.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000398858.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT024319 ;
chr11	lncipedia.org	exon	115630748	115630912	.	-	.	gene_id lnc-CADM1-2 ; transcript_id lnc-CADM1-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000246100 ; gene_alias_2 CTC-774J1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000246100.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168216.1 ; gene_alias_5 ENSG00000246100.3 ; gene_alias_6 LINC00900 ; transcript_alias_1 ENST00000499809 ; transcript_alias_2 ENST00000499809.1 ; transcript_alias_3 CTC-774J1.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000398858.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT024319 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127399766	127399995	.	-	.	gene_id lnc-SLC15A4-15 ; transcript_id lnc-SLC15A4-15:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249345 ; transcript_alias_1 ENST00000512624 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127399783	127399995	.	-	.	gene_id lnc-SLC15A4-15 ; transcript_id lnc-SLC15A4-15:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249345 ; transcript_alias_1 ENST00000512624 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127407253	127407505	.	-	.	gene_id lnc-SLC15A4-15 ; transcript_id lnc-SLC15A4-15:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249345 ; transcript_alias_1 ENST00000512624 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127407576	127407751	.	-	.	gene_id lnc-SLC15A4-15 ; transcript_id lnc-SLC15A4-15:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249345 ; transcript_alias_1 ENST00000512624 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127460384	127460462	.	-	.	gene_id lnc-SLC15A4-15 ; transcript_id lnc-SLC15A4-15:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249345 ; transcript_alias_1 ENST00000512624 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127485101	127485195	.	-	.	gene_id lnc-SLC15A4-15 ; transcript_id lnc-SLC15A4-15:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249345 ; transcript_alias_1 ENST00000512624 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127516412	127516611	.	-	.	gene_id lnc-SLC15A4-15 ; transcript_id lnc-SLC15A4-15:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249345 ; transcript_alias_1 ENST00000512624 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127544632	127544942	.	-	.	gene_id lnc-SLC15A4-15 ; transcript_id lnc-SLC15A4-15:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249345 ; transcript_alias_1 ENST00000512624 ;
chr14	lncipedia.org	exon	50408665	50410610	.	-	.	gene_id lnc-C14orf182-1 ; transcript_id lnc-C14orf182-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000249220 ; transcript_alias_1 ENST00000510752 ;
chr14	lncipedia.org	exon	50412872	50413035	.	-	.	gene_id lnc-C14orf182-1 ; transcript_id lnc-C14orf182-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000249220 ; transcript_alias_1 ENST00000510752 ;
chr14	lncipedia.org	exon	50427257	50427337	.	-	.	gene_id lnc-C14orf182-1 ; transcript_id lnc-C14orf182-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000249220 ; transcript_alias_1 ENST00000510752 ;
chr14	lncipedia.org	exon	50428421	50428678	.	-	.	gene_id lnc-C14orf182-1 ; transcript_id lnc-C14orf182-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000249220 ; transcript_alias_1 ENST00000510752 ;
chr3	lncipedia.org	exon	180892813	180893166	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000493116 ; transcript_alias_2 ENST00000493116.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350350.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT093473 ;
chr3	lncipedia.org	exon	180893302	180893371	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000493116 ; transcript_alias_2 ENST00000493116.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350350.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT093473 ;
chr3	lncipedia.org	exon	181281508	181281643	.	+	.	gene_id lnc-SOX2-1 ; transcript_id lnc-SOX2-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000242808 ; gene_alias_2 RP11-4B14.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242808.1 ; gene_alias_4 SOX2-OT ; gene_alias_5 OTTHUMG00000158186.2 ; gene_alias_6 ENSG00000242808.3 ; transcript_alias_1 ENST00000493116 ; transcript_alias_2 ENST00000493116.1 ; transcript_alias_3 SOX2-OT-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350350.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT093473 ;
chr7	lncipedia.org	exon	141423702	141423824	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1147-2 ; transcript_id lnc-KIAA1147-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000228775 ; gene_alias_2 RP5-894A10.5 ; gene_alias_3 ENSG00000228775.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000157538.1 ; gene_alias_5 WEE2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000486906 ; transcript_alias_2 ENST00000486906.1 ; transcript_alias_3 RP5-894A10.5-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000349101.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123741 ;
chr7	lncipedia.org	exon	141427792	141427945	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1147-2 ; transcript_id lnc-KIAA1147-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000228775 ; gene_alias_2 RP5-894A10.5 ; gene_alias_3 ENSG00000228775.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000157538.1 ; gene_alias_5 WEE2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000486906 ; transcript_alias_2 ENST00000486906.1 ; transcript_alias_3 RP5-894A10.5-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000349101.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123741 ;
chr7	lncipedia.org	exon	141437183	141437575	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1147-2 ; transcript_id lnc-KIAA1147-2:9 ; gene_alias_1 ENSG00000228775 ; gene_alias_2 RP5-894A10.5 ; gene_alias_3 ENSG00000228775.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000157538.1 ; gene_alias_5 WEE2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000486906 ; transcript_alias_2 ENST00000486906.1 ; transcript_alias_3 RP5-894A10.5-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000349101.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123741 ;
chr15	lncipedia.org	exon	57596923	57598820	.	+	.	gene_id lnc-TCF12-1 ; transcript_id lnc-TCF12-1:17 ; gene_alias_1 ENSG00000247982 ; gene_alias_2 XLOC_011264 ; gene_alias_3 linc-CGNL1-2 ; gene_alias_4 AC016525.1 ; gene_alias_5 ENSG00000247982.2 ; gene_alias_6 RP11-358M11.2 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000172641.1 ; gene_alias_8 LINC00926 ; transcript_alias_1 ENST00000502027 ; transcript_alias_2 TCONS_00023264 ; transcript_alias_3 ENST00000502027.1 ; transcript_alias_4 RP11-358M11.2-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000419623.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT044066 ;
chr15	lncipedia.org	exon	57599241	57599266	.	+	.	gene_id lnc-TCF12-1 ; transcript_id lnc-TCF12-1:17 ; gene_alias_1 ENSG00000247982 ; gene_alias_2 XLOC_011264 ; gene_alias_3 linc-CGNL1-2 ; gene_alias_4 AC016525.1 ; gene_alias_5 ENSG00000247982.2 ; gene_alias_6 RP11-358M11.2 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000172641.1 ; gene_alias_8 LINC00926 ; transcript_alias_1 ENST00000502027 ; transcript_alias_2 TCONS_00023264 ; transcript_alias_3 ENST00000502027.1 ; transcript_alias_4 RP11-358M11.2-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000419623.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT044066 ;
chr15	lncipedia.org	exon	57599740	57599956	.	+	.	gene_id lnc-TCF12-1 ; transcript_id lnc-TCF12-1:17 ; gene_alias_1 ENSG00000247982 ; gene_alias_2 XLOC_011264 ; gene_alias_3 linc-CGNL1-2 ; gene_alias_4 AC016525.1 ; gene_alias_5 ENSG00000247982.2 ; gene_alias_6 RP11-358M11.2 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000172641.1 ; gene_alias_8 LINC00926 ; transcript_alias_1 ENST00000502027 ; transcript_alias_2 TCONS_00023264 ; transcript_alias_3 ENST00000502027.1 ; transcript_alias_4 RP11-358M11.2-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000419623.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT044066 ;
chr15	lncipedia.org	exon	32898619	32898860	.	-	.	gene_id lnc-FMN1-5 ; transcript_id lnc-FMN1-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244952 ; gene_alias_2 AC123768.6 ; gene_alias_3 ENSG00000262728.1 ; gene_alias_4 AC123768.4 ; transcript_alias_1 ENST00000500941 ; transcript_alias_2 ENST00000576873.1 ; transcript_alias_3 AC123768.4-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT041514 ;
chr15	lncipedia.org	exon	32906638	32907361	.	-	.	gene_id lnc-FMN1-5 ; transcript_id lnc-FMN1-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244952 ; gene_alias_2 AC123768.6 ; gene_alias_3 ENSG00000262728.1 ; gene_alias_4 AC123768.4 ; transcript_alias_1 ENST00000500941 ; transcript_alias_2 ENST00000576873.1 ; transcript_alias_3 AC123768.4-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT041514 ;
chr1	lncipedia.org	exon	2481359	2481713	.	-	.	gene_id lnc-HES5-1 ; transcript_id lnc-HES5-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000238164 ; gene_alias_2 RP3-395M20.8 ; gene_alias_3 ENSG00000238164.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000000818.3 ; transcript_alias_1 ENST00000449660 ; transcript_alias_2 ENST00000449660.1 ; transcript_alias_3 RP3-395M20.8-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000002186.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	2482012	2482170	.	-	.	gene_id lnc-HES5-1 ; transcript_id lnc-HES5-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000238164 ; gene_alias_2 RP3-395M20.8 ; gene_alias_3 ENSG00000238164.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000000818.3 ; transcript_alias_1 ENST00000449660 ; transcript_alias_2 ENST00000449660.1 ; transcript_alias_3 RP3-395M20.8-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000002186.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	2482431	2483545	.	-	.	gene_id lnc-HES5-1 ; transcript_id lnc-HES5-1:8 ; gene_alias_1 ENSG00000238164 ; gene_alias_2 RP3-395M20.8 ; gene_alias_3 ENSG00000238164.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000000818.3 ; transcript_alias_1 ENST00000449660 ; transcript_alias_2 ENST00000449660.1 ; transcript_alias_3 RP3-395M20.8-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000002186.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	8858134	8858323	.	+	.	gene_id lnc-KDM4C-8 ; transcript_id lnc-KDM4C-8:2 ; gene_alias_1 ENSG00000225706 ; gene_alias_2 RP11-75C9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000225706.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000019543.1 ; transcript_alias_1 ENST00000430766 ; transcript_alias_2 ENST00000430766.1 ; transcript_alias_3 RP11-75C9.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000051710.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT130193 ;
chr9	lncipedia.org	exon	8859956	8861724	.	+	.	gene_id lnc-KDM4C-8 ; transcript_id lnc-KDM4C-8:2 ; gene_alias_1 ENSG00000225706 ; gene_alias_2 RP11-75C9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000225706.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000019543.1 ; transcript_alias_1 ENST00000430766 ; transcript_alias_2 ENST00000430766.1 ; transcript_alias_3 RP11-75C9.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000051710.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT130193 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27053578	27053618	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:26 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 MIAT ; gene_alias_5 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000453023 ; transcript_alias_2 TCONS_00029386 ; transcript_alias_3 ENST00000453023.1 ; transcript_alias_4 MIAT-023 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320818.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084529 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27059280	27059473	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:26 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 MIAT ; gene_alias_5 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000453023 ; transcript_alias_2 TCONS_00029386 ; transcript_alias_3 ENST00000453023.1 ; transcript_alias_4 MIAT-023 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320818.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084529 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27061421	27061757	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:26 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 MIAT ; gene_alias_5 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000453023 ; transcript_alias_2 TCONS_00029386 ; transcript_alias_3 ENST00000453023.1 ; transcript_alias_4 MIAT-023 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320818.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084529 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114290865	114291442	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000519104 ; transcript_alias_2 ENST00000519104.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379761.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114584 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114313057	114313182	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000519104 ; transcript_alias_2 ENST00000519104.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379761.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114584 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114314507	114314651	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000519104 ; transcript_alias_2 ENST00000519104.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379761.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114584 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114316764	114317224	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000519104 ; transcript_alias_2 ENST00000519104.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379761.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114584 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114410101	114410183	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000519104 ; transcript_alias_2 ENST00000519104.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379761.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114584 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114437282	114437344	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000519104 ; transcript_alias_2 ENST00000519104.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379761.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114584 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114499817	114499884	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000519104 ; transcript_alias_2 ENST00000519104.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379761.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114584 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114500189	114500321	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000519104 ; transcript_alias_2 ENST00000519104.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379761.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114584 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114556794	114556935	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000519104 ; transcript_alias_2 ENST00000519104.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379761.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114584 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114661686	114661902	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000519104 ; transcript_alias_2 ENST00000519104.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379761.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114584 ;
chr4	lncipedia.org	exon	110351119	110351936	.	-	.	gene_id lnc-COL25A1-1 ; transcript_id lnc-COL25A1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247950 ; gene_alias_2 RP11-264J9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247950.2 ; gene_alias_4 SEC24B-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000161048.2 ; transcript_alias_1 ENST00000499359 ; transcript_alias_2 ENST00000499359.2 ; transcript_alias_3 SEC24B-AS1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000363576.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT097781 ; transcript_alias_6 NR_039978 ;
chr4	lncipedia.org	exon	110352848	110352902	.	-	.	gene_id lnc-COL25A1-1 ; transcript_id lnc-COL25A1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247950 ; gene_alias_2 RP11-264J9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247950.2 ; gene_alias_4 SEC24B-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000161048.2 ; transcript_alias_1 ENST00000499359 ; transcript_alias_2 ENST00000499359.2 ; transcript_alias_3 SEC24B-AS1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000363576.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT097781 ; transcript_alias_6 NR_039978 ;
chr4	lncipedia.org	exon	110354890	110354973	.	-	.	gene_id lnc-COL25A1-1 ; transcript_id lnc-COL25A1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247950 ; gene_alias_2 RP11-264J9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247950.2 ; gene_alias_4 SEC24B-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000161048.2 ; transcript_alias_1 ENST00000499359 ; transcript_alias_2 ENST00000499359.2 ; transcript_alias_3 SEC24B-AS1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000363576.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT097781 ; transcript_alias_6 NR_039978 ;
chr12	lncipedia.org	exon	72667232	72667725	.	-	.	gene_id lnc-ZFC3H1-6 ; transcript_id lnc-ZFC3H1-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236333 ; gene_alias_2 AC087886.1 ; gene_alias_3 ENSG00000236333.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150370.2 ; transcript_alias_1 ENST00000552396 ; transcript_alias_2 ENST00000552396.1 ; transcript_alias_3 AC087886.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405388.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029468 ;
chr12	lncipedia.org	exon	72668600	72668687	.	-	.	gene_id lnc-ZFC3H1-6 ; transcript_id lnc-ZFC3H1-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236333 ; gene_alias_2 AC087886.1 ; gene_alias_3 ENSG00000236333.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150370.2 ; transcript_alias_1 ENST00000552396 ; transcript_alias_2 ENST00000552396.1 ; transcript_alias_3 AC087886.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405388.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029468 ;
chr2	lncipedia.org	exon	74612630	74612877	.	+	.	gene_id lnc-WDR54-1 ; transcript_id lnc-WDR54-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000237737 ; gene_alias_2 AC005041.9 ; gene_alias_3 ENSG00000237737.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152826.1 ; gene_alias_5 DCTN1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000427343 ; transcript_alias_2 ENST00000427343.1 ; transcript_alias_3 AC005041.9-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000328160.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT071689 ;
chr2	lncipedia.org	exon	74618286	74618370	.	+	.	gene_id lnc-WDR54-1 ; transcript_id lnc-WDR54-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000237737 ; gene_alias_2 AC005041.9 ; gene_alias_3 ENSG00000237737.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152826.1 ; gene_alias_5 DCTN1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000427343 ; transcript_alias_2 ENST00000427343.1 ; transcript_alias_3 AC005041.9-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000328160.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT071689 ;
chr2	lncipedia.org	exon	74619116	74619360	.	+	.	gene_id lnc-WDR54-1 ; transcript_id lnc-WDR54-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000237737 ; gene_alias_2 AC005041.9 ; gene_alias_3 ENSG00000237737.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152826.1 ; gene_alias_5 DCTN1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000427343 ; transcript_alias_2 ENST00000427343.1 ; transcript_alias_3 AC005041.9-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000328160.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT071689 ;
chr3	lncipedia.org	exon	172427787	172429793	.	+	.	gene_id lnc-ECT2-1 ; transcript_id lnc-ECT2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246811 ; transcript_alias_1 ENST00000501930 ;
chr3	lncipedia.org	exon	172441574	172443930	.	+	.	gene_id lnc-ECT2-1 ; transcript_id lnc-ECT2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246811 ; transcript_alias_1 ENST00000501930 ;
chr4	lncipedia.org	exon	14911585	14912392	.	-	.	gene_id lnc-FBXL5-3 ; transcript_id lnc-FBXL5-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247624 ; gene_alias_2 AC006296.3 ; gene_alias_3 ENSG00000247624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160381.3 ; gene_alias_5 CPEB2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500394 ; transcript_alias_2 ENST00000500394.2 ; transcript_alias_3 AC006296.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000360403.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT095610 ; transcript_alias_6 NR_038857 ;
chr4	lncipedia.org	exon	14986845	14987000	.	-	.	gene_id lnc-FBXL5-3 ; transcript_id lnc-FBXL5-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247624 ; gene_alias_2 AC006296.3 ; gene_alias_3 ENSG00000247624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160381.3 ; gene_alias_5 CPEB2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500394 ; transcript_alias_2 ENST00000500394.2 ; transcript_alias_3 AC006296.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000360403.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT095610 ; transcript_alias_6 NR_038857 ;
chr4	lncipedia.org	exon	14992078	14992178	.	-	.	gene_id lnc-FBXL5-3 ; transcript_id lnc-FBXL5-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247624 ; gene_alias_2 AC006296.3 ; gene_alias_3 ENSG00000247624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160381.3 ; gene_alias_5 CPEB2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500394 ; transcript_alias_2 ENST00000500394.2 ; transcript_alias_3 AC006296.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000360403.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT095610 ; transcript_alias_6 NR_038857 ;
chr4	lncipedia.org	exon	14994336	14994526	.	-	.	gene_id lnc-FBXL5-3 ; transcript_id lnc-FBXL5-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247624 ; gene_alias_2 AC006296.3 ; gene_alias_3 ENSG00000247624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160381.3 ; gene_alias_5 CPEB2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500394 ; transcript_alias_2 ENST00000500394.2 ; transcript_alias_3 AC006296.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000360403.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT095610 ; transcript_alias_6 NR_038857 ;
chr4	lncipedia.org	exon	14996878	14996974	.	-	.	gene_id lnc-FBXL5-3 ; transcript_id lnc-FBXL5-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247624 ; gene_alias_2 AC006296.3 ; gene_alias_3 ENSG00000247624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160381.3 ; gene_alias_5 CPEB2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500394 ; transcript_alias_2 ENST00000500394.2 ; transcript_alias_3 AC006296.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000360403.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT095610 ; transcript_alias_6 NR_038857 ;
chr4	lncipedia.org	exon	15002785	15002853	.	-	.	gene_id lnc-FBXL5-3 ; transcript_id lnc-FBXL5-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247624 ; gene_alias_2 AC006296.3 ; gene_alias_3 ENSG00000247624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160381.3 ; gene_alias_5 CPEB2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500394 ; transcript_alias_2 ENST00000500394.2 ; transcript_alias_3 AC006296.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000360403.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT095610 ; transcript_alias_6 NR_038857 ;
chr4	lncipedia.org	exon	15003250	15003349	.	-	.	gene_id lnc-FBXL5-3 ; transcript_id lnc-FBXL5-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247624 ; gene_alias_2 AC006296.3 ; gene_alias_3 ENSG00000247624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160381.3 ; gene_alias_5 CPEB2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500394 ; transcript_alias_2 ENST00000500394.2 ; transcript_alias_3 AC006296.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000360403.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT095610 ; transcript_alias_6 NR_038857 ;
chr4	lncipedia.org	exon	15003562	15003669	.	-	.	gene_id lnc-FBXL5-3 ; transcript_id lnc-FBXL5-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247624 ; gene_alias_2 AC006296.3 ; gene_alias_3 ENSG00000247624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160381.3 ; gene_alias_5 CPEB2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500394 ; transcript_alias_2 ENST00000500394.2 ; transcript_alias_3 AC006296.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000360403.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT095610 ; transcript_alias_6 NR_038857 ;
chr3	lncipedia.org	exon	186172771	186172963	.	-	.	gene_id lnc-CRYGS-1 ; transcript_id lnc-CRYGS-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000224406 ; gene_alias_2 XLOC_003358 ; gene_alias_3 linc-DGKG ; gene_alias_4 RP11-48F14.1 ; gene_alias_5 ENSG00000224406.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000156618.1 ; transcript_alias_1 ENST00000427474 ; transcript_alias_2 TCONS_00005905 ; transcript_alias_3 ENST00000427474.1 ; transcript_alias_4 RP11-48F14.1-004 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000344806.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT093820 ;
chr3	lncipedia.org	exon	186173437	186173562	.	-	.	gene_id lnc-CRYGS-1 ; transcript_id lnc-CRYGS-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000224406 ; gene_alias_2 XLOC_003358 ; gene_alias_3 linc-DGKG ; gene_alias_4 RP11-48F14.1 ; gene_alias_5 ENSG00000224406.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000156618.1 ; transcript_alias_1 ENST00000427474 ; transcript_alias_2 TCONS_00005905 ; transcript_alias_3 ENST00000427474.1 ; transcript_alias_4 RP11-48F14.1-004 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000344806.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT093820 ;
chr3	lncipedia.org	exon	186173777	186173825	.	-	.	gene_id lnc-CRYGS-1 ; transcript_id lnc-CRYGS-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000224406 ; gene_alias_2 XLOC_003358 ; gene_alias_3 linc-DGKG ; gene_alias_4 RP11-48F14.1 ; gene_alias_5 ENSG00000224406.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000156618.1 ; transcript_alias_1 ENST00000427474 ; transcript_alias_2 TCONS_00005905 ; transcript_alias_3 ENST00000427474.1 ; transcript_alias_4 RP11-48F14.1-004 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000344806.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT093820 ;
chr2	lncipedia.org	exon	64834495	64834554	.	+	.	gene_id lnc-AFTPH-1 ; transcript_id lnc-AFTPH-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000233694 ; gene_alias_2 AC007365.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233694.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152679.1 ; transcript_alias_1 ENST00000417695 ; transcript_alias_2 ENST00000417695.1 ; transcript_alias_3 AC007365.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000327324.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	64839900	64840219	.	+	.	gene_id lnc-AFTPH-1 ; transcript_id lnc-AFTPH-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000233694 ; gene_alias_2 AC007365.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233694.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152679.1 ; transcript_alias_1 ENST00000417695 ; transcript_alias_2 ENST00000417695.1 ; transcript_alias_3 AC007365.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000327324.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	64840312	64840424	.	+	.	gene_id lnc-AFTPH-1 ; transcript_id lnc-AFTPH-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000233694 ; gene_alias_2 AC007365.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233694.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152679.1 ; transcript_alias_1 ENST00000417695 ; transcript_alias_2 ENST00000417695.1 ; transcript_alias_3 AC007365.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000327324.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	64842388	64843616	.	+	.	gene_id lnc-AFTPH-1 ; transcript_id lnc-AFTPH-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000233694 ; gene_alias_2 AC007365.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233694.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152679.1 ; transcript_alias_1 ENST00000417695 ; transcript_alias_2 ENST00000417695.1 ; transcript_alias_3 AC007365.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000327324.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	71547044	71547096	.	+	.	gene_id lnc-CTH-6 ; transcript_id lnc-CTH-6:3 ; gene_alias_1 ENSG00000229956 ; gene_alias_2 RP11-386O9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229956.2 ; gene_alias_4 ZRANB2-AS2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000009662.2 ; gene_alias_6 ENSG00000229956.5 ; transcript_alias_1 ENST00000413421 ; transcript_alias_2 ENST00000413421.1 ; transcript_alias_3 ZRANB2-AS2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000026643.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003889 ;
chr1	lncipedia.org	exon	71557347	71557387	.	+	.	gene_id lnc-CTH-6 ; transcript_id lnc-CTH-6:3 ; gene_alias_1 ENSG00000229956 ; gene_alias_2 RP11-386O9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229956.2 ; gene_alias_4 ZRANB2-AS2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000009662.2 ; gene_alias_6 ENSG00000229956.5 ; transcript_alias_1 ENST00000413421 ; transcript_alias_2 ENST00000413421.1 ; transcript_alias_3 ZRANB2-AS2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000026643.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003889 ;
chr1	lncipedia.org	exon	71667718	71667814	.	+	.	gene_id lnc-CTH-6 ; transcript_id lnc-CTH-6:3 ; gene_alias_1 ENSG00000229956 ; gene_alias_2 RP11-386O9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229956.2 ; gene_alias_4 ZRANB2-AS2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000009662.2 ; gene_alias_6 ENSG00000229956.5 ; transcript_alias_1 ENST00000413421 ; transcript_alias_2 ENST00000413421.1 ; transcript_alias_3 ZRANB2-AS2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000026643.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003889 ;
chr1	lncipedia.org	exon	71668701	71668776	.	+	.	gene_id lnc-CTH-6 ; transcript_id lnc-CTH-6:3 ; gene_alias_1 ENSG00000229956 ; gene_alias_2 RP11-386O9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229956.2 ; gene_alias_4 ZRANB2-AS2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000009662.2 ; gene_alias_6 ENSG00000229956.5 ; transcript_alias_1 ENST00000413421 ; transcript_alias_2 ENST00000413421.1 ; transcript_alias_3 ZRANB2-AS2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000026643.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003889 ;
chr1	lncipedia.org	exon	71669495	71669603	.	+	.	gene_id lnc-CTH-6 ; transcript_id lnc-CTH-6:3 ; gene_alias_1 ENSG00000229956 ; gene_alias_2 RP11-386O9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229956.2 ; gene_alias_4 ZRANB2-AS2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000009662.2 ; gene_alias_6 ENSG00000229956.5 ; transcript_alias_1 ENST00000413421 ; transcript_alias_2 ENST00000413421.1 ; transcript_alias_3 ZRANB2-AS2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000026643.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003889 ;
chr1	lncipedia.org	exon	71688740	71688797	.	+	.	gene_id lnc-CTH-6 ; transcript_id lnc-CTH-6:3 ; gene_alias_1 ENSG00000229956 ; gene_alias_2 RP11-386O9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229956.2 ; gene_alias_4 ZRANB2-AS2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000009662.2 ; gene_alias_6 ENSG00000229956.5 ; transcript_alias_1 ENST00000413421 ; transcript_alias_2 ENST00000413421.1 ; transcript_alias_3 ZRANB2-AS2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000026643.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003889 ;
chr1	lncipedia.org	exon	71702813	71702878	.	+	.	gene_id lnc-CTH-6 ; transcript_id lnc-CTH-6:3 ; gene_alias_1 ENSG00000229956 ; gene_alias_2 RP11-386O9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229956.2 ; gene_alias_4 ZRANB2-AS2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000009662.2 ; gene_alias_6 ENSG00000229956.5 ; transcript_alias_1 ENST00000413421 ; transcript_alias_2 ENST00000413421.1 ; transcript_alias_3 ZRANB2-AS2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000026643.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003889 ;
chr1	lncipedia.org	exon	71733588	71733913	.	+	.	gene_id lnc-CTH-6 ; transcript_id lnc-CTH-6:3 ; gene_alias_1 ENSG00000229956 ; gene_alias_2 RP11-386O9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000229956.2 ; gene_alias_4 ZRANB2-AS2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000009662.2 ; gene_alias_6 ENSG00000229956.5 ; transcript_alias_1 ENST00000413421 ; transcript_alias_2 ENST00000413421.1 ; transcript_alias_3 ZRANB2-AS2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000026643.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003889 ;
chr11	lncipedia.org	exon	111284967	111285465	.	-	.	gene_id lnc-BTG4-2 ; transcript_id lnc-BTG4-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255428 ; gene_alias_2 RP11-794P6.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255428.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166660.1 ; transcript_alias_1 ENST00000528614 ; transcript_alias_2 ENST00000528614.1 ; transcript_alias_3 RP11-794P6.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391020.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT024107 ; transcript_alias_6 NR_046085 ;
chr11	lncipedia.org	exon	111285563	111285706	.	-	.	gene_id lnc-BTG4-2 ; transcript_id lnc-BTG4-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255428 ; gene_alias_2 RP11-794P6.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255428.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166660.1 ; transcript_alias_1 ENST00000528614 ; transcript_alias_2 ENST00000528614.1 ; transcript_alias_3 RP11-794P6.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391020.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT024107 ; transcript_alias_6 NR_046085 ;
chr11	lncipedia.org	exon	111286644	111286765	.	-	.	gene_id lnc-BTG4-2 ; transcript_id lnc-BTG4-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255428 ; gene_alias_2 RP11-794P6.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255428.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166660.1 ; transcript_alias_1 ENST00000528614 ; transcript_alias_2 ENST00000528614.1 ; transcript_alias_3 RP11-794P6.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391020.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT024107 ; transcript_alias_6 NR_046085 ;
chr11	lncipedia.org	exon	111287090	111288911	.	-	.	gene_id lnc-BTG4-2 ; transcript_id lnc-BTG4-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255428 ; gene_alias_2 RP11-794P6.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255428.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166660.1 ; transcript_alias_1 ENST00000528614 ; transcript_alias_2 ENST00000528614.1 ; transcript_alias_3 RP11-794P6.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000391020.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT024107 ; transcript_alias_6 NR_046085 ;
chr8	lncipedia.org	exon	91660976	91661093	.	+	.	gene_id lnc-NECAB1-1 ; transcript_id lnc-NECAB1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000246792 ; gene_alias_2 RP11-68L18.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246792.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164007.1 ; transcript_alias_1 ENST00000522132 ; transcript_alias_2 ENST00000522132.1 ; transcript_alias_3 RP11-68L18.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000376725.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127659 ;
chr8	lncipedia.org	exon	91663632	91663790	.	+	.	gene_id lnc-NECAB1-1 ; transcript_id lnc-NECAB1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000246792 ; gene_alias_2 RP11-68L18.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246792.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164007.1 ; transcript_alias_1 ENST00000522132 ; transcript_alias_2 ENST00000522132.1 ; transcript_alias_3 RP11-68L18.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000376725.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127659 ;
chr8	lncipedia.org	exon	91668742	91668826	.	+	.	gene_id lnc-NECAB1-1 ; transcript_id lnc-NECAB1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000246792 ; gene_alias_2 RP11-68L18.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246792.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164007.1 ; transcript_alias_1 ENST00000522132 ; transcript_alias_2 ENST00000522132.1 ; transcript_alias_3 RP11-68L18.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000376725.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127659 ;
chr12	lncipedia.org	exon	73509789	73510351	.	-	.	gene_id lnc-ZFC3H1-8 ; transcript_id lnc-ZFC3H1-8:4 ; gene_alias_1 ENSG00000258294 ; gene_alias_2 RP11-314D7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258294.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169671.1 ; transcript_alias_1 ENST00000552541 ; transcript_alias_2 ENST00000552541.1 ; transcript_alias_3 RP11-314D7.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405359.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029483 ;
chr12	lncipedia.org	exon	73521670	73521796	.	-	.	gene_id lnc-ZFC3H1-8 ; transcript_id lnc-ZFC3H1-8:4 ; gene_alias_1 ENSG00000258294 ; gene_alias_2 RP11-314D7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258294.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169671.1 ; transcript_alias_1 ENST00000552541 ; transcript_alias_2 ENST00000552541.1 ; transcript_alias_3 RP11-314D7.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405359.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029483 ;
chr12	lncipedia.org	exon	73522872	73522942	.	-	.	gene_id lnc-ZFC3H1-8 ; transcript_id lnc-ZFC3H1-8:4 ; gene_alias_1 ENSG00000258294 ; gene_alias_2 RP11-314D7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258294.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169671.1 ; transcript_alias_1 ENST00000552541 ; transcript_alias_2 ENST00000552541.1 ; transcript_alias_3 RP11-314D7.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405359.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029483 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101536824	101537076	.	-	.	gene_id lnc-RTL1-2 ; transcript_id lnc-RTL1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000248952 ; gene_alias_2 XLOC_011130 ; gene_alias_3 linc-RTL1-6 ; transcript_alias_1 ENST00000514741 ; transcript_alias_2 TCONS_00022413 ; transcript_alias_3 NONHSAT040001 ;
chr14	lncipedia.org	exon	101537120	101539261	.	-	.	gene_id lnc-RTL1-2 ; transcript_id lnc-RTL1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000248952 ; gene_alias_2 XLOC_011130 ; gene_alias_3 linc-RTL1-6 ; transcript_alias_1 ENST00000514741 ; transcript_alias_2 TCONS_00022413 ; transcript_alias_3 NONHSAT040001 ;
chr7	lncipedia.org	exon	27154967	27155962	.	+	.	gene_id lnc-EVX1-10 ; transcript_id lnc-EVX1-10:3 ; gene_alias_1 ENSG00000253552 ; gene_alias_2 AC004080.12 ; gene_alias_3 ENSG00000253552.2 ; gene_alias_4 HOXA-AS2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000063274.3 ; gene_alias_6 ENSG00000253552.3 ; transcript_alias_1 ENST00000517635 ; transcript_alias_2 ENST00000517635.2 ; transcript_alias_3 HOXA-AS2-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000082076.4 ;
chr7	lncipedia.org	exon	27161538	27162996	.	+	.	gene_id lnc-EVX1-10 ; transcript_id lnc-EVX1-10:3 ; gene_alias_1 ENSG00000253552 ; gene_alias_2 AC004080.12 ; gene_alias_3 ENSG00000253552.2 ; gene_alias_4 HOXA-AS2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000063274.3 ; gene_alias_6 ENSG00000253552.3 ; transcript_alias_1 ENST00000517635 ; transcript_alias_2 ENST00000517635.2 ; transcript_alias_3 HOXA-AS2-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000082076.4 ;
chr2	lncipedia.org	exon	61370690	61371401	.	-	.	gene_id lnc-USP34-1 ; transcript_id lnc-USP34-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000212978 ; gene_alias_2 AC016747.3 ; gene_alias_3 ENSG00000212978.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152156.3 ; gene_alias_5 ENSG00000212978.5 ; transcript_alias_1 ENST00000417691 ; transcript_alias_2 ENST00000417691.1 ; transcript_alias_3 AC016747.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000325688.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT070930 ;
chr2	lncipedia.org	exon	61371908	61372087	.	-	.	gene_id lnc-USP34-1 ; transcript_id lnc-USP34-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000212978 ; gene_alias_2 AC016747.3 ; gene_alias_3 ENSG00000212978.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152156.3 ; gene_alias_5 ENSG00000212978.5 ; transcript_alias_1 ENST00000417691 ; transcript_alias_2 ENST00000417691.1 ; transcript_alias_3 AC016747.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000325688.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT070930 ;
chr3	lncipedia.org	exon	107149777	107149805	.	+	.	gene_id lnc-CCDC54-1 ; transcript_id lnc-CCDC54-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245070 ; gene_alias_2 AC068765.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499000 ;
chr3	lncipedia.org	exon	107179520	107179637	.	+	.	gene_id lnc-CCDC54-1 ; transcript_id lnc-CCDC54-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245070 ; gene_alias_2 AC068765.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499000 ;
chr3	lncipedia.org	exon	107181420	107182756	.	+	.	gene_id lnc-CCDC54-1 ; transcript_id lnc-CCDC54-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245070 ; gene_alias_2 AC068765.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499000 ;
chr1	lncipedia.org	exon	234791871	234791979	.	+	.	gene_id lnc-C1orf31-6 ; transcript_id lnc-C1orf31-6:3 ; gene_alias_1 ENSG00000228044 ; gene_alias_2 XLOC_000624 ; gene_alias_3 linc-GGPS1-4 ; gene_alias_4 RP4-781K5.4 ; gene_alias_5 ENSG00000228044.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000037980.1 ; transcript_alias_1 ENST00000449012 ; transcript_alias_2 TCONS_00000421 ; transcript_alias_3 ENST00000449012.1 ; transcript_alias_4 RP4-781K5.4-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000092702.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT010297 ;
chr1	lncipedia.org	exon	234816557	234816868	.	+	.	gene_id lnc-C1orf31-6 ; transcript_id lnc-C1orf31-6:3 ; gene_alias_1 ENSG00000228044 ; gene_alias_2 XLOC_000624 ; gene_alias_3 linc-GGPS1-4 ; gene_alias_4 RP4-781K5.4 ; gene_alias_5 ENSG00000228044.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000037980.1 ; transcript_alias_1 ENST00000449012 ; transcript_alias_2 TCONS_00000421 ; transcript_alias_3 ENST00000449012.1 ; transcript_alias_4 RP4-781K5.4-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000092702.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT010297 ;
chr6	lncipedia.org	exon	28089573	28090989	.	-	.	gene_id lnc-ZKSCAN4-1 ; transcript_id lnc-ZKSCAN4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224024 ; gene_alias_2 ENSG00000269293.2 ; gene_alias_3 ZSCAN16-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000440300 ; transcript_alias_2 ENST00000600652.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	28093401	28093597	.	-	.	gene_id lnc-ZKSCAN4-1 ; transcript_id lnc-ZKSCAN4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224024 ; gene_alias_2 ENSG00000269293.2 ; gene_alias_3 ZSCAN16-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000440300 ; transcript_alias_2 ENST00000600652.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	28104523	28105071	.	-	.	gene_id lnc-ZKSCAN4-1 ; transcript_id lnc-ZKSCAN4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224024 ; gene_alias_2 ENSG00000269293.2 ; gene_alias_3 ZSCAN16-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000440300 ; transcript_alias_2 ENST00000600652.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	177041208	177041420	.	-	.	gene_id lnc-AC009336.1-2 ; transcript_id lnc-AC009336.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000224189 ; gene_alias_2 AC009336.23 ; gene_alias_3 ENSG00000224189.2 ; gene_alias_4 HOXD-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000154172.2 ; transcript_alias_1 ENST00000425005 ; transcript_alias_2 ENST00000425005.1 ; transcript_alias_3 HOXD-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000334218.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075646 ;
chr2	lncipedia.org	exon	177042060	177042222	.	-	.	gene_id lnc-AC009336.1-2 ; transcript_id lnc-AC009336.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000224189 ; gene_alias_2 AC009336.23 ; gene_alias_3 ENSG00000224189.2 ; gene_alias_4 HOXD-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000154172.2 ; transcript_alias_1 ENST00000425005 ; transcript_alias_2 ENST00000425005.1 ; transcript_alias_3 HOXD-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000334218.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075646 ;
chr2	lncipedia.org	exon	177042439	177042554	.	-	.	gene_id lnc-AC009336.1-2 ; transcript_id lnc-AC009336.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000224189 ; gene_alias_2 AC009336.23 ; gene_alias_3 ENSG00000224189.2 ; gene_alias_4 HOXD-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000154172.2 ; transcript_alias_1 ENST00000425005 ; transcript_alias_2 ENST00000425005.1 ; transcript_alias_3 HOXD-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000334218.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075646 ;
chr2	lncipedia.org	exon	177043757	177043826	.	-	.	gene_id lnc-AC009336.1-2 ; transcript_id lnc-AC009336.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000224189 ; gene_alias_2 AC009336.23 ; gene_alias_3 ENSG00000224189.2 ; gene_alias_4 HOXD-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000154172.2 ; transcript_alias_1 ENST00000425005 ; transcript_alias_2 ENST00000425005.1 ; transcript_alias_3 HOXD-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000334218.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075646 ;
chr2	lncipedia.org	exon	177053147	177053207	.	-	.	gene_id lnc-AC009336.1-2 ; transcript_id lnc-AC009336.1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000224189 ; gene_alias_2 AC009336.23 ; gene_alias_3 ENSG00000224189.2 ; gene_alias_4 HOXD-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000154172.2 ; transcript_alias_1 ENST00000425005 ; transcript_alias_2 ENST00000425005.1 ; transcript_alias_3 HOXD-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000334218.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075646 ;
chr1	lncipedia.org	exon	54515817	54516126	.	+	.	gene_id lnc-TCEANC2-1 ; transcript_id lnc-TCEANC2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248303 ; transcript_alias_1 ENST00000509052 ;
chr1	lncipedia.org	exon	54517248	54518429	.	+	.	gene_id lnc-TCEANC2-1 ; transcript_id lnc-TCEANC2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248303 ; transcript_alias_1 ENST00000509052 ;
chr21	lncipedia.org	exon	19933583	19934009	.	-	.	gene_id lnc-TMPRSS15-3 ; transcript_id lnc-TMPRSS15-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224141 ; gene_alias_2 AL109763.2 ; gene_alias_3 ENSG00000224141.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000074544.1 ; transcript_alias_1 ENST00000437492 ; transcript_alias_2 ENST00000437492.1 ; transcript_alias_3 AL109763.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000158276.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT081310 ;
chr21	lncipedia.org	exon	19961845	19961938	.	-	.	gene_id lnc-TMPRSS15-3 ; transcript_id lnc-TMPRSS15-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224141 ; gene_alias_2 AL109763.2 ; gene_alias_3 ENSG00000224141.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000074544.1 ; transcript_alias_1 ENST00000437492 ; transcript_alias_2 ENST00000437492.1 ; transcript_alias_3 AL109763.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000158276.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT081310 ;
chr21	lncipedia.org	exon	20110242	20110343	.	-	.	gene_id lnc-TMPRSS15-3 ; transcript_id lnc-TMPRSS15-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224141 ; gene_alias_2 AL109763.2 ; gene_alias_3 ENSG00000224141.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000074544.1 ; transcript_alias_1 ENST00000437492 ; transcript_alias_2 ENST00000437492.1 ; transcript_alias_3 AL109763.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000158276.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT081310 ;
chr21	lncipedia.org	exon	20132092	20132321	.	-	.	gene_id lnc-TMPRSS15-3 ; transcript_id lnc-TMPRSS15-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224141 ; gene_alias_2 AL109763.2 ; gene_alias_3 ENSG00000224141.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000074544.1 ; transcript_alias_1 ENST00000437492 ; transcript_alias_2 ENST00000437492.1 ; transcript_alias_3 AL109763.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000158276.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT081310 ;
chr21	lncipedia.org	exon	43131680	43133160	.	-	.	gene_id lnc-RIPK4-1 ; transcript_id lnc-RIPK4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236384 ; gene_alias_2 C21orf129 ; gene_alias_3 ENSG00000236384.2 ; gene_alias_4 LINC00479 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000086773.4 ; gene_alias_6 ENSG00000236384.3 ; transcript_alias_1 ENST00000412102 ; transcript_alias_2 ENST00000412102.1 ; transcript_alias_3 LINC00479-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000195207.3 ; transcript_alias_5 NONHSAT082274 ; transcript_alias_6 NR_027272 ;
chr21	lncipedia.org	exon	43133711	43133832	.	-	.	gene_id lnc-RIPK4-1 ; transcript_id lnc-RIPK4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236384 ; gene_alias_2 C21orf129 ; gene_alias_3 ENSG00000236384.2 ; gene_alias_4 LINC00479 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000086773.4 ; gene_alias_6 ENSG00000236384.3 ; transcript_alias_1 ENST00000412102 ; transcript_alias_2 ENST00000412102.1 ; transcript_alias_3 LINC00479-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000195207.3 ; transcript_alias_5 NONHSAT082274 ; transcript_alias_6 NR_027272 ;
chr21	lncipedia.org	exon	43134180	43134292	.	-	.	gene_id lnc-RIPK4-1 ; transcript_id lnc-RIPK4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236384 ; gene_alias_2 C21orf129 ; gene_alias_3 ENSG00000236384.2 ; gene_alias_4 LINC00479 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000086773.4 ; gene_alias_6 ENSG00000236384.3 ; transcript_alias_1 ENST00000412102 ; transcript_alias_2 ENST00000412102.1 ; transcript_alias_3 LINC00479-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000195207.3 ; transcript_alias_5 NONHSAT082274 ; transcript_alias_6 NR_027272 ;
chr21	lncipedia.org	exon	43134394	43134512	.	-	.	gene_id lnc-RIPK4-1 ; transcript_id lnc-RIPK4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236384 ; gene_alias_2 C21orf129 ; gene_alias_3 ENSG00000236384.2 ; gene_alias_4 LINC00479 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000086773.4 ; gene_alias_6 ENSG00000236384.3 ; transcript_alias_1 ENST00000412102 ; transcript_alias_2 ENST00000412102.1 ; transcript_alias_3 LINC00479-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000195207.3 ; transcript_alias_5 NONHSAT082274 ; transcript_alias_6 NR_027272 ;
chr21	lncipedia.org	exon	43135280	43135443	.	-	.	gene_id lnc-RIPK4-1 ; transcript_id lnc-RIPK4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236384 ; gene_alias_2 C21orf129 ; gene_alias_3 ENSG00000236384.2 ; gene_alias_4 LINC00479 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000086773.4 ; gene_alias_6 ENSG00000236384.3 ; transcript_alias_1 ENST00000412102 ; transcript_alias_2 ENST00000412102.1 ; transcript_alias_3 LINC00479-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000195207.3 ; transcript_alias_5 NONHSAT082274 ; transcript_alias_6 NR_027272 ;
chr21	lncipedia.org	exon	43135902	43135935	.	-	.	gene_id lnc-RIPK4-1 ; transcript_id lnc-RIPK4-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236384 ; gene_alias_2 C21orf129 ; gene_alias_3 ENSG00000236384.2 ; gene_alias_4 LINC00479 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000086773.4 ; gene_alias_6 ENSG00000236384.3 ; transcript_alias_1 ENST00000412102 ; transcript_alias_2 ENST00000412102.1 ; transcript_alias_3 LINC00479-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000195207.3 ; transcript_alias_5 NONHSAT082274 ; transcript_alias_6 NR_027272 ;
chr11	lncipedia.org	exon	7456954	7457208	.	-	.	gene_id lnc-CYB5R2-3 ; transcript_id lnc-CYB5R2-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000251364 ; gene_alias_2 ENSG00000251364.2 ; gene_alias_3 CTD-2516F10.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165526.1 ; transcript_alias_1 ENST00000533693 ; transcript_alias_2 ENST00000533693.1 ; transcript_alias_3 CTD-2516F10.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000384648.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017776 ;
