lncipediaTranscriptID conservation syntenic_region LINC01725:44 No - lnc-ZFHX3-27:11 No - lnc-GPR119-1:1 No - CACNA1G-AS1:3 No - TNFRSF14-AS1:18 No - PIK3CD-AS2:1 Yes chr3R:20628972-20634732 SNHG12:5 No - NNT-AS1:9 No - PITPNM2-AS1:6 No - DUBR:2 No - lnc-HOMER2-2:2 Yes chr2L:6719394-6723359 SNHG1:14 No - LINC00922:3 No - lnc-RNF227-2:1 Yes chr2L:2878344-2879001 lnc-ABHD12B-2:1 No - lnc-GRHL2-4:1 No - lnc-KCNC2-2:3 No - lnc-MYO19-1:1 Yes chr2L:8466817-8488671 LINC02372:15 No - LINC02447:27 No - lnc-NAA50-3:1 Yes chr2L:13000770-13004107 LIFR-AS1:6 No - lnc-DCAF1-1:1 Yes chr2R:7962463-7969805 lnc-PABPC4L-5:1 No - PRR7-AS1:4 No - LINC00958:1 No - FRG1-DT:27 No - lnc-REXO5-1:2 No - ZNF674-AS1:2 No - TRHDE-AS1:10 Yes chr3R:21740105-21744431 lnc-COX19-2:1 No - LINC02327:27 No - lnc-ENPP1-1:1 No - LINC02413:13 No - lnc-CRYBA4-52:14 No - lnc-MAPK6-3:9 Yes chr3R:30532607-30578905 lnc-C2CD4B-2:2 No - lnc-CRYBA4-52:28 No - lnc-UQCRHL-1:5 No - SNHG6:11 No - PCED1B-AS1:4 No - lnc-OR1J2-2:1 No - lnc-IGHMBP2-1:1 No - SOCS2-AS1:1 Yes chr2R:8127575-8129476 LINC00200:1 No - MRGPRF-AS1:4 No - MIR3663HG:2 No - SNHG1:30 No - SNAP25-AS1:8 No - lnc-FGF3-2:3 No - lnc-ZNF644-1:4 No - MIR205HG:1 No - lnc-CHID1-1:1 No - MALINC1:76 No - IFNG-AS1:4 No - lnc-ITIH2-3:1 No - HDAC2-AS2:83 Yes chr3L:4626734-4629467 lnc-MEIS2-2:1 Yes chr3L:15832464-15833947 STXBP5-AS1:8 No - lnc-ZNF681-2:1 No - TRHDE-AS1:4 Yes chr3R:21740105-21744431 lnc-NINJ1-2:1 No - lnc-CCDC8-1:1 Yes chr3R:9747875-9751094 LINC01124:18 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-CPM-2:5 Yes chr2L:10733293-10736071 lnc-HMGB2-3:3 Yes chrX:18495067-18499986 lnc-GPR63-1:1 No - lnc-CIT-1:4 No - PLUT:6 Yes chr3R:6752864-6754194 lnc-RARRES2-1:1 No - DCTN1-AS1:5 Yes chr3L:19538425-19544172 lnc-DIAPH1-1:1 No - ZFHX4-AS1:7 No - MEF2C-AS1:4 Yes chr2R:9913496-9958858 lnc-COL20A1-2:1 No - RAB30-AS1:22 No - LINC00158:1 No - LINC02447:25 No - lnc-WIF1-6:31 No - HDAC2-AS2:109 Yes chr2R:18718114-18754675 lnc-DHX37-9:4 No - lnc-PTPRE-1:2 No - ZNF529-AS1:22 No - lnc-IQCG-1:1 Yes chr2L:17367511-17384115 MIR4500HG:6 No - lnc-SPRYD3-1:1 Yes chr3R:9528238-9533011 lnc-JAM3-3:1 No - LINC01504:2 No - lnc-HTR4-1:2 No - lnc-UCN-1:1 Yes chr2L:10544883-10628054 lnc-NXPE2-52:4 No - lnc-CRYBA4-52:38 No - lnc-PPP1R12B-2:1 Yes chr2L:2772327-2799979 DCTN1-AS1:7 No - lnc-INTS14-1:2 No - lnc-LRBA-1:1 No - MIR210HG:5 No - lnc-FAM49B-1:1 Yes chr2R:8114286-8123001 lnc-ITGAL-2:2 No - lnc-NXPH1-2:6 No - LINC01366:6 No - lnc-HNRNPH1-2:1 No - LINC01725:31 No - SNHG11:13 No - LINC00671:1 No - lnc-JAM3-3:4 No - lnc-PNMA2-1:1 Yes chr3R:10126129-10139772 lnc-ANP32A-3:1 No - SNHG6:12 No - PART1:9 Yes chrX:3176440-3343767 WEE2-AS1:5 Yes chr2L:6911090-6914138 ALKBH3-AS1:7 No - GMDS-DT:88 No - LINC02456:9 No - SOX2-OT:30 Yes chr2L:8825645-8829670 PTPRG-AS1:2 No - lnc-AP3S1-124:1 Yes chr2R:18616692-18619328 lnc-PPM1H-7:1 Yes chr2L:8116965-8124010 WEE2-AS1:11 Yes chr2L:6911090-6914138 lnc-SLC39A11-1:7 No - LINC00668:9 No - lnc-EVX1-15:1 No - lnc-PTS-1:2 No - lnc-SRP68-1:1 No - TRAF3IP2-AS1:9 No - LINC00963:19 No - LINC01266:1 No - lnc-CCDC68-2:1 Yes chr2L:10388105-10393228 lnc-VWDE-2:1 Yes chr2L:17486806-17497208 TLX1NB:2 Yes chr3R:21499986-21512814 LINC00158:6 No - lnc-PRKD1-3:5 No - lnc-VSX1-1:1 No - lnc-SOX5-1:1 No - lnc-ZNF708-2:1 No - MIR924HG:1 No - lnc-PPARA-1:1 Yes chr3R:8676915-8678955 lnc-DCTD-65:19 No - lnc-LARP1B-1:4 No - lnc-TMEM30B-1:2 Yes chr3R:29039156-29049148 lnc-BOLL-1:1 Yes chr3R:14249043-14259991 LINC00668:5 No - ATP6V0E2-AS1:9 Yes chr3L:21539862-21541215 SNHG1:26 No - HAGLR:12 No - lnc-LRRC72-3:1 Yes chr3R:22586149-22586625 ATP2C2-AS1:4 Yes chr3L:22749444-22787631 STX18-AS1:4 Yes chr3R:24623802-24625562 LINC01102:8 No - LINC00472:3 No - lnc-SDSL-13:2 No - lnc-NKX2-3-1:2 No - LINC01693:13 No - MEF2C-AS1:13 Yes chr2R:9913496-9958858 LRRC75A-AS1:67 No - lnc-CRYBA4-52:16 No - lnc-FBN1-3:2 Yes chr2L:11011312-11012135 PPFIA2-AS1:17 Yes chr2L:6723903-6732766 lnc-SDCBP-2:1 Yes chr3L:1600726-1602674 lnc-ZNF345-29:3 No - SNHG1:28 No - LINC01550:12 No - EPHA5-AS1:1 No - lnc-SLC14A1-5:1 No - ZBED5-AS1:8 No - lnc-ROBO3-2:1 No - RASSF8-AS1:7 Yes chr3R:25661795-25665640 LINC01776:31 No - NRSN2-AS1:18 No - lnc-SERPIND1-1:58 No - lnc-WIF1-6:21 No - BAALC-AS1:13 No - SNHG12:2 Yes chr2L:4453169-4454453 MIR924HG:6 No - lnc-RNF149-2:1 No - LINC00939:5 No - lnc-MYOM1-2:6 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-NBEA-2:1 Yes chr2R:4815426-4824319 SNCA-AS1:2 No - LINC-PINT:78 No - MIR205HG:9 No - lnc-TMEM53-1:1 Yes chr3R:22724884-22726414 lnc-BRSK1-1:1 No - lnc-CENPVL2-3:1 Yes chr2L:12434452-12441279 lnc-FAAP20-2:1 No - lnc-ZNF705E-1:19 Yes chrX:19243631-19245224 lnc-RHOV-1:1 Yes chr3R:19368995-19403153 lnc-GPR183-47:20 Yes chr2L:20730416-20734309 PCED1B-AS1:9 No - lnc-SLC30A7-2:6 No - LINC01693:12 No - lnc-FGFR2-12:13 No - lnc-C3orf85-4:6 No - IFNG-AS1:5 No - lnc-UGDH-1:1 Yes chr2R:24531594-24533391 lnc-EVPL-1:1 Yes chr2R:21389405-21392439 ALKBH3-AS1:1 No - lnc-KLF4-14:1 Yes chr3R:8690980-8697822 lnc-TRMT61B-5:2 Yes chr3R:29765995-29794113 lnc-CCDC102B-1:1 Yes chr2L:6491061-6496988 lnc-KCNV2-1:1 Yes chrX:21346503-21349843 LINC00599:2 No - lnc-UQCRHL-1:1 Yes chr2L:159032-203397 lnc-RPRML-3:28 No - TUG1:19 No - lnc-ALCAM-2:1 No - ZMIZ1-AS1:3 No - LINC01992:4 No - lnc-PHLPP1-1:4 No - lnc-CRYBA4-52:56 No - lnc-USP6NL-3:1 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-RAB19-1:1 No - PAXBP1-AS1:4 No - lnc-LLPH-2:9 No - lnc-ZNF567-2:1 No - FTX:15 No - PRKG1-AS1:8 Yes chr2L:3622074-3656953 lnc-ZNF682-1:1 No - LINC01788:7 No - lnc-ZKSCAN8-2:1 No - WEE2-AS1:3 Yes chr2L:6911090-6914138 lnc-RPS24-3:7 No - PTPRG-AS1:3 Yes chr3R:29377646-29487131 FLVCR1-DT:26 No - lnc-NBN-1:5 No - lnc-NECAB1-1:1 Yes chr3L:22728111-22733446 lnc-CPN2-4:2 No - lnc-ZNF101-1:1 No - LINC02052:18 No - lnc-MKLN1-2:1 No - GAS5:32 No - LINC01405:1 No - TRAM2-AS1:11 No - lnc-PRAC2-6:1 No - PTPRG-AS1:1 No - lnc-EIF2AK4-1:5 No - lnc-SOX5-5:13 Yes chr4:800436-834393 ZNF426-DT:20 No - CPEB2-DT:26 No - GABPB1-AS1:7 No - LINC02418:12 No - FMR1-AS1:7 No - lnc-NQO2-5:1 No - lnc-NBN-1:2 No - LINC00609:1 No - LINC02288:19 No - lnc-PXDC1-1:1 No - LINC00612:2 No - PPFIA2-AS1:16 Yes chr2L:6723903-6732766 SLC2A1-AS1:1 Yes chr3L:914074-993788 KCTD21-AS1:4 No - LINC02298:24 No - LINC02369:23 No - LINC01359:9 No - lnc-MTUS2-1:1 Yes chr3L:22881045-22893821 LINC00574:4 No - lnc-ENPP1-1:3 No - lnc-LARP1B-1:2 No - lnc-EMP1-1:2 Yes chrX:1483625-1507809 lnc-CYB5R2-3:6 No - lnc-CIB3-1:1 No - lnc-SOD3-6:3 No - LINC02468:5 No - lnc-RAB23-1:2 No - SAMMSON:1 No - lnc-TMEM132B-4:18 No - lnc-CES5A-3:6 No - SNHG12:1 Yes chr2L:4453169-4454453 STXBP5-AS1:14 No - TRAF3IP2-AS1:11 Yes chr2R:7793625-7801044 LINC01234:9 No - LINC00402:5 No - lnc-GPR39-4:2 No - RASSF8-AS1:8 No - SDCBP2-AS1:9 No - EIF1B-AS1:4 No - LINC02397:20 No - DACT3-AS1:3 No - XIST:25 No - lnc-ZNF814-1:1 No - lnc-TBC1D22A-4:2 No - GAS5:43 No - lnc-VSX1-1:9 No - lnc-NBN-1:6 No - lnc-SLC39A10-3:1 No - lnc-CCDC73-1:1 No - lnc-DHX37-9:11 No - lnc-SOX5-5:27 Yes chr4:800436-834393 SOX2-OT:13 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-HASPIN-2:1 No - MCM8-AS1:1 Yes chr3R:15823019-15832632 LINC00461:13 No - lnc-ACTR2-3:13 No - SNHG11:5 No - lnc-DCTD-65:10 No - OSTM1-AS1:2 Yes chr3L:3333119-3334978 lnc-FOXG1-22:2 No - LINC00476:12 No - lnc-COL2A1-2:1 No - LINC02298:19 No - RPL34-AS1:7 No - CASC2:12 No - NOP14-AS1:3 Yes chr3R:17535533-17539963 PCED1B-AS1:2 No - LINC02327:40 No - FAM222A-AS1:8 No - SNHG12:12 No - lnc-GTF2B-15:3 Yes chr2R:9252310-9285097 lnc-EPS8L1-1:1 Yes chr3R:18378124-18381178 RAPGEF4-AS1:4 No - lnc-HARS-3:1 Yes chr3R:16484566-16495422 LINC00698:5 No - LINC00900:10 No - MIR210HG:4 No - lnc-VMO1-1:1 Yes chr2R:21290914-21292181 MIR4300HG:2 No - LINC02446:5 No - LINC00261:4 No - LINC02532:42 No - LRRC75A-AS1:2 No - lnc-HEXA-1:1 No - lnc-P2RX5-5:1 Yes chr2R:15258761-15262873 MIR4300HG:1 No - lnc-NBN-1:3 No - LINC01405:3 No - MEF2C-AS1:8 Yes chr2R:9913496-9958858 LINC01102:1 No - GPRC5D-AS1:38 No - LINC02475:10 No - RASSF8-AS1:5 Yes chr3R:25661795-25665640 lnc-KLF4-14:2 No - LINC02327:44 No - LINC02175:19 No - CARMN:18 No - LINC02125:6 Yes chr3L:12146519-12156990 SOX2-OT:24 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-ZNF574-1:10 Yes chr2L:12587625-12628135 MIR99AHG:12 No - lnc-DCTD-65:29 No - lnc-JAM3-3:7 No - lnc-LINC00483-1:1 No - NTRK3-AS1:2 No - lnc-JAM2-1:1 No - lnc-CRYBA4-52:1 No - LOXL1-AS1:1 Yes chr2R:21789623-21791580 lnc-GRM7-2:5 No - CASC18:4 No - HOXA-AS2:13 Yes chr3R:6752864-6754194 lnc-EXOSC6-2:1 No - RAPGEF4-AS1:1 Yes chr2R:6759715-6798941 lnc-LRPPRC-1:1 No - PSMG3-AS1:1 No - lnc-FANCL-1:1 Yes chr3R:26864605-26866807 DSCR9:1 No - LINC02356:10 No - lnc-ALX4-5:2 No - LINC01898:6 No - LINC01351:16 No - RASSF8-AS1:6 Yes chr3R:25661795-25665640 lnc-CYB5R2-3:3 No - lnc-MCF2L-1:1 Yes chrX:16405509-16414651 MIR137HG:4 Yes chrX:9196808-9201820 LINC00461:9 No - lnc-ZNF644-1:3 No - LINC01169:3 No - LINC00847:13 No - lnc-RNF113B-2:1 Yes chr3R:4649176-4654624 lnc-M1AP-1:1 No - LINC02268:15 No - lnc-CAND1-3:2 Yes chr2L:10358134-10362707 LINC01168:1 No - lnc-CYB5R2-3:8 No - lnc-CHSY1-5:1 No - lnc-COA4-1:1 No - lnc-HIST1H2BA-1:1 Yes chr2R:16973927-16996057 lnc-ACTR2-3:17 No - lnc-GADD45B-1:1 No - MIR646HG:8 No - lnc-DHX37-9:9 No - MIR9-3HG:1 No - lnc-GRM7-3:1 No - lnc-LYPLA1-1:2 No - LINC-PINT:80 No - HDAC2-AS2:123 No - SOX2-OT:7 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-TOR1AIP1-2:1 No - RPL34-AS1:5 No - LINC01268:5 No - lnc-XRCC3-1:1 Yes chr3L:12746616-12750056 MIR4500HG:4 No - lnc-ITGB2-1:1 No - lnc-CBARP-2:1 Yes chrX:10711163-10744943 lnc-C8orf74-1:2 No - lnc-ADAMTSL4-2:1 Yes chr3L:14029579-14031706 LINC02579:8 No - lnc-SLC15A1-1:1 Yes chr3R:17085513-17087988 lnc-NAT2-1:1 No - FAM111A-DT:19 No - LINC01415:1 No - NNT-AS1:5 No - lnc-CRYBA4-52:6 No - LINC01159:6 No - VLDLR-AS1:6 No - lnc-NACA2-10:1 Yes chrX:4412856-4485647 lnc-RPS24-3:1 No - MIR99AHG:15 No - lnc-FAM78A-1:1 Yes chr2R:22918937-22924742 MYCNOS:5 Yes chrX:3373159-3391697 lnc-FAM20C-3:7 No - LRRC75A-AS1:66 No - lnc-SVIL-1:1 No - NEAT1:3 No - MALAT1:23 No - lnc-WDR1-1:2 No - lnc-CXCL2-1:1 No - lnc-SLC38A6-1:1 Yes chr2R:10738617-10739829 PSMG3-AS1:13 No - SNHG11:14 No - lnc-ZCCHC9-1:1 No - lnc-ADAM10-1:1 No - MIR646HG:23 No - PCF11-AS1:3 No - lnc-ANGPTL2-3:1 Yes chrX:18097558-18101314 LINC01305:1 Yes chrX:9729648-9782094 LINC00857:2 No - PITPNM2-AS1:8 No - LINC00877:6 No - LINC00958:6 No - lnc-AATK-10:2 Yes chrX:6082634-6090201 MEF2C-AS1:14 Yes chr2R:9913496-9958858 TP53TG1:13 No - XIST:24 No - LINC00615:2 No - lnc-LINC00483-1:3 No - lnc-KLF17-1:5 No - lnc-PLK1-1:5 Yes chr2L:15005733-15006607 SNHG11:17 No - lnc-RDM1-1:1 No - lnc-ATP6AP2-4:1 No - LRRC75A-AS1:42 No - lnc-NFYB-2:1 Yes chr2L:16879517-16886319 lnc-TMEM69-1:1 Yes chr2L:13216290-13219923 lnc-SLC10A5-1:1 No - lnc-ZNF429-2:1 No - lnc-DNAJC7-1:1 No - FZD10-DT:37 No - TRAF3IP2-AS1:15 No - PCED1B-AS1:5 No - lnc-RTN2-1:1 Yes chr2R:14852941-14853948 lnc-CEP41-1:1 Yes chrX:17080423-17087675 SNHG5:27 No - lnc-COA6-6:1 No - lnc-TSSK6-4:1 No - PCED1B-AS1:7 No - lnc-NKX2-6-1:1 No - lnc-WIF1-6:32 No - lnc-EMP1-1:1 Yes chrX:1483625-1507809 lnc-GADD45A-9:5 Yes chr3L:11166620-11169625 lnc-ZNF100-10:2 No - lnc-CIB1-1:1 No - lnc-CHSY1-5:3 No - lnc-IL12RB2-1:1 No - lnc-CHP2-1:1 Yes chr2R:16898535-16901575 ZBED5-AS1:11 No - lnc-PIGBOS1-1:7 No - STX18-AS1:8 No - lnc-NBN-1:1 No - lnc-TFAP2A-4:1 No - LINC00461:4 No - XIST:23 No - GMDS-DT:105 No - lnc-LIX1-1:1 Yes chr3R:23227727-23248903 lnc-CCDC140-1:5 No - lnc-ACTR2-3:7 No - LINC00621:1 No - lnc-EYS-1:1 Yes chr3R:12413828-12421251 LINC00944:1 No - GAS5:5 No - lnc-SCRN3-3:2 No - lnc-JAM3-3:3 No - LINC00964:20 No - SAP30L-AS1:3 No - lnc-SULF1-3:1 No - lnc-SCAND1-3:1 Yes chr2R:19229063-19243751 SNHG1:5 No - lnc-CYB5R2-3:14 No - lnc-TAF7-3:1 No - lnc-ZNF136-1:1 No - lnc-ZNF26-12:1 No - lnc-HPGDS-1:1 No - PCED1B-AS1:10 No - LINC01194:1 No - lnc-USP34-1:6 No - LINC01405:7 No - lnc-HNRNPA3-1:1 Yes chr3R:23185580-23226711 EIF1B-AS1:6 No - lnc-IL6-3:2 No - lnc-BIN3-2:1 No - SCAMP1-AS1:4 No - PTPRG-AS1:10 Yes chr3R:29377646-29487131 BAALC-AS1:10 No - LINC00954:6 No - lnc-WIF1-6:13 No - LINC01498:2 No - lnc-HPCAL1-1:8 No - SAP30L-AS1:1 No - lnc-DAGLA-1:1 No - LINC00472:11 No - LINC01366:7 No - MIR503HG:5 No - lnc-RPIA-1:3 No - lnc-CRYBA4-52:79 No - LINC00615:1 No - lnc-ARL13A-1:1 No - lnc-CLRN2-1:1 Yes chr3L:9134560-9135916 NEAT1:6 No - LINC01060:1 No - TRG-AS1:5 No - lnc-DSCC1-1:1 No - lnc-F2RL2-2:1 No - SNHG1:27 No - lnc-ZBED5-1:1 No - lnc-CCDC57-1:1 No - MYCNOS:1 Yes chrX:3373159-3391697 lnc-C2CD4B-13:1 Yes chr3L:8545001-8574409 lnc-CPVL-4:2 No - lnc-DET1-1:17 Yes chr2L:10973443-10975293 lnc-MINDY2-2:1 Yes chrX:17911462-17924163 lnc-TRMT61B-5:1 Yes chr3R:29765995-29794113 lnc-ATG7-1:1 No - lnc-PPM1H-1:1 No - lnc-DDX27-3:1 Yes chr2R:18117896-18125779 SOX5-AS1:11 Yes chr4:800436-834393 CARMN:9 No - GAS5:6 No - lnc-SPRTN-2:1 Yes chr3R:5257037-5269507 lnc-ZNF689-1:1 No - lnc-DNASE1L3-2:1 No - LINC01970:6 No - lnc-C1QTNF8-4:1 No - MIR205HG:11 No - GMDS-DT:92 No - LINC00663:9 No - LINC00877:9 No - NNT-AS1:7 No - lnc-ENPP1-1:2 No - lnc-KLRC4-KLRK1-2:1 No - BAALC-AS1:17 No - LINC01159:3 No - LINC00964:6 No - lnc-PJVK-2:22 Yes chr2L:13382652-13385671 lnc-WIF1-6:35 No - LINC00682:6 No - lnc-LYPD5-1:1 No - LINC02347:14 No - lnc-APAF1-1:1 Yes chr3R:23375928-23384777 RMST:17 No - lnc-PDCD7-1:1 No - CASC2:2 Yes chrX:18635642-18647648 LINC01018:1 No - RAD51-AS1:5 Yes chr3R:30054696-30056037 lnc-CRYBA4-52:55 No - lnc-LMTK3-1:1 Yes chr2L:21740041-21757466 LINC02470:13 No - ZBED5-AS1:6 No - lnc-UGGT1-1:1 No - lnc-DDX51-6:1 Yes chrX:1012779-1046040 APCDD1L-DT:42 No - LINC02202:26 No - SNHG17:12 No - lnc-PDE6A-1:1 Yes chr3R:4422483-4429335 KCNMB2-AS1:10 No - SOCS2-AS1:2 Yes chr2R:8127575-8129476 SPATA3-AS1:9 No - RASSF8-AS1:1 Yes chr3R:25661795-25665640 FGF13-AS1:1 No - lnc-IFT140-2:1 No - lnc-COQ9-1:1 Yes chr2L:15036293-15038861 lnc-ZNF404-1:2 No - SEC24B-AS1:2 Yes chr2R:9876232-9882357 APCDD1L-DT:26 No - LINC01234:5 No - lnc-AMPH-2:1 No - lnc-SLC26A8-1:1 Yes chr2R:7272275-7278101 lnc-SLC30A7-2:3 Yes chr3R:22582028-22583225 PRKG1-AS1:6 Yes chr2L:3622074-3656953 C9orf135-DT:11 No - lnc-FAM86B2-58:2 No - lnc-SPO11-1:3 No - LINC00900:4 No - lnc-KLHL13-1:1 Yes chr3R:29869365-29875159 LINC00958:7 No - lnc-SHANK2-1:2 Yes chr2L:6723903-6732766 lnc-SPRTN-1:1 No - RAB30-AS1:14 No - LINC00518:3 No - SNHG1:10 No - lnc-ALX4-8:1 No - PARD6G-AS1:2 Yes chrX:17703352-17707096 GATA3-AS1:8 Yes chr3R:8147368-8181444 lnc-RIMBP2-6:1 Yes chrX:6225647-6236218 SNHG6:1 No - lnc-NRGN-1:2 No - SLC2A1-AS1:2 Yes chr3L:914074-993788 GAS5:1 No - lnc-HYAL3-1:1 No - LINC02067:7 No - lnc-NBN-1:8 No - FTX:9 No - lnc-OR7C2-1:1 No - lnc-TSTA3-2:1 Yes chr2L:8464488-8466694 lnc-DEC1-3:4 No - lnc-ANXA2R-1:16 No - lnc-C12orf49-9:1 No - GMDS-DT:113 No - lnc-RNF186-1:1 No - STX18-AS1:5 Yes chr3R:24623802-24625562 LINC01234:1 No - lnc-FAM46C-1:1 Yes chr2R:7716807-7782637 lnc-PABPC4L-5:13 No - lnc-BEST3-1:1 No - SOX2-OT:32 Yes chr2L:8825645-8829670 PART1:6 Yes chrX:3176440-3343767 lnc-BLID-3:2 No - lnc-NAA16-2:1 Yes chr2L:13219979-13221398 LINC01060:2 No - lnc-FAM84B-15:112 No - LINC00461:17 No - lnc-ZNF322-2:1 No - LINC00663:11 No - lnc-GLUD1-1:1 No - lnc-BRD3OS-1:1 No - VPS33B-DT:17 Yes chr3R:25347431-25475756 BAALC-AS1:14 No - lnc-C11orf88-1:1 Yes chrX:16074717-16091495 lnc-SLC6A12-3:4 Yes chr3L:21034535-21075444 LINC01684:27 No - LINC00877:14 No - lnc-CD9-1:1 No - LINC02226:21 No - LINC02402:4 No - LINC01124:19 Yes chr2L:7377702-7384344 UBA6-AS1:6 No - lnc-ADAMTS14-2:1 No - lnc-NUP107-26:1 No - WEE2-AS1:7 Yes chr2L:6911090-6914138 CARMN:14 No - LRRC75A-AS1:49 No - lnc-PHKB-5:1 No - lnc-DIAPH1-2:1 No - lnc-NFRKB-2:1 No - lnc-PTN-2:1 Yes chr2R:24378630-24390294 LINC01801:13 No - lnc-GXYLT2-1:1 No - LINC02347:21 No - lnc-MPEG1-1:1 No - lnc-SLX4IP-1:2 Yes chr3R:27172090-27194267 LINC00900:9 No - LINC02405:24 No - LINC01588:93 No - SOX2-OT:12 No - WEE2-AS1:10 Yes chr2L:6911090-6914138 LINC00926:20 No - lnc-GOLGA8O-5:7 No - TNFRSF14-AS1:28 No - PTPRD-AS1:4 Yes chr2L:19586623-19732069 lnc-ERV3-1-1:1 No - lnc-CRYBA4-52:47 No - HDAC2-AS2:64 No - SEC24B-AS1:1 Yes chr2R:9876232-9882357 TRHDE-AS1:1 Yes chr3R:21740105-21744431 DCTN1-AS1:4 Yes chr3L:19538425-19544172 CPEB2-DT:21 No - LINC02052:20 No - LINC02579:11 No - ZRANB2-AS2:13 No - lnc-BTG4-2:1 No - SNHG12:13 Yes chr2L:4453169-4454453 lnc-NECAB1-1:3 Yes chr3L:22728111-22733446 lnc-ZFC3H1-8:4 No - lnc-RTL1-3:17 No - HOXA-AS2:4 Yes chr3R:6752864-6754194 lnc-USP34-1:3 No - LINC01990:12 No - lnc-COA6-6:4 No - ZSCAN16-AS1:3 No - HAGLR:10 No - lnc-STRN3-1:2 No - lnc-TCEANC2-1:1 No - MIMT1:2 No - GMDS-DT:90 No - LINC01305:3 Yes chrX:9729648-9782094 GATA2-AS1:2 Yes chr3R:8147368-8181444 MIR548XHG:1 No - LINC00479:1 No - LINC00612:1 No - lnc-CYB5R2-3:4 No - PURPL:35 No - LINC01359:6 No - SNHG6:13 No - lnc-GK3P-1:3 No - LINC02453:19 No - LINC00630:3 No - lnc-CRACR2A-1:2 Yes chr3R:10786481-10788226 lnc-TNFRSF13B-1:1 No - lnc-RFLNA-3:4 Yes chrX:12684203-12742618 MIR205HG:12 No - FOXP1-AS1:4 Yes chr3R:9726020-9730872 LINC00461:8 No - lnc-SCGB2B2-131:1 No - MIR3150BHG:5 Yes chrX:11891732-11893745 NBAT1:2 No - lnc-SHANK2-1:3 Yes chr2L:6723903-6732766 lnc-CD3D-9:1 Yes chr3R:14263358-14286903 lnc-SERPIND1-1:46 No - lnc-ARMC6-1:1 Yes chr3R:5485543-5489489 lnc-B3GNT10-21:19 No - SNHG5:16 No - MIR548XHG:4 No - LINC01301:8 No - KCNMB2-AS1:6 No - lnc-IL34-3:1 No - lnc-RAB15-1:1 No - SATB2-AS1:8 No - lnc-SMARCB1-1:3 Yes chr2R:8087396-8089297 NNT-AS1:1 No - lnc-HPCAL1-2:1 No - lnc-ATP4B-1:1 Yes chr2R:13222433-13228202 lnc-GOLGA8R-1:1 No - lnc-C17orf80-1:1 No - LINC00847:10 No - lnc-CEP83-6:1 No - LINC00943:3 No - lnc-EFEMP1-3:2 Yes chr2L:2999286-3016069 LINC01359:10 No - LINC02135:5 No - LINC00944:2 No - lnc-CALM2-2:4 No - lnc-MYO1D-1:1 Yes chr2R:14750166-14752910 lnc-ZNF720-1:3 No - HAGLR:15 No - lnc-INF2-1:5 No - lnc-ERGIC2-5:1 No - lnc-USP44-4:2 No - lnc-NUBPL-1:1 No - LINC01312:1 No - CARMN:19 No - lnc-PABPC4L-9:3 No - lnc-C21orf58-1:1 No - BAALC-AS1:5 No - OIP5-AS1:9 No - LINC01303:29 Yes chr2R:9252310-9285097 lnc-PIK3C2G-1:1 No - SNHG12:14 Yes chr2L:4453169-4454453 MIR924HG:5 No - LINC01583:1 No - UBA6-AS1:10 No - lnc-TMEM105-1:1 No - lnc-SENP6-3:1 No - lnc-IKBIP-14:1 No - EPB41L4A-AS1:6 Yes chr3R:31311157-31371748 lnc-EVI5L-5:2 No - GAS5:22 No - lnc-ZNF8-2:1 No - SOCS2-AS1:4 Yes chr2R:8127575-8129476 LINC00861:6 No - TMEM72-AS1:1 No - lnc-DAD1-2:1 No - lnc-FH-1:1 Yes chrX:16838173-16844433 lnc-RNFT2-1:1 Yes chrX:15570380-15572149 lnc-SLC15A4-14:3 No - lnc-STX4-1:2 No - lnc-TSHR-9:7 Yes chr3R:27251112-27256463 lnc-NBN-1:4 No - lnc-PRSS23-1:3 No - DDX11-AS1:1 Yes chrX:1236873-1239884 FAM111A-DT:27 No - FLG-AS1:3 No - lnc-ANKRD11-3:1 Yes chrX:2694392-2698211 lnc-FGFR2-12:12 No - BAALC-AS1:15 No - lnc-B3GNT10-21:14 No - HHIP-AS1:4 No - lnc-MRPL19-1:1 Yes chr3R:4077939-4104326 lnc-GRHL2-9:1 No - LINC01184:19 No - EPB41L4A-AS1:5 Yes chr3R:31311157-31371748 lnc-COX6A1-1:1 No - lnc-KCNA1-97:26 No - HIPK1-AS1:2 No - LINC02376:5 No - lnc-WRNIP1-3:1 Yes chr2L:4975300-4977023 LINC00964:2 No - lnc-SPRY1-11:31 No - PAX8-AS1:31 Yes chr4:1088798-1113317 SPATA3-AS1:12 No - lnc-TIPIN-1:1 No - lnc-RPS24-3:3 No - lnc-TMC6-2:1 No - LINC02268:9 No - lnc-SLC39A11-1:3 No - lnc-P4HA1-1:1 No - ARNTL2-AS1:3 Yes chr3L:19813770-19815938 lnc-SPAG9-1:1 No - lnc-RIMS3-5:1 No - LINC00954:3 No - KCNQ1-AS1:2 No - lnc-SOD3-6:1 No - lnc-HIST1H2AI-3:4 No - lnc-TMEM88B-1:1 No - lnc-GRHL3-1:1 No - lnc-SERPIND1-1:32 No - LINC02401:11 No - SLC26A4-AS1:2 Yes chr3L:17898889-17907812 LINC01136:3 No - lnc-TMEM189-2:1 No - CARMN:1 No - lnc-GOPC-1:1 No - lnc-BEST3-1:4 No - lnc-LXN-1:2 No - lnc-TIMM13-1:1 No - LINC02372:19 No - lnc-CNMD-1:1 Yes chr3R:8304190-8305274 LINC00858:1 No - IFNG-AS1:2 No - lnc-RADIL-1:1 Yes chr3L:11114169-11120783 lnc-CRYBA4-52:9 No - lnc-VSX1-1:2 No - LRRC75A-AS1:60 No - EPB41L4A-AS1:1 Yes chr3R:31311157-31371748 HAGLR:27 No - lnc-GRM7-2:1 No - lnc-HSD3B2-1:1 No - CASC16:5 No - MIR646HG:17 No - FZD10-DT:51 No - lnc-HNRNPU-3:1 Yes chr2L:7844905-7855475 LINC00996:1 No - lnc-TCAIM-2:1 No - LINC00908:2 No - FRG1-DT:24 No - LINC02327:43 No - HIPK1-AS1:4 No - lnc-MAPK6-4:2 No - DACT3-AS1:5 No - CBR3-AS1:12 No - lnc-TRIB1-3:1 No - SNHG1:31 No - lnc-CT47A1-1:1 Yes chr3R:23935958-23943101 lnc-DDX39A-1:1 Yes chr2R:8614722-8625203 SNHG1:15 No - PCAT19:1 No - lnc-TUB-1:1 No - BDNF-AS:23 No - lnc-TMEM132B-10:3 No - RNF144A-AS1:3 Yes chr2R:10740054-10798709 lnc-PYGL-1:1 No - GAS5:40 No - lnc-RHOG-1:1 Yes chrX:19196058-19201979 lnc-DSCAML1-1:4 No - lnc-DCAF17-2:1 No - lnc-KLF17-1:2 No - lnc-CRYBA4-52:26 No - lnc-C12orf74-5:6 No - lnc-ADGRL4-6:1 No - LINC01624:4 No - lnc-FLII-1:1 No - XIST:19 No - GAS5:37 No - MIR210HG:1 No - lnc-LY86-4:1 No - LINC01964:4 No - lnc-CES5A-3:1 No - HOXA-AS2:3 Yes chr3R:6752864-6754194 LINGO1-AS1:1 Yes chr2R:21872030-21946259 IL10RB-DT:17 No - LINC01684:24 No - lnc-RD3-1:1 Yes chrX:16415046-16417585 LINC01134:2 No - GMDS-DT:91 No - HDAC2-AS2:125 No - lnc-CPVL-4:1 No - RPL34-AS1:2 No - lnc-CRYBA4-52:81 No - SLC25A5-AS1:4 Yes chrX:10778954-10786907 LINC00518:1 No - ATP6V0E2-AS1:11 Yes chr3L:21539862-21541215 SNHG1:11 No - lnc-DRD2-3:1 Yes chrX:4132887-4206093 LINC00964:18 No - lnc-SEPT9-3:4 No - GAS5:33 No - MEF2C-AS1:19 No - lnc-ZNF136-1:2 No - RERG-AS1:1 No - APTR:10 No - lnc-RBKS-11:4 No - SNHG1:16 No - CASC2:7 No - LINC00996:3 No - HDAC2-AS2:102 No - lnc-MYBBP1A-2:1 Yes chr2R:16124981-16138238 LINC02029:13 No - lnc-WNT8A-57:3 Yes chr2R:17703335-17719346 RAD51-AS1:2 Yes chr3R:30054696-30056037 lnc-FNBP1-4:1 Yes chrX:9228796-9232378 PURPL:50 No - LINC00963:33 No - lnc-REL-6:3 No - LINC01312:3 No - PCED1B-AS1:1 No - lnc-SULF1-3:4 No - lnc-CENPV-1:1 No - SNAP25-AS1:2 No - lnc-DLGAP2-2:5 No - LINC00939:1 No - lnc-FAM86B2-58:6 No - lnc-FAM228B-1:1 No - LINC00265:6 No - FAM111A-DT:28 No - lnc-CYP4F22-1:1 No - TRAF3IP2-AS1:13 No - lnc-JCAD-2:1 No - lnc-RTKN2-1:1 Yes chrX:18843663-18855858 lnc-ALDH3B1-2:7 No - lnc-DAD1-2:3 No - HOXA-AS2:7 Yes chr3R:6752864-6754194 lnc-B3GNT10-21:25 No - LINC00885:1 No - LINC00682:1 No - lnc-USP34-1:2 No - LINC00698:10 No - lnc-CCT4-2:1 No - lnc-DUSP1-4:2 Yes chr3L:18898875-18900408 lnc-LGALSL-2:3 No - lnc-CPNE8-1:3 No - lnc-CHST4-3:1 No - lnc-SERPIND1-1:37 No - lnc-TMEM160-1:1 Yes chrX:17639147-17652562 POT1-AS1:9 No - lnc-NMI-1:1 No - lnc-SOX5-5:18 Yes chr4:800436-834393 APCDD1L-DT:29 No - lnc-C20orf96-3:1 Yes chr2R:23978801-23985177 SNHG5:4 No - MEF2C-AS1:3 Yes chr2R:9913496-9958858 lnc-SLC46A2-1:1 No - lnc-GRM7-3:2 No - LINC01224:13 No - LINC01819:14 No - LINC02356:12 No - lnc-ZNF644-1:6 No - lnc-FAM84B-15:113 No - lnc-FOXC1-2:1 No - LINC00963:17 No - LRRC75A-AS1:65 No - lnc-TSPAN33-2:1 No - lnc-CALM2-2:1 No - LINC02347:15 No - STXBP5-AS1:11 No - LINC00963:31 No - lnc-ENDOD1-1:7 Yes chr2R:23713900-23734846 SPATA3-AS1:5 No - lnc-ANP32E-1:1 No - lnc-PLCB1-1:1 No - LRRC75A-AS1:41 No - lnc-CCDC63-1:1 No - lnc-B3GNT10-21:29 No - RNF144A-AS1:7 Yes chr2R:10740054-10798709 WDFY3-AS2:4 Yes chr2L:5907169-5922776 TUB-AS1:2 Yes chr2R:21101928-21123704 lnc-YTHDF1-1:1 No - LINC02327:29 No - HAGLR:22 No - L3MBTL4-AS1:2 Yes chr3R:27266326-27273273 lnc-ZNF740-2:1 Yes chr2L:13821248-13823979 LINC02441:5 No - lnc-SERPIND1-1:47 No - lnc-FDX1-1:2 No - lnc-PRKD1-3:2 No - lnc-HSDL2-1:1 Yes chr3R:31846987-32015520 COL18A1-AS1:2 Yes chr3L:6998843-7053499 KRBOX1-AS1:1 No - lnc-ENDOD1-1:2 Yes chr2R:23713900-23734846 lnc-TDP2-1:1 Yes chr3L:2600331-2601536 lnc-ITGAL-1:1 No - lnc-ZNF217-2:2 No - HOXA-AS2:11 Yes chr3R:6752864-6754194 TRHDE-AS1:8 Yes chr3R:21740105-21744431 lnc-IRX3-80:33 Yes chr3L:12609631-12710249 RAB30-AS1:23 No - lnc-KLF17-1:3 No - ALKBH3-AS1:3 No - lnc-KCNT2-2:1 No - ZMIZ1-AS1:1 Yes chr3L:10857889-10876496 CACNA1G-AS1:2 No - SNHG12:15 Yes chr2L:4453169-4454453 LINC00472:12 No - GAS5:7 No - lnc-OGFOD1-2:1 Yes chr2R:10437985-10465701 lnc-PDZD8-4:1 No - LINC02388:5 No - lnc-PIK3R3-6:1 Yes chr3L:15566013-15576313 lnc-GFI1B-3:1 Yes chr3R:24130307-24134654 lnc-KIAA1191-1:1 No - LINC00847:16 No - lnc-CIT-1:1 No - SNHG11:16 No - lnc-P2RX7-1:1 No - LINC01750:10 No - lnc-RAB40B-1:1 No - APTR:7 No - FMR1-AS1:1 Yes chr3R:10101420-10110121 MIR99AHG:7 No - lnc-ZNF726-1:4 No - lnc-SULF1-3:2 No - lnc-TMEM88B-3:1 No - POT1-AS1:2 No - APTR:8 No - lnc-NXPH2-3:1 No - LINC01136:4 No - lnc-RIPOR2-1:1 No - lnc-NCKIPSD-1:5 No - lnc-ZNF506-2:1 No - lnc-TMEM88B-3:3 Yes chr3L:13017149-13017867 SNHG12:3 Yes chr2L:4453169-4454453 SNHG6:14 No - GAS5:34 No - lnc-SENP2-1:2 No - LINC00461:21 No - LINC01016:6 No - MIR646HG:18 No - lnc-DIO3-4:1 No - MEF2C-AS1:18 No - lnc-CPN2-4:1 No - LHX1-DT:15 No - lnc-RMI1-6:1 No - MYCNOS:4 Yes chrX:3373159-3391697 lnc-DAD1-2:4 No - SAP30L-AS1:6 Yes chr2L:3470182-3472364 lnc-ANKRD54-1:1 No - RASSF8-AS1:4 Yes chr3R:25661795-25665640 lnc-RPLP1-12:23 No - UBOX5-AS1:4 Yes chr3R:30425427-30428276 lnc-WIF1-6:23 No - lnc-PATJ-2:1 Yes chr4:268175-276369 SNHG1:2 No - LINC01750:13 No - lnc-SETD4-1:1 Yes chr3L:1618414-1620397 lnc-SLC35B4-3:1 Yes chr3R:5754932-5758997 LINC00857:1 No - lnc-ZFC3H1-8:2 No - LINC00943:8 No - lnc-STAT1-1:1 Yes chr2R:12670483-12679593 LRRC75A-AS1:63 No - DCTN1-AS1:2 Yes chr3L:19538425-19544172 LIFR-AS1:2 No - lnc-KLHDC3-1:1 Yes chr3R:14512639-14513637 LINC01016:3 No - LINC01864:5 No - MEF2C-AS1:23 No - SNHG1:29 No - lnc-C20orf203-1:4 No - lnc-DET1-1:18 Yes chr2L:10973443-10975293 lnc-AAK1-2:1 Yes chrX:20171445-20173514 BAALC-AS1:4 No - EWSAT1:1 No - lnc-FBXL7-2:1 Yes chr2R:20727829-20730610 BAALC-AS1:20 No - FTX:14 No - lnc-ZMYND19-2:1 Yes chr3L:176306-178963 MIR646HG:9 No - LINC02008:5 No - lnc-CADM1-1:1 No - lnc-PRL-2:1 Yes chr3R:30052514-30054697 lnc-CPM-2:1 Yes chr2L:10733293-10736071 lnc-BLID-3:1 No - lnc-MLXIP-1:1 No - LINC01234:4 No - MIR503HG:10 No - LINC02388:6 No - lnc-CCDC140-1:1 No - FRY-AS1:1 Yes chr3L:9631834-9679103 TLX1NB:3 Yes chr3R:21499986-21512814 lnc-ZNF473-4:1 Yes chr3R:26864605-26866807 GABPB1-AS1:15 No - lnc-MAP1LC3B2-1:13 No - LINC01819:13 No - LINC01366:5 No - lnc-RPGRIP1-2:1 No - lnc-SRPRA-9:3 Yes chrX:2740384-3134532 MIR646HG:14 No - SNHG11:1 No - MIR646HG:13 No - DANCR:10 No - DCTN1-AS1:1 Yes chr3L:19538425-19544172 OSTM1-AS1:1 Yes chr3L:3333119-3334978 lnc-SERPIND1-1:33 No - NIPBL-DT:14 No - LINC01139:1 No - DPH6-DT:16 No - lnc-ANKRD27-2:1 No - lnc-STC2-1:1 No - LINC02418:9 No - lnc-SLC30A7-2:7 No - lnc-ULK4-1:1 Yes chrX:1891401-1900646 lnc-SMIM14-2:1 Yes chr2R:12027985-12033725 FAM111A-DT:30 No - LINC00974:1 No - LINC02405:29 No - PTPRG-AS1:7 Yes chr3R:29377646-29487131 LINC01094:12 No - lnc-CRYBA4-52:69 No - SNHG5:15 No - LINC01184:9 No - lnc-HIST4H4-2:1 Yes chr2L:21423737-21424229 LINC02327:42 No - HDAC2-AS2:95 Yes chr3L:4626734-4629467 lnc-PPM1M-2:1 Yes chr3R:14122654-14124474 lnc-SETD6-1:2 No - lnc-ANKS4B-5:1 Yes chrX:16881347-16882790 lnc-PRDM14-1:1 No - lnc-CCDC6-1:2 Yes chr3L:7655389-7718395 HAGLR:1 Yes chr3R:6661427-6678590 RAB30-AS1:15 No - MIR646HG:20 No - SNHG1:17 No - LINC01838:7 No - MIR31HG:3 No - lnc-ATP1A3-1:1 Yes chr3R:20860187-20866231 lnc-MTERF1-5:1 Yes chr3L:14274343-14368639 lnc-KLF13-2:8 Yes chr2L:476446-479688 FGF13-AS1:2 No - lnc-ZNF720-1:5 No - LINC00957:5 No - lnc-ZNF667-2:1 No - lnc-ZSCAN10-3:7 No - lnc-ATMIN-4:1 No - LINC00662:42 No - C9orf135-DT:13 No - RNF144A-AS1:8 Yes chr2R:10740054-10798709 LINC00652:5 No - lnc-SRSF1-1:2 No - lnc-FGF3-2:1 No - lnc-ZIC5-2:1 No - lnc-CDH6-3:1 No - LINC01270:7 No - lnc-SLC30A7-2:2 Yes chr3R:22582028-22583225 SNHG1:32 No - LINC01550:11 No - lnc-MAP1LC3B2-28:1 No - MALINC1:75 No - lnc-APELA-1:2 No - WEE2-AS1:1 No - lnc-PDE10A-2:4 No - XIST:1 No - IL12A-AS1:2 No - lnc-SRSF6-3:1 No - lnc-NAT1-3:17 No - PCF11-AS1:2 No - COL18A1-AS1:1 Yes chr3L:6998843-7053499 lnc-PJVK-2:6 Yes chr2L:13382652-13385671 lnc-ENDOD1-1:6 Yes chr2R:23713900-23734846 lnc-LGALSL-2:2 No - lnc-CALM2-2:2 No - lnc-PHYHIP-2:1 No - lnc-BAALC-1:1 No - RAB30-AS1:16 No - LINC00461:12 No - lnc-LARP1B-1:1 No - RMST:1 No - lnc-AKAP3-2:1 Yes chr3R:28748384-28751661 lnc-CNEP1R1-1:1 No - lnc-MFAP5-1:1 No - GATA2-AS1:3 Yes chr3R:8147368-8181444 SNHG11:4 No - GAS5:3 No - lnc-PRKD1-3:3 No - ADAMTS9-AS2:4 Yes chr2R:22807860-22815993 ELOVL2-AS1:4 No - lnc-CRYBA4-52:25 No - lnc-TBCC-1:1 No - GMDS-DT:89 No - PDYN-AS1:16 No - lnc-KLF17-1:1 No - lnc-CNNM3-1:1 No - lnc-PPP1R3G-8:1 No - HDAC2-AS2:104 Yes chr2R:18718114-18754675 lnc-ZNF136-1:3 No - lnc-C4orf36-3:1 Yes chr2L:2885929-2954406 FENDRR:4 No - lnc-RBBP6-1:5 Yes chr4:649041-663103 lnc-CKAP4-3:1 Yes chr2R:12039041-12042623 lnc-ZNF587-2:1 No - lnc-NCKIPSD-1:6 Yes chr2R:22212835-22217264 lnc-CREG1-3:1 No - LINC01070:4 No - lnc-RDH10-4:1 Yes chr2R:18117896-18125779 lnc-CDC27-2:3 No - LINC02424:3 No - CASC18:1 No - lnc-KIAA0141-1:1 No - lnc-COA6-6:6 No - lnc-ENDOD1-1:8 Yes chr2R:23713900-23734846 lnc-NXPH1-2:4 Yes chr3L:21131446-21133310 LINC01136:5 No - VPS33B-DT:20 No - lnc-ENDOD1-1:9 No - lnc-MAP1LC3B2-28:6 No - SNHG17:10 No - LINC00963:15 No - LINC01301:5 No - LINC02458:14 No - lnc-STOM-1:1 Yes chr2L:17486806-17497208 lnc-ANXA2R-1:8 No - DANCR:8 No - lnc-C12orf29-1:1 No - MIR548A1HG:7 No - lnc-SERPIND1-1:57 No - lnc-ERV3-1-10:9 No - CARMN:15 No - lnc-PPP1R3G-9:3 No - lnc-ACBD6-2:1 Yes chr3R:23702761-23704542 SNHG17:22 No - lnc-DHX37-9:10 No - MIR9-3HG:14 No - TNFRSF14-AS1:24 No - TMEM132D-AS1:24 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-HIST1H2BK-1:1 No - lnc-NXPE2-52:3 No - lnc-CALM2-2:3 No - LINC02459:5 No - LRRC75A-AS1:68 No - MALAT1:32 No - lnc-RHBG-1:1 No - lnc-SIAH1-1:1 No - TUSC8:7 No - lnc-CTDSP2-1:2 No - LINC02008:6 No - lnc-VKORC1L1-2:1 No - lnc-SOX5-5:17 Yes chr4:800436-834393 LINC00963:1 No - lnc-GATM-1:7 No - lnc-RPIA-1:6 No - PTPRG-AS1:11 Yes chr3R:29377646-29487131 lnc-PRKACG-1:1 Yes chr2R:22874769-22881436 lnc-BMP6-106:93 No - LYPLAL1-DT:5 Yes chr3R:10853374-10854451 UBL7-AS1:1 No - SATB2-AS1:2 No - ELOVL2-AS1:9 No - LINC01301:3 No - lnc-DHX37-6:1 No - FZD10-DT:46 No - GSEC:12 Yes chr3R:5753318-5754774 GAS5:20 No - LINC00847:14 No - lnc-MSANTD3-1:8 No - LINC02419:5 No - LINC00963:37 No - lnc-BAK1-2:1 No - lnc-GOLGA6A-1:1 No - lnc-MRPS17-1:1 Yes chrX:16070365-16073568 lnc-SERHL2-3:1 Yes chr3R:25832230-25842878 APCDD1L-DT:30 No - MALINC1:58 Yes chr4:558016-567257 lnc-TRPM7-1:1 No - LINC00964:12 No - lnc-LGALSL-2:5 No - lnc-KCNT1-2:1 No - LINC00886:4 No - POT1-AS1:8 No - CASC2:11 No - LINC00964:13 No - lnc-CLRN2-1:2 No - RMST:14 No - lnc-DCTD-65:3 No - lnc-BRF1-1:1 No - lnc-KLHL28-3:5 No - LINC01533:2 No - lnc-MAP6-2:1 Yes chr2R:7712578-7714182 FTX:6 No - LINC01227:3 No - LINC02293:20 No - lnc-ALX4-5:3 Yes chrX:7908931-7911885 lnc-ZNF132-1:1 No - lnc-RPP40-1:2 No - ZMIZ1-AS1:5 No - DANCR:6 No - LINC02458:9 No - LINC02347:19 No - SOX2-OT:36 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-PHACTR4-1:1 Yes chr3L:3714826-3806459 SPATA3-AS1:6 No - LINC00526:2 No - lnc-SYPL2-1:1 Yes chr2R:17412767-17413769 STX18-AS1:7 Yes chr3R:24623802-24625562 lnc-TNFSF4-3:1 No - PCED1B-AS1:11 No - lnc-JUN-5:1 No - lnc-CYP7B1-2:1 Yes chr2L:17589184-17591267 lnc-TBC1D22A-4:3 No - LINC00461:22 No - lnc-GADD45G-3:1 No - lnc-GNA14-1:1 No - NEXN-AS1:1 No - lnc-C11orf1-1:1 No - lnc-LARP1B-1:3 No - lnc-NETO1-1:9 No - LINC02315:13 No - lnc-NKX6-1-2:1 No - lnc-DUSP1-3:1 No - lnc-ENDOD1-1:5 Yes chr2R:23713900-23734846 RAB30-AS1:1 No - lnc-SLC30A7-2:5 No - LINC02519:32 No - TBC1D8-AS1:9 Yes chr3L:21337681-21343716 lnc-TIMP3-2:1 No - lnc-RALB-8:1 No - lnc-GGT5-1:1 No - lnc-PRSS23-1:2 No - lnc-B3GNT10-1:33 No - LINC01016:9 No - RASSF8-AS1:2 Yes chr3R:25661795-25665640 lnc-GRM1-1:1 Yes chr3L:6174248-6178941 LINC00476:6 No - PCF11-AS1:9 No - PTPRG-AS1:15 Yes chr3R:29377646-29487131 SCAMP1-AS1:5 No - lnc-ALX4-5:4 Yes chrX:7908931-7911885 GMDS-DT:102 No - lnc-CTDSP2-1:4 No - TESC-AS1:4 No - lnc-JMJD1C-2:1 No - TLX1NB:1 Yes chr3R:21499986-21512814 LINC00877:13 No - RMST:8 No - lnc-GATM-1:4 No - LINC00698:6 No - LINC02350:21 No - lnc-FGFR1OP-18:3 No - lnc-IKBIP-1:1 Yes chr3L:14537651-14540441 VLDLR-AS1:3 Yes chr3R:25698727-25740465 lnc-RTP4-1:1 No - lnc-PDSS2-2:1 Yes chr2R:11827170-11839825 lnc-LOXL1-1:1 No - TP53TG1:6 No - lnc-CYB5R2-3:7 No - lnc-GJA10-4:1 No - lnc-SHANK2-1:1 No - lnc-CYB5R2-3:1 No - lnc-ADAMTS20-1:1 No - lnc-TSHZ2-1:1 No - lnc-HPS6-1:1 Yes chrX:11219379-11302783 lnc-ITGB8-4:1 No - LINC02369:22 No - LINC01562:1 No - RNASEH1-AS1:17 Yes chr2R:7931054-7932380 DIO3OS:18 No - SOX2-OT:23 No - lnc-SLC25A30-1:1 No - lnc-MAK-5:4 No - lnc-GADD45B-1:2 No - lnc-POLR1A-2:1 No - TMPO-AS1:2 No - LINC00958:8 No - HAGLR:23 No - LINC00391:4 No - HDAC2-AS2:93 Yes chr3L:4626734-4629467 lnc-SERPIND1-1:56 No - LINC00963:12 No - TP53TG1:7 No - lnc-DRD2-3:2 Yes chrX:4132887-4206093 SRP14-AS1:6 No - GAS5:39 No - LINC01843:10 No - lnc-SLC6A12-3:2 Yes chr3L:21034535-21075444 lnc-SLC15A3-2:1 Yes chr3R:31458380-31459869 lnc-ATP1B3-3:1 Yes chr2R:13222433-13228202 LINC00927:50 No - lnc-TSSK6-4:2 Yes chr3R:15209204-15211347 lnc-NDRG2-1:1 Yes chr2L:9952072-9954181 lnc-PPA2-1:1 No - lnc-CDPF1-1:2 No - lnc-TAF7-4:1 No - LINC00662:7 No - GAS5:12 No - lnc-APMAP-1:1 No - DUBR:13 No - LINC02532:46 No - TMEM132D-AS1:25 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-GLB1L2-4:1 No - lnc-FBXO7-1:1 No - lnc-CRYBA4-52:17 No - LINC01127:21 No - PRR7-AS1:10 No - lnc-PRKD1-3:4 No - lnc-GAS2L2-1:1 Yes chrX:19731004-19734581 lnc-ZNF814-2:1 No - lnc-COL20A1-1:2 Yes chrX:8276200-8367169 lnc-C12orf74-3:23 Yes chrX:16074717-16091495 LINC00877:2 No - ZFHX4-AS1:6 No - lnc-ACOT9-2:1 No - lnc-TIGD6-1:1 Yes chr3L:17898889-17907812 FLG-AS1:7 No - lnc-CCDC140-1:3 No - lnc-FAM20C-3:6 No - LINC00599:1 No - lnc-GPR39-4:1 No - lnc-TMEM132B-10:4 No - LINC00900:7 No - SPACA6P-AS:1 No - APTR:9 No - lnc-NDUFV3-1:1 No - lnc-C1QTNF9-1:3 Yes chr3L:277437-305292 lnc-SLC25A16-3:1 No - RHOXF1-AS1:1 No - SNHG12:11 Yes chr2L:4453169-4454453 FRG1-DT:28 No - LINC01405:4 No - NNT-AS1:3 No - SOX2-OT:33 No - ADAMTS9-AS2:3 Yes chr2R:22807860-22815993 lnc-VN1R1-1:1 No - LINC01094:3 No - LINC00886:5 No - lnc-COL24A1-1:1 Yes chrX:12609977-12611667 lnc-RWDD4-1:1 No - lnc-CRYBA4-52:27 No - lnc-DCTD-65:31 No - lnc-MAP1LC3B2-28:5 No - MAPKAPK5-AS1:1 No - lnc-DCTD-65:11 No - LINC00847:15 No - lnc-NAT1-3:10 No - lnc-C19orf54-1:1 No - DSG2-AS1:1 No - LINC02325:30 No - lnc-SPRYD3-1:4 No - LINC00671:5 No - LRRC75A-AS1:69 No - lnc-PRPF18-2:1 No - SLC16A1-AS1:15 No - LINC02002:8 No - LINC01016:8 No - lnc-GSG1-1:1 No - CBR3-AS1:19 No - LINC01572:14 No - LINC00271:1 No - LINC00526:3 No - LINC02397:24 No - RORA-AS1:7 Yes chr2R:10203995-10237348 NOP14-AS1:13 Yes chr3R:17535533-17539963 lnc-RPL36AL-1:1 Yes chr3R:30015513-30022221 lnc-RABGAP1-1:3 No - lnc-TMEM88B-3:5 Yes chr3L:13017149-13017867 lnc-ARFGEF2-2:6 No - LINC02527:6 No - lnc-NPIPB6-1:4 No - lnc-EFEMP1-3:1 Yes chr2L:2999286-3016069 NR2F1-AS1:24 No - USP3-AS1:7 No - lnc-PTS-1:5 No - APTR:11 No - SLC26A4-AS1:13 Yes chr3L:17898889-17907812 FENDRR:7 No - lnc-C9orf85-1:1 No - LIMD1-AS1:1 No - MALINC1:57 Yes chr4:558016-567257 lnc-AP3M1-1:1 Yes chrX:2214347-2222567 LINC01782:6 No - lnc-TMEM250-1:5 No - lnc-LMNTD2-3:1 No - ZNF582-AS1:18 No - lnc-TLE3-6:11 Yes chr2L:419952-420864 MIR646HG:7 No - lnc-C10orf90-3:1 Yes chr3R:23781765-23801634 lnc-WASHC3-2:1 Yes chrX:2076966-2078455 VASH1-AS1:11 No - LINC00518:6 No - WEE2-AS1:8 Yes chr2L:6911090-6914138 lnc-CYP7B1-2:2 No - lnc-ZNF726-1:2 No - lnc-KCNC2-2:4 No - MIR548XHG:3 No - SH3TC2-DT:40 No - TRHDE-AS1:7 Yes chr3R:21740105-21744431 LINC01016:2 No - TMEM51-AS1:1 Yes chr2R:22333500-22373109 TRAF3IP2-AS1:7 Yes chr2R:7793625-7801044 lnc-NKX6-1-1:1 No - MIR503HG:9 No - lnc-RNFT2-2:1 No - lnc-IGFL4-1:1 No - LINC00671:3 No - SOX2-OT:10 No - GATA3-AS1:2 Yes chr3R:8147368-8181444 lnc-MBOAT4-2:1 No - HAGLR:8 No - PRR7-AS1:7 No - lnc-VPS18-1:3 No - GAS5:42 No - LINC01060:11 No - lnc-FSIP1-4:32 No - LINC00895:11 No - LINC01301:9 No - lnc-COX19-2:2 No - lnc-NAA35-2:1 No - lnc-VEZF1-1:1 No - lnc-CPPED1-1:1 Yes chr2L:13177150-13178978 lnc-AUH-3:1 No - SOX2-OT:21 No - PCF11-AS1:6 No - lnc-ZNF720-1:1 No - lnc-PRDM9-4:6 No - lnc-JAM3-3:9 No - lnc-COL2A1-2:2 No - lnc-DES-1:1 No - RASAL2-AS1:4 No - lnc-ASCC2-1:1 No - LINC02286:16 No - lnc-CCDC102B-7:2 No - lnc-KIF13B-2:1 No - lnc-HIST1H2AI-1:3 No - SNHG1:18 No - HOXA-AS2:10 Yes chr3R:6752864-6754194 HOXA-AS2:8 Yes chr3R:6752864-6754194 lnc-KLRG2-1:1 No - TMEM132D-AS1:18 Yes chrX:6225647-6236218 LINC02418:13 No - NIFK-AS1:8 No - lnc-TSPYL6-1:1 Yes chr2L:5327975-5328879 lnc-PAGR1-2:10 No - lnc-CPN2-4:59 No - MIR99AHG:9 No - SNHG17:19 No - DNAJC3-DT:21 No - LIFR-AS1:5 No - lnc-QRFP-1:1 Yes chr3R:6642262-6644434 TRAF3IP2-AS1:18 No - ZNF528-AS1:9 No - GAS5:8 No - LINC01152:3 No - SNHG1:19 No - LINC02413:12 No - lnc-MAB21L2-1:1 Yes chrX:5085759-5254864 LINC02532:50 No - lnc-HSPB6-1:1 No - lnc-RMDN3-1:1 Yes chr3R:30054696-30056037 lnc-ZNF681-2:2 No - lnc-IGFL3-3:1 No - lnc-IKZF2-3:2 No - lnc-CENPB-3:1 No - lnc-GLTP-1:1 No - STXBP5-AS1:5 No - lnc-SEC24B-1:1 No - lnc-TESC-1:1 No - lnc-DUT-1:1 No - MIR4500HG:2 No - lnc-ARF6-2:1 No - lnc-SLC35G3-1:3 No - LINC00652:3 No - ALKBH3-AS1:5 No - MALINC1:77 No - lnc-ACTR2-3:14 No - GATA6-AS1:1 No - SNHG1:20 No - PTOV1-AS1:1 No - LINC00683:4 No - LINC01285:2 No - SNHG1:24 No - lnc-TMTC2-1:1 No - STXBP5-AS1:4 No - HHIP-AS1:1 No - lnc-JAM3-3:5 No - lnc-TIGD4-2:1 No - lnc-ALX4-5:1 Yes chrX:7908931-7911885 ITFG2-AS1:39 No - lnc-SMG6-1:1 No - lnc-RPLP1-12:38 No - LINC00271:9 No - LINC02532:45 No - LINC01132:2 No - LINC02411:11 No - lnc-VWA8-2:1 No - LINC00656:2 No - UBA6-AS1:9 No - GMDS-DT:72 No - lnc-PIPOX-4:7 Yes chrX:6295389-6298970 GABPB1-AS1:11 No - lnc-RRM1-1:1 Yes chrX:15934495-15940451 SNHG8:6 No - LINC00664:1 No - LINC02293:23 No - lnc-NUP153-1:1 Yes chr2L:1151678-1158262 ST3GAL5-AS1:7 No - lnc-CPM-3:1 Yes chr3L:1859115-1862239 lnc-TMEM99-5:1 No - lnc-HERC6-2:1 No - lnc-SEMA5B-1:1 No - lnc-ARHGAP17-1:1 No - lnc-IRX3-80:44 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-GNG2-1:2 No - HOXA-AS2:5 Yes chr3R:6752864-6754194 lnc-RGS3-1:1 No - lnc-NWD2-1:1 No - lnc-NUBPL-1:4 No - SNHG10:2 Yes chrX:14837471-14838198 lnc-WIF1-6:30 No - lnc-USP34-1:7 No - LINC00630:1 No - lnc-SUSD1-1:2 No - lnc-SEC24D-1:1 No - lnc-B2M-1:1 No - TRAF3IP2-AS1:14 Yes chr2R:7793625-7801044 PTPRG-AS1:8 Yes chr3R:29377646-29487131 lnc-POMP-1:1 No - SIRPG-AS1:1 No - SNHG1:13 No - MYCNOS:2 Yes chrX:3373159-3391697 lnc-CSDC2-1:2 No - LINC00158:3 No - LINC01194:2 No - lnc-RPIA-2:1 Yes chr3R:5458563-5464753 SPATA3-AS1:13 No - lnc-USP34-1:4 No - lnc-THEGL-1:1 No - lnc-KANSL1-2:1 No - lnc-PKD1L3-1:1 Yes chr3L:6754017-6756497 OSER1-DT:29 No - XIST:20 No - LINC02181:3 No - LINC00877:11 No - SMC2-AS1:2 No - lnc-ERG28-1:1 Yes chr2R:7595265-7620711 SH3TC2-DT:38 No - LINC02156:9 No - lnc-SNX10-2:7 No - LINC00943:2 No - lnc-DAD1-2:5 No - LINC01266:2 No - lnc-KHNYN-1:2 No - lnc-LARP1B-1:5 No - lnc-CALML6-2:1 Yes chrX:15860115-15866175 lnc-USP44-4:1 No - PCED1B-AS1:12 No - WEE2-AS1:6 Yes chr2L:6911090-6914138 lnc-SMIM37-1:6 No - TMEM132D-AS1:33 Yes chrX:6225647-6236218 SNHG5:9 No - lnc-PJVK-2:20 Yes chr2L:13382652-13385671 lnc-CLGN-2:1 No - lnc-NTM-1:1 No - lnc-OXCT1-1:8 No - RAD51-AS1:4 Yes chr3R:30054696-30056037 VLDLR-AS1:9 No - LINC00943:4 No - LINC02202:29 No - lnc-C17orf58-4:1 Yes chr3L:233926-246912 lnc-RPIA-1:1 No - lnc-TAF7-6:1 No - lnc-JAM3-3:6 No - MEF2C-AS1:5 Yes chr2R:9913496-9958858 LINC00265:13 No - XIST:22 No - lnc-TMEM88B-3:4 No - lnc-CX3CR1-1:1 No - LINC00958:9 No - ZSCAN16-AS1:4 No - SNHG17:13 No - SH3TC2-DT:35 No - lnc-PCED1B-1:4 No - lnc-FDX1-1:4 No - lnc-FOXG1-22:1 No - MALINC1:74 No - lnc-CPN2-4:4 No - lnc-RUNDC3B-1:1 Yes chr3L:6234323-6245746 FTX:12 No - HDAC2-AS2:96 No - lnc-NPAS4-1:3 No - SNAP25-AS1:1 No - ZFHX4-AS1:5 No - lnc-TSR3-1:1 No - MAPKAPK5-AS1:17 No - lnc-ARSF-3:1 No - LINC01234:7 No - lnc-FARP1-2:1 Yes chr3R:4649176-4654624 LINC01159:7 No - DUBR:3 No - LINC00964:17 No - lnc-TEAD2-1:1 No - lnc-GRM6-1:1 No - lnc-B4GALNT1-1:1 No - LHX1-DT:16 No - LRRC75A-AS1:50 No - lnc-TMEM211-1:1 No - lnc-IL4R-2:12 No - lnc-SLC39A11-10:33 No - GAS5:41 No - PSMG3-AS1:8 No - lnc-LARP1B-1:13 No - lnc-SNX10-2:3 No - MEF2C-AS1:11 Yes chr2R:9913496-9958858 lnc-SMAD3-1:1 No - lnc-ROBO3-2:2 No - lnc-NCL-2:1 No - lnc-NT5C2-1:1 Yes chr2R:7564434-7565751 LINC01224:7 No - lnc-DCAF8-1:1 No - BAALC-AS1:11 No - ISPD-AS1:10 No - RASAL2-AS1:3 No - lnc-SPRY1-11:35 No - RB1-DT:22 No - lnc-NCOA3-3:1 Yes chr3R:31669465-31677971 LNCAROD:19 No - lnc-INSM2-1:1 Yes chrX:12907986-12909622 lnc-RFX2-1:10 Yes chr3R:10361760-10378068 lnc-GPD2-1:1 Yes chr2L:20683462-20714588 RB1-DT:21 No - lnc-PIP5K1C-1:1 No - LINC00943:9 No - lnc-PRODH2-5:5 No - MIR99AHG:28 No - lnc-FAAH2-1:1 No - lnc-KCNE4-1:1 Yes chr2R:8665813-8683022 lnc-SYT13-2:1 No - OLMALINC:18 No - lnc-SPCS2-1:1 No - RASSF8-AS1:17 No - HIPK1-AS1:3 No - LINC01102:9 No - PRR29-AS1:1 No - MIR3150BHG:6 Yes chrX:11891732-11893745 SNHG6:4 No - lnc-DLGAP2-1:2 No - lnc-PERP-2:2 No - LINC01029:7 No - lnc-INAVA-1:9 No - lnc-DYNAP-1:2 No - lnc-UTP14C-1:1 No - lnc-CIT-1:2 No - IL21R-AS1:1 No - lnc-NCL-32:1 No - lnc-CYR61-3:1 No - BOLA3-AS1:14 Yes chr3R:22421161-22423302 SNHG1:4 No - lnc-NLRP2B-1:1 No - lnc-ZNF550-2:1 No - lnc-ETNK1-4:3 No - lnc-ARL5B-1:1 Yes chr3L:22872200-22873702 LINC00683:1 No - lnc-RPL30-1:1 No - lnc-TBC1D22A-4:1 No - LINC01852:19 No - LINC02370:8 No - lnc-HARS-6:1 Yes chr3R:16484566-16495422 lnc-MKRN2OS-1:2 No - C9orf135-DT:18 No - lnc-SLC15A4-14:1 No - lnc-PTS-1:1 No - ADAMTS9-AS2:5 Yes chr2R:22807860-22815993 lnc-APELA-1:3 No - LINC01586:5 No - lnc-INAVA-1:3 No - lnc-ZNF559-ZNF177-1:1 No - SNHG5:14 No - lnc-CTSV-2:3 No - lnc-BRD1-2:1 No - lnc-TFB2M-1:1 No - PLS3-AS1:1 Yes chrX:17285704-17301929 lnc-PRKD1-1:1 Yes chr3R:18303279-18314407 LINC01097:1 No - MIR99AHG:4 No - lnc-TMEM272-1:3 No - CARMN:20 No - lnc-CRYBA4-52:70 No - UBA6-AS1:18 No - lnc-RPS24-3:2 No - MIR503HG:3 No - TUG1:24 No - LINC00884:4 Yes chr4:132220-143123 lnc-RNASEH1-12:1 Yes chr3R:30206447-30209020 lnc-ANKRD9-1:1 Yes chr2R:7459685-7463395 THRIL:1 No - lnc-ENDOD1-1:1 No - LINC01858:10 No - lnc-LOXHD1-3:1 Yes chr3R:11744229-11750029 lnc-STARD9-1:1 Yes chr4:469409-488994 lnc-SLC6A15-1:1 No - lnc-AK4-1:1 No - lnc-HNF1B-3:1 No - LINC01725:43 No - STXBP5-AS1:7 No - LINC02204:14 No - LINC01204:1 No - lnc-ELMOD3-1:1 Yes chr4:69326-114270 LINC02298:23 No - LIMD1-AS1:3 Yes chrX:13826041-13830317 lnc-CSPP1-1:1 Yes chrX:17080423-17087675 MYCNOS:6 Yes chrX:3373159-3391697 lnc-RTN4-1:1 Yes chr2L:4958411-4965430 lnc-HMGB2-3:2 Yes chrX:18495067-18499986 lnc-STK17A-1:1 No - LINC01097:3 No - lnc-VSIG10-1:1 Yes chrX:19569721-19579800 lnc-ATXN7L3-1:3 No - LINC-PINT:74 No - RNF217-AS1:2 No - SNHG11:18 No - lnc-ERGIC2-2:2 Yes chrX:2201820-2203866 ISPD-AS1:4 No - lnc-RIMKLB-1:11 No - lnc-NBN-1:9 No - lnc-GPR68-1:1 No - LINC00461:7 No - LINC01859:15 No - COX10-AS1:4 No - lnc-PRKAG2-1:1 Yes chr3R:21140739-21214269 LINC01043:1 No - SNHG1:21 No - lnc-NBN-1:7 No - lnc-SEM1-1:1 Yes chr3R:30445635-30455867 lnc-PABPC4L-9:1 No - lnc-CCDC140-1:6 No - LINC00921:6 No - RMST:10 No - LINC00943:1 No - lnc-POTEB3-1:1 No - lnc-PGPEP1L-26:1 No - lnc-ZNF280D-3:4 Yes chr2R:15206527-15213634 lnc-RAD52-2:5 No - lnc-RAN-2:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-EN1-2:3 No - lnc-ALDH1A3-1:6 No - LRRC75A-AS1:70 No - HOXA-AS3:7 Yes chr3R:6752864-6754194 LINC02399:4 No - BDNF-AS:19 No - LINC00963:16 No - GAS5:9 No - lnc-RIMKLB-1:9 No - HDAC2-AS2:82 Yes chr3L:4626734-4629467 SIRPG-AS1:3 No - lnc-CNOT1-1:1 Yes chr2R:21502097-21517241 DUBR:8 No - HIPK1-AS1:5 No - lnc-ZNF667-1:1 No - ZNF582-AS1:20 No - lnc-TMEM88B-3:2 No - lnc-ZNF286A-2:1 No - lnc-PSMC2-1:1 No - KTN1-AS1:2 No - LINC00271:14 No - HOXA-AS2:12 Yes chr3R:6752864-6754194 HDAC2-AS2:107 Yes chr2R:18718114-18754675 MIR205HG:2 No - LINC01094:14 No - SOX2-OT:6 No - lnc-HPCAL1-1:1 No - LINC02294:9 No - PRR7-AS1:5 No - lnc-VSTM2B-9:1 No - lnc-MAGI2-1:1 No - lnc-KCNC2-2:2 No - lnc-PEBP4-1:1 Yes chr3L:20376242-20382398 lnc-FKBP3-1:1 No - lnc-TM6SF1-2:1 Yes chr3R:30052514-30054697 PCED1B-AS1:6 No - lnc-CCT7-1:1 No - LINC02405:23 No - LINC00958:4 No - lnc-ATP1B3-2:1 Yes chr2R:13222433-13228202 LINC00473:2 No - lnc-FAM84B-15:109 No - lnc-SPG7-4:3 Yes chr3L:12750119-12753402 lnc-KCNMB2-7:1 Yes chr2L:415067-418536 lnc-C2orf78-1:1 No - LINC00671:4 No - LINC00473:6 No - ZNF451-AS1:30 No - STPG3-AS1:3 No - lnc-LINC00483-1:15 No - lnc-SMIM37-1:1 No - BCAR4:2 No - lnc-ELF5-1:1 Yes chr2L:8705572-8707527 NR2F1-AS1:25 No - lnc-CPM-2:3 Yes chr2L:10733293-10736071 lnc-CDK5R1-3:1 Yes chr2L:10491814-10506779 SAMMSON:2 No - lnc-CCDC140-1:4 No - LINC00898:1 No - LINC01352:1 No - LINC01764:7 No - TRAF3IP2-AS1:10 No - LINC00461:16 No - lnc-MAP7D2-1:1 No - SATB2-AS1:5 No - PCED1B-AS1:8 No - LINC00861:7 No - lnc-GGNBP2-1:1 Yes chr2L:8466817-8488671 SNHG11:23 No - lnc-PCSK9-1:1 No - LNCAROD:12 No - lnc-GOLPH3L-1:1 Yes chr3L:14029579-14031706 lnc-C12orf74-3:28 No - RASAL2-AS1:2 No - GAS5:11 No - LINC02052:16 No - lnc-GRM7-2:2 No - lnc-SOX5-5:16 Yes chr4:800436-834393 MEF2C-AS1:1 Yes chr2R:9913496-9958858 KCTD21-AS1:9 No - lnc-TOP3A-1:1 No - PRKG1-AS1:3 No - lnc-WIF1-6:28 No - TUB-AS1:3 Yes chr2R:21101928-21123704 lnc-DCTD-65:33 No - SAP30L-AS1:5 Yes chr2L:3470182-3472364 ADAMTS9-AS2:6 Yes chr2R:22807860-22815993 lnc-GAB2-1:1 No - lnc-PUM2-1:1 Yes chr2R:16102687-16107229 lnc-MAP1LC3B-3:1 No - lnc-GTF2B-15:1 Yes chr2R:9252310-9285097 ARHGEF7-AS2:2 Yes chr2L:20350434-20365254 LINC01504:4 No - lnc-CNN1-2:1 Yes chr3R:5856585-5857914 LINC00476:7 No - lnc-RTN4R-1:1 No - lnc-SPTBN5-2:1 No - lnc-SDCBP-2:2 No - lnc-FAM200A-1:1 No - lnc-RALGAPA1-1:1 Yes chrX:12907986-12909622 CSTF3-DT:21 Yes chrX:23096771-23101431 lnc-ALX4-8:2 No - lnc-COL6A3-14:7 Yes chr2L:8364855-8365663 SNCA-AS1:3 No - SH3TC2-DT:39 No - lnc-VSTM2B-1:1 No - lnc-LGALSL-2:6 No - lnc-NT5DC2-1:1 Yes chrX:7011357-7012137 GMDS-DT:129 No - lnc-ST8SIA1-1:1 Yes chr3R:24349182-24356241 lnc-CD3D-1:1 No - lnc-PLCL2-3:1 Yes chr3R:13269137-13272011 lnc-TMEM250-1:7 No - RNF144A-AS1:6 Yes chr2R:10740054-10798709 lnc-FAM19A2-2:7 No - LINC01060:4 No - SNHG6:2 No - LINC00847:1 No - PTPRD-AS1:3 Yes chr2L:19586623-19732069 lnc-MFSD4A-1:1 No - SNHG1:22 No - TNFRSF14-AS1:23 No - lnc-ELAC2-3:1 No - MEF2C-AS1:9 Yes chr2R:9913496-9958858 lnc-MID1-1:7 No - lnc-CRYBA4-52:75 No - LINC00886:2 No - LINC02363:14 No - lnc-MIEF1-1:1 Yes chr2L:13180398-13182596 lnc-RAD1-1:1 No - lnc-ZNF705E-1:18 Yes chrX:19243631-19245224 lnc-ASPHD1-1:2 No - SNHG12:10 Yes chr2L:4453169-4454453 lnc-TAF12-2:1 Yes chr3L:5930262-5932773 LINC01550:4 No - lnc-EMP2-2:1 Yes chr2R:10800420-10808938 LINC00957:7 No - TMEM132D-AS1:30 Yes chrX:6225647-6236218 LINC01060:9 No - lnc-CEP83-2:1 No - lnc-C8orf74-1:1 No - LINC01267:1 No - SNHG1:23 No - LINC00884:5 Yes chr4:132220-143123 lnc-ABI1-4:1 Yes chrX:19830215-19852059 lnc-MMP28-4:2 Yes chrX:16288810-16293520 TP53TG1:14 No - lnc-CRYBA4-52:29 No - lnc-IGF2BP3-1:1 No - LINC01134:6 No - lnc-SNX17-1:2 No - lnc-CSPG4-1:1 Yes chr3R:23695221-23696245 lnc-ZNF720-1:2 No - ARHGEF7-AS2:1 Yes chr2L:20350434-20365254 SNAP47-AS1:1 No - LINC00476:8 No - lnc-ATP6V0E2-1:1 No - LINC00707:4 No - APCDD1L-DT:43 No - lnc-CROCC-1:6 No - PAX8-AS1:1 Yes chr4:1088798-1113317 ZNF350-AS1:4 No - lnc-HOGA1-1:1 Yes chr3R:5557663-5563652 DENND6A-DT:10 No - ZFHX4-AS1:4 Yes chr4:501810-540874 LINC02363:12 No - lnc-MIB2-1:4 No - lnc-PRKN-4:2 Yes chr3R:22042191-22079321 lnc-PRKD1-1:4 Yes chr3R:18303279-18314407 lnc-MYL4-2:1 Yes chr3L:7245481-7249340 lnc-AEBP2-1:1 No - SOX2-OT:37 No - LINC00518:5 No - GAS5:13 No - lnc-NKPD1-1:1 Yes chr3R:11346294-11353131 lnc-SPRY1-11:32 No - DANCR:9 No - GAS5:10 No - RUNX2-AS1:23 No - lnc-RPIA-1:5 No - lnc-UQCRFS1-3:1 No - LINC01184:11 No - LINC02532:52 No - lnc-ALX4-8:3 No - lnc-GPR180-2:1 No - lnc-RPIA-1:4 No - ZFHX4-AS1:1 Yes chr4:501810-540874 lnc-EZH2-3:1 No - lnc-TRIL-3:2 No - SNHG5:13 No - lnc-DUSP1-4:1 Yes chr3L:18898875-18900408 lnc-FAM86B2-58:4 No - lnc-CALML4-1:1 No - lnc-MAP1LC3B2-28:18 No - FLVCR1-DT:27 No - LINC00652:4 No - MIR646HG:11 No - SNHG5:23 No - lnc-STYXL1-1:1 No - lnc-MAP3K9-12:1 Yes chrX:12988615-13079070 LINC00471:1 No - lnc-SLC26A8-1:2 Yes chr2R:7272275-7278101 lnc-CRYBA4-52:71 No - LINC02378:3 No - HAGLR:26 No - SNHG17:20 No - lnc-C10orf143-46:8 No - lnc-CXADR-2:1 No - PAN3-AS1:1 Yes chr3L:3071133-3090406 lnc-NKX6-1-2:3 No - lnc-ZNF473-1:1 No - TARID:13 No - lnc-LGALSL-2:1 Yes chr3R:23860162-23890052 lnc-BRF1-1:2 No - lnc-IWS1-2:1 Yes chr2L:7666047-7689459 lnc-MRPL15-1:1 Yes chr2R:17792870-17800677 lnc-AARS-1:3 No - USP3-AS1:5 No - lnc-NRGN-1:1 No - lnc-CISD2-1:1 No - lnc-TPGS2-1:1 No - HDAC2-AS2:66 Yes chr3L:4626734-4629467 lnc-CLUH-1:1 Yes chr2R:16178826-16185103 DACT3-AS1:1 No - MIR99AHG:26 No - TUG1:12 No - LHX1-DT:20 No - TAPT1-AS1:1 Yes chr3R:18161392-18164397 lnc-FGFR1OP2-1:1 No - SNHG11:7 No - POT1-AS1:5 No - lnc-GPR183-47:21 Yes chr2L:20730416-20734309 LINC02532:44 No - LINC00461:6 No - MIR646HG:12 No - MAPKAPK5-AS1:2 No - MALINC1:51 Yes chr4:558016-567257 lnc-ZNF566-1:1 No - lnc-NXPE2-3:1 No - SNAP25-AS1:6 No - MALAT1:5 No - LINC00861:4 No - SH3TC2-DT:51 No - SOX5-AS1:9 Yes chr4:800436-834393 ZNF528-AS1:3 No - lnc-GVQW2-1:5 No - LINC00518:2 No - lnc-HIP1R-1:1 Yes chr3R:5226158-5227526 lnc-ZNF720-1:4 No - PCF11-AS1:8 No - GATA2-AS1:4 Yes chr3R:8147368-8181444 LINC00641:1 No - lnc-PHACTR4-1:2 Yes chr3L:3714826-3806459 lnc-KCNC2-2:7 No - OIP5-AS1:19 No - LINC01478:1 No - lnc-LRRFIP2-1:1 Yes chr2R:23371360-23377045 PPFIA2-AS1:19 Yes chr2L:6723903-6732766 LINGO1-AS2:3 Yes chr2R:21872030-21946259 lnc-ASXL1-1:1 No - lnc-RPP38-2:1 No - BSN-DT:13 No - SNHG11:19 No - PPFIA2-AS1:18 Yes chr2L:6723903-6732766 lnc-PABPC4L-9:2 No - SNHG17:7 No - lnc-FOXG1-5:12 No - STXBP5-AS1:1 Yes chrX:12631605-12653442 CARD8-AS1:1 No - LRRC75A-AS1:5 No - NIFK-AS1:13 No - HOXA-AS3:2 Yes chr3R:6752864-6754194 lnc-RPRML-3:2 No - ZNF582-AS1:16 No - lnc-GUSB-4:1 Yes chrX:16884581-16886612 lnc-SDCBP-2:3 No - lnc-ZFC3H1-8:3 No - lnc-RAB11FIP4-4:1 Yes chr3R:25983013-25995737 LINC00964:1 No - LINC00920:2 No - SLC25A5-AS1:7 No - lnc-COL4A5-1:1 No - lnc-SNX10-2:6 No - lnc-FBXL14-3:2 Yes chr2R:9503765-9541565 lnc-CDIPT-1:3 No - lnc-NMNAT3-1:2 No - PCF11-AS1:4 No - lnc-MRPL40-1:1 No - LINC02394:3 No - lnc-FAM129B-1:1 No - FENDRR:14 No - lnc-WDR31-1:1 No - LINC01301:6 No - lnc-ENDOD1-1:4 No - lnc-SLA2-1:1 No - LINC01184:20 No - RNASEH1-AS1:13 Yes chr2R:7931054-7932380 SPATA3-AS1:14 No - ZRANB2-AS2:1 No - HOTTIP:8 No - lnc-CPN2-4:58 No - GSEC:8 No - GATA3-AS1:9 Yes chr3R:8147368-8181444 lnc-ZFAND2A-1:1 No - LINC01018:4 No - RASSF8-AS1:16 No - LINC00265:16 No - PURPL:46 No - lnc-PGM3-1:1 Yes chr2R:18836821-18846619 RARA-AS1:2 Yes chr2R:6087873-6169087 SEC24B-AS1:5 No - HDAC2-AS2:92 Yes chr3L:4626734-4629467 LINC00271:13 No - lnc-CALM2-2:5 No - lnc-KCNG3-2:1 No - lnc-MYC-1:1 No - LINC01569:3 No - PRR7-AS1:6 Yes chr3R:31405245-31457873 SNHG11:15 No - lnc-SNX10-2:4 No - LINC01018:3 No - lnc-SNX10-2:2 No - lnc-DBT-2:1 Yes chrX:2072413-2074890 lnc-ST8SIA4-3:1 No - GAS5:38 No - lnc-FAM174B-5:1 Yes chr2L:9521210-9540060 KTN1-AS1:1 No - lnc-CRYBA4-52:44 No - lnc-CMTM3-1:1 Yes chrX:11154421-11164670 lnc-PTS-1:3 No - lnc-PABPC4L-5:4 No - lnc-MED6-1:1 No - STX18-AS1:2 Yes chr3R:24623802-24625562 PCAT19:2 No - EPHA1-AS1:3 No - lnc-CHD2-4:2 No - lnc-ZBED5-1:3 No - lnc-RDH10-3:1 Yes chr2R:18117896-18125779 LINC00943:10 No - lnc-CNOT7-1:1 Yes chr2R:10028443-10032893 lnc-PJVK-2:11 No - WEE2-AS1:2 Yes chr2L:6911090-6914138 lnc-HHIPL1-1:1 No - LINC01018:7 No - lnc-ALDH9A1-1:1 No - lnc-FOXD4L3-3:1 Yes chr3L:16126018-16128531 SLC25A5-AS1:2 Yes chrX:10778954-10786907 HAGLR:25 No - NR2F1-AS1:13 No - LINC02356:11 No - lnc-DCAF10-1:1 No - lnc-SEPT9-3:1 No - lnc-CYB5R2-3:9 No - lnc-C6orf201-2:1 No - PURPL:47 No - lnc-C1QL4-1:1 No - MIR205HG:4 No - lnc-FAM133B-1:1 Yes chr2R:16579470-16585448 LINC01184:28 No - lnc-ZNF726-4:1 No - LINC01301:2 No - lnc-PRKACG-2:1 No - LINC01819:12 No - FRG1-DT:26 No - SOCS2-AS1:7 No - TNFRSF14-AS1:17 No - lnc-VSX1-1:4 No - lnc-TMC6-3:1 No - lnc-CRYBA4-52:15 No - LINC00964:19 No - LINC02327:28 No - lnc-TIGIT-1:1 No - LOXL1-AS1:10 Yes chr2R:21789623-21791580 SATB2-AS1:1 No - lnc-OR10AD1-3:1 No - RAPGEF4-AS1:3 No - lnc-NXPE2-52:1 No - CACNA1C-AS1:4 Yes chr2L:16165831-16190540 lnc-SEMA4B-2:1 Yes chr3R:15348048-15350391 ZNF561-AS1:5 No - LINC00954:7 No - RMST:5 No - lnc-RNF208-1:1 No - lnc-AASDH-1:1 No - lnc-ETNK1-4:2 No - lnc-GRSF1-1:1 Yes chr3R:27229505-27239085 LINC01585:1 No - TMEM132D-AS1:28 Yes chrX:6225647-6236218 LRRC75A-AS1:53 No - lnc-SLTM-2:1 Yes chr3R:11744229-11750029 HAGLR:28 No - LINC01359:2 No - EPHA5-AS1:4 No - LINC00944:23 No - lnc-NETO1-1:3 No - lnc-ME3-1:1 No - OSER1-DT:27 No - lnc-SOD3-6:2 No - SH3TC2-DT:50 No - lnc-SCRN3-3:1 No - CACNA1G-AS1:1 Yes chrX:6104085-6192483 PSMG3-AS1:9 No - LINC00698:7 No - lnc-FBXO31-12:2 No - LRRC75A-AS1:71 No - lnc-FAM168B-1:1 Yes chr3L:277437-305292 lnc-DDC-1:4 No - CASC2:10 No - lnc-ZNF891-2:1 No - lnc-SNX17-1:1 No - lnc-PPM1M-2:3 No - LINC01184:10 No - LINC01060:14 No - LINC02202:21 No - LINC00629:3 No - LINC01094:2 No - EPB41L4A-AS1:3 Yes chr3R:31311157-31371748 lnc-DCTD-65:24 No - LINC00958:15 No - lnc-CPNE8-1:1 No - SNHG11:6 No - OSER1-DT:34 No - LINC01257:5 No - lnc-ZNF30-1:1 No - LINC01204:4 No - lnc-TSPAN11-3:1 No - lnc-PTN-2:3 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-ZNF527-1:9 Yes chr2L:12046711-12048918 lnc-SDSL-14:1 No - LINC00472:15 No - lnc-KCTD7-1:2 No - MIR4300HG:6 No - lnc-XKR5-1:1 Yes chrX:16323286-16325768 EWSAT1:10 No - LINC00939:8 No - lnc-RNF219-3:1 Yes chr2L:19493251-19497978 LINC01504:6 No - TRAF3IP2-AS1:8 No - lnc-CERS5-2:1 No - lnc-ORMDL1-1:1 No - lnc-CD80-1:1 Yes chr3R:14124163-14125548 lnc-FAM92B-1:1 No - lnc-ERV3-1-10:2 No - lnc-PRKD1-3:1 No - lnc-SPRY1-11:24 No - lnc-NKD2-2:1 No - lnc-PABPC4-1:1 No - lnc-ID3-4:1 No - LINC01471:12 No - LINC00461:20 No - lnc-NXPH2-3:2 No - ATP6V0E2-AS1:7 Yes chr3L:21539862-21541215 LINC01184:12 No - GAS1RR:6 No - lnc-NBN-1:10 No - LINC00922:1 No - ZRANB2-AS2:23 No - SOX2-OT:34 No - lnc-LXN-1:1 No - lnc-YIF1A-2:1 No - lnc-PJVK-2:19 No - LINC00158:2 No - PSMG3-AS1:10 No - lnc-TMEM250-1:8 No - POT1-AS1:6 No - LINC01152:1 No - GAS5:14 No - lnc-BHLHE41-3:1 No - OSER1-DT:43 No - lnc-LAMTOR5-1:2 Yes chr2R:11845324-11852324 lnc-SPO11-1:1 No - lnc-CA7-4:1 Yes chrX:11154421-11164670 HNF4A-AS1:3 Yes chr2L:8687226-8709611 lnc-CPN2-4:3 No - GMDS-DT:106 No - lnc-PLEKHJ1-1:1 Yes chr3R:6406855-6449274 lnc-FAM20C-3:1 No - lnc-GRM7-1:1 Yes chr4:936819-949441 lnc-DNTTIP2-1:1 Yes chr2L:6007364-6012338 lnc-SERPIND1-1:36 No - PTPRD-AS2:2 No - LINC02347:20 No - RPL34-AS1:4 No - lnc-ADAM30-1:1 No - LINC00461:1 No - LINC00664:4 No - EIF1B-AS1:10 No - NR2F1-AS1:28 No - PART1:1 Yes chrX:3176440-3343767 lnc-NECAB1-1:2 Yes chr3L:22728111-22733446 EPHA5-AS1:2 No - TNFRSF14-AS1:31 No - lnc-SEC16B-4:1 Yes chrX:17710144-17752007 lnc-BORCS5-2:1 No - lnc-MYO6-1:1 Yes chrX:12760642-12763611 lnc-UBALD1-1:1 Yes chrX:13718734-13721977 lnc-ZC2HC1B-1:1 No - IL12A-AS1:4 No - LINC01915:6 No - MIR646HG:19 No - NOP14-AS1:14 Yes chr3R:17535533-17539963 lnc-NXPE2-2:1 No - LINC00513:12 No - LINC01094:11 No - lnc-GLRX5-2:2 No - lnc-APAF1-2:1 Yes chr3R:23375928-23384777 lnc-ARHGEF10L-1:1 No - lnc-UQCRFS1-3:20 No - LINC00664:9 No - lnc-PJVK-2:5 No - LINC00682:4 No - LINC02532:43 No - PTOV1-AS1:4 No - lnc-CRYBA4-52:72 No - LINC00605:3 No - lnc-PDHX-1:1 No - RUNDC3A-AS1:2 Yes chr3R:27229505-27239085 lnc-ZNF136-1:4 No - LINC00472:13 No - HDAC2-AS2:105 Yes chr2R:18718114-18754675 lnc-PRIMPOL-2:2 No - lnc-HMGB2-3:1 Yes chrX:18495067-18499986 MEF2C-AS1:10 Yes chr2R:9913496-9958858 UBA6-AS1:19 No - lnc-SLAMF7-1:1 No - lnc-G3BP1-3:13 No - lnc-MED7-1:1 No - NRAV:4 No - lnc-NAT1-3:23 No - lnc-ZNF160-1:1 No - lnc-KLLN-1:1 Yes chr2L:10256319-10261049 LINC00698:4 No - NR2F1-AS1:2 Yes chr3R:12258737-12302785 HDAC2-AS2:94 Yes chr3L:4626734-4629467 lnc-WIF1-6:29 No - PCF11-AS1:11 No - lnc-MRPL14-1:1 No - MIR9-3HG:6 No - SOCS2-AS1:6 Yes chr2R:8127575-8129476 lnc-LRRC42-1:1 No - lnc-KMT5A-1:25 No - LINC01979:4 No - lnc-FTO-1:1 No - lnc-UBE2N-3:1 No - LINC00402:3 No - lnc-CAPN13-1:1 No - MESTIT1:1 No - lnc-TMEM272-1:4 No - lnc-GABARAPL2-1:1 Yes chr2L:6498647-6526996 lnc-MFSD14B-7:1 No - DUBR:4 No - lnc-PCED1B-1:5 No - lnc-DAD1-2:6 No - lnc-CYB5R2-3:2 No - lnc-SBF2-2:3 No - lnc-PTS-1:4 No - lnc-MAP3K3-1:1 No - lnc-NAT1-3:11 No - lnc-PHYHD1-1:1 No - RPL34-AS1:6 No - NIFK-AS1:10 No - lnc-NPAS4-1:1 No - lnc-MAP1LC3B2-28:14 No - lnc-NDST2-2:1 Yes chrX:18863950-18884075 lnc-FAM20C-3:4 No - lnc-KCNC2-4:1 No - LINC02372:11 No - LINC00599:9 No - LINC00944:22 No - KCNMB2-AS1:1 No - lnc-SEMA6A-1:1 Yes chrX:11677344-11678589 lnc-SERPIND1-1:61 No - lnc-SLC30A7-2:1 Yes chr3R:22582028-22583225 lnc-PTPA-4:1 No - lnc-MTMR9-1:1 Yes chrX:16323286-16325768 MEF2C-AS1:12 Yes chr2R:9913496-9958858 SNHG5:28 No - lnc-GYPE-1:1 No - LINC00479:4 No - lnc-NXPE2-1:1 No - DCTN1-AS1:3 Yes chr3L:19538425-19544172 lnc-ALG12-1:1 Yes chr2L:6954357-6956950 lnc-SCUBE3-4:1 No - lnc-FST-1:1 Yes chrX:19492421-19493337 LINC02411:17 No - SNHG1:12 No - lnc-SLC2A12-4:1 Yes chr2L:6527447-6546976 VLDLR-AS1:11 No - lnc-FAM84B-15:110 No - LINC-PINT:79 No - ZNF561-AS1:7 No - lnc-TEX13B-1:1 Yes chr2L:10544883-10628054 lnc-PERP-2:9 No - LINC00944:3 No - GAS5:23 No - lnc-ZNF44-2:1 No - TMEM132D-AS1:26 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-FARS2-2:1 No - lnc-ACTR2-3:9 No - lnc-ITGB7-1:1 Yes chr2L:13821248-13823979 lnc-RPS24-3:6 No - GAS5:15 No - lnc-UCK2-1:1 Yes chr2L:19049076-19049884 LINC00630:10 No - MIR503HG:7 No - lnc-KLF17-1:4 No - MIR205HG:6 No - lnc-ZNF66-2:1 No - LINC01684:28 No - LHX1-DT:19 No - LINC02370:12 No - LINC00630:4 No - LINC02350:20 No - MIR210HG:6 No - lnc-RIMBP2-4:1 No - CARMN:10 No - NR2F2-AS1:5 Yes chr3R:12258737-12302785 DLGAP1-AS2:3 Yes chr2R:5702112-5705439 TRAF3IP2-AS1:12 No - lnc-ZNF484-1:1 No - SNHG12:8 Yes chr2L:4453169-4454453 CLIP1-AS1:4 Yes chr2R:19485494-19486837 lnc-C12orf74-6:4 No - LINC02411:18 No - lnc-SOX5-5:32 Yes chr4:800436-834393 LINC01028:3 Yes chr2L:18711071-18713748 lnc-CATSPERB-1:1 Yes chr3R:13683921-13693905 CSTF3-DT:19 Yes chrX:23096771-23101431 lnc-PCBP1-2:1 No - LINC00926:19 No - LINC01550:19 No - lnc-CYGB-1:1 Yes chr2L:10368025-10373900 EGOT:2 Yes chr3R:5517117-5539411 lnc-PEBP4-1:2 No - lnc-LDHD-1:1 Yes chrX:6838174-6843921 lnc-EMX1-1:1 No - lnc-ZNF708-1:1 No - lnc-CADM2-8:1 Yes chr2R:13171401-13174796 CBR3-AS1:15 No - CASC2:9 No - LINC00926:12 No - SPATA3-AS1:15 No - SNHG17:23 No - lnc-KCNC2-2:5 No - lnc-UQCC2-1:1 No - LINC02052:12 No - lnc-GUSB-1:1 No - lnc-AKR1C3-1:1 Yes chr3L:11620535-11624381 LINC00599:3 No - lnc-ZNF582-8:1 No - LINC02453:25 No - lnc-TBC1D22A-2:1 No - lnc-PERP-2:1 No - LINC01270:1 No - lnc-ABT1-2:1 No - GNG12-AS1:5 No - lnc-C1QTNF9-3:1 Yes chr3L:277437-305292 PCAT19:3 No - LINC00944:6 No - LINC00668:13 No - lnc-UXS1-3:1 Yes chr2L:825969-833241 lnc-SHCBP1L-1:1 Yes chr2R:5974857-5980778 lnc-FSCN1-1:1 No - lnc-WASHC3-2:2 Yes chrX:2076966-2078455 USP27X-AS1:2 No - LRRC75A-AS1:72 No - lnc-MUTYH-1:1 No - lnc-MMD-2:1 No - lnc-TSPAN11-4:1 No - FAM222A-AS1:1 No - lnc-CEP152-1:1 Yes chr3L:9427010-9428671 KIAA1614-AS1:1 No - WEE2-AS1:4 Yes chr2L:6911090-6914138 lnc-SPPL2A-1:1 No - lnc-HSP90AA1-2:1 Yes chr3R:26719847-26725216 GMDS-DT:107 No - LINC00858:2 No - FAM222A-AS1:5 No - lnc-TIGIT-1:2 No - LINC01152:4 No - lnc-CDK18-1:1 No - LINC01512:3 No - LINC01684:25 No - LINC00476:3 No - lnc-DRGX-1:1 No - lnc-FAM168B-1:2 Yes chr3L:277437-305292 lnc-FAM156A-1:2 No - lnc-C1QL4-3:2 No - RPARP-AS1:10 No - EPHA1-AS1:1 No - lnc-TAF7-1:3 No - lnc-AGMAT-1:1 Yes chr3L:25798441-26014112 LINC00630:6 No - LINC02401:13 No - SOX2-OT:35 Yes chr2L:8825645-8829670 EWSAT1:9 No - BAALC-AS1:18 No - KLHL7-DT:8 No - LINC01197:6 No - LINC02475:13 No - lnc-DBX1-4:1 No - GAS5:28 No - UBA6-AS1:11 No - lnc-ZSCAN10-3:27 No - GAS5:35 No - LINC01624:3 No - APCDD1L-DT:31 No - MIR205HG:7 No - lnc-CRYBA4-52:8 No - lnc-CDC27-1:1 No - HAGLR:9 No - lnc-CYR61-3:2 Yes chrX:13294473-13302415 lnc-WIF1-6:22 Yes chr3R:10863355-10868642 LINC00954:5 No - lnc-ZNF841-1:1 No - lnc-ZFC3H1-8:1 No - LINC01094:13 No - lnc-LGALSL-2:4 No - lnc-PROC-1:1 No - LINC01184:18 No - lnc-HMGB2-2:1 Yes chrX:18495067-18499986 LINC00877:8 No - lnc-NDUFA4-2:1 No - lnc-ECHDC1-1:1 No - MIR155HG:1 No - lnc-RNF135-1:1 No - KCNMB2-AS1:7 No - lnc-B3GNT10-21:15 No - XIST:21 No - FLVCR1-DT:28 No - lnc-PLXND1-1:1 Yes chr3R:6389162-6405895 LINC00461:14 No - LINC00599:8 No - PTPRG-AS1:13 Yes chr3R:29377646-29487131 LINC00461:19 No - TRAF3IP2-AS1:6 Yes chr2R:7793625-7801044 LINC02393:5 No - lnc-ELOVL2-1:1 No - lnc-APOC3-6:13 No - KTN1-AS1:3 No - LINC00963:2 No - lnc-NAT1-3:15 No - LINC00900:1 No - DDX11-AS1:4 No - lnc-OR8D4-1:1 Yes chr2L:3358640-3373372 lnc-LINC00483-1:16 No - FLG-AS1:2 No - lnc-DAD1-2:7 No - FZD10-DT:53 No - lnc-NDUFV1-2:1 No - LINC00987:1 No - lnc-KBTBD6-1:1 No - APCDD1L-DT:44 No - lnc-CDRT15-1:1 No - LINC01448:1 No - lnc-SBDS-1:1 No - PURPL:48 No - lnc-ETNK1-4:1 No - lnc-DNAAF5-3:14 No - LINC01194:3 No - lnc-COL20A1-1:1 Yes chrX:8276200-8367169 lnc-CHMP3-1:1 No - PURPL:36 No - LINC00877:3 No - lnc-C7orf49-1:1 No - lnc-FHL2-1:1 No - lnc-MRPL40-2:1 No - TP53TG1:15 No - MIR205HG:10 No - lnc-PRKD1-1:5 Yes chr3R:18303279-18314407 SNHG5:5 No - lnc-NXPH1-2:3 Yes chr3L:21131446-21133310 LINC01257:3 No - MAPKAPK5-AS1:15 No - lnc-SULF1-3:3 No - SEC24B-AS1:3 No - DSCR9:11 No - lnc-MRPL39-2:1 No - KCNMB2-AS1:5 No - ZNRF3-AS1:1 No - lnc-NUMB-3:1 Yes chr3R:28520665-28540324 SOX2-OT:2 Yes chrX:7407208-7407854 LINC01301:1 No - lnc-SLC39A11-1:1 No - LINC01725:42 No - STXBP5-AS1:3 Yes chrX:12631605-12653442 lnc-ZNF605-1:7 No - lnc-RSL24D1-1:1 No - lnc-ALDH3B1-2:5 No - lnc-POT1-2:1 No - lnc-DUSP1-4:3 Yes chr3L:18898875-18900408 lnc-MAN1A1-1:2 No - ZMIZ1-AS1:16 No - CLIP1-AS1:1 Yes chr2R:19485494-19486837 lnc-ANXA2R-1:22 No - lnc-PAICS-7:1 Yes chr3L:6911999-6914876 lnc-ZNHIT2-2:1 Yes chr2R:18708152-18710865 lnc-JUN-5:4 No - lnc-SNX10-2:1 No - lnc-RPS24-3:4 No - LINC01725:40 No - lnc-FABP5-6:1 No - lnc-RPS24-3:5 No - LINC01184:21 No - ITGA9-AS1:36 Yes chr2R:15258761-15262873 HHIP-AS1:3 No - SNHG12:9 No - SATB2-AS1:7 No - lnc-ERH-1:1 Yes chr4:310930-314087 PTPRG-AS1:12 Yes chr3R:29377646-29487131 lnc-CALHM3-2:1 No - lnc-NPAS4-1:2 No - lnc-NUTM1-5:1 Yes chrX:5900861-5905399 lnc-ZNF280D-3:2 Yes chr2R:15206527-15213634 lnc-APOC3-3:1 Yes chr2R:18688132-18705805 RNF144A-AS1:4 Yes chr2R:10740054-10798709 LINC01134:3 No - lnc-LMNTD1-2:1 No - lnc-ST8SIA4-3:2 No - lnc-DHX37-9:5 No - RAB30-AS1:2 No - GAS5:36 No - lnc-CTCFL-1:1 No - IL12A-AS1:1 No - lnc-CAMKK2-1:1 No - LINC00476:10 No - BSN-DT:14 No - NIFK-AS1:2 No - APCDD1L-DT:47 No - GMDS-DT:104 No - lnc-CRYBA4-52:43 No - lnc-OPA3-1:1 Yes chr3L:14903805-14942907 SNHG11:2 No - lnc-HIST1H3F-1:1 Yes chr2L:21418112-21418706 lnc-F13A1-3:8 No - lnc-CYB5R2-3:5 No - lnc-SVOP-1:1 Yes chr2R:24014917-24017198 ST3GAL5-AS1:14 No - lnc-NEDD4L-2:1 No - KCTD21-AS1:10 No - SNAP25-AS1:12 No - lnc-TUBGCP3-4:2 No - TMEM51-AS1:4 Yes chr2R:22333500-22373109 SOX2-OT:26 Yes chr2L:8825645-8829670 RAB30-AS1:6 No - SNHG11:8 No - LINC00485:1 No - LRRC75A-AS1:75 No - CBR3-AS1:11 No - lnc-ANKS4B-5:11 No - lnc-NKX6-1-2:2 No - lnc-SNX10-2:5 No - GMDS-DT:121 No - LINC00461:11 No - lnc-MKLN1-2:2 No - lnc-C20orf96-1:1 No - LINC01996:4 No - lnc-NOD1-1:1 No - HDAC2-AS2:76 Yes chr3L:4626734-4629467 LINC00861:1 No - PSMG3-AS1:5 No - lnc-WBP4-2:1 No - lnc-SERPIND1-1:55 No - SNHG17:21 No - WDFY3-AS2:6 No - lnc-CPN2-4:5 No - lnc-TMEM250-1:6 No - lnc-GLRX3-2:1 No - SOX2-OT:31 Yes chr2L:8825645-8829670 LINC01102:7 No - lnc-ALDH3B1-2:3 No - lnc-SLC30A7-2:4 No - lnc-SBF2-2:2 No - VWA8-AS1:2 No - lnc-BRINP3-3:1 No - lnc-CLVS1-1:4 No - lnc-UXS1-2:1 No - lnc-PANK1-3:1 No - lnc-PALLD-1:3 No - LINC01022:2 No - lnc-PDGFA-17:28 No - lnc-SPTB-1:1 No - lnc-CNPY1-3:5 No - LINC01352:2 No - lnc-PELP1-1:1 No - lnc-COA6-7:5 No - PVT1:48 No - lnc-GNG2-1:5 No - LINC01679:10 No - lnc-PLPP4-4:2 No - lnc-ST3GAL6-1:1 No - lnc-TMEM65-1:2 No - lnc-JPH3-3:7 No - lnc-RALB-2:2 No - XIST:2 No - lnc-WDR11-3:1 No - lnc-TLE3-6:2 No - lnc-ACTR3C-1:1 No - lnc-RP1L1-1:1 No - LINC00885:3 No - lnc-BOD1-1:7 No - lnc-SESN3-1:1 No - LINC02018:24 No - lnc-GATB-2:1 No - lnc-RUBCN-2:2 No - TTTY4B:1 No - lnc-VN1R2-1:2 No - lnc-PCDH18-1:1 No - lnc-GPR137B-1:1 No - PRKCQ-AS1:1 No - TRHDE-AS1:12 Yes chr3R:21740105-21744431 lnc-JADE2-2:5 No - lnc-RETNLB-1:1 No - lnc-CYS1-3:1 No - lnc-TBP-2:2 No - lnc-IRX2-6:1 No - lnc-PCED1B-5:33 No - lnc-PAX9-11:6 No - lnc-SLC12A7-1:10 No - lnc-FAM241A-2:1 No - MIR663AHG:38 No - lnc-TMEM17-1:1 No - lnc-ZBP1-1:1 No - LINC01146:24 No - LINC01471:1 No - LINC02064:9 No - lnc-CASP10-1:5 No - lnc-SMARCA2-1:1 No - lnc-CELF2-2:1 Yes chr2R:13984815-13990707 LINC01356:2 No - RUNX2-AS1:26 No - lnc-OTULIN-3:1 No - LINC01241:16 No - lnc-THAP6-1:2 No - lnc-WDR4-3:1 No - lnc-HSPB11-1:1 No - lnc-PAFAH2-1:1 No - lnc-TRMT61B-1:3 No - lnc-NKD2-3:6 No - LNCARSR:11 No - lnc-HIVEP1-2:1 No - lnc-NTMT1-5:1 No - lnc-HERPUD2-1:1 No - lnc-ADGRV1-4:3 No - lnc-ERI1-32:7 No - XIST:11 No - RASGRF2-AS1:8 No - lnc-MAP3K9-3:13 No - LINC00951:4 No - lnc-RAB6C-4:1 No - lnc-NTRK2-1:1 No - lnc-PDPK1-3:3 No - TNFRSF14-AS1:25 No - lnc-CITED2-3:1 No - lnc-LCLAT1-2:3 No - lnc-ITGA6-1:8 No - lnc-COL6A1-2:1 No - lnc-ATAD2B-4:1 No - lnc-TLR5-1:2 No - lnc-TMEM17-2:1 No - lnc-ZFP42-2:10 No - lnc-CRYBA4-52:90 No - lnc-MRPS30-2:1 No - lnc-SLC12A8-3:1 No - lnc-GNAO1-1:4 No - lnc-UBR2-1:1 No - lnc-F8A2-1:1 No - ST3GAL5-AS1:8 No - LINC00205:11 No - LINC00313:21 No - lnc-TRMT61B-1:2 No - lnc-DYNC1I1-2:1 No - lnc-LRP5L-2:9 No - LINC00973:2 No - lnc-NECTIN1-1:1 No - RGPD4-AS1:4 No - lnc-DMAC1-2:2 No - LINC02020:15 No - lnc-GPALPP1-1:1 No - lnc-COPS8-3:6 No - LINC02498:9 No - lnc-ZKSCAN1-1:4 No - lnc-AQP12A-1:6 No - LINC01105:4 No - lnc-UMODL1-4:2 No - lnc-HMBOX1-1:1 No - lnc-C2orf91-2:1 No - lnc-HDDC2-1:1 No - lnc-NIFK-1:2 No - lnc-ZNF672-1:1 No - lnc-FBXL14-2:1 No - lnc-KCNG2-1:1 No - lnc-CLEC2D-4:1 No - LINC01706:6 No - lnc-TRIB2-5:1 No - lnc-NBPF15-4:4 No - lnc-CABP2-1:1 No - lnc-VCX3A-1:1 No - lnc-NOS1AP-1:2 No - lnc-EPHA4-2:1 No - lnc-TMEM17-2:5 No - LINC00670:2 No - lnc-POTEJ-1:1 No - lnc-IFI44-2:4 No - LINC00635:32 No - lnc-SAP30-2:2 No - LINC01114:1 No - lnc-ADTRP-1:1 No - lnc-CXorf51B-1:1 No - lnc-MAP3K8-3:1 No - lnc-LSM3-1:3 No - LINC02036:8 No - lnc-FAM234B-1:1 No - GMDS-DT:75 No - MLIP-IT1:1 No - lnc-AKR1E2-5:1 No - lnc-IGFL4-1:2 No - lnc-GMNC-1:1 No - lnc-STOML3-2:1 No - ZNF582-AS1:11 No - lnc-DRD5-4:1 No - LINC00662:33 No - LINC01986:5 No - lnc-UEVLD-7:3 No - LINC01697:27 No - lnc-C3orf30-4:1 No - lnc-C5orf38-1:1 No - lnc-GDAP2-1:1 No - lnc-SLC35C1-83:12 No - lnc-SPOPL-4:1 No - LINC00428:4 No - LINC01483:6 No - LIVAR:6 No - lnc-TMCC1-1:1 No - lnc-ACP1-5:1 No - lnc-KRCC1-1:1 No - LINC02272:7 No - lnc-GPBP1-2:1 No - LINC02248:8 No - LINC02501:9 No - LINC01831:5 No - lnc-PXDC1-1:7 No - CCDC144NL-AS1:8 No - LINC00882:10 No - lnc-JPH1-2:4 No - lnc-ADAMTS16-5:1 No - LINC02541:62 No - lnc-HPF1-1:2 No - lnc-FGF9-3:3 No - lnc-OR10J1-1:1 No - lnc-TPT1-1:1 No - lnc-PRELID3A-1:3 No - lnc-ZIC1-22:2 No - lnc-DNAJB6-2:3 No - lnc-SEPT7-1:3 No - lnc-OXCT1-1:1 No - lnc-ALDH1A1-4:1 No - RASSF8-AS1:22 No - LINC02085:9 No - LINC02583:22 No - lnc-AGGF1-1:1 Yes chr2R:15218379-15224795 lnc-FAM172A-7:9 No - lnc-BANP-14:4 No - lnc-CYBB-1:1 No - LINC01795:4 No - lnc-SLC18B1-1:1 No - lnc-SV2B-1:3 No - LINC01714:36 No - lnc-APOC3-6:1 No - lnc-DYSF-1:1 No - LINC01539:5 No - lnc-CD55-1:1 Yes chr2R:9227785-9247249 LINC01625:3 No - lnc-SH3BGRL2-1:2 No - lnc-TMEM132C-6:7 No - LINC00982:12 No - LINC01117:7 No - lnc-WRB-2:2 Yes chr3R:24319000-24328619 LINC01093:6 No - lnc-CHMP2B-2:4 No - lnc-CYSTM1-1:13 No - lnc-KLF15-2:1 No - LINC01278:19 No - lnc-PPDPF-1:1 No - lnc-MYEOV-2:1 No - LINC01789:4 No - LINC01150:2 No - LINC00609:6 No - lnc-THBS1-7:3 No - BOLA3-AS1:13 No - lnc-PGM5-2:7 Yes chr3L:16126018-16128531 LINC01878:12 No - LINC01760:11 No - lnc-NTF3-5:4 No - lnc-PAH-3:3 Yes chr3L:7760453-7763166 lnc-SLC1A4-1:1 No - lnc-MMP16-1:1 No - lnc-GADD45G-5:4 No - lnc-TMEM72-1:2 No - lnc-CDH9-3:1 No - lnc-BCL2L11-2:2 No - lnc-HOXC4-4:2 Yes chr3R:17150587-17151630 lnc-CHRNB4-1:4 Yes chrX:8276200-8367169 PTCSC3:10 No - lnc-AGA-4:1 No - lnc-CCDC171-1:2 No - lnc-HMGB2-15:8 Yes chrX:16787283-16789644 lnc-SMIM37-1:2 No - lnc-TNFAIP6-2:9 No - lnc-ITGB2-3:2 No - UCA1:6 No - lnc-SDCBP-1:1 No - lnc-TNP1-3:1 No - LINC02331:9 No - lnc-CFAP100-2:6 No - LINC00692:11 No - CCDC18-AS1:13 No - lnc-ULK4-2:1 No - lnc-HNRNPA2B1-4:1 No - lnc-ENPP6-2:1 No - lnc-PRKCQ-1:1 No - LINC01363:5 No - lnc-RAD23B-3:1 No - LINC02518:5 No - lnc-RIPOR2-3:1 No - lnc-BRD1-22:3 No - lnc-COX7A2L-1:5 No - lnc-CDYL2-5:1 No - FZD10-DT:55 No - lnc-CTAGE5-8:23 No - LINC01121:3 No - lnc-KIAA1147-3:7 No - lnc-FAM153B-6:1 Yes chr3R:8307473-8308645 lnc-GALNT13-1:1 No - lnc-FOXD4L6-1:1 No - lnc-KLHL18-8:8 No - lnc-PIEZO2-2:5 No - lnc-TFEC-3:1 No - lnc-PPIAL4F-3:6 No - lnc-MBIP-1:1 No - lnc-MSX2-2:1 No - lnc-RIPOR2-3:2 No - lnc-C15orf41-6:1 No - lnc-ZDHHC8-1:2 No - lnc-AGA-2:1 No - lnc-HABP2-1:1 No - lnc-EMX2-2:2 No - lnc-NPHP4-3:1 No - CASC22:22 No - lnc-SLC15A4-9:1 No - lnc-TMEFF2-1:2 No - lnc-SERPINA12-1:1 No - lnc-BDH1-2:1 No - lnc-LARGE1-1:3 No - lnc-FAM47B-1:2 No - lnc-BUB3-4:15 No - lnc-ACTR2-3:6 No - lnc-TMEM132B-4:2 No - lnc-TSPAN12-2:1 No - C5orf66-AS2:2 No - lnc-ZSCAN2-2:1 No - lnc-GJE1-3:1 No - lnc-RAB1A-2:1 No - lnc-WISP1-2:1 No - lnc-INPP4B-1:1 No - LINC01628:1 No - lnc-STX18-1:1 No - lnc-TMPRSS15-5:1 No - lnc-KCNIP4-1:1 No - lnc-NRL-3:1 No - lnc-BTNL8-1:1 No - lnc-PFKP-11:1 No - LINC02431:8 No - lnc-OSMR-4:1 No - lnc-SRL-1:1 No - lnc-SPRY4-1:1 No - LINC01394:34 No - lnc-ARL4D-1:1 No - lnc-MEX3B-2:2 No - LINC00310:15 No - lnc-MID1-1:19 No - lnc-SIPA1L2-2:1 No - CHKB-DT:49 Yes chr2L:21614232-21624080 TMEM202-AS1:36 No - lnc-API5-4:1 No - LINC01917:7 No - lnc-OXCT1-1:6 No - lnc-ZBED5-1:4 No - lnc-TMEM268-1:1 No - LINC02015:24 No - lnc-PCDH10-2:1 No - LINC01744:9 No - lnc-REEP3-2:1 No - lnc-C12orf74-10:4 No - lnc-PTPRU-11:1 No - lnc-JAM3-3:13 No - lnc-QPCT-1:1 No - lnc-SNRPN-8:102 No - lnc-RIOK1-1:6 No - lnc-RHOBTB3-1:4 No - lnc-LELP1-1:1 No - lnc-FSCB-1:6 No - lnc-MAGI2-1:2 No - LINC00895:13 No - LINC02271:7 No - lnc-INSIG2-1:3 No - lnc-GLIPR1L1-1:3 No - CASC11:5 No - lnc-ING1-1:2 No - LINC02328:35 No - lnc-CCDC125-6:9 No - LINC01657:4 No - lnc-PRSS3-2:16 No - lnc-PERP-2:8 No - LINC00388:1 No - lnc-PHACTR2-2:1 No - lnc-PIGT-2:1 Yes chrX:8404535-8407263 lnc-CD2AP-1:1 No - lnc-CD8B2-4:1 No - lnc-PLPP3-12:30 No - lnc-OARD1-1:4 No - lnc-STAT6-1:3 Yes chrX:16653220-16655015 lnc-ALDH3B1-2:8 No - LINC01938:13 No - lnc-XKR9-1:11 No - lnc-LRFN2-3:2 No - KCTD21-AS1:3 No - LINC02395:14 No - LINC01270:5 No - lnc-CCBE1-2:2 No - LINC01055:4 No - lnc-TMEM105-2:6 No - lnc-SNTG2-3:3 No - lnc-GABARAPL1-1:1 No - lnc-CADM2-7:1 No - DLEU1:31 No - lnc-BDP1-6:5 No - lnc-CLCN4-1:1 No - LINC01868:3 No - lnc-ETAA1-4:6 No - FZD10-DT:44 No - lnc-ST6GAL2-2:1 No - lnc-EFNB2-3:1 No - LINC02212:15 No - lnc-SREK1-1:4 No - lnc-PDCD1-1:19 No - lnc-SERPINB1-1:1 No - LINC01673:7 No - lnc-ITPR3-1:3 No - lnc-RSPH1-4:1 No - lnc-EPB42-5:1 No - lnc-NOP56-1:1 No - lnc-DIAPH3-3:1 No - LINC01241:11 No - LINC01487:1 No - LINC02146:3 No - LINC01486:1 Yes chr3L:1318480-1329617 lnc-FOXD4L5-23:4 No - LINC00926:13 No - lnc-ZSWIM6-6:7 No - lnc-RAB37-1:6 No - MIR4307HG:2 No - lnc-ICOSLG-6:13 No - lnc-GAP43-9:1 No - lnc-BRI3BP-1:1 No - lnc-FTCDNL1-1:2 No - lnc-WDR11-2:1 No - lnc-PPDPFL-2:11 No - lnc-MMS22L-1:1 No - lnc-ETV1-2:1 No - lnc-AGTPBP1-3:1 No - lnc-DENND3-1:1 No - LINC01859:17 No - LINC01397:1 No - lnc-NFAM1-1:1 No - LINC00919:2 No - LINC02098:9 No - lnc-SELENOF-4:1 No - lnc-ARL6IP5-2:1 No - lnc-NFIL3-1:1 No - lnc-DLK1-1:1 No - lnc-OR4F21-3:4 No - lnc-GAPVD1-2:1 No - lnc-EGLN1-1:6 No - lnc-WDR3-2:1 No - lnc-VSX1-1:6 No - lnc-ETS2-2:1 No - lnc-CRISP1-1:2 No - lnc-SOX2-3:1 No - EDRF1-AS1:38 No - lnc-FOXD4L6-6:1 No - lnc-WDR70-7:18 No - lnc-ZNF804A-1:6 No - LINC00922:2 No - lnc-GRM7-5:1 No - lnc-DCTD-10:1 No - LINC02080:7 No - lnc-JUN-5:3 No - lnc-GRAMD1B-2:1 No - lnc-OSBPL1A-4:1 No - lnc-SMIM23-1:1 No - lnc-BUB3-4:25 No - lnc-SMC2-1:3 No - LINC01646:11 No - LINC00184:1 No - lnc-MFHAS1-2:1 No - lnc-UGT8-2:1 No - LINC02567:3 No - LINC01676:25 No - lnc-STAP1-4:1 No - lnc-ERICH2-1:15 No - lnc-ARHGEF11-1:1 No - lnc-SMOC2-7:1 No - lnc-BTBD19-1:1 No - lnc-UBLCP1-2:19 No - LINC01688:8 No - lnc-LSMEM1-2:3 No - LINC00851:2 No - lnc-NCOA3-5:1 No - lnc-BLM-6:7 No - LINC01746:8 No - lnc-CLEC2D-2:1 No - LINC02247:3 No - lnc-NUTM2B-1:9 No - lnc-MATN1-1:1 No - lnc-USP31-3:1 No - LINC02050:15 No - lnc-HAND2-3:1 No - lnc-FAM174A-1:2 No - lnc-LRIT2-2:1 No - LINC00251:5 No - lnc-FAM160A1-1:1 No - lnc-MAT2B-1:1 No - LINC01018:16 No - lnc-KRTAP19-8-2:1 No - lnc-ARFGEF2-2:3 No - lnc-MATN1-2:1 No - LINC01230:13 No - LINC01702:18 No - lnc-TBL1XR1-6:1 No - LINC02298:17 No - lnc-CDK20-1:1 No - lnc-NEUROG3-1:1 No - LINC01234:2 No - LINC01724:5 No - lnc-SYT10-1:1 No - lnc-EVX1-14:4 No - lnc-LYPLAL1-1:4 No - lnc-RPS4Y1-8:1 No - lnc-FAM57A-1:1 Yes chr2L:4382925-4386062 lnc-C17orf51-2:1 No - lnc-EXOC3-2:1 No - lnc-SFMBT2-1:1 No - LINC00635:3 No - lnc-KDM4C-3:2 No - lnc-EDRF1-1:23 No - lnc-DIO3-4:2 No - lnc-PREX1-6:2 No - lnc-ERLIN2-1:2 No - lnc-ZFP42-2:3 No - lnc-CDH23-1:2 Yes chr2L:6562325-6564709 lnc-ABCA1-1:1 No - lnc-MYH13-1:1 No - lnc-TUBGCP3-1:3 No - lnc-OR10AD1-3:2 No - lnc-CLDN24-6:5 No - lnc-COL4A1-2:4 No - lnc-METTL4-1:2 No - lnc-ERMARD-3:1 No - lnc-CRYBA4-7:1 No - LINC02454:14 No - PVT1:42 No - lnc-ECI2-2:1 No - lnc-IGF1R-1:1 No - lnc-CRYBB3-1:1 No - lnc-ZFP42-2:4 No - lnc-ARID1B-2:2 No - lnc-C16orf78-3:3 No - LINC02519:29 No - LINC01201:2 No - IGFBP7-AS1:10 No - lnc-YTHDF3-6:2 No - LINC00882:27 No - lnc-ATIC-3:2 No - lnc-VWF-2:3 No - lnc-SOCS6-3:1 No - lnc-MAP1LC3B-1:1 No - lnc-SYK-1:1 No - lnc-ARHGAP10-2:1 No - lnc-ZCWPW2-1:1 No - lnc-ZHX2-6:9 No - lnc-BCAS1-1:1 No - lnc-EBPL-1:1 No - lnc-APBB1IP-1:14 No - lnc-CLVS2-2:2 No - lnc-MTA3-1:1 No - lnc-KATNAL2-4:1 No - TBX2-AS1:15 No - LINC01304:1 No - lnc-ERI1-2:10 No - lnc-VCX-2:1 No - LINC01204:5 No - LINC02541:47 No - LINC01487:10 No - lnc-PAPD7-4:1 No - SPATA3-AS1:16 No - lnc-BNIP3-2:1 Yes chr3R:10126129-10139772 lnc-ZDHHC17-20:3 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-KLRC4-KLRK1-3:1 No - lnc-OLFM4-2:1 No - lnc-SIPA1L1-1:1 No - LINC00892:7 No - lnc-MED10-9:1 No - LINC01934:15 No - lnc-CTSO-1:1 No - lnc-CIR1-1:1 Yes chrX:9729648-9782094 lnc-WASHC1-1:1 No - lnc-DAGLA-1:5 No - lnc-UBLCP1-30:4 No - LINC00945:2 No - LINC01269:1 No - lnc-ARID1B-2:1 No - lnc-C22orf42-1:1 No - lnc-CELF4-6:1 No - lnc-TASP1-5:1 No - LINC02262:4 No - lnc-ZNF680-2:1 No - lnc-AZI2-1:1 No - LINC01372:3 No - lnc-PGRMC2-1:2 No - lnc-SERPINI1-23:14 No - lnc-GP9-1:1 No - LINC00331:7 No - lnc-NIFK-2:1 No - lnc-TMEM18-3:1 No - lnc-TMEM132B-4:15 No - lnc-TACR3-1:1 No - lnc-C3orf30-2:3 No - lnc-PCYOX1-2:1 No - LINC02327:45 No - lnc-SDC2-1:1 No - LINC02036:12 No - TCL6:3 No - lnc-EMX2-5:8 No - lnc-CTNNA3-1:1 No - lnc-GCA-3:1 No - lnc-C16orf72-5:1 No - lnc-TET2-1:1 No - lnc-PAPPA2-1:2 No - lnc-NADSYN1-2:1 No - lnc-SAMD12-1:1 No - lnc-PFKFB3-453:4 No - LINC01304:11 No - lnc-PITRM1-2:3 No - lnc-ISX-2:1 No - lnc-CRP-2:5 No - lnc-PRSS3-1:2 No - lnc-ANKRD50-4:1 No - lnc-ATF3-1:3 No - lnc-THSD4-2:1 No - lnc-MTERF3-1:8 No - lnc-LRIG2-1:1 No - lnc-TIMM22-1:1 No - lnc-ATG2B-20:3 No - MIR193BHG:8 No - lnc-NWD2-3:3 No - lnc-CCDC179-1:1 No - lnc-ARHGEF5-2:4 No - LINC01168:2 No - lnc-CENPP-2:1 No - lnc-CSNK1G3-11:1 No - lnc-C11orf86-1:1 Yes chrX:13359248-13368179 LINC02537:16 No - lnc-ZNF792-1:3 No - lnc-C15orf41-2:1 No - lnc-PPT1-1:1 No - lnc-CES5A-1:2 No - lnc-CSRNP3-11:1 Yes chrX:16455027-16533096 PAXIP1-AS1:8 No - lnc-RGL4-4:3 No - lnc-GPM6A-2:1 No - lnc-CYP7A1-1:1 No - lnc-KIFC2-2:2 No - CCDC18-AS1:19 No - lnc-PABPC4L-4:1 No - LINC00320:1 No - TMEM212-AS1:1 No - lnc-KRTAP13-1-1:1 No - lnc-TEX53-2:1 No - lnc-CD93-1:1 No - lnc-HACE1-4:1 No - lnc-SRSF2-1:1 Yes chr3R:12449296-12456355 lnc-PRPS1-1:1 No - LINC01389:8 No - LINC00996:2 No - lnc-HTR1B-1:8 No - LINC01363:2 No - FENDRR:12 No - lnc-FSTL5-3:1 No - LINC02348:13 No - lnc-TOMM20-2:12 No - lnc-KCNK10-1:1 No - LINC02520:43 No - lnc-PIK3C3-2:2 No - lnc-CCDC85A-1:1 No - lnc-SLC2A13-3:4 No - lnc-PLEKHO1-1:2 No - lnc-RBMY1B-1:5 No - lnc-PNPT1-1:1 No - lnc-CLMP-2:1 No - lnc-MRPL39-14:1 No - lnc-RGPD4-3:4 No - PAXIP1-AS1:2 No - LINC01923:9 No - lnc-LPP-10:2 No - lnc-SLC12A7-1:5 No - LINC01635:10 No - TTTY12:1 No - EXTL3-AS1:3 Yes chr2R:19129589-19133706 DLEU1:45 No - lnc-FNDC1-3:1 No - lnc-VEZF1-1:4 No - PRKCQ-AS1:4 No - lnc-PANK1-2:4 No - LINC01249:1 No - lnc-TLR4-9:3 No - lnc-PTER-2:2 No - LINC02369:17 No - lnc-CD8B2-2:1 Yes chr3R:25618414-25621838 lnc-CLDN11-1:1 No - lnc-PITRM1-7:3 No - lnc-WDR7-8:1 No - lnc-NPAP1-11:1 No - LINC02305:9 No - lnc-LRP5L-2:6 No - lnc-CKAP2L-1:7 No - lnc-AUTS2-2:1 No - lnc-LONP2-4:1 No - TM4SF1-AS1:4 No - lnc-UPK3B-6:1 No - lnc-HOXA13-1:1 No - lnc-PAX8-6:1 Yes chr2R:15562697-15565801 DNAJC27-AS1:13 No - LINC00115:22 No - lnc-CADM2-3:1 No - lnc-APOBEC3A-1:1 No - LINC01070:7 No - lnc-GRIA2-2:1 No - lnc-RAB23-5:1 No - lnc-FRG1-11:9 No - lnc-SCN9A-72:2 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-PSMG1-4:12 No - lnc-TMEM56-1:1 No - lnc-USP42-1:1 No - lnc-MRM1-1:1 No - lnc-ACBD5-1:1 No - lnc-NDUFS6-5:4 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-RHOB-5:1 No - lnc-GPBP1-3:3 No - lnc-BCOR-2:1 No - lnc-SLC4A3-8:1 No - lnc-HMHB1-2:1 No - lnc-ACP1-9:2 No - lnc-CHST1-1:1 No - lnc-MPPED2-3:1 No - lnc-TMEM132B-2:2 No - lnc-SOWAHB-5:11 No - PSORS1C3:2 No - HAR1A:3 No - lnc-RAD23B-21:5 No - lnc-CTSO-1:2 No - PRR29-AS1:4 No - lnc-PPDPFL-4:1 No - lnc-AAGAB-1:41 No - LINC02399:5 No - lnc-TEAD1-1:1 No - lnc-GLB1L2-1:2 No - lnc-CXXC1-1:1 No - lnc-CCDC152-1:1 No - lnc-HECTD2-1:1 No - lnc-FCN2-1:1 No - MRPL23-AS1:5 No - lnc-SERPINI1-23:17 No - lnc-CELF4-4:1 No - LINC02072:3 No - MIR3945HG:3 No - lnc-GLYCTK-1:1 Yes chr2L:8374461-8375549 lnc-WNT7A-1:3 No - lnc-PCM1-4:2 No - lnc-ZNF729-1:1 No - LINC00399:2 No - lnc-FRG1-11:6 No - LINC02140:16 Yes chr3L:12609631-12710249 LINC00222:11 No - LINC02115:4 No - lnc-ANKRD30A-4:1 No - LINC00326:5 No - lnc-GBE1-1:1 No - lnc-ATIC-6:1 No - lnc-TUBGCP3-4:4 No - lnc-NR1I2-1:4 No - TMEM161B-AS1:27 No - LINC00964:7 No - lnc-COPS4-1:1 No - lnc-HNRNPA2B1-2:8 No - lnc-SEPT9-1:3 No - lnc-HS3ST5-2:1 No - lnc-TP53BP2-8:8 No - lnc-HAS2-1:1 No - LINC00642:9 No - LINC02472:5 No - lnc-SPATA31D4-1:12 No - lnc-MBL2-2:6 No - lnc-CHODL-14:1 No - TTTY2:4 No - lnc-TXN2-1:1 No - lnc-NAB2-1:1 Yes chrX:16653220-16655015 lnc-MED15-1:8 Yes chr2L:473013-476170 lnc-ZSCAN30-7:1 No - LINC02345:19 No - lnc-COL6A6-1:1 No - lnc-DRD5-10:15 No - lnc-RNF113A-5:1 Yes chr3R:27115152-27116707 lnc-TNFAIP3-5:2 No - lnc-TRPV6-1:1 No - LINC01315:3 No - LINC01608:8 No - LINC01520:2 No - lnc-DDC-1:3 No - lnc-GPR78-1:1 No - lnc-SERPINI1-23:18 No - lnc-BMI1-2:6 No - LINC01798:23 No - lnc-MGAT1-4:2 No - lnc-CD58-2:2 No - LINC02263:25 No - lnc-ADGRB3-4:1 No - LINC01615:3 No - LINC01332:1 No - lnc-SLITRK6-5:1 No - lnc-GADL1-1:2 No - LINC00908:5 No - RBM26-AS1:2 Yes chr2L:19493251-19497978 AATBC:6 No - lnc-CDC42EP5-1:1 No - LINC00838:3 No - lnc-RREB1-4:9 No - LINC02588:24 No - lnc-MITF-2:1 No - lnc-LDLRAP1-1:1 No - LINC01482:7 No - lnc-LRP5-1:2 No - SEMA3B-AS1:4 No - lnc-CCDC171-1:1 No - lnc-EGFL7-2:1 No - lnc-MID1-1:20 No - lnc-HIST4H4-3:1 No - lnc-ZKSCAN1-1:6 No - lnc-BRINP1-1:7 No - lnc-MAP6-2:2 Yes chr2R:7712578-7714182 lnc-HNRNPA2B1-2:4 No - LINC00851:3 No - lnc-CCDC187-1:32 No - lnc-FAM229A-4:1 No - lnc-RERE-2:1 No - lnc-CADM2-3:6 No - lnc-RBP5-1:3 Yes chr4:1112874-1123357 lnc-GBE1-3:2 No - lnc-SYF2-1:4 No - lnc-TMEM206-5:6 No - LINC00331:2 No - lnc-TRMT9B-1:1 No - lnc-RFX8-1:2 No - lnc-KCNK13-1:1 No - lnc-BANP-14:6 No - LINC01121:7 No - lnc-DAAM2-9:12 No - lnc-GADD45G-1:1 No - lnc-FAM84B-15:129 No - lnc-TPO-4:2 No - LINC01828:30 No - lnc-ADCY2-5:3 No - LINC00678:4 No - lnc-GLRX3-3:1 No - lnc-SRGAP2C-5:5 No - LINC01991:7 No - lnc-MAD2L2-1:1 No - LINC01197:10 No - lnc-DHX15-1:1 No - lnc-SGCG-1:1 No - ZNF582-AS1:22 No - lnc-NR4A3-1:3 No - lnc-TMEM174-1:2 No - lnc-ZNF91-4:13 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-ZNF30-3:3 No - lnc-TCF4-8:1 No - lnc-CARD11-7:1 No - LINC01606:4 No - lnc-POLE4-8:12 No - lnc-TMED7-1:1 No - LINC01082:4 No - lnc-SEL1L3-2:1 No - lnc-CHRAC1-1:4 No - lnc-SKAP2-1:2 No - lnc-RLIM-1:1 No - lnc-STIM2-2:1 No - lnc-PFKP-5:1 No - lnc-THRB-2:1 No - lnc-DNAAF5-3:22 No - lnc-TMCC1-3:1 No - LUCAT1:8 No - lnc-PDCD2-2:1 No - LINC02022:6 No - lnc-LARGE1-2:1 No - LINC00605:1 No - lnc-PPDPFL-1:1 No - LINC01490:8 No - LINC00205:8 No - LINC00298:1 No - lnc-OR4F5-2:1 No - lnc-SNX19-3:2 No - lnc-BORA-31:2 No - lnc-EXOC4-7:2 No - lnc-RIT2-1:1 No - LINC00313:22 No - lnc-SALL1-6:3 No - LINC01948:12 No - lnc-LMX1A-1:1 No - LINC01148:5 No - lnc-ZNF460-1:1 No - lnc-TSN-9:1 No - LINC01278:14 No - lnc-IRS1-2:11 No - lnc-CARD11-5:2 No - lnc-TMEM169-1:1 No - LINC02027:15 No - lnc-HNF4G-1:1 No - lnc-WDR5-2:1 No - lnc-TMEM18-6:6 No - lnc-HNF1A-1:3 No - lnc-ARHGAP29-1:1 No - LINC00299:4 No - PABPC1L2B-AS1:1 No - LINC01907:6 No - LINC02345:21 No - lnc-GLIPR1-2:1 No - lnc-HPCAL1-1:2 No - lnc-PQLC1-15:2 No - lnc-SORCS3-5:1 No - lnc-GDF10-2:1 No - lnc-ADAM29-5:6 No - lnc-RTL1-5:2 No - lnc-EGFL7-1:3 No - MHENCR:24 No - lnc-HPS3-2:2 No - lnc-CDC5L-2:1 No - lnc-NXPH2-2:1 No - lnc-CCNH-1:2 No - lnc-RWDD3-7:6 No - lnc-DNAH6-3:1 No - EDRF1-AS1:35 No - LINC02303:17 No - lnc-VSX1-1:7 No - lnc-CHD9-2:2 No - LINC00112:6 No - lnc-FAM84B-15:123 No - lnc-ALDH7A1-2:2 No - LINC01493:17 No - lnc-NUDT4-10:1 No - lnc-UTP23-1:1 No - LINC01986:6 No - lnc-USP14-4:1 No - lnc-DEUP1-1:1 No - lnc-TNP1-5:1 No - lnc-VSTM2B-5:19 No - lnc-RFC2-1:1 No - lnc-AJAP1-3:1 No - lnc-IQCM-1:1 No - lnc-RUBCNL-4:6 No - lnc-ANKRD30A-14:1 No - lnc-XCL2-2:5 No - OIP5-AS1:8 No - LINC01588:98 No - LINC01533:16 No - lnc-KLHL25-1:1 No - lnc-ATG10-2:1 Yes chr2R:9207561-9209774 lnc-HERC6-1:1 No - lnc-DCUN1D1-1:2 No - SIRLNT:10 No - LINC00298:5 No - RASGRF2-AS1:4 No - lnc-TCERG1L-2:1 No - lnc-DAW1-1:1 No - lnc-NUPL2-2:2 No - lnc-DLGAP5-3:1 No - lnc-QKI-1:1 No - lnc-ADGRL3-7:1 No - lnc-RADIL-2:1 No - lnc-ZADH2-2:1 No - lnc-SHOX2-1:2 No - lnc-GATA5-5:1 No - lnc-SYCP3-1:1 Yes chr2R:13486634-13494862 lnc-WIF1-6:33 No - lnc-TTPA-1:2 No - lnc-SPCS3-1:1 No - lnc-POTEC-5:1 No - lnc-CHD9-3:1 No - lnc-GPALPP1-2:1 No - lnc-PIWIL4-1:4 No - lnc-SNTG2-4:4 No - lnc-SYT1-2:1 No - LINC01718:17 No - lnc-SMC2-1:1 No - SPATA41:6 No - LINC01231:1 No - lnc-ADGRV1-5:2 No - LINC00251:2 No - lnc-MPHOSPH8-11:1 No - LINC00390:4 No - lnc-MC3R-2:1 No - lnc-KLF6-4:2 No - lnc-PRELID2-2:1 No - lnc-IGFBP2-4:3 No - LINC02446:7 No - lnc-C17orf67-1:1 No - lnc-PCDH8-2:2 No - lnc-ENC1-3:1 No - lnc-CRP-2:9 No - LINC01300:1 No - lnc-HRCT1-5:4 No - lnc-ZNF727-16:1 No - LINC01811:27 No - LINC00426:2 No - ZMIZ1-AS1:19 No - lnc-FOXA2-7:6 No - lnc-PSMD7-9:1 Yes chr4:501810-540874 lnc-TP53-1:1 No - lnc-FGF12-2:1 No - lnc-EBF3-7:1 No - lnc-RBP3-1:1 No - lnc-GRXCR1-4:1 No - lnc-TCEAL3-1:4 No - lnc-PLEKHA3-7:2 No - lnc-FAM84B-15:130 No - lnc-EN2-3:8 No - lnc-ADGRB1-4:1 No - lnc-LRRC58-1:1 No - lnc-RWDD3-7:7 No - lnc-UGT2A3-1:1 No - lnc-CTDSP2-3:1 No - lnc-THSD4-3:3 Yes chr2R:15331325-15339384 lnc-MPLKIP-5:7 No - LINC01846:3 No - LINC01841:7 No - lnc-OLFM1-1:1 No - lnc-PAPPA-1:1 No - LINC00347:7 No - lnc-FAM174A-1:1 No - LINC01187:9 No - lnc-MAP1LC3B2-28:16 No - lnc-PLXDC2-1:1 No - LINC01515:11 No - LINC01727:17 No - lnc-APPL2-2:1 No - lnc-COL4A1-2:5 No - lnc-KLF13-2:6 Yes chr2L:476446-479688 lnc-BOD1-1:18 No - lnc-HERC6-2:3 No - lnc-MAP1LC3B2-28:7 No - lnc-ZNF736-2:1 No - lnc-ARL14EP-3:7 No - lnc-NDFIP2-7:1 No - lnc-CADM2-3:5 No - LINC01736:18 No - LINC00649:27 No - lnc-IL6-3:7 No - lnc-POC1A-1:1 No - lnc-PKN2-2:1 No - lnc-RBMX-2:1 No - lnc-XRCC2-2:1 No - LINC00964:3 No - lnc-PHACTR2-1:1 No - LINC02525:24 No - lnc-ERP44-3:19 No - lnc-WNT7B-1:1 No - lnc-ABCA8-1:1 No - LINC00601:1 No - lnc-AKT3-2:1 No - DSCR9:2 No - LINC01384:4 No - lnc-GNAQ-1:1 No - lnc-FNDC1-3:2 No - lnc-ANKRD20A2-21:1 No - lnc-DGCR6-2:33 No - LINC01988:13 No - lnc-DDX27-4:1 Yes chr3L:2895017-2959579 lnc-OLFM3-1:1 No - JRKL-AS1:2 No - lnc-FAM174B-1:1 No - lnc-AUH-2:13 No - LINC02569:8 No - KCNQ1DN:1 No - lnc-SLX4IP-35:3 No - lnc-CPNE5-1:2 No - lnc-TNC-21:8 No - lnc-SELENOK-1:2 No - LINC02188:14 No - lnc-OAF-4:11 No - lnc-ARHGAP12-1:1 No - lnc-DAAM2-2:1 No - lnc-PLGLB2-10:1 No - lnc-RBFOX1-1:1 No - lnc-IRX3-80:35 Yes chr3L:12609631-12710249 LINC01808:12 No - lnc-FOS-1:2 No - lnc-CD6-1:1 No - lnc-MBD2-1:6 No - lnc-USP12-9:10 No - lnc-CELF4-4:2 No - lnc-SLC45A4-1:1 No - LINC02050:14 No - LINC00303:3 No - lnc-MIB2-1:3 No - lnc-TMEM99-3:1 No - LINC01806:16 No - LINC01394:33 No - LINC02286:12 No - LINC00642:6 No - lnc-KCNJ12-1:1 No - lnc-NDN-3:2 No - lnc-PABPC3-1:1 No - LINC01233:8 No - lnc-GNG5-1:1 No - lnc-ZNF726-8:2 No - lnc-SIRPA-1:1 No - lnc-SH3D21-2:2 No - lnc-NBDY-3:1 No - lnc-NCOR2-1:2 No - LINC01066:2 No - LINC01516:1 No - lnc-GYPC-1:2 No - KIF25-AS1:2 No - LINC01767:18 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-DTNBP1-16:9 No - lnc-OSBPL1A-7:1 No - lnc-PPP1R3D-2:1 No - lnc-RND3-4:1 No - lnc-MBL2-2:5 No - lnc-UBL5-7:1 No - LINC01491:2 No - lnc-TDRD3-3:5 No - lnc-THAP12-1:9 No - lnc-PMP22-1:1 No - lnc-CDH9-4:1 No - lnc-ACKR3-1:3 No - lnc-ANKRD20A2-18:3 No - lnc-ELK3-1:1 No - LINC00837:6 No - lnc-PCDH7-12:1 No - LINC02471:9 No - UBE2E2-AS1:2 No - MINCR:2 No - lnc-HEATR6-1:3 No - LINC01705:3 No - lnc-ACP1-3:4 No - lnc-APOL1-1:2 No - LINC00313:6 No - lnc-ARID2-2:1 No - MIR3945HG:4 No - lnc-ZNF91-1:20 No - lnc-ITGB1BP1-1:1 No - lnc-ASCL1-6:12 No - MYCNUT:3 No - LINC01694:21 No - lnc-PDCD2-1:1 No - lnc-RASSF2-5:1 No - lnc-ZWINT-1:1 No - LINC00426:16 No - lnc-ZNF804A-1:1 No - PVT1:31 No - LINC00205:6 No - lnc-SLC25A13-1:7 No - lnc-ULBP2-1:1 No - lnc-P2RX7-2:2 No - LINC01098:2 No - lnc-BRD3-2:1 No - LINC00320:7 No - lnc-CDH19-2:1 No - lnc-MANEA-5:1 No - RNASEH1-AS1:16 Yes chr2R:7931054-7932380 lnc-MED4-5:1 Yes chr3R:8938724-8943027 LINC02324:4 No - LINC02106:11 No - lnc-MRPL39-3:1 No - lnc-ACTR2-3:1 No - CASC16:2 No - lnc-SELENOP-1:4 No - lnc-SERINC3-29:10 No - lnc-FMN1-2:4 No - lnc-PRR16-1:3 No - lnc-TGFBRAP1-11:1 No - lnc-CKB-5:1 No - LINC02572:14 No - STK32A-AS1:16 No - lnc-FAM126B-1:1 No - lnc-LAT2-1:1 No - LINC02185:29 No - LINC02139:11 No - lnc-SLC6A9-2:15 No - lnc-GORASP2-1:1 No - lnc-RPIA-3:1 No - lnc-SERPINB6-2:3 No - LINC00474:4 No - lnc-LMF1-1:1 No - lnc-RAET1L-1:1 No - lnc-BOC-3:1 No - lnc-OR1J1-1:1 No - LINC01558:6 No - lnc-CMPK2-5:3 No - lnc-PRAG1-3:3 No - lnc-BAG1-2:3 No - lnc-FRMD4B-1:1 No - LINC02232:32 No - LINC01362:3 No - lnc-ROBO2-3:3 No - OLMALINC:8 No - lnc-RABL6-2:1 No - lnc-WDR60-5:1 No - PCBP1-AS1:3 No - LINC02165:7 No - LINC02508:5 No - lnc-SGCG-3:1 No - LINC01749:6 No - LINC02274:3 No - lnc-ZNF736-1:2 No - lnc-MPHOSPH8-14:1 No - lnc-ADGRL3-2:8 No - TMEM161B-AS1:17 Yes chr3L:11109690-11112117 lnc-SLC24A3-1:1 No - LINC01248:5 No - LINC00944:9 No - LINC01730:9 No - lnc-HIST1H1A-1:2 No - lnc-ZMYND19-3:2 Yes chrX:245978-254650 lnc-NCOA1-1:1 No - LINC00330:1 No - RNASEH1-AS1:5 Yes chr2R:7931054-7932380 lnc-CTAGE5-8:7 No - lnc-RPS4Y1-2:1 No - LINC00626:2 No - lnc-PELI2-6:1 No - lnc-ABI3-2:1 No - lnc-U2SURP-3:1 No - lnc-C10orf142-2:1 No - lnc-SLC35D3-1:1 No - lnc-SYN3-1:1 No - lnc-MFSD1-1:1 No - lnc-PELI1-5:2 No - lnc-ACSM5-2:1 No - LINC01426:5 No - lnc-LRRC8C-2:3 No - lnc-PLCXD1-3:1 No - LINC01170:15 No - lnc-TASP1-7:1 No - lnc-ZNF485-68:13 No - LINC01888:5 No - lnc-CERKL-2:1 Yes chr2L:10765010-10768006 lnc-THBS1-6:2 No - lnc-CAPZA3-2:1 No - lnc-ZFP64-4:1 No - lnc-SH3BGRL2-1:4 No - lnc-TRAF5-6:5 No - lnc-LGALS9B-2:3 No - lnc-ZNF804B-2:1 No - lnc-SERINC3-29:5 No - lnc-GEMIN2-2:1 No - lnc-TIMP1-1:1 No - lnc-RAB11FIP4-3:1 No - lnc-CCKAR-2:1 No - lnc-OLFM4-5:1 No - LINC02025:5 No - LINC01197:1 No - LINC01341:23 No - lnc-RPP30-1:1 No - lnc-MUC20-1:1 No - SAMMSON:3 No - lnc-DR1-1:1 No - lnc-CYS1-1:18 No - lnc-SLC15A4-1:4 No - lnc-SDSL-1:1 No - lnc-FOXA2-3:4 No - lnc-RREB1-9:8 No - lnc-U2SURP-3:2 No - MIR646HG:21 No - LINC01571:10 No - lnc-ADGRB3-2:2 No - lnc-ZNF485-68:8 No - LINC02289:35 No - lnc-PTS-1:31 No - lnc-SSTR4-4:3 No - GMDS-DT:135 No - lnc-PITX1-2:1 No - lnc-MAP10-1:2 No - TMEM161B-AS1:48 No - lnc-FAAH2-1:12 No - lnc-METTL14-3:17 No - lnc-ARHGEF26-1:1 No - lnc-NUTM2B-1:10 No - lnc-HFM1-1:2 No - lnc-ALOX12-1:1 No - lnc-SPAG1-3:3 No - lnc-MSH6-2:3 No - lnc-IL6-8:5 No - lnc-CYB5R4-5:5 No - lnc-KHDRBS3-5:5 No - lnc-SORBS3-1:6 Yes chr2R:10269016-10307024 lnc-CCDC180-4:2 No - lnc-ATP6V1H-2:1 No - LINC00648:5 No - LINC01592:4 No - RTCA-AS1:4 No - lnc-KLF6-1:1 No - lnc-UCHL5-3:1 No - EXTL3-AS1:4 Yes chr2R:19129589-19133706 lnc-PCLO-2:1 No - lnc-CHD2-2:1 No - lnc-MAGI1-2:1 No - LINC02352:16 No - LINC02397:31 No - lnc-SPATA31A3-3:2 No - lnc-ASB4-2:1 No - lnc-MTHFSD-3:1 No - lnc-ATAD2B-3:2 No - LINC00658:2 No - lnc-CSMD1-1:4 No - LINC01103:1 No - LINC00944:8 No - lnc-TPCN2-6:1 No - lnc-MPPED2-1:1 No - lnc-NOCT-6:1 No - lnc-NUDT7-1:1 No - lnc-LIN28B-10:5 No - LINC00954:4 No - LINC02395:22 No - lnc-ENOPH1-1:1 No - lnc-CLVS1-2:1 No - LRRC8C-DT:35 No - lnc-EDRF1-1:24 No - LINC01829:47 No - LINC02473:7 No - LINC01608:2 No - lnc-FRG2-5:1 No - LINC02290:18 No - lnc-POTEG-7:2 No - lnc-NR2F2-1:1 No - LINC01748:26 No - lnc-KIF20B-1:3 No - lnc-RAD23B-1:1 No - LINC01522:2 No - lnc-GRXCR1-4:2 No - lnc-RNF150-1:1 No - lnc-GPR149-1:1 No - LINC01833:37 No - lnc-CENPP-20:31 No - lnc-CRLS1-1:1 No - LINC00661:4 No - lnc-BATF3-2:2 No - lnc-TPO-1:2 No - lnc-DYNC1I1-1:1 No - lnc-OTOL1-3:1 No - lnc-BEND7-5:6 No - LINC01605:11 No - lnc-ZDHHC7-1:3 No - MIR3976HG:5 No - LINC00924:11 No - lnc-RPRM-4:1 No - lnc-TMEM70-1:4 No - UBE2E2-AS1:3 No - lnc-SHISA9-3:2 No - lnc-NAA35-16:1 No - lnc-COL18A1-3:1 No - LINC00928:1 No - LINC01341:9 No - lnc-SLITRK5-13:1 No - lnc-ALDH1A2-2:1 No - LINC02055:23 No - PRKCQ-AS1:50 No - lnc-NPIPA7-3:1 No - lnc-NVL-2:1 No - lnc-TTLL7-3:1 No - LINC01622:5 No - lnc-STAP1-3:1 No - lnc-MID1IP1-1:1 No - lnc-RIT2-2:1 No - LINC00370:4 No - lnc-POTEB3-2:2 No - lnc-NABP1-3:1 No - DARS-AS1:35 No - lnc-KLHL18-8:12 No - lnc-ALKAL2-2:26 No - LINC01887:7 No - lnc-OLFM3-1:3 No - lnc-TNFAIP6-1:1 No - lnc-EMP3-1:4 No - lnc-EPHA6-1:5 No - lnc-TENM4-4:7 No - lnc-GREM2-7:1 No - lnc-USP16-5:1 No - LINC02159:9 No - lnc-LYPLAL1-1:3 No - lnc-CARD11-5:3 No - lnc-ALDH7A1-3:1 No - lnc-GALNT15-1:1 No - LINC00353:3 No - lnc-SATB2-1:1 No - lnc-PCDH10-5:1 No - GAS5-AS1:1 No - LINC00906:6 No - lnc-SUSD4-1:1 No - lnc-SEC61G-7:3 No - lnc-LIMCH1-1:1 No - LINC02208:31 No - LINC00908:7 No - MYCNOS:7 No - RAB30-AS1:20 No - LINC00999:11 No - LINC02411:19 No - LINC00926:1 No - STK24-AS1:3 Yes chr3R:17085513-17087988 lnc-SBDS-2:1 No - lnc-EMX2-2:3 No - lnc-MON2-2:1 No - GATA3-AS1:3 Yes chr3R:8147368-8181444 lnc-COG6-2:1 No - LINC00968:5 No - LINC00906:2 No - lnc-PAFAH1B1-2:2 Yes chr2R:16186584-16194277 lnc-ZEB2-2:1 No - lnc-ZBBX-6:1 No - LINC01364:2 No - lnc-CXCL12-3:1 No - LINC02281:10 No - lnc-BRD1-26:1 No - lnc-SLC39A11-1:9 No - lnc-CCDC71L-1:2 No - lnc-GJA5-1:1 No - lnc-CD83-5:2 No - CFAP58-DT:7 No - lnc-LRRFIP1-1:1 No - lnc-MEF2C-1:1 No - lnc-POLR1A-8:1 No - lnc-POTEB-5:2 No - LINC01926:7 No - lnc-HOOK1-2:2 No - LINC01350:1 No - lnc-TMEM189-UBE2V1-3:1 No - lnc-LDLRAP1-1:2 No - lnc-ATAD5-9:10 No - LINC00630:41 No - lnc-LRRTM4-1:1 No - lnc-TMEM132B-4:6 No - lnc-AMELY-4:1 No - lnc-NIFK-4:1 No - LUCAT1:13 No - lnc-C6orf118-9:1 No - lnc-C3orf38-7:2 No - lnc-TIMM21-5:4 No - lnc-PAH-3:2 Yes chr3L:7760453-7763166 lnc-ZNF66-3:1 No - lnc-CMPK2-5:1 No - LINC00313:8 No - LINC00578:3 No - lnc-CDRT4-1:2 No - LINC01572:11 No - LINC01777:16 No - lnc-KIF26A-5:1 No - lnc-PGGHG-1:5 No - LINC01760:7 No - lnc-PTPRN2-1:1 No - DUBR:5 No - LINC01716:5 No - FAM160A1-DT:24 No - LINC01605:3 No - LINC00892:1 No - lnc-PRDM4-2:1 No - LINC02470:14 No - lnc-C19orf57-10:1 Yes chrX:11931280-11985087 lnc-TIMM21-5:1 Yes chrX:13445903-13527282 lnc-HIVEP1-3:1 No - LINC00327:7 No - LINC01635:15 No - lnc-KCNE1B-4:1 No - lnc-FAM182B-3:1 No - lnc-MAN2C1-2:3 No - lnc-ECEL1-1:1 Yes chr2R:22206005-22210765 lnc-BRD7-2:1 No - lnc-LCLAT1-2:1 No - lnc-NUDT4-10:2 No - lnc-NLGN4Y-1:1 No - lnc-UVSSA-1:4 No - LINC02309:5 No - lnc-SEPT9-3:7 No - lnc-U2SURP-1:1 No - lnc-CDH5-10:1 No - lnc-CDH5-4:2 No - lnc-NUTM2B-1:1 No - LINC00944:10 No - lnc-ZC3H12C-1:1 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-BMP7-1:1 No - lnc-TP53TG3F-29:1 No - LINC02286:15 No - lnc-ZNF804A-1:2 No - lnc-ABHD2-1:1 No - lnc-FBXO15-4:1 No - lnc-FERMT2-1:1 Yes chr3L:17024328-17027117 lnc-NSA2-1:1 No - LINC00882:12 No - lnc-PPP2R2D-2:1 No - lnc-ADCY2-3:1 No - lnc-RNASEH1-1:8 Yes chr2R:7931054-7932380 lnc-PARP11-3:1 No - lnc-ZFP36L2-1:1 No - lnc-ACTR2-1:1 No - lnc-ATIC-4:2 No - lnc-MUC20-68:2 No - lnc-PLEKHG6-2:1 No - lnc-RXFP3-1:1 Yes chr3L:18668153-18673324 lnc-SOD2-3:2 No - LINC00882:2 No - lnc-PGS1-1:2 No - lnc-TEKT4-7:2 No - LINC01622:1 No - LINC01375:1 No - lnc-ZFHX3-27:9 No - lnc-HNRNPA1P48-6:1 No - lnc-CCT8-1:1 No - LINC01350:2 No - LINC01217:1 No - lnc-PLA2R1-1:2 No - lnc-LRSAM1-3:2 Yes chr3L:4136359-4138996 lnc-CYSTM1-1:5 No - lnc-NAIF1-1:1 No - lnc-SLC24A3-2:1 No - lnc-BATF3-2:5 No - LINC02045:3 No - lnc-COL28A1-1:1 No - LINC02417:7 No - lnc-TOMM20-2:7 No - lnc-MUC20-67:92 No - LINC01104:1 No - lnc-ZNF664-3:6 No - lnc-HSP90AA1-3:1 No - lnc-ABHD12B-4:1 Yes chr2L:2130813-2137296 LINC01571:1 No - lnc-BMP6-106:141 No - lnc-RAB3GAP2-3:1 No - LINC02374:10 No - lnc-MAP3K2-2:1 Yes chrX:16309817-16313138 lnc-OR4F3-2:1 No - lnc-PTPN14-2:2 No - lnc-PCDH18-1:7 No - lnc-SAMD11-4:2 No - lnc-PCTP-2:2 No - lnc-FOXD3-3:1 No - lnc-RP9-2:2 No - lnc-GPBP1-2:4 No - lnc-MSI2-2:1 No - LINC01980:18 No - lnc-LRP8-1:2 No - lnc-SCIMP-1:2 No - lnc-ZCCHC17-1:1 No - lnc-MOCS3-2:1 No - lnc-BCKDHB-1:6 No - LINC01405:9 No - lnc-ERI1-1:1 No - LINC01310:2 No - lnc-VPS18-1:1 No - LINC00824:4 No - lnc-TMEM174-1:5 No - lnc-TOX3-1:9 No - LINC01098:3 No - lnc-PGM5-2:11 Yes chr3L:16126018-16128531 LINC01018:5 No - lnc-SRCIN1-1:8 Yes chrX:20469955-20510694 lnc-BUB3-4:10 No - lnc-SMARCAL1-1:1 No - lnc-LAMA2-1:1 No - lnc-ID4-2:1 No - lnc-TRIP10-1:1 No - lnc-SLFN5-1:7 No - LINC00917:14 No - lnc-GABRG1-1:1 No - lnc-MEI4-3:4 No - lnc-FAHD2B-2:1 No - lnc-EGLN3-1:3 Yes chr3R:5257037-5269507 lnc-PQLC2-1:1 No - LINC02305:6 No - LINC02508:6 No - lnc-GATA3-7:1 No - CCDC18-AS1:29 No - lnc-HAPLN3-1:1 No - lnc-C7orf25-2:1 No - lnc-TNFAIP6-2:1 No - lnc-NR5A2-1:1 No - lnc-NDUFV3-2:7 No - lnc-BCL11B-1:2 No - LINC02343:19 No - lnc-FRG2C-6:1 No - lnc-UTP11-4:3 No - LINC01248:8 No - lnc-OTX2-2:1 No - LINC01013:15 No - LINC00575:4 No - lnc-LRRC10B-1:2 No - lnc-EPHA7-4:1 No - LINC02358:3 No - LINC01913:12 No - lnc-HPCAL1-1:7 No - lnc-NAA35-1:2 No - LINC00052:7 No - lnc-ZNF91-4:14 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-C9orf66-4:2 No - lnc-CPEB4-1:2 No - lnc-RIPOR3-2:1 No - ST3GAL5-AS1:2 No - CHKB-DT:59 Yes chr2L:21614232-21624080 lnc-MAX-2:2 No - lnc-SLC2A13-3:3 No - lnc-ALK-2:1 No - lnc-MYB-5:1 No - PARAL1:5 No - lnc-FAM20C-3:2 No - lnc-ZNF287-1:1 No - lnc-CDK12-1:1 Yes chr3L:21516306-21522684 lnc-CCDC74A-6:1 No - lnc-P2RX5-1:1 No - lnc-RBM10-1:1 No - lnc-RUNX1T1-4:5 No - LINC01741:3 No - lnc-SALL1-2:1 No - lnc-ATP10A-2:2 No - LINC02068:10 No - LINC01426:4 No - LINC01176:18 No - lnc-DNAJB11-1:1 No - LINC01036:27 No - lnc-GPR89B-1:2 No - lnc-ATF3-1:2 No - LINC01883:9 No - lnc-RNF113B-1:1 No - lnc-RAB1A-1:3 No - lnc-FEZ2-7:8 No - lnc-NR2F1-2:1 No - lnc-KLF6-5:5 No - LINC02384:45 No - LINC01224:52 No - LINC01811:25 No - PVT1:28 No - lnc-KLHL31-2:2 No - LINC00685:4 No - lnc-TAF13-1:1 No - lnc-SPANXB1-1:2 No - lnc-FAM43A-6:1 No - LINC01732:13 No - lnc-GRPEL1-2:1 No - lnc-AHR-3:1 No - lnc-SPATA17-3:1 No - lnc-FBXO15-3:2 No - lnc-DHX37-5:1 No - lnc-SPOPL-1:1 No - lnc-ACBD5-2:2 No - lnc-ZPLD1-2:1 No - lnc-SEC22A-1:2 No - LINC01241:12 No - LINC02374:12 No - lnc-TRAPPC12-3:1 No - lnc-CNOT8-1:1 No - lnc-DLL1-5:1 No - lnc-SFMBT2-2:1 No - lnc-IFI44-2:1 No - lnc-ETAA1-2:1 No - lnc-C5orf38-1:6 No - lnc-ANP32D-1:1 No - LINC01060:12 No - lnc-ALX1-2:1 No - GACAT1:1 No - lnc-ZNF582-1:1 No - lnc-GCLC-1:13 Yes chrX:8102181-8116147 lnc-NRP2-1:1 No - lnc-CD33-1:1 No - lnc-CATSPER3-3:1 No - lnc-ISX-1:1 No - LINC00332:1 No - FENDRR:5 No - lnc-FRAT1-1:2 No - lnc-ZCCHC7-1:1 No - LINC01717:11 No - lnc-TBC1D22A-4:20 No - LINC01569:14 No - lnc-CHAF1B-1:1 No - lnc-TNFAIP6-2:3 No - lnc-KCNRG-5:1 No - lnc-SPAG1-3:8 No - lnc-MTRNR2L12-3:1 No - lnc-USP12-9:8 No - lnc-GREM2-8:1 No - lnc-PRDM9-23:1 No - lnc-SAMD11-16:1 No - LINC00114:12 No - LINC00261:2 No - PTCSC3:1 No - lnc-FAM183A-3:2 No - lnc-CACNB3-1:3 No - lnc-CHN1-1:1 Yes chrX:8276200-8367169 PRKCQ-AS1:28 No - LINC01166:2 No - lnc-PPARGC1A-1:1 No - lnc-CRYBA4-52:84 No - lnc-LSM6-1:2 No - lnc-LGALS12-2:3 No - lnc-IGFBP7-5:8 No - lnc-STAT6-1:1 Yes chrX:16653220-16655015 lnc-ONECUT1-1:4 No - lnc-PTGER4-1:1 No - lnc-YWHAH-1:1 No - LINC01255:1 No - LINC01351:9 No - lnc-API5-4:2 No - lnc-DNAH14-1:1 No - lnc-SLC40A1-1:2 No - lnc-ABHD2-1:6 No - lnc-ARHGEF5-2:2 No - lnc-KLHDC7B-1:2 No - lnc-C2orf69-1:1 No - LINC01187:5 No - lnc-AKR1E2-5:2 No - lnc-EVX1-14:1 No - lnc-PQLC1-5:5 No - LINC00692:8 No - lnc-ANLN-3:1 No - lnc-ZPR1-1:1 Yes chrX:9160124-9162090 lnc-EXOC4-2:5 No - lnc-STMP1-8:9 No - lnc-MRPL33-1:4 No - lnc-MFSD8-4:2 No - lnc-TMEM64-3:1 No - lnc-SWT1-1:1 No - lnc-KCNAB2-2:1 No - lnc-EFNB2-5:1 No - lnc-C5orf63-1:1 No - lnc-TMEM38B-1:1 No - LINC02192:3 No - PWRN1:14 No - LINC01197:3 No - lnc-TMEM132C-6:1 No - LINC00917:1 No - LINC02017:3 No - lnc-NIFK-2:5 No - lnc-MUC20-6:7 No - lnc-FAM20C-5:2 No - LINC00683:5 No - lnc-VTI1A-1:1 No - LINC00899:15 No - lnc-SMIM23-1:2 No - UCA1:12 No - lnc-ZNF131-2:15 No - lnc-PTPRD-5:1 No - lnc-PAXIP1-23:4 No - OSTM1-AS1:3 Yes chr3L:3333119-3334978 lnc-MAPK6-10:3 Yes chr2R:11619479-11640941 CASC22:23 No - lnc-ADGRL4-2:1 No - lnc-WASHC5-4:2 No - lnc-GPCPD1-8:13 No - TUG1:10 No - lnc-SEPT7-1:6 No - lnc-HES1-2:7 No - lnc-APIP-1:1 No - lnc-DLGAP2-3:2 No - lnc-CDKAL1-2:1 No - lnc-ABCD3-2:2 No - lnc-PTPA-1:6 No - lnc-LRRTM4-2:1 No - lnc-KLF7-1:13 No - lnc-DNAJC19-4:1 No - lnc-MRPS9-1:1 No - lnc-NDEL1-2:1 No - lnc-RNF34-1:1 Yes chr3L:3905344-3907813 LINC00635:4 No - lnc-TMEM63B-1:1 No - lnc-GPCPD1-8:9 No - lnc-HDAC2-4:4 No - lnc-SH3RF3-1:1 No - lnc-ZNF516-4:1 No - lnc-FRG1-11:3 No - LINC00642:2 No - lnc-ABHD12-1:1 No - lnc-TMEM242-3:2 No - LINC01013:2 No - lnc-PPP4R1-2:6 No - lnc-MAP3K9-3:5 Yes chrX:12988615-13079070 LINC01723:34 No - lnc-FAM84A-1:1 No - lnc-PFKFB3-453:5 No - LINC01574:2 No - lnc-FAM172A-3:1 No - LINC02561:21 No - lnc-RGPD3-1:1 No - lnc-TSPAN12-2:2 No - lnc-PDGFD-1:3 No - LINC01018:15 No - lnc-SAMD11-16:5 No - LINC00964:8 No - lnc-LRP5L-2:4 No - LINC01550:22 No - lnc-PARD3B-1:1 No - lnc-USP12-9:11 No - lnc-GRHL2-3:2 No - lnc-PGM5-2:12 Yes chr3L:16126018-16128531 lnc-ALDH1A1-4:3 No - lnc-LRRC46-1:1 No - LINC01323:1 No - LINC02200:9 No - lnc-ZNF98-2:3 No - lnc-RPLP1-12:15 No - lnc-PBX3-6:1 No - FAM41C:4 No - TP53TG1:11 No - lnc-ZNF705E-2:1 Yes chrX:5329876-5332435 lnc-CA5A-4:1 No - LINC00662:16 No - lnc-BRF2-9:10 No - LINC01397:5 No - LINC02109:46 No - lnc-P2RY1-3:9 No - lnc-FAM72B-6:5 No - lnc-FMNL2-1:1 No - LINC01997:3 No - LINC01427:5 No - lnc-LYPLAL1-1:1 No - lnc-SLC25A6-1:2 No - lnc-C19orf12-1:1 No - lnc-COL4A1-2:1 No - lnc-OTULIN-3:2 No - lnc-TRIM38-6:1 No - lnc-ITGA6-1:4 No - LINC01007:2 No - lnc-PTK2B-6:3 No - LINC02109:33 No - lnc-PITRM1-7:5 No - lnc-SLC39A11-1:19 No - lnc-CPA1-1:1 No - lnc-AHNAK-3:1 No - LINC01013:6 No - LINC00314:1 No - PANTR1:53 No - lnc-HIVEP1-1:1 No - LINC00662:30 No - lnc-ARHGAP26-4:4 No - lnc-TIMM21-3:1 No - lnc-MGAT1-4:13 No - lnc-RHOBTB3-1:3 No - lnc-ELF2-2:1 No - lnc-SORCS3-3:1 No - lnc-TAS2R1-1:1 No - lnc-SCLT1-9:1 No - lnc-PRDM11-3:2 No - lnc-TRMT112-3:2 No - LINC00313:36 No - lnc-SYK-6:1 No - LINC02248:11 No - LINC01899:15 No - lnc-PLK2-2:1 No - TNFRSF14-AS1:26 No - lnc-FBXO31-12:4 No - lnc-GAS1-1:1 No - lnc-IMMP2L-1:1 No - LINC00513:17 No - LINC01747:13 No - lnc-UTRN-2:1 No - lnc-TMEM132B-12:2 No - lnc-MECR-2:1 No - lnc-STPG1-3:3 Yes chr3R:16186999-16197584 LINC00507:4 No - lnc-ING2-1:1 No - lnc-BCL11A-2:1 No - lnc-FANCL-2:1 No - LINC02295:5 No - lnc-DUSP10-2:1 No - LINC01697:42 No - lnc-RPP40-1:3 No - lnc-MEMO1-3:1 No - lnc-IFITM3-1:2 No - lnc-TCIRG1-2:2 No - lnc-NEUROD1-1:1 No - lnc-KLF7-1:4 No - lnc-ADD3-2:1 No - lnc-SOCS5-4:13 No - lnc-EXOC4-7:3 No - lnc-ABRA-4:1 No - LUCAT1:10 No - lnc-ZFAT-5:1 No - lnc-VPS37C-3:2 No - LINC01744:10 No - lnc-FCMR-1:1 No - lnc-ANXA2R-1:2 No - LINC00924:13 No - lnc-SRCIN1-1:4 Yes chrX:20469955-20510694 LINC01790:3 No - LINC02498:10 No - lnc-SMIM2-2:4 No - lnc-BMP6-106:142 No - lnc-SSTR4-2:3 No - LINC01842:5 No - LINC01718:11 No - LINC01563:5 No - lnc-LRRC61-2:2 No - lnc-HDAC2-4:3 No - lnc-BLCAP-3:1 No - lnc-SOX17-1:1 No - lnc-SPATA31A3-4:1 No - lnc-CEP95-1:4 Yes chrX:18813297-18830406 LINC02217:40 No - LINC00637:1 No - lnc-MBNL1-1:1 No - lnc-ZNF705D-2:41 No - lnc-HECA-3:5 No - lnc-EMX2-5:9 No - lnc-GDAP2-1:4 No - lnc-C2CD4A-6:1 No - lnc-OR5H15-1:1 No - LINC02006:9 No - lnc-LARS2-1:1 No - lnc-MITF-4:1 No - PWRN1:2 No - WASIR2:3 No - lnc-CCDC93-1:1 No - lnc-KCNJ4-1:2 No - lnc-SFSWAP-1:2 No - lnc-IL31RA-4:6 No - lnc-LRFN2-1:1 No - lnc-ACOT11-1:1 No - lnc-ZFP42-2:5 No - lnc-OXCT1-1:7 No - lnc-ALPK1-1:3 No - lnc-SNX16-1:3 No - lnc-PTPRU-3:1 No - LINC01102:11 No - lnc-CCDC140-5:2 No - lnc-APOL3-1:1 No - lnc-TSPAN18-1:1 No - lnc-MPRIP-2:1 No - lnc-ZNF705D-2:53 No - lnc-CTR9-4:1 No - lnc-RAB6C-3:1 No - lnc-NPAP1-8:3 No - FAM27E5:2 No - lnc-RPLP1-12:50 No - lnc-MPV17L2-1:1 No - lnc-TRPM1-1:8 No - lnc-NUPR2-5:4 No - LINC00290:4 No - lnc-MUC20-67:146 No - lnc-TFCP2L1-1:1 No - lnc-TAOK3-7:3 No - LINC00929:13 No - RRS1-AS1:1 No - lnc-COL6A3-4:1 No - lnc-RPL13-1:8 Yes chrX:2694392-2698211 lnc-FSCB-1:1 No - MIR4307HG:3 No - LINC01372:9 No - lnc-TINCR-6:1 No - lnc-ABO-33:8 No - LINC00317:1 No - lnc-BAG1-2:1 No - LINC02476:16 No - lnc-COA6-3:1 No - LINC01257:1 No - lnc-TRIM43-9:1 No - LINC01038:3 No - lnc-APOL1-1:1 No - lnc-FABP3-2:1 No - OLMALINC:17 No - lnc-CDH9-2:6 No - lnc-IDH3B-1:2 No - lnc-SERPINI1-1:1 No - lnc-HIVEP1-4:1 No - LINC01961:13 No - LIN28B-AS1:12 No - lnc-TMCC1-12:4 No - lnc-ZSWIM6-6:9 No - lnc-MBL2-1:1 No - lnc-KDM4C-7:1 No - lnc-CAND2-1:1 No - C5orf64-AS1:10 No - GAS1RR:7 No - lnc-ITIH2-4:1 No - lnc-RGS18-2:1 No - lnc-PANK1-2:3 No - lnc-SPNS3-1:10 Yes chrX:9192669-9193620 RBM26-AS1:12 No - lnc-HSBP1L1-1:1 No - LINC02289:36 No - lnc-KLF3-2:1 No - lnc-NCOA3-9:2 No - LINC01470:4 No - lnc-PPP2R5B-1:1 Yes chrX:16740906-16742918 lnc-ZNF577-4:2 No - PWRN1:26 No - FENDRR:10 No - lnc-SLITRK5-35:4 No - lnc-PLAGL2-2:1 No - lnc-INSIG2-1:1 No - lnc-NAV2-2:3 No - LINC02362:22 No - lnc-SLC12A7-2:1 No - lnc-TUBB8P12-2:4 No - IDH2-DT:21 No - lnc-PSMC5-1:1 No - LINC01672:13 No - lnc-PML-1:1 No - lnc-BNIP1-4:1 No - lnc-NBPF3-1:1 No - LINC01855:11 No - LINC00670:6 No - lnc-BUB3-4:30 No - lnc-EXOC2-1:1 No - GNG12-AS1:6 No - lnc-SPDL1-1:1 No - lnc-KLRB1-1:1 No - LINC02126:7 No - lnc-IGFBP7-2:1 No - LINC01445:2 No - lnc-MEF2D-1:1 No - LINC02114:6 No - lnc-GCLC-1:3 Yes chrX:8102181-8116147 LINC02153:22 No - LINC00911:8 No - lnc-TMEM106C-1:2 No - lnc-LCORL-1:1 No - lnc-GABRB3-2:1 No - lnc-MSL2-1:1 No - LINC02583:29 No - LINC00927:34 No - lnc-APBA1-2:1 No - LINC01049:2 No - LINC02407:29 No - LINC01202:11 No - lnc-ZBTB7C-1:1 No - lnc-ITPRIP-2:1 No - lnc-PFKP-12:1 No - LINC01569:13 No - lnc-BIRC6-1:4 No - lnc-TENM4-4:6 No - lnc-PTN-1:1 No - lnc-S100P-2:18 No - lnc-ZNF485-68:20 No - lnc-ABI3-1:1 No - lnc-NOM1-2:1 No - lnc-KLF4-15:1 No - LINC02389:16 No - lnc-EFHB-1:1 No - lnc-PPA2-2:1 No - LINC01644:5 No - lnc-FBXW11-2:2 No - LINC00426:22 No - LINC02065:6 No - LINC00426:17 No - LINC00687:4 No - lnc-ITGA6-1:1 No - lnc-CHMP2B-2:1 No - lnc-NKD2-3:2 No - lnc-SLC38A11-1:1 No - lnc-TTC14-3:2 No - lnc-NLRP3-1:2 No - lnc-COL6A3-2:1 No - lnc-SECTM1-1:1 No - lnc-HNRNPA1-3:1 No - lnc-SPAG16-1:1 No - lnc-ADAMTS9-3:3 No - lnc-TRAPPC12-3:2 No - lnc-DYNC1I1-1:3 No - TTTY8B:1 No - TBX2-AS1:18 No - lnc-C17orf67-2:1 Yes chr3R:22639808-22683827 lnc-TMEM161B-1:1 Yes chr3L:11109690-11112117 lnc-C16orf78-1:7 No - lnc-TMEM242-1:1 No - lnc-SALL3-2:1 No - PRKCQ-AS1:8 No - lnc-ADAMTS9-2:1 No - lnc-PCED1B-2:6 No - MIR3681HG:2 No - lnc-ERCC6L2-3:2 No - lnc-RAMP3-2:1 No - LINC01622:18 No - lnc-ALX4-2:1 No - LINC00941:6 No - lnc-TMEM132B-2:4 No - lnc-NXPE2-8:1 No - lnc-DEPP1-2:13 No - lnc-ZNF609-4:1 No - lnc-PCDH20-7:1 No - lnc-TMEM250-2:10 No - lnc-DCAF4L1-1:1 No - LINC00313:19 No - lnc-TMEM196-1:1 No - LINC01809:4 No - LINC02593:39 No - LINC01078:2 No - lnc-BCKDHB-1:5 No - lnc-CXCL8-1:1 No - lnc-OR4F29-7:3 No - lnc-AUH-2:1 No - LINC00620:8 No - lnc-RHOBTB1-1:1 No - lnc-FAM172A-7:4 No - lnc-GPCPD1-8:4 No - lnc-BUB3-4:16 No - lnc-ATAD2B-12:1 No - lnc-PLPP4-2:1 No - lnc-PYDC2-2:1 No - lnc-NPAP1-6:4 No - lnc-SERHL2-2:1 No - LINC01950:6 No - lnc-PPP1R3A-1:1 No - lnc-IRX2-2:1 No - lnc-TMEM17-2:8 No - lnc-GNG2-1:3 No - lnc-KMT2B-1:1 No - LINC01612:2 No - lnc-ADARB1-1:1 No - lnc-ASMT-1:1 No - lnc-PMAIP1-2:1 No - lnc-TSN-14:8 No - lnc-NDUFS6-1:1 No - lnc-KLF6-5:3 No - LINC01672:15 No - lnc-ETDB-1:10 No - lnc-BMX-1:1 No - lnc-DMAC1-1:2 No - LINC01304:14 No - RUNX2-AS1:27 No - ZNF236-DT:21 No - lnc-WRB-1:1 No - lnc-BTG3-2:1 No - lnc-EML6-4:4 Yes chr2L:4958411-4965430 lnc-UNC13C-2:2 No - lnc-PIGP-1:1 No - lnc-KLF12-1:3 No - LINC00205:14 No - lnc-AMD1-1:1 No - lnc-SRPK2-1:3 No - LINC01471:9 No - lnc-PDGFA-17:18 No - lnc-CCSER1-1:2 No - ZFHX4-AS1:14 No - lnc-HDAC9-2:1 Yes chr2R:22985374-23048325 lnc-SLC20A1-2:2 No - lnc-ZPBP-3:2 No - lnc-ABT1-3:2 No - lnc-RNF144A-1:1 No - FRGCA:1 No - lnc-ZFP36L1-1:1 No - lnc-KHDRBS3-4:5 No - LINC02142:6 No - BBOX1-AS1:7 No - lnc-SLC2A9-2:1 No - lnc-SLC25A13-1:8 No - lnc-GPR39-2:2 No - lnc-WRB-2:1 Yes chr3R:24319000-24328619 lnc-ZNF726-8:1 No - LINC02494:8 No - lnc-GAS6-2:1 No - LINC01919:11 No - lnc-NR1I2-1:10 No - lnc-OR51B6-1:1 No - lnc-CCDC68-1:1 No - SMCR2:1 No - lnc-HES1-1:1 No - ITPR1-DT:17 No - lnc-DRD5-7:1 No - lnc-RHOXF1-3:12 No - LINC01063:1 No - lnc-ZADH2-1:1 No - LINC02273:12 No - lnc-PIK3R1-4:1 No - lnc-FAM110B-1:1 No - lnc-ANKH-2:1 No - lnc-CEP57-1:2 No - lnc-FKBP1C-5:1 No - lnc-C8orf48-1:2 No - LINC00926:6 No - lnc-CHST1-4:2 No - lnc-BNIP1-1:1 No - lnc-CDR1-1:1 No - lnc-SH3BGRL2-1:1 No - lnc-PRSS3-2:14 No - lnc-NID2-4:1 No - C10orf71-AS1:6 No - lnc-NPY5R-1:4 Yes chr2L:18698714-18700645 LINC01527:1 No - lnc-KLHDC10-1:1 No - LINC01141:7 No - lnc-INO80D-1:1 No - lnc-TAOK3-1:3 No - lnc-PDE7A-6:3 No - LINC00662:10 No - lnc-AADAT-2:1 No - lnc-TEX13C-1:2 No - lnc-LGALSL-1:1 No - lnc-NDFIP2-7:7 No - lnc-PGM5-2:8 Yes chr3L:16126018-16128531 LINC00486:3 No - lnc-C5orf38-4:2 No - lnc-PARN-1:1 No - LINC02004:9 No - lnc-TCIM-2:1 No - lnc-PPDPF-1:4 No - lnc-ZNF423-1:2 No - LINC02427:12 No - IGFBP7-AS1:8 No - LINC00284:8 No - lnc-ATAD2B-3:3 No - LINC01146:17 No - LUADT1:1 No - lnc-SMIM11B-3:1 No - lnc-GPR137B-1:2 No - lnc-TAGAP-1:1 No - LINC01880:15 No - lnc-CFAP46-3:4 No - lnc-MRPL19-3:1 No - CISTR:3 No - lnc-ATP6V1D-8:11 No - TUG1:31 No - lnc-SSTR4-5:1 No - LNCARSR:12 No - lnc-NOCT-5:5 No - lnc-PDCD2-2:2 No - lnc-STIM2-4:3 Yes chrX:15934495-15940451 LINC01233:3 No - LINC01730:11 No - MIR99AHG:32 No - LINC00662:3 No - lnc-ZNF676-1:4 No - lnc-ETV3-1:1 No - LINC02453:14 No - lnc-COIL-2:4 No - lnc-HIST1H2AI-3:1 No - lnc-CYBB-1:2 No - DIRC3-AS1:3 No - lnc-UPK3B-2:2 No - LINC02348:15 No - lnc-CHST4-1:1 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-FAM53A-1:2 No - lnc-CAPRIN2-1:1 No - lnc-ACP1-3:3 No - lnc-RAD23B-7:1 No - lnc-MFSD4B-1:3 No - lnc-EDAR-5:1 No - LINC01483:2 No - lnc-CEBPD-13:1 No - lnc-VEZF1-1:2 No - lnc-KLHL31-2:5 No - lnc-CCDC7-21:1 No - LINC01760:10 No - LINC01543:4 No - lnc-SSUH2-4:1 No - LINC01336:4 No - lnc-DRD5-11:1 No - lnc-ACSM4-1:1 No - lnc-CADM1-4:2 No - lnc-ERCC6L2-2:4 No - lnc-SOD2-2:4 No - PAXIP1-AS1:3 No - lnc-OGFRL1-3:1 No - lnc-MSX1-1:1 No - lnc-MN1-4:1 No - lnc-LINC02203-2:1 No - lnc-C15orf41-2:5 No - lnc-IL20RA-1:3 No - lnc-LARGE1-5:1 No - lnc-GDF10-2:2 No - lnc-PRDM1-2:1 Yes chrX:7314622-7323770 lnc-PQLC1-5:3 No - lnc-NOC4L-2:1 No - lnc-DHRS2-3:2 No - LINC01187:2 No - lnc-PMEPA1-1:1 No - lnc-TFEC-4:1 No - lnc-CNTNAP5-1:1 No - lnc-COX10-6:1 No - lnc-TMEFF2-2:1 No - lnc-MRPL39-13:2 No - lnc-CFAP100-1:2 No - lnc-CPHXL-1:2 No - LINC01524:20 No - lnc-GIN1-1:1 No - lnc-KHDRBS3-5:1 No - lnc-ZNF599-3:4 No - lnc-FAM160A1-4:1 No - LINC01255:16 No - lnc-SCAND1-2:1 No - lnc-ZKSCAN1-1:1 No - LINC01786:5 No - lnc-LARGE1-4:1 No - lnc-PDGFA-17:17 No - lnc-PCDH7-10:1 No - LINC01127:38 No - lnc-GJD4-1:1 No - LINC01948:11 No - lnc-CCDC140-5:1 No - lnc-APOB-2:1 No - lnc-C2orf71-1:1 No - lnc-ITGB1-6:7 No - LINC00982:13 No - LINC00564:6 No - TMEM161B-AS1:25 No - lnc-DNAAF5-3:16 No - lnc-DRD5-8:2 No - lnc-HPCA-1:1 No - LINC01716:7 No - lnc-EPCAM-2:2 No - lnc-ERICH2-1:9 No - LINC01614:8 No - lnc-NAV3-5:6 No - LINC01405:5 No - lnc-EXT1-4:3 No - lnc-CHODL-4:1 No - lnc-KCNE1B-1:2 No - lnc-PLCZ1-1:1 No - lnc-ODF2L-1:1 No - lnc-KCNS3-2:1 No - lnc-SLC39A11-1:24 No - lnc-SLC16A11-7:24 No - LINC02391:9 No - lnc-FTCDNL1-1:1 No - lnc-BMP7-2:2 No - lnc-METTL15-3:1 No - LINC00880:5 No - LINC01229:4 No - lnc-FAM50B-1:1 No - lnc-CIDEA-1:1 No - LINC00222:1 No - lnc-SGTB-4:1 No - LINC01405:10 No - lnc-NEURL1B-3:2 No - lnc-OLIG3-1:1 No - lnc-WRN-4:1 No - lnc-RPS21-4:1 No - PAXIP1-AS1:9 No - LINC00528:17 No - lnc-NLGN2-1:1 Yes chr3R:7570281-7639434 lnc-CA5A-4:6 No - lnc-ALKAL2-1:1 No - lnc-EBAG9-4:2 No - lnc-SAMD11-4:3 No - lnc-ZNF837-1:14 No - lnc-USP34-1:1 No - lnc-RYR2-2:1 No - lnc-SHPRH-1:3 No - lnc-SERPINI1-3:2 No - lnc-ANGPT2-3:2 No - HAR1B:2 No - LINC02077:3 No - lnc-EPHA4-1:1 No - lnc-RMDN2-3:24 No - lnc-ZNF131-2:8 No - RC3H1-IT1:2 Yes chr3L:16370938-16378566 lnc-CWC22-1:1 No - lnc-NXPH2-5:1 No - lnc-CHRD-10:4 No - LINC00346:2 No - lnc-FAM84B-3:1 No - lnc-ATP23-89:11 No - lnc-NFRKB-1:1 No - lnc-PABPC4L-2:1 No - lnc-NOM1-1:1 No - lnc-PRMT6-2:2 No - LINC01197:9 No - LINC00629:4 No - lnc-SPATA31A1-5:7 No - lnc-PFKP-9:1 No - LINC02537:12 No - lnc-COPS8-17:1 No - lnc-ZNF32-3:1 No - lnc-FTCD-2:1 No - lnc-USP41-1:5 No - lnc-VGLL3-2:2 No - LINC02064:12 No - lnc-ST3GAL4-55:9 No - lnc-RPS4Y1-4:1 No - lnc-PRMT6-2:1 No - LINC00365:2 No - lnc-ITIH2-1:1 No - lnc-SYF2-1:1 No - lnc-ETS1-2:1 No - lnc-MAP3K9-3:1 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-SLX4IP-37:5 No - lnc-OTOL1-13:3 No - lnc-SPATA19-9:5 No - LINC00609:4 No - lnc-DRD5-5:1 No - lnc-RGMA-5:1 No - lnc-KLF8-4:15 No - lnc-C10orf120-2:1 No - DANT2:1 No - lnc-S100P-2:17 No - lnc-PGS1-2:1 No - lnc-C8orf34-1:1 No - lnc-C3orf67-1:1 No - lnc-GPR63-4:1 No - LINC00396:2 No - lnc-VSTM2B-5:1 Yes chr2L:1612429-1614160 LINC01804:7 No - lnc-DNAH5-2:1 No - lnc-CKAP2L-1:4 No - LINC00348:2 No - LINC00642:5 No - lnc-CHST8-5:2 No - lnc-ADAMTS16-4:2 No - lnc-ANKMY1-5:7 No - lnc-SLC35B4-2:1 No - EDRF1-AS1:31 No - lnc-HNRNPA2B1-2:1 No - lnc-SLC9A3-3:1 No - LNCARSR:14 No - lnc-NELL1-1:1 No - LINC02283:5 No - lnc-FBXW4-1:1 No - lnc-PPP2R2C-1:1 No - lnc-NRAP-2:2 No - lnc-TRIML2-5:1 No - LINC02576:10 No - lnc-RCHY1-1:1 No - lnc-USP6NL-7:9 No - lnc-TMEM132B-10:1 No - lnc-HPCAL1-1:10 No - lnc-MGAT1-4:1 No - lnc-NBAS-2:1 No - lnc-MARCH11-1:1 Yes chr2R:20727829-20730610 lnc-DMRT2-2:1 No - LINC00298:4 No - lnc-GOLGA7B-2:1 No - lnc-PCDH10-9:1 No - lnc-ZNF91-1:19 No - lnc-GAP43-1:1 No - lnc-OFD1-1:1 No - lnc-TAMM41-5:1 No - lnc-NOC2L-2:1 No - lnc-WNT7A-1:2 No - lnc-HS3ST2-2:2 No - lnc-ZNF91-4:15 Yes chr3R:11674920-11678116 LINC02177:25 No - lnc-MMRN1-12:7 No - lnc-GRM3-2:2 No - lnc-HEATR6-1:4 No - LINC02013:3 No - LINC01350:8 No - lnc-CHAD-2:1 No - LINC02174:5 No - lnc-CCDC187-1:21 No - lnc-IGFL1-1:4 No - lnc-CNR1-1:1 No - lnc-KIAA1147-3:6 No - lnc-ULBP2-1:2 No - LINC01517:1 No - lnc-ICOSLG-6:14 No - lnc-ABT1-3:6 No - lnc-CCAR2-1:1 No - LINC02263:20 No - lnc-NUPR2-3:1 No - lnc-CRISPLD1-1:1 No - lnc-FAM160A1-5:2 No - lnc-FAM151A-2:1 No - lnc-FAM120B-6:1 No - lnc-OR52A5-1:1 No - LINC01254:3 No - lnc-TBX3-1:2 No - lnc-WDR7-3:1 No - lnc-FAT3-5:1 No - LINC02109:41 No - HCG27:4 No - lnc-DMRTA2-1:3 No - lnc-EIF4E-1:1 No - LINC02251:9 No - lnc-ZEB2-5:1 No - lnc-EMP3-1:3 No - lnc-CELF4-2:1 No - lnc-MRPL39-12:1 No - lnc-MOCS2-2:2 No - MAPKAPK5-AS1:8 No - LINC01419:3 No - LINC01016:5 No - LINC01273:12 No - LINC01358:15 No - lnc-ERI1-2:15 No - lnc-GLIPR1L1-1:5 No - lnc-MITF-4:2 No - lnc-VPS54-1:1 Yes chr2L:1711302-1715851 lnc-CIB2-1:1 Yes chr2R:24445500-24446839 LINC01920:3 No - lnc-ZKSCAN1-1:7 No - lnc-MTERF1-3:2 No - LINC01539:6 No - lnc-TFAP2D-1:2 No - LINC02102:16 No - lnc-JPH4-4:2 No - lnc-KIAA1211L-1:4 No - LINC01907:7 No - LINC01865:6 No - LINC01143:1 No - lnc-PYDC2-1:3 No - lnc-UGGT2-1:1 No - TSIX:2 No - LINC01496:1 No - LINC02290:27 No - lnc-FOXG1-3:10 No - lnc-TEK-2:1 No - LINC01116:7 No - LINC00472:1 No - lnc-NR3C2-1:1 No - lnc-CCDC69-1:1 No - lnc-ANK2-1:1 No - lnc-SIM2-1:1 No - lnc-GLB1L2-1:10 No - lnc-HOOK1-1:3 Yes chr3L:4022700-4026011 lnc-PTGR2-1:3 No - lnc-AKR1B1-1:1 No - lnc-PDE6B-1:9 No - lnc-TMEM206-5:3 No - lnc-HPCAL1-1:9 No - LINC02047:4 No - lnc-LY86-2:1 No - lnc-NPY5R-1:1 Yes chr2L:18698714-18700645 LINC02002:12 No - CHKB-DT:55 Yes chr2L:21614232-21624080 lnc-CNOT6-2:1 No - GMDS-DT:96 No - lnc-RPAP1-1:1 No - lnc-AJAP1-3:4 No - lnc-TTC24-1:1 No - lnc-NAV3-2:2 No - lnc-SBDS-1:3 No - lnc-PTPRE-1:1 No - lnc-PEAK1-1:11 No - lnc-GPAT2-1:1 No - lnc-RGL4-1:1 No - TEMN3-AS1:3 No - lnc-GGTLC1-1:1 No - CAMTA1-DT:10 No - lnc-SMIM15-3:3 No - lnc-SPIDR-2:1 No - lnc-PKN2-2:2 No - LINC02053:9 No - lnc-COX7A2L-1:6 No - lnc-LRRTM3-3:1 No - lnc-AACS-3:1 Yes chrX:6225647-6236218 ENTPD1-AS1:7 No - lnc-MANEA-1:1 No - lnc-CTAGE1-1:27 No - lnc-RPP30-5:1 No - LINC02406:5 No - LINC00882:28 No - lnc-KLF6-5:2 No - lnc-RPS4Y1-2:4 No - LINC00996:4 No - lnc-EPS8L3-1:1 No - lnc-DEK-1:1 No - lnc-LAT2-1:2 No - lnc-RMDN2-3:12 No - LINC01989:13 No - LNCPRESS1:16 No - lnc-CLRN1-2:1 No - LINC02020:21 No - lnc-KLF13-2:11 Yes chr2L:476446-479688 LINC01989:19 No - lnc-CCDC125-6:8 No - lnc-TWIST1-1:3 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-GATA3-2:2 No - lnc-EDEM3-1:1 No - lnc-MGLL-1:1 No - lnc-NACC1-1:1 No - lnc-MED10-8:2 No - BARX1-DT:13 No - lnc-SLCO1A2-4:3 No - LINC01798:27 No - lnc-ZNF507-5:1 No - LINC01950:8 No - lnc-SLC47A2-2:1 No - lnc-TOMM20-2:2 No - lnc-GLB1L2-1:8 No - lnc-GIN1-1:2 No - lnc-SAP30-1:1 No - lnc-ATAD5-9:19 No - lnc-ZNF727-3:1 No - lnc-IER3-15:8 No - CRTC3-AS1:6 No - lnc-RNASE6-2:1 No - lnc-QKI-2:3 No - lnc-TCF7-3:1 No - lnc-USP42-1:2 No - lnc-DAAM2-9:4 No - lnc-EXT1-4:2 No - lnc-NUDT12-3:3 No - TTTY15:1 No - lnc-SP140-3:1 No - LINC00642:13 No - lnc-LTBP3-3:1 No - lnc-IRF8-3:1 No - LINC00939:7 No - LINC01815:10 No - lnc-FGF9-2:1 No - lnc-INSIG2-1:5 No - lnc-CHST2-2:2 No - lnc-ADGRA1-1:1 No - LINC00029:1 No - lnc-C4orf3-1:1 No - LINC02470:22 No - lnc-BMP15-1:1 No - lnc-ANKRD50-3:1 No - lnc-RNASEH1-1:10 Yes chr2R:7931054-7932380 lnc-STX18-1:2 No - LINC02109:38 No - lnc-TAOK3-1:5 No - lnc-OXCT1-1:4 No - LINC01365:6 No - lnc-BCL2L11-3:2 No - lnc-PCSK9-4:2 No - lnc-SLFN5-1:2 No - lnc-RHOXF1-3:14 No - lnc-ZIC4-2:1 No - CASC22:18 No - LINC01079:1 No - PANCR:3 No - lnc-JMJD7-PLA2G4B-11:6 No - lnc-FAM49A-1:1 No - LINC02173:17 No - LINC02153:34 No - lnc-KCNC2-2:1 No - lnc-MRPL39-11:1 No - lnc-NTSR2-5:8 No - lnc-ACTR2-3:4 No - lnc-ZNF705D-2:49 No - lnc-WNT4-1:1 No - LINC00545:2 No - LINC02555:10 No - lnc-LRRK1-2:1 No - LINC02485:11 No - lnc-CD83-3:3 No - lnc-CUL2-1:5 No - NUTM2B-AS1:58 No - lnc-TMEM206-5:2 No - lnc-COX7C-4:2 No - lnc-NKAIN3-14:24 No - lnc-CCND1-1:1 No - lnc-DNAJC15-2:1 No - lnc-CRYBA4-52:48 No - lnc-GBE1-5:3 No - lnc-AHI1-3:1 No - LINC01398:2 No - CCDC18-AS1:24 No - FAM138B:1 No - lnc-FRG1-12:4 No - lnc-SLC44A3-1:5 No - lnc-B3GNT10-2:1 No - KCTD21-AS1:11 No - LINC00691:1 No - CARMN:23 No - lnc-ACOT11-2:1 No - lnc-CCDC179-1:3 No - lnc-PAPPA-3:1 No - lnc-GLRB-3:1 No - LINC01550:3 No - lnc-CHMP7-1:4 No - lnc-DERA-1:1 Yes chrX:15082827-15084017 lnc-CCDC59-1:1 No - lnc-PCLO-1:2 No - lnc-CLDN24-2:7 No - LINC02041:9 No - lnc-NPY5R-2:2 No - LINC01728:8 No - lnc-DHX37-5:6 No - lnc-VSTM2B-7:2 No - lnc-WFDC12-1:1 No - lnc-SDSL-16:2 No - LINC00612:5 No - lnc-CSF2RB-1:1 No - lnc-ZWINT-2:2 No - lnc-SP140-3:2 No - MAPKAPK5-AS1:16 No - lnc-GJA10-7:1 No - lnc-WDR70-7:17 No - lnc-LYZL1-5:1 No - TTTY2:2 No - lnc-THBS1-1:2 No - lnc-PDE6B-1:10 No - LINC00310:11 No - lnc-TMEM229A-1:1 No - lnc-ESM1-1:1 No - lnc-CTAGE5-8:13 No - LINC02348:11 No - LINC02180:19 No - lnc-RAD51AP1-1:1 Yes chr2L:14184478-14234126 lnc-RPL13-1:7 Yes chrX:2694392-2698211 WDR7-OT1:3 No - LINC00944:15 No - lnc-SPRY1-11:9 No - lnc-TMEM132B-12:4 No - lnc-SERTAD2-3:2 No - G2E3-AS1:15 No - lnc-SEPT9-1:2 No - lnc-IKZF2-2:1 No - LINC01869:22 No - LINC01931:7 No - LINC01333:2 No - lnc-ITPR3-1:5 No - lnc-MPHOSPH6-2:1 No - lnc-TNFRSF19-1:1 No - lnc-TMEM132B-4:7 No - lnc-SDK2-5:1 No - LINC02180:15 No - LINC00652:1 No - lnc-SLC25A30-2:2 No - MIR3663HG:4 No - lnc-TBC1D19-3:1 No - LINC02360:7 No - lnc-ARHGAP28-2:2 No - lnc-GBP5-3:1 No - lnc-LBR-1:3 No - lnc-SMPD1-1:2 No - LINC00927:33 No - lnc-GPR101-1:2 No - LINC02081:29 No - lnc-BCL3-1:1 No - LINC02528:4 No - LINC00486:5 No - lnc-SCAF8-1:1 No - LINC01186:3 No - LINC02056:39 No - lnc-SEPT7-1:7 No - lnc-FBXO8-2:1 No - lnc-ACP1-6:1 No - lnc-MID1IP1-3:1 No - LINC01988:10 No - lnc-AMY1B-2:1 No - lnc-HS3ST4-1:3 No - LINC02374:11 No - lnc-ONECUT1-1:2 No - lnc-IER5L-1:1 No - LINC01940:13 No - LINC02541:64 No - lnc-TBP-2:1 No - LINC02217:27 No - lnc-TNFRSF13B-3:1 No - lnc-CENPP-20:32 No - LINC01676:23 No - lnc-HIST1H1A-1:1 No - lnc-TGFBRAP1-11:2 No - lnc-DHX57-1:1 No - lnc-TSHZ1-1:4 No - lnc-CUL2-1:4 No - LINC01936:27 No - lnc-TRIB1-4:2 No - LINC00687:5 No - lnc-POTEF-4:1 No - lnc-ADGRD2-1:1 No - lnc-ABI3-2:2 No - lnc-FOXD4L6-1:10 No - LINC01717:9 No - TTTY6:1 No - lnc-CYYR1-2:1 No - lnc-EXO1-1:1 No - lnc-BOLL-2:2 No - lnc-DENND1A-2:1 No - lnc-MYL2-1:3 No - lnc-VLDLR-1:1 No - lnc-ZNF804B-2:4 No - lnc-LHFPL6-1:1 No - lnc-PBX3-1:1 No - LINC01486:2 Yes chr3L:1318480-1329617 lnc-FTCDNL1-1:5 No - lnc-ZBED3-1:1 No - lnc-C2orf54-1:2 Yes chr3R:24113286-24128193 LINC00278:4 No - lnc-ETS2-4:1 No - lnc-FSIP1-4:2 No - lnc-CLEC19A-2:1 No - lnc-CCSAP-6:1 No - lnc-TBX3-3:1 No - lnc-MSN-1:6 Yes chr2R:24607267-24610847 lnc-ZNF23-2:1 Yes chr3R:26041736-26049911 lnc-EIF2B1-1:2 No - lnc-FAM49A-4:1 No - lnc-BTN3A2-1:2 No - lnc-LSMEM1-1:3 No - lnc-ANKRD55-8:2 No - lnc-CDC42SE2-1:7 Yes chr3R:5616644-5624125 lnc-TPST1-1:4 No - lnc-THNSL2-1:1 No - lnc-CYSTM1-1:2 No - TRHDE-AS1:11 Yes chr3R:21740105-21744431 LINC01852:13 No - lnc-PPP1R14C-1:2 No - lnc-KIF25-2:1 No - lnc-ATP6V1D-8:10 No - RRS1-AS1:11 No - lnc-BTG2-2:3 No - MIR3976HG:6 No - lnc-PARVG-2:3 No - lnc-CBLB-5:1 No - lnc-TECRL-1:1 No - lnc-ASAP2-1:1 No - LINC01030:3 No - lnc-BCL9-1:1 No - lnc-NR2F1-1:4 No - lnc-ADARB2-4:1 No - lnc-JAK1-2:1 No - lnc-RORB-2:3 No - lnc-ROPN1B-20:2 No - LINC01431:9 No - lnc-VN1R2-1:4 No - LINC00690:4 No - lnc-RAB28-1:1 No - lnc-TMEM105-2:1 No - lnc-ARMCX3-2:1 No - LINC01487:3 No - lnc-WASL-1:1 No - SNHG21:16 No - LINC01142:1 No - lnc-NDUFV2-1:3 No - FAM111A-DT:31 No - LINC01879:5 No - lnc-ZC3H12D-5:1 No - LINC02052:13 No - LINC02290:28 No - lnc-RAPGEF2-1:1 No - lnc-CNTNAP4-2:1 Yes chr3L:12146519-12156990 LINC00930:3 No - lnc-ANGPTL2-2:4 No - LINC01081:7 No - lnc-NPIPA7-1:1 No - lnc-XRCC2-4:1 No - lnc-COP1-1:1 No - lnc-QKI-2:2 No - LINC02369:16 No - LINC01558:2 No - lnc-TMEM260-1:1 No - lnc-ZNF648-2:1 No - lnc-PRM1-6:1 No - lnc-SAMSN1-1:3 No - lnc-GRAMD4-2:2 No - lnc-CHSY1-2:1 No - lnc-ZNF736-1:1 No - lnc-RIMBP2-3:1 No - lnc-SEMA3D-1:2 No - lnc-RGS17-1:2 No - lnc-HDAC4-2:1 No - LINC02208:33 No - lnc-FRG2-1:1 No - BOK-AS1:7 No - lnc-TPD52-5:1 No - lnc-FAM20C-4:1 No - lnc-SLITRK6-1:2 No - TRERNA1:2 No - lnc-AKR1C2-3:2 No - LINC01360:14 No - LINC00284:16 No - lnc-NEUROG3-1:2 No - lnc-THBS2-5:6 No - LINC01550:16 No - lnc-STX18-1:4 No - LINC02289:37 No - lnc-VPS13D-1:1 No - lnc-MBOAT7-1:1 No - lnc-USP6NL-10:1 No - lnc-CPNE5-1:1 No - LINC00426:4 No - lnc-UBE2B-1:1 No - lnc-GRXCR1-1:1 No - lnc-ADD3-2:2 No - lnc-SETD6-5:1 No - LINC00523:2 No - lnc-ANXA1-1:2 No - LINC01187:6 No - LINC01812:15 No - IGFBP7-AS1:12 No - LINC00662:28 No - LINC01522:4 No - LINC01739:8 No - LINC01811:28 No - lnc-USP6NL-7:4 No - LINC01229:3 No - LINC02180:20 No - lnc-RIOK1-1:1 No - lnc-CLN8-1:2 Yes chr2R:5702112-5705439 LINC02204:24 No - lnc-PUDP-1:1 No - RASGRF2-AS1:3 No - lnc-SLC22A2-1:1 No - LINC01081:9 No - FAM160A1-DT:27 No - lnc-PDE8B-1:1 Yes chr3R:31743490-31744248 lnc-SUMF2-5:7 No - LINC00485:2 No - LINC00326:1 No - lnc-PIK3R1-5:2 No - XIST:14 No - lnc-TMEM206-1:1 No - lnc-ATP5PO-1:1 No - lnc-CRBN-1:1 No - lnc-GNAO1-1:5 No - lnc-EBF3-4:1 No - lnc-MAT2B-3:17 No - lnc-CRYBA4-9:1 No - lnc-ECHDC3-11:2 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-FAM160A1-5:1 No - LINC00707:11 No - lnc-KLHL31-2:1 No - lnc-SLC25A27-2:1 No - lnc-POP1-1:1 No - lnc-SOD2-2:3 No - lnc-LINC02203-1:2 No - lnc-MRPL57-1:1 No - lnc-JPH4-4:7 No - lnc-CHD2-2:3 No - lnc-IRX3-80:36 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-TTC23-2:2 No - lnc-CYP3A43-1:2 No - lnc-E2F7-2:1 No - LINC02412:5 No - lnc-CNTN6-2:1 No - lnc-KLF4-1:4 No - GACAT3:3 No - lnc-SAXO1-2:1 Yes chr2L:21684106-21729051 lnc-ZNF485-68:11 No - lnc-EBF3-4:2 No - LINC00839:1 No - lnc-C5orf30-2:1 No - LINC00689:9 No - LINC01356:5 No - SCAMP1-AS1:6 No - lnc-ZNF723-2:4 No - LINC00365:1 No - lnc-SNTG2-4:1 No - lnc-KLHL8-3:1 No - lnc-DIAPH3-1:1 No - lnc-PRSS23-1:5 No - lnc-SH2D4B-1:1 No - lnc-EZH2-2:1 No - lnc-C12orf74-6:3 No - lnc-NUDT15-3:1 No - lnc-GPX5-1:1 No - lnc-SCIMP-1:1 No - LINC01478:9 No - LINC02489:6 No - LINC02440:17 No - HCCAT5:1 Yes chr4:501810-540874 lnc-PTPRD-2:1 No - lnc-LSM14B-1:1 No - lnc-GTPBP4-3:12 No - lnc-ORAOV1-1:4 No - LINC02229:7 No - lnc-BCKDHB-1:8 No - lnc-FAM19A3-2:2 No - lnc-VSNL1-4:1 No - lnc-CALN1-1:3 No - lnc-NOCT-1:8 No - lnc-SPPL2A-1:11 No - lnc-KLHL34-2:9 No - lnc-AGTR1-3:1 No - lnc-ZSWIM2-7:3 No - lnc-ASF1A-4:1 No - lnc-SPACA1-1:1 No - lnc-AHCTF1-1:1 No - lnc-SULF2-2:1 No - lnc-THBS1-1:4 No - lnc-NVL-1:2 No - lnc-NDFIP2-4:1 No - lnc-ERP44-3:3 No - C21orf62-AS1:9 No - lnc-ASB1-1:1 No - lnc-SAAL1-1:1 No - LINC02271:6 No - LINC01837:26 No - lnc-GPR31-1:3 No - lnc-CADM2-4:3 No - lnc-UBIAD1-2:1 No - lnc-SNX5-1:1 No - lnc-TDRD15-2:1 No - lnc-PDGFA-17:21 No - LINC01082:5 No - lnc-PLD5-2:1 No - LINC01229:5 No - lnc-FOXA2-3:2 No - lnc-GTF2F2-1:1 No - LINC01060:3 No - lnc-HSPH1-1:2 No - lnc-APMAP-2:1 No - LINC01714:29 No - lnc-GRIP1-1:2 Yes chrX:5966279-5986699 lnc-SPATA19-9:1 No - lnc-XRN2-4:1 No - lnc-XRCC4-1:2 No - lnc-OAF-4:1 No - lnc-PPP1R3D-3:1 No - lnc-SNAP25-1:1 No - lnc-USP44-7:1 No - lnc-STK35-4:1 No - LINC02541:59 No - lnc-NID2-7:1 No - lnc-CRABP2-2:1 No - lnc-CBLN4-1:1 No - lnc-SFRP1-1:1 No - LINC01341:24 No - LINC01936:16 No - lnc-PPDPF-1:6 No - LINC01585:2 No - LINC01467:5 No - LINC01428:2 No - TMEM161B-AS1:37 No - PAXIP1-AS1:4 No - lnc-CECR2-1:4 No - lnc-CMPK2-10:1 No - LINC00662:18 No - lnc-TRAM1-1:1 No - lnc-LRRC4C-5:6 No - lnc-CREG1-1:1 Yes chr3R:17393272-17394640 lnc-ZNF366-6:1 No - lnc-DPP6-17:1 No - LINC02215:3 No - lnc-EMC2-3:1 Yes chr3L:16785242-16786941 PVT1:40 No - lnc-DYNC1I1-1:2 No - lnc-RNF26-1:2 No - lnc-IGFBP3-8:2 No - lnc-ZNF236-11:3 No - lnc-ARFGEF2-2:1 No - lnc-MGMT-5:1 No - lnc-KRBA1-1:1 No - LINC02006:8 No - lnc-CBWD3-1:1 No - OIP5-AS1:21 No - lnc-SEC61G-6:1 No - lnc-NAALADL2-1:15 No - LINC02549:4 No - HCG23:3 No - lnc-SOX9-6:1 No - lnc-DCT-9:1 No - PWRN1:23 No - lnc-UNC13C-2:1 No - lnc-BCKDHB-1:1 No - lnc-TSEN2-1:1 No - lnc-GABRB3-2:2 No - lnc-ANKRD46-1:3 No - lnc-LNPEP-8:6 No - lnc-HOXB8-1:4 No - lnc-FBXW7-3:1 No - lnc-SLC35C2-1:1 No - lnc-CCDC125-2:1 No - lnc-OAF-1:14 No - lnc-DHCR7-1:1 Yes chrX:13684380-13718285 PVT1:20 No - lnc-SSH1-2:1 No - lnc-CADM1-3:1 No - lnc-MED15-1:11 Yes chr2L:473013-476170 lnc-VIRMA-1:13 No - lnc-KLF6-1:2 No - lnc-KDM4C-19:7 No - lnc-ASMT-2:1 No - lnc-MIXL1-1:1 No - lnc-FAM174A-1:3 No - LINC01121:9 No - LINC00881:8 No - lnc-ROCK2-1:1 No - lnc-HRH4-7:1 No - lnc-SLC12A7-1:9 No - lnc-COPS8-17:3 No - lnc-ZIC1-5:4 No - lnc-UCHL3-5:17 No - LINC00395:3 No - CEBPA-DT:18 No - lnc-ETS2-1:1 No - LINC02576:7 No - lnc-SYF2-1:2 No - lnc-SPRED2-1:1 No - lnc-RNPC3-1:2 No - lnc-IFI44-1:1 No - lnc-GUF1-2:1 No - lnc-TMEM191B-5:1 No - lnc-SLC38A2-1:5 No - lnc-ZNF146-1:2 No - lnc-IAH1-2:2 No - lnc-MX1-1:1 No - lnc-FKBP3-2:1 No - lnc-AMMECR1-1:1 No - lnc-RFT1-1:1 Yes chrX:5692945-5695205 lnc-USP6NL-8:3 No - LINC01871:9 No - LINC00968:8 No - SUCLG2-AS1:7 No - lnc-C2CD4A-4:1 No - lnc-ASF1A-2:1 No - lnc-KIAA1210-2:1 No - CCDC18-AS1:12 No - lnc-ANXA2R-1:32 No - lnc-C12orf42-1:1 No - lnc-GMPS-1:3 No - lnc-ABCA5-3:1 No - lnc-SERTAD2-3:8 No - lnc-C3orf38-7:3 No - ILF3-DT:15 No - lnc-ESR2-3:5 No - KAZN-AS1:11 Yes chr2R:22333500-22373109 LINC01822:5 No - lnc-ATP6V1G3-4:2 No - lnc-PCSK9-4:14 No - LINC00533:2 No - lnc-BICC1-1:1 No - LINC02583:23 No - CCDC18-AS1:23 No - lnc-ZBTB18-1:1 No - lnc-BHLHE22-9:2 No - LINC01153:1 No - lnc-IRX3-80:62 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-AMY1B-1:7 No - lnc-DYNLRB2-3:3 No - lnc-OAF-1:5 No - lnc-PCDH17-1:1 No - lnc-ATAD2B-12:5 No - lnc-FYTTD1-8:6 No - lnc-TXLNB-2:1 No - lnc-CNIH3-1:2 No - LINC02428:25 No - LINC01478:6 No - LINC00687:6 No - lnc-PHTF2-1:1 No - lnc-HDAC4-4:1 No - lnc-SNRPN-8:105 No - DSCR9:3 No - lnc-SHPRH-1:1 No - MAFA-AS1:10 Yes chr2L:19464267-19467758 lnc-TMEM72-1:4 No - lnc-NLRP3-1:1 No - lnc-NCOA3-9:3 No - LINC01978:23 No - lnc-SLC25A13-1:11 No - LINC01120:3 No - lnc-RBL2-1:3 No - LINC00383:2 No - LINC00205:2 No - lnc-LRMP-4:3 No - lnc-SPRY2-3:1 No - lnc-IRX3-80:19 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-NRN1-1:1 No - lnc-VPS8-2:8 No - lnc-EXOSC9-4:1 No - lnc-ZNF91-4:16 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-OXCT1-1:11 No - lnc-RAB40AL-1:3 No - lnc-FAM237A-1:3 No - lnc-RXRA-1:1 No - lnc-HOXC13-2:3 No - lnc-C21orf62-4:3 No - LINC02024:17 No - LINC00114:10 No - lnc-FAT3-5:2 No - lnc-CDK12-1:3 Yes chr3L:21516306-21522684 lnc-CNTNAP3B-3:2 No - lnc-PABPC1L2B-1:1 No - TUSC8:9 No - lnc-FCMR-1:2 No - lnc-SMLR1-2:1 No - lnc-TEX38-2:5 Yes chr2R:15942864-15947266 LINC00853:7 No - lnc-NDFIP2-11:2 No - LINC01069:1 No - LINC01885:3 No - lnc-GPR157-7:4 No - lnc-ABCD3-1:1 No - FEZF1-AS1:12 No - lnc-ADPRM-5:6 No - lnc-SEMA4D-3:1 No - lnc-KLHDC4-1:4 No - lnc-EIF2AK4-1:1 No - lnc-CHST12-1:6 Yes chr2L:16879517-16886319 lnc-OPN4-1:2 No - lnc-ARF6-1:1 No - lnc-SV2B-1:9 No - lnc-CD83-3:8 No - lnc-VWDE-4:1 No - lnc-SORCS3-1:1 No - lnc-ANKRD20A8P-3:1 No - SIX3-AS1:5 No - lnc-PCDH7-13:1 No - lnc-DISP1-8:7 No - HOXD-AS2:4 No - lnc-BATF3-2:7 No - LINC02483:7 No - lnc-TSHR-1:1 No - lnc-SUMF2-5:4 No - lnc-GCLC-1:4 Yes chrX:8102181-8116147 lnc-GALC-3:4 No - GAPLINC:5 No - lnc-VEZF1-1:3 No - lnc-PLPP3-2:4 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-TCF7-3:2 No - lnc-IPCEF1-1:1 No - LINC02588:21 No - lnc-GTF2B-15:9 No - LINC02318:11 No - lnc-BCL11B-1:4 No - DANT2:2 No - lnc-RTL1-8:1 No - FENDRR:11 No - LINC02519:23 No - lnc-NCAM2-4:1 No - RUNX2-AS1:22 No - lnc-RALB-2:1 No - LINC02391:7 No - lnc-FAM135A-1:4 No - lnc-ZBED5-1:2 No - lnc-VAV3-1:3 No - LINC01656:3 No - lnc-SALL1-6:4 No - lnc-TCF7L2-1:3 No - lnc-RPL24-2:3 No - lnc-ZHX2-6:2 No - lnc-C9orf66-5:1 No - LINC00566:4 No - lnc-PRL-4:1 No - lnc-SRP9-1:3 No - lnc-ZNF727-18:3 No - lnc-ERCC6L2-3:1 No - LINC01710:3 No - LINC00972:2 No - LINC00999:10 No - lnc-MEIS2-6:1 No - lnc-ZNF487-1:2 No - LINC02588:18 No - lnc-GUCY1A1-3:3 No - lnc-DHX37-5:2 No - MIR3681HG:11 No - lnc-FRG2C-4:1 No - lnc-PTGFR-1:7 No - lnc-DLK1-35:107 No - LINC2194:7 No - lnc-ASCL1-6:10 No - lnc-CBR3-1:2 No - lnc-UBE2N-1:8 No - lnc-FAM84B-2:1 No - lnc-MME-9:1 No - lnc-C2orf91-3:1 No - lnc-PGA3-1:1 No - lnc-MAFB-1:1 No - lnc-ANKRD1-1:1 No - lnc-C2orf81-1:1 No - LINC01777:19 No - lnc-SLC25A38-1:1 No - lnc-TRPM6-3:1 No - BACH1-AS1:2 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-SEMA4D-1:1 No - LINC02474:4 No - lnc-STMP1-5:3 No - lnc-NOVA1-4:1 No - lnc-FAM78B-1:1 No - OLMALINC:9 No - lnc-CMPK2-5:60 No - lnc-FAM43A-5:1 No - lnc-DLL1-2:1 No - lnc-FGF3-2:2 No - lnc-ZNF131-2:10 No - lnc-ARF5-5:1 No - lnc-ZNF608-2:1 No - EDRF1-AS1:36 No - lnc-ANLN-1:1 No - lnc-TFCP2L1-2:1 No - lnc-EIF5-1:1 No - lnc-TSPYL5-2:1 No - LINC00939:2 No - lnc-NR1D1-1:2 No - lnc-DENND5A-1:2 Yes chr3L:7562610-7569499 lnc-AKR1E2-5:5 No - EXTL3-AS1:12 Yes chr2R:19129589-19133706 lnc-NR1I2-1:9 No - lnc-LAMA4-1:1 No - LINC00623:49 No - LINC01927:8 No - lnc-MYB-1:1 No - lnc-IGFBP7-5:2 No - LINC00844:9 No - lnc-RWDD3-7:1 No - lnc-ABRAXAS2-1:1 No - lnc-STK39-1:2 No - LINC02588:33 No - NDST1-AS1:8 Yes chr3L:6495680-6550104 LINC00642:14 No - lnc-IGFBP1-2:2 No - lnc-CTSO-1:6 No - MRPL23-AS1:6 Yes chr3L:2372844-2373704 lnc-C9orf152-1:1 No - lnc-TPTE-1:9 No - lnc-PSMG1-4:9 No - LINC01270:8 No - PART1:14 No - lnc-SIAH2-1:5 No - LINC02499:9 No - lnc-GPCPD1-8:21 No - lnc-SSTR4-2:1 No - LINC00366:3 No - lnc-FAM20C-4:2 No - lnc-CRYBA4-52:82 No - lnc-EDAR-7:1 No - LINC00682:5 No - lnc-SEMA5A-1:1 No - lnc-GPC5-2:2 No - LINC02200:6 No - lnc-PTPN2-2:1 No - lnc-DCLK2-2:1 No - lnc-MANEA-3:4 No - LINC01013:14 No - RNASEH1-AS1:12 Yes chr2R:7931054-7932380 lnc-RAPH1-2:1 No - lnc-B4GALT6-2:2 No - lnc-CPEB4-4:5 No - lnc-F11-1:1 No - lnc-ENPP1-3:1 No - lnc-CMPK2-5:78 No - lnc-DMRTA1-7:5 No - LINC01878:15 No - lnc-CSTF3-1:1 No - LINC01884:8 No - lnc-FRG1-12:5 No - lnc-MAP3K9-3:2 Yes chrX:12988615-13079070 LINC01507:8 No - lnc-PCDH7-9:2 No - LINC02345:32 No - lnc-MVB12B-2:1 No - lnc-ZNF333-4:1 No - lnc-CXCL12-2:1 No - lnc-LZTS1-2:3 No - lnc-UCHL3-7:2 No - lnc-ZNFX1-1:1 Yes chr3L:2895017-2959579 lnc-SLC11A2-1:1 No - lnc-CKAP2L-1:5 No - LRRC3-DT:15 No - lnc-SORCS1-1:1 No - lnc-CARD11-8:6 No - lnc-SH2D4A-2:4 No - LINC00901:1 Yes chr3L:5424109-5442399 LINC00908:8 No - lnc-CDK9-1:1 No - lnc-BTG2-2:1 No - lnc-DHX37-9:6 No - lnc-CCDC125-1:1 No - LINC02453:22 No - lnc-MALRD1-3:1 No - LINC01525:4 No - lnc-SRCIN1-1:3 Yes chrX:20469955-20510694 lnc-GLRX3-3:3 No - lnc-TMEM70-1:1 No - MANCR:34 No - lnc-PPP1R3G-9:4 No - LINC00486:7 No - lnc-ART1-1:1 No - lnc-SOD1-1:1 No - lnc-FOXD1-3:9 No - LINC00524:2 No - lnc-TREM2-1:1 No - lnc-ADAMTS12-6:6 No - PANTR1:40 No - lnc-HS3ST5-2:6 No - lnc-SELENOI-1:3 No - lnc-RAB2A-1:1 No - lnc-USP6NL-7:19 No - lnc-BMP6-106:159 No - lnc-SAMD12-1:2 No - lnc-USP25-13:2 No - LINC01646:9 No - LINC01031:2 No - GLIDR:18 No - lnc-SLC17A9-2:1 No - lnc-SFPQ-1:1 No - lnc-TOMM20-2:1 No - lnc-JAM2-3:1 No - lnc-HEATR6-1:1 No - lnc-ZNF32-3:3 No - lnc-KCNE1B-3:1 No - lnc-ANKRD33B-1:1 No - LINC01896:44 No - lnc-LMNTD1-1:7 No - lnc-MAFB-2:4 No - lnc-DBX2-1:1 No - lnc-SLITRK5-1:1 No - lnc-MCTP2-7:10 No - lnc-IRF4-2:1 No - LINC00968:9 No - LINC02511:8 No - lnc-MEOX2-1:1 No - lnc-ADGRL3-6:2 No - lnc-TBX20-2:1 No - lnc-FOXF2-1:1 No - lnc-TGS1-2:1 No - lnc-NKX2-3-1:1 No - LINC01838:9 No - LINC02491:7 No - lnc-RPS4Y1-3:1 No - LINC01007:9 No - lnc-PRRC2B-2:2 Yes chr2L:10250737-10251714 lnc-TIMM21-1:1 No - lnc-MAN2A1-10:1 No - lnc-MUC20-6:5 No - lnc-RP9-3:1 No - LINC01969:15 No - TTTY2B:3 No - LINC01771:17 No - lnc-CCDC9B-1:1 No - LINC01114:9 No - lnc-PPIAL4F-3:14 No - lnc-CD9-2:1 No - lnc-TOMM20-1:2 No - lnc-FAT3-2:2 No - lnc-EXTL3-1:1 No - GAPLINC:9 No - lnc-RTN4IP1-1:2 No - lnc-EXOSC1-1:1 Yes chrX:13619276-13624408 lnc-TAOK1-8:2 No - DUBR:11 No - lnc-BOD1-1:19 No - LINC01477:1 No - MIR137HG:15 Yes chrX:9196808-9201820 LINC01290:2 No - LINC01176:12 No - lnc-ZFP64-4:2 No - lnc-UBE2L5-2:7 No - lnc-SEC24D-1:2 No - lnc-MTOR-1:1 No - lnc-LVRN-1:1 No - LINC01343:2 No - UCA1:1 No - RBM26-AS1:10 No - LINC02074:16 No - lnc-SYNDIG1-4:1 No - lnc-SPAG16-1:2 No - CERNA2:5 No - MNX1-AS1:4 No - lnc-TEX53-2:3 No - lnc-RGCC-1:2 No - LINC02453:20 No - lnc-WDR48-1:2 No - lnc-TNFAIP6-2:7 No - lnc-ITPR3-1:6 No - lnc-RCHY1-3:1 No - LINC02056:41 No - lnc-GLI2-4:2 No - lnc-FOXB1-2:1 No - lnc-TDRD3-19:2 No - lnc-IL4R-2:18 No - ZNF582-AS1:17 No - lnc-SH2D4A-2:1 No - LINP1:7 No - LINC02328:64 No - lnc-QKI-3:1 No - IGFBP7-AS1:13 No - lnc-COL6A1-3:14 No - lnc-ZNF664-2:19 No - LINC02257:5 No - lnc-WDR37-3:2 No - lnc-USP42-1:3 No - lnc-CMPK2-5:61 No - lnc-FILIP1L-1:1 No - lnc-EFCAB1-4:1 No - LINC00930:6 No - lnc-TCF7L2-1:1 No - LINC02053:14 No - LINC01742:6 No - lnc-RXRA-3:2 No - lnc-THBS2-1:2 No - LINC00222:7 No - LINC02127:9 No - lnc-PREX1-2:2 No - lnc-NIFK-2:4 No - lnc-CEBPB-11:1 No - lnc-ASB7-2:1 No - lnc-CCR8-1:2 No - lnc-TMEM71-2:3 No - lnc-CTTNBP2-3:12 No - LINC01350:12 No - lnc-TP53TG3-32:1 No - lnc-RND3-2:1 No - lnc-FRG1-11:10 No - LINC02120:5 No - lnc-PAFAH1B1-3:2 No - lnc-ADAMTS19-2:1 No - lnc-HEATR6-1:6 No - lnc-LMX1A-3:1 No - lnc-GPX5-2:1 No - lnc-VEGFC-2:1 No - lnc-MYO6-2:2 No - LINC00926:2 No - lnc-CLCN2-8:1 No - lnc-ZNF445-14:6 No - lnc-DEFB104B-1:2 No - LINC01584:1 No - lnc-UNCX-1:1 No - LINC01700:3 No - LINC00944:12 No - LINC00410:1 No - LINC01301:4 No - LINC01569:18 No - lnc-OSMR-1:11 No - lnc-MAP6-2:3 Yes chr2R:7709873-7714182 lnc-PHF14-3:2 No - lnc-FAM84B-15:128 No - lnc-BIN1-3:1 No - lnc-CDH5-4:1 No - lnc-OXSM-1:1 No - lnc-NTM-5:1 No - LINC00377:5 No - lnc-PPP1R26-1:1 No - lnc-TK2-4:3 No - LINC01372:4 No - lnc-COX7C-3:1 No - lnc-ATAD5-9:17 No - lnc-PER2-1:1 No - LINC02382:6 No - LINC00920:4 No - lnc-CTBS-4:9 No - RAB30-AS1:21 No - lnc-UVSSA-1:8 No - lnc-CENPS-CORT-1:2 No - lnc-BRINP3-2:1 No - LINC02076:11 No - lnc-HOOK1-8:1 No - LINC01989:11 No - lnc-GPR179-4:1 No - lnc-GRIA3-1:1 No - lnc-PAFAH1B1-3:1 No - lnc-RDX-1:1 No - lnc-IL6-3:8 No - TMEM92-AS1:4 No - AFDN-DT:21 No - lnc-GOT2-5:1 No - lnc-CFL1-1:1 No - LINC01224:49 No - lnc-IGFBP3-7:1 No - lnc-STIL-3:1 No - LINC01247:1 No - lnc-SLC16A7-1:1 No - lnc-PPFIBP2-1:1 No - COX10-AS1:16 No - lnc-IL6-3:5 No - lnc-IRX2-1:2 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-PCMTD2-2:1 No - LINC01278:1 No - lnc-ST8SIA4-3:11 No - LINC01000:1 No - BMPR1B-DT:8 No - lnc-ZNF804A-1:4 No - lnc-UTP11-2:2 No - LINC02488:3 No - lnc-ZFP42-2:1 No - lnc-PGPEP1L-10:1 No - lnc-CCDC102B-2:1 No - lnc-CDC73-4:1 No - lnc-PFDN1-1:1 No - lnc-CHSY1-1:1 No - lnc-P2RY2-2:2 No - LINC01400:2 No - lnc-GLIS3-1:1 No - lnc-NLGN1-2:1 No - lnc-TBX1-3:6 No - lnc-CHGA-1:4 No - lnc-GALNT18-1:1 No - lnc-KCNN4-1:1 No - LINC00887:8 No - lnc-PHF10-1:2 Yes chrX:19626548-19638369 lnc-SLITRK1-2:1 No - lnc-PPP1R3D-2:3 No - lnc-IGFBP3-8:3 No - lnc-RUBCN-2:9 No - lnc-BCL2L11-2:1 No - lnc-AGPAT2-2:4 No - MIR100HG:34 No - LINC01665:8 No - lnc-RNASEH1-5:1 No - LINC02315:14 No - TBX2-AS1:6 No - lnc-DTNBP1-2:1 No - LINC02056:42 No - lnc-COL15A1-1:1 No - PURPL:51 No - LINC02199:11 No - lnc-MYO10-2:1 No - lnc-AKT3-3:1 No - lnc-PITX2-4:1 No - lnc-TECRL-2:1 No - lnc-TRIQK-1:1 No - LINC01505:5 No - LINC02208:20 No - LINC00710:27 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-CANX-1:6 No - LINC01786:7 No - lnc-EVA1C-2:1 No - lnc-VWC2L-1:1 No - lnc-TNFSF4-1:1 No - SRP14-AS1:14 No - MAPKAPK5-AS1:7 No - lnc-KLHDC10-1:3 No - lnc-ZEB1-2:1 No - LINC01785:6 No - CHKB-DT:54 Yes chr2L:21614232-21624080 lnc-SLC17A6-1:1 No - LINC00309:1 No - lnc-DAAM2-9:9 No - lnc-TP53TG3-3:1 No - lnc-TMPRSS15-6:1 No - LINC00608:10 No - lnc-ADHFE1-1:12 No - lnc-MRPL33-1:13 No - lnc-GLT6D1-1:1 No - lnc-VSTM2B-8:1 No - lnc-GADD45G-4:3 No - lnc-PIK3R1-3:1 No - lnc-PAPPA2-1:1 No - LINC02153:25 No - lnc-RIPK1-1:1 No - lnc-TSN-6:2 No - lnc-PRSS3-1:3 No - lnc-OIP5-1:2 No - lnc-PSMG1-4:1 No - lnc-CEP170-3:1 No - LINC00354:3 No - lnc-ALCAM-1:1 No - lnc-BTN1A1-1:1 No - lnc-SIK1-1:1 No - lnc-COL4A1-1:1 No - lnc-CSRNP3-9:7 No - lnc-C16orf72-2:1 No - lnc-G2E3-1:1 No - lnc-AUH-4:1 No - lnc-QPCT-2:1 No - lnc-PKD2L1-1:1 No - LINC01980:16 No - lnc-SLITRK6-2:1 No - VAV3-AS1:16 No - lnc-FMN1-2:1 No - lnc-GPR101-1:1 No - LINC01350:3 No - lnc-CCT8L2-9:1 No - lnc-OTOS-1:1 No - LINC02260:4 No - lnc-WARS2-2:1 No - lnc-SUCLG1-3:2 No - lnc-SNX19-1:1 No - LINC01704:19 No - LINC02123:5 No - lnc-NPAS2-1:1 No - lnc-RALGPS2-2:1 No - lnc-IQCM-3:1 No - lnc-AGA-24:6 No - LINC01550:5 No - PAXIP1-AS1:12 No - lnc-CD83-3:1 No - lnc-CST11-2:4 No - LINC02142:7 No - LINC01767:16 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-CCDC39-1:3 No - lnc-CTNND2-1:1 No - lnc-SGMS2-1:1 No - lnc-FAM53A-1:1 No - lnc-SMAD5-4:1 No - lnc-MAP3K8-6:2 No - LINC00315:1 No - lnc-DPP6-17:2 No - LINC01969:17 No - lnc-BIRC7-6:1 No - lnc-EFNA5-1:1 No - lnc-RASGRP1-1:2 No - lnc-USP35-8:1 No - lnc-USP6NL-9:1 No - lnc-SLC4A3-3:1 No - lnc-CHAC1-1:1 Yes chr3R:23723331-23731499 lnc-SLC6A9-2:1 No - LINC02052:15 No - lnc-SIX3-3:1 No - lnc-FAM217A-2:1 No - LINC00161:2 No - lnc-SLC44A3-1:2 No - lnc-GPR132-1:1 No - lnc-POTEF-1:1 No - lnc-GALNTL6-1:1 No - LINC02504:3 No - lnc-MTUS2-9:1 No - lnc-BORA-31:3 No - lnc-PGPEP1L-10:4 No - lnc-MEF2A-6:2 No - lnc-CSMD3-1:1 No - lnc-PML-2:1 No - LINC01563:6 No - LINC02352:15 No - lnc-CDC42-1:1 No - lnc-CCDC140-3:1 No - lnc-ASB3-12:1 No - lnc-JUN-4:1 No - lnc-SNCA-1:1 No - lnc-C9orf50-4:1 No - lnc-SLFN5-1:3 No - LINC01280:1 No - lnc-PIGB-1:2 No - lnc-BBC3-1:1 No - lnc-CPO-3:1 No - MIR5689HG:1 No - lnc-ZNF492-3:1 No - lnc-GSDME-3:8 No - LINC02468:4 No - LINC01229:6 No - lnc-ZNF792-1:2 No - LINC02182:6 No - lnc-GPR3-2:1 No - lnc-FAT3-5:3 No - LINC00472:2 No - LINC01911:3 No - lnc-EIF4A2-1:1 No - lnc-TAF3-1:10 Yes chr3R:8147368-8181444 LINC02216:3 No - LINC02407:21 No - LINC00494:3 No - LINC00608:8 No - LINC02298:25 No - lnc-OPA1-2:1 No - SNHG27:12 No - lnc-USP16-1:1 No - LINC01044:1 No - lnc-NCOA3-5:9 No - LINC00486:12 No - lnc-SGCG-5:1 No - lnc-KITLG-2:1 No - LINC00460:7 No - lnc-AP3S1-2:1 No - lnc-P2RY1-3:7 No - LINC01506:3 No - lnc-PTGFR-1:5 No - LINC01880:12 No - LINC01402:2 No - lnc-ALDH1A3-1:7 No - lnc-TNP1-5:2 No - lnc-BEST3-1:2 No - LINC02431:11 No - lnc-FBXO5-2:2 No - lnc-SLC25A32-3:2 No - LINC02109:34 No - lnc-ORAOV1-4:1 No - lnc-KIAA1147-3:5 No - lnc-SEC61G-7:1 No - lnc-AMN1-2:2 No - lnc-SLC35G1-1:2 No - lnc-SMOC2-8:1 No - LINC00934:9 No - lnc-ENPP4-4:1 No - LINC01248:6 No - lnc-HRCT1-7:3 No - lnc-EPHA4-2:3 No - LNCAROD:20 No - lnc-LRP8-1:1 No - lnc-GOLGA8J-1:1 No - lnc-ACP1-3:2 No - lnc-AASDHPPT-1:1 No - LINC00689:1 No - lnc-TRUB2-2:1 No - lnc-SUCLG1-1:1 No - LINC02292:9 No - lnc-DRD5-8:6 No - LINC01918:23 No - TTTY21B:4 No - LMO7DN-IT1:3 No - lnc-SHOC2-1:1 No - lnc-TRIM29-9:7 No - lnc-SLC38A9-2:1 No - lnc-TMEM17-2:4 No - lnc-SCEL-2:1 No - lnc-MID1IP1-2:1 No - lnc-RWDD3-7:4 No - lnc-RPP30-6:5 No - LINC01931:5 No - lnc-RAD23B-10:1 No - lnc-ANKRD55-7:1 No - lnc-SGCG-3:4 No - lnc-CMTR1-2:1 No - LINC02111:5 No - LINC01757:3 No - lnc-AIPL1-2:2 No - lnc-PMFBP1-7:2 Yes chr4:501810-540874 lnc-VCX3B-1:1 No - LINC01424:1 No - LINC02040:5 No - lnc-CCKAR-5:8 No - lnc-MYO3A-1:1 No - lnc-CTNNA2-3:1 No - lnc-C3orf30-2:4 No - lnc-HHIP-1:2 Yes chr2R:17517261-17518186 lnc-GBE1-6:1 No - LINC00303:8 No - lnc-ITGA11-2:1 No - lnc-TMEM206-5:4 No - lnc-ACTRT2-1:1 No - LINC01152:7 No - lnc-MBOAT1-1:1 No - lnc-ATAD2B-8:2 No - lnc-MYT1L-1:1 No - PWRN1:8 No - lnc-CEP44-2:1 No - lnc-CDH8-1:1 No - lnc-ASCL1-6:8 No - lnc-STIM2-13:1 No - lnc-HOMER1-1:1 No - lnc-C1orf185-1:1 No - lnc-CDKN2AIPNL-1:2 No - lnc-PUDP-1:2 No - lnc-SLC52A1-2:1 Yes chr2L:11794327-11809438 MAFTRR:9 No - lnc-KHDRBS2-1:2 No - lnc-CPEB2-3:1 No - lnc-BNIP3-1:1 Yes chr3R:10126129-10139772 lnc-VSTM2B-5:3 No - LINC01093:7 No - lnc-CRYBA4-7:2 No - lnc-RORB-1:1 No - lnc-CHODL-13:1 No - PVT1:37 No - CASC22:24 No - lnc-DNAAF5-3:15 No - lnc-FOXO1-2:3 No - lnc-CLCN3-1:1 No - lnc-SNRPN-5:4 No - MIR124-2HG:8 No - DNAJC27-AS1:11 No - lnc-PDGFA-17:22 No - lnc-SPRED2-4:1 No - lnc-LRRC38-3:1 Yes chr2R:22333500-22373109 lnc-ISCU-1:3 No - lnc-TPO-2:2 No - LINC01722:8 No - lnc-ZNF507-1:1 No - lnc-PRDM11-3:6 No - LINC00689:2 No - FAM225A:1 No - lnc-SPATA5-2:1 No - lnc-POLE4-8:9 No - LINC00662:17 No - lnc-ATIC-1:1 No - lnc-TLE1-14:1 No - lnc-SEMA6C-2:1 No - lnc-EXD1-1:1 No - lnc-BCL6-5:1 No - lnc-SERINC1-2:1 No - lnc-CCDC59-4:1 No - LINC01852:20 No - lnc-PLEKHA5-3:2 Yes chr2R:6502006-6621792 LINC01337:2 No - LINC01564:1 No - lnc-TGFBI-80:5 Yes chr3R:27559379-27561319 lnc-PPDPFL-3:2 No - LINC01389:10 No - LINC01365:1 No - lnc-FARS2-1:1 No - DLEU1:32 No - lnc-CRIM1-1:1 No - lnc-PLCXD1-2:1 No - LINC01767:19 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-GPR132-2:1 No - lnc-RGS7-1:2 No - lnc-AQP12A-1:4 No - lnc-RNF7-1:1 No - lnc-SUMF2-5:3 No - lnc-SRPK2-1:2 No - lnc-DUSP1-1:1 No - LINC00442:5 No - lnc-DCTD-9:1 No - lnc-PEAK1-1:13 No - LINC01797:7 No - LINC01356:4 No - lnc-PRKN-21:11 No - lnc-PFKP-7:1 No - LINC01612:5 No - lnc-CFAP100-3:10 No - KCTD21-AS1:12 No - lnc-GABRG2-1:1 No - LINC01980:13 No - lnc-JMJD1C-1:1 No - lnc-SLC39A11-1:10 No - lnc-ZNF131-2:14 No - lnc-AMOTL2-2:2 No - LINC02252:5 No - lnc-SLC25A26-1:2 No - lnc-PRL-3:1 No - LINC02173:16 No - lnc-NCAM2-8:1 No - lnc-CCKAR-1:3 Yes chrX:15934495-15940451 lnc-RGL4-2:1 No - lnc-TRAF5-6:3 No - lnc-CCDC187-1:31 No - lnc-CYSTM1-1:3 No - lnc-ZNF91-4:17 Yes chr3R:11674920-11678116 LINC01811:18 No - lnc-PCBD1-2:2 No - lnc-ERI1-2:16 No - lnc-CXCR4-1:1 No - lnc-GPD2-3:1 No - lnc-ZMAT5-1:2 No - lnc-VPS18-1:6 No - lnc-POLN-1:2 Yes chr3R:21223704-21229512 lnc-TSPY4-4:1 No - lnc-CADM2-7:3 No - lnc-DNAJC19-2:1 No - LINC01282:1 No - lnc-MAS1L-1:1 No - LINC02517:10 No - LINC01896:40 No - lnc-ZNF485-68:21 No - lnc-LAMA2-1:2 No - lnc-ALDH1L1-1:1 No - LINC01625:4 No - lnc-TGDS-1:2 No - lnc-ABT1-3:8 No - lnc-MEIS1-2:2 No - lnc-WISP3-1:1 No - lnc-CXXC5-1:2 No - lnc-ERI1-2:11 No - DANT1:1 No - LINC00882:23 No - lnc-VSNL1-2:1 No - lnc-PGLYRP2-1:1 No - lnc-PRR14-1:1 No - lnc-OCM-1:2 No - lnc-TSC22D2-1:1 Yes chr2L:12455540-12546611 lnc-CEP19-1:1 No - lnc-METTL14-1:3 No - lnc-ZNF91-4:8 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-HLA-DQA2-1:3 No - LINC02462:3 No - lnc-LSMEM1-2:2 No - lnc-CNTNAP5-4:1 No - lnc-RAP2B-4:3 No - lnc-RAP1GDS1-3:1 No - LINC01093:1 No - lnc-HAAO-1:1 No - lnc-DDX18-2:1 No - PRKAR2A-AS1:4 No - lnc-GREB1-3:1 No - DNAJC3-DT:22 No - LINC01146:14 No - lnc-PPP1R3D-3:2 No - lnc-ROBO2-3:1 No - lnc-ZNF664-3:3 No - LINC01141:10 No - lnc-HFM1-1:1 No - lnc-ULBP2-2:1 No - lnc-PPARGC1B-1:1 No - lnc-KLF7-1:10 No - lnc-TRMO-2:2 No - lnc-ARF5-2:1 Yes chr3R:5794705-5799994 lnc-EXOC2-2:1 No - LINC01781:13 No - lnc-SMIM37-3:1 No - lnc-TBC1D1-1:1 No - lnc-OSTC-1:1 No - lnc-TLR4-9:2 No - lnc-IGFBP1-5:1 No - lnc-DRD5-10:3 No - lnc-INTS6-1:1 No - lnc-TSKU-2:4 No - lnc-KDM4C-19:1 No - LINC01988:16 No - lnc-WDR11-1:2 No - BANCR:1 No - MIR124-2HG:1 No - lnc-ITGA6-1:5 No - lnc-MMD-1:1 No - lnc-ARHGEF5-1:2 No - lnc-TPBG-1:1 No - LINC01923:11 No - MIR9-3HG:34 No - PART1:8 Yes chrX:3176440-3343767 lnc-NPAP1-9:3 No - lnc-RBM11-13:1 No - lnc-RABL2A-1:1 No - LINC01495:3 No - lnc-TCERG1-1:1 No - LINC01640:3 No - lnc-ANXA2R-1:29 No - lnc-COX7A2L-1:7 No - LINC00635:9 No - lnc-MFSD9-5:1 No - lnc-RBM28-1:1 No - lnc-DEFB104B-1:1 No - lnc-MAN2A1-11:2 No - lnc-KLF15-2:4 No - LINC02142:8 No - lnc-NFATC1-1:1 No - lnc-MYEOV-1:1 No - LINC02156:7 No - lnc-APOL6-1:1 No - lnc-TMEM132B-2:6 No - lnc-TMEM206-1:2 No - LINC00612:3 No - LINC02554:9 No - lnc-UGT2B15-1:1 No - lnc-ZNF804A-1:7 No - lnc-ADAM20-1:2 No - lnc-PDE6B-1:4 No - lnc-GPR27-1:2 No - lnc-MSH6-2:4 No - lnc-COPG1-1:1 No - lnc-RLN2-1:1 No - lnc-TRMT61B-4:1 No - lnc-DEFA1-1:1 No - lnc-LBX1-3:1 No - lnc-CADM2-7:2 No - lnc-RBBP9-10:2 No - lnc-HNF1B-2:5 No - lnc-SNRPN-8:107 No - lnc-FAM174B-2:11 No - lnc-MEI4-3:2 No - LINC00887:5 No - lnc-NPAP1-9:2 No - lnc-FOXD3-2:1 No - lnc-SRD5A3-1:1 No - lnc-FOXD4L6-1:3 No - lnc-FHIT-1:1 No - lnc-CLIC4-2:1 No - lnc-PDGFD-1:9 No - lnc-MYT1L-3:1 No - lnc-HELZ-1:3 No - lnc-NRXN1-2:1 No - lnc-C5orf38-1:5 No - lnc-SPTBN1-1:1 No - LINC01851:9 No - lnc-IGFBP7-5:7 No - lnc-IRX1-4:1 No - LINC00351:4 No - lnc-RPLP1-12:44 No - lnc-CALN1-1:1 No - lnc-MCRIP1-1:3 No - lnc-FGFR1OP-7:1 No - lnc-PCED1B-5:13 No - lnc-PCED1B-5:29 No - lnc-UGT8-1:1 No - lnc-NCBP3-1:1 No - lnc-ZNF296-1:1 No - lnc-TDO2-1:1 No - lnc-ICOSLG-1:1 No - lnc-HOXC13-2:2 No - lnc-CCDC125-6:4 No - lnc-SSTR4-4:1 No - lnc-TRMT11-2:1 No - lnc-APOC3-6:2 No - PSD2-AS1:19 No - lnc-PIEZO2-17:2 No - LINC01204:2 No - lnc-TMEM132E-2:1 No - lnc-MEF2C-3:1 No - lnc-SORBS3-1:2 Yes chr2R:10269016-10307024 lnc-MTR-1:1 No - lnc-KLF4-2:1 No - LINC00635:5 No - lnc-SLC15A4-13:1 No - LINC00640:6 No - lnc-EFCAB2-1:1 No - LINC02010:6 No - lnc-ZNF676-1:1 No - ZNF236-DT:15 No - lnc-CPA4-1:1 Yes chr2L:9767058-9770409 lnc-TARBP2-3:1 No - lnc-CLDN23-8:2 No - lnc-CABLES1-1:1 No - lnc-FBXO4-1:1 No - lnc-PCDH20-8:1 No - lnc-UCK2-3:2 No - lnc-GLRX3-3:2 No - LINC01303:25 Yes chr2R:9252310-9285097 LINC01593:1 No - lnc-TECRL-1:2 No - lnc-PRR15L-1:1 No - lnc-RFPL4B-2:1 No - LINC00930:1 No - lnc-TCIRG1-2:1 No - lnc-PDGFB-1:1 No - lnc-GCLC-1:5 Yes chrX:8102181-8116147 LINC00310:9 No - LINC02103:3 No - lnc-GATA5-6:1 No - LINC00313:16 No - lnc-IAH1-2:6 No - lnc-C2CD4B-3:1 No - lnc-THAP5-6:1 No - lnc-TUBGCP3-6:1 No - lnc-RTL8C-1:1 No - lnc-MRPS9-1:3 No - LINC00474:2 No - lnc-SLC44A3-1:7 No - lnc-CLBA1-6:1 No - lnc-FAAP20-1:1 No - lnc-MED15-1:5 Yes chr2L:473013-476170 lnc-P2RY1-3:8 No - lnc-HMCN1-2:2 No - lnc-EMX2-5:1 No - lnc-RSPH3-1:1 No - LINC02362:23 No - lnc-CDH9-7:1 No - LINC02429:5 No - lnc-DERL1-4:2 No - lnc-ICE1-1:1 No - lnc-CFAP46-3:5 No - lnc-MSR1-2:7 No - FAM138E:1 No - lnc-PTGFR-1:3 No - LINC02296:5 No - LINC00331:6 No - lnc-HIVEP2-5:3 No - LINC00486:20 No - lnc-NPAT-1:1 No - lnc-COA6-6:5 No - lnc-CCDC171-10:1 No - lnc-DUSP4-3:1 No - lnc-SLC1A2-2:3 No - lnc-GABRR3-2:4 No - LINC01374:24 No - lnc-HIVEP2-1:1 Yes chr2R:11159086-11217394 LINC02583:36 No - TUSC8:4 No - lnc-TIMM21-5:3 No - lnc-SPRED2-3:2 No - LINC01230:15 No - lnc-PTS-1:30 No - lnc-ALG10-1:1 No - ZNF582-AS1:19 No - lnc-PREP-1:1 No - lnc-MCM10-1:1 No - lnc-GMDS-4:2 No - LINC01814:11 No - lnc-CRYBA4-52:53 No - lnc-STEAP1-1:1 No - lnc-DRD5-8:4 No - LINC02577:24 No - lnc-GPM6B-1:3 No - lnc-ITM2C-1:4 No - lnc-RASSF2-5:2 No - lnc-BRD1-29:6 No - lnc-SPO11-1:2 No - lnc-ERI1-32:21 No - lnc-CCDC125-6:1 No - lnc-SERPINI1-2:1 No - lnc-TDRD9-4:2 No - lnc-HTR4-1:1 No - lnc-EVX2-4:1 No - lnc-CCSER2-2:5 No - lnc-MT1A-1:2 No - LINC00428:5 No - lnc-GOLGA8K-4:1 No - LINC01942:15 No - LINC01501:6 No - LINC02240:17 No - lnc-MUC20-67:138 No - lnc-KCNMB1-3:6 No - lnc-CDKN3-1:1 No - lnc-HECA-3:4 No - lnc-NEPRO-1:3 No - lnc-CBLB-3:5 No - LINC01678:13 No - lnc-DERA-1:3 Yes chrX:15082827-15084017 LINC01869:26 No - lnc-TRPM1-1:9 No - LINC02218:5 No - lnc-ACTR2-3:2 No - lnc-BLCAP-1:3 Yes chr3L:5565231-5566765 lnc-TSHB-2:1 No - lnc-GNG5-1:11 Yes chrX:2698701-2701033 lnc-SH3BP4-2:1 No - LINC01697:35 No - lnc-LEPROTL1-3:2 No - LINC02109:47 No - lnc-ZNF507-5:2 No - PANTR1:46 No - lnc-ZNF658-1:1 No - lnc-BBIP1-2:1 No - lnc-COBLL1-1:1 No - FAM111A-DT:33 No - TTTY7:4 No - lnc-C11orf95-1:7 No - lnc-CTBS-4:7 No - lnc-DCUN1D1-1:1 No - LINC02349:6 No - lnc-POLE4-8:5 No - RCAN3AS:24 No - lnc-CDC42SE2-1:5 Yes chr3R:5616644-5624125 LINC01875:3 No - LINC00326:2 No - lnc-HELT-3:1 No - lnc-ANKRD60-2:1 No - LINC01470:7 No - lnc-IRX5-2:1 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-EMX2-2:4 No - lnc-BNIP1-3:3 No - lnc-FBXO15-3:1 No - lnc-PML-3:1 No - lnc-ZNF33A-9:2 No - LINC02508:7 No - lnc-STK39-1:3 No - lnc-GPD2-2:1 No - lnc-PRR26-3:2 No - lnc-LRRC32-6:1 No - lnc-TCP11L2-1:1 No - lnc-PRSS51-4:5 No - lnc-ZNF837-1:12 No - lnc-BANP-14:8 No - lnc-FAM182B-1:1 No - lnc-BUB3-4:9 No - lnc-NEURL1B-3:1 No - LINC00661:14 No - LINC01869:31 No - lnc-CDKN1B-1:1 No - lnc-SLC12A7-1:1 No - lnc-ADCY9-1:1 No - lnc-SGTB-1:1 No - lnc-SLC15A4-1:1 No - lnc-GATA4-2:2 No - lnc-FMOD-1:1 No - LINC01649:9 No - lnc-MFAP3-1:10 No - lnc-MBTPS2-1:1 No - lnc-HS1BP3-1:4 No - lnc-KCNH1-1:7 No - lnc-NTM-2:1 No - lnc-EMC8-1:1 No - lnc-CAPN13-2:1 No - lnc-TRIM38-2:10 No - LINC01372:5 No - lnc-MRPS18A-1:1 No - lnc-VPS13C-1:2 No - lnc-ATAD2B-1:1 No - lnc-WDR11-2:2 No - AATBC:8 Yes chr2L:13363308-13366189 lnc-KHDRBS3-4:6 No - lnc-ADAMTS18-2:1 No - lnc-OTOL1-13:4 No - LINC02052:17 No - lnc-KY-1:1 No - OVAAL:1 No - lnc-NETO1-1:13 No - lnc-ABRACL-1:1 No - lnc-CA5A-4:5 No - lnc-CLDN20-22:3 No - INSYN1-AS1:32 No - LINC02016:10 No - lnc-FTMT-1:1 No - lnc-RNASEH1-1:11 Yes chr2R:7931054-7932380 lnc-MC4R-1:1 No - HAGLROS:7 No - PRKCQ-AS1:9 No - lnc-TMEM132E-1:1 No - lnc-TRAPPC12-3:3 No - LINC01517:2 No - lnc-MARCH6-1:1 No - lnc-ZNF516-10:1 No - lnc-SLX4IP-37:4 No - lnc-BDP1-1:1 No - LINC02173:10 No - PWRN1:3 No - lnc-CTR9-1:1 Yes chr3L:1307224-1311805 lnc-RPIA-2:2 No - lnc-MTERF1-4:1 No - lnc-ASB3-3:1 No - LINC02267:4 No - lnc-TCL1B-2:4 No - LINC02217:37 No - LINC01539:4 No - lnc-TNFAIP3-4:1 No - lnc-MCUR1-3:2 No - P3H2-AS1:3 No - lnc-FOXD4L6-2:1 No - lnc-DHX37-9:8 No - lnc-NCOA3-4:9 No - CHKB-DT:61 Yes chr2L:21614232-21624080 lnc-TINCR-1:9 No - MIR193BHG:9 No - lnc-KHNYN-5:3 No - lnc-NUPR2-3:7 No - lnc-ZC3H12D-6:1 No - lnc-INSIG1-3:2 No - lnc-NDUFS6-5:6 Yes chr3L:12609631-12710249 LINC01763:14 No - lnc-NR2F2-7:1 No - lnc-GKN2-1:1 No - LINC02188:15 No - lnc-ASCL1-6:2 No - LINC00903:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-MAT2B-3:14 No - lnc-SLC24A1-1:1 Yes chr3R:21111408-21116146 LINC02102:17 No - lnc-TLR10-4:1 No - lnc-CCER1-2:2 No - lnc-COMMD10-13:1 No - lnc-SPNS3-1:7 Yes chrX:9192669-9193620 lnc-ST8SIA4-2:1 No - lnc-GDE1-3:3 No - lnc-F13A1-3:4 No - lnc-CHGA-1:2 No - lnc-ZNF404-1:1 No - lnc-PI3-1:6 No - lnc-THBD-1:1 No - lnc-AK5-1:2 No - lnc-BTF3-3:1 No - lnc-OR2T5-1:1 No - LINC02588:26 No - lnc-HS3ST2-1:1 No - LINC02154:7 No - PWRN1:19 No - LINC01936:23 No - lnc-NCOA3-5:2 No - lnc-CCDC82-5:1 No - lnc-ZNF485-68:26 No - lnc-TCF7-1:1 No - lnc-LAPTM4A-1:1 No - lnc-AJAP1-3:6 No - lnc-ARFGEF2-4:1 No - lnc-PPIAL4F-8:1 No - lnc-TP53I11-2:1 No - lnc-ZNF792-1:1 No - LINC00486:8 No - lnc-SHB-1:2 No - LINC00899:5 No - lnc-FGFR2-3:1 No - FAM138D:3 No - lnc-TAF7-6:10 No - lnc-CCDC184-1:1 No - lnc-BEND7-5:2 No - LINC00544:4 No - lnc-PLXNA2-1:1 No - LINC00927:47 No - FAM242A:13 No - lnc-ONECUT1-1:1 No - lnc-TGFBRAP1-3:1 No - lnc-PLCB4-1:1 Yes chr2L:305935-355566 lnc-ANKRD26-1:1 No - lnc-FXYD4-1:2 No - lnc-SOX6-1:1 No - lnc-KLK4-1:1 No - lnc-ANO10-2:1 No - LINC02217:28 No - LINC02109:48 No - LINC01981:4 No - lnc-ST3GAL4-55:16 No - lnc-ADD3-2:3 No - lnc-FAM53A-1:3 No - lnc-MGAT1-4:15 No - PRKCQ-AS1:27 No - lnc-RCBTB2-1:1 Yes chrX:797090-801479 lnc-ADAMTS16-4:1 No - TTTY7B:1 No - LINC01471:7 No - lnc-POU5F1-7:1 No - LINC00927:48 No - LINC02217:36 No - lnc-CRYBA4-52:87 No - lnc-MED15-1:12 Yes chr2L:473013-476170 lnc-PXMP4-1:1 No - lnc-ERC1-1:1 No - LINC01488:5 No - lnc-TMCC1-12:1 No - lnc-TAOK3-1:8 No - lnc-HNRNPA3-4:1 No - lnc-ST6GAL2-4:1 No - lnc-KCTD6-1:4 No - lnc-SAA2-2:1 No - lnc-EDN1-1:1 No - lnc-SERPINB6-2:1 No - lnc-PPP4R1-3:1 No - LINC02237:22 No - lnc-FEZ2-7:9 No - LINC01961:11 No - lnc-MARK1-1:1 No - LINC00906:4 No - LINC01047:1 No - lnc-TXNRD1-1:1 No - LINC00882:17 No - lnc-DHX37-7:1 No - lnc-RGL4-4:1 No - lnc-PI3-1:2 No - lnc-RIPK1-159:1 No - lnc-PRDM9-3:2 No - lnc-IGFBP7-7:1 No - lnc-NUF2-2:1 No - LINC02407:20 No - lnc-LRRC4C-5:3 No - lnc-C9orf116-4:1 No - lnc-GOLGA8S-5:2 Yes chr3L:18721893-18723272 LINC01427:4 No - lnc-CHRD-1:1 No - lnc-MRPS30-6:1 No - lnc-HEATR6-1:2 No - LINC01186:10 No - lnc-WFDC1-1:1 No - PRKAR2A-AS1:10 No - lnc-MORF4L1-1:1 No - lnc-CFAP46-3:10 No - lnc-RPLP1-12:7 No - lnc-RPRM-4:2 No - AFDN-DT:20 No - lnc-FAM43A-9:1 No - lnc-ZNF30-3:2 No - KAZN-AS1:7 Yes chr2R:22333500-22373109 HUNK-AS1:1 No - lnc-GLI2-3:2 No - lnc-LRP5L-2:7 No - LINC01524:21 No - LINC02153:26 No - lnc-UQCRHL-2:1 No - PTCSC3:6 No - LINC00690:2 No - lnc-TOX3-1:12 No - lnc-NTF3-3:8 No - lnc-MCTP2-9:1 No - lnc-PRR26-4:1 No - lnc-ERCC6L2-2:7 No - lnc-FTCDNL1-1:6 No - lnc-SGCG-3:5 No - lnc-ZNF814-4:1 No - LINC00895:15 No - lnc-ZNF644-1:5 No - lnc-DYSF-3:1 No - lnc-ST3GAL4-55:10 No - lnc-CDH2-1:1 No - LINC01878:10 No - lnc-PTER-2:1 No - lnc-EIF2AK3-1:1 No - lnc-HSF2-4:2 No - RORB-AS1:4 No - lnc-CCDC127-2:1 No - LINC00354:1 No - lnc-FPGT-5:1 No - LINC01343:1 No - lnc-ATXN10-4:1 No - LINC00370:1 No - lnc-TMEM161B-1:2 Yes chr3L:11109690-11112117 LINC01278:25 No - lnc-YOD1-1:1 No - lnc-MTFP1-2:3 No - lnc-TRAF5-6:4 No - lnc-NCAM2-7:1 No - lnc-MEIS1-2:3 No - lnc-MCMBP-1:1 No - lnc-MMEL1-1:1 No - lnc-BPGM-1:1 No - lnc-CTH-2:1 No - lnc-INIP-1:5 No - lnc-SBF2-2:1 No - lnc-NTRK3-2:2 No - LINC01019:1 No - lnc-GLIS2-1:1 No - PWRN1:28 No - lnc-SORCS3-5:4 No - lnc-KIAA1211L-1:5 No - lnc-COL18A1-1:1 No - lnc-TMEM140-1:1 No - lnc-BEST3-1:5 No - lnc-IFI44-2:5 No - lnc-LTBP3-2:4 No - lnc-CYR61-1:1 No - lnc-ZNF107-1:2 No - lnc-NOCT-5:4 No - lnc-JUN-3:1 No - LINC02127:8 No - lnc-HS1BP3-1:5 No - lnc-ATP8A1-1:1 No - lnc-LPP-10:1 No - LINC01688:10 No - lnc-RTP5-3:2 No - lnc-ADRA2C-4:1 No - lnc-FGF8-1:1 No - DLEU1:38 No - lnc-C1QTNF1-1:1 No - lnc-HSPB8-1:1 No - lnc-FAM120B-3:1 No - lnc-FCN1-3:1 No - lnc-NPAS2-1:3 No - lnc-ROPN1B-5:2 No - lnc-PRKAR2A-1:1 Yes chr2R:21646177-21657935 LINC02225:4 No - lnc-SMC2-1:2 No - lnc-REELD1-1:1 No - lnc-CD83-1:1 No - lnc-FAM209B-1:1 No - lnc-ARHGAP10-2:2 No - PROX1-AS1:49 No - lnc-COL28A1-1:3 No - LINC00900:13 No - LINC02315:18 No - lnc-HERC6-2:2 No - lnc-TMEM98-2:2 No - lnc-EXOC4-7:4 No - lnc-ALK-2:2 No - lnc-GALNT13-3:1 No - LINC01255:7 No - LINC01117:6 No - lnc-ARF5-5:2 No - lnc-COPG1-2:3 No - lnc-ADAMTS12-4:1 No - lnc-ZNF146-1:6 No - lnc-CDR1-2:1 No - lnc-CCKAR-5:7 No - lnc-CAP2-1:1 No - lnc-HS3ST4-1:5 No - lnc-CPNE8-1:2 No - OVAAL:4 No - LINC00901:2 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-CYLD-2:17 No - lnc-FAM84B-15:119 No - lnc-DNAJC19-3:2 No - lnc-SLC35F5-4:1 No - lnc-TAF1B-1:1 No - lnc-FGFRL1-2:1 No - lnc-COX19-1:1 No - lnc-PAX4-1:1 No - LINC01105:5 No - lnc-MRPL39-7:1 No - PLCG1-AS1:4 No - lnc-KIAA1211L-1:7 No - TAF1A-AS1:3 No - lnc-ZPBP-3:1 No - lnc-MAP9-2:2 No - lnc-FSCB-1:17 No - lnc-ROCK2-3:6 No - lnc-FAM96B-1:1 No - lnc-ABCC4-1:1 No - LINC02262:5 No - lnc-PIGF-3:2 Yes chr3R:5591763-5595356 lnc-PZP-3:1 No - lnc-BTG2-2:4 No - lnc-JADE1-1:3 No - lnc-TOX3-3:2 No - lnc-TMEM185B-4:1 No - lnc-ANKRD34C-1:1 No - lnc-NTRK2-2:3 No - lnc-ABLIM1-1:1 No - lnc-THAP6-1:1 No - lnc-TMEM14A-2:1 No - lnc-MCCC2-2:2 No - ARLNC1:10 No - DSCR4-IT1:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-SRBD1-1:1 No - lnc-F13A1-3:5 No - LINC00265:7 No - lnc-ZFP64-1:1 No - lnc-CDH3-3:1 No - lnc-MT1A-1:3 No - lnc-AGPAT2-2:2 No - lnc-GRHL3-1:3 No - AATBC:11 No - lnc-RGPD4-3:3 No - lnc-LECT2-1:1 No - lnc-MRPL39-7:2 No - lnc-FSIP2-1:1 No - lnc-TEX53-2:8 No - lnc-SAMD11-1:2 No - LINC01208:3 No - lnc-SYNDIG1-3:1 No - lnc-MEIS2-4:2 No - lnc-NSDHL-1:1 No - lnc-SLFN5-1:9 No - lnc-CRYL1-1:1 No - lnc-PGS1-1:1 No - LINC02519:27 No - lnc-HDGFL1-1:1 No - lnc-MSX1-2:1 No - lnc-CCDC42-1:1 No - lnc-MRGPRX4-1:8 No - lnc-KCNC4-1:1 Yes chr2L:3718185-3729145 LINC02075:3 No - LINC00589:4 No - lnc-FOXO6-1:1 No - lnc-PCDH7-6:1 No - LINC01701:3 No - lnc-PCSK9-4:1 No - lnc-B3GALT2-1:1 No - LINC00629:6 No - LINC02120:7 No - lnc-STIM2-4:2 Yes chrX:15934495-15940451 lnc-CD46-2:4 No - lnc-BMPER-1:1 No - lnc-ANXA2R-1:17 No - LINC00661:1 No - LINC01374:25 No - LINC01114:4 No - LINC02589:11 No - LINC02384:35 No - GMDS-DT:123 No - LINC01629:3 No - lnc-UBXN10-1:1 No - STK24-AS1:1 Yes chr3R:17085513-17087988 lnc-UBE2N-1:11 No - LINC00635:35 No - LINC01350:6 No - lnc-AKR1E2-4:1 No - lnc-SPATA5-1:1 No - lnc-BMP2K-2:1 No - lnc-ZNF333-3:1 No - lnc-ITGB1-6:8 No - LINC01364:1 No - lnc-SLC39A11-10:49 No - LINC01533:10 No - GAS1RR:2 No - lnc-MARCKS-1:3 No - lnc-FAT1-3:1 No - lnc-SLC44A3-2:3 No - lnc-RAB6D-3:2 No - LINC00390:5 No - FTX:59 No - lnc-CLMP-1:2 No - lnc-ZNF837-1:16 No - lnc-SLC25A13-1:9 No - LINC01696:7 No - lnc-ANKRD30A-6:1 No - lnc-UQCRFS1-5:1 No - lnc-HES1-2:1 No - lnc-ASB4-3:1 No - lnc-SPOPL-3:3 No - lnc-SPO11-3:1 No - lnc-TMEM98-1:3 No - lnc-GFRA2-1:1 No - lnc-SOCS5-4:10 No - lnc-TMEM132B-4:3 No - LINC02074:14 No - lnc-DHX37-9:12 No - lnc-TRIML1-2:1 No - lnc-ARSJ-1:3 No - lnc-MTRNR2L12-3:4 No - lnc-ADD3-1:1 No - lnc-FRG1-11:7 No - LINC02544:4 No - lnc-BLM-6:12 No - lnc-C10orf143-3:1 No - lnc-TMEM116-1:1 No - lnc-GLRX3-4:1 No - lnc-FAM174B-3:2 No - lnc-TMEM163-6:1 No - lnc-XKR9-5:1 Yes chr2L:6527447-6546976 lnc-MFSD1-1:2 No - lnc-SPATA31A1-5:2 No - lnc-CREB3L1-3:1 No - LINC01586:4 No - lnc-GRIP1-2:2 No - lnc-CSMD1-6:2 No - lnc-MANEA-3:1 No - lnc-CDK12-1:5 Yes chr3L:21516306-21522684 lnc-IL4R-2:17 No - DIRC3-AS1:2 No - LINC01273:14 No - lnc-TBC1D1-1:5 No - lnc-SH3D21-2:1 No - lnc-RPL38-1:1 No - lnc-ADAM2-3:1 No - lnc-PCSK2-1:1 No - lnc-EFCAB1-4:2 No - lnc-ADCY6-1:1 No - lnc-GRB7-1:1 No - lnc-DCTD-1:2 No - LINC01858:14 No - LINC02407:30 No - lnc-RNF26-1:4 No - LINC01945:3 No - lnc-ARHGAP15-1:1 No - lnc-ZNF32-3:4 No - LINC00844:3 No - lnc-MED13L-3:1 No - lnc-ARMCX3-2:2 No - lnc-LIN28B-3:2 No - LINC01020:9 No - LINC00331:4 No - lnc-DENND6B-1:4 No - lnc-NPAP1-11:2 No - LINC00967:7 No - lnc-SHB-1:3 No - lnc-ZNF133-1:1 No - lnc-NR1I2-1:12 No - lnc-HERPUD2-3:1 No - lnc-LONRF1-1:3 No - PSORS1C3:1 No - LINC02291:7 No - LINC02454:13 No - lnc-HSPB9-1:1 No - LINC01589:4 No - lnc-TSHZ2-19:3 No - lnc-SERHL2-2:2 No - lnc-DLL1-1:1 No - LINC01141:12 No - lnc-ATP23-89:2 No - lnc-FAM135A-1:3 No - lnc-HRH4-2:1 No - lnc-CHD2-1:1 No - lnc-ABI3-2:7 No - lnc-ELAVL2-3:1 No - LINC01934:19 No - LINC01721:3 No - lnc-ADGRB3-2:3 No - lnc-CCZ1B-2:1 No - MIR3681HG:1 No - LINC00545:1 No - lnc-SEC61G-2:1 No - lnc-HIST1H2BJ-2:1 No - lnc-GEMIN2-2:2 No - lnc-SRBD1-3:1 No - LINC02198:22 No - lnc-MRPL33-1:5 No - LINC01648:5 No - lnc-KCTD6-5:2 No - LINC01708:22 No - lnc-STOX2-1:2 No - lnc-PKN2-1:3 No - lnc-ZNF227-1:2 No - lnc-GARS-9:1 Yes chr3L:18461957-18463163 LINC00899:2 No - lnc-TMEM132C-5:1 No - lnc-PEX7-2:1 No - lnc-DOK7-2:4 No - XIST:4 No - lnc-LYPD6-1:1 No - LINC01550:17 No - lnc-CNOT6-4:1 No - lnc-ZSWIM2-7:1 No - lnc-CD6-1:2 No - LINC02050:24 No - lnc-PIEZO2-18:5 No - lnc-INTS10-1:1 No - lnc-TBC1D8-1:8 Yes chr3L:21337681-21343716 FZD10-DT:47 No - LINC01828:23 No - NRIR:7 No - lnc-ZNF236-11:4 No - lnc-C14orf177-4:1 No - lnc-SMC1B-4:1 No - lnc-STPG1-3:5 Yes chr3R:16186999-16197584 lnc-SYCP2-2:1 No - lnc-SLC44A3-1:1 No - lnc-CRABP2-1:1 No - lnc-ZFP42-2:6 No - lnc-PHACTR1-1:1 No - LINC00347:6 No - LINC00326:9 No - lnc-ZNF486-2:1 No - lnc-KRT80-2:2 No - lnc-C1QL4-1:5 No - lnc-MIB2-1:2 No - lnc-GLRB-4:1 No - lnc-ZNF664-2:20 No - LINC02541:61 No - lnc-CECR2-2:1 No - LINC01745:8 No - lnc-SFPQ-1:3 No - lnc-LMO2-1:2 No - lnc-SUMF2-1:1 No - lnc-ZC2HC1A-2:1 No - lnc-ZFHX4-3:1 No - lnc-WRN-1:1 No - LINC00421:1 No - lnc-TNFRSF19-2:1 No - LINC00678:5 No - ZNF236-DT:16 No - lnc-PHTF2-1:3 No - lnc-TMEM18-6:2 No - lnc-LYPD6-2:2 No - lnc-CD8B2-5:2 No - lnc-KLHL5-1:1 No - lnc-LSR-1:1 No - lnc-SYNC-1:5 No - GMDS-DT:127 No - LINC00955:1 No - lnc-RPS6KA4-1:4 No - LINC00844:10 No - lnc-MYO7B-2:12 Yes chrX:16309817-16313138 lnc-GPR183-47:12 Yes chr2L:20730416-20734309 lnc-HAAO-7:11 No - LINC00899:3 No - LINC01255:2 No - lnc-WDR48-1:1 No - LINC02472:4 No - HOXA11-AS:7 No - LINC00114:8 No - lnc-IL17A-1:1 No - ZNF582-AS1:2 No - lnc-HS1BP3-3:1 No - lnc-GPR39-2:1 No - lnc-FRG2-5:2 No - lnc-ANP32A-2:3 No - lnc-LRRN3-1:1 No - LINC02309:7 No - LINC02558:4 No - lnc-RPLP1-12:32 No - lnc-UBE2F-1:1 No - lnc-FAM92A-9:8 No - lnc-TDRD15-5:1 No - lnc-RWDD3-1:1 No - lnc-ENC1-3:2 No - LINC02084:10 No - lnc-ERP44-3:6 No - lnc-ETAA1-4:3 No - LINC00996:5 No - lnc-KITLG-1:2 No - lnc-SULF1-2:1 No - lnc-SLC4A10-3:1 No - C5orf66-AS1:1 No - LINC01170:14 No - LINC02198:30 No - lnc-MBTPS2-1:2 No - lnc-SCLT1-2:1 No - lnc-FOXF1-1:1 No - lnc-AMY1B-1:5 No - lnc-NPVF-1:1 No - LINC00999:4 No - lnc-PRRT1B-1:1 No - LINC01116:5 No - lnc-TPST1-1:6 No - lnc-CPXM2-3:1 No - LINC02290:19 No - lnc-PGPEP1L-18:1 No - lnc-GGTLC1-3:1 No - lnc-LRRC30-1:1 No - lnc-TLE3-1:1 No - lnc-IRX3-80:48 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-TP53TG3-7:1 No - LINC02517:9 No - lnc-SPRY1-11:2 No - lnc-OTX2-2:2 No - lnc-CAMK2N1-1:1 No - lnc-ZSWIM6-6:8 No - MMP2-AS1:10 No - lnc-RDH14-2:1 No - LINC02074:11 No - lnc-HSPH1-6:1 No - lnc-FAM19A5-4:1 No - lnc-CBR3-1:3 No - lnc-KY-2:3 No - lnc-GMNC-2:1 No - lnc-PIK3CG-3:1 No - LINC01176:14 No - lnc-EPSTI1-3:1 No - lnc-ENDOD1-1:3 No - LINC02294:7 No - LINC00308:1 No - lnc-ITIH2-6:1 No - lnc-C2orf76-1:1 No - lnc-MBOAT2-1:1 No - lnc-APOBEC3G-3:1 No - lnc-CHMP2B-2:2 No - lnc-BOD1L2-1:1 Yes chrX:1908920-1916825 lnc-PIF1-1:1 No - lnc-GCNT1-2:1 No - MIR137HG:17 Yes chrX:9196808-9201820 LINC02099:14 No - lnc-KIAA1147-5:1 No - LINC02134:5 No - lnc-DUSP22-2:1 No - lnc-PIK3C3-2:3 No - lnc-NAALADL2-15:1 No - lnc-RIPOR2-2:1 No - lnc-NKAIN3-1:1 No - lnc-VWC2-2:1 No - lnc-TMEM26-3:1 No - lnc-TRAF5-4:1 No - lnc-IL16-12:3 No - lnc-RHOG-2:1 Yes chrX:15934495-15940451 lnc-EMB-1:1 No - lnc-CBLN4-3:1 No - lnc-AKTIP-10:3 No - lnc-GPATCH2L-1:6 No - LINC02398:22 No - lnc-HMGB2-3:21 No - LINC00279:1 No - lnc-POM121L12-4:1 No - lnc-FBXL12-1:1 No - LINC00205:16 No - lnc-TMPRSS2-2:1 No - lnc-KLHL32-1:1 No - lnc-SLX4IP-35:4 No - LINC00701:1 No - lnc-WDR63-2:1 No - lnc-STK35-4:7 No - lnc-ZIC1-1:1 Yes chr3R:4852813-4869979 lnc-FCHSD2-1:1 No - lnc-LGALSL-1:2 No - LINC01307:5 No - lnc-ATP6V1G3-4:11 No - lnc-BTG3-4:1 No - lnc-LYPLAL1-3:3 No - LINC01070:1 No - lnc-TRHDE-5:1 No - lnc-VSTM2B-7:1 No - MIR670HG:27 No - LINC01020:10 No - lnc-TRIML2-14:1 No - lnc-ZC3H12B-18:3 No - lnc-LINC02203-8:1 No - CSE1L-AS1:6 No - lnc-MBOAT1-2:22 No - lnc-NVL-1:1 No - lnc-PAPOLA-1:1 No - lnc-OR5AC2-1:1 No - lnc-FBXW7-1:2 No - lnc-UBE2E2-1:2 No - lnc-PDE7A-6:2 No - EDRF1-AS1:32 No - lnc-MC3R-2:2 No - LINC02053:11 No - lnc-TP53TG3F-2:1 No - lnc-TSSC4-2:2 Yes chr3R:25872900-25881427 LINC02173:11 No - lnc-TET3-2:1 No - IGFBP7-AS1:6 No - lnc-HIST1H2AI-1:4 No - lnc-ZNF536-2:1 No - lnc-PRKAA2-7:1 No - LINC02020:17 No - lnc-ZNF397-1:1 No - lnc-SLC13A1-1:2 No - lnc-MSN-1:5 Yes chr2R:24607267-24610847 LINC02186:5 No - lnc-MTR-1:4 No - lnc-TTC21A-1:1 No - LINC01341:13 No - LRRC8C-DT:38 No - lnc-LRRTM4-3:1 No - LINC02293:17 No - lnc-AKR1C2-5:1 No - lnc-TGFBRAP1-2:2 No - LINC00299:11 No - lnc-IRX4-2:1 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-WSB1-2:1 No - HCG27:1 No - lnc-HRCT1-7:2 No - HCG27:5 No - lnc-OAF-4:8 No - lnc-PCDH7-9:1 No - lnc-SLC39A11-1:8 No - lnc-MAP10-1:3 No - lnc-SSTR4-2:5 No - LINC02487:6 No - LINC00926:3 No - lnc-ARRDC3-3:1 No - lnc-BPY2C-25:1 No - lnc-SDK1-2:1 No - lnc-ABT1-1:1 No - lnc-POLR3G-1:2 No - LINC02541:60 No - lnc-VPS13D-1:2 No - LINC01384:1 No - lnc-TGFBI-1:1 Yes chr2L:3146056-3159643 lnc-TAOK3-7:2 No - lnc-MS4A4A-1:1 No - lnc-ANKRD50-4:2 No - LINC02583:24 No - LINC00319:17 No - lnc-ERGIC1-2:4 No - lnc-C2orf54-1:4 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-FOXA2-7:1 No - lnc-TPO-3:1 No - lnc-NDEL1-1:1 No - lnc-LGALS9B-2:1 No - LINC02593:43 No - LINC02083:3 No - lnc-CA8-5:2 No - lnc-ECI2-2:2 No - lnc-ZNF236-7:2 No - lnc-EFR3A-2:2 No - lnc-FOXD4L6-1:7 No - LINC00885:7 No - lnc-ABT1-3:5 No - lnc-NDUFS5-2:1 No - lnc-TGFBR2-3:2 No - ST3GAL5-AS1:9 No - lnc-AAGAB-1:43 No - lnc-HNRNPAB-2:1 No - lnc-POLR2B-18:1 No - LINC01514:5 No - lnc-ANGPT2-5:1 No - LINC00926:7 No - LINC00299:2 No - lnc-CHRD-10:3 No - lnc-CMPK2-5:65 No - lnc-GAS6-4:1 No - lnc-RALGDS-2:1 No - lnc-UVSSA-1:5 No - lnc-ZNF146-1:3 No - lnc-SLC39A11-10:50 No - lnc-FUT8-1:1 No - lnc-CST8-3:1 No - lnc-JPH4-4:4 No - LINC01013:8 No - lnc-ANXA2R-1:15 No - lnc-ATOH7-1:1 No - lnc-CLUAP1-8:2 No - LINC01685:9 No - lnc-PIGN-1:4 Yes chr3R:22707786-22710762 MIR3663HG:5 No - lnc-C16orf95-2:23 No - lnc-LRSAM1-1:3 Yes chr3L:4136359-4138996 lnc-MSX2-5:1 No - lnc-MBOAT1-1:2 No - LINC01989:17 No - lnc-TBX15-1:2 No - SRP14-AS1:3 No - lnc-ABI1-5:1 No - lnc-C20orf196-3:4 No - LINC01249:6 No - LINC01273:8 No - lnc-CCDC187-1:29 No - PROX1-AS1:59 No - lnc-DIAPH3-5:1 No - lnc-NT5DC1-3:1 No - lnc-ZNF131-2:6 No - LINC00398:1 No - lnc-GALNT2-1:1 No - lnc-GRXCR1-4:3 No - lnc-SPATA31A6-1:1 No - lnc-ZC3H11B-2:1 No - lnc-ADGRA1-2:2 No - lnc-ELOVL1-1:3 No - lnc-ZC3H11B-1:18 No - lnc-SLC46A2-2:1 No - lnc-ANGPTL2-2:2 No - LINC01081:12 No - lnc-PCDH10-9:2 No - lnc-FAM20C-5:1 No - lnc-RBMY1B-1:3 No - lnc-PPARA-2:1 No - lnc-SORL1-2:1 No - lnc-CBLB-5:3 No - lnc-SEC22A-1:1 No - lnc-HEPH-2:1 No - lnc-TAF3-1:11 Yes chr3R:8147368-8181444 lnc-CELF4-3:1 No - ST3GAL5-AS1:3 No - lnc-GJA10-5:1 No - lnc-ADAM32-1:1 No - LINC01429:2 No - lnc-COX10-6:3 No - lnc-ABI3-2:9 No - LINC00313:12 No - lnc-RAB11FIP2-2:4 No - lnc-ASCL1-6:13 No - lnc-MGMT-2:1 No - lnc-SETD6-4:1 No - lnc-ACTR3C-2:1 No - lnc-MAFB-2:1 No - LINC02441:6 No - lnc-LRFN2-3:1 No - LINC02156:8 No - lnc-DTNBP1-2:2 No - LINC01704:21 No - lnc-CHMP4C-3:1 No - lnc-PCM1-4:5 No - LINC02519:33 No - LINC02357:7 No - lnc-SMOC2-2:1 No - LINC02519:34 No - lnc-AP3B2-1:2 No - lnc-ADGRL3-2:2 No - lnc-CYYR1-1:1 No - lnc-IGSF10-6:5 No - GAS1RR:3 No - LINC01081:8 No - lnc-ACP1-7:3 No - LINC02172:4 No - LINC01402:3 No - LINC01341:8 No - lnc-AFDN-1:4 No - lnc-GATB-2:2 No - lnc-NR3C1-1:1 No - lnc-POLR3G-3:1 No - lnc-TAF5L-1:1 No - lnc-POTEC-5:2 No - lnc-ZNF804B-2:5 No - lnc-GATB-2:5 No - LINC00507:10 No - lnc-NBAS-1:1 No - LINC01634:4 No - lnc-PREX1-4:1 No - lnc-IKZF2-3:3 No - lnc-RPIA-3:2 No - lnc-USP6NL-8:4 No - LINC01507:7 No - lnc-ULBP2-2:3 No - LINC01584:2 No - LINC02039:9 No - lnc-OLFML3-1:1 No - lnc-SBDS-3:1 No - lnc-ZNF706-2:2 No - lnc-ERMARD-2:8 Yes chrX:19626548-19638369 lnc-APBB1IP-1:4 No - lnc-MICU2-1:1 No - lnc-TOMM20-2:6 No - LINC01550:6 No - lnc-TP53TG3-69:1 No - MIR9-3HG:13 No - LINC01304:2 No - lnc-DEPDC1-2:1 No - lnc-SERGEF-2:2 No - lnc-NCOA3-6:1 No - PRKAR2A-AS1:8 No - lnc-ADGRL4-3:1 No - lnc-ABCD4-1:2 No - LINC00567:4 No - LINC01248:11 No - lnc-EMB-4:1 No - lnc-INSIG1-2:1 No - lnc-GDAP2-1:7 No - lnc-USP44-7:2 No - LINC01571:3 No - lnc-NPIPB5-1:1 Yes chr2L:20678921-20681846 LINC02086:18 No - lnc-NDC80-2:1 No - lnc-MAFB-2:2 No - lnc-COX10-1:1 No - lnc-COPS4-1:2 No - LINC01431:7 No - lnc-ZBBX-2:1 No - LINC02437:4 No - lnc-FAM71A-1:3 No - lnc-IRAK1BP1-10:1 No - LINC01618:1 No - PVT1:38 No - lnc-ZIC4-1:1 No - lnc-RHOBTB3-1:7 No - lnc-SZRD1-4:2 No - lnc-MED15-1:3 Yes chr2L:473013-476170 LINC00710:4 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-MOGAT1-1:2 No - lnc-RNF113B-3:1 No - lnc-SH3BGRL-5:18 No - lnc-FPGT-5:2 No - lnc-ZCCHC24-1:1 No - lnc-COL18A1-2:1 No - lnc-SUMF2-4:1 No - KTN1-AS1:4 No - lnc-NETO1-1:6 No - lnc-MYOM2-4:1 No - lnc-B4GALT1-1:1 No - lnc-ASB7-4:1 No - lnc-GPCPD1-8:20 No - lnc-FABP5-2:4 No - lnc-MMP16-1:3 No - lnc-GCLC-1:12 Yes chrX:8102181-8116147 lnc-CBLB-3:1 No - LINC01065:4 No - LINC01081:5 No - lnc-KLHL32-4:2 No - lnc-OPRD1-1:1 Yes chr3L:18560258-18576326 lnc-ULK4-5:1 No - LINC00456:1 No - lnc-ZNF827-7:1 No - lnc-NT5DC1-4:1 No - LINC01740:4 No - lnc-SAMSN1-2:4 No - LINC00448:4 No - lnc-TMEM105-2:12 No - lnc-PI3-1:3 No - lnc-ANXA1-2:1 No - MIMT1:1 No - lnc-COIL-2:6 No - lnc-KLF4-16:1 No - lnc-DYDC1-2:1 No - lnc-SBDS-1:2 No - lnc-SORCS3-4:1 No - LINC00702:4 No - lnc-DHRSX-1:1 No - lnc-SCGB1D4-3:1 No - lnc-GALC-6:1 No - LINC01141:3 No - lnc-C12orf74-1:1 No - lnc-DHX35-1:1 No - LINC01811:21 No - lnc-PKDCC-1:1 No - lnc-BRF2-9:1 No - lnc-FMN1-2:2 No - lnc-LHX8-1:1 No - lnc-NR1I2-1:5 No - LINC00881:4 No - LINC00899:11 No - LINC01467:2 No - lnc-C3orf30-2:1 No - lnc-NTSR2-4:1 No - LINC01558:1 No - lnc-CLN8-7:1 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-USP12-9:13 No - lnc-PITRM1-7:10 No - lnc-IMMP2L-1:2 No - LINC01436:2 No - lnc-CDH16-1:1 No - SPATA3-AS1:7 No - lnc-ZNF703-3:1 No - LINC00661:23 No - lnc-TOX3-1:13 No - lnc-NADSYN1-1:1 No - LINC02250:6 No - LINC00513:18 No - LINC02040:7 No - MYCNUT:1 No - lnc-WAS-1:1 No - lnc-MYCN-6:1 No - lnc-PPIC-2:1 No - LINC00927:43 No - PCAT6:1 No - lnc-DZANK1-3:1 No - lnc-TTK-1:1 No - LINC00363:1 No - LINC02055:19 No - lnc-ALDH1B1-13:5 No - lnc-B3GNT10-5:4 No - lnc-SLCO1A2-4:1 No - lnc-ILKAP-1:1 No - lnc-TMEM206-5:5 No - LINC00564:7 No - lnc-BMS1-16:1 No - LINC01068:2 No - lnc-RIPOR1-1:13 No - lnc-KCNS3-1:1 No - lnc-RGL1-1:3 No - lnc-DNAJB6-7:2 No - LINC01572:10 No - lnc-MPPE1-10:2 No - lnc-ING1-1:1 No - lnc-SIX3-2:1 No - lnc-SPATA6-1:1 No - lnc-HS3ST4-1:2 No - lnc-FAM92A-4:1 No - lnc-SSTR4-4:4 No - lnc-FOXO4-1:1 No - lnc-ERRFI1-1:2 No - lnc-NME4-1:4 Yes chr3R:25199818-25214255 lnc-TMEFF2-3:1 No - lnc-FOXD4L6-1:11 No - lnc-CADM2-3:7 No - lnc-PLEKHA5-3:4 Yes chr2R:6502006-6621792 lnc-TK2-6:1 No - lnc-EXOC4-4:1 No - LINC02420:5 No - LINC01550:8 No - lnc-IMPACT-1:1 No - lnc-EPHA4-3:2 No - lnc-LRP5L-2:3 No - lnc-RHD-1:1 No - lnc-NAALADL1-1:1 No - lnc-EGFL7-1:4 No - lnc-ATP11B-5:1 No - lnc-TRPM1-1:15 No - lnc-GRID1-1:1 No - lnc-ACTR2-3:21 No - lnc-GPBP1-2:2 No - LINC01020:11 No - lnc-PTBP2-1:1 No - lnc-PRR15-1:1 No - LINC00592:1 No - lnc-CPEB2-2:2 No - LINC00652:7 No - lnc-FDX1-1:5 No - lnc-ESM1-1:2 No - lnc-TMEM242-3:1 No - LINC02345:30 No - LINC02275:9 No - lnc-ACTL7A-2:1 No - lnc-CA5A-4:4 No - lnc-SAXO1-1:1 Yes chr2L:21684106-21729051 lnc-FAT3-5:11 No - lnc-DNAJB9-2:1 No - lnc-RTCB-5:1 No - lnc-RUFY1-1:1 No - lnc-PCDH18-1:4 No - lnc-MARCKS-4:1 No - LINC02024:14 No - lnc-NYAP1-1:1 No - lnc-PTPRD-5:3 No - lnc-MRGPRF-4:1 No - lnc-DNAAF5-3:25 No - LINC01351:6 No - lnc-DRD5-10:4 No - LINC02411:15 No - lnc-WSCD1-1:2 Yes chrX:15380371-15385441 LINC01333:9 No - CALML3-AS1:5 No - LINC02059:10 No - LINC2194:11 No - lnc-PERP-1:1 No - TPT1-AS1:4 No - lnc-CCKAR-1:1 Yes chrX:15934495-15940451 lnc-RGMA-18:2 No - lnc-PDGFA-17:1 No - lnc-SNU13-1:1 No - lnc-MPPED2-3:2 No - lnc-ANXA5-1:1 No - lnc-AFG1L-1:1 No - lnc-NPAP1-10:3 No - LINC00375:1 No - LINC02140:17 Yes chr3L:12609631-12710249 LINC01491:9 No - lnc-ONECUT1-1:5 No - LINC00240:5 No - lnc-TMEM26-3:3 No - lnc-GDF10-3:1 No - LINC02422:24 No - DNAJC27-AS1:9 No - lnc-BOD1-1:3 No - PURPL:53 No - lnc-SDSL-13:1 No - LINC00929:1 No - LINC02593:36 No - lnc-SMOC2-5:1 No - lnc-C5orf67-2:1 No - lnc-KCNE1B-3:3 No - lnc-NKX2-5-1:1 No - LINC01424:3 No - lnc-ARL4C-2:2 No - lnc-GGTLC1-2:1 No - LINC02520:39 No - lnc-POU3F3-1:1 No - LINC00924:2 No - lnc-DNAJC28-1:5 No - MAFG-DT:13 No - lnc-WDR91-4:6 No - lnc-GDF6-1:1 No - lnc-TIMP4-1:1 No - lnc-SEPT7-1:2 No - lnc-SNCB-1:1 No - lnc-TGFBI-80:6 Yes chr3R:27559379-27561319 lnc-RHOBTB2-1:1 Yes chr2L:12707661-12708680 lnc-CHD9-3:2 No - lnc-PRB1-1:1 No - lnc-CRYBA4-10:1 No - lnc-TBXT-1:1 No - LINC01093:8 No - lnc-DCAF17-1:1 No - lnc-LRRC32-5:1 No - lnc-NUMB-1:2 No - SRGAP3-AS4:2 No - lnc-SLC6A9-2:2 No - lnc-S1PR1-2:1 No - lnc-SPRY2-132:8 No - lnc-NPVF-4:1 No - lnc-TNFAIP2-1:1 No - lnc-GREM2-4:1 Yes chr2R:24378630-24390294 LINC01365:2 No - lnc-FRG1-2:1 No - lnc-NCOA3-5:3 No - lnc-NCR3LG1-1:3 No - LINC02564:11 No - LINC01257:4 No - LINC01105:12 No - LINC01678:17 No - lnc-ZFHX4-2:2 No - lnc-POU3F3-3:1 No - SMC2-AS1:4 No - LINC01072:1 No - lnc-CYSTM1-1:6 No - LINC00299:5 No - LINC02043:12 No - UBE2E2-AS1:4 No - LINC00345:1 No - lnc-KBTBD8-1:2 No - lnc-NTM-4:1 No - lnc-IGIP-4:2 No - lnc-MED10-4:1 No - lnc-PLEKHH2-2:1 No - LINC02325:33 No - lnc-DRD5-10:13 No - lnc-FAM20C-4:3 No - LINC01440:5 No - lnc-BANP-14:7 No - lnc-ERGIC2-3:3 No - lnc-NUCB2-2:1 No - lnc-HPS3-3:2 No - lnc-IAH1-2:5 No - LINC01203:4 No - LINC00326:10 No - lnc-KIAA1328-1:1 No - lnc-WDR26-3:1 No - lnc-C5orf38-1:3 No - LINC00836:8 No - lnc-ARHGEF26-14:2 No - lnc-FOXO1-2:2 No - lnc-POM121L12-1:1 No - lnc-OR4F3-1:1 No - lnc-FAM84A-2:1 No - lnc-CXorf49-3:1 No - LINC02510:5 No - LINC02407:18 No - lnc-INIP-1:4 No - lnc-C5orf49-2:4 No - lnc-IRX3-80:45 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-MBOAT1-2:23 No - lnc-CD1D-1:1 No - lnc-GNA12-2:1 No - LINC00434:1 No - LINC00265:11 No - lnc-CYB5R4-5:3 No - lnc-TMEM70-1:2 No - MIR100HG:32 No - lnc-ASCC3-1:1 No - lnc-DAGLA-1:4 No - lnc-OBSL1-1:1 No - LINC01702:13 No - lnc-RAD23B-21:2 No - lnc-CDC16-1:1 No - lnc-DLK1-35:135 No - LINC02401:12 No - lnc-MGMT-6:2 No - lnc-IGFBP4-1:1 No - lnc-GTF2B-4:1 No - LINC01019:5 No - lnc-IL17RA-35:1 No - TMEM161B-AS1:35 No - lnc-PSD2-2:2 No - lnc-PROP1-2:2 No - lnc-ARHGAP26-4:36 No - LINC00523:7 No - LNCARSR:15 No - lnc-PXN-1:1 No - lnc-SERPINI1-23:1 No - lnc-C9orf50-4:3 No - LINC01748:29 No - lnc-F3-7:25 No - lnc-LINC02203-7:2 No - lnc-FAF1-1:1 No - LINC02529:5 No - lnc-DNAH8-2:1 No - LINC02059:11 No - lnc-MRPL32-2:1 No - ERICD:6 No - lnc-CPXM2-1:5 No - LINC01574:3 No - lnc-TSHZ1-1:2 No - LINC02318:10 No - lnc-ZIC1-2:3 No - LINC01978:14 No - LINC02499:12 No - lnc-NFE2L2-3:2 No - lnc-S1PR1-5:1 No - LINC01020:2 No - lnc-HNRNPU-2:1 No - lnc-XPO7-1:1 No - LINC02020:24 No - lnc-MTG2-1:1 Yes chr2R:23992138-23995055 lnc-IL7R-1:1 No - lnc-ENOSF1-1:1 No - lnc-AKAP9-1:1 No - lnc-C15orf41-7:1 No - lnc-FANCM-5:1 No - lnc-SMARCA2-2:1 No - lnc-CFLAR-1:6 No - lnc-LAMA1-3:1 Yes chr2R:4744348-4758048 lnc-PRSS3-1:4 No - lnc-BUB3-4:32 No - lnc-C10orf67-2:5 No - lnc-POU4F2-3:1 No - lnc-STN1-2:6 No - lnc-TSKU-2:1 No - lnc-MYL2-2:1 No - lnc-EPG5-2:1 No - lnc-SDSL-3:1 No - lnc-ZBED2-6:1 No - RUNX2-AS1:28 No - lnc-TMEM189-1:3 No - LINC00844:6 No - lnc-GINS2-2:2 No - LINC02153:35 No - LINC00489:1 No - lnc-NOX3-3:1 No - lnc-MRPL19-2:1 Yes chr3R:4077939-4104326 lnc-IFT74-4:1 No - lnc-TOPAZ1-2:1 No - lnc-NETO1-1:2 No - lnc-FGF9-3:4 No - lnc-F13A1-3:15 No - LINC02453:15 No - lnc-FANCI-3:1 No - lnc-ARL4C-2:1 No - lnc-BHLHE22-9:3 No - lnc-ANKRD27-2:5 No - lnc-PDE1A-1:1 No - lnc-EXT1-2:1 No - LINC01431:5 No - lnc-JAM3-3:2 No - LINC01505:8 No - lnc-ENPP6-1:1 No - lnc-ADGRL3-2:9 No - LINC00327:5 No - lnc-TDRD15-2:2 No - lnc-ETAA1-4:1 No - lnc-MTHFSD-62:1 No - LINC01405:8 No - lnc-NMNAT2-1:1 No - lnc-CEBPB-12:2 No - lnc-ZNF248-1:3 No - LINC01948:8 No - lnc-LYZL1-1:1 No - RPS6KA2-AS1:4 No - lnc-LY86-5:1 No - LINC01672:14 No - MID1IP1-AS1:9 No - lnc-SSU72P8-1:1 No - LINC01116:8 No - lnc-NCF4-2:2 No - lnc-PHB-2:1 No - LINC01870:3 No - lnc-COL5A1-3:1 No - lnc-SLC25A32-3:5 No - LINC00112:5 No - LINC00928:2 No - LINC01349:5 No - lnc-SAMSN1-3:3 No - lnc-ZPLD1-1:1 No - LINC01582:4 No - lnc-RNPC3-3:1 No - lnc-COL4A1-2:3 No - lnc-EIF3H-1:1 No - LINC02020:14 No - lnc-GNAO1-1:1 No - LINC02542:11 No - LINC00994:1 No - LINC01614:1 No - lnc-KLK3-1:2 No - lnc-TMEM18-1:1 No - LINC00692:12 No - LINC00968:10 No - LINC00310:4 No - lnc-DKK3-3:1 No - lnc-SUMF1-7:1 No - lnc-PTN-2:13 No - LINC00895:14 No - lnc-SOCS6-2:2 No - RGPD4-AS1:9 No - lnc-TFAP2D-1:1 No - LINC00592:11 No - LINC01533:11 No - LINC01965:17 No - lnc-LYZL1-6:1 No - LINC01229:7 No - lnc-GOLGA8S-1:2 No - lnc-PABPC4L-8:1 No - LINC02044:4 No - lnc-KCNN2-2:2 No - lnc-ZMYM2-6:1 No - lnc-CDKN2C-1:1 No - lnc-KIDINS220-9:1 No - lnc-CCDC187-1:26 No - lnc-TCTE3-6:1 No - lnc-ATXN3L-3:2 No - LINC01582:9 No - lnc-TRIB2-3:1 No - lnc-POTEB-5:1 No - lnc-GNA13-1:1 No - lnc-PHGDH-4:4 No - lnc-ZNF273-1:3 No - lnc-BUB3-4:5 No - LINC02521:4 No - PURPL:29 No - lnc-SEPT9-3:3 No - lnc-FZD10-3:1 No - LINC02400:24 No - lnc-GYG1-1:1 No - LINC01304:12 No - LINC02400:19 No - lnc-WRAP73-1:2 No - lnc-BUB3-4:24 No - LINC02097:4 No - lnc-C10orf90-2:1 No - lnc-ERMARD-4:1 No - LHX1-DT:14 No - lnc-MAGEA1-1:1 No - lnc-SPATA19-9:2 No - lnc-ASCL1-6:14 No - lnc-GINS2-2:1 No - lnc-B4GALNT4-1:2 No - LINC01980:14 No - LINC01758:5 No - LINC02021:15 No - lnc-CFAP126-1:2 No - lnc-UTP18-2:1 No - lnc-UFM1-1:1 Yes chr2L:16663454-16676701 lnc-GLB1-1:1 No - lnc-TSPAN32-1:1 No - LINC02162:5 No - LINC00608:11 No - ZNF674-AS1:3 No - LINC01142:4 No - lnc-VRK2-2:1 No - lnc-OR4F29-3:11 No - lnc-MAP1LC3B2-7:1 No - LINC02400:15 No - lnc-CRYBA4-52:78 No - lnc-CLMP-1:3 No - lnc-KBTBD12-1:1 No - lnc-LYPLAL1-3:1 No - LINC00565:7 No - LINC01929:9 No - LINC01341:10 No - lnc-PITRM1-7:8 No - LINC02299:5 No - LINC01934:20 No - lnc-ZNF727-7:1 No - lnc-REG1B-4:1 No - lnc-BTN2A1-1:2 No - lnc-ERP44-3:5 No - lnc-DRD5-10:2 No - lnc-WDR60-3:2 No - LINC00589:9 No - lnc-SPERT-1:1 No - lnc-LRP5-1:1 No - lnc-KIAA1147-3:4 No - lnc-SARS-1:1 No - lnc-CRYBG3-1:1 No - LINC02298:21 No - lnc-OPRM1-2:1 No - PVT1:43 No - LINC01288:4 No - lnc-GAPVD1-2:2 No - lnc-EIF5B-1:1 No - lnc-ILDR2-1:1 No - lnc-U2SURP-3:7 No - LINC01031:1 No - lnc-PATJ-1:1 No - lnc-ABI1-3:2 No - lnc-ZNF680-5:1 No - SRP14-AS1:15 No - lnc-TXN2-1:2 No - lnc-KIF25-2:3 No - lnc-CHAC2-1:1 No - lnc-SND1-1:1 No - lnc-ARFGEF2-2:2 No - lnc-DAOA-6:1 No - lnc-LGALS9B-2:5 No - lnc-CD276-1:1 No - lnc-UVSSA-1:1 No - LINC02542:9 No - PWRN4:1 No - lnc-TEX53-2:6 No - lnc-C8orf48-1:3 No - lnc-NUPR2-2:2 No - LINC01704:25 No - LINC01241:14 No - lnc-KCTD6-1:2 No - lnc-IFNLR1-1:1 No - LINC00472:18 No - lnc-NETO1-1:1 No - lnc-STX2-6:1 No - lnc-RPLP1-12:34 No - lnc-SEPT7-1:5 No - lnc-MPDZ-2:1 No - LINC00494:5 No - LINC00442:8 No - lnc-ATP6AP2-6:1 No - lnc-SPIN1-1:1 No - lnc-NUPR2-4:2 No - LINC02499:11 No - lnc-TAF12-3:2 Yes chr3L:18560258-18576326 lnc-SOCS5-4:11 No - lnc-RHOBTB3-1:6 No - lnc-FHDC1-1:1 No - lnc-MAP1LC3B2-28:21 No - lnc-TRPM1-1:2 No - lnc-GABPA-6:1 No - lnc-CAPN13-2:2 No - lnc-WDR70-7:25 No - CASC22:29 No - lnc-ASIC2-2:4 No - RAB30-AS1:7 No - lnc-ZNF791-1:1 No - lnc-TNFAIP3-3:2 No - lnc-TTC7A-4:2 No - lnc-SMC1B-1:1 No - lnc-EMX2-1:2 No - lnc-RAD23B-8:6 No - LINC01818:7 No - lnc-TMEM132B-10:5 No - lnc-RAB28-3:1 No - lnc-SPIRE2-1:1 Yes chr2L:20311219-20348386 GAS6-DT:21 No - lnc-CHMP2B-1:3 No - PURPL:52 No - LINC00327:4 No - lnc-ALG14-5:2 No - lnc-FOXJ2-1:1 No - lnc-SLC12A7-1:15 No - lnc-SH3BP4-1:1 No - lnc-PDCD1-1:23 No - lnc-ZNF485-3:1 No - lnc-NPAS2-1:5 No - lnc-PRKAG2-2:1 No - MIR663AHG:36 No - SGO1-AS1:8 No - lnc-MAN2A1-11:1 No - lnc-CYSTM1-1:11 No - LINC02423:9 No - LINC01781:14 No - lnc-BIRC2-5:1 No - lnc-FAM120B-5:2 No - lnc-TAOK3-1:2 No - LINC02217:41 No - lnc-C5orf38-3:3 No - lnc-TRPM6-4:1 No - lnc-GPD2-2:7 No - lnc-KIF2B-6:2 No - lnc-PPDPF-1:2 No - lnc-PFKP-14:1 No - lnc-ALPK1-1:4 No - INSYN1-AS1:26 No - lnc-LYRM7-2:1 No - lnc-PCED1B-5:14 No - LINC01747:8 No - lnc-NFATC2-1:1 No - LINC00613:1 No - lnc-ZNF705D-2:55 No - lnc-GLB1L2-1:11 No - lnc-TMEM105-2:9 No - lnc-PLS3-2:1 No - lnc-BUB3-4:19 No - LINC01505:7 No - lnc-MFSD14B-2:1 No - lnc-SYNC-1:1 No - lnc-ASPH-2:2 No - LINC00885:4 No - lnc-CHD1L-5:4 No - lnc-KLF7-1:8 No - LINC01093:13 No - LINC02076:13 No - LINC01303:27 Yes chr2R:9252310-9285097 LINC00351:1 No - LINC02048:3 No - lnc-CMTM4-1:1 Yes chr3R:18980995-18982749 lnc-ARHGAP20-1:1 No - lnc-KLF13-2:7 Yes chr2L:476446-479688 lnc-ZFP42-2:9 No - lnc-MOCS3-3:1 No - lnc-HTR2C-1:2 No - SRGAP3-AS4:4 No - lnc-WDR7-6:1 No - lnc-RALGPS1-1:1 No - lnc-THBS1-6:3 No - lnc-EPB41-1:1 No - lnc-ITPR3-1:11 No - lnc-AASDHPPT-1:2 No - lnc-JCAD-1:1 No - GMDS-DT:126 No - lnc-MANEA-3:2 No - lnc-ADD3-3:1 No - lnc-CTDSP2-2:4 No - lnc-STMP1-5:2 No - lnc-CLASP2-2:1 No - lnc-NEDD1-5:1 No - LINC00941:5 No - lnc-HSPA1B-1:1 No - LINC01040:1 No - TTTY1:1 No - lnc-RNF152-2:6 No - lnc-CCDC80-1:1 No - lnc-TMEM132B-4:21 No - lnc-RPLP1-12:12 No - lnc-SLC9A1-1:2 No - lnc-CDK20-4:2 No - lnc-WDR70-7:24 No - lnc-GRIK2-2:13 No - LINC01102:3 No - LINC02263:22 No - lnc-MAPK13-1:1 No - lnc-CCDC93-3:1 No - lnc-KLF7-1:9 No - lnc-F13A1-3:7 No - lnc-DTNBP1-4:1 No - lnc-IL6-3:1 No - LRRC8C-DT:48 No - lnc-KLHL32-4:4 No - lnc-GLB1L2-3:3 No - LINC01952:11 No - SIX3-AS1:8 No - RAB30-AS1:5 No - lnc-DAAM2-9:8 No - lnc-PYDC2-1:2 No - lnc-ERAL1-8:5 No - lnc-PLPP3-12:21 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-SBDS-10:1 No - LINC02109:49 No - lnc-BTBD9-1:1 No - lnc-PRB1-1:6 No - LINC00707:5 No - lnc-KCNQ2-2:1 No - LINC00440:1 No - GMDS-DT:134 No - LINC01197:11 No - lnc-WDR4-4:1 No - lnc-HDDC2-2:3 No - lnc-CYB5R4-5:6 No - lnc-BPIFA2-1:1 No - lnc-MUTYH-1:2 No - lnc-CRYBA4-52:76 No - lnc-DLK1-35:119 No - LINC01005:2 No - lnc-ANKUB1-1:1 No - lnc-SERTAD2-1:1 No - lnc-RCC2-1:1 No - LINC01491:3 No - lnc-CNPY1-3:4 No - lnc-ARHGEF28-2:1 No - lnc-EIF2AK3-1:3 No - lnc-SLC35A5-1:1 No - LINC02293:18 No - lnc-ARMC4-4:1 Yes chr2R:11226458-11232516 lnc-SAP30-22:1 No - lnc-RNF152-2:4 No - LINC00899:6 No - lnc-HOXC4-4:4 Yes chr3R:17150587-17151630 lnc-GSDMC-34:25 No - lnc-FAM120B-5:1 No - lnc-IQCG-4:1 No - lnc-CHST12-1:5 Yes chr2L:16879517-16886319 lnc-FRAT1-1:3 No - lnc-ICE1-1:2 No - lnc-FAM172A-7:3 No - LINC00999:2 No - lnc-C5orf38-2:1 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-AKR1D1-1:1 No - lnc-STIM2-3:2 No - PSORS1C3:4 No - lnc-CALB2-1:1 No - lnc-ANKRD20A4-15:1 No - lnc-RUNX1T1-4:2 No - lnc-CAPZA3-3:1 No - lnc-CDKN2AIP-1:1 No - LINC02541:57 No - lnc-ZNF286A-51:1 No - LINC02469:5 No - LINC01471:13 No - LINC01197:15 No - EPHA5-AS1:3 No - GLIDR:10 No - lnc-SOD3-4:2 Yes chr3R:4422483-4429335 lnc-PDCD4-1:1 No - TNFRSF14-AS1:27 No - lnc-ELF2-2:3 No - LINC02175:22 No - lnc-POTED-2:1 No - lnc-TTLL7-1:1 No - LINC01627:1 No - lnc-TMEM252-1:1 Yes chr3L:16126018-16128531 lnc-TGFBRAP1-1:1 No - lnc-ASAP2-5:1 No - lnc-PDGFA-5:3 No - lnc-NTPCR-1:1 No - LINC02171:4 No - lnc-MKI67-1:1 No - PANTR1:47 No - LINC01215:4 No - LINC01360:11 No - lnc-GREB1-15:2 No - LINC01032:4 No - lnc-GPR65-16:2 No - lnc-PTP4A3-3:1 No - lnc-PPP1R3B-3:1 No - lnc-NPAP1-8:1 No - lnc-DROSHA-6:1 No - lnc-CERS6-1:1 No - lnc-UTS2R-1:1 No - lnc-CDH23-3:1 No - lnc-PAX9-5:1 No - LINC01273:6 No - lnc-NPAP1-9:6 No - lnc-METTL22-2:1 No - lnc-ZC3H12D-8:2 No - lnc-SPTBN1-3:1 No - lnc-ENPEP-1:3 Yes chr3R:13298768-13302334 lnc-NAALADL2-1:9 No - lnc-JPH3-2:1 No - lnc-ANKRD30B-3:1 No - lnc-SH3RF2-2:2 No - lnc-COA6-7:1 No - OVAAL:3 No - lnc-HS3ST3B1-1:1 No - lnc-SORCS1-5:1 No - lnc-FAM241B-2:1 No - LINC00205:12 No - lnc-DMRT2-2:2 No - LINC02582:9 No - lnc-LSMEM1-4:1 No - lnc-PFKP-16:2 No - SOX1-OT:23 No - lnc-CBLB-4:1 No - lnc-OR13C4-2:1 No - lnc-HOXC13-1:2 No - lnc-CNIH3-1:1 No - LINC01961:14 No - lnc-FRG2C-2:1 No - lnc-TGIF2LX-1:1 No - LINC00690:3 No - lnc-WDR60-2:1 No - lnc-ARHGEF5-2:3 No - lnc-TSN-8:1 No - lnc-FAHD2B-7:1 No - lnc-DAAM2-9:10 No - lnc-PGAP2-1:1 Yes chrX:15934495-15940451 LINC00887:10 No - LINC02147:8 No - LINC00112:2 No - lnc-PLPPR3-1:1 No - TMEM92-AS1:1 No - lnc-DTWD2-2:1 No - lnc-ZC3H11B-1:6 No - lnc-QRSL1-2:1 No - LUCAT1:14 No - lnc-CD47-1:1 No - MAFTRR:20 No - MYOSLID:16 No - LINC01447:1 No - lnc-BTC-1:1 No - lnc-NCOR2-7:1 No - lnc-WRN-6:1 No - lnc-SUMF2-5:5 No - lnc-ID3-1:1 No - lnc-RUNX2-2:1 No - lnc-ITGB2-3:1 No - lnc-SAMD11-1:1 No - LINC02212:10 No - lnc-IDH3B-1:1 No - lnc-SIK1-2:1 No - lnc-BOC-3:3 No - RBM26-AS1:3 Yes chr2L:19493251-19497978 lnc-RTL1-5:1 No - LINC00968:11 No - lnc-NFKBID-1:1 No - lnc-BEST3-1:6 No - lnc-SLC35C1-3:3 No - lnc-CENPP-20:10 No - lnc-MAP3K9-1:1 No - lnc-SOD2-3:1 No - lnc-ZNF571-1:5 No - LINC02049:7 No - lnc-NDFIP2-11:1 No - LINC02150:9 No - lnc-MEF2C-4:1 No - lnc-ABCD4-1:1 No - LINC00900:2 No - LINC00944:16 No - lnc-RHEX-1:1 No - lnc-PBDC1-1:1 No - lnc-NPAP1-7:1 No - CCDC18-AS1:27 No - lnc-YEATS4-1:1 No - lnc-RAB37-1:7 No - lnc-STAT6-1:4 Yes chrX:16653220-16655015 lnc-MAP3K9-3:12 No - LINC01859:18 No - LINC02250:7 No - LINC02380:7 No - lnc-SLC45A4-3:5 Yes chr3L:25236940-25670980 CCDC18-AS1:6 No - LINC00313:13 No - lnc-PPARGC1A-1:2 No - lnc-SIAH2-1:2 No - lnc-CCKAR-4:1 No - lnc-ROR2-1:1 Yes chr2R:13168498-13170744 lnc-OR51E1-1:1 No - LINC00887:7 No - lnc-TMEM18-3:7 No - lnc-FCGR3A-3:2 No - lnc-TSHZ1-1:1 No - lnc-SERHL2-2:3 No - lnc-ZNF599-3:1 No - lnc-TTC34-1:1 No - lnc-TOP1-1:1 No - lnc-AQP12A-1:9 No - lnc-GLI2-5:1 No - lnc-EIF3A-2:1 No - lnc-CD207-1:1 No - LINC01541:1 No - lnc-IFI44-2:2 No - LINC00692:3 No - lnc-PUS3-2:3 Yes chr3L:27279316-27422159 lnc-NEURL1B-3:10 No - lnc-CHD2-4:7 No - LINC02261:3 No - lnc-CD93-3:1 No - LINC02123:4 No - lnc-C2orf76-1:3 No - lnc-ETDB-1:12 No - MIR4432HG:7 No - lnc-DPP6-1:1 No - lnc-GNAQ-2:5 No - lnc-SRGAP2C-5:4 No - lnc-LANCL2-1:7 No - lnc-PTPRG-1:1 No - lnc-F13A1-3:6 No - RAB30-AS1:8 No - lnc-NDFIP1-2:1 No - lnc-PSMD7-4:2 No - lnc-MAGEB18-1:1 No - lnc-ANKRD27-2:4 No - lnc-PCED1B-5:34 No - lnc-SH2D4A-2:5 No - lnc-CHST12-1:2 Yes chr2L:16879517-16886319 lnc-CCL2-2:1 No - lnc-SLC22A18-8:2 No - lnc-BUB3-4:7 No - lnc-C5orf38-4:1 No - lnc-ZEB1-1:2 No - LINC01384:3 No - LINC01069:3 No - lnc-FOXD4L6-1:9 No - lnc-SLITRK5-1:2 No - LINC01550:9 No - lnc-COPZ2-1:4 No - lnc-HMGA1-1:1 No - lnc-DNAJB6-7:7 No - lnc-PCDH18-3:1 No - lnc-CDC42-1:2 No - lnc-SOCS6-5:1 No - lnc-TBX19-1:1 No - LINC00629:1 No - LINC00662:61 No - lnc-ALKBH1-1:1 No - lnc-DUSP26-1:1 No - lnc-SOCS5-4:1 No - lnc-ADAM29-5:5 No - lnc-NUF2-1:1 Yes chr2R:17792870-17800677 lnc-ZSCAN30-2:3 No - lnc-TTC33-1:1 No - LINC01151:2 No - LINC00662:43 No - lnc-CXCR5-1:2 No - LINC00348:3 No - LINC00708:4 No - lnc-DHRS9-1:1 No - lnc-SLC35G4-3:1 No - LINC00649:9 Yes chr3R:15265591-15266690 TTTY4:1 No - lnc-ASB15-2:1 No - lnc-TSKU-2:2 No - lnc-UBE2H-2:1 No - lnc-STAG1-3:1 No - lnc-HECA-3:3 No - LINC00917:8 No - lnc-STOML3-2:2 No - LINC01230:10 No - LINC02147:9 No - lnc-NKD2-1:1 No - lnc-CDH18-4:1 No - lnc-IGFBP2-7:2 No - lnc-RASGRP3-5:1 No - lnc-SH2D7-5:1 Yes chr2R:21872030-21946259 lnc-EDAR-1:1 No - LINC01950:9 No - lnc-MFSD9-3:1 No - TNKS2-AS1:6 No - lnc-UBAP1L-1:1 No - lnc-CRTC3-1:1 No - lnc-ACOD1-1:1 No - LINC01360:3 No - LINC01299:2 No - LINC01013:19 No - lnc-ODF1-1:5 No - lnc-TBL1Y-3:1 No - lnc-ZFHX4-3:5 No - lnc-RNF26-1:13 No - lnc-RTL1-4:1 No - LINC02050:22 No - lnc-LGALS12-2:1 No - lnc-CST8-1:2 No - lnc-RBM11-4:6 No - lnc-VPS33B-2:1 No - lnc-AUH-5:1 No - lnc-TPO-1:3 No - lnc-JUN-6:1 No - RASSF8-AS1:23 No - LINC01303:43 Yes chr2R:9252310-9285097 lnc-PHLDA3-2:1 No - lnc-SETD6-8:1 No - LINC00844:1 No - lnc-ANKRD18B-2:1 No - lnc-KCNN2-2:1 No - LINC01883:7 No - lnc-CTTNBP2-3:2 No - lnc-QPCT-1:2 No - lnc-DMAC1-4:2 No - LINC00298:3 No - TTTY2:1 No - OIP5-AS1:6 No - lnc-SEC24D-1:3 No - lnc-C10orf105-2:1 No - lnc-SEL1L-9:1 No - LINC00488:1 No - lnc-DPH3-1:1 No - lnc-NRXN3-1:1 No - lnc-HS3ST5-2:7 No - lnc-ASB4-1:1 No - lnc-EXOSC9-48:1 No - lnc-CYSTM1-1:12 No - lnc-DMAC1-5:1 No - lnc-CAAP1-1:1 No - lnc-TK2-3:1 No - lnc-RAB40B-1:3 No - LINC00334:2 No - lnc-SEPT9-1:1 No - lnc-MTRNR2L12-3:3 No - lnc-STK32C-2:1 No - lnc-PPP4R1-6:1 No - lnc-SCP2D1-1:2 No - lnc-CDK20-3:1 No - LINC01259:2 No - lnc-FAM213B-3:1 No - lnc-CD46-3:1 No - lnc-PRSS22-1:1 No - lnc-CENPS-CORT-1:1 No - lnc-ANKRD36-2:1 No - lnc-FAM20C-3:5 No - lnc-CAMSAP2-1:2 No - lnc-HS3ST3A1-2:1 No - P4HA2-AS1:1 No - lnc-C5orf38-1:7 No - lnc-PTDSS1-2:1 No - lnc-EIPR1-1:1 No - LINC00705:4 No - lnc-RANBP3L-1:1 No - lnc-HMGB2-15:7 Yes chrX:16787283-16789644 LINC02384:43 No - lnc-SMC3-1:2 No - lnc-SRY-5:1 No - LINC00882:46 No - lnc-DHX37-9:1 No - LINC01360:4 No - lnc-FBXO15-3:10 No - lnc-TAF12-3:1 Yes chr3L:18560258-18576326 lnc-ITPR3-1:1 No - lnc-AMZ2-1:2 No - GASAL1:30 No - lnc-MRPL33-1:6 No - lnc-CDH2-3:1 No - lnc-KCNG2-1:2 No - lnc-DAZAP2-1:1 No - lnc-NHLH2-1:1 No - lnc-CENPP-1:1 No - LINC01896:41 No - lnc-WDR4-1:1 No - lnc-OTOL1-13:1 No - lnc-POLE4-8:6 No - lnc-HDGFL1-2:10 No - LINC01268:3 No - LINC01069:5 No - lnc-FYB2-1:1 No - lnc-DHX37-9:7 No - lnc-ADAR-5:1 Yes chrX:5340236-5405138 lnc-CRP-2:8 No - lnc-ZNF507-2:1 No - LINC00926:17 No - lnc-KLHL18-8:9 No - lnc-MTRR-4:3 No - lnc-ROBO4-1:1 No - lnc-SUCLG1-2:1 No - LINC02512:4 No - LINC01102:17 No - lnc-DENND6B-1:6 No - lnc-SLC35B3-6:1 No - LINC01036:3 No - lnc-VTI1A-2:1 No - lnc-UBASH3B-1:1 No - lnc-MFSD8-4:1 No - lnc-CFL1-1:2 No - DUBR:15 No - lnc-DLL1-12:1 No - lnc-CBARP-1:2 No - LINC01810:5 No - lnc-IL18-1:2 Yes chr3R:23759483-23760600 lnc-NOCT-7:1 No - lnc-NTF3-5:1 No - lnc-SYTL5-1:1 No - lnc-OSTF1-1:1 No - lnc-NKAIN3-14:9 No - lnc-CSMD1-1:18 No - lnc-PIEZO2-2:7 No - lnc-GNAQ-2:1 No - LINC02494:6 No - lnc-TOX3-3:1 No - LINC01007:3 No - lnc-SLC5A9-2:1 No - lnc-ZHX2-6:4 No - lnc-NDUFV2-1:1 No - lnc-APLN-1:1 No - lnc-COG6-1:1 No - lnc-VGLL3-3:1 No - lnc-ERI1-2:9 No - lnc-CHST4-1:4 Yes chr3R:18367927-18372738 LINC01941:3 No - lnc-ATP23-1:1 No - lnc-CRACR2A-3:7 No - lnc-NUAK1-3:1 No - lnc-PPM1M-1:1 No - lnc-NDUFA4-1:1 No - LINC01909:13 No - PRKCQ-AS1:14 No - lnc-DIAPH3-3:2 No - LINC02336:4 No - lnc-IFT20-1:1 No - lnc-HIST1H2AI-3:12 No - lnc-LRIG1-1:1 No - lnc-HRH4-2:2 No - lnc-TNFAIP3-5:1 No - LINC02198:24 No - lnc-CD1B-3:2 No - lnc-CARD11-5:1 No - LINC00941:8 No - RBM15-AS1:27 Yes chr2R:7962463-7969805 lnc-ZNF728-2:1 No - LINC01423:2 No - LINC02243:7 No - lnc-CELF2-3:1 No - lnc-ARHGEF5-1:3 No - lnc-HS3ST4-1:6 No - lnc-FRG1-6:2 No - lnc-DUSP19-1:1 Yes chrX:18648182-18649489 lnc-ZBTB37-1:1 No - lnc-ARMCX4-2:1 No - lnc-TUBGCP3-6:3 No - lnc-MAP3K9-3:4 Yes chrX:12988615-13079070 RUNX2-AS1:20 No - CD81-AS1:4 No - lnc-FRG1-11:8 No - lnc-KHNYN-3:1 No - lnc-SLC12A7-1:6 No - lnc-TTC21A-2:1 No - LINC01349:2 No - lnc-OSBPL8-1:1 No - lnc-CDKL5-1:1 No - BOLA3-AS1:11 No - lnc-TRMT112-3:1 No - LINC01513:1 No - lnc-ARSJ-1:4 No - lnc-EGLN1-1:5 No - lnc-TRIM62-1:1 No - ST3GAL5-AS1:16 No - LINC00592:8 No - DNAJB8-AS1:6 No - lnc-USP12-9:15 No - RBM26-AS1:14 No - SLC25A25-AS1:15 No - LINC02345:18 No - lnc-SPATA31A1-5:3 No - lnc-CHST12-1:3 Yes chr2L:16879517-16886319 LINC00670:3 No - lnc-LACTB-1:1 No - lnc-HIST1H2AI-3:2 No - ZNF571-AS1:2 No - lnc-PRKD1-4:1 No - lnc-CPEB2-7:1 No - LINC00426:10 No - lnc-GBP5-5:1 No - lnc-SPAM1-1:1 No - LINC02024:16 No - lnc-CHRDL2-1:1 No - lnc-PTCH1-2:1 No - SATB1-AS1:89 No - lnc-LZTS1-2:2 No - LINC01524:24 No - lnc-MTOR-2:1 No - lnc-F13A1-3:1 No - lnc-ELAVL4-10:1 No - lnc-ARL5B-2:1 No - LINC01470:6 No - lnc-DDX1-1:2 No - LINC01832:3 No - lnc-PDE3B-1:1 No - lnc-AMZ2-1:3 No - lnc-NDUFV2-1:4 No - LINC01018:6 No - lnc-ZNF516-8:1 No - lnc-BRINP3-1:1 No - LINC01811:30 No - lnc-TMEM88B-4:2 No - lnc-TVP23C-1:1 No - lnc-LSR-1:3 No - lnc-TSPAN11-3:2 No - lnc-VRK2-7:1 No - lnc-PRDM9-18:4 No - lnc-HTR1B-2:2 No - ENO1-AS1:1 Yes chr2L:1724768-1729636 LINC00635:17 No - lnc-HNF1B-1:1 No - lnc-MARK1-4:1 No - lnc-MPLKIP-7:1 No - LINC00211:1 No - LINC01874:7 No - lnc-HTR1A-2:1 No - lnc-SLC44A3-1:9 No - lnc-ATG4C-1:1 No - lnc-GADD45G-5:2 No - lnc-ERCC6L2-2:1 No - LINC00982:15 No - lnc-LAMA1-4:1 No - lnc-POTED-3:1 No - lnc-CCDC187-1:27 No - lnc-RAB11FIP4-1:1 No - lnc-CCDC127-1:1 No - lnc-HTR3A-1:1 No - LINC00322:1 No - lnc-LASP1-5:1 No - lnc-MYCN-5:1 No - lnc-AMPH-1:1 No - lnc-HOXA13-5:1 No - lnc-PARM1-1:1 No - lnc-ERI1-2:17 No - LINC01550:7 No - LINC00237:2 No - lnc-GPR27-1:1 No - RAB30-AS1:17 No - lnc-STX18-1:3 No - LINC02084:9 No - lnc-IFT20-4:1 No - AATBC:10 No - lnc-HECA-3:9 No - lnc-SCN11A-1:2 No - lnc-ATP1B3-1:2 No - LINC02480:9 No - lnc-GPR31-1:2 No - LINC01886:6 No - lnc-MTPAP-2:1 No - lnc-PZP-4:1 No - lnc-IGFL3-1:1 No - lnc-LRRC72-4:1 No - lnc-NDUFS6-5:3 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-ERCC6L2-4:2 No - lnc-CPSF7-2:1 Yes chr2R:8172364-8173613 lnc-ROR1-1:1 No - lnc-MAFK-2:1 No - PTCSC3:2 No - lnc-BMP6-106:129 No - lnc-KCTD6-1:7 No - lnc-CCL23-1:1 No - lnc-LRRK2-1:5 No - lnc-PLA2R1-1:1 No - lnc-MRPS30-1:1 No - lnc-MUC2-1:1 No - LINC01360:2 No - lnc-RALGAPA1-3:1 No - lnc-PCDH18-1:3 No - lnc-RAB11FIP2-2:1 No - lnc-GALNT18-3:1 No - lnc-CFAP74-2:4 No - LINC02525:28 No - lnc-HS1BP3-1:11 No - lnc-PPP1R26-2:1 No - lnc-SOX11-2:1 No - lnc-SH2D4A-1:1 No - lnc-GPRIN3-1:1 No - lnc-CD300C-2:1 No - lnc-B3GLCT-2:1 No - lnc-NUTM2E-1:9 No - lnc-FBXO31-13:1 No - lnc-BATF3-2:1 No - lnc-ZNF503-1:2 No - lnc-SLC39A11-1:28 No - lnc-LYPD6-1:2 No - LINC01612:7 No - lnc-ERLIN2-1:1 No - lnc-DDI1-2:1 No - lnc-JAM2-8:1 No - lnc-KIAA0930-1:1 No - lnc-IGFBP7-3:3 No - LINC02039:8 No - lnc-BMPER-2:1 No - lnc-VEGFC-1:2 No - lnc-CXorf51B-1:2 No - LINC00426:8 No - LINC01853:3 No - lnc-ST8SIA4-2:2 No - lnc-CCDC179-1:2 No - lnc-HS1BP3-1:2 No - lnc-SNAP47-1:1 No - lnc-NETO1-1:7 No - lnc-FOXD4L6-1:4 No - LINC01343:3 No - lnc-PRDM11-3:5 No - lnc-HAO2-2:7 No - lnc-DR1-1:2 No - lnc-SYT10-3:1 No - lnc-MECOM-1:1 No - LINC02153:29 No - lnc-TMPRSS15-1:1 Yes chr2R:7540111-7564435 lnc-SORCS3-6:2 No - lnc-ADGRA1-4:1 No - lnc-TRIM7-3:1 No - lnc-TUBGCP3-8:1 No - LINC01032:1 No - LINC01081:10 No - lnc-FOXB1-2:2 No - LINC02383:4 No - lnc-PRKX-4:1 No - lnc-PIK3C3-2:1 No - lnc-GPR39-14:1 No - lnc-RBM28-2:1 No - lnc-CYLC2-1:1 No - lnc-TRIM61-1:1 No - lnc-SORBS2-2:1 No - lnc-PRSS42-1:1 No - lnc-JPH1-2:3 No - lnc-PREX1-7:1 No - lnc-TCIM-1:2 No - LINC01351:15 No - lnc-LRRC38-4:1 Yes chr2R:22333500-22373109 lnc-ZNF676-1:2 No - lnc-CKAP2L-1:2 No - LINC00899:10 No - lnc-LSM11-5:1 No - lnc-TBC1D22A-3:1 No - lnc-GINS1-12:3 No - lnc-POU4F2-3:2 No - lnc-CACNA1E-2:1 No - LINC01487:8 No - lnc-RUBCN-2:7 No - lnc-STX18-1:5 No - CARMN:5 No - lnc-HMGB3-1:2 No - lnc-TRIM38-2:9 No - lnc-POLG-1:1 No - lnc-CPO-1:4 No - LINC00917:13 No - lnc-ALX1-2:2 No - lnc-CUL2-1:3 No - lnc-NPAP1-4:1 No - LINC02168:6 No - lnc-LRRC4C-1:1 No - lnc-TMEM174-1:4 No - lnc-PAPOLA-1:5 No - lnc-PDE1A-1:3 No - LINC01780:17 No - LINC02411:13 No - FMR1-AS1:20 No - lnc-SRRM4-2:1 No - lnc-PARP4-2:1 No - LINC01333:8 No - SIRLNT:9 No - lnc-MUC20-67:90 No - LINC01105:15 No - LINC00662:21 No - PCBP1-AS1:5 No - LINC00683:6 No - lnc-TRMT11-1:2 No - lnc-ANKRD9-2:1 No - lnc-NOM1-6:1 No - lnc-SEL1L-3:1 No - lnc-BORA-31:4 No - lnc-MTERF1-2:1 No - lnc-MRPL39-8:1 No - lnc-RNF20-2:1 No - lnc-PDCD10-1:1 No - LINC01526:1 No - lnc-TMEM185B-3:1 No - lnc-ZNF724-2:1 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-NDN-4:1 No - LINC01333:12 No - lnc-SIAH2-1:1 No - LINC00824:9 No - lnc-HS1BP3-1:3 No - lnc-CACNA1A-1:2 No - lnc-DDIAS-4:3 No - LINC01913:10 No - lnc-PDE6B-1:6 No - lnc-NTSR2-5:1 No - lnc-ASCL1-1:1 Yes chr3L:7760453-7763166 FLVCR1-DT:19 No - lnc-RMI1-3:1 No - lnc-HECW2-1:1 No - lnc-SLFN5-1:6 No - lnc-HPCAL1-1:5 No - PSD2-AS1:15 No - LINC02291:11 No - lnc-MLANA-1:1 No - lnc-HDGFL1-2:9 No - lnc-PAM-2:1 No - lnc-KCNJ3-1:2 No - lnc-PLCXD1-3:3 No - LINC01063:2 No - lnc-MYT1L-2:1 No - LINC01723:30 No - LINC02401:15 No - lnc-PPP4R1-6:2 No - GMDS-DT:95 No - lnc-NUPR2-3:2 No - lnc-TMEM161B-3:1 No - lnc-LCLAT1-2:2 No - lnc-RGS8-3:1 No - lnc-RUVBL1-1:2 No - lnc-RAB8B-1:1 No - LINC00917:12 No - LINC00114:1 No - LINC00964:10 No - LINC01077:1 Yes chrX:797090-801479 lnc-SLIT3-1:1 No - lnc-DNAJB6-7:6 No - lnc-AMPD2-1:1 Yes chr3L:6972750-6980044 lnc-C9orf66-6:1 No - lnc-LINGO2-2:1 No - lnc-DSG1-6:1 No - LINC02554:12 No - lnc-WNT5A-1:1 No - lnc-SLC24A5-1:2 No - lnc-NDC80-1:2 No - lnc-PTPDC1-2:1 No - lnc-KLHL31-2:3 No - lnc-C9orf50-2:1 No - lnc-PRELID3B-2:1 No - lnc-PDGFA-17:2 No - lnc-NTRK2-3:1 No - TTTY6:2 No - lnc-ADAMTS9-3:1 No - lnc-ZNF8-1:4 No - lnc-TRPM1-1:11 No - lnc-CMPK2-5:64 No - lnc-CCDC187-1:34 No - lnc-SI-3:1 No - LINC00333:2 No - lnc-GNAT3-2:1 No - lnc-JPH3-3:4 No - lnc-TYW1-14:2 No - lnc-KIAA1217-1:3 No - lnc-LRCOL1-3:5 No - lnc-CLEC16A-7:4 No - lnc-VPS8-2:4 No - lnc-LRRIQ1-1:1 No - lnc-SPATA31E1-1:2 No - lnc-USP6NL-7:1 No - LINC00500:1 No - LINC01905:18 No - lnc-STK35-4:5 No - lnc-PELI2-1:1 No - lnc-GLA-1:1 No - lnc-GUSB-2:1 Yes chr2L:8939725-8942105 lnc-YTHDF3-2:2 No - lnc-ABI1-3:3 No - lnc-WRN-5:2 No - lnc-JPH4-4:3 No - lnc-SULF2-4:1 No - lnc-PFKP-4:1 No - lnc-CBLB-5:2 No - lnc-ATXN3L-3:1 No - lnc-WAPL-1:1 No - lnc-CBLB-2:1 No - lnc-RTRAF-1:1 No - lnc-TRIP11-5:6 No - LINC01696:6 No - lnc-RAN-3:1 No - LINC02020:25 No - lnc-GRAMD4-2:5 No - PVT1:21 No - lnc-DRD5-10:12 No - lnc-NDN-4:2 No - lnc-PABPC3-1:2 No - lnc-C1orf198-1:1 No - lnc-BNIP1-3:5 No - LINC01105:16 No - lnc-MUSK-1:1 No - lnc-ZHX2-6:3 No - TMEM202-AS1:37 No - LINC02169:7 No - LINC01797:10 No - lnc-CPO-1:5 No - lnc-OR13C4-3:1 No - lnc-NETO1-1:5 No - LINC02027:23 No - LINC00882:24 No - lnc-NAALADL2-1:4 No - lnc-NDN-3:1 No - lnc-AKR1E2-5:3 No - lnc-BTC-7:1 No - lnc-FSIP1-4:3 No - lnc-MMP2-1:1 No - lnc-C9orf50-5:1 No - lnc-PROX1-1:1 No - lnc-PLPP3-4:1 No - lnc-SBDS-8:1 No - lnc-ANXA1-4:1 No - lnc-KCNA4-2:2 No - lnc-BAG1-2:8 No - lnc-TMEM105-2:2 No - lnc-LRP1B-4:1 No - LINC01947:5 No - lnc-MYEF2-3:1 No - lnc-TAOK3-1:7 No - lnc-NR4A3-1:6 No - LINC01571:8 No - lnc-TRIM39-1:1 No - LINC01862:8 No - lnc-RTL1-3:4 No - LINC01213:4 No - LINC00944:4 No - lnc-MTHFSD-62:2 No - lnc-PTGER3-1:1 No - lnc-PCGF5-1:1 No - lnc-ADGRL4-7:1 No - LINC00261:3 No - lnc-ARSD-2:1 No - LINC02219:9 No - lnc-GNB2-1:1 No - lnc-PTCD2-1:1 No - LINC02292:12 No - MAFTRR:8 No - lnc-ACVR2A-3:1 No - ACTN1-AS1:2 No - LINC02328:57 No - lnc-FAM19A5-18:1 No - LINC00690:7 No - LINC01058:2 No - LINC01871:11 No - lnc-CTAGE5-8:24 No - NUP50-DT:55 No - lnc-BCHE-1:1 No - LINC01197:16 No - lnc-OR10Q1-1:1 No - lnc-RIOK1-1:3 No - lnc-RPL24-2:2 No - lnc-DRD5-10:6 No - LINC01249:2 No - LINC01584:3 No - lnc-PTGS1-2:1 No - lnc-USP6NL-8:10 No - lnc-GPR183-47:14 Yes chr2L:20730416-20734309 lnc-ANXA1-2:2 No - lnc-TMEM132C-6:4 No - LINC02219:12 No - lnc-FBXO32-1:1 No - LINC02587:11 No - lnc-COL5A1-1:1 No - lnc-CYR61-2:1 No - lnc-HIVEP2-5:1 No - LINC00853:3 No - lnc-PRKN-21:12 No - C5orf64-AS1:12 No - LINC00494:2 No - lnc-CBR3-1:1 No - lnc-TMTC3-5:16 No - lnc-WWOX-1:1 No - lnc-CIDEA-2:1 No - lnc-BAG1-2:9 No - lnc-NR2F1-1:1 No - LINC02189:10 No - lnc-CDK17-3:1 No - lnc-HSCB-2:1 No - lnc-DAAM1-1:1 No - lnc-SGTB-4:3 No - lnc-DEC1-10:7 No - lnc-ZFP64-3:1 No - lnc-NAALADL2-1:16 No - lnc-CLDN10-1:1 No - lnc-SERPINB3-3:4 No - lnc-CERK-19:1 No - lnc-FSIP1-4:16 No - ZNF582-AS1:13 No - lnc-NR1I2-1:7 No - lnc-KLF6-2:1 No - LINC01634:5 No - lnc-MRPS14-1:1 Yes chrX:6653113-6654248 lnc-ADGRA3-1:1 Yes chr2L:14029262-14031539 lnc-CCDC179-1:4 No - LINC00659:1 No - LINC02385:5 No - lnc-NBPF3-2:2 No - TAPT1-AS1:8 No - LINC01763:13 No - lnc-POFUT2-3:2 No - lnc-NPAP1-1:1 No - lnc-THBS2-8:1 No - lnc-GCLC-1:6 Yes chrX:8102181-8116147 GMDS-DT:132 No - lnc-DAOA-14:6 No - LINC00603:1 No - lnc-ZFP42-2:2 No - LINC02482:23 No - LINC01940:15 No - LINC02071:4 No - lnc-C5orf49-2:5 No - LINC00442:9 No - LINC01075:5 No - LINC01622:8 No - LINC02413:15 No - LINC01016:10 No - lnc-SRP9-1:5 No - LINC00703:1 No - LINC01324:1 No - lnc-SLC16A8-2:1 Yes chr3R:5371795-5372397 lnc-SPRY2-132:2 No - lnc-CLN8-9:1 Yes chr2R:5702112-5705439 LINC01255:8 No - lnc-PAWR-5:1 No - lnc-ZNF248-1:1 No - LINC02253:9 No - lnc-SHOX2-1:1 No - lnc-TAF1L-2:1 No - lnc-ALDH1B1-13:6 No - LINC01304:10 No - lnc-ERRFI1-1:3 No - lnc-ZXDB-1:1 No - lnc-PRKD1-1:3 Yes chr3R:18303279-18314407 lnc-PIGM-3:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-C22orf42-2:1 No - lnc-FAM135A-1:1 No - lnc-PRMT6-2:3 No - MIR9-3HG:25 No - lnc-NR1D1-1:1 No - MIR3976HG:12 No - HDAC2-AS2:121 No - LINC02374:9 No - lnc-POLR1A-1:1 No - lnc-WSCD1-1:1 Yes chrX:15380371-15385441 lnc-FOXL1-2:3 No - LINC01880:20 No - lnc-ABCA8-2:1 No - lnc-C14orf177-1:1 No - lnc-ABCA1-1:2 No - LINC00922:7 No - lnc-SPATA31D1-4:35 No - lnc-C15orf59-1:1 No - lnc-DNAJC19-3:1 No - lnc-RREB1-2:1 No - lnc-ARHGAP28-10:4 No - lnc-DCUN1D1-6:2 No - PAXIP1-AS1:5 No - lnc-UTP11-2:3 No - lnc-H2BFS-3:1 No - lnc-PIGF-2:1 No - lnc-CADM2-3:2 No - LINC00685:1 No - lnc-CCDC125-6:6 No - lnc-IFI44-2:3 No - LINC00390:1 No - lnc-KLHL25-9:1 No - lnc-MAS1-1:1 No - lnc-MSX2-1:1 No - LINC00575:1 No - lnc-CCDC125-7:1 No - lnc-XCL2-2:1 No - lnc-BEST3-1:7 No - lnc-FAM169A-1:1 No - PVT1:46 No - LINC00662:32 No - lnc-PPP1R3B-2:3 No - lnc-KCMF1-1:1 No - lnc-MGAT1-4:6 No - lnc-GZMK-1:1 No - LINC00200:3 No - lnc-C12orf50-1:1 No - lnc-ADRA1D-2:2 No - lnc-DTHD1-3:3 No - lnc-CADM2-4:1 No - MINCR:3 No - LINC01374:15 No - LINC02176:4 No - lnc-VAV3-1:4 No - lnc-NDUFV3-2:5 No - LINC01795:5 No - lnc-APOL1-2:1 No - lnc-SMIM11A-1:1 No - lnc-IRX3-80:20 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-HS1BP3-1:1 No - TP53TG1:8 No - lnc-CACNA1A-1:3 No - LINC02552:17 No - lnc-JMJD1C-1:3 No - lnc-RYK-1:1 Yes chr2R:13055246-13079539 lnc-CCDC13-1:1 No - LINC01727:14 No - lnc-SMPDL3A-1:1 No - lnc-RPS29-6:1 No - lnc-NUDT12-3:1 No - lnc-CDH10-1:1 No - lnc-TLR4-9:4 No - lnc-AGT-1:1 No - lnc-NDFIP2-8:1 No - RPS6KA2-AS1:1 No - LINC01676:30 No - GATA3-AS1:7 Yes chr3R:8147368-8181444 lnc-SLITRK5-2:1 No - LINC00517:2 No - lnc-TPO-1:1 No - lnc-SOD2-1:1 No - lnc-CRYAA-2:1 No - lnc-PIWIL4-1:2 No - MAPKAPK5-AS1:11 No - lnc-ISOC1-1:1 No - ZMIZ1-AS1:14 No - LINC02117:4 No - lnc-CFAP46-3:6 No - lnc-C1orf198-2:1 No - WDR86-AS1:9 No - LINC00426:18 No - lnc-PLCH1-3:1 No - lnc-PRELID2-1:2 Yes chr2L:6046516-6048706 lnc-TOX3-1:19 No - lnc-PGPEP1L-14:1 No - lnc-PAK1-1:1 Yes chr3R:6350896-6361614 lnc-ASB7-4:4 No - lnc-MAP1LC3B2-6:1 No - LINC02293:22 No - lnc-LSR-1:4 No - lnc-ETDB-1:9 No - lnc-CLDN20-3:1 No - EDRF1-AS1:34 No - LINC01227:4 No - LINC01432:3 No - lnc-FAM71A-1:2 No - lnc-LINS1-7:1 No - lnc-UBXN4-4:1 No - lnc-MAP3K4-1:1 No - LINC02286:14 No - lnc-PPP4R1-2:3 No - lnc-CRYBA4-52:85 No - LINC01493:12 No - TTTY22:1 No - lnc-TUBB8-1:1 No - lnc-SHQ1-1:1 No - lnc-EBF1-2:1 No - lnc-SLC25A13-1:6 No - lnc-NUFIP1-1:2 No - lnc-GPATCH2L-1:4 No - LINC02059:7 No - lnc-TNFAIP3-1:3 No - LINC00964:11 No - lnc-UMODL1-4:1 No - PCAT6:8 No - lnc-VWC2-1:1 No - lnc-MCUR1-1:2 No - lnc-RNF224-1:1 No - lnc-NR2F1-4:2 No - lnc-VSTM2B-2:1 No - lnc-PPID-1:1 No - NDST1-AS1:11 No - LINC00472:5 No - LINC01515:12 No - lnc-IRX3-80:63 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-WDR26-1:2 Yes chr2L:16309292-16310726 LINC02106:13 No - lnc-EMX2-5:2 No - lnc-GATA3-5:1 No - LINC01307:3 No - lnc-NRXN1-2:2 No - LINC01808:13 No - lnc-ACBD6-3:1 No - lnc-LINC02203-7:3 No - lnc-GRXCR1-5:1 No - LINC01806:25 No - lnc-PRND-1:1 No - lnc-TPST1-1:2 No - LINC02520:35 No - LINC00964:4 No - lnc-SNRPN-5:5 No - LINC01341:17 No - lnc-FBXO8-6:2 No - lnc-METTL15-2:2 Yes chr3R:10696647-10698976 lnc-MGMT-6:1 No - lnc-BRINP1-1:5 No - LINC00954:9 No - LINC02144:3 No - OLMALINC:10 No - MIR3976HG:2 No - lnc-NPHP3-ACAD11-1:6 No - lnc-CRBN-1:2 No - lnc-COL28A1-1:2 No - lnc-SGCE-1:1 No - lnc-FOXJ1-1:1 Yes chr3L:8411851-8415910 lnc-ZFP42-2:7 No - lnc-VKORC1L1-5:9 No - LINC02362:24 No - SLC25A25-AS1:7 No - lnc-GTF2B-15:10 No - lnc-C5orf63-1:2 No - LINC01724:4 No - lnc-UBR3-4:2 No - LINC01241:15 No - lnc-CMKLR1-1:1 No - lnc-FAM153C-1:1 No - lnc-TGFBR2-3:1 No - LRRC8C-DT:36 No - lnc-ZNF644-1:7 No - lnc-METRNL-11:1 No - lnc-MTR-1:2 No - lnc-MFSD4A-2:1 No - OLMALINC:11 No - LINC00656:1 No - lnc-LBR-1:1 No - lnc-VPS8-2:2 No - lnc-PRSS3-1:1 No - lnc-SNRPB2-2:1 No - lnc-FAH-1:1 No - lnc-PRKACB-2:1 No - LINC00661:18 No - lnc-IGFBP7-5:11 No - lnc-ANKRD20A4-14:1 No - lnc-GRIA3-1:2 No - lnc-BOD1-1:23 No - lnc-CD36-12:2 No - lnc-CSMD1-1:8 No - lnc-CTDSP2-1:1 No - LINC01934:17 No - lnc-LYZL2-11:1 No - TTTY1B:1 No - lnc-TPBG-3:1 No - lnc-PRPF4-1:1 No - lnc-SUCLG2-1:1 No - lnc-AURKA-1:2 No - lnc-TDRD15-1:2 No - lnc-FAM78A-2:1 Yes chr2L:10250737-10251714 lnc-NEIL3-2:3 No - lnc-ZNF730-2:1 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-P2RY1-3:4 No - lnc-MBOAT1-2:3 No - lnc-CADM1-4:1 No - lnc-FKBP14-2:1 No - LINC01605:14 No - lnc-ERP44-3:7 No - lnc-NR2E3-1:1 No - LINC002481:12 No - lnc-BTG3-1:1 No - lnc-ICOSLG-1:5 No - lnc-OAF-4:10 No - LINC00635:18 No - lnc-TMEM229A-2:2 No - lnc-XRCC2-3:1 No - lnc-TBX2-1:1 No - lnc-TUBGCP3-6:6 No - lnc-RPL7-2:2 No - lnc-EMX2-5:10 No - LINC00917:2 No - LINC01781:18 No - PRKAG2-AS1:7 No - lnc-LNPEP-8:2 No - FAM160A1-DT:28 No - lnc-NDUFV2-1:5 No - lnc-RUVBL1-1:1 No - lnc-REG1B-3:1 No - LINC00838:4 No - CSE1L-AS1:3 No - LINC00887:1 No - lnc-IRF8-2:1 No - lnc-TUBB1-1:4 Yes chr2R:11159086-11217394 SPATA3-AS1:10 No - lnc-TNKS2-1:1 No - LINC01722:6 No - lnc-FOXA2-3:5 No - lnc-FAM76B-1:1 No - lnc-C9orf47-1:1 No - LINC02427:21 No - lnc-ALG2-1:1 No - LINC01020:3 No - lnc-HEATR6-1:10 No - lnc-BATF3-2:3 No - lnc-MAPK6-10:1 Yes chr2R:11619479-11640941 LINC00278:1 No - lnc-PPP1R3D-2:2 No - lnc-FOXD4L3-1:1 No - LINC01176:13 No - lnc-METTL14-3:19 No - lnc-NCOR2-1:1 No - LINC02470:23 No - LINC01523:1 No - lnc-GPR39-2:3 No - LINC02353:3 No - LINC02357:9 No - lnc-PARP11-2:1 No - lnc-CTSO-1:4 No - GMDS-DT:76 No - lnc-IGLL1-1:58 No - lnc-CELF4-5:1 No - lnc-FKBP3-1:5 No - lnc-PRR34-4:2 No - lnc-KCNS3-4:1 No - lnc-FKBP3-1:4 No - lnc-ASB7-4:3 No - lnc-GNG5-1:3 No - LINC00662:41 No - lnc-TXLNB-2:2 No - ST3GAL5-AS1:5 No - lnc-LRCH2-1:2 No - lnc-MCUR1-4:1 No - LINC00837:1 No - LINC00687:7 No - LUCAT1:15 No - CALML3-AS1:13 No - lnc-ZNF227-1:1 No - lnc-LRRC4C-5:1 No - lnc-SS18-1:1 No - lnc-F8A3-1:1 No - lnc-UGT2B15-1:3 No - lnc-RAI14-1:1 No - lnc-SLC35G3-1:2 No - LINC02006:6 No - LINC02286:17 No - lnc-CDH16-1:2 No - lnc-ATP13A4-4:1 No - PWRN1:4 No - lnc-GDF10-2:4 No - lnc-PMP22-2:3 No - LINC01374:19 No - lnc-LRCH1-5:1 No - LINC00313:17 No - LINC00423:2 No - lnc-ANGPTL2-2:3 No - MIR3976HG:8 No - lnc-SEPT9-1:4 No - lnc-CCNI-1:1 No - MAPKAPK5-AS1:14 No - lnc-CDH10-5:2 No - lnc-EBF3-6:1 No - LINC02121:5 No - lnc-BEND7-5:3 No - lnc-ABCA5-1:1 No - LINC02483:5 No - lnc-KCNS3-12:1 No - lnc-MAGEE2-1:1 No - lnc-HS6ST1-2:1 No - LINC01428:3 No - lnc-ZDHHC7-1:1 No - LINC00702:13 No - lnc-PIGF-3:1 Yes chr3R:5591763-5595356 LINC01829:45 No - LINC01122:13 No - AATBC:4 No - KIF25-AS1:3 No - lnc-CES1-2:1 No - LUCAT1:16 No - lnc-ROBO2-1:1 No - lnc-RASSF2-5:3 No - lnc-ACP1-3:1 No - lnc-CDC5L-1:1 No - lnc-DNAAF5-3:24 No - lnc-RGPD4-3:2 No - lnc-YWHAQ-1:1 No - lnc-TRMT61B-1:5 No - lnc-ZNF485-68:10 No - lnc-C6orf223-1:1 No - lnc-MRPS27-2:1 No - lnc-FAAH2-1:11 No - lnc-LRCOL1-3:8 No - lnc-FAM72A-1:1 No - lnc-RUBCNL-3:1 No - lnc-UTP23-2:1 No - lnc-GPBP1-3:1 No - lnc-REEP5-1:1 No - lnc-FAM43A-1:1 No - lnc-RADIL-3:1 No - lnc-PTPN14-2:1 No - lnc-NUDT4-10:4 No - lnc-WRAP73-1:1 No - lnc-ZFHX3-27:13 No - EDRF1-AS1:28 No - lnc-HES1-2:4 No - lnc-HSPH1-1:3 No - LINC00851:6 No - lnc-PPP4R1-9:1 No - lnc-ZMAT4-2:1 No - lnc-ACP1-9:3 No - lnc-RNASEH1-12:6 No - lnc-ERC1-1:3 No - lnc-CHD9-3:3 No - lnc-MC3R-1:1 No - lnc-HOMER1-2:1 No - lnc-ZNF736-1:3 No - lnc-USP14-1:1 No - LINC01493:16 No - lnc-SPP2-1:1 No - TTTY19:1 No - lnc-DYDC2-1:1 No - lnc-PLP1-1:1 No - lnc-TMEM70-1:5 No - lnc-IRS4-3:1 No - TPT1-AS1:18 No - lnc-SBDS-9:1 No - lnc-AJAP1-3:2 No - lnc-MGAT1-4:7 No - lnc-CLYBL-1:1 No - lnc-ATP10A-2:1 No - lnc-CRABP2-1:2 No - SNHG17:14 No - lnc-RNLS-1:1 No - lnc-PRAG1-3:9 No - lnc-NXPH2-4:1 No - lnc-ST3GAL4-8:1 No - LINC02423:10 No - lnc-BNIP3-4:1 No - LINC00518:4 No - lnc-ATG4C-2:1 No - lnc-FBXO31-12:5 No - lnc-NEMF-1:1 No - lnc-FER-1:1 No - lnc-POLE4-8:7 No - lnc-AURKA-1:1 No - LINC02413:14 No - LINC01166:3 No - lnc-FGF12-1:1 No - lnc-HRCT1-5:3 No - lnc-MYCN-3:1 No - lnc-TUBGCP3-1:1 No - lnc-MPHOSPH8-11:3 No - lnc-COIL-1:1 No - lnc-SMDT1-3:44 Yes chr2R:18094940-18101031 LINC02165:8 No - lnc-COG2-1:1 No - lnc-SAFB-1:1 No - lnc-PPP1R42-1:13 No - lnc-GDAP2-1:9 No - lnc-PAXIP1-23:1 No - lnc-SLC44A3-1:10 No - lnc-DNAJC19-2:2 No - lnc-PRR25-1:1 No - lnc-SPAG1-3:4 No - lnc-TBX3-1:1 No - lnc-TYW1-12:1 No - lnc-HERC6-2:4 No - lnc-CTAGE5-8:8 No - LINC01248:12 No - lnc-SEPT7-1:4 No - lnc-SYF2-1:3 No - lnc-KIF25-1:1 No - lnc-VPS8-2:10 No - lnc-FOXD4L6-1:13 No - lnc-ZBTB18-2:1 No - lnc-COPS8-17:4 No - lnc-SHPRH-1:2 No - lnc-VPS18-1:5 No - lnc-PAM-5:1 No - lnc-IGFBP7-5:1 No - lnc-MPLKIP-2:1 No - lnc-ZNF516-4:10 No - lnc-SAXO2-2:2 No - lnc-KLF8-1:1 No - LINC00605:4 No - lnc-STAP1-13:2 No - lnc-CNIH1-1:2 No - lnc-RPS4Y1-2:2 No - TTTY14:17 No - lnc-LYPD5-1:2 No - LINC01615:6 No - LINC02384:46 No - lnc-TRAK1-1:1 Yes chr2L:7037823-7056010 lnc-FBXO15-3:11 No - lnc-B3GLCT-1:3 No - lnc-FNDC1-1:1 No - lnc-RNF32-53:2 No - lnc-PYDC2-1:5 No - lnc-CA2-1:1 No - LINC01774:3 No - lnc-B3GNT10-5:1 No - LINC00400:2 No - lnc-MNAT1-2:1 Yes chr2R:7419350-7434872 lnc-MAGEE2-1:2 No - lnc-AKR1E2-5:4 No - LINC00426:23 No - lnc-SAMD11-2:2 No - LINC00703:5 No - lnc-TMPRSS15-4:1 No - lnc-CIB4-1:1 No - lnc-SGCE-1:4 No - lnc-BOD1-1:17 No - lnc-OR6B2-1:1 Yes chr3R:22027709-22029393 lnc-SRY-5:2 No - lnc-NFE2L2-3:1 No - LINC02369:18 No - lnc-MRAP2-1:1 No - lnc-SSTR4-2:2 No - lnc-ABHD2-1:3 No - LINC00955:2 No - lnc-LMO2-1:1 No - lnc-HOOK1-2:1 No - RNASEH1-AS1:6 Yes chr2R:7931054-7932380 lnc-TDRD3-19:3 No - lnc-GRM3-2:1 No - lnc-MAP1LC3B2-28:8 No - lnc-CRP-2:6 No - lnc-NKAP-4:7 No - lnc-ADGRB3-3:2 No - HCG14:1 No - LINC01628:3 No - LINC01571:9 No - lnc-TAOK1-8:3 No - lnc-ANXA1-1:3 No - lnc-TUSC5-1:1 No - lnc-PCLO-1:1 No - lnc-ASTN2-1:1 No - lnc-WRB-2:4 Yes chr3R:24319000-24328619 BOLA3-AS1:12 No - lnc-CNTNAP4-3:1 Yes chr3L:12146519-12156990 lnc-CIB1-134:1 No - BOK-AS1:8 No - lnc-RIOK1-1:5 No - LINC01121:1 No - lnc-ARSJ-1:5 No - lnc-SFMBT2-2:2 No - lnc-SOD3-4:1 Yes chr3R:4422483-4429335 lnc-ZDHHC11-1:1 Yes chr2L:7782865-7786061 lnc-FKBP3-1:6 No - lnc-ZNF674-1:12 Yes chr2L:6677835-6684364 lnc-AMY1B-1:2 No - lnc-CTSO-1:3 No - LINC01605:15 No - lnc-PKNOX1-1:1 No - lnc-PLXDC2-1:2 No - lnc-C9orf50-1:1 No - lnc-C9orf16-1:1 No - lnc-PIEZO2-1:1 No - LINC02521:5 No - lnc-MOGAT1-1:1 No - lnc-TRIML2-14:2 No - lnc-ZPBP-2:1 No - lnc-IL5RA-4:1 No - LINC01229:8 No - lnc-ZNF664-1:1 No - lnc-MTHFSD-62:3 No - lnc-LRRC4C-4:1 No - lnc-MEX3B-1:1 No - ST3GAL5-AS1:13 No - lnc-PTK2B-6:2 No - LINC01351:5 No - lnc-FRG1-11:4 No - lnc-TEAD3-1:1 No - lnc-TTC14-3:1 No - lnc-LIN28B-3:1 No - lnc-PLCG2-1:5 Yes chrX:16350315-16356482 lnc-NAA50-2:1 No - lnc-COL1A2-1:1 No - lnc-CFAP100-4:2 No - LINC02290:25 No - LINC00924:12 No - lnc-SIAH2-1:4 No - lnc-ZC3H12D-8:1 No - LINC02289:32 No - lnc-OPN5-1:1 No - lnc-FOXN2-1:1 No - LINC00635:36 No - lnc-SHARPIN-1:1 No - lnc-SNRPN-8:103 No - lnc-THBS1-1:6 No - LINC01483:9 No - LINC01298:2 No - lnc-CLVS2-2:1 No - LINC01229:14 No - lnc-RAB4A-1:1 No - LINC02023:3 No - lnc-DUT-2:1 No - lnc-C10orf142-1:1 No - lnc-SPATA31A6-4:1 No - LINC00363:4 No - LINC02395:20 No - lnc-VPS8-2:7 No - lnc-FAT3-4:2 No - lnc-RPS24-3:18 No - lnc-GATA3-6:1 No - MIR3976HG:7 No - lnc-USP6NL-7:2 No - lnc-GPR26-2:1 No - lnc-CILP-1:1 No - lnc-FAM160A1-1:2 No - lnc-SERPINB3-3:1 No - G2E3-AS1:12 No - lnc-EMX2-5:7 No - lnc-TSPAN13-7:1 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-KHDRBS3-3:1 No - lnc-ADCY9-1:6 No - lnc-TBC1D19-2:1 No - HOXA11-AS:3 No - LINC01362:1 No - lnc-ASCL4-4:1 No - LINC01852:18 No - lnc-SLC25A13-1:5 No - LINC01934:21 No - lnc-EGFL7-1:1 No - GMDS-DT:128 No - lnc-ANKRD20A2-18:1 No - lnc-TNS3-2:9 No - lnc-SELENOP-2:2 No - lnc-MARK1-2:1 No - lnc-NAALADL2-1:13 No - lnc-SLFNL1-1:1 No - lnc-DNAH8-2:3 No - PRKCQ-AS1:56 No - SRP14-AS1:21 No - lnc-LYZL1-4:1 No - lnc-MBL2-2:3 No - lnc-HHIPL2-1:1 No - lnc-DHRS7-1:3 No - lnc-KLHL25-9:2 No - TM4SF1-AS1:5 No - LINC01506:2 No - lnc-ECI2-2:3 No - lnc-PCTP-2:1 No - IGFBP7-AS1:9 No - LINC01569:15 No - lnc-PLAT-1:7 No - lnc-AHSP-5:9 Yes chr2L:18695664-18698571 lnc-SNTG2-4:2 No - lnc-LCP1-1:1 No - lnc-PPP1R14C-1:1 No - lnc-CMPK2-5:2 No - LINC02519:30 No - lnc-RPS24-3:10 No - lnc-ASCL1-2:1 Yes chr3L:7760453-7763166 lnc-ZNF485-68:14 No - lnc-TAF4B-3:1 No - LINC01102:14 No - lnc-OR4F29-2:1 No - lnc-DHX37-5:5 No - LINC01197:12 No - lnc-MYCN-6:2 No - lnc-MRPL39-4:2 No - LINC01105:13 No - lnc-PREX1-5:1 No - RAB30-AS1:18 No - lnc-PDGFA-17:3 No - LINC01626:3 No - lnc-STK35-1:1 No - lnc-TMEM174-1:3 No - lnc-TMEM18-4:1 No - lnc-SLC38A2-1:3 No - LINC00311:2 No - LINC01763:12 No - lnc-ETAA1-4:4 No - lnc-CALN1-1:6 No - LINC01717:10 No - RALY-AS1:9 No - lnc-ZNF507-3:1 No - lnc-FAM103A1-2:1 No - lnc-SGCG-3:2 No - lnc-MTUS2-2:1 No - lnc-STMP1-8:8 No - lnc-FAM120B-3:2 No - lnc-FAM182B-5:1 No - lnc-TMEM18-11:1 No - lnc-ITGA11-2:3 No - LINC01523:3 No - lnc-DAOA-14:4 No - lnc-FTMT-2:1 No - lnc-KATNAL2-1:1 No - lnc-CARD19-4:1 No - lnc-ASTN1-1:2 No - lnc-GAPVD1-2:3 No - PWRN1:24 No - lnc-ABI3-2:3 No - lnc-TGFBRAP1-11:3 No - lnc-TK2-4:1 No - FLVCR1-DT:16 No - lnc-FSIP1-6:2 No - lnc-ELF1-1:1 No - lnc-BCKDHB-1:3 No - LINC01449:1 No - MIR3663HG:6 No - LINC02024:11 No - LINC00702:5 No - lnc-NEIL3-6:12 No - LINC00408:1 No - lnc-CCKAR-1:4 Yes chrX:15934495-15940451 lnc-SLC44A5-4:1 No - LINC02480:10 No - lnc-ZIC1-5:2 No - lnc-PET117-1:1 No - DUBR:9 No - lnc-RNASEH1-1:12 Yes chr2R:7931054-7932380 LINC01257:2 No - lnc-BCL11B-1:3 No - lnc-ZC3H11B-3:1 No - lnc-C3orf30-3:1 No - lnc-EVX1-14:5 No - lnc-HS1BP3-1:8 No - lnc-USP31-4:1 No - LINC01365:5 No - lnc-C4orf46-1:1 Yes chrX:13161714-13189164 lnc-MEGF10-1:1 No - lnc-SDSL-5:1 No - LINC00926:18 No - LINC01304:13 No - lnc-HOOK1-3:1 No - lnc-CDH5-7:1 No - lnc-GMDS-4:1 No - lnc-MAPK6-11:1 No - lnc-FBXW7-1:1 No - lnc-SMIM10L2A-1:1 No - LINC01350:4 No - lnc-GPT2-1:1 No - lnc-NUTM2B-1:8 No - LINC02546:11 No - lnc-TMEM132C-6:2 No - LINC01060:8 No - lnc-TPTE-1:8 No - LINC00319:16 No - LINC01837:23 No - lnc-PDGFD-1:1 No - lnc-SYNCRIP-1:1 No - TNKS2-AS1:2 No - UCA1:5 No - lnc-DLL1-3:1 No - lnc-ZNF567-1:1 No - lnc-ALDH7A1-2:1 No - LINC01423:3 No - lnc-MFSD4B-1:4 No - LINC01569:19 No - lnc-APBB1IP-1:5 No - LINC01224:39 No - LINC00919:1 No - LINC02208:21 No - LINC01351:13 No - lnc-RTL6-2:2 No - lnc-OARD1-1:10 No - lnc-PLEKHG6-3:1 No - LINC00964:15 No - lnc-VPS18-1:2 No - lnc-CANX-1:8 No - lnc-SLC12A7-1:2 No - LINC01744:8 No - LINC01018:10 No - lnc-C3orf30-6:1 No - lnc-BANP-14:5 No - lnc-PTPRT-1:1 No - lnc-AQP11-2:1 No - lnc-PLCXD3-1:1 No - lnc-APOA4-1:1 No - lnc-BMP7-2:1 No - TPT1-AS1:30 No - lnc-NOVA1-1:1 No - lnc-PPP4R1-1:1 No - LINC01049:6 No - LINC02281:11 No - LINC01142:5 No - lnc-HMX1-6:1 No - LINC01859:19 No - lnc-SRCIN1-1:1 Yes chrX:20469955-20510694 lnc-SCP2D1-1:7 No - lnc-LYPLAL1-1:2 No - lnc-SLFN5-1:4 No - lnc-C6orf118-11:1 No - lnc-FMN1-2:3 No - lnc-MEI4-3:3 No - LINC01833:30 No - lnc-STK39-3:2 No - lnc-CMPK2-9:1 No - LINC01584:4 No - LINC00923:10 No - lnc-KIAA1024-2:1 Yes chrX:11850909-11852530 CCDC18-AS1:25 No - lnc-RAB40AL-1:2 No - lnc-IRX4-4:1 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-TOMM20-2:10 No - lnc-ID4-1:1 No - lnc-CEBPB-11:3 No - LINC00926:4 No - lnc-ETV3-2:2 No - lnc-PLPP3-2:6 Yes chr2R:9400531-9413463 LINC01596:5 No - LINC01605:12 No - lnc-C16orf78-2:2 No - LINC01963:8 No - lnc-BMP6-106:137 No - lnc-ANKRD20A4-12:3 No - lnc-RP9-2:1 No - lnc-MSI2-1:1 No - lnc-TM2D2-2:1 No - lnc-FAM217A-1:1 No - LINC02395:13 No - lnc-IWS1-1:4 No - lnc-SLC16A7-9:1 No - LINC01689:14 No - lnc-ATP6AP2-2:1 No - lnc-CAND1-1:1 No - lnc-AGGF1-2:1 Yes chr3R:30435177-30443599 lnc-FANCM-1:1 No - lnc-EDEM3-2:1 No - lnc-GPR33-5:1 No - lnc-CDH8-2:1 No - lnc-ARF5-5:3 No - GAS6-DT:19 No - LINC00944:7 No - LINC00102:1 No - lnc-CPEB4-4:3 No - lnc-NKD1-3:3 No - LINC01678:12 No - lnc-AFG3L2-1:1 No - lnc-LRP8-3:1 No - LINC02580:13 No - LINC02341:9 No - lnc-FAM160A1-3:2 No - lnc-GPR132-1:2 No - lnc-MRPL39-10:1 No - lnc-MUC20-6:6 No - lnc-PARPBP-3:1 Yes chrX:2076966-2078455 lnc-SLC9A2-1:1 No - lnc-UBXN4-3:1 No - lnc-SOD1-2:1 No - lnc-UBE2E3-3:1 No - LINC00408:2 No - LINC01450:1 No - lnc-ZNF30-3:1 No - lnc-DFFB-4:1 No - lnc-TMEM18-3:2 No - lnc-CHD2-4:8 No - lnc-NOM1-3:1 No - BDNF-AS:14 No - lnc-PWP2-2:3 No - lnc-LRP5-1:4 No - lnc-FRMD1-3:1 No - lnc-ID3-3:1 No - LINC02471:8 No - lnc-GPR39-2:4 No - lnc-FAM84B-1:1 No - lnc-NAIF1-1:2 No - lnc-RAB23-1:1 No - lnc-NAA35-15:1 No - lnc-MACROD1-1:1 No - lnc-TNFAIP6-2:4 No - LINC00999:9 No - LINC02583:32 No - DSCR9:10 No - lnc-VSX1-1:3 No - lnc-PITRM1-7:2 No - lnc-BUB3-4:17 No - lnc-RAP2A-1:1 No - RBM26-AS1:13 No - lnc-EPHA7-2:1 No - lnc-PLPP7-1:1 No - lnc-ZNF804A-2:1 No - lnc-CCNK-2:1 No - lnc-RBM33-1:4 No - lnc-NUTM2B-1:6 No - WDR86-AS1:10 No - LINC01013:16 No - lnc-TMEM132B-4:4 No - lnc-HERPUD2-1:2 No - lnc-CENPJ-2:1 No - lnc-AKR1C2-11:1 Yes chr3L:11620535-11626125 OIP5-AS1:24 No - lnc-COBL-1:1 No - lnc-TET2-5:2 No - lnc-TLR5-1:1 No - LINC00426:21 No - LINC02018:23 No - lnc-CYP7A1-1:3 No - lnc-DCTD-8:1 No - lnc-TRIB2-2:1 No - lnc-P2RX7-2:1 No - lnc-EFNA5-3:1 No - lnc-ZEB2-3:1 No - lnc-CHD2-2:4 No - lnc-VSTM2B-1:2 No - lnc-ATP6AP2-2:3 No - lnc-CRHBP-1:1 No - MIR3663HG:8 No - lnc-COL4A2-3:1 No - lnc-PGAM1-1:2 Yes chrX:13619276-13624408 lnc-GLIPR1L1-1:1 No - lnc-LURAP1L-8:2 No - lnc-RHOXF1-3:13 No - lnc-IGFL1-1:6 No - lnc-CARD19-4:2 No - lnc-RUNX3-4:1 No - lnc-FSCB-1:7 No - LINC01765:11 No - lnc-HSF2-4:3 No - LINC00892:4 No - lnc-FAT3-2:5 No - lnc-MYB-3:1 Yes chr3L:1862881-1865240 LINC01679:9 No - lnc-MFSD8-5:1 No - lnc-RGL4-4:2 No - lnc-VLDLR-2:1 No - lnc-NPVF-3:1 No - lnc-MINOS1-1:1 No - lnc-CD83-5:1 No - lnc-ADAMTS2-1:2 No - lnc-SOD2-2:5 No - GAPLINC:6 No - lnc-GRK3-1:1 No - lnc-FOXD4L5-37:2 No - PANTR1:45 No - lnc-HNF1A-1:2 No - lnc-EMP3-1:1 No - lnc-SLC15A4-8:1 No - lnc-RP9-1:1 No - lnc-PSMD7-7:3 Yes chr4:501810-540874 lnc-GYPA-1:2 No - lnc-IL5RA-3:1 No - LINC00280:1 No - lnc-BCL3-1:2 No - ZBED5-AS1:4 No - LINC01761:3 No - lnc-ZNF208-1:1 No - lnc-POTEB-4:1 No - lnc-NBEA-3:1 No - lnc-RAB40AL-1:1 No - lnc-HPS4-2:1 No - lnc-PNRC2-1:1 No - lnc-SLC39A11-10:52 No - GASAL1:21 No - lnc-POLR1A-8:2 No - LINC00424:6 No - LINC02161:3 No - lnc-SHQ1-1:2 No - lnc-MAML3-3:1 No - lnc-RAB1A-1:4 No - lnc-WFS1-1:1 No - lnc-MOXD1-1:1 No - LINC00222:2 No - lnc-C5orf63-2:1 No - lnc-ENAH-1:1 No - lnc-TRIM36-1:1 No - lnc-VAPA-1:1 No - LINC02063:3 No - lnc-CRP-2:7 No - LINC01515:8 No - lnc-NIFK-2:6 No - lnc-DEC1-4:1 No - lnc-VGLL3-2:1 No - lnc-GATB-2:3 No - LINC02558:5 No - lnc-PTPRN2-2:1 No - lnc-GLI2-1:1 No - lnc-WASHC5-2:5 No - lnc-FBXO8-5:3 No - lnc-KLF15-2:6 No - LINC02579:9 No - lnc-SBK2-1:1 No - LINC00472:49 No - lnc-ZNF131-3:1 No - lnc-RAB3GAP2-2:1 No - LINC00906:3 No - LINC01013:1 No - lnc-BMP2-2:1 No - lnc-ABCA13-2:1 No - lnc-NTRK3-2:1 No - lnc-RGMA-9:2 No - lnc-CCR8-1:1 No - LINC00911:4 No - SNRK-AS1:1 Yes chr2R:14235787-14239703 LINC02318:15 No - EXTL3-AS1:13 Yes chr2R:19129589-19133706 LINC01182:14 No - lnc-ZNF131-2:11 No - lnc-PFKFB3-1:1 No - LINC00261:13 No - lnc-ADSS-2:1 No - lnc-FAM172A-7:2 No - lnc-GNAQ-2:3 No - lnc-DTL-1:1 No - lnc-CYP7B1-3:1 No - PWRN1:12 No - lnc-CPXM2-1:2 No - lnc-ADGRL3-2:3 No - lnc-GDF10-1:1 No - LINC02281:7 No - lnc-ALDH1B1-2:1 No - lnc-LRRC61-2:1 No - lnc-ARL4A-54:9 No - LINC01989:16 No - lnc-SOD2-2:1 No - lnc-SPAG16-3:1 No - lnc-SLC17A6-2:1 No - lnc-NEIL3-3:4 No - lnc-USP38-1:1 No - lnc-IL6-3:6 No - lnc-BCKDHB-1:9 No - LINC01878:13 No - lnc-RNF187-1:2 No - lnc-TMEM238L-2:1 No - lnc-KCND3-1:1 No - lnc-MRPL33-1:7 No - lnc-TMEM8A-1:1 No - lnc-MSX2-3:1 No - lnc-USP53-5:1 No - lnc-ENPP1-3:2 No - LINC02188:10 No - lnc-DOK7-3:1 No - LINC00395:1 No - LINC01767:23 Yes chr2R:9400531-9413463 LINC02200:8 No - lnc-MAGI1-1:1 No - lnc-LRRTM1-3:1 No - LINC00210:2 No - lnc-CA5A-4:3 No - lnc-ZNF723-5:1 No - CARMN:13 No - lnc-TK2-4:2 No - lnc-GTF2B-15:11 No - lnc-FAM20C-7:1 No - lnc-EBF1-1:1 No - lnc-MED10-9:2 No - lnc-TLE1-15:1 No - lnc-LAMA4-1:2 No - lnc-VSX1-1:8 No - lnc-PTPRD-5:2 No - lnc-PFDN4-1:1 No - LINC01723:35 No - LINC02476:17 No - lnc-LRP5L-2:1 No - LINC01732:9 No - LINC00307:1 No - lnc-ACTR2-3:5 No - lnc-PI3-1:4 No - lnc-C6orf118-1:1 No - MANCR:32 No - lnc-BPIFA3-1:1 No - lnc-ZNF728-1:2 No - LINC02494:9 No - LINC01927:9 No - lnc-LAMA4-1:4 No - lnc-ICOS-1:1 No - LINC02271:5 No - lnc-HIVEP1-2:2 No - lnc-SCIMP-1:3 No - lnc-CNTRL-2:2 No - lnc-UXS1-1:1 No - lnc-USP31-3:2 No - lnc-ADCY2-5:1 No - lnc-BOD1-1:26 No - LINC00320:4 No - lnc-PRDM9-1:1 No - LINC00353:2 No - lnc-NUMB-1:1 No - FAM160A1-DT:25 No - lnc-SBDS-6:1 No - lnc-ITM2C-1:1 No - LINC02034:7 No - lnc-SLC39A11-1:26 No - lnc-KY-2:4 No - lnc-CYSTM1-1:7 No - lnc-PROP1-2:1 No - lnc-BTG2-2:2 No - LINC02104:13 No - lnc-DPH5-1:1 No - SGO1-AS1:6 No - lnc-RAB1A-1:1 No - lnc-VSTM2B-3:1 No - LINC02086:20 No - lnc-CAPN13-2:3 No - lnc-FAM49A-5:2 No - lnc-TES-1:2 No - LINC02221:6 No - lnc-C5orf42-1:1 No - lnc-RTP5-8:20 No - lnc-ADAMTS12-1:1 No - lnc-FOLR3-1:2 No - lnc-ADPRM-5:10 No - lnc-PLPP3-2:5 Yes chr2R:9400531-9413463 LINC2194:10 No - lnc-SREK1-1:2 No - lnc-TBL1Y-1:1 No - lnc-SLC6A12-5:1 No - LINC02185:28 No - LINC02373:5 No - LINC02290:17 No - lnc-MYEOV-4:1 No - LINC00575:5 No - lnc-SYCE3-1:1 No - lnc-JMJD1C-3:1 No - ZBED3-AS1:26 No - lnc-HS3ST5-2:2 No - lnc-VAV3-1:1 No - lnc-GAB1-1:1 No - lnc-CLDN23-1:3 No - lnc-CRYM-1:3 No - lnc-ACOT9-1:1 No - lnc-SALL1-1:1 No - LINC00900:5 No - LINC00290:1 No - lnc-GNG2-1:4 No - lnc-SNX16-1:4 No - LINC00908:13 No - lnc-FAT3-5:4 No - lnc-F11-2:17 No - lnc-HELT-2:8 No - lnc-SLC39A11-1:5 No - lnc-CNPY1-11:3 No - LINC01880:16 No - lnc-SORCS3-2:1 No - lnc-ANKRD36B-4:1 No - LINC01811:19 No - LINC01016:7 No - lnc-FAHD2B-1:2 No - lnc-ZFAT-4:1 No - LINC02587:9 No - lnc-TPO-1:4 No - lnc-PRKN-21:7 No - lnc-ZC3H12B-1:3 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-PCM1-4:4 No - lnc-BPY2C-4:2 No - lnc-ANKRD30A-14:3 No - lnc-ZNF708-14:7 No - lnc-C9orf66-4:1 No - lnc-CCL28-1:1 No - LINC02482:21 No - lnc-MUC20-67:135 No - lnc-ALDH7A1-2:4 No - lnc-CCDC187-1:20 No - lnc-ZFP62-1:1 No - BOK-AS1:4 Yes chr2R:6648654-6652842 lnc-DMBX1-4:1 No - LINC01826:3 No - LINC02411:16 No - DUBR:10 No - lnc-GPBP1-2:3 No - LINC00114:11 No - LINC00882:7 No - LINC01203:3 No - lnc-MINPP1-1:1 No - lnc-SPOPL-18:1 No - lnc-OLFM1-2:1 No - FENDRR:6 No - lnc-DTYMK-7:3 No - LINC01508:4 No - lnc-NXPE4-1:1 No - lnc-LNPK-1:1 No - lnc-PTGFR-1:8 No - lnc-PLCXD1-1:4 No - LINC00547:1 No - lnc-SLC5A9-1:1 No - lnc-HSP90AA1-10:1 No - lnc-CHL1-1:3 No - LINC01828:22 No - LINC01621:2 No - lnc-XCL1-2:1 No - lnc-CRYBA4-52:83 No - lnc-GC-1:1 No - CCDC18-AS1:14 No - lnc-WRB-2:3 Yes chr3R:24319000-24328619 lnc-FRK-1:2 No - lnc-ZMYND19-3:3 No - lnc-MYLIP-1:1 No - ZBED5-AS1:13 No - lnc-GADD45G-5:1 No - lnc-SLC10A2-1:1 No - lnc-ELF2-2:2 No - LINC00635:33 No - lnc-TMEM17-2:6 No - lnc-TGFBRAP1-12:1 No - LINC01730:12 No - lnc-ADRA2A-2:1 No - LINC00313:1 No - lnc-P2RY1-3:2 No - LINC01102:12 No - LINC00929:12 No - lnc-NTMT1-4:7 No - LINC01572:13 No - LINC02328:41 No - lnc-TMTC3-2:1 No - lnc-TMTC3-1:1 No - lnc-TRNP1-1:1 No - TTTY14:15 No - lnc-MSR1-2:5 No - lnc-ITPR3-1:8 No - lnc-IRX3-80:15 Yes chr3L:12609631-12710249 LINC01563:2 No - LINC00313:24 No - lnc-SERPINI1-3:1 No - lnc-ZNF214-1:1 No - lnc-FANCI-3:2 No - lnc-U2SURP-3:3 No - LINC01938:15 No - lnc-DYNC1I1-3:1 No - LINC00029:2 No - lnc-KCNMB2-3:1 No - lnc-SLITRK5-35:3 No - lnc-ADGRL4-1:1 No - lnc-ZNF777-1:1 No - lnc-RYBP-2:1 No - lnc-LSM3-1:1 No - lnc-RABGAP1-1:4 No - lnc-CD58-3:2 No - lnc-DCC-2:1 No - lnc-FABP5-2:2 No - lnc-AKR1E2-5:7 No - LINC02218:7 No - lnc-FLNB-2:1 No - LINC01154:7 No - lnc-BUB1-1:2 No - lnc-PFKP-3:1 No - EPHA5-AS1:13 No - LINC01679:8 No - lnc-NDFIP2-7:2 No - lnc-NTSR2-5:6 No - lnc-SPACA7-2:1 No - lnc-SLCO4A1-1:1 No - lnc-CDH9-2:2 No - lnc-DZANK1-3:2 No - lnc-GLB1L2-3:1 No - lnc-THBS1-6:1 No - lnc-DMRTA1-5:1 No - lnc-NABP1-2:4 No - lnc-DNAJB6-7:1 No - lnc-BUB3-4:28 No - LINC01360:7 No - LINC00689:6 No - lnc-MTR-1:3 No - lnc-POLR2B-17:1 No - lnc-KLF15-3:1 No - lnc-CITED2-2:1 No - LINC02272:8 No - lnc-MIDN-1:1 Yes chr2R:14602004-14604337 lnc-PPP1R3B-2:4 No - lnc-WNK1-1:1 No - COX10-AS1:15 No - LINC01789:5 No - LINC00698:12 No - lnc-CLCNKB-1:13 No - lnc-NEK10-1:1 No - lnc-BAG1-2:7 No - lnc-PLEKHA3-7:1 No - lnc-ADAT1-1:1 No - lnc-HES4-1:1 Yes chrX:6282037-6283575 lnc-GSR-1:1 No - lnc-MDFIC2-2:4 No - lnc-ATAD1-1:1 Yes chr2L:10302173-10303947 LINC00662:14 No - PTCSC3:8 No - lnc-CHST4-1:2 Yes chr3R:18367927-18372738 LINC00393:1 No - lnc-CDH9-2:5 No - LINC01839:3 No - lnc-MBOAT1-2:2 No - lnc-UMODL1-4:4 No - LINC01032:7 No - LINC00922:5 No - LINC02056:46 No - lnc-TIMM21-2:1 No - lnc-FGF9-3:2 No - lnc-PIEZO2-2:6 No - lnc-CADM2-3:3 No - LINC01441:1 No - LINC01850:5 No - lnc-HPCAL1-1:6 No - lnc-GPR89B-1:1 No - lnc-SACS-1:1 No - lnc-CLCN3-1:2 No - LINC02580:15 No - lnc-PFKP-13:1 No - lnc-BRD1-22:2 No - lnc-HMBOX1-1:2 No - lnc-ISL1-5:1 No - lnc-SGPP1-1:1 No - LINC00284:6 No - lnc-FAM76B-2:1 No - lnc-SLC16A1-2:2 No - lnc-SLX4IP-35:2 No - lnc-UTP18-1:1 No - LINC01909:11 No - GAU1:5 Yes chr3L:20492082-20497084 lnc-HS3ST3B1-2:1 No - lnc-CARD18-1:1 No - lnc-NTMT1-4:6 No - TRHDE-AS1:9 Yes chr3R:21740105-21744431 LINC01278:20 No - LINC02298:15 No - lnc-HSF2-4:4 No - lnc-GREB1-2:1 No - LINC00692:6 No - lnc-AQP12A-1:5 No - lnc-DMAC1-1:1 No - lnc-ATAD2B-5:1 No - lnc-THBD-1:3 No - LINC01397:4 No - lnc-SLC2A13-3:2 No - LINC00205:5 No - LINC02518:4 No - LINC02101:8 No - lnc-GPR137B-1:3 No - ZMIZ1-AS1:15 No - lnc-TMPRSS2-3:1 No - LINC01220:4 No - lnc-FGGY-6:1 No - lnc-JPH3-3:6 No - lnc-PCDH1-1:1 No - RUNX2-AS1:29 No - CDRT7:1 No - NRIR:5 No - lnc-RETNLB-2:1 No - lnc-FOXA2-7:3 No - lnc-TSN-7:1 No - RASGRF2-AS1:7 No - lnc-CLEC2D-5:1 No - lnc-NOP58-1:1 No - lnc-VPS8-2:6 No - lnc-COL4A2-1:1 No - lnc-ZFP42-2:8 No - lnc-NPC2-1:2 No - lnc-ANKRD27-1:1 No - lnc-COBL-2:1 No - lnc-LHFPL6-2:1 No - lnc-ZNF248-1:2 No - lnc-ADHFE1-1:11 No - LINC01952:16 No - lnc-FAM153C-3:1 No - lnc-STPG1-3:4 Yes chr3R:16186999-16197584 lnc-LRRC38-1:1 No - lnc-REG1B-1:1 No - LINC00348:1 No - lnc-DDI1-3:1 No - TTTY2B:1 No - lnc-PRDM15-1:1 No - lnc-CA2-2:1 No - MIR29B2CHG:92 No - lnc-GPR27-2:1 No - lnc-SEMA3B-1:8 No - PRKCQ-AS1:35 No - LINC01569:11 No - lnc-GPCPD1-8:12 No - lnc-STOX2-11:1 No - LINC02546:13 No - lnc-FBXW11-2:3 No - GMDS-DT:94 No - lnc-SERPINI1-23:19 No - LINC01365:4 No - LINC01813:8 No - lnc-SLC2A9-1:1 No - lnc-OGFOD3-1:2 No - lnc-ANXA2R-1:3 No - lnc-TLE3-6:1 No - lnc-TMEM17-2:7 No - lnc-ASCL1-6:15 No - lnc-NCOA3-10:1 No - lnc-VWA5A-1:1 No - GAS1RR:9 No - lnc-TMEM238L-16:7 No - CASC23:3 No - lnc-SERPINB3-3:2 No - LINC01115:5 No - lnc-PATE4-1:1 No - lnc-MALT1-1:1 No - lnc-HIST1H2BL-1:1 No - lnc-NOL6-2:1 No - lnc-ZFHX3-27:8 No - lnc-ICOSLG-6:7 No - LINC02149:5 No - CASC20:2 No - lnc-SLC4A3-9:1 No - ZMIZ1-AS1:13 No - lnc-OTUD7B-1:1 No - OLMALINC:12 No - lnc-APBA2-2:1 No - lnc-ZNF705D-2:57 No - lnc-ASAP1-2:1 No - lnc-OTULIN-2:1 No - lnc-TRPM1-1:14 No - lnc-GABRA6-1:1 No - LINC01005:6 No - lnc-TMEM18-6:3 No - lnc-PTPN1-2:1 No - lnc-TAOK3-1:1 No - lnc-NPAP1-7:3 No - lnc-ABT1-3:4 No - lnc-ZDHHC17-20:4 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-TGFBI-80:2 Yes chr3R:27559379-27561319 LINC00927:32 No - LINC01105:6 No - lnc-FOXD4L6-1:5 No - lnc-GADD45G-2:1 No - lnc-ABHD2-1:2 No - LINC00662:37 No - lnc-IFNK-3:1 No - lnc-PTAR1-1:1 No - lnc-ETS2-2:2 No - lnc-POU2AF1-8:1 No - lnc-CDH20-1:1 No - lnc-SREK1-1:6 No - lnc-CCR7-1:2 No - LINC02564:16 No - LINC01972:4 No - lnc-NELL1-1:2 No - lnc-TNFAIP3-1:1 No - lnc-TUBB8P12-3:1 No - lnc-CTBP1-1:1 No - lnc-NDUFS6-7:1 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-C20orf196-3:3 No - lnc-NUPR2-5:2 No - lnc-SPOPL-3:2 No - LINC02453:21 No - lnc-BUB3-4:20 No - LINC01413:1 No - RBM15-AS1:18 Yes chr2R:7962463-7969805 lnc-IGFL1-1:3 No - lnc-STX2-1:1 No - lnc-HS6ST1-1:1 No - LINC01146:20 No - lnc-AUH-2:2 No - lnc-SPNS3-1:8 Yes chrX:9192669-9193620 lnc-ZNF804A-1:5 No - lnc-CRISP2-1:1 No - lnc-EFNB2-2:1 No - SRGAP3-AS4:5 No - lnc-CFH-1:1 No - lnc-LTN1-1:1 No - LINC01366:9 No - lnc-SCGB2B2-1:1 No - lnc-SLC15A4-5:1 No - lnc-ZNF333-2:1 No - lnc-BDP1-6:3 No - lnc-NPAP1-10:2 No - CASC22:25 No - lnc-ETV1-1:1 No - lnc-FAM110B-1:2 No - lnc-FCGR3B-4:2 No - lnc-NUFIP1-1:3 No - lnc-AJAP1-2:1 No - lnc-ZNF485-68:23 No - LINC02360:6 No - lnc-VIP-5:1 No - lnc-OLFM3-1:2 No - lnc-SERGEF-2:1 No - LINC01471:8 No - lnc-PLAGL2-1:1 No - LINC00676:2 No - lnc-RPS4Y1-4:2 No - LINC02109:50 No - LINC02537:13 No - lnc-CACNA1E-1:1 No - lnc-ZRANB1-2:1 No - lnc-ZNF367-1:1 Yes chr2L:7801668-7810703 LINC00604:1 No - lnc-EGLN1-1:7 No - lnc-PDCD1-1:21 No - lnc-MGAT5B-1:1 No - lnc-PSD2-2:1 No - lnc-LSMEM1-2:4 No - lnc-HLTF-2:1 No - lnc-TUBB8P12-2:1 No - lnc-CSAG1-1:4 No - lnc-SGTB-4:2 No - lnc-AKR1C4-1:2 No - lnc-WDR7-6:5 No - LINC00944:11 No - lnc-LCP2-1:1 No - LINC01490:1 No - LINC01501:7 No - SAMMSON:43 No - LINC01479:5 No - lnc-CLN8-5:2 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-EHD3-1:1 No - LINC00113:1 No - lnc-PLEKHO2-2:1 No - lnc-CHMP2B-1:2 No - LINC01093:5 No - lnc-HRH4-1:1 No - lnc-RAD23B-2:1 No - lnc-RAB2A-1:2 No - LINC00426:19 No - lnc-PITRM1-5:1 No - lnc-GSAP-1:2 No - lnc-CHD1L-5:7 Yes chr2R:6642418-6645098 lnc-RHOBTB3-1:5 No - lnc-C19orf12-2:1 No - LINC00885:6 No - C9orf135-DT:19 No - lnc-RAB1A-2:2 No - LINC01445:5 No - lnc-CADM2-7:4 No - TTTY13:1 No - LINC02020:20 No - lnc-ACTR2-3:19 No - lnc-FDX1-1:1 No - lnc-CTAGE5-8:25 No - lnc-WNT5A-2:1 No - LINC01592:6 No - lnc-FAT1-1:1 No - lnc-RWDD3-7:3 No - LINC00313:4 No - LINC01017:1 No - lnc-LRPAP1-3:1 No - lnc-EVX2-3:1 No - lnc-SLC12A7-1:12 No - LINC00882:77 No - lnc-KCNK1-1:1 No - lnc-C16orf78-1:5 No - lnc-RAPH1-3:1 No - lnc-HECA-3:8 No - lnc-PITRM1-2:1 Yes chr2R:10109740-10117457 lnc-CCDC172-1:5 No - lnc-DNAJC19-2:3 No - lnc-BMP6-106:143 No - lnc-ATP2B3-4:1 No - lnc-NBPF15-4:7 No - lnc-BDH1-1:1 No - lnc-DMRT2-2:6 No - lnc-TP53I11-1:1 No - lnc-PABPC4L-3:1 No - lnc-CRYBA4-9:2 No - lnc-ATXN3L-2:1 No - lnc-HES1-2:6 No - LINC02081:28 No - LINC02053:13 No - CHKB-DT:50 Yes chr2L:21614232-21624080 lnc-CD2AP-2:1 No - LINC01797:11 No - lnc-CCM2-1:1 No - lnc-ADRB1-2:1 No - CLMAT3:9 No - lnc-SLC7A11-1:2 No - lnc-PRRX1-1:1 No - lnc-HYOU1-1:1 Yes chr3L:23147656-23150499 lnc-FAM241A-1:1 No - LINC02109:32 No - LINC01736:13 No - LINC01673:8 No - LUCAT1:11 No - lnc-NANOS1-2:1 No - lnc-SEPT5-5:1 No - DUBR:6 No - LINC00550:1 No - lnc-ECI2-3:1 No - LINC01798:18 No - lnc-RELL1-5:2 No - lnc-MAN2C1-3:1 No - LINC02217:45 No - lnc-C12orf74-9:2 No - LINC02498:11 No - lnc-TMEM156-2:1 No - lnc-PRDM1-1:1 Yes chrX:7314622-7323770 LINC01837:32 No - lnc-YTHDF1-3:1 No - lnc-SPRY2-132:9 No - lnc-OXCT1-1:10 No - LINC01625:1 No - lnc-FBXO45-1:1 No - LINC01961:15 No - LINC02503:4 No - LINC01744:7 No - LINC01918:22 No - lnc-NNT-4:1 No - LINC02327:46 No - lnc-AP3B2-1:1 No - lnc-ANXA2R-1:4 No - lnc-CDYL2-6:7 No - lnc-KIF26A-4:1 No - lnc-ADRA1D-2:1 No - lnc-RAB6C-4:2 No - lnc-TMEM206-5:1 No - lnc-KHNYN-5:2 No - lnc-NLGN2-1:2 Yes chr3R:7570281-7639434 lnc-DHRS7-1:4 No - MAP3K20-AS1:25 No - lnc-BASP1-2:1 No - LINC01867:4 No - lnc-NDST3-3:1 No - LINC02537:17 No - lnc-CDH6-1:1 No - lnc-NIFK-2:2 No - lnc-TPCN2-4:1 No - LINC01301:10 No - lnc-OTOL1-13:6 No - LINC02189:13 No - lnc-FAM92B-3:1 No - LINC01690:5 No - lnc-SOD3-15:2 Yes chr3R:4422483-4429335 lnc-RAB40B-1:4 No - lnc-PTPN23-2:1 No - lnc-FRG2-3:1 No - lnc-SERPING1-1:1 No - lnc-MAP7D2-1:2 No - lnc-ZNF837-1:15 No - LINC02221:8 No - lnc-ANKRD18B-1:1 No - lnc-TUBGCP3-7:1 No - lnc-B3GNT2-1:2 No - lnc-VEGFC-1:1 No - DNAJC27-AS1:10 No - LINC01428:5 No - lnc-DCTD-23:1 No - lnc-NR1I2-1:8 No - lnc-TSNARE1-1:1 No - lnc-MRGPRX4-1:5 No - lnc-FAM19A5-2:3 No - lnc-CDK18-1:2 No - lnc-FSTL5-1:1 No - lnc-EMC8-2:2 No - lnc-PRMT6-3:9 No - LINC01264:1 No - lnc-GLB1L2-1:6 No - lnc-GLRX3-2:2 No - lnc-MED15-1:7 Yes chr2L:473013-476170 LINC01923:13 No - lnc-SRY-1:1 No - lnc-ERI1-32:19 No - lnc-NUDT12-2:1 No - LINC01755:5 No - lnc-ARL15-3:1 No - lnc-ARFIP1-1:1 No - lnc-CFAP100-2:7 No - lnc-SLC25A30-2:1 No - lnc-NAPB-3:1 No - lnc-ETAA1-1:1 No - lnc-GOT2-4:1 No - lnc-CUL2-1:2 No - lnc-DUSP22-3:1 No - LINC02369:19 No - lnc-DDIAS-3:3 No - lnc-PDZD7-3:1 No - LINC02317:5 No - lnc-PITRM1-10:4 No - lnc-ACTR2-3:3 No - lnc-MFAP5-2:1 No - lnc-LBX1-1:1 No - lnc-ITPR3-1:10 No - LINC02485:7 No - LINC02211:11 No - LINC00922:6 No - lnc-TOMM20-2:3 No - lnc-CDC73-2:1 No - lnc-C1GALT1-1:3 No - PURPL:30 No - lnc-MAP3K8-195:2 No - lnc-MRPS33-1:1 No - lnc-RABGAP1-1:1 No - lnc-GNG8-1:1 No - lnc-FAM198A-2:1 No - LINC00520:5 No - LINC02280:17 No - LINC01146:3 No - lnc-SLC44A3-1:6 No - NEBL-AS1:5 No - lnc-SKAP2-1:1 No - lnc-CEACAM20-2:6 No - lnc-TCFL5-2:1 No - lnc-CST11-2:2 No - lnc-SGCE-1:3 No - lnc-AAGAB-1:42 No - lnc-ELOVL1-1:2 No - CCDC18-AS1:20 No - lnc-PGPEP1L-1:3 No - lnc-CRYBB1-1:1 No - lnc-NLRP3-3:1 No - LINC01467:3 No - lnc-TSPAN5-1:1 No - lnc-SERPINI1-23:21 No - LINC00303:4 No - lnc-ADAMTSL4-1:2 No - lnc-TMEM206-5:8 No - lnc-IRS1-1:1 No - lnc-TMEM212-1:1 No - LINC01201:1 No - lnc-PRSS3-1:5 No - lnc-ATP2B2-1:1 No - lnc-ZNF169-1:1 No - LINC01888:7 No - lnc-SLC6A9-1:1 No - lnc-FAM153B-6:5 Yes chr3R:8307473-8308645 lnc-DHX36-2:11 No - lnc-MAST4-2:1 No - lnc-MAP1LC3B2-32:1 No - LINC02314:5 No - lnc-EMC2-1:1 No - lnc-PJA1-1:1 No - lnc-NPY5R-1:5 Yes chr2L:18698714-18700645 CASC16:4 No - lnc-FLNA-1:1 No - lnc-IGFL1-1:5 No - lnc-SPATA31A7-14:5 No - LINC02419:7 No - LINC00349:1 No - lnc-PANK1-1:1 No - lnc-STIM2-4:4 Yes chrX:15934495-15940451 lnc-ZNF644-1:2 No - lnc-CPO-1:2 No - lnc-SPPL2A-1:13 No - lnc-FOXA1-2:3 No - lnc-PCDH9-3:1 No - lnc-FBXO17-1:4 No - lnc-MN1-3:1 No - TMEM161B-AS1:26 No - lnc-ZKSCAN1-1:3 No - LINC01630:23 No - lnc-FAM53A-2:1 No - lnc-BCL6-1:1 No - CASC9:9 No - lnc-INSIG2-3:1 No - MIR3976HG:3 No - lnc-CNTNAP5-5:1 No - LINC00882:30 No - LINC01953:5 No - lnc-QKI-5:1 No - lnc-HMGB2-15:3 Yes chrX:16787283-16789644 lnc-MBOAT1-2:18 No - lnc-ZFP42-2:15 No - CHKB-DT:51 Yes chr2L:21614232-21624080 lnc-MCM5-1:1 No - LINC02400:16 No - lnc-KCNE1B-2:1 No - lnc-ECI2-2:4 No - lnc-CRYBA4-9:3 No - LINC02498:13 No - lnc-FRG2-4:1 No - lnc-BHLHE22-2:1 No - lnc-APBB1IP-1:2 No - lnc-CPEB2-1:1 No - lnc-CLDN24-6:1 No - LINC02352:11 No - RNASEH1-AS1:7 Yes chr2R:7931054-7932380 lnc-MED10-8:1 No - lnc-C17orf51-2:2 No - MIR4307HG:4 No - lnc-SEC61G-5:1 No - lnc-ASMT-4:1 No - lnc-ERGIC1-2:3 No - lnc-ZNF438-3:1 No - lnc-TFAP2A-1:1 No - LINC01304:15 No - lnc-SORBS3-1:3 Yes chr2R:10269016-10307024 lnc-RNF38-2:1 No - lnc-NR5A2-1:3 No - lnc-ARAP2-7:1 No - lnc-ADAMTS8-1:1 No - lnc-ZHX2-6:5 No - lnc-TASP1-5:3 No - LINC01615:2 No - lnc-PKN2-1:2 No - SPATA3-AS1:4 No - LINC01533:9 No - LINC00689:7 No - lnc-ZNF664-7:4 No - lnc-GMPS-1:2 No - lnc-IRF8-1:1 No - LINC02533:5 No - lnc-RAB23-53:32 No - lnc-TMEM174-1:1 No - lnc-TMEM132B-4:9 No - LINC01423:4 No - lnc-WRN-5:1 No - lnc-PPIE-3:1 No - LINC02494:7 No - lnc-USP6NL-7:5 No - LINC00982:11 No - lnc-CSRNP3-10:1 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-TUBGCP3-4:3 No - LINC01582:10 No - lnc-TMEM74-1:2 No - lnc-KMT2E-1:10 No - lnc-RABL3-2:1 No - lnc-MFSD4B-1:2 No - lnc-LY86-1:1 No - lnc-CCKAR-3:1 No - lnc-NPFFR2-2:1 No - LINC01241:19 No - LINC02583:25 No - lnc-USP25-1:1 No - lnc-AADAT-5:1 No - lnc-RBP5-1:4 Yes chr4:1112874-1123357 LINC01614:2 No - lnc-FANCM-5:2 No - lnc-COA6-6:2 No - lnc-ZNF91-4:9 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-CLMP-1:1 No - lnc-OXCT1-1:5 No - CRTC3-AS1:5 No - lnc-DGCR6-2:34 No - LINC01081:11 No - LINC01961:10 No - lnc-FAM84B-15:120 No - lnc-STX17-1:1 No - lnc-LRP5L-2:8 No - lnc-ST3GAL4-10:4 No - lnc-ANKRD30BL-1:1 No - lnc-NABP1-2:3 No - lnc-TRIB2-4:1 No - lnc-FAM120B-6:2 No - LINC01718:15 No - lnc-CCER1-1:4 No - LINC02147:10 No - lnc-MBL2-2:7 No - LINC01948:13 No - lnc-CADM2-3:9 No - LINC00572:1 No - lnc-PIEZO2-17:1 No - LINC02497:6 No - lnc-SAMSN1-3:2 No - lnc-SEMA6A-2:1 Yes chrX:11677344-11678589 lnc-HNRNPA2B1-2:2 No - lnc-OPN4-1:1 No - LINC02577:22 No - lnc-ATP23-3:1 No - lnc-RNF182-1:1 No - lnc-QKI-4:1 No - lnc-NUFIP1-1:4 No - LINC02189:14 No - LINC01612:3 No - LINC02298:18 No - TTTY15:7 No - lnc-BANP-14:3 No - LINC00926:14 No - lnc-SLC16A11-5:2 No - lnc-ATP5PO-1:3 No - lnc-PABPC4L-2:2 No - lnc-C5orf38-1:4 No - lnc-MGMT-3:1 No - lnc-INSC-2:3 No - LINC00205:9 No - lnc-ZNF705D-2:54 No - UBE2E2-AS1:1 No - lnc-HPCAL1-1:3 No - lnc-MARCH7-2:1 No - lnc-LVRN-1:2 No - lnc-MKKS-2:1 No - lnc-CARD11-1:1 No - lnc-PRSS23-1:4 No - lnc-TMCC1-12:2 No - lnc-CALML5-5:1 No - lnc-ALDH1B1-9:4 No - ATXN8OS:7 No - lnc-HPCAL1-1:4 No - lnc-CHRAC1-1:1 No - lnc-CHST8-1:5 Yes chr2R:21560246-21576035 XIST:8 No - lnc-KLF3-1:1 No - lnc-HNF1A-1:4 No - C10orf71-AS1:3 No - LINC00299:15 No - FAM167A-AS1:1 No - lnc-ZKSCAN1-1:2 No - lnc-NOX3-1:1 No - LINC01929:8 No - LINC02379:5 No - lnc-FOXL1-2:1 No - lnc-MID1-1:8 No - LINC01318:2 No - LUCAT1:12 No - LINC02564:12 No - LINC01717:8 No - lnc-PPDPFL-2:2 No - LINC02027:22 No - lnc-RELN-1:1 No - LINC00320:5 No - lnc-SEL1L3-1:1 No - lnc-HOXC4-4:3 Yes chr3R:17150587-17151630 CASC22:19 No - lnc-CABCOCO1-1:1 No - lnc-ADAM11-1:1 No - lnc-ACKR3-1:4 No - lnc-WDR25-2:2 Yes chr3L:3472447-3510895 LINC01702:21 No - lnc-ZFHX4-2:1 No - lnc-IL37-1:1 No - lnc-MYEF2-3:3 No - lnc-CFAP100-2:9 No - lnc-DBH-2:1 No - lnc-PIWIL4-1:5 No - lnc-TRMT61B-1:1 No - LINC02292:10 No - STT3A-AS1:3 Yes chrX:21049885-21053937 lnc-LGALS3-1:1 No - lnc-SALL1-6:1 No - RUNX2-AS1:33 No - LINC00211:7 No - lnc-FES-1:1 Yes chr3R:9412548-9417264 LINC00608:5 No - lnc-F3-1:1 No - lnc-ALDH3B1-2:6 No - lnc-ZBTB44-1:1 No - lnc-ZNF131-4:1 No - lnc-ZNF257-1:1 No - lnc-SLC12A7-3:1 No - lnc-DIRC1-1:2 No - lnc-LAMB3-2:1 No - LINC00944:13 No - lnc-RBMY1B-1:2 No - lnc-PCDH10-8:1 No - lnc-GLIPR1L1-1:2 No - lnc-RAD23B-21:4 No - lnc-MPPED2-5:1 No - lnc-FAM151A-3:1 Yes chr3R:18192494-18199595 lnc-SLC4A3-2:14 No - lnc-CTAGE5-8:15 No - lnc-AIFM2-1:3 No - lnc-RAC3-1:2 No - LINC01029:5 No - lnc-TMEM189-1:1 No - LINC00972:1 No - LINC02450:5 No - LINC01808:11 No - lnc-TMEM98-1:4 No - lnc-FBXO5-1:1 No - lnc-FBXO15-3:4 No - LINC02579:12 No - lnc-ANKRD30A-14:2 No - LINC01539:21 No - lnc-SNTG2-4:3 No - lnc-CYB5R4-5:7 No - lnc-KDM4C-4:1 No - LINC00924:10 No - LINC02015:18 No - lnc-RPS21-4:2 No - LINC02393:6 No - LINC00319:6 No - LINC00929:9 No - lnc-FHIT-2:1 No - lnc-BOD1-1:8 No - lnc-UCHL3-5:15 No - lnc-TNFAIP3-3:3 No - lnc-PCDH18-1:5 No - lnc-ZDHHC17-3:1 No - LINC02064:10 No - lnc-NVL-3:1 No - LINC01929:6 No - lnc-ROBO1-2:1 No - lnc-HNRNPA2B1-4:2 No - lnc-CHODL-15:1 No - lnc-DYM-1:1 No - lnc-ASB1-1:2 No - lnc-SHOX2-2:1 No - LINC01173:7 No - lnc-TNFAIP3-5:3 No - lnc-TECRL-3:1 No - lnc-ZSCAN30-2:1 No - lnc-TRUB2-1:1 No - lnc-EFNB1-1:1 No - lnc-DOK7-2:3 No - lnc-TOX-1:1 No - lnc-PRDM4-3:4 No - lnc-PCDH15-1:1 No - lnc-TMEM132B-2:1 No - lnc-SHOC2-1:3 No - lnc-DMRTA2-1:2 No - lnc-FOXD4L5-44:5 No - lnc-LMO4-1:1 No - lnc-SHPRH-1:4 No - lnc-PDE6B-1:7 No - lnc-IL17RA-36:27 No - LINC02586:6 No - LINC00222:3 No - lnc-NCOA3-5:4 No - lnc-ZNF507-3:2 No - lnc-TTC21A-2:2 No - lnc-VSX1-1:5 No - LINC02574:3 No - LINC01013:18 No - lnc-SLITRK1-1:1 No - lnc-BTRC-2:1 No - lnc-PALM2-AKAP2-1:2 No - lnc-FAS-2:1 No - lnc-CADM1-4:4 No - lnc-PTP4A3-1:1 No - PVT1:41 No - LINC02458:10 No - lnc-CST8-2:1 No - lnc-GPBP1-3:2 No - lnc-SNX10-1:1 No - LINC01116:4 No - lnc-KHNYN-4:1 No - lnc-DRD5-10:14 No - lnc-ADAM20-1:3 No - lnc-SSX3-1:1 No - lnc-SPATA31A1-5:1 No - lnc-IGSF21-1:1 No - lnc-DEFB112-1:1 No - lnc-CLEC18B-1:1 No - lnc-PCDH8-2:1 No - lnc-PAM-4:2 No - MRPL23-AS1:7 Yes chr3L:2372844-2373704 LINC01899:10 No - lnc-THBS2-12:2 No - MIR4500HG:10 No - LINC00662:39 No - lnc-MAOA-2:1 No - lnc-RPL24-2:4 No - PAXIP1-AS1:6 No - LINC02588:19 No - lnc-SLITRK6-6:2 No - lnc-CCDC125-6:7 No - lnc-AJAP1-3:5 No - LINC02479:3 No - LINC00642:1 No - USP12-AS2:1 No - LINC01608:6 No - lnc-GBE1-4:1 No - lnc-ADARB2-1:1 No - LINC00407:1 No - LINC02002:11 No - lnc-CBLB-3:2 No - lnc-DMRTA1-5:2 No - lnc-ZCCHC17-5:1 No - RASGRF2-AS1:5 No - lnc-POLE4-8:8 No - LINC01745:9 No - lnc-TMEM105-2:11 No - lnc-ANLN-4:1 No - LINC01747:10 No - lnc-GNAQ-1:2 No - lnc-GCNT1-1:1 No - lnc-AKT3-1:1 No - lnc-CDH4-1:1 No - lnc-TNC-1:1 No - lnc-GADD45G-4:2 No - lnc-CDHR4-1:1 No - lnc-PHF3-4:1 No - LINC01431:8 No - lnc-EXOC4-7:1 No - DUBR:14 No - LINC00426:5 No - lnc-SEMA6A-4:1 No - lnc-TP53TG3-4:2 No - lnc-CES5A-1:1 No - LINC01127:39 No - lnc-DMRTB1-1:2 No - lnc-POTEB-5:4 No - LINC01491:4 No - lnc-SLC25A32-2:1 No - lnc-IAH1-3:1 No - lnc-P4HA2-1:1 No - lnc-POLE4-8:11 No - LINC00404:1 No - LINC01625:2 No - lnc-TGDS-1:1 No - lnc-CD109-2:1 No - lnc-TMEM260-3:1 No - lnc-STX18-1:6 No - lnc-C21orf62-1:1 No - lnc-PRICKLE2-3:4 No - lnc-FAM160A1-7:1 No - lnc-NSUN6-6:1 No - LINC01360:13 No - lnc-KIAA1328-2:1 No - lnc-RAD23B-2:2 No - LINC02217:42 No - lnc-HNRNPLL-1:1 No - lnc-NDC80-3:1 No - lnc-SLC12A7-1:3 No - lnc-TMSB4X-1:1 No - lnc-PARVG-1:2 No - LINC01829:44 No - LINC01543:3 No - C5orf66-AS1:4 No - lnc-C20orf196-3:2 No - LINC02349:7 No - LINC01647:5 No - lnc-NAV1-1:1 No - lnc-MRPL44-1:1 No - lnc-PFAS-1:2 No - lnc-PCDH10-9:3 No - lnc-JPH4-4:10 No - LINC00709:2 No - lnc-ARHGAP10-3:1 No - lnc-PIK3R1-5:1 No - LINC01909:9 No - lnc-ABCA5-4:1 No - IGFBP7-AS1:11 No - lnc-CSNK1A1-1:1 No - LINC01811:24 No - lnc-ASCL1-6:3 No - LINC02289:27 No - LINC02569:13 No - lnc-SYNE3-2:2 No - lnc-SLC15A4-1:2 No - LINC01550:10 No - LINC00944:17 No - lnc-HNRNPA2B1-1:1 No - lnc-ASB4-3:3 No - lnc-SOD2-2:2 No - lnc-HOXC4-5:1 Yes chr3R:17150587-17151630 TP53TG1:5 No - lnc-MRPS18A-3:1 No - LINC00163:1 No - lnc-ATG10-1:1 No - lnc-SETD6-6:1 No - lnc-SLC30A9-24:2 No - LINC01202:7 Yes chrX:15921955-15924558 lnc-MBL2-2:1 No - SRRM2-AS1:6 No - WSPAR:1 No - lnc-SLC12A7-4:3 No - lnc-PRDM4-2:2 No - lnc-SLC25A13-1:12 No - lnc-FNBP1-5:1 No - LINC00934:6 No - lnc-NOVA1-3:1 No - LINC02264:5 No - lnc-PRR16-1:2 No - lnc-EIF2AK4-1:2 No - lnc-ZNF837-1:5 No - lnc-GRIP2-4:8 No - lnc-GRHL2-2:1 No - lnc-SIX1-1:1 No - lnc-BIRC7-6:2 No - LINC02206:9 No - TTTY8:1 No - lnc-TACC2-2:1 No - lnc-USP6NL-7:7 No - LINC01186:4 No - lnc-IGSF10-1:1 No - lnc-MRPS27-1:1 No - lnc-SGCG-3:3 No - lnc-ANKMY1-5:6 No - lnc-CYTL1-1:1 No - lnc-PLA2G4A-7:1 No - LINC02180:16 No - lnc-PPP1R14C-1:3 No - lnc-SERPIND1-1:34 No - LINC00649:22 No - LINC02180:14 No - lnc-MAP3K1-1:1 No - lnc-MYCN-5:2 No - lnc-SETD6-3:3 No - lnc-PIK3R1-6:1 No - lnc-SSTR1-2:2 No - lnc-THNSL2-1:2 No - DNAJC27-AS1:14 No - lnc-MPHOSPH6-2:2 No - lnc-LRRIQ1-1:2 No - LINC01817:3 No - CASC16:3 No - lnc-ANKDD1B-1:1 No - lnc-DNAH6-2:1 No - lnc-CNNM1-2:1 No - LINC00951:3 No - lnc-CRIPT-1:1 No - LINC00384:1 No - lnc-U2SURP-3:4 No - LINC00682:3 No - LINC01816:15 No - LINC02541:48 No - lnc-DTNBP1-2:4 No - MIR3663HG:7 No - LINC02290:30 No - lnc-WDR33-1:1 No - lnc-CDK9-1:2 No - lnc-HIST3H3-1:1 No - lnc-CDH2-1:2 No - lnc-TMEM167A-3:1 No - lnc-PGPEP1L-1:2 No - lnc-SLC25A30-2:3 No - CCDC18-AS1:4 No - LINC00581:11 No - TTTY7B:4 No - lnc-MUC20-5:6 No - lnc-EEPD1-49:8 No - lnc-HLA-DQA2-1:1 No - LINC02070:3 No - lnc-KLF6-4:1 No - lnc-NDUFS5-1:1 No - lnc-KIZ-5:2 No - lnc-NME4-1:2 Yes chr3R:25199818-25214255 lnc-CDH19-1:1 No - lnc-IQCK-1:1 No - lnc-DHX37-5:3 No - LINC01081:1 No - LINC01936:28 No - lnc-FOXA2-3:3 No - lnc-HOXB8-1:1 No - lnc-TMEM135-2:2 No - lnc-SPATA31D4-1:11 No - lnc-USP6NL-10:2 No - lnc-CD180-7:1 No - LINC01013:3 No - lnc-TBL1XR1-1:1 No - lnc-ADGRV1-5:1 No - lnc-NCOA3-9:4 No - lnc-KIF16B-3:1 No - lnc-DENND1A-1:1 No - lnc-DAOA-1:1 No - lnc-ABI3-1:3 No - LINC02541:63 No - LINC02240:18 No - LINC01487:7 No - lnc-MAP1LC3B-4:1 No - LINC01467:4 No - lnc-ADGRL4-5:1 No - MAFA-AS1:1 Yes chr2L:19464267-19467758 lnc-EVX1-2:1 No - lnc-SPOPL-5:1 No - LINC01197:21 No - lnc-STX6-3:1 No - lnc-ZNF804B-2:2 No - lnc-ERCC6L2-6:2 No - lnc-DIAPH3-4:1 No - LINC01335:1 No - lnc-ZEB1-1:1 No - TMEM161B-AS1:44 No - lnc-CHIC2-1:1 No - lnc-ANKRD36-1:1 No - lnc-ANKRD55-1:1 No - LINC02428:26 No - lnc-FGFBP1-1:1 No - LINC00836:5 No - lnc-ZNF485-68:29 No - lnc-GPCPD1-8:23 No - lnc-KRBOX4-2:1 No - LINC00327:1 No - lnc-IRX1-2:1 No - lnc-FTCDNL1-1:4 No - lnc-TMEM217-1:1 No - lnc-GUCY1A2-2:1 No - lnc-FAM71A-1:1 No - LINC00313:9 No - LINC01082:1 No - lnc-TGIF2LY-1:1 No - lnc-CNOT6L-1:1 Yes chr3R:31596642-31612664 lnc-SYNDIG1-1:1 No - lnc-RNPC3-1:1 No - LINC01588:94 No - CHKB-DT:52 Yes chr2L:21614232-21624080 DSCR9:4 No - LINC00205:15 No - lnc-FAM209B-1:2 No - lnc-FGF8-1:2 No - lnc-CNST-1:2 No - LINC00996:6 No - lnc-SRP9-1:4 No - lnc-ROCK2-2:1 No - lnc-PAXIP1-23:5 No - lnc-OAF-1:6 No - AFDN-DT:12 No - lnc-EN2-6:1 No - lnc-CNTNAP5-2:1 No - lnc-PCBD1-2:1 No - lnc-MGST2-1:2 No - lnc-SLC25A13-1:3 No - lnc-JAG1-1:1 No - lnc-EZH2-1:1 No - RNASEH1-AS1:14 Yes chr2R:7931054-7932380 lnc-IAH1-2:3 No - lnc-NCOA3-6:2 No - lnc-ATP23-89:10 No - LINC02576:8 No - lnc-ADGRV1-4:1 No - lnc-ERI1-32:8 No - lnc-CKAP2L-1:1 No - lnc-HEATR6-1:9 No - lnc-SCGB1C2-7:1 No - lnc-STIM2-4:5 Yes chrX:15934495-15940451 lnc-SCUBE1-1:1 No - lnc-KCNA1-97:10 No - lnc-B3GALT5-1:6 No - lnc-CXorf49-5:2 No - LINC02583:30 No - lnc-TRIB2-3:3 No - lnc-PDE4D-1:1 Yes chrX:3176440-3343767 lnc-NUTM2E-2:4 No - lnc-UCHL3-5:18 No - lnc-TRIM27-10:1 No - lnc-TSEN2-1:2 No - LINC02230:3 No - lnc-ASF1A-3:2 No - lnc-TLR4-1:1 No - lnc-SCN11A-1:1 No - LINC01114:5 No - lnc-CSNK1G3-9:1 No - lnc-ITGA6-1:3 No - lnc-CTAGE5-8:16 No - lnc-MBOAT1-2:28 No - lnc-LSM3-1:2 No - lnc-ZIC1-3:1 No - lnc-KATNA1-1:1 No - lnc-SPRY2-132:1 No - lnc-CYLC2-6:1 No - LINC00376:1 No - lnc-SPATA31D1-4:36 No - lnc-CAST-3:1 No - LINC01522:3 No - lnc-MTRNR2L5-3:1 No - lnc-IKZF2-3:1 No - lnc-ALG2-3:1 No - lnc-PRKAA2-2:1 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-BARHL2-2:1 No - LINC01988:14 No - lnc-GTF2H5-24:1 Yes chr3R:27607879-27634932 lnc-NTSR2-5:3 No - lnc-GLIPR1L1-3:1 No - LINC01694:29 No - lnc-RHOXF1-3:5 No - lnc-CHMP2B-2:6 No - lnc-PGM5-2:10 Yes chr3L:16126018-16128531 LINC00426:6 No - LINC01505:6 No - lnc-RXRA-3:1 No - lnc-SLC35F5-5:1 No - LINC00299:10 No - lnc-OR4F16-3:1 No - LINC00661:12 No - LINC01635:14 No - lnc-WASF3-1:1 No - lnc-U2AF2-3:2 No - lnc-PDGFD-1:20 No - lnc-COL11A1-1:1 No - lnc-BPY2C-2:2 No - lnc-NRROS-1:1 No - LINC00029:4 No - lnc-GRXCR1-2:1 No - lnc-LYPLAL1-2:1 No - lnc-FSCN2-1:2 No - lnc-KCTD1-2:2 No - lnc-CPO-2:1 No - LINC01829:38 No - lnc-IL5RA-7:1 No - lnc-ATAD2B-12:6 No - LINC00320:8 No - lnc-CD8B2-5:4 No - LINC02177:26 No - lnc-XKR9-1:8 No - LINC01397:2 No - lnc-ADAM29-1:1 No - LINC00383:5 No - lnc-BEND7-5:4 No - lnc-TMEM206-5:9 No - lnc-ADGRL3-6:3 No - LINC01120:8 No - lnc-FAM19A3-2:1 No - LINC01098:4 No - lnc-GMPS-1:1 No - lnc-DISC1-1:1 No - LINC01739:9 No - lnc-SPRY1-12:2 No - lnc-ZNF608-5:1 No - LINC00662:31 No - lnc-COL28A1-1:6 No - lnc-CRYBA4-52:88 No - lnc-ZEB2-1:2 Yes chr3R:30765926-30789202 LINC02519:28 No - lnc-CDKN2B-1:1 No - lnc-C12orf74-8:3 No - DLX2-DT:3 No - LINC01278:9 No - lnc-PTPRD-3:1 No - lnc-LRRC10B-1:4 No - lnc-RWDD3-7:2 No - lnc-MC3R-3:1 No - lnc-GPATCH2L-1:7 No - LINC01564:2 No - LINC00320:9 No - lnc-FAT3-5:5 No - LUCAT1:3 No - lnc-SOCS6-4:1 No - lnc-C17orf58-5:1 No - lnc-MRM1-2:1 No - lnc-EDNRB-1:2 No - lnc-GPR27-1:4 No - TMEM161B-AS1:40 No - SIRLNT:11 No - LINC02272:11 No - lnc-EGLN1-1:1 No - lnc-LURAP1L-1:1 No - LINC01224:43 No - lnc-EGFL7-1:2 No - lnc-TNP1-2:1 No - LINC00390:3 No - lnc-ZNF366-4:1 No - lnc-TBX3-2:1 No - TMEM161B-AS1:46 No - lnc-CLCN3-2:1 No - LINC02020:16 No - lnc-PRDM2-1:1 No - lnc-EMX2-5:4 No - lnc-VPS8-5:1 No - lnc-BCKDHB-1:7 No - lnc-PNRC1-3:1 No - lnc-NDFIP2-7:9 No - ILF3-DT:16 No - lnc-CETN1-1:1 No - lnc-MRPS18A-1:2 No - lnc-CPEB2-7:2 No - lnc-HSPH1-1:1 No - lnc-CNPY1-11:1 No - LINC01248:3 No - lnc-CTSD-2:1 No - lnc-YTHDF3-2:3 No - lnc-ACTR2-3:10 No - LINC00908:1 No - lnc-LRP1B-3:1 No - TPT1-AS1:24 No - lnc-ZIC1-5:3 No - MHENCR:23 No - LINC02229:8 No - lnc-ANKRD60-2:2 No - lnc-ASAP1-1:1 Yes chr2R:8114286-8123001 LINC00844:11 No - lnc-PLG-1:1 No - MMP2-AS1:9 No - lnc-CALN1-1:7 No - lnc-DCAF10-2:1 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-LTBP3-2:2 No - ZMIZ1-AS1:17 No - LINC02583:26 No - lnc-AFF1-1:1 No - lnc-AVPR1A-1:1 No - lnc-LRRC8C-14:1 No - lnc-VAV3-1:2 No - lnc-POTEM-21:2 No - lnc-GJA8-1:2 No - LINC01304:3 No - LINC00649:5 Yes chr3R:15265591-15266690 lnc-OLFM4-4:1 No - lnc-MLYCD-2:4 No - LINC02477:3 No - lnc-DNAH8-1:1 No - lnc-BMP6-106:162 No - lnc-KIF20B-5:1 No - LINC01030:6 No - LINC00473:9 No - lnc-MGME1-1:2 No - lnc-COL4A1-2:6 No - lnc-C18orf21-1:1 No - lnc-FPGT-4:1 No - lnc-CTR9-5:1 No - lnc-INSIG1-1:1 No - lnc-PYDC2-3:2 No - lnc-APOL3-2:1 No - lnc-MTA3-2:1 No - lnc-SNAP25-1:4 No - lnc-ANKRD27-2:2 No - LINC02325:37 No - lnc-LYPD6-1:3 No - lnc-TRIB1-2:1 No - lnc-IGFBP1-6:1 No - LINC01517:35 No - LINC02405:25 No - lnc-SLC22A16-1:1 No - lnc-IGFBP7-5:3 No - lnc-FOXD4L6-1:8 No - DLEU1:40 No - LINC00635:6 No - lnc-SUMF1-6:1 No - lnc-ST3GAL1-1:1 No - lnc-HES1-2:5 No - LINC00358:4 No - lnc-ASB13-3:1 No - lnc-MUC20-5:5 No - lnc-KIF13B-1:1 No - LINC02453:24 No - lnc-SLC25A26-1:1 No - lnc-DNAAF4-1:2 No - lnc-ARL4A-54:3 No - lnc-PRKAB2-1:1 No - lnc-NR1I2-1:11 No - lnc-FOXB1-1:1 No - lnc-ZNF608-4:1 No - lnc-FBXO15-3:9 No - LINC01167:1 No - PROX1-AS1:60 No - STK4-AS1:4 No - lnc-CA8-1:1 No - lnc-WISP3-2:1 No - lnc-ERGIC1-1:2 No - lnc-ERAL1-8:3 No - lnc-MRPL33-1:3 No - LINC01121:8 No - lnc-SMC3-1:1 No - LINC02151:3 No - lnc-PFKP-17:1 No - lnc-LRRC61-2:3 No - lnc-RPS6KC1-1:1 No - PANTR1:41 No - lnc-AKR1E2-3:1 No - lnc-JAM2-4:2 No - lnc-CCSAP-3:6 No - lnc-TMEM17-2:2 No - lnc-PRKN-5:3 No - LINC00623:50 No - lnc-PSMG1-4:10 No - lnc-DCTD-23:2 No - lnc-GPR39-2:5 No - lnc-ECI2-2:7 No - lnc-SH3BP2-1:1 No - NIFK-AS1:6 No - lnc-SLFN5-1:8 No - LINC02293:14 No - lnc-SORCS3-6:1 No - lnc-DDX3Y-1:1 No - lnc-ABCD3-2:1 No - lnc-CTDSP2-2:8 No - lnc-TP53TG3D-9:3 No - lnc-ATG4C-3:1 No - lnc-KHDRBS3-4:3 No - lnc-STK39-3:3 No - lnc-TPPP-1:1 No - lnc-GSDMC-34:4 No - LINC01499:5 No - LINC01584:11 No - lnc-KLHL29-3:1 No - lnc-S100G-1:1 No - lnc-NUMB-1:3 No - LINC01278:10 No - lnc-C2CD4A-1:3 No - LINC01524:2 No - lnc-SCIMP-1:4 No - lnc-SEPT9-3:2 No - lnc-FAM120AOS-2:1 No - lnc-CALM1-2:1 No - lnc-CBR1-2:1 No - lnc-DISC1-2:1 No - lnc-ASB13-2:1 No - LINC01691:3 No - lnc-FRG1-11:5 No - LINC01878:14 No - lnc-PHTF2-1:2 No - lnc-IL6-3:4 No - lnc-TSPY4-2:1 No - lnc-FAM20C-3:3 No - lnc-TSHZ2-19:4 No - LINC01880:21 No - LINC02511:9 No - lnc-SAMD11-16:4 No - LINC00608:1 No - lnc-TBX15-1:1 No - OLMALINC:20 No - lnc-FLI1-3:1 No - LINC01324:3 No - LINC01270:2 No - LINC01723:32 No - LINC02345:31 No - lnc-PLXDC2-1:3 No - lnc-OR52K2-1:1 No - lnc-CDH5-3:2 No - lnc-RPSA-1:1 No - LINC01987:3 No - lnc-ARHGEF5-2:1 No - lnc-C16orf78-1:6 No - LINC02248:9 No - lnc-M1AP-6:6 No - lnc-BMS1-15:1 No - lnc-CARD11-6:1 No - lnc-LMO7DN-2:1 No - lnc-HHIP-1:3 Yes chr2R:17517261-17518186 lnc-RSPO3-1:1 No - LINC02292:15 No - lnc-MVB12B-1:1 No - C5orf64-AS1:14 No - lnc-KLF6-5:1 No - lnc-NCOA3-5:5 No - LINC00462:2 Yes chrX:797090-801479 ST3GAL5-AS1:4 No - lnc-UMOD-1:1 No - lnc-NIPAL2-1:1 No - LINC00111:3 No - lnc-TLR3-1:1 No - lnc-SH2D4A-2:2 No - LINC02185:26 No - lnc-CDK12-1:2 Yes chr3L:21516306-21522684 lnc-TRIM27-15:1 No - lnc-LZTS1-2:4 No - lnc-PROP1-3:1 No - TUSC8:8 No - lnc-ZNF727-16:2 No - lnc-NOCT-1:7 No - lnc-SORCS3-5:2 No - lnc-CBLN4-2:1 No - lnc-DDX20-4:1 No - LINC02411:14 No - lnc-RWDD3-6:1 No - LINC00380:2 No - lnc-KLK3-1:3 No - lnc-ARF6-1:2 No - lnc-VWDE-3:1 No - LINC00853:5 No - lnc-RPP30-6:3 No - LINC00114:4 No - lnc-KHDRBS3-10:1 No - lnc-VAV3-1:5 No - LINC02519:24 No - LINC00682:7 No - LINC00331:5 No - lnc-GPR137B-2:1 No - lnc-DISP1-2:1 No - lnc-NBAS-5:1 No - lnc-IRX4-3:1 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-PAFAH1B1-1:1 No - LINC00376:5 No - lnc-LVRN-1:3 No - lnc-TUBA3C-3:1 No - lnc-USO1-1:1 No - lnc-SLC40A1-1:1 No - LINC00426:14 No - lnc-FRMD3-1:1 No - lnc-SALL1-6:2 No - lnc-MSR1-1:12 No - LINC02068:11 No - LINC01501:8 No - lnc-MTRNR2L5-3:2 No - GAS1RR:4 No - LINC00705:2 No - lnc-SFTPB-1:1 No - lnc-MAFK-2:2 No - lnc-PCSK5-1:1 No - lnc-MAPK8-1:1 No - lnc-C9orf135-1:1 No - FAM225A:3 No - LINC00899:16 No - lnc-KLF3-2:2 No - lnc-FXYD4-1:1 No - lnc-ETDB-1:13 No - lnc-DMRTA1-4:1 No - lnc-NKD2-3:5 No - lnc-RFPL4B-4:1 No - lnc-TRIML2-2:1 No - lnc-MAPK6-10:2 Yes chr2R:11619479-11640941 LINC01425:2 No - lnc-SLC12A7-1:7 No - LINC02589:10 No - lnc-USP28-2:1 No - LINC00926:5 No - lnc-SH3BGRL2-1:6 No - lnc-CPEB4-1:1 No - LINC00927:40 No - lnc-ANP32D-1:2 No - LINC02517:12 No - lnc-DTHD1-2:1 No - lnc-ZC3H11B-1:15 No - lnc-MIB2-1:5 No - LINC00924:5 No - lnc-RAB43-1:2 No - lnc-RHOXF1-2:1 No - lnc-PTGFR-1:1 No - lnc-FAM19A5-5:1 No - RUNX2-AS1:30 No - lnc-TNFRSF14-1:1 No - LINC01137:5 No - lnc-DNAJB5-2:1 No - lnc-SAMD11-16:2 No - lnc-PRIMPOL-6:5 No - lnc-ANKRD50-2:1 No - RTCA-AS1:5 No - lnc-ZHX2-6:6 No - lnc-C4orf3-1:5 No - LINC02085:10 No - BMPR1B-DT:7 No - lnc-CMPK2-5:77 No - lnc-ZNF429-2:2 No - lnc-STK35-4:2 No - lnc-RXRA-3:3 No - lnc-CHCHD7-2:1 No - lnc-ADGB-1:3 No - LINC00265:9 No - LINC00205:19 No - lnc-ZNF730-3:1 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-FRG2C-5:1 No - LINC01779:3 No - LINC00926:8 No - lnc-RPRM-2:1 No - LINC01569:1 No - lnc-EGLN1-1:4 No - lnc-TCF7L2-1:2 No - lnc-CANX-1:4 No - lnc-KDR-1:1 No - lnc-JPH3-3:5 No - lnc-UBE2E2-1:1 No - lnc-TASP1-6:1 No - lnc-GSAP-1:1 No - lnc-PLEKHA5-4:1 Yes chr2R:6502006-6621792 lnc-LCLAT1-1:1 No - lnc-LRRC10B-1:6 No - lnc-BMP6-106:147 No - lnc-GPM6A-1:1 No - lnc-FCN1-5:1 No - lnc-PPP1R26-6:1 No - DNAJC3-DT:13 No - LINC01886:8 No - lnc-PLCL2-1:1 Yes chr3R:13269137-13272011 lnc-LRRC31-1:2 Yes chr2L:10009381-10013170 CASC17:2 No - lnc-DEC1-10:8 No - lnc-KCTD6-1:1 No - lnc-TMEM132C-6:10 No - lnc-RALB-2:3 No - LINC00304:4 No - lnc-BDP1-6:4 No - lnc-CEBPB-6:1 No - lnc-AKR1C2-3:1 No - lnc-ABCA1-3:1 No - lnc-CDC42BPB-1:2 No - lnc-LYZL2-1:1 No - LINC00692:2 No - lnc-PRAG1-3:1 No - LINC00272:1 No - lnc-NFE2L3-2:1 No - lnc-TNRC6C-1:1 No - lnc-HNRNPA1P48-124:5 No - STK24-AS1:4 No - lnc-HEATR6-1:7 No - LINC02289:31 No - lnc-PRDM9-18:3 No - lnc-MCM5-1:2 No - lnc-ZNF827-4:1 No - LINC02589:9 No - lnc-QKI-2:1 No - FENDRR:17 No - lnc-SMC1A-2:1 No - lnc-CD99L2-2:1 No - lnc-CBLN4-3:2 No - PWRN2:5 No - LINC02301:15 No - POT1-AS1:10 No - lnc-ADGRV1-2:1 No - lnc-HDDC2-2:2 No - lnc-ZMYND19-21:2 No - lnc-PLPP3-12:15 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-FAT3-5:6 No - lnc-BDP1-6:1 No - lnc-SLC44A3-2:2 No - lnc-LRRC8D-3:4 No - GACAT3:1 No - lnc-CYSTM1-1:8 No - lnc-TBXAS1-1:1 No - LINC00911:2 No - lnc-NAV1-1:3 No - LINC00363:2 No - lnc-ATXN1-1:1 No - lnc-CCT6B-6:1 No - LINC00917:9 No - LINC01341:22 No - FENDRR:8 No - LINC02369:20 No - lnc-ZFP42-4:1 No - lnc-ADGRB3-1:2 No - lnc-NAV2-1:1 No - lnc-FAM118B-2:3 No - lnc-H2AFV-1:1 No - lnc-PDP2-3:2 Yes chrX:7731779-7734651 lnc-OLFM4-1:1 No - lnc-SERPINB6-2:2 No - lnc-P2RY2-3:1 No - lnc-ZNF623-1:1 No - LINC00708:1 No - lnc-RNASE10-1:1 No - lnc-DFFB-50:6 No - lnc-UTP11-3:2 No - lnc-DCLK2-1:1 No - lnc-NIFK-5:1 No - lnc-SLC38A2-1:1 No - lnc-EPHA6-1:4 No - lnc-LUC7L3-1:1 No - lnc-SH3BGRL2-1:5 No - lnc-S1PR2-1:1 No - lnc-PGM5-2:9 Yes chr3L:16126018-16128531 lnc-KDM4C-6:1 No - lnc-TEKT5-1:1 No - LINC01216:1 No - lnc-RAD23B-8:2 No - LINC01248:10 No - lnc-PPP1R3G-9:12 No - lnc-NQO2-3:2 No - lnc-BRINP1-1:8 No - lnc-COL6A3-1:2 No - lnc-TNFAIP6-2:5 No - lnc-GAP43-9:2 No - lnc-RNF34-1:2 Yes chr3L:3905344-3907813 NIFK-AS1:17 No - lnc-FBN1-1:2 No - lnc-RBMY1B-1:1 No - LNCPRESS2:6 No - lnc-TNFAIP8L1-1:1 No - lnc-ZNF146-1:5 No - lnc-NYAP2-1:1 No - SLC12A9-AS1:12 Yes chr2L:18599755-18605249 lnc-CD9-3:1 No - lnc-FOXD1-3:1 No - lnc-LRRC10B-1:5 No - LINC00486:13 No - lnc-CMPK2-5:63 No - PANTR1:48 No - lnc-ASPH-1:2 No - GMDS-DT:108 No - lnc-CDYL-1:1 No - lnc-CTBS-4:11 No - LINC01605:9 No - lnc-TSPAN14-2:3 Yes chr2L:6000228-6003738 LINC00887:11 No - lnc-HMCN1-2:1 No - lnc-TEX53-2:4 No - KIF25-AS1:7 No - lnc-RPS6KA3-1:1 No - lnc-SHB-1:1 No - PRKAG2-AS1:9 No - lnc-RTL1-6:1 No - LINC00370:2 No - LINC00222:8 No - lnc-CNOT6-1:1 No - lnc-PFKP-16:1 No - lnc-CARD11-22:8 No - lnc-SPATA31A6-60:1 No - lnc-FGFR2-2:1 No - lnc-SNAPC2-1:1 No - lnc-LEKR1-1:9 No - lnc-LRCH1-2:1 No - lnc-PRKD1-3:6 No - lnc-SULF2-2:2 No - LINC01874:9 No - lnc-PCDH7-5:1 No - lnc-EDRF1-1:19 No - lnc-DLX4-1:1 No - lnc-TBX20-1:1 No - lnc-ZNF32-2:1 No - lnc-NTRK2-4:1 No - lnc-COL4A1-2:8 No - lnc-XCL2-2:2 No - lnc-MGAT1-4:16 No - lnc-RPP30-6:1 No - lnc-TERF1-2:1 Yes chrX:10967722-11039901 lnc-MCTP2-3:1 No - lnc-BPY2C-4:3 No - lnc-NR4A2-3:1 No - lnc-C1orf174-2:1 No - lnc-ATF3-1:4 No - LINC01777:17 No - LINC01476:4 No - lnc-TOMM20-1:3 No - lnc-WNT3-1:1 No - LINC01176:19 No - lnc-NOC4L-1:1 No - lnc-TAOK1-8:1 No - lnc-RCHY1-2:1 No - lnc-FAM135A-1:2 No - lnc-CRYBA4-52:80 No - lnc-KIAA0040-1:1 No - LINC01962:9 No - lnc-TMEM132B-4:8 No - lnc-MRGPRX4-1:6 No - lnc-PLEKHA7-1:1 No - lnc-SREK1-1:3 No - lnc-PQLC1-104:12 No - lnc-SSTR4-2:4 No - PTCSC3:9 No - lnc-EPSTI1-3:3 No - lnc-HOXB8-1:3 No - lnc-NKD2-3:3 No - LINC01440:10 No - LINC02328:62 No - lnc-PANK1-2:1 No - lnc-C5orf38-1:2 No - lnc-CRYL1-1:3 No - lnc-FGD4-1:1 No - lnc-CSF2RA-2:1 No - LINC02290:31 No - lnc-CNPY1-1:1 No - lnc-TDRD3-18:1 No - lnc-ZNF664-3:4 No - TTTY8B:2 No - LINC01845:5 No - lnc-ZNF485-68:25 No - lnc-ZADH2-1:3 No - lnc-BRD1-22:1 No - lnc-CNN1-1:1 No - lnc-XKR4-2:1 No - lnc-PLPPR5-1:2 Yes chrX:9196808-9201820 lnc-FAM9A-1:2 No - lnc-TIGD4-1:1 No - lnc-APIP-3:1 Yes chrX:13737942-13739177 LINC01927:12 No - lnc-TNFAIP6-2:2 No - lnc-ZNF486-1:1 No - LINC01653:3 No - lnc-BRINP3-4:1 No - lnc-IL4R-2:19 No - lnc-FAM19A5-2:2 No - lnc-SMOC2-4:1 No - lnc-KIF4B-1:1 No - lnc-NAA16-1:1 No - lnc-TP53TG3F-8:2 No - lnc-ARSF-1:2 No - lnc-HACE1-3:2 No - LINC00051:2 No - lnc-HTR7-1:1 No - lnc-UBIAD1-1:1 No - lnc-PRELID2-1:3 Yes chr2L:6046516-6048706 lnc-TOMM20-2:9 No - LINC02384:50 No - lnc-DHX34-1:1 No - LINC01013:7 No - LINC01351:14 No - lnc-KLRG1-8:2 No - LINC00320:23 No - LINC01270:4 No - lnc-LRIT2-65:2 No - lnc-TMEM105-2:13 No - lnc-UQCRFS1-6:1 No - LINC00927:39 No - lnc-GUCY1A1-3:2 No - lnc-ATG5-1:1 No - LINC02015:32 No - lnc-CCDC187-1:22 No - SOX21-AS1:1 No - lnc-PMP22-2:1 No - lnc-CRBN-1:4 No - lnc-TYRP1-2:1 No - LINC02408:6 No - lnc-FAM153B-6:3 Yes chr3R:8307473-8308645 lnc-RAB6C-2:1 No - lnc-P2RY1-3:5 No - lnc-KRTDAP-1:1 No - LINC02583:27 No - lnc-ZNF599-3:3 No - lnc-C8orf74-3:2 No - lnc-DMRT2-2:3 No - lnc-ZNF404-1:4 No - lnc-CWF19L2-1:2 No - lnc-LPGAT1-2:1 No - lnc-ITM2C-1:3 No - lnc-NCOA3-5:6 No - LINC02005:4 No - lnc-ADAMTS16-2:1 No - lnc-XBP1-1:1 No - lnc-ADCY2-5:2 No - LINC02588:28 No - lnc-GNG2-1:6 No - lnc-RAB43-1:3 No - lnc-RUBCN-1:1 No - LINC02127:10 No - lnc-PRY-1:5 No - lnc-PPIAL4F-6:1 No - lnc-RUNX1T1-4:3 No - HOXA11-AS:4 No - LINC00661:10 No - lnc-RAB37-1:8 No - CHKB-DT:45 Yes chr2L:21614232-21624080 lnc-SMIM11B-4:1 No - lnc-SUCLA2-6:1 No - TTTY18:2 No - HAR1A:1 No - lnc-IGFL2-1:1 No - lnc-TGFBI-80:1 Yes chr3R:27559379-27561319 LNCPRESS2:7 No - lnc-FAM135B-2:1 No - GAS1RR:8 No - STK4-AS1:2 No - lnc-NUTM2B-1:2 No - lnc-CDH9-2:4 No - lnc-IKZF2-3:4 No - lnc-OXCT1-1:9 No - lnc-PDLIM1-2:2 No - lnc-CDR1-1:2 No - lnc-CWC27-1:1 No - LINC01648:7 No - LINC00691:2 No - lnc-SH3BGRL2-1:3 No - lnc-ANKRD20A4-12:6 No - BANCR:2 No - lnc-NCOA3-9:1 No - lnc-EGLN1-1:3 No - lnc-HLA-DQA2-1:2 No - LINC02327:49 No - LINC00670:7 No - lnc-RPL3-1:1 No - LINC01036:26 No - lnc-HAND2-2:1 No - lnc-TOMM20-2:5 No - lnc-PCSK1-1:1 No - lnc-C2CD4B-1:1 No - lnc-EXOC2-3:1 No - lnc-ATP6V1D-1:1 No - lnc-TMEM18-4:2 No - lnc-CXorf36-46:12 No - lnc-TANC2-1:1 No - lnc-ELOVL5-2:1 No - lnc-TMEM170A-1:1 Yes chr2R:10812157-10813310 lnc-REG3G-3:2 No - lnc-PAM-9:1 No - FZD10-DT:38 No - lnc-SNRPN-8:144 No - lnc-DLK1-2:1 No - RBM26-AS1:11 No - lnc-MAT2B-3:15 No - LINC00251:1 No - lnc-HIVEP1-2:3 No - lnc-CTBP2-2:1 No - lnc-ULK4-3:1 No - lnc-CD180-7:2 No - LINC02500:4 No - LINC02289:47 No - lnc-HRH3-1:1 Yes chr2R:23992138-23995055 LINC02470:15 No - lnc-B3GNT2-1:1 No - INSYN1-AS1:34 No - lnc-MS4A8-17:4 No - LINC02401:19 No - LINC02293:19 No - LINC01098:5 No - lnc-EIPR1-4:1 No - lnc-TNC-21:9 No - lnc-CD55-5:1 No - lnc-SPRTN-3:1 No - lnc-RAB2A-2:1 No - lnc-KLHDC4-1:2 No - lnc-TMEM255B-3:2 No - MIR3945HG:2 No - LINC02109:45 No - lnc-GDAP2-1:6 No - lnc-ALDH1B1-13:7 No - lnc-ATP6V1C2-1:1 No - lnc-MIPOL1-1:2 No - lnc-MGAT1-4:4 No - GATA6-AS1:29 No - lnc-VN1R2-1:1 No - lnc-RPS4Y1-2:3 No - lnc-RUNX1T1-4:4 No - LINC02453:16 No - lnc-TLR4-3:2 No - lnc-PCP4L1-46:1 Yes chr3R:11114671-11115706 lnc-MED15-1:13 Yes chr2L:473013-476170 lnc-C2CD4A-6:2 No - lnc-ERCC6L2-1:1 No - lnc-PITRM1-7:4 No - lnc-EMX2-5:5 No - lnc-PRKCQ-2:1 No - lnc-MFAP4-3:9 No - lnc-EMX2-2:1 No - lnc-GAS1-1:2 No - lnc-ELF2-3:1 No - lnc-MARCKS-1:2 No - PANTR1:55 No - LINC02509:4 No - lnc-MID1-1:21 No - lnc-C20orf196-3:5 No - lnc-SRCIN1-1:11 Yes chrX:20469955-20510694 LINC02397:27 No - lnc-ZNF91-4:18 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-NLRP3-1:7 No - lnc-MAP10-1:4 No - lnc-EGLN3-1:7 Yes chr3R:5257037-5269507 lnc-USP53-2:1 No - lnc-APOL6-1:2 No - LINC01471:14 No - lnc-ZFP64-4:3 No - lnc-TNFRSF14-1:2 No - lnc-MRPS30-4:1 No - lnc-SLC39A10-2:1 No - LINC00430:2 No - LINC00377:2 No - lnc-PRKN-3:3 No - lnc-CLSTN1-3:2 No - lnc-ATP1B1-1:1 No - lnc-EVX1-14:3 No - lnc-C5orf49-2:2 No - lnc-DHRS2-3:3 No - lnc-MEOX2-2:1 No - STK32A-AS1:19 No - lnc-BCL11A-1:1 No - lnc-API5-2:1 No - LINC00303:7 No - LINC00211:3 No - LINC00161:5 No - lnc-FAM217A-1:8 No - lnc-GCNT7-1:1 No - LINC01718:14 No - LINC01229:1 No - LINC01475:1 No - lnc-KCNJ4-1:1 No - lnc-FTH1-1:1 No - lnc-TBP-2:3 No - lnc-CLASP2-1:1 Yes chr3R:27696466-27700110 lnc-NSG2-1:1 No - ZNF582-AS1:4 No - lnc-TRIM29-9:5 No - lnc-POTEG-7:3 No - lnc-ST8SIA4-1:1 No - lnc-DAW1-2:2 No - lnc-FAM72B-6:4 No - lnc-AUH-2:4 No - LINC00390:2 No - LINC01114:6 No - LINC00951:6 No - lnc-PMAIP1-1:1 No - lnc-PTPRU-4:1 No - LINC02588:22 No - LINC01569:7 No - lnc-SRD5A2-3:1 No - lnc-RPP40-1:1 No - lnc-FICD-1:1 No - lnc-RSBN1L-1:1 No - lnc-TAOK3-1:4 No - lnc-SLC25A6-1:1 No - lnc-SAMD12-2:1 No - lnc-NBPF15-4:5 No - LINC00313:28 No - XIST:5 No - lnc-SEC61G-1:1 No - lnc-COPS8-1:1 No - LINC02396:11 No - PARD3-AS1:3 No - lnc-UGT8-2:2 No - lnc-FCMR-2:1 No - lnc-RTTN-2:1 No - PWRN1:5 No - LINC01828:24 No - LINC00605:7 No - LINC00707:3 No - lnc-NKD2-3:4 No - lnc-RPAP1-1:2 No - lnc-DCAF8L1-1:1 No - lnc-HECA-3:6 No - lnc-LRMDA-1:1 No - LINC00999:3 No - lnc-C5orf49-2:3 No - lnc-PLCXD3-1:3 No - lnc-ZFY-2:1 No - lnc-ARL1-2:1 No - lnc-KHDRBS3-4:7 No - lnc-CDH9-2:3 No - lnc-DRD5-8:1 No - lnc-SBDS-2:2 No - lnc-ZNF804A-1:3 No - lnc-ITLN2-1:1 No - lnc-MBOAT1-2:1 No - LINC01389:7 No - lnc-UBE2A-1:1 No - lnc-TDRD3-2:7 No - lnc-CYSTM1-1:4 No - lnc-RICTOR-54:16 No - lnc-ZNF131-10:4 No - lnc-PPDPF-1:5 No - lnc-USP6NL-8:11 No - LINC02143:6 No - lnc-GDAP2-1:2 No - lnc-TTC24-1:2 No - LINC01093:9 No - lnc-NYAP1-1:2 No - lnc-ARF5-1:1 No - lnc-TNK2-2:5 No - LINC02019:6 No - LINC00632:10 No - LINC02433:7 No - LINC01919:15 No - lnc-DMRTA1-6:1 No - LINC02328:66 No - lnc-FGF8-1:3 No - LINC02453:17 No - lnc-SAP30-2:1 No - LINC00486:6 No - lnc-ZNF792-1:4 No - lnc-DHX38-3:1 No - lnc-PSMG1-4:2 No - LINC02539:13 No - lnc-GNAO1-1:6 No - lnc-NUPR2-5:1 No - lnc-PAPD7-2:1 No - LINC01728:9 No - LINC02037:7 No - lnc-GMDS-1:1 No - lnc-C8orf48-1:4 No - lnc-TBC1D8-3:1 No - lnc-ARFGEF2-2:4 No - MIR5689HG:2 No - lnc-SLK-1:1 No - LINC01364:3 No - LINC02588:30 No - LINC00882:13 No - lnc-FAM20C-6:2 No - LINC02052:21 No - lnc-ZADH2-1:2 No - lnc-PPP1R3D-1:1 No - lnc-NPAP1-9:7 No - lnc-IRX1-3:1 No - lnc-GLI2-4:3 No - lnc-RPS4Y1-8:2 No - lnc-KCTD6-1:3 No - lnc-KITLG-2:2 No - KTN1-AS1:8 No - lnc-MFNG-1:1 No - LINC01592:3 No - LINC01833:40 No - lnc-BMP6-106:16 No - LINC02056:47 No - lnc-IDO2-1:1 No - lnc-PELI1-1:1 No - lnc-SLC25A26-1:3 No - LINC01301:19 No - lnc-DCUN1D1-6:3 No - LINC01524:19 No - lnc-CDC42EP1-1:1 No - LINC01704:23 No - LINC02122:3 No - lnc-TOR1AIP2-3:2 No - LINC00662:19 No - lnc-RBM26-3:1 No - lnc-STAP1-13:3 No - LINC01117:2 No - lnc-CHST1-3:1 No - lnc-KLF7-1:5 No - LINC01880:17 No - lnc-TAOK3-1:6 No - lnc-COL20A1-3:4 Yes chr2R:10145897-10192394 lnc-P2RY1-3:1 No - lnc-CD8B2-5:3 No - lnc-GPATCH4-3:1 No - lnc-UBE3C-1:1 No - lnc-C15orf48-4:7 No - lnc-ZNF664-3:5 No - lnc-MANEA-3:5 No - LINC00692:9 No - lnc-SLC4A3-2:1 No - lnc-AGA-5:1 No - lnc-ADAM29-5:2 No - lnc-VRK2-3:1 No - lnc-COIL-2:7 No - lnc-TTC34-2:1 No - BOLA3-AS1:9 No - lnc-EXOSC8-1:1 No - lnc-CXCL12-1:2 No - lnc-C3orf30-4:2 No - lnc-CDH26-2:1 No - lnc-PRMT9-1:1 No - lnc-UTRN-1:1 Yes chr3R:19461085-19597288 lnc-ZBTB7C-10:1 Yes chrX:8137041-8142279 lnc-BMP6-106:138 No - lnc-MBL2-2:4 No - lnc-FSTL4-1:1 No - lnc-GLDC-8:1 No - lnc-UMODL1-1:1 No - lnc-PFKP-6:1 No - lnc-CDH10-3:1 No - LINC00649:12 Yes chr3R:15265591-15266690 lnc-ERGIC2-1:1 Yes chr2R:21798017-21799195 lnc-TMEM132B-2:5 No - lnc-ZCCHC17-1:2 No - lnc-CPHXL-3:3 No - lnc-VWF-2:2 No - lnc-SRPK2-1:4 No - lnc-IGFBP1-1:1 No - lnc-SEPSECS-1:1 No - lnc-PIEZO2-18:3 No - lnc-RRP15-1:1 No - lnc-MGAT1-4:8 No - lnc-TNFAIP6-2:8 No - lnc-ITGB2-5:1 No - lnc-FAM182B-2:1 No - lnc-ITGA11-2:4 No - lnc-SFPQ-1:2 No - lnc-CHMP7-1:2 No - lnc-ENPP6-1:2 No - lnc-BPY2C-4:4 No - lnc-TRIML2-14:4 No - lnc-BUB3-4:31 No - lnc-ASCL1-6:11 No - lnc-GRIP2-1:16 No - lnc-C21orf62-4:2 No - LINC01154:9 No - LINC00899:12 No - lnc-TIMM21-5:7 No - lnc-ZNF485-68:15 No - lnc-TMEM132B-4:1 No - LINC01781:15 No - lnc-NPAP1-6:3 No - LINC00958:2 No - lnc-RHOXF1-3:2 No - lnc-EFR3A-2:1 No - lnc-NMBR-1:1 No - lnc-OSMR-1:12 No - lnc-SLC25A13-1:10 No - LINC01249:7 No - lnc-FAM135B-3:1 No - lnc-BNIP1-2:1 No - lnc-CERKL-2:4 No - RGPD4-AS1:10 No - lnc-KLF15-3:2 No - lnc-CFAP74-1:6 No - lnc-RAB11FIP5-1:1 Yes chrX:18635642-18647648 lnc-ANGPT2-2:4 No - lnc-ELOVL1-1:1 No - lnc-AGAP9-2:7 No - lnc-C4orf3-1:2 No - lnc-NOX3-4:1 No - lnc-CCDC179-2:1 No - LINC01697:34 No - lnc-PCED1B-5:18 No - lnc-UQCRFS1-10:1 No - lnc-NR2F1-4:1 No - TNKS2-AS1:5 No - LINC01678:16 No - lnc-PDLIM5-1:1 No - FOXCUT:8 No - lnc-ZNF131-2:9 No - lnc-AP3S1-2:2 No - LINC01697:24 No - lnc-EML6-1:1 No - lnc-EIF2S3B-2:3 No - LINC01141:5 No - lnc-PCED1B-5:40 No - lnc-AQP11-1:2 Yes chr2R:17590964-17591881 lnc-FRMD8-1:6 No - lnc-PALLD-1:1 No - LINC02430:5 No - lnc-ITGA6-1:2 No - lnc-SRGAP2C-5:1 No - lnc-RIOK1-1:4 No - lnc-FAM241A-1:2 No - lnc-SMIM30-2:1 No - lnc-PPA2-4:1 No - lnc-PDE7A-6:1 No - lnc-PEX2-3:1 No - lnc-ANKRD27-2:3 No - lnc-ITGA1-2:2 No - lnc-FSCB-1:5 No - lnc-TBC1D1-1:4 No - lnc-SESN3-1:2 No - LINC00302:1 No - lnc-PLPP4-4:3 No - lnc-GPCPD1-8:5 No - lnc-CCSAP-2:1 No - lnc-FAM174B-1:4 No - lnc-ALDH1B1-1:1 No - lnc-SNRPN-8:104 No - lnc-MEX3B-3:1 No - LINC01829:46 No - lnc-KCNE1B-3:4 No - lnc-CEP44-1:2 No - lnc-CDC40-2:1 No - lnc-TRIP13-1:2 No - lnc-PLCXD1-3:2 No - LINC00906:5 No - lnc-PFKP-9:2 No - lnc-WFDC8-1:1 No - lnc-SLITRK6-7:1 No - LINC01268:1 No - lnc-MBD2-1:7 No - lnc-NUPR2-4:1 No - OLMALINC:5 No - lnc-SLC38A9-1:1 No - LINC00968:6 No - lnc-FMOD-2:1 No - LINC00662:20 No - lnc-ZNF567-2:2 No - lnc-FAM84B-15:132 No - lnc-DDX1-1:1 No - lnc-NETO1-1:12 No - lnc-CDH5-14:1 No - lnc-ACTBL2-1:1 No - lnc-MAP3K9-3:9 No - LINC00320:24 No - CASC22:20 No - lnc-OTULIN-3:3 No - LINC02039:7 No - lnc-BCKDHB-1:2 No - lnc-CPT2-1:1 No - lnc-ANGPT2-5:2 No - lnc-FAM174B-3:1 No - lnc-NFRKB-1:2 No - PAXIP1-AS1:10 No - lnc-C10orf120-1:1 No - lnc-ZSCAN30-2:2 No - LINC01197:2 No - lnc-ARHGAP5-1:1 Yes chrX:17639147-17652562 lnc-MED15-1:4 Yes chr2L:473013-476170 lnc-ZNF32-3:5 No - LINC01197:13 No - lnc-GNA12-1:1 No - LINC02526:6 No - lnc-NAV3-2:3 No - lnc-SLC38A2-1:4 No - lnc-HPCAL1-1:13 No - LINC02064:14 No - lnc-FSCN2-1:3 No - lnc-ZNF107-1:1 No - lnc-DHX37-2:1 No - lnc-RXRA-2:1 No - lnc-ALG10B-2:1 No - lnc-PRSS23-1:1 No - lnc-HDAC2-4:1 No - LINC02318:14 No - lnc-TMEM229A-2:1 No - lnc-KDM5C-1:1 No - LINC00299:8 No - lnc-STK39-1:1 No - lnc-CNST-1:3 No - lnc-SPATA19-9:7 No - lnc-GALR1-1:1 Yes chr3R:28737109-28744782 lnc-BORA-1:1 No - LINC01186:6 No - lnc-NOC2L-5:1 No - lnc-GBE1-5:2 No - lnc-FAM160A1-5:5 No - LINC01589:3 No - lnc-TMEM206-4:1 No - lnc-ARRDC4-4:1 No - lnc-CCDC187-1:33 No - LINC02454:20 No - LINC00944:5 No - LINC01478:5 No - lnc-ABCA13-1:1 No - lnc-USP6NL-7:20 No - LINC01355:8 No - LINC01683:3 No - LINC02097:5 No - lnc-CD300C-1:1 No - lnc-PCDH10-6:1 No - LINC00958:11 No - lnc-RBMY1B-1:4 No - lnc-COL6A3-3:1 No - lnc-BRF2-13:1 No - lnc-GBP5-3:5 No - lnc-PPDPFL-2:3 No - TMEM92-AS1:2 No - lnc-SLX4IP-37:7 No - lnc-NPR3-2:6 No - lnc-ZNF485-68:18 No - lnc-LPP-1:1 No - LINC02528:5 No - lnc-HPCAL1-1:11 No - lnc-CYS1-1:16 No - lnc-TMEM132B-12:3 No - lnc-ANXA2R-1:33 No - lnc-TRMT61B-3:1 No - lnc-IDS-3:1 No - RNF139-AS1:5 No - lnc-ERICH2-1:14 No - lnc-ATIC-4:1 No - lnc-ABT1-3:7 No - GMDS-DT:140 No - lnc-FAM181B-3:1 No - lnc-SNAP91-1:1 No - lnc-SMOC2-7:2 No - LINC02222:5 No - LINC00880:4 No - lnc-CALB2-1:2 No - lnc-LRMP-4:1 No - lnc-GBE1-2:1 No - lnc-CCDC166-1:1 No - lnc-TOX3-1:10 No - lnc-FIG4-1:1 No - lnc-NPR2-1:3 No - lnc-PCDH18-1:2 No - lnc-HOOK1-1:7 Yes chr3L:4022700-4026011 lnc-LAPTM5-1:1 No - LINC01255:14 No - LINC01515:13 No - LINC01550:14 No - lnc-CISD1-1:1 No - lnc-TMEM14A-1:2 No - LINC02520:36 No - lnc-GDF10-2:3 No - lnc-STK32B-1:1 No - lnc-TMEM135-1:1 No - LINC01060:10 No - LINC00426:20 No - lnc-UTP23-1:2 No - lnc-NABP1-3:2 No - lnc-PCDH8-1:1 No - lnc-CHMP2B-2:5 No - lnc-FER1L6-1:3 No - lnc-TMEM98-2:3 No - lnc-KHDRBS3-5:3 No - LINC01614:6 No - lnc-PROP1-2:3 No - lnc-FBXO33-1:1 No - lnc-GPR55-3:1 No - lnc-SH2D7-2:3 Yes chr2R:24445500-24446839 lnc-VSNL1-4:2 No - lnc-IL20RA-1:4 No - lnc-SLC20A1-2:1 No - lnc-SLC4A3-7:3 No - lnc-PAM-9:4 No - lnc-ELFN1-1:1 No - lnc-FAM50B-1:2 No - DNAJC27-AS1:4 No - lnc-VEZF1-1:6 No - LINC01650:5 No - lnc-LARGE1-11:1 No - lnc-CCDC82-3:1 No - LINC00642:11 No - lnc-CCT8L2-7:1 No - LINC00265:12 No - lnc-ZNF236-7:6 No - LINC02273:10 No - lnc-ST3GAL4-8:2 No - LINC01733:5 No - LINC02356:13 No - LINC01896:31 No - lnc-AMZ2-1:1 No - lnc-SUMF2-5:1 No - LINC00838:7 No - lnc-SATB1-1:2 No - lnc-ERI1-2:14 No - lnc-EPCAM-2:1 No - LINC01478:8 No - lnc-TRPM1-1:12 No - lnc-APOB-3:1 No - lnc-TRMT61B-1:4 No - LINC02248:13 No - lnc-GPR183-47:22 Yes chr2L:20730416-20734309 LINC01066:3 No - lnc-DDX53-1:1 No - lnc-NCAM2-1:1 No - lnc-RNF150-3:1 No - lnc-SLCO1A2-4:2 No - lnc-TLR4-3:1 No - lnc-CASK-1:1 No - lnc-C4orf3-1:4 No - LINC02596:6 No - lnc-SPAG6-1:1 No - lnc-EIF2B1-1:5 No - lnc-NRAP-2:1 No - lnc-NDST2-3:1 No - lnc-UPP2-2:1 Yes chr3R:26949692-26958491 lnc-SLC12A7-1:11 No - lnc-DMRTA2-1:18 No - lnc-CA5A-3:1 No - lnc-SOX9-6:2 No - lnc-MFAP4-3:14 No - lnc-DRD5-8:5 No - lnc-WRN-4:2 No - lnc-PDE6B-1:5 No - lnc-ACP1-7:1 No - lnc-RAD23B-8:7 No - LINC01315:8 No - LINC01069:2 No - lnc-CCDC140-4:1 No - lnc-ABI3-2:5 No - lnc-FBN2-3:1 No - lnc-FPGT-6:1 No - LINC01950:7 No - LINC02188:16 No - lnc-CLDN24-6:2 No - lnc-ANKRD10-1:1 No - LINC01431:6 No - lnc-SLC44A3-1:3 No - lnc-SSTR4-6:1 No - lnc-TASP1-8:1 No - lnc-SEMA6A-5:1 No - lnc-AGA-24:12 No - lnc-WARS2-2:4 No - LINC02085:7 No - lnc-NABP1-6:1 No - lnc-CRYBA4-52:52 No - lnc-GLB1L2-1:9 No - lnc-ABRA-5:1 No - lnc-SLC15A4-14:2 No - lnc-ALKAL2-2:32 No - lnc-ARID1B-1:1 No - lnc-ZNF727-2:1 No - CISTR:4 No - lnc-ROBO2-6:1 No - lnc-KHDRBS3-6:1 No - lnc-C8orf86-1:3 No - lnc-BIRC2-5:2 No - LINC01433:3 No - lnc-NUDT12-3:4 No - lnc-WNT7A-1:1 No - LINC01697:41 No - lnc-TOMM20-2:11 No - lnc-ZIC1-22:1 No - lnc-KAT7-3:1 No - LINC02503:5 No - lnc-INSIG2-1:4 No - lnc-PRICKLE2-3:1 No - ZBED5-AS1:10 No - lnc-CADM2-3:4 No - XACT:2 No - lnc-FAM174B-2:10 No - lnc-DAPK2-1:1 No - LINC00692:1 No - lnc-KRR1-4:20 No - lnc-GATA3-3:1 No - lnc-CD83-4:1 No - lnc-QPCT-1:3 No - lnc-PTPN2-3:1 No - LINC02204:25 No - lnc-RNF13-6:1 No - lnc-NAF1-1:1 Yes chr2L:18698714-18700645 lnc-DUSP22-5:1 No - lnc-MCM2-2:1 No - LOH12CR2:1 No - LINC01798:28 No - lnc-P2RX2-1:1 No - lnc-PIEZO2-7:1 No - lnc-SEC61G-3:1 No - LINC02433:10 No - lnc-DNAAF5-3:21 No - lnc-FAHD2B-1:1 No - lnc-IFITM2-4:3 No - lnc-METAP1-1:1 No - lnc-CHMP7-1:5 No - LINC01702:22 No - lnc-CCDC74A-2:3 No - lnc-ZMYM2-1:1 No - LINC00887:2 No - CYP4A22-AS1:2 No - lnc-LGALS12-2:2 No - lnc-ANKFY1-1:1 Yes chrX:9192669-9193620 lnc-LRRTM1-6:1 No - lnc-USP42-1:4 No - lnc-ITPR3-1:2 No - lnc-ZMAT5-1:3 No - LINC01120:4 No - HID1-AS1:3 No - lnc-ADCY9-1:3 No - lnc-FBXO25-4:1 Yes chr2R:5702112-5705439 LINC01067:1 No - lnc-LRRK1-3:1 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-RPL11-1:6 No - lnc-FAM19A5-2:4 No - lnc-TIFA-3:1 No - LINC00299:1 No - lnc-USP9X-1:1 No - lnc-ISX-2:2 No - lnc-RALGPS2-1:1 No - C10orf71-AS1:1 No - lnc-ZNF723-1:1 No - lnc-SCAMP1-2:3 No - lnc-PSKH2-3:1 No - lnc-ANO1-2:1 No - lnc-PABPC4L-10:1 No - lnc-NELL1-2:1 No - lnc-GRHL2-7:3 No - lnc-CHGA-1:3 No - LINC02573:3 No - lnc-MN1-5:1 No - lnc-SUMF2-5:8 No - LINC01102:4 No - lnc-COX7C-4:1 No - lnc-ATP6V1G3-4:7 No - lnc-ERICH2-1:12 No - lnc-MDFIC2-2:3 No - lnc-DHX37-5:4 No - lnc-CD109-1:1 No - lnc-ZDHHC17-19:1 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-ZMYND19-3:4 No - LINC01678:21 No - lnc-KLF7-1:7 No - IGFBP7-AS1:15 No - lnc-JPH4-4:5 No - lnc-ANXA1-3:1 No - lnc-NAALAD2-4:3 No - lnc-THAP5-2:9 No - lnc-FAM120B-11:1 No - lnc-HACE1-3:1 No - lnc-JPH4-4:6 No - lnc-MRPL39-13:1 No - LINC02514:3 No - lnc-MAP1LC3B2-29:1 No - lnc-GNG5-1:9 Yes chrX:2698701-2701033 lnc-CHIC1-2:1 No - lnc-TNFAIP3-4:2 No - lnc-NCAM2-5:1 No - LINC01013:5 No - lnc-ADAMTS16-2:2 No - lnc-CELF4-1:1 No - lnc-PDE6B-1:1 No - lnc-DHRS2-2:1 No - lnc-CCND2-1:1 No - lnc-PTPRU-4:2 No - lnc-ACP1-4:1 No - lnc-PTPRC-1:2 No - lnc-CAVIN2-1:1 Yes chr2L:7408533-7409809 MIR9-3HG:27 No - lnc-MTRNR2L13-4:1 No - lnc-PDGFA-6:3 No - lnc-HNRNPA2B1-2:3 No - lnc-SMIM15-2:2 No - LINC02458:12 No - lnc-KIAA1211L-1:6 No - LINC02153:31 No - lnc-ZNF711-1:2 Yes chr3R:15213974-15214845 lnc-SKIL-1:2 No - LINC02580:14 No - lnc-DMRTA2-1:19 No - lnc-ELFN2-1:2 No - lnc-DEFB112-1:2 No - lnc-ATM-1:1 No - LINC02217:39 No - lnc-FOXG1-4:6 No - lnc-NR4A3-1:4 No - lnc-EXT1-4:1 No - lnc-MYADM-1:1 No - LINC02020:19 No - LINC02554:11 No - lnc-GP9-1:2 No - lnc-ABT1-3:1 No - lnc-TRMT11-1:1 No - LINC01331:1 No - LINC00882:29 No - LINC00029:5 No - lnc-COX7A2L-1:8 No - lnc-C6orf141-2:1 No - LINC02236:3 No - lnc-RAN-3:2 No - GMDS-DT:111 No - lnc-RYR3-1:1 No - LINC01563:7 No - LINC02308:5 No - lnc-DYDC1-1:1 Yes chr2L:6000228-6003738 lnc-NPY5R-2:1 No - LINC00967:2 No - lnc-FNDC1-5:2 No - lnc-TMEM99-1:1 No - LINC01502:1 No - lnc-BOLL-2:1 No - lnc-CACNA1B-1:3 No - TBX2-AS1:19 No - lnc-RNFT2-1:8 No - lnc-RGS18-1:1 No - LINC01771:15 No - BACH1-IT3:1 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-TMPRSS15-11:1 No - lnc-EMC8-2:1 No - LINC02400:20 No - LINC02237:17 No - lnc-TAOK3-7:1 No - lnc-AGAP9-2:3 No - lnc-NUDT6-1:1 No - LINC02220:3 No - lnc-P2RY6-1:1 No - lnc-ZEB2-4:1 No - lnc-COPS8-16:2 No - lnc-RPS6KA4-1:7 No - LINC00320:18 No - lnc-FRG1-12:3 No - lnc-AUTS2-1:1 No - lnc-IGSF3-1:1 No - lnc-IGFBP7-5:10 No - PVT1:39 No - LINC02233:3 No - lnc-MTDH-1:1 No - LINC02036:9 No - lnc-NIFK-1:1 No - lnc-FAM20C-3:8 No - lnc-KCNH1-1:5 No - lnc-NLK-1:1 No - LINC01105:2 No - lnc-RASGRP1-5:1 No - lnc-SH2D4A-2:7 No - lnc-SLC39A11-1:27 No - LINC01093:11 No - LINC01582:2 No - lnc-CMPK2-5:62 No - lnc-KIAA1211L-1:10 No - lnc-KLF4-15:3 No - lnc-PRDM9-21:3 No - lnc-MPLKIP-7:2 No - lnc-SLC2A13-2:1 Yes chr3R:20635480-20644279 lnc-PRR32-1:1 No - lnc-RNF20-5:3 No - lnc-CARD11-22:1 No - lnc-EIPR1-1:2 No - lnc-MFAP3-1:9 No - lnc-GDA-1:1 No - LINC02464:4 No - lnc-ARL6IP6-1:1 No - lnc-NDUFS6-5:5 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-TPTE2-1:1 No - lnc-COL1A1-1:1 No - lnc-ATP23-89:9 No - lnc-HIST1H2AI-1:1 No - GMDS-DT:110 No - lnc-RSF1-1:1 Yes chr2R:17590964-17591881 lnc-CSNK2A1-1:1 Yes chr3L:23097072-23103460 lnc-UBXN10-1:2 No - lnc-CDH3-2:1 No - LINC01895:13 No - lnc-POLR3A-1:1 No - LINC00687:1 No - lnc-NR1I2-1:2 No - lnc-EIF2S3B-3:1 No - lnc-COL28A1-1:4 No - LINC02474:5 No - LINC00690:5 No - lnc-EMX2-5:3 No - lnc-HAAO-1:2 No - lnc-XPO7-3:3 No - LINC01117:8 No - LINC02543:4 No - lnc-NKAIN3-14:10 No - lnc-C2CD4A-5:2 Yes chr3L:8545001-8574409 lnc-OPRK1-1:1 No - lnc-FBXO8-5:1 No - lnc-SLC12A7-1:13 No - lnc-ACTL7B-3:1 No - lnc-ACTL8-1:2 No - lnc-POLR3G-1:1 No - RCAN3AS:21 Yes chr3R:16186999-16197584 lnc-KHNYN-5:4 No - lnc-ZNF146-1:7 No - LINC02116:5 No - lnc-HIST1H2AI-3:3 No - LINC01786:6 No - lnc-YPEL5-1:1 No - lnc-TRIO-1:1 No - lnc-SH3GL3-1:1 No - LINC00928:8 No - lnc-PDLIM1-2:1 No - LINC00391:1 No - lnc-HIST2H3PS2-13:1 No - lnc-CYP24A1-1:1 No - lnc-MUC2-1:2 No - LINC01646:10 No - lnc-TMEM185B-4:2 No - lnc-SHB-1:4 No - lnc-GTF2B-15:16 No - lnc-GPR157-7:7 No - lnc-AUH-2:3 No - lnc-SNRPB2-1:1 No - lnc-ZFP64-4:5 No - LINC02154:5 No - LINC02380:8 No - lnc-FAM120B-3:3 No - lnc-PSMB2-1:1 No - lnc-ZBBX-3:1 No - HTT-AS:1 No - lnc-CST7-1:1 No - lnc-ANXA2R-1:26 No - lnc-GUCY1A1-2:1 No - LINC01333:4 No - LINC01013:4 No - HTT-AS:5 No - lnc-MTERF1-3:1 No - lnc-SLITRK5-4:1 No - LINC01502:6 No - LINC01013:9 No - lnc-CRYL1-1:2 No - lnc-RBMS1-1:1 No - lnc-LRRC58-1:2 No - LINC01255:17 No - LINC00442:2 No - LINC02186:7 No - lnc-OLFM4-6:1 No - LINC02298:16 No - lnc-ATP2B3-1:2 Yes chr3R:18403026-18404726 lnc-TFAP2C-3:1 No - PRKCQ-AS1:55 No - lnc-TLK1-1:1 No - lnc-HS3ST4-1:1 No - lnc-COL6A1-3:15 No - lnc-SMPD1-1:1 No - LINC02139:7 No - lnc-INSC-2:1 No - lnc-COL6A1-1:1 No - lnc-ITM2C-1:5 No - lnc-PRY-1:3 No - lnc-RPP30-3:1 No - LINC01810:4 No - lnc-BLCAP-1:2 Yes chr3L:5565231-5566765 ARLNC1:14 No - LINC01957:3 No - lnc-ZFAT-5:3 No - LINC01473:14 No - lnc-BRF2-7:9 No - lnc-VPS54-1:2 Yes chr2L:1711302-1715851 LINC00592:3 No - lnc-ZNF207-1:1 No - LINC00661:2 No - lnc-CDYL-3:1 No - lnc-TRIM38-2:11 No - LINC00955:6 No - LINC02430:6 No - lnc-ADRA2A-1:1 No - lnc-TRIM29-9:6 No - LINC00844:7 No - lnc-SGCE-1:2 No - LINC02480:8 No - lnc-TGFBI-80:10 Yes chr3R:27559379-27561319 lnc-RAB11FIP2-2:3 No - LINC00486:2 No - LINC01303:44 Yes chr2R:9252310-9285097 LINC01273:9 No - lnc-SEH1L-1:1 Yes chr3L:1342493-1475257 lnc-PRIMPOL-7:1 No - LINC01278:3 No - lnc-HNRNPA3-3:1 No - lnc-DPT-1:1 No - LINC01186:9 No - lnc-SPO11-4:1 No - lnc-CFAP46-3:2 No - LINC02257:4 No - LINC02374:8 No - ZBED5-AS1:12 No - LINC02211:9 No - lnc-PIEZO2-6:1 No - LINC01843:17 No - lnc-CDK5RAP1-1:1 No - lnc-VCAM1-1:1 No - lnc-GPR31-1:1 No - LINC02237:19 No - lnc-PABPC4L-7:1 No - lnc-FAM43A-7:1 No - lnc-AKAP4-1:1 Yes chr3R:24867934-24870816 lnc-GPR27-1:5 No - EDRF1-AS1:30 No - LINC01663:7 No - LINC01056:1 No - LINC02431:12 No - lnc-COL6A1-1:2 No - lnc-ZNF705D-2:40 No - LINC02428:30 No - lnc-ZNF837-1:13 No - lnc-GLI2-4:1 No - lnc-GLI3-1:1 No - lnc-TRIML2-7:1 No - lnc-DACT2-1:1 No - lnc-F3-7:26 No - lnc-TOMM20-2:8 No - lnc-NAALADL2-1:14 No - lnc-NR2C1-1:1 Yes chr2L:2579201-2580172 lnc-TP53TG3-51:2 No - lnc-GPM6A-3:1 No - lnc-SGCG-5:3 No - lnc-PRKAA2-7:2 No - lnc-SEC62-1:1 Yes chr2L:10009381-10013170 LINC00426:3 No - IGFBP7-AS1:5 No - LINC02368:6 No - LINC01890:12 No - lnc-ERAL1-8:4 No - lnc-GTF2I-1:3 No - lnc-TCOF1-1:1 No - LINC01137:3 No - lnc-FBN1-1:1 No - lnc-NOCT-5:3 No - lnc-JAM2-4:1 No - lnc-BCL2L11-3:1 No - lnc-HECA-3:2 No - lnc-UTY-5:1 No - lnc-CRYBA4-52:86 No - lnc-IL6-3:3 No - LINC02475:12 No - LINC01880:18 No - lnc-DDX51-5:1 No - lnc-ZNF32-3:2 No - lnc-DENND5A-1:1 Yes chr3L:7562610-7569499 LINC00661:7 No - lnc-TP53TG3F-3:2 No - PURPL:49 No - lnc-NUDT3-1:1 Yes chr3L:10894776-10899123 lnc-LINGO2-2:2 No - lnc-PIEZO2-18:4 No - lnc-PHGDH-2:1 No - LINC02199:8 No - LINC02068:12 No - lnc-SSU72P8-3:1 No - LINC02027:13 No - lnc-FGFRL1-9:1 No - lnc-NOTCH2-2:1 No - lnc-STX18-1:7 No - lnc-IGFBP1-1:2 No - MIR100HG:33 No - lnc-PPP6C-1:1 No - lnc-TBC1D22A-1:2 No - lnc-OSR1-2:1 No - lnc-KLF6-5:4 No - lnc-BARHL2-1:1 No - lnc-UGT8-3:1 No - lnc-ADGRB3-2:4 No - lnc-CDC25A-1:1 No - lnc-WRN-2:1 No - lnc-PITRM1-2:2 Yes chr2R:10109740-10117457 LINC01787:3 No - lnc-SLC6A11-1:1 No - lnc-NUPR2-3:5 No - lnc-TNFAIP6-2:6 No - lnc-CXorf66-1:1 No - RUNX2-AS1:21 No - lnc-NDUFB4-2:1 No - SPATA41:5 No - lnc-IFNK-1:1 No - lnc-MAP3K9-3:8 No - LINC02290:29 No - LINC01550:15 No - lnc-MAL2-1:1 No - lnc-BMS1-1:1 No - lnc-RNF216-1:1 No - LINC02153:27 No - lnc-RSPH1-3:2 No - LINC02198:23 No - lnc-DOK7-2:5 No - LINC01845:4 No - LINC00940:2 No - lnc-ELAVL4-3:1 No - LINC01351:10 No - lnc-PTGER3-2:1 No - PVT1:27 No - lnc-MFSD8-2:1 Yes chr3L:20367198-20370259 lnc-SUMF2-5:2 No - lnc-RFPL4B-3:1 No - lnc-ASB13-1:1 No - lnc-CHD2-2:2 No - lnc-C7orf57-4:1 No - lnc-PNMA2-6:1 Yes chr3L:22035003-22065279 lnc-DNAJC19-3:3 No - lnc-KLF3-4:1 No - lnc-VCY-1:2 No - lnc-STK3-1:1 No - lnc-SLC20A1-1:1 No - lnc-SH2D4A-2:6 No - lnc-SERAC1-5:1 Yes chr3L:9710422-9713827 lnc-CFAP74-2:5 No - lnc-MEIS2-1:3 No - LINC00609:7 No - lnc-CALN1-1:5 No - lnc-PHF20L1-2:1 No - lnc-TNFRSF19-3:1 No - lnc-CTDSP2-2:6 No - lnc-OLFM3-1:4 No - lnc-HS1BP3-1:6 No - LINC01855:8 No - lnc-EIF2AK3-1:2 No - lnc-NDC80-1:1 No - lnc-SERPINB3-3:3 No - lnc-GCLC-1:10 Yes chrX:8102181-8116147 LINC00424:2 No - lnc-TDO2-2:1 No - lnc-GFRA2-2:1 No - lnc-MARCKS-6:1 No - LINC01255:6 No - lnc-FOXD2-3:1 No - lnc-IGFBP7-8:1 No - lnc-ARSJ-1:6 No - LINC02148:5 No - lnc-PRR34-5:2 No - lnc-STAC-1:1 No - lnc-ICE1-1:4 No - lnc-CST8-1:1 No - lnc-SMKR1-5:2 No - lnc-FAM20C-1:1 No - lnc-ZSWIM2-7:2 No - LINC02546:9 No - lnc-ABCD3-2:4 No - LINC00278:2 No - lnc-SRCIN1-1:6 Yes chrX:20469955-20510694 LINC00492:1 No - LINC00919:3 No - LINC02535:25 No - lnc-AFG1L-2:1 No - lnc-PROK2-1:1 No - lnc-MIB2-1:1 No - lnc-ERGIC1-1:1 No - lnc-GPR183-47:19 Yes chr2L:20730416-20734309 lnc-IL6-4:1 No - lnc-ABHD2-1:4 No - LINC01913:9 No - lnc-NFE2L2-4:1 No - LINC01366:1 No - LINC01208:5 No - CHKB-DT:34 Yes chr2L:21614232-21624080 LNCARSR:13 No - lnc-TTC21A-1:2 No - lnc-RHOH-1:1 No - lnc-USP6NL-10:4 No - LINC02588:23 No - lnc-TRMO-2:1 No - lnc-IGFBP7-3:1 No - LINC02513:3 No - lnc-CLSTN1-2:2 No - lnc-TRMT112-2:1 No - lnc-C5orf49-2:1 No - LINC01884:7 No - lnc-C9orf16-1:2 No - lnc-PIK3CG-1:1 No - lnc-PTPA-1:5 No - lnc-C6orf118-1:2 No - lnc-RAP1GDS1-3:4 No - lnc-SIRT1-1:1 No - lnc-CNR1-1:2 No - lnc-ALOX12B-1:1 No - lnc-LRP5-1:3 No - LINC01032:5 No - lnc-CD58-4:2 No - lnc-PTGFR-1:4 No - LINC02491:6 No - lnc-ILK-4:1 No - lnc-DHX37-9:2 No - LINC01241:17 No - lnc-PCDH7-6:2 No - lnc-TMEM132C-6:3 No - LRRC3-DT:14 No - lnc-COG6-2:2 No - CASC15:74 No - lnc-NAA35-17:1 No - LINC02415:10 No - lnc-MRPL39-4:3 No - lnc-BBS12-3:1 No - lnc-SHE-1:1 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-HES1-2:2 No - lnc-P2RY1-3:3 No - lnc-NDUFV3-2:6 No - LINC02588:27 No - lnc-ANGPT2-6:1 No - lnc-AIFM2-1:2 No - lnc-NOS1AP-1:1 No - lnc-QDPR-1:1 Yes chr3L:9134560-9135916 lnc-LMO2-2:1 No - lnc-TDRD3-2:8 No - LINC01629:4 No - lnc-C9orf116-3:1 No - lnc-SCLT1-2:2 No - lnc-BRI3BP-2:1 No - LINC02519:26 No - lnc-KLK4-1:2 No - LINC01788:9 No - lnc-EMC8-6:2 No - LINC02229:11 No - lnc-DHRS2-3:1 No - lnc-KCTD12-1:1 No - lnc-ERCC6L2-2:6 No - lnc-ARSJ-1:1 No - lnc-TIMP3-4:1 No - lnc-NUAK2-1:1 No - lnc-ANKRD62-1:1 No - lnc-IGFL1-1:1 No - TMEM161B-AS1:24 No - lnc-IRS1-2:1 No - lnc-FAT3-2:4 No - lnc-TYRP1-1:1 No - lnc-OTOL1-4:1 No - lnc-FAM3C-1:1 No - lnc-IFT20-2:1 No - LINC02039:11 No - lnc-PTER-1:1 No - lnc-ZNF32-4:1 No - lnc-DCTD-1:3 No - lnc-WDR37-3:1 No - lnc-HIST1H2AI-1:2 No - lnc-MRPL33-1:8 No - LINC02074:15 No - lnc-NR4A2-1:1 No - LINC01020:8 No - lnc-C9orf50-4:2 No - lnc-ATP8A1-1:3 No - lnc-CDK12-1:4 Yes chr3L:21516306-21522684 ZNF571-AS1:1 No - LINC01748:25 No - lnc-SCPEP1-1:1 No - lnc-ZNF727-7:2 No - lnc-MGAT1-4:14 No - lnc-DLX3-3:6 No - LINC01717:12 No - lnc-RNF26-1:12 No - lnc-EGR3-1:2 No - lnc-GPR142-1:1 No - lnc-EPDR1-1:1 No - lnc-MANEA-3:6 No - lnc-LONRF1-1:2 No - lnc-ADHFE1-1:10 No - LINC01054:1 No - lnc-MBL2-2:2 No - lnc-HMGCLL1-1:1 No - LINC02434:8 No - lnc-CLDN6-1:1 No - lnc-PRKD1-4:2 No - LINC01586:7 No - lnc-SPOPL-3:1 No - lnc-EPSTI1-3:2 No - lnc-ADAM2-4:1 No - lnc-DHX37-9:3 No - lnc-TRAF5-6:1 No - lnc-SLC25A13-1:4 No - lnc-RFX8-1:1 No - LINC01360:5 No - lnc-GRHL2-5:1 No - lnc-DTHD1-3:1 No - lnc-LINC02203-7:4 No - lnc-ATXN7L3B-2:2 No - LINC02130:3 No - LINC01878:11 No - lnc-ZEB2-1:3 Yes chr3R:30765926-30789202 LINC01191:4 No - lnc-EDRF1-1:25 No - TMEM161B-AS1:36 No - lnc-PLEKHA5-3:1 Yes chr2R:6502006-6621792 lnc-SNAI2-2:1 No - lnc-HMGB2-15:4 Yes chrX:16787283-16789644 lnc-SYT16-67:2 No - lnc-NUFIP1-1:1 No - lnc-ZNF608-6:1 No - lnc-UMODL1-1:2 No - lnc-HSFY1-1:2 No - lnc-ABI3-2:4 No - lnc-MCCC2-2:1 No - lnc-FBXW7-3:4 No - SOX1-OT:20 No - LINC01615:7 No - MANCR:40 No - LINC02583:28 No - lnc-CPO-4:1 No - lnc-CHRD-10:7 No - lnc-COPRS-1:1 No - lnc-ITGA2-1:6 No - lnc-PRELID2-1:1 Yes chr2L:6046516-6048706 LINC01358:11 No - lnc-PHACTR3-1:1 No - lnc-NECAP2-1:2 No - lnc-NAALADL2-15:2 No - lnc-AKTIP-10:4 No - lnc-TXNDC16-1:1 No - LINC02020:18 No - lnc-NEURL3-1:1 No - MEIS1-AS3:1 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-FZD10-3:2 No - lnc-PVALB-2:1 No - PVT1:30 No - lnc-PFKP-8:1 No - lnc-ATP6V1G3-1:1 No - lnc-KCTD1-2:3 No - LINC00964:5 No - lnc-KCNMB1-3:4 No - lnc-HIVEP2-5:2 No - lnc-ZNF22-1:1 No - lnc-MAFB-1:2 No - LINC02578:3 No - lnc-TUBGCP3-1:2 No - lnc-COPG1-2:5 No - LINC00528:12 No - LINC00261:11 No - lnc-MEST-1:1 No - lnc-NCOA3-7:1 No - lnc-FZD1-1:1 No - lnc-ERICH1-5:1 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-UCHL3-7:1 No - lnc-CACNA1A-1:4 No - LINC01146:16 No - lnc-PAX1-4:1 No - lnc-ZC3H12B-3:1 No - lnc-DAAM1-2:1 No - lnc-AAGAB-1:44 No - LINC02383:5 No - lnc-MAP3K8-6:1 No - lnc-CNPY1-11:2 No - lnc-UVSSA-1:3 No - ZBED5-AS1:7 No - LINC01886:7 No - lnc-DDX1-9:2 No - lnc-SEPT9-3:6 No - lnc-UQCRFS1-5:2 No - LINC02289:29 No - lnc-SORL1-1:1 No - SPATA41:2 No - lnc-SLC39A11-10:48 No - LINC01385:1 No - LINC01988:11 No - ZNF582-AS1:3 No - lnc-WDR26-1:1 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-CHST2-5:4 No - lnc-NRXN1-2:3 No - lnc-OGFRL1-1:1 No - LINC00427:1 No - LINC01030:2 No - lnc-TAGAP-2:1 No - lnc-PDE6B-1:2 No - LINC00377:6 No - lnc-MAPKAP1-1:1 No - lnc-ANXA2R-1:18 No - lnc-CYSTM1-1:9 No - lnc-EMB-2:1 No - LINC00885:5 No - lnc-MED4-4:2 Yes chr3R:8938724-8943027 lnc-LYPLAL1-3:2 No - lnc-ZEB2-1:1 Yes chr3R:30765926-30789202 LINC00662:40 No - lnc-BOD1-1:4 No - lnc-LYZL2-10:1 No - lnc-VN1R2-1:3 No - MIR4458HG:7 No - lnc-IGSF5-1:3 No - lnc-CLEC4D-1:2 No - LINC02100:21 No - LINC01625:5 No - LINC00473:10 No - LINC02198:25 No - lnc-KLF6-3:1 No - lnc-ADAM29-5:4 No - LINC00880:2 No - lnc-PDHA1-2:1 No - lnc-KITLG-1:1 No - LINC00926:11 No - lnc-ARHGAP28-10:2 No - LINC01517:5 No - lnc-FAM92A-9:7 No - lnc-F11-2:18 No - LINC00964:14 No - lnc-BBS12-1:1 No - LINC01538:1 No - lnc-SLC25A32-3:3 No - lnc-AKAP14-1:2 No - lnc-RBM7-1:1 No - lnc-DTHD1-4:1 No - LINC00299:13 No - lnc-ITGB1BP1-1:2 No - lnc-GPC5-2:1 No - lnc-CYP4V2-1:1 Yes chr2R:7540111-7564435 lnc-NTSR2-5:5 No - lnc-ARHGEF2-1:1 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-ASF1A-3:1 No - lnc-BCKDHB-1:4 No - lnc-ZSWIM6-8:1 No - lnc-ADCYAP1-1:1 No - lnc-PRELID2-3:1 No - lnc-ZPLD1-2:2 No - LINC01114:10 No - LINC01142:2 No - LINC01533:1 No - lnc-DDX51-4:1 No - lnc-TEX53-2:7 No - lnc-LANCL2-1:1 No - lnc-PRKDC-1:1 No - lnc-RCHY1-4:1 No - lnc-EHF-1:1 No - lnc-DTNBP1-2:3 No - lnc-RWDD3-1:9 No - lnc-FOXD1-5:1 No - lnc-SPATA31D1-4:33 No - lnc-RUNX3-4:2 No - lnc-OSR1-1:1 No - UCHL1-AS1:3 No - lnc-TREM1-1:1 No - lnc-KCNE2-2:1 No - LINC01936:17 No - LINC02529:6 No - lnc-USP10-1:1 No - lnc-ERP44-3:4 No - lnc-ADGRL3-3:1 No - lnc-SMDT1-3:42 Yes chr2R:18094940-18101031 lnc-RPP30-2:1 No - lnc-CTNNA2-2:1 No - LRRC8C-DT:34 No - lnc-TPO-2:1 No - lnc-NOCT-12:2 No - LINC00882:3 No - lnc-AJAP1-3:3 No - LINC01060:5 No - ZFHX4-AS1:12 No - lnc-NETO1-1:10 No - lnc-CLN8-5:1 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-INO80C-1:1 Yes chrX:8590775-8591729 lnc-FSIP1-4:1 No - lnc-GGTLC1-5:1 No - lnc-ZSCAN1-1:2 No - LINC00354:7 No - lnc-C2orf76-1:2 No - lnc-PDGFA-8:8 No - GLIDR:17 No - lnc-HIST1H2AI-3:5 No - lnc-ECHDC3-1:1 No - lnc-TBX3-4:1 No - lnc-SRP9-1:2 No - lnc-SOHLH2-4:1 No - lnc-SUMF1-8:1 No - lnc-TTLL2-1:1 No - XIST:10 No - lnc-FAM19A5-2:1 No - lnc-RCC2-2:1 No - lnc-CASC10-1:1 No - LINC01048:2 No - LINC00881:1 No - lnc-IRS2-1:1 No - LINC02109:51 No - lnc-BEND7-5:7 No - LINC00299:12 No - lnc-RAD1-3:1 No - lnc-SLC9A2-2:1 No - lnc-DUSP22-4:1 No - lnc-TCERG1L-1:1 No - lnc-MAP1LC3B2-31:1 No - LINC01572:28 No - lnc-WDR7-4:2 No - lnc-IL4R-2:16 No - LINC00352:1 No - lnc-GPR65-17:1 No - LINC00678:6 No - lnc-CDKN2C-1:2 No - lnc-SOX11-4:1 No - lnc-SLC35B4-1:1 No - lnc-RBM12B-2:1 Yes chrX:7731779-7734651 lnc-GJA8-1:1 No - lnc-SRGAP2C-5:2 No - lnc-TMEM105-2:3 No - lnc-TFAP2E-1:1 No - lnc-WDR25-2:1 Yes chr3L:3472447-3510895 lnc-WASL-2:1 No - lnc-GPATCH2L-1:5 No - LINC01304:4 No - LINC00608:9 No - LINC00114:5 No - CYMP-AS1:3 No - lnc-NRIP1-3:1 No - lnc-ROPN1B-5:1 No - TTTY15:5 No - lnc-LHX2-1:1 No - LINC01075:4 No - MIR9-3HG:11 No - lnc-DHRSX-1:2 No - lnc-MPRIP-1:1 No - lnc-BRF2-9:11 No - lnc-IGFBP7-5:9 No - lnc-TCFL5-2:2 No - lnc-ERGIC1-2:2 No - lnc-ZNF621-2:1 No - LINC02219:10 No - lnc-OTUD4-1:1 No - lnc-KLF7-1:3 No - lnc-ZNF705D-2:38 No - lnc-MYCT1-1:1 No - lnc-WDR26-1:3 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-SLCO5A1-3:1 No - lnc-LIPI-26:1 No - lnc-RORB-2:1 No - lnc-MED15-1:6 Yes chr2L:473013-476170 LINC02101:6 No - LINC01858:11 No - lnc-ZNF705D-2:56 No - lnc-TOX3-1:20 No - GATA3-AS1:5 Yes chr3R:8147368-8181444 lnc-BRINP1-1:6 No - ITPR1-DT:14 No - lnc-MYCN-132:1 No - lnc-CBLB-3:3 No - lnc-ZNF32-2:3 No - lnc-PRB1-1:7 No - lnc-ST6GALNAC5-1:1 No - lnc-GPCPD1-8:6 No - lnc-ZNF146-1:4 No - SRP14-AS1:2 No - lnc-PLPP4-4:1 No - lnc-FOXD3-1:1 No - TMEM161B-AS1:4 Yes chr3L:11109690-11112117 lnc-KLHL32-4:3 No - FAM138F:1 No - LINC02360:5 No - lnc-GPM6A-4:1 No - lnc-ZNF25-5:1 No - lnc-SMIM23-1:3 No - lnc-CIDEA-2:2 No - LINC01470:2 No - LINC00513:19 No - lnc-PREX1-3:1 No - LINC00881:5 No - lnc-TTLL7-6:1 No - lnc-ENPP4-1:1 No - lnc-KRBOX4-1:3 No - lnc-ANLN-2:1 No - lnc-CD101-3:1 Yes chr3R:7916599-7920299 lnc-CPXM2-1:1 No - lnc-BABAM2-1:1 No - lnc-NECAP2-1:4 No - LINC01622:9 No - lnc-ADAM10-2:1 No - lnc-SERPINI1-7:1 No - LINC02442:6 No - lnc-C12orf60-2:4 No - MIR646HG:22 No - lnc-USP12-9:18 No - lnc-TMEM215-1:2 No - lnc-TPST1-1:5 No - lnc-ITIH2-2:1 No - lnc-TRIML2-14:6 No - lnc-UCHL5-3:2 No - FZD10-DT:45 No - lnc-FER1L6-1:2 No - lnc-C1QL4-1:2 No - lnc-PWP2-1:7 No - LINC02126:8 No - lnc-KIAA1217-1:2 No - lnc-C9orf50-4:4 No - LINC02482:26 No - LINC01836:7 No - lnc-SFN-1:1 Yes chr3L:13411122-13412453 lnc-CMPK2-14:1 No - lnc-TDRD3-5:1 No - LINC01278:2 No - lnc-GADD45G-5:3 No - lnc-TRIP11-5:3 No - LINC01102:6 No - lnc-FAM153B-6:2 Yes chr3R:8307473-8308645 lnc-HERC6-1:2 No - TAPT1-AS1:10 No - lnc-GABRB3-1:1 No - lnc-MAGEB10-1:1 No - lnc-BRD3-1:2 No - lnc-IRX3-80:59 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-F3-7:27 No - LINC02396:12 No - lnc-ANKRD55-8:1 No - LINC01186:5 No - lnc-ABT1-3:3 No - lnc-ACTR3C-1:2 No - LINC01936:24 No - lnc-PRR27-1:1 No - LINC02056:40 No - lnc-LAMA2-1:3 No - lnc-SLCO4A1-2:4 No - lnc-NPBWR2-1:1 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-PAM-9:2 No - LINC02137:9 No - lnc-NAA35-1:1 No - lnc-GJA10-6:1 No - LINC01081:13 No - lnc-ZNF680-1:1 No - lnc-CPSF7-1:1 Yes chr2R:8172364-8173613 lnc-AMY1B-1:6 No - lnc-NTSR2-3:1 No - lnc-NDUFS6-5:1 Yes chr3L:12609631-12710249 LINC00581:4 No - FIRRE:9 No - LINC02156:11 No - lnc-FTH1-3:1 No - lnc-RAB11FIP2-1:1 No - HCG27:3 No - lnc-LRRTM1-4:1 No - lnc-ZC3H12D-7:1 No - lnc-CERK-18:1 No - lnc-PLA2G4A-5:1 No - lnc-TWIST1-1:2 No - lnc-PDGFD-1:4 No - lnc-ZFP64-2:1 No - lnc-PRELID3B-1:1 No - lnc-ABI1-3:4 No - lnc-BARHL2-1:2 No - LINC02074:12 No - lnc-ST3GAL4-55:12 No - lnc-COX10-6:2 No - lnc-DNAJC28-1:6 No - lnc-HDAC2-4:2 No - lnc-FAM92B-2:1 No - lnc-GZMK-2:1 No - lnc-RPIA-3:3 No - LINC00882:31 No - lnc-SLITRK5-3:1 No - lnc-CTSO-1:5 No - lnc-TGFBI-80:9 Yes chr3R:27559379-27561319 lnc-USP11-1:1 No - LINC02401:14 No - lnc-RASGRP1-1:1 No - lnc-THBS2-5:10 No - LINC01768:3 No - lnc-FTCD-1:1 No - LINC02219:13 No - LINC00426:15 No - lnc-VPS8-2:1 No - LINC02589:8 No - lnc-TMEM8B-1:1 Yes chr3R:25199818-25214255 lnc-DNAJC19-2:4 No - LINC00659:7 No - lnc-KLF11-1:1 No - lnc-NELL1-1:3 No - lnc-SPRY1-11:4 No - lnc-DIAPH3-6:1 No - lnc-BAG1-2:13 No - lnc-NABP1-1:5 Yes chr2L:7408533-7409809 lnc-DAAM2-1:1 No - lnc-TBC1D19-1:1 No - KAZN-AS1:8 Yes chr2R:22333500-22373109 lnc-USP6NL-7:3 No - lnc-ACP1-7:2 No - lnc-COIL-2:5 No - lnc-ZNF131-2:5 No - MAFG-DT:20 No - lnc-VPS13B-1:1 No - lnc-WDR7-4:1 No - lnc-SELENOV-1:2 No - lnc-SIAH2-1:3 No - LINC00958:12 No - LINC01804:6 No - lnc-DISP1-3:1 No - lnc-PITRM1-7:1 No - lnc-PRKAA2-3:1 No - lnc-RGS7-1:3 No - lnc-BORA-31:5 No - lnc-C16orf74-1:3 No - lnc-NOVA1-1:2 No - lnc-TMPRSS15-13:1 No - HCG27:6 No - lnc-NR4A2-4:1 No - lnc-DPP6-16:1 No - PURPL:31 No - lnc-ABI1-3:1 No - lnc-MTRR-1:1 No - lnc-TMEM206-2:1 No - lnc-FAM50B-2:1 No - LINC01980:15 No - LINC02554:8 No - lnc-EBLN1-1:1 No - lnc-EFNA5-1:2 No - lnc-GPR132-1:3 No - lnc-TWIST1-1:1 No - lnc-AP3S1-3:1 No - lnc-TTLL7-5:1 No - LINC02380:9 No - LINC01512:4 No - lnc-ZMYM2-3:1 No - LIN28B-AS1:11 No - lnc-ERICH2-1:13 No - lnc-FAM20C-4:4 No - LINC02102:14 No - LINC00205:17 No - lnc-FCGR3B-1:1 No - lnc-AGA-4:2 No - lnc-CD83-3:2 No - lnc-SERGEF-2:4 No - lnc-SBDS-1:4 No - lnc-AGA-24:4 No - lnc-PHF14-4:1 No - lnc-LRRC3C-1:4 No - LINC01221:1 No - lnc-C1QB-1:1 No - lnc-SSTR4-4:2 No - lnc-STPG2-1:1 No - lnc-LRCH1-1:1 Yes chr3R:8578205-8629996 PWRN1:15 No - lnc-PGS1-1:3 No - lnc-USP35-9:1 No - DNAJC27-AS1:7 No - lnc-FLRT2-1:5 No - lnc-POTEB-5:3 No - LINC01628:4 No - lnc-BANP-4:1 No - lnc-SLFN5-1:1 No - ZNF582-AS1:12 No - LINC01837:20 No - lnc-DTWD2-4:1 No - lnc-BDP1-6:2 No - lnc-TTC26-1:1 No - lnc-SLC44A3-1:4 No - lnc-EXT1-3:2 No - LINC01612:6 No - LINC00608:6 No - lnc-FNDC1-5:1 No - lnc-USP6NL-11:2 No - lnc-ULK4-6:1 Yes chr3L:8601006-8602392 lnc-TMEM135-2:1 No - lnc-MICU3-2:1 No - lnc-TRAM1L1-2:1 No - lnc-GPR141-1:1 No - lnc-FCHSD2-2:11 No - LINC02376:6 No - lnc-EPG5-1:1 No - lnc-SUMO1-3:1 No - BACH1-IT2:4 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-XPO7-3:1 No - lnc-NAALAD2-4:4 No - lnc-U2SURP-3:5 No - lnc-ZNF485-68:27 No - SRRM2-AS1:7 No - lnc-SMIM10L2A-2:1 No - lnc-VRK2-2:2 No - lnc-SPOCK3-2:1 No - lnc-B4GALNT4-1:1 No - lnc-CCSER2-2:1 No - lnc-CRYBA4-6:1 No - LINC02402:5 No - lnc-ZNF727-13:1 No - lnc-DRD5-10:10 No - LINC01488:6 No - lnc-NEUROD6-2:1 No - lnc-RAP1GDS1-3:3 No - lnc-GYPC-1:1 No - lnc-SPRED2-2:1 No - lnc-DNAJB6-7:3 No - lnc-ZMAT5-1:1 No - MIR100HG:39 No - LINC00391:9 No - lnc-C5orf49-2:6 No - lnc-BTG3-3:1 No - lnc-PELI1-5:1 No - lnc-ARL4C-3:1 No - lnc-CCDC114-1:1 No - LINC00606:2 No - lnc-OCM-1:1 No - lnc-PYDC2-3:1 No - LINC01431:1 No - LINC00472:21 No - lnc-SLCO1A2-2:1 No - lnc-FBXO31-12:9 No - PSORS1C3:3 No - lnc-SKIL-1:1 No - LINC01704:20 No - lnc-PTPRN2-1:2 No - LINC01569:12 No - lnc-RPLP1-12:30 No - lnc-PDGFA-17:24 No - lnc-METTL4-1:1 No - LINC01053:2 No - lnc-ART1-2:1 No - lnc-SH2D1B-1:1 No - TMEM161B-AS1:23 No - lnc-CNTNAP3-1:1 No - lnc-GALNT18-2:1 No - lnc-FAM160A1-3:1 No - LINC01622:10 No - DANT1:3 No - lnc-UNC5D-1:2 No - lnc-VWF-2:1 No - lnc-EXT1-3:1 No - LINC02150:8 No - lnc-PFN2-2:1 No - HDAC2-AS2:122 No - lnc-UNC93A-1:1 No - lnc-S1PR1-2:4 No - GACAT1:3 No - lnc-EXOC4-1:1 No - lnc-NUTM1-1:1 No - LINC00926:9 No - lnc-GABRR3-2:5 No - LINC02119:3 No - lnc-KHDRBS3-5:2 No - lnc-AGA-24:13 No - lnc-EVA1C-1:1 No - LINC02082:5 No - lnc-GSDME-3:11 No - lnc-WDR60-3:1 No - LINC00299:14 No - lnc-CASC10-2:1 No - lnc-RAMP3-1:1 No - lnc-ID3-2:1 No - lnc-C1orf21-1:1 No - lnc-JAM2-7:1 No - lnc-PPP1R3G-9:13 No - lnc-GADL1-1:1 No - lnc-PDGFA-17:27 No - LINC02076:12 No - lnc-SMIM15-2:3 No - LINC02111:7 No - lnc-AGBL4-2:1 No - GATA3-AS1:4 Yes chr3R:8147368-8181444 lnc-PGPEP1L-12:3 No - lnc-AP4S1-1:2 Yes chr2L:22239916-22246988 lnc-SPOCK3-1:1 No - lnc-NDUFS6-4:1 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IGFBP3-8:1 No - LINC02056:43 No - lnc-LY6H-1:1 No - lnc-ELFN1-1:4 No - lnc-GADD45G-4:1 No - LINC01816:19 No - lnc-ANO5-2:1 No - lnc-LEF1-3:12 No - LINC01248:7 No - LUCAT1:17 No - LINC02428:20 No - lnc-PEAK1-1:12 No - LINC01278:13 No - LINC00968:14 No - lnc-AMY1B-1:4 No - lnc-COX7C-1:1 No - lnc-SLC35F5-23:1 No - LINC00313:2 No - MAPKAPK5-AS1:13 No - lnc-GLRB-5:1 No - LINC01402:4 No - lnc-DHX37-4:1 No - LINC01069:4 No - lnc-SLC38A2-1:2 No - KCTD21-AS1:5 No - lnc-MCUR1-1:4 No - LINC00581:3 No - lnc-AGPAT2-2:3 No - lnc-P2RY2-2:1 No - lnc-PPIAL4F-3:11 No - LINC01571:2 No - LINC00346:1 No - lnc-VSTM2B-5:2 Yes chr2L:1612429-1614160 lnc-ATIC-3:1 No - RTCA-AS1:3 No - lnc-SMAD5-3:2 No - lnc-NPHP4-1:1 No - lnc-ZNF507-2:2 No - LINC01182:15 No - LINC00486:10 No - lnc-SPATA31A1-5:8 No - lnc-CRH-1:1 No - lnc-SPRY1-11:3 No - lnc-CHST8-5:1 No - lnc-FBXW11-1:1 No - lnc-ZMYM3-1:1 No - lnc-NUPR2-2:1 No - lnc-CHD9-4:1 No - lnc-CHL1-1:2 No - lnc-ADCY2-4:1 No - lnc-CCDC59-5:1 No - lnc-PCDH9-2:1 No - lnc-PREX1-1:1 No - lnc-SNX19-4:1 No - SRP14-AS1:18 No - lnc-DNAJC8-1:1 No - lnc-ATP1B3-1:1 No - lnc-KLK3-1:1 No - lnc-MAGOHB-1:1 No - LINC02325:34 No - lnc-TSHZ3-1:1 No - lnc-PCSK9-4:13 No - LINC02519:25 No - LINC02520:40 No - LINC02068:17 No - lnc-C1orf87-1:1 No - lnc-SUMF2-5:6 No - lnc-ZNF783-1:1 No - lnc-POM121L12-2:1 No - lnc-MCL1-8:1 No - lnc-SIX3-3:2 No - DLEU1:41 No - lnc-BCL6-4:1 No - lnc-TRUB1-1:1 No - lnc-CHST12-1:4 Yes chr2L:16879517-16886319 lnc-ANKRD50-4:3 No - lnc-RAD23B-8:1 No - LINC00316:1 No - lnc-RFTN1-1:1 No - lnc-SLC35F5-3:22 No - lnc-ALDH1A1-5:1 No - lnc-RAP1GDS1-2:1 No - lnc-ID2-1:1 No - lnc-SLITRK6-1:1 No - LINC00866:2 No - lnc-SLC30A5-1:1 No - lnc-PITRM1-7:9 No - lnc-SNRPN-8:141 No - lnc-SFSWAP-2:1 No - SLC25A25-AS1:10 No - lnc-STX18-2:1 No - LINC00844:2 No - lnc-CADM2-5:1 No - lnc-OXSM-1:2 No - lnc-DHRS2-1:1 No - SNHG27:15 No - lnc-PFKP-9:3 No - lnc-KIAA1217-1:1 No - lnc-GPR27-1:3 No - lnc-FOXA2-7:2 No - LINC00265:10 No - lnc-LSMEM1-2:7 No - HCG24:3 No - lnc-BSND-1:1 No - EHHADH-AS1:1 No - lnc-TRIB2-3:2 No - lnc-PROM1-1:1 No - LINC02174:4 No - lnc-RAB30-2:1 No - lnc-HS3ST4-1:7 No - LINC00900:8 No - lnc-PLD5-1:1 No - lnc-FGFR2-1:1 No - lnc-C8orf74-3:1 No - lnc-SEPT9-3:5 No - lnc-SLC39A11-1:22 No - MIR100HG:36 No - lnc-KIT-2:1 No - lnc-DCAF4L2-1:1 No - TMEM161B-AS1:45 No - lnc-DMRT2-2:4 No - lnc-ZDHHC2-1:2 No - lnc-NR1I2-1:6 No - lnc-KLF15-3:3 No - LINC01811:22 No - lnc-CXCL12-1:1 No - lnc-MAP3K7-1:1 No - lnc-CHCHD6-1:1 No - LINC00408:5 No - lnc-ERAL1-8:6 No - LINC01363:3 No - lnc-MAP3K8-5:1 No - lnc-KIF16B-2:1 No - lnc-RTP5-8:19 No - lnc-PAPOLA-1:4 No - LINC00350:1 No - lnc-API5-4:3 No - lnc-MS4A8-17:1 No - LINC00375:2 No - LINC01525:5 No - lnc-AGTPBP1-3:2 No - lnc-NUTM2B-1:11 No - lnc-CCKAR-1:2 Yes chrX:15934495-15940451 lnc-GDE1-3:2 No - lnc-LGALS9B-2:2 No - lnc-ZC3H12B-18:1 No - lnc-TRMT11-1:3 No - lnc-KLF6-5:6 No - lnc-PFKP-9:4 No - lnc-FBXO5-2:1 No - LINC01312:2 No - lnc-CLK4-1:2 Yes chr3R:9775121-9777943 lnc-GPR63-3:1 No - lnc-SLC44A1-1:1 No - lnc-ANKRD36C-2:1 No - lnc-MANEA-2:1 No - LINC00892:5 No - lnc-CHMP2B-1:1 No - lnc-CLTA-1:1 No - lnc-RPP30-6:4 No - lnc-ACTL7A-1:1 No - lnc-CMYA5-1:1 No - lnc-CLN8-9:2 Yes chr2R:5702112-5705439 MAPKAPK5-AS1:12 No - lnc-RAP2B-3:2 No - lnc-NRG2-2:1 No - lnc-SLC25A32-2:2 No - CASC22:26 No - lnc-DNAAF5-3:17 No - lnc-ATAD2B-12:4 No - lnc-FOXD4L5-37:1 No - lnc-GRIP1-3:1 No - LINC02051:3 No - lnc-CMPK2-5:72 No - lnc-INSIG2-1:2 No - lnc-DSG1-4:1 No - lnc-KY-2:2 No - MIR670HG:29 No - lnc-FRG1-12:6 No - lnc-SLITRK6-6:1 No - lnc-ZFAT-5:2 No - lnc-ZFP90-2:1 No - lnc-CA5A-4:2 No - lnc-MGST1-2:1 No - lnc-SLC12A7-4:1 No - lnc-TMEM169-2:1 No - lnc-GPAT2-1:2 No - lnc-ZNF804B-2:3 No - lnc-CXorf49-4:1 No - lnc-DEPDC1-1:1 No - lnc-HRCT1-7:1 No - lnc-SOCS5-4:3 No - lnc-EPHA4-2:2 No - LINC02208:22 No - lnc-DRD5-10:1 No - PRKCQ-AS1:2 No - lnc-PGPEP1L-15:2 No - lnc-ALDH1A3-1:9 No - lnc-FGF10-2:1 No - LINC02109:42 No - lnc-PDSS1-2:1 No - LINC02345:20 No - lnc-BCL11B-3:1 No - TPT1-AS1:22 No - lnc-CEP44-1:1 Yes chr2L:9426784-9427917 DNAJC27-AS1:12 No - lnc-RGL4-3:1 No - lnc-STK39-3:1 No - lnc-C4orf3-1:3 No - lnc-OR5H15-1:2 No - lnc-GDF7-2:1 No - RUNX2-AS1:31 No - LINC01508:2 No - LINC01539:2 No - lnc-HPS3-2:1 No - lnc-PDGFD-1:15 No - lnc-ZNF621-1:1 No - lnc-IGFBP4-1:3 No - lnc-CST3-1:1 No - lnc-GRHL2-8:1 No - LINC01909:10 No - lnc-NOX3-2:1 No - FZD10-DT:52 No - lnc-KLF5-2:1 No - lnc-LY96-2:1 No - lnc-ANKRD18B-3:1 No - GAPLINC:11 No - lnc-NR5A2-1:2 No - TMEM202-AS1:29 No - lnc-CCDC140-2:1 No - LINC01248:4 No - lnc-SENP2-2:4 No - DLEU1-AS1:1 No - MIR4500HG:7 No - lnc-ADCY9-1:8 No - lnc-ZIC5-3:1 No - LINC00924:14 No - lnc-TPO-4:1 No - lnc-CRIPT-1:2 No - lnc-PRY-1:4 No - lnc-DPYS-2:1 No - lnc-MAP3K8-1:1 No - lnc-SERINC1-1:1 No - LINC00222:4 No - lnc-KIAA1147-3:3 No - lnc-RPIA-3:4 No - lnc-LAMB3-2:2 No - lnc-MRGPRF-4:2 No - lnc-RWDD3-7:5 No - lnc-UBLCP1-2:20 No - lnc-RPS25-6:1 No - lnc-CPE-1:1 No - lnc-LARGE1-1:5 No - lnc-CRISP1-1:1 No - lnc-APOBEC3G-3:2 No - LINC01218:1 No - lnc-RGS7-1:1 No - lnc-TMEM238L-16:9 No - LINC02550:14 No - LUCAT1:19 No - LINC01197:19 No - lnc-SOCS5-4:2 No - lnc-MIB1-1:1 No - lnc-SLC6A1-1:1 No - LINC01386:2 No - lnc-MED15-1:9 Yes chr2L:473013-476170 lnc-COPZ2-1:5 No - lnc-SLC35C1-3:2 No - lnc-MRPS30-3:1 No - LINC00640:8 No - lnc-ATP6V1G2-DDX39B-4:1 No - DNAJB5-DT:7 No - LINC01456:1 No - LINC01508:6 No - LINC00692:10 No - lnc-MRGPRX4-1:7 No - LINC01303:45 Yes chr2R:9252310-9285097 lnc-RUFY4-1:2 Yes chr3R:9528238-9533011 lnc-SLC35G3-1:1 No - lnc-KIF25-2:2 No - LINC00112:3 No - LINC00395:2 No - ZNF236-DT:20 No - lnc-PDZK1IP1-1:1 No - lnc-EPHA6-2:1 No - LINC00313:5 No - lnc-CRYBA4-52:73 No - LINC01141:1 No - PWRN1:6 No - LINC02232:34 No - lnc-MED10-1:1 No - lnc-GDE1-3:4 No - lnc-COA6-7:3 No - PINCR:6 No - lnc-ACSM6-1:1 No - lnc-FAM161A-1:1 No - lnc-DUSP4-2:1 No - lnc-LAPTM4A-2:1 No - LINC02173:12 No - lnc-COL28A1-1:5 No - lnc-ZNF676-1:3 No - lnc-C22orf42-2:2 No - lnc-TK2-5:1 No - lnc-VPS8-1:1 No - lnc-RGL4-4:5 No - lnc-DAGLA-1:3 No - lnc-PFKP-9:5 No - LINC01431:10 No - lnc-COIL-2:1 No - lnc-ARHGAP22-1:1 No - lnc-IAH1-2:4 No - lnc-INSIG1-1:2 No - LINC02173:15 No - lnc-SULF2-1:1 No - lnc-C1orf94-1:1 No - lnc-RHEX-2:1 No - lnc-MFSD9-5:2 No - lnc-PRDM2-8:2 Yes chr2R:22333500-22373109 LINC01394:30 No - LINC02348:12 No - LINC02010:7 No - lnc-LRRC74A-2:1 No - lnc-LHFPL4-1:1 No - lnc-ALDH1B1-9:1 No - INSYN1-AS1:19 No - lnc-FAR2-1:1 No - lnc-NDFIP1-1:1 No - lnc-ABI3-1:2 No - lnc-NPAP1-9:8 No - lnc-SMIM12-1:5 No - lnc-XPC-1:1 Yes chr3R:23996262-23997017 lnc-JRKL-2:2 No - LINC01991:9 No - lnc-FAIM2-2:1 No - lnc-ZNF487-1:4 No - lnc-ASB4-3:2 No - lnc-TSTD2-3:1 Yes chr2R:20319180-20325973 LINC00494:7 No - lnc-NHLRC3-1:1 No - lnc-IFNAR2-1:1 No - lnc-CANX-1:2 No - lnc-P2RY1-3:6 No - lnc-TEX53-2:2 No - lnc-CFAP100-2:5 No - lnc-TSC22D1-2:1 No - lnc-SLC25A13-1:1 No - lnc-GABRR3-2:6 No - LINC02431:13 No - lnc-FAM172A-7:1 No - lnc-CFAP46-3:7 No - LINC01230:12 No - LINC02583:34 No - LINC02263:21 No - lnc-CNTN6-1:1 No - lnc-HFM1-4:8 No - lnc-DRD5-8:3 No - LINC01039:1 No - LINC01336:2 No - lnc-ZNF485-68:24 No - lnc-JUN-6:2 No - LINC02024:19 No - lnc-RNASEH1-1:13 Yes chr2R:7931054-7932380 lnc-TLR4-8:1 No - LINC00629:2 No - lnc-DNAJC8-1:2 No - lnc-RCC1L-1:1 Yes chr2L:824329-825861 lnc-DERL1-3:10 No - lnc-TPBG-2:1 No - LINC02286:13 No - lnc-C2orf91-4:1 No - LINC00927:38 No - lnc-OSTC-2:1 No - lnc-NPTX2-1:1 No - LINC00354:9 No - lnc-OXCT1-1:2 No - lnc-POTEF-3:1 No - LINC02217:25 No - LINC01146:2 No - LINC02427:20 No - lnc-GOLGA8J-5:3 No - lnc-RNF170-1:1 No - lnc-SETD7-2:1 No - lnc-PHF21A-1:1 No - lnc-ZNF404-1:3 No - LINC00882:26 No - FRGCA:2 No - lnc-PARN-1:2 No - lnc-MYL2-3:1 No - lnc-SMIM36-1:1 No - lnc-DEGS2-1:1 No - lnc-C5orf47-2:1 No - lnc-TPD52-5:2 No - lnc-DRD5-10:5 No - lnc-ITGA1-2:1 No - lnc-ASB15-1:1 No - lnc-MAN2A1-1:3 No - LINC01233:6 No - lnc-OR51E1-1:2 No - lnc-SNRPN-8:137 No - lnc-ARF5-4:1 No - LINC01154:10 No - lnc-ATP6AP2-5:1 No - LINC01186:8 No - lnc-AQP11-1:1 Yes chr2R:17590964-17591881 lnc-DIO3-2:1 No - lnc-PELI1-3:1 No - lnc-FLNB-1:1 No - LINC01865:5 No - LINC00205:1 No - LINC00689:3 No - lnc-DDX18-1:2 No - lnc-GNAI1-1:1 No - CARMN:24 No - lnc-TRMO-1:1 No - LINC01116:1 No - lnc-ZRANB1-2:2 No - lnc-KHDRBS3-5:4 No - LINC02362:25 No - lnc-TBP-1:2 No - lnc-PPP1R3D-3:3 No - lnc-SMOC2-1:1 No - LINC02541:58 No - lnc-RMDN2-1:1 No - lnc-OGFOD3-1:5 No - lnc-KCNA4-2:3 No - lnc-CCDC179-2:3 No - lnc-XPR1-1:1 No - LUCAT1:18 No - lnc-TMEM132B-4:13 No - lnc-NUP107-26:2 No - lnc-MRPL47-1:1 No - lnc-DAAM2-9:6 No - lnc-DTL-3:1 No - LINC01224:46 No - lnc-NPAP1-9:10 No - lnc-UGT2B15-1:2 No - lnc-IL4R-1:1 No - lnc-APOC3-2:1 Yes chrX:9160124-9162090 lnc-CHST2-1:1 No - lnc-GPR83-2:1 No - lnc-RASL10A-1:1 Yes chr3R:5414527-5458394 LINC02400:17 No - LINC02519:35 No - lnc-SPTBN1-2:1 No - lnc-POU3F1-2:1 No - LINC01341:6 No - lnc-KCNK1-1:2 No - LINC01350:5 No - lnc-PCED1B-1:6 No - lnc-IGFBP1-4:1 No - lnc-PRR5-1:1 No - lnc-DAP-1:1 No - lnc-PCED1B-5:25 No - TBX2-AS1:12 No - lnc-TMEM132B-4:17 No - lnc-CBARP-1:1 No - lnc-NDFIP2-3:1 No - lnc-NEURL1B-3:11 No - LINC01219:1 No - lnc-CAST-1:1 No - lnc-SLC9A1-1:1 No - LINC02036:10 No - lnc-TRAPPC12-2:1 No - lnc-SMIM21-2:1 No - lnc-TMEM105-2:30 No - lnc-AMELY-6:3 No - lnc-RPLP1-12:33 No - lnc-NDFIP2-12:1 No - lnc-ZC3H11B-1:16 No - lnc-CALN1-1:2 No - GMDS-DT:136 No - lnc-REG3G-3:1 No - lnc-DTNB-4:1 Yes chr2R:14503958-14512493 LINC00887:9 No - LINC00662:15 No - LINC01934:16 No - LINC00310:5 No - lnc-FAR2-1:2 No - lnc-ANKRD1-2:1 No - LINC01224:53 No - LINC00313:3 No - lnc-CTTNBP2-3:3 No - ZBED5-AS1:9 No - lnc-COL15A1-1:2 No - lnc-BUB3-4:29 No - lnc-SHH-1:1 No - lnc-OR2W1-1:1 No - lnc-TGIF2LX-1:2 No - lnc-SLC39A11-1:6 No - RAB30-AS1:11 No - lnc-PELI2-4:1 No - lnc-CCDC74A-6:2 No - lnc-ZNF445-14:3 No - LINC01861:3 No - lnc-MAP1LC3B-1:2 No - lnc-FAM49A-5:1 No - lnc-SVIL-2:1 No - lnc-SIX2-1:1 No - LINC00460:1 No - lnc-MEX3B-1:2 No - lnc-CCDC187-1:23 No - lnc-RAB28-2:1 No - LINC00494:1 No - LINC02058:3 No - lnc-CMPK2-7:1 No - lnc-FOXD4L6-1:15 No - lnc-NAV1-1:2 No - lnc-POLN-1:3 Yes chr3R:21223704-21229512 LINC01517:7 No - lnc-KCTD6-1:6 No - lnc-NIPBL-1:1 No - lnc-HDGFL1-2:11 No - lnc-GPCPD1-8:7 No - lnc-DIRAS2-3:1 No - lnc-OTOL1-13:5 No - LINC00408:4 No - lnc-TK2-4:4 No - lnc-ERICH2-1:5 No - lnc-TMEM132B-4:5 No - lnc-BCL11A-5:1 No - lnc-BASP1-2:2 No - lnc-ST3GAL4-55:11 No - lnc-NKAIN3-14:7 No - LINC02577:23 No - lnc-CLEC4D-1:1 No - lnc-AIG1-1:1 No - lnc-ZNF708-14:1 No - LINC00900:11 No - MIR193BHG:12 No - lnc-HOXD13-1:1 No - LINC02325:31 No - lnc-EXOSC9-4:2 No - lnc-WDR11-1:1 No - LINC00642:8 No - lnc-KCNH1-2:1 Yes chrX:19521929-19530896 LINC00112:4 No - INSYN1-AS1:28 No - lnc-PYDC2-1:1 No - LINC00376:2 No - LINC01889:5 No - lnc-SEL1L3-1:2 No - LINC00303:5 No - LINC02537:11 No - lnc-PGPEP1L-10:3 No - lnc-ABCD3-4:1 No - LINC02523:5 No - lnc-FAM47B-1:1 No - lnc-LRRC1-4:1 No - lnc-SNX18-1:1 No - LINC00208:2 No - LINC01708:27 No - lnc-F13A1-3:2 No - lnc-TENM4-2:2 No - lnc-ACBD5-2:1 No - lnc-PREPL-1:1 No - lnc-TRIM43-7:2 No - lnc-USP34-1:5 No - lnc-ISL1-1:1 No - LINC01702:14 No - GAS1RR:1 No - PRKAR2A-AS1:11 No - lnc-ZWINT-2:1 No - lnc-SALL3-1:1 No - lnc-ACP1-9:1 No - lnc-HNF1A-1:1 No - lnc-ASCL1-6:4 No - lnc-FOXD4L5-13:2 No - lnc-PI3-1:5 No - lnc-CD83-3:9 No - lnc-SPATA31A1-5:4 No - LINC00899:7 No - LINC01471:10 No - lnc-AIFM2-1:1 No - LINC00927:44 No - lnc-TMEM74B-1:1 Yes chr2R:11967343-11970115 lnc-DHX37-6:3 No - LINC00486:17 No - LINC01550:23 No - lnc-NTM-6:1 No - MIR663AHG:4 No - lnc-DCUN1D1-6:1 No - ZNF426-DT:21 No - LINC00635:19 No - lnc-MGAT1-4:3 No - BSN-DT:22 No - lnc-CCDC187-1:28 No - lnc-NCOA3-5:8 No - lnc-KCTD6-1:5 No - lnc-PLTP-1:1 No - lnc-PIP4P2-3:1 No - lnc-KCNE1B-5:2 No - lnc-SDSL-6:2 No - lnc-WHAMM-1:1 Yes chr2L:6719394-6723359 lnc-IER3-15:6 No - LINC00954:1 No - lnc-S1PR1-2:2 No - LINC00881:6 No - lnc-SFT2D3-1:1 No - lnc-MYEF2-3:2 No - lnc-RUBCN-2:6 No - lnc-GBP5-1:1 No - lnc-WARS2-2:2 No - DLEU1:42 No - lnc-CLDN20-2:1 No - lnc-NCOA3-10:5 No - LINC02162:7 No - lnc-FAT1-2:1 No - lnc-DDX58-1:1 No - lnc-CCDC7-18:1 No - lnc-CBLB-3:4 No - LINC01972:5 No - lnc-PPDPFL-2:12 No - lnc-ZNF599-3:2 No - lnc-POTEM-2:30 No - lnc-CHRNB4-1:2 Yes chrX:8276200-8367169 lnc-SLC30A4-8:1 No - lnc-DCTD-1:1 No - LINC02248:10 No - lnc-CDH22-1:1 No - lnc-POTED-4:1 No - lnc-MFSD14B-2:2 No - lnc-PITRM1-7:7 No - lnc-CYSTM1-1:10 No - LINC00513:20 No - LINC01180:2 No - lnc-FSCB-4:1 No - lnc-NPAP1-5:1 No - lnc-RGS8-2:1 No - LINC01533:3 No - LINC02102:15 No - lnc-S1PR1-2:3 No - lnc-KLF7-1:12 No - RRS1-AS1:12 No - lnc-ZKSCAN1-1:5 No - lnc-LEPROTL1-3:3 No - LINC01697:26 No - lnc-GATA3-2:1 No - lnc-CNOT6-4:2 No - BOK-AS1:6 No - lnc-NTRK2-2:1 No - lnc-LRGUK-1:1 No - lnc-PDE10A-1:4 No - LINC02292:13 No - lnc-NPAS2-1:4 No - LINC01544:1 No - lnc-TINCR-1:2 No - lnc-OR14K1-1:6 No - lnc-FER-2:1 No - lnc-TGIF1-12:2 No - lnc-NUDT12-3:2 No - lnc-MT1A-1:1 No - lnc-GJD2-1:1 No - LINC01939:7 No - LINC00652:2 No - lnc-ZNF791-2:1 No - lnc-HDDC2-2:1 No - PWRN1:29 No - LINC02217:44 No - LINC00929:5 No - LINC01208:1 No - LINC01869:27 No - lnc-ADCY9-1:4 No - lnc-ACVR2A-1:1 No - CASC23:2 No - FAM111A-DT:34 No - LINC01327:1 No - LINC00882:16 No - lnc-MIPOL1-2:1 No - lnc-CTDSP2-2:1 No - lnc-SLC12A7-1:16 No - lnc-MRPS9-1:4 No - LINC01589:2 No - lnc-MEOX1-1:1 No - lnc-PTPRU-2:1 No - LINC00613:4 No - lnc-ZNF705D-2:52 No - lnc-IL1R1-1:1 No - lnc-OTOL1-13:2 No - lnc-ONECUT1-1:3 No - LINC02147:11 No - lnc-OTOS-1:2 No - lnc-FAM110B-4:1 No - LINC02040:6 No - lnc-SPATA31A7-1:1 No - LINC01825:3 No - lnc-TNFAIP3-4:3 No - lnc-RPLP1-12:26 No - lnc-DEC1-10:1 No - lnc-EIF2AK4-1:3 No - lnc-ASAP2-4:1 No - lnc-CTU1-2:1 No - lnc-BNIP1-3:1 No - lnc-NETO1-1:14 No - lnc-KIAA0232-1:1 No - lnc-SYNE3-3:4 No - lnc-ROBO2-2:1 No - lnc-BUB3-4:8 No - lnc-PRR16-1:1 No - CHKB-DT:56 Yes chr2L:21614232-21624080 lnc-CDK20-5:1 No - lnc-COL6A3-12:1 No - lnc-CHD9-3:4 No - lnc-BUB3-4:18 No - lnc-CAPN13-2:4 No - lnc-NR2F1-1:2 No - lnc-BTN3A2-1:1 No - lnc-AMOTL2-2:1 No - lnc-EMP3-1:2 No - LINC02315:12 No - lnc-HELZ-1:1 No - lnc-KCNE4-3:1 No - lnc-LYZL2-11:2 No - lnc-TCP11L2-1:2 No - lnc-CHAC2-2:1 No - lnc-RAP2B-4:2 No - lnc-NRSN1-3:1 No - lnc-KHDRBS3-4:2 No - lnc-TDRD3-2:6 No - lnc-SH3D21-1:1 No - lnc-POM121L12-1:2 No - LINC01220:6 No - lnc-NDUFV2-1:2 No - lnc-TTPA-1:6 No - LINC01739:7 No - lnc-ERICH1-21:1 No - lnc-DRD5-3:1 No - LINC01364:4 No - LINC02317:6 No - lnc-ZNF507-5:3 No - LINC02530:4 No - lnc-GNAQ-2:4 No - lnc-POU1F1-1:2 Yes chr2R:12884632-12899385 FRMPD3-AS1:1 Yes chr3R:15095957-15131926 lnc-ARSJ-1:2 No - lnc-PPME1-1:2 No - lnc-FBXO8-1:1 No - LINC01449:2 No - lnc-LSM6-1:1 No - lnc-ZNF423-2:1 No - lnc-UBL5-7:2 No - lnc-PTS-3:2 No - lnc-ANKRD46-1:1 No - lnc-EEPD1-49:7 No - MAFTRR:1 No - lnc-CPEB2-8:1 No - lnc-GOLGA8S-2:1 No - lnc-HS3ST4-1:4 No - lnc-LHFPL6-1:2 No - lnc-SLC5A9-2:2 No - lnc-TRIML1-6:1 No - lnc-BRD3-1:1 Yes chrX:2585980-2588217 lnc-ANKRD60-1:1 No - PRKCQ-AS1:13 No - LINC02050:23 No - lnc-DSC3-2:1 No - lnc-LTBP3-2:3 No - lnc-DMRTA2-1:17 No - DUBR:12 No - LINC01838:6 No - LINC01859:14 No - lnc-RTN4IP1-1:1 No - lnc-MAK16-1:3 No - lnc-GRAMD4-2:1 No - lnc-CCDC125-6:5 No - lnc-CDX2-1:1 No - lnc-ELAVL4-1:1 No - lnc-DFFB-50:1 No - lnc-USP12-9:12 No - lnc-SPIRE2-1:2 Yes chr2L:20311219-20348386 lnc-HMGB3-1:1 No - lnc-CTDSPL2-1:1 No - lnc-NRK-1:1 No - LINC01811:29 No - lnc-XKR9-5:2 Yes chr2L:6527447-6546976 LINC00592:12 No - lnc-BOD1-1:6 No - lnc-PIGF-3:3 Yes chr3R:5591763-5595356 lnc-ULBP3-1:1 No - PANTR1:34 No - LINC00662:44 No - lnc-SLFN5-1:5 No - lnc-TNFAIP3-5:6 No - LINC01303:28 Yes chr2R:9252310-9285097 lnc-CLDN14-1:1 No - lnc-EXOSC9-2:2 No - lnc-GNLY-1:1 No - LINC01074:1 No - lnc-ETAA1-4:5 No - lnc-INSC-3:3 No - lnc-FAM84A-1:2 No - lnc-JAM2-7:2 No - lnc-TMEM132E-1:2 No - lnc-ASB15-2:2 No - lnc-REG1B-2:1 No - lnc-AK5-1:1 No - lnc-ELFN1-1:3 No - lnc-GDAP2-1:5 No - lnc-GLI2-2:1 No - lnc-PHIP-1:1 No - lnc-ASB4-3:4 No - LINC00460:2 No - lnc-SCLT1-1:1 No - LINC01470:1 No - SATB1-AS1:88 No - LINC01961:12 No - LINC01524:18 No - lnc-UCHL5-108:18 No - LINC02499:13 No - lnc-CSGALNACT1-2:1 Yes chrX:17911462-17924163 lnc-ZNF621-3:1 No - lnc-LRRC30-3:1 Yes chr2R:4744348-4758048 lnc-CMPK2-34:4 No - lnc-MUC20-5:7 No - lnc-GINM1-1:1 No - LINC01833:38 No - lnc-EIF5AL1-1:1 No - lnc-PCDH7-2:1 No - SLC25A25-AS1:9 No - lnc-C3orf30-5:1 No - lnc-SMIM37-1:4 No - lnc-CHRAC1-1:2 No - lnc-INSC-3:4 No - lnc-SLC44A3-2:1 No - LINC01226:1 No - LINC01333:1 No - LINC01018:13 No - GMDS-DT:124 No - lnc-ABLIM2-1:1 No - lnc-TMCC1-12:3 No - lnc-JUN-6:3 No - lnc-SYK-6:2 No - lnc-FABP1-1:1 No - lnc-ANO1-1:1 No - LINC01798:19 No - RAB30-AS1:13 No - lnc-FBXW11-2:1 No - lnc-CCR7-1:1 No - LINC00626:4 No - LINC02368:7 No - lnc-SEL1L-10:1 No - lnc-VPS8-2:5 No - lnc-NR1D1-1:3 No - lnc-IGFBP7-6:2 No - lnc-C8orf86-1:2 No - lnc-OXNAD1-1:1 No - lnc-LONP2-2:1 No - lnc-PRSS22-1:2 No - lnc-CASP10-1:6 No - lnc-TBC1D4-2:8 No - lnc-THBS2-1:1 No - lnc-CD46-2:1 