chr11	lncipedia.org	exon	7461358	7461470	.	-	.	gene_id lnc-CYB5R2-3 ; transcript_id lnc-CYB5R2-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000251364 ; gene_alias_2 ENSG00000251364.2 ; gene_alias_3 CTD-2516F10.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165526.1 ; transcript_alias_1 ENST00000533693 ; transcript_alias_2 ENST00000533693.1 ; transcript_alias_3 CTD-2516F10.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000384648.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017776 ;
chr11	lncipedia.org	exon	7482470	7482567	.	-	.	gene_id lnc-CYB5R2-3 ; transcript_id lnc-CYB5R2-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000251364 ; gene_alias_2 ENSG00000251364.2 ; gene_alias_3 CTD-2516F10.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165526.1 ; transcript_alias_1 ENST00000533693 ; transcript_alias_2 ENST00000533693.1 ; transcript_alias_3 CTD-2516F10.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000384648.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017776 ;
chr11	lncipedia.org	exon	7486984	7487021	.	-	.	gene_id lnc-CYB5R2-3 ; transcript_id lnc-CYB5R2-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000251364 ; gene_alias_2 ENSG00000251364.2 ; gene_alias_3 CTD-2516F10.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165526.1 ; transcript_alias_1 ENST00000533693 ; transcript_alias_2 ENST00000533693.1 ; transcript_alias_3 CTD-2516F10.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000384648.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017776 ;
chr1	lncipedia.org	exon	65458602	65459264	.	-	.	gene_id lnc-JAK1-1 ; transcript_id lnc-JAK1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000226891 ; gene_alias_2 RP11-182I10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000226891.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009307.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436350 ; transcript_alias_2 ENST00000436350.1 ; transcript_alias_3 RP11-182I10.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000025783.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003720 ;
chr1	lncipedia.org	exon	65460670	65460771	.	-	.	gene_id lnc-JAK1-1 ; transcript_id lnc-JAK1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000226891 ; gene_alias_2 RP11-182I10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000226891.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009307.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436350 ; transcript_alias_2 ENST00000436350.1 ; transcript_alias_3 RP11-182I10.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000025783.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003720 ;
chr1	lncipedia.org	exon	65468088	65468123	.	-	.	gene_id lnc-JAK1-1 ; transcript_id lnc-JAK1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000226891 ; gene_alias_2 RP11-182I10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000226891.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009307.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436350 ; transcript_alias_2 ENST00000436350.1 ; transcript_alias_3 RP11-182I10.3-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000025783.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003720 ;
chr17	lncipedia.org	exon	15555480	15555527	.	-	.	gene_id lnc-ZSWIM7-1 ; transcript_id lnc-ZSWIM7-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248550 ; transcript_alias_1 ENST00000437813 ;
chr17	lncipedia.org	exon	15596563	15596608	.	-	.	gene_id lnc-ZSWIM7-1 ; transcript_id lnc-ZSWIM7-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248550 ; transcript_alias_1 ENST00000437813 ;
chr17	lncipedia.org	exon	15949376	15949795	.	-	.	gene_id lnc-ZSWIM7-1 ; transcript_id lnc-ZSWIM7-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248550 ; transcript_alias_1 ENST00000437813 ;
chr4	lncipedia.org	exon	166651932	166652836	.	-	.	gene_id lnc-TMEM192-1 ; transcript_id lnc-TMEM192-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248358 ; gene_alias_2 XLOC_004147 ; gene_alias_3 linc-TMEM192-2 ; transcript_alias_1 ENST00000509114 ; transcript_alias_2 TCONS_00007892 ; transcript_alias_3 NONHSAT099111 ;
chr4	lncipedia.org	exon	166655825	166656055	.	-	.	gene_id lnc-TMEM192-1 ; transcript_id lnc-TMEM192-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248358 ; gene_alias_2 XLOC_004147 ; gene_alias_3 linc-TMEM192-2 ; transcript_alias_1 ENST00000509114 ; transcript_alias_2 TCONS_00007892 ; transcript_alias_3 NONHSAT099111 ;
chr4	lncipedia.org	exon	166659483	166659847	.	-	.	gene_id lnc-TMEM192-1 ; transcript_id lnc-TMEM192-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248358 ; gene_alias_2 XLOC_004147 ; gene_alias_3 linc-TMEM192-2 ; transcript_alias_1 ENST00000509114 ; transcript_alias_2 TCONS_00007892 ; transcript_alias_3 NONHSAT099111 ;
chr4	lncipedia.org	exon	166664171	166664223	.	-	.	gene_id lnc-TMEM192-1 ; transcript_id lnc-TMEM192-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248358 ; gene_alias_2 XLOC_004147 ; gene_alias_3 linc-TMEM192-2 ; transcript_alias_1 ENST00000509114 ; transcript_alias_2 TCONS_00007892 ; transcript_alias_3 NONHSAT099111 ;
chr12	lncipedia.org	exon	98879322	98880966	.	-	.	gene_id lnc-RP11-181C3.1.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-181C3.1.1-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000245017 ; gene_alias_2 XLOC_010167 ; gene_alias_3 linc-CDK17-4 ; transcript_alias_1 ENST00000501499 ; transcript_alias_2 TCONS_00020218 ; transcript_alias_3 NR_038383 ;
chr12	lncipedia.org	exon	98887209	98887262	.	-	.	gene_id lnc-RP11-181C3.1.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-181C3.1.1-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000245017 ; gene_alias_2 XLOC_010167 ; gene_alias_3 linc-CDK17-4 ; transcript_alias_1 ENST00000501499 ; transcript_alias_2 TCONS_00020218 ; transcript_alias_3 NR_038383 ;
chr12	lncipedia.org	exon	98896361	98896390	.	-	.	gene_id lnc-RP11-181C3.1.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-181C3.1.1-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000245017 ; gene_alias_2 XLOC_010167 ; gene_alias_3 linc-CDK17-4 ; transcript_alias_1 ENST00000501499 ; transcript_alias_2 TCONS_00020218 ; transcript_alias_3 NR_038383 ;
chr12	lncipedia.org	exon	98897538	98897633	.	-	.	gene_id lnc-RP11-181C3.1.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-181C3.1.1-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000245017 ; gene_alias_2 XLOC_010167 ; gene_alias_3 linc-CDK17-4 ; transcript_alias_1 ENST00000501499 ; transcript_alias_2 TCONS_00020218 ; transcript_alias_3 NR_038383 ;
chrX	lncipedia.org	exon	102024107	102024269	.	+	.	gene_id lnc-BHLHB9-1 ; transcript_id lnc-BHLHB9-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000223546 ; gene_alias_2 LL0XNC01-157D4.1 ; gene_alias_3 ENSG00000223546.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022077.1 ; gene_alias_5 LINC00630 ; transcript_alias_1 ENST00000440496 ; transcript_alias_2 ENST00000440496.1 ; transcript_alias_3 LL0XNC01-157D4.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057664.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	102025280	102025348	.	+	.	gene_id lnc-BHLHB9-1 ; transcript_id lnc-BHLHB9-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000223546 ; gene_alias_2 LL0XNC01-157D4.1 ; gene_alias_3 ENSG00000223546.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022077.1 ; gene_alias_5 LINC00630 ; transcript_alias_1 ENST00000440496 ; transcript_alias_2 ENST00000440496.1 ; transcript_alias_3 LL0XNC01-157D4.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057664.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	102071920	102072010	.	+	.	gene_id lnc-BHLHB9-1 ; transcript_id lnc-BHLHB9-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000223546 ; gene_alias_2 LL0XNC01-157D4.1 ; gene_alias_3 ENSG00000223546.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022077.1 ; gene_alias_5 LINC00630 ; transcript_alias_1 ENST00000440496 ; transcript_alias_2 ENST00000440496.1 ; transcript_alias_3 LL0XNC01-157D4.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057664.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	102081897	102082072	.	+	.	gene_id lnc-BHLHB9-1 ; transcript_id lnc-BHLHB9-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000223546 ; gene_alias_2 LL0XNC01-157D4.1 ; gene_alias_3 ENSG00000223546.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022077.1 ; gene_alias_5 LINC00630 ; transcript_alias_1 ENST00000440496 ; transcript_alias_2 ENST00000440496.1 ; transcript_alias_3 LL0XNC01-157D4.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057664.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	102094729	102094791	.	+	.	gene_id lnc-BHLHB9-1 ; transcript_id lnc-BHLHB9-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000223546 ; gene_alias_2 LL0XNC01-157D4.1 ; gene_alias_3 ENSG00000223546.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022077.1 ; gene_alias_5 LINC00630 ; transcript_alias_1 ENST00000440496 ; transcript_alias_2 ENST00000440496.1 ; transcript_alias_3 LL0XNC01-157D4.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057664.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	102100785	102100948	.	+	.	gene_id lnc-BHLHB9-1 ; transcript_id lnc-BHLHB9-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000223546 ; gene_alias_2 LL0XNC01-157D4.1 ; gene_alias_3 ENSG00000223546.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022077.1 ; gene_alias_5 LINC00630 ; transcript_alias_1 ENST00000440496 ; transcript_alias_2 ENST00000440496.1 ; transcript_alias_3 LL0XNC01-157D4.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057664.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	102119970	102120080	.	+	.	gene_id lnc-BHLHB9-1 ; transcript_id lnc-BHLHB9-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000223546 ; gene_alias_2 LL0XNC01-157D4.1 ; gene_alias_3 ENSG00000223546.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022077.1 ; gene_alias_5 LINC00630 ; transcript_alias_1 ENST00000440496 ; transcript_alias_2 ENST00000440496.1 ; transcript_alias_3 LL0XNC01-157D4.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057664.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	102139071	102140334	.	+	.	gene_id lnc-BHLHB9-1 ; transcript_id lnc-BHLHB9-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000223546 ; gene_alias_2 LL0XNC01-157D4.1 ; gene_alias_3 ENSG00000223546.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000022077.1 ; gene_alias_5 LINC00630 ; transcript_alias_1 ENST00000440496 ; transcript_alias_2 ENST00000440496.1 ; transcript_alias_3 LL0XNC01-157D4.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000057664.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	3592880	3598768	.	-	.	gene_id lnc-EFCAB4B-1 ; transcript_id lnc-EFCAB4B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249143 ; gene_alias_2 AC005908.1 ; transcript_alias_1 ENST00000503679 ; transcript_alias_2 NONHSAT025904 ;
chr12	lncipedia.org	exon	3601898	3601975	.	-	.	gene_id lnc-EFCAB4B-1 ; transcript_id lnc-EFCAB4B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249143 ; gene_alias_2 AC005908.1 ; transcript_alias_1 ENST00000503679 ; transcript_alias_2 NONHSAT025904 ;
chr12	lncipedia.org	exon	124997768	124998243	.	+	.	gene_id lnc-FAM101A-3 ; transcript_id lnc-FAM101A-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000214650 ; gene_alias_2 RP11-83B20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000214650.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168623.1 ; transcript_alias_1 ENST00000543970 ; transcript_alias_2 ENST00000543970.1 ; transcript_alias_3 RP11-83B20.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000400414.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031672 ;
chr12	lncipedia.org	exon	124998554	124999359	.	+	.	gene_id lnc-FAM101A-3 ; transcript_id lnc-FAM101A-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000214650 ; gene_alias_2 RP11-83B20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000214650.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168623.1 ; transcript_alias_1 ENST00000543970 ; transcript_alias_2 ENST00000543970.1 ; transcript_alias_3 RP11-83B20.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000400414.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031672 ;
chr3	lncipedia.org	exon	71338920	71339122	.	+	.	gene_id lnc-GPR27-4 ; transcript_id lnc-GPR27-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244203 ; gene_alias_2 FOXP1-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000244203.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158800.2 ; transcript_alias_1 ENST00000465742 ; transcript_alias_2 ENST00000465742.2 ; transcript_alias_3 FOXP1-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352247.2 ;
chr3	lncipedia.org	exon	71341668	71341791	.	+	.	gene_id lnc-GPR27-4 ; transcript_id lnc-GPR27-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244203 ; gene_alias_2 FOXP1-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000244203.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158800.2 ; transcript_alias_1 ENST00000465742 ; transcript_alias_2 ENST00000465742.2 ; transcript_alias_3 FOXP1-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352247.2 ;
chr3	lncipedia.org	exon	71345601	71345658	.	+	.	gene_id lnc-GPR27-4 ; transcript_id lnc-GPR27-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244203 ; gene_alias_2 FOXP1-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000244203.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158800.2 ; transcript_alias_1 ENST00000465742 ; transcript_alias_2 ENST00000465742.2 ; transcript_alias_3 FOXP1-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352247.2 ;
chr3	lncipedia.org	exon	71351879	71352011	.	+	.	gene_id lnc-GPR27-4 ; transcript_id lnc-GPR27-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244203 ; gene_alias_2 FOXP1-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000244203.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158800.2 ; transcript_alias_1 ENST00000465742 ; transcript_alias_2 ENST00000465742.2 ; transcript_alias_3 FOXP1-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352247.2 ;
chr3	lncipedia.org	exon	71354823	71355004	.	+	.	gene_id lnc-GPR27-4 ; transcript_id lnc-GPR27-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244203 ; gene_alias_2 FOXP1-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000244203.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158800.2 ; transcript_alias_1 ENST00000465742 ; transcript_alias_2 ENST00000465742.2 ; transcript_alias_3 FOXP1-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000352247.2 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87803363	87803508	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; gene_alias_6 ENSG00000245526.4 ; transcript_alias_1 ENST00000506978 ; transcript_alias_2 ENST00000506978.1 ; transcript_alias_3 LINC00461-013 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369811.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102657 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87804099	87804171	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; gene_alias_6 ENSG00000245526.4 ; transcript_alias_1 ENST00000506978 ; transcript_alias_2 ENST00000506978.1 ; transcript_alias_3 LINC00461-013 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369811.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102657 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87836898	87836941	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; gene_alias_6 ENSG00000245526.4 ; transcript_alias_1 ENST00000506978 ; transcript_alias_2 ENST00000506978.1 ; transcript_alias_3 LINC00461-013 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369811.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102657 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87837853	87837888	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; gene_alias_6 ENSG00000245526.4 ; transcript_alias_1 ENST00000506978 ; transcript_alias_2 ENST00000506978.1 ; transcript_alias_3 LINC00461-013 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369811.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102657 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87966854	87966903	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; gene_alias_6 ENSG00000245526.4 ; transcript_alias_1 ENST00000506978 ; transcript_alias_2 ENST00000506978.1 ; transcript_alias_3 LINC00461-013 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369811.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102657 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87968783	87968846	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; gene_alias_6 ENSG00000245526.4 ; transcript_alias_1 ENST00000506978 ; transcript_alias_2 ENST00000506978.1 ; transcript_alias_3 LINC00461-013 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369811.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102657 ;
chr5	lncipedia.org	exon	87980475	87980625	.	-	.	gene_id lnc-MEF2C-2 ; transcript_id lnc-MEF2C-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000245526 ; gene_alias_2 CTC-547D20.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245526.2 ; gene_alias_4 LINC00461 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000162632.2 ; gene_alias_6 ENSG00000245526.4 ; transcript_alias_1 ENST00000506978 ; transcript_alias_2 ENST00000506978.1 ; transcript_alias_3 LINC00461-013 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000369811.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102657 ;
chr19	lncipedia.org	exon	34790582	34791336	.	-	.	gene_id lnc-RPS4XP21-1 ; transcript_id lnc-RPS4XP21-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249886 ; transcript_alias_1 ENST00000514883 ;
chr19	lncipedia.org	exon	34819737	34820103	.	-	.	gene_id lnc-RPS4XP21-1 ; transcript_id lnc-RPS4XP21-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249886 ; transcript_alias_1 ENST00000514883 ;
chr8	lncipedia.org	exon	96081152	96081463	.	-	.	gene_id lnc-TP53INP1-1 ; transcript_id lnc-TP53INP1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245080 ; gene_alias_2 RP11-320N21.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245080.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164658.3 ; gene_alias_5 ENSG00000245080.4 ; gene_alias_6 MIR3150A ; transcript_alias_1 ENST00000517864 ; transcript_alias_2 ENST00000517864.1 ; transcript_alias_3 RP11-320N21.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379663.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT127819 ;
chr8	lncipedia.org	exon	96085157	96085410	.	-	.	gene_id lnc-TP53INP1-1 ; transcript_id lnc-TP53INP1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245080 ; gene_alias_2 RP11-320N21.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245080.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164658.3 ; gene_alias_5 ENSG00000245080.4 ; gene_alias_6 MIR3150A ; transcript_alias_1 ENST00000517864 ; transcript_alias_2 ENST00000517864.1 ; transcript_alias_3 RP11-320N21.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379663.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT127819 ;
chr6	lncipedia.org	exon	22135186	22136898	.	-	.	gene_id lnc-PRL-1 ; transcript_id lnc-PRL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250785 ; gene_alias_2 ENSG00000260455.1 ; gene_alias_3 RP1-67M12.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000175902.1 ; gene_alias_5 CASC14 ; transcript_alias_1 ENST00000511541 ; transcript_alias_2 ENST00000566912.1 ; transcript_alias_3 RP1-67M12.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000431254.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	22146908	22146980	.	-	.	gene_id lnc-PRL-1 ; transcript_id lnc-PRL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250785 ; gene_alias_2 ENSG00000260455.1 ; gene_alias_3 RP1-67M12.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000175902.1 ; gene_alias_5 CASC14 ; transcript_alias_1 ENST00000511541 ; transcript_alias_2 ENST00000566912.1 ; transcript_alias_3 RP1-67M12.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000431254.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	22147269	22147422	.	-	.	gene_id lnc-PRL-1 ; transcript_id lnc-PRL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250785 ; gene_alias_2 ENSG00000260455.1 ; gene_alias_3 RP1-67M12.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000175902.1 ; gene_alias_5 CASC14 ; transcript_alias_1 ENST00000511541 ; transcript_alias_2 ENST00000566912.1 ; transcript_alias_3 RP1-67M12.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000431254.1 ;
chr21	lncipedia.org	exon	17442842	17442868	.	+	.	gene_id lnc-USP25-2 ; transcript_id lnc-USP25-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000215386 ; gene_alias_2 C21orf34 ; gene_alias_3 ENSG00000215386.5 ; gene_alias_4 LINC00478 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000074377.1 ; gene_alias_6 ENSG00000215386.6 ; transcript_alias_1 ENST00000458468 ; transcript_alias_2 ENST00000458468.1 ; transcript_alias_3 LINC00478-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000158029.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT081220 ; transcript_alias_6 NR_027790 ;
chr21	lncipedia.org	exon	17443434	17443718	.	+	.	gene_id lnc-USP25-2 ; transcript_id lnc-USP25-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000215386 ; gene_alias_2 C21orf34 ; gene_alias_3 ENSG00000215386.5 ; gene_alias_4 LINC00478 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000074377.1 ; gene_alias_6 ENSG00000215386.6 ; transcript_alias_1 ENST00000458468 ; transcript_alias_2 ENST00000458468.1 ; transcript_alias_3 LINC00478-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000158029.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT081220 ; transcript_alias_6 NR_027790 ;
chr21	lncipedia.org	exon	17553911	17554007	.	+	.	gene_id lnc-USP25-2 ; transcript_id lnc-USP25-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000215386 ; gene_alias_2 C21orf34 ; gene_alias_3 ENSG00000215386.5 ; gene_alias_4 LINC00478 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000074377.1 ; gene_alias_6 ENSG00000215386.6 ; transcript_alias_1 ENST00000458468 ; transcript_alias_2 ENST00000458468.1 ; transcript_alias_3 LINC00478-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000158029.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT081220 ; transcript_alias_6 NR_027790 ;
chr21	lncipedia.org	exon	17603376	17603435	.	+	.	gene_id lnc-USP25-2 ; transcript_id lnc-USP25-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000215386 ; gene_alias_2 C21orf34 ; gene_alias_3 ENSG00000215386.5 ; gene_alias_4 LINC00478 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000074377.1 ; gene_alias_6 ENSG00000215386.6 ; transcript_alias_1 ENST00000458468 ; transcript_alias_2 ENST00000458468.1 ; transcript_alias_3 LINC00478-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000158029.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT081220 ; transcript_alias_6 NR_027790 ;
chr21	lncipedia.org	exon	17859810	17859858	.	+	.	gene_id lnc-USP25-2 ; transcript_id lnc-USP25-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000215386 ; gene_alias_2 C21orf34 ; gene_alias_3 ENSG00000215386.5 ; gene_alias_4 LINC00478 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000074377.1 ; gene_alias_6 ENSG00000215386.6 ; transcript_alias_1 ENST00000458468 ; transcript_alias_2 ENST00000458468.1 ; transcript_alias_3 LINC00478-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000158029.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT081220 ; transcript_alias_6 NR_027790 ;
chr21	lncipedia.org	exon	17909699	17909759	.	+	.	gene_id lnc-USP25-2 ; transcript_id lnc-USP25-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000215386 ; gene_alias_2 C21orf34 ; gene_alias_3 ENSG00000215386.5 ; gene_alias_4 LINC00478 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000074377.1 ; gene_alias_6 ENSG00000215386.6 ; transcript_alias_1 ENST00000458468 ; transcript_alias_2 ENST00000458468.1 ; transcript_alias_3 LINC00478-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000158029.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT081220 ; transcript_alias_6 NR_027790 ;
chr21	lncipedia.org	exon	17966660	17966774	.	+	.	gene_id lnc-USP25-2 ; transcript_id lnc-USP25-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000215386 ; gene_alias_2 C21orf34 ; gene_alias_3 ENSG00000215386.5 ; gene_alias_4 LINC00478 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000074377.1 ; gene_alias_6 ENSG00000215386.6 ; transcript_alias_1 ENST00000458468 ; transcript_alias_2 ENST00000458468.1 ; transcript_alias_3 LINC00478-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000158029.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT081220 ; transcript_alias_6 NR_027790 ;
chr21	lncipedia.org	exon	17979314	17982094	.	+	.	gene_id lnc-USP25-2 ; transcript_id lnc-USP25-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000215386 ; gene_alias_2 C21orf34 ; gene_alias_3 ENSG00000215386.5 ; gene_alias_4 LINC00478 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000074377.1 ; gene_alias_6 ENSG00000215386.6 ; transcript_alias_1 ENST00000458468 ; transcript_alias_2 ENST00000458468.1 ; transcript_alias_3 LINC00478-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000158029.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT081220 ; transcript_alias_6 NR_027790 ;
chr11	lncipedia.org	exon	70227197	70227383	.	-	.	gene_id lnc-SHANK2-1 ; transcript_id lnc-SHANK2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000246889 ; gene_alias_2 ENSG00000246889.2 ; gene_alias_3 AP000487.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167270.2 ; transcript_alias_1 ENST00000524619 ; transcript_alias_2 ENST00000524619.1 ; transcript_alias_3 AP000487.5-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393965.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT022657 ;
chr11	lncipedia.org	exon	70244204	70244408	.	-	.	gene_id lnc-SHANK2-1 ; transcript_id lnc-SHANK2-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000246889 ; gene_alias_2 ENSG00000246889.2 ; gene_alias_3 AP000487.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167270.2 ; transcript_alias_1 ENST00000524619 ; transcript_alias_2 ENST00000524619.1 ; transcript_alias_3 AP000487.5-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393965.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT022657 ;
chr11	lncipedia.org	exon	118307944	118308295	.	-	.	gene_id lnc-RP11-770J1.4.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-770J1.4.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245740 ; transcript_alias_1 ENST00000502111 ;
chr11	lncipedia.org	exon	118308733	118309873	.	-	.	gene_id lnc-RP11-770J1.4.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-770J1.4.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245740 ; transcript_alias_1 ENST00000502111 ;
chr12	lncipedia.org	exon	81672980	81673084	.	+	.	gene_id lnc-ACSS3-1 ; transcript_id lnc-ACSS3-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000257467 ; gene_alias_2 RP11-121G22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257467.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170246.1 ; transcript_alias_1 ENST00000553197 ; transcript_alias_2 ENST00000553197.1 ; transcript_alias_3 RP11-121G22.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408176.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029698 ;
chr12	lncipedia.org	exon	81676466	81676573	.	+	.	gene_id lnc-ACSS3-1 ; transcript_id lnc-ACSS3-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000257467 ; gene_alias_2 RP11-121G22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257467.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170246.1 ; transcript_alias_1 ENST00000553197 ; transcript_alias_2 ENST00000553197.1 ; transcript_alias_3 RP11-121G22.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408176.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029698 ;
chr12	lncipedia.org	exon	81686122	81686303	.	+	.	gene_id lnc-ACSS3-1 ; transcript_id lnc-ACSS3-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000257467 ; gene_alias_2 RP11-121G22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257467.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170246.1 ; transcript_alias_1 ENST00000553197 ; transcript_alias_2 ENST00000553197.1 ; transcript_alias_3 RP11-121G22.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408176.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029698 ;
chr12	lncipedia.org	exon	81690413	81690548	.	+	.	gene_id lnc-ACSS3-1 ; transcript_id lnc-ACSS3-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000257467 ; gene_alias_2 RP11-121G22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257467.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170246.1 ; transcript_alias_1 ENST00000553197 ; transcript_alias_2 ENST00000553197.1 ; transcript_alias_3 RP11-121G22.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408176.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029698 ;
chr12	lncipedia.org	exon	81691842	81691942	.	+	.	gene_id lnc-ACSS3-1 ; transcript_id lnc-ACSS3-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000257467 ; gene_alias_2 RP11-121G22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257467.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170246.1 ; transcript_alias_1 ENST00000553197 ; transcript_alias_2 ENST00000553197.1 ; transcript_alias_3 RP11-121G22.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408176.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029698 ;
chr12	lncipedia.org	exon	81705826	81706068	.	+	.	gene_id lnc-ACSS3-1 ; transcript_id lnc-ACSS3-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000257467 ; gene_alias_2 RP11-121G22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257467.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170246.1 ; transcript_alias_1 ENST00000553197 ; transcript_alias_2 ENST00000553197.1 ; transcript_alias_3 RP11-121G22.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408176.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029698 ;
chr19	lncipedia.org	exon	19101703	19103094	.	+	.	gene_id lnc-ARMC6-1 ; transcript_id lnc-ARMC6-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245755 ; transcript_alias_1 ENST00000500699 ;
chr19	lncipedia.org	exon	19103397	19104419	.	+	.	gene_id lnc-ARMC6-1 ; transcript_id lnc-ARMC6-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245755 ; transcript_alias_1 ENST00000500699 ;
chr9	lncipedia.org	exon	123607152	123607474	.	+	.	gene_id lnc-CNTRL-1 ; transcript_id lnc-CNTRL-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000226752 ; gene_alias_2 RP11-27I1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000226752.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020572.1 ; gene_alias_5 ENSG00000226752.3 ; gene_alias_6 PSMD5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000447891 ; transcript_alias_2 ENST00000447891.1 ; transcript_alias_3 RP11-27I1.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000053820.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT134527 ;
chr9	lncipedia.org	exon	123609572	123609631	.	+	.	gene_id lnc-CNTRL-1 ; transcript_id lnc-CNTRL-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000226752 ; gene_alias_2 RP11-27I1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000226752.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020572.1 ; gene_alias_5 ENSG00000226752.3 ; gene_alias_6 PSMD5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000447891 ; transcript_alias_2 ENST00000447891.1 ; transcript_alias_3 RP11-27I1.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000053820.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT134527 ;
chr9	lncipedia.org	exon	123613516	123616651	.	+	.	gene_id lnc-CNTRL-1 ; transcript_id lnc-CNTRL-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000226752 ; gene_alias_2 RP11-27I1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000226752.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020572.1 ; gene_alias_5 ENSG00000226752.3 ; gene_alias_6 PSMD5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000447891 ; transcript_alias_2 ENST00000447891.1 ; transcript_alias_3 RP11-27I1.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000053820.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT134527 ;
chr8	lncipedia.org	exon	61325569	61326029	.	-	.	gene_id lnc-CA8-3 ; transcript_id lnc-CA8-3:7 ; gene_alias_1 ENSG00000251396 ; gene_alias_2 ENSG00000251396.2 ; gene_alias_3 RP11-163N6.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165326.1 ; transcript_alias_1 ENST00000530033 ; transcript_alias_2 ENST00000530033.1 ; transcript_alias_3 RP11-163N6.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000383454.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT126827 ;
chr8	lncipedia.org	exon	61326115	61326211	.	-	.	gene_id lnc-CA8-3 ; transcript_id lnc-CA8-3:7 ; gene_alias_1 ENSG00000251396 ; gene_alias_2 ENSG00000251396.2 ; gene_alias_3 RP11-163N6.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165326.1 ; transcript_alias_1 ENST00000530033 ; transcript_alias_2 ENST00000530033.1 ; transcript_alias_3 RP11-163N6.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000383454.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT126827 ;
chr16	lncipedia.org	exon	70835990	70838077	.	+	.	gene_id lnc-IL34-3 ; transcript_id lnc-IL34-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251103 ; gene_alias_2 XLOC_011772 ; gene_alias_3 linc-CALB2-2 ; transcript_alias_1 ENST00000513068 ; transcript_alias_2 TCONS_00024294 ; transcript_alias_3 NONHSAT143451 ;
chr16	lncipedia.org	exon	70838337	70840039	.	+	.	gene_id lnc-IL34-3 ; transcript_id lnc-IL34-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251103 ; gene_alias_2 XLOC_011772 ; gene_alias_3 linc-CALB2-2 ; transcript_alias_1 ENST00000513068 ; transcript_alias_2 TCONS_00024294 ; transcript_alias_3 NONHSAT143451 ;
chr14	lncipedia.org	exon	65517922	65518245	.	-	.	gene_id lnc-RAB15-1 ; transcript_id lnc-RAB15-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249059 ; transcript_alias_1 ENST00000504268 ;
chr14	lncipedia.org	exon	65518601	65520344	.	-	.	gene_id lnc-RAB15-1 ; transcript_id lnc-RAB15-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249059 ; transcript_alias_1 ENST00000504268 ;
chr2	lncipedia.org	exon	200334619	200337356	.	+	.	gene_id lnc-C2orf69-3 ; transcript_id lnc-C2orf69-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000225953 ; gene_alias_2 AC017096.1 ; gene_alias_3 ENSG00000225953.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154470.1 ; gene_alias_5 SATB2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000416200 ; transcript_alias_2 ENST00000416200.1 ; transcript_alias_3 AC017096.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000335368.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT076258 ;
chr2	lncipedia.org	exon	200341200	200341658	.	+	.	gene_id lnc-C2orf69-3 ; transcript_id lnc-C2orf69-3:5 ; gene_alias_1 ENSG00000225953 ; gene_alias_2 AC017096.1 ; gene_alias_3 ENSG00000225953.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154470.1 ; gene_alias_5 SATB2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000416200 ; transcript_alias_2 ENST00000416200.1 ; transcript_alias_3 AC017096.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000335368.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT076258 ;
chr22	lncipedia.org	exon	24201144	24202487	.	+	.	gene_id lnc-AP000350.10.1-1 ; transcript_id lnc-AP000350.10.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247349 ; transcript_alias_1 ENST00000511223 ;
chr22	lncipedia.org	exon	24203152	24203477	.	+	.	gene_id lnc-AP000350.10.1-1 ; transcript_id lnc-AP000350.10.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247349 ; transcript_alias_1 ENST00000511223 ;
chr13	lncipedia.org	exon	114253448	114254884	.	-	.	gene_id lnc-ATP4B-1 ; transcript_id lnc-ATP4B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246397 ; transcript_alias_1 ENST00000500168 ;
chr13	lncipedia.org	exon	114255004	114255555	.	-	.	gene_id lnc-ATP4B-1 ; transcript_id lnc-ATP4B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246397 ; transcript_alias_1 ENST00000500168 ;
chr13	lncipedia.org	exon	114255654	114256664	.	-	.	gene_id lnc-ATP4B-1 ; transcript_id lnc-ATP4B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246397 ; transcript_alias_1 ENST00000500168 ;
chr15	lncipedia.org	exon	30857143	30857384	.	-	.	gene_id lnc-RP11-382B18.2.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-382B18.2.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247728 ; gene_alias_2 AC026150.6 ; transcript_alias_1 ENST00000501830 ;
chr15	lncipedia.org	exon	30917254	30917976	.	-	.	gene_id lnc-RP11-382B18.2.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-382B18.2.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247728 ; gene_alias_2 AC026150.6 ; transcript_alias_1 ENST00000501830 ;
chr5	lncipedia.org	exon	180257957	180258229	.	+	.	gene_id lnc-BTNL8-3 ; transcript_id lnc-BTNL8-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245060 ; gene_alias_2 CTC-205M6.2 ; gene_alias_3 ENSG00000245060.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162270.1 ; gene_alias_5 LINC00847 ; transcript_alias_1 ENST00000501855 ; transcript_alias_2 ENST00000501855.2 ; transcript_alias_3 CTC-205M6.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000368344.1 ; transcript_alias_5 NR_045678 ;
chr5	lncipedia.org	exon	180258759	180258941	.	+	.	gene_id lnc-BTNL8-3 ; transcript_id lnc-BTNL8-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245060 ; gene_alias_2 CTC-205M6.2 ; gene_alias_3 ENSG00000245060.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162270.1 ; gene_alias_5 LINC00847 ; transcript_alias_1 ENST00000501855 ; transcript_alias_2 ENST00000501855.2 ; transcript_alias_3 CTC-205M6.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000368344.1 ; transcript_alias_5 NR_045678 ;
chr5	lncipedia.org	exon	180261312	180262726	.	+	.	gene_id lnc-BTNL8-3 ; transcript_id lnc-BTNL8-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245060 ; gene_alias_2 CTC-205M6.2 ; gene_alias_3 ENSG00000245060.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162270.1 ; gene_alias_5 LINC00847 ; transcript_alias_1 ENST00000501855 ; transcript_alias_2 ENST00000501855.2 ; transcript_alias_3 CTC-205M6.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000368344.1 ; transcript_alias_5 NR_045678 ;
chr12	lncipedia.org	exon	94185692	94188353	.	-	.	gene_id lnc-RP11-1105G2.3.1-4 ; transcript_id lnc-RP11-1105G2.3.1-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251157 ; transcript_alias_1 ENST00000505974 ;
chr12	lncipedia.org	exon	94370026	94370048	.	-	.	gene_id lnc-RP11-1105G2.3.1-4 ; transcript_id lnc-RP11-1105G2.3.1-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251157 ; transcript_alias_1 ENST00000505974 ;
chr1	lncipedia.org	exon	65445260	65445415	.	-	.	gene_id lnc-JAK1-1 ; transcript_id lnc-JAK1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000226891 ; gene_alias_2 RP11-182I10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000226891.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009307.1 ; gene_alias_5 ENSG00000226891.2 ; transcript_alias_1 ENST00000444349 ; transcript_alias_2 ENST00000444349.1 ; transcript_alias_3 RP11-182I10.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000025782.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003718 ;
chr1	lncipedia.org	exon	65445494	65445551	.	-	.	gene_id lnc-JAK1-1 ; transcript_id lnc-JAK1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000226891 ; gene_alias_2 RP11-182I10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000226891.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009307.1 ; gene_alias_5 ENSG00000226891.2 ; transcript_alias_1 ENST00000444349 ; transcript_alias_2 ENST00000444349.1 ; transcript_alias_3 RP11-182I10.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000025782.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003718 ;
chr1	lncipedia.org	exon	65455118	65455177	.	-	.	gene_id lnc-JAK1-1 ; transcript_id lnc-JAK1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000226891 ; gene_alias_2 RP11-182I10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000226891.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009307.1 ; gene_alias_5 ENSG00000226891.2 ; transcript_alias_1 ENST00000444349 ; transcript_alias_2 ENST00000444349.1 ; transcript_alias_3 RP11-182I10.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000025782.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003718 ;
chr1	lncipedia.org	exon	65456981	65457087	.	-	.	gene_id lnc-JAK1-1 ; transcript_id lnc-JAK1-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000226891 ; gene_alias_2 RP11-182I10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000226891.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000009307.1 ; gene_alias_5 ENSG00000226891.2 ; transcript_alias_1 ENST00000444349 ; transcript_alias_2 ENST00000444349.1 ; transcript_alias_3 RP11-182I10.3-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000025782.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT003718 ;
chr16	lncipedia.org	exon	86320033	86320155	.	+	.	gene_id lnc-FOXF1-2 ; transcript_id lnc-FOXF1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248463 ; gene_alias_2 XLOC_011813 ; gene_alias_3 linc-FOXF1-2 ; gene_alias_4 AC040170.1 ; transcript_alias_1 ENST00000511252 ; transcript_alias_2 TCONS_00024297 ;
chr16	lncipedia.org	exon	86324271	86324350	.	+	.	gene_id lnc-FOXF1-2 ; transcript_id lnc-FOXF1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248463 ; gene_alias_2 XLOC_011813 ; gene_alias_3 linc-FOXF1-2 ; gene_alias_4 AC040170.1 ; transcript_alias_1 ENST00000511252 ; transcript_alias_2 TCONS_00024297 ;
chr16	lncipedia.org	exon	86325134	86326993	.	+	.	gene_id lnc-FOXF1-2 ; transcript_id lnc-FOXF1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248463 ; gene_alias_2 XLOC_011813 ; gene_alias_3 linc-FOXF1-2 ; gene_alias_4 AC040170.1 ; transcript_alias_1 ENST00000511252 ; transcript_alias_2 TCONS_00024297 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127232602	127232673	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-10 ; transcript_id lnc-DHX37-10:2 ; gene_alias_1 ENSG00000256128 ; gene_alias_2 RP11-173C20.2 ; gene_alias_3 ENSG00000256128.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168480.1 ; gene_alias_5 LINC00944 ; transcript_alias_1 ENST00000542248 ; transcript_alias_2 ENST00000542248.1 ; transcript_alias_3 RP11-173C20.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399873.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031827 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127245478	127245591	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-10 ; transcript_id lnc-DHX37-10:2 ; gene_alias_1 ENSG00000256128 ; gene_alias_2 RP11-173C20.2 ; gene_alias_3 ENSG00000256128.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168480.1 ; gene_alias_5 LINC00944 ; transcript_alias_1 ENST00000542248 ; transcript_alias_2 ENST00000542248.1 ; transcript_alias_3 RP11-173C20.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399873.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031827 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127247961	127248044	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-10 ; transcript_id lnc-DHX37-10:2 ; gene_alias_1 ENSG00000256128 ; gene_alias_2 RP11-173C20.2 ; gene_alias_3 ENSG00000256128.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168480.1 ; gene_alias_5 LINC00944 ; transcript_alias_1 ENST00000542248 ; transcript_alias_2 ENST00000542248.1 ; transcript_alias_3 RP11-173C20.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399873.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031827 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127256625	127256902	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-10 ; transcript_id lnc-DHX37-10:2 ; gene_alias_1 ENSG00000256128 ; gene_alias_2 RP11-173C20.2 ; gene_alias_3 ENSG00000256128.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168480.1 ; gene_alias_5 LINC00944 ; transcript_alias_1 ENST00000542248 ; transcript_alias_2 ENST00000542248.1 ; transcript_alias_3 RP11-173C20.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399873.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031827 ;
chr2	lncipedia.org	exon	47419544	47419956	.	-	.	gene_id lnc-CALM2-2 ; transcript_id lnc-CALM2-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000234690 ; gene_alias_2 AC073283.4 ; gene_alias_3 ENSG00000234690.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151698.6 ; transcript_alias_1 ENST00000448713 ; transcript_alias_2 ENST00000448713.1 ; transcript_alias_3 AC073283.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323497.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT070549 ;
chr2	lncipedia.org	exon	47550560	47550634	.	-	.	gene_id lnc-CALM2-2 ; transcript_id lnc-CALM2-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000234690 ; gene_alias_2 AC073283.4 ; gene_alias_3 ENSG00000234690.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151698.6 ; transcript_alias_1 ENST00000448713 ; transcript_alias_2 ENST00000448713.1 ; transcript_alias_3 AC073283.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323497.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT070549 ;
chr2	lncipedia.org	exon	47572040	47572128	.	-	.	gene_id lnc-CALM2-2 ; transcript_id lnc-CALM2-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000234690 ; gene_alias_2 AC073283.4 ; gene_alias_3 ENSG00000234690.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151698.6 ; transcript_alias_1 ENST00000448713 ; transcript_alias_2 ENST00000448713.1 ; transcript_alias_3 AC073283.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323497.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT070549 ;
chr17	lncipedia.org	exon	30748305	30748673	.	-	.	gene_id lnc-MYO1D-1 ; transcript_id lnc-MYO1D-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246715 ; gene_alias_2 AC005899.1 ; transcript_alias_1 ENST00000429292 ; transcript_alias_2 NONHSAT052946 ;
chr17	lncipedia.org	exon	30750990	30751332	.	-	.	gene_id lnc-MYO1D-1 ; transcript_id lnc-MYO1D-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246715 ; gene_alias_2 AC005899.1 ; transcript_alias_1 ENST00000429292 ; transcript_alias_2 NONHSAT052946 ;
chr17	lncipedia.org	exon	30765492	30765778	.	-	.	gene_id lnc-MYO1D-1 ; transcript_id lnc-MYO1D-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246715 ; gene_alias_2 AC005899.1 ; transcript_alias_1 ENST00000429292 ; transcript_alias_2 NONHSAT052946 ;
chr17	lncipedia.org	exon	30770534	30772564	.	-	.	gene_id lnc-MYO1D-1 ; transcript_id lnc-MYO1D-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246715 ; gene_alias_2 AC005899.1 ; transcript_alias_1 ENST00000429292 ; transcript_alias_2 NONHSAT052946 ;
chr2	lncipedia.org	exon	177037923	177041420	.	-	.	gene_id lnc-AC009336.1-2 ; transcript_id lnc-AC009336.1-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000224189 ; gene_alias_2 AC009336.23 ; gene_alias_3 ENSG00000224189.2 ; gene_alias_4 HOXD-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000154172.2 ; transcript_alias_1 ENST00000416928 ; transcript_alias_2 ENST00000416928.2 ; transcript_alias_3 HOXD-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000334217.2 ;
chr2	lncipedia.org	exon	177042060	177042222	.	-	.	gene_id lnc-AC009336.1-2 ; transcript_id lnc-AC009336.1-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000224189 ; gene_alias_2 AC009336.23 ; gene_alias_3 ENSG00000224189.2 ; gene_alias_4 HOXD-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000154172.2 ; transcript_alias_1 ENST00000416928 ; transcript_alias_2 ENST00000416928.2 ; transcript_alias_3 HOXD-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000334217.2 ;
chr2	lncipedia.org	exon	177042439	177043012	.	-	.	gene_id lnc-AC009336.1-2 ; transcript_id lnc-AC009336.1-2:6 ; gene_alias_1 ENSG00000224189 ; gene_alias_2 AC009336.23 ; gene_alias_3 ENSG00000224189.2 ; gene_alias_4 HOXD-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000154172.2 ; transcript_alias_1 ENST00000416928 ; transcript_alias_2 ENST00000416928.2 ; transcript_alias_3 HOXD-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000334217.2 ;
chr14	lncipedia.org	exon	105147483	105147919	.	+	.	gene_id lnc-RP11-982M15.6.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-982M15.6.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256050 ; transcript_alias_1 ENST00000540171 ;
chr14	lncipedia.org	exon	105150400	105151268	.	+	.	gene_id lnc-RP11-982M15.6.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-982M15.6.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256050 ; transcript_alias_1 ENST00000540171 ;
chr12	lncipedia.org	exon	28974908	28975206	.	-	.	gene_id lnc-ERGIC2-5 ; transcript_id lnc-ERGIC2-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256513 ; gene_alias_2 RP11-977P2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256513.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169144.1 ; transcript_alias_1 ENST00000537327 ; transcript_alias_2 ENST00000537327.1 ; transcript_alias_3 RP11-977P2.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402463.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027477 ;
chr12	lncipedia.org	exon	28978631	28978764	.	-	.	gene_id lnc-ERGIC2-5 ; transcript_id lnc-ERGIC2-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256513 ; gene_alias_2 RP11-977P2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256513.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169144.1 ; transcript_alias_1 ENST00000537327 ; transcript_alias_2 ENST00000537327.1 ; transcript_alias_3 RP11-977P2.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402463.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027477 ;
chr12	lncipedia.org	exon	95809607	95809874	.	-	.	gene_id lnc-RP11-167N24.6.1-4 ; transcript_id lnc-RP11-167N24.6.1-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000257943 ; gene_alias_2 RP11-167N24.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257943.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170260.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551610 ; transcript_alias_2 ENST00000551610.1 ; transcript_alias_3 RP11-167N24.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408219.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030027 ;
chr12	lncipedia.org	exon	95830335	95830418	.	-	.	gene_id lnc-RP11-167N24.6.1-4 ; transcript_id lnc-RP11-167N24.6.1-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000257943 ; gene_alias_2 RP11-167N24.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257943.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170260.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551610 ; transcript_alias_2 ENST00000551610.1 ; transcript_alias_3 RP11-167N24.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408219.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030027 ;
chr12	lncipedia.org	exon	95830530	95830585	.	-	.	gene_id lnc-RP11-167N24.6.1-4 ; transcript_id lnc-RP11-167N24.6.1-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000257943 ; gene_alias_2 RP11-167N24.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257943.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170260.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551610 ; transcript_alias_2 ENST00000551610.1 ; transcript_alias_3 RP11-167N24.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408219.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030027 ;
chr14	lncipedia.org	exon	31889492	31889791	.	+	.	gene_id lnc-NUBPL-1 ; transcript_id lnc-NUBPL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250365 ; gene_alias_2 CTD-2213F21.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250365.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170517.1 ; transcript_alias_1 ENST00000549844 ; transcript_alias_2 ENST00000549844.1 ; transcript_alias_3 CTD-2213F21.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409473.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036280 ;
chr14	lncipedia.org	exon	31891054	31891174	.	+	.	gene_id lnc-NUBPL-1 ; transcript_id lnc-NUBPL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250365 ; gene_alias_2 CTD-2213F21.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250365.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170517.1 ; transcript_alias_1 ENST00000549844 ; transcript_alias_2 ENST00000549844.1 ; transcript_alias_3 CTD-2213F21.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409473.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036280 ;
chr14	lncipedia.org	exon	31908878	31909155	.	+	.	gene_id lnc-NUBPL-1 ; transcript_id lnc-NUBPL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250365 ; gene_alias_2 CTD-2213F21.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250365.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170517.1 ; transcript_alias_1 ENST00000549844 ; transcript_alias_2 ENST00000549844.1 ; transcript_alias_3 CTD-2213F21.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000409473.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036280 ;