No - lnc-TRIM7-1:1 No - lnc-PTPRD-4:1 No - LINC00944:24 No - LINC00894:36 No - lnc-SLC25A37-1:1 No - lnc-TSHR-3:1 No - lnc-MRPL33-1:9 No - OLMALINC:13 No - lnc-SPAG1-3:9 No - lnc-PDP2-3:3 Yes chrX:7731779-7734651 lnc-SATB1-1:1 No - lnc-OAF-2:1 No - lnc-CXCR5-1:1 No - LINC01248:1 No - lnc-SLC38A11-1:2 No - lnc-PHOX2B-3:1 No - TTTY8:2 No - GMDS-DT:109 No - lnc-SOCS5-4:9 No - lnc-ADCY1-2:1 No - lnc-DRD5-10:7 No - LINC01931:6 No - lnc-NEUROD2-1:1 No - lnc-HAND2-3:2 No - LINC02527:5 No - lnc-FAM83A-1:1 Yes chr2R:15794000-15855645 SIRLNT:12 No - lnc-JPH4-4:8 No - lnc-LGALS12-1:1 No - lnc-CSMD1-1:7 No - LINC01505:2 No - lnc-RBM11-10:2 No - lnc-ARL4A-54:5 No - LINC00899:14 No - lnc-ZNF705D-2:58 No - lnc-REG3G-89:1 No - lnc-FGFRL1-3:1 No - lnc-ERICH1-80:1 Yes chr2R:5702112-5705439 LINC01224:54 No - lnc-PPP1R3B-2:2 No - OLMALINC:6 No - lnc-HIVEP1-1:3 No - lnc-GTF2B-15:17 No - lnc-NUMB-1:5 No - lnc-TMEM18-6:4 No - lnc-NGF-1:1 No - LINC00887:6 No - LINC01756:4 No - lnc-IRX1-4:2 No - lnc-ASPH-5:2 No - lnc-RIOK2-2:1 No - lnc-FAM49A-3:1 No - FZD10-DT:54 No - lnc-BEST3-1:8 No - lnc-KMT2E-1:11 No - LINC01515:14 No - lnc-ADGRA1-2:1 No - lnc-RAB27B-11:7 No - lnc-ALDH3B1-2:2 No - lnc-NEURL1B-1:1 No - lnc-SPATA31E1-1:1 No - lnc-COL28A1-1:7 No - lnc-PADI1-1:1 No - lnc-ANKRD50-5:1 No - lnc-SEZ6-2:1 No - lnc-CDC42SE2-1:8 Yes chr3R:5616644-5624125 lnc-ZNF680-11:1 No - lnc-CTAGE5-8:14 No - lnc-IGFBP2-8:3 No - lnc-ST3GAL4-55:6 No - lnc-HS3ST3B1-1:2 No - lnc-RAD54L-1:1 No - lnc-KCNJ3-1:1 No - lnc-ANGPT2-2:3 No - lnc-TGFBRAP1-8:1 No - CCDC18-AS1:10 No - lnc-ZNF644-1:8 No - lnc-CHL1-1:1 No - lnc-PAX4-1:2 No - lnc-FSCB-1:2 No - lnc-EIPR1-5:1 No - lnc-C1orf21-2:1 No - lnc-CTDSP2-4:1 No - LINC00029:8 No - lnc-AJAP1-3:7 No - lnc-FAM182B-4:1 No - lnc-PDE6B-1:3 No - lnc-TM4SF1-1:1 No - LINC00882:25 No - lnc-HOXC13-2:1 No - lnc-MTURN-1:2 No - lnc-KHNYN-5:1 No - lnc-ADRA2C-5:1 No - lnc-TMEM132C-6:5 No - lnc-ERP44-3:2 No - lnc-EVA1C-2:2 No - LINC02037:6 No - lnc-ADD3-3:3 No - lnc-UBE2L5-1:1 No - lnc-TSTA3-5:1 No - LINC02305:7 No - lnc-PGPEP1L-10:2 No - lnc-PLPP2-5:1 No - lnc-PELI2-3:1 No - lnc-UBE2H-1:1 No - SATB1-AS1:87 No - lnc-IGSF5-1:1 No - lnc-FBXW4-1:3 No - lnc-MYO3A-2:1 No - lnc-MDFIC2-2:1 No - lnc-CHST14-3:1 No - lnc-RAD23B-3:6 No - lnc-NUAK1-4:1 No - lnc-GPCPD1-8:2 No - lnc-SORBS2-1:1 No - lnc-RAP2B-5:1 No - lnc-JPH1-2:2 No - lnc-NOVA1-3:2 No - lnc-ZNF98-1:1 No - LINC02053:12 No - lnc-SCEL-1:1 No - LINC00702:3 No - lnc-DERL1-1:1 No - lnc-JUN-5:2 No - LINC01360:6 No - lnc-ZFP64-5:1 No - lnc-BET1-1:1 No - lnc-TET2-5:1 No - lnc-MUC22-1:6 No - lnc-SOD3-15:1 Yes chr3R:4422483-4429335 lnc-TENM4-4:8 No - LINC01047:3 No - lnc-MUC20-67:91 No - lnc-MYOF-1:1 No - lnc-EVX2-4:2 No - lnc-TCIM-2:2 No - lnc-TBXT-2:3 No - lnc-ALCAM-3:1 No - LINC02050:21 No - LINC00635:7 No - TAF1A-AS1:5 No - lnc-KDM5D-4:1 No - SEMA3B-AS1:1 No - lnc-ZNF236-7:7 No - lnc-ZFHX4-3:3 No - ILF3-DT:17 No - lnc-CYLD-2:7 No - lnc-HSP90AA1-3:2 No - LINC00662:13 No - lnc-GADD45G-6:1 No - lnc-SLC25A15-1:1 No - lnc-TMEM206-5:7 No - lnc-RNF32-53:3 No - lnc-ABT1-3:9 No - lnc-ATP6V1E2-2:1 Yes chr3R:30058311-30121798 lnc-E2F3-1:1 No - lnc-PRICKLE3-4:1 No - lnc-LRCOL1-3:6 No - lnc-TBC1D1-1:3 No - lnc-SCGB1C2-8:1 No - lnc-SMC1B-4:2 No - LINC02143:7 No - PWRN1:1 No - lnc-BOD1-1:9 No - lnc-CKAP2L-1:6 No - lnc-DLGAP5-2:1 No - LINC01105:14 No - lnc-TMEM185B-2:1 No - lnc-MRPL39-7:3 No - LINC01326:1 No - lnc-USP35-10:1 No - lnc-NDUFS6-5:2 Yes chr3L:12609631-12710249 SRP14-AS1:4 No - lnc-DROSHA-4:1 No - LINC02153:23 No - CCDC18-AS1:18 No - LINC00710:8 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-NTRK2-2:2 No - LINC00211:8 No - LUCAT1:7 No - lnc-RTL1-3:15 No - lnc-HERPUD2-4:1 No - lnc-TMEM132B-4:16 No - LINC01285:3 No - OIP5-AS1:15 No - lnc-LSR-1:2 No - lnc-THBS1-1:5 No - lnc-TSN-6:1 No - TNKS2-AS1:3 No - LINC01248:2 No - lnc-BORA-32:1 No - lnc-CCDC187-1:25 No - lnc-ST3GAL4-55:7 No - lnc-COX10-1:2 No - lnc-PHF10-1:1 Yes chrX:19626548-19638369 lnc-CLHC1-1:1 No - LINC02030:3 No - lnc-OPRK1-3:12 No - lnc-ITM2C-1:2 No - lnc-NAALADL2-2:1 No - lnc-TACR1-1:1 No - LINC02283:4 No - lnc-COL4A1-2:7 No - lnc-TXNRD1-3:1 No - lnc-KCNQ2-1:1 Yes chr2R:10145897-10192394 lnc-ZNF516-7:1 No - LINC002481:13 No - SPATA41:1 No - lnc-NOP14-3:1 Yes chr3R:9791483-9793098 LINC01032:2 No - LINC02555:11 No - LINC02240:19 No - SPATA41:4 No - lnc-GSDME-3:7 No - lnc-SNCA-2:1 No - LINC00237:3 No - lnc-CDRT15L2-1:2 No - TTTY7:1 No - lnc-NETO1-2:1 No - lnc-EEPD1-4:1 No - LINC01366:8 No - LINC01896:42 No - lnc-RAP1B-1:2 No - LINC01596:3 No - RORB-AS1:5 No - lnc-TYW5-2:1 Yes chr2R:24969678-24970855 lnc-ELOVL5-1:1 No - lnc-ZNF703-2:4 No - LRRC8C-DT:39 No - LINC01805:3 No - lnc-NETO1-1:8 No - lnc-ZFP64-4:4 No - lnc-KLF15-2:5 No - LINC01586:1 No - LINC00396:3 No - lnc-PSMD7-7:6 Yes chr4:501810-540874 lnc-PPP4R1-2:1 No - lnc-KIF1BP-2:2 No - lnc-CLMP-2:2 No - lnc-SBF2-2:4 No - lnc-TSPO2-1:1 No - lnc-RIMBP2-2:1 No - lnc-MRM2-1:1 No - lnc-NMT2-1:1 No - lnc-COL8A1-2:1 No - lnc-SGPL1-3:1 No - lnc-GLI2-3:1 No - lnc-GDAP2-1:3 No - lnc-FOXL1-2:2 No - LINC01381:1 No - lnc-GATA3-9:1 No - lnc-RMDN2-3:13 No - lnc-IRF2BP2-1:1 No - FAM87B:5 No - LINC01345:7 No - lnc-ZPBP-4:1 No - lnc-OXNAD1-1:2 No - lnc-DAOA-14:5 No - LINC02434:9 No - lnc-CCL13-1:1 No - lnc-SNRPB2-1:2 No - LINC02384:38 No - LINC01859:20 No - lnc-BTRC-1:1 No - lnc-TMEM235-1:1 No - lnc-CSN2-1:1 No - lnc-C10orf143-5:1 No - lnc-PITRM1-7:6 No - LINC02460:5 No - lnc-SORCS3-5:5 No - lnc-PXDC1-1:6 No - lnc-ELFN1-1:2 No - lnc-RTP5-1:4 No - lnc-ATP6AP1L-2:1 No - lnc-LRRC4C-5:5 No - lnc-EPHA6-1:3 No - lnc-C16orf95-1:11 No - lnc-MED15-1:10 Yes chr2L:473013-476170 lnc-PYDC2-3:3 No - LINC01811:31 No - NUTM2B-AS1:57 No - lnc-MTRR-2:1 No - lnc-MERTK-1:1 Yes chrX:15455544-15462441 lnc-ADARB2-4:6 No - lnc-GBE1-5:1 No - lnc-TMEM105-2:4 No - lnc-E2F7-2:2 No - LINC01592:2 No - lnc-NAALADL2-1:17 No - lnc-CPO-1:1 No - LINC01248:13 No - LINC01229:13 No - lnc-RAP1GDS1-3:5 No - LINC00999:5 No - lnc-NEIL3-1:1 No - LINC02429:6 No - lnc-HPDL-1:1 No - lnc-ANKRD10-4:1 No - RBM26-AS1:15 No - lnc-TLR4-3:5 No - lnc-GATA3-4:1 No - lnc-SUMF2-3:1 No - lnc-TOX3-1:11 No - LINC00939:3 No - lnc-TET2-2:2 No - LINC01584:15 No - LINC01081:6 No - lnc-SORCS3-6:3 No - LINC00661:24 No - lnc-C1orf21-3:1 No - lnc-GREM2-1:1 No - LINC01149:2 No - PVT1:29 No - lnc-PRKX-5:1 No - lnc-CFAP74-1:7 No - LINC01938:14 No - lnc-MTIF3-1:1 No - lnc-FAM110B-3:2 No - lnc-AKR1E2-5:6 No - MAFTRR:10 No - lnc-STK35-4:4 No - lnc-THBS1-2:1 No - lnc-TRAF5-6:2 No - LINC02434:7 No - lnc-NTN1-4:1 No - lnc-TNFAIP3-3:1 No - lnc-COL5A1-2:1 No - KTN1-AS1:5 No - lnc-TGFBI-80:11 Yes chr3R:27559379-27561319 LINC02173:13 No - LINC00326:6 No - lnc-ADCY9-1:2 No - lnc-BATF3-2:6 No - lnc-WDR70-7:15 No - lnc-TPK1-1:1 No - lnc-TRPM1-1:10 No - lnc-RETNLB-1:2 No - lnc-MBNL2-1:1 No - lnc-PLEC-1:1 No - LINC01851:8 No - lnc-C5orf63-1:3 No - lnc-SERTAD2-3:1 No - lnc-TMTC3-5:3 No - lnc-ATP11B-1:1 No - lnc-SRD5A3-1:2 No - LINC02328:56 No - lnc-OR2J3-7:1 No - LINC02106:8 No - lnc-CTAGE5-4:1 No - lnc-ASB2-1:1 No - lnc-LAMA4-1:3 No - lnc-PRIM2-4:1 No - lnc-TOR1AIP2-1:1 No - lnc-PITRM1-7:11 No - LINC02397:32 No - LINC02189:11 No - lnc-KRT80-5:1 No - lnc-NFE2L3-1:1 No - lnc-UCHL3-4:1 No - CARMN:16 No - MIR9-3HG:24 No - LINC02482:22 No - lnc-ERC2-1:1 No - lnc-DYDC1-3:1 No - lnc-TSSC4-2:1 Yes chr3R:25872900-25881427 lnc-ID2-2:1 No - lnc-ADGRL4-8:1 No - lnc-IFNG-2:1 No - lnc-DTNBP1-2:5 No - lnc-TGFBR1-1:1 No - lnc-MPZ-1:1 No - LINC00659:2 No - lnc-ZNF236-13:2 No - lnc-TDRD3-4:11 No - LINC00387:1 No - lnc-WDR26-1:4 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-FAM153C-2:1 No - lnc-PPP1R1A-1:1 No - lnc-STMP1-2:1 No - lnc-GYPA-1:1 No - lnc-BAG1-2:12 No - lnc-CTNNA1-1:1 No - LINC00710:25 Yes chr2L:12344219-12397528 LINC00261:5 No - lnc-HECA-3:1 No - lnc-ERP44-3:1 No - LINC00415:2 No - lnc-NTM-3:1 No - LINC00908:11 No - lnc-CMPK2-5:66 No - lnc-ITGA11-2:2 No - LINC02345:24 No - lnc-ADGRL3-2:10 No - lnc-PAM-4:1 No - lnc-IQCK-1:2 No - LINC02568:21 No - lnc-PSMD7-7:2 Yes chr4:501810-540874 LINC01139:2 No - LINC02447:15 No - lnc-ALX4-1:1 No - lnc-ASB9-1:1 No - lnc-POLE4-8:14 No - lnc-RAB1A-1:2 No - lnc-CCDC125-6:2 No - LINC01081:2 No - lnc-ZNF503-1:1 No - lnc-ARID3B-1:1 No - GMDS-DT:122 No - LINC01649:13 No - LINC02020:22 No - lnc-CLEC2D-6:1 No - lnc-AMY1B-1:3 No - LINC01946:3 No - lnc-NDUFV3-2:4 No - lnc-CCDC187-1:35 No - lnc-TAF3-1:7 Yes chr3R:8147368-8181444 LINC02150:10 No - lnc-ING1-1:3 No - LINC01137:6 No - LINC00486:1 No - LINC02290:26 No - lnc-BOD1L1-2:1 No - lnc-CKS2-1:1 No - lnc-CIDEA-2:3 No - lnc-KCNB2-12:3 No - lnc-POLN-1:1 Yes chr3R:21223704-21229512 lnc-OR5AK2-1:2 No - lnc-NOCT-1:6 No - BARX1-DT:12 No - lnc-PXDN-1:1 No - lnc-OR2J2-1:1 No - LINC02000:4 No - lnc-TMEM132D-2:1 No - lnc-RPLP1-12:29 No - lnc-PCP4L1-1:1 No - lnc-NTSR2-5:7 No - lnc-NCOA3-7:2 No - lnc-APBB1IP-1:1 No - LINC02447:26 No - LINC01016:4 No - lnc-MATN2-2:1 Yes chr2L:19008031-19009306 lnc-TNP1-1:1 No - lnc-ANKRD55-7:2 No - lnc-ASTN2-3:1 No - lnc-ADAMTS6-1:1 No - lnc-GOT2-1:3 No - lnc-MBOAT1-2:19 No - lnc-PPDPFL-5:3 No - MIR4500HG:1 No - lnc-RIPOR1-1:12 No - LINC02372:12 No - lnc-UMPS-2:1 No - LINC02039:10 No - lnc-ANGEL2-1:1 No - lnc-PSMG1-4:3 No - lnc-SMCHD1-1:1 No - lnc-PPM1M-2:2 No - lnc-CST8-2:2 No - lnc-KCNJ2-1:1 No - lnc-CHMP2B-2:3 No - LINC02027:16 No - lnc-USP14-2:1 No - lnc-SPTSSB-1:1 No - LINC00924:3 No - lnc-PTPRU-5:1 No - LINC02060:6 No - lnc-ARAP2-4:1 No - LINC01182:2 No - PWRN1:9 No - lnc-TMEM70-1:3 No - lnc-NIFK-6:1 No - MHENCR:25 No - lnc-PREX1-6:1 No - lnc-MN1-2:1 No - LINC00944:14 No - lnc-FOXD4L6-1:6 No - LINC01909:15 No - lnc-ANXA2R-1:23 No - LINC01615:5 No - lnc-CABCOCO1-1:8 No - lnc-UVSSA-1:6 No - HCG26:1 No - LINC01425:3 No - lnc-SLC39A11-1:25 No - lnc-EGLN1-1:2 No - lnc-DUXA-1:1 No - lnc-GNAO1-1:2 No - LINC01818:6 No - lnc-PHF10-1:3 Yes chrX:19626548-19638369 lnc-SMIM15-3:2 No - LINC00632:12 No - lnc-ANTXRL-3:1 No - LINC01834:3 No - lnc-PDGFA-2:1 No - lnc-USP6NL-10:3 No - lnc-EFNB2-1:1 No - lnc-SEPT9-4:1 No - lnc-METTL22-2:2 No - lnc-POM121L12-3:1 No - lnc-DRD5-10:8 No - lnc-MAPK6-2:2 No - lnc-SORCS3-5:3 No - lnc-ZNF32-2:2 No - lnc-FABP5-1:1 No - lnc-SLC25A30-2:4 No - lnc-HMGB2-15:9 No - lnc-PGM5-2:13 Yes chr3L:16126018-16128531 LINC01307:4 No - lnc-CDH5-13:1 No - LINC02362:28 No - lnc-GSDME-2:1 No - lnc-HS1BP3-1:10 No - lnc-FSIP1-6:1 No - ZNF426-DT:22 No - LINC02099:15 No - lnc-MBOAT1-2:21 No - lnc-TRIML2-14:3 No - lnc-MED13L-1:1 No - lnc-EMC8-6:5 No - lnc-CCKAR-5:6 No - lnc-ARRDC4-5:1 No - lnc-LRRC28-1:1 No - MIR3976HG:4 No - lnc-BMP4-2:1 No - lnc-SSU72P8-2:1 No - lnc-SMPDL3A-3:3 Yes chr2L:19435850-19442727 lnc-B3GNT10-22:2 No - lnc-IAH1-2:1 No - LINC01226:2 No - lnc-DDX18-1:4 No - lnc-URI1-1:1 No - lnc-ATG10-2:2 Yes chr2R:9207561-9209774 lnc-FRG1-6:1 No - lnc-CRBN-1:3 No - LINC01933:7 No - lnc-SLC12A7-1:8 No - LINC01341:15 No - lnc-PCID2-1:1 No - LINC02085:11 No - lnc-FOXD4L6-1:2 No - lnc-SUN3-1:1 No - lnc-DRD5-10:9 No - lnc-NUFIP1-1:5 No - lnc-STRA6-1:2 No - lnc-KLF7-1:6 No - lnc-LRRC32-6:2 No - lnc-PSMA2-1:1 No - lnc-TNFRSF10A-1:2 No - LINC00707:8 No - lnc-NOCT-8:3 No - LINC02221:9 No - LINC00919:5 No - lnc-ADAMTS15-5:9 No - LINC02114:7 No - lnc-WDR60-1:1 Yes chr2R:16230198-16234087 lnc-GJA5-2:1 No - lnc-ZNF605-1:8 No - LINC00366:1 No - lnc-TLE3-1:2 No - lnc-KCND2-1:1 No - LINC02487:5 No - lnc-GALM-3:1 No - lnc-ULK4-4:1 No - lnc-NRSN1-3:2 No - lnc-PXDC1-1:8 No - lnc-ARFGEF2-2:9 No - lnc-MAFB-2:3 No - lnc-MT1A-1:4 No - lnc-MFNG-1:2 No - LINC01384:2 No - lnc-TMEM17-2:3 No - lnc-SMIM14-1:1 No - lnc-CRYBA4-5:1 No - lnc-ZNF608-1:1 No - lnc-CDKN1C-1:1 No - lnc-IGFBP7-5:5 No - LINC01019:3 No - lnc-LNPEP-8:7 No - LINC02525:25 No - GMDS-DT:103 No - lnc-ALDH1A3-1:10 No - lnc-ABRAXAS1-1:1 No - LINC00437:2 No - LINC01840:3 No - lnc-PPARGC1A-2:1 No - LRRC8C-DT:40 No - lnc-GCNT7-2:1 No - lnc-ITGA1-2:3 No - lnc-BOD1-1:24 No - lnc-IRX1-5:1 No - lnc-DHRS7B-1:3 No - lnc-FZD10-3:3 No - LINC01374:14 No - LINC00927:45 No - lnc-CD55-2:1 No - LINC00661:13 No - lnc-VPS8-2:3 No - LINC01258:1 No - lnc-FSTL5-2:1 No - lnc-MPPE1-1:1 No - LINC01727:15 No - lnc-DNAH8-2:2 No - lnc-CNBD1-4:19 No - lnc-POLR3G-2:1 No - lnc-KCNE1B-3:2 No - lnc-PCSK9-4:3 No - lnc-LINC02203-7:1 No - lnc-BEND7-5:8 No - LINC02369:24 No - lnc-PRICKLE2-3:2 No - IGFBP7-AS1:7 No - LINC00964:9 No - lnc-KIAA1147-5:2 No - lnc-HEATR6-1:5 No - LINC02278:3 No - lnc-HS1BP3-1:9 No - lnc-ASMT-5:1 No - LINC00906:7 No - lnc-MGST2-1:1 No - lnc-KATNAL2-1:2 No - lnc-FOXD4L6-1:14 No - lnc-KLF4-15:2 No - lnc-RWDD4-2:15 No - lnc-FRK-1:1 No - lnc-RNF187-1:1 No - lnc-CITED2-4:1 No - lnc-NR2F1-1:3 No - lnc-SORL1-2:2 No - LINC00426:12 No - TTTY5:1 No - lnc-TBC1D22A-1:1 No - lnc-ANKMY1-1:1 No - lnc-HIST1H2AG-1:1 No - lnc-DCUN1D1-7:1 No - lnc-FSCB-1:18 No - lnc-RALGAPA2-1:1 No - LINC00649:13 No - LINC02264:4 No - lnc-TMEM232-2:1 No - lnc-ADAMTS9-3:2 No - lnc-NBAS-3:1 No - lnc-PHF20L1-1:1 No - lnc-MDGA2-2:1 No - lnc-PIWIL4-1:1 No - LINC02525:30 No - lnc-CA5A-4:7 No - lnc-CYB5R4-5:4 No - LINC00375:4 No - lnc-CRYAA-1:1 No - lnc-ZNF444-1:1 No - lnc-CDH26-1:2 No - lnc-CCDC179-1:5 No - lnc-TMEM26-3:4 No - LINC01734:4 No - lnc-PRKAB2-2:2 No - LINC02084:15 No - LINC02428:27 No - lnc-TMEM189-UBE2V1-3:5 No - LINC01977:8 No - lnc-FOXA2-3:1 No - lnc-LBR-1:2 No - lnc-ADAMTSL4-1:1 No - lnc-DDX51-1:1 No - lnc-RIOK1-1:2 No - lnc-UBASH3B-2:2 No - lnc-PENK-1:3 No - lnc-ASCL5-1:1 No - LINC00954:8 No - lnc-FBN2-4:1 No - lnc-ATAD2B-3:1 No - lnc-LPA-2:1 No - lnc-GJA1-2:1 No - lnc-GDNF-2:1 No - lnc-AMY1B-2:2 No - lnc-FGF23-3:1 No - lnc-EXOC6B-1:1 No - XIST:7 No - lnc-SPATA31A1-5:5 No - lnc-C12orf50-2:1 No - lnc-CABCOCO1-1:7 No - lnc-OAF-1:7 No - LINC01571:4 No - lnc-SAMSN1-2:5 No - lnc-CHM-1:1 No - LINC01227:9 No - LINC00114:6 No - lnc-CCKAR-14:1 No - lnc-GDAP2-1:8 No - EDRF1-AS1:29 No - lnc-GALC-8:1 No - LINC01364:5 No - lnc-GNAZ-1:1 No - lnc-GPR149-2:1 No - lnc-PAX1-2:1 No - lnc-SOX1-8:1 No - lnc-IRF2BP2-2:10 No - lnc-CDK17-4:1 No - LINC02593:42 No - lnc-NEK6-1:1 Yes chr2R:5706202-5727525 lnc-EXTL3-4:2 No - lnc-C11orf74-2:1 No - lnc-RAB11FIP4-2:2 No - lnc-MIS12-1:1 No - lnc-SNCB-2:1 No - lnc-WNT1-3:1 No - LINC01338:1 No - lnc-ASB7-4:2 No - LINC02239:4 No - lnc-CDCA4-1:1 No - lnc-SLC4A3-5:1 No - LINC01046:1 No - lnc-POU4F2-1:1 No - lnc-ZUFSP-1:1 Yes chr3R:24187724-24188896 LINC01141:11 No - LINC01105:3 No - LINC00393:2 No - lnc-SLC7A11-1:1 No - lnc-CHRAC1-1:3 No - LINC02211:10 No - lnc-OXCT1-1:3 No - LINC02042:4 No - lnc-ACTRT2-1:2 No - lnc-PHF14-3:1 No - lnc-CCDC184-1:2 No - lnc-TCF4-8:2 No - lnc-DNAH8-2:4 No - LINC01582:5 No - lnc-SMAD5-3:1 No - LINC01121:2 No - lnc-CXorf49-4:2 No - lnc-STAT6-1:2 Yes chrX:16653220-16655015 lnc-IGF1R-1:3 No - TUG1:8 No - lnc-ZFHX3-27:12 No - lnc-ALDH1A1-3:1 No - LRRC3-DT:9 No - lnc-ZMAT3-1:1 No - lnc-TBC1D4-2:9 No - lnc-B4GALNT4-1:3 No - lnc-FOLR3-1:1 No - lnc-FRG1-12:2 No - LINC02325:36 No - LINC01487:2 No - lnc-GTF2B-15:18 No - lnc-CBWD5-1:1 No - OLMALINC:19 No - lnc-PTEN-1:1 No - LINC01005:5 No - lnc-DRD5-10:11 No - lnc-THBS2-5:1 No - lnc-PEAK1-1:14 No - lnc-ANXA1-1:1 No - lnc-CLCN3-1:4 No - lnc-MMP21-1:9 Yes chr3R:15788521-15789494 lnc-ETAA1-4:2 No - lnc-PPDPFL-4:5 No - lnc-RASA1-4:1 No - lnc-MED12L-2:2 No - lnc-STAT6-1:5 Yes chrX:16653220-16655015 lnc-FBXL14-2:2 No - lnc-KLF15-2:3 No - LINC01811:17 No - lnc-FDX1-1:3 No - lnc-EDAR-5:2 No - lnc-ZNF404-1:5 No - lnc-MAFB-1:3 No - lnc-SETBP1-1:1 No - lnc-CFAP46-3:11 No - lnc-FAM168B-1:3 No - lnc-IL1B-1:1 No - lnc-KBTBD8-1:1 No - lnc-TSHZ1-1:3 No - lnc-CPN2-3:1 No - lnc-NFIA-1:1 No - LINC01505:3 No - lnc-ZNF131-2:16 No - lnc-EGR4-1:1 No - lnc-INSIG1-3:1 No - LINC00358:1 No - lnc-NUMB-1:4 No - lnc-CPXM2-1:6 No - lnc-ACTL8-1:1 No - lnc-INTS1-1:1 No - lnc-UBR3-2:1 No - LINC00354:8 No - lnc-BFSP1-1:1 No - lnc-MMP16-1:2 No - RNASEH1-AS1:8 Yes chr2R:7931054-7932380 lnc-PDGFRA-2:1 No - lnc-ZNF492-8:2 No - lnc-ZFHX4-2:4 No - LINC02517:11 No - LINC00319:2 No - LINC01539:19 No - lnc-C2CD4B-13:3 Yes chr3L:8545001-8574409 LINC01019:4 No - lnc-MTRR-4:2 No - lnc-CPO-1:3 No - LINC01363:4 No - lnc-TRIML2-3:1 No - LINC02126:11 No - lnc-NLRP4-1:1 No - PWRN2:1 No - lnc-CCDC187-1:24 No - LINC02422:16 No - LINC00486:18 No - lnc-MAN1A1-1:1 No - lnc-SDCBP-1:2 No - LINC00904:2 No - lnc-PGRMC1-1:1 No - lnc-ESM1-4:2 No - lnc-ZNF146-1:1 No - lnc-ST3GAL4-9:1 No - lnc-ZNF91-1:21 No - lnc-SEL1L3-1:3 No - lnc-TNP1-1:2 No - LINC02407:17 No - lnc-RUNX1-1:1 No - lnc-MS4A8-17:12 No - lnc-PTPRC-1:1 No - lnc-STN1-2:7 No - lnc-RAD23B-11:1 No - LINC02453:18 No - lnc-SLC22A11-2:1 No - LINC01402:1 No - lnc-ZNF680-10:1 No - lnc-PCDH18-1:6 No - LINC00924:1 No - lnc-WDR11-2:3 No - lnc-DNM1L-2:1 No - LINC01351:8 No - lnc-PRDM4-3:3 No - lnc-POT1-1:1 No - lnc-HAAO-7:13 No - lnc-SGPL1-1:1 No - lnc-BCL11B-1:1 No - lnc-MPDZ-2:2 No - lnc-TRPM1-1:13 No - lnc-PARP11-1:1 No - lnc-HNRNPA2B1-4:3 No - lnc-PDGFA-17:4 No - lnc-C3orf30-2:2 No - LUCAT1:9 No - lnc-ATP11B-4:1 No - lnc-AHNAK-1:13 No - LINC01107:2 No - lnc-SLC16A11-7:1 No - lnc-MFAP3L-1:4 No - lnc-VSNL1-1:1 No - lnc-PFKP-2:1 No - LINC02400:21 No - lnc-TM2D3-2:1 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-DMRT2-2:5 No - MAPKAPK5-AS1:6 No - lnc-TMEM132B-2:3 No - lnc-ZDHHC7-1:2 No - lnc-EPHA4-3:1 No - lnc-WAPL-1:2 No - LINC00691:6 No - lnc-CADM2-4:2 No - lnc-FAM9A-1:1 No - lnc-BOD1-1:22 No - lnc-POLR1E-2:1 No - DNAJB8-AS1:7 No - LINC01869:28 No - lnc-LRP5L-2:5 No - lnc-FAT3-5:7 No - lnc-RBBP6-4:2 Yes chr4:649041-663103 lnc-ACTR2-3:8 No - SLC25A25-AS1:11 No - lnc-ICOSLG-6:22 No - lnc-LYZL1-2:1 No - lnc-NPAP1-9:4 No - lnc-ADPRH-1:1 No - lnc-TASP1-5:2 No - lnc-LARGE1-1:4 No - LINC01428:4 No - lnc-GGTLC1-4:1 No - lnc-DMRTB1-1:1 No - lnc-LNPK-2:2 No - lnc-CDH6-20:1 No - RNASEH1-AS1:4 Yes chr2R:7931054-7932380 lnc-GNB5-1:2 Yes chrX:8150731-8152275 lnc-SLC34A2-1:1 No - lnc-DLX2-1:1 No - lnc-ATIC-5:1 No - lnc-TRABD2B-3:1 No - lnc-TMEM215-1:1 No - lnc-AACS-2:1 No - lnc-CDH12-1:1 No - lnc-CCNI-1:2 No - lnc-MANEA-3:3 No - lnc-ZNF717-2:1 No - CHKB-DT:57 Yes chr2L:21614232-21624080 lnc-NQO2-3:1 No - lnc-C20orf196-3:1 No - MAFTRR:2 No - lnc-LECT2-1:3 No - lnc-CDKN2AIPNL-1:1 No - lnc-RABL2B-2:2 No - lnc-CLCN3-1:3 No - lnc-ADGRL4-4:1 No - lnc-CCDC125-6:3 No - lnc-SAMD11-5:9 No - lnc-PAPD7-2:5 No - LINC00592:2 No - lnc-ZNF85-1:1 No - lnc-CTSD-1:1 No - lnc-MGAT1-4:5 No - NDFIP2-AS1:4 No - PVT1:36 No - lnc-INF2-2:2 No - lnc-ARSI-1:1 No - lnc-CILP-1:2 No - lnc-LAMA4-1:5 No - GAS6-DT:20 No - LINC02500:5 No - lnc-SMOC2-6:1 No - lnc-CALML5-4:1 No - lnc-WASHC3-4:1 Yes chrX:2076966-2078455 PURPL:32 No - lnc-SNRPN-5:6 No - lnc-GLRB-4:2 No - lnc-IMPAD1-1:1 No - LINC01093:2 No - lnc-CD1D-2:1 No - lnc-HNRNPAB-1:1 No - lnc-NKD2-3:1 No - LINC00982:14 No - lnc-PRKCE-1:1 No - lnc-RBKS-1:4 No - lnc-SERPINI1-23:16 No - lnc-MKRN3-4:1 No - lnc-FBXL7-3:1 No - lnc-POLE4-8:10 No - lnc-CDH9-2:1 No - LINC00486:14 No - lnc-STARD10-1:11 No - lnc-KCNA4-4:1 No - lnc-WDR75-1:1 No - lnc-ZNF266-1:1 No - MANCR:35 No - lnc-TGFBI-80:7 Yes chr3R:27559379-27561319 lnc-GATB-2:6 No - lnc-SGCG-5:2 No - lnc-CADM2-3:8 No - lnc-C6orf201-3:1 No - lnc-ALDH7A1-2:3 No - lnc-PI16-1:2 No - lnc-ARL4C-2:4 No - lnc-FNDC1-2:1 No - lnc-ITGA4-1:1 No - lnc-QKI-2:4 No - LINC02556:3 No - lnc-ECI2-2:5 No - lnc-PDE5A-1:1 No - lnc-SSTR4-3:1 No - lnc-ABCD3-2:3 No - lnc-TSTD2-4:1 No - lnc-PPP4R1-2:4 No - lnc-IRF2BP2-2:1 No - lnc-MAGEA1-1:2 No - lnc-SLC6A9-2:3 No - lnc-ADCY2-2:1 No - lnc-RGMA-9:1 No - lnc-C1GALT1-1:1 No - lnc-OR4N4-2:1 No - lnc-SMOC1-1:1 No - lnc-EMX2-5:6 No - lnc-GCA-10:1 No - LINC02219:8 No - lnc-BRMS1L-4:1 No - lnc-AZIN1-1:4 Yes chr2R:8007246-8009062 lnc-PPP4R1-2:5 No - lnc-DCT-1:1 No - lnc-B3GNT10-5:3 No - lnc-RNASE1-1:2 No - lnc-UNC50-1:1 No - lnc-PI3-1:1 No - lnc-TNFAIP3-1:2 No - lnc-CRYBA4-9:4 No - lnc-ZNF236-11:1 No - lnc-TMEM135-2:3 No - lnc-BOC-3:4 No - lnc-NPAS2-1:2 No - lnc-FGGY-6:2 No - lnc-MN1-2:3 No - lnc-FBXO15-3:3 No - LINC00589:2 No - lnc-CANX-1:5 No - lnc-FAM241B-2:2 No - lnc-VRK2-3:2 No - LINC02024:15 No - lnc-PITRM1-6:1 No - lnc-UVSSA-1:2 No - lnc-ZNF107-2:1 No - lnc-ABI1-2:1 No - lnc-CD1B-3:1 No - lnc-C8orf48-1:1 No - lnc-FBXL7-4:1 No - SNHG27:14 No - lnc-HMG20A-5:1 Yes chr2R:21872030-21946259 lnc-TWIST2-6:1 No - LINC01203:5 No - lnc-ARHGAP28-13:1 No - lnc-KDM4C-3:1 No - lnc-DDX18-1:3 No - lnc-BEST3-1:3 No - lnc-METTL2B-6:1 No - lnc-XIRP2-1:1 No - LINC00662:11 No - PICSAR:4 No - lnc-SYNGR1-1:1 No - lnc-SLC12A7-1:4 No - ZNF582-AS1:15 No - lnc-FZD8-1:1 No - LINC01991:8 No - LINC02430:7 No - lnc-IGFBP4-1:4 No - LINC00494:9 No - PVT1:44 No - lnc-SEC61G-7:2 No - lnc-P2RY1-2:1 No - lnc-DMRTA2-1:1 No - lnc-TUBGCP3-4:1 No - lnc-ATOH7-1:2 No - lnc-KLF15-2:2 No - lnc-GSDMC-34:32 No - lnc-NOCT-10:3 No - LINC00426:7 No - LINC01179:1 No - IDH2-DT:20 No - lnc-COX10-1:4 No - lnc-SAMSN1-2:1 No - lnc-AGPAT2-2:1 No - lnc-COL4A1-2:2 No - LINC00996:7 No - lnc-TMEM14A-1:1 No - lnc-UBE3D-1:1 No - TMEM212-IT1:1 No - lnc-AKAP17A-1:1 No - lnc-FAM156B-1:1 No - lnc-XPO7-2:1 No - lnc-GATAD1-1:1 No - lnc-STIM2-3:1 No - LINC01673:9 No - lnc-C15orf41-6:2 No - LINC00710:12 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-PRLR-1:1 No - lnc-TBCK-1:1 Yes chr3L:4384442-4403181 lnc-FOXQ1-21:1 No - lnc-EXOC2-8:1 No - LINC01901:5 No - lnc-TMEFF2-1:1 No - lnc-ZDHHC14-2:2 Yes chr3L:9710422-9713827 lnc-SGCG-2:1 No - lnc-CHGA-1:5 No - lnc-DLGAP1-1:1 No - LINC01608:3 No - lnc-GINS2-3:1 No - lnc-AIPL1-1:1 No - lnc-LMBR1-3:3 No - lnc-SLC17A6-2:3 No - LINC01213:1 No - MRPL23-AS1:2 Yes chr3L:2372844-2373704 lnc-MBOAT1-2:20 No - lnc-RPL24-2:1 No - lnc-GPR101-3:3 No - LINC01479:8 No - lnc-UBA5-3:1 No - lnc-SLC15A4-1:3 No - lnc-UNC5D-1:1 No - lnc-PPP2R2D-1:1 Yes chr3R:10126129-10139772 lnc-NIFK-1:3 No - lnc-ENPP6-2:2 No - lnc-JMJD1C-1:2 No - lnc-NMNAT2-3:1 No - lnc-LTBP3-2:1 No - LINC00895:12 No - LINC01341:4 No - lnc-NPAP1-6:2 No - lnc-INTS6-2:1 No - LINC01065:5 No - lnc-CBLB-1:1 No - lnc-MTA3-3:1 No - lnc-DNAAF5-3:18 No - lnc-KLHL31-2:4 No - lnc-AMY1C-2:1 No - lnc-CDK20-4:1 No - lnc-HOXB8-1:7 No - lnc-HTR1B-1:1 No - lnc-TMEM189-1:2 No - LINC01582:3 No - lnc-ZFP42-1:1 No - lnc-EMC8-8:1 No - lnc-C5orf67-2:2 No - lnc-LSG1-2:1 No - LINC02516:3 No - lnc-PDGFA-17:6 No - LINC01356:8 No - LINC01948:10 No - lnc-PSMG1-4:11 No - lnc-JAM3-3:8 No - lnc-TIMM21-5:6 No - lnc-CPEB2-2:1 No - lnc-BLCAP-1:1 Yes chr3L:5565231-5566765 lnc-OR4F29-3:12 No - lnc-PITRM1-4:1 No - lnc-ZFC3H1-2:1 No - LINC01345:6 No - lnc-SEPT7-1:1 No - LINC01953:4 No - lnc-NUDT12-4:1 No - lnc-SMIM37-1:3 No - lnc-CFLAR-1:5 No - lnc-ADRB1-1:1 No - LINC01491:5 No - LINC02016:11 No - lnc-SPANXN2-1:1 No - LINC02086:21 No - LINC00824:5 No - lnc-PUS3-2:6 Yes chr3L:27279316-27422159 lnc-CLIC6-1:1 No - lnc-RNF152-2:5 No - lnc-NCOA3-4:1 No - lnc-EXT1-1:1 No - lnc-FAM174B-2:12 No - lnc-APBB1IP-1:11 No - BOLA3-AS1:7 No - TUSC8:5 No - lnc-OIP5-1:1 No - lnc-PRKAA2-2:2 Yes chr2R:9400531-9413463 LINC00958:14 No - LINC00486:4 No - lnc-C11orf71-1:2 No - lnc-DTNBP1-16:39 No - LINC02263:23 No - lnc-RNF152-2:1 No - PRKCQ-AS1:10 No - lnc-SULF1-68:1 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-DCAF5-2:2 No - lnc-NEDD1-2:1 No - LINC01829:37 No - LINC01176:17 No - CHKB-DT:62 Yes chr2L:21614232-21624080 lnc-JPH3-1:1 No - TTTY21:4 No - LINC01120:2 No - lnc-TRNP1-1:2 No - lnc-CCDC7-4:4 No - lnc-CCDC187-1:36 No - lnc-TMEM132B-10:2 No - lnc-CTDSP2-2:3 No - WDR7-OT1:2 Yes chrX:1908920-1916825 lnc-KLHL32-4:1 No - lnc-RPS4Y1-7:1 No - LINC02104:21 No - lnc-TECRL-1:3 No - lnc-RFT1-1:2 Yes chrX:5692945-5695205 lnc-XPNPEP1-1:1 No - LINC02214:4 No - lnc-ERICH2-1:1 No - lnc-DYRK1A-1:1 No - lnc-MAGOHB-1:2 No - lnc-OR4F29-1:3 No - lnc-DLK1-35:110 No - LINC01435:5 No - lnc-PANK3-1:1 No - MIR100HG:3 No - lnc-SGCG-5:4 No - lnc-CCDC71L-1:3 No - LINC02298:22 No - lnc-RASSF8-1:1 No - lnc-PRDM11-4:1 No - lnc-NETO1-1:4 No - lnc-USP16-1:2 No - LINC00606:1 No - lnc-DERA-1:2 Yes chrX:15082827-15084017 lnc-SKAP2-72:1 No - lnc-TGFBRAP1-2:1 No - LINC00922:8 No - lnc-GRID1-2:1 No - LINC01018:14 No - lnc-TTC7B-2:1 No - LINC01637:15 No - lnc-ADM-1:1 No - lnc-NTF3-3:7 No - lnc-NCOA3-5:7 No - lnc-NDUFS6-8:1 Yes chr3L:12609631-12710249 LINC00205:7 No - lnc-TUBGCP3-6:2 No - lnc-PM20D2-1:1 No - LINC02520:37 No - SNHG17:25 No - lnc-MAP3K9-3:6 No - lnc-ADRA1D-1:1 No - lnc-FBXO8-6:1 No - lnc-CLVS1-1:5 No - lnc-DYDC1-1:2 Yes chr2L:6000228-6003738 LINC02541:46 No - lnc-MKI67-3:1 No - lnc-PYDC2-1:4 No - lnc-TBC1D1-1:2 No - LINC00899:1 No - LINC00707:2 No - lnc-HS1BP3-1:7 No - lnc-NEDD1-5:2 No - lnc-PLCXD3-1:2 No - lnc-FAM153B-6:4 Yes chr3R:8307473-8308645 lnc-OR4C12-1:1 No - lnc-PLPP3-12:20 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-PCM1-4:3 No - LINC01788:8 No - lnc-CLMN-2:1 No - LINC02440:11 No - LINC02542:10 No - lnc-TMEM18-6:1 No - lnc-C20orf196-2:1 No - lnc-PCED1B-5:1 No - lnc-WDR70-7:23 No - LINC02493:6 No - lnc-ALDH1B1-9:3 No - LINC02587:15 No - LINC02415:12 No - lnc-DISC1-3:1 No - lnc-KCTD6-5:1 No - lnc-ROBO2-3:2 No - lnc-RAD23B-21:6 No - lnc-ERCC6L2-4:1 No - lnc-MUC20-67:147 No - LINC01360:12 No - PRKCQ-AS1:11 No - lnc-SLC12A7-1:14 No - lnc-PRPF18-6:1 No - LINC00635:20 No - LINC01121:6 No - lnc-TRIM38-2:5 No - lnc-SPOCD1-1:1 No - lnc-CTBS-4:8 No - lnc-LMAN1-1:1 No - lnc-LACTB-1:2 No - lnc-ARHGEF5-1:1 No - LINC01478:2 No - lnc-RIMKLB-6:5 No - lnc-EIPR1-3:1 No - lnc-MYEOV-3:1 No - lnc-SUN3-2:1 No - lnc-NCOA3-9:5 No - lnc-KCNMB1-3:5 No - lnc-KLF15-3:4 No - lnc-PLPP4-4:5 No - LINC01315:7 No - MIR4527HG:29 No - lnc-SSTR1-3:1 No - lnc-ADD3-3:2 No - lnc-HOXC4-4:1 Yes chr3R:17150587-17151630 lnc-GBE1-3:1 No - STK32A-AS1:17 No - lnc-ECI2-2:6 No - lnc-TRPM1-1:7 No - lnc-RAD23B-3:2 No - lnc-SNAPC2-5:1 No - LINC02453:23 No - lnc-CADM1-4:3 No - lnc-ZBTB18-2:5 No - lnc-MAP1LC3B2-28:25 No - LINC01672:21 No - lnc-TAF1A-1:1 No - lnc-ANO2-3:3 Yes chrX:11877737-11887162 lnc-ADCY9-1:5 No - LINC02217:38 No - lnc-CHD2-4:6 No - LINC01539:3 No - LINC00661:19 No - INSYN1-AS1:33 No - lnc-SV2B-1:8 No - lnc-XRCC4-1:1 No - LINC01679:12 No - CCDC18-AS1:9 No - lnc-SMC1B-2:1 No - lnc-TBXT-2:1 No - lnc-HELZ-1:2 No - lnc-ANKRD30A-5:1 No - lnc-BRF2-9:12 No - LINC01936:26 No - LINC01918:24 No - lnc-EPB41-1:2 No - lnc-FMN1-2:5 No - lnc-PCDH20-2:1 No - lnc-C5orf38-3:1 No - LINC00613:5 No - LINC01837:29 No - lnc-PPP1R3A-1:2 No - lnc-CCSER2-1:1 No - lnc-LRP8-2:1 No - lnc-REG3G-3:3 No - LINC02064:11 No - lnc-GPM6B-1:2 No - lnc-MCCC1-1:1 No - lnc-KLHL29-1:1 No - lnc-UMODL1-4:3 No - LINC01197:5 No - lnc-ATP8A1-1:2 No - lnc-CASP9-8:1 Yes chr2R:22333500-22373109 lnc-PDGFD-1:2 No - lnc-ZNF609-3:2 No - lnc-NETO1-1:11 No - lnc-NCOA3-7:3 No - lnc-TAF4-6:1 No - MAPKAPK5-AS1:21 No - lnc-PPARGC1A-3:1 No - LINC00927:46 No - LINC00211:2 No - LINC02218:6 No - LINC01728:10 No - lnc-MATN1-1:2 No - LINC02089:5 No - lnc-PARP8-1:1 No - lnc-ST3GAL4-10:1 No - lnc-THBD-1:4 No - TUG1:32 No - lnc-IGFL1-1:2 No - lnc-NMNAT3-1:4 No - lnc-HES1-2:3 No - lnc-EN2-3:7 No - LINC02263:24 No - lnc-STMP1-8:6 No - SCHLAP1:1 No - lnc-ACTR3C-2:2 No - lnc-PPDPF-1:3 No - LINC02173:14 No - lnc-LANCL2-1:6 No - lnc-SEMA3B-1:7 No - SRGAP3-AS4:3 No - lnc-GPD2-2:8 No - lnc-OTX2-3:1 No - lnc-F13A1-3:3 No - lnc-MCFD2-1:1 No - lnc-C5orf38-3:2 No - lnc-FGF9-1:1 No - lnc-TMEM18-7:1 No - lnc-MAP3K9-3:10 No - lnc-ARHGEF5-1:4 No - lnc-RAB31-1:1 No - LINC02056:44 No - LINC02590:3 No - LINC01514:8 No - lnc-NR2F2-6:3 No - lnc-NDUFS6-6:1 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-WDR4-1:2 No - lnc-MSH6-2:2 No - LINC01952:12 No - lnc-FCGR3B-4:1 No - LINC02548:5 No - lnc-CCT5-2:1 No - LINC01859:21 No - lnc-ETS2-2:3 No - lnc-ZNF101-2:1 No - LINC00205:13 No - LINC00544:2 No - LINC01022:3 No - lnc-PTGFR-1:2 No - lnc-SYNGR1-11:4 No - lnc-PEAK1-1:15 No - LINC00662:1 No - LINC02016:7 No - MIR100HG:35 No - LINC01777:12 No - LINC00029:3 No - lnc-NKD2-3:7 No - lnc-UBE2E3-2:15 Yes chr2L:10765010-10768006 lnc-PEX6-1:1 No - lnc-DLC1-4:1 No - lnc-UCK2-3:1 No - INSYN1-AS1:27 No - LINC01471:2 No - lnc-PANK1-2:5 No - MIR122HG:9 No - lnc-ERCC4-2:1 No - LINC01005:3 No - lnc-LARGE1-2:2 No - lnc-TSSK3-1:1 No - lnc-EXOSC6-1:1 No - LINC00589:11 No - lnc-RGL4-4:4 No - lnc-COPZ2-1:2 No - lnc-PDE2A-1:1 No - LINC02109:52 No - LINC02239:5 No - lnc-ZFHX3-27:18 No - LINC01020:6 No - lnc-RXFP4-1:1 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-PDE1A-1:2 No - lnc-PTBP2-1:2 No - lnc-FAAP20-1:3 No - LINC01455:1 No - lnc-LHFPL6-3:1 No - lnc-SAP30-21:1 No - lnc-SNCA-2:2 No - lnc-TDRD3-17:1 No - LINC01438:1 No - lnc-DIO3-1:1 No - lnc-RAB27B-11:6 No - LINC00424:3 No - lnc-HECA-3:7 No - lnc-ATP13A4-2:1 No - lnc-UBLCP1-2:5 No - lnc-DLL1-4:1 No - lnc-EXTL1-1:1 No - LINC01935:3 No - lnc-SIX3-1:2 No - FAM138B:2 No - lnc-REG3G-5:1 No - lnc-TMEM88B-4:1 No - lnc-SPRED2-3:1 No - lnc-RAB28-4:1 No - MAPKAPK5-AS1:9 No - lnc-ERI1-8:2 No - lnc-TMEM130-1:1 No - lnc-SH3RF2-2:1 No - lnc-SOCS6-2:1 No - lnc-GPR65-16:1 No - lnc-AKAP14-1:1 No - LINC01702:19 No - LINC02049:9 No - lnc-CPEB4-4:1 No - LINC02150:11 No - lnc-PLEK-1:1 No - lnc-MAP3K9-3:11 No - lnc-TGFBRAP1-1:2 No - lnc-RORB-2:2 No - SMC2-AS1:3 No - lnc-MTRNR2L12-3:6 No - lnc-PRDM11-2:1 No - lnc-MTA3-2:2 No - lnc-CTTNBP2-3:1 No - lnc-RGS17-1:1 No - lnc-FGD3-1:1 No - lnc-PIK3CG-4:1 No - lnc-PFKP-10:1 No - lnc-CEP350-1:1 No - lnc-PTP4A3-3:2 No - lnc-ACP1-5:2 No - lnc-CMPK2-12:1 No - lnc-IKZF1-3:1 No - lnc-COX10-1:3 No - lnc-RAB6D-3:1 No - lnc-GGPS1-2:1 No - lnc-DTHD1-3:2 No - lnc-NPAP1-9:9 No - lnc-OARD1-1:3 No - lnc-GPR137B-1:4 No - LINC02109:53 No - lnc-RNF227-2:2 Yes chr2L:2878344-2879001 LINC02185:16 No - TMEM161B-AS1:28 No - lnc-TSKU-2:3 No - lnc-UBLCP1-30:6 No - lnc-MEX3B-4:3 No - MYOSLID:15 No - lnc-SAP30-22:2 No - lnc-NTF3-3:11 No - LINC01108:5 No - LINC01070:2 No - lnc-TSPY10-4:1 No - LINC00442:7 No - lnc-ZNF711-1:1 Yes chr3R:15213974-15214845 LINC02526:7 No - lnc-DTNBP1-1:1 No - lnc-RMDN2-3:6 No - lnc-WDR63-1:1 No - NIFK-AS1:11 No - LINC00163:2 No - LINC01093:10 No - lnc-AHSP-5:10 Yes chr2L:18695664-18698571 PTCSC3:7 No - lnc-MTRR-4:1 No - lnc-BATF3-2:4 No - LINC01104:2 No - lnc-TRMT61B-1:6 No - lnc-LRP5L-2:2 No - LUCAT1:2 No - DLEU1:46 No - lnc-BOD1L1-3:1 No - lnc-IL4R-2:13 No - LINC01781:16 No - TTTY4C:1 No - LINC01273:7 No - lnc-ATXN1-2:1 No - lnc-NCOR2-2:1 No - lnc-PID1-1:1 No - lnc-PELI2-7:2 No - lnc-PLPPR3-1:3 No - lnc-CD47-1:2 No - lnc-FRG2C-2:2 No - lnc-NPAP1-6:1 No - lnc-MFSD11-1:1 No - lnc-ASPH-6:1 No - lnc-ST3GAL4-55:8 No - lnc-FOXA2-7:9 No - lnc-UBR2-1:3 No - LINC01032:3 No - lnc-MCMDC2-1:1 No - AATBC:7 No - lnc-PPIE-3:2 No - lnc-NPHP4-1:2 No - lnc-HLF-1:1 No - PRKCQ-AS1:51 No - LINC00313:14 No - lnc-CCDC82-4:1 No - lnc-HARS-1:1 No - MIR29B2CHG:51 No - lnc-SLC35B3-1:1 No - lnc-ZNF644-1:1 No - lnc-PDE9A-1:1 No - lnc-SLC35C1-3:5 No - lnc-HTR2C-1:1 No - lnc-TXLNB-1:1 No - lnc-LPA-1:1 No - lnc-FAM49A-2:1 No - lnc-PSMG1-4:14 No - lnc-WRN-3:3 No - LINC01093:4 No - LINC-PINT:22 No - lnc-GRHL2-7:2 No - ENOX1-AS2:2 Yes chr3L:12844254-12850117 LINC00174:6 Yes chrX:13563823-13593224 ITGA9-AS1:17 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-NFE2L2-2:1 No - lnc-NUDT12-5:2 No - lnc-WNT11-1:1 No - LINC01115:6 No - lnc-NMBR-2:1 No - lnc-BRF1-4:1 No - LINC01823:9 No - lnc-APOC3-6:7 No - lnc-MRPL57-4:1 No - lnc-SLC39A11-10:38 No - lnc-NUDT12-5:7 No - lnc-ZBBX-4:1 No - lnc-APOC3-4:2 No - LINC01376:6 No - lnc-LRRC32-4:1 No - ITGA9-AS1:5 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-CELA3A-5:3 No - TCL6:5 No - lnc-CDH9-6:1 No - lnc-RPS24-3:26 No - lnc-MDM4-3:1 Yes chr2R:8009119-8013755 LINC01121:10 No - LINC01830:7 No - lnc-TP53I11-3:1 No - lnc-SPATA31A7-2:3 No - LINC01128:74 No - lnc-ZMAT4-1:1 No - lnc-SLC35C1-1:1 No - lnc-API5-3:1 No - lnc-FSHR-9:1 Yes chr3R:22468512-22486969 lnc-MRC2-3:2 No - lnc-JUN-2:18 No - lnc-ANKRD18B-6:7 No - lnc-ROCK2-3:1 No - lnc-PRDM11-3:1 No - TTTY7B:5 No - lnc-MTNR1B-1:1 No - LINC01192:6 No - lnc-ITGB8-2:3 No - lnc-HHIP-1:1 Yes chr2R:17517261-17518186 lnc-POU3F3-2:1 No - CYTOR:94 No - lnc-CREB3L1-2:1 No - lnc-RXFP2-1:2 Yes chr3L:9631834-9679103 LINC00484:9 No - lnc-FOXD4L5-40:1 No - lnc-XPC-2:1 No - lnc-TMEM30B-1:1 Yes chr3R:29039156-29049148 LINC00571:1 No - LINC00326:3 No - lnc-NUTM2G-6:1 No - lnc-FBXO32-2:1 No - lnc-LTBP2-1:1 No - OR2A1-AS1:6 Yes chr3L:16970013-16994388 TTTY7B:2 No - lnc-TAF1L-1:1 No - H19:17 No - LINC00608:12 No - LINC00989:1 No - LINC01287:1 No - OR2A1-AS1:10 Yes chr3L:16970013-16994388 lnc-IL17RA-36:33 No - lnc-APBB1IP-1:16 No - FAM224B:1 No - lnc-OR4F29-3:8 No - FAM225B:2 No - lnc-MSC-1:1 No - lnc-FBXO8-5:2 No - lnc-KCNH5-1:1 No - lnc-UNC93B1-3:1 No - LINC01333:10 No - LINC01873:3 No - lnc-PLET1-1:1 No - lnc-RRAS2-9:1 No - LINC02328:60 No - ZBED5-AS1:21 No - LINC01393:1 No - H19:14 No - lnc-TRIM26-2:5 No - RFX3-AS1:2 No - lnc-POTEH-3:1 No - SNHG26:35 No - lnc-MFAP2-53:15 Yes chr3R:24113286-24128193 OR2A1-AS1:4 No - lnc-SLC39A11-10:36 No - lnc-NIPA1-1:1 No - lnc-POTEG-14:9 No - LINC00894:27 No - lnc-MFSD8-11:1 No - lnc-CDH18-2:1 No - TTC28-AS1:25 Yes chr3L:8472807-8507146 LINC00879:9 No - lnc-GNA13-2:2 No - MIR99AHG:106 No - lnc-CYP7A1-1:4 No - lnc-DLK1-35:111 No - LINC00184:2 No - lnc-PAWR-1:2 Yes chr2L:2772327-2799979 lnc-C8A-6:1 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-PIK3R6-1:1 No - LINC00484:10 No - lnc-CEP57L1-1:4 No - KRTAP5-AS1:5 No - lnc-HMGA1-2:1 Yes chr3L:10894776-10899123 HOTAIR:4 No - lnc-RNASE1-1:3 No - MEG9:1 No - lnc-NKAIN3-14:29 No - lnc-GPR65-15:1 No - LINC01492:1 No - lnc-ALX1-2:5 No - CHODL-AS1:1 No - lnc-STRAP-1:1 Yes chr3R:17008269-17012533 lnc-KCNB2-12:4 No - lnc-SLC6A12-2:9 Yes chr3L:21034535-21075444 LINC00992:2 No - LINC01376:3 No - ITGB2-AS1:7 Yes chrX:8061645-8070237 LINC01715:18 No - MIRLET7DHG:5 No - SLC16A1-AS1:7 No - lnc-TLR3-2:1 Yes chr2R:10269016-10307024 lnc-IGFBP7-3:2 No - KIF25-AS1:4 No - lnc-HMX1-6:2 No - lnc-DLGAP5-4:2 No - lnc-SH2D4A-2:3 No - lnc-ZBTB2-1:1 No - LINC00992:7 No - lnc-LRRC32-2:5 No - lnc-XRCC3-1:2 Yes chr3L:12746616-12750056 LINC01823:7 No - LINC02324:5 No - LINC00894:32 No - LINC01422:3 No - lnc-JAM3-4:1 No - JPX:17 No - LINC00824:1 No - lnc-RNASE3-1:1 No - lnc-DGKK-1:2 No - lnc-DLK1-35:121 No - LINC02226:18 No - LINC01353:4 No - lnc-HOXD13-2:1 No - lnc-GGT2-26:12 No - LINC01320:19 No - LINC02307:3 No - lnc-ETNK1-3:3 No - lnc-AGPAT5-1:1 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-MS4A8-17:2 No - lnc-CEACAM20-1:6 No - lnc-NAALAD2-4:2 No - lnc-PDGFA-6:2 No - LINC00343:16 No - LINC01182:1 No - LINC02237:20 No - LINC01891:5 No - LINC01677:12 No - LINC01933:10 No - LINC00115:5 No - lnc-C1orf61-2:8 No - lnc-LINC02203-6:1 No - LINC00303:1 No - lnc-GGT2-26:5 No - lnc-SNTG2-1:1 No - lnc-TDRD15-3:4 No - lnc-MYCBP2-1:7 Yes chr2R:17646848-17665068 lnc-METAP1-11:1 No - lnc-DKK3-2:1 No - lnc-TFEC-1:1 No - lnc-ATXN7L3B-2:1 No - lnc-AVPR1A-1:2 No - lnc-MICU3-1:1 No - lnc-RGMA-7:11 No - lnc-TTC30B-2:1 Yes chr3R:23185580-23226711 LINC02350:18 No - LINC02055:20 No - LINC02451:4 No - lnc-UBE2K-2:7 No - lnc-TRIM49-1:1 No - lnc-ATP6V0D2-2:1 No - LINC-PINT:15 No - lnc-CCDC179-1:6 No - LINC01590:2 Yes chr3L:21827774-21828480 GACAT3:4 No - LINC02461:3 No - LINC01198:14 No - lnc-GOLGA6L6-1:1 No - TMEM254-AS1:9 No - TMEM161B-AS1:16 Yes chr3L:11109690-11112117 lnc-PFKP-16:10 No - lnc-ZNF195-1:1 No - lnc-ERI1-11:3 No - H19:2 No - lnc-USP35-6:2 No - lnc-PRSS55-1:2 No - lnc-C7orf57-6:11 No - lnc-KIAA1210-1:1 No - LINC00930:4 No - lnc-FZD5-1:4 Yes chr2R:22103177-22105963 LINC02386:7 No - lnc-PWWP2B-1:1 No - lnc-DLK1-35:124 No - lnc-SMARCA5-4:13 No - lnc-ZNF608-9:1 No - lnc-CENPP-20:30 No - lnc-CEP57-1:1 No - lnc-TRIM26-2:7 No - lnc-OR7C2-1:2 No - lnc-ZC3H12B-1:5 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-PPIAL4F-3:12 No - NPSR1-AS1:5 Yes chr3R:25923499-25956270 lnc-CEACAM20-1:7 No - LINC02354:8 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-RAB23-53:27 No - TTC28-AS1:12 Yes chr3R:19215434-19226651 lnc-GPR33-3:1 No - LINC02267:5 No - lnc-FABP5-2:3 No - lnc-POTEG-14:4 No - LINC00894:9 No - lnc-MS4A8-17:5 No - LINC01121:4 No - lnc-KHDRBS3-2:1 No - lnc-HIST2H3PS2-3:11 No - lnc-DUSP10-5:1 No - LINC02265:5 No - LINC02290:20 No - LINC00161:3 No - lnc-TUBA3C-1:1 No - lnc-FAM229A-1:2 No - PKIA-AS1:1 No - lnc-TSPAN11-1:1 No - lnc-TNN-1:1 No - LINC01609:1 No - LINC00616:8 No - lnc-FOXO1-2:1 No - lnc-NXPE2-6:1 No - lnc-NLGN4X-1:3 No - lnc-CSMD1-6:1 No - LINC00458:11 No - LINC02207:13 No - TMEM161B-AS1:7 Yes chr3L:11109690-11112117 lnc-CEP170B-1:1 No - DIO3OS:3 No - LINC01210:8 No - lnc-FZD1-2:2 No - lnc-CYP7A1-1:5 No - LINC01752:4 No - lnc-RASA1-2:2 No - lnc-GTF2H2-2:1 No - lnc-MICAL2-1:1 No - ZNF385D-AS2:2 No - lnc-TMEM121-3:2 No - LINC02492:14 No - MEG9:4 No - ZFAS1:9 Yes chr3R:24193832-24196880 lnc-CSNK1G3-11:3 No - lnc-HDGFL1-5:1 No - C5orf64-AS1:13 No - lnc-GSDMC-34:26 No - lnc-TMEM255B-5:29 No - lnc-SPAG1-1:1 No - TCL6:6 No - lnc-COL22A1-2:1 No - LINC00211:6 No - lnc-TENM4-1:2 No - LINC00314:2 No - lnc-ZNF479-1:1 No - LINC00824:11 No - lnc-HAND1-1:2 No - lnc-EXOC5-1:1 No - lnc-SV2B-1:1 No - lnc-TDRD15-4:1 No - lnc-SV2B-1:2 No - lnc-SPATA31A5-1:3 No - lnc-MFAP2-5:1 Yes chr3R:24113286-24128193 DLEU2:12 No - lnc-CKAP2L-1:3 No - TMPO-AS1:3 No - lnc-SEPT9-2:1 No - lnc-LRP5L-1:3 No - lnc-SLC48A1-23:7 No - lnc-REG3G-1:1 No - TOB1-AS1:5 Yes chrX:16074717-16091495 LINC01849:7 No - KRTAP5-AS1:1 No - lnc-RAB23-53:21 No - LINC01591:1 No - lnc-GAS2-1:3 No - lnc-POLD3-3:1 No - VASH1-AS1:12 No - lnc-WDR73-5:2 No - lnc-PDCD1-16:1 No - lnc-SPATA31A7-6:1 No - lnc-LRRC4C-2:2 No - LINC01128:101 No - lnc-OR5AK2-1:1 No - LINC01304:7 No - lnc-IDE-1:1 No - lnc-RNASE13-1:1 Yes chr2R:21502097-21517241 FAM239A:20 No - LINC00968:4 No - LINC00824:6 No - PVT1:15 No - lnc-SCRIB-1:1 No - EXTL3-AS1:5 Yes chr2R:19129589-19133706 lnc-APOBEC3G-1:1 No - lnc-SLC39A11-10:46 No - TMEM254-AS1:7 No - lnc-ITGB8-1:1 No - lnc-RC3H1-1:2 No - lnc-IGFBP7-6:1 No - lnc-RPS24-3:27 No - lnc-FANCM-4:1 No - PRKCQ-AS1:5 No - lnc-ARAP2-6:2 No - lnc-EIF3B-1:1 No - lnc-MFHAS1-1:2 No - lnc-DDX18-1:1 No - ISPD-AS1:11 No - lnc-DDX51-3:1 Yes chr3R:20591024-20592671 LINC00640:3 No - lnc-ATP6V1B2-6:1 No - lnc-KHDRBS3-2:2 No - LINC01191:7 No - MIR217HG:1 No - lnc-APOB-5:2 No - lnc-ANKRD20A4-4:1 No - LINC00968:12 No - lnc-NLGN4X-1:2 No - SMILR:9 No - lnc-KCNC3-1:1 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-IMPAD1-2:1 No - LINC01747:12 No - lnc-GALC-2:1 No - LINC01714:23 No - lnc-FSCB-3:1 No - TTTY4C:2 No - lnc-INSC-2:10 No - lnc-NDUFA9-1:3 Yes chr2L:14184478-14234126 LINC-PINT:13 No - lnc-DLK1-35:76 No - LINC00160:2 No - LINC01192:2 No - LINC01490:2 No - lnc-FOXO6-2:2 No - lnc-MTSS1-1:1 No - lnc-EMC2-2:1 No - lnc-CSGALNACT1-1:1 No - LINC02280:19 No - lnc-GRHL2-7:1 No - LINC01095:9 No - lnc-TRIM26-2:9 No - LINC01133:2 No - LINC01794:13 No - lnc-YY1-1:3 Yes chr2L:10322476-10324990 LINC02196:3 No - LINC00484:6 No - lnc-TOR1AIP1-1:1 No - FAM239B:12 No - lnc-GRIP1-2:4 No - LINC02046:4 No - LINC01317:1 No - lnc-SAMD5-4:1 Yes chr3R:22133830-22296126 MEG9:5 No - LINC01346:4 No - LINC01877:7 No - lnc-METTL15-6:1 No - lnc-POTEM-4:12 No - lnc-ARHGAP18-1:2 No - lnc-SYT16-67:1 No - LINC01310:3 No - lnc-RBM43-1:1 No - lnc-DLK1-35:90 No - lnc-TEX48-1:3 No - lnc-EQTN-1:1 No - LINC00589:1 No - FAM66B:1 No - WT1-AS:14 No - lnc-SPATA31A7-2:4 No - lnc-CD82-1:1 No - lnc-RDX-1:2 No - LINC02280:16 No - LINC01339:5 No - lnc-IGFBP7-5:6 No - lnc-NBPF4-1:1 No - lnc-SLC4A3-7:2 No - MIR7-3HG:3 No - LINC00960:5 No - lnc-SLC35C1-83:11 No - LINC02299:4 No - LINC01284:2 No - LINC01473:6 No - lnc-C1QTNF9B-1:2 No - lnc-LRRC3B-1:1 No - ZFAS1:1 Yes chr3R:24193832-24196880 lnc-AGPAT5-1:2 No - lnc-TARBP1-4:1 Yes chr3R:20740108-20756639 TTTY10:2 No - TTTY5:2 No - lnc-FAM160A1-5:3 No - lnc-C2orf49-2:1 No - lnc-STC1-1:1 No - lnc-SNX16-1:1 No - lnc-ZNF608-12:1 No - lnc-KRTAP5-11-1:1 No - lnc-OR4C13-1:1 No - lnc-ADCY8-1:1 No - LINC01713:3 No - LINC01501:4 No - lnc-GRIFIN-1:2 No - lnc-CENPP-20:34 No - LINC00642:7 No - lnc-ETS1-1:2 No - LINC01579:1 No - LINC02240:21 No - lnc-GSDMC-34:17 No - lnc-GRAMD2B-16:1 No - lnc-NRIP1-2:1 No - LINC02451:5 No - PTCSC2:1 No - LINC01503:17 No - lnc-LINC02203-5:1 No - LINC01378:2 No - lnc-CACNB3-1:1 No - MIR7-3HG:1 No - lnc-LDB2-1:1 No - lnc-MTRNR2L5-1:1 Yes chr3R:11893512-11949129 LINC01588:95 No - lnc-ST3GAL4-55:3 No - lnc-ACTA1-1:2 Yes chr3R:22690607-22694772 lnc-PSMG1-4:15 No - VPS33B-DT:29 No - lnc-ECI2-1:1 No - lnc-RGMA-4:1 No - lnc-ASPH-2:1 No - LINC02458:15 No - HPYR1:1 No - lnc-NBPF11-1:40 No - LINC01750:15 No - LINC02093:3 No - lnc-TTPA-1:5 No - lnc-SYT7-1:1 No - lnc-PHLDA3-1:1 No - lnc-PCMTD1-1:1 No - lnc-MYOM2-4:2 No - lnc-DLGAP5-4:1 No - lnc-APAF1-2:2 Yes chr3R:23375928-23384777 TPT1-AS1:13 No - lnc-TSC1-1:1 No - LINC00454:13 No - lnc-IGSF6-1:1 Yes chr2R:23896896-23898246 FAM238C:15 No - lnc-RTL1-3:1 No - lnc-PRDM11-3:4 No - lnc-DLK1-35:138 No - lnc-BET1L-2:1 No - lnc-DCAF5-1:2 Yes chr3R:11433488-11435703 OTX2-AS1:4 No - lnc-CACNB3-1:2 No - TPT1-AS1:14 No - FAM242C:10 Yes chr3R:17150587-17151630 lnc-CYP7A1-1:2 No - lnc-CELA3A-5:32 No - lnc-ZNF674-13:1 No - LINC01519:3 No - lnc-TSPAN11-5:1 No - lnc-SNX16-3:1 No - LINC02055:21 No - lnc-DNM1L-8:3 No - lnc-NUDT12-5:5 No - LINC02396:16 No - lnc-PRAMEF8-1:1 No - LINC00446:6 No - lnc-ANXA13-1:1 Yes chr3L:8905918-8912671 lnc-CENPC-1:6 No - RBM15-AS1:19 Yes chr2R:7962463-7969805 LINC01503:3 No - LINC01783:10 No - lnc-CCDC59-3:1 No - LINC02209:6 No - MCHR2-AS1:11 Yes chr3L:18560258-18576326 lnc-ZNF608-3:1 No - LINC02423:11 No - TMPO-AS1:1 No - lnc-TRIM29-9:2 No - lnc-ZNF37A-4:1 No - LINC02309:6 No - LINC00678:2 No - CASC15:16 No - lnc-IKBIP-16:4 No - lnc-CD180-2:1 No - LINC01114:2 No - lnc-CTAGE5-8:29 No - lnc-GALC-10:1 No - LINC00867:1 No - LINC01393:4 No - lnc-AADACL2-1:3 No - WT1-AS:9 No - lnc-FOXG1-1:1 No - lnc-PJA2-1:1 No - lnc-TPST1-1:1 No - lnc-DLK1-35:96 No - lnc-TRIQK-7:1 No - lnc-GGT2-26:2 No - lnc-ABCD3-2:9 No - lnc-SAMD11-7:30 No - lnc-OR4C13-1:2 No - LINC00446:4 No - JRKL-AS1:4 No - LINC00930:5 No - LINC01823:10 No - lnc-ZFAT-2:1 No - lnc-SLC7A14-3:7 No - LINC01122:4 No - lnc-AADACL2-1:2 No - lnc-PRAG1-1:2 No - MIR3142HG:2 No - lnc-JPH1-4:1 No - lnc-ANKRD30BL-2:2 No - lnc-LMBR1-12:3 No - lnc-ZMAT3-3:1 No - LINC02384:36 No - NUTM2B-AS1:25 No - LINC02354:10 Yes chrX:13262687-13285632 ADGRD1-AS1:6 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-JAG1-3:2 No - lnc-PABPC4L-6:2 No - lnc-PDGFA-6:4 No - lnc-AP3S1-2:3 No - LINC02290:24 No - LINC02059:8 No - lnc-FAM237B-1:1 No - lnc-RNF39-4:2 Yes chr3R:21777203-21777847 LINC01983:7 No - SATB1-AS1:16 No - lnc-MFAP2-5:2 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-FN1-1:1 No - lnc-PPP1R3B-3:2 No - lnc-PRDM11-5:1 No - lnc-SATB2-2:1 No - lnc-SLC9C1-2:6 No - lnc-ZNF37A-1:1 No - lnc-POTEG-14:3 No - lnc-ZCCHC7-2:1 No - LINC02395:16 No - LINC02311:4 No - LINC02055:25 No - lnc-POLR2B-17:2 No - LINC01660:8 No - lnc-NUDT12-7:2 No - lnc-SNX13-2:7 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-NGFR-3:2 No - lnc-GRHL2-7:6 No - LINC01944:3 No - lnc-ANKRD20A4-5:1 No - lnc-ARRDC4-3:1 No - lnc-MUC15-1:1 No - lnc-UBLCP1-2:1 No - LINC01106:10 No - lnc-LRCOL1-2:12 No - lnc-PGR-2:1 No - LINC01487:4 No - lnc-FAM236D-2:2 Yes chrX:13368191-13370472 lnc-SLC24A3-1:2 No - lnc-CLINT1-2:1 No - LINC01105:8 No - lnc-IGFL1-1:7 No - lnc-PLD1-2:1 Yes chr2L:16545016-16663218 LINC00484:1 No - lnc-ANKRD30BL-14:1 No - lnc-C8orf86-2:1 No - LINC01160:1 Yes chr3L:1859115-1862239 TEX41:22 No - JPX:21 No - lnc-ERCC6L2-2:5 No - LINC00870:4 No - CYTOR:108 No - lnc-SLC17A9-1:1 No - LINC00466:14 No - lnc-PASD1-1:1 No - LINC00623:32 No - lnc-SOD3-5:1 No - ENTPD3-AS1:4 No - lnc-STEAP1B-2:1 No - lnc-FAM92A-7:2 No - LINC01419:4 No - LINC02443:19 No - lnc-PRL-7:1 No - OR2A1-AS1:14 No - lnc-NBPF1-1:4 No - lnc-CNTNAP3B-2:2 No - lnc-MGST1-3:1 No - LINC01766:14 No - CBR3-AS1:34 No - lnc-POTEG-14:16 No - lnc-TRIML1-4:1 No - LINC01288:2 No - lnc-SNX10-87:3 No - lnc-PPDPFL-2:9 No - PVT1:10 No - lnc-RNF144A-2:6 No - H19:3 No - lnc-MSH4-1:4 No - SLC25A30-AS1:1 Yes chr3L:11720934-11728118 lnc-TRIM26-2:3 No - LINC01013:10 No - lnc-KDM8-1:1 No - lnc-STARD13-2:2 No - LINC01709:9 No - TPT1-AS1:31 No - OR2A1-AS1:9 No - lnc-UNC93B1-4:1 No - lnc-ARL1-1:1 No - lnc-ZMAT3-3:4 No - lnc-OTX2-1:1 No - lnc-FAM98A-3:1 No - LINC00867:4 No - lnc-DDX51-8:1 No - lnc-ZFHX4-3:4 No - lnc-GPR89B-3:2 No - lnc-CAPRIN2-2:1 No - LINC00616:4 No - lnc-PIWIL4-1:19 No - lnc-ZIC1-5:1 No - lnc-ZNF479-1:2 No - PCBP1-AS1:1 No - lnc-CHRM2-1:1 No - LINC00421:2 No - lnc-CIT-1:3 No - lnc-NWD2-2:5 No - lnc-KMO-1:2 No - lnc-SP3-1:1 No - lnc-FGL2-2:1 No - SNHG21:11 No - GASAL1:17 No - LINC01124:1 No - EDNRB-AS1:3 No - LINC02370:9 No - LINC02282:5 No - lnc-FSCB-1:4 No - lnc-NBPF3-2:1 No - lnc-PRKD1-1:2 Yes chr3R:18303279-18314407 H19:13 No - LINC02449:14 No - lnc-DLK1-35:86 No - LINC01205:1 No - lnc-CEP170-2:3 No - lnc-BRF1-4:3 No - lnc-ZNF131-1:5 No - lnc-VWC2L-1:6 No - lnc-SYN3-2:1 No - LINC00824:7 No - LINC00710:15 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-BOD1-1:15 No - LINC02460:4 No - LINC00458:3 No - lnc-CFLAR-2:1 No - lnc-RAB30-2:2 No - lnc-CPT2-3:1 No - lnc-IFITM2-1:4 No - lnc-RWDD3-5:2 No - lnc-ETDB-59:1 No - LINC00319:7 No - LINC02241:9 No - LINC02432:18 No - lnc-SERPINA3-1:1 No - lnc-HLX-1:1 No - LINC01856:3 No - LINC02159:10 No - SLC16A1-AS1:17 No - lnc-NBPF15-1:1 No - TTC28-AS1:9 No - lnc-SPTLC1-2:1 No - lnc-MSMB-6:1 No - LINC00379:3 No - LINC01854:19 No - LINC02056:34 No - lnc-RPS24-3:23 No - lnc-COL6A1-2:2 No - lnc-RUNX1T1-4:1 No - LINC01914:18 No - lnc-SLC17A5-1:1 Yes chr2L:19548507-19556451 SNHG18:3 No - LINC02241:10 No - LINC01103:2 No - LINC00640:1 No - lnc-ZNF680-4:1 No - LINC00454:12 No - LINC01378:5 No - PGM5P4-AS1:6 No - lnc-OR4E1-1:2 No - lnc-CSMD1-1:1 No - lnc-GRXCR1-4:4 No - TCL6:11 No - lnc-RNF39-4:3 Yes chr3R:21777203-21777847 lnc-LRRC47-78:34 No - LINC00276:1 No - lnc-DLC1-5:1 No - lnc-GYPC-2:2 No - lnc-SPATA31D4-1:1 No - LINC00700:4 No - lnc-RBMX-1:1 No - lnc-FOXD4L5-25:11 No - lnc-FOXD4L5-35:4 No - FAM41C:2 No - lnc-OR13A1-1:1 No - ZNF295-AS1:8 No - lnc-RPP30-6:2 No - lnc-ADAM18-1:1 No - LINC01135:5 No - lnc-OSR2-1:1 No - lnc-NKAIN3-14:27 No - LINC01388:13 No - lnc-NUDT8-1:1 No - lnc-FOXD4L5-35:7 No - HAR1A:2 No - TMEM132D-AS1:31 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-LSM11-4:1 No - WT1-AS:15 No - lnc-HMBOX1-5:7 No - lnc-ADAM21-3:1 No - lnc-STMP1-8:3 No - lnc-ETAA1-7:1 No - lnc-DERL1-7:1 No - lnc-NLGN4X-1:1 No - LINC02506:12 No - LINC01933:11 No - lnc-KHDRBS3-21:1 No - lnc-CLVS1-1:3 No - lnc-DLX4-2:1 No - lnc-ELF5-2:1 No - LINC02365:13 No - lnc-C8orf86-1:4 No - lnc-PRDM11-3:3 No - lnc-LRTM1-2:1 No - LINC02238:5 No - lnc-FBXO11-1:1 No - VPS33B-DT:18 No - FALEC:2 No - lnc-ANKRD36B-3:19 No - LINC00645:1 No - lnc-NCAM1-1:1 No - LINC02398:24 No - lnc-NKAIN3-14:28 No - DICER1-AS1:4 Yes chr3R:22734007-22741091 LINC01105:10 No - lnc-RUFY1-2:1 No - lnc-COQ2-1:1 No - LINC01393:2 No - ZFAS1:12 No - LINC00870:3 No - lnc-LECT2-1:2 No - LINC01138:38 No - lnc-ZSWIM2-6:2 No - LINC01813:6 No - LINC01940:14 No - lnc-INSC-3:1 No - PAX8-AS1:25 Yes chr4:1088798-1113317 MAL2-AS1:8 No - lnc-GPCPD1-8:10 No - lnc-RC3H1-1:1 Yes chr3L:8346561-8352279 lnc-TRIM36-2:1 No - lnc-TMEM65-1:1 No - lnc-FOXO1-2:12 No - FILNC1:19 No - lnc-ADAM8-1:7 Yes chr3R:14664907-14697292 LINC01509:3 No - lnc-KCNK9-1:1 No - LINC00649:6 Yes chr3R:15265591-15266690 lnc-FAM72B-4:5 No - LINC02139:8 No - lnc-SERPINB8-2:1 No - LINC01910:4 No - lnc-CAND2-2:1 Yes chr3L:21034535-21075444 lnc-RYBP-3:1 No - ZFAS1:2 Yes chr3R:24193832-24196880 LINC01660:10 No - lnc-SIPA1L3-3:19 No - lnc-ERG-9:8 No - lnc-NBPF1-2:15 No - LINC02279:3 No - lnc-METTL18-1:1 No - TMEM161B-AS1:6 Yes chr3L:11109690-11112117 SREBF2-AS1:5 Yes chr3L:19793935-19798979 lnc-DUSP26-2:1 No - lnc-DENND3-2:2 No - lnc-PTH-2:1 No - ZNF385D-AS2:1 No - lnc-WISP1-4:1 No - ALDH1L1-AS2:3 Yes chr2L:21371227-21377995 lnc-THOC3-2:6 No - LINC00535:3 No - lnc-USP38-3:1 Yes chrX:14228060-14234066 DIO3OS:4 No - lnc-ZSWIM2-6:1 No - H19:5 No - PVT1:16 No - LINC00864:3 No - LINC01591:7 No - lnc-PRR34-1:2 No - lnc-YTHDF3-8:1 No - PROX1-AS1:34 No - LINC02303:13 No - lnc-NUAK1-1:1 No - FAM242E:7 No - lnc-FAM198A-1:1 Yes chr2L:2381097-2383073 TTTY7:2 No - lnc-METTL15-2:1 Yes chr3R:10696647-10698976 lnc-DROSHA-3:1 Yes chr2R:22855688-22858794 lnc-ZFYVE1-1:1 Yes chrX:5666052-5670652 LINC00501:1 No - lnc-ZNF37A-2:1 No - lnc-SHC3-2:2 No - LINC01938:16 No - LINC01649:10 No - LINC00276:2 No - lnc-OTX2-1:3 No - lnc-CYP7A1-3:1 No - LINC02290:21 No - lnc-CCDC179-1:7 No - lnc-MED10-11:1 No - LINC00534:4 No - LINC00378:2 No - lnc-CENPC-1:5 No - LINC02107:3 No - LINC02032:5 No - lnc-SORCS1-4:1 No - OR2A1-AS1:7 No - LINC02319:3 No - LINC00648:7 No - KIZ-AS1:5 No - LINC02539:14 No - lnc-CCND2-2:2 No - lnc-APC-2:1 No - lnc-IQCM-2:1 No - lnc-MYC-3:1 No - CNTN4-AS2:1 Yes chr3R:4381306-4387018 lnc-LRCH2-3:1 Yes chrX:17285704-17301929 lnc-TENM4-7:2 No - lnc-POU5F1B-5:1 No - lnc-CLEC4E-1:1 No - LINC01719:31 No - LINC01762:44 No - LINC02325:23 No - LINC01567:1 Yes chr4:649041-663103 lnc-TMEM255B-5:20 No - lnc-NBPF6-1:6 No - lnc-RWDD3-5:4 No - LINC01361:4 No - LINC02571:3 No - LINC02392:20 No - lnc-GPR89A-1:1 No - lnc-LRP5L-1:1 No - lnc-PPP2R1B-1:1 No - lnc-FAM181B-1:1 No - lnc-PRELID2-4:1 No - TTTY11:1 No - LINC02463:3 No - FAM242C:7 Yes chr3R:17150587-17151630 lnc-VPS33B-1:1 No - lnc-TMEM132B-4:10 No - lnc-BMT2-1:6 No - LINC02421:3 No - lnc-EDIL3-3:1 No - LINC00644:1 No - lnc-THOC3-2:15 No - LINC00305:6 No - lnc-UBLCP1-2:2 No - lnc-NKAIN3-14:22 No - VASH1-AS1:17 No - FGF10-AS1:1 No - lnc-MMP23B-1:1 Yes chrX:22444227-22447808 LINC02395:23 No - lnc-GGT2-26:8 No - LINC02505:5 No - LINC02432:19 No - lnc-BMT2-1:7 No - lnc-CCDC179-3:1 No - LINC02372:13 No - LINC00305:5 No - lnc-METAP1-3:2 No - LINC02038:7 No - LINC02522:5 No - lnc-C12orf73-1:1 No - DAB1-AS1:14 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-SPATA31A7-2:1 No - CD27-AS1:14 No - LINC02366:6 No - LMCD1-AS1:7 No - LINC00638:2 No - LINC02598:3 No - LINC02105:6 No - LINC02395:15 No - LINC02438:3 No - lnc-AGTPBP1-1:1 No - lnc-ETNK1-3:4 No - lnc-IL17RA-33:1 No - KIZ-AS1:3 No - lnc-PARP8-2:1 No - LINC02153:21 No - lnc-SSUH2-1:1 Yes chr2R:17465879-17469177 MYT1L-AS1:3 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-PRSS55-1:1 No - lnc-DPF3-1:1 Yes chrX:16838173-16844433 LINC00222:6 No - lnc-RPS24-18:1 No - lnc-NUDT4B-1:9 No - lnc-MAT2B-2:1 No - LINC01391:3 No - lnc-C4orf17-53:1 Yes chr3R:10870906-10872381 lnc-KCNC2-2:6 No - LINC01358:5 No - LINC02466:6 No - lnc-PKN2-1:1 No - SNHG10:3 Yes chrX:14837471-14838198 LINC01985:13 No - LINC01629:2 No - LINC01603:3 No - LINC02552:19 No - lnc-NBPF1-2:16 No - NPSR1-AS1:8 Yes chr3R:25923499-25956270 lnc-LY86-4:5 No - lnc-DLGAP5-1:1 No - HAS2-AS1:6 No - OTX2-AS1:1 No - lnc-BTBD17-3:2 Yes chr2R:4515388-4516458 PGM5P4-AS1:9 No - lnc-SLC7A13-1:1 Yes chr2L:2037714-2044372 LINC01803:3 No - LINC00174:8 No - PVT1:17 No - lnc-FAM84B-15:133 No - lnc-IKBIP-16:5 No - LINC01353:1 No - lnc-GRB10-1:1 No - lnc-YTHDF3-7:3 No - LINC00174:1 Yes chrX:13563823-13593224 LINC00539:1 No - LBX1-AS1:11 No - LINC02300:5 No - LINC02301:16 No - lnc-NAIP-1:5 Yes chr3L:22879089-22880963 LINC02354:11 Yes chrX:13262687-13285632 LINC01007:8 No - lnc-BOD1-1:1 No - lnc-CCDC96-1:1 No - lnc-ASTN2-6:1 No - lnc-ATF7IP-3:1 No - BASP1-AS1:22 No - TRPM2-AS:4 Yes chr2R:15262808-15309368 lnc-SLC39A11-10:10 No - TTC28-AS1:10 Yes chr3R:19215434-19226651 lnc-MSR1-1:11 No - ZEB1-AS1:12 Yes chr3R:30765926-30789202 LINC00486:9 No - CHRM3-AS2:10 Yes chr2R:24378630-24390294 LINC02404:4 No - LZTS1-AS1:1 Yes chrX:9054698-9067983 lnc-RWDD3-5:1 No - LINC01135:2 No - DLG1-AS1:2 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-ZNF26-12:6 No - lnc-KIDINS220-8:2 No - LINC01322:5 No - TMEM161B-AS1:49 No - lnc-CCNH-8:1 No - lnc-TRIM29-9:10 No - lnc-STX2-3:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-TRAF5-3:1 No - LINC00881:7 No - lnc-ETNK1-3:1 No - lnc-GPR65-5:1 No - lnc-LRRIQ1-2:1 No - lnc-FOXO6-2:1 No - lnc-SMARCA5-4:10 No - LINC01658:6 No - lnc-NAP1L3-1:1 Yes chr3R:14630478-14641776 lnc-TMEM70-2:2 No - lnc-LGALS14-1:4 No - ELFN1-AS1:4 No - lnc-POTEM-4:3 No - LINC01361:1 No - LINC02153:28 No - lnc-FOXD4L5-35:6 No - lnc-THOC3-2:22 No - lnc-BRF1-9:2 No - LINC01010:7 No - LINC02507:4 No - lnc-GABPA-7:1 No - lnc-CD180-4:2 No - LINC01965:13 No - lnc-PRORY-6:1 No - DAB1-AS1:18 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-C2CD5-1:1 No - LINC01968:3 No - lnc-ALDH3A2-1:3 No - GPR158-AS1:1 Yes chr2L:12142780-12170508 LINC01001:9 No - lnc-EVX1-14:2 No - lnc-GLB1L2-1:5 No - LINC02099:16 No - CERNA2:6 No - lnc-FOXD4L5-35:5 No - lnc-KIF26A-5:2 No - IGFL2-AS1:12 No - LINC01703:20 No - lnc-OTX2-1:2 No - lnc-KIF18A-1:1 No - lnc-RGMA-7:13 No - LINC02492:15 No - LINC01677:10 No - LINC02055:24 No - STARD4-AS1:3 No - lnc-SLC16A9-1:1 No - CD27-AS1:13 No - lnc-UNC5D-2:1 No - lnc-LY96-2:2 No - LINC02350:19 No - LINC02153:24 No - lnc-HIST2H3PS2-3:9 No - lnc-ZNF195-1:2 No - THRB-AS1:3 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-ANKRD30A-15:1 No - lnc-JAG1-3:1 No - lnc-ITGB8-2:1 No - lnc-ATP6V1C1-10:1 No - lnc-CCDC150-1:2 Yes chrX:9608946-9623243 LINC01501:5 No - CASC11:1 No - MIR99AHG:107 No - lnc-FZD1-2:3 No - lnc-PKIA-2:2 No - lnc-RTN1-2:2 No - lnc-ATP6V0D2-2:2 No - lnc-LRRC4C-1:2 No - lnc-OR14J1-2:1 No - lnc-SLC13A1-1:1 No - LINC00327:8 No - lnc-BTBD10-2:1 No - LINC02065:5 No - LINC02148:7 No - lnc-BNIP1-3:4 No - lnc-WRN-3:1 No - lnc-JPH4-4:9 No - DLEU2:13 No - TTC28-AS1:17 Yes chr3R:19215434-19226651 lnc-N6AMT1-1:1 No - lnc-PRC1-1:1 No - lnc-RTL1-5:3 No - lnc-IQCM-1:3 No - lnc-ATXN2L-1:1 No - LINC00466:16 No - lnc-ST6GALNAC3-1:1 No - lnc-WDR3-1:1 Yes chr2R:7716807-7735622 lnc-MFAP2-53:8 Yes chr3R:24113286-24128193 OTX2-AS1:5 No - lnc-NBPF1-1:6 No - lnc-ERI1-32:20 No - CASC11:2 No - lnc-METAP1-11:3 No - LINC00708:2 No - TTC28-AS1:22 No - lnc-DLK1-35:53 No - lnc-ATP6V0E2-2:3 No - LINC02068:16 No - lnc-ZNF706-3:1 No - lnc-OR4C11-1:1 No - lnc-ANO5-1:1 No - lnc-PAMR1-1:1 No - lnc-DCAF5-2:1 No - LINC02389:15 No - lnc-GRM7-7:1 No - lnc-MSRB3-3:2 No - FAM239B:13 No - lnc-MUC2-1:4 No - lnc-OSBP-1:1 No - LINC00303:2 No - TTTY6:3 No - lnc-ATP5S-1:5 Yes chr2L:5706374-5713791 LINC02159:11 No - LINC01518:9 No - LINC01778:13 No - lnc-RNF39-4:4 Yes chr3R:21777203-21777847 LINC01298:3 No - lnc-POTEG-14:1 No - lnc-P2RY2-3:2 No - lnc-RPL26L1-1:1 No - LINC02389:17 No - lnc-RGS1-1:1 No - NUTM2B-AS1:30 No - LINC02492:13 No - LINC01824:3 No - lnc-LMO2-1:3 No - TOB1-AS1:1 Yes chrX:16074717-16091495 LINC02439:3 No - LINC01505:11 No - LINC01500:3 No - lnc-GYPC-2:1 No - LINC00870:1 No - lnc-C1orf61-2:6 No - lnc-BOD1-1:25 No - lnc-BMS1-2:1 No - SUCLG2-AS1:4 No - LINC02551:12 No - CHRM3-AS2:6 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-PZP-1:1 No - JPX:10 No - OR2A1-AS1:15 No - lnc-MAPKAP1-2:1 No - lnc-API5-4:4 No - ITGA9-AS1:7 Yes chr2R:15258761-15262873 LINC02554:10 No - lnc-ALG10-1:2 No - LINC01020:7 No - lnc-CELA3A-5:30 No - PSG8-AS1:4 No - lnc-GLB1L2-5:1 No - lnc-ZNF33A-13:2 No - lnc-SLC39A11-10:24 No - lnc-TRIM43-7:3 No - LINC00487:2 No - lnc-HEY1-1:1 No - lnc-NUDT12-5:4 No - LINC01503:1 No - lnc-KCNA4-3:2 No - LINC01659:9 No - ADGRD1-AS1:7 Yes chr2R:8614722-8625203 PVT1:18 No - LINC02073:5 No - lnc-ROCK2-3:5 No - lnc-F9-1:1 No - LINC01749:7 No - lnc-UBLCP1-30:5 No - LINC02466:5 No - ZBTB20-AS4:1 No - lnc-WASHC5-2:4 No - LINC01967:8 No - lnc-PPIAL4D-19:10 No - NPSR1-AS1:11 Yes chr3R:25923499-25956270 LINC00879:7 No - lnc-IFT74-1:3 No - LINC02423:8 No - DAB1-AS1:3 Yes chr3L:16712126-16724575 TMEM161B-AS1:19 Yes chr3L:11109690-11112117 LINC01425:4 No - lnc-CDH17-1:1 No - lnc-LPA-3:2 No - LINC01192:5 No - MIR663AHG:20 No - LINC01210:4 No - lnc-ANKRD20A2-1:21 No - lnc-RGMA-18:1 No - lnc-IQCM-2:3 No - LINC00448:6 No - LINC01603:1 No - lnc-CHGA-1:7 No - lnc-COA4-1:2 No - lnc-IL20RA-1:2 No - LINC01001:3 No - lnc-LRRC10B-1:1 No - lnc-SLC39A11-10:23 No - lnc-IFITM2-3:4 No - LINC00491:1 No - lnc-SULT1C2-1:1 No - lnc-C8orf86-1:1 No - lnc-TREML1-1:2 No - lnc-TRMT2B-1:1 No - LINC00494:10 No - LINC-PINT:14 No - lnc-ZCCHC24-2:1 No - LINC01579:2 No - lnc-GLB1L2-3:2 No - lnc-SGK1-3:1 No - LINC01942:9 No - lnc-SMDT1-3:30 Yes chr2R:18094940-18101031 lnc-RHOXF1-3:3 No - lnc-LONRF1-1:4 No - LINC01608:4 No - MAL2-AS1:7 No - lnc-EBAG9-2:2 No - FAM239A:21 No - lnc-PCBP1-1:1 No - LINC01762:46 No - lnc-DLK1-35:92 No - lnc-METTL15-5:1 No - lnc-PPP1R3B-4:1 No - SLC16A1-AS1:9 No - lnc-PRAG1-2:1 No - lnc-UBC-1:1 Yes chr3L:7733250-7743041 LINC01500:5 No - lnc-FGF3-1:1 No - lnc-KIAA1549L-10:1 No - lnc-DLK1-35:126 No - LINC01493:14 No - lnc-CHD2-4:4 No - SMILR:8 No - lnc-GRAMD2B-14:1 No - lnc-NOC4L-2:2 No - LINC01391:2 No - lnc-PCSK6-3:1 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-NDRG2-3:1 No - lnc-PDYN-1:21 No - lnc-POTEG-14:11 No - lnc-POTEM-4:13 No - lnc-ARAP2-6:1 No - LINC01001:6 No - lnc-TTPA-1:4 No - lnc-DAGLA-1:2 No - LINC01645:4 No - lnc-NEDD1-1:1 No - lnc-CEP57L1-1:6 No - lnc-TENM2-1:1 No - lnc-ZHX2-6:1 No - lnc-RNF144A-2:2 No - LINC01276:1 No - lnc-MLXIP-12:15 No - LINC01095:1 No - lnc-EPB41L1-1:2 No - lnc-TRIM16-2:3 No - lnc-IL17RA-36:32 No - LINC00445:1 No - DIO3OS:12 No - lnc-EFCAB1-3:1 No - DAB1-AS1:36 Yes chr3L:16712126-16724575 ZNF295-AS1:1 No - TNK2-AS1:1 Yes chr3L:4108186-4114157 LINC00499:4 No - lnc-PPHLN1-4:1 No - ZEB1-AS1:13 Yes chr3R:30765926-30789202 LBX1-AS1:12 No - LINC00466:4 No - lnc-WNT8A-1:1 Yes chr2R:17703335-17719346 LINC02366:9 No - LINC00845:1 Yes chr3L:20376242-20382398 lnc-PRMT6-3:2 No - LINC01947:4 No - lnc-IZUMO1R-1:1 No - lnc-NPBWR1-11:1 No - lnc-RNASE1-2:3 No - NUTM2B-AS1:28 No - lnc-TRIB1-2:2 No - lnc-LRRIQ1-2:2 No - lnc-LPA-3:4 No - TTTY23:1 No - LINC02231:3 No - lnc-CEACAM20-1:8 No - lnc-SLC35C1-3:4 No - LINC00491:8 No - lnc-HOXA10-1:5 No - LINC02056:35 No - lnc-CDKL1-1:1 Yes chr2R:16148812-16149795 LINC01939:6 No - lnc-RNF39-4:5 Yes chr3R:21777203-21777847 lnc-HEPH-1:2 No - lnc-CSMD1-1:5 No - lnc-NTF3-5:6 No - lnc-MFHAS1-1:1 No - lnc-IL20RA-1:1 No - lnc-SRSF4-1:1 No - FAM238C:13 No - LINC00426:11 No - LINC00968:7 No - LINC02535:26 No - lnc-MYOM2-1:1 No - lnc-AIG1-8:17 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-ERI1-32:24 No - lnc-AACS-1:1 No - lnc-RIMKLB-6:3 No - SIRLNT:15 No - lnc-KCNC3-1:5 Yes chr2R:6087873-6169087 LINC01006:7 No - LINC01643:3 No - DIO3OS:19 No - lnc-SERPINB9-1:2 No - lnc-CHST12-1:1 Yes chr2L:16879517-16886319 LINC02396:17 No - lnc-CSMD1-4:1 No - H19:10 No - lnc-PIWIL4-1:12 No - HOTAIR:3 Yes chr3R:16927212-16972236 PVT1:23 No - LINC01122:5 No - lnc-UBLCP1-30:1 No - lnc-EFCAB1-1:1 No - lnc-RAB23-53:22 No - VAV3-AS1:18 No - lnc-NDRG2-2:1 No - LINC01715:16 No - LINC02318:9 No - lnc-MRPL39-4:1 No - lnc-RGMA-6:1 No - LINC02199:12 No - lnc-TRABD2B-4:1 No - LINC00641:5 No - lnc-MAP1LC3B2-4:6 No - lnc-TMEM167A-2:1 No - lnc-MLXIP-12:13 No - lnc-AK6-2:2 No - LINC00989:2 No - lnc-OR9I1-1:1 No - lnc-ZNF664-7:1 No - lnc-XIAP-1:1 No - lnc-BRF2-21:1 No - lnc-OR5B21-1:1 No - lnc-FAM172A-1:1 No - lnc-GGT2-26:7 No - LINC01602:1 No - lnc-ZBTB49-1:1 No - LINC01681:4 No - lnc-NKAIN3-14:23 No - lnc-SDSL-6:3 No - LINC01322:8 No - LINC02143:9 No - lnc-ARFGEF2-2:5 No - lnc-KCNK10-1:3 No - lnc-DLK1-35:61 No - LINC01802:3 No - lnc-CHST1-5:4 No - lnc-IQCM-2:9 No - lnc-LSM11-6:1 No - LINC01827:8 No - ZBTB20-AS3:2 No - LINC01695:5 No - lnc-SPATA19-9:3 No - lnc-RNF7-2:2 No - lnc-ZNF131-1:2 No - LINC01095:7 No - LINC02531:3 No - lnc-NEUROD6-1:1 No - lnc-SMPD1-2:1 No - lnc-PRAMEF25-1:2 No - lnc-KCNJ6-1:2 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-ZCCHC7-2:2 No - lnc-TRIM26-2:10 No - lnc-WFS1-3:1 No - TPT1-AS1:10 No - lnc-CEBPB-4:1 No - lnc-RIMKLB-6:4 No - lnc-ZNF100-2:1 No - lnc-C2orf49-1:1 No - LINC00159:1 No - HOTTIP:1 Yes chr3R:16927212-16972236 LINC02355:5 No - lnc-KCNH5-4:1 Yes chr3R:4314455-4319069 LINC02223:12 No - lnc-TTPA-1:3 No - lnc-KIAA0040-2:1 No - HAS2-AS1:2 No - lnc-NUDCD2-2:17 No - lnc-ANGPT2-3:1 No - lnc-NIPA1-1:2 No - LMCD1-AS1:1 Yes chr2R:17465879-17469177 lnc-USP44-5:1 No - lnc-ATAD5-9:20 No - LINC00491:7 No - lnc-A1BG-1:1 No - lnc-DLK1-35:118 No - lnc-SEL1L-5:1 No - TCL6:1 No - lnc-OR4F16-4:1 No - lnc-PANK3-11:1 No - lnc-OVOL1-1:1 No - lnc-PSD3-1:1 No - lnc-GALNT3-1:1 No - TTTY1:2 No - LINC02386:6 No - lnc-C1QL4-3:1 No - LINC00670:4 No - lnc-PAWR-1:3 Yes chr2L:2772327-2799979 lnc-DLK1-35:125 No - LINC01160:3 Yes chr3L:1859115-1862239 LINC00536:6 No - lnc-MUC20-7:4 No - AFDN-DT:18 No - lnc-SEMA3B-1:3 No - LINC02416:3 No - lnc-KBTBD3-2:1 No - LINC01951:5 No - LINC01209:1 No - LINC01317:5 No - lnc-SNX19-7:1 No - TTTY6:5 No - lnc-API5-4:5 No - lnc-RICTOR-54:2 No - lnc-KIAA0040-2:3 No - H19:15 No - lnc-EBAG9-3:1 No - lnc-CRYBB1-2:1 No - lnc-POTEH-3:2 No - LINC00494:8 No - lnc-FAM84B-15:126 No - lnc-PRSS23-2:1 No - LINC00365:3 No - LINC02365:12 No - lnc-NRIP2-3:1 No - lnc-PPP1R13B-1:1 No - lnc-HMBOX1-5:1 No - lnc-CREB3L1-4:1 No - lnc-CHD2-4:1 No - LINC01099:3 No - lnc-KCNH5-3:1 Yes chr3R:4314455-4319069 HNF4A-AS1:8 Yes chr2L:8687226-8709611 lnc-MINDY4B-1:2 No - LINC00163:4 No - lnc-SERPINI1-23:5 No - SNHG18:1 No - FAM66E:4 No - lnc-ATL2-1:1 No - LINC01252:4 No - lnc-TNFAIP6-3:1 No - lnc-FAM92A-9:6 No - LINC01738:3 No - lnc-WRN-4:3 No - LINC02384:40 No - LINC02442:7 No - lnc-RIMKLB-6:2 No - lnc-MDGA2-3:1 No - DICER1-AS1:12 Yes chr3R:22734007-22741091 lnc-CDC42BPA-1:1 No - WT1-AS:7 Yes chr3L:10981171-11009188 lnc-FSCB-1:8 No - MIR3681HG:5 No - ALDH1L1-AS2:1 Yes chr2L:21371227-21377995 lnc-NUDT12-7:1 No - MIR3681HG:9 No - lnc-CEP170-2:1 No - lnc-DTHD1-1:1 Yes chrX:16943290-16956234 lnc-CPM-2:2 Yes chr2L:10733293-10736071 lnc-CFAP69-1:1 No - LINC01712:7 No - lnc-DENND1A-3:2 Yes chr2R:5706202-5727525 SRGAP2-AS1:5 No - FAM41C:1 No - LINC01170:6 No - LINC02395:18 No - lnc-KRTAP5-4-1:1 No - HAS2-AS1:4 No - LINC00320:20 No - LINC02096:7 No - lnc-LINC02203-6:2 No - LINC00364:1 No - lnc-HMHB1-2:2 No - lnc-CTAGE5-8:18 No - lnc-KCNB2-2:1 No - LINC01579:6 No - lnc-LRRC4C-3:1 No - LINC01707:3 No - LINC00689:8 No - LINC00474:1 No - lnc-USP35-7:1 No - lnc-COA6-7:4 No - lnc-AGAP4-1:2 No - lnc-PFKP-16:11 No - LINC00467:3 No - CYTOR:112 No - lnc-TRIB1-4:1 No - ZFAS1:3 Yes chr3R:24193832-24196880 LINC00681:1 No - lnc-FAM92A-5:1 No - lnc-MRPL14-2:1 No - MIR22HG:13 No - lnc-DLK1-35:122 No - LINC01238:13 No - LINC01526:3 No - lnc-FGF3-1:2 No - lnc-CACNA2D3-4:1 Yes chr2R:9503765-9541565 lnc-KHDRBS1-4:1 Yes chr2L:16245835-16257606 lnc-UBE2K-2:8 No - lnc-AGTR1-2:2 No - lnc-APOB-5:1 No - lnc-USP38-2:1 Yes chrX:14228060-14234066 LINC01372:6 No - LINC01706:7 No - lnc-ROCK2-3:4 No - LINC01493:10 No - lnc-POTEG-23:3 No - LINC00115:4 No - lnc-FMN2-1:1 No - lnc-SFSWAP-1:1 No - lnc-SYT16-67:14 No - LINC01410:2 No - lnc-TSR3-2:1 Yes chr2L:540599-542580 lnc-SPANXA2-1:1 No - lnc-SBDS-4:1 No - lnc-TREML1-1:3 No - ITGA9-AS1:8 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-NR1I2-1:1 No - lnc-KIAA1210-1:2 No - PVT1:11 No - MIR34AHG:11 No - LINC00426:13 No - lnc-C13orf42-1:5 No - LINC01495:5 No - LINC00115:9 No - lnc-TRAPPC6B-1:1 Yes chr3R:9740899-9742844 LINC02447:17 No - lnc-METTL15-5:2 No - lnc-SLC16A7-2:1 No - RALY-AS1:8 No - LINC00923:1 No - TMEM161B-AS1:15 Yes chr3L:11109690-11112117 LINC00535:1 Yes chr2L:12424904-12426440 NPSR1-AS1:9 Yes chr3R:25923499-25956270 LINC00320:19 No - DIO3OS:2 No - lnc-SMIM10L2B-1:11 No - FZD10-DT:48 No - lnc-OR5B21-1:3 No - lnc-ANO3-2:1 No - lnc-EFR3A-4:1 Yes chr3L:10640286-10661013 lnc-DLK1-35:98 No - LINC01579:9 No - lnc-KHDRBS3-4:4 No - lnc-EIF2AK3-4:77 No - lnc-RNF19A-1:2 No - MIR4432HG:1 No - LINC00871:1 No - lnc-RUNX1T1-2:1 No - lnc-SLC24A3-1:3 No - DNAJC27-AS1:8 No - lnc-MEP1B-2:1 No - LINC01524:22 No - LINC02385:4 No - lnc-SEMA3B-1:1 No - lnc-FER1L6-1:1 No - lnc-RHOB-1:1 No - LINC01262:1 No - LINC02315:17 No - lnc-RTL1-3:2 No - TPT1-AS1:11 No - LINC00320:10 No - lnc-ANO1-3:1 No - lnc-PRSS51-3:3 No - lnc-PPDPFL-2:10 No - lnc-SPATA31A7-14:4 No - LY6E-DT:35 No - CYTOR:95 No - lnc-SH3BGRL2-2:1 No - DLEU2:11 No - TPT1-AS1:33 No - lnc-ABCB9-1:1 No - lnc-CT83-1:2 No - lnc-ASAP2-2:1 No - TPT1-AS1:35 No - lnc-IQCM-2:2 No - LINC01320:4 No - LINC02547:3 No - LINC01687:16 No - lnc-ZNF727-17:4 No - LINC01146:15 No - lnc-GPR89B-6:1 No - lnc-TMEM260-2:1 No - LINC00392:1 No - lnc-GRIP1-2:1 Yes chrX:5966279-5986699 LINC02305:8 No - MCHR2-AS1:3 Yes chr3L:18560258-18576326 lnc-CXorf49-2:1 No - lnc-SPRED2-1:2 No - lnc-HOXC4-1:1 No - lnc-SMIM36-5:1 No - TMEM132D-AS1:27 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-C5orf30-3:1 No - lnc-RNF13-3:6 No - lnc-CBFA2T3-1:1 No - lnc-C12orf74-3:24 Yes chrX:16074717-16091495 lnc-HPD-2:1 Yes chrX:9356634-9358594 LINC01001:12 No - lnc-RHOXF1-3:6 No - LINC01588:96 No - LINC00159:2 No - lnc-ANGEL1-5:1 Yes chr3L:8183361-8186671 lnc-SSTR1-2:1 No - lnc-DZANK1-1:2 No - DIO3OS:5 No - LINC00536:1 No - lnc-PTS-3:4 No - LINC00616:2 No - FAM138B:5 No - lnc-TMEM135-3:1 No - OR2A1-AS1:19 No - lnc-POTEG-14:2 No - LINC02449:10 No - lnc-SMDT1-3:29 Yes chr2R:18094940-18101031 lnc-GNRH1-1:1 No - lnc-TRIM26-2:8 No - lnc-DLK1-35:116 No - lnc-MAP1LC3B2-2:9 No - lnc-IKBIP-16:3 No - LINC00882:4 No - PVT1:24 No - lnc-SHC3-1:1 Yes chr3L:9427010-9428671 WT1-AS:13 No - lnc-TIFA-2:1 No - lnc-ADAM8-1:8 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-MAP3K4-2:1 No - LINC02346:6 No - lnc-ATP6V0E2-2:2 No - LINC00879:1 No - LINC01095:8 No - lnc-EPCAM-8:2 No - LINC02553:3 No - PVT1:26 No - SACS-AS1:1 No - lnc-MARCKS-2:1 No - lnc-GPR65-2:11 No - lnc-FKBP3-1:3 No - LINC00161:4 No - lnc-TACR2-2:1 Yes chrX:9585675-9589813 lnc-MS4A8-17:7 No - lnc-CENPP-20:27 No - lnc-PRY2-1:2 No - lnc-PPDPFL-5:4 Yes chr2R:24602472-24603488 lnc-MS4A8-17:10 No - lnc-LRCOL1-2:21 No - MIR663AHG:26 No - LINC02384:34 No - lnc-KLF4-13:1 No - LINC01959:4 Yes chr3R:27559379-27561319 lnc-DNAJB9-1:1 No - lnc-PABPC4L-21:8 No - LINC02443:13 No - LINC00460:3 No - TMEM132D-AS1:19 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-ANO3-3:2 No - lnc-PPP1R3B-4:3 No - LINC00534:1 No - MIR3681HG:13 No - lnc-ATP10A-4:1 Yes chrX:15925105-15928529 lnc-WDR73-5:1 No - lnc-GGT2-26:6 No - lnc-POTEG-14:8 No - lnc-TRIQK-3:1 No - LINC02113:5 No - lnc-TFEC-1:3 No - lnc-DLK1-35:54 No - lnc-INSC-2:2 No - lnc-MFAP4-2:1 No - lnc-TCHP-3:1 No - LINC00960:4 No - LINC00705:1 No - lnc-CEP170-2:2 No - lnc-SGMS2-2:1 No - lnc-SLC35F5-3:3 No - lnc-MFSD8-11:3 No - lnc-CHD2-4:3 No - lnc-INHBC-1:1 No - lnc-POTEG-14:18 No - lnc-CLINT1-1:1 No - lnc-LRRC47-78:27 No - lnc-SLC39A11-10:32 No - lnc-RPS24-4:1 No - lnc-DLK1-35:128 No - lnc-LPCAT1-1:1 No - lnc-PABPC4L-4:2 No - lnc-SLC39A11-10:51 No - TMEM161B-AS1:22 No - lnc-CLDN23-1:5 No - lnc-SSU72P8-6:1 No - lnc-LRRC71-1:1 No - POU6F2-AS2:2 Yes chr2R:8327490-8396280 lnc-COMMD9-1:1 No - lnc-CREBL2-1:1 No - lnc-ZNF705A-3:1 No - LINC01281:2 No - lnc-BRF1-4:2 No - lnc-MRPS35-1:1 No - lnc-DLK1-35:117 No - H19:12 No - ZFAS1:13 No - TCL6:4 No - lnc-CCNJ-1:8 No - LINC02270:6 No - lnc-ANGEL1-3:1 No - lnc-ZNF717-1:1 No - LINC01659:8 No - lnc-FZD10-2:1 No - LINC02207:11 No - CXXC5-AS1:4 Yes chr3L:2786207-2879158 CASC9:6 No - lnc-SLC35C1-83:1 No - LINC01823:8 No - lnc-GALNT18-1:2 No - lnc-NUPR2-1:1 No - lnc-CDRT15-4:1 No - LINC01154:5 No - lnc-COX10-2:1 No - lnc-NPBWR1-8:1 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-KANTR-23:14 No - LINC00824:8 No - LINC01170:2 No - lnc-TMTC3-5:2 No - LINC01214:4 No - lnc-PSD3-1:3 No - lnc-ADGRV1-1:1 No - lnc-SRD5A2-3:11 No - lnc-CNTNAP3-24:5 No - KIF25-AS1:11 No - lnc-CYP1B1-1:1 No - lnc-IL17RA-33:2 No - lnc-NBPF1-3:1 No - lnc-ASAP2-4:2 No - LINC01754:9 No - LINC02224:5 No - lnc-XRCC4-2:1 No - lnc-ZNF8-4:3 No - lnc-FAM160A1-5:4 No - LINC01732:10 No - lnc-NKAIN3-14:8 No - LINC00499:5 No - lnc-NUDT12-7:4 No - LINC01876:27 No - lnc-CBX5-4:1 Yes chr3R:17150587-17151630 lnc-ATG2B-21:1 No - CASC9:4 No - lnc-TMEM258-3:7 Yes chrX:13783714-13811493 LINC01579:10 No - MANCR:28 No - lnc-EIF2B1-3:1 No - lnc-STX16-2:1 No - LINC00665:20 No - lnc-TCIM-3:2 No - LINC00448:7 No - LINC01206:6 No - LINC00880:1 No - LINC01006:9 No - lnc-CCND2-2:1 No - lnc-GSDMC-34:5 No - lnc-COL22A1-1:1 No - lnc-FN1-2:1 No - LINC01470:5 No - LINC00535:4 No - lnc-CCDC85C-1:1 No - lnc-FBRSL1-1:1 No - lnc-PRSS55-1:3 No - LINC02087:7 No - LINC01197:17 No - lnc-CPM-2:4 Yes chr2L:10733293-10736071 LINC01146:19 No - lnc-ZNF32-1:1 No - TTC28-AS1:13 No - lnc-EGFL6-8:2 No - LINC02296:4 No - LINC00665:19 No - lnc-SSU72P8-6:4 No - TTC28-AS1:7 No - lnc-SLC6A12-2:10 Yes chr3L:21034535-21075444 lnc-RALYL-1:1 No - lnc-NUDT4-10:3 No - lnc-UQCRFS1-1:1 No - lnc-PCSK9-4:6 No - lnc-MSR1-1:5 No - DLEU2:18 No - lnc-RTL1-3:5 No - LINC00326:8 No - lnc-FAM135B-1:1 No - lnc-LRCOL1-2:15 No - lnc-DEPTOR-1:2 No - lnc-CLDN23-1:2 No - TCL6:12 No - lnc-HOXA10-1:2 No - lnc-RPS24-3:28 No - LINC01820:23 No - lnc-STX2-7:1 No - lnc-GPR89B-5:1 No - lnc-C12orf71-1:1 No - lnc-SAMD5-1:10 Yes chrX:12631605-12653442 lnc-SERPINI1-23:2 No - lnc-GPR89B-3:1 No - lnc-IGFBP2-4:4 No - LINC00092:6 No - lnc-HIST2H3PS2-3:10 No - lnc-ERG-9:1 No - ITGB1-DT:32 Yes chrX:8061645-8070237 lnc-THOC3-2:20 No - LINC00863:6 No - lnc-RNF39-4:9 No - HOTAIR:10 No - LINC01762:30 No - LINC01128:66 No - lnc-RNASE1-1:4 No - C5orf64-AS1:15 No - DNAJC27-AS1:2 No - lnc-AGTPBP1-2:4 No - lnc-LGALS14-1:1 No - LINC02303:16 No - lnc-NID1-2:1 No - lnc-PCM1-4:6 No - H19:16 No - lnc-ADAM20-2:1 No - lnc-POLR2B-16:1 No - lnc-NBPF1-1:10 No - SIRLNT:14 No - HIF1A-AS2:5 Yes chr3R:30058311-30121798 lnc-NDFIP2-7:8 No - lnc-SCAF4-1:1 No - lnc-SREK1-1:5 No - lnc-KMT2E-1:12 No - LINC02242:3 No - LINC02301:24 No - lnc-HOOK1-1:4 Yes chr3L:4022700-4026011 LINC01965:16 No - DIO3OS:9 No - lnc-FZD1-2:1 No - CYP4A22-AS1:3 No - FAM239A:18 No - lnc-ADCY8-2:1 No - lnc-PRIM2-7:10 No - lnc-TOMM20-2:4 No - LINC01019:2 No - lnc-KLF7-1:11 No - lnc-SLC39A11-10:27 No - WT1-AS:2 Yes chr3L:10981171-11009188 lnc-ANKRD46-1:2 No - lnc-APBB1IP-1:13 No - lnc-TMEM132B-2:11 No - LINC02545:3 No - lnc-AIG1-3:1 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-FAM236B-4:1 Yes chrX:13368191-13370472 HOTTIP:2 No - LINC00570:1 No - lnc-FAM153A-1:1 No - LINC01146:13 No - lnc-DCAF5-1:3 No - LINC01154:1 No - lnc-TKT-3:3 No - LINC00240:8 No - lnc-KCNE4-2:1 No - lnc-ERI1-32:23 No - LINC01360:8 No - lnc-ADAM8-1:11 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-TMEM30B-1:3 Yes chr3R:29039156-29049148 lnc-GJA1-1:1 No - lnc-BOD1L1-1:1 No - LINC01660:11 No - lnc-AGTPBP1-2:3 No - LINC02449:13 No - lnc-MTRNR2L5-2:1 Yes chr3R:11893512-11949129 lnc-TEAD4-1:1 No - LINC02361:13 No - lnc-AFTPH-3:1 No - MIR4307HG:7 No - lnc-IFITM2-3:9 No - lnc-PPIAL4C-4:28 No - lnc-HIST2H3PS2-3:14 No - LINC00641:2 No - LINC00342:6 No - LINC00115:7 No - lnc-LGALS14-1:3 No - lnc-CCDC93-2:3 No - lnc-SEL1L-4:1 No - KIF25-AS1:10 No - lnc-SYT16-67:16 No - LINC01289:1 No - lnc-ROCK2-3:3 No - lnc-HGF-2:1 No - LINC01376:2 No - lnc-DLK1-35:55 No - LINC01185:2 No - lnc-UBE2K-2:2 No - lnc-CHCHD5-1:1 No - lnc-NR1I2-1:3 No - LINC02106:12 No - lnc-TFEC-1:4 No - LINC01358:3 No - lnc-PRMT6-3:1 No - lnc-BOD1-1:16 No - lnc-SLC39A11-10:45 No - LINC02396:15 No - LINC00645:4 No - PVT1:14 No - lnc-ERGIC1-1:3 No - lnc-GOLGA8O-3:2 No - lnc-ACOX3-1:1 No - lnc-TSPAN12-3:1 No - lnc-ERG-9:2 No - lnc-NUDCD2-2:14 No - LINC00208:1 No - lnc-GINS1-3:2 No - LINC01099:4 No - lnc-PLEKHF2-4:1 No - LINC01857:12 No - LINC01719:32 No - lnc-POU3F2-3:1 No - lnc-NXPE2-5:1 No - FOCAD-AS1:2 Yes chr2R:23396770-23402309 lnc-POTEG-7:4 No - LINC00924:8 No - LINC02515:5 No - lnc-TMEM196-1:2 No - LINC01580:2 No - TTC28-AS1:15 Yes chr3R:19215434-19226651 LINC01322:1 No - lnc-HNRNPH1-3:1 No - lnc-BTBD10-1:1 No - lnc-EIF2S2-1:1 Yes chr3L:7423827-7454717 lnc-AATK-6:1 Yes chrX:6082634-6090201 TTTY1B:2 No - EXTL3-AS1:2 Yes chr2R:19129589-19133706 TTTY15:2 No - lnc-BMP6-106:115 No - lnc-SDSL-14:2 No - lnc-ANKRD20A2-1:19 No - lnc-SLITRK5-5:1 No - LINC01579:7 No - lnc-CPEB4-6:1 No - lnc-TEK-1:1 No - lnc-ADAM21-2:2 No - TPT1-AS1:1 Yes chr3R:11210247-11211898 lnc-AGTPBP1-2:1 No - lnc-AAK1-6:1 Yes chrX:20171445-20173514 lnc-ZNF705D-2:43 No - lnc-GOLGA8Q-4:1 No - lnc-OR4N2-1:1 No - lnc-EVX1-14:17 Yes chr2R:18775669-18776978 lnc-ZMAT3-1:2 No - LINC00445:6 No - lnc-FAM20C-6:1 No - lnc-PLCH1-1:1 No - LINC01623:4 No - lnc-SLC4A3-7:1 No - lnc-CNTN5-1:1 No - lnc-UTP23-14:2 No - lnc-NTS-1:1 Yes chr3L:14762028-14767703 lnc-LTBP2-1:2 No - lnc-UTP23-14:4 No - LINC01410:3 No - lnc-SNTG2-2:1 No - LINC00570:2 No - LINC01502:4 No - lnc-MLXIP-12:3 No - lnc-NKAIN3-14:30 No - lnc-B3GAT1-3:1 No - lnc-RTN1-2:1 No - lnc-SYT10-2:1 Yes chr3L:11164971-11166620 lnc-MNX1-1:1 No - TTTY4:2 No - lnc-PAWR-1:1 Yes chr2L:2772327-2799979 OR2A1-AS1:20 No - lnc-FANCM-1:6 No - lnc-KCNA4-3:1 No - lnc-NKAIN3-14:26 No - lnc-LRIG3-1:4 No - lnc-RTKN2-2:1 No - lnc-EXPH5-1:1 No - lnc-HDDC2-5:2 Yes chr2R:7995438-7998278 ASH1L-AS1:4 Yes chr3L:19590773-19598755 lnc-TRIM29-9:1 No - NUTM2B-AS1:12 No - TPT1-AS1:43 No - LINC02322:7 No - lnc-WRN-3:2 No - lnc-ADCY1-1:1 No - lnc-KLHL32-4:23 No - SMAD5-AS1:1 Yes chr2L:3146056-3159643 lnc-RIMBP2-5:1 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-ZNF280B-6:5 No - lnc-TENM4-4:3 No - lnc-LEPROTL1-3:1 No - lnc-TECRL-5:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-EFR3A-5:1 Yes chr3L:10640286-10661013 DSCR10:2 Yes chr3R:23168317-23185642 RNF139-AS1:4 No - LINC02444:3 No - LINC00894:34 No - LINC01007:4 No - lnc-OTX2-1:4 No - NPSR1-AS1:1 Yes chr3R:25923499-25956270 lnc-EIF2AK3-4:78 No - TEX41:29 No - LINC01793:3 No - LINC02450:6 No - LINC02238:4 No - LINC-PINT:19 No - lnc-ATP6V1B2-3:1 No - LINC01393:3 No - lnc-BRF2-9:2 No - lnc-EHF-2:1 No - lnc-ETNK1-3:5 No - lnc-METTL25-1:2 No - lnc-FSHB-4:1 No - lnc-HDAC9-5:1 No - lnc-STARD13-2:3 No - PVT1:12 No - LINC01816:18 No - lnc-HES1-5:1 No - lnc-NPC2-1:1 No - lnc-ZFPM2-1:1 No - lnc-SERPINB9-1:1 No - lnc-BRF1-14:1 No - OR2A1-AS1:17 No - lnc-GLT1D1-3:1 Yes chrX:6225647-6236218 LINC01370:7 No - LINC00987:2 No - lnc-LRRC4C-1:3 No - lnc-FOXO6-2:3 No - ENOX1-AS1:1 Yes chr3L:12844254-12850117 LINC02510:6 No - lnc-SYT9-1:1 No - lnc-DEFB115-4:1 No - LINC00114:9 No - lnc-AK6-2:1 No - LINC00205:3 No - LINC01252:3 No - MEG9:3 No - ALDH1L1-AS2:4 No - LINC01473:4 No - LINC01863:3 No - LINC00689:5 No - lnc-ZMAT3-3:2 No - KIF25-AS1:5 No - lnc-BOD1-1:2 No - lnc-PSMG3-2:2 No - lnc-CETN3-2:1 No - LINC01983:8 No - LINC00507:2 No - lnc-SNX16-2:2 No - LINC00616:7 No - lnc-C2orf49-2:2 No - lnc-ZNF608-11:1 No - lnc-GGT2-26:9 No - LINC01339:3 No - lnc-ADAM18-1:2 No - CARMN:17 No - lnc-DLK1-35:1 No - LINC01276:4 No - LMCD1-AS1:8 No - lnc-ETS1-1:3 No - lnc-BRF1-9:3 No - FAM238C:12 No - lnc-MRPL39-4:4 No - lnc-SPATA19-9:4 No - FAM239A:22 No - lnc-ADAM8-1:5 Yes chr3R:14664907-14697292 CLDN10-AS1:2 No - TMEM254-AS1:10 No - lnc-RAB38-2:1 No - lnc-SNRPN-5:2 No - NUP50-DT:49 No - LINC02287:3 No - lnc-CTSV-5:6 No - LINC00929:2 No - lnc-FOXG1-22:3 No - LINC00871:5 No - HAGLROS:2 No - lnc-DNAH7-2:1 No - lnc-ALG10-2:1 No - lnc-DLK1-35:139 No - LINC00174:13 No - HAR1B:4 No - lnc-AQP2-2:1 No - lnc-IFT74-1:1 No - lnc-TCP10L-1:1 No - lnc-LONRF1-1:1 No - lnc-FAM153B-2:1 No - OR2A1-AS1:8 No - LINC01695:6 No - LINC02235:4 No - lnc-METAP1-11:4 No - LINC00899:8 No - lnc-SPATA31A7-14:1 No - SNHG26:36 No - LINC00824:10 No - TTTY8:3 No - lnc-MANSC4-4:1 Yes chr3L:13513254-13516276 LINC00115:45 No - LINC00523:4 No - LINC01479:3 No - LINC00929:11 No - LINC01370:10 No - lnc-BRF1-4:6 No - lnc-GLB1L2-1:3 No - lnc-DTHD1-1:2 No - LINC00630:13 No - lnc-SNAI2-2:2 No - MIR194-2HG:1 No - lnc-ZNF365-1:1 No - lnc-HOXA10-1:4 No - LINC01759:27 No - lnc-SMARCA5-4:15 No - lnc-ZBTB49-2:1 No - lnc-UCHL3-5:19 No - lnc-CENPP-20:25 No - LINC01675:3 No - MIR4290HG:1 No - LINC01315:2 No - lnc-TRIM26-2:1 No - LINCMD1:1 No - lnc-ATG10-3:1 No - lnc-PITRM1-1:1 No - LINC02409:3 No - lnc-FAM110B-3:1 No - lnc-SLC22A3-1:1 Yes chr3R:16171991-16180475 lnc-BYSL-1:1 No - LINC02426:3 No - LINC02055:28 No - OR2A1-AS1:12 No - lnc-LEMD3-5:1 No - FAM242D:4 No - lnc-CNBD1-1:1 No - lnc-NUDT12-5:3 No - lnc-IQCM-2:4 No - LINC00303:6 No - lnc-CEBPB-13:9 No - lnc-OPRK1-3:1 No - TPT1-AS1:21 No - lnc-SLC39A11-10:29 No - LINC00887:4 No - LINC02330:3 No - UCA1:2 No - LINC01192:11 No - LINC01035:1 No - lnc-TTPA-1:7 No - LINC02414:3 No - TCL6:7 No - LINC02291:8 No - FAM239B:14 No - lnc-TMEM121-3:1 No - lnc-KDM4C-9:1 Yes chr2L:19586623-19732069 lnc-RNASE7-1:2 Yes chr2R:21502097-21517241 lnc-XPO7-3:2 No - lnc-PELI1-4:1 No - lnc-TDRD15-4:2 No - lnc-TOP3B-1:4 No - BASP1-AS1:30 No - lnc-MYOM2-3:1 No - lnc-TCL1A-1:1 No - lnc-EVX2-3:2 No - lnc-TRIQK-5:1 No - TPT1-AS1:39 No - lnc-ITPR3-1:7 No - LINC01146:4 No - lnc-ZFP37-1:1 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-GSTO2-1:1 No - lnc-MCTP2-18:1 No - LBX1-AS1:6 No - LINC00534:5 No - PKIA-AS1:2 No - lnc-CEP57L1-1:7 No - LINC00894:4 No - lnc-KCNB2-12:2 No - lnc-TBL1X-1:1 No - lnc-CEP57-2:1 No - lnc-YTHDF1-2:1 No - lnc-CCDC93-2:2 No - lnc-ATP6V1G3-4:8 No - LINC02270:8 No - lnc-FAM84B-3:2 No - lnc-SDSL-6:4 No - LINC01517:16 No - lnc-ANKRD18B-6:10 No - lnc-RNF34-1:3 Yes chr3L:3905344-3907813 lnc-STX2-4:1 Yes chr3R:15374635-15402543 lnc-CLSTN2-2:1 No - LINC00882:6 No - CD27-AS1:12 No - lnc-CDCA2-2:1 No - lnc-MPHOSPH8-16:1 No - lnc-KPNA2-6:3 No - LINC01474:6 No - lnc-CTAGE5-8:27 No - lnc-DLK1-35:59 No - LINC01495:1 No - lnc-C11orf74-1:1 No - lnc-IGFBP1-2:4 No - TPT1-AS1:8 No - lnc-SPATA31D1-4:17 No - LINC00466:13 No - lnc-TRIM36-3:1 No - lnc-MEAF6-2:1 No - LINC00968:3 No - LBX1-AS1:1 Yes chr3R:21409979-21434133 lnc-KMO-1:1 No - lnc-ZNF680-7:1 No - LINC02195:3 No - lnc-SHISA6-1:1 No - LINC01479:1 No - LINC01865:7 No - lnc-ZC3H12B-1:6 Yes chrX:8873012-8898332 OR2A1-AS1:5 No - lnc-WIF1-6:34 No - lnc-MINDY4B-1:1 No - lnc-ATG7-2:1 No - UBAC2-AS1:6 No - lnc-CDK13-1:1 No - LINC01143:2 No - LINC01210:7 No - MIR4432HG:2 No - lnc-EFR3A-1:2 No - lnc-ARRDC3-4:1 No - LINC02031:3 No - lnc-ANKRD30A-15:2 No - LINC00589:8 No - SNHG17:26 No - lnc-TTPA-1:1 No - TCL6:25 No - lnc-POTEM-4:2 No - lnc-ITGB8-2:2 No - LINC02289:28 No - LINC00539:7 No - lnc-ASMT-3:1 No - TEX41:31 No - lnc-DLK1-35:103 No - lnc-MSRB3-3:1 No - TOB1-AS1:8 No - LINC01187:8 No - lnc-SYNE3-1:6 No - lnc-ETNK1-3:21 No - lnc-RAB23-53:1 No - LINC01780:18 No - lnc-CCDC150-1:1 Yes chrX:9608946-9623243 lnc-HEY1-1:2 No - lnc-STARD13-2:1 No - lnc-ATP6V1G3-4:9 No - lnc-GDF6-1:2 No - lnc-LTBR-1:1 No - lnc-ASPH-5:1 No - LINC00242:2 No - LINC01695:7 No - LINC01486:3 Yes chr3L:1318480-1329617 lnc-PGGT1B-1:1 Yes chr2L:4945579-4948324 LINC02094:5 No - lnc-DDIAS-3:4 No - SOCS2-AS1:3 Yes chr2R:8127575-8129476 IL6R-AS1:3 No - MAL2-AS1:11 No - TPT1-AS1:19 No - LINC01661:5 No - LINC00310:6 No - LINC01762:42 No - lnc-PGR-1:1 Yes chrX:15751674-15760733 lnc-TMEM179-1:4 No - PVT1:25 No - lnc-ANKRD36B-3:28 No - LINC01206:8 No - lnc-AP3B1-1:1 No - lnc-TES-1:1 No - lnc-BRF2-21:2 No - lnc-MLXIP-12:2 No - LINC02223:13 No - lnc-SV2B-2:1 No - LINC02365:11 No - FRMD6-AS2:1 Yes chr2L:431227-448701 lnc-GGTLC3-1:2 No - lnc-AGTPBP1-2:2 No - lnc-DLK1-35:74 No - SATB1-AS1:3 No - LINC02425:3 No - LINC02292:14 No - LINC01281:12 No - lnc-ADAMTS2-1:1 No - lnc-LSM11-2:1 No - OR2A1-AS1:1 No - lnc-LEPROTL1-2:1 No - LINC01238:11 No - TMEM161B-AS1:11 Yes chr3L:11109690-11112117 CYTOR:106 No - LINC02405:26 No - lnc-TUBA3C-1:2 No - LINC01141:6 No - lnc-CSMD1-1:2 No - LINC01497:1 No - lnc-FAT4-1:1 No - LINC01388:11 No - FAM138D:4 No - lnc-TDRD15-3:2 No - lnc-NBPF1-2:1 No - DLEU2:14 No - EXTL3-AS1:10 Yes chr2R:19129589-19133706 lnc-MED10-10:1 No - lnc-FGFRL1-1:1 No - LINC00539:2 No - ZNF295-AS1:10 No - lnc-SLC39A11-10:34 No - lnc-DZANK1-1:1 No - lnc-CTXN3-1:1 No - lnc-CYSTM1-1:1 No - LINC01699:3 No - lnc-ZNF37A-5:1 No - LINC02534:4 No - lnc-NBPF1-2:13 No - LINC01013:13 No - lnc-NTF3-1:1 No - lnc-RNF39-4:6 Yes chr3R:21777203-21777847 lnc-B3GNT7-1:1 No - lnc-SCRN3-1:1 No - lnc-RTP4-6:3 No - lnc-POTEG-14:12 No - lnc-ERGIC2-3:1 No - lnc-SDSL-15:1 No - LINC02106:10 No - lnc-RNF144A-2:3 No - LINC01965:10 No - lnc-TFEC-3:2 No - lnc-MYOD1-1:1 No - LINC01303:38 Yes chr2R:9252310-9285097 LINC02153:32 No - lnc-CA6-2:1 Yes chr3L:8449922-8472669 PVT1:19 No - LINC01192:4 No - CYTOR:87 No - lnc-AP3B2-1:3 No - LINC01591:6 No - lnc-GPR20-2:1 Yes chr2L:16245835-16257606 LINC02163:5 No - lnc-CD180-6:1 No - lnc-MAK16-1:1 No - lnc-CCNJ-1:6 No - lnc-MEIS1-2:1 No - lnc-SLCO5A1-4:1 No - lnc-POU3F3-5:1 No - lnc-NEPRO-1:4 No - lnc-ADAM20-1:1 No - TCL6:13 No - DLEU2:15 No - lnc-PPM1H-1:2 No - LINC02328:63 No - PGM5P4-AS1:5 No - LINC02428:17 No - lnc-APBB1IP-1:15 No - lnc-RNF144A-2:1 No - LINC00648:8 No - lnc-SNX10-87:2 No - FAM138D:1 No - LBX1-AS1:3 Yes chr3R:21409979-21434133 LINC00174:7 Yes chrX:13563823-13593224 LINC01309:1 No - lnc-PCM1-1:1 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-NTF3-2:1 No - lnc-CXorf49-2:2 No - NUTM2B-AS1:10 No - LINC00342:8 No - LINC02384:47 No - LINC02384:48 No - LINC02440:10 No - LINC01388:1 No - lnc-RNF39-4:10 No - LINC01146:10 No - NUTM2B-AS1:4 No - LINC01933:8 No - lnc-POC5-2:1 Yes chr3R:25216297-25218708 lnc-PROP1-1:1 No - PVT1:33 No - lnc-ART1-3:1 No - LINC01847:9 No - lnc-EFR3A-1:1 No - lnc-MGAT4C-1:1 Yes chr3L:14762028-14767703 LINC01497:4 No - lnc-ZMAT3-3:3 No - HCG20:2 No - lnc-MGST3-1:1 No - lnc-SYT13-3:1 No - lnc-EHD3-3:1 No - lnc-ANGPT2-2:1 Yes chr2R:11895997-11903918 TEX41:53 No - lnc-ZDHHC2-1:1 No - LINC00968:13 No - LINC01006:10 No - LINC00163:3 No - OR2A1-AS1:18 No - DSCR10:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-CDH18-3:1 No - lnc-KIAA0040-2:2 No - lnc-AADACL2-1:1 No - PRKCQ-AS1:3 No - LINC01185:3 No - lnc-NAV2-2:2 No - lnc-APBB1IP-1:3 No - LINC01138:40 No - lnc-CSNK1G3-7:1 No - lnc-ATAD5-9:9 No - MIR3945HG:1 No - LINC00488:2 No - lnc-APMAP-3:1 No - lnc-COX7C-5:1 No - lnc-FAM160A1-5:6 No - LINC01410:1 No - lnc-FSHB-3:1 No - TEX41:14 No - LINC00640:4 No - CYTOR:88 No - GASAL1:22 No - lnc-FIGN-1:1 No - SIRLNT:13 No - LINC02386:5 No - lnc-C21orf62-7:1 No - SATB1-AS1:12 No - LINC01090:4 No - LINC00305:3 No - lnc-ZNF648-1:1 No - PVT1:13 No - lnc-BRF1-4:4 No - lnc-MED10-11:6 No - lnc-MED10-11:5 No - PVT1:4 No - lnc-LRMP-4:2 No - TPT1-AS1:9 No - LINC00648:4 No - lnc-IFITM2-3:5 No - DIO3OS:1 No - LINC00700:2 No - LINC02291:10 No - LINC00894:29 No - LINC02422:28 No - lnc-MGST1-1:1 No - lnc-GLYATL1-1:1 No - LINC00222:5 No - lnc-EXOSC9-3:2 No - NUTM2B-AS1:26 No - LINC00578:6 No - lnc-TRIM26-2:4 No - LINC01778:22 No - LINC01317:3 No - lnc-ZNF131-1:3 No - LINC01128:88 No - LINC00487:1 No - lnc-BNIP1-3:2 No - LINC00477:1 No - lnc-ALX4-3:1 No - lnc-TGFB3-3:1 No - ITGA9-AS1:1 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-ASB3-1:2 No - lnc-NATD1-1:1 No - LINC01510:6 No - lnc-GGT2-1:1 No - lnc-RDH10-1:2 No - lnc-CD1B-1:1 No - ZBTB20-AS2:1 No - TCL6:22 No - lnc-LGALS14-1:2 No - LINC02223:9 No - LINC00942:1 No - lnc-OR5AK2-1:3 No - BHLHE40-AS1:6 No - TPT1-AS1:7 No - LINC01998:7 No - LINC01146:9 No - SNHG26:38 No - LINC01099:1 No - LINC01579:4 No - lnc-CCDC179-2:2 No - lnc-APBB1IP-1:17 No - lnc-USP35-6:3 No - lnc-P2RY1-1:1 No - lnc-RGPD4-3:1 No - lnc-PANK3-10:1 No - lnc-ERI1-11:6 No - LINC01608:7 No - lnc-RHOXF1-3:4 No - lnc-EXOC2-29:3 No - LINC01597:3 No - TTTY3:1 No - lnc-ZNF37A-5:2 No - lnc-MUC22-1:5 No - lnc-GPR89B-2:1 No - lnc-ELAVL2-1:1 No - LINC02201:12 No - lnc-TP53RK-1:1 Yes chr2L:6527447-6546976 lnc-FABP5-4:1 No - lnc-TMEM255B-5:23 No - lnc-MTBP-2:1 No - lnc-CTDSP2-1:3 No - lnc-TRIML2-14:5 No - lnc-CDYL-1:2 No - lnc-CXorf49B-2:2 No - lnc-CASP9-1:1 No - lnc-PABPC5-1:1 No - lnc-FBXO8-3:1 No - lnc-CENPP-20:24 No - LINC02314:4 No - TEX41:55 No - TCL6:14 No - lnc-PPP1R3B-2:1 No - lnc-UTP23-14:3 No - lnc-LRRC32-1:1 No - LINC01913:11 No - lnc-SLC48A1-23:6 No - LINC00923:5 No - LINC01821:9 No - LINC01010:10 No - lnc-ATG2B-21:2 No - lnc-RNF39-4:7 Yes chr3R:21777203-21777847 lnc-KCNC3-1:3 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-DUSP26-2:2 No - LINC02273:11 No - LINC00523:3 No - SLC16A1-AS1:1 No - LINC01281:1 No - lnc-MFAP2-53:6 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-KCNB2-8:1 No - lnc-BNIP1-3:6 No - lnc-TDRD3-16:1 No - LMCD1-AS1:4 No - lnc-BRF2-6:1 No - lnc-DLK1-35:62 No - lnc-KDM8-1:2 No - CASC6:3 No - LINC02201:9 No - lnc-NRG1-1:1 No - LINC02484:12 No - LINC00375:5 No - lnc-ORAOV1-3:1 No - LINC01095:3 No - ZFHX4-AS1:13 No - lnc-OTULIN-1:1 No - lnc-FAM160B1-1:1 No - HOTAIR:1 Yes chr3R:16927212-16972236 lnc-LRCOL1-2:13 No - TTC28-AS1:16 Yes chr3R:19215434-19226651 lnc-CEBPB-13:15 No - lnc-ADAM8-1:10 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-MAK16-3:1 No - NDST1-AS1:10 Yes chr3L:6495680-6550104 LINC01128:80 No - lnc-CYP7A1-2:1 No - LINC01197:4 No - lnc-POTEG-14:13 No - lnc-TRA2A-2:1 No - lnc-ITIH2-5:1 No - LINC02443:18 No - lnc-SUCLG1-3:1 No - LINC01762:39 No - lnc-RFPL3-2:1 No - lnc-CMTR1-14:1 No - lnc-TMPRSS15-2:1 No - lnc-MYL2-1:2 No - LINC01692:7 No - LINC00867:5 No - lnc-TSPAN18-1:2 No - lnc-ZNF727-6:1 No - lnc-SLC39A11-10:41 No - lnc-LRRC4C-3:2 No - lnc-RPS23-2:1 No - CASC11:3 No - ZRANB2-AS2:26 No - LINC02325:32 No - LINC00865:5 No - LINC02484:13 No - lnc-NDUFB1-2:1 No - lnc-ANKRD46-1:4 No - lnc-PRAG1-1:1 No - TCL6:23 No - lnc-DLK1-35:2 No - lnc-KIAA0040-2:5 No - LINC00588:1 No - LINC00312:4 Yes chr2R:17465879-17469177 lnc-BASP1-1:1 No - lnc-DEUP1-1:2 No - lnc-MAK16-1:2 No - LINC01674:4 No - lnc-MAP1LC3B2-2:10 No - GAU1:4 Yes chr3L:20492082-20497084 lnc-ERI1-11:1 No - lnc-RPS23-3:1 No - lnc-PENK-3:1 No - lnc-STIL-2:4 No - LINC01187:3 No - LINC01913:13 No - lnc-IZUMO1R-1:2 No - LINC00665:17 No - LINC02329:3 No - LINC01698:5 No - lnc-GPHB5-1:2 Yes chr2L:23311700-23312464 lnc-SMIM10L2B-1:10 No - lnc-RNF7-2:3 No - lnc-SMIM10L2B-1:9 No - FAM225B:3 No - LINC00499:2 No - MIR3681HG:10 No - lnc-ERI1-11:8 No - TEX41:2 No - LINC02392:21 No - lnc-ARL4C-2:5 No - lnc-MYBL2-1:1 No - LINC01490:3 No - lnc-THOC3-2:24 No - lnc-C8A-3:1 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-MARCH7-1:1 No - LINC00411:2 No - CYTOR:107 No - lnc-ITGB8-1:3 No - lnc-CNRIP1-1:1 No - lnc-NUDT6-2:1 No - LINC01995:4 No - PAX8-AS1:2 Yes chr4:1088798-1113317 ELFN1-AS1:5 No - lnc-RUNX1T1-3:1 No - LINC02160:3 No - lnc-CEBPB-13:1 No - ITGA9-AS1:6 Yes chr2R:15258761-15262873 SNHG10:6 Yes chrX:14837471-14838198 lnc-CHD2-4:17 No - lnc-TPTE2-2:1 No - lnc-GGCT-1:26 Yes chr3L:18461957-18463163 TPT1-AS1:17 No - LINC01719:23 No - lnc-NRTN-1:1 Yes chr3L:15147137-15154395 lnc-KCNA4-2:1 No - lnc-ZNF706-2:1 No - lnc-MANEA-4:1 No - lnc-ADAM8-1:9 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-FAM229A-1:3 No - lnc-ADAM8-1:6 Yes chr3R:14664907-14697292 DLEU2:19 No - lnc-HAND1-1:1 No - TPT1-AS1:5 No - STK4-AS1:3 No - lnc-KIAA1549L-2:2 No - LINC01122:6 No - LINC02364:3 No - lnc-IL17RA-36:24 No - lnc-INTS10-2:1 Yes chr2R:10249220-10255495 lnc-RDH10-1:1 No - LINC01609:3 No - lnc-JPH1-6:1 No - lnc-DLK1-35:32 No - lnc-CALM1-3:1 Yes chr2R:6209782-6214122 lnc-ZSWIM2-6:3 No - LINC00845:2 No - LINC00839:4 No - H19:11 No - LINC02016:8 No - LINC01474:1 No - LINC01365:3 No - lnc-PRAG1-4:1 No - lnc-RNASE3-1:2 No - lnc-MAP1LC3B2-3:1 No - lnc-SOX6-2:1 No - lnc-CNTNAP3-2:1 No - RASSF8-AS1:18 No - lnc-DRD5-9:1 No - LINC01588:97 No - LINC01238:8 No - lnc-LRRC4C-5:4 No - lnc-LRRC47-78:19 No - lnc-EBF2-1:1 No - lnc-SLC16A1-2:1 No - lnc-VWF-2:10 No - lnc-GPR3-1:1 Yes chr2L:10976772-10982395 lnc-C11orf74-4:1 No - lnc-SYT16-67:13 No - lnc-LAMB3-3:1 No - HCG20:1 No - lnc-MGAT4C-1:2 Yes chr3L:14762028-14767703 lnc-B3GNT7-1:3 No - TTTY7B:3 No - lnc-KIAA1614-1:1 No - LINC00302:2 No - FAM225A:4 No - lnc-BOD1-1:20 No - WT1-AS:8 No - SNHG10:10 Yes chrX:14837471-14838198 lnc-POTEM-4:11 No - TEX41:99 No - lnc-ST3GAL1-2:1 No - LINC01638:15 No - lnc-SSU72P8-6:3 No - lnc-SEC22B-2:1 No - LINC00865:4 No - lnc-LRFN2-4:1 No - LINC00029:7 No - LINC00700:3 No - lnc-SGCG-7:1 No - LINC00616:3 No - lnc-FOXD4L6-3:1 No - lnc-SOX6-7:2 No - LINC00623:33 No - INKA2-AS1:21 No - lnc-IGSF11-5:11 No - ZEB1-AS1:9 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-FTH1-2:1 No - lnc-ADGRL3-5:1 No - LINC01354:1 No - LINC02575:9 No - NPSR1-AS1:12 Yes chr3R:25923499-25956270 lnc-KIDINS220-8:1 No - LINC02303:10 No - lnc-NUDCD2-3:1 No - LINC02099:17 No - lnc-DUSP10-5:2 No - lnc-FSCB-1:11 No - lnc-FKBP3-1:2 No - lnc-CEP170-2:4 No - LINC00894:25 No - lnc-TMEM243-1:4 No - lnc-KCNC3-1:4 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-NUDT12-7:5 No - LINC00487:3 No - lnc-B3GNT7-1:2 No - lnc-NRG1-2:2 No - lnc-LAMA4-2:1 No - LINC00839:5 No - LINC01637:10 No - LINC02546:10 No - RBM26-AS1:4 Yes chr2L:19493251-19497978 lnc-GGT2-26:3 No - lnc-SPATA31A5-1:1 No - LINC00665:13 No - TTTY10:1 No - lnc-NRG1-2:1 No - LINC01687:10 No - lnc-CLDN23-1:1 No - lnc-BOD1-1:21 No - lnc-TBCK-2:1 No - lnc-POTEM-4:4 No - LY6E-DT:31 No - LINC02049:8 No - TTLL11-IT1:1 No - LINC00272:2 No - lnc-RNF144A-2:5 No - lnc-PTS-3:3 No - lnc-SLC17A6-2:2 No - lnc-USP35-6:1 No - lnc-DIO2-1:1 No - lnc-MGAT5-1:1 No - lnc-EEF1B2-2:1 Yes chr3R:29854695-29857491 lnc-EEF1B2-2:2 Yes chr3R:29854695-29857491 lnc-MAD2L1-1:1 No - LINC02328:55 No - lnc-CELA3A-5:25 No - LINC00609:3 No - lnc-RNASE7-1:1 Yes chr2R:21502097-21517241 lnc-MGAT1-4:10 No - lnc-PPP4R3C-2:12 No - lnc-REEP3-2:4 No - lnc-FAM84B-5:1 No - lnc-RPS28-1:1 No - LINC01010:1 No - lnc-TLE1-1:4 No - lnc-FASLG-1:1 No - lnc-APBA2-1:3 No - lnc-CPEB4-5:1 No - lnc-STIM2-12:1 No - lnc-GNG2-1:1 No - lnc-CLIC6-3:1 Yes chrX:20538497-20567097 lnc-UNC93B1-1:1 Yes chr2R:7466879-7477162 LINC02392:13 No - lnc-MPP7-2:1 No - PGM5P4-AS1:7 No - ASH1L-AS1:3 Yes chr3L:19590773-19598755 lnc-EFCAB1-4:3 No - lnc-UBE2K-2:3 No - lnc-STK32C-3:1 No - PPP1R26-AS1:11 No - LINC01446:1 No - lnc-CXXC5-1:1 No - lnc-GRAMD2B-15:1 No - lnc-WDR73-5:4 No - LINC02433:8 No - lnc-ANO3-3:3 No - LINC00174:5 Yes chrX:13563823-13593224 lnc-PIK3R6-1:2 No - lnc-MC1R-1:10 No - LINC00658:10 No - COX10-AS1:13 No - lnc-COX10-2:2 No - lnc-LPA-3:1 No - lnc-RAN-1:1 No - EXTL3-AS1:9 Yes chr2R:19129589-19133706 LINC01799:7 No - lnc-APOB-5:6 No - LINC01783:9 No - lnc-PXDN-2:1 No - lnc-NTSR2-5:2 No - lnc-CDCA2-1:1 No - lnc-MYL2-1:1 No - TEX41:58 No - LINC00570:4 No - lnc-CTAGE5-2:1 No - FOCAD-AS1:3 Yes chr2R:23396770-23402309 lnc-RICTOR-54:5 No - lnc-CA8-14:3 No - lnc-ACTBL2-2:1 No - ENTPD3-AS1:1 No - LINC01581:3 No - lnc-ATP6V1B2-3:2 No - MCHR2-AS1:9 Yes chr3L:18560258-18576326 LINC01442:2 No - lnc-RPS29-2:1 No - lnc-SLC39A11-10:3 No - LINC01614:3 No - lnc-POTEM-4:15 No - PGM5P4-AS1:8 No - lnc-NKAIN3-14:20 No - lnc-FAM92A-9:1 No - lnc-CCT8L2-7:2 No - LINC01967:9 No - LINC01937:3 No - lnc-MAN2A1-9:1 No - LINC01934:18 No - lnc-SEL1L-8:1 No - lnc-ALG1L-2:24 No - lnc-SLC35F5-1:1 No - lnc-PLCL2-2:1 Yes chr3R:13269137-13272011 lnc-LMNTD1-3:1 No - lnc-DLK1-35:123 No - lnc-DAD1-2:2 No - LINC01191:5 No - LMCD1-AS1:2 No - CASC9:1 No - lnc-SGK1-3:18 No - lnc-ITPR3-1:9 No - lnc-CCDC167-1:1 No - lnc-IL17RA-36:20 No - lnc-TRIO-3:1 No - LINC01807:3 No - lnc-NKAIN3-14:21 No - PVT1:45 No - LINC02326:3 No - lnc-AADAC-1:1 No - lnc-TMEM170B-2:1 No - lnc-ETNK1-1:1 No - NPSR1-AS1:13 Yes chr3R:25923499-25956270 HCG27:2 No - LINC00839:8 No - lnc-CYP7B1-1:2 No - ACVR2B-AS1:1 Yes chr3R:14619030-14625703 lnc-SPDYE1-1:1 No - lnc-CAPRIN2-2:2 No - lnc-GPR65-4:1 No - lnc-ATP6V1D-8:9 No - LINC00864:1 No - lnc-EDIL3-1:1 No - lnc-ZNF680-6:1 No - lnc-LZTS1-1:2 No - LINC01206:5 No - lnc-PADI1-1:2 No - lnc-GPHB5-1:1 Yes chr2L:23311700-23312464 LINC01474:5 No - LINC01239:7 No - lnc-CATSPER3-1:1 No - lnc-CHST1-5:1 No - lnc-SLC15A5-1:1 Yes chr3R:17008269-17012533 LINC00658:15 No - lnc-UTP23-14:11 No - SUCLG2-AS1:5 No - LINC01473:7 No - LINC00028:1 No - LY6E-DT:39 No - PCBP1-AS1:4 No - lnc-FOXO1-2:10 Yes chr3R:14056945-14087978 lnc-TOP3B-1:1 No - lnc-RCN1-8:1 No - lnc-FOXD4L5-23:1 No - LINC01638:21 No - lnc-DROSHA-2:1 Yes chr2R:22855688-22858794 lnc-LOX-2:1 No - LINC01206:17 No - lnc-ZNF891-2:2 No - lnc-ATL2-1:3 No - NUTM2B-AS1:15 No - TPT1-AS1:12 No - lnc-TSKU-3:1 No - lnc-PCM1-4:7 No - DNAJC27-AS1:1 No - lnc-RNF13-3:7 No - lnc-PRAME-1:3 No - LINC01877:8 No - lnc-WDR73-5:3 No - HIF1A-AS1:7 Yes chr3R:30058311-30121798 MAL2-AS1:9 No - LINC02201:11 No - lnc-POU5F1B-7:1 No - LINC02069:3 No - lnc-RNFT2-1:3 No - KRTAP5-AS1:6 No - DLG1-AS1:3 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-IGSF9B-1:1 No - LINC01133:4 No - TEX41:15 No - EP300-AS1:5 Yes chrX:9665442-9687066 lnc-RGMA-10:2 No - lnc-FBXO33-2:1 No - lnc-C4orf3-2:1 No - lnc-ORAOV1-1:1 No - LINC01205:3 No - lnc-KCNC3-1:2 Yes chr2R:6087873-6169087 LINC00523:6 No - LINC01391:1 No - lnc-ZBTB18-2:6 No - lnc-CSNK1G3-8:1 No - lnc-TINCR-1:1 No - lnc-RTL1-3:3 No - LINC00343:22 No - lnc-GMNN-2:1 No - lnc-PHYHIPL-27:2 No - lnc-NBPF1-2:14 No - lnc-RBM12B-1:1 No - LINC02366:8 No - OR2A1-AS1:3 No - lnc-VRK2-4:1 No - lnc-JUN-2:2 No - lnc-SLC25A16-1:1 No - lnc-THOC3-2:9 No - NRAV:5 No - FAM239C:4 No - TTC28-AS1:6 No - lnc-B3GAT1-1:1 No - NUP50-DT:43 No - lnc-SNX16-1:2 No - LINC00309:2 No - lnc-CDH10-6:2 No - lnc-PGRMC2-1:1 No - LINC00320:17 No - lnc-CCER1-3:2 No - PVT1:35 No - lnc-C11orf74-3:1 No - lnc-PCNX1-3:1 No - lnc-MICAL2-2:1 No - SMG7-AS1:5 No - lnc-ALG1L-2:1 No - lnc-SOD1-3:1 Yes chr3L:5657913-5749599 lnc-TMTC3-5:18 No - lnc-TNFRSF10C-1:1 No - lnc-GLB1L2-1:1 No - lnc-PHF21A-1:2 No - lnc-OR4F16-4:2 No - LINC01877:10 No - lnc-MGMT-1:1 No - lnc-ZNF705D-2:42 No - lnc-PUS7L-1:1 Yes chr3L:8510003-8513007 lnc-TCIM-1:1 No - LINC01287:3 No - DIO3OS:6 No - LINC00111:1 No - lnc-RNF39-4:1 Yes chr3R:21777203-21777847 lnc-ZNF33A-1:1 No - LINC00571:4 No - CPB2-AS1:7 Yes chrX:17080423-17087675 lnc-TUSC3-1:1 No - lnc-STAT4-1:1 Yes chr3R:24154826-24161498 lnc-KY-2:1 No - lnc-RHOXF1-3:11 No - lnc-RGS20-1:1 No - LINC01146:12 No - lnc-CDH10-6:1 No - LINC00115:17 No - lnc-HPRT1-8:5 No - LINC02325:20 No - lnc-ZNF672-5:2 No - lnc-MUC2-1:3 No - LINC01249:3 No - lnc-RAB43-4:1 No - lnc-LRP5L-1:2 No - LINC01821:6 No - lnc-ZMAT3-3:5 No - LINC01762:47 No - lnc-TMEM167A-1:1 No - lnc-ANKRD36B-3:32 No - LINC02038:5 No - LINC01128:96 No - LINC01197:7 No - lnc-ARHGAP21-1:1 Yes chrX:1673110-1692768 LINC02046:5 No - lnc-ATL2-1:2 No - lnc-PIWIL4-1:3 No - ITGB2-AS1:12 Yes chrX:8061645-8070237 lnc-SAMD11-7:29 No - LINC01001:10 No - lnc-RARB-1:1 No - TTTY7:5 No - LINC00355:1 No - LINC01186:7 No - LINC02209:8 No - lnc-RIOX1-3:1 No - LINC01509:2 No - lnc-FAM229A-1:1 No - lnc-ZNF25-9:4 No - LINC01339:1 No - lnc-CD180-2:2 No - lnc-ELF2-1:1 No - lnc-PRKACB-1:1 No - LINC00368:1 No - H19:9 No - LINC02552:18 No - lnc-WDR73-10:4 No - MIR381HG:1 No - lnc-PPDPFL-4:3 No - SEMA6A-AS2:3 Yes chr2R:17672839-17683499 LINC00929:8 No - LINC02308:4 No - LINC01192:3 No - LINC00458:4 No - lnc-CHST1-2:1 No - LINC00467:4 No - LINC00879:8 No - LINC01096:3 No - lnc-CHGA-1:1 No - LINC02443:17 No - lnc-ZNF280B-6:3 No - lnc-DENND3-5:1 Yes chr3L:25236940-25670980 lnc-DLK1-35:131 No - lnc-NPHP4-2:1 No - lnc-NUDT12-5:6 No - lnc-FGFR1OP-20:1 No - lnc-OR2H1-7:1 No - lnc-CTNNBL1-1:1 No - LINC02415:11 No - lnc-SENP6-2:13 No - lnc-ATP6V0D2-3:1 No - LINC02120:6 No - lnc-OR2K2-1:1 No - LMCD1-AS1:5 No - SLC16A1-AS1:5 No - LINC02420:7 No - lnc-TMEM258-3:3 Yes chr2R:24162489-24173660 lnc-APOD-1:1 No - lnc-ABI3-2:6 No - LINC00499:6 No - lnc-CXorf51A-6:1 No - lnc-NGFR-3:3 No - ZEB1-AS1:3 Yes chr3R:30765926-30789202 LINC01128:72 No - lnc-TET2-2:1 No - lnc-RAB23-53:2 No - LINC01500:4 No - LINC02105:5 No - lnc-SLC25A37-1:8 No - LINC01877:11 No - lnc-TMEM243-1:10 No - lnc-CEBPB-13:7 No - lnc-RPS21-2:1 No - lnc-CA8-14:7 No - LINC01123:5 No - RALY-AS1:3 Yes chr3L:7423827-7454717 lnc-HEPH-1:1 No - LINC01364:6 No - TTC28-AS1:11 No - LINC01580:3 No - lnc-ATP6V1C1-11:1 Yes chr2R:8007246-8009062 lnc-ATP6V1B2-4:1 No - lnc-HOXD13-2:2 No - lnc-ATL2-1:5 No - lnc-PIWIL4-1:14 No - lnc-MAK16-1:5 No - lnc-LRRC4C-2:1 No - CLMAT3:8 Yes chr3R:26869238-26871995 lnc-DUSP26-3:1 No - lnc-ZNF25-9:7 No - CD27-AS1:16 No - OR2A1-AS1:13 No - lnc-FAM47A-1:1 No - LINC00575:2 No - lnc-NCOA2-1:1 No - lnc-DLK1-35:129 No - lnc-POTEG-14:15 No - RFX3-AS1:5 No - lnc-TMEM238L-16:6 No - LINC00894:6 No - lnc-CA8-14:8 No - lnc-SLCO5A1-2:4 No - LINC01866:3 No - LINC00571:5 No - ITGB1-DT:41 Yes chrX:8061645-8070237 lnc-NBPF1-2:4 No - LINC01346:3 No - lnc-CGRRF1-1:1 No - lnc-AADACL2-1:5 No - lnc-APOC3-6:8 No - LINC01122:2 No - OR2A1-AS1:11 No - lnc-FGFR1OP-6:1 No - lnc-LRRC4C-5:2 No - LINC01502:5 No - LINC00507:7 No - lnc-CCDC93-2:1 No - lnc-TGS1-3:2 Yes chrX:16323286-16325768 STAU2-AS1:1 Yes chr2R:18117896-18125779 LINC02258:3 No - LINC00454:2 No - LINC01422:1 No - lnc-JPH4-4:1 No - lnc-NTF3-5:3 No - PROX1-AS1:38 No - lnc-MYO6-2:1 No - LINC01579:8 No - LINC02316:3 No - lnc-C3orf85-6:1 No - LINC01192:8 No - lnc-HMX1-1:1 No - lnc-SPATA6-8:2 No - UBAC2-AS1:7 No - lnc-CUL2-2:1 No - lnc-FAM110B-5:2 No - TRPM2-AS:2 Yes chr2R:15262808-15309368 lnc-NUPR2-3:6 No - lnc-ANXA6-1:1 No - lnc-TSHZ2-2:1 No - TTTY13:2 No - lnc-PCDH9-1:1 No - ITGA9-AS1:12 Yes chr2R:15258761-15262873 LINC01322:3 No - lnc-CDH18-2:2 No - LINC00562:10 Yes chr3R:8938724-8943027 lnc-C12orf71-1:2 No - lnc-ZFHX4-2:3 No - lnc-ST7L-2:1 No - lnc-PZP-2:2 No - lnc-GAS2-1:14 No - LINC02199:10 No - LINC01510:1 No - lnc-LRCOL1-2:22 No - LINC02384:39 No - lnc-SLC39A11-10:54 No - CD27-AS1:4 No - lnc-CNTNAP3B-2:5 No - lnc-PRSS23-3:1 No - lnc-SORCS1-4:7 No - lnc-CD180-4:1 No - PANCR:1 No - lnc-GOLGA8J-3:2 No - lnc-LRRC4C-3:3 No - LINC01828:28 No - LINC00290:2 No - lnc-SYT16-67:12 No - lnc-ERI1-11:2 No - LINC02288:20 No - NUTM2B-AS1:23 No - LHFPL3-AS2:3 No - LINC02354:9 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-CENPC-1:8 No - LINC02320:24 No - JPX:14 No - NFYC-AS1:7 No - LINC02346:7 No - lnc-CHST2-2:1 Yes chr2L:6498647-6526996 lnc-USP44-6:1 No - lnc-STMP1-8:1 No - lnc-SEMA3D-1:1 No - lnc-CEP44-1:15 No - LINC01036:30 No - lnc-NBPF1-2:11 No - LINC01655:5 No - lnc-IGFBP2-1:1 No - lnc-HOXA10-1:3 No - lnc-FABP5-3:1 No - LINC-PINT:23 No - lnc-DLK1-35:115 No - lnc-KLHL32-4:24 No - lnc-SNRPN-8:108 No - lnc-PIWIL4-1:13 No - lnc-TOX-1:2 No - lnc-DLK1-35:89 No - DSCR9:13 Yes chr3L:20768207-20769482 lnc-ZDHHC20-3:2 No - LINC01210:6 No - lnc-CELA3A-5:31 No - lnc-ASTN1-1:1 No - LINC00535:2 No - lnc-RC3H1-1:4 No - LINC02428:18 No - lnc-MTSS1-1:2 No - SNHG10:8 Yes chrX:14837471-14838198 lnc-PEAK1-2:2 Yes chr2R:21146203-21147608 RNF139-AS1:3 No - lnc-ZFC3H1-9:1 No - LINC01798:16 No - LINC00222:9 No - lnc-RFC3-1:1 No - lnc-BCL2L11-1:1 No - lnc-SLC7A13-1:2 Yes chr2L:2037714-2044372 HAS2-AS1:1 No - lnc-TOP3B-1:2 No - LINC01208:12 No - RALY-AS1:5 Yes chr3L:7423827-7454717 lnc-GPR65-6:1 No - lnc-COX7C-6:1 No - lnc-KLRG1-3:1 No - lnc-ATP6V1D-8:1 No - lnc-MCTP2-5:1 No - LINC00484:16 No - lnc-DLK1-35:56 No - LINC02228:8 No - lnc-TP53I11-4:1 No - LINC00871:8 No - lnc-ERCC5-1:1 No - LINC02303:14 No - lnc-POTEM-4:7 No - LINC01160:2 Yes chr3L:1859115-1862239 lnc-MFSD14B-3:1 No - lnc-KCNA1-97:22 No - lnc-APBA2-1:2 No - lnc-ZNF280B-6:4 No - lnc-MFSD8-6:1 No - lnc-UBQLN2-1:1 No - lnc-ASMT-3:2 No - LINC00891:4 No - lnc-GALC-3:1 No - lnc-BATF3-2:12 No - lnc-CYP7B1-1:1 No - HCG11:3 No - PVT1:34 No - lnc-FAM50B-2:2 No - LINC01665:6 No - lnc-LPA-3:3 No - LINC02387:4 No - lnc-EPB41L1-1:1 No - LBX1-AS1:8 No - lnc-POTEM-4:14 No - LINC02454:21 No - lnc-C1GALT1-1:2 No - lnc-PYGL-1:2 No - LINC02251:8 No - ZBTB20-AS5:6 No - lnc-CHD2-4:5 No - lnc-CRACR2A-3:8 No - lnc-DLK1-35:136 No - lnc-B3GAT1-2:1 No - lnc-ANKRD20A3-3:1 No - lnc-CSMD1-5:1 No - LINC00240:6 No - lnc-ARHGAP18-1:1 No - lnc-LSM11-3:1 No - lnc-IER3-15:9 No - LINC02317:7 No - LINC00879:2 No - lnc-FSCB-1:9 No - LINC01095:16 No - LINC01682:12 No - FRMD6-AS2:3 Yes chr2L:431227-448701 lnc-CCNJ-1:3 No - LINC01342:1 No - lnc-SLC39A11-10:8 Yes chr3R:31065253-31083407 lnc-IRX2-7:1 No - lnc-NUDT12-5:1 No - lnc-PPP1R3B-4:2 No - CASC9:10 No - lnc-NUBPL-1:3 No - lnc-ATP6V1G3-4:1 No - lnc-SEMA3B-1:5 No - LINC00929:6 No - lnc-PTPA-3:2 No - lnc-SMIM10L2B-1:12 No - lnc-PDGFD-1:5 No - LINC01138:46 No - lnc-POTEM-4:9 No - lnc-KIAA1614-1:2 No - LINC00113:3 No - lnc-CADPS-1:1 No - lnc-GMNN-2:2 No - lnc-GUF1-1:1 No - INTS6-AS1:11 Yes chrX:5738663-5747254 lnc-RNF19A-1:1 No - lnc-RAB2A-3:2 No - SOX21-AS1:2 No - lnc-MDM4-2:1 Yes chr2R:8009119-8013755 lnc-API5-6:1 Yes chr2R:21872030-21946259 LINC02229:9 No - LINC00466:6 No - LINC00523:1 No - lnc-EFR3A-1:3 No - LINC01849:6 No - lnc-GLRX3-1:1 No - NUTM2B-AS1:17 No - LINC02091:9 No - lnc-KHDRBS3-8:1 No - lnc-ATP6AP2-2:2 No - lnc-PKIA-2:1 No - DICER1-AS1:16 No - lnc-NKAIN3-14:25 No - LINC01830:10 No - lnc-PIK3R1-2:1 No - lnc-OR56A3-1:1 No - lnc-SERPINB8-2:2 No - lnc-GAS2-1:15 No - LINC01639:4 No - LINC01287:2 No - lnc-MMD-4:1 Yes chr3L:7811458-7867369 LINC00575:3 No - lnc-FAM236D-2:1 Yes chrX:13368191-13370472 LINC00498:2 No - lnc-SYT10-3:2 No - NPSR1-AS1:2 Yes chr3R:25923499-25956270 lnc-TSPAN9-1:1 No - PAX8-AS1:3 Yes chr4:1088798-1113317 lnc-IGFBP7-5:4 No - lnc-SNX13-2:1 Yes chr3R:16374434-16403690 LINC02055:26 No - lnc-PTS-3:1 No - PKIA-AS1:3 No - DIO3OS:8 No - lnc-RAB2A-3:1 No - lnc-UTP23-14:5 No - lnc-FOXD4L5-44:3 No - LINC02442:5 No - TTTY12:2 No - lnc-FABP5-2:1 No - lnc-ARHGEF7-7:3 No - lnc-PIP4P1-1:1 Yes chr2R:23718798-23719936 lnc-RNF144A-2:4 No - lnc-CTAGE5-3:1 No - INKA2-AS1:23 No - lnc-TMTC3-5:1 No - lnc-CCDC125-6:12 No - LINC01020:4 No - lnc-HAAO-7:12 No - LINC02384:51 No - LINC01938:17 No - SCOC-AS1:3 Yes chr3R:27273705-27274565 lnc-TFEC-1:2 No - lnc-HDDC2-5:1 Yes chr2R:7995438-7998278 STAU2-AS1:2 Yes chr2R:18117896-18125779 lnc-GALC-3:3 No - lnc-ADAM18-2:1 No - lnc-PDGFA-1:1 No - lnc-PDLIM1-1:1 No - LINC02224:6 No - lnc-SHC3-2:1 No - lnc-ELAVL2-2:1 No - lnc-COX7C-9:1 No - lnc-CDH10-6:3 No - LINC01001:8 No - LINC02145:5 No - lnc-ETNK1-3:2 No - LINC01001:2 No - lnc-ZNF608-10:1 No - LINC02577:14 No - LINC00578:4 No - LINC02406:4 No - DIO3OS:16 No - LINC02492:9 No - lnc-TRIB1-1:1 No - lnc-TMEM253-1:1 No - lnc-SLC4A3-6:1 No - lnc-FSTL4-1:2 No - lnc-KIF26A-5:3 No - LINC-PINT:2 Yes chr2R:12628697-12632378 LINC01726:3 No - LINC01597:2 No - LINC02505:6 No - lnc-BUB3-4:6 No - lnc-PELI2-7:1 No - lnc-CSMD1-1:3 No - lnc-OR4F3-5:5 No - lnc-METAP1-11:2 Yes chr3R:10870906-10872381 LINC01799:5 No - lnc-FAM110B-7:1 No - LINC00562:11 Yes chr3R:8938724-8943027 LINC01146:5 No - lnc-MYOD1-1:2 No - lnc-BOD1-1:5 No - lnc-APOC3-4:1 No - lnc-ERG-9:3 No - LINC02493:5 No - DLEU2:9 No - lnc-XKR9-1:9 No - lnc-CHST1-5:2 No - lnc-MAK16-1:4 No - lnc-RAN-4:1 Yes chr3R:15374635-15402543 LINC01250:1 No - LINC01806:17 No - lnc-AGAP4-1:1 No - MCHR2-AS1:12 No - lnc-LZTS1-1:1 No - lnc-ITPR3-1:4 No - LINC01876:26 No - LINC02291:9 No - HOTTIP:5 No - lnc-CLMP-2:3 No - ZFAS1:4 Yes chr3R:24193832-24196880 lnc-PDE6B-1:8 No - C9orf41-AS1:3 Yes chrX:1927683-1930517 LINC00968:1 No - lnc-ARL4C-2:3 No - LINC01847:7 Yes chr3L:22035003-22065279 TTTY8B:3 No - lnc-BTBD17-3:1 No - LINC02111:6 No - MIR17HG:1 No - lnc-SNX13-2:2 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-TET2-3:1 No - lnc-MRPL39-6:1 No - lnc-ST8SIA2-1:3 No - lnc-CCDC179-3:2 No - lnc-LRRC32-2:1 No - lnc-ZFHX4-3:2 No - lnc-ATL1-1:1 No - SMG7-AS1:2 No - lnc-CHD1L-5:6 No - lnc-DLK1-35:113 No - lnc-ESRRB-1:1 No - lnc-CYP7A1-1:6 No - LINC02269:7 No - lnc-ZBED2-2:1 No - LINC01500:1 No - lnc-PPP1R12B-3:1 Yes chr2L:2772327-2799979 lnc-GALC-2:2 No - lnc-ANGPT2-2:2 No - lnc-ACTRT1-2:1 No - LINC00635:21 No - LINC01122:1 No - lnc-CYP1B1-1:2 No - MIR4307HG:5 No - lnc-TOP3B-1:3 No - PKNOX2-AS1:1 No - ENTPD3-AS1:8 No - lnc-EDIL3-2:1 No - lnc-FBRSL1-2:1 No - CHRM3-AS2:9 Yes chr2R:24378630-24390294 LINC01271:1 No - lnc-ARRDC3-2:1 No - lnc-CREB3L1-1:1 No - lnc-SERPINI1-23:20 No - NPSR1-AS1:3 Yes chr3R:25923499-25956270 lnc-TCL1A-1:2 No - MIR583HG:39 No - LINC00460:4 No - lnc-DROSHA-1:1 Yes chr2R:22855688-22858794 LINC00909:3 No - lnc-BMP4-3:1 No - lnc-ENTPD4-1:1 No - ITGA9-AS1:34 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-TCIM-2:3 No - lnc-RAP1GDS1-5:1 No - lnc-DLK1-35:66 No - LINC00924:9 No - lnc-MSRB3-1:1 No - LINC00867:3 No - lnc-GALC-3:2 No - lnc-ATL2-1:4 No - lnc-WISP1-3:1 No - lnc-GPR89B-4:1 No - LINC02273:13 No - LINC00284:15 No - CYTOR:83 No - MIR4458HG:4 No - LINC02289:34 No - lnc-NEFM-1:1 No - LINC01784:5 No - lnc-CHGA-1:6 No - LINC00645:3 No - lnc-KRTAP5-6-1:1 No - lnc-YTHDF3-7:2 No - LINC02318:12 No - OVAAL:2 No - LINC01777:13 No - lnc-CHD7-1:1 No - LINC02055:29 No - lnc-ZNF131-1:1 No - lnc-DLK1-35:81 No - lnc-GPR89B-2:2 No - LINC02232:33 No - CLMAT3:6 Yes chr3R:26869238-26871995 lnc-ANGPT2-4:1 No - lnc-KIDINS220-3:1 No - LINC01412:2 No - LINC01422:6 No - lnc-FOXD4L5-25:4 No - lnc-IL17RA-36:28 No - lnc-KL-3:1 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-BRF1-4:5 No - lnc-ANKRD20A2-1:20 No - lnc-GGTLC3-1:1 No - LINC00491:2 No - LINC01704:22 No - lnc-NWD2-2:3 No - lnc-OR4F16-15:3 No - LINC02197:7 No - CYTOR:121 No - lnc-SMPDL3A-3:2 Yes chr2L:19435850-19442727 lnc-ACVR1-1:1 No - LINC02408:5 No - LINC01120:5 No - lnc-IKBIP-16:2 No - LINC00299:9 No - lnc-CNTNAP3B-2:4 No - LINC01579:3 No - lnc-STMN2-1:1 No - LINC00894:21 No - lnc-ANGEL1-4:1 No - lnc-GALC-9:1 No - LINC01138:39 No - lnc-SEL1L-6:1 No - lnc-ZNF608-1:2 No - LINC01798:24 No - lnc-OR5B21-1:2 No - LINC01354:2 No - TPT1-AS1:28 No - LINC02505:7 No - RNF219-AS1:15 Yes chrX:15350239-15379064 lnc-ZNF131-1:4 No - TOB1-AS1:7 Yes chrX:16074717-16091495 LINC00578:7 No - lnc-TAOK3-6:1 No - lnc-IER3-15:10 No - LINC00570:3 No - GASAL1:23 No - LINC00113:2 No - lnc-SGK1-3:23 No - PCAT1:2 No - LINC00379:2 No - lnc-ALG14-5:4 No - LINC01226:3 No - LINC00463:1 No - LINC01697:25 No - lnc-SMPD1-2:2 No - lnc-BASP1-6:1 No - lnc-KHDRBS3-4:1 No - lnc-YY1-1:1 Yes chr2L:10322476-10324990 lnc-NR2F1-3:1 No - LINC02354:7 Yes chrX:13262687-13285632 LINC01537:2 No - lnc-ERVMER34-1-1:1 No - lnc-ASPH-1:1 No - lnc-SPP2-3:1 No - lnc-DLK1-35:57 No - LINC02099:10 No - lnc-ARL4A-1:3 Yes chr2L:17486806-17497208 lnc-CLN8-11:1 Yes chr2R:5702112-5705439 LINC00929:7 No - LINC02557:3 No - KIZ-AS1:7 No - lnc-CSMD1-1:6 No - LINC01123:8 No - LINC01792:6 No - lnc-DCAF5-1:1 Yes chr3R:11433488-11435703 lnc-BRF1-5:1 No - lnc-C12orf74-19:1 No - LINC02289:46 No - lnc-SSPN-1:1 No - lnc-RAB2A-1:3 No - lnc-EIF2AK3-4:80 No - LINC01122:9 No - LINC02432:11 No - PVT1:32 No - LINC01698:4 No - LINC02155:3 No - lnc-GLB1L2-2:1 No - LINC01723:24 No - CYTOR:113 No - lnc-PTAR1-4:2 Yes chrX:10627737-10710947 lnc-DLK1-35:72 No - lnc-CXCR3-1:1 No - lnc-SLC35F5-3:1 No - lnc-CA2-2:2 No - lnc-SGCG-6:1 No - lnc-GNAT3-1:1 Yes chr3L:7733250-7743041 MIR3681HG:4 No - LINC00911:6 No - LINC01339:4 No - lnc-C12orf56-1:1 No - AFDN-DT:19 No - lnc-TSHR-4:1 No - lnc-TPST1-1:3 No - lnc-NEGR1-1:1 No - lnc-FAM229A-1:4 No - LINC02455:11 No - LINC02501:6 No - lnc-FAM43A-3:3 No - lnc-PRDM8-3:1 No - lnc-API5-4:6 No - lnc-IGFBP1-2:1 No - lnc-CXorf36-46:3 No - lnc-DLK1-35:50 No - lnc-RIMBP2-1:1 Yes chr3R:15374635-15402543 TMEM161B-AS1:12 Yes chr3L:11109690-11112117 MIR100HG:30 No - LINC01939:5 No - FAM224A:1 No - lnc-CLVS1-1:1 No - lnc-YTHDF3-7:1 No - lnc-SCGB1C1-1:1 Yes chr3L:19261394-19262437 DICER1-AS1:2 Yes chr3R:22734007-22741091 lnc-WFS1-3:8 No - PGM5-AS1:6 Yes chr3L:16126018-16128531 lnc-COX7C-8:1 No - FAM238C:10 No - lnc-PPP2R1B-1:2 No - LINC01913:15 No - LINC01090:2 No - lnc-LUZP2-1:1 No - lnc-ROCK2-3:2 No - lnc-C7orf57-6:8 No - lnc-SNX10-87:1 No - lnc-LRRC47-78:21 No - PGM5-AS1:7 Yes chr3L:16126018-16128531 LINC01376:4 No - LINC01206:11 No - lnc-NGFR-3:1 No - lnc-GRHL2-3:1 No - NPSR1-AS1:14 Yes chr3R:25923499-25956270 LINC01692:5 No - lnc-TBL1XR1-5:1 No - lnc-FAM236B-4:3 Yes chrX:13368191-13370472 LINC01096:4 No - lnc-CLEC6A-1:1 No - lnc-TMEM132B-12:1 No - lnc-COX7C-7:1 No - lnc-YBX1-1:1 No - lnc-THOC3-2:27 No - LINC02269:9 No - lnc-PZP-2:1 No - lnc-PRY2-1:1 No - lnc-NRP1-3:1 No - LINC01676:26 No - lnc-CLVS1-1:2 No - lnc-IGSF11-5:10 No - lnc-EIF2B1-1:1 Yes chrX:4540908-4542506 lnc-NAA30-1:1 No - lnc-GPHB5-2:1 No - LINC02197:6 No - lnc-MAN2A1-2:1 No - LINC01234:8 No - LINC02433:11 No - lnc-CLEC6A-1:2 No - lnc-ELFN2-1:1 No - THRB-AS1:1 Yes chr2R:6087873-6169087 HOTAIR:9 No - LINC00494:4 No - lnc-PLA2G7-1:1 No - lnc-FANCC-1:12 No - LINC00589:5 No - lnc-MSMB-6:5 No - lnc-RNF39-4:8 Yes chr3R:21777203-21777847 lnc-ZFHX4-1:1 No - LINC01122:7 No - lnc-KDM4C-216:2 Yes chr2L:19586623-19732069 LINC02396:18 No - lnc-CEACAM20-1:1 No - lnc-NEUROD4-1:1 No - lnc-BTBD17-3:3 No - lnc-ITGB8-1:2 No - lnc-UCHL3-5:16 No - LINC00467:9 No - lnc-FSCB-1:3 No - lnc-ZNF704-1:1 No - LINC01605:16 No - LINC02237:21 No - lnc-RTL1-3:6 No - lnc-KHDRBS3-22:1 No - lnc-CENPP-20:16 No - lnc-MAP9-1:1 No - lnc-GALNT3-1:4 No - LINC02290:22 No - CYTOR:86 No - LINC-ROR:1 No - LINC00578:1 No - SEMA5A-AS1:3 Yes chr3L:12067511-12081830 LINC00519:1 No - lnc-BBOX1-15:1 Yes chr3R:10696647-10698976 lnc-RNF38-5:1 No - LINC00635:12 No - LINC02311:5 No - LINC02384:49 No - LINC01677:13 No - LINC02260:5 No - LINC01087:1 No - TTTY4B:2 No - H19:8 No - LINC00222:10 No - lnc-RPL10A-1:1 No - lnc-ERVMER34-1-1:4 No - lnc-SAMD11-7:13 No - lnc-PPIAL4F-1:2 No - LINC01983:9 No - lnc-SYNE3-1:8 No - lnc-BUB1-1:1 No - LINC01687:17 No - LINC00911:3 No - lnc-POTEM-21:1 No - lnc-NTSR2-5:4 No - LINC02431:9 No - LINC01052:2 No - LINC00385:2 No - lnc-HAS2-2:1 No - lnc-LSMEM1-3:2 No - LINC01505:12 No - LINC02145:4 No - lnc-SCRN3-1:2 No - lnc-CLMP-2:4 No - LINC02483:6 No - lnc-MMP17-1:1 No - LINC02454:22 No - lnc-CDH10-5:1 No - LINC02241:8 No - lnc-TRIM26-2:2 No - lnc-SLC35F5-3:2 No - LINC02306:14 No - LINC02368:5 No - LINC02445:3 No - LINC01936:25 No - lnc-GGT2-26:11 No - PCAT1:68 No - lnc-ALG14-5:1 No - lnc-NFE2L2-2:2 No - lnc-AGTR1-2:1 No - NPSR1-AS1:6 Yes chr3R:25923499-25956270 LINC-PINT:12 No - lnc-GNG11-3:1 No - LINC01814:9 No - LMCD1-AS1:6 No - lnc-SMOC1-2:3 No - lnc-CCDC140-1:2 No - lnc-CLRN3-1:1 No - lnc-TMEM132C-4:1 No - LINC00523:5 No - LINC01192:1 No - lnc-DLK1-35:102 No - LINC00229:2 No - lnc-GGT2-26:4 No - LINC01049:1 No - LINC01658:8 No - LINC02417:5 No - LINC02301:23 No - lnc-ABI3-2:8 No - LINC01192:7 No - lnc-CAPRIN2-2:3 No - LINC01510:4 No - lnc-KCNV1-1:1 No - OR2A1-AS1:16 No - LINC00626:1 No - lnc-CXCR3-1:2 No - SUCLG2-AS1:2 No - LINC00630:12 No - lnc-ZNF705D-7:1 No - lnc-ZNF706-4:1 No - lnc-RC3H1-1:3 No - MORF4L2-AS1:1 Yes chr3R:15276440-15278109 lnc-SMDT1-3:31 Yes chr2R:18094940-18101031 lnc-SPOCK3-1:2 No - LINC02321:3 No - lnc-SLC1A1-1:1 No - lnc-JUN-2:1 No - lnc-EGFL6-8:1 No - KIZ-AS1:1 No - lnc-SLC15A4-3:1 Yes chrX:6225647-6236218 CD27-AS1:5 No - PAX8-AS1:28 Yes chr4:1088798-1113317 LINC01733:4 No - lnc-LRRC47-78:18 No - LINC01336:3 No - TTTY7:3 No - lnc-RGS3-4:6 No - lnc-TMEM258-3:4 No - RFX3-AS1:21 No - LINC02297:5 No - LINC01252:1 No - LINC02066:3 No - lnc-TRIM44-1:1 No - lnc-TRIB2-6:1 No - SLC16A1-AS1:18 No - lnc-KIF26A-5:12 No - lnc-FGFR1OP-5:1 No - lnc-NAA50-1:1 Yes chr2L:13000770-13004107 lnc-BRF2-9:9 No - LINC00578:15 No - lnc-KLHL32-4:22 No - lnc-GSDMC-34:16 No - LINC01535:7 No - lnc-GNA13-2:1 No - lnc-RNF227-1:1 No - lnc-ULBP3-2:1 No - TTTY21B:5 No - LINC01503:5 No - lnc-LURAP1L-4:3 No - LINC02014:3 Yes chr3R:17809401-17811134 LINC02290:23 No - LINC02303:15 No - LINC00167:2 No - lnc-NIPSNAP3B-1:1 No - lnc-FAM126A-1:1 Yes chr2R:17734419-17737269 lnc-TDRD15-3:1 No - LINC01821:7 No - lnc-SERPIND1-2:2 Yes chrX:2624804-2633672 lnc-MS4A6A-2:1 No - lnc-GAS2-1:1 No - lnc-C1QTNF9B-1:1 No - lnc-N6AMT1-1:2 No - lnc-AHI1-2:1 No - lnc-POU5F1B-6:1 No - CD27-AS1:20 No - FAM41AY2:4 No - lnc-FAM110B-5:1 No - lnc-FOXD4L5-34:1 No - lnc-HIST2H3PS2-2:1 No - TPT1-AS1:6 No - lnc-TMEM70-2:1 No - LINC01762:38 No - LINC01087:3 No - lnc-CCDC140-5:3 No - lnc-THOC3-2:16 No - lnc-THOC2-5:5 Yes chr2L:6950421-6954586 lnc-DNAJB13-1:2 No - lnc-STK3-1:2 No - lnc-GSDMC-34:1 No - lnc-POTEM-21:3 No - lnc-YY1-1:2 Yes chr2L:10322476-10324990 lnc-ESR2-3:1 No - lnc-HOXC4-2:1 Yes chr3R:17150587-17151630 lnc-MFSD8-11:2 No - lnc-PDCD1LG2-1:1 No - FAM242C:8 Yes chr3R:17150587-17151630 LINC02375:5 No - lnc-SPATA32-2:12 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-CD5-1:1 No - H19:7 No - FILNC1:23 No - CD27-AS1:7 No - lnc-RIMBP3B-5:1 No - lnc-MAK16-2:1 No - lnc-CHMP4C-26:1 No - lnc-HHIPL1-1:2 No - lnc-NAV2-2:1 No - CLEC12A-AS1:4 No - lnc-PSMB9-6:1 No - SEC23A-AS1:12 Yes chr3R:5649065-5652629 TTTY15:3 No - LINC01914:21 No - lnc-TREML1-1:1 No - lnc-MAP1LC3B2-30:1 No - lnc-ATP6V0E2-2:1 No - lnc-KCTD8-1:1 No - LINC00507:5 No - LINC01772:3 No - LINC02022:5 No - lnc-ERICH1-8:2 No - lnc-ERVMER34-1-1:2 No - lnc-PENK-1:2 No - LINC01498:1 No - lnc-SLC15A4-7:1 No - LINC02061:3 No - lnc-PENK-1:1 No - FAM242C:9 Yes chr3R:17150587-17151630 lnc-JRKL-1:1 No - lnc-TSPAN9-1:2 No - lnc-INSC-3:2 No - TMEM161B-AS1:21 Yes chr3L:11109690-11112117 lnc-ATP6V1D-8:8 No - LINC00678:7 No - lnc-JRKL-2:1 No - lnc-PRICKLE2-1:1 Yes chr2R:7086316-7127868 LY6E-DT:22 No - lnc-CTSF-1:1 Yes chrX:2023822-2042311 lnc-GNG11-3:2 No - lnc-SNAI2-7:1 No - lnc-NBPF1-2:9 No - lnc-SREK1-1:1 No - lnc-RAB38-1:1 No - HCG9:1 No - lnc-GGT2-26:13 No - lnc-IKBIP-16:1 No - lnc-RFC3-2:1 No - MAL2-AS1:10 No - LINC01671:9 No - MYT1L-AS1:1 Yes chrX:4075978-4092237 ITGA9-AS1:18 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-YTHDF3-2:1 No - lnc-SMOC1-2:2 No - lnc-TMED7-2:1 No - OTX2-AS1:3 No - lnc-FAM230A-2:1 No - LINC02552:28 No - LINC01588:66 No - lnc-ANAPC1-4:1 No - lnc-LZTS1-2:1 No - LINC02198:26 No - lnc-TNC-2:1 No - LINC00343:9 No - CD27-AS1:3 No - lnc-RPL7-2:5 No - lnc-CPSF7-3:1 Yes chr4:278685-306481 LINC01106:8 No - RNF139-AS1:7 No - lnc-ERICH1-1:1 Yes chr2R:5702112-5705439 LINC01122:12 No - lnc-C7orf57-6:10 No - TPRG1-AS1:1 No - lnc-GAS2-1:2 No - LINC00534:2 No - LINC00640:7 No - lnc-CGGBP1-1:1 No - LINC02171:5 No - lnc-FGF9-3:1 No - lnc-ZNF706-5:1 No - lnc-ARHGAP26-4:40 No - LINC01524:25 No - lnc-FAM110B-4:2 No - lnc-HOXC4-4:7 Yes chr3R:17150587-17151630 LINC01370:8 No - lnc-HDDC2-5:3 No - FAM239B:9 No - lnc-CTAGE5-8:26 No - LINC02114:5 No - GLIDR:13 No - lnc-SMOC1-2:1 No - lnc-TRIM26-2:6 No - LINC00642:3 No - lnc-OR4F5-7:1 No - RFX3-AS1:8 No - LINC01492:3 No - lnc-ZNF25-9:5 No - LINC01489:1 No - lnc-TBP-1:1 No - lnc-RWDD3-5:3 No - LINC00310:12 No - lnc-RAP1B-1:1 No - lnc-SSUH2-3:1 No - lnc-UNC5D-2:2 No - lnc-ANO3-3:1 No - lnc-DLK1-35:127 No - lnc-POTEM-4:16 No - LINC00378:3 No - DEPDC1-AS1:1 No - lnc-RASA1-2:1 No - lnc-DLK1-35:58 No - DAB1-AS1:10 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-OR4F5-7:2 No - lnc-IGSF5-1:2 No - lnc-WDR73-5:5 No - lnc-PSD3-1:2 No - lnc-ASB3-1:1 No - lnc-MREG-1:1 No - VPS33B-DT:21 No - LINC00871:2 No - lnc-DENND3-2:1 No - LINC02207:12 No - lnc-FOXD4L5-25:13 No - lnc-SORCS3-7:1 No - lnc-VPREB1-1:1 No - lnc-RUNX1T1-3:2 No - lnc-CHRM2-1:2 No - lnc-OR4F29-3:6 No - lnc-GRAMD1B-1:1 No - LINC01932:5 No - lnc-POTEM-4:8 No - lnc-SLC16A9-1:2 No - lnc-SNX16-2:1 No - lnc-DLK1-35:95 No - LINC00269:1 No - LINC01814:10 No - LINC01734:5 No - lnc-ERVMER34-1-1:3 No - lnc-FSHR-9:2 Yes chr3R:22468512-22486969 lnc-NBPF1-1:14 No - lnc-DLK1-35:93 No - lnc-RUNX1T1-1:1 No - SRGAP2-AS1:4 No - LINC01297:5 No - LINC02548:4 No - lnc-TET2-2:3 No - lnc-BMP6-106:17 No - SMG7-AS1:4 No - lnc-SDSL-6:1 No - LINC02546:8 No - LINC02395:21 No - ENTPD3-AS1:9 No - lnc-ANO2-1:1 No - lnc-SPATA31E1-2:1 No - lnc-CHST1-5:3 No - lnc-GLB1L2-1:7 No - lnc-BPIFA3-1:2 No - lnc-UBE2K-2:1 No - LINC00658:16 No - lnc-CYP7A1-4:1 No - LY6E-DT:21 No - lnc-GRIP1-2:3 No - lnc-EXOC5-1:2 No - lnc-BMP6-106:127 No - VAV3-AS1:19 No - DLEU2:1 No - lnc-ZNF573-1:1 No - lnc-APBA2-1:1 No - lnc-ALDH8A1-1:1 No - FAM41AY1:5 No - lnc-NXPH1-1:1 No - lnc-SPATA19-1:8 Yes chr2L:4283148-4323781 lnc-WASHC5-4:3 No - lnc-EFCAB1-2:1 No - lnc-EVX1-1:1 Yes chr2R:9979319-9980795 CDH18-AS1:5 No - FAM66E:2 No - LINC00837:7 No - LINC02390:3 No - lnc-COL8A1-1:1 No - lnc-SSTR1-1:1 No - lnc-MKI67-2:1 No - LINC02396:13 No - lnc-N6AMT1-1:3 No - lnc-DERL1-5:1 No - lnc-FBXO9-1:1 No - lnc-LRR1-1:1 Yes chr3R:9778042-9779528 lnc-NDST1-1:1 Yes chrX:7933742-7934677 lnc-NDST1-1:2 Yes chrX:7933742-7934677 lnc-EPCAM-8:3 No - lnc-OR51B4-3:1 No - DIO3OS:20 No - KCNQ1OT1:1 No - RBM5-AS1:1 Yes chr2L:1173009-1182454 MALAT1:4 No - NCRUPAR:1 No - NEAT1:5 No - lnc-ANGPTL2-10:1 Yes chrX:18097558-18101314 FAS-AS1:5 No - KCNIP4-IT1:1 Yes chrX:11219379-11302783 lnc-DIO2-4:1 Yes chr3R:22468512-22486969 lnc-NEIL3-6:6 No - lnc-LINC02203-1:3 No - HOXC-AS3:3 No - lnc-GSX2-1:1 Yes chr3R:4485008-4487677 lnc-CLLU1OS-1:5 Yes chrX:16074717-16091495 INO80-AS1:3 Yes chr3R:19368995-19403153 lnc-WDPCP-1:1 Yes chr3L:13011976-13015332 SPINT1-AS1:27 No - lnc-YTHDC2-1:3 Yes chr3R:15363786-15367665 lnc-RAB3GAP2-4:1 Yes chr3R:11346294-11353131 lnc-TKT-3:7 Yes chr2R:23888764-23890276 LINC01858:12 No - lnc-TIGD7-2:1 No - lnc-ERLIN2-1:3 No - lnc-STK39-2:2 No - lnc-GGCT-1:8 No - lnc-SMIM20-1:1 No - lnc-OLR1-1:1 No - lnc-NSFL1C-1:1 No - lnc-HSPB8-2:1 No - lnc-MEF2A-1:2 Yes chrX:5698557-5708633 UBR5-AS1:3 Yes chr3R:9714623-9725615 lnc-IGFBP4-1:5 No - lnc-OR4N4-1:4 No - SEPT7-AS1:5 No - lnc-PLA2G2C-2:1 No - lnc-PIPOX-5:5 Yes chrX:6295389-6298970 lnc-ZBTB10-2:1 No - lnc-PIWIL1-1:1 No - lnc-SRBD1-2:1 Yes chr3R:29039156-29049148 MINCR:11 No - lnc-BOLA2B-1:2 No - lnc-CCDC180-1:1 No - lnc-INPP5F-1:1 Yes chr2L:8134247-8159638 PCBP1-AS1:99 No - lnc-MDFIC2-6:1 No - lnc-PTPRZ1-3:1 Yes chr4:1230837-1271759 lnc-PDSS2-1:2 Yes chr2R:11827170-11839825 lnc-SERHL2-1:1 Yes chr2L:6022951-6024539 LINC00470:6 No - lnc-VSIG10L2-1:1 No - HLA-F-AS1:1 No - lnc-CCDC166-1:2 No - lnc-CSAG2-2:1 No - LINC00661:21 No - lnc-SHANK2-2:1 Yes chr2L:6723903-6732766 lnc-RGS5-1:11 No - lnc-ANAPC11-2:1 Yes chr3L:19928743-19932930 lnc-MUC22-1:2 No - lnc-SDK2-3:1 No - HOXA11-AS:6 No - lnc-MARCH4-2:1 No - lnc-SERGEF-2:3 No - lnc-FAM198B-1:1 No - lnc-SERPINE2-1:1 Yes chr3R:5469463-5470636 lnc-CDH11-4:1 No - lnc-ZSCAN10-3:8 No - lnc-STX4-1:1 No - lnc-LRRC53-1:1 No - lnc-NXPE2-7:1 No - lnc-RPRML-3:6 No - lnc-C6orf118-12:1 No - PWRN4:3 No - PACRG-AS2:4 Yes chr2R:19497752-19500372 lnc-CEP170-13:14 No - lnc-OR1Q1-1:2 No - LINC00670:8 No - lnc-NDUFA5-1:5 No - lnc-MAPK15-2:1 No - lnc-SASS6-2:1 No - lnc-CYP7B1-6:1 No - lnc-DYNLRB2-2:1 No - lnc-PKMYT1-1:1 No - KCNH1-IT1:1 No - lnc-C11orf95-1:15 No - MKX-AS1:3 No - lnc-KMT2E-12:2 Yes chr2R:15380724-15387851 lnc-NTN4-1:4 No - lnc-DHRS7-1:6 No - lnc-SLC37A4-1:27 No - lnc-XPC-5:7 Yes chrX:5966279-5986699 CSMD2-AS1:11 Yes chrX:11992915-12003914 LINC01582:6 No - SMARCA5-AS1:2 Yes chr2R:12636671-12640628 lnc-SETD6-7:1 No - LGALS8-AS1:3 No - lnc-OLFML2A-1:1 Yes chrX:1941940-2007956 TMEM202-AS1:30 No - GPC5-AS1:2 Yes chr3L:8827505-8891192 SMIM2-IT1:1 No - lnc-ZIC2-1:1 No - lnc-GCA-2:1 Yes chr2R:24047411-24053035 ZEB2-AS1:14 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-AGRP-1:22 No - AGBL5-IT1:1 No - lnc-ACSS3-2:1 Yes chr2L:6723903-6732766 lnc-SLC37A4-1:31 No - RARA-AS1:3 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-ELFN2-2:5 No - lnc-NME4-1:5 Yes chr3R:25199818-25214255 LINC01584:10 No - lnc-ZDHHC6-1:1 Yes chr3L:18878250-18890483 lnc-SOX15-1:2 No - lnc-LHX2-2:1 Yes chr2R:9123304-9132030 KCND3-IT1:1 Yes chr3L:19566851-19584568 LINC01006:11 No - lnc-BPIFB1-1:1 No - PWRN1:27 No - lnc-SLC45A4-2:1 No - lnc-CACNG2-1:1 No - lnc-GLRA3-1:1 No - lnc-LIMS4-1:6 Yes chr3R:8356978-8359964 lnc-INTS8-1:2 Yes chrX:11891732-11893745 lnc-BOD1-4:3 No - C5orf66-AS2:1 No - LARGE-AS1:13 No - lnc-ZSCAN10-3:29 No - LINC00555:3 No - lnc-FRRS1L-1:1 Yes chr2R:16017737-16024627 P4HA2-AS1:2 Yes chr3R:30466050-30485799 lnc-TMEM60-5:1 Yes chr2R:21129463-21142261 lnc-PIGK-1:1 Yes chr3L:12200322-12204082 LINC02320:25 No - SMYD3-IT1:1 Yes chrX:2606680-2608876 lnc-KIAA0319L-1:2 Yes chr3L:21586828-21613349 lnc-SNRPN-8:160 No - lnc-NAV1-8:2 No - FLG-AS1:29 No - CCDC144NL-AS1:28 No - lnc-SMG6-3:1 Yes chr3L:11693879-11696963 lnc-CDH2-4:1 No - lnc-USP20-1:1 Yes chr3L:4322491-4364102 TSPOAP1-AS1:44 Yes chr2R:12633589-12634172 lnc-TRIQK-2:2 No - lnc-HEATR4-2:1 No - lnc-SOX13-1:1 Yes chrX:16278328-16285618 LNCPRESS1:25 No - lnc-BCOR-1:1 No - lnc-LRRC31-1:4 No - lnc-GALR1-3:1 No - lnc-KALRN-1:1 Yes chr3L:995982-1034875 lnc-CHST15-1:1 No - lnc-MTFR2-2:3 No - lnc-MTRNR2L1-2:1 No - TBL1XR1-AS1:2 Yes chr2L:415067-418536 lnc-AKAP10-1:1 No - lnc-PGPEP1L-11:2 No - lnc-TMOD3-1:1 No - lnc-SDK2-1:1 No - LINC02323:10 No - lnc-SLC37A4-1:33 No - lnc-VAPA-2:1 No - LOXL1-AS1:14 Yes chr2R:21789623-21791580 TMEM9B-AS1:4 No - BNC2-AS1:14 Yes chrX:16118067-16148977 lnc-MKL1-1:1 No - LINC00967:5 No - lnc-BCL9L-2:1 No - SLC39A12-AS1:1 Yes chr3L:14992289-14997983 lnc-PAXIP1-3:4 No - lnc-SMG1-5:7 No - SSTR5-AS1:6 No - lnc-DEXI-1:1 No - lnc-BDKRB1-1:1 No - lnc-RTN4-3:1 Yes chrX:17657372-17669371 lnc-GTPBP8-2:1 No - lnc-SAYSD1-1:1 Yes chr3R:9651179-9674643 MELTF-AS1:19 Yes chrX:18387084-18390344 lnc-PYCARD-1:1 Yes chrX:16288810-16293520 lnc-MINDY2-2:2 Yes chrX:17911462-17924163 lnc-PTPN1-1:1 No - lnc-IL16-11:1 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-PXDN-3:1 No - lnc-LRRC40-2:1 Yes chr2R:14935660-14940722 DNM3OS:4 No - ST8SIA6-AS1:7 No - lnc-MFSD6-1:1 No - lnc-GRAP-6:2 No - lnc-GTPBP4-3:1 No - CHL1-AS2:2 Yes chrX:8517373-8555170 lnc-BCAP31-5:6 No - lnc-ZFC3H1-5:1 Yes chr3L:1190384-1193173 lnc-NUTM1-5:7 Yes chrX:5900861-5905399 lnc-PLXDC1-3:4 No - lnc-CLCNKB-1:12 No - lnc-DNAJB6-10:1 Yes chr2L:1008378-1048053 lnc-RPS24-2:2 Yes chr2L:11508399-11517081 lnc-TAF4-3:1 No - lnc-RPLP1-12:35 No - lnc-SNRPN-8:128 No - LINC00618:4 No - NRG1-IT1:9 No - lnc-COL1A1-1:2 No - lnc-RHBDD1-3:13 No - lnc-CEMP1-4:1 No - lnc-PEF1-1:1 No - lnc-IL31RA-1:4 No - DENND5B-AS1:2 No - lnc-NDUFB4-1:1 No - LINC00982:6 No - lnc-MRPL11-1:1 Yes chr3R:8344400-8347465 lnc-CPPED1-2:1 Yes chr2L:13177150-13178978 lnc-RAB11FIP2-3:1 No - LRRC75A-AS1:62 No - lnc-PHKB-1:1 Yes chr3L:15560726-15563065 lnc-C2CD4A-1:2 No - KLHL6-AS1:1 No - lnc-LRRC31-1:1 Yes chr2L:10009381-10013170 FOXD3-AS1:12 No - lnc-USP31-1:1 No - lnc-INO80D-10:1 No - lnc-BPY2C-3:1 No - lnc-ZNF117-1:1 No - MYO16-AS1:1 No - lnc-NR2F2-6:1 No - lnc-TMEM258-2:2 No - LINC01089:11 Yes chr3R:9497101-9502581 lnc-MARCH11-2:2 Yes chr3R:15920898-15932887 WASF3-AS1:1 Yes chr2L:10976772-10982395 lnc-CYLD-2:13 No - lnc-DBT-3:1 Yes chr2L:7801668-7810703 lnc-LIMS3-2:10 No - lnc-HIGD1A-1:1 No - lnc-FANCF-4:1 Yes chr3L:11984906-11990505 lnc-KLHDC9-1:1 No - lnc-POLR3E-2:2 Yes chr2L:20678921-20681846 lnc-KIF26B-2:2 Yes chrX:2606680-2608876 MIR100HG:7 No - lnc-TP53TG3D-2:1 No - CYYR1-AS1:1 No - lnc-ASPHD1-1:1 Yes chr2R:5339706-5340995 SATB1-AS1:8 No - lnc-PHF3-3:1 No - lnc-GPR65-3:1 No - lnc-EMX2-1:1 No - lnc-LRPAP1-1:1 No - LINC02259:7 No - CCDC37-DT:13 No - lnc-C9orf66-15:23 Yes chr2L:94739-102086 lnc-POTEC-4:1 No - lnc-PINX1-85:1 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-DRC3-1:1 Yes chr2R:18094940-18101031 ANKRD34C-AS1:1 No - lnc-SEC16B-2:1 Yes chrX:12596047-12609910 lnc-ABCA1-2:1 No - lnc-KHDC1L-2:1 Yes chr2R:10145897-10192394 lnc-MUC20-67:65 No - lnc-SP110-1:1 No - lnc-ZDHHC17-2:1 Yes chr3R:7112850-7117732 lnc-RELT-1:2 No - lnc-RFC5-1:1 Yes chr3R:5478390-5483906 MIR100HG:16 No - MIR583HG:37 Yes chr3L:19889120-19909410 lnc-HOXC8-1:1 No - lnc-WDR34-2:2 Yes chr2R:8627900-8630186 lnc-MTERF4-1:1 No - lnc-KCNQ4-1:1 No - PWRN1:21 No - lnc-COL12A1-1:2 No - lnc-ZNF438-1:5 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-ROM1-3:1 No - lnc-LYPD8-1:12 No - lnc-KLHL28-2:1 No - lnc-MFSD14B-6:1 No - lnc-SLC16A3-3:1 No - RBFADN:7 No - lnc-THNSL1-1:1 Yes chrX:1673110-1692768 LINC01833:32 No - IPO9-AS1:1 No - lnc-DPH1-5:1 Yes chr2L:13212335-13215350 LINC01584:5 No - lnc-ATXN7-17:5 Yes chr3R:22460662-22462054 lnc-HSP90AA1-15:1 Yes chr3R:18167757-18180049 lnc-MYBBP1A-2:2 Yes chr2R:16124981-16138238 lnc-HSPA12A-1:13 No - STX18-IT1:1 Yes chr3R:24623802-24625562 lnc-TIAL1-1:1 Yes chr3L:13477541-13483515 RHPN1-AS1:3 No - lnc-CA5A-5:1 No - lnc-MT1G-2:1 No - lnc-ZBTB2-1:5 Yes chr3R:10696534-10703316 lnc-APBB1IP-2:1 Yes chr3R:31236035-31252608 BIRC6-AS1:1 Yes chr3R:10312039-10331353 KCNMA1-AS1:1 Yes chr3R:24662491-24711595 lnc-PDGFRB-1:2 Yes chr2L:8220980-8239878 lnc-ATIC-8:2 No - lnc-IL16-11:3 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-NDN-2:1 No - lnc-C17orf75-1:1 Yes chr3L:1463811-1468944 lnc-GRAPL-1:1 No - lnc-HAPLN1-2:1 No - lnc-URB2-1:1 No - lnc-SLC22A31-3:1 Yes chr3L:12750119-12753402 lnc-PRR4-1:17 No - lnc-NFKBIA-1:1 No - lnc-PPIAL4A-2:11 No - lnc-WNT1-1:1 No - lnc-MMADHC-2:1 Yes chr2R:16266960-16271971 lnc-SLC13A4-1:1 No - lnc-SH2D1B-1:2 No - lnc-HDAC4-1:1 No - lnc-PNMA1-1:1 Yes chr2L:15979486-15981455 LINC00324:1 No - LOXL1-AS1:9 Yes chr2R:21789623-21791580 lnc-GCLC-1:2 Yes chrX:8102181-8116147 ZFPM2-AS1:5 No - lnc-ANP32A-2:1 No - lnc-HRH4-3:1 No - lnc-ZNF843-2:1 No - lnc-SH2D7-5:3 Yes chr2R:21872030-21946259 lnc-METTL5-4:98 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-TPCN2-5:1 No - lnc-NWD2-3:5 No - TCEAL3-AS1:2 No - lnc-FGL2-1:1 Yes chrY:3561745-3618339 lnc-PCSK1N-1:1 Yes chr3R:15259864-15263458 lnc-ZGRF1-1:3 Yes chrX:9243817-9245925 lnc-CPHXL-3:1 No - THUMPD3-AS1:1 No - FGF14-AS1:2 No - lnc-SYNCRIP-8:1 No - lnc-SH2D7-4:1 No - lnc-TIGIT-6:1 No - CFLAR-AS1:27 No - lnc-YAP1-1:1 No - lnc-SP3-2:1 No - KIRREL3-AS3:1 Yes chrX:2740384-3134532 lnc-TOMM20L-1:1 No - lnc-AGAP2-1:1 Yes chr2L:13835564-13898712 LINC01033:1 No - lnc-TTC7B-3:1 No - NDUFA6-DT:56 Yes chrX:18688538-18693042 lnc-IRX3-80:57 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-PRAG1-3:2 No - lnc-KLRB1-1:2 No - LINC02591:10 No - lnc-SCCPDH-2:1 No - lnc-TMEM114-10:1 No - lnc-AMELY-1:6 No - lnc-EIF4A3-1:1 Yes chr2L:10432687-10435656 lnc-CWC15-2:2 Yes chrX:9317915-9319223 lnc-EMC8-6:3 No - lnc-SUSD1-2:1 Yes chr2R:22075988-22079381 lnc-KIFAP3-2:1 Yes chr3L:17427305-17428836 lnc-LMF1-3:4 No - lnc-RPL17-1:1 No - BOLA3-AS1:6 No - LINC02280:14 No - LINC01088:1 Yes chr3L:9972312-9974023 lnc-LDHC-1:1 Yes chr3L:6259105-6262694 lnc-ITGA7-1:1 No - lnc-SLC39A11-1:29 No - lnc-NDUFAF2-2:18 Yes chrX:3176440-3343767 lnc-TSKU-1:1 No - lnc-BOD1-4:1 No - lnc-VPS50-1:5 Yes chr2R:16579470-16585448 CAPN10-DT:6 No - PWRN1:31 No - lnc-C17orf51-6:1 No - lnc-RNF40-1:1 Yes chr2R:14173693-14182838 lnc-OR2A1-1:10 No - lnc-SETD4-5:1 Yes chrX:20538497-20567097 lnc-NTN4-1:2 No - lnc-SLC22A31-6:7 No - lnc-MACC1-1:4 No - USP2-AS1:7 No - lnc-HPGD-1:1 No - HAND2-AS1:3 No - lnc-MACC1-1:5 No - CACNA1C-AS1:2 Yes chr2L:16165831-16190540 lnc-GFM1-6:1 Yes chr2L:4838347-4841465 lnc-COL4A3BP-1:1 Yes chr3R:23733324-23750992 lnc-CLN5-1:1 No - lnc-ETS2-3:1 No - lnc-CA5A-2:1 No - lnc-CNST-1:1 No - lnc-CLIC3-4:1 No - PCOLCE-AS1:2 No - lnc-NT5E-1:1 Yes chr3R:20756729-20810726 lnc-AGR3-1:1 No - lnc-FMN1-4:1 No - OSTN-AS1:1 No - lnc-DIO2-2:1 Yes chr3R:22468512-22486969 lnc-VSIG2-1:1 No - lnc-SMARCC2-2:1 No - lnc-PPP1R9B-3:1 No - lnc-RASGRP1-3:2 No - LINC01033:3 No - lnc-CES5A-3:7 No - lnc-UNC93B1-1:3 Yes chr2R:7466879-7477162 lnc-TYMS-4:1 Yes chr3L:4592447-4626196 LINC02057:4 No - lnc-GTSF1L-1:1 No - lnc-TMEM37-1:2 No - lnc-NPBWR1-12:14 No - lnc-NSUN6-2:1 Yes chr3L:22872200-22873702 lnc-C19orf47-1:1 Yes chr3R:16099228-16105670 lnc-CDH5-12:1 No - ARLNC1:11 No - KLF7-IT1:1 Yes chr2R:10977956-11116378 lnc-PPIAL4F-4:4 No - lnc-N4BP1-1:1 Yes chrX:2708684-2711668 lnc-GDE1-2:1 Yes chr3L:9597764-9614001 DPP10-AS3:1 No - lnc-ANKRD35-1:1 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-PYM1-1:1 No - IDH2-DT:18 No - lnc-DGAT2-1:1 Yes chr2L:13286777-13289556 SLIT1-AS1:2 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-SGK1-3:10 No - lnc-LIMS3-2:8 No - lnc-ATG9B-2:1 Yes chr2R:16294400-16297232 lnc-KLHL25-1:3 No - lnc-GABPA-3:2 No - LINC00115:12 No - lnc-DHRS7-1:2 No - lnc-FAM92A-6:2 No - lnc-FAM171B-1:3 No - LINC01443:3 No - lnc-CTNNA1-2:1 Yes chr3R:25233636-25235529 lnc-COG1-1:1 No - DLG5-AS1:3 No - lnc-SHF-3:1 Yes chr2R:9082395-9085717 RBMS3-AS1:1 Yes chr3L:5155821-5277944 lnc-USP53-6:12 No - MMP25-AS1:4 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-MKRN3-2:1 No - lnc-MCTP2-1:1 Yes chr2R:18761758-18774824 BEAN1-AS1:4 No - lnc-SHARPIN-5:1 Yes chr2R:22478379-22483054 LINC00520:2 No - MRGPRF-AS1:1 No - lnc-LRRC30-4:1 No - lnc-GATA6-1:1 No - lnc-RGS5-1:2 No - THUMPD3-AS1:19 No - lnc-ECEL1-2:1 Yes chr2R:22208464-22210765 lnc-DLX2-4:1 No - lnc-AGAP5-1:2 No - lnc-CCDC102A-1:1 Yes chr3L:23784231-23787405 KIF25-AS1:9 No - lnc-FOXB1-5:1 Yes chr2R:10203995-10237348 lnc-NSUN6-1:1 No - lnc-C21orf62-5:1 No - lnc-VAC14-1:1 No - lnc-SERAC1-4:1 Yes chr3L:9710422-9713827 ITPKB-AS1:1 Yes chrX:13303633-13329303 FAM230B:4 No - lnc-SLC37A4-1:21 No - lnc-TTLL7-8:1 Yes chr2R:8614722-8625203 ADARB2-AS1:3 Yes chrX:1773725-1788065 lnc-C8orf76-3:1 No - GRM7-AS3:1 Yes chr4:936819-949441 lnc-NEURL4-1:6 No - lnc-GGCT-1:7 No - lnc-ZNF236-11:2 No - lnc-FAT3-5:8 No - KDM7A-DT:10 No - SNHG20:12 Yes chr2L:6448464-6455929 lnc-FIP1L1-2:1 Yes chr3R:4485008-4487677 lnc-RALGAPA2-2:1 Yes chr2R:22707794-22712724 LINC01088:8 Yes chr3L:9972312-9974023 lnc-ADCY9-1:7 No - lnc-GOLGA8J-5:1 No - LHFPL3-AS1:11 Yes chr3L:1885657-1891462 lnc-ODF3L1-2:8 No - lnc-FASTK-1:1 Yes chr3L:9763544-9786466 lnc-CIT-3:1 No - lnc-HPCAL1-1:12 No - FAM66C:14 No - lnc-ASIP-1:1 Yes chr3L:7423827-7454717 CYYR1-AS1:2 No - lnc-POTEG-6:1 No - lnc-FSIP1-4:15 No - lnc-GSG1L-1:1 No - lnc-CSPG5-2:1 Yes chr3R:15968134-15972913 LINC02564:13 No - lnc-DOCK4-2:1 Yes chr2R:20641742-20642558 lnc-IDNK-1:4 No - CD81-AS1:3 Yes chr3R:25872900-25881427 lnc-CCDC144A-2:1 No - DHRSX-IT1:1 Yes chr2R:20304517-20308671 lnc-TRDMT1-5:1 No - lnc-ZFP36L1-2:1 No - lnc-MED31-1:1 No - lnc-KRT81-1:1 No - PAPPA-AS2:1 No - lnc-MT1G-2:2 No - THUMPD3-AS1:12 No - lnc-ZBTB10-3:1 Yes chr2R:18421413-18426221 lnc-SALL3-3:1 No - lnc-UCHL3-5:13 No - lnc-OR6C70-1:1 No - LINC02373:4 No - lnc-SBDS-11:1 No - LINC00165:3 No - FAM95B1:6 No - lnc-CYB561-5:1 Yes chr3L:12008225-12064859 lnc-AGAP5-1:6 Yes chr2L:13835564-13898712 lnc-PTPN1-1:2 No - lnc-TP53TG3-29:2 No - lnc-TP53TG3-30:1 No - NUTM2A-AS1:13 No - lnc-STOM-3:1 Yes chrX:17710144-17752007 lnc-LRRC31-1:3 No - lnc-FBLL1-4:5 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-RCL1-1:1 Yes chrX:13757179-13758598 lnc-SASH3-1:1 No - lnc-CLIC2-1:1 No - ZRANB2-AS2:28 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-NEURL4-4:2 No - lnc-MAEA-2:1 No - EPN2-AS1:1 Yes chr3L:7528780-7540012 lnc-RBPMS2-1:1 No - PCDH9-AS1:1 Yes chr3R:14630478-14641776 lnc-C17orf75-4:1 Yes chr2L:10491814-10506779 TEX26-AS1:20 No - lnc-CTH-3:1 No - OPCML-IT1:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-PPP2R2A-1:1 No - TUSC7:4 Yes chr3L:5424109-5442399 DLX6-AS1:7 Yes chr2R:24814822-24835667 lnc-CDY1B-1:1 No - lnc-JPH1-1:1 Yes chr3L:5141953-5144317 lnc-LRRC37A3-5:7 No - lnc-TAX1BP3-1:1 Yes chr3R:23054410-23058958 MORC2-AS1:4 No - lnc-PANK4-1:1 No - lnc-C21orf140-1:2 No - lnc-PRODH2-5:6 No - lnc-UTS2-2:1 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-ZNF646-139:1 Yes chrX:4909102-4915161 lnc-WDR70-7:16 No - lnc-SRCIN1-1:7 Yes chrX:20469955-20510694 lnc-SRPK2-1:13 No - lnc-SRD5A3-2:1 Yes chr2L:8220980-8239878 lnc-TPBGL-3:1 Yes chr3L:8647261-8648936 FBXO3-DT:23 No - CASC22:16 No - FSIP2-AS1:2 No - lnc-FAM174B-3:3 No - lnc-SH3KBP1-1:2 No - lnc-TM2D2-3:1 No - RBMS3-AS2:1 No - lnc-OSBPL7-3:21 Yes chr3L:1502843-1523380 lnc-NUDCD2-2:3 No - lnc-CD38-3:2 No - lnc-SHMT1-1:1 No - lnc-MMP24OS-73:11 No - CTBP1-DT:27 No - lnc-SUMO2-1:1 No - lnc-PDILT-1:2 No - lnc-EVPLL-3:7 No - lnc-SLC39A6-1:1 Yes chr2R:10645735-10648634 lnc-RBM34-1:1 No - lnc-NBPF11-1:1 No - lnc-LOX-1:1 No - MMP25-AS1:20 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-IFT140-1:1 Yes chrX:2734248-2738773 lnc-ALB-1:1 No - lnc-CES5A-3:3 No - lnc-TBC1D31-2:2 No - lnc-SF3B5-1:1 Yes chr3R:19461085-19597288 lnc-PIEZO2-6:2 No - lnc-SAMD14-2:3 Yes chr3L:2505245-2554292 lnc-RASGEF1B-1:3 Yes chr2R:17514217-17517445 USP2-AS1:4 No - LENG8-AS1:1 Yes chr2L:10837732-10842597 lnc-SMARCC2-3:2 No - lnc-RAB30-1:1 No - lnc-CDC73-3:1 No - lnc-ATP5ME-1:19 No - lnc-ACSS3-2:2 Yes chr2L:6723903-6732766 lnc-TERF1-3:1 Yes chr3L:2895017-2959579 lnc-PAQR5-1:1 No - lnc-MAT2B-3:11 No - lnc-LIMS3-1:17 Yes chr3R:8356978-8359964 TMEM202-AS1:22 Yes chrX:18130392-18137784 lnc-GAREM1-3:1 No - lnc-LEF1-3:2 No - lnc-MYNN-1:1 No - lnc-NTRK3-2:9 No - lnc-STYX-3:1 No - LARGE-AS1:8 No - lnc-UVRAG-1:1 Yes chr2R:7712578-7714182 lnc-ARPC2-1:1 No - TMEM246-AS1:12 No - lnc-IL15RA-1:1 No - lnc-TFEC-2:3 No - lnc-ZC2HC1C-1:5 No - lnc-DNAAF4-2:6 No - lnc-MTBP-1:1 Yes chr3L:21745359-21770534 lnc-DAPP1-2:1 No - COL18A1-AS2:1 Yes chr3L:6998843-7053499 lnc-DNASE1L2-2:13 No - lnc-PCDH18-5:1 No - lnc-PTPN9-1:3 No - MIR9-3HG:20 No - PCBP1-AS1:45 No - lnc-TIFA-1:1 No - lnc-MEIS2-1:2 No - lnc-ESRP2-4:7 Yes chr2L:20447734-20449964 LINC02465:9 No - SPINT1-AS1:29 No - lnc-EMC2-4:1 Yes chr3L:16785242-16786941 THUMPD3-AS1:4 No - lnc-C12orf74-8:4 No - OGFR-AS1:1 No - lnc-CDH5-3:1 No - MIR100HG:20 No - lnc-HLA-DRB1-3:1 No - lnc-HEATR1-1:1 No - lnc-CBLL1-1:1 Yes chr2L:19580612-19582474 lnc-DGCR6-6:25 No - lnc-METTL5-4:87 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-TP53TG3-28:1 No - lnc-NEK3-1:3 No - lnc-SERHL2-1:2 Yes chr2L:6022951-6024539 lnc-FIP1L1-2:2 Yes chr3R:4485008-4487677 lnc-RASA1-5:1 No - FAM155A-IT1:2 No - CHL1-AS2:1 Yes chrX:8517373-8555170 LINC02088:5 No - lnc-LRRTM1-1:1 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-TRIP11-5:4 No - lnc-FAM91A1-1:1 No - lnc-FGFRL1-4:1 No - lnc-ALG14-5:3 No - lnc-OR4N4-1:3 No - lnc-YTHDF3-4:1 No - lnc-RABEP2-2:1 No - PCCA-AS1:2 No - lnc-JPH1-5:1 No - LINC00312:1 Yes chr2R:17465879-17469177 lnc-NPBWR1-12:8 No - NAALADL2-AS1:1 No - lnc-SYT1-3:2 No - lnc-TSPAN5-2:1 No - lnc-PHOX2A-3:1 No - lnc-PLAU-2:1 Yes chrX:2214347-2222567 lnc-ALDH1A3-1:1 No - lnc-CDIP1-1:1 No - lnc-THBS1-1:7 No - lnc-TP53TG3-5:1 No - lnc-VWA8-1:2 Yes chr3R:7814361-7855392 CADM2-AS2:1 No - lnc-MAP3K9-2:1 Yes chrX:2225296-2238045 lnc-ATG2B-15:1 No - lnc-SLC25A29-1:1 No - lnc-ICA1-1:1 No - lnc-C17orf75-2:1 Yes chr2L:10491814-10506779 CSMD2-AS1:13 Yes chrX:11992915-12003914 WWTR1-IT1:1 Yes chr2R:24065975-24068485 GRM7-AS3:3 Yes chr4:936819-949441 lnc-SPACA3-3:3 No - lnc-TM4SF20-1:4 Yes chr2L:5029609-5037279 lnc-CYB5A-1:1 No - lnc-MIEN1-1:1 No - PRKCZ-AS1:6 Yes chr2R:14944458-14962969 lnc-CTIF-3:1 Yes chr2R:8944298-8947344 lnc-MZT2B-1:1 No - lnc-DYNLRB2-1:1 Yes chr3L:851346-852673 lnc-TOMM7-1:1 No - lnc-CDY1B-2:1 No - lnc-C2orf72-4:1 No - lnc-DET1-1:16 No - lnc-CEP83-3:1 Yes chr4:32478-43778 lnc-MFAP4-3:1 No - lnc-GOLGA8Q-1:1 No - lnc-KRT81-2:1 No - HOTAIRM1:6 No - lnc-ALG14-2:1 No - HCFC1-AS1:2 Yes chr4:359938-375554 lnc-AMIGO2-2:1 No - lnc-DYNLRB2-4:1 No - lnc-FBXO31-12:3 No - lnc-PAGR1-2:5 No - lnc-SLC36A4-2:1 Yes chr3L:20005301-20024607 lnc-TTC23-2:3 No - lnc-EVPLL-3:1 No - lnc-CHTF8-1:1 Yes chr2L:18969028-18972004 lnc-ASAH2B-1:1 No - NRG1-IT3:1 No - lnc-SRR-2:1 Yes chr3R:25029429-25033465 lnc-SLC12A7-4:4 No - GLYCTK-AS1:1 Yes chr2L:2420830-2424647 lnc-ZDHHC9-1:1 Yes chr3L:15580800-15583373 lnc-STPG2-2:2 Yes chr2R:6975285-6985712 LINC02520:23 No - lnc-ANKRD30B-13:10 No - HMMR-AS1:3 No - LINC01594:1 No - lnc-DTYMK-7:4 Yes chrX:2141489-2144937 lnc-OSBPL7-3:14 Yes chr3L:1502843-1523380 lnc-DYNC1I2-1:1 No - lnc-RNF135-1:24 No - GABPB1-AS1:6 Yes chr3L:324985-327992 HAND2-AS1:36 No - lnc-SSU72P8-5:1 No - MIR22HG:14 No - LINC01029:8 No - lnc-FZD4-1:1 No - ANKRD34C-AS1:8 No - lnc-RPRML-3:12 Yes chr3L:5366455-5367381 SNHG3:5 Yes chr3L:5930262-5932773 lnc-SMC5-2:1 Yes chr2R:15262808-15309368 lnc-LYRM2-1:2 Yes chr2R:10816037-10819884 MEIS1-AS2:2 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-BARD1-1:1 No - lnc-GOLGA6B-1:3 Yes chrX:18130392-18137784 lnc-C17orf97-1:1 No - lnc-LENG9-7:1 Yes chrX:21328613-21339676 lnc-KBTBD3-1:1 Yes chr3L:12149273-12150329 MIR4435-2HG:9 No - LINC01029:6 No - LINC01770:16 No - lnc-SALL1-4:1 No - lnc-MOCS2-1:2 Yes chr2R:15248784-15262873 lnc-POP5-1:2 No - lnc-FAM241B-1:1 No - lnc-RIOX1-3:2 No - lnc-KAT2B-3:1 No - lnc-MLLT6-1:1 No - lnc-ZNF680-9:1 No - lnc-ITPR2-2:1 No - lnc-LEXM-2:8 No - lnc-DLAT-1:1 Yes chrX:11355881-11358724 lnc-IFT20-1:2 No - lnc-MAT2B-3:7 No - lnc-LYSMD2-2:1 No - lnc-RBP5-1:1 Yes chr4:1112874-1123357 lnc-MLYCD-2:6 No - lnc-ABCC6-2:1 No - lnc-HLA-DMA-1:1 Yes chrX:8037808-8061436 lnc-CLCN3-3:1 No - lnc-ACD-1:1 Yes chr3L:7353578-7356713 lnc-PCBD1-1:1 Yes chr2R:17088441-17091958 lnc-MDGA1-1:1 No - lnc-ALK-1:3 No - lnc-TRAF6-1:1 No - lnc-NTN4-1:3 No - lnc-ARID2-1:1 No - LINC00937:11 No - LHFPL3-AS1:5 Yes chr3L:1885657-1891462 PPP2R2B-IT1:1 Yes chr3R:10126129-10139772 lnc-MNT-1:2 Yes chrX:20433950-20445599 lnc-TP53TG3D-3:4 No - lnc-SLC30A7-1:1 Yes chr3R:22582028-22583225 ELOA-AS1:22 Yes chr3R:23251563-23255071 lnc-PARN-4:1 Yes chr3L:2717615-2766536 LINC00520:3 No - lnc-NBPF6-8:4 No - lnc-ITSN2-2:1 No - lnc-ADGRD2-2:1 No - lnc-DTHD1-5:4 No - LINC02496:3 No - lnc-SPAG5-1:1 No - lnc-PLA2G10-1:1 No - lnc-MTRR-6:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-HELZ-2:1 No - lnc-EMB-4:6 Yes chr2L:18859507-18881261 lnc-GATM-7:1 No - lnc-ZNF26-2:1 No - lnc-AQP8-1:1 No - THUMPD3-AS1:30 No - lnc-MAP3K12-1:1 Yes chr3L:21844788-21932702 lnc-CD226-1:1 Yes chrX:7324214-7328806 lnc-PKIA-1:1 No - F11-AS1:3 Yes chr2R:9599909-9601252 lnc-TMCO1-2:1 No - LRRC8C-DT:52 No - lnc-EPB41-2:1 Yes chr3R:13661311-13666891 PCBP1-AS1:12 Yes chr3L:21844788-21932702 LINC02056:26 Yes chr3L:6200473-6203776 lnc-TGFBRAP1-4:1 Yes chr3R:7889277-7902667 lnc-PAWR-2:1 Yes chr2L:2772327-2799979 lnc-EIF3A-1:1 Yes chr3R:19157238-19160202 lnc-ZSCAN10-1:2 No - CCDC18-AS1:38 No - lnc-LALBA-1:1 No - SPON1-AS1:3 Yes chr2R:12310689-12313834 lnc-SLC25A32-1:1 No - LINC01481:15 Yes chr3L:8755989-8757167 lnc-NXPH2-1:1 No - lnc-SLC5A1-1:2 No - HAND2-AS1:5 No - lnc-PLEKHM1-12:3 Yes chr2R:12474424-12487986 lnc-FAS-1:1 No - OSBPL10-AS1:7 Yes chr3L:1034697-1036298 lnc-NNT-2:1 No - MMP25-AS1:13 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-HEMGN-1:1 Yes chr2R:17866178-17872015 lnc-METTL16-2:2 Yes chrX:3671801-3701672 lnc-ITGAL-2:3 No - PWRN2:7 No - lnc-MED12L-2:1 No - DHRS4-AS1:1 No - lnc-OR1Q1-1:1 No - MMP25-AS1:17 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-MIB1-2:4 Yes chr2R:9132480-9135453 lnc-PPP4C-10:4 Yes chrX:10205292-10212374 lnc-MYO1G-1:1 No - LINC02407:28 No - lnc-DERL1-2:1 No - lnc-SCML1-1:1 No - lnc-PPIAL4A-2:15 No - lnc-MYO1D-2:1 No - HAND2-AS1:6 No - lnc-SLC51A-1:1 No - lnc-ZNF236-1:2 No - lnc-GALC-1:1 No - ACTN1-AS1:3 No - lnc-CCDC146-1:5 No - lnc-WSB1-4:1 Yes chr3R:5478390-5483906 lnc-NEMP2-1:1 Yes chr3L:4153618-4160932 GSN-AS1:2 Yes chr2L:17486806-17497208 lnc-FAM92A-6:1 No - lnc-RNASE6-1:1 No - PCBP1-AS1:146 No - LINC01165:1 No - lnc-C2CD4A-1:1 No - lnc-PBDC1-2:1 No - RNASEH2B-AS1:2 Yes chrX:13668014-13669573 lnc-CDC25C-1:1 No - lnc-MMD-1:2 No - lnc-ADA-3:14 No - lnc-DISP1-1:12 No - lnc-ANP32A-2:2 No - LINC01543:1 No - lnc-HYPM-1:1 No - LINC00304:5 No - lnc-GRAMD1B-7:1 No - lnc-C13orf42-1:6 No - lnc-ATP12A-1:1 No - lnc-C11orf91-2:5 No - lnc-EVPLL-3:5 No - lnc-ACP2-1:1 No - GATA6-AS1:4 No - lnc-CEP170-13:9 No - lnc-NOC4L-4:14 Yes chr3R:28748384-28751661 lnc-TWSG1-1:1 Yes chr3R:21017684-21020753 lnc-SUSD1-1:4 No - LINC02057:5 No - lnc-DENND1B-1:1 Yes chr3R:24295078-24314541 OPA1-AS1:2 Yes chr2R:14230611-14235449 lnc-CDRT4-1:1 No - NDUFA6-DT:64 No - lnc-LRRC24-2:4 Yes chr3L:8170640-8175978 STAM-AS1:2 No - MACROD2-IT1:1 No - lnc-GABRB1-2:1 Yes chrX:15921955-15924558 THUMPD3-AS1:25 No - lnc-KIAA1549L-1:2 No - lnc-GALNTL5-2:2 Yes chr3R:21140739-21214269 LIF-AS1:11 No - lnc-CARD11-8:5 No - lnc-FBXO31-12:7 No - lnc-MICAL3-2:4 No - LINC00937:4 No - lnc-AGPS-3:2 No - LNX1-AS1:3 Yes chr3R:4485008-4487677 ATG10-IT1:1 Yes chr2R:7832171-7835518 lnc-BRF1-2:1 No - PSMA3-AS1:10 No - lnc-HELZ-3:1 No - LINC01416:1 No - lnc-CPHXL-1:4 No - lnc-SNX11-2:1 No - lnc-LONP2-4:2 No - MAFA-AS1:2 No - lnc-SHANK2-4:1 Yes chr2L:6723903-6732766 lnc-DYNLRB2-3:1 No - lnc-ZNF316-2:1 No - lnc-AKT1-99:1 Yes chr3R:23985213-23986569 lnc-MYO7B-2:13 Yes chrX:16309817-16313138 LINC00670:5 No - lnc-TSR3-5:1 No - lnc-CEMP1-5:1 No - lnc-ZNF423-1:1 No - lnc-FBN2-6:2 No - lnc-DLX2-4:18 Yes chrX:13214409-13258490 LINC01481:19 No - lnc-PDGFRB-1:1 Yes chr2L:8220980-8239878 lnc-PQLC1-5:4 No - lnc-USP25-2:29 No - THUMPD3-AS1:6 No - lnc-TRIM16-2:6 No - lnc-CLEC18B-7:1 No - TUSC7:10 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-SERF1B-1:1 No - lnc-GALM-1:1 Yes chr2R:19517864-19631508 lnc-FAM234B-2:5 No - lnc-IFIT2-1:4 Yes chr2L:10643971-10645891 lnc-ECHDC3-2:1 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-RPL31-1:1 No - lnc-GPN2-2:1 Yes chr3R:17687818-17718350 lnc-DPEP2NB-1:1 Yes chrX:14237988-14240152 MMP25-AS1:15 Yes chr2R:9611139-9683858 BBOX1-AS1:3 No - LINC01606:16 No - lnc-SIRT1-2:1 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-CTAGE1-9:1 No - lnc-C1orf123-1:1 Yes chr3L:2981022-2983551 lnc-LRRC18-3:1 No - lnc-PADI1-4:4 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-MAT2B-3:16 No - lnc-DPYS-1:1 Yes chr3R:5571108-5579189 PWRN1:10 No - lnc-MAST4-5:7 No - lnc-VANGL2-1:1 No - lnc-TSTA3-5:2 No - PWRN3:1 No - lnc-SPATA9-1:2 No - lnc-ACOXL-2:1 Yes chr3R:8356978-8359964 lnc-BID-1:2 No - lnc-ZNF804B-1:1 No - LINC01570:4 Yes chr3L:10481412-10594012 HAND2-AS1:21 No - lnc-UBB-1:2 No - KLF3-AS1:9 No - lnc-TMX1-2:1 Yes chr2L:10544883-10628054 lnc-TTC30B-1:3 No - MIR4435-2HG:5 No - lnc-SSH2-1:1 Yes chr2R:6862001-6872718 lnc-TMEM56-2:1 Yes chrX:15472164-15472859 lnc-PKN3-2:1 Yes chr3R:15263552-15265253 lnc-LMF1-3:2 No - lnc-KCNA6-2:1 Yes chr3R:28748384-28751661 BEAN1-AS1:6 No - lnc-TMEM250-2:6 No - TTC21B-AS1:8 No - lnc-RGS5-1:9 No - FAM181A-AS1:3 No - lnc-SETD6-1:3 No - lnc-CD177-1:1 No - lnc-DOCK8-1:1 Yes chr2R:14901475-14928425 CKMT2-AS1:7 Yes chr2R:22825093-22828903 LINC02520:24 No - CACNA1C-AS1:1 Yes chr2L:16165831-16190540 lnc-ATG9B-2:13 No - LINC01341:2 No - lnc-SLC38A5-2:1 No - STARD7-AS1:3 No - LINC2194:8 No - lnc-ADAM19-2:2 Yes chr3R:15333266-15338365 lnc-MMRN1-12:18 No - lnc-FAM43A-3:2 No - lnc-SNRPD1-3:1 No - DLX6-AS1:20 No - lnc-VTI1A-1:2 No - lnc-ZNF639-1:1 No - lnc-LRRC56-1:1 No - lnc-ABR-1:1 No - LINC02337:3 No - lnc-STK3-3:1 Yes chr3R:29935978-29948207 lnc-TOR1AIP2-2:1 No - lnc-FCGR3B-2:1 No - LINC01584:14 No - lnc-CCDC102B-7:1 No - PSMA3-AS1:18 No - lnc-IL17A-2:1 No - lnc-COX4I1-14:1 No - lnc-GREB1-1:1 Yes chr2R:8136986-8156654 lnc-PLSCR3-1:6 No - lnc-B4GALT7-1:1 No - lnc-KHNYN-2:1 No - lnc-METTL16-1:3 Yes chr2R:15147860-15149709 lnc-RPS27L-1:1 Yes chr3R:15310193-15315197 lnc-ARHGAP10-1:1 No - DISC1FP1:5 No - LINC01476:3 No - FAM230B:5 No - lnc-JMJD7-PLA2G4B-2:1 No - VSTM2A-OT1:1 No - lnc-DHX38-3:5 No - EMX2OS:15 No - lnc-PTPN20-7:1 No - LINC00838:5 No - lnc-PRSS51-2:1 Yes chr2L:17454263-17458044 lnc-C16orf78-5:1 No - lnc-HSPA4-2:1 No - lnc-ANKMY2-1:1 Yes chr3R:5595364-5601136 KIRREL1-IT1:3 Yes chrX:2740384-3134532 lnc-FBXL5-2:1 No - lnc-NEDD8-MDP1-1:12 No - lnc-MAGEB5-1:1 No - lnc-SGPL1-2:2 No - LINC01550:2 No - MAMDC2-AS1:6 No - lnc-PPARA-11:4 No - lnc-OR6F1-1:2 No - lnc-MTRNR2L5-4:1 Yes chr3R:11893512-11949129 lnc-RWDD3-3:1 No - lnc-CCT8L2-6:1 No - NAV2-AS5:1 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-ZNF680-8:1 No - lnc-NPVF-2:1 No - SP2-AS1:27 No - lnc-NES-1:1 No - lnc-ADAMTS14-1:1 Yes chr2R:17088441-17091958 lnc-RABEP2-4:1 No - lnc-TLK1-6:7 Yes chr3L:4074077-4088744 lnc-TFEC-2:2 No - BOLA3-AS1:8 No - lnc-MAP3K9-3:14 No - FAM181A-AS1:2 No - lnc-NR2F2-4:1 No - POU6F2-AS1:2 Yes chr2R:8327490-8396280 lnc-DGCR6-2:26 No - lnc-PTX3-4:5 Yes chr3L:7134516-7143074 lnc-HIVEP2-4:1 Yes chr2L:281670-283269 F11-AS1:4 No - lnc-CDNF-1:1 No - lnc-PRAC2-1:1 No - lnc-CDRT15L2-1:1 No - LINC02562:9 No - lnc-MTRNR2L1-1:1 No - lnc-HGF-1:2 No - lnc-PPIAL4A-2:17 No - lnc-PRM1-2:1 No - lnc-SLC25A32-3:4 No - NUTM2A-AS1:12 No - lnc-SLC19A3-1:1 No - lnc-ZGRF1-1:1 Yes chrX:9243817-9245925 lnc-DERL1-4:3 No - lnc-RABGAP1-1:2 No - LINC02206:7 No - lnc-CEMP1-1:2 No - lnc-GGCT-1:12 No - lnc-ALK-1:1 No - SMIM2-AS1:8 No - LINC00566:5 No - MAST4-IT1:1 Yes chr3L:15566013-15576313 CSMD2-AS1:8 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-PFAS-1:1 No - ENTPD1-AS1:16 No - lnc-PIP4P2-1:1 No - DDR1-DT:3 No - lnc-ZC3H12D-4:1 No - lnc-SERAC1-1:1 Yes chr3L:9710422-9713827 lnc-EDN2-1:1 Yes chr3R:14056945-14087978 lnc-NBPF11-1:5 No - lnc-TNS2-1:2 Yes chr3L:27842669-27858271 MMP25-AS1:21 Yes chr2R:9611139-9683858 RORA-AS1:9 Yes chr2R:10203995-10237348 ZBED3-AS1:11 No - lnc-GOLGA7B-1:1 No - lnc-EVPLL-3:2 No - PLCE1-AS1:2 No - lnc-WDR60-7:1 Yes chr2L:1008378-1048053 DOCK4-AS1:2 Yes chr3R:28845270-28870439 LINC00304:3 No - lnc-PABPC4-3:1 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-ALX3-1:3 No - lnc-PDGFRL-1:1 No - lnc-RPE-9:3 No - LNCOC1:13 No - LINC02246:20 No - C1RL-AS1:7 No - LINC01592:9 No - lnc-MRPL11-1:2 No - lnc-WDPCP-1:4 Yes chr3L:13011976-13015332 lnc-KHDC3L-2:6 No - lnc-CCDC102B-5:1 No - LANCL1-AS1:5 Yes chrX:11092492-11094947 ZFPM2-AS1:6 No - lnc-TP53TG3-168:4 No - lnc-WDR73-2:1 Yes chr2R:14173693-14182838 lnc-IAH1-1:1 Yes chr3R:30000530-30003678 lnc-SGSH-1:2 No - lnc-LGALS9B-2:4 No - lnc-PRDM14-6:1 No - lnc-PRDM7-2:2 No - lnc-CLEC3A-4:1 Yes chr2L:7999670-8004286 lnc-P2RY2-1:1 No - AGBL1-AS1:6 No - LINC02165:9 No - lnc-HRH4-5:1 No - lnc-TMPRSS2-83:5 No - lnc-CCDC171-2:1 Yes chrX:16118067-16148977 lnc-UBE2J2-1:1 No - lnc-PRDX3-1:1 Yes chr3R:31405245-31457873 lnc-DIRC1-1:1 No - lnc-MAGEB10-2:1 No - lnc-SLC7A7-1:2 Yes chr3L:10884261-10886471 lnc-C1QTNF9-2:1 No - lnc-ZFYVE26-1:1 No - lnc-C15orf41-4:1 No - lnc-SMOC2-3:1 No - BFSP2-AS1:3 No - BAIAP2-DT:29 No - lnc-MTRNR2L1-16:2 No - lnc-F3-7:7 No - MIR100HG:8 No - lnc-SPACA9-1:4 Yes chr2L:6821934-6838995 lnc-TP53INP1-2:1 Yes chrX:11891732-11893745 lnc-ZNF843-2:5 No - lnc-SUSD1-1:3 No - lnc-LSS-1:2 Yes chrX:17154110-17159306 lnc-SCNN1B-1:3 Yes chr3R:29930551-29933057 lnc-TFPI2-1:1 Yes chr3L:19261394-19262437 lnc-DUSP4-1:1 No - lnc-LTF-1:1 No - INHBA-AS1:4 No - lnc-PIPOX-2:1 Yes chr3R:16068523-16098761 GRIK1-AS1:4 Yes chr3R:20860187-20866231 lnc-GLG1-1:1 Yes chr3L:21497549-21507538 lnc-SPPL3-2:1 Yes chrX:7288367-7291298 DPP10-AS1:4 No - lnc-SPAM1-2:1 No - LINC00919:4 No - lnc-GOLGA8K-1:1 No - lnc-FKBP5-1:1 No - lnc-SNX20-8:3 Yes chr3L:19003741-19045449 lnc-AAAS-1:1 No - lnc-DYTN-1:1 Yes chrX:15946936-15973159 lnc-GAMT-1:1 Yes chrX:15985473-15986808 ZBED3-AS1:8 No - lnc-MCTP2-7:1 No - lnc-SYNJ2BP-1:1 No - lnc-MYH3-1:1 No - lnc-SH3TC2-1:1 No - lnc-PLD6-1:1 Yes chr2L:14599196-14689340 LINC01011:1 No - MIR100HG:21 No - lnc-CTSV-3:2 No - lnc-FAM120AOS-1:1 No - lnc-WFIKKN2-2:1 No - CBR3-AS1:49 Yes chr3L:1618414-1620397 OSBPL10-AS1:1 Yes chr3L:1034697-1036298 lnc-GATM-1:3 No - lnc-MRPS5-1:1 No - lnc-C17orf62-1:1 Yes chr2R:4130974-4133484 PABPC5-AS1:1 No - lnc-LEKR1-43:1 No - FGD5-AS1:3 No - lnc-PAXIP1-26:1 No - lnc-CERKL-3:1 Yes chr2L:10765010-10768006 lnc-INHBA-1:1 No - lnc-MRPL3-1:1 No - lnc-CKB-2:1 No - lnc-TRIM9-2:1 No - lnc-ECI1-1:1 No - lnc-LRRC49-3:1 No - lnc-CACNA1C-1:1 Yes chr2R:13805794-13819571 lnc-LRRC32-6:4 No - lnc-DRD2-1:3 No - lnc-OR6C70-1:3 No - LRRC75A-AS1:44 No - lnc-PTGFR-1:6 No - COX10-AS1:10 No - F11-AS1:5 Yes chr2R:9599909-9601252 lnc-PGPEP1L-9:1 No - lnc-CHPF2-1:1 Yes chrX:13157445-13159508 lnc-MSR1-3:1 Yes chrX:1735945-1754065 lnc-CCNYL1-2:2 No - LINC00115:37 No - lnc-RXRG-1:1 Yes chr2L:13212335-13215350 lnc-ZNF395-2:1 No - CERS3-AS1:3 No - lnc-SYT1-3:3 No - LINC02180:17 No - lnc-SPTBN5-1:1 Yes chr2L:1884622-1944289 lnc-KRT80-4:2 Yes chr2L:20683462-20714588 LINC01910:5 No - lnc-CDH8-10:3 No - lnc-VIRMA-1:10 No - SNHG21:13 No - lnc-SLC37A4-1:36 No - lnc-NPIPB15-2:1 No - MACROD2-AS1:7 No - MIR100HG:22 No - SP2-AS1:1 No - lnc-SLF1-1:1 Yes chr2R:18761758-18774824 LINC02179:4 No - lnc-PAX9-2:1 Yes chrX:750347-758719 LINC01355:5 No - CCDC144NL-AS1:5 No - lnc-KLHL25-5:1 Yes chr2L:19502335-19508764 NHS-AS1:2 No - lnc-ZNF207-1:2 No - lnc-SGSH-1:3 No - lnc-ZNF236-1:4 No - lnc-EIF2AK4-1:4 No - lnc-PTPN2-2:7 No - MAGEA4-AS1:7 No - lnc-FAM174B-5:2 Yes chr2L:9521210-9540060 lnc-MTFR2-2:13 No - lnc-SGTB-2:1 Yes chr2L:9912911-9915044 lnc-ZNF727-5:1 No - lnc-VTI1A-3:1 Yes chr4:69326-114270 lnc-ZNF783-2:1 No - lnc-PRKACB-4:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-UPF2-1:1 Yes chr3R:31196916-31203722 lnc-FAT3-5:12 No - lnc-FAM153C-5:1 No - lnc-PGPEP1L-60:3 No - lnc-AATK-3:1 No - lnc-C1orf50-1:1 No - lnc-LIPC-1:1 Yes chr2L:13550139-13639411 lnc-ITSN2-1:1 No - lnc-ZNF200-1:1 No - lnc-TRIM29-1:3 Yes chr2L:12587625-12628135 lnc-JOSD1-1:1 No - lnc-ASB7-1:1 Yes chr2R:8914524-8918234 lnc-SLC39A11-1:2 No - lnc-RTL1-3:18 No - lnc-PLCG2-1:4 Yes chrX:16350315-16356482 TMEM9B-AS1:3 No - lnc-TNP1-4:1 No - lnc-TCIRG1-2:4 No - FARP1-AS1:1 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-TMEM18-13:1 Yes chr2R:16552258-16558486 ARHGEF3-AS1:1 Yes chr3L:4692783-4796253 LINC02133:6 No - lnc-GREM2-3:2 Yes chr2L:3872646-3902860 lnc-ST7L-1:1 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-P2RX7-1:2 No - ST8SIA6-AS1:6 No - lnc-IFITM10-1:3 No - ARHGEF26-AS1:1 Yes chr3L:16970013-16994388 lnc-USP35-4:1 Yes chr2R:17001994-17003599 lnc-LINC00483-1:4 No - lnc-CPPED1-4:1 No - lnc-BOLA2B-1:1 No - SLIT2-IT1:1 Yes chr2R:15869495-15922118 LINC02178:3 No - lnc-VRK1-3:1 No - INSYN1-AS1:29 No - lnc-TRIM41-3:16 No - lnc-NABP1-3:3 No - lnc-LRP5L-3:1 Yes chr2R:4322295-4471060 lnc-PARP10-1:4 Yes chr2R:22478379-22483054 LINC01193:4 No - lnc-ALX3-2:1 No - LINC01641:5 No - lnc-ARRDC4-1:1 No - lnc-TP53TG3C-3:1 No - lnc-CAPSL-1:1 No - lnc-TOMM20-1:1 No - lnc-DUSP22-1:1 No - lnc-ITPRIPL2-2:6 No - lnc-GNPTG-1:1 Yes chr3R:23149653-23157862 lnc-OR1G1-1:2 No - NDUFA6-DT:57 Yes chrX:18688538-18693042 lnc-GSDMD-1:1 No - lnc-LSMEM1-8:1 No - lnc-PPIF-1:1 No - lnc-RPRM-1:2 No - STEAP2-AS1:1 No - lnc-DTWD1-7:5 No - lnc-PHLPP2-1:1 No - lnc-CCDC7-15:1 No - LINC01630:17 No - lnc-TMEM220-1:2 No - lnc-ZBTB4-1:1 No - lnc-TPBGL-2:1 No - lnc-EMILIN2-1:1 Yes chr2R:8136986-8156654 lnc-NSRP1-1:1 Yes chr2R:24404595-24411074 lnc-MRPL11-1:3 Yes chr3R:8344400-8347465 lnc-BIRC2-4:2 Yes chr2R:9611139-9683858 EIF3J-DT:43 No - CCDC144NL-AS1:7 No - lnc-ODF3L1-2:4 No - NEBL-AS1:2 Yes chr3L:16676406-16711677 lnc-EIF4EBP1-1:1 No - lnc-SHF-3:2 Yes chr2R:9082395-9085717 RBFADN:10 No - lnc-PDZD9-1:2 Yes chr3L:19978713-19979812 lnc-RPRML-3:8 No - lnc-HMGA1-2:11 No - FAM66C:16 No - lnc-OPLAH-1:4 Yes chr2L:13221397-13222429 lnc-SLC6A12-3:1 Yes chr3L:21034535-21075444 lnc-NPDC1-2:1 No - INTS6L-AS1:1 Yes chrX:5738663-5747254 lnc-CHP1-3:1 No - lnc-DNAJB6-12:1 Yes chr2L:1008378-1048053 lnc-ATP2B3-1:1 Yes chr3R:18403026-18404726 lnc-RXRG-1:3 Yes chr2L:13212335-13215350 lnc-FBLL1-2:1 Yes chr2R:15869495-15922118 SRGAP3-AS2:8 No - LINC00271:16 No - lnc-TBC1D8-2:2 No - lnc-SBDS-11:2 No - lnc-OR10K2-1:4 No - lnc-TCTA-1:1 No - lnc-KRR1-1:1 No - lnc-C19orf48-1:1 No - lnc-LAMA2-2:1 No - lnc-MAT2B-3:2 No - ARHGEF26-AS1:4 Yes chr3L:16970013-16994388 lnc-GUSB-3:1 No - lnc-ALDH1A3-1:13 No - lnc-TLCD1-3:1 Yes chr3R:24822401-24825648 lnc-SLC47A2-2:9 No - LINC02188:11 No - lnc-MRPL57-3:1 No - lnc-SHANK2-5:1 No - lnc-ATP5ME-1:18 No - lnc-PARP10-1:5 Yes chr2R:22478379-22483054 lnc-CAPN9-1:1 No - lnc-FBXO47-1:1 Yes chr3L:16676406-16711677 lnc-FAM76A-1:1 No - lnc-MAT2B-3:8 No - lnc-ZIC1-20:3 No - LRRC75A-AS1:51 No - lnc-LRRC24-2:7 Yes chr3L:8170640-8175978 ZNF337-AS1:7 Yes chrX:5755574-5759751 lnc-SLC7A5-3:1 Yes chr3L:12535426-12537315 IQCH-AS1:12 No - LIN28B-AS1:1 Yes chr3L:5654681-5657384 lnc-KCNG4-5:1 No - lnc-MBOAT1-5:1 Yes chr2R:17425670-17427511 lnc-SOCS2-2:1 No - lnc-TMPRSS2-83:4 No - lnc-TSR1-1:1 Yes chr3R:25029429-25033465 LINC00937:1 No - lnc-ARF5-3:1 Yes chr4:936819-949441 lnc-DTNB-1:1 No - LINC01284:12 No - lnc-DDX51-2:1 Yes chr2R:21323430-21341847 TTTY9B:2 No - lnc-TP53TG3C-4:3 No - LINC02418:11 No - lnc-FTCDNL1-4:29 No - lnc-AATK-8:1 Yes chrX:6082634-6090201 PSMA3-AS1:15 No - lnc-C20orf196-1:1 No - lnc-USP50-2:1 Yes chr3R:21134262-21138214 CCDC18-AS1:37 No - lnc-ADAMTS18-6:1 Yes chr2L:7999670-8004286 lnc-JPH3-3:2 No - LINC02092:6 No - lnc-SPDYE6-2:2 Yes chrX:7609148-7678859 CD44-AS1:3 No - lnc-RNF26-2:1 No - lnc-CCDC182-1:1 Yes chr3R:25516118-25608423 lnc-RASL11B-2:1 No - CCDC37-DT:23 No - lnc-SLC22A31-6:8 No - lnc-PGPEP1L-60:1 No - IPO9-AS1:3 No - lnc-HRH4-6:1 No - lnc-USP7-1:1 Yes chrX:16792119-16797742 PCOLCE-AS1:4 No - lnc-PRPF18-5:1 No - LINC01887:6 No - lnc-AGR3-1:8 Yes chr3R:16374434-16403690 FGD5-AS1:4 Yes chr3L:21494019-21497494 PRR34-AS1:6 No - lnc-NOC3L-2:1 No - DNAJB8-AS1:3 Yes chr2R:16203329-16221793 lnc-CHST9-6:3 No - SLC7A11-AS1:1 No - LY86-AS1:6 No - RRM1-AS1:1 Yes chr2L:10325026-10327943 lnc-LRRC24-3:1 Yes chr3L:8170640-8175978 lnc-NUMB-4:1 No - lnc-FAM72A-7:1 No - lnc-MAPK6-1:1 No - LINC02254:5 No - lnc-LIN28B-2:1 No - ATP11A-AS1:5 Yes chrX:16405509-16414651 lnc-TCERG1-2:1 Yes chr3R:10126129-10139772 lnc-FMN2-2:1 No - lnc-CCT8L2-1:2 No - lnc-PIKFYVE-2:1 No - lnc-ARHGAP28-5:1 Yes chr3R:27266326-27273273 lnc-CDK17-1:1 No - PXN-AS1:4 Yes chr2L:19400753-19426596 lnc-PHF14-14:8 No - CASC23:4 No - lnc-ST3GAL6-1:2 No - LINC00670:1 No - LINC00470:2 No - lnc-OSBPL1A-3:1 No - lnc-PHF24-1:1 No - lnc-SMARCC2-1:1 No - SRRM2-AS1:5 Yes chr3L:1654247-1665064 THUMPD3-AS1:21 No - lnc-ASXL1-4:1 Yes chr2L:14104090-14160587 TMEM246-AS1:4 No - lnc-CTU2-5:2 Yes chr3R:2554162-3263582 lnc-PPIAL4F-4:5 No - lnc-WFIKKN2-2:2 No - lnc-OXGR1-8:3 No - DLGAP1-AS5:4 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-RASGRP1-2:1 No - ARHGAP26-AS1:2 Yes chrX:15751674-15760733 PWRN1:11 No - LINC00520:12 No - lnc-MTHFS-1:1 No - lnc-LOX-4:13 No - DLGAP1-AS4:1 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-CARHSP1-1:1 Yes chr3L:12534590-12535513 lnc-TMIGD1-3:3 No - lnc-ABHD4-4:1 No - lnc-THAP12-1:10 No - lnc-TSTD2-1:1 Yes chrX:4650015-4658259 lnc-CTXN1-1:1 No - lnc-RGS5-1:5 No - lnc-RIOK1-2:1 Yes chrX:4617564-4627206 MIR181A2HG:4 Yes chrX:1941940-2007956 lnc-POU4F2-4:1 No - lnc-PDILT-1:1 No - lnc-PIGM-2:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-HMBOX1-2:1 Yes chr2R:15515778-15532259 lnc-MAF-4:1 No - KCND3-AS1:2 Yes chr3L:19566851-19584568 lnc-TUBA1A-1:1 Yes chr3R:9731221-9733250 LINC01014:2 No - lnc-EFCAB5-1:1 Yes chr3R:24938710-24944956 lnc-PKDCC-3:1 No - lnc-MYEOV-5:1 No - lnc-MED10-3:1 No - lnc-GNAO1-1:7 No - lnc-KCNJ12-3:1 No - lnc-MEIS2-1:1 No - LINC02190:5 No - lnc-TP53TG3C-5:1 No - LINC01444:1 No - lnc-GOLGA8J-3:1 No - lnc-ZBTB25-4:1 No - ITFG2-AS1:33 Yes chr2L:9888005-9890119 lnc-GRAP-4:1 No - lnc-SPCS3-2:1 No - lnc-NCR3LG1-1:2 No - LINC00271:5 No - lnc-AUNIP-2:11 No - lnc-C17orf97-12:1 Yes chr2L:4382925-4386062 lnc-CEBPD-7:2 No - lnc-TMEM41B-2:1 Yes chr3L:8116179-8121579 OIP5-AS1:4 No - lnc-TESMIN-1:1 No - lnc-M6PR-1:1 No - lnc-LYZL1-15:21 Yes chr3L:2377655-2499226 lnc-DYNLL2-2:2 Yes chr3L:1857165-1859047 lnc-SLC37A4-1:29 No - lnc-ADPRM-1:2 No - lnc-ERN2-1:1 Yes chr3L:20309654-20313466 lnc-SLC12A7-5:2 No - lnc-C8orf74-2:1 No - LINC00482:4 No - lnc-YES1-8:7 No - lnc-C15orf41-3:1 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-CD44-1:1 Yes chr2L:737212-744395 INTS9-AS1:3 Yes chr3L:16103432-16105627 lnc-GRAP-2:1 No - lnc-TBCD-2:3 No - lnc-TRIM41-4:4 No - SPINT1-AS1:30 No - UBL7-AS1:13 No - lnc-ERCC4-1:1 No - ITPK1-AS1:1 No - ADAMTS19-AS1:2 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-GTPBP8-2:2 No - lnc-DHRS12-2:1 Yes chr2L:10423291-10425482 THUMPD3-AS1:14 No - CDKN2B-AS1:2 Yes chr3R:25036944-25037982 lnc-DISP1-1:1 No - lnc-PTPRZ1-3:18 Yes chr4:1230837-1271759 lnc-NFE2L2-5:4 No - CFTR-AS1:3 Yes chr2L:8355678-8362469 lnc-CA7-1:1 Yes chrX:7731779-7734651 lnc-PRR15L-4:1 Yes chr2R:21007755-21009576 lnc-PCED1B-5:8 No - lnc-MYEF2-1:3 No - LINC01572:7 No - PSMA3-AS1:17 No - lnc-LAMA5-1:1 Yes chr2R:13958545-13960404 MACC1-AS1:1 No - lnc-BAZ2B-1:2 No - lnc-SOX11-1:1 Yes chr2R:23978801-23985177 lnc-ADAM2-2:1 No - lnc-C16orf46-1:1 No - lnc-QDPR-2:1 No - lnc-SOX15-1:1 No - lnc-INPP4B-2:2 No - lnc-TP53TG3-1:1 No - SNHG21:12 No - lnc-ARHGAP15-2:1 Yes chrX:15853421-15854970 lnc-NR2E3-3:3 No - PCBP1-AS1:17 No - PCAT4:2 No - lnc-BCAP31-5:1 Yes chr4:32478-43778 LINC01030:4 No - PCBP1-AS1:21 No - lnc-YIF1A-1:2 Yes chr3R:21266029-21269060 lnc-CDRT15-3:1 No - lnc-CKAP2-1:1 No - lnc-BBOX1-1:2 Yes chr2L:13982743-14001248 lnc-CBLN2-1:1 Yes chrX:13445903-13527282 PWRN1:25 No - lnc-ACACB-1:3 No - DLGAP4-AS1:7 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-DUOXA1-2:1 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-ANKRD11-1:1 Yes chrX:2694392-2698211 lnc-OR2AT4-1:1 Yes chr2L:9521210-9540060 ACTN1-AS1:1 No - lnc-SRCIN1-1:9 Yes chrX:20469955-20510694 CSE1L-AS1:4 No - lnc-AGAP5-1:5 No - lnc-RWDD4-2:1 No - LINC00659:6 No - lnc-PDK3-1:1 No - lnc-TPCN2-5:2 No - MIR100HG:14 No - lnc-SAT2-1:1 No - lnc-IL15RA-1:2 No - lnc-CNBD1-4:5 No - DLGAP1-AS1:5 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-PSMB7-1:1 No - lnc-CALB2-4:1 No - lnc-BRD1-4:1 No - lnc-NDUFA5-1:1 No - lnc-SIN3A-6:1 No - lnc-ENGASE-1:1 Yes chr3L:10481412-10594012 LINC00623:51 No - lnc-FAM103A1-1:1 No - lnc-LRRC10-1:2 Yes chr2R:13445700-13446309 OIP5-AS1:16 No - LINC01963:12 No - lnc-PRDM13-4:1 Yes chr3R:13057755-13078124 RORA-AS2:1 Yes chr2R:10203995-10237348 lnc-PLCG2-1:13 Yes chrX:16350315-16356482 lnc-KCNMA1-1:1 Yes chr3R:26989035-26989852 LINC01030:1 No - lnc-USO1-2:1 No - lnc-SLC37A4-1:22 No - lnc-FARSB-1:1 No - lnc-FAM237B-2:4 Yes chr3L:3515751-3610521 lnc-CCRL2-1:1 No - lnc-NBPF6-8:5 No - lnc-PSMD7-5:1 Yes chr4:501810-540874 LINC02465:8 No - lnc-FAM50B-1:3 Yes chr3R:27919844-27921089 PCBP1-AS1:64 No - LINC01541:2 No - lnc-NOTUM-1:1 No - LINC02436:9 No - lnc-NSUN6-1:5 No - THUMPD3-AS1:22 No - PIK3IP1-AS1:1 No - lnc-FANCF-3:3 Yes chr2L:2391660-2410662 LOXL1-AS1:15 Yes chr2R:21789623-21791580 lnc-PPRC1-1:1 No - lnc-SNAPC3-11:8 Yes chr4:268175-276369 lnc-CCDC28A-1:4 No - lnc-ADGRV1-3:1 No - lnc-COPG2-19:2 No - lnc-HSPA4-4:1 No - lnc-TASP1-1:1 No - lnc-MMP24OS-73:1 No - NUTM2A-AS1:16 No - lnc-GRAMD2A-1:1 Yes chr2R:12337797-12339544 LINC02284:7 No - lnc-SAMD11-7:2 No - lnc-NKAIN3-1:2 No - lnc-BLZF1-1:1 Yes chr3R:9679939-9681502 lnc-ZDHHC17-20:1 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-ELAVL4-4:1 Yes chr2R:16024628-16028161 LRRC75A-AS1:73 No - lnc-TMEM250-2:7 No - lnc-FOXA1-3:1 Yes chrX:750347-758719 LINC02568:15 No - lnc-AIPL1-2:3 No - NUTM2A-AS1:10 No - MME-AS1:1 Yes chr3R:27057908-27064199 LINC02246:21 No - lnc-BCKDK-1:1 Yes chrX:5873840-5876853 lnc-CNOT2-1:1 No - NAV2-AS2:2 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-NPIPA1-1:1 Yes chrX:21324046-21328150 lnc-ADAM19-2:1 No - lnc-CXorf67-1:1 No - lnc-UBE2R2-1:1 Yes chr2R:8067977-8078815 lnc-GNAT2-1:1 Yes chrX:13830741-13845866 LINC01915:7 No - lnc-GIP-2:1 Yes chrX:10787869-10824277 lnc-COX14-1:1 Yes chrX:6257668-6267228 WWC2-AS2:1 No - lnc-ADPRM-1:3 No - lnc-ARC-2:1 Yes chr3L:13044434-13046894 lnc-MEGF11-1:1 No - lnc-DEPP1-2:12 No - LINC01443:1 No - lnc-SCG3-1:1 Yes chr3R:30532607-30578905 LINC02592:7 No - lnc-STRN3-1:3 No - lnc-BTG4-1:1 No - lnc-CHMP7-1:3 No - lnc-BTF3-4:1 No - MORC2-AS1:1 No - lnc-SNRPD1-1:1 Yes chr3L:12733364-12734611 lnc-OR2T29-1:1 No - lnc-FSIP1-4:4 No - lnc-MIA3-1:1 No - lnc-MTRNR2L1-16:1 No - LINC02184:3 No - lnc-ZNF99-2:2 No - lnc-TMEM114-3:1 No - lnc-PLEKHA8-3:2 No - lnc-SPTBN5-2:2 No - HAND2-AS1:7 No - lnc-MARCKS-3:1 Yes chr3L:4626734-4629467 lnc-S100A13-1:1 No - LINC01904:3 No - IGBP1-AS1:1 Yes chr2L:13367617-13369021 PCBP1-AS1:26 No - lnc-ART5-1:2 No - lnc-ALDH7A1-1:3 No - LINC01206:9 No - lnc-DNAJB6-10:5 Yes chr2L:1008378-1048053 lnc-CACNA1B-1:1 No - lnc-RGS5-1:7 No - lnc-RBPMS-1:1 Yes chr3L:4287038-4288349 lnc-SNRPN-8:101 No - lnc-WSB1-3:1 No - lnc-MPHOSPH8-9:4 No - CELF2-AS2:5 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-HDDC3-2:1 Yes chr3R:9412548-9417264 lnc-THBD-1:2 No - LINC00607:7 No - CYP1B1-AS1:17 Yes chr3L:5590083-5592571 lnc-UQCRFS1-3:28 No - lnc-ALK-1:2 No - lnc-CNN3-1:2 Yes chr3L:4277962-4281585 lnc-DPP4-2:3 No - lnc-YTHDF1-4:1 No - MIR100HG:17 No - ZBED3-AS1:16 No - lnc-RSPRY1-1:1 No - lnc-FAM83B-1:1 No - lnc-MAX-2:3 No - lnc-NOC4L-4:8 Yes chr3R:28748384-28751661 ARHGEF26-AS1:2 Yes chr3L:16970013-16994388 lnc-ATG2B-16:3 Yes chr2R:19663919-19669832 lnc-DNAJC25-4:1 No - MKLN1-AS:8 Yes chr2R:12628697-12632378 LINC00937:9 No - RBFADN:9 No - lnc-YIF1A-3:1 Yes chr3L:12746616-12750056 lnc-BAZ1A-4:5 Yes chr3L:5152678-5154777 lnc-BATF3-2:15 No - LINC02407:22 No - LINC01654:4 No - lnc-RASGEF1B-1:1 Yes chr2R:17514217-17517445 lnc-C17orf58-1:1 No - lnc-TMEM178A-1:5 No - lnc-C11orf94-1:1 Yes chr3L:1196317-1199339 lnc-FAM98B-5:2 No - ID2-AS1:12 No - LINC01956:17 No - lnc-SHISA9-3:1 No - lnc-VSTM4-1:1 No - lnc-YES1-8:4 No - lnc-NOMO3-1:1 No - lnc-EVPLL-3:4 No - lnc-PEA15-1:1 No - LINC02281:8 No - lnc-CCDC102B-3:1 No - lnc-CACNA1B-1:2 No - lnc-CORIN-2:1 No - ARHGAP22-IT1:3 No - lnc-ANKRD20A2-2:2 No - lnc-FAM167A-6:1 Yes chrX:16323286-16325768 PSMA3-AS1:19 No - lnc-FKBP14-1:1 Yes chr3L:8282528-8289870 SLC8A1-AS1:9 No - lnc-CALB2-2:1 No - lnc-IVNS1ABP-1:1 No - ANKRD34C-AS1:6 No - CDKN2B-AS1:20 Yes chr3R:25036944-25037982 ZBED3-AS1:6 No - lnc-PDGFB-5:1 Yes chr3L:21306138-21318020 lnc-FAM189A1-3:1 No - TSPEAR-AS1:4 No - lnc-N4BP2-1:1 No - lnc-DHRS7-1:5 No - lnc-CCDC146-6:2 No - lnc-LSS-1:1 Yes chrX:17154110-17159306 EGFLAM-AS3:1 Yes chr2R:16031930-16047243 lnc-ZNF217-2:4 No - lnc-ACBD6-4:1 No - LINC01606:1 No - lnc-TRIM16-4:1 No - LINC01917:6 No - lnc-PUS3-2:5 Yes chr3L:27279316-27422159 CCDC144NL-AS1:11 No - lnc-SLC52A1-2:3 No - lnc-FSIP1-4:5 No - lnc-CXCL16-1:1 Yes chr3L:18745856-18746623 lnc-ZNF503-2:1 Yes chr3R:26989035-26989852 lnc-TP53TG3-2:1 No - C4B-AS1:1 Yes chr2L:8074117-8082982 lnc-LMOD1-2:1 Yes chr2L:19796365-19958424 LHX5-AS1:1 Yes chrX:8756539-8805804 lnc-C1orf74-1:1 No - lnc-C6orf120-1:1 Yes chr2L:6686791-6709086 lnc-SPRYD3-1:7 No - lnc-WWOX-1:2 No - PGM5P3-AS1:10 Yes chr2R:12180493-12182373 lnc-NUB1-2:1 No - PCBP1-AS1:132 No - lnc-KIF3B-1:1 Yes chr2R:14161430-14163054 MIR4435-2HG:21 No - lnc-MNS1-2:1 Yes chr2R:24578247-24579827 lnc-CENPM-1:1 No - lnc-GDPD5-1:1 No - CFLAR-AS1:2 No - ACOXL-AS1:7 No - HHATL-AS1:1 Yes chr3L:16673964-16676264 KANSL1-AS1:5 Yes chr3R:15793782-15802102 LINC00639:4 No - lnc-NIM1K-1:2 Yes chr2R:16336090-16341242 lnc-KDM5A-1:1 No - lnc-ADA-3:13 No - lnc-TWIST1-2:1 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-FOXG1-6:17 Yes chr3R:18303279-18314407 lnc-RECQL5-1:1 Yes chr2R:9285310-9286634 lnc-STYX-5:2 No - GABPB1-AS1:4 Yes chr3L:324985-327992 lnc-TMEM65-3:1 Yes chr3L:8905918-8912671 lnc-DTHD1-5:1 No - lnc-DEGS2-5:1 Yes chr2R:19141632-19163705 lnc-LINC00854-1:29 No - LINC01900:5 No - LINC01088:4 Yes chr3L:9972312-9974023 lnc-CD109-3:1 No - lnc-C15orf48-4:8 No - lnc-OR6C70-1:4 No - CDKN2B-AS1:3 Yes chr3R:25036944-25037982 lnc-PNPLA3-1:1 No - lnc-HYI-3:1 No - lnc-POTEI-1:1 No - lnc-LIMS3-2:9 No - OIP5-AS1:10 No - lnc-FARSB-2:1 Yes chr2R:8665813-8683022 HDHD5-AS1:24 No - lnc-LPIN2-1:2 No - FEZF1-AS1:3 Yes chr2L:1950239-1970362 lnc-LRRC3C-1:1 No - CNTFR-AS1:5 No - lnc-CALML6-1:1 No - lnc-CES5A-3:5 No - lnc-VCL-1:1 Yes chr2R:7243024-7245776 DSCAM-AS1:2 Yes chr3R:17473935-17505667 lnc-ROS1-1:1 No - LINC01227:1 No - lnc-C10orf71-1:1 No - lnc-C17orf97-1:4 No - lnc-ADAM19-2:9 Yes chr3R:15333266-15338365 NECTIN3-AS1:16 No - lnc-MYEF2-9:3 Yes chr2R:17672839-17683499 lnc-FAM78A-3:2 Yes chr2R:22918937-22924742 LINC01852:21 No - lnc-CTDSP2-4:2 No - LINC02436:10 No - LMNB1-DT:13 No - lnc-SMNDC1-2:1 No - lnc-IPO5-1:1 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-DTYMK-4:1 Yes chrX:2141489-2144937 lnc-ST7-1:1 No - lnc-ARL16-1:1 Yes chr2L:2739986-2743377 lnc-ACOXL-1:1 No - lnc-CYBA-5:1 No - lnc-SGSH-1:5 No - lnc-AMELY-2:9 No - UGDH-AS1:3 No - lnc-NWD2-3:2 No - lnc-DLX2-4:19 Yes chrX:13214409-13258490 lnc-MRPS22-1:6 No - lnc-FSIP1-6:3 No - lnc-ELN-3:2 No - HAND2-AS1:29 No - lnc-MEIS2-3:1 Yes chr3L:15832464-15833947 lnc-RAB11FIP2-2:2 No - TMLHE-AS1:3 Yes chr3R:20406615-20407871 lnc-KCTD7-2:14 Yes chr3L:1295913-1298497 lnc-ZNF778-1:6 Yes chr3L:12750119-12753402 LINC00937:2 No - lnc-LMBRD1-5:23 No - lnc-ZWINT-4:1 Yes chr3R:11893512-11949129 FLNB-AS1:4 No - lnc-SHPK-1:1 No - lnc-C9orf66-1:1 Yes chr2L:94739-102086 lnc-TMEM63A-1:1 No - lnc-EPN2-3:1 No - lnc-TVP23A-1:1 No - lnc-HSPA4-2:2 No - lnc-CDK17-2:1 No - lnc-NKX6-3-5:1 Yes chrX:7106272-7110321 lnc-UAP1L1-5:2 No - lnc-ZNF469-5:1 No - HEXA-AS1:1 Yes chr2R:12487451-12507333 lnc-GLDN-1:1 No - lnc-ANP32A-3:3 No - lnc-ABCD2-1:1 No - lnc-UQCRFS1-1:2 No - lnc-FBXO31-3:1 No - lnc-SEPHS2-2:1 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-SWAP70-2:1 Yes chr3R:11789293-11796948 lnc-ZC3H3-1:1 No - lnc-LIG3-1:3 No - RGPD4-AS1:5 No - CDKN2B-AS1:21 Yes chr3R:25036944-25037982 lnc-HIST2H3C-1:1 No - NRSN2-AS1:2 No - lnc-PBX3-2:1 Yes chr2R:14411825-14413851 lnc-RPRML-3:11 Yes chr3L:5366455-5367381 FOXC2-AS1:1 Yes chr3L:21474133-21476479 lnc-CNN3-1:1 Yes chr3L:4277962-4281585 lnc-MFAP4-1:1 Yes chr3R:24625671-24634714 lnc-GPR83-1:1 Yes chr2L:11282090-11284335 COL4A2-AS1:1 No - lnc-PTX3-4:3 No - lnc-TEFM-2:1 Yes chr2R:8922785-8925346 lnc-TRIM69-1:1 No - LINC01015:6 No - lnc-B9D1-1:1 Yes chr3L:7528780-7540012 lnc-TNP1-3:2 No - lnc-TMEM126B-1:1 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-ADGRL2-3:2 No - lnc-EPCAM-3:8 Yes chr2L:14362069-14366840 lnc-RAP1GDS1-3:2 No - lnc-DIO2-5:2 Yes chr3R:22468512-22486969 lnc-CALM1-5:1 Yes chr2R:6209782-6214122 lnc-SERTM2-1:3 No - lnc-SPRYD3-1:2 Yes chr3R:9528238-9533011 lnc-B4GALT6-2:1 No - lnc-FAM151A-1:1 No - lnc-THBS1-7:4 No - USP3-AS1:8 No - lnc-SLC16A11-5:1 No - lnc-TSPAN12-1:1 Yes chr3L:19566851-19584568 lnc-MACC1-1:7 No - lnc-NPIPB11-1:1 No - lnc-PPIAL4F-4:1 No - lnc-NTN1-2:1 No - LINC00561:3 No - lnc-ANKS4B-5:3 Yes chrX:16881347-16882790 SGMS1-AS1:6 No - lnc-TMEM218-2:1 No - lnc-RANBP9-1:1 No - lnc-DPP4-2:2 No - lnc-PRB1-1:2 No - lnc-TSPYL5-1:1 No - LINC02252:7 No - lnc-ETNK1-5:1 Yes chr4:800436-834393 lnc-LRRC40-1:1 Yes chr2L:9912911-9915044 lnc-KRT80-1:2 No - lnc-STX3-1:1 No - lnc-OSBPL10-1:1 No - lnc-FSCN1-2:1 No - lnc-NFX1-1:1 No - lnc-STX8-3:1 Yes chrX:14604012-14653928 lnc-TRMT61B-2:1 Yes chr2L:5746157-5747961 LINC02403:3 No - SLCO4A1-AS1:3 Yes chr2L:6625138-6632407 lnc-ZNF23-1:1 No - lnc-COPS3-1:1 No - LINC00473:5 No - FAM170B-AS1:3 No - lnc-PSMD11-1:1 No - LINC01982:3 No - lnc-EPN2-1:10 No - lnc-TIAL1-1:2 Yes chr3L:13477541-13483515 LEF1-AS1:9 No - LINC01896:38 No - lnc-TRIM44-3:1 No - lnc-SOCS6-6:1 No - lnc-TMEM232-1:1 No - lnc-TTC30B-1:1 No - HM13-AS1:1 Yes chr2L:542786-544653 lnc-OSR2-2:1 Yes chr3R:29935978-29948207 OVOL1-AS1:6 Yes chrX:5048273-5070929 lnc-SMG1-5:13 Yes chr3L:9597764-9614001 MAFTRR:7 No - LINC00661:11 No - lnc-UBLCP1-12:1 No - lnc-CBWD2-1:1 No - lnc-AMIGO1-2:8 No - lnc-NEFL-6:13 No - CATIP-AS2:1 No - lnc-MEF2A-10:1 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-GSTM3-1:1 No - USP3-AS1:13 No - lnc-GCM1-1:1 No - lnc-SLC5A1-1:1 No - FOXG1-AS1:2 Yes chr2L:3836840-3839185 lnc-TOX4-1:1 Yes chr2L:11434311-11445614 lnc-MARK1-3:1 No - lnc-NID2-1:1 No - LINC01491:7 No - lnc-LONP2-6:3 No - lnc-TTC8-1:2 Yes chrX:7682338-7709385 VPS13A-AS1:2 No - lnc-PTGDR2-1:1 No - lnc-ZDHHC17-19:2 Yes chr2L:19796365-19958424 LINC00582:1 Yes chr3R:15361692-15362850 lnc-DZIP1-3:1 Yes chr3L:18872747-18878245 lnc-TMEM106C-1:1 No - SZT2-AS1:1 No - lnc-HS1BP3-2:1 No - lnc-MYEF2-1:1 No - lnc-ARMC1-2:1 No - ZNF630-AS1:1 No - ANKRD44-IT1:1 No - lnc-ATP6V1B2-2:1 No - LINC00189:1 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-GATM-1:5 No - lnc-RDX-1:10 No - lnc-GLOD4-1:1 Yes chr3L:19589072-19590524 lnc-UTP11-1:6 No - lnc-MAN2C1-2:2 No - ENTPD1-AS1:8 No - ARHGAP26-AS1:3 Yes chrX:15751674-15760733 MAMDC2-AS1:9 No - lnc-MED6-1:2 Yes chr3R:9766031-9768984 lnc-F2RL2-1:1 No - lnc-RGS9-1:18 No - lnc-COL8A2-1:1 No - CLYBL-AS2:1 No - lnc-AGO2-1:1 Yes chr2R:13943387-13958089 lnc-SLC19A1-3:1 Yes chr3L:21844788-21932702 lnc-RNASEH1-1:9 Yes chr2R:7931054-7932380 LINC00482:1 No - LINC01554:6 No - FAM87A:8 No - lnc-SMARCA5-4:14 No - lnc-PPIAL4F-4:2 No - SSSCA1-AS1:4 No - lnc-ZSWIM2-2:1 No - lnc-RBBP9-4:1 No - lnc-OPALIN-1:1 Yes chr3R:24719697-24749125 lnc-NT5DC1-2:2 No - lnc-GABRB2-1:1 Yes chrX:15921955-15924558 lnc-SLC16A3-2:1 No - lnc-SLC37A4-1:26 No - lnc-TRIM41-3:17 No - lnc-SPAG1-3:2 No - lnc-FAM186B-1:1 No - OPA1-AS1:1 Yes chr2R:14230611-14235449 PRKCA-AS1:4 Yes chr2R:16898535-16901575 lnc-SLC39A11-1:23 No - MIR200CHG:13 No - lnc-STX6-2:1 No - lnc-ABI3-6:1 No - lnc-CCDC117-1:1 No - lnc-HAO2-2:5 No - lnc-FAM153A-2:2 No - lnc-RPAP1-1:3 No - lnc-ARHGAP24-1:1 Yes chr2L:10247502-10250501 ALMS1-IT1:2 No - lnc-FOXI2-1:1 No - lnc-LYPD6-2:1 Yes chrX:9194750-9196414 lnc-SOX15-1:4 Yes chr2L:21573389-21577103 PCAT1:56 No - PCBP1-AS1:65 No - lnc-TMEM105-2:5 No - lnc-SNX33-1:1 Yes chr2R:17518223-17519027 lnc-OR4F29-1:8 No - lnc-CDYL2-6:1 Yes chr2R:24475386-24476032 EVX1-AS:3 Yes chr2R:9979319-9980795 lnc-MBP-3:1 No - lnc-FMN1-1:2 No - C21orf91-OT1:2 No - MIR193BHG:3 No - lnc-TMEM170B-2:10 No - UNC5B-AS1:3 Yes chr2R:15340472-15368300 lnc-DHX40-1:1 Yes chrX:15827986-15835490 SPATA42:1 No - lnc-RPP40-3:1 No - DSG1-AS1:5 No - lnc-ATG9B-2:2 No - lnc-RNF111-1:1 No - lnc-TMEM35A-1:1 Yes chr3L:18997875-19000608 lnc-KDM8-2:1 No - lnc-YIF1A-4:1 Yes chr3L:12746616-12750056 lnc-NPAP1-8:2 No - lnc-IMPACT-2:1 Yes chr2R:23992138-23995055 lnc-CRLF3-3:1 No - lnc-ARPP19-1:1 Yes chr2R:11619479-11640941 lnc-KCTD7-2:15 Yes chr3L:1295913-1298497 lnc-SALL1-3:1 No - lnc-RBMXL3-1:1 Yes chr3R:8578205-8629996 lnc-PLA2G7-2:3 Yes chrX:17844949-17848223 lnc-TDRD5-1:1 No - LINC02002:10 No - LAMTOR5-AS1:33 No - lnc-ADSS-1:1 No - lnc-PTTG1-3:1 Yes chr2L:9495474-9520696 lnc-COX10-4:1 Yes chrX:19248639-19252045 lnc-ACTR6-1:1 No - lnc-ZFC3H1-4:1 Yes chrX:23012140-23013409 lnc-TXLNB-3:1 Yes chr3R:30277932-30372382 lnc-SPINK9-1:1 No - lnc-FAM228A-1:1 Yes chr2L:21134439-21142347 lnc-CPHXL-1:5 No - lnc-OPCML-3:20 Yes chr3L:5424109-5442399 LINC00472:46 No - lnc-KMT2C-1:4 Yes chr2L:14359252-14361411 lnc-PITPNC1-1:1 Yes chr3L:14789935-14801089 lnc-HPS4-1:1 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-DISP1-1:11 No - lnc-PLCG2-1:8 Yes chrX:16350315-16356482 lnc-ZGRF1-5:1 Yes chr3L:7655389-7718395 lnc-VWDE-1:1 Yes chr2L:17486806-17497208 lnc-STPG4-1:2 Yes chr2R:6209782-6214122 lnc-GABPA-5:1 No - lnc-AP3S1-5:1 No - ZNF503-AS1:3 No - lnc-DBX1-5:1 No - lnc-HNRNPA0-4:4 No - lnc-SETDB1-1:2 No - lnc-FSHB-1:1 No - lnc-SGPL1-2:1 No - LINC02185:27 No - lnc-HEATR6-1:8 No - lnc-WDR73-4:2 No - lnc-C16orf58-4:1 No - lnc-IRX2-5:1 Yes chr3L:12693639-12710249 lnc-HRH4-9:1 Yes chr2R:14435899-14465881 lnc-CHAF1B-2:1 No - lnc-CREB5-2:8 Yes chr3R:19862517-19864393 lnc-IGIP-5:1 No - EGFLAM-AS2:4 Yes chr2R:16031930-16047243 lnc-SHCBP1-1:2 No - lnc-TFDP2-2:1 No - lnc-MRPS16-1:5 Yes chr3R:11220268-11221639 ZNF503-AS1:11 No - lnc-IFT46-1:5 No - LINC00941:9 No - lnc-TCIRG1-1:2 Yes chr2L:21614232-21624080 ENTPD1-AS1:4 No - lnc-LNPEP-6:5 No - lnc-GNG11-2:2 Yes chr3L:19261394-19262437 lnc-AMELY-5:1 No - lnc-TAF6-1:1 No - OVOL1-AS1:5 Yes chrX:5048273-5070929 MCPH1-AS1:6 Yes chr2R:11895997-11903918 PSMA3-AS1:11 No - lnc-TNK2-2:1 No - lnc-PRPF18-7:1 No - lnc-SLC25A47-1:1 Yes chr3R:9265027-9266904 lnc-CFC1B-1:1 No - CACNA1C-IT1:1 Yes chr2L:16165831-16190540 STPG2-AS1:1 No - lnc-BCL11B-7:1 No - lnc-BRF2-4:1 No - lnc-FAM103A1-2:2 No - lnc-PLAT-3:5 No - lnc-CCDC82-3:3 No - lnc-RPS27L-2:5 Yes chr3L:8545001-8574409 lnc-PPIE-2:1 Yes chr2R:7995438-7998278 lnc-GPER1-2:4 No - lnc-SKA2-1:1 No - lnc-PITPNC1-2:1 Yes chr3L:14789935-14801089 SLC6A1-AS1:1 Yes chr4:629691-635350 lnc-GARS-3:1 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-DEXI-1:2 No - EIF1AX-AS1:1 Yes chr3R:18274665-18283005 lnc-WSB1-1:1 No - LINC02167:6 No - lnc-UQCRFS1-1:3 No - lnc-HRH4-6:3 No - lnc-MUC20-4:1 No - lnc-TMC5-1:1 Yes chr3R:16456052-16458233 lnc-MRPL3-2:1 No - CHKB-DT:35 Yes chr2L:21614232-21624080 lnc-CD44-2:1 Yes chr2L:737212-744395 TBX5-AS1:5 No - lnc-GTF2I-1:2 No - lnc-GAN-1:1 No - lnc-UBE2N-1:7 No - ANKRD33B-AS1:1 No - lnc-TP53TG3-7:2 No - IQCH-AS1:1 No - ARHGEF7-AS1:5 Yes chr2L:20350434-20365254 lnc-FITM2-1:2 No - lnc-MEIS2-2:2 No - lnc-A1CF-3:1 Yes chr2L:3622074-3656953 lnc-CFC1-2:2 No - GRK5-IT1:1 Yes chr3R:31405245-31457873 lnc-GOT2-8:1 No - lnc-LRRC75A-1:2 No - lnc-RPLP1-12:48 No - lnc-ALDH1A2-4:1 No - lnc-F3-7:10 No - lnc-TMPRSS2-83:19 No - lnc-KRR1-4:11 No - MIR100HG:28 No - MAP3K20-AS1:27 No - lnc-ESR2-1:1 No - lnc-MEF2A-3:2 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-ALDH3A2-2:2 No - MAGI2-AS2:1 Yes chr2R:21129463-21142261 lnc-RPS6KA4-1:6 No - lnc-FAM163A-1:2 No - LINC02400:23 No - lnc-CAMSAP2-1:1 No - LINC01088:11 Yes chr3L:9972312-9974023 PCBP1-AS1:66 No - lnc-DGCR6-6:22 No - CCNT2-AS1:9 No - LINC00937:10 No - lnc-FLI1-2:1 Yes chr3R:23290231-23346167 lnc-FBXL20-1:2 Yes chr2R:11641477-11651616 lnc-ZNF423-3:1 Yes chr3R:6368965-6371115 lnc-CCT8L2-1:1 No - lnc-TK2-7:1 No - lnc-ECEL1-2:2 Yes chr2R:22208464-22210765 lnc-PAPOLA-1:2 No - HOXC-AS2:1 No - lnc-ST3GAL4-55:13 No - lnc-RHOC-1:1 No - lnc-LGALS9B-1:1 No - NREP-AS1:2 No - lnc-NPB-5:1 Yes chr3R:17534815-17537136 lnc-MANSC4-10:1 No - lnc-DICER1-1:3 No - lnc-DHRS7B-1:2 Yes chr3L:5780051-5784685 lnc-YBEY-5:1 Yes chrX:17154110-17159306 lnc-C17orf80-3:5 No - lnc-RWDD2B-1:1 Yes chr2R:8904844-8906990 TTTY14:12 No - lnc-PSMA2-2:1 Yes chrX:9608946-9623243 lnc-CYP11B1-1:2 No - lnc-TLE3-5:1 No - lnc-THRSP-3:1 No - lnc-CA5A-1:1 No - lnc-TEX50-1:1 No - lnc-CISD2-4:1 Yes chr3R:29950796-29969447 lnc-TRMT112-1:1 No - lnc-FBXO31-12:6 No - lnc-C17orf51-5:1 No - LINC00189:5 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-BRD7-3:1 Yes chr3R:6368965-6371115 lnc-EZH2-4:1 Yes chr3L:12146519-12156990 lnc-TESMIN-1:2 No - lnc-NBPF6-8:3 No - lnc-AP3M1-2:1 Yes chrX:2214347-2222567 lnc-SBF2-1:1 No - lnc-ALX4-7:1 No - LINC01770:18 No - lnc-CPLX1-2:1 No - MAPT-AS1:3 No - lnc-B4GALNT1-1:7 Yes chr3L:995982-1034875 lnc-C16orf78-2:1 No - lnc-SMIM11B-5:3 No - lnc-MAP2K4-1:1 No - TTC21B-AS1:9 No - lnc-SUZ12-2:1 No - PLCB1-IT1:1 Yes chr2L:305935-355566 lnc-ART5-1:1 No - lnc-OVGP1-2:1 Yes chr3L:3090985-3106958 lnc-PKD1L3-2:1 No - LINC01411:10 No - PLS1-AS1:1 Yes chrX:17285704-17301929 UST-AS1:1 Yes chr3L:19298623-19337609 lnc-SLC37A4-1:37 No - lnc-TLCD1-3:2 Yes chr3R:24822401-24825648 lnc-WNT11-2:1 Yes chr2L:13286777-13289556 lnc-NLRP12-1:1 No - HAND2-AS1:8 No - lnc-PRC1-5:1 No - lnc-SNW1-3:1 Yes chr3R:22468512-22486969 LINC00327:6 No - lnc-SRCIN1-1:10 Yes chrX:20469955-20510694 CD81-AS1:1 Yes chr3R:25872900-25881427 lnc-GABPA-3:4 No - lnc-PRR15L-2:1 Yes chr3R:7810532-7811912 lnc-ZNF705D-2:26 No - lnc-LRRC24-3:3 Yes chr3L:8170640-8175978 lnc-F3-7:20 No - lnc-SRCIN1-1:12 Yes chrX:20469955-20510694 lnc-DMAC1-6:1 Yes chr2L:19586623-19732069 UBL7-AS1:2 No - lnc-TRIM45-1:2 No - LHFPL3-AS1:8 Yes chr3L:1885657-1891462 lnc-IFIT2-1:1 Yes chr2L:10643971-10645891 lnc-TLR10-3:1 No - lnc-ODF4-2:3 No - ZEB2-AS1:19 Yes chr3R:30765926-30789202 MIR1-1HG-AS1:32 No - FAM198B-AS1:23 No - lnc-TRIM29-1:1 Yes chr2L:12587625-12628135 lnc-C15orf48-2:1 No - lnc-ITGAL-2:1 No - lnc-SMARCC2-4:1 No - lnc-FSIP1-4:12 No - lnc-TBC1D31-2:1 No - lnc-TSPOAP1-1:4 No - lnc-TTC8-3:1 Yes chrX:7682338-7709385 lnc-GDI2-1:1 No - lnc-PIPOX-4:8 Yes chrX:6295389-6298970 TTC39C-AS1:4 No - lnc-CA7-2:1 Yes chrX:7731779-7734651 LINC01029:3 No - lnc-GPR82-1:1 No - lnc-OSBPL6-1:1 No - lnc-XKR6-3:1 No - HOXC-AS3:2 No - A2ML1-AS1:1 No - NDUFA6-DT:72 No - EVX1-AS:5 No - CASC16:8 No - lnc-FNBP1L-7:1 Yes chr2L:6007364-6012338 lnc-SGK1-3:8 No - lnc-TTC5-2:1 No - lnc-GOT2-1:1 No - lnc-NPY2R-1:1 No - lnc-DNAAF1-1:1 No - lnc-LIMS3-2:1 No - lnc-SRSF6-1:1 No - lnc-STARD5-1:1 No - FAM230B:2 No - lnc-KIAA0930-3:1 No - lnc-KCNJ12-2:1 No - lnc-RFPL3-1:2 No - HAND2-AS1:25 No - lnc-PLEKHG4-1:1 Yes chr2L:21104568-21134255 lnc-ELFN2-2:6 No - lnc-EMC3-1:14 Yes chr2L:10731400-10732423 lnc-MED24-1:2 No - lnc-BCL11A-18:7 No - lnc-LCOR-1:2 Yes chr3R:21949114-22014539 lnc-TP53TG3C-4:1 No - lnc-B3GALT5-1:4 No - lnc-SCN9A-72:1 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-CDIPT-1:4 No - GRPEL2-AS1:1 Yes chr2R:13554077-13555606 lnc-STYX-2:1 Yes chr3R:29738275-29741952 lnc-GLS-1:1 Yes chr3R:20535323-20552311 lnc-C1orf232-1:5 No - lnc-PAFAH1B1-2:1 Yes chr2R:16186584-16194277 lnc-RABEP2-2:2 No - DHRS4-AS1:11 Yes chr3L:5140440-5141646 MIR4435-2HG:26 No - lnc-C2CD5-3:7 No - lnc-FAM153A-2:3 No - MIR1302-2HG:5 No - MPRIP-AS1:1 Yes chr2L:14599196-14689340 lnc-MYEF2-1:2 No - lnc-OSBPL9-1:1 Yes chr2R:24768314-24775265 lnc-HNRNPA1-2:1 Yes chr2L:8209626-8211122 DLGAP4-AS1:1 No - lnc-NT5DC3-2:1 No - lnc-RTN3-2:1 No - lnc-OTOL1-2:1 No - KCND3-AS1:5 Yes chr3L:19566851-19584568 lnc-RBM11-2:3 No - lnc-TSN-4:1 Yes chr3L:21172853-21183278 lnc-TIPIN-2:1 No - lnc-STYX-1:1 Yes chr3R:29738275-29741952 TMEM108-AS1:1 No - EGFLAM-AS1:1 Yes chr2R:16031930-16047243 lnc-RBP5-2:2 Yes chrX:1866832-1869061 CALML3-AS1:1 No - lnc-FBXO28-1:1 No - lnc-KNOP1-1:1 No - lnc-SUMF1-5:7 Yes chr3R:8126605-8129835 lnc-ARAP2-1:1 Yes chrX:16943290-16956234 WASIR2:4 No - lnc-ATIC-8:1 No - lnc-SRCIN1-1:2 Yes chrX:20469955-20510694 lnc-CCT6B-1:1 No - lnc-CDH8-10:12 No - lnc-ATG9B-2:3 No - lnc-SH3BGRL3-1:1 No - lnc-LINC00854-1:23 No - RMST:18 No - MIR124-2HG:9 No - lnc-TNFRSF17-2:1 Yes chr2L:12434452-12441279 LEF1-AS1:3 No - lnc-TTC30B-1:4 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-JAG1-6:1 Yes chr3R:17379944-17390265 lnc-ABL1-1:1 Yes chr2R:1649061-1778937 ARHGEF38-IT1:1 No - lnc-ZMYM2-5:1 Yes chr3R:27256595-27264055 lnc-USP6NL-5:1 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-F3-7:8 No - KDM5C-IT1:1 Yes chr2L:5989400-5999501 lnc-F2RL2-3:1 Yes chr3R:25216297-25218708 MAGI2-AS3:22 No - lnc-FBXL16-1:1 No - lnc-C5orf22-3:1 Yes chr2R:22855688-22858794 CAMTA1-IT1:1 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-CTSV-5:7 No - lnc-LY6G6E-1:1 No - DLX6-AS1:1 Yes chr2R:24814822-24835667 lnc-MRPL9-1:1 No - DSCR9:5 No - ACOXL-AS1:5 No - lnc-ERICH1-19:8 No - lnc-SLC37A4-1:23 No - lnc-INTS12-1:1 Yes chr3L:4384442-4403181 CNTN4-AS1:2 Yes chr3R:4381306-4387018 lnc-SHCBP1-2:1 Yes chr2R:22185972-22189886 lnc-TIMM21-5:2 No - GPC5-IT1:1 Yes chr3L:8827505-8891192 lnc-ZFC3H1-3:1 No - lnc-NOTCH2-1:1 No - lnc-AGAP5-1:4 No - lnc-GAS8-1:6 No - lnc-SLC39A8-1:5 No - lnc-OSCAR-1:1 No - lnc-TSPAN1-1:1 Yes chr2L:297880-305233 lnc-MEP1B-1:8 No - lnc-KIFAP3-2:4 No - lnc-ARAP2-1:3 Yes chrX:16943290-16956234 LINC02112:30 No - lnc-ANP32A-2:5 No - lnc-NUBP1-1:1 Yes chrX:21605884-21608920 lnc-ZGRF1-1:2 Yes chrX:9243817-9245925 NUTM2A-AS1:17 No - lnc-SNX27-2:1 Yes chr3L:13521907-13803400 SNHG20:8 Yes chr2L:6448464-6455929 lnc-GDAP1-1:1 No - lnc-FAM25A-4:1 No - lnc-POLR3K-3:1 No - KDM4A-AS1:6 Yes chr2R:13176553-13198337 LINC00687:10 No - lnc-GPR33-6:1 No - lnc-CDK20-1:3 No - lnc-NPIPA8-7:1 No - lnc-TRPT1-1:1 No - lnc-TERB1-4:1 Yes chr3L:11098412-11100578 lnc-SCPEP1-2:1 No - OSBPL10-AS1:6 Yes chr3L:1034697-1036298 lnc-AATK-5:1 Yes chr2R:22608310-22609419 lnc-FKBP2-1:1 No - SNHG15:13 No - LINC00607:4 No - lnc-SHISA9-1:4 No - lnc-TMPRSS15-10:1 Yes chrX:4132887-4206093 lnc-FANCF-3:1 Yes chr2L:2391660-2410662 FOXP1-IT1:1 Yes chr3R:9726020-9730872 lnc-CDR2-2:1 No - NEURL1-AS1:3 Yes chr3R:9020348-9039471 lnc-TNFSF4-3:10 No - MAMDC2-AS1:5 No - lnc-C2CD4A-8:1 Yes chr2R:10203995-10237348 lnc-ERP44-1:1 Yes chr3L:4403487-4405168 lnc-IL2RA-3:1 Yes chrX:19495505-19509350 lnc-AHNAK-1:1 No - lnc-CYP7B1-6:2 No - FOXD2-AS1:1 No - lnc-TRIB2-1:1 No - lnc-RASL11B-4:1 No - lnc-SNX11-2:2 No - FBXO3-DT:24 No - lnc-DTL-2:4 No - lnc-SRPRA-1:1 No - lnc-LIMS3-1:12 Yes chr3R:8356978-8359964 HCG23:1 No - lnc-TSTD3-2:4 Yes chr3R:11949680-11954038 lnc-SPAG1-3:1 No - lnc-DIO3-2:2 No - SPATA41:3 No - lnc-PAGE5-1:1 No - lnc-DUOX2-2:1 Yes chr3R:7052335-7054541 lnc-ZNF280D-3:3 Yes chr2R:15206527-15213634 ADPGK-AS1:5 Yes chr3L:14031450-14034909 lnc-IGSF10-11:2 Yes chr2R:17216549-17379376 lnc-ABCA5-2:1 Yes chr2L:18711071-18713748 NFIA-AS2:5 Yes chr4:268175-276369 lnc-SOWAHB-3:1 Yes chr2R:14308142-14351802 lnc-GOLGA7-4:1 No - lnc-AKAP1-1:1 Yes chr2L:15898879-15900524 DPP10-AS2:1 No - lnc-OR3A2-1:8 No - FAM242A:12 No - lnc-OR2A1-1:2 No - lnc-TRAPPC6B-2:1 Yes chr2L:6649388-6654574 PCAT1:63 No - LINC01581:1 No - LINC00200:2 No - lnc-RPA2-1:1 Yes chr2L:6527447-6546976 lnc-TAF1C-1:1 No - lnc-FAM213B-2:1 No - lnc-RALGDS-1:1 No - CTBP1-DT:30 No - CDC42-IT1:1 Yes chrX:19697091-19699938 lnc-CMC2-1:9 No - lnc-FSIP1-4:11 No - lnc-COX7A2L-1:4 No - lnc-SNX20-8:6 Yes chr3L:19003741-19045449 lnc-GPR33-2:1 Yes chr2L:22239916-22246988 lnc-LIMS3-1:11 Yes chr3R:8356978-8359964 lnc-NR2F2-6:2 No - lnc-LIG3-1:2 No - LINC02436:15 No - lnc-NKAIN3-2:1 Yes chr3L:16234140-16236999 lnc-CEP170B-2:1 No - lnc-SLC30A1-1:1 No - LINC02490:3 No - DPH6-DT:22 No - lnc-TNS2-1:1 Yes chr3L:27842669-27858271 lnc-CMC2-1:7 No - LINC02191:3 No - lnc-DAOA-14:8 No - lnc-JAG1-4:1 No - lnc-STARD4-1:1 No - lnc-NECAP2-2:2 No - lnc-HRASLS-2:2 No - LINC00909:1 Yes chr2L:21762314-21795447 lnc-CLIC4-1:1 Yes chrX:9284649-9303636 lnc-MVP-3:7 Yes chrX:15701451-15703770 lnc-PTPN9-1:1 No - lnc-SLITRK5-35:5 No - lnc-RBM11-2:2 Yes chrX:17911462-17924163 lnc-IRX3-80:21 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-ATMIN-2:1 No - lnc-VMO1-2:1 No - lnc-SLC25A47-4:1 No - lnc-SNRPN-8:146 No - MAGI1-AS1:1 No - lnc-MBOAT4-1:1 No - lnc-FASLG-2:1 No - lnc-NNT-2:4 No - lnc-HSP90AA1-1:3 Yes chr3L:4807368-4825687 LINC02096:6 No - lnc-GFAP-1:1 No - lnc-RASGEF1B-1:5 Yes chr2R:17514217-17517445 BCAR4:3 No - LINC01571:5 No - lnc-FRMD6-1:1 No - FNDC1-IT1:1 No - LINC01494:2 No - lnc-SLC38A8-6:1 No - lnc-METTL23-16:2 No - lnc-BOLA2B-1:3 No - lnc-LSAMP-1:1 No - lnc-FSIP1-4:13 No - lnc-CCDC82-3:2 No - lnc-FGFR1-1:1 Yes chr2R:24509508-24515320 lnc-GPR20-1:1 No - lnc-BARHL2-3:1 No - lnc-KLHL36-1:1 Yes chrX:18775228-18781345 lnc-ZBTB25-2:1 Yes chr3R:10696534-10703316 PRKAR2A-AS1:5 No - LINGO1-AS2:4 Yes chr2R:21872030-21946259 lnc-ALDH1A3-1:2 No - lnc-FAM118B-1:10 No - BOLA3-AS1:5 No - lnc-PPP2R2D-3:1 No - lnc-SLIT2-1:1 No - LINC01088:15 Yes chr3L:9972312-9974023 lnc-IRX6-2:1 No - MIR9-3HG:19 No - lnc-AGR3-1:3 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-KDM5B-1:1 No - LINC02588:32 No - lnc-TM4SF20-1:1 No - lnc-GAS8-1:1 No - SPATA41:8 No - lnc-ZNF236-11:5 No - lnc-CCL1-2:1 No - lnc-DOCK8-2:2 Yes chr2R:14901475-14928425 lnc-MCTP2-7:2 No - lnc-SLC16A8-1:1 Yes chr2L:12695033-12698917 lnc-TPSG1-2:1 Yes chrX:6104085-6192483 USP3-AS1:17 No - lnc-TCL1B-2:3 No - LINC01151:1 No - lnc-KRT83-1:1 No - lnc-RABEPK-1:1 Yes chrX:11325385-11334071 lnc-PRSS54-1:1 Yes chrX:10383353-10385861 lnc-SOX17-4:13 No - LINC00115:32 No - lnc-CIT-5:1 No - ROR1-AS1:3 Yes chr2L:10251843-10254686 lnc-CYB5A-1:2 No - lnc-KLHL11-1:1 No - lnc-SAYSD1-1:3 Yes chr3R:9651179-9674643 lnc-ACSL6-1:1 Yes chr3R:30466050-30485799 lnc-ADA-3:1 No - lnc-PRDM9-19:1 No - lnc-IFIT2-1:3 Yes chr2L:10643971-10645891 lnc-TEX51-2:5 No - LINC00459:1 No - lnc-ERAL1-2:1 Yes chrX:14839376-14933946 lnc-TIGD1-1:2 Yes chr3R:24063077-24108960 lnc-PDCD1-17:5 No - lnc-OR2A1-1:7 No - lnc-GGCT-1:21 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-DISP1-1:5 No - lnc-MAEA-1:1 No - lnc-PLA2G10-3:2 No - lnc-NSMCE1-1:1 Yes chr3L:839980-841360 lnc-PARN-1:3 No - lnc-GNAQ-2:2 No - lnc-KIAA1257-1:2 No - lnc-UBAP2-1:1 Yes chr3L:15585431-15588175 lnc-GOLGA8N-1:2 No - lnc-NBPF9-2:1 No - lnc-RTTN-5:1 No - lnc-RIMS3-4:1 No - lnc-RARRES2-2:1 No - lnc-PAX6-2:2 Yes chr3L:1298672-1300389 lnc-BAZ2B-1:1 No - ENTPD1-AS1:14 No - lnc-PADI1-4:3 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-GTDC1-2:2 No - lnc-FOXA1-1:2 No - lnc-RXRG-1:7 No - LNX1-AS2:1 Yes chr3R:4485008-4487677 LINC00851:4 No - LINC00115:11 No - lnc-GGCT-1:6 No - LINC00470:16 No - lnc-BTBD17-2:1 Yes chrX:21328613-21339676 DIAPH2-AS1:3 Yes chr2L:20758144-20768053 lnc-SGCG-6:2 No - lnc-USP8-1:1 Yes chr2R:15262808-15309368 ZFX-AS1:1 No - lnc-TTC23-1:1 No - lnc-POP5-1:1 No - lnc-RGS9-2:1 Yes chr2L:22981816-22992951 lnc-SCD-3:1 Yes chr3R:16046347-16049421 LINC00271:4 No - CDRT7:2 No - lnc-PLAT-3:6 No - lnc-STRA6-1:1 No - LINC02582:11 No - lnc-TMCO4-1:1 No - lnc-ROPN1B-1:1 Yes chrX:8489348-8517029 LINC01896:39 No - CDKN2B-AS1:22 Yes chr3R:25036944-25037982 lnc-IGFBP7-1:1 No - LINC01989:15 No - lnc-KIF16B-1:1 Yes chrX:5309242-5310501 lnc-ARRB1-1:2 No - CA3-AS1:3 No - lnc-PLAT-3:3 No - SEPT7-AS1:6 No - lnc-PAQR5-1:3 No - lnc-ADPRM-1:4 No - lnc-ANO9-1:1 No - lnc-ZSCAN10-3:3 No - lnc-OST4-2:2 Yes chr2L:4149279-4151203 lnc-HECA-1:1 Yes chr3R:25851632-25853989 NARF-AS1:3 Yes chr2R:4130974-4133484 lnc-C1QTNF5-1:1 No - lnc-MARCH4-1:1 Yes chr2L:4955509-4958292 lnc-RNF135-1:27 No - lnc-SPTBN5-1:2 Yes chr2L:1884622-1944289 MIR193BHG:4 No - lnc-SCRN3-4:1 No - CASC16:1 No - lnc-GTF2A2-2:1 No - lnc-DNPEP-1:2 No - lnc-B3GNTL1-1:3 No - lnc-RFC4-1:1 Yes chr2L:5981764-5985909 lnc-NRAP-1:1 Yes chr2R:23551313-23553547 lnc-BOD1-3:1 No - lnc-LIMS3-1:15 Yes chr3R:8356978-8359964 lnc-MAP1LC3C-1:1 Yes chr2L:21166046-21168581 lnc-PABPC4-1:24 Yes chr2R:23851562-23853247 LINC00293:1 No - lnc-CDC42BPB-1:1 No - lnc-ATG9B-2:6 Yes chr2R:16294400-16297232 FAM230B:3 No - REV3L-IT1:1 Yes chr2R:7793625-7801044 lnc-KIAA1755-1:1 No - lnc-SLC16A3-4:1 No - lnc-ANKRA2-2:1 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-VPS13C-1:1 No - lnc-NPTX1-2:2 No - lnc-MPPE1-12:2 No - lnc-PPDPF-2:1 Yes chr2R:10145897-10192394 lnc-COIL-2:2 No - lnc-ADA-3:17 No - SP2-AS1:15 No - lnc-CHRFAM7A-1:2 No - HOXA10-AS:7 No - lnc-GABPA-1:1 Yes chrX:530501-579044 LINC00687:12 No - lnc-ACAP3-1:1 Yes chr3R:29745337-29747513 lnc-NUDT16-1:1 No - lnc-PTGR2-1:2 Yes chr3R:9461084-9493677 MORC1-AS1:1 No - lnc-RGS9-3:4 No - lnc-HNRNPA2B1-16:8 No - lnc-FNBP1L-2:1 No - lnc-CDH5-2:1 No - lnc-HAO2-2:6 No - lnc-MAPK6-2:1 No - MIR22HG:10 No - MLIP-AS1:3 No - CASC17:3 No - EMX2OS:8 No - LINC01229:9 No - lnc-UBLCP1-7:1 Yes chr2R:14772650-14807061 lnc-EMC3-1:19 Yes chr2L:10731400-10732423 HNF1A-AS1:1 No - lnc-CARD11-9:1 No - LINC01592:8 No - lnc-NCALD-1:1 Yes chr2R:17801132-17842820 lnc-COQ8A-1:1 Yes chr2R:24092079-24098636 lnc-SMIM15-4:10 No - lnc-DERA-2:1 No - PXN-AS1:5 Yes chr2L:19400753-19426596 LINC00667:1 No - lnc-RPL27A-1:1 Yes chr3R:20593139-20612540 lnc-MRE11-1:9 No - lnc-OR2G6-2:2 No - LINC02087:5 No - lnc-USP9Y-2:1 No - lnc-NAPB-2:1 Yes chr2R:23811321-23811974 lnc-SLC38A8-2:1 No - LINC01481:21 Yes chr3L:8755989-8757167 lnc-BIN3-1:1 No - lnc-OR2A1-1:6 No - lnc-TICRR-2:1 No - lnc-GXYLT1-2:2 Yes chr4:663621-669884 PCBP1-AS1:52 No - lnc-MAP3K6-1:1 Yes chr2R:18151704-18154060 lnc-KDM6A-1:1 No - GRM5-AS1:2 Yes chr4:936819-949441 lnc-NHLH2-2:1 No - lnc-MBOAT1-2:25 No - lnc-PARN-7:1 Yes chrX:4314230-4318801 SNHG15:3 No - lnc-LEXM-2:9 No - LINC01089:1 Yes chr3R:9497101-9502581 lnc-CCDC51-1:1 No - LINC01089:26 No - ID2-AS1:1 Yes chr3L:749400-753492 lnc-MMRN1-12:12 No - lnc-DDX60-1:1 No - lnc-EEPD1-49:4 No - lnc-TEKT5-2:1 No - lnc-MARVELD3-3:1 No - lnc-AP1S2-1:1 Yes chr2L:13803626-13809994 lnc-RFXAP-1:1 Yes chr2L:3146056-3159643 lnc-KDM4C-5:1 No - KLF3-AS1:4 Yes chr2R:23011078-23042943 lnc-SPAG9-2:1 Yes chr2L:13169649-13176785 ARMCX3-AS1:2 No - lnc-PTX4-2:1 Yes chr2L:553742-560310 lnc-MTERF2-1:5 No - lnc-ASTE1-2:1 Yes chr3L:22749444-22787631 lnc-ZSCAN2-1:1 Yes chr3R:6657882-6659442 LINC02253:6 No - lnc-C12orf66-1:1 No - lnc-C8orf48-2:1 Yes chr3R:14391683-14481713 LINC02584:8 No - lnc-CTXND1-2:1 Yes chr3R:9016773-9020022 lnc-RPL24-1:1 No - lnc-DEGS2-4:1 Yes chr2R:19141632-19163705 FRMPD4-AS1:1 Yes chr3R:15095957-15131926 LINC00909:6 No - lnc-RBL2-1:1 No - LINC01605:1 No - CTBP1-DT:29 No - lnc-CXorf67-1:2 No - LINC00928:10 No - lnc-PBX2-1:1 Yes chrX:15992468-15996509 lnc-TM4SF18-1:1 No - lnc-PLAU-1:1 Yes chrX:2214347-2222567 LINC01568:14 Yes chr4:501810-540874 lnc-UTP6-2:1 No - lnc-TP53TG3-64:3 No - lnc-DGCR6-6:26 No - lnc-SLC6A12-4:1 Yes chr3L:21034535-21075444 lnc-ZBTB25-1:1 Yes chr3R:10696534-10703316 lnc-C1orf232-1:8 No - lnc-OR4F4-1:1 No - lnc-CYB561-1:1 No - lnc-CCL1-12:8 No - LINGO1-AS1:2 Yes chr2R:21872030-21946259 lnc-ZCRB1-1:1 Yes chr2R:7086316-7127868 lnc-RPP38-3:1 No - RXYLT1-AS1:4 No - MIR124-2HG:14 No - lnc-LIMS3-1:13 Yes chr3R:8356978-8359964 RBPMS-AS1:1 No - BTBD9-AS1:1 Yes chrX:10768537-10772154 lnc-NPHS2-1:1 No - lnc-INSL5-5:1 Yes chrX:3176440-3343767 AGBL1-AS1:1 No - NR2F2-AS1:15 No - lnc-GTF2IRD2-1:11 No - lnc-FOXB2-9:1 Yes chr3L:4037523-4040482 lnc-TOR1AIP2-2:2 No - GSN-AS1:1 Yes chr2L:17486806-17497208 LINC01606:10 No - LINC01978:15 No - TMEM108-AS1:3 No - lnc-GGCT-1:2 No - lnc-TRPM1-1:1 No - PAPPA-AS2:2 No - AQP4-AS1:16 No - lnc-ANAPC11-1:1 No - LINC02024:18 No - USP2-AS1:8 No - lnc-SLC22A12-2:1 Yes chr3R:22468512-22486969 lnc-DEGS2-2:1 Yes chr3L:9452803-9456281 PCBP1-AS1:95 No - lnc-POC5-1:1 No - TTC3-AS1:1 No - lnc-NOMO3-2:1 No - lnc-CLDN11-2:2 No - lnc-LAMC2-1:1 No - lnc-PMEL-2:1 No - lnc-HS3ST2-2:1 No - lnc-FAM153B-1:1 No - LINC01770:15 No - LINC01531:8 No - lnc-ERFE-4:1 No - lnc-TJP1-2:1 No - lnc-SLC37A4-1:35 No - lnc-KHDC3L-2:1 No - lnc-IRX3-3:2 No - lnc-GATAD2B-1:1 Yes chr2R:4235779-4242934 lnc-SLC4A3-2:5 No - lnc-UBE2QL1-1:1 No - lnc-PMM2-3:1 No - LINC00467:14 No - lnc-CPT2-2:1 No - lnc-PIP4P2-1:2 No - lnc-UBE3A-2:1 No - lnc-SNRPN-8:148 No - NDUFA6-DT:58 No - lnc-CDYL2-6:3 Yes chr2R:24475386-24476032 BBOX1-AS1:1 Yes chr2R:13375975-13377731 lnc-GGCT-1:11 No - DIAPH3-AS2:3 Yes chr2L:20758144-20768053 ZBED3-AS1:2 No - lnc-ZNF280D-1:1 No - lnc-CNTLN-3:1 Yes chrX:16118067-16148977 lnc-SUZ12-1:1 Yes chrX:9078823-9081057 lnc-ANTXRL-2:1 No - TBX18-AS1:17 No - WDR86-AS1:8 No - lnc-FAM25C-2:1 No - lnc-DTL-2:3 No - LINC01984:3 No - lnc-TMEM123-1:1 Yes chr2R:24065975-24068485 lnc-COQ8A-2:1 Yes chr2R:24092079-24098636 lnc-FAM43A-3:1 No - lnc-AP1S2-2:3 Yes chr2R:17646848-17665068 NDUFA6-DT:43 No - lnc-AGAP5-1:3 Yes chr2L:13835564-13898712 LINC01128:67 No - lnc-AGPAT5-2:1 No - LINC00457:3 No - lnc-LRFN5-1:10 No - SNHG15:5 No - PSMA3-AS1:21 No - lnc-SPECC1-2:1 No - TUG1:21 No - lnc-TAF4-3:2 No - lnc-PINX1-84:1 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-KMT2B-2:1 No - lnc-SLC35A3-1:2 No - lnc-TTLL11-1:1 No - lnc-COX10-5:1 No - lnc-BID-2:1 No - lnc-WDR73-4:1 No - DLX6-AS1:10 Yes chr2R:24814822-24835667 LHFPL3-AS1:7 Yes chr3L:1885657-1891462 lnc-CHADL-1:1 No - lnc-NEFL-3:6 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-NMNAT1-2:1 No - THUMPD3-AS1:37 No - lnc-OSBPL1A-6:1 No - lnc-GTDC1-5:2 No - lnc-OR10K2-1:1 No - TTTY20:1 No - lnc-INAFM2-2:1 No - lnc-SPRYD3-1:3 No - lnc-ESRP2-4:8 Yes chr2L:20447734-20449964 lnc-GRXCR1-3:1 No - lnc-DHRS7B-6:1 No - lnc-ROCK1-1:1 Yes chrX:16624012-16637414 lnc-PRSS27-1:1 No - lnc-ZBTB2-3:1 Yes chr3R:10696534-10703316 LINC00469:2 No - lnc-COMMD6-1:1 Yes chr3R:4659579-4712193 HMMR-AS1:1 No - lnc-RPRM-5:1 No - lnc-CCDC28A-1:3 No - lnc-TMPRSS2-1:1 No - CNOT10-AS1:1 Yes chr3R:12630647-12633188 lnc-FOXO6-3:1 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-TRMT44-1:2 No - PGM5P3-AS1:9 Yes chr2R:12180493-12182373 TM4SF1-AS1:1 No - lnc-NEK3-1:4 No - lnc-TAT-1:1 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-AP1S2-2:2 No - ATG10-AS1:1 Yes chr2R:7832171-7835518 lnc-RACGAP1-1:1 No - DSCR9:6 No - lnc-BARD1-1:2 No - lnc-MED24-1:1 No - lnc-RXRG-1:2 Yes chr2L:13212335-13215350 HS6ST2-AS1:1 Yes chr3R:19929277-20008512 lnc-TBX18-1:1 No - KCNMA1-AS2:4 Yes chr3R:24662491-24711595 lnc-SHF-1:1 No - ST7-AS2:8 Yes chr3L:20806868-20809272 lnc-SOX17-4:2 No - lnc-MAP6-1:2 No - lnc-ULK2-1:1 Yes chr2L:16288290-16291195 lnc-PRPF18-1:3 No - lnc-GLIPR1-3:3 No - lnc-C16orf72-1:1 No - lnc-ANKH-1:3 No - lnc-BAZ1A-4:16 Yes chr3L:5152678-5154777 lnc-SEC22C-2:1 No - lnc-FBXO28-1:2 No - lnc-GPR151-1:1 No - lnc-KDM5D-2:2 No - lnc-ZNF516-9:1 No - lnc-POTEM-1:5 No - lnc-PURG-1:1 No - lnc-AMELY-30:1 No - lnc-GDF5-1:2 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-METTL4-2:3 No - lnc-RIMS3-3:1 No - FAM83C-AS1:1 No - lnc-TDRP-1:1 No - lnc-NBPF3-4:1 Yes chrX:19961297-19969323 lnc-MBLAC1-1:1 No - lnc-ZNF678-1:5 No - lnc-GLIPR1L1-1:6 Yes chr3R:12855544-12859246 lnc-JPH1-2:1 No - lnc-EEPD1-1:1 No - lnc-FSD1L-1:1 Yes chr3L:4277962-4281585 lnc-IL21R-1:1 No - LINC00621:2 No - lnc-INPPL1-4:1 No - lnc-SH2D4A-3:1 No - lnc-PSPC1-1:1 Yes chrX:16361569-16371547 OPCML-IT2:1 Yes chr3L:5424109-5442399 LARGE-AS1:12 No - lnc-CFAP99-3:1 Yes chr3R:27124759-27151069 LINC00293:5 No - lnc-FPGT-1:2 No - lnc-METTL5-4:104 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-CYB5R2-1:9 No - lnc-SRSF6-2:1 No - lnc-LMF1-3:8 No - lnc-CLEC14A-1:4 No - lnc-PRAMEF15-1:1 No - lnc-MTHFSD-4:1 No - DDX39B-AS1:1 No - lnc-CTU2-5:1 Yes chr3R:2554162-3263582 lnc-ZNF286B-2:1 No - lnc-ANXA4-1:1 No - lnc-SLC6A7-1:1 Yes chr2L:20770731-20783135 HORMAD2-AS1:3 No - lnc-HDDC3-4:6 No - lnc-NUF2-3:1 Yes chr2R:17792870-17800677 lnc-DUOXA1-1:1 Yes chrX:12516634-12568452 NAV2-AS5:3 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-FOXD4L6-1:12 No - lnc-ATMIN-3:1 No - lnc-OR6F1-1:1 No - lnc-CDON-1:7 Yes chr3L:27279316-27422159 NCAM1-AS1:2 Yes chrX:4132887-4206093 lnc-ISLR-1:1 No - lnc-KLHL28-1:1 No - RUNX2-AS1:24 No - lnc-CLEC2D-1:2 No - lnc-FGFR1OP2-2:1 No - lnc-NBPF9-6:2 No - MIR100HG:4 No - LINC02304:3 No - lnc-SMARCC2-3:1 No - NECTIN3-AS1:11 No - lnc-CFAP74-2:7 No - lnc-ATMIN-3:2 No - lnc-PSMD7-1:1 No - lnc-ANXA8-3:1 Yes chr3L:5882304-5884090 lnc-SLC15A3-1:1 No - lnc-LINC02210-CRHR1-10:1 Yes chr2R:22103177-22105963 lnc-SLC44A5-3:1 No - lnc-IKBKE-1:1 No - LINC02185:25 No - lnc-MUC20-67:59 No - lnc-NMNAT3-4:1 Yes chr4:1112874-1123357 lnc-ZSCAN10-3:4 No - lnc-PCBP3-3:8 Yes chr3L:21844788-21932702 LRRC8C-DT:51 No - lnc-RECQL4-2:3 No - lnc-SAP30-23:1 No - lnc-ATP6V1E2-3:1 Yes chr3R:29039156-29049148 lnc-GDPD4-1:1 No - FAM230B:8 No - lnc-NRBF2-1:1 Yes chr3R:9516007-9520938 lnc-SLC38A5-1:1 No - MAMDC2-AS1:8 No - lnc-BCL7C-1:1 Yes chrX:9356634-9358594 lnc-ERICH1-19:2 No - LINC02400:22 No - lnc-ARHGAP26-4:35 No - lnc-APOB-1:1 No - SPAG5-AS1:3 No - lnc-METTL14-3:1 No - lnc-CHST14-3:2 No - JAZF1-AS1:4 No - lnc-ADAMTS5-1:1 No - lnc-TBCCD1-4:16 No - lnc-POTEM-2:29 No - MINCR:17 No - lnc-RPS24-5:7 Yes chr3R:24662491-24711595 LINC01411:3 No - lnc-ZNF362-1:1 No - lnc-MTERF1-1:1 No - lnc-KRT80-4:1 Yes chr2L:20683462-20714588 lnc-OR10V1-1:1 No - lnc-ZNF705D-2:21 No - FER1L6-AS1:1 Yes chr3L:8905918-8912671 LINC00520:9 No - H1FX-AS1:12 No - lnc-SLC19A2-1:2 No - lnc-CORO7-PAM16-1:1 No - ENTPD1-AS1:6 No - lnc-TMEM156-1:1 Yes chrX:9250420-9255953 lnc-SPATA46-1:1 Yes chr3L:9547220-9596713 LEF1-AS1:7 No - lnc-FADD-1:1 Yes chrX:11877737-11887162 lnc-CCL27-1:1 No - lnc-SLA2-4:2 No - lnc-RAB40B-1:2 No - lnc-KDM5D-2:1 No - lnc-LMF1-1:4 No - LINC02295:4 No - lnc-BRF2-11:1 No - SNHG7:2 No - lnc-MYLPF-1:1 No - lnc-RPL27A-2:3 No - lnc-SNRPN-8:161 No - lnc-IGFBP7-1:2 No - lnc-AZIN1-5:1 Yes chr2R:16324813-16336637 ERI3-IT1:6 No - lnc-C1QL4-4:1 Yes chr3R:9731221-9733250 lnc-SLC1A2-2:1 No - TAPT1-AS1:4 Yes chr3R:18161392-18164397 lnc-CCDC189-1:1 Yes chr2R:21323430-21341847 lnc-MOCS1-1:3 Yes chrX:1289713-1322362 lnc-TJP1-1:1 No - lnc-LEO1-2:1 Yes chr3R:30532607-30578905 lnc-MEIS2-5:2 No - lnc-VPS13C-1:3 No - HAND2-AS1:23 No - lnc-BEST4-1:1 No - lnc-IPO5-1:2 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-GTDC1-4:1 No - lnc-FAM98B-5:1 No - MNX1-AS2:1 Yes chr3L:7948186-7951563 lnc-NBPF11-2:2 No - lnc-NEURL4-1:7 No - LINC02345:33 No - LINC01960:4 No - lnc-PXDN-14:1 Yes chr2R:16552258-16558486 RUVBL1-AS1:1 Yes chr3R:10262123-10263899 lnc-CRHR2-1:1 No - lnc-DEPTOR-1:3 No - lnc-CCT8L2-1:4 No - LINC02021:12 Yes chr3R:17809401-17811134 lnc-GALK2-1:1 No - lnc-VPS50-1:11 No - lnc-ZFAT-1:1 No - lnc-CPLX1-2:2 No - lnc-ANKRD42-3:4 Yes chrX:11369665-11409776 MINCR:6 No - lnc-APC-5:1 Yes chr3R:31311157-31371748 LINC01606:5 No - lnc-IRX3-80:18 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-AKTIP-1:5 No - lnc-AARS-1:1 No - lnc-ZNF705E-1:11 No - LINC00607:5 No - ARHGEF26-AS1:3 Yes chr3L:16970013-16994388 lnc-HIBADH-1:1 No - lnc-IL16-4:1 No - lnc-MYOM1-1:1 No - MIR100HG:31 No - lnc-ETS1-1:1 No - ARHGAP26-AS1:4 Yes chrX:15751674-15760733 lnc-GAN-1:2 No - MIR600HG:6 No - lnc-MAP3K9-3:3 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-RNASEH1-3:1 No - lnc-CEP83-3:2 Yes chr4:32478-43778 lnc-AGRP-1:19 No - lnc-SLC39A8-2:1 Yes chr3R:14577217-14608079 WWC2-AS2:2 No - TBX5-AS1:4 No - lnc-LIMS4-1:4 Yes chr3R:8356978-8359964 lnc-MEIS2-4:1 No - lnc-TSR3-1:4 Yes chr2L:540599-542580 lnc-WASHC5-3:9 No - AATBC:12 No - lnc-ADPRM-3:1 No - lnc-RBL2-2:1 Yes chr2L:210735-250823 lnc-CETN3-1:1 No - THUMPD3-AS1:5 No - lnc-SNW1-2:1 Yes chr3R:22468512-22486969 lnc-SCN8A-1:1 Yes chrX:16455027-16533096 WWC2-AS1:2 Yes chr3R:14697689-14724261 ADIRF-AS1:6 No - lnc-SLC39A8-1:4 No - lnc-NUDT4B-1:3 No - FOXG1-AS1:4 Yes chr2L:3836840-3839185 HAND2-AS1:9 No - lnc-PTPN9-1:4 No - lnc-CLIP1-1:1 No - lnc-SPARCL1-1:3 No - lnc-RGS5-1:3 No - lnc-ADA-3:2 No - lnc-GTDC1-3:1 No - lnc-NNT-3:1 No - PHACTR2-AS1:8 Yes chr3L:3714826-3806459 lnc-TLE4-1:1 No - lnc-TP53TG3F-7:1 No - lnc-MARCH10-1:1 No - lnc-ABCC6-1:2 Yes chr2R:10070981-10075645 lnc-ACSM3-1:1 No - lnc-EBPL-2:1 Yes chr3R:9574484-9577733 PCAT1:4 No - lnc-ARRB1-1:1 Yes chr3R:11822702-11869460 lnc-PSKH2-2:2 Yes chrX:3880748-3882967 lnc-LDOC1-1:1 No - lnc-DOCK4-1:2 Yes chr2R:23062747-23064260 lnc-CCL2-2:2 No - lnc-APOBEC4-1:1 Yes chr3L:13906897-13925335 MAPT-AS1:6 No - lnc-SRPK2-1:1 Yes chr3L:14002127-14020148 lnc-MAGEA10-1:3 No - THUMPD3-AS1:2 Yes chr3L:14002127-14020148 LINC00596:1 No - lnc-PPP4C-11:1 No - lnc-RPLP1-12:42 No - lnc-MAP1LC3B-5:1 No - DARS-AS1:6 Yes chr2R:12877004-12883168 lnc-SUSD1-1:1 No - lnc-EID1-1:2 No - lnc-MAEL-1:1 No - lnc-ZFP69B-1:1 No - LINC02177:18 No - lnc-AGR3-1:4 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-BTBD17-1:1 Yes chr3L:11697126-11699263 lnc-CLDN9-20:1 No - SNHG9:5 No - SNHG20:13 Yes chr2L:6448464-6455929 lnc-MAT2B-3:13 No - CA3-AS1:1 No - UBXN10-AS1:2 No - lnc-ACOX3-2:1 Yes chr3R:9553696-9555408 MAFTRR:6 No - lnc-SCN4A-1:1 No - lnc-MAPK6-6:2 Yes chrX:8150731-8152275 lnc-FBXO28-1:3 No - lnc-IKZF2-4:1 No - lnc-BCL11A-18:5 No - lnc-LOX-3:1 No - lnc-CISD2-4:2 Yes chr3R:29950796-29969447 SSSCA1-AS1:2 No - lnc-GTDC1-5:3 No - GPC6-AS1:1 Yes chr3L:14632601-14671609 SLC25A25-AS1:5 No - lnc-CRNKL1-1:1 Yes chr2R:22707794-22712724 lnc-GGCT-1:22 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-SHANK2-3:1 Yes chr2L:6723903-6732766 lnc-FAM163B-1:1 No - LINC01895:14 No - lnc-U2SURP-3:6 No - FOXD3-AS1:4 Yes chr2R:22868159-22870706 lnc-ASTE1-1:2 No - CISTR:6 No - C21orf91-OT1:3 No - RSF1-IT2:1 Yes chr2L:21221312-21232059 lnc-SENP6-2:3 No - LCMT1-AS2:1 Yes chr2L:15764220-15766267 lnc-MASTL-2:1 No - LINC01908:3 No - HID1-AS1:2 Yes chr2R:12322507-12326258 TRDN-AS1:28 No - NALT1:2 No - lnc-C14orf177-2:1 No - lnc-SMG6-4:1 Yes chr2L:13212335-13215350 SMAD1-AS1:2 Yes chr2L:3146056-3159643 lnc-ELOVL3-1:1 No - lnc-MPZL1-1:1 No - lnc-ABT1-3:10 No - LINC02246:23 No - lnc-TMCO1-1:1 Yes chr3R:24290172-24293371 ZSWIM8-AS1:2 No - lnc-NT5C-1:1 No - lnc-TNS3-3:3 No - GRM7-AS3:6 Yes chr4:936819-949441 lnc-TGFB3-1:1 Yes chr3R:25112867-25122920 lnc-C18orf32-1:1 Yes chr2R:8944298-8947344 lnc-ANXA9-1:1 No - lnc-AIPL1-2:1 No - lnc-HABP4-1:1 Yes chr2L:7801668-7810703 lnc-AKIP1-2:2 Yes chr3L:7562610-7569499 lnc-PRR11-2:1 Yes chr2L:18700606-18703105 ST3GAL6-AS1:3 No - lnc-SLC22A31-6:5 No - lnc-TRIM44-2:1 No - PCAT1:64 No - lnc-IRX3-2:4 No - BSN-AS1:1 No - lnc-ATG9B-2:7 Yes chr2R:16294400-16297232 SLC7A11-AS1:5 No - lnc-SLC38A8-4:1 No - FAM242A:10 No - lnc-LUZP1-1:1 No - lnc-TAF15-1:1 No - lnc-DAPP1-3:1 Yes chr3L:11487550-11499055 BACH1-IT1:1 Yes chr3R:23185580-23226711 LINC01887:9 No - lnc-CPT2-6:1 Yes chr3R:25698727-25740465 lnc-CCAR2-2:1 No - lnc-PIGB-1:1 No - LINC01605:5 No - NAV2-IT1:1 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-PGBD5-1:1 Yes chr2L:3404460-3426719 lnc-RPRML-3:3 No - lnc-RBKS-87:1 No - UVRAG-DT:29 Yes chr2R:7712578-7714182 lnc-TEX49-1:1 Yes chr3L:16491838-16543370 DHRS4-AS1:4 Yes chr3L:5140440-5141646 LINC01193:6 No - ATP1B3-AS1:1 Yes chr2L:6789770-6798862 SNAI3-AS1:2 No - lnc-PCGF1-1:1 Yes chr3R:21409979-21434133 lnc-PTX4-1:1 Yes chr2R:12572068-12575299 TLR8-AS1:2 Yes chr3L:20361843-20366724 lnc-EDC3-2:8 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-DSG1-5:1 No - lnc-ARHGEF28-1:1 No - lnc-FBLL1-4:22 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-ATG9B-2:8 No - lnc-SPAM1-2:2 No - LINC01229:15 No - lnc-SCAF11-1:2 No - lnc-ZNF800-1:1 Yes chr4:936819-949441 TRIM52-AS1:17 No - lnc-CPHXL-5:1 No - lnc-STMND1-4:4 Yes chrX:6823204-6824203 C8orf37-AS1:12 No - RUSC1-AS1:5 No - lnc-KCNG4-1:1 No - lnc-TMPRSS2-83:12 No - lnc-CNTLN-1:1 No - ARHGAP5-AS1:3 Yes chrX:17639147-17652562 lnc-PDCD11-2:1 Yes chr3R:9020348-9039471 lnc-IL16-5:1 No - lnc-BCL2L10-2:1 No - lnc-PRSS51-2:2 Yes chr3L:16339003-16345241 lnc-ZGRF1-3:1 Yes chr3L:7655389-7718395 lnc-AMDHD2-1:1 No - LINC01088:10 Yes chr3L:9972312-9974023 lnc-TGFB3-2:1 No - lnc-NID2-2:1 No - lnc-TEFM-12:1 No - PACRG-AS2:5 Yes chr2R:19497752-19500372 lnc-TUSC5-2:1 Yes chr4:210224-213165 lnc-GAPDH-2:1 Yes chr3R:29675651-29680257 lnc-ASXL3-2:2 No - lnc-FAM174B-2:13 No - LINC00470:1 No - lnc-ALX3-1:1 No - lnc-PLA2G2F-1:2 No - ADGRL3-AS1:3 Yes chr2R:8614722-8625203 LINC01686:5 No - lnc-PRSS27-4:8 No - lnc-SLC7A5-1:1 Yes chr2L:13803626-13809994 lnc-TNS3-3:2 No - lnc-BCL11A-18:1 No - WASIR2:5 No - lnc-FOXN3-1:2 No - lnc-GDF7-1:1 No - LINC00115:33 No - lnc-CACNG5-1:1 Yes chr2R:16898535-16901575 ATP6V1B1-AS1:1 No - lnc-SERAC1-3:1 Yes chr3L:9710422-9713827 CCND2-AS1:1 Yes chrX:15906822-15909676 lnc-GATAD2B-1:2 Yes chr2R:4235779-4242934 lnc-RNF135-1:26 No - CACNA1C-AS2:1 Yes chr2L:16165831-16190540 lnc-CBX2-1:1 Yes chr3L:21306138-21318020 lnc-FLII-1:2 No - lnc-WASHC3-4:2 Yes chrX:2076966-2078455 lnc-C12orf66-5:1 No - lnc-CTDSPL2-2:1 Yes chr2R:9968929-9970897 BVES-AS1:6 Yes chrX:21053963-21082391 lnc-DISP1-1:4 No - LINC01162:1 No - lnc-PCYOX1L-1:1 No - lnc-GGCT-1:24 Yes chr3L:18461957-18463163 G2E3-AS1:9 Yes chrX:20160355-20165830 lnc-NBPF11-1:4 No - MAGI2-AS3:42 No - CCDC18-AS1:11 No - LINC00970:1 No - lnc-IL18R1-1:1 No - SLC12A5-AS1:5 No - lnc-PLCG1-1:1 No - lnc-HNRNPU-1:2 Yes chr2R:18632328-18639270 lnc-CCNJL-4:1 No - lnc-PINK1-1:1 No - lnc-NCKAP1-1:2 Yes chr3L:182522-184540 LINC01585:5 No - NR2F2-AS1:12 No - ZFY-AS1:1 No - LRRC8C-DT:49 No - CCNT2-AS1:7 No - lnc-AMDHD1-1:1 Yes chr2L:18855126-18859248 lnc-MANSC4-3:2 No - LINC01003:1 No - lnc-PPP1R12B-1:1 Yes chr2L:2772327-2799979 TOB1-AS1:2 Yes chrX:16074717-16091495 IGSF21-AS1:5 No - lnc-IFNG-3:1 Yes chr4:1225089-1230713 THUMPD3-AS1:23 No - lnc-AP1S2-2:1 No - lnc-ZNF236-13:3 No - lnc-EID1-1:1 No - SMIM10L2B-AS1:7 No - MMP25-AS1:25 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-RBP5-1:2 Yes chr4:1112874-1123357 lnc-HHIPL2-2:1 No - EVX1-AS:4 Yes chr2R:9979319-9980795 LINC01088:14 Yes chr3L:9972312-9974023 lnc-GJE1-2:1 No - lnc-TSSK2-1:1 No - lnc-TRPV3-1:1 Yes chr3L:14186249-14189648 KCNQ5-AS1:1 Yes chr2R:10145897-10192394 lnc-SRSF2-4:2 No - lnc-TGFBRAP1-3:3 Yes chr3R:7889277-7902667 LINC01033:4 No - lnc-CPVL-1:1 Yes chrX:5616572-5618806 CKMT2-AS1:12 No - lnc-HNRNPLL-2:1 Yes chr2L:11694804-11696107 lnc-AKTIP-2:1 No - lnc-PRDM4-3:2 No - CDKN2B-AS1:23 Yes chr3R:25036944-25037982 NEURL1-AS1:4 Yes chr3R:9020348-9039471 lnc-PAX6-3:1 Yes chr3L:1298672-1300389 lnc-TBC1D7-1:6 No - lnc-ESCO2-1:1 Yes chrX:7013887-7015009 MIR3936HG:16 No - TTTY6B:4 No - DPH6-DT:25 No - lnc-RNF7-2:1 No - lnc-PTX3-4:6 Yes chr3L:7134516-7143074 lnc-SNX20-5:2 Yes chr2L:10295859-10299847 lnc-TP53TG3-4:1 No - lnc-ZDHHC17-1:1 Yes chr3R:7112850-7117732 TDRKH-AS1:14 Yes chr2L:2220748-2225544 lnc-SLC13A4-1:2 No - lnc-NUTM2E-1:6 No - lnc-HBEGF-2:1 Yes chr2L:7223328-7249343 lnc-OXR1-1:2 No - lnc-CCDC107-2:1 No - lnc-TMEM41B-1:1 Yes chr3L:1537137-1544823 lnc-C19orf12-3:1 No - THSD4-AS1:8 No - lnc-GGCT-1:15 No - BRWD1-IT1:1 Yes chr3R:24319000-24328619 lnc-DLX2-2:1 Yes chrX:13214409-13258490 lnc-CLEC20A-1:1 No - lnc-TMEM68-1:1 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-FMN1-4:2 No - lnc-KIN-1:1 No - lnc-FUCA1-1:1 No - lnc-DTWD2-5:1 No - lnc-DLC1-1:1 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-DSEL-2:1 No - UBE2E1-AS1:1 Yes chr2L:10765010-10768006 lnc-CD226-2:1 Yes chrX:7324214-7328806 lnc-STN1-1:1 No - lnc-FTCDNL1-4:30 No - MIR4435-2HG:18 No - NUTM2A-AS1:14 No - lnc-ENTHD1-1:1 No - lnc-ST8SIA2-1:5 No - lnc-UTP23-3:1 Yes chr2L:10333734-10339185 MAGI2-AS1:1 Yes chr2R:21129463-21142261 AGBL1-AS1:7 No - lnc-PACRGL-4:1 Yes chrX:11219379-11302783 lnc-TMC3-2:1 No - lnc-SPX-1:1 Yes chr3L:6259105-6262694 lnc-C1orf185-2:1 Yes chr4:314923-331387 DENND5B-AS1:1 Yes chr3L:1537137-1544823 lnc-CLCNKB-1:1 Yes chr4:610684-622470 lnc-FGFR1OP-2:1 No - lnc-HSD17B2-2:1 No - lnc-CCNE2-1:1 Yes chrX:18653392-18657286 lnc-NBPF11-1:6 No - LINC01344:1 No - lnc-MAP1LC3B-2:1 No - ST7-AS1:1 Yes chr3L:20806868-20809272 lnc-HNRNPA2B1-16:17 No - MAST4-AS1:2 Yes chr3L:15566013-15576313 HAND2-AS1:26 No - lnc-SNAPC3-11:3 Yes chr4:268175-276369 lnc-OST4-2:3 Yes chr2L:4149279-4151203 lnc-GOLGA8J-3:3 No - lnc-WWP2-2:1 Yes chrX:13624745-13664568 FAM181A-AS1:1 No - LINC01641:7 No - HOXC-AS1:1 No - lnc-ACER2-7:1 No - lnc-ELAC2-1:1 Yes chr3R:19905164-19914272 HOXC-AS3:4 No - lnc-SMIM11B-5:2 No - lnc-SSBP3-1:1 No - lnc-MUC22-1:3 No - lnc-PCNX1-1:3 No - lnc-AGR3-1:5 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-PLA2G2F-1:1 No - lnc-IAH1-1:2 Yes chr3R:30000530-30003678 lnc-KCNMB4-1:6 No - lnc-FAM163A-1:1 No - lnc-ANGPTL2-2:1 No - lnc-MMRN1-12:16 No - lnc-MACC1-1:8 No - PCYT1B-AS1:1 Yes chr3L:1546092-1553504 ADIRF-AS1:5 No - lnc-LACTB-1:3 No - lnc-TOB1-2:1 No - lnc-FZD5-6:1 Yes chr2R:22103177-22105963 lnc-LONP2-3:1 Yes chr3R:20033881-20036056 DSG2-AS1:4 No - LINC02126:10 No - lnc-CD8B2-6:1 Yes chr2R:24691422-24694386 LINC02592:10 No - lnc-ELFN2-2:10 No - lnc-ATP6V1D-2:1 Yes chrX:255674-258469 SLCO4A1-AS1:1 Yes chr2L:6625138-6632407 lnc-CFAP52-2:2 Yes chr3L:16586108-16587057 LINC00607:2 No - lnc-APEX1-1:1 Yes chr3L:16351991-16353286 LINC02076:8 No - PLCG1-AS1:1 No - PCBP1-AS1:67 No - MAGI2-AS3:25 No - LINC01089:17 Yes chr3R:9497101-9502581 lnc-PANK3-6:1 Yes chrX:10964032-10967134 lnc-MMRN1-12:17 No - lnc-KDM4C-1:2 No - TTTY6B:2 No - lnc-EMILIN2-2:1 Yes chr2R:8136986-8156654 SOS1-IT1:1 Yes chr2L:13813816-13819824 lnc-MYLK4-1:1 No - MIR9-3HG:28 No - lnc-USP24-1:1 No - LARGE-IT1:1 No - ZNF341-AS1:4 No - LINC00668:1 No - lnc-DEXI-2:1 Yes chr3R:16436880-16441661 SLC7A11-AS1:2 No - lnc-ZNF778-2:9 Yes chr3L:12750119-12753402 lnc-ESRP2-1:1 Yes chrX:13624745-13664568 LOXL1-AS1:19 Yes chr2R:21789623-21791580 lnc-KCNMB1-3:1 No - CNTFR-AS1:6 No - MIR100HG:23 No - FOXD3-AS1:8 No - lnc-SEC22C-2:3 No - lnc-ADPRM-5:8 No - lnc-PANK3-5:1 Yes chrX:10964032-10967134 lnc-ADAM2-1:1 No - MIR100HG:5 No - lnc-LYRM2-1:1 Yes chr2R:10816037-10819884 CCDC18-AS1:41 No - lnc-SLC12A7-4:2 No - LINC02074:10 No - lnc-PCNX1-2:17 No - lnc-CWC15-2:1 Yes chrX:9317915-9319223 lnc-YIF1A-1:1 Yes chr3R:21266029-21269060 POLH-AS1:3 Yes chr3L:21938634-21941812 lnc-PBX1-2:1 Yes chr3L:12290956-12296123 lnc-STX8-1:1 No - lnc-FABP5-5:2 No - lnc-SBDS-7:1 No - lnc-KNSTRN-2:2 Yes chr3R:5849697-5856311 lnc-CLN6-1:1 Yes chr2R:20662474-20667306 lnc-SLC16A3-5:1 No - TAPT1-AS1:6 Yes chr3R:18161392-18164397 lnc-ANTXR2-1:1 Yes chr3L:5882304-5884090 lnc-NME3-2:1 Yes chr3L:7916650-7936120 lnc-B4GALT3-1:1 Yes chr2R:16006893-16007667 lnc-RHBDL3-1:1 No - lnc-FAM237B-2:2 Yes chr3L:3515751-3610521 lnc-MYCT1-2:1 No - lnc-FAM153C-5:9 No - lnc-FAM168A-2:1 Yes chr3R:17768272-17794490 lnc-BEST4-1:2 Yes chrX:11129362-11137118 lnc-DDI1-1:1 No - lnc-TERF1-1:1 No - lnc-THAP10-2:1 No - SNHG15:2 No - lnc-AMELY-3:3 No - XXYLT1-AS2:1 Yes chr2R:24022343-24023981 LIX1L-AS1:44 No - LINC01896:32 No - LINC00667:9 No - lnc-TAF4B-9:1 No - CALML3-AS1:4 No - lnc-C14orf28-1:3 No - DLGAP1-AS5:5 Yes chr2R:5702112-5705439 LINC00567:5 No - lnc-LLPH-21:7 No - lnc-TMEM67-2:1 Yes chr2L:12424904-12426440 lnc-OR4N4-1:8 No - lnc-NTAN1-2:1 No - lnc-KIAA1147-3:2 Yes chr2L:10270051-10271465 ZBED3-AS1:1 No - lnc-GRAP-1:1 No - lnc-HMOX1-1:1 Yes chr3R:10788524-10791150 SALRNA1:8 No - lnc-SRSF2-4:1 No - lnc-PTPN14-1:1 Yes chr2L:6332881-6338671 LINC01566:3 No - lnc-ANKRD65-1:1 No - lnc-TTC30B-1:5 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-CPLX1-2:3 Yes chr3L:16588475-16590132 LINC01014:1 No - TTTY14:6 No - lnc-ADAP2-1:1 No - lnc-FBXL7-1:1 Yes chr2R:20727829-20730610 lnc-KDM6A-1:2 No - lnc-NKX6-2-1:1 No - lnc-IBTK-3:1 Yes chr2R:7737019-7782637 lnc-FAM98B-7:1 No - lnc-CMC2-1:1 No - lnc-C7orf33-1:1 Yes chr3L:12146519-12156990 lnc-HNRNPU-1:1 Yes chr2R:18632328-18639270 lnc-NFKBIA-2:1 No - MTUS2-AS2:10 No - SLC7A11-AS1:4 No - lnc-PNRC2-2:1 Yes chr3L:3172817-3178580 lnc-SIMC1-2:1 No - lnc-IFT20-3:1 No - lnc-HJURP-2:1 No - lnc-C11orf71-2:1 No - lnc-BAZ1A-4:19 Yes chr3L:5152678-5154777 IL20RB-AS1:1 No - lnc-TMC7-3:1 No - lnc-CNBD1-4:2 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-PAPSS2-2:1 Yes chr2L:10256319-10261049 lnc-SBSPON-1:1 Yes chr3L:2895017-2959579 LINC02175:20 No - SLC8A1-AS1:11 No - lnc-ZNF624-6:1 No - DAPK1-IT1:1 No - lnc-TRIO-2:1 Yes chrY:336381-563165 lnc-PIGU-1:3 No - lnc-MTERF3-1:1 No - STEAP2-AS1:2 No - lnc-EFCAB8-1:1 No - lnc-NUMB-3:2 Yes chr3R:28520665-28540324 LARGE-AS1:3 No - lnc-BTC-4:1 No - GCC2-AS1:2 No - lnc-RNF26-1:11 No - lnc-THBS1-7:1 No - lnc-XPC-10:4 Yes chrX:5966279-5986699 lnc-MMP24OS-73:5 No - lnc-CA7-2:2 Yes chrX:7731779-7734651 HCG21:5 No - lnc-DRD2-1:2 No - lnc-TASP1-15:1 Yes chr2L:15499127-15505018 lnc-PHF2-1:1 No - BCAR4:6 No - lnc-LGR6-8:1 Yes chr2R:17646848-17665068 LINC00504:1 No - CCDC144NL-AS1:10 No - lnc-TP53TG3F-6:1 No - HCP5:4 No - LINC01089:5 Yes chr3R:9497101-9502581 lnc-TSPAN33-1:1 Yes chrX:2617758-2619738 lnc-MTHFR-2:1 No - lnc-ISG15-5:1 No - lnc-CNBD1-4:4 No - lnc-GGCT-1:14 No - lnc-TUBB8P12-1:1 No - FSIP2-AS1:1 No - CYP17A1-AS1:2 No - lnc-MRPL19-4:1 Yes chr3L:4803077-4805274 MPPED2-AS1:7 Yes chr3L:9679201-9681060 lnc-NFE4-1:1 No - LINC00668:12 No - lnc-TNFRSF13B-2:1 No - lnc-GABARAPL2-1:2 Yes chr2L:6498647-6526996 C1QTNF9-AS1:1 No - PCBP1-AS1:27 No - NRG3-AS1:1 No - lnc-PRSS27-4:18 No - lnc-PCBP4-1:1 No - lnc-ALG1-5:1 Yes chr3L:10481412-10594012 LINC00607:6 No - BCAR4:8 No - lnc-CHCHD7-1:2 No - GPR50-AS1:1 Yes chr2R:9599909-9601252 lnc-CBLL1-1:2 Yes chr2L:19580612-19582474 lnc-METTL4-2:1 No - lnc-KHNYN-2:8 No - lnc-RHEX-1:2 No - NRG1-IT1:10 No - PCBP1-AS1:18 No - MAFA-AS1:9 No - lnc-C8orf59-7:1 Yes chr2L:21154293-21156749 LHFPL3-AS1:1 Yes chr3L:1885657-1891462 LINC00529:1 No - lnc-EPN2-1:8 No - PCBP1-AS1:68 No - lnc-MGST3-2:1 No - lnc-GABRB1-1:1 No - lnc-KCNS2-1:1 Yes chr2R:19493996-19496856 lnc-PMP22-2:2 No - THUMPD3-AS1:18 No - lnc-COL9A2-1:1 No - lnc-MTX3-1:1 No - lnc-AMFR-2:1 Yes chr2R:10437985-10465701 lnc-NPBWR1-12:2 No - lnc-C13orf42-1:1 No - LINC02254:7 No - lnc-RIC3-1:1 Yes chr2R:21101928-21123704 FLG-AS1:12 No - KCNMA1-AS3:3 Yes chr3R:24662491-24711595 lnc-ZNF778-1:8 Yes chr3L:12750119-12753402 LINC01852:23 No - lnc-KCTD10-1:1 Yes chr3L:1318480-1329617 lnc-KCNMA1-2:1 Yes chr3R:26989035-26989852 LINC00592:4 No - TBILA:3 No - lnc-H2AFJ-2:1 Yes chr3R:4491943-4558067 lnc-SLC44A3-1:8 No - lnc-CCDC32-2:1 Yes chrX:19866146-19908108 lnc-AGA-1:1 No - STEAP3-AS1:1 No - lnc-SERGEF-3:1 No - ZBED3-AS1:14 No - LINC02332:7 No - lnc-NOS2-4:1 No - LINC01392:1 No - lnc-SLC23A1-1:1 No - TMEM246-AS1:7 No - lnc-MIEF2-1:1 No - LINC01919:13 No - lnc-ZNF727-1:1 No - lnc-C5orf47-1:1 No - lnc-STPG1-1:1 Yes chr2R:17801132-17842820 lnc-LIF-1:1 No - lnc-SLTM-1:1 No - lnc-PAX6-1:2 Yes chr2L:5524139-5525809 lnc-TCEAL4-1:1 Yes chrX:12459796-12463112 lnc-CYB5R2-1:8 No - lnc-RAB37-1:1 No - lnc-THRSP-2:1 No - lnc-MIPOL1-1:1 No - lnc-BRD1-1:1 No - lnc-NCS1-1:1 Yes chrX:9228796-9232378 SNHG20:14 Yes chr2L:6448464-6455929 PLCE1-AS1:7 No - CASC15:28 No - lnc-TCP11L2-2:1 Yes chr3R:10264306-10308467 OSBPL10-AS1:5 Yes chr3L:1034697-1036298 ISM1-AS1:2 No - HCG23:19 No - lnc-UBASH3A-1:5 Yes chr2R:21282298-21285679 LINC01237:3 No - lnc-JMJD8-1:1 No - lnc-ALDH1A3-2:1 No - OIP5-AS1:5 No - LINC01300:3 No - EWSAT1:3 No - LINC01481:20 Yes chr3L:8755989-8757167 lnc-POLE2-1:1 No - lnc-MYEF2-2:1 No - RPS6KA2-IT1:1 Yes chrX:22529964-22536371 lnc-CHN2-3:1 No - lnc-FOXI3-2:2 Yes chr3L:4018878-4021279 lnc-KCNB2-1:1 No - lnc-GUCY1A2-1:1 Yes chr3R:29682503-29685758 lnc-HSP90AA1-4:1 Yes chr3R:18167757-18180049 LINC00967:1 No - lnc-LRRK1-2:3 No - BCDIN3D-AS1:7 No - lnc-LRRC32-6:5 No - LINC01570:6 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-IL17B-2:2 No - OSGEPL1-AS1:3 Yes chrX:19699820-19701755 lnc-C16orf58-2:1 No - NLGN1-AS1:3 Yes chr3R:7570281-7639434 lnc-GGCT-1:18 No - MIR193BHG:11 No - lnc-PXDN-4:1 Yes chr2R:16552258-16558486 lnc-ADAMTS15-6:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-ACSL1-3:1 No - lnc-SERPINB6-1:1 No - DOCK9-DT:4 No - lnc-KAT6A-1:1 Yes chr3L:7655389-7718395 lnc-ODF4-2:2 No - lnc-PSMG3-1:3 No - lnc-PGPEP1L-12:1 No - lnc-DENND1A-3:1 Yes chr2R:5706202-5727525 lnc-DIO2-3:1 Yes chr3R:22468512-22486969 CDKN2B-AS1:24 Yes chr3R:25036944-25037982 lnc-C1orf232-1:7 No - ISX-AS1:3 No - lnc-HDDC3-3:1 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-EIF2AK4-4:1 No - MELTF-AS1:18 Yes chrX:18387084-18390344 lnc-ASXL1-2:2 Yes chr2L:14104090-14160587 PINK1-AS:1 No - lnc-ZSCAN10-3:6 No - lnc-PRDM4-1:1 No - lnc-C1orf232-1:4 No - lnc-ASTE1-1:3 No - lnc-WDR45B-1:2 Yes chr3L:11114169-11120783 lnc-CHCHD5-2:1 No - lnc-PMP2-1:2 Yes chr3R:11559896-11567054 lnc-SCAMP5-1:2 No - lnc-C9orf3-1:1 No - XIRP2-AS1:1 No - lnc-C17orf97-3:3 No - lnc-PTHLH-1:1 No - ROR1-AS1:1 Yes chr2L:10251843-10254686 HAND2-AS1:43 No - LINC01491:6 No - PCBP1-AS1:61 No - PTPRJ-AS1:1 No - LINC01227:8 No - lnc-C17orf58-2:1 Yes chr3L:233926-246912 lnc-PAWR-4:1 No - SEMA6A-AS1:6 Yes chr2R:17672839-17683499 A2ML1-AS2:1 No - lnc-EMC3-1:16 Yes chr2L:10731400-10732423 CATIP-AS1:2 No - lnc-RPRML-4:1 Yes chr3L:7245481-7249340 DISC1FP1:4 No - MIR4435-2HG:6 No - lnc-SPATC1-1:1 No - lnc-SLC38A8-6:2 No - lnc-TP53TG3-65:1 No - PWRN1:7 No - lnc-GLIPR1L1-1:4 Yes chr3R:12855544-12859246 lnc-CHRNA6-1:1 Yes chrX:8276200-8367169 lnc-CCNYL1-2:1 No - lnc-L3MBTL4-1:1 No - MIR100HG:1 No - lnc-ODR4-1:2 Yes chr3L:15608707-15610386 lnc-WDR1-1:1 No - lnc-GAREM1-2:1 No - lnc-CCT5-6:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-ZDHHC6-4:1 Yes chr4:69326-114270 LINC01900:7 No - lnc-MAGEA4-1:1 Yes chrX:15921955-15924558 lnc-CHAF1B-2:2 No - lnc-MAGEL2-1:1 Yes chr3L:18721893-18723272 lnc-NEMP2-1:2 Yes chr3L:4153618-4160932 ENTPD1-AS1:11 Yes chr2R:17539322-17544353 HDAC11-AS1:1 Yes chr3R:24854496-24856243 LINC02003:8 No - lnc-FCHSD2-2:1 No - lnc-NBPF6-8:1 No - LINC01566:1 No - lnc-ALDH1A2-3:1 No - PWRN1:22 No - LINC01254:1 No - LINC02588:20 No - ITPKB-IT1:2 Yes chrX:13303633-13329303 lnc-AUNIP-2:10 No - lnc-VCAN-1:4 No - lnc-ATG2B-3:5 No - PLCE1-AS2:9 No - lnc-ACCSL-1:1 No - lnc-HOXC13-1:1 No - lnc-CPLX1-3:1 Yes chr3L:16588475-16590132 lnc-FAM192A-2:1 No - lnc-ARHGAP17-5:1 No - lnc-OR2A1-1:1 No - lnc-OR2G6-2:1 No - SRRM2-AS1:10 No - GABPB1-AS1:10 No - EHD4-AS1:1 No - lnc-RGS5-1:12 No - GRIK1-AS1:7 Yes chr3R:20860187-20866231 lnc-TFDP2-4:1 No - lnc-TAF1C-1:2 No - LINC01189:3 No - lnc-DGCR6-6:17 No - HOXC-AS1:2 No - lnc-TMEM238L-16:8 No - GRM7-AS1:2 Yes chr4:936819-949441 FBXO3-DT:25 No - lnc-MDM4-1:1 No - lnc-BAHCC1-1:1 No - lnc-CALM1-4:1 Yes chr2R:6209782-6214122 lnc-TSPYL6-2:1 Yes chrX:17657372-17669371 DSCAM-IT1:1 Yes chr3R:17473935-17505667 lnc-CENPJ-1:1 No - DMD-AS3:1 Yes chr3R:19461085-19597288 lnc-SASS6-1:1 No - lnc-RELT-1:1 No - LINC00115:13 No - lnc-KLHL25-4:1 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-MTIF2-1:1 No - MINCR:12 No - lnc-SLC38A8-4:3 No - lnc-GEMIN4-1:1 Yes chrX:21026125-21028361 KRT7-AS:3 No - lnc-PPIAL4A-2:10 No - lnc-ZG16B-1:4 No - lnc-SVBP-1:11 No - lnc-PPIAL4F-4:6 No - lnc-TMEM234-1:2 No - lnc-GAPVD1-1:1 No - lnc-HCN4-1:1 Yes chr2R:12529053-12564184 lnc-HBE1-1:4 No - lnc-CDYL2-1:1 Yes chr3L:851346-852673 LINC01595:3 No - lnc-WDFY2-4:3 No - lnc-NFIB-1:1 Yes chr3R:18330932-18360728 EDRF1-AS1:27 No - lnc-ZDHHC17-4:1 No - lnc-SOX1-1:1 No - lnc-ANKRD30B-6:1 No - lnc-PPIAL4C-4:19 No - GRIK1-AS1:1 Yes chr3R:20860187-20866231 lnc-C11orf88-3:1 No - lnc-ELFN2-2:11 No - lnc-SIVA1-1:1 Yes chr3R:16099228-16105670 lnc-SLC39A11-1:13 No - MEIS1-AS2:3 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-PARP16-1:1 No - lnc-ACOX3-3:1 Yes chr3R:17558930-17569097 lnc-ZNF205-1:1 No - lnc-RAB37-1:10 No - lnc-DNASE1L2-2:3 Yes chrX:22872812-22875367 lnc-CCL18-1:1 No - DCUN1D2-AS:1 Yes chr3L:15563427-15565559 lnc-SYCP3-2:1 Yes chr3L:3172817-3178580 LINC02591:14 No - PSMA3-AS1:23 No - lnc-CCDC187-1:37 No - lnc-SEMA4D-2:1 Yes chr3L:9427010-9428671 lnc-TMEM211-2:1 No - PLCH1-AS2:1 No - lnc-RPGRIP1-1:1 No - lnc-PACRGL-2:1 Yes chrX:11219379-11302783 lnc-RAD51-1:1 No - lnc-CASC1-1:1 No - lnc-CMPK2-6:1 Yes chr2R:10740054-10798709 lnc-MCF2L-9:1 Yes chrX:16405509-16414651 lnc-LOX-4:3 No - lnc-GSG1L-1:2 No - HOXB-AS2:1 Yes chr3R:6752864-6754194 lnc-TCIRG1-1:3 Yes chr2L:21614232-21624080 lnc-N4BP2L2-5:2 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-TRIQK-2:6 No - DSCAM-AS1:3 Yes chr3R:17473935-17505667 lnc-CMBL-1:1 No - MIR4435-2HG:15 No - lnc-NT5DC3-3:1 No - lnc-KIF26B-1:1 Yes chrX:2606680-2608876 lnc-RAC3-1:3 No - LINC02182:8 No - lnc-C16orf45-1:1 Yes chr3L:9898703-9903031 lnc-CCDC117-1:4 No - lnc-ZNF574-1:1 Yes chr2L:12587625-12628135 lnc-ABCC6-1:1 Yes chr2R:10070981-10075645 lnc-RPRML-3:1 No - LINC00971:2 No - lnc-ROPN1B-2:1 Yes chrX:8489348-8517029 lnc-HEBP1-1:1 No - lnc-SLC38A8-2:2 No - lnc-PICALM-1:1 No - lnc-ABHD3-2:1 No - lnc-CCDC71L-1:1 No - lnc-DPH1-1:2 Yes chr2L:13212335-13215350 lnc-CYB561-3:1 Yes chr3L:12008225-12064859 lnc-ROM1-2:1 No - lnc-ADAMTS12-3:1 No - lnc-ALG1-2:2 Yes chr3L:10481412-10594012 OSBPL10-AS1:9 Yes chr3L:1034697-1036298 lnc-CCDC117-1:3 No - WNT5A-AS1:1 No - lnc-ARAP2-1:2 Yes chrX:16943290-16956234 B4GALT4-AS1:1 Yes chr3R:29032660-29034008 lnc-ABRA-1:1 No - lnc-MRM3-4:1 No - lnc-ZSCAN10-3:1 No - lnc-TMEM99-1:2 No - lnc-CDR2-3:1 No - TIPARP-AS1:4 No - lnc-TRIQK-2:1 No - lnc-SELENOF-2:10 No - lnc-CDK1-1:1 No - lnc-NCF4-1:1 No - lnc-ATP12A-1:2 No - LINC01499:1 No - lnc-AATK-6:2 No - lnc-ELN-3:1 No - lnc-SLC25A35-1:1 Yes chr3L:16970013-16994388 SPINT1-AS1:31 No - lnc-SH2D7-5:2 Yes chr2R:21872030-21946259 lnc-SIX3-1:1 No - lnc-TRIM41-3:18 No - lnc-HIST2H3D-1:1 No - lnc-F3-7:15 No - lnc-GCLC-1:9 Yes chrX:8102181-8116147 lnc-RASL11B-2:3 No - lnc-KIAA1324L-1:2 Yes chr4:936819-949441 ARNTL2-AS1:4 Yes chr3L:19813770-19815938 lnc-TLN2-2:1 No - lnc-ZNFX1-3:1 Yes chr3L:2895017-2959579 THSD4-AS1:11 No - lnc-DEPP1-2:10 No - lnc-CYB561-4:1 Yes chr3L:12008225-12064859 MUC5B-AS1:5 Yes chr3L:13846054-13860001 VCAN-AS1:6 No - lnc-TLN2-3:1 No - FGF14-AS1:4 No - lnc-TBCK-3:1 Yes chr3R:26863376-26864559 PPEF1-AS1:2 Yes chr3L:20248080-20265554 lnc-WDR45B-4:1 Yes chrX:12459796-12463112 lnc-LRRC37A3-5:5 No - lnc-IL23A-2:9 Yes chr2R:10050862-10052167 lnc-HS3ST3A1-1:1 No - lnc-CPT2-4:1 Yes chr3R:25698727-25740465 lnc-FLRT3-2:1 No - HAND2-AS1:10 No - LINC01238:9 No - CCDC18-AS1:26 No - lnc-CLK1-1:1 Yes chr3R:5595364-5601136 FGD5-AS1:10 No - lnc-AMELY-2:6 No - lnc-CDK2AP1-1:4 Yes chr2R:16291453-16292269 lnc-EMC3-1:12 Yes chr2L:10731400-10732423 lnc-DCTD-2:1 No - lnc-MALL-1:1 Yes chr2R:7960133-7961921 lnc-ASPH-3:2 Yes chr2L:19435850-19442727 lnc-RPLP1-12:24 No - lnc-CLEC1B-1:1 No - lnc-RECQL5-2:2 Yes chr2R:9285310-9286634 lnc-TBCK-3:3 Yes chr3R:26863376-26864559 lnc-GNG11-1:1 No - lnc-FAM19A3-1:1 No - lnc-WDR45B-2:1 Yes chr3L:11114169-11120783 lnc-DEPP1-2:1 No - lnc-DYNLRB2-3:2 No - lnc-MANSC4-3:1 No - HAND2-AS1:44 No - LINC00115:43 No - PRR34-AS1:5 No - lnc-SVBP-1:13 No - lnc-FITM2-1:1 No - lnc-TMEM242-2:1 Yes chr3R:17687818-17718350 LINC00092:3 No - RABGAP1L-IT1:1 Yes chr3L:8346561-8352279 lnc-CD36-11:1 Yes chr2R:13805794-13819571 lnc-ASAH2B-4:1 Yes chr2L:3622074-3656953 lnc-CCDC102B-4:1 No - lnc-LIMS3-2:4 No - lnc-PREX2-1:1 Yes chrX:17080423-17087675 lnc-MAPK6-8:1 Yes chr2R:7500147-7508625 lnc-RECQL4-2:1 No - LPP-AS1:1 Yes chr4:1057365-1065001 lnc-CFAP52-4:2 Yes chr3L:16586108-16587057 LIX1L-AS1:34 No - lnc-SNRPN-8:154 No - lnc-DHX38-1:1 Yes chr2L:4403251-4403955 HCCAT5:2 Yes chr4:501810-540874 lnc-CD302-1:1 No - lnc-OR4F29-1:5 No - LINC02563:3 No - SP2-AS1:5 No - THAP7-AS1:4 No - lnc-NCAM2-6:1 No - lnc-NSUN6-2:4 Yes chr3L:22872200-22873702 lnc-CCDC117-1:2 No - LINC01903:3 No - TPM1-AS:9 Yes chr3R:15310193-15315197 lnc-C9orf66-3:1 Yes chr2R:14901475-14928425 lnc-MARCH4-2:4 Yes chr2L:4955509-4958292 lnc-MESD-4:5 No - lnc-MEGF11-2:1 No - LINC00469:4 No - lnc-TIGIT-9:1 No - lnc-OR52B2-1:1 No - lnc-HAO2-2:3 No - lnc-FAM171B-1:1 No - EIF3J-DT:30 No - lnc-NANOGP8-1:2 No - lnc-ATF3-1:1 No - lnc-TOR3A-1:1 Yes chr3L:16615866-16647882 lnc-RPRM-1:1 No - lnc-SLC49A3-1:1 Yes chr3L:16588475-16590132 lnc-ZSCAN2-3:1 No - lnc-MAN2C1-4:1 No - lnc-ZNF609-1:1 No - C1RL-AS1:1 No - LINC00922:4 No - lnc-GPR33-6:2 No - LINC01193:2 No - lnc-C12orf42-7:2 No - ADARB2-AS1:2 Yes chrX:1773725-1788065 lnc-SERTAD2-1:2 No - lnc-CEP170-13:3 No - lnc-TGFBR2-1:1 No - lnc-VSIG10L2-2:1 Yes chr3L:27279316-27422159 lnc-FAT3-5:10 No - lnc-AARS-1:2 No - lnc-LYZL1-15:23 Yes chr3L:2377655-2499226 MMP2-AS1:7 No - lnc-KHDRBS2-1:1 Yes chr2R:22409208-22411545 lnc-THEMIS-1:1 No - SSTR5-AS1:1 No - lnc-MAP1LC3B-3:2 No - lnc-EFR3B-1:1 Yes chr2R:8729502-8734304 CYP1B1-AS1:4 Yes chr3L:5590083-5592571 lnc-CBLN2-2:1 No - lnc-MANSC4-3:3 No - lnc-DGCR6-6:16 No - lnc-GPR183-47:25 Yes chr2L:20730416-20734309 lnc-COQ10B-1:1 No - lnc-ATP6V1E1-1:1 Yes chr3R:11967708-11971686 lnc-ELL2-1:1 No - lnc-SLC38A8-1:2 No - lnc-GLB1L2-1:4 No - lnc-ROCK1-2:1 No - HAO2-IT1:1 Yes chr2R:10883547-10884936 lnc-LRRC18-2:1 No - lnc-C2orf83-1:1 Yes chr3R:10858202-10859813 MINCR:13 No - lnc-HPS4-3:1 Yes chr3R:16068523-16098761 FER1L6-AS2:1 Yes chr3L:8905918-8912671 lnc-EEF1B2-1:1 Yes chrX:8248651-8251687 lnc-RBL2-1:2 No - GNA14-AS1:2 No - LINC01892:5 No - lnc-MMP24OS-73:12 No - LINC01243:1 No - lnc-ALDH7A1-1:1 No - lnc-NPTX1-2:1 No - lnc-CMPK2-6:2 No - lnc-NDST2-1:4 No - lnc-TMPRSS2-83:6 No - LINC00928:9 No - DLGAP4-AS1:3 No - lnc-MNX1-2:1 Yes chr2L:1008378-1048053 FLNC-AS1:9 No - lnc-TRMT2A-1:1 No - lnc-ZSCAN10-3:11 No - HLX-AS1:1 Yes chr2L:6013059-6019402 lnc-HSFY2-1:1 No - LINC02189:15 No - TIPARP-AS1:7 No - lnc-ARL13B-1:1 No - lnc-PIGB-1:3 No - PLCE1-AS2:14 No - lnc-IRX3-80:34 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-CEMP1-1:5 No - lnc-UHRF2-9:1 Yes chr2R:13176553-13198337 MYLK-AS2:1 Yes chr2R:9716348-9748121 lnc-PHF14-14:13 No - lnc-C17orf62-1:2 No - lnc-ZNF705E-1:15 Yes chrX:19243631-19245224 lnc-GALR1-2:1 No - lnc-SMYD3-3:1 Yes chr2L:7844905-7855475 lnc-KLHDC4-1:3 No - SLC8A1-AS1:38 No - lnc-STMP1-1:1 Yes chrX:19082609-19083290 PCAT18:1 No - lnc-OR4F29-1:4 No - NEGR1-IT1:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-SQOR-1:3 No - RSF1-IT1:1 Yes chr2L:21221312-21232059 lnc-LRRC37A3-5:3 No - lnc-NENF-1:1 Yes chrX:16740906-16742918 lnc-CD58-2:1 No - WWC3-AS1:1 Yes chr3R:14697689-14724261 LINC02076:9 No - lnc-EIF2AK4-1:6 No - lnc-CCDC9B-2:1 Yes chr3R:5849697-5856311 lnc-KPNA4-1:1 No - lnc-TRAM1L1-3:2 No - lnc-OTX2-10:1 No - MIR4435-2HG:16 No - lnc-SFTPA2-1:1 No - lnc-YPEL5-2:1 Yes chr2R:16625293-16640011 lnc-LAMA2-3:1 No - lnc-SNRPD3-2:1 Yes chr3R:7747913-7750079 lnc-SAYSD1-1:2 Yes chr3R:9651179-9674643 lnc-CDK13-2:1 Yes chr3R:20562486-20564067 IGBP1-AS2:1 Yes chr2L:13367617-13369021 lnc-HJURP-1:1 Yes chr2R:15262808-15309368 lnc-TTR-1:1 Yes chr3R:29032660-29034008 LINC01491:1 No - ST3GAL6-AS1:1 No - lnc-TET1-1:1 No - THOC7-AS1:1 Yes chr3L:211636-212687 SNHG7:11 No - lnc-GTDC1-6:1 No - lnc-PAX5-2:1 No - lnc-GRHL1-1:1 No - OIP5-AS1:11 No - lnc-PRICKLE4-1:1 Yes chr4:1198852-1224467 DDX39B-AS1:2 No - lnc-TLCD1-1:1 Yes chr3L:1667192-1668654 lnc-MPHOSPH6-1:3 Yes chr2R:12064565-12079543 lnc-PLAT-1:1 No - lnc-LINS1-1:1 Yes chr2R:8914524-8918234 lnc-NOXO1-1:1 No - lnc-SUSD2-1:1 No - NORAD:3 No - lnc-SLC39A11-1:18 No - lnc-HDLBP-1:1 Yes chrX:21358286-21361688 lnc-METTL26-1:5 No - lnc-OTX2-9:2 No - lnc-GRM7-6:1 No - lnc-LEXM-1:2 No - lnc-MMRN1-12:25 No - USP12-AS1:2 Yes chr3R:22750901-22776374 lnc-NBPF11-1:2 No - lnc-SLC43A1-1:1 Yes chr2L:13212335-13215350 lnc-CFAP52-1:2 Yes chr3L:16586108-16587057 SP2-AS1:6 No - lnc-RPLP1-12:14 No - lnc-NPR2-1:1 No - lnc-YBX2-1:1 Yes chr3L:914074-993788 BMP7-AS1:3 Yes chr2R:23851562-23853247 lnc-RAB37-1:5 No - SLC8A1-AS1:34 No - lnc-FSIP1-3:1 No - lnc-SGK1-3:9 No - lnc-CLEC3A-3:1 Yes chr2L:7999670-8004286 lnc-CDC42SE1-1:1 Yes chr3R:5616644-5624125 lnc-THAP10-2:2 No - lnc-TMEM18-12:1 No - lnc-ZSCAN10-3:10 No - ZBED3-AS1:3 No - ARLNC1:13 No - MIR22HG:1 Yes chr2L:12014304-12020960 lnc-FOXA1-1:1 No - lnc-GLYATL2-2:1 No - lnc-MED10-5:1 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-MAT2B-3:4 No - lnc-ZNF236-1:6 No - PIK3IP1-AS1:2 No - lnc-NSUN6-8:1 No - lnc-KIFC3-1:1 No - MAGI1-IT1:1 No - lnc-SLC29A4-1:1 Yes chr3R:22710883-22721150 lnc-OR14K1-1:7 No - lnc-MEP1B-1:3 No - CCDC144NL-AS1:51 Yes chr3L:18618305-18622129 lnc-NEO1-1:2 Yes chr2R:14276130-14300095 lnc-HOXB4-1:1 Yes chr3R:6752864-6754194 lnc-IFT46-1:2 No - lnc-CDK5R1-1:1 Yes chr2L:10491814-10506779 LINC02157:3 No - lnc-ZNF550-1:1 No - ERICH6-AS1:4 No - LINC00470:15 No - lnc-PITX2-1:4 Yes chr3R:13298768-13302334 MIR1302-2HG:4 No - lnc-CTAGE1-9:19 No - lnc-DCTD-3:1 No - lnc-OR1G1-1:1 No - MCF2L-AS1:3 Yes chr2R:5468319-5495861 lnc-DENND1A-4:1 Yes chr2R:5706202-5727525 lnc-ETDB-1:8 No - lnc-AARD-1:1 Yes chr2L:12164241-12166704 lnc-WDPCP-2:1 Yes chr3L:13011976-13015332 lnc-STRN3-1:4 No - MKLN1-AS:7 Yes chr2R:12628697-12632378 lnc-ELFN2-2:9 No - lnc-CEP170-13:4 No - lnc-PRMT8-2:1 No - lnc-INPPL1-3:1 No - lnc-TAF4B-6:1 No - lnc-MTO1-1:1 Yes chr3R:31738468-31743306 lnc-ONECUT1-1:6 No - lnc-NGFR-3:8 No - MRPS30-DT:68 No - LINC00558:1 No - lnc-NT5M-1:2 Yes chr2L:14599196-14689340 lnc-ZNF236-1:5 No - lnc-FABP5-5:3 Yes chr3R:11559896-11567054 LINC02398:14 No - RERG-IT1:1 No - LINC01571:6 No - lnc-FAM98B-2:1 No - lnc-SAA2-SAA4-1:1 No - LMO7-AS1:1 No - CCDC37-DT:22 No - LINC01978:17 No - lnc-ANKRD13B-2:1 Yes chr3R:24938710-24944956 lnc-DDX19A-1:1 No - lnc-CEP170-13:8 No - lnc-CD40LG-2:3 No - lnc-DAAM2-9:11 No - lnc-TNMD-4:1 No - CKMT2-AS1:11 No - LINC01499:3 No - lnc-ADAM10-1:2 No - lnc-PAX6-2:1 Yes chr3L:1298672-1300389 lnc-METTL16-1:4 Yes chr2R:15147860-15149709 lnc-ZNF852-2:1 No - lnc-RGS5-1:10 No - lnc-THBS3-1:1 Yes chr3R:9561583-9563673 lnc-DNASE1L2-2:12 No - lnc-TPST2-1:1 Yes chrX:13563823-13593224 OVOL1-AS1:3 Yes chrX:5048273-5070929 lnc-POTEC-1:1 No - lnc-FUS-5:1 No - lnc-USP40-1:1 No - lnc-IL17B-2:1 No - lnc-SNX20-1:3 Yes chr2L:10295859-10299847 lnc-C21orf2-1:2 Yes chr3L:4094343-4103256 SP2-AS1:14 No - lnc-TIMP3-5:1 No - lnc-FSIP1-6:4 No - lnc-TSPAN5-2:2 No - CACNA2D3-AS1:1 Yes chr2R:13805794-13819571 LINC02136:4 No - lnc-LAMA1-5:2 No - lnc-SHCBP1-1:1 No - lnc-FAM189A2-1:1 Yes chrX:10627737-10710947 MELTF-AS1:17 Yes chrX:18387084-18390344 lnc-NCBP3-1:2 No - lnc-ZBTB25-3:1 No - lnc-AKT1-2:1 Yes chr3L:7094818-7123297 LINC01029:2 No - lnc-SMIM15-4:1 No - LOXL1-AS1:7 Yes chr2R:21789623-21791580 lnc-MUC20-67:82 No - lnc-MNX1-23:3 No - lnc-KLHDC4-1:1 No - lnc-AGPAT2-1:1 Yes chr3L:4384442-4403181 SNHG20:1 Yes chr2L:6448464-6455929 DPH6-DT:17 No - lnc-ACTL7B-1:1 Yes chr3R:11650971-11655691 lnc-SNRPN-8:158 No - PCBP1-AS1:100 No - LINC00667:10 No - CCDC144NL-AS1:22 Yes chr3L:18618305-18622129 lnc-ANXA2-1:1 No - lnc-RYBP-1:1 No - MAMDC2-AS1:1 No - lnc-LARS-1:1 No - lnc-KCNMB1-1:1 Yes chrX:11219379-11302783 lnc-FOXD4L3-4:1 Yes chr3L:16126018-16128531 ZNF341-AS1:2 No - lnc-KNOP1-1:6 No - NUTM2A-AS1:15 No - lnc-ZNF154-1:1 No - lnc-PPDPFL-3:1 No - TGFA-IT1:2 No - lnc-ZNF703-3:2 No - lnc-CEMP1-7:1 No - UBL7-AS1:11 No - CDKN2B-AS1:66 Yes chr3R:25036944-25037982 RASA3-IT1:1 Yes chr3L:9839093-9855285 lnc-FCRL3-1:1 No - lnc-GGCT-1:23 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-SLC9A4-1:1 No - lnc-TMEM234-1:1 No - lnc-SFTA3-1:1 No - RBPMS-AS1:4 No - lnc-VWA3B-1:1 Yes chr2R:16243145-16259805 lnc-TMEM218-3:1 No - MAGI2-AS3:24 No - lnc-KLF7-1:1 Yes chrX:18366357-18377864 lnc-ADA-3:11 Yes chr3L:17690015-17748839 lnc-SLC25A21-1:1 Yes chr3R:8319025-8333792 lnc-KCNC2-2:24 No - LINC01606:6 No - DGUOK-AS1:1 Yes chr3R:18980995-18982749 lnc-PAXIP1-3:2 No - lnc-PKLR-1:1 Yes chr2R:11305511-11307528 lnc-EMB-4:7 No - lnc-GRIP2-3:1 No - lnc-ANKRD13C-1:1 No - EDRF1-AS1:22 Yes chr3L:8721324-8726108 lnc-KCNJ12-4:1 No - LINC00668:8 No - GYG2-AS1:1 Yes chr2R:21200483-21210821 lnc-CLEC18B-7:4 Yes chr2R:24400028-24404527 lnc-CORO6-1:1 Yes chr3R:24938710-24944956 lnc-RGS5-1:1 No - lnc-GLUD2-1:1 No - LINC02091:6 No - lnc-AGBL4-1:1 Yes chr2L:2954762-2968434 lnc-XKR7-1:1 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-CDON-2:6 No - RUSC1-AS1:4 No - LINC01195:1 No - lnc-CHST4-1:3 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-BARHL1-1:1 No - lnc-SERPINB6-1:2 No - lnc-DTWD1-1:1 Yes chr3R:29489468-29491383 lnc-SLC25A28-1:1 No - LRRC75A-AS1:1 No - FGF14-IT1:2 No - lnc-UBL3-2:1 No - LINC01534:2 No - LINC01227:20 Yes chr2R:24475386-24476032 lnc-MRGPRD-1:1 No - MIR202HG:1 No - lnc-DALRD3-1:13 Yes chr2R:22212835-22217264 lnc-FAM167A-2:4 Yes chr3L:4592447-4626196 LINC01996:5 No - lnc-RSL1D1-2:1 Yes chr2L:12434452-12441279 lnc-OR11H2-4:1 No - USP3-AS1:16 No - lnc-SMNDC1-1:1 No - PHEX-AS1:1 Yes chr3R:27057908-27064199 MIR9-3HG:21 No - ZBTB20-AS1:8 No - lnc-DSG1-3:1 No - lnc-BEND2-2:1 No - MIR4435-2HG:7 No - lnc-LRP5L-4:1 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-DMRTA1-3:1 Yes chr2L:2954762-2968434 lnc-ARID4A-4:1 No - PKP4-AS1:5 Yes chr2R:4595288-4609492 EDRF1-AS1:48 No - LINC00639:3 No - lnc-SRRD-1:2 No - SAPCD1-AS1:1 No - LINC01611:1 No - LINC02131:3 No - lnc-KLC1-16:1 Yes chr3L:13477541-13483515 NAALADL2-AS3:1 No - lnc-RPL27A-2:1 No - DCUN1D2-AS:2 Yes chr3L:15563427-15565559 lnc-BRINP2-2:1 No - lnc-PSMD7-3:1 No - lnc-CCDC180-1:2 No - MIR22HG:7 No - lnc-ZIC4-3:1 No - NCK1-DT:27 No - lnc-KCNMB1-3:2 No - NDUFV2-AS1:4 No - lnc-SLC25A48-1:1 No - LHX4-AS1:6 No - lnc-IKZF1-2:2 No - lnc-ADAM8-2:1 Yes chrX:19559431-19565764 lnc-PGGHG-1:12 No - LIX1L-AS1:33 No - lnc-PANK3-7:1 Yes chrX:10964032-10967134 lnc-MESP2-1:1 No - lnc-SMYD2-1:1 Yes chr3R:11328480-11407627 HM13-IT1:1 Yes chr2L:542786-544653 lnc-NME4-1:1 Yes chr3R:25199818-25214255 CHRM3-AS1:1 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-RIMS3-2:1 No - lnc-PKP4-1:1 No - LINC01237:9 No - lnc-MEP1B-1:7 No - LANCL1-AS1:4 Yes chrX:11092492-11094947 lnc-CHRFAM7A-1:1 No - lnc-HASPIN-1:1 Yes chr2R:15258761-15262873 LINC00565:10 No - lnc-GREB1-1:2 Yes chr2R:8136986-8156654 lnc-SLTM-3:1 No - lnc-CETP-1:2 Yes chr2L:7796314-7800058 lnc-FGF10-4:1 Yes chr2R:14276130-14300095 lnc-MACC1-1:1 No - USP3-AS1:9 No - lnc-NFAT5-2:1 Yes chrX:6274972-6276724 lnc-CCDC117-1:5 No - LINC01801:20 No - lnc-TMEM105-2:8 No - lnc-COX10-3:1 Yes chrX:19248639-19252045 EWSAT1:7 No - LINC01833:43 No - lnc-TTC24-1:5 No - lnc-PRSS27-4:21 No - lnc-CYP2J2-1:1 Yes chr3L:4022700-4026011 lnc-PLA2G4A-4:1 No - lnc-ATG9B-2:5 Yes chr2R:16294400-16297232 LGALS8-AS1:1 No - lnc-METRNL-10:3 No - lnc-SEMA6C-1:1 No - lnc-MTFR2-2:11 No - MYB-AS1:3 Yes chrX:15854832-15857823 lnc-LRMP-2:1 Yes chrX:13396899-13401224 lnc-WDR70-7:14 No - DIAPH2-AS1:7 Yes chr2L:20758144-20768053 lnc-PMM2-6:3 Yes chrX:16792119-16797742 lnc-URB1-1:1 No - lnc-CLK4-4:1 Yes chr3R:16502770-16571363 lnc-LRRD1-1:1 No - LINC00852:1 No - lnc-MEIS2-1:4 No - EDRF1-AS1:23 Yes chr3L:8721324-8726108 lnc-BEGAIN-2:1 No - SHANK2-AS3:1 Yes chr2R:14060456-14140902 lnc-ADAMTS12-3:2 No - lnc-EXOSC6-3:20 No - lnc-ARHGAP28-10:5 No - LINC01630:15 No - lnc-CCL2-6:1 No - lnc-C6orf132-1:1 No - lnc-AAGAB-1:26 No - lnc-ERG28-2:5 No - lnc-MRPL16-1:1 No - lnc-SOX9-5:1 No - lnc-NR5A1-1:1 Yes chrX:1941940-2007956 lnc-CLSTN2-1:1 Yes chr4:1112874-1123357 LNCSRLR:3 No - MAFTRR:3 No - MAGI2-AS3:47 No - lnc-FAM222B-3:1 Yes chr2L:4361925-4380716 lnc-MSMP-1:1 Yes chr3R:5219657-5221548 ANKRD10-IT1:1 No - lnc-CTSZ-1:1 Yes chr2R:23942538-23946936 lnc-TUBA1C-1:5 No - lnc-ZNF286A-3:1 No - lnc-DGCR6-2:27 No - lnc-GNS-2:1 No - lnc-MBL2-3:1 No - LINC02205:3 No - lnc-CEP170-13:1 No - lnc-DTWD1-7:6 No - lnc-ANP32A-3:2 No - lnc-PPP1R3B-1:1 No - LINC01989:12 No - lnc-KIAA0319L-1:1 Yes chr3L:21586828-21613349 lnc-KAT8-1:1 No - lnc-KLHDC4-1:7 No - lnc-ZFP1-1:1 No - lnc-BRD3OS-2:2 Yes chrX:8037808-8061436 MINCR:15 No - LINC01630:13 No - lnc-GRAPL-5:3 No - L3MBTL4-AS1:3 Yes chr3R:27266326-27273273 lnc-USP53-6:2 Yes chr3L:5812135-5813093 lnc-SLC39A11-1:21 No - RFPL1S:12 No - lnc-ABCC3-1:1 No - FAM83A-AS1:1 No - LINC01606:2 No - lnc-MAP3K9-3:7 No - lnc-UEVLD-2:1 Yes chr3L:16842294-16844585 lnc-CORO6-5:1 No - lnc-PCGF2-1:1 Yes chr3R:7094596-7124185 lnc-IL17B-3:1 No - FBXL19-AS1:2 Yes chr3R:9052495-9063245 lnc-PPM1H-3:2 No - lnc-FBLL1-3:1 Yes chr2R:15869495-15922118 IQCH-AS1:14 No - lnc-PIGBOS1-1:6 No - EIPR1-IT1:3 Yes chr3L:12502467-12503894 lnc-FAM196B-1:1 Yes chr3R:23781765-23801634 lnc-CAPZA3-1:1 No - LARS2-AS1:1 Yes chr3L:4825853-4829038 lnc-VDAC2-1:13 Yes chr3R:26989035-26989852 TMLHE-AS1:1 No - lnc-NUPL2-2:1 No - lnc-TAF4B-7:1 No - lnc-PHF14-14:9 No - lnc-GPR137C-1:1 Yes chr3L:4170404-4173789 lnc-COX6C-1:1 Yes chr3R:29935978-29948207 lnc-SOCS5-1:1 No - PROSER2-AS1:4 No - lnc-MEX3B-4:1 No - lnc-SLC25A48-3:2 No - LINC00115:30 No - lnc-PGGHG-1:3 No - lnc-CCDC40-1:2 Yes chr2L:10432687-10435656 lnc-NME4-1:3 Yes chr3R:25199818-25214255 lnc-RPRM-3:1 Yes chr2L:5072170-5093592 lnc-GNS-1:1 No - FANK1-AS1:2 No - PXN-AS1:6 No - lnc-COIL-3:1 Yes chrX:5412386-5420867 lnc-POLR1E-2:4 No - lnc-PSMD7-9:2 Yes chr4:501810-540874 lnc-ZCCHC17-2:1 No - lnc-NT5DC3-1:1 No - lnc-MAST4-5:6 No - C4A-AS1:1 Yes chr2L:8074117-8082982 LRRC75A-AS1:45 No - lnc-C16orf78-5:8 No - lnc-IL32-1:1 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-C17orf97-4:2 No - lnc-USP53-4:1 No - LINC01586:2 No - lnc-SYT1-3:1 No - lnc-ERICH1-22:1 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-GGCT-1:19 No - lnc-SLC39A11-1:12 No - lnc-GPBP1L1-3:4 Yes chr2L:13216290-13219923 PKP4-AS1:6 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-SLC22A31-4:2 No - lnc-STMND1-4:11 No - lnc-POLD3-2:1 No - lnc-RABL2B-2:1 No - MIR133A1HG:1 Yes chr3L:16006552-16011812 lnc-WDR45B-1:1 Yes chr3L:11114169-11120783 lnc-PLSCR3-1:2 No - lnc-EBF3-1:1 Yes chr3R:6658806-6660100 lnc-TMEM43-1:1 No - UVRAG-DT:18 No - lnc-EMP2-1:4 Yes chrX:1483625-1507809 lnc-TRAPPC3L-1:1 No - lnc-FAM192A-1:1 No - SP2-AS1:12 No - lnc-SMYD3-2:1 Yes chr2L:7844905-7855475 THRB-IT1:1 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-AMELY-5:2 No - lnc-PAX8-1:2 Yes chr3R:22587755-22608842 lnc-RSPH1-3:1 No - lnc-SPPL3-1:2 No - lnc-ZNF131-10:1 No - lnc-RPS6KA6-1:1 No - MIR22HG:15 No - LOXL1-AS1:17 Yes chr2R:21789623-21791580 BGLT3:1 No - lnc-LIFR-1:1 No - lnc-PANK3-3:1 Yes chrX:10964032-10967134 TAB2-AS1:7 No - lnc-RIPOR3-1:1 Yes chr3L:1342493-1475257 lnc-TMEM178A-1:15 No - LINC00266-1:1 No - lnc-PABPN1L-1:1 Yes chr2R:24275734-24291084 TH2LCRR:2 No - lnc-CBLL1-1:3 Yes chr2L:19580612-19582474 lnc-RPL38-3:1 No - lnc-CLEC20A-5:1 Yes chrX:17710144-17752007 NADK2-AS1:1 Yes chr2R:9089774-9092893 LINC01499:2 No - lnc-SUZ12-3:1 No - LOXL1-AS1:5 Yes chr2R:21789623-21791580 lnc-OCA2-2:2 Yes chrX:15921955-15924558 CCNT2-AS1:6 No - lnc-MMP24OS-73:10 No - lnc-UBLCP1-6:1 Yes chr2R:14772650-14807061 lnc-SCOC-1:1 No - lnc-BEX1-1:1 Yes chrX:12459796-12463112 lnc-ARHGEF2-1:8 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-RAD1-2:1 No - lnc-TRPT1-1:2 No - TTLL10-AS1:1 No - lnc-HDAC9-1:1 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-EXOSC6-3:26 No - lnc-PABPC4-1:27 Yes chr2R:23851562-23853247 lnc-ROPN1L-14:1 No - SP2-AS1:7 No - lnc-ATG2B-1:2 No - lnc-MT1G-1:1 No - lnc-STEAP1B-1:1 No - lnc-AMELY-19:2 No - lnc-IRX3-80:8 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-C17orf58-3:1 No - RHOXF1-AS1:3 No - DLGAP1-AS5:2 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-METTL4-2:4 No - PRR29-AS1:2 No - lnc-RPS27L-9:7 Yes chr3L:8545001-8574409 lnc-TC2N-1:1 No - lnc-SLC2A13-3:1 No - lnc-ZNF33A-137:7 No - lnc-SERHL2-1:4 No - lnc-ACAA1-1:1 No - THUMPD3-AS1:16 No - lnc-PRR4-1:10 No - lnc-TMEM105-2:7 No - THAP9-AS1:7 Yes chr2R:8893613-8898798 MIR3976HG:13 No - lnc-SVBP-1:2 No - lnc-ZFC3H1-7:1 No - lnc-SDK2-4:1 No - PCBP1-AS1:69 No - IL21R-AS1:2 No - lnc-NPC1-1:1 No - lnc-PLEKHA8-1:1 No - LINC01269:3 No - lnc-SRRD-1:1 No - lnc-TBCD-2:1 No - HAND2-AS1:11 No - BBOX1-AS1:4 Yes chr2R:13375975-13377731 LINC02377:11 No - lnc-EPS8L2-1:1 Yes chr3L:19818174-19830686 lnc-PRKACG-3:1 Yes chr2R:22874769-22881436 lnc-GGCT-1:5 No - lnc-ULBP2-2:2 No - HORMAD2-AS1:5 No - lnc-HSPA4-3:1 No - SNHG15:11 No - lnc-OCA2-3:1 Yes chrX:15921955-15924558 IQCJ-SCHIP1-AS1:4 Yes chr2L:10328200-10331116 lnc-ALDH1A3-1:11 No - lnc-TBCK-3:2 Yes chr3R:26863376-26864559 KDM4A-AS1:2 No - lnc-POLR3E-2:1 Yes chr2L:20678921-20681846 lnc-NDC80-4:1 No - lnc-NR2F2-2:2 No - SNHG20:9 Yes chr2L:6448464-6455929 lnc-DNAAF5-2:2 Yes chr3L:20816118-20836048 lnc-RALGAPA1-2:1 No - lnc-CLEC3A-5:1 Yes chr2L:7999670-8004286 lnc-SLC1A2-2:2 No - lnc-PAPOLA-1:3 No - lnc-ART1-10:1 No - lnc-NSUN6-1:2 No - GAPLINC:8 No - HAND2-AS1:35 No - lnc-TP53TG3-168:1 No - lnc-TNN-2:1 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-PRR26-2:1 No - DLG3-AS1:3 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-C5orf49-1:1 Yes chr3L:19939287-19977960 C21orf91-OT1:1 No - lnc-TOR1AIP2-3:1 No - lnc-ZNF154-1:2 No - lnc-S1PR1-1:1 No - MIR3936HG:20 No - lnc-PANK3-4:1 Yes chrX:10964032-10967134 lnc-SPI1-1:1 Yes chr3R:29863701-29868895 LINC02367:6 No - lnc-KRTAP9-7-1:1 No - lnc-COA6-2:1 Yes chr3R:20740108-20756639 lnc-TFPT-1:1 Yes chr3L:15159100-15161138 lnc-COMMD10-14:1 Yes chr2R:17672839-17683499 lnc-A1CF-1:1 Yes chr2L:3622074-3656953 lnc-TBC1D28-1:1 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-PRAMEF15-1:4 No - lnc-BBOX1-1:1 Yes chr2L:13982743-14001248 lnc-GABPA-2:1 Yes chrX:530501-579044 lnc-RSPH1-1:1 Yes chr2R:21282298-21285679 lnc-PRKG1-1:1 No - lnc-PSMA8-1:1 Yes chr3L:16113212-16121651 lnc-KCNJ9-1:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-DTWD2-1:1 Yes chrX:6240745-6255487 lnc-USP35-5:1 No - ANKRD34C-AS1:7 No - LINC01974:5 No - DLGAP1-AS2:1 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-ELFN2-2:8 No - lnc-OCA2-1:1 No - lnc-OTOGL-5:1 Yes chr3L:16051959-16082026 LINC00937:6 No - LINC00999:1 No - lnc-OTOA-1:1 Yes chr2R:23896896-23898246 lnc-TRIM29-1:2 Yes chr2L:12587625-12628135 LINC01922:7 No - lnc-CHMP4C-1:1 No - lnc-MASP1-1:1 No - SENCR:1 Yes chr3L:6097617-6123913 lnc-RNF13-6:2 No - RDH10-AS1:3 Yes chr2L:21057706-21071502 MAFG-DT:14 No - lnc-AMELY-2:4 No - lnc-CSPG4-2:1 No - lnc-FIGNL2-6:2 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-STX16-1:1 No - LINC01896:45 No - lnc-SPATA6L-1:1 No - LINC02180:12 No - DSG1-AS1:1 No - LINC01605:7 No - ZFPM2-AS1:10 No - lnc-WASHC5-1:3 No - lnc-KIFAP3-2:3 No - lnc-PGPEP1L-25:3 No - lnc-C12orf42-7:1 No - lnc-UBE2N-1:3 No - lnc-DISP1-1:6 No - lnc-SP110-1:2 No - lnc-CDC40-1:1 No - lnc-CHST1-4:1 No - LINC00526:1 No - TRPC7-AS1:2 No - lnc-WFDC2-1:1 No - lnc-TRIM29-10:1 Yes chr3R:20860187-20866231 PRKCZ-AS1:5 Yes chr2R:14944458-14962969 lnc-DIO2-5:1 Yes chr3R:22468512-22486969 SPINT1-AS1:20 No - lnc-LIPG-2:1 No - LINC00667:14 No - EGFLAM-AS4:1 Yes chr2R:16031930-16047243 lnc-NDUFS6-2:1 Yes chr3L:12693639-12710249 lnc-AKR1D1-2:1 Yes chr3L:15535395-15553214 LINC01433:2 No - lnc-ACE-1:1 No - lnc-NOMO1-1:1 No - lnc-TMEM258-1:2 No - lnc-PLPPR5-3:2 Yes chrX:9196808-9201820 RORA-AS1:13 Yes chr2R:10203995-10237348 LRRC75A-AS1:3 No - lnc-AGRP-1:18 No - lnc-LARS-1:2 No - lnc-SLC24A5-2:1 Yes chr2R:17672839-17683499 lnc-GIP-1:1 Yes chrX:10787869-10824277 lnc-CFC1-1:1 Yes chr3L:6092188-6093313 LMO7-AS1:2 No - lnc-BIRC2-9:4 No - JARID2-AS1:3 Yes chr3L:9477038-9486530 lnc-RGS18-3:1 No - lnc-TPSB2-1:1 No - RHOXF1-AS1:2 No - lnc-RHOB-3:1 No - lnc-RAB18-2:1 No - lnc-MPHOSPH8-3:1 Yes chr3R:27256595-27264055 lnc-TOR2A-3:1 No - lnc-IGFALS-1:1 Yes chr3L:15968204-15969902 SNHG19:2 No - lnc-SAMD3-1:1 Yes chr3R:27266326-27273273 lnc-TRIM45-1:1 No - lnc-SALL3-4:1 No - lnc-WRAP73-3:1 No - lnc-RFPL4B-1:1 No - lnc-LRP12-1:1 No - lnc-EMC3-1:15 Yes chr2L:10731400-10732423 lnc-CDRT4-4:1 No - lnc-ZNF124-1:1 No - lnc-TM6SF1-3:1 No - lnc-CEP170-4:1 Yes chr3R:16099228-16105670 LINC00470:7 No - lnc-USP35-2:1 Yes chr3L:2589414-2595590 lnc-RTN4-2:1 Yes chr2L:4958411-4965430 LINC02284:5 No - FAM27E5:1 No - lnc-POLR2L-1:2 Yes chr3L:14776496-14786412 lnc-TLE3-2:1 No - lnc-NAPG-4:2 Yes chr3R:2554162-3263582 LURAP1L-AS1:2 No - lnc-RASGEF1B-1:4 Yes chr2R:17514217-17517445 lnc-FBLL1-4:25 Yes chr2R:15869495-15922118 RBPMS-AS1:2 No - LINC00556:3 No - FLNB-AS1:2 No - lnc-TNFRSF11B-1:1 No - lnc-CHAD-3:1 No - lnc-GRAP-6:1 No - CCNT2-AS1:8 No - lnc-KRAS-1:2 No - lnc-SLCO4A1-5:1 No - lnc-ZNF316-3:1 No - lnc-GDE1-3:5 No - lnc-DNAJB6-10:4 Yes chr2L:1008378-1048053 lnc-ACSF3-1:6 No - lnc-FXN-1:1 No - lnc-RPS27L-9:8 Yes chr3L:8545001-8574409 lnc-PTPRU-1:1 Yes chr2R:13860349-13862002 KLF3-AS1:6 Yes chr2R:23011078-23042943 lnc-THEMIS-2:1 No - lnc-AMELY-1:5 No - MKLN1-AS:5 Yes chr2R:12628697-12632378 EMX2OS:6 No - lnc-MYL10-2:1 Yes chrX:7609148-7678859 ANO1-AS1:1 Yes chrX:11877737-11887162 lnc-RNF135-1:25 No - lnc-LRRTM1-2:1 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-DGCR6-2:25 No - FAR1-IT1:1 Yes chrX:2201820-2203866 lnc-PRR15L-3:1 No - lnc-OLR1-2:1 No - SPIN4-AS1:1 No - HORMAD2-AS1:6 No - lnc-RCC1L-2:1 No - lnc-CLVS2-3:1 Yes chr2R:24881570-24888615 lnc-GTDC1-7:1 No - C5orf66-AS2:4 No - lnc-ARHGAP11A-1:1 No - lnc-C20orf202-1:3 Yes chr2R:11967343-11970115 lnc-PAWR-3:1 No - lnc-C2CD4B-2:1 No - lnc-TBCCD1-4:59 No - lnc-CDK5R1-4:1 Yes chr2L:10491814-10506779 lnc-UACA-1:1 No - lnc-NME3-1:1 Yes chr3L:7916650-7936120 lnc-TACR2-1:1 Yes chrX:9585675-9589813 ZBED3-AS1:20 No - lnc-FAM153C-10:1 No - lnc-POMGNT1-1:12 No - lnc-RGS5-1:13 No - NAALADL2-AS2:1 No - lnc-HDDC3-7:1 No - lnc-FAM161B-1:2 No - lnc-SH2D7-1:1 Yes chr2R:24445500-24446839 lnc-RTN1-1:1 No - lnc-AGT-6:6 Yes chr3L:9888762-9893319 lnc-KATNA1-2:1 No - lnc-ADCYAP1-2:4 No - lnc-CDK12-2:1 No - lnc-TBK1-1:1 No - lnc-NPBWR1-4:2 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-SLC25A37-3:1 No - lnc-PSMA2-2:2 Yes chrX:9608946-9623243 lnc-AGBL1-3:1 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-TNFRSF21-1:1 Yes chr3R:30808617-30827005 AGBL4-IT1:1 Yes chr3R:30597004-30599296 lnc-WDR26-2:1 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-MTRNR2L1-14:1 No - lnc-MYB-2:1 No - lnc-RGS9-16:1 No - lnc-FAM120B-1:1 No - lnc-CEP170-13:6 No - lnc-HTR1A-1:1 No - lnc-RIPK1-11:4 No - lnc-OPHN1-1:1 No - ARLNC1:12 No - DLGAP1-AS1:8 Yes chr2R:5702112-5705439 CSMD2-AS1:9 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-CBX4-1:1 No - DLX6-AS1:35 Yes chr2R:24814822-24835667 lnc-OXR1-1:1 No - lnc-CPHXL-1:1 No - lnc-G3BP1-3:12 No - PCBP1-AS1:200 No - PCAT1:65 No - lnc-PINX1-6:3 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-MKKS-1:1 No - lnc-IFITM3-1:1 No - IRAIN:10 No - lnc-CRLF3-8:1 No - lnc-MFAP4-3:13 No - lnc-ZNF217-3:1 No - lnc-TMEM170A-4:1 Yes chr2R:1343403-1345119 lnc-CHST9-6:4 No - BPESC1:1 Yes chr3R:27916908-27918248 lnc-DPH6-2:1 No - PCBP1-AS1:164 No - LINC02167:7 No - lnc-C2orf54-1:1 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-ICA1-1:3 No - lnc-TRIP4-1:1 Yes chr2R:18278198-18357296 lnc-GLYATL2-1:1 No - lnc-CEP170-13:16 No - lnc-DALRD3-1:12 Yes chr2R:22212835-22217264 RNF219-AS1:18 Yes chrX:15350239-15379064 LINC00504:7 No - lnc-FBLL1-4:6 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-HBE1-1:2 No - FAM198B-AS1:30 No - lnc-ATG14-1:1 No - lnc-CLEC18B-7:3 Yes chr2R:24400028-24404527 lnc-LEPROT-1:1 No - lnc-G2E3-2:1 Yes chr3R:18303279-18314407 lnc-PRDM7-1:1 No - lnc-MAST4-5:9 No - lnc-LEMD3-1:1 Yes chr3R:10863355-10868642 RMDN2-AS1:4 No - BVES-AS1:1 No - lnc-PRSS3-2:11 No - lnc-NAT8L-1:1 Yes chr3R:12705523-12712299 lnc-SPATA32-1:6 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-ZSWIM2-1:1 No - lnc-PABPC4-1:22 Yes chr2R:23851562-23853247 lnc-DISP1-1:3 No - EDRF1-AS1:24 Yes chr3L:8721324-8726108 lnc-EGFL7-3:1 Yes chrX:3134870-3172221 lnc-MARCKSL1-1:1 Yes chr3L:4626734-4629467 lnc-JPH1-3:3 No - BAIAP2-DT:22 No - LINC00543:5 No - MIR3976HG:9 No - LINC01977:10 No - lnc-HIC1-1:1 Yes chr3R:25029429-25033465 lnc-EPN2-1:9 No - lnc-ORC4-1:1 Yes chr3R:14619030-14625703 lnc-TNFSF4-3:7 No - lnc-HIST2H3D-2:1 No - lnc-RPS27L-9:6 Yes chr3L:8545001-8574409 FAM138E:5 No - lnc-METRNL-3:1 Yes chr2L:2147518-2151664 lnc-ZDHHC13-2:1 No - LRRC75A-AS1:61 No - lnc-FOXL1-1:1 No - lnc-RNF135-1:20 No - lnc-ANKRD30B-2:2 No - SNHG15:12 No - MIR202HG:2 No - LINC01387:2 No - lnc-TSPO-3:1 Yes chr3L:7562610-7569499 lnc-TP53TG3-4:3 No - LINC01510:7 No - UBR5-AS1:1 No - lnc-FANCF-3:2 Yes chr2L:2391660-2410662 lnc-INTS8-1:1 Yes chrX:11891732-11893745 CACNA1C-AS3:1 Yes chr2L:16165831-16190540 WDR86-AS1:7 No - lnc-AVEN-1:1 No - lnc-ATF7IP-1:1 Yes chr3L:5343619-5355923 lnc-PHF14-14:4 No - lnc-GOLPH3-1:1 Yes chr2R:22855688-22858794 ST6GAL2-IT1:1 Yes chr2R:24691422-24694386 lnc-ZNF18-1:1 No - lnc-IRX2-1:1 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-MAT2B-3:18 No - LINC01011:2 No - HLCS-IT1:1 Yes chr3R:5474899-5485393 MIR4713HG:7 No - lnc-AMELY-30:2 No - lnc-PUM3-1:1 Yes chr3L:15970082-15982869 FOXP4-AS1:2 No - lnc-EPB42-1:6 No - lnc-AKR1C1-2:2 Yes chr3L:11620535-11624381 SCEL-AS1:1 No - lnc-LRRC24-2:8 Yes chr3L:8170640-8175978 lnc-FGF3-4:1 Yes chr2R:14060456-14140902 LINC02177:24 No - lnc-CHRNA5-1:1 Yes chrX:8276200-8367169 lnc-SEBOX-1:1 Yes chr3R:22362620-22364580 lnc-MAB21L1-2:1 No - lnc-HPD-1:1 No - LINC01833:31 No - lnc-SLC25A32-9:1 No - lnc-SPATA17-2:1 No - lnc-FAM83G-2:1 Yes chr3R:30592971-30601489 lnc-SNRPN-8:121 No - lnc-METTL22-1:1 No - lnc-LRRC40-2:2 Yes chr2R:14935660-14940722 OSBPL10-AS1:3 Yes chr3L:1034697-1036298 lnc-KIF16B-4:1 No - lnc-OR4F29-1:2 No - lnc-FOS-1:1 No - NRSN2-AS1:8 No - lnc-NEURL3-1:2 No - lnc-OTX2-9:1 No - HAND2-AS1:39 No - LCMT1-AS1:4 No - lnc-PARN-8:2 No - lnc-CALB2-3:1 No - lnc-POU4F2-2:1 No - LINC00686:1 No - lnc-BOD1-4:2 No - LINC00334:1 No - lnc-CSF1-1:1 No - KCNQ5-IT1:1 Yes chr2R:10145897-10192394 lnc-FSCN2-1:1 No - lnc-USP53-6:11 Yes chr3L:5812135-5813093 lnc-NKX6-3-1:1 Yes chr2R:24068757-24073552 lnc-OR4N4-1:2 No - lnc-GPR26-1:1 No - lnc-PLCG2-8:1 Yes chrX:16350315-16356482 ENTPD1-AS1:5 No - lnc-NSUN6-4:1 No - HOXD-AS2:1 Yes chr3R:6752864-6754194 LCMT1-AS1:1 No - lnc-MYEOV-1:2 No - lnc-SPOP-1:1 No - lnc-CRLF3-2:1 Yes chr3L:16132028-16136691 lnc-ENPP2-1:1 Yes chr3L:17690015-17748839 lnc-MLST8-1:1 Yes chrX:2706151-2707427 FMR1-IT1:1 Yes chr3R:10101420-10110121 lnc-CHRAC1-8:2 Yes chr2L:20650755-20656178 lnc-SSTR5-1:1 No - lnc-MYOC-1:1 Yes chr2R:6642418-6645098 LINC00562:8 Yes chr3R:8938724-8943027 lnc-NOMO2-2:1 No - lnc-HAGH-1:1 Yes chrX:7918517-7920131 lnc-TPCN2-3:1 No - lnc-UBAP1-1:2 Yes chr3R:12014943-12017031 lnc-SLC12A7-5:3 No - lnc-SNX33-2:1 Yes chr3L:2652088-2655455 LINC01584:12 No - lnc-PGPEP1L-25:1 No - lnc-SLC25A19-1:1 Yes chr2R:13495222-13502841 lnc-TFEC-5:1 No - LINC01014:3 No - THAP9-AS1:1 No - lnc-METRNL-2:1 No - lnc-CPPED1-3:1 Yes chr2L:13177150-13178978 TET2-AS1:2 Yes chr3L:2786207-2879158 lnc-UPF2-5:1 Yes chr2R:13984815-13990707 lnc-PIGF-1:1 No - LATS2-AS1:1 Yes chr3R:30789625-30806619 lnc-PDE4D-5:2 No - lnc-BMI1-1:1 No - LINC01660:9 No - LINC00271:2 No - LINC02562:7 No - BAIAP2-DT:26 No - lnc-GOLGA8K-1:6 No - lnc-C21orf2-1:1 Yes chr3L:4094343-4103256 LINC00472:44 No - lnc-SLC6A4-2:1 No - lnc-SYCP2-1:1 Yes chr3L:3714826-3806459 lnc-NOS2-1:1 No - lnc-EHD3-2:1 Yes chr2L:3404460-3426719 LINC02126:9 No - lnc-LIMS4-1:5 Yes chr3R:8356978-8359964 lnc-HHIPL1-2:1 No - lnc-C17orf97-3:4 No - lnc-AK6-1:2 No - STT3A-AS1:2 No - SNHG26:23 No - lnc-SLC24A5-1:1 No - lnc-GCLC-1:7 Yes chrX:8102181-8116147 lnc-CYS1-3:2 No - lnc-MYOM1-1:2 No - HOXB-AS4:2 No - UNC5B-AS1:4 Yes chr2R:15340472-15368300 lnc-UTS2-3:2 Yes chr2R:9446046-9480076 ZEB2-AS1:8 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-ESCO1-2:1 No - LRRC75A-AS1:43 No - lnc-ICA1-3:1 No - KCNMA1-AS2:3 Yes chr3R:24662491-24711595 lnc-SLCO1A2-6:1 No - lnc-SCGB1D4-1:1 Yes chrX:15568993-15570369 lnc-DNPH1-1:3 No - lnc-FAM131B-1:1 No - OTUD6B-AS1:2 No - lnc-ZNF683-1:1 Yes chrX:7931745-7933351 lnc-PGM5-1:1 No - lnc-SLC5A8-1:1 Yes chr3L:11984906-11990505 lnc-COL9A1-1:1 Yes chr3L:1275956-1295699 lnc-ASPH-3:1 Yes chr2L:19435850-19442727 PLCE1-AS2:10 No - lnc-SLC37A4-1:32 No - lnc-MELK-1:1 Yes chr4:1088798-1113317 lnc-IRX3-80:46 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-MST1-1:13 Yes chr3L:9074643-9092131 lnc-CHD9-3:6 No - lnc-ZFP36L1-2:12 No - LINC01569:17 No - lnc-RAB40B-2:1 No - lnc-EGR2-2:1 Yes chr3R:9516007-9520938 lnc-CCT4-1:1 No - MKLN1-AS:4 Yes chr2R:12628697-12632378 lnc-TNFRSF14-2:4 No - CCDC144NL-AS1:19 No - lnc-ZBTB4-2:1 No - G2E3-AS1:10 No - lnc-FOXD1-4:3 No - DIAPH2-AS1:1 Yes chr2L:20758144-20768053 NDUFV2-AS1:6 Yes chrX:17632089-17633509 PCBP1-AS1:70 No - lnc-SPCS3-2:2 No - lnc-OPRK1-2:1 No - lnc-UAP1L1-2:1 Yes chr2R:24760664-24762605 LINC01524:1 No - lnc-PLSCR3-1:3 No - lnc-MRPS22-1:1 No - FREM2-AS1:1 No - lnc-PHF3-2:1 No - lnc-DCAF4L2-2:3 No - LINC00941:2 No - SNHG15:9 No - lnc-SLC26A11-1:1 No - lnc-CCNE2-1:2 Yes chrX:18653392-18657286 lnc-FOS-1:3 No - lnc-TLN2-1:1 No - DSCAM-AS1:4 Yes chr3R:17473935-17505667 LINC02412:4 No - lnc-SSU72P5-2:3 No - lnc-CHTF8-2:1 No - lnc-N4BP2L1-1:1 Yes chr3L:22067270-22071848 SNHG3:3 Yes chr3L:5930262-5932773 lnc-PPIC-1:1 No - lnc-CENPBD1-3:7 No - P3H2-AS1:1 No - HTR2A-AS1:4 Yes chr3R:8578205-8629996 PSMA3-AS1:5 No - CRTC3-AS1:3 No - lnc-ARSD-3:1 Yes chr2R:20304517-20308671 MIR22HG:9 No - lnc-RBBP9-5:1 Yes chrX:23022898-23035550 lnc-ALOX12B-2:1 No - lnc-IFT46-1:3 No - lnc-SYK-2:1 No - BMF-AS1:3 No - lnc-CFAP52-3:2 Yes chr3L:16586108-16587057 LINC01900:6 No - lnc-ANKRD11-2:1 No - lnc-CTAGE1-9:8 No - LINC01511:5 No - lnc-NMNAT3-3:3 Yes chr4:1112874-1123357 lnc-NKX2-5-2:1 Yes chr3R:5822026-5824532 MIR17HG:5 No - lnc-E2F7-3:1 Yes chr2L:19796365-19958424 LINC01411:8 No - lnc-SPG11-2:1 No - lnc-CPHXL-3:2 No - lnc-TRPM1-1:4 No - LINC00470:19 No - LINC02112:31 No - LEF1-AS1:8 No - LY86-AS1:4 No - ELN-AS1:6 No - NR2F2-AS1:1 Yes chr3R:12258737-12302785 lnc-LBX1-2:1 Yes chr3R:21499986-21512814 lnc-MUC20-71:3 No - lnc-BAIAP2-1:1 No - lnc-PPP4R1-11:1 No - lnc-CAGE1-1:1 No - lnc-SYT17-1:2 No - LINC00337:1 No - ZNF337-AS1:9 No - RDH10-AS1:2 Yes chr2L:21057706-21071502 DPP10-AS1:3 No - lnc-TTC30B-1:2 No - FAM230B:6 No - HCP5:1 No - lnc-NBPF9-6:1 No - lnc-CDH11-5:1 No - lnc-NOL11-1:1 Yes chr2R:17695776-17698362 LNX1-AS1:5 Yes chr3R:4485008-4487677 INHBA-AS1:1 No - lnc-FAM196A-1:1 Yes chr3R:23781765-23801634 lnc-RPP40-2:1 Yes chr3L:851346-852673 LINC00661:8 No - lnc-SNRPN-8:163 No - ACAP2-IT1:1 Yes chr3R:23118400-23124217 lnc-ANKK1-1:1 Yes chrX:20004680-20062706 lnc-C17orf97-3:2 No - DLX6-AS1:4 Yes chr2R:24814822-24835667 THAP9-AS1:12 Yes chr2R:8893613-8898798 UVRAG-DT:27 No - lnc-PRSS22-1:3 No - lnc-CLIC5-2:1 Yes chr3R:12017156-12018550 lnc-RGS5-1:6 No - lnc-ZFAND4-1:1 Yes chr3L:9386827-9399227 LINC01229:19 No - lnc-FOXJ3-1:1 No - lnc-GPS2-2:1 Yes chr3L:14043694-14049892 lnc-CHAF1B-6:1 No - lnc-ADAMTS14-3:1 No - lnc-PKD1L3-1:2 Yes chr3L:6754017-6756497 GRM7-AS3:11 No - lnc-SLC5A8-2:1 Yes chr3L:11984906-11990505 lnc-IL23A-6:2 No - lnc-KMT2B-2:3 No - lnc-CHPF-1:1 No - LINC01572:5 No - lnc-SMC4-1:1 No - LRRC75A-AS1:46 No - lnc-TUFM-3:1 No - TAPT1-AS1:5 Yes chr3R:18161392-18164397 LINC00909:5 No - MIR100HG:24 No - lnc-CS-1:1 Yes chr2R:6669024-6670076 lnc-CCL2-1:1 No - lnc-VCAN-1:3 No - lnc-TAS2R1-3:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-APPL2-1:1 No - lnc-TTC8-4:5 Yes chrX:7682338-7709385 lnc-SCN4B-51:1 No - lnc-DISP1-1:10 No - LINC00266-1:3 No - lnc-CSRP1-1:1 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-ODF4-1:1 No - lnc-CBR1-1:1 Yes chr3L:1618414-1620397 lnc-ABRA-3:1 No - PCBP1-AS1:104 No - lnc-DTL-2:2 No - lnc-SMG6-2:1 No - WWOX-AS1:7 Yes chr2L:7999670-8004286 lnc-PPIAL4A-2:16 No - lnc-ATG9B-4:1 Yes chrX:12592555-12595624 lnc-MEP1B-5:1 No - LINC00337:4 No - lnc-LRRC24-2:6 Yes chr3L:8170640-8175978 lnc-KDM5A-3:1 Yes chr3R:12695129-12697379 BCAR4:7 No - lnc-FAM237B-3:1 No - LINC00927:54 No - lnc-HHIP-2:1 No - lnc-CTSV-2:8 No - LINC01229:18 No - lnc-ANKRD20A4-9:1 No - lnc-ACTRT3-1:1 No - lnc-CCDC59-2:1 No - lnc-TTC14-1:6 Yes chr3R:10101420-10110121 RASGRF2-AS1:1 No - lnc-KRTDAP-1:4 No - lnc-FMN1-3:2 No - lnc-STARD4-2:1 No - lnc-SH3GL3-5:2 Yes chr3R:30052514-30054697 lnc-RANBP3L-4:1 No - lnc-ATF7IP2-1:1 No - LINC00367:3 No - lnc-C5orf22-2:1 Yes chr2R:22855688-22858794 lnc-MPV17L-1:1 No - ENTPD1-AS1:18 No - lnc-ITPR2-2:4 No - lnc-C11orf95-1:20 No - lnc-RTTN-4:1 No - lnc-PGGHG-1:11 No - lnc-NSRP1-2:1 Yes chrX:8437057-8441264 lnc-EFR3A-6:1 Yes chr3L:10640286-10661013 lnc-LIN7A-1:1 Yes chrX:11622015-11677338 lnc-AKAIN1-5:1 No - HLA-F-AS1:8 No - lnc-CBLL2-1:1 No - IDH1-AS1:3 Yes chr3L:8356404-8360906 lnc-EGR3-1:1 No - lnc-GINS1-2:1 No - lnc-SPOP-2:1 No - lnc-TPX2-1:1 No - lnc-ZFAND6-1:1 Yes chr3L:4072032-4073954 lnc-MUC20-67:89 No - lnc-TELO2-2:1 Yes chr2R:12572068-12575299 lnc-OR2C3-1:4 No - lnc-KCTD16-1:1 Yes chr3R:20894452-20897320 lnc-THOC1-1:1 No - LINC00668:2 No - lnc-ANKRD34B-2:1 Yes chr2L:7983946-7986785 lnc-PMM2-1:1 Yes chr3L:16780100-16782419 lnc-OCA2-2:1 Yes chrX:15921955-15924558 lnc-NEK3-1:1 No - WDR86-AS1:1 No - lnc-CLEC6A-2:1 No - lnc-TSPO-1:1 Yes chr3L:7562610-7569499 lnc-ZNF251-2:4 No - UVRAG-DT:26 No - lnc-C11orf54-1:1 No - WAC-AS1:5 No - ANKRD34C-AS1:9 No - lnc-TMEM114-1:1 No - RGMB-AS1:4 No - HCG11:6 No - lnc-GRID2IP-1:1 No - lnc-PLA2G7-2:1 No - lnc-PPM1D-1:2 No - lnc-KLHL25-11:1 No - ZNF503-AS1:2 No - THUMPD3-AS1:26 No - lnc-EPCAM-3:9 Yes chr2L:14362069-14366840 lnc-PUS3-1:1 No - CRTC3-AS1:1 No - lnc-CSNK1G3-2:1 Yes chr2R:18278198-18357296 FAM138E:4 No - lnc-IGFBP4-1:2 No - ETV5-AS1:1 Yes chr3R:24788054-24797955 ATXN8OS:6 Yes chrX:9250420-9255953 NTM-AS1:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-LAMA1-3:2 Yes chr2R:4744348-4758048 lnc-PDE4D-2:1 No - lnc-DTHD1-5:3 No - CERS6-AS1:3 Yes chrX:6257668-6267228 ZFPM2-AS1:2 No - lnc-FEZ2-7:11 No - lnc-IRX2-8:1 No - lnc-GAPDH-1:1 No - lnc-CIB1-2:2 No - lnc-DPCD-1:1 Yes chr3R:21219077-21222843 SSTR5-AS1:3 No - lnc-PTGDR2-3:1 No - lnc-SLC39A8-1:3 No - lnc-TAOK1-1:3 No - lnc-ESRP1-1:2 Yes chr2R:23360192-23366355 lnc-TMEM71-1:1 Yes chr3R:12352143-12356265 lnc-IL17B-3:3 No - lnc-FAM69C-1:1 Yes chr2R:5697872-5700212 lnc-IDNK-3:9 Yes chr2L:10344442-10347706 lnc-LRP1B-1:1 Yes chr2R:8174165-8226438 lnc-ZNF33A-137:2 No - lnc-ANKRD30B-13:4 No - lnc-USP47-1:1 Yes chr3R:28748384-28751661 KCND3-AS1:4 Yes chr3L:19566851-19584568 lnc-ZNF735-4:1 No - LINC01735:3 No - lnc-KIF15-1:1 Yes chr2L:8011405-8026898 lnc-CHAD-3:2 No - lnc-HMHB1-1:1 No - lnc-TOB1-1:1 No - lnc-TP53TG3-8:1 No - lnc-MYEF2-9:2 Yes chr2R:17672839-17683499 lnc-CA8-4:1 Yes chr2R:6696739-6699469 NECTIN3-AS1:12 No - STARD13-AS:39 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-NRDE2-1:1 Yes chr2L:3784947-3785622 lnc-SLC39A11-1:15 No - lnc-IDNK-3:5 No - LOXL1-AS1:18 Yes chr2R:21789623-21791580 THUMPD3-AS1:13 No - lnc-SRSF1-1:1 No - MIR4435-2HG:13 No - lnc-IL2RA-2:1 No - lnc-OAZ3-2:1 No - lnc-WDR34-2:1 Yes chr2R:8627900-8630186 DLGAP4-AS1:5 No - lnc-HPGDS-8:1 Yes chr2L:4830846-4835300 RBMS3-AS3:1 No - LINC02167:9 No - lnc-LINC02210-CRHR1-52:16 Yes chr2R:12474424-12487986 lnc-DUOX2-1:1 Yes chr3R:7052335-7054541 lnc-USP6-4:12 No - lnc-CLEC16A-7:2 No - lnc-KLF8-4:1 No - C1RL-AS1:3 No - lnc-CBX5-5:1 Yes chr3R:17150587-17151630 lnc-NT5DC1-2:1 No - FAM170B-AS1:6 No - SNAI3-AS1:8 No - HYI-AS1:1 No - HOXB-AS4:1 No - lnc-SELENOF-2:11 No - lnc-GRAP-7:1 No - lnc-SRSF2-4:3 No - lnc-CDH8-10:1 No - SHANK2-AS2:1 Yes chr2R:14060456-14140902 lnc-PARN-7:2 Yes chrX:4314230-4318801 lnc-MTERF2-2:1 No - lnc-SMC1A-1:1 Yes chrX:18091259-18092853 lnc-CDRT1-2:1 No - lnc-PSCA-3:1 No - CDKN2B-AS1:4 Yes chr3R:25036944-25037982 PLCB1-IT1:2 Yes chr2L:305935-355566 lnc-KIAA1147-4:1 No - LINC02592:8 No - lnc-CCL2-4:1 No - NUTM2A-AS1:3 No - LINC01554:7 No - lnc-C16orf78-11:1 No - lnc-PMM2-4:1 Yes chrX:12022837-12029032 lnc-MMP24OS-73:6 No - lnc-XPC-10:2 Yes chrX:5966279-5986699 GK-IT1:1 Yes chr3L:1738407-1745421 lnc-UBE2N-1:9 No - LINC00336:1 No - lnc-PTGDR2-2:1 Yes chrX:19616196-19616825 lnc-HSF2-1:1 No - lnc-MMD-3:1 No - lnc-CTAGE1-9:20 No - lnc-PPP1R3D-4:1 No - MYO16-AS2:1 No - lnc-SQOR-1:10 No - MIR1-1HG-AS1:42 No - lnc-SEC22C-2:2 No - RNF185-AS1:1 No - lnc-SVBP-1:12 No - FAM170B-AS1:5 No - lnc-SOCS2-10:1 No - lnc-MON2-2:4 No - lnc-GREM2-2:1 Yes chr2L:3872646-3902860 lnc-RCN1-1:3 Yes chr3L:1298672-1300389 lnc-PPP1R14B-1:1 No - lnc-USP14-4:2 No - lnc-CYS1-1:1 No - lnc-AGAP2-2:1 No - lnc-MACC1-1:6 No - lnc-NUAK1-2:1 No - lnc-ZGRF1-2:3 No - lnc-UBAP1-1:1 Yes chr3R:12014943-12017031 lnc-ERGIC1-2:1 No - SPATA8-AS1:2 No - lnc-LIMS3-1:10 Yes chr3R:8356978-8359964 ZNF503-AS1:4 No - lnc-FRMD5-1:1 No - lnc-PRPF18-1:2 No - lnc-LGALS9C-3:1 No - lnc-SNX20-6:1 No - lnc-SLC36A4-1:1 Yes chr3L:20005301-20024607 lnc-CDC27-2:6 No - lnc-DDX54-1:1 No - lnc-TLR2-1:1 Yes chrX:17848110-17850342 lnc-MARCH4-2:2 Yes chr2L:5070957-5072055 LINC01534:8 No - lnc-LGALS2-1:1 No - lnc-COG5-2:1 Yes chr2R:9993890-10026042 lnc-TPSG1-1:1 Yes chrX:6104085-6192483 lnc-GPR39-1:1 No - GATA6-AS1:2 No - ESRG:1 Yes chr2R:13805794-13819571 lnc-TIGIT-9:2 No - RORB-AS1:1 Yes chr2R:10203995-10237348 NALT1:8 No - lnc-TMC7-4:1 No - lnc-FRY-1:1 Yes chr3L:9631834-9679103 TM4SF19-AS1:1 No - lnc-TESMIN-1:3 Yes chr3L:6164916-6173880 lnc-LAMA1-2:1 Yes chr2R:4744348-4758048 lnc-CTIF-2:1 Yes chr2R:8944298-8947344 lnc-SDK2-3:2 No - LINC02465:13 No - lnc-ZNF705E-1:17 Yes chrX:19243631-19245224 lnc-VCAN-1:1 No - lnc-ZNF442-1:1 No - lnc-PRC1-5:2 No - lnc-HSD17B2-1:1 No - AADACL2-AS1:1 No - CHL1-AS2:3 Yes chrX:8517373-8555170 LRP1-AS:1 Yes chr2R:8174165-8226438 MIR762HG:1 Yes chrX:9356634-9358594 LINC00892:6 No - lnc-CHD9-2:3 No - ST7-AS2:4 Yes chr3L:20806868-20809272 lnc-RNASEH1-2:1 No - lnc-JPH1-3:1 No - lnc-CWC15-3:1 No - MIR124-2HG:12 No - MRPS30-DT:70 No - lnc-DTL-2:1 No - lnc-LAMB3-1:2 No - lnc-TNS3-1:1 No - ADGRA1-AS1:2 No - ID2-AS1:6 No - lnc-LRCOL1-2:14 No - lnc-ACSL4-1:1 No - lnc-GPR65-3:2 No - lnc-ARHGAP23-1:1 Yes chrX:1673110-1692768 lnc-FBXL17-1:1 Yes chr3R:9367603-9394546 lnc-LIMS4-1:10 Yes chr3R:8356978-8359964 LINC01299:1 No - lnc-PTPN9-1:2 No - lnc-GSN-1:1 No - lnc-SKA2-2:1 Yes chrX:10205292-10212374 LINC02188:13 No - lnc-PSMB4-1:1 Yes chr3R:6449944-6456676 TRIM52-AS1:15 No - lnc-BRF2-7:2 No - lnc-YWHAZ-1:1 No - lnc-INPPL1-2:1 No - EGFR-AS1:2 Yes chr2R:21522420-21559977 lnc-CIT-6:1 No - lnc-AATK-4:2 No - lnc-CENPV-2:1 Yes chrX:6282037-6283575 lnc-SIX6-1:1 No - lnc-BTBD10-5:1 Yes chrX:15804370-15827682 AQP4-AS1:7 No - lnc-NDUFB1-1:10 No - LINC01006:8 No - lnc-LIMS4-1:3 Yes chr3R:8356978-8359964 lnc-LSMEM1-8:3 No - ZMYM4-AS1:1 Yes chr3R:27256595-27264055 lnc-CHFR-3:4 No - lnc-CHST6-1:1 No - lnc-C11orf96-1:1 No - NECTIN3-AS1:14 No - lnc-RASSF5-1:1 No - FAM181A-AS1:4 No - lnc-LOX-4:2 No - lnc-GLIS2-2:1 Yes chrX:15510877-15554278 lnc-NSUN6-8:2 No - lnc-WDPCP-1:2 Yes chr3L:13011976-13015332 lnc-PKN3-1:1 Yes chr3L:1490951-1496643 lnc-FBXW8-2:1 Yes chr3R:5478390-5483906 lnc-SPIDR-1:7 No - lnc-RPLP1-12:45 No - lnc-ADPRM-5:7 No - lnc-TPR-1:1 Yes chr3L:2117466-2151700 lnc-NPBWR1-9:1 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-SHISA9-4:1 Yes chr2L:13177150-13178978 lnc-SALL3-5:1 No - lnc-RPLP1-12:8 No - AATBC:13 No - lnc-ZNF516-4:3 No - TMEM44-AS1:9 No - lnc-PALLD-2:1 No - MIR9-3HG:16 No - MIR4435-2HG:10 No - lnc-LPIN2-2:1 Yes chr3R:16649981-16651157 lnc-MTA2-1:1 No - lnc-RHOJ-1:1 No - lnc-FBXO15-2:1 No - LINC00092:4 No - HNF1A-AS1:4 No - lnc-LRRC61-1:1 No - lnc-SPRYD3-1:5 No - TUG1:28 No - ZFPM2-AS1:8 No - MIR22HG:2 No - lnc-NPIPB15-1:1 No - TMEM147-AS1:2 No - lnc-VCAN-1:2 No - lnc-KIAA1147-1:1 No - lnc-LRRC32-5:2 No - lnc-SOX14-2:1 No - lnc-TFDP2-3:1 Yes chr2R:5116990-5128321 ATP6V1B1-AS1:5 No - SNHG20:2 Yes chr2L:6448464-6455929 lnc-ZNF18-2:1 Yes chrY:22250-137486 PSMA3-AS1:25 No - lnc-BAG3-1:1 Yes chr3R:24043056-24048265 lnc-MTPAP-1:1 No - USP3-AS1:1 No - ADGRL3-AS1:5 No - lnc-RANBP3L-4:4 Yes chr2L:9333567-9341925 LINC02237:14 No - LINC02259:8 No - LINC02237:13 No - LINC01181:1 No - lnc-AGRP-1:1 No - lnc-OXR1-5:1 No - lnc-ANO3-1:1 No - lnc-OVGP1-1:1 No - lnc-CYB5R2-1:11 No - MIR4435-2HG:8 No - lnc-C2orf54-1:3 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-SEMA5A-2:1 No - lnc-EXOC2-6:1 No - TCERG1L-AS1:1 No - LINC01277:11 No - lnc-AMELY-3:2 No - PCBP1-AS1:102 No - TUG1:25 No - lnc-FSIP1-4:14 No - lnc-AHCY-1:1 No - DSCR9:7 No - EDRF1-AS1:15 Yes chr3L:8721324-8726108 KCNJ6-AS1:1 Yes chr3R:23168317-23185642 LINC02564:10 No - lnc-MARCH10-1:4 No - FEZF1-AS1:5 Yes chr2L:1950239-1970362 lnc-FAM160A1-2:1 Yes chr3R:24128049-24130255 lnc-CEP170-13:12 No - lnc-CTDSP2-2:2 No - lnc-RPRML-3:10 Yes chr3L:5366455-5367381 lnc-GFM1-6:2 Yes chr2L:4838347-4841465 lnc-SPINK1-1:1 No - lnc-KRT80-1:1 No - lnc-CCDC144A-1:1 No - lnc-NPY4R-2:1 No - lnc-OSBPL7-3:17 Yes chr3L:1502843-1523380 CDKN2B-AS1:1 Yes chr3R:25036944-25037982 lnc-KLHL25-6:1 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-FBXL5-1:1 No - lnc-CDIPT-1:6 No - lnc-SLC39A10-6:1 No - lnc-WDR72-1:1 No - lnc-LOX-1:2 No - lnc-CHRNA3-2:1 Yes chr3R:10408618-10412869 lnc-RGMA-1:1 No - lnc-SPARCL1-1:4 No - LINC00909:7 No - lnc-SLC7A7-1:3 Yes chr3L:10884261-10886471 lnc-METRNL-1:1 No - lnc-DHX38-4:5 Yes chr4:501810-540874 lnc-WDFY4-1:1 No - lnc-PGPEP1L-2:1 Yes chr3R:21570248-21619321 LINC00982:3 No - lnc-ZSCAN10-1:1 No - lnc-CDH7-1:1 No - MAP3K20-AS1:26 No - lnc-EFCAB5-2:1 Yes chr3R:24938710-24944956 lnc-STYX-5:1 No - lnc-DPP4-1:1 No - IGSF11-AS1:1 No - UPK1A-AS1:1 No - NRG3-AS1:3 No - SORCS3-AS1:1 No - MIR9-3HG:4 No - CALML3-AS1:6 No - lnc-CTR9-6:1 No - NCKAP5-IT1:1 No - KCNQ1OT1:4 No - lnc-FBXL14-3:1 Yes chr2R:9503765-9541565 lnc-CDYL2-6:5 Yes chr2R:24475386-24476032 lnc-TUSC5-2:2 Yes chr4:210224-213165 lnc-RBM4-1:1 No - lnc-PSMG3-1:2 No - lnc-PSTPIP1-1:1 No - HAND2-AS1:12 No - lnc-HLTF-1:1 Yes chr2L:9767058-9770409 lnc-C2orf40-1:1 Yes chr3L:8180923-8183369 BBOX1-AS1:6 Yes chr2R:13375975-13377731 lnc-TMSB4Y-1:1 No - lnc-CTDSP2-2:5 No - lnc-TMIGD1-3:4 No - lnc-PRR11-1:1 No - lnc-ZFAT-3:1 No - lnc-TP53TG3F-9:2 No - lnc-SEMA4D-2:2 Yes chr3L:9427010-9428671 lnc-KRTAP5-11-2:1 No - lnc-MRPL3-2:2 No - lnc-PRSS27-4:23 No - DLGAP2-AS1:3 Yes chr2R:5702112-5705439 SNAI3-AS1:1 Yes chr2L:15333866-15336138 MMP25-AS1:6 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-NPBWR1-1:1 No - LINC01592:5 No - CCDC144NL-AS1:1 No - CERS3-AS1:1 No - LINC01511:3 No - lnc-LRRC57-2:1 No - lnc-CREB5-2:9 Yes chr3R:19862517-19864393 LINC00520:11 No - lnc-OAZ3-3:1 No - LINC00473:1 No - lnc-PAWR-3:2 No - lnc-BCL9L-1:3 No - lnc-KIAA1257-1:1 No - lnc-CDKN2A-1:1 No - lnc-C10orf71-2:1 No - lnc-PRIM2-1:1 No - lnc-KRT80-3:1 No - OIP5-AS1:12 No - lnc-ZNF609-2:1 No - lnc-ZNF77-165:4 No - lnc-ANKRD30B-13:13 No - lnc-SYT15-1:1 No - lnc-SRL-1:2 No - lnc-PDZD7-2:1 Yes chr2R:23698105-23699014 lnc-SCGB3A2-1:1 No - lnc-ZNHIT2-1:1 Yes chr2R:18708152-18710865 LINC01572:1 No - lnc-TGFBRAP1-3:2 Yes chr3R:7889277-7902667 LINC02137:8 No - RGMB-AS1:5 No - lnc-SHANK2-5:2 No - lnc-TMTC4-1:1 Yes chr2R:24940625-24942413 lnc-TSC22D2-1:2 Yes chr2L:12455540-12546611 lnc-DHCR24-1:1 No - lnc-ADCK1-1:1 Yes chr3R:22468512-22486969 lnc-TMEM35B-1:1 No - lnc-NPIPB2-1:1 Yes chr2L:13177150-13178978 lnc-OR4F29-1:1 No - lnc-APOA1-4:1 Yes chr2R:18688132-18705805 lnc-IFITM2-2:4 No - lnc-ACP2-2:1 Yes chrX:15089682-15113762 lnc-DHRS7-2:2 No - LINC01859:16 No - lnc-XKR9-2:1 No - LINC01887:8 No - lnc-RBM22-1:1 No - lnc-TAB2-1:3 No - lnc-COPZ2-1:1 No - lnc-GRAPL-5:1 No - lnc-TPSB2-1:2 No - lnc-TUBB8P12-2:2 No - lnc-AGT-6:5 No - LINC02137:7 No - lnc-EN1-1:1 No - lnc-BLM-6:8 No - lnc-CILP2-1:1 Yes chrX:15992468-15996509 lnc-ZSWIM8-2:1 Yes chr4:1035288-1053703 lnc-CYB561-5:2 Yes chr3L:12008225-12064859 lnc-DGLUCY-2:2 No - lnc-C17orf97-3:1 No - ENTPD1-AS1:13 No - ZIC4-AS1:1 Yes chr3R:4852813-4869979 LINC2194:9 No - lnc-PDGFA-8:1 Yes chr3R:23605751-23669659 lnc-DISP1-1:2 No - lnc-SLC37A4-1:24 No - SLC8A1-AS1:41 No - lnc-SAMD14-1:1 Yes chr2R:9426439-9434638 lnc-CDIPT-1:1 No - LINC00927:52 No - DLGAP1-AS2:4 Yes chr2R:5702112-5705439 TBX18-AS1:15 No - MYLK-AS2:2 Yes chr2R:9716348-9748121 lnc-SPI1-1:3 No - UCHL1-AS1:2 Yes chr2L:2212738-2214211 PWRN1:16 No - lnc-KLHDC10-1:2 No - lnc-LRRC57-1:1 Yes chr3L:24074180-24299205 USP2-AS1:10 No - lnc-HSFX3-2:1 No - LINC00639:7 No - lnc-SPARCL1-1:1 No - lnc-AAGAB-1:39 No - lnc-MSRA-1:1 No - lnc-MBD2-2:1 Yes chr2R:12529053-12564184 lnc-RLBP1-1:1 Yes chr2L:3163645-3169462 lnc-ARHGAP28-10:6 No - lnc-DISP1-1:8 No - lnc-RPS25-1:29 No - lnc-REV3L-1:1 Yes chr3R:12682186-12689367 lnc-MMP24OS-73:13 No - lnc-CSNK1G1-1:2 No - lnc-NIF3L1-5:2 No - G2E3-AS1:13 No - lnc-KDM3A-2:1 No - lnc-HMHB1-3:1 Yes chr3R:20894452-20897320 lnc-GHR-1:1 No - lnc-RACGAP1-1:3 No - lnc-C2CD2-1:1 No - ITCH-IT1:1 Yes chr2L:2037714-2044372 lnc-ETFA-1:1 No - lnc-GABRG3-2:1 Yes chr2L:4908581-4932384 lnc-SPANXN4-6:1 No - lnc-GGCT-1:25 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-IVNS1ABP-1:2 No - LINC00683:2 No - lnc-EPHA7-3:1 No - THAP9-AS1:8 Yes chr2R:8893613-8898798 MCPH1-AS1:1 Yes chr2R:11895997-11903918 lnc-ALDH7A1-1:2 No - ZBTB40-IT1:1 No - lnc-SCAPER-1:1 No - lnc-SCNN1B-1:2 Yes chr3R:29930551-29933057 LINC00668:14 No - lnc-SGSH-1:4 No - lnc-LRRC3C-1:2 No - ELF3-AS1:5 No - lnc-MDFIC2-6:2 No - lnc-RALBP1-1:1 No - lnc-ZGRF1-2:4 No - lnc-PCNX1-2:18 No - CCND2-AS1:8 Yes chrX:15906822-15909676 HOXC-AS3:1 Yes chr3R:16927212-16972236 lnc-IRX3-80:31 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-LRRC38-2:1 No - lnc-EYS-2:1 Yes chr2L:16245835-16257606 lnc-FKBP9-1:1 Yes chr2R:24195498-24197027 lnc-YIF1A-5:1 Yes chr3L:12746616-12750056 lnc-SETD6-3:1 No - lnc-HNRNPA2B1-15:11 No - LINC00524:3 No - lnc-CDIPT-1:5 No - lnc-ARHGAP28-19:1 No - lnc-ADGRB1-1:5 No - lnc-CCT4-1:2 No - lnc-C4BPA-1:1 No - CCDC144NL-AS1:12 No - lnc-LMF1-3:5 No - lnc-YES1-8:5 No - LINC00472:27 No - lnc-SPACA9-1:2 Yes chr2L:6821934-6838995 lnc-VCAN-1:5 No - lnc-SCRN1-1:2 No - MACROD2-AS1:4 No - lnc-CSMD1-7:1 No - lnc-CYP27B1-1:1 No - lnc-C15orf40-1:1 No - lnc-DZANK1-1:4 Yes chr2L:12046711-12048918 lnc-PRB1-1:5 No - lnc-KLHL25-9:3 No - lnc-PRR34-3:2 No - SNHG21:9 No - lnc-SMTNL2-2:1 No - MRPS30-DT:65 No - PCSK6-AS1:1 Yes chr3R:25347431-25473058 ID2-AS1:7 No - RDH10-AS1:1 Yes chr2L:21057706-21071502 lnc-NMNAT1-1:1 No - LINC00971:3 No - LINC01630:18 No - lnc-MTERF4-2:1 No - LINC02285:5 No - lnc-TLN2-3:2 No - lnc-SERINC5-1:1 Yes chr2L:6686791-6709086 CCDC144NL-AS1:20 No - LRRC75A-AS1:64 No - lnc-USP6-4:1 No - lnc-CHD9-3:5 No - NLGN1-AS1:1 Yes chr3R:7570281-7639434 lnc-TMEM100-2:1 Yes chr2L:13374019-13376404 lnc-CHD9-3:7 No - KDM4A-AS1:4 No - lnc-PLCG2-1:7 Yes chrX:16350315-16356482 lnc-PTPRC-3:1 No - lnc-POTEB-17:1 No - lnc-SCAF11-1:1 No - lnc-CYLD-2:14 No - lnc-GGCT-1:9 No - lnc-STYX-5:4 No - LINC01585:3 No - ATP2B2-IT2:2 Yes chr4:328193-358917 lnc-PADI1-3:2 Yes chr3R:24113286-24128193 SRGAP3-AS2:1 No - lnc-SPI1-1:2 Yes chr3R:29863701-29868895 lnc-SNRPN-8:100 No - lnc-CETP-1:1 Yes chr2L:7796314-7800058 lnc-COPZ2-1:3 No - lnc-OR4N4-1:6 No - lnc-GARS-1:1 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-RNASET2-1:1 No - lnc-SUMO1-2:1 No - lnc-TP53TG3D-1:1 No - lnc-TIMM9-1:1 No - SPATA13-AS1:1 Yes chr3L:277437-305292 lnc-CLEC3A-1:1 Yes chr2L:7999670-8004286 lnc-POLRMT-1:1 No - lnc-LEF1-3:18 Yes chrX:18688538-18693042 lnc-SYCE1L-2:1 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-ADAR-6:1 Yes chrX:5340236-5405138 lnc-PDGFA-4:2 No - lnc-TBC1D8-2:3 No - lnc-MOCS2-1:1 Yes chr2R:15248784-15262873 lnc-TPPP-2:1 No - lnc-TOX3-2:1 No - FGD5-AS1:6 Yes chr3L:21494019-21497494 lnc-CLUAP1-7:1 No - lnc-SLC29A4-1:2 Yes chr3R:22710883-22721150 lnc-SPANXN4-1:1 No - lnc-CDH5-9:1 No - MTUS2-AS1:2 No - lnc-SNX20-5:1 Yes chr2L:10295859-10299847 LINC01572:4 No - MMP2-AS1:8 No - lnc-NUDT5-1:1 No - lnc-TCF7L2-2:1 Yes chr3L:691486-692919 FAM170B-AS1:4 No - lnc-ATG9B-2:10 No - lnc-KANK4-1:1 Yes chr3R:18330932-18360728 lnc-CCZ1B-1:1 No - lnc-TMEM105-2:14 No - lnc-CUBN-1:1 Yes chr2L:13639447-13642602 lnc-KCNK10-1:2 No - lnc-AATK-7:1 Yes chrX:6082634-6090201 lnc-RNF227-1:2 No - lnc-MEIS2-5:1 No - lnc-TMCO3-2:1 Yes chr3L:15563427-15565559 lnc-RAP1GDS1-1:1 Yes chr2L:6000228-6003738 lnc-MAPK6-5:1 Yes chrX:8150731-8152275 lnc-TRIM55-1:10 No - lnc-HSPA4-3:2 No - lnc-IRX3-80:39 Yes chr3L:12609631-12710249 SNAI3-AS1:14 No - GPRC5D-AS1:32 No - lnc-MYZAP-1:1 No - FAM53B-AS1:2 Yes chr2L:2978411-2979288 lnc-SLC16A11-1:1 No - lnc-PDXDC1-1:1 No - lnc-NID1-3:1 Yes chr3L:1950306-1964178 lnc-ANKRD42-2:2 No - VASH1-AS1:19 No - lnc-NTSR2-1:1 Yes chr2R:8136986-8156654 lnc-SH3GL3-5:3 No - lnc-SERAC1-3:2 Yes chr3L:9710422-9713827 lnc-RCC1L-3:1 No - lnc-BHLHA9-1:1 Yes chrX:127449-140340 LINC01277:16 No - lnc-SLC7A4-3:1 No - lnc-CST9L-2:2 No - lnc-NPPC-1:1 Yes chr3L:212709-216479 OTUD6B-AS1:8 No - lnc-UNKL-1:1 No - DAOA-AS1:1 No - lnc-AGBL1-1:1 No - lnc-PER2-2:1 No - lnc-PPIC-1:2 No - lnc-CCSAP-1:11 No - LINC02141:4 No - SNHG20:10 Yes chr2L:6448464-6455929 PCAT4:1 No - FGF14-IT1:9 No - lnc-GDPGP1-1:1 No - ITFG2-AS1:27 No - THAP9-AS1:14 Yes chr2R:8893613-8898798 lnc-FSIP1-4:10 No - lnc-INTS12-1:2 Yes chr3L:4384442-4403181 lnc-SLC6A4-3:1 No - LINC00470:14 No - lnc-DNAAF5-1:15 Yes chr3L:20816118-20836048 lnc-DPM1-1:1 Yes chr3L:2895017-2959579 lnc-ZNF316-3:2 No - lnc-C11orf96-1:2 No - lnc-SPAG1-4:1 Yes chr2L:10204757-10206961 lnc-DCAF13-1:1 No - lnc-ZNF706-1:1 No - lnc-AATK-10:1 Yes chrX:6082634-6090201 lnc-GOLGA6L7-1:1 Yes chrX:10627737-10710947 lnc-ANP32A-1:1 Yes chr2R:16307269-16316485 lnc-ASAH2B-3:1 No - lnc-UBE2N-3:2 No - RBFADN:13 No - lnc-POTEM-2:31 No - CCDC144NL-AS1:6 No - PCDH9-AS3:2 Yes chr3R:14630478-14641776 lnc-SCGB1D4-2:1 No - SNHG15:10 No - lnc-TBX15-2:1 Yes chr3L:17849727-17852453 EHHADH-AS1:2 No - LINC00667:6 No - lnc-CFAP99-1:1 No - lnc-ENTPD7-1:1 No - lnc-BRF2-15:1 No - lnc-TSFM-1:1 Yes chr3L:15992669-16004736 lnc-KLHL25-1:2 No - lnc-KLHL35-1:1 No - lnc-LEO1-4:1 Yes chr3R:30532607-30578905 LINC01237:8 No - lnc-CHRNA7-1:1 No - lnc-UTS2-1:1 Yes chrX:2685580-2692780 LCMT1-AS1:3 No - CDKN2B-AS1:25 Yes chr3R:25036944-25037982 lnc-SLC10A6-1:2 Yes chr2L:10247502-10250501 lnc-LRP11-1:1 Yes chr3R:5552823-5554316 CCDC144NL-AS1:26 No - lnc-MESD-1:1 No - lnc-FAM98A-1:1 No - lnc-GPBP1-1:1 No - lnc-TUBB8P12-2:3 No - OSGEPL1-AS1:4 Yes chrX:19699820-19701755 LINC00442:3 No - lnc-SLC35G2-1:6 No - lnc-ISCA2-1:1 Yes chr2L:4477462-4614300 lnc-BID-6:1 No - lnc-UBAP2-6:5 No - lnc-GPATCH2L-1:3 No - lnc-A1CF-2:1 No - lnc-LYSMD2-1:1 No - LNX1-AS1:4 Yes chr3R:4485008-4487677 lnc-HRH4-1:2 No - lnc-NIPAL4-1:1 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-PSMA2-2:3 Yes chrX:9608946-9623243 lnc-MED9-1:1 No - DOCK9-AS1:1 Yes chr2L:7472513-7496307 lnc-IL16-4:2 No - lnc-ADCYAP1-4:1 No - lnc-POTEB2-1:1 No - lnc-PABPN1L-1:2 Yes chr2R:24275734-24291084 lnc-DPY19L2-1:1 No - lnc-TAOK1-3:2 No - FIRRE:1 No - THUMPD3-AS1:36 No - HCP5:5 No - lnc-KL-1:1 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-ACACB-2:1 No - PANTR1:43 No - lnc-INTS4-1:1 No - DLGAP1-AS5:6 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-RHOBTB2-2:2 Yes chr2L:12707661-12708680 SEPT7-AS1:8 No - lnc-FANCI-1:2 No - lnc-NDUFV1-1:1 No - lnc-ZFHX3-27:3 No - lnc-CCDC125-6:13 No - lnc-TUFM-2:1 Yes chr3R:25888542-25893270 lnc-B4GALNT1-1:8 Yes chr3L:995982-1034875 lnc-DLX2-4:2 No - lnc-ABI1-1:1 No - HECW1-IT1:1 Yes chrX:9608946-9623243 lnc-GPRIN2-1:3 No - CLRN1-AS1:1 No - lnc-SPRYD3-1:6 Yes chr3L:27842669-27858271 lnc-SNX19-9:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-KNOP1-1:2 No - lnc-MPHOSPH6-2:3 No - LEMD1-AS1:1 No - lnc-LIMS3-2:7 No - LINC00941:1 No - FAM230B:7 No - lnc-XRN2-1:2 No - lnc-EGFR-4:8 Yes chr2R:20512697-20513169 lnc-PWP1-1:4 No - LIX1L-AS1:45 No - lnc-NCDN-1:1 Yes chr3L:21586828-21613349 lnc-PADI1-4:1 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-IDI1-1:1 Yes chrX:1773725-1788065 PSMA3-AS1:7 No - lnc-MAGOH-1:1 Yes chr3R:25698727-25740465 lnc-ATP6V1E2-4:1 Yes chr3R:29039156-29049148 lnc-TUBA3C-2:1 No - lnc-FBXO7-2:1 No - TMEM44-AS1:2 No - LINC00115:41 No - lnc-KLRF2-1:1 No - lnc-DSG1-5:2 No - lnc-NFE2L2-5:2 No - lnc-UNC5CL-3:1 Yes chr2R:8009119-8013755 LINC00687:8 No - lnc-PPP4R1-5:1 Yes chrX:17632089-17633509 LINC01089:20 Yes chr3R:9497101-9502581 CCDC144NL-AS1:16 No - ZNF32-AS3:1 Yes chr2L:4463611-4465075 lnc-SYT16-1:1 Yes chr3R:4314455-4319069 LMLN-AS1:2 Yes chr3R:10144668-10159134 LINC00609:12 Yes chrX:12907986-12909622 lnc-NEFL-6:12 No - lnc-LAMP5-1:1 Yes chrX:16610685-16614856 LINC01089:14 Yes chr3R:9497101-9502581 lnc-MRPS14-2:1 Yes chr3L:8346561-8352279 lnc-HBE1-1:3 No - AQP4-AS1:6 No - FOXG1-AS1:3 Yes chr2L:3836840-3839185 LINC00327:2 No - lnc-SMARCC2-5:1 No - lnc-SPAG1-4:2 Yes chr2L:10204757-10206961 lnc-GGCT-1:13 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-UBE2N-1:6 No - lnc-PRAC2-3:3 No - lnc-SPACA3-2:1 No - lnc-ART3-1:1 No - TUSC7:5 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-NAT9-1:1 No - lnc-LEXM-2:10 No - lnc-COX7A2L-4:1 Yes chr3L:14903805-14942907 lnc-LMF1-3:6 No - THAP9-AS1:9 Yes chr2R:8893613-8898798 lnc-IRX3-13:1 Yes chr3L:12609631-12710249 CDKN2B-AS1:26 Yes chr3R:25036944-25037982 LINC02138:3 No - lnc-CYB5R2-9:1 Yes chr3L:13513254-13516276 LINC02112:21 No - lnc-NT5M-1:3 Yes chr2L:14599196-14689340 ST7-AS2:1 Yes chr3L:20806868-20809272 lnc-STRN3-1:5 No - lnc-WISP1-2:2 No - NCK1-DT:25 No - lnc-C17orf51-3:1 No - lnc-SAMD11-7:12 No - lnc-IL2RA-1:1 No - SLC9A9-AS1:1 Yes chr2L:6677835-6684364 TRIM52-AS1:16 No - lnc-CTBP2-1:1 Yes chr3R:9705996-9711037 lnc-STXBP4-1:1 No - lnc-RBM11-2:1 Yes chrX:17911462-17924163 lnc-GGA2-1:1 Yes chr3R:29930551-29933057 lnc-SLC7A6OS-1:1 Yes chr2R:15657318-15676669 lnc-C20orf196-6:2 No - lnc-OST4-2:4 Yes chr2L:4149279-4151203 lnc-RPGRIP1L-4:1 No - lnc-POLE3-1:1 Yes chr2R:17792870-17800677 RGMB-AS1:9 No - lnc-CERS5-6:1 No - lnc-ZNF236-1:3 No - MANEA-DT:18 No - lnc-TMX3-1:1 Yes chr2L:6491061-6496988 lnc-CCDC90B-1:1 No - lnc-ARFGAP2-1:1 No - lnc-JAG2-1:1 Yes chr3R:27172090-27228561 lnc-BDNF-2:1 No - lnc-CRNKL1-2:1 Yes chr2R:22707794-22712724 lnc-DHRS7B-1:1 Yes chr3L:5780051-5784685 LARGE-AS1:9 No - CLSTN2-AS1:1 Yes chr4:1112874-1123357 THAP9-AS1:13 Yes chr2R:8893613-8898798 HAND2-AS1:32 No - lnc-KRR1-4:19 No - lnc-CCDC175-1:2 No - lnc-C11orf95-1:21 No - CHL1-AS1:1 Yes chrX:8517373-8555170 lnc-CLIC5-1:2 No - HOTAIRM1:3 No - lnc-SLC37A4-1:28 No - lnc-ATP6V0D2-1:1 No - lnc-CSNK1G3-3:1 Yes chr2R:18278198-18357296 lnc-GNB1L-1:1 Yes chrX:16684216-16695173 lnc-NEK3-1:2 No - lnc-PPP4R3C-2:1 No - lnc-CDY1-1:3 No - lnc-ADCYAP1-2:2 No - lnc-THBS1-1:3 No - lnc-AHSP-5:2 Yes chr2L:18695664-18698571 lnc-AMY1C-2:5 No - lnc-PRR25-2:1 No - lnc-ACSBG1-1:2 No - lnc-KDM6A-1:3 No - lnc-SEC16B-2:15 Yes chrX:12596047-12609910 LINC02237:16 No - lnc-ZNF705D-2:37 No - LINC02345:23 No - GLYCTK-AS1:2 Yes chr2L:2420830-2424647 lnc-ANKH-1:1 No - LINC02473:5 No - lnc-UBAP2-6:6 No - THAP9-AS1:6 Yes chr2R:8893613-8898798 lnc-C17orf58-3:2 No - YEATS2-AS1:5 Yes chr2L:8434058-8437365 LINC01088:2 Yes chr3L:9972312-9974023 lnc-AGAP4-2:2 No - lnc-CDYL2-6:4 Yes chr2R:24475386-24476032 ADNP-AS1:1 No - lnc-PRSS27-4:6 No - lnc-GPR33-1:1 Yes chr2L:22239916-22246988 lnc-C9orf135-2:1 No - lnc-CXXC4-1:1 No - lnc-DHX38-26:3 Yes chr4:501810-540874 lnc-RAC3-1:1 No - lnc-SOX30-1:1 No - LINC01956:15 No - lnc-CHRNA3-1:1 Yes chrX:8276200-8367169 WASIR1:1 No - TTC39A-AS1:2 No - lnc-CD40LG-2:4 No - lnc-SLC1A7-1:1 No - MIR9-3HG:29 No - THSD4-AS1:12 No - SLC7A11-AS1:8 No - lnc-MARCKS-1:1 No - lnc-CSNK1G1-1:5 No - MKLN1-AS:2 Yes chr2R:12628697-12632378 lnc-ARVCF-4:12 Yes chrX:13616989-13619207 DIP2A-IT1:1 Yes chr3L:250229-257954 lnc-NDUFA5-1:4 No - MNX1-AS1:1 No - SIDT1-AS1:1 No - PTCSC3:4 No - lnc-MACC1-1:2 No - lnc-GOLGA8M-1:1 No - lnc-RTL1-1:1 No - lnc-ZNF827-1:1 No - ZFHX2-AS1:36 Yes chr4:501810-540874 lnc-TKT-3:4 No - NECTIN3-AS1:10 No - lnc-LMF1-3:1 No - lnc-NPR2-1:2 No - lnc-TSPYL4-1:1 Yes chr3L:1304850-1307418 lnc-NME1-2:1 Yes chr3L:7916650-7936120 lnc-PLOD2-2:1 No - LINC01572:8 No - lnc-ZNF516-4:11 No - lnc-BCL11A-18:3 No - lnc-ZC3H14-1:1 Yes chr2L:6332881-6338671 NUTM2A-AS1:21 No - LINC01477:2 No - LINC02489:5 No - lnc-CCDC38-2:1 No - lnc-MMP24OS-73:8 No - lnc-PDE1B-1:1 No - lnc-WDR34-1:1 No - lnc-TMEM178A-1:34 No - lnc-ATAD1-2:1 Yes chr3L:19845293-19860925 lnc-ITGAE-1:3 No - ANKRD34C-AS1:5 No - lnc-C1orf122-1:1 Yes chrX:1922981-1927524 lnc-ZNF550-1:2 No - lnc-NDUFS6-3:1 No - lnc-DGCR6-6:13 No - lnc-PTBP3-8:6 Yes chr3R:27677522-27679013 lnc-GLRB-1:1 No - lnc-TFEC-2:4 No - lnc-HMCN1-1:1 No - lnc-TP53TG3F-9:1 No - MIR9-3HG:18 No - lnc-ZNF574-1:2 Yes chr2L:12587625-12628135 lnc-PTPRR-2:1 No - IQCJ-SCHIP1-AS1:2 Yes chr2L:10328200-10331116 LINC01568:1 Yes chr4:501810-540874 ST7-AS2:7 Yes chr3L:20806868-20809272 lnc-AKIP1-2:1 Yes chr3L:7562610-7569499 lnc-WDPCP-1:3 Yes chr3L:13011976-13015332 lnc-FNDC9-2:1 Yes chr3R:15333266-15338365 XIAP-AS1:1 Yes chr3L:16038410-16051034 lnc-NTHL1-1:1 No - lnc-CHRAC1-8:3 Yes chr2L:20650755-20656178 lnc-ZNF267-1:2 No - MIR4435-2HG:19 No - lnc-ALG14-1:1 No - lnc-COX7A2L-4:2 Yes chr3L:14903805-14942907 lnc-JPH3-3:3 No - F10-AS1:2 No - lnc-SLURP1-1:1 Yes chrX:6078708-6081372 LINC00293:3 No - lnc-BMF-1:1 No - MAP3K20-AS1:22 No - lnc-CERK-1:1 No - HAND2-AS1:31 No - MIR133A1HG:4 Yes chr3L:16006552-16011812 LINC01089:15 No - lnc-SIGLEC5-1:1 No - lnc-KATNAL2-2:1 No - lnc-MON2-3:1 No - lnc-TRIM36-4:2 No - lnc-AGO2-2:5 No - lnc-NEMP2-1:3 Yes chr3L:4153618-4160932 lnc-CHAC1-2:1 Yes chr3R:19368995-19403153 lnc-NPBWR1-12:9 No - lnc-AEBP2-2:1 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-LRRC8C-1:1 No - LINC00659:16 No - lnc-SPIDR-3:1 No - TSPAN9-IT1:1 No - EGLN3-AS1:1 Yes chr3R:5257037-5269507 TXNDC12-AS1:1 No - lnc-NMNAT3-3:2 Yes chr4:1112874-1123357 TBX5-AS1:1 No - lnc-C8orf89-7:1 Yes chrX:10967722-11039901 LINC01006:5 No - MIR100HG:2 No - lnc-TM2D2-1:1 No - lnc-RGMA-3:1 No - lnc-COX14-3:1 No - lnc-TRIM56-1:1 Yes chr2R:18987344-19008944 lnc-ASH1L-2:1 Yes chrX:21388977-21391533 lnc-ACSM3-1:2 No - lnc-PHF3-1:1 No - lnc-AATK-5:2 Yes chr2R:22608310-22609419 lnc-CHAD-1:1 No - lnc-C12orf66-3:1 No - LINC01089:19 Yes chr3R:9497101-9502581 lnc-LMF1-3:12 No - ZFY-AS1:2 No - lnc-NRARP-1:1 No - CATIP-AS1:4 No - lnc-SHF-3:3 Yes chr2R:9082395-9085717 CDKN2B-AS1:35 No - LINC02418:10 No - LNX1-AS2:3 Yes chr3R:4485008-4487677 lnc-PRPF18-4:1 No - lnc-IL10RA-1:6 No - CCDC18-AS1:28 No - lnc-PHGDH-1:1 No - lnc-CCAR2-2:9 Yes chr2L:12707661-12708680 lnc-CHRNB4-1:3 Yes chrX:8276200-8367169 lnc-SLC25A48-7:1 No - lnc-MEP1B-1:2 No - lnc-GUCY1A1-1:1 No - lnc-MAT2B-3:12 No - LINC01088:9 Yes chr3L:9972312-9974023 PCBP1-AS1:19 No - lnc-HSD17B11-1:1 No - C3orf67-AS1:1 No - lnc-SDF2-1:1 Yes chrX:6267797-6274984 lnc-PLCD3-4:11 No - LINC00620:4 No - lnc-TAB2-1:1 No - LINC01277:8 No - lnc-LYZL1-15:22 No - TH2LCRR:3 No - lnc-REM2-2:1 No - LINC01898:7 No - lnc-NBPF11-1:3 No - lnc-HENMT1-1:1 No - lnc-MPHOSPH6-3:1 No - lnc-FAM131B-1:2 No - lnc-TMEM178A-1:6 No - lnc-GPN3-1:1 No - lnc-TBC1D12-1:1 No - lnc-USP50-1:1 Yes chr3R:21134262-21138214 AQP4-AS1:2 No - lnc-PKD1L3-4:1 No - DSCR9:8 No - lnc-FTCDNL1-4:25 No - lnc-EXOC3-1:2 Yes chr2L:21104568-21134255 ENTPD1-AS1:10 No - lnc-HRH4-6:2 No - lnc-ELAC2-2:1 Yes chr3R:19905164-19914272 lnc-ST20-MTHFS-1:1 Yes chr2R:23359215-23360266 lnc-HBE1-1:1 No - lnc-INAVA-1:12 Yes chr2L:16165831-16190540 LINC00999:6 No - MEIS1-AS2:1 Yes chr3R:10507561-10639568 NR2F2-AS1:7 Yes chr3R:12258737-12302785 MAFG-DT:21 No - lnc-TP53I11-6:1 Yes chrX:6069131-6074857 lnc-KLHL25-3:1 Yes chr2L:19502335-19508764 LINC02011:3 No - LINC00469:3 No - NR2F2-AS1:6 Yes chr3R:12258737-12302785 lnc-FLRT1-2:1 No - lnc-SMG1-5:11 No - DNM3-IT1:1 No - TMEM72-AS1:18 No - lnc-TP53TG3-36:1 No - lnc-ENTPD1-1:2 No - lnc-GLYATL2-2:2 No - NFIA-AS2:1 Yes chr4:268175-276369 lnc-MYOM1-3:1 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-GSG1L2-1:2 No - lnc-SLC22A18-10:1 No - lnc-SLC39A11-1:16 No - lnc-IRF1-2:2 Yes chr2R:22421013-22425482 lnc-ANK2-2:1 Yes chr2R:12655954-12659341 lnc-AMFR-1:1 Yes chr2R:10437985-10465701 lnc-ARRB2-2:1 No - DGUOK-AS1:5 Yes chr3R:18980995-18982749 lnc-FKBP1C-6:2 No - lnc-OIT3-2:1 Yes chr3L:6550738-6593940 lnc-MCTP2-2:1 No - lnc-PHYHIPL-1:1 Yes chr2R:17703335-17719346 LINC00927:41 No - SSTR5-AS1:4 No - TEX36-AS1:1 No - lnc-NUTM1-11:8 No - LINC00967:6 No - lnc-SNX20-1:1 No - lnc-TTC34-4:1 Yes chr2L:18714453-18732524 lnc-TFB1M-1:1 Yes chr3L:5657913-5749599 SYNJ2-IT1:1 No - lnc-HMG20A-2:1 No - lnc-PFKP-42:1 Yes chr2R:5090581-5095090 PCDH9-AS4:1 Yes chr3R:14630478-14641776 lnc-OSBPL9-1:2 Yes chr2R:24768314-24775265 ZBED3-AS1:21 No - lnc-CCDC28A-1:2 No - lnc-ASTN2-2:2 No - NCF4-AS1:13 No - NCAM1-AS1:4 Yes chrX:4132887-4206093 LLPH-DT:8 No - lnc-EVPLL-3:3 No - MIR583HG:48 No - lnc-MNT-1:1 Yes chrX:20433950-20445599 TTTY14:8 No - FAM83A-AS1:2 No - lnc-PRM1-1:2 No - LINC00327:3 No - USP3-AS1:10 No - GPC6-AS2:2 Yes chr3L:14632601-14671609 lnc-ANKRD34B-2:2 No - lnc-GDF11-1:4 Yes chr2L:21344607-21358271 LINC01916:3 No - lnc-DPH1-1:1 Yes chr2L:13212335-13215350 lnc-LRRC14B-1:1 No - LINC02502:9 No - lnc-CXorf56-2:1 No - lnc-ARHGAP24-1:2 Yes chr2L:10247502-10250501 lnc-UBAP2-6:3 No - lnc-CCDC182-2:1 Yes chr3R:25516118-25608423 C3orf67-AS1:4 No - lnc-METTL4-2:2 No - KCNAB1-AS2:1 Yes chrX:10233347-10263485 lnc-SH2D7-3:1 No - lnc-CCDC113-2:1 Yes chr3L:23097072-23103460 LINC01237:4 No - LINC01193:5 No - lnc-B3GNTL1-1:4 No - lnc-OR4F29-1:7 No - lnc-MUC20-67:72 No - lnc-CCDC114-1:2 No - lnc-IYD-1:1 No - lnc-LAMA1-5:1 No - lnc-THBS1-7:2 No - lnc-MBIP-3:1 No - lnc-ALDH1A3-1:12 No - lnc-ACTRT1-1:1 No - ARHGAP26-IT1:1 Yes chrX:15751674-15760733 NCOA7-AS1:1 No - lnc-PPP1R9B-2:2 Yes chr2L:8303429-8305376 SYNPR-AS1:2 No - lnc-RECQL4-2:2 No - lnc-UNCX-3:14 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-CCNE2-1:3 Yes chrX:18653392-18657286 lnc-THUMPD1-1:1 No - lnc-SLC39A11-1:4 No - lnc-ZNF609-3:1 No - lnc-TAB2-1:2 No - lnc-BTC-2:2 No - LINC00563:3 No - lnc-OR10J3-1:1 No - lnc-AMELY-2:7 No - lnc-P3H1-1:7 No - LINC01568:15 Yes chr4:501810-540874 lnc-SPARCL1-1:2 No - lnc-SENP8-1:1 No - LINC01751:5 No - LINC00893:6 No - lnc-ISCU-1:1 No - lnc-PLXDC1-3:3 No - lnc-EPHA1-1:1 No - lnc-ERICH1-4:1 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-STK32C-1:1 No - lnc-MEX3B-2:1 No - lnc-KCNJ13-1:1 Yes chr4:853557-867025 lnc-NENF-2:1 Yes chrX:16740906-16742918 lnc-TMEM232-3:1 No - OSBPL10-AS1:2 Yes chr3L:1034697-1036298 lnc-FBN2-6:1 No - lnc-ZNF33A-3:1 No - lnc-MED13L-4:1 No - lnc-CCL2-7:1 No - lnc-NR2E3-3:2 No - lnc-ZNF827-2:1 No - LINC02310:3 No - lnc-MTERF3-1:3 No - lnc-DISP1-1:9 No - LINC00667:15 No - lnc-ARHGEF38-1:2 No - lnc-STRA8-1:1 Yes chr3R:19022458-19024030 lnc-RPLP1-12:53 No - CDRT8:1 No - MIR22HG:22 No - lnc-MTERF2-3:1 No - LINC00982:1 No - lnc-TP53TG3-72:1 No - lnc-MDM4-4:1 No - lnc-NPDC1-1:1 No - PLCXD2-AS1:1 Yes chr2L:20089636-20091348 lnc-SLC38A8-4:4 No - lnc-DSC3-1:1 No - lnc-COL6A3-14:14 No - lnc-DSTYK-1:1 Yes chr3R:6389162-6405895 lnc-ZNF124-2:1 No - lnc-ZFC3H1-1:1 Yes chr2L:13982743-14001248 lnc-FRMD5-1:2 No - lnc-PRSS27-4:19 No - lnc-CHST9-6:5 No - lnc-DTWD2-1:2 Yes chrX:6240745-6255487 lnc-ITK-1:1 No - lnc-CLDN6-2:1 No - lnc-MAT2B-3:36 No - lnc-PLAT-3:4 No - lnc-CD300LF-1:1 Yes chr3L:21318774-21335027 lnc-PPM1H-7:2 Yes chr2L:8116965-8124010 lnc-SEZ6-1:1 No - lnc-ZNF768-1:1 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-PTPN3-2:1 No - PCBP1-AS1:71 No - lnc-ABCC1-1:1 No - lnc-HNRNPAB-3:1 Yes chr3R:16502770-16571363 lnc-KCNMB4-1:5 No - ELOA-AS1:25 No - lnc-CCSAP-1:12 No - lnc-TP53TG3D-3:1 No - LINC01311:1 No - lnc-CD36-11:3 Yes chr2R:13805794-13819571 LIVAR:5 No - lnc-GPR15-1:1 No - lnc-CD38-1:1 Yes chr3R:18161392-18164397 lnc-CDH1-1:1 Yes chr2L:18969028-18972004 lnc-AAGAB-1:36 No - lnc-CCNK-1:1 No - lnc-ALKBH6-1:1 No - lnc-MMP24OS-73:7 No - lnc-SLC6A4-151:1 Yes chrX:13338318-13341009 lnc-IL4-1:1 Yes chr3L:5356864-5359392 SKAP1-AS1:3 No - SLC5A4-AS1:5 Yes chr3L:1933633-1939103 lnc-RNF135-1:19 No - lnc-MAGEA10-1:2 No - CNTFR-AS1:7 No - lnc-SRSF2-3:1 No - lnc-RXRG-1:5 No - lnc-MRPS22-1:4 No - PCAT6:7 No - lnc-SPP2-2:1 No - lnc-TIGD3-1:1 Yes chr3R:27559379-27561319 lnc-CNN3-2:1 Yes chrX:15472164-15472859 LINC00473:7 No - lnc-GRAP-3:1 No - lnc-ZNF33B-2:1 No - lnc-MUC20-67:49 No - SCEL-AS1:5 No - lnc-CTIF-1:1 Yes chr2R:8944298-8947344 lnc-MRC2-3:1 No - lnc-IRF1-2:1 Yes chr2R:22421013-22425482 VWC2L-IT1:2 No - LINC01494:3 Yes chr2L:10308131-10310956 lnc-FAM92A-2:1 No - LINC02591:11 No - lnc-OR4N2-2:1 No - lnc-NDUFA5-1:3 No - lnc-STK32C-1:2 No - lnc-EXOC3L4-1:1 No - lnc-ODF3L1-2:1 No - lnc-POTEC-2:1 No - lnc-DALRD3-1:1 No - lnc-RHOB-2:1 No - lnc-RAB4A-1:2 No - lnc-WWC1-1:1 Yes chrX:10964032-10967134 lnc-NUDT4B-1:11 No - lnc-MACC1-1:3 No - lnc-MAT2B-3:3 No - ZNF710-AS1:6 Yes chr3R:15348048-15350391 lnc-RECQL4-2:5 No - lnc-ZNF22-2:1 No - lnc-PAFAH1B2-1:1 No - lnc-GANC-1:2 No - TUG1:35 No - lnc-HAND2-1:1 No - lnc-ENOSF1-3:1 Yes chr3L:4592447-4626196 PRRX2-AS1:2 No - LINC01341:7 No - lnc-HBZ-1:1 Yes chr3L:13999380-14001880 lnc-GALR1-4:1 No - lnc-OSBPL1A-4:2 No - lnc-TMEM178A-1:16 No - KANSL1-AS1:2 Yes chr3R:15793782-15802102 LINC02092:5 No - lnc-GAS8-1:4 No - lnc-ADAM19-2:8 Yes chr3R:15333266-15338365 lnc-SLC44A5-1:1 Yes chr3L:3846206-3861692 ARPP21-AS1:1 Yes chr3L:3818679-3842326 lnc-DNAAF4-2:7 No - ISPD-AS1:9 No - lnc-DEPP1-2:18 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-ATG16L2-1:1 No - MAGI2-AS3:32 No - lnc-KDM5D-1:1 No - lnc-ARL6-1:1 No - lnc-EPOP-2:1 Yes chr3R:7094596-7124185 lnc-UNC5CL-2:1 Yes chr2R:8009119-8013755 lnc-C17orf97-6:1 Yes chr2L:4382925-4386062 lnc-COMMD3-1:1 No - lnc-MAN2C1-2:1 No - lnc-PPFIBP2-2:1 Yes chr2R:21798017-21799195 lnc-PRODH2-5:7 No - lnc-IBTK-10:2 Yes chr2R:7737019-7782637 lnc-RGS8-6:1 Yes chr2R:17792870-17800677 lnc-GTPBP4-1:12 No - lnc-TRPM1-1:5 No - USP30-AS1:3 Yes chrX:5877000-5879787 lnc-LEF1-3:1 No - lnc-GLRX-1:1 No - lnc-KCNMB1-2:1 Yes chrX:11219379-11302783 PCGEM1:2 No - lnc-DRD2-1:1 No - DISC1FP1:2 No - EDRF1-AS1:26 No - GRM7-AS3:10 No - lnc-ZFP2-1:1 No - lnc-CYLD-4:1 Yes chr2L:11434311-11445614 NR2F2-AS1:11 Yes chr3R:12258737-12302785 lnc-CRACR2A-2:1 Yes chr3R:10786481-10788226 lnc-JOSD1-1:2 No - lnc-ANP32A-2:4 No - lnc-CEMP1-1:3 No - DSG1-AS1:4 No - lnc-DDIAS-2:2 No - CCDC144NL-AS1:3 No - lnc-PABPC4-1:23 Yes chr2R:23851562-23853247 lnc-IFT46-1:4 No - lnc-EN2-1:1 Yes chr2R:10050862-10052167 lnc-SLC45A1-1:2 Yes chr3L:8449922-8472669 lnc-LYZL1-15:26 Yes chr3L:2377655-2499226 lnc-SLC19A2-1:1 No - lnc-KCTD3-3:1 Yes chrX:14604012-14653928 LINC02562:8 No - lnc-IFNA2-1:1 No - lnc-PXDC1-15:12 No - LINC02124:3 No - lnc-CCDC7-1:1 Yes chr2R:11452043-11465270 RGMB-AS1:12 No - lnc-TSHZ3-2:1 No - lnc-LRTM2-1:1 Yes chr2L:16165831-16190540 lnc-DCUN1D1-3:1 No - RFPL1S:6 No - lnc-IYD-2:1 No - lnc-LRRC72-5:1 Yes chr2R:7834812-7885982 lnc-CCDC102B-6:1 No - LINC01568:8 Yes chr4:501810-540874 lnc-ACACB-1:5 Yes chr2R:7974115-7991862 lnc-CCDC107-1:1 No - lnc-KBTBD3-1:2 Yes chr3L:12149273-12150329 LINC01336:11 No - lnc-IKZF2-5:1 No - lnc-TEX35-3:1 No - lnc-C11orf71-1:1 No - lnc-ALDH1A3-1:8 No - lnc-MRC2-2:1 No - lnc-GDE1-3:1 No - LINC00605:5 No - lnc-PNPLA3-1:2 No - lnc-C1orf232-1:6 No - lnc-RPRML-3:5 No - MRPS30-DT:66 No - FAM99B:1 No - MIR9-3HG:2 No - lnc-IRF4-1:1 Yes chr2L:3457302-3460367 LNX1-AS1:1 Yes chr3R:4485008-4487677 lnc-SLC37A2-1:2 No - ATP6V1B1-AS1:4 No - CYP1B1-AS1:34 No - lnc-ENY2-1:1 Yes chrX:11852692-11854931 lnc-SYCP2-1:2 Yes chr3L:3714826-3806459 lnc-MPLKIP-6:1 No - lnc-CCT8L2-1:3 No - lnc-LRMDA-3:1 Yes chr3R:24662491-24711595 lnc-NT5C-2:1 No - lnc-MAT2B-3:6 No - lnc-HOXB1-1:1 No - LINC00853:6 No - lnc-C3orf38-1:1 Yes chr3L:206134-207527 lnc-UQCRHL-3:1 No - lnc-JOSD1-1:4 No - lnc-ADIRF-1:1 No - LINC00927:49 No - lnc-KIF7-1:1 No - PCBP1-AS1:72 No - ANKRD34C-AS1:2 No - LARGE-AS1:10 No - lnc-GRIN2A-2:1 Yes chr2R:10800420-10808938 PROSER2-AS1:2 No - lnc-METTL5-4:160 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-GLYATL2-2:3 No - lnc-OR4N4-1:1 No - LINC01227:10 No - lnc-IL25-1:1 Yes chr3L:152884-174517 lnc-GTF2I-1:1 No - lnc-CGN-1:1 No - lnc-GSN-2:1 No - lnc-LRRC49-1:1 No - ST8SIA6-AS1:4 No - G2E3-AS1:14 No - lnc-TSPAN8-4:1 No - lnc-FBN1-3:1 Yes chr2L:11011312-11012135 lnc-C15orf48-4:6 No - lnc-SMPD2-1:1 No - LINGO1-AS1:9 Yes chr2R:21872030-21946259 lnc-MIS12-1:2 No - lnc-NUTM2E-1:7 No - lnc-TMEM185B-1:1 Yes chr3R:13428867-13434984 lnc-HDAC9-3:1 No - lnc-C1orf131-1:1 Yes chr2L:10544883-10628054 UFL1-AS1:1 Yes chr3R:7071624-7074452 lnc-LRRC46-1:2 No - LINC00271:8 No - lnc-EXOSC6-2:2 No - lnc-MRPL57-5:1 No - lnc-TP53TG3C-1:1 No - LINC00661:5 No - lnc-POLR3E-5:1 Yes chr2L:20678921-20681846 lnc-CPEB2-18:1 No - lnc-MYBBP1A-2:3 Yes chr2R:16124981-16138238 GRIK1-AS1:6 Yes chr3R:20860187-20866231 lnc-CLEC14A-1:1 No - lnc-NT5DC3-1:2 No - lnc-OR3A2-1:9 No - lnc-STOML1-3:6 No - ZFHX2-AS1:29 No - LINC00189:2 Yes chr3R:23185580-23226711 LINC01892:4 No - lnc-F13A1-2:1 No - LINC00266-1:4 No - LY86-AS1:8 No - lnc-KLHL8-1:1 No - LINC00691:4 No - lnc-EDRF1-1:20 No - lnc-CCDC125-2:2 No - lnc-SLC25A5-1:1 No - lnc-MOCS1-1:2 Yes chrX:1289713-1322362 EWSAT1:11 No - lnc-MAP1LC3B2-28:24 No - lnc-APC-9:1 Yes chr3R:31311157-31371748 CACNA1C-IT2:1 Yes chr2L:16165831-16190540 PRKX-AS1:1 Yes chr3L:15925805-15954797 THSD4-AS1:7 No - ATP2B2-IT1:1 Yes chr4:328193-358917 LINC01227:11 No - lnc-CDH8-10:13 No - EAF1-AS1:11 No - lnc-TMEM114-4:1 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-ERP29-1:1 Yes chr3R:20021704-20026482 lnc-NEFL-3:7 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-CA12-1:1 No - lnc-RAB12-3:1 No - lnc-TPP1-1:4 No - lnc-DSEL-1:1 No - lnc-C17orf75-3:1 Yes chr2L:10491814-10506779 lnc-BAG4-1:1 Yes chr3R:24650125-24653376 LINC00092:7 No - lnc-TP53TG3-168:3 No - lnc-SNRPN-8:112 No - CDKN2B-AS1:5 Yes chr3R:25036944-25037982 USP2-AS1:9 No - lnc-PTK2B-6:4 No - CCDC18-AS1:31 No - lnc-TBC1D30-1:1 No - lnc-LRRC36-1:1 Yes chr2R:12064565-12079543 C3orf67-AS1:2 No - LINGO1-AS1:7 Yes chr2R:21872030-21946259 lnc-MYH13-2:1 No - lnc-AP5B1-2:1 Yes chrX:5048273-5070929 lnc-KIAA0895-1:1 No - SNHG21:14 No - lnc-ANKRD20A2-2:1 No - lnc-TMEM105-2:10 No - lnc-TARBP1-1:1 Yes chrX:254876-255524 lnc-CNBD1-3:1 No - lnc-ZNF516-4:9 No - lnc-DMXL2-1:1 No - lnc-KCNK12-1:1 Yes chr2L:14362069-14366840 lnc-RARRES2-3:1 No - HAND2-AS1:13 No - lnc-ADAMTS12-3:3 No - lnc-FBXW5-1:1 No - lnc-DDX25-1:2 Yes chr3L:27279316-27422159 lnc-CES5A-3:4 No - HS1BP3-IT1:1 No - lnc-PMEL-1:1 Yes chr2R:7834812-7885982 LINC01411:6 No - lnc-OR6C70-1:2 No - CASC16:6 No - LINC01611:3 No - lnc-TRPM1-1:3 No - lnc-TKT-3:5 No - PDCD4-AS1:1 Yes chrX:13745577-13755406 lnc-B4GALNT3-1:1 Yes chr3R:12695129-12697379 lnc-PMFBP1-7:1 Yes chr4:501810-540874 lnc-LRRC75A-2:1 Yes chr3L:14186249-14189648 lnc-FAM222B-2:2 No - lnc-CEP170-13:10 No - lnc-ANKRD30B-2:1 No - lnc-HNRNPA1-1:1 No - lnc-CEP120-2:1 Yes chr2R:18278198-18357296 lnc-TNPO3-2:1 Yes chr2L:277582-282167 lnc-UCK1-1:1 Yes chr3L:11584122-11587770 lnc-MYEF2-8:1 Yes chr2R:17672839-17683499 GNAS-AS1:7 Yes chr2R:23942538-23946936 LINC00517:1 No - lnc-KANSL1-1:2 Yes chr3R:27639886-27656996 LINC01927:10 No - lnc-WDR77-1:2 No - lnc-CDC14A-1:1 Yes chr2L:7801668-7810703 LINC01475:2 No - HDHD5-AS1:21 No - lnc-TNFRSF10B-2:1 Yes chr2L:12707661-12708680 lnc-RPRML-3:7 Yes chr3L:5366455-5367381 NFIA-AS2:4 Yes chr4:268175-276369 lnc-ASAP2-3:1 No - lnc-C5orf22-1:1 Yes chr2R:22855688-22858794 lnc-RAPH1-1:1 Yes chr3R:14119262-14122420 lnc-TGS1-1:1 Yes chr3L:4592447-4626196 NUTM2A-AS1:20 No - lnc-SLC38A2-1:6 No - lnc-COPS7B-1:1 No - LINC01239:3 No - lnc-CDH13-1:1 No - MRGPRF-AS1:5 No - lnc-USP10-2:1 No - lnc-CCNB2-1:1 No - lnc-C5orf63-3:1 No - lnc-TLK1-6:6 Yes chr3L:4074077-4088744 lnc-HDDC2-3:1 No - DPYD-AS2:1 Yes chrX:9196808-9201820 lnc-SRCIN1-1:5 Yes chrX:20469955-20510694 lnc-MPHOSPH6-8:1 No - LINC02109:39 No - lnc-ATP10A-1:1 No - lnc-IVNS1ABP-1:3 No - lnc-MAT2B-3:9 No - lnc-NRP1-2:1 Yes chrX:8061645-8070237 KIRREL3-AS1:1 Yes chrX:2740384-3134532 lnc-MAB21L1-1:1 Yes chrX:5085759-5254864 TUG1:20 No - lnc-C22orf31-2:1 No - SLCO4A1-AS1:2 Yes chr2L:6625138-6632407 lnc-SLC45A1-1:1 Yes chr3L:8449922-8472669 RFPL1S:10 No - lnc-GREM2-8:2 No - lnc-HOXA13-2:1 No - FAM83A-AS1:3 No - lnc-FAM25C-5:1 No - GAPLINC:1 No - lnc-APCDD1-1:1 No - lnc-MAF-5:1 Yes chr2L:7999670-8004286 lnc-CHODL-1:2 No - lnc-ACP1-1:2 No - lnc-RLBP1-1:2 Yes chr2L:3163645-3169462 lnc-GGCT-1:3 No - LINC00470:3 No - lnc-RCC1L-3:2 No - lnc-CNNM1-1:1 No - lnc-CPPED1-5:1 No - lnc-GNG11-2:1 Yes chr3L:19261394-19262437 CCDC144NL-AS1:24 No - lnc-LRRC24-2:5 Yes chr3L:8170640-8175978 LINC02256:3 No - LINC01229:10 No - lnc-ACHE-1:4 No - lnc-TTC30A-1:1 No - lnc-SCPEP1-6:1 Yes chr2R:12757546-12759724 lnc-PHF14-14:12 No - lnc-RPLP1-12:9 No - lnc-GAS8-1:3 No - lnc-ATAD5-2:2 No - LINC01470:3 No - lnc-ZNF275-1:1 No - lnc-BRD1-3:1 No - lnc-CA5A-4:8 No - lnc-YES1-2:1 No - LINC00564:5 No - HOXA10-AS:4 No - TUSC7:11 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-JAK1-3:1 Yes chr3R:4211783-4227518 lnc-OR4N4-1:12 No - lnc-SLC25A27-1:1 No - lnc-ADCYAP1-2:5 No - SUCLA2-AS1:1 Yes chr3R:8938724-8943027 lnc-LRRTM2-1:1 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-PDE4D-5:1 No - lnc-USP53-3:1 No - lnc-HRH4-8:1 No - lnc-CHD9-2:1 No - LINC01426:1 No - lnc-OR4N4-1:5 No - lnc-SLX1B-3:14 No - DSCAM-AS1:5 Yes chr3R:17473935-17505667 lnc-KLF7-1:2 Yes chrX:18366357-18377864 lnc-CRB2-1:1 Yes chr2R:9123304-9132030 lnc-PAX9-4:1 Yes chrX:750347-758719 BVES-AS1:3 Yes chrX:21053963-21082391 lnc-MCTP2-7:3 No - SNHG7:3 No - lnc-PRPF19-1:1 No - lnc-CDK2AP1-1:3 No - lnc-CPLX1-2:4 Yes chr3L:16588475-16590132 LINC00937:8 No - lnc-ANKRD33-2:17 No - MIR600HG:4 No - LINC00115:44 No - lnc-GDPD4-2:1 No - ERICH6-AS1:6 No - lnc-UTP11-1:11 No - lnc-RASSF7-1:3 No - lnc-ACSBG1-1:1 Yes chr3R:13382106-13385283 lnc-PRORY-1:1 No - PRKAG2-AS1:2 Yes chr3R:21140739-21214269 lnc-TMEM178A-1:4 No - lnc-CTTN-1:1 Yes chr2L:6723903-6732766 lnc-GABRA5-3:1 Yes chrX:15921955-15924558 lnc-SNCA-4:1 No - MKX-AS1:2 Yes chr2L:204743-207297 lnc-CHST9-6:2 No - LINC01088:12 Yes chr3L:9972312-9974023 lnc-AK6-1:1 No - lnc-MRGPRF-1:1 No - lnc-RPLP1-12:19 No - lnc-CD177-1:2 No - lnc-LY96-1:1 No - lnc-SSTR4-1:2 No - lnc-NPY2R-1:2 No - LINC02186:6 No - lnc-NPIPB4-1:1 No - DHRS4-AS1:14 No - lnc-EAPP-1:3 No - lnc-BTC-2:1 No - lnc-CDC27-8:1 No - lnc-LOX-4:4 No - lnc-KMT2B-2:2 No - lnc-SNRPN-8:151 No - LINC01089:32 Yes chr3R:9497101-9502581 LINC00504:5 No - lnc-TAMM41-5:2 No - MIR4435-2HG:14 No - AQP4-AS1:1 No - lnc-FAM167A-4:1 Yes chr3L:8968528-8971752 lnc-UCK2-2:1 No - MRGPRF-AS1:2 No - lnc-FGF3-6:1 Yes chr2R:14060456-14140902 MIR762HG:5 Yes chrX:9356634-9358594 lnc-ATOH8-1:1 No - lnc-IL16-13:1 No - lnc-LGSN-1:2 No - lnc-PXDNL-1:1 No - lnc-LRRK1-2:2 No - lnc-CDY1-2:1 No - lnc-BRF2-7:10 No - lnc-MB-11:5 No - MIR124-2HG:4 No - DISC1-IT1:1 No - lnc-FABP3-1:1 No - lnc-THNSL1-3:1 Yes chrX:1673110-1692768 LINC00469:5 No - lnc-SHF-2:1 No - lnc-PDE4DIP-1:1 No - lnc-ARC-1:6 No - lnc-C1orf131-1:2 Yes chr2L:10544883-10628054 lnc-CDIPT-2:1 No - lnc-GTDC1-1:1 No - ZBED3-AS1:10 No - lnc-BANP-14:1 No - SNHG20:11 Yes chr2L:6448464-6455929 TNR-IT1:1 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-RMI1-2:1 No - LINC01919:12 No - lnc-PTTG1-2:1 Yes chr2L:9495474-9520696 INHBA-AS1:5 No - ALG9-IT1:1 No - lnc-NFE2L2-1:1 Yes chr3R:26872129-26875742 lnc-TP53TG3C-4:2 No - lnc-NSUN6-2:3 Yes chr3L:22872200-22873702 lnc-AGAP4-2:1 No - lnc-FAM3A-1:1 No - LINC01894:17 No - lnc-ZNF550-1:3 No - lnc-PHKB-3:1 Yes chr3L:15560726-15563065 lnc-MYOC-1:3 Yes chr2R:6642418-6645098 lnc-TMEM74-1:1 No - lnc-STK3-2:1 No - ARLNC1:15 No - lnc-SRP54-2:2 Yes chr2L:8218071-8220741 lnc-GTDC1-3:2 No - lnc-PKP2-1:1 No - PSMA3-AS1:6 No - LINC02127:11 No - lnc-CLEC3A-2:1 Yes chr2L:7999670-8004286 lnc-HRASLS-2:1 No - LINC01344:3 No - lnc-TMEM178A-1:29 No - lnc-TP53TG3-6:1 No - lnc-ARL15-2:1 Yes chrX:19492421-19493337 lnc-RNF24-2:1 No - lnc-CDIPT-1:2 No - HAND2-AS1:27 No - lnc-FKBP1C-6:1 No - RAI1-AS1:1 Yes chr2R:18094940-18101031 lnc-RERE-6:1 Yes chr2L:1724768-1729636 LINC02345:22 No - LINC02465:12 No - lnc-MOCS1-1:1 No - lnc-SRSF2-2:2 No - lnc-PRB1-1:4 No - lnc-MUC20-71:4 No - lnc-NSMAF-1:1 Yes chr3L:1600726-1602674 lnc-PDZD8-1:1 No - lnc-SGIP1-1:1 Yes chr3R:9999771-10001276 lnc-UNCX-3:1 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-PUS3-1:2 No - lnc-C16orf78-5:18 No - PWRN2:2 No - TARID:15 Yes chr2L:6527447-6546976 lnc-MEX3B-4:2 No - lnc-CWC15-2:3 Yes chrX:9317915-9319223 lnc-BEAN1-1:1 No - lnc-MAP9-2:1 No - lnc-MRPL39-1:1 No - lnc-CYP11B1-1:1 No - ZNF337-AS1:10 Yes chr2L:12046711-12048918 PSMA3-AS1:13 No - lnc-CTSZ-2:2 Yes chr2R:23942538-23946936 SLC16A12-AS1:6 No - lnc-VEZF1-1:5 No - lnc-DGCR6-6:11 No - lnc-LINC02210-CRHR1-52:23 Yes chr2R:12474424-12487986 lnc-IRX3-80:47 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-MTRNR2L3-1:1 No - lnc-CCDC113-1:1 Yes chr3L:23097072-23103460 lnc-CPEB2-18:2 No - THAP9-AS1:15 Yes chr2R:8893613-8898798 LINC02125:9 Yes chr3L:12146519-12156990 lnc-BEST3-2:1 Yes chr2R:24162489-24173660 lnc-MARCH8-1:1 No - LINC00554:5 No - lnc-MRPL3-2:4 No - lnc-KIF23-1:1 No - lnc-CYB561-2:1 Yes chr3L:12008225-12064859 lnc-TEKT3-1:1 No - SMAD1-AS2:2 Yes chr2L:3146056-3159643 ZDHHC20-IT1:1 Yes chr2R:10028443-10032893 UVRAG-DT:25 No - LINC00559:6 No - lnc-NPY5R-3:1 No - lnc-UBASH3B-2:1 No - lnc-FBXO47-2:1 Yes chr3L:16676406-16711677 lnc-DONSON-1:1 No - lnc-MRPS5-2:1 No - lnc-C4orf51-1:1 No - lnc-IRX3-80:65 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-MSH2-1:2 Yes chr3L:15154233-15158562 lnc-PGPEP1L-15:1 No - LINC02588:29 No - CDH23-AS1:2 No - lnc-MAP1LC3B2-5:1 No - lnc-NUP58-2:1 No - lnc-SGSM2-1:1 Yes chrX:3671801-3701672 lnc-GATA5-1:1 No - SNHG14:7 Yes chr3L:11206422-11210583 LINC01605:13 No - lnc-PRSS27-4:5 No - lnc-PURG-1:2 No - lnc-TMPRSS2-83:20 No - HAND2-AS1:40 No - MAMDC2-AS1:7 No - lnc-CDK5R1-2:1 Yes chr2L:10491814-10506779 TUSC7:12 Yes chr3L:5424109-5442399 CDKN2B-AS1:27 Yes chr3R:25036944-25037982 lnc-RBM4-1:2 Yes chr3L:7339266-7341893 TRDN-AS1:29 No - lnc-SLC25A47-4:2 No - lnc-FTO-3:1 No - lnc-GABARAP-1:1 No - lnc-ESRP2-2:9 No - lnc-C8orf48-3:1 Yes chrX:1735945-1754065 lnc-NEFL-3:8 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-CPEB4-4:2 No - lnc-KLHL32-4:14 No - lnc-DPH6-2:2 No - ZBED3-AS1:4 No - IL1R1-AS1:3 No - FOXD3-AS1:6 No - NR2F2-AS1:10 Yes chr3R:12258737-12302785 lnc-HMGB2-1:1 Yes chrX:18495067-18499986 LINC00662:68 No - lnc-LRRC75A-3:1 Yes chr3L:14186249-14189648 lnc-FBLL1-4:3 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-GGCT-1:1 No - lnc-C15orf41-7:2 No - lnc-BTBD1-1:9 No - FGF12-AS1:2 No - lnc-FAM196A-1:14 Yes chr3R:23781765-23801634 GLIS2-AS1:1 Yes chr2R:12924567-12930644 lnc-GDF5-1:3 Yes chr3R:24113286-24128193 GLYCTK-AS1:6 Yes chr2L:2420830-2424647 lnc-ALPK3-1:1 No - lnc-CPM-1:1 No - lnc-SNX19-9:4 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-PRM1-1:1 No - PCBP1-AS1:20 No - lnc-TMEM109-4:6 No - PCDH9-AS2:2 Yes chr3R:14630478-14641776 lnc-RIPOR2-21:1 No - LINC02158:10 No - PAQR9-AS1:12 Yes chr2R:21011970-21015628 lnc-GPR176-3:1 No - PCBP1-AS1:16 No - STX17-AS1:1 No - TCF7L1-IT1:1 Yes chr4:69326-114270 PPP4R1-AS1:4 No - lnc-LONP2-6:2 No - lnc-TSPYL6-3:1 Yes chrX:17657372-17669371 lnc-CASP9-3:1 No - SNHG21:3 No - lnc-SEPHS2-1:1 Yes chr2R:15258761-15262873 AGBL5-AS1:1 No - lnc-EEPD1-49:3 No - lnc-FPGS-2:1 Yes chr2L:21262956-21282790 lnc-SPNS3-2:2 No - lnc-TMEM178A-1:33 No - lnc-ALKBH4-1:1 Yes chr2R:17843442-17860582 lnc-DDX31-1:1 No - lnc-KLHL22-1:1 Yes chr2L:473013-476170 lnc-PTN-2:2 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-GLUD1-2:1 No - lnc-DGKH-1:1 No - ZNF385D-AS1:2 No - AOAH-IT1:1 No - lnc-EMID1-1:1 No - LRRC75A-AS1:52 No - FAM66C:17 No - ZBED3-AS1:13 No - lnc-PLEKHA8-3:1 No - lnc-MNS1-1:1 Yes chr2R:24578247-24579827 AMMECR1-IT1:1 Yes chr3R:23986642-23988738 PTCHD1-AS:2 Yes chr3R:8122725-8125273 lnc-ZNF236-9:1 No - lnc-ADAM22-2:1 No - lnc-TRIM36-4:1 Yes chrX:5340236-5405138 lnc-TBCD-2:4 No - lnc-CSNK1G3-5:1 Yes chr2R:18278198-18357296 lnc-SLC2A4RG-2:5 No - lnc-MAP7-1:1 No - NREP-AS1:3 No - lnc-MIER3-1:1 No - lnc-IL34-5:1 Yes chr3R:12462562-12465298 LINC01541:4 No - EWSAT1:6 No - lnc-RNASE1-1:1 No - EWSAT1:2 No - lnc-ZNF236-13:1 No - HLA-F-AS1:4 No - lnc-PIRT-3:1 No - lnc-IGFBP2-8:4 No - PRKCZ-AS1:7 Yes chr2R:14944458-14962969 lnc-XRN1-1:1 Yes chrX:16391698-16399850 lnc-NOS2-2:1 No - lnc-ZSCAN10-3:28 No - lnc-BECN2-2:4 Yes chr2L:21166046-21168581 LOXL1-AS1:8 Yes chr2R:21789623-21791580 lnc-CMC2-2:1 Yes chr3L:851346-852673 lnc-RPRML-3:4 No - lnc-PRPF18-8:1 No - lnc-PHOX2B-1:1 Yes chr3R:4659579-4712193 lnc-TMEM220-1:1 No - lnc-COL3A1-1:1 No - LINC02140:14 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-GDPD4-1:3 No - lnc-SLC38A8-3:1 No - LINC01006:6 No - lnc-PPP4R1-2:2 No - lnc-SLC22A18-1:1 Yes chrX:928798-930098 lnc-LRRC26-1:1 No - lnc-TADA2B-1:1 No - lnc-TBCD-1:1 No - LINC01753:5 No - lnc-RPP38-1:1 No - lnc-PANK3-2:1 Yes chrX:10964032-10967134 lnc-ACSM5-1:1 No - LINC01300:2 No - NAALADL2-AS3:3 No - lnc-SLC5A9-3:1 Yes chr3R:30597004-30599296 NUTM2A-AS1:22 No - lnc-ZNF782-3:1 Yes chr3L:3128034-3143457 lnc-ARHGAP18-1:6 Yes chr2L:14263027-14328262 lnc-IL10RA-1:1 No - lnc-PLAT-3:2 No - lnc-SLC37A4-1:38 No - LINC02249:7 No - lnc-ELMOD2-1:1 Yes chr3L:21337681-21343716 lnc-NTN1-3:1 Yes chr3L:16586108-16587057 lnc-AMELY-2:5 No - lnc-CHSY1-3:1 Yes chr3R:20635480-20644279 lnc-CTNNA1-2:3 Yes chr3R:25233636-25235529 LINC01912:9 No - lnc-KCNJ4-2:1 Yes chr3R:31054085-31061210 lnc-GCSH-1:1 No - lnc-CHST9-6:1 No - lnc-TAOK1-5:1 Yes chrX:19569721-19579800 TUG1:27 No - lnc-HSPB7-1:1 No - lnc-MYL12B-1:1 No - lnc-DUSP1-2:1 Yes chr3R:9020348-9039471 lnc-CDIPT-1:7 No - lnc-USP6NL-4:1 Yes chr2L:12344219-12397528 SRP14-AS1:24 No - lnc-CCNB1IP1-2:1 No - LINC01070:5 No - lnc-DLGAP3-1:1 No - lnc-WDR72-1:2 No - TIPARP-AS1:5 No - lnc-LINGO2-1:1 No - AKT3-IT1:1 Yes chr3R:16099228-16105670 TNFRSF10A-AS1:3 No - lnc-PDRG1-1:1 No - lnc-RABL2B-1:1 No - lnc-FBXW11-3:1 No - lnc-CTAGE1-9:17 No - RPS6KB2-AS1:3 Yes chr3L:5797549-5810931 SNRK-AS1:2 Yes chr2R:14235787-14239703 lnc-ZNF217-4:1 No - lnc-MYBBP1A-1:1 Yes chr2R:16124981-16138238 lnc-AKT1-1:1 No - lnc-YRDC-1:1 Yes chr2L:5536850-5539196 lnc-FBN1-2:1 No - lnc-CNPY3-1:1 No - GABPB1-AS1:14 No - lnc-PADI6-2:1 Yes chr2L:6050800-6053877 MIR100HG:10 No - lnc-TLE3-4:1 No - lnc-RPH3AL-1:5 No - lnc-RPLP1-12:17 No - lnc-SLC2A6-1:1 Yes chr3L:15810081-15816410 lnc-PDZD7-1:1 No - lnc-SPSB4-1:1 Yes chr2L:1716244-1724388 LINC00470:5 No - lnc-DDX60L-1:1 No - lnc-PGPEP1L-1:1 No - lnc-IFNK-2:1 Yes chr2L:10265336-10266570 lnc-LIMS4-1:7 Yes chr3R:8356978-8359964 lnc-APTX-1:1 No - lnc-MMP24OS-73:4 No - SRP14-AS1:12 No - lnc-SVOP-1:2 Yes chr2R:24014917-24017198 lnc-FZD3-1:2 No - lnc-PCED1B-5:19 No - KDM4A-AS1:1 No - TH2LCRR:1 No - lnc-KHDC3L-2:8 No - lnc-RBM22-2:1 No - lnc-TSTD2-2:1 Yes chr3R:30532607-30578905 lnc-ARHGAP28-12:1 Yes chr3R:27266326-27273273 GRM7-AS3:5 Yes chr4:936819-949441 DLX6-AS1:16 Yes chr2R:24814822-24835667 lnc-TRPT1-2:1 No - lnc-TLE3-6:9 No - lnc-GRAP-6:3 No - ADIPOQ-AS1:2 No - lnc-C8orf33-6:1 No - lnc-SRSF2-2:1 No - lnc-FAM153C-5:8 No - lnc-SLC37A4-1:30 No - lnc-CCL1-1:1 No - UBE2E2-AS1:5 No - lnc-GPT2-2:1 No - lnc-MRPS14-2:2 Yes chr3L:8346561-8352279 lnc-SLC47A1-8:1 No - lnc-NUDCD2-2:2 No - ZNF341-AS1:3 No - lnc-ZWINT-5:1 Yes chr3R:11893512-11949129 LOXL1-AS1:21 No - lnc-SBDS-11:3 No - lnc-PPP4R1-8:1 No - lnc-RNF125-3:1 Yes chr3L:19613427-19618521 lnc-TBL1XR1-7:1 No - CNTFR-AS1:12 No - lnc-PAQR9-1:1 Yes chr2L:6677835-6684364 lnc-RD3L-1:7 No - CDKN2B-AS1:31 No - lnc-SPAG1-3:5 No - lnc-GALNTL5-2:1 Yes chr3R:21140739-21214269 lnc-FAM173B-1:1 No - lnc-INS-IGF2-1:1 No - lnc-MLH3-1:1 Yes chrX:2704571-2706217 lnc-GABRR3-1:2 No - lnc-KDM5A-2:1 No - lnc-TNFRSF10B-1:1 No - WAC-AS1:3 Yes chrX:17068717-17077897 lnc-DTYMK-1:1 Yes chr2L:13385848-13387312 lnc-GRIA1-1:1 No - lnc-FAM237B-2:12 Yes chr3L:3515751-3610521 lnc-NUP58-1:1 No - lnc-EXOSC6-3:27 No - lnc-HMBOX1-1:5 No - lnc-TLCD2-2:1 Yes chr2L:12014304-12020960 LINC01254:2 No - lnc-CDK2AP1-1:1 No - lnc-C9orf116-1:1 Yes chr2L:4849439-4850419 lnc-TP53BP1-1:1 Yes chr2L:10483295-10485857 lnc-LIMS3-2:3 No - lnc-GGCT-1:10 No - CDKN2B-AS1:6 Yes chr3R:25036944-25037982 MTUS2-AS2:11 No - lnc-GGCT-1:16 No - lnc-C2orf54-2:1 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-NIM1K-1:1 Yes chr2R:16336090-16341242 lnc-TMEM41B-3:1 No - lnc-FANCC-9:3 No - lnc-CDK2AP1-1:2 Yes chrX:11137859-11139689 LINC01719:36 No - lnc-IRS4-3:2 No - lnc-HNRNPA0-4:12 No - lnc-ATF7IP2-2:1 Yes chrX:1483625-1507809 LINC00928:3 No - lnc-RPRML-1:1 No - lnc-TNFRSF17-1:1 Yes chr2L:12434452-12441279 lnc-REG3A-1:1 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-MAST4-5:2 No - lnc-AP3S1-4:1 Yes chrX:11850909-11852530 lnc-TRAPPC11-2:1 Yes chr3L:21075581-21131159 lnc-OSBPL1A-2:1 No - ZBED3-AS1:17 No - lnc-ATP2B3-1:3 Yes chr3R:18403026-18404726 lnc-OSBPL7-1:1 Yes chr2L:20734609-20750941 lnc-TIMM21-5:5 No - lnc-CMSS1-1:4 No - lnc-C2CD4B-4:1 No - GPC5-AS2:2 Yes chr3L:8827505-8891192 LINC01894:16 No - lnc-COQ7-1:1 No - lnc-SPP2-2:2 No - lnc-NPAP1-9:5 No - DLG3-AS1:1 Yes chrX:11369665-11409776 SEMA3F-AS1:1 No - ZNF503-AS1:9 No - lnc-CNBD1-4:3 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-OST4-2:1 Yes chr2L:4149279-4151203 LINC01582:1 No - lnc-ZNF267-1:1 No - ST8SIA6-AS1:2 No - lnc-KCTD6-2:1 No - NUTM2A-AS1:4 No - lnc-ADCYAP1-2:3 No - LINC01413:3 No - lnc-EIF2D-1:1 Yes chr4:1225089-1230713 lnc-TMCO2-1:1 Yes chr2R:16998610-17000126 lnc-TAF1C-1:4 No - LINC00622:2 No - lnc-NAV3-2:4 No - lnc-PGPEP1L-8:3 No - lnc-TMEM105-2:32 No - LINC01919:14 No - KCNAB1-AS1:1 Yes chrX:10233347-10263485 TAF1A-AS1:1 No - lnc-PGPEP1L-11:1 No - LINC02533:6 No - lnc-SNRPN-8:124 No - lnc-FAM167A-2:3 Yes chr3L:4592447-4626196 lnc-DYNLL2-2:1 Yes chr3L:1857165-1859047 ARHGEF19-AS1:1 Yes chr3L:16970013-16994388 lnc-IKZF1-2:1 No - PRKCA-AS1:3 Yes chr2R:16898535-16901575 PSMA3-AS1:16 No - lnc-SLC7A6-1:1 Yes chr2R:23076688-23079038 SLC8A1-AS1:30 No - lnc-PANO1-1:11 No - GPRC5D-AS1:35 No - LINC02352:14 No - lnc-PAX8-1:1 Yes chr3R:22587755-22608842 USP3-AS1:6 No - lnc-CCDC146-6:1 No - lnc-ZNF131-10:2 No - lnc-RFESD-1:1 No - lnc-TRAP1-1:1 No - lnc-SLC45A4-2:2 No - USP3-AS1:15 No - lnc-CHADL-1:2 No - lnc-MRPS22-1:2 No - lnc-LIMS3-2:2 No - lnc-RXYLT1-1:2 No - NGF-AS1:8 No - lnc-CSNK1G1-1:4 No - lnc-TAF1C-1:3 No - LINC01925:6 No - LINC02520:41 No - LINC00661:17 No - lnc-GDF5-1:1 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-MPLKIP-1:4 Yes chr3L:21516306-21522684 lnc-GABRA5-1:1 Yes chrX:15921955-15924558 LINC00667:18 No - lnc-MEX3C-1:1 No - lnc-ARHGAP28-3:1 No - lnc-NPAT-2:1 No - lnc-EYA3-1:1 No - NR2F2-AS1:9 Yes chr3R:12258737-12302785 LINC01344:4 No - lnc-DHRS7-2:1 No - DHRS4-AS1:9 Yes chr3L:5140440-5141646 RNF216-IT1:1 No - lnc-OSBPL7-3:16 No - lnc-DAZL-1:1 No - lnc-SHISA9-1:1 No - lnc-OR5H6-1:1 No - ASTN2-AS1:1 No - lnc-DCLK3-1:1 No - CCDC18-AS1:1 No - lnc-CEMP1-6:1 No - RUSC1-AS1:2 No - LINC02134:4 No - lnc-NFYB-1:1 No - LINC00115:15 No - AATBC:14 No - lnc-ASTE1-1:1 No - lnc-RMDN2-3:14 No - lnc-PPP1R3A-2:1 No - lnc-SLC1A1-3:1 No - MIR100HG:25 No - LINC01613:1 No - SLC25A34-AS1:5 No - lnc-GTF2IRD2-1:12 No - LINC02021:10 Yes chr3R:17809401-17811134 lnc-DYSF-2:1 No - LINC00967:3 No - CCDC18-AS1:40 No - lnc-GDPD5-2:1 No - lnc-ELFN2-2:7 No - lnc-ADIRF-1:4 No - lnc-RAB11FIP4-4:2 Yes chr3R:25983013-25995737 lnc-STYX-4:1 No - LIPC-AS1:4 No - lnc-FAM168A-1:1 No - lnc-NABP1-5:1 No - lnc-PTGR2-1:1 Yes chr3R:9461084-9493677 lnc-PTP4A3-3:3 No - lnc-STX3-1:2 No - MGAT3-AS1:3 Yes chr2L:13180398-13182596 lnc-CATSPER3-2:6 No - lnc-ZDHHC6-3:1 Yes chr3L:691486-692919 lnc-TEFM-3:1 No - lnc-MGAT1-1:1 Yes chr2R:20559156-20562331 lnc-C16orf78-5:16 No - TEX26-AS1:8 No - CADM3-AS1:6 No - lnc-GABRG3-1:1 No - lnc-PMFBP1-1:1 No - lnc-GGCT-1:20 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-ITSN2-2:2 No - LINC01089:25 Yes chr3R:9497101-9502581 SH3RF3-AS1:2 No - lnc-CTTNBP2-1:1 Yes chr2L:8355678-8362469 lnc-RACK1-1:3 No - lnc-BRF2-15:2 No - lnc-PSKH2-2:1 Yes chrX:3880748-3882967 lnc-GLDC-7:1 No - LINC01237:1 No - MIR100HG:6 No - lnc-CHAC2-4:1 Yes chr3R:22468512-22486969 LHFPL3-AS1:6 Yes chr3L:1885657-1891462 lnc-DLX2-4:3 Yes chr2R:9426439-9434638 lnc-PRMT8-2:3 No - lnc-SLC22A31-5:1 No - lnc-GPER1-1:8 No - STARD13-IT1:1 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-RALGPS1-2:1 No - lnc-B4GALNT3-2:3 Yes chr3R:12695129-12697379 lnc-RGS5-1:4 No - lnc-PCDHGA1-1:3 Yes chr2L:20758144-20768053 lnc-TP53TG3D-3:2 No - lnc-SPATA9-1:1 No - lnc-KRAS-1:1 No - lnc-SOX13-3:1 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-TMEM178A-1:2 No - lnc-SLC38A8-4:2 No - lnc-ESR1-2:1 No - MCPH1-AS1:4 Yes chr2R:11895997-11903918 lnc-C2CD4A-2:1 No - lnc-NMRK1-1:1 Yes chrX:1927683-1930517 lnc-GXYLT1-1:1 No - lnc-BHLHE41-1:1 No - lnc-STAP1-2:1 No - lnc-JMJD8-1:2 No - KIRREL3-AS2:1 Yes chrX:2740384-3134532 LRP1-AS:2 Yes chr2R:8174165-8226438 lnc-ARHGAP28-4:5 No - lnc-DOCK8-4:1 Yes chr2R:12180493-12182373 lnc-UBR2-4:3 No - lnc-NDUFAF2-2:17 Yes chrX:3176440-3343767 lnc-RANBP3L-4:3 No - lnc-GGCT-1:17 No - lnc-MYEF2-9:1 Yes chr2R:17672839-17683499 lnc-ADAMTS18-1:1 No - lnc-LMX1A-2:1 Yes chrX:15992468-15996509 lnc-HNRNPA2B1-15:9 No - THUMPD3-AS1:10 No - lnc-FBN1-3:3 Yes chr2L:11011312-11012135 lnc-PUS3-2:4 Yes chr3L:27279316-27422159 ZFHX2-AS1:32 No - BCAR4:1 No - lnc-ZNF569-1:1 No - lnc-C15orf41-18:9 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-RPLP1-12:6 No - lnc-DPP4-1:2 No - MKLN1-AS:1 Yes chr2R:12628697-12632378 lnc-GAS8-1:5 No - lnc-KRT80-2:1 No - lnc-CNBD1-1:3 Yes chr2R:21692691-21697152 lnc-MAPK6-4:1 No - lnc-FBRSL1-3:1 No - lnc-IQSEC3-1:1 No - lnc-SMIM21-1:2 No - LINC01584:9 No - NCF4-AS1:12 No - lnc-PPP1R1B-1:1 No - lnc-KAT7-1:1 Yes chr2L:7412417-7422736 lnc-NTSR2-2:1 Yes chr2R:8136986-8156654 lnc-CLN6-27:1 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-FBLL1-4:21 Yes chr2R:15869495-15922118 CSMD2-AS1:10 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-NPAP1-9:11 No - lnc-PNLIPRP1-1:1 No - lnc-TNS3-1:2 No - LINC01228:1 No - lnc-SPG11-4:1 No - lnc-HNRNPA1P48-1:1 No - lnc-STAT3-1:1 Yes chr3R:20535323-20552311 lnc-RASGEF1B-1:2 Yes chr2R:17514217-17517445 lnc-ERCC6L2-5:2 No - lnc-ACTG1-1:1 Yes chr3R:22710883-22721150 NRG3-AS1:5 No - SPATA17-AS1:2 No - DIAPH2-AS1:5 Yes chr2L:20758144-20768053 lnc-RXRG-1:4 No - lnc-PSMD7-8:1 Yes chr4:501810-540874 