chr6	lncipedia.org	exon	134142285	134142873	.	+	.	gene_id lnc-TCF21-1 ; transcript_id lnc-TCF21-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223586 ; gene_alias_2 RP4-662A9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000223586.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015606.1 ; transcript_alias_1 ENST00000456347 ; transcript_alias_2 ENST00000456347.1 ; transcript_alias_3 RP4-662A9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000042289.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	134158731	134158862	.	+	.	gene_id lnc-TCF21-1 ; transcript_id lnc-TCF21-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223586 ; gene_alias_2 RP4-662A9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000223586.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015606.1 ; transcript_alias_1 ENST00000456347 ; transcript_alias_2 ENST00000456347.1 ; transcript_alias_3 RP4-662A9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000042289.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	134172335	134172426	.	+	.	gene_id lnc-TCF21-1 ; transcript_id lnc-TCF21-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223586 ; gene_alias_2 RP4-662A9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000223586.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015606.1 ; transcript_alias_1 ENST00000456347 ; transcript_alias_2 ENST00000456347.1 ; transcript_alias_3 RP4-662A9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000042289.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	148786527	148786641	.	+	.	gene_id lnc-PCYOX1L-2 ; transcript_id lnc-PCYOX1L-2:12 ; gene_alias_1 ENSG00000249669 ; gene_alias_2 RP11-394O4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000249669.2 ; gene_alias_4 MIR143HG ; gene_alias_5 OTTHUMG00000163464.3 ; gene_alias_6 ENSG00000249669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000505340 ; transcript_alias_2 ENST00000505340.1 ; transcript_alias_3 MIR143HG-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000373590.1 ;
chr5	lncipedia.org	exon	148800044	148800500	.	+	.	gene_id lnc-PCYOX1L-2 ; transcript_id lnc-PCYOX1L-2:12 ; gene_alias_1 ENSG00000249669 ; gene_alias_2 RP11-394O4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000249669.2 ; gene_alias_4 MIR143HG ; gene_alias_5 OTTHUMG00000163464.3 ; gene_alias_6 ENSG00000249669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000505340 ; transcript_alias_2 ENST00000505340.1 ; transcript_alias_3 MIR143HG-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000373590.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	135226557	135227041	.	-	.	gene_id lnc-RP11-62N21.1.1-9 ; transcript_id lnc-RP11-62N21.1.1-9:3 ; gene_alias_1 ENSG00000251199 ; gene_alias_2 RP11-400D2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000251199.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161471.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515491 ; transcript_alias_2 ENST00000515491.1 ; transcript_alias_3 RP11-400D2.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000365046.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT098358 ;
chr4	lncipedia.org	exon	135228696	135228878	.	-	.	gene_id lnc-RP11-62N21.1.1-9 ; transcript_id lnc-RP11-62N21.1.1-9:3 ; gene_alias_1 ENSG00000251199 ; gene_alias_2 RP11-400D2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000251199.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161471.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515491 ; transcript_alias_2 ENST00000515491.1 ; transcript_alias_3 RP11-400D2.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000365046.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT098358 ;
chr4	lncipedia.org	exon	135248413	135248604	.	-	.	gene_id lnc-RP11-62N21.1.1-9 ; transcript_id lnc-RP11-62N21.1.1-9:3 ; gene_alias_1 ENSG00000251199 ; gene_alias_2 RP11-400D2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000251199.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161471.1 ; transcript_alias_1 ENST00000515491 ; transcript_alias_2 ENST00000515491.1 ; transcript_alias_3 RP11-400D2.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000365046.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT098358 ;
chr21	lncipedia.org	exon	47874900	47875831	.	-	.	gene_id lnc-C21orf58-1 ; transcript_id lnc-C21orf58-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245754 ; gene_alias_2 AP000337.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499524 ; transcript_alias_2 NONHSAT083071 ;
chr21	lncipedia.org	exon	47877997	47878593	.	-	.	gene_id lnc-C21orf58-1 ; transcript_id lnc-C21orf58-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245754 ; gene_alias_2 AP000337.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499524 ; transcript_alias_2 NONHSAT083071 ;
chr8	lncipedia.org	exon	104258701	104258912	.	-	.	gene_id lnc-C8orf56-1 ; transcript_id lnc-C8orf56-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247081 ; gene_alias_2 RP11-318M2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247081.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164798.3 ; gene_alias_5 ENSG00000247081.3 ; transcript_alias_1 ENST00000521383 ; transcript_alias_2 ENST00000521383.1 ; transcript_alias_3 RP11-318M2.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000380352.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128171 ;
chr8	lncipedia.org	exon	104290206	104290249	.	-	.	gene_id lnc-C8orf56-1 ; transcript_id lnc-C8orf56-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247081 ; gene_alias_2 RP11-318M2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247081.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164798.3 ; gene_alias_5 ENSG00000247081.3 ; transcript_alias_1 ENST00000521383 ; transcript_alias_2 ENST00000521383.1 ; transcript_alias_3 RP11-318M2.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000380352.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128171 ;
chr8	lncipedia.org	exon	104298066	104298130	.	-	.	gene_id lnc-C8orf56-1 ; transcript_id lnc-C8orf56-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247081 ; gene_alias_2 RP11-318M2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247081.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164798.3 ; gene_alias_5 ENSG00000247081.3 ; transcript_alias_1 ENST00000521383 ; transcript_alias_2 ENST00000521383.1 ; transcript_alias_3 RP11-318M2.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000380352.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128171 ;
chr8	lncipedia.org	exon	104310577	104310991	.	-	.	gene_id lnc-C8orf56-1 ; transcript_id lnc-C8orf56-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247081 ; gene_alias_2 RP11-318M2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247081.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164798.3 ; gene_alias_5 ENSG00000247081.3 ; transcript_alias_1 ENST00000521383 ; transcript_alias_2 ENST00000521383.1 ; transcript_alias_3 RP11-318M2.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000380352.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128171 ;
chr1	lncipedia.org	exon	28905050	28905192	.	-	.	gene_id lnc-TAF12-1 ; transcript_id lnc-TAF12-1:11 ; gene_alias_1 ENSG00000197989 ; gene_alias_2 SNHG12 ; gene_alias_3 ENSG00000197989.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000003654.2 ; gene_alias_5 ENSG00000197989.9 ; transcript_alias_1 ENST00000475441 ; transcript_alias_2 ENST00000475441.1 ; transcript_alias_3 SNHG12-011 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000010366.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT001970 ;
chr1	lncipedia.org	exon	28906045	28906099	.	-	.	gene_id lnc-TAF12-1 ; transcript_id lnc-TAF12-1:11 ; gene_alias_1 ENSG00000197989 ; gene_alias_2 SNHG12 ; gene_alias_3 ENSG00000197989.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000003654.2 ; gene_alias_5 ENSG00000197989.9 ; transcript_alias_1 ENST00000475441 ; transcript_alias_2 ENST00000475441.1 ; transcript_alias_3 SNHG12-011 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000010366.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT001970 ;
chr1	lncipedia.org	exon	28906454	28906493	.	-	.	gene_id lnc-TAF12-1 ; transcript_id lnc-TAF12-1:11 ; gene_alias_1 ENSG00000197989 ; gene_alias_2 SNHG12 ; gene_alias_3 ENSG00000197989.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000003654.2 ; gene_alias_5 ENSG00000197989.9 ; transcript_alias_1 ENST00000475441 ; transcript_alias_2 ENST00000475441.1 ; transcript_alias_3 SNHG12-011 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000010366.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT001970 ;
chr1	lncipedia.org	exon	28907072	28907158	.	-	.	gene_id lnc-TAF12-1 ; transcript_id lnc-TAF12-1:11 ; gene_alias_1 ENSG00000197989 ; gene_alias_2 SNHG12 ; gene_alias_3 ENSG00000197989.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000003654.2 ; gene_alias_5 ENSG00000197989.9 ; transcript_alias_1 ENST00000475441 ; transcript_alias_2 ENST00000475441.1 ; transcript_alias_3 SNHG12-011 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000010366.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT001970 ;
chr1	lncipedia.org	exon	28907623	28907741	.	-	.	gene_id lnc-TAF12-1 ; transcript_id lnc-TAF12-1:11 ; gene_alias_1 ENSG00000197989 ; gene_alias_2 SNHG12 ; gene_alias_3 ENSG00000197989.8 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000003654.2 ; gene_alias_5 ENSG00000197989.9 ; transcript_alias_1 ENST00000475441 ; transcript_alias_2 ENST00000475441.1 ; transcript_alias_3 SNHG12-011 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000010366.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT001970 ;
chr18	lncipedia.org	exon	36786888	36788753	.	-	.	gene_id lnc-CELF4-7 ; transcript_id lnc-CELF4-7:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249862 ; gene_alias_2 AC016205.1 ; transcript_alias_1 ENST00000503211 ; transcript_alias_2 NONHSAT059015 ; transcript_alias_3 NR_024391 ;
chr18	lncipedia.org	exon	37115422	37115579	.	-	.	gene_id lnc-CELF4-7 ; transcript_id lnc-CELF4-7:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249862 ; gene_alias_2 AC016205.1 ; transcript_alias_1 ENST00000503211 ; transcript_alias_2 NONHSAT059015 ; transcript_alias_3 NR_024391 ;
chr18	lncipedia.org	exon	37331293	37331324	.	-	.	gene_id lnc-CELF4-7 ; transcript_id lnc-CELF4-7:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249862 ; gene_alias_2 AC016205.1 ; transcript_alias_1 ENST00000503211 ; transcript_alias_2 NONHSAT059015 ; transcript_alias_3 NR_024391 ;
chr18	lncipedia.org	exon	37331869	37331959	.	-	.	gene_id lnc-CELF4-7 ; transcript_id lnc-CELF4-7:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249862 ; gene_alias_2 AC016205.1 ; transcript_alias_1 ENST00000503211 ; transcript_alias_2 NONHSAT059015 ; transcript_alias_3 NR_024391 ;
chr15	lncipedia.org	exon	82380935	82381069	.	+	.	gene_id lnc-RP11-597K23.2.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-597K23.2.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249946 ; transcript_alias_1 ENST00000509213 ;
chr15	lncipedia.org	exon	82384068	82384945	.	+	.	gene_id lnc-RP11-597K23.2.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-597K23.2.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249946 ; transcript_alias_1 ENST00000509213 ;
chr15	lncipedia.org	exon	82385735	82385835	.	+	.	gene_id lnc-RP11-597K23.2.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-597K23.2.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249946 ; transcript_alias_1 ENST00000509213 ;
chr15	lncipedia.org	exon	82386324	82386575	.	+	.	gene_id lnc-RP11-597K23.2.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-597K23.2.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249946 ; transcript_alias_1 ENST00000509213 ;
chr15	lncipedia.org	exon	82387823	82388777	.	+	.	gene_id lnc-RP11-597K23.2.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-597K23.2.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249946 ; transcript_alias_1 ENST00000509213 ;
chr15	lncipedia.org	exon	82389789	82390032	.	+	.	gene_id lnc-RP11-597K23.2.1-1 ; transcript_id lnc-RP11-597K23.2.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249946 ; transcript_alias_1 ENST00000509213 ;
chr4	lncipedia.org	exon	68567079	68567202	.	+	.	gene_id lnc-TMPRSS11E-1 ; transcript_id lnc-TMPRSS11E-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000248049 ; gene_alias_2 RP11-453E17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248049.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160769.4 ; gene_alias_5 UBA6-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500538 ; transcript_alias_2 ENST00000500538.2 ; transcript_alias_3 RP11-453E17.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000362199.2 ;
chr4	lncipedia.org	exon	68586140	68586769	.	+	.	gene_id lnc-TMPRSS11E-1 ; transcript_id lnc-TMPRSS11E-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000248049 ; gene_alias_2 RP11-453E17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248049.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160769.4 ; gene_alias_5 UBA6-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500538 ; transcript_alias_2 ENST00000500538.2 ; transcript_alias_3 RP11-453E17.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000362199.2 ;
chr4	lncipedia.org	exon	68594258	68594404	.	+	.	gene_id lnc-TMPRSS11E-1 ; transcript_id lnc-TMPRSS11E-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000248049 ; gene_alias_2 RP11-453E17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248049.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160769.4 ; gene_alias_5 UBA6-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500538 ; transcript_alias_2 ENST00000500538.2 ; transcript_alias_3 RP11-453E17.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000362199.2 ;
chr4	lncipedia.org	exon	68595792	68595888	.	+	.	gene_id lnc-TMPRSS11E-1 ; transcript_id lnc-TMPRSS11E-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000248049 ; gene_alias_2 RP11-453E17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248049.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160769.4 ; gene_alias_5 UBA6-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500538 ; transcript_alias_2 ENST00000500538.2 ; transcript_alias_3 RP11-453E17.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000362199.2 ;
chr4	lncipedia.org	exon	68597224	68598063	.	+	.	gene_id lnc-TMPRSS11E-1 ; transcript_id lnc-TMPRSS11E-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000248049 ; gene_alias_2 RP11-453E17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248049.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160769.4 ; gene_alias_5 UBA6-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500538 ; transcript_alias_2 ENST00000500538.2 ; transcript_alias_3 RP11-453E17.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000362199.2 ;
chr4	lncipedia.org	exon	68620907	68620973	.	+	.	gene_id lnc-TMPRSS11E-1 ; transcript_id lnc-TMPRSS11E-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000248049 ; gene_alias_2 RP11-453E17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248049.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160769.4 ; gene_alias_5 UBA6-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500538 ; transcript_alias_2 ENST00000500538.2 ; transcript_alias_3 RP11-453E17.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000362199.2 ;
chr4	lncipedia.org	exon	68928325	68928939	.	+	.	gene_id lnc-TMPRSS11E-1 ; transcript_id lnc-TMPRSS11E-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000248049 ; gene_alias_2 RP11-453E17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248049.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160769.4 ; gene_alias_5 UBA6-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500538 ; transcript_alias_2 ENST00000500538.2 ; transcript_alias_3 RP11-453E17.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000362199.2 ;
chr4	lncipedia.org	exon	68945839	68946670	.	+	.	gene_id lnc-TMPRSS11E-1 ; transcript_id lnc-TMPRSS11E-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000248049 ; gene_alias_2 RP11-453E17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248049.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160769.4 ; gene_alias_5 UBA6-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000500538 ; transcript_alias_2 ENST00000500538.2 ; transcript_alias_3 RP11-453E17.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000362199.2 ;
chr6	lncipedia.org	exon	75994730	75995025	.	+	.	gene_id lnc-SENP6-3 ; transcript_id lnc-SENP6-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225793 ; gene_alias_2 RP1-234P15.4 ; gene_alias_3 ENSG00000225793.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015048.1 ; gene_alias_5 ENSG00000225793.2 ; transcript_alias_1 ENST00000438676 ; transcript_alias_2 ENST00000438676.1 ; transcript_alias_3 RP1-234P15.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000041240.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT113601 ;
chr6	lncipedia.org	exon	76003209	76003310	.	+	.	gene_id lnc-SENP6-3 ; transcript_id lnc-SENP6-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225793 ; gene_alias_2 RP1-234P15.4 ; gene_alias_3 ENSG00000225793.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015048.1 ; gene_alias_5 ENSG00000225793.2 ; transcript_alias_1 ENST00000438676 ; transcript_alias_2 ENST00000438676.1 ; transcript_alias_3 RP1-234P15.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000041240.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT113601 ;
chr6	lncipedia.org	exon	76006237	76006283	.	+	.	gene_id lnc-SENP6-3 ; transcript_id lnc-SENP6-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000225793 ; gene_alias_2 RP1-234P15.4 ; gene_alias_3 ENSG00000225793.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015048.1 ; gene_alias_5 ENSG00000225793.2 ; transcript_alias_1 ENST00000438676 ; transcript_alias_2 ENST00000438676.1 ; transcript_alias_3 RP1-234P15.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000041240.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT113601 ;
chr12	lncipedia.org	exon	98506792	98506934	.	-	.	gene_id lnc-RP11-181C3.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP11-181C3.1.1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258312 ; gene_alias_2 RP11-690J15.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258312.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170161.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548344 ; transcript_alias_2 ENST00000548344.1 ; transcript_alias_3 RP11-690J15.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407744.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030117 ;
chr12	lncipedia.org	exon	98507498	98507715	.	-	.	gene_id lnc-RP11-181C3.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP11-181C3.1.1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258312 ; gene_alias_2 RP11-690J15.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258312.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170161.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548344 ; transcript_alias_2 ENST00000548344.1 ; transcript_alias_3 RP11-690J15.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407744.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030117 ;
chr12	lncipedia.org	exon	98508730	98508821	.	-	.	gene_id lnc-RP11-181C3.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP11-181C3.1.1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258312 ; gene_alias_2 RP11-690J15.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258312.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170161.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548344 ; transcript_alias_2 ENST00000548344.1 ; transcript_alias_3 RP11-690J15.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407744.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030117 ;
chr12	lncipedia.org	exon	98593883	98593914	.	-	.	gene_id lnc-RP11-181C3.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP11-181C3.1.1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258312 ; gene_alias_2 RP11-690J15.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258312.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170161.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548344 ; transcript_alias_2 ENST00000548344.1 ; transcript_alias_3 RP11-690J15.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407744.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030117 ;
chr12	lncipedia.org	exon	98686188	98686223	.	-	.	gene_id lnc-RP11-181C3.1.1-3 ; transcript_id lnc-RP11-181C3.1.1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258312 ; gene_alias_2 RP11-690J15.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258312.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170161.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548344 ; transcript_alias_2 ENST00000548344.1 ; transcript_alias_3 RP11-690J15.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407744.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030117 ;
chr5	lncipedia.org	exon	111496631	111496688	.	+	.	gene_id lnc-APC-6 ; transcript_id lnc-APC-6:4 ; gene_alias_1 ENSG00000224032 ; gene_alias_2 NCRNA00219 ; gene_alias_3 ENSG00000224032.2 ; gene_alias_4 EPB41L4A-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000128803.3 ; transcript_alias_1 ENST00000508590 ; transcript_alias_2 ENST00000508590.1 ; transcript_alias_3 EPB41L4A-AS1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000370979.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT103213 ;
chr5	lncipedia.org	exon	111497400	111497472	.	+	.	gene_id lnc-APC-6 ; transcript_id lnc-APC-6:4 ; gene_alias_1 ENSG00000224032 ; gene_alias_2 NCRNA00219 ; gene_alias_3 ENSG00000224032.2 ; gene_alias_4 EPB41L4A-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000128803.3 ; transcript_alias_1 ENST00000508590 ; transcript_alias_2 ENST00000508590.1 ; transcript_alias_3 EPB41L4A-AS1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000370979.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT103213 ;
chr5	lncipedia.org	exon	111497848	111498008	.	+	.	gene_id lnc-APC-6 ; transcript_id lnc-APC-6:4 ; gene_alias_1 ENSG00000224032 ; gene_alias_2 NCRNA00219 ; gene_alias_3 ENSG00000224032.2 ; gene_alias_4 EPB41L4A-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000128803.3 ; transcript_alias_1 ENST00000508590 ; transcript_alias_2 ENST00000508590.1 ; transcript_alias_3 EPB41L4A-AS1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000370979.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT103213 ;
chr19	lncipedia.org	exon	58808733	58810295	.	+	.	gene_id lnc-ZNF8-2 ; transcript_id lnc-ZNF8-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244936 ; transcript_alias_1 ENST00000501378 ;
chr19	lncipedia.org	exon	58811107	58813217	.	+	.	gene_id lnc-ZNF8-2 ; transcript_id lnc-ZNF8-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244936 ; transcript_alias_1 ENST00000501378 ;
chr12	lncipedia.org	exon	93959360	93959520	.	-	.	gene_id lnc-UBE2N-2 ; transcript_id lnc-UBE2N-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000246985 ; gene_alias_2 RP11-887P2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246985.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170159.1 ; gene_alias_5 ENSG00000246985.3 ; gene_alias_6 SOCS2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000551626 ; transcript_alias_2 ENST00000551626.1 ; transcript_alias_3 RP11-887P2.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407729.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029958 ;
chr12	lncipedia.org	exon	93960520	93960746	.	-	.	gene_id lnc-UBE2N-2 ; transcript_id lnc-UBE2N-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000246985 ; gene_alias_2 RP11-887P2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246985.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170159.1 ; gene_alias_5 ENSG00000246985.3 ; gene_alias_6 SOCS2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000551626 ; transcript_alias_2 ENST00000551626.1 ; transcript_alias_3 RP11-887P2.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407729.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029958 ;
chr12	lncipedia.org	exon	93960840	93960935	.	-	.	gene_id lnc-UBE2N-2 ; transcript_id lnc-UBE2N-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000246985 ; gene_alias_2 RP11-887P2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246985.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170159.1 ; gene_alias_5 ENSG00000246985.3 ; gene_alias_6 SOCS2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000551626 ; transcript_alias_2 ENST00000551626.1 ; transcript_alias_3 RP11-887P2.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407729.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029958 ;
chr12	lncipedia.org	exon	93965041	93965174	.	-	.	gene_id lnc-UBE2N-2 ; transcript_id lnc-UBE2N-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000246985 ; gene_alias_2 RP11-887P2.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246985.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170159.1 ; gene_alias_5 ENSG00000246985.3 ; gene_alias_6 SOCS2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000551626 ; transcript_alias_2 ENST00000551626.1 ; transcript_alias_3 RP11-887P2.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407729.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029958 ;
chr8	lncipedia.org	exon	126934767	126934791	.	-	.	gene_id lnc-FAM84B-7 ; transcript_id lnc-FAM84B-7:4 ; gene_alias_1 ENSG00000245164 ; gene_alias_2 RP11-622O11.2 ; gene_alias_3 ENSG00000245164.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165025.1 ; gene_alias_5 LINC00861 ; transcript_alias_1 ENST00000517869 ; transcript_alias_2 ENST00000517869.1 ; transcript_alias_3 RP11-622O11.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381472.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	126948484	126948577	.	-	.	gene_id lnc-FAM84B-7 ; transcript_id lnc-FAM84B-7:4 ; gene_alias_1 ENSG00000245164 ; gene_alias_2 RP11-622O11.2 ; gene_alias_3 ENSG00000245164.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165025.1 ; gene_alias_5 LINC00861 ; transcript_alias_1 ENST00000517869 ; transcript_alias_2 ENST00000517869.1 ; transcript_alias_3 RP11-622O11.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381472.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	126958177	126958426	.	-	.	gene_id lnc-FAM84B-7 ; transcript_id lnc-FAM84B-7:4 ; gene_alias_1 ENSG00000245164 ; gene_alias_2 RP11-622O11.2 ; gene_alias_3 ENSG00000245164.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165025.1 ; gene_alias_5 LINC00861 ; transcript_alias_1 ENST00000517869 ; transcript_alias_2 ENST00000517869.1 ; transcript_alias_3 RP11-622O11.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381472.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	126963158	126963394	.	-	.	gene_id lnc-FAM84B-7 ; transcript_id lnc-FAM84B-7:4 ; gene_alias_1 ENSG00000245164 ; gene_alias_2 RP11-622O11.2 ; gene_alias_3 ENSG00000245164.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165025.1 ; gene_alias_5 LINC00861 ; transcript_alias_1 ENST00000517869 ; transcript_alias_2 ENST00000517869.1 ; transcript_alias_3 RP11-622O11.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381472.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	45306472	45307631	.	-	.	gene_id lnc-C10orf10-2 ; transcript_id lnc-C10orf10-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224812 ; gene_alias_2 RP11-18M11.2 ; gene_alias_3 ENSG00000224812.1 ; gene_alias_4 TMEM72-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000018062.1 ; transcript_alias_1 ENST00000450287 ; transcript_alias_2 ENST00000450287.1 ; transcript_alias_3 TMEM72-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000047757.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT013042 ;
chr10	lncipedia.org	exon	45318638	45318736	.	-	.	gene_id lnc-C10orf10-2 ; transcript_id lnc-C10orf10-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224812 ; gene_alias_2 RP11-18M11.2 ; gene_alias_3 ENSG00000224812.1 ; gene_alias_4 TMEM72-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000018062.1 ; transcript_alias_1 ENST00000450287 ; transcript_alias_2 ENST00000450287.1 ; transcript_alias_3 TMEM72-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000047757.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT013042 ;
chr10	lncipedia.org	exon	45320950	45321029	.	-	.	gene_id lnc-C10orf10-2 ; transcript_id lnc-C10orf10-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224812 ; gene_alias_2 RP11-18M11.2 ; gene_alias_3 ENSG00000224812.1 ; gene_alias_4 TMEM72-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000018062.1 ; transcript_alias_1 ENST00000450287 ; transcript_alias_2 ENST00000450287.1 ; transcript_alias_3 TMEM72-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000047757.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT013042 ;
chr10	lncipedia.org	exon	45321600	45321818	.	-	.	gene_id lnc-C10orf10-2 ; transcript_id lnc-C10orf10-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224812 ; gene_alias_2 RP11-18M11.2 ; gene_alias_3 ENSG00000224812.1 ; gene_alias_4 TMEM72-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000018062.1 ; transcript_alias_1 ENST00000450287 ; transcript_alias_2 ENST00000450287.1 ; transcript_alias_3 TMEM72-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000047757.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT013042 ;
chr10	lncipedia.org	exon	45326448	45326693	.	-	.	gene_id lnc-C10orf10-2 ; transcript_id lnc-C10orf10-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224812 ; gene_alias_2 RP11-18M11.2 ; gene_alias_3 ENSG00000224812.1 ; gene_alias_4 TMEM72-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000018062.1 ; transcript_alias_1 ENST00000450287 ; transcript_alias_2 ENST00000450287.1 ; transcript_alias_3 TMEM72-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000047757.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT013042 ;
chr10	lncipedia.org	exon	45329514	45330767	.	-	.	gene_id lnc-C10orf10-2 ; transcript_id lnc-C10orf10-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224812 ; gene_alias_2 RP11-18M11.2 ; gene_alias_3 ENSG00000224812.1 ; gene_alias_4 TMEM72-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000018062.1 ; transcript_alias_1 ENST00000450287 ; transcript_alias_2 ENST00000450287.1 ; transcript_alias_3 TMEM72-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000047757.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT013042 ;
chr10	lncipedia.org	exon	45418529	45418674	.	-	.	gene_id lnc-C10orf10-2 ; transcript_id lnc-C10orf10-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224812 ; gene_alias_2 RP11-18M11.2 ; gene_alias_3 ENSG00000224812.1 ; gene_alias_4 TMEM72-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000018062.1 ; transcript_alias_1 ENST00000450287 ; transcript_alias_2 ENST00000450287.1 ; transcript_alias_3 TMEM72-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000047757.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT013042 ;
chr10	lncipedia.org	exon	45455040	45455137	.	-	.	gene_id lnc-C10orf10-2 ; transcript_id lnc-C10orf10-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224812 ; gene_alias_2 RP11-18M11.2 ; gene_alias_3 ENSG00000224812.1 ; gene_alias_4 TMEM72-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000018062.1 ; transcript_alias_1 ENST00000450287 ; transcript_alias_2 ENST00000450287.1 ; transcript_alias_3 TMEM72-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000047757.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT013042 ;
chr14	lncipedia.org	exon	22849083	22850808	.	-	.	gene_id lnc-DAD1-2 ; transcript_id lnc-DAD1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251002 ; gene_alias_2 AE000661.37 ; gene_alias_3 ENSG00000251002.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168895.2 ; transcript_alias_1 ENST00000514473 ; transcript_alias_2 ENST00000514473.2 ; transcript_alias_3 AE000661.37-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401530.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT035765 ;
chr14	lncipedia.org	exon	22950230	22950347	.	-	.	gene_id lnc-DAD1-2 ; transcript_id lnc-DAD1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251002 ; gene_alias_2 AE000661.37 ; gene_alias_3 ENSG00000251002.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168895.2 ; transcript_alias_1 ENST00000514473 ; transcript_alias_2 ENST00000514473.2 ; transcript_alias_3 AE000661.37-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401530.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT035765 ;
chr14	lncipedia.org	exon	22951842	22951948	.	-	.	gene_id lnc-DAD1-2 ; transcript_id lnc-DAD1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251002 ; gene_alias_2 AE000661.37 ; gene_alias_3 ENSG00000251002.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168895.2 ; transcript_alias_1 ENST00000514473 ; transcript_alias_2 ENST00000514473.2 ; transcript_alias_3 AE000661.37-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401530.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT035765 ;
chr1	lncipedia.org	exon	241505195	241505390	.	-	.	gene_id lnc-FH-1 ; transcript_id lnc-FH-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248169 ; transcript_alias_1 ENST00000515837 ;
chr1	lncipedia.org	exon	241506602	241513514	.	-	.	gene_id lnc-FH-1 ; transcript_id lnc-FH-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248169 ; transcript_alias_1 ENST00000515837 ;
chr12	lncipedia.org	exon	117147983	117149097	.	+	.	gene_id lnc-RNFT2-1 ; transcript_id lnc-RNFT2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250553 ; gene_alias_2 XLOC_009900 ; gene_alias_3 linc-RNFT2-1 ; transcript_alias_1 ENST00000509590 ; transcript_alias_2 TCONS_00020237 ; transcript_alias_3 NONHSAT030962 ;
chr12	lncipedia.org	exon	117149742	117150681	.	+	.	gene_id lnc-RNFT2-1 ; transcript_id lnc-RNFT2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250553 ; gene_alias_2 XLOC_009900 ; gene_alias_3 linc-RNFT2-1 ; transcript_alias_1 ENST00000509590 ; transcript_alias_2 TCONS_00020237 ; transcript_alias_3 NONHSAT030962 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127630186	127630379	.	-	.	gene_id lnc-SLC15A4-14 ; transcript_id lnc-SLC15A4-14:3 ; gene_alias_1 ENSG00000256001 ; gene_alias_2 RP11-575F12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000256001.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168461.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535022 ; transcript_alias_2 ENST00000535022.1 ; transcript_alias_3 RP11-575F12.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399832.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031850 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127630487	127630534	.	-	.	gene_id lnc-SLC15A4-14 ; transcript_id lnc-SLC15A4-14:3 ; gene_alias_1 ENSG00000256001 ; gene_alias_2 RP11-575F12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000256001.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168461.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535022 ; transcript_alias_2 ENST00000535022.1 ; transcript_alias_3 RP11-575F12.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399832.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031850 ;
chr16	lncipedia.org	exon	31052374	31052665	.	+	.	gene_id lnc-AC135050.1-2 ; transcript_id lnc-AC135050.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249093 ; gene_alias_2 AC135050.2 ; transcript_alias_1 ENST00000503629 ; transcript_alias_2 NONHSAT141838 ;
chr16	lncipedia.org	exon	31053038	31053348	.	+	.	gene_id lnc-AC135050.1-2 ; transcript_id lnc-AC135050.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249093 ; gene_alias_2 AC135050.2 ; transcript_alias_1 ENST00000503629 ; transcript_alias_2 NONHSAT141838 ;
chr16	lncipedia.org	exon	31053463	31054276	.	+	.	gene_id lnc-AC135050.1-2 ; transcript_id lnc-AC135050.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249093 ; gene_alias_2 AC135050.2 ; transcript_alias_1 ENST00000503629 ; transcript_alias_2 NONHSAT141838 ;
chr14	lncipedia.org	exon	81687562	81687869	.	+	.	gene_id lnc-TSHR-2 ; transcript_id lnc-TSHR-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247694 ; gene_alias_2 AL136040.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501656 ; transcript_alias_2 NONHSAT038055 ;
chr14	lncipedia.org	exon	81687983	81688799	.	+	.	gene_id lnc-TSHR-2 ; transcript_id lnc-TSHR-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247694 ; gene_alias_2 AL136040.2 ; transcript_alias_1 ENST00000501656 ; transcript_alias_2 NONHSAT038055 ;
chr11	lncipedia.org	exon	86667133	86667302	.	+	.	gene_id lnc-PRSS23-1 ; transcript_id lnc-PRSS23-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000246523 ; gene_alias_2 RP11-736K20.6 ; gene_alias_3 ENSG00000246523.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167232.1 ; gene_alias_5 ENSG00000246523.3 ; transcript_alias_1 ENST00000531827 ; transcript_alias_2 ENST00000531827.1 ; transcript_alias_3 RP11-736K20.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393820.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	86669024	86669068	.	+	.	gene_id lnc-PRSS23-1 ; transcript_id lnc-PRSS23-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000246523 ; gene_alias_2 RP11-736K20.6 ; gene_alias_3 ENSG00000246523.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167232.1 ; gene_alias_5 ENSG00000246523.3 ; transcript_alias_1 ENST00000531827 ; transcript_alias_2 ENST00000531827.1 ; transcript_alias_3 RP11-736K20.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393820.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	86710918	86711532	.	+	.	gene_id lnc-PRSS23-1 ; transcript_id lnc-PRSS23-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000246523 ; gene_alias_2 RP11-736K20.6 ; gene_alias_3 ENSG00000246523.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167232.1 ; gene_alias_5 ENSG00000246523.3 ; transcript_alias_1 ENST00000531827 ; transcript_alias_2 ENST00000531827.1 ; transcript_alias_3 RP11-736K20.6-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393820.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	58907188	58907564	.	-	.	gene_id lnc-MPEG1-2 ; transcript_id lnc-MPEG1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245571 ; gene_alias_2 AP001258.4 ; gene_alias_3 ENSG00000245571.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167435.1 ; transcript_alias_1 ENST00000533220 ; transcript_alias_2 ENST00000533220.1 ; transcript_alias_3 AP001258.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000394609.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT021508 ;
chr11	lncipedia.org	exon	58910088	58910244	.	-	.	gene_id lnc-MPEG1-2 ; transcript_id lnc-MPEG1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245571 ; gene_alias_2 AP001258.4 ; gene_alias_3 ENSG00000245571.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167435.1 ; transcript_alias_1 ENST00000533220 ; transcript_alias_2 ENST00000533220.1 ; transcript_alias_3 AP001258.4-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000394609.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT021508 ;
chr18	lncipedia.org	exon	3653410	3653979	.	+	.	gene_id lnc-AP002478.1-2 ; transcript_id lnc-AP002478.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000251512 ; transcript_alias_1 ENST00000509728 ;
chr18	lncipedia.org	exon	3654705	3654815	.	+	.	gene_id lnc-AP002478.1-2 ; transcript_id lnc-AP002478.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000251512 ; transcript_alias_1 ENST00000509728 ;
chr18	lncipedia.org	exon	3655509	3656280	.	+	.	gene_id lnc-AP002478.1-2 ; transcript_id lnc-AP002478.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000251512 ; transcript_alias_1 ENST00000509728 ;
chr16	lncipedia.org	exon	89584045	89584375	.	-	.	gene_id lnc-ANKRD11-3 ; transcript_id lnc-ANKRD11-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245196 ; gene_alias_2 AC092123.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499807 ; transcript_alias_2 NONHSAT144536 ;
chr16	lncipedia.org	exon	89584809	89588625	.	-	.	gene_id lnc-ANKRD11-3 ; transcript_id lnc-ANKRD11-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245196 ; gene_alias_2 AC092123.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499807 ; transcript_alias_2 NONHSAT144536 ;
chr10	lncipedia.org	exon	122522913	122523187	.	-	.	gene_id lnc-FGFR2-4 ; transcript_id lnc-FGFR2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227165 ; gene_alias_2 RP11-323P17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000227165.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000019169.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451706 ; transcript_alias_2 ENST00000451706.1 ; transcript_alias_3 RP11-323P17.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000050705.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	122536247	122536396	.	-	.	gene_id lnc-FGFR2-4 ; transcript_id lnc-FGFR2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227165 ; gene_alias_2 RP11-323P17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000227165.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000019169.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451706 ; transcript_alias_2 ENST00000451706.1 ; transcript_alias_3 RP11-323P17.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000050705.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	122550826	122551109	.	-	.	gene_id lnc-FGFR2-4 ; transcript_id lnc-FGFR2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227165 ; gene_alias_2 RP11-323P17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000227165.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000019169.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451706 ; transcript_alias_2 ENST00000451706.1 ; transcript_alias_3 RP11-323P17.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000050705.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	122551240	122551437	.	-	.	gene_id lnc-FGFR2-4 ; transcript_id lnc-FGFR2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000227165 ; gene_alias_2 RP11-323P17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000227165.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000019169.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451706 ; transcript_alias_2 ENST00000451706.1 ; transcript_alias_3 RP11-323P17.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000050705.1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	104279624	104279748	.	-	.	gene_id lnc-C8orf56-1 ; transcript_id lnc-C8orf56-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000247081 ; gene_alias_2 RP11-318M2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247081.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164798.3 ; gene_alias_5 ENSG00000247081.3 ; transcript_alias_1 ENST00000523673 ; transcript_alias_2 ENST00000523673.1 ; transcript_alias_3 RP11-318M2.2-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000380353.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128176 ;
chr8	lncipedia.org	exon	104280619	104280700	.	-	.	gene_id lnc-C8orf56-1 ; transcript_id lnc-C8orf56-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000247081 ; gene_alias_2 RP11-318M2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247081.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164798.3 ; gene_alias_5 ENSG00000247081.3 ; transcript_alias_1 ENST00000523673 ; transcript_alias_2 ENST00000523673.1 ; transcript_alias_3 RP11-318M2.2-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000380353.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128176 ;
chr8	lncipedia.org	exon	104280920	104281071	.	-	.	gene_id lnc-C8orf56-1 ; transcript_id lnc-C8orf56-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000247081 ; gene_alias_2 RP11-318M2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247081.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164798.3 ; gene_alias_5 ENSG00000247081.3 ; transcript_alias_1 ENST00000523673 ; transcript_alias_2 ENST00000523673.1 ; transcript_alias_3 RP11-318M2.2-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000380353.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128176 ;
chr8	lncipedia.org	exon	104298066	104298130	.	-	.	gene_id lnc-C8orf56-1 ; transcript_id lnc-C8orf56-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000247081 ; gene_alias_2 RP11-318M2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247081.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164798.3 ; gene_alias_5 ENSG00000247081.3 ; transcript_alias_1 ENST00000523673 ; transcript_alias_2 ENST00000523673.1 ; transcript_alias_3 RP11-318M2.2-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000380353.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128176 ;
chr9	lncipedia.org	exon	123605378	123605717	.	+	.	gene_id lnc-CNTRL-1 ; transcript_id lnc-CNTRL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226752 ; gene_alias_2 RP11-27I1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000226752.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020572.1 ; gene_alias_5 ENSG00000226752.3 ; gene_alias_6 PSMD5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000442982 ; transcript_alias_2 ENST00000442982.1 ; transcript_alias_3 RP11-27I1.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000053821.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	123607271	123607474	.	+	.	gene_id lnc-CNTRL-1 ; transcript_id lnc-CNTRL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226752 ; gene_alias_2 RP11-27I1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000226752.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020572.1 ; gene_alias_5 ENSG00000226752.3 ; gene_alias_6 PSMD5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000442982 ; transcript_alias_2 ENST00000442982.1 ; transcript_alias_3 RP11-27I1.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000053821.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	123609572	123609631	.	+	.	gene_id lnc-CNTRL-1 ; transcript_id lnc-CNTRL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226752 ; gene_alias_2 RP11-27I1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000226752.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020572.1 ; gene_alias_5 ENSG00000226752.3 ; gene_alias_6 PSMD5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000442982 ; transcript_alias_2 ENST00000442982.1 ; transcript_alias_3 RP11-27I1.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000053821.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	123613516	123614881	.	+	.	gene_id lnc-CNTRL-1 ; transcript_id lnc-CNTRL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226752 ; gene_alias_2 RP11-27I1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000226752.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020572.1 ; gene_alias_5 ENSG00000226752.3 ; gene_alias_6 PSMD5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000442982 ; transcript_alias_2 ENST00000442982.1 ; transcript_alias_3 RP11-27I1.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000053821.1 ;
chr4	lncipedia.org	exon	145564376	145564886	.	-	.	gene_id lnc-ANAPC10-1 ; transcript_id lnc-ANAPC10-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000248890 ; gene_alias_2 RP11-291L15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248890.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161429.1 ; gene_alias_5 HHIP-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000503066 ; transcript_alias_2 ENST00000503066.1 ; transcript_alias_3 RP11-291L15.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364895.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT098600 ;
chr4	lncipedia.org	exon	145566440	145566619	.	-	.	gene_id lnc-ANAPC10-1 ; transcript_id lnc-ANAPC10-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000248890 ; gene_alias_2 RP11-291L15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248890.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161429.1 ; gene_alias_5 HHIP-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000503066 ; transcript_alias_2 ENST00000503066.1 ; transcript_alias_3 RP11-291L15.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364895.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT098600 ;
chr4	lncipedia.org	exon	145566859	145567064	.	-	.	gene_id lnc-ANAPC10-1 ; transcript_id lnc-ANAPC10-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000248890 ; gene_alias_2 RP11-291L15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000248890.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161429.1 ; gene_alias_5 HHIP-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000503066 ; transcript_alias_2 ENST00000503066.1 ; transcript_alias_3 RP11-291L15.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364895.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT098600 ;
chr2	lncipedia.org	exon	75767865	75767996	.	+	.	gene_id lnc-MRPL19-1 ; transcript_id lnc-MRPL19-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231172 ; gene_alias_2 AC007099.1 ; gene_alias_3 ENSG00000231172.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152941.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451622 ; transcript_alias_2 ENST00000451622.1 ; transcript_alias_3 AC007099.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000328729.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT071801 ;
chr2	lncipedia.org	exon	75768864	75769832	.	+	.	gene_id lnc-MRPL19-1 ; transcript_id lnc-MRPL19-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000231172 ; gene_alias_2 AC007099.1 ; gene_alias_3 ENSG00000231172.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152941.1 ; transcript_alias_1 ENST00000451622 ; transcript_alias_2 ENST00000451622.1 ; transcript_alias_3 AC007099.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000328729.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT071801 ;
chr8	lncipedia.org	exon	102019205	102021354	.	+	.	gene_id lnc-GRHL2-9 ; transcript_id lnc-GRHL2-9:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248638 ; transcript_alias_1 ENST00000512945 ;
chr8	lncipedia.org	exon	102021531	102023783	.	+	.	gene_id lnc-GRHL2-9 ; transcript_id lnc-GRHL2-9:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248638 ; transcript_alias_1 ENST00000512945 ;
chr8	lncipedia.org	exon	102025826	102029741	.	+	.	gene_id lnc-GRHL2-9 ; transcript_id lnc-GRHL2-9:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248638 ; transcript_alias_1 ENST00000512945 ;
chr12	lncipedia.org	exon	120827349	120827371	.	+	.	gene_id lnc-COX6A1-1 ; transcript_id lnc-COX6A1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256695 ; gene_alias_2 RP1-166H1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000256695.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169024.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536933 ; transcript_alias_2 ENST00000536933.1 ; transcript_alias_3 RP1-166H1.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401995.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031170 ;
chr12	lncipedia.org	exon	120831305	120831380	.	+	.	gene_id lnc-COX6A1-1 ; transcript_id lnc-COX6A1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256695 ; gene_alias_2 RP1-166H1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000256695.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169024.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536933 ; transcript_alias_2 ENST00000536933.1 ; transcript_alias_3 RP1-166H1.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401995.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031170 ;
chr12	lncipedia.org	exon	120832200	120832325	.	+	.	gene_id lnc-COX6A1-1 ; transcript_id lnc-COX6A1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256695 ; gene_alias_2 RP1-166H1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000256695.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169024.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536933 ; transcript_alias_2 ENST00000536933.1 ; transcript_alias_3 RP1-166H1.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401995.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031170 ;
chr12	lncipedia.org	exon	120833658	120833797	.	+	.	gene_id lnc-COX6A1-1 ; transcript_id lnc-COX6A1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256695 ; gene_alias_2 RP1-166H1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000256695.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169024.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536933 ; transcript_alias_2 ENST00000536933.1 ; transcript_alias_3 RP1-166H1.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401995.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031170 ;
chr12	lncipedia.org	exon	5132848	5133071	.	+	.	gene_id lnc-KCNA5-1 ; transcript_id lnc-KCNA5-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256654 ; gene_alias_2 RP11-429A20.4 ; gene_alias_3 ENSG00000256654.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168298.1 ; transcript_alias_1 ENST00000538202 ; transcript_alias_2 ENST00000538202.1 ; transcript_alias_3 RP11-429A20.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399212.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT025985 ;
chr12	lncipedia.org	exon	5134260	5134758	.	+	.	gene_id lnc-KCNA5-1 ; transcript_id lnc-KCNA5-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256654 ; gene_alias_2 RP11-429A20.4 ; gene_alias_3 ENSG00000256654.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168298.1 ; transcript_alias_1 ENST00000538202 ; transcript_alias_2 ENST00000538202.1 ; transcript_alias_3 RP11-429A20.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399212.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT025985 ;
chr1	lncipedia.org	exon	114470257	114471010	.	-	.	gene_id lnc-AP4B1-1 ; transcript_id lnc-AP4B1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235527 ; gene_alias_2 RP5-1073O3.7 ; gene_alias_3 ENSG00000235527.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000011982.2 ; transcript_alias_1 ENST00000426237 ; transcript_alias_2 ENST00000426237.2 ; transcript_alias_3 RP5-1073O3.7-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000033126.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT005348 ;
chr1	lncipedia.org	exon	114471831	114472114	.	-	.	gene_id lnc-AP4B1-1 ; transcript_id lnc-AP4B1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235527 ; gene_alias_2 RP5-1073O3.7 ; gene_alias_3 ENSG00000235527.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000011982.2 ; transcript_alias_1 ENST00000426237 ; transcript_alias_2 ENST00000426237.2 ; transcript_alias_3 RP5-1073O3.7-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000033126.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT005348 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127759012	127759066	.	-	.	gene_id lnc-SLC15A4-12 ; transcript_id lnc-SLC15A4-12:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256292 ; gene_alias_2 RP11-955H22.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256292.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168443.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536330 ; transcript_alias_2 ENST00000536330.1 ; transcript_alias_3 RP11-955H22.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399771.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031861 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127759994	127760119	.	-	.	gene_id lnc-SLC15A4-12 ; transcript_id lnc-SLC15A4-12:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256292 ; gene_alias_2 RP11-955H22.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256292.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168443.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536330 ; transcript_alias_2 ENST00000536330.1 ; transcript_alias_3 RP11-955H22.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399771.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031861 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127767781	127768181	.	-	.	gene_id lnc-SLC15A4-12 ; transcript_id lnc-SLC15A4-12:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256292 ; gene_alias_2 RP11-955H22.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256292.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168443.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536330 ; transcript_alias_2 ENST00000536330.1 ; transcript_alias_3 RP11-955H22.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399771.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031861 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127768687	127768828	.	-	.	gene_id lnc-SLC15A4-12 ; transcript_id lnc-SLC15A4-12:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256292 ; gene_alias_2 RP11-955H22.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256292.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168443.1 ; transcript_alias_1 ENST00000536330 ; transcript_alias_2 ENST00000536330.1 ; transcript_alias_3 RP11-955H22.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399771.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031861 ;
chr6	lncipedia.org	exon	2244111	2245348	.	+	.	gene_id lnc-WRNIP1-3 ; transcript_id lnc-WRNIP1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246005 ; gene_alias_2 AL158139.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500716 ; transcript_alias_2 NONHSAT106618 ;
chr6	lncipedia.org	exon	2245771	2245808	.	+	.	gene_id lnc-WRNIP1-3 ; transcript_id lnc-WRNIP1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246005 ; gene_alias_2 AL158139.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500716 ; transcript_alias_2 NONHSAT106618 ;
chr8	lncipedia.org	exon	125861008	125861063	.	+	.	gene_id lnc-ZNF572-1 ; transcript_id lnc-ZNF572-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249816 ; gene_alias_2 ENSG00000249816.2 ; gene_alias_3 RP11-6D1.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165101.1 ; gene_alias_5 LINC00964 ; transcript_alias_1 ENST00000528090 ; transcript_alias_2 ENST00000528090.1 ; transcript_alias_3 RP11-6D1.6-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381821.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128605 ;
chr8	lncipedia.org	exon	125861517	125861578	.	+	.	gene_id lnc-ZNF572-1 ; transcript_id lnc-ZNF572-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249816 ; gene_alias_2 ENSG00000249816.2 ; gene_alias_3 RP11-6D1.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165101.1 ; gene_alias_5 LINC00964 ; transcript_alias_1 ENST00000528090 ; transcript_alias_2 ENST00000528090.1 ; transcript_alias_3 RP11-6D1.6-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381821.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128605 ;
chr8	lncipedia.org	exon	125861987	125862195	.	+	.	gene_id lnc-ZNF572-1 ; transcript_id lnc-ZNF572-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249816 ; gene_alias_2 ENSG00000249816.2 ; gene_alias_3 RP11-6D1.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165101.1 ; gene_alias_5 LINC00964 ; transcript_alias_1 ENST00000528090 ; transcript_alias_2 ENST00000528090.1 ; transcript_alias_3 RP11-6D1.6-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381821.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128605 ;
chr8	lncipedia.org	exon	125953705	125953789	.	+	.	gene_id lnc-ZNF572-1 ; transcript_id lnc-ZNF572-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249816 ; gene_alias_2 ENSG00000249816.2 ; gene_alias_3 RP11-6D1.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165101.1 ; gene_alias_5 LINC00964 ; transcript_alias_1 ENST00000528090 ; transcript_alias_2 ENST00000528090.1 ; transcript_alias_3 RP11-6D1.6-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381821.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128605 ;
chr8	lncipedia.org	exon	125955512	125955625	.	+	.	gene_id lnc-ZNF572-1 ; transcript_id lnc-ZNF572-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249816 ; gene_alias_2 ENSG00000249816.2 ; gene_alias_3 RP11-6D1.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165101.1 ; gene_alias_5 LINC00964 ; transcript_alias_1 ENST00000528090 ; transcript_alias_2 ENST00000528090.1 ; transcript_alias_3 RP11-6D1.6-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381821.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128605 ;
chr8	lncipedia.org	exon	125956809	125956854	.	+	.	gene_id lnc-ZNF572-1 ; transcript_id lnc-ZNF572-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249816 ; gene_alias_2 ENSG00000249816.2 ; gene_alias_3 RP11-6D1.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165101.1 ; gene_alias_5 LINC00964 ; transcript_alias_1 ENST00000528090 ; transcript_alias_2 ENST00000528090.1 ; transcript_alias_3 RP11-6D1.6-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381821.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128605 ;
chr4	lncipedia.org	exon	124571446	124571484	.	+	.	gene_id lnc-SPRY1-2 ; transcript_id lnc-SPRY1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000249464 ; gene_alias_2 RP11-93L9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000249464.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161162.3 ; gene_alias_5 LINC01091 ; transcript_alias_1 ENST00000511919 ; transcript_alias_2 ENST00000511919.1 ; transcript_alias_3 RP11-93L9.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364191.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT098198 ;
chr4	lncipedia.org	exon	124573942	124574057	.	+	.	gene_id lnc-SPRY1-2 ; transcript_id lnc-SPRY1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000249464 ; gene_alias_2 RP11-93L9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000249464.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161162.3 ; gene_alias_5 LINC01091 ; transcript_alias_1 ENST00000511919 ; transcript_alias_2 ENST00000511919.1 ; transcript_alias_3 RP11-93L9.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364191.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT098198 ;
chr4	lncipedia.org	exon	124582908	124582988	.	+	.	gene_id lnc-SPRY1-2 ; transcript_id lnc-SPRY1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000249464 ; gene_alias_2 RP11-93L9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000249464.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161162.3 ; gene_alias_5 LINC01091 ; transcript_alias_1 ENST00000511919 ; transcript_alias_2 ENST00000511919.1 ; transcript_alias_3 RP11-93L9.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364191.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT098198 ;
chr4	lncipedia.org	exon	124750250	124750342	.	+	.	gene_id lnc-SPRY1-2 ; transcript_id lnc-SPRY1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000249464 ; gene_alias_2 RP11-93L9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000249464.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161162.3 ; gene_alias_5 LINC01091 ; transcript_alias_1 ENST00000511919 ; transcript_alias_2 ENST00000511919.1 ; transcript_alias_3 RP11-93L9.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364191.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT098198 ;
chr4	lncipedia.org	exon	124846339	124846492	.	+	.	gene_id lnc-SPRY1-2 ; transcript_id lnc-SPRY1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000249464 ; gene_alias_2 RP11-93L9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000249464.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161162.3 ; gene_alias_5 LINC01091 ; transcript_alias_1 ENST00000511919 ; transcript_alias_2 ENST00000511919.1 ; transcript_alias_3 RP11-93L9.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364191.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT098198 ;
chr4	lncipedia.org	exon	124851403	124851509	.	+	.	gene_id lnc-SPRY1-2 ; transcript_id lnc-SPRY1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000249464 ; gene_alias_2 RP11-93L9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000249464.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000161162.3 ; gene_alias_5 LINC01091 ; transcript_alias_1 ENST00000511919 ; transcript_alias_2 ENST00000511919.1 ; transcript_alias_3 RP11-93L9.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000364191.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT098198 ;
chr2	lncipedia.org	exon	114008343	114008499	.	+	.	gene_id lnc-PSD4-1 ; transcript_id lnc-PSD4-1:15 ; gene_alias_1 ENSG00000189223 ; gene_alias_2 AC016683.6 ; gene_alias_3 ENSG00000189223.7 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153340.3 ; gene_alias_5 ENSG00000189223.9 ; gene_alias_6 PAX8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000510859 ; transcript_alias_2 ENST00000510859.1 ; transcript_alias_3 AC016683.6-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000370822.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT073772 ;
chr2	lncipedia.org	exon	114012967	114013126	.	+	.	gene_id lnc-PSD4-1 ; transcript_id lnc-PSD4-1:15 ; gene_alias_1 ENSG00000189223 ; gene_alias_2 AC016683.6 ; gene_alias_3 ENSG00000189223.7 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153340.3 ; gene_alias_5 ENSG00000189223.9 ; gene_alias_6 PAX8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000510859 ; transcript_alias_2 ENST00000510859.1 ; transcript_alias_3 AC016683.6-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000370822.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT073772 ;
chr2	lncipedia.org	exon	114016841	114017161	.	+	.	gene_id lnc-PSD4-1 ; transcript_id lnc-PSD4-1:15 ; gene_alias_1 ENSG00000189223 ; gene_alias_2 AC016683.6 ; gene_alias_3 ENSG00000189223.7 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153340.3 ; gene_alias_5 ENSG00000189223.9 ; gene_alias_6 PAX8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000510859 ; transcript_alias_2 ENST00000510859.1 ; transcript_alias_3 AC016683.6-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000370822.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT073772 ;
chr2	lncipedia.org	exon	114020855	114021031	.	+	.	gene_id lnc-PSD4-1 ; transcript_id lnc-PSD4-1:15 ; gene_alias_1 ENSG00000189223 ; gene_alias_2 AC016683.6 ; gene_alias_3 ENSG00000189223.7 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153340.3 ; gene_alias_5 ENSG00000189223.9 ; gene_alias_6 PAX8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000510859 ; transcript_alias_2 ENST00000510859.1 ; transcript_alias_3 AC016683.6-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000370822.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT073772 ;
chr2	lncipedia.org	exon	114023053	114024550	.	+	.	gene_id lnc-PSD4-1 ; transcript_id lnc-PSD4-1:15 ; gene_alias_1 ENSG00000189223 ; gene_alias_2 AC016683.6 ; gene_alias_3 ENSG00000189223.7 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000153340.3 ; gene_alias_5 ENSG00000189223.9 ; gene_alias_6 PAX8-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000510859 ; transcript_alias_2 ENST00000510859.1 ; transcript_alias_3 AC016683.6-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000370822.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT073772 ;
chr2	lncipedia.org	exon	231852886	231852894	.	-	.	gene_id lnc-GPR55-1 ; transcript_id lnc-GPR55-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000238062 ; gene_alias_2 XLOC_002517 ; gene_alias_3 linc-GPR55 ; gene_alias_4 AC105344.2 ; gene_alias_5 ENSG00000238062.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000154076.1 ; gene_alias_7 SPATA3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000457803 ; transcript_alias_2 TCONS_00003512 ; transcript_alias_3 ENST00000457803.1 ; transcript_alias_4 AC105344.2-004 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000333740.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT077328 ;
chr2	lncipedia.org	exon	231856484	231856690	.	-	.	gene_id lnc-GPR55-1 ; transcript_id lnc-GPR55-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000238062 ; gene_alias_2 XLOC_002517 ; gene_alias_3 linc-GPR55 ; gene_alias_4 AC105344.2 ; gene_alias_5 ENSG00000238062.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000154076.1 ; gene_alias_7 SPATA3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000457803 ; transcript_alias_2 TCONS_00003512 ; transcript_alias_3 ENST00000457803.1 ; transcript_alias_4 AC105344.2-004 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000333740.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT077328 ;
chr2	lncipedia.org	exon	231859992	231860100	.	-	.	gene_id lnc-GPR55-1 ; transcript_id lnc-GPR55-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000238062 ; gene_alias_2 XLOC_002517 ; gene_alias_3 linc-GPR55 ; gene_alias_4 AC105344.2 ; gene_alias_5 ENSG00000238062.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000154076.1 ; gene_alias_7 SPATA3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000457803 ; transcript_alias_2 TCONS_00003512 ; transcript_alias_3 ENST00000457803.1 ; transcript_alias_4 AC105344.2-004 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000333740.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT077328 ;
chr2	lncipedia.org	exon	231860563	231860744	.	-	.	gene_id lnc-GPR55-1 ; transcript_id lnc-GPR55-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000238062 ; gene_alias_2 XLOC_002517 ; gene_alias_3 linc-GPR55 ; gene_alias_4 AC105344.2 ; gene_alias_5 ENSG00000238062.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000154076.1 ; gene_alias_7 SPATA3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000457803 ; transcript_alias_2 TCONS_00003512 ; transcript_alias_3 ENST00000457803.1 ; transcript_alias_4 AC105344.2-004 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000333740.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT077328 ;
chr10	lncipedia.org	exon	80008505	80008827	.	+	.	gene_id lnc-RPS24-3 ; transcript_id lnc-RPS24-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000230417 ; gene_alias_2 RP11-90J7.3 ; gene_alias_3 ENSG00000230417.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018555.2 ; gene_alias_5 ENSG00000230417.6 ; gene_alias_6 LINC00856 ; transcript_alias_1 ENST00000434974 ; transcript_alias_2 ENST00000434974.1 ; transcript_alias_3 RP11-90J7.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000048934.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	80010034	80012402	.	+	.	gene_id lnc-RPS24-3 ; transcript_id lnc-RPS24-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000230417 ; gene_alias_2 RP11-90J7.3 ; gene_alias_3 ENSG00000230417.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000018555.2 ; gene_alias_5 ENSG00000230417.6 ; gene_alias_6 LINC00856 ; transcript_alias_1 ENST00000434974 ; transcript_alias_2 ENST00000434974.1 ; transcript_alias_3 RP11-90J7.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000048934.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	75524207	75527891	.	-	.	gene_id lnc-AC015804.1-2 ; transcript_id lnc-AC015804.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250179 ; transcript_alias_1 ENST00000543179 ;
chr17	lncipedia.org	exon	75529179	75529348	.	-	.	gene_id lnc-AC015804.1-2 ; transcript_id lnc-AC015804.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250179 ; transcript_alias_1 ENST00000543179 ;
chr17	lncipedia.org	exon	75530537	75530769	.	-	.	gene_id lnc-AC015804.1-2 ; transcript_id lnc-AC015804.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250179 ; transcript_alias_1 ENST00000543179 ;
chr17	lncipedia.org	exon	75532322	75532673	.	-	.	gene_id lnc-AC015804.1-2 ; transcript_id lnc-AC015804.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250179 ; transcript_alias_1 ENST00000543179 ;
chr4	lncipedia.org	exon	175015811	175016604	.	-	.	gene_id lnc-FBXO8-4 ; transcript_id lnc-FBXO8-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248174 ; gene_alias_2 RP11-148L24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248174.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160745.2 ; transcript_alias_1 ENST00000515444 ; transcript_alias_2 ENST00000515444.1 ; transcript_alias_3 RP11-148L24.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000362083.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099311 ; transcript_alias_6 NR_125896 ;
chr4	lncipedia.org	exon	175017883	175017934	.	-	.	gene_id lnc-FBXO8-4 ; transcript_id lnc-FBXO8-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248174 ; gene_alias_2 RP11-148L24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248174.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160745.2 ; transcript_alias_1 ENST00000515444 ; transcript_alias_2 ENST00000515444.1 ; transcript_alias_3 RP11-148L24.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000362083.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099311 ; transcript_alias_6 NR_125896 ;
chr4	lncipedia.org	exon	175018774	175018980	.	-	.	gene_id lnc-FBXO8-4 ; transcript_id lnc-FBXO8-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248174 ; gene_alias_2 RP11-148L24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248174.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160745.2 ; transcript_alias_1 ENST00000515444 ; transcript_alias_2 ENST00000515444.1 ; transcript_alias_3 RP11-148L24.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000362083.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099311 ; transcript_alias_6 NR_125896 ;
chr4	lncipedia.org	exon	175041048	175041237	.	-	.	gene_id lnc-FBXO8-4 ; transcript_id lnc-FBXO8-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248174 ; gene_alias_2 RP11-148L24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248174.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160745.2 ; transcript_alias_1 ENST00000515444 ; transcript_alias_2 ENST00000515444.1 ; transcript_alias_3 RP11-148L24.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000362083.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099311 ; transcript_alias_6 NR_125896 ;
chr4	lncipedia.org	exon	175141465	175141549	.	-	.	gene_id lnc-FBXO8-4 ; transcript_id lnc-FBXO8-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248174 ; gene_alias_2 RP11-148L24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248174.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160745.2 ; transcript_alias_1 ENST00000515444 ; transcript_alias_2 ENST00000515444.1 ; transcript_alias_3 RP11-148L24.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000362083.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099311 ; transcript_alias_6 NR_125896 ;
chr17	lncipedia.org	exon	70380443	70381427	.	-	.	gene_id lnc-SLC39A11-1 ; transcript_id lnc-SLC39A11-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000227036 ; gene_alias_2 XLOC_012568 ; gene_alias_3 linc-ABCA5-3 ; gene_alias_4 AC007639.1 ; transcript_alias_1 ENST00000453722 ; transcript_alias_2 TCONS_00025252 ; transcript_alias_3 NONHSAT055685 ;
chr17	lncipedia.org	exon	70424377	70424439	.	-	.	gene_id lnc-SLC39A11-1 ; transcript_id lnc-SLC39A11-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000227036 ; gene_alias_2 XLOC_012568 ; gene_alias_3 linc-ABCA5-3 ; gene_alias_4 AC007639.1 ; transcript_alias_1 ENST00000453722 ; transcript_alias_2 TCONS_00025252 ; transcript_alias_3 NONHSAT055685 ;
chr17	lncipedia.org	exon	70427269	70427365	.	-	.	gene_id lnc-SLC39A11-1 ; transcript_id lnc-SLC39A11-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000227036 ; gene_alias_2 XLOC_012568 ; gene_alias_3 linc-ABCA5-3 ; gene_alias_4 AC007639.1 ; transcript_alias_1 ENST00000453722 ; transcript_alias_2 TCONS_00025252 ; transcript_alias_3 NONHSAT055685 ;
chr17	lncipedia.org	exon	70588342	70588943	.	-	.	gene_id lnc-SLC39A11-1 ; transcript_id lnc-SLC39A11-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000227036 ; gene_alias_2 XLOC_012568 ; gene_alias_3 linc-ABCA5-3 ; gene_alias_4 AC007639.1 ; transcript_alias_1 ENST00000453722 ; transcript_alias_2 TCONS_00025252 ; transcript_alias_3 NONHSAT055685 ;
chr10	lncipedia.org	exon	74857802	74859592	.	-	.	gene_id lnc-P4HA1-1 ; transcript_id lnc-P4HA1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251086 ; gene_alias_2 XLOC_008852 ; gene_alias_3 linc-P4HA1 ; gene_alias_4 ENSG00000272630.1 ; gene_alias_5 RP11-344N10.5 ; transcript_alias_1 ENST00000507930 ; transcript_alias_2 TCONS_00017996 ; transcript_alias_3 NONHSAT013940 ; transcript_alias_4 ENST00000608005.1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	74859842	74861055	.	-	.	gene_id lnc-P4HA1-1 ; transcript_id lnc-P4HA1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251086 ; gene_alias_2 XLOC_008852 ; gene_alias_3 linc-P4HA1 ; gene_alias_4 ENSG00000272630.1 ; gene_alias_5 RP11-344N10.5 ; transcript_alias_1 ENST00000507930 ; transcript_alias_2 TCONS_00017996 ; transcript_alias_3 NONHSAT013940 ; transcript_alias_4 ENST00000608005.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	27542759	27543101	.	-	.	gene_id lnc-C12orf71-2 ; transcript_id lnc-C12orf71-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245311 ; transcript_alias_1 ENST00000500498 ;
chr12	lncipedia.org	exon	27543328	27543422	.	-	.	gene_id lnc-C12orf71-2 ; transcript_id lnc-C12orf71-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245311 ; transcript_alias_1 ENST00000500498 ;
chr12	lncipedia.org	exon	27547357	27547556	.	-	.	gene_id lnc-C12orf71-2 ; transcript_id lnc-C12orf71-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245311 ; transcript_alias_1 ENST00000500498 ;
chr12	lncipedia.org	exon	27599430	27599558	.	-	.	gene_id lnc-C12orf71-2 ; transcript_id lnc-C12orf71-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245311 ; transcript_alias_1 ENST00000500498 ;
chr17	lncipedia.org	exon	49012350	49013086	.	-	.	gene_id lnc-SPAG9-1 ; transcript_id lnc-SPAG9-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247011 ; gene_alias_2 XLOC_012521 ; gene_alias_3 linc-TOB1 ; gene_alias_4 RP11-700H6.1 ; gene_alias_5 ENSG00000247011.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000162317.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501718 ; transcript_alias_2 TCONS_00025242 ; transcript_alias_3 ENST00000501718.2 ; transcript_alias_4 RP11-700H6.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000368558.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT054736 ;
chr17	lncipedia.org	exon	49020758	49022074	.	-	.	gene_id lnc-SPAG9-1 ; transcript_id lnc-SPAG9-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247011 ; gene_alias_2 XLOC_012521 ; gene_alias_3 linc-TOB1 ; gene_alias_4 RP11-700H6.1 ; gene_alias_5 ENSG00000247011.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000162317.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501718 ; transcript_alias_2 TCONS_00025242 ; transcript_alias_3 ENST00000501718.2 ; transcript_alias_4 RP11-700H6.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000368558.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT054736 ;
chr1	lncipedia.org	exon	40932412	40932826	.	-	.	gene_id lnc-RIMS3-5 ; transcript_id lnc-RIMS3-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250648 ; gene_alias_2 XLOC_000796 ; gene_alias_3 linc-COL9A2-2 ; transcript_alias_1 ENST00000515449 ; transcript_alias_2 TCONS_00000506 ; transcript_alias_3 NONHSAT002641 ;
chr1	lncipedia.org	exon	40936182	40938148	.	-	.	gene_id lnc-RIMS3-5 ; transcript_id lnc-RIMS3-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250648 ; gene_alias_2 XLOC_000796 ; gene_alias_3 linc-COL9A2-2 ; transcript_alias_1 ENST00000515449 ; transcript_alias_2 TCONS_00000506 ; transcript_alias_3 NONHSAT002641 ;
chr2	lncipedia.org	exon	20068621	20068713	.	+	.	gene_id lnc-RHOB-4 ; transcript_id lnc-RHOB-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000228784 ; gene_alias_2 AC013400.2 ; gene_alias_3 ENSG00000228784.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151773.1 ; gene_alias_5 ENSG00000228784.3 ; gene_alias_6 LINC00954 ; transcript_alias_1 ENST00000438692 ; transcript_alias_2 ENST00000438692.1 ; transcript_alias_3 AC013400.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323864.1 ; transcript_alias_5 ENST00000607100.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	20069257	20069374	.	+	.	gene_id lnc-RHOB-4 ; transcript_id lnc-RHOB-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000228784 ; gene_alias_2 AC013400.2 ; gene_alias_3 ENSG00000228784.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151773.1 ; gene_alias_5 ENSG00000228784.3 ; gene_alias_6 LINC00954 ; transcript_alias_1 ENST00000438692 ; transcript_alias_2 ENST00000438692.1 ; transcript_alias_3 AC013400.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323864.1 ; transcript_alias_5 ENST00000607100.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	20072154	20072357	.	+	.	gene_id lnc-RHOB-4 ; transcript_id lnc-RHOB-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000228784 ; gene_alias_2 AC013400.2 ; gene_alias_3 ENSG00000228784.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151773.1 ; gene_alias_5 ENSG00000228784.3 ; gene_alias_6 LINC00954 ; transcript_alias_1 ENST00000438692 ; transcript_alias_2 ENST00000438692.1 ; transcript_alias_3 AC013400.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323864.1 ; transcript_alias_5 ENST00000607100.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	20072893	20073125	.	+	.	gene_id lnc-RHOB-4 ; transcript_id lnc-RHOB-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000228784 ; gene_alias_2 AC013400.2 ; gene_alias_3 ENSG00000228784.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151773.1 ; gene_alias_5 ENSG00000228784.3 ; gene_alias_6 LINC00954 ; transcript_alias_1 ENST00000438692 ; transcript_alias_2 ENST00000438692.1 ; transcript_alias_3 AC013400.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323864.1 ; transcript_alias_5 ENST00000607100.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	20075564	20077154	.	+	.	gene_id lnc-RHOB-4 ; transcript_id lnc-RHOB-4:3 ; gene_alias_1 ENSG00000228784 ; gene_alias_2 AC013400.2 ; gene_alias_3 ENSG00000228784.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151773.1 ; gene_alias_5 ENSG00000228784.3 ; gene_alias_6 LINC00954 ; transcript_alias_1 ENST00000438692 ; transcript_alias_2 ENST00000438692.1 ; transcript_alias_3 AC013400.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323864.1 ; transcript_alias_5 ENST00000607100.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	2861365	2861672	.	-	.	gene_id lnc-CDKN1C-2 ; transcript_id lnc-CDKN1C-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229414 ; gene_alias_2 AC013791.10 ; gene_alias_3 ENSG00000229414.2 ; gene_alias_4 KCNQ1-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000011704.2 ; transcript_alias_1 ENST00000440887 ; transcript_alias_2 ENST00000440887.2 ; transcript_alias_3 KCNQ1-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000383080.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017529 ;
chr11	lncipedia.org	exon	2879973	2880169	.	-	.	gene_id lnc-CDKN1C-2 ; transcript_id lnc-CDKN1C-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229414 ; gene_alias_2 AC013791.10 ; gene_alias_3 ENSG00000229414.2 ; gene_alias_4 KCNQ1-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000011704.2 ; transcript_alias_1 ENST00000440887 ; transcript_alias_2 ENST00000440887.2 ; transcript_alias_3 KCNQ1-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000383080.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017529 ;
chr11	lncipedia.org	exon	2882220	2882798	.	-	.	gene_id lnc-CDKN1C-2 ; transcript_id lnc-CDKN1C-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229414 ; gene_alias_2 AC013791.10 ; gene_alias_3 ENSG00000229414.2 ; gene_alias_4 KCNQ1-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000011704.2 ; transcript_alias_1 ENST00000440887 ; transcript_alias_2 ENST00000440887.2 ; transcript_alias_3 KCNQ1-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000383080.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017529 ;
chr4	lncipedia.org	exon	22999174	22999236	.	+	.	gene_id lnc-SOD3-6 ; transcript_id lnc-SOD3-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248837 ; gene_alias_2 RP11-412P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248837.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160256.1 ; transcript_alias_1 ENST00000511453 ; transcript_alias_2 ENST00000511453.1 ; transcript_alias_3 RP11-412P11.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000359921.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT095770 ;
chr4	lncipedia.org	exon	23001208	23001335	.	+	.	gene_id lnc-SOD3-6 ; transcript_id lnc-SOD3-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248837 ; gene_alias_2 RP11-412P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248837.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160256.1 ; transcript_alias_1 ENST00000511453 ; transcript_alias_2 ENST00000511453.1 ; transcript_alias_3 RP11-412P11.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000359921.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT095770 ;
chr4	lncipedia.org	exon	23004773	23004866	.	+	.	gene_id lnc-SOD3-6 ; transcript_id lnc-SOD3-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248837 ; gene_alias_2 RP11-412P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248837.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160256.1 ; transcript_alias_1 ENST00000511453 ; transcript_alias_2 ENST00000511453.1 ; transcript_alias_3 RP11-412P11.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000359921.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT095770 ;
chr4	lncipedia.org	exon	23057462	23058485	.	+	.	gene_id lnc-SOD3-6 ; transcript_id lnc-SOD3-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248837 ; gene_alias_2 RP11-412P11.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248837.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160256.1 ; transcript_alias_1 ENST00000511453 ; transcript_alias_2 ENST00000511453.1 ; transcript_alias_3 RP11-412P11.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000359921.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT095770 ;
chr6	lncipedia.org	exon	27661858	27662005	.	+	.	gene_id lnc-HIST1H2AI-3 ; transcript_id lnc-HIST1H2AI-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000246046 ; gene_alias_2 AL009179.1 ; transcript_alias_1 ENST00000446316 ;
chr6	lncipedia.org	exon	27670093	27670196	.	+	.	gene_id lnc-HIST1H2AI-3 ; transcript_id lnc-HIST1H2AI-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000246046 ; gene_alias_2 AL009179.1 ; transcript_alias_1 ENST00000446316 ;
chr6	lncipedia.org	exon	27674418	27676935	.	+	.	gene_id lnc-HIST1H2AI-3 ; transcript_id lnc-HIST1H2AI-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000246046 ; gene_alias_2 AL009179.1 ; transcript_alias_1 ENST00000446316 ;
chr1	lncipedia.org	exon	1363502	1364435	.	+	.	gene_id lnc-TMEM88B-1 ; transcript_id lnc-TMEM88B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000203586 ; gene_alias_2 AL391244.1 ; transcript_alias_1 ENST00000366395 ; transcript_alias_2 NONHSAT000322 ;
chr1	lncipedia.org	exon	1365360	1365634	.	+	.	gene_id lnc-TMEM88B-1 ; transcript_id lnc-TMEM88B-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000203586 ; gene_alias_2 AL391244.1 ; transcript_alias_1 ENST00000366395 ; transcript_alias_2 NONHSAT000322 ;
chr1	lncipedia.org	exon	24526730	24526881	.	+	.	gene_id lnc-GRHL3-1 ; transcript_id lnc-GRHL3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230023 ; gene_alias_2 XLOC_000098 ; gene_alias_3 linc-GRHL3-1 ; gene_alias_4 RP11-10N16.2 ; transcript_alias_1 ENST00000439059 ; transcript_alias_2 TCONS_00000167 ; transcript_alias_3 NONHSAT001587 ;
chr1	lncipedia.org	exon	24528953	24529089	.	+	.	gene_id lnc-GRHL3-1 ; transcript_id lnc-GRHL3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230023 ; gene_alias_2 XLOC_000098 ; gene_alias_3 linc-GRHL3-1 ; gene_alias_4 RP11-10N16.2 ; transcript_alias_1 ENST00000439059 ; transcript_alias_2 TCONS_00000167 ; transcript_alias_3 NONHSAT001587 ;
chr1	lncipedia.org	exon	24536623	24538183	.	+	.	gene_id lnc-GRHL3-1 ; transcript_id lnc-GRHL3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000230023 ; gene_alias_2 XLOC_000098 ; gene_alias_3 linc-GRHL3-1 ; gene_alias_4 RP11-10N16.2 ; transcript_alias_1 ENST00000439059 ; transcript_alias_2 TCONS_00000167 ; transcript_alias_3 NONHSAT001587 ;
chr22	lncipedia.org	exon	21055220	21055955	.	+	.	gene_id lnc-POM121L4P-1 ; transcript_id lnc-POM121L4P-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000226287 ; gene_alias_2 TMEM191A ; gene_alias_3 ENSG00000226287.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150164.2 ; transcript_alias_1 ENST00000359859 ; transcript_alias_2 ENST00000359859.2 ; transcript_alias_3 TMEM191A-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT083578 ;
chr1	lncipedia.org	exon	203267886	203269775	.	-	.	gene_id lnc-CHIT1-1 ; transcript_id lnc-CHIT1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233791 ; gene_alias_2 RP11-134P9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233791.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000035835.2 ; gene_alias_5 LINC01136 ; transcript_alias_1 ENST00000457348 ; transcript_alias_2 ENST00000457348.1 ; transcript_alias_3 RP11-134P9.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000087170.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	203270218	203270409	.	-	.	gene_id lnc-CHIT1-1 ; transcript_id lnc-CHIT1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233791 ; gene_alias_2 RP11-134P9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233791.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000035835.2 ; gene_alias_5 LINC01136 ; transcript_alias_1 ENST00000457348 ; transcript_alias_2 ENST00000457348.1 ; transcript_alias_3 RP11-134P9.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000087170.1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	203273981	203274437	.	-	.	gene_id lnc-CHIT1-1 ; transcript_id lnc-CHIT1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000233791 ; gene_alias_2 RP11-134P9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000233791.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000035835.2 ; gene_alias_5 LINC01136 ; transcript_alias_1 ENST00000457348 ; transcript_alias_2 ENST00000457348.1 ; transcript_alias_3 RP11-134P9.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000087170.1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	48864180	48864290	.	-	.	gene_id lnc-TMEM189-2 ; transcript_id lnc-TMEM189-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250931 ; transcript_alias_1 ENST00000513193 ;
chr20	lncipedia.org	exon	48864400	48864532	.	-	.	gene_id lnc-TMEM189-2 ; transcript_id lnc-TMEM189-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250931 ; transcript_alias_1 ENST00000513193 ;
chr20	lncipedia.org	exon	48869933	48870144	.	-	.	gene_id lnc-TMEM189-2 ; transcript_id lnc-TMEM189-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250931 ; transcript_alias_1 ENST00000513193 ;
chr20	lncipedia.org	exon	48874895	48875003	.	-	.	gene_id lnc-TMEM189-2 ; transcript_id lnc-TMEM189-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250931 ; transcript_alias_1 ENST00000513193 ;
chr20	lncipedia.org	exon	48880739	48880860	.	-	.	gene_id lnc-TMEM189-2 ; transcript_id lnc-TMEM189-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250931 ; transcript_alias_1 ENST00000513193 ;
chr20	lncipedia.org	exon	48881905	48883632	.	-	.	gene_id lnc-TMEM189-2 ; transcript_id lnc-TMEM189-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250931 ; transcript_alias_1 ENST00000513193 ;
chr5	lncipedia.org	exon	148786252	148786321	.	+	.	gene_id lnc-PCYOX1L-2 ; transcript_id lnc-PCYOX1L-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249669 ; gene_alias_2 XLOC_004598 ; gene_alias_3 linc-ARHGEF37-2 ; gene_alias_4 RP11-394O4.2 ; gene_alias_5 ENSG00000249669.2 ; gene_alias_6 MIR143HG ; gene_alias_7 OTTHUMG00000163464.3 ; gene_alias_8 ENSG00000249669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000512096 ; transcript_alias_2 TCONS_00009538 ; transcript_alias_3 ENST00000512096.1 ; transcript_alias_4 MIR143HG-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000373588.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT104491 ;
chr5	lncipedia.org	exon	148786586	148786641	.	+	.	gene_id lnc-PCYOX1L-2 ; transcript_id lnc-PCYOX1L-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249669 ; gene_alias_2 XLOC_004598 ; gene_alias_3 linc-ARHGEF37-2 ; gene_alias_4 RP11-394O4.2 ; gene_alias_5 ENSG00000249669.2 ; gene_alias_6 MIR143HG ; gene_alias_7 OTTHUMG00000163464.3 ; gene_alias_8 ENSG00000249669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000512096 ; transcript_alias_2 TCONS_00009538 ; transcript_alias_3 ENST00000512096.1 ; transcript_alias_4 MIR143HG-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000373588.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT104491 ;
chr5	lncipedia.org	exon	148801044	148801164	.	+	.	gene_id lnc-PCYOX1L-2 ; transcript_id lnc-PCYOX1L-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249669 ; gene_alias_2 XLOC_004598 ; gene_alias_3 linc-ARHGEF37-2 ; gene_alias_4 RP11-394O4.2 ; gene_alias_5 ENSG00000249669.2 ; gene_alias_6 MIR143HG ; gene_alias_7 OTTHUMG00000163464.3 ; gene_alias_8 ENSG00000249669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000512096 ; transcript_alias_2 TCONS_00009538 ; transcript_alias_3 ENST00000512096.1 ; transcript_alias_4 MIR143HG-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000373588.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT104491 ;
chr5	lncipedia.org	exon	148803653	148803960	.	+	.	gene_id lnc-PCYOX1L-2 ; transcript_id lnc-PCYOX1L-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249669 ; gene_alias_2 XLOC_004598 ; gene_alias_3 linc-ARHGEF37-2 ; gene_alias_4 RP11-394O4.2 ; gene_alias_5 ENSG00000249669.2 ; gene_alias_6 MIR143HG ; gene_alias_7 OTTHUMG00000163464.3 ; gene_alias_8 ENSG00000249669.3 ; transcript_alias_1 ENST00000512096 ; transcript_alias_2 TCONS_00009538 ; transcript_alias_3 ENST00000512096.1 ; transcript_alias_4 MIR143HG-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000373588.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT104491 ;
chr12	lncipedia.org	exon	70116102	70116351	.	-	.	gene_id lnc-BEST3-1 ; transcript_id lnc-BEST3-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000247131 ; gene_alias_2 RP11-588G21.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247131.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169398.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501300 ; transcript_alias_2 ENST00000501300.1 ; transcript_alias_3 RP11-588G21.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000403872.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	70119002	70119169	.	-	.	gene_id lnc-BEST3-1 ; transcript_id lnc-BEST3-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000247131 ; gene_alias_2 RP11-588G21.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247131.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169398.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501300 ; transcript_alias_2 ENST00000501300.1 ; transcript_alias_3 RP11-588G21.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000403872.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	70132058	70132342	.	-	.	gene_id lnc-BEST3-1 ; transcript_id lnc-BEST3-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000247131 ; gene_alias_2 RP11-588G21.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247131.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169398.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501300 ; transcript_alias_2 ENST00000501300.1 ; transcript_alias_3 RP11-588G21.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000403872.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	2414256	2414396	.	-	.	gene_id lnc-TIMM13-1 ; transcript_id lnc-TIMM13-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235230 ; transcript_alias_1 ENST00000424899 ;
chr19	lncipedia.org	exon	2610318	2611860	.	-	.	gene_id lnc-TIMM13-1 ; transcript_id lnc-TIMM13-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235230 ; transcript_alias_1 ENST00000424899 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27043188	27043304	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 MIAT ; gene_alias_5 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000450203 ; transcript_alias_2 TCONS_00029375 ; transcript_alias_3 ENST00000450203.1 ; transcript_alias_4 MIAT-008 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320803.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084509 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27059280	27059362	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 MIAT ; gene_alias_5 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000450203 ; transcript_alias_2 TCONS_00029375 ; transcript_alias_3 ENST00000450203.1 ; transcript_alias_4 MIAT-008 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320803.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084509 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27061495	27061873	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 MIAT ; gene_alias_5 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000450203 ; transcript_alias_2 TCONS_00029375 ; transcript_alias_3 ENST00000450203.1 ; transcript_alias_4 MIAT-008 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320803.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084509 ;
chr12	lncipedia.org	exon	111834639	111834677	.	+	.	gene_id lnc-SH2B3-1 ; transcript_id lnc-SH2B3-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000257595 ; gene_alias_2 RP3-473L9.4 ; gene_alias_3 ENSG00000257595.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169548.1 ; gene_alias_5 ENSG00000257595.2 ; transcript_alias_1 ENST00000548846 ; transcript_alias_2 ENST00000548846.1 ; transcript_alias_3 RP3-473L9.4-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404777.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030728 ;
chr12	lncipedia.org	exon	111840942	111841111	.	+	.	gene_id lnc-SH2B3-1 ; transcript_id lnc-SH2B3-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000257595 ; gene_alias_2 RP3-473L9.4 ; gene_alias_3 ENSG00000257595.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169548.1 ; gene_alias_5 ENSG00000257595.2 ; transcript_alias_1 ENST00000548846 ; transcript_alias_2 ENST00000548846.1 ; transcript_alias_3 RP3-473L9.4-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404777.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030728 ;
chr1	lncipedia.org	exon	33592954	33593583	.	+	.	gene_id lnc-ADC-2 ; transcript_id lnc-ADC-2:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT002260 ;
chr1	lncipedia.org	exon	36321683	36323276	.	+	.	gene_id lnc-EIF2C1-1 ; transcript_id lnc-EIF2C1-1:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT002382 ;
chr10	lncipedia.org	exon	65394077	65394587	.	-	.	gene_id lnc-JMJD1C-6 ; transcript_id lnc-JMJD1C-6:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT013608 ;
chr10	lncipedia.org	exon	66451201	66451267	.	+	.	gene_id lnc-REEP3-2 ; transcript_id lnc-REEP3-2:2 ; transcript_alias_1 NONHSAT013625 ;
chr10	lncipedia.org	exon	66452250	66452778	.	+	.	gene_id lnc-REEP3-2 ; transcript_id lnc-REEP3-2:2 ; transcript_alias_1 NONHSAT013625 ;
chr10	lncipedia.org	exon	66451213	66451267	.	+	.	gene_id lnc-REEP3-2 ; transcript_id lnc-REEP3-2:3 ; transcript_alias_1 NONHSAT013626 ; transcript_alias_2 FPKM1_group_3403_transcript_1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	66452249	66452732	.	+	.	gene_id lnc-REEP3-2 ; transcript_id lnc-REEP3-2:3 ; transcript_alias_1 NONHSAT013626 ; transcript_alias_2 FPKM1_group_3403_transcript_1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	66783731	66783814	.	+	.	gene_id lnc-REEP3-9 ; transcript_id lnc-REEP3-9:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT013630 ; transcript_alias_2 FPKM1_group_3404_transcript_1 ;
chr10	lncipedia.org	exon	66784153	66784424	.	+	.	gene_id lnc-REEP3-9 ; transcript_id lnc-REEP3-9:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT013630 ; transcript_alias_2 FPKM1_group_3404_transcript_1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	65189793	65190665	.	-	.	gene_id lnc-LTBP3-2 ; transcript_id lnc-LTBP3-2:5 ; transcript_alias_1 NONHSAT022110 ;
chr11	lncipedia.org	exon	65191486	65192178	.	-	.	gene_id lnc-LTBP3-2 ; transcript_id lnc-LTBP3-2:5 ; transcript_alias_1 NONHSAT022110 ;
chr11	lncipedia.org	exon	65193086	65204597	.	-	.	gene_id lnc-LTBP3-2 ; transcript_id lnc-LTBP3-2:5 ; transcript_alias_1 NONHSAT022110 ;
chr11	lncipedia.org	exon	65266598	65267460	.	-	.	gene_id lnc-LTBP3-2 ; transcript_id lnc-LTBP3-2:5 ; transcript_alias_1 NONHSAT022110 ;
chr11	lncipedia.org	exon	65268769	65268909	.	-	.	gene_id lnc-LTBP3-2 ; transcript_id lnc-LTBP3-2:5 ; transcript_alias_1 NONHSAT022110 ;
chr11	lncipedia.org	exon	65269039	65270107	.	-	.	gene_id lnc-LTBP3-2 ; transcript_id lnc-LTBP3-2:5 ; transcript_alias_1 NONHSAT022110 ;
chr11	lncipedia.org	exon	65270590	65271258	.	-	.	gene_id lnc-LTBP3-2 ; transcript_id lnc-LTBP3-2:5 ; transcript_alias_1 NONHSAT022110 ;
chr11	lncipedia.org	exon	66445277	66448988	.	+	.	gene_id lnc-RBM4-2 ; transcript_id lnc-RBM4-2:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT022342 ;
chr11	lncipedia.org	exon	66840753	66841223	.	+	.	gene_id lnc-RHOD-1 ; transcript_id lnc-RHOD-1:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT022373 ; transcript_alias_2 FPKM1_group_4803_transcript_1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	66841304	66842325	.	+	.	gene_id lnc-RHOD-1 ; transcript_id lnc-RHOD-1:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT022373 ; transcript_alias_2 FPKM1_group_4803_transcript_1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	68536475	68536592	.	+	.	gene_id lnc-GAL-3 ; transcript_id lnc-GAL-3:1 ; transcript_alias_1 ucscGeneNc_uc001ooq_2 ;
chr11	lncipedia.org	exon	68537835	68537948	.	+	.	gene_id lnc-GAL-3 ; transcript_id lnc-GAL-3:1 ; transcript_alias_1 ucscGeneNc_uc001ooq_2 ;
chr11	lncipedia.org	exon	68538175	68538360	.	+	.	gene_id lnc-GAL-3 ; transcript_id lnc-GAL-3:1 ; transcript_alias_1 ucscGeneNc_uc001ooq_2 ;
chr11	lncipedia.org	exon	68538485	68538635	.	+	.	gene_id lnc-GAL-3 ; transcript_id lnc-GAL-3:1 ; transcript_alias_1 ucscGeneNc_uc001ooq_2 ;
chr11	lncipedia.org	exon	68539655	68539763	.	+	.	gene_id lnc-GAL-3 ; transcript_id lnc-GAL-3:1 ; transcript_alias_1 ucscGeneNc_uc001ooq_2 ;
chr11	lncipedia.org	exon	68541680	68542489	.	+	.	gene_id lnc-GAL-3 ; transcript_id lnc-GAL-3:1 ; transcript_alias_1 ucscGeneNc_uc001ooq_2 ;
chr11	lncipedia.org	exon	68996233	68997071	.	-	.	gene_id lnc-MRGPRF-4 ; transcript_id lnc-MRGPRF-4:6 ; transcript_alias_1 NONHSAT022582 ;
chr11	lncipedia.org	exon	68998254	68998491	.	-	.	gene_id lnc-MRGPRF-4 ; transcript_id lnc-MRGPRF-4:6 ; transcript_alias_1 NONHSAT022582 ;
chr11	lncipedia.org	exon	68999083	68999183	.	-	.	gene_id lnc-MRGPRF-4 ; transcript_id lnc-MRGPRF-4:6 ; transcript_alias_1 NONHSAT022582 ;
chr11	lncipedia.org	exon	68999957	69000182	.	-	.	gene_id lnc-MRGPRF-4 ; transcript_id lnc-MRGPRF-4:6 ; transcript_alias_1 NONHSAT022582 ;
chr12	lncipedia.org	exon	7087683	7089103	.	+	.	gene_id lnc-C1S-1 ; transcript_id lnc-C1S-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000272201.1 ; gene_alias_2 U47924.30 ; transcript_alias_1 ENST00000606112.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	19101702	19101958	.	-	.	gene_id lnc-HOMER3-3 ; transcript_id lnc-HOMER3-3:3 ; transcript_alias_1 NONHSAT063011 ;
chr19	lncipedia.org	exon	19102149	19102427	.	-	.	gene_id lnc-HOMER3-3 ; transcript_id lnc-HOMER3-3:3 ; transcript_alias_1 NONHSAT063011 ;
chr19	lncipedia.org	exon	19101702	19101958	.	-	.	gene_id lnc-HOMER3-3 ; transcript_id lnc-HOMER3-3:2 ; transcript_alias_1 NONHSAT063013 ;
chr19	lncipedia.org	exon	19104086	19104251	.	-	.	gene_id lnc-HOMER3-3 ; transcript_id lnc-HOMER3-3:2 ; transcript_alias_1 NONHSAT063013 ;
chr19	lncipedia.org	exon	19728917	19730355	.	-	.	gene_id lnc-PBX4-1 ; transcript_id lnc-PBX4-1:1 ; transcript_alias_1 ucscGeneNc_uc010ech_1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	19734347	19734455	.	-	.	gene_id lnc-PBX4-1 ; transcript_id lnc-PBX4-1:1 ; transcript_alias_1 ucscGeneNc_uc010ech_1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	19748136	19748202	.	-	.	gene_id lnc-PBX4-1 ; transcript_id lnc-PBX4-1:1 ; transcript_alias_1 ucscGeneNc_uc010ech_1 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37275834	37276875	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1755-9 ; transcript_id lnc-KIAA1755-9:2 ; transcript_alias_1 NONHSAT079697 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37277604	37277719	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1755-9 ; transcript_id lnc-KIAA1755-9:2 ; transcript_alias_1 NONHSAT079697 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37278004	37278169	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1755-9 ; transcript_id lnc-KIAA1755-9:2 ; transcript_alias_1 NONHSAT079697 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37286612	37286805	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1755-9 ; transcript_id lnc-KIAA1755-9:2 ; transcript_alias_1 NONHSAT079697 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37275838	37276875	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1755-9 ; transcript_id lnc-KIAA1755-9:1 ; transcript_alias_1 l_2110_NR_027124 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37277604	37277719	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1755-9 ; transcript_id lnc-KIAA1755-9:1 ; transcript_alias_1 l_2110_NR_027124 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37278004	37278169	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1755-9 ; transcript_id lnc-KIAA1755-9:1 ; transcript_alias_1 l_2110_NR_027124 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37286612	37286805	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1755-9 ; transcript_id lnc-KIAA1755-9:1 ; transcript_alias_1 l_2110_NR_027124 ;
chr3	lncipedia.org	exon	13691765	13692333	.	+	.	gene_id lnc-FBLN2-1 ; transcript_id lnc-FBLN2-1:5 ; transcript_alias_1 NONHSAT088308 ;
chr3	lncipedia.org	exon	13693344	13693490	.	+	.	gene_id lnc-FBLN2-1 ; transcript_id lnc-FBLN2-1:5 ; transcript_alias_1 NONHSAT088308 ;
chr3	lncipedia.org	exon	13695676	13695787	.	+	.	gene_id lnc-FBLN2-1 ; transcript_id lnc-FBLN2-1:5 ; transcript_alias_1 NONHSAT088308 ;
chr3	lncipedia.org	exon	13711574	13712283	.	+	.	gene_id lnc-FBLN2-1 ; transcript_id lnc-FBLN2-1:5 ; transcript_alias_1 NONHSAT088308 ;
chr3	lncipedia.org	exon	17685533	17685612	.	-	.	gene_id lnc-SATB1-8 ; transcript_id lnc-SATB1-8:2 ; transcript_alias_1 NONHSAT088556 ;
chr3	lncipedia.org	exon	17688453	17688548	.	-	.	gene_id lnc-SATB1-8 ; transcript_id lnc-SATB1-8:2 ; transcript_alias_1 NONHSAT088556 ;
chr3	lncipedia.org	exon	17783973	17784231	.	-	.	gene_id lnc-SATB1-8 ; transcript_id lnc-SATB1-8:2 ; transcript_alias_1 NONHSAT088556 ;
chr3	lncipedia.org	exon	44157312	44158979	.	-	.	gene_id lnc-ZNF445-6 ; transcript_id lnc-ZNF445-6:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT089304 ;
chr5	lncipedia.org	exon	65264659	65268220	.	+	.	gene_id lnc-NLN-2 ; transcript_id lnc-NLN-2:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT101771 ;
chr9	lncipedia.org	exon	2840592	2841471	.	+	.	gene_id lnc-KCNV2-1 ; transcript_id lnc-KCNV2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234656 ; gene_alias_2 AL589675.1 ; transcript_alias_1 ENST00000421272 ; transcript_alias_2 NONHSAT130012 ;
chr9	lncipedia.org	exon	2844019	2844073	.	+	.	gene_id lnc-KCNV2-1 ; transcript_id lnc-KCNV2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234656 ; gene_alias_2 AL589675.1 ; transcript_alias_1 ENST00000421272 ; transcript_alias_2 NONHSAT130012 ;
chr2	lncipedia.org	exon	11805495	11806095	.	-	.	gene_id lnc-E2F6-3 ; transcript_id lnc-E2F6-3:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT069184 ;
chr19	lncipedia.org	exon	57021466	57021682	.	+	.	gene_id lnc-ZFP28-2 ; transcript_id lnc-ZFP28-2:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT068165 ;
chr19	lncipedia.org	exon	57037069	57037390	.	+	.	gene_id lnc-ZFP28-2 ; transcript_id lnc-ZFP28-2:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT068165 ;