lnc-NMNAT1-3:1 No - lnc-ITPR2-2:3 No - SRD5A3-AS1:21 Yes chr2L:8305586-8306741 TMEM246-AS1:1 No - lnc-SETD6-3:2 No - lnc-RYR2-3:1 No - lnc-SNRPN-8:88 No - HAND2-AS1:28 No - RHOA-IT1:1 Yes chr2R:16102687-16107229 lnc-C21orf2-2:1 No - lnc-ESCO2-2:1 No - lnc-PGBD5-2:1 Yes chr2L:3404460-3426719 lnc-C8orf59-8:2 No - EGFLAM-AS2:3 Yes chr2R:16031930-16047243 lnc-THAP10-3:1 No - lnc-LEXM-2:7 No - lnc-EID1-2:1 Yes chr3L:9427010-9428671 lnc-PRR14-1:2 No - lnc-LRIF1-1:1 No - GAPLINC:10 No - FLNC-AS1:10 No - lnc-ATP6V1G3-2:1 No - lnc-NPTX1-2:3 No - UBL7-AS1:3 No - lnc-PPFIA2-1:1 Yes chr3R:24336922-24340645 lnc-RBM11-3:2 No - lnc-SRP54-2:1 Yes chr2L:8218071-8220741 lnc-NRBP2-1:1 Yes chr3R:5742510-5747138 lnc-NPTX1-1:1 No - LINC02006:7 No - lnc-G3BP1-1:1 Yes chr3L:21640995-21642599 lnc-CTDSP2-2:7 No - lnc-OR2C3-1:3 No - lnc-MUC20-71:5 No - lnc-PHLDB1-1:1 Yes chr2L:10239341-10242172 lnc-MDH1B-1:1 No - LINC00691:5 No - lnc-PRSS27-4:9 No - DBH-AS1:5 Yes chrX:7995697-8027394 lnc-COIL-2:3 No - HAND2-AS1:14 No - lnc-CSNK1G3-6:1 Yes chr2R:18278198-18357296 lnc-ERGIC2-2:1 Yes chrX:2201820-2203866 lnc-MAST4-5:8 No - lnc-HIVEP1-1:2 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-TTLL7-7:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-MEP1A-2:1 No - lnc-POLR2L-1:1 No - lnc-ZBTB10-1:1 No - lnc-TP53TG3-31:1 No - lnc-PLCG2-1:10 Yes chrX:16350315-16356482 LINC01994:4 No - NTM-IT:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-ELF2-2:4 No - lnc-FBLL1-4:7 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-CPEB2-18:3 No - NUTM2A-AS1:18 No - TAB3-AS1:1 No - lnc-ELAVL4-11:1 Yes chr3R:30597004-30599296 ELF3-AS1:4 No - LHFPL3-AS1:2 Yes chr3L:1885657-1891462 ID2-AS1:3 Yes chr3L:749400-753492 SNHG20:3 Yes chr2L:6448464-6455929 LINC01922:6 No - LINC00442:4 No - lnc-PRDM4-4:1 Yes chr3L:21644958-21666306 LENG8-AS1:3 Yes chr2L:10837732-10842597 lnc-UPB1-1:3 No - lnc-AGRP-1:20 No - lnc-CCDC32-1:1 Yes chrX:19866146-19908108 LINC01411:11 No - NRG1-IT1:8 No - lnc-ARHGAP26-4:7 Yes chr3R:19794073-19836817 lnc-ARAP2-2:1 No - lnc-SLC25A47-3:1 Yes chr3L:9452803-9456281 lnc-LRRC57-2:2 No - MRPS30-DT:72 No - EP300-AS1:19 Yes chrX:9665442-9687066 PRKCA-AS1:1 Yes chr2R:16898535-16901575 lnc-NEFL-3:5 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-SLX1B-3:11 No - lnc-SLC37A2-1:1 No - lnc-PPIE-1:1 No - LINC02588:31 No - lnc-CDH5-6:1 No - lnc-LOX-4:1 No - lnc-GXYLT1-2:1 Yes chr4:663621-669884 lnc-TRIP11-5:7 No - lnc-ARHGAP28-17:1 Yes chr2R:19229063-19243751 lnc-DSC2-1:1 No - lnc-NSUN6-8:3 No - lnc-ERAL1-1:1 No - C6orf47-AS1:1 No - LINC01606:7 No - lnc-AGRP-1:2 No - DLGAP1-AS1:4 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-ATP6V0D1-1:1 Yes chr2R:12064565-12079543 lnc-SLC7A7-1:4 Yes chr3L:10884261-10886471 CDKN2B-AS1:7 Yes chr3R:25036944-25037982 lnc-KCNA3-3:1 No - lnc-LPIN3-2:1 No - lnc-SPOPL-2:2 Yes chr3R:13967061-14032057 lnc-GDF5-1:4 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-THOC3-1:1 Yes chr3R:8307473-8308645 RORA-AS1:8 Yes chr2R:10203995-10237348 lnc-MPHOSPH6-8:2 No - lnc-MFN1-1:1 Yes chrX:15860115-15866175 lnc-NKX6-3-4:3 No - lnc-PPM1D-1:1 No - KIF26B-AS1:3 Yes chr2L:7844905-7855475 lnc-PRSS27-4:22 No - HOXA11-AS:5 No - PDZRN3-AS1:2 Yes chr4:663621-669884 lnc-MUC20-67:75 No - lnc-PANK3-9:1 Yes chrX:10964032-10967134 lnc-PRDM9-2:4 No - LOXL1-AS1:4 Yes chr2R:21789623-21791580 lnc-DNAH6-1:1 No - lnc-DAZ1-166:2 No - LINC01906:3 No - lnc-MPLKIP-4:1 Yes chrX:3704610-3719635 lnc-CEP83-1:1 Yes chr4:32478-43778 ZBED3-AS1:7 No - lnc-ZBTB25-4:2 No - lnc-CPPED1-8:2 Yes chr2L:13177150-13178978 lnc-SPACA3-3:1 No - lnc-MRPL3-2:3 No - BACE2-IT1:1 No - lnc-BANP-1:15 No - EWSAT1:4 No - lnc-PARN-8:1 No - lnc-SCRN1-1:1 No - lnc-YES1-8:1 No - lnc-IL3-2:1 Yes chr3L:18878250-18890483 lnc-SSTR4-1:1 Yes chr3L:18560258-18576326 lnc-TTC23-3:1 No - lnc-WDR70-7:19 No - LINC01606:13 No - lnc-PAX6-1:3 Yes chr2L:5524139-5525809 lnc-MPHOSPH8-1:1 Yes chrX:16361569-16371547 CA3-AS1:7 No - lnc-DCAF4L2-2:1 No - CERNA3:3 No - lnc-TMEM64-2:1 No - lnc-TMEM252-2:4 Yes chr3L:16126018-16128531 lnc-MTHFR-1:1 No - lnc-HIST4H4-1:1 No - lnc-CARNS1-1:1 Yes chr3R:24518270-24522331 lnc-ACP2-2:2 Yes chrX:15089682-15113762 CECR3:1 No - lnc-GGH-1:1 Yes chr2R:24881570-24888615 lnc-TMEM178A-1:32 No - lnc-C16orf58-1:1 Yes chr3L:1933633-1939103 RORA-AS2:4 Yes chr2R:10203995-10237348 LINC02418:14 No - lnc-TGFB3-1:2 Yes chr3R:25112867-25122920 lnc-PARVA-7:1 No - ITCH-AS1:1 Yes chr2L:2037714-2044372 lnc-CTR9-1:2 No - ZBTB46-AS1:1 No - lnc-CYB5R2-1:10 No - HOTAIRM1:8 No - lnc-CDC27-2:9 No - lnc-TBC1D3K-1:2 No - LANCL1-AS1:6 Yes chrX:11092492-11094947 lnc-MED10-6:1 No - lnc-RNASE12-1:1 No - TTLL7-IT1:1 No - lnc-CEP170-13:15 No - lnc-CCDC81-1:1 Yes chr2R:16414815-16419398 lnc-ATMIN-1:1 No - lnc-ZSCAN10-1:3 No - lnc-FAM174B-1:3 No - lnc-KTN1-1:1 No - GRM7-AS3:8 No - PRICKLE2-AS2:1 Yes chr2R:7086316-7127868 lnc-IBTK-3:2 Yes chr2R:7737019-7782637 MPPED2-AS1:11 Yes chr3L:9679201-9681060 lnc-DGLUCY-1:1 No - lnc-WRN-8:1 No - lnc-KCNK15-1:1 No - lnc-RGS7-2:1 No - lnc-TMEM94-2:1 Yes chr2R:13495222-13502841 lnc-SLC2A12-3:1 Yes chr2L:6527447-6546976 lnc-MAST4-5:1 No - lnc-FAM83G-1:1 Yes chr3L:1933633-1939103 lnc-SNRPN-8:147 No - lnc-TRIM55-1:8 No - lnc-MARCH11-2:1 Yes chr3R:15920898-15932887 LINC00668:6 No - lnc-BCL11B-2:1 No - lnc-TUBB8P12-1:2 No - MAGI2-AS3:23 No - lnc-MAST2-1:1 No - lnc-IFT46-1:1 No - lnc-TMEM35B-1:5 No - lnc-ZSCAN10-3:9 No - lnc-CEMP1-6:2 No - lnc-CHRNB4-1:5 Yes chrX:8276200-8367169 lnc-ESCO1-1:1 Yes chr2R:9132480-9135453 lnc-CKAP2-1:2 No - TRIM36-IT1:1 Yes chr2L:10544883-10628054 NAV2-AS1:1 Yes chr2L:19796365-19958424 GRIK1-AS1:5 Yes chr3R:20860187-20866231 LINC00293:9 No - lnc-FSIP1-2:1 No - lnc-SUMO1-1:1 No - lnc-ACSM5-2:2 No - lnc-RPRML-3:9 Yes chr3L:5366455-5367381 lnc-SERPINB8-3:1 No - lnc-FGFRL1-4:2 No - lnc-ARHGAP28-16:1 Yes chr2R:19229063-19243751 lnc-HSP90AA1-1:2 Yes chr3L:4807368-4825687 lnc-ANKRD40-2:1 Yes chrX:6104085-6192483 DLEU7-AS1:2 No - lnc-STYX-5:3 No - lnc-ARMCX5-2:1 No - lnc-ATAD5-2:1 No - lnc-PRMT8-2:2 No - lnc-NKD1-1:1 Yes chr3L:19003741-19045449 NLGN4Y-AS1:1 Yes chr3R:7570281-7639434 RASA2-IT1:1 Yes chr3L:9839093-9855285 lnc-CD40LG-2:2 No - lnc-MTO1-1:2 No - lnc-GTDC1-2:1 No - LINC01720:3 No - lnc-STAT1-2:1 Yes chr2R:12670483-12679593 LINC00472:45 No - lnc-CWF19L2-1:1 No - lnc-SMIM10L2B-1:7 No - lnc-SLC39A11-1:30 No - lnc-ARHGAP26-4:2 Yes chr3L:3401153-3424935 IDH1-AS1:2 Yes chr3L:8356404-8360906 lnc-CPEB2-18:6 No - lnc-SLC6A12-2:1 Yes chr3L:21034535-21075444 lnc-C2CD4A-7:1 Yes chr2R:10203995-10237348 lnc-PPP1R1A-2:1 Yes chr3L:22284354-22288195 LINC01833:39 No - lnc-ZFHX3-27:1 No - H1FX-AS1:11 No - lnc-USP20-2:1 Yes chr3L:4322491-4364102 lnc-CDC42BPB-1:3 No - lnc-FAM120B-4:1 No - lnc-GAMT-2:1 Yes chrX:15985473-15986808 THUMPD3-AS1:32 No - LINC00620:5 No - lnc-CPA6-1:2 No - lnc-ZNF275-4:1 No - LEF1-AS1:4 No - lnc-SNAPC5-1:1 No - lnc-NPIPA7-2:1 No - lnc-NKD1-3:4 No - lnc-ZBTB20-1:1 No - lnc-PSMG3-3:1 Yes chr2R:9288957-9291565 lnc-ADGRD2-3:1 No - LINC00310:16 No - lnc-JAG1-2:1 No - lnc-ARL14EP-1:1 Yes chr3L:9679201-9681060 lnc-NUDCD2-2:4 No - lnc-TCIRG1-2:3 No - lnc-SPDYE16-1:1 Yes chrX:6533999-6538575 GABRG3-AS1:1 Yes chrX:15921955-15924558 lnc-TM4SF20-1:2 No - lnc-TP53TG3-49:1 No - lnc-ACOT12-2:1 No - LINC00470:8 No - MIR22HG:8 No - lnc-SRSF11-1:2 Yes chr2R:14935660-14940722 lnc-CCK-1:1 No - lnc-MYEF2-4:10 Yes chr2R:17672839-17683499 PLCE1-AS2:6 No - lnc-ARMCX3-1:1 No - lnc-ZSCAN2-11:2 No - UVRAG-DT:16 Yes chr2L:13286777-13289556 lnc-IL15RA-1:3 No - lnc-RIIAD1-3:1 No - lnc-SNRPN-8:129 No - lnc-ZSCAN10-3:2 No - lnc-RDH14-1:1 No - lnc-CRAMP1-1:1 Yes chr2L:553742-560310 LINC02568:16 No - ENTPD1-AS1:1 Yes chr3L:3466428-3468098 lnc-SLC35E3-1:1 No - lnc-ATP10A-69:1 Yes chr3L:11206422-11210583 lnc-SRPK2-1:12 No - LINC00525:1 Yes chr3R:4808336-4812096 lnc-VIP-1:1 Yes chr2L:13219979-13221398 CKMT2-AS1:8 Yes chr2R:22825093-22828903 lnc-AGR3-1:7 Yes chr3R:16374434-16403690 GCC2-AS1:1 Yes chr3R:12010772-12015059 lnc-SLC25A32-3:1 Yes chr3R:17872748-17916578 lnc-TIMD4-1:1 Yes chrX:1735945-1754065 lnc-OR1J2-1:1 No - SMIM15-AS1:18 No - lnc-RAB1A-4:1 Yes chr2R:14759646-14769423 lnc-MEIS2-5:3 No - lnc-VPS50-1:12 No - lnc-JMJD7-PLA2G4B-2:13 No - lnc-SEC16B-2:20 Yes chrX:12596047-12609910 lnc-MAT2B-3:19 No - lnc-KRR1-4:16 No - lnc-BIN1-1:1 No - SLC12A5-AS1:7 Yes chr2R:23907654-23925066 lnc-TBCCD1-4:58 No - lnc-WDR72-1:3 No - EMX2OS:1 Yes chr3R:13867345-13874916 lnc-GPT2-4:1 Yes chr2L:8190808-8196918 MRPS30-DT:71 No - FBXO36-IT1:1 No - lnc-MAPT-1:1 Yes chr3R:15793782-15802102 lnc-C17orf51-1:1 No - lnc-ODF4-2:4 No - lnc-FAM78A-3:1 Yes chr2R:22918937-22924742 LINC01089:12 Yes chr3R:9497101-9502581 lnc-PAK6-1:2 Yes chrX:16610685-16614856 DLGAP1-AS1:6 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-OR3A2-1:1 No - lnc-EID1-4:1 No - lnc-INTS4-2:1 No - SNHG14:11 Yes chr3L:11206422-11210583 MRPS30-DT:67 No - CASK-AS1:1 Yes chr3R:21783400-21822674 lnc-CLUAP1-1:1 No - lnc-PBX1-2:2 Yes chr3L:12290956-12296123 lnc-GABPA-3:3 No - lnc-CHSY1-3:3 Yes chr3R:20635480-20644279 lnc-PRDM4-3:1 No - lnc-DAPP1-2:3 Yes chr3L:11487550-11499055 PLCH1-AS1:1 No - lnc-GOT2-1:2 No - lnc-ZNF687-1:1 Yes chr3R:6449944-6456676 THUMPD3-AS1:24 No - lnc-LMF1-3:11 No - lnc-PTP4A2-1:1 No - lnc-TP53TG3F-36:1 No - lnc-PPIAL4F-4:3 No - lnc-SMIM21-4:1 No - LINC01979:5 No - lnc-RECQL5-2:1 Yes chr2R:9285310-9286634 lnc-DKK4-1:1 Yes chr3L:11123348-11134663 lnc-LRRC49-2:1 No - lnc-CATSPER3-2:5 No - lnc-ASB7-1:2 Yes chr2R:8914524-8918234 lnc-IPMK-1:1 No - lnc-ATG2B-2:9 No - lnc-C7orf25-1:2 No - CCDC183-AS1:1 No - lnc-PAPOLG-1:1 No - lnc-CCL2-3:1 No - lnc-CORIN-1:1 No - MIR1-1HG-AS1:41 No - lnc-ARFIP1-2:1 No - WWTR1-AS1:3 Yes chr2R:24065975-24068485 lnc-SLC39A3-1:1 No - lnc-SRPRA-5:1 No - BEAN1-AS1:3 No - TTTY14:9 No - lnc-NPIPA8-6:1 No - lnc-ZNF727-4:3 No - MCPH1-AS1:3 Yes chr2R:11895997-11903918 lnc-WDR17-1:1 Yes chr3L:21507852-21512749 lnc-MIS18A-1:1 No - lnc-ATG16L2-4:1 No - lnc-ASB5-2:5 Yes chr3R:24228342-24230035 lnc-IFIT2-1:2 Yes chr2L:10643971-10645891 lnc-CDYL2-6:6 Yes chr2R:24475386-24476032 lnc-MMP24OS-73:15 No - lnc-R3HDM2-1:1 No - lnc-KLHL25-1:6 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-MPHOSPH6-1:4 Yes chr2R:12064565-12079543 lnc-CTAGE1-7:1 Yes chr3R:16026079-16041796 lnc-SEZ6L2-1:1 No - lnc-THEM6-1:2 No - lnc-IGHMBP2-4:1 No - lnc-FLRT1-2:5 No - SLC8A1-AS1:39 No - lnc-ATG9B-2:4 Yes chr2R:16294400-16297232 BVES-AS1:4 Yes chrX:21053963-21082391 lnc-CREG1-2:1 No - lnc-DDIAS-1:2 No - lnc-SLC25A48-3:1 No - lnc-PIGM-1:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-KCNT1-1:1 No - lnc-OR4F4-1:2 No - CCDC144NL-AS1:4 No - lnc-C1QTNF8-2:1 Yes chrX:6104085-6192483 H1FX-AS1:9 No - LINC01611:2 No - lnc-TMEM206-3:1 Yes chrX:16740906-16742918 lnc-EEF1B2-3:1 Yes chr3R:29854695-29857491 ZNF503-AS1:1 No - lnc-CDH8-10:2 No - lnc-RPL36AL-2:1 Yes chr2R:7800785-7806385 lnc-FLRT1-2:2 No - lnc-ZW10-1:1 No - lnc-EAPP-1:1 No - lnc-INF2-1:6 No - KCNQ1DN:2 No - lnc-RASGRP1-3:1 No - lnc-SLC47A2-4:1 Yes chr2R:7466879-7477162 lnc-TMEM183A-5:2 No - lnc-GPR82-1:2 No - lnc-PDE4C-1:1 Yes chr2R:10721335-10729203 lnc-CCDC175-1:1 No - lnc-CCDC51-1:2 No - lnc-MOCS2-2:1 Yes chr2R:15258761-15262873 C8orf37-AS1:1 No - GPC5-AS1:1 Yes chr3L:8827505-8891192 lnc-KCTD7-2:16 Yes chr3L:1295913-1298497 lnc-TUBB2A-1:1 Yes chr3R:22466905-22468157 lnc-WDR4-5:1 Yes chrX:12785563-12897327 lnc-CD40LG-2:1 No - lnc-SLC6A12-3:3 Yes chr3L:21034535-21075444 lnc-OLR1-3:1 No - LINC00618:2 No - lnc-RRP1B-1:1 Yes chr3L:9360316-9362042 lnc-GMEB2-1:1 No - lnc-PEX7-1:1 Yes chr3R:19879719-19886030 GACAT2:1 Yes chr2L:6932545-6942814 lnc-PLA2G7-2:2 Yes chrX:17844949-17848223 lnc-MVP-3:14 No - lnc-FANCM-2:1 No - DLGAP1-AS3:2 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-TEFM-4:1 No - ISPD-AS1:8 No - lnc-ATP13A5-1:1 No - lnc-ARCN1-1:1 Yes chrX:17107582-17135988 lnc-RBP5-2:1 Yes chrX:1866832-1869061 lnc-LINC02210-CRHR1-52:24 Yes chr2R:12474424-12487986 lnc-PLAT-3:1 No - lnc-NR2E3-3:1 No - lnc-OR4F29-1:6 No - lnc-RPS25-5:1 No - lnc-SLC39A11-1:31 No - lnc-DNAJB6-10:2 Yes chr2L:1008378-1048053 lnc-LINC02203-4:1 No - lnc-HCRTR1-5:2 No - lnc-SMAD3-2:1 No - lnc-CLIC5-1:1 No - ARHGEF3-AS1:3 Yes chr3L:4692783-4796253 PCBP1-AS1:115 No - lnc-KCNMB1-3:3 No - lnc-STPG1-1:2 Yes chr2R:17801132-17842820 lnc-SNW1-4:1 Yes chr3R:22468512-22486969 AFF2-IT1:1 Yes chr2L:2885929-2954406 lnc-USP14-3:1 No - FGF12-AS1:1 No - lnc-SPACA3-3:2 No - OSGEPL1-AS1:1 Yes chrX:19699820-19701755 LINC00115:42 No - lnc-TOPAZ1-1:2 No - LINC02352:12 No - lnc-PDSS2-1:1 Yes chr2R:11827170-11839825 LINC02176:5 No - LINC02584:7 No - lnc-BZW1-1:1 Yes chr3R:5595364-5601136 MIR9-3HG:9 No - lnc-PGPEP1L-25:4 No - lnc-FMN1-1:1 No - lnc-AUNIP-3:1 Yes chrX:10266792-10325958 lnc-ZNF236-1:1 No - OCIAD1-AS1:1 Yes chr2R:22886398-22887578 lnc-SLC12A7-5:1 No - lnc-FKBP2-1:2 No - lnc-CDH11-2:1 No - CCDC144NL-AS1:17 No - lnc-LONP2-6:1 No - lnc-OR11H12-1:1 No - lnc-PIGBOS1-1:1 No - lnc-TP53I11-5:1 Yes chrX:6069131-6074857 GRM7-AS2:1 Yes chr4:936819-949441 lnc-TP53TG3-54:1 No - lnc-CALB2-4:2 No - lnc-SLC22A31-2:1 Yes chrX:7329046-7331255 lnc-GRIK2-2:1 No - LINC01630:19 No - lnc-SLC37A4-1:34 No - LCMT1-AS2:3 Yes chr2L:15764220-15766267 TRDN-AS1:30 No - lnc-DOCK8-2:1 Yes chr2R:14901475-14928425 lnc-HACD1-3:1 No - ST8SIA6-AS1:5 No - lnc-CDH5-8:1 No - lnc-ANKRD30B-2:3 No - lnc-MFSD14B-5:1 No - lnc-COA6-1:1 No - LINC01220:3 No - LINC02021:11 Yes chr3R:17809401-17811134 lnc-NAPG-4:1 Yes chr3R:2554162-3263582 LINC02555:17 No - lnc-NFE2L2-5:1 No - lnc-PDCD11-1:1 No - PCBP1-AS1:103 No - RORA-AS1:14 Yes chr2R:10203995-10237348 lnc-PABPC4-1:21 Yes chr2R:23851562-23853247 lnc-PPIAL4A-2:14 No - lnc-IRF1-1:1 Yes chr2R:22421013-22425482 WDR86-AS1:4 No - lnc-HSPA14-1:1 No - MIR124-2HG:5 No - ZRANB2-AS2:2 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-PAQR3-1:1 No - lnc-PTPN3-1:1 Yes chr3L:328097-356050 lnc-CATSPER3-2:4 No - RGMB-AS1:3 No - lnc-HMG20A-1:1 No - lnc-SCN8A-2:10 No - LINC01975:3 No - lnc-RPAP2-1:1 Yes chr2L:9890061-9890772 LINC00115:16 No - lnc-ALDH3A2-5:1 No - lnc-IRX5-1:1 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-CALN1-1:4 No - lnc-BASP1-6:3 No - lnc-POLD3-4:2 No - lnc-GREM2-3:1 Yes chr2L:3872646-3902860 lnc-SLC39A11-1:20 No - lnc-MAP6-1:1 No - lnc-PADI1-4:5 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-TNFRSF10B-1:2 No - lnc-MYOC-1:2 Yes chr2R:6642418-6645098 lnc-STAB2-1:11 Yes chr2R:9577427-9581847 LINC00502:2 No - lnc-RABEP2-3:1 Yes chr2R:16124981-16138238 CKMT2-AS1:6 Yes chr2R:22825093-22828903 lnc-PANK1-2:2 No - THSD4-AS1:6 No - lnc-CHST4-3:2 No - lnc-SRP9-1:1 No - lnc-METRNL-10:1 No - LIMS1-AS1:1 Yes chr3R:8356978-8359964 lnc-NUDT4B-1:1 No - NFIA-AS1:3 Yes chr4:268175-276369 lnc-GTDC1-5:1 No - LINC01568:6 Yes chr4:501810-540874 lnc-RPL27A-2:2 No - lnc-ZNF33A-137:6 No - lnc-TNFRSF14-2:1 No - lnc-COMMD7-4:1 Yes chr2L:4149279-4151203 HTR3E-AS1:1 Yes chr2L:545129-547096 lnc-DNASE1L2-1:1 Yes chr2L:9920160-9921459 lnc-PHYHIP-1:1 Yes chr3L:18107848-18109574 lnc-CDH19-3:1 No - lnc-SNX2-1:1 No - BOK-AS1:3 Yes chr2R:6648654-6652842 lnc-CTSZ-2:1 Yes chr2R:23942538-23946936 THUMPD3-AS1:31 No - lnc-TMEM151A-1:1 No - lnc-PRB1-1:3 No - lnc-EPB41L4B-1:1 Yes chr3L:328097-356050 MIR100HG:18 No - lnc-HLCS-1:1 Yes chr3R:13057755-13078124 TMLHE-AS1:2 Yes chr3R:20406615-20407871 OIP5-AS1:17 No - HAND2-AS1:30 No - KBTBD11-OT1:3 No - LINC00525:2 Yes chr3R:4808336-4812096 lnc-TOX3-8:1 No - MIR22HG:11 No - GCSAML-AS1:2 No - lnc-ARF5-3:2 Yes chr4:936819-949441 lnc-ICAM2-1:5 Yes chr3R:19853908-19861291 lnc-AKR1C2-1:1 Yes chr3L:11620535-11624381 lnc-PANK3-8:1 Yes chrX:10964032-10967134 lnc-KIF26B-2:1 Yes chrX:2606680-2608876 lnc-TTC8-4:1 Yes chrX:7682338-7709385 lnc-PTX3-4:9 Yes chr3L:7134516-7143074 lnc-RPS27L-9:9 Yes chr3L:8545001-8574409 lnc-TUBA1C-2:2 Yes chr3R:23128169-23141906 lnc-CRNKL1-3:1 Yes chrX:23022898-23035550 lnc-TMEM97-1:1 No - lnc-ELAC2-4:1 Yes chr3L:2717615-2766536 HOXD-AS2:3 No - LINC01089:6 Yes chr3R:9497101-9502581 LINC01290:1 No - LINC00927:51 No - lnc-TRAPPC8-1:2 No - lnc-IRX3-80:56 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-SLC35C1-2:2 Yes chr2L:6498647-6526996 lnc-BUD23-1:1 No - lnc-PRSS51-4:4 No - lnc-SNRPN-8:120 No - lnc-TK2-2:1 No - lnc-SH3TC1-2:1 Yes chr3R:9694386-9705417 LINC01833:42 No - lnc-RPLP1-12:51 No - lnc-DMTF1-1:1 No - LINC00470:20 No - lnc-ANKH-1:2 No - lnc-CCAR2-2:10 Yes chr2L:12707661-12708680 lnc-POTEB2-3:1 No - lnc-JMJD7-PLA2G4B-2:12 No - lnc-THAP12-1:11 No - lnc-NOX4-1:1 No - UBL7-AS1:14 No - lnc-OMG-5:6 Yes chr3R:25983013-25995737 LINC00607:3 No - lnc-STK4-1:1 Yes chr2R:19493996-19496856 lnc-RGS9-3:3 No - lnc-OR4N4-1:7 No - ST3GAL6-AS1:4 No - UPP2-IT1:1 Yes chr3R:26949692-26958491 lnc-STPG1-3:1 Yes chr3R:16186999-16197584 PWRN1:18 No - lnc-SPPL3-3:3 Yes chr2L:21102743-21104321 lnc-DPP4-2:1 No - lnc-WWC2-1:1 No - lnc-TMPRSS2-83:3 No - APOBEC3B-AS1:2 No - lnc-SLC24A5-3:1 Yes chr2R:17672839-17683499 lnc-NOXO1-1:2 Yes chrX:19748314-19750167 lnc-ARHGAP26-4:1 Yes chr3L:3401153-3424935 lnc-MRPL37-1:4 Yes chr3R:18192494-18199595 lnc-PSMB11-1:3 No - DISC1FP1:1 No - RUSC1-AS1:1 No - lnc-MIER3-2:1 No - lnc-SCRT1-2:1 No - lnc-CYB561-6:1 Yes chr3L:12008225-12064859 lnc-SSTR5-2:1 No - ID2-AS1:5 No - lnc-RABGAP1-1:5 No - lnc-TMEM263-1:1 Yes chr2L:20643351-20645791 CACNA1C-IT3:1 Yes chr2L:16165831-16190540 lnc-ZBED4-2:1 No - lnc-DTWD2-1:3 No - lnc-C20orf196-6:3 No - lnc-DTHD1-5:2 No - CPNE8-AS1:5 No - DSCAM-IT1:2 Yes chr3R:17473935-17505667 lnc-NT5DC1-1:1 No - KDM4A-AS1:5 Yes chr2R:13176553-13198337 lnc-ADM-2:1 Yes chr3R:11789293-11796948 lnc-SNW1-1:1 Yes chr3R:22468512-22486969 lnc-TBC1D2B-1:1 No - SLC39A12-AS1:2 Yes chr3L:14992289-14997983 LINC00928:11 No - lnc-NOMO2-1:1 No - lnc-TSR3-1:3 Yes chr2L:540599-542580 lnc-ST6GALNAC6-1:7 No - CSMD2-AS1:1 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-CCT6B-5:1 No - THAP9-AS1:19 Yes chr2R:8893613-8898798 lnc-SLC38A8-2:4 No - NRG1-IT1:5 No - LINC01852:14 No - LINC01011:8 No - lnc-SLC35G1-2:1 No - lnc-TNFRSF13C-1:1 No - AGAP1-IT1:1 Yes chr2L:13835564-13898712 LINC02133:5 No - lnc-SLC39A8-1:7 No - PWRN2:6 No - LINC01089:24 Yes chr3R:9497101-9502581 lnc-BIN3-3:1 Yes chr2R:10269016-10307024 lnc-SPRYD3-1:8 Yes chr3L:27842669-27858271 lnc-B4GALT7-2:2 No - lnc-RPS6KA4-1:5 No - lnc-NOS2-5:1 No - lnc-GLP2R-1:1 No - lnc-IRX3-13:2 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-DHRS7-1:1 Yes chr3R:26344290-26345473 lnc-DKK3-1:1 No - lnc-ACHE-1:6 No - lnc-TMIGD1-1:1 No - lnc-RELL1-1:1 No - lnc-ZNF624-1:1 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-NPIPB2-6:1 Yes chr2L:13177150-13178978 AADACL2-AS1:4 No - ZNF197-AS1:1 No - lnc-KRR1-4:17 No - SRRM2-AS1:2 Yes chr3L:1654247-1665064 LINC02168:7 No - lnc-VAX2-2:1 Yes chr2R:19397032-19424903 lnc-MUC20-67:141 No - lnc-TM4SF20-1:3 No - lnc-MAT2B-3:10 No - lnc-LRRC14-1:1 Yes chr3R:21083043-21097827 lnc-C16orf58-5:1 No - lnc-NTN1-2:4 No - lnc-EEF1A1-1:1 Yes chr2R:22492197-22494295 lnc-NAV1-9:3 Yes chr3R:7112850-7117732 ADAMTS9-AS1:27 Yes chr2R:22807860-22815993 lnc-TP53TG3-32:2 No - lnc-LYST-4:3 Yes chr3L:1950306-1964178 lnc-PGPEP1L-3:1 No - lnc-SSH1-1:1 Yes chr3R:24938710-24944956 lnc-TMEM94-1:2 Yes chr2R:13495222-13502841 lnc-CASP9-2:1 No - lnc-SMPD3-1:1 Yes chr3R:9775121-9777943 lnc-RBP7-1:1 Yes chr3R:24945237-24947400 lnc-PAPPA2-2:1 No - lnc-MRPL11-1:4 No - CCDC18-AS1:8 No - lnc-B3GNTL1-1:2 No - lnc-F8A2-1:2 No - lnc-CHFR-2:1 No - SEMA6A-AS1:5 Yes chr2R:17672839-17683499 LSAMP-AS1:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-C14orf37-1:1 No - MIR9-3HG:5 No - LINC02464:5 No - lnc-C9orf50-4:11 No - DLX6-AS1:17 Yes chr2R:24814822-24835667 lnc-CHD9-1:1 Yes chrX:797090-801479 lnc-DNAJC11-2:1 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-ISCU-1:2 No - lnc-SCAP-1:1 No - TMEM44-AS1:5 No - lnc-TRIM16-2:5 No - lnc-ZSCAN10-3:5 No - lnc-RASSF10-1:1 Yes chrX:15804370-15827682 LINC01731:3 No - LINC02164:3 No - lnc-CSMD1-7:2 No - VPS33B-DT:19 No - lnc-FAM153A-2:1 No - lnc-TRIM16-2:1 No - lnc-NIPSNAP1-1:1 Yes chr2R:23954091-23956406 HOTAIRM1:7 No - lnc-SERF1B-1:2 No - LUARIS:7 Yes chrX:9608946-9623243 lnc-ZNF37A-1:2 No - lnc-S100A1-2:1 No - lnc-RXRG-1:6 No - NR2F2-AS1:17 No - lnc-RNF13-6:3 No - lnc-MRPS16-2:1 No - lnc-C8orf59-8:1 No - lnc-TTC5-1:1 No - lnc-JPH1-3:2 No - lnc-SMIM15-4:9 No - lnc-MKLN1-18:1 Yes chr4:1009895-1027101 lnc-NADSYN1-1:2 No - lnc-TEX261-2:1 Yes chr3R:15337908-15343256 HNF1A-AS1:7 No - lnc-UBASH3A-2:1 Yes chr2R:21282298-21285679 lnc-MFAP4-3:2 No - lnc-AGT-6:7 Yes chr3L:9888762-9893319 lnc-AHNAK-4:1 Yes chrX:15568993-15570369 LINC02377:9 No - lnc-ST3GAL4-7:1 Yes chrX:2740384-3134532 GPRC5D-AS1:25 No - TPM1-AS:6 Yes chr3R:15310193-15315197 MIR17HG:2 No - LINC02152:3 No - lnc-METTL22-2:3 No - LINC00639:5 No - VASH1-AS1:18 No - lnc-DNAH9-1:1 No - LINC01177:1 No - lnc-TNFRSF25-1:1 Yes chrX:17232942-17280964 lnc-PAXIP1-3:3 No - lnc-CLP1-3:5 No - CCDC144NL-AS1:18 Yes chr3L:18618305-18622129 lnc-ADPRM-1:1 No - lnc-PLK1-2:1 Yes chr3R:19853908-19861291 lnc-FAM184B-1:1 Yes chr3L:8619888-8622091 lnc-UNCX-3:4 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-CKB-1:1 No - lnc-SERPINH1-1:1 No - lnc-OR1D5-1:1 Yes chr2L:7497805-7578980 lnc-OR2F1-1:1 No - lnc-AGR3-1:6 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-SEMA6D-1:1 No - lnc-UXS1-4:1 Yes chr2L:825969-833241 lnc-RIMKLB-2:2 No - lnc-CES1-3:1 Yes chr3L:12693639-12710249 lnc-SMARCAL1-4:1 Yes chr2R:20727829-20730610 lnc-OR2A1-1:9 No - lnc-ZNF778-2:8 Yes chr3L:12750119-12753402 LINC01193:7 No - HCP5:6 No - lnc-SH2B2-1:1 Yes chrX:7609148-7678859 NCK1-DT:26 No - FGD5-AS1:11 No - lnc-PRR15L-2:2 Yes chr3R:7810532-7811912 lnc-ADAM22-2:7 No - lnc-TMEM126B-2:1 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-SMC5-1:1 Yes chr2R:15262808-15309368 lnc-UAP1L1-1:1 Yes chr2R:24760664-24762605 LINC01394:27 No - lnc-NAIF1-2:1 Yes chr3L:12402295-12414842 RBFADN:8 No - lnc-RNF13-6:4 No - lnc-LRRC7-2:1 No - lnc-ATMIN-4:2 No - lnc-F3-7:1 No - lnc-PARG-1:2 No - lnc-CDH18-6:1 No - MAFTRR:4 No - lnc-STARD9-1:3 Yes chr4:469409-488994 lnc-BLOC1S6-1:1 No - lnc-MVB12B-3:1 Yes chr3L:12290956-12296123 THAP7-AS1:2 No - lnc-DOPEY1-1:1 No - lnc-AEBP2-3:1 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-SLC52A1-1:1 Yes chr2R:16751503-16772671 LINC01893:3 No - lnc-DRD5-2:1 Yes chr2R:8087396-8089297 lnc-CPEB4-4:4 No - lnc-TSEN15-2:1 No - GPRC5D-AS1:34 No - lnc-AGR3-1:2 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-HECA-1:2 Yes chr3R:25851632-25853989 lnc-UCP2-1:2 Yes chr3L:1797305-1798610 SEMA3F-AS1:2 No - ISX-AS1:1 No - lnc-FBXO15-1:1 No - lnc-GPR39-3:1 No - SNHG25:3 No - lnc-CCDC39-4:1 No - lnc-MRE11-1:1 No - lnc-MASTL-3:3 No - lnc-GPC1-1:1 No - lnc-TELO2-1:1 Yes chr2L:553742-560310 LHX4-AS1:8 No - lnc-MYLK3-1:1 No - lnc-FAM174B-4:1 Yes chr2L:9521210-9540060 lnc-NPBWR1-1:2 Yes chr3L:18560258-18576326 lnc-LIFR-1:2 Yes chr2R:16031930-16047243 lnc-JMJD7-PLA2G4B-5:1 No - lnc-CLP1-3:1 No - lnc-BEGAIN-1:1 No - lnc-NR2F2-2:1 No - NDFIP2-AS1:1 Yes chr3L:17647442-17654280 lnc-KIAA1257-1:4 No - lnc-MUC22-1:1 No - lnc-ZSWIM8-1:1 Yes chr4:1035288-1053703 MTUS2-AS2:12 No - lnc-NCF4-2:1 No - LEF1-AS1:10 No - HAND2-AS1:15 No - lnc-TNFRSF10A-1:1 No - lnc-MPLKIP-3:5 Yes chr3R:20562486-20564067 lnc-METTL26-3:1 Yes chrX:21350280-21357912 lnc-TCN2-1:1 Yes chr2L:9708921-9711271 lnc-CDH5-5:1 No - lnc-MRPS22-2:1 Yes chr3R:11559896-11567054 lnc-RUNX3-1:1 No - TDRKH-AS1:22 Yes chr2L:2220748-2225544 NUCB1-AS1:1 Yes chr3L:17797738-17802279 lnc-ITPR2-2:2 No - lnc-TRPC7-1:1 No - lnc-HDAC9-2:2 Yes chr2R:22985374-23048325 lnc-TARBP1-3:1 Yes chr3R:20740108-20756639 HTR2A-AS1:3 Yes chr3R:8578205-8629996 PCCA-AS1:3 No - lnc-BCL11A-18:4 No - LINC00271:10 No - MIR100HG:29 No - lnc-SGMS1-1:1 Yes chr3R:20756729-20810726 ST7-AS2:5 Yes chr3L:20806868-20809272 KIRREL3-AS2:3 Yes chrX:2740384-3134532 lnc-ZNF217-2:1 No - lnc-PAPSS2-1:1 No - lnc-EPB41L3-1:1 No - lnc-ANKRD42-1:1 Yes chr2R:14860936-14871071 lnc-TRAM1L1-3:1 No - NDUFB2-AS1:1 No - ZNRF3-IT1:1 No - lnc-ICMT-1:1 No - lnc-CHSY1-5:2 No - lnc-DCAF4L2-2:2 No - FOXN3-AS2:1 Yes chrX:7682338-7709385 lnc-EPCAM-6:1 No - lnc-AKAIN1-5:2 No - lnc-HOXB8-1:5 No - SPATA42:3 No - lnc-SMNDC1-3:1 No - lnc-CCNJL-4:2 No - LINC02240:23 No - DCST1-AS1:27 Yes chr3L:13174478-13176781 SHANK2-AS1:1 Yes chr2R:14060456-14140902 lnc-ZC2HC1A-1:1 No - lnc-WDR73-3:1 No - lnc-ARHGAP26-4:6 No - lnc-PRPF18-3:1 No - lnc-CDYL2-6:2 Yes chr2R:24475386-24476032 lnc-KRTAP13-1-1:2 No - lnc-NEDD8-MDP1-1:11 No - lnc-BTBD10-4:1 Yes chrX:15804370-15827682 DLGAP1-AS1:1 Yes chr2R:5702112-5705439 LINC01015:4 No - lnc-USP6-4:13 No - LINC01770:11 No - lnc-CD34-22:4 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-HAPLN3-1:2 No - lnc-MYBPH-1:1 Yes chr3R:30134856-30149606 lnc-CEMP1-3:1 No - NR2F2-AS1:4 Yes chr3R:12258737-12302785 LINC00893:25 No - lnc-MRPS23-1:1 No - lnc-CELF6-1:1 No - lnc-FAM167A-2:2 Yes chr3L:4592447-4626196 SNAI3-AS1:3 No - PROX1-AS1:24 Yes chr3R:11328480-11407627 lnc-RBBP9-11:1 Yes chrX:23022898-23035550 lnc-JOSD1-1:3 No - lnc-ZIC1-20:1 No - MAGEA4-AS1:6 No - LINC01239:5 No - ZBED3-AS1:12 No - lnc-LYZL1-15:6 No - lnc-CDR2-1:2 No - lnc-AMELY-2:10 No - CKMT2-AS1:5 Yes chr2R:22825093-22828903 lnc-ERCC6L2-5:1 No - lnc-IL18-1:1 Yes chr3R:23759483-23760600 RAP2C-AS1:3 No - lnc-TOR2A-1:1 No - lnc-ERMP1-1:1 Yes chr3L:22257749-22262921 lnc-ZNF362-2:1 Yes chrX:2115727-2123286 lnc-TP53TG3D-3:3 No - ZBED3-AS1:15 No - lnc-KCNC2-1:1 Yes chr3L:18681037-18681836 lnc-NUFIP2-1:1 Yes chrX:19569721-19579800 lnc-ATP12A-1:3 No - LINC02349:5 No - lnc-DAPP1-2:2 No - lnc-F3-7:17 No - IQCH-AS1:6 No - lnc-RPRM-1:3 No - lnc-COMMD3-2:1 No - lnc-SLC9A3-6:2 No - lnc-SHISA9-3:3 No - lnc-PPIAL4F-4:7 No - NRG3-AS1:7 No - lnc-RORA-1:1 No - lnc-ANKS6-1:1 Yes chr2R:16673235-16732916 lnc-NPIPB11-2:5 No - lnc-SCIMP-1:5 No - CCDC18-AS1:34 No - LINC01444:3 No - lnc-HIST2H2AA3-1:1 No - C1RL-AS1:4 No - PCBP1-AS1:73 No - lnc-SULF1-1:1 No - lnc-IL22RA1-1:1 Yes chr3L:3172817-3178580 lnc-ZNF33A-2:1 No - lnc-SYNE1-1:1 No - lnc-SYCP3-2:2 Yes chr3L:3172817-3178580 MAPT-AS1:2 No - lnc-LGSN-1:1 No - lnc-IQGAP2-1:1 Yes chr3R:25216297-25218708 lnc-IL10RA-1:5 No - lnc-BCL11A-18:2 No - lnc-STRN3-1:1 No - lnc-JOSD1-1:12 No - lnc-ESR2-1:2 No - lnc-ATP6V1C1-1:1 Yes chr2R:8007246-8009062 TTTY9B:3 No - DSG2-AS1:2 No - lnc-TM9SF2-2:1 No - lnc-MGMT-4:1 Yes chr2R:14772650-14807061 lnc-ZNF841-1:2 No - lnc-CA5A-4:9 No - lnc-PRY-6:2 No - lnc-SLC37A4-1:25 No - lnc-PLEKHA2-1:1 No - lnc-ZNF454-1:1 Yes chr4:936819-949441 TPRG1-AS2:1 No - MIR100HG:15 No - lnc-C8A-1:1 No - OSBPL10-AS1:8 Yes chr3L:1034697-1036298 lnc-POLD3-4:1 Yes chr2R:9107151-9109718 lnc-C6orf141-1:2 No - lnc-TMC7-1:1 No - lnc-SSTR2-2:1 Yes chr3L:18560258-18576326 lnc-MBL2-3:2 No - lnc-SLC38A8-2:3 No - lnc-SP140L-1:3 No - lnc-LEFTY2-1:1 No - lnc-WDR4-2:1 No - lnc-OR2F1-1:2 No - lnc-UBASH3A-2:2 Yes chr2R:21282298-21285679 LINC00661:22 No - lnc-RBBP6-4:3 Yes chr4:649041-663103 lnc-ARHGAP26-4:5 Yes chr3R:19794073-19836817 lnc-SUMF2-18:1 No - lnc-CBLL1-1:4 Yes chr2L:19580612-19582474 lnc-GPT2-1:2 No - lnc-OSBPL9-2:1 Yes chr2R:24768314-24775265 lnc-MUC20-4:2 No - lnc-OR4N4-1:13 No - PCBP1-AS1:123 No - lnc-PANK4-2:1 No - lnc-PHF14-14:5 No - lnc-PLPP3-12:18 Yes chr2R:9400531-9413463 PAN3-AS1:5 No - lnc-ZNF395-1:1 No - lnc-GABPB1-1:1 No - SRRM2-AS1:8 No - lnc-ATXN7-17:7 Yes chr3R:22460662-22462054 lnc-VPS18-1:4 No - lnc-SEMA6D-2:1 No - lnc-LONP2-5:1 No - PLCL2-AS1:1 No - lnc-HPGDS-2:1 Yes chr2L:4830846-4835300 lnc-EXOSC9-1:1 No - lnc-C14orf28-1:1 No - lnc-NEURL1B-2:1 No - lnc-ZSCAN10-4:1 No - CCDC39-AS1:1 Yes chr3R:4781120-4784722 lnc-C12orf49-16:1 No - VAV3-AS1:1 Yes chrX:19261820-19273280 LRRC75A-AS1:4 No - LINC02086:16 No - lnc-CHSY1-5:4 No - lnc-USP6-4:2 No - lnc-C15orf48-4:5 No - lnc-CD58-1:4 Yes chr3R:20948714-20976239 LINC01544:2 No - ODF2-AS1:1 No - lnc-EIF4ENIF1-1:1 Yes chr2R:12037298-12038851 lnc-BCL11A-18:6 No - lnc-SRR-1:1 Yes chr3R:25029429-25033465 NREP-AS1:1 No - lnc-TRMT10A-1:1 Yes chr2L:20919094-20922876 lnc-MORC1-1:1 No - lnc-TRIQK-2:7 No - lnc-PPP6C-2:1 Yes chr3L:6082883-6092188 PCCA-AS1:5 No - lnc-NUDCD2-2:1 No - lnc-TRPM1-1:6 No - HLA-DQB1-AS1:1 No - lnc-CYP7B1-6:4 No - GABPB1-AS1:8 No - lnc-NSUN6-2:2 Yes chr3L:22872200-22873702 lnc-PAX5-3:1 No - ATP2A1-AS1:5 Yes chr2R:23925077-23935884 lnc-AMZ1-1:1 No - THUMPD3-AS1:38 No - lnc-TRIML2-1:1 No - lnc-LRRC32-6:3 No - MRPL23-AS1:3 Yes chr3L:2372844-2373704 lnc-TIGD1-1:1 Yes chr3R:24063077-24108960 lnc-GABRA2-1:1 No - lnc-MAGEA10-1:1 No - lnc-ZPBP-1:1 No - lnc-RAB11FIP4-2:1 No - lnc-SLC5A10-3:1 No - lnc-PLA2G15-2:1 Yes chrX:13624745-13664568 lnc-IL17B-3:2 No - lnc-NPBWR1-12:13 No - TEX36-AS1:5 No - lnc-RGS5-1:8 No - lnc-XYLT1-1:1 No - lnc-SOX9-4:1 No - DSCR9:9 No - ADGRL3-AS1:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-CEP83-22:2 No - FOXP4-AS1:7 No - SNHG20:5 Yes chr2L:6448464-6455929 SNHG14:10 Yes chr3L:11206422-11210583 FOXD3-AS1:1 Yes chr2R:22868159-22870706 SPATA8-AS1:3 No - lnc-PAX6-1:1 Yes chr2L:5524139-5525809 lnc-C14orf28-1:2 No - lnc-AVEN-2:1 No - lnc-SPOPL-2:4 Yes chr3R:13967061-14032057 lnc-SCN4B-51:2 No - lnc-MCTS1-1:1 Yes chrX:6037892-6039576 SRD5A3-AS1:16 Yes chr2L:8305586-8306741 PACRG-AS2:1 Yes chr2R:19497752-19500372 lnc-RECQL4-2:6 No - lnc-B3GNTL1-1:1 No - lnc-HNRNPH1-1:1 Yes chr3R:27229505-27239085 lnc-PDE10A-2:3 No - lnc-CCL2-5:1 No - LINC00189:4 Yes chr3R:23185580-23226711 MIR4435-2HG:20 No - lnc-ANGPTL2-1:1 Yes chr2R:16783671-16792472 lnc-ERG28-2:7 No - lnc-FAM153C-5:10 No - lnc-YPEL5-3:1 Yes chr2R:16625293-16640011 lnc-NIN-1:1 Yes chr2L:2130813-2137296 lnc-FGG-1:1 Yes chr3R:20756729-20810726 lnc-STEAP4-1:1 No - lnc-ALDH1L2-1:1 No - lnc-TMEM231-1:1 No - lnc-MAP6-1:3 No - lnc-SUPT6H-3:1 No - LINC01006:4 No - lnc-FTCDNL1-4:19 No - lnc-PSMD7-6:1 Yes chr4:501810-540874 lnc-SALL1-6:7 No - MIR22HG:25 No - C1RL-AS1:8 No - NAV2-AS4:2 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-FMN1-3:1 No - lnc-LIPG-1:1 No - SNHG7:4 No - lnc-CA8-7:1 Yes chr2L:210735-250823 lnc-PLCG2-1:11 Yes chrX:16350315-16356482 lnc-NCBP1-1:1 No - lnc-ZG16-1:1 No - lnc-ALYREF-1:1 No - lnc-MAT2B-3:5 No - lnc-ANKRD34B-1:1 Yes chr3R:16481167-16481878 lnc-PLLP-1:1 No - lnc-PCDH12-1:1 No - lnc-SLC22A31-6:3 No - HMBOX1-IT1:1 No - DLGAP4-AS1:6 No - LINC00661:15 No - LINC00472:28 No - DLGAP2-AS1:1 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-SEC16B-2:16 Yes chrX:12596047-12609910 lnc-NTN3-1:1 Yes chr2L:20871335-20918931 lnc-TMSB4X-2:1 No - lnc-CEP120-1:1 Yes chr2R:18278198-18357296 lnc-AP3M1-3:1 Yes chr2R:7243024-7245776 DPYD-AS2:3 Yes chrX:9196808-9201820 TUSC7:9 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-FAM174B-1:2 No - lnc-AKAP13-1:1 No - lnc-C11orf95-1:19 No - ZNF346-IT1:1 No - lnc-NEFL-6:19 No - lnc-SYT13-2:3 No - MMP25-AS1:23 Yes chr2R:9611139-9683858 SPATA41:7 No - CCDC18-AS1:42 No - lnc-PPIAL4A-2:12 No - lnc-PMM2-6:1 Yes chrX:16792119-16797742 lnc-CLEC14A-1:2 No - lnc-ALDH1A3-1:5 No - MAGI2-AS3:20 No - lnc-OSBPL1A-1:1 No - lnc-ASPSCR1-1:1 No - lnc-GRAPL-5:2 No - LAMP5-AS1:1 No - LINC00852:2 No - lnc-CCDC7-3:1 Yes chr2R:11452043-11465270 lnc-ABHD17A-1:2 No - lnc-CCDC146-1:4 No - lnc-PCDH18-4:1 No - lnc-SOX15-1:3 No - GRM7-AS3:7 Yes chr4:936819-949441 lnc-CDH19-4:1 No - lnc-FAM71B-1:1 Yes chr2L:8258373-8301079 lnc-SLC38A8-5:1 No - lnc-ACER2-1:1 No - PGM5P3-AS1:7 Yes chr2R:12180493-12182373 lnc-GTF2A1-78:1 Yes chr3R:17725777-17733207 ITFG2-AS1:34 Yes chr2L:9888005-9890119 HAND2-AS1:16 No - lnc-GLIPR1-1:1 No - DHRS4-AS1:12 Yes chr3L:5140440-5141646 lnc-C1QBP-4:1 No - lnc-RASL11B-2:2 No - NAV2-AS3:1 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-GABPA-3:1 No - lnc-NPIPA8-7:2 No - XXYLT1-AS1:1 Yes chr2R:24022343-24023981 lnc-TLK1-6:8 Yes chr3L:4074077-4088744 lnc-SSPN-2:1 No - lnc-DROSHA-5:1 No - SRGAP3-AS3:2 No - lnc-FAR2-3:2 No - lnc-TFEC-2:5 Yes chr2R:17465879-17469177 ITPKB-IT1:3 Yes chrX:13303633-13329303 lnc-EXOSC6-3:22 No - SNHG21:18 No - lnc-PGAM2-1:1 No - LINC01852:22 No - PWRN1:30 No - lnc-SELENOF-1:1 Yes chr2L:19442833-19444750 lnc-HMBOX1-3:1 No - lnc-THAP12-1:4 No - lnc-KCNMB4-1:1 No - lnc-UCHL3-2:1 Yes chr3R:5685855-5712837 lnc-PACRGL-5:1 No - ITGB5-AS1:1 No - PRKAR2A-AS1:9 No - lnc-C1orf53-1:1 Yes chr2R:9123304-9132030 lnc-C5orf58-1:1 Yes chrX:11219379-11302783 lnc-KCNG4-2:1 No - MID1IP1-AS1:1 No - lnc-UHRF2-1:1 Yes chr2R:13176553-13198337 lnc-ZHX2-6:7 No - lnc-GDPD4-1:2 No - HAND2-AS1:17 No - lnc-RBPMS2-1:2 No - lnc-NELL2-1:1 No - lnc-SERHL2-1:3 Yes chr2L:6022951-6024539 lnc-TMBIM4-1:1 Yes chr3R:27251131-27253182 lnc-KLHL31-4:1 Yes chr2R:22189817-22202671 PCBP1-AS1:13 Yes chr3L:21844788-21932702 lnc-DOCK4-1:1 Yes chr2R:23062747-23064260 CCDC18-AS1:21 No - LINC01089:18 Yes chr3R:9497101-9502581 lnc-PRDM7-2:1 No - lnc-SPG11-3:1 No - lnc-NPAP1-9:1 No - lnc-CHAF1B-3:1 No - lnc-RAB9A-1:1 No - lnc-POTEB2-2:1 No - lnc-AMELY-2:8 No - lnc-CDH8-3:3 No - IFT74-AS1:2 No - lnc-CPSF6-1:1 No - LINC00668:10 No - lnc-OST4-3:1 No - E2F3-IT1:2 Yes chr3R:21620304-21660871 lnc-SOX17-4:10 No - lnc-TMEM9-1:1 Yes chr3L:3172817-3178580 lnc-RBM17-1:1 Yes chrX:19495505-19509350 lnc-DCLRE1B-12:1 No - TRAPPC12-AS1:1 Yes chr3L:20786340-20788137 FOXP4-AS1:8 No - lnc-KIAA1024-1:1 Yes chrX:11850909-11852530 lnc-RBL2-1:4 No - LINC01833:41 No - MIR3976HG:10 No - lnc-FAM222B-1:1 Yes chr2L:4361925-4380716 LINC00893:14 No - FAM230B:9 No - lnc-DST-1:1 No - lnc-METTL26-2:1 Yes chr3L:6965260-6967897 lnc-TOR1AIP2-4:1 No - lnc-NTRK3-3:1 No - lnc-TMEM238L-16:4 No - lnc-MED13L-4:2 No - LINC01989:14 No - CCDC144NL-AS1:14 No - lnc-PDCD1-2:1 No - RORA-AS1:2 Yes chr2R:10203995-10237348 LARGE-AS1:7 No - lnc-ZNF750-1:1 Yes chr2L:2147518-2151664 lnc-RACGAP1-2:1 No - TBX5-AS1:3 No - lnc-SLC39A8-3:1 No - RORA-AS1:11 Yes chr2R:10203995-10237348 lnc-WRAP73-2:1 No - CASC15:72 No - lnc-NSMCE1-3:1 No - lnc-HACD1-2:1 Yes chr2L:10858536-10862006 lnc-GDE1-1:1 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-FAM153C-5:7 No - lnc-TMEM37-1:1 No - lnc-ABCC11-1:1 No - ASH1L-IT1:1 Yes chr3L:19590773-19598755 SMCR5:1 Yes chr2R:18094940-18101031 LRRC75A-AS1:47 No - lnc-C8A-1:8 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-LYPLA1-1:1 No - GRID1-AS1:7 Yes chr2L:4830846-4835300 lnc-ANKRD42-3:2 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-NCBP2-AS2-1:4 No - lnc-WDR73-6:1 No - lnc-C17orf62-3:1 No - lnc-ZNF790-1:1 No - lnc-COQ10B-2:1 No - MIR133A1HG:2 Yes chr3L:16006552-16011812 lnc-MAGEB1-2:1 Yes chr3L:1738407-1745421 lnc-NINJ1-1:1 No - lnc-SPECC1-5:3 No - lnc-SQSTM1-37:1 Yes chr2R:25072627-25084347 SEMA6A-AS1:7 Yes chr2R:17672839-17683499 lnc-PLEKHB1-1:1 Yes chr2L:12107221-12109116 lnc-SLC16A7-10:1 No - lnc-ESRP1-2:1 No - FAM66C:15 No - lnc-SYT15-1:2 No - lnc-PLXNA2-3:1 No - ANKRD34C-AS1:4 No - lnc-MYO1D-3:1 No - lnc-CD63-7:1 No - lnc-CARD18-2:1 No - TMEM202-AS1:38 No - lnc-SNTG2-3:2 No - lnc-LAMA5-1:2 Yes chr2R:13958545-13960404 lnc-FAM83H-1:1 Yes chrX:9261376-9267698 EIF3J-DT:26 No - lnc-ADAR-1:1 Yes chrX:8276200-8367169 lnc-CPLX1-1:1 No - FAM215B:1 No - lnc-ANKRD42-3:1 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-DCTN5-2:1 No - lnc-OAZ3-4:1 No - lnc-CHAC1-3:1 Yes chr3R:19368995-19403153 lnc-ZNF322-1:1 Yes chr2R:14173693-14182838 PCAT6:9 No - CKMT2-AS1:10 Yes chr2R:22825093-22828903 lnc-NLRP12-1:5 No - lnc-NTMT1-2:6 No - lnc-ACP1-1:1 No - lnc-KNSTRN-1:2 Yes chr3R:5849697-5856311 lnc-SYT1-1:1 No - lnc-JRK-1:12 No - lnc-ARHGAP28-10:3 No - LINC02582:12 No - lnc-YIF1A-6:1 No - lnc-CLP1-3:4 No - lnc-ADCY9-1:9 No - lnc-SPPL3-3:2 Yes chr2L:21102743-21104321 ATP2A1-AS1:7 Yes chr2R:23925077-23935884 lnc-PAXIP1-1:1 No - lnc-CYP7B1-6:3 No - lnc-JPH3-3:1 No - lnc-ADCYAP1-3:1 No - LINC02253:8 No - PCOLCE-AS1:1 Yes chr3L:11801951-11814755 GRTP1-AS1:6 Yes chr3R:16147029-16149636 lnc-NAPG-1:1 No - lnc-BMP3-1:2 Yes chr2L:10144776-10156407 lnc-GLRB-2:1 No - lnc-MRPS23-1:2 No - GK-AS1:1 Yes chr3L:1738407-1745421 lnc-EXTL3-4:1 No - HTR2A-AS1:5 Yes chr3R:8578205-8629996 lnc-LIMS3-1:18 Yes chr3R:8356978-8359964 lnc-ALDH1A3-1:4 No - lnc-HNRNPA2B1-16:9 No - lnc-GOLGA8R-1:2 No - lnc-MRGPRF-2:1 No - lnc-FOXB1-5:2 Yes chr2R:10203995-10237348 lnc-SYNDIG1L-2:1 No - lnc-MYBPH-2:1 Yes chr3R:30134856-30149606 THAP9-AS1:17 Yes chr2R:8893613-8898798 lnc-SH3KBP1-1:1 No - lnc-TMEM238L-16:2 No - lnc-TBCD-2:2 No - lnc-INAFM2-1:2 No - lnc-RAB3C-1:1 Yes chrX:3176440-3343767 lnc-KIFAP3-2:2 No - ADGRL3-AS1:2 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-UNCX-3:13 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-USP28-1:1 Yes chrX:2604197-2606824 lnc-EXOC4-5:1 No - lnc-AMELY-8:1 No - LINC00112:7 No - MIR4422HG:4 No - lnc-PELI2-5:1 No - DSG1-AS1:3 No - lnc-PLA2G6-1:1 Yes chr3L:1569181-1576330 KANSL1-AS1:4 Yes chr3R:15793782-15802102 lnc-TKT-3:1 No - lnc-RRP8-1:1 Yes chr3L:21216901-21219240 lnc-PRDM9-21:1 No - LINC01592:1 No - lnc-DLX2-4:5 No - lnc-ATP13A3-1:1 Yes chr4:132220-143123 TEX26-AS1:14 No - MATN1-AS1:7 No - lnc-RASAL1-1:1 No - lnc-UBE2N-1:10 No - lnc-USP53-6:3 Yes chr3L:5812135-5813093 CACNA1C-AS4:2 Yes chr2L:16165831-16190540 LINC00457:1 No - LINC02002:9 No - lnc-SGSH-1:1 No - EIF3J-DT:28 No - lnc-SLC25A16-2:1 Yes chr3L:2786207-2879158 lnc-SRSF2-4:4 No - lnc-OR4N4-1:11 No - CADM2-AS1:1 No - lnc-KLHL32-4:17 No - lnc-TMUB2-1:1 No - OIP5-AS1:13 No - lnc-PACRGL-3:1 Yes chrX:11219379-11302783 lnc-NUCB1-1:1 No - lnc-KCNAB2-1:1 No - lnc-ZNF280D-1:2 No - RORA-AS1:10 Yes chr2R:10203995-10237348 VIM-AS1:5 No - lnc-RHOBTB2-2:1 Yes chr2L:12707661-12708680 GNAS-AS1:1 Yes chr2R:23942538-23946936 NARF-IT1:3 Yes chr2R:4130974-4133484 lnc-IQCG-2:1 Yes chr2L:17367511-17384115 LINC02074:13 No - lnc-LPIN2-1:1 No - lnc-NDUFA5-1:2 No - lnc-STK39-2:1 No - lnc-SH3GL3-5:1 Yes chr3R:30052514-30054697 lnc-KCNMB4-1:4 No - lnc-DRD5-1:1 Yes chr2R:8087396-8089297 lnc-UTS2-3:1 Yes chr2R:9446046-9480076 TGFB2-AS1:2 No - lnc-HGF-1:1 No - MAGEA8-AS1:2 No - lnc-FYB2-1:2 No - lnc-FABP5-5:4 Yes chr3R:11559896-11567054 lnc-SCN2A-12:6 No - lnc-PINX1-85:2 Yes chrX:16323286-16325768 PCBP1-AS1:96 No - lnc-CEP170-13:11 No - lnc-TMEM178A-1:17 No - lnc-SLC16A6-1:1 No - lnc-MKLN1-9:1 Yes chr4:1009895-1027101 lnc-TNFRSF10A-1:3 No - lnc-IL17A-5:1 No - SSTR5-AS1:5 No - lnc-MMRN1-12:13 No - lnc-KIAA1147-3:1 Yes chr2L:10270051-10271465 lnc-GSG1L-1:3 No - LINC01154:8 No - lnc-TRIM41-4:8 No - lnc-RGS6-1:1 No - lnc-RIC3-1:2 Yes chr2R:21101928-21123704 lnc-CA7-5:1 Yes chrX:11154421-11164670 SNHG15:6 No - lnc-FRS3-1:1 No - LINC01630:20 No - lnc-H1FNT-1:1 No - lnc-THAP10-1:1 Yes chr2R:14420324-14424764 EVX1-AS:1 Yes chr2R:9979319-9980795 lnc-IL17RA-36:18 No - LCMT1-AS1:5 No - lnc-HMG20A-2:2 No - LINC02140:15 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-TEFM-1:1 Yes chr3L:16132028-16136691 lnc-CLP1-3:2 No - SDCBP2-AS1:12 No - lnc-MDGA1-2:1 Yes chrX:10768537-10772154 STT3A-AS1:1 No - PLCE1-AS2:15 No - lnc-BIN3-4:1 No - lnc-ZNF316-3:3 No - lnc-SLC7A7-1:1 Yes chr3L:10884261-10886471 lnc-RACGAP1-1:2 No - lnc-BACE1-1:2 Yes chrX:15977967-15982944 lnc-NKX6-3-2:2 Yes chr3R:26055657-26056547 lnc-SMPD3-2:1 No - lnc-UTP4-1:1 Yes chr3L:21745359-21770534 POTEH-AS1:1 No - lnc-AQP4-1:1 No - lnc-SNX19-9:5 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-ASPH-4:1 Yes chr2L:19435850-19442727 LINC02345:29 No - ST7-AS2:2 Yes chr3L:20806868-20809272 lnc-ADAMTS18-4:1 No - TRIM52-AS1:10 No - lnc-SNRPN-8:106 No - lnc-B4GALNT3-2:1 Yes chr3R:12695129-12697379 lnc-NTAN1-1:1 Yes chrX:21324046-21328150 LINC00115:14 No - lnc-GPR146-1:1 No - lnc-MARCH4-2:3 Yes chr2L:5070957-5072055 LRRC75A-AS1:57 No - lnc-FZD4-1:2 No - lnc-PAMR1-3:7 No - lnc-KIF20B-1:2 Yes chr3L:20384429-20391913 lnc-SLC44A5-2:1 Yes chr3L:3846206-3861692 lnc-PLEKHM1-12:1 Yes chr2R:12474424-12487986 lnc-KDM5D-2:3 No - lnc-GAREM1-1:1 No - lnc-PRPS1L1-1:1 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-MYBBP1A-2:4 Yes chr2R:16124981-16138238 OIP5-AS1:14 No - lnc-KIAA1324L-2:1 Yes chr4:936819-949441 lnc-MYH13-3:1 No - lnc-SNRPN-8:92 No - lnc-LRP12-13:1 No - lnc-PABPC4-1:26 Yes chr2R:23851562-23853247 THUMPD3-AS1:3 No - lnc-TARBP1-5:1 Yes chr3R:20740108-20756639 lnc-UCP2-1:1 Yes chr3L:1797305-1798610 lnc-UBE2N-1:2 No - SRGAP3-AS3:3 No - lnc-AP3B2-1:4 No - lnc-OGFOD3-1:4 No - lnc-QPRT-3:2 No - LINC02137:6 No - MIS18A-AS1:1 No - lnc-HNRNPU-1:3 No - lnc-AGAP5-1:1 No - lnc-NAV3-2:1 No - lnc-SLC7A4-3:3 No - lnc-ANKRD30B-5:1 No - lnc-ADAL-1:1 Yes chr2L:8011405-8026898 lnc-MRGPRF-3:1 No - lnc-C15orf48-4:1 No - lnc-NR2F2-5:1 No - lnc-ODF4-2:1 No - GPRC5D-AS1:26 No - lnc-C17orf80-3:1 No - lnc-PQLC1-105:1 No - LRRC75A-AS1:48 No - TTTY14:18 No - lnc-TPO-5:1 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-WDR77-1:1 No - MRPS30-DT:69 No - lnc-ARHGAP17-3:1 Yes chr4:649041-663103 MAPK6-DT:9 No - PITPNA-AS1:2 Yes chr3R:19215434-19226651 lnc-PLK1-1:7 Yes chr2L:15005733-15006607 lnc-NCKAP1-1:1 Yes chr3L:182522-184540 FOXP4-AS1:1 No - KLF3-AS1:1 Yes chr2R:23011078-23042943 lnc-DUPD1-1:1 Yes chr2R:24099210-24107032 lnc-HEATR4-1:2 No - LINC02024:13 No - lnc-MBOAT2-11:1 Yes chr2R:21295652-21310411 lnc-COLEC12-1:1 No - lnc-HSPH1-3:1 No - lnc-CSNK1G1-1:3 No - PRKCQ-AS1:26 No - lnc-EGR2-1:1 Yes chr3L:8123612-8124531 FAM53B-AS1:8 Yes chr2L:2978411-2979288 lnc-LIMS3-2:5 No - lnc-GGCT-1:4 No - lnc-RPS6-1:1 Yes chrX:8592031-8602036 lnc-GNG13-1:1 No - lnc-ABHD2-1:5 No - lnc-KIAA1324L-1:1 Yes chr4:936819-949441 lnc-MYOCD-1:1 Yes chr3R:19905164-19914272 lnc-MCL1-7:1 No - lnc-SLC2A4RG-2:3 No - lnc-LRRC24-3:4 Yes chr3L:8170640-8175978 LINC02249:5 No - TMEM9B-AS1:2 Yes chr3R:5355092-5356748 lnc-TICRR-1:1 No - lnc-STOML1-3:5 No - lnc-STXBP6-2:1 Yes chr3R:9417940-9455500 SMIM2-AS1:9 No - lnc-FAM153C-6:1 No - MAGI2-AS3:43 No - lnc-MUC22-1:4 No - lnc-DYNLL2-1:1 Yes chr2L:1344400-1345135 lnc-NKX6-3-2:1 Yes chr3R:26055657-26056547 lnc-CSAG2-2:2 No - lnc-NFE2L2-5:3 No - lnc-GNAO1-1:3 No - LINC01411:1 No - lnc-TRIM32-1:1 No - lnc-RBMS1-2:1 No - LINC01964:5 No - lnc-MZT2B-2:1 No - PCBP1-AS1:9 Yes chr3L:21844788-21932702 PCBP1-AS1:74 No - LINC01568:7 Yes chr4:501810-540874 LGALSL-DT:13 No - LINC02562:6 No - lnc-NEUROD1-2:1 No - lnc-ERICH1-19:3 No - lnc-CIT-4:1 Yes chr3L:9377802-9379534 MRTFA-AS1:3 Yes chr3L:2717615-2766536 lnc-GPR6-1:1 Yes chr3R:22032150-22034286 lnc-CDR2-1:3 No - lnc-LRRC3C-1:3 No - lnc-TMEM247-2:1 Yes chr3R:5591763-5595356 lnc-THRSP-1:1 No - lnc-MAP3K8-2:1 No - lnc-SNRPN-8:114 No - LINC02112:28 No - lnc-MAX-2:1 No - lnc-LIMS4-1:9 Yes chr3R:8356978-8359964 lnc-NUTM1-11:6 No - lnc-PPDPFL-6:1 Yes chr2R:16552258-16558486 lnc-ZNF517-4:1 No - lnc-SYN3-3:1 No - lnc-CWC15-2:4 Yes chrX:9317915-9319223 lnc-ZNF366-1:1 No - lnc-OR52H1-1:1 No - SNHG15:4 No - LINC00051:3 No - lnc-C19orf48-1:2 No - IPO9-AS1:4 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-CEP170-13:7 No - lnc-CFC1-2:1 No - LINC00520:6 No - HAND2-AS1:24 No - lnc-NOC4L-4:13 Yes chr3R:28748384-28751661 IQCH-AS1:7 No - lnc-ZNF236-8:7 No - DISC1FP1:3 No - lnc-MAT2B-3:1 No - lnc-EXOSC6-3:28 No - LINC00982:7 No - lnc-PABPC4-1:25 Yes chr2R:23851562-23853247 lnc-ADTRP-2:3 No - lnc-OR2A1-1:5 No - UGDH-AS1:6 Yes chr2R:24531594-24533391 MIR9-3HG:23 No - FLNC-AS1:8 No - lnc-FBLL1-4:8 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-RHOBTB2-2:3 Yes chr2L:12707661-12708680 lnc-C1QBP-1:1 No - lnc-PAXIP1-3:1 No - lnc-SMG1-2:1 No - lnc-CTDSP2-2:9 No - GRM7-AS3:9 No - C8orf37-AS1:2 No - lnc-IL11RA-3:1 No - lnc-RPL30-2:1 No - LRRC8C-DT:55 No - GPRC5D-AS1:36 No - lnc-HLA-DPB1-14:1 Yes chrX:8037808-8061436 lnc-LRRC18-1:1 No - CCDC144NL-AS1:9 No - lnc-H3F3C-4:1 Yes chr2L:17459605-17473215 lnc-SUFU-1:5 No - lnc-FAM161B-1:1 No - NRIR:1 No - DGUOK-AS1:6 Yes chr3R:18980995-18982749 lnc-UBB-1:3 No - lnc-GAP43-2:1 No - lnc-SLF1-2:1 Yes chr2R:18761758-18774824 XXYLT1-AS2:4 Yes chr2R:24022343-24023981 lnc-MAPKAPK5-1:2 Yes chr2L:9387389-9391567 LINC00639:1 No - LINC02079:3 No - lnc-RPS25-1:21 No - ID2-AS1:4 Yes chr3L:749400-753492 lnc-HSP90AA1-1:1 Yes chr3L:4807368-4825687 lnc-GPRIN2-1:2 No - lnc-MYOC-2:1 No - lnc-OR14K1-1:8 No - lnc-TMEM135-4:1 Yes chr2R:9177864-9186342 lnc-STARD9-1:2 Yes chr4:469409-488994 lnc-TBC1D8-2:1 No - lnc-FUS-1:1 No - GAPLINC:2 No - lnc-TP53TG3-50:1 No - lnc-KCTD17-1:1 Yes chr2R:7540111-7564435 lnc-BIRC2-4:1 Yes chr2R:9611139-9683858 PCBP1-AS1:41 No - lnc-IL34-1:2 Yes chr3L:826720-833385 lnc-PDZD9-1:1 Yes chr3L:19978713-19979812 lnc-HPS3-3:1 No - lnc-NUMB-2:1 Yes chr3R:28520665-28540324 LINC00893:24 Yes chr3L:3378268-3380083 lnc-PIPOX-4:10 Yes chrX:6295389-6298970 BCAR4:9 No - lnc-PGPEP1L-25:2 No - lnc-ZKSCAN8-1:1 No - lnc-ADGRB1-3:1 No - lnc-KIFC2-1:8 Yes chr3L:3055908-3070839 lnc-ZNF286A-4:1 No - lnc-SSTR2-3:1 Yes chr2R:11899517-11901394 DPYD-IT1:1 Yes chrX:9196808-9201820 lnc-UBE2N-1:1 No - lnc-ASAP1-3:1 No - PSMA3-AS1:20 No - lnc-PON1-1:1 Yes chr3L:2505245-2554292 lnc-CTXND1-5:1 Yes chr3R:9016773-9020022 lnc-KRT80-1:3 No - LINC01743:4 No - lnc-GPRC5A-1:1 No - CALML3-AS1:14 No - ZFPM2-AS1:11 No - lnc-RDX-1:9 No - LINC02544:5 No - lnc-FAM171B-1:2 No - EIF3J-DT:45 No - lnc-FBLL1-4:23 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-PTPA-1:1 No - lnc-STRN3-2:1 Yes chr2L:2488197-2492671 lnc-FAM91A1-1:2 No - lnc-FBXL5-2:2 Yes chr3L:8937100-8954463 lnc-FSIP1-4:33 No - lnc-PRSS27-4:24 No - lnc-GPN2-1:1 No - HOXC13-AS:1 Yes chr3R:16927212-16972236 HAND2-AS1:33 No - LINC01770:19 No - lnc-ZGRF1-4:1 Yes chr3L:7655389-7718395 lnc-FANCI-1:1 No - LINC01397:3 No - lnc-CLIC2-1:2 No - ARHGEF9-IT1:1 Yes chr3L:277437-305292 lnc-RHEX-1:3 No - lnc-TVP23C-4:1 No - lnc-CDH9-1:1 No - lnc-GJA4-1:1 No - lnc-CCDC189-1:5 Yes chr2R:21323430-21341847 lnc-SLC39A11-1:11 No - lnc-ARIH1-2:1 No - MAGEA4-AS1:8 No - lnc-FBLL1-4:9 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-USP31-2:2 Yes chr2R:24743749-24756976 lnc-NMNAT3-1:1 No - lnc-LRCH1-3:1 No - lnc-PLCG2-1:9 Yes chrX:16350315-16356482 lnc-TRMT44-1:1 Yes chr3R:9553696-9555408 lnc-CA5A-2:2 No - lnc-MUC20-67:53 No - lnc-NEFL-6:18 No - lnc-PINK1-2:1 No - lnc-FNTB-1:2 Yes chr3L:19262232-19264184 LINC00470:17 No - lnc-BHLHE41-1:2 No - USP46-AS1:2 No - TOLLIP-AS1:3 No - lnc-FAM189A1-1:1 No - lnc-NMNAT3-3:1 Yes chr4:1112874-1123357 lnc-SLC45A4-3:7 Yes chr3L:25236940-25670980 FAM99A:1 No - lnc-DNTT-1:1 No - lnc-MFSD8-1:1 Yes chr3L:14037019-14043686 lnc-GRHL3-1:2 No - lnc-HAO2-2:4 No - LINC00524:1 No - MIR583HG:29 No - lnc-PAMR1-3:8 No - MIR4435-2HG:11 No - lnc-DLX2-4:4 Yes chr2R:9426439-9434638 lnc-VPS50-1:2 Yes chr2R:16579470-16585448 ARHGAP31-AS1:1 Yes chr2L:19774874-19791882 lnc-TMEM74-1:3 No - lnc-HBEGF-1:1 No - lnc-ZNF705D-2:22 No - lnc-DTWD1-2:1 No - lnc-ADAMTS18-3:1 No - lnc-AATK-4:1 No - lnc-NEBL-1:1 Yes chrX:10348680-10366273 lnc-RNF215-1:1 No - lnc-COL12A1-1:1 No - LINC00901:3 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-TBC1D8-7:1 No - lnc-NFAT5-1:1 No - TH2LCRR:4 No - lnc-KIAA1147-3:8 No - lnc-INPP4B-2:1 No - lnc-EN2-2:4 No - lnc-NOS2-5:2 No - lnc-MRPS22-1:3 No - LINC01481:1 No - ZFPM2-AS1:9 No - lnc-TMEM30B-2:1 No - lnc-C11orf95-1:16 No - HNF1A-AS1:2 No - lnc-TNFRSF17-3:2 Yes chr2L:13177150-13178978 lnc-COG7-1:1 Yes chrX:9601030-9604280 LINC01633:4 No - lnc-C9orf131-1:1 Yes chr2R:18426421-18430333 lnc-CCNB1IP1-1:1 No - lnc-TUFM-1:1 Yes chr3R:15408423-15417277 lnc-NPIPB15-2:2 No - lnc-DEGS2-3:1 Yes chr3L:9452803-9456281 EMX2OS:10 No - LINC00971:1 No - LINC01341:20 No - HCG15:12 No - lnc-THBS1-1:1 No - LINC01514:4 No - lnc-AP3S1-4:2 No - lnc-CUL2-1:1 Yes chrX:18366357-18377864 lnc-LYZL1-15:8 No - CALML3-AS1:7 No - lnc-SETD7-2:2 No - lnc-POLD4-1:2 Yes chr3L:18870045-18872553 UVRAG-DT:24 No - lnc-LAMB3-1:1 No - lnc-BAZ1A-4:17 Yes chr3L:5152678-5154777 EMX2OS:12 No - ITFG2-AS1:31 No - LINC01595:4 No - PCBP1-AS1:46 No - lnc-ANKRD11-1:2 Yes chrX:2694392-2698211 lnc-SERINC5-1:2 Yes chr2L:6686791-6709086 lnc-BCKDHB-2:1 No - lnc-CTAGE1-3:2 Yes chr3R:16026079-16041796 lnc-NEO1-1:1 Yes chr2R:14276130-14300095 lnc-CSNK1G3-4:1 Yes chr2R:18278198-18357296 SEC62-AS1:1 Yes chr2L:10009381-10013170 lnc-CDR2-1:1 No - lnc-RIMKLB-2:1 No - lnc-SLC22A31-1:1 Yes chr3L:12750119-12753402 LENG8-AS1:6 No - ARHGEF7-IT1:1 Yes chr2L:20350434-20365254 lnc-SLC39A11-1:14 No - LINC01569:5 No - lnc-SEC16B-2:18 Yes chrX:12596047-12609910 SNHG9:2 No - lnc-CHN2-1:1 Yes chr3R:19862517-19864393 lnc-RNASE10-2:1 No - PAQR9-AS1:10 Yes chr2R:21011970-21015628 ABCC5-AS1:1 No - lnc-TARBP2-1:1 No - lnc-ERAP1-1:1 No - lnc-NSMCE3-1:1 No - UCHL1-AS1:1 Yes chr2L:2212738-2214211 lnc-C1orf185-3:1 Yes chr4:314923-331387 lnc-BTC-5:1 No - LINC01511:2 No - lnc-AGRP-1:16 No - lnc-TNFRSF17-3:1 Yes chr2L:13177150-13178978 LINC00557:4 No - lnc-LMBR1-1:5 No - HAND2-AS1:4 No - lnc-SNRNP200-1:1 No - lnc-PDZD9-1:3 Yes chr3L:19978713-19979812 PWRN1:13 No - lnc-LEO1-1:1 Yes chr3R:30532607-30578905 lnc-TFEC-2:1 No - lnc-PMP2-1:1 Yes chr3R:11559896-11567054 LINC01088:13 Yes chr3L:9972312-9974023 lnc-EXOSC6-3:23 No - lnc-BMP3-1:1 Yes chr2L:10144776-10156407 lnc-ADCYAP1-2:1 No - lnc-CYLD-2:15 No - CLYBL-AS1:6 No - lnc-POU5F2-5:1 Yes chr3R:12348987-12350644 ZNF503-AS1:10 No - LINC02129:4 No - lnc-LRRC10-1:1 Yes chr2R:13445700-13446309 lnc-SERPINI1-6:1 No - lnc-ARID3B-2:1 No - lnc-CBR4-1:1 No - lnc-CCDC33-2:1 No - lnc-ZDHHC6-1:7 Yes chr3L:18878250-18890483 lnc-IFFO1-1:1 No - LINC01089:13 Yes chr3R:9497101-9502581 LINC02127:12 No - LINC02062:24 No - lnc-ST6GALNAC6-1:8 No - THUMPD3-AS1:35 No - lnc-AKR1C4-1:1 No - lnc-GCOM1-1:1 No - AATBC:5 No - lnc-IDS-1:26 No - lnc-PPP2R2A-2:1 No - lnc-ALX4-6:1 Yes chrX:4549883-4551878 LINC00504:4 No - lnc-CYP19A1-1:1 Yes chr2R:23698949-23702406 POC1B-AS1:43 Yes chr4:328193-358917 lnc-GAMT-2:2 Yes chrX:15985473-15986808 lnc-UMODL1-3:1 No - lnc-RFPL3-1:1 No - lnc-ZIC1-20:2 Yes chr3L:11198166-11206016 lnc-LIMS3-2:6 No - lnc-CCDC40-1:1 Yes chr2L:10432687-10435656 HCG15:11 No - THAP9-AS1:10 Yes chr2R:8893613-8898798 LINC01256:1 No - lnc-ROPN1B-2:2 Yes chrX:8489348-8517029 lnc-PAPSS2-1:2 No - lnc-PCM1-4:1 No - LINC01476:1 No - lnc-ALG14-1:2 No - lnc-TP53TG3-29:1 No - DARS-AS1:17 No - CTBP1-DT:28 No - lnc-LRRK1-1:1 No - lnc-PLSCR3-1:4 No - DLGAP1-AS3:1 Yes chr2R:5702112-5705439 HAND2-AS1:18 No - lnc-AMOTL2-1:1 No - LINC01606:12 No - lnc-DCUN1D5-1:1 No - lnc-PAXIP1-3:5 No - COX10-AS1:9 No - lnc-LACTBL1-1:1 No - LINC01033:5 No - lnc-ENOSF1-2:1 No - lnc-CLUL1-1:1 No - lnc-C13orf42-1:3 No - lnc-CNBD1-4:6 No - lnc-PCDH18-4:2 No - LINC00355:16 No - lnc-FPGT-1:1 No - lnc-POTEG-10:2 No - LINC01616:1 No - lnc-NARF-1:1 Yes chr3L:11114169-11120783 lnc-SENP6-2:2 No - lnc-ALDH1A3-1:3 No - lnc-BEND6-1:1 Yes chr2R:13864237-13942110 PHKA1-AS1:2 Yes chrX:9093612-9103739 lnc-INSL6-1:1 No - lnc-IGLL1-1:56 No - lnc-BCAR1-1:1 Yes chr2R:1343403-1345119 NR2F2-AS1:21 No - lnc-CEMP1-1:1 No - lnc-SRY-3:1 No - lnc-RPS4Y1-5:1 No - lnc-RPS4Y1-6:3 No - lnc-RPS4Y1-6:1 No - lnc-BPY2C-26:1 No - lnc-RPS4Y1-6:2 No - lnc-SRY-4:1 No - lnc-RPS4Y1-6:4 No - lnc-OR4F5-4:1 No - lnc-OR4F5-4:2 No - lnc-OR4F5-4:3 No - lnc-OR4F5-4:5 No - lnc-OR4F29-11:7 No - lnc-OR4F29-11:1 No - lnc-OR4F29-11:2 No - lnc-OR4F29-11:6 No - lnc-OR4F29-11:4 No - lnc-OR4F29-11:3 No - FAM138A:1 No - FAM138A:3 No - lnc-OR4F29-10:1 No - lnc-OR4F5-3:1 No - lnc-OR4F29-8:1 No - LINC00115:34 No - lnc-OR4F29-9:1 No - lnc-OR4F5-5:1 No - lnc-OR4F29-7:5 No - lnc-OR4F29-7:8 No - lnc-OR4F29-7:1 No - lnc-OR4F29-7:9 No - lnc-OR4F29-7:2 No - lnc-OR4F29-7:7 No - lnc-OR4F29-7:6 No - lnc-OR4F29-3:7 No - lnc-OR4F5-6:1 No - lnc-OR4F29-3:9 No - lnc-OR4F29-3:10 No - LINC00115:39 No - LINC00115:38 No - lnc-OR4F29-1:9 No - lnc-OR4F29-1:11 No - lnc-OR4F29-1:12 No - lnc-OR4F29-1:14 No - lnc-OR4F29-1:15 No - lnc-OR4F29-1:16 No - lnc-OR4F29-1:17 No - lnc-OR4F29-1:18 No - lnc-OR4F29-1:19 No - lnc-OR4F29-1:20 No - lnc-OR4F29-1:21 No - lnc-OR4F5-14:1 No - lnc-OR4F29-1:22 No - lnc-OR4F29-1:23 No - lnc-OR4F5-13:1 No - lnc-OR4F5-12:1 No - lnc-OR4F29-1:24 No - lnc-OR4F5-11:1 No - lnc-OR4F5-11:2 No - lnc-OR4F29-1:25 No - lnc-OR4F29-1:26 No - lnc-OR4F29-5:1 No - LINC00115:21 No - LINC00115:20 No - lnc-SAMD11-15:1 No - lnc-OR4F16-8:1 No - lnc-SAMD11-14:1 No - lnc-SAMD11-13:1 No - lnc-SAMD11-13:3 No - lnc-SAMD11-12:1 No - lnc-SAMD11-12:3 No - lnc-SAMD11-12:4 No - lnc-SAMD11-11:1 No - lnc-SAMD11-10:1 No - lnc-OR4F16-15:8 No - lnc-OR4F16-15:9 No - lnc-OR4F16-15:6 No - lnc-OR4F16-15:5 No - lnc-OR4F16-15:4 No - lnc-OR4F16-15:2 No - lnc-SAMD11-9:1 No - lnc-OR4F16-15:1 No - lnc-OR4F16-4:3 No - lnc-SAMD11-8:1 No - lnc-SAMD11-8:2 No - lnc-SAMD11-8:3 No - lnc-OR4F16-4:4 No - lnc-SAMD11-7:10 No - lnc-SAMD11-7:14 No - lnc-SAMD11-7:15 No - lnc-SAMD11-7:16 No - lnc-SAMD11-7:17 No - lnc-SAMD11-7:18 No - lnc-SAMD11-7:19 No - lnc-SAMD11-7:20 No - lnc-SAMD11-7:21 No - lnc-SAMD11-7:22 No - lnc-SAMD11-7:25 No - lnc-SAMD11-7:26 No - lnc-OR4F16-16:2 No - lnc-SAMD11-8:4 No - lnc-SAMD11-8:5 No - lnc-OR4F16-16:1 No - lnc-SAMD11-7:28 No - LINC00115:8 No - lnc-SAMD11-7:31 No - LINC00115:1 No - lnc-NOC2L-12:3 No - lnc-NOC2L-12:4 No - lnc-NOC2L-12:1 No - lnc-NOC2L-12:2 No - LINC01128:57 No - LINC01128:58 No - LINC01128:59 No - LINC01128:60 No - LINC01128:61 No - LINC01128:62 No - LINC01128:63 No - LINC01128:64 No - LINC01128:75 No - LINC01128:76 No - LINC01128:77 No - LINC01128:78 No - LINC01128:79 No - LINC01128:83 No - LINC01128:87 No - LINC01128:90 No - LINC01128:91 No - LINC01128:93 No - LINC01128:94 No - LINC01128:95 No - LINC01128:97 No - LINC01128:98 No - LINC01128:99 No - LINC01128:100 No - LINC01128:102 No - LINC01128:103 No - LINC01128:104 No - LINC01128:105 No - LINC01128:106 No - LINC01128:107 No - lnc-SAMD11-6:1 No - lnc-SAMD11-5:1 No - lnc-SAMD11-5:2 No - lnc-NOC2L-11:1 No - lnc-NOC2L-11:3 No - LINC02593:40 No - LINC02593:41 No - LINC02593:34 No - LINC02593:32 No - LINC02593:33 No - lnc-NOC2L-6:1 No - lnc-NOC2L-7:2 No - lnc-ISG15-1:1 No - lnc-AGRN-2:1 No - lnc-AGRN-2:2 No - lnc-AGRN-2:3 No - lnc-AGRN-2:4 No - lnc-AGRN-2:6 No - lnc-AGRN-2:7 No - lnc-AGRN-2:8 No - lnc-AGRN-2:9 No - lnc-RNF223-1:1 No - lnc-C1orf159-1:1 No - lnc-C1orf159-1:5 No - lnc-C1orf159-1:6 No - lnc-C1orf159-1:7 No - lnc-C1orf159-1:2 No - lnc-C1orf159-1:4 No - lnc-C1orf159-1:3 No - lnc-RNF223-4:2 No - lnc-RNF223-4:3 No - lnc-RNF223-4:1 No - lnc-TTLL10-3:1 No - lnc-TTLL10-2:1 No - lnc-TNFRSF4-1:1 No - lnc-TNFRSF4-1:2 No - lnc-C1QTNF12-2:1 Yes chr3R:19180659-19201096 lnc-SDF4-1:1 No - lnc-C1QTNF12-1:3 Yes chr3R:17532325-17534587 lnc-C1QTNF12-1:1 Yes chr3R:17532325-17534587 lnc-C1QTNF12-1:2 Yes chr3R:17532325-17534587 lnc-INTS11-3:1 Yes chr3R:23118400-23124217 lnc-INTS11-2:1 Yes chr3R:23118400-23124217 lnc-INTS11-1:2 Yes chr3R:23118400-23124217 lnc-INTS11-1:1 Yes chr3R:23118400-23124217 lnc-ACAP3-2:7 No - lnc-ACAP3-2:4 No - lnc-ACAP3-2:6 Yes chr3R:29745337-29747513 lnc-ACAP3-2:5 Yes chr3R:29745337-29747513 lnc-ACAP3-2:3 Yes chr3R:29745337-29747513 lnc-ACAP3-2:2 Yes chr3R:29745337-29747513 lnc-ACAP3-2:1 Yes chr3R:29745337-29747513 lnc-DVL1-2:1 No - lnc-DVL1-1:2 No - lnc-DVL1-1:1 No - lnc-CCNL2-4:3 No - lnc-CCNL2-4:2 No - lnc-CCNL2-4:1 No - lnc-TAS1R3-3:1 No - lnc-CCNL2-1:2 No - lnc-MRPL20-1:5 Yes chrX:2078343-2080405 lnc-MRPL20-1:4 Yes chrX:2078343-2080405 lnc-MRPL20-1:1 Yes chrX:2078343-2080405 lnc-MRPL20-1:3 Yes chrX:2078343-2080405 lnc-MRPL20-1:2 Yes chrX:2078343-2080405 lnc-TMEM88B-3:6 Yes chr3L:13017149-13017867 lnc-TMEM88B-3:8 Yes chr3L:13017149-13017867 lnc-CCNL2-3:1 Yes chr3L:13017149-13017867 lnc-CCNL2-3:2 Yes chr3L:13017149-13017867 lnc-CCNL2-2:1 Yes chr3L:13017149-13017867 lnc-TMEM88B-6:1 No - lnc-ANKRD65-5:1 No - lnc-TMEM88B-5:1 No - lnc-ANKRD65-4:2 Yes chr2L:5346200-5365760 lnc-TMEM88B-2:2 Yes chr2L:5346200-5365760 LINC01770:17 No - lnc-TMEM240-1:1 Yes chrX:19664561-19666866 lnc-MIB2-4:1 No - lnc-MIB2-2:1 No - lnc-MIB2-1:6 No - lnc-MIB2-1:7 No - lnc-MIB2-1:8 No - lnc-MIB2-1:9 No - lnc-FNDC10-1:6 No - lnc-MMP23B-4:1 Yes chrX:22444227-22447808 lnc-MMP23B-4:2 Yes chrX:22444227-22447808 lnc-CDK11A-2:5 Yes chr3L:20771528-20776931 lnc-CDK11A-2:4 Yes chr3L:20771528-20776931 lnc-MMP23B-1:2 Yes chrX:22444227-22447808 lnc-CDK11A-1:1 Yes chrX:22444227-22447808 lnc-CDK11A-2:3 Yes chrX:22444227-22447808 lnc-MMP23B-1:3 Yes chrX:22444227-22447808 lnc-MMP23B-1:4 Yes chrX:22444227-22447808 lnc-SLC35E2-1:1 Yes chr2R:13548244-13553240 lnc-NADK-1:1 Yes chr2R:13548244-13553240 lnc-TMEM52-1:1 Yes chrX:15860115-15866175 lnc-CALML6-1:2 No - lnc-CALML6-1:3 No - lnc-CALML6-1:4 No - lnc-CFAP74-4:1 No - lnc-CFAP74-3:1 No - lnc-CFAP74-1:3 No - lnc-CFAP74-1:1 No - lnc-CFAP74-1:4 No - lnc-CFAP74-1:5 No - lnc-CFAP74-1:2 No - lnc-CFAP74-5:1 No - lnc-FAAP20-1:2 No - lnc-FAAP20-1:5 No - lnc-FAAP20-1:4 No - lnc-SKI-4:1 No - lnc-MORN1-3:1 No - lnc-SKI-3:1 No - lnc-SKI-2:1 No - lnc-SKI-1:1 No - lnc-PEX10-8:1 No - lnc-PEX10-6:1 No - lnc-PEX10-6:3 No - lnc-PEX10-1:1 No - lnc-MORN1-1:2 Yes chr3L:1558228-1559863 lnc-MORN1-1:1 Yes chr3L:1558228-1559863 lnc-PLCH2-3:1 No - lnc-PEX10-4:1 No - lnc-HES5-4:1 No - lnc-HES5-2:1 No - lnc-HES5-3:5 No - lnc-HES5-3:1 No - lnc-HES5-3:4 No - lnc-HES5-3:2 No - TNFRSF14-AS1:30 No - TNFRSF14-AS1:29 No - TNFRSF14-AS1:21 No - TNFRSF14-AS1:22 No - lnc-TNFRSF14-3:2 No - lnc-TNFRSF14-2:5 No - lnc-TTC34-9:1 Yes chr3R:27057908-27064199 lnc-TTC34-6:1 Yes chr3R:27057908-27064199 lnc-FAM213B-2:2 No - lnc-FAM213B-2:3 No - lnc-FAM213B-2:4 No - lnc-FAM213B-2:5 No - lnc-TTC34-5:1 No - lnc-TTC34-7:1 No - lnc-TTC34-8:1 No - lnc-ACTRT2-1:3 No - LINC00982:4 No - LINC00982:9 No - LINC00982:2 No - lnc-MEGF6-6:1 Yes chr2L:18714453-18732524 lnc-MEGF6-6:2 Yes chr2L:18714453-18732524 lnc-MEGF6-4:1 Yes chr2L:18714453-18732524 lnc-MEGF6-3:1 Yes chr2L:18714453-18732524 lnc-MEGF6-2:1 Yes chr2L:18714453-18732524 lnc-WRAP73-4:2 No - lnc-WRAP73-4:1 No - lnc-MEGF6-1:1 No - lnc-WRAP73-2:2 No - lnc-LRRC47-78:8 No - lnc-LRRC47-78:9 No - lnc-LRRC47-78:10 No - lnc-LRRC47-78:11 No - lnc-LRRC47-78:16 No - lnc-LRRC47-78:25 No - lnc-LRRC47-78:26 No - lnc-LRRC47-78:17 No - lnc-LRRC47-78:20 No - lnc-LRRC47-78:31 No - lnc-LRRC47-78:30 No - lnc-LRRC47-78:33 No - lnc-LRRC47-78:32 No - lnc-LRRC47-78:15 No - lnc-LRRC47-78:14 No - lnc-LRRC47-78:13 No - lnc-SMIM1-1:1 No - lnc-LRRC47-2:1 Yes chr2L:19526686-19532985 lnc-LRRC47-3:1 Yes chr2L:19526686-19532985 LINC01134:4 No - LINC01134:5 No - LINC01134:7 No - LINC01134:8 No - LINC01134:9 No - lnc-DFFB-50:5 No - lnc-C1orf174-5:1 No - lnc-AJAP1-9:1 No - lnc-AJAP1-8:1 No - lnc-AJAP1-7:1 No - lnc-C1orf174-6:1 No - lnc-AJAP1-5:1 No - lnc-AJAP1-5:2 No - lnc-NPHP4-7:1 No - lnc-AJAP1-3:8 No - lnc-AJAP1-3:9 No - lnc-NPHP4-6:1 No - lnc-NPHP4-5:1 No - lnc-KCNAB2-3:1 No - lnc-NPHP4-4:3 No - lnc-NPHP4-4:2 No - lnc-NPHP4-4:1 No - lnc-RNF207-4:1 Yes chrX:10233347-10263485 lnc-RNF207-2:1 Yes chrX:762560-765130 lnc-CHD5-1:1 Yes chrX:762560-765130 lnc-RPL22-1:1 No - lnc-ICMT-1:2 No - lnc-RPL22-2:1 Yes chr3L:13018266-13019687 LINC00337:2 No - LINC00337:3 No - lnc-ACOT7-2:1 No - lnc-GPR153-1:1 No - lnc-ACOT7-1:1 No - lnc-ESPN-2:1 No - lnc-ACOT7-3:1 Yes chr2L:19027710-19030780 lnc-PLEKHG5-2:1 No - lnc-PLEKHG5-1:1 No - lnc-TAS1R1-1:1 Yes chr2R:16099306-16102608 lnc-PLEKHG5-3:2 Yes chr2R:16099306-16102608 lnc-PLEKHG5-3:1 Yes chr2R:16099306-16102608 lnc-THAP3-2:1 Yes chr2R:14256493-14258787 lnc-THAP3-2:2 Yes chr2R:14256493-14258787 lnc-THAP3-2:4 Yes chr2R:14256493-14258787 lnc-KLHL21-1:1 Yes chr2R:14256493-14258787 LINC01672:12 No - LINC01672:20 No - lnc-CAMTA1-3:1 No - CAMTA1-DT:11 No - lnc-DNAJC11-3:1 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-DNAJC11-2:2 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-THAP3-3:1 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-THAP3-4:1 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-UTS2-3:4 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-UTS2-3:3 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-UTS2-3:5 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-UTS2-11:1 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-UTS2-10:1 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-UTS2-10:2 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-UTS2-9:1 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-UTS2-8:1 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-UTS2-8:2 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-UTS2-7:1 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-UTS2-6:1 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-UTS2-5:4 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-UTS2-5:3 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-UTS2-5:2 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-UTS2-5:5 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-UTS2-5:1 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-CAMTA1-2:7 Yes chr2R:10249435-10252417 lnc-UTS2-4:1 No - lnc-PARK7-3:1 No - LINC01714:24 No - lnc-ERRFI1-5:1 No - LINC01714:28 No - lnc-PARK7-4:1 No - lnc-ERRFI1-2:1 No - lnc-SLC45A1-5:1 No - lnc-SLC45A1-4:1 No - lnc-RERE-5:1 No - lnc-SLC45A1-3:1 No - lnc-ERRFI1-3:1 Yes chr3L:8449922-8472669 lnc-ERRFI1-4:2 Yes chr3L:8449922-8472669 lnc-ERRFI1-4:1 Yes chr3L:8449922-8472669 lnc-SLC45A1-1:3 Yes chr3L:8449922-8472669 lnc-ENO1-5:1 Yes chr3L:8449922-8472669 lnc-SLC45A1-6:1 Yes chr3L:8449922-8472669 lnc-ENO1-4:1 Yes chr3L:8449922-8472669 lnc-RERE-3:1 Yes chr3L:8449922-8472669 lnc-CA6-5:1 Yes chr3L:8449922-8472669 lnc-CA6-4:1 No - lnc-RERE-4:1 Yes chr2L:1724768-1729636 lnc-RERE-4:2 Yes chr2L:1724768-1729636 lnc-CA6-3:1 No - lnc-ENO1-1:1 No - lnc-SLC2A7-1:1 No - lnc-SLC2A7-2:1 Yes chr2R:8087396-8089297 lnc-GPR157-3:2 Yes chr2R:8087396-8089297 lnc-GPR157-3:1 Yes chr2R:8087396-8089297 lnc-GPR157-2:1 No - lnc-H6PD-3:1 No - MIR34AHG:15 No - LINC01759:19 No - LINC01759:28 No - LINC01759:29 No - MIR34AHG:13 No - lnc-GPR157-5:1 No - lnc-H6PD-2:1 Yes chr3L:22026230-22028325 lnc-GPR157-7:9 No - lnc-SPSB1-1:1 No - lnc-TMEM201-1:1 No - lnc-CLSTN1-6:2 Yes chr3R:20628972-20634732 PIK3CD-AS2:5 Yes chr3R:20628972-20634732 PIK3CD-AS2:6 Yes chr3R:20628972-20634732 lnc-TMEM201-2:1 Yes chr3R:20628972-20634732 lnc-CTNNBIP1-8:2 Yes chr4:1112874-1123357 lnc-CTNNBIP1-9:2 Yes chr4:1112874-1123357 lnc-PIK3CD-2:1 Yes chr4:1112874-1123357 lnc-CTNNBIP1-1:1 No - lnc-CTNNBIP1-2:1 No - lnc-RBP7-3:1 Yes chr3R:24945237-24947400 lnc-RBP7-2:1 Yes chr3R:24945237-24947400 lnc-LZIC-1:1 No - lnc-LZIC-2:1 Yes chr2L:13013276-13019434 lnc-PGD-4:1 Yes chr2R:16751503-16772671 lnc-PGD-1:1 No - lnc-CENPS-CORT-6:1 Yes chr3L:20778799-20780378 lnc-DFFA-12:1 Yes chr3L:11513705-11518904 lnc-DFFA-6:1 Yes chr3L:11513705-11518904 lnc-DFFA-9:1 Yes chr3L:11513705-11518904 lnc-TARDBP-9:1 No - lnc-TARDBP-8:1 No - lnc-TARDBP-4:1 No - lnc-TARDBP-5:1 No - lnc-SRM-1:3 Yes chr3R:14882498-14886246 lnc-SRM-1:1 Yes chr3R:14882498-14886246 lnc-SRM-1:2 Yes chr3R:14882498-14886246 lnc-SRM-2:1 Yes chr3R:14882498-14886246 lnc-SRM-3:1 Yes chr3R:14882498-14886246 lnc-TARDBP-2:3 No - lnc-MTOR-3:1 No - lnc-MTOR-4:1 No - lnc-MTOR-5:1 Yes chr2L:16296051-16299858 lnc-MTOR-6:1 No - lnc-DISP3-2:1 No - lnc-DISP3-1:1 Yes chr3R:5849697-5856311 lnc-FBXO2-1:1 Yes chr3R:5849697-5856311 LINC01647:7 No - lnc-MAD2L2-3:1 No - lnc-MAD2L2-2:1 No - lnc-DRAXIN-3:1 Yes chr3R:5588873-5589703 lnc-DRAXIN-1:1 No - lnc-NPPA-1:1 Yes chr3L:11425158-11426395 lnc-KIAA2013-1:1 No - lnc-KIAA2013-2:1 No - lnc-TNFRSF8-2:1 No - lnc-VPS13D-2:1 No - lnc-KIAA2013-3:1 No - lnc-AADACL4-2:1 Yes chr3L:12755049-12768605 lnc-VPS13D-1:3 No - lnc-VPS13D-1:4 No - lnc-PRAMEF11-3:2 Yes chr3R:23033284-23035563 lnc-PRAMEF11-3:3 Yes chr3R:23033284-23035563 lnc-PRAMEF11-3:1 Yes chr3R:23033284-23035563 lnc-PRAMEF11-2:1 No - LINC01784:4 No - lnc-HNRNPCL2-1:2 No - lnc-PRAMEF15-1:5 No - lnc-LRRC38-5:1 No - lnc-LRRC38-6:1 No - lnc-PRDM2-1:2 No - lnc-PRDM2-2:1 No - lnc-LRRC38-7:1 Yes chr2R:22333500-22373109 lnc-PRDM2-7:1 Yes chr2R:22333500-22373109 lnc-PRDM2-8:1 Yes chr2R:22333500-22373109 lnc-LRRC38-3:2 Yes chr2R:22333500-22373109 lnc-LRRC38-4:2 Yes chr2R:22333500-22373109 lnc-PRDM2-3:2 Yes chr2R:22333500-22373109 lnc-PRDM2-4:3 Yes chr2R:22333500-22373109 KAZN-AS1:9 Yes chr2R:22333500-22373109 lnc-CASP9-8:2 Yes chr2R:22333500-22373109 lnc-CASP9-6:1 Yes chr2R:22333500-22373109 TMEM51-AS1:2 Yes chr2R:22333500-22373109 TMEM51-AS1:5 Yes chr2R:22333500-22373109 lnc-CASP9-4:1 Yes chrX:633622-635545 lnc-AGMAT-1:2 No - lnc-DNAJC16-1:1 No - lnc-AGMAT-5:1 No - lnc-RSC1A1-1:1 Yes chrX:16441433-16445367 lnc-UQCRHL-2:2 No - lnc-ZBTB17-4:1 Yes chr2R:8677219-8677661 lnc-UQCRHL-1:2 Yes chr2L:159032-203397 lnc-UQCRHL-1:8 No - lnc-ZBTB17-3:1 Yes chr2L:159032-203397 lnc-HSPB7-5:5 No - lnc-HSPB7-5:3 No - lnc-HSPB7-5:4 No - lnc-HSPB7-5:2 No - lnc-HSPB7-5:1 No - lnc-HSPB7-4:1 No - lnc-SRARP-3:1 No - lnc-SRARP-1:1 No - lnc-HSPB7-2:1 No - lnc-SRARP-2:1 Yes chr3R:11797244-11813207 lnc-CLCNKA-1:1 Yes chr3R:11797244-11813207 lnc-HSPB7-3:1 No - lnc-EPHA2-4:1 No - lnc-ARHGEF19-1:2 No - lnc-ARHGEF19-1:1 No - lnc-FBXO42-1:1 No - lnc-SPATA21-3:1 Yes chrX:16796902-16800710 lnc-SPATA21-4:7 No - lnc-SPATA21-4:6 No - lnc-SPATA21-6:2 No - lnc-SPATA21-6:1 No - lnc-SPATA21-6:3 No - lnc-NECAP2-2:1 No - lnc-NECAP2-1:3 No - LINC01783:7 No - lnc-NECAP2-3:1 No - lnc-NBPF1-2:17 No - lnc-NBPF1-2:10 No - lnc-NBPF1-2:6 No - lnc-NBPF1-2:7 No - lnc-NBPF1-2:2 No - lnc-NBPF1-2:12 No - lnc-NBPF1-2:5 No - lnc-CROCC-8:1 No - lnc-NBPF1-2:8 No - lnc-NBPF1-2:3 No - lnc-NBPF1-1:12 No - lnc-NBPF1-1:13 No - lnc-NBPF1-1:15 No - lnc-NBPF1-1:5 No - lnc-NBPF1-1:9 No - lnc-NBPF1-1:11 No - lnc-NBPF1-1:8 No - lnc-NBPF1-1:2 No - lnc-NBPF1-1:1 No - lnc-CROCC-3:3 No - lnc-CROCC-3:4 No - lnc-CROCC-3:5 No - lnc-CROCC-3:7 No - lnc-CROCC-3:8 No - lnc-CROCC-3:9 No - lnc-CROCC-3:10 No - lnc-CROCC-3:11 No - lnc-CROCC-3:12 No - lnc-CROCC-3:13 No - lnc-CROCC-3:14 No - lnc-CROCC-3:15 No - lnc-NBPF1-4:2 No - lnc-NBPF1-4:6 No - lnc-NBPF1-4:5 No - lnc-NBPF1-4:4 No - lnc-NBPF1-4:7 No - lnc-NBPF1-4:1 No - lnc-CROCC-2:2 No - lnc-NBPF1-6:3 No - lnc-NBPF1-6:2 No - lnc-CROCC-4:2 No - lnc-NBPF1-6:1 No - lnc-CROCC-5:2 No - lnc-NBPF1-8:2 No - lnc-NBPF1-8:1 No - lnc-CROCC-6:2 No - lnc-NECAP2-7:1 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-NECAP2-8:1 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-NBPF1-10:2 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-NBPF1-10:1 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-MFAP2-53:7 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-MFAP2-53:2 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-MFAP2-53:10 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-MFAP2-53:1 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-PADI1-5:1 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-MFAP2-4:1 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-MFAP2-1:1 No - lnc-MFAP2-1:2 No - lnc-MFAP2-2:1 No - lnc-ATP13A2-1:1 Yes chrX:18894446-18896581 lnc-PADI2-1:1 Yes chr2L:6050800-6053877 lnc-PADI6-3:4 No - lnc-ACTL8-5:1 Yes chrX:17456169-17561180 lnc-ACTL8-1:3 No - IGSF21-AS1:7 No - IGSF21-AS1:6 No - lnc-KLHDC7A-4:1 No - lnc-KLHDC7A-3:1 No - lnc-IGSF21-3:1 No - lnc-KLHDC7A-1:1 No - lnc-KLHDC7A-1:2 No - lnc-PAX7-1:1 No - lnc-PAX7-6:1 Yes chr2L:12082995-12085827 lnc-PAX7-6:2 Yes chr2L:12082995-12085827 lnc-UBR4-1:1 Yes chr2L:8054322-8071624 lnc-EMC1-4:1 Yes chr2L:8054322-8071624 lnc-EMC1-3:1 Yes chr2L:8054322-8071624 lnc-EMC1-2:1 Yes chr2L:8054322-8071624 lnc-MRTO4-1:2 Yes chr2L:8054322-8071624 lnc-MRTO4-1:3 No - lnc-UBR4-3:1 Yes chr3R:7903030-7907363 lnc-EMC1-1:1 Yes chr2R:10098518-10099590 lnc-EMC1-1:2 Yes chr2R:10098518-10099590 lnc-AKR7A3-2:3 No - lnc-AKR7A3-1:1 No - lnc-PQLC2-2:1 No - lnc-AKR7A2-1:1 No - lnc-AKR7A2-2:1 Yes chr2L:1704902-1706962 lnc-AKR7A2-3:2 Yes chr2L:1704902-1706962 lnc-AKR7A2-3:1 Yes chr2L:1704902-1706962 lnc-PQLC2-5:1 Yes chr2L:1704902-1706962 lnc-RNF186-3:1 No - lnc-RNF186-2:1 No - lnc-PLA2G5-2:1 No - lnc-PLA2G2E-1:1 No - lnc-PLA2G2E-1:2 No - lnc-PLA2G5-1:1 No - lnc-PLA2G2F-4:1 No - lnc-PLA2G2F-4:4 No - lnc-PLA2G5-1:2 No - lnc-PLA2G2D-1:1 No - lnc-PLA2G2F-3:1 No - lnc-PLA2G2F-2:1 No - lnc-PLA2G2C-5:2 No - UBXN10-AS1:1 No - lnc-PLA2G2C-4:3 No - lnc-PLA2G2C-4:4 No - lnc-PLA2G2C-4:1 No - lnc-PLA2G2C-3:1 No - LINC01141:13 No - LINC01141:9 No - lnc-VWA5B1-2:1 No - LINC01141:8 No - lnc-FAM43B-20:2 No - lnc-CAMK2N1-4:1 No - lnc-MUL1-3:1 No - lnc-CAMK2N1-3:1 No - PINK1-AS:2 Yes chrX:6683798-6687302 lnc-KIF17-2:1 Yes chrX:9156929-9158515 lnc-KIF17-1:1 Yes chr4:1147466-1169239 lnc-DDOST-2:1 Yes chr4:1147466-1169239 lnc-SH2D5-1:1 Yes chr4:1147466-1169239 lnc-EIF4G3-2:1 No - lnc-HP1BP3-1:1 Yes chr4:915297-930715 lnc-HP1BP3-2:1 Yes chr4:915297-930715 lnc-ECE1-4:1 Yes chr4:915297-930715 lnc-NBPF3-9:1 Yes chr4:915297-930715 lnc-EIF4G3-1:1 No - lnc-EIF4G3-3:1 Yes chrX:19961297-19969323 lnc-EIF4G3-5:1 Yes chrX:19961297-19969323 lnc-EIF4G3-4:1 Yes chrX:19961297-19969323 lnc-NBPF3-7:1 Yes chrX:19961297-19969323 lnc-NBPF3-45:1 Yes chrX:19961297-19969323 lnc-ECE1-2:1 No - lnc-NBPF3-5:1 No - lnc-ALPL-3:2 No - lnc-ALPL-2:1 No - lnc-ECE1-3:1 No - lnc-USP48-4:2 Yes chr2L:7497805-7578980 lnc-USP48-4:1 Yes chr2L:7497805-7578980 lnc-RAP1GAP-1:1 Yes chr3R:31777020-31790681 lnc-RAP1GAP-2:1 Yes chr3R:31777020-31790681 lnc-HSPG2-3:1 Yes chr3R:31777020-31790681 lnc-LDLRAD2-1:1 No - lnc-USP48-1:1 No - lnc-USP48-2:1 Yes chrX:2470460-2545410 lnc-USP48-3:1 Yes chrX:2470460-2545410 lnc-USP48-5:1 Yes chrX:2470460-2545410 lnc-USP48-6:1 Yes chrX:2470460-2545410 lnc-USP48-7:1 Yes chrX:2470460-2545410 lnc-LDLRAD2-2:1 Yes chrX:2470460-2545410 lnc-LDLRAD2-2:2 Yes chrX:2470460-2545410 lnc-LDLRAD2-2:3 Yes chrX:2470460-2545410 lnc-LDLRAD2-2:5 Yes chrX:2470460-2545410 lnc-HSPG2-2:1 Yes chr3L:6593938-6603366 lnc-CELA3A-3:1 Yes chr3L:6593938-6603366 lnc-HSPG2-4:1 Yes chr3L:6593938-6603366 lnc-CELA3B-1:1 Yes chr3L:6593938-6603366 LINC01635:11 No - LINC01635:9 No - lnc-CELA3A-5:5 No - lnc-CELA3A-5:6 No - lnc-CELA3A-5:22 No - lnc-CELA3A-5:23 No - lnc-CELA3A-5:27 No - lnc-CELA3A-5:28 No - lnc-CELA3A-5:29 No - lnc-WNT4-5:1 No - CDC42-IT1:2 Yes chrX:19697091-19699938 lnc-WNT4-4:1 Yes chrX:19697091-19699938 lnc-WNT4-3:1 No - lnc-WNT4-2:1 No - lnc-CDC42-3:1 No - lnc-WNT4-6:1 No - lnc-WNT4-1:2 No - lnc-EPHB2-1:2 No - lnc-KDM1A-1:1 No - lnc-LUZP1-3:1 Yes chr3L:20226381-20230250 lnc-KDM1A-2:1 No - lnc-KDM1A-9:1 No - lnc-KDM1A-3:2 No - LINC01355:1 Yes chr3R:20756729-20810726 LINC01355:7 No - LINC01355:2 Yes chr3R:20756729-20810726 ZNF436-AS1:2 Yes chr2R:14173693-14182838 lnc-TCEA3-1:1 No - lnc-ASAP3-2:1 Yes chrX:15644222-15644991 lnc-RPL11-7:1 Yes chrX:15644222-15644991 lnc-ASAP3-2:2 Yes chrX:15644222-15644991 lnc-ASAP3-1:1 Yes chrX:15644222-15644991 lnc-E2F2-3:1 Yes chr2R:8114286-8123001 lnc-E2F2-2:1 Yes chr2R:8114286-8123001 lnc-ASAP3-3:1 Yes chr3R:21620304-21660871 lnc-RPL11-3:1 Yes chr3R:21620304-21660871 lnc-E2F2-1:1 Yes chr3L:749400-753492 lnc-RPL11-1:5 No - lnc-RPL11-1:9 No - lnc-RPL11-2:1 No - lnc-GALE-4:1 No - lnc-ELOA-2:2 No - lnc-GALE-3:1 No - ELOA-AS1:23 Yes chr3R:23251563-23255071 ELOA-AS1:24 Yes chr3R:23251563-23255071 lnc-ELOA-1:2 No - ELOA-AS1:14 No - lnc-HMGCL-2:1 Yes chr3L:648555-651311 lnc-HMGCL-1:2 Yes chr3L:648555-651311 lnc-HMGCL-1:1 Yes chr3L:648555-651311 lnc-GALE-2:1 Yes chr2L:6960377-6961653 lnc-GALE-2:2 Yes chr2L:6960377-6961653 lnc-FUCA1-2:1 No - lnc-FUCA1-1:2 No - lnc-PNRC2-5:1 No - lnc-PNRC2-4:1 No - lnc-SRSF10-1:1 No - lnc-CNR2-1:6 No - lnc-CNR2-1:7 No - lnc-CNR2-1:4 No - lnc-CNR2-1:2 No - lnc-PNRC2-1:2 No - lnc-PNRC2-1:4 No - lnc-PNRC2-2:2 Yes chr3L:3172817-3178580 lnc-IL22RA1-2:1 No - lnc-GRHL3-3:1 No - lnc-GRHL3-2:1 No - lnc-STPG1-2:5 No - lnc-STPG1-2:6 No - lnc-STPG1-2:2 No - lnc-STPG1-2:3 No - lnc-STPG1-2:4 No - lnc-IFNLR1-3:1 No - lnc-NIPAL3-2:1 No - lnc-NIPAL3-3:1 No - RCAN3AS:15 Yes chr3R:16186999-16197584 RCAN3AS:22 Yes chr3R:16186999-16197584 RCAN3AS:23 Yes chr3R:16186999-16197584 lnc-STPG1-4:1 Yes chr3R:16186999-16197584 lnc-NCMAP-1:1 Yes chr3R:16186999-16197584 lnc-RCAN3-2:1 No - lnc-SRRM1-1:1 Yes chr3L:13036821-13040976 lnc-SRRM1-2:1 No - lnc-RUNX3-3:2 Yes chrX:9284649-9303636 lnc-SYF2-7:2 Yes chrX:9284649-9303636 lnc-SYF2-7:1 Yes chrX:9284649-9303636 lnc-RUNX3-2:1 Yes chrX:9284649-9303636 lnc-SYF2-6:1 Yes chrX:9284649-9303636 lnc-CLIC4-1:2 Yes chrX:9284649-9303636 lnc-RUNX3-1:2 No - lnc-RUNX3-3:1 No - lnc-CLIC4-2:2 No - lnc-SYF2-5:1 No - lnc-RSRP1-1:1 Yes chr2R:10822400-10823372 lnc-RHD-4:1 No - lnc-SYF2-3:5 No - lnc-SYF2-3:2 No - lnc-SYF2-3:6 No - lnc-SYF2-3:3 No - lnc-SYF2-3:4 No - lnc-SYF2-3:1 No - lnc-SYF2-1:5 No - lnc-SYF2-1:6 No - lnc-SYF2-4:2 No - lnc-SYF2-4:1 No - lnc-RHCE-2:6 No - lnc-RHCE-2:4 No - lnc-RHCE-2:2 No - lnc-RHCE-2:3 No - lnc-RHCE-1:1 No - lnc-RHCE-2:5 No - lnc-RHCE-2:1 No - lnc-MACO1-1:1 Yes chr3L:4910368-4920198 lnc-MACO1-1:2 Yes chr3L:4910368-4920198 lnc-RSRP1-2:1 Yes chr3L:4910368-4920198 lnc-LDLRAP1-1:3 No - lnc-MAN1C1-1:1 No - lnc-SELENON-2:1 Yes chrX:10266792-10325958 lnc-SELENON-2:2 Yes chrX:10266792-10325958 lnc-SELENON-2:3 Yes chrX:10266792-10325958 lnc-SELENON-2:4 Yes chrX:10266792-10325958 lnc-SELENON-2:5 Yes chrX:10266792-10325958 lnc-SELENON-2:6 Yes chrX:10266792-10325958 lnc-SELENON-2:7 Yes chrX:10266792-10325958 lnc-SELENON-2:8 Yes chrX:10266792-10325958 lnc-SELENON-2:9 Yes chrX:10266792-10325958 lnc-AUNIP-2:12 No - lnc-AUNIP-2:9 No - lnc-AUNIP-2:1 No - lnc-PAQR7-4:1 No - lnc-MTFR1L-2:1 No - lnc-PAQR7-1:1 No - lnc-PAQR7-1:2 No - lnc-SLC30A2-1:1 No - lnc-SLC30A2-1:2 No - lnc-PDIK1L-1:1 No - lnc-ZNF593-1:1 No - lnc-CEP85-2:1 No - lnc-CEP85-1:1 No - lnc-CEP85-1:2 No - lnc-UBXN11-1:1 No - lnc-CD52-1:1 No - lnc-ZNF683-2:1 No - lnc-ZNF683-1:2 Yes chrX:7931745-7933351 lnc-ZNF683-3:1 No - lnc-ZNF683-4:1 No - lnc-ZNF683-5:1 No - lnc-GPN2-4:1 No - lnc-ARID1A-1:1 No - lnc-PIGV-3:1 Yes chr3R:17687818-17718350 lnc-PIGV-2:1 Yes chr3R:17687818-17718350 lnc-PIGV-1:1 No - lnc-ZDHHC18-2:1 No - lnc-ZDHHC18-1:1 No - lnc-SFN-2:1 No - lnc-NUDC-1:1 No - lnc-TRNP1-2:1 No - lnc-TRNP1-4:1 No - lnc-TRNP1-5:1 No - lnc-FAM46B-1:2 Yes chr2L:21104568-21134255 lnc-WDTC1-4:1 No - lnc-SLC9A1-2:1 No - lnc-SLC9A1-3:1 No - lnc-WDTC1-3:1 No - lnc-SLC9A1-1:3 No - lnc-WDTC1-1:1 No - lnc-FCN3-1:2 Yes chr3R:19879719-19886030 lnc-FCN3-1:1 Yes chr3R:19879719-19886030 lnc-CD164L2-1:1 Yes chr2R:1649061-1778937 lnc-GPR3-3:1 No - lnc-GPR3-4:1 No - lnc-AHDC1-2:1 No - lnc-AHDC1-3:1 No - lnc-AHDC1-1:4 No - lnc-AHDC1-1:3 No - lnc-AHDC1-1:2 No - lnc-IFI6-2:1 No - lnc-PPP1R8-1:1 Yes chr3L:21445834-21448128 lnc-RPA2-2:1 No - lnc-RPA2-4:1 Yes chr2L:6527447-6546976 lnc-PTAFR-3:1 Yes chr2L:6527447-6546976 lnc-PTAFR-10:1 Yes chr2L:6527447-6546976 lnc-EYA3-2:1 No - lnc-ATP5IF1-3:2 No - lnc-PTAFR-9:1 No - lnc-PTAFR-1:3 Yes chr3R:23767712-23768984 lnc-PTAFR-2:3 Yes chr3R:23767712-23768984 lnc-DNAJC8-1:5 No - lnc-DNAJC8-1:3 No - lnc-DNAJC8-1:4 No - lnc-ATP5IF1-1:2 No - lnc-RCC1-4:1 Yes chr3L:3714826-3806459 SNHG3:1 Yes chr3L:5930262-5932773 SNHG3:2 Yes chr3L:5930262-5932773 SNHG3:6 Yes chr3L:5930262-5932773 lnc-PHACTR4-3:1 Yes chr3L:5930262-5932773 SNHG3:7 Yes chr3L:5930262-5932773 lnc-RCC1-6:2 No - SNHG12:6 Yes chr2L:4453169-4454453 SNHG12:7 Yes chr2L:4453169-4454453 lnc-TRNAU1AP-1:1 No - LINC01715:19 No - lnc-TAF12-4:1 No - lnc-TAF12-5:1 No - lnc-OPRD1-1:2 Yes chr3L:18560258-18576326 lnc-OPRD1-1:3 Yes chr3L:18560258-18576326 lnc-EPB41-3:1 No - lnc-EPB41-4:1 No - lnc-MECR-1:6 Yes chr3R:13661311-13666891 lnc-MECR-1:5 Yes chr3R:13661311-13666891 lnc-MECR-1:3 Yes chr3R:13661311-13666891 lnc-SRSF4-2:3 Yes chr2R:13860349-13862002 lnc-SRSF4-2:2 Yes chr2R:13860349-13862002 lnc-SRSF4-2:4 Yes chr2R:13860349-13862002 lnc-SRSF4-2:1 Yes chr2R:13860349-13862002 lnc-MECR-3:5 Yes chr2R:13860349-13862002 lnc-MECR-3:4 Yes chr2R:13860349-13862002 lnc-MECR-3:2 Yes chr2R:13860349-13862002 lnc-MECR-3:3 Yes chr2R:13860349-13862002 LINC01756:5 No - lnc-PTPRU-6:1 No - lnc-MECR-6:1 No - lnc-MECR-4:1 No - lnc-MECR-5:3 No - lnc-PTPRU-8:1 No - LINC01648:6 No - lnc-PTPRU-5:2 No - lnc-MATN1-4:1 No - lnc-PTPRU-9:1 No - lnc-ZCCHC17-15:1 No - lnc-ZCCHC17-15:2 No - lnc-ZCCHC17-14:1 No - LINC01778:14 No - LINC01778:23 No - lnc-ZCCHC17-11:1 No - lnc-ZCCHC17-10:1 Yes chr2R:21392402-21481176 lnc-PUM1-3:1 Yes chr2R:21392402-21481176 lnc-SDC3-1:4 Yes chr3R:9066343-9237682 lnc-SDC3-1:3 Yes chr3R:9066343-9237682 lnc-SDC3-1:2 Yes chr3R:9066343-9237682 lnc-SDC3-1:1 Yes chr3R:9066343-9237682 lnc-ZCCHC17-9:1 Yes chr3R:9066343-9237682 lnc-NKAIN1-4:1 Yes chr3R:9066343-9237682 lnc-ZCCHC17-8:1 Yes chr3R:9066343-9237682 lnc-PUM1-1:1 No - lnc-PUM1-2:1 No - lnc-SNRNP40-1:1 Yes chr2R:24881570-24888615 lnc-NKAIN1-1:1 Yes chr2L:156029-157666 lnc-NKAIN1-1:2 Yes chr2L:156029-157666 lnc-NKAIN1-2:1 Yes chr2L:156029-157666 lnc-ZCCHC17-7:2 Yes chr2L:156029-157666 lnc-SNRNP40-3:2 Yes chr2L:156029-157666 lnc-FABP3-3:1 No - lnc-SERINC2-2:1 No - LINC01226:10 No - lnc-PEF1-2:1 Yes chr3R:21276664-21293998 lnc-COL16A1-2:3 Yes chr2R:10480163-10481886 lnc-COL16A1-2:4 Yes chr2R:10480163-10481886 lnc-COL16A1-2:5 Yes chr2R:10480163-10481886 lnc-PEF1-3:3 No - lnc-PEF1-3:6 No - lnc-HCRTR1-5:3 No - lnc-PEF1-3:7 No - lnc-PEF1-3:4 No - lnc-PEF1-3:5 No - lnc-PEF1-3:2 No - lnc-PEF1-3:1 No - lnc-HCRTR1-3:1 No - lnc-ADGRB2-4:3 No - lnc-ADGRB2-4:2 No - lnc-ADGRB2-4:1 No - lnc-ADGRB2-2:1 No - lnc-COL16A1-3:1 No - lnc-COL16A1-4:1 No - lnc-PTP4A2-5:1 Yes chr2L:16245835-16257606 lnc-PTP4A2-2:1 Yes chr2L:16245835-16257606 lnc-SPOCD1-2:1 Yes chr2L:16245835-16257606 lnc-PTP4A2-3:10 Yes chr2L:16245835-16257606 lnc-PTP4A2-3:6 Yes chr2L:16245835-16257606 lnc-PTP4A2-3:2 Yes chr2L:16245835-16257606 lnc-PTP4A2-3:8 Yes chr2L:16245835-16257606 lnc-PTP4A2-3:7 Yes chr2L:16245835-16257606 lnc-PTP4A2-3:5 Yes chr2L:16245835-16257606 lnc-PTP4A2-3:3 Yes chr2L:16245835-16257606 lnc-PTP4A2-3:4 Yes chr2L:16245835-16257606 lnc-PTP4A2-3:9 Yes chr2L:16245835-16257606 lnc-KHDRBS1-1:3 Yes chr2R:22409208-22411545 lnc-TMEM234-7:1 Yes chr3L:19807232-19810398 lnc-TMEM39B-1:1 Yes chr3L:19807232-19810398 lnc-TMEM39B-2:1 Yes chr3L:19807232-19810398 lnc-TMEM234-4:1 Yes chr3R:25851632-25853989 lnc-TMEM234-1:4 No - lnc-TMEM234-1:3 No - lnc-TMEM234-2:2 No - lnc-TMEM234-2:5 No - lnc-TMEM234-2:4 No - lnc-TMEM234-2:3 Yes chr2R:9586110-9586714 lnc-TMEM234-2:1 No - lnc-TMEM234-3:4 No - lnc-TMEM234-3:3 No - lnc-TMEM234-3:5 No - lnc-TMEM234-3:2 No - lnc-TMEM234-3:12 No - lnc-TMEM234-3:9 No - lnc-TMEM234-3:11 No - lnc-TMEM234-3:7 No - lnc-TMEM234-3:8 No - lnc-TMEM234-3:6 No - lnc-FAM167B-1:1 No - lnc-FAM167B-2:1 Yes chr3L:4592447-4626196 lnc-TSSK3-2:1 No - lnc-TSSK3-2:2 No - lnc-FAM229A-2:1 No - lnc-FAM229A-2:2 No - lnc-FAM229A-3:1 No - lnc-BSDC1-2:1 No - lnc-ZBTB8B-1:1 No - lnc-BSDC1-3:1 No - lnc-ZBTB8OS-3:3 Yes chr3R:21661186-21662972 lnc-ZBTB8OS-3:5 Yes chr3R:21661186-21662972 lnc-ZBTB8OS-3:7 Yes chr3R:21661186-21662972 lnc-ZBTB8OS-3:8 Yes chr3R:21661186-21662972 lnc-ZBTB8OS-3:1 Yes chr3R:21661186-21662972 lnc-ZBTB8OS-3:6 Yes chr3R:21661186-21662972 lnc-ZBTB8OS-3:2 Yes chr3R:21661186-21662972 lnc-ZBTB8OS-3:4 Yes chr3R:21661186-21662972 lnc-SYNC-4:1 Yes chr3L:16417349-16419302 lnc-FNDC5-3:1 Yes chr3L:16417349-16419302 lnc-FNDC5-2:1 Yes chr3L:16417349-16419302 lnc-KIAA1522-1:1 No - lnc-KIAA1522-1:2 No - lnc-FNDC5-1:2 No - lnc-FNDC5-1:3 No - lnc-FNDC5-1:1 No - lnc-TMEM54-1:3 No - lnc-TMEM54-1:2 No - lnc-TMEM54-1:1 No - lnc-HPCA-4:1 No - lnc-HPCA-6:1 No - lnc-RNF19B-1:7 Yes chr2R:24024207-24025877 lnc-RNF19B-1:6 Yes chr2R:24024207-24025877 lnc-AK2-1:4 Yes chr2R:24024207-24025877 lnc-AK2-1:2 Yes chr2R:24024207-24025877 lnc-AK2-1:3 Yes chr2R:24024207-24025877 lnc-AZIN2-4:1 Yes chr2R:24024207-24025877 lnc-TRIM62-3:1 No - lnc-AZIN2-2:1 No - lnc-AZIN2-3:1 No - lnc-TRIM62-6:1 No - lnc-TRIM62-2:2 No - lnc-AZIN2-5:1 Yes chr3R:7272617-7309629 lnc-AZIN2-6:1 Yes chr3R:7272617-7309629 lnc-ZNF362-3:1 Yes chr3R:7272617-7309629 lnc-ZNF362-1:4 No - lnc-A3GALT2-4:1 Yes chrX:2115727-2123286 lnc-A3GALT2-5:1 Yes chrX:2115727-2123286 lnc-A3GALT2-1:1 Yes chrX:2115727-2123286 lnc-PHC2-4:2 Yes chrX:2115727-2123286 lnc-PHC2-4:3 Yes chrX:2115727-2123286 lnc-ZSCAN20-2:1 Yes chrX:2115727-2123286 lnc-ZSCAN20-1:1 Yes chrX:2115727-2123286 lnc-CSMD2-1:1 No - lnc-PHC2-1:1 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-C1orf94-2:1 Yes chrX:11992915-12003914 CSMD2-AS1:3 Yes chrX:11992915-12003914 CSMD2-AS1:4 Yes chrX:11992915-12003914 CSMD2-AS1:5 Yes chrX:11992915-12003914 CSMD2-AS1:6 Yes chrX:11992915-12003914 CSMD2-AS1:7 Yes chrX:11992915-12003914 CSMD2-AS1:12 Yes chrX:11992915-12003914 CSMD2-AS1:14 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-CSMD2-2:1 No - lnc-CSMD2-3:1 No - lnc-GJB5-2:1 No - lnc-SMIM12-2:1 No - lnc-GJA4-2:1 No - lnc-SMIM12-3:1 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-DLGAP3-2:7 No - lnc-DLGAP3-2:3 No - lnc-DLGAP3-2:5 No - lnc-DLGAP3-2:2 No - lnc-DLGAP3-2:1 No - lnc-DLGAP3-2:4 No - lnc-DLGAP3-2:6 No - lnc-TMEM35B-2:1 No - lnc-TMEM35B-4:1 No - lnc-TMEM35B-5:2 No - lnc-TMEM35B-5:1 No - lnc-ZMYM1-1:1 No - lnc-ZMYM1-2:1 No - lnc-SFPQ-3:1 No - lnc-SFPQ-1:4 No - lnc-SFPQ-2:9 Yes chrX:16361569-16371547 lnc-SFPQ-2:5 Yes chrX:16361569-16371547 lnc-SFPQ-2:8 Yes chrX:16361569-16371547 lnc-SFPQ-2:3 Yes chrX:16361569-16371547 lnc-SFPQ-2:1 Yes chrX:16361569-16371547 lnc-SFPQ-2:7 Yes chrX:16361569-16371547 lnc-SFPQ-2:6 Yes chrX:16361569-16371547 lnc-SFPQ-2:2 Yes chrX:16361569-16371547 lnc-SFPQ-2:4 Yes chrX:16361569-16371547 lnc-ZMYM4-1:1 No - lnc-SFPQ-4:1 No - lnc-SFPQ-5:1 No - lnc-SFPQ-6:1 Yes chr3R:27256595-27264055 lnc-KIAA0319L-3:1 Yes chr3R:27256595-27264055 lnc-PSMB2-6:1 Yes chr3L:8087635-8091786 lnc-PSMB2-5:1 Yes chr3L:8087635-8091786 lnc-PSMB2-4:1 Yes chr3L:8087635-8091786 lnc-PSMB2-3:1 No - lnc-NCDN-3:1 Yes chr3L:8087635-8091786 lnc-PSMB2-3:2 No - lnc-PSMB2-2:1 Yes chr3L:8087635-8091786 lnc-C1orf216-1:1 No - lnc-CLSPN-1:2 No - lnc-CLSPN-1:1 No - lnc-C1orf216-2:1 Yes chr3L:4313483-4318608 lnc-C1orf216-3:1 Yes chr3L:4313483-4318608 lnc-AGO1-1:1 Yes chr2R:13943387-13958089 lnc-CLSPN-3:1 Yes chr2R:13943387-13958089 lnc-AGO3-2:1 Yes chr2R:13943387-13958089 lnc-COL8A2-3:2 Yes chr2R:13943387-13958089 lnc-COL8A2-3:1 Yes chr2R:13943387-13958089 lnc-AGO3-3:2 Yes chr2R:13943387-13958089 lnc-COL8A2-2:1 No - lnc-MAP7D1-1:1 No - lnc-EVA1B-1:1 No - lnc-LSM10-2:1 No - lnc-STK40-1:1 No - lnc-LSM10-1:1 Yes chr2R:12143191-12144552 lnc-LSM10-3:1 Yes chr2R:12143191-12144552 lnc-SH3D21-4:1 No - lnc-MRPS15-1:1 No - lnc-MRPS15-1:3 No - lnc-MRPS15-1:2 No - lnc-MRPS15-2:2 No - lnc-MRPS15-2:1 No - lnc-SH3D21-5:1 No - lnc-SH3D21-6:1 No - lnc-CSF3R-1:1 Yes chr3R:20860187-20866231 lnc-GRIK3-1:1 No - lnc-MEAF6-5:1 No - LINC01137:1 No - LINC01137:2 No - LINC01137:7 No - lnc-MEAF6-4:1 No - lnc-GNL2-2:2 Yes chrX:23082738-23084576 lnc-DNALI1-2:1 Yes chrX:23082738-23084576 lnc-GNL2-2:1 Yes chrX:23082738-23084576 lnc-DNALI1-1:1 No - lnc-DNALI1-1:2 No - lnc-GNL2-1:1 No - lnc-SNIP1-1:1 Yes chr2R:17565779-17568456 lnc-GNL2-3:1 Yes chr2R:17565779-17568456 lnc-DNALI1-3:1 No - lnc-C1orf109-1:3 No - lnc-C1orf109-1:2 No - lnc-C1orf109-1:1 No - lnc-C1orf109-2:1 Yes chr4:610684-622470 lnc-YRDC-1:2 Yes chr2L:5536850-5539196 lnc-MANEAL-3:1 No - lnc-MANEAL-3:2 No - lnc-YRDC-3:1 Yes chr3L:9430312-9439490 lnc-MTF1-2:1 Yes chrX:1922981-1927524 lnc-INPP5B-1:1 Yes chr3R:5589601-5591459 lnc-FHL3-2:1 Yes chr3R:5589601-5591459 lnc-FHL3-1:1 Yes chr3R:5589601-5591459 lnc-SF3A3-1:1 No - lnc-UTP11-6:1 No - lnc-POU3F1-3:1 Yes chr3L:6790158-6794941 LINC01343:5 No - lnc-POU3F1-4:1 No - lnc-UTP11-3:1 No - lnc-UTP11-2:1 No - lnc-UTP11-4:1 No - lnc-UTP11-4:2 No - lnc-UTP11-9:1 No - lnc-POU3F1-2:2 No - lnc-AKIRIN1-14:1 No - lnc-AKIRIN1-13:1 No - lnc-AKIRIN1-11:1 No - lnc-GJA9-1:10 Yes chr2R:8161679-8163500 lnc-GJA9-1:1 No - lnc-GJA9-1:8 No - lnc-GJA9-1:9 No - lnc-GJA9-1:6 No - lnc-RHBDL2-1:1 No - lnc-MACF1-2:1 No - lnc-MACF1-1:1 No - lnc-NDUFS5-6:1 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-PABPC4-7:1 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-PABPC4-5:1 No - lnc-PABPC4-1:13 Yes chr2R:23851562-23853247 lnc-PABPC4-1:12 Yes chr2R:23851562-23853247 lnc-PABPC4-1:17 Yes chr2R:23851562-23853247 lnc-PABPC4-1:4 Yes chr2R:23851562-23853247 lnc-PABPC4-1:20 Yes chr2R:23851562-23853247 lnc-PABPC4-1:15 Yes chr2R:23851562-23853247 lnc-PABPC4-1:19 Yes chr2R:23851562-23853247 lnc-PABPC4-1:18 Yes chr2R:23851562-23853247 lnc-PABPC4-1:16 Yes chr2R:23851562-23853247 lnc-PABPC4-1:14 No - lnc-PABPC4-1:9 No - lnc-PABPC4-1:11 No - lnc-PABPC4-1:6 No - lnc-BMP8A-2:1 No - lnc-PABPC4-1:3 No - lnc-PABPC4-1:7 No - lnc-PABPC4-1:5 No - lnc-PABPC4-1:2 No - lnc-PABPC4-4:7 No - lnc-PABPC4-4:4 No - lnc-PABPC4-4:6 No - lnc-PABPC4-4:5 No - lnc-PABPC4-4:1 No - lnc-PABPC4-4:3 No - lnc-PABPC4-4:2 No - lnc-HEYL-5:1 No - lnc-HEYL-4:1 No - lnc-PPIE-6:1 Yes chr2R:23851562-23853247 lnc-PPIE-6:2 Yes chr2R:23851562-23853247 lnc-PPIE-1:7 No - lnc-PPIE-1:8 No - lnc-PPIE-10:1 No - lnc-PPIE-11:1 No - lnc-MYCL-3:1 Yes chr3R:24877045-24878827 lnc-MYCL-2:1 Yes chr3R:24877045-24878827 lnc-MYCL-1:1 No - lnc-MFSD2A-2:1 No - lnc-CAP1-1:1 No - lnc-RLF-4:1 No - lnc-PPT1-1:2 No - lnc-COL9A2-5:1 No - lnc-COL9A2-1:2 No - lnc-COL9A2-2:1 Yes chr2R:16998610-17000126 lnc-COL9A2-3:6 Yes chr3R:16502770-16571363 lnc-COL9A2-3:4 Yes chr3R:16502770-16571363 lnc-COL9A2-3:2 Yes chr3R:16502770-16571363 lnc-COL9A2-3:5 Yes chr3R:16502770-16571363 lnc-COL9A2-3:3 Yes chr3R:16502770-16571363 lnc-SMAP2-1:1 No - lnc-SMAP2-2:1 No - lnc-COL9A2-4:1 No - lnc-ZFP69-1:1 No - lnc-RIMS3-7:1 No - lnc-NFYC-2:1 Yes chr3R:17872748-17916578 NFYC-AS1:8 No - NFYC-AS1:3 No - NFYC-AS1:1 Yes chrX:6818178-6820919 lnc-NFYC-1:1 Yes chr2R:10145897-10192394 lnc-CITED4-1:1 No - lnc-KCNQ4-7:6 No - lnc-CITED4-2:1 No - lnc-SLFNL1-3:1 No - lnc-KCNQ4-5:1 Yes chr3L:15097914-15113003 lnc-SLFNL1-2:1 Yes chr3R:9633359-9637611 lnc-CTPS1-3:1 Yes chr3R:9633359-9637611 lnc-SLFNL1-4:1 Yes chr3R:9633359-9637611 lnc-SCMH1-1:1 Yes chr3R:9633359-9637611 lnc-FOXO6-2:4 No - lnc-FOXO6-2:5 No - lnc-FOXO6-2:6 No - lnc-FOXO6-2:7 No - lnc-SCMH1-2:1 No - lnc-SCMH1-3:1 No - lnc-SCMH1-4:1 No - lnc-SCMH1-5:1 No - lnc-EDN2-2:1 No - lnc-EDN2-2:9 No - lnc-EDN2-2:8 No - lnc-EDN2-2:7 No - lnc-EDN2-2:6 No - lnc-EDN2-2:5 No - lnc-EDN2-2:4 No - lnc-EDN2-2:3 No - lnc-EDN2-2:2 No - lnc-EDN2-3:1 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-EDN2-4:1 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-FOXO6-4:1 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-EDN2-5:1 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-FOXO6-5:1 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-HIVEP3-1:1 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-HIVEP3-1:2 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-HIVEP3-1:3 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-GUCA2A-1:1 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-GUCA2B-3:1 No - lnc-GUCA2B-2:1 No - lnc-GUCA2B-1:1 No - lnc-FOXJ3-1:2 No - lnc-RIMKLA-1:3 No - lnc-RIMKLA-1:1 No - lnc-ZMYND12-1:1 No - lnc-PPIH-2:1 No - lnc-YBX1-1:2 No - lnc-CLDN19-2:2 No - lnc-CLDN19-2:3 No - lnc-CLDN19-2:1 No - lnc-P3H1-1:5 No - lnc-P3H1-1:6 No - lnc-SVBP-4:1 No - lnc-SVBP-2:2 No - lnc-TMEM269-2:2 No - lnc-SVBP-1:14 No - lnc-SVBP-1:15 No - lnc-ZNF691-3:1 No - SLC2A1-AS1:3 Yes chr3L:914074-993788 lnc-SLC2A1-1:1 No - lnc-FAM183A-2:1 No - lnc-EBNA1BP2-1:7 Yes chr3R:31213458-31214784 lnc-EBNA1BP2-1:1 No - lnc-EBNA1BP2-1:3 Yes chr3R:31213458-31214784 lnc-EBNA1BP2-1:4 Yes chr3R:31213458-31214784 lnc-EBNA1BP2-1:2 Yes chr3R:31213458-31214784 lnc-EBNA1BP2-1:6 Yes chr3R:31213458-31214784 lnc-EBNA1BP2-1:5 Yes chr3R:31213458-31214784 lnc-ELOVL1-1:4 No - lnc-ELOVL1-1:5 No - lnc-MED8-1:2 Yes chr3R:23923300-23924319 lnc-HYI-5:1 No - lnc-MED8-4:3 No - lnc-MED8-4:1 No - lnc-MED8-4:2 No - lnc-HYI-7:1 Yes chr2L:19586623-19732069 KDM4A-AS1:3 No - lnc-KDM4A-1:1 No - lnc-SLC6A9-2:14 No - lnc-SLC6A9-2:4 No - lnc-SLC6A9-6:1 No - lnc-SLC6A9-5:2 Yes chr2R:23820354-23839864 lnc-KLF18-1:1 Yes chr2R:23820354-23839864 lnc-KLF17-1:6 No - lnc-KLF17-1:11 No - lnc-KLF18-7:1 No - lnc-KLF18-8:1 No - lnc-KLF18-9:1 No - lnc-ERI3-4:1 No - lnc-KLF18-3:1 No - lnc-KLF18-2:1 No - lnc-ERI3-1:1 No - ERI3-IT1:3 No - ERI3-IT1:2 No - ERI3-IT1:1 No - lnc-BEST4-2:1 No - lnc-PTCH2-1:1 Yes chr2R:15542661-15544409 lnc-EIF2B3-1:1 No - lnc-ZSWIM5-1:1 No - lnc-HPDL-1:2 No - LINC01144:13 No - lnc-TESK2-3:1 No - lnc-TESK2-2:8 No - lnc-TESK2-2:7 No - lnc-TESK2-2:4 No - lnc-TESK2-2:3 No - lnc-TESK2-2:9 No - lnc-TESK2-2:2 No - lnc-TESK2-2:1 No - lnc-TESK2-2:6 No - lnc-TESK2-2:5 No - lnc-CCDC163-2:1 Yes chr3R:19044882-19094270 lnc-TOE1-1:1 Yes chr3R:19044882-19094270 lnc-TESK2-1:4 No - lnc-TESK2-1:5 No - lnc-AKR1A1-3:1 No - lnc-MMACHC-2:1 No - lnc-CCDC17-5:1 No - lnc-GPBP1L1-2:1 No - lnc-CCDC17-1:1 No - lnc-CCDC17-2:1 No - lnc-CCDC17-2:2 No - lnc-CCDC17-3:1 No - lnc-CCDC17-4:1 No - lnc-IPP-2:1 No - lnc-GPBP1L1-1:8 No - lnc-GPBP1L1-1:7 No - lnc-GPBP1L1-1:9 No - lnc-GPBP1L1-1:6 No - lnc-GPBP1L1-1:5 No - lnc-GPBP1L1-3:2 Yes chr2L:13216290-13219923 lnc-GPBP1L1-3:3 Yes chr2L:13216290-13219923 lnc-GPBP1L1-3:1 Yes chr2L:13216290-13219923 lnc-MAST2-3:1 No - lnc-PIK3R3-5:1 Yes chr3L:15566013-15576313 lnc-PIK3R3-2:1 Yes chr3L:15566013-15576313 lnc-MAST2-5:1 No - lnc-POMGNT1-1:13 Yes chr2L:297880-305233 lnc-PIK3R3-3:1 No - lnc-PIK3R3-4:1 No - lnc-POMGNT1-2:1 No - lnc-RAD54L-4:1 Yes chr2L:2989594-2992759 lnc-LRRC41-1:1 No - lnc-RAD54L-3:1 No - lnc-POMGNT1-4:1 No - lnc-LRRC41-2:1 No - lnc-NSUN4-1:1 No - lnc-FAAH-1:1 No - LINC01398:3 No - lnc-DMBX1-3:1 No - lnc-KNCN-2:1 No - lnc-KNCN-2:2 No - lnc-KNCN-3:8 Yes chr3R:11750931-11764457 lnc-KNCN-3:7 Yes chr3R:11750931-11764457 lnc-MOB3C-3:3 Yes chr3R:11750931-11764457 lnc-MOB3C-3:4 Yes chr3R:11750931-11764457 lnc-MOB3C-3:2 Yes chr3R:11750931-11764457 lnc-MOB3C-3:1 Yes chr3R:11750931-11764457 lnc-TEX38-3:8 Yes chr3R:11750931-11764457 lnc-ATPAF1-1:1 Yes chr3R:16613398-16614391 lnc-ATPAF1-1:2 Yes chr3R:16613398-16614391 lnc-EFCAB14-1:2 Yes chr3R:16613398-16614391 lnc-ATPAF1-2:1 No - lnc-CYP4B1-1:1 No - lnc-TEX38-2:4 Yes chr2R:15942864-15947266 lnc-EFCAB14-4:1 Yes chr2R:15942864-15947266 lnc-CYP4A11-1:1 No - lnc-CYP4X1-1:1 No - lnc-PDZK1IP1-6:1 No - lnc-PDZK1IP1-5:1 No - CYP4A22-AS1:1 No - LINC00853:1 No - LINC00853:2 No - LINC00853:4 No - lnc-PDZK1IP1-3:1 No - lnc-PDZK1IP1-3:2 No - lnc-TAL1-3:2 No - lnc-TAL1-1:2 Yes chrX:2680199-2681723 lnc-TAL1-1:1 Yes chrX:2680199-2681723 lnc-TAL1-1:3 Yes chrX:2680199-2681723 lnc-TAL1-1:4 Yes chrX:2680199-2681723 lnc-TAL1-4:1 No - lnc-STIL-4:1 No - lnc-CMPK1-2:1 No - LINC01389:9 No - lnc-STIL-5:1 No - LINC01389:4 Yes chr2R:22868159-22870706 lnc-FOXD2-4:1 No - lnc-STIL-7:1 No - lnc-STIL-8:1 No - lnc-STIL-3:2 No - lnc-STIL-9:1 No - lnc-TRABD2B-7:1 No - lnc-FOXD2-5:1 No - lnc-FOXD2-6:1 No - lnc-TRABD2B-5:1 No - lnc-FOXD2-7:1 No - lnc-SPATA6-8:1 No - lnc-SLC5A9-12:1 No - lnc-SLC5A9-12:2 No - lnc-SPATA6-7:1 No - lnc-SPATA6-6:1 No - lnc-SLC5A9-9:1 No - lnc-SLC5A9-2:3 No - lnc-TRABD2B-6:1 No - lnc-SLC5A9-6:1 No - lnc-SLC5A9-2:5 No - lnc-TRABD2B-4:2 No - lnc-SLC5A9-4:1 No - lnc-SPATA6-4:1 Yes chr3L:1933633-1939103 lnc-SPATA6-2:1 No - lnc-AGBL4-8:3 No - lnc-AGBL4-7:1 No - lnc-AGBL4-8:4 No - lnc-AGBL4-5:1 No - lnc-AGBL4-8:1 No - lnc-AGBL4-8:2 No - lnc-SLC5A9-8:1 No - lnc-SPATA6-3:1 No - lnc-SLC5A9-10:1 Yes chr3R:30597004-30599296 lnc-SPATA6-5:1 Yes chr3R:30597004-30599296 lnc-SLC5A9-11:1 Yes chr3R:30597004-30599296 lnc-ELAVL4-11:2 Yes chr3R:30597004-30599296 lnc-DMRTA2-11:1 Yes chr3R:30597004-30599296 lnc-DMRTA2-10:1 Yes chr3R:30597004-30599296 lnc-ELAVL4-2:2 Yes chr3R:30597004-30599296 lnc-CDKN2C-32:1 Yes chr2L:2954762-2968434 lnc-DMRTA2-1:16 No - lnc-DMRTA2-5:1 No - lnc-ELAVL4-8:1 No - lnc-ELAVL4-8:2 No - lnc-CDKN2C-3:1 Yes chr2R:16024628-16028161 lnc-CDKN2C-2:1 Yes chr2R:16024628-16028161 lnc-FAF1-3:1 No - lnc-CDKN2C-1:3 No - lnc-CDKN2C-1:5 No - lnc-FAF1-4:1 No - lnc-TTC39A-2:1 Yes chr4:314923-331387 lnc-RNF11-2:1 Yes chr2R:24768314-24775265 lnc-TTC39A-3:1 Yes chr2R:24768314-24775265 lnc-OSBPL9-6:1 No - lnc-OSBPL9-5:1 No - lnc-EPS15-1:1 No - lnc-EPS15-2:1 Yes chr2R:9882572-9891689 lnc-RNF11-4:1 Yes chr2R:9882572-9891689 lnc-RAB3B-3:1 No - lnc-RAB3B-2:1 Yes chrX:11864651-11868893 lnc-RAB3B-1:1 Yes chrX:11864651-11868893 lnc-OSBPL9-7:1 Yes chrX:11864651-11868893 lnc-BTF3L4-5:1 No - lnc-BTF3L4-4:1 No - lnc-TXNDC12-1:2 No - lnc-TXNDC12-1:1 No - lnc-KTI12-1:3 No - lnc-BTF3L4-3:1 Yes chr2R:21481927-21487107 lnc-TXNDC12-2:1 Yes chr2R:21481927-21487107 lnc-TXNDC12-3:1 Yes chr2R:21481927-21487107 lnc-TXNDC12-4:1 Yes chr2R:21481927-21487107 lnc-CC2D1B-2:1 Yes chr2R:21481927-21487107 lnc-PRPF38A-1:1 Yes chr2R:21481927-21487107 lnc-CC2D1B-1:2 No - lnc-ORC1-1:1 Yes chr2L:11106943-11110851 lnc-CC2D1B-1:1 Yes chr2L:11106943-11110851 lnc-ZFYVE9-2:1 No - lnc-ORC1-2:3 No - lnc-ORC1-2:2 No - lnc-ORC1-2:1 No - lnc-ORC1-3:1 No - lnc-ORC1-4:1 No - lnc-ZYG11B-2:1 No - lnc-ZYG11B-1:1 No - lnc-ECHDC2-1:1 No - lnc-SLC1A7-5:10 No - lnc-SLC1A7-5:7 No - lnc-SLC1A7-5:6 No - lnc-SLC1A7-5:9 No - lnc-SLC1A7-5:8 No - lnc-SLC1A7-5:5 No - lnc-SLC1A7-5:3 No - lnc-SLC1A7-5:2 No - lnc-SLC1A7-5:4 No - lnc-SLC1A7-5:1 No - lnc-SCP2-2:1 No - lnc-ECHDC2-2:1 Yes chr2L:18831229-18833630 lnc-SLC1A7-3:1 No - lnc-C1orf123-3:1 Yes chr2L:9333567-9341925 lnc-C1orf123-2:1 Yes chr2L:9333567-9341925 lnc-MAGOH-3:2 Yes chr2R:13219396-13220251 lnc-MAGOH-3:1 Yes chr2R:13219396-13220251 lnc-MAGOH-2:1 Yes chr2R:13219396-13220251 lnc-MAGOH-2:2 Yes chr2R:13219396-13220251 lnc-CPT2-2:2 No - lnc-CPT2-3:3 No - lnc-LRP8-4:1 Yes chr3R:25698727-25740465 lnc-CPT2-4:2 Yes chr3R:25698727-25740465 lnc-CPT2-8:1 Yes chr3R:25698727-25740465 lnc-MAGOH-4:1 Yes chr3R:25698727-25740465 lnc-LRP8-1:3 No - lnc-LRP8-2:4 No - lnc-LRP8-2:3 No - lnc-LRP8-2:2 No - lnc-GLIS1-2:2 No - lnc-GLIS1-2:3 No - lnc-GLIS1-2:1 No - lnc-GLIS1-1:4 No - lnc-DMRTB1-2:1 No - lnc-YIPF1-1:2 Yes chr3L:4621219-4622985 lnc-DIO1-1:1 No - lnc-HSPB11-3:3 Yes chrX:12909953-12912070 lnc-YIPF1-2:2 No - lnc-YIPF1-2:1 No - lnc-YIPF1-3:1 No - lnc-HSPB11-2:1 No - lnc-TCEANC2-4:1 No - lnc-TCEANC2-2:1 No - lnc-TCEANC2-2:2 No - lnc-LDLRAD1-2:2 No - lnc-LDLRAD1-9:1 No - lnc-LDLRAD1-2:1 No - lnc-MRPL37-6:1 No - lnc-CDCP2-6:1 No - lnc-CDCP2-1:3 Yes chrX:19192219-19193448 lnc-CDCP2-5:1 No - lnc-CDCP2-2:2 No - lnc-TCEANC2-5:1 No - lnc-CYB5RL-4:5 Yes chr3R:18192494-18199595 lnc-CYB5RL-4:1 Yes chr3R:18192494-18199595 SSBP3-AS1:2 Yes chr3R:18192494-18199595 lnc-CYB5RL-4:4 Yes chr3R:18192494-18199595 lnc-CYB5RL-4:3 Yes chr3R:18192494-18199595 lnc-CYB5RL-4:2 Yes chr3R:18192494-18199595 lnc-MRPL37-1:6 Yes chr3R:18192494-18199595 lnc-CYB5RL-2:2 Yes chr3R:18192494-18199595 lnc-ACOT11-4:1 No - lnc-MROH7-2:1 Yes chrX:9275318-9283117 lnc-LEXM-1:1 No - lnc-LEXM-1:3 No - lnc-LEXM-2:6 No - lnc-USP24-3:6 No - lnc-DHCR24-2:1 No - lnc-DHCR24-3:1 No - lnc-PCSK9-1:2 No - lnc-PCSK9-1:3 No - lnc-PCSK9-7:1 No - lnc-USP24-5:1 No - lnc-USP24-4:1 No - lnc-PCSK9-8:1 No - lnc-PCSK9-9:2 No - lnc-PCSK9-4:4 No - lnc-PCSK9-4:5 No - lnc-PRKAA2-11:1 No - lnc-PLPP3-8:1 No - LINC01755:4 No - lnc-PRKAA2-10:1 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-PLPP3-12:22 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-PLPP3-12:19 Yes chr2R:9400531-9413463 LINC01767:13 Yes chr2R:9400531-9413463 LINC01767:17 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-FYB2-5:1 Yes chr2R:9400531-9417846 lnc-PRKAA2-9:1 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-PLPP3-2:3 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-FYB2-4:1 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-FYB2-3:1 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-PLPP3-2:2 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-PRKAA2-8:1 Yes chrX:1375536-1378896 lnc-PLPP3-6:1 No - lnc-DAB1-2:1 No - lnc-C8B-1:3 No - lnc-C8B-1:2 No - lnc-C8A-1:2 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-C8A-1:3 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-C8A-1:4 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-C8B-4:1 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-C8A-1:5 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-C8A-1:6 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-C8A-1:7 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-C8B-2:1 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-C8B-3:1 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-OMA1-4:1 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:1 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:2 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:7 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:8 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:11 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:15 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:16 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:20 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:21 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:22 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:23 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:24 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:25 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:26 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:27 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:28 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:29 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:33 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-C8A-8:1 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-C8A-9:1 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-OMA1-3:1 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-TACSTD2-4:1 No - lnc-TACSTD2-3:1 No - lnc-OMA1-1:1 No - lnc-TACSTD2-1:1 No - lnc-MYSM1-1:1 No - lnc-FGGY-11:1 No - lnc-TACSTD2-2:4 Yes chr2L:11130737-11136003 lnc-TACSTD2-2:2 Yes chr2L:11130737-11136003 lnc-TACSTD2-2:1 Yes chr2L:11130737-11136003 lnc-JUN-11:1 Yes chr2L:11130737-11136003 lnc-JUN-10:1 Yes chr2L:11130737-11136003 lnc-FGGY-6:3 No - lnc-FGGY-6:4 No - lnc-FGGY-10:1 No - LINC01135:1 No - LINC01135:3 No - LINC01135:6 No - LINC01135:22 No - LINC01135:24 No - LINC01135:8 No - lnc-JUN-8:1 No - lnc-JUN-9:1 No - lnc-JUN-2:3 No - lnc-JUN-2:4 No - lnc-JUN-12:3 No - lnc-JUN-12:1 No - LINC01358:9 No - lnc-JUN-5:5 No - lnc-JUN-5:7 No - lnc-JUN-5:8 No - LINC01358:14 No - lnc-JUN-6:10 No - lnc-HOOK1-7:3 Yes chr3L:4022700-4026011 lnc-HOOK1-6:1 Yes chr3L:4022700-4026011 lnc-HOOK1-5:1 Yes chr3L:4022700-4026011 lnc-HOOK1-1:2 Yes chr3L:4022700-4026011 lnc-HOOK1-4:1 Yes chrX:18688538-18693042 lnc-C1orf87-4:1 No - lnc-C1orf87-5:1 No - lnc-C1orf87-6:1 No - lnc-NFIA-2:1 No - LINC01748:27 No - NFIA-AS2:6 Yes chr4:268175-276369 lnc-TM2D1-6:1 Yes chr4:268175-276369 lnc-PATJ-2:2 Yes chr4:268175-276369 NFIA-AS1:2 Yes chr4:268175-276369 NFIA-AS1:4 Yes chr4:268175-276369 lnc-PATJ-6:1 Yes chr4:268175-276369 lnc-TM2D1-5:1 No - lnc-TM2D1-3:1 No - lnc-KANK4-7:8 Yes chr2R:21383227-21384391 lnc-KANK4-7:3 Yes chr2R:21383227-21384391 lnc-KANK4-7:6 Yes chr2R:21383227-21384391 lnc-KANK4-7:7 Yes chr2R:21383227-21384391 lnc-KANK4-7:4 Yes chr2R:21383227-21384391 lnc-KANK4-7:2 Yes chr2R:21383227-21384391 lnc-KANK4-7:5 Yes chr2R:21383227-21384391 lnc-KANK4-7:1 Yes chr2R:21383227-21384391 lnc-TM2D1-4:1 Yes chr3R:18330932-18360728 lnc-L1TD1-6:1 Yes chr3R:18330932-18360728 lnc-L1TD1-5:1 Yes chr3R:18330932-18360728 lnc-L1TD1-7:1 Yes chr3R:18330932-18360728 lnc-L1TD1-2:1 No - lnc-L1TD1-1:1 No - lnc-KANK4-2:1 No - lnc-L1TD1-3:1 No - lnc-ANGPTL3-1:1 Yes chr2L:94739-102086 lnc-KANK4-3:1 Yes chr2L:94739-102086 lnc-KANK4-4:1 Yes chr2L:94739-102086 lnc-ANGPTL3-2:1 Yes chr2L:94739-102086 lnc-DOCK7-2:2 No - lnc-DOCK7-2:3 No - lnc-DOCK7-2:1 Yes chr3R:15353720-15356924 lnc-ANGPTL3-5:1 Yes chr3R:15353720-15356924 lnc-ATG4C-4:1 No - lnc-ATG4C-5:1 No - lnc-ATG4C-3:2 No - lnc-DOCK7-4:1 No - LINC00466:9 No - lnc-FOXD3-1:2 No - lnc-FOXD3-1:3 No - LINC00466:5 No - lnc-FOXD3-5:1 No - LINC00466:8 No - LINC00466:1 No - FOXD3-AS1:10 No - lnc-FOXD3-4:1 Yes chr2R:22868159-22870706 lnc-ITGB3BP-5:10 No - lnc-ITGB3BP-5:7 No - lnc-ITGB3BP-5:8 No - lnc-ITGB3BP-5:9 No - lnc-ITGB3BP-5:4 No - lnc-ITGB3BP-5:3 No - lnc-ITGB3BP-5:6 No - lnc-ITGB3BP-5:5 No - lnc-EFCAB7-3:1 No - lnc-ITGB3BP-5:1 No - lnc-DOCK7-6:1 No - lnc-PGM1-1:4 No - lnc-DOCK7-7:1 No - lnc-EFCAB7-2:1 Yes chr3L:16126018-16128531 lnc-EFCAB7-4:1 Yes chr3L:16126018-16128531 lnc-ITGB3BP-6:1 No - lnc-ITGB3BP-7:1 Yes chr2L:10251843-10254686 lnc-ITGB3BP-10:1 Yes chr2L:10251843-10254686 ROR1-AS1:4 Yes chr2L:10251843-10254686 ROR1-AS1:5 Yes chr2L:10251843-10254686 lnc-ROR1-2:1 Yes chr2L:10251843-10254686 lnc-ROR1-1:2 No - lnc-UBE2U-1:1 No - lnc-ITGB3BP-12:1 Yes chrX:11360930-11368098 lnc-ITGB3BP-13:1 Yes chrX:11360930-11368098 lnc-RAVER2-2:1 Yes chrX:11360930-11368098 lnc-RAVER2-3:1 Yes chrX:11360930-11368098 LINC01359:8 No - LINC01359:7 No - lnc-AK4-2:1 No - lnc-JAK1-6:1 No - lnc-JAK1-7:1 Yes chr3R:10887345-10889588 lnc-DNAJC6-2:1 Yes chr3R:10887345-10889588 lnc-JAK1-8:1 Yes chr3R:4211783-4227518 lnc-JAK1-3:2 Yes chr3R:4211783-4227518 lnc-JAK1-9:1 No - lnc-LEPR-1:1 No - lnc-JAK1-10:1 No - lnc-PDE4B-1:1 No - lnc-INSL5-1:1 Yes chr3L:149679-152589 lnc-SLC35D1-9:1 No - lnc-SLC35D1-9:2 No - lnc-IL23R-1:1 No - lnc-IL12RB2-4:2 No - lnc-C1orf141-2:1 Yes chr3R:25123373-25125619 lnc-IL12RB2-6:1 No - lnc-SERBP1-1:1 No - LINC01702:20 No - LINC01702:23 No - lnc-GADD45A-5:1 No - lnc-GADD45A-4:1 No - lnc-GNG12-2:1 No - lnc-GNG12-1:1 No - lnc-DIRAS3-2:1 No - lnc-GADD45A-6:1 No - lnc-WLS-1:1 Yes chr3R:9784653-9789323 lnc-DIRAS3-1:1 Yes chr3L:11166620-11169625 lnc-GADD45A-10:1 Yes chr3L:11166620-11169625 lnc-GADD45A-7:1 No - lnc-RPE65-3:1 No - lnc-RPE65-2:1 No - lnc-RPE65-1:1 No - lnc-DEPDC1-3:1 No - lnc-LRRC7-7:1 No - lnc-DEPDC1-4:1 No - lnc-LRRC7-6:1 No - LINC01758:4 No - lnc-LRRC40-6:1 Yes chr2R:14935660-14940722 lnc-SRSF11-3:1 Yes chr2R:14935660-14940722 lnc-SRSF11-2:1 Yes chr2R:14935660-14940722 lnc-LRRC40-4:1 Yes chr2R:14935660-14940722 lnc-ANKRD13C-2:1 Yes chr3R:13695263-13700838 lnc-LRRC7-5:3 Yes chr2L:9912911-9915044 lnc-LRRC40-3:1 Yes chr2R:18148096-18151410 lnc-LRRC40-5:1 Yes chr2R:18148096-18151410 lnc-CTH-11:2 No - lnc-ANKRD13C-3:1 No - lnc-CTH-10:1 No - lnc-PTGER3-9:1 No - LINC01788:6 No - lnc-PTGER3-8:1 No - lnc-CTH-2:2 No - lnc-CTH-12:1 No - lnc-ZRANB2-3:1 No - lnc-ZRANB2-2:1 No - lnc-CTH-13:1 No - lnc-PTGER3-7:2 Yes chr2R:22638807-22640201 lnc-PTGER3-7:1 Yes chr2R:22638807-22640201 lnc-PTGER3-7:4 Yes chr2R:22638807-22640201 lnc-PTGER3-7:3 Yes chr2R:22638807-22640201 ZRANB2-AS2:4 Yes chr3L:5424109-5442399 ZRANB2-AS2:11 No - ZRANB2-AS2:19 Yes chr3L:5424109-5442399 ZRANB2-AS2:24 No - ZRANB2-AS2:25 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-NEGR1-2:1 No - ZRANB2-AS2:29 Yes chr3L:5424109-5442399 ZRANB2-AS2:30 Yes chr3L:5424109-5442399 ZRANB2-AS2:31 Yes chr3L:5424109-5442399 ZRANB2-AS2:32 Yes chr3L:5424109-5442399 ZRANB2-AS2:33 Yes chr3L:5424109-5442399 ZRANB2-AS2:36 Yes chr3L:5424109-5442399 ZRANB2-AS2:38 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-ZRANB2-4:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-NEGR1-3:1 No - lnc-NEGR1-4:1 No - lnc-FPGT-12:1 No - lnc-FPGT-6:2 No - lnc-FPGT-5:3 No - lnc-FPGT-4:2 No - lnc-FPGT-11:1 No - lnc-NEGR1-5:1 No - lnc-FPGT-10:1 No - lnc-NEGR1-6:1 No - lnc-FPGT-9:1 No - lnc-FPGT-9:3 No - lnc-FPGT-9:4 No - lnc-FPGT-9:5 No - lnc-FPGT-9:6 No - lnc-LRRIQ3-1:1 No - LINC01360:1 No - lnc-FPGT-8:1 No - lnc-FPGT-8:2 No - lnc-LRRC53-2:3 No - lnc-LRRC53-2:2 No - lnc-LRRC53-2:1 No - lnc-FPGT-1:3 No - lnc-FPGT-1:5 No - lnc-FPGT-1:6 No - ERICH3-AS1:1 No - lnc-ERICH3-1:1 No - lnc-TNNI3K-4:1 No - lnc-LHX8-1:2 No - lnc-ACADM-2:1 Yes chr3R:29123370-29128247 lnc-ACADM-1:1 Yes chr3R:29123370-29128247 lnc-SLC44A5-4:3 No - lnc-SLC44A5-4:4 No - lnc-SLC44A5-4:2 No - lnc-RABGGTB-1:1 No - lnc-RABGGTB-2:1 No - lnc-MSH4-1:1 No - lnc-ST6GALNAC3-1:2 No - lnc-ST6GALNAC3-1:3 No - lnc-ST6GALNAC3-1:4 No - lnc-ASB17-2:1 Yes chr2R:24691422-24694386 lnc-PIGK-4:1 Yes chr2R:24691422-24694386 lnc-ST6GALNAC5-2:1 No - lnc-USP33-7:1 Yes chrX:2007911-2009364 lnc-AK5-1:3 No - lnc-PIGK-3:1 No - lnc-AK5-1:14 No - lnc-USP33-2:2 Yes chr2L:6959099-6960328 lnc-USP33-2:1 Yes chr2L:6959099-6960328 lnc-USP33-1:1 Yes chr2L:6959099-6960328 lnc-USP33-1:3 Yes chr2L:6959099-6960328 lnc-AK5-3:1 Yes chr2L:6959099-6960328 lnc-USP33-1:2 Yes chr2L:6959099-6960328 lnc-FUBP1-1:4 Yes chr2R:14239932-14243655 lnc-FUBP1-58:2 Yes chr2R:14239932-14243655 lnc-FUBP1-58:1 Yes chr2R:14239932-14243655 lnc-FUBP1-56:4 Yes chr2R:14239932-14243655 lnc-FUBP1-56:1 Yes chr2R:14239932-14243655 lnc-FUBP1-56:2 Yes chr2R:14239932-14243655 lnc-FUBP1-6:2 Yes chr2R:14239932-14243655 lnc-FUBP1-6:3 Yes chr2R:14239932-14243655 lnc-NEXN-1:1 Yes chrX:8433923-8437820 NEXN-AS1:2 No - lnc-FUBP1-2:2 Yes chr2R:16861321-16867714 lnc-FUBP1-2:4 Yes chr2R:16861321-16867714 lnc-FUBP1-2:8 Yes chr2R:16861321-16867714 lnc-FUBP1-2:9 Yes chr2R:16861321-16867714 lnc-FUBP1-2:6 Yes chr2R:16861321-16867714 lnc-FUBP1-2:3 Yes chr2R:16861321-16867714 lnc-FUBP1-2:5 Yes chr2R:16861321-16867714 lnc-FUBP1-2:7 Yes chr2R:16861321-16867714 lnc-FUBP1-2:1 Yes chr2R:16861321-16867714 lnc-DNAJB4-1:1 No - lnc-FUBP1-4:1 No - lnc-PTGFR-1:9 No - lnc-IFI44-4:1 No - lnc-ADGRL4-1:2 No - lnc-IFI44-7:1 No - lnc-IFI44-2:6 No - lnc-ADGRL4-5:3 No - lnc-IFI44-1:2 No - lnc-IFI44-1:3 No - lnc-ADGRL4-9:1 No - lnc-ADGRL4-10:1 No - lnc-IFI44-8:1 No - lnc-ADGRL4-11:1 No - lnc-ADGRL4-12:1 No - lnc-ADGRL2-11:2 No - lnc-ADGRL4-13:1 No - lnc-ADGRL2-10:5 No - lnc-ADGRL2-10:6 No - lnc-ADGRL2-10:7 No - lnc-ADGRL4-14:1 No - LINC01781:11 No - LINC01781:12 No - LINC01781:19 No - lnc-ADGRL2-8:2 No - lnc-ADGRL2-7:2 No - lnc-ADGRL2-6:2 No - lnc-ADGRL2-4:3 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-ADGRL2-4:4 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-TTLL7-8:2 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-TTLL7-15:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-PRKACB-11:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-TTLL7-14:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-ADGRL2-5:2 No - lnc-TTLL7-13:1 No - lnc-ADGRL2-9:3 No - lnc-ADGRL2-9:4 No - lnc-TTLL7-12:2 No - lnc-TTLL7-12:1 No - LINC01362:2 No - LINC01361:2 No - lnc-ADGRL2-12:2 No - lnc-PRKACB-7:1 No - LINC01725:49 No - LINC01712:8 No - LINC01712:9 No - lnc-PRKACB-2:2 No - lnc-PRKACB-2:3 No - LINC01725:52 No - LINC01725:51 No - LINC01725:48 No - LINC01725:50 No - lnc-TTLL7-11:1 No - LINC01725:28 No - LINC01725:29 No - lnc-GNG5-8:1 No - lnc-GNG5-7:2 No - lnc-GNG5-7:1 No - lnc-GNG5-6:1 No - lnc-TTLL7-9:1 No - lnc-TTLL7-3:2 No - lnc-SAMD13-2:1 Yes chr2L:9682315-9699297 lnc-PRKACB-5:1 No - lnc-GNG5-1:10 Yes chrX:2698701-2701033 lnc-GNG5-1:2 No - lnc-GNG5-5:1 No - lnc-SPATA1-1:1 No - lnc-SPATA1-1:2 No - lnc-CTBS-1:1 No - lnc-CTBS-2:1 No - lnc-CTBS-3:1 No - lnc-SPATA1-2:2 No - lnc-CTBS-4:10 No - lnc-CTBS-4:12 No - lnc-SSX2IP-3:1 No - lnc-CTBS-5:1 No - lnc-CTBS-6:1 No - lnc-SPATA1-4:1 No - lnc-LPAR3-1:1 Yes chr3L:19714418-19718328 lnc-MCOLN2-1:1 Yes chr3L:19714418-19718328 lnc-MCOLN3-1:1 Yes chr3L:7583454-7587248 lnc-MCOLN2-2:1 Yes chr3L:7583454-7587248 lnc-SYDE2-1:1 No - lnc-C1orf52-2:1 Yes chr3R:31812609-31846570 lnc-CYR61-3:3 No - lnc-CYR61-5:1 Yes chrX:13294473-13302415 lnc-BCL10-1:1 Yes chrX:13294473-13302415 lnc-ZNHIT6-1:5 Yes chrX:13294473-13302415 lnc-ZNHIT6-1:1 Yes chrX:13294473-13302415 lnc-ZNHIT6-1:2 Yes chrX:13294473-13302415 lnc-ZNHIT6-1:4 Yes chrX:13294473-13302415 lnc-ZNHIT6-1:3 Yes chrX:13294473-13302415 lnc-WDR63-5:1 Yes chr3L:17690015-17748839 lnc-CYR61-1:2 No - lnc-CYR61-2:2 No - lnc-CLCA2-1:1 No - lnc-ODF2L-3:1 No - lnc-COL24A1-2:1 No - lnc-COL24A1-3:1 No - lnc-COL24A1-3:2 No - lnc-ODF2L-2:1 No - lnc-ODF2L-1:2 No - lnc-SELENOF-6:1 Yes chr3L:17654617-17655645 lnc-SELENOF-6:3 Yes chr3L:17654617-17655645 lnc-SELENOF-6:2 Yes chr3L:17654617-17655645 lnc-SELENOF-7:1 Yes chr2L:19442833-19444750 lnc-SELENOF-8:1 No - lnc-LMO4-4:1 No - lnc-SELENOF-10:2 Yes chr2L:19442833-19444750 lnc-SELENOF-9:1 Yes chr2L:19442833-19444750 lnc-SELENOF-11:1 No - lnc-SELENOF-4:2 No - lnc-SELENOF-13:1 No - lnc-SELENOF-14:1 No - lnc-LMO4-1:2 No - lnc-LMO4-1:4 No - lnc-GTF2B-8:1 No - lnc-GTF2B-15:2 Yes chr2R:9252310-9285097 lnc-GTF2B-15:5 No - lnc-PKN2-3:1 No - lnc-GTF2B-7:1 No - lnc-GTF2B-6:1 Yes chr2R:9252310-9285097 lnc-GBP6-5:1 Yes chr2R:9252310-9285097 lnc-GTF2B-2:4 Yes chr2L:10431338-10433116 lnc-GTF2B-2:3 Yes chr2L:10431338-10433116 lnc-KYAT3-1:1 No - lnc-PKN2-5:1 No - lnc-GBP1-1:1 No - lnc-GBP3-1:1 No - lnc-GBP3-2:1 No - lnc-GBP2-1:2 No - lnc-GBP2-1:1 No - lnc-GBP6-3:1 No - lnc-GBP7-1:2 No - lnc-GBP7-1:1 No - lnc-GBP4-1:1 No - lnc-LRRC8C-4:1 No - lnc-LRRC8C-5:1 No - lnc-GBP5-9:1 No - LRRC8C-DT:37 No - LRRC8C-DT:53 No - LRRC8C-DT:54 No - LRRC8C-DT:50 No - lnc-GBP5-10:1 No - lnc-LRRC8D-8:1 No - lnc-GBP5-3:4 No - lnc-GBP5-3:3 No - lnc-GBP5-3:2 No - lnc-LRRC8C-3:4 No - lnc-LRRC8D-5:1 No - lnc-GBP5-12:1 No - lnc-ZNF326-2:1 No - lnc-BARHL2-6:1 No - lnc-BARHL2-4:4 No - lnc-BARHL2-4:3 No - lnc-BARHL2-4:2 No - lnc-ZNF326-3:1 No - lnc-ZNF326-4:1 No - lnc-ZNF644-1:13 No - lnc-ZNF644-1:15 No - lnc-ZNF644-1:9 No - lnc-ZNF644-1:10 No - lnc-ZNF644-1:11 No - LINC01763:11 No - lnc-ZNF644-1:14 No - lnc-BARHL2-5:2 No - lnc-BARHL2-5:5 No - lnc-BARHL2-5:6 No - lnc-BARHL2-5:4 No - lnc-BARHL2-5:1 No - lnc-BARHL2-5:3 No - lnc-HFM1-2:1 No - lnc-HFM1-2:2 No - lnc-CDC7-2:1 No - lnc-HFM1-3:3 No - lnc-SETSIP-5:1 No - lnc-SETSIP-3:2 No - lnc-BRDT-1:1 No - lnc-EPHX4-4:1 Yes chrX:8037808-8061436 lnc-EPHX4-4:2 Yes chrX:8037808-8061436 lnc-EPHX4-4:3 Yes chrX:8037808-8061436 lnc-EPHX4-4:4 Yes chrX:8037808-8061436 lnc-EPHX4-2:6 No - lnc-C1orf146-1:1 No - lnc-GLMN-1:1 No - lnc-RPAP2-1:2 Yes chr2L:9890061-9890772 lnc-GFI1-1:1 No - lnc-RPAP2-2:1 No - lnc-RPAP2-3:1 No - lnc-EVI5-1:1 Yes chr2L:6821934-6838995 lnc-GFI1-2:1 Yes chrX:11430523-11454386 lnc-FAM69A-2:1 Yes chrX:11430523-11454386 lnc-RPL5-4:1 Yes chrX:11430523-11454386 lnc-FAM69A-2:2 Yes chrX:11430523-11454386 lnc-RPL5-2:1 Yes chrX:11430523-11454386 lnc-RPL5-3:1 No - lnc-RPL5-3:2 No - lnc-FAM69A-1:1 No - lnc-MTF2-2:1 No - lnc-TMED5-3:1 No - lnc-TMED5-4:1 No - CCDC18-AS1:43 No - CCDC18-AS1:33 No - CCDC18-AS1:2 No - CCDC18-AS1:39 No - CCDC18-AS1:35 No - CCDC18-AS1:36 No - CCDC18-AS1:30 No - CCDC18-AS1:17 No - CCDC18-AS1:3 Yes chr2L:15007813-15008538 lnc-DR1-1:3 No - CCDC18-AS1:22 No - CCDC18-AS1:15 No - CCDC18-AS1:16 No - lnc-DR1-3:1 No - lnc-BCAR3-1:1 No - lnc-FNBP1L-1:6 Yes chr2L:6007364-6012338 lnc-DNTTIP2-5:1 Yes chr2L:6007364-6012338 lnc-FNBP1L-3:1 Yes chr2L:6007364-6012338 lnc-DNTTIP2-1:2 Yes chr2L:6007364-6012338 lnc-DNTTIP2-1:3 Yes chr2L:6007364-6012338 lnc-FNBP1L-2:2 Yes chr2L:6007364-6012338 lnc-FNBP1L-2:3 No - lnc-FNBP1L-2:7 No - lnc-GCLM-4:1 Yes chr3R:7472458-7473781 lnc-DNTTIP2-2:1 Yes chr3R:22685006-22686510 lnc-FNBP1L-5:1 No - lnc-GCLM-1:1 No - lnc-GCLM-2:1 No - lnc-GCLM-3:1 No - lnc-GCLM-5:1 No - lnc-GCLM-6:1 No - lnc-GCLM-7:1 No - lnc-GCLM-8:1 No - lnc-GCLM-9:1 No - lnc-ABCD3-8:1 No - lnc-ARHGAP29-4:1 No - lnc-ARHGAP29-3:1 No - lnc-ABCD3-7:1 No - lnc-ARHGAP29-2:1 No - lnc-ABCD3-6:1 No - lnc-ABCA4-1:1 No - lnc-ABCA4-2:1 No - lnc-ABCD3-2:10 No - lnc-ABCD3-2:5 No - lnc-ABCD3-2:6 No - lnc-ABCD3-5:1 No - lnc-ARHGAP29-5:1 No - lnc-ARHGAP29-6:1 No - lnc-F3-5:1 No - lnc-ARHGAP29-7:1 No - lnc-ABCD3-1:2 No - lnc-F3-7:24 No - lnc-F3-7:23 No - lnc-F3-7:22 No - lnc-F3-4:1 No - lnc-F3-7:21 No - lnc-F3-7:19 No - lnc-F3-7:18 No - lnc-SLC44A3-2:4 No - lnc-F3-7:16 No - lnc-F3-7:9 No - lnc-ALG14-8:1 Yes chr3L:4114289-4122388 lnc-SLC44A3-1:11 No - lnc-SLC44A3-1:12 No - lnc-SLC44A3-1:13 No - lnc-SLC44A3-1:14 No - lnc-SLC44A3-1:15 No - lnc-SLC44A3-1:16 No - lnc-SLC44A3-1:17 No - lnc-ALG14-6:2 No - lnc-ALG14-7:1 No - lnc-ALG14-9:2 No - lnc-ALG14-9:3 No - lnc-RWDD3-9:1 No - lnc-ALG14-2:2 No - lnc-RWDD3-1:3 No - lnc-RWDD3-1:4 No - lnc-RWDD3-1:5 No - lnc-RWDD3-1:6 No - lnc-RWDD3-1:7 No - LINC01760:8 No - LINC01760:9 No - LINC01650:4 No - lnc-RWDD3-5:6 No - lnc-RWDD3-5:18 No - lnc-RWDD3-5:19 No - lnc-RWDD3-5:25 No - lnc-RWDD3-5:27 No - lnc-RWDD3-5:28 No - lnc-RWDD3-12:1 No - lnc-RWDD3-6:2 No - lnc-RWDD3-7:8 No - lnc-RWDD3-7:9 No - lnc-RWDD3-7:10 No - lnc-RWDD3-7:11 No - lnc-RWDD3-7:12 No - lnc-DPYD-9:1 No - lnc-PTBP2-7:1 No - lnc-PTBP2-6:1 No - lnc-DPYD-8:1 No - lnc-PTBP2-1:3 No - lnc-PTBP2-3:1 No - lnc-DPYD-7:1 No - lnc-DPYD-7:2 No - lnc-DPYD-6:1 No - lnc-PTBP2-10:1 Yes chrX:9196808-9201820 lnc-PLPPR5-5:3 Yes chrX:9196808-9201820 lnc-SNX7-12:1 Yes chrX:9196808-9201820 lnc-PLPPR5-13:1 Yes chrX:9196808-9201820 lnc-SNX7-11:1 Yes chrX:9196808-9201820 MIR137HG:16 Yes chrX:9196808-9201820 MIR137HG:18 Yes chrX:9196808-9201820 MIR137HG:1 Yes chrX:9196808-9201820 lnc-SNX7-10:1 Yes chrX:9196808-9201820 MIR137HG:2 Yes chrX:9196808-9201820 lnc-SNX7-9:1 No - lnc-SNX7-8:1 No - lnc-SNX7-7:1 No - MIR137HG:7 No - MIR137HG:8 No - MIR137HG:5 No - MIR137HG:6 No - lnc-SNX7-6:1 No - LINC01776:25 No - LINC01776:30 No - lnc-FRRS1-5:1 No - lnc-SNX7-4:1 No - lnc-PLPPR5-2:2 No - lnc-PALMD-1:1 No - lnc-SASS6-5:2 Yes chr2R:16017737-16024627 lnc-SASS6-5:1 Yes chr2R:16017737-16024627 lnc-FRRS1-3:1 Yes chr2R:16017737-16024627 lnc-SASS6-2:12 Yes chr2R:21312399-21319569 lnc-SLC35A3-3:1 No - lnc-SLC35A3-2:1 No - lnc-SLC35A3-5:1 No - lnc-SASS6-2:2 No - lnc-SLC35A3-1:3 No - lnc-MFSD14A-2:1 Yes chr3R:29995357-29997034 lnc-TRMT13-1:1 Yes chr3R:29995357-29997034 lnc-TRMT13-2:1 Yes chrX:15086125-15088629 lnc-RTCA-2:1 Yes chrX:15086125-15088629 lnc-RTCA-1:1 No - lnc-DBT-4:1 No - lnc-DBT-5:1 Yes chr2L:7801668-7810703 lnc-DBT-6:1 Yes chr2L:7801668-7810703 lnc-EXTL2-3:1 No - LINC01349:1 No - lnc-VCAM1-2:1 No - lnc-VCAM1-1:2 No - lnc-DPH5-3:3 No - lnc-DPH5-3:2 No - lnc-DPH5-2:6 Yes chr3R:22582028-22583225 lnc-DPH5-2:8 Yes chr3R:22582028-22583225 lnc-DPH5-2:1 Yes chr3R:22582028-22583225 lnc-DPH5-2:3 Yes chr3R:22582028-22583225 lnc-DPH5-2:5 Yes chr3R:22582028-22583225 lnc-DPH5-2:7 Yes chr3R:22582028-22583225 lnc-DPH5-2:2 Yes chr3R:22582028-22583225 lnc-DPH5-2:4 Yes chr3R:22582028-22583225 lnc-SLC30A7-2:9 Yes chr3R:22582028-22583225 lnc-SLC30A7-2:10 Yes chr3R:22582028-22583225 lnc-SLC30A7-2:11 Yes chr3R:22582028-22583225 lnc-SLC30A7-2:12 Yes chr3R:22582028-22583225 lnc-SLC30A7-2:13 Yes chr3R:22582028-22583225 lnc-SLC30A7-4:1 No - lnc-SLC30A7-5:1 No - lnc-SLC30A7-2:14 No - lnc-SLC30A7-2:15 No - lnc-SLC30A7-6:1 No - lnc-SLC30A7-7:1 No - lnc-SLC30A7-2:16 No - lnc-SLC30A7-2:17 No - lnc-SLC30A7-2:18 No - lnc-SLC30A7-2:19 No - lnc-S1PR1-9:1 No - lnc-S1PR1-9:2 No - lnc-S1PR1-9:3 No - lnc-S1PR1-2:5 No - lnc-S1PR1-7:1 No - lnc-DPH5-1:2 No - lnc-DPH5-4:1 No - lnc-DPH5-5:1 No - lnc-S1PR1-6:1 No - lnc-S1PR1-8:1 No - LINC01307:1 No - LINC01307:6 No - lnc-OLFM3-4:1 No - lnc-S1PR1-10:1 No - lnc-S1PR1-11:1 No - LINC01709:8 No - lnc-S1PR1-13:1 No - lnc-S1PR1-12:1 No - lnc-S1PR1-13:2 No - lnc-OLFM3-3:1 No - lnc-COL11A1-3:1 No - lnc-AMY1B-6:1 No - lnc-AMY1B-5:1 No - lnc-AMY1B-4:1 No - lnc-RNPC3-8:1 No - lnc-COL11A1-2:2 No - lnc-COL11A1-2:1 No - lnc-RNPC3-7:1 No - lnc-RNPC3-4:1 No - lnc-AMY1C-3:1 No - lnc-AMY1C-2:2 No - lnc-AMY1C-2:4 No - lnc-AMY1B-8:3 No - lnc-AMY1B-8:2 No - lnc-PRMT6-11:1 No - lnc-AMY1B-2:3 No - LINC01676:34 No - LINC01676:35 No - LINC01676:36 No - LINC01676:37 No - LINC01676:32 No - LINC01676:38 No - LINC01676:24 No - LINC01676:31 No - lnc-PRMT6-10:1 No - lnc-VAV3-10:2 No - lnc-VAV3-10:1 No - lnc-PRMT6-9:1 No - lnc-VAV3-7:1 No - lnc-VAV3-6:1 No - lnc-VAV3-5:1 No - lnc-PRMT6-8:1 No - lnc-PRMT6-6:1 No - lnc-VAV3-4:1 No - lnc-VAV3-3:1 No - lnc-PRMT6-5:2 Yes chrX:14604012-14653928 lnc-NTNG1-1:1 Yes chrX:14604012-14653928 lnc-NTNG1-2:1 No - lnc-SLC25A24-1:2 Yes chrX:19261820-19273280 lnc-SLC25A24-1:1 Yes chrX:19261820-19273280 lnc-NTNG1-3:1 Yes chrX:19261820-19273280 lnc-NTNG1-3:2 Yes chrX:19261820-19273280 VAV3-AS1:15 No - lnc-NBPF6-2:2 Yes chr3L:12402295-12414842 lnc-NBPF6-8:2 No - lnc-NBPF4-2:1 No - lnc-NBPF6-7:1 No - lnc-FAM102B-3:1 Yes chr2R:12145710-12152752 lnc-FAM102B-3:2 Yes chr2R:12145710-12152752 lnc-FAM102B-3:3 No - lnc-HENMT1-2:1 Yes chrX:13297082-13299910 lnc-STXBP3-2:1 No - lnc-AKNAD1-3:1 Yes chr3L:4136359-4138996 lnc-AKNAD1-1:3 No - lnc-AKNAD1-1:2 No - SPATA42:2 No - lnc-WDR47-1:2 No - lnc-WDR47-1:1 No - lnc-CLCC1-1:1 Yes chr2R:23925236-23926911 lnc-TMEM167B-3:1 Yes chr2R:23925236-23926911 lnc-TMEM167B-1:1 No - lnc-TMEM167B-1:2 No - lnc-TAF13-3:1 No - lnc-MYBPHL-1:1 No - lnc-SORT1-3:1 Yes chr3L:3172817-3178580 lnc-PSMA5-1:2 No - lnc-PSMA5-1:4 No - lnc-PSMA5-1:3 No - lnc-PSMA5-1:1 No - lnc-SORT1-1:1 Yes chr2R:17412767-17413769 lnc-SORT1-2:1 Yes chr2R:17412767-17413769 lnc-SORT1-4:1 Yes chr2R:17412767-17413769 lnc-GNAI3-3:1 No - lnc-GNAI3-2:1 No - lnc-AMIGO1-2:1 No - lnc-AMIGO1-2:2 No - lnc-GSTM4-3:1 No - lnc-GSTM3-5:1 No - lnc-GSTM3-3:2 No - lnc-GSTM3-3:1 No - lnc-GSTM3-4:2 No - lnc-GSTM3-4:1 No - lnc-GSTM5-1:7 No - lnc-EPS8L3-2:1 No - lnc-ALX3-4:1 Yes chr3L:2768466-2772325 lnc-STRIP1-2:1 No - LINC02586:8 No - RBM15-AS1:33 No - lnc-RBM15-1:1 No - LAMTOR5-AS1:2 No - LAMTOR5-AS1:3 No - LAMTOR5-AS1:19 No - LAMTOR5-AS1:24 No - LAMTOR5-AS1:25 No - LAMTOR5-AS1:28 No - LAMTOR5-AS1:29 No - LAMTOR5-AS1:34 No - LAMTOR5-AS1:40 No - LAMTOR5-AS1:41 No - LAMTOR5-AS1:42 No - LAMTOR5-AS1:54 No - LAMTOR5-AS1:56 No - lnc-LAMTOR5-2:2 No - LAMTOR5-AS1:60 No - lnc-LAMTOR5-3:2 No - lnc-KCNA10-2:1 No - lnc-PROK1-2:1 No - lnc-PROK1-2:2 No - lnc-PROK1-2:3 No - lnc-KCNA3-2:1 Yes chrX:17924307-18063247 lnc-KCNA3-3:3 No - lnc-KCNA3-3:2 No - lnc-KCNA3-3:6 No - lnc-CD53-4:1 No - lnc-PROK1-4:8 No - lnc-LRIF1-2:1 No - lnc-DENND2D-2:5 Yes chrX:2076966-2078455 lnc-DENND2D-2:7 Yes chrX:2076966-2078455 lnc-DENND2D-2:6 Yes chrX:2076966-2078455 lnc-DENND2D-2:4 Yes chrX:2076966-2078455 lnc-DENND2D-2:1 No - lnc-DENND2D-2:2 No - lnc-DENND2D-2:3 No - lnc-CHIA-1:1 No - lnc-OVGP1-4:1 No - lnc-PIFO-2:2 No - lnc-WDR77-4:1 Yes chr3L:3090985-3106958 lnc-WDR77-3:1 Yes chr3L:3090985-3106958 lnc-ATP5PB-2:1 No - lnc-WDR77-2:1 Yes chr3L:9729999-9731224 lnc-ADORA3-5:1 Yes chr3R:30134856-30149606 lnc-WDR77-6:1 Yes chr3R:30134856-30149606 LINC01160:4 Yes chr3L:1859115-1862239 lnc-FAM212B-2:1 No - lnc-DDX20-6:1 No - lnc-KCND3-3:1 No - INKA2-AS1:22 No - lnc-FAM212B-5:2 No - lnc-FAM212B-5:4 No - lnc-FAM212B-5:1 No - lnc-FAM212B-3:1 Yes chr3L:19566851-19584568 lnc-DDX20-5:1 Yes chr3L:19566851-19584568 KCND3-AS1:1 Yes chr3L:19566851-19584568 KCND3-AS1:3 Yes chr3L:19566851-19584568 lnc-KCND3-4:2 Yes chr3L:19566851-19584568 lnc-FAM212B-4:1 Yes chr3L:19566851-19584568 LINC01750:14 No - lnc-DDX20-4:2 No - lnc-CTTNBP2NL-3:1 No - lnc-CTTNBP2NL-2:1 No - lnc-WNT2B-2:1 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-CTTNBP2NL-4:1 No - lnc-ST7L-3:13 No - lnc-ST7L-3:14 No - lnc-ST7L-3:15 No - lnc-ST7L-3:2 No - lnc-ST7L-3:12 Yes chr3L:20806868-20809272 lnc-ST7L-3:10 Yes chr3L:20806868-20809272 lnc-ST7L-3:5 No - lnc-ST7L-3:6 No - lnc-ST7L-3:9 Yes chr3L:20806868-20809272 lnc-ST7L-3:7 Yes chr3L:20806868-20809272 lnc-ST7L-3:8 Yes chr3L:20806868-20809272 lnc-ST7L-3:11 Yes chr3L:20806868-20809272 lnc-ST7L-3:4 No - lnc-ST7L-3:3 No - lnc-ST7L-5:2 Yes chr2R:21057787-21059883 lnc-ST7L-5:1 Yes chr2R:21057787-21059883 lnc-ST7L-5:3 Yes chr2R:21057787-21059883 lnc-ST7L-8:1 Yes chr2R:21057787-21059883 lnc-CAPZA1-1:1 No - lnc-CAPZA1-1:2 No - lnc-MOV10-2:1 Yes chr2R:21057787-21059883 lnc-MOV10-1:1 No - lnc-PPM1J-6:1 No - lnc-RHOC-2:1 Yes chrX:22534831-22540383 lnc-FAM19A3-1:2 No - lnc-FAM19A3-6:1 No - LINC01356:7 No - lnc-FAM19A3-5:1 No - LINC01356:3 No - lnc-FAM19A3-6:2 No - lnc-FAM19A3-2:3 No - lnc-FAM19A3-7:1 No - lnc-FAM19A3-7:2 No - lnc-PPM1J-1:1 No - lnc-PPM1J-2:1 No - SLC16A1-AS1:2 No - SLC16A1-AS1:3 No - SLC16A1-AS1:10 No - SLC16A1-AS1:11 No - SLC16A1-AS1:13 No - SLC16A1-AS1:14 No - lnc-SLC16A1-3:1 No - SLC16A1-AS1:16 No - lnc-LRIG2-5:1 No - SLC16A1-AS1:19 No - lnc-SLC16A1-2:3 No - lnc-SLC16A1-5:1 No - lnc-LRIG2-6:1 No - lnc-SLC16A1-6:1 No - lnc-SLC16A1-6:2 No - lnc-LRIG2-10:1 Yes chr2R:21129463-21142261 lnc-RSBN1-5:1 Yes chr2R:6741899-6746141 lnc-RSBN1-4:1 Yes chr2R:6741899-6746141 lnc-RSBN1-3:2 Yes chr2R:6741899-6746141 lnc-RSBN1-3:1 Yes chr2R:6741899-6746141 lnc-PHTF1-1:1 Yes chr2R:6741899-6746141 lnc-RSBN1-1:1 Yes chr2L:18833710-18839679 lnc-RSBN1-2:1 No - lnc-BCL2L15-3:1 No - lnc-BCL2L15-1:1 No - lnc-BCL2L15-2:1 No - lnc-HIPK1-1:1 Yes chr3R:5555084-5557786 lnc-OLFML3-3:1 No - lnc-SYT6-2:2 No - lnc-SYT6-2:1 No - lnc-OLFML3-2:1 No - lnc-SYT6-3:1 No - lnc-OLFML3-4:1 No - lnc-OLFML3-5:1 No - lnc-BCAS2-4:2 Yes chr3R:20593139-20612540 lnc-BCAS2-4:1 Yes chr3R:20593139-20612540 lnc-SYCP1-3:1 Yes chr3R:20593139-20612540 lnc-BCAS2-3:1 No - lnc-SYCP1-2:1 No - lnc-DENND2C-1:1 No - lnc-AMPD1-1:1 No - lnc-NRAS-1:1 Yes chr3L:8432322-8442381 lnc-SIKE1-2:2 Yes chr3L:8432322-8442381 lnc-SIKE1-2:1 Yes chr3L:8432322-8442381 lnc-SYCP1-1:1 No - lnc-TSHB-5:2 No - lnc-NGF-2:1 Yes chr3R:25872900-25881427 LINC01765:10 No - NGF-AS1:9 No - lnc-VANGL1-4:1 No - lnc-VANGL1-3:1 No - lnc-CASQ2-1:1 No - lnc-VANGL1-2:1 No - lnc-NHLH2-3:1 No - lnc-SLC22A15-4:1 No - LINC01649:12 No - lnc-SLC22A15-3:1 No - lnc-CD58-7:5 No - lnc-CD58-4:3 No - lnc-CD58-7:3 No - lnc-CD58-7:8 No - lnc-CD58-7:4 No - lnc-CD58-7:6 No - lnc-CD58-7:7 No - lnc-ATP1A1-3:1 No - lnc-CD58-3:3 No - lnc-CD58-6:2 No - ATP1A1-AS1:1 Yes chr3R:20948714-20976239 ATP1A1-AS1:4 Yes chr3R:20948714-20976239 ATP1A1-AS1:5 Yes chr3R:20948714-20976239 ATP1A1-AS1:3 Yes chr3R:20948714-20976239 ATP1A1-AS1:7 Yes chr3R:20948714-20976239 lnc-CD58-2:3 No - LINC01762:43 No - LINC01762:48 No - LINC01762:32 No - LINC01762:45 No - LINC01762:33 No - lnc-ATP1A1-2:1 No - lnc-IGSF3-2:2 No - lnc-ATP1A1-1:2 No - lnc-IGSF3-3:1 No - lnc-IGSF3-4:1 No - lnc-CD101-1:1 No - lnc-TRIM45-1:3 No - lnc-TTF2-2:2 No - lnc-VTCN1-2:1 No - LINC01525:2 No - LINC01525:3 No - lnc-VTCN1-3:1 No - lnc-FAM46C-5:1 Yes chrX:10266792-10325958 lnc-FAM46C-3:1 Yes chrX:10266792-10325958 lnc-FAM46C-2:1 Yes chrX:10266792-10325958 lnc-GDAP2-1:11 No - lnc-GDAP2-1:10 No - lnc-GDAP2-8:1 Yes chr2R:7716807-7782637 lnc-GDAP2-3:3 Yes chr2R:7716807-7782637 lnc-GDAP2-3:1 Yes chr2R:7716807-7782637 lnc-GDAP2-2:1 Yes chr2R:7716807-7782637 lnc-SPAG17-1:2 No - lnc-SPAG17-1:1 No - lnc-GDAP2-5:1 No - lnc-GDAP2-6:1 No - lnc-GDAP2-7:1 No - lnc-TBX15-6:1 No - lnc-TBX15-3:2 No - lnc-TBX15-3:1 No - lnc-TBX15-1:3 No - lnc-WARS2-3:1 No - lnc-HAO2-10:1 No - WARS2-IT1:1 Yes chr3L:17849727-17852453 lnc-TBX15-4:1 Yes chr3L:17849727-17852453 lnc-HAO2-2:8 Yes chr3L:17849727-17852453 lnc-HAO2-2:9 Yes chr3L:17849727-17852453 lnc-TBX15-5:1 Yes chr3L:17849727-17852453 lnc-HAO2-2:12 No - lnc-HAO2-2:13 No - lnc-WARS2-4:1 No - lnc-HAO2-8:1 No - lnc-HAO2-7:1 No - lnc-HAO2-6:1 No - lnc-HAO2-5:1 No - lnc-HAO2-2:14 No - lnc-HAO2-2:15 No - lnc-HAO2-4:1 No - lnc-WARS2-2:3 No - LINC01780:16 No - LINC01780:19 No - lnc-WARS2-5:2 No - lnc-WARS2-5:1 No - lnc-HAO2-3:1 No - lnc-WARS2-6:2 Yes chr2R:10883547-10884936 lnc-WARS2-6:1 Yes chr2R:10883547-10884936 lnc-ZNF697-4:1 No - lnc-ZNF697-3:1 No - LINC00622:1 No - lnc-ZNF697-2:1 No - lnc-PHGDH-3:1 No - lnc-FCGR1B-11:2 No - lnc-FAM72B-7:3 No - lnc-FCGR1B-12:2 No - lnc-SRGAP2C-5:3 No - lnc-SRGAP2C-13:1 No - lnc-FAM72B-4:7 No - lnc-SRGAP2C-14:1 No - lnc-FAM72B-8:12 No - lnc-SRGAP2C-15:1 No - lnc-SRGAP2C-15:2 No - lnc-SRGAP2C-16:1 No - lnc-SMIM11B-5:4 No - lnc-NUDT4B-1:2 No - lnc-PPIAL4G-11:1 No - lnc-HIST2H3PS2-12:1 No - lnc-PPIAL4F-12:1 No - lnc-PPIAL4F-12:2 No - lnc-PPIAL4F-12:3 No - lnc-FAM72D-3:1 No - lnc-PPIAL4F-1:4 No - lnc-PPIAL4F-1:3 No - lnc-PPIAL4D-19:7 No - lnc-NBPF20-3:2 No - lnc-NBPF14-3:1 No - lnc-PDE4DIP-4:1 No - lnc-PDE4DIP-1:2 No - lnc-PDE4DIP-3:1 No - lnc-NUDT4B-8:1 No - lnc-NUDT4B-8:2 No - lnc-NBPF9-3:1 No - lnc-NBPF9-4:1 No - lnc-NBPF14-4:1 No - lnc-PDE4DIP-5:1 No - lnc-NOTCH2NL-2:2 No - LINC01719:37 No - LINC01719:35 No - LINC01719:34 No - LINC01719:25 No - lnc-HFE2-1:1 No - lnc-HFE2-2:2 Yes chr3R:7804665-7810014 lnc-POLR3GL-4:1 No - lnc-POLR3GL-3:3 No - lnc-RBM8A-1:1 No - lnc-POLR3GL-5:5 Yes chr2R:9110799-9111578 lnc-PEX11B-2:1 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-PEX11B-3:1 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-ANKRD35-2:1 Yes chr2R:9116122-9122000 lnc-PIAS3-1:1 Yes chr3R:9006456-9008030 lnc-PDZK1-2:1 Yes chr2R:17394593-17405171 lnc-RNF115-1:1 Yes chr2R:17394593-17405171 lnc-NBPF11-1:15 No - lnc-NBPF11-1:14 No - lnc-NBPF11-1:13 No - lnc-NBPF11-1:8 No - lnc-NBPF11-1:10 No - lnc-NBPF11-1:7 No - lnc-NBPF11-1:12 No - lnc-NBPF12-1:1 No - lnc-NBPF12-1:2 No - lnc-PRKAB2-7:1 No - lnc-PRKAB2-6:1 No - lnc-PRKAB2-5:1 No - lnc-PRKAB2-4:1 No - lnc-CHD1L-4:1 No - lnc-PRKAB2-3:2 Yes chr2R:9135375-9137933 lnc-PRKAB2-3:4 Yes chr2R:9135375-9137933 lnc-CHD1L-2:1 Yes chr2R:6642418-6645098 lnc-BCL9-5:1 No - LINC00624:5 No - lnc-GJA8-4:1 No - lnc-BCL9-4:1 No - lnc-BCL9-4:2 No - lnc-BCL9-4:4 No - lnc-GJA5-3:1 No - lnc-GJA8-2:1 Yes chr2R:15199065-15201200 lnc-GPR89B-1:3 No - lnc-GPR89B-9:1 No - lnc-NBPF11-5:1 No - lnc-GJA5-4:8 No - lnc-GJA5-5:1 No - lnc-GPR89B-3:3 No - lnc-GPR89B-3:4 No - lnc-GPR89B-3:5 No - lnc-GPR89B-3:6 No - lnc-GPR89B-3:7 No - lnc-GPR89B-3:8 No - lnc-GPR89B-3:9 No - lnc-NBPF11-1:42 No - lnc-NBPF11-1:35 No - lnc-GPR89B-10:1 No - lnc-GPR89B-10:2 No - lnc-GPR89B-11:1 No - lnc-GPR89B-11:2 No - lnc-NBPF11-7:1 No - LINC01138:45 No - LINC01138:43 No - LINC01138:44 No - lnc-GPR89B-6:2 No - lnc-PPIAL4G-5:17 No - lnc-PPIAL4G-4:16 No - lnc-PPIAL4G-3:6 No - LINC01138:7 No - lnc-NBPF26-1:4 No - lnc-FAM72B-16:3 No - lnc-NBPF14-2:1 No - lnc-NBPF15-7:1 No - lnc-NBPF15-4:2 No - lnc-NBPF15-4:3 No - lnc-NBPF15-4:8 No - lnc-PPIAL4F-9:1 No - lnc-NBPF15-5:1 No - lnc-NBPF26-1:5 No - lnc-HIST2H3PS2-14:1 No - lnc-PPIAL4F-5:1 No - lnc-HIST2H3PS2-14:3 No - lnc-HIST2H3PS2-3:2 No - lnc-HIST2H3PS2-3:3 No - lnc-HIST2H3PS2-3:4 No - lnc-HIST2H3PS2-3:13 No - lnc-PPIAL4F-7:1 No - lnc-HIST2H3PS2-11:1 No - lnc-HIST2H3PS2-11:2 No - lnc-PPIAL4F-13:1 No - lnc-PPIAL4F-3:5 No - lnc-PPIAL4F-4:8 No - lnc-PPIAL4F-11:1 No - lnc-PPIAL4F-10:1 No - LINC02591:16 No - LINC02591:17 No - lnc-PPIAL4F-2:1 No - lnc-HIST2H3PS2-5:1 No - lnc-PPIAL4F-2:2 No - lnc-PPIAL4F-2:3 No - lnc-HIST2H3PS2-10:1 No - lnc-FAM72C-3:1 No - lnc-NBPF26-1:6 No - lnc-HIST2H2BF-5:2 No - lnc-FCGR1A-3:2 No - lnc-HIST2H2BF-3:1 No - lnc-HIST2H2BF-2:1 No - lnc-FCGR1A-1:1 Yes chr2L:21418112-21418706 lnc-HIST2H4A-1:1 No - lnc-HIST2H4B-1:1 No - lnc-SF3B4-1:1 Yes chrX:14832647-14836262 lnc-SF3B4-1:2 Yes chrX:14832647-14836262 lnc-VPS45-6:1 No - lnc-VPS45-5:1 No - lnc-CA14-3:1 No - lnc-CA14-2:1 No - lnc-CA14-1:1 No - lnc-APH1A-1:4 No - lnc-APH1A-1:3 No - lnc-APH1A-1:5 No - lnc-APH1A-1:6 Yes chr2L:2766233-2767281 lnc-APH1A-1:1 No - lnc-MCL1-6:2 No - FALEC:1 No - lnc-ADAMTSL4-4:1 No - lnc-MCL1-5:2 No - lnc-MCL1-7:2 No - lnc-MCL1-2:1 No - lnc-MCL1-2:2 No - lnc-MCL1-1:1 No - lnc-ENSA-4:2 No - lnc-ADAMTSL4-5:1 Yes chr3L:14029579-14031706 lnc-ENSA-1:1 Yes chr3L:14029579-14031706 lnc-ENSA-1:2 Yes chr3L:14029579-14031706 lnc-ADAMTSL4-7:1 No - lnc-HORMAD1-2:1 Yes chr2L:2226342-2231099 lnc-GOLPH3L-2:1 No - lnc-HORMAD1-1:1 No - lnc-CTXND2-7:2 No - lnc-CTXND2-6:2 Yes chr2R:13960675-13967981 lnc-CTSK-1:1 Yes chr3R:9016773-9020022 lnc-CTSK-2:2 Yes chr3R:9016773-9020022 lnc-CTSK-2:1 Yes chr3R:9016773-9020022 lnc-CTXND2-5:2 No - lnc-ARNT-1:1 No - lnc-SETDB1-4:1 No - lnc-SETDB1-2:1 No - lnc-MINDY1-1:4 No - lnc-MINDY1-1:3 No - lnc-CERS2-1:1 No - lnc-CDC42SE1-1:5 Yes chr3R:5616644-5624125 lnc-CDC42SE1-1:4 Yes chr3R:5616644-5624125 lnc-CDC42SE1-1:3 Yes chr3R:5616644-5624125 lnc-CDC42SE1-1:2 No - lnc-GABPB2-1:1 Yes chr3L:324985-327992 lnc-SEMA6C-1:2 No - lnc-LYSMD1-3:1 Yes chr2R:17672839-17683499 lnc-LYSMD1-2:1 Yes chr2R:17672839-17683499 lnc-LYSMD1-2:2 Yes chr2R:17672839-17683499 lnc-LYSMD1-1:1 Yes chr2R:17672839-17683499 lnc-SEMA6C-3:1 No - lnc-TMOD4-1:1 No - lnc-VPS72-2:2 Yes chr2L:10970443-10972093 lnc-VPS72-2:1 Yes chr2L:10970443-10972093 lnc-VPS72-1:1 Yes chr2R:22874769-22881436 lnc-PI4KB-1:4 No - lnc-PI4KB-1:2 No - lnc-RFX5-3:1 Yes chr3L:305393-319884 lnc-RFX5-2:1 Yes chr3L:305393-319884 lnc-ZNF687-4:1 No - lnc-PI4KB-2:1 Yes chr3R:6449944-6456676 lnc-SELENBP1-1:1 Yes chr3R:6449944-6456676 lnc-SELENBP1-2:1 Yes chr2R:15206527-15213634 lnc-SELENBP1-3:1 Yes chr2R:15206527-15213634 lnc-PSMB4-2:1 Yes chr2R:15206527-15213634 lnc-CELF3-2:1 Yes chrX:5719374-5738031 lnc-CELF3-1:1 No - lnc-OAZ3-8:1 No - lnc-OAZ3-7:1 No - lnc-OAZ3-6:1 Yes chr3R:15330738-15331588 lnc-OAZ3-5:1 No - lnc-TDRKH-1:4 Yes chr3R:15330738-15331588 lnc-TDRKH-1:5 Yes chr3R:15330738-15331588 lnc-TDRKH-1:3 No - lnc-TDRKH-1:2 No - lnc-TDRKH-1:1 No - lnc-MRPL9-2:1 No - lnc-LINGO4-2:1 Yes chr2L:2220748-2225544 TDRKH-AS1:20 Yes chr2L:2220748-2225544 TDRKH-AS1:23 No - TDRKH-AS1:25 No - lnc-LINGO4-1:1 Yes chr2R:10203995-10237348 lnc-OAZ3-2:4 No - lnc-S100A10-1:1 No - lnc-S100A11-2:3 No - lnc-S100A11-2:2 No - lnc-S100A11-2:1 No - lnc-OAZ3-3:2 No - lnc-OAZ3-3:3 No - lnc-OAZ3-3:5 No - lnc-S100A11-1:1 No - lnc-OAZ3-14:1 No - lnc-TCHHL1-1:1 No - FLG-AS1:28 No - lnc-HRNR-1:1 No - lnc-FLG2-2:1 No - lnc-FLG2-1:1 No - FLG-AS1:8 No - FLG-AS1:9 No - lnc-LCE3D-1:1 No - lnc-LCE3D-1:2 No - lnc-LCE3A-1:1 No - LINC00302:3 No - lnc-C1orf68-2:1 No - lnc-KPRP-1:1 No - lnc-SPRR4-1:1 No - lnc-SPRR4-1:2 No - lnc-SPRR1A-2:1 No - lnc-SPRR1B-1:1 No - lnc-SPRR2G-1:1 No - lnc-SPRR2G-1:3 No - lnc-SPRR2G-1:2 No - lnc-SPRR2G-1:4 No - lnc-SPRR2G-2:1 No - lnc-LOR-4:1 No - lnc-S100A12-3:1 Yes chrX:15801153-15803880 lnc-S100A12-1:1 No - lnc-S100A12-2:1 No - lnc-S100A7L2-1:1 No - lnc-S100A6-1:1 No - lnc-S100A5-1:1 No - lnc-S100A16-1:2 No - lnc-S100A13-2:7 No - lnc-S100A13-2:3 No - lnc-S100A13-2:5 No - lnc-S100A13-2:4 No - lnc-S100A13-2:1 No - lnc-NPR1-1:1 No - lnc-ILF2-1:1 No - lnc-CREB3L4-5:1 Yes chr3L:10664739-10690734 lnc-CREB3L4-1:2 Yes chr3L:10664739-10690734 lnc-CREB3L4-1:3 No - lnc-DENND4B-1:1 Yes chrX:8592031-8602036 lnc-DENND4B-1:3 Yes chrX:8592031-8602036 lnc-DENND4B-1:2 Yes chrX:8592031-8602036 lnc-CRTC2-2:1 Yes chrX:8592031-8602036 lnc-DENND4B-2:1 No - lnc-DENND4B-3:1 No - lnc-DENND4B-3:2 No - lnc-SLC39A1-1:1 No - lnc-CRTC2-1:1 Yes chr2R:6718196-6719533 lnc-RAB13-1:1 No - lnc-RAB13-1:2 No - lnc-CREB3L4-4:2 No - lnc-JTB-1:2 No - lnc-RPS27-2:1 Yes chr2R:5760862-5774324 lnc-RPS27-2:2 Yes chr2R:5760862-5774324 lnc-RPS27-3:1 Yes chr2R:5760862-5774324 lnc-NUP210L-2:3 Yes chr3R:15310193-15315197 lnc-NUP210L-2:4 Yes chr3R:15310193-15315197 lnc-NUP210L-1:1 Yes chr3R:15310193-15315197 lnc-NUP210L-2:5 Yes chr3R:15310193-15315197 lnc-NUP210L-2:1 Yes chr3R:15310193-15315197 lnc-C1orf189-3:1 Yes chr3R:15310193-15315197 lnc-C1orf189-1:1 Yes chr2R:16957465-16958927 lnc-C1orf189-2:1 Yes chr2R:16957465-16958927 lnc-HAX1-3:1 Yes chr2R:8067977-8078815 lnc-C1orf43-4:1 Yes chr2R:8067977-8078815 lnc-HAX1-6:1 Yes chr2R:8067977-8078815 lnc-SHE-3:1 No - lnc-ADAR-2:2 Yes chrX:2264657-2270761 lnc-ADAR-2:4 Yes chrX:2264657-2270761 lnc-ADAR-2:1 Yes chrX:2264657-2270761 lnc-ADAR-2:3 Yes chrX:2264657-2270761 lnc-UBE2Q1-1:1 No - lnc-UBE2Q1-2:1 No - lnc-ADAR-3:4 No - lnc-ADAR-3:3 No - lnc-ADAR-3:5 No - lnc-CHRNB2-2:1 No - lnc-CHRNB2-3:1 No - lnc-ADAR-4:2 Yes chrX:5340236-5405138 lnc-ADAR-4:1 Yes chrX:5340236-5405138 lnc-CKS1B-4:1 No - lnc-PMVK-1:1 No - lnc-PYGO2-2:2 No - lnc-PYGO2-2:1 No - lnc-CKS1B-2:1 No - lnc-PYGO2-1:1 No - lnc-SHC1-1:1 Yes chr2L:9330763-9331981 lnc-DCST2-2:1 No - DCST1-AS1:23 No - DCST1-AS1:16 No - DCST1-AS1:24 No - DCST1-AS1:25 Yes chr3L:13174478-13176781 DCST1-AS1:17 No - lnc-SLC50A1-2:1 No - lnc-SLC50A1-2:2 No - lnc-KRTCAP2-1:7 No - lnc-KRTCAP2-1:4 No - lnc-KRTCAP2-1:6 No - lnc-KRTCAP2-1:2 No - lnc-KRTCAP2-1:1 No - lnc-KRTCAP2-1:5 No - lnc-KRTCAP2-1:3 No - lnc-MUC1-2:2 No - lnc-MUC1-2:1 No - lnc-THBS3-2:3 Yes chr2L:6686791-6709086 lnc-MUC1-1:1 Yes chr2L:6686791-6709086 lnc-GBA-1:1 No - lnc-FAM189B-3:1 Yes chr3R:23704804-23708512 lnc-FAM189B-2:1 Yes chr3R:23704804-23708512 lnc-FAM189B-2:2 Yes chr3R:23704804-23708512 lnc-SCAMP3-1:1 No - lnc-FAM189B-1:1 No - lnc-CLK2-2:3 Yes chrX:15446179-15449883 lnc-CLK2-2:1 Yes chrX:15446179-15449883 lnc-CLK2-2:2 Yes chrX:15446179-15449883 lnc-CLK2-1:1 No - lnc-CLK2-1:2 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-FDPS-3:2 No - lnc-FDPS-1:1 No - RUSC1-AS1:3 No - lnc-PKLR-3:1 Yes chr3L:19590773-19598755 lnc-RUSC1-2:1 Yes chr3L:19590773-19598755 lnc-YY1AP1-6:1 Yes chr3L:19590773-19598755 ASH1L-AS1:1 Yes chr3L:19590773-19598755 lnc-ASH1L-3:1 No - lnc-MSTO1-3:1 No - lnc-YY1AP1-3:1 Yes chrX:21388977-21391533 lnc-YY1AP1-2:1 No - lnc-GON4L-1:1 Yes chr2R:16948296-16955266 lnc-GON4L-1:2 Yes chr2R:16948296-16955266 lnc-YY1AP1-4:1 Yes chr2R:16948296-16955266 lnc-YY1AP1-5:1 Yes chr2R:16948296-16955266 lnc-RIT1-3:1 Yes chr2R:16948296-16955266 lnc-RXFP4-3:1 Yes chr3R:7266065-7270809 lnc-KHDC4-2:2 Yes chr2R:16107440-16110017 lnc-RIT1-1:1 No - lnc-RIT1-1:2 No - lnc-RIT1-2:1 No - lnc-KHDC4-1:2 No - lnc-ARHGEF2-1:3 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-SSR2-2:4 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-SSR2-2:3 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-SSR2-2:2 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-SSR2-2:1 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-ARHGEF2-1:2 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-ARHGEF2-3:4 Yes chr3L:16129617-16130983 lnc-ARHGEF2-3:3 Yes chr3L:16129617-16130983 lnc-ARHGEF2-3:1 Yes chr3L:16129617-16130983 lnc-ARHGEF2-3:2 Yes chr3L:16129617-16130983 lnc-SSR2-1:1 Yes chrX:19683808-19687658 lnc-UBQLN4-1:1 Yes chr4:671142-690650 lnc-RAB25-1:4 Yes chr2L:5542480-5546642 lnc-RAB25-1:5 Yes chr2L:5542480-5546642 lnc-MEX3A-1:1 Yes chr2L:5542480-5546642 lnc-RAB25-2:1 Yes chr2L:5542480-5546642 lnc-SEMA4A-1:2 Yes chr2L:5542480-5546642 lnc-LMNA-3:1 No - lnc-PAQR6-2:1 Yes chr2L:13898828-13904661 lnc-PAQR6-3:1 Yes chr2L:13898828-13904661 lnc-PAQR6-4:1 Yes chr2L:13898828-13904661 lnc-GLMP-1:3 No - lnc-GLMP-1:5 No - lnc-GLMP-1:4 No - lnc-GLMP-1:2 No - lnc-GLMP-1:1 No - lnc-VHLL-2:1 Yes chr3R:16647605-16649978 lnc-C1orf61-2:30 No - lnc-C1orf61-2:31 No - lnc-C1orf61-2:10 No - lnc-C1orf61-2:15 No - lnc-C1orf61-2:21 No - lnc-C1orf61-2:27 No - lnc-C1orf61-2:24 No - lnc-C1orf61-2:20 No - lnc-C1orf61-2:26 No - lnc-C1orf61-2:28 No - lnc-C1orf61-2:17 No - lnc-C1orf61-2:23 No - lnc-C1orf61-2:25 No - lnc-C1orf61-2:18 No - lnc-C1orf61-2:22 No - lnc-C1orf61-2:13 No - lnc-C1orf61-2:14 No - lnc-C1orf61-2:11 No - lnc-C1orf61-2:19 No - lnc-C1orf61-2:16 No - lnc-C1orf61-2:9 No - lnc-C1orf61-2:12 No - lnc-C1orf61-2:7 No - lnc-C1orf61-2:5 No - lnc-IQGAP3-2:3 Yes chr2R:9913496-9958858 lnc-IQGAP3-2:2 Yes chr2R:9913496-9958858 lnc-IQGAP3-2:1 Yes chr2R:9913496-9958858 lnc-TTC24-1:6 No - lnc-TTC24-3:1 No - lnc-MEF2D-4:1 No - lnc-GPATCH4-1:8 Yes chr3R:31214776-31215942 lnc-GPATCH4-1:9 Yes chr3R:31214776-31215942 lnc-GPATCH4-1:6 Yes chr3R:31214776-31215942 lnc-GPATCH4-1:4 Yes chr3R:31214776-31215942 lnc-GPATCH4-1:3 Yes chr3R:31214776-31215942 lnc-GPATCH4-1:7 Yes chr3R:31214776-31215942 lnc-GPATCH4-1:5 Yes chr3R:31214776-31215942 lnc-NES-2:1 No - lnc-MRPL24-1:2 No - lnc-MRPL24-1:1 No - lnc-MRPL24-2:1 No - lnc-MRPL24-2:2 No - lnc-INSRR-1:1 No - lnc-SH2D2A-1:1 No - lnc-INSRR-2:1 Yes chr2R:17027190-17044653 lnc-ETV3L-1:1 Yes chr2R:17027190-17044653 lnc-LRRC71-3:1 Yes chr2L:544925-552923 lnc-FCRL5-1:3 No - lnc-FCRL5-1:1 No - lnc-FCRL5-1:2 No - lnc-FCRL5-2:1 No - lnc-FCRL3-3:1 No - lnc-FCRL2-1:1 No - lnc-FCRL1-1:3 No - lnc-FCRL1-1:2 No - lnc-FCRL1-1:4 No - lnc-FCRL1-1:1 No - lnc-KIRREL1-2:1 No - lnc-KIRREL1-2:3 No - lnc-KIRREL1-2:4 No - lnc-CD1B-3:3 No - LINC01704:24 No - lnc-CD1D-2:2 No - lnc-CD1D-1:2 No - lnc-CD1B-1:5 No - lnc-CD1A-1:1 No - lnc-CD1A-1:2 No - lnc-CD1B-4:1 No - lnc-OR10K1-1:1 No - lnc-OR10R2-1:1 No - lnc-OR10X1-4:1 No - lnc-MNDA-1:1 No - lnc-AIM2-2:1 No - lnc-OR10J3-2:1 No - CADM3-AS1:8 No - CADM3-AS1:3 No - CADM3-AS1:7 No - CADM3-AS1:2 No - lnc-APCS-2:1 No - lnc-APCS-1:1 No - lnc-APCS-1:2 No - lnc-APCS-3:1 No - lnc-CRP-1:1 No - lnc-VSIG8-3:1 No - lnc-VSIG8-2:7 No - SNHG28:5 No - lnc-VSIG8-1:1 No - lnc-CFAP45-1:1 No - lnc-TAGLN2-1:1 No - lnc-IGSF9-1:1 Yes chr3L:4114289-4122388 lnc-SLAMF9-1:1 Yes chr2L:4283148-4323781 LINC01133:1 Yes chr3R:23168317-23185642 LINC01133:5 No - lnc-KCNJ10-2:2 No - lnc-KCNJ9-4:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-PEX19-6:1 No - lnc-PEX19-5:1 No - lnc-PEX19-4:4 No - lnc-PEX19-4:1 No - lnc-COPA-1:3 No - lnc-PEX19-1:1 No - lnc-PEX19-2:1 No - lnc-PEX19-3:1 No - lnc-SLAMF7-10:1 No - lnc-SLAMF7-10:2 No - lnc-SLAMF7-6:1 No - lnc-SLAMF7-5:1 No - lnc-ITLN1-1:1 No - lnc-TSTD1-2:1 No - lnc-F11R-1:2 No - lnc-USF1-1:1 No - lnc-TSTD1-1:2 Yes chrX:4544617-4548794 lnc-KLHDC9-5:5 No - lnc-KLHDC9-1:2 No - lnc-PFDN2-1:1 Yes chr3L:11073292-11074388 lnc-DEDD-1:1 No - lnc-NIT1-1:1 No - lnc-NIT1-1:2 No - lnc-ADAMTS4-2:1 Yes chr3R:24660197-24661851 lnc-ADAMTS4-1:4 Yes chr3R:24660197-24661851 lnc-ADAMTS4-1:1 Yes chr3R:24660197-24661851 lnc-ADAMTS4-1:2 Yes chr3R:24660197-24661851 lnc-ADAMTS4-1:3 Yes chr3R:24660197-24661851 lnc-APOA2-2:1 No - lnc-APOA2-1:1 No - lnc-APOA2-1:3 No - lnc-APOA2-1:2 No - lnc-APOA2-1:5 No - lnc-APOA2-1:4 No - lnc-APOA2-3:2 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-APOA2-3:1 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-CFAP126-2:1 No - lnc-CFAP126-2:2 No - lnc-FCGR3A-1:1 No - lnc-FCGR2B-2:1 No - lnc-FCGR2B-5:1 No - lnc-FCGR3B-5:1 No - lnc-FCGR3A-5:1 No - lnc-FCRLB-1:1 No - lnc-FCGR3B-4:17 Yes chrX:19623114-19625729 lnc-FCGR3B-4:3 No - lnc-NOS1AP-2:1 Yes chr2R:5144733-5154756 lnc-OLFML2B-1:3 Yes chr3L:9547220-9596713 lnc-OLFML2B-1:2 Yes chr3L:9547220-9596713 lnc-OLFML2B-1:1 Yes chr3L:9547220-9596713 lnc-SH2D1B-3:1 No - lnc-SH2D1B-2:1 No - lnc-UAP1-4:1 Yes chrX:16356696-16359039 lnc-SH2D1B-4:1 No - lnc-SH2D1B-5:1 No - lnc-DDR2-3:1 No - lnc-UAP1-1:1 No - lnc-UAP1-2:1 No - lnc-UAP1-3:1 No - lnc-HSD17B7-4:1 No - lnc-HSD17B7-1:2 No - lnc-CCDC190-1:2 No - lnc-HSD17B7-2:1 No - lnc-CCDC190-1:1 No - lnc-CCDC190-2:1 No - lnc-RGS5-1:16 Yes chr2R:17792870-17800677 lnc-NUF2-4:1 Yes chr2R:17792870-17800677 lnc-RGS4-1:1 No - lnc-RGS5-1:15 No - lnc-RGS5-1:14 No - lnc-RGS4-2:1 No - lnc-RGS5-2:2 No - lnc-RGS5-2:3 No - lnc-RGS5-3:1 No - lnc-NUF2-5:1 No - lnc-NUF2-7:1 No - lnc-PBX1-5:1 No - lnc-LRRC52-8:1 Yes chrX:15992468-15996509 lnc-LRRC52-9:1 Yes chrX:15992468-15996509 lnc-PBX1-4:1 Yes chrX:15992468-15996509 lnc-LMX1A-7:1 Yes chrX:15992468-15996509 lnc-LRRC52-7:1 Yes chrX:15992468-15996509 lnc-LRRC52-5:1 Yes chrX:15992468-15996509 lnc-LMX1A-6:1 No - lnc-LMX1A-5:1 No - lnc-LMX1A-4:1 No - lnc-RXRG-4:1 Yes chr3L:12290956-12296123 lnc-PBX1-2:3 Yes chr3L:12290956-12296123 lnc-PBX1-2:4 Yes chr3L:12290956-12296123 lnc-PBX1-2:5 Yes chr3L:12290956-12296123 lnc-RXRG-2:1 Yes chrX:2038798-2042311 lnc-RXRG-3:2 Yes chrX:2038798-2042311 lnc-RXRG-3:4 Yes chrX:2038798-2042311 lnc-RXRG-3:3 Yes chrX:2038798-2042311 lnc-RXRG-3:1 Yes chrX:2038798-2042311 lnc-RXRG-1:8 Yes chr2L:13212335-13215350 lnc-RXRG-1:11 No - lnc-RXRG-1:10 Yes chr2L:13212335-13215350 lnc-LRRC52-1:1 No - lnc-RXRG-1:9 Yes chr2L:13212335-13215350 lnc-MGST3-1:2 No - lnc-LRRC52-3:2 No - lnc-LRRC52-2:1 No - lnc-TMCO1-4:1 No - lnc-MGST3-3:1 No - lnc-MGST3-4:1 No - lnc-MGST3-2:3 No - lnc-UCK2-1:2 Yes chr2L:19049076-19049884 lnc-UCK2-1:3 Yes chr2L:19049076-19049884 lnc-UCK2-1:8 Yes chr2L:19049076-19049884 lnc-UCK2-2:5 No - lnc-TMCO1-5:1 No - lnc-FAM78B-3:1 No - lnc-UCK2-3:3 No - lnc-POGK-5:1 No - lnc-POGK-4:1 No - lnc-POGK-2:1 No - lnc-TADA1-3:1 No - lnc-TADA1-3:2 No - lnc-TADA1-1:1 No - lnc-POGK-1:1 Yes chr2L:11992902-11994054 lnc-TADA1-2:3 No - lnc-ILDR2-3:1 No - lnc-DUSP27-3:1 No - lnc-GPA33-2:1 No - lnc-MAEL-101:1 No - lnc-DUSP27-1:1 Yes chr2L:12587625-12628135 lnc-RCSD1-5:1 Yes chr2L:12587625-12628135 lnc-RCSD1-5:2 Yes chr2L:12587625-12628135 lnc-CD247-1:1 No - lnc-CREG1-1:2 Yes chr3R:17393272-17394640 lnc-RCSD1-2:1 No - lnc-ADCY10-2:1 No - lnc-ADCY10-1:1 No - lnc-ADCY10-2:3 No - lnc-ADCY10-2:2 No - lnc-MPZL1-2:1 No - lnc-MPC2-3:1 No - lnc-MPC2-2:1 No - lnc-GPR161-3:2 No - lnc-GPR161-1:1 No - lnc-MPC2-1:1 No - lnc-TIPRL-1:1 No - lnc-SFT2D2-3:1 No - lnc-GPR161-4:1 Yes chr3L:20521009-20522434 lnc-TBX19-2:1 Yes chr3L:20521009-20522434 lnc-XCL2-2:3 No - lnc-XCL2-3:2 No - lnc-XCL1-3:1 No - lnc-XCL2-4:1 No - lnc-ATP1B1-4:1 No - lnc-ATP1B1-3:1 No - lnc-ATP1B1-2:1 No - lnc-ATP1B1-2:2 No - lnc-ATP1B1-1:2 No - lnc-NME7-2:3 No - lnc-NME7-2:4 No - lnc-CCDC181-2:1 Yes chr3R:9679939-9681502 lnc-BLZF1-2:1 No - lnc-BLZF1-2:5 No - lnc-F5-1:1 No - lnc-SELE-1:4 No - lnc-SELE-1:2 No - lnc-SELE-1:3 No - lnc-SELL-1:1 No - lnc-C1orf112-2:1 Yes chr2R:5653676-5656778 lnc-SCYL3-1:1 Yes chrX:11334187-11340084 lnc-SCYL3-2:1 Yes chrX:11334187-11340084 lnc-SCYL3-3:1 Yes chrX:11334187-11340084 LINC01681:5 No - lnc-KIFAP3-4:1 No - lnc-METTL11B-3:1 No - LINC01142:3 No - lnc-KIFAP3-2:5 No - lnc-KIFAP3-2:6 No - lnc-KIFAP3-5:1 No - lnc-FMO2-1:1 No - lnc-FMO4-2:1 No - lnc-MYOC-6:1 No - lnc-MYOC-5:1 No - lnc-FMO4-3:1 No - lnc-MYOC-4:1 No - lnc-MYOC-3:1 No - lnc-MYOCOS-1:1 No - lnc-MYOCOS-2:1 No - lnc-MYOCOS-3:1 No - lnc-MYOCOS-4:1 No - lnc-PRRC2C-5:1 No - lnc-VAMP4-4:2 No - lnc-VAMP4-4:3 No - lnc-VAMP4-2:1 No - lnc-VAMP4-3:1 No - lnc-METTL13-3:1 No - lnc-DNM3-1:1 Yes chr2L:20656426-20659218 lnc-METTL13-5:1 No - lnc-C1orf105-6:1 No - DNM3OS:1 No - DNM3OS:2 No - DNM3OS:3 No - DNM3OS:6 No - lnc-PIGC-5:1 No - lnc-C1orf105-2:1 No - lnc-PIGC-2:4 No - lnc-PIGC-2:5 No - lnc-PIGC-2:3 No - lnc-PIGC-2:1 No - lnc-PIGC-2:2 No - lnc-PIGC-4:1 Yes chr2L:20659132-20675941 lnc-FASLG-4:1 No - lnc-TNFSF18-3:1 No - lnc-TNFSF18-2:1 No - lnc-TNFSF18-1:1 No - lnc-TNFSF18-4:1 No - lnc-PRDX6-4:1 No - lnc-SLC9C2-6:1 No - lnc-SLC9C2-5:1 No - lnc-PRDX6-3:1 No - lnc-TNFSF4-3:8 No - lnc-SLC9C2-3:1 No - lnc-PRDX6-2:1 No - lnc-ANKRD45-2:1 No - lnc-ANKRD45-1:1 No - lnc-ANKRD45-1:2 No - lnc-TEX50-5:1 No - lnc-SLC9C2-4:1 No - lnc-TEX50-4:1 No - lnc-DARS2-4:1 Yes chr3L:15826888-15832004 lnc-KLHL20-3:1 No - lnc-CENPL-7:2 No - lnc-CENPL-7:4 No - lnc-CENPL-7:1 No - lnc-CENPL-7:3 No - GAS5:2 Yes chr2L:16827078-16832093 GAS5-AS1:2 No - GAS5:4 No - GAS5:30 No - GAS5:31 No - GAS5:16 No - GAS5:17 No - GAS5:18 No - GAS5:19 No - lnc-ZBTB37-2:1 No - lnc-DARS2-3:2 No - lnc-RC3H1-2:1 Yes chr3L:16370938-16378566 lnc-SERPINC1-4:1 Yes chr3L:16370938-16378566 lnc-SERPINC1-5:1 Yes chr3L:16370938-16378566 lnc-SERPINC1-6:1 Yes chr3L:16370938-16378566 RC3H1-IT1:1 Yes chr3L:16370938-16378566 lnc-RC3H1-1:6 No - lnc-RC3H1-1:5 Yes chr3L:8346561-8352279 lnc-RC3H1-3:1 Yes chr3L:8346561-8352279 lnc-RC3H1-4:1 Yes chr3L:8346561-8352279 lnc-RC3H1-5:1 Yes chr3L:8346561-8352279 lnc-MRPS14-5:1 Yes chr3L:8346561-8352279 lnc-CACYBP-3:1 Yes chr3L:8346561-8352279 lnc-MRPS14-4:1 Yes chr3L:8346561-8352279 lnc-MRPS14-1:3 No - lnc-MRPS14-1:2 Yes chrX:6653113-6654248 lnc-MRPS14-3:2 No - lnc-KIAA0040-2:4 No - lnc-KIAA0040-4:1 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-TNR-3:1 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-TNN-3:1 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-TNN-3:2 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-TNN-4:1 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-TNR-5:1 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-COP1-4:1 No - lnc-COP1-3:1 No - lnc-PAPPA2-7:1 No - lnc-COP1-6:1 No - lnc-COP1-6:2 No - lnc-PAPPA2-6:1 No - lnc-PAPPA2-1:3 No - lnc-COP1-5:1 No - lnc-COP1-2:1 No - lnc-PAPPA2-4:1 No - lnc-PAPPA2-4:2 No - lnc-PAPPA2-4:3 No - lnc-ASTN1-3:1 No - lnc-ASTN1-3:2 No - lnc-BRINP2-3:1 No - lnc-COP1-7:1 No - lnc-COP1-8:1 No - lnc-SEC16B-2:19 Yes chrX:12596047-12609910 lnc-SEC16B-2:14 Yes chrX:12596047-12609910 lnc-SEC16B-2:7 No - lnc-RASAL2-3:1 No - lnc-SEC16B-2:8 No - lnc-SEC16B-2:10 No - lnc-SEC16B-2:3 No - lnc-SEC16B-2:11 No - lnc-SEC16B-2:12 No - lnc-SEC16B-2:6 No - lnc-SEC16B-2:4 No - lnc-SEC16B-2:13 No - lnc-SEC16B-2:9 No - lnc-SEC16B-2:5 No - RASAL2-AS1:1 No - lnc-SEC16B-6:1 Yes chrX:17710144-17752007 lnc-SEC16B-7:1 Yes chrX:17710144-17752007 lnc-ANGPTL1-11:1 No - lnc-CLEC20A-10:1 No - lnc-CLEC20A-8:2 No - lnc-TEX35-2:1 No - lnc-CLEC20A-7:1 No - lnc-TEX35-4:1 No - lnc-TEX35-5:1 No - lnc-TEX35-6:1 No - lnc-CLEC20A-4:1 No - lnc-RALGPS2-4:1 No - lnc-ANGPTL1-2:1 Yes chr2R:16783671-16792472 lnc-FAM20B-2:2 Yes chr2R:16783671-16792472 lnc-ABL2-3:1 No - lnc-ABL2-2:1 Yes chr3R:14879457-14882631 lnc-ABL2-1:1 Yes chrX:4648592-4650032 lnc-ANGPTL1-5:1 Yes chr3L:16615866-16647882 lnc-ANGPTL1-6:1 Yes chr3L:16615866-16647882 lnc-TOR3A-2:1 Yes chr3L:16615866-16647882 lnc-TOR3A-2:2 Yes chr3L:16615866-16647882 lnc-SOAT1-4:1 Yes chr3L:16615866-16647882 lnc-SOAT1-2:1 Yes chr3L:16615866-16647882 lnc-AXDND1-1:1 No - lnc-SOAT1-3:1 No - lnc-SOAT1-3:2 No - lnc-NPHS2-5:1 No - lnc-NPHS2-4:1 No - lnc-TDRD5-3:1 No - lnc-NPHS2-2:1 No - lnc-NPHS2-3:1 No - lnc-FAM163A-1:3 No - lnc-TOR1AIP2-2:4 No - lnc-TOR1AIP2-2:3 No - lnc-TOR1AIP2-2:5 No - lnc-NPHS2-6:1 No - lnc-NPHS2-7:4 No - lnc-NPHS2-7:1 No - lnc-NPHS2-7:2 No - lnc-NPHS2-7:3 No - lnc-TOR1AIP2-5:1 No - lnc-CEP350-2:1 No - lnc-CEP350-3:5 No - lnc-TOR1AIP2-3:4 No - lnc-TOR1AIP2-3:3 No - lnc-TOR1AIP2-6:1 No - lnc-ACBD6-3:2 No - lnc-LHX4-1:1 Yes chr3R:23702761-23704542 LHX4-AS1:7 No - lnc-TOR1AIP2-8:1 Yes chrX:21317936-21319296 lnc-LHX4-2:1 Yes chrX:21317936-21319296 lnc-TOR1AIP2-7:1 Yes chrX:21317936-21319296 lnc-KIAA1614-3:1 Yes chr2L:19890201-19892550 lnc-KIAA1614-1:3 No - lnc-STX6-4:1 No - lnc-KIAA1614-2:2 No - lnc-KIAA1614-6:2 Yes chr2R:11219539-11222480 lnc-ACBD6-7:1 Yes chr2R:11219539-11222480 lnc-IER5-4:1 No - lnc-IER5-3:1 No - lnc-STX6-5:1 No - lnc-STX6-6:1 No - lnc-STX6-7:1 No - LINC01732:11 No - lnc-IER5-5:1 Yes chrX:11931280-11985087 lnc-RGSL1-8:1 Yes chrX:11931280-11985087 lnc-RGSL1-8:2 Yes chrX:11931280-11985087 lnc-ZNF648-4:1 No - lnc-CACNA1E-5:1 No - lnc-CACNA1E-5:3 No - lnc-CACNA1E-4:1 No - lnc-RGSL1-7:1 No - lnc-ZNF648-3:1 No - lnc-RGSL1-6:1 No - LINC01344:2 No - lnc-RGSL1-5:1 No - lnc-RGSL1-4:1 Yes chr2R:17792870-17800677 LINC01686:4 No - lnc-RGS8-6:2 Yes chr2R:17792870-17800677 lnc-RGS8-1:4 Yes chr2R:17792870-17800677 lnc-RGS8-1:3 Yes chr2R:17792870-17800677 LINC01688:7 No - LINC01688:9 No - LINC01688:11 No - lnc-NPL-4:1 No - lnc-NPL-2:1 No - lnc-NPL-2:2 No - lnc-SHCBP1L-1:2 Yes chr2R:5974857-5980778 lnc-SHCBP1L-1:4 No - lnc-SHCBP1L-1:3 No - lnc-SHCBP1L-1:5 No - lnc-DHX9-1:1 No - lnc-RGS8-5:1 Yes chr2L:20093972-20096253 lnc-LAMC1-1:1 No - lnc-LAMC2-3:1 No - SMG7-AS1:3 No - SMG7-AS1:1 No - lnc-ARPC5-2:1 No - lnc-ARPC5-1:1 Yes chr2L:2580292-2581423 lnc-APOBEC4-3:1 Yes chr2L:2580292-2581423 lnc-APOBEC4-2:1 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-APOBEC4-4:1 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-TSEN15-4:1 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-COLGALT2-1:1 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-COLGALT2-6:1 Yes chr2L:5528123-5530682 lnc-APOBEC4-5:1 Yes chr2L:5528123-5530682 lnc-RGL1-3:3 No - lnc-RGL1-1:2 No - lnc-COLGALT2-2:1 No - lnc-C1orf21-4:1 No - lnc-EDEM3-6:1 No - lnc-TSEN15-5:1 No - lnc-EDEM3-3:1 No - lnc-C1orf21-1:2 No - lnc-C1orf21-5:1 No - lnc-C1orf21-6:1 No - lnc-C1orf21-7:1 No - lnc-EDEM3-4:1 No - lnc-EDEM3-5:1 No - lnc-TRMT1L-3:1 Yes chr3R:27680431-27682029 lnc-FAM129A-1:1 No - lnc-TRMT1L-1:1 No - lnc-RNF2-2:1 Yes chrX:18088725-18090509 lnc-TRMT1L-2:1 Yes chrX:18088725-18090509 lnc-IVNS1ABP-4:1 Yes chrX:18088725-18090509 lnc-IVNS1ABP-3:1 No - lnc-TRMT1L-4:1 No - lnc-IVNS1ABP-1:4 No - lnc-SWT1-5:1 No - lnc-SWT1-4:1 No - lnc-HMCN1-4:1 No - LINC01350:11 No - lnc-HMCN1-3:1 Yes chr3L:2117466-2151700 lnc-HMCN1-3:2 Yes chr3L:2117466-2151700 lnc-PRG4-1:1 No - lnc-PDC-1:1 Yes chr2R:11852617-11861202 lnc-PTGS2-1:1 No - lnc-PDC-2:1 No - lnc-PLA2G4A-8:1 No - lnc-PTGS2-2:1 No - lnc-PTGS2-3:1 No - LINC01036:24 No - LINC01036:1 No - lnc-PTGS2-4:1 No - LINC01036:5 No - LINC01036:6 No - LINC01036:28 No - lnc-PTGS2-5:1 No - lnc-PLA2G4A-12:1 No - lnc-PTGS2-6:1 No - lnc-PLA2G4A-13:1 No - lnc-PTGS2-7:1 No - lnc-PTGS2-8:1 No - lnc-PTGS2-9:1 No - lnc-PTGS2-10:1 No - lnc-PLA2G4A-14:1 No - lnc-PLA2G4A-15:1 No - lnc-PLA2G4A-16:2 No - lnc-BRINP3-14:1 No - lnc-PLA2G4A-7:2 No - lnc-PLA2G4A-18:1 No - lnc-BRINP3-5:1 No - lnc-UCHL5-9:2 No - lnc-UCHL5-9:1 No - lnc-RGS18-14:1 No - lnc-UCHL5-8:1 No - LINC01351:1 No - LINC01351:2 No - LINC01351:3 No - LINC01351:4 No - lnc-RGS18-13:1 No - lnc-BRINP3-6:1 No - lnc-RGS18-12:1 No - lnc-RGS18-11:1 No - lnc-BRINP3-7:1 No - lnc-BRINP3-9:1 No - lnc-BRINP3-10:1 No - lnc-BRINP3-11:1 No - lnc-RGS18-9:1 No - lnc-RGS18-1:2 No - lnc-RGS18-8:1 No - lnc-UCHL5-7:1 No - lnc-UCHL5-6:1 No - lnc-UCHL5-5:1 No - lnc-RGS13-1:1 No - lnc-RGS2-3:1 No - lnc-RGS2-2:1 No - lnc-UCHL5-4:1 No - lnc-TROVE2-3:1 No - lnc-TROVE2-3:2 No - lnc-TROVE2-3:3 No - lnc-TROVE2-2:1 No - lnc-GLRX2-2:2 Yes chr3L:9475493-9476965 lnc-CDC73-5:1 No - lnc-B3GALT2-2:1 No - lnc-CDC73-7:1 No - lnc-CDC73-9:1 No - lnc-CDC73-8:1 No - lnc-B3GALT2-3:1 No - lnc-CDC73-10:1 No - lnc-CDC73-11:1 No - lnc-B3GALT2-4:1 No - lnc-B3GALT2-5:1 No - lnc-CDC73-4:2 No - lnc-CDC73-12:1 No - lnc-CDC73-13:1 No - lnc-KCNT2-5:1 No - lnc-KCNT2-2:3 No - lnc-KCNT2-2:2 No - lnc-KCNT2-3:1 No - lnc-CFH-3:1 Yes chr2R:10322195-10416996 lnc-F13B-1:1 No - lnc-ASPM-2:1 No - lnc-ZBTB41-1:5 Yes chr3R:24753849-24760513 lnc-ZBTB41-1:4 No - lnc-ZBTB41-2:1 Yes chr3R:24753849-24760513 lnc-ZBTB41-8:1 Yes chr3R:24753849-24760513 lnc-ZBTB41-1:2 Yes chr2R:10894459-10897222 lnc-CRB1-2:1 No - lnc-CRB1-3:1 No - lnc-CRB1-4:1 No - lnc-CRB1-4:2 No - lnc-ZBTB41-3:2 Yes chr3R:24295078-24314541 lnc-CFHR5-5:1 Yes chr3R:24295078-24314541 lnc-CFHR5-6:1 Yes chr3R:24295078-24314541 lnc-ZBTB41-4:1 Yes chr2R:9123304-9132030 lnc-ZBTB41-5:1 Yes chr2R:9123304-9132030 lnc-DENND1B-6:3 Yes chr2R:9123304-9132030 lnc-DENND1B-6:2 Yes chr2R:9123304-9132030 lnc-DENND1B-6:1 Yes chr2R:9123304-9132030 lnc-ZBTB41-7:1 Yes chr2R:9123304-9132030 lnc-NEK7-1:1 No - lnc-ATP6V1G3-9:1 No - lnc-ATP6V1G3-6:1 No - lnc-NEK7-4:2 No - lnc-ATP6V1G3-7:1 No - lnc-ATP6V1G3-4:4 No - lnc-ATP6V1G3-8:1 No - lnc-PTPRC-4:1 No - lnc-PTPRC-5:1 No - lnc-ATP6V1G3-4:6 No - lnc-PTPRC-6:1 No - lnc-PTPRC-7:1 No - lnc-PTPRC-8:1 No - lnc-NR5A2-9:1 No - lnc-NR5A2-3:1 No - lnc-NR5A2-2:1 No - lnc-NR5A2-7:1 No - lnc-NR5A2-4:1 No - LINC00862:2 No - lnc-NR5A2-5:1 No - lnc-NR5A2-6:1 No - lnc-KIF14-1:2 No - lnc-NR5A2-1:4 No - lnc-NR5A2-1:5 No - lnc-NR5A2-1:6 No - lnc-NR5A2-10:1 No - lnc-ZNF281-2:1 No - lnc-CAMSAP2-4:1 No - lnc-CAMSAP2-1:3 No - lnc-CAMSAP2-3:1 No - lnc-CAMSAP2-2:1 No - lnc-GPR25-1:1 No - lnc-INAVA-1:1 No - lnc-INAVA-1:2 No - lnc-INAVA-1:10 No - lnc-ASCL5-2:1 Yes chr2L:16165831-16190540 lnc-TMEM9-3:1 No - lnc-IGFN1-1:1 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-TNNT2-2:1 No - lnc-TNNT2-1:1 No - lnc-TNNT2-1:2 No - lnc-TNNT2-1:3 No - lnc-TNNT2-1:4 No - lnc-LAD1-1:4 No - lnc-LAD1-1:5 No - lnc-LAD1-1:3 No - lnc-LAD1-1:2 No - lnc-LAD1-1:1 No - lnc-TNNT2-3:2 No - lnc-TNNT2-3:1 No - lnc-PKP1-1:1 No - lnc-PKP1-2:1 No - lnc-PHLDA3-1:2 No - lnc-CSRP1-2:2 No - lnc-PHLDA3-3:2 Yes chr3R:7112850-7117732 lnc-PHLDA3-3:1 Yes chr3R:7112850-7117732 lnc-NAV1-8:3 No - lnc-NAV1-8:4 No - lnc-NAV1-7:1 No - lnc-NAV1-6:1 No - lnc-NAV1-5:1 No - lnc-NAV1-2:5 No - lnc-NAV1-2:6 No - lnc-CSRP1-4:1 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-LMOD1-5:1 No - lnc-GPR37L1-4:1 No - lnc-LGR6-2:4 No - lnc-PTPN7-1:2 Yes chr3R:8126605-8129835 lnc-PTPN7-1:1 Yes chr3R:8126605-8129835 lnc-ARL8A-1:4 Yes chr2R:21619321-21624446 lnc-LGR6-1:2 No - lnc-PTPN7-2:1 Yes chr2L:13982743-14001248 lnc-PTPN7-3:1 Yes chr2L:14563015-14563726 lnc-UBE2T-1:1 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-LGR6-9:1 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-LGR6-9:2 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-SYT2-4:1 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-LGR6-5:1 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-LGR6-6:1 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-KDM5B-3:1 Yes chr2L:2772327-2799979 lnc-PPP1R12B-5:1 Yes chr2L:2772327-2799979 lnc-SYT2-1:1 Yes chr2L:5989400-5999501 lnc-SYT2-2:1 Yes chr2L:5989400-5999501 lnc-SYT2-3:1 Yes chr2L:5989400-5999501 lnc-PPP1R12B-6:2 Yes chr2L:5989400-5999501 PCAT6:6 No - PCAT6:10 No - lnc-RABIF-1:1 No - lnc-RABIF-1:3 No - lnc-RABIF-1:2 No - lnc-TMEM183A-5:1 No - lnc-TMEM183A-5:3 No - lnc-ADIPOR1-2:1 Yes chr3L:11816695-11822275 lnc-TMEM183A-2:1 No - lnc-PPFIA4-1:1 Yes chr2R:13230583-13231663 lnc-ADORA1-1:1 Yes chr2L:6723903-6732766 lnc-CHI3L1-1:1 Yes chr3L:3090985-3106958 lnc-CHI3L1-1:3 Yes chr3L:3090985-3106958 lnc-CHI3L1-1:2 Yes chr3L:3090985-3106958 lnc-CHI3L1-2:3 Yes chr3L:3090985-3106958 lnc-CHIT1-2:1 Yes chr3L:3090985-3106958 LINC01136:1 No - LINC01136:2 No - lnc-FMOD-3:1 No - lnc-FMOD-3:2 No - lnc-FMOD-4:1 No - lnc-BTG2-2:5 No - lnc-FMOD-5:1 No - lnc-FMOD-6:1 Yes chr4:328193-358917 lnc-LAX1-1:1 Yes chr4:328193-358917 lnc-ZC3H11A-1:1 No - lnc-ZC3H11A-1:2 No - lnc-ZC3H11A-1:3 No - lnc-ETNK2-7:1 No - lnc-ETNK2-4:1 No - lnc-ETNK2-4:2 No - lnc-SNRPE-3:1 No - lnc-REN-2:1 Yes chrX:16278328-16285618 lnc-ETNK2-1:9 Yes chr2R:14390696-14392209 lnc-SOX13-4:1 Yes chr2R:14390696-14392209 lnc-SOX13-5:1 Yes chr2R:14390696-14392209 lnc-KISS1-1:1 Yes chrX:16285953-16288533 lnc-GOLT1A-1:1 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-GOLT1A-2:1 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-GOLT1A-3:1 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-MDM4-10:1 Yes chr3R:13715207-13764667 LINC00628:2 Yes chr3R:13715207-13764667 LINC00628:1 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-MDM4-9:1 No - lnc-MDM4-8:1 No - lnc-PPP1R15B-1:1 Yes chr3L:11774650-11790013 lnc-PPP1R15B-3:1 Yes chr3L:11774650-11790013 lnc-PPP1R15B-4:1 Yes chr3L:11774650-11790013 lnc-PIK3C2B-1:1 Yes chr2R:8009119-8013755 lnc-MDM4-5:1 Yes chr2R:8009119-8013755 lnc-MDM4-3:2 Yes chr2R:8009119-8013755 lnc-MDM4-3:3 Yes chr2R:8009119-8013755 lnc-LRRN2-1:1 No - lnc-CNTN2-4:1 Yes chrX:8517373-8555170 lnc-CNTN2-2:1 Yes chrX:8517373-8555170 lnc-NFASC-1:1 Yes chr3R:4381306-4387018 lnc-CNTN2-1:1 Yes chr3L:20345736-20347942 lnc-DSTYK-2:1 Yes chr3L:20345736-20347942 lnc-CNTN2-3:1 No - lnc-DSTYK-1:2 Yes chr3R:6389162-6405895 lnc-NUAK2-2:1 No - lnc-TMCC2-2:1 No - BLACAT1:15 No - BLACAT1:10 No - BLACAT1:9 No - BLACAT1:12 No - BLACAT1:11 No - BLACAT1:13 No - lnc-ELK4-1:2 No - lnc-ELK4-1:1 No - lnc-SLC45A3-4:1 No - lnc-SLC45A3-3:1 No - lnc-MFSD4A-9:1 No - lnc-SLC45A3-2:1 No - lnc-SLC41A1-4:1 No - lnc-SLC41A1-3:2 No - lnc-SLC41A1-3:1 No - lnc-RAB29-1:1 Yes chrX:8489348-8517029 lnc-SLC41A1-1:1 Yes chrX:8489348-8517029 lnc-RHEX-7:1 Yes chrX:8489348-8517029 lnc-RHEX-7:2 Yes chrX:8489348-8517029 lnc-SLC41A1-2:2 No - lnc-SLC41A1-2:1 No - lnc-RHEX-8:1 No - lnc-RHEX-5:1 No - lnc-FAM72A-3:1 No - lnc-AVPR1B-1:1 No - lnc-FAM72A-3:2 No - lnc-FAM72A-3:3 No - lnc-FAM72A-4:1 No - lnc-RHEX-1:7 No - lnc-RHEX-1:4 No - lnc-RHEX-1:6 No - lnc-RHEX-1:8 No - lnc-RHEX-1:5 No - lnc-CTSE-1:1 No - lnc-RAB7B-2:1 Yes chr3R:17411108-17412680 lnc-EIF2D-2:2 No - lnc-EIF2D-2:1 Yes chr3R:29149896-29151794 lnc-IL10-2:1 Yes chr3R:29149896-29151794 lnc-EIF2D-1:2 Yes chr4:1225089-1230713 lnc-IL10-1:1 Yes chrX:5759908-5764203 lnc-IL10-5:1 No - lnc-IL10-5:2 No - lnc-IL19-1:1 No - lnc-PIGR-3:1 No - lnc-IL24-1:1 No - lnc-PIGR-1:1 No - lnc-FCMR-3:1 No - lnc-FCMR-4:1 No - lnc-PIGR-2:1 No - lnc-PIGR-4:2 No - lnc-PIGR-4:1 No - lnc-PFKFB2-2:1 No - lnc-C4BPB-1:2 Yes chrX:19495505-19509350 lnc-YOD1-2:1 No - lnc-C4BPA-2:1 No - lnc-CD55-3:1 No - lnc-YOD1-1:2 No - lnc-CR2-3:1 No - lnc-CR2-3:2 No - lnc-CD34-22:1 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-CD34-22:2 