chr2	lncipedia.org	exon	171785763	171785913	.	+	.	gene_id lnc-GAD1-1 ; transcript_id lnc-GAD1-1:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT075437 ;
chr2	lncipedia.org	exon	171804860	171805271	.	+	.	gene_id lnc-GAD1-1 ; transcript_id lnc-GAD1-1:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT075437 ;
chr9	lncipedia.org	exon	42853720	42853828	.	-	.	gene_id lnc-ANKRD20A3-12 ; transcript_id lnc-ANKRD20A3-12:3 ; transcript_alias_1 NONHSAT131332 ;
chr9	lncipedia.org	exon	42856170	42856277	.	-	.	gene_id lnc-ANKRD20A3-12 ; transcript_id lnc-ANKRD20A3-12:3 ; transcript_alias_1 NONHSAT131332 ;
chr9	lncipedia.org	exon	42857152	42857254	.	-	.	gene_id lnc-ANKRD20A3-12 ; transcript_id lnc-ANKRD20A3-12:3 ; transcript_alias_1 NONHSAT131332 ;
chr9	lncipedia.org	exon	42857697	42857852	.	-	.	gene_id lnc-ANKRD20A3-12 ; transcript_id lnc-ANKRD20A3-12:3 ; transcript_alias_1 NONHSAT131332 ;
chr1	lncipedia.org	exon	204144294	204144640	.	+	.	gene_id lnc-SOX13-4 ; transcript_id lnc-SOX13-4:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT008929 ; transcript_alias_2 FPKM1_group_2128_transcript_1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	204144927	204145041	.	+	.	gene_id lnc-SOX13-4 ; transcript_id lnc-SOX13-4:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT008929 ; transcript_alias_2 FPKM1_group_2128_transcript_1 ;
chr8	lncipedia.org	exon	1703947	1704248	.	+	.	gene_id lnc-CLN8-2 ; transcript_id lnc-CLN8-2:2 ; transcript_alias_1 NONHSAT124676 ;
chr8	lncipedia.org	exon	1707463	1707667	.	+	.	gene_id lnc-CLN8-2 ; transcript_id lnc-CLN8-2:2 ; transcript_alias_1 NONHSAT124676 ;
chr7	lncipedia.org	exon	38570642	38570939	.	-	.	gene_id lnc-FAM183B-5 ; transcript_id lnc-FAM183B-5:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT120188 ;
chr8	lncipedia.org	exon	8247672	8248105	.	-	.	gene_id lnc-PRAGMIN.1-5 ; transcript_id lnc-PRAGMIN.1-5:2 ; transcript_alias_1 FPKM1_group_30826_transcript_2 ;
chr8	lncipedia.org	exon	8248563	8248678	.	-	.	gene_id lnc-PRAGMIN.1-5 ; transcript_id lnc-PRAGMIN.1-5:2 ; transcript_alias_1 FPKM1_group_30826_transcript_2 ;
chr6	lncipedia.org	exon	89789883	89790386	.	-	.	gene_id lnc-SRSF12-1 ; transcript_id lnc-SRSF12-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000271931.1 ; gene_alias_2 RP11-63L7.5 ; transcript_alias_1 ENST00000606729.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	220034077	220034400	.	-	.	gene_id lnc-CNPPD1-1 ; transcript_id lnc-CNPPD1-1:3 ; transcript_alias_1 NONHSAT076982 ;
chr2	lncipedia.org	exon	220034545	220034751	.	-	.	gene_id lnc-CNPPD1-1 ; transcript_id lnc-CNPPD1-1:3 ; transcript_alias_1 NONHSAT076982 ;
chr16	lncipedia.org	exon	87419617	87419812	.	-	.	gene_id lnc-ZCCHC14-1 ; transcript_id lnc-ZCCHC14-1:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT144290 ;
chr16	lncipedia.org	exon	87422295	87422364	.	-	.	gene_id lnc-ZCCHC14-1 ; transcript_id lnc-ZCCHC14-1:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT144290 ;
chr16	lncipedia.org	exon	87423343	87423454	.	-	.	gene_id lnc-ZCCHC14-1 ; transcript_id lnc-ZCCHC14-1:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT144290 ;
chr16	lncipedia.org	exon	87425689	87425748	.	-	.	gene_id lnc-ZCCHC14-1 ; transcript_id lnc-ZCCHC14-1:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT144290 ;
chr12	lncipedia.org	exon	125079630	125079985	.	-	.	gene_id lnc-NCOR2-6 ; transcript_id lnc-NCOR2-6:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT031673 ; transcript_alias_2 FPKM1_group_7309_transcript_1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	125083084	125083209	.	-	.	gene_id lnc-NCOR2-6 ; transcript_id lnc-NCOR2-6:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT031673 ; transcript_alias_2 FPKM1_group_7309_transcript_1 ;
chrY	lncipedia.org	exon	19687042	19687247	.	-	.	gene_id lnc-CDY2B-1 ; transcript_id lnc-CDY2B-1:3 ; transcript_alias_1 NONHSAT139540 ;
chrY	lncipedia.org	exon	19688583	19688700	.	-	.	gene_id lnc-CDY2B-1 ; transcript_id lnc-CDY2B-1:3 ; transcript_alias_1 NONHSAT139540 ;
chrY	lncipedia.org	exon	19691196	19691353	.	-	.	gene_id lnc-CDY2B-1 ; transcript_id lnc-CDY2B-1:3 ; transcript_alias_1 NONHSAT139540 ;
chr9	lncipedia.org	exon	118954208	118954799	.	+	.	gene_id lnc-TRIM32-9 ; transcript_id lnc-TRIM32-9:1 ; transcript_alias_1 NONHSAT134432 ;
chr22	lncipedia.org	exon	26847446	26847787	.	-	.	gene_id lnc-TFIP11-1 ; transcript_id lnc-TFIP11-1:8 ; transcript_alias_1 NONHSAT084483 ;
chr22	lncipedia.org	exon	26848715	26848858	.	-	.	gene_id lnc-TFIP11-1 ; transcript_id lnc-TFIP11-1:8 ; transcript_alias_1 NONHSAT084483 ;
chr4	lncipedia.org	exon	23882711	23882932	.	-	.	gene_id lnc-DHX15-4 ; transcript_id lnc-DHX15-4:7 ; transcript_alias_1 NONHSAT095792 ;
chr4	lncipedia.org	exon	23883401	23883726	.	-	.	gene_id lnc-DHX15-4 ; transcript_id lnc-DHX15-4:7 ; transcript_alias_1 NONHSAT095792 ;
chr1	lncipedia.org	exon	47694019	47694194	.	-	.	gene_id lnc-TAL1-1 ; transcript_id lnc-TAL1-1:3 ; transcript_alias_1 NONHSAT003067 ;
chr1	lncipedia.org	exon	47694868	47695023	.	-	.	gene_id lnc-TAL1-1 ; transcript_id lnc-TAL1-1:3 ; transcript_alias_1 NONHSAT003067 ;
chr1	lncipedia.org	exon	47696719	47696890	.	-	.	gene_id lnc-TAL1-1 ; transcript_id lnc-TAL1-1:3 ; transcript_alias_1 NONHSAT003067 ;
chr2	lncipedia.org	exon	200181061	200181095	.	+	.	gene_id lnc-C2orf69-14 ; transcript_id lnc-C2orf69-14:1 ; transcript_alias_1 l_2013_chr2:200181060-200203316_brain ;
chr2	lncipedia.org	exon	200202032	200202114	.	+	.	gene_id lnc-C2orf69-14 ; transcript_id lnc-C2orf69-14:1 ; transcript_alias_1 l_2013_chr2:200181060-200203316_brain ;
chr2	lncipedia.org	exon	200202893	200203067	.	+	.	gene_id lnc-C2orf69-14 ; transcript_id lnc-C2orf69-14:1 ; transcript_alias_1 l_2013_chr2:200181060-200203316_brain ;
chr2	lncipedia.org	exon	200203214	200203316	.	+	.	gene_id lnc-C2orf69-14 ; transcript_id lnc-C2orf69-14:1 ; transcript_alias_1 l_2013_chr2:200181060-200203316_brain ;
chr1	lncipedia.org	exon	145110974	145111762	.	+	.	gene_id lnc-NOTCH2NL-3 ; transcript_id lnc-NOTCH2NL-3:1 ; transcript_alias_1 ucscGeneNc_uc001epf_1 ;
chr1	lncipedia.org	exon	145112627	145113408	.	+	.	gene_id lnc-NOTCH2NL-3 ; transcript_id lnc-NOTCH2NL-3:1 ; transcript_alias_1 ucscGeneNc_uc001epf_1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26103355	26103430	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:23 ; transcript_alias_1 NONHSAT027370 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26108071	26108174	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:23 ; transcript_alias_1 NONHSAT027370 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26109160	26109280	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:23 ; transcript_alias_1 NONHSAT027370 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26109572	26109694	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:23 ; transcript_alias_1 NONHSAT027370 ;
chr12	lncipedia.org	exon	26110386	26110433	.	-	.	gene_id lnc-BHLHE41-2 ; transcript_id lnc-BHLHE41-2:23 ; transcript_alias_1 NONHSAT027370 ;
chr6	lncipedia.org	exon	5047437	5047764	.	-	.	gene_id lnc-RPP40-1 ; transcript_id lnc-RPP40-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_005592 ; gene_alias_2 linc-RPP40 ; transcript_alias_1 TCONS_00012063 ; transcript_alias_2 NONHSAT107510 ;
chr6	lncipedia.org	exon	5054312	5054329	.	-	.	gene_id lnc-RPP40-1 ; transcript_id lnc-RPP40-1:3 ; gene_alias_1 XLOC_005592 ; gene_alias_2 linc-RPP40 ; transcript_alias_1 TCONS_00012063 ; transcript_alias_2 NONHSAT107510 ;
chr11	lncipedia.org	exon	27686807	27686939	.	+	.	gene_id lnc-METTL15-4 ; transcript_id lnc-METTL15-4:10 ; gene_alias_1 ENSG00000245573 ; gene_alias_2 AC104563.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245573.3 ; gene_alias_4 BDNF-AS ; gene_alias_5 OTTHUMG00000166125.5 ; transcript_alias_1 ENST00000501663 ; transcript_alias_2 ENST00000501663.2 ; transcript_alias_3 BDNF-AS-011 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000388073.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT018526 ;
chr11	lncipedia.org	exon	27698529	27699354	.	+	.	gene_id lnc-METTL15-4 ; transcript_id lnc-METTL15-4:10 ; gene_alias_1 ENSG00000245573 ; gene_alias_2 AC104563.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245573.3 ; gene_alias_4 BDNF-AS ; gene_alias_5 OTTHUMG00000166125.5 ; transcript_alias_1 ENST00000501663 ; transcript_alias_2 ENST00000501663.2 ; transcript_alias_3 BDNF-AS-011 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000388073.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT018526 ;
chr15	lncipedia.org	exon	74595346	74595435	.	+	.	gene_id lnc-ISLR-1 ; transcript_id lnc-ISLR-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000261384.1 ; gene_alias_2 RP11-60L3.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172634.1 ; transcript_alias_1 ENST00000562561.1 ; transcript_alias_2 RP11-60L3.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000419598.1 ;
chr15	lncipedia.org	exon	74596393	74596684	.	+	.	gene_id lnc-ISLR-1 ; transcript_id lnc-ISLR-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000261384.1 ; gene_alias_2 RP11-60L3.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000172634.1 ; transcript_alias_1 ENST00000562561.1 ; transcript_alias_2 RP11-60L3.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000419598.1 ;
chr3	lncipedia.org	exon	140179842	140180219	.	-	.	gene_id lnc-NMNAT3-4 ; transcript_id lnc-NMNAT3-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251058.1 ; gene_alias_2 RP11-68L1.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000160141.1 ; transcript_alias_1 ENST00000483759.2 ; transcript_alias_2 RP11-68L1.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000359395.1 ; transcript_alias_4 NONHSAT092399 ;
chr3	lncipedia.org	exon	140181564	140181667	.	-	.	gene_id lnc-NMNAT3-4 ; transcript_id lnc-NMNAT3-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251058.1 ; gene_alias_2 RP11-68L1.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000160141.1 ; transcript_alias_1 ENST00000483759.2 ; transcript_alias_2 RP11-68L1.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000359395.1 ; transcript_alias_4 NONHSAT092399 ;
chr3	lncipedia.org	exon	9433031	9433510	.	-	.	gene_id lnc-SRGAP3-1 ; transcript_id lnc-SRGAP3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000206573.4 ; gene_alias_2 RP11-58B17.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000164357.4 ; gene_alias_4 SETD5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000521708.1 ; transcript_alias_2 RP11-58B17.1-016 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000378520.1 ; transcript_alias_4 NONHSAT087786 ;
chr3	lncipedia.org	exon	9439983	9440051	.	-	.	gene_id lnc-SRGAP3-1 ; transcript_id lnc-SRGAP3-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000206573.4 ; gene_alias_2 RP11-58B17.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000164357.4 ; gene_alias_4 SETD5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000521708.1 ; transcript_alias_2 RP11-58B17.1-016 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000378520.1 ; transcript_alias_4 NONHSAT087786 ;
chr9	lncipedia.org	exon	72786915	72787045	.	-	.	gene_id lnc-KLF9-1 ; transcript_id lnc-KLF9-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000204706.6 ; gene_alias_2 RP11-195E11.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000019987.2 ; gene_alias_4 ENSG00000204706.10 ; gene_alias_5 MAMDC2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000420573.1 ; transcript_alias_2 RP11-195E11.3-004 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000368128.1 ; transcript_alias_4 NONHSAT131804 ;
chr9	lncipedia.org	exon	72787476	72787683	.	-	.	gene_id lnc-KLF9-1 ; transcript_id lnc-KLF9-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000204706.6 ; gene_alias_2 RP11-195E11.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000019987.2 ; gene_alias_4 ENSG00000204706.10 ; gene_alias_5 MAMDC2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000420573.1 ; transcript_alias_2 RP11-195E11.3-004 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000368128.1 ; transcript_alias_4 NONHSAT131804 ;
chr17	lncipedia.org	exon	45759783	45760049	.	-	.	gene_id lnc-OSBPL7-1 ; transcript_id lnc-OSBPL7-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000264558.1 ; gene_alias_2 RP11-138C9.1 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000178285.1 ; transcript_alias_1 ENST00000578482.1 ; transcript_alias_2 RP11-138C9.1-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000441360.1 ; transcript_alias_4 NONHSAT054325 ;
chr7	lncipedia.org	exon	50934444	50934467	.	+	.	gene_id lnc-IKZF1-2 ; transcript_id lnc-IKZF1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228204.2 ; gene_alias_2 RP4-724E13.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000155997.3 ; transcript_alias_1 ENST00000420449.1 ; transcript_alias_2 RP4-724E13.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000342680.2 ; transcript_alias_4 NONHSAT120580 ;
chr7	lncipedia.org	exon	51085090	51085214	.	+	.	gene_id lnc-IKZF1-2 ; transcript_id lnc-IKZF1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228204.2 ; gene_alias_2 RP4-724E13.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000155997.3 ; transcript_alias_1 ENST00000420449.1 ; transcript_alias_2 RP4-724E13.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000342680.2 ; transcript_alias_4 NONHSAT120580 ;
chr7	lncipedia.org	exon	51086054	51086108	.	+	.	gene_id lnc-IKZF1-2 ; transcript_id lnc-IKZF1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228204.2 ; gene_alias_2 RP4-724E13.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000155997.3 ; transcript_alias_1 ENST00000420449.1 ; transcript_alias_2 RP4-724E13.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000342680.2 ; transcript_alias_4 NONHSAT120580 ;
chr7	lncipedia.org	exon	51088669	51088749	.	+	.	gene_id lnc-IKZF1-2 ; transcript_id lnc-IKZF1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228204.2 ; gene_alias_2 RP4-724E13.2 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000155997.3 ; transcript_alias_1 ENST00000420449.1 ; transcript_alias_2 RP4-724E13.2-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000342680.2 ; transcript_alias_4 NONHSAT120580 ;
chr12	lncipedia.org	exon	7273154	7273221	.	+	.	gene_id lnc-CLSTN3-1 ; transcript_id lnc-CLSTN3-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000205885.3 ; gene_alias_2 ABC12-49244600F4.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000168164.1 ; gene_alias_4 C1RL-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000535078.1 ; transcript_alias_2 ABC12-49244600F4.3-005 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000398552.1 ; transcript_alias_4 NONHSAT026236 ;
chr12	lncipedia.org	exon	7274841	7275097	.	+	.	gene_id lnc-CLSTN3-1 ; transcript_id lnc-CLSTN3-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000205885.3 ; gene_alias_2 ABC12-49244600F4.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000168164.1 ; gene_alias_4 C1RL-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000535078.1 ; transcript_alias_2 ABC12-49244600F4.3-005 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000398552.1 ; transcript_alias_4 NONHSAT026236 ;
chr9	lncipedia.org	exon	72768050	72768243	.	-	.	gene_id lnc-KLF9-1 ; transcript_id lnc-KLF9-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000204706.6 ; gene_alias_2 RP11-195E11.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000019987.2 ; gene_alias_4 ENSG00000204706.10 ; gene_alias_5 MAMDC2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000451488.1 ; transcript_alias_2 RP11-195E11.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000052596.1 ; transcript_alias_4 NONHSAT131799 ;
chr9	lncipedia.org	exon	72769064	72769157	.	-	.	gene_id lnc-KLF9-1 ; transcript_id lnc-KLF9-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000204706.6 ; gene_alias_2 RP11-195E11.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000019987.2 ; gene_alias_4 ENSG00000204706.10 ; gene_alias_5 MAMDC2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000451488.1 ; transcript_alias_2 RP11-195E11.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000052596.1 ; transcript_alias_4 NONHSAT131799 ;
chr9	lncipedia.org	exon	72772428	72772456	.	-	.	gene_id lnc-KLF9-1 ; transcript_id lnc-KLF9-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000204706.6 ; gene_alias_2 RP11-195E11.3 ; gene_alias_3 OTTHUMG00000019987.2 ; gene_alias_4 ENSG00000204706.10 ; gene_alias_5 MAMDC2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000451488.1 ; transcript_alias_2 RP11-195E11.3-001 ; transcript_alias_3 OTTHUMT00000052596.1 ; transcript_alias_4 NONHSAT131799 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127354647	127355108	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-11 ; transcript_id lnc-DHX37-11:5 ; gene_alias_1 ENSG00000249873 ; gene_alias_2 RP11-983C2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000249873.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168453.1 ; transcript_alias_1 ENST00000541348 ; transcript_alias_2 ENST00000541348.1 ; transcript_alias_3 RP11-983C2.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399784.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031833 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127357880	127358050	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-11 ; transcript_id lnc-DHX37-11:5 ; gene_alias_1 ENSG00000249873 ; gene_alias_2 RP11-983C2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000249873.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168453.1 ; transcript_alias_1 ENST00000541348 ; transcript_alias_2 ENST00000541348.1 ; transcript_alias_3 RP11-983C2.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399784.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031833 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127359003	127359196	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-11 ; transcript_id lnc-DHX37-11:5 ; gene_alias_1 ENSG00000249873 ; gene_alias_2 RP11-983C2.2 ; gene_alias_3 ENSG00000249873.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168453.1 ; transcript_alias_1 ENST00000541348 ; transcript_alias_2 ENST00000541348.1 ; transcript_alias_3 RP11-983C2.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399784.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031833 ;
chr13	lncipedia.org	exon	53263722	53263958	.	-	.	gene_id lnc-LECT1-1 ; transcript_id lnc-LECT1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248190 ; gene_alias_2 XLOC_010622 ; gene_alias_3 linc-VPS36-1 ; transcript_alias_1 ENST00000509401 ; transcript_alias_2 TCONS_00021656 ; transcript_alias_3 NONHSAT034000 ;
chr13	lncipedia.org	exon	53268955	53274883	.	-	.	gene_id lnc-LECT1-1 ; transcript_id lnc-LECT1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248190 ; gene_alias_2 XLOC_010622 ; gene_alias_3 linc-VPS36-1 ; transcript_alias_1 ENST00000509401 ; transcript_alias_2 TCONS_00021656 ; transcript_alias_3 NONHSAT034000 ;
chr10	lncipedia.org	exon	86039736	86039821	.	+	.	gene_id lnc-RGR-1 ; transcript_id lnc-RGR-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229404 ; gene_alias_2 XLOC_008537 ; gene_alias_3 linc-FAM190B ; gene_alias_4 RP11-124L5.7 ; gene_alias_5 ENSG00000229404.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000018638.1 ; gene_alias_7 LINC00858 ; transcript_alias_1 ENST00000415469 ; transcript_alias_2 TCONS_00017711 ; transcript_alias_3 ENST00000415469.1 ; transcript_alias_4 RP11-124L5.7-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000049127.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT015325 ; transcript_alias_7 NR_038220 ;
chr10	lncipedia.org	exon	86047980	86048176	.	+	.	gene_id lnc-RGR-1 ; transcript_id lnc-RGR-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229404 ; gene_alias_2 XLOC_008537 ; gene_alias_3 linc-FAM190B ; gene_alias_4 RP11-124L5.7 ; gene_alias_5 ENSG00000229404.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000018638.1 ; gene_alias_7 LINC00858 ; transcript_alias_1 ENST00000415469 ; transcript_alias_2 TCONS_00017711 ; transcript_alias_3 ENST00000415469.1 ; transcript_alias_4 RP11-124L5.7-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000049127.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT015325 ; transcript_alias_7 NR_038220 ;
chr10	lncipedia.org	exon	86048350	86048536	.	+	.	gene_id lnc-RGR-1 ; transcript_id lnc-RGR-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229404 ; gene_alias_2 XLOC_008537 ; gene_alias_3 linc-FAM190B ; gene_alias_4 RP11-124L5.7 ; gene_alias_5 ENSG00000229404.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000018638.1 ; gene_alias_7 LINC00858 ; transcript_alias_1 ENST00000415469 ; transcript_alias_2 TCONS_00017711 ; transcript_alias_3 ENST00000415469.1 ; transcript_alias_4 RP11-124L5.7-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000049127.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT015325 ; transcript_alias_7 NR_038220 ;
chr10	lncipedia.org	exon	86048731	86048800	.	+	.	gene_id lnc-RGR-1 ; transcript_id lnc-RGR-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229404 ; gene_alias_2 XLOC_008537 ; gene_alias_3 linc-FAM190B ; gene_alias_4 RP11-124L5.7 ; gene_alias_5 ENSG00000229404.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000018638.1 ; gene_alias_7 LINC00858 ; transcript_alias_1 ENST00000415469 ; transcript_alias_2 TCONS_00017711 ; transcript_alias_3 ENST00000415469.1 ; transcript_alias_4 RP11-124L5.7-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000049127.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT015325 ; transcript_alias_7 NR_038220 ;
chr10	lncipedia.org	exon	86051163	86051893	.	+	.	gene_id lnc-RGR-1 ; transcript_id lnc-RGR-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229404 ; gene_alias_2 XLOC_008537 ; gene_alias_3 linc-FAM190B ; gene_alias_4 RP11-124L5.7 ; gene_alias_5 ENSG00000229404.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000018638.1 ; gene_alias_7 LINC00858 ; transcript_alias_1 ENST00000415469 ; transcript_alias_2 TCONS_00017711 ; transcript_alias_3 ENST00000415469.1 ; transcript_alias_4 RP11-124L5.7-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000049127.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT015325 ; transcript_alias_7 NR_038220 ;
chr10	lncipedia.org	exon	86053002	86054415	.	+	.	gene_id lnc-RGR-1 ; transcript_id lnc-RGR-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229404 ; gene_alias_2 XLOC_008537 ; gene_alias_3 linc-FAM190B ; gene_alias_4 RP11-124L5.7 ; gene_alias_5 ENSG00000229404.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000018638.1 ; gene_alias_7 LINC00858 ; transcript_alias_1 ENST00000415469 ; transcript_alias_2 TCONS_00017711 ; transcript_alias_3 ENST00000415469.1 ; transcript_alias_4 RP11-124L5.7-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000049127.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT015325 ; transcript_alias_7 NR_038220 ;
chr12	lncipedia.org	exon	68383225	68383359	.	+	.	gene_id lnc-DYRK2-4 ; transcript_id lnc-DYRK2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255733 ; gene_alias_2 GS1-410F4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000255733.1 ; gene_alias_4 IFNG-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000169108.1 ; transcript_alias_1 ENST00000538665 ; transcript_alias_2 ENST00000538665.1 ; transcript_alias_3 IFNG-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402294.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029277 ; transcript_alias_6 NR_104125 ;
chr12	lncipedia.org	exon	68389721	68389853	.	+	.	gene_id lnc-DYRK2-4 ; transcript_id lnc-DYRK2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255733 ; gene_alias_2 GS1-410F4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000255733.1 ; gene_alias_4 IFNG-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000169108.1 ; transcript_alias_1 ENST00000538665 ; transcript_alias_2 ENST00000538665.1 ; transcript_alias_3 IFNG-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402294.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029277 ; transcript_alias_6 NR_104125 ;
chr12	lncipedia.org	exon	68399870	68399926	.	+	.	gene_id lnc-DYRK2-4 ; transcript_id lnc-DYRK2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255733 ; gene_alias_2 GS1-410F4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000255733.1 ; gene_alias_4 IFNG-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000169108.1 ; transcript_alias_1 ENST00000538665 ; transcript_alias_2 ENST00000538665.1 ; transcript_alias_3 IFNG-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402294.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029277 ; transcript_alias_6 NR_104125 ;
chr12	lncipedia.org	exon	68413642	68415107	.	+	.	gene_id lnc-DYRK2-4 ; transcript_id lnc-DYRK2-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255733 ; gene_alias_2 GS1-410F4.2 ; gene_alias_3 ENSG00000255733.1 ; gene_alias_4 IFNG-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000169108.1 ; transcript_alias_1 ENST00000538665 ; transcript_alias_2 ENST00000538665.1 ; transcript_alias_3 IFNG-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402294.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029277 ; transcript_alias_6 NR_104125 ;
chr7	lncipedia.org	exon	4807257	4807749	.	-	.	gene_id lnc-RADIL-1 ; transcript_id lnc-RADIL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251104 ; transcript_alias_1 ENST00000515163 ;
chr7	lncipedia.org	exon	4808070	4809064	.	-	.	gene_id lnc-RADIL-1 ; transcript_id lnc-RADIL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251104 ; transcript_alias_1 ENST00000515163 ;
chr7	lncipedia.org	exon	4810155	4811074	.	-	.	gene_id lnc-RADIL-1 ; transcript_id lnc-RADIL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251104 ; transcript_alias_1 ENST00000515163 ;
chr20	lncipedia.org	exon	25124001	25124149	.	-	.	gene_id lnc-VSX1-1 ; transcript_id lnc-VSX1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000230725 ; gene_alias_2 XLOC_013704 ; gene_alias_3 linc-VSX1-2 ; gene_alias_4 RP4-738P15.1 ; gene_alias_5 ENSG00000230725.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000032113.1 ; transcript_alias_1 ENST00000440357 ; transcript_alias_2 TCONS_00028031 ; transcript_alias_3 ENST00000440357.1 ; transcript_alias_4 RP4-738P15.1-004 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000078392.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT079135 ;
chr20	lncipedia.org	exon	25124915	25125059	.	-	.	gene_id lnc-VSX1-1 ; transcript_id lnc-VSX1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000230725 ; gene_alias_2 XLOC_013704 ; gene_alias_3 linc-VSX1-2 ; gene_alias_4 RP4-738P15.1 ; gene_alias_5 ENSG00000230725.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000032113.1 ; transcript_alias_1 ENST00000440357 ; transcript_alias_2 TCONS_00028031 ; transcript_alias_3 ENST00000440357.1 ; transcript_alias_4 RP4-738P15.1-004 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000078392.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT079135 ;
chr20	lncipedia.org	exon	25129828	25129876	.	-	.	gene_id lnc-VSX1-1 ; transcript_id lnc-VSX1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000230725 ; gene_alias_2 XLOC_013704 ; gene_alias_3 linc-VSX1-2 ; gene_alias_4 RP4-738P15.1 ; gene_alias_5 ENSG00000230725.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000032113.1 ; transcript_alias_1 ENST00000440357 ; transcript_alias_2 TCONS_00028031 ; transcript_alias_3 ENST00000440357.1 ; transcript_alias_4 RP4-738P15.1-004 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000078392.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT079135 ;
chr3	lncipedia.org	exon	6549468	6549639	.	+	.	gene_id lnc-GRM7-2 ; transcript_id lnc-GRM7-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000189229 ; gene_alias_2 AC069277.2 ; gene_alias_3 ENSG00000189229.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154923.2 ; transcript_alias_1 ENST00000342990 ; transcript_alias_2 ENST00000342990.3 ; transcript_alias_3 AC069277.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000337643.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT087676 ;
chr3	lncipedia.org	exon	6736412	6736485	.	+	.	gene_id lnc-GRM7-2 ; transcript_id lnc-GRM7-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000189229 ; gene_alias_2 AC069277.2 ; gene_alias_3 ENSG00000189229.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000154923.2 ; transcript_alias_1 ENST00000342990 ; transcript_alias_2 ENST00000342990.3 ; transcript_alias_3 AC069277.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000337643.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT087676 ;
chr1	lncipedia.org	exon	119952263	119952538	.	+	.	gene_id lnc-HSD3B2-1 ; transcript_id lnc-HSD3B2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249401 ; transcript_alias_1 ENST00000506663 ;
chr1	lncipedia.org	exon	120074820	120078855	.	+	.	gene_id lnc-HSD3B2-1 ; transcript_id lnc-HSD3B2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249401 ; transcript_alias_1 ENST00000506663 ;
chr16	lncipedia.org	exon	52586008	52586346	.	-	.	gene_id lnc-TOX3-1 ; transcript_id lnc-TOX3-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000249231 ; gene_alias_2 AC026462.2 ; transcript_alias_1 ENST00000510238 ;
chr16	lncipedia.org	exon	52596726	52596774	.	-	.	gene_id lnc-TOX3-1 ; transcript_id lnc-TOX3-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000249231 ; gene_alias_2 AC026462.2 ; transcript_alias_1 ENST00000510238 ;
chr16	lncipedia.org	exon	52624848	52624979	.	-	.	gene_id lnc-TOX3-1 ; transcript_id lnc-TOX3-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000249231 ; gene_alias_2 AC026462.2 ; transcript_alias_1 ENST00000510238 ;
chr16	lncipedia.org	exon	52640416	52640847	.	-	.	gene_id lnc-TOX3-1 ; transcript_id lnc-TOX3-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000249231 ; gene_alias_2 AC026462.2 ; transcript_alias_1 ENST00000510238 ;
chr20	lncipedia.org	exon	58713548	58713700	.	+	.	gene_id lnc-C20orf197-3 ; transcript_id lnc-C20orf197-3:8 ; gene_alias_1 ENSG00000228340 ; gene_alias_2 RP5-1043L13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000228340.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032883.1 ; transcript_alias_1 ENST00000432910 ; transcript_alias_2 ENST00000432910.1 ; transcript_alias_3 RP5-1043L13.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079947.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT080648 ; transcript_alias_6 NR_046099 ;
chr20	lncipedia.org	exon	58729463	58729562	.	+	.	gene_id lnc-C20orf197-3 ; transcript_id lnc-C20orf197-3:8 ; gene_alias_1 ENSG00000228340 ; gene_alias_2 RP5-1043L13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000228340.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032883.1 ; transcript_alias_1 ENST00000432910 ; transcript_alias_2 ENST00000432910.1 ; transcript_alias_3 RP5-1043L13.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079947.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT080648 ; transcript_alias_6 NR_046099 ;
chr20	lncipedia.org	exon	58755893	58755971	.	+	.	gene_id lnc-C20orf197-3 ; transcript_id lnc-C20orf197-3:8 ; gene_alias_1 ENSG00000228340 ; gene_alias_2 RP5-1043L13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000228340.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032883.1 ; transcript_alias_1 ENST00000432910 ; transcript_alias_2 ENST00000432910.1 ; transcript_alias_3 RP5-1043L13.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079947.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT080648 ; transcript_alias_6 NR_046099 ;
chr20	lncipedia.org	exon	58893979	58894065	.	+	.	gene_id lnc-C20orf197-3 ; transcript_id lnc-C20orf197-3:8 ; gene_alias_1 ENSG00000228340 ; gene_alias_2 RP5-1043L13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000228340.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032883.1 ; transcript_alias_1 ENST00000432910 ; transcript_alias_2 ENST00000432910.1 ; transcript_alias_3 RP5-1043L13.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079947.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT080648 ; transcript_alias_6 NR_046099 ;
chr20	lncipedia.org	exon	58895691	58897314	.	+	.	gene_id lnc-C20orf197-3 ; transcript_id lnc-C20orf197-3:8 ; gene_alias_1 ENSG00000228340 ; gene_alias_2 RP5-1043L13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000228340.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032883.1 ; transcript_alias_1 ENST00000432910 ; transcript_alias_2 ENST00000432910.1 ; transcript_alias_3 RP5-1043L13.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079947.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT080648 ; transcript_alias_6 NR_046099 ;
chr12	lncipedia.org	exon	130639817	130640327	.	-	.	gene_id lnc-TMEM132D-3 ; transcript_id lnc-TMEM132D-3:8 ; gene_alias_1 ENSG00000250208 ; gene_alias_2 RP11-143E21.7 ; gene_alias_3 ENSG00000250208.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168379.1 ; gene_alias_5 FZD10-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000542000 ; transcript_alias_2 ENST00000542000.1 ; transcript_alias_3 RP11-143E21.7-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399506.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT140102 ;
chr12	lncipedia.org	exon	130646507	130646689	.	-	.	gene_id lnc-TMEM132D-3 ; transcript_id lnc-TMEM132D-3:8 ; gene_alias_1 ENSG00000250208 ; gene_alias_2 RP11-143E21.7 ; gene_alias_3 ENSG00000250208.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168379.1 ; gene_alias_5 FZD10-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000542000 ; transcript_alias_2 ENST00000542000.1 ; transcript_alias_3 RP11-143E21.7-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399506.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT140102 ;
chr1	lncipedia.org	exon	245384437	245384824	.	-	.	gene_id lnc-HNRNPU-3 ; transcript_id lnc-HNRNPU-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250146 ; transcript_alias_1 ENST00000509125 ;
chr1	lncipedia.org	exon	245385542	245387587	.	-	.	gene_id lnc-HNRNPU-3 ; transcript_id lnc-HNRNPU-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250146 ; transcript_alias_1 ENST00000509125 ;
chr7	lncipedia.org	exon	150130742	150130917	.	+	.	gene_id lnc-GIMAP8-1 ; transcript_id lnc-GIMAP8-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000242258 ; gene_alias_2 RP11-511P7.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242258.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158321.1 ; gene_alias_5 LINC00996 ; transcript_alias_1 ENST00000477392 ; transcript_alias_2 ENST00000477392.1 ; transcript_alias_3 RP11-511P7.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350672.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT124136 ; transcript_alias_6 NR_034033 ;
chr7	lncipedia.org	exon	150139637	150140248	.	+	.	gene_id lnc-GIMAP8-1 ; transcript_id lnc-GIMAP8-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000242258 ; gene_alias_2 RP11-511P7.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242258.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158321.1 ; gene_alias_5 LINC00996 ; transcript_alias_1 ENST00000477392 ; transcript_alias_2 ENST00000477392.1 ; transcript_alias_3 RP11-511P7.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350672.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT124136 ; transcript_alias_6 NR_034033 ;
chr7	lncipedia.org	exon	150143788	150143977	.	+	.	gene_id lnc-GIMAP8-1 ; transcript_id lnc-GIMAP8-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000242258 ; gene_alias_2 RP11-511P7.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242258.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158321.1 ; gene_alias_5 LINC00996 ; transcript_alias_1 ENST00000477392 ; transcript_alias_2 ENST00000477392.1 ; transcript_alias_3 RP11-511P7.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350672.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT124136 ; transcript_alias_6 NR_034033 ;
chr7	lncipedia.org	exon	150144164	150145228	.	+	.	gene_id lnc-GIMAP8-1 ; transcript_id lnc-GIMAP8-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000242258 ; gene_alias_2 RP11-511P7.2 ; gene_alias_3 ENSG00000242258.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158321.1 ; gene_alias_5 LINC00996 ; transcript_alias_1 ENST00000477392 ; transcript_alias_2 ENST00000477392.1 ; transcript_alias_3 RP11-511P7.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350672.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT124136 ; transcript_alias_6 NR_034033 ;
chr3	lncipedia.org	exon	44482424	44482682	.	+	.	gene_id lnc-C3orf23-2 ; transcript_id lnc-C3orf23-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245865 ; gene_alias_2 AC134943.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500374 ; transcript_alias_2 NONHSAT089321 ;
chr3	lncipedia.org	exon	44485398	44486946	.	+	.	gene_id lnc-C3orf23-2 ; transcript_id lnc-C3orf23-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245865 ; gene_alias_2 AC134943.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500374 ; transcript_alias_2 NONHSAT089321 ;
chr18	lncipedia.org	exon	74240612	74240920	.	+	.	gene_id lnc-RP11-17M16.1.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-17M16.1.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247544 ; gene_alias_2 XLOC_012726 ; gene_alias_3 linc-ZNF236-4 ; gene_alias_4 AC034110.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501504 ; transcript_alias_2 TCONS_00026179 ;
chr18	lncipedia.org	exon	74242341	74242421	.	+	.	gene_id lnc-RP11-17M16.1.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-17M16.1.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247544 ; gene_alias_2 XLOC_012726 ; gene_alias_3 linc-ZNF236-4 ; gene_alias_4 AC034110.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501504 ; transcript_alias_2 TCONS_00026179 ;
chr18	lncipedia.org	exon	74269932	74271783	.	+	.	gene_id lnc-RP11-17M16.1.1-2 ; transcript_id lnc-RP11-17M16.1.1-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000247544 ; gene_alias_2 XLOC_012726 ; gene_alias_3 linc-ZNF236-4 ; gene_alias_4 AC034110.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501504 ; transcript_alias_2 TCONS_00026179 ;
chr4	lncipedia.org	exon	190701490	190701953	.	-	.	gene_id lnc-FRG2-2 ; transcript_id lnc-FRG2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245685 ; gene_alias_2 AF146191.4 ; gene_alias_3 ENSG00000245685.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160585.3 ; transcript_alias_1 ENST00000506276 ; transcript_alias_2 ENST00000506276.1 ; transcript_alias_3 AF146191.4-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000361304.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099797 ;
chr4	lncipedia.org	exon	190858352	190858488	.	-	.	gene_id lnc-FRG2-2 ; transcript_id lnc-FRG2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245685 ; gene_alias_2 AF146191.4 ; gene_alias_3 ENSG00000245685.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160585.3 ; transcript_alias_1 ENST00000506276 ; transcript_alias_2 ENST00000506276.1 ; transcript_alias_3 AF146191.4-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000361304.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099797 ;
chr4	lncipedia.org	exon	190861325	190861426	.	-	.	gene_id lnc-FRG2-2 ; transcript_id lnc-FRG2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245685 ; gene_alias_2 AF146191.4 ; gene_alias_3 ENSG00000245685.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000160585.3 ; transcript_alias_1 ENST00000506276 ; transcript_alias_2 ENST00000506276.1 ; transcript_alias_3 AF146191.4-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000361304.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT099797 ;
chr1	lncipedia.org	exon	114466623	114466954	.	-	.	gene_id lnc-AP4B1-1 ; transcript_id lnc-AP4B1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000235527 ; gene_alias_2 RP5-1073O3.7 ; gene_alias_3 ENSG00000235527.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000011982.2 ; transcript_alias_1 ENST00000450706 ; transcript_alias_2 ENST00000450706.1 ; transcript_alias_3 RP5-1073O3.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000033123.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT005346 ; transcript_alias_6 NR_110725 ;
chr1	lncipedia.org	exon	114469250	114469363	.	-	.	gene_id lnc-AP4B1-1 ; transcript_id lnc-AP4B1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000235527 ; gene_alias_2 RP5-1073O3.7 ; gene_alias_3 ENSG00000235527.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000011982.2 ; transcript_alias_1 ENST00000450706 ; transcript_alias_2 ENST00000450706.1 ; transcript_alias_3 RP5-1073O3.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000033123.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT005346 ; transcript_alias_6 NR_110725 ;
chr1	lncipedia.org	exon	114469475	114470444	.	-	.	gene_id lnc-AP4B1-1 ; transcript_id lnc-AP4B1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000235527 ; gene_alias_2 RP5-1073O3.7 ; gene_alias_3 ENSG00000235527.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000011982.2 ; transcript_alias_1 ENST00000450706 ; transcript_alias_2 ENST00000450706.1 ; transcript_alias_3 RP5-1073O3.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000033123.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT005346 ; transcript_alias_6 NR_110725 ;
chr1	lncipedia.org	exon	114470866	114471010	.	-	.	gene_id lnc-AP4B1-1 ; transcript_id lnc-AP4B1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000235527 ; gene_alias_2 RP5-1073O3.7 ; gene_alias_3 ENSG00000235527.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000011982.2 ; transcript_alias_1 ENST00000450706 ; transcript_alias_2 ENST00000450706.1 ; transcript_alias_3 RP5-1073O3.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000033123.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT005346 ; transcript_alias_6 NR_110725 ;
chr1	lncipedia.org	exon	114471325	114471880	.	-	.	gene_id lnc-AP4B1-1 ; transcript_id lnc-AP4B1-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000235527 ; gene_alias_2 RP5-1073O3.7 ; gene_alias_3 ENSG00000235527.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000011982.2 ; transcript_alias_1 ENST00000450706 ; transcript_alias_2 ENST00000450706.1 ; transcript_alias_3 RP5-1073O3.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000033123.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT005346 ; transcript_alias_6 NR_110725 ;
chr8	lncipedia.org	exon	144821566	144821673	.	+	.	gene_id lnc-MAPK15-1 ; transcript_id lnc-MAPK15-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000203499 ; gene_alias_2 RP11-429J17.6 ; gene_alias_3 ENSG00000203499.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165151.1 ; gene_alias_5 FAM83H-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000534398 ; transcript_alias_2 ENST00000534398.1 ; transcript_alias_3 RP11-429J17.6-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000382209.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT129648 ;
chr8	lncipedia.org	exon	144822029	144822118	.	+	.	gene_id lnc-MAPK15-1 ; transcript_id lnc-MAPK15-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000203499 ; gene_alias_2 RP11-429J17.6 ; gene_alias_3 ENSG00000203499.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165151.1 ; gene_alias_5 FAM83H-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000534398 ; transcript_alias_2 ENST00000534398.1 ; transcript_alias_3 RP11-429J17.6-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000382209.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT129648 ;
chr8	lncipedia.org	exon	144823922	144824305	.	+	.	gene_id lnc-MAPK15-1 ; transcript_id lnc-MAPK15-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000203499 ; gene_alias_2 RP11-429J17.6 ; gene_alias_3 ENSG00000203499.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165151.1 ; gene_alias_5 FAM83H-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000534398 ; transcript_alias_2 ENST00000534398.1 ; transcript_alias_3 RP11-429J17.6-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000382209.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT129648 ;
chr15	lncipedia.org	exon	52393790	52393888	.	+	.	gene_id lnc-MAPK6-4 ; transcript_id lnc-MAPK6-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000231111 ; gene_alias_2 AC023906.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544821 ;
chr15	lncipedia.org	exon	52402812	52403225	.	+	.	gene_id lnc-MAPK6-4 ; transcript_id lnc-MAPK6-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000231111 ; gene_alias_2 AC023906.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544821 ;
chr19	lncipedia.org	exon	47165242	47165454	.	+	.	gene_id lnc-CALM3-1 ; transcript_id lnc-CALM3-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000245598 ; gene_alias_2 CTB-12A17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245598.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165987.1 ; gene_alias_5 DACT3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000525352 ; transcript_alias_2 ENST00000525352.1 ; transcript_alias_3 CTB-12A17.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000387313.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT066910 ;
chr19	lncipedia.org	exon	47176726	47176893	.	+	.	gene_id lnc-CALM3-1 ; transcript_id lnc-CALM3-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000245598 ; gene_alias_2 CTB-12A17.1 ; gene_alias_3 ENSG00000245598.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165987.1 ; gene_alias_5 DACT3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000525352 ; transcript_alias_2 ENST00000525352.1 ; transcript_alias_3 CTB-12A17.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000387313.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT066910 ;
chr8	lncipedia.org	exon	126257796	126258152	.	+	.	gene_id lnc-TRIB1-3 ; transcript_id lnc-TRIB1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244882 ; transcript_alias_1 ENST00000501085 ;
chr8	lncipedia.org	exon	126258545	126259405	.	+	.	gene_id lnc-TRIB1-3 ; transcript_id lnc-TRIB1-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244882 ; transcript_alias_1 ENST00000501085 ;
chr11	lncipedia.org	exon	62620544	62620587	.	-	.	gene_id lnc-WDR74-1 ; transcript_id lnc-WDR74-1:24 ; gene_alias_1 ENSG00000255717 ; gene_alias_2 SNHG1 ; gene_alias_3 ENSG00000255717.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167743.1 ; gene_alias_5 ENSG00000255717.2 ; transcript_alias_1 ENST00000545920 ; transcript_alias_2 ENST00000545920.1 ; transcript_alias_3 SNHG1-024 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000396030.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT021843 ;
chr11	lncipedia.org	exon	62621024	62621062	.	-	.	gene_id lnc-WDR74-1 ; transcript_id lnc-WDR74-1:24 ; gene_alias_1 ENSG00000255717 ; gene_alias_2 SNHG1 ; gene_alias_3 ENSG00000255717.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167743.1 ; gene_alias_5 ENSG00000255717.2 ; transcript_alias_1 ENST00000545920 ; transcript_alias_2 ENST00000545920.1 ; transcript_alias_3 SNHG1-024 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000396030.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT021843 ;
chr11	lncipedia.org	exon	62621273	62621814	.	-	.	gene_id lnc-WDR74-1 ; transcript_id lnc-WDR74-1:24 ; gene_alias_1 ENSG00000255717 ; gene_alias_2 SNHG1 ; gene_alias_3 ENSG00000255717.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167743.1 ; gene_alias_5 ENSG00000255717.2 ; transcript_alias_1 ENST00000545920 ; transcript_alias_2 ENST00000545920.1 ; transcript_alias_3 SNHG1-024 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000396030.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT021843 ;
chr19	lncipedia.org	exon	14495031	14495735	.	-	.	gene_id lnc-DDX39A-1 ; transcript_id lnc-DDX39A-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247801 ; transcript_alias_1 ENST00000502238 ;
chr19	lncipedia.org	exon	14497651	14499039	.	-	.	gene_id lnc-DDX39A-1 ; transcript_id lnc-DDX39A-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247801 ; transcript_alias_1 ENST00000502238 ;
chr10	lncipedia.org	exon	49782017	49782955	.	+	.	gene_id lnc-WDFY4-2 ; transcript_id lnc-WDFY4-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250000 ; transcript_alias_1 ENST00000515396 ;
chr10	lncipedia.org	exon	49812817	49813142	.	+	.	gene_id lnc-WDFY4-2 ; transcript_id lnc-WDFY4-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250000 ; transcript_alias_1 ENST00000515396 ;
chr19	lncipedia.org	exon	41961601	41962392	.	-	.	gene_id lnc-ATP5SL-1 ; transcript_id lnc-ATP5SL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249527 ; gene_alias_2 ENSG00000267107.2 ; gene_alias_3 AC011526.1 ; transcript_alias_1 ENST00000507129 ; transcript_alias_2 ENST00000594315.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	41984989	41985192	.	-	.	gene_id lnc-ATP5SL-1 ; transcript_id lnc-ATP5SL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249527 ; gene_alias_2 ENSG00000267107.2 ; gene_alias_3 AC011526.1 ; transcript_alias_1 ENST00000507129 ; transcript_alias_2 ENST00000594315.1 ;
chr19	lncipedia.org	exon	42006494	42006559	.	-	.	gene_id lnc-ATP5SL-1 ; transcript_id lnc-ATP5SL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249527 ; gene_alias_2 ENSG00000267107.2 ; gene_alias_3 AC011526.1 ; transcript_alias_1 ENST00000507129 ; transcript_alias_2 ENST00000594315.1 ;
chr11	lncipedia.org	exon	8190714	8190736	.	+	.	gene_id lnc-TUB-1 ; transcript_id lnc-TUB-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246820 ; gene_alias_2 RP11-379P15.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246820.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165832.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499752 ; transcript_alias_2 ENST00000499752.2 ; transcript_alias_3 RP11-379P15.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000386502.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017843 ;
chr11	lncipedia.org	exon	8191432	8191535	.	+	.	gene_id lnc-TUB-1 ; transcript_id lnc-TUB-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246820 ; gene_alias_2 RP11-379P15.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246820.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165832.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499752 ; transcript_alias_2 ENST00000499752.2 ; transcript_alias_3 RP11-379P15.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000386502.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017843 ;
chr11	lncipedia.org	exon	8196844	8200450	.	+	.	gene_id lnc-TUB-1 ; transcript_id lnc-TUB-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246820 ; gene_alias_2 RP11-379P15.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246820.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165832.1 ; transcript_alias_1 ENST00000499752 ; transcript_alias_2 ENST00000499752.2 ; transcript_alias_3 RP11-379P15.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000386502.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017843 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127175025	127175244	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-10 ; transcript_id lnc-TMEM132B-10:3 ; gene_alias_1 ENSG00000255998 ; gene_alias_2 RP11-407A16.7 ; gene_alias_3 ENSG00000255998.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168478.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544711 ; transcript_alias_2 ENST00000544711.1 ; transcript_alias_3 RP11-407A16.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399861.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031801 ;
chr12	lncipedia.org	exon	127176346	127176464	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-10 ; transcript_id lnc-TMEM132B-10:3 ; gene_alias_1 ENSG00000255998 ; gene_alias_2 RP11-407A16.7 ; gene_alias_3 ENSG00000255998.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168478.1 ; transcript_alias_1 ENST00000544711 ; transcript_alias_2 ENST00000544711.1 ; transcript_alias_3 RP11-407A16.7-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399861.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031801 ;
chr2	lncipedia.org	exon	7052408	7053795	.	-	.	gene_id lnc-CMPK2-2 ; transcript_id lnc-CMPK2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228203 ; gene_alias_2 AC017076.4 ; gene_alias_3 ENSG00000228203.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151701.2 ; transcript_alias_1 ENST00000418970 ; transcript_alias_2 ENST00000418970.1 ; transcript_alias_3 AC017076.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323504.2 ;
chr2	lncipedia.org	exon	7054324	7054481	.	-	.	gene_id lnc-CMPK2-2 ; transcript_id lnc-CMPK2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228203 ; gene_alias_2 AC017076.4 ; gene_alias_3 ENSG00000228203.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151701.2 ; transcript_alias_1 ENST00000418970 ; transcript_alias_2 ENST00000418970.1 ; transcript_alias_3 AC017076.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323504.2 ;
chr2	lncipedia.org	exon	7055954	7056098	.	-	.	gene_id lnc-CMPK2-2 ; transcript_id lnc-CMPK2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228203 ; gene_alias_2 AC017076.4 ; gene_alias_3 ENSG00000228203.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151701.2 ; transcript_alias_1 ENST00000418970 ; transcript_alias_2 ENST00000418970.1 ; transcript_alias_3 AC017076.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323504.2 ;
chr2	lncipedia.org	exon	7056981	7057355	.	-	.	gene_id lnc-CMPK2-2 ; transcript_id lnc-CMPK2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228203 ; gene_alias_2 AC017076.4 ; gene_alias_3 ENSG00000228203.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151701.2 ; transcript_alias_1 ENST00000418970 ; transcript_alias_2 ENST00000418970.1 ; transcript_alias_3 AC017076.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323504.2 ;
chr2	lncipedia.org	exon	7058533	7058813	.	-	.	gene_id lnc-CMPK2-2 ; transcript_id lnc-CMPK2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000228203 ; gene_alias_2 AC017076.4 ; gene_alias_3 ENSG00000228203.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151701.2 ; transcript_alias_1 ENST00000418970 ; transcript_alias_2 ENST00000418970.1 ; transcript_alias_3 AC017076.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323504.2 ;
chr1	lncipedia.org	exon	173833042	173833213	.	-	.	gene_id lnc-SERPINC1-1 ; transcript_id lnc-SERPINC1-1:26 ; gene_alias_1 ENSG00000234741 ; gene_alias_2 GAS5 ; gene_alias_3 ENSG00000234741.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037216.2 ; gene_alias_5 ENSG00000234741.3 ; transcript_alias_1 ENST00000422207 ; transcript_alias_2 ENST00000422207.1 ; transcript_alias_3 GAS5-023 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000090599.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT007680 ;
chr1	lncipedia.org	exon	173833395	173833442	.	-	.	gene_id lnc-SERPINC1-1 ; transcript_id lnc-SERPINC1-1:26 ; gene_alias_1 ENSG00000234741 ; gene_alias_2 GAS5 ; gene_alias_3 ENSG00000234741.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037216.2 ; gene_alias_5 ENSG00000234741.3 ; transcript_alias_1 ENST00000422207 ; transcript_alias_2 ENST00000422207.1 ; transcript_alias_3 GAS5-023 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000090599.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT007680 ;
chr1	lncipedia.org	exon	173833622	173834044	.	-	.	gene_id lnc-SERPINC1-1 ; transcript_id lnc-SERPINC1-1:26 ; gene_alias_1 ENSG00000234741 ; gene_alias_2 GAS5 ; gene_alias_3 ENSG00000234741.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000037216.2 ; gene_alias_5 ENSG00000234741.3 ; transcript_alias_1 ENST00000422207 ; transcript_alias_2 ENST00000422207.1 ; transcript_alias_3 GAS5-023 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000090599.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT007680 ;
chr11	lncipedia.org	exon	117671559	117672750	.	-	.	gene_id lnc-FXYD2-1 ; transcript_id lnc-FXYD2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251594 ; gene_alias_2 ENSG00000251594.1 ; gene_alias_3 RP11-728F11.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166495.1 ; transcript_alias_1 ENST00000514385 ; transcript_alias_2 ENST00000514385.1 ; transcript_alias_3 RP11-728F11.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000390047.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT024413 ;
chr11	lncipedia.org	exon	117688455	117690134	.	-	.	gene_id lnc-FXYD2-1 ; transcript_id lnc-FXYD2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251594 ; gene_alias_2 ENSG00000251594.1 ; gene_alias_3 RP11-728F11.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000166495.1 ; transcript_alias_1 ENST00000514385 ; transcript_alias_2 ENST00000514385.1 ; transcript_alias_3 RP11-728F11.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000390047.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT024413 ;
chr2	lncipedia.org	exon	172167776	172169682	.	+	.	gene_id lnc-DCAF17-2 ; transcript_id lnc-DCAF17-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250738 ; gene_alias_2 XLOC_001751 ; gene_alias_3 linc-DCAF17-1 ; gene_alias_4 AC007739.1 ; transcript_alias_1 ENST00000514012 ; transcript_alias_2 TCONS_00003048 ; transcript_alias_3 NONHSAT075451 ;
chr2	lncipedia.org	exon	172170001	172170351	.	+	.	gene_id lnc-DCAF17-2 ; transcript_id lnc-DCAF17-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250738 ; gene_alias_2 XLOC_001751 ; gene_alias_3 linc-DCAF17-1 ; gene_alias_4 AC007739.1 ; transcript_alias_1 ENST00000514012 ; transcript_alias_2 TCONS_00003048 ; transcript_alias_3 NONHSAT075451 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27053244	27053318	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:11 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 MIAT ; gene_alias_5 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000455640 ; transcript_alias_2 TCONS_00029380 ; transcript_alias_3 ENST00000455640.1 ; transcript_alias_4 MIAT-015 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320810.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084516 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27059280	27059362	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:11 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 MIAT ; gene_alias_5 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000455640 ; transcript_alias_2 TCONS_00029380 ; transcript_alias_3 ENST00000455640.1 ; transcript_alias_4 MIAT-015 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320810.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084516 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27061429	27061882	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:11 ; gene_alias_1 ENSG00000225783 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 MIAT ; gene_alias_5 ENSG00000225783.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150985.2 ; transcript_alias_1 ENST00000455640 ; transcript_alias_2 TCONS_00029380 ; transcript_alias_3 ENST00000455640.1 ; transcript_alias_4 MIAT-015 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320810.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084516 ;
chr17	lncipedia.org	exon	74136637	74136761	.	+	.	gene_id lnc-ZACN-1 ; transcript_id lnc-ZACN-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247180 ; gene_alias_2 AC018665.1 ; gene_alias_3 ENSG00000267128.1 ; gene_alias_4 RNF157-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000499811 ; transcript_alias_2 ENST00000590137.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	74139311	74139429	.	+	.	gene_id lnc-ZACN-1 ; transcript_id lnc-ZACN-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247180 ; gene_alias_2 AC018665.1 ; gene_alias_3 ENSG00000267128.1 ; gene_alias_4 RNF157-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000499811 ; transcript_alias_2 ENST00000590137.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	74141003	74141167	.	+	.	gene_id lnc-ZACN-1 ; transcript_id lnc-ZACN-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247180 ; gene_alias_2 AC018665.1 ; gene_alias_3 ENSG00000267128.1 ; gene_alias_4 RNF157-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000499811 ; transcript_alias_2 ENST00000590137.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	74141503	74141645	.	+	.	gene_id lnc-ZACN-1 ; transcript_id lnc-ZACN-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247180 ; gene_alias_2 AC018665.1 ; gene_alias_3 ENSG00000267128.1 ; gene_alias_4 RNF157-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000499811 ; transcript_alias_2 ENST00000590137.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	74142355	74142418	.	+	.	gene_id lnc-ZACN-1 ; transcript_id lnc-ZACN-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247180 ; gene_alias_2 AC018665.1 ; gene_alias_3 ENSG00000267128.1 ; gene_alias_4 RNF157-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000499811 ; transcript_alias_2 ENST00000590137.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	74143375	74143680	.	+	.	gene_id lnc-ZACN-1 ; transcript_id lnc-ZACN-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247180 ; gene_alias_2 AC018665.1 ; gene_alias_3 ENSG00000267128.1 ; gene_alias_4 RNF157-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000499811 ; transcript_alias_2 ENST00000590137.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	74149214	74149869	.	+	.	gene_id lnc-ZACN-1 ; transcript_id lnc-ZACN-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247180 ; gene_alias_2 AC018665.1 ; gene_alias_3 ENSG00000267128.1 ; gene_alias_4 RNF157-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000499811 ; transcript_alias_2 ENST00000590137.1 ;
chr17	lncipedia.org	exon	74150131	74150364	.	+	.	gene_id lnc-ZACN-1 ; transcript_id lnc-ZACN-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247180 ; gene_alias_2 AC018665.1 ; gene_alias_3 ENSG00000267128.1 ; gene_alias_4 RNF157-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000499811 ; transcript_alias_2 ENST00000590137.1 ;
chr12	lncipedia.org	exon	92073908	92074070	.	+	.	gene_id lnc-CLLU1.1-5 ; transcript_id lnc-CLLU1.1-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258125 ; gene_alias_2 RP11-1041F24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258125.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170068.1 ; transcript_alias_1 ENST00000550035 ; transcript_alias_2 ENST00000550035.1 ; transcript_alias_3 RP11-1041F24.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407131.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029865 ;
chr12	lncipedia.org	exon	92074567	92074650	.	+	.	gene_id lnc-CLLU1.1-5 ; transcript_id lnc-CLLU1.1-5:1 ; gene_alias_1 ENSG00000258125 ; gene_alias_2 RP11-1041F24.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258125.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170068.1 ; transcript_alias_1 ENST00000550035 ; transcript_alias_2 ENST00000550035.1 ; transcript_alias_3 RP11-1041F24.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407131.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029865 ;
chr1	lncipedia.org	exon	79034380	79034524	.	-	.	gene_id lnc-ELTD1-6 ; transcript_id lnc-ELTD1-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249107 ; transcript_alias_1 ENST00000513923 ;
chr1	lncipedia.org	exon	79127046	79129763	.	-	.	gene_id lnc-ELTD1-6 ; transcript_id lnc-ELTD1-6:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249107 ; transcript_alias_1 ENST00000513923 ;
chr6	lncipedia.org	exon	170586027	170586111	.	+	.	gene_id lnc-FAM120B-2 ; transcript_id lnc-FAM120B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000227508 ; gene_alias_2 XLOC_005564 ; gene_alias_3 linc-FAM120B-1 ; gene_alias_4 RP5-894D12.3 ; gene_alias_5 ENSG00000227508.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000016077.1 ; gene_alias_7 ENSG00000227508.2 ; transcript_alias_1 ENST00000438622 ; transcript_alias_2 TCONS_00011426 ; transcript_alias_3 ENST00000438622.1 ; transcript_alias_4 RP5-894D12.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000043252.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT116267 ;
chr6	lncipedia.org	exon	170588297	170588557	.	+	.	gene_id lnc-FAM120B-2 ; transcript_id lnc-FAM120B-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000227508 ; gene_alias_2 XLOC_005564 ; gene_alias_3 linc-FAM120B-1 ; gene_alias_4 RP5-894D12.3 ; gene_alias_5 ENSG00000227508.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000016077.1 ; gene_alias_7 ENSG00000227508.2 ; transcript_alias_1 ENST00000438622 ; transcript_alias_2 TCONS_00011426 ; transcript_alias_3 ENST00000438622.1 ; transcript_alias_4 RP5-894D12.3-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000043252.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT116267 ;
chr17	lncipedia.org	exon	18079879	18081679	.	-	.	gene_id lnc-FLII-1 ; transcript_id lnc-FLII-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246628 ; gene_alias_2 ENSG00000266677.1 ; gene_alias_3 RP11-258F1.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000179407.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500385 ; transcript_alias_2 ENST00000583062.1 ; transcript_alias_3 RP11-258F1.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000446134.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT146155 ;
chr17	lncipedia.org	exon	18087711	18088067	.	-	.	gene_id lnc-FLII-1 ; transcript_id lnc-FLII-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246628 ; gene_alias_2 ENSG00000266677.1 ; gene_alias_3 RP11-258F1.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000179407.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500385 ; transcript_alias_2 ENST00000583062.1 ; transcript_alias_3 RP11-258F1.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000446134.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT146155 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73047636	73047763	.	-	.	gene_id lnc-NAP1L2-1 ; transcript_id lnc-NAP1L2-1:10 ; gene_alias_1 ENSG00000229807 ; gene_alias_2 XLOC_008185 ; gene_alias_3 linc-NAP1L2-4 ; gene_alias_4 XIST ; gene_alias_5 ENSG00000229807.3 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021839.3 ; gene_alias_7 ENSG00000229807.5 ; transcript_alias_1 ENST00000445814 ; transcript_alias_2 TCONS_00017075 ; transcript_alias_3 ENST00000445814.1 ; transcript_alias_4 XIST-004 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000057242.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73048903	73049066	.	-	.	gene_id lnc-NAP1L2-1 ; transcript_id lnc-NAP1L2-1:10 ; gene_alias_1 ENSG00000229807 ; gene_alias_2 XLOC_008185 ; gene_alias_3 linc-NAP1L2-4 ; gene_alias_4 XIST ; gene_alias_5 ENSG00000229807.3 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021839.3 ; gene_alias_7 ENSG00000229807.5 ; transcript_alias_1 ENST00000445814 ; transcript_alias_2 TCONS_00017075 ; transcript_alias_3 ENST00000445814.1 ; transcript_alias_4 XIST-004 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000057242.1 ;
chrX	lncipedia.org	exon	73050901	73051045	.	-	.	gene_id lnc-NAP1L2-1 ; transcript_id lnc-NAP1L2-1:10 ; gene_alias_1 ENSG00000229807 ; gene_alias_2 XLOC_008185 ; gene_alias_3 linc-NAP1L2-4 ; gene_alias_4 XIST ; gene_alias_5 ENSG00000229807.3 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000021839.3 ; gene_alias_7 ENSG00000229807.5 ; transcript_alias_1 ENST00000445814 ; transcript_alias_2 TCONS_00017075 ; transcript_alias_3 ENST00000445814.1 ; transcript_alias_4 XIST-004 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000057242.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	6725119	6725533	.	+	.	gene_id lnc-LY86-4 ; transcript_id lnc-LY86-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247225 ; gene_alias_2 AL031123.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501751 ;
chr6	lncipedia.org	exon	6729229	6730139	.	+	.	gene_id lnc-LY86-4 ; transcript_id lnc-LY86-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247225 ; gene_alias_2 AL031123.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501751 ;
chr2	lncipedia.org	exon	85291257	85291802	.	-	.	gene_id lnc-C2orf89-1 ; transcript_id lnc-C2orf89-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250112 ; transcript_alias_1 ENST00000508627 ;
chr2	lncipedia.org	exon	85291906	85294470	.	-	.	gene_id lnc-C2orf89-1 ; transcript_id lnc-C2orf89-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000250112 ; transcript_alias_1 ENST00000508627 ;
chr20	lncipedia.org	exon	37053843	37053978	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1755-3 ; transcript_id lnc-KIAA1755-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000235408 ; gene_alias_2 AL080249.2 ; gene_alias_3 ENSG00000235408.1 ; gene_alias_4 SNORA71B ; gene_alias_5 OTTHUMG00000032446.1 ; transcript_alias_1 ENST00000439232 ; transcript_alias_2 ENST00000439232.1 ; transcript_alias_3 SNORA71B-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000079173.1 ;
chr16	lncipedia.org	exon	56126899	56127430	.	-	.	gene_id lnc-AMFR-4 ; transcript_id lnc-AMFR-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246379 ; gene_alias_2 AC007495.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246379.2 ; gene_alias_4 RP11-461O7.1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000176719.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501259 ; transcript_alias_2 ENST00000501259.1 ; transcript_alias_3 RP11-461O7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000433290.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT142643 ; transcript_alias_6 NR_027078 ;
chr16	lncipedia.org	exon	56134958	56135124	.	-	.	gene_id lnc-AMFR-4 ; transcript_id lnc-AMFR-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246379 ; gene_alias_2 AC007495.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246379.2 ; gene_alias_4 RP11-461O7.1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000176719.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501259 ; transcript_alias_2 ENST00000501259.1 ; transcript_alias_3 RP11-461O7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000433290.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT142643 ; transcript_alias_6 NR_027078 ;
chr16	lncipedia.org	exon	56135944	56136231	.	-	.	gene_id lnc-AMFR-4 ; transcript_id lnc-AMFR-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246379 ; gene_alias_2 AC007495.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246379.2 ; gene_alias_4 RP11-461O7.1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000176719.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501259 ; transcript_alias_2 ENST00000501259.1 ; transcript_alias_3 RP11-461O7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000433290.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT142643 ; transcript_alias_6 NR_027078 ;
chr16	lncipedia.org	exon	56221515	56221612	.	-	.	gene_id lnc-AMFR-4 ; transcript_id lnc-AMFR-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246379 ; gene_alias_2 AC007495.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246379.2 ; gene_alias_4 RP11-461O7.1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000176719.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501259 ; transcript_alias_2 ENST00000501259.1 ; transcript_alias_3 RP11-461O7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000433290.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT142643 ; transcript_alias_6 NR_027078 ;
chr16	lncipedia.org	exon	56223414	56225006	.	-	.	gene_id lnc-AMFR-4 ; transcript_id lnc-AMFR-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246379 ; gene_alias_2 AC007495.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246379.2 ; gene_alias_4 RP11-461O7.1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000176719.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501259 ; transcript_alias_2 ENST00000501259.1 ; transcript_alias_3 RP11-461O7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000433290.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT142643 ; transcript_alias_6 NR_027078 ;
chr15	lncipedia.org	exon	77934106	77934299	.	+	.	gene_id lnc-HMG20A-3 ; transcript_id lnc-HMG20A-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249469 ; transcript_alias_1 ENST00000507300 ;
chr15	lncipedia.org	exon	77938730	77938853	.	+	.	gene_id lnc-HMG20A-3 ; transcript_id lnc-HMG20A-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249469 ; transcript_alias_1 ENST00000507300 ;
chr15	lncipedia.org	exon	77940181	77941579	.	+	.	gene_id lnc-HMG20A-3 ; transcript_id lnc-HMG20A-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249469 ; transcript_alias_1 ENST00000507300 ;
chr21	lncipedia.org	exon	25801054	25801218	.	+	.	gene_id lnc-JAM2-6 ; transcript_id lnc-JAM2-6:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237484 ; gene_alias_2 AP000476.1 ; gene_alias_3 ENSG00000237484.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000078326.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535533 ; transcript_alias_2 ENST00000535533.1 ; transcript_alias_3 AP000476.1-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT081451 ;
chr21	lncipedia.org	exon	25810567	25810747	.	+	.	gene_id lnc-JAM2-6 ; transcript_id lnc-JAM2-6:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237484 ; gene_alias_2 AP000476.1 ; gene_alias_3 ENSG00000237484.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000078326.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535533 ; transcript_alias_2 ENST00000535533.1 ; transcript_alias_3 AP000476.1-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT081451 ;
chr21	lncipedia.org	exon	25813483	25813667	.	+	.	gene_id lnc-JAM2-6 ; transcript_id lnc-JAM2-6:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237484 ; gene_alias_2 AP000476.1 ; gene_alias_3 ENSG00000237484.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000078326.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535533 ; transcript_alias_2 ENST00000535533.1 ; transcript_alias_3 AP000476.1-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT081451 ;
chr21	lncipedia.org	exon	25814109	25814227	.	+	.	gene_id lnc-JAM2-6 ; transcript_id lnc-JAM2-6:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237484 ; gene_alias_2 AP000476.1 ; gene_alias_3 ENSG00000237484.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000078326.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535533 ; transcript_alias_2 ENST00000535533.1 ; transcript_alias_3 AP000476.1-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT081451 ;
chr21	lncipedia.org	exon	25860368	25862621	.	+	.	gene_id lnc-JAM2-6 ; transcript_id lnc-JAM2-6:2 ; gene_alias_1 ENSG00000237484 ; gene_alias_2 AP000476.1 ; gene_alias_3 ENSG00000237484.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000078326.1 ; transcript_alias_1 ENST00000535533 ; transcript_alias_2 ENST00000535533.1 ; transcript_alias_3 AP000476.1-201 ; transcript_alias_4 NONHSAT081451 ;
chr1	lncipedia.org	exon	211536969	211537777	.	-	.	gene_id lnc-RD3-1 ; transcript_id lnc-RD3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251496 ; transcript_alias_1 ENST00000510684 ;
chr1	lncipedia.org	exon	211547334	211548284	.	-	.	gene_id lnc-RD3-1 ; transcript_id lnc-RD3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251496 ; transcript_alias_1 ENST00000510684 ;
chr1	lncipedia.org	exon	3816936	3817195	.	+	.	gene_id lnc-DFFB-1 ; transcript_id lnc-DFFB-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236423 ; gene_alias_2 RP13-15E13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000236423.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000041129.2 ; gene_alias_5 LINC01134 ; transcript_alias_1 ENST00000413332 ; transcript_alias_2 ENST00000413332.1 ; transcript_alias_3 RP13-15E13.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000158499.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT000554 ;
chr1	lncipedia.org	exon	3820529	3820600	.	+	.	gene_id lnc-DFFB-1 ; transcript_id lnc-DFFB-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236423 ; gene_alias_2 RP13-15E13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000236423.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000041129.2 ; gene_alias_5 LINC01134 ; transcript_alias_1 ENST00000413332 ; transcript_alias_2 ENST00000413332.1 ; transcript_alias_3 RP13-15E13.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000158499.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT000554 ;
chr1	lncipedia.org	exon	3821795	3822096	.	+	.	gene_id lnc-DFFB-1 ; transcript_id lnc-DFFB-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000236423 ; gene_alias_2 RP13-15E13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000236423.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000041129.2 ; gene_alias_5 LINC01134 ; transcript_alias_1 ENST00000413332 ; transcript_alias_2 ENST00000413332.1 ; transcript_alias_3 RP13-15E13.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000158499.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT000554 ;
chr6	lncipedia.org	exon	2246011	2246164	.	+	.	gene_id lnc-WRNIP1-2 ; transcript_id lnc-WRNIP1-2:7 ; gene_alias_1 ENSG00000250903 ; gene_alias_2 RP1-80B9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250903.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014120.3 ; gene_alias_5 ENSG00000250903.4 ; gene_alias_6 GMDS-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000456943 ; transcript_alias_2 ENST00000456943.2 ; transcript_alias_3 RP1-80B9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000039631.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT106625 ;
chr6	lncipedia.org	exon	2249071	2249160	.	+	.	gene_id lnc-WRNIP1-2 ; transcript_id lnc-WRNIP1-2:7 ; gene_alias_1 ENSG00000250903 ; gene_alias_2 RP1-80B9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250903.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014120.3 ; gene_alias_5 ENSG00000250903.4 ; gene_alias_6 GMDS-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000456943 ; transcript_alias_2 ENST00000456943.2 ; transcript_alias_3 RP1-80B9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000039631.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT106625 ;
chr6	lncipedia.org	exon	2263835	2263918	.	+	.	gene_id lnc-WRNIP1-2 ; transcript_id lnc-WRNIP1-2:7 ; gene_alias_1 ENSG00000250903 ; gene_alias_2 RP1-80B9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250903.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014120.3 ; gene_alias_5 ENSG00000250903.4 ; gene_alias_6 GMDS-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000456943 ; transcript_alias_2 ENST00000456943.2 ; transcript_alias_3 RP1-80B9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000039631.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT106625 ;
chr6	lncipedia.org	exon	2269932	2270033	.	+	.	gene_id lnc-WRNIP1-2 ; transcript_id lnc-WRNIP1-2:7 ; gene_alias_1 ENSG00000250903 ; gene_alias_2 RP1-80B9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250903.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014120.3 ; gene_alias_5 ENSG00000250903.4 ; gene_alias_6 GMDS-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000456943 ; transcript_alias_2 ENST00000456943.2 ; transcript_alias_3 RP1-80B9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000039631.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT106625 ;
chr6	lncipedia.org	exon	2272050	2273651	.	+	.	gene_id lnc-WRNIP1-2 ; transcript_id lnc-WRNIP1-2:7 ; gene_alias_1 ENSG00000250903 ; gene_alias_2 RP1-80B9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250903.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014120.3 ; gene_alias_5 ENSG00000250903.4 ; gene_alias_6 GMDS-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000456943 ; transcript_alias_2 ENST00000456943.2 ; transcript_alias_3 RP1-80B9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000039631.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT106625 ;
chr6	lncipedia.org	exon	2283733	2284008	.	+	.	gene_id lnc-WRNIP1-2 ; transcript_id lnc-WRNIP1-2:7 ; gene_alias_1 ENSG00000250903 ; gene_alias_2 RP1-80B9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000250903.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000014120.3 ; gene_alias_5 ENSG00000250903.4 ; gene_alias_6 GMDS-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000456943 ; transcript_alias_2 ENST00000456943.2 ; transcript_alias_3 RP1-80B9.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000039631.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT106625 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114770124	114770195	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:19 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000517965 ; transcript_alias_2 ENST00000517965.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379771.1 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114777021	114777798	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:19 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000517965 ; transcript_alias_2 ENST00000517965.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379771.1 ;
chr7	lncipedia.org	exon	29554707	29554933	.	-	.	gene_id lnc-CPVL-4 ; transcript_id lnc-CPVL-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223813 ; gene_alias_2 AC007255.8 ; gene_alias_3 ENSG00000223813.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152753.1 ; transcript_alias_1 ENST00000450540 ; transcript_alias_2 ENST00000450540.1 ; transcript_alias_3 AC007255.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000327680.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT119798 ;
chr7	lncipedia.org	exon	29603004	29603286	.	-	.	gene_id lnc-CPVL-4 ; transcript_id lnc-CPVL-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000223813 ; gene_alias_2 AC007255.8 ; gene_alias_3 ENSG00000223813.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152753.1 ; transcript_alias_1 ENST00000450540 ; transcript_alias_2 ENST00000450540.1 ; transcript_alias_3 AC007255.8-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000327680.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT119798 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27113332	27113422	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:43 ; gene_alias_1 ENSG00000244625 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 CTA-211A9.5 ; gene_alias_5 ENSG00000244625.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150981.2 ; transcript_alias_1 ENST00000417083 ; transcript_alias_2 TCONS_00029395 ; transcript_alias_3 ENST00000417083.1 ; transcript_alias_4 CTA-211A9.5-008 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320775.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084547 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27114103	27114194	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:43 ; gene_alias_1 ENSG00000244625 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 CTA-211A9.5 ; gene_alias_5 ENSG00000244625.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150981.2 ; transcript_alias_1 ENST00000417083 ; transcript_alias_2 TCONS_00029395 ; transcript_alias_3 ENST00000417083.1 ; transcript_alias_4 CTA-211A9.5-008 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320775.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084547 ;
chr22	lncipedia.org	exon	27117613	27118135	.	+	.	gene_id lnc-CRYBA4-1 ; transcript_id lnc-CRYBA4-1:43 ; gene_alias_1 ENSG00000244625 ; gene_alias_2 XLOC_014192 ; gene_alias_3 linc-HSCB-11 ; gene_alias_4 CTA-211A9.5 ; gene_alias_5 ENSG00000244625.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000150981.2 ; transcript_alias_1 ENST00000417083 ; transcript_alias_2 TCONS_00029395 ; transcript_alias_3 ENST00000417083.1 ; transcript_alias_4 CTA-211A9.5-008 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000320775.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT084547 ;
chrX	lncipedia.org	exon	118599997	118603058	.	-	.	gene_id lnc-CXorf56-1 ; transcript_id lnc-CXorf56-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000224281 ; gene_alias_2 RP3-404F18.2 ; gene_alias_3 ENSG00000224281.3 ; gene_alias_4 SLC25A5-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000022273.1 ; gene_alias_6 ENSG00000224281.4 ; transcript_alias_1 ENST00000395539 ; transcript_alias_2 ENST00000395539.2 ; transcript_alias_3 SLC25A5-AS1-201 ;
chr6	lncipedia.org	exon	10429781	10430546	.	-	.	gene_id lnc-TFAP2A-2 ; transcript_id lnc-TFAP2A-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000183674 ; gene_alias_2 XLOC_005602 ; gene_alias_3 linc-TFAP2A-2 ; gene_alias_4 RP1-290I10.8 ; gene_alias_5 ENSG00000183674.7 ; gene_alias_6 LINC00518 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000159175.1 ; transcript_alias_1 ENST00000487130 ; transcript_alias_2 TCONS_00011447 ; transcript_alias_3 ENST00000487130.1 ; transcript_alias_4 LINC00518-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000353700.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT107685 ;
chr6	lncipedia.org	exon	10434875	10435107	.	-	.	gene_id lnc-TFAP2A-2 ; transcript_id lnc-TFAP2A-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000183674 ; gene_alias_2 XLOC_005602 ; gene_alias_3 linc-TFAP2A-2 ; gene_alias_4 RP1-290I10.8 ; gene_alias_5 ENSG00000183674.7 ; gene_alias_6 LINC00518 ; gene_alias_7 OTTHUMG00000159175.1 ; transcript_alias_1 ENST00000487130 ; transcript_alias_2 TCONS_00011447 ; transcript_alias_3 ENST00000487130.1 ; transcript_alias_4 LINC00518-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000353700.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT107685 ;
chr7	lncipedia.org	exon	149564786	149566947	.	-	.	gene_id lnc-ZNF467-1 ; transcript_id lnc-ZNF467-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000204934 ; gene_alias_2 RP4-751H13.6 ; gene_alias_3 ENSG00000204934.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158095.1 ; gene_alias_5 ATP6V0E2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000488315 ; transcript_alias_2 ENST00000488315.1 ; transcript_alias_3 RP4-751H13.6-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350181.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT124074 ;
chr7	lncipedia.org	exon	149568731	149568885	.	-	.	gene_id lnc-ZNF467-1 ; transcript_id lnc-ZNF467-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000204934 ; gene_alias_2 RP4-751H13.6 ; gene_alias_3 ENSG00000204934.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158095.1 ; gene_alias_5 ATP6V0E2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000488315 ; transcript_alias_2 ENST00000488315.1 ; transcript_alias_3 RP4-751H13.6-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350181.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT124074 ;
chr7	lncipedia.org	exon	149570313	149570931	.	-	.	gene_id lnc-ZNF467-1 ; transcript_id lnc-ZNF467-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000204934 ; gene_alias_2 RP4-751H13.6 ; gene_alias_3 ENSG00000204934.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158095.1 ; gene_alias_5 ATP6V0E2-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000488315 ; transcript_alias_2 ENST00000488315.1 ; transcript_alias_3 RP4-751H13.6-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000350181.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT124074 ;
chr11	lncipedia.org	exon	112830002	112831574	.	-	.	gene_id lnc-DRD2-3 ; transcript_id lnc-DRD2-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247416 ; gene_alias_2 RP11-629G13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247416.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167662.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500537 ; transcript_alias_2 ENST00000500537.2 ; transcript_alias_3 RP11-629G13.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000395469.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT024227 ;
chr11	lncipedia.org	exon	112832089	112832198	.	-	.	gene_id lnc-DRD2-3 ; transcript_id lnc-DRD2-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247416 ; gene_alias_2 RP11-629G13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247416.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167662.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500537 ; transcript_alias_2 ENST00000500537.2 ; transcript_alias_3 RP11-629G13.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000395469.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT024227 ;
chr11	lncipedia.org	exon	112833932	112834182	.	-	.	gene_id lnc-DRD2-3 ; transcript_id lnc-DRD2-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247416 ; gene_alias_2 RP11-629G13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247416.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167662.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500537 ; transcript_alias_2 ENST00000500537.2 ; transcript_alias_3 RP11-629G13.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000395469.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT024227 ;
chr8	lncipedia.org	exon	125957254	125957293	.	+	.	gene_id lnc-ZNF572-1 ; transcript_id lnc-ZNF572-1:17 ; gene_alias_1 ENSG00000249816 ; gene_alias_2 ENSG00000249816.2 ; gene_alias_3 RP11-6D1.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165101.1 ; gene_alias_5 LINC00964 ; transcript_alias_1 ENST00000532713 ; transcript_alias_2 ENST00000532713.1 ; transcript_alias_3 RP11-6D1.6-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381826.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128946 ;
chr8	lncipedia.org	exon	125957880	125957988	.	+	.	gene_id lnc-ZNF572-1 ; transcript_id lnc-ZNF572-1:17 ; gene_alias_1 ENSG00000249816 ; gene_alias_2 ENSG00000249816.2 ; gene_alias_3 RP11-6D1.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165101.1 ; gene_alias_5 LINC00964 ; transcript_alias_1 ENST00000532713 ; transcript_alias_2 ENST00000532713.1 ; transcript_alias_3 RP11-6D1.6-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381826.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128946 ;
chr8	lncipedia.org	exon	125958297	125958401	.	+	.	gene_id lnc-ZNF572-1 ; transcript_id lnc-ZNF572-1:17 ; gene_alias_1 ENSG00000249816 ; gene_alias_2 ENSG00000249816.2 ; gene_alias_3 RP11-6D1.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165101.1 ; gene_alias_5 LINC00964 ; transcript_alias_1 ENST00000532713 ; transcript_alias_2 ENST00000532713.1 ; transcript_alias_3 RP11-6D1.6-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381826.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128946 ;
chr8	lncipedia.org	exon	125963058	125963338	.	+	.	gene_id lnc-ZNF572-1 ; transcript_id lnc-ZNF572-1:17 ; gene_alias_1 ENSG00000249816 ; gene_alias_2 ENSG00000249816.2 ; gene_alias_3 RP11-6D1.6 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165101.1 ; gene_alias_5 LINC00964 ; transcript_alias_1 ENST00000532713 ; transcript_alias_2 ENST00000532713.1 ; transcript_alias_3 RP11-6D1.6-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381826.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT128946 ;
chr17	lncipedia.org	exon	75554224	75556678	.	+	.	gene_id lnc-SEPT9-3 ; transcript_id lnc-SEPT9-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249845 ; gene_alias_2 XLOC_012317 ; gene_alias_3 linc-TNRC6C-3 ; transcript_alias_1 ENST00000510484 ; transcript_alias_2 TCONS_00025200 ;
chr17	lncipedia.org	exon	75556778	75556925	.	+	.	gene_id lnc-SEPT9-3 ; transcript_id lnc-SEPT9-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249845 ; gene_alias_2 XLOC_012317 ; gene_alias_3 linc-TNRC6C-3 ; transcript_alias_1 ENST00000510484 ; transcript_alias_2 TCONS_00025200 ;
chr17	lncipedia.org	exon	75557027	75558813	.	+	.	gene_id lnc-SEPT9-3 ; transcript_id lnc-SEPT9-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249845 ; gene_alias_2 XLOC_012317 ; gene_alias_3 linc-TNRC6C-3 ; transcript_alias_1 ENST00000510484 ; transcript_alias_2 TCONS_00025200 ;
chr17	lncipedia.org	exon	75558983	75559074	.	+	.	gene_id lnc-SEPT9-3 ; transcript_id lnc-SEPT9-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000249845 ; gene_alias_2 XLOC_012317 ; gene_alias_3 linc-TNRC6C-3 ; transcript_alias_1 ENST00000510484 ; transcript_alias_2 TCONS_00025200 ;
chr5	lncipedia.org	exon	88261692	88261732	.	+	.	gene_id lnc-RASA1-7 ; transcript_id lnc-RASA1-7:13 ; gene_alias_1 ENSG00000248309 ; gene_alias_2 CTC-454M9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248309.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162630.2 ; gene_alias_5 MEF2C-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000514571 ; transcript_alias_2 ENST00000514571.1 ; transcript_alias_3 CTC-454M9.1-012 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000370012.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102709 ;
chr5	lncipedia.org	exon	88390776	88390846	.	+	.	gene_id lnc-RASA1-7 ; transcript_id lnc-RASA1-7:13 ; gene_alias_1 ENSG00000248309 ; gene_alias_2 CTC-454M9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248309.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162630.2 ; gene_alias_5 MEF2C-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000514571 ; transcript_alias_2 ENST00000514571.1 ; transcript_alias_3 CTC-454M9.1-012 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000370012.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102709 ;
chr5	lncipedia.org	exon	88446350	88446412	.	+	.	gene_id lnc-RASA1-7 ; transcript_id lnc-RASA1-7:13 ; gene_alias_1 ENSG00000248309 ; gene_alias_2 CTC-454M9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248309.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162630.2 ; gene_alias_5 MEF2C-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000514571 ; transcript_alias_2 ENST00000514571.1 ; transcript_alias_3 CTC-454M9.1-012 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000370012.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102709 ;
chr5	lncipedia.org	exon	88464067	88464485	.	+	.	gene_id lnc-RASA1-7 ; transcript_id lnc-RASA1-7:13 ; gene_alias_1 ENSG00000248309 ; gene_alias_2 CTC-454M9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248309.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162630.2 ; gene_alias_5 MEF2C-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000514571 ; transcript_alias_2 ENST00000514571.1 ; transcript_alias_3 CTC-454M9.1-012 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000370012.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102709 ;
chr12	lncipedia.org	exon	15304857	15305004	.	+	.	gene_id lnc-PTPRO-1 ; transcript_id lnc-PTPRO-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255660 ; gene_alias_2 RERG-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000255660.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168747.1 ; transcript_alias_1 ENST00000541243 ; transcript_alias_2 ENST00000541243.1 ; transcript_alias_3 RERG-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000400893.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027110 ;
chr12	lncipedia.org	exon	15307174	15307274	.	+	.	gene_id lnc-PTPRO-1 ; transcript_id lnc-PTPRO-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255660 ; gene_alias_2 RERG-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000255660.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168747.1 ; transcript_alias_1 ENST00000541243 ; transcript_alias_2 ENST00000541243.1 ; transcript_alias_3 RERG-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000400893.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027110 ;
chr12	lncipedia.org	exon	15308130	15308217	.	+	.	gene_id lnc-PTPRO-1 ; transcript_id lnc-PTPRO-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000255660 ; gene_alias_2 RERG-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000255660.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168747.1 ; transcript_alias_1 ENST00000541243 ; transcript_alias_2 ENST00000541243.1 ; transcript_alias_3 RERG-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000400893.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027110 ;
chr20	lncipedia.org	exon	21106648	21106845	.	+	.	gene_id lnc-XRN2-2 ; transcript_id lnc-XRN2-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000088970 ; gene_alias_2 PLK1S1 ; gene_alias_3 ENSG00000088970.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032020.2 ; gene_alias_5 ENSG00000088970.11 ; transcript_alias_1 ENST00000445992 ; transcript_alias_2 ENST00000445992.1 ; transcript_alias_3 PLK1S1-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000078268.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT147157 ;
chr20	lncipedia.org	exon	21112738	21112800	.	+	.	gene_id lnc-XRN2-2 ; transcript_id lnc-XRN2-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000088970 ; gene_alias_2 PLK1S1 ; gene_alias_3 ENSG00000088970.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032020.2 ; gene_alias_5 ENSG00000088970.11 ; transcript_alias_1 ENST00000445992 ; transcript_alias_2 ENST00000445992.1 ; transcript_alias_3 PLK1S1-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000078268.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT147157 ;
chr20	lncipedia.org	exon	21126206	21126295	.	+	.	gene_id lnc-XRN2-2 ; transcript_id lnc-XRN2-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000088970 ; gene_alias_2 PLK1S1 ; gene_alias_3 ENSG00000088970.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032020.2 ; gene_alias_5 ENSG00000088970.11 ; transcript_alias_1 ENST00000445992 ; transcript_alias_2 ENST00000445992.1 ; transcript_alias_3 PLK1S1-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000078268.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT147157 ;
chr20	lncipedia.org	exon	21142512	21143148	.	+	.	gene_id lnc-XRN2-2 ; transcript_id lnc-XRN2-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000088970 ; gene_alias_2 PLK1S1 ; gene_alias_3 ENSG00000088970.10 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032020.2 ; gene_alias_5 ENSG00000088970.11 ; transcript_alias_1 ENST00000445992 ; transcript_alias_2 ENST00000445992.1 ; transcript_alias_3 PLK1S1-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000078268.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT147157 ;
chr7	lncipedia.org	exon	77313260	77313650	.	-	.	gene_id lnc-TMEM60-1 ; transcript_id lnc-TMEM60-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000214293 ; gene_alias_2 AC090421.1 ; gene_alias_3 ENSG00000214293.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162596.1 ; gene_alias_5 RSBN1L-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000416650 ; transcript_alias_2 ENST00000416650.1 ; transcript_alias_3 AC090421.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000340794.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT121675 ;
chr7	lncipedia.org	exon	77314519	77314645	.	-	.	gene_id lnc-TMEM60-1 ; transcript_id lnc-TMEM60-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000214293 ; gene_alias_2 AC090421.1 ; gene_alias_3 ENSG00000214293.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162596.1 ; gene_alias_5 RSBN1L-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000416650 ; transcript_alias_2 ENST00000416650.1 ; transcript_alias_3 AC090421.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000340794.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT121675 ;
chr7	lncipedia.org	exon	77325489	77325579	.	-	.	gene_id lnc-TMEM60-1 ; transcript_id lnc-TMEM60-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000214293 ; gene_alias_2 AC090421.1 ; gene_alias_3 ENSG00000214293.4 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162596.1 ; gene_alias_5 RSBN1L-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000416650 ; transcript_alias_2 ENST00000416650.1 ; transcript_alias_3 AC090421.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000340794.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT121675 ;
chr2	lncipedia.org	exon	28371422	28373107	.	-	.	gene_id lnc-RBKS-1 ; transcript_id lnc-RBKS-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250468 ; transcript_alias_1 ENST00000506391 ;
chr2	lncipedia.org	exon	28374043	28374136	.	-	.	gene_id lnc-RBKS-1 ; transcript_id lnc-RBKS-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250468 ; transcript_alias_1 ENST00000506391 ;
chr2	lncipedia.org	exon	28429351	28429830	.	-	.	gene_id lnc-RBKS-1 ; transcript_id lnc-RBKS-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250468 ; transcript_alias_1 ENST00000506391 ;
chr10	lncipedia.org	exon	119806335	119806614	.	+	.	gene_id lnc-EMX2-4 ; transcript_id lnc-EMX2-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000177640 ; gene_alias_2 CASC2 ; gene_alias_3 ENSG00000177640.11 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000019127.5 ; transcript_alias_1 ENST00000435944 ; transcript_alias_2 ENST00000435944.1 ; transcript_alias_3 CASC2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000050577.4 ;
chr10	lncipedia.org	exon	119809023	119809128	.	+	.	gene_id lnc-EMX2-4 ; transcript_id lnc-EMX2-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000177640 ; gene_alias_2 CASC2 ; gene_alias_3 ENSG00000177640.11 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000019127.5 ; transcript_alias_1 ENST00000435944 ; transcript_alias_2 ENST00000435944.1 ; transcript_alias_3 CASC2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000050577.4 ;
chr10	lncipedia.org	exon	119811642	119811707	.	+	.	gene_id lnc-EMX2-4 ; transcript_id lnc-EMX2-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000177640 ; gene_alias_2 CASC2 ; gene_alias_3 ENSG00000177640.11 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000019127.5 ; transcript_alias_1 ENST00000435944 ; transcript_alias_2 ENST00000435944.1 ; transcript_alias_3 CASC2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000050577.4 ;
chr10	lncipedia.org	exon	119966034	119966133	.	+	.	gene_id lnc-EMX2-4 ; transcript_id lnc-EMX2-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000177640 ; gene_alias_2 CASC2 ; gene_alias_3 ENSG00000177640.11 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000019127.5 ; transcript_alias_1 ENST00000435944 ; transcript_alias_2 ENST00000435944.1 ; transcript_alias_3 CASC2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000050577.4 ;
chr10	lncipedia.org	exon	119966948	119969663	.	+	.	gene_id lnc-EMX2-4 ; transcript_id lnc-EMX2-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000177640 ; gene_alias_2 CASC2 ; gene_alias_3 ENSG00000177640.11 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000019127.5 ; transcript_alias_1 ENST00000435944 ; transcript_alias_2 ENST00000435944.1 ; transcript_alias_3 CASC2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000050577.4 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114317139	114317224	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:11 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000519270 ; transcript_alias_2 ENST00000519270.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379765.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114596 ;
chr6	lncipedia.org	exon	114379795	114380952	.	+	.	gene_id lnc-MARCKS-5 ; transcript_id lnc-MARCKS-5:11 ; gene_alias_1 ENSG00000228624 ; gene_alias_2 RP3-399L15.3 ; gene_alias_3 ENSG00000228624.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000164691.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228624.3 ; transcript_alias_1 ENST00000519270 ; transcript_alias_2 ENST00000519270.1 ; transcript_alias_3 RP3-399L15.3-009 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000379765.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT114596 ;
chr17	lncipedia.org	exon	4383675	4383809	.	-	.	gene_id lnc-MYBBP1A-2 ; transcript_id lnc-MYBBP1A-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247652 ; transcript_alias_1 ENST00000500040 ;
chr17	lncipedia.org	exon	4384324	4385884	.	-	.	gene_id lnc-MYBBP1A-2 ; transcript_id lnc-MYBBP1A-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247652 ; transcript_alias_1 ENST00000500040 ;
chr17	lncipedia.org	exon	4389419	4389747	.	-	.	gene_id lnc-MYBBP1A-2 ; transcript_id lnc-MYBBP1A-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247652 ; transcript_alias_1 ENST00000500040 ;
chr3	lncipedia.org	exon	156799630	156800707	.	+	.	gene_id lnc-LEKR1-1 ; transcript_id lnc-LEKR1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000241544 ; gene_alias_2 XLOC_002891 ; gene_alias_3 linc-PTX3-5 ; gene_alias_4 RP11-6F2.5 ; gene_alias_5 ENSG00000241544.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000158714.1 ; transcript_alias_1 ENST00000469196 ; transcript_alias_2 TCONS_00005633 ; transcript_alias_3 ENST00000469196.1 ; transcript_alias_4 RP11-6F2.5-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000351883.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT092879 ;
chr3	lncipedia.org	exon	156805648	156805805	.	+	.	gene_id lnc-LEKR1-1 ; transcript_id lnc-LEKR1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000241544 ; gene_alias_2 XLOC_002891 ; gene_alias_3 linc-PTX3-5 ; gene_alias_4 RP11-6F2.5 ; gene_alias_5 ENSG00000241544.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000158714.1 ; transcript_alias_1 ENST00000469196 ; transcript_alias_2 TCONS_00005633 ; transcript_alias_3 ENST00000469196.1 ; transcript_alias_4 RP11-6F2.5-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000351883.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT092879 ;
chr3	lncipedia.org	exon	156806076	156806336	.	+	.	gene_id lnc-LEKR1-1 ; transcript_id lnc-LEKR1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000241544 ; gene_alias_2 XLOC_002891 ; gene_alias_3 linc-PTX3-5 ; gene_alias_4 RP11-6F2.5 ; gene_alias_5 ENSG00000241544.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000158714.1 ; transcript_alias_1 ENST00000469196 ; transcript_alias_2 TCONS_00005633 ; transcript_alias_3 ENST00000469196.1 ; transcript_alias_4 RP11-6F2.5-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000351883.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT092879 ;
chr5	lncipedia.org	exon	137368463	137368641	.	+	.	gene_id lnc-WNT8A-2 ; transcript_id lnc-WNT8A-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246323 ; gene_alias_2 RP11-325L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246323.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163222.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500267 ; transcript_alias_2 ENST00000500267.2 ; transcript_alias_3 RP11-325L7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000372158.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT103999 ;
chr5	lncipedia.org	exon	137371882	137372955	.	+	.	gene_id lnc-WNT8A-2 ; transcript_id lnc-WNT8A-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246323 ; gene_alias_2 RP11-325L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246323.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000163222.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500267 ; transcript_alias_2 ENST00000500267.2 ; transcript_alias_3 RP11-325L7.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000372158.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT103999 ;
chr9	lncipedia.org	exon	132264269	132264491	.	+	.	gene_id lnc-METTL11A-3 ; transcript_id lnc-METTL11A-3:9 ; gene_alias_1 ENSG00000239353 ; gene_alias_2 RP11-492E3.51 ; gene_alias_3 ENSG00000239353.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000046208.1 ; transcript_alias_1 ENST00000427778 ; transcript_alias_2 ENST00000427778.1 ; transcript_alias_3 RP11-492E3.51-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000106525.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT135086 ;