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-CD34-21:1 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-CD34-21:2 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-CR1-1:1 Yes chrX:11992915-12003914 MIR29B2CHG:59 No - MIR29B2CHG:82 No - MIR29B2CHG:83 No - MIR29B2CHG:93 No - MIR29B2CHG:84 No - lnc-CD46-4:1 No - MIR29B2CHG:52 No - MIR29B2CHG:50 No - lnc-PLXNA2-8:1 No - lnc-CD46-2:2 No - lnc-CD34-2:1 Yes chr4:1009895-1027101 lnc-CD34-3:1 Yes chr4:1009895-1027101 lnc-CD34-4:1 Yes chr4:1009895-1027101 lnc-CD46-5:1 No - lnc-PLXNA2-1:2 No - lnc-PLXNA2-5:1 No - LINC01717:13 No - lnc-CAMK1G-11:1 No - lnc-LAMB3-3:2 No - lnc-LAMB3-5:1 No - lnc-CAMK1G-10:1 No - lnc-LAMB3-4:1 No - LINC01696:5 No - lnc-CAMK1G-7:1 No - MIR205HG:3 No - MIR205HG:5 No - lnc-LAMB3-2:3 No - lnc-LAMB3-2:4 No - lnc-LAMB3-1:3 No - lnc-LAMB3-1:4 No - lnc-G0S2-2:1 No - lnc-HSD11B1-1:1 No - lnc-TRAF3IP3-1:1 Yes chr2L:22579072-22585843 lnc-HSD11B1-4:1 Yes chr2L:22579072-22585843 lnc-HSD11B1-4:2 Yes chr2L:22579072-22585843 lnc-HSD11B1-4:3 Yes chr2L:22579072-22585843 lnc-HSD11B1-4:4 Yes chr2L:22579072-22585843 lnc-C1orf74-2:1 Yes chr2L:22579072-22585843 lnc-HSD11B1-4:5 Yes chr2L:22579072-22585843 lnc-HSD11B1-4:6 Yes chr2L:22579072-22585843 lnc-HSD11B1-4:7 Yes chr2L:22579072-22585843 lnc-IRF6-1:1 No - SERTAD4-AS1:2 No - SERTAD4-AS1:4 No - SERTAD4-AS1:1 No - lnc-SERTAD4-1:1 No - lnc-KCNH1-1:8 No - lnc-KCNH1-1:4 No - lnc-KCNH1-1:2 No - lnc-KCNH1-1:6 No - lnc-HHAT-2:1 No - lnc-HHAT-1:1 No - lnc-KCNH1-6:1 Yes chr3L:3162180-3163852 lnc-KCNH1-5:1 Yes chr3L:3162180-3163852 lnc-SERTAD4-3:1 Yes chr3L:3162180-3163852 lnc-RD3-11:1 Yes chrX:14955477-15009989 lnc-RD3-9:1 Yes chrX:14955477-15009989 lnc-RCOR3-1:1 Yes chrX:14955477-15009989 lnc-RCOR3-1:2 Yes chrX:14955477-15009989 lnc-KCNH1-2:2 Yes chrX:19521929-19530896 lnc-TRAF5-8:1 Yes chrX:19521929-19530896 lnc-RD3-7:1 No - lnc-RD3-6:1 No - LINC00467:1 No - LINC00467:6 No - LINC00467:7 No - LINC00467:10 No - lnc-RD3-5:1 No - lnc-RD3-4:1 No - LINC00467:13 No - lnc-RD3-3:1 No - lnc-TRAF5-11:1 Yes chr3L:3303708-3314009 lnc-NEK2-2:1 Yes chr3L:3303708-3314009 LINC01693:9 No - lnc-LPGAT1-3:1 Yes chrX:7889066-7891646 lnc-TRAF5-6:6 No - lnc-TRAF5-6:7 No - lnc-NEK2-4:1 No - lnc-NEK2-3:1 No - lnc-DTL-7:1 No - lnc-INTS7-3:1 No - lnc-DTL-2:5 No - lnc-INTS7-2:2 Yes chr3L:9723423-9726706 lnc-INTS7-2:3 Yes chr3L:9723423-9726706 lnc-DTL-6:1 No - lnc-DTL-4:1 No - lnc-DTL-5:1 No - lnc-TMEM206-6:1 No - lnc-TMEM206-5:10 No - lnc-NENF-4:2 Yes chrX:16740906-16742918 lnc-BATF3-7:1 No - lnc-TMEM206-4:2 No - lnc-BATF3-6:1 No - lnc-BATF3-5:1 No - lnc-FAM71A-2:1 No - lnc-FAM71A-1:4 No - lnc-FAM71A-1:5 No - lnc-BATF3-4:1 No - lnc-BATF3-4:2 No - lnc-TATDN3-1:1 No - lnc-TATDN3-2:1 No - FLVCR1-DT:29 No - lnc-FLVCR1-1:1 No - FLVCR1-DT:17 No - FLVCR1-DT:18 No - lnc-SPATA45-2:1 No - lnc-VASH2-1:1 No - lnc-SPATA45-3:1 Yes chr2R:23694003-23695232 lnc-SPATA45-4:1 Yes chr2R:23694003-23695232 lnc-RPS6KC1-2:1 No - lnc-PTPN14-9:1 No - PROX1-AS1:35 No - PROX1-AS1:36 No - PROX1-AS1:61 No - PROX1-AS1:11 Yes chr3R:11328480-11407627 PROX1-AS1:48 No - PROX1-AS1:32 No - PROX1-AS1:47 No - PROX1-AS1:28 No - PROX1-AS1:46 No - PROX1-AS1:45 No - lnc-PROX1-3:1 No - PROX1-AS1:18 Yes chr3R:11328480-11407627 PROX1-AS1:31 No - PROX1-AS1:29 No - lnc-PROX1-41:1 No - PROX1-AS1:9 Yes chr3R:11328480-11407627 PROX1-AS1:12 Yes chr3R:11328480-11407627 PROX1-AS1:10 Yes chr3R:11328480-11407627 lnc-PTPN14-7:2 Yes chr3R:11328480-11407627 lnc-USH2A-6:2 Yes chr2L:6332881-6338671 lnc-USH2A-6:1 Yes chr2L:6332881-6338671 lnc-PTPN14-4:1 Yes chr2L:6332881-6338671 lnc-USH2A-4:1 Yes chr2L:6332881-6338671 lnc-USH2A-4:2 Yes chr2L:6332881-6338671 lnc-PTPN14-4:2 Yes chr2L:6332881-6338671 lnc-PTPN14-6:1 No - lnc-KCNK2-1:1 No - lnc-KCTD3-6:1 No - lnc-KCTD3-5:1 No - lnc-USH2A-2:1 No - lnc-USH2A-1:1 No - lnc-KCTD3-7:1 Yes chrX:14604012-14653928 lnc-KCTD3-8:1 Yes chrX:14604012-14653928 lnc-KCTD3-9:1 Yes chrX:14604012-14653928 lnc-USH2A-3:2 Yes chr3L:8183361-8186671 lnc-USH2A-3:1 Yes chr3L:8183361-8186671 lnc-GPATCH2-6:4 Yes chr3L:8183361-8186671 lnc-GPATCH2-6:2 Yes chr3L:8183361-8186671 lnc-GPATCH2-6:1 Yes chr3L:8183361-8186671 lnc-GPATCH2-6:3 Yes chr3L:8183361-8186671 lnc-GPATCH2-5:1 Yes chr3L:8183361-8186671 lnc-GPATCH2-3:1 No - lnc-ESRRG-2:1 No - lnc-ESRRG-3:1 No - lnc-ESRRG-4:3 No - lnc-ESRRG-4:1 No - lnc-ESRRG-4:2 No - lnc-ESRRG-5:1 No - SPATA17-AS1:1 No - lnc-GPATCH2-4:1 No - LINC00210:1 No - lnc-GPATCH2-7:1 Yes chr3R:14898739-14899617 lnc-RRP15-2:1 No - TGFB2-AS1:1 No - lnc-GPATCH2-8:1 Yes chr2L:2805261-2812376 lnc-TGFB2-1:2 No - lnc-GPATCH2-9:1 No - lnc-GPATCH2-10:1 No - lnc-ZC3H11B-12:1 No - lnc-LYPLAL1-10:1 No - lnc-LYPLAL1-8:1 No - lnc-LYPLAL1-3:4 No - LYPLAL1-DT:6 No - lnc-ZC3H11B-11:1 Yes chr3R:10853374-10854451 lnc-LYPLAL1-6:1 No - lnc-LYPLAL1-1:5 No - lnc-LYPLAL1-7:1 No - lnc-ZC3H11B-10:1 No - lnc-ZC3H11B-1:17 No - lnc-ZC3H11B-1:5 No - lnc-ZC3H11B-1:4 No - lnc-LYPLAL1-9:1 No - lnc-LYPLAL1-11:1 No - lnc-ZC3H11B-9:3 No - lnc-ZC3H11B-5:1 Yes chr3L:20484293-20494921 lnc-EPRS-4:2 Yes chr3L:20484293-20494921 lnc-EPRS-1:2 No - lnc-SLC30A10-7:1 Yes chr3R:23952136-23958391 lnc-EPRS-1:1 Yes chr3R:23952136-23958391 lnc-IARS2-2:2 Yes chr3R:23952136-23958391 lnc-EPRS-2:1 Yes chr3R:29803196-29804389 lnc-EPRS-2:2 Yes chr3R:29803196-29804389 lnc-RAB3GAP2-1:1 Yes chr3L:16100280-16103482 lnc-BPNT1-2:2 Yes chr2L:12058304-12063184 lnc-BPNT1-1:1 Yes chr2L:12058304-12063184 lnc-BPNT1-1:2 Yes chr2L:12058304-12063184 lnc-BPNT1-2:1 Yes chr2L:12058304-12063184 lnc-IARS2-1:1 Yes chr2L:12058304-12063184 lnc-BPNT1-2:4 Yes chr2L:12058304-12063184 lnc-IARS2-3:1 Yes chr2L:12058304-12063184 lnc-BPNT1-2:3 Yes chr2L:12058304-12063184 lnc-BPNT1-2:6 Yes chr2L:12058304-12063184 lnc-BPNT1-2:5 Yes chr2L:12058304-12063184 lnc-IARS2-4:1 No - lnc-MARK1-3:2 No - lnc-MARK1-6:1 No - lnc-RAB3GAP2-5:1 No - lnc-MARK1-5:1 No - lnc-RAB3GAP2-6:1 No - lnc-RAB3GAP2-7:1 Yes chr3R:11346294-11353131 lnc-C1orf115-2:1 Yes chr3R:11346294-11353131 lnc-HLX-2:2 Yes chr2L:6013059-6019402 lnc-HLX-2:3 Yes chr2L:6013059-6019402 lnc-HLX-2:4 Yes chr2L:6013059-6019402 lnc-HLX-2:5 Yes chr2L:6013059-6019402 lnc-HLX-2:6 Yes chr2L:6013059-6019402 lnc-HLX-2:7 Yes chr2L:6013059-6019402 lnc-HLX-2:8 Yes chr2L:6013059-6019402 lnc-HLX-2:9 Yes chr2L:6013059-6019402 lnc-HLX-2:10 No - lnc-HLX-2:11 No - lnc-DUSP10-9:1 No - lnc-DUSP10-8:1 No - lnc-DUSP10-7:1 No - lnc-HLX-4:1 No - lnc-HLX-5:1 No - lnc-DUSP10-6:1 No - lnc-DUSP10-2:2 No - LINC01655:4 No - lnc-MIA3-7:1 No - lnc-HHIPL2-6:1 No - lnc-HHIPL2-6:2 No - lnc-MIA3-6:1 No - lnc-HHIPL2-4:1 No - lnc-TAF1A-3:2 No - lnc-TAF1A-2:1 No - lnc-HHIPL2-5:1 No - TAF1A-AS1:6 No - lnc-TAF1A-4:1 No - lnc-FAM177B-3:2 No - lnc-FAM177B-3:3 No - lnc-AIDA-2:1 No - lnc-FAM177B-1:1 No - lnc-DISP1-1:13 No - lnc-DISP1-1:15 No - lnc-DISP1-1:16 No - lnc-DISP1-4:9 No - lnc-TLR5-2:1 No - lnc-DISP1-5:1 No - lnc-DISP1-6:1 No - lnc-TLR5-1:4 No - lnc-TLR5-1:3 No - lnc-SUSD4-2:2 Yes chr3L:20361843-20366724 lnc-SUSD4-2:1 Yes chr3L:20361843-20366724 lnc-CAPN8-1:1 Yes chr3L:9888762-9893319 lnc-CAPN8-1:2 Yes chr3L:9888762-9893319 lnc-TP53BP2-5:1 Yes chr3L:9888762-9893319 lnc-CAPN2-2:1 No - lnc-TP53BP2-2:2 Yes chr2R:21217856-21251150 lnc-TP53BP2-2:3 Yes chr2R:21217856-21251150 lnc-TP53BP2-2:1 Yes chr2R:21217856-21251150 lnc-CAPN2-3:1 No - lnc-FBXO28-5:1 No - lnc-TP53BP2-8:11 No - lnc-TP53BP2-8:13 No - lnc-TP53BP2-8:10 No - lnc-TP53BP2-8:9 No - lnc-TP53BP2-8:6 No - lnc-TP53BP2-8:7 No - lnc-FBXO28-1:4 No - lnc-FBXO28-1:5 No - lnc-FBXO28-1:6 No - lnc-FBXO28-1:7 No - lnc-FBXO28-1:8 No - lnc-FBXO28-1:9 No - lnc-FBXO28-4:1 No - lnc-FBXO28-4:2 No - lnc-FBXO28-4:3 No - lnc-TP53BP2-7:1 No - lnc-FBXO28-3:1 No - lnc-NVL-9:1 No - lnc-DEGS1-2:1 Yes chr2R:10117694-10121451 lnc-NVL-6:1 No - lnc-NVL-4:3 Yes chr3L:7381614-7385637 lnc-NVL-4:2 Yes chr3L:7381614-7385637 lnc-NVL-4:1 Yes chr3L:7381614-7385637 lnc-WDR26-5:1 Yes chr3L:7381614-7385637 lnc-CNIH4-2:1 Yes chr3L:7381614-7385637 lnc-WDR26-4:1 Yes chr3L:7381614-7385637 lnc-NVL-7:1 Yes chr3L:21523186-21528163 lnc-NVL-8:1 Yes chr3L:21523186-21528163 lnc-CNIH3-2:1 No - lnc-CNIH3-2:2 No - lnc-CNIH3-2:3 No - lnc-CNIH3-2:4 No - lnc-CNIH3-2:5 No - lnc-CNIH3-2:6 No - lnc-CNIH3-2:7 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-CNIH3-2:8 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-CNIH3-2:9 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-CNIH3-2:10 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-CNIH3-2:12 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-CNIH3-2:13 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-CNIH3-2:14 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-CNIH3-2:16 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-CNIH3-2:17 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-WDR26-6:1 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-WDR26-7:1 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-CNIH3-1:3 No - lnc-ENAH-5:1 Yes chr2R:21720495-21724055 lnc-ENAH-4:1 Yes chr2R:21720495-21724055 lnc-LBR-4:2 Yes chr2R:19141632-19163705 lnc-LBR-4:1 Yes chr2R:19141632-19163705 lnc-LBR-4:4 Yes chr2R:19141632-19163705 lnc-LBR-4:3 Yes chr2R:19141632-19163705 lnc-LBR-3:1 Yes chr2R:19141632-19163705 lnc-ENAH-3:1 No - lnc-EPHX1-1:1 No - lnc-LEFTY1-5:2 Yes chr2R:8098684-8102306 lnc-LEFTY1-5:1 Yes chr2R:8098684-8102306 lnc-LEFTY1-4:1 Yes chr2R:8098684-8102306 lnc-LEFTY1-3:2 Yes chr2R:8098684-8102306 lnc-LEFTY1-3:1 Yes chr2R:8098684-8102306 lnc-LEFTY1-1:1 No - lnc-LEFTY1-2:2 No - lnc-LEFTY1-2:1 No - lnc-H3F3A-5:1 No - lnc-SDE2-1:13 Yes chrX:9152523-9156669 lnc-SDE2-1:15 No - lnc-SDE2-1:1 Yes chrX:9152523-9156669 lnc-MIXL1-7:1 Yes chrX:9152523-9156669 LINC01703:17 No - LINC01703:18 No - LINC01703:19 No - LINC01703:21 No - lnc-H3F3A-2:1 No - lnc-LIN9-2:1 Yes chrX:19701927-19704259 lnc-MIXL1-5:1 No - lnc-MIXL1-5:2 No - lnc-ACBD3-1:1 No - lnc-ACBD3-2:1 No - lnc-LIN9-1:2 Yes chr3R:3461351-3587054 lnc-LIN9-1:1 Yes chr3R:3461351-3587054 lnc-PARP1-2:1 No - lnc-STUM-2:1 No - lnc-ITPKB-2:2 No - lnc-ITPKB-2:1 No - lnc-PSEN2-4:1 No - ITPKB-IT1:1 Yes chrX:13303633-13329303 lnc-CDC42BPA-5:1 Yes chrX:13303633-13329303 lnc-PSEN2-3:1 No - lnc-CDC42BPA-3:1 Yes chr3L:20432468-20435156 lnc-COQ8A-4:1 Yes chr3L:20432468-20435156 lnc-COQ8A-3:1 Yes chr3L:20432468-20435156 lnc-PSEN2-1:1 Yes chrX:12898768-12901114 lnc-COQ8A-5:1 Yes chr2R:24092079-24098636 lnc-ITPKB-3:1 Yes chr2R:24092079-24098636 lnc-ITPKB-4:1 Yes chr2R:24092079-24098636 lnc-COQ8A-6:1 Yes chr2R:24092079-24098636 lnc-JMJD4-6:1 Yes chr2R:24092079-24098636 lnc-JMJD4-5:1 Yes chr2R:24092079-24098636 LINC01641:6 No - lnc-ZNF678-3:1 No - lnc-JMJD4-4:1 No - lnc-JMJD4-3:1 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-JMJD4-2:1 No - lnc-JMJD4-2:3 No - lnc-JMJD4-2:2 No - lnc-WNT9A-3:1 No - SNAP47-AS1:2 No - lnc-SNAP47-1:2 No - lnc-SNAP47-1:3 No - lnc-WNT9A-2:2 No - lnc-WNT9A-1:2 No - lnc-WNT9A-1:1 No - lnc-ARF1-4:2 No - lnc-ARF1-2:1 No - lnc-C1orf35-1:1 No - lnc-C1orf35-1:2 No - lnc-ARF1-1:1 No - lnc-C1orf35-2:8 Yes chr3R:19094394-19094905 lnc-C1orf35-2:9 Yes chr3R:19094394-19094905 lnc-C1orf35-2:1 Yes chr3R:19094394-19094905 lnc-C1orf35-2:7 Yes chr3R:19094394-19094905 lnc-C1orf35-2:5 Yes chr3R:19094394-19094905 lnc-C1orf35-2:2 Yes chr3R:19094394-19094905 lnc-C1orf35-2:3 Yes chr3R:19094394-19094905 lnc-C1orf35-2:6 Yes chr3R:19094394-19094905 lnc-C1orf35-2:4 Yes chr3R:19094394-19094905 lnc-ARF1-3:1 No - lnc-MRPL55-1:1 No - lnc-ARF1-3:7 No - lnc-ARF1-3:8 No - lnc-MRPL55-2:1 No - lnc-GUK1-1:1 No - lnc-GJC2-1:1 No - IBA57-DT:6 No - lnc-OBSCN-2:1 No - lnc-IBA57-2:1 Yes chr3L:2117466-2151700 lnc-TRIM11-8:1 Yes chr3L:2117466-2151700 lnc-TRIM11-7:1 Yes chr3L:2117466-2151700 lnc-TRIM11-7:2 Yes chr3L:2117466-2151700 lnc-TRIM11-5:1 Yes chr3L:2117466-2151700 lnc-TRIM11-3:2 Yes chr3L:2117466-2151700 lnc-TRIM11-3:1 Yes chr3L:2117466-2151700 lnc-TRIM11-2:1 Yes chr3L:2117466-2151700 lnc-TRIM11-1:1 No - lnc-TRIM17-1:1 No - lnc-HIST3H2A-1:1 No - lnc-HIST3H2A-2:1 No - lnc-RHOU-4:1 No - lnc-RNF187-3:3 Yes chrX:10086527-10148876 lnc-RHOU-3:2 Yes chrX:10086527-10148876 lnc-RHOU-1:1 No - lnc-RHOU-2:1 No - lnc-RHOU-7:1 No - lnc-RHOU-5:1 No - lnc-CCSAP-7:1 No - lnc-CCSAP-7:2 No - lnc-RHOU-6:1 No - lnc-CCSAP-5:1 No - lnc-CCSAP-4:1 No - lnc-CCSAP-1:2 Yes chr2R:17573462-17574979 lnc-RAB4A-3:1 No - lnc-CCSAP-1:1 Yes chr2R:17573462-17574979 lnc-SPHAR-2:1 Yes chr2R:17573462-17574979 lnc-ACTA1-2:1 No - lnc-RAB4A-4:1 No - lnc-ACTA1-4:1 Yes chr3R:22690607-22694772 lnc-ACTA1-3:1 Yes chr3R:22690607-22694772 lnc-URB2-1:4 No - lnc-URB2-2:1 No - lnc-ABCB10-1:1 Yes chr3R:23255070-23258087 lnc-TAF5L-4:2 No - LINC01682:8 No - LINC01682:10 No - LINC01682:11 No - LINC01682:9 No - LINC01736:11 No - LINC01736:12 No - LINC01736:19 No - lnc-PGBD5-5:1 No - lnc-COG2-4:2 Yes chr2L:3404460-3426719 lnc-PGBD5-4:1 Yes chr2L:3404460-3426719 lnc-PGBD5-2:3 Yes chr2L:3404460-3426719 lnc-PGBD5-2:2 Yes chr2L:3404460-3426719 lnc-PGBD5-2:4 Yes chr2L:3404460-3426719 lnc-AGT-7:1 No - lnc-GALNT2-3:1 No - LINC01737:3 No - lnc-AGT-4:1 No - lnc-AGT-3:1 No - lnc-CAPN9-4:1 Yes chr3R:15358481-15361657 lnc-AGT-2:1 No - lnc-CAPN9-2:1 No - lnc-COG2-2:1 Yes chr3L:9888762-9893319 lnc-AGT-6:3 Yes chr3L:9888762-9893319 lnc-AGT-6:4 Yes chr3L:9888762-9893319 lnc-AGT-6:2 Yes chr3L:9888762-9893319 lnc-TTC13-3:1 No - lnc-TTC13-1:1 No - lnc-CAPN9-1:2 No - lnc-CAPN9-1:3 No - lnc-ARV1-2:1 No - lnc-C1orf198-4:1 No - lnc-TTC13-2:2 No - lnc-TTC13-2:1 No - lnc-EXOC8-4:1 No - lnc-GNPAT-1:1 No - lnc-GNPAT-2:1 No - lnc-EXOC8-2:1 No - lnc-EXOC8-1:1 No - lnc-SPRTN-4:1 Yes chr3R:5257037-5269507 lnc-EXOC8-3:1 Yes chr3R:5257037-5269507 lnc-EGLN1-4:1 No - lnc-EGLN1-4:2 No - lnc-EGLN1-1:8 No - lnc-EGLN1-1:9 No - lnc-DISC1-8:1 Yes chr3R:15361692-15362850 lnc-DISC1-4:12 Yes chr3R:15361692-15362850 lnc-TSNAX-2:1 No - DISC2:3 No - DISC2:1 No - DISC2:4 No - DISC2:2 No - DISC2:5 No - lnc-SIPA1L2-13:1 No - lnc-DISC1-1:2 No - lnc-DISC1-5:1 No - lnc-SIPA1L2-8:1 No - lnc-DISC1-6:1 No - lnc-SIPA1L2-5:1 No - lnc-SIPA1L2-4:1 No - lnc-PCNX2-7:1 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-PCNX2-6:1 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-SIPA1L2-3:1 No - lnc-SIPA1L2-3:3 No - lnc-MAP10-8:1 No - lnc-MAP10-6:1 No - lnc-MAP10-5:1 No - LINC01745:6 No - LINC01745:7 No - lnc-MAP10-5:3 No - lnc-MAP10-5:4 No - lnc-SIPA1L2-9:1 No - lnc-MAP10-5:5 No - LINC01744:11 No - lnc-MAP10-4:1 No - lnc-MAP10-4:3 No - lnc-MAP10-3:1 No - lnc-PCNX2-4:1 No - lnc-MAP10-1:1 No - lnc-MAP10-1:5 No - lnc-NTPCR-1:2 No - lnc-PCNX2-3:1 Yes chr3L:21033554-21034203 lnc-SIPA1L2-1:8 Yes chrX:2225296-2238045 lnc-SIPA1L2-1:9 Yes chrX:2225296-2238045 lnc-SIPA1L2-10:1 Yes chrX:2225296-2238045 lnc-SIPA1L2-11:1 Yes chrX:2225296-2238045 lnc-NTPCR-2:1 Yes chrX:2225296-2238045 lnc-SIPA1L2-12:3 Yes chrX:2225296-2238045 lnc-SIPA1L2-12:4 Yes chrX:2225296-2238045 lnc-SIPA1L2-12:5 Yes chrX:2225296-2238045 lnc-SIPA1L2-12:2 Yes chrX:2225296-2238045 lnc-SIPA1L2-12:6 Yes chrX:2225296-2238045 lnc-SIPA1L2-14:1 Yes chrX:2225296-2238045 lnc-SIPA1L2-14:2 Yes chrX:2225296-2238045 lnc-PCNX2-2:1 Yes chrX:2225296-2238045 lnc-KCNK1-1:3 No - lnc-TARBP1-9:1 Yes chr3R:20740108-20756639 lnc-TARBP1-8:1 Yes chr3R:20740108-20756639 lnc-TARBP1-7:1 Yes chr3R:20740108-20756639 lnc-COA6-10:1 Yes chr3R:20740108-20756639 lnc-TARBP1-6:1 No - lnc-IRF2BP2-9:2 Yes chr3R:22375923-22379955 lnc-IRF2BP2-9:3 Yes chr3R:22375923-22379955 lnc-IRF2BP2-9:1 Yes chr3R:22375923-22379955 lnc-IRF2BP2-8:1 Yes chr3R:22375923-22379955 lnc-COA6-11:1 No - lnc-IRF2BP2-4:1 No - LINC00184:3 No - lnc-COA6-6:3 No - lnc-IRF2BP2-5:1 No - lnc-IRF2BP2-2:4 No - lnc-IRF2BP2-2:3 No - lnc-IRF2BP2-2:2 No - lnc-COA6-7:2 No - LINC01132:1 No - lnc-IRF2BP2-6:1 No - lnc-IRF2BP2-7:1 No - lnc-GGPS1-11:1 No - lnc-TOMM20-2:14 No - lnc-TOMM20-1:4 No - lnc-GGPS1-9:1 No - lnc-GGPS1-8:1 No - lnc-TOMM20-3:4 No - lnc-RBM34-3:1 Yes chr3L:20000644-20002446 lnc-TOMM20-4:3 No - lnc-TOMM20-6:1 No - lnc-RBM34-2:1 No - lnc-GGPS1-6:1 No - lnc-B3GALNT2-3:1 No - lnc-B3GALNT2-2:1 No - lnc-TBCE-3:2 No - lnc-TBCE-3:3 No - lnc-TBCE-2:1 No - lnc-GGPS1-3:1 Yes chr2R:6042532-6044964 lnc-GGPS1-4:1 Yes chr2R:6042532-6044964 lnc-GGPS1-5:1 Yes chr2R:6042532-6044964 lnc-TBCE-1:1 Yes chr2R:6042532-6044964 lnc-ARID4B-1:1 Yes chr2R:6042532-6044964 lnc-GNG4-9:1 Yes chr2R:8626181-8627611 lnc-GNG4-7:1 Yes chr2R:8626181-8627611 lnc-TBCE-4:1 No - lnc-TBCE-5:1 No - lnc-GNG4-5:1 No - lnc-GNG4-4:2 No - lnc-GNG4-4:1 No - lnc-GNG4-3:1 No - lnc-GNG4-2:1 No - lnc-GNG4-1:1 No - lnc-TBCE-6:1 No - lnc-GNG4-6:1 Yes chr3L:1950306-1964178 lnc-GNG4-8:1 Yes chr3L:1950306-1964178 lnc-LYST-4:1 Yes chr3L:1950306-1964178 lnc-LYST-4:2 Yes chr3L:1950306-1964178 LYST-AS1:1 Yes chr3L:1950306-1964178 lnc-NID1-5:1 Yes chr3L:1950306-1964178 lnc-GPR137B-8:1 No - lnc-GPR137B-7:1 No - lnc-GPR137B-6:1 No - lnc-GPR137B-5:1 No - lnc-ERO1B-1:1 No - lnc-EDARADD-1:2 No - lnc-HEATR1-4:1 No - lnc-HEATR1-3:1 No - lnc-ERO1B-2:1 Yes chr2L:6854142-6860849 lnc-ACTN2-1:1 No - lnc-MTR-1:5 No - lnc-MTR-3:1 No - lnc-MTR-4:1 No - lnc-MTR-5:1 No - lnc-RYR2-5:1 No - lnc-RYR2-5:2 No - lnc-MTR-7:1 No - lnc-MT1HL1-5:1 No - lnc-RYR2-10:2 No - lnc-MTRNR2L11-2:2 No - lnc-RYR2-11:2 No - lnc-MTRNR2L11-3:2 No - lnc-MTRNR2L11-4:2 No - lnc-RYR2-1:2 No - lnc-RYR2-6:1 No - lnc-MTRNR2L11-6:2 No - lnc-MTRNR2L11-7:4 No - lnc-GREM2-8:4 No - lnc-GREM2-8:3 No - lnc-CHRM3-1:1 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-CHRM3-1:2 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-CHRM3-1:4 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-CHRM3-1:5 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-FMN2-6:1 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-FMN2-6:2 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-CHRM3-1:6 Yes chr2R:24378630-24390294 CHRM3-AS2:11 Yes chr2R:24378630-24390294 CHRM3-AS2:1 Yes chr2R:24378630-24390294 CHRM3-AS2:7 Yes chr2R:24378630-24390294 CHRM3-AS2:2 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-FMN2-4:1 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-FMN2-3:2 No - lnc-FMN2-3:3 No - lnc-FMN2-3:4 No - lnc-CHRM3-2:1 Yes chr2L:3872646-3902860 lnc-GREM2-12:1 Yes chr2L:3872646-3902860 lnc-RGS7-3:1 No - lnc-GREM2-9:1 No - lnc-FMN2-5:1 No - lnc-RGS7-1:4 No - lnc-RGS7-10:1 No - lnc-FH-7:1 Yes chrX:16838173-16844433 lnc-GREM2-11:1 Yes chrX:16838173-16844433 lnc-GREM2-13:1 Yes chrX:16838173-16844433 lnc-FH-6:1 Yes chrX:16838173-16844433 lnc-FH-5:4 Yes chrX:16838173-16844433 lnc-FH-5:3 Yes chrX:16838173-16844433 lnc-FH-5:2 Yes chrX:16838173-16844433 lnc-FH-5:1 Yes chrX:16838173-16844433 lnc-FH-4:9 Yes chrX:16838173-16844433 lnc-FH-4:1 Yes chrX:16838173-16844433 lnc-FH-4:10 Yes chrX:16838173-16844433 lnc-FH-4:11 Yes chrX:16838173-16844433 lnc-FH-4:8 Yes chrX:16838173-16844433 lnc-FH-4:5 Yes chrX:16838173-16844433 lnc-FH-4:3 Yes chrX:16838173-16844433 lnc-FH-4:6 Yes chrX:16838173-16844433 lnc-FH-4:7 Yes chrX:16838173-16844433 lnc-FH-4:4 Yes chrX:16838173-16844433 lnc-FH-4:2 Yes chrX:16838173-16844433 lnc-FH-3:1 Yes chrX:16838173-16844433 lnc-KMO-3:1 No - lnc-KMO-3:2 No - lnc-KMO-1:3 No - lnc-KMO-1:4 No - lnc-KMO-1:5 No - lnc-KMO-1:6 No - lnc-KMO-1:7 No - lnc-OPN3-2:1 Yes chrX:6681767-6683696 lnc-OPN3-1:1 Yes chrX:6681767-6683696 lnc-CHML-1:1 Yes chr3R:18899423-18901019 lnc-EXO1-4:1 No - lnc-EXO1-1:2 No - lnc-EXO1-5:1 No - lnc-BECN2-9:1 Yes chr2L:21166046-21168581 lnc-MAP1LC3C-2:1 Yes chr2L:21166046-21168581 lnc-MAP1LC3C-3:1 Yes chr2L:21166046-21168581 lnc-PLD5-1:2 No - lnc-SDCCAG8-4:1 No - lnc-CEP170-13:17 No - lnc-CEP170-13:2 No - lnc-CEP170-13:13 No - lnc-AKT3-7:1 No - lnc-AKT3-7:4 No - lnc-AKT3-7:3 No - lnc-AKT3-7:2 No - lnc-AKT3-6:2 No - lnc-AKT3-6:1 No - lnc-AKT3-5:1 No - lnc-CEP170-6:1 Yes chr3R:15910372-15918007 lnc-ZBTB18-5:1 Yes chr3R:15910372-15918007 lnc-CEP170-10:2 Yes chr3R:16099228-16105670 lnc-CEP170-10:1 Yes chr3R:16099228-16105670 lnc-CEP170-11:1 Yes chr3R:16099228-16105670 lnc-CEP170-12:1 Yes chr3R:16099228-16105670 lnc-CEP170-4:4 Yes chr3R:16099228-16105670 lnc-CEP170-4:5 Yes chr3R:16099228-16105670 lnc-CEP170-4:2 Yes chr3R:16099228-16105670 lnc-CEP170-4:3 Yes chr3R:16099228-16105670 lnc-ZBTB18-3:1 No - lnc-ADSS-5:1 No - lnc-ADSS-4:1 No - lnc-ADSS-3:1 No - lnc-HNRNPU-11:1 Yes chr3R:20824667-20830580 lnc-ADSS-6:1 No - lnc-HNRNPU-7:2 Yes chr2R:10813405-10815781 lnc-HNRNPU-7:1 Yes chr2R:10813405-10815781 lnc-DESI2-2:1 No - lnc-COX20-1:1 No - lnc-HNRNPU-1:4 No - lnc-HNRNPU-1:5 No - lnc-HNRNPU-1:7 No - lnc-HNRNPU-1:9 Yes chr2R:18632328-18639270 lnc-EFCAB2-4:1 No - lnc-EFCAB2-3:1 No - lnc-EFCAB2-2:1 No - lnc-HNRNPU-5:1 Yes chr2R:21142368-21143261 lnc-HNRNPU-8:1 Yes chr2R:21142368-21143261 lnc-HNRNPU-9:1 Yes chr2R:21142368-21143261 lnc-HNRNPU-10:1 Yes chr2L:7844905-7855475 lnc-SMYD3-7:1 Yes chr2L:7844905-7855475 lnc-SMYD3-5:1 Yes chr2L:7844905-7855475 lnc-KIF26B-3:1 Yes chr2L:7844905-7855475 lnc-SMYD3-6:4 Yes chrX:2606680-2608876 lnc-SMYD3-6:2 Yes chrX:2606680-2608876 lnc-SMYD3-6:3 Yes chrX:2606680-2608876 lnc-KIF26B-4:1 Yes chrX:2606680-2608876 lnc-KIF26B-2:3 Yes chrX:2606680-2608876 lnc-CNST-4:1 Yes chrX:2606680-2608876 LINC01743:5 No - lnc-CNST-2:1 No - lnc-TFB2M-3:1 No - lnc-SMYD3-4:1 No - lnc-TFB2M-4:1 No - lnc-SCCPDH-3:1 No - lnc-TFB2M-5:1 No - lnc-CNST-1:4 No - lnc-AHCTF1-4:1 Yes chr3R:12406532-12408107 lnc-CNST-3:1 Yes chr3R:12406532-12408107 LINC01341:1 No - LINC01341:3 No - LINC01341:5 No - LINC01341:11 No - LINC01341:12 No - LINC01341:14 No - lnc-AHCTF1-2:1 No - LINC01341:16 No - LINC01341:18 No - LINC01341:19 No - lnc-ZNF670-ZNF695-2:1 Yes chrX:19652305-19659407 lnc-ZNF670-ZNF695-3:2 No - lnc-SCCPDH-4:1 No - lnc-ZNF670-1:2 No - lnc-ZNF670-ZNF695-1:1 No - lnc-NLRP3-10:1 No - lnc-ZNF669-1:1 No - lnc-NLRP3-9:1 No - lnc-ZNF669-2:3 No - lnc-ZNF669-2:1 No - lnc-ZNF669-2:2 No - lnc-NLRP3-8:1 No - lnc-NLRP3-7:1 No - lnc-NLRP3-7:2 No - lnc-ZNF124-3:1 No - lnc-NLRP3-6:1 No - lnc-NLRP3-5:1 No - lnc-NLRP3-4:1 No - lnc-NLRP3-1:3 No - lnc-NLRP3-1:4 No - lnc-NLRP3-1:5 No - lnc-OR2G2-1:1 No - lnc-OR2G2-1:2 No - lnc-OR2G2-1:3 No - GCSAML-AS1:1 No - lnc-OR2G3-2:1 No - lnc-OR1C1-1:1 No - lnc-OR11L1-1:1 No - lnc-OR11L1-2:1 No - lnc-OR2AJ1-1:1 No - lnc-OR2T33-1:1 No - lnc-OR2T29-1:3 No - lnc-OR2T29-1:2 No - lnc-OR2T29-2:1 No - lnc-OR2G6-4:1 No - lnc-ZNF672-5:1 No - lnc-LYPD8-1:14 No - lnc-LYPD8-1:13 No - lnc-LYPD8-4:2 No - lnc-ZNF672-3:1 No - lnc-ZNF692-1:1 Yes chr2R:14981263-14991336 lnc-SH3BP5L-1:1 No - lnc-ZNF672-2:1 No - lnc-ZNF672-2:2 No - lnc-ZNF672-2:3 No - lnc-SH3BP5L-2:1 No - lnc-SH3BP5L-3:6 No - lnc-SH3BP5L-3:7 No - lnc-SH3BP5L-3:3 No - lnc-SH3BP5L-3:1 No - lnc-SH3BP5L-3:5 No - lnc-SH3BP5L-3:2 No - lnc-SH3BP5L-3:4 No - lnc-PGBD2-1:1 No - lnc-ZMYND11-3:1 No - lnc-TUBB8-2:1 No - lnc-ZMYND11-2:1 No - lnc-TUBB8-4:1 No - lnc-PRR26-2:2 No - lnc-LARP4B-3:1 No - lnc-PRR26-3:1 No - lnc-PRR26-6:1 No - lnc-DIP2C-2:1 No - lnc-IDI2-3:1 No - lnc-IDI2-3:2 No - lnc-GTPBP4-3:2 No - lnc-LARP4B-1:1 No - lnc-GTPBP4-3:3 No - lnc-GTPBP4-3:5 No - lnc-LARP4B-2:1 No - lnc-LARP4B-5:1 No - lnc-IDI2-1:1 Yes chr3R:21270126-21271408 lnc-IDI1-2:2 Yes chr3R:18400373-18402716 lnc-IDI1-2:1 Yes chr3R:18400373-18402716 lnc-GTPBP4-5:1 Yes chr3R:18400373-18402716 lnc-GTPBP4-6:1 Yes chr3R:18400373-18402716 lnc-GTPBP4-7:1 Yes chr3R:18400373-18402716 lnc-ADARB2-6:2 Yes chrX:1773725-1788065 lnc-ADARB2-6:1 Yes chrX:1773725-1788065 lnc-IDI1-3:1 Yes chrX:1773725-1788065 lnc-IDI1-4:2 Yes chrX:1773725-1788065 lnc-IDI1-4:1 Yes chrX:1773725-1788065 lnc-WDR37-5:1 Yes chrX:1773725-1788065 lnc-WDR37-5:2 Yes chrX:1773725-1788065 lnc-WDR37-5:3 Yes chrX:1773725-1788065 lnc-IDI1-5:4 Yes chrX:1773725-1788065 lnc-IDI1-5:3 Yes chrX:1773725-1788065 lnc-IDI1-5:1 Yes chrX:1773725-1788065 lnc-IDI1-5:2 Yes chrX:1773725-1788065 lnc-IDI1-6:1 Yes chrX:1773725-1788065 ADARB2-AS1:1 Yes chrX:1773725-1788065 ADARB2-AS1:4 Yes chrX:1773725-1788065 ADARB2-AS1:5 Yes chrX:1773725-1788065 lnc-IDI1-7:1 Yes chrX:1773725-1788065 lnc-ADARB2-8:1 No - lnc-ADARB2-9:1 No - lnc-ADARB2-10:2 No - lnc-ADARB2-10:1 No - lnc-ADARB2-10:3 No - LINC00700:1 No - lnc-WDR37-6:1 No - lnc-WDR37-6:2 No - lnc-PFKP-35:1 No - lnc-ADARB2-11:1 No - lnc-ADARB2-4:3 No - lnc-ADARB2-4:5 No - lnc-ADARB2-4:2 No - LINC00701:3 No - LINC00701:2 No - lnc-PITRM1-13:2 No - lnc-PITRM1-13:3 No - lnc-PFKP-28:1 No - lnc-PFKP-27:1 No - lnc-PFKP-27:2 No - lnc-PFKP-9:6 No - lnc-PFKP-23:1 No - lnc-PFKP-21:1 No - lnc-PFKP-19:1 No - lnc-PITRM1-2:7 No - lnc-PITRM1-2:5 Yes chr2R:10109740-10117457 lnc-PITRM1-2:4 Yes chr2R:10109740-10117457 lnc-PITRM1-8:1 Yes chr2R:5090581-5095090 lnc-KLF6-16:1 Yes chr2R:5090581-5095090 lnc-PFKP-18:1 No - lnc-PFKP-20:1 No - lnc-PITRM1-9:1 No - lnc-PITRM1-1:2 No - lnc-PFKP-22:1 No - lnc-PFKP-6:2 No - lnc-PITRM1-11:1 No - lnc-PFKP-24:1 No - lnc-PFKP-24:2 No - lnc-PFKP-25:1 No - lnc-PFKP-11:2 No - lnc-PFKP-26:1 No - lnc-KLF6-5:10 No - lnc-KLF6-5:7 No - lnc-KLF6-5:8 No - lnc-KLF6-13:1 No - lnc-KLF6-13:2 No - lnc-KLF6-12:1 No - lnc-PFKP-7:2 No - lnc-KLF6-9:1 No - lnc-PFKP-11:3 No - lnc-PFKP-11:4 No - lnc-PFKP-12:2 No - lnc-PFKP-30:1 No - lnc-PFKP-31:1 No - lnc-KLF6-8:3 Yes chr2R:10977956-11116378 lnc-PFKP-32:1 No - lnc-PFKP-33:1 No - lnc-PFKP-16:3 No - lnc-PFKP-16:4 No - lnc-PFKP-34:2 No - lnc-PFKP-34:3 No - lnc-PFKP-16:6 No - lnc-PFKP-16:7 No - lnc-KLF6-11:1 No - lnc-PFKP-16:9 No - lnc-AKR1E2-12:1 No - lnc-AKR1E2-5:8 No - lnc-AKR1E2-5:9 No - lnc-AKR1E2-11:1 No - LINC00702:16 No - LINC00702:15 No - LINC00702:6 No - lnc-KLF6-14:1 No - lnc-KLF6-14:2 No - lnc-AKR1E2-9:1 No - lnc-AKR1C2-10:2 No - lnc-AKR1E2-9:3 No - lnc-AKR1C2-10:1 No - LINC00703:4 No - MANCR:33 No - MANCR:22 No - MANCR:37 No - MANCR:41 No - MANCR:38 No - lnc-AKR1E2-8:1 No - MANCR:36 No - lnc-AKR1E2-7:1 No - lnc-AKR1E2-7:2 No - lnc-AKR1C2-8:1 No - lnc-AKR1E2-6:1 No - lnc-AKR1C2-3:3 No - lnc-AKR1C2-7:2 Yes chr3L:11620535-11626125 lnc-AKR1C3-1:2 Yes chr3L:11620535-11624381 lnc-AKR1C3-4:1 Yes chr3L:11620535-11624381 lnc-AKR1C1-2:3 Yes chr3L:11620535-11624381 lnc-AKR1C2-6:1 Yes chr3L:11620535-11624381 lnc-AKR1C2-6:2 Yes chr3L:11620535-11624381 lnc-AKR1C2-6:3 Yes chr3L:11620535-11624381 lnc-AKR1C2-6:4 Yes chr3L:11620535-11624381 lnc-AKR1C3-5:1 Yes chr3L:11620535-11624381 lnc-AKR1C4-3:1 No - lnc-TUBAL3-3:1 No - lnc-TUBAL3-1:1 No - lnc-UCN3-1:1 No - lnc-ASB13-5:1 No - lnc-ASB13-3:2 No - lnc-FAM208B-7:1 No - lnc-FAM208B-6:1 No - lnc-ASB13-4:3 No - lnc-GDI2-5:1 No - lnc-GDI2-4:1 No - lnc-FAM208B-2:1 No - lnc-FAM208B-1:1 No - lnc-GDI2-1:2 No - lnc-GDI2-1:3 No - lnc-FAM208B-9:1 Yes chr2L:9491176-9494876 lnc-GDI2-2:1 No - lnc-GDI2-3:1 No - lnc-FBXO18-1:1 No - lnc-IL15RA-2:2 No - lnc-IL15RA-2:1 No - lnc-IL15RA-2:3 No - lnc-IL15RA-4:1 No - lnc-IL2RA-4:1 No - lnc-RBM17-3:1 Yes chrX:19495505-19509350 lnc-IL2RA-5:3 Yes chrX:19495505-19509350 lnc-IL2RA-5:2 Yes chrX:19495505-19509350 lnc-PRKCQ-4:1 No - lnc-PFKFB3-3:1 No - lnc-IL2RA-6:1 Yes chrX:12432224-12453650 PRKCQ-AS1:7 No - lnc-PRKCQ-3:1 No - PRKCQ-AS1:25 No - PRKCQ-AS1:33 No - PRKCQ-AS1:52 No - lnc-PFKFB3-9:2 No - lnc-PRKCQ-2:2 No - lnc-PFKFB3-10:2 No - LINC00707:1 No - lnc-PFKFB3-4:1 No - lnc-PFKFB3-4:2 No - lnc-PRKCQ-5:1 No - LINC00707:10 No - lnc-PRKCQ-7:1 No - lnc-SFMBT2-2:3 No - lnc-SFMBT2-4:1 No - lnc-ITIH2-11:1 No - lnc-ITIH2-10:1 No - lnc-SFMBT2-3:1 No - lnc-ITIH2-9:1 No - lnc-ITIH2-8:1 No - lnc-ITIH5-1:1 No - lnc-ITIH2-1:2 No - lnc-KIN-6:1 Yes chr4:459887-466828 GATA3-AS1:11 Yes chr3R:8147368-8181444 GATA3-AS1:12 Yes chr3R:8147368-8181444 lnc-TAF3-1:12 Yes chr3R:8147368-8181444 lnc-GATA3-11:1 No - lnc-KIN-8:3 No - lnc-KIN-8:2 No - lnc-GATA3-12:1 No - lnc-GATA3-14:1 No - lnc-GATA3-13:1 No - lnc-GATA3-15:1 No - lnc-GATA3-16:1 No - lnc-GATA3-6:2 No - lnc-GATA3-17:1 No - lnc-GATA3-7:4 No - lnc-GATA3-7:2 No - lnc-GATA3-19:1 No - lnc-GATA3-19:2 No - lnc-GATA3-20:1 No - lnc-GATA3-21:1 No - lnc-GATA3-22:1 No - lnc-USP6NL-11:1 No - lnc-USP6NL-19:1 No - lnc-CELF2-10:1 No - lnc-CELF2-9:1 No - lnc-CELF2-9:2 No - lnc-USP6NL-8:5 No - lnc-CELF2-8:1 No - lnc-USP6NL-17:1 No - lnc-USP6NL-8:9 No - lnc-USP6NL-8:6 No - lnc-USP6NL-8:7 No - lnc-USP6NL-8:2 No - lnc-USP6NL-7:22 No - lnc-USP6NL-7:23 No - lnc-USP6NL-7:6 No - lnc-USP6NL-7:8 No - lnc-USP6NL-15:3 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-USP6NL-15:2 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-USP6NL-15:1 Yes chr2L:12344219-12397528 LINC00710:26 Yes chr2L:12344219-12397528 LINC00710:9 Yes chr2L:12344219-12397528 LINC00710:1 Yes chr2L:12344219-12397528 LINC00710:22 Yes chr2L:12344219-12397528 LINC00710:16 Yes chr2L:12344219-12397528 LINC00710:5 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-ECHDC3-11:1 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-USP6NL-14:2 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-USP6NL-14:3 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-USP6NL-14:1 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-ECHDC3-10:1 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-ECHDC3-2:2 Yes chr2L:12344219-12397528 CELF2-AS2:3 Yes chr2L:12344219-12397528 CELF2-AS2:9 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-ECHDC3-9:1 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-ECHDC3-8:1 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-ECHDC3-7:1 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-ECHDC3-5:1 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-CELF2-6:1 No - lnc-CELF2-7:1 Yes chr2R:13984815-13990707 lnc-ECHDC3-4:1 Yes chr2R:13984815-13990707 lnc-USP6NL-2:1 No - lnc-ECHDC3-1:2 No - PROSER2-AS1:1 No - PROSER2-AS1:5 No - PROSER2-AS1:6 No - lnc-PROSER2-2:1 No - lnc-NUDT5-5:1 Yes chrX:8070244-8075466 lnc-NUDT5-3:1 Yes chrX:8070244-8075466 lnc-DHTKD1-2:1 No - lnc-DHTKD1-1:1 No - lnc-UPF2-4:1 No - lnc-NUDT5-1:2 No - lnc-CDC123-1:1 No - lnc-CDC123-2:1 No - lnc-NUDT5-4:1 No - lnc-CAMK1D-1:1 Yes chr4:445504-453947 lnc-CAMK1D-1:2 Yes chr4:445504-453947 lnc-CCDC3-1:1 No - lnc-CCDC3-2:1 No - lnc-CCDC3-3:1 No - lnc-CCDC3-4:1 No - lnc-CCDC3-5:1 No - lnc-CCDC3-6:1 No - lnc-MCM10-2:1 No - lnc-SEPHS1-1:2 No - lnc-SEPHS1-1:1 No - lnc-PHYH-2:1 Yes chr2R:14268772-14270658 lnc-MCM10-1:2 No - lnc-BEND7-1:2 No - lnc-BEND7-1:4 No - lnc-BEND7-1:3 No - lnc-BEND7-1:1 No - lnc-PRPF18-13:1 No - lnc-BEND7-5:9 No - lnc-BEND7-5:1 No - lnc-BEND7-5:5 No - lnc-PRPF18-9:1 No - lnc-FRMD4A-2:1 Yes chr3R:19029968-19031271 lnc-PRPF18-1:6 No - lnc-PRPF18-1:11 No - lnc-PRPF18-1:12 No - lnc-PRPF18-1:13 No - lnc-BEND7-2:1 No - lnc-PRPF18-1:18 No - lnc-BEND7-3:1 No - lnc-BEND7-3:2 No - lnc-PRPF18-4:2 No - lnc-PRPF18-12:1 No - lnc-PRPF18-5:2 No - lnc-PRPF18-7:2 No - lnc-PRPF18-7:3 No - lnc-BEND7-4:1 No - lnc-PRPF18-8:2 No - lnc-PRPF18-8:3 No - lnc-PRPF18-8:4 No - lnc-PRPF18-8:5 No - lnc-FRMD4A-3:1 No - lnc-FRMD4A-4:1 No - lnc-FRMD4A-5:1 No - lnc-FRMD4A-6:1 No - lnc-DCLRE1C-1:1 Yes chr3L:8344421-8346382 lnc-DCLRE1C-1:2 Yes chr3L:8344421-8346382 lnc-DCLRE1C-1:4 No - lnc-CDNF-2:3 Yes chr3R:5555084-5557786 lnc-CDNF-3:1 Yes chr3R:5555084-5557786 lnc-ACBD7-1:1 No - lnc-ACBD7-2:1 No - lnc-OLAH-1:1 No - lnc-NMT2-2:2 No - lnc-NMT2-2:1 No - lnc-NMT2-3:1 No - lnc-MINDY3-2:1 Yes chrX:16752189-16783434 lnc-MINDY3-1:1 Yes chrX:16752189-16783434 lnc-ITGA8-1:1 Yes chrX:18884513-18888860 lnc-PTER-6:1 No - lnc-PTER-5:1 No - lnc-MINDY3-3:1 No - lnc-PTER-4:1 No - lnc-PTER-4:2 No - lnc-C1QL3-2:1 No - lnc-C1QL3-1:1 No - lnc-RSU1-1:1 Yes chr3L:11801951-11814755 lnc-TRDMT1-4:1 Yes chr3L:11801951-11814755 VIM-AS1:16 Yes chr2L:12096525-12097687 VIM-AS1:17 Yes chr2L:12096525-12097687 VIM-AS1:18 Yes chr2L:12096525-12097687 VIM-AS1:14 Yes chr2L:12096525-12097687 VIM-AS1:15 Yes chr2L:12096525-12097687 VIM-AS1:13 Yes chr2L:12096525-12097687 VIM-AS1:3 No - VIM-AS1:6 No - lnc-ST8SIA6-3:1 No - ST8SIA6-AS1:1 No - ST8SIA6-AS1:3 No - lnc-ST8SIA6-2:1 No - lnc-STAM-3:1 No - lnc-STAM-2:1 No - lnc-ST8SIA6-4:1 Yes chr2L:12001234-12002266 lnc-HACD1-4:1 No - lnc-STAM-1:1 No - lnc-NSUN6-4:2 No - lnc-NSUN6-1:4 No - lnc-NSUN6-1:3 No - lnc-HACD1-5:1 Yes chr3L:22872200-22873702 lnc-CACNB2-1:1 Yes chr3L:8298501-8299839 lnc-ARL5B-5:1 No - lnc-ARL5B-6:1 No - lnc-MALRD1-7:1 No - lnc-ARL5B-8:1 No - lnc-NSUN6-7:1 No - lnc-PLXDC2-4:1 No - lnc-NSUN6-8:4 No - lnc-PLXDC2-2:1 No - lnc-NEBL-3:4 No - lnc-NEBL-3:3 No - lnc-NEBL-3:2 No - lnc-PLXDC2-3:1 No - lnc-PLXDC2-5:1 No - lnc-PLXDC2-9:1 Yes chr3L:16676406-16711677 lnc-C10orf113-3:2 Yes chr3L:16676406-16711677 lnc-C10orf113-3:3 Yes chr3L:16676406-16711677 lnc-C10orf113-3:1 Yes chr3L:16676406-16711677 lnc-PLXDC2-10:1 Yes chr3L:16676406-16711677 lnc-MLLT10-6:1 Yes chr3L:16676406-16711677 lnc-C10orf113-1:1 Yes chr3L:16676406-16711677 lnc-C10orf113-2:2 Yes chr3L:16676406-16711677 lnc-C10orf113-2:1 Yes chr3L:16676406-16711677 NEBL-AS1:3 No - NEBL-AS1:4 No - lnc-MLLT10-4:1 No - lnc-CASC10-6:1 No - lnc-CASC10-4:1 No - lnc-CASC10-3:1 No - lnc-CASC10-5:1 No - lnc-SKIDA1-1:1 Yes chr3R:7094596-7124185 lnc-SKIDA1-2:1 Yes chrX:19176109-19179830 lnc-MLLT10-2:1 Yes chrX:19176109-19179830 lnc-MLLT10-3:1 Yes chrX:19176109-19179830 lnc-COMMD3-5:1 No - lnc-COMMD3-4:1 No - lnc-EBLN1-1:9 No - lnc-COMMD3-1:2 No - lnc-COMMD3-1:3 No - lnc-COMMD3-3:1 No - lnc-PIP4K2A-1:1 No - lnc-PIP4K2A-1:2 No - lnc-BMI1-2:5 No - lnc-EBLN1-6:1 Yes chr4:1192419-1196848 lnc-EBLN1-7:1 Yes chr4:1192419-1196848 lnc-EBLN1-8:1 Yes chr4:1192419-1196848 lnc-C10orf67-2:6 No - lnc-PTF1A-1:1 No - lnc-OTUD1-2:1 Yes chrX:1673110-1692768 lnc-OTUD1-3:1 Yes chrX:1673110-1692768 lnc-THNSL1-3:2 Yes chrX:1673110-1692768 lnc-ARHGAP21-1:2 Yes chrX:1673110-1692768 lnc-ARHGAP21-4:1 Yes chrX:1673110-1692768 lnc-PRTFDC1-4:1 Yes chrX:20469955-20510694 lnc-PRTFDC1-3:1 Yes chrX:20469955-20510694 lnc-PRTFDC1-2:1 Yes chrX:20469955-20510694 lnc-PRTFDC1-1:3 Yes chrX:20469955-20510694 lnc-PRTFDC1-1:1 Yes chrX:20469955-20510694 lnc-PRTFDC1-1:2 Yes chrX:20469955-20510694 lnc-ARHGAP21-2:1 No - lnc-THNSL1-5:1 No - lnc-ENKUR-3:1 No - lnc-THNSL1-4:1 No - lnc-ENKUR-2:2 Yes chr3L:2595781-2596998 LINC01516:2 No - LINC01516:3 No - lnc-GPR158-3:1 No - lnc-ENKUR-4:1 Yes chr2L:12142780-12170508 lnc-ENKUR-6:1 Yes chr2L:12142780-12170508 lnc-ENKUR-7:1 No - LINC00836:1 No - LINC00836:4 No - lnc-GPR158-4:1 No - lnc-GPR158-4:3 No - lnc-ABI1-5:3 No - lnc-ABI1-5:2 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-ABI1-10:1 No - lnc-APBB1IP-4:1 No - lnc-APBB1IP-4:3 No - lnc-PDSS1-9:1 Yes chrX:19830215-19852059 lnc-PDSS1-7:1 Yes chrX:19830215-19852059 lnc-ABI1-9:1 No - lnc-APBB1IP-1:6 No - lnc-APBB1IP-1:7 No - lnc-APBB1IP-1:10 No - lnc-ABI1-8:3 No - lnc-ABI1-8:2 No - lnc-APBB1IP-3:1 No - lnc-APBB1IP-1:12 No - lnc-PDSS1-5:1 No - lnc-PDSS1-3:1 No - lnc-PDSS1-3:2 No - lnc-PDSS1-3:3 No - lnc-ABI1-7:1 No - lnc-ABI1-6:1 Yes chr3R:31236035-31252608 lnc-APBB1IP-5:1 Yes chr3R:31236035-31252608 FAM238C:9 No - FAM238C:11 No - FAM238C:14 No - lnc-ANKRD26-5:1 No - lnc-ANKRD26-1:2 No - lnc-ANKRD26-1:5 No - lnc-ANKRD26-1:4 No - lnc-ANKRD26-1:3 No - lnc-ANKRD26-4:1 No - lnc-YME1L1-1:2 No - lnc-YME1L1-1:1 No - lnc-ACBD5-1:2 No - lnc-ACBD5-1:4 No - lnc-MASTL-3:1 No - lnc-MASTL-3:2 No - lnc-ACBD5-4:1 No - lnc-MASTL-4:1 Yes chrX:5670827-5671812 lnc-MASTL-6:1 Yes chrX:5670827-5671812 lnc-MASTL-7:1 Yes chrX:5670827-5671812 MKX-AS1:4 No - lnc-ARMC4-1:2 No - lnc-ARMC4-2:1 Yes chr2L:7388508-7390902 lnc-ARMC4-2:2 Yes chr2L:7388508-7390902 lnc-RAB18-4:1 Yes chr2L:7388508-7390902 lnc-RAB18-5:1 Yes chr2L:7388508-7390902 lnc-RAB18-7:1 No - lnc-ARMC4-3:1 Yes chr2R:11226458-11232516 lnc-MPP7-5:1 No - lnc-MPP7-6:1 No - lnc-WAC-1:1 No - WAC-AS1:2 Yes chrX:17068717-17077897 WAC-AS1:7 No - WAC-AS1:4 Yes chrX:17068717-17077897 lnc-MPP7-7:1 No - lnc-BAMBI-2:1 No - LINC01517:4 No - LINC01517:6 No - LINC01517:31 No - LINC00837:5 No - LINC00837:2 No - LINC00837:3 No - LINC01517:12 No - LINC01517:13 No - LINC01517:14 No - LINC01517:15 No - LINC01517:17 No - lnc-MPP7-8:3 No - lnc-MPP7-8:1 No - LINC01517:33 No - LINC01517:36 No - lnc-LYZL1-5:2 No - lnc-LYZL1-2:2 No - lnc-SVIL-5:2 No - lnc-SVIL-5:1 No - lnc-SVIL-4:1 No - lnc-LYZL1-1:2 No - lnc-LYZL1-15:7 No - lnc-SVIL-3:1 No - lnc-LYZL1-7:1 No - lnc-LYZL1-8:1 No - lnc-LYZL1-9:1 No - lnc-LYZL1-15:29 Yes chr3L:2377655-2499226 lnc-JCAD-11:1 Yes chr3L:2377655-2499226 lnc-JCAD-10:1 Yes chr3L:2377655-2499226 lnc-JCAD-9:1 Yes chr3L:2377655-2499226 lnc-JCAD-8:1 Yes chr3L:2377655-2499226 lnc-JCAD-7:1 Yes chr3L:2377655-2499226 lnc-LYZL1-12:1 Yes chr3L:2377655-2499226 lnc-LYZL1-6:2 No - lnc-JCAD-4:1 No - lnc-MAP3K8-19:1 No - lnc-MAP3K8-6:3 No - lnc-MAP3K8-5:2 No - lnc-SVIL-6:1 No - lnc-MAP3K8-16:1 No - lnc-JCAD-3:1 No - lnc-MAP3K8-11:1 No - lnc-MTPAP-3:1 No - lnc-MTPAP-6:4 Yes chrX:1344872-1349357 lnc-JCAD-5:1 Yes chrX:1344872-1349357 lnc-MTPAP-6:2 Yes chrX:1344872-1349357 lnc-MTPAP-6:3 Yes chrX:1344872-1349357 lnc-MTPAP-6:5 Yes chrX:1344872-1349357 lnc-MTPAP-6:1 Yes chrX:1344872-1349357 lnc-MTPAP-6:6 Yes chrX:1344872-1349357 lnc-LYZL2-4:1 Yes chrX:1344872-1349357 lnc-MAP3K8-10:1 No - lnc-MAP3K8-9:1 No - lnc-MAP3K8-7:1 No - lnc-LYZL2-3:1 No - lnc-LYZL2-2:1 No - lnc-MAP3K8-12:1 No - lnc-MAP3K8-14:2 No - lnc-MAP3K8-15:1 No - lnc-LYZL2-10:2 No - lnc-LYZL2-5:1 No - lnc-LYZL2-6:1 No - lnc-ZEB1-4:2 No - ZEB1-AS1:10 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB1-AS1:4 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-ZEB1-3:1 No - ZEB1-AS1:14 No - ZEB1-AS1:11 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB1-AS1:6 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB1-AS1:15 No - lnc-MAP3K8-21:2 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-MAP3K8-20:1 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-MAP3K8-25:1 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-ZEB1-5:1 No - lnc-ARHGAP12-3:1 No - lnc-ARHGAP12-2:1 No - lnc-KIF5B-2:2 No - lnc-KIF5B-2:1 No - lnc-ZEB1-6:1 No - lnc-ZEB1-7:1 No - lnc-ZEB1-8:1 No - lnc-KIF5B-1:1 No - lnc-CCDC7-6:1 No - lnc-EPC1-2:1 No - lnc-KIF5B-3:1 Yes chr2R:11452043-11465270 lnc-KIF5B-4:3 Yes chr2R:11452043-11465270 lnc-KIF5B-4:2 Yes chr2R:11452043-11465270 lnc-KIF5B-4:1 Yes chr2R:11452043-11465270 lnc-KIF5B-5:2 Yes chr2R:11452043-11465270 lnc-KIF5B-5:3 Yes chr2R:11452043-11465270 lnc-KIF5B-6:1 Yes chr2R:11452043-11465270 lnc-EPC1-3:1 No - lnc-EPC1-5:1 No - lnc-NRP1-6:1 Yes chrX:8061645-8070237 lnc-CCDC7-9:2 Yes chrX:8061645-8070237 ITGB1-DT:25 Yes chrX:8061645-8070237 ITGB1-DT:40 Yes chrX:8061645-8070237 lnc-ITGB1-2:1 No - lnc-ITGB1-3:1 No - lnc-NRP1-4:2 No - lnc-ITGB1-4:2 No - lnc-ITGB1-5:1 No - lnc-NRP1-7:1 No - lnc-CCDC7-19:1 No - LINC00838:2 No - LINC00838:1 No - LINC00838:6 No - lnc-CCDC7-20:1 No - lnc-CCDC7-22:1 No - lnc-NRP1-8:1 Yes chrX:17160006-17200728 lnc-CREM-6:1 Yes chrX:17160006-17200728 lnc-CREM-6:2 Yes chrX:17160006-17200728 lnc-CUL2-6:1 Yes chrX:17160006-17200728 lnc-CUL2-5:1 Yes chrX:17160006-17200728 lnc-CUL2-4:1 Yes chrX:17160006-17200728 PARD3-AS1:1 No - PARD3-AS1:2 No - lnc-CREM-4:1 No - lnc-CREM-3:1 No - lnc-CREM-2:1 No - lnc-PARD3-2:1 Yes chr2L:21658735-21663698 lnc-PARD3-2:2 Yes chr2L:21658735-21663698 lnc-CCNY-3:1 Yes chrX:18366357-18377864 lnc-CCNY-1:1 Yes chrX:18366357-18377864 lnc-CUL2-3:2 Yes chr2L:11810092-11813780 lnc-CUL2-3:3 Yes chr2L:11810092-11813780 lnc-CUL2-3:1 Yes chr2L:11810092-11813780 lnc-FZD8-2:2 No - lnc-FZD8-2:1 No - PCAT5:2 No - lnc-FZD8-3:1 No - lnc-FZD8-4:1 No - lnc-ANKRD30A-13:1 No - lnc-ANKRD30A-13:2 No - lnc-MTRNR2L7-3:1 No - lnc-ANKRD30A-11:1 No - lnc-ZNF33A-13:1 No - lnc-ZNF33A-137:1 No - lnc-ZNF33A-12:1 No - lnc-ZNF33A-11:1 No - lnc-MTRNR2L7-2:1 No - lnc-ZNF33A-137:9 No - lnc-ZNF33A-10:1 No - lnc-ZNF33A-9:1 No - lnc-ANKRD30A-5:2 No - lnc-ANKRD30A-5:3 No - lnc-ANKRD30A-5:4 No - lnc-ANKRD30A-12:1 No - lnc-MTRNR2L7-1:1 No - lnc-ZNF25-4:2 No - lnc-ZNF25-4:1 No - lnc-ZNF25-2:1 No - lnc-ZNF33A-2:8 No - lnc-ZNF33A-5:1 No - lnc-ZNF33A-1:2 No - lnc-ZNF25-1:1 No - lnc-ZNF33A-6:2 No - lnc-ZNF33A-7:2 No - lnc-ZNF37A-1:3 No - lnc-ZNF37A-11:1 No - lnc-ZNF25-3:8 No - lnc-ZNF25-3:6 No - lnc-ZNF25-3:5 No - lnc-ZNF25-3:7 No - LINC00999:8 No - lnc-ZNF25-7:1 No - lnc-ZNF25-6:1 No - lnc-ZNF37A-13:1 No - lnc-ZNF37A-14:1 No - lnc-ZNF37A-15:1 No - lnc-ZNF37A-16:1 No - lnc-ZNF25-9:6 No - lnc-ZNF25-9:1 No - lnc-ZNF25-9:3 No - lnc-ZNF25-9:2 No - lnc-ZNF37A-5:3 No - lnc-ZNF37A-18:1 No - lnc-ZNF37A-18:2 No - lnc-ZNF25-10:1 No - lnc-ZNF37A-19:1 No - lnc-ZNF33B-13:1 No - lnc-ZNF33B-12:1 No - lnc-BMS1-11:2 No - lnc-BMS1-10:3 No - lnc-ZNF33B-14:1 No - lnc-ZNF33B-11:1 No - lnc-BMS1-9:1 No - lnc-BMS1-8:1 No - lnc-ZNF33B-10:1 No - lnc-BMS1-7:1 No - lnc-BMS1-7:2 No - lnc-ZNF33B-9:1 No - lnc-BMS1-6:1 No - lnc-ZNF33B-8:1 No - lnc-ZNF33B-7:1 No - lnc-ZNF33B-6:1 No - lnc-ZNF33B-6:2 No - lnc-ZNF33B-6:3 No - LINC00839:2 No - LINC00839:3 No - LINC00839:6 No - LINC00839:9 No - LINC00839:10 No - LINC00839:11 No - LINC00839:12 No - LINC00839:13 No - LINC00839:14 No - LINC00839:15 No - LINC00839:17 No - lnc-ZNF33B-4:1 No - lnc-ZNF33B-4:4 No - lnc-ZNF33B-4:14 No - lnc-ZNF33B-4:16 No - lnc-ZNF33B-4:2 No - lnc-ZNF33B-4:12 No - lnc-ZNF33B-4:11 No - lnc-ZNF33B-4:9 No - lnc-ZNF33B-4:8 No - lnc-ZNF33B-4:7 No - lnc-ZNF33B-4:15 No - lnc-ZNF33B-4:10 No - lnc-ZNF33B-4:6 No - lnc-ZNF33B-4:5 No - lnc-ZNF33B-4:3 No - lnc-ZNF33B-4:13 No - lnc-ZNF33B-3:6 No - lnc-ZNF33B-3:2 No - lnc-ZNF33B-3:3 No - lnc-ZNF33B-3:1 No - lnc-BMS1-5:1 No - LINC01518:2 No - LINC01518:7 No - LINC01518:8 No - LINC01518:1 No - lnc-BMS1-4:1 No - lnc-ZNF33B-5:1 No - lnc-RET-2:1 No - lnc-RASGEF1A-3:2 Yes chr2L:21182446-21198762 lnc-RASGEF1A-3:3 Yes chr2L:21182446-21198762 lnc-CSGALNACT2-1:1 No - lnc-HNRNPF-3:2 Yes chr2R:17514217-17517445 lnc-CSGALNACT2-2:2 Yes chr2R:17514217-17517445 lnc-HNRNPF-2:1 Yes chr2R:17514217-17517445 lnc-CSGALNACT2-4:1 Yes chr2R:17514217-17517445 lnc-FXYD4-1:3 No - lnc-FXYD4-3:1 No - lnc-FXYD4-2:1 No - lnc-ZNF487-4:3 No - lnc-ZNF487-1:3 No - lnc-ZNF487-3:1 No - lnc-ZNF487-2:1 No - lnc-HNRNPF-1:1 No - lnc-FXYD4-4:2 No - lnc-FXYD4-4:3 No - lnc-ZNF487-7:1 No - lnc-ZNF487-5:1 No - lnc-ZNF239-1:1 No - lnc-ZNF32-5:1 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-ZNF485-5:1 No - lnc-ZNF485-6:1 No - lnc-ZNF239-2:1 Yes chr2L:4463611-4465075 lnc-ZNF485-7:1 No - lnc-ZNF485-8:1 No - lnc-ZNF32-6:1 No - lnc-ZNF32-2:4 No - lnc-ZNF485-68:1 No - lnc-ZNF485-68:9 No - lnc-ZNF485-68:12 No - lnc-ZNF485-68:19 No - lnc-ZNF32-8:1 No - lnc-ZNF32-9:1 No - lnc-ZNF485-68:28 No - lnc-C10orf142-4:1 No - lnc-C10orf142-5:1 No - lnc-DEPP1-1:1 No - lnc-CXCL12-4:1 No - lnc-CXCL12-4:2 No - lnc-CXCL12-5:1 No - lnc-C10orf142-3:1 No - lnc-C10orf142-3:2 No - lnc-TMEM72-2:1 No - TMEM72-AS1:2 No - TMEM72-AS1:3 No - TMEM72-AS1:4 No - lnc-RASSF4-2:1 No - lnc-TMEM72-1:3 No - TMEM72-AS1:15 Yes chr3R:23114014-23117931 lnc-DEPP1-3:1 Yes chr3R:23114014-23117931 lnc-DEPP1-2:19 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-DEPP1-2:8 No - lnc-DEPP1-2:21 No - lnc-DEPP1-2:3 No - lnc-ZNF22-5:1 No - lnc-DEPP1-2:14 No - lnc-DEPP1-2:20 No - lnc-DEPP1-2:15 No - lnc-DEPP1-2:16 No - lnc-DEPP1-2:17 No - lnc-DEPP1-2:22 No - lnc-DEPP1-4:1 No - lnc-DEPP1-2:9 No - lnc-DEPP1-2:4 No - lnc-DEPP1-2:2 No - lnc-DEPP1-2:11 No - lnc-DEPP1-2:5 No - lnc-ZNF22-2:2 No - lnc-DEPP1-2:7 No - lnc-ZNF22-2:3 No - lnc-ZNF22-2:4 No - lnc-OR13A1-5:1 No - lnc-ZNF22-2:5 No - lnc-ZNF22-2:6 No - lnc-OR13A1-3:1 No - lnc-OR13A1-2:1 No - lnc-WASHC2C-4:1 No - lnc-OR13A1-4:1 Yes chr3L:9386827-9399227 lnc-ALOX5-1:1 Yes chr3L:9386827-9399227 lnc-ZFAND4-1:2 Yes chr3L:9386827-9399227 lnc-MARCH8-2:1 Yes chrX:9215785-9216540 lnc-MARCH8-3:3 Yes chrX:9215785-9216540 lnc-MARCH8-3:2 Yes chrX:9215785-9216540 lnc-ZFAND4-2:1 No - lnc-ZFAND4-2:2 No - lnc-ZFAND4-4:1 No - lnc-ZFAND4-3:1 No - lnc-AGAP4-3:1 No - lnc-NCOA4-5:1 Yes chr2L:13835564-13898712 lnc-AGAP4-2:3 No - lnc-WASHC2C-1:1 No - lnc-PTPN20-2:1 No - lnc-PTPN20-3:1 No - lnc-PTPN20-3:2 No - lnc-PTPN20-1:1 No - lnc-GPRIN2-4:1 No - lnc-GPRIN2-4:3 No - lnc-SYT15-4:1 No - lnc-GPRIN2-2:1 No - lnc-SYT15-1:3 No - lnc-SYT15-1:9 No - lnc-SYT15-1:4 No - lnc-SYT15-6:1 No - lnc-SYT15-5:1 No - lnc-SYT15-2:3 No - lnc-NPY4R-4:1 No - lnc-NPY4R-1:1 No - lnc-NPY4R-1:2 No - lnc-FAM25C-1:7 No - lnc-AGAP9-39:2 No - lnc-AGAP9-2:4 No - lnc-AGAP9-3:3 No - lnc-MSMB-6:7 No - lnc-MSMB-6:3 No - lnc-MSMB-6:4 No - lnc-MSMB-6:6 No - lnc-MSMB-6:2 No - lnc-NPY4R-5:1 No - lnc-ANXA8L1-1:2 No - lnc-GPRIN2-4:2 No - lnc-ANXA8-1:2 No - lnc-ANXA8-1:3 No - lnc-FAM25G-2:1 Yes chrX:20171445-20173514 lnc-PTPN20-6:1 No - lnc-PTPN20-6:2 No - lnc-PTPN20-5:1 No - lnc-PTPN20-4:1 No - lnc-RBP3-2:1 No - lnc-RBP3-2:2 No - lnc-RBP3-2:3 No - lnc-AGAP9-3:4 No - lnc-FAM25C-31:3 No - lnc-FAM25C-31:1 No - lnc-FAM25C-1:6 No - lnc-FAM25C-6:1 No - lnc-MAPK8-4:1 No - lnc-ARHGAP22-7:1 No - lnc-MAPK8-3:1 No - lnc-FRMPD2-2:1 Yes chr2L:10247502-10250501 lnc-ARHGAP22-2:1 No - lnc-FRMPD2-5:4 No - lnc-FRMPD2-5:1 No - lnc-FRMPD2-5:5 No - ARHGAP22-IT1:1 No - ARHGAP22-IT1:2 No - lnc-FRMPD2-4:1 No - lnc-FRMPD2-5:2 No - lnc-FRMPD2-5:3 No - lnc-VSTM4-1:3 No - lnc-LRRC18-110:1 No - lnc-FAM170B-4:1 No - FAM170B-AS1:1 No - FAM170B-AS1:2 No - FAM170B-AS1:7 No - FAM170B-AS1:8 No - FAM170B-AS1:9 No - FAM170B-AS1:10 No - lnc-FAM170B-1:1 No - C10orf71-AS1:2 No - C10orf71-AS1:5 No - lnc-CHAT-2:1 No - lnc-C10orf71-3:1 No - lnc-ERCC6-1:1 No - lnc-DRGX-2:7 No - lnc-DRGX-3:1 No - lnc-DRGX-4:1 No - lnc-CHAT-1:1 No - lnc-C10orf53-1:1 No - lnc-C10orf53-2:1 No - lnc-OGDHL-1:1 Yes chrX:3668837-3671502 lnc-OGDHL-2:1 Yes chrX:3668837-3671502 lnc-TIMM23B-1:5 Yes chrX:3668837-3671502 lnc-AGAP4-3:2 No - lnc-TIMM23-1:2 No - lnc-MSMB-1:2 No - lnc-MSMB-1:3 No - lnc-MSMB-1:4 No - lnc-MSMB-1:5 No - lnc-MSMB-1:6 No - lnc-MSMB-3:1 No - lnc-WASHC2C-2:1 Yes chr2L:23312465-23313578 lnc-TIMM23-1:1 No - lnc-AGAP6-1:1 No - lnc-WASHC2A-1:1 No - lnc-ASAH2-2:1 No - lnc-SGMS1-3:1 Yes chr3R:30459521-30465736 lnc-ASAH2-7:1 No - lnc-ASAH2-4:1 No - lnc-ASAH2-6:1 No - lnc-ASAH2-7:2 No - lnc-ASAH2B-3:2 No - SGMS1-AS1:1 No - SGMS1-AS1:5 No - lnc-SGMS1-2:1 No - lnc-ASAH2B-5:1 No - lnc-A1CF-7:1 No - lnc-A1CF-5:1 Yes chr3R:30459521-30465736 lnc-SGMS1-5:1 No - lnc-A1CF-6:1 No - lnc-PRKG1-1:2 No - lnc-A1CF-8:2 Yes chr2L:3622074-3656953 lnc-A1CF-8:1 Yes chr2L:3622074-3656953 lnc-ASAH2B-6:1 Yes chr2L:3622074-3656953 lnc-CSTF2T-2:3 Yes chr2L:3622074-3656953 lnc-CSTF2T-2:1 Yes chr2L:3622074-3656953 lnc-DKK1-2:1 Yes chr2L:3622074-3656953 PRKG1-AS1:1 No - PRKG1-AS1:5 Yes chr2L:3622074-3656953 PRKG1-AS1:7 Yes chr2L:3622074-3656953 PRKG1-AS1:9 Yes chr2L:3622074-3656953 lnc-MBL2-9:1 No - LNCAROD:14 No - LNCAROD:21 No - lnc-MBL2-3:3 No - lnc-MBL2-6:2 No - lnc-PCDH15-3:1 No - lnc-MBL2-7:1 No - lnc-MBL2-8:1 No - lnc-MBL2-2:8 No - lnc-DKK1-3:1 No - lnc-DKK1-4:1 No - lnc-MTRNR2L5-4:2 Yes chr3R:11893512-11949129 lnc-ZWINT-5:2 Yes chr3R:11893512-11949129 lnc-MTRNR2L5-5:1 No - lnc-ZWINT-1:2 No - lnc-MTRNR2L5-3:3 No - lnc-PCDH15-2:1 No - lnc-PCDH15-2:3 No - lnc-PCDH15-2:2 No - lnc-CISD1-6:1 No - lnc-CISD1-5:1 No - lnc-CISD1-4:1 No - lnc-CISD1-3:1 No - lnc-IPMK-2:1 No - lnc-FAM13C-5:1 Yes chr2L:573033-574264 lnc-CISD1-1:2 No - lnc-TFAM-3:1 Yes chr2L:16042047-16048757 lnc-TFAM-5:2 Yes chr2L:16042047-16048757 lnc-TFAM-7:1 Yes chr2L:16042047-16048757 lnc-BICC1-2:1 No - LINC00844:5 No - LINC00844:8 No - lnc-FAM13C-4:1 No - lnc-FAM13C-3:1 No - CCEPR:6 No - CCEPR:8 No - lnc-PHYHIPL-4:1 Yes chr2R:17703335-17719346 lnc-SLC16A9-6:2 Yes chr2R:17703335-17719346 lnc-SLC16A9-6:1 Yes chr2R:17703335-17719346 lnc-SLC16A9-5:2 Yes chr2R:17703335-17719346 lnc-PHYHIPL-5:1 Yes chr2R:17703335-17719346 lnc-PHYHIPL-6:1 Yes chr2R:17703335-17719346 lnc-SLC16A9-5:1 Yes chr2R:17703335-17719346 lnc-SLC16A9-4:1 No - lnc-MRLN-1:1 Yes chrX:2189188-2205373 lnc-SLC16A9-1:5 No - lnc-SLC16A9-1:4 No - lnc-SLC16A9-1:3 No - lnc-SLC16A9-1:9 No - lnc-SLC16A9-1:6 No - lnc-SLC16A9-1:8 No - lnc-SLC16A9-1:7 No - lnc-MRLN-3:1 Yes chr3L:17012886-17016180 lnc-CCDC6-3:1 Yes chr3L:7655389-7718395 lnc-CCDC6-4:1 Yes chr3L:7655389-7718395 lnc-CCDC6-5:1 Yes chr3L:7655389-7718395 lnc-CCDC6-6:1 Yes chr3L:7655389-7718395 lnc-RHOBTB1-2:1 Yes chr3L:7655389-7718395 lnc-CDK1-6:1 Yes chr3L:7655389-7718395 lnc-CDK1-5:1 Yes chr3L:7655389-7718395 lnc-CDK1-4:1 No - lnc-ANK3-1:5 Yes chr3L:20376242-20382398 lnc-ANK3-1:4 Yes chr3L:20376242-20382398 lnc-ANK3-1:3 Yes chr3L:20376242-20382398 LINC00845:4 Yes chr3L:20376242-20382398 lnc-TMEM26-1:1 Yes chr3R:26458249-26460981 lnc-CABCOCO1-1:6 No - lnc-TMEM26-3:5 No - lnc-TMEM26-3:2 No - lnc-RTKN2-4:1 Yes chrX:18843663-18855858 lnc-ZNF365-1:2 No - lnc-ZNF365-2:1 No - lnc-ZNF365-3:1 No - lnc-EGR2-1:3 No - lnc-EGR2-3:1 Yes chr3R:18090803-18135583 lnc-JMJD1C-4:1 Yes chr3R:9516007-9520938 lnc-EGR2-4:2 Yes chr3R:9516007-9520938 lnc-EGR2-4:1 Yes chr3R:9516007-9520938 lnc-EGR2-6:2 Yes chr3R:9516007-9520938 lnc-EGR2-6:1 Yes chr3R:9516007-9520938 lnc-NRBF2-2:1 Yes chr3R:9516007-9520938 lnc-EGR2-5:1 Yes chr3R:9516007-9520938 lnc-REEP3-5:1 Yes chr3R:9516007-9520938 lnc-JMJD1C-6:1 No - lnc-REEP3-3:1 No - lnc-JMJD1C-7:1 No - lnc-JMJD1C-8:1 No - lnc-JMJD1C-2:2 No - lnc-REEP3-2:10 No - lnc-JMJD1C-11:3 No - lnc-JMJD1C-11:2 No - lnc-JMJD1C-11:1 No - lnc-REEP3-2:11 No - lnc-JMJD1C-12:1 No - lnc-JMJD1C-13:1 No - lnc-REEP3-2:2 No - lnc-REEP3-2:3 No - lnc-CTNNA3-9:1 No - lnc-REEP3-8:1 No - lnc-REEP3-9:1 No - lnc-REEP3-10:1 No - lnc-CTNNA3-8:1 No - lnc-CTNNA3-7:1 No - lnc-LRRTM3-14:2 No - LINC01515:2 No - LINC01515:3 No - LINC01515:4 No - LINC01515:7 No - LINC01515:9 No - LINC01515:15 No - LINC01515:16 No - LINC01515:19 No - LINC01515:20 No - LINC01515:21 No - LINC01515:22 No - LINC01515:23 No - LINC01515:28 No - LINC01515:29 No - LINC01515:30 No - lnc-LRRTM3-13:1 No - lnc-LRRTM3-12:1 No - lnc-LRRTM3-11:1 No - lnc-LRRTM3-10:1 No - lnc-CTNNA3-6:1 No - lnc-LRRTM3-9:1 No - lnc-LRRTM3-8:1 No - lnc-CTNNA3-5:1 No - lnc-LRRTM3-7:1 No - lnc-LRRTM3-6:1 No - lnc-DNAJC12-7:1 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-SIRT1-9:2 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-LRRTM3-4:1 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-DNAJC12-6:1 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-DNAJC12-1:1 No - lnc-SIRT1-8:1 No - lnc-HERC4-3:1 Yes chr3R:30517059-30527037 lnc-SIRT1-4:1 Yes chr3R:30517059-30527037 lnc-SIRT1-3:1 No - lnc-HERC4-1:1 Yes chr2L:13165564-13169551 lnc-HERC4-1:2 Yes chr2L:13165564-13169551 lnc-DNAJC12-2:1 Yes chr3L:1313696-1318330 lnc-DNAJC12-3:1 Yes chr3L:1313696-1318330 lnc-DNAJC12-4:1 Yes chr3L:1313696-1318330 lnc-DNAJC12-5:1 Yes chr3L:1313696-1318330 lnc-ATOH7-4:1 Yes chr3L:1313696-1318330 lnc-ATOH7-3:1 Yes chr3L:1313696-1318330 lnc-ATOH7-3:2 Yes chr3L:1313696-1318330 lnc-ATOH7-3:3 Yes chr3L:1313696-1318330 lnc-HERC4-2:1 No - lnc-HNRNPH3-4:1 No - lnc-ATOH7-1:3 No - lnc-MYPN-1:1 No - lnc-MYPN-2:1 No - lnc-ATOH7-2:1 No - lnc-PBLD-1:4 Yes chr3R:27229505-27239085 lnc-PBLD-1:3 Yes chr3R:27229505-27239085 lnc-HNRNPH3-2:1 No - lnc-HNRNPH3-3:1 No - lnc-RUFY2-1:3 Yes chrX:10010481-10014279 lnc-RUFY2-2:1 Yes chrX:10010481-10014279 lnc-SLC25A16-1:2 No - lnc-DNA2-1:1 No - lnc-DNA2-1:3 No - lnc-TET1-3:1 No - lnc-DNA2-1:2 No - lnc-CCAR1-4:1 Yes chr3L:2786207-2879158 lnc-CCAR1-3:1 Yes chr3L:2786207-2879158 lnc-TET1-1:2 No - lnc-SLC25A16-4:1 No - lnc-CCAR1-1:1 No - lnc-CCAR1-2:1 No - lnc-DDX50-1:1 No - lnc-TACR2-7:1 No - lnc-KIF1BP-1:1 No - lnc-KIF1BP-2:1 No - lnc-TACR2-6:1 No - lnc-TACR2-5:1 No - lnc-SRGN-3:1 No - lnc-SRGN-4:1 No - lnc-TACR2-4:1 No - lnc-TACR2-1:2 Yes chr3R:26449079-26452327 lnc-TACR2-3:1 No - lnc-NEUROG3-6:1 No - lnc-TSPAN15-1:1 No - lnc-NEUROG3-2:1 No - lnc-NEUROG3-3:1 No - lnc-NEUROG3-4:1 No - lnc-NEUROG3-5:1 No - lnc-FAM241B-4:1 No - lnc-NEUROG3-7:1 No - lnc-AIFM2-1:4 No - lnc-AIFM2-2:1 No - lnc-TYSND1-1:7 Yes chr2R:24783555-24785542 lnc-TYSND1-1:6 Yes chr2R:24783555-24785542 lnc-TYSND1-1:5 Yes chr2R:24783555-24785542 lnc-TYSND1-2:1 Yes chr3R:22356685-22360711 lnc-PPA1-2:1 No - lnc-H2AFY2-2:1 No - lnc-NPFFR1-1:1 No - lnc-PPA1-1:1 No - lnc-LRRC20-2:1 Yes chr2L:3478434-3479612 lnc-NODAL-1:1 No - lnc-PCBD1-5:1 No - lnc-TBATA-1:1 No - lnc-PCBD1-1:2 Yes chr2R:17088441-17091958 lnc-TBATA-2:1 Yes chr3R:29723163-29724226 lnc-PCBD1-4:1 No - lnc-SGPL1-2:3 No - UNC5B-AS1:1 Yes chr2R:15340472-15368300 lnc-UNC5B-1:1 Yes chr2R:15340472-15368300 lnc-C10orf105-8:2 Yes chr2L:6562325-6564709 lnc-C10orf105-8:1 Yes chr2L:6562325-6564709 lnc-CDH23-2:2 Yes chr2L:6562325-6564709 lnc-C10orf105-7:2 No - lnc-C10orf105-7:1 No - lnc-SLC29A3-3:1 No - lnc-C10orf105-3:1 No - lnc-VSIR-1:2 Yes chr3R:30883464-30889062 lnc-CHST3-2:1 No - lnc-CHST3-1:1 Yes chr3R:23070516-23112730 lnc-SPOCK2-1:3 Yes chr3R:23070516-23112730 lnc-SPOCK2-2:3 Yes chr2R:10033304-10034698 lnc-ANAPC16-2:1 Yes chr2R:10033304-10034698 lnc-SPOCK2-4:1 No - lnc-ASCC1-2:1 No - DDIT4-AS1:3 Yes chr3L:11487550-11499055 lnc-DDIT4-1:1 No - lnc-DNAJB12-1:1 No - lnc-DNAJB12-2:1 Yes chr2L:7182234-7185529 lnc-DNAJB12-3:1 Yes chr2L:7182234-7185529 lnc-DNAJB12-4:1 Yes chr2L:7182234-7185529 lnc-MICU1-1:1 No - lnc-MCU-2:1 No - lnc-OIT3-4:1 No - lnc-P4HA1-2:1 No - lnc-PLA2G12B-1:1 Yes chr3R:30466050-30485799 lnc-NUDT13-2:1 Yes chr3R:30466050-30485799 lnc-ECD-3:1 Yes chr3R:30466050-30485799 lnc-ECD-2:1 No - lnc-DNAJC9-1:1 No - lnc-NUDT13-4:1 No - lnc-MRPS16-2:3 No - lnc-MRPS16-2:4 No - lnc-MRPS16-2:2 No - lnc-FAM149B1-5:1 No - lnc-CFAP70-2:1 No - lnc-ANXA7-1:1 No - lnc-FAM149B1-6:1 No - lnc-USP54-1:1 Yes chrX:16554627-16560016 PPP3CB-AS1:8 Yes chrX:3811698-3857621 PPP3CB-AS1:14 Yes chrX:3811698-3857621 PPP3CB-AS1:16 Yes chrX:3811698-3857621 PPP3CB-AS1:17 Yes chrX:3811698-3857621 lnc-PPP3CB-1:1 Yes chrX:3811698-3857621 lnc-SEC24C-7:1 Yes chrX:3811698-3857621 lnc-PPP3CB-2:1 Yes chrX:3811698-3857621 lnc-MYOZ1-1:2 Yes chrX:3811698-3857621 lnc-MYOZ1-1:1 Yes chrX:3811698-3857621 lnc-SEC24C-6:1 Yes chrX:3811698-3857621 lnc-SEC24C-5:1 Yes chrX:3811698-3857621 lnc-SEC24C-4:1 Yes chrX:3811698-3857621 lnc-SEC24C-5:2 Yes chrX:3811698-3857621 lnc-AGAP5-1:32 No - lnc-AGAP5-1:8 No - lnc-SEC24C-3:1 No - lnc-SEC24C-3:2 No - lnc-SEC24C-3:3 No - lnc-SEC24C-3:5 No - lnc-AGAP5-1:24 No - lnc-AGAP5-1:13 No - lnc-AGAP5-1:20 No - lnc-AGAP5-1:19 No - lnc-NDST2-4:1 Yes chr2L:9428669-9431052 lnc-NDST2-3:2 No - lnc-CHCHD1-2:1 Yes chrX:18863950-18884075 ZSWIM8-AS1:3 No - ZSWIM8-AS1:1 No - lnc-CAMK2G-3:1 No - lnc-CAMK2G-2:1 No - lnc-NDST2-5:1 Yes chr4:1035288-1053703 lnc-NDST2-5:5 Yes chr4:1035288-1053703 lnc-NDST2-5:3 Yes chr4:1035288-1053703 lnc-NDST2-5:4 Yes chr4:1035288-1053703 lnc-NDST2-5:2 Yes chr4:1035288-1053703 lnc-AP3M1-2:2 Yes chrX:2214347-2222567 lnc-AP3M1-4:1 No - lnc-VCL-2:1 No - lnc-C10orf55-1:1 Yes chrX:7009006-7011145 lnc-C10orf55-2:1 Yes chrX:7009006-7011145 lnc-VCL-4:1 Yes chr2R:7243024-7245776 lnc-AP3M1-5:1 Yes chr2R:7243024-7245776 lnc-AP3M1-6:1 Yes chr2R:7243024-7245776 lnc-AP3M1-3:4 Yes chr2R:7243024-7245776 lnc-AP3M1-3:5 Yes chr2R:7243024-7245776 lnc-KAT6B-3:2 Yes chr2R:7243024-7245776 lnc-DUPD1-7:1 Yes chr2R:7243024-7245776 lnc-KAT6B-2:1 Yes chr2R:7243024-7245776 lnc-DUPD1-6:1 No - lnc-SAMD8-1:1 No - lnc-DUPD1-4:1 Yes chr2R:24099210-24107032 lnc-DUPD1-4:2 Yes chr2R:24099210-24107032 lnc-DUPD1-3:1 No - lnc-VDAC2-3:1 Yes chr3L:7374050-7381474 lnc-VDAC2-2:1 No - lnc-COMTD1-6:2 No - lnc-COMTD1-6:3 No - lnc-COMTD1-6:1 No - lnc-COMTD1-3:1 No - lnc-ZNF503-1:3 Yes chr2L:14490859-14494019 lnc-COMTD1-1:1 No - ZNF503-AS1:5 No - ZNF503-AS1:6 No - ZNF503-AS1:7 No - ZNF503-AS1:8 No - lnc-ZNF503-1:8 No - ZNF503-AS2:3 Yes chr2L:14490859-14494019 ZNF503-AS2:4 No - ZNF503-AS2:6 No - ZNF503-AS2:8 No - ZNF503-AS2:10 No - ZNF503-AS2:12 No - ZNF503-AS2:33 No - lnc-VDAC2-5:1 Yes chr3R:26989035-26989852 lnc-KCNMA1-6:1 Yes chr3R:26989035-26989852 lnc-VDAC2-10:1 Yes chr3R:26989035-26989852 lnc-KCNMA1-5:1 Yes chr3R:26989035-26989852 lnc-KCNMA1-4:1 Yes chr3R:26989035-26989852 lnc-LRMDA-7:1 No - lnc-LRMDA-7:2 No - lnc-LRMDA-8:1 No - lnc-DLG5-5:1 Yes chr3R:24662491-24711595 KCNMA1-AS1:2 Yes chr3R:24662491-24711595 lnc-DLG5-4:1 Yes chr3R:24662491-24711595 lnc-DLG5-4:2 Yes chr3R:24662491-24711595 KCNMA1-AS2:1 Yes chr3R:24662491-24711595 lnc-LRMDA-14:1 Yes chr3R:24662491-24711595 KCNMA1-AS3:2 Yes chr3R:24662491-24711595 lnc-RPS24-20:1 Yes chr3R:24662491-24711595 lnc-RPS24-20:2 Yes chr3R:24662491-24711595 lnc-DLG5-2:1 Yes chr3R:24662491-24711595 lnc-DLG5-1:1 Yes chr3R:24662491-24711595 lnc-RPS24-17:2 No - lnc-RPS24-2:3 No - lnc-RPS24-2:4 Yes chr2L:11508399-11517081 lnc-POLR3A-4:1 Yes chr2L:11508399-11517081 lnc-RPS24-7:4 Yes chr2L:11508399-11517081 lnc-POLR3A-3:1 Yes chr2L:11508399-11517081 DLG5-AS1:2 No - lnc-RPS24-12:1 No - lnc-RPS24-11:1 Yes chrX:15762956-15769514 lnc-RPS24-10:1 No - lnc-POLR3A-2:1 No - lnc-RPS24-14:2 No - lnc-RPS24-3:8 No - lnc-RPS24-3:9 No - lnc-RPS24-13:1 No - lnc-RPS24-3:22 No - lnc-RPS24-3:24 No - lnc-RPS24-4:2 No - lnc-POLR3A-5:1 No - lnc-RPS24-15:1 No - lnc-ZMIZ1-1:1 No - ZMIZ1-AS1:6 No - ZMIZ1-AS1:7 No - ZMIZ1-AS1:18 No - ZMIZ1-AS1:2 No - ZMIZ1-AS1:4 No - ZMIZ1-AS1:9 No - ZMIZ1-AS1:10 No - ZMIZ1-AS1:11 No - lnc-ZCCHC24-8:1 Yes chr3L:10857889-10876496 lnc-ZCCHC24-7:1 Yes chr3L:10857889-10876496 lnc-ZCCHC24-7:2 Yes chr3L:10857889-10876496 lnc-ZCCHC24-1:2 No - lnc-PPIF-1:2 No - lnc-PPIF-1:3 No - lnc-SFTPA2-6:1 No - lnc-ZCCHC24-4:1 No - lnc-EIF5AL1-4:1 No - lnc-ZCCHC24-5:1 No - lnc-ZCCHC24-6:1 No - lnc-SFTPA2-1:5 No - lnc-SFTPA2-1:4 No - lnc-SFTPA2-1:3 No - lnc-EIF5AL1-2:1 No - lnc-EIF5AL1-2:2 No - lnc-SFTPA2-1:2 No - lnc-EIF5AL1-3:1 No - lnc-SFTPA2-3:1 No - lnc-SFTPA2-4:1 No - lnc-SFTPA2-4:2 No - lnc-NUTM2B-1:3 No - NUTM2B-AS1:33 No - NUTM2B-AS1:34 No - NUTM2B-AS1:38 No - lnc-NUTM2B-2:1 No - NUTM2B-AS1:39 No - NUTM2B-AS1:32 No - NUTM2B-AS1:14 No - NUTM2B-AS1:24 No - NUTM2B-AS1:19 No - NUTM2B-AS1:35 No - NUTM2B-AS1:29 No - NUTM2B-AS1:22 No - NUTM2B-AS1:21 No - lnc-NUTM2E-1:2 No - lnc-NUTM2E-1:4 No - lnc-NUTM2E-3:1 No - lnc-SFTPD-9:1 No - lnc-SFTPD-6:1 No - lnc-NUTM2E-2:1 No - lnc-TMEM254-3:1 No - lnc-SFTPD-4:1 No - lnc-SFTPD-5:1 No - lnc-SFTPD-5:2 No - lnc-SFTPD-7:2 No - lnc-SFTPD-7:1 No - lnc-SFTPD-8:1 No - TMEM254-AS1:2 No - TMEM254-AS1:3 No - TMEM254-AS1:4 No - TMEM254-AS1:5 No - TMEM254-AS1:6 No - TMEM254-AS1:1 No - lnc-TMEM254-1:1 No - lnc-TMEM254-1:2 No - lnc-PLAC9-1:1 No - lnc-ANXA11-1:1 No - lnc-MAT1A-3:1 Yes chrX:20171445-20173514 lnc-MAT1A-2:1 Yes chrX:20171445-20173514 lnc-MAT1A-1:1 Yes chrX:20171445-20173514 lnc-MAT1A-1:2 Yes chrX:20171445-20173514 lnc-ANXA11-2:1 No - lnc-PLAC9-2:6 No - lnc-DYDC2-4:1 No - lnc-DYDC2-3:1 No - lnc-DYDC2-1:2 No - lnc-TSPAN14-1:3 No - lnc-DYDC1-1:8 Yes chr2L:6000228-6003738 lnc-DYDC1-6:1 No - lnc-TSPAN14-3:2 No - lnc-SH2D4B-3:1 No - lnc-DYDC1-7:1 No - lnc-DYDC1-8:1 No - lnc-DYDC1-9:1 No - lnc-DYDC1-10:1 No - lnc-NRG3-1:1 No - NRG3-AS1:4 No - NRG3-AS1:6 No - lnc-LRIT2-8:1 No - lnc-LRIT2-7:1 No - lnc-LRIT2-6:1 No - lnc-GHITM-2:1 No - lnc-LRIT2-5:1 No - lnc-GHITM-1:1 No - lnc-RGR-2:2 No - lnc-GRID1-10:2 No - LINC01519:1 No - lnc-GRID1-9:1 No - lnc-CCSER2-5:1 No - lnc-CCSER2-2:2 No - lnc-CCSER2-2:3 No - LINC01520:1 No - lnc-GRID1-7:1 No - lnc-GRID1-6:1 No - lnc-CCSER2-6:1 No - lnc-GRID1-1:2 No - GRID1-AS1:1 Yes chr2L:4830846-4835300 GRID1-AS1:4 Yes chr2L:4830846-4835300 GRID1-AS1:5 Yes chr2L:4830846-4835300 lnc-WAPL-3:1 Yes chr2L:4830846-4835300 lnc-OPN4-4:1 Yes chr2L:4830846-4835300 lnc-GRID1-4:1 No - lnc-WAPL-2:1 Yes chrX:2149936-2158983 lnc-GRID1-8:4 Yes chrX:2149936-2158983 lnc-GRID1-8:3 Yes chrX:2149936-2158983 lnc-GRID1-8:2 Yes chrX:2149936-2158983 lnc-GRID1-8:1 Yes chrX:2149936-2158983 lnc-OPN4-1:4 No - lnc-MMRN2-2:1 Yes chr2L:5219000-5271384 lnc-GLUD1-7:1 No - ADIRF-AS1:4 No - lnc-ADIRF-1:3 No - lnc-FAM25A-2:1 No - lnc-FAM25A-3:1 No - lnc-MMRN2-1:1 Yes chr3R:23935958-23943101 lnc-GLUD1-6:1 No - lnc-GLUD1-8:1 No - NUTM2A-AS1:5 No - NUTM2A-AS1:6 No - NUTM2A-AS1:26 No - NUTM2A-AS1:23 No - lnc-NUTM2A-1:1 No - NUTM2A-AS1:7 No - NUTM2A-AS1:8 No - LINC00863:1 No - LINC00863:3 No - LINC00863:4 No - LINC00863:5 No - LINC00863:7 No - LINC00863:8 No - lnc-NUTM2D-2:1 No - LINC00864:6 No - LINC00864:4 No - LINC00864:2 No - lnc-GLUD1-11:1 No - lnc-ATAD1-5:1 No - lnc-PAPSS2-1:3 No - lnc-PAPSS2-3:1 No - lnc-ATAD1-4:1 Yes chr3L:19845293-19860925 lnc-PTEN-12:1 Yes chr2L:10302173-10303947 lnc-PTEN-12:2 Yes chr2L:10302173-10303947 lnc-KLLN-3:1 Yes chr2L:10302173-10303947 lnc-PTEN-6:4 No - lnc-PTEN-5:1 No - lnc-KLLN-2:2 Yes chr2L:10256319-10261049 lnc-KLLN-2:1 Yes chr2L:10256319-10261049 lnc-PAPSS2-10:1 Yes chr2L:10256319-10261049 lnc-KLLN-4:1 No - lnc-PTEN-7:1 No - lnc-PTEN-8:1 No - lnc-PTEN-9:1 No - lnc-PTEN-11:1 No - lnc-PTEN-10:1 No - lnc-LIPJ-2:1 No - lnc-RNLS-2:1 Yes chr2L:10639931-10645891 lnc-LIPF-1:1 Yes chr2L:10639931-10645891 lnc-ACTA2-2:1 No - lnc-LIPM-1:1 Yes chr3R:30456441-30459300 lnc-LIPM-1:2 Yes chr3R:30456441-30459300 ACTA2-AS1:5 Yes chr3R:30456441-30459300 lnc-ANKRD22-1:2 No - lnc-ANKRD22-1:1 No - FAS-AS1:6 No - lnc-FAS-2:2 No - lnc-FAS-4:1 No - lnc-CH25H-2:1 Yes chr2L:10643971-10645891 lnc-IFIT2-1:5 Yes chr2L:10643971-10645891 lnc-CH25H-2:3 Yes chr2L:10643971-10645891 lnc-CH25H-2:4 Yes chr2L:10643971-10645891 lnc-CH25H-2:2 Yes chr2L:10643971-10645891 lnc-IFIT5-4:1 No - lnc-SLC16A12-1:1 Yes chr3L:20384429-20391913 lnc-KIF20B-1:4 No - lnc-PANK1-2:16 No - LINC00865:1 No - LINC00865:2 No - LINC00865:3 No - LINC00865:6 No - LINC00865:7 No - lnc-PANK1-6:1 No - lnc-PANK1-7:1 No - lnc-KIF20B-7:1 No - lnc-PANK1-8:1 No - lnc-KIF20B-8:1 No - lnc-HTR7-2:1 No - lnc-RPP30-10:2 No - lnc-RPP30-10:3 No - lnc-RPP30-10:4 No - lnc-RPP30-10:5 No - lnc-RPP30-9:1 No - lnc-RPP30-1:2 No - lnc-ANKRD1-3:1 No - lnc-RPP30-2:2 No - lnc-RPP30-8:1 No - LINC00502:1 No - lnc-HECTD2-4:1 No - lnc-HECTD2-3:1 No - HECTD2-AS1:1 No - HECTD2-AS1:2 No - lnc-HECTD2-2:1 No - lnc-PPP1R3C-1:1 No - lnc-FGFBP3-2:2 Yes chr3R:25653091-25661286 lnc-FGFBP3-2:1 Yes chr3R:25653091-25661286 lnc-BTAF1-2:1 Yes chr3L:8937100-8954463 lnc-MARCH5-1:1 No - lnc-MARCH5-1:2 No - lnc-CPEB3-1:2 Yes chr3L:20371672-20375896 lnc-CPEB3-1:1 Yes chr3L:20371672-20375896 lnc-CPEB3-2:1 Yes chr3L:20371672-20375896 lnc-IDE-2:1 Yes chr3L:1241568-1245910 lnc-KIF11-2:1 No - lnc-MYOF-1:2 No - lnc-MYOF-3:1 No - lnc-MYOF-2:1 No - lnc-RBP4-4:1 No - lnc-RBP4-3:1 No - lnc-CEP55-1:1 No - lnc-RBP4-1:1 Yes chr2L:13782231-13784338 lnc-RBP4-1:3 Yes chr2L:13782231-13784338 lnc-RBP4-1:2 Yes chr2L:13782231-13784338 lnc-RBP4-2:2 Yes chr2L:13782231-13784338 lnc-RBP4-2:1 Yes chr2L:13782231-13784338 lnc-FRA10AC1-1:1 No - lnc-FRA10AC1-2:1 No - lnc-FRA10AC1-2:2 No - lnc-FRA10AC1-3:1 No - PLCE1-AS2:11 No - PLCE1-AS2:16 No - PLCE1-AS2:18 No - PLCE1-AS2:1 No - PLCE1-AS2:17 No - PLCE1-AS2:8 No - PLCE1-AS2:7 No - PLCE1-AS2:4 No - PLCE1-AS1:3 No - PLCE1-AS1:4 No - lnc-NOC3L-4:1 Yes chr3R:7244232-7246969 lnc-CYP2C18-2:1 No - lnc-CYP2C18-1:1 No - lnc-NOC3L-8:1 No - lnc-CYP2C8-5:1 No - lnc-CYP2C8-4:1 No - lnc-CYP2C19-1:1 No - lnc-CYP2C8-3:1 No - lnc-CYP2C8-1:1 No - lnc-CYP2C9-1:1 No - lnc-CYP2C8-2:1 No - lnc-PDLIM1-2:3 No - lnc-ACSM6-2:1 No - lnc-PDLIM1-1:4 No - lnc-PDLIM1-1:2 No - lnc-PDLIM1-1:3 No - lnc-SORBS1-2:1 No - lnc-SORBS1-1:1 Yes chr2R:10269016-10307024 lnc-PDLIM1-4:1 Yes chr2R:10269016-10307024 lnc-SORBS1-1:2 Yes chr2R:10269016-10307024 lnc-ALDH18A1-1:1 No - lnc-ENTPD1-3:1 No - ENTPD1-AS1:2 No - ENTPD1-AS1:17 No - lnc-CC2D2B-2:1 No - ENTPD1-AS1:3 No - lnc-BLNK-5:1 Yes chr2R:17539322-17544353 lnc-CCNJ-2:1 No - lnc-CCNJ-3:1 No - lnc-CCNJ-4:1 No - lnc-BLNK-4:1 No - lnc-BLNK-2:1 No - lnc-BLNK-1:4 No - lnc-BLNK-1:6 No - lnc-BLNK-1:5 No - lnc-BLNK-3:1 No - lnc-TLL2-1:1 Yes chr3L:5601096-5603979 lnc-TLL2-2:1 Yes chr3L:5601096-5603979 lnc-PIK3AP1-1:1 Yes chr3L:5601096-5603979 lnc-TM9SF3-1:2 Yes chr3R:14577217-14608079 lnc-TM9SF3-1:1 Yes chr3R:14577217-14608079 lnc-LCOR-3:1 Yes chr3R:14577217-14608079 lnc-TM9SF3-2:1 Yes chr3R:14577217-14608079 lnc-PIK3AP1-2:1 No - lnc-PIK3AP1-3:1 No - lnc-PIK3AP1-4:1 No - lnc-PIK3AP1-5:1 No - lnc-LCOR-2:1 No - lnc-PIK3AP1-6:1 No - lnc-FRAT1-7:1 Yes chr3R:21949114-22014539 lnc-SLIT1-2:1 Yes chr3R:21949114-22014539 lnc-LCOR-1:3 Yes chr3R:21949114-22014539 lnc-ARHGAP19-SLIT1-7:1 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-ARHGAP19-SLIT1-4:1 Yes chr2R:15869495-15922118 SLIT1-AS1:1 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-ARHGAP19-3:2 No - lnc-FRAT1-4:1 Yes chr2R:17586425-17590884 lnc-FRAT1-4:2 Yes chr2R:17586425-17590884 lnc-FRAT1-3:1 No - lnc-PGAM1-4:1 No - lnc-FRAT2-1:1 Yes chrX:13619276-13624408 lnc-FRAT2-2:1 Yes chrX:13619276-13624408 lnc-EXOSC1-5:1 Yes chrX:13619276-13624408 lnc-EXOSC1-4:1 Yes chrX:13619276-13624408 lnc-EXOSC1-1:2 Yes chrX:13619276-13624408 lnc-RRP12-3:2 Yes chr2L:11122574-11123567 lnc-RRP12-3:1 Yes chr2L:11122574-11123567 lnc-RRP12-3:3 Yes chr2L:11122574-11123567 lnc-MARVELD1-1:1 No - lnc-MARVELD1-1:2 No - lnc-MARVELD1-1:3 No - lnc-AVPI1-1:1 No - LINC00866:1 No - lnc-CRTAC1-2:1 No - lnc-R3HCC1L-2:1 No - lnc-HPS1-2:1 No - lnc-R3HCC1L-4:1 No - lnc-HPS1-1:2 No - lnc-HPS1-1:1 No - lnc-PYROXD2-1:1 Yes chr2R:14855429-14857502 lnc-HPSE2-1:1 Yes chr2R:14855429-14857502 lnc-R3HCC1L-7:1 Yes chr2R:14855429-14857502 lnc-R3HCC1L-7:9 Yes chr2R:14855429-14857502 lnc-R3HCC1L-7:10 No - lnc-R3HCC1L-7:11 No - lnc-R3HCC1L-6:1 No - lnc-GOT1-2:1 No - lnc-CNNM1-2:2 No - lnc-CNNM1-1:2 No - lnc-CNNM1-1:12 No - lnc-NKX2-3-2:2 No - lnc-ENTPD7-2:1 No - lnc-COX15-1:1 No - lnc-SLC25A28-5:1 Yes chr3R:15370036-15372212 lnc-COX15-2:1 Yes chr2L:12719045-12766546 lnc-ABCC2-3:1 No - lnc-CPN1-1:1 No - lnc-ERLIN1-1:1 No - lnc-ERLIN1-2:1 Yes chr3R:16046347-16049421 lnc-ERLIN1-2:2 Yes chr3R:16046347-16049421 lnc-ERLIN1-2:3 Yes chr3R:16046347-16049421 lnc-CHUK-1:1 Yes chr2R:11301916-11305607 lnc-PKD2L1-1:2 No - OLMALINC:1 Yes chr3R:30194790-30196228 OLMALINC:3 Yes chr3R:30194790-30196228 OLMALINC:4 No - OLMALINC:7 No - OLMALINC:14 No - OLMALINC:16 No - lnc-SEC31B-4:1 No - lnc-SEC31B-2:1 No - lnc-NDUFB8-2:3 Yes chr2R:8893613-8898798 lnc-NDUFB8-2:2 Yes chr2R:8893613-8898798 lnc-NDUFB8-8:1 Yes chr2R:8893613-8898798 lnc-NDUFB8-6:2 No - lnc-SEC31B-1:1 No - lnc-PAX2-2:1 No - lnc-PDZD7-7:1 Yes chr2R:23698105-23699014 lnc-PDZD7-6:2 Yes chr2R:23698105-23699014 lnc-PDZD7-6:1 Yes chr2R:23698105-23699014 lnc-MRPL43-1:1 Yes chr3L:13867414-13903236 lnc-KAZALD1-1:1 No - TLX1NB:4 No - lnc-PDZD7-8:1 No - TLX1NB:9 No - lnc-TLX1-3:1 No - LINC01514:2 No - LINC01514:3 No - lnc-LBX1-5:1 No - LINC01514:6 No - LINC01514:7 No - lnc-TLX1-5:1 No - lnc-TLX1-6:2 Yes chr3R:21409979-21434133 lnc-TLX1-6:4 Yes chr3R:21409979-21434133 LBX1-AS1:2 Yes chr3R:21409979-21434133 LBX1-AS1:5 No - lnc-TLX1-7:1 No - LBX1-AS1:9 No - LBX1-AS1:10 No - lnc-LBX1-1:2 No - lnc-BTRC-6:1 No - lnc-LBX1-7:2 No - lnc-LBX1-3:2 No - lnc-FBXW4-4:2 Yes chr3L:836667-837821 lnc-BTRC-4:1 Yes chr3L:836667-837821 lnc-POLL-1:1 No - lnc-POLL-3:1 No - lnc-FBXW4-3:1 No - lnc-FBXW4-1:2 No - lnc-FGF8-1:5 No - lnc-FGF8-1:4 No - lnc-NPM3-1:1 Yes chr3R:21219077-21222843 lnc-MGEA5-1:1 Yes chrX:11219379-11302783 lnc-LDB1-4:1 Yes chr3R:8824411-8827279 lnc-HPS6-2:1 No - lnc-HPS6-3:1 No - lnc-LDB1-3:1 No - lnc-LDB1-2:1 No - lnc-PPRC1-4:1 No - lnc-PPRC1-3:1 No - lnc-C10orf76-1:1 Yes chr2R:24031538-24033943 lnc-PPRC1-1:2 No - lnc-ELOVL3-2:1 Yes chr2R:12326360-12333860 lnc-ELOVL3-3:1 Yes chr2R:12326360-12333860 lnc-PSD-1:3 No - lnc-PSD-1:1 No - lnc-PSD-1:2 No - RPARP-AS1:1 No - lnc-FBXL15-2:1 No - lnc-FBXL15-2:2 No - RPARP-AS1:2 No - RPARP-AS1:4 No - RPARP-AS1:5 No - RPARP-AS1:6 No - RPARP-AS1:7 No - RPARP-AS1:12 No - RPARP-AS1:14 No - RPARP-AS1:15 No - RPARP-AS1:22 No - RPARP-AS1:23 No - lnc-MFSD13A-4:1 Yes chr3R:12689873-12691468 lnc-ACTR1A-1:1 Yes chr3R:12689873-12691468 lnc-ARL3-2:1 No - lnc-CYP17A1-1:1 No - lnc-BORCS7-2:1 No - lnc-CYP17A1-2:1 No - lnc-PCGF6-3:1 Yes chrX:18390498-18410144 lnc-PCGF6-2:1 Yes chrX:18390498-18410144 lnc-PCGF6-1:1 Yes chrX:18390498-18410144 lnc-RPEL1-2:1 Yes chrX:18390498-18410144 lnc-RPEL1-1:1 Yes chrX:18390498-18410144 lnc-NT5C2-1:2 No - lnc-ATP5MD-1:1 No - lnc-TAF5-1:1 No - lnc-CALHM1-1:7 No - lnc-CALHM1-1:4 No - lnc-CALHM1-1:5 No - lnc-CALHM1-1:3 No - lnc-CALHM1-1:6 No - lnc-PDCD11-5:1 Yes chr3R:9020348-9039471 SH3PXD2A-AS1:2 No - lnc-STN1-1:2 No - lnc-STN1-2:8 No - lnc-STN1-3:1 No - lnc-CFAP43-3:1 No - lnc-CFAP43-2:1 No - lnc-GSTO2-3:1 Yes chr3L:8518885-8520295 lnc-GSTO2-4:1 No - lnc-ITPRIP-5:1 No - lnc-SORCS3-8:1 No - SORCS3-AS1:4 No - SORCS3-AS1:2 No - lnc-ITPRIP-7:1 No - lnc-SORCS1-12:1 No - lnc-SORCS1-4:5 No - lnc-SORCS1-4:4 No - lnc-SORCS1-4:3 No - lnc-SORCS1-4:2 No - lnc-SORCS1-10:1 No - lnc-SORCS3-10:1 No - lnc-SORCS1-9:2 No - lnc-SORCS3-4:2 No - lnc-SORCS3-4:3 No - lnc-SORCS3-11:1 No - lnc-SORCS3-12:1 No - lnc-SORCS3-13:1 No - lnc-SORCS1-7:1 No - lnc-SORCS3-14:1 No - lnc-SORCS3-15:1 No - lnc-SORCS3-15:2 No - lnc-SORCS3-5:6 No - lnc-SORCS1-6:1 No - lnc-SORCS3-15:3 No - lnc-SORCS3-15:4 No - lnc-SORCS3-5:7 No - lnc-SORCS3-6:4 No - lnc-SORCS3-16:1 No - lnc-SORCS3-17:1 No - LINC01435:9 No - LINC01435:10 No - LINC01435:11 No - LINC01435:12 No - LINC01435:13 No - lnc-SORCS1-11:1 No - LINC01435:14 No - LINC01435:15 No - lnc-SORCS1-8:1 No - LINC01435:16 No - LINC01435:17 No - LINC01435:18 No - LINC01435:19 No - LINC01435:6 No - LINC01435:4 No - lnc-ADD3-13:1 No - lnc-XPNPEP1-3:1 No - lnc-ADD3-12:1 No - lnc-ADD3-11:1 No - lnc-XPNPEP1-5:1 No - lnc-ADD3-9:1 No - lnc-ADD3-8:1 No - lnc-ADD3-7:1 No - lnc-ADD3-6:1 No - lnc-ADD3-5:1 No - lnc-SMNDC1-11:1 No - lnc-SMNDC1-10:1 No - ADD3-AS1:8 Yes chr2R:19397032-19424903 lnc-MXI1-4:1 Yes chr2R:19397032-19424903 lnc-XPNPEP1-2:2 Yes chr2R:19397032-19424903 lnc-SMNDC1-4:1 No - lnc-ADD3-4:1 No - lnc-XPNPEP1-4:1 Yes chr3L:23715023-23716689 lnc-XPNPEP1-4:2 Yes chr3L:23715023-23716689 lnc-DUSP5-3:1 No - lnc-DUSP5-2:1 No - lnc-SMNDC1-6:1 No - lnc-BBIP1-7:1 No - lnc-BBIP1-6:1 No - lnc-BBIP1-5:1 No - lnc-PDCD4-5:1 No - PDCD4-AS1:2 No - PDCD4-AS1:4 No - lnc-SMNDC1-7:1 No - lnc-SMNDC1-8:1 No - lnc-SHOC2-3:2 No - lnc-SMNDC1-8:2 No - lnc-SHOC2-1:2 No - lnc-SHOC2-4:1 No - lnc-ADRA2A-3:1 No - lnc-ADRA2A-5:1 No - lnc-BBIP1-8:1 No - lnc-BBIP1-9:1 No - lnc-GPAM-1:1 No - lnc-GPAM-1:2 No - lnc-GPAM-2:1 No - lnc-ZDHHC6-1:2 Yes chr3L:18878250-18890483 lnc-ZDHHC6-1:4 Yes chr3L:18878250-18890483 lnc-ZDHHC6-1:3 Yes chr3L:18878250-18890483 lnc-ZDHHC6-5:1 Yes chr3L:691486-692919 lnc-VTI1A-5:1 No - lnc-TCF7L2-3:1 No - lnc-VTI1A-7:1 Yes chr4:69326-114270 lnc-VTI1A-8:1 Yes chr4:69326-114270 lnc-HABP2-3:1 No - lnc-DCLRE1A-1:1 No - lnc-NRAP-4:1 No - lnc-ADRB1-4:1 Yes chr2R:4785855-4788965 lnc-CCDC186-1:1 Yes chr3R:12550625-12595725 lnc-ADRB1-3:1 Yes chr3R:12550625-12595725 lnc-TDRD1-3:1 No - lnc-AFAP1L2-4:2 Yes chr3L:16348747-16351951 lnc-AFAP1L2-4:1 Yes chr3L:16348747-16351951 lnc-TDRD1-1:1 No - lnc-ABLIM1-3:1 No - lnc-ABLIM1-2:1 No - lnc-VWA2-1:1 No - lnc-VWA2-2:1 No - lnc-AFAP1L2-1:1 Yes chr3R:9694386-9705417 lnc-AFAP1L2-2:1 Yes chr3R:9694386-9705417 lnc-AFAP1L2-3:1 Yes chr3R:9694386-9705417 lnc-AFAP1L2-5:1 Yes chr3R:9694386-9705417 lnc-FAM160B1-1:2 No - lnc-ABLIM1-1:2 No - lnc-FAM160B1-3:1 No - lnc-FAM160B1-2:1 No - lnc-TRUB1-2:1 No - lnc-TRUB1-3:1 No - lnc-TRUB1-1:2 No - lnc-ABLIM1-4:1 No - lnc-GFRA1-2:1 Yes chr3R:27597563-27607396 lnc-GFRA1-1:1 No - lnc-C10orf82-2:1 No - lnc-CCDC172-1:4 No - lnc-PNLIPRP3-1:1 No - lnc-PNLIPRP1-4:1 No - lnc-PNLIP-1:1 Yes chrX:5988791-5992640 lnc-C10orf82-1:1 No - lnc-HSPA12A-1:12 No - lnc-HSPA12A-1:15 No - lnc-HSPA12A-4:1 No - MIR3663HG:9 No - MIR3663HG:1 No - lnc-VAX1-2:1 No - lnc-PDZD8-1:2 No - lnc-PDZD8-8:1 No - lnc-VAX1-4:2 Yes chrX:11926424-11930850 lnc-VAX1-4:1 Yes chrX:11926424-11930850 EMX2OS:11 No - EMX2OS:2 Yes chr3R:13867345-13874916 EMX2OS:5 No - EMX2OS:7 No - lnc-PDZD8-9:1 No - lnc-EMX2-6:1 No - lnc-EMX2-6:2 No - lnc-EMX2-7:2 No - lnc-EMX2-2:5 No - lnc-EMX2-2:6 No - lnc-EMX2-2:7 No - lnc-EMX2-8:1 No - lnc-EMX2-3:4 Yes chrX:18635642-18647648 lnc-FAM204A-3:1 Yes chrX:18635642-18647648 CASC2:3 No - CASC2:4 No - CASC2:5 No - CASC2:6 No - lnc-EMX2-9:2 No - lnc-EMX2-9:3 No - lnc-EMX2-9:4 No - lnc-EMX2-9:5 No - lnc-RAB11FIP2-8:1 No - lnc-FAM204A-6:5 No - lnc-FAM204A-6:4 No - lnc-FAM204A-6:2 No - lnc-FAM204A-6:3 No - lnc-FAM204A-6:1 No - lnc-NANOS1-7:1 No - lnc-NANOS1-7:2 No - lnc-NANOS1-7:3 No - LINC00867:2 No - lnc-NANOS1-6:1 No - lnc-NANOS1-5:1 No - lnc-NANOS1-5:2 No - lnc-NANOS1-4:1 No - lnc-PRLHR-1:2 No - lnc-PRLHR-1:1 No - lnc-PRLHR-2:1 No - lnc-PRLHR-3:1 No - lnc-PRLHR-4:1 No - lnc-CACUL1-1:1 No - lnc-EIF3A-5:1 No - lnc-EIF3A-4:1 No - lnc-EIF3A-3:1 Yes chr3R:4429798-4433895 lnc-FAM45A-4:1 No - lnc-FAM45A-3:1 No - lnc-NANOS1-3:1 No - lnc-PRDX3-5:1 No - lnc-PRDX3-4:2 No - lnc-SFXN4-1:1 Yes chr3R:17545222-17546531 lnc-GRK5-1:1 No - lnc-PRDX3-2:1 No - lnc-PRDX3-3:1 No - lnc-FAM45A-5:1 Yes chr3R:31405245-31457873 lnc-FAM45A-6:1 Yes chr3R:31405245-31457873 lnc-PRDX3-1:3 Yes chr3R:31405245-31457873 lnc-RGS10-5:1 Yes chr3R:31405245-31457873 lnc-TIAL1-4:1 No - lnc-TIAL1-3:1 No - lnc-TIAL1-2:1 No - lnc-RGS10-1:1 Yes chr3R:24043056-24048265 lnc-RGS10-2:2 Yes chr3R:24043056-24048265 lnc-RGS10-2:1 Yes chr3R:24043056-24048265 lnc-RGS10-4:2 Yes chr3R:24043056-24048265 lnc-RGS10-4:1 Yes chr3R:24043056-24048265 lnc-BAG3-4:1 No - lnc-BAG3-3:1 No - lnc-BAG3-2:1 No - lnc-TIAL1-5:1 No - lnc-INPP5F-2:1 No - lnc-TIAL1-1:3 Yes chr3R:21520928-21528598 lnc-BAG3-5:1 Yes chr3R:21520928-21528598 lnc-MCMBP-2:1 Yes chr3R:21520928-21528598 lnc-INPP5F-3:5 Yes chr2L:8134247-8159638 lnc-MCMBP-1:2 No - lnc-SEC23IP-2:1 No - lnc-PLPP4-4:4 No - lnc-PLPP4-1:1 No - lnc-FGFR2-10:1 No - lnc-FGFR2-12:6 No - lnc-FGFR2-12:2 No - lnc-FGFR2-12:10 No - lnc-PLPP4-2:2 No - lnc-WDR11-1:3 No - lnc-WDR11-1:4 No - lnc-WDR11-1:5 No - lnc-WDR11-1:6 No - lnc-WDR11-5:1 No - lnc-FGFR2-8:1 No - lnc-PLPP4-8:1 No - lnc-FGFR2-7:1 No - lnc-WDR11-2:4 No - lnc-FGFR2-6:1 No - lnc-WDR11-6:1 No - lnc-WDR11-7:1 No - lnc-ATE1-8:1 Yes chr3L:14075772-14083229 lnc-ATE1-7:1 Yes chr3L:14075772-14083229 lnc-ATE1-6:2 Yes chr3L:14075772-14083229 lnc-FGFR2-5:1 No - lnc-NSMCE4A-6:1 Yes chr2R:20254966-20257390 lnc-NSMCE4A-4:2 Yes chr2R:20254966-20257390 lnc-TACC2-10:2 No - lnc-TACC2-9:1 No - lnc-ATE1-1:1 No - lnc-ATE1-2:1 No - lnc-ATE1-3:1 No - lnc-ATE1-4:1 No - lnc-NSMCE4A-3:1 No - lnc-NSMCE4A-2:1 No - lnc-NSMCE4A-1:1 No - lnc-ATE1-5:6 No - lnc-ATE1-5:5 No - lnc-ATE1-5:1 No - lnc-ATE1-5:4 No - lnc-ATE1-5:2 No - lnc-ATE1-5:3 No - lnc-BTBD16-2:1 No - lnc-NSMCE4A-5:1 No - lnc-C10orf120-1:2 No - lnc-C10orf120-3:1 No - lnc-DMBT1-2:1 No - lnc-DMBT1-2:2 No - lnc-FAM24A-2:1 No - lnc-FAM24B-1:2 No - lnc-FAM24A-1:1 No - lnc-FAM24B-1:3 No - lnc-FAM24A-1:2 No - lnc-FAM24A-1:3 No - lnc-IKZF5-2:3 No - lnc-IKZF5-2:2 No - lnc-IKZF5-1:5 No - lnc-IKZF5-1:6 No - lnc-BUB3-1:1 No - lnc-IKZF5-4:1 No - lnc-BUB3-2:1 No - lnc-GPR26-9:2 No - lnc-CPXM2-6:1 No - lnc-GPR26-9:4 No - lnc-BUB3-4:21 No - lnc-BUB3-4:22 No - lnc-BUB3-4:23 No - lnc-CPXM2-5:1 No - lnc-BUB3-4:26 No - lnc-BUB3-4:27 No - lnc-GPR26-6:1 No - lnc-GPR26-5:1 No - lnc-CHST15-4:1 No - lnc-CHST15-3:1 No - lnc-CHST15-1:2 No - lnc-CPXM2-1:3 No - lnc-GPR26-8:1 No - lnc-GPR26-8:2 No - lnc-CHST15-2:1 No - lnc-CPXM2-4:1 No - lnc-NKX1-2-4:1 Yes chr3L:19647280-19649851 lnc-NKX1-2-2:1 Yes chr3L:19647280-19649851 lnc-NKX1-2-2:2 Yes chr3L:19647280-19649851 lnc-NKX1-2-1:1 Yes chr3R:21548661-21557182 lnc-NKX1-2-3:1 No - FAM53B-AS1:4 Yes chr2L:2978411-2979288 lnc-FAM53B-1:1 No - lnc-FAM53B-1:2 No - lnc-FAM53B-2:1 No - lnc-ZRANB1-5:1 No - lnc-ABRAXAS2-2:1 No - lnc-ZRANB1-4:1 No - lnc-CTBP2-4:1 No - lnc-CTBP2-3:3 Yes chr3R:13011649-13026275 lnc-CTBP2-3:2 Yes chr3R:13011649-13026275 lnc-EEF1AKMT2-2:1 Yes chr3R:13011649-13026275 lnc-CTBP2-3:4 Yes chr3R:13011649-13026275 lnc-TEX36-3:1 No - TEX36-AS1:2 No - TEX36-AS1:3 No - TEX36-AS1:6 No - lnc-EDRF1-4:2 No - lnc-EDRF1-1:17 No - lnc-EDRF1-1:21 No - lnc-EDRF1-1:22 No - lnc-EDRF1-1:29 No - EDRF1-AS1:14 Yes chr3L:8721324-8726108 EDRF1-AS1:19 Yes chr3L:8721324-8726108 EDRF1-AS1:1 Yes chr3L:8721324-8726108 EDRF1-AS1:2 Yes chr3L:8721324-8726108 EDRF1-AS1:12 Yes chr3L:8721324-8726108 EDRF1-AS1:5 Yes chr3L:8721324-8726108 lnc-MMP21-2:5 Yes chr3R:15788521-15789494 lnc-MMP21-2:4 Yes chr3R:15788521-15789494 lnc-MMP21-2:3 Yes chr3R:15788521-15789494 lnc-MMP21-2:2 Yes chr3R:15788521-15789494 lnc-MMP21-2:1 Yes chr3R:15788521-15789494 lnc-UROS-3:1 No - FANK1-AS1:1 No - lnc-DHX32-1:1 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-DHX32-1:2 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-DHX32-2:1 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-DHX32-2:2 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-DHX32-3:1 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-DHX32-4:1 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-C10orf90-5:1 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-C10orf90-4:1 No - lnc-C10orf90-2:2 Yes chr3R:23781765-23801634 lnc-FAM196A-1:10 Yes chr3R:23781765-23801634 lnc-FAM196A-1:11 Yes chr3R:23781765-23801634 lnc-FAM196A-1:9 Yes chr3R:23781765-23801634 lnc-FAM196A-1:8 Yes chr3R:23781765-23801634 lnc-FAM196A-1:7 Yes chr3R:23781765-23801634 lnc-FAM196A-1:6 Yes chr3R:23781765-23801634 lnc-FAM196A-1:5 Yes chr3R:23781765-23801634 lnc-FAM196A-1:4 Yes chr3R:23781765-23801634 lnc-FAM196A-1:3 Yes chr3R:23781765-23801634 lnc-FAM196A-3:2 Yes chr3R:23781765-23801634 lnc-FAM196A-3:1 Yes chr3R:23781765-23801634 lnc-NPS-1:1 No - lnc-CLRN3-2:1 No - lnc-PTPRE-2:1 No - lnc-FOXI2-2:1 No - lnc-MKI67-4:1 No - lnc-CLRN3-3:1 No - lnc-MKI67-5:1 No - lnc-MKI67-6:1 No - lnc-MGMT-11:1 No - lnc-MKI67-7:1 No - lnc-MGMT-8:2 No - lnc-MGMT-5:2 No - lnc-EBF3-15:1 No - lnc-MGMT-3:2 No - lnc-EBF3-4:4 No - lnc-EBF3-4:3 No - lnc-GLRX3-11:1 Yes chr3R:6658806-6660100 lnc-GLRX3-10:1 Yes chr3R:6658806-6660100 lnc-EBF3-1:5 Yes chr3R:6658806-6660100 lnc-EBF3-1:4 Yes chr3R:6658806-6660100 lnc-EBF3-1:3 Yes chr3R:6658806-6660100 lnc-EBF3-1:2 Yes chr3R:6658806-6660100 lnc-C10orf143-46:1 No - lnc-C10orf143-46:9 No - lnc-C10orf143-46:11 No - lnc-C10orf143-46:15 No - lnc-GLRX3-6:1 No - lnc-C10orf143-46:16 No - lnc-EBF3-10:1 No - lnc-GLRX3-2:3 No - lnc-C10orf143-11:6 No - lnc-C10orf143-12:1 No - lnc-C10orf143-14:1 No - lnc-GLRX3-8:1 No - lnc-BNIP3-4:3 No - lnc-BNIP3-4:2 No - lnc-JAKMIP3-5:1 Yes chr3R:10126129-10139772 lnc-JAKMIP3-5:2 Yes chr3R:10126129-10139772 lnc-PPP2R2D-6:1 No - lnc-LRRC27-1:1 Yes chr3R:4407227-4419578 lnc-BNIP3-3:1 Yes chr3R:4407227-4419578 lnc-STK32C-5:2 No - lnc-STK32C-6:1 No - lnc-PWWP2B-4:1 No - lnc-STK32C-3:2 No - lnc-STK32C-3:3 No - lnc-STK32C-7:3 Yes chr3R:25040427-25045151 lnc-PWWP2B-2:5 Yes chr3R:25040427-25045151 lnc-STK32C-7:2 Yes chr3R:25040427-25045151 lnc-STK32C-7:1 Yes chr3R:25040427-25045151 lnc-NKX6-2-6:1 Yes chr3R:25040427-25045151 lnc-CFAP46-6:1 No - lnc-NKX6-2-2:1 No - lnc-NKX6-2-3:1 No - lnc-NKX6-2-3:2 No - lnc-INPP5A-2:1 No - lnc-NKX6-2-4:1 No - lnc-NKX6-2-5:1 No - lnc-ADGRA1-4:2 No - LINC01166:1 No - LINC01168:3 No - lnc-CFAP46-3:8 No - lnc-CFAP46-3:1 No - lnc-CFAP46-3:9 No - lnc-CFAP46-3:3 No - ADGRA1-AS1:6 No - ADGRA1-AS1:7 No - ADGRA1-AS1:8 No - ADGRA1-AS1:5 No - lnc-CFAP46-8:1 No - lnc-ADAM8-4:1 No - lnc-ADAM8-3:1 No - lnc-UTF1-1:1 No - lnc-ADAM8-1:12 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-CALY-3:2 No - lnc-ZNF511-1:2 Yes chr2R:9399080-9399899 lnc-CALY-1:1 Yes chr2R:9399080-9399899 lnc-CALY-2:1 Yes chr2R:9399080-9399899 lnc-ECHS1-1:1 No - lnc-PAOX-2:1 No - lnc-SYCE1-4:1 No - lnc-SYCE1-1:2 No - lnc-CYP2E1-2:1 No - lnc-SYCE1-2:2 No - lnc-FRG2B-1:1 No - lnc-FRG2B-2:1 No - lnc-CYP2E1-3:1 No - lnc-CYP2E1-4:1 No - lnc-CYP2E1-5:1 No - lnc-CYP2E1-6:1 No - lnc-CYP2E1-7:1 No - lnc-CYP2E1-8:1 No - lnc-CYP2E1-10:1 No - lnc-CYP2E1-11:1 No - lnc-CYP2E1-12:1 No - lnc-SCGB1C1-3:1 No - lnc-SCGB1C1-2:1 No - LINC01001:7 No - LINC01001:4 No - LINC01001:5 No - lnc-BET1L-4:1 Yes chr3L:19261394-19262437 lnc-SIRT3-2:1 Yes chr3L:19261394-19262437 lnc-SIRT3-1:1 Yes chr3L:19261394-19262437 lnc-RIC8A-2:1 Yes chrX:9256168-9259202 lnc-BET1L-3:1 No - lnc-IFITM5-1:1 No - lnc-PGGHG-1:1 No - lnc-PGGHG-1:2 No - lnc-PGGHG-1:4 No - lnc-IFITM2-1:5 No - lnc-IFITM2-1:6 No - lnc-IFITM5-2:1 No - lnc-IFITM5-3:1 No - lnc-IFITM2-4:4 No - lnc-SIGIRR-1:1 No - lnc-SIGIRR-1:2 No - lnc-SIGIRR-1:3 No - lnc-SIGIRR-1:4 No - lnc-SIGIRR-2:1 Yes chr3L:11984906-11990505 lnc-SIGIRR-3:1 Yes chr3L:11984906-11990505 lnc-SIGIRR-4:1 Yes chr3L:11984906-11990505 lnc-LRRC56-3:1 No - lnc-LRRC56-3:2 No - lnc-LRRC56-3:3 No - lnc-LRRC56-3:4 No - lnc-HRAS-4:1 No - lnc-HRAS-4:3 No - lnc-HRAS-4:2 No - lnc-LRRC56-1:4 No - lnc-LRRC56-1:7 No - lnc-LRRC56-1:8 No - lnc-LRRC56-1:9 No - lnc-LRRC56-1:2 No - lnc-LRRC56-1:3 No - lnc-LMNTD2-4:1 Yes chr3R:9510561-9513067 lnc-HRAS-1:1 Yes chr3R:9510561-9513067 lnc-HRAS-3:1 No - MIR210HG:2 No - MIR210HG:3 No - lnc-LMNTD2-3:2 No - lnc-LMNTD2-3:3 No - lnc-PHRF1-1:1 No - lnc-CDHR5-2:1 No - lnc-CDHR5-3:1 No - lnc-CDHR5-1:4 No - lnc-CDHR5-1:3 No - lnc-CDHR5-1:2 No - lnc-CDHR5-1:5 No - lnc-SCT-2:1 Yes chr3L:19818174-19830686 lnc-SCT-3:1 Yes chr3L:19818174-19830686 lnc-GATD1-2:1 No - lnc-DEAF1-2:1 Yes chr3R:17008269-17012533 lnc-EPS8L2-2:1 No - lnc-GATD1-1:1 No - lnc-CEND1-3:1 No - lnc-CEND1-2:1 No - lnc-CEND1-2:2 No - lnc-PANO1-1:1 No - lnc-PANO1-1:2 No - lnc-PANO1-1:8 No - lnc-PANO1-1:9 No - lnc-SLC25A22-1:1 No - lnc-PIDD1-1:4 Yes chr3R:11967708-11971686 lnc-PIDD1-1:1 Yes chr3R:11967708-11971686 lnc-PIDD1-1:2 Yes chr3R:11967708-11971686 lnc-PIDD1-1:3 Yes chr3R:11967708-11971686 lnc-PIDD1-2:3 Yes chr2R:21688773-21690253 lnc-PIDD1-2:2 No - lnc-PIDD1-2:1 No - lnc-CHID1-1:2 No - lnc-POLR2L-4:1 Yes chr2L:8197193-8198813 lnc-POLR2L-5:1 Yes chr2L:8197193-8198813 lnc-POLR2L-6:1 Yes chr2L:8197193-8198813 lnc-POLR2L-7:1 Yes chr2L:8197193-8198813 lnc-TSPAN4-2:1 Yes chr2L:408030-414777 lnc-TSPAN4-2:2 Yes chr2L:408030-414777 lnc-CHID1-2:1 Yes chr3L:13846054-13860001 lnc-MUC6-1:1 No - MUC5B-AS1:4 Yes chr3L:13846054-13860001 lnc-MOB2-2:3 No - lnc-MOB2-2:2 No - lnc-MOB2-2:4 No - lnc-MOB2-2:1 No - TOLLIP-AS1:2 No - lnc-MOB2-1:1 Yes chr3L:11522757-11562233 lnc-MOB2-1:2 Yes chr3L:11522757-11562233 KRTAP5-AS1:4 No - lnc-KRTAP5-4-3:1 No - lnc-KRTAP5-4-4:1 No - lnc-KRTAP5-4-4:2 No - FAM99A:3 No - lnc-IFITM10-2:1 No - lnc-CTSD-4:1 No - lnc-CTSD-3:1 No - lnc-SYT8-4:1 No - lnc-CTSD-2:2 No - lnc-SYT8-3:1 No - lnc-TNNI2-2:1 No - lnc-TNNT3-1:1 Yes chr3L:2372844-2373704 lnc-TNNT3-4:1 Yes chr3L:2372844-2373704 MRPL23-AS1:1 Yes chr3L:2372844-2373704 MRPL23-AS1:4 Yes chr3L:2372844-2373704 H19:18 No - H19:19 No - H19:1 No - lnc-MRPL23-2:2 No - lnc-IGF2-4:1 No - lnc-IGF2-4:2 No - lnc-INS-1:1 Yes chr3L:6713356-6719525 lnc-INS-2:1 Yes chr3L:6713356-6719525 lnc-INS-3:1 Yes chr3L:6713356-6719525 lnc-TH-1:1 No - lnc-TSPAN32-4:1 No - lnc-C11orf21-2:1 No - lnc-C11orf21-2:3 No - lnc-TRPM5-1:1 No - KCNQ1OT1:2 No - KCNQ1OT1:3 No - KCNQ1OT1:7 No - KCNQ1OT1:6 No - lnc-SLC22A18-5:1 No - KCNQ1-AS1:1 No - KCNQ1DN:3 No - lnc-SLC22A18AS-1:1 No - lnc-NAP1L4-1:1 Yes chrX:928798-930098 lnc-NAP1L4-1:5 Yes chrX:928798-930098 lnc-NAP1L4-1:4 Yes chrX:928798-930098 lnc-NAP1L4-1:7 Yes chrX:928798-930098 lnc-NAP1L4-1:3 Yes chrX:928798-930098 lnc-NAP1L4-1:6 Yes chrX:928798-930098 lnc-NAP1L4-1:2 Yes chrX:928798-930098 lnc-NAP1L4-2:6 Yes chr2R:16143147-16145906 lnc-NAP1L4-2:5 Yes chr2R:16143147-16145906 lnc-NAP1L4-3:1 Yes chr2R:16143147-16145906 lnc-OSBPL5-2:1 Yes chr2R:16143147-16145906 lnc-OSBPL5-2:2 Yes chr2R:16143147-16145906 lnc-OSBPL5-1:1 No - lnc-CARS-1:1 Yes chr3R:20309344-20324196 lnc-CARS-2:1 Yes chr3R:20309344-20324196 lnc-CARS-3:1 Yes chr3R:20309344-20324196 lnc-SLC22A18-7:1 Yes chr3R:20309344-20324196 lnc-MRGPRG-1:1 Yes chr3R:20309344-20324196 lnc-SLC22A18-8:1 No - lnc-SLC22A18-9:1 No - lnc-MRGPRE-1:9 No - lnc-MRGPRE-2:2 No - lnc-MRGPRE-2:5 No - lnc-MRGPRE-2:4 No - lnc-MRGPRE-2:3 No - lnc-MRGPRE-2:1 No - lnc-ZNF195-2:1 No - lnc-ART1-6:1 No - lnc-ART1-6:2 No - lnc-ART1-6:3 No - lnc-ART1-6:4 No - lnc-ART1-6:5 No - lnc-ART1-6:7 No - lnc-ART1-6:8 No - lnc-ART1-8:1 No - lnc-ZNF195-1:3 No - lnc-ZNF195-1:4 No - lnc-ART5-1:4 No - lnc-ART5-1:3 No - lnc-ART1-7:1 No - lnc-ART5-3:1 No - lnc-ART5-2:1 No - lnc-NUP98-1:1 Yes chr2L:545129-547096 lnc-CHRNA10-1:1 Yes chr3R:23774225-23781621 lnc-CHRNA10-2:1 Yes chr3R:23774225-23781621 lnc-CHRNA10-3:1 Yes chr3R:23774225-23781621 lnc-CHRNA10-4:1 Yes chr3R:23774225-23781621 lnc-RHOG-3:1 Yes chr3R:23774225-23781621 lnc-RRM1-8:1 Yes chrX:15934495-15940451 lnc-RHOG-4:1 Yes chrX:15934495-15940451 lnc-RRM1-5:1 Yes chrX:15934495-15940451 lnc-SSU72P5-2:1 No - lnc-SSU72P2-3:1 No - lnc-SSU72P5-2:2 No - lnc-SSU72P2-2:1 No - lnc-C11orf40-1:1 No - lnc-C11orf40-2:1 No - lnc-OR51E1-1:3 No - lnc-OR52R1-1:1 No - lnc-OR51G2-1:1 No - lnc-OR51A4-1:1 No - lnc-OR52E2-1:1 No - lnc-OR52J3-1:1 No - lnc-HBD-1:3 No - lnc-HBD-1:2 No - lnc-HBD-1:1 No - lnc-OR51B4-3:2 No - lnc-OR51B4-5:2 No - lnc-OR51B4-5:1 No - lnc-OR51B4-4:1 No - lnc-OR51B6-2:1 No - lnc-UBQLNL-1:1 No - lnc-OR52H1-2:1 No - lnc-OR52N5-1:1 No - lnc-OR52E4-1:1 No - lnc-FAM160A2-1:1 No - lnc-OR52B2-2:1 Yes chr2L:2992870-2998726 lnc-CAVIN3-2:2 No - lnc-CAVIN3-1:4 No - lnc-CAVIN3-1:3 No - lnc-SMPD1-3:1 No - lnc-SMPD1-3:2 No - lnc-HPX-2:2 No - lnc-TRIM3-2:2 No - lnc-TRIM3-2:1 No - lnc-ARFIP2-3:6 No - lnc-ARFIP2-3:5 No - lnc-ARFIP2-3:2 No - lnc-ARFIP2-3:3 No - lnc-ARFIP2-3:4 No - lnc-ARFIP2-3:1 No - lnc-ARFIP2-1:1 No - lnc-TRIM3-1:1 Yes chr3R:11232429-11235013 lnc-TRIM3-1:2 Yes chr3R:11232429-11235013 lnc-ARFIP2-2:1 Yes chrX:19616663-19618537 lnc-RRP8-5:1 No - lnc-TPP1-2:4 Yes chr2L:2767286-2767845 lnc-TPP1-2:3 No - lnc-TPP1-2:2 No - lnc-DCHS1-1:2 No - lnc-DCHS1-1:3 No - lnc-DCHS1-1:1 No - lnc-DCHS1-1:4 No - lnc-ILK-5:1 No - lnc-ILK-6:1 No - lnc-DCHS1-2:1 Yes chr3L:264779-265932 lnc-MRPL17-1:1 No - lnc-ILK-8:1 No - lnc-ILK-7:1 No - lnc-OR2AG1-2:1 No - lnc-OR2AG1-1:1 No - lnc-OR6A2-1:1 No - lnc-OR2D2-2:1 No - lnc-CYB5R2-3:11 No - lnc-CYB5R2-3:12 No - lnc-CYB5R2-3:10 Yes chr3L:13513254-13516276 lnc-CYB5R2-6:1 Yes chr3L:13513254-13516276 lnc-OLFML1-2:1 Yes chr3L:13513254-13516276 lnc-OLFML1-2:2 Yes chr3L:13513254-13516276 lnc-CYB5R2-1:17 Yes chr3L:11816695-11822275 lnc-CYB5R2-1:18 Yes chr3L:11816695-11822275 lnc-CYB5R2-1:16 Yes chr3L:11816695-11822275 lnc-CYB5R2-1:15 Yes chr2R:21798017-21799195 lnc-PPFIBP2-3:1 No - lnc-CYB5R2-1:2 No - lnc-TUB-5:1 Yes chr3R:4712882-4714182 CASC23:5 No - TUB-AS1:1 Yes chr2R:21101928-21123704 lnc-RIC3-2:1 Yes chr2R:21101928-21123704 lnc-LMO1-3:2 No - lnc-TUB-1:2 No - lnc-TUB-1:3 No - lnc-LMO1-2:1 No - lnc-TUB-8:1 Yes chrX:18515428-18572809 lnc-TRIM66-6:1 Yes chr3R:23520146-23521583 lnc-TRIM66-5:1 Yes chr3R:23520146-23521583 lnc-STK33-1:1 Yes chr3R:20593139-20612540 lnc-STK33-2:1 Yes chr3R:20593139-20612540 lnc-RPL27A-4:1 Yes chr3R:20593139-20612540 lnc-ST5-1:1 Yes chr3R:20593139-20612540 lnc-ST5-2:1 Yes chr3R:20593139-20612540 lnc-TRIM66-3:1 No - lnc-TRIM66-4:1 No - lnc-C11orf16-7:2 No - lnc-C11orf16-7:8 No - lnc-C11orf16-7:7 No - lnc-C11orf16-7:3 No - lnc-C11orf16-7:6 No - lnc-C11orf16-7:5 No - lnc-C11orf16-7:1 No - lnc-C11orf16-7:4 No - lnc-C11orf16-1:3 No - lnc-C11orf16-1:2 No - lnc-AKIP1-6:1 No - TMEM9B-AS1:1 Yes chr3R:5355092-5356748 lnc-NRIP3-1:1 Yes chr3L:7562610-7569499 lnc-NRIP3-2:1 Yes chr3L:7562610-7569499 lnc-NRIP3-3:1 Yes chr3L:7562610-7569499 lnc-AKIP1-2:12 Yes chr3L:7562610-7569499 lnc-NRIP3-4:1 Yes chr3L:7562610-7569499 lnc-SCUBE2-1:1 Yes chr3L:7562610-7569499 lnc-SCUBE2-2:1 Yes chr3L:1537137-1544823 lnc-DENND5A-2:2 Yes chrX:17623221-17627895 lnc-DENND5A-3:1 Yes chrX:17623221-17627895 lnc-TMEM41B-5:1 No - lnc-ZNF143-3:1 Yes chr2L:6911090-6914138 lnc-SBF2-6:1 No - lnc-SBF2-5:1 No - lnc-SWAP70-3:1 No - lnc-WEE1-2:1 No - lnc-WEE1-3:1 No - lnc-SBF2-3:1 No - lnc-TMEM41B-6:1 Yes chr3R:11789293-11796948 lnc-TMEM41B-7:1 Yes chr3R:11789293-11796948 lnc-TMEM41B-8:1 Yes chr3R:11789293-11796948 lnc-MTRNR2L8-3:1 Yes chr3R:11789293-11796948 lnc-MTRNR2L8-2:1 Yes chr3R:11789293-11796948 lnc-SBF2-1:2 No - lnc-AMPD3-2:1 Yes chrX:13830741-13845866 lnc-AMPD3-2:3 Yes chrX:13830741-13845866 lnc-AMPD3-2:4 Yes chrX:13830741-13845866 lnc-AMPD3-2:5 Yes chrX:13830741-13845866 lnc-AMPD3-2:6 Yes chrX:13830741-13845866 lnc-MTRNR2L8-1:1 No - lnc-RNF141-1:1 No - lnc-LYVE1-1:1 No - lnc-LYVE1-1:2 No - lnc-CTR9-1:3 Yes chr3L:1307224-1311805 lnc-ZBED5-5:3 No - lnc-ZBED5-5:2 No - lnc-ZBED5-5:1 No - lnc-ZBED5-4:1 No - lnc-ZBED5-3:6 Yes chr2R:12915994-12923734 lnc-ZBED5-3:2 Yes chr2R:12915994-12923734 lnc-ZBED5-3:1 Yes chr2R:12915994-12923734 lnc-ZBED5-3:4 Yes chr2R:12915994-12923734 lnc-ZBED5-3:5 Yes chr2R:12915994-12923734 lnc-ZBED5-3:3 Yes chr2R:12915994-12923734 lnc-ZBED5-2:3 No - lnc-ZBED5-2:4 No - lnc-ZBED5-2:1 No - lnc-ZBED5-2:2 No - ZBED5-AS1:1 No - ZBED5-AS1:2 No - lnc-CTR9-5:2 No - lnc-CTR9-7:1 No - lnc-GALNT18-4:1 No - lnc-CTR9-8:1 No - lnc-GALNT18-5:1 No - lnc-DKK3-7:1 Yes chr3L:5752973-5761886 lnc-DKK3-6:1 Yes chr3L:5752973-5761886 lnc-DKK3-4:1 No - lnc-GALNT18-6:1 No - lnc-GALNT18-7:1 No - lnc-MICAL2-2:2 No - lnc-DKK3-5:1 No - lnc-MICAL2-1:2 No - lnc-MICAL2-1:7 No - lnc-PARVA-6:2 No - lnc-DKK3-8:1 No - lnc-DKK3-8:2 No - lnc-MICAL2-5:2 Yes chrX:19746041-19748458 lnc-PARVA-2:1 No - lnc-TEAD1-1:2 No - LINC00958:13 No - LINC00958:10 No - LINC00958:3 No - lnc-BTBD10-2:2 No - lnc-BTBD10-7:2 Yes chr3L:19813770-19815938 lnc-BTBD10-7:1 Yes chr3L:19813770-19815938 lnc-BTBD10-6:1 Yes chr3L:19813770-19815938 lnc-FAR1-5:1 Yes chr3L:19813770-19815938 lnc-PTH-3:1 Yes chr3L:200174-202152 lnc-ARNTL-2:1 No - lnc-ARNTL-3:1 No - lnc-PTH-4:1 No - lnc-FAR1-2:1 No - lnc-SPON1-4:1 No - lnc-COPB1-1:1 Yes chrX:18381549-18385242 lnc-PSMA1-5:1 Yes chrX:18381549-18385242 lnc-PSMA1-4:1 Yes chrX:18381549-18385242 lnc-PSMA1-3:4 No - lnc-PSMA1-3:3 No - lnc-PSMA1-3:2 No - lnc-PSMA1-2:7 No - lnc-PSMA1-2:2 No - lnc-PSMA1-2:6 No - lnc-PSMA1-2:5 No - lnc-PSMA1-2:3 No - lnc-PSMA1-2:4 No - lnc-PSMA1-1:1 Yes chr2L:13232039-13233058 lnc-CALCB-4:1 No - lnc-CALCA-2:1 Yes chrX:18688538-18693042 lnc-CALCB-1:1 Yes chrX:18688538-18693042 lnc-PDE3B-2:1 No - lnc-CYP2R1-2:1 No - lnc-CALCA-1:1 No - lnc-INSC-4:1 No - lnc-INSC-2:9 No - lnc-SOX6-7:1 No - lnc-INSC-2:4 No - lnc-INSC-6:1 No - lnc-INSC-3:5 No - lnc-PLEKHA7-8:1 Yes chr4:800436-834393 lnc-C11orf58-5:1 Yes chr4:800436-834393 lnc-PLEKHA7-7:1 Yes chr4:800436-834393 lnc-PLEKHA7-6:1 Yes chr4:800436-834393 lnc-PLEKHA7-5:1 Yes chr4:800436-834393 lnc-PLEKHA7-4:1 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX6-3:5 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX6-3:4 No - lnc-SOX6-3:3 No - lnc-C11orf58-3:1 Yes chr4:800436-834393 lnc-NUCB2-30:1 No - lnc-C11orf58-8:1 No - lnc-PLEKHA7-2:1 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-SOX6-4:3 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-SOX6-4:2 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-SOX6-4:1 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-C11orf58-4:1 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-RPS13-5:2 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-RPS13-5:1 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-RPS13-4:1 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-NUCB2-6:1 No - lnc-NUCB2-7:3 No - lnc-RPS13-1:7 Yes chr2L:8363477-8364662 lnc-RPS13-1:6 Yes chr2L:8363477-8364662 lnc-RPS13-1:3 Yes chr2L:8363477-8364662 lnc-RPS13-1:5 Yes chr2L:8363477-8364662 lnc-RPS13-1:4 Yes chr2L:8363477-8364662 lnc-RPS13-1:1 Yes chr2L:8363477-8364662 lnc-RPS13-1:2 Yes chr2L:8363477-8364662 lnc-PIK3C2A-1:2 No - lnc-RPS13-3:1 Yes chr3L:11774650-11790013 lnc-NUCB2-5:1 Yes chr3L:11774650-11790013 lnc-PIK3C2A-1:1 Yes chr3L:11774650-11790013 lnc-NUCB2-4:1 Yes chr3L:17797738-17802279 lnc-NCR3LG1-4:1 Yes chr3L:17797738-17802279 lnc-NCR3LG1-2:1 Yes chr3L:17797738-17802279 lnc-NCR3LG1-3:1 Yes chr3L:17797738-17802279 lnc-NCR3LG1-1:1 No - lnc-NCR3LG1-1:4 No - lnc-ABCC8-1:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-KCNJ11-1:1 No - lnc-KCNJ11-2:1 No - lnc-KCNJ11-4:1 No - lnc-KCNJ11-3:1 No - lnc-OTOG-1:1 No - lnc-ABCC8-2:2 Yes chrX:6050828-6065646 lnc-ABCC8-2:1 Yes chrX:6050828-6065646 lnc-ABCC8-3:1 Yes chrX:6050828-6065646 lnc-SERGEF-2:6 No - lnc-SERGEF-2:5 No - lnc-MYOD1-2:1 Yes chr2L:3718185-3729145 lnc-SERGEF-1:10 No - lnc-SERGEF-1:8 No - lnc-SERGEF-1:9 No - lnc-SERGEF-1:11 No - lnc-SERGEF-1:6 No - lnc-MYOD1-8:1 No - lnc-SERGEF-1:7 Yes chr2L:1500784-1502904 lnc-SERGEF-3:2 Yes chr2L:1500784-1502904 lnc-SERGEF-3:3 Yes chr2L:1500784-1502904 lnc-MRGPRX3-3:1 No - lnc-SAAL1-2:2 Yes chr2R:15538175-15540014 lnc-SAAL1-2:1 Yes chr2R:15538175-15540014 lnc-TPH1-1:1 Yes chr2R:15538175-15540014 lnc-MRGPRX3-1:1 No - lnc-SAAL1-1:2 No - lnc-SAAL1-1:3 No - lnc-MRGPRX3-2:1 No - lnc-SAAL1-3:2 No - lnc-MRGPRX4-2:1 No - lnc-MRGPRX4-3:1 No - lnc-SAA2-3:1 Yes chr3R:8660903-8670684 lnc-SAA2-4:1 Yes chr3R:8660903-8670684 lnc-SAA2-4:2 Yes chr3R:8660903-8670684 lnc-GTF2H1-1:1 No - lnc-GTF2H1-2:1 No - lnc-TSG101-2:1 Yes chr3L:6259105-6262694 lnc-UEVLD-6:4 Yes chr3L:16842294-16844585 lnc-UEVLD-5:1 Yes chr3L:16842294-16844585 lnc-UEVLD-6:2 Yes chr3L:16842294-16844585 lnc-UEVLD-6:3 Yes chr3L:16842294-16844585 lnc-UEVLD-6:1 Yes chr3L:16842294-16844585 lnc-UEVLD-4:1 Yes chr3L:16842294-16844585 lnc-LDHAL6A-1:1 Yes chr3L:16842294-16844585 lnc-TSG101-1:1 Yes chr3L:6259105-6262694 lnc-UEVLD-1:5 Yes chr3L:6259105-6262694 lnc-UEVLD-1:4 Yes chr3L:6259105-6262694 lnc-UEVLD-7:1 No - lnc-UEVLD-7:2 No - lnc-UEVLD-3:1 No - lnc-UEVLD-3:3 No - lnc-UEVLD-3:2 No - lnc-SPTY2D1OS-4:2 No - lnc-PTPN5-1:1 Yes chr3L:3172817-3178580 lnc-MRGPRX1-1:1 No - lnc-MRGPRX2-1:1 No - lnc-CSRP3-1:1 No - lnc-ZDHHC13-1:2 No - NAV2-AS4:1 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-ZDHHC13-6:1 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-DBX1-6:3 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-DBX1-6:1 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-DBX1-6:2 Yes chr2L:19796365-19958424 NAV2-AS2:1 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-NAV2-3:1 No - lnc-NELL1-1:4 No - lnc-ANO5-2:2 No - LINC01495:4 No - lnc-SLC17A6-2:4 No - lnc-SLC17A6-3:1 No - lnc-SLC17A6-4:1 No - lnc-SVIP-1:4 No - lnc-SVIP-1:2 No - lnc-SVIP-1:3 No - lnc-SVIP-1:1 No - lnc-GAS2-3:1 No - lnc-GAS2-4:1 No - lnc-GAS2-5:1 No - lnc-GAS2-1:12 No - lnc-CCDC179-4:1 No - lnc-GAS2-8:1 No - lnc-LUZP2-5:1 No - lnc-LUZP2-4:1 No - lnc-LUZP2-1:2 No - lnc-CCDC179-5:1 No - lnc-CCDC179-6:1 No - lnc-LUZP2-3:1 No - lnc-CCDC179-7:1 No - lnc-ANO3-6:1 No - lnc-ANO3-5:1 No - lnc-MUC15-4:1 No - lnc-MUC15-3:1 No - lnc-MUC15-3:2 No - lnc-MUC15-3:3 No - lnc-LUZP2-2:1 No - lnc-ANO3-3:4 No - lnc-ANO3-2:2 No - lnc-ANO3-4:1 No - lnc-FIBIN-5:1 Yes chr3L:11984906-11990505 lnc-FIBIN-3:1 Yes chr3L:11984906-11990505 lnc-MUC15-2:1 Yes chr3L:1933633-1939103 lnc-FIBIN-1:1 Yes chr2R:13375975-13377731 lnc-BBOX1-2:1 No - lnc-CCDC34-2:1 No - lnc-CCDC34-3:1 Yes chr2L:13982743-14001248 lnc-CCDC34-4:1 Yes chr2L:13982743-14001248 lnc-CCDC34-5:1 Yes chr2L:13982743-14001248 lnc-BBOX1-3:1 Yes chr2L:13982743-14001248 lnc-BBOX1-4:1 No - lnc-BBOX1-5:1 No - BDNF-AS:16 No - lnc-BBOX1-6:1 No - lnc-BBOX1-7:1 No - lnc-BBOX1-8:1 No - lnc-BBOX1-9:1 No - lnc-BBOX1-9:2 No - LINC00678:1 No - LINC00678:3 No - lnc-LIN7C-1:2 No - lnc-LIN7C-1:4 No - lnc-LIN7C-1:3 No - lnc-LIN7C-1:1 No - BDNF-AS:21 No - BDNF-AS:22 No - lnc-METTL15-10:1 No - lnc-BDNF-3:1 No - lnc-BDNF-4:1 No - lnc-METTL15-9:1 No - lnc-METTL15-8:1 No - lnc-BDNF-6:1 Yes chr3L:9362636-9367046 lnc-BDNF-7:1 Yes chr3L:9362636-9367046 lnc-KIF18A-2:1 Yes chr3R:10696647-10698976 lnc-KIF18A-3:1 Yes chr3R:10696647-10698976 lnc-KIF18A-4:1 Yes chr3R:10696647-10698976 lnc-KIF18A-5:1 Yes chr3R:10696647-10698976 lnc-KIF18A-6:1 Yes chr3R:10696647-10698976 lnc-KIF18A-7:1 Yes chr3R:10696647-10698976 lnc-BBOX1-11:1 Yes chr3R:10696647-10698976 lnc-METTL15-2:3 Yes chr3R:10696647-10698976 lnc-METTL15-2:4 Yes chr3R:10696647-10698976 lnc-BBOX1-14:1 Yes chr3R:10696647-10698976 lnc-METTL15-5:3 No - lnc-KIF18A-8:1 No - lnc-KIF18A-9:1 No - lnc-METTL15-12:1 No - lnc-FSHB-9:1 No - LINC02546:12 No - lnc-KCNA4-7:1 No - lnc-KCNA4-6:1 No - lnc-FSHB-7:1 No - lnc-MPPED2-4:1 Yes chrX:17924307-18063247 lnc-ARL14EP-4:1 Yes chr2R:4829246-4830587 lnc-ARL14EP-5:1 No - lnc-DCDC1-2:2 Yes chr3L:9679201-9681060 lnc-DCDC1-2:3 Yes chr3L:9679201-9681060 lnc-ARL14EP-3:6 No - lnc-DNAJC24-8:1 No - lnc-MPPED2-2:2 No - lnc-IMMP1L-8:1 No - lnc-IMMP1L-3:1 No - lnc-DCDC1-3:1 Yes chrX:15700172-15701259 lnc-DCDC1-5:3 Yes chrX:15700172-15701259 lnc-DCDC1-5:5 Yes chrX:15700172-15701259 lnc-DCDC1-5:2 Yes chrX:15700172-15701259 lnc-DCDC1-5:4 Yes chrX:15700172-15701259 lnc-DCDC1-5:1 Yes chrX:15700172-15701259 lnc-DNAJC24-6:1 Yes chr2L:5524139-5525809 lnc-PAX6-9:1 Yes chr2L:5524139-5525809 lnc-IMMP1L-5:1 No - lnc-IMMP1L-6:2 No - lnc-IMMP1L-6:3 No - lnc-IMMP1L-6:1 No - lnc-IMMP1L-7:2 No - lnc-IMMP1L-7:1 No - lnc-ELP4-2:1 No - PAUPAR:10 Yes chr3L:1298672-1300389 lnc-PAX6-5:1 Yes chr3L:1298672-1300389 lnc-ELP4-12:1 Yes chr3L:1298672-1300389 lnc-RCN1-5:2 Yes chr3L:1298672-1300389 lnc-PAX6-2:6 Yes chr3L:1298672-1300389 lnc-PAX6-2:5 Yes chr3L:1298672-1300389 lnc-PAX6-2:3 Yes chr3L:1298672-1300389 lnc-PAX6-2:4 Yes chr3L:1298672-1300389 lnc-PAX6-3:2 Yes chr3L:1298672-1300389 lnc-RCN1-6:2 Yes chr3L:1298672-1300389 lnc-RCN1-7:1 Yes chr3L:1298672-1300389 lnc-PAX6-4:2 No - lnc-RCN1-8:2 No - lnc-CCDC73-4:1 Yes chr3L:10981171-11009188 WT1-AS:10 No - WT1-AS:11 No - lnc-CCDC73-3:1 Yes chr2R:14163066-14164825 lnc-PRRG4-4:1 No - lnc-CCDC73-2:1 No - lnc-PRRG4-3:1 No - lnc-PRRG4-2:1 No - lnc-PRRG4-1:1 No - lnc-QSER1-1:1 No - lnc-CSTF3-1:2 No - lnc-CSTF3-2:1 Yes chrX:5879869-5883391 LINC00294:2 No - CSTF3-DT:20 Yes chrX:23096771-23101431 lnc-CSTF3-3:1 No - lnc-CSTF3-4:1 No - lnc-CSTF3-5:1 No - CSTF3-DT:22 No - lnc-HIPK3-2:1 No - lnc-HIPK3-5:1 No - lnc-C11orf91-2:6 No - lnc-C11orf91-2:2 No - lnc-C11orf91-2:3 No - lnc-C11orf91-2:4 No - lnc-C11orf91-2:1 No - lnc-CD59-1:8 No - lnc-C11orf91-1:1 No - lnc-CD59-2:1 No - lnc-FBXO3-3:2 No - lnc-FBXO3-3:3 No - FBXO3-DT:14 No - FBXO3-DT:15 No - lnc-LMO2-1:4 No - lnc-LMO2-3:1 No - lnc-FBXO3-2:2 No - lnc-FBXO3-2:1 No - lnc-CAPRIN1-4:2 No - lnc-CAPRIN1-5:3 No - lnc-NAT10-5:1 Yes chrX:8716713-8720277 lnc-NAT10-5:2 Yes chrX:8716713-8720277 lnc-ELF5-4:1 Yes chr3L:21644958-21666306 lnc-ABTB2-1:1 No - lnc-CAT-1:1 No - lnc-ABTB2-2:1 No - lnc-EHF-4:1 No - lnc-APIP-3:2 Yes chrX:13737942-13739177 lnc-EHF-5:1 No - lnc-CD44-7:1 No - lnc-APIP-1:2 No - lnc-CD44-5:1 No - lnc-CD44-7:2 No - lnc-CD44-4:1 No - lnc-CD44-3:1 No - lnc-SLC1A2-4:1 No - lnc-CD44-6:1 Yes chr2L:737212-744395 lnc-SLC1A2-3:1 No - lnc-PAMR1-2:1 No - lnc-LDLRAD3-1:1 No - lnc-COMMD9-7:1 No - lnc-COMMD9-6:1 No - lnc-COMMD9-4:2 No - lnc-COMMD9-2:2 No - lnc-COMMD9-2:1 No - lnc-TRAF6-17:2 No - lnc-TRAF6-17:1 No - lnc-PRR5L-1:2 No - lnc-RAG1-5:1 No - lnc-RAG1-5:2 No - lnc-RAG1-5:3 No - lnc-RAG1-4:1 No - lnc-TRAF6-2:1 Yes chrX:8154599-8157386 lnc-RAG2-3:1 Yes chrX:8154599-8157386 lnc-RAG1-1:1 No - lnc-RAG2-1:4 No - lnc-RAG2-1:3 No - lnc-RAG2-1:1 No - lnc-RAG2-1:2 No - lnc-C11orf74-9:1 No - lnc-C11orf74-10:1 No - lnc-RAG2-4:1 No - lnc-RAG2-5:1 No - lnc-C11orf74-11:1 No - LINC01493:11 No - LINC01493:13 No - LINC01493:15 No - lnc-C11orf74-13:1 No - lnc-C11orf74-15:1 No - lnc-LRRC4C-8:1 No - lnc-LRRC4C-7:1 No - lnc-ALX4-18:1 Yes chr2R:21872030-21946259 lnc-ALX4-17:1 Yes chr2R:21872030-21946259 lnc-API5-12:1 Yes chr2R:21872030-21946259 lnc-API5-11:1 No - lnc-API5-10:1 No - LINC01499:4 No - lnc-API5-4:7 No - lnc-LRRC4C-3:4 No - lnc-API5-9:1 No - lnc-ALX4-16:2 No - lnc-ALX4-16:1 No - lnc-ALX4-7:2 No - lnc-ALX4-15:1 Yes chrX:4549883-4551878 lnc-ALX4-14:1 No - lnc-ALX4-13:1 No - lnc-TTC17-5:1 No - MIR670HG:19 No - MIR670HG:21 No - lnc-TTC17-3:1 No - MIR670HG:22 No - MIR670HG:24 No - MIR670HG:26 No - lnc-HSD17B12-1:14 No - lnc-HSD17B12-1:15 No - lnc-HSD17B12-1:17 No - lnc-ALX4-12:1 No - MIR670HG:28 No - lnc-ALKBH3-3:1 Yes chrX:7908931-7911885 lnc-ALKBH3-5:1 Yes chrX:7908931-7911885 ALKBH3-AS1:2 No - ALKBH3-AS1:4 No - ALKBH3-AS1:6 No - lnc-ACCS-1:1 No - lnc-ALX4-2:2 No - lnc-ALX4-9:1 No - lnc-TP53I11-7:1 No - lnc-CD82-2:1 No - lnc-CD82-3:1 No - lnc-SYT13-9:1 No - lnc-SYT13-7:1 No - lnc-SYT13-6:1 No - lnc-TP53I11-1:2 No - lnc-TP53I11-2:2 No - lnc-SYT13-5:3 No - lnc-SYT13-5:1 No - lnc-SYT13-5:2 No - lnc-SYT13-2:2 No - lnc-SYT13-4:1 No - lnc-PRDM11-3:7 No - lnc-PRDM11-4:2 No - lnc-PRDM11-10:1 No - lnc-CHST1-6:1 No - lnc-SLC35C1-3:1 No - lnc-C11orf94-6:1 Yes chr2L:6498647-6526996 lnc-C11orf94-5:1 Yes chr2L:6498647-6526996 lnc-SLC35C1-2:1 Yes chr2L:6498647-6526996 lnc-SLC35C1-83:4 No - lnc-SLC35C1-7:1 No - lnc-CHST1-3:2 No - lnc-SLC35C1-6:1 No - lnc-SLC35C1-1:2 No - lnc-SLC35C1-1:3 No - lnc-C11orf94-3:1 Yes chr3L:20776766-20778264 lnc-C11orf94-4:1 Yes chr3L:20776766-20778264 lnc-PEX16-1:1 No - lnc-PEX16-2:1 No - lnc-PEX16-3:1 No - lnc-PEX16-4:1 No - lnc-PEX16-5:1 No - lnc-CREB3L1-2:2 No - lnc-PHF21A-1:3 No - lnc-CHRM4-2:1 No - lnc-CHRM4-4:1 No - lnc-HARBI1-2:1 No - lnc-HARBI1-1:1 No - lnc-ZNF408-5:1 No - lnc-ZNF408-5:2 No - lnc-ZNF408-5:3 No - lnc-ARHGAP1-1:1 Yes chr3R:8349815-8352817 lnc-ZNF408-3:1 Yes chr3R:8349815-8352817 lnc-ATG13-1:1 Yes chr3L:12138868-12143380 lnc-LRP4-2:1 Yes chr3R:16050801-16060675 lnc-LRP4-1:4 Yes chr3R:16050801-16060675 lnc-LRP4-1:3 Yes chr3R:16050801-16060675 lnc-PACSIN3-4:2 Yes chr3L:22714313-22717577 lnc-PACSIN3-4:1 Yes chr3L:22714313-22717577 lnc-PACSIN3-3:1 Yes chr3L:22714313-22717577 lnc-PACSIN3-1:1 Yes chr3L:22714313-22717577 lnc-PACSIN3-2:1 No - lnc-DDB2-1:1 No - lnc-PACSIN3-5:1 Yes chr3L:19492053-19497723 lnc-MADD-2:1 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-SLC39A13-1:1 No - lnc-PSMC3-1:1 Yes chr3R:29863701-29868895 lnc-RAPSN-1:1 Yes chr3R:23752876-23754623 lnc-RAPSN-1:3 Yes chr3R:23752876-23754623 lnc-RAPSN-1:2 Yes chr3R:23752876-23754623 lnc-PSMC3-2:1 Yes chr4:583108-589348 lnc-RAPSN-2:1 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-KBTBD4-4:2 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-KBTBD4-4:1 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-RAPSN-4:1 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-RAPSN-5:1 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-KBTBD4-3:1 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-KBTBD4-2:1 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-FAM180B-2:1 No - lnc-C1QTNF4-1:1 Yes chrX:7852481-7854244 lnc-AGBL2-2:1 Yes chrX:7852481-7854244 lnc-FAM180B-3:1 No - lnc-FNBP4-2:2 Yes chrX:13692292-13717835 lnc-FNBP4-2:1 Yes chrX:13692292-13717835 lnc-AGBL2-1:5 No - lnc-AGBL2-1:2 No - lnc-AGBL2-1:4 No - lnc-AGBL2-1:3 No - lnc-AGBL2-1:1 No - lnc-NUP160-2:1 No - lnc-FNBP4-1:1 No - lnc-FNBP4-3:1 Yes chr2L:11123777-11129335 lnc-PTPRJ-3:1 Yes chr2L:11123777-11129335 lnc-FNBP4-4:1 Yes chr2L:11123777-11129335 lnc-FNBP4-4:2 Yes chr2L:11123777-11129335 lnc-FNBP4-5:1 Yes chr2L:11123777-11129335 lnc-FNBP4-6:1 Yes chr2L:11123777-11129335 lnc-PTPRJ-2:1 Yes chr2L:11123777-11129335 lnc-NUP160-3:1 No - lnc-PTPRJ-1:1 No - lnc-OR4C5-1:1 No - lnc-OR4A47-1:1 No - lnc-TRIM49B-6:1 No - lnc-TRIM64C-4:1 No - lnc-TRIM49B-5:1 No - lnc-TRIM49B-4:1 No - lnc-TRIM49B-2:1 No - lnc-TRIM64C-3:1 No - lnc-TRIM64C-2:1 No - lnc-TRIM64C-1:1 No - lnc-TRIM49B-1:1 No - lnc-TRIM49B-3:1 No - lnc-FOLH1-1:1 No - lnc-TRIM49B-7:1 No - lnc-TRIM49B-7:2 No - lnc-FOLH1-2:1 No - lnc-TRIM49B-8:1 No - lnc-TRIM49B-9:1 No - lnc-OR4C12-8:1 No - lnc-OR4C13-5:1 No - lnc-OR4C12-7:1 No - lnc-OR4C13-4:1 No - lnc-OR4C13-3:1 No - lnc-OR4C12-6:1 No - lnc-OR4C12-5:1 No - lnc-OR4C12-4:1 No - lnc-OR4C12-3:1 No - lnc-OR4C13-2:1 No - lnc-OR4C12-2:1 No - lnc-OR4C13-6:1 No - lnc-OR4C12-9:3 No - lnc-OR4C12-9:2 No - lnc-OR4C12-9:1 No - lnc-OR4C12-9:4 No - lnc-OR4C13-1:3 No - lnc-OR4C13-7:1 No - lnc-OR4C13-7:2 No - lnc-OR4C13-7:3 No - lnc-OR4C13-7:4 No - lnc-OR4C13-7:5 No - lnc-OR4C13-9:1 No - lnc-OR4C13-9:3 No - lnc-OR4A5-1:1 No - lnc-OR4A5-2:1 No - lnc-OR4C46-1:1 No - lnc-OR4C46-2:1 No - lnc-OR4A5-3:1 No - lnc-OR4A16-3:1 No - lnc-OR4C11-4:2 No - lnc-TRIM48-1:1 No - lnc-TRIM48-2:1 No - lnc-OR4C11-4:1 No - lnc-OR4C11-3:2 No - lnc-OR4C11-2:1 No - lnc-OR4A16-2:1 No - lnc-OR4A16-1:1 No - lnc-OR4A15-1:1 No - lnc-OR4A15-2:1 No - lnc-OR4A15-3:1 No - lnc-OR4C15-3:1 No - lnc-OR4C15-2:1 No - lnc-OR4C15-1:1 No - lnc-OR4C6-1:1 No - lnc-OR4C6-2:1 No - lnc-OR5D16-1:1 No - lnc-TRIM51-1:1 No - lnc-OR5W2-1:1 No - lnc-OR10AG1-1:1 No - lnc-OR8I2-1:1 No - lnc-OR8J3-3:1 No - lnc-OR8J3-1:1 No - lnc-OR8J3-2:1 No - lnc-OR8K5-1:1 No - lnc-OR5T2-1:1 No - lnc-OR8H1-1:1 No - lnc-OR8H1-2:1 No - lnc-OR8K1-1:1 No - lnc-OR8U1-1:1 No - lnc-OR8U1-2:1 No - lnc-OR5AP2-1:1 No - lnc-OR9G1-1:1 No - lnc-OR9G1-2:1 No - lnc-OR9G1-2:2 No - lnc-OR9G4-1:1 No - lnc-APLNR-2:1 No - lnc-LRRC55-1:1 No - lnc-P2RX3-4:1 Yes chr2L:13212335-13215350 lnc-SSRP1-1:1 No - lnc-SLC43A3-1:1 No - lnc-PRG2-1:1 No - lnc-RTN4RL2-1:1 No - lnc-TIMM10-1:1 No - lnc-YPEL4-1:5 Yes chrX:10205292-10212374 lnc-YPEL4-1:4 No - lnc-YPEL4-1:2 No - lnc-YPEL4-1:1 No - lnc-YPEL4-1:3 No - lnc-CLP1-1:1 Yes chrX:9324508-9356227 lnc-CLP1-1:2 Yes chrX:9324508-9356227 lnc-TMX2-1:1 Yes chrX:9324508-9356227 lnc-BTBD18-1:1 No - lnc-OR9I1-4:1 No - lnc-OR9Q1-1:1 No - lnc-OR9I1-3:1 No - lnc-OR9I1-2:1 No - lnc-OR10Q1-2:1 No - lnc-OR5B17-2:1 No - lnc-OR5B17-1:1 No - lnc-OR5B21-1:4 No - lnc-CNTF-2:1 No - lnc-CNTF-3:1 No - lnc-GLYATL2-6:1 No - lnc-GLYATL2-3:1 No - lnc-GLYATL1-1:2 No - lnc-GLYATL1-1:3 No - lnc-GLYATL1-3:1 No - lnc-GLYATL2-4:1 No - lnc-GLYATL2-5:1 No - FAM111A-DT:29 No - lnc-MPEG1-6:1 No - lnc-FAM111B-1:2 No - lnc-FAM111B-1:3 No - lnc-MPEG1-4:1 Yes chrX:6533999-6538575 lnc-MPEG1-3:1 No - lnc-DTX4-1:1 No - lnc-MPEG1-1:3 No - lnc-MPEG1-7:1 No - lnc-OR5A2-1:1 No - lnc-OR4D10-1:1 No - lnc-OR4D9-1:1 No - lnc-OR4D9-1:4 No - lnc-STX3-2:3 No - lnc-OSBP-2:1 No - lnc-OR10V1-2:1 No - lnc-OR4D9-7:1 No - lnc-OR4D9-6:1 No - lnc-MRPL16-2:1 No - lnc-GIF-1:2 Yes chrX:1890256-1891482 lnc-GIF-1:1 Yes chrX:1890256-1891482 lnc-TCN1-1:1 No - lnc-OOSP2-3:1 No - lnc-MS4A6A-1:6 No - lnc-MS4A6A-1:5 No - lnc-MS4A6A-1:4 No - lnc-MS4A6A-1:3 No - lnc-MS4A6A-1:2 No - lnc-MS4A7-1:1 No - lnc-MS4A7-1:2 No - lnc-MS4A8-17:3 No - lnc-MS4A8-17:8 No - lnc-MS4A8-17:9 No - lnc-MS4A8-17:11 No - lnc-SLC15A3-6:1 Yes chr2R:18447361-18451041 lnc-SLC15A3-5:1 Yes chr2R:18447361-18451041 lnc-TMEM109-2:1 No - lnc-TMEM109-1:7 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-VPS37C-3:1 No - lnc-VWCE-2:1 Yes chr3R:5226158-5227526 lnc-CD5-2:1 No - lnc-PGA3-2:1 No - lnc-PGA3-1:2 No - lnc-DDB1-4:1 No - lnc-DDB1-2:1 No - lnc-VWCE-1:1 Yes chr3R:13052245-13056725 lnc-TMEM138-9:1 No - lnc-TMEM138-4:1 No - lnc-DDB1-1:3 No - lnc-DDB1-1:4 No - lnc-DDB1-1:1 No - lnc-DDB1-1:2 No - lnc-TMEM138-10:1 No - lnc-TMEM138-2:1 No - lnc-TMEM138-3:1 No - lnc-CYB561A3-1:1 Yes chr3L:8310493-8315502 lnc-CYB561A3-2:1 No - lnc-PPP1R32-3:1 Yes chr2R:8172364-8173613 lnc-CPSF7-2:2 Yes chr2R:8172364-8173613 lnc-LRRC10B-1:3 No - lnc-CPSF7-5:1 Yes chr4:278685-306481 lnc-DAGLA-1:6 No - lnc-DAGLA-3:1 No - lnc-DAGLA-3:2 No - lnc-DAGLA-3:3 No - lnc-DAGLA-3:4 No - lnc-DAGLA-2:6 No - lnc-TMEM258-3:5 Yes chr2R:24162489-24173660 lnc-TMEM258-3:1 Yes chr2R:24162489-24173660 lnc-TMEM258-3:6 Yes chr2R:24162489-24173660 lnc-TMEM258-3:2 Yes chr2R:24162489-24173660 lnc-TMEM258-1:1 Yes chr3L:16844568-16844991 lnc-TMEM258-2:1 No - lnc-RAB3IL1-3:1 No - lnc-RAB3IL1-1:1 No - lnc-FADS3-1:1 No - lnc-FTH1-5:1 Yes chr3R:10161464-10170487 lnc-FTH1-4:1 Yes chr3R:10161464-10170487 lnc-RAB3IL1-2:2 No - lnc-RAB3IL1-2:1 Yes chrX:13107382-13108194 lnc-FTH1-6:1 No - lnc-INCENP-1:1 Yes chr2R:7278467-7281795 lnc-ROM1-6:1 No - lnc-TUT1-2:1 No - lnc-TUT1-1:2 No - lnc-TUT1-1:1 No - lnc-EML3-1:1 Yes chr3R:5638655-5648738 lnc-MTA2-2:1 Yes chr3L:14903805-14942907 lnc-MTA2-4:1 Yes chr3L:14903805-14942907 lnc-CSKMT-3:1 No - lnc-B3GAT3-1:1 Yes chrX:21600502-21605264 lnc-INTS5-1:1 Yes chrX:21600502-21605264 lnc-C11orf98-1:1 No - lnc-UQCC3-1:1 No - lnc-C11orf98-2:1 No - lnc-C11orf98-2:2 No - lnc-LBHD1-2:1 Yes chr3L:7976406-7977849 lnc-LBHD1-2:2 Yes chr3L:7976406-7977849 lnc-HNRNPUL2-BSCL2-1:5 No - lnc-HNRNPUL2-BSCL2-1:4 No - lnc-HNRNPUL2-BSCL2-1:3 No - lnc-HNRNPUL2-BSCL2-1:2 Yes chr2R:18632328-18639270 lnc-TTC9C-1:1 No - lnc-TMEM223-2:1 Yes chr3R:5548115-5551168 lnc-TMEM223-1:1 No - lnc-NXF1-2:1 No - lnc-TMEM223-3:1 Yes chrX:10832752-10847092 lnc-STX5-3:2 Yes chrX:10832752-10847092 lnc-STX5-3:1 Yes chrX:10832752-10847092 lnc-NXF1-1:1 Yes chr2L:16307346-16309274 lnc-NXF1-3:1 Yes chr2L:16307346-16309274 lnc-TEX54-1:1 Yes chr2R:6074471-6076367 lnc-TEX54-2:1 Yes chr2R:6074471-6076367 SNHG1:1 No - SNHG1:3 No - SNHG1:25 No - lnc-SLC3A2-3:1 No - lnc-SLC3A2-4:1 No - lnc-SLC22A6-1:1 No - lnc-SLC22A8-1:1 Yes chr2R:19979242-19984895 lnc-SLC22A8-1:2 Yes chr2R:19979242-19984895 lnc-SLC22A8-2:1 Yes chr2R:19979242-19984895 lnc-SLC22A25-2:1 Yes chr2R:19979242-19984895 lnc-SLC22A25-1:2 Yes chr2R:19979242-19984895 lnc-SLC22A25-1:1 Yes chr2R:19979242-19984895 lnc-LGALS12-2:4 No - lnc-PLA2G16-1:1 No - lnc-ATL3-2:1 Yes chr3R:24625671-24634714 lnc-PLA2G16-2:1 Yes chr3R:24625671-24634714 lnc-C11orf95-1:22 No - lnc-C11orf95-1:18 No - lnc-C11orf95-1:6 No - lnc-C11orf95-6:1 No - lnc-C11orf95-5:1 No - lnc-C11orf95-3:1 No - lnc-MACROD1-3:1 Yes chrX:19521929-19530896 lnc-RCOR2-4:3 No - lnc-RCOR2-4:1 No - lnc-RCOR2-4:2 No - lnc-FLRT1-2:3 No - lnc-FLRT1-2:4 No - lnc-TRPT1-4:1 No - lnc-TRPT1-3:1 No - lnc-MACROD1-1:2 No - lnc-MACROD1-1:3 Yes chr2L:295122-297449 lnc-STIP1-1:1 Yes chr2L:295122-297449 lnc-PPP1R14B-2:6 No - lnc-PPP1R14B-2:2 No - lnc-PPP1R14B-2:3 No - lnc-PPP1R14B-2:7 No - lnc-PPP1R14B-2:4 No - lnc-PPP1R14B-2:1 No - lnc-PPP1R14B-2:5 No - lnc-BAD-1:2 No - lnc-BAD-1:1 No - lnc-BAD-2:1 No - lnc-PRDX5-1:1 No - lnc-CCDC88B-1:1 No - lnc-RPS6KA4-1:3 No - lnc-RASGRP2-2:1 Yes chr3R:22468512-22486969 lnc-SLC22A12-2:2 Yes chr3R:22468512-22486969 lnc-SLC22A12-2:3 Yes chr3R:22468512-22486969 lnc-SLC22A12-2:4 Yes chr3R:22468512-22486969 lnc-NRXN2-1:1 No - lnc-PYGM-1:1 No - lnc-RASGRP2-1:1 Yes chr2L:2130813-2137296 lnc-PPP2R5B-6:1 No - lnc-PYGM-2:6 Yes chr3R:17540421-17545148 lnc-PYGM-3:1 Yes chr3R:17540421-17545148 lnc-MAP4K2-3:2 Yes chr3R:17540421-17545148 lnc-MAP4K2-3:1 Yes chr3R:17540421-17545148 lnc-PPP2R5B-5:1 No - lnc-SF1-2:1 Yes chr2R:19178738-19227193 lnc-MAP4K2-1:1 Yes chr2L:7056301-7063586 lnc-MEN1-1:1 Yes chr2R:24092079-24098636 lnc-EHD1-4:2 Yes chr2R:24092079-24098636 lnc-EHD1-4:1 Yes chr2R:24092079-24098636 lnc-CDC42BPG-2:1 Yes chr3R:12697322-12704875 lnc-ATG2A-3:1 Yes chr3R:12697322-12704875 lnc-PPP2R5B-3:1 Yes chr3R:12697322-12704875 MIR194-2HG:4 No - MIR194-2HG:3 No - lnc-PPP2R5B-2:1 No - lnc-ATG2A-2:1 Yes chr3L:2774338-2780677 lnc-EHD1-3:1 Yes chr3L:2774338-2780677 lnc-GPHA2-1:1 No - lnc-MAJIN-1:1 No - lnc-NAALADL1-2:1 Yes chr3R:8341100-8341872 lnc-CDCA5-2:4 No - lnc-CDCA5-2:3 No - lnc-CDCA5-2:1 No - lnc-CDCA5-2:2 No - lnc-CDCA5-1:1 No - lnc-NAALADL1-1:2 No - lnc-TMEM262-2:1 No - lnc-TMEM262-2:2 No - lnc-TMEM262-1:1 No - lnc-TM7SF2-2:1 No - lnc-SYVN1-1:1 No - lnc-SYVN1-1:2 No - lnc-FAU-1:1 Yes chr3R:31772219-31775163 lnc-FAU-1:2 Yes chr3R:31772219-31775163 lnc-SYVN1-2:1 No - lnc-CAPN1-2:1 No - lnc-SLC25A45-2:1 Yes chr3R:27239163-27241228 lnc-SLC25A45-1:1 No - lnc-LTBP3-8:1 Yes chr3R:27559379-27561319 lnc-LTBP3-7:1 Yes chr3R:27559379-27561319 NEAT1:1 No - lnc-LTBP3-2:5 No - NEAT1:7 No - NEAT1:8 No - NEAT1:12 No - NEAT1:14 No - NEAT1:17 No - lnc-FRMD8-1:5 No - lnc-LTBP3-6:1 No - MALAT1:1 No - MALAT1:2 No - MALAT1:3 No - lnc-LTBP3-5:1 No - MALAT1:10 No - MALAT1:11 No - MALAT1:12 No - MALAT1:13 No - MALAT1:14 No - MALAT1:15 No - MALAT1:16 No - MALAT1:17 No - MALAT1:18 No - MALAT1:19 No - MALAT1:25 No - MALAT1:26 No - MALAT1:27 No - MALAT1:28 No - lnc-LTBP3-2:6 No - lnc-KCNK7-7:2 Yes chr2L:4477462-4614300 lnc-KCNK7-7:1 Yes chr2L:4477462-4614300 lnc-KCNK7-6:1 Yes chr2L:4477462-4614300 lnc-KCNK7-5:2 Yes chr2L:4477462-4614300 lnc-KCNK7-5:1 Yes chr2L:4477462-4614300 lnc-KCNK7-4:1 Yes chr2L:4477462-4614300 lnc-SSSCA1-1:1 No - SSSCA1-AS1:1 No - SSSCA1-AS1:3 No - lnc-KCNK7-2:1 Yes chrX:8170229-8177185 lnc-KCNK7-2:2 Yes chrX:8170229-8177185 lnc-KCNK7-3:1 Yes chrX:8170229-8177185 lnc-MAP3K11-1:2 Yes chr2L:17436830-17450364 lnc-MAP3K11-1:1 Yes chr2L:17436830-17450364 lnc-MAP3K11-2:1 Yes chr2L:17436830-17450364 lnc-SIPA1-2:1 Yes chr2L:17436830-17450364 lnc-SIPA1-2:2 Yes chr2L:17436830-17450364 lnc-SIPA1-2:3 No - lnc-SIPA1-2:4 No - lnc-KAT5-1:1 No - lnc-RNASEH2C-1:1 No - lnc-RNASEH2C-1:2 No - OVOL1-AS1:2 Yes chrX:5048273-5070929 OVOL1-AS1:1 Yes chrX:5048273-5070929 lnc-CFL1-1:8 No - lnc-CFL1-2:4 No - lnc-CFL1-2:1 No - lnc-CFL1-2:3 No - lnc-CFL1-2:2 No - lnc-CFL1-3:3 No - lnc-CFL1-5:1 Yes chr4:215009-227748 lnc-EIF1AD-2:1 No - lnc-CATSPER1-1:1 No - lnc-EIF1AD-3:1 No - lnc-CATSPER1-2:1 No - lnc-SF3B2-1:1 Yes chr2L:3026252-3029168 lnc-YIF1A-6:2 Yes chr3L:12746616-12750056 lnc-YIF1A-6:4 No - lnc-YIF1A-6:3 No - lnc-CD248-1:1 Yes chr3R:26717871-26719806 lnc-YIF1A-7:1 No - lnc-TMEM151A-2:1 No - lnc-BRMS1-2:1 Yes chrX:10490069-10585422 lnc-BRMS1-1:1 Yes chrX:10490069-10585422 lnc-TMEM151A-3:1 No - lnc-TMEM151A-4:1 Yes chr2L:355565-357874 lnc-NPAS4-9:1 No - lnc-NPAS4-1:4 No - lnc-PELI3-1:1 Yes chr3R:14511838-14512691 lnc-MRPL11-1:7 Yes chr3R:23860162-23890052 lnc-MRPL11-1:5 No - lnc-MRPL11-1:6 Yes chr3R:8344400-8347465 lnc-CTSF-2:1 Yes chr2R:22425733-22426977 lnc-ZDHHC24-1:2 Yes chr3R:5237651-5251745 lnc-ZDHHC24-1:1 Yes chr3R:5237651-5251745 lnc-CCDC87-1:1 No - lnc-SPTBN2-3:2 No - lnc-SPTBN2-3:1 No - lnc-RBM4-2:1 Yes chr3L:7339266-7341893 lnc-RBM4B-1:1 Yes chrX:17657372-17669371 lnc-RBM4B-2:1 Yes chrX:17657372-17669371 lnc-RBM4B-3:1 Yes chrX:17657372-17669371 lnc-RBM4B-4:1 Yes chrX:17657372-17669371 lnc-SPTBN2-1:1 No - lnc-SPTBN2-2:1 No - lnc-SPTBN2-4:1 No - lnc-SPTBN2-5:1 Yes chr2R:9850703-9861543 lnc-SPTBN2-6:1 Yes chr2R:9850703-9861543 lnc-C11orf86-2:1 No - lnc-KDM2A-4:1 No - lnc-RHOD-2:1 No - lnc-KDM2A-3:1 No - lnc-KDM2A-2:1 No - lnc-KDM2A-1:1 No - lnc-POLD4-2:1 Yes chr2R:19133727-19137169 lnc-SSH3-4:1 Yes chr2R:19133727-19137169 lnc-RAD9A-6:1 Yes chr3L:18870045-18872553 lnc-RAD9A-6:2 Yes chr3L:18870045-18872553 lnc-RAD9A-6:3 Yes chr3L:18870045-18872553 lnc-RAD9A-6:5 Yes chr3L:18870045-18872553 lnc-POLD4-1:4 Yes chr3L:18870045-18872553 lnc-POLD4-1:3 Yes chr3L:18870045-18872553 lnc-POLD4-1:10 Yes chr3L:18870045-18872553 lnc-POLD4-1:6 Yes chr3L:18870045-18872553 lnc-POLD4-1:9 Yes chr3L:18870045-18872553 lnc-POLD4-1:5 Yes chr3L:18870045-18872553 lnc-POLD4-1:8 Yes chr3L:18870045-18872553 lnc-POLD4-1:7 Yes chr3L:18870045-18872553 lnc-SSH3-5:1 Yes chr3L:18870045-18872553 lnc-TBC1D10C-3:1 Yes chr3L:18870045-18872553 lnc-RAD9A-6:7 Yes chr3L:18870045-18872553 lnc-CLCF1-2:1 Yes chr3R:24518270-24522331 lnc-CARNS1-2:1 No - lnc-PTPRCAP-2:1 Yes chr2R:6862001-6872718 lnc-RPS6KB2-1:3 No - lnc-CABP4-2:1 No - lnc-TMEM134-1:1 Yes chr3L:1865430-1869491 lnc-GPR152-1:8 Yes chr3L:1865430-1869491 lnc-GPR152-1:7 Yes chr3L:1865430-1869491 lnc-GPR152-1:6 Yes chr3L:1865430-1869491 lnc-CDK2AP2-2:1 No - lnc-CDK2AP2-1:1 No - lnc-PITPNM1-1:1 Yes chrX:11137859-11139689 lnc-CABP2-2:1 No - lnc-GSTP1-3:1 No - lnc-CABP2-1:2 No - lnc-GSTP1-1:1 No - lnc-NUDT8-2:2 No - lnc-NUDT8-2:1 No - lnc-NDUFV1-4:1 No - lnc-NDUFV1-4:2 No - lnc-NDUFV1-6:1 Yes chr2R:7466879-7477162 lnc-ACY3-1:1 Yes chr2R:7466879-7477162 lnc-ALDH3B2-1:1 No - lnc-NDUFV1-7:1 No - lnc-ALDH3B2-2:1 No - lnc-NDUFV1-8:1 No - lnc-ALDH3B2-3:2 No - lnc-ALDH3B2-3:1 No - lnc-ALDH3B2-3:3 No - lnc-ALDH3B1-2:4 No - lnc-ALDH3B1-6:1 No - lnc-CHKA-2:1 Yes chrX:2254403-2259863 lnc-UNC93B1-1:2 Yes chr2R:7466879-7477162 lnc-UNC93B1-1:10 Yes chr2R:7466879-7477162 lnc-TCIRG1-1:6 Yes chr2L:21614232-21624080 lnc-UNC93B1-6:1 Yes chr2L:21614232-21624080 lnc-UNC93B1-5:1 Yes chr2L:21614232-21624080 lnc-UNC93B1-7:1 Yes chr2L:21614232-21624080 lnc-TCIRG1-2:5 No - lnc-TCIRG1-2:6 No - lnc-CHKA-1:1 Yes chrX:648483-656033 lnc-C11orf24-1:1 Yes chrX:648483-656033 lnc-KMT5B-1:2 No - lnc-KMT5B-2:5 No - lnc-KMT5B-2:8 No - lnc-KMT5B-2:7 No - lnc-KMT5B-2:6 No - lnc-C11orf24-2:1 No - lnc-C11orf24-3:1 Yes chr3L:6164916-6173880 lnc-GAL-1:1 No - lnc-CPT1A-3:1 Yes chr2R:13506430-13513112 lnc-CPT1A-2:1 Yes chr2R:13506430-13513112 lnc-CPT1A-1:2 Yes chr2R:13506430-13513112 lnc-CPT1A-1:1 Yes chr2R:13506430-13513112 lnc-TESMIN-2:1 Yes chr2R:10469473-10478567 lnc-IGHMBP2-2:1 No - lnc-MRPL21-1:1 Yes chr3L:19253290-19255061 lnc-MRPL21-1:2 Yes chr3L:19253290-19255061 lnc-TPCN2-4:2 No - MRGPRF-AS1:6 No - lnc-MRGPRF-5:2 No - lnc-MRGPRF-5:1 No - lnc-TPCN2-5:3 No - lnc-MRGPRF-4:6 No - lnc-MRGPRF-4:3 No - lnc-MRGPRF-4:4 No - lnc-MYEOV-11:1 No - lnc-MYEOV-11:5 No - lnc-MRGPRF-6:1 No - lnc-MYEOV-11:6 No - lnc-MYEOV-11:7 No - LINC01488:7 No - lnc-ORAOV1-5:1 No - lnc-FGF19-1:2 No - lnc-FGF19-1:3 No - lnc-FGF19-1:1 No - lnc-FGF19-2:1 No - lnc-CCND1-2:1 No - lnc-CCND1-2:2 No - lnc-CCND1-1:2 No - lnc-FGF3-5:1 No - lnc-ANO1-1:2 No - LINC02584:9 No - LINC02584:6 Yes chrX:11877737-11887162 lnc-SHANK2-5:3 No - lnc-SHANK2-8:1 No - lnc-PPFIA1-1:1 No - lnc-SHANK2-7:1 Yes chr2L:6723903-6732766 lnc-CTTN-9:1 Yes chr2R:14060456-14140902 lnc-DHCR7-5:1 Yes chr2R:14060456-14140902 lnc-DHCR7-3:2 No - lnc-DHCR7-3:1 No - lnc-NADSYN1-1:3 No - lnc-KRTAP5-7-1:1 Yes chrX:13684380-13718285 lnc-KRTAP5-7-1:2 Yes chrX:13684380-13718285 lnc-DHCR7-4:1 Yes chrX:13684380-13718285 lnc-KRTAP5-10-1:1 No - lnc-KRTAP5-11-3:1 No - lnc-KRTAP5-10-2:1 No - lnc-KRTAP5-11-4:1 No - lnc-FAM86C1-1:1 No - lnc-FAM86C1-1:2 No - lnc-FAM86C1-1:3 No - lnc-FAM86C1-1:4 No - lnc-FAM86C1-1:5 No - lnc-ZNF705E-1:21 Yes chrX:19243631-19245224 lnc-ZNF705E-1:12 Yes chrX:19243631-19245224 lnc-ZNF705E-1:22 Yes chrX:19243631-19245224 lnc-ZNF705E-1:13 Yes chrX:19243631-19245224 lnc-ZNF705E-1:16 No - lnc-ZNF705E-1:2 No - lnc-ZNF705E-1:14 No - lnc-ZNF705E-1:1 No - lnc-DEFB131B-1:1 No - lnc-DEFB131B-1:2 No - lnc-DEFB131B-5:1 Yes chrX:5329876-5332435 lnc-NUMA1-5:1 Yes chrX:5329876-5332435 lnc-NUMA1-2:3 Yes chrX:17848110-17850342 lnc-RNF121-1:1 No - lnc-RNF121-1:2 No - lnc-RNF121-1:3 No - lnc-RNF121-2:1 No - lnc-LAMTOR1-3:4 No - lnc-LAMTOR1-2:1 No - lnc-NUMA1-3:3 No - lnc-NUMA1-3:2 No - lnc-LAMTOR1-1:1 No - lnc-LRTOMT-2:1 No - lnc-FOLR3-2:1 No - lnc-FOLR3-2:2 No - lnc-FOLR1-1:1 No - lnc-INPPL1-5:1 No - lnc-INPPL1-6:1 No - lnc-PDE2A-6:1 No - lnc-ARAP1-3:1 No - lnc-ARAP1-2:1 No - lnc-PDE2A-2:1 No - lnc-PDE2A-2:2 No - lnc-PDE2A-3:2 Yes chrX:16943290-16956234 lnc-PDE2A-3:1 Yes chrX:16943290-16956234 lnc-PDE2A-4:1 Yes chrX:16943290-16956234 lnc-ATG16L2-10:1 Yes chrX:16943290-16956234 lnc-PDE2A-5:1 Yes chrX:16943290-16956234 lnc-PDE2A-7:1 No - lnc-STARD10-1:4 No - lnc-STARD10-1:3 No - lnc-STARD10-1:5 No - lnc-ATG16L2-9:1 Yes chr3L:9137860-9145693 lnc-FCHSD2-1:4 No - lnc-P2RY2-1:2 No - lnc-P2RY2-4:1 No - lnc-FAM168A-2:2 Yes chr3R:17768272-17794490 lnc-RAB6A-1:1 No - lnc-RELT-4:1 No - lnc-PLEKHB1-3:1 No - lnc-PLEKHB1-2:1 No - lnc-MRPL48-4:4 No - lnc-COA4-4:1 Yes chr2L:12107221-12109116 lnc-COA4-3:1 Yes chr2L:1710462-1711465 lnc-COA4-2:1 Yes chr2L:1710462-1711465 lnc-UCP2-2:2 Yes chr3R:12996876-12997726 lnc-UCP2-2:1 No - lnc-UCP3-4:1 No - lnc-UCP3-2:4 No - lnc-UCP3-2:3 No - lnc-UCP3-2:2 No - lnc-UCP3-2:1 No - lnc-UCP3-1:1 No - lnc-C2CD3-1:1 No - lnc-UCP3-3:1 Yes chr3L:20497323-20514107 lnc-UCP3-5:1 Yes chr3L:20497323-20514107 lnc-UCP3-6:1 Yes chr3L:20497323-20514107 lnc-UCP3-7:1 Yes chr3L:20497323-20514107 lnc-UCP3-8:1 Yes chr3L:20497323-20514107 lnc-P4HA3-3:1 Yes chr3L:20497323-20514107 lnc-P4HA3-2:2 Yes chr3L:20497323-20514107 lnc-PPME1-2:1 Yes chr3L:20497323-20514107 lnc-P4HA3-2:3 Yes chr3L:20497323-20514107 lnc-P4HA3-2:1 No - lnc-DNAJB13-4:1 Yes chr3L:8986710-8989135 lnc-P4HA3-1:1 No - lnc-PGM2L1-1:2 Yes chr3R:30496751-30500326 lnc-PPME1-1:3 No - lnc-PPME1-3:1 Yes chr2R:9107151-9109718 lnc-KCNE3-1:1 Yes chr2R:9107151-9109718 lnc-POLD3-5:1 No - lnc-LIPT2-1:1 No - lnc-CHRDL2-4:1 No - lnc-RNF169-3:1 No - lnc-POLD3-6:1 No - lnc-POLD3-7:1 No - lnc-XRRA1-2:1 Yes chrX:15603283-15633434 lnc-CHRDL2-2:1 No - lnc-CHRDL2-3:1 No - lnc-XRRA1-1:2 No - lnc-XRRA1-1:1 No - lnc-CHRDL2-5:1 No - lnc-RNF169-2:1 No - lnc-RNF169-1:1 No - lnc-CHRDL2-6:1 No - lnc-SPCS2-3:1 No - lnc-SPCS2-3:2 No - lnc-OR2AT4-4:1 No - lnc-SPCS2-3:3 No - lnc-SPCS2-3:4 No - lnc-SPCS2-3:5 No - lnc-SPCS2-3:6 No - lnc-XRRA1-1:3 No - lnc-XRRA1-1:4 No - lnc-XRRA1-1:5 No - lnc-SPCS2-2:1 No - lnc-ARRB1-1:4 Yes chr2L:9521210-9540060 lnc-ARRB1-1:5 No - lnc-ARRB1-1:3 Yes chr3R:11822702-11869460 lnc-ARRB1-2:1 No - lnc-KLHL35-6:1 Yes chr3L:8647261-8648936 lnc-KLHL35-5:1 Yes chr3L:8647261-8648936 lnc-GDPD5-4:1 No - lnc-GDPD5-3:1 No - lnc-KLHL35-2:1 No - lnc-KLHL35-4:2 No - lnc-KLHL35-4:3 No - lnc-KLHL35-4:1 No - lnc-MOGAT2-5:1 No - lnc-GDPD5-5:1 No - lnc-SERPINH1-2:1 No - lnc-MOGAT2-4:1 No - lnc-MAP6-5:1 Yes chr2R:7712578-7714182 lnc-MOGAT2-2:1 Yes chr2R:7709873-7714182 lnc-MAP6-2:5 Yes chr2R:7709873-7714182 lnc-MAP6-2:4 Yes chr2R:7709873-7714182 UVRAG-DT:28 No - UVRAG-DT:17 No - lnc-MAP6-6:1 Yes chr2L:13286777-13289556 lnc-WNT11-5:1 Yes chr2L:13286777-13289556 lnc-THAP12-3:1 No - lnc-GVQW3-4:1 No - lnc-GVQW3-4:2 No - lnc-GVQW3-4:3 No - lnc-GVQW3-4:4 No - lnc-GVQW3-3:1 No - lnc-GVQW3-2:1 No - lnc-WNT11-4:2 No - lnc-WNT11-4:1 No - lnc-EMSY-1:1 No - lnc-THAP12-1:3 No - lnc-THAP12-4:1 No - lnc-ACER3-1:1 No - lnc-TSKU-1:2 No - lnc-LRRC32-7:1 No - lnc-B3GNT6-1:1 No - lnc-PAK1-5:1 No - lnc-GDPD4-3:1 No - lnc-GDPD4-3:3 No - lnc-GDPD4-3:2 No - lnc-MYO7A-2:1 No - lnc-GDPD4-7:1 Yes chr3R:6350896-6361614 lnc-GDPD4-6:1 Yes chr3R:6350896-6361614 lnc-AQP11-4:1 No - lnc-CLNS1A-3:3 Yes chr2R:17590964-17591881 lnc-CLNS1A-3:4 Yes chr2R:17590964-17591881 lnc-CLNS1A-3:2 Yes chr2R:17590964-17591881 lnc-CLNS1A-3:1 Yes chr2R:17590964-17591881 lnc-AQP11-2:2 No - lnc-INTS4-4:2 Yes chr2L:21221312-21232059 lnc-INTS4-4:1 Yes chr2L:21221312-21232059 lnc-THRSP-6:1 No - lnc-INTS4-3:1 No - lnc-RSF1-3:1 No - lnc-RSF1-2:1 No - lnc-RSF1-3:2 Yes chrX:8555239-8558781 lnc-THRSP-1:2 No - lnc-THRSP-4:1 No - lnc-NDUFC2-1:4 Yes chrX:6821016-6822840 lnc-NDUFC2-1:2 Yes chrX:6821016-6822840 lnc-NDUFC2-1:3 Yes chrX:6821016-6822840 lnc-NDUFC2-1:1 Yes chrX:6821016-6822840 KCTD21-AS1:1 No - KCTD21-AS1:13 No - KCTD21-AS1:14 No - KCTD21-AS1:28 No - KCTD21-AS1:29 No - KCTD21-AS1:30 No - lnc-GAB2-2:1 Yes chr2R:17001994-17003599 lnc-TENM4-5:2 Yes chr2R:17001994-17003599 lnc-USP35-15:1 No - lnc-NARS2-1:1 No - lnc-NARS2-1:3 No - lnc-NARS2-1:2 No - lnc-TENM4-3:4 No - lnc-TENM4-3:3 No - lnc-NARS2-2:1 No - lnc-USP35-17:1 No - lnc-USP35-18:1 No - lnc-USP35-9:2 No - lnc-USP35-9:3 No - lnc-TENM4-4:9 No - lnc-DDIAS-9:1 No - lnc-DDIAS-4:2 No - lnc-DDIAS-8:1 No - lnc-FAM181B-8:1 No - lnc-FAM181B-7:1 No - lnc-DDIAS-3:2 No - MIR4300HG:4 No - lnc-FAM181B-6:2 No - MIR4300HG:5 No - lnc-DDIAS-6:3 No - lnc-FAM181B-5:7 Yes chr2L:20461585-20463444 lnc-FAM181B-5:6 Yes chr2L:20461585-20463444 lnc-FAM181B-5:3 Yes chr2L:20461585-20463444 lnc-FAM181B-5:5 Yes chr2L:20461585-20463444 lnc-FAM181B-5:4 Yes chr2L:20461585-20463444 lnc-FAM181B-5:2 Yes chr2L:20461585-20463444 lnc-FAM181B-5:1 Yes chr2L:20461585-20463444 lnc-PRCP-1:1 Yes chr2L:7030493-7032606 lnc-PRCP-2:1 Yes chr2L:7030493-7032606 RAB30-AS1:4 No - RAB30-AS1:10 No - RAB30-AS1:19 No - lnc-RAB30-2:3 No - lnc-RAB30-3:1 No - lnc-RAB30-4:1 No - lnc-PCF11-3:1 No - PCF11-AS1:12 Yes chr2R:14860936-14871071 PCF11-AS1:13 Yes chr2R:14860936-14871071 PCF11-AS1:1 No - PCF11-AS1:10 No - PCF11-AS1:5 No - PCF11-AS1:7 No - lnc-PCF11-2:1 No - lnc-CCDC90B-4:1 No - lnc-CCDC90B-3:1 No - lnc-DLG2-2:1 No - lnc-DLG2-3:1 No - lnc-DLG2-3:2 No - lnc-ANKRD42-5:1 No - lnc-CCDC90B-5:1 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-CCDC90B-6:1 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-CCDC90B-7:1 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-CCDC90B-8:1 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-ANKRD42-6:1 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-CCDC90B-9:1 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-CCDC90B-10:1 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-CREBZF-6:1 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-TMEM126B-5:1 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-CREBZF-5:1 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-TMEM126B-4:1 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-CREBZF-4:1 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-CREBZF-3:1 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-CREBZF-2:1 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-DLG2-1:5 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-DLG2-1:3 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-DLG2-1:4 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-CCDC89-5:6 No - lnc-CCDC89-5:1 No - lnc-CCDC89-5:7 No - lnc-CCDC89-1:1 No - lnc-CCDC89-4:4 Yes chr3R:14804092-14875488 lnc-CCDC89-4:3 Yes chr3R:14804092-14875488 lnc-CCDC89-4:1 Yes chr3R:14804092-14875488 lnc-CCDC89-4:2 Yes chr3R:14804092-14875488 lnc-CCDC89-8:1 Yes chr3R:14804092-14875488 lnc-SYTL2-2:2 Yes chr3R:7186994-7200941 lnc-SYTL2-2:1 Yes chr3R:7186994-7200941 lnc-SYTL2-3:1 Yes chr3R:7186994-7200941 lnc-SYTL2-4:1 Yes chr3R:7186994-7200941 lnc-SYTL2-5:1 Yes chr3R:7186994-7200941 lnc-EED-1:1 No - lnc-HIKESHI-2:1 No - lnc-ME3-3:1 Yes chr3L:1617348-1618158 lnc-CCDC81-1:2 No - lnc-ME3-2:1 No - lnc-FZD4-7:1 Yes chr2R:16414815-16419398 lnc-FZD4-5:1 No - lnc-TMEM135-7:1 No - lnc-FZD4-1:3 No - lnc-PRSS23-1:6 No - lnc-PRSS23-1:8 No - lnc-PRSS23-1:9 No - lnc-FZD4-2:1 No - lnc-FZD4-6:1 Yes chr3R:8523944-8526667 lnc-FZD4-8:1 Yes chr3R:8523944-8526667 lnc-FZD4-9:1 Yes chr3R:8523944-8526667 lnc-FZD4-10:1 No - lnc-TMEM135-5:1 No - lnc-RAB38-4:1 No - lnc-TMEM135-9:1 No - lnc-CTSC-5:1 Yes chr2R:9177864-9186342 lnc-CTSC-1:1 No - lnc-CTSC-2:1 No - lnc-CTSC-3:1 No - lnc-CTSC-4:1 No - lnc-TYR-3:1 No - lnc-TYR-2:1 No - lnc-CTSC-6:1 Yes chr4:936819-949441 lnc-NOX4-2:1 No - lnc-GRM5-1:3 No - lnc-TRIM49-5:1 No - lnc-NOX4-4:2 No - lnc-TRIM77-11:2 No - lnc-TRIM77-10:2 No - lnc-TRIM49-3:1 No - lnc-TRIM77-9:2 No - lnc-TRIM77-8:2 No - lnc-TRIM77-7:2 No - lnc-TRIM49-2:1 No - lnc-TRIM64B-1:1 No - lnc-TRIM64B-2:1 No - lnc-TRIM49D2-5:1 No - lnc-TRIM49D2-3:1 No - lnc-TRIM64-2:2 No - lnc-TRIM64-1:2 No - lnc-TRIM49D1-4:1 No - lnc-TRIM49C-5:2 No - lnc-TRIM49D1-5:1 No - lnc-TRIM49D1-1:1 No - lnc-UBTFL1-4:1 No - lnc-CHORDC1-3:1 No - lnc-CHORDC1-2:1 No - lnc-NAALAD2-2:1 No - lnc-CHORDC1-1:1 No - lnc-TRIM49D1-2:1 Yes chr3R:24186359-24187785 lnc-TRIM49D1-2:2 Yes chr3R:24186359-24187785 lnc-NAALAD2-3:1 Yes chr3R:24186359-24187785 DISC1FP1:6 No - lnc-CHORDC1-6:1 No - lnc-NAALAD2-6:1 No - lnc-FAT3-5:9 No - lnc-FAT3-2:3 No - lnc-FAT3-2:6 No - lnc-FAT3-4:1 No - lnc-SLC36A4-9:1 No - lnc-FAT3-3:1 No - lnc-SLC36A4-8:1 Yes chr3L:20005301-20024607 lnc-SLC36A4-7:1 Yes chr3L:20005301-20024607 lnc-SLC36A4-5:3 No - lnc-SLC36A4-5:2 No - lnc-SLC36A4-5:1 No - lnc-FAT3-1:1 No - lnc-MTNR1B-2:1 No - lnc-SLC36A4-4:1 No - lnc-SMCO4-5:1 Yes chr3L:9494555-9505328 lnc-SMCO4-4:2 Yes chr3L:9494555-9505328 lnc-MTNR1B-3:1 Yes chr3L:9494555-9505328 lnc-SMCO4-4:1 Yes chr3L:9494555-9505328 lnc-SMCO4-3:1 Yes chr3L:9494555-9505328 lnc-SMCO4-1:1 Yes chr3L:22863864-22864496 lnc-CEP295-3:1 No - lnc-SMCO4-2:1 No - lnc-C11orf54-1:2 No - lnc-TAF1D-1:1 No - lnc-VSTM5-1:13 No - lnc-VSTM5-1:8 No - lnc-VSTM5-1:10 No - lnc-VSTM5-1:2 No - lnc-VSTM5-1:1 No - lnc-VSTM5-1:12 No - lnc-VSTM5-1:11 No - lnc-VSTM5-1:14 No - lnc-VSTM5-1:9 No - lnc-VSTM5-1:7 No - lnc-VSTM5-1:5 No - lnc-VSTM5-1:6 No - lnc-VSTM5-1:4 No - lnc-VSTM5-1:3 No - lnc-C11orf54-3:1 No - lnc-VSTM5-2:1 No - lnc-VSTM5-3:1 No - lnc-VSTM5-4:1 No - lnc-HEPHL1-1:1 No - lnc-GPR83-5:1 No - lnc-GPR83-2:2 No - lnc-PANX1-1:1 No - lnc-IZUMO1R-4:1 No - lnc-MRE11-2:1 No - lnc-GPR83-3:1 Yes chr2L:11282090-11284335 lnc-GPR83-4:1 No - lnc-GPR83-4:2 No - lnc-MRE11-3:5 No - lnc-MRE11-3:1 No - lnc-FUT4-1:1 No - lnc-PIWIL4-1:6 No - lnc-PIWIL4-1:20 No - lnc-PIWIL4-1:21 No - lnc-KDM4D-1:1 No - lnc-KDM4F-1:1 No - lnc-ENDOD1-4:1 No - lnc-ENDOD1-3:1 No - lnc-ENDOD1-2:1 No - lnc-ENDOD1-5:1 No - lnc-ENDOD1-6:1 No - lnc-CWC15-1:2 Yes chr2R:23713900-23734846 lnc-CWC15-1:1 Yes chr2R:23713900-23734846 lnc-CWC15-6:1 Yes chr2R:23713900-23734846 lnc-ENDOD1-1:11 Yes chr2R:23713900-23734846 lnc-MTMR2-3:4 Yes chr3L:9367377-9370300 lnc-MTMR2-3:1 Yes chr3L:9367377-9370300 lnc-MTMR2-3:3 Yes chr3L:9367377-9370300 lnc-MTMR2-3:2 Yes chr3L:9367377-9370300 lnc-MTMR2-2:1 No - lnc-MTMR2-4:1 No - lnc-MTMR2-1:7 Yes chr2L:6034731-6037015 lnc-MTMR2-1:5 Yes chr2L:6034731-6037015 lnc-MTMR2-1:6 Yes chr2L:6034731-6037015 lnc-MTMR2-1:10 Yes chr2L:6034731-6037015 lnc-MTMR2-1:9 Yes chr2L:6034731-6037015 lnc-MTMR2-1:8 Yes chr2L:6034731-6037015 lnc-MTMR2-1:4 Yes chr2L:6034731-6037015 lnc-MTMR2-1:3 Yes chr2L:6034731-6037015 lnc-MTMR2-1:2 Yes chr2L:6034731-6037015 lnc-CEP57-3:1 No - lnc-MAML2-6:1 No - lnc-MAML2-6:2 No - lnc-JRKL-3:1 No - JRKL-AS1:5 No - JRKL-AS1:3 No - JRKL-AS1:1 No - lnc-JRKL-4:1 No - lnc-JRKL-5:1 No - lnc-CCDC82-7:1 No - lnc-CCDC82-8:1 No - lnc-JRKL-2:3 No - lnc-CCDC82-9:1 No - lnc-CCDC82-10:1 No - lnc-CCDC82-11:1 No - lnc-CCDC82-3:4 No - lnc-CCDC82-12:1 No - lnc-CCDC82-13:1 No - lnc-ARHGAP42-2:1 Yes chr3R:4381306-4387018 lnc-ARHGAP42-1:1 Yes chr3R:4381306-4387018 lnc-PGR-6:1 No - lnc-CNTN5-2:1 Yes chrX:15751674-15760733 lnc-PGR-3:6 No - lnc-TRPC6-2:1 No - lnc-TRPC6-3:1 No - PGR-AS1:7 No - PGR-AS1:8 No - PGR-AS1:9 No - lnc-ARHGAP42-4:1 No - lnc-PGR-4:1 No - lnc-ARHGAP42-6:1 No - lnc-PGR-5:1 No - lnc-TRPC6-1:1 No - lnc-CEP126-2:1 No - lnc-CEP126-2:2 No - lnc-ANGPTL5-1:1 No - lnc-TMEM123-4:1 No - lnc-TMEM123-3:1 No - lnc-BIRC2-1:3 Yes chr3L:16038410-16051034 lnc-BIRC2-1:4 Yes chr3L:16038410-16051034 lnc-BIRC2-3:1 No - lnc-TMEM123-2:1 No - lnc-MMP7-1:1 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-MMP7-2:1 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-DYNC2H1-3:2 No - lnc-MMP10-1:1 No - lnc-MMP10-2:1 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-MMP10-3:1 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-MMP1-1:1 No - lnc-DYNC2H1-4:5 No - lnc-MMP12-2:1 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-DYNC2H1-5:2 No - lnc-DYNC2H1-1:1 No - lnc-DCUN1D5-1:2 No - lnc-MMP13-1:1 Yes chr3L:20299410-20309511 lnc-DCUN1D5-3:2 Yes chr2L:17962625-17982472 lnc-DCUN1D5-3:1 Yes chr2L:17962625-17982472 lnc-DCUN1D5-4:1 Yes chr2L:17962625-17982472 lnc-DCUN1D5-5:1 Yes chr2L:17962625-17982472 lnc-DCUN1D5-6:1 Yes chr2L:17962625-17982472 lnc-DCUN1D5-7:1 Yes chr2L:17962625-17982472 lnc-DDI1-2:2 No - LINC02552:16 No - LINC02552:29 No - lnc-CASP4-3:3 No - lnc-CASP4-3:5 No - lnc-CASP4-3:1 No - lnc-CASP4-3:2 No - lnc-CASP4-1:1 No - lnc-CASP4-1:3 No - lnc-CASP4-1:2 No - lnc-CASP5-4:1 No - lnc-CASP5-2:1 No - lnc-CARD16-1:1 No - lnc-CASP1-3:1 No - lnc-CARD18-3:1 No - lnc-CARD18-4:1 No - lnc-AASDHPPT-5:1 Yes chr3L:6624032-6635059 lnc-MSANTD4-1:1 No - lnc-MSANTD4-2:3 No - lnc-MSANTD4-2:2 No - lnc-MSANTD4-2:1 No - lnc-AASDHPPT-2:1 No - lnc-AASDHPPT-1:3 No - lnc-AASDHPPT-1:4 No - lnc-AASDHPPT-1:5 No - lnc-AASDHPPT-1:6 No - lnc-AASDHPPT-1:7 No - lnc-AASDHPPT-1:8 No - lnc-KBTBD3-4:1 No - lnc-AASDHPPT-3:1 No - lnc-AASDHPPT-6:1 No - lnc-GUCY1A2-1:2 Yes chr3R:29682503-29685758 lnc-CWF19L2-1:3 No - lnc-ALKBH8-3:1 Yes chrX:15572076-15574535 lnc-ALKBH8-1:1 No - lnc-RAB39A-2:2 Yes chr3R:7126271-7128027 lnc-ALKBH8-2:1 Yes chr3R:7126271-7128027 lnc-SLN-1:1 Yes chr3R:7126271-7128027 lnc-ACAT1-1:1 No - lnc-C11orf65-1:1 No - lnc-KDELC2-2:1 No - lnc-ATM-1:3 No - lnc-EXPH5-2:2 No - lnc-EXPH5-2:1 No - lnc-KDELC2-1:1 No - lnc-EXPH5-3:1 No - lnc-EXPH5-4:1 Yes chrX:17636281-17639003 lnc-EXPH5-5:1 Yes chrX:17636281-17639003 lnc-DDX10-1:1 No - lnc-RDX-10:1 No - lnc-RDX-9:1 No - lnc-RDX-1:3 No - lnc-ARHGAP20-7:2 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-ZC3H12C-3:1 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-ARHGAP20-6:2 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-ARHGAP20-52:1 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-ARHGAP20-5:1 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-ZC3H12C-2:1 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-ARHGAP20-4:1 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-ARHGAP20-3:1 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-FDX1-1:6 No - lnc-FDX1-1:7 No - lnc-RDX-4:1 No - lnc-FDX1-2:1 No - lnc-C11orf53-2:1 No - LINC02550:15 No - LINC02550:13 No - lnc-C11orf53-1:1 No - lnc-POU2AF1-6:1 No - lnc-POU2AF1-5:1 No - lnc-POU2AF1-4:1 No - lnc-POU2AF1-1:4 No - lnc-BTG4-3:11 No - lnc-BTG4-3:7 No - lnc-BTG4-3:10 No - lnc-BTG4-3:8 No - lnc-BTG4-3:9 No - lnc-POU2AF1-3:2 No - lnc-POU2AF1-3:5 No - lnc-POU2AF1-3:3 No - lnc-POU2AF1-3:6 No - lnc-POU2AF1-3:1 No - lnc-C11orf88-2:3 No - lnc-C11orf88-1:2 Yes chrX:16074717-16091495 lnc-LAYN-1:1 Yes chrX:2055310-2061915 lnc-ALG9-2:1 Yes chr2L:8366038-8370090 lnc-SIK2-1:1 Yes chr3R:25221589-25224118 lnc-ALG9-3:3 No - lnc-FDXACB1-3:9 No - lnc-C11orf1-2:1 No - lnc-ALG9-3:1 No - lnc-ALG9-3:2 No - lnc-FDXACB1-2:1 No - lnc-CRYAB-1:1 Yes chrX:11355881-11358724 lnc-PIH1D2-3:1 Yes chr2L:7426866-7430329 lnc-PIH1D2-2:1 Yes chr2L:7426866-7430329 lnc-TIMM8B-1:1 No - lnc-PIH1D2-1:2 No - lnc-TIMM8B-2:3 Yes chr3R:23759483-23760600 lnc-TIMM8B-2:1 Yes chr3R:23759483-23760600 lnc-TIMM8B-2:2 Yes chr3R:23759483-23760600 lnc-PTS-2:4 Yes chr3R:13700565-13703164 lnc-PTS-4:1 Yes chr3R:13700565-13703164 lnc-PLET1-3:1 Yes chr2L:20073719-20075458 lnc-IL18-2:1 Yes chr2L:20073719-20075458 lnc-IL18-2:2 Yes chr2L:20073719-20075458 lnc-PTS-1:6 Yes chr2L:20073719-20075458 lnc-PLET1-2:1 No - lnc-PTS-1:7 No - lnc-PTS-1:9 No - lnc-PTS-1:10 No - lnc-PTS-1:11 No - lnc-PTS-1:12 No - lnc-PTS-1:13 No - lnc-PTS-1:14 No - lnc-PTS-1:15 No - lnc-PTS-1:16 No - lnc-PTS-1:17 No - lnc-PLET1-4:1 No - lnc-PLET1-5:1 No - lnc-TTC12-2:1 Yes chrX:4132887-4206093 NCAM1-AS1:1 Yes chrX:4132887-4206093 NCAM1-AS1:5 Yes chrX:4132887-4206093 NCAM1-AS1:3 Yes chrX:4132887-4206093 lnc-DRD2-1:4 No - lnc-DRD2-4:1 No - lnc-TMPRSS5-2:1 Yes chrX:20004680-20062706 lnc-TMPRSS5-1:1 Yes chrX:20004680-20062706 lnc-ZW10-3:2 Yes chr2R:7540111-7564435 lnc-ZW10-3:1 Yes chr2R:7540111-7564435 lnc-CLDN25-5:1 No - lnc-CLDN25-2:1 Yes chrX:2604197-2606824 lnc-CLDN25-3:1 No - lnc-CLDN25-4:1 No - lnc-ZW10-2:1 No - lnc-HTR3A-1:2 No - lnc-USP28-5:1 No - lnc-NNMT-1:1 No - lnc-ZBTB16-1:1 No - lnc-C11orf71-1:3 No - lnc-RBM7-1:2 No - lnc-C11orf71-1:4 No - lnc-REXO2-1:1 No - lnc-NXPE1-1:1 No - lnc-REXO2-3:1 No - lnc-NXPE2-4:1 No - lnc-CADM1-5:2 No - lnc-CADM1-5:3 No - lnc-CADM1-5:1 No - lnc-NXPE4-2:1 No - lnc-NXPE4-4:1 No - lnc-CADM1-6:1 No - lnc-CADM1-7:1 No - LINC00900:3 No - LINC00900:12 No - lnc-APOC3-6:3 No - lnc-APOC3-6:4 No - lnc-APOC3-6:5 No - lnc-CADM1-10:1 No - lnc-CADM1-11:1 No - lnc-CADM1-12:1 No - lnc-CADM1-4:6 No - lnc-CADM1-4:7 No - lnc-CADM1-4:5 No - lnc-APOC3-8:1 No - lnc-APOC3-8:3 No - lnc-BUD13-3:2 No - lnc-CADM1-4:8 No - lnc-ZPR1-1:2 Yes chrX:9160124-9162090 lnc-APOA5-1:2 Yes chrX:9160124-9162090 lnc-APOA5-1:1 Yes chrX:9160124-9162090 lnc-APOA4-1:2 No - lnc-APOA1-2:1 Yes chr2R:18688132-18705805 lnc-APOA1-3:1 Yes chr2R:18688132-18705805 lnc-PCSK7-3:1 Yes chr2R:18688132-18705805 lnc-PCSK7-6:1 Yes chr2R:18688132-18705805 lnc-PAFAH1B2-1:2 No - lnc-SIK3-1:1 No - lnc-PAFAH1B2-4:1 No - lnc-PAFAH1B2-4:2 No - lnc-SIK3-2:1 No - lnc-SIDT2-2:2 Yes chrX:15784009-15785583 lnc-PCSK7-1:4 No - lnc-PCSK7-1:3 No - lnc-PCSK7-1:2 No - lnc-PCSK7-1:1 No - lnc-TAGLN-1:1 No - lnc-BACE1-2:4 No - lnc-BACE1-2:3 No - lnc-BACE1-2:5 No - lnc-BACE1-2:1 No - lnc-BACE1-2:2 No - lnc-BACE1-4:1 No - lnc-PCSK7-4:1 No - lnc-PCSK7-2:2 No - lnc-RNF214-2:1 No - lnc-BACE1-3:1 Yes chrX:15977967-15982944 lnc-CEP164-3:1 Yes chr3R:17473935-17505667 lnc-DSCAML1-1:5 No - lnc-FXYD6-FXYD2-2:1 No - lnc-FXYD6-FXYD2-2:3 No - lnc-FXYD6-FXYD2-2:2 No - lnc-IL10RA-1:7 No - lnc-FXYD2-1:5 No - lnc-FXYD2-1:6 No - lnc-FXYD2-1:3 No - lnc-FXYD2-1:4 No - lnc-FXYD6-3:1 Yes chr2R:7540111-7564435 lnc-IL10RA-2:1 No - lnc-SCN4B-51:3 No - lnc-SCN4B-51:4 No - lnc-SMIM35-3:2 Yes chr2R:7540111-7564435 lnc-SMIM35-3:1 Yes chr2R:7540111-7564435 lnc-SCN4B-2:2 No - lnc-SCN4B-2:3 No - lnc-SCN4B-2:4 No - lnc-SCN4B-2:1 No - lnc-MPZL3-4:1 No - lnc-JAML-1:1 No - lnc-MPZL3-2:1 No - lnc-MPZL3-3:1 No - lnc-MPZL3-3:2 No - lnc-CD3E-1:1 No - lnc-CD3D-4:1 No - lnc-CD3D-2:2 No - lnc-CD3D-2:1 No - lnc-CD3D-2:3 No - lnc-CD3D-3:1 No - lnc-CD3D-6:1 No - lnc-CD3D-6:2 No - lnc-CD3D-5:2 No - lnc-UBE4A-3:1 Yes chr2L:10975522-10976399 lnc-KMT2A-1:1 Yes chr2L:10975522-10976399 lnc-ATP5MG-1:1 Yes chr2L:10975522-10976399 lnc-ATP5MG-1:2 No - lnc-IFT46-3:1 Yes chr3R:14263358-14286903 lnc-IFT46-1:7 Yes chr3R:14263358-14286903 lnc-IFT46-1:6 Yes chr3R:14263358-14286903 lnc-TTC36-2:1 Yes chr3R:14263358-14286903 lnc-TREH-2:1 Yes chr2L:18614339-18616106 lnc-TREH-2:2 Yes chr2L:18614339-18616106 lnc-TREH-1:1 Yes chr2R:16359730-16363524 lnc-DDX6-1:1 Yes chr2L:10239341-10242172 lnc-DDX6-3:2 Yes chr2L:10239341-10242172 lnc-DDX6-3:3 Yes chr2L:10239341-10242172 lnc-DDX6-3:1 Yes chr2L:10239341-10242172 lnc-CXCR5-1:3 No - lnc-CXCR5-2:1 No - lnc-CCDC84-1:1 No - lnc-RPS25-1:28 No - lnc-RPS25-3:3 No - lnc-RPS25-3:4 No - lnc-RPS25-4:1 No - lnc-RPS25-2:5 No - lnc-RPS25-2:4 No - lnc-RPS25-2:3 No - lnc-RPS25-2:1 No - lnc-RPS25-2:2 No - lnc-SLC37A4-1:40 No - lnc-SLC37A4-1:39 No - lnc-SLC37A4-3:2 Yes chrX:2271008-2275068 lnc-SLC37A4-3:3 Yes chrX:2271008-2275068 lnc-VPS11-3:1 No - lnc-HYOU1-1:4 No - lnc-HYOU1-1:2 Yes chr3L:23147656-23150499 lnc-H2AFX-1:1 Yes chr2L:13179247-13183495 lnc-H2AFX-1:2 Yes chr2L:13179247-13183495 lnc-H2AFX-2:1 Yes chr2L:13179247-13183495 lnc-H2AFX-2:2 Yes chr2L:13179247-13183495 lnc-C2CD2L-1:1 No - lnc-C2CD2L-1:2 No - lnc-C2CD2L-1:3 No - lnc-C2CD2L-1:4 No - lnc-DPAGT1-1:1 No - lnc-C1QTNF5-6:1 No - lnc-C1QTNF5-5:8 No - lnc-C1QTNF5-5:9 No - lnc-C1QTNF5-5:7 No - lnc-C1QTNF5-5:6 No - lnc-C1QTNF5-5:10 No - lnc-C1QTNF5-8:1 No - lnc-C1QTNF5-3:1 No - lnc-C1QTNF5-2:1 No - lnc-C1QTNF5-7:1 Yes chr3L:11801951-11814755 lnc-MFRP-4:1 Yes chrX:22455803-22470146 lnc-RNF26-3:1 Yes chrX:22455803-22470146 USP2-AS1:6 No - lnc-RNF26-4:1 No - lnc-THY1-1:1 No - lnc-USP2-2:3 No - lnc-USP2-2:2 No - lnc-USP2-2:1 No - lnc-THY1-2:1 No - lnc-NECTIN1-2:1 No - lnc-RNF26-5:2 No - lnc-THY1-4:1 No - lnc-RNF26-6:1 No - lnc-RNF26-1:15 No - lnc-OAF-4:7 No - lnc-OAF-4:9 No - lnc-TRIM29-9:8 No - lnc-TRIM29-9:3 No - lnc-TRIM29-9:9 No - lnc-TRIM29-9:4 No - lnc-TRIM29-2:2 No - lnc-OAF-1:4 No - lnc-OAF-1:12 No - lnc-OAF-1:13 No - lnc-NECTIN1-4:4 No - lnc-NECTIN1-4:2 No - lnc-NECTIN1-4:1 No - lnc-NECTIN1-4:3 No - lnc-NECTIN1-5:1 No - lnc-NECTIN1-6:1 No - lnc-OAF-3:1 No - lnc-POU2F3-2:1 Yes chr2L:2492955-2498846 lnc-TRIM29-3:1 Yes chr2L:2492955-2498846 lnc-TRIM29-4:1 No - lnc-TRIM29-5:1 Yes chr3R:20860187-20866231 lnc-TRIM29-6:1 Yes chr3R:20860187-20866231 lnc-TRIM29-8:3 Yes chr3R:20860187-20866231 lnc-BLID-12:1 No - lnc-BLID-11:1 No - lnc-BLID-10:1 No - lnc-SC5D-1:1 No - lnc-BLID-9:1 No - lnc-SORL1-3:1 No - lnc-BLID-8:1 No - lnc-SORL1-1:2 No - MIR100HG:37 No - MIR100HG:26 No - MIR100HG:27 No - MIR100HG:42 No - MIR100HG:41 No - MIR100HG:38 No - MIR100HG:40 No - MIR100HG:19 No - lnc-SORL1-4:1 No - MIR100HG:9 No - MIR100HG:13 No - lnc-BLID-5:1 No - lnc-BLID-4:1 No - lnc-UBASH3B-2:3 No - MIR100HG:11 No - lnc-UBASH3B-2:4 No - lnc-UBASH3B-2:6 No - lnc-UBASH3B-7:1 No - lnc-UBASH3B-6:1 No - lnc-UBASH3B-5:1 No - lnc-UBASH3B-4:1 No - MIR100HG:65 No - lnc-UBASH3B-2:7 No - lnc-UBASH3B-1:2 No - lnc-UBASH3B-3:1 No - lnc-HSPA8-3:1 Yes chr2L:19765776-19769067 lnc-JHY-2:1 No - lnc-JHY-3:1 No - lnc-HSPA8-1:1 No - lnc-JHY-4:1 No - lnc-CLMP-3:2 Yes chr3L:13974061-13977761 lnc-CLMP-3:1 Yes chr3L:13974061-13977761 lnc-JHY-5:1 Yes chr3L:13974061-13977761 lnc-HSPA8-2:1 No - lnc-GRAMD1B-5:2 No - lnc-CLMP-4:1 No - lnc-JHY-7:1 Yes chr2L:3358640-3373372 lnc-CLMP-5:1 Yes chr2L:3358640-3373372 lnc-CLMP-8:1 Yes chr2L:3358640-3373372 lnc-CLMP-6:1 Yes chr2L:3358640-3373372 lnc-CLMP-7:1 Yes chr2L:3358640-3373372 lnc-OR8D4-4:1 Yes chr2L:3358640-3373372 lnc-GRAMD1B-3:1 No - lnc-ZNF202-1:1 No - lnc-ZNF202-1:3 No - lnc-ZNF202-1:2 No - lnc-TMEM225-1:1 No - lnc-VWA5A-2:1 No - lnc-OR10D3-1:1 No - lnc-OR8D1-1:1 No - lnc-OR8G5-6:1 No - lnc-OR8G5-5:1 No - lnc-OR8D2-1:1 No - lnc-OR8B3-1:1 No - lnc-OR8B12-1:1 No - lnc-OR8A1-1:2 No - lnc-SIAE-1:1 No - lnc-ESAM-1:1 No - lnc-ESAM-2:1 No - lnc-NRGN-3:1 No - lnc-ROBO3-2:3 No - lnc-ROBO3-2:4 No - lnc-ROBO3-2:5 No - lnc-ROBO3-2:6 No - lnc-MSANTD2-1:1 No - lnc-HEPACAM-1:1 Yes chr2L:1380086-1420453 lnc-SLC37A2-2:1 Yes chr2R:21282298-21285679 lnc-TMEM218-1:7 No - lnc-TMEM218-1:2 No - lnc-TMEM218-1:6 No - lnc-TMEM218-1:1 No - lnc-TMEM218-1:5 No - lnc-TMEM218-1:9 No - lnc-TMEM218-1:8 No - lnc-SLC37A2-4:3 No - lnc-EI24-1:1 No - lnc-ACRV1-1:5 Yes chrX:2080610-2093948 lnc-ACRV1-1:3 Yes chrX:2080610-2093948 lnc-ACRV1-1:2 Yes chrX:2080610-2093948 lnc-ACRV1-1:4 Yes chrX:2080610-2093948 lnc-PATE3-2:1 No - lnc-PATE4-3:1 No - lnc-PUS3-1:3 No - lnc-PUS3-4:1 No - lnc-FAM118B-4:1 No - lnc-FAM118B-2:1 No - lnc-FAM118B-1:11 No - lnc-RPUSD4-2:1 No - lnc-SRPRA-6:2 No - lnc-SRPRA-6:1 No - lnc-RPUSD4-1:1 No - lnc-FOXRED1-2:1 No - lnc-SRPRA-2:1 No - lnc-SRPRA-3:2 No - lnc-SRPRA-4:1 No - lnc-ST3GAL4-2:1 Yes chr3R:5753318-5754774 GSEC:9 Yes chr3R:5753318-5754774 lnc-DCPS-1:1 No - lnc-SRPRA-7:1 No - lnc-KIRREL3-1:1 Yes chrX:2740384-3134532 lnc-KIRREL3-1:2 Yes chrX:2740384-3134532 lnc-KIRREL3-1:3 Yes chrX:2740384-3134532 lnc-ST3GAL4-4:2 Yes chrX:2740384-3134532 lnc-SRPRA-9:1 Yes chrX:2740384-3134532 lnc-SRPRA-9:2 Yes chrX:2740384-3134532 lnc-SRPRA-8:1 Yes chrX:2740384-3134532 KIRREL3-AS2:2 Yes chrX:2740384-3134532 KIRREL3-AS2:4 Yes chrX:2740384-3134532 KIRREL3-AS3:2 Yes chrX:2740384-3134532 lnc-ST3GAL4-55:1 No - lnc-ST3GAL4-55:2 No - lnc-ST3GAL4-55:15 No - lnc-KIRREL3-2:1 No - lnc-ST3GAL4-11:1 No - lnc-FLI1-7:1 No - lnc-FLI1-5:1 No - lnc-FLI1-5:2 No - lnc-KCNJ1-3:1 Yes chr3R:23290231-23346167 lnc-FLI1-4:1 Yes chr3R:23290231-23346167 lnc-KCNJ1-3:2 Yes chr3R:23290231-23346167 lnc-ETS1-1:8 No - lnc-ETS1-1:7 No - SENCR:2 Yes chr3L:6097617-6123913 lnc-KCNJ5-2:1 Yes chr3L:6097617-6123913 lnc-FLI1-1:1 No - lnc-C11orf45-3:2 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-C11orf45-3:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-KCNJ1-1:1 No - lnc-C11orf45-2:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-C11orf45-1:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-C11orf45-1:2 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-KCNJ5-1:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-ARHGAP32-3:1 No - lnc-ARHGAP32-1:1 No - lnc-ARHGAP32-2:2 No - lnc-ARHGAP32-2:3 No - lnc-ARHGAP32-2:1 No - lnc-ARHGAP32-4:2 No - lnc-ARHGAP32-4:1 No - lnc-BARX2-2:1 No - lnc-TMEM45B-2:1 No - lnc-APLP2-5:1 No - lnc-PRDM10-1:1 Yes chr3R:8984718-8990649 LINC00167:1 No - lnc-APLP2-4:1 No - lnc-APLP2-3:1 No - lnc-ST14-1:1 Yes chrX:530501-579044 lnc-PRDM10-2:1 Yes chrX:530501-579044 lnc-ADAMTS8-3:1 No - lnc-ADAMTS15-1:2 No - lnc-ADAMTS15-1:8 No - lnc-ADAMTS15-1:9 No - lnc-ADAMTS15-1:11 No - lnc-ADAMTS15-1:13 No - lnc-ADAMTS15-1:22 No - lnc-ADAMTS15-1:23 No - lnc-ADAMTS15-1:25 No - lnc-ADAMTS8-2:1 No - lnc-ADAMTS15-3:1 No - lnc-ADAMTS15-4:1 No - lnc-ADAMTS15-5:8 No - lnc-ADAMTS15-5:10 No - lnc-ADAMTS15-5:11 No - lnc-ADAMTS15-5:12 No - lnc-ADAMTS15-8:1 No - lnc-SNX19-6:1 No - LINC02551:13 No - LINC02551:15 No - LINC02551:9 No - LINC02551:10 No - lnc-ADAMTS8-5:2 No - lnc-SNX19-2:1 No - lnc-NTM-6:2 No - lnc-NTM-6:3 No - lnc-NTM-6:4 No - lnc-SNX19-9:2 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-SNX19-9:7 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-SNX19-9:3 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-SNX19-9:6 Yes chr3L:5424109-5442399 NTM-AS1:3 Yes chr3L:5424109-5442399 NTM-AS1:4 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-ADAMTS15-12:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-OPCML-4:2 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-OPCML-6:4 Yes chr3L:5424109-5442399 NTM-IT:2 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-SPATA19-8:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-SPATA19-7:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-SPATA19-6:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-NTM-7:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-SPATA19-5:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-SPATA19-9:6 No - lnc-IGSF9B-13:2 No - lnc-SPATA19-1:9 Yes chr2L:4283148-4323781 lnc-JAM3-3:10 No - lnc-JAM3-3:11 No - lnc-JAM3-3:12 No - lnc-NCAPD3-2:1 No - lnc-NCAPD3-1:1 No - lnc-THYN1-4:1 No - lnc-JAM3-5:1 No - lnc-THYN1-3:1 No - lnc-THYN1-2:1 No - lnc-NCAPD3-3:2 No - lnc-NCAPD3-3:1 No - lnc-THYN1-1:1 No - lnc-THYN1-1:3 No - lnc-THYN1-1:2 Yes chr2L:6003574-6006827 lnc-B3GAT1-4:1 Yes chr2L:6003574-6006827 lnc-THYN1-5:2 Yes chrX:4131211-4132833 lnc-THYN1-5:1 Yes chrX:4131211-4132833 lnc-GLB1L2-1:12 No - lnc-GLB1L2-1:13 No - lnc-GLB1L2-1:14 No - lnc-GLB1L2-1:15 No - lnc-GLB1L2-1:16 No - lnc-GLB1L2-1:17 No - lnc-GLB1L2-1:18 No - lnc-GLB1L2-1:19 No - lnc-GLB1L2-1:20 No - lnc-GLB1L2-1:21 No - lnc-GLB1L2-6:1 No - lnc-GLB1L2-3:4 No - lnc-GLB1L2-3:5 No - lnc-SLC6A12-12:1 No - lnc-IQSEC3-9:1 No - lnc-SLC6A12-3:6 Yes chr3L:21034535-21075444 lnc-SLC6A12-2:2 Yes chr3L:21034535-21075444 lnc-CCDC77-4:1 Yes chr3L:21034535-21075444 lnc-SLC6A12-1:6 No - lnc-SLC6A12-1:7 No - lnc-SLC6A12-1:5 No - lnc-SLC6A12-1:3 No - lnc-SLC6A12-1:4 No - lnc-SLC6A12-7:5 No - lnc-SLC6A12-7:2 No - lnc-SLC6A12-7:4 No - lnc-SLC6A12-7:3 No - lnc-SLC6A12-7:1 No - lnc-KDM5A-2:2 No - lnc-SLC6A13-2:1 Yes chr2L:5989400-5999501 lnc-SLC6A13-3:1 Yes chr2L:5989400-5999501 lnc-SLC6A13-4:1 Yes chr2L:5989400-5999501 lnc-CCDC77-1:1 No - lnc-KDM5A-4:1 No - lnc-KDM5A-5:1 Yes chr3R:12695129-12697379 lnc-B4GALNT3-2:4 Yes chr3R:12695129-12697379 lnc-B4GALNT3-2:5 Yes chr3R:12695129-12697379 lnc-NINJ2-4:2 No - lnc-NINJ2-4:3 No - lnc-NINJ2-4:4 No - lnc-NINJ2-4:1 No - lnc-RAD52-2:2 No - lnc-RAD52-2:1 No - lnc-RAD52-2:4 No - lnc-RAD52-2:3 Yes chr2R:9503765-9541565 lnc-WNK1-3:4 Yes chr2R:9503765-9541565 lnc-WNK1-2:1 Yes chr2R:9503765-9541565 lnc-WNT5B-6:1 Yes chr2R:9503765-9541565 lnc-WNT5B-4:1 Yes chr2R:9503765-9541565 lnc-WNT5B-7:1 Yes chr2R:9503765-9541565 lnc-WNT5B-3:3 Yes chr2R:9503765-9541565 lnc-ERC1-1:4 No - lnc-ERC1-1:5 No - lnc-ERC1-2:1 No - lnc-CACNA2D4-3:1 No - lnc-ADIPOR2-3:1 No - lnc-WNT5B-1:1 Yes chr3R:22543693-22547846 lnc-CACNA2D4-2:1 Yes chr3R:22543693-22547846 lnc-CACNA2D4-1:1 Yes chr3R:22543693-22547846 lnc-DCP1B-5:1 Yes chr2R:13805794-13819571 lnc-DCP1B-4:2 Yes chr2R:13805794-13819571 lnc-DCP1B-4:3 Yes chr2R:13805794-13819571 lnc-DCP1B-4:1 Yes chr2R:13805794-13819571 lnc-LRTM2-5:1 Yes chr2R:13805794-13819571 lnc-LRTM2-5:2 Yes chr2R:13805794-13819571 lnc-LRTM2-5:3 Yes chr2R:13805794-13819571 lnc-LRTM2-5:4 Yes chr2R:13805794-13819571 lnc-ADIPOR2-2:1 Yes chr2R:13805794-13819571 lnc-ADIPOR2-2:2 Yes chr2R:13805794-13819571 lnc-ADIPOR2-2:5 Yes chr2R:13805794-13819571 lnc-DCP1B-3:1 Yes chr2R:13805794-13819571 LINC00940:1 No - LINC00940:3 No - CACNA1C-AS4:3 Yes chr2L:16165831-16190540 CACNA1C-AS4:1 Yes chr2L:16165831-16190540 lnc-DCP1B-6:2 Yes chr2L:16165831-16190540 lnc-DCP1B-6:1 Yes chr2L:16165831-16190540 lnc-DCP1B-7:2 Yes chr2L:16165831-16190540 lnc-DCP1B-7:1 Yes chr2L:16165831-16190540 lnc-FKBP4-5:1 Yes chr2L:16165831-16190540 CACNA1C-AS1:3 Yes chr2L:16165831-16190540 LINC02371:5 No - lnc-NRIP2-3:2 No - ITFG2-AS1:38 No - ITFG2-AS1:37 No - lnc-NRIP2-8:1 No - ITFG2-AS1:36 No - lnc-RHNO1-2:1 No - lnc-RHNO1-1:1 No - lnc-TEX52-1:1 Yes chr3R:14056945-14087978 lnc-FOXM1-1:1 Yes chr2R:21101928-21123704 lnc-FOXM1-2:1 Yes chrX:15804370-15827682 lnc-FOXM1-2:2 No - lnc-TEAD4-1:2 No - lnc-TEAD4-3:1 No - lnc-TEAD4-4:1 No - lnc-FOXM1-4:1 No - lnc-CRACR2A-3:6 No - lnc-CRACR2A-9:1 No - LINC02417:6 No - lnc-TSPAN9-2:1 Yes chr3R:10786481-10788226 lnc-CRACR2A-1:3 Yes chr3R:10786481-10788226 lnc-PARP11-4:1 No - lnc-CRACR2A-5:1 No - lnc-CRACR2A-5:2 No - lnc-PRMT8-5:1 No - lnc-PRMT8-6:1 No - lnc-PRMT8-6:2 No - lnc-CRACR2A-6:1 No - lnc-CRACR2A-7:1 No - lnc-PRMT8-2:4 No - lnc-PRMT8-2:5 No - lnc-PARP11-2:2 No - lnc-CCND2-4:1 No - lnc-CCND2-4:2 No - lnc-CCND2-2:3 No - lnc-PARP11-5:1 No - lnc-PARP11-6:1 No - lnc-CCND2-1:2 No - lnc-CCND2-3:1 No - lnc-FGF6-1:1 No - lnc-FGF6-2:1 Yes chr3R:28606079-28608372 lnc-FGF6-3:1 Yes chr3R:28606079-28608372 lnc-C12orf4-1:1 Yes chr3R:28606079-28608372 lnc-C12orf4-2:1 Yes chr2L:14184478-14234126 lnc-AKAP3-3:1 Yes chr2L:14184478-14234126 lnc-AKAP3-3:2 Yes chr2L:14184478-14234126 lnc-AKAP3-3:3 Yes chr2L:14184478-14234126 lnc-KCNA6-1:1 Yes chr3R:28748384-28751661 lnc-KCNA1-97:4 Yes chrX:17924307-18063247 lnc-KCNA1-97:5 Yes chrX:17924307-18063247 lnc-KCNA1-97:6 Yes chrX:17924307-18063247 lnc-KCNA1-97:24 No - lnc-KCNA5-4:1 No - LINC02443:15 No - LINC02443:11 No - LINC02443:16 No - LINC02443:12 No - lnc-NTF3-5:2 No - lnc-ANO2-5:1 No - lnc-KCNA5-5:1 No - lnc-ANO2-9:1 No - lnc-NTF3-3:9 No - lnc-NTF3-3:10 No - lnc-ANO2-3:2 Yes chrX:11877737-11887162 lnc-ANO2-3:4 Yes chrX:11877737-11887162 lnc-VWF-5:2 Yes chrX:11877737-11887162 lnc-VWF-5:1 Yes chrX:11877737-11887162 lnc-VWF-4:2 Yes chrX:11877737-11887162 lnc-VWF-4:1 Yes chrX:11877737-11887162 lnc-ANO2-4:1 Yes chr3L:13846054-13860001 lnc-ANO2-6:1 Yes chr3L:13846054-13860001 lnc-ANO2-7:1 Yes chr3L:13846054-13860001 lnc-CD9-6:1 No - lnc-VWF-2:4 No - lnc-CD9-5:1 No - lnc-CD9-3:2 No - lnc-CD9-2:2 No - lnc-TNFRSF1A-5:1 No - lnc-SCNN1A-2:1 No - lnc-SCNN1A-1:1 No - lnc-SCNN1A-1:2 No - lnc-PLEKHG6-4:1 No - lnc-TNFRSF1A-1:2 No - lnc-TNFRSF1A-1:1 No - lnc-TNFRSF1A-2:1 No - lnc-TNFRSF1A-4:3 No - lnc-TNFRSF1A-4:1 No - lnc-TNFRSF1A-4:2 No - lnc-LTBR-1:2 No - lnc-LTBR-1:3 No - lnc-LTBR-1:4 No - lnc-SCNN1A-3:1 No - CD27-AS1:8 No - CD27-AS1:6 No - CD27-AS1:9 No - CD27-AS1:10 No - CD27-AS1:17 No - CD27-AS1:18 No - CD27-AS1:23 No - CD27-AS1:22 No - CD27-AS1:15 No - CD27-AS1:19 No - CD27-AS1:11 No - CD27-AS1:2 No - CD27-AS1:1 No - lnc-MRPL51-1:1 No - lnc-TAPBPL-1:1 No - lnc-VAMP1-2:1 No - lnc-VAMP1-2:2 Yes chr2L:8516753-8517380 lnc-TAPBPL-2:2 No - lnc-GAPDH-2:2 Yes chr3R:29675651-29680257 lnc-IFFO1-3:1 Yes chr2R:16958943-16960195 lnc-IFFO1-4:1 No - lnc-CHD4-2:1 No - lnc-CHD4-1:1 No - lnc-CHD4-1:2 No - lnc-NOP2-1:1 No - lnc-NOP2-2:1 No - lnc-LPAR5-2:1 Yes chr3L:19882051-19910215 lnc-LPAR5-1:1 Yes chr3L:19882051-19910215 lnc-GAPDH-4:2 No - lnc-ACRBP-1:1 No - lnc-ING4-1:1 No - lnc-ACRBP-2:2 Yes chr2L:13385848-13387312 lnc-ACRBP-2:1 Yes chr2L:13385848-13387312 lnc-ING4-2:1 Yes chr3R:7272617-7309629 lnc-ZNF384-1:1 Yes chr3R:7272617-7309629 lnc-COPS7A-1:1 No - lnc-COPS7A-3:1 No - lnc-PIANP-3:1 Yes chr2R:15935893-15940073 lnc-PIANP-3:3 Yes chr2R:15935893-15940073 lnc-PIANP-3:2 Yes chr2R:15935893-15940073 lnc-MLF2-1:1 No - lnc-CDCA3-2:1 No - lnc-SPSB2-2:3 No - lnc-SPSB2-2:4 No - lnc-SPSB2-2:2 No - lnc-SPSB2-2:1 No - lnc-LRRC23-1:1 No - lnc-LRRC23-1:2 No - lnc-LRRC23-1:3 No - lnc-LRRC23-1:5 No - lnc-SPSB2-1:1 No - lnc-TPI1-1:1 No - lnc-PHB2-2:1 No - MIR200CHG:9 Yes chr2R:18819467-18822250 lnc-PHB2-1:6 Yes chr2R:18819467-18822250 lnc-PHB2-1:1 Yes chr2R:18819467-18822250 lnc-PHB2-1:4 Yes chr2R:18819467-18822250 lnc-PHB2-1:5 Yes chr2R:18819467-18822250 lnc-PHB2-1:3 Yes chr2R:18819467-18822250 lnc-PHB2-1:2 Yes chr2R:18819467-18822250 lnc-PHB2-3:3 No - lnc-PHB2-3:2 No - lnc-PHB2-3:1 No - lnc-PHB2-5:1 No - lnc-EMG1-2:1 No - lnc-C1RL-1:1 No - lnc-RBP5-5:1 No - lnc-RBP5-4:1 No - lnc-C1R-1:1 No - lnc-C1R-2:2 No - lnc-C1R-2:1 No - C1RL-AS1:5 No - lnc-RBP5-3:1 Yes chr3R:11559896-11567054 lnc-PEX5-2:1 No - lnc-ACSM4-1:2 No - lnc-CD163-3:1 No - lnc-CD163-3:2 No - lnc-CD163-2:1 No - lnc-CD163-1:1 No - lnc-APOBEC1-2:1 No - lnc-APOBEC1-2:2 No - lnc-ACSM4-4:1 No - lnc-ACSM4-5:1 No - lnc-DPPA3-3:1 No - lnc-DPPA3-2:1 No - lnc-APOBEC1-1:1 No - lnc-DPPA3-1:1 No - lnc-CLEC4C-1:1 No - lnc-CLEC4C-2:1 Yes chr3L:914074-993788 lnc-NANOG-2:1 Yes chr3L:914074-993788 lnc-SLC2A3-2:1 Yes chr3L:914074-993788 lnc-SLC2A14-1:1 No - lnc-NANOG-3:1 No - lnc-SLC2A14-2:1 Yes chr3L:914074-993788 lnc-SLC2A14-3:1 Yes chr3L:914074-993788 lnc-SLC2A14-4:1 Yes chr3L:914074-993788 lnc-SLC2A14-4:2 Yes chr3L:914074-993788 lnc-C3AR1-1:1 No - lnc-SLC2A3-3:1 No - lnc-C3AR1-3:1 No - FAM66C:13 No - lnc-FAM90A1-2:1 No - lnc-FAM90A1-2:2 No - lnc-ZNF705A-4:1 No - lnc-FAM90A1-1:2 No - lnc-FAM90A1-1:9 No - lnc-FAM90A1-1:10 No - lnc-FAM90A1-1:7 No - lnc-FAM90A1-1:1 No - lnc-FAM90A1-1:5 No - lnc-FAM90A1-1:8 No - LINC02449:9 No - lnc-FAM90A1-1:3 No - lnc-FAM90A1-1:6 No - lnc-FAM90A1-1:4 No - LINC02449:15 No - LINC00937:5 No - lnc-CLEC6A-2:2 No - LINC00937:3 No - lnc-CLEC4E-4:1 No - lnc-CLEC4E-3:1 No - lnc-CLEC4D-2:1 No - lnc-AICDA-1:1 No - lnc-CLEC4D-1:3 No - lnc-CLEC4D-1:4 No - lnc-MFAP5-4:1 No - lnc-MFAP5-3:2 No - lnc-MFAP5-3:1 No - lnc-RIMKLB-4:1 No - lnc-RIMKLB-1:10 No - lnc-RIMKLB-1:12 No - lnc-RIMKLB-6:1 No - lnc-M6PR-5:1 No - lnc-KLRG1-9:5 No - lnc-PZP-8:2 Yes chr2L:8074117-8082982 lnc-PZP-8:1 Yes chr2L:8074117-8082982 lnc-PZP-6:1 Yes chr2L:8074117-8082982 lnc-PZP-6:2 Yes chr2L:8074117-8082982 lnc-KLRG1-4:1 No - lnc-KLRG1-5:1 No - lnc-A2M-2:1 Yes chr2L:8074117-8082982 LINC00987:3 No - lnc-KLRG1-6:2 No - lnc-KLRG1-6:3 No - lnc-KLRG1-7:1 No - lnc-KLRG1-8:1 No - lnc-PZP-3:2 No - lnc-PZP-10:1 No - lnc-CLEC2D-6:2 No - lnc-CLEC2D-5:2 No - LINC02367:7 No - lnc-PZP-11:1 No - LINC02367:8 No - LINC02367:9 No - lnc-KLRB1-12:7 No - lnc-KLRB1-12:1 No - lnc-KLRB1-12:2 No - lnc-KLRB1-12:3 No - lnc-CLEC2D-10:1 No - lnc-KLRB1-3:1 No - lnc-CLEC2D-9:1 No - lnc-CLEC2D-8:1 No - lnc-CLEC2D-8:2 No - lnc-CLEC2D-8:3 No - lnc-CLEC2D-8:4 No - lnc-CLEC2D-8:6 No - lnc-CLEC2D-8:7 No - lnc-CLEC2D-8:8 No - lnc-CLEC2D-8:9 No - lnc-CLEC2D-8:10 No - lnc-CLEC2D-8:11 No - lnc-CLEC2D-8:12 No - lnc-CLEC2D-8:13 No - lnc-CD69-1:2 No - lnc-CD69-1:1 No - lnc-CLEC2B-1:1 No - lnc-CLEC2A-3:1 No - lnc-CLEC2A-3:2 No - lnc-CLEC1B-1:2 No - lnc-CLEC9A-1:1 No - lnc-CLEC7A-1:1 No - lnc-CLEC7A-1:2 No - lnc-CLEC7A-2:1 No - lnc-GABARAPL1-2:1 No - lnc-GABARAPL1-2:2 No - lnc-OLR1-5:1 No - lnc-OLR1-5:2 No - lnc-KLRC4-1:1 No - lnc-EIF2S3B-4:1 No - lnc-MAGOHB-2:1 No - LINC02446:6 No - lnc-EIF2S3B-2:1 No - lnc-MAGOHB-1:4 No - lnc-STYK1-1:3 Yes chr3L:12121274-12125150 lnc-STYK1-1:1 Yes chr3L:12121274-12125150 lnc-STYK1-1:2 Yes chr3L:12121274-12125150 lnc-STYK1-2:1 Yes chr3L:12121274-12125150 lnc-STYK1-2:2 Yes chr3L:12121274-12125150 lnc-PRH2-3:1 No - lnc-TAS2R10-1:1 No - lnc-PRR4-1:14 No - lnc-PRR4-1:15 No - lnc-PRR4-1:13 No - lnc-PRR4-1:12 No - lnc-PRR4-1:4 No - lnc-PRR4-1:8 No - lnc-PRR4-1:11 No - lnc-PRR4-1:9 No - lnc-PRR4-1:3 No - lnc-TAS2R50-1:1 No - lnc-PRR4-1:7 No - lnc-PRR4-1:6 No - lnc-PRR4-1:2 No - lnc-TAS2R46-1:1 No - lnc-TAS2R43-1:1 No - lnc-PRR4-1:5 No - lnc-TAS2R30-1:2 No - lnc-TAS2R30-1:1 No - lnc-PRB4-1:1 No - lnc-PRB2-2:1 No - lnc-ETV6-4:1 No - lnc-PRB1-1:8 No - lnc-ETV6-3:1 No - lnc-ETV6-1:5 No - lnc-ETV6-6:1 No - lnc-MANSC1-4:1 No - lnc-BORCS5-6:1 No - lnc-BCL2L14-2:1 Yes chr2R:13453640-13483229 lnc-BORCS5-5:1 No - lnc-DUSP16-3:1 Yes chrX:11871299-11872779 lnc-BORCS5-1:1 No - lnc-MANSC1-3:1 No - lnc-MANSC1-2:2 No - lnc-BORCS5-4:1 No - lnc-GPR19-3:1 No - lnc-DUSP16-2:1 No - lnc-GPR19-2:1 Yes chr2L:10264125-10265229 lnc-DUSP16-4:2 No - lnc-DUSP16-4:1 No - lnc-GPRC5D-3:1 No - lnc-GPRC5D-2:1 No - lnc-GPRC5A-5:1 No - lnc-DDX47-3:1 No - GPRC5D-AS1:33 No - lnc-GPRC5D-1:1 No - GPRC5D-AS1:37 No - lnc-FAM234B-2:1 No - lnc-FAM234B-2:2 No - lnc-HEBP1-2:1 No - lnc-FAM234B-3:1 No - LINC01559:1 No - lnc-EMP1-5:1 Yes chrX:1483625-1507809 lnc-ATF7IP-9:1 No - lnc-ATF7IP-8:1 No - lnc-ATF7IP-7:1 No - lnc-ATF7IP-6:1 No - lnc-ATF7IP-5:1 No - lnc-PLBD1-1:3 No - lnc-PLBD1-1:2 No - lnc-PLBD1-1:1 No - lnc-H2AFJ-4:2 Yes chr2R:10800420-10808938 lnc-ATF7IP-1:2 Yes chr3L:5343619-5355923 lnc-GUCY2C-1:1 Yes chr3L:5343619-5355923 lnc-HIST4H4-5:5 No - lnc-HIST4H4-4:1 No - lnc-HIST4H4-1:3 No - lnc-HIST4H4-1:2 No - lnc-HIST4H4-5:4 No - lnc-HIST4H4-5:3 No - lnc-HIST4H4-5:2 No - lnc-HIST4H4-5:1 No - lnc-SMCO3-1:1 Yes chrX:2711756-2713960 lnc-SMCO3-1:2 Yes chrX:2711756-2713960 lnc-C12orf60-2:1 No - lnc-C12orf60-2:2 No - lnc-SMCO3-2:1 No - lnc-SMCO3-2:2 No - lnc-SMCO3-3:1 No - lnc-ERP27-1:2 No - lnc-ERP27-1:1 No - lnc-ARHGDIB-2:1 No - lnc-ARHGDIB-3:2 No - lnc-ARHGDIB-3:1 No - lnc-ARHGDIB-4:1 No - lnc-ARHGDIB-5:1 No - lnc-RERG-1:1 No - lnc-STRAP-5:1 No - lnc-RERG-2:1 Yes chr3R:17008269-17012533 lnc-DERA-4:2 Yes chrX:15082827-15084017 lnc-DERA-1:4 Yes chrX:15082827-15084017 lnc-DERA-5:1 Yes chrX:15082827-15084017 lnc-DERA-7:1 Yes chrX:15082827-15084017 lnc-LMO3-1:5 No - lnc-LMO3-1:4 No - lnc-LMO3-1:7 No - lnc-LMO3-1:1 No - lnc-LMO3-1:2 No - lnc-LMO3-1:8 No - lnc-LMO3-1:6 No - lnc-LMO3-1:9 No - lnc-MGST1-4:1 No - lnc-MGST1-1:2 No - lnc-MGST1-3:2 No - lnc-MGST1-7:1 No - lnc-MGST1-9:1 No - lnc-RERGL-4:1 No - lnc-RERGL-3:1 Yes chr3L:11774650-11790013 lnc-CAPZA3-5:1 Yes chr3L:11774650-11790013 lnc-CAPZA3-4:1 Yes chr3L:11774650-11790013 lnc-PIK3C2G-2:1 No - lnc-PIK3C2G-3:1 No - lnc-RERGL-5:5 No - lnc-RERGL-6:1 No - lnc-RERGL-6:2 No - lnc-RERGL-6:3 No - lnc-CAPZA3-2:2 No - lnc-CAPZA3-3:2 No - lnc-PLCZ1-2:1 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-PLCZ1-3:1 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-AEBP2-6:1 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-PLEKHA5-5:1 Yes chr2R:6502006-6621792 lnc-PLCZ1-4:1 Yes chr2R:6502006-6621792 lnc-PLEKHA5-6:1 Yes chr2R:6502006-6621792 lnc-PLEKHA5-3:3 Yes chr2R:6502006-6621792 lnc-PLCZ1-1:2 No - LINC02398:21 No - LINC02398:23 No - LINC02398:25 No - lnc-SLCO1C1-2:1 No - lnc-SLCO1C1-1:1 Yes chr2L:9521210-9540060 lnc-SLCO1C1-1:3 Yes chr2L:9521210-9540060 lnc-SLCO1A2-5:1 Yes chr2L:9521210-9540060 lnc-SLCO1A2-1:4 Yes chr2L:9521210-9540060 lnc-SLCO1A2-1:3 Yes chr2L:9521210-9540060 lnc-SLCO1A2-1:2 Yes chr2L:9521210-9540060 lnc-KCNJ8-2:2 Yes chr3L:6259105-6262694 lnc-KCNJ8-2:1 Yes chr3L:6259105-6262694 lnc-CMAS-3:1 No - lnc-CMAS-2:1 No - lnc-ST8SIA1-2:2 No - lnc-ST8SIA1-2:1 No - lnc-ABCC9-1:1 No - lnc-ABCC9-2:1 No - lnc-C2CD5-4:1 No - lnc-ST8SIA1-3:1 No - lnc-ST8SIA1-3:2 No - lnc-ST8SIA1-4:1 Yes chr3R:24349182-24356241 lnc-ST8SIA1-5:2 Yes chr3R:24349182-24356241 lnc-ST8SIA1-5:1 Yes chr3R:24349182-24356241 lnc-ST8SIA1-6:1 Yes chr3R:24349182-24356241 lnc-ST8SIA1-6:2 Yes chr3R:24349182-24356241 lnc-ST8SIA1-8:1 Yes chr3R:24349182-24356241 lnc-ETNK1-9:1 No - lnc-ETNK1-7:1 No - lnc-C2CD5-3:1 Yes chrX:16278328-16285618 lnc-CMAS-6:1 Yes chrX:16278328-16285618 lnc-ETNK1-8:1 No - lnc-ETNK1-3:6 No - lnc-ETNK1-3:7 No - lnc-ETNK1-3:8 No - lnc-SOX5-1:2 No - lnc-SOX5-5:34 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:37 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:35 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:36 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:33 Yes chr4:800436-834393 SOX5-AS1:8 Yes chr4:800436-834393 SOX5-AS1:12 Yes chr4:800436-834393 SOX5-AS1:13 Yes chr4:800436-834393 lnc-LRMP-10:1 Yes chr4:800436-834393 lnc-LRMP-9:1 No - lnc-LRMP-8:1 No - lnc-LRMP-7:1 No - lnc-SOX5-3:1 Yes chrX:13396899-13401224 lnc-CASC1-5:1 Yes chrX:13396899-13401224 lnc-CASC1-4:1 Yes chrX:13396899-13401224 lnc-BCAT1-3:1 No - lnc-BCAT1-4:4 No - lnc-CASC1-2:1 No - lnc-KRAS-2:3 No - lnc-KRAS-2:1 No - lnc-KRAS-2:2 No - lnc-LRMP-6:1 Yes chr2L:16887109-16887966 lnc-LMNTD1-1:8 No - lnc-KRAS-3:1 No - lnc-KRAS-1:3 No - lnc-LMNTD1-5:1 No - RASSF8-AS1:9 No - RASSF8-AS1:20 No - RASSF8-AS1:15 No - RASSF8-AS1:13 No - RASSF8-AS1:21 No - RASSF8-AS1:19 No - RASSF8-AS1:11 No - RASSF8-AS1:12 No - RASSF8-AS1:10 No - lnc-SSPN-6:1 Yes chr3R:25661795-25665640 lnc-SSPN-6:4 Yes chr3R:25661795-25665640 lnc-ITPR2-4:1 No - lnc-RASSF8-1:2 No - lnc-SSPN-3:4 No - lnc-SSPN-4:1 No - lnc-BHLHE41-4:1 No - lnc-INTS13-4:1 No - lnc-FGFR1OP2-5:1 No - lnc-FGFR1OP2-4:1 No - lnc-TM7SF3-2:1 Yes chr3R:16264271-16266891 lnc-TM7SF3-1:1 Yes chr3R:16264271-16266891 lnc-INTS13-1:1 No - lnc-INTS13-2:1 No - lnc-MED21-1:1 Yes chr3L:25114924-25115946 lnc-MED21-1:2 Yes chr3L:25114924-25115946 lnc-C12orf71-3:1 No - lnc-MED21-5:1 No - lnc-MED21-5:2 No - lnc-C12orf71-1:3 No - lnc-C12orf71-4:1 No - ARNTL2-AS1:1 No - lnc-SMCO2-3:1 No - lnc-SMCO2-2:1 No - lnc-SMCO2-1:1 No - lnc-PPFIBP1-1:1 No - lnc-SMCO2-4:1 Yes chr3L:13513254-13516276 lnc-MANSC4-4:2 Yes chr3L:13513254-13516276 lnc-MANSC4-6:1 Yes chr3L:13513254-13516276 lnc-REP15-1:1 No - lnc-MANSC4-1:2 No - lnc-MANSC4-2:2 No - lnc-MANSC4-5:1 No - lnc-KLHL42-2:1 No - lnc-PTHLH-2:1 No - lnc-MANSC4-8:1 No - lnc-KLHL42-3:1 No - lnc-KLHL42-4:1 No - lnc-PTHLH-1:2 No - lnc-KLHL42-5:1 No - lnc-ERGIC2-12:6 No - lnc-CCDC91-3:1 Yes chrX:2201820-2203866 lnc-CCDC91-3:2 Yes chrX:2201820-2203866 lnc-ERGIC2-2:3 Yes chrX:2201820-2203866 lnc-OVCH1-1:1 Yes chrX:527941-530291 OVCH1-AS1:6 Yes chr2R:21798017-21799195 lnc-FAR2-3:1 No - lnc-OVCH1-2:1 No - lnc-OVCH1-3:1 No - lnc-TSPAN11-11:1 No - lnc-IPO8-2:1 No - lnc-CAPRIN2-4:1 Yes chr3L:8116179-8121579 LINC00941:3 No - LINC00941:4 No - LINC00941:7 No - lnc-TSPAN11-6:1 No - lnc-CAPRIN2-2:15 No - lnc-SINHCAF-8:1 No - lnc-SINHCAF-7:1 No - lnc-DDX11-3:1 No - lnc-DENND5B-3:1 Yes chrX:4921678-4938105 lnc-DDX11-2:1 Yes chrX:4921678-4938105 lnc-SINHCAF-3:1 Yes chr3L:1537137-1544823 lnc-SINHCAF-3:2 Yes chr3L:1537137-1544823 lnc-SINHCAF-5:1 Yes chr3L:1537137-1544823 lnc-ETFBKMT-2:1 Yes chr3L:1537137-1544823 lnc-ETFBKMT-1:1 Yes chr3L:1537137-1544823 lnc-AMN1-3:1 Yes chr3L:1537137-1544823 lnc-DENND5B-2:1 No - lnc-ETFBKMT-7:1 No - lnc-ETFBKMT-6:1 No - lnc-ETFBKMT-4:1 No - lnc-ETFBKMT-3:1 No - DENND5B-AS1:6 No - lnc-AMN1-1:2 No - lnc-AMN1-1:5 No - lnc-AMN1-1:4 No - lnc-AMN1-1:3 No - lnc-ETFBKMT-8:4 No - lnc-AMN1-2:1 No - lnc-KIAA1551-12:2 No - LINC02422:23 No - lnc-H3F3C-5:1 No - lnc-KIAA1551-11:2 No - lnc-KIAA1551-10:2 No - lnc-KIAA1551-9:2 No - lnc-KIAA1551-8:2 No - LINC02422:22 No - lnc-H3F3C-7:1 No - lnc-KIAA1551-5:2 No - lnc-KIAA1551-2:2 No - LINC02422:21 No - lnc-BICD1-6:1 No - lnc-KIAA1551-4:2 No - lnc-KIAA1551-6:2 No - lnc-KIAA1551-7:2 No - lnc-BICD1-2:1 No - lnc-H3F3C-8:1 No - lnc-H3F3C-9:1 Yes chr2L:17459605-17473215 lnc-BICD1-1:1 Yes chr2L:17459605-17473215 lnc-DNM1L-3:1 No - lnc-YARS2-1:1 Yes chr2L:2581281-2585430 lnc-YARS2-2:1 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-DNM1L-5:1 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-YARS2-3:1 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-SYT10-1:2 No - lnc-PKP2-2:1 No - lnc-ALG10-6:1 No - lnc-ALG10-3:1 No - lnc-SYT10-4:1 No - lnc-SYT10-3:3 No - lnc-ALG10-5:1 No - lnc-ALG10-7:1 No - lnc-SYT10-5:1 No - lnc-CPNE8-10:1 No - lnc-CPNE8-9:1 No - lnc-ALG10B-10:1 No - lnc-ALG10B-10:2 No - lnc-CPNE8-8:1 No - lnc-ALG10B-6:1 No - lnc-CPNE8-7:1 No - lnc-ALG10B-5:1 No - lnc-ALG10B-4:1 No - lnc-CPNE8-6:1 No - lnc-ALG10B-3:1 No - lnc-ALG10B-3:2 No - lnc-ALG10B-7:1 No - lnc-KIF21A-2:1 No - lnc-KIF21A-1:1 No - CPNE8-AS1:4 No - lnc-CPNE8-3:1 No - lnc-CPNE8-4:1 No - lnc-C12orf40-5:1 No - lnc-C12orf40-4:1 No - lnc-ABCD2-7:1 Yes chr2L:10414017-10418991 lnc-C12orf40-3:2 Yes chr2L:10414017-10418991 lnc-C12orf40-3:3 Yes chr2L:10414017-10418991 lnc-ABCD2-6:1 Yes chr2L:10414017-10418991 lnc-ABCD2-5:1 Yes chr2L:10414017-10418991 lnc-ABCD2-2:1 No - lnc-C12orf40-1:1 Yes chr4:184076-193829 lnc-ABCD2-4:1 No - lnc-ABCD2-8:1 No - LINC02471:7 No - lnc-MUC19-2:1 Yes chr3R:20635480-20644279 lnc-SLC2A13-3:5 No - lnc-MUC19-1:1 No - lnc-MUC19-1:2 No - lnc-MUC19-1:3 No - lnc-MUC19-1:4 No - lnc-MUC19-1:5 No - lnc-MUC19-3:1 Yes chr3R:4381306-4387018 lnc-MUC19-5:1 Yes chr3R:4381306-4387018 lnc-GXYLT1-7:1 No - lnc-GXYLT1-6:1 No - LINC02400:14 No - LINC02400:18 No - lnc-PPHLN1-5:1 No - lnc-GXYLT1-3:1 No - lnc-GXYLT1-4:5 Yes chr2R:22670587-22673212 lnc-GXYLT1-4:3 Yes chr2R:22670587-22673212 lnc-GXYLT1-4:4 Yes chr2R:22670587-22673212 lnc-GXYLT1-4:2 Yes chr2R:22670587-22673212 lnc-PDZRN4-2:1 No - lnc-PDZRN4-3:1 No - lnc-YAF2-1:1 No - lnc-YAF2-1:2 No - lnc-PRICKLE1-2:1 No - lnc-ZCRB1-2:1 Yes chr2R:7086316-7127868 lnc-ZCRB1-1:2 Yes chr2R:7086316-7127868 lnc-PRICKLE1-3:1 No - lnc-PRICKLE1-4:1 No - lnc-PRICKLE1-5:1 No - lnc-ADAMTS20-4:1 No - lnc-ADAMTS20-2:1 No - lnc-ADAMTS20-3:1 No - lnc-IRAK4-2:2 Yes chr3L:8510003-8513007 lnc-IRAK4-2:3 Yes chr3L:8510003-8513007 lnc-PUS7L-2:3 Yes chr3R:14122654-14124474 lnc-PUS7L-2:4 Yes chr3R:14122654-14124474 lnc-TWF1-1:1 No - lnc-NELL2-2:1 No - lnc-DBX2-5:1 No - lnc-DBX2-3:1 No - lnc-DBX2-4:2 Yes chr3L:11984906-11990505 lnc-DBX2-4:1 Yes chr3L:11984906-11990505 lnc-ANO6-3:1 No - lnc-ANO6-2:1 No - lnc-ARID2-6:1 No - LINC00938:2 No - LINC00938:5 No - lnc-ANO6-5:1 Yes chr2R:6636512-6642358 lnc-SCAF11-5:1 Yes chr2R:6636512-6642358 lnc-SCAF11-4:1 Yes chr2R:6636512-6642358 lnc-SCAF11-2:1 Yes chr3R:5579301-5588380 lnc-SLC38A1-10:1 Yes chr3R:5579301-5588380 lnc-SLC38A1-9:1 Yes chr3R:5579301-5588380 lnc-SLC38A1-9:2 Yes chr3R:5579301-5588380 lnc-SLC38A1-8:1 Yes chr3R:5579301-5588380 lnc-SLC38A1-7:1 Yes chr3R:5579301-5588380 lnc-SCAF11-3:1 No - lnc-SLC38A2-5:1 No - lnc-SLC38A2-2:1 No - lnc-ARID2-8:1 No - lnc-SLC38A1-1:1 No - lnc-ARID2-8:2 No - lnc-ARID2-8:3 No - lnc-ARID2-10:1 No - lnc-ARID2-11:1 No - lnc-SLC38A1-4:2 No - lnc-SLC38A1-4:1 No - lnc-SLC38A1-5:1 No - lnc-SLC38A1-6:1 No - lnc-SLC38A2-1:7 No - lnc-PCED1B-5:2 No - lnc-PCED1B-5:9 No - lnc-PCED1B-5:10 No - lnc-PCED1B-5:15 No - lnc-PCED1B-5:16 No - lnc-ARID2-12:1 No - lnc-SLC38A2-1:8 No - lnc-PCED1B-5:32 No - lnc-SLC38A4-3:1 No - lnc-SLC38A4-2:1 No - lnc-PCED1B-11:2 No - lnc-SLC38A4-1:1 No - lnc-PCED1B-2:5 No - lnc-AMIGO2-3:1 No - PCED1B-AS1:13 No - PCED1B-AS1:3 No - lnc-PCED1B-6:2 No - lnc-PCED1B-7:3 No - lnc-AMIGO2-2:2 No - lnc-AMIGO2-5:1 No - LINC02156:10 No - lnc-PCED1B-9:2 No - lnc-PCED1B-10:2 No - lnc-SLC48A1-7:1 No - lnc-SLC48A1-4:1 No - lnc-ENDOU-6:1 Yes chr2R:24159384-24161503 lnc-ENDOU-3:1 Yes chr2R:24159384-24161503 lnc-ENDOU-2:1 Yes chr2R:24159384-24161503 lnc-ENDOU-1:1 No - lnc-ENDOU-4:2 Yes chr2R:6759715-6798941 lnc-ENDOU-4:1 Yes chr2R:6759715-6798941 lnc-ENDOU-5:1 Yes chr2R:6759715-6798941 lnc-HDAC7-1:1 No - lnc-TMEM106C-7:1 No - lnc-TMEM106C-6:1 No - lnc-RAPGEF3-1:1 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-RAPGEF3-2:2 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-RAPGEF3-2:1 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-HDAC7-2:1 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-TMEM106C-3:1 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-VDR-1:1 No - lnc-VDR-3:1 No - lnc-SENP1-2:2 No - lnc-SENP1-2:4 No - lnc-SENP1-2:1 No - lnc-SENP1-2:3 No - lnc-COL2A1-3:1 Yes chr2L:7529-9484 lnc-ASB8-1:6 Yes chr2L:7529-9484 lnc-ASB8-1:5 Yes chr2L:7529-9484 lnc-ASB8-1:2 No - lnc-ASB8-1:1 No - lnc-OR10AD1-2:1 No - lnc-CCDC184-2:1 No - lnc-H1FNT-1:2 No - lnc-H1FNT-1:3 No - lnc-ZNF641-2:1 No - lnc-ZNF641-3:1 No - lnc-ZNF641-4:1 No - lnc-ANP32D-1:3 No - lnc-ANP32D-2:2 No - lnc-CCNT1-3:2 Yes chr3R:29854695-29857491 lnc-CCNT1-3:1 Yes chr3R:29854695-29857491 lnc-CCNT1-2:1 Yes chr3R:29854695-29857491 lnc-KANSL2-1:2 Yes chr3L:17551004-17557788 lnc-KANSL2-2:1 Yes chr3L:17551004-17557788 lnc-CCNT1-4:1 Yes chr3L:16491838-16543370 lnc-DDX23-3:2 Yes chr3L:16491838-16543370 lnc-DDX23-3:1 Yes chr3L:16491838-16543370 lnc-DDX23-2:1 Yes chr3L:16491838-16543370 lnc-CACNB3-1:4 No - lnc-ADCY6-1:3 No - lnc-TEX49-4:1 No - lnc-RND1-2:1 Yes chr2L:18606832-18609550 lnc-DDX23-1:6 Yes chr2L:18606832-18609550 lnc-DDX23-1:3 Yes chr2L:18606832-18609550 lnc-DDX23-1:5 Yes chr2L:18606832-18609550 lnc-DDX23-1:4 Yes chr2L:18606832-18609550 lnc-DDX23-1:2 Yes chr2L:18606832-18609550 lnc-DDX23-4:1 Yes chr3R:9497101-9502581 lnc-FKBP11-2:2 Yes chr3L:22868380-22872231 lnc-FKBP11-2:1 Yes chr3L:22868380-22872231 lnc-FKBP11-1:1 Yes chr3L:22868380-22872231 lnc-FKBP11-1:4 Yes chr3L:22868380-22872231 lnc-FKBP11-1:3 Yes chr3L:22868380-22872231 lnc-FKBP11-1:2 Yes chr3L:22868380-22872231 lnc-WNT10B-1:2 No - lnc-WNT10B-1:3 No - lnc-WNT10B-1:4 No - lnc-WNT10B-1:1 No - lnc-KMT2D-1:1 Yes chr3R:21140739-21214269 lnc-PRKAG1-1:1 Yes chrX:1881313-1889950 lnc-PRKAG1-2:1 Yes chrX:1881313-1889950 lnc-RHEBL1-1:1 Yes chrX:1881313-1889950 lnc-WNT1-3:2 No - lnc-LMBR1L-1:1 Yes chr3R:23128169-23141906 lnc-DHH-1:1 Yes chr3R:24805445-24814012 lnc-DHH-3:2 Yes chr3R:24805445-24814012 lnc-DHH-2:1 Yes chr3R:24805445-24814012 lnc-DHH-3:1 Yes chr3R:24805445-24814012 lnc-DHH-3:3 Yes chr3R:24805445-24814012 lnc-LMBR1L-2:1 Yes chr3R:9731221-9733250 lnc-PRPH-3:3 No - lnc-PRPH-2:1 Yes chr3R:9731221-9733250 lnc-C1QL4-4:2 Yes chr3R:9731221-9733250 lnc-C1QL4-1:4 No - lnc-C1QL4-1:3 No - lnc-C1QL4-5:1 No - lnc-PRPH-1:1 No - lnc-SPATS2-1:3 Yes chrX:16938244-16940873 lnc-C1QL4-6:1 No - lnc-KCNH3-2:1 No - lnc-FAM186B-3:4 No - lnc-FAM186B-3:3 Yes chr3L:4040529-4042597 lnc-FAM186B-3:1 Yes chr3L:4040529-4042597 lnc-FAM186B-3:2 Yes chr3L:4040529-4042597 lnc-PRPF40B-1:3 No - lnc-KCNH3-4:1 No - lnc-FAM186B-4:1 No - lnc-PRPF40B-2:1 No - lnc-BCDIN3D-1:1 No - lnc-BCDIN3D-1:2 No - lnc-NCKAP5L-1:1 No - LINC02396:14 No - LINC02395:17 No - LINC02395:19 No - lnc-RACGAP1-3:1 No - lnc-GPD1-1:1 Yes chrX:13157445-13159508 lnc-COX14-2:1 No - lnc-COX14-2:3 No - lnc-LIMA1-3:3 Yes chrX:6257668-6267228 lnc-LIMA1-3:2 Yes chrX:6257668-6267228 lnc-LIMA1-3:1 Yes chrX:6257668-6267228 lnc-LIMA1-1:10 Yes chrX:6257668-6267228 lnc-LIMA1-1:9 Yes chrX:6257668-6267228 lnc-LIMA1-1:8 Yes chrX:6257668-6267228 lnc-CERS5-3:1 No - lnc-CERS5-4:1 No - lnc-CERS5-2:2 No - lnc-CERS5-5:1 No - lnc-LARP4-6:1 No - lnc-LARP4-5:1 No - lnc-LARP4-4:1 No - lnc-LARP4-3:1 No - lnc-LARP4-2:1 No - lnc-SLC11A2-4:1 No - lnc-SLC11A2-3:1 No - lnc-SLC11A2-2:1 No - lnc-CSRNP2-3:1 Yes chr3R:21051383-21060800 lnc-CSRNP2-2:3 Yes chr3R:21051383-21060800 lnc-CSRNP2-2:2 Yes chr3R:21051383-21060800 lnc-CSRNP2-2:1 Yes chr3R:21051383-21060800 lnc-CSRNP2-1:9 No - lnc-CSRNP2-1:7 No - lnc-CSRNP2-1:8 No - lnc-LETMD1-1:1 Yes chr2R:10124293-10137472 lnc-TFCP2-2:4 Yes chr2R:8327490-8396280 lnc-TFCP2-4:1 Yes chr2R:8327490-8396280 lnc-TFCP2-4:2 Yes chr2R:8327490-8396280 lnc-DAZAP2-3:1 Yes chr2R:8327490-8396280 lnc-SMAGP-1:1 Yes chr2R:12593604-12612068 lnc-CELA1-1:2 Yes chr2R:12593604-12612068 lnc-CELA1-1:1 Yes chr2R:12593604-12612068 lnc-CELA1-2:15 No - lnc-CELA1-2:13 No - lnc-CELA1-2:18 No - lnc-CELA1-2:14 No - lnc-CELA1-2:17 No - lnc-CELA1-2:16 No - lnc-GALNT6-1:1 Yes chr2L:7223328-7249343 lnc-GALNT6-3:1 Yes chr2L:7223328-7249343 lnc-KRT80-14:1 No - lnc-KRT80-13:1 No - lnc-KRT80-5:2 No - lnc-ANKRD33-2:13 No - lnc-ANKRD33-2:18 No - lnc-ANKRD33-2:19 No - lnc-ACVRL1-1:3 Yes chr2R:7806484-7810067 lnc-ACVRL1-1:4 Yes chr2R:7806484-7810067 lnc-FIGNL2-10:2 Yes chr2R:8952339-8962796 lnc-FIGNL2-9:2 Yes chr3L:6076722-6082491 lnc-ATG101-1:1 Yes chrX:18791668-18793517 lnc-ATG101-1:2 Yes chrX:18791668-18793517 lnc-ATG101-3:1 No - lnc-ATG101-4:2 No - lnc-KRT80-2:8 No - lnc-ATG101-4:3 No - lnc-KRT80-1:5 No - lnc-KRT80-1:4 No - LINC00592:5 No - LINC00592:7 No - LINC00592:9 No - LINC00592:10 No - lnc-KRT7-2:1 No - lnc-KRT6A-1:1 No - lnc-KRT71-2:1 No - lnc-KRT71-1:1 No - lnc-KRT2-1:1 No - lnc-KRT77-1:1 No - lnc-KRT76-1:1 No - lnc-KRT79-1:1 No - lnc-KRT18-3:1 No - lnc-KRT79-2:1 No - lnc-KRT18-2:1 No - lnc-KRT8-1:4 No - lnc-KRT8-1:3 No - lnc-KRT8-1:2 No - lnc-KRT8-1:1 No - lnc-SPRYD3-1:14 No - lnc-SPRYD3-1:13 No - lnc-SPRYD3-1:12 No - lnc-SPRYD3-1:11 No - lnc-SPRYD3-1:9 Yes chr3R:9528238-9533011 lnc-SPRYD3-1:10 Yes chr3R:9528238-9533011 lnc-SOAT2-1:1 No - lnc-ITGB7-6:1 Yes chr2L:13821248-13823979 lnc-ITGB7-6:2 Yes chr2L:13821248-13823979 lnc-ITGB7-4:1 Yes chr2L:13821248-13823979 lnc-MFSD5-3:1 No - lnc-CSAD-1:3 No - lnc-CSAD-1:4 No - lnc-CSAD-1:2 No - lnc-ITGB7-2:1 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-ITGB7-3:1 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-ITGB7-5:1 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-ITGB7-5:5 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-ITGB7-5:3 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-ITGB7-5:4 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-ITGB7-5:6 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-ITGB7-5:2 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-SP7-2:3 Yes chr2L:10172702-10174090 lnc-SP7-2:2 Yes chr2L:10172702-10174090 lnc-SP7-2:1 Yes chr2L:10172702-10174090 lnc-SP7-1:1 Yes chr2L:10172702-10174090 lnc-SP7-1:2 Yes chr2L:10172702-10174090 lnc-SP7-3:1 No - lnc-NPFF-4:3 No - lnc-NPFF-4:1 Yes chr3L:19624406-19635783 lnc-NPFF-4:2 Yes chr3L:19624406-19635783 lnc-MAP3K12-3:1 Yes chr2L:13382652-13385671 lnc-NPFF-1:5 No - lnc-NPFF-2:1 No - lnc-NPFF-3:1 No - lnc-ATP5MC2-1:1 No - lnc-TARBP2-4:1 Yes chr3R:31216145-31219630 lnc-ATF7-1:1 Yes chr3R:31216145-31219630 lnc-CALCOCO1-3:1 Yes chr3R:31216145-31219630 lnc-TARBP2-5:1 Yes chr3R:31216145-31219630 lnc-ATP5MC2-2:1 No - lnc-HOXC13-2:4 No - CISTR:5 No - lnc-HOXC13-5:1 No - lnc-HOXC13-4:1 No - lnc-HOXC13-3:1 No - HOTAIR:2 Yes chr3R:16927212-16972236 HOTAIR:7 No - HOTAIR:5 No - HOTAIR:11 No - HOTAIR:6 No - HOXC-AS2:3 No - HOXC-AS2:2 No - lnc-SMUG1-9:1 No - lnc-SMUG1-9:2 No - lnc-SMUG1-9:3 No - lnc-HOXC4-1:2 No - FAM242C:11 Yes chr3R:17150587-17151630 lnc-HOXC4-4:6 Yes chr3R:17150587-17151630 lnc-CBX5-3:2 Yes chr3R:17150587-17151630 lnc-CBX5-3:1 Yes chr3R:17150587-17151630 lnc-CBX5-2:3 Yes chr3R:17150587-17151630 lnc-CBX5-2:2 Yes chr3R:17150587-17151630 lnc-HNRNPA1-6:1 No - lnc-NFE2-1:1 Yes chr2L:8209626-8211122 lnc-COPZ1-3:1 Yes chr3R:26872129-26875742 lnc-COPZ1-3:2 Yes chr3R:26872129-26875742 lnc-HNRNPA1-5:1 Yes chr3L:16671664-16673555 lnc-ZNF385A-1:1 No - lnc-ZNF385A-2:1 Yes chrX:16752189-16783434 lnc-ZNF385A-3:2 Yes chrX:16752189-16783434 lnc-ZNF385A-3:1 Yes chrX:16752189-16783434 lnc-ZNF385A-4:1 Yes chrX:16752189-16783434 lnc-ITGA5-1:1 No - lnc-GTSF1-2:3 No - lnc-GTSF1-2:1 No - lnc-GTSF1-2:2 No - lnc-PPP1R1A-1:2 No - lnc-PPP1R1A-1:3 No - lnc-PPP1R1A-1:4 No - lnc-DCD-1:1 No - lnc-TESPA1-3:3 Yes chr3R:8278052-8279274 lnc-TESPA1-3:4 Yes chr3R:8278052-8279274 lnc-OR6C1-1:1 No - lnc-OR6C1-1:2 No - lnc-OR6C1-1:3 No - lnc-OR6C65-2:1 No - lnc-OR6C65-1:1 No - lnc-OR6C70-3:1 No - lnc-CD63-6:1 Yes chrX:13214409-13258490 lnc-CD63-5:1 Yes chrX:13214409-13258490 lnc-CD63-4:1 Yes chrX:13214409-13258490 lnc-CD63-3:1 Yes chrX:13214409-13258490 lnc-RDH5-2:7 No - lnc-ITGA7-2:3 Yes chr2L:21344607-21358271 lnc-ITGA7-2:2 Yes chr2L:21344607-21358271 lnc-ITGA7-2:1 Yes chr2L:21344607-21358271 lnc-ITGA7-2:4 Yes chr2L:21344607-21358271 lnc-GDF11-1:8 Yes chr2L:21344607-21358271 lnc-CD63-2:1 No - lnc-GDF11-1:1 No - lnc-CD63-1:2 No - lnc-ORMDL2-1:1 No - lnc-ORMDL2-1:2 No - lnc-ORMDL2-1:3 No - lnc-ORMDL2-1:4 No - lnc-ORMDL2-1:5 Yes chr3R:4437387-4441328 lnc-ORMDL2-1:6 No - lnc-ORMDL2-1:7 No - lnc-ORMDL2-1:8 Yes chr3R:4437387-4441328 lnc-ORMDL2-1:9 No - lnc-ORMDL2-1:10 No - lnc-ORMDL2-1:11 No - lnc-ORMDL2-1:12 Yes chr3R:4437387-4441328 lnc-ORMDL2-1:16 No - lnc-ORMDL2-1:17 No - lnc-ORMDL2-1:18 No - lnc-ORMDL2-1:19 No - lnc-ORMDL2-1:20 No - lnc-ORMDL2-1:21 No - lnc-ORMDL2-1:22 No - lnc-ORMDL2-1:23 No - lnc-ORMDL2-1:24 No - lnc-MMP19-2:1 No - lnc-DGKA-2:1 No - lnc-DGKA-1:1 No - lnc-PYM1-3:1 No - lnc-PYM1-2:1 No - lnc-PYM1-4:1 No - lnc-PYM1-4:3 No - lnc-PYM1-4:2 No - lnc-PYM1-4:4 No - lnc-RAB5B-2:1 Yes chrX:18846389-18848566 lnc-SMARCC2-7:1 No - lnc-RPL41-1:1 No - lnc-SMARCC2-9:2 Yes chr3R:27657078-27660177 lnc-RNF41-2:1 Yes chr3R:15968134-15972913 lnc-NABP2-3:1 No - lnc-NABP2-1:1 Yes chr3L:8525244-8534503 lnc-CS-2:1 No - lnc-ANKRD52-3:2 Yes chrX:6350629-6361323 lnc-ANKRD52-3:1 Yes chrX:6350629-6361323 lnc-CNPY2-4:1 No - lnc-CNPY2-4:2 No - lnc-CNPY2-4:6 No - lnc-CNPY2-4:3 No - lnc-CNPY2-4:4 No - lnc-CNPY2-4:5 No - lnc-IL23A-6:1 Yes chr2R:10050862-10052167 lnc-IL23A-2:8 Yes chr2R:10050862-10052167 lnc-PAN2-1:1 No - lnc-PAN2-1:3 No - lnc-PAN2-1:2 No - lnc-CNPY2-1:2 Yes chr2R:8928169-8933103 lnc-CNPY2-1:1 Yes chr2R:8928169-8933103 lnc-CNPY2-2:1 Yes chr2R:8928169-8933103 lnc-CNPY2-3:2 Yes chr2R:8928169-8933103 lnc-CNPY2-3:1 Yes chr2R:8928169-8933103 lnc-COQ10A-3:1 No - lnc-APOF-1:2 Yes chr3R:20535323-20552311 lnc-APOF-1:3 Yes chr3R:20535323-20552311 lnc-APOF-1:1 Yes chr3R:20535323-20552311 lnc-IL23A-4:1 No - lnc-MIP-3:1 Yes chr3R:13088651-13163876 lnc-MIP-1:1 No - lnc-MIP-2:1 No - lnc-SPRYD4-1:1 Yes chr3L:5155821-5277944 lnc-ATP5F1B-4:1 No - lnc-ATP5F1B-4:2 No - lnc-ATP5F1B-3:1 No - lnc-BAZ2A-1:3 No - lnc-BAZ2A-1:2 No - lnc-BAZ2A-2:1 Yes chr4:1031484-1034917 lnc-ATP5F1B-5:1 Yes chrX:3482965-3484555 lnc-ATP5F1B-2:1 Yes chrX:3482965-3484555 lnc-NACA-2:1 Yes chrX:3482965-3484555 lnc-PRIM1-1:6 Yes chr2R:12759693-12760999 lnc-PRIM1-1:1 Yes chr2R:12759693-12760999 lnc-PRIM1-1:2 Yes chr2R:12759693-12760999 lnc-PRIM1-1:3 Yes chr2R:12759693-12760999 lnc-PRIM1-1:5 Yes chr2R:12759693-12760999 lnc-NACA-1:1 Yes chr3L:8340314-8344404 lnc-RBMS2-2:1 No - lnc-HSD17B6-1:1 No - lnc-HSD17B6-1:2 No - lnc-SDR9C7-1:1 No - lnc-ZBTB39-2:1 No - lnc-ZBTB39-2:2 No - lnc-ZBTB39-1:2 No - lnc-TAC3-1:1 Yes chr3R:24154826-24161498 lnc-MYO1A-1:1 Yes chr3R:24154826-24161498 lnc-LRP1-1:1 No - lnc-NEMP1-1:1 Yes chr3R:20535323-20552311 lnc-NEMP1-2:1 Yes chr3R:20535323-20552311 lnc-NDUFA4L2-1:4 No - lnc-NDUFA4L2-1:1 No - lnc-NDUFA4L2-1:5 Yes chr3L:23339326-23345936 lnc-NDUFA4L2-1:3 Yes chr3L:23339326-23345936 lnc-NDUFA4L2-1:2 Yes chr3L:23339326-23345936 lnc-R3HDM2-1:6 No - lnc-R3HDM2-1:4 No - lnc-R3HDM2-1:3 No - lnc-R3HDM2-1:2 No - lnc-ARHGAP9-2:1 Yes chr3L:3818679-3842326 lnc-ARHGAP9-1:1 Yes chr3L:3818679-3842326 lnc-MBD6-1:1 Yes chr2R:18846858-18850599 lnc-MBD6-2:4 No - lnc-DDIT3-1:2 Yes chr2R:8891832-8893339 lnc-DDIT3-1:1 Yes chr2R:8891832-8893339 lnc-DDIT3-2:1 Yes chr2R:8891832-8893339 lnc-DDIT3-2:2 Yes chr2R:8891832-8893339 lnc-PIP4K2C-1:1 Yes chr2R:16266960-16271971 lnc-B4GALNT1-1:3 No - lnc-B4GALNT1-1:2 No - lnc-DCTN2-1:1 No - lnc-DCTN2-2:1 No - lnc-DCTN2-2:2 No - lnc-AGAP2-1:3 Yes chr2L:13835564-13898712 lnc-AGAP2-1:2 Yes chr2L:13835564-13898712 lnc-AGAP2-3:2 No - lnc-AGAP2-3:1 No - lnc-CYP27B1-1:4 No - lnc-CYP27B1-1:2 No - lnc-CYP27B1-1:3 No - lnc-AVIL-1:1 No - lnc-CTDSP2-5:1 No - lnc-EEF1AKMT3-2:1 No - lnc-TSFM-2:1 Yes chr2L:17486806-17497208 lnc-AVIL-2:1 Yes chr3L:15992669-16004736 lnc-TSFM-1:2 Yes chr3L:15992669-16004736 lnc-CTDSP2-2:10 No - lnc-CTDSP2-2:11 No - lnc-CTDSP2-2:12 No - lnc-ATP23-5:1 No - lnc-CTDSP2-6:1 No - lnc-CTDSP2-4:3 No - lnc-CTDSP2-4:4 No - lnc-ATP23-6:1 No - lnc-ATP23-7:1 No - lnc-ATP23-4:1 No - lnc-ATP23-8:1 No - lnc-ATP23-9:1 No - lnc-ATP23-89:8 No - lnc-CTDSP2-7:1 No - lnc-CTDSP2-8:1 No - lnc-SLC16A7-7:2 No - lnc-SLC16A7-4:1 No - lnc-ATP23-2:1 No - lnc-LRIG3-2:1 No - lnc-SLC16A7-5:1 No - lnc-FAM19A2-5:2 No - lnc-SLC16A7-6:1 No - lnc-FAM19A2-1:1 No - lnc-USP15-4:1 No - lnc-PPM1H-6:2 No - lnc-FAM19A2-2:6 No - lnc-FAM19A2-2:9 No - lnc-PPM1H-5:2 No - lnc-FAM19A2-2:5 No - lnc-FAM19A2-2:4 No - lnc-FAM19A2-2:8 No - lnc-FAM19A2-2:3 No - lnc-FAM19A2-2:2 No - lnc-MON2-2:2 No - lnc-MON2-2:3 No - lnc-MON2-4:1 Yes chrX:22534831-22540383 lnc-AVPR1A-4:3 Yes chrX:22534831-22540383 lnc-MON2-9:1 No - lnc-AVPR1A-3:1 No - lnc-AVPR1A-2:1 No - lnc-AVPR1A-6:1 No - lnc-DPY19L2-3:1 No - lnc-DPY19L2-4:1 No - lnc-DPY19L2-5:1 No - RXYLT1-AS1:5 No - lnc-DPY19L2-6:1 No - lnc-DPY19L2-7:1 No - lnc-RXYLT1-3:2 No - lnc-RXYLT1-4:2 No - lnc-XPOT-1:2 No - lnc-XPOT-4:1 No - lnc-SRGAP1-3:1 No - lnc-C12orf66-2:7 No - lnc-C12orf66-2:11 No - lnc-C12orf66-2:8 No - lnc-C12orf66-2:9 No - lnc-C12orf66-2:10 No - lnc-XPOT-4:2 No - lnc-XPOT-4:3 No - lnc-XPOT-4:4 No - lnc-XPOT-4:5 No - lnc-XPOT-4:6 No - lnc-XPOT-4:7 No - lnc-C12orf56-3:1 Yes chr2L:20676045-20678979 lnc-GNS-3:1 No - lnc-RASSF3-1:1 No - lnc-WIF1-3:1 Yes chr2R:13408042-13409887 lnc-TBC1D30-4:1 No - lnc-GNS-4:1 Yes chr3R:10225690-10251277 LINC02389:14 No - LINC02389:25 No - lnc-LEMD3-2:1 No - lnc-WIF1-6:2 No - lnc-WIF1-6:1 No - lnc-HMGA2-2:1 No - lnc-LLPH-22:1 No - lnc-LLPH-6:1 No - lnc-IRAK3-3:1 No - lnc-LLPH-4:1 No - LLPH-DT:9 No - lnc-LLPH-3:1 No - lnc-LLPH-1:5 No - lnc-LLPH-1:4 No - lnc-HELB-2:1 Yes chr3R:27251131-27253182 lnc-HELB-1:1 No - lnc-TMBIM4-2:1 Yes chrX:5966279-5986699 lnc-TMBIM4-6:2 Yes chrX:5966279-5986699 lnc-TMBIM4-7:1 Yes chrX:5966279-5986699 lnc-GRIP1-2:5 No - lnc-GRIP1-7:1 No - lnc-GRIP1-8:1 No - lnc-CAND1-3:3 Yes chr2L:10358134-10362707 lnc-CAND1-2:1 No - lnc-GRIP1-9:1 No - LINC02420:6 No - LINC02408:7 No - lnc-DYRK2-6:1 No - lnc-DYRK2-6:2 No - lnc-IFNG-2:2 No - LINC01479:4 No - LINC01479:6 No - lnc-IFNG-7:1 No - IFNG-AS1:1 No - IFNG-AS1:6 No - lnc-IFNG-6:1 No - lnc-IFNG-5:2 No - lnc-DYRK2-14:1 No - lnc-DYRK2-15:1 No - lnc-RAP1B-6:1 No - lnc-IL26-1:1 No - lnc-MDM1-2:1 No - lnc-IL22-1:3 No - lnc-IL22-1:2 No - lnc-IL22-1:1 No - lnc-IL22-2:1 No - lnc-RAP1B-5:1 No - LINC02384:41 No - lnc-RAP1B-4:1 No - LINC02384:44 No - LINC02384:42 No - lnc-NUP107-2:1 Yes chr3L:1859115-1862239 lnc-CPM-6:1 Yes chr3L:1859115-1862239 lnc-CPM-2:7 Yes chr2L:10733293-10736071 lnc-NUP107-1:1 No - lnc-CPM-2:6 Yes chr2L:10733293-10736071 lnc-CPM-5:1 No - lnc-SLC35E3-8:1 No - lnc-SLC35E3-8:2 No - lnc-SLC35E3-8:3 No - lnc-MDM2-1:1 Yes chrX:16696131-16711145 lnc-CPM-4:3 Yes chrX:16696131-16711145 lnc-CPM-4:2 Yes chrX:16696131-16711145 lnc-CPM-7:1 No - lnc-CPSF6-2:1 No - lnc-YEATS4-2:1 No - lnc-YEATS4-3:1 No - lnc-YEATS4-4:1 No - lnc-YEATS4-5:1 Yes chr2L:8412144-8415256 lnc-LRRC10-2:1 Yes chr3R:10161464-10170487 lnc-LRRC10-3:2 Yes chr3R:10161464-10170487 lnc-BEST3-6:1 No - lnc-CNOT2-3:1 No - LINC01481:22 No - lnc-CNOT2-2:1 No - LINC01481:18 Yes chr3L:8755989-8757167 lnc-KCNMB4-2:1 No - lnc-PTPRB-4:1 No - lnc-KCNMB4-1:10 No - lnc-PTPRR-1:2 No - lnc-PTPRB-3:2 Yes chr2R:21619321-21624446 lnc-PTPRB-3:3 Yes chr2R:21619321-21624446 lnc-TSPAN8-1:3 No - lnc-PTPRR-3:3 No - lnc-PTPRR-3:2 No - lnc-PTPRR-3:1 No - lnc-LGR5-1:1 No - lnc-TSPAN8-2:2 No - lnc-TSPAN8-2:1 No - lnc-TSPAN8-3:3 No - lnc-TSPAN8-3:2 No - lnc-TSPAN8-3:1 No - lnc-ZFC3H1-10:1 No - lnc-ZFC3H1-10:2 No - lnc-ZFC3H1-11:1 Yes chr2L:207179-210725 lnc-ZFC3H1-11:2 Yes chr2L:207179-210725 lnc-ZFC3H1-12:1 No - TRHDE-AS1:5 Yes chr3R:21740105-21744431 lnc-TPH2-3:1 Yes chr3R:21740105-21744431 TRHDE-AS1:6 Yes chr3R:21740105-21744431 TRHDE-AS1:3 Yes chr3R:21740105-21744431 lnc-ZFC3H1-13:1 Yes chr3R:21740105-21744431 lnc-TPH2-5:1 Yes chr3R:21740105-21744431 lnc-ZFC3H1-14:1 Yes chr3R:21740105-21744431 lnc-ZFC3H1-15:1 No - lnc-ATXN7L3B-7:1 No - lnc-KCNC2-2:10 No - lnc-ATXN7L3B-5:1 No - lnc-KCNC2-2:8 No - lnc-ATXN7L3B-4:1 No - lnc-KCNC2-7:1 No - lnc-ATXN7L3B-6:1 No - lnc-CAPS2-2:1 Yes chr2L:3718185-3729145 lnc-GLIPR1L1-1:7 No - lnc-CAPS2-1:1 No - lnc-CAPS2-4:3 Yes chr3R:12855544-12859246 lnc-KCNC2-5:1 Yes chr3R:12855544-12859246 lnc-KCNC2-6:1 Yes chr3R:12855544-12859246 lnc-CAPS2-4:2 Yes chr3R:12855544-12859246 lnc-CAPS2-4:1 Yes chr3R:12855544-12859246 lnc-CAPS2-4:4 Yes chr3R:12855544-12859246 lnc-GLIPR1-5:1 No - lnc-GLIPR1-6:1 No - lnc-GLIPR1-7:1 No - lnc-PHLDA1-3:1 No - lnc-GLIPR1-2:2 No - lnc-PHLDA1-1:1 Yes chrX:928798-930098 lnc-PHLDA1-1:2 Yes chrX:928798-930098 lnc-PHLDA1-2:2 Yes chrX:928798-930098 lnc-PHLDA1-2:1 Yes chrX:928798-930098 lnc-PHLDA1-2:3 Yes chrX:928798-930098 lnc-ZDHHC17-16:1 No - lnc-ZDHHC17-15:1 No - LINC02407:19 No - lnc-BBS10-4:1 No - lnc-BBS10-4:2 No - lnc-BBS10-2:1 No - lnc-ZDHHC17-13:1 No - lnc-BBS10-1:1 Yes chr3R:20309344-20324196 lnc-BBS10-3:1 Yes chr3R:20309344-20324196 lnc-BBS10-5:1 Yes chr3R:20309344-20324196 lnc-ZDHHC17-12:1 No - lnc-OSBPL8-2:1 No - lnc-ZDHHC17-11:1 No - lnc-ZDHHC17-10:1 No - lnc-ZDHHC17-8:1 No - lnc-ZDHHC17-7:1 No - lnc-E2F7-7:1 Yes chr3R:7112850-7117732 lnc-E2F7-6:1 Yes chr3R:7112850-7117732 lnc-E2F7-5:1 No - lnc-E2F7-4:1 No - lnc-ZDHHC17-3:2 No - lnc-ZDHHC17-20:2 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-ZDHHC17-20:5 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-NAV3-3:1 No - lnc-NAV3-6:1 Yes chr2L:2772327-2799979 lnc-PAWR-8:1 No - lnc-SYT1-3:4 No - lnc-PAWR-7:1 No - lnc-SYT1-6:1 No - lnc-PPP1R12A-3:1 No - lnc-PPP1R12A-2:1 No - lnc-PAWR-9:1 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-PAWR-9:2 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-PAWR-10:3 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-PAWR-10:2 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-PAWR-10:1 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-PAWR-11:1 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-OTOGL-1:2 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-OTOGL-1:3 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-PPP1R12A-1:1 No - lnc-PPP1R12A-4:1 Yes chr3L:13846054-13860001 lnc-LIN7A-4:1 Yes chrX:11622015-11677338 LINC01490:7 No - lnc-MYF5-2:1 No - lnc-LIN7A-3:1 No - lnc-PPFIA2-4:1 No - lnc-PPFIA2-2:1 Yes chr3R:24336922-24340645 PPFIA2-AS1:15 Yes chr2L:6723903-6732766 PPFIA2-AS1:20 Yes chr2L:6723903-6732766 lnc-LIN7A-5:1 Yes chr2L:6723903-6732766 lnc-LIN7A-6:1 Yes chr2L:6723903-6732766 lnc-CCDC59-6:1 Yes chr2L:6723903-6732766 lnc-METTL25-4:2 No - lnc-METTL25-3:2 No - lnc-PPFIA2-5:2 No - lnc-PPFIA2-5:3 No - lnc-TMTC2-4:1 Yes chr2R:7956150-7958254 lnc-TMTC2-2:1 No - lnc-SLC6A15-1:2 No - lnc-SLC6A15-3:1 No - lnc-LRRIQ1-4:1 No - lnc-TSPAN19-2:1 No - lnc-TSPAN19-1:1 No - lnc-TSPAN19-1:2 No - lnc-SLC6A15-2:1 Yes chrX:6069131-6074857 lnc-LRRIQ1-3:1 No - lnc-ALX1-2:6 No - lnc-ALX1-2:3 No - lnc-ALX1-2:4 No - lnc-ALX1-3:1 No - lnc-RASSF9-1:1 No - lnc-MGAT4C-1:4 Yes chr3L:14762028-14767703 lnc-MGAT4C-1:5 Yes chr3L:14762028-14767703 lnc-NTS-2:1 Yes chr3L:14762028-14767703 lnc-MGAT4C-1:3 Yes chr3L:14762028-14767703 lnc-MGAT4C-1:6 Yes chr3L:14762028-14767703 lnc-MGAT4C-3:1 No - lnc-MGAT4C-4:1 No - lnc-C12orf50-6:2 No - lnc-C12orf50-5:1 No - lnc-C12orf29-6:1 No - lnc-C12orf50-3:1 No - lnc-C12orf50-4:1 No - lnc-TMTC3-9:1 No - lnc-TMTC3-11:1 No - lnc-TMTC3-13:1 No - lnc-TMTC3-13:2 No - lnc-POC1B-1:7 Yes chr3L:13388299-13390006 lnc-POC1B-1:6 Yes chr3L:13388299-13390006 lnc-GALNT4-1:2 Yes chr3L:13388299-13390006 lnc-GALNT4-1:3 Yes chr3L:13388299-13390006 lnc-GALNT4-1:1 No - lnc-POC1B-GALNT4-2:1 No - lnc-POC1B-GALNT4-1:1 No - lnc-TMTC3-2:2 No - lnc-POC1B-GALNT4-3:1 Yes chr4:328193-358917 ATP2B1-AS1:9 Yes chr4:328193-358917 lnc-ATP2B1-1:1 No - lnc-TMTC3-5:4 No - lnc-TMTC3-5:17 No - LINC02392:22 No - lnc-C12orf74-10:3 No - lnc-CCER1-1:3 No - LINC00615:3 No - lnc-LUM-1:1 No - lnc-C12orf74-15:2 No - lnc-DCN-1:1 No - lnc-C12orf74-5:4 No - LINC02404:5 No - LINC01619:10 No - LINC01619:3 Yes chrX:16074717-16091495 LINC01619:8 Yes chrX:16074717-16091495 LINC01619:13 No - LINC01619:12 No - LINC01619:2 Yes chrX:16074717-16091495 LINC01619:11 No - LINC01619:1 Yes chrX:16074717-16091495 lnc-C12orf74-3:27 No - lnc-BTG1-2:1 No - LINC02391:8 No - LINC02397:21 No - LINC02397:22 No - LINC02397:23 No - LINC02397:25 No - LINC02397:26 No - lnc-C12orf74-1:2 No - lnc-EEA1-2:1 No - lnc-PLEKHG7-1:1 No - LINC02413:9 No - LINC02413:10 No - lnc-EEA1-3:1 No - LINC02413:11 No - lnc-EEA1-4:1 No - lnc-UBE2N-1:4 No - lnc-PLEKHG7-6:2 No - lnc-PLEKHG7-5:2 No - lnc-NUDT4-9:1 No - lnc-EEA1-5:1 No - lnc-EEA1-6:1 No - lnc-UBE2N-9:1 No - lnc-UBE2N-8:1 No - lnc-UBE2N-6:1 No - lnc-NUDT4-8:1 No - lnc-NUDT4-8:2 No - lnc-UBE2N-1:5 No - lnc-NUDT4-7:1 No - lnc-NUDT4-6:1 No - lnc-NUDT4-5:1 No - lnc-NUDT4-4:1 No - lnc-NUDT4-3:1 No - lnc-NUDT4-2:1 No - lnc-NUDT4-1:1 No - lnc-UBE2N-4:1 No - lnc-SOCS2-4:4 No - lnc-SOCS2-1:3 No - lnc-UBE2N-5:1 No - SOCS2-AS1:8 No - lnc-SOCS2-3:1 No - lnc-UBE2N-7:1 Yes chr2R:8127575-8129476 lnc-SOCS2-6:1 No - lnc-SOCS2-7:1 No - lnc-CRADD-1:1 No - lnc-CEP83-10:1 No - lnc-CEP83-5:1 Yes chr4:32478-43778 lnc-TMCC3-6:1 No - lnc-PLXNC1-2:1 No - lnc-TMCC3-8:1 No - lnc-TMCC3-9:1 No - CEP83-DT:8 No - lnc-PLXNC1-4:1 No - lnc-TMCC3-2:1 No - lnc-TMCC3-1:1 No - lnc-PLXNC1-5:1 No - lnc-PLXNC1-6:1 Yes chr3R:6389162-6405895 lnc-CEP83-4:1 Yes chr3R:6389162-6405895 lnc-NR2C1-1:2 Yes chr2L:2579201-2580172 lnc-NR2C1-4:1 Yes chr2L:2579201-2580172 lnc-FGD6-2:2 Yes chr3L:21494019-21497494 lnc-FGD6-2:8 Yes chr3L:21494019-21497494 lnc-FGD6-2:6 Yes chr3L:21494019-21497494 lnc-FGD6-2:7 Yes chr3L:21494019-21497494 lnc-FGD6-2:3 Yes chr3L:21494019-21497494 lnc-FGD6-2:5 Yes chr3L:21494019-21497494 lnc-FGD6-2:1 Yes chr3L:21494019-21497494 lnc-FGD6-2:4 Yes chr3L:21494019-21497494 lnc-NR2C1-3:1 No - lnc-NR2C1-5:1 No - lnc-FGD6-5:1 No - lnc-VEZT-2:1 No - lnc-USP44-1:1 No - lnc-NTN4-2:1 No - lnc-NTN4-3:1 No - lnc-USP44-2:1 No - lnc-CCDC38-7:1 No - lnc-CCDC38-6:1 No - lnc-CCDC38-4:1 No - lnc-CCDC38-3:1 No - lnc-HAL-3:1 No - lnc-HAL-2:1 No - lnc-LTA4H-3:1 No - lnc-LTA4H-1:1 No - lnc-AMDHD1-1:2 Yes chr2L:18855126-18859248 lnc-HAL-1:1 Yes chr2L:18855126-18859248 lnc-LTA4H-2:1 No - lnc-LTA4H-4:1 No - LINC02452:5 No - lnc-AMDHD1-5:1 No - lnc-LTA4H-5:1 No - lnc-LTA4H-6:1 No - lnc-LTA4H-7:1 No - lnc-CDK17-6:1 No - lnc-CDK17-8:1 No - lnc-CDK17-9:1 No - lnc-CDK17-11:1 No - RMST:20 No - lnc-NEDD1-7:1 No - RMST:3 No - RMST:6 No - lnc-NEDD1-8:1 No - RMST:7 No - RMST:9 No - RMST:11 No - RMST:12 No - RMST:15 No - lnc-TMPO-2:1 No - lnc-TMPO-1:1 No - lnc-IKBIP-5:2 No - lnc-IKBIP-6:3 No - TMPO-AS1:7 No - TMPO-AS1:4 No - TMPO-AS1:5 No - lnc-IKBIP-7:2 No - lnc-IKBIP-11:1 No - lnc-IKBIP-2:1 No - lnc-SLC25A3-2:1 No - lnc-APAF1-3:1 Yes chr3L:14537651-14540441 lnc-SLC25A3-7:1 No - lnc-IKBIP-3:1 Yes chr3R:23375928-23384777 lnc-APAF1-5:1 Yes chr3R:23375928-23384777 lnc-IKBIP-4:1 Yes chr3R:23375928-23384777 lnc-IKBIP-13:1 Yes chr3R:23375928-23384777 lnc-IKBIP-12:1 Yes chr3R:23375928-23384777 lnc-IKBIP-13:2 Yes chr3R:23375928-23384777 lnc-IKBIP-15:1 Yes chr3R:23375928-23384777 lnc-IKBIP-8:2 Yes chr3R:23375928-23384777 lnc-IKBIP-8:1 Yes chr3R:23375928-23384777 lnc-UHRF1BP1L-4:1 Yes chr3R:23375928-23384777 lnc-ACTR6-4:1 No - lnc-UHRF1BP1L-1:1 No - lnc-ANKS1B-1:1 Yes chr2L:4981614-4992702 lnc-ANKS1B-2:1 Yes chr2L:4981614-4992702 lnc-ANKS1B-3:1 Yes chr2L:4981614-4992702 lnc-ACTR6-2:1 No - lnc-DEPDC4-2:23 No - lnc-DEPDC4-2:9 No - lnc-DEPDC4-2:22 No - lnc-DEPDC4-2:7 No - lnc-DEPDC4-2:21 No - lnc-DEPDC4-2:12 No - lnc-DEPDC4-2:24 No - lnc-DEPDC4-2:11 No - lnc-DEPDC4-2:20 No - lnc-DEPDC4-2:18 No - lnc-DEPDC4-2:14 No - lnc-DEPDC4-2:19 No - lnc-DEPDC4-2:10 No - lnc-DEPDC4-2:16 No - lnc-DEPDC4-2:13 No - lnc-DEPDC4-2:17 No - lnc-DEPDC4-2:2 Yes chrX:15735774-15737120 lnc-DEPDC4-2:6 No - lnc-DEPDC4-2:5 No - lnc-DEPDC4-2:8 No - lnc-DEPDC4-2:4 No - lnc-DEPDC4-1:1 No - lnc-UHRF1BP1L-3:1 No - lnc-DEPDC4-4:1 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-NR1H4-1:1 No - lnc-UTP20-2:1 Yes chr3L:11984906-11990505 lnc-SLC5A8-3:1 No - lnc-SLC5A8-4:2 Yes chr3L:15983135-15984362 lnc-SLC5A8-4:1 Yes chr3L:15983135-15984362 lnc-UTP20-1:1 No - lnc-SYCP3-3:1 Yes chr2R:13486634-13494862 lnc-SYCP3-3:2 Yes chr2R:13486634-13494862 lnc-MYBPC1-1:1 Yes chr2R:13486634-13494862 lnc-SYCP3-4:1 Yes chr2R:9204410-9207124 lnc-SYCP3-5:1 Yes chr2R:9204410-9207124 lnc-GNPTAB-1:1 No - lnc-WASHC3-4:3 Yes chrX:2076966-2078455 lnc-CHPT1-5:1 Yes chrX:2076966-2078455 lnc-CHPT1-6:1 Yes chrX:2076966-2078455 lnc-CHPT1-7:1 Yes chrX:2076966-2078455 lnc-PARPBP-8:1 Yes chrX:2076966-2078455 lnc-PARPBP-7:1 Yes chrX:2076966-2078455 lnc-WASHC3-1:1 Yes chr3R:25247658-25249100 lnc-WASHC3-3:1 Yes chr3R:25247658-25249100 lnc-PARPBP-4:1 No - lnc-PMCH-1:1 No - lnc-PARPBP-5:1 No - lnc-PMCH-2:1 No - lnc-PARPBP-6:1 No - LINC02456:7 No - lnc-PMCH-4:1 No - lnc-IGF1-1:1 No - lnc-PARPBP-11:1 No - lnc-C12orf42-6:1 Yes chr3L:7760453-7763166 lnc-PAH-3:1 No - lnc-PAH-3:5 Yes chr3L:7760453-7763166 lnc-C12orf42-5:1 Yes chr3L:7760453-7763166 lnc-PAH-3:4 Yes chr3L:7760453-7763166 lnc-ASCL1-6:1 No - lnc-ASCL1-6:9 No - lnc-ASCL1-6:17 No - lnc-NT5DC3-5:11 No - lnc-NT5DC3-5:9 No - lnc-NT5DC3-5:10 No - lnc-NT5DC3-5:7 No - lnc-NT5DC3-5:2 No - lnc-NT5DC3-5:8 No - lnc-NT5DC3-5:6 No - lnc-NT5DC3-5:3 No - lnc-NT5DC3-5:4 No - lnc-NT5DC3-5:5 No - lnc-NT5DC3-5:1 No - lnc-C12orf42-4:1 No - LINC02401:16 No - LINC02401:17 No - LINC02401:18 No - lnc-C12orf73-4:1 Yes chr2R:9577427-9581847 lnc-C12orf73-3:1 Yes chr2R:9577427-9581847 lnc-NT5DC3-4:2 No - lnc-C12orf73-2:3 No - lnc-C12orf73-2:2 No - lnc-TDG-1:1 No - lnc-C12orf73-2:1 No - lnc-GLT8D2-1:1 Yes chr2L:19736044-19737088 lnc-TXNRD1-4:1 No - lnc-CHST11-1:1 Yes chr2L:16879517-16886319 lnc-TXNRD1-5:1 Yes chr2L:16879517-16886319 lnc-C12orf45-3:1 Yes chr2L:16879517-16886319 lnc-ALDH1L2-4:1 Yes chrX:8489348-8517029 lnc-ALDH1L2-1:2 Yes chrX:16313709-16317750 lnc-ALDH1L2-3:1 No - lnc-APPL2-3:1 No - lnc-C12orf75-1:2 No - lnc-C12orf75-1:3 No - lnc-C12orf75-5:1 No - lnc-C12orf75-6:1 No - lnc-NUAK1-3:2 No - lnc-TCP11L2-4:1 No - lnc-NUAK1-5:1 No - lnc-NUAK1-7:1 No - lnc-NUAK1-6:1 No - lnc-TCP11L2-1:3 No - lnc-CKAP4-1:1 Yes chr2R:12039041-12042623 lnc-MTERF2-3:2 No - lnc-MTERF2-5:1 No - lnc-RIC8B-1:1 No - lnc-MTERF2-1:1 No - lnc-CRY1-1:1 No - lnc-MTERF2-4:1 Yes chr2L:20643351-20645791 lnc-MTERF2-6:1 Yes chr2L:20643351-20645791 lnc-PWP1-3:1 Yes chr3L:21644958-21666306 lnc-PWP1-2:1 No - lnc-CMKLR1-4:1 No - lnc-PRDM4-5:1 No - lnc-PRDM4-6:3 No - lnc-ASCL4-2:1 No - lnc-PRDM4-6:1 No - lnc-PRDM4-6:2 No - lnc-PRDM4-7:1 No - lnc-ASCL4-3:1 No - lnc-FICD-4:1 Yes chrX:15380371-15385441 lnc-FICD-4:2 Yes chrX:15380371-15385441 lnc-FICD-4:3 Yes chrX:15380371-15385441 lnc-FICD-4:4 Yes chrX:15380371-15385441 lnc-FICD-4:5 Yes chrX:15380371-15385441 lnc-FICD-4:6 Yes chrX:15380371-15385441 lnc-CMKLR1-3:1 Yes chrX:15380371-15385441 lnc-FICD-4:7 Yes chrX:15380371-15385441 lnc-CMKLR1-1:2 No - lnc-SART3-2:1 No - lnc-WSCD2-1:1 No - LINC01498:3 No - lnc-TMEM119-3:1 Yes chrX:5318928-5322696 lnc-TMEM119-2:1 Yes chrX:5318928-5322696 lnc-TMEM119-1:1 Yes chrX:5318928-5322696 lnc-SELPLG-2:1 No - lnc-SELPLG-1:1 Yes chr2R:6862001-6872718 lnc-DAO-5:5 No - lnc-DAO-5:1 No - lnc-DAO-4:1 Yes chr3R:24938710-24944956 lnc-CORO1C-1:2 Yes chr3R:24938710-24944956 lnc-CORO1C-1:1 Yes chr3R:24938710-24944956 lnc-DAO-1:1 Yes chr2L:6803011-6804372 lnc-SVOP-1:3 Yes chr2R:24014917-24017198 lnc-SSH1-3:1 Yes chr2R:24014917-24017198 lnc-ALKBH2-6:1 Yes chr2R:24014917-24017198 lnc-ALKBH2-4:1 Yes chr2R:24014917-24017198 USP30-AS1:1 Yes chrX:5877000-5879787 lnc-ALKBH2-2:1 Yes chrX:5877000-5879787 lnc-ALKBH2-1:1 No - lnc-ACACB-1:2 No - lnc-ALKBH2-3:1 Yes chr2R:7974115-7991862 lnc-KCTD10-2:1 No - lnc-MMAB-1:1 No - lnc-MVK-2:1 No - FAM222A-AS1:6 No - FAM222A-AS1:2 No - FAM222A-AS1:7 No - FAM222A-AS1:9 No - lnc-GLTP-2:2 Yes chr3L:14186249-14189648 lnc-GLTP-2:1 Yes chr3L:14186249-14189648 lnc-TRPV4-2:1 Yes chrX:15462722-15466812 lnc-TRPV4-3:1 Yes chrX:15462722-15466812 lnc-GLTP-3:5 No - lnc-GLTP-3:4 No - lnc-GLTP-3:1 No - lnc-GLTP-3:2 No - lnc-GLTP-3:3 No - lnc-C12orf76-2:1 No - lnc-C12orf76-1:2 No - lnc-C12orf76-1:1 No - lnc-GIT2-1:1 Yes chr2R:19133727-19137169 lnc-GIT2-2:1 No - lnc-IFT81-4:1 No - lnc-IFT81-1:1 No - lnc-IFT81-2:1 No - lnc-IFT81-3:1 No - lnc-IFT81-5:1 No - lnc-ANAPC7-3:1 No - lnc-IFT81-6:1 No - lnc-ANAPC7-2:1 No - lnc-ATP2A2-7:1 No - lnc-ATP2A2-6:1 No - lnc-ATP2A2-5:1 No - lnc-ATP2A2-4:1 No - lnc-ATP2A2-2:1 No - lnc-ATP2A2-1:1 No - lnc-ANAPC7-1:1 No - lnc-ARPC3-3:1 Yes chrX:6597088-6599699 lnc-ARPC3-2:6 Yes chrX:17104571-17105852 lnc-ARPC3-2:3 Yes chrX:17104571-17105852 lnc-ARPC3-2:2 Yes chrX:17104571-17105852 lnc-ARPC3-2:1 Yes chrX:17104571-17105852 lnc-ARPC3-2:5 Yes chrX:17104571-17105852 lnc-GPN3-1:2 No - lnc-GPN3-3:8 Yes chr2L:1150766-1151764 lnc-GPN3-3:7 No - lnc-GPN3-3:5 No - lnc-GPN3-3:6 No - lnc-HVCN1-1:1 No - lnc-PPP1CC-2:1 No - lnc-HVCN1-2:1 No - lnc-PPP1CC-1:1 No - lnc-HVCN1-3:1 No - lnc-HVCN1-4:1 No - lnc-MYL2-7:1 No - lnc-PPP1CC-3:1 Yes chr3R:30171438-30174551 lnc-MYL2-4:1 Yes chr3R:30171438-30174551 LINC01405:2 No - lnc-MYL2-1:7 No - lnc-CUX2-1:1 No - lnc-FAM109A-1:7 No - lnc-FAM109A-5:5 Yes chr3R:15408423-15417277 lnc-FAM109A-5:3 Yes chr3R:15408423-15417277 lnc-FAM109A-5:4 Yes chr3R:15408423-15417277 lnc-FAM109A-5:2 Yes chr3R:15408423-15417277 lnc-FAM109A-5:1 Yes chr3R:15408423-15417277 lnc-BRAP-2:1 Yes chr3R:15408423-15417277 lnc-BRAP-1:1 Yes chr3R:15408423-15417277 lnc-ACAD10-1:7 No - lnc-ACAD10-2:1 Yes chr2L:9387389-9391567 MAPKAPK5-AS1:18 No - lnc-TMEM116-6:1 No - lnc-ALDH2-1:2 No - lnc-MAPKAPK5-3:1 No - lnc-MAPKAPK5-4:1 No - lnc-MAPKAPK5-5:1 No - lnc-NAA25-5:4 No - lnc-NAA25-5:1 No - lnc-NAA25-5:2 No - lnc-ERP29-2:1 No - lnc-NAA25-1:1 No - lnc-NAA25-5:3 No - lnc-TMEM116-4:1 Yes chr3R:20021704-20026482 lnc-TMEM116-5:1 Yes chr3R:20021704-20026482 lnc-HECTD4-2:1 Yes chr3R:20021704-20026482 lnc-TRAFD1-2:1 No - lnc-NAA25-2:1 No - lnc-NAA25-2:2 No - lnc-NAA25-3:1 No - lnc-TRAFD1-4:1 No - lnc-PTPN11-3:1 No - lnc-PTPN11-2:1 No - lnc-HECTD4-1:4 Yes chr3R:31594792-31596204 lnc-HECTD4-1:1 Yes chr3R:31594792-31596204 lnc-HECTD4-1:2 Yes chr3R:31594792-31596204 lnc-HECTD4-1:3 Yes chr3R:31594792-31596204 lnc-PTPN11-1:1 No - lnc-OAS2-1:1 No - lnc-DTX1-2:1 No - lnc-DTX1-1:1 Yes chrX:6533999-6538575 lnc-DDX54-2:1 No - lnc-RASAL1-2:1 No - lnc-RASAL1-2:2 No - lnc-RASAL1-3:1 Yes chr3L:321233-324720 lnc-IQCD-1:1 Yes chr3L:321233-324720 lnc-IQCD-2:1 Yes chr2R:8701835-8704502 lnc-TPCN1-1:1 Yes chr2R:8701835-8704502 lnc-SDS-1:1 No - lnc-SLC8B1-1:2 No - lnc-SDSL-1:2 No - lnc-LHX5-1:1 Yes chrX:8756539-8805804 lnc-LHX5-2:1 No - LINC01234:6 No - lnc-SDSL-8:1 No - lnc-RBM19-3:1 No - lnc-RBM19-2:1 Yes chr3L:9624237-9627321 lnc-SDSL-5:2 No - lnc-RBM19-4:1 No - lnc-SDSL-6:5 No - lnc-SDSL-6:6 No - lnc-SDSL-6:7 No - lnc-SDSL-6:8 No - lnc-SDSL-6:9 No - lnc-SDSL-9:1 No - lnc-SDSL-10:1 No - lnc-SDSL-11:1 No - LINC02459:4 No - TBX5-AS1:2 No - TBX5-AS1:6 No - lnc-TBX5-2:1 No - lnc-SDSL-17:1 No - lnc-TBX5-3:1 Yes chrX:4412856-4485647 lnc-TBX5-4:1 Yes chrX:4412856-4485647 lnc-TBX5-4:2 Yes chrX:4412856-4485647 lnc-TBX3-5:1 No - lnc-TBX3-1:3 No - lnc-SDSL-14:3 No - lnc-SDSL-16:1 No - lnc-MAP1LC3B2-15:1 No - lnc-MAP1LC3B2-4:7 No - lnc-TBX3-6:1 No - lnc-MED13L-7:1 No - lnc-MAP1LC3B2-16:2 No - lnc-C12orf49-17:1 No - lnc-C12orf49-8:1 No - lnc-C12orf49-7:1 No - lnc-C12orf49-6:1 No - lnc-MAP1LC3B2-10:1 No - lnc-MAP1LC3B2-7:2 No - lnc-MAP1LC3B2-6:2 No - lnc-MED13L-6:1 No - lnc-C12orf49-5:1 No - lnc-MAP1LC3B2-28:4 No - lnc-MAP1LC3B2-28:17 No - lnc-MAP1LC3B2-28:19 No - lnc-MAP1LC3B2-28:20 No - lnc-C12orf49-4:2 No - lnc-RNFT2-1:2 Yes chrX:15570380-15572149 lnc-C12orf49-3:1 Yes chrX:15570380-15572149 lnc-C12orf49-2:3 No - lnc-C12orf49-15:1 No - lnc-C12orf49-1:2 No - lnc-FBXW8-3:1 No - lnc-TESC-1:2 No - lnc-TESC-4:1 No - lnc-TESC-3:1 No - lnc-FBXO21-2:2 No - TESC-AS1:2 No - TESC-AS1:5 No - lnc-TESC-2:1 No - lnc-FBXO21-1:1 Yes chr2L:10804274-10837511 lnc-NOS1-1:2 Yes chr2L:10804274-10837511 lnc-KSR2-2:1 Yes chr2L:10804274-10837511 lnc-NOS1-1:1 Yes chr2L:10804274-10837511 lnc-FBXW8-2:2 Yes chr3R:5478390-5483906 lnc-NOS1-2:1 Yes chr3R:5478390-5483906 lnc-RFC5-3:1 Yes chr3R:5478390-5483906 lnc-RFC5-3:2 Yes chr3R:5478390-5483906 lnc-RFC5-2:1 Yes chr3R:5478390-5483906 lnc-WSB2-1:1 No - lnc-WSB2-2:1 No - lnc-TAOK3-1:18 No - lnc-TAOK3-1:14 No - lnc-TAOK3-1:15 No - lnc-TAOK3-1:9 No - lnc-TAOK3-1:13 No - lnc-TAOK3-1:16 No - lnc-PEBP1-1:1 No - lnc-TAOK3-1:12 No - lnc-TAOK3-1:11 No - lnc-TAOK3-1:10 No - lnc-TAOK3-9:1 Yes chr2L:12707661-12708680 lnc-VSIG10-3:1 Yes chrX:19569721-19579800 lnc-VSIG10-4:1 Yes chrX:19569721-19579800 lnc-TAOK3-8:1 No - lnc-TAOK3-11:1 No - LINC02423:12 No - LINC02440:16 No - lnc-SRRM4-4:1 No - lnc-TAOK3-7:4 No - lnc-TAOK3-7:5 No - lnc-HSPB8-6:1 No - lnc-CIT-9:1 No - LINC00934:7 No - lnc-CIT-1:5 No - lnc-CIT-7:1 No - lnc-RAB35-6:1 Yes chr3L:12507998-12514815 lnc-RAB35-5:2 Yes chr3L:12507998-12514815 lnc-RAB35-5:1 Yes chr3L:12507998-12514815 lnc-RAB35-4:1 Yes chr3L:12507998-12514815 lnc-PRKAB1-2:1 Yes chr3L:12507998-12514815 lnc-RAB35-3:2 Yes chr3L:12507998-12514815 lnc-RAB35-3:1 Yes chr3L:12507998-12514815 lnc-BICDL1-2:1 No - lnc-SIRT4-31:1 Yes chr3L:13939250-13962647 lnc-GCN1-3:2 Yes chrX:20155766-20159872 lnc-BICDL1-1:1 Yes chrX:20155766-20159872 lnc-RAB35-1:1 Yes chr3L:27967244-28012599 lnc-RPLP0-3:1 Yes chr3L:27967244-28012599 lnc-RPLP0-2:1 Yes chr3L:27967244-28012599 lnc-GCN1-1:2 Yes chr3L:22075867-22077487 lnc-GCN1-2:2 Yes chr3L:22075867-22077487 PXN-AS1:3 No - lnc-RPLP0-1:1 Yes chr2L:19400753-19426596 lnc-RPLP0-4:2 Yes chr2L:19400753-19426596 lnc-RPLP0-4:3 Yes chr2L:19400753-19426596 lnc-RPLP0-4:5 Yes chr2L:19400753-19426596 lnc-RPLP0-4:4 Yes chr2L:19400753-19426596 lnc-RPLP0-4:1 Yes chr2L:19400753-19426596 lnc-SIRT4-4:1 Yes chr2L:19400753-19426596 lnc-PLA2G1B-1:1 Yes chr3R:25516118-25608423 lnc-SIRT4-5:1 No - lnc-SIRT4-5:2 No - lnc-SIRT4-5:3 No - lnc-SRSF9-1:1 Yes chr2L:13831482-13833105 lnc-TRIAP1-1:1 No - lnc-TRIAP1-1:2 No - lnc-TRIAP1-2:1 No - NRAV:1 No - lnc-SRSF9-2:1 Yes chrX:13193094-13194551 lnc-POP5-2:1 Yes chrX:13193094-13194551 lnc-COQ5-2:2 Yes chr3L:17044401-17045038 lnc-COQ5-2:1 Yes chr3L:17044401-17045038 lnc-POP5-1:3 No - lnc-SPPL3-4:1 Yes chr2L:21102743-21104321 lnc-SPPL3-3:1 Yes chr2L:21102743-21104321 lnc-POP5-3:1 Yes chr3R:25881984-25888230 HNF1A-AS1:5 No - HNF1A-AS1:6 No - lnc-P2RX7-6:1 No - lnc-P2RX7-4:1 No - lnc-CAMKK2-6:1 No - lnc-P2RX7-1:3 No - lnc-CAMKK2-2:1 Yes chr3L:3905344-3907813 lnc-CAMKK2-3:1 Yes chr3L:3905344-3907813 lnc-CAMKK2-3:2 Yes chr3L:3905344-3907813 lnc-CAMKK2-4:1 Yes chr3L:3905344-3907813 lnc-CAMKK2-5:1 Yes chr3L:3905344-3907813 lnc-KDM2B-1:1 Yes chr3L:3905344-3907813 lnc-RNF34-1:4 Yes chr3L:3905344-3907813 lnc-RNF34-1:5 Yes chr3L:3905344-3907813 lnc-ORAI1-3:1 No - lnc-ORAI1-2:1 No - lnc-TMEM120B-1:5 No - lnc-TMEM120B-1:1 No - lnc-SETD1B-4:5 No - lnc-SETD1B-4:6 No - lnc-SETD1B-3:1 Yes chr3R:9497101-9502581 LINC01089:10 Yes chr3R:9497101-9502581 LINC01089:31 Yes chr3R:9497101-9502581 LINC01089:22 Yes chr3R:9497101-9502581 LINC01089:30 Yes chr3R:9497101-9502581 LINC01089:8 Yes chr3R:9497101-9502581 LINC01089:29 Yes chr3R:9497101-9502581 LINC01089:2 Yes chr3R:9497101-9502581 LINC01089:28 Yes chr3R:9497101-9502581 LINC01089:16 Yes chr3R:9497101-9502581 LINC01089:23 Yes chr3R:9497101-9502581 LINC01089:7 Yes chr3R:9497101-9502581 LINC01089:3 Yes chr3R:9497101-9502581 LINC01089:21 Yes chr3R:9497101-9502581 LINC01089:9 Yes chr3R:9497101-9502581 lnc-RHOF-4:1 Yes chr3L:20438166-20439872 lnc-WDR66-2:1 No - lnc-BCL7A-2:1 No - lnc-MLXIP-12:14 No - lnc-MLXIP-1:2 No - lnc-DIABLO-1:3 No - lnc-DIABLO-1:2 No - lnc-DIABLO-1:4 No - lnc-DIABLO-1:1 No - lnc-VPS33A-1:1 No - lnc-VPS33A-2:1 Yes chr2R:19485494-19486837 lnc-B3GNT4-4:1 Yes chr2R:19485494-19486837 CLIP1-AS1:3 Yes chr2R:19485494-19486837 lnc-RSRC2-1:1 Yes chr2R:24533374-24556300 lnc-ZCCHC8-1:10 Yes chrX:15482374-15486612 lnc-ZCCHC8-1:7 Yes chrX:15482374-15486612 lnc-ZCCHC8-1:4 Yes chrX:15482374-15486612 lnc-ZCCHC8-1:8 Yes chrX:15482374-15486612 lnc-ZCCHC8-1:9 Yes chrX:15482374-15486612 lnc-ZCCHC8-1:5 Yes chrX:15482374-15486612 lnc-ZCCHC8-1:6 Yes chrX:15482374-15486612 lnc-KNTC1-2:1 Yes chr3R:31580951-31588244 lnc-KNTC1-2:2 Yes chr3R:31580951-31588244 lnc-KNTC1-3:2 No - lnc-KNTC1-4:1 No - lnc-HCAR1-1:2 No - lnc-VPS37B-1:1 No - lnc-HIP1R-1:2 Yes chr3R:5226158-5227526 lnc-ABCB9-2:1 Yes chr3R:5226158-5227526 lnc-HIP1R-2:1 No - lnc-ARL6IP4-2:1 No - lnc-MPHOSPH9-2:1 No - PITPNM2-AS1:7 No - PITPNM2-AS1:9 No - lnc-C12orf65-2:1 No - lnc-MPHOSPH9-1:1 No - lnc-PITPNM2-1:3 No - lnc-CDK2AP1-4:1 No - lnc-CDK2AP1-3:1 No - lnc-CDK2AP1-1:7 No - lnc-C12orf65-1:1 Yes chrX:11137859-11139689 lnc-SBNO1-1:1 Yes chrX:13195499-13211674 lnc-CDK2AP1-2:1 Yes chrX:13195499-13211674 lnc-KMT5A-1:15 Yes chrX:13195499-13211674 lnc-KMT5A-1:16 Yes chrX:13195499-13211674 lnc-KMT5A-1:17 Yes chrX:13195499-13211674 lnc-KMT5A-1:24 Yes chrX:13195499-13211674 lnc-RILPL2-1:1 No - lnc-KMT5A-20:1 No - lnc-SNRNP35-2:1 Yes chrX:1393054-1397337 lnc-EIF2B1-1:3 No - lnc-EIF2B1-4:1 Yes chr2R:18908961-18911895 lnc-EIF2B1-5:1 Yes chr2R:18908961-18911895 lnc-CCDC92-3:1 No - lnc-CCDC92-1:2 No - lnc-CCDC92-1:1 No - lnc-DNAH10OS-1:1 No - lnc-DNAH10OS-2:1 No - lnc-DNAH10OS-3:1 No - lnc-DNAH10OS-4:1 No - lnc-DNAH10OS-5:1 No - lnc-DNAH10OS-6:1 No - lnc-DNAH10OS-7:1 No - lnc-DNAH10OS-8:1 No - lnc-DNAH10-2:1 No - lnc-DNAH10-2:2 No - lnc-CCDC92-2:1 No - lnc-ZNF664-7:2 No - lnc-ZNF664-7:3 No - lnc-CCDC92-4:1 Yes chrX:12684203-12742618 lnc-CCDC92-4:2 Yes chrX:12684203-12742618 lnc-CCDC92-5:1 Yes chrX:12684203-12742618 lnc-CCDC92-6:1 Yes chrX:12684203-12742618 lnc-CCDC92-6:2 Yes chrX:12684203-12742618 lnc-CCDC92-7:3 Yes chrX:12684203-12742618 lnc-CCDC92-7:2 Yes chrX:12684203-12742618 lnc-CCDC92-7:1 Yes chrX:12684203-12742618 lnc-NCOR2-4:1 Yes chrX:12684203-12742618 lnc-SCARB1-5:1 Yes chrX:12684203-12742618 lnc-RFLNA-3:3 Yes chrX:12684203-12742618 lnc-NCOR2-6:1 No - lnc-NCOR2-3:7 No - lnc-BRI3BP-1:2 No - lnc-UBC-2:1 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-BRI3BP-3:1 No - lnc-SCARB1-1:1 Yes chrX:6276876-6279647 lnc-DHX37-12:1 Yes chrX:2237858-2242035 lnc-DHX37-12:2 Yes chrX:2237858-2242035 lnc-AACS-5:1 No - lnc-AACS-4:1 No - lnc-DHX37-13:1 No - lnc-AACS-2:2 No - lnc-DHX37-14:1 No - lnc-AACS-3:2 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-DHX37-16:1 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-AACS-11:1 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-DHX37-20:1 No - LINC00939:4 No - LINC00939:6 No - lnc-TMEM132B-2:7 No - lnc-TMEM132B-2:8 No - lnc-TMEM132B-2:9 No - lnc-TMEM132B-4:12 No - lnc-TMEM132B-4:14 No - lnc-DHX37-21:1 No - lnc-DHX37-5:8 No - lnc-TMEM132B-4:11 No - lnc-DHX37-5:7 No - lnc-DHX37-23:1 No - lnc-DHX37-6:2 No - LINC02347:16 No - LINC02347:17 No - LINC02347:18 No - lnc-TMEM132B-16:1 No - lnc-DHX37-24:1 No - LINC02347:24 No - lnc-DHX37-25:1 No - lnc-TMEM132B-18:1 No - lnc-DHX37-27:1 No - lnc-DHX37-9:17 No - LINC00944:19 No - LINC00944:18 No - LINC00944:20 No - LINC00944:21 No - LINC00943:5 No - LINC00943:6 No - LINC02372:16 No - LINC02372:17 No - LINC02372:18 No - lnc-TMEM132B-12:5 No - lnc-TMEM132B-12:6 No - lnc-TMEM132B-12:7 No - lnc-SLC15A4-25:1 No - lnc-TMEM132B-19:1 No - LINC02405:30 No - lnc-TMEM132C-12:1 No - lnc-TMEM132C-6:6 No - lnc-SLC15A4-13:2 No - lnc-TMEM132C-11:1 No - lnc-SLC15A4-24:1 No - LINC02375:7 No - LINC02375:6 No - lnc-TMEM132C-5:2 No - lnc-TMEM132C-10:1 No - lnc-SLC15A4-8:2 No - lnc-SLC15A4-21:1 No - LINC00507:1 No - LINC00507:3 No - LINC00507:6 No - LINC00507:8 No - LINC00507:9 No - LINC02441:7 No - LINC02369:14 No - LINC02369:15 No - lnc-SLC15A4-18:1 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-TMEM132D-5:1 No - lnc-TMEM132D-4:1 No - lnc-GLT1D1-4:1 No - lnc-GLT1D1-4:2 No - lnc-GLT1D1-5:1 No - TMEM132D-AS1:32 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-GLT1D1-2:3 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-GLT1D1-8:1 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-FZD10-7:1 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-RIMBP2-9:1 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-RIMBP2-5:3 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-RIMBP2-5:2 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-TMEM132D-2:2 No - LINC02419:6 No - FZD10-DT:49 No - FZD10-DT:36 No - lnc-RIMBP2-7:1 No - lnc-PIWIL1-1:2 No - lnc-RIMBP2-2:2 No - lnc-STX2-11:1 Yes chr3R:15374635-15402543 lnc-RAN-4:3 Yes chr3R:15374635-15402543 lnc-RAN-4:4 Yes chr3R:15374635-15402543 lnc-RAN-4:5 Yes chr3R:15374635-15402543 lnc-STX2-1:2 No - lnc-RAN-3:3 No - lnc-RAN-3:4 No - lnc-RAN-5:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-STX2-9:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-STX2-10:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-STX2-13:1 No - LINC02415:8 No - LINC02415:9 No - LINC02370:10 No - LINC02370:11 No - lnc-SFSWAP-2:2 No - lnc-STX2-7:2 No - lnc-STX2-7:3 No - lnc-STX2-7:4 No - lnc-STX2-17:1 No - lnc-DDX51-12:1 No - lnc-SFSWAP-1:3 No - lnc-SFSWAP-6:1 No - lnc-SFSWAP-5:1 No - lnc-SFSWAP-4:1 No - lnc-MMP17-2:1 No - lnc-ULK1-1:1 No - lnc-DDX51-4:2 No - lnc-EP400-1:1 No - lnc-EP400-1:2 No - lnc-EP400-1:3 No - lnc-EP400-1:4 No - lnc-EP400-1:5 No - lnc-EP400-1:6 No - lnc-DDX51-9:1 No - lnc-GALNT9-3:1 Yes chr3L:16728496-16730818 lnc-GALNT9-2:1 Yes chr3L:16728496-16730818 lnc-NOC4L-1:2 No - lnc-NOC4L-1:3 No - lnc-NOC4L-1:4 No - lnc-DDX51-10:1 Yes chr3R:28748384-28751661 lnc-NOC4L-4:7 Yes chr3R:28748384-28751661 lnc-NOC4L-4:9 Yes chr3R:28748384-28751661 lnc-NOC4L-4:16 Yes chr3R:28748384-28751661 lnc-NOC4L-4:17 Yes chr3R:28748384-28751661 lnc-FBRSL1-3:2 No - lnc-FBRSL1-3:3 No - lnc-FBRSL1-3:4 No - lnc-FBRSL1-3:5 No - lnc-FBRSL1-3:6 No - lnc-FBRSL1-6:1 No - lnc-FBRSL1-1:2 No - lnc-FBRSL1-5:1 No - lnc-LRCOL1-2:19 No - lnc-LRCOL1-2:20 No - lnc-LRCOL1-2:16 No - lnc-LRCOL1-2:17 No - lnc-LRCOL1-2:18 No - lnc-LRCOL1-4:2 Yes chr3R:23348128-23355163 lnc-ANKLE2-3:1 Yes chr3R:23348128-23355163 lnc-ANKLE2-2:1 No - lnc-GOLGA3-1:1 Yes chrX:17571854-17579229 lnc-PGAM5-2:1 Yes chrX:17571854-17579229 lnc-ANKLE2-1:1 No - lnc-CHFR-3:6 No - lnc-CHFR-3:7 No - lnc-GOLGA3-4:1 No - lnc-CHFR-3:5 No - lnc-CHFR-3:2 No - lnc-CHFR-3:3 No - lnc-CHFR-3:1 No - lnc-GOLGA3-5:1 No - lnc-CHFR-2:6 No - lnc-ZNF26-11:1 No - lnc-ZNF605-2:1 No - lnc-ZNF26-12:2 No - lnc-ZNF26-12:7 No - lnc-ZNF26-12:9 No - lnc-ZNF26-12:10 No - lnc-ZNF26-8:1 No - lnc-CHFR-2:2 No - lnc-CHFR-2:4 No - lnc-CHFR-2:3 No - lnc-CHFR-2:5 No - lnc-ZNF26-7:1 No - lnc-ZNF26-5:1 No - lnc-ZNF26-4:1 No - lnc-ZNF605-3:1 No - lnc-ZNF605-4:2 No - lnc-ZNF605-4:1 No - lnc-ZNF891-2:6 No - lnc-ZNF26-1:11 No - lnc-ZNF891-1:1 No - lnc-ZNF10-1:1 No - lnc-ANHX-1:1 No - lnc-MPHOSPH8-22:1 No - lnc-MPHOSPH8-21:1 No - lnc-TUBA3C-20:1 No - lnc-TUBA3C-19:1 No - lnc-MPHOSPH8-20:1 No - lnc-MPHOSPH8-19:1 No - lnc-TUBA3C-18:1 No - lnc-MPHOSPH8-18:1 No - lnc-TUBA3C-2:3 No - lnc-TUBA3C-2:2 No - lnc-TUBA3C-2:4 No - lnc-TUBA3C-17:1 No - lnc-MPHOSPH8-17:1 No - lnc-TUBA3C-16:2 No - lnc-TUBA3C-16:1 No - lnc-TUBA3C-16:4 No - lnc-TUBA3C-16:3 No - lnc-TUBA3C-15:1 No - LINC00408:3 No - lnc-TUBA3C-14:1 No - lnc-TUBA3C-13:1 No - lnc-TUBA3C-12:1 No - lnc-TUBA3C-11:1 No - lnc-MPHOSPH8-13:1 No - LINC00442:1 No - lnc-TUBA3C-10:1 No - lnc-TUBA3C-9:2 No - lnc-TUBA3C-9:4 No - lnc-TUBA3C-9:5 No - lnc-TUBA3C-9:1 No - lnc-TUBA3C-9:3 No - lnc-TUBA3C-6:1 No - lnc-TUBA3C-5:1 No - lnc-TUBA3C-7:2 No - lnc-TUBA3C-7:1 No - lnc-TUBA3C-8:1 No - lnc-TPTE2-5:1 No - lnc-TPTE2-7:1 No - LINC00421:3 No - lnc-MPHOSPH8-6:1 No - lnc-TPTE2-3:3 No - lnc-PSPC1-4:1 No - lnc-TPTE2-6:1 No - lnc-MPHOSPH8-5:1 No - lnc-PSPC1-2:1 No - PSPC1-AS2:3 Yes chrX:16361569-16371547 lnc-PSPC1-1:4 Yes chrX:16361569-16371547 lnc-PSPC1-1:5 Yes chrX:16361569-16371547 lnc-ZMYM5-2:1 Yes chrX:16361569-16371547 lnc-PSPC1-3:2 Yes chr3R:27256595-27264055 lnc-PSPC1-3:1 Yes chr3R:27256595-27264055 lnc-ZMYM2-5:2 Yes chr3R:27256595-27264055 lnc-ZMYM5-1:1 No - lnc-MPHOSPH8-7:1 Yes chr3R:27256595-27264055 lnc-GJA3-1:1 Yes chr3R:27256595-27264055 lnc-ZMYM2-7:1 No - lnc-ZMYM2-8:1 No - lnc-GJB2-1:1 No - lnc-ZMYM2-9:1 No - lnc-ZMYM2-10:1 No - lnc-GJB2-2:3 No - lnc-GJB2-2:2 No - lnc-GJB2-2:1 No - lnc-EEF1AKMT1-3:7 No - lnc-EEF1AKMT1-3:4 No - lnc-EEF1AKMT1-3:1 No - lnc-IFT88-1:1 No - lnc-EEF1AKMT1-4:1 No - lnc-EEF1AKMT1-4:2 No - lnc-XPO4-3:1 Yes chr2L:6069790-6070686 lnc-EEF1AKMT1-1:2 Yes chr2L:6069790-6070686 lnc-EEF1AKMT1-1:1 Yes chr2L:6069790-6070686 lnc-XPO4-1:1 No - lnc-XPO4-1:2 No - lnc-XPO4-2:1 No - lnc-LATS2-2:1 No - lnc-LATS2-3:1 No - lnc-SKA3-1:1 Yes chr3R:16186156-16189564 lnc-MRPL57-8:1 No - lnc-MRPL57-4:2 No - lnc-MRPL57-5:3 No - lnc-MRPL57-5:4 No - lnc-MRPL57-5:5 No - lnc-MRPL57-5:6 No - LINC00539:6 No - LINC00539:3 No - LINC00539:9 No - lnc-ZDHHC20-6:3 No - lnc-ZDHHC20-6:4 No - lnc-ZDHHC20-5:2 No - lnc-MRPL57-9:1 No - lnc-MICU2-2:1 Yes chr2R:10028443-10032893 lnc-MICU2-7:3 Yes chr2R:10028443-10032893 lnc-MICU2-7:2 Yes chr2R:10028443-10032893 lnc-MICU2-7:1 Yes chr2R:10028443-10032893 ZDHHC20-IT1:2 Yes chr2R:10028443-10032893 lnc-MRPL57-10:1 Yes chr2R:10028443-10032893 ZDHHC20-IT1:3 Yes chr2R:10028443-10032893 lnc-MICU2-7:4 Yes chr2R:10028443-10032893 lnc-MICU2-4:1 No - lnc-FGF9-10:1 No - lnc-FGF9-9:1 No - lnc-ZDHHC20-88:4 Yes chr3R:19847311-19854403 lnc-ZDHHC20-88:3 Yes chr3R:19847311-19854403 lnc-ZDHHC20-88:2 Yes chr3R:19847311-19854403 lnc-ZDHHC20-88:1 Yes chr3R:19847311-19854403 lnc-FGF9-8:1 Yes chr3R:19847311-19854403 lnc-FGF9-4:1 No - lnc-FGF9-1:2 No - lnc-FGF9-5:1 No - lnc-FGF9-6:1 No - LINC00424:1 No - lnc-MICU2-5:1 No - lnc-FGF9-3:5 No - lnc-FGF9-3:6 No - lnc-FGF9-13:1 No - lnc-FGF9-13:2 No - lnc-FGF9-13:3 No - lnc-MICU2-6:1 No - lnc-MICU2-3:1 No - lnc-FGF9-3:7 No - lnc-FGF9-15:1 No - lnc-FGF9-16:1 No - lnc-SACS-6:1 No - lnc-SGCG-13:1 No - lnc-SACS-5:3 No - lnc-SACS-5:1 No - lnc-SACS-5:2 No - lnc-SGCG-12:1 No - lnc-SGCG-7:2 No - LINC00621:7 No - LINC00621:8 No - lnc-SGCG-5:5 No - lnc-SGCG-8:1 No - LINC00362:1 No - lnc-TNFRSF19-8:1 Yes chrX:1735945-1754065 lnc-TNFRSF19-7:1 Yes chrX:1735945-1754065 lnc-SGCG-9:1 No - SACS-AS1:2 No - lnc-TNFRSF19-3:2 No - lnc-TNFRSF19-1:2 No - lnc-C1QTNF9B-2:1 Yes chr2R:5758065-5760407 lnc-MIPEP-1:2 No - lnc-C1QTNF9B-1:3 No - lnc-C1QTNF9B-1:5 No - lnc-SPATA13-4:1 No - lnc-C1QTNF9-1:4 Yes chr3L:277437-305292 lnc-C1QTNF9-8:1 Yes chr3L:277437-305292 lnc-C1QTNF9-4:1 No - lnc-PARP4-2:2 No - lnc-PARP4-4:1 No - lnc-C1QTNF9-6:1 No - lnc-ATP12A-1:4 No - lnc-CENPJ-9:1 No - lnc-PARP4-1:2 No - lnc-PARP4-1:1 No - lnc-ATP12A-3:1 No - lnc-ATP12A-2:1 No - lnc-ATP12A-1:5 No - lnc-ATP12A-1:6 No - lnc-CENPJ-7:1 Yes chr3R:20948714-20976239 lnc-CENPJ-6:1 No - lnc-RNF17-1:1 No - lnc-CENPJ-5:1 No - lnc-AMER2-3:1 Yes chr3R:7151367-7154219 lnc-CENPJ-1:11 No - lnc-CENPJ-1:7 No - lnc-CENPJ-1:10 No - lnc-CENPJ-1:5 No - lnc-CENPJ-1:4 No - lnc-CENPJ-1:9 No - lnc-CENPJ-1:2 No - lnc-RNF17-2:1 No - lnc-CENPJ-3:1 No - lnc-CENPJ-1:8 No - lnc-CENPJ-1:6 No - lnc-CENPJ-4:1 No - lnc-PABPC3-3:1 No - lnc-PABPC3-3:2 No - lnc-MTMR6-3:1 No - LINC00463:2 No - lnc-AMER2-2:1 No - lnc-NUP58-5:1 No - lnc-MTMR6-1:1 No - lnc-MTMR6-4:1 Yes chr2R:13414978-13439051 lnc-SHISA2-4:2 Yes chr2R:13414978-13439051 lnc-SHISA2-4:1 Yes chr2R:13414978-13439051 lnc-CDK8-3:1 Yes chr2R:13414978-13439051 lnc-SHISA2-2:1 Yes chr2R:13414978-13439051 LINC00415:1 No - lnc-RNF6-4:4 Yes chr3R:9535625-9551806 lnc-RNF6-3:1 No - lnc-RNF6-2:1 No - lnc-RNF6-4:1 Yes chr3R:9535625-9551806 lnc-SHISA2-3:1 Yes chr3R:9535625-9551806 lnc-RNF6-4:3 Yes chr3R:9535625-9551806 lnc-RNF6-4:2 Yes chr3R:9535625-9551806 lnc-RNF6-1:1 No - lnc-CDK8-1:1 No - lnc-ATP8A2-4:1 Yes chr3L:9837080-9838670 lnc-WASF3-3:1 Yes chr3L:9837080-9838670 lnc-WASF3-2:1 Yes chr3L:9837080-9838670 WASF3-AS1:2 Yes chr2L:10976772-10982395 WASF3-AS1:3 Yes chr2L:10976772-10982395 lnc-GPR12-2:1 No - lnc-WASF3-4:1 No - lnc-RPL21-6:1 No - lnc-USP12-7:2 No - lnc-USP12-7:1 No - lnc-RPL21-5:1 No - lnc-RPL21-4:1 No - lnc-USP12-9:1 Yes chr2L:22247111-22247875 lnc-MTIF3-2:1 Yes chrX:16785115-16787008 lnc-LNX2-2:1 No - lnc-LNX2-2:3 No - lnc-LNX2-2:2 No - lnc-GTF3A-3:1 No - lnc-POLR1D-1:1 No - lnc-POLR1D-1:2 No - lnc-GSX1-2:1 Yes chr2L:19133023-19135233 lnc-LNX2-1:1 Yes chr2L:19133023-19135233 lnc-CDX2-1:2 No - lnc-CDX2-3:1 No - lnc-URAD-1:1 No - lnc-URAD-2:2 Yes chr2L:8220980-8239878 lnc-URAD-2:1 Yes chr2L:8220980-8239878 lnc-PAN3-3:1 Yes chr2L:8220980-8239878 lnc-PAN3-2:1 No - lnc-PAN3-2:2 No - PAN3-AS1:3 No - PAN3-AS1:2 Yes chr3L:3071133-3090406 lnc-FLT1-2:1 No - lnc-FLT1-1:1 No - lnc-FLT3-2:1 Yes chr2L:8220980-8239878 lnc-FLT3-2:2 Yes chr2L:8220980-8239878 lnc-POMP-9:1 No - lnc-POMP-6:1 No - lnc-POMP-5:1 No - lnc-POMP-3:1 No - lnc-SLC46A3-1:1 No - lnc-MTUS2-8:1 No - lnc-MTUS2-7:1 No - lnc-SLC46A3-2:1 No - lnc-SLC46A3-3:1 No - lnc-SLC46A3-4:3 No - lnc-SLC46A3-4:1 No - lnc-SLC46A3-5:1 No - lnc-POMP-11:2 No - lnc-SLC46A3-6:1 No - lnc-SLC7A1-8:1 No - MTUS2-AS2:4 No - MTUS2-AS2:7 No - MTUS2-AS2:8 No - MTUS2-AS2:9 No - MTUS2-AS2:1 No - MTUS2-AS2:6 No - MTUS2-AS2:3 No - MTUS2-AS2:2 No - lnc-SLC7A1-6:1 No - lnc-SLC7A1-5:1 No - MTUS2-AS1:3 No - MTUS2-AS1:4 No - lnc-SLC7A1-3:2 No - lnc-SLC7A1-3:4 No - lnc-SLC7A1-3:3 No - lnc-SLC7A1-3:1 No - lnc-MTUS2-3:1 No - lnc-MTUS2-3:2 No - lnc-SLC7A1-4:1 No - lnc-MTUS2-4:1 No - lnc-MTUS2-6:2 Yes chrX:15849731-15853175 lnc-SLC7A1-7:2 Yes chrX:15849731-15853175 lnc-UBL3-3:1 No - LINC00297:1 No - lnc-UBL3-5:2 No - LINC00544:1 No - LINC00544:3 No - lnc-UBE2L5-5:1 No - LINC00385:1 No - lnc-HMGB1-4:1 Yes chr3R:5227289-5232209 lnc-HMGB1-3:1 Yes chr3R:5227289-5232209 lnc-UBE2L5-6:1 Yes chr3R:5227289-5232209 lnc-UBE2L5-2:6 No - lnc-UBE2L5-2:8 No - LINC00426:1 No - lnc-HMGB1-2:1 No - lnc-KATNAL1-5:1 Yes chrX:16333612-16340624 lnc-KATNAL1-6:1 Yes chrX:16333612-16340624 lnc-KATNAL1-8:1 Yes chrX:16333612-16340624 lnc-KATNAL1-7:1 Yes chrX:16333612-16340624 lnc-USPL1-3:1 Yes chrX:16333612-16340624 LINC00398:2 No - TEX26-AS1:24 No - TEX26-AS1:5 No - TEX26-AS1:15 No - TEX26-AS1:23 No - TEX26-AS1:16 No - TEX26-AS1:22 No - TEX26-AS1:19 No - TEX26-AS1:18 No - TEX26-AS1:21 No - TEX26-AS1:4 No - TEX26-AS1:11 No - TEX26-AS1:17 No - TEX26-AS1:6 No - TEX26-AS1:1 No - TEX26-AS1:2 No - TEX26-AS1:3 No - LINC01066:1 No - lnc-HSPH1-1:5 No - lnc-HSPH1-1:4 No - lnc-B3GLCT-4:1 No - lnc-B3GLCT-3:1 No - lnc-TEX26-2:1 Yes chr2L:6025870-6034423 lnc-B3GLCT-1:2 No - lnc-ZAR1L-6:1 Yes chrX:13161714-13189164 lnc-ZAR1L-5:1 Yes chr3L:9631834-9679103 FRY-AS1:2 Yes chr3L:9631834-9679103 FRY-AS1:3 Yes chr3L:9631834-9679103 lnc-RXFP2-2:2 Yes chr3L:9631834-9679103 lnc-RXFP2-3:1 Yes chr3L:9631834-9679103 lnc-ZAR1L-2:1 Yes chr3L:9631834-9679103 lnc-FRY-1:2 Yes chr3L:9631834-9679103 lnc-FRY-1:3 Yes chr3L:9631834-9679103 lnc-N4BP2L2-2:14 Yes chr3L:22067270-22071848 lnc-N4BP2L2-2:13 Yes chr3L:22067270-22071848 lnc-N4BP2L2-2:12 No - lnc-N4BP2L2-2:11 Yes chr3L:22067270-22071848 lnc-N4BP2L2-2:10 Yes chr3L:22067270-22071848 lnc-N4BP2L2-2:9 Yes chr3L:22067270-22071848 lnc-N4BP2L1-1:2 Yes chr3L:22067270-22071848 N4BP2L2-IT2:1 Yes chr3L:22067270-22071848 lnc-N4BP2L1-4:1 Yes chr3L:22067270-22071848 lnc-N4BP2L2-2:8 Yes chr3L:22067270-22071848 lnc-N4BP2L2-2:4 Yes chr3L:22067270-22071848 lnc-N4BP2L2-2:6 Yes chr3L:22067270-22071848 lnc-N4BP2L2-2:5 Yes chr3L:22067270-22071848 lnc-N4BP2L2-2:7 Yes chr3L:22067270-22071848 lnc-N4BP2L2-3:1 Yes chr2R:12027985-12033725 LINC00423:1 No - lnc-PDS5B-1:1 No - lnc-STARD13-4:1 No - lnc-N4BP2L2-5:1 Yes chr3R:14391683-14481713 STARD13-AS:13 Yes chr3R:14391683-14481713 STARD13-AS:14 Yes chr3R:14391683-14481713 STARD13-AS:15 Yes chr3R:14391683-14481713 STARD13-AS:16 Yes chr3R:14391683-14481713 STARD13-AS:17 Yes chr3R:14391683-14481713 STARD13-AS:40 Yes chr3R:14391683-14481713 STARD13-AS:41 Yes chr3R:14391683-14481713 STARD13-AS:42 Yes chr3R:14391683-14481713 STARD13-AS:43 Yes chr3R:14391683-14481713 STARD13-AS:44 Yes chr3R:14391683-14481713 STARD13-AS:45 Yes chr3R:14391683-14481713 STARD13-AS:46 Yes chr3R:14391683-14481713 STARD13-AS:47 Yes chr3R:14391683-14481713 STARD13-AS:48 Yes chr3R:14391683-14481713 STARD13-AS:49 Yes chr3R:14391683-14481713 STARD13-AS:50 Yes chr3R:14391683-14481713 STARD13-AS:51 Yes chr3R:14391683-14481713 STARD13-AS:52 Yes chr3R:14391683-14481713 STARD13-AS:53 Yes chr3R:14391683-14481713 LINC02344:5 Yes chr3R:14391683-14481713 LINC02344:6 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-KL-4:1 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-STARD13-2:5 No - lnc-RFC3-7:1 No - lnc-STARD13-2:4 No - lnc-RFC3-6:1 No - lnc-RFC3-6:2 No - lnc-RFC3-4:1 No - lnc-RFC3-3:1 No - lnc-RFC3-5:1 No - lnc-STARD13-5:1 No - LINC02343:18 No - lnc-MAB21L1-5:1 No - lnc-NBEA-9:1 No - lnc-NBEA-9:2 No - lnc-RFC3-11:1 Yes chrX:5085759-5254864 lnc-CCNA1-3:1 Yes chrX:5085759-5254864 lnc-NBEA-5:1 Yes chrX:5085759-5254864 LINC00445:2 No - LINC00445:3 No - LINC00445:4 No - LINC00445:5 No - lnc-MAB21L1-4:1 Yes chr2R:4815426-4824319 lnc-SOHLH2-3:1 Yes chr2R:4815426-4824319 lnc-NBEA-2:2 Yes chr2R:4815426-4824319 lnc-SOHLH2-1:2 No - lnc-SPART-2:2 No - lnc-SPART-2:3 No - lnc-SPART-2:4 No - lnc-SPART-2:1 No - lnc-CCDC169-SOHLH2-2:3 Yes chr3R:4654800-4657985 lnc-CCDC169-SOHLH2-2:1 Yes chr3R:4654800-4657985 lnc-CCDC169-SOHLH2-2:2 Yes chr3R:4654800-4657985 lnc-SPART-1:1 No - lnc-SPART-3:1 No - lnc-SERTM1-1:1 No - lnc-SMAD9-5:1 No - lnc-RFXAP-3:1 No - lnc-RFXAP-3:2 No - lnc-RFXAP-3:3 No - lnc-RFXAP-3:4 No - lnc-SMAD9-4:1 No - lnc-RFXAP-2:1 Yes chr2L:3146056-3159643 SMAD9-IT1:1 Yes chr2L:3146056-3159643 lnc-SMAD9-1:1 Yes chr2L:3146056-3159643 lnc-SMAD9-2:1 No - lnc-ALG5-2:1 No - lnc-SMAD9-3:2 Yes chr2L:8301345-8302985 lnc-SMAD9-3:1 Yes chr2L:8301345-8302985 lnc-ALG5-2:3 Yes chr2L:8301345-8302985 lnc-ALG5-2:2 Yes chr2L:8301345-8302985 lnc-ALG5-1:1 No - lnc-SUPT20H-1:1 No - lnc-SUPT20H-1:3 No - lnc-SUPT20H-1:2 No - lnc-ALG5-3:1 Yes chr3L:13502707-13511541 lnc-ALG5-4:3 Yes chr3L:13502707-13511541 lnc-ALG5-4:5 Yes chr3L:13502707-13511541 lnc-ALG5-4:2 Yes chr3L:13502707-13511541 lnc-ALG5-4:1 Yes chr3L:13502707-13511541 lnc-ALG5-4:6 Yes chr3L:13502707-13511541 lnc-ALG5-4:4 Yes chr3L:13502707-13511541 lnc-EXOSC8-4:1 No - lnc-CSNK1A1L-1:1 No - lnc-CSNK1A1L-2:1 No - lnc-POSTN-3:1 No - lnc-EXOSC8-5:2 No - lnc-TRPC4-2:4 Yes chr3R:16625238-16639771 lnc-TRPC4-2:2 Yes chr3R:16625238-16639771 lnc-TRPC4-2:3 Yes chr3R:16625238-16639771 lnc-TRPC4-2:1 Yes chr3R:16625238-16639771 lnc-POSTN-2:1 Yes chr2L:16663454-16676701 LINC02334:10 No - lnc-UFM1-11:1 No - LINC00571:3 No - lnc-UFM1-8:1 No - lnc-UFM1-7:1 No - lnc-UFM1-6:1 No - lnc-UFM1-5:1 No - lnc-UFM1-4:1 No - lnc-UFM1-3:1 No - lnc-UFM1-9:1 No - LINC00437:3 No - LINC00366:2 No - lnc-STOML3-8:1 No - lnc-FREM2-2:1 No - lnc-STOML3-6:1 No - lnc-STOML3-4:1 No - lnc-STOML3-4:2 No - lnc-STOML3-5:2 No - lnc-STOML3-5:3 No - lnc-STOML3-5:1 No - lnc-STOML3-7:1 No - lnc-NHLRC3-3:1 No - lnc-LHFPL6-6:1 No - lnc-LHFPL6-5:1 No - lnc-PROSER1-2:1 No - lnc-PROSER1-3:1 No - lnc-LHFPL6-4:1 No - lnc-LHFPL6-7:1 No - lnc-LHFPL6-8:1 No - LINC00332:2 No - LINC00332:3 No - lnc-FOXO1-4:1 No - lnc-SLC25A15-13:1 No - lnc-FOXO1-2:8 No - lnc-FOXO1-2:6 Yes chr3R:14056945-14087978 lnc-FOXO1-2:5 Yes chr3R:14056945-14087978 lnc-FOXO1-3:1 No - lnc-FOXO1-2:7 Yes chr3R:14056945-14087978 lnc-FOXO1-2:4 Yes chr3R:14056945-14087978 lnc-SLC25A15-12:1 Yes chr3R:14056945-14087978 lnc-SLC25A15-11:1 Yes chr3R:14056945-14087978 lnc-SLC25A15-10:1 Yes chr3R:14056945-14087978 lnc-SLC25A15-9:1 Yes chr3R:14056945-14087978 lnc-SLC25A15-8:1 Yes chr3R:14056945-14087978 lnc-SLC25A15-7:1 Yes chr3R:14056945-14087978 lnc-SLC25A15-6:1 No - lnc-SLC25A15-3:1 No - lnc-ELF1-2:2 Yes chrX:10598146-10602714 lnc-ELF1-2:3 Yes chrX:10598146-10602714 lnc-ELF1-2:8 No - lnc-ELF1-2:9 No - lnc-ELF1-2:7 No - lnc-ELF1-5:2 No - lnc-ELF1-1:2 No - lnc-SLC25A15-4:1 No - lnc-SLC25A15-5:1 No - lnc-ELF1-2:5 No - lnc-ELF1-2:6 No - lnc-ELF1-2:1 No - lnc-MRPS31-2:1 Yes chr3L:17558672-17619325 lnc-KBTBD6-4:1 Yes chr3L:17558672-17619325 lnc-WBP4-3:1 No - lnc-KBTBD6-2:1 No - lnc-WBP4-2:2 No - lnc-KBTBD7-1:1 No - lnc-MTRF1-1:1 No - lnc-NAA16-2:2 Yes chr2L:13219979-13221398 lnc-NAA16-2:3 Yes chr2L:13219979-13221398 lnc-MTRF1-2:2 Yes chr2L:13219979-13221398 lnc-MTRF1-2:3 Yes chr2L:13219979-13221398 lnc-MTRF1-2:4 Yes chr2L:13219979-13221398 lnc-MTRF1-6:1 No - lnc-VWA8-5:1 No - lnc-VWA8-4:1 No - lnc-RGCC-1:1 No - lnc-MTRF1-3:1 Yes chrX:9319359-9324458 lnc-MTRF1-5:2 Yes chrX:9319359-9324458 lnc-DGKH-4:1 Yes chrX:9319359-9324458 VWA8-AS1:3 No - lnc-DGKH-3:1 No - lnc-AKAP11-4:1 Yes chr3R:7814361-7855392 lnc-VWA8-6:1 Yes chr3R:7814361-7855392 lnc-AKAP11-1:1 Yes chr3R:7814361-7855392 lnc-AKAP11-1:2 Yes chr3R:7814361-7855392 LINC02341:7 No - lnc-VWA8-7:1 No - lnc-AKAP11-3:1 No - lnc-FAM216B-1:1 No - LINC01050:1 No - LINC00428:1 No - lnc-FAM216B-2:1 No - lnc-EPSTI1-4:1 No - lnc-EPSTI1-4:4 No - lnc-DNAJC15-6:5 No - lnc-DNAJC15-6:6 No - lnc-DNAJC15-5:1 No - lnc-EPSTI1-4:3 No - lnc-EPSTI1-4:2 No - lnc-EPSTI1-5:1 No - lnc-ENOX1-3:1 No - lnc-EPSTI1-9:1 Yes chr3L:12844254-12850117 lnc-EPSTI1-10:1 Yes chr3L:12844254-12850117 lnc-DNAJC15-7:1 Yes chr3L:12844254-12850117 lnc-LACC1-8:1 Yes chr3L:12844254-12850117 lnc-CCDC122-3:1 Yes chr3L:12844254-12850117 lnc-LACC1-7:1 Yes chr3L:12844254-12850117 lnc-LACC1-6:1 No - lnc-CCDC122-2:1 No - LINC00284:2 No - LINC00284:3 No - lnc-LACC1-5:1 No - LINC00284:5 No - LINC00284:9 No - LINC00284:14 No - lnc-SMIM2-4:1 No - LINC00390:6 No - SMIM2-AS1:3 No - SMIM2-AS1:5 No - SMIM2-AS1:6 No - SMIM2-AS1:7 No - lnc-SERP2-11:1 No - lnc-SERP2-10:1 No - lnc-SMIM2-2:3 No - SMIM2-AS1:11 No - lnc-SERP2-9:1 No - lnc-SERP2-8:1 No - lnc-SMIM2-3:1 No - lnc-SERP2-7:1 No - lnc-SERP2-6:1 No - lnc-SERP2-5:1 No - lnc-TSC22D1-2:4 No - lnc-TSC22D1-2:2 Yes chr3L:3197863-3199047 lnc-TSC22D1-2:3 No - TUSC8:6 No - TUSC8:1 No - lnc-SERP2-3:1 Yes chr2L:12455540-12546611 lnc-SMIM2-5:1 Yes chr2L:12455540-12546611 lnc-SERP2-4:1 Yes chr2L:12455540-12546611 lnc-SERP2-4:2 Yes chr2L:12455540-12546611 lnc-SMIM2-6:1 Yes chr2L:12455540-12546611 lnc-SERP2-17:1 Yes chr2L:12455540-12546611 lnc-TSC22D1-3:1 No - lnc-NUFIP1-1:7 No - lnc-NUFIP1-1:6 No - lnc-NUFIP1-2:4 Yes chr3L:18746611-18748367 lnc-GTF2F2-10:1 Yes chr3R:14886456-14889146 lnc-GTF2F2-14:1 Yes chr3R:14886456-14889146 lnc-GPALPP1-4:1 No - lnc-KCTD4-1:1 Yes chr3R:10766622-10767804 lnc-COG3-5:1 Yes chr3R:10766622-10767804 lnc-GTF2F2-3:1 No - lnc-GTF2F2-4:1 No - lnc-GTF2F2-4:2 No - lnc-GTF2F2-5:1 No - lnc-GTF2F2-6:1 No - lnc-SLC25A30-4:3 Yes chr3R:11210247-11211898 lnc-SLC25A30-4:2 Yes chr3R:11210247-11211898 lnc-SLC25A30-4:1 Yes chr3R:11210247-11211898 TPT1-AS1:2 Yes chr3R:11210247-11211898 TPT1-AS1:16 No - lnc-GTF2F2-8:1 No - lnc-TPT1-2:1 No - lnc-TPT1-2:2 No - TPT1-AS1:25 No - TPT1-AS1:26 No - TPT1-AS1:27 No - TPT1-AS1:32 No - TPT1-AS1:34 No - TPT1-AS1:36 No - TPT1-AS1:37 No - TPT1-AS1:38 No - TPT1-AS1:42 No - TPT1-AS1:44 No - lnc-COG3-4:1 No - lnc-COG3-3:1 No - lnc-ERICH6B-2:1 No - lnc-SLC25A30-5:1 No - lnc-SPERT-3:1 No - LINC01055:1 No - lnc-CPB2-1:1 No - CPB2-AS1:2 Yes chrX:17080423-17087675 CPB2-AS1:3 Yes chrX:17080423-17087675 CPB2-AS1:6 Yes chrX:17080423-17087675 CPB2-AS1:9 No - lnc-LRRC63-3:1 No - lnc-CPB2-3:1 Yes chrX:17285704-17301929 lnc-CPB2-2:1 Yes chrX:17285704-17301929 lnc-LRCH1-11:1 No - lnc-LRCH1-10:1 No - lnc-LRCH1-9:1 No - lnc-LRCH1-8:1 No - lnc-RUBCNL-3:2 No - lnc-LRRC63-2:1 No - lnc-LCP1-2:1 Yes chrX:8677063-8680912 LINC01198:9 No - LINC01198:10 No - LINC01198:12 No - LINC01198:4 No - LINC01198:15 No - LINC01198:1 No - LINC01198:11 No - LINC01198:7 No - LINC01198:13 No - lnc-LRCH1-3:2 No - LINC01198:5 No - LINC01198:8 No - lnc-LRCH1-2:2 No - LINC01198:3 No - lnc-LRCH1-6:1 No - lnc-LRRC63-4:1 Yes chr2L:17367511-17384115 lnc-ESD-1:3 Yes chr2L:17367511-17384115 lnc-ESD-1:1 No - HTR2A-AS1:1 Yes chr3R:8578205-8629996 HTR2A-AS1:2 Yes chr3R:8578205-8629996 lnc-ESD-2:1 Yes chr3R:8578205-8629996 lnc-LRCH1-7:1 No - lnc-HTR2A-1:1 No - lnc-LRCH1-5:2 No - lnc-LRCH1-12:1 No - lnc-SUCLA2-11:1 No - lnc-SUCLA2-10:1 No - lnc-SUCLA2-9:1 No - lnc-MED4-8:1 Yes chr3R:8938724-8943027 lnc-NUDT15-5:1 Yes chr3R:8938724-8943027 lnc-MED4-7:1 Yes chr3R:8938724-8943027 LINC00562:7 Yes chr3R:8938724-8943027 lnc-NUDT15-4:1 Yes chr3R:8938724-8943027 lnc-MED4-4:1 Yes chr3R:8938724-8943027 lnc-MED4-2:1 Yes chr3R:8938724-8943027 RB1-DT:23 No - RB1-DT:18 No - RB1-DT:19 No - lnc-RB1-1:1 No - RB1-DT:20 No - lnc-LPAR6-4:1 Yes chrX:797090-801479 lnc-RCBTB2-2:7 Yes chrX:797090-801479 lnc-RCBTB2-2:6 Yes chrX:797090-801479 lnc-RCBTB2-2:5 Yes chrX:797090-801479 lnc-RCBTB2-2:2 Yes chrX:797090-801479 lnc-RCBTB2-2:4 Yes chrX:797090-801479 lnc-RCBTB2-5:1 Yes chrX:797090-801479 lnc-RCBTB2-2:3 Yes chrX:797090-801479 lnc-LPAR6-3:1 Yes chrX:797090-801479 lnc-CYSLTR2-3:1 Yes chrX:797090-801479 LINC00462:1 Yes chrX:797090-801479 lnc-CYSLTR2-1:1 No - lnc-FNDC3A-2:1 No - lnc-CAB39L-10:3 No - lnc-CAB39L-9:1 No - lnc-CAB39L-2:1 No - lnc-MLNR-1:1 No - lnc-CAB39L-1:1 No - lnc-CAB39L-1:2 No - lnc-CAB39L-1:3 No - lnc-CDADC1-1:1 No - lnc-RCBTB1-3:2 Yes chr3L:16613218-16615472 lnc-RCBTB1-3:1 Yes chr3L:16613218-16615472 lnc-RCBTB1-2:2 Yes chr3L:16613218-16615472 lnc-RCBTB1-2:1 Yes chr3L:16613218-16615472 lnc-PHF11-2:1 No - lnc-PHF11-1:1 No - lnc-CAB39L-3:2 No - lnc-CAB39L-4:4 No - lnc-ARL11-3:1 No - lnc-ARL11-2:1 No - lnc-RCBTB1-1:1 No - lnc-ARL11-1:1 No - lnc-PHF11-3:1 No - lnc-ARL11-4:1 No - lnc-SPRYD7-3:1 No - DLEU2:47 Yes chr3R:18021600-18023689 DLEU2:48 Yes chr3R:18021600-18023689 lnc-TRIM13-7:1 No - lnc-TRIM13-7:3 No - lnc-TRIM13-6:1 No - DLEU2:26 No - lnc-TRIM13-5:1 No - DLEU2:28 No - lnc-TRIM13-4:1 No - lnc-TRIM13-3:1 No - DLEU2:2 No - DLEU2:25 No - lnc-TRIM13-2:1 No - DLEU2:29 No - DLEU2:27 No - DLEU2:24 No - DLEU2:21 No - lnc-KCNRG-1:1 No - DLEU2:23 No - DLEU2:22 No - DLEU2:7 No - DLEU2:8 No - DLEU2:4 No - DLEU2:20 No - lnc-KCNRG-5:2 No - lnc-KCNRG-2:2 No - DLEU1:4 No - DLEU1:5 No - DLEU1:6 No - DLEU1:7 No - DLEU1:8 No - DLEU1:9 No - DLEU1:10 No - DLEU1:11 No - DLEU1:12 No - DLEU1:13 No - DLEU1:14 No - DLEU1:15 No - DLEU1:16 No - DLEU1:17 No - DLEU1:18 No - DLEU1:19 No - lnc-KCNRG-6:1 No - DLEU1:20 No - DLEU1:21 No - DLEU1:22 No - lnc-SPRYD7-5:1 No - DLEU1:23 No - DLEU1:25 No - DLEU1:26 No - DLEU1:27 No - DLEU1:28 No - DLEU1:29 No - lnc-DLEU7-10:1 No - lnc-DLEU7-9:1 No - lnc-DLEU7-8:1 No - DLEU1:30 No - DLEU1:33 No - DLEU1:34 No - DLEU1:36 No - DLEU1:39 No - DLEU1:43 No - DLEU1:44 No - DLEU1:47 No - DLEU1:48 No - DLEU1:49 No - DLEU1:50 No - DLEU1:52 No - lnc-DLEU7-6:1 No - lnc-DLEU7-4:1 No - lnc-RNASEH2B-4:1 No - DLEU7-AS1:1 No - RNASEH2B-AS1:4 Yes chrX:13668014-13669573 RNASEH2B-AS1:5 Yes chrX:13668014-13669573 RNASEH2B-AS1:10 No - RNASEH2B-AS1:9 No - RNASEH2B-AS1:6 Yes chrX:13668014-13669573 lnc-C13orf42-7:1 Yes chrX:13668014-13669573 lnc-C13orf42-7:3 Yes chrX:13668014-13669573 lnc-C13orf42-7:2 Yes chrX:13668014-13669573 lnc-INTS6-7:1 No - lnc-FAM124A-2:1 No - lnc-INTS6-6:1 No - lnc-FAM124A-1:1 No - lnc-SERPINE3-2:1 No - lnc-INTS6-3:1 No - lnc-C13orf42-8:1 No - lnc-C13orf42-2:1 No - lnc-C13orf42-6:1 Yes chrX:5738663-5747254 lnc-C13orf42-5:1 Yes chrX:5738663-5747254 lnc-SERPINE3-1:1 Yes chrX:5738663-5747254 lnc-SERPINE3-1:2 Yes chrX:5738663-5747254 lnc-C13orf42-4:1 Yes chrX:5738663-5747254 lnc-C13orf42-4:3 Yes chrX:5738663-5747254 lnc-C13orf42-4:2 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:6 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:7 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:9 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:10 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:12 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:13 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:14 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:15 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:16 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:17 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:18 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:19 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:20 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:21 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:22 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:23 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:24 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:25 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:26 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:28 Yes chrX:5738663-5747254 lnc-SERPINE3-3:1 No - lnc-INTS6-4:1 No - lnc-INTS6-5:1 Yes chr2L:10423291-10425482 lnc-SERPINE3-6:1 Yes chr2L:10423291-10425482 lnc-TMEM272-2:1 No - lnc-WDFY2-4:1 No - lnc-WDFY2-4:5 No - lnc-WDFY2-4:6 No - lnc-CCDC70-1:1 No - lnc-CCDC70-2:1 Yes chrX:11855022-11864754 lnc-NEK5-1:4 No - lnc-UTP14C-1:2 No - lnc-NEK5-3:1 No - lnc-NEK3-1:10 No - lnc-NEK3-1:9 No - lnc-NEK3-1:8 No - lnc-NEK3-1:7 No - lnc-NEK3-1:6 No - lnc-NEK3-1:15 No - lnc-NEK3-1:13 No - lnc-NEK3-1:12 No - lnc-NEK3-1:17 No - lnc-NEK3-1:14 No - lnc-NEK3-1:11 No - lnc-NEK3-1:16 No - lnc-NEK3-1:5 No - lnc-THSD1-4:1 No - LINC02333:4 No - lnc-THSD1-1:1 Yes chr3L:13511646-13513112 lnc-THSD1-1:2 Yes chr3L:13511646-13513112 lnc-THSD1-2:1 Yes chr3L:13511646-13513112 lnc-THSD1-3:1 Yes chr3L:13511646-13513112 lnc-VPS36-2:1 No - lnc-CKAP2-4:1 No - lnc-HNRNPA1L2-2:5 No - lnc-PCDH8-6:2 No - lnc-PCDH8-6:3 No - lnc-PCDH8-6:1 No - lnc-PCDH8-2:3 No - lnc-PCDH8-2:4 No - LINC01065:6 No - LINC01065:2 No - LINC01065:3 No - lnc-OLFM4-7:1 No - lnc-OLFM4-8:1 No - lnc-OLFM4-9:1 No - lnc-PCDH8-7:1 No - LINC00458:12 No - LINC00458:5 No - lnc-OLFM4-11:1 No - LINC00458:6 No - lnc-OLFM4-4:2 No - lnc-OLFM4-4:3 No - lnc-OLFM4-12:1 No - LINC02335:6 No - LINC02335:7 No - lnc-PRR20C-10:1 No - lnc-PRR20C-9:1 No - lnc-PRR20C-8:1 No - lnc-PRR20C-7:1 No - lnc-PCDH8-8:1 No - lnc-PCDH8-10:1 No - lnc-PCDH8-9:1 No - lnc-PRR20C-6:1 No - lnc-PRR20C-5:1 No - lnc-PRR20C-5:2 No - lnc-PRR20C-4:1 No - lnc-PCDH8-11:1 No - lnc-PRR20C-3:1 No - lnc-PCDH8-12:1 No - lnc-PRR20C-2:1 No - lnc-DIAPH3-21:1 No - lnc-DIAPH3-20:1 No - lnc-PRR20C-1:1 No - lnc-DIAPH3-19:1 No - lnc-PRR20E-1:1 No - lnc-PRR20E-2:1 No - lnc-DIAPH3-5:2 No - lnc-DIAPH3-5:3 No - lnc-PRR20E-3:1 No - lnc-DIAPH3-18:1 No - lnc-DIAPH3-17:1 No - lnc-DIAPH3-16:1 No - LINC00374:1 No - lnc-DIAPH3-12:1 No - lnc-DIAPH3-4:2 No - lnc-PCDH17-3:1 No - lnc-PCDH17-4:1 No - lnc-DIAPH3-11:1 No - lnc-DIAPH3-10:1 No - lnc-TDRD3-12:1 No - lnc-TDRD3-11:2 No - lnc-TDRD3-11:3 No - lnc-DIAPH3-1:2 No - lnc-PCDH20-22:1 Yes chr2L:20758144-20768053 lnc-TDRD3-9:1 Yes chr2L:20758144-20768053 lnc-PCDH20-21:1 Yes chr2L:20758144-20768053 lnc-TDRD3-15:1 Yes chr2L:20758144-20768053 lnc-PCDH20-19:1 Yes chr2L:20758144-20768053 DIAPH3-AS2:1 Yes chr2L:20758144-20768053 DIAPH3-AS2:2 Yes chr2L:20758144-20768053 lnc-DIAPH3-7:1 No - lnc-DIAPH3-8:1 No - lnc-TDRD3-6:1 No - lnc-DIAPH3-3:5 No - lnc-DIAPH3-3:3 No - LINC00378:4 No - lnc-TDRD3-7:1 No - lnc-PCDH20-13:1 No - LINC01442:1 No - LINC01442:3 No - lnc-TDRD3-8:1 No - lnc-TDRD3-10:1 No - LINC02339:4 Yes chr3R:14630478-14641776 lnc-PCDH20-12:3 No - lnc-PCDH20-12:2 No - lnc-TDRD3-13:1 No - LINC00358:2 No - lnc-PCDH20-14:1 No - LINC01075:3 No - lnc-TDRD3-25:1 No - lnc-PCDH20-15:1 No - lnc-PCDH20-17:2 No - lnc-PCDH20-17:1 No - lnc-TDRD3-23:1 No - lnc-PCDH20-18:2 No - LINC00448:5 No - lnc-PCDH20-20:1 No - lnc-TDRD3-3:4 No - lnc-TDRD3-2:4 No - lnc-TDRD3-2:5 No - lnc-TDRD3-20:1 No - lnc-TDRD3-20:2 No - lnc-TDRD3-20:3 No - lnc-TDRD3-20:4 No - lnc-TDRD3-20:5 No - lnc-TDRD3-20:6 No - LINC00355:12 No - LINC00355:9 No - LINC00355:10 No - LINC00355:17 No - LINC00355:14 No - lnc-TDRD3-21:1 No - LINC00355:13 No - LINC00355:8 No - LINC00355:2 No - lnc-TDRD3-22:2 No - lnc-PCDH9-9:1 No - lnc-PCDH9-7:1 No - lnc-PCDH9-6:1 No - LINC01052:1 No - lnc-TDRD3-19:1 No - lnc-TDRD3-26:1 No - lnc-TDRD3-26:2 No - lnc-KLHL1-11:1 Yes chr3R:14630478-14641776 PCDH9-AS2:1 Yes chr3R:14630478-14641776 PCDH9-AS2:3 Yes chr3R:14630478-14641776 PCDH9-AS3:1 Yes chr3R:14630478-14641776 lnc-KLHL1-10:1 Yes chr3R:14630478-14641776 lnc-KLHL1-9:1 Yes chr3R:14630478-14641776 lnc-PCDH9-5:1 No - lnc-PCDH9-8:1 No - lnc-BORA-28:2 No - lnc-BORA-31:1 No - lnc-BORA-29:1 No - lnc-BORA-30:1 No - lnc-PCDH9-11:1 No - lnc-PCDH9-12:1 No - lnc-BORA-27:1 No - lnc-BORA-26:1 No - lnc-KLHL1-8:1 No - LINC00550:2 No - lnc-BORA-25:1 No - lnc-KLHL1-7:1 No - LINC00383:1 No - LINC00383:4 No - lnc-BORA-24:1 No - lnc-KLHL1-4:1 No - lnc-KLHL1-2:1 No - lnc-BORA-23:1 Yes chrX:9250420-9255953 lnc-BORA-19:1 No - lnc-BORA-16:1 No - lnc-BORA-15:1 Yes chr2L:16466512-16485998 lnc-MZT1-6:1 Yes chr2L:16466512-16485998 lnc-BORA-14:1 Yes chr2L:16466512-16485998 lnc-MZT1-5:1 Yes chr2L:16466512-16485998 lnc-MZT1-4:1 Yes chr2L:16466512-16485998 lnc-BORA-13:1 No - lnc-DACH1-1:1 No - lnc-BORA-12:1 No - lnc-MZT1-3:2 No - lnc-MZT1-3:1 No - lnc-BORA-10:1 No - lnc-BORA-7:1 No - lnc-MZT1-1:1 Yes chr3R:24333433-24337248 lnc-MZT1-2:2 Yes chr3R:24333433-24337248 lnc-MZT1-2:1 No - lnc-BORA-8:1 No - lnc-DIS3-2:1 No - lnc-DIS3-3:1 No - lnc-KLF5-4:1 No - lnc-DIS3-4:1 No - lnc-KLF5-5:1 No - lnc-KLF5-6:2 No - lnc-KLF5-9:1 No - lnc-KLF12-3:1 No - lnc-KLF5-11:1 No - lnc-KLF5-11:3 No - lnc-KLF5-12:1 Yes chr2R:23011078-23042943 lnc-KLF12-5:1 No - lnc-KLF12-4:1 No - lnc-KLF5-13:1 No - lnc-KLF5-13:2 No - lnc-KLF5-2:2 No - lnc-KLF5-14:1 No - LINC00402:1 No - LINC00402:2 No - LINC00402:4 No - lnc-KLF12-6:1 No - LINC00402:6 No - lnc-UCHL3-5:5 No - lnc-UCHL3-5:6 No - lnc-UCHL3-5:7 No - lnc-UCHL3-5:10 No - lnc-UCHL3-5:11 No - LINC00347:5 No - lnc-UCHL3-4:2 No - lnc-UCHL3-13:1 No - lnc-UCHL3-12:1 No - lnc-UCHL3-11:1 No - LINC01078:1 No - lnc-COMMD6-9:1 Yes chr3R:5685855-5712837 lnc-COMMD6-8:1 Yes chr3R:5685855-5712837 lnc-COMMD6-2:7 No - lnc-COMMD6-2:12 No - lnc-COMMD6-2:10 No - lnc-COMMD6-2:11 No - lnc-COMMD6-2:8 No - lnc-COMMD6-2:9 No - lnc-COMMD6-2:6 No - lnc-COMMD6-5:1 No - lnc-COMMD6-6:1 No - LMO7-AS1:5 No - lnc-COMMD6-7:1 Yes chr3R:4659579-4712193 lnc-COMMD6-10:1 No - LINC01034:1 No - lnc-LMO7DN-5:1 No - lnc-ACOD1-4:1 No - lnc-ACOD1-3:2 No - lnc-KCTD12-2:2 No - lnc-ACOD1-2:2 No - lnc-ACOD1-2:3 No - lnc-ACOD1-2:4 No - lnc-FBXL3-2:1 No - lnc-FBXL3-1:7 No - lnc-FBXL3-1:6 No - lnc-FBXL3-1:4 No - lnc-FBXL3-1:5 No - lnc-FBXL3-1:3 No - lnc-FBXL3-1:2 No - lnc-FBXL3-1:1 No - MYCBP2-AS2:1 No - lnc-FBXL3-4:1 No - lnc-FBXL3-5:1 No - lnc-FBXL3-6:1 Yes chrX:15010137-15063429 lnc-FBXL3-7:1 Yes chrX:15010137-15063429 lnc-SCEL-2:2 No - SCEL-AS1:2 No - SCEL-AS1:6 No - lnc-SCEL-3:1 No - lnc-EDNRB-4:2 No - EDNRB-AS1:1 No - EDNRB-AS1:2 Yes chr2R:17646848-17665068 lnc-MYCBP2-2:3 Yes chr2R:17646848-17665068 lnc-MYCBP2-2:2 Yes chr2R:17646848-17665068 lnc-MYCBP2-2:1 Yes chr2R:17646848-17665068 RNF219-AS1:1 Yes chr2R:17646848-17665068 lnc-MYCBP2-3:1 Yes chr2R:17646848-17665068 LINC00446:1 No - LINC00446:2 No - LINC00446:5 No - lnc-SLAIN1-6:1 No - lnc-SLAIN1-8:1 No - lnc-POU4F1-3:1 No - lnc-SLAIN1-10:1 No - lnc-SLAIN1-11:1 Yes chrX:15350239-15379064 lnc-POU4F1-2:1 No - lnc-NDFIP2-22:2 No - lnc-NDFIP2-21:1 No - lnc-NDFIP2-20:1 No - LINC00331:1 No - LINC00331:3 No - lnc-NDFIP2-16:1 No - lnc-NDFIP2-14:1 No - lnc-RNF219-6:1 Yes chr2L:19493251-19497978 lnc-RNF219-7:1 Yes chr2L:19493251-19497978 lnc-RBM26-4:1 Yes chr2L:19493251-19497978 RBM26-AS1:5 Yes chr2L:19493251-19497978 RBM26-AS1:6 Yes chr2L:19493251-19497978 RBM26-AS1:16 No - LINC01068:1 No - LINC01068:5 No - LINC01068:6 No - lnc-NDFIP2-4:2 No - LINC01038:2 No - lnc-NDFIP2-7:3 No - lnc-NDFIP2-7:4 No - lnc-NDFIP2-15:1 No - lnc-NDFIP2-7:13 No - lnc-NDFIP2-19:1 No - lnc-NDFIP2-23:1 No - lnc-SPRY2-3:2 No - LINC00377:1 No - LINC00377:4 No - lnc-SPRY2-5:1 No - lnc-NDFIP2-11:3 No - lnc-NDFIP2-24:1 No - lnc-NDFIP2-11:4 No - lnc-NDFIP2-26:1 No - lnc-NDFIP2-26:2 No - lnc-SLITRK1-8:1 No - lnc-NDFIP2-28:1 No - lnc-NDFIP2-29:1 No - lnc-NDFIP2-30:1 No - lnc-SLITRK1-3:1 No - lnc-SLITRK1-4:1 No - lnc-SLITRK5-13:2 No - lnc-SLITRK5-34:1 No - lnc-SLITRK1-1:2 No - LINC00333:1 No - LINC00333:5 No - lnc-SLITRK5-32:1 No - lnc-SLITRK5-31:1 No - LINC00351:3 No - lnc-SLITRK5-30:1 No - lnc-SLITRK5-29:1 No - lnc-SLITRK5-27:1 No - lnc-SLITRK5-26:1 No - lnc-SLITRK5-25:1 No - lnc-SLITRK6-13:2 No - lnc-SLITRK6-13:3 No - lnc-SLITRK5-20:1 No - lnc-SLITRK5-19:1 No - LINC00430:3 No - lnc-SLITRK5-17:1 No - lnc-SLITRK5-16:1 No - lnc-SLITRK5-14:1 No - lnc-SLITRK5-14:2 No - lnc-SLITRK6-14:2 No - lnc-SLITRK5-2:2 No - lnc-SLITRK5-1:3 No - lnc-SLITRK5-3:2 No - LINC00397:3 No - lnc-SLITRK5-4:2 No - lnc-SLITRK6-16:1 No - lnc-SLITRK6-17:1 No - lnc-SLITRK6-17:2 No - lnc-SLITRK5-15:1 No - lnc-SLITRK6-18:1 No - lnc-SLITRK6-19:1 No - lnc-SLITRK6-20:1 No - lnc-SLITRK6-20:2 No - lnc-SLITRK5-35:1 No - lnc-SLITRK5-35:2 No - lnc-SLITRK6-22:1 No - lnc-SLITRK6-24:1 No - LINC01047:2 No - LINC01047:4 No - lnc-SLITRK6-25:1 No - lnc-SLITRK5-23:1 No - lnc-SLITRK5-24:1 No - lnc-SLITRK5-28:1 No - LINC00353:1 No - lnc-SLITRK6-26:1 No - lnc-SLITRK6-27:1 No - lnc-SLITRK6-28:1 No - lnc-SLITRK6-28:2 No - LINC00559:8 No - LINC00559:9 No - lnc-GPC5-10:1 No - lnc-GPC5-9:1 No - lnc-GPC5-8:1 No - LINC01049:3 No - LINC01049:5 No - lnc-DCT-18:1 No - lnc-GPC5-2:3 No - LINC00379:1 No - lnc-GPC5-5:1 No - lnc-DCT-17:1 No - MIR17HG:3 No - MIR17HG:11 No - lnc-GPC6-6:1 Yes chr3L:8827505-8891192 lnc-GPC6-3:1 Yes chr3L:8827505-8891192 GPC5-AS1:4 Yes chr3L:8827505-8891192 lnc-DCT-16:1 No - lnc-DCT-15:1 Yes chr3L:14632601-14671609 lnc-GPC5-7:1 Yes chr3L:14632601-14671609 GPC6-AS2:1 Yes chr3L:14632601-14671609 lnc-DCT-13:1 Yes chr3L:14632601-14671609 GPC6-AS1:2 Yes chr3L:14632601-14671609 lnc-DCT-11:1 Yes chr3L:14632601-14671609 lnc-TGDS-1:3 No - lnc-DCT-12:1 No - lnc-DCT-12:2 No - lnc-GPR180-4:1 No - lnc-GPR180-5:1 No - LINC00391:12 No - LINC00391:6 No - LINC00391:11 No - LINC00391:10 No - LINC00391:3 Yes chr3L:14112405-14131324 lnc-SOX21-4:1 No - lnc-GPR180-2:2 No - LINC00557:5 No - lnc-GPR180-6:1 No - lnc-GPR180-7:1 No - lnc-SOX21-5:1 Yes chr2L:8355678-8362469 lnc-SOX21-6:1 Yes chr2L:8355678-8362469 lnc-SOX21-7:1 Yes chr2L:8355678-8362469 lnc-SOX21-8:1 Yes chr2L:8355678-8362469 lnc-CLDN10-6:1 No - lnc-ABCC4-2:1 No - lnc-CLDN10-3:1 No - lnc-CLDN10-1:2 No - CLDN10-AS1:1 No - lnc-DZIP1-4:1 No - lnc-UGGT2-3:1 No - DNAJC3-DT:20 No - lnc-CLDN10-4:1 Yes chr3R:9586942-9589581 lnc-DZIP1-5:1 Yes chr3R:9586942-9589581 lnc-CLDN10-5:1 Yes chr3R:9586942-9589581 lnc-CLDN10-10:1 Yes chr3R:9586942-9589581 lnc-DZIP1-6:1 Yes chr3L:18872747-18878245 lnc-DZIP1-7:1 Yes chr3L:18872747-18878245 lnc-DZIP1-8:1 Yes chr3L:18872747-18878245 lnc-DZIP1-9:1 Yes chr3L:18872747-18878245 lnc-UGGT2-1:2 No - lnc-DNAJC3-3:1 Yes chr3R:19929277-20008512 lnc-UGGT2-4:1 Yes chr3R:19929277-20008512 lnc-MBNL2-4:1 Yes chr3R:19929277-20008512 lnc-OXGR1-8:1 No - lnc-HS6ST3-2:1 No - lnc-OXGR1-3:1 No - lnc-HS6ST3-3:1 No - lnc-MBNL2-3:1 No - lnc-OXGR1-5:1 Yes chr2R:17216549-17379376 lnc-OXGR1-6:1 No - lnc-IPO5-2:1 No - lnc-RNF113B-9:1 Yes chr3R:4649176-4654624 lnc-IPO5-3:2 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-RNF113B-4:1 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-IPO5-11:1 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-RNF113B-5:1 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-RNF113B-6:1 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-IPO5-1:5 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-IPO5-1:6 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-IPO5-1:8 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-IPO5-1:10 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-IPO5-1:12 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-IPO5-1:13 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-IPO5-1:14 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-IPO5-1:15 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-IPO5-1:16 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-IPO5-1:17 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-IPO5-1:19 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-IPO5-1:20 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-STK24-3:1 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-IPO5-5:1 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-IPO5-7:1 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-IPO5-7:2 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-IPO5-10:3 No - lnc-IPO5-10:4 No - lnc-FARP1-4:1 Yes chr3R:17085513-17087988 STK24-AS1:2 Yes chr3R:17085513-17087988 STK24-AS1:5 No - lnc-STK24-2:1 No - lnc-FARP1-7:1 No - lnc-FARP1-8:1 No - lnc-SLC15A1-2:1 Yes chr2L:7472513-7496307 lnc-SLC15A1-4:1 Yes chr2L:7472513-7496307 lnc-UBAC2-6:2 No - lnc-UBAC2-5:1 No - UBAC2-AS1:4 No - UBAC2-AS1:5 No - lnc-UBAC2-3:1 No - UBAC2-AS1:1 No - UBAC2-AS1:3 No - lnc-TM9SF2-8:1 No - lnc-TM9SF2-7:1 No - lnc-TM9SF2-6:1 No - lnc-TM9SF2-5:1 No - lnc-TM9SF2-4:1 No - lnc-UBAC2-4:1 No - LINC01039:2 No - LINC01039:4 No - CLYBL-AS1:7 No - CLYBL-AS1:4 No - CLYBL-AS1:5 No - lnc-ZIC5-8:1 No - lnc-ZIC5-2:2 No - lnc-CLYBL-2:1 No - LINC00554:6 No - lnc-ZIC5-6:1 No - lnc-ZIC5-3:2 No - lnc-ZIC5-7:1 No - lnc-PCCA-3:1 No - lnc-PCCA-2:1 No - lnc-ZIC5-3:3 No - lnc-ZIC5-9:1 No - PCCA-AS1:4 No - PCCA-AS1:1 No - lnc-TMTC4-1:2 Yes chr2R:24940625-24942413 lnc-GGACT-2:1 Yes chr3R:15351225-15353926 lnc-GGACT-3:1 Yes chr3R:15351225-15353926 lnc-GGACT-4:1 Yes chr3R:15351225-15353926 LINC00411:1 No - lnc-TMTC4-2:1 Yes chrX:14266367-14277416 lnc-PCCA-4:1 No - lnc-TPP2-8:1 No - lnc-FGF14-3:1 No - lnc-ITGBL1-2:1 No - lnc-NALCN-1:4 No - lnc-ITGBL1-3:1 No - lnc-NALCN-2:1 No - lnc-TPP2-7:2 No - FGF14-IT1:3 No - FGF14-IT1:7 No - FGF14-IT1:6 No - FGF14-IT1:5 No - FGF14-AS1:3 No - FGF14-AS2:1 No - FGF14-IT1:1 No - lnc-TPP2-2:1 Yes chr2R:13152885-13159141 lnc-TPP2-3:1 No - lnc-BIVM-4:1 No - lnc-CCDC168-1:1 No - lnc-BIVM-3:1 No - lnc-TEX30-1:1 Yes chr3R:22747690-22749056 lnc-ERCC5-3:1 No - lnc-ERCC5-3:2 No - lnc-TPP2-5:1 No - lnc-ERCC5-4:1 No - lnc-ERCC5-5:1 No - lnc-SLC10A2-2:1 No - lnc-ERCC5-6:1 No - lnc-SLC10A2-3:1 No - lnc-DAOA-11:2 No - lnc-DAOA-11:3 No - lnc-DAOA-11:4 No - lnc-DAOA-9:1 No - lnc-DAOA-9:2 No - lnc-DAOA-9:4 No - lnc-DAOA-1:2 No - LINC00343:2 No - LINC00343:3 No - LINC00343:4 No - LINC00343:5 No - LINC00343:6 No - LINC00343:10 No - LINC00343:11 No - LINC00343:13 No - LINC00343:14 No - LINC00343:15 No - LINC00343:17 No - LINC00343:18 No - LINC00343:23 No - LINC00460:5 No - LINC00460:6 No - lnc-DAOA-10:1 No - lnc-EFNB2-2:2 No - lnc-EFNB2-6:2 Yes chr2L:9934767-9938134 lnc-EFNB2-6:1 Yes chr2L:9934767-9938134 lnc-DAOA-14:1 No - lnc-DAOA-14:3 No - lnc-DAOA-14:7 No - lnc-FAM155A-1:1 No - FAM155A-IT1:3 No - lnc-ABHD13-3:1 No - lnc-ABHD13-2:1 No - lnc-ABHD13-1:1 No - lnc-TNFSF13B-2:1 No - lnc-MYO16-6:1 No - lnc-MYO16-5:1 No - lnc-TNFSF13B-4:1 No - lnc-IRS2-9:1 No - lnc-IRS2-8:1 No - LINC00370:3 No - LINC00399:1 No - lnc-MYO16-7:1 No - lnc-IRS2-6:1 No - lnc-IRS2-1:7 No - LINC00676:1 No - lnc-COL4A1-6:1 Yes chr2L:10242512-10247078 lnc-COL4A1-5:1 Yes chr2L:10242512-10247078 lnc-COL4A2-3:2 Yes chr2L:10242512-10247078 lnc-COL4A2-3:3 No - lnc-COL4A2-3:4 No - lnc-COL4A2-8:1 No - lnc-COL4A2-7:1 No - LINC00396:1 No - LINC00396:4 No - lnc-COL4A1-4:1 No - lnc-COL4A2-5:1 No - lnc-RAB20-6:1 Yes chr2L:5029609-5037279 lnc-RAB20-2:11 Yes chr2L:5029609-5037279 lnc-NAXD-2:1 No - lnc-RAB20-4:1 No - lnc-COL4A2-4:1 No - lnc-NAXD-4:1 Yes chr3L:19096399-19097709 lnc-CARS2-2:10 Yes chr2R:14159096-14161262 lnc-CARS2-2:5 Yes chr2R:14159096-14161262 lnc-CARS2-2:3 Yes chr2R:14159096-14161262 lnc-CARS2-2:11 Yes chr2R:14159096-14161262 lnc-CARS2-2:9 Yes chr2R:14159096-14161262 lnc-CARS2-2:8 Yes chr2R:14159096-14161262 lnc-CARS2-2:4 Yes chr2R:14159096-14161262 lnc-CARS2-2:6 Yes chr2R:14159096-14161262 lnc-CARS2-2:2 Yes chr2R:14159096-14161262 lnc-CARS2-2:7 Yes chr2R:14159096-14161262 lnc-RAB20-3:3 No - lnc-RAB20-3:4 Yes chr2R:14159096-14161262 lnc-RAB20-3:1 No - lnc-RAB20-3:2 No - lnc-CARS2-1:1 No - lnc-ING1-1:4 No - lnc-ING1-2:1 No - lnc-ING1-1:5 No - LINC00346:3 No - lnc-CARS2-4:2 No - lnc-CARS2-4:4 No - lnc-CARS2-4:1 No - lnc-CARS2-4:3 No - lnc-ARHGEF7-5:2 No - lnc-ARHGEF7-5:3 No - lnc-ANKRD10-1:2 No - lnc-ARHGEF7-7:2 No - ARHGEF7-AS2:4 No - ARHGEF7-AS2:3 Yes chr2L:20350434-20365254 ARHGEF7-IT1:2 Yes chr2L:20350434-20365254 ARHGEF7-AS1:3 Yes chr2L:20350434-20365254 ARHGEF7-AS1:2 Yes chr2L:20350434-20365254 lnc-ANKRD10-6:1 Yes chr2L:20350434-20365254 lnc-TEX29-9:1 Yes chr2L:20350434-20365254 lnc-TEX29-5:1 Yes chr2L:20350434-20365254 lnc-TEX29-3:1 Yes chr2L:20350434-20365254 lnc-ANKRD10-4:2 No - lnc-ANKRD10-9:1 No - lnc-ANKRD10-10:1 No - lnc-ANKRD10-11:1 No - lnc-TEX29-2:2 No - lnc-ANKRD10-13:2 No - lnc-ANKRD10-13:1 No - LINC00354:4 No - lnc-TUBGCP3-17:1 No - LINC00354:6 No - LINC00354:10 No - SOX1-OT:21 No - lnc-SOX1-5:1 No - SOX1-OT:22 No - SOX1-OT:24 No - lnc-TUBGCP3-6:5 No - lnc-TUBGCP3-6:4 No - LINC01070:6 No - lnc-TUBGCP3-13:1 No - lnc-SPACA7-2:2 No - lnc-TUBGCP3-12:1 No - lnc-SPACA7-3:1 No - lnc-TUBGCP3-10:1 No - lnc-SPACA7-4:1 No - lnc-ATP11A-2:1 No - lnc-TUBGCP3-1:4 No - lnc-TUBGCP3-1:5 No - ATP11A-AS1:1 Yes chrX:16405509-16414651 ATP11A-AS1:4 Yes chrX:16405509-16414651 lnc-MCF2L-1:2 Yes chrX:16405509-16414651 lnc-TUBGCP3-14:1 Yes chrX:16405509-16414651 lnc-MCF2L-8:1 Yes chrX:16405509-16414651 lnc-MCF2L-4:5 Yes chrX:16405509-16414651 lnc-TUBGCP3-15:1 Yes chrX:16405509-16414651 lnc-MCF2L-2:1 Yes chrX:16405509-16414651 MCF2L-AS1:6 Yes chr2R:5468319-5495861 MCF2L-AS1:1 Yes chr2R:5468319-5495861 lnc-F7-8:1 Yes chr2R:5468319-5495861 lnc-F7-7:1 Yes chr2R:5468319-5495861 lnc-F7-6:1 Yes chr2R:5468319-5495861 lnc-F7-2:1 No - lnc-PCID2-1:2 No - lnc-PCID2-4:1 No - lnc-GRTP1-3:2 Yes chr3L:11626441-11627715 lnc-GRTP1-3:1 Yes chr3L:11626441-11627715 lnc-GRTP1-2:2 Yes chr3L:11626441-11627715 lnc-GRTP1-2:1 No - lnc-CUL4A-1:1 No - lnc-CUL4A-2:1 No - lnc-ADPRHL1-6:1 Yes chr3R:16147029-16149636 lnc-GRTP1-4:2 No - lnc-ADPRHL1-1:1 Yes chr3L:15563427-15565559 lnc-ADPRHL1-3:1 Yes chr3L:15563427-15565559 lnc-ADPRHL1-2:1 Yes chr3L:15563427-15565559 lnc-DCUN1D2-1:1 No - lnc-TFDP1-2:1 No - lnc-TMCO3-3:1 Yes chr2R:13222433-13228202 lnc-ATP4B-1:2 Yes chr2R:13222433-13228202 lnc-GAS6-8:1 No - lnc-TMEM255B-6:2 No - lnc-GAS6-2:2 No - GAS6-AS1:4 Yes chr3L:7650548-7759123 GAS6-AS1:5 Yes chr3L:7650548-7759123 lnc-C13orf46-4:2 Yes chr3L:7650548-7759123 lnc-C13orf46-3:2 Yes chr3L:7650548-7759123 GAS6-DT:18 No - LINC00454:5 No - LINC00454:6 No - LINC00454:7 No - lnc-TMEM255B-5:21 No - lnc-TMEM255B-5:24 No - lnc-TMEM255B-5:30 No - lnc-TMEM255B-5:37 No - lnc-TMEM255B-5:38 No - LINC00565:8 No - LINC00565:9 No - lnc-TMEM255B-7:2 No - lnc-RASA3-2:1 No - lnc-UPF3A-2:1 No - lnc-UPF3A-1:1 No - lnc-UPF3A-3:1 No - lnc-OR11H12-6:1 No - lnc-OR11H12-5:1 No - lnc-OR11H12-2:1 No - lnc-POTEG-17:1 No - lnc-OR11H12-4:1 No - lnc-POTEG-16:1 No - lnc-OR11H12-3:1 No - lnc-POTEG-15:1 No - lnc-OR11H12-9:1 No - lnc-POTEM-4:10 No - lnc-POTEM-4:17 No - lnc-POTEG-11:1 No - lnc-POTEM-12:1 No - lnc-POTEG-14:19 No - lnc-POTEG-14:17 No - lnc-POTEG-14:5 No - lnc-POTEG-14:6 No - lnc-POTEG-14:14 No - lnc-OR4N2-8:1 No - lnc-OR4N2-8:2 No - lnc-OR11H2-11:1 No - lnc-OR4N2-7:1 No - lnc-OR4N2-6:1 No - lnc-OR4N2-5:1 No - lnc-OR4K14-1:1 No - lnc-OR4L1-1:1 No - lnc-OR4K17-1:1 No - lnc-OR4N5-1:1 No - lnc-OR11G2-1:1 No - lnc-TTC5-2:2 No - lnc-TTC5-2:3 No - lnc-CCNB1IP1-4:4 No - lnc-CCNB1IP1-4:1 No - lnc-CCNB1IP1-4:3 No - lnc-CCNB1IP1-4:2 No - lnc-CCNB1IP1-1:2 No - lnc-KLHL33-1:1 Yes chr2R:14858845-14860758 lnc-APEX1-2:1 No - lnc-APEX1-2:2 No - lnc-PIP4P1-2:1 Yes chr3L:16351991-16353286 lnc-PIP4P1-2:3 Yes chr3L:16351991-16353286 lnc-PIP4P1-2:2 Yes chr3L:16351991-16353286 lnc-OSGEP-1:1 Yes chr3L:9894807-9898575 lnc-OSGEP-1:2 Yes chr3L:9894807-9898575 lnc-RNASE11-1:1 No - lnc-OR6S1-2:1 No - lnc-OR6S1-3:1 No - lnc-ANG-1:2 No - lnc-OR6S1-4:1 No - lnc-EDDM3A-1:1 No - lnc-RNASE2-1:1 No - lnc-RNASE2-2:1 No - lnc-NDRG2-6:1 No - lnc-METTL17-2:1 No - lnc-RNASE13-4:2 Yes chr2R:21502097-21517241 lnc-RNASE13-4:3 Yes chr2R:21502097-21517241 lnc-RNASE13-4:1 Yes chr2R:21502097-21517241 lnc-RNASE13-3:1 Yes chr2R:21502097-21517241 lnc-RNASE13-2:1 Yes chr2R:21502097-21517241 lnc-RNASE13-1:2 Yes chr2R:21502097-21517241 lnc-ARHGEF40-2:1 Yes chr2R:21502097-21517241 lnc-NDRG2-4:1 No - lnc-NDRG2-4:2 No - lnc-NDRG2-5:1 No - lnc-ZNF219-1:1 No - lnc-TMEM253-3:1 No - lnc-HNRNPC-2:1 No - LINC00641:3 No - LINC00641:6 No - lnc-SUPT16H-3:1 Yes chr3L:7423827-7454717 lnc-SUPT16H-3:2 Yes chr3L:7423827-7454717 lnc-CHD8-3:1 Yes chr3L:1871574-1876312 lnc-SUPT16H-1:1 Yes chr2L:210735-250823 lnc-SUPT16H-2:1 Yes chr2L:210735-250823 lnc-RPGRIP1-3:1 Yes chr2L:210735-250823 lnc-TOX4-2:1 Yes chr2L:210735-250823 lnc-RAB2B-1:1 Yes chr2L:210735-250823 lnc-SALL2-2:2 Yes chr2L:210735-250823 lnc-SALL2-2:4 Yes chr2L:210735-250823 lnc-SALL2-2:3 Yes chr2L:210735-250823 lnc-CHD8-2:2 No - lnc-SALL2-1:3 Yes chr3R:24032157-24034257 lnc-SALL2-1:2 Yes chr3R:24032157-24034257 lnc-SALL2-1:1 Yes chr3R:24032157-24034257 lnc-OR10G2-2:1 No - lnc-OR4E1-4:2 No - lnc-OR4E2-1:1 No - lnc-ABHD4-12:1 No - lnc-OR4E2-2:1 No - lnc-OR4E1-5:2 No - lnc-ABHD4-12:2 No - lnc-OR4E2-3:1 No - lnc-ABHD4-12:3 No - lnc-ABHD4-12:4 No - lnc-ABHD4-12:5 No - lnc-ABHD4-12:6 No - lnc-ABHD4-12:7 No - lnc-ABHD4-12:8 No - lnc-ABHD4-12:9 No - lnc-ABHD4-12:10 No - lnc-OR4E2-5:1 No - lnc-OR4E1-6:2 No - lnc-OR4E2-6:1 No - lnc-ABHD4-12:11 No - lnc-ABHD4-12:12 No - lnc-ABHD4-12:13 No - lnc-ABHD4-12:14 No - lnc-ABHD4-12:15 No - lnc-ABHD4-12:16 No - lnc-ABHD4-12:17 No - lnc-ABHD4-12:18 No - lnc-ABHD4-12:19 No - lnc-ABHD4-12:20 No - lnc-ABHD4-12:21 No - lnc-ABHD4-12:22 No - lnc-ABHD4-12:23 No - lnc-ABHD4-12:24 No - lnc-ABHD4-12:25 No - lnc-ABHD4-12:26 No - lnc-ABHD4-12:27 No - lnc-ABHD4-12:28 No - lnc-ABHD4-12:29 No - lnc-OR4E2-7:1 No - lnc-OR4E1-8:2 No - lnc-ABHD4-12:30 No - lnc-ABHD4-12:31 No - lnc-ABHD4-12:32 No - lnc-ABHD4-10:1 No - lnc-DAD1-5:1 No - lnc-ABHD4-9:1 No - lnc-ABHD4-8:1 No - lnc-ABHD4-7:1 No - lnc-ABHD4-6:1 No - lnc-DAD1-4:1 No - lnc-DAD1-2:9 No - lnc-DAD1-2:8 No - lnc-DAD1-2:10 No - lnc-ABHD4-12:33 No - lnc-ABHD4-12:34 No - lnc-OR6J1-2:1 Yes chr2L:8383612-8384137 lnc-ABHD4-1:1 No - lnc-OXA1L-3:1 Yes chr2R:7812504-7815486 lnc-OR6J1-1:1 No - lnc-SLC7A7-3:1 No - lnc-SLC7A7-1:5 No - lnc-RBM23-4:2 Yes chr3R:31382109-31391893 lnc-RBM23-4:1 Yes chr3R:31382109-31391893 lnc-RBM23-4:4 Yes chr3R:31382109-31391893 lnc-RBM23-4:3 Yes chr3R:31382109-31391893 lnc-PRMT5-1:4 Yes chr2L:7032721-7037878 lnc-PRMT5-1:3 Yes chr2L:7032721-7037878 lnc-PRMT5-1:2 Yes chr2L:7032721-7037878 lnc-PRMT5-1:1 Yes chr2L:7032721-7037878 lnc-PRMT5-1:5 Yes chr2L:7032721-7037878 lnc-RBM23-1:1 Yes chr2R:16264652-16266959 lnc-RBM23-2:4 Yes chr2R:16264652-16266959 lnc-RBM23-2:3 Yes chr2R:16264652-16266959 lnc-RBM23-2:1 Yes chr2R:16264652-16266959 lnc-RBM23-2:2 Yes chr2R:16264652-16266959 lnc-AJUBA-2:2 No - lnc-AJUBA-2:1 No - lnc-C14orf93-2:5 No - lnc-C14orf93-2:6 No - lnc-C14orf93-2:3 No - lnc-C14orf93-2:4 No - lnc-C14orf93-2:7 No - lnc-C14orf93-1:1 Yes chr2L:17990418-17991951 lnc-C14orf93-2:1 Yes chr2L:17990418-17991951 lnc-CDH24-1:1 Yes chr2L:19045355-19048817 lnc-CDH24-2:1 Yes chr2L:19045355-19048817 lnc-CDH24-3:1 Yes chr2L:19045355-19048817 lnc-C14orf119-1:1 No - lnc-PPP1R3E-1:4 No - lnc-PPP1R3E-1:3 No - lnc-BCL2L2-2:1 No - lnc-BCL2L2-2:2 No - lnc-BCL2L2-1:1 No - lnc-SLC22A17-3:1 No - lnc-HOMEZ-1:5 No - lnc-HOMEZ-1:6 No - lnc-HOMEZ-1:4 No - lnc-EFS-1:2 No - lnc-MYH6-1:1 Yes chr2L:16766566-16788766 ZFHX2-AS1:30 No - ZFHX2-AS1:31 No - ZFHX2-AS1:40 No - lnc-JPH4-1:18 No - lnc-JPH4-1:15 No - lnc-JPH4-1:17 Yes chrX:9108691-9117744 lnc-JPH4-1:16 Yes chrX:9108691-9117744 lnc-JPH4-1:13 Yes chrX:9108691-9117744 lnc-JPH4-1:14 Yes chrX:9108691-9117744 lnc-JPH4-1:12 Yes chrX:9108691-9117744 lnc-JPH4-2:1 Yes chrX:9108691-9117744 lnc-JPH4-2:2 Yes chrX:9108691-9117744 lnc-THTPA-4:1 No - lnc-DHRS2-2:2 No - lnc-DHRS2-3:4 No - lnc-DHRS2-3:5 No - lnc-JPH4-4:11 No - lnc-DHRS2-5:1 No - lnc-DHRS2-6:1 No - lnc-JPH4-3:1 No - lnc-NRL-3:2 No - LINC00596:2 No - DHRS4-AS1:7 Yes chr3L:5140440-5141646 DHRS4-AS1:3 Yes chr3L:5140440-5141646 DHRS4-AS1:8 Yes chr3L:5140440-5141646 lnc-DHRS4L2-2:7 Yes chr3L:5140440-5141646 lnc-DHRS4L2-2:1 No - lnc-DHRS4L2-2:2 No - lnc-DHRS4L2-2:3 No - lnc-DHRS4L2-2:4 No - lnc-NRL-4:1 Yes chr2R:7676540-7698902 lnc-PSME2-1:4 No - lnc-PSME2-1:3 Yes chr2R:22881322-22882690 lnc-EMC9-1:2 Yes chrX:13212325-13214408 lnc-EMC9-1:1 Yes chrX:13212325-13214408 lnc-EMC9-2:1 Yes chrX:13212325-13214408 lnc-EMC9-3:4 Yes chrX:13212325-13214408 lnc-EMC9-3:2 Yes chrX:13212325-13214408 lnc-EMC9-3:3 Yes chrX:13212325-13214408 lnc-EMC9-3:1 Yes chrX:13212325-13214408 lnc-PSME2-2:1 No - lnc-TM9SF1-3:1 No - lnc-TM9SF1-2:1 No - lnc-TM9SF1-1:3 No - lnc-TM9SF1-1:2 No - lnc-NEDD8-MDP1-1:18 No - lnc-NEDD8-MDP1-1:17 No - lnc-NEDD8-MDP1-1:16 No - lnc-NEDD8-MDP1-1:14 No - lnc-NEDD8-MDP1-1:15 No - lnc-NEDD8-MDP1-1:10 No - lnc-NEDD8-MDP1-1:13 No - lnc-NEDD8-MDP1-1:4 No - lnc-NEDD8-MDP1-1:9 No - lnc-NEDD8-MDP1-1:5 No - lnc-NEDD8-MDP1-1:3 No - lnc-NEDD8-MDP1-1:7 No - lnc-NEDD8-MDP1-1:2 No - lnc-NEDD8-MDP1-1:8 No - lnc-NEDD8-MDP1-1:1 No - lnc-TINF2-1:5 No - lnc-TINF2-1:4 No - lnc-TINF2-1:3 No - lnc-TINF2-1:2 No - lnc-TINF2-1:1 No - lnc-RABGGTA-1:1 Yes chr3R:5128087-5129939 lnc-TGM1-1:1 Yes chr3R:5128087-5129939 lnc-TGM1-1:2 Yes chr3R:5128087-5129939 lnc-DHRS1-1:2 No - lnc-DHRS1-1:3 No - lnc-DHRS1-1:1 No - lnc-CIDEB-3:2 No - lnc-CIDEB-3:1 No - lnc-ADCY4-3:1 No - lnc-CIDEB-2:3 No - lnc-CIDEB-1:1 Yes chr3L:19939287-19977960 lnc-RIPK3-2:1 Yes chr3L:19939287-19977960 lnc-ADCY4-1:1 No - lnc-ADCY4-4:1 No - lnc-ADCY4-4:3 No - lnc-ADCY4-4:2 No - lnc-SDR39U1-1:2 No - lnc-SDR39U1-1:3 No - lnc-SDR39U1-1:4 No - lnc-SDR39U1-1:1 Yes chr2R:12691308-12692690 lnc-KHNYN-2:9 No - LINC02286:10 No - LINC02286:11 No - lnc-STXBP6-3:1 No - lnc-KHNYN-8:1 No - lnc-KHNYN-10:1 No - lnc-KHNYN-13:1 No - lnc-NOVA1-1:3 No - lnc-STXBP6-5:2 Yes chr3R:9417940-9455500 lnc-STXBP6-5:1 Yes chr3R:9417940-9455500 LINC02588:25 No - LINC02294:10 No - LINC02294:11 No - LINC02293:13 No - LINC02293:21 No - MIR4307HG:1 No - MIR4307HG:6 No - lnc-NOVA1-9:5 No - lnc-NOVA1-9:2 No - lnc-NOVA1-9:4 No - lnc-NOVA1-9:3 No - lnc-NOVA1-9:1 No - LINC00645:2 No - lnc-FOXG1-9:1 No - lnc-FOXG1-17:1 No - lnc-PRKD1-17:1 No - LINC02282:4 No - LINC01551:6 No - LINC02281:9 No - LINC02327:26 No - LINC02327:41 No - lnc-PRKD1-15:1 No - lnc-FOXG1-12:2 No - lnc-FOXG1-8:4 No - LINC02327:47 No - LINC02327:48 No - lnc-FOXG1-3:8 No - lnc-FOXG1-4:5 No - lnc-PRKD1-10:1 No - lnc-STRN3-17:1 Yes chr3R:18303279-18314407 lnc-STRN3-16:1 Yes chr3R:18303279-18314407 lnc-STRN3-15:2 Yes chr3R:18303279-18314407 lnc-STRN3-15:1 Yes chr3R:18303279-18314407 lnc-STRN3-14:1 Yes chr3R:18303279-18314407 lnc-G2E3-8:1 Yes chr3R:18303279-18314407 lnc-PRKD1-11:1 No - lnc-G2E3-7:1 No - G2E3-AS1:11 No - lnc-PRKD1-14:1 No - lnc-STRN3-12:1 Yes chr2L:2488197-2492671 lnc-SCFD1-2:1 No - lnc-COCH-3:1 No - lnc-COCH-2:1 No - lnc-STRN3-1:7 No - lnc-STRN3-1:6 No - lnc-HECTD1-1:1 Yes chr2L:8030721-8040826 lnc-AP4S1-4:1 Yes chr2L:8030721-8040826 lnc-STRN3-3:1 Yes chr2L:10281943-10292365 lnc-STRN3-4:1 Yes chr2L:10281943-10292365 lnc-STRN3-6:1 Yes chr2L:10281943-10292365 lnc-STRN3-5:1 Yes chr2L:10281943-10292365 lnc-STRN3-7:1 Yes chr2L:10281943-10292365 lnc-STRN3-8:1 Yes chr2L:10281943-10292365 lnc-STRN3-9:1 Yes chr2L:10281943-10292365 lnc-STRN3-10:1 Yes chr2L:10281943-10292365 lnc-HEATR5A-3:1 Yes chr2L:10281943-10292365 lnc-HEATR5A-2:1 Yes chr2L:10281943-10292365 lnc-HEATR5A-1:1 No - lnc-DTD2-9:1 No - lnc-DTD2-7:1 No - ARHGAP5-AS1:2 Yes chrX:17639147-17652562 lnc-GPR33-10:1 No - lnc-ARHGAP5-4:1 No - lnc-GPR33-12:1 No - lnc-NPAS3-3:1 No - lnc-AKAP6-1:1 No - lnc-EGLN3-3:1 Yes chr3L:366524-392633 lnc-EGLN3-2:1 Yes chr3L:366524-392633 lnc-EGLN3-2:2 Yes chr3L:366524-392633 lnc-EGLN3-1:9 Yes chr3R:5257037-5269507 lnc-EGLN3-1:10 Yes chr3R:5257037-5269507 lnc-EGLN3-1:2 Yes chr3R:5257037-5269507 EGLN3-AS1:2 Yes chr3R:5257037-5269507 lnc-SPTSSA-3:1 Yes chr3R:5257037-5269507 lnc-EGLN3-1:5 Yes chr3R:5257037-5269507 lnc-EGLN3-1:4 Yes chr3R:5257037-5269507 lnc-EGLN3-1:6 Yes chr3R:5257037-5269507 lnc-EGLN3-1:8 Yes chr3R:5257037-5269507 lnc-SPTSSA-2:1 Yes chr3R:5257037-5269507 lnc-EAPP-3:1 Yes chr2L:8218071-8220741 lnc-SRP54-6:1 No - lnc-BAZ1A-2:1 No - lnc-CFL2-4:1 Yes chr3R:31793981-31799799 lnc-CFL2-5:1 Yes chr3R:31793981-31799799 lnc-CFL2-1:2 Yes chr3R:31793981-31799799 lnc-CFL2-1:1 Yes chr3R:31793981-31799799 lnc-BAZ1A-4:18 Yes chr3L:5152678-5154777 lnc-BAZ1A-4:20 No - lnc-SRP54-3:1 No - lnc-BAZ1A-4:6 Yes chr3L:5152678-5154777 lnc-BAZ1A-4:3 Yes chr3L:5152678-5154777 lnc-BAZ1A-3:1 No - lnc-BAZ1A-3:2 No - lnc-PPP2R3C-1:1 No - lnc-PPP2R3C-2:1 No - lnc-PSMA6-3:1 No - lnc-PSMA6-1:1 No - lnc-PSMA6-2:1 No - lnc-PSMA6-4:1 No - lnc-RALGAPA1-4:1 Yes chr2L:16313036-16326207 lnc-NFKBIA-3:1 No - lnc-INSM2-4:1 No - lnc-INSM2-3:1 No - lnc-NFKBIA-5:8 Yes chr3R:26966930-26977878 lnc-NFKBIA-7:1 Yes chr3R:26966930-26977878 lnc-NFKBIA-7:2 Yes chr3R:26966930-26977878 lnc-NFKBIA-8:1 Yes chr3R:26966930-26977878 lnc-NFKBIA-9:1 Yes chr3R:26966930-26977878 lnc-NFKBIA-9:2 Yes chr3R:26966930-26977878 lnc-BRMS1L-6:1 Yes chr3R:26966930-26977878 lnc-NFKBIA-10:1 Yes chr3R:26966930-26977878 lnc-NFKBIA-6:1 Yes chr3R:26966930-26977878 lnc-INSM2-7:1 Yes chrX:12907986-12909622 lnc-BRMS1L-5:1 No - lnc-MBIP-5:1 No - LINC00609:2 No - LINC00609:5 No - lnc-MBIP-4:1 No - lnc-SFTA3-3:3 No - lnc-SFTA3-3:2 No - lnc-SFTA3-3:1 No - lnc-PAX9-9:1 No - lnc-PAX9-9:2 No - lnc-SFTA3-1:3 No - lnc-SFTA3-1:2 No - lnc-SFTA3-1:4 No - lnc-NKX2-8-1:1 No - lnc-NKX2-8-2:1 No - lnc-PAX9-6:1 Yes chr3R:8319025-8333792 lnc-NKX2-8-3:1 Yes chrX:750347-758719 lnc-NKX2-8-5:1 Yes chrX:750347-758719 lnc-FOXA1-3:2 Yes chrX:750347-758719 lnc-TTC6-3:1 No - lnc-FOXA1-6:1 No - lnc-TTC6-2:1 No - lnc-SLC25A21-3:1 Yes chr3R:28580976-28585264 lnc-FOXA1-4:2 No - lnc-MIPOL1-2:2 No - lnc-MIPOL1-6:1 No - lnc-SSTR1-3:2 No - lnc-SSTR1-4:1 No - lnc-TTC6-1:1 No - lnc-CLEC14A-1:3 No - lnc-SSTR1-1:2 No - lnc-CLEC14A-3:1 No - lnc-SSTR1-7:1 No - lnc-GEMIN2-9:1 No - lnc-GEMIN2-8:1 No - lnc-GEMIN2-2:3 No - lnc-SEC23A-4:1 No - lnc-SEC23A-2:1 Yes chr3R:5649065-5652629 lnc-TRAPPC6B-5:1 Yes chr3R:5649065-5652629 lnc-GEMIN2-4:1 Yes chr3R:5649065-5652629 lnc-TRAPPC6B-4:1 Yes chr3R:5649065-5652629 SEC23A-AS1:17 Yes chr3R:5649065-5652629 lnc-SEC23A-3:2 Yes chr3L:19099123-19100363 lnc-SEC23A-3:1 Yes chr3L:19099123-19100363 lnc-TRAPPC6B-3:1 Yes chr3R:15350345-15350995 lnc-TRAPPC6B-3:2 Yes chr3R:15350345-15350995 lnc-PNN-1:1 No - lnc-PNN-2:1 No - lnc-CTAGE5-1:30 No - lnc-TRAPPC6B-2:2 Yes chr2L:6649388-6654574 lnc-PNN-4:1 Yes chr2L:6649388-6654574 lnc-FBXO33-3:1 Yes chr2L:6649388-6654574 lnc-CTAGE5-8:1 No - lnc-CTAGE5-8:2 No - lnc-CTAGE5-8:17 No - lnc-CTAGE5-5:1 No - lnc-CTAGE5-8:28 No - lnc-CTAGE5-6:1 No - lnc-CTAGE5-7:1 No - lnc-LRFN5-6:1 No - LINC02315:11 No - lnc-LRFN5-5:1 No - lnc-FBXO33-5:1 No - lnc-LRFN5-4:1 No - lnc-FBXO33-6:1 No - lnc-LRFN5-3:1 No - lnc-FBXO33-7:1 No - lnc-FBXO33-2:2 No - lnc-CTAGE5-10:1 Yes chr2R:8009119-8013755 lnc-CTAGE5-10:2 Yes chr2R:8009119-8013755 lnc-CTAGE5-9:1 Yes chr2R:8009119-8013755 lnc-LRFN5-7:1 No - lnc-LRFN5-2:4 No - lnc-LRFN5-8:1 No - lnc-FSCB-10:1 No - lnc-LRFN5-9:1 No - lnc-LRFN5-10:1 No - lnc-C14orf28-8:1 No - lnc-C14orf28-3:1 No - lnc-FSCB-7:1 No - lnc-FSCB-5:1 No - lnc-FSCB-1:10 No - lnc-C14orf28-1:4 No - lnc-KLHL28-4:1 No - lnc-KLHL28-1:5 No - lnc-KLHL28-1:2 No - lnc-KLHL28-1:3 No - lnc-KLHL28-1:4 No - lnc-FKBP3-7:1 No - lnc-KLHL28-3:4 No - lnc-TOGARAM1-1:1 No - lnc-FKBP3-1:7 No - lnc-MIS18BP1-2:1 Yes chr2R:19290109-19290962 lnc-FKBP3-4:1 No - lnc-FKBP3-4:2 No - lnc-FKBP3-5:1 No - lnc-FKBP3-6:1 No - lnc-FANCM-8:1 No - lnc-FANCM-8:2 No - lnc-FANCM-8:3 No - lnc-MIS18BP1-3:1 No - LINC02303:11 No - lnc-FANCM-5:3 No - LINC02303:12 No - lnc-FANCM-5:4 No - lnc-FANCM-5:5 No - lnc-FANCM-9:1 No - lnc-FANCM-10:1 No - LINC00871:3 No - LINC00871:4 No - LINC00871:6 No - LINC00871:7 No - lnc-RPL10L-1:1 No - lnc-FANCM-11:1 No - lnc-RPL10L-2:1 No - lnc-RPL10L-3:2 No - lnc-LRR1-9:1 No - LINC00648:6 No - lnc-MDGA2-4:1 No - lnc-LRR1-8:1 No - lnc-LRR1-7:1 No - lnc-MDGA2-2:2 No - lnc-LRR1-6:1 No - lnc-MDGA2-5:1 No - lnc-LRR1-5:1 No - lnc-LRR1-4:1 No - lnc-LRR1-3:1 No - lnc-LRR1-2:1 No - lnc-RPL36AL-4:1 Yes chr3R:9778042-9779528 lnc-RPL36AL-3:3 Yes chr3R:9778042-9779528 lnc-RPL36AL-3:1 Yes chr3R:9778042-9779528 lnc-RPL36AL-3:2 Yes chr3R:9778042-9779528 lnc-RPL36AL-3:4 Yes chr3R:9778042-9779528 lnc-MGAT2-1:1 No - lnc-POLE2-2:1 Yes chr3L:5895691-5897435 lnc-POLE2-2:4 Yes chr3L:5895691-5897435 lnc-POLE2-2:6 Yes chr3L:5895691-5897435 lnc-POLE2-2:5 Yes chr3L:5895691-5897435 lnc-POLE2-2:3 Yes chr3L:5895691-5897435 lnc-POLE2-2:2 Yes chr3L:5895691-5897435 lnc-KLHDC1-1:1 Yes chr3L:5895691-5897435 lnc-POLE2-4:1 No - lnc-POLE2-3:1 Yes chr3R:25127502-25131155 lnc-POLE2-5:1 Yes chr3R:25127502-25131155 lnc-POLE2-6:1 Yes chr3R:25127502-25131155 lnc-NEMF-2:1 No - lnc-NEMF-1:4 No - lnc-ARF6-5:1 No - lnc-ARF6-3:1 Yes chr2R:15322501-15325490 lnc-ARF6-4:1 No - lnc-NEMF-5:1 No - lnc-ARF6-6:1 No - lnc-ARF6-7:1 No - lnc-ARF6-9:1 No - lnc-ARF6-8:1 No - lnc-NEMF-3:2 No - lnc-NEMF-6:1 No - LINC01588:82 No - LINC01588:91 No - LINC01588:83 No - LINC01588:88 No - LINC01588:90 No - LINC01588:71 No - LINC01588:80 No - LINC01588:81 No - LINC01588:72 No - lnc-ARF6-10:1 No - LINC01588:67 No - LINC01588:59 No - LINC01588:60 No - lnc-ARF6-11:1 No - lnc-ARF6-12:1 No - lnc-CDKL1-2:1 Yes chr2L:18971993-18974448 lnc-L2HGDH-1:2 Yes chr2L:5706374-5713791 lnc-L2HGDH-1:1 Yes chr2L:5706374-5713791 lnc-MAP4K5-3:1 Yes chr2L:5706374-5713791 lnc-MAP4K5-1:1 No - lnc-MAP4K5-1:2 No - lnc-CDKL1-3:2 No - lnc-CDKL1-3:1 No - lnc-MAP4K5-2:1 Yes chr3R:24625671-24634714 lnc-MAP4K5-4:1 Yes chr3R:23058609-23061304 lnc-NIN-4:1 Yes chr3R:23058609-23061304 lnc-NIN-3:1 Yes chr3R:23058609-23061304 lnc-NIN-2:1 No - lnc-SAV1-1:1 Yes chr2L:5271728-5278548 lnc-SAV1-2:1 Yes chr2L:5271728-5278548 lnc-PYGL-1:3 No - lnc-PYGL-2:1 Yes chr2L:10544883-10628054 lnc-PYGL-3:1 Yes chr2L:10544883-10628054 lnc-PYGL-3:2 Yes chr2L:10544883-10628054 lnc-TRIM9-4:1 No - lnc-TMX1-4:1 No - LINC00640:2 No - LINC00640:5 No - lnc-FRMD6-4:1 No - lnc-FRMD6-3:1 No - lnc-FRMD6-2:1 Yes chr2L:431227-448701 lnc-FRMD6-2:2 Yes chr2L:431227-448701 lnc-FRMD6-2:3 Yes chr2L:431227-448701 lnc-FRMD6-2:4 Yes chr2L:431227-448701 lnc-FRMD6-2:5 Yes chr2L:431227-448701 FRMD6-AS1:1 Yes chr2L:431227-448701 lnc-NID2-3:2 No - lnc-GNG2-4:1 No - lnc-RTRAF-2:1 No - lnc-RTRAF-2:2 No - lnc-RTRAF-2:3 No - lnc-RTRAF-2:4 No - lnc-NID2-5:1 Yes chr3R:17685689-17687071 lnc-PTGDR-2:1 No - lnc-PTGDR-2:2 No - lnc-TXNDC16-2:1 No - lnc-TXNDC16-3:3 Yes chr3L:4170404-4173789 lnc-TXNDC16-3:2 Yes chr3L:4170404-4173789 lnc-TXNDC16-3:1 Yes chr3L:4170404-4173789 lnc-GNPNAT1-3:1 Yes chr3L:4170404-4173789 lnc-GNPNAT1-2:1 Yes chr3L:4170404-4173789 lnc-PSMC6-1:1 No - lnc-ERO1A-1:1 Yes chr3R:29738275-29741952 lnc-FERMT2-3:1 Yes chr3R:29738275-29741952 lnc-STYX-7:1 Yes chr3R:29738275-29741952 lnc-FERMT2-2:1 Yes chr3L:17024328-17027117 lnc-FERMT2-2:2 Yes chr3L:17024328-17027117 lnc-STYX-9:1 Yes chr3L:17024328-17027117 lnc-STYX-10:1 No - lnc-DDHD1-7:1 No - lnc-STYX-11:1 No - lnc-DDHD1-2:1 No - lnc-FERMT2-4:1 No - lnc-FERMT2-5:1 No - lnc-FERMT2-6:1 No - lnc-DDHD1-1:1 No - lnc-DDHD1-3:1 No - lnc-DDHD1-4:1 No - lnc-DDHD1-5:1 No - lnc-DDHD1-6:1 No - lnc-DDHD1-8:1 No - lnc-STYX-12:1 No - lnc-BMP4-3:2 No - LINC02331:7 No - LINC02331:8 No - lnc-BMP4-4:1 No - lnc-CNIH1-3:1 Yes chr2L:2428372-2459823 lnc-CDKN3-1:2 No - lnc-BMP4-2:2 No - lnc-CNIH1-1:3 No - lnc-CNIH1-1:1 No - lnc-CNIH1-2:3 Yes chr2L:16301656-16302954 lnc-CNIH1-2:2 Yes chr2L:16301656-16302954 lnc-CNIH1-2:1 Yes chr2L:16301656-16302954 lnc-GMFB-1:1 No - lnc-CGRRF1-2:1 No - lnc-GCH1-2:3 Yes chr3L:8990317-8997989 lnc-GCH1-2:2 Yes chr3L:8990317-8997989 lnc-GCH1-2:1 Yes chr3L:8990317-8997989 lnc-CGRRF1-3:1 Yes chr3L:8990317-8997989 lnc-WDHD1-3:2 Yes chr2R:21175315-21182608 lnc-WDHD1-3:1 Yes chr2R:21175315-21182608 lnc-SOCS4-5:1 No - lnc-SOCS4-4:1 No - lnc-SOCS4-3:1 No - lnc-GCH1-1:1 Yes chr2R:13980362-13983317 lnc-MAPK1IP1L-1:1 Yes chr2L:18138675-18152417 lnc-SOCS4-1:1 No - lnc-WDHD1-1:1 No - lnc-WDHD1-4:1 Yes chr2R:13500621-13506011 lnc-DLGAP5-5:1 No - lnc-DLGAP5-4:3 No - lnc-ATG14-3:1 No - lnc-TBPL2-2:1 Yes chr3R:29116391-29118390 lnc-ATG14-2:1 Yes chr2R:21686192-21687642 lnc-KTN1-3:1 No - KTN1-AS1:6 No - KTN1-AS1:20 No - lnc-KTN1-2:1 No - lnc-KTN1-4:1 No - LINC00520:1 No - LINC00520:7 No - LINC00520:8 No - lnc-PELI2-5:2 No - lnc-TBPL2-4:1 No - lnc-PELI2-3:2 No - LINC02284:6 No - lnc-OTX2-4:1 No - lnc-PELI2-6:2 No - lnc-TMEM260-6:1 No - lnc-OTX2-7:1 No - lnc-TMEM260-7:1 No - lnc-OTX2-5:1 Yes chrX:8630159-8650681 lnc-OTX2-6:1 No - lnc-EXOC5-5:1 No - lnc-AP5M1-1:1 No - lnc-EXOC5-4:1 No - lnc-EXOC5-1:3 No - lnc-CCDC198-3:1 Yes chr3R:24134831-24137538 lnc-NAA30-4:1 No - lnc-CCDC198-2:1 No - lnc-SLC35F4-1:2 No - lnc-SLC35F4-1:1 No - lnc-CCDC198-1:1 No - lnc-SLC35F4-4:3 Yes chr3R:20740108-20756639 lnc-SLC35F4-4:1 Yes chr3R:20740108-20756639 lnc-NAA30-5:1 Yes chr3R:20740108-20756639 lnc-C14orf37-4:1 Yes chr3R:20740108-20756639 lnc-SLC35F4-4:2 Yes chr3R:20740108-20756639 lnc-ACTR10-6:1 No - lnc-C14orf37-5:1 No - lnc-ACTR10-5:1 No - lnc-SLC35F4-2:1 No - PSMA3-AS1:1 No - lnc-ACTR10-4:1 No - lnc-ACTR10-3:1 No - lnc-ACTR10-2:1 No - PSMA3-AS1:3 No - PSMA3-AS1:4 No - PSMA3-AS1:24 No - PSMA3-AS1:14 No - PSMA3-AS1:22 No - lnc-ARID4A-2:1 No - PSMA3-AS1:2 No - lnc-C14orf37-3:1 No - lnc-C14orf37-3:3 Yes chrX:13385210-13385893 lnc-C14orf37-3:2 Yes chrX:13385210-13385893 lnc-C14orf37-3:4 Yes chrX:13385210-13385893 lnc-DACT1-2:1 No - lnc-KIAA0586-1:1 No - lnc-TIMM9-4:1 No - LINC01500:2 No - LINC01500:6 No - lnc-DAAM1-10:1 No - lnc-DAAM1-2:2 No - lnc-GPR135-3:1 No - lnc-DAAM1-5:1 No - lnc-DAAM1-7:1 No - lnc-GPR135-1:1 Yes chr2R:9599909-9601252 lnc-L3HYPDH-1:6 No - lnc-L3HYPDH-1:2 No - lnc-L3HYPDH-1:1 No - lnc-L3HYPDH-1:5 No - lnc-L3HYPDH-1:4 No - lnc-L3HYPDH-1:3 No - lnc-RTN1-4:1 No - lnc-RTN1-3:1 Yes chr3R:7528864-7530241 lnc-RTN1-3:2 Yes chr3R:7528864-7530241 lnc-CCDC175-2:1 Yes chr3R:7528864-7530241 lnc-LRRC9-5:1 Yes chr3R:7528864-7530241 lnc-LRRC9-3:1 Yes chr3R:7528864-7530241 lnc-DHRS7-4:1 Yes chrX:2225296-2238045 lnc-LRRC9-4:1 Yes chrX:2225296-2238045 lnc-C14orf39-3:2 No - lnc-PPM1A-2:1 No - lnc-C14orf39-3:1 No - lnc-PCNX4-1:1 No - lnc-DHRS7-3:1 No - lnc-DHRS7-1:7 No - lnc-PCNX4-3:1 Yes chr3R:26344290-26345473 LINC02322:5 No - LINC02322:6 No - lnc-SIX1-4:1 No - lnc-SIX6-2:1 No - lnc-C14orf39-2:1 No - lnc-SIX1-2:1 Yes chr2R:7419350-7434872 lnc-MNAT1-5:1 No - lnc-SIX4-1:1 Yes chr2R:7419350-7434872 lnc-PRKCH-2:1 No - lnc-SLC38A6-2:1 Yes chr3R:29039156-29049148 lnc-TMEM30B-1:4 Yes chr3R:29039156-29049148 lnc-SLC38A6-3:1 Yes chr3R:29039156-29049148 lnc-SLC38A6-4:1 Yes chr3R:29039156-29049148 LINC01303:42 Yes chr2R:9252310-9285097 LINC01303:30 Yes chr2R:9252310-9285097 LINC01303:26 Yes chr2R:9252310-9285097 lnc-PRKCH-3:3 Yes chr2R:9252310-9285097 lnc-PRKCH-3:5 Yes chr2R:9252310-9285097 lnc-TMEM30B-6:1 Yes chr3R:30058311-30121798 HIF1A-AS2:6 Yes chr3R:30058311-30121798 lnc-TMEM30B-9:1 Yes chr3R:30058311-30121798 lnc-TMEM30B-9:2 Yes chr3R:30058311-30121798 lnc-SNAPC1-1:1 No - lnc-SYT16-67:3 No - lnc-SYT16-67:17 No - lnc-KCNH5-10:1 No - lnc-KCNH5-7:1 No - lnc-KCNH5-5:1 No - lnc-WDR89-4:3 Yes chrX:16740906-16742918 lnc-WDR89-4:1 Yes chrX:16740906-16742918 lnc-RHOJ-2:1 Yes chrX:16740906-16742918 lnc-SYNE2-4:1 Yes chr2R:9971143-9972780 lnc-SYNE2-3:1 No - lnc-WDR89-1:1 No - lnc-WDR89-2:1 No - lnc-SYNE2-3:9 No - lnc-MTHFD1-4:1 Yes chr3R:27246403-27247992 lnc-ZBTB25-5:1 No - lnc-ZBTB25-7:1 No - lnc-ESR2-3:16 No - lnc-ESR2-3:4 No - lnc-ESR2-3:2 No - lnc-ESR2-3:3 No - lnc-ZBTB25-1:3 Yes chr3R:10696534-10703316 lnc-ZBTB1-1:1 No - lnc-GPX2-4:1 Yes chrX:17657372-17669371 lnc-GPX2-3:1 No - lnc-FNTB-2:1 No - lnc-GPX2-2:1 Yes chr3R:16432998-16434740 lnc-CHURC1-1:1 No - lnc-RAB15-2:5 Yes chr3L:19262232-19264184 lnc-RAB15-2:4 Yes chr3L:19262232-19264184 lnc-RAB15-2:3 Yes chr3L:19262232-19264184 lnc-MAX-5:1 No - lnc-MAX-2:11 No - lnc-FUT8-5:1 No - lnc-MAX-7:1 No - lnc-MAX-8:1 No - lnc-FUT8-4:1 No - lnc-MAX-9:1 No - lnc-FUT8-4:2 No - lnc-MAX-10:1 No - FUT8-AS1:3 Yes chrX:11706575-11709951 lnc-FNTB-4:1 Yes chrX:11706575-11709951 lnc-FNTB-4:2 Yes chrX:11706575-11709951 lnc-MAX-12:1 Yes chrX:11706575-11709951 lnc-MAX-13:1 Yes chrX:11706575-11709951 lnc-MAX-15:1 No - lnc-FUT8-1:2 No - lnc-FUT8-3:1 No - lnc-MAX-3:2 No - lnc-CCDC196-3:1 No - lnc-CCDC196-1:1 Yes chrX:255674-258469 lnc-MPP5-1:1 No - lnc-ATP6V1D-4:1 No - lnc-FAM71D-1:1 Yes chrX:8178549-8240474 lnc-FAM71D-1:2 Yes chrX:8178549-8240474 lnc-ATP6V1D-3:1 Yes chrX:8178549-8240474 lnc-PLEK2-3:1 No - lnc-PLEK2-1:1 Yes chr2R:12257282-12258652 lnc-TMEM229B-2:1 No - lnc-TMEM229B-1:1 No - lnc-PLEK2-2:1 No - lnc-VTI1B-2:1 No - lnc-ARG2-1:6 No - lnc-ARG2-1:1 No - lnc-RDH11-2:2 Yes chr3R:18396995-18400339 lnc-RDH11-4:5 No - lnc-RDH11-4:3 No - lnc-RDH11-4:4 No - lnc-RDH11-4:2 No - lnc-VTI1B-1:1 No - lnc-RDH11-4:1 Yes chr3R:18378124-18381178 lnc-ARG2-7:1 Yes chr3R:18378124-18381178 lnc-ARG2-8:1 Yes chr3R:18378124-18381178 lnc-RDH11-5:1 Yes chr3R:11422092-11429969 lnc-RDH11-3:1 Yes chr3R:11422092-11429969 lnc-ZFYVE26-2:1 Yes chr3R:11422092-11429969 lnc-ZFYVE26-4:1 No - lnc-ZFYVE26-5:1 No - lnc-ZFP36L1-8:1 No - lnc-EXD2-5:1 No - lnc-EXD2-4:1 No - lnc-EXD2-3:1 No - lnc-ZFP36L1-2:11 No - lnc-ZFP36L1-2:2 No - lnc-EXD2-2:1 No - lnc-RAD51B-1:1 No - lnc-RAD51B-2:1 No - lnc-ACTN1-1:1 No - lnc-ZFP36L1-4:1 Yes chrX:2023822-2042311 lnc-ZFP36L1-5:1 Yes chrX:2023822-2042311 lnc-ZFP36L1-6:1 Yes chrX:2023822-2042311 lnc-RAD51B-3:1 Yes chrX:2023822-2042311 lnc-DCAF5-4:1 Yes chrX:2023822-2042311 lnc-DCAF5-3:1 Yes chr3R:31799634-31805278 lnc-DCAF5-1:4 No - lnc-GALNT16-7:1 Yes chr3R:11433488-11435703 lnc-DCAF5-2:3 No - lnc-ERH-2:1 Yes chr2L:3404460-3426719 lnc-GALNT16-1:1 Yes chr2L:3404460-3426719 lnc-GALNT16-2:1 No - lnc-GALNT16-3:1 No - lnc-GALNT16-4:1 No - lnc-CCDC177-4:1 No - lnc-CCDC177-2:1 No - lnc-PLEKHD1-2:1 No - lnc-CCDC177-1:1 No - lnc-CCDC177-3:1 No - lnc-PLEKHD1-3:1 No - lnc-SLC10A1-1:1 Yes chr3R:13661311-13666891 lnc-SRSF5-3:1 No - lnc-SLC10A1-2:1 No - lnc-SLC8A3-2:1 No - lnc-SMOC1-2:4 No - lnc-SMOC1-2:12 No - lnc-ADAM21-3:2 No - lnc-SYNJ2BP-1:3 No - lnc-SYNJ2BP-1:2 No - lnc-MED6-2:1 No - lnc-TTC9-3:1 Yes chr3R:9766031-9768984 lnc-MED6-1:3 Yes chr3R:9766031-9768984 lnc-TTC9-2:1 No - LINC01269:2 No - lnc-MED6-3:1 Yes chrX:8170229-8177185 lnc-MED6-4:1 Yes chrX:8170229-8177185 lnc-PCNX1-2:2 No - lnc-PCNX1-2:8 No - lnc-PCNX1-4:1 No - lnc-MAP3K9-4:1 No - lnc-MAP3K9-5:1 No - lnc-MAP3K9-6:1 Yes chrX:2225296-2238045 lnc-MAP3K9-7:1 Yes chrX:2225296-2238045 lnc-MAP3K9-8:1 Yes chrX:2225296-2238045 lnc-MAP3K9-9:1 Yes chrX:2225296-2238045 lnc-SIPA1L1-5:1 Yes chrX:2225296-2238045 lnc-MAP3K9-10:1 No - lnc-PCNX1-1:2 No - lnc-SIPA1L1-4:1 No - lnc-SIPA1L1-1:2 No - lnc-SIPA1L1-1:3 No - lnc-MAP3K9-3:15 No - lnc-SIPA1L1-2:1 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-SIPA1L1-2:2 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-SIPA1L1-2:3 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-SIPA1L1-2:4 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-SIPA1L1-2:5 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-SIPA1L1-2:6 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-SIPA1L1-2:7 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-SIPA1L1-2:8 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-SIPA1L1-2:9 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-SIPA1L1-2:10 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-SIPA1L1-2:11 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-SIPA1L1-2:12 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-RGS6-3:1 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-SIPA1L1-3:1 No - lnc-DCAF4-6:1 Yes chrX:16838173-16844433 lnc-DCAF4-4:1 Yes chrX:16838173-16844433 lnc-DCAF4-8:1 Yes chrX:16838173-16844433 lnc-DPF3-1:2 No - lnc-DPF3-2:1 No - lnc-ZFYVE1-8:2 Yes chr2R:5259004-5295965 lnc-ZFYVE1-8:3 Yes chr2R:5259004-5295965 lnc-ZFYVE1-8:1 Yes chr2R:5259004-5295965 lnc-ZFYVE1-7:1 Yes chr2R:5259004-5295965 lnc-ZFYVE1-6:2 Yes chr2R:5259004-5295965 lnc-ZFYVE1-6:1 Yes chr2R:5259004-5295965 lnc-ZFYVE1-6:3 Yes chr2R:5259004-5295965 lnc-DPF3-3:1 No - lnc-DCAF4-1:1 No - lnc-ZFYVE1-2:1 No - lnc-DPF3-4:1 No - lnc-ZFYVE1-4:1 No - lnc-ZFYVE1-1:2 Yes chrX:5666052-5670652 lnc-ZFYVE1-5:1 Yes chrX:5666052-5670652 lnc-RBM25-1:1 No - lnc-PAPLN-4:1 Yes chr3L:20432468-20435156 lnc-PAPLN-2:1 Yes chr3L:20432468-20435156 lnc-NUMB-1:10 No - lnc-NUMB-1:12 No - lnc-NUMB-1:8 No - lnc-NUMB-1:11 No - lnc-NUMB-1:7 No - lnc-NUMB-1:9 No - lnc-NUMB-1:6 No - lnc-HEATR4-4:1 No - lnc-HEATR4-3:1 No - lnc-HEATR4-3:2 No - lnc-NUMB-5:1 No - lnc-HEATR4-5:1 No - lnc-HEATR4-6:1 No - lnc-HEATR4-7:1 No - lnc-HEATR4-8:1 No - lnc-ACOT2-1:1 No - lnc-HEATR4-9:1 No - lnc-HEATR4-1:3 No - lnc-ACOT6-1:1 No - lnc-ACOT6-2:1 No - lnc-PNMA1-2:1 Yes chr3R:9461084-9493677 lnc-PNMA1-3:1 Yes chr3R:9461084-9493677 lnc-ELMSAN1-2:1 Yes chr3R:9461084-9493677 lnc-DNAL1-2:1 Yes chr3R:9461084-9493677 lnc-PTGR2-1:4 Yes chr3R:9461084-9493677 lnc-PTGR2-1:6 Yes chr3R:9461084-9493677 lnc-PTGR2-5:1 No - lnc-PTGR2-3:1 No - lnc-ENTPD5-5:4 No - lnc-FAM161B-3:1 No - lnc-ENTPD5-5:1 No - lnc-ENTPD5-5:2 Yes chr2L:2880704-2885850 lnc-FAM161B-4:1 Yes chr2L:2880704-2885850 lnc-ENTPD5-5:3 Yes chr2L:2880704-2885850 lnc-BBOF1-2:1 Yes chrX:5753390-5754958 lnc-VSX2-3:1 Yes chrX:5753390-5754958 lnc-VSX2-2:1 Yes chrX:5753390-5754958 lnc-ABCD4-1:3 No - lnc-SYNDIG1L-2:4 No - lnc-SYNDIG1L-2:2 No - lnc-SYNDIG1L-2:3 No - lnc-SYNDIG1L-1:4 No - lnc-SYNDIG1L-1:3 No - lnc-VSX2-1:1 No - lnc-NPC2-4:1 No - lnc-NPC2-2:1 No - lnc-ISCA2-3:1 Yes chr2L:1988290-1988940 lnc-NPC2-3:1 Yes chr2L:4477462-4614300 lnc-AREL1-1:2 Yes chr2L:2009859-2030788 lnc-FCF1-1:1 Yes chr2L:2009859-2030788 lnc-LTBP2-2:2 Yes chr2L:2009859-2030788 lnc-LTBP2-4:1 Yes chr2L:2009859-2030788 lnc-LTBP2-4:2 Yes chr2L:2009859-2030788 lnc-LTBP2-4:4 Yes chr2L:2009859-2030788 lnc-LTBP2-4:3 Yes chr2L:2009859-2030788 lnc-DLST-2:1 Yes chrX:10071858-10082492 lnc-RPS6KL1-2:1 No - lnc-DLST-1:1 Yes chr3R:11244302-11407627 lnc-DLST-1:2 Yes chr3R:11244302-11407627 lnc-PGF-1:2 Yes chr3R:18239420-18242159 lnc-PGF-1:1 Yes chr3R:18239420-18242159 lnc-RPS6KL1-1:2 No - lnc-RPS6KL1-1:1 No - lnc-MLH3-2:1 Yes chrX:2704571-2706217 lnc-ACYP1-5:1 No - lnc-ACYP1-3:1 No - lnc-ACYP1-1:1 No - lnc-ZC2HC1C-2:1 No - lnc-ACYP1-2:1 No - lnc-ACYP1-4:1 No - lnc-TMED10-1:1 No - lnc-TMED10-2:1 No - LINC01220:5 No - lnc-ERG28-2:6 No - lnc-BATF-1:1 No - lnc-TGFB3-5:1 Yes chr3R:25112867-25122920 lnc-ERG28-3:1 Yes chr2L:12693872-12694988 lnc-TGFB3-4:1 Yes chr2L:12693872-12694988 lnc-TGFB3-4:2 Yes chr2L:12693872-12694988 lnc-TTLL5-2:1 Yes chr2L:12693872-12694988 lnc-ESRRB-3:1 No - lnc-ESRRB-2:1 No - lnc-GPATCH2L-1:1 No - lnc-TGFB3-8:1 No - lnc-GPATCH2L-1:2 No - lnc-GPATCH2L-2:1 No - lnc-TGFB3-9:1 Yes chr3L:8183361-8186671 lnc-ANGEL1-7:1 No - lnc-VASH1-1:1 No - lnc-ANGEL1-6:1 No - VASH1-AS1:15 No - VASH1-AS1:16 No - lnc-LRRC74A-4:1 No - lnc-IRF2BPL-5:1 No - LINC01629:1 No - lnc-IRF2BPL-4:1 No - LINC01629:5 No - lnc-IRF2BPL-3:1 No - lnc-CIPC-4:1 No - lnc-CIPC-1:1 Yes chrX:12569169-12583193 lnc-CIPC-1:3 Yes chrX:12569169-12583193 LINC02288:16 No - LINC02289:30 No - lnc-CIPC-3:1 No - lnc-ZDHHC22-2:1 No - lnc-ZDHHC22-1:1 No - lnc-CIPC-5:1 No - lnc-NGB-3:1 No - lnc-NGB-1:1 Yes chrX:784746-788215 lnc-NGB-1:2 Yes chrX:784746-788215 lnc-NGB-2:2 Yes chrX:784746-788215 lnc-NGB-2:1 Yes chrX:784746-788215 lnc-TMED8-1:3 Yes chrX:784746-788215 lnc-TMED8-1:2 Yes chrX:784746-788215 lnc-TMED8-1:1 Yes chrX:784746-788215 lnc-POMT2-1:1 Yes chrX:19701927-19704259 lnc-SAMD15-1:1 Yes chrX:19701927-19704259 lnc-SAMD15-2:1 No - lnc-VIPAS39-1:1 No - lnc-ISM2-1:1 Yes chr2L:15499127-15505018 lnc-ISM2-2:1 Yes chr2L:15499127-15505018 lnc-ISM2-3:1 Yes chr2L:15499127-15505018 lnc-ALKBH1-2:1 No - lnc-ALKBH1-1:2 No - lnc-SLIRP-2:1 No - lnc-SNW1-6:1 Yes chrX:15858134-15859487 lnc-SNW1-5:1 Yes chrX:15858134-15859487 lnc-SLIRP-1:1 Yes chrX:15858134-15859487 lnc-ADCK1-2:1 No - lnc-ADCK1-3:1 No - lnc-SNW1-8:1 Yes chr3R:22468512-22486969 lnc-SNW1-3:2 Yes chr3R:22468512-22486969 lnc-SNW1-9:1 Yes chr3R:22468512-22486969 lnc-CEP128-4:1 No - lnc-DIO2-6:1 No - lnc-DIO2-6:2 No - lnc-TSHR-7:1 No - lnc-GTF2A1-5:1 No - lnc-CEP128-1:1 No - lnc-CEP128-1:2 No - lnc-NRXN3-4:1 Yes chr3R:17725777-17733207 lnc-CEP128-2:1 Yes chr3R:17725777-17733207 lnc-GTF2A1-3:1 No - lnc-STON2-5:1 Yes chr3R:27251112-27256463 lnc-GTF2A1-2:1 Yes chr3R:27251112-27256463 lnc-TSHR-9:10 No - lnc-TSHR-9:11 No - lnc-STON2-3:2 No - lnc-STON2-3:1 No - lnc-STON2-2:1 No - lnc-GTF2A1-4:1 Yes chrX:22980722-23004648 lnc-SEL1L-11:1 Yes chrX:22980722-23004648 lnc-STON2-4:1 Yes chr3R:23754623-23758557 LINC01467:1 No - lnc-SEL1L-12:1 No - lnc-SEL1L-3:2 No - lnc-SEL1L-13:1 No - LINC02301:14 No - LINC02301:25 No - lnc-FLRT2-11:2 No - lnc-FLRT2-10:2 No - lnc-FLRT2-9:2 No - lnc-FLRT2-8:2 No - lnc-SEL1L-9:2 No - lnc-GALC-15:1 No - LINC00911:1 No - LINC00911:7 No - lnc-GALC-8:2 No - lnc-GPR65-19:1 No - lnc-GPR65-19:2 No - lnc-GPR65-19:3 No - lnc-GPR65-19:4 No - lnc-GPR65-18:1 No - lnc-GALC-14:1 No - LINC02328:42 No - LINC02328:59 No - LINC02328:65 No - lnc-GALC-13:1 No - lnc-GALC-6:3 No - lnc-GALC-6:2 No - lnc-GALC-3:5 No - lnc-KCNK10-4:1 No - lnc-KCNK10-3:1 No - lnc-KCNK10-2:1 No - lnc-GALC-1:2 No - lnc-GALC-2:3 No - LINC01146:1 No - LINC01146:7 No - LINC01146:8 No - LINC01146:18 No - LINC01146:21 No - LINC01146:22 No - LINC01146:23 No - lnc-GPR65-3:3 No - lnc-SPATA7-4:1 Yes chr3R:24314660-24318419 lnc-PTPN21-1:1 No - lnc-PTPN21-2:1 Yes chr2L:4958411-4965430 lnc-EML5-1:1 No - lnc-TTC8-2:1 No - lnc-EML5-3:2 Yes chrX:7682338-7709385 lnc-EML5-3:1 Yes chrX:7682338-7709385 lnc-EML5-3:3 Yes chrX:7682338-7709385 lnc-EFCAB11-11:2 Yes chrX:7682338-7709385 lnc-EML5-10:1 Yes chrX:7682338-7709385 lnc-EFCAB11-9:1 Yes chrX:7682338-7709385 lnc-EFCAB11-11:1 Yes chrX:7682338-7709385 FOXN3-AS1:1 Yes chrX:7682338-7709385 lnc-TDP1-6:1 Yes chrX:7682338-7709385 lnc-TDP1-6:2 Yes chrX:7682338-7709385 lnc-TDP1-6:3 Yes chrX:7682338-7709385 lnc-TDP1-7:1 No - lnc-FOXN3-2:1 No - lnc-TDP1-8:1 No - lnc-FOXN3-2:2 No - lnc-TDP1-3:1 No - lnc-FOXN3-7:1 No - lnc-FOXN3-6:1 No - lnc-FOXN3-8:3 No - lnc-FOXN3-8:1 No - lnc-FOXN3-8:2 No - lnc-KCNK13-3:2 Yes chr2L:3159950-3162399 lnc-KCNK13-1:2 No - lnc-TDP1-1:1 No - lnc-TTC7B-9:1 No - lnc-CALM1-7:1 No - LINC00642:4 No - LINC00642:10 No - LINC00642:12 No - lnc-TTC7B-2:2 No - lnc-CALM1-8:1 Yes chr2R:6209782-6214122 lnc-NRDE2-7:1 Yes chr2R:6209782-6214122 lnc-NRDE2-6:1 Yes chr2R:6209782-6214122 lnc-NRDE2-2:1 Yes chr2R:6209782-6214122 lnc-NRDE2-3:1 Yes chr2R:6209782-6214122 lnc-NRDE2-8:2 Yes chr2R:6209782-6214122 lnc-NRDE2-8:1 Yes chr2R:6209782-6214122 lnc-RPS6KA5-3:1 Yes chr2R:6209782-6214122 lnc-DGLUCY-4:4 Yes chr2R:6209782-6214122 lnc-RPS6KA5-2:1 Yes chr2R:6209782-6214122 lnc-DGLUCY-3:1 Yes chr3L:11078752-11093193 lnc-TTC7B-8:1 Yes chr3L:11078752-11093193 lnc-CALM1-9:1 No - lnc-CCDC88C-1:1 No - lnc-GPR68-2:1 Yes chr3L:3178930-3185287 lnc-GPR68-3:1 Yes chr3L:3178930-3185287 lnc-PPP4R3A-3:1 Yes chr3L:3178930-3185287 lnc-PPP4R3A-2:1 Yes chr3L:3178930-3185287 lnc-DGLUCY-6:1 No - lnc-CCDC88C-2:1 Yes chr3R:13683921-13693905 lnc-CCDC88C-3:1 Yes chr3R:13683921-13693905 lnc-PPP4R3A-4:1 No - lnc-PPP4R3A-5:1 No - lnc-PPP4R3A-6:1 No - lnc-CPSF2-4:1 No - lnc-TC2N-3:1 No - lnc-TC2N-1:2 No - lnc-CATSPERB-2:1 No - lnc-TC2N-2:1 No - lnc-FBLN5-1:1 Yes chr4:215009-227748 lnc-TRIP11-2:1 Yes chr4:215009-227748 lnc-CPSF2-2:1 Yes chrX:15486922-15511223 lnc-ATXN3-4:1 Yes chrX:15486922-15511223 lnc-TRIP11-5:1 No - lnc-TRIP11-5:5 No - lnc-TRIP11-5:2 No - lnc-NDUFB1-1:9 No - lnc-NDUFB1-1:2 No - lnc-NDUFB1-1:3 No - lnc-NDUFB1-1:4 No - lnc-NDUFB1-1:5 No - lnc-NDUFB1-1:6 No - lnc-NDUFB1-1:7 No - lnc-NDUFB1-1:8 No - lnc-ATXN3-2:1 No - lnc-ATXN3-3:1 No - lnc-ATXN3-3:2 No - lnc-SLC24A4-1:2 Yes chr3R:29034573-29037062 lnc-SLC24A4-2:1 No - lnc-LGMN-1:2 Yes chrX:23022898-23035550 lnc-LGMN-1:1 Yes chrX:23022898-23035550 lnc-RIN3-3:1 Yes chrX:23022898-23035550 lnc-RIN3-1:1 No - lnc-ITPK1-3:1 No - lnc-ITPK1-2:2 No - lnc-ITPK1-2:1 No - lnc-CHGA-1:8 No - lnc-CHGA-1:9 No - lnc-MOAP1-3:1 No - lnc-TMEM251-3:1 No - lnc-TMEM251-2:1 No - lnc-UBR7-2:1 Yes chrX:15870183-15875607 lnc-FAM181A-1:1 No - FAM181A-AS1:7 No - FAM181A-AS1:6 No - FAM181A-AS1:5 No - lnc-DDX24-1:2 No - lnc-DDX24-1:1 No - lnc-IFI27L2-3:3 Yes chr2R:20275973-20278915 lnc-IFI27L2-3:1 Yes chr2R:20275973-20278915 lnc-IFI27L2-3:2 Yes chr2R:20275973-20278915 lnc-IFI27L2-1:5 No - lnc-IFI27L2-1:3 No - lnc-IFI27L2-1:4 No - lnc-IFI27L2-1:1 No - lnc-IFI27L2-1:2 No - lnc-SERPINA11-1:4 No - lnc-SERPINA11-1:1 No - lnc-SERPINA11-1:3 No - lnc-SERPINA11-1:2 No - lnc-SERPINA4-4:1 No - lnc-SERPINA9-1:1 No - lnc-SERPINA4-2:1 No - lnc-SERPINA12-1:2 No - lnc-SERPINA5-1:1 No - lnc-SERPINA3-2:1 No - lnc-GSC-2:1 No - lnc-GSC-1:1 No - lnc-DICER1-4:1 No - lnc-CLMN-3:1 Yes chr3R:22734007-22741091 lnc-DICER1-2:1 Yes chr3R:22734007-22741091 DICER1-AS1:1 Yes chr3R:22734007-22741091 DICER1-AS1:5 Yes chr3R:22734007-22741091 DICER1-AS1:6 Yes chr3R:22734007-22741091 DICER1-AS1:7 Yes chr3R:22734007-22741091 DICER1-AS1:8 Yes chr3R:22734007-22741091 DICER1-AS1:10 Yes chr3R:22734007-22741091 DICER1-AS1:11 Yes chr3R:22734007-22741091 DICER1-AS1:13 No - DICER1-AS1:14 No - DICER1-AS1:15 No - lnc-DICER1-5:2 No - lnc-DICER1-5:1 No - lnc-DICER1-5:3 No - lnc-GLRX5-5:2 No - LINC02292:11 No - lnc-SYNE3-1:7 No - lnc-SYNE3-3:5 No - lnc-SYNE3-3:6 No - SNHG10:1 Yes chrX:14837471-14838198 SNHG10:9 Yes chrX:14837471-14838198 SNHG10:4 Yes chrX:14837471-14838198 SNHG10:5 Yes chrX:14837471-14838198 SNHG10:11 Yes chrX:14837471-14838198 LINC02318:13 No - TCL6:2 No - lnc-TCL1B-5:1 No - TCL6:8 No - TCL6:9 No - TCL6:20 No - TCL6:21 No - lnc-TCL1B-4:1 No - lnc-SYNE3-5:2 No - lnc-SYNE3-6:2 No - lnc-C14orf132-4:1 No - lnc-ATG2B-9:2 No - lnc-C14orf132-3:1 No - lnc-BDKRB1-3:1 No - lnc-ATG2B-2:8 No - lnc-ATG2B-5:2 No - lnc-ATG2B-13:1 No - lnc-TCL1A-6:2 Yes chr3L:2774338-2780677 lnc-TCL1A-7:2 Yes chr3L:2774338-2780677 lnc-TCL1A-8:2 Yes chr3L:2774338-2780677 lnc-AK7-2:1 No - lnc-AK7-2:2 No - lnc-ATG2B-14:1 No - lnc-ATG2B-6:1 No - lnc-ATG2B-16:4 Yes chr2R:19663919-19669832 lnc-ATG2B-16:7 Yes chr2R:19663919-19669832 lnc-PAPOLA-1:6 No - lnc-PAPOLA-1:7 No - lnc-ATG2B-8:1 No - lnc-ATG2B-20:1 No - lnc-VRK1-7:1 No - lnc-ATG2B-20:2 No - lnc-ATG2B-20:4 No - lnc-VRK1-9:1 No - LINC02325:35 No - lnc-ATG2B-22:1 No - lnc-ATG2B-23:1 No - lnc-ATG2B-24:1 No - lnc-C14orf177-7:1 No - LINC01550:1 No - lnc-C14orf177-6:1 No - lnc-BCL11B-6:1 No - lnc-CCNK-5:1 No - lnc-BCL11B-4:1 No - lnc-C14orf177-5:1 No - lnc-CCNK-4:1 No - lnc-BCL11B-1:5 No - lnc-CCDC85C-3:1 Yes chrX:6958032-6968750 lnc-CCDC85C-2:1 No - lnc-HHIPL1-1:5 No - lnc-HHIPL1-1:6 No - lnc-EML1-3:1 Yes chr2R:19141632-19163705 lnc-EML1-3:2 Yes chr2R:19141632-19163705 lnc-EML1-3:3 Yes chr2R:19141632-19163705 lnc-EML1-3:4 Yes chr2R:19141632-19163705 lnc-EML1-4:1 Yes chr2R:19141632-19163705 lnc-EML1-4:2 Yes chr2R:19141632-19163705 lnc-DEGS2-6:1 No - lnc-EVL-6:11 No - lnc-EVL-1:1 No - lnc-EVL-3:1 No - lnc-DEGS2-7:1 No - lnc-DEGS2-2:9 No - lnc-DEGS2-2:8 Yes chr3L:9452803-9456281 lnc-SLC25A47-6:2 Yes chr3L:9452803-9456281 lnc-SLC25A29-1:2 Yes chr3L:9452803-9456281 lnc-SLC25A47-5:1 Yes chr3L:9452803-9456281 lnc-WARS-3:1 Yes chr2L:10322476-10324990 lnc-WARS-2:1 Yes chr2L:10322476-10324990 lnc-WARS-2:8 Yes chr2L:10322476-10324990 lnc-WARS-2:9 Yes chr2L:10322476-10324990 lnc-WARS-2:7 Yes chr2L:10322476-10324990 lnc-WARS-2:2 Yes chr2L:10322476-10324990 lnc-WARS-2:3 Yes chr2L:10322476-10324990 lnc-WARS-2:6 Yes chr2L:10322476-10324990 lnc-WARS-1:1 Yes chr2L:10322476-10324990 lnc-WARS-2:5 Yes chr2L:10322476-10324990 lnc-WARS-2:4 Yes chr2L:10322476-10324990 lnc-SLC25A29-2:1 No - lnc-SLC25A29-5:2 Yes chr3R:9265027-9266904 lnc-WDR25-3:1 Yes chr3R:9265027-9266904 lnc-SLC25A29-5:1 Yes chr3R:9265027-9266904 lnc-SLC25A47-8:1 No - lnc-SLC25A47-9:1 No - lnc-WDR25-4:1 Yes chr3L:3472447-3510895 lnc-WARS-4:1 Yes chr3L:3472447-3510895 lnc-WDR25-2:3 Yes chr3L:3472447-3510895 lnc-DLK1-2:2 No - lnc-DLK1-35:3 No - lnc-DLK1-35:4 No - lnc-DLK1-35:5 No - lnc-DLK1-35:6 No - lnc-DLK1-35:7 No - lnc-DLK1-35:8 No - lnc-DLK1-35:9 No - lnc-DLK1-35:10 No - lnc-DLK1-35:11 No - lnc-DLK1-35:12 No - lnc-DLK1-35:13 No - lnc-DLK1-35:14 No - lnc-DLK1-35:15 No - lnc-DLK1-35:16 No - lnc-DLK1-35:30 No - lnc-RTL1-13:1 No - lnc-DLK1-35:31 No - lnc-DLK1-35:63 No - lnc-DLK1-35:64 No - lnc-DLK1-35:65 No - lnc-DLK1-35:83 No - lnc-DLK1-35:84 No - lnc-DLK1-35:87 No - lnc-RTL1-11:1 No - lnc-DLK1-35:100 No - lnc-DLK1-35:101 No - lnc-DLK1-35:108 No - lnc-DLK1-35:109 No - lnc-RTL1-9:1 No - lnc-RTL1-10:1 No - lnc-RTL1-12:1 No - lnc-DLK1-35:134 No - lnc-DLK1-35:137 No - lnc-RTL1-14:1 No - lnc-RTL1-15:1 No - lnc-RTL1-16:1 No - lnc-RTL1-3:16 No - MEG9:2 No - lnc-DLK1-17:1 No - lnc-RTL1-17:1 No - lnc-RTL1-18:1 No - lnc-RTL1-5:4 No - lnc-RTL1-8:2 No - DIO3OS:7 No - DIO3OS:21 No - lnc-DIO3-5:1 No - DIO3OS:15 No - DIO3OS:17 No - lnc-PPP2R5C-2:1 No - lnc-DYNC1H1-7:1 Yes chr3R:18167757-18180049 lnc-HSP90AA1-13:1 Yes chr3R:18167757-18180049 lnc-DYNC1H1-3:1 Yes chr3R:18167757-18180049 lnc-DYNC1H1-1:1 No - lnc-HSP90AA1-3:3 No - lnc-HSP90AA1-12:1 Yes chr3L:4807368-4825687 lnc-HSP90AA1-11:1 No - lnc-MOK-7:1 Yes chr3L:3192969-3197059 lnc-MOK-6:1 Yes chr3L:3192969-3197059 lnc-HSP90AA1-5:3 No - lnc-HSP90AA1-5:2 No - lnc-MOK-1:9 No - lnc-HSP90AA1-14:1 No - lnc-HSP90AA1-14:4 No - lnc-HSP90AA1-14:2 No - lnc-HSP90AA1-14:3 No - lnc-CINP-2:4 No - lnc-CINP-2:1 No - lnc-CINP-2:3 No - lnc-CINP-2:2 No - lnc-CINP-2:5 No - lnc-MOK-3:1 No - lnc-MOK-4:1 No - LINC02323:11 No - LINC02323:17 No - lnc-ANKRD9-3:1 No - lnc-ANKRD9-4:1 No - lnc-RCOR1-2:1 No - lnc-ANKRD9-5:1 Yes chrX:19521929-19530896 lnc-TRAF3-2:1 No - lnc-LBHD2-4:1 No - LINC00677:2 No - LINC00677:1 No - lnc-EXOC3L4-3:1 Yes chr2R:18625249-18627718 lnc-TNFAIP2-2:1 No - lnc-TNFAIP2-2:2 No - lnc-TNFAIP2-2:3 No - lnc-TNFAIP2-3:1 No - lnc-TNFAIP2-5:1 No - lnc-TNFAIP2-5:2 No - lnc-TNFAIP2-5:3 No - lnc-TNFAIP2-6:1 No - LINC00605:2 No - LINC00605:6 No - lnc-EIF5-4:1 No - lnc-EIF5-1:2 No - lnc-EIF5-2:1 Yes chrX:15987008-15991974 lnc-CKB-4:1 No - lnc-CKB-3:1 No - lnc-TRMT61A-1:1 No - lnc-XRCC3-1:3 Yes chr3L:12746616-12750056 lnc-ZFYVE21-1:3 Yes chr3L:12746616-12750056 lnc-XRCC3-3:1 Yes chr3L:12746616-12750056 lnc-ZFYVE21-2:1 Yes chr3L:12746616-12750056 lnc-XRCC3-2:1 Yes chr3L:12746616-12750056 lnc-ZFYVE21-3:1 Yes chr3L:12746616-12750056 lnc-PPP1R13B-2:2 No - lnc-PPP1R13B-2:3 No - lnc-PPP1R13B-2:1 No - lnc-KLC1-1:3 No - lnc-XRCC3-4:1 Yes chr2R:21217856-21251150 lnc-XRCC3-5:1 Yes chr2R:21217856-21251150 lnc-XRCC3-6:1 Yes chr2R:21217856-21251150 lnc-XRCC3-6:4 Yes chr2R:21217856-21251150 lnc-XRCC3-6:2 Yes chr2R:21217856-21251150 lnc-XRCC3-6:3 Yes chr2R:21217856-21251150 lnc-XRCC3-7:1 Yes chr2R:21217856-21251150 lnc-ZFYVE21-4:1 Yes chr2R:21217856-21251150 lnc-ZFYVE21-4:2 Yes chr2R:21217856-21251150 lnc-PPP1R13B-1:3 No - lnc-PPP1R13B-1:2 No - lnc-TDRD9-4:1 No - lnc-TDRD9-2:1 No - lnc-TDRD9-1:1 No - lnc-RD3L-2:6 No - lnc-RD3L-2:5 No - lnc-RD3L-2:4 No - lnc-ASPG-4:1 Yes chr3R:15837419-15844415 lnc-KIF26A-1:2 Yes chr3R:9801280-9803461 lnc-KIF26A-1:3 Yes chr3R:9801280-9803461 lnc-KIF26A-5:13 No - lnc-TMEM179-3:3 No - lnc-TMEM179-3:4 No - lnc-TMEM179-2:10 No - lnc-C14orf180-4:1 No - lnc-AKT1-5:2 Yes chr3R:23985213-23986569 lnc-C14orf180-1:1 Yes chr3R:23985213-23986569 lnc-C14orf180-1:2 Yes chr3R:23985213-23986569 lnc-C14orf180-2:2 Yes chr3R:23985213-23986569 LINC02280:15 No - lnc-SIVA1-1:4 No - lnc-AHNAK2-9:1 Yes chr3R:16099228-16105670 lnc-AHNAK2-8:1 Yes chr3R:16099228-16105670 lnc-AHNAK2-7:1 Yes chr3R:16099228-16105670 LINC00638:1 No - lnc-AKT1-3:1 No - lnc-AKT1-1:12 No - lnc-AKT1-1:7 No - lnc-AKT1-1:6 No - lnc-AKT1-1:5 No - lnc-AKT1-1:4 No - lnc-AKT1-1:3 No - lnc-CEP170B-3:1 No - lnc-AKT1-1:9 No - lnc-AKT1-1:8 No - lnc-AKT1-1:11 No - lnc-AKT1-1:10 No - lnc-AKT1-1:2 No - lnc-AKT1-1:13 No - lnc-AHNAK2-6:1 No - lnc-AHNAK2-5:1 No - lnc-CLBA1-3:1 No - lnc-CLBA1-4:1 No - LINC02298:14 No - lnc-NUDT14-1:1 Yes chr3R:27172090-27194267 lnc-NUDT14-2:1 Yes chr3R:17374833-17391337 lnc-BTBD6-3:1 Yes chr3R:17374833-17391337 lnc-BTBD6-2:1 Yes chr3R:17374833-17391337 lnc-TEX22-3:1 Yes chr3R:23997538-24031827 lnc-TEX22-1:1 Yes chr3R:23997538-24031827 lnc-BRF1-1:5 No - lnc-BRF1-1:4 No - lnc-BRF1-1:3 No - lnc-TEDC1-1:2 No - lnc-BRF1-42:1 No - lnc-BRF1-42:2 No - lnc-BRF1-42:3 No - lnc-BRF1-42:4 No - lnc-BRF1-42:5 No - lnc-BRF1-42:6 No - lnc-TMEM121-1:1 No - lnc-BRF1-10:1 No - lnc-BRF1-10:2 No - lnc-BRF1-10:3 No - lnc-BRF1-7:2 No - lnc-BRF1-7:1 No - lnc-BRF1-6:2 No - lnc-BRF1-6:1 No - lnc-BRF1-8:1 No - lnc-BRF1-11:1 No - lnc-BRF1-12:1 No - lnc-TMEM121-2:15 No - lnc-TMEM121-2:16 No - lnc-TMEM121-2:17 No - lnc-TMEM121-2:18 No - lnc-TMEM121-2:19 No - lnc-TMEM121-2:20 No - lnc-TMEM121-2:21 No - lnc-TMEM121-2:22 No - lnc-TMEM121-2:23 No - lnc-BRF1-31:8 No - lnc-BRF1-23:1 No - lnc-BRF1-31:1 No - lnc-BRF1-31:14 No - lnc-BRF1-31:16 No - lnc-TMEM121-2:24 No - lnc-BRF1-31:9 No - lnc-BRF1-31:4 No - lnc-BRF1-31:5 No - lnc-BRF1-31:11 No - lnc-BRF1-31:2 No - lnc-BRF1-31:15 No - lnc-BRF1-31:10 No - FAM30A:11 No - FAM30A:12 No - lnc-BRF1-13:1 No - lnc-TMEM121-2:25 No - lnc-TMEM121-2:26 No - lnc-BRF1-15:1 No - lnc-BRF1-16:1 No - lnc-BRF1-17:1 No - lnc-BRF1-18:1 No - lnc-BRF1-19:1 No - lnc-BRF1-20:1 No - lnc-BRF1-21:1 No - lnc-BRF1-22:1 No - lnc-BRF1-42:7 No - lnc-TMEM121-5:1 No - lnc-BRF1-24:1 No - lnc-BRF1-25:1 No - lnc-BRF1-31:12 No - lnc-BRF1-26:1 No - lnc-BRF1-27:1 No - lnc-BRF1-28:1 No - lnc-BRF1-29:1 No - lnc-BRF1-30:1 No - lnc-BRF1-32:1 No - lnc-BRF1-33:1 No - lnc-BRF1-34:1 No - lnc-BRF1-35:1 No - lnc-BRF1-36:1 No - lnc-BRF1-37:1 No - lnc-BRF1-31:6 No - lnc-BRF1-38:1 No - lnc-BRF1-39:1 No - lnc-BRF1-40:1 No - lnc-BRF1-41:1 No - lnc-TMEM121-6:1 No - lnc-BRF1-43:1 No - lnc-BRF1-44:1 No - lnc-BRF1-45:1 No - lnc-BRF1-47:1 No - lnc-BRF1-48:1 No - lnc-BRF1-49:1 No - lnc-BRF1-23:2 No - lnc-BRF1-23:3 No - lnc-BRF1-50:1 No - lnc-BRF1-51:1 No - lnc-BRF1-52:1 No - lnc-BRF1-53:1 No - lnc-BRF1-55:1 No - lnc-BRF1-56:1 No - lnc-BRF1-57:1 No - lnc-BRF1-59:1 No - lnc-BRF1-61:1 No - lnc-BRF1-62:1 No - lnc-BRF1-63:1 No - lnc-BRF1-31:3 No - lnc-BRF1-64:1 No - lnc-BRF1-65:1 No - lnc-BRF1-66:1 No - lnc-BRF1-67:1 No - lnc-BRF1-68:1 No - lnc-BRF1-69:1 No - lnc-BRF1-70:1 No - lnc-BRF1-71:1 No - lnc-BRF1-72:1 No - lnc-BRF1-73:1 No - lnc-BRF1-74:1 No - lnc-BRF1-75:1 No - lnc-BRF1-76:1 No - lnc-BRF1-77:1 No - lnc-BRF1-78:1 No - lnc-LINC02203-23:1 No - lnc-GOLGA6L6-9:1 No - lnc-GOLGA6L6-8:1 No - lnc-GOLGA6L6-7:1 No - lnc-LINC02203-22:1 No - lnc-LINC02203-22:2 No - lnc-LINC02203-22:3 No - lnc-LINC02203-22:4 No - lnc-LINC02203-22:5 No - lnc-LINC02203-22:6 No - lnc-LINC02203-22:7 No - lnc-LINC02203-21:1 No - lnc-GOLGA6L6-14:1 No - lnc-GOLGA6L6-12:1 No - lnc-GOLGA6L6-11:1 No - lnc-GOLGA6L6-10:1 No - lnc-GOLGA6L6-6:4 No - lnc-GOLGA6L6-6:2 No - lnc-GOLGA6L6-6:3 No - lnc-LINC02203-20:1 No - lnc-GOLGA6L6-2:1 No - lnc-LINC02203-18:1 No - lnc-GOLGA6L6-4:1 No - lnc-GOLGA6L6-5:1 No - lnc-POTEB2-2:3 No - lnc-LINC02203-17:1 No - lnc-POTEB2-2:5 No - lnc-POTEB2-2:2 No - lnc-LINC02203-16:1 No - lnc-POTEB2-6:1 No - lnc-LINC02203-15:1 No - lnc-POTEB2-5:1 No - lnc-POTEB2-7:1 No - LINC01193:1 No - LINC01193:3 No - lnc-POTEB2-8:1 No - lnc-LINC02203-13:1 No - lnc-POTEB2-9:1 No - lnc-POTEB3-13:8 No - lnc-POTEB3-13:6 No - lnc-POTEB3-13:7 No - lnc-LINC02203-12:1 No - lnc-POTEB3-2:1 No - lnc-POTEB3-2:3 No - lnc-POTEB3-1:6 No - lnc-POTEB3-1:7 No - lnc-POTEB3-11:1 No - lnc-LINC02203-11:1 No - lnc-LINC02203-10:1 No - lnc-POTEB3-10:1 No - lnc-OR4N4-1:17 No - lnc-OR4M2-9:1 No - lnc-OR4N4-1:20 No - lnc-POTEB-15:3 No - lnc-POTEB-15:2 No - lnc-POTEB-15:1 No - lnc-POTEB-4:2 No - lnc-POTEB-4:4 No - lnc-POTEB-4:3 No - lnc-POTEB-5:5 No - lnc-POTEB-5:6 No - lnc-OR4N4-3:1 No - lnc-OR4N4-3:2 No - lnc-GOLGA6L1-2:1 No - lnc-CYFIP1-8:1 No - lnc-GOLGA8S-3:1 No - lnc-CYFIP1-2:1 Yes chr3L:11993274-11998138 lnc-CYFIP1-1:1 Yes chr3L:11993274-11998138 lnc-TUBGCP5-2:1 Yes chr3R:15333266-15338365 lnc-NIPA1-3:4 Yes chr2L:12704725-12706683 lnc-NIPA1-3:3 Yes chr2L:12704725-12706683 lnc-NIPA1-3:1 Yes chr2L:12704725-12706683 lnc-NIPA1-3:2 Yes chr2L:12704725-12706683 lnc-NIPA1-2:11 Yes chr2L:12704725-12706683 lnc-CYFIP1-3:1 Yes chr2L:12704725-12706683 lnc-CYFIP1-3:2 Yes chr2L:12704725-12706683 lnc-CYFIP1-3:3 Yes chr2L:12704725-12706683 lnc-NIPA1-2:13 No - lnc-NIPA1-2:12 No - lnc-NIPA1-2:4 No - lnc-NIPA1-2:10 No - lnc-CYFIP1-4:1 No - lnc-NIPA1-4:2 No - lnc-NIPA1-4:1 No - lnc-NIPA1-5:1 No - lnc-NIPA1-1:13 No - lnc-NIPA1-1:4 No - lnc-NIPA1-1:7 No - lnc-NIPA1-1:6 No - lnc-NIPA1-1:14 No - lnc-NIPA1-1:3 No - lnc-NIPA1-1:12 No - lnc-NIPA1-1:9 No - lnc-NIPA1-1:10 No - lnc-NIPA1-1:8 No - lnc-CYFIP1-6:1 No - lnc-GOLGA6L22-5:1 No - lnc-GOLGA6L22-5:2 No - lnc-GOLGA6L22-4:1 No - lnc-GOLGA6L22-3:3 No - lnc-GOLGA6L22-3:1 No - lnc-GOLGA6L22-3:2 No - lnc-GOLGA8S-4:1 No - lnc-GOLGA6L22-1:1 No - lnc-GOLGA6L22-2:1 No - lnc-GOLGA6L2-3:1 No - lnc-MKRN3-6:1 No - lnc-GOLGA8S-1:1 No - lnc-GOLGA6L2-1:1 No - lnc-MAGEL2-2:1 Yes chr3L:18721893-18723272 lnc-GOLGA8S-5:1 Yes chr3L:18721893-18723272 lnc-MKRN3-7:2 No - lnc-MKRN3-7:3 No - lnc-MKRN3-4:2 No - PWRN2:3 No - PWRN2:4 No - lnc-NPAP1-10:1 No - lnc-NPAP1-7:2 No - PWRN1:17 No - lnc-UBE3A-8:1 Yes chr2L:10425483-10426627 lnc-SNRPN-8:87 No - lnc-SNRPN-8:89 No - lnc-SNRPN-8:91 No - lnc-SNRPN-8:93 No - lnc-SNRPN-1:12 No - lnc-SNRPN-1:13 No - lnc-SNRPN-1:15 No - lnc-SNRPN-1:16 No - lnc-SNRPN-8:94 No - lnc-SNRPN-8:95 No - lnc-SNRPN-8:96 No - lnc-SNRPN-8:97 No - lnc-SNRPN-8:98 No - lnc-SNRPN-8:99 No - lnc-SNRPN-8:109 No - lnc-SNRPN-8:110 No - lnc-SNRPN-8:111 No - lnc-SNRPN-8:115 No - lnc-SNRPN-8:116 No - lnc-SNRPN-8:117 No - lnc-SNRPN-8:118 No - lnc-SNRPN-8:119 No - lnc-UBE3A-6:1 No - lnc-SNRPN-8:122 No - lnc-SNRPN-8:123 No - lnc-SNRPN-8:125 No - lnc-SNRPN-8:126 No - lnc-SNRPN-8:127 No - lnc-SNRPN-8:130 No - lnc-SNRPN-8:132 No - lnc-SNRPN-8:133 No - lnc-SNRPN-8:134 No - lnc-SNRPN-8:135 No - lnc-SNRPN-8:136 No - lnc-SNRPN-8:138 No - lnc-SNRPN-8:139 No - lnc-SNRPN-8:140 No - lnc-SNRPN-8:142 No - lnc-SNRPN-8:145 No - lnc-SNRPN-10:2 No - lnc-SNRPN-11:3 No - lnc-UBE3A-4:1 No - lnc-SNRPN-8:149 No - lnc-SNRPN-8:152 No - lnc-SNRPN-8:153 No - lnc-SNRPN-8:155 No - lnc-SNRPN-8:156 No - lnc-SNRPN-8:157 No - lnc-SNRPN-8:159 No - lnc-SNRPN-8:162 No - lnc-SNRPN-8:164 No - lnc-SNRPN-8:165 No - lnc-SNRPN-8:167 No - lnc-SNRPN-12:2 No - SNHG14:8 Yes chr3L:11206422-11210583 SNHG14:9 Yes chr3L:11206422-11210583 lnc-SNRPN-161:1 Yes chr3L:11206422-11210583 lnc-ATP10A-3:4 Yes chr3L:11206422-11210583 lnc-ATP10A-3:5 Yes chr3L:11206422-11210583 lnc-SNRPN-13:2 Yes chr3L:11206422-11210583 LINC02250:5 No - lnc-ATP10A-5:1 No - lnc-UBE3A-5:1 No - lnc-UBE3A-7:1 No - lnc-SNRPN-5:3 No - lnc-ATP10A-6:1 No - lnc-ATP10A-2:4 No - LINC00929:3 No - LINC00929:4 No - LINC00929:10 No - lnc-ATP10A-2:3 No - lnc-GABRB3-4:1 No - LINC02248:12 No - lnc-GABRB3-1:2 No - lnc-ATP10A-7:2 Yes chrX:15925105-15928529 lnc-ATP10A-4:2 Yes chrX:15925105-15928529 lnc-ATP10A-8:1 Yes chrX:15925105-15928529 lnc-OCA2-9:1 Yes chrX:15925105-15928529 lnc-GABRG3-3:1 No - GABRG3-AS1:3 Yes chrX:15921955-15924558 GABRG3-AS1:4 Yes chrX:15921955-15924558 GABRG3-AS1:6 Yes chrX:15921955-15924558 GABRG3-AS1:5 Yes chrX:15921955-15924558 lnc-GABRA5-5:1 Yes chrX:15921955-15924558 lnc-GABRA5-7:1 Yes chrX:15921955-15924558 lnc-GABRA5-8:1 Yes chrX:15921955-15924558 lnc-OCA2-6:1 No - lnc-OCA2-5:1 No - lnc-HERC2-2:1 Yes chr2L:4908581-4932384 lnc-OCA2-4:1 Yes chrX:20394395-20412247 lnc-OCA2-7:1 Yes chrX:20394395-20412247 lnc-OCA2-8:1 Yes chrX:20394395-20412247 lnc-GOLGA8F-4:1 Yes chrX:20394395-20412247 lnc-HERC2-1:1 No - lnc-APBA2-8:1 No - lnc-GOLGA8F-2:1 No - lnc-GOLGA8G-2:1 No - lnc-GOLGA8M-6:1 No - lnc-GOLGA8G-1:1 No - lnc-GOLGA8G-1:5 No - lnc-GOLGA8G-1:4 No - lnc-GOLGA8F-5:1 No - lnc-GOLGA8F-6:1 No - lnc-GOLGA8F-6:2 No - lnc-GOLGA8F-7:1 No - lnc-GOLGA8F-6:3 No - lnc-GOLGA8F-9:1 No - lnc-APBA2-10:1 No - lnc-APBA2-7:3 No - lnc-APBA2-7:4 No - lnc-APBA2-2:2 No - lnc-GOLGA6L7-3:1 No - lnc-GOLGA8M-1:2 No - lnc-APBA2-1:4 No - lnc-APBA2-1:5 No - lnc-APBA2-1:7 No - lnc-APBA2-1:8 No - lnc-APBA2-1:9 No - lnc-APBA2-6:1 No - lnc-APBA2-6:2 No - lnc-APBA2-9:1 No - lnc-GOLGA6L7-2:1 No - lnc-APBA2-5:4 No - lnc-APBA2-5:5 No - lnc-APBA2-5:6 No - lnc-APBA2-5:7 No - lnc-APBA2-5:9 No - lnc-APBA2-5:10 No - lnc-APBA2-5:11 No - lnc-APBA2-5:12 No - lnc-GOLGA8M-3:1 No - lnc-GOLGA6L7-4:1 No - lnc-GOLGA6L7-5:1 No - lnc-APBA2-3:1 No - lnc-NSMCE3-2:1 No - lnc-TJP1-4:1 No - lnc-TJP1-3:1 No - lnc-FAM189A1-5:1 No - lnc-GOLGA8J-4:1 No - lnc-FAM189A1-6:1 No - lnc-FAM189A1-7:1 No - lnc-FAM189A1-8:1 No - lnc-GOLGA8T-4:1 No - lnc-GOLGA8T-3:1 No - lnc-GOLGA8T-3:2 No - lnc-GOLGA8J-2:4 No - lnc-TJP1-5:1 No - LINC02249:6 No - lnc-CHRFAM7A-2:1 Yes chr2L:9793317-9886250 lnc-GOLGA8R-2:2 Yes chr2L:9793317-9886250 lnc-GOLGA8R-2:3 Yes chr2L:9793317-9886250 lnc-GOLGA8R-2:4 Yes chr2L:9793317-9886250 lnc-GOLGA8R-2:1 Yes chr2L:9793317-9886250 lnc-CHRFAM7A-3:1 No - lnc-CHRFAM7A-4:1 No - lnc-GOLGA8Q-4:3 No - lnc-GOLGA8Q-4:4 No - lnc-GOLGA8Q-4:5 No - lnc-GOLGA8Q-3:1 No - lnc-GOLGA8H-5:1 No - lnc-GOLGA8H-2:2 No - lnc-GOLGA8H-2:3 No - lnc-GOLGA8H-2:4 No - lnc-GOLGA8H-2:6 No - lnc-GOLGA8R-3:1 No - lnc-GOLGA8Q-2:1 No - lnc-GOLGA8H-1:1 No - lnc-GOLGA8H-3:1 No - lnc-GOLGA8H-119:1 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-GOLGA8H-119:2 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-GOLGA8H-4:1 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-GOLGA8H-119:3 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-GOLGA8H-119:4 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-GOLGA8H-119:7 No - lnc-GOLGA8H-119:8 No - lnc-FAN1-11:1 No - lnc-FAN1-10:1 No - lnc-FAN1-9:1 No - lnc-FAN1-8:1 No - lnc-FAN1-5:1 No - lnc-FAN1-4:1 No - lnc-FAN1-3:1 No - lnc-FAN1-3:2 No - lnc-GOLGA8H-8:1 No - lnc-TRPM1-2:1 Yes chrX:14832647-14836262 lnc-FAN1-1:3 Yes chr2R:15262808-15309368 LINC02352:10 No - lnc-FAN1-12:1 Yes chr2L:476446-479688 lnc-KLF13-2:4 Yes chr2L:476446-479688 lnc-KLF13-2:5 Yes chr2L:476446-479688 lnc-KLF13-2:10 Yes chr2L:476446-479688 lnc-KLF13-2:12 Yes chr2L:476446-479688 lnc-TRPM1-4:1 No - lnc-KLF13-3:1 No - lnc-KLF13-3:2 No - lnc-TRPM1-3:1 No - lnc-GOLGA8K-2:1 No - lnc-GOLGA8O-2:1 No - lnc-GOLGA8K-1:4 No - lnc-GOLGA8K-1:2 No - lnc-GOLGA8K-1:5 No - lnc-GOLGA8K-1:3 No - lnc-GOLGA8K-3:1 No - lnc-GOLGA8O-3:5 No - lnc-GOLGA8N-7:1 No - lnc-GOLGA8O-3:4 No - lnc-GOLGA8O-3:1 No - lnc-GOLGA8N-1:3 No - lnc-ARHGAP11A-5:1 No - lnc-GOLGA8O-4:1 No - lnc-ARHGAP11A-2:1 No - lnc-ARHGAP11A-7:1 No - lnc-FMN1-8:1 No - lnc-FMN1-7:1 No - lnc-GOLGA8O-6:1 Yes chr2L:3872646-3902860 lnc-GOLGA8O-7:1 Yes chr2L:3872646-3902860 lnc-GOLGA8O-8:1 Yes chr2L:3872646-3902860 lnc-GOLGA8O-9:1 Yes chr2L:3872646-3902860 lnc-GOLGA8O-10:1 Yes chr2L:3872646-3902860 lnc-FMN1-2:9 No - lnc-FMN1-2:6 No - lnc-FMN1-2:8 No - lnc-FMN1-2:7 No - lnc-AVEN-3:1 No - lnc-AVEN-2:2 No - lnc-AVEN-1:2 No - lnc-EMC7-4:1 No - lnc-EMC7-3:1 No - lnc-PGBD4-1:1 No - lnc-EMC7-1:1 No - lnc-AVEN-4:1 Yes chr2R:16016042-16017154 lnc-KATNBL1-2:1 Yes chr2R:16016042-16017154 lnc-EMC7-2:1 No - lnc-KATNBL1-1:1 No - lnc-KATNBL1-1:2 No - lnc-KATNBL1-1:5 No - lnc-KATNBL1-1:4 No - lnc-KATNBL1-1:6 No - lnc-KATNBL1-1:3 No - lnc-GOLGA8A-3:1 Yes chrX:9571537-9579987 lnc-GOLGA8A-2:2 Yes chrX:9571537-9579987 lnc-GOLGA8A-2:3 Yes chrX:9571537-9579987 lnc-GOLGA8A-2:1 Yes chrX:9571537-9579987 lnc-NUTM1-3:1 No - lnc-GOLGA8A-1:5 No - lnc-GOLGA8A-6:1 No - lnc-GOLGA8A-6:2 No - lnc-GOLGA8A-6:3 No - lnc-GOLGA8A-5:1 No - lnc-NUTM1-12:1 No - lnc-NUTM1-1:2 No - lnc-NUTM1-8:1 No - lnc-NUTM1-9:1 No - lnc-ACTC1-1:1 Yes chr3R:11882790-11892382 lnc-NUTM1-10:1 Yes chr3R:11882790-11892382 lnc-ZNF770-2:1 Yes chr3R:11882790-11892382 lnc-NUTM1-11:7 No - lnc-ZNF770-1:1 No - lnc-NANOGP8-3:8 No - lnc-NUTM1-14:1 No - lnc-NUTM1-14:2 No - lnc-NUTM1-15:1 No - lnc-DPH6-3:1 Yes chrX:11808506-11816551 lnc-NUTM1-16:1 No - lnc-NANOGP8-4:2 Yes chrX:11808506-11816551 lnc-NUTM1-17:1 Yes chrX:11808506-11816551 DPH6-DT:18 No - DPH6-DT:23 No - lnc-C15orf41-20:1 No - DPH6-DT:24 No - lnc-C15orf41-7:3 No - lnc-C15orf41-6:3 No - lnc-MEIS2-6:2 No - lnc-MEIS2-11:1 No - lnc-C15orf41-2:2 No - lnc-C15orf41-2:4 No - lnc-C15orf41-9:1 No - lnc-MEIS2-2:5 Yes chr3L:15832464-15833947 lnc-MEIS2-2:6 Yes chr3L:15832464-15833947 lnc-MEIS2-2:3 Yes chr3L:15832464-15833947 lnc-MEIS2-2:8 Yes chr3L:15832464-15833947 lnc-MEIS2-2:7 No - lnc-C15orf41-10:1 No - lnc-DPH6-7:3 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-DPH6-7:7 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-DPH6-7:8 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-DPH6-7:2 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-DPH6-7:5 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-DPH6-7:6 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-DPH6-7:4 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-DPH6-7:1 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-RASGRP1-12:1 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-RASGRP1-10:1 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-C15orf41-19:1 No - lnc-C15orf41-13:1 No - lnc-C15orf41-16:1 No - lnc-RASGRP1-3:3 No - lnc-FAM98B-4:1 Yes chr2R:14759646-14769423 lnc-FAM98B-1:2 No - lnc-FAM98B-6:1 No - lnc-FSIP1-4:8 No - lnc-FSIP1-4:7 No - lnc-FSIP1-4:6 No - lnc-THBS1-2:2 No - lnc-THBS1-1:8 No - lnc-THBS1-1:9 No - lnc-GPR176-2:1 No - lnc-EIF2AK4-4:2 No - lnc-GPR176-1:1 Yes chr3R:31395660-31402013 lnc-BMF-3:4 Yes chr3R:20580115-20580764 lnc-BMF-3:3 Yes chr3R:20580115-20580764 lnc-BMF-3:2 Yes chr3R:20580115-20580764 SRP14-AS1:1 No - SRP14-AS1:5 No - SRP14-AS1:7 No - SRP14-AS1:8 No - SRP14-AS1:9 No - SRP14-AS1:10 No - SRP14-AS1:16 No - SRP14-AS1:17 No - SRP14-AS1:19 No - SRP14-AS1:20 No - SRP14-AS1:22 No - SRP14-AS1:23 No - lnc-SRP14-1:1 No - lnc-BMF-2:1 No - lnc-PAK6-1:3 Yes chrX:16610685-16614856 lnc-BUB1B-2:1 No - lnc-BUB1B-3:1 No - lnc-PLCB2-1:2 Yes chr2L:305935-355566 lnc-PLCB2-1:1 Yes chr2L:305935-355566 lnc-CCDC9B-3:3 No - lnc-CCDC9B-3:2 No - lnc-CCDC9B-3:1 No - lnc-KNSTRN-1:1 Yes chr3R:5849697-5856311 lnc-KNSTRN-2:1 Yes chr3R:5849697-5856311 lnc-IVD-1:1 No - lnc-RMDN3-6:1 No - lnc-RMDN3-5:1 No - lnc-RMDN3-5:2 No - lnc-CCDC32-4:1 No - lnc-RAD51-2:1 No - RAD51-AS1:1 Yes chr3R:30054696-30056037 lnc-DNAJC17-2:1 No - lnc-DNAJC17-2:2 No - lnc-GCHFR-1:1 No - lnc-RMDN3-3:1 Yes chr3R:11230617-11231879 lnc-PPP1R14D-1:16 No - lnc-PPP1R14D-1:18 Yes chr3R:11230617-11231879 lnc-PPP1R14D-1:17 Yes chr3R:11230617-11231879 lnc-SPINT1-1:1 No - lnc-VPS18-3:1 No - lnc-VPS18-2:1 No - lnc-INO80-2:1 No - lnc-INO80-1:1 No - lnc-RHOV-2:3 Yes chr3R:19368995-19403153 lnc-RHOV-2:2 Yes chr3R:19368995-19403153 lnc-CHP1-8:1 Yes chr3R:19368995-19403153 lnc-CHP1-6:2 No - lnc-CHP1-6:3 No - lnc-CHP1-6:4 No - lnc-INO80-3:1 Yes chr2R:23734904-23746829 lnc-OIP5-2:1 Yes chr2R:23734904-23746829 OIP5-AS1:1 No - OIP5-AS1:3 No - OIP5-AS1:25 No - lnc-LTK-1:1 Yes chrX:13303633-13329303 lnc-LTK-2:1 Yes chr3L:12393804-12399322 lnc-LTK-3:1 Yes chr3L:12393804-12399322 lnc-LTK-4:1 Yes chr3L:12393804-12399322 lnc-RPAP1-2:1 No - lnc-SPTBN5-5:1 No - lnc-JMJD7-7:1 Yes chr2L:1884622-1944289 lnc-EHD4-1:1 Yes chr3L:3336860-3368133 lnc-JMJD7-PLA2G4B-2:7 No - lnc-JMJD7-PLA2G4B-2:8 No - lnc-SPTBN5-4:1 No - lnc-JMJD7-PLA2G4B-11:5 No - lnc-PLA2G4E-1:1 No - lnc-PLA2G4F-2:1 Yes chr3R:18271189-18274446 lnc-PLA2G4F-3:2 Yes chr3R:18271189-18274446 lnc-PLA2G4F-3:1 Yes chr3R:18271189-18274446 lnc-TMEM87A-1:1 Yes chr3R:18271189-18274446 lnc-VPS39-1:1 No - lnc-LRRC57-4:2 No - lnc-LRRC57-4:1 No - lnc-HAUS2-1:1 Yes chr3L:24074180-24299205 lnc-ZNF106-1:1 No - lnc-LRRC57-3:1 No - lnc-TTBK2-1:1 Yes chr3L:1789631-1795328 lnc-TTBK2-1:2 Yes chr3L:1789631-1795328 lnc-CDAN1-1:1 Yes chr4:469409-488994 lnc-UBR1-1:1 Yes chr4:469409-488994 lnc-TMEM62-1:1 No - lnc-TTBK2-4:2 Yes chrX:16956232-16968679 lnc-EPB42-1:7 No - lnc-EPB42-3:1 Yes chr2L:8011405-8026898 lnc-TUBGCP4-2:1 Yes chr3R:9065183-9066303 lnc-LCMT2-1:1 No - lnc-TP53BP1-4:1 No - lnc-TP53BP1-3:1 Yes chr2L:10483295-10485857 lnc-ZSCAN29-1:1 No - lnc-ZSCAN29-2:1 No - lnc-PPIP5K1-3:1 No - lnc-TP53BP1-2:1 No - lnc-STRC-3:1 Yes chrX:22487180-22508129 lnc-STRC-2:1 Yes chrX:22487180-22508129 lnc-PPIP5K1-1:2 No - lnc-PPIP5K1-1:5 No - lnc-PPIP5K1-1:4 No - lnc-PPIP5K1-1:3 No - lnc-STRC-5:1 No - lnc-STRC-4:1 No - lnc-STRC-4:2 No - lnc-CATSPER2-1:5 No - lnc-CATSPER2-2:1 No - lnc-ELL3-1:3 No - lnc-ELL3-1:4 No - lnc-ELL3-1:2 Yes chr2R:11887568-11890979 lnc-ELL3-1:6 No - lnc-ELL3-1:5 No - lnc-SERINC4-2:6 No - lnc-SERINC4-2:5 No - lnc-SERINC4-2:4 No - lnc-MFAP1-1:1 No - lnc-MFAP1-3:1 Yes chr2L:10344442-10347706 lnc-FRMD5-3:1 No - lnc-CTDSPL2-3:1 No - lnc-CASC4-1:1 No - EIF3J-DT:24 Yes chr2R:9968929-9970897 EIF3J-DT:25 No - EIF3J-DT:44 No - EIF3J-DT:31 No - lnc-PATL2-6:1 Yes chr2R:22847832-22853827 lnc-PATL2-5:2 Yes chr2R:22847832-22853827 lnc-PATL2-5:1 Yes chr2R:22847832-22853827 lnc-PATL2-3:1 Yes chr2R:22847832-22853827 lnc-SPG11-5:2 No - lnc-SPG11-5:1 No - lnc-PATL2-1:1 No - lnc-TRIM69-3:1 No - lnc-TRIM69-2:8 No - lnc-B2M-1:2 No - lnc-B2M-1:3 No - lnc-B2M-1:4 No - lnc-B2M-1:5 No - lnc-PATL2-2:1 No - lnc-PATL2-8:6 No - lnc-PATL2-7:1 No - lnc-PATL2-7:2 No - lnc-TERB2-2:1 No - lnc-DUOX2-5:1 No - lnc-TERB2-1:1 No - lnc-DUOX2-4:1 No - lnc-DUOXA1-4:1 Yes chr2L:2815970-2830248 lnc-DUOXA1-3:1 Yes chr2L:2815970-2830248 lnc-DUOX2-3:1 Yes chr2L:14975747-14997559 lnc-DUOX2-3:2 Yes chr2L:14975747-14997559 lnc-SLC28A2-2:1 No - lnc-GATM-4:1 No - lnc-GATM-3:1 No - lnc-GATM-2:1 No - lnc-SPATA5L1-3:1 No - lnc-GATM-1:6 No - lnc-SPATA5L1-2:1 No - lnc-GATM-1:2 No - lnc-GATM-5:1 No - lnc-GATM-6:1 No - lnc-BLOC1S6-3:1 No - lnc-BLOC1S6-3:2 No - lnc-BLOC1S6-1:2 No - lnc-BLOC1S6-2:1 No - lnc-SQOR-2:1 No - lnc-SLC30A4-3:1 No - lnc-SQOR-3:1 No - lnc-SLC30A4-7:1 No - lnc-SEMA6D-3:1 No - lnc-SLC24A5-9:1 Yes chr2R:17672839-17683499 lnc-MYEF2-5:2 Yes chr2R:17672839-17683499 lnc-SLC24A5-8:1 Yes chr2R:17672839-17683499 LINC01491:8 No - LINC01491:10 No - lnc-MYEF2-6:1 No - lnc-FBN1-5:3 No - lnc-FBN1-5:2 No - lnc-FBN1-5:4 No - lnc-FBN1-5:1 Yes chr3R:9505853-9510324 lnc-FBN1-4:1 Yes chr3R:9505853-9510324 lnc-MYEF2-1:4 No - lnc-MYEF2-7:1 Yes chr2L:4477462-4614300 lnc-FBN1-2:2 No - lnc-SHC4-1:1 No - lnc-SHC4-1:2 No - lnc-CEP152-2:1 Yes chr3L:9427010-9428671 lnc-SHC4-2:1 Yes chr3L:8304157-8305325 lnc-SHC4-3:1 Yes chr3L:8304157-8305325 lnc-SHC4-3:2 Yes chr3L:8304157-8305325 lnc-COPS2-6:1 Yes chr3L:8304157-8305325 lnc-COPS2-5:1 Yes chr3L:8304157-8305325 lnc-COPS2-1:1 No - lnc-SECISBP2L-2:1 Yes chr2L:8993818-8997379 lnc-SECISBP2L-3:1 Yes chr2L:8993818-8997379 lnc-COPS2-3:1 Yes chr3L:8982212-8986091 lnc-COPS2-4:1 Yes chr3L:8982212-8986091 lnc-COPS2-7:1 No - lnc-COPS2-8:1 No - lnc-ATP8B4-1:4 No - lnc-ATP8B4-1:2 No - lnc-ATP8B4-1:1 No - lnc-ATP8B4-1:3 No - lnc-DTWD1-1:2 Yes chr3R:29489468-29491383 lnc-DTWD1-3:1 No - lnc-DTWD1-7:1 No - lnc-DTWD1-7:2 No - lnc-DTWD1-7:3 No - lnc-DTWD1-7:4 No - lnc-FAM227B-1:1 No - lnc-HDC-3:1 No - lnc-GABPB1-2:1 Yes chr2R:10237988-10246077 lnc-HDC-1:1 Yes chr3L:324985-327992 GABPB1-IT1:9 Yes chr3L:324985-327992 GABPB1-IT1:8 Yes chr3L:324985-327992 GABPB1-IT1:7 Yes chr3L:324985-327992 GABPB1-AS1:1 Yes chr3L:324985-327992 GABPB1-AS1:12 No - GABPB1-AS1:13 No - lnc-SLC27A2-2:1 Yes chr3R:21134262-21138214 lnc-USP50-3:1 No - lnc-USP50-4:2 Yes chr2R:15262808-15309368 lnc-USP50-4:1 Yes chr2R:15262808-15309368 lnc-USP50-6:1 Yes chr2R:15262808-15309368 lnc-USP8-4:1 No - lnc-TRPM7-2:2 No - lnc-TRPM7-2:3 No - lnc-TRPM7-2:1 No - lnc-TRPM7-3:1 No - lnc-AP4E1-5:1 No - lnc-AP4E1-4:1 No - lnc-AP4E1-3:1 No - lnc-SPPL2A-1:3 No - lnc-USP8-7:1 No - lnc-GLDN-5:1 No - lnc-GLDN-5:2 No - lnc-TNFAIP8L3-1:1 No - lnc-DMXL2-5:1 No - lnc-DMXL2-4:1 No - lnc-DMXL2-3:1 No - lnc-GLDN-1:2 No - lnc-DMXL2-2:1 No - lnc-CYP19A1-2:1 Yes chrX:6240745-6255487 lnc-CYP19A1-3:2 Yes chrX:6240745-6255487 lnc-CYP19A1-3:1 Yes chrX:6240745-6255487 lnc-LYSMD2-3:2 Yes chrX:6240745-6255487 lnc-LYSMD2-3:1 Yes chrX:6240745-6255487 lnc-LYSMD2-1:2 No - lnc-TMOD3-2:1 Yes chr3R:30532607-30578905 lnc-MAPK6-3:10 Yes chr3R:30532607-30578905 lnc-MAPK6-3:11 Yes chr3R:30532607-30578905 lnc-LEO1-5:1 Yes chr3R:30532607-30578905 lnc-MAPK6-3:12 Yes chr3R:30532607-30578905 lnc-MAPK6-3:13 No - lnc-MAPK6-12:1 No - lnc-BCL2L10-6:1 No - lnc-MAPK6-12:3 No - lnc-MAPK6-12:4 No - lnc-MAPK6-12:5 No - lnc-MAPK6-12:6 No - lnc-MAPK6-12:7 No - lnc-MAPK6-12:8 No - lnc-MAPK6-13:1 No - lnc-MAPK6-14:1 No - lnc-BCL2L10-3:1 No - lnc-BCL2L10-4:1 Yes chrX:8150731-8152275 lnc-BCL2L10-5:1 