chr9	lncipedia.org	exon	132275807	132275965	.	+	.	gene_id lnc-METTL11A-3 ; transcript_id lnc-METTL11A-3:9 ; gene_alias_1 ENSG00000239353 ; gene_alias_2 RP11-492E3.51 ; gene_alias_3 ENSG00000239353.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000046208.1 ; transcript_alias_1 ENST00000427778 ; transcript_alias_2 ENST00000427778.1 ; transcript_alias_3 RP11-492E3.51-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000106525.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT135086 ;
chr2	lncipedia.org	exon	61159963	61161931	.	+	.	gene_id lnc-REL-1 ; transcript_id lnc-REL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245247 ; gene_alias_2 XLOC_001489 ; gene_alias_3 linc-PEX13 ; transcript_alias_1 ENST00000501118 ; transcript_alias_2 TCONS_00002901 ; transcript_alias_3 NONHSAT070917 ;
chr2	lncipedia.org	exon	61162609	61163467	.	+	.	gene_id lnc-REL-1 ; transcript_id lnc-REL-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245247 ; gene_alias_2 XLOC_001489 ; gene_alias_3 linc-PEX13 ; transcript_alias_1 ENST00000501118 ; transcript_alias_2 TCONS_00002901 ; transcript_alias_3 NONHSAT070917 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47599724	47599928	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000552975 ; transcript_alias_2 ENST00000552975.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405095.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027906 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47609948	47610047	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000552975 ; transcript_alias_2 ENST00000552975.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405095.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027906 ;
chr12	lncipedia.org	exon	47610167	47610239	.	-	.	gene_id lnc-AMIGO2-1 ; transcript_id lnc-AMIGO2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247774 ; gene_alias_2 RP11-493L12.2 ; gene_alias_3 ENSG00000247774.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169619.1 ; gene_alias_5 PCED1B-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000552975 ; transcript_alias_2 ENST00000552975.1 ; transcript_alias_3 RP11-493L12.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405095.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027906 ;
chr8	lncipedia.org	exon	70755534	70755632	.	+	.	gene_id lnc-SULF1-3 ; transcript_id lnc-SULF1-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000246528 ; gene_alias_2 RP11-159H10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000246528.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165122.2 ; gene_alias_5 ENSG00000246528.3 ; transcript_alias_1 ENST00000530194 ; transcript_alias_2 ENST00000530194.1 ; transcript_alias_3 RP11-159H10.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000382015.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127143 ;
chr8	lncipedia.org	exon	70762372	70762544	.	+	.	gene_id lnc-SULF1-3 ; transcript_id lnc-SULF1-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000246528 ; gene_alias_2 RP11-159H10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000246528.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165122.2 ; gene_alias_5 ENSG00000246528.3 ; transcript_alias_1 ENST00000530194 ; transcript_alias_2 ENST00000530194.1 ; transcript_alias_3 RP11-159H10.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000382015.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127143 ;
chr8	lncipedia.org	exon	70766907	70767206	.	+	.	gene_id lnc-SULF1-3 ; transcript_id lnc-SULF1-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000246528 ; gene_alias_2 RP11-159H10.3 ; gene_alias_3 ENSG00000246528.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165122.2 ; gene_alias_5 ENSG00000246528.3 ; transcript_alias_1 ENST00000530194 ; transcript_alias_2 ENST00000530194.1 ; transcript_alias_3 RP11-159H10.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000382015.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT127143 ;
chr17	lncipedia.org	exon	16220016	16221006	.	-	.	gene_id lnc-CENPV-1 ; transcript_id lnc-CENPV-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250690 ; transcript_alias_1 ENST00000504164 ;
chr17	lncipedia.org	exon	16253943	16255093	.	-	.	gene_id lnc-CENPV-1 ; transcript_id lnc-CENPV-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250690 ; transcript_alias_1 ENST00000504164 ;
chr20	lncipedia.org	exon	10084993	10085042	.	-	.	gene_id lnc-MKKS-3 ; transcript_id lnc-MKKS-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000227906 ; gene_alias_2 RP5-839B4.7 ; gene_alias_3 ENSG00000227906.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031867.1 ; gene_alias_5 ENSG00000227906.3 ; gene_alias_6 SNAP25-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000453544 ; transcript_alias_2 ENST00000453544.1 ; transcript_alias_3 RP5-839B4.7-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000077987.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT078578 ;
chr20	lncipedia.org	exon	10177466	10177585	.	-	.	gene_id lnc-MKKS-3 ; transcript_id lnc-MKKS-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000227906 ; gene_alias_2 RP5-839B4.7 ; gene_alias_3 ENSG00000227906.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031867.1 ; gene_alias_5 ENSG00000227906.3 ; gene_alias_6 SNAP25-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000453544 ; transcript_alias_2 ENST00000453544.1 ; transcript_alias_3 RP5-839B4.7-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000077987.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT078578 ;
chr20	lncipedia.org	exon	10212132	10212267	.	-	.	gene_id lnc-MKKS-3 ; transcript_id lnc-MKKS-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000227906 ; gene_alias_2 RP5-839B4.7 ; gene_alias_3 ENSG00000227906.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031867.1 ; gene_alias_5 ENSG00000227906.3 ; gene_alias_6 SNAP25-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000453544 ; transcript_alias_2 ENST00000453544.1 ; transcript_alias_3 RP5-839B4.7-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000077987.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT078578 ;
chr20	lncipedia.org	exon	10349363	10349424	.	-	.	gene_id lnc-MKKS-3 ; transcript_id lnc-MKKS-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000227906 ; gene_alias_2 RP5-839B4.7 ; gene_alias_3 ENSG00000227906.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031867.1 ; gene_alias_5 ENSG00000227906.3 ; gene_alias_6 SNAP25-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000453544 ; transcript_alias_2 ENST00000453544.1 ; transcript_alias_3 RP5-839B4.7-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000077987.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT078578 ;
chr8	lncipedia.org	exon	607192	608212	.	+	.	gene_id lnc-FBXO25-2 ; transcript_id lnc-FBXO25-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244964 ; transcript_alias_1 ENST00000499740 ;
chr8	lncipedia.org	exon	609383	611619	.	+	.	gene_id lnc-FBXO25-2 ; transcript_id lnc-FBXO25-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000244964 ; transcript_alias_1 ENST00000499740 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126443234	126443498	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-3 ; transcript_id lnc-DHX37-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249267 ; gene_alias_2 RP5-916L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000249267.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168492.1 ; gene_alias_5 LINC00939 ; transcript_alias_1 ENST00000545784 ; transcript_alias_2 ENST00000545784.1 ; transcript_alias_3 RP5-916L7.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399907.1 ; transcript_alias_5 NR_034132 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126446288	126446527	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-3 ; transcript_id lnc-DHX37-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249267 ; gene_alias_2 RP5-916L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000249267.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168492.1 ; gene_alias_5 LINC00939 ; transcript_alias_1 ENST00000545784 ; transcript_alias_2 ENST00000545784.1 ; transcript_alias_3 RP5-916L7.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399907.1 ; transcript_alias_5 NR_034132 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126447557	126447629	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-3 ; transcript_id lnc-DHX37-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249267 ; gene_alias_2 RP5-916L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000249267.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168492.1 ; gene_alias_5 LINC00939 ; transcript_alias_1 ENST00000545784 ; transcript_alias_2 ENST00000545784.1 ; transcript_alias_3 RP5-916L7.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399907.1 ; transcript_alias_5 NR_034132 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126450746	126451888	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-3 ; transcript_id lnc-DHX37-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249267 ; gene_alias_2 RP5-916L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000249267.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168492.1 ; gene_alias_5 LINC00939 ; transcript_alias_1 ENST00000545784 ; transcript_alias_2 ENST00000545784.1 ; transcript_alias_3 RP5-916L7.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399907.1 ; transcript_alias_5 NR_034132 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126454357	126454542	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-3 ; transcript_id lnc-DHX37-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249267 ; gene_alias_2 RP5-916L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000249267.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168492.1 ; gene_alias_5 LINC00939 ; transcript_alias_1 ENST00000545784 ; transcript_alias_2 ENST00000545784.1 ; transcript_alias_3 RP5-916L7.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399907.1 ; transcript_alias_5 NR_034132 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126467750	126467920	.	-	.	gene_id lnc-DHX37-3 ; transcript_id lnc-DHX37-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249267 ; gene_alias_2 RP5-916L7.1 ; gene_alias_3 ENSG00000249267.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168492.1 ; gene_alias_5 LINC00939 ; transcript_alias_1 ENST00000545784 ; transcript_alias_2 ENST00000545784.1 ; transcript_alias_3 RP5-916L7.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399907.1 ; transcript_alias_5 NR_034132 ;
chr8	lncipedia.org	exon	12452490	12452805	.	-	.	gene_id lnc-LONRF1-2 ; transcript_id lnc-LONRF1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000247397 ; gene_alias_2 AC068587.3 ; transcript_alias_1 ENST00000500410 ; transcript_alias_2 NONHSAT125166 ;
chr8	lncipedia.org	exon	12453527	12453682	.	-	.	gene_id lnc-LONRF1-2 ; transcript_id lnc-LONRF1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000247397 ; gene_alias_2 AC068587.3 ; transcript_alias_1 ENST00000500410 ; transcript_alias_2 NONHSAT125166 ;
chr8	lncipedia.org	exon	12454070	12454228	.	-	.	gene_id lnc-LONRF1-2 ; transcript_id lnc-LONRF1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000247397 ; gene_alias_2 AC068587.3 ; transcript_alias_1 ENST00000500410 ; transcript_alias_2 NONHSAT125166 ;
chr8	lncipedia.org	exon	12455144	12455546	.	-	.	gene_id lnc-LONRF1-2 ; transcript_id lnc-LONRF1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000247397 ; gene_alias_2 AC068587.3 ; transcript_alias_1 ENST00000500410 ; transcript_alias_2 NONHSAT125166 ;
chr8	lncipedia.org	exon	12513484	12514228	.	-	.	gene_id lnc-LONRF1-2 ; transcript_id lnc-LONRF1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000247397 ; gene_alias_2 AC068587.3 ; transcript_alias_1 ENST00000500410 ; transcript_alias_2 NONHSAT125166 ;
chr8	lncipedia.org	exon	12516639	12516880	.	-	.	gene_id lnc-LONRF1-2 ; transcript_id lnc-LONRF1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000247397 ; gene_alias_2 AC068587.3 ; transcript_alias_1 ENST00000500410 ; transcript_alias_2 NONHSAT125166 ;
chr8	lncipedia.org	exon	12517271	12517338	.	-	.	gene_id lnc-LONRF1-2 ; transcript_id lnc-LONRF1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000247397 ; gene_alias_2 AC068587.3 ; transcript_alias_1 ENST00000500410 ; transcript_alias_2 NONHSAT125166 ;
chr8	lncipedia.org	exon	12522787	12522859	.	-	.	gene_id lnc-LONRF1-2 ; transcript_id lnc-LONRF1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000247397 ; gene_alias_2 AC068587.3 ; transcript_alias_1 ENST00000500410 ; transcript_alias_2 NONHSAT125166 ;
chr2	lncipedia.org	exon	24281863	24282964	.	+	.	gene_id lnc-AC008073.6.1-1 ; transcript_id lnc-AC008073.6.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248732 ; transcript_alias_1 ENST00000513229 ;
chr2	lncipedia.org	exon	24284274	24284864	.	+	.	gene_id lnc-AC008073.6.1-1 ; transcript_id lnc-AC008073.6.1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248732 ; transcript_alias_1 ENST00000513229 ;
chr11	lncipedia.org	exon	58897606	58897773	.	-	.	gene_id lnc-MPEG1-2 ; transcript_id lnc-MPEG1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000245571 ; gene_alias_2 AP001258.4 ; gene_alias_3 ENSG00000245571.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167435.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501817 ; transcript_alias_2 ENST00000501817.2 ; transcript_alias_3 AP001258.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000394606.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT021501 ;
chr11	lncipedia.org	exon	58901697	58903061	.	-	.	gene_id lnc-MPEG1-2 ; transcript_id lnc-MPEG1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000245571 ; gene_alias_2 AP001258.4 ; gene_alias_3 ENSG00000245571.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167435.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501817 ; transcript_alias_2 ENST00000501817.2 ; transcript_alias_3 AP001258.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000394606.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT021501 ;
chr11	lncipedia.org	exon	58903530	58903754	.	-	.	gene_id lnc-MPEG1-2 ; transcript_id lnc-MPEG1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000245571 ; gene_alias_2 AP001258.4 ; gene_alias_3 ENSG00000245571.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167435.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501817 ; transcript_alias_2 ENST00000501817.2 ; transcript_alias_3 AP001258.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000394606.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT021501 ;
chr11	lncipedia.org	exon	58907430	58907640	.	-	.	gene_id lnc-MPEG1-2 ; transcript_id lnc-MPEG1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000245571 ; gene_alias_2 AP001258.4 ; gene_alias_3 ENSG00000245571.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167435.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501817 ; transcript_alias_2 ENST00000501817.2 ; transcript_alias_3 AP001258.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000394606.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT021501 ;
chr11	lncipedia.org	exon	58910088	58910228	.	-	.	gene_id lnc-MPEG1-2 ; transcript_id lnc-MPEG1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000245571 ; gene_alias_2 AP001258.4 ; gene_alias_3 ENSG00000245571.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167435.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501817 ; transcript_alias_2 ENST00000501817.2 ; transcript_alias_3 AP001258.4-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000394606.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT021501 ;
chr19	lncipedia.org	exon	15524893	15525331	.	+	.	gene_id lnc-CYP4F22-1 ; transcript_id lnc-CYP4F22-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247638 ; transcript_alias_1 ENST00000421670 ;
chr19	lncipedia.org	exon	15526732	15527617	.	+	.	gene_id lnc-CYP4F22-1 ; transcript_id lnc-CYP4F22-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247638 ; transcript_alias_1 ENST00000421670 ;
chr6	lncipedia.org	exon	111804815	111804868	.	+	.	gene_id lnc-KIAA1919-3 ; transcript_id lnc-KIAA1919-3:8 ; gene_alias_1 ENSG00000231889 ; gene_alias_2 TRAF3IP2-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000231889.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015378.2 ; gene_alias_5 ENSG00000231889.3 ; transcript_alias_1 ENST00000456352 ; transcript_alias_2 ENST00000456352.2 ; transcript_alias_3 TRAF3IP2-AS1-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000041840.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT114473 ;
chr6	lncipedia.org	exon	111895824	111895861	.	+	.	gene_id lnc-KIAA1919-3 ; transcript_id lnc-KIAA1919-3:8 ; gene_alias_1 ENSG00000231889 ; gene_alias_2 TRAF3IP2-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000231889.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015378.2 ; gene_alias_5 ENSG00000231889.3 ; transcript_alias_1 ENST00000456352 ; transcript_alias_2 ENST00000456352.2 ; transcript_alias_3 TRAF3IP2-AS1-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000041840.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT114473 ;
chr6	lncipedia.org	exon	111897565	111897956	.	+	.	gene_id lnc-KIAA1919-3 ; transcript_id lnc-KIAA1919-3:8 ; gene_alias_1 ENSG00000231889 ; gene_alias_2 TRAF3IP2-AS1 ; gene_alias_3 ENSG00000231889.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015378.2 ; gene_alias_5 ENSG00000231889.3 ; transcript_alias_1 ENST00000456352 ; transcript_alias_2 ENST00000456352.2 ; transcript_alias_3 TRAF3IP2-AS1-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000041840.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT114473 ;
chr10	lncipedia.org	exon	29941944	29942409	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1462-2 ; transcript_id lnc-KIAA1462-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250659 ; transcript_alias_1 ENST00000502624 ;
chr10	lncipedia.org	exon	29962389	29964348	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1462-2 ; transcript_id lnc-KIAA1462-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250659 ; transcript_alias_1 ENST00000502624 ;
chr10	lncipedia.org	exon	30190540	30190584	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1462-2 ; transcript_id lnc-KIAA1462-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250659 ; transcript_alias_1 ENST00000502624 ;
chr10	lncipedia.org	exon	30543637	30543666	.	-	.	gene_id lnc-KIAA1462-2 ; transcript_id lnc-KIAA1462-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250659 ; transcript_alias_1 ENST00000502624 ;
chr11	lncipedia.org	exon	67654061	67654160	.	+	.	gene_id lnc-NDUFS8-2 ; transcript_id lnc-NDUFS8-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000251637 ; gene_alias_2 RP11-119D9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251637.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167223.1 ; transcript_alias_1 ENST00000533670 ; transcript_alias_2 ENST00000533670.1 ; transcript_alias_3 RP11-119D9.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393801.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT022479 ;
chr11	lncipedia.org	exon	67655624	67655795	.	+	.	gene_id lnc-NDUFS8-2 ; transcript_id lnc-NDUFS8-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000251637 ; gene_alias_2 RP11-119D9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251637.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167223.1 ; transcript_alias_1 ENST00000533670 ; transcript_alias_2 ENST00000533670.1 ; transcript_alias_3 RP11-119D9.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393801.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT022479 ;
chr11	lncipedia.org	exon	67673481	67673821	.	+	.	gene_id lnc-NDUFS8-2 ; transcript_id lnc-NDUFS8-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000251637 ; gene_alias_2 RP11-119D9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000251637.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167223.1 ; transcript_alias_1 ENST00000533670 ; transcript_alias_2 ENST00000533670.1 ; transcript_alias_3 RP11-119D9.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000393801.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT022479 ;
chr14	lncipedia.org	exon	22849969	22850077	.	-	.	gene_id lnc-DAD1-2 ; transcript_id lnc-DAD1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000251002 ; gene_alias_2 AE000661.37 ; gene_alias_3 ENSG00000251002.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168895.2 ; transcript_alias_1 ENST00000541008 ; transcript_alias_2 ENST00000541008.1 ; transcript_alias_3 AE000661.37-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401532.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT035767 ;
chr14	lncipedia.org	exon	22850247	22850383	.	-	.	gene_id lnc-DAD1-2 ; transcript_id lnc-DAD1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000251002 ; gene_alias_2 AE000661.37 ; gene_alias_3 ENSG00000251002.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168895.2 ; transcript_alias_1 ENST00000541008 ; transcript_alias_2 ENST00000541008.1 ; transcript_alias_3 AE000661.37-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401532.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT035767 ;
chr14	lncipedia.org	exon	22850754	22850808	.	-	.	gene_id lnc-DAD1-2 ; transcript_id lnc-DAD1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000251002 ; gene_alias_2 AE000661.37 ; gene_alias_3 ENSG00000251002.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168895.2 ; transcript_alias_1 ENST00000541008 ; transcript_alias_2 ENST00000541008.1 ; transcript_alias_3 AE000661.37-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401532.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT035767 ;
chr14	lncipedia.org	exon	22869445	22869575	.	-	.	gene_id lnc-DAD1-2 ; transcript_id lnc-DAD1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000251002 ; gene_alias_2 AE000661.37 ; gene_alias_3 ENSG00000251002.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168895.2 ; transcript_alias_1 ENST00000541008 ; transcript_alias_2 ENST00000541008.1 ; transcript_alias_3 AE000661.37-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401532.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT035767 ;
chr14	lncipedia.org	exon	22872095	22872164	.	-	.	gene_id lnc-DAD1-2 ; transcript_id lnc-DAD1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000251002 ; gene_alias_2 AE000661.37 ; gene_alias_3 ENSG00000251002.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168895.2 ; transcript_alias_1 ENST00000541008 ; transcript_alias_2 ENST00000541008.1 ; transcript_alias_3 AE000661.37-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401532.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT035767 ;
chr14	lncipedia.org	exon	22901658	22901731	.	-	.	gene_id lnc-DAD1-2 ; transcript_id lnc-DAD1-2:3 ; gene_alias_1 ENSG00000251002 ; gene_alias_2 AE000661.37 ; gene_alias_3 ENSG00000251002.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168895.2 ; transcript_alias_1 ENST00000541008 ; transcript_alias_2 ENST00000541008.1 ; transcript_alias_3 AE000661.37-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000401532.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT035767 ;
chr7	lncipedia.org	exon	27160556	27160812	.	+	.	gene_id lnc-EVX1-10 ; transcript_id lnc-EVX1-10:5 ; gene_alias_1 ENSG00000253552 ; gene_alias_2 AC004080.12 ; gene_alias_3 ENSG00000253552.2 ; gene_alias_4 HOXA-AS2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000063274.3 ; gene_alias_6 ENSG00000253552.3 ; transcript_alias_1 ENST00000523364 ; transcript_alias_2 ENST00000523364.1 ; transcript_alias_3 HOXA-AS2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407127.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT119675 ;
chr7	lncipedia.org	exon	27161538	27162269	.	+	.	gene_id lnc-EVX1-10 ; transcript_id lnc-EVX1-10:5 ; gene_alias_1 ENSG00000253552 ; gene_alias_2 AC004080.12 ; gene_alias_3 ENSG00000253552.2 ; gene_alias_4 HOXA-AS2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000063274.3 ; gene_alias_6 ENSG00000253552.3 ; transcript_alias_1 ENST00000523364 ; transcript_alias_2 ENST00000523364.1 ; transcript_alias_3 HOXA-AS2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407127.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT119675 ;
chr9	lncipedia.org	exon	123607927	123608104	.	+	.	gene_id lnc-CNTRL-1 ; transcript_id lnc-CNTRL-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000226752 ; gene_alias_2 RP11-27I1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000226752.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020572.1 ; gene_alias_5 ENSG00000226752.3 ; gene_alias_6 PSMD5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000432640 ; transcript_alias_2 ENST00000432640.1 ; transcript_alias_3 RP11-27I1.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000053823.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT134528 ;
chr9	lncipedia.org	exon	123609572	123609631	.	+	.	gene_id lnc-CNTRL-1 ; transcript_id lnc-CNTRL-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000226752 ; gene_alias_2 RP11-27I1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000226752.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020572.1 ; gene_alias_5 ENSG00000226752.3 ; gene_alias_6 PSMD5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000432640 ; transcript_alias_2 ENST00000432640.1 ; transcript_alias_3 RP11-27I1.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000053823.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT134528 ;
chr9	lncipedia.org	exon	123613516	123613996	.	+	.	gene_id lnc-CNTRL-1 ; transcript_id lnc-CNTRL-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000226752 ; gene_alias_2 RP11-27I1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000226752.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020572.1 ; gene_alias_5 ENSG00000226752.3 ; gene_alias_6 PSMD5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000432640 ; transcript_alias_2 ENST00000432640.1 ; transcript_alias_3 RP11-27I1.2-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000053823.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT134528 ;
chr3	lncipedia.org	exon	195869507	195869871	.	+	.	gene_id lnc-AC069257.9.1-2 ; transcript_id lnc-AC069257.9.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224652 ; gene_alias_2 XLOC_003002 ; gene_alias_3 linc-OSTalpha-1 ; gene_alias_4 AC139666.1 ; gene_alias_5 ENSG00000224652.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000155713.1 ; gene_alias_7 LINC00885 ; transcript_alias_1 ENST00000457079 ; transcript_alias_2 TCONS_00005389 ; transcript_alias_3 ENST00000457079.1 ; transcript_alias_4 AC139666.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000341345.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT094296 ; transcript_alias_7 NR_034088 ;
chr3	lncipedia.org	exon	195870777	195871248	.	+	.	gene_id lnc-AC069257.9.1-2 ; transcript_id lnc-AC069257.9.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224652 ; gene_alias_2 XLOC_003002 ; gene_alias_3 linc-OSTalpha-1 ; gene_alias_4 AC139666.1 ; gene_alias_5 ENSG00000224652.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000155713.1 ; gene_alias_7 LINC00885 ; transcript_alias_1 ENST00000457079 ; transcript_alias_2 TCONS_00005389 ; transcript_alias_3 ENST00000457079.1 ; transcript_alias_4 AC139666.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000341345.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT094296 ; transcript_alias_7 NR_034088 ;
chr3	lncipedia.org	exon	195886771	195887761	.	+	.	gene_id lnc-AC069257.9.1-2 ; transcript_id lnc-AC069257.9.1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000224652 ; gene_alias_2 XLOC_003002 ; gene_alias_3 linc-OSTalpha-1 ; gene_alias_4 AC139666.1 ; gene_alias_5 ENSG00000224652.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000155713.1 ; gene_alias_7 LINC00885 ; transcript_alias_1 ENST00000457079 ; transcript_alias_2 TCONS_00005389 ; transcript_alias_3 ENST00000457079.1 ; transcript_alias_4 AC139666.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000341345.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT094296 ; transcript_alias_7 NR_034088 ;
chr4	lncipedia.org	exon	41878498	41878997	.	-	.	gene_id lnc-PHOX2B-2 ; transcript_id lnc-PHOX2B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245870 ; gene_alias_2 XLOC_003937 ; gene_alias_3 linc-PHOX2B-2 ; gene_alias_4 RP11-457P14.4 ; gene_alias_5 ENSG00000245870.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000160528.2 ; gene_alias_7 LINC00682 ; transcript_alias_1 ENST00000504870 ; transcript_alias_2 TCONS_00007751 ; transcript_alias_3 ENST00000504870.1 ; transcript_alias_4 RP11-457P14.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000360959.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT096175 ;
chr4	lncipedia.org	exon	41884497	41884628	.	-	.	gene_id lnc-PHOX2B-2 ; transcript_id lnc-PHOX2B-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245870 ; gene_alias_2 XLOC_003937 ; gene_alias_3 linc-PHOX2B-2 ; gene_alias_4 RP11-457P14.4 ; gene_alias_5 ENSG00000245870.2 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000160528.2 ; gene_alias_7 LINC00682 ; transcript_alias_1 ENST00000504870 ; transcript_alias_2 TCONS_00007751 ; transcript_alias_3 ENST00000504870.1 ; transcript_alias_4 RP11-457P14.4-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000360959.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT096175 ;
chr2	lncipedia.org	exon	61371541	61371777	.	-	.	gene_id lnc-USP34-1 ; transcript_id lnc-USP34-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000212978 ; gene_alias_2 XLOC_002111 ; gene_alias_3 linc-PUS10 ; gene_alias_4 AC016747.3 ; gene_alias_5 ENSG00000212978.4 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000152156.3 ; gene_alias_7 ENSG00000212978.5 ; transcript_alias_1 ENST00000443946 ; transcript_alias_2 TCONS_00003299 ; transcript_alias_3 ENST00000443946.1 ; transcript_alias_4 AC016747.3-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000325686.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT070934 ;
chr2	lncipedia.org	exon	61371908	61372104	.	-	.	gene_id lnc-USP34-1 ; transcript_id lnc-USP34-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000212978 ; gene_alias_2 XLOC_002111 ; gene_alias_3 linc-PUS10 ; gene_alias_4 AC016747.3 ; gene_alias_5 ENSG00000212978.4 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000152156.3 ; gene_alias_7 ENSG00000212978.5 ; transcript_alias_1 ENST00000443946 ; transcript_alias_2 TCONS_00003299 ; transcript_alias_3 ENST00000443946.1 ; transcript_alias_4 AC016747.3-002 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000325686.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT070934 ;
chr3	lncipedia.org	exon	63091651	63092098	.	+	.	gene_id lnc-SYNPR-2 ; transcript_id lnc-SYNPR-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000244342 ; gene_alias_2 RP11-129K20.2 ; gene_alias_3 ENSG00000244342.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158701.1 ; gene_alias_5 LINC00698 ; transcript_alias_1 ENST00000497573 ; transcript_alias_2 ENST00000497573.1 ; transcript_alias_3 RP11-129K20.2-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351804.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090201 ;
chr3	lncipedia.org	exon	63099253	63099571	.	+	.	gene_id lnc-SYNPR-2 ; transcript_id lnc-SYNPR-2:5 ; gene_alias_1 ENSG00000244342 ; gene_alias_2 RP11-129K20.2 ; gene_alias_3 ENSG00000244342.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000158701.1 ; gene_alias_5 LINC00698 ; transcript_alias_1 ENST00000497573 ; transcript_alias_2 ENST00000497573.1 ; transcript_alias_3 RP11-129K20.2-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000351804.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT090201 ;
chr2	lncipedia.org	exon	62193535	62193673	.	-	.	gene_id lnc-CCT4-2 ; transcript_id lnc-CCT4-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250876 ; transcript_alias_1 ENST00000506268 ;
chr2	lncipedia.org	exon	62194013	62195941	.	-	.	gene_id lnc-CCT4-2 ; transcript_id lnc-CCT4-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250876 ; transcript_alias_1 ENST00000506268 ;
chr2	lncipedia.org	exon	62465037	62465171	.	-	.	gene_id lnc-CCT4-2 ; transcript_id lnc-CCT4-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250876 ; transcript_alias_1 ENST00000506268 ;
chr2	lncipedia.org	exon	62603286	62603410	.	-	.	gene_id lnc-CCT4-2 ; transcript_id lnc-CCT4-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000250876 ; transcript_alias_1 ENST00000506268 ;
chr12	lncipedia.org	exon	38938130	38938378	.	-	.	gene_id lnc-CPNE8-1 ; transcript_id lnc-CPNE8-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000258119 ; gene_alias_2 RP11-804F13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258119.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169418.1 ; transcript_alias_1 ENST00000549364 ; transcript_alias_2 ENST00000549364.1 ; transcript_alias_3 RP11-804F13.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000403914.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027687 ;
chr12	lncipedia.org	exon	38940187	38940279	.	-	.	gene_id lnc-CPNE8-1 ; transcript_id lnc-CPNE8-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000258119 ; gene_alias_2 RP11-804F13.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258119.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169418.1 ; transcript_alias_1 ENST00000549364 ; transcript_alias_2 ENST00000549364.1 ; transcript_alias_3 RP11-804F13.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000403914.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027687 ;
chr16	lncipedia.org	exon	71496181	71496289	.	+	.	gene_id lnc-CHST4-3 ; transcript_id lnc-CHST4-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247324 ; gene_alias_2 AC010547.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247324.2 ; gene_alias_4 RP11-510M2.2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000176798.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500612 ; transcript_alias_2 ENST00000500612.1 ; transcript_alias_3 RP11-510M2.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000433802.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT143480 ;
chr16	lncipedia.org	exon	71497161	71499844	.	+	.	gene_id lnc-CHST4-3 ; transcript_id lnc-CHST4-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000247324 ; gene_alias_2 AC010547.1 ; gene_alias_3 ENSG00000247324.2 ; gene_alias_4 RP11-510M2.2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000176798.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500612 ; transcript_alias_2 ENST00000500612.1 ; transcript_alias_3 RP11-510M2.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000433802.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT143480 ;
chr7	lncipedia.org	exon	124633062	124633253	.	+	.	gene_id lnc-SPAM1-4 ; transcript_id lnc-SPAM1-4:5 ; gene_alias_1 ENSG00000224897 ; gene_alias_2 RP11-3B12.1 ; gene_alias_3 ENSG00000224897.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000157170.1 ; gene_alias_5 POT1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000415715 ; transcript_alias_2 ENST00000415715.1 ; transcript_alias_3 RP11-3B12.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000347737.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123096 ;
chr7	lncipedia.org	exon	124660387	124660467	.	+	.	gene_id lnc-SPAM1-4 ; transcript_id lnc-SPAM1-4:5 ; gene_alias_1 ENSG00000224897 ; gene_alias_2 RP11-3B12.1 ; gene_alias_3 ENSG00000224897.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000157170.1 ; gene_alias_5 POT1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000415715 ; transcript_alias_2 ENST00000415715.1 ; transcript_alias_3 RP11-3B12.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000347737.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123096 ;
chr7	lncipedia.org	exon	124720766	124720867	.	+	.	gene_id lnc-SPAM1-4 ; transcript_id lnc-SPAM1-4:5 ; gene_alias_1 ENSG00000224897 ; gene_alias_2 RP11-3B12.1 ; gene_alias_3 ENSG00000224897.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000157170.1 ; gene_alias_5 POT1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000415715 ; transcript_alias_2 ENST00000415715.1 ; transcript_alias_3 RP11-3B12.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000347737.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123096 ;
chr7	lncipedia.org	exon	124729744	124729830	.	+	.	gene_id lnc-SPAM1-4 ; transcript_id lnc-SPAM1-4:5 ; gene_alias_1 ENSG00000224897 ; gene_alias_2 RP11-3B12.1 ; gene_alias_3 ENSG00000224897.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000157170.1 ; gene_alias_5 POT1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000415715 ; transcript_alias_2 ENST00000415715.1 ; transcript_alias_3 RP11-3B12.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000347737.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123096 ;
chr7	lncipedia.org	exon	124739458	124739567	.	+	.	gene_id lnc-SPAM1-4 ; transcript_id lnc-SPAM1-4:5 ; gene_alias_1 ENSG00000224897 ; gene_alias_2 RP11-3B12.1 ; gene_alias_3 ENSG00000224897.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000157170.1 ; gene_alias_5 POT1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000415715 ; transcript_alias_2 ENST00000415715.1 ; transcript_alias_3 RP11-3B12.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000347737.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123096 ;
chr7	lncipedia.org	exon	124742014	124742104	.	+	.	gene_id lnc-SPAM1-4 ; transcript_id lnc-SPAM1-4:5 ; gene_alias_1 ENSG00000224897 ; gene_alias_2 RP11-3B12.1 ; gene_alias_3 ENSG00000224897.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000157170.1 ; gene_alias_5 POT1-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000415715 ; transcript_alias_2 ENST00000415715.1 ; transcript_alias_3 RP11-3B12.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000347737.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT123096 ;
chr2	lncipedia.org	exon	152194344	152195913	.	-	.	gene_id lnc-NMI-1 ; transcript_id lnc-NMI-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248650 ; transcript_alias_1 ENST00000505147 ;
chr2	lncipedia.org	exon	152229309	152229430	.	-	.	gene_id lnc-NMI-1 ; transcript_id lnc-NMI-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248650 ; transcript_alias_1 ENST00000505147 ;
chr2	lncipedia.org	exon	152235702	152235885	.	-	.	gene_id lnc-NMI-1 ; transcript_id lnc-NMI-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248650 ; transcript_alias_1 ENST00000505147 ;
chr12	lncipedia.org	exon	24366276	24366351	.	-	.	gene_id lnc-BCAT1-2 ; transcript_id lnc-BCAT1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000255864 ; gene_alias_2 RP11-444D3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255864.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169057.3 ; transcript_alias_1 ENST00000446891 ; transcript_alias_2 ENST00000446891.2 ; transcript_alias_3 RP11-444D3.1-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402439.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027313 ;
chr12	lncipedia.org	exon	24430150	24430246	.	-	.	gene_id lnc-BCAT1-2 ; transcript_id lnc-BCAT1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000255864 ; gene_alias_2 RP11-444D3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255864.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169057.3 ; transcript_alias_1 ENST00000446891 ; transcript_alias_2 ENST00000446891.2 ; transcript_alias_3 RP11-444D3.1-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402439.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027313 ;
chr12	lncipedia.org	exon	24521497	24521573	.	-	.	gene_id lnc-BCAT1-2 ; transcript_id lnc-BCAT1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000255864 ; gene_alias_2 RP11-444D3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255864.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169057.3 ; transcript_alias_1 ENST00000446891 ; transcript_alias_2 ENST00000446891.2 ; transcript_alias_3 RP11-444D3.1-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402439.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027313 ;
chr12	lncipedia.org	exon	24715263	24715421	.	-	.	gene_id lnc-BCAT1-2 ; transcript_id lnc-BCAT1-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000255864 ; gene_alias_2 RP11-444D3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000255864.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169057.3 ; transcript_alias_1 ENST00000446891 ; transcript_alias_2 ENST00000446891.2 ; transcript_alias_3 RP11-444D3.1-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000402439.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT027313 ;
chr20	lncipedia.org	exon	57090555	57090796	.	+	.	gene_id lnc-VAPB-1 ; transcript_id lnc-VAPB-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000231290 ; gene_alias_2 RP5-907D15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000231290.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032847.2 ; gene_alias_5 APCDD1L-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000445984 ; transcript_alias_2 ENST00000445984.1 ; transcript_alias_3 RP5-907D15.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000267920.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT080549 ;
chr20	lncipedia.org	exon	57094560	57094681	.	+	.	gene_id lnc-VAPB-1 ; transcript_id lnc-VAPB-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000231290 ; gene_alias_2 RP5-907D15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000231290.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032847.2 ; gene_alias_5 APCDD1L-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000445984 ; transcript_alias_2 ENST00000445984.1 ; transcript_alias_3 RP5-907D15.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000267920.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT080549 ;
chr20	lncipedia.org	exon	57098225	57098337	.	+	.	gene_id lnc-VAPB-1 ; transcript_id lnc-VAPB-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000231290 ; gene_alias_2 RP5-907D15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000231290.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032847.2 ; gene_alias_5 APCDD1L-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000445984 ; transcript_alias_2 ENST00000445984.1 ; transcript_alias_3 RP5-907D15.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000267920.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT080549 ;
chr20	lncipedia.org	exon	57098770	57098858	.	+	.	gene_id lnc-VAPB-1 ; transcript_id lnc-VAPB-1:4 ; gene_alias_1 ENSG00000231290 ; gene_alias_2 RP5-907D15.2 ; gene_alias_3 ENSG00000231290.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000032847.2 ; gene_alias_5 APCDD1L-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000445984 ; transcript_alias_2 ENST00000445984.1 ; transcript_alias_3 RP5-907D15.2-008 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000267920.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT080549 ;
chr20	lncipedia.org	exon	306269	306497	.	-	.	gene_id lnc-C20orf96-3 ; transcript_id lnc-C20orf96-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246892 ; gene_alias_2 AL034548.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500146 ; transcript_alias_2 NONHSAT078055 ;
chr20	lncipedia.org	exon	307819	309372	.	-	.	gene_id lnc-C20orf96-3 ; transcript_id lnc-C20orf96-3:1 ; gene_alias_1 ENSG00000246892 ; gene_alias_2 AL034548.1 ; transcript_alias_1 ENST00000500146 ; transcript_alias_2 NONHSAT078055 ;
chr5	lncipedia.org	exon	88179216	88179302	.	+	.	gene_id lnc-RASA1-7 ; transcript_id lnc-RASA1-7:2 ; gene_alias_1 ENSG00000248309 ; gene_alias_2 CTC-454M9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248309.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162630.2 ; gene_alias_5 MEF2C-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000514794 ; transcript_alias_2 ENST00000514794.1 ; transcript_alias_3 CTC-454M9.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000370005.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102691 ;
chr5	lncipedia.org	exon	88199755	88199977	.	+	.	gene_id lnc-RASA1-7 ; transcript_id lnc-RASA1-7:2 ; gene_alias_1 ENSG00000248309 ; gene_alias_2 CTC-454M9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248309.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162630.2 ; gene_alias_5 MEF2C-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000514794 ; transcript_alias_2 ENST00000514794.1 ; transcript_alias_3 CTC-454M9.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000370005.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102691 ;
chr5	lncipedia.org	exon	88201026	88201087	.	+	.	gene_id lnc-RASA1-7 ; transcript_id lnc-RASA1-7:2 ; gene_alias_1 ENSG00000248309 ; gene_alias_2 CTC-454M9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248309.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162630.2 ; gene_alias_5 MEF2C-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000514794 ; transcript_alias_2 ENST00000514794.1 ; transcript_alias_3 CTC-454M9.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000370005.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102691 ;
chr5	lncipedia.org	exon	88238833	88239031	.	+	.	gene_id lnc-RASA1-7 ; transcript_id lnc-RASA1-7:2 ; gene_alias_1 ENSG00000248309 ; gene_alias_2 CTC-454M9.1 ; gene_alias_3 ENSG00000248309.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000162630.2 ; gene_alias_5 MEF2C-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000514794 ; transcript_alias_2 ENST00000514794.1 ; transcript_alias_3 CTC-454M9.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000370005.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT102691 ;
chr9	lncipedia.org	exon	115631918	115632206	.	-	.	gene_id lnc-SLC46A2-1 ; transcript_id lnc-SLC46A2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249440 ; transcript_alias_1 ENST00000508251 ;
chr9	lncipedia.org	exon	115635151	115636827	.	-	.	gene_id lnc-SLC46A2-1 ; transcript_id lnc-SLC46A2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249440 ; transcript_alias_1 ENST00000508251 ;
chr3	lncipedia.org	exon	6532490	6532633	.	+	.	gene_id lnc-GRM7-3 ; transcript_id lnc-GRM7-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000189229 ; gene_alias_2 XLOC_002569 ; gene_alias_3 linc-GRM7-2 ; gene_alias_4 AC069277.2 ; gene_alias_5 ENSG00000189229.10 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000154923.2 ; transcript_alias_1 ENST00000414603 ; transcript_alias_2 TCONS_00005491 ; transcript_alias_3 ENST00000414603.1 ; transcript_alias_4 AC069277.2-007 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000337619.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT087675 ;
chr3	lncipedia.org	exon	6599274	6599646	.	+	.	gene_id lnc-GRM7-3 ; transcript_id lnc-GRM7-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000189229 ; gene_alias_2 XLOC_002569 ; gene_alias_3 linc-GRM7-2 ; gene_alias_4 AC069277.2 ; gene_alias_5 ENSG00000189229.10 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000154923.2 ; transcript_alias_1 ENST00000414603 ; transcript_alias_2 TCONS_00005491 ; transcript_alias_3 ENST00000414603.1 ; transcript_alias_4 AC069277.2-007 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000337619.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT087675 ;
chr19	lncipedia.org	exon	23582272	23583849	.	-	.	gene_id lnc-ZNF91-1 ; transcript_id lnc-ZNF91-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246181 ; gene_alias_2 AC022409.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501220 ;
chr19	lncipedia.org	exon	23584979	23585314	.	-	.	gene_id lnc-ZNF91-1 ; transcript_id lnc-ZNF91-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246181 ; gene_alias_2 AC022409.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501220 ;
chr19	lncipedia.org	exon	23586008	23586295	.	-	.	gene_id lnc-ZNF91-1 ; transcript_id lnc-ZNF91-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246181 ; gene_alias_2 AC022409.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501220 ;
chr19	lncipedia.org	exon	23586522	23586549	.	-	.	gene_id lnc-ZNF91-1 ; transcript_id lnc-ZNF91-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246181 ; gene_alias_2 AC022409.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501220 ;
chr19	lncipedia.org	exon	23587753	23587910	.	-	.	gene_id lnc-ZNF91-1 ; transcript_id lnc-ZNF91-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246181 ; gene_alias_2 AC022409.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501220 ;
chr19	lncipedia.org	exon	23588060	23588137	.	-	.	gene_id lnc-ZNF91-1 ; transcript_id lnc-ZNF91-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246181 ; gene_alias_2 AC022409.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501220 ;
chr19	lncipedia.org	exon	23588802	23588907	.	-	.	gene_id lnc-ZNF91-1 ; transcript_id lnc-ZNF91-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246181 ; gene_alias_2 AC022409.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501220 ;
chr19	lncipedia.org	exon	23590700	23590900	.	-	.	gene_id lnc-ZNF91-1 ; transcript_id lnc-ZNF91-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000246181 ; gene_alias_2 AC022409.1 ; transcript_alias_1 ENST00000501220 ;
chr2	lncipedia.org	exon	43260372	43260665	.	-	.	gene_id lnc-THADA-3 ; transcript_id lnc-THADA-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000231826 ; gene_alias_2 AC016735.2 ; gene_alias_3 ENSG00000231826.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152373.2 ; transcript_alias_1 ENST00000425212 ; transcript_alias_2 ENST00000425212.1 ; transcript_alias_3 AC016735.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000326018.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT070371 ;
chr2	lncipedia.org	exon	43263835	43263904	.	-	.	gene_id lnc-THADA-3 ; transcript_id lnc-THADA-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000231826 ; gene_alias_2 AC016735.2 ; gene_alias_3 ENSG00000231826.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152373.2 ; transcript_alias_1 ENST00000425212 ; transcript_alias_2 ENST00000425212.1 ; transcript_alias_3 AC016735.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000326018.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT070371 ;
chr2	lncipedia.org	exon	43266259	43266680	.	-	.	gene_id lnc-THADA-3 ; transcript_id lnc-THADA-3:3 ; gene_alias_1 ENSG00000231826 ; gene_alias_2 AC016735.2 ; gene_alias_3 ENSG00000231826.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000152373.2 ; transcript_alias_1 ENST00000425212 ; transcript_alias_2 ENST00000425212.1 ; transcript_alias_3 AC016735.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000326018.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT070371 ;
chr1	lncipedia.org	exon	91295104	91297753	.	-	.	gene_id lnc-ZNF644-1 ; transcript_id lnc-ZNF644-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000233593 ; gene_alias_2 XLOC_000915 ; gene_alias_3 linc-BARHL2 ; gene_alias_4 RP4-665J23.1 ; gene_alias_5 ENSG00000233593.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000010018.1 ; gene_alias_7 ENSG00000233593.2 ; transcript_alias_1 ENST00000455680 ; transcript_alias_2 TCONS_00000088 ; transcript_alias_3 ENST00000455680.1 ; transcript_alias_4 RP4-665J23.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000027724.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT004411 ;
chr1	lncipedia.org	exon	91301383	91301718	.	-	.	gene_id lnc-ZNF644-1 ; transcript_id lnc-ZNF644-1:6 ; gene_alias_1 ENSG00000233593 ; gene_alias_2 XLOC_000915 ; gene_alias_3 linc-BARHL2 ; gene_alias_4 RP4-665J23.1 ; gene_alias_5 ENSG00000233593.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000010018.1 ; gene_alias_7 ENSG00000233593.2 ; transcript_alias_1 ENST00000455680 ; transcript_alias_2 TCONS_00000088 ; transcript_alias_3 ENST00000455680.1 ; transcript_alias_4 RP4-665J23.1-001 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000027724.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT004411 ;
chr8	lncipedia.org	exon	128302062	128302305	.	-	.	gene_id lnc-TMEM75-3 ; transcript_id lnc-TMEM75-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000246228 ; gene_alias_2 RP11-382A18.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246228.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165066.1 ; gene_alias_5 CASC8 ; transcript_alias_1 ENST00000501396 ; transcript_alias_2 ENST00000501396.1 ; transcript_alias_3 RP11-382A18.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381642.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT129028 ;
chr8	lncipedia.org	exon	128335260	128335399	.	-	.	gene_id lnc-TMEM75-3 ; transcript_id lnc-TMEM75-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000246228 ; gene_alias_2 RP11-382A18.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246228.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165066.1 ; gene_alias_5 CASC8 ; transcript_alias_1 ENST00000501396 ; transcript_alias_2 ENST00000501396.1 ; transcript_alias_3 RP11-382A18.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381642.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT129028 ;
chr8	lncipedia.org	exon	128433074	128433619	.	-	.	gene_id lnc-TMEM75-3 ; transcript_id lnc-TMEM75-3:4 ; gene_alias_1 ENSG00000246228 ; gene_alias_2 RP11-382A18.1 ; gene_alias_3 ENSG00000246228.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165066.1 ; gene_alias_5 CASC8 ; transcript_alias_1 ENST00000501396 ; transcript_alias_2 ENST00000501396.1 ; transcript_alias_3 RP11-382A18.1-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000381642.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT129028 ;
chr6	lncipedia.org	exon	1496350	1496458	.	+	.	gene_id lnc-FOXC1-2 ; transcript_id lnc-FOXC1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251522 ; transcript_alias_1 ENST00000514601 ; transcript_alias_2 NONHSAT106504 ;
chr6	lncipedia.org	exon	1498564	1498777	.	+	.	gene_id lnc-FOXC1-2 ; transcript_id lnc-FOXC1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251522 ; transcript_alias_1 ENST00000514601 ; transcript_alias_2 NONHSAT106504 ;
chr6	lncipedia.org	exon	1509048	1509149	.	+	.	gene_id lnc-FOXC1-2 ; transcript_id lnc-FOXC1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251522 ; transcript_alias_1 ENST00000514601 ; transcript_alias_2 NONHSAT106504 ;
chr6	lncipedia.org	exon	1515206	1515378	.	+	.	gene_id lnc-FOXC1-2 ; transcript_id lnc-FOXC1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251522 ; transcript_alias_1 ENST00000514601 ; transcript_alias_2 NONHSAT106504 ;
chr6	lncipedia.org	exon	1518831	1519554	.	+	.	gene_id lnc-FOXC1-2 ; transcript_id lnc-FOXC1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251522 ; transcript_alias_1 ENST00000514601 ; transcript_alias_2 NONHSAT106504 ;
chr12	lncipedia.org	exon	81664454	81664628	.	+	.	gene_id lnc-ACSS3-1 ; transcript_id lnc-ACSS3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257467 ; gene_alias_2 RP11-121G22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257467.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170246.1 ; transcript_alias_1 ENST00000549161 ; transcript_alias_2 ENST00000549161.1 ; transcript_alias_3 RP11-121G22.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408170.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029693 ;
chr12	lncipedia.org	exon	81676466	81676573	.	+	.	gene_id lnc-ACSS3-1 ; transcript_id lnc-ACSS3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257467 ; gene_alias_2 RP11-121G22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257467.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170246.1 ; transcript_alias_1 ENST00000549161 ; transcript_alias_2 ENST00000549161.1 ; transcript_alias_3 RP11-121G22.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408170.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029693 ;
chr12	lncipedia.org	exon	81677995	81678158	.	+	.	gene_id lnc-ACSS3-1 ; transcript_id lnc-ACSS3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257467 ; gene_alias_2 RP11-121G22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257467.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170246.1 ; transcript_alias_1 ENST00000549161 ; transcript_alias_2 ENST00000549161.1 ; transcript_alias_3 RP11-121G22.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408170.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029693 ;
chr12	lncipedia.org	exon	81686173	81686303	.	+	.	gene_id lnc-ACSS3-1 ; transcript_id lnc-ACSS3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257467 ; gene_alias_2 RP11-121G22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257467.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170246.1 ; transcript_alias_1 ENST00000549161 ; transcript_alias_2 ENST00000549161.1 ; transcript_alias_3 RP11-121G22.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408170.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029693 ;
chr12	lncipedia.org	exon	81690413	81690548	.	+	.	gene_id lnc-ACSS3-1 ; transcript_id lnc-ACSS3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257467 ; gene_alias_2 RP11-121G22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257467.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170246.1 ; transcript_alias_1 ENST00000549161 ; transcript_alias_2 ENST00000549161.1 ; transcript_alias_3 RP11-121G22.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408170.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029693 ;
chr12	lncipedia.org	exon	81691842	81691942	.	+	.	gene_id lnc-ACSS3-1 ; transcript_id lnc-ACSS3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257467 ; gene_alias_2 RP11-121G22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257467.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170246.1 ; transcript_alias_1 ENST00000549161 ; transcript_alias_2 ENST00000549161.1 ; transcript_alias_3 RP11-121G22.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408170.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029693 ;
chr12	lncipedia.org	exon	81705826	81706090	.	+	.	gene_id lnc-ACSS3-1 ; transcript_id lnc-ACSS3-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257467 ; gene_alias_2 RP11-121G22.3 ; gene_alias_3 ENSG00000257467.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170246.1 ; transcript_alias_1 ENST00000549161 ; transcript_alias_2 ENST00000549161.1 ; transcript_alias_3 RP11-121G22.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408170.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029693 ;
chr7	lncipedia.org	exon	128768553	128768607	.	+	.	gene_id lnc-TSPAN33-2 ; transcript_id lnc-TSPAN33-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248549 ; transcript_alias_1 ENST00000514496 ;
chr7	lncipedia.org	exon	128834103	128835941	.	+	.	gene_id lnc-TSPAN33-2 ; transcript_id lnc-TSPAN33-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248549 ; transcript_alias_1 ENST00000514496 ;
chr2	lncipedia.org	exon	47419863	47419956	.	-	.	gene_id lnc-CALM2-2 ; transcript_id lnc-CALM2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234690 ; gene_alias_2 AC073283.4 ; gene_alias_3 ENSG00000234690.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151698.6 ; transcript_alias_1 ENST00000441997 ; transcript_alias_2 ENST00000441997.1 ; transcript_alias_3 AC073283.4-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323567.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT070550 ;
chr2	lncipedia.org	exon	47426576	47426682	.	-	.	gene_id lnc-CALM2-2 ; transcript_id lnc-CALM2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234690 ; gene_alias_2 AC073283.4 ; gene_alias_3 ENSG00000234690.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151698.6 ; transcript_alias_1 ENST00000441997 ; transcript_alias_2 ENST00000441997.1 ; transcript_alias_3 AC073283.4-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323567.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT070550 ;
chr2	lncipedia.org	exon	47559412	47559547	.	-	.	gene_id lnc-CALM2-2 ; transcript_id lnc-CALM2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234690 ; gene_alias_2 AC073283.4 ; gene_alias_3 ENSG00000234690.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151698.6 ; transcript_alias_1 ENST00000441997 ; transcript_alias_2 ENST00000441997.1 ; transcript_alias_3 AC073283.4-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323567.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT070550 ;
chr2	lncipedia.org	exon	47560073	47560165	.	-	.	gene_id lnc-CALM2-2 ; transcript_id lnc-CALM2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234690 ; gene_alias_2 AC073283.4 ; gene_alias_3 ENSG00000234690.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151698.6 ; transcript_alias_1 ENST00000441997 ; transcript_alias_2 ENST00000441997.1 ; transcript_alias_3 AC073283.4-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323567.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT070550 ;
chr2	lncipedia.org	exon	47572040	47572213	.	-	.	gene_id lnc-CALM2-2 ; transcript_id lnc-CALM2-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000234690 ; gene_alias_2 AC073283.4 ; gene_alias_3 ENSG00000234690.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151698.6 ; transcript_alias_1 ENST00000441997 ; transcript_alias_2 ENST00000441997.1 ; transcript_alias_3 AC073283.4-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323567.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT070550 ;
chr17	lncipedia.org	exon	26201671	26201805	.	+	.	gene_id lnc-NLK-2 ; transcript_id lnc-NLK-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251558 ; gene_alias_2 ENSG00000266527.1 ; gene_alias_3 RP11-138P22.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000179206.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502259 ; transcript_alias_2 ENST00000581901.1 ; transcript_alias_3 RP11-138P22.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000445282.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT052350 ;
chr17	lncipedia.org	exon	26206133	26208263	.	+	.	gene_id lnc-NLK-2 ; transcript_id lnc-NLK-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251558 ; gene_alias_2 ENSG00000266527.1 ; gene_alias_3 RP11-138P22.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000179206.1 ; transcript_alias_1 ENST00000502259 ; transcript_alias_2 ENST00000581901.1 ; transcript_alias_3 RP11-138P22.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000445282.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT052350 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126927027	126927134	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-9 ; transcript_id lnc-TMEM132B-9:2 ; gene_alias_1 ENSG00000214043 ; gene_alias_2 RP5-944M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000214043.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000397346 ; transcript_alias_2 ENST00000397346.3 ; transcript_alias_3 RP5-944M2.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399847.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031776 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126927512	126927573	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-9 ; transcript_id lnc-TMEM132B-9:2 ; gene_alias_1 ENSG00000214043 ; gene_alias_2 RP5-944M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000214043.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000397346 ; transcript_alias_2 ENST00000397346.3 ; transcript_alias_3 RP5-944M2.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399847.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031776 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126929431	126929599	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-9 ; transcript_id lnc-TMEM132B-9:2 ; gene_alias_1 ENSG00000214043 ; gene_alias_2 RP5-944M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000214043.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000397346 ; transcript_alias_2 ENST00000397346.3 ; transcript_alias_3 RP5-944M2.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399847.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031776 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126932525	126932607	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-9 ; transcript_id lnc-TMEM132B-9:2 ; gene_alias_1 ENSG00000214043 ; gene_alias_2 RP5-944M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000214043.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000397346 ; transcript_alias_2 ENST00000397346.3 ; transcript_alias_3 RP5-944M2.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399847.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031776 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126942479	126943087	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-9 ; transcript_id lnc-TMEM132B-9:2 ; gene_alias_1 ENSG00000214043 ; gene_alias_2 RP5-944M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000214043.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000397346 ; transcript_alias_2 ENST00000397346.3 ; transcript_alias_3 RP5-944M2.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399847.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031776 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126947264	126947371	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-9 ; transcript_id lnc-TMEM132B-9:2 ; gene_alias_1 ENSG00000214043 ; gene_alias_2 RP5-944M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000214043.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000397346 ; transcript_alias_2 ENST00000397346.3 ; transcript_alias_3 RP5-944M2.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399847.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031776 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126950260	126950535	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-9 ; transcript_id lnc-TMEM132B-9:2 ; gene_alias_1 ENSG00000214043 ; gene_alias_2 RP5-944M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000214043.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000397346 ; transcript_alias_2 ENST00000397346.3 ; transcript_alias_3 RP5-944M2.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399847.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031776 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126951095	126951273	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-9 ; transcript_id lnc-TMEM132B-9:2 ; gene_alias_1 ENSG00000214043 ; gene_alias_2 RP5-944M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000214043.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000397346 ; transcript_alias_2 ENST00000397346.3 ; transcript_alias_3 RP5-944M2.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399847.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031776 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126953304	126953653	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-9 ; transcript_id lnc-TMEM132B-9:2 ; gene_alias_1 ENSG00000214043 ; gene_alias_2 RP5-944M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000214043.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000397346 ; transcript_alias_2 ENST00000397346.3 ; transcript_alias_3 RP5-944M2.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399847.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031776 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126954278	126954431	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-9 ; transcript_id lnc-TMEM132B-9:2 ; gene_alias_1 ENSG00000214043 ; gene_alias_2 RP5-944M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000214043.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000397346 ; transcript_alias_2 ENST00000397346.3 ; transcript_alias_3 RP5-944M2.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399847.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031776 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126955207	126955361	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-9 ; transcript_id lnc-TMEM132B-9:2 ; gene_alias_1 ENSG00000214043 ; gene_alias_2 RP5-944M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000214043.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000397346 ; transcript_alias_2 ENST00000397346.3 ; transcript_alias_3 RP5-944M2.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399847.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031776 ;
chr12	lncipedia.org	exon	126957132	126957336	.	+	.	gene_id lnc-TMEM132B-9 ; transcript_id lnc-TMEM132B-9:2 ; gene_alias_1 ENSG00000214043 ; gene_alias_2 RP5-944M2.3 ; gene_alias_3 ENSG00000214043.3 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168469.1 ; transcript_alias_1 ENST00000397346 ; transcript_alias_2 ENST00000397346.3 ; transcript_alias_3 RP5-944M2.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399847.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031776 ;
chr6	lncipedia.org	exon	147185595	147185738	.	-	.	gene_id lnc-SHPRH-2 ; transcript_id lnc-SHPRH-2:7 ; gene_alias_1 ENSG00000233452 ; gene_alias_2 RP11-497D6.4 ; gene_alias_3 ENSG00000233452.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015762.3 ; gene_alias_5 ENSG00000233452.2 ; gene_alias_6 STXBP5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000443712 ; transcript_alias_2 ENST00000443712.1 ; transcript_alias_3 RP11-497D6.4-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000042594.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT115443 ;
chr6	lncipedia.org	exon	147199251	147199470	.	-	.	gene_id lnc-SHPRH-2 ; transcript_id lnc-SHPRH-2:7 ; gene_alias_1 ENSG00000233452 ; gene_alias_2 RP11-497D6.4 ; gene_alias_3 ENSG00000233452.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015762.3 ; gene_alias_5 ENSG00000233452.2 ; gene_alias_6 STXBP5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000443712 ; transcript_alias_2 ENST00000443712.1 ; transcript_alias_3 RP11-497D6.4-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000042594.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT115443 ;
chr6	lncipedia.org	exon	147227055	147227152	.	-	.	gene_id lnc-SHPRH-2 ; transcript_id lnc-SHPRH-2:7 ; gene_alias_1 ENSG00000233452 ; gene_alias_2 RP11-497D6.4 ; gene_alias_3 ENSG00000233452.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015762.3 ; gene_alias_5 ENSG00000233452.2 ; gene_alias_6 STXBP5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000443712 ; transcript_alias_2 ENST00000443712.1 ; transcript_alias_3 RP11-497D6.4-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000042594.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT115443 ;
chr6	lncipedia.org	exon	147232688	147232742	.	-	.	gene_id lnc-SHPRH-2 ; transcript_id lnc-SHPRH-2:7 ; gene_alias_1 ENSG00000233452 ; gene_alias_2 RP11-497D6.4 ; gene_alias_3 ENSG00000233452.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000015762.3 ; gene_alias_5 ENSG00000233452.2 ; gene_alias_6 STXBP5-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000443712 ; transcript_alias_2 ENST00000443712.1 ; transcript_alias_3 RP11-497D6.4-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000042594.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT115443 ;
chr9	lncipedia.org	exon	132260618	132260743	.	+	.	gene_id lnc-METTL11A-3 ; transcript_id lnc-METTL11A-3:8 ; gene_alias_1 ENSG00000204054 ; gene_alias_2 RP11-492E3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000204054.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020783.2 ; gene_alias_5 ENSG00000204054.7 ; gene_alias_6 LINC00963 ; transcript_alias_1 ENST00000453213 ; transcript_alias_2 ENST00000453213.1 ; transcript_alias_3 RP11-492E3.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000054581.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT135083 ;
chr9	lncipedia.org	exon	132265602	132265944	.	+	.	gene_id lnc-METTL11A-3 ; transcript_id lnc-METTL11A-3:8 ; gene_alias_1 ENSG00000204054 ; gene_alias_2 RP11-492E3.1 ; gene_alias_3 ENSG00000204054.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020783.2 ; gene_alias_5 ENSG00000204054.7 ; gene_alias_6 LINC00963 ; transcript_alias_1 ENST00000453213 ; transcript_alias_2 ENST00000453213.1 ; transcript_alias_3 RP11-492E3.1-004 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000054581.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT135083 ;
chr2	lncipedia.org	exon	231852357	231852894	.	-	.	gene_id lnc-GPR55-1 ; transcript_id lnc-GPR55-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000238062 ; gene_alias_2 XLOC_002517 ; gene_alias_3 linc-GPR55 ; gene_alias_4 AC105344.2 ; gene_alias_5 ENSG00000238062.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000154076.1 ; gene_alias_7 SPATA3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000446741 ; transcript_alias_2 TCONS_00003507 ; transcript_alias_3 ENST00000446741.1 ; transcript_alias_4 AC105344.2-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000333739.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT077323 ;
chr2	lncipedia.org	exon	231856484	231856751	.	-	.	gene_id lnc-GPR55-1 ; transcript_id lnc-GPR55-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000238062 ; gene_alias_2 XLOC_002517 ; gene_alias_3 linc-GPR55 ; gene_alias_4 AC105344.2 ; gene_alias_5 ENSG00000238062.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000154076.1 ; gene_alias_7 SPATA3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000446741 ; transcript_alias_2 TCONS_00003507 ; transcript_alias_3 ENST00000446741.1 ; transcript_alias_4 AC105344.2-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000333739.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT077323 ;
chr2	lncipedia.org	exon	231859992	231860100	.	-	.	gene_id lnc-GPR55-1 ; transcript_id lnc-GPR55-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000238062 ; gene_alias_2 XLOC_002517 ; gene_alias_3 linc-GPR55 ; gene_alias_4 AC105344.2 ; gene_alias_5 ENSG00000238062.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000154076.1 ; gene_alias_7 SPATA3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000446741 ; transcript_alias_2 TCONS_00003507 ; transcript_alias_3 ENST00000446741.1 ; transcript_alias_4 AC105344.2-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000333739.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT077323 ;
chr2	lncipedia.org	exon	231860563	231860747	.	-	.	gene_id lnc-GPR55-1 ; transcript_id lnc-GPR55-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000238062 ; gene_alias_2 XLOC_002517 ; gene_alias_3 linc-GPR55 ; gene_alias_4 AC105344.2 ; gene_alias_5 ENSG00000238062.1 ; gene_alias_6 OTTHUMG00000154076.1 ; gene_alias_7 SPATA3-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000446741 ; transcript_alias_2 TCONS_00003507 ; transcript_alias_3 ENST00000446741.1 ; transcript_alias_4 AC105344.2-003 ; transcript_alias_5 OTTHUMT00000333739.1 ; transcript_alias_6 NONHSAT077323 ;
chr20	lncipedia.org	exon	8000549	8000751	.	+	.	gene_id lnc-PLCB1-1 ; transcript_id lnc-PLCB1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229766 ; gene_alias_2 RP5-971N18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000229766.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031842.1 ; gene_alias_5 ENSG00000229766.2 ; transcript_alias_1 ENST00000457707 ; transcript_alias_2 ENST00000457707.1 ; transcript_alias_3 RP5-971N18.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000077927.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT078550 ;
chr20	lncipedia.org	exon	8001038	8001908	.	+	.	gene_id lnc-PLCB1-1 ; transcript_id lnc-PLCB1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229766 ; gene_alias_2 RP5-971N18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000229766.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031842.1 ; gene_alias_5 ENSG00000229766.2 ; transcript_alias_1 ENST00000457707 ; transcript_alias_2 ENST00000457707.1 ; transcript_alias_3 RP5-971N18.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000077927.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT078550 ;
chr20	lncipedia.org	exon	8002706	8002802	.	+	.	gene_id lnc-PLCB1-1 ; transcript_id lnc-PLCB1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229766 ; gene_alias_2 RP5-971N18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000229766.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031842.1 ; gene_alias_5 ENSG00000229766.2 ; transcript_alias_1 ENST00000457707 ; transcript_alias_2 ENST00000457707.1 ; transcript_alias_3 RP5-971N18.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000077927.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT078550 ;
chr20	lncipedia.org	exon	8003028	8003096	.	+	.	gene_id lnc-PLCB1-1 ; transcript_id lnc-PLCB1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229766 ; gene_alias_2 RP5-971N18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000229766.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031842.1 ; gene_alias_5 ENSG00000229766.2 ; transcript_alias_1 ENST00000457707 ; transcript_alias_2 ENST00000457707.1 ; transcript_alias_3 RP5-971N18.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000077927.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT078550 ;
chr20	lncipedia.org	exon	8003204	8003414	.	+	.	gene_id lnc-PLCB1-1 ; transcript_id lnc-PLCB1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229766 ; gene_alias_2 RP5-971N18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000229766.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031842.1 ; gene_alias_5 ENSG00000229766.2 ; transcript_alias_1 ENST00000457707 ; transcript_alias_2 ENST00000457707.1 ; transcript_alias_3 RP5-971N18.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000077927.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT078550 ;
chr20	lncipedia.org	exon	8003918	8004099	.	+	.	gene_id lnc-PLCB1-1 ; transcript_id lnc-PLCB1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229766 ; gene_alias_2 RP5-971N18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000229766.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031842.1 ; gene_alias_5 ENSG00000229766.2 ; transcript_alias_1 ENST00000457707 ; transcript_alias_2 ENST00000457707.1 ; transcript_alias_3 RP5-971N18.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000077927.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT078550 ;
chr20	lncipedia.org	exon	8008308	8008603	.	+	.	gene_id lnc-PLCB1-1 ; transcript_id lnc-PLCB1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000229766 ; gene_alias_2 RP5-971N18.3 ; gene_alias_3 ENSG00000229766.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000031842.1 ; gene_alias_5 ENSG00000229766.2 ; transcript_alias_1 ENST00000457707 ; transcript_alias_2 ENST00000457707.1 ; transcript_alias_3 RP5-971N18.3-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000077927.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT078550 ;
chr12	lncipedia.org	exon	111269583	111269798	.	+	.	gene_id lnc-CCDC63-1 ; transcript_id lnc-CCDC63-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257268 ; gene_alias_2 RP1-74B13.2 ; gene_alias_3 ENSG00000257268.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169533.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551161 ; transcript_alias_2 ENST00000551161.1 ; transcript_alias_3 RP1-74B13.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404670.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030706 ;
chr12	lncipedia.org	exon	111283403	111283767	.	+	.	gene_id lnc-CCDC63-1 ; transcript_id lnc-CCDC63-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000257268 ; gene_alias_2 RP1-74B13.2 ; gene_alias_3 ENSG00000257268.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000169533.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551161 ; transcript_alias_2 ENST00000551161.1 ; transcript_alias_3 RP1-74B13.2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000404670.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT030706 ;
chr9	lncipedia.org	exon	123608960	123609081	.	+	.	gene_id lnc-CNTRL-1 ; transcript_id lnc-CNTRL-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000226752 ; gene_alias_2 RP11-27I1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000226752.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020572.1 ; transcript_alias_1 ENST00000450803 ; transcript_alias_2 ENST00000450803.1 ; transcript_alias_3 RP11-27I1.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000053822.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	123609572	123609631	.	+	.	gene_id lnc-CNTRL-1 ; transcript_id lnc-CNTRL-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000226752 ; gene_alias_2 RP11-27I1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000226752.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020572.1 ; transcript_alias_1 ENST00000450803 ; transcript_alias_2 ENST00000450803.1 ; transcript_alias_3 RP11-27I1.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000053822.1 ;
chr9	lncipedia.org	exon	123613516	123614245	.	+	.	gene_id lnc-CNTRL-1 ; transcript_id lnc-CNTRL-1:5 ; gene_alias_1 ENSG00000226752 ; gene_alias_2 RP11-27I1.2 ; gene_alias_3 ENSG00000226752.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000020572.1 ; transcript_alias_1 ENST00000450803 ; transcript_alias_2 ENST00000450803.1 ; transcript_alias_3 RP11-27I1.2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000053822.1 ;
chr2	lncipedia.org	exon	7053758	7053795	.	-	.	gene_id lnc-CMPK2-2 ; transcript_id lnc-CMPK2-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000228203 ; gene_alias_2 AC017076.4 ; gene_alias_3 ENSG00000228203.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151701.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228203.2 ; gene_alias_6 RNF144A-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000426122 ; transcript_alias_2 ENST00000426122.1 ; transcript_alias_3 AC017076.4-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323506.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT068930 ;
chr2	lncipedia.org	exon	7054324	7054481	.	-	.	gene_id lnc-CMPK2-2 ; transcript_id lnc-CMPK2-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000228203 ; gene_alias_2 AC017076.4 ; gene_alias_3 ENSG00000228203.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151701.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228203.2 ; gene_alias_6 RNF144A-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000426122 ; transcript_alias_2 ENST00000426122.1 ; transcript_alias_3 AC017076.4-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323506.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT068930 ;
chr2	lncipedia.org	exon	7058416	7058798	.	-	.	gene_id lnc-CMPK2-2 ; transcript_id lnc-CMPK2-2:4 ; gene_alias_1 ENSG00000228203 ; gene_alias_2 AC017076.4 ; gene_alias_3 ENSG00000228203.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000151701.2 ; gene_alias_5 ENSG00000228203.2 ; gene_alias_6 RNF144A-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000426122 ; transcript_alias_2 ENST00000426122.1 ; transcript_alias_3 AC017076.4-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000323506.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT068930 ;
chr4	lncipedia.org	exon	85887538	85888280	.	+	.	gene_id lnc-CDS1-2 ; transcript_id lnc-CDS1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000180769 ; gene_alias_2 NCRNA00247 ; gene_alias_3 ENSG00000180769.4 ; gene_alias_4 WDFY3-AS2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000141281.2 ; transcript_alias_1 ENST00000451762 ; transcript_alias_2 ENST00000451762.1 ; transcript_alias_3 WDFY3-AS2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000280506.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT097252 ;
chr4	lncipedia.org	exon	85890878	85891029	.	+	.	gene_id lnc-CDS1-2 ; transcript_id lnc-CDS1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000180769 ; gene_alias_2 NCRNA00247 ; gene_alias_3 ENSG00000180769.4 ; gene_alias_4 WDFY3-AS2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000141281.2 ; transcript_alias_1 ENST00000451762 ; transcript_alias_2 ENST00000451762.1 ; transcript_alias_3 WDFY3-AS2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000280506.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT097252 ;
chr4	lncipedia.org	exon	85921844	85921918	.	+	.	gene_id lnc-CDS1-2 ; transcript_id lnc-CDS1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000180769 ; gene_alias_2 NCRNA00247 ; gene_alias_3 ENSG00000180769.4 ; gene_alias_4 WDFY3-AS2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000141281.2 ; transcript_alias_1 ENST00000451762 ; transcript_alias_2 ENST00000451762.1 ; transcript_alias_3 WDFY3-AS2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000280506.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT097252 ;
chr4	lncipedia.org	exon	85925383	85925480	.	+	.	gene_id lnc-CDS1-2 ; transcript_id lnc-CDS1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000180769 ; gene_alias_2 NCRNA00247 ; gene_alias_3 ENSG00000180769.4 ; gene_alias_4 WDFY3-AS2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000141281.2 ; transcript_alias_1 ENST00000451762 ; transcript_alias_2 ENST00000451762.1 ; transcript_alias_3 WDFY3-AS2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000280506.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT097252 ;
chr4	lncipedia.org	exon	85926627	85926721	.	+	.	gene_id lnc-CDS1-2 ; transcript_id lnc-CDS1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000180769 ; gene_alias_2 NCRNA00247 ; gene_alias_3 ENSG00000180769.4 ; gene_alias_4 WDFY3-AS2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000141281.2 ; transcript_alias_1 ENST00000451762 ; transcript_alias_2 ENST00000451762.1 ; transcript_alias_3 WDFY3-AS2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000280506.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT097252 ;
chr4	lncipedia.org	exon	85927160	85932430	.	+	.	gene_id lnc-CDS1-2 ; transcript_id lnc-CDS1-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000180769 ; gene_alias_2 NCRNA00247 ; gene_alias_3 ENSG00000180769.4 ; gene_alias_4 WDFY3-AS2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000141281.2 ; transcript_alias_1 ENST00000451762 ; transcript_alias_2 ENST00000451762.1 ; transcript_alias_3 WDFY3-AS2-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000280506.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT097252 ;
chr11	lncipedia.org	exon	8081585	8081625	.	+	.	gene_id lnc-EIF3F-1 ; transcript_id lnc-EIF3F-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248332 ; gene_alias_2 ENSG00000248332.2 ; gene_alias_3 RP11-236J17.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165692.1 ; transcript_alias_1 ENST00000530466 ; transcript_alias_2 ENST00000530466.1 ; transcript_alias_3 RP11-236J17.5-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000385826.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017824 ;
chr11	lncipedia.org	exon	8083620	8083778	.	+	.	gene_id lnc-EIF3F-1 ; transcript_id lnc-EIF3F-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248332 ; gene_alias_2 ENSG00000248332.2 ; gene_alias_3 RP11-236J17.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165692.1 ; transcript_alias_1 ENST00000530466 ; transcript_alias_2 ENST00000530466.1 ; transcript_alias_3 RP11-236J17.5-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000385826.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017824 ;
chr11	lncipedia.org	exon	8089157	8089487	.	+	.	gene_id lnc-EIF3F-1 ; transcript_id lnc-EIF3F-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000248332 ; gene_alias_2 ENSG00000248332.2 ; gene_alias_3 RP11-236J17.5 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000165692.1 ; transcript_alias_1 ENST00000530466 ; transcript_alias_2 ENST00000530466.1 ; transcript_alias_3 RP11-236J17.5-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000385826.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT017824 ;
chr14	lncipedia.org	exon	29299454	29299708	.	+	.	gene_id lnc-C14orf23-1 ; transcript_id lnc-C14orf23-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000258038 ; gene_alias_2 CTD-2384A14.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258038.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170368.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551588 ; transcript_alias_2 ENST00000551588.1 ; transcript_alias_3 CTD-2384A14.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408707.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036169 ;
chr14	lncipedia.org	exon	29301212	29301266	.	+	.	gene_id lnc-C14orf23-1 ; transcript_id lnc-C14orf23-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000258038 ; gene_alias_2 CTD-2384A14.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258038.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170368.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551588 ; transcript_alias_2 ENST00000551588.1 ; transcript_alias_3 CTD-2384A14.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408707.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036169 ;
chr14	lncipedia.org	exon	29306459	29306536	.	+	.	gene_id lnc-C14orf23-1 ; transcript_id lnc-C14orf23-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000258038 ; gene_alias_2 CTD-2384A14.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258038.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170368.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551588 ; transcript_alias_2 ENST00000551588.1 ; transcript_alias_3 CTD-2384A14.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408707.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036169 ;
chr14	lncipedia.org	exon	29339509	29339622	.	+	.	gene_id lnc-C14orf23-1 ; transcript_id lnc-C14orf23-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000258038 ; gene_alias_2 CTD-2384A14.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258038.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170368.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551588 ; transcript_alias_2 ENST00000551588.1 ; transcript_alias_3 CTD-2384A14.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408707.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036169 ;
chr14	lncipedia.org	exon	29399146	29399200	.	+	.	gene_id lnc-C14orf23-1 ; transcript_id lnc-C14orf23-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000258038 ; gene_alias_2 CTD-2384A14.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258038.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170368.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551588 ; transcript_alias_2 ENST00000551588.1 ; transcript_alias_3 CTD-2384A14.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408707.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036169 ;
chr14	lncipedia.org	exon	29437279	29437606	.	+	.	gene_id lnc-C14orf23-1 ; transcript_id lnc-C14orf23-1:3 ; gene_alias_1 ENSG00000258038 ; gene_alias_2 CTD-2384A14.1 ; gene_alias_3 ENSG00000258038.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170368.1 ; transcript_alias_1 ENST00000551588 ; transcript_alias_2 ENST00000551588.1 ; transcript_alias_3 CTD-2384A14.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408707.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036169 ;
chr2	lncipedia.org	exon	177041200	177041420	.	-	.	gene_id lnc-AC009336.1-2 ; transcript_id lnc-AC009336.1-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000224189 ; gene_alias_2 AC009336.23 ; gene_alias_3 ENSG00000224189.2 ; gene_alias_4 HOXD-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000154172.2 ; transcript_alias_1 ENST00000456876 ; transcript_alias_2 ENST00000456876.1 ; transcript_alias_3 HOXD-AS1-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000334222.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075644 ;
chr2	lncipedia.org	exon	177042439	177042853	.	-	.	gene_id lnc-AC009336.1-2 ; transcript_id lnc-AC009336.1-2:8 ; gene_alias_1 ENSG00000224189 ; gene_alias_2 AC009336.23 ; gene_alias_3 ENSG00000224189.2 ; gene_alias_4 HOXD-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000154172.2 ; transcript_alias_1 ENST00000456876 ; transcript_alias_2 ENST00000456876.1 ; transcript_alias_3 HOXD-AS1-006 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000334222.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT075644 ;
chr18	lncipedia.org	exon	6256746	6256872	.	+	.	gene_id lnc-ARHGAP28-4 ; transcript_id lnc-ARHGAP28-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249597 ; transcript_alias_1 ENST00000513742 ;
chr18	lncipedia.org	exon	6258653	6258795	.	+	.	gene_id lnc-ARHGAP28-4 ; transcript_id lnc-ARHGAP28-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249597 ; transcript_alias_1 ENST00000513742 ;
chr18	lncipedia.org	exon	6259159	6260930	.	+	.	gene_id lnc-ARHGAP28-4 ; transcript_id lnc-ARHGAP28-4:2 ; gene_alias_1 ENSG00000249597 ; transcript_alias_1 ENST00000513742 ;
chr12	lncipedia.org	exon	53551573	53552188	.	+	.	gene_id lnc-ZNF740-2 ; transcript_id lnc-ZNF740-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251245 ; transcript_alias_1 ENST00000503138 ;
chr12	lncipedia.org	exon	53568345	53570194	.	+	.	gene_id lnc-ZNF740-2 ; transcript_id lnc-ZNF740-2:1 ; gene_alias_1 ENSG00000251245 ; transcript_alias_1 ENST00000503138 ;
chr12	lncipedia.org	exon	128508333	128508367	.	-	.	gene_id lnc-SLC15A4-4 ; transcript_id lnc-SLC15A4-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256643 ; gene_alias_2 RP11-349K16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256643.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168427.1 ; transcript_alias_1 ENST00000543651 ; transcript_alias_2 ENST00000543651.1 ; transcript_alias_3 RP11-349K16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399705.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031894 ;
chr12	lncipedia.org	exon	128510404	128510744	.	-	.	gene_id lnc-SLC15A4-4 ; transcript_id lnc-SLC15A4-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256643 ; gene_alias_2 RP11-349K16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256643.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168427.1 ; transcript_alias_1 ENST00000543651 ; transcript_alias_2 ENST00000543651.1 ; transcript_alias_3 RP11-349K16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399705.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031894 ;
chr12	lncipedia.org	exon	128511536	128511711	.	-	.	gene_id lnc-SLC15A4-4 ; transcript_id lnc-SLC15A4-4:1 ; gene_alias_1 ENSG00000256643 ; gene_alias_2 RP11-349K16.1 ; gene_alias_3 ENSG00000256643.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000168427.1 ; transcript_alias_1 ENST00000543651 ; transcript_alias_2 ENST00000543651.1 ; transcript_alias_3 RP11-349K16.1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000399705.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT031894 ;
chr14	lncipedia.org	exon	24608654	24608685	.	+	.	gene_id lnc-PSME1-1 ; transcript_id lnc-PSME1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249554 ; transcript_alias_1 ENST00000506818 ;
chr14	lncipedia.org	exon	24608939	24609637	.	+	.	gene_id lnc-PSME1-1 ; transcript_id lnc-PSME1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249554 ; transcript_alias_1 ENST00000506818 ;
chr17	lncipedia.org	exon	56414576	56414671	.	+	.	gene_id lnc-LPO-1 ; transcript_id lnc-LPO-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000246115 ; transcript_alias_1 ENST00000500597 ;
chr17	lncipedia.org	exon	56414809	56415040	.	+	.	gene_id lnc-LPO-1 ; transcript_id lnc-LPO-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000246115 ; transcript_alias_1 ENST00000500597 ;
chr17	lncipedia.org	exon	56429096	56429275	.	+	.	gene_id lnc-LPO-1 ; transcript_id lnc-LPO-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000246115 ; transcript_alias_1 ENST00000500597 ;
chr17	lncipedia.org	exon	56429360	56431077	.	+	.	gene_id lnc-LPO-1 ; transcript_id lnc-LPO-1:7 ; gene_alias_1 ENSG00000246115 ; transcript_alias_1 ENST00000500597 ;
chr14	lncipedia.org	exon	29743959	29743987	.	-	.	gene_id lnc-PRKD1-3 ; transcript_id lnc-PRKD1-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000257522 ; gene_alias_2 RP11-562L8.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257522.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170373.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548306 ; transcript_alias_2 ENST00000548306.1 ; transcript_alias_3 RP11-562L8.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408749.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036197 ;
chr14	lncipedia.org	exon	29778386	29778523	.	-	.	gene_id lnc-PRKD1-3 ; transcript_id lnc-PRKD1-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000257522 ; gene_alias_2 RP11-562L8.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257522.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170373.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548306 ; transcript_alias_2 ENST00000548306.1 ; transcript_alias_3 RP11-562L8.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408749.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036197 ;
chr14	lncipedia.org	exon	29787162	29787208	.	-	.	gene_id lnc-PRKD1-3 ; transcript_id lnc-PRKD1-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000257522 ; gene_alias_2 RP11-562L8.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257522.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170373.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548306 ; transcript_alias_2 ENST00000548306.1 ; transcript_alias_3 RP11-562L8.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408749.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036197 ;
chr14	lncipedia.org	exon	29815651	29815731	.	-	.	gene_id lnc-PRKD1-3 ; transcript_id lnc-PRKD1-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000257522 ; gene_alias_2 RP11-562L8.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257522.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170373.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548306 ; transcript_alias_2 ENST00000548306.1 ; transcript_alias_3 RP11-562L8.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408749.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036197 ;
chr14	lncipedia.org	exon	29847499	29847662	.	-	.	gene_id lnc-PRKD1-3 ; transcript_id lnc-PRKD1-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000257522 ; gene_alias_2 RP11-562L8.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257522.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170373.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548306 ; transcript_alias_2 ENST00000548306.1 ; transcript_alias_3 RP11-562L8.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408749.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036197 ;
chr14	lncipedia.org	exon	29850387	29850496	.	-	.	gene_id lnc-PRKD1-3 ; transcript_id lnc-PRKD1-3:2 ; gene_alias_1 ENSG00000257522 ; gene_alias_2 RP11-562L8.1 ; gene_alias_3 ENSG00000257522.1 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000170373.1 ; transcript_alias_1 ENST00000548306 ; transcript_alias_2 ENST00000548306.1 ; transcript_alias_3 RP11-562L8.1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000408749.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT036197 ;
chr9	lncipedia.org	exon	114991488	114991602	.	+	.	gene_id lnc-HSDL2-1 ; transcript_id lnc-HSDL2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245756 ; transcript_alias_1 ENST00000500353 ;
chr9	lncipedia.org	exon	114992111	114992595	.	+	.	gene_id lnc-HSDL2-1 ; transcript_id lnc-HSDL2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000245756 ; transcript_alias_1 ENST00000500353 ;
chr21	lncipedia.org	exon	46839631	46841534	.	-	.	gene_id lnc-SLC19A1-1 ; transcript_id lnc-SLC19A1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000183535 ; gene_alias_2 NCRNA00175 ; gene_alias_3 ENSG00000183535.5 ; gene_alias_4 COL18A1-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000090401.3 ; transcript_alias_1 ENST00000397787 ; transcript_alias_2 ENST00000397787.1 ; transcript_alias_3 COL18A1-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000269033.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT082960 ; transcript_alias_6 NR_028082 ;
chr21	lncipedia.org	exon	46842327	46842576	.	-	.	gene_id lnc-SLC19A1-1 ; transcript_id lnc-SLC19A1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000183535 ; gene_alias_2 NCRNA00175 ; gene_alias_3 ENSG00000183535.5 ; gene_alias_4 COL18A1-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000090401.3 ; transcript_alias_1 ENST00000397787 ; transcript_alias_2 ENST00000397787.1 ; transcript_alias_3 COL18A1-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000269033.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT082960 ; transcript_alias_6 NR_028082 ;
chr21	lncipedia.org	exon	46843685	46844955	.	-	.	gene_id lnc-SLC19A1-1 ; transcript_id lnc-SLC19A1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000183535 ; gene_alias_2 NCRNA00175 ; gene_alias_3 ENSG00000183535.5 ; gene_alias_4 COL18A1-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000090401.3 ; transcript_alias_1 ENST00000397787 ; transcript_alias_2 ENST00000397787.1 ; transcript_alias_3 COL18A1-AS1-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000269033.2 ; transcript_alias_5 NONHSAT082960 ; transcript_alias_6 NR_028082 ;
chr3	lncipedia.org	exon	42975744	42976848	.	-	.	gene_id lnc-CYP8B1-1 ; transcript_id lnc-CYP8B1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000206552 ; gene_alias_2 RP11-141M3.3 ; gene_alias_3 ENSG00000206552.4 ; gene_alias_4 KRBOX1-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156447.1 ; transcript_alias_1 ENST00000447834 ; transcript_alias_2 ENST00000447834.1 ; transcript_alias_3 KRBOX1-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000344229.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT089273 ;
chr3	lncipedia.org	exon	42977249	42978277	.	-	.	gene_id lnc-CYP8B1-1 ; transcript_id lnc-CYP8B1-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000206552 ; gene_alias_2 RP11-141M3.3 ; gene_alias_3 ENSG00000206552.4 ; gene_alias_4 KRBOX1-AS1 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000156447.1 ; transcript_alias_1 ENST00000447834 ; transcript_alias_2 ENST00000447834.1 ; transcript_alias_3 KRBOX1-AS1-001 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000344229.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT089273 ;
chr11	lncipedia.org	exon	94884217	94884666	.	+	.	gene_id lnc-ENDOD1-1 ; transcript_id lnc-ENDOD1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245552 ; gene_alias_2 RP11-712B9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000245552.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167830.2 ; transcript_alias_1 ENST00000534864 ; transcript_alias_2 ENST00000534864.1 ; transcript_alias_3 RP11-712B9.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000396516.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT023766 ;
chr11	lncipedia.org	exon	94890792	94890967	.	+	.	gene_id lnc-ENDOD1-1 ; transcript_id lnc-ENDOD1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245552 ; gene_alias_2 RP11-712B9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000245552.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167830.2 ; transcript_alias_1 ENST00000534864 ; transcript_alias_2 ENST00000534864.1 ; transcript_alias_3 RP11-712B9.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000396516.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT023766 ;
chr11	lncipedia.org	exon	94937970	94938044	.	+	.	gene_id lnc-ENDOD1-1 ; transcript_id lnc-ENDOD1-1:2 ; gene_alias_1 ENSG00000245552 ; gene_alias_2 RP11-712B9.2 ; gene_alias_3 ENSG00000245552.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000167830.2 ; transcript_alias_1 ENST00000534864 ; transcript_alias_2 ENST00000534864.1 ; transcript_alias_3 RP11-712B9.2-002 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000396516.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT023766 ;
chr6	lncipedia.org	exon	24667807	24669720	.	-	.	gene_id lnc-TDP2-1 ; transcript_id lnc-TDP2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249810 ; transcript_alias_1 ENST00000503700 ;
chr6	lncipedia.org	exon	24669773	24670175	.	-	.	gene_id lnc-TDP2-1 ; transcript_id lnc-TDP2-1:1 ; gene_alias_1 ENSG00000249810 ; transcript_alias_1 ENST00000503700 ;
chr20	lncipedia.org	exon	52014199	52017025	.	-	.	gene_id lnc-ZNF217-2 ; transcript_id lnc-ZNF217-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000231703 ; gene_alias_2 RP4-669H2.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436286 ;
chr20	lncipedia.org	exon	52017671	52017772	.	-	.	gene_id lnc-ZNF217-2 ; transcript_id lnc-ZNF217-2:2 ; gene_alias_1 ENSG00000231703 ; gene_alias_2 RP4-669H2.1 ; transcript_alias_1 ENST00000436286 ;
chr7	lncipedia.org	exon	27162167	27162285	.	+	.	gene_id lnc-EVX1-10 ; transcript_id lnc-EVX1-10:8 ; gene_alias_1 ENSG00000253552 ; gene_alias_2 AC004080.12 ; gene_alias_3 ENSG00000253552.2 ; gene_alias_4 HOXA-AS2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000063274.3 ; gene_alias_6 ENSG00000253552.3 ; transcript_alias_1 ENST00000521159 ; transcript_alias_2 ENST00000521159.1 ; transcript_alias_3 HOXA-AS2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407129.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT119678 ;
chr7	lncipedia.org	exon	27163079	27163257	.	+	.	gene_id lnc-EVX1-10 ; transcript_id lnc-EVX1-10:8 ; gene_alias_1 ENSG00000253552 ; gene_alias_2 AC004080.12 ; gene_alias_3 ENSG00000253552.2 ; gene_alias_4 HOXA-AS2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000063274.3 ; gene_alias_6 ENSG00000253552.3 ; transcript_alias_1 ENST00000521159 ; transcript_alias_2 ENST00000521159.1 ; transcript_alias_3 HOXA-AS2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407129.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT119678 ;
chr7	lncipedia.org	exon	27163950	27164229	.	+	.	gene_id lnc-EVX1-10 ; transcript_id lnc-EVX1-10:8 ; gene_alias_1 ENSG00000253552 ; gene_alias_2 AC004080.12 ; gene_alias_3 ENSG00000253552.2 ; gene_alias_4 HOXA-AS2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000063274.3 ; gene_alias_6 ENSG00000253552.3 ; transcript_alias_1 ENST00000521159 ; transcript_alias_2 ENST00000521159.1 ; transcript_alias_3 HOXA-AS2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407129.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT119678 ;
chr7	lncipedia.org	exon	27173700	27173921	.	+	.	gene_id lnc-EVX1-10 ; transcript_id lnc-EVX1-10:8 ; gene_alias_1 ENSG00000253552 ; gene_alias_2 AC004080.12 ; gene_alias_3 ENSG00000253552.2 ; gene_alias_4 HOXA-AS2 ; gene_alias_5 OTTHUMG00000063274.3 ; gene_alias_6 ENSG00000253552.3 ; transcript_alias_1 ENST00000521159 ; transcript_alias_2 ENST00000521159.1 ; transcript_alias_3 HOXA-AS2-003 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000407129.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT119678 ;
chr12	lncipedia.org	exon	72649461	72649554	.	-	.	gene_id lnc-ZFC3H1-6 ; transcript_id lnc-ZFC3H1-6:4 ; gene_alias_1 ENSG00000236333 ; gene_alias_2 AC087886.1 ; gene_alias_3 ENSG00000236333.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150370.2 ; gene_alias_5 ENSG00000236333.3 ; gene_alias_6 TRHDE-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000550334 ; transcript_alias_2 ENST00000550334.1 ; transcript_alias_3 AC087886.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405387.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029463 ;
chr12	lncipedia.org	exon	72658262	72658401	.	-	.	gene_id lnc-ZFC3H1-6 ; transcript_id lnc-ZFC3H1-6:4 ; gene_alias_1 ENSG00000236333 ; gene_alias_2 AC087886.1 ; gene_alias_3 ENSG00000236333.2 ; gene_alias_4 OTTHUMG00000150370.2 ; gene_alias_5 ENSG00000236333.3 ; gene_alias_6 TRHDE-AS1 ; transcript_alias_1 ENST00000550334 ; transcript_alias_2 ENST00000550334.1 ; transcript_alias_3 AC087886.1-005 ; transcript_alias_4 OTTHUMT00000405387.1 ; transcript_alias_5 NONHSAT029463 ;
chr12	lncipedia.org	exon	726656