Yes chrX:8150731-8152275 lnc-MAPK6-8:2 Yes chr2R:7500147-7508625 lnc-MAPK6-8:3 Yes chr2R:7500147-7508625 lnc-MYO5C-1:1 Yes chr2R:7500147-7508625 lnc-MYO5C-2:4 Yes chr2R:7500147-7508625 lnc-MYO5C-2:3 Yes chr2R:7500147-7508625 lnc-MYO5C-2:2 Yes chr2R:7500147-7508625 lnc-MYO5C-2:1 Yes chr2R:7500147-7508625 lnc-MYO5A-1:1 Yes chr3L:14029579-14031706 lnc-ARPP19-2:3 Yes chr2R:11619479-11640941 lnc-ARPP19-2:4 Yes chr2R:11619479-11640941 lnc-ONECUT1-5:1 Yes chr2R:11619479-11640941 lnc-MAPK6-17:1 Yes chr2R:11619479-11640941 lnc-MAPK6-10:4 Yes chr2R:11619479-11640941 lnc-FAM214A-2:1 No - lnc-FAM214A-1:1 No - lnc-ONECUT1-1:7 No - lnc-UNC13C-8:1 No - lnc-UNC13C-7:1 No - lnc-ONECUT1-3:1 No - lnc-UNC13C-6:1 No - lnc-UNC13C-2:3 No - lnc-UNC13C-5:1 No - lnc-UNC13C-4:1 No - lnc-WDR72-2:4 Yes chrX:1908920-1916825 lnc-WDR72-2:3 Yes chrX:1908920-1916825 lnc-ONECUT1-6:1 Yes chrX:1908920-1916825 lnc-WDR72-3:1 No - lnc-WDR72-5:1 Yes chr4:867824-912331 lnc-RSL24D1-4:1 Yes chr4:867824-912331 lnc-PIGB-1:4 No - lnc-RAB27A-3:1 Yes chr3R:11430740-11431582 lnc-RAB27A-3:3 Yes chr3R:11430740-11431582 lnc-RAB27A-3:2 Yes chr3R:11430740-11431582 lnc-PIGBOS1-6:1 Yes chrX:1473884-1476974 lnc-PIGBOS1-6:2 Yes chrX:1473884-1476974 lnc-PIGBOS1-1:5 No - lnc-PIGBOS1-3:2 No - lnc-PIGBOS1-3:1 No - lnc-PYGO1-1:1 Yes chr3R:31575835-31580699 lnc-PYGO1-2:1 No - lnc-PYGO1-3:1 No - lnc-NEDD4-2:1 No - lnc-PRTG-2:2 Yes chr3L:17530081-17546660 lnc-PRTG-2:1 Yes chr3L:17530081-17546660 lnc-RFX7-3:1 Yes chr3L:17530081-17546660 lnc-NEDD4-1:1 No - lnc-TEX9-2:1 No - lnc-TCF12-6:1 Yes chr2R:24578247-24579827 lnc-MNS1-4:1 No - lnc-ZNF280D-2:1 No - lnc-MNS1-5:1 Yes chr2R:15206527-15213634 lnc-MNS1-5:2 Yes chr2R:15206527-15213634 lnc-MNS1-6:1 No - lnc-MNS1-8:1 No - lnc-MNS1-9:1 No - lnc-ZNF280D-10:1 Yes chr2R:15206527-15213634 lnc-TCF12-3:1 Yes chr2R:15206527-15213634 LINC00926:10 No - LINC00926:15 No - lnc-ZNF280D-5:1 No - LINC01413:2 No - lnc-ZNF280D-4:1 No - lnc-TCF12-2:5 No - lnc-CGNL1-3:1 No - lnc-GCOM1-2:1 No - lnc-ADAM10-10:1 No - lnc-ALDH1A2-9:13 No - lnc-ALDH1A2-9:12 No - lnc-ALDH1A2-9:7 No - lnc-ALDH1A2-9:5 No - lnc-ALDH1A2-9:6 No - lnc-ALDH1A2-9:1 No - lnc-ALDH1A2-9:8 No - lnc-LIPC-6:1 No - lnc-LIPC-5:1 No - lnc-LIPC-4:1 No - lnc-LIPC-3:1 No - lnc-LIPC-2:1 No - lnc-AQP9-2:1 No - lnc-AQP9-3:1 No - lnc-ALDH1A2-9:10 No - lnc-ALDH1A2-9:2 No - lnc-ALDH1A2-9:9 No - lnc-ALDH1A2-9:3 No - lnc-ALDH1A2-9:4 No - lnc-ADAM10-2:2 No - lnc-ALDH1A2-5:4 Yes chr2L:13550139-13639411 lnc-ALDH1A2-5:3 Yes chr2L:13550139-13639411 lnc-ALDH1A2-5:2 Yes chr2L:13550139-13639411 lnc-ALDH1A2-5:1 Yes chr2L:13550139-13639411 lnc-SLTM-7:2 Yes chr2L:13550139-13639411 lnc-SLTM-7:4 Yes chr2L:13550139-13639411 lnc-MINDY2-5:1 Yes chr2L:13550139-13639411 lnc-SLTM-7:1 Yes chr2L:13550139-13639411 lnc-SLTM-7:3 Yes chr2L:13550139-13639411 lnc-MINDY2-4:1 Yes chr2L:13550139-13639411 lnc-SLTM-5:1 Yes chr2L:13550139-13639411 lnc-ADAM10-3:1 No - lnc-ADAM10-4:1 No - lnc-ADAM10-1:3 No - lnc-RNF111-3:1 No - lnc-SLTM-1:2 No - lnc-RNF111-2:1 No - lnc-MINDY2-3:1 Yes chr3R:11744229-11750029 lnc-ADAM10-5:2 Yes chr3R:11744229-11750029 lnc-ADAM10-5:1 Yes chr3R:11744229-11750029 lnc-ADAM10-6:1 Yes chr3R:11744229-11750029 lnc-ADAM10-7:1 Yes chr3R:11744229-11750029 lnc-ADAM10-8:1 Yes chr3R:11744229-11750029 lnc-SLTM-4:1 Yes chr3R:11744229-11750029 lnc-MYO1E-2:1 Yes chr3R:11744229-11750029 lnc-SLTM-8:1 No - lnc-SLTM-9:1 No - lnc-GTF2A2-6:1 No - lnc-LDHAL6B-3:1 No - lnc-MYO1E-1:1 No - lnc-GCNT3-3:1 No - lnc-GCNT3-3:2 No - lnc-GCNT3-3:3 No - lnc-GCNT3-3:4 No - lnc-GTF2A2-5:1 No - lnc-FAM81A-1:1 No - lnc-GTF2A2-4:1 No - lnc-GCNT3-2:1 No - lnc-GCNT3-2:2 No - lnc-GCNT3-2:3 No - lnc-GCNT3-2:4 No - lnc-GCNT3-2:5 No - lnc-GTF2A2-1:3 No - lnc-GTF2A2-1:5 Yes chr3R:23890388-23891060 lnc-GTF2A2-1:2 Yes chr3R:23890388-23891060 lnc-GTF2A2-1:4 Yes chr3R:23890388-23891060 lnc-GTF2A2-3:2 Yes chr3L:4037523-4040482 lnc-GTF2A2-3:3 Yes chr3L:4037523-4040482 lnc-GTF2A2-3:1 Yes chr3L:4037523-4040482 lnc-FOXB1-6:1 Yes chr3R:25095012-25096099 lnc-FOXB1-6:2 Yes chr3R:25095012-25096099 lnc-ANXA2-3:1 Yes chr3R:25095012-25096099 lnc-ICE2-3:2 Yes chrX:20171445-20173514 lnc-ICE2-1:6 Yes chrX:20171445-20173514 lnc-ICE2-1:7 Yes chrX:20171445-20173514 lnc-FOXB1-8:1 Yes chrX:20171445-20173514 lnc-ICE2-1:8 Yes chrX:20171445-20173514 lnc-ICE2-1:5 Yes chrX:20171445-20173514 lnc-FOXB1-9:1 No - lnc-ANXA2-2:1 No - lnc-ANXA2-2:2 No - lnc-RORA-5:2 No - lnc-RORA-5:1 No - lnc-RORA-4:1 No - lnc-RORA-3:2 No - lnc-RORA-3:1 No - RORA-AS1:1 Yes chr2R:10203995-10237348 lnc-RORA-2:1 Yes chr2R:10203995-10237348 RORA-AS1:12 Yes chr2R:10203995-10237348 lnc-ICE2-4:2 Yes chr2R:10203995-10237348 lnc-ICE2-2:2 Yes chr2R:10203995-10237348 lnc-ICE2-7:4 Yes chr2R:10203995-10237348 lnc-ICE2-7:3 Yes chr2R:10203995-10237348 RORA-AS2:5 Yes chr2R:10203995-10237348 lnc-ICE2-5:2 Yes chr2R:10203995-10237348 lnc-ICE2-6:6 Yes chr2R:10203995-10237348 lnc-ICE2-7:2 Yes chr2R:10203995-10237348 lnc-ICE2-7:5 Yes chr2R:10203995-10237348 lnc-C2CD4A-8:2 Yes chr2R:10203995-10237348 lnc-C2CD4A-8:3 Yes chr2R:10203995-10237348 lnc-C2CD4A-6:3 No - lnc-C2CD4A-14:1 No - lnc-VPS13C-2:1 No - lnc-C2CD4A-12:1 No - lnc-C2CD4A-2:2 No - lnc-C2CD4B-10:1 No - lnc-C2CD4A-10:1 No - lnc-C2CD4B-9:1 No - lnc-VPS13C-3:1 No - lnc-C2CD4A-11:1 No - lnc-C2CD4B-5:3 No - lnc-C2CD4B-5:1 No - lnc-C2CD4B-5:2 No - lnc-C2CD4B-5:4 No - lnc-C2CD4B-6:1 No - lnc-C2CD4B-6:4 No - lnc-C2CD4B-6:3 No - lnc-C2CD4B-6:2 No - lnc-C2CD4B-7:1 No - lnc-C2CD4B-8:1 No - lnc-C2CD4A-13:1 Yes chr3L:8545001-8574409 lnc-C2CD4A-15:1 Yes chr3L:8545001-8574409 lnc-TPM1-2:1 Yes chr3L:8545001-8574409 lnc-TLN2-4:1 Yes chr3L:8545001-8574409 lnc-TPM1-1:1 No - lnc-RPS27L-3:2 No - lnc-RPS27L-3:1 Yes chr3R:25245955-25247514 lnc-RAB8B-2:1 Yes chr2L:2766233-2767281 lnc-RPS27L-6:1 No - lnc-RPS27L-7:1 No - lnc-USP3-3:1 No - lnc-USP3-2:1 No - lnc-HERC1-5:1 No - USP3-AS1:2 No - USP3-AS1:4 No - USP3-AS1:3 No - USP3-AS1:14 No - USP3-AS1:12 No - lnc-CA12-2:1 Yes chr3R:21887029-21907182 lnc-DAPK2-5:1 Yes chr3R:21887029-21907182 lnc-DAPK2-4:1 Yes chr3R:21887029-21907182 lnc-HERC1-2:1 No - lnc-HERC1-3:1 No - lnc-HERC1-4:1 No - lnc-FAM96A-1:1 No - lnc-DAPK2-2:2 Yes chr2R:20670636-20673495 lnc-CSNK1G1-1:1 No - lnc-PCLAF-2:1 Yes chrX:20427411-20429673 lnc-PCLAF-3:1 Yes chrX:20427411-20429673 lnc-PCLAF-4:1 No - lnc-PCLAF-5:1 Yes chr2R:18278198-18357296 lnc-PCLAF-6:1 Yes chr2R:18278198-18357296 lnc-OAZ2-4:1 Yes chr2R:18278198-18357296 lnc-RBPMS2-3:1 No - lnc-RBPMS2-1:3 No - lnc-RBPMS2-1:4 No - lnc-ZNF609-5:1 No - lnc-RBPMS2-2:2 Yes chr2L:3467342-3470004 lnc-RBPMS2-2:3 Yes chr2L:3467342-3470004 lnc-RBPMS2-2:1 Yes chr2L:3467342-3470004 lnc-PLEKHO2-1:1 No - lnc-SPG21-2:1 No - lnc-MTFMT-2:1 No - lnc-MTFMT-2:2 No - lnc-MTFMT-1:1 No - lnc-RASL12-1:1 Yes chr3R:31253659-31254900 lnc-SLC51B-1:1 Yes chr3R:31253659-31254900 lnc-UBAP1L-1:3 No - lnc-UBAP1L-1:2 No - lnc-KBTBD13-1:1 No - lnc-UBAP1L-2:1 No - lnc-PDCD7-3:1 Yes chr3R:19897372-19903689 lnc-PARP16-2:1 No - lnc-KBTBD13-3:1 No - lnc-PARP16-3:1 No - lnc-PARP16-4:1 No - lnc-PARP16-5:1 No - lnc-IGDCC4-1:1 No - lnc-IGDCC3-1:2 No - lnc-IGDCC3-1:1 No - lnc-DPP8-1:1 No - lnc-IGDCC4-2:2 Yes chr3R:24871202-24876654 lnc-IGDCC4-2:1 Yes chr3R:24871202-24876654 lnc-HACD3-2:1 Yes chr3R:24871202-24876654 lnc-DPP8-2:1 Yes chr2L:1164443-1166425 lnc-DENND4A-7:1 Yes chr2L:1164443-1166425 lnc-HACD3-1:1 Yes chr2L:9711512-9746495 lnc-INTS14-2:1 Yes chrX:8592031-8602036 lnc-INTS14-3:1 Yes chrX:8592031-8602036 lnc-INTS14-4:1 Yes chrX:8592031-8602036 lnc-SLC24A1-1:2 Yes chr3R:21111408-21116146 lnc-DENND4A-1:1 Yes chr3R:21111408-21116146 lnc-RAB11A-2:1 Yes chr3R:21111408-21116146 lnc-DENND4A-2:1 Yes chr3L:1715595-1731107 lnc-DENND4A-2:2 Yes chr3L:1715595-1731107 lnc-DENND4A-3:1 Yes chr3L:1715595-1731107 lnc-DENND4A-4:3 Yes chr3L:1715595-1731107 lnc-DENND4A-4:2 Yes chr3L:1715595-1731107 lnc-DENND4A-4:1 Yes chr3L:1715595-1731107 lnc-DENND4A-5:1 Yes chr3L:1715595-1731107 lnc-DENND4A-5:2 Yes chr3L:1715595-1731107 lnc-DENND4A-6:1 Yes chr3L:1715595-1731107 lnc-SNAPC5-6:1 Yes chr2L:18689528-18690906 lnc-TIPIN-3:1 Yes chrX:9247342-9250037 lnc-SNAPC5-1:3 Yes chrX:9247342-9250037 lnc-SNAPC5-3:5 Yes chr3R:27922821-27924888 lnc-SNAPC5-3:4 Yes chr3R:27922821-27924888 lnc-SNAPC5-3:3 Yes chr3R:27922821-27924888 lnc-SNAPC5-3:2 Yes chr3R:27922821-27924888 lnc-SNAPC5-3:1 Yes chr3R:27922821-27924888 lnc-SNAPC5-4:2 Yes chr3R:27922821-27924888 lnc-SNAPC5-4:3 Yes chr3R:27922821-27924888 lnc-SNAPC5-4:1 Yes chr3R:27922821-27924888 lnc-SNAPC5-5:1 No - lnc-RPL4-1:2 Yes chr3L:16733546-16739364 lnc-RPL4-1:3 Yes chr3L:16733546-16739364 lnc-SMAD6-2:1 No - lnc-SMAD6-2:2 No - lnc-SMAD6-2:3 No - LINC02206:10 No - lnc-AAGAB-1:28 No - lnc-AAGAB-1:33 No - lnc-AAGAB-1:30 No - lnc-AAGAB-1:32 No - lnc-AAGAB-1:38 No - lnc-AAGAB-1:29 No - lnc-AAGAB-1:34 No - lnc-AAGAB-1:35 No - lnc-SMAD3-3:1 No - lnc-AAGAB-4:2 No - lnc-IQCH-7:1 Yes chrX:8137041-8142279 lnc-IQCH-5:1 Yes chrX:8137041-8142279 lnc-IQCH-4:1 No - lnc-LCTL-3:1 No - IQCH-AS1:2 No - IQCH-AS1:3 No - IQCH-AS1:4 No - lnc-IQCH-3:1 No - lnc-IQCH-1:1 No - lnc-IQCH-2:1 No - IQCH-AS1:10 No - IQCH-AS1:8 No - IQCH-AS1:5 Yes chr3R:21877870-21878686 lnc-AAGAB-3:2 No - lnc-CALML4-1:2 No - lnc-CALML4-1:3 No - lnc-CALML4-5:1 No - lnc-PIAS1-1:1 No - lnc-CLN6-3:2 No - lnc-CLN6-3:1 No - lnc-FEM1B-1:1 No - lnc-CLN6-1:2 No - lnc-CLN6-2:1 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-ITGA11-2:7 No - lnc-ITGA11-2:6 No - lnc-ITGA11-2:5 No - lnc-ITGA11-3:1 Yes chr2R:17866178-17872015 lnc-ITGA11-4:1 Yes chr2R:17866178-17872015 lnc-ITGA11-6:2 Yes chr2R:17866178-17872015 ANP32A-IT1:1 Yes chr2R:17866178-17872015 lnc-ITGA11-6:1 Yes chr2R:17866178-17872015 lnc-CORO2B-1:1 No - lnc-CORO2B-1:2 No - lnc-NOX5-2:2 No - lnc-NOX5-3:2 Yes chr2R:16307269-16316485 EWSAT1:5 No - EWSAT1:8 No - EWSAT1:13 No - lnc-ANP32A-4:1 Yes chr2R:6670154-6673372 lnc-ANP32A-2:7 Yes chr2R:6670154-6673372 lnc-ANP32A-2:8 No - lnc-ANP32A-2:9 No - lnc-ANP32A-2:6 No - lnc-PAQR5-1:4 No - lnc-TLE3-6:10 No - lnc-TLE3-6:3 No - lnc-RPLP1-12:10 No - lnc-RPLP1-12:22 No - lnc-RPLP1-12:27 No - lnc-RPLP1-12:28 No - lnc-RPLP1-12:31 No - lnc-TLE3-13:1 No - lnc-RPLP1-12:47 No - lnc-TLE3-12:1 No - lnc-UACA-6:2 Yes chr3R:26041736-26049911 lnc-UACA-6:3 Yes chr3R:26041736-26049911 lnc-UACA-6:1 Yes chr3R:26041736-26049911 lnc-UACA-5:1 Yes chr3R:26041736-26049911 lnc-LRRC49-11:1 No - lnc-UACA-4:1 No - LINC02204:15 No - lnc-LRRC49-7:1 No - lnc-LARP6-6:1 No - lnc-LARP6-5:1 No - lnc-LARP6-4:1 No - lnc-LARP6-3:1 No - lnc-LRRC49-5:1 No - lnc-LARP6-2:3 No - lnc-LARP6-2:2 No - lnc-LARP6-2:1 No - lnc-LARP6-1:1 Yes chr2R:14420324-14424764 lnc-LRRC49-4:1 Yes chr3L:4829092-4833591 THSD4-AS1:1 No - THSD4-AS1:10 No - THSD4-AS1:13 No - lnc-CT62-2:1 No - lnc-LRRC49-6:1 No - lnc-NR2E3-9:1 No - lnc-GRAMD2A-6:1 No - lnc-NR2E3-3:4 No - lnc-GRAMD2A-5:1 No - lnc-GRAMD2A-4:1 No - lnc-GRAMD2A-3:2 No - lnc-GRAMD2A-3:3 No - lnc-GRAMD2A-3:1 No - lnc-GRAMD2A-2:1 No - lnc-TMEM202-4:1 Yes chr2R:12337797-12339544 lnc-PKM-66:4 No - lnc-PKM-66:5 No - lnc-PKM-66:3 No - lnc-PKM-66:2 No - lnc-PKM-66:1 No - lnc-PKM-1:4 No - lnc-PKM-1:3 No - lnc-PARP6-1:1 Yes chr3R:14751748-14754460 lnc-PKM-2:2 No - lnc-CELF6-3:1 No - lnc-HEXA-5:1 No - lnc-CELF6-1:5 No - lnc-CELF6-1:4 No - lnc-CELF6-1:6 No - lnc-CELF6-1:2 No - lnc-CELF6-1:3 No - lnc-HEXA-4:1 No - lnc-ARIH1-3:1 No - TMEM202-AS1:40 No - TMEM202-AS1:39 No - TMEM202-AS1:28 No - TMEM202-AS1:23 Yes chrX:18130392-18137784 lnc-ARIH1-5:1 No - lnc-ARIH1-4:1 No - lnc-ARIH1-1:3 No - lnc-BBS4-2:1 No - lnc-ADPGK-2:1 Yes chrX:16331281-16333600 ADPGK-AS1:6 Yes chr3L:14031450-14034909 ADPGK-AS1:7 No - lnc-NEO1-3:1 No - lnc-ADPGK-3:1 No - lnc-ADPGK-3:2 No - lnc-HCN4-4:1 Yes chr2R:12529053-12564184 lnc-HCN4-3:1 Yes chr2R:12529053-12564184 lnc-HCN4-2:1 Yes chr2R:12529053-12564184 lnc-NEO1-1:3 Yes chr2R:14276130-14300095 lnc-NPTN-2:1 Yes chr2R:14276130-14300095 lnc-C15orf59-6:1 Yes chr2L:8083420-8116531 NPTN-IT1:1 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-C15orf59-4:1 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-C15orf59-2:1 No - INSYN1-AS1:31 No - INSYN1-AS1:35 No - lnc-C15orf59-1:2 No - lnc-C15orf59-1:3 No - lnc-STOML1-3:2 No - lnc-STOML1-3:3 No - lnc-STOML1-3:4 No - lnc-STOML1-3:1 No - LOXL1-AS1:20 No - lnc-LOXL1-1:2 No - LOXL1-AS1:11 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:2 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:3 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:6 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:12 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:13 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:16 Yes chr2R:21789623-21791580 lnc-PML-3:2 No - lnc-STOML1-4:1 No - lnc-STOML1-2:7 No - lnc-ISLR2-1:1 No - lnc-GOLGA6A-1:2 No - lnc-STRA6-1:3 No - lnc-GOLGA6A-3:1 No - lnc-GOLGA6A-5:1 No - lnc-GOLGA6A-6:3 No - lnc-GOLGA6A-6:2 No - lnc-GOLGA6A-6:1 No - lnc-STRA6-2:1 No - lnc-ISLR-1:2 No - lnc-SEMA7A-3:1 No - lnc-SEMA7A-2:1 No - lnc-CCDC33-3:1 No - lnc-CCDC33-3:2 No - lnc-SEMA7A-1:1 No - lnc-CCDC33-4:1 No - lnc-UBL7-2:1 No - lnc-ARID3B-8:1 No - UBL7-AS1:4 No - UBL7-AS1:9 No - UBL7-AS1:10 No - UBL7-AS1:12 No - lnc-UBL7-1:1 No - lnc-UBL7-1:2 No - lnc-ARID3B-2:2 No - lnc-CLK3-2:1 Yes chr2R:23632610-23654820 lnc-CLK3-1:1 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-EDC3-6:1 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-ARID3B-4:1 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-EDC3-2:21 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-EDC3-2:20 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-CLK3-1:2 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-CLK3-1:3 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-EDC3-2:19 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-EDC3-2:2 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-EDC3-2:1 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-CYP1A1-2:1 Yes chr3L:17525333-17529861 lnc-CYP1A1-1:1 Yes chr3L:17525333-17529861 lnc-SCAMP2-1:4 Yes chr3R:9332064-9334714 lnc-SCAMP2-1:5 Yes chr3R:9332064-9334714 lnc-ULK3-1:1 Yes chrX:15446179-15449883 lnc-COX5A-1:3 No - lnc-COX5A-1:1 No - lnc-COX5A-1:2 No - lnc-RPP25-1:1 Yes chrX:15446179-15449883 lnc-PPCDC-3:1 Yes chrX:15446179-15449883 lnc-PPCDC-2:1 No - lnc-PPCDC-1:1 Yes chr2R:21691295-21692764 lnc-C15orf39-2:1 Yes chr2R:21691295-21692764 lnc-MAN2C1-10:1 No - lnc-C15orf39-1:1 No - lnc-MAN2C1-3:2 No - lnc-GOLGA6D-3:2 No - lnc-GOLGA6C-1:1 No - lnc-GOLGA6D-1:1 No - lnc-MAN2C1-8:1 No - lnc-MAN2C1-6:1 No - lnc-COMMD4-1:2 No - lnc-COMMD4-1:4 No - lnc-SIN3A-5:4 No - lnc-SIN3A-5:3 No - lnc-SIN3A-5:1 No - lnc-SIN3A-5:2 No - lnc-SIN3A-2:2 No - lnc-SIN3A-2:5 No - lnc-SIN3A-2:4 No - lnc-SIN3A-2:3 No - lnc-SIN3A-2:1 No - lnc-SIN3A-1:1 No - lnc-SIN3A-1:3 No - lnc-SIN3A-1:2 No - lnc-MAN2C1-7:1 Yes chr2R:12575240-12592917 lnc-NEIL1-3:1 Yes chr2R:12575240-12592917 lnc-NEIL1-4:1 Yes chr2R:12575240-12592917 lnc-PTPN9-2:1 Yes chr2R:12575240-12592917 lnc-NEIL1-5:1 Yes chrX:9626294-9659145 lnc-SIN3A-3:1 Yes chrX:9626294-9659145 lnc-SNX33-4:1 Yes chrX:9626294-9659145 lnc-SIN3A-4:1 Yes chrX:9626294-9659145 lnc-SNUPN-1:1 No - lnc-ODF3L1-5:1 Yes chr3L:9710422-9713827 lnc-ODF3L1-1:1 No - lnc-ODF3L1-1:2 No - lnc-CSPG4-1:5 Yes chr3R:23695221-23696245 lnc-CSPG4-1:3 Yes chr3R:23695221-23696245 lnc-CSPG4-1:4 No - lnc-CSPG4-1:7 No - lnc-CSPG4-1:6 No - lnc-ODF3L1-2:3 No - lnc-ODF3L1-2:9 No - lnc-ODF3L1-2:10 No - lnc-ODF3L1-2:12 No - lnc-ODF3L1-4:1 No - lnc-ODF3L1-4:2 No - lnc-ODF3L1-3:1 No - lnc-CSPG4-1:2 No - lnc-FBXO22-2:1 Yes chrX:2264657-2270761 lnc-NRG4-4:1 No - lnc-NRG4-1:2 No - lnc-NRG4-1:1 No - lnc-CSPG4-4:1 No - lnc-ETFA-2:1 No - lnc-FBXO22-5:1 No - lnc-SCAPER-7:1 No - lnc-SCAPER-7:2 No - lnc-SCAPER-5:1 Yes chr2R:11688569-11690863 lnc-SCAPER-3:1 Yes chr2R:11688569-11690863 lnc-ISL2-2:1 No - lnc-ISL2-1:1 No - lnc-ETFA-4:2 Yes chr2L:18916347-18943960 lnc-ETFA-4:1 Yes chr2L:18916347-18943960 lnc-ISL2-4:1 Yes chr2L:18916347-18943960 lnc-ETFA-5:1 Yes chr2L:18916347-18943960 lnc-RCN2-1:1 Yes chr2L:18916347-18943960 lnc-TSPAN3-5:1 Yes chr2L:18916347-18943960 lnc-TSPAN3-5:2 Yes chr2L:18916347-18943960 lnc-SCAPER-2:1 Yes chr2L:5040648-5044712 lnc-TSPAN3-3:1 No - lnc-PEAK1-4:2 No - lnc-PEAK1-3:2 No - lnc-TSPAN3-2:1 No - lnc-PEAK1-1:17 No - lnc-PSTPIP1-3:1 No - lnc-TSPAN3-4:1 No - lnc-PEAK1-1:16 No - lnc-PEAK1-1:19 No - lnc-PEAK1-1:18 No - lnc-HMG20A-7:1 No - lnc-HMG20A-7:2 No - lnc-PEAK1-1:20 No - lnc-HMG20A-6:1 Yes chr2R:21146203-21147608 lnc-PEAK1-5:2 Yes chr2R:21146203-21147608 LINGO1-AS1:4 Yes chr2R:21872030-21946259 LINGO1-AS1:5 Yes chr2R:21872030-21946259 LINGO1-AS1:6 Yes chr2R:21872030-21946259 LINGO1-AS1:10 Yes chr2R:21872030-21946259 LINGO1-AS2:5 Yes chr2R:21872030-21946259 lnc-TBC1D2B-7:3 Yes chr2R:21872030-21946259 lnc-TBC1D2B-7:1 Yes chr2R:21872030-21946259 lnc-TBC1D2B-7:2 Yes chr2R:21872030-21946259 lnc-SH2D7-9:1 No - lnc-SH2D7-8:1 No - lnc-TBC1D2B-8:1 No - lnc-TBC1D2B-8:2 No - lnc-TBC1D2B-8:3 No - lnc-TBC1D2B-5:1 No - lnc-TBC1D2B-6:2 No - lnc-TBC1D2B-3:2 No - lnc-TBC1D2B-3:3 No - lnc-TBC1D2B-3:1 No - lnc-SH2D7-11:1 No - lnc-SH2D7-3:5 No - lnc-SH2D7-3:6 No - lnc-CIB2-5:1 No - lnc-CIB2-4:1 No - lnc-CIB2-4:2 No - lnc-CIB2-3:1 No - lnc-CIB2-2:1 No - lnc-IDH3A-1:1 No - lnc-TBC1D2B-2:1 Yes chr2R:20879930-20882663 lnc-ACSBG1-2:2 Yes chr2L:14027001-14029368 lnc-ACSBG1-2:1 Yes chr2L:14027001-14029368 lnc-WDR61-1:1 Yes chr2L:14027001-14029368 lnc-ACSBG1-4:1 No - lnc-ACSBG1-5:1 Yes chr3R:10043270-10044606 lnc-ACSBG1-5:2 Yes chr3R:10043270-10044606 lnc-ACSBG1-5:3 Yes chr3R:10043270-10044606 lnc-ACSBG1-6:1 Yes chr3R:10043270-10044606 lnc-ACSBG1-7:5 Yes chr3R:10043270-10044606 lnc-ACSBG1-7:4 Yes chr3R:10043270-10044606 lnc-ACSBG1-7:2 Yes chr3R:10043270-10044606 lnc-ACSBG1-7:3 Yes chr3R:10043270-10044606 lnc-ACSBG1-7:1 Yes chr3R:10043270-10044606 lnc-ACSBG1-7:6 Yes chr3R:10043270-10044606 lnc-CHRNA3-5:1 Yes chr3R:10408618-10412869 lnc-CHRNA3-3:4 Yes chr3R:24485428-24515106 lnc-CHRNB4-3:1 Yes chrX:8276200-8367169 lnc-CHRNB4-3:2 Yes chrX:8276200-8367169 lnc-CHRNA5-1:2 Yes chrX:8276200-8367169 lnc-CHRNA5-3:1 Yes chrX:8276200-8367169 lnc-CHRNA3-4:1 Yes chrX:8276200-8367169 lnc-CHRNA5-3:2 Yes chrX:8276200-8367169 lnc-CHRNA5-3:3 No - lnc-CHRNA5-3:4 No - lnc-MORF4L1-4:1 No - lnc-MORF4L1-4:2 No - lnc-CHRNB4-2:1 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-ADAMTS7-2:1 Yes chr3R:15276440-15278109 lnc-MORF4L1-3:1 No - lnc-RASGRF1-4:6 Yes chr2L:10354743-10356597 lnc-RASGRF1-4:4 Yes chr2L:10354743-10356597 lnc-RASGRF1-4:5 Yes chr2L:10354743-10356597 lnc-RASGRF1-4:1 Yes chr2L:10354743-10356597 lnc-RASGRF1-4:3 Yes chr2L:10354743-10356597 lnc-RASGRF1-4:2 Yes chr2L:10354743-10356597 lnc-RASGRF1-3:1 No - lnc-RASGRF1-2:1 No - lnc-CTSH-1:1 No - lnc-CTSH-2:1 No - lnc-CTSH-3:1 No - lnc-RASGRF1-5:1 No - ANKRD34C-AS1:3 No - ANKRD34C-AS1:10 No - lnc-RASGRF1-6:1 No - lnc-RASGRF1-7:1 Yes chrX:11850909-11852530 lnc-MTHFS-4:1 No - lnc-MTHFS-3:1 No - lnc-MTHFS-2:1 No - lnc-ZFAND6-2:2 No - lnc-ZFAND6-5:1 No - lnc-ZFAND6-6:1 No - lnc-FAH-2:1 No - LINC00927:59 No - LINC00927:37 No - LINC00927:58 No - LINC00927:42 No - LINC00927:36 No - lnc-ARNT2-2:1 No - lnc-ARNT2-1:1 No - LINC00927:31 No - lnc-CTXND1-2:2 Yes chr3R:9016773-9020022 lnc-CTXND1-6:1 Yes chr3R:9016773-9020022 lnc-ABHD17C-2:1 No - lnc-MESD-4:2 No - lnc-MESD-4:1 No - lnc-MESD-4:3 Yes chr2R:7565873-7566738 lnc-MESD-2:2 No - lnc-TLNRD1-2:1 Yes chr3R:21567519-21569149 lnc-IL16-6:1 Yes chr2R:22855688-22858794 lnc-IL16-12:1 No - lnc-IL16-7:1 No - lnc-MEX3B-4:4 No - lnc-MEX3B-5:1 No - lnc-MEX3B-1:5 No - lnc-MEX3B-1:4 No - lnc-MEX3B-1:3 No - LINC01583:2 No - lnc-SAXO2-2:1 No - lnc-GOLGA6L9-11:1 No - lnc-EFL1-1:1 No - lnc-GOLGA6L9-2:4 No - lnc-GOLGA6L9-2:6 No - lnc-RPS17-3:1 No - lnc-RPS17-1:4 No - lnc-RPS17-1:2 No - lnc-EFL1-1:2 No - lnc-GOLGA6L9-2:15 No - lnc-RPS17-3:2 No - lnc-RPS17-1:5 No - lnc-RPS17-1:3 No - lnc-RPS17-2:11 No - lnc-CPEB1-1:1 Yes chr3R:23260610-23280856 lnc-AP3B2-2:1 Yes chr3R:23260610-23280856 CPEB1-AS1:3 Yes chr3R:23260610-23280856 lnc-CPEB1-2:1 Yes chrX:4535635-4540626 lnc-AP3B2-1:5 No - lnc-FSD2-2:2 No - lnc-WHAMM-5:1 No - SNHG21:19 No - SNHG21:2 No - SNHG21:15 No - lnc-FSD2-1:1 No - lnc-WHAMM-4:1 No - lnc-FSD2-31:1 Yes chr2L:6719394-6723359 lnc-FSD2-3:1 Yes chr2L:6719394-6723359 lnc-FAM103A1-3:1 Yes chr2L:6719394-6723359 lnc-C15orf40-3:1 Yes chr2L:6719394-6723359 lnc-HOMER2-2:1 No - lnc-HOMER2-3:2 Yes chr3L:3197045-3197631 lnc-HOMER2-3:1 Yes chr3L:3197045-3197631 lnc-C15orf40-4:1 No - lnc-TM6SF1-3:2 No - lnc-TM6SF1-5:1 No - lnc-TM6SF1-4:1 No - lnc-BTBD1-1:8 No - lnc-BTBD1-2:1 No - lnc-BNC1-2:1 Yes chr3R:30052514-30054697 lnc-BNC1-1:1 No - lnc-SH3GL3-3:1 Yes chr2L:21684106-21729051 lnc-BNC1-16:1 Yes chr2L:21684106-21729051 lnc-WDR73-15:1 No - lnc-UBE2Q2L-3:2 No - lnc-WDR73-5:7 No - lnc-WDR73-5:8 No - lnc-WDR73-5:11 No - lnc-WDR73-5:10 No - lnc-WDR73-5:9 No - lnc-WDR73-5:6 No - lnc-WDR73-14:1 No - lnc-GOLGA6L4-2:1 No - lnc-GOLGA6L4-2:2 No - lnc-WDR73-13:1 No - lnc-GOLGA6L4-3:1 No - lnc-WDR73-12:1 No - lnc-WDR73-11:1 No - lnc-ZSCAN2-10:1 No - lnc-WDR73-3:10 No - lnc-WDR73-3:11 No - lnc-WDR73-3:9 No - lnc-WDR73-3:5 No - lnc-WDR73-3:3 No - lnc-WDR73-3:8 No - lnc-WDR73-3:7 No - lnc-WDR73-3:4 No - lnc-WDR73-3:6 No - lnc-WDR73-3:2 No - lnc-ZSCAN2-6:1 No - lnc-ZSCAN2-6:2 No - lnc-ZSCAN2-6:3 No - lnc-ZSCAN2-6:4 No - lnc-ZSCAN2-6:6 No - lnc-ZSCAN2-6:7 No - lnc-ZSCAN2-6:8 No - lnc-WDR73-10:1 Yes chr2R:14173693-14182838 lnc-WDR73-9:1 Yes chr2R:14173693-14182838 lnc-ZSCAN2-4:1 Yes chr2R:14173693-14182838 lnc-WDR73-10:6 No - lnc-ZSCAN2-5:1 No - lnc-ZSCAN2-5:4 No - lnc-ZSCAN2-5:5 No - lnc-ZSCAN2-5:6 No - lnc-ZSCAN2-5:7 No - lnc-ZSCAN2-5:8 No - lnc-ZSCAN2-5:9 No - lnc-WDR73-7:8 No - lnc-ZSCAN2-5:10 No - lnc-ZSCAN2-5:12 No - lnc-ZSCAN2-5:13 No - lnc-ZSCAN2-5:14 No - lnc-WDR73-7:7 No - lnc-WDR73-7:4 No - lnc-WDR73-7:3 No - lnc-WDR73-7:2 No - lnc-WDR73-7:6 No - lnc-WDR73-7:5 No - lnc-WDR73-7:1 No - lnc-ZSCAN2-7:1 No - lnc-ZSCAN2-8:1 No - lnc-ZSCAN2-9:1 No - lnc-NMB-1:4 Yes chr3R:6657882-6659442 lnc-NMB-1:3 Yes chr3R:6657882-6659442 lnc-ZNF592-5:1 No - lnc-ZNF592-4:1 No - lnc-ZNF592-3:1 No - lnc-ZNF592-2:1 No - lnc-ZNF592-1:1 No - lnc-SEC11A-2:1 No - lnc-SEC11A-3:1 Yes chr2R:9082395-9085717 lnc-SLC28A1-2:1 No - lnc-SLC28A1-2:2 No - lnc-SLC28A1-2:3 No - lnc-SLC28A1-1:2 No - lnc-SLC28A1-3:1 Yes chr2R:23657567-23680844 lnc-SLC28A1-4:1 Yes chr2R:23657567-23680844 lnc-PDE8A-2:4 No - lnc-SEC11A-6:12 No - lnc-SEC11A-6:5 No - lnc-SEC11A-6:9 No - lnc-SEC11A-6:3 No - lnc-SEC11A-6:8 No - lnc-SEC11A-6:7 No - lnc-SEC11A-6:2 No - lnc-SEC11A-6:6 No - lnc-SEC11A-6:4 No - lnc-SEC11A-5:1 No - lnc-PDE8A-3:1 No - lnc-PDE8A-3:2 No - lnc-PDE8A-3:3 No - lnc-KLHL25-16:1 No - lnc-KLHL25-9:7 No - lnc-AKAP13-4:2 No - lnc-KLHL25-9:5 No - lnc-KLHL25-9:8 No - lnc-KLHL25-9:4 No - lnc-KLHL25-9:6 No - lnc-AKAP13-5:2 No - lnc-AKAP13-6:2 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-KLHL25-14:1 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-KLHL25-6:2 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-AGBL1-7:1 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-KLHL25-1:4 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-SEC11A-7:1 No - lnc-KLHL25-13:1 No - LINC01584:6 No - LINC01584:7 No - LINC01584:8 No - lnc-KLHL25-15:1 No - AGBL1-AS1:5 No - AGBL1-AS1:3 No - AGBL1-AS1:2 No - AGBL1-AS1:4 No - lnc-AKAP13-7:1 No - lnc-NTRK3-6:2 No - LINC00052:6 No - lnc-MRPS11-4:1 No - lnc-MRPL46-9:2 No - lnc-MRPL46-7:2 No - lnc-MRPL46-6:2 No - lnc-MRPL46-5:2 No - lnc-MRPL46-4:2 No - lnc-MRPL46-3:2 No - lnc-MRPL46-2:2 No - lnc-NTRK3-4:1 No - NTRK3-AS1:3 No - lnc-DET1-1:21 Yes chr3L:1777439-1778347 lnc-DET1-3:1 Yes chr2L:10973443-10975293 lnc-DET1-1:20 Yes chr2L:10973443-10975293 lnc-AEN-3:1 No - lnc-ISG20-1:1 No - lnc-DET1-4:1 No - lnc-ACAN-1:1 No - lnc-ACAN-2:1 No - lnc-MFGE8-1:1 No - lnc-HAPLN3-2:1 No - lnc-HAPLN3-3:1 No - lnc-MFGE8-1:4 No - lnc-MFGE8-1:3 No - lnc-MFGE8-1:2 No - lnc-ACAN-3:1 No - lnc-ABHD2-8:1 No - lnc-ABHD2-6:1 No - lnc-MFGE8-2:1 No - lnc-MFGE8-3:1 No - lnc-RLBP1-1:4 Yes chr2L:3163645-3169462 lnc-RLBP1-1:3 Yes chr2L:3163645-3169462 lnc-FANCI-5:1 Yes chr2L:3163645-3169462 lnc-FANCI-5:2 Yes chr2L:3163645-3169462 lnc-FANCI-5:3 Yes chr2L:3163645-3169462 lnc-RLBP1-4:1 Yes chr2L:3163645-3169462 lnc-RLBP1-3:1 Yes chr2L:3163645-3169462 lnc-ABHD2-2:1 No - lnc-ABHD2-3:1 No - lnc-ABHD2-4:1 No - lnc-RLBP1-2:1 No - lnc-POLG-2:1 Yes chr2L:19435850-19442727 lnc-RLBP1-5:1 Yes chr2L:13823980-13827772 lnc-RLBP1-5:2 Yes chr2L:13823980-13827772 lnc-FANCI-1:3 Yes chr2L:13823980-13827772 lnc-FANCI-1:4 No - lnc-FANCI-4:1 No - MIR9-3HG:3 No - MIR9-3HG:7 No - MIR9-3HG:8 No - MIR9-3HG:10 No - MIR9-3HG:12 No - MIR9-3HG:22 No - MIR9-3HG:26 No - MIR9-3HG:30 No - MIR9-3HG:31 No - MIR9-3HG:32 No - MIR9-3HG:33 No - MIR9-3HG:35 No - MIR9-3HG:36 No - lnc-FANCI-3:3 No - lnc-TICRR-5:1 No - lnc-TICRR-4:1 No - lnc-TICRR-3:1 No - lnc-KIF7-3:2 Yes chr3L:4910368-4920198 LINC00928:4 No - LINC00928:5 No - LINC00928:6 No - LINC00928:7 No - lnc-TICRR-2:2 No - lnc-KIF7-2:1 No - lnc-PEX11A-2:1 No - lnc-PEX11A-1:1 No - lnc-PLIN1-1:1 Yes chr2R:15991367-15992375 lnc-MESP1-1:2 No - lnc-MESP1-1:1 No - lnc-MESP2-2:1 No - lnc-AP3S2-2:1 Yes chr2L:15876938-15880156 lnc-AP3S2-1:1 Yes chr2L:15876938-15880156 lnc-ANPEP-1:7 No - lnc-ANPEP-1:6 No - lnc-ANPEP-1:5 No - lnc-ANPEP-1:4 No - lnc-MESP2-3:1 No - lnc-ARPIN-1:2 No - lnc-ZNF710-3:1 No - lnc-ZNF710-2:1 No - lnc-SEMA4B-6:1 Yes chr3R:15348048-15350391 ZNF710-AS1:9 Yes chr3R:15348048-15350391 lnc-ZNF710-1:1 Yes chr3R:15348048-15350391 lnc-IDH2-2:1 No - lnc-SEMA4B-5:1 No - lnc-SEMA4B-4:1 No - lnc-SEMA4B-3:1 No - lnc-GDPGP1-6:1 No - lnc-GDPGP1-5:1 No - lnc-CIB1-1:2 No - lnc-NGRN-1:2 No - lnc-CIB1-134:2 No - lnc-BLM-7:1 No - lnc-CRTC3-4:1 No - lnc-BLM-4:1 No - lnc-HDDC3-6:1 Yes chr3R:11736810-11741783 lnc-BLM-1:1 No - lnc-BLM-6:13 No - lnc-HDDC3-5:1 No - lnc-FURIN-3:1 No - lnc-FURIN-2:1 No - lnc-HDDC3-3:2 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-MAN2A2-1:1 No - lnc-FES-1:2 Yes chr3R:9412548-9417264 lnc-PRC1-4:2 No - lnc-VPS33B-4:1 No - lnc-VPS33B-4:2 No - lnc-PRC1-2:1 No - lnc-PRC1-3:1 No - lnc-VPS33B-3:1 No - lnc-VPS33B-6:1 Yes chr3R:25216297-25218708 lnc-VPS33B-6:4 Yes chr3R:25216297-25218708 lnc-VPS33B-6:2 Yes chr3R:25216297-25218708 lnc-VPS33B-6:3 Yes chr3R:25216297-25218708 lnc-SV2B-3:1 Yes chr3R:25216297-25218708 lnc-SLCO3A1-5:1 No - lnc-VPS33B-7:1 No - lnc-SLCO3A1-3:1 No - lnc-SLCO3A1-2:2 No - lnc-FAM174B-3:5 No - lnc-FAM174B-3:4 No - LINC00930:2 No - lnc-ST8SIA2-1:2 No - lnc-ST8SIA2-1:4 No - lnc-ST8SIA2-5:1 No - lnc-ST8SIA2-4:1 No - lnc-RGMA-14:1 No - lnc-RGMA-13:2 No - lnc-CHD2-13:1 No - lnc-RGMA-13:1 No - lnc-CHD2-12:1 No - lnc-CHD2-11:1 No - lnc-CHD2-10:1 No - lnc-RGMA-3:2 No - lnc-FAM174B-2:9 No - lnc-FAM174B-2:8 No - lnc-CHD2-9:1 No - lnc-FAM174B-2:7 No - lnc-CHD2-7:1 No - LINC01578:1 Yes chr2L:2979562-2987723 LINC01578:3 Yes chr2L:2979562-2987723 LINC01578:4 Yes chr2L:2979562-2987723 LINC01578:6 Yes chr2L:2979562-2987723 LINC01578:8 Yes chr2L:2979562-2987723 LINC01578:9 Yes chr2L:2979562-2987723 LINC01578:11 Yes chr2L:2979562-2987723 LINC01578:12 Yes chr2L:2979562-2987723 LINC01578:13 Yes chr2L:2979562-2987723 LINC01578:14 Yes chr2L:2979562-2987723 lnc-FAM174B-6:1 No - lnc-FAM174B-7:2 No - lnc-FAM174B-7:1 No - lnc-CHD2-2:5 No - lnc-CHD2-14:1 No - lnc-RGMA-11:1 No - lnc-CHD2-4:9 No - lnc-RGMA-12:1 No - lnc-CHD2-4:10 No - lnc-CHD2-4:11 No - lnc-MCTP2-18:2 No - LINC01579:5 No - LINC02207:8 No - LINC02207:9 No - LINC01580:1 No - LINC01580:4 No - LINC01581:2 No - LINC01581:5 No - lnc-MCTP2-11:1 No - lnc-CHD2-16:1 Yes chr2R:18761758-18774824 lnc-CHD2-15:1 Yes chr2R:18761758-18774824 lnc-MCTP2-3:2 No - lnc-RGMA-25:1 No - lnc-MCTP2-7:4 No - lnc-RGMA-24:1 No - lnc-MCTP2-7:11 No - lnc-MCTP2-9:2 No - lnc-MCTP2-16:1 No - LINC01197:22 No - lnc-RGMA-23:1 No - lnc-MCTP2-17:1 No - LINC00924:4 No - LINC00924:6 No - LINC00924:7 No - lnc-RGMA-7:12 No - lnc-NR2F2-14:1 No - NR2F2-AS1:23 No - NR2F2-AS1:24 No - NR2F2-AS1:25 No - lnc-NR2F2-6:4 No - lnc-NR2F2-6:5 No - NR2F2-AS1:20 No - NR2F2-AS1:49 No - lnc-NR2F2-7:2 No - NR2F2-AS1:2 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F2-AS1:18 No - NR2F2-AS1:14 No - NR2F2-AS1:13 No - lnc-NR2F2-9:1 No - NR2F2-AS1:3 Yes chr3R:12258737-12302785 lnc-PGPEP1L-28:1 No - lnc-PGPEP1L-27:1 No - lnc-PGPEP1L-24:1 No - lnc-NR2F2-10:1 No - lnc-NR2F2-12:1 No - lnc-SPATA8-3:1 No - lnc-SPATA8-1:1 No - lnc-PGPEP1L-23:1 No - SPATA8-AS1:1 No - lnc-PGPEP1L-22:1 No - lnc-SPATA8-4:1 No - lnc-SPATA8-5:1 No - lnc-PGPEP1L-20:1 No - lnc-PGPEP1L-19:1 No - lnc-PGPEP1L-18:2 No - lnc-SPATA8-11:1 No - LINC02253:7 No - lnc-PGPEP1L-13:1 No - lnc-PGPEP1L-12:4 No - lnc-ARRDC4-4:2 No - LINC00923:7 No - LINC02251:7 No - LINC01582:8 No - lnc-PGPEP1L-8:1 No - lnc-PGPEP1L-8:2 No - LINC02351:4 No - lnc-IGF1R-6:1 No - lnc-PGPEP1L-6:1 No - lnc-IGF1R-5:1 No - lnc-IGF1R-4:1 No - lnc-IGF1R-3:1 No - IRAIN:8 No - lnc-IGF1R-1:5 No - lnc-TTC23-4:1 No - lnc-PGPEP1L-4:3 No - lnc-PGPEP1L-5:1 No - lnc-SYNM-6:5 Yes chr2R:20236235-20239200 lnc-MEF2A-2:1 Yes chr2R:20236235-20239200 lnc-LYSMD4-4:1 No - lnc-LRRC28-7:1 Yes chr2R:9913496-9958858 lnc-LYSMD4-1:3 No - lnc-LYSMD4-1:2 No - lnc-LYSMD4-1:1 No - lnc-LYSMD4-2:3 No - lnc-LYSMD4-2:2 No - lnc-LYSMD4-2:4 No - lnc-MEF2A-4:2 No - lnc-MEF2A-4:3 No - lnc-LYSMD4-2:6 No - lnc-LYSMD4-2:1 No - lnc-LYSMD4-2:5 No - lnc-MEF2A-9:3 No - lnc-LYSMD4-3:1 No - lnc-MEF2A-9:6 No - lnc-MEF2A-9:7 No - lnc-LYSMD4-5:1 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-CERS3-4:2 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-CERS3-4:1 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-CERS3-3:1 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-ASB7-4:5 No - lnc-ASB7-4:6 No - CERS3-AS1:8 No - lnc-CERS3-1:1 No - lnc-LINS1-6:1 No - lnc-LINS1-5:1 No - lnc-LINS1-2:1 No - lnc-LINS1-2:2 No - lnc-CERS3-2:1 Yes chr2R:8914524-8918234 lnc-LINS1-3:1 No - lnc-LINS1-4:1 Yes chr2L:5047818-5051062 lnc-ASB7-2:2 No - lnc-ALDH1A3-2:2 No - lnc-ALDH1A3-2:3 No - lnc-ALDH1A3-1:14 No - lnc-CHSY1-5:6 No - lnc-CHSY1-5:15 No - lnc-CHSY1-5:5 No - lnc-CHSY1-3:2 Yes chr3R:20635480-20644279 lnc-SELENOS-2:1 Yes chrX:15585289-15593534 lnc-PCSK6-4:6 Yes chr2R:7675362-7676362 lnc-PCSK6-4:5 Yes chr2R:7675362-7676362 lnc-PCSK6-4:4 Yes chr2R:7675362-7676362 lnc-PCSK6-4:1 Yes chr2R:7675362-7676362 lnc-PCSK6-4:2 Yes chr2R:7675362-7676362 lnc-PCSK6-4:3 Yes chr2R:7675362-7676362 lnc-PCSK6-1:7 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-PCSK6-1:3 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-PCSK6-1:4 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-PCSK6-1:8 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-PCSK6-1:6 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-PCSK6-1:5 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-SNRPA1-2:1 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-OR4F6-5:1 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-OR4F6-5:2 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-PCSK6-3:2 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-PCSK6-2:1 No - lnc-OR4F6-4:1 No - lnc-OR4F6-3:1 No - lnc-TM2D3-4:1 No - LINC02348:14 No - LINC02348:9 No - lnc-TARSL2-3:2 Yes chrX:9245915-9247336 lnc-TARSL2-3:1 Yes chrX:9245915-9247336 lnc-TARSL2-2:1 Yes chrX:9245915-9247336 lnc-TARSL2-1:2 Yes chrX:9245915-9247336 lnc-TARSL2-1:1 Yes chrX:9245915-9247336 lnc-TM2D3-3:3 Yes chr2L:12103751-12107170 lnc-TM2D3-1:8 Yes chr2L:12103751-12107170 lnc-OR4F6-2:1 No - lnc-OR4F6-1:1 No - lnc-OR4F6-1:2 No - lnc-OR4F6-1:3 No - lnc-OR4F6-1:4 No - lnc-OR4F6-1:5 No - lnc-TARSL2-5:1 No - lnc-OR4F15-3:1 No - lnc-OR4F4-3:1 No - lnc-OR4F4-2:1 No - FAM138E:2 No - lnc-OR4F15-4:2 No - lnc-OR4F15-4:3 No - lnc-OR4F15-4:4 No - lnc-OR4F15-4:5 No - lnc-OR4F4-4:1 No - lnc-OR4F4-4:3 No - lnc-OR4F4-4:2 No - lnc-OR4F4-4:5 No - lnc-OR4F4-4:4 No - lnc-SNRNP25-4:1 No - lnc-SNRNP25-4:2 No - lnc-SNRNP25-4:3 No - lnc-SNRNP25-4:4 No - lnc-POLR3K-3:6 No - lnc-POLR3K-3:2 No - lnc-POLR3K-3:3 No - lnc-POLR3K-3:4 No - lnc-POLR3K-3:5 No - WASIR2:1 No - WASIR2:2 No - lnc-RHBDF1-2:1 Yes chr2R:20642466-20643785 lnc-POLR3K-1:2 Yes chr2L:10368025-10373900 lnc-POLR3K-1:1 Yes chr2L:10368025-10373900 lnc-NPRL3-2:3 Yes chr2L:10368025-10373900 lnc-NPRL3-2:2 Yes chr2L:10368025-10373900 lnc-MPG-1:1 Yes chr2L:10368025-10373900 lnc-RHBDF1-1:1 No - lnc-MPG-2:1 Yes chr3L:13999380-14001880 lnc-HBM-1:1 No - lnc-LUC7L-2:1 No - lnc-LUC7L-1:1 No - lnc-NPRL3-3:1 Yes chr3L:17514298-17524740 lnc-RGS11-2:1 Yes chr3L:17514298-17524740 lnc-RGS11-1:2 Yes chr3L:17514298-17524740 lnc-RGS11-1:1 Yes chr3L:17514298-17524740 lnc-FAM234A-2:1 No - lnc-AXIN1-1:1 Yes chr3L:19928743-19932930 lnc-MRPL28-2:1 Yes chr2L:4973976-4975316 lnc-DECR2-4:1 Yes chr3L:14190870-14233250 lnc-CAPN15-4:1 Yes chr3L:14190870-14233250 lnc-CAPN15-3:1 Yes chr3L:14190870-14233250 lnc-CAPN15-3:2 Yes chr3L:14190870-14233250 lnc-CAPN15-3:3 Yes chr3L:14190870-14233250 LINC00235:1 No - LINC00235:2 No - lnc-RAB11FIP3-2:1 Yes chrX:21350280-21357912 lnc-RAB11FIP3-1:1 Yes chrX:21350280-21357912 lnc-RAB11FIP3-2:2 Yes chrX:21350280-21357912 lnc-METTL26-8:1 Yes chrX:16359143-16361275 lnc-RAB40C-1:1 No - lnc-METTL26-7:4 No - lnc-PIGQ-1:1 Yes chrX:12459796-12463112 lnc-WFIKKN1-2:1 Yes chrX:12459796-12463112 lnc-METTL26-5:1 Yes chrX:12459796-12463112 lnc-JMJD8-2:5 Yes chr2L:8997605-8998544 lnc-MCRIP2-1:1 No - lnc-MCRIP2-1:2 No - lnc-METTL26-1:8 No - lnc-METTL26-1:7 No - lnc-METTL26-1:6 No - lnc-METTL26-2:2 Yes chr3L:6965260-6967897 lnc-METTL26-6:1 Yes chr3L:6965260-6967897 lnc-WDR24-1:3 No - lnc-WDR24-1:2 No - lnc-WDR24-1:1 No - lnc-STUB1-2:3 Yes chr3L:11650517-11680344 lnc-WDR24-2:1 Yes chr3L:11650517-11680344 lnc-FAM173A-1:2 No - lnc-CCDC78-1:6 No - lnc-CCDC78-1:5 No - lnc-CCDC78-1:2 No - lnc-CCDC78-1:4 No - lnc-CCDC78-1:3 No - lnc-CCDC78-1:7 No - lnc-CCDC78-1:1 No - lnc-CCDC78-2:1 No - lnc-CCDC78-2:2 No - lnc-CCDC78-3:4 No - lnc-CCDC78-3:3 No - lnc-CCDC78-3:6 No - lnc-CCDC78-3:5 No - lnc-CCDC78-3:2 Yes chr2R:4130974-4133484 lnc-CCDC78-3:1 Yes chr2R:4130974-4133484 lnc-MSLN-2:4 No - lnc-MSLNL-1:2 No - lnc-MSLNL-1:1 No - lnc-GNG13-3:2 No - lnc-GNG13-2:1 No - lnc-LMF1-3:9 No - lnc-LMF1-3:3 No - lnc-LMF1-3:10 No - lnc-LMF1-3:7 No - SSTR5-AS1:2 No - SSTR5-AS1:7 No - lnc-C1QTNF8-5:1 No - lnc-SSTR5-2:2 No - lnc-TPSB2-6:1 No - lnc-TPSB2-3:1 No - lnc-TPSB2-4:1 No - lnc-TPSB2-5:1 No - lnc-TPSB2-5:2 No - lnc-UBE2I-1:1 Yes chr2L:540599-542580 lnc-UBE2I-2:1 No - lnc-TSR3-3:1 Yes chr3R:23149653-23157862 lnc-TSR3-4:1 Yes chr3R:23149653-23157862 lnc-GNPTG-1:2 Yes chr3R:23149653-23157862 lnc-CCDC154-1:1 Yes chr2R:12572068-12575299 lnc-CCDC154-2:1 Yes chr2R:12572068-12575299 lnc-TELO2-4:1 No - lnc-PTX4-4:1 Yes chr2L:553742-560310 lnc-NME3-2:2 Yes chr3L:7916650-7936120 lnc-NME3-1:2 Yes chr3L:7916650-7936120 lnc-MRPS34-1:2 No - lnc-MRPS34-1:1 No - lnc-IGFALS-3:1 Yes chr3L:20798645-20800081 lnc-HAGH-2:1 No - LINC00254:5 Yes chrX:7918517-7920131 lnc-MEIOB-1:1 No - lnc-RPL3L-2:1 No - lnc-RPL3L-1:1 No - lnc-RPS2-1:1 Yes chr3R:11221894-11225173 lnc-RPL3L-4:2 Yes chr2L:9896265-9897552 lnc-RPL3L-4:1 Yes chr2L:9896265-9897552 lnc-RPL3L-3:1 Yes chr2L:9896265-9897552 SNHG9:1 Yes chr2L:9896265-9897552 SNHG9:3 No - SNHG9:6 No - lnc-NOXO1-2:1 Yes chr2R:24561607-24565058 lnc-NTHL1-2:1 Yes chr2R:17394593-17405171 lnc-ZNF598-1:1 Yes chr2L:20926319-20927860 lnc-ZNF598-2:1 No - lnc-NTHL1-3:2 No - lnc-NTHL1-3:1 No - lnc-NTHL1-4:1 No - lnc-NTHL1-4:2 No - lnc-NTHL1-5:1 No - lnc-MLST8-2:1 Yes chrX:9604154-9605969 lnc-MLST8-2:2 Yes chrX:9604154-9605969 lnc-PGP-1:1 No - lnc-ECI1-2:3 Yes chrX:22872812-22875367 lnc-ABCA3-2:1 Yes chrX:22872812-22875367 lnc-ABCA3-1:1 Yes chrX:22872812-22875367 lnc-DNASE1L2-2:11 No - lnc-RNPS1-1:1 Yes chr3R:19972898-19979569 lnc-CCNF-4:1 Yes chr3R:19972898-19979569 lnc-CCNF-4:2 Yes chr3R:19972898-19979569 lnc-CCNF-4:3 No - lnc-CCNF-4:4 No - lnc-CCNF-4:5 No - lnc-CCNF-4:6 No - lnc-CCNF-3:8 No - lnc-CCNF-1:1 No - lnc-CEMP1-6:3 No - lnc-NTN3-2:1 Yes chr2L:20871335-20918931 lnc-CEMP1-1:4 No - lnc-CCDC144NL-8:1 Yes chr3L:18618305-18622129 lnc-CCDC144NL-7:1 Yes chr3L:18618305-18622129 lnc-DHRS7B-7:1 Yes chr3L:18618305-18622129 LINC01563:1 No - lnc-NATD1-4:1 Yes chr3L:5780051-5784685 lnc-DHRS7B-1:4 Yes chr3L:5780051-5784685 lnc-NATD1-3:1 No - lnc-NATD1-2:1 No - lnc-MAP2K3-6:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-KCNJ12-7:1 No - lnc-C17orf51-1:9 No - lnc-C17orf51-1:8 No - lnc-C17orf51-1:5 No - lnc-C17orf51-1:2 No - lnc-C17orf51-1:4 No - lnc-KCNJ12-10:1 No - lnc-C17orf51-1:7 No - lnc-C17orf51-1:3 No - lnc-C17orf51-1:6 No - lnc-KCNJ18-11:1 No - lnc-KCNJ18-12:1 No - lnc-KCNJ18-5:1 No - lnc-KCNJ18-5:2 No - lnc-MTRNR2L1-18:1 No - lnc-MTRNR2L1-17:1 No - LINC02002:13 No - lnc-C17orf51-8:1 No - lnc-C17orf51-9:1 No - lnc-C17orf51-10:1 No - lnc-C17orf51-11:1 No - lnc-MTRNR2L1-15:1 No - lnc-MTRNR2L1-83:1 No - lnc-MTRNR2L1-83:2 No - lnc-MTRNR2L1-83:3 No - lnc-C17orf51-13:1 No - lnc-C17orf51-14:1 No - lnc-C17orf51-15:1 No - lnc-C17orf51-16:1 No - lnc-MTRNR2L1-1:2 No - lnc-MTRNR2L1-1:3 No - lnc-MTRNR2L1-5:1 No - lnc-MTRNR2L1-3:1 No - lnc-MTRNR2L1-4:1 No - lnc-MTRNR2L1-6:1 No - lnc-MTRNR2L1-7:1 No - lnc-MTRNR2L1-8:1 No - lnc-MTRNR2L1-9:1 No - lnc-MTRNR2L1-2:2 No - lnc-MTRNR2L1-2:3 No - lnc-C17orf51-17:1 No - lnc-MTRNR2L1-2:4 No - lnc-MTRNR2L1-10:1 No - lnc-WSB1-10:1 No - lnc-NOS2-5:4 No - lnc-NOS2-5:3 No - lnc-WSB1-9:1 No - lnc-NOS2-13:1 No - lnc-NOS2-12:1 No - lnc-WSB1-7:1 No - lnc-WSB1-7:2 No - lnc-WSB1-6:1 No - lnc-NOS2-11:1 No - lnc-KSR1-3:1 No - lnc-KSR1-3:2 No - lnc-KSR1-3:3 No - lnc-NOS2-10:1 Yes chr3R:5478390-5483906 lnc-NOS2-9:1 Yes chr3R:5478390-5483906 lnc-LGALS9-1:2 No - lnc-NOS2-8:1 Yes chr2L:76348-77783 lnc-NOS2-1:2 No - lnc-NOS2-1:6 No - lnc-NOS2-1:5 No - lnc-NOS2-1:4 No - lnc-NOS2-1:3 No - lnc-NOS2-7:2 No - lnc-NOS2-7:1 No - lnc-NOS2-6:1 No - lnc-LGALS9-2:1 No - lnc-LGALS9-4:1 No - lnc-LYRM9-3:1 Yes chr2L:10804274-10837511 lnc-LYRM9-2:1 No - LINC01992:5 No - lnc-NLK-1:2 No - lnc-IFT20-11:1 Yes chr3L:7979046-8054147 lnc-NLK-4:1 No - lnc-IFT20-10:1 No - lnc-NLK-5:1 No - lnc-NLK-5:3 No - lnc-NLK-5:4 No - lnc-NLK-6:1 No - lnc-IFT20-9:1 No - lnc-IFT20-1:3 No - lnc-IFT20-8:1 No - lnc-IFT20-7:2 No - lnc-POLDIP2-6:1 No - lnc-IFT20-5:3 Yes chr2R:5351717-5352122 lnc-IFT20-5:1 Yes chr2R:5351717-5352122 lnc-IFT20-5:2 Yes chr2R:5351717-5352122 lnc-TMEM199-4:1 Yes chr2R:5339706-5340995 lnc-SEBOX-3:1 No - lnc-VTN-1:1 Yes chr3L:8063874-8108897 lnc-VTN-3:1 No - lnc-SARM1-4:1 No - lnc-SLC46A1-1:1 No - lnc-FOXN1-2:1 No - lnc-PIGS-1:1 No - lnc-UNC119-1:1 No - lnc-ALDOC-1:1 No - lnc-ALDOC-2:5 No - lnc-ALDOC-2:4 No - lnc-ALDOC-2:3 No - lnc-ALDOC-2:2 No - lnc-ALDOC-2:1 No - SPAG5-AS1:6 No - lnc-SUPT6H-3:2 No - lnc-KIAA0100-4:1 No - lnc-KIAA0100-1:3 No - lnc-KIAA0100-1:6 No - lnc-KIAA0100-1:5 No - lnc-KIAA0100-1:2 No - lnc-KIAA0100-1:4 No - lnc-SDF2-2:2 Yes chr3L:3210992-3218920 lnc-SDF2-2:3 Yes chr3L:3210992-3218920 lnc-SDF2-2:1 Yes chr3L:3210992-3218920 lnc-SUPT6H-5:1 Yes chr3L:3210992-3218920 lnc-SDF2-3:3 No - lnc-SDF2-3:4 No - lnc-SDF2-3:2 No - lnc-SUPT6H-4:1 Yes chr3R:5353717-5354747 lnc-KIAA0100-2:1 Yes chr3R:5353717-5354747 lnc-SDF2-3:1 No - lnc-RAB34-1:1 Yes chrX:8157628-8159348 lnc-RAB34-1:4 Yes chrX:8157628-8159348 lnc-RAB34-1:3 Yes chrX:8157628-8159348 lnc-RAB34-1:2 Yes chrX:8157628-8159348 lnc-PROCA1-1:4 Yes chr3L:1668901-1670108 lnc-PROCA1-1:3 Yes chr3L:1668901-1670108 lnc-PROCA1-1:2 Yes chr3L:1668901-1670108 lnc-PROCA1-1:1 Yes chr3L:1668901-1670108 lnc-TRAF4-1:1 No - lnc-ERAL1-6:1 No - lnc-FAM222B-2:1 No - lnc-DHRS13-2:4 Yes chrX:14839376-14933946 lnc-DHRS13-2:3 Yes chrX:14839376-14933946 lnc-DHRS13-2:1 Yes chrX:14839376-14933946 lnc-DHRS13-2:2 Yes chrX:14839376-14933946 lnc-FLOT2-2:1 Yes chr2R:7656895-7659061 lnc-PHF12-1:1 Yes chr2R:7656895-7659061 lnc-DHRS13-1:1 Yes chrX:6295389-6298970 lnc-SEZ6-3:1 No - lnc-PIPOX-4:11 Yes chrX:6295389-6298970 lnc-ERAL1-5:2 No - lnc-ERAL1-8:1 No - lnc-ERAL1-8:2 No - lnc-ERAL1-8:7 No - lnc-TIAF1-4:1 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-TIAF1-1:1 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-TIAF1-2:1 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-TIAF1-3:1 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-TIAF1-3:3 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-TIAF1-3:2 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-MYO18A-1:1 No - lnc-NUFIP2-2:1 No - lnc-NUFIP2-1:5 No - lnc-TAOK1-4:1 Yes chrX:19569721-19579800 lnc-TAOK1-4:2 Yes chrX:19569721-19579800 lnc-TAOK1-8:4 No - lnc-ABHD15-1:1 Yes chr2R:10641818-10645427 lnc-SSH2-2:1 Yes chr2R:6862001-6872718 lnc-CORO6-1:2 Yes chr3R:24938710-24944956 lnc-CORO6-4:4 No - lnc-CORO6-2:1 Yes chr3R:24938710-24944956 lnc-CORO6-3:1 Yes chr3R:24938710-24944956 lnc-CORO6-4:3 No - lnc-EFCAB5-4:1 Yes chr3R:24938710-24944956 lnc-NSRP1-3:1 No - lnc-SLC6A4-6:1 Yes chrX:13338318-13341009 lnc-BLMH-3:1 Yes chr2R:24404595-24411074 lnc-NSRP1-2:2 Yes chrX:8437057-8441264 lnc-SLC6A4-1:3 Yes chrX:8437057-8441264 lnc-SLC6A4-4:1 Yes chrX:8437057-8441264 lnc-SLC6A4-5:1 Yes chrX:8437057-8441264 lnc-BLMH-2:1 Yes chrX:8437057-8441264 lnc-TMIGD1-1:2 No - lnc-TMIGD1-3:2 No - lnc-TMIGD1-3:1 No - lnc-CRLF3-7:3 No - lnc-CRLF3-7:1 No - lnc-CRLF3-7:2 No - lnc-RNF135-1:2 No - lnc-RNF135-1:3 No - lnc-RNF135-1:4 No - lnc-RNF135-1:5 No - lnc-RNF135-1:6 No - lnc-RNF135-1:7 No - lnc-RNF135-1:8 No - lnc-RNF135-1:9 No - lnc-CRLF3-6:1 No - lnc-RNF135-1:10 No - lnc-RNF135-1:11 No - lnc-TBC1D29-5:1 No - lnc-CRLF3-5:1 No - lnc-ATAD5-9:1 No - lnc-ATAD5-9:2 No - lnc-ATAD5-9:5 No - lnc-ATAD5-9:6 No - lnc-ATAD5-9:8 No - lnc-ATAD5-9:11 No - lnc-ATAD5-9:12 No - lnc-ATAD5-5:1 No - lnc-ATAD5-9:13 No - lnc-ATAD5-9:14 No - lnc-ATAD5-9:15 No - lnc-ATAD5-9:16 No - lnc-ATAD5-9:18 No - lnc-ATAD5-9:21 No - lnc-ATAD5-9:22 No - lnc-CRLF3-4:2 No - lnc-ATAD5-9:23 No - lnc-TEFM-9:1 No - lnc-TEFM-7:1 No - lnc-TEFM-6:1 No - lnc-ADAP2-4:2 No - lnc-ADAP2-4:3 No - lnc-ATAD5-3:24 Yes chr2R:8922785-8925346 lnc-ADAP2-2:1 No - lnc-RNF135-3:1 No - lnc-ADAP2-5:1 No - lnc-TEFM-8:1 No - lnc-RNF135-1:12 No - lnc-RNF135-1:13 No - lnc-RNF135-1:14 No - lnc-RNF135-1:15 No - lnc-RNF135-1:16 No - lnc-TEFM-10:2 No - lnc-TEFM-10:4 No - lnc-TEFM-10:1 No - lnc-RNF135-1:17 No - lnc-RNF135-1:18 No - lnc-OMG-1:2 Yes chr3R:25983013-25995737 lnc-OMG-1:1 Yes chr3R:25983013-25995737 lnc-NF1-1:1 Yes chr3R:25983013-25995737 lnc-NF1-1:2 Yes chr3R:25983013-25995737 lnc-NF1-6:1 Yes chr3L:14190870-14233250 lnc-NF1-7:1 Yes chr3L:14190870-14233250 lnc-NF1-7:2 Yes chr3L:14190870-14233250 lnc-NF1-2:1 Yes chr3L:14190870-14233250 lnc-EVI2A-1:1 No - lnc-RAB11FIP4-8:1 No - lnc-SUZ12-8:1 No - lnc-COPRS-2:1 Yes chrX:9078823-9081057 lnc-UTP6-1:2 No - lnc-UTP6-1:1 No - lnc-SUZ12-7:1 No - lnc-LRRC37B-2:1 No - lnc-LRRC37B-2:2 No - lnc-UTP6-4:1 No - lnc-UTP6-3:1 No - lnc-UTP6-3:2 No - lnc-RHOT1-1:1 No - lnc-C17orf75-11:1 Yes chr3R:24034362-24038847 lnc-C17orf75-5:2 Yes chr3R:24034362-24038847 lnc-C17orf75-1:2 Yes chr3L:1463811-1468944 lnc-MYO1D-10:1 No - lnc-MYO1D-4:1 No - lnc-MYO1D-5:2 No - lnc-C17orf75-7:1 Yes chr2L:10491814-10506779 lnc-C17orf75-8:1 Yes chr2L:10491814-10506779 lnc-CDK5R1-6:1 Yes chr2L:10491814-10506779 lnc-C17orf75-9:1 Yes chr2L:10491814-10506779 lnc-C17orf75-10:1 Yes chr2L:10491814-10506779 lnc-TMEM98-2:4 No - lnc-TMEM98-1:5 No - lnc-MYO1D-6:1 No - lnc-SPACA3-1:2 No - lnc-SPACA3-1:3 No - lnc-SPACA3-3:4 No - lnc-CCL1-12:3 No - lnc-CCL2-3:2 No - LINC01989:18 No - lnc-CCL2-2:3 No - lnc-CCL2-2:4 No - lnc-CCL1-4:1 No - lnc-CCL13-1:2 No - lnc-CCL13-1:3 No - lnc-TMEM132E-1:3 No - lnc-CCT6B-6:2 No - lnc-CCT6B-2:1 No - lnc-LIG3-2:1 Yes chrX:15746648-15748971 lnc-LIG3-1:4 No - lnc-CCT6B-4:1 No - lnc-RAD51D-1:1 No - lnc-FNDC8-1:1 No - lnc-RAD51D-2:2 No - lnc-RAD51D-2:3 No - lnc-NLE1-1:1 Yes chr3R:8033301-8037403 lnc-UNC45B-1:1 Yes chr3R:8033301-8037403 lnc-SLC35G3-1:4 No - lnc-SLC35G3-1:6 No - lnc-SLC35G3-1:5 No - lnc-SLFN11-2:1 No - lnc-SLFN5-1:10 No - lnc-SLFN5-1:11 No - lnc-SLFN5-2:1 No - lnc-SLFN12-6:1 No - lnc-SLFN12-5:2 No - lnc-SLFN12-5:1 No - lnc-SLFN11-1:1 No - lnc-SLFN12-3:1 No - lnc-SLFN12-2:1 No - lnc-SLFN12-1:2 No - lnc-SLFN12-1:3 No - lnc-SLFN12-1:1 No - lnc-SLFN13-1:1 No - lnc-SLFN12-4:1 No - lnc-SLFN12L-3:1 No - lnc-SLFN12L-3:2 No - lnc-SLFN13-2:2 No - lnc-SLFN14-3:1 No - lnc-SLFN14-2:1 No - lnc-SLFN12L-1:1 No - LINC02001:14 No - LINC02001:15 No - lnc-PEX12-1:1 Yes chrX:19731004-19734581 lnc-GAS2L2-1:2 Yes chrX:19731004-19734581 lnc-RASL10B-1:2 No - lnc-GAS2L2-4:1 Yes chrX:16288810-16293520 lnc-MMP28-1:1 Yes chrX:16288810-16293520 lnc-MMP28-4:1 Yes chrX:16288810-16293520 lnc-C17orf50-1:1 Yes chrX:16288810-16293520 lnc-CCL5-3:1 No - lnc-CCL5-1:1 No - lnc-TAF15-1:2 No - lnc-TAF15-1:3 No - lnc-RDM1-1:8 No - lnc-TAF15-5:1 No - lnc-RDM1-1:3 No - lnc-RDM1-1:5 No - lnc-RDM1-1:2 No - lnc-CCL18-4:1 No - lnc-CCL18-1:2 No - lnc-CCL18-1:3 No - lnc-CCL3-1:1 No - lnc-CCL3-1:2 No - lnc-CCL3-1:4 No - lnc-CCL3-1:3 No - lnc-CCL4-1:1 No - lnc-CCL4-3:1 Yes chr2R:13984815-13990707 lnc-CCL4L2-2:1 No - lnc-CCL3L1-2:3 Yes chr2R:13984815-13990707 lnc-CCL4-3:2 Yes chr2R:13984815-13990707 lnc-CCL4L2-1:3 No - lnc-CCL4L2-1:4 No - lnc-CCL3L1-1:2 No - lnc-CCL3L1-1:3 No - lnc-TBC1D3I-3:1 No - lnc-TBC1D3I-1:1 No - lnc-TBC1D3F-6:1 Yes chr2R:13984815-13990707 lnc-TBC1D3F-4:2 Yes chr2R:13984815-13990707 lnc-TBC1D3H-3:1 Yes chr2R:13984815-13990707 lnc-TBC1D3F-5:1 No - lnc-TBC1D3H-6:1 Yes chr2R:13984815-13990707 lnc-TBC1D3H-7:1 Yes chr2R:13984815-13990707 lnc-TBC1D3H-1:1 Yes chr2R:13984815-13990707 lnc-TBC1D3H-1:2 Yes chr2R:13984815-13990707 lnc-MYO19-2:1 No - lnc-MYO19-2:3 No - lnc-MYO19-2:2 No - lnc-TBC1D3F-1:6 No - lnc-TBC1D3F-1:7 No - lnc-TBC1D3F-2:4 Yes chr2L:8466817-8488671 lnc-TBC1D3F-2:2 Yes chr2L:8466817-8488671 lnc-TBC1D3F-2:3 Yes chr2L:8466817-8488671 lnc-TBC1D3F-3:2 Yes chr2L:8466817-8488671 lnc-TBC1D3F-7:1 Yes chr2L:8466817-8488671 lnc-TBC1D3F-8:1 Yes chr2L:8466817-8488671 lnc-MYO19-1:7 Yes chr2L:8466817-8488671 lnc-MYO19-1:6 Yes chr2L:8466817-8488671 lnc-MYO19-1:4 Yes chr2L:8466817-8488671 lnc-MYO19-1:5 Yes chr2L:8466817-8488671 lnc-MYO19-1:3 Yes chr2L:8466817-8488671 lnc-MYO19-1:2 Yes chr2L:8466817-8488671 lnc-MRM1-5:1 No - lnc-MRM1-6:1 No - lnc-MRM1-7:1 No - lnc-MRM1-2:2 No - lnc-LHX1-4:1 No - LHX1-DT:22 No - LHX1-DT:17 No - LHX1-DT:21 No - LHX1-DT:18 No - lnc-LHX1-1:1 Yes chr2L:6717625-6719389 lnc-LHX1-2:1 Yes chr2L:6717625-6719389 lnc-LHX1-3:1 Yes chr2L:6717625-6719389 lnc-ACACA-3:1 Yes chr2L:6717625-6719389 lnc-SYNRG-4:1 Yes chr2R:7974115-7991862 lnc-AATF-4:1 Yes chr2R:7974115-7991862 lnc-SYNRG-3:1 Yes chr2R:7974115-7991862 lnc-SYNRG-2:1 Yes chr2R:7974115-7991862 lnc-SYNRG-6:2 Yes chr2R:7974115-7991862 lnc-SYNRG-6:1 Yes chr2R:7974115-7991862 lnc-TADA2A-2:1 Yes chr2R:7974115-7991862 lnc-SYNRG-1:6 Yes chr2R:7974115-7991862 lnc-ACACA-2:1 Yes chr3R:18252843-18255487 lnc-DUSP14-2:1 Yes chr3R:18252843-18255487 lnc-DUSP14-9:1 Yes chr3R:18252843-18255487 lnc-DUSP14-1:1 No - lnc-DDX52-4:1 No - lnc-DUSP14-3:1 No - lnc-DDX52-2:1 No - lnc-DUSP14-8:2 Yes chr3L:17802490-17804715 lnc-DUSP14-6:1 No - lnc-TBC1D3K-4:1 No - lnc-TBC1D3K-3:1 No - lnc-HNF1B-2:4 No - lnc-GPR179-1:1 Yes chr2L:12142780-12170508 lnc-SOCS7-1:1 No - lnc-GPR179-2:1 No - lnc-SOCS7-2:1 No - lnc-SRCIN1-1:13 Yes chrX:20469955-20510694 lnc-EPOP-1:1 Yes chrX:1673110-1692768 lnc-SRCIN1-2:1 No - lnc-SRCIN1-3:1 No - lnc-SRCIN1-4:1 No - lnc-PCGF2-5:1 No - lnc-EPOP-2:8 No - lnc-PCGF2-3:1 Yes chr3R:7094596-7124185 lnc-CISD3-1:2 Yes chr3R:7094596-7124185 lnc-PCGF2-4:2 Yes chr4:1192419-1196848 lnc-PCGF2-4:1 Yes chr4:1192419-1196848 lnc-CWC25-1:1 Yes chr4:1192419-1196848 lnc-PIP4K2B-1:1 Yes chr2L:2745098-2746944 lnc-PIP4K2B-2:2 Yes chr2L:2745098-2746944 lnc-C17orf98-1:3 Yes chr2R:22854383-22855694 lnc-C17orf98-1:5 Yes chr2R:22854383-22855694 lnc-C17orf98-1:1 Yes chr2R:22854383-22855694 lnc-C17orf98-1:2 Yes chr2R:22854383-22855694 lnc-C17orf98-1:4 Yes chr2R:22854383-22855694 lnc-LASP1-3:1 No - lnc-LINC00672-1:1 Yes chr3L:16676406-16711677 lnc-FBXO47-4:1 No - lnc-PLXDC1-3:2 No - lnc-PLXDC1-3:1 No - lnc-LINC00672-4:1 No - lnc-LINC00672-4:2 No - lnc-LINC00672-4:3 No - lnc-LINC00672-4:4 No - lnc-LINC00672-5:1 No - lnc-ARL5C-9:3 Yes chrX:10348680-10366273 lnc-ARL5C-9:1 Yes chrX:10348680-10366273 lnc-ARL5C-9:2 Yes chrX:10348680-10366273 lnc-ARL5C-8:1 Yes chrX:10348680-10366273 lnc-RPL19-4:1 Yes chrX:10348680-10366273 lnc-ARL5C-4:1 Yes chrX:10348680-10366273 lnc-ARL5C-1:2 Yes chr3L:8298501-8299839 lnc-ARL5C-1:3 Yes chr3L:8298501-8299839 lnc-ARL5C-1:1 Yes chr3L:8298501-8299839 lnc-ARL5C-2:1 Yes chr2L:11156118-11203544 lnc-ARL5C-3:1 Yes chr2L:11156118-11203544 lnc-STAC2-2:2 Yes chr2L:11156118-11203544 lnc-STAC2-2:1 Yes chr2L:11156118-11203544 lnc-RPL19-6:1 No - lnc-RPL19-6:2 No - lnc-RPL19-6:3 No - lnc-RPL19-6:4 No - lnc-RPL19-6:5 No - lnc-RPL19-6:6 No - lnc-RPL19-6:7 No - lnc-RPL19-6:8 No - lnc-FBXL20-1:3 Yes chr2R:11641477-11651616 lnc-FBXL20-3:1 Yes chr3L:21628325-21634446 lnc-FBXL20-2:1 Yes chr3L:21628325-21634446 lnc-CDK12-1:6 Yes chr3L:21516306-21522684 lnc-CDK12-1:7 Yes chr3L:21516306-21522684 lnc-CDK12-1:8 Yes chr3L:21516306-21522684 lnc-CDK12-1:9 Yes chr3L:21516306-21522684 lnc-CDK12-1:10 Yes chr3L:21516306-21522684 lnc-CDK12-1:11 Yes chr3L:21516306-21522684 lnc-CDK12-1:12 Yes chr3L:21516306-21522684 lnc-CDK12-1:13 Yes chr3L:21516306-21522684 lnc-NEUROD2-2:1 No - lnc-NEUROD2-3:1 No - lnc-PNMT-1:1 No - lnc-MIEN1-2:2 No - lnc-MIEN1-2:3 No - lnc-MIEN1-2:1 No - lnc-ZPBP2-1:1 No - lnc-ZPBP2-2:1 No - lnc-ZPBP2-3:1 No - lnc-ZPBP2-5:1 No - lnc-ZPBP2-4:1 No - lnc-ORMDL3-1:1 No - lnc-GSDMB-1:1 Yes chr3L:21635305-21636251 lnc-LRRC3C-2:1 Yes chr3L:21635305-21636251 lnc-GSDMB-2:1 Yes chr3L:21635305-21636251 lnc-LRRC3C-1:5 No - lnc-ORMDL3-2:1 No - lnc-NR1D1-5:2 Yes chr3L:8191270-8196573 lnc-NR1D1-5:1 Yes chr3L:8191270-8196573 lnc-NR1D1-4:1 Yes chr3L:8191270-8196573 lnc-NR1D1-33:1 Yes chr3L:8191270-8196573 lnc-NR1D1-3:8 Yes chr3L:8191270-8196573 lnc-MED24-4:1 Yes chr3L:21226609-21266503 lnc-NR1D1-1:4 No - lnc-NR1D1-2:1 No - lnc-CDC6-1:1 Yes chr3L:8631509-8634069 lnc-CDC6-3:1 Yes chr2R:6087873-6169087 RARA-AS1:4 Yes chr2R:6087873-6169087 RARA-AS1:1 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-RARA-2:1 No - lnc-GJD3-2:1 Yes chr2L:19447365-19453490 lnc-TOP2A-1:1 No - lnc-TNS4-2:1 No - lnc-TNS4-1:1 Yes chr3R:9528238-9533011 lnc-IGFBP4-1:6 No - lnc-IGFBP4-2:1 No - lnc-SMARCE1-2:1 No - lnc-KRT222-1:1 No - lnc-TMEM99-5:2 No - lnc-KRT24-1:1 No - lnc-KRT24-2:2 No - lnc-KRT24-2:1 No - lnc-KRT27-1:1 No - lnc-KRT12-1:1 No - lnc-KRT23-1:2 No - lnc-KRT23-1:1 No - lnc-KRTAP3-1-2:1 No - lnc-KRTAP3-1-1:1 No - lnc-KRTAP4-7-1:1 No - lnc-KRTAP4-8-1:1 No - lnc-KRTAP9-7-2:1 No - lnc-KRTAP9-7-3:1 No - lnc-KRTAP9-7-4:1 No - lnc-KRT32-1:1 No - lnc-KRT36-1:1 No - lnc-KRT15-2:1 No - lnc-KRT13-1:1 No - lnc-KRT15-1:1 No - lnc-KRT9-2:1 No - lnc-KRT17-1:4 No - lnc-KRT17-2:2 No - lnc-KRT17-2:1 No - lnc-EIF1-3:1 No - lnc-GAST-2:1 Yes chr3L:3223341-3224650 lnc-JUP-2:1 Yes chr2L:7037823-7056010 lnc-NT5C3B-3:1 No - lnc-NT5C3B-2:1 No - lnc-P3H4-1:1 No - lnc-P3H4-1:3 Yes chr2R:24195498-24197027 lnc-NT5C3B-1:1 Yes chrUnmapped_Scaffold_8:53442-85529 lnc-KLHL11-2:1 Yes chr2R:15993531-16001290 lnc-TTC25-3:1 Yes chr2R:15993531-16001290 lnc-ACLY-2:1 Yes chr2R:15993531-16001290 lnc-TTC25-4:1 No - lnc-ZNF385C-6:1 Yes chr2L:16491540-16507621 lnc-ZNF385C-7:1 Yes chr2L:16491540-16507621 lnc-ZNF385C-5:2 Yes chr2L:16491540-16507621 lnc-ZNF385C-4:2 No - lnc-ZNF385C-4:3 No - lnc-ZNF385C-4:1 No - lnc-ZNF385C-1:1 No - lnc-ZNF385C-1:2 No - lnc-C17orf113-2:1 No - lnc-C17orf113-1:1 No - lnc-ZNF385C-8:1 No - lnc-DHX58-1:1 No - lnc-KCNH4-1:1 No - lnc-HSPB9-2:1 No - lnc-HSPB9-3:1 No - lnc-HSPB9-4:1 No - lnc-STAT5B-1:1 No - lnc-STAT5B-1:3 No - lnc-STAT5B-1:2 No - lnc-STAT5A-1:1 Yes chr3R:20535323-20552311 lnc-STAT3-1:2 Yes chr3R:20535323-20552311 lnc-STAT5B-2:1 Yes chr3R:20535323-20552311 lnc-STAT5B-3:2 Yes chr3R:20535323-20552311 lnc-STAT5B-3:1 Yes chr3R:20535323-20552311 lnc-CAVIN1-1:1 Yes chr3R:20535323-20552311 lnc-ATP6V0A1-2:1 No - lnc-NAGLU-4:1 Yes chr3R:29131193-29137980 lnc-NAGLU-3:1 Yes chr3R:29131193-29137980 lnc-NAGLU-2:1 No - lnc-NAGLU-1:1 No - lnc-PSMC3IP-3:4 No - lnc-PSMC3IP-3:3 No - lnc-PSMC3IP-3:2 No - lnc-PSMC3IP-3:1 No - lnc-COASY-2:3 Yes chr3L:5767017-5768794 lnc-PSMC3IP-1:1 Yes chr3R:27287366-27288526 lnc-RETREG3-1:1 No - lnc-MLX-2:1 No - lnc-MLX-3:1 No - lnc-PSMC3IP-2:2 No - lnc-PSMC3IP-2:3 No - lnc-TUBG1-1:1 No - lnc-TUBG2-1:1 No - lnc-CCR10-1:3 Yes chrX:808217-927975 lnc-CCR10-4:1 No - lnc-CCR10-3:1 Yes chr3L:10634575-10638130 lnc-CNTNAP1-2:1 Yes chr3L:10634575-10638130 lnc-CCR10-5:1 Yes chr3L:10634575-10638130 lnc-CCR10-5:2 Yes chr3L:10634575-10638130 lnc-COA3-5:1 Yes chr3L:10634575-10638130 RAMP2-AS1:22 No - RAMP2-AS1:23 No - RAMP2-AS1:1 No - RAMP2-AS1:2 No - RAMP2-AS1:3 No - RAMP2-AS1:6 No - RAMP2-AS1:4 No - RAMP2-AS1:8 No - lnc-COA3-2:1 No - lnc-COA3-4:2 Yes chr3R:24049180-24050782 lnc-COA3-4:1 Yes chr3R:24049180-24050782 lnc-PSME3-1:1 No - lnc-AOC3-2:1 No - lnc-AOC3-4:1 No - LINC00671:2 No - lnc-AOC3-3:1 No - lnc-G6PC-1:1 No - lnc-PTGES3L-AARSD1-3:1 No - lnc-RUNDC1-2:1 No - lnc-RUNDC1-1:1 No - lnc-PTGES3L-AARSD1-2:5 Yes chrX:3482965-3484555 lnc-PTGES3L-AARSD1-2:6 Yes chrX:3482965-3484555 lnc-PTGES3L-AARSD1-2:4 Yes chrX:3482965-3484555 lnc-PTGES3L-AARSD1-2:7 Yes chrX:3482965-3484555 lnc-PTGES3L-AARSD1-2:3 Yes chrX:3482965-3484555 lnc-PTGES3L-AARSD1-2:2 Yes chrX:3482965-3484555 lnc-PTGES3L-AARSD1-2:1 Yes chrX:3482965-3484555 lnc-AARSD1-2:8 Yes chrX:3482965-3484555 lnc-IFI35-1:1 Yes chr3R:9497101-9502581 NBR2:1 No - NBR2:2 No - NBR2:3 No - NBR2:4 No - NBR2:5 No - NBR2:7 No - lnc-BRCA1-3:8 No - lnc-BRCA1-3:9 No - lnc-BRCA1-3:5 No - lnc-BRCA1-3:2 No - lnc-LINC00854-1:30 No - lnc-LINC00854-1:38 No - lnc-LINC00854-1:24 No - lnc-LINC00854-1:28 No - lnc-LINC00854-1:21 No - lnc-LINC00854-1:31 No - lnc-LINC00854-1:32 No - lnc-LINC00854-1:33 No - lnc-LINC00854-1:34 No - lnc-LINC00854-1:35 No - lnc-LINC00854-1:37 No - lnc-LINC00854-1:26 No - lnc-LINC00854-1:25 No - lnc-TMEM106A-3:1 No - LINC00910:30 No - LINC00910:2 No - LINC00910:3 No - LINC00910:4 No - LINC00910:10 No - LINC00910:6 No - LINC00910:8 No - LINC00910:7 No - LINC00910:1 No - lnc-ETV4-3:1 No - lnc-ARL4D-2:1 No - MIR2117HG:1 No - lnc-DHX8-2:1 No - lnc-MEOX1-3:2 No - lnc-MEOX1-3:3 No - lnc-MEOX1-3:1 No - lnc-DHX8-6:1 Yes chr3R:24788054-24797955 LINC02594:3 No - lnc-SOST-1:1 Yes chrX:18900410-18911843 lnc-DUSP3-1:1 No - lnc-DUSP3-2:2 Yes chr2R:11226458-11232516 lnc-PPY-2:1 Yes chr2L:20788662-20797042 lnc-MPP2-1:2 No - lnc-MPP2-1:3 No - lnc-MPP2-2:1 No - lnc-MPP2-2:2 No - lnc-CD300LG-2:1 No - lnc-CD300LG-2:2 No - lnc-NAGS-1:4 No - lnc-PPY-1:2 No - lnc-PPY-1:1 No - lnc-NAGS-3:1 No - lnc-TMEM101-1:2 No - lnc-TMEM101-1:3 No - lnc-TMEM101-2:1 Yes chrX:12018640-12020719 lnc-LSM12-2:1 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-C17orf53-1:1 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-ATXN7L3-3:1 No - ASB16-AS1:1 No - ASB16-AS1:2 No - ASB16-AS1:6 No - ASB16-AS1:3 No - lnc-TMUB2-2:1 Yes chr3L:18681037-18681836 lnc-UBTF-4:2 Yes chr3L:18681037-18681836 lnc-UBTF-4:1 Yes chr3L:18681037-18681836 lnc-ATXN7L3-2:1 No - lnc-TMUB2-1:2 No - lnc-TMUB2-1:3 No - lnc-TMUB2-1:4 No - lnc-UBTF-1:1 No - lnc-SLC4A1-1:1 Yes chr3L:9763544-9786466 lnc-SLC4A1-2:1 No - lnc-SLC4A1-3:1 No - RUNDC3A-AS1:3 Yes chr3R:27229505-27239085 RUNDC3A-AS1:5 No - lnc-SLC25A39-2:1 Yes chrX:19611526-19615617 lnc-FAM171A2-2:1 Yes chrX:19611526-19615617 lnc-RUNDC3A-2:1 No - lnc-RUNDC3A-3:1 No - lnc-FAM171A2-1:1 No - lnc-ITGA2B-1:1 No - lnc-FZD2-2:1 No - lnc-GPATCH8-2:1 Yes chr3L:14274343-14368639 lnc-FZD2-1:1 No - LINC01180:1 No - lnc-GJC1-4:1 No - lnc-CCDC43-3:1 No - lnc-CCDC43-4:1 No - lnc-CCDC43-5:1 No - lnc-ADAM11-2:1 No - lnc-GJC1-1:1 No - lnc-HIGD1B-2:1 No - lnc-GJC1-2:1 Yes chr3R:27963415-27966958 lnc-GFAP-4:1 Yes chr3R:27963415-27966958 lnc-CCDC103-4:1 Yes chr3R:27963415-27966958 lnc-GFAP-3:2 No - lnc-GFAP-3:3 Yes chr3R:27963415-27966958 lnc-GFAP-3:1 No - lnc-GFAP-1:3 No - lnc-GFAP-1:2 No - lnc-CCDC103-2:3 No - lnc-EFTUD2-1:4 No - lnc-EFTUD2-1:3 No - lnc-EFTUD2-1:1 No - lnc-EFTUD2-1:2 No - lnc-EFTUD2-2:1 No - lnc-GFAP-2:1 Yes chr3L:9362636-9367046 lnc-CCDC103-6:5 No - lnc-NMT1-9:1 No - lnc-NMT1-8:1 No - lnc-DCAKD-1:1 No - lnc-NMT1-1:1 No - lnc-NMT1-1:2 Yes chr3L:8176135-8178429 lnc-DCAKD-4:1 No - lnc-DCAKD-5:1 No - lnc-ACBD4-1:1 No - lnc-ACBD4-1:2 No - lnc-ACBD4-1:3 No - lnc-PLCD3-1:17 No - lnc-PLCD3-1:15 No - lnc-PLCD3-4:3 No - lnc-PLCD3-4:10 No - lnc-PLCD3-4:12 No - lnc-PLCD3-4:9 No - lnc-PLCD3-4:2 No - lnc-PLCD3-3:2 No - lnc-PLCD3-3:1 No - lnc-HEXIM2-1:1 No - lnc-SPATA32-2:13 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-HEXIM2-2:1 No - lnc-FMNL1-7:1 No - lnc-SPATA32-2:14 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-SPATA32-2:16 No - lnc-SPATA32-2:5 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-SPATA32-2:18 No - lnc-SPATA32-2:15 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-FMNL1-3:1 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-SPATA32-1:1 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-SPATA32-1:5 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-SPATA32-4:1 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-SPATA32-4:4 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-SPATA32-4:5 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-SPATA32-4:3 No - lnc-ARHGAP27-3:1 No - lnc-PLEKHM1-6:3 No - lnc-PLEKHM1-6:2 No - lnc-PLEKHM1-6:1 No - lnc-PLEKHM1-2:1 No - lnc-ARHGAP27-1:5 Yes chr2R:22103177-22105963 lnc-ARHGAP27-1:6 Yes chr2R:22103177-22105963 lnc-ARHGAP27-2:1 Yes chr2R:22103177-22105963 lnc-PLEKHM1-1:3 Yes chr2R:22103177-22105963 lnc-ARHGAP27-5:1 Yes chr2R:22103177-22105963 lnc-PLEKHM1-1:2 Yes chr2R:22103177-22105963 lnc-LINC02210-CRHR1-9:1 No - lnc-PLEKHM1-3:4 No - lnc-PLEKHM1-3:6 No - lnc-PLEKHM1-3:9 No - lnc-PLEKHM1-3:8 No - lnc-LINC02210-CRHR1-8:1 No - lnc-PLEKHM1-4:1 No - lnc-LINC02210-CRHR1-6:1 No - lnc-PLEKHM1-3:5 No - lnc-PLEKHM1-5:1 No - lnc-LINC02210-CRHR1-5:1 No - lnc-LINC02210-CRHR1-9:2 No - lnc-PLEKHM1-8:1 No - lnc-LINC02210-CRHR1-2:1 No - lnc-LINC02210-CRHR1-2:2 No - lnc-LINC02210-CRHR1-2:3 No - lnc-LINC02210-CRHR1-2:4 No - lnc-PLEKHM1-7:1 No - lnc-LINC02210-CRHR1-4:1 No - lnc-LINC02210-CRHR1-3:1 No - lnc-PLEKHM1-8:2 No - lnc-LINC02210-CRHR1-7:1 No - lnc-PLEKHM1-9:1 No - lnc-PLEKHM1-9:2 No - lnc-LINC02210-CRHR1-1:1 No - lnc-LINC02210-CRHR1-1:2 No - lnc-LINC02210-CRHR1-52:2 Yes chr2R:12474424-12487986 lnc-LINC02210-CRHR1-52:4 Yes chr2R:12474424-12487986 lnc-LINC02210-CRHR1-52:5 Yes chr2R:12474424-12487986 lnc-LINC02210-CRHR1-52:6 Yes chr2R:12474424-12487986 lnc-LINC02210-CRHR1-52:7 Yes chr2R:12474424-12487986 lnc-LINC02210-CRHR1-52:10 Yes chr2R:12474424-12487986 lnc-LINC02210-CRHR1-52:11 Yes chr2R:12474424-12487986 lnc-PLEKHM1-10:1 Yes chr2R:12474424-12487986 lnc-LINC02210-CRHR1-52:12 Yes chr2R:12474424-12487986 lnc-LINC02210-CRHR1-52:13 Yes chr2R:12474424-12487986 lnc-LINC02210-CRHR1-52:14 Yes chr2R:12474424-12487986 lnc-LINC02210-CRHR1-52:15 Yes chr2R:12474424-12487986 lnc-LINC02210-CRHR1-52:17 Yes chr2R:12474424-12487986 lnc-LINC02210-CRHR1-52:18 Yes chr2R:12474424-12487986 lnc-LINC02210-CRHR1-52:25 Yes chr2R:12474424-12487986 lnc-LINC02210-CRHR1-52:26 Yes chr2R:12474424-12487986 lnc-LINC02210-CRHR1-52:27 Yes chr2R:12474424-12487986 lnc-PLEKHM1-12:2 Yes chr2R:12474424-12487986 MAPT-AS1:4 No - MAPT-AS1:5 No - MAPT-IT1:1 Yes chr3R:27639886-27656996 lnc-KANSL1-1:1 Yes chr3R:27639886-27656996 lnc-KANSL1-7:1 Yes chr3R:27639886-27656996 lnc-KANSL1-7:2 Yes chr3R:27639886-27656996 lnc-KANSL1-7:3 Yes chr3R:27639886-27656996 lnc-KANSL1-7:4 Yes chr3R:27639886-27656996 lnc-KANSL1-4:3 Yes chr3R:27639886-27656996 lnc-KANSL1-4:1 Yes chr3R:27639886-27656996 lnc-KANSL1-4:4 Yes chr3R:27639886-27656996 lnc-KANSL1-4:5 Yes chr3R:27639886-27656996 lnc-ARL17B-2:4 Yes chr3R:15793782-15802102 lnc-ARL17B-2:3 Yes chr3R:15793782-15802102 lnc-ARL17B-2:2 Yes chr3R:15793782-15802102 lnc-ARL17B-2:1 Yes chr3R:15793782-15802102 KANSL1-AS1:1 Yes chr3R:15793782-15802102 lnc-LRRC37A-2:1 No - lnc-LRRC37A-2:2 No - lnc-LRRC37A2-4:1 No - lnc-NSF-3:1 No - lnc-NSF-2:1 No - lnc-WNT3-1:3 No - lnc-WNT3-1:2 No - LINC01974:4 No - lnc-RPRML-3:20 Yes chr3L:5366455-5367381 lnc-RPRML-3:25 Yes chr3L:5366455-5367381 lnc-GOSR2-1:1 Yes chr3L:5366455-5367381 lnc-GOSR2-2:2 Yes chr3L:5366455-5367381 lnc-GOSR2-2:3 Yes chr3L:5366455-5367381 lnc-RPRML-3:24 Yes chr3L:5366455-5367381 lnc-RPRML-3:17 No - lnc-RPRML-3:23 No - lnc-RPRML-3:22 No - lnc-RPRML-3:19 No - lnc-GOSR2-2:4 No - lnc-RPRML-3:13 No - lnc-RPRML-3:21 No - lnc-CDC27-3:1 No - lnc-RPRML-3:16 No - lnc-RPRML-3:18 No - lnc-RPRML-3:14 No - lnc-RPRML-3:15 No - lnc-CDC27-7:2 Yes chr3L:7245481-7249340 lnc-CDC27-7:5 Yes chr3L:7245481-7249340 lnc-CDC27-7:4 Yes chr3L:7245481-7249340 lnc-CDC27-7:1 Yes chr3L:7245481-7249340 lnc-CDC27-7:3 Yes chr3L:7245481-7249340 lnc-MYL4-3:1 No - lnc-CDC27-2:5 No - lnc-CDC27-2:8 No - lnc-CDC27-2:2 No - lnc-NPEPPS-2:1 No - lnc-EFCAB13-1:1 No - lnc-CDC27-9:1 No - lnc-CDC27-9:3 No - lnc-CDC27-9:5 No - lnc-CDC27-9:2 No - lnc-CDC27-9:4 No - lnc-OSBPL7-3:15 Yes chr3L:1502843-1523380 lnc-NPEPPS-1:1 No - lnc-NPEPPS-1:2 No - lnc-NPEPPS-1:3 No - lnc-OSBPL7-3:2 Yes chr2L:20734609-20750941 lnc-MRPL10-1:1 No - lnc-MRPL10-1:2 No - lnc-SCRN2-1:2 Yes chr2L:203779-204782 lnc-SP6-3:3 Yes chr3R:7124548-7126503 lnc-SP6-3:1 Yes chr3R:7124548-7126503 lnc-SP6-3:2 Yes chr3R:7124548-7126503 SP2-AS1:13 No - SP2-AS1:10 No - SP2-AS1:9 No - SP2-AS1:3 No - SP2-AS1:4 No - SP2-AS1:8 No - lnc-PNPO-1:1 No - lnc-COPZ2-2:2 No - lnc-COPZ2-2:3 No - lnc-COPZ2-1:7 No - lnc-COPZ2-1:6 No - lnc-SNX11-10:1 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-SNX11-10:2 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-SNX11-10:3 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-SNX11-10:4 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-SNX11-6:1 No - lnc-SNX11-7:1 No - lnc-SNX11-8:1 No - lnc-CBX1-3:1 No - lnc-SNX11-2:4 No - lnc-HOXB1-2:1 No - lnc-PRAC2-3:2 No - lnc-HOXB2-1:1 Yes chr3R:6707800-6742063 lnc-HOXB2-1:2 Yes chr3R:6707800-6742063 HOXB-AS3:21 No - lnc-HOXB2-2:1 Yes chr3R:6752864-6754194 lnc-HOXB3-2:2 Yes chr3R:6752864-6754194 lnc-HOXB3-2:1 No - lnc-PRAC2-13:1 Yes chr3R:6752864-6754194 HOXB-AS3:22 No - HOXB-AS3:27 No - HOXB-AS3:28 No - HOXB-AS3:30 No - HOXB-AS3:32 No - HOXB-AS3:35 No - HOXB-AS3:36 No - HOXB-AS3:37 No - lnc-HOXB5-1:1 No - lnc-HOXB7-2:1 No - HOXB-AS3:38 No - HOXB-AS3:39 No - lnc-HOXB8-1:8 No - lnc-HOXB8-1:16 No - lnc-PRAC1-1:1 No - lnc-PRAC2-11:1 No - lnc-PRAC2-10:1 No - lnc-HOXB13-1:1 Yes chr3R:27248234-27251007 lnc-HOXB13-2:1 Yes chr3R:27248234-27251007 lnc-CALCOCO2-9:1 No - lnc-SNF8-1:1 No - lnc-SNF8-1:2 No - lnc-ATP5MC1-1:1 No - lnc-GIP-5:1 Yes chr3R:21865168-21866238 lnc-GIP-4:1 Yes chr3R:21865168-21866238 lnc-GIP-4:2 Yes chr3R:21865168-21866238 lnc-UBE2Z-2:1 Yes chr3R:21865168-21866238 lnc-GIP-3:1 No - lnc-GIP-1:2 No - lnc-B4GALNT2-3:1 Yes chrX:10787869-10824277 lnc-B4GALNT2-2:1 Yes chrX:10787869-10824277 lnc-IGF2BP1-1:1 No - lnc-ABI3-1:4 No - lnc-ABI3-2:10 No - lnc-ABI3-3:1 No - lnc-ABI3-5:1 No - lnc-ZNF652-1:1 No - lnc-PHB-3:1 No - lnc-NGFR-3:25 No - lnc-NGFR-3:26 No - lnc-NGFR-3:7 No - lnc-ZNF652-2:1 Yes chr2L:19121345-19123869 lnc-ZNF652-3:1 Yes chr2L:19121345-19123869 lnc-ZNF652-4:1 Yes chr2L:19121345-19123869 lnc-NXPH3-1:1 No - lnc-SLC35B1-4:2 Yes chr3R:13967061-14032057 lnc-SLC35B1-4:1 Yes chr3R:13967061-14032057 lnc-SLC35B1-3:1 Yes chr3R:13967061-14032057 lnc-SLC35B1-2:1 Yes chr3R:13967061-14032057 lnc-SLC35B1-2:2 Yes chr3R:13967061-14032057 lnc-SLC35B1-2:3 Yes chr3R:13967061-14032057 lnc-KAT7-5:1 No - lnc-FAM117A-2:1 Yes chr3R:21138270-21140365 lnc-FAM117A-3:1 Yes chr3R:21138270-21140365 lnc-FAM117A-1:5 No - lnc-FAM117A-1:4 No - lnc-FAM117A-1:2 No - lnc-FAM117A-1:7 No - lnc-FAM117A-1:3 No - lnc-FAM117A-1:6 No - lnc-FAM117A-1:8 No - lnc-KAT7-2:2 No - lnc-ITGA3-3:1 Yes chr2R:24814822-24835667 lnc-DLX3-3:12 No - lnc-DLX3-3:8 No - lnc-PPP1R9B-8:2 No - lnc-PPP1R9B-8:1 No - lnc-PPP1R9B-7:2 No - lnc-PPP1R9B-7:1 No - lnc-PPP1R9B-2:1 Yes chr2L:8303429-8305376 lnc-COL1A1-6:3 Yes chr2L:8303429-8305376 lnc-COL1A1-6:2 Yes chr2L:8303429-8305376 lnc-COL1A1-6:1 Yes chr2L:8303429-8305376 lnc-PPP1R9B-4:2 No - lnc-PPP1R9B-5:5 No - lnc-PPP1R9B-5:3 No - lnc-PPP1R9B-5:4 No - lnc-PPP1R9B-5:2 No - lnc-PPP1R9B-5:1 No - lnc-PPP1R9B-6:2 No - lnc-PPP1R9B-6:1 No - lnc-COL1A1-5:1 No - LINC01969:16 No - lnc-TMEM92-3:2 No - lnc-TMEM92-2:1 No - lnc-TMEM92-1:1 No - lnc-TMEM92-1:2 No - lnc-LRRC59-1:1 Yes chr2L:4458595-4459638 lnc-CHAD-6:1 Yes chr2L:5339132-5342234 lnc-MYCBPAP-2:1 No - lnc-MYCBPAP-2:3 No - lnc-MYCBPAP-2:4 No - lnc-MYCBPAP-2:5 No - lnc-LINC00483-7:1 No - lnc-LUC7L3-6:1 Yes chrX:6668539-6673973 lnc-LINC00483-1:2 No - lnc-LINC00483-1:18 No - lnc-LINC00483-1:17 No - lnc-TOB1-1:2 No - lnc-WFIKKN2-3:1 No - TOB1-AS1:3 Yes chrX:16074717-16091495 TOB1-AS1:6 Yes chrX:16074717-16091495 lnc-TOB1-3:1 No - lnc-WFIKKN2-4:1 No - lnc-TOB1-4:1 Yes chr3L:7916650-7936120 lnc-TOB1-5:1 Yes chr3L:7916650-7936120 lnc-TOB1-6:1 Yes chr3L:7916650-7936120 lnc-MBTD1-3:2 Yes chr3L:7916650-7936120 lnc-MBTD1-3:1 Yes chr3L:7916650-7936120 lnc-SPAG9-3:1 Yes chr2L:13169649-13176785 lnc-SPAG9-2:2 Yes chr2L:13169649-13176785 lnc-MBTD1-2:1 No - lnc-UTP18-2:2 No - LINC02073:4 No - lnc-CA10-1:1 No - lnc-MBTD1-4:1 Yes chrX:7826197-7842679 lnc-MBTD1-5:1 Yes chrX:7826197-7842679 LINC02089:4 No - lnc-CA10-3:1 No - lnc-KIF2B-6:1 No - lnc-KIF2B-4:1 No - lnc-KIF2B-4:2 No - lnc-CA10-4:1 No - lnc-KIF2B-3:1 No - lnc-KIF2B-2:1 No - lnc-COX11-6:1 No - lnc-COX11-5:2 No - lnc-COX11-5:1 No - lnc-TOM1L1-9:1 No - lnc-COX11-3:1 No - lnc-TOM1L1-7:1 No - lnc-STXBP4-8:1 No - lnc-COX11-2:5 No - lnc-COX11-2:6 No - lnc-COX11-2:3 No - lnc-MMD-9:1 No - lnc-COX11-2:4 No - lnc-HLF-3:2 No - lnc-STXBP4-1:2 No - lnc-STXBP4-1:3 No - lnc-STXBP4-1:4 No - lnc-STXBP4-1:5 No - lnc-STXBP4-6:2 Yes chr3L:7811458-7867369 lnc-SMIM36-6:1 Yes chrX:7098578-7102300 lnc-SMIM36-7:1 No - lnc-SMIM36-8:2 No - lnc-SMIM36-8:3 No - lnc-SMIM36-8:1 No - lnc-NOG-1:2 Yes chr3R:22639808-22683827 lnc-C17orf67-3:1 No - lnc-C17orf67-4:1 No - lnc-SCPEP1-3:1 Yes chr2R:12757546-12759724 lnc-DGKE-3:1 No - lnc-DGKE-4:1 No - lnc-DGKE-5:1 No - lnc-DGKE-6:1 No - lnc-TRIM25-1:1 No - lnc-COIL-7:1 No - lnc-COIL-6:2 No - lnc-COIL-6:1 No - lnc-COIL-5:1 No - lnc-COIL-2:8 No - lnc-COIL-3:2 Yes chrX:5412386-5420867 lnc-MSI2-2:2 No - lnc-CCDC182-5:1 Yes chr3R:25516118-25608423 lnc-DYNLL2-6:1 Yes chr3R:25516118-25608423 lnc-DYNLL2-4:1 Yes chr3R:25516118-25608423 lnc-MSI2-1:2 No - lnc-MRPS23-1:3 No - lnc-MSI2-4:1 No - lnc-MRPS23-2:1 No - lnc-MSI2-5:1 Yes chr2L:13834250-13835072 lnc-MRPS23-1:6 Yes chr2L:13834250-13835072 lnc-MRPS23-3:1 Yes chr3L:1857165-1859047 lnc-MRPS23-3:3 Yes chr3L:1857165-1859047 lnc-MRPS23-3:4 Yes chr3L:1857165-1859047 lnc-MRPS23-3:5 Yes chr3L:1857165-1859047 lnc-MRPS23-3:2 Yes chr3L:1857165-1859047 lnc-VEZF1-1:9 No - lnc-VEZF1-1:8 No - lnc-VEZF1-1:7 No - lnc-VEZF1-2:2 No - lnc-DYNLL2-3:2 No - lnc-MPO-3:1 Yes chrX:12494395-12496597 lnc-TSPOAP1-3:1 Yes chr3R:17425768-17446499 lnc-MPO-2:2 Yes chr3R:15374635-15402543 lnc-MPO-1:1 Yes chr3R:15374635-15402543 lnc-MPO-4:1 Yes chr3R:15374635-15402543 lnc-SUPT4H1-2:1 Yes chr3R:15374635-15402543 lnc-RNF43-2:2 Yes chr2R:12633589-12634172 lnc-SUPT4H1-1:1 No - lnc-RNF43-1:1 No - lnc-MTMR4-2:1 No - lnc-HSF5-1:1 Yes chrX:16296671-16303308 lnc-SEPT4-1:1 Yes chrX:16296671-16303308 lnc-C17orf47-2:3 Yes chrX:16684216-16695173 lnc-C17orf47-2:2 Yes chrX:16684216-16695173 lnc-C17orf47-2:1 Yes chrX:16684216-16695173 lnc-C17orf47-2:5 Yes chrX:16684216-16695173 lnc-C17orf47-2:4 Yes chrX:16684216-16695173 lnc-C17orf47-1:1 Yes chrX:16684216-16695173 lnc-C17orf47-3:1 No - lnc-RAD51C-3:1 Yes chr2L:18700606-18703105 lnc-SKA2-5:1 No - lnc-PPM1E-3:1 No - lnc-SKA2-4:1 No - lnc-SKA2-3:1 No - lnc-PRR11-1:2 No - lnc-TRIM37-1:1 No - lnc-TRIM37-1:2 No - lnc-GDPD1-1:1 No - lnc-GDPD1-2:1 Yes chrX:10205292-10212374 lnc-PTRH2-3:1 No - lnc-PTRH2-2:1 No - lnc-VMP1-1:1 No - lnc-CLTC-2:1 Yes chrX:10760048-10764413 lnc-RPS6KB1-2:1 Yes chr3L:6530729-6532429 lnc-RNFT1-2:7 No - lnc-RNFT1-2:6 No - lnc-RNFT1-2:5 No - lnc-RNFT1-2:4 No - lnc-RNFT1-2:3 No - lnc-RNFT1-1:1 Yes chrX:793147-797061 lnc-CA4-3:1 No - lnc-HEATR6-1:16 No - lnc-HEATR6-1:11 No - lnc-HEATR6-1:13 No - lnc-HEATR6-1:12 No - lnc-HEATR6-1:14 No - lnc-HEATR6-1:17 No - lnc-HEATR6-3:1 No - lnc-USP32-2:5 No - lnc-USP32-2:2 No - lnc-USP32-2:1 No - lnc-USP32-2:3 No - lnc-USP32-2:4 No - lnc-USP32-2:8 No - lnc-CA4-2:1 No - lnc-CA4-2:2 No - lnc-CA4-1:1 No - lnc-HEATR6-4:1 Yes chr3L:19871139-19881783 lnc-HEATR6-5:1 Yes chr3L:19871139-19881783 lnc-APPBP2-2:1 Yes chr3L:19871139-19881783 lnc-C17orf64-1:1 Yes chr3L:19871139-19881783 lnc-USP32-3:1 Yes chrX:6590776-6596954 lnc-C17orf64-2:1 Yes chrX:6590776-6596954 lnc-PPM1D-1:11 No - lnc-PPM1D-1:13 No - lnc-PPM1D-1:3 No - lnc-APPBP2-1:1 No - lnc-BCAS3-2:1 Yes chrX:4679988-4686903 lnc-PPM1D-3:1 Yes chrX:11816898-11837460 lnc-APPBP2-3:1 Yes chrX:11816898-11837460 lnc-PPM1D-7:1 Yes chrX:11816898-11837460 lnc-PPM1D-8:1 Yes chrX:11816898-11837460 lnc-APPBP2-4:1 Yes chrX:11816898-11837460 lnc-NACA2-7:1 Yes chrX:11816898-11837460 lnc-TBX2-7:1 Yes chrX:11816898-11837460 lnc-NACA2-6:1 Yes chrX:11816898-11837460 TBX2-AS1:3 No - lnc-TBX2-3:1 Yes chrX:11816898-11837460 lnc-TBX2-3:2 Yes chrX:11816898-11837460 TBX2-AS1:22 No - TBX2-AS1:21 No - TBX2-AS1:11 No - TBX2-AS1:13 No - TBX2-AS1:1 Yes chrX:4412856-4485647 TBX2-AS1:14 No - TBX2-AS1:16 No - lnc-TBX2-2:1 Yes chrX:4412856-4485647 lnc-NACA2-4:1 No - lnc-INTS2-3:1 No - lnc-BRIP1-1:2 Yes chrX:17652761-17656818 lnc-INTS2-1:1 Yes chr3L:20992814-21027434 lnc-INTS2-2:1 Yes chr3L:20992814-21027434 lnc-INTS2-4:3 Yes chr3L:20992814-21027434 lnc-INTS2-4:1 Yes chr3L:20992814-21027434 lnc-INTS2-4:2 Yes chr3L:20992814-21027434 lnc-MED13-3:1 No - lnc-EFCAB3-5:1 No - lnc-EFCAB3-4:1 No - lnc-MED13-4:2 No - lnc-MED13-4:1 No - lnc-EFCAB3-2:1 No - lnc-METTL2A-1:1 No - lnc-MARCH10-5:1 No - lnc-MARCH10-4:1 No - lnc-MARCH10-3:1 No - lnc-CYB561-116:1 No - lnc-MRC2-3:5 No - lnc-TANC2-2:1 No - lnc-MARCH10-1:2 No - lnc-MARCH10-6:1 No - lnc-MARCH10-7:1 No - lnc-ACE-3:1 Yes chr3L:12008225-12064859 lnc-CYB561-3:2 Yes chr3L:12008225-12064859 lnc-STRADA-4:1 Yes chr3L:2252744-2257423 lnc-STRADA-3:1 No - lnc-CCDC47-2:2 Yes chr2R:4546691-4565281 lnc-CCDC47-2:3 Yes chr2R:4546691-4565281 lnc-CCDC47-2:1 Yes chr2R:4546691-4565281 lnc-CCDC47-2:4 Yes chr2R:4546691-4565281 lnc-MAP3K3-2:1 Yes chr2R:4546691-4565281 lnc-MAP3K3-2:2 Yes chr2R:4546691-4565281 lnc-LIMD2-1:2 No - lnc-LIMD2-1:1 No - lnc-CCDC47-1:1 No - lnc-PSMC5-4:1 Yes chr3L:10876315-10879037 lnc-SMARCD2-2:1 Yes chrX:15997016-15999698 lnc-SMARCD2-1:1 Yes chrX:15997016-15999698 lnc-FTSJ3-1:1 No - lnc-PSMC5-3:1 Yes chrX:13157445-13159508 lnc-PSMC5-7:1 No - lnc-PSMC5-7:2 No - lnc-PSMC5-7:3 No - lnc-GH2-1:1 No - lnc-PSMC5-8:1 No - lnc-CSH1-1:1 No - lnc-PSMC5-1:2 No - lnc-CD79B-1:1 No - lnc-SCN4A-2:1 No - lnc-SCN4A-2:2 No - lnc-CD79B-2:1 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-CD79B-3:1 Yes chrX:16455027-16533096 PRR29-AS1:3 No - lnc-ICAM2-2:1 No - lnc-ERN1-4:1 No - lnc-PRR29-2:1 No - lnc-PRR29-3:1 No - lnc-PRR29-4:1 No - lnc-ICAM2-3:1 Yes chr3R:19853908-19861291 lnc-TEX2-3:2 Yes chr3R:19853908-19861291 lnc-TEX2-3:1 Yes chr3R:19853908-19861291 SNHG25:4 Yes chr3L:8932235-8954272 lnc-ERN1-3:1 Yes chr3L:8932235-8954272 lnc-TEX2-1:1 No - lnc-TEX2-2:1 No - lnc-DDX5-2:3 No - lnc-DDX5-2:5 No - lnc-DDX5-2:4 No - lnc-DDX5-2:2 No - lnc-DDX5-2:1 No - lnc-POLG2-1:6 Yes chr3R:6000426-6008579 lnc-POLG2-1:3 Yes chr3R:6000426-6008579 lnc-POLG2-1:5 Yes chr3R:6000426-6008579 lnc-POLG2-1:4 Yes chr3R:6000426-6008579 lnc-POLG2-1:2 Yes chr3R:6000426-6008579 lnc-POLG2-1:1 Yes chr3R:6000426-6008579 lnc-POLG2-2:1 Yes chr3R:6000426-6008579 lnc-DDX5-1:2 No - lnc-DDX5-1:1 No - lnc-DDX5-3:2 Yes chr2R:17592791-17604461 lnc-DDX5-3:1 Yes chr2R:17592791-17604461 lnc-DDX5-4:1 Yes chr2R:17592791-17604461 lnc-SMURF2-1:1 No - lnc-SMURF2-2:1 No - lnc-LRRC37A3-5:4 No - lnc-LRRC37A3-5:16 No - lnc-LRRC37A3-5:14 No - lnc-LRRC37A3-5:15 No - lnc-LRRC37A3-5:1 No - lnc-LRRC37A3-5:6 No - lnc-LRRC37A3-5:2 No - lnc-CEP95-8:1 No - lnc-LRRC37A3-4:1 No - lnc-LRRC37A3-4:2 No - lnc-CEP95-7:1 No - lnc-LRRC37A3-3:3 No - lnc-GNA13-6:1 No - lnc-GNA13-5:2 No - lnc-GNA13-5:1 No - lnc-RGS9-15:1 No - lnc-RGS9-15:2 No - lnc-RGS9-15:3 No - lnc-RGS9-15:4 No - lnc-RGS9-15:5 No - lnc-LRRC37A3-1:1 No - lnc-RGS9-14:1 No - lnc-RGS9-15:9 No - lnc-GNA13-2:8 No - lnc-GNA13-2:7 No - lnc-GNA13-2:6 No - lnc-GNA13-2:5 No - lnc-GNA13-2:4 No - lnc-GNA13-2:13 No - lnc-GNA13-2:9 No - lnc-GNA13-2:12 No - lnc-GNA13-2:14 No - lnc-GNA13-2:16 No - lnc-GNA13-2:11 No - lnc-GNA13-2:10 No - lnc-GNA13-2:3 No - lnc-RGS9-13:1 No - lnc-RGS9-8:1 No - lnc-RGS9-7:1 No - lnc-RGS9-6:1 No - lnc-GNA13-3:1 No - lnc-RGS9-5:1 No - lnc-CEP112-2:1 Yes chr3R:30022842-30035311 lnc-RGS9-9:1 No - lnc-AXIN2-3:1 No - lnc-RGS9-17:1 No - lnc-RGS9-12:1 No - lnc-AXIN2-1:1 No - lnc-AXIN2-2:1 No - lnc-CEP112-1:1 No - lnc-APOH-2:1 No - lnc-CACNG5-3:1 Yes chr2R:16898535-16901575 lnc-HELZ-8:1 No - lnc-HELZ-6:1 No - lnc-HELZ-1:4 No - lnc-HELZ-4:1 Yes chr3L:14789935-14801089 lnc-PSMD12-3:1 Yes chr3L:14789935-14801089 lnc-PSMD12-2:1 Yes chr3L:14789935-14801089 lnc-PITPNC1-7:1 Yes chr3L:14789935-14801089 lnc-HELZ-5:1 No - lnc-HELZ-7:1 Yes chr3R:5789493-5791569 lnc-PSMD12-1:1 Yes chr2R:17695776-17698362 lnc-NOL11-4:1 Yes chr2R:17695776-17698362 lnc-NOL11-4:2 Yes chr2R:17695776-17698362 lnc-C17orf58-8:2 Yes chr2R:17695776-17698362 lnc-C17orf58-8:1 Yes chr2R:17695776-17698362 lnc-NOL11-3:2 Yes chr2R:17695776-17698362 lnc-C17orf58-7:1 No - lnc-C17orf58-6:1 No - lnc-KPNA2-3:1 Yes chr3L:233926-246912 lnc-KPNA2-2:1 Yes chr3L:233926-246912 lnc-C17orf58-1:2 No - lnc-C17orf58-3:3 No - lnc-KPNA2-6:1 No - lnc-KPNA2-6:4 No - lnc-KPNA2-6:5 No - lnc-KPNA2-6:6 No - lnc-KPNA2-6:8 No - lnc-KPNA2-6:9 No - lnc-KPNA2-6:10 No - lnc-KPNA2-6:11 No - lnc-KPNA2-6:12 No - lnc-KPNA2-6:13 No - lnc-KPNA2-6:14 No - lnc-KPNA2-6:15 No - lnc-KPNA2-6:18 No - lnc-KPNA2-6:19 No - lnc-KPNA2-6:20 No - lnc-KPNA2-6:21 No - lnc-SLC16A6-2:1 No - lnc-SLC16A6-2:2 No - lnc-SLC16A6-2:3 No - lnc-AMZ2-10:1 No - lnc-AMZ2-9:1 No - lnc-AMZ2-1:4 No - lnc-AMZ2-8:1 No - lnc-AMZ2-7:1 No - lnc-AMZ2-7:2 No - lnc-AMZ2-5:6 No - lnc-AMZ2-5:1 No - lnc-AMZ2-5:2 No - lnc-AMZ2-5:3 No - lnc-AMZ2-3:1 No - lnc-AMZ2-2:1 No - lnc-ARSG-7:1 No - lnc-FAM20A-2:1 Yes chr2L:21212322-21220572 lnc-ARSG-2:8 Yes chr3L:20816118-20836048 lnc-PRKAR1A-3:1 Yes chr3R:23605751-23669659 LINC01482:1 Yes chr3R:23605751-23669659 LINC01482:2 Yes chr3R:23605751-23669659 lnc-PRKAR1A-4:1 No - LINC01482:3 No - LINC01482:4 No - LINC01482:5 No - LINC01482:6 No - LINC01482:8 No - lnc-ABCA8-2:2 No - lnc-PRKAR1A-5:1 No - lnc-PRKAR1A-6:1 No - lnc-ABCA9-5:1 Yes chr2L:13784084-13790562 lnc-ABCA9-4:1 Yes chr2L:13784084-13790562 lnc-ABCA9-3:1 Yes chr2L:13784084-13790562 lnc-ABCA8-3:1 Yes chr2L:13784084-13790562 lnc-ABCA8-4:1 Yes chr2L:13784084-13790562 lnc-ABCA9-1:1 Yes chr2L:13784084-13790562 lnc-ABCA9-2:1 Yes chr2L:13784084-13790562 lnc-MAP2K6-9:1 Yes chr2L:13784084-13790562 lnc-MAP2K6-9:2 Yes chr2L:13784084-13790562 lnc-ABCA10-3:1 Yes chr2L:13784084-13790562 lnc-ABCA6-1:1 Yes chr2L:13784084-13790562 lnc-ABCA6-1:2 Yes chr2L:13784084-13790562 lnc-MAP2K6-8:1 Yes chr2L:13784084-13790562 lnc-MAP2K6-8:2 Yes chr2L:13784084-13790562 lnc-ABCA5-5:1 Yes chr2L:13784084-13790562 lnc-ABCA10-1:1 Yes chr2L:13784084-13790562 lnc-ABCA10-2:1 Yes chr2L:13784084-13790562 lnc-ABCA10-4:1 Yes chr2L:13784084-13790562 lnc-MAP2K6-7:1 Yes chr2L:13784084-13790562 lnc-ABCA5-6:2 Yes chrX:13091145-13093986 lnc-ABCA5-6:1 Yes chrX:13091145-13093986 lnc-ABCA5-7:2 Yes chrX:13091145-13093986 lnc-MAP2K6-5:1 Yes chrX:13091145-13093986 LINC01483:1 No - lnc-ABCA5-9:1 No - lnc-ABCA5-9:2 No - lnc-MAP2K6-6:1 No - LINC01483:3 No - LINC01483:7 No - lnc-ABCA5-8:1 No - lnc-ABCA5-8:3 No - lnc-ABCA5-8:2 No - LINC01483:8 No - LINC01483:10 No - lnc-ABCA5-10:1 Yes chr2L:18711071-18713748 lnc-ABCA5-10:2 Yes chr2L:18711071-18713748 lnc-ABCA5-2:2 Yes chr2L:18711071-18713748 LINC01028:4 Yes chr2L:18711071-18713748 LINC01028:5 Yes chr2L:18711071-18713748 lnc-KCNJ2-3:2 Yes chr2L:18711071-18713748 lnc-ABCA5-3:2 No - KCNJ2-AS1:2 No - KCNJ2-AS1:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-ABCA5-13:1 No - lnc-ABCA5-14:1 No - lnc-ABCA5-15:1 No - lnc-KCNJ2-2:1 No - lnc-ABCA5-16:1 No - lnc-KCNJ2-7:1 No - lnc-KCNJ2-4:1 No - lnc-ABCA5-4:2 No - lnc-KCNJ2-5:1 No - CASC17:4 No - LINC01152:8 No - lnc-SLC39A11-10:31 No - lnc-SLC39A11-10:30 No - lnc-SLC39A11-10:26 No - lnc-SLC39A11-10:28 No - lnc-SLC39A11-10:40 No - lnc-SLC39A11-10:9 No - lnc-SLC39A11-10:15 No - lnc-SLC39A11-10:39 No - lnc-SLC39A11-10:16 No - lnc-SLC39A11-10:25 No - lnc-SLC39A11-10:35 No - lnc-SLC39A11-10:2 No - lnc-SLC39A11-1:36 No - lnc-SLC39A11-1:38 No - lnc-SLC39A11-1:37 No - lnc-SLC39A11-1:32 No - lnc-SLC39A11-1:34 No - lnc-SOX9-4:2 No - lnc-SLC39A11-1:33 No - lnc-SOX9-7:1 No - lnc-SLC39A11-1:35 No - lnc-SOX9-8:1 No - lnc-FAM104A-6:1 Yes chr2R:11899517-11901394 lnc-FAM104A-5:1 Yes chr2R:11899517-11901394 lnc-FAM104A-4:2 Yes chr2R:11899517-11901394 lnc-FAM104A-4:1 Yes chr2R:11899517-11901394 lnc-FAM104A-3:1 No - lnc-SSTR2-1:2 Yes chr3L:18560258-18576326 lnc-FAM104A-2:1 Yes chr3L:18560258-18576326 lnc-FAM104A-1:1 No - lnc-C17orf80-6:1 No - lnc-CPSF4L-1:1 No - lnc-CPSF4L-1:2 No - lnc-SDK2-8:1 No - lnc-CDC42EP4-3:1 No - lnc-C17orf80-3:2 No - lnc-SDK2-6:1 No - lnc-SDK2-7:1 No - LINC00469:1 No - LINC02092:7 No - lnc-RPL38-1:2 No - LINC02074:17 No - lnc-BTBD17-5:1 No - lnc-BTBD17-1:2 Yes chr3L:11697126-11699263 lnc-CD300A-1:1 No - lnc-CD300A-2:1 No - lnc-CD300C-3:1 No - lnc-CD300LD-1:1 No - lnc-RAB37-1:9 No - lnc-CD300E-1:1 Yes chr3L:21318774-21335027 lnc-SLC9A3R1-2:1 Yes chr3L:21318774-21335027 lnc-SLC9A3R1-2:2 Yes chr3L:21318774-21335027 lnc-NAT9-1:2 Yes chr3L:21318774-21335027 lnc-NAT9-1:3 No - lnc-NAT9-3:5 Yes chr3R:31615284-31616160 lnc-NAT9-3:4 Yes chr3R:31615284-31616160 lnc-NAT9-3:2 Yes chr3R:31615284-31616160 lnc-NAT9-3:1 Yes chr3R:31615284-31616160 lnc-NAT9-3:3 Yes chr3R:31615284-31616160 lnc-NAT9-2:1 Yes chr3L:20427962-20430475 lnc-SLC9A3R1-4:1 Yes chr3L:20427962-20430475 lnc-FDXR-1:1 Yes chrX:1483625-1507809 lnc-FADS6-1:2 Yes chr2R:11290994-11293174 lnc-FADS6-1:1 Yes chr2R:11290994-11293174 lnc-USH1G-1:1 Yes chr2R:12322507-12326258 lnc-USH1G-2:1 Yes chr2R:12322507-12326258 lnc-USH1G-3:1 Yes chr2R:12322507-12326258 lnc-CDR2L-2:1 No - lnc-ATP5PD-1:1 Yes chrX:1483479-1517615 lnc-HID1-2:1 Yes chrX:1483479-1517615 lnc-MRPL58-2:1 Yes chrX:1483479-1517615 lnc-JPT1-1:1 No - lnc-NT5C-3:3 No - lnc-SUMO2-3:1 No - lnc-MRPS7-4:1 Yes chr2R:18164694-18167140 lnc-MIF4GD-3:1 Yes chrX:9601030-9604280 lnc-MIF4GD-3:2 Yes chrX:9601030-9604280 lnc-MIF4GD-1:1 Yes chrX:9601030-9604280 lnc-SLC25A19-3:1 No - lnc-MIF4GD-2:1 Yes chr2R:24897902-24900734 lnc-SLC25A19-4:1 Yes chr2R:13495222-13502841 lnc-MRPS7-6:1 Yes chr2R:13495222-13502841 lnc-CASKIN2-5:2 Yes chr2R:13495222-13502841 lnc-CASKIN2-5:1 Yes chr2R:13495222-13502841 lnc-TSEN54-2:3 Yes chr2L:4394196-4400487 lnc-GRB2-1:1 Yes chr2R:14963292-14980795 lnc-GRB2-2:1 Yes chr2R:14963292-14980795 lnc-CASKIN2-1:3 Yes chr3L:12204123-12206022 lnc-CASKIN2-1:4 Yes chr3L:12204123-12206022 lnc-CASKIN2-1:1 No - lnc-CASKIN2-1:2 No - lnc-MYO15B-4:1 Yes chr2L:9839-21376 lnc-MYO15B-3:1 Yes chr2L:9839-21376 lnc-RECQL5-3:1 Yes chr3L:14628160-14632077 lnc-CASKIN2-2:1 Yes chr3L:14628160-14632077 lnc-MYO15B-1:1 Yes chr3L:14628160-14632077 lnc-GALK1-4:2 Yes chr3L:14628160-14632077 lnc-GALK1-4:1 Yes chr3L:14628160-14632077 lnc-SAP30BP-1:1 No - lnc-H3F3B-3:1 No - lnc-GALK1-2:6 Yes chrX:9152523-9156669 lnc-GALK1-2:7 Yes chrX:9152523-9156669 lnc-GALK1-2:8 Yes chrX:9152523-9156669 lnc-GALK1-2:5 Yes chrX:9152523-9156669 lnc-H3F3B-1:1 No - lnc-ITGB4-2:3 Yes chr3R:23149653-23157862 lnc-UNC13D-2:1 Yes chr3R:23149653-23157862 lnc-UNK-1:1 No - lnc-WBP2-3:1 Yes chr3L:7266192-7312896 lnc-WBP2-2:1 Yes chr3L:7266192-7312896 lnc-WBP2-1:1 Yes chr3L:7266192-7312896 lnc-UNC13D-1:1 Yes chr3L:12850165-12853169 lnc-MRPL38-1:1 No - lnc-TRIM65-1:3 No - lnc-TRIM65-1:4 No - lnc-TRIM65-1:2 No - lnc-TRIM65-1:1 No - lnc-ACOX1-1:4 Yes chr3L:11790212-11793283 lnc-ACOX1-1:3 Yes chr3L:11790212-11793283 lnc-FBF1-3:1 Yes chr2R:21389405-21392439 lnc-TEN1-1:1 Yes chr2R:21389405-21392439 lnc-FBF1-2:1 Yes chr2R:21389405-21392439 lnc-EVPL-3:1 Yes chr2R:21389405-21392439 lnc-SRP68-5:1 No - lnc-EVPL-2:2 Yes chr3L:8975046-8977401 lnc-EXOC7-1:1 Yes chr3L:8975046-8977401 lnc-EXOC7-2:1 Yes chr3L:8975046-8977401 lnc-EXOC7-3:2 No - lnc-EXOC7-3:1 No - lnc-SRP68-4:2 Yes chr3L:8411851-8415910 lnc-SRP68-4:1 Yes chr3L:8411851-8415910 lnc-ZACN-64:1 No - lnc-ZACN-64:2 Yes chrX:13718734-13721977 lnc-FOXJ1-2:1 Yes chrX:13718734-13721977 lnc-FOXJ1-3:1 Yes chrX:13718734-13721977 lnc-ZACN-65:1 Yes chrX:13718734-13721977 lnc-ZACN-65:2 Yes chrX:13718734-13721977 lnc-FOXJ1-4:1 Yes chrX:13718734-13721977 lnc-QRICH2-1:2 Yes chr3R:30592971-30601489 lnc-QRICH2-1:1 Yes chr3R:30592971-30601489 lnc-SPHK1-1:1 Yes chr3R:30592971-30601489 lnc-UBE2O-1:1 Yes chrX:11442539-11446012 lnc-UBE2O-2:2 Yes chr2L:10368025-10373900 lnc-UBE2O-2:1 Yes chr2L:10368025-10373900 lnc-CYGB-4:1 Yes chr2L:10368025-10373900 lnc-RHBDF2-1:1 No - lnc-CYGB-5:1 No - lnc-RHBDF2-2:1 No - lnc-PRCD-5:1 No - lnc-PRCD-5:2 No - lnc-PRCD-5:3 No - lnc-PRCD-5:4 No - lnc-CYGB-3:3 No - lnc-AANAT-2:1 No - lnc-CYGB-3:4 No - lnc-CYGB-3:2 No - SNHG16:1 No - SNHG16:2 No - SNHG16:3 No - SNHG16:4 No - SNHG16:5 No - SNHG16:6 No - SNHG16:7 No - SNHG16:8 No - SNHG16:9 No - SNHG16:11 No - SNHG16:12 No - SNHG16:13 No - SNHG16:15 No - lnc-ST6GALNAC2-2:4 No - lnc-ST6GALNAC2-2:3 No - lnc-ST6GALNAC2-2:1 No - lnc-ST6GALNAC2-2:2 No - lnc-ST6GALNAC2-1:1 No - lnc-MXRA7-2:2 No - lnc-JMJD6-2:2 No - lnc-JMJD6-2:1 No - lnc-MXRA7-1:1 Yes chr3R:22360782-22362371 lnc-MXRA7-1:2 Yes chr3R:22360782-22362371 lnc-JMJD6-1:3 No - lnc-JMJD6-1:2 No - lnc-JMJD6-1:6 Yes chr3R:16049670-16050693 lnc-JMJD6-1:5 No - lnc-JMJD6-1:4 No - LINC02080:5 No - LINC00868:1 No - LINC00868:2 No - LINC00868:4 No - LINC00868:5 No - lnc-SRSF2-2:3 No - lnc-SRSF2-2:9 No - SNHG20:4 Yes chr2L:6448464-6455929 SNHG20:7 Yes chr2L:6448464-6455929 lnc-SRSF2-6:1 Yes chr2L:6448464-6455929 lnc-MGAT5B-3:1 Yes chr2L:6448464-6455929 lnc-MGAT5B-4:1 Yes chr2L:6448464-6455929 lnc-SRSF2-7:1 Yes chr2L:6448464-6455929 lnc-SEPT9-1:5 No - lnc-SRSF2-10:1 No - lnc-SRSF2-9:1 No - lnc-SRSF2-9:3 No - lnc-SRSF2-9:2 No - lnc-SEC14L1-1:14 No - lnc-SEPT9-2:2 No - lnc-SEPT9-3:8 No - lnc-SEPT9-2:3 No - lnc-SEPT9-2:4 No - lnc-SEPT9-2:5 No - lnc-SEPT9-3:9 No - lnc-SEPT9-3:10 No - lnc-TMC6-8:1 No - lnc-TMC6-1:1 No - lnc-TMC6-1:2 No - LINC01973:4 No - lnc-TMC6-5:5 No - lnc-TMC8-4:1 Yes chr4:649041-663103 lnc-TMC6-6:1 Yes chr4:649041-663103 lnc-TMC8-1:1 Yes chr4:649041-663103 TNRC6C-AS1:3 Yes chr4:649041-663103 TNRC6C-AS1:1 No - lnc-TK1-6:1 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-TK1-3:1 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-TK1-4:4 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-TK1-4:1 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-TK1-4:2 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-TK1-4:3 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-TK1-5:1 No - lnc-TK1-1:1 No - lnc-TK1-2:1 Yes chr3R:17149667-17150455 LINC01993:5 No - lnc-PGS1-2:2 No - lnc-PGS1-1:4 No - lnc-PGS1-1:5 No - lnc-SOCS3-1:1 No - lnc-SOCS3-2:1 Yes chr3R:21024580-21042499 lnc-PGS1-6:1 Yes chr3R:21024580-21042499 lnc-CYTH1-3:2 Yes chr3R:21024580-21042499 lnc-PGS1-7:2 No - LINC02081:27 No - LINC02081:23 No - lnc-USP36-4:4 Yes chr2L:21740041-21757466 lnc-USP36-4:3 Yes chr2L:21740041-21757466 lnc-USP36-4:2 Yes chr2L:21740041-21757466 lnc-USP36-4:1 Yes chr2L:21740041-21757466 lnc-CYTH1-1:3 Yes chr3L:5769002-5776271 lnc-TIMP2-1:1 Yes chr3L:5769002-5776271 lnc-C1QTNF1-8:1 Yes chr3L:5769002-5776271 lnc-USP36-2:1 No - lnc-CEP295NL-1:1 No - lnc-USP36-3:1 No - lnc-C1QTNF1-6:1 No - lnc-C1QTNF1-5:1 No - lnc-LGALS3BP-2:4 Yes chrX:11720245-11723854 lnc-LGALS3BP-2:5 Yes chrX:11720245-11723854 lnc-LGALS3BP-2:2 Yes chrX:11720245-11723854 lnc-LGALS3BP-4:1 Yes chr3R:11431738-11433543 lnc-LGALS3BP-3:1 Yes chr3R:11431738-11433543 lnc-LGALS3BP-4:5 Yes chr3R:11431738-11433543 lnc-LGALS3BP-4:2 Yes chr3R:11431738-11433543 lnc-LGALS3BP-4:3 Yes chr3R:11431738-11433543 lnc-LGALS3BP-4:4 Yes chr3R:11431738-11433543 lnc-ENGASE-2:2 No - lnc-CANT1-3:1 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-CANT1-3:2 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-CANT1-3:3 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-CANT1-2:5 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-CANT1-3:4 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-CBX8-5:1 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-CBX8-3:1 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-CBX2-5:1 Yes chr3L:21306138-21318020 lnc-CBX8-1:1 Yes chr3L:21306138-21318020 LINC01977:7 No - LINC01977:9 No - LINC01978:13 No - lnc-CBX4-4:1 Yes chr2L:10432687-10435656 lnc-CBX4-4:2 Yes chr2L:10432687-10435656 lnc-CCDC40-1:3 Yes chr2L:10432687-10435656 lnc-TBC1D16-3:1 Yes chr2R:1349392-1443935 lnc-TBC1D16-3:2 Yes chr2R:1349392-1443935 lnc-CCDC40-3:1 No - lnc-GAA-1:1 No - lnc-GAA-2:1 No - lnc-SGSH-5:1 Yes chr3R:8313208-8314864 lnc-SGSH-4:1 Yes chr3R:8313208-8314864 lnc-CARD14-4:1 No - lnc-CARD14-4:7 No - lnc-SLC26A11-2:3 No - lnc-SLC26A11-2:4 No - lnc-SGSH-1:8 No - lnc-SGSH-1:6 No - lnc-SGSH-1:9 No - lnc-SGSH-1:7 No - lnc-SGSH-1:10 No - lnc-SGSH-2:2 No - lnc-SGSH-2:1 No - lnc-EIF4A3-2:1 No - lnc-SGSH-3:1 No - lnc-NPTX1-2:4 No - lnc-RNF213-2:5 No - lnc-NPTX1-3:1 No - lnc-NPTX1-6:1 No - lnc-RPTOR-2:1 No - lnc-RPTOR-1:1 No - lnc-AATK-5:3 Yes chr2R:22608310-22609419 lnc-BAIAP2-4:1 Yes chr2R:22608310-22609419 lnc-BAIAP2-3:1 No - BAIAP2-DT:16 No - BAIAP2-DT:19 No - lnc-AATK-2:1 Yes chr3L:11136049-11163984 lnc-CEP131-2:1 No - lnc-CEP131-1:1 No - lnc-AATK-1:1 No - lnc-BAIAP2-5:1 No - lnc-SLC38A10-2:1 No - lnc-SLC38A10-1:2 No - lnc-SLC38A10-1:1 No - lnc-TEPSIN-1:1 Yes chr2R:21320040-21323320 lnc-TEPSIN-2:1 Yes chr2R:21320040-21323320 LINC00482:2 No - LINC00482:3 No - lnc-SLC38A10-3:1 No - lnc-SLC38A10-3:2 No - lnc-SLC38A10-3:3 No - lnc-TMEM105-2:17 No - lnc-TMEM105-2:18 No - lnc-BAHCC1-2:1 No - lnc-TMEM105-2:16 No - lnc-TMEM105-2:15 No - lnc-TMEM105-2:22 No - lnc-TMEM105-2:31 No - lnc-TMEM105-4:1 Yes chr3R:22710883-22721150 lnc-FSCN2-5:2 Yes chr3R:22710883-22721150 lnc-TMEM105-5:1 Yes chr3R:22710883-22721150 lnc-ACTG1-4:2 Yes chr3R:22710883-22721150 lnc-ACTG1-4:5 Yes chr3R:22710883-22721150 lnc-ACTG1-4:4 Yes chr3R:22710883-22721150 lnc-ACTG1-4:3 Yes chr3R:22710883-22721150 lnc-ACTG1-4:6 Yes chr3R:22710883-22721150 lnc-ACTG1-4:1 Yes chr3R:22710883-22721150 LINC01971:7 No - lnc-FAAP100-1:1 No - lnc-FAAP100-1:2 No - lnc-FSCN2-1:4 No - lnc-FSCN2-3:1 Yes chr3R:25611013-25624662 lnc-FAAP100-2:4 Yes chr3R:25611013-25624662 lnc-FAAP100-2:3 Yes chr3R:25611013-25624662 lnc-FAAP100-2:2 Yes chr3R:25611013-25624662 lnc-FAAP100-2:1 Yes chr3R:25611013-25624662 lnc-PDE6G-3:1 Yes chr3R:25611013-25624662 lnc-PDE6G-2:1 Yes chr3R:25611013-25624662 lnc-OXLD1-2:1 No - lnc-OXLD1-1:1 No - lnc-OXLD1-1:2 Yes chr3R:26876630-26880459 lnc-OXLD1-3:1 No - lnc-OXLD1-3:2 No - lnc-OXLD1-3:3 No - lnc-OXLD1-3:5 No - lnc-OXLD1-3:4 No - lnc-ARL16-3:1 Yes chr3L:18694187-18698412 lnc-SLC25A10-4:1 Yes chr3L:18694187-18695648 lnc-SLC25A10-1:1 No - lnc-MCRIP1-1:4 No - lnc-PPP1R27-2:3 No - lnc-PPP1R27-2:4 No - lnc-MCRIP1-3:2 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-PPP1R27-1:1 Yes chr3L:15137738-15142840 lnc-ARHGDIA-2:2 Yes chr3L:15137738-15142840 lnc-ARHGDIA-2:1 Yes chr3L:15137738-15142840 lnc-ANAPC11-7:1 Yes chr3L:15137738-15142840 lnc-ARHGDIA-1:1 Yes chr3L:19928743-19932930 lnc-P4HB-1:1 Yes chr3L:19928743-19932930 lnc-P4HB-2:1 Yes chr3L:19928743-19932930 lnc-ANAPC11-4:1 No - lnc-ANAPC11-3:1 No - lnc-PCYT2-1:1 Yes chr3R:7077904-7080387 lnc-SIRT7-2:3 Yes chr2L:13203762-13210828 lnc-SIRT7-2:2 Yes chr2L:13203762-13210828 lnc-SIRT7-2:1 Yes chr2L:13203762-13210828 lnc-SIRT7-1:1 Yes chr3R:29055927-29059204 lnc-SIRT7-1:3 Yes chr3R:29055927-29059204 lnc-SIRT7-1:2 Yes chr3R:29055927-29059204 lnc-MAFG-1:1 Yes chr3R:29055927-29059204 MAFG-DT:17 No - lnc-PYCR1-2:1 No - lnc-MYADML2-1:1 Yes chr3R:17534815-17537136 lnc-ASPSCR1-1:2 No - lnc-ASPSCR1-1:9 No - lnc-NOTUM-2:1 No - lnc-DCXR-2:1 No - lnc-DCXR-2:6 No - lnc-DCXR-2:5 No - lnc-DCXR-2:3 No - lnc-DCXR-2:4 No - lnc-DCXR-2:2 No - lnc-RFNG-3:1 Yes chrX:18855873-18857757 lnc-RFNG-3:2 Yes chrX:18855873-18857757 lnc-RAC3-1:4 No - lnc-RFNG-1:7 Yes chr3L:20925891-20949512 lnc-RFNG-1:6 Yes chr3L:20925891-20949512 lnc-RFNG-1:5 No - lnc-RFNG-1:1 No - lnc-RFNG-1:3 No - lnc-RFNG-1:2 No - lnc-RFNG-1:4 No - lnc-RFNG-2:1 Yes chr2L:252589-271744 lnc-RFNG-2:3 Yes chr2L:252589-271744 lnc-RFNG-2:2 Yes chr2L:252589-271744 lnc-GPS1-2:1 No - lnc-CCDC57-2:2 No - lnc-CCDC57-2:1 No - lnc-FASN-1:1 No - lnc-FASN-2:1 No - lnc-FASN-3:1 No - lnc-CSNK1D-4:1 No - lnc-CCDC57-3:1 No - lnc-SLC16A3-8:1 No - lnc-SLC16A3-7:1 No - lnc-SLC16A3-6:1 No - lnc-TEX19-2:1 No - lnc-CCDC57-5:1 No - lnc-CCDC57-6:6 No - lnc-CCDC57-6:4 No - lnc-CCDC57-6:2 No - lnc-CCDC57-6:3 No - lnc-CCDC57-6:5 No - lnc-CCDC57-6:1 No - lnc-CCDC57-4:2 No - lnc-CCDC57-4:3 No - lnc-CCDC57-4:1 Yes chr3R:31054085-31061210 lnc-SLC16A3-10:1 No - lnc-SLC16A3-10:2 No - lnc-SLC16A3-3:2 No - lnc-UTS2R-2:1 No - lnc-OGFOD3-1:3 No - lnc-OGFOD3-1:1 No - lnc-OGFOD3-3:1 No - lnc-OGFOD3-3:2 No - lnc-C17orf62-7:1 No - lnc-C17orf62-7:3 No - lnc-C17orf62-7:2 No - lnc-C17orf62-5:2 No - lnc-OGFOD3-4:1 No - lnc-C17orf62-6:2 No - lnc-C17orf62-6:7 No - lnc-C17orf62-6:3 No - lnc-C17orf62-6:5 No - lnc-C17orf62-6:4 No - lnc-C17orf62-6:1 No - lnc-C17orf62-6:6 No - lnc-C17orf62-6:8 No - lnc-HEXDC-1:1 Yes chr2R:4130974-4133484 lnc-NARF-2:1 No - lnc-WDR45B-5:1 Yes chr3L:11114169-11120783 lnc-RAB40B-4:1 No - lnc-WDR45B-3:1 Yes chrX:12459796-12463112 lnc-WDR45B-6:1 Yes chrX:12459796-12463112 lnc-FOXK2-2:4 Yes chrX:12459796-12463112 lnc-FOXK2-2:5 Yes chrX:12459796-12463112 lnc-WDR45B-4:2 Yes chrX:12459796-12463112 lnc-FN3KRP-1:1 No - lnc-B3GNTL1-2:2 No - lnc-B3GNTL1-2:6 No - lnc-B3GNTL1-2:1 No - lnc-B3GNTL1-2:4 No - lnc-B3GNTL1-2:5 No - lnc-B3GNTL1-2:3 No - lnc-METRNL-5:3 No - lnc-METRNL-2:2 No - lnc-METRNL-10:2 No - lnc-METRNL-6:2 No - LINC02564:14 No - LINC02564:17 No - lnc-USP14-7:1 No - lnc-TUBB8P12-4:1 No - lnc-USP14-2:2 No - lnc-USP14-2:3 No - lnc-USP14-1:2 No - lnc-COLEC12-7:1 Yes chr3R:5818794-5821440 lnc-COLEC12-5:1 Yes chr3R:5818794-5821440 lnc-COLEC12-4:3 Yes chr3R:5818794-5821440 lnc-COLEC12-4:2 Yes chr3R:5818794-5821440 lnc-COLEC12-4:1 Yes chr3R:5818794-5821440 lnc-USP14-3:7 No - lnc-COLEC12-3:1 No - LINC01925:7 No - LINC01925:5 No - lnc-ENOSF1-6:1 No - lnc-YES1-1:9 No - lnc-YES1-1:8 No - lnc-YES1-7:1 No - lnc-YES1-7:2 No - lnc-ENOSF1-4:4 Yes chr3L:4592447-4626196 lnc-ENOSF1-4:3 Yes chr3L:4592447-4626196 lnc-ADCYAP1-6:1 Yes chr3L:4592447-4626196 lnc-ADCYAP1-5:1 No - lnc-YES1-8:6 No - lnc-YES1-4:5 No - lnc-YES1-3:2 No - LINC00470:9 No - LINC00470:24 No - LINC00470:10 No - LINC00470:11 No - LINC00470:12 No - LINC00470:23 No - LINC00470:21 No - LINC00470:22 No - LINC00470:18 No - lnc-ADCYAP1-8:1 No - lnc-YES1-6:1 No - lnc-ADCYAP1-9:1 No - lnc-YES1-9:1 No - lnc-ADCYAP1-3:2 No - lnc-ADCYAP1-10:1 No - lnc-METTL4-6:1 No - lnc-NDC80-1:3 No - lnc-NDC80-1:4 No - lnc-METTL4-4:1 No - lnc-NDC80-5:1 Yes chr3R:16649981-16651157 lnc-METTL4-3:1 No - lnc-METTL4-5:1 No - lnc-MYOM1-6:2 Yes chr2R:8136986-8156654 lnc-MYOM1-6:3 Yes chr2R:8136986-8156654 lnc-MYOM1-6:1 Yes chr2R:8136986-8156654 lnc-MYOM1-5:1 Yes chr2R:8136986-8156654 lnc-EMILIN2-4:1 Yes chr2R:8136986-8156654 lnc-LPIN2-3:1 Yes chr3L:3172817-3178580 lnc-MYOM1-4:1 No - lnc-MYL12B-3:2 No - LINC01895:9 No - LINC01895:15 No - lnc-DLGAP1-7:1 No - lnc-TGIF1-5:1 No - lnc-TGIF1-4:1 No - lnc-DLGAP1-6:1 No - lnc-MYL12B-4:1 Yes chr2R:12511534-12515062 lnc-MYL12B-6:1 Yes chr2R:12511534-12515062 GAPLINC:7 No - lnc-MYOM1-7:1 Yes chr2R:5702112-5705439 DLGAP1-AS1:9 Yes chr2R:5702112-5705439 DLGAP1-AS2:5 Yes chr2R:5702112-5705439 DLGAP1-AS2:6 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-MYOM1-8:1 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-MYOM1-2:7 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-MYOM1-2:9 Yes chr2R:5702112-5705439 DLGAP1-AS4:2 Yes chr2R:5702112-5705439 DLGAP1-AS4:3 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-MYOM1-11:1 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-MYOM1-2:8 Yes chr2R:5702112-5705439 DLGAP1-AS5:1 Yes chr2R:5702112-5705439 DLGAP1-AS5:3 Yes chr2R:5702112-5705439 DLGAP1-AS5:7 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-AKAIN1-8:1 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-AKAIN1-9:1 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-TGIF1-17:1 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-TGIF1-12:1 No - lnc-TGIF1-16:1 No - lnc-TGIF1-15:1 No - lnc-AKAIN1-2:1 No - lnc-AKAIN1-2:2 No - LINC00667:2 No - LINC00667:3 No - LINC00526:4 No - LINC00667:4 No - LINC00667:5 No - LINC00667:8 No - LINC00667:11 No - LINC00667:13 No - LINC00667:16 No - lnc-AKAIN1-3:1 No - LINC00667:17 No - lnc-AKAIN1-4:1 No - lnc-ZBTB14-1:1 Yes chr2R:19229063-19243751 lnc-ZBTB14-2:1 Yes chr2R:19229063-19243751 lnc-EPB41L3-3:2 Yes chr2R:19229063-19243751 lnc-EPB41L3-3:1 Yes chr2R:19229063-19243751 MIR3976HG:1 No - MIR3976HG:11 No - L3MBTL4-AS1:4 Yes chr3R:27266326-27273273 lnc-TMEM200C-2:1 Yes chr3R:27266326-27273273 lnc-TMEM200C-1:1 Yes chr3R:27266326-27273273 lnc-L3MBTL4-2:1 No - lnc-ARHGAP28-8:1 No - lnc-ARHGAP28-6:1 No - LINC00668:7 No - LINC00668:3 No - LINC00668:4 No - lnc-ARHGAP28-7:1 No - LINC00668:11 No - lnc-L3MBTL4-3:1 Yes chr2L:14263027-14328262 lnc-L3MBTL4-4:1 Yes chr2L:14263027-14328262 lnc-L3MBTL4-5:1 Yes chr2L:14263027-14328262 lnc-LAMA1-6:1 No - lnc-LAMA1-5:3 No - lnc-RAB12-9:1 No - lnc-PTPRM-1:1 No - lnc-PTPRM-2:1 No - lnc-PTPRM-3:1 No - lnc-RAB12-2:2 No - lnc-RAB12-2:3 No - lnc-PPP4R1-19:1 No - GACAT2:2 No - lnc-NDUFV2-1:12 No - lnc-NDUFV2-1:6 No - lnc-NDUFV2-2:1 No - lnc-RALBP1-3:1 No - lnc-PIEZO2-14:3 No - lnc-PIEZO2-14:4 No - lnc-PIEZO2-14:5 No - lnc-PIEZO2-14:2 No - PPP4R1-AS1:3 No - lnc-PPP4R1-13:1 No - lnc-PPP4R1-14:1 No - lnc-PPP4R1-16:1 No - lnc-PPP4R1-17:1 Yes chrX:5312171-5313125 lnc-PPP4R1-18:1 Yes chr3L:8109132-8110043 lnc-TXNDC2-1:1 Yes chr3L:8109132-8110043 lnc-VAPA-1:2 No - lnc-VAPA-3:1 No - lnc-PIEZO2-6:3 No - lnc-PIEZO2-6:4 No - lnc-APCDD1-3:1 No - lnc-PIEZO2-8:1 No - lnc-PPP4R1-22:1 Yes chr3R:2554162-3263582 lnc-NAPG-3:2 Yes chr3R:2554162-3263582 lnc-MPPE1-15:1 Yes chr3R:2554162-3263582 lnc-MPPE1-13:1 Yes chr3R:2554162-3263582 lnc-SLC35G4-3:2 No - lnc-PIEZO2-9:1 No - lnc-PIEZO2-10:1 No - lnc-SLC35G4-7:1 No - lnc-PIEZO2-18:2 No - lnc-PIEZO2-18:1 No - LINC01928:4 No - lnc-PIEZO2-2:8 No - LINC01255:3 No - LINC01255:5 No - LINC01255:11 No - LINC01255:13 No - LINC01255:15 No - lnc-MPPE1-6:1 No - lnc-MPPE1-5:1 No - lnc-MPPE1-12:1 No - lnc-CHMP1B-1:1 Yes chr2R:23942538-23946936 lnc-MPPE1-4:1 Yes chr2R:23942538-23946936 CHMP1B-AS1:3 Yes chr2R:23942538-23946936 lnc-IMPA2-1:1 Yes chr2R:23942538-23946936 lnc-AFG3L2-7:1 No - lnc-AFG3L2-6:1 Yes chr2L:8198882-8200652 lnc-AFG3L2-6:3 Yes chr2L:8198882-8200652 lnc-AFG3L2-6:4 Yes chr2L:8198882-8200652 lnc-AFG3L2-6:5 Yes chr2L:8198882-8200652 lnc-AFG3L2-6:2 Yes chr2L:8198882-8200652 lnc-AFG3L2-6:7 Yes chr2L:8198882-8200652 lnc-AFG3L2-6:6 Yes chr2L:8198882-8200652 lnc-GNAL-2:1 No - lnc-MPPE1-9:1 Yes chr3L:21266680-21268335 lnc-MPPE1-10:1 No - lnc-MPPE1-11:1 No - lnc-ANKRD62-2:1 No - lnc-MPPE1-3:2 No - lnc-ANKRD62-4:1 No - lnc-CIDEA-2:4 No - lnc-CIDEA-2:5 No - lnc-CIDEA-2:6 No - lnc-CIDEA-2:7 No - lnc-CIDEA-2:9 No - lnc-CIDEA-2:10 No - lnc-CIDEA-2:11 No - lnc-CIDEA-6:1 No - lnc-CIDEA-2:12 No - lnc-AFG3L2-1:2 No - lnc-CIDEA-5:1 No - lnc-CIDEA-4:2 No - lnc-CIDEA-1:2 No - lnc-SPIRE1-3:1 No - lnc-SPIRE1-2:1 Yes chr3L:17238613-17242128 lnc-AFG3L2-2:1 No - lnc-TUBB6-1:2 Yes chr2L:6046516-6048706 lnc-PRELID3A-1:2 No - lnc-PRELID3A-1:4 No - lnc-PRELID3A-1:5 Yes chr2L:20311219-20348386 lnc-PRELID3A-1:6 Yes chr2L:20311219-20348386 lnc-PRELID3A-1:7 Yes chr2L:20311219-20348386 lnc-AFG3L2-3:1 Yes chr2L:20311219-20348386 lnc-PSMG2-1:3 No - lnc-SPIRE1-4:1 Yes chr3R:18187805-18188707 lnc-CEP76-1:3 Yes chr3R:18187805-18188707 lnc-CEP76-1:4 Yes chr3R:18187805-18188707 lnc-CEP76-1:2 Yes chr3R:18187805-18188707 lnc-PTPN2-5:1 No - lnc-PTPN2-2:5 No - lnc-PTPN2-2:4 No - lnc-PTPN2-2:2 No - lnc-PTPN2-2:3 No - lnc-PTPN2-4:1 Yes chr3L:1342493-1475257 lnc-CEP76-3:1 Yes chr3L:1342493-1475257 lnc-SEH1L-5:1 Yes chr3L:1342493-1475257 lnc-SEH1L-4:1 Yes chr3L:1342493-1475257 lnc-SEH1L-3:1 Yes chr3L:1342493-1475257 lnc-PTPN2-6:1 Yes chr2R:7988462-7991283 lnc-PTPN2-7:1 No - lnc-CEP192-1:1 No - lnc-PTPN2-8:1 No - lnc-PTPN2-9:1 No - lnc-LDLRAD4-2:1 No - lnc-PTPN2-3:2 No - lnc-PTPN2-3:3 No - lnc-LDLRAD4-1:1 No - lnc-LDLRAD4-1:2 No - lnc-PTPN2-11:1 No - lnc-CEP192-4:1 No - lnc-FAM210A-9:1 No - LDLRAD4-AS1:2 No - lnc-RNMT-7:1 No - lnc-FAM210A-7:2 No - lnc-FAM210A-7:3 No - lnc-RNMT-6:1 No - lnc-FAM210A-7:1 No - lnc-FAM210A-6:1 No - lnc-FAM210A-6:2 No - lnc-RNMT-6:2 No - lnc-RNMT-6:3 No - lnc-RNMT-5:1 No - lnc-FAM210A-5:1 No - lnc-RNMT-4:1 No - lnc-FAM210A-4:1 No - lnc-RNMT-2:2 No - lnc-RNMT-2:3 No - lnc-RNMT-2:4 No - lnc-RNMT-2:5 No - lnc-FAM210A-3:1 No - lnc-FAM210A-2:1 No - lnc-MC2R-5:1 Yes chrX:22469981-22472021 lnc-MC2R-5:2 Yes chrX:22469981-22472021 lnc-MC2R-3:1 Yes chrX:22469981-22472021 lnc-MC5R-2:1 Yes chr2L:15009939-15011764 lnc-MC2R-1:1 No - lnc-MC2R-2:1 No - lnc-MC5R-5:1 No - lnc-ZNF519-1:2 No - lnc-ZNF519-1:12 No - lnc-MC5R-6:1 No - lnc-MC2R-4:1 No - lnc-ZNF519-1:1 No - lnc-ZNF519-1:5 No - lnc-ZNF519-1:11 No - lnc-ZNF519-1:8 No - lnc-ZNF519-1:9 No - lnc-MC5R-8:1 No - lnc-ZNF519-1:10 No - lnc-ZNF519-1:3 No - lnc-ZNF519-1:7 No - lnc-ZNF519-1:4 No - lnc-ZNF519-1:6 No - lnc-MC5R-10:1 No - lnc-MC5R-1:2 No - lnc-MC5R-1:4 No - lnc-MC5R-1:6 No - lnc-MC5R-11:1 No - lnc-MC5R-11:2 No - lnc-ANKRD30B-13:2 No - lnc-ANKRD30B-13:3 No - lnc-ANKRD30B-13:5 No - lnc-ANKRD30B-13:6 No - lnc-ANKRD30B-13:7 No - lnc-ANKRD30B-13:8 No - lnc-ANKRD30B-13:11 No - lnc-ANKRD30B-13:14 No - lnc-POTEC-6:1 No - lnc-ANKRD30B-11:1 No - lnc-POTEC-8:1 No - lnc-ANKRD30B-9:1 No - lnc-POTEC-9:1 No - lnc-POTEC-10:1 No - lnc-ANKRD30B-10:1 No - lnc-POTEC-11:2 No - lnc-POTEC-11:3 No - lnc-POTEC-11:1 No - lnc-POTEC-12:1 No - lnc-POTEC-13:1 No - lnc-POTEC-14:3 No - lnc-ESCO1-7:1 Yes chrX:16624012-16637414 lnc-ESCO1-6:1 Yes chrX:16624012-16637414 lnc-ESCO1-5:1 Yes chrX:16624012-16637414 lnc-ROCK1-4:3 Yes chrX:16624012-16637414 lnc-ESCO1-3:1 Yes chrX:16624012-16637414 lnc-ROCK1-3:1 No - lnc-ROCK1-2:2 No - lnc-ABHD3-3:1 Yes chr3L:7335442-7339340 lnc-SNRPD1-4:1 No - lnc-SNRPD1-6:1 Yes chr3L:16006552-16011812 lnc-SNRPD1-7:1 Yes chr3L:16006552-16011812 MIR133A1HG:5 Yes chr3L:16006552-16011812 lnc-ABHD3-5:1 Yes chr3L:16006552-16011812 lnc-ABHD3-6:1 No - lnc-GATA6-2:1 No - GATA6-AS1:28 No - GATA6-AS1:6 Yes chr3R:16026079-16041796 lnc-GATA6-4:1 No - lnc-RBBP8-10:1 No - lnc-CTAGE1-2:1 No - lnc-CTAGE1-8:1 No - lnc-RBBP8-9:1 No - lnc-CTAGE1-4:1 No - lnc-RBBP8-6:1 No - lnc-CABLES1-7:1 No - lnc-CABLES1-6:1 No - lnc-CABLES1-3:2 No - lnc-CABLES1-5:1 No - lnc-CTAGE1-9:9 No - lnc-TMEM241-5:1 No - lnc-CABLES1-4:2 No - lnc-TMEM241-4:1 No - lnc-CABLES1-2:1 No - lnc-CABLES1-1:2 No - lnc-TMEM241-3:1 Yes chr2R:13580313-13593339 lnc-TMEM241-2:1 No - lnc-NPC1-7:4 No - lnc-NPC1-6:1 No - lnc-NPC1-7:3 No - lnc-NPC1-7:1 No - lnc-NPC1-7:2 No - lnc-ANKRD29-3:1 Yes chrX:20934869-20939503 lnc-ANKRD29-1:1 Yes chrX:20934869-20939503 lnc-RMC1-4:1 No - lnc-NPC1-2:1 Yes chr2L:2848989-2855778 lnc-NPC1-2:2 Yes chr2L:2848989-2855778 lnc-NPC1-2:3 Yes chr2L:2848989-2855778 TTC39C-AS1:2 No - TTC39C-AS1:3 No - lnc-ANKRD29-4:1 Yes chr2R:23992138-23995055 lnc-ANKRD29-6:1 Yes chr2R:23992138-23995055 lnc-ZNF521-4:2 Yes chr2R:23992138-23995055 lnc-ZNF521-4:1 Yes chr2R:23992138-23995055 lnc-ZNF521-4:3 Yes chr2R:23992138-23995055 lnc-HRH4-2:3 No - LINC01915:5 No - lnc-OSBPL1A-9:1 No - lnc-OSBPL1A-10:1 No - lnc-HRH4-13:1 No - lnc-HRH4-7:2 No - lnc-ZNF521-7:2 Yes chr2R:14435899-14465881 lnc-ZNF521-7:1 Yes chr2R:14435899-14465881 lnc-ZNF521-7:3 Yes chr2R:14435899-14465881 lnc-SS18-6:1 Yes chr2R:14435899-14465881 lnc-SS18-4:1 No - lnc-SS18-2:1 No - lnc-KCTD1-5:1 Yes chrX:8398940-8404516 lnc-KCTD1-5:3 Yes chrX:8398940-8404516 lnc-KCTD1-5:2 Yes chrX:8398940-8404516 lnc-KCTD1-4:1 Yes chrX:8398940-8404516 lnc-KCTD1-4:3 Yes chrX:8398940-8404516 lnc-KCTD1-4:2 Yes chrX:8398940-8404516 lnc-KCTD1-3:1 Yes chrX:8398940-8404516 lnc-PSMA8-3:1 No - lnc-PSMA8-2:1 No - lnc-SS18-3:1 Yes chr3L:16113212-16121651 lnc-PSMA8-4:1 Yes chr3L:16113212-16121651 lnc-SS18-5:1 Yes chr2R:21560246-21576035 lnc-AQP4-2:3 Yes chr2R:21560246-21576035 PCAT18:2 No - lnc-TAF4B-10:1 No - lnc-CHST9-2:1 No - lnc-AQP4-6:1 Yes chr3L:1876551-1883041 AQP4-AS1:10 Yes chr3L:1876551-1883041 lnc-AQP4-3:1 Yes chr3L:1876551-1883041 lnc-CHST9-4:1 No - lnc-CHST9-5:1 No - lnc-DSG1-13:1 No - lnc-DSG1-12:1 No - lnc-CDH2-6:1 No - lnc-DSG1-14:2 No - lnc-DSG1-8:1 No - lnc-DSG1-8:2 No - lnc-DSG1-7:1 No - DSG2-AS1:3 No - DSG2-AS1:6 No - DSG2-AS1:5 No - lnc-TTR-1:2 Yes chr3R:29032660-29034008 lnc-TTR-2:1 No - lnc-TTR-3:1 No - lnc-TTR-3:2 No - lnc-TTR-4:1 No - lnc-SLC25A52-1:1 Yes chr3L:19613427-19618521 lnc-SLC25A52-1:2 Yes chr3L:19613427-19618521 lnc-SLC25A52-2:1 Yes chr3L:19613427-19618521 lnc-SLC25A52-3:1 Yes chr3L:19613427-19618521 lnc-RNF125-6:1 Yes chr3L:19613427-19618521 lnc-RNF125-5:1 Yes chr3L:19613427-19618521 lnc-TRAPPC8-3:1 Yes chr3L:19613427-19618521 lnc-GAREM1-4:1 No - lnc-MEP1B-3:1 No - lnc-MEP1B-6:1 No - lnc-MEP1B-1:4 No - lnc-MEP1B-1:5 No - lnc-MEP1B-1:6 No - lnc-MEP1B-1:9 No - lnc-NOL4-5:1 No - lnc-CCDC178-3:1 No - lnc-ASXL3-1:1 Yes chr2R:14503958-14512493 lnc-CCDC178-4:1 Yes chr2L:14104090-14160587 lnc-NOL4-1:1 Yes chr2L:14104090-14160587 lnc-NOL4-1:2 Yes chr2L:14104090-14160587 lnc-DTNA-3:1 No - lnc-MAPRE2-4:1 Yes chr2R:12437345-12452916 lnc-MAPRE2-4:2 Yes chr2R:12437345-12452916 lnc-ZSCAN30-6:1 Yes chr2R:12437345-12452916 lnc-ZSCAN30-5:3 Yes chr2R:12437345-12452916 lnc-ZSCAN30-5:2 No - lnc-ZSCAN30-5:1 No - lnc-ZSCAN30-2:4 No - lnc-DTNA-2:1 Yes chr2L:4149279-4151203 lnc-ZNF397-3:1 No - lnc-ZNF24-1:7 No - lnc-ZNF24-1:3 No - lnc-ZNF397-4:1 No - lnc-ZNF397-4:2 No - lnc-ZNF397-4:3 No - lnc-ZNF397-4:4 No - lnc-ZNF396-1:1 No - lnc-INO80C-1:5 Yes chrX:8590775-8591729 lnc-INO80C-1:4 No - lnc-INO80C-1:3 No - lnc-INO80C-1:2 No - lnc-ZNF396-2:1 No - lnc-ZNF396-2:2 No - lnc-GALNT1-2:1 Yes chr2L:5072170-5093592 lnc-GALNT1-2:2 Yes chr2L:5072170-5093592 lnc-ZNF397-5:1 Yes chr2L:5072170-5093592 lnc-INO80C-2:1 Yes chr2L:5072170-5093592 lnc-GALNT1-1:1 No - lnc-GALNT1-1:2 No - lnc-RPRD1A-3:1 No - lnc-RPRD1A-2:2 No - lnc-RPRD1A-2:1 No - lnc-C18orf21-2:1 No - lnc-RPRD1A-2:3 No - lnc-SLC39A6-3:1 Yes chr3L:2235284-2237076 lnc-SLC39A6-2:1 Yes chr3L:2235284-2237076 lnc-MOCOS-2:1 Yes chr2R:10645735-10648634 lnc-SLC39A6-1:2 Yes chr2R:10645735-10648634 lnc-MOCOS-1:1 No - lnc-SLC39A6-5:1 No - lnc-MOCOS-4:1 Yes chr3L:8753619-8798719 lnc-TPGS2-3:2 No - lnc-TPGS2-3:1 No - lnc-CELF4-11:1 Yes chr3L:11990736-11992000 lnc-TPGS2-1:2 No - lnc-FHOD3-2:1 No - lnc-KIAA1328-3:1 No - lnc-CELF4-9:1 No - lnc-KIAA1328-4:1 Yes chr3L:13521907-13803400 lnc-KIAA1328-4:2 Yes chr3L:13521907-13803400 lnc-TPGS2-6:1 Yes chr3L:13521907-13803400 lnc-KIAA1328-5:1 Yes chr3L:13521907-13803400 lnc-KIAA1328-5:2 Yes chr3L:13521907-13803400 lnc-TPGS2-9:1 Yes chr3L:13521907-13803400 lnc-KIAA1328-8:1 No - lnc-CELF4-4:5 No - lnc-CELF4-4:6 No - lnc-CELF4-4:4 No - lnc-CELF4-4:3 No - lnc-CELF4-5:2 No - lnc-CELF4-13:1 No - MIR924HG:8 No - lnc-KIAA1328-11:1 No - MIR924HG:2 No - MIR924HG:7 No - lnc-KIAA1328-2:2 No - lnc-KIAA1328-12:1 No - lnc-PIK3C3-2:4 No - MIR924HG:3 No - lnc-PIK3C3-16:1 No - lnc-PIK3C3-15:1 No - lnc-PIK3C3-2:5 No - lnc-PIK3C3-14:1 No - lnc-PIK3C3-13:1 No - lnc-PIK3C3-12:1 No - lnc-PIK3C3-11:1 No - LINC01901:4 No - lnc-CELF4-15:1 No - lnc-CELF4-16:1 No - lnc-PIK3C3-8:1 No - lnc-RIT2-2:11 No - lnc-RIT2-2:8 No - lnc-RIT2-2:6 No - lnc-RIT2-2:2 No - lnc-RIT2-2:10 No - lnc-RIT2-2:7 No - lnc-RIT2-2:9 No - lnc-RIT2-2:3 No - lnc-RIT2-2:5 No - lnc-RIT2-2:4 No - lnc-RIT2-9:1 No - lnc-RIT2-8:1 No - lnc-PIK3C3-4:1 No - lnc-SETBP1-8:1 Yes chr2R:23560492-23564045 lnc-PIK3C3-3:1 No - LINC00907:1 No - LINC00907:2 No - LINC00907:3 No - LINC00907:4 No - LINC00907:5 No - LINC00907:6 No - LINC00907:7 No - LINC00907:8 No - LINC00907:16 No - lnc-RIT2-7:1 No - lnc-PIK3C3-6:1 No - lnc-PIK3C3-7:1 No - lnc-RIT2-6:1 No - lnc-RIT2-3:1 No - lnc-RIT2-4:1 Yes chr3R:7266065-7270809 lnc-RIT2-4:2 Yes chr3R:7266065-7270809 lnc-SETBP1-5:1 No - LINC01478:7 No - lnc-SYT4-7:1 No - LINC01478:3 No - LINC01478:4 No - lnc-EPG5-1:2 No - lnc-EPG5-1:3 No - lnc-SETBP1-2:1 No - lnc-EPG5-9:2 No - lnc-EPG5-9:4 No - lnc-SLC14A2-3:2 No - lnc-EPG5-9:1 No - lnc-EPG5-9:3 No - SLC14A2-AS1:1 No - SLC14A2-AS1:6 No - SLC14A2-AS1:5 No - SLC14A2-AS1:3 No - lnc-SLC14A1-6:1 No - lnc-SLC14A1-6:2 No - lnc-SLC14A1-6:4 No - lnc-SLC14A1-6:5 No - lnc-SLC14A1-6:6 No - lnc-SLC14A1-5:2 No - lnc-SLC14A1-5:3 No - lnc-SLC14A1-3:1 No - lnc-EPG5-5:2 No - lnc-EPG5-5:1 No - lnc-SLC14A1-1:1 No - lnc-PSTPIP2-4:1 Yes chr3R:18750436-18758873 lnc-PSTPIP2-3:1 Yes chr3R:18750436-18758873 lnc-EPG5-3:1 No - lnc-EPG5-4:1 No - lnc-PSTPIP2-1:1 Yes chr2R:22799099-22802180 lnc-PSTPIP2-2:1 Yes chr2R:22799099-22802180 lnc-PSTPIP2-2:2 Yes chr2R:22799099-22802180 lnc-C18orf25-1:1 No - lnc-LOXHD1-1:3 No - lnc-LOXHD1-1:2 No - lnc-KATNAL2-10:1 No - lnc-KATNAL2-1:6 No - lnc-KATNAL2-1:7 No - lnc-KATNAL2-7:1 Yes chr2R:9116122-9122000 lnc-PIAS2-1:1 Yes chr2R:9116122-9122000 lnc-ST8SIA5-2:1 Yes chr2R:9116122-9122000 lnc-ST8SIA5-4:1 Yes chr2R:9116122-9122000 lnc-ST8SIA5-3:1 Yes chr2R:9116122-9122000 lnc-ELOA3D-2:1 Yes chr2R:9116122-9122000 lnc-ELOA3D-2:2 Yes chr2R:9116122-9122000 lnc-ELOA3D-1:1 Yes chr2R:9116122-9122000 lnc-KATNAL2-5:1 Yes chr2L:8377035-8378206 lnc-IER3IP1-1:1 No - lnc-KATNAL2-6:1 No - MIR4527HG:28 No - MIR4527HG:30 No - lnc-KATNAL2-9:1 No - lnc-KATNAL2-2:2 No - MIR4527HG:33 No - lnc-KATNAL2-11:1 No - lnc-KATNAL2-4:2 No - lnc-KATNAL2-4:3 No - lnc-KATNAL2-4:4 No - lnc-KATNAL2-12:1 No - lnc-ZBTB7C-10:2 Yes chrX:8137041-8142279 lnc-ZBTB7C-6:1 Yes chrX:8137041-8142279 lnc-ZBTB7C-5:1 Yes chrX:8137041-8142279 lnc-ZBTB7C-4:1 Yes chrX:8137041-8142279 lnc-SMAD2-2:1 No - lnc-ZBTB7C-1:2 No - lnc-SMAD2-400:1 No - lnc-SMAD2-3:17 No - lnc-SMAD2-3:18 No - lnc-SMAD2-3:13 No - lnc-SMAD2-3:14 No - lnc-SMAD2-3:15 No - lnc-SMAD2-3:16 No - lnc-CTIF-4:1 No - lnc-LIPG-11:1 No - lnc-ZBTB7C-7:1 No - lnc-SMAD7-4:3 No - lnc-SMAD7-4:2 No - lnc-SMAD7-4:1 No - lnc-LIPG-9:1 No - lnc-SMAD7-2:1 No - lnc-LIPG-8:1 No - lnc-LIPG-7:1 No - lnc-DYM-3:1 Yes chr3R:17054007-17070408 lnc-SMAD7-1:1 No - lnc-SMAD7-1:2 No - lnc-DYM-1:2 No - lnc-CTIF-1:2 No - lnc-SMAD7-3:1 Yes chr2R:8944298-8947344 lnc-C18orf32-3:1 Yes chr2R:8944298-8947344 lnc-C18orf32-2:12 Yes chr2R:8944298-8947344 lnc-C18orf32-2:11 Yes chr2R:8944298-8947344 lnc-C18orf32-2:7 Yes chr2R:8944298-8947344 lnc-C18orf32-2:9 Yes chr2R:8944298-8947344 lnc-C18orf32-2:8 Yes chr2R:8944298-8947344 lnc-C18orf32-2:10 Yes chr2R:8944298-8947344 lnc-LIPG-5:1 No - lnc-RPL17-2:1 No - lnc-RPL17-2:6 No - lnc-RPL17-2:5 No - lnc-RPL17-2:3 No - lnc-RPL17-2:2 No - lnc-RPL17-2:4 No - lnc-LIPG-4:1 No - lnc-LIPG-4:2 No - lnc-LIPG-4:3 No - lnc-ACAA2-1:1 No - lnc-MYO5B-2:1 Yes chr2L:9915253-9917220 lnc-LIPG-13:1 No - lnc-LIPG-13:2 Yes chr2R:7500147-7508625 lnc-ACAA2-2:1 Yes chr2R:7500147-7508625 lnc-CFAP53-2:1 Yes chr2R:7500147-7508625 lnc-SKA1-3:1 Yes chr2R:7500147-7508625 lnc-SKA1-2:1 Yes chr2R:7500147-7508625 lnc-MYO5B-1:1 No - lnc-CFAP53-1:1 No - lnc-CXXC1-3:2 No - lnc-CXXC1-3:1 No - lnc-CXXC1-2:2 No - lnc-CXXC1-2:1 No - lnc-MBD1-1:2 Yes chrX:9268438-9269925 lnc-MBD1-1:1 Yes chrX:9268438-9269925 lnc-MBD1-2:1 Yes chrX:9268438-9269925 lnc-SKA1-1:1 No - lnc-CXXC1-4:1 No - lnc-CXXC1-1:2 No - lnc-ME2-5:1 No - lnc-ME2-4:2 No - lnc-ME2-3:1 No - lnc-ME2-2:1 No - lnc-ME2-1:1 Yes chr2R:16414815-16419398 lnc-ME2-6:1 No - lnc-MRO-1:1 No - lnc-SMAD4-2:2 No - lnc-MEX3C-4:1 No - lnc-MEX3C-3:1 No - lnc-MEX3C-2:1 No - lnc-SMAD4-3:1 No - lnc-MEX3C-5:1 No - lnc-SMAD4-4:1 No - lnc-MEX3C-6:1 No - lnc-MEX3C-7:1 No - lnc-SMAD4-6:1 Yes chr2R:12529053-12564184 LINC01919:9 No - LINC01917:5 No - lnc-MBD2-5:1 No - lnc-DCC-3:1 No - lnc-POLI-2:1 No - lnc-POLI-1:1 No - lnc-STARD6-2:1 No - lnc-DYNAP-3:2 No - lnc-DYNAP-36:1 No - lnc-DYNAP-2:2 No - lnc-CCDC68-1:2 No - lnc-TCF4-6:1 No - lnc-RAB27B-1:1 No - lnc-CCDC68-3:1 No - LINC01929:7 No - lnc-CCDC68-4:1 Yes chr2L:10388105-10393228 lnc-CCDC68-5:2 Yes chr2L:10388105-10393228 lnc-CCDC68-5:1 Yes chr2L:10388105-10393228 TCF4-AS1:1 Yes chr2L:10388105-10393228 TCF4-AS2:1 Yes chr2L:10388105-10393228 lnc-RAB27B-9:1 Yes chr2L:10388105-10393228 lnc-RAB27B-11:1 No - lnc-RAB27B-11:2 No - lnc-RAB27B-11:3 No - LINC01415:2 No - lnc-RAB27B-11:5 No - lnc-WDR7-11:1 No - lnc-WDR7-6:2 No - lnc-WDR7-6:3 No - LINC01539:1 No - lnc-WDR7-6:4 No - LINC01539:18 No - LINC01905:11 No - LINC01905:12 No - LINC01905:13 No - LINC01539:20 No - LINC01905:14 No - LINC01905:15 No - lnc-TCF4-7:1 No - LINC01539:8 No - LINC01539:9 No - LINC01539:16 No - LINC01539:17 No - LINC01539:14 No - LINC01539:10 No - LINC01905:17 No - LINC01539:11 No - LINC01539:13 No - LINC01539:15 No - LINC01539:12 No - lnc-WDR7-4:3 No - lnc-TCF4-2:5 Yes chr3L:5765846-5767084 lnc-TCF4-2:6 Yes chr3L:5765846-5767084 lnc-FECH-3:7 Yes chr3L:5765846-5767084 lnc-FECH-3:8 Yes chr3L:5765846-5767084 lnc-TXNL1-4:1 Yes chrX:1908920-1916825 WDR7-OT1:1 Yes chrX:1908920-1916825 lnc-WDR7-3:2 No - LINC-ROR:2 No - LINC-ROR:5 No - lnc-FECH-4:4 No - lnc-FECH-4:3 No - lnc-FECH-4:2 No - lnc-FECH-4:1 No - LINC02565:13 No - lnc-ONECUT2-1:2 No - lnc-ONECUT2-2:7 No - lnc-NARS-2:1 Yes chr3R:31810460-31812296 lnc-NARS-2:2 Yes chr3R:31810460-31812296 lnc-NARS-2:3 Yes chr3R:31810460-31812296 lnc-ONECUT2-4:1 No - lnc-NARS-1:1 No - lnc-FECH-2:1 Yes chr2L:19129469-19131954 lnc-ONECUT2-5:1 No - lnc-ONECUT2-5:2 No - lnc-ONECUT2-6:1 No - LINC01897:5 No - LINC01897:6 No - LINC01897:7 No - lnc-ATP8B1-1:1 No - lnc-ATP8B1-1:2 No - lnc-ATP8B1-2:1 No - lnc-ATP8B1-4:1 Yes chr3L:17530081-17546660 lnc-ATP8B1-4:2 Yes chr3L:17530081-17546660 lnc-ALPK2-8:3 Yes chr3L:17530081-17546660 lnc-ALPK2-8:1 Yes chr3L:17530081-17546660 lnc-ALPK2-8:2 Yes chr3L:17530081-17546660 lnc-MALT1-11:1 Yes chr3L:17530081-17546660 lnc-ALPK2-4:2 Yes chr3L:17530081-17546660 lnc-ALPK2-4:1 Yes chr3L:17530081-17546660 lnc-ALPK2-3:1 No - lnc-NEDD4L-3:1 No - MIR122HG:10 No - MIR122HG:11 No - MIR122HG:15 No - lnc-ALPK2-1:1 No - lnc-NEDD4L-4:1 No - lnc-RAX-6:2 No - lnc-RAX-6:1 No - lnc-MALT1-7:1 No - lnc-RAX-7:1 No - lnc-MALT1-5:1 No - lnc-MALT1-1:2 No - lnc-ALPK2-2:2 No - lnc-ALPK2-2:1 No - lnc-ALPK2-5:1 No - lnc-ALPK2-5:2 No - lnc-ZNF532-3:1 No - lnc-MALT1-2:1 No - lnc-ALPK2-6:1 No - lnc-ALPK2-7:1 No - lnc-MALT1-4:1 No - lnc-MALT1-3:1 No - lnc-MALT1-6:1 No - LINC01926:5 No - LINC01926:6 No - lnc-ZNF532-2:1 No - lnc-ZNF532-2:2 No - lnc-SEC11C-4:1 No - lnc-SEC11C-2:1 No - lnc-SEC11C-2:2 No - lnc-SEC11C-2:3 No - lnc-SEC11C-2:4 No - lnc-SEC11C-1:1 No - lnc-RAX-2:1 No - lnc-RAX-1:1 No - lnc-CPLX4-2:1 No - lnc-CPLX4-1:2 Yes chr3L:8534977-8538013 lnc-CPLX4-1:1 Yes chr3L:8534977-8538013 lnc-GRP-2:1 No - lnc-LMAN1-1:2 No - lnc-GRP-3:1 No - lnc-PMAIP1-13:1 No - lnc-PMAIP1-13:2 No - lnc-PMAIP1-12:1 No - lnc-PMAIP1-10:1 No - lnc-PMAIP1-8:1 No - lnc-PMAIP1-5:1 No - lnc-CCBE1-4:1 No - lnc-PMAIP1-3:1 No - lnc-PMAIP1-7:1 No - lnc-PMAIP1-4:1 No - lnc-PMAIP1-6:1 No - lnc-PMAIP1-9:1 No - lnc-PMAIP1-9:2 No - lnc-PMAIP1-1:2 No - lnc-PMAIP1-2:2 No - lnc-MC4R-2:1 No - lnc-PMAIP1-14:1 No - lnc-MC4R-3:1 No - lnc-MC4R-5:1 No - lnc-CDH20-5:1 No - lnc-MC4R-4:2 No - lnc-MC4R-4:1 No - lnc-RNF152-10:1 No - lnc-CDH20-3:1 No - lnc-RNF152-2:10 No - lnc-RNF152-2:9 No - lnc-RNF152-2:8 No - lnc-RNF152-2:3 No - lnc-RNF152-2:2 No - lnc-RNF152-2:7 No - lnc-RNF152-5:1 No - lnc-CDH20-1:6 No - LINC01544:4 No - lnc-PIGN-6:1 No - lnc-RNF152-3:11 No - lnc-RNF152-3:10 No - lnc-RNF152-4:1 Yes chr3R:22707786-22710762 lnc-RNF152-6:1 Yes chr3R:22707786-22710762 lnc-RNF152-8:1 Yes chr3R:22707786-22710762 lnc-PIGN-10:1 No - lnc-PIGN-10:3 No - lnc-TNFRSF11A-5:1 No - lnc-PIGN-10:2 No - lnc-KIAA1468-1:1 No - lnc-PIGN-2:1 No - lnc-KIAA1468-1:2 No - lnc-PIGN-4:1 No - lnc-TNFRSF11A-1:1 No - lnc-TNFRSF11A-2:1 No - lnc-ZCCHC2-3:1 No - lnc-ZCCHC2-2:1 No - lnc-PIGN-7:2 No - lnc-PIGN-7:1 No - lnc-PIGN-8:1 No - lnc-ZCCHC2-4:1 Yes chr2L:19059129-19063132 lnc-KDSR-6:1 No - lnc-KDSR-5:2 No - lnc-KDSR-2:1 No - lnc-BCL2-1:2 Yes chr3R:25260963-25262498 lnc-BCL2-3:1 Yes chr3R:25260963-25262498 lnc-VPS4B-2:2 Yes chr3R:25260963-25262498 lnc-VPS4B-2:1 Yes chr3R:25260963-25262498 lnc-VPS4B-1:1 No - lnc-KDSR-3:6 Yes chrX:17907692-17911097 lnc-KDSR-3:4 Yes chrX:17907692-17911097 lnc-KDSR-3:5 Yes chrX:17907692-17911097 lnc-KDSR-4:1 Yes chrX:17907692-17911097 lnc-SERPINB12-3:1 No - lnc-SERPINB12-1:1 No - lnc-SERPINB3-4:1 No - lnc-SERPINB3-5:1 No - lnc-SERPINB3-6:1 No - lnc-SERPINB8-4:1 No - LINC00305:1 No - LINC01924:4 No - LINC00305:2 No - lnc-SERPINB8-2:3 No - LINC01538:2 No - lnc-CDH19-6:1 No - lnc-CDH19-5:1 No - lnc-DSEL-8:1 No - lnc-DSEL-4:1 No - lnc-DSEL-5:1 No - lnc-DSEL-6:1 No - lnc-DSEL-7:1 No - LINC01912:10 No - LINC01912:11 No - lnc-CCDC102B-10:1 No - lnc-CD226-10:1 Yes chr3L:16229100-16231139 lnc-CD226-7:1 Yes chr3L:16229100-16231139 lnc-CD226-6:1 Yes chr3L:16229100-16231139 lnc-CCDC102B-1:2 No - lnc-CCDC102B-1:3 Yes chr2L:6491061-6496988 lnc-DOK6-5:1 Yes chr2L:6491061-6496988 lnc-TMX3-4:1 Yes chr2L:6491061-6496988 lnc-TMX3-6:1 Yes chr2L:6491061-6496988 lnc-CCDC102B-2:2 No - lnc-CCDC102B-11:1 Yes chrX:7324214-7328806 lnc-CCDC102B-11:2 Yes chrX:7324214-7328806 lnc-CCDC102B-12:1 Yes chrX:7324214-7328806 lnc-SOCS6-10:1 No - lnc-DOK6-1:1 No - lnc-DOK6-2:1 No - lnc-CD226-3:3 No - lnc-CD226-3:1 No - lnc-CD226-3:4 No - lnc-CD226-3:2 No - lnc-CD226-4:1 No - lnc-DOK6-3:1 No - LINC01909:14 No - lnc-SOCS6-7:1 No - lnc-SOCS6-8:1 No - lnc-SOCS6-8:2 No - lnc-SOCS6-9:1 No - lnc-RTTN-4:2 No - lnc-SOCS6-11:1 No - lnc-SOCS6-12:1 No - lnc-SOCS6-14:1 No - lnc-SOCS6-15:1 No - LINC01899:13 No - LINC01899:11 No - LINC01899:9 No - lnc-SOCS6-16:1 No - lnc-SOCS6-16:2 No - lnc-SOCS6-17:1 No - lnc-CBLN2-6:2 Yes chr3L:18668153-18673324 lnc-CBLN2-6:1 Yes chr3L:18668153-18673324 lnc-CBLN2-6:3 Yes chr3L:18668153-18673324 lnc-CBLN2-11:1 Yes chrX:13445903-13527282 lnc-NETO1-3:1 Yes chrX:13445903-13527282 lnc-TIMM21-5:9 No - lnc-NETO1-1:18 No - lnc-TIMM21-12:1 No - lnc-NETO1-1:16 No - lnc-NETO1-1:17 No - LINC02582:10 No - LINC02582:14 No - lnc-TIMM21-10:1 No - lnc-TIMM21-9:1 No - lnc-TIMM21-8:1 No - lnc-TIMM21-7:1 No - lnc-FBXO15-7:1 No - lnc-CYB5A-3:2 No - lnc-CYB5A-3:1 No - lnc-CYB5A-3:3 No - lnc-CYB5A-1:3 No - lnc-TIMM21-6:1 No - lnc-FBXO15-6:1 Yes chrX:6274972-6276724 lnc-FBXO15-6:3 Yes chrX:6274972-6276724 lnc-FBXO15-6:2 Yes chrX:6274972-6276724 lnc-ZNF407-3:1 Yes chr2R:5697872-5700212 lnc-ZNF407-1:2 No - LINC00909:4 No - lnc-ZNF407-1:3 No - lnc-ZADH2-2:2 No - lnc-SMIM21-1:1 No - lnc-TSHZ1-4:1 No - LINC01898:8 No - lnc-ZNF236-12:1 No - lnc-ZNF236-7:3 No - lnc-ZNF236-7:4 No - lnc-ZNF236-7:5 No - lnc-ZNF516-4:2 No - lnc-MBP-15:1 No - lnc-MBP-12:1 No - LINC00908:12 No - lnc-ZNF236-10:1 No - LINC00683:3 No - LINC01927:13 No - LINC01879:6 No - lnc-ZNF236-4:1 No - lnc-ZNF236-3:1 No - ZNF236-DT:17 No - ZNF236-DT:13 No - lnc-MBP-7:1 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-MBP-6:1 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-MBP-13:10 No - lnc-MBP-13:11 No - lnc-ZNF236-1:7 No - lnc-MBP-13:6 No - lnc-MBP-13:8 No - lnc-MBP-13:9 No - lnc-MBP-13:7 No - lnc-MBP-13:4 No - lnc-MBP-13:3 No - lnc-MBP-13:5 No - lnc-MBP-13:2 No - lnc-GALR1-1:2 Yes chr3R:28737109-28744782 lnc-MBP-8:1 No - lnc-MBP-9:1 No - lnc-MBP-10:1 No - lnc-SALL3-1:2 No - lnc-PQLC1-5:2 No - LINC01896:43 No - LINC01896:30 No - lnc-SALL3-7:1 Yes chr2L:13289997-13301668 lnc-PQLC1-12:2 Yes chr2L:13289997-13301668 lnc-PQLC1-11:2 Yes chr2L:13289997-13301668 lnc-PQLC1-10:2 Yes chr2L:13289997-13301668 lnc-PQLC1-9:2 Yes chr2L:13289997-13301668 lnc-ATP9B-1:1 Yes chrX:13624745-13664568 lnc-PQLC1-8:2 No - lnc-NFATC1-1:2 No - lnc-NFATC1-1:3 No - lnc-CTDP1-3:1 No - lnc-PQLC1-104:5 No - lnc-PQLC1-104:7 No - lnc-PQLC1-104:16 No - lnc-NFATC1-2:1 Yes chr2R:24567987-24571821 lnc-PQLC1-7:2 Yes chr2R:24567987-24571821 lnc-CTDP1-1:1 No - lnc-CTDP1-2:1 No - lnc-TXNL4A-2:2 Yes chr2L:7204538-7220033 lnc-TXNL4A-2:1 Yes chr2L:7204538-7220033 lnc-PQLC1-2:1 Yes chr2L:4403251-4403955 lnc-PQLC1-1:5 Yes chr2L:4403251-4403955 lnc-ADNP2-2:3 No - RBFADN:12 No - RBFADN:14 No - RBFADN:15 No - PARD6G-AS1:1 No - lnc-ADNP2-5:1 Yes chrX:17703352-17707096 lnc-ADNP2-5:2 Yes chrX:17703352-17707096 lnc-PLPP2-5:4 No - lnc-PLPP2-5:2 No - lnc-PLPP2-5:5 No - lnc-PLPP2-5:3 No - lnc-OR4F17-5:1 No - lnc-OR4F17-4:1 No - lnc-OR4F17-4:3 No - FAM138F:2 No - FAM138F:5 No - lnc-OR4F17-2:1 No - lnc-OR4F17-1:1 No - lnc-OR4F17-3:1 No - lnc-PLPP2-4:1 No - lnc-PLPP2-3:1 No - lnc-OR4F17-6:1 No - lnc-PLPP2-2:1 No - lnc-OR4F17-7:1 No - LINC01002:34 No - LINC01002:30 No - lnc-OR4F17-8:1 No - lnc-OR4F17-8:2 No - lnc-OR4F17-9:1 No - lnc-MADCAM1-5:1 Yes chr2R:7493806-7496466 lnc-THEG-1:1 Yes chr2R:7493806-7496466 lnc-MIER2-1:1 No - lnc-MADCAM1-4:1 No - lnc-MADCAM1-3:1 No - lnc-MADCAM1-2:1 No - lnc-SHC2-1:1 Yes chr3L:9427010-9428671 lnc-SHC2-2:1 Yes chr3R:23695221-23696245 lnc-ODF3L2-2:1 No - lnc-ODF3L2-2:2 No - lnc-ODF3L2-3:1 No - lnc-POLRMT-6:5 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-POLRMT-6:7 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-POLRMT-6:2 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-POLRMT-6:4 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-POLRMT-6:3 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-POLRMT-6:1 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-POLRMT-5:1 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-POLRMT-8:1 Yes chr2R:14276130-14300095 lnc-POLRMT-3:3 Yes chr2L:1103254-1108373 lnc-POLRMT-3:2 Yes chr2L:1103254-1108373 lnc-POLRMT-7:1 Yes chr3R:9006456-9008030 lnc-POLRMT-4:2 Yes chr3R:9006456-9008030 lnc-POLRMT-4:1 Yes chr3R:9006456-9008030 lnc-FSTL3-1:2 No - lnc-FSTL3-1:1 No - lnc-RNF126-2:1 No - lnc-MISP-1:1 No - lnc-MISP-2:1 No - lnc-PLPPR3-1:2 No - LINC01836:9 No - LINC01836:11 No - lnc-PTBP1-2:1 No - lnc-PTBP1-2:2 No - lnc-MED16-3:1 No - lnc-PLPPR3-3:1 Yes chrX:1468693-1469817 lnc-MED16-1:2 No - lnc-MED16-1:1 No - lnc-R3HDM4-3:3 Yes chr2R:22183138-22185892 lnc-R3HDM4-3:1 Yes chr2R:22183138-22185892 lnc-R3HDM4-3:2 Yes chr2R:22183138-22185892 lnc-CFD-1:1 Yes chr2R:22183138-22185892 lnc-R3HDM4-1:1 Yes chr2R:22183138-22185892 lnc-MED16-2:1 No - lnc-ARID3A-1:1 Yes chr2R:23632610-23654820 lnc-ARID3A-1:2 Yes chr2R:23632610-23654820 lnc-R3HDM4-2:1 Yes chr2R:23632610-23654820 lnc-R3HDM4-2:2 Yes chr2R:23632610-23654820 lnc-ARID3A-1:3 Yes chr2R:23632610-23654820 lnc-WDR18-2:1 Yes chr2R:23632610-23654820 lnc-TMEM259-2:1 No - lnc-GRIN3B-1:1 No - lnc-TMEM259-1:3 No - lnc-POLR2E-2:2 No - lnc-POLR2E-2:1 Yes chr2R:16047648-16060835 lnc-POLR2E-1:1 Yes chr2R:16047648-16060835 lnc-TMEM259-5:1 Yes chr3L:4114289-4122388 lnc-SBNO2-1:3 No - lnc-SBNO2-1:2 Yes chr2R:10898031-10899060 lnc-SBNO2-1:1 Yes chr2R:10898031-10899060 lnc-STK11-2:1 Yes chrX:13195499-13211674 lnc-ATP5F1D-3:3 No - lnc-ATP5F1D-2:1 No - lnc-MIDN-1:2 Yes chr2R:14602004-14604337 lnc-MIDN-1:3 Yes chr2R:14602004-14604337 lnc-MIDN-1:4 Yes chr2R:14602004-14604337 lnc-CBARP-3:1 Yes chr2R:14602004-14604337 CIRBP-AS1:1 Yes chr2R:14602004-14604337 CIRBP-AS1:4 Yes chr2R:14602004-14604337 lnc-CBARP-5:1 No - lnc-EFNA2-1:1 No - lnc-GAMT-7:1 No - lnc-GAMT-6:1 No - lnc-GAMT-6:2 No - lnc-GAMT-2:3 Yes chrX:15985473-15986808 lnc-GAMT-2:4 Yes chrX:15985473-15986808 lnc-GAMT-1:2 Yes chrX:15985473-15986808 lnc-GAMT-1:4 Yes chrX:15985473-15986808 lnc-NDUFS7-3:1 Yes chr2L:6920704-6932057 lnc-C19orf25-2:2 Yes chr3R:24163966-24168264 lnc-C19orf25-2:1 No - lnc-PCSK4-2:1 No - lnc-PCSK4-2:2 No - lnc-PCSK4-1:4 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-PCSK4-1:6 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-PCSK4-1:5 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-REEP6-1:1 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-PCSK4-1:1 No - lnc-PCSK4-1:2 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-PCSK4-1:3 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-ADAMTSL5-1:1 No - lnc-ADAMTSL5-1:2 No - lnc-ADAMTSL5-2:2 No - lnc-ADAMTSL5-2:1 No - lnc-MEX3D-4:1 No - lnc-MEX3D-3:1 No - lnc-MEX3D-2:1 No - lnc-MBD3-3:2 Yes chr4:671142-690650 lnc-MBD3-3:1 Yes chr4:671142-690650 lnc-MEX3D-1:1 No - lnc-MBD3-1:1 Yes chr3R:9559760-9561533 lnc-UQCR11-3:1 No - lnc-MEX3D-6:1 No - lnc-UQCR11-1:1 No - lnc-TCF3-2:2 No - lnc-TCF3-2:1 No - lnc-UQCR11-2:2 Yes chr2L:10388105-10393228 lnc-UQCR11-2:1 Yes chr2L:10388105-10393228 lnc-ONECUT3-4:1 No - lnc-ONECUT3-2:1 No - lnc-ONECUT3-2:2 No - lnc-ATP8B3-4:1 No - lnc-ATP8B3-3:1 No - lnc-ONECUT3-3:1 Yes chr3R:27707100-27710857 lnc-ATP8B3-2:1 Yes chr3R:27707100-27710857 lnc-ONECUT3-1:3 Yes chr3R:27707100-27710857 lnc-REXO1-1:1 No - lnc-SCAMP4-4:1 Yes chr2L:476446-479688 lnc-SCAMP4-3:1 Yes chr2L:476446-479688 lnc-ABHD17A-1:1 No - lnc-SCAMP4-2:1 No - lnc-KLF16-2:1 Yes chr3R:25097672-25102146 lnc-CSNK1G2-5:1 Yes chrX:15446179-15449883 lnc-ADAT3-4:1 Yes chrX:15446179-15449883 lnc-ADAT3-3:1 Yes chrX:15446179-15449883 lnc-ADAT3-5:1 Yes chrX:15446179-15449883 lnc-CSNK1G2-1:4 Yes chr3R:16272452-16304768 CSNK1G2-AS1:2 Yes chr3R:16272452-16304768 CSNK1G2-AS1:3 Yes chr3R:16272452-16304768 lnc-MKNK2-3:2 No - lnc-MKNK2-3:1 No - lnc-BTBD2-2:1 No - lnc-BTBD2-2:3 No - lnc-BTBD2-2:2 No - lnc-CSNK1G2-2:1 No - lnc-CSNK1G2-3:1 No - lnc-MKNK2-1:1 No - lnc-IZUMO4-1:1 No - lnc-AP3D1-1:1 Yes chr2L:10265336-10266570 lnc-MOB3A-1:1 Yes chrX:13727204-13736278 lnc-MOB3A-2:1 Yes chrX:13727204-13736278 lnc-MOB3A-2:2 Yes chrX:13727204-13736278 lnc-MOB3A-3:1 Yes chrX:13727204-13736278 lnc-DOT1L-1:1 No - lnc-JSRP1-4:1 No - lnc-JSRP1-3:1 No - lnc-PEAK3-2:1 No - lnc-PEAK3-2:2 No - lnc-JSRP1-1:2 No - lnc-LINGO3-1:1 No - lnc-LINGO3-4:1 No - lnc-LINGO3-3:1 No - lnc-LSM7-3:1 No - lnc-OAZ1-3:1 No - lnc-TIMM13-2:1 Yes chr2L:5542480-5546642 lnc-TIMM13-3:1 Yes chr2L:5542480-5546642 LINC01775:7 No - lnc-GNG7-1:1 No - lnc-GADD45B-4:1 No - lnc-GADD45B-5:1 No - lnc-TIMM13-1:2 No - lnc-THOP1-2:1 No - lnc-DIRAS1-2:1 No - lnc-SGTA-1:1 No - lnc-SLC39A3-2:1 Yes chr2L:17471603-17474773 lnc-SLC39A3-3:1 Yes chr2L:17471603-17474773 lnc-SGTA-4:1 No - lnc-ZNF77-3:1 No - lnc-ZNF77-165:3 No - lnc-ZNF77-165:5 No - lnc-ZNF77-165:2 No - lnc-ZNF77-165:1 No - lnc-ZNF77-1:1 No - lnc-TLE6-1:1 No - lnc-ZNF77-2:2 No - lnc-ZNF77-2:1 No - lnc-AES-2:7 Yes chr3R:26041736-26049911 lnc-AES-2:5 Yes chr3R:26041736-26049911 lnc-AES-2:1 Yes chr3R:26041736-26049911 lnc-AES-2:2 Yes chr3R:26041736-26049911 lnc-AES-2:6 Yes chr3R:26041736-26049911 lnc-AES-2:3 Yes chr3R:26041736-26049911 lnc-AES-2:4 Yes chr3R:26041736-26049911 lnc-AES-1:5 Yes chr3R:26041736-26049911 lnc-GNA11-3:1 Yes chr3R:26041736-26049911 lnc-AES-1:3 Yes chr3R:26041736-26049911 lnc-AES-1:4 Yes chr3R:26041736-26049911 lnc-AES-1:6 Yes chr3R:26041736-26049911 lnc-AES-1:1 Yes chr3R:26041736-26049911 lnc-AES-1:2 Yes chr3R:26041736-26049911 lnc-GNA11-2:1 No - lnc-AES-4:1 Yes chr2R:12612740-12623197 lnc-AES-5:1 Yes chr2R:12612740-12623197 lnc-GNA15-3:1 Yes chr2R:12612740-12623197 lnc-GNA15-3:2 Yes chr2R:12612740-12623197 lnc-GNA15-1:1 No - lnc-AES-6:1 No - lnc-SMIM24-2:1 Yes chr3L:13521907-13803400 lnc-SMIM24-2:6 Yes chr3L:13521907-13803400 lnc-SMIM24-2:5 Yes chr3L:13521907-13803400 lnc-CELF5-1:2 Yes chr4:268175-276369 lnc-DOHH-1:1 No - lnc-FZR1-1:1 No - lnc-DOHH-2:2 No - lnc-DOHH-2:1 No - lnc-TBXA2R-2:1 No - lnc-C19orf71-3:1 No - lnc-MFSD12-1:2 No - lnc-C19orf71-4:1 No - lnc-MFSD12-1:1 No - lnc-TBXA2R-1:1 Yes chrX:20424069-20426402 lnc-TJP3-2:1 Yes chr2R:22874769-22881436 lnc-RAX2-2:3 Yes chrX:10627737-10710947 lnc-RAX2-2:2 Yes chrX:10627737-10710947 lnc-RAX2-2:1 Yes chrX:10627737-10710947 lnc-RAX2-1:1 Yes chrX:10627737-10710947 lnc-ZFR2-2:2 Yes chr3R:11633278-11650706 lnc-ZFR2-2:3 Yes chr3R:11633278-11650706 lnc-ZFR2-2:1 Yes chr3R:11633278-11650706 lnc-DAPK3-4:1 Yes chr3L:4037523-4040482 lnc-NMRK2-2:1 Yes chr3L:4037523-4040482 lnc-ATCAY-1:1 Yes chr3L:4037523-4040482 lnc-DAPK3-1:1 Yes chr2L:21677913-21682164 lnc-DAPK3-2:1 Yes chr2L:21677913-21682164 lnc-NMRK2-5:1 Yes chr2R:9116122-9122000 lnc-NMRK2-5:2 Yes chr2R:9116122-9122000 lnc-NMRK2-5:3 Yes chr2R:9116122-9122000 lnc-NMRK2-5:4 Yes chr2R:9116122-9122000 lnc-NMRK2-5:5 Yes chr2R:9116122-9122000 lnc-NMRK2-5:6 Yes chr2R:9116122-9122000 lnc-NMRK2-5:7 Yes chr2R:9116122-9122000 lnc-NMRK2-5:8 Yes chr2R:9116122-9122000 lnc-ZBTB7A-1:5 Yes chr2R:9116122-9122000 lnc-NMRK2-5:9 Yes chr2R:9116122-9122000 lnc-ZBTB7A-1:6 Yes chr2R:9116122-9122000 lnc-NMRK2-5:10 Yes chr2R:9116122-9122000 lnc-ZBTB7A-1:7 Yes chr2R:9116122-9122000 lnc-ZBTB7A-1:4 Yes chr2R:9116122-9122000 lnc-MAP2K2-2:3 No - lnc-MAP2K2-1:1 No - lnc-ZBTB7A-2:2 Yes chrX:9247342-9250037 lnc-ZBTB7A-2:3 Yes chrX:9247342-9250037 lnc-ZBTB7A-2:1 Yes chrX:9247342-9250037 lnc-SIRT6-1:1 No - lnc-MAP2K2-3:2 Yes chr3R:10255349-10261849 lnc-MAP2K2-3:1 Yes chr3R:10255349-10261849 lnc-EBI3-1:1 No - lnc-TMIGD2-1:1 Yes chr2R:16169600-16170861 lnc-MPND-1:1 No - lnc-STAP2-2:1 Yes chr2L:11130737-11136003 lnc-STAP2-1:1 Yes chr2L:11130737-11136003 lnc-SH3GL1-1:1 Yes chr2L:11130737-11136003 lnc-UBXN6-3:1 Yes chrX:8602137-8606304 lnc-SH3GL1-3:2 No - lnc-SH3GL1-3:4 No - lnc-CHAF1A-1:1 Yes chr2R:18658418-18661548 lnc-SH3GL1-3:3 Yes chr2R:18658418-18661548 lnc-SH3GL1-3:1 Yes chr2R:18658418-18661548 lnc-UBXN6-2:2 No - lnc-UBXN6-2:3 No - lnc-HDGFL2-3:1 No - lnc-HDGFL2-2:1 No - lnc-HDGFL2-1:1 No - lnc-UBXN6-2:1 No - lnc-CHAF1A-3:1 Yes chr3R:30052514-30054697 lnc-HDGFL2-5:1 Yes chr2R:17672839-17683499 lnc-LRG1-1:1 Yes chr2R:17672839-17683499 lnc-TNFAIP8L1-1:2 No - lnc-TNFAIP8L1-1:3 No - lnc-TNFAIP8L1-1:4 No - lnc-TNFAIP8L1-3:1 No - lnc-TNFAIP8L1-2:1 No - lnc-DPP9-2:1 No - lnc-DPP9-1:1 No - lnc-MYDGF-2:1 Yes chr3R:24871202-24876654 lnc-MYDGF-2:3 Yes chr3R:24871202-24876654 lnc-MYDGF-2:2 Yes chr3R:24871202-24876654 lnc-FEM1A-3:1 No - MIR7-3HG:2 No - MIR7-3HG:4 No - MIR7-3HG:5 No - MIR7-3HG:6 No - MIR7-3HG:7 No - MIR7-3HG:8 No - MIR7-3HG:9 No - MIR7-3HG:10 No - MIR7-3HG:11 No - MIR7-3HG:12 No - MIR7-3HG:13 No - lnc-FEM1A-2:1 No - lnc-TICAM1-2:1 No - lnc-TICAM1-1:2 Yes chr3R:15079320-15095631 lnc-TICAM1-1:1 Yes chr3R:15079320-15095631 lnc-FEM1A-4:1 No - lnc-UHRF1-2:1 Yes chr2R:13176553-13198337 lnc-UHRF1-3:1 Yes chr2R:13176553-13198337 lnc-UHRF1-3:2 Yes chr2R:13176553-13198337 lnc-UHRF1-3:3 Yes chr2R:13176553-13198337 lnc-UHRF1-3:4 Yes chr2R:13176553-13198337 lnc-PTPRS-1:1 Yes chr2R:13176553-13198337 lnc-KDM4B-1:1 Yes chr2L:19586623-19732069 lnc-KDM4B-2:1 Yes chr2L:19586623-19732069 lnc-KDM4B-3:1 Yes chr2L:19586623-19732069 lnc-KDM4B-4:1 Yes chr2L:19586623-19732069 lnc-KDM4B-5:1 Yes chr2L:19586623-19732069 lnc-ARRDC5-1:1 Yes chr2L:19586623-19732069 lnc-ARRDC5-2:1 Yes chr2L:19586623-19732069 lnc-ARRDC5-3:1 Yes chr2L:19586623-19732069 lnc-TINCR-7:1 Yes chr2L:19586623-19732069 lnc-KDM4B-6:1 Yes chr2L:19586623-19732069 lnc-KDM4B-7:1 Yes chr2L:19586623-19732069 lnc-ZNRF4-2:1 No - lnc-ZNRF4-1:1 No - lnc-TINCR-4:1 No - lnc-TINCR-1:8 No - lnc-SAFB2-3:1 No - lnc-TINCR-3:3 Yes chr3R:24817464-24822350 lnc-TINCR-3:1 Yes chr3R:24817464-24822350 lnc-TINCR-3:2 Yes chr3R:24817464-24822350 lnc-TINCR-2:1 Yes chr3R:24817464-24822350 lnc-C19orf70-1:1 Yes chrX:628338-629483 lnc-HSD11B1L-1:1 Yes chrX:628338-629483 lnc-PRR22-1:1 No - lnc-PRR22-2:1 Yes chr2L:19758879-19760986 lnc-DUS3L-1:1 No - lnc-FUT3-1:2 Yes chr3L:15147137-15154395 lnc-FUT3-1:1 Yes chr3L:15147137-15154395 lnc-FUT6-1:2 Yes chr3L:15147137-15154395 lnc-FUT6-1:1 Yes chr3L:15147137-15154395 lnc-NRTN-2:1 Yes chr3L:15147137-15154395 lnc-VMAC-2:1 Yes chr2R:21025078-21026086 lnc-RANBP3-3:3 No - lnc-VMAC-1:1 No - lnc-VMAC-1:2 No - lnc-NDUFA11-3:1 No - lnc-RANBP3-1:1 No - lnc-RFX2-2:6 Yes chr3R:23750937-23752834 lnc-RFX2-2:7 Yes chr3R:23750937-23752834 lnc-RFX2-2:2 Yes chr3R:23750937-23752834 lnc-RFX2-2:1 Yes chr3R:23750937-23752834 lnc-RFX2-2:5 Yes chr3R:23750937-23752834 lnc-RFX2-2:3 Yes chr3R:23750937-23752834 lnc-RFX2-2:4 Yes chr3R:23750937-23752834 lnc-CAPS-2:1 No - lnc-CAPS-2:2 Yes chr3R:10361760-10378068 lnc-RANBP3-4:1 Yes chr3R:10361760-10378068 lnc-ACSBG2-2:7 Yes chr3R:10361760-10378068 lnc-ACSBG2-2:1 Yes chr3R:10361760-10378068 lnc-RANBP3-4:2 Yes chr3R:10361760-10378068 lnc-ACSBG2-1:1 Yes chr3R:10361760-10378068 lnc-RFX2-1:9 Yes chr3R:10361760-10378068 lnc-RFX2-1:11 Yes chr3R:10361760-10378068 lnc-RFX2-1:12 Yes chr3R:10361760-10378068 lnc-RFX2-1:8 Yes chr3R:10361760-10378068 lnc-MLLT1-2:1 Yes chr3R:15320756-15325279 lnc-MLLT1-2:2 Yes chr3R:15320756-15325279 lnc-ACSBG2-3:1 Yes chr3R:15320756-15325279 lnc-ACER1-1:1 Yes chr2L:10356795-10358078 lnc-CLPP-1:1 No - lnc-PSPN-1:1 Yes chr3R:6380467-6382604 lnc-SLC25A41-4:1 Yes chr2R:16861321-16867714 lnc-SLC25A41-2:1 Yes chr2R:16861321-16867714 lnc-KHSRP-1:2 Yes chr2R:16861321-16867714 lnc-SLC25A41-3:1 Yes chr3L:12402295-12414842 lnc-SLC25A23-1:1 Yes chr2R:9123304-9132030 lnc-SLC25A23-2:1 Yes chr2R:9123304-9132030 lnc-SLC25A23-2:2 Yes chr2R:9123304-9132030 lnc-CRB3-1:1 No - lnc-CRB3-1:2 No - lnc-CD70-2:1 No - lnc-CD70-1:1 No - lnc-TNFSF9-1:1 No - lnc-TNFSF9-2:1 No - lnc-TNFSF9-3:1 No - lnc-CD70-3:1 No - lnc-TRIP10-5:1 No - lnc-TRIP10-1:2 No - lnc-TNFSF14-1:1 No - lnc-TNFSF14-4:1 Yes chr2L:8074117-8082982 lnc-TNFSF14-2:1 Yes chr2L:8074117-8082982 lnc-TNFSF14-3:1 Yes chr2L:8074117-8082982 lnc-GPR108-2:1 Yes chr2L:8074117-8082982 lnc-C3-1:3 No - lnc-C3-1:2 No - lnc-C3-2:1 Yes chrX:9228796-9232378 lnc-SH2D3A-2:1 Yes chr3L:4322491-4364102 lnc-SH2D3A-1:2 Yes chr2L:6007364-6012338 lnc-SH2D3A-1:1 Yes chr2L:6007364-6012338 lnc-SH2D3A-3:1 No - lnc-MBD3L2B-4:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-VAV1-1:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-ADGRE1-1:3 No - lnc-MBD3L2B-5:1 No - lnc-MBD3L2B-3:1 No - lnc-MBD3L2B-2:1 No - lnc-MBD3L2B-2:2 No - lnc-ZNF557-1:1 No - lnc-INSR-1:7 No - lnc-INSR-1:1 No - lnc-ARHGEF18-1:1 No - lnc-INSR-6:1 No - lnc-PEX11G-4:1 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-PEX11G-1:1 No - lnc-PEX11G-2:1 Yes chr3R:23123962-23126422 lnc-PEX11G-3:1 No - lnc-MCOLN1-1:2 No - lnc-PCP2-1:1 No - lnc-RETN-1:1 No - lnc-CD209-1:1 No - lnc-CLEC4M-3:1 No - lnc-CLEC4M-2:1 No - lnc-EVI5L-5:1 No - lnc-EVI5L-5:3 No - lnc-EVI5L-5:4 No - lnc-EVI5L-5:5 No - lnc-PRR36-6:1 No - lnc-PRR36-3:1 Yes chrX:11430523-11454386 lnc-PRR36-1:1 No - lnc-CTXN1-4:4 No - lnc-CTXN1-6:1 Yes chrX:13079205-13090434 lnc-CTXN1-5:1 Yes chrX:13079205-13090434 lnc-CTXN1-2:1 No - lnc-SNAPC2-2:2 No - lnc-TIMM44-1:2 Yes chr3R:19154097-19159878 lnc-TIMM44-1:1 Yes chr3R:19154097-19159878 lnc-CTXN1-3:1 Yes chr3R:19154097-19159878 lnc-SNAPC2-4:1 Yes chr2L:2954762-2968434 lnc-TIMM44-2:1 Yes chr2L:2954762-2968434 lnc-CCL25-1:1 No - lnc-ELAVL1-1:1 Yes chr2L:4477462-4614300 lnc-ELAVL1-2:1 Yes chr2L:4477462-4614300 lnc-KANK3-3:1 No - lnc-ELAVL1-3:1 Yes chr2L:4477462-4614300 lnc-CERS4-5:1 No - lnc-CERS4-4:1 No - lnc-CERS4-2:1 No - lnc-RPS28-4:1 No - lnc-RPS28-4:2 No - lnc-CERS4-1:1 No - lnc-CD320-1:1 No - lnc-CD320-2:2 No - lnc-NDUFA7-1:1 No - lnc-NDUFA7-1:2 No - lnc-ANGPTL4-3:1 No - RAB11B-AS1:4 No - RAB11B-AS1:1 Yes chr3R:21111408-21116146 RAB11B-AS1:5 No - RAB11B-AS1:3 Yes chr3R:21111408-21116146 lnc-PRAM1-4:1 No - lnc-PRAM1-3:1 No - lnc-PRAM1-2:2 Yes chr3R:9505853-9510324 lnc-PRAM1-2:1 Yes chr3R:9505853-9510324 lnc-PRAM1-1:1 No - lnc-ZNF414-1:1 No - lnc-ZNF414-2:1 No - lnc-ZNF414-3:1 No - lnc-HNRNPM-2:1 No - lnc-ADAMTS10-3:2 No - lnc-ADAMTS10-3:1 No - lnc-ADAMTS10-1:1 No - lnc-HNRNPM-3:1 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-MYO1F-1:1 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-MYO1F-2:2 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-MYO1F-2:1 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-OR2Z1-4:1 No - lnc-ADAMTS10-2:1 No - lnc-OR2Z1-5:1 No - LINC01862:6 No - LINC01862:7 No - LINC01862:9 No - lnc-OR2Z1-2:1 No - lnc-ACTL9-1:1 No - lnc-MBD3L1-2:1 No - lnc-MUC16-1:1 No - lnc-MUC16-1:3 No - lnc-MUC16-1:2 No - lnc-MUC16-1:4 No - lnc-OR2Z1-1:5 Yes chr3R:9559760-9561533 lnc-ZNF558-2:1 No - lnc-OR1M1-1:1 No - lnc-OR7G2-1:1 No - lnc-OR7D4-2:1 No - lnc-OR7D4-1:1 No - lnc-OR7D4-1:2 No - lnc-ZNF699-2:1 No - lnc-ZNF699-2:2 No - lnc-ZNF699-2:3 No - lnc-ZNF559-3:1 No - lnc-ZNF699-1:1 No - lnc-ZNF177-2:12 No - lnc-ZNF266-1:9 No - lnc-ZNF266-2:1 No - lnc-ZNF266-4:1 No - lnc-ZNF559-ZNF177-4:1 No - lnc-ZNF426-1:1 No - lnc-ZNF121-3:1 No - ZNF426-DT:23 No - lnc-ZNF121-1:1 No - lnc-ZNF562-2:8 No - lnc-ZNF562-2:3 No - lnc-ZNF562-2:7 No - lnc-ZNF562-2:2 No - lnc-ZNF562-2:6 No - lnc-ZNF562-2:1 No - lnc-ZNF562-2:4 No - lnc-ZNF562-2:5 No - ZNF561-AS1:2 No - ZNF561-AS1:12 No - lnc-ZNF562-1:2 No - lnc-ZNF846-4:1 No - lnc-UBL5-5:1 No - lnc-FBXL12-4:1 No - lnc-FBXL12-3:6 No - lnc-FBXL12-3:5 No - lnc-FBXL12-3:4 No - lnc-FBXL12-2:4 No - lnc-ZNF846-2:3 No - lnc-ZNF846-2:2 No - lnc-ZNF846-2:4 No - lnc-UBL5-4:1 No - lnc-FBXL12-1:2 No - lnc-UBL5-1:4 Yes chrX:21345358-21346858 lnc-OLFM2-1:1 No - lnc-RDH8-1:1 No - lnc-RDH8-3:1 No - lnc-C19orf66-1:1 No - lnc-ANGPTL6-1:1 No - lnc-EIF3G-24:1 Yes chr2R:1649061-1778937 lnc-ANGPTL6-2:1 Yes chrX:2609247-2610336 lnc-EIF3G-1:6 Yes chrX:2609247-2610336 lnc-EIF3G-1:8 Yes chrX:2609247-2610336 lnc-EIF3G-1:7 Yes chrX:2609247-2610336 lnc-EIF3G-1:9 Yes chrX:2609247-2610336 lnc-EIF3G-2:1 No - lnc-EIF3G-4:1 No - lnc-S1PR2-3:1 No - lnc-ZGLP1-6:1 No - lnc-ZGLP1-6:2 No - lnc-ZGLP1-3:1 No - lnc-S1PR2-2:1 Yes chr2L:16328059-16329132 lnc-ICAM4-1:1 No - lnc-ZGLP1-2:1 No - lnc-ZGLP1-1:1 No - lnc-RAVER1-1:3 No - lnc-RAVER1-1:1 No - lnc-RAVER1-1:2 No - lnc-ICAM3-1:2 Yes chrX:11360930-11368098 lnc-ICAM3-1:3 Yes chrX:11360930-11368098 lnc-ICAM3-1:4 Yes chrX:11360930-11368098 lnc-ICAM3-2:1 Yes chrX:11360930-11368098 lnc-CDC37-1:1 Yes chrX:11360930-11368098 lnc-PDE4A-3:1 No - lnc-PDE4A-1:1 Yes chr3L:1795392-1797307 lnc-PDE4A-2:1 No - lnc-S1PR5-1:1 Yes chr3R:17073942-17079945 lnc-CDKN2D-1:1 Yes chr3L:12133771-12136706 lnc-CDKN2D-1:2 Yes chr3L:12133771-12136706 lnc-AP1M2-2:1 No - ILF3-DT:13 No - ILF3-DT:18 No - lnc-YIPF2-1:1 No - lnc-TMED1-2:1 Yes chrX:12909953-12912070 lnc-TIMM29-1:1 Yes chrX:3484605-3485378 lnc-YIPF2-2:1 Yes chr3L:15970082-15982869 lnc-LDLR-2:1 Yes chr3L:15970082-15982869 lnc-SMARCA4-4:1 No - lnc-DOCK6-1:2 Yes chr2R:14901475-14928425 lnc-DOCK6-1:3 Yes chr2R:14901475-14928425 lnc-DOCK6-1:1 Yes chr2R:14901475-14928425 lnc-ANGPTL8-1:1 Yes chr2L:94739-102086 lnc-KANK2-1:1 Yes chr2L:94739-102086 lnc-KANK2-2:1 Yes chr2L:94739-102086 lnc-KANK2-3:1 Yes chr2L:94739-102086 lnc-KANK2-4:1 Yes chr2L:94739-102086 lnc-KANK2-5:1 Yes chr2L:94739-102086 lnc-KANK2-6:1 Yes chr2L:94739-102086 lnc-KANK2-7:1 Yes chr2L:94739-102086 lnc-RAB3D-2:1 No - lnc-RAB3D-2:2 No - lnc-CCDC159-4:1 No - lnc-CCDC159-3:1 No - lnc-EPOR-1:1 No - lnc-EPOR-2:1 No - lnc-EPOR-3:1 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-CCDC151-3:1 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-CCDC151-2:1 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-CCDC151-1:1 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-RGL3-1:1 Yes chr3L:11881384-11883546 lnc-SWSAP1-4:1 Yes chr2L:17481988-17484307 lnc-PRKCSH-1:1 No - lnc-ELAVL3-1:1 No - lnc-ECSIT-1:1 No - lnc-ZNF653-1:1 Yes chr3R:5856585-5857914 lnc-CNN1-4:1 Yes chr3R:5856585-5857914 lnc-CNN1-3:8 No - lnc-CNN1-7:1 No - lnc-ZNF627-2:2 No - lnc-ZNF627-2:3 No - lnc-ZNF627-2:4 No - lnc-ZNF627-2:5 No - lnc-ACP5-1:1 No - lnc-ZNF823-1:1 No - lnc-ZNF823-2:1 No - lnc-ZNF491-1:1 No - lnc-ZNF491-1:2 No - lnc-ZNF491-2:1 No - lnc-ZNF823-4:1 No - lnc-ZNF823-3:1 No - lnc-ZNF439-1:1 No - lnc-ZNF439-1:2 No - lnc-ZNF700-1:1 No - ZNF433-AS1:24 No - ZNF433-AS1:26 No - ZNF433-AS1:34 No - ZNF433-AS1:35 No - ZNF433-AS1:36 No - lnc-ZNF433-1:1 No - ZNF433-AS1:37 No - ZNF433-AS1:38 No - ZNF433-AS1:39 No - lnc-ZNF625-ZNF20-1:3 No - lnc-ZNF136-1:5 No - lnc-ZNF136-1:6 No - lnc-ZNF136-1:7 No - lnc-ZNF136-1:8 No - lnc-ZNF625-ZNF20-2:1 No - lnc-ZNF625-ZNF20-2:3 No - lnc-ZNF625-ZNF20-2:4 No - lnc-ZNF625-ZNF20-2:2 No - lnc-ZNF136-1:11 No - lnc-ZNF563-1:1 No - lnc-ZNF442-1:2 No - lnc-ZNF709-2:2 No - lnc-ZNF709-2:1 No - lnc-ZNF791-9:1 No - lnc-ZNF791-8:1 No - lnc-ZNF791-7:1 No - lnc-ZNF791-6:1 No - lnc-ZNF709-1:1 No - lnc-ZNF490-3:1 No - lnc-ZNF490-1:1 No - lnc-MAN2B1-1:1 No - lnc-ZNF791-3:1 Yes chr2L:10457658-10462472 lnc-ZNF490-2:1 Yes chr2L:10452677-10462472 lnc-WDR83OS-3:1 Yes chr2L:10457658-10462472 lnc-WDR83OS-3:2 Yes chr2L:10457658-10462472 lnc-MAN2B1-2:1 Yes chr2L:16262141-16263483 lnc-WDR83OS-2:3 No - lnc-WDR83OS-4:1 Yes chr3L:8198207-8199491 lnc-FBXW9-1:1 No - lnc-TNPO2-1:1 Yes chrX:19741224-19744335 lnc-TRIR-1:3 Yes chr2L:19030844-19033498 lnc-TRIR-1:2 Yes chr2L:19030844-19033498 lnc-TRIR-1:1 Yes chr2L:19030844-19033498 lnc-PRDX2-3:10 Yes chr2L:19030844-19033498 lnc-PRDX2-3:9 Yes chr2L:19030844-19033498 lnc-PRDX2-3:7 Yes chr2L:19030844-19033498 lnc-PRDX2-3:6 Yes chr2L:19030844-19033498 lnc-PRDX2-3:8 Yes chr2L:19030844-19033498 lnc-JUNB-3:1 Yes chr2L:19030844-19033498 lnc-PRDX2-4:1 Yes chr2L:19030844-19033498 lnc-JUNB-1:1 Yes chr2L:19030844-19033498 lnc-PRDX2-1:1 Yes chr2L:19030844-19033498 lnc-THSD8-2:1 Yes chr2L:19030844-19033498 lnc-RTBDN-2:1 Yes chr2L:19030844-19033498 lnc-FARSA-1:1 No - lnc-GADD45GIP1-1:1 Yes chr3R:9628691-9630851 lnc-GADD45GIP1-2:1 Yes chr4:268175-276369 lnc-LYL1-3:2 Yes chr4:268175-276369 lnc-TRMT1-1:1 Yes chrX:2680199-2681723 lnc-LYL1-1:1 Yes chr2L:12428028-12430021 lnc-LYL1-2:2 Yes chr2L:12428028-12430021 lnc-LYL1-2:1 Yes chr2L:12428028-12430021 lnc-IER2-1:1 No - lnc-STX10-3:1 No - lnc-STX10-1:1 No - lnc-STX10-2:2 No - lnc-STX10-2:1 No - lnc-STX10-4:1 Yes chrX:11931280-11985087 lnc-MRI1-1:1 Yes chr2R:18850844-18851963 lnc-C19orf57-4:1 Yes chr3R:31459822-31463037 lnc-C19orf57-4:2 Yes chr3R:31459822-31463037 lnc-C19orf57-3:1 Yes chr3R:31459822-31463037 lnc-C19orf57-7:1 No - lnc-C19orf57-5:1 No - lnc-C19orf57-6:6 No - lnc-C19orf57-6:5 No - lnc-RFX1-2:1 No - lnc-PODNL1-1:1 Yes chr3R:10361760-10378068 lnc-PODNL1-1:2 Yes chr3R:10361760-10378068 lnc-RFX1-1:1 Yes chr3R:10361760-10378068 lnc-PALM3-1:1 No - lnc-C19orf67-1:1 No - lnc-SAMD1-1:1 Yes chr2L:9682315-9699297 lnc-MISP3-3:4 Yes chr3L:19618894-19620398 lnc-ASF1B-1:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-MISP3-2:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-MISP3-5:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-ASF1B-2:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-MISP3-6:1 No - lnc-ADGRE5-5:1 No - lnc-ADGRL1-1:7 No - LINC01841:6 No - LINC01841:5 No - LINC01842:6 No - lnc-DDX39A-3:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-PTGER1-1:2 Yes chr2L:5539326-5542314 lnc-ADGRE5-3:1 Yes chr2R:9252310-9285097 lnc-PKN1-1:2 Yes chr2R:8146918-8156654 lnc-GIPC1-1:1 No - lnc-TECR-2:2 No - lnc-TECR-3:1 No - lnc-OR7C1-2:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-ZNF333-3:2 No - lnc-ZNF333-2:2 No - lnc-ZNF333-4:2 No - lnc-OR7C1-1:2 No - lnc-ADGRE2-1:1 No - lnc-OR7C1-1:3 No - lnc-OR7C1-1:4 No - lnc-OR7A10-1:2 No - lnc-OR7A10-1:1 No - lnc-OR7A10-2:1 No - lnc-OR7A17-1:1 No - lnc-OR7C2-2:1 No - lnc-OR7A17-2:2 Yes chr2L:9333567-9341925 lnc-OR7A17-2:1 Yes chr2L:9333567-9341925 lnc-SYDE1-1:1 No - lnc-NOTCH3-1:1 No - lnc-EPHX3-6:1 Yes chrX:3134870-3172221 lnc-EPHX3-1:1 No - lnc-BRD4-1:1 Yes chrX:8037808-8061436 lnc-EPHX3-2:1 Yes chrX:8037808-8061436 lnc-EPHX3-3:1 Yes chrX:8037808-8061436 lnc-SYDE1-2:1 Yes chrX:8037808-8061436 lnc-EPHX3-5:1 Yes chrX:8037808-8061436 lnc-CYP4F22-6:1 Yes chrX:8037808-8061436 lnc-CYP4F22-5:1 No - lnc-CYP4F22-4:1 No - lnc-CYP4F22-3:2 No - lnc-AKAP8-1:1 No - lnc-AKAP8-3:1 No - lnc-AKAP8-4:1 No - lnc-WIZ-1:2 Yes chrX:17710144-17752007 lnc-WIZ-1:1 Yes chrX:17710144-17752007 lnc-PGLYRP2-2:1 Yes chr2R:15942864-15947266 lnc-PGLYRP2-3:1 No - lnc-CYP4F8-1:1 No - lnc-CYP4F8-1:2 No - lnc-PGLYRP2-4:2 No - lnc-CYP4F12-1:1 Yes chr2R:15942864-15947266 lnc-OR10H1-1:4 No - lnc-OR10H5-1:7 No - lnc-OR10H1-1:5 No - lnc-OR10H5-1:8 No - lnc-OR10H1-2:1 No - LINC01764:6 No - UCA1:3 No - UCA1:8 No - LINC01764:5 No - lnc-OR10H1-3:1 No - lnc-CYP4F2-1:5 No - lnc-CYP4F2-1:3 No - lnc-CYP4F2-1:1 No - lnc-CYP4F11-1:1 Yes chr2R:15942864-15947266 lnc-OR10H4-2:1 No - LINC00905:1 No - lnc-CYP4F11-2:1 No - LINC00661:3 No - LINC00661:6 No - lnc-TPM4-4:1 No - LINC00661:20 No - LINC00905:2 No - LINC00905:4 No - LINC00905:5 No - LINC00905:6 No - LINC00905:8 No - LINC00905:9 No - LINC00905:13 No - LINC00905:14 No - lnc-CYP4F11-3:1 No - lnc-TPM4-2:25 No - LINC01855:7 No - LINC01855:9 No - LINC01855:10 No - lnc-CIB3-4:1 No - lnc-CIB3-1:2 No - lnc-EPS15L1-5:1 Yes chr2R:20879930-20882663 lnc-CIB3-3:1 Yes chr2L:4442320-4442985 lnc-CIB3-5:1 Yes chr3R:9557712-9559525 lnc-EPS15L1-3:2 No - lnc-EPS15L1-2:1 No - lnc-CALR3-6:1 Yes chr2R:24768314-24775265 lnc-CALR3-5:1 Yes chr2R:24768314-24775265 lnc-C19orf44-6:1 Yes chr2R:24768314-24775265 lnc-CALR3-7:1 Yes chr2R:24768314-24775265 lnc-EPS15L1-1:1 No - lnc-CALR3-4:4 Yes chr4:778516-788978 lnc-SLC35E1-2:1 Yes chr4:778516-788978 lnc-CHERP-1:1 Yes chr4:778516-788978 lnc-CHERP-1:2 Yes chr4:778516-788978 lnc-SLC35E1-1:1 Yes chr4:778516-788978 lnc-SLC35E1-1:2 Yes chr4:778516-788978 lnc-C19orf44-3:1 Yes chr4:778516-788978 lnc-MED26-3:1 Yes chr4:778516-788978 lnc-C19orf44-5:1 No - lnc-MED26-4:5 No - lnc-SLC35E1-3:1 No - lnc-C19orf44-7:1 No - lnc-TMEM38A-3:1 No - lnc-TMEM38A-2:1 No - lnc-SMIM7-1:1 No - lnc-TMEM38A-2:2 No - lnc-MED26-1:3 No - lnc-MED26-2:1 No - lnc-MED26-4:1 No - lnc-MED26-4:2 No - lnc-MED26-4:6 No - lnc-MED26-4:4 No - lnc-MED26-4:3 No - lnc-NWD1-1:1 No - lnc-SMIM7-2:1 No - lnc-SIN3B-1:1 Yes chr3R:16060589-16067594 lnc-NWD1-2:1 Yes chr2R:12575240-12592917 lnc-HAUS8-4:3 No - lnc-HAUS8-4:2 No - lnc-HAUS8-4:4 No - lnc-HAUS8-4:5 No - lnc-HAUS8-4:1 No - lnc-F2RL3-1:1 No - lnc-HAUS8-3:1 No - lnc-HAUS8-2:1 No - lnc-MYO9B-2:1 No - lnc-HAUS8-1:1 No - lnc-NR2F6-4:2 No - lnc-NR2F6-4:1 No - lnc-NR2F6-3:1 No - lnc-NR2F6-1:1 No - lnc-NR2F6-2:2 Yes chr3R:15363786-15367665 lnc-NR2F6-2:1 Yes chr3R:15363786-15367665 lnc-NR2F6-2:4 Yes chr3R:15363786-15367665 lnc-NR2F6-2:3 Yes chr3R:15363786-15367665 lnc-USHBP1-1:1 No - lnc-ANKLE1-1:1 No - lnc-DDA1-1:3 Yes chr3R:24358095-24360144 lnc-DDA1-1:4 Yes chr3R:24358095-24360144 lnc-GTPBP3-2:1 No - lnc-PLVAP-1:1 No - lnc-PLVAP-2:1 No - lnc-BST2-3:2 No - lnc-CCDC194-4:2 No - lnc-CCDC194-4:1 No - BISPR:1 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:3 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:4 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:5 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:6 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:7 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:8 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:9 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:10 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:12 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:13 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:14 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:16 Yes chrX:18097558-18101314 lnc-BST2-4:1 Yes chrX:18097558-18101314 lnc-BST2-1:1 Yes chrX:18097558-18101314 lnc-BST2-2:1 Yes chrX:18097558-18101314 lnc-NXNL1-2:2 No - lnc-NXNL1-2:1 No - lnc-NXNL1-1:1 No - lnc-NXNL1-3:5 Yes chr2L:10510672-10517218 lnc-NXNL1-3:1 No - lnc-NXNL1-3:4 Yes chr2L:10510672-10517218 lnc-NXNL1-3:3 Yes chr2L:10510672-10517218 lnc-NXNL1-7:3 No - lnc-NXNL1-4:1 Yes chrX:10847438-10848534 lnc-UNC13A-1:1 No - lnc-NXNL1-5:1 Yes chr4:867824-912331 lnc-NXNL1-6:1 Yes chr4:867824-912331 lnc-COLGALT1-1:1 Yes chr4:867824-912331 lnc-COLGALT1-2:1 Yes chr4:867824-912331 lnc-UNC13A-2:1 Yes chrX:1409069-1453686 lnc-FCHO1-1:1 No - lnc-MAP1S-1:3 Yes chr3R:9516007-9527237 lnc-JAK3-1:1 Yes chrX:11360930-11368098 lnc-CCDC124-1:1 Yes chrX:5340236-5405138 lnc-IL12RB1-2:1 Yes chr3R:7804665-7810014 lnc-ARRDC2-4:1 No - lnc-ARRDC2-2:1 No - lnc-RAB3A-1:2 No - lnc-RAB3A-3:2 Yes chr3L:15566013-15576313 lnc-MPV17L2-1:6 Yes chrX:3176440-3343767 lnc-MPV17L2-1:8 Yes chrX:3176440-3343767 lnc-RAB3A-2:2 Yes chrX:3176440-3343767 lnc-IQCN-1:1 No - lnc-IQCN-1:2 No - lnc-JUND-1:3 No - lnc-JUND-1:2 No - lnc-JUND-1:1 No - lnc-PGPEP1-5:1 No - lnc-PGPEP1-4:1 No - lnc-PGPEP1-3:1 No - lnc-PGPEP1-1:1 No - lnc-PGPEP1-7:1 Yes chr2L:19699379-19700968 lnc-SSBP4-2:1 Yes chr3L:19889120-19909410 lnc-ISYNA1-2:1 Yes chr3L:19889120-19909410 lnc-KXD1-3:1 Yes chr2R:18629594-18632045 lnc-KXD1-2:1 Yes chr2R:18629594-18632045 lnc-CRLF1-4:3 Yes chr3L:12501513-12502647 lnc-UBA52-1:1 Yes chr3L:12501513-12502647 lnc-CRLF1-4:2 Yes chr3L:12501513-12502647 lnc-CRLF1-4:1 Yes chr3L:12501513-12502647 lnc-CRLF1-2:1 No - lnc-FKBP8-2:1 No - lnc-CRLF1-1:1 No - lnc-CRLF1-3:1 No - lnc-CRTC1-1:1 No - lnc-KLHL26-1:1 No - lnc-UPF1-2:1 No - lnc-COPE-1:2 Yes chr2L:6489090-6490194 lnc-COPE-1:1 Yes chr2L:6489090-6490194 lnc-HOMER3-2:1 No - lnc-COPE-2:2 Yes chr2L:6719394-6723359 HOMER3-AS1:9 Yes chr2L:6719394-6723359 lnc-HOMER3-1:1 No - lnc-HOMER3-3:3 Yes chr3R:5485543-5489489 lnc-ARMC6-1:2 Yes chr3R:5485543-5489489 lnc-HOMER3-3:2 Yes chr3R:5485543-5489489 lnc-HOMER3-3:1 Yes chr3R:5485543-5489489 lnc-BORCS8-MEF2B-2:1 Yes chr3L:11109690-11112117 lnc-BORCS8-MEF2B-1:2 Yes chr3L:11109690-11112117 lnc-BORCS8-MEF2B-1:1 Yes chr3L:11109690-11112117 lnc-SLC25A42-2:1 No - lnc-TMEM161A-2:1 Yes chr2R:9913496-9958858 lnc-BORCS8-1:3 No - lnc-BORCS8-1:6 No - lnc-BORCS8-1:1 No - lnc-BORCS8-1:4 No - lnc-BORCS8-1:2 No - lnc-BORCS8-1:5 No - lnc-NR2C2AP-1:1 No - lnc-NR2C2AP-1:2 No - lnc-BORCS8-2:1 Yes chr2R:23967124-23967745 lnc-NCAN-2:1 No - lnc-TM6SF2-1:1 No - lnc-TM6SF2-3:1 Yes chr3R:5485543-5489489 lnc-TM6SF2-2:1 Yes chr3R:5485543-5489489 lnc-GATAD2A-1:1 No - lnc-SUGP1-2:1 Yes chr3L:10664739-10690734 lnc-MAU2-1:1 Yes chr3L:10664739-10690734 lnc-NDUFA13-1:1 Yes chr3L:10664739-10690734 lnc-NDUFA13-1:2 Yes chr3L:10664739-10690734 lnc-TSSK6-2:1 No - lnc-TSSK6-3:1 No - lnc-TSSK6-1:3 Yes chrX:15992468-15996509 lnc-LPAR2-3:1 Yes chrX:15992468-15996509 lnc-LPAR2-2:1 Yes chrX:15992468-15996509 lnc-GMIP-1:2 No - lnc-GMIP-1:1 No - lnc-GMIP-2:1 Yes chr2L:11115635-11120319 lnc-ZNF101-3:1 No - lnc-ZNF14-1:1 No - lnc-ZNF14-2:1 No - lnc-ZNF14-2:2 No - lnc-ZNF101-5:1 No - LINC00663:5 No - LINC00663:6 No - LINC00663:13 No - LINC00663:3 No - LINC00663:7 No - LINC00663:2 No - LINC00663:10 No - lnc-ZNF101-6:1 No - LINC00663:8 No - LINC00663:4 No - lnc-ZNF253-2:2 No - lnc-ZNF253-2:3 No - lnc-ZNF14-4:1 No - lnc-ZNF14-3:1 No - LINC00663:1 No - lnc-ZNF253-1:1 No - lnc-ZNF506-5:2 No - lnc-ZNF506-5:1 No - lnc-ZNF506-6:1 No - lnc-ZNF506-2:2 No - lnc-ZNF93-1:2 No - lnc-ZNF506-7:1 No - lnc-ZNF506-8:1 No - lnc-ZNF90-3:1 No - lnc-ZNF90-2:1 No - lnc-ZNF682-2:1 No - lnc-ZNF486-4:1 No - lnc-ZNF682-3:6 No - lnc-ZNF682-3:1 No - lnc-ZNF682-3:3 No - lnc-ZNF682-3:5 No - lnc-ZNF90-1:1 No - lnc-ZNF682-4:1 No - lnc-ZNF682-3:2 No - lnc-ZNF682-5:1 No - lnc-ZNF682-6:1 No - lnc-ZNF486-3:1 No - lnc-ZNF486-5:1 No - lnc-ZNF486-6:1 No - lnc-ZNF737-7:1 No - lnc-ZNF737-3:3 No - lnc-ZNF737-3:5 No - lnc-ZNF486-8:1 No - lnc-ZNF737-3:8 No - lnc-ZNF737-3:2 No - lnc-ZNF737-3:6 No - lnc-ZNF737-3:1 No - lnc-ZNF486-10:1 No - lnc-ZNF486-11:1 No - lnc-ZNF737-2:1 No - lnc-ZNF737-1:1 No - lnc-ZNF626-2:2 No - lnc-ZNF66-8:1 No - lnc-ZNF626-3:1 No - lnc-ZNF626-4:1 No - lnc-ZNF85-5:1 No - lnc-ZNF85-6:1 No - lnc-ZNF626-5:1 No - lnc-ZNF430-1:1 No - lnc-ZNF430-2:1 No - lnc-ZNF431-3:1 No - lnc-ZNF431-2:3 No - lnc-ZNF714-1:2 No - lnc-ZNF708-10:1 No - lnc-ZNF708-9:1 No - lnc-ZNF431-4:1 No - lnc-ZNF708-5:1 No - lnc-ZNF708-4:1 No - lnc-ZNF708-3:1 No - lnc-ZNF738-3:1 No - lnc-ZNF708-2:2 No - lnc-ZNF708-2:5 No - lnc-ZNF708-2:4 No - lnc-ZNF708-2:6 No - lnc-ZNF708-2:7 No - lnc-ZNF708-2:3 No - LINC00664:2 No - LINC00664:5 No - LINC00664:6 No - LINC00664:7 No - LINC00664:8 No - lnc-ZNF708-11:1 No - lnc-ZNF708-14:5 No - lnc-ZNF100-2:2 No - lnc-ZNF100-2:4 No - lnc-ZNF100-8:1 No - lnc-ZNF100-10:3 No - lnc-ZNF100-10:5 No - lnc-ZNF100-10:1 No - lnc-ZNF429-4:1 No - lnc-ZNF100-6:1 No - lnc-ZNF429-5:1 No - lnc-ZNF100-4:1 No - lnc-ZNF43-2:1 No - lnc-ZNF100-5:2 No - lnc-ZNF100-5:1 No - lnc-ZNF429-7:2 No - lnc-ZNF257-6:1 No - lnc-ZNF100-7:1 No - lnc-ZNF257-5:1 No - lnc-ZNF100-1:6 No - lnc-ZNF257-4:1 No - lnc-ZNF257-2:1 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-ZNF208-1:2 No - lnc-ZNF208-2:1 No - lnc-ZNF208-3:1 No - lnc-ZNF676-3:1 No - lnc-ZNF676-2:1 No - lnc-ZNF729-5:1 No - lnc-ZNF676-1:5 No - lnc-ZNF676-1:6 No - lnc-ZNF729-2:1 No - lnc-ZNF98-8:1 No - lnc-ZNF98-6:1 No - lnc-ZNF729-3:1 No - lnc-ZNF729-4:1 No - lnc-ZNF98-3:1 No - lnc-ZNF98-9:2 No - lnc-ZNF676-5:1 No - lnc-ZNF729-6:1 No - lnc-ZNF676-6:1 No - lnc-ZNF99-8:1 No - lnc-ZNF98-9:1 No - lnc-ZNF492-8:1 No - LINC01233:4 No - LINC01233:5 No - LINC01233:7 No - lnc-ZNF98-2:2 No - lnc-ZNF492-7:1 No - lnc-ZNF492-7:2 No - lnc-ZNF492-6:4 No - lnc-ZNF492-6:5 No - lnc-ZNF492-5:1 No - LINC01785:7 No - lnc-ZNF492-4:1 No - lnc-ZNF99-7:1 No - lnc-ZNF99-7:2 No - lnc-ZNF492-2:3 No - lnc-ZNF99-5:1 No - lnc-ZNF99-4:1 No - lnc-ZNF99-3:2 No - lnc-ZNF723-3:1 No - lnc-ZNF723-4:1 No - lnc-ZNF99-6:1 No - lnc-ZNF723-6:1 No - lnc-ZNF723-2:1 No - lnc-ZNF723-2:2 No - lnc-ZNF728-1:1 No - lnc-ZNF723-2:3 No - LINC01859:22 No - lnc-ZNF730-9:1 No - LINC01859:23 No - LINC01859:13 No - LINC01858:9 No - LINC01858:15 No - LINC01858:13 No - lnc-ZNF728-5:4 No - lnc-ZNF728-5:2 No - lnc-ZNF728-5:1 No - lnc-ZNF728-5:3 No - lnc-ZNF730-6:1 No - lnc-ZNF730-6:2 No - lnc-ZNF730-6:3 No - lnc-ZNF724-4:1 No - lnc-ZNF730-7:1 No - lnc-ZNF730-8:1 No - LINC01224:57 No - LINC01224:32 No - LINC01224:33 No - LINC01224:44 No - LINC01224:41 No - LINC01224:45 No - LINC01224:35 No - LINC01224:42 No - LINC01224:40 No - LINC01224:55 No - LINC01224:36 No - LINC01224:50 No - LINC01224:51 No - lnc-ZNF730-10:1 No - lnc-ZNF91-4:7 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-ZNF91-4:10 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-ZNF91-4:4 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-ZNF91-4:12 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-ZNF91-4:11 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-ZNF730-11:1 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-ZNF91-4:6 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-ZNF91-4:2 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-ZNF91-4:3 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-ZNF91-4:1 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-ZNF730-12:1 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-ZNF730-13:1 Yes chr3R:11674920-11678116 LINC01224:1 No - LINC01224:8 No - LINC01224:14 No - LINC01224:11 No - LINC01224:2 No - LINC01224:18 No - LINC01224:3 No - LINC01224:9 No - LINC01224:4 No - lnc-ZNF730-14:1 No - LINC01224:10 No - LINC01224:16 No - LINC01224:17 No - lnc-ZNF730-15:1 No - lnc-ZNF730-16:1 No - lnc-ZNF675-3:2 No - lnc-ZNF91-1:22 No - lnc-ZNF726-7:1 No - lnc-ZNF726-6:1 No - lnc-ZNF675-2:1 No - lnc-ZNF726-5:1 No - lnc-ZNF726-5:2 No - lnc-ZNF681-3:1 No - lnc-ZNF726-3:2 No - lnc-ZNF726-3:4 No - lnc-ZNF254-4:1 No - lnc-ZNF681-2:4 No - lnc-ZNF681-2:5 No - lnc-ZNF681-2:3 No - lnc-ZNF726-1:3 No - lnc-ZNF726-2:1 No - lnc-ZNF681-4:1 No - lnc-ZNF726-1:5 No - lnc-ZNF681-5:1 No - lnc-ZNF681-6:1 No - lnc-UQCRFS1-10:4 No - LINC00662:25 No - LINC00662:23 No - LINC00662:12 No - LINC00662:38 No - LINC00662:24 No - LINC00662:36 No - LINC00662:2 No - lnc-VSTM2B-9:2 No - LINC00662:26 No - LINC00662:29 No - LINC00662:4 No - LINC00662:5 No - LINC00662:35 No - LINC00662:8 No - lnc-VSTM2B-9:3 No - lnc-VSTM2B-9:4 No - lnc-VSTM2B-9:5 No - lnc-VSTM2B-9:6 No - lnc-VSTM2B-9:7 No - lnc-VSTM2B-9:9 No - lnc-VSTM2B-9:10 No - lnc-VSTM2B-9:11 No - lnc-VSTM2B-9:14 No - lnc-VSTM2B-9:15 No - lnc-VSTM2B-9:16 No - lnc-VSTM2B-9:17 No - lnc-VSTM2B-9:18 No - lnc-VSTM2B-9:19 No - lnc-UQCRFS1-19:1 No - lnc-VSTM2B-9:20 No - lnc-VSTM2B-9:21 No - lnc-VSTM2B-9:22 No - lnc-VSTM2B-9:23 No - lnc-UQCRFS1-18:1 No - lnc-VSTM2B-17:1 No - lnc-VSTM2B-17:2 No - lnc-VSTM2B-16:1 No - lnc-UQCRFS1-17:1 No - lnc-UQCRFS1-16:2 No - lnc-UQCRFS1-16:1 No - lnc-UQCRFS1-16:3 No - lnc-UQCRFS1-15:1 No - lnc-UQCRFS1-3:3 No - lnc-UQCRFS1-3:6 No - lnc-UQCRFS1-3:7 No - lnc-UQCRFS1-3:8 No - lnc-UQCRFS1-3:9 No - lnc-UQCRFS1-3:21 No - lnc-VSTM2B-15:1 No - lnc-UQCRFS1-3:22 No - lnc-VSTM2B-14:1 No - lnc-UQCRFS1-3:5 No - lnc-UQCRFS1-3:4 No - lnc-UQCRFS1-3:2 No - lnc-VSTM2B-13:1 No - lnc-VSTM2B-7:3 No - lnc-VSTM2B-7:4 No - lnc-VSTM2B-7:5 No - lnc-UQCRFS1-13:1 No - lnc-UQCRFS1-12:1 No - LINC00906:1 No - LINC00906:8 No - LINC00906:9 No - LINC00906:13 No - LINC00906:14 No - LINC00906:15 No - LINC01532:1 No - LINC01532:2 No - LINC01532:4 No - lnc-VSTM2B-5:4 Yes chr2L:1612429-1614160 lnc-VSTM2B-5:5 Yes chr2L:1612429-1614160 lnc-VSTM2B-5:6 Yes chr2L:1612429-1614160 lnc-VSTM2B-5:7 No - lnc-UQCRFS1-11:1 No - lnc-VSTM2B-10:1 No - lnc-C19orf12-6:1 No - lnc-C19orf12-5:1 No - lnc-C19orf12-4:1 No - lnc-C19orf12-2:2 No - lnc-PLEKHF1-1:1 No - lnc-C19orf12-7:1 No - lnc-C19orf12-8:1 No - lnc-C19orf12-9:1 No - lnc-ZNF536-3:1 No - lnc-TSHZ3-5:1 No - lnc-ZNF536-4:1 No - lnc-ZNF536-5:1 No - lnc-TSHZ3-1:2 No - lnc-ZNF536-6:1 No - LINC01791:4 No - LINC01791:5 No - lnc-TSHZ3-4:1 No - lnc-ANKRD27-10:1 No - lnc-ANKRD27-9:1 No - lnc-ZNF536-8:1 No - lnc-ZNF536-8:2 No - lnc-ZNF536-8:3 No - lnc-ZNF536-8:4 No - lnc-ZNF536-8:20 No - lnc-ZNF536-8:21 No - lnc-ZNF536-9:2 No - lnc-ZNF507-8:1 No - lnc-ZNF507-8:2 No - LINC01837:37 No - LINC01837:34 No - LINC01837:36 No - LINC01837:35 No - LINC01837:33 No - LINC01837:25 No - LINC01837:24 No - LINC01837:27 No - LINC01533:4 No - LINC01533:12 No - LINC01533:14 No - LINC01533:15 No - LINC01533:17 No - lnc-ZNF507-3:3 No - lnc-ANKRD27-8:1 No - LINC01782:7 No - LINC01782:9 No - lnc-ZNF507-2:4 No - lnc-ZNF507-1:2 No - lnc-ANKRD27-2:8 No - lnc-ANKRD27-2:9 No - lnc-ANKRD27-2:7 Yes chrX:18653392-18657286 lnc-ZNF507-7:1 Yes chrX:18653392-18657286 lnc-SLC7A9-4:1 No - lnc-RGS9BP-3:1 No - lnc-SLC7A9-3:1 No - lnc-SLC7A9-2:1 No - lnc-RGS9BP-2:1 No - lnc-RGS9BP-1:1 No - lnc-ANKRD27-7:1 No - lnc-ANKRD27-7:2 No - lnc-SLC7A9-1:1 No - lnc-CEP89-3:1 Yes chrX:14584733-14602580 lnc-CEP89-2:2 No - lnc-RHPN2-1:1 No - lnc-FAAP24-2:1 No - lnc-CEP89-1:2 No - lnc-CEP89-1:1 No - lnc-CEP89-1:3 No - lnc-GPATCH1-2:1 No - lnc-CEP89-4:1 Yes chrX:15788897-15793632 lnc-GPATCH1-1:1 No - lnc-SLC7A10-1:1 No - lnc-WDR88-1:1 No - lnc-LRP3-1:1 Yes chr3R:31382109-31391893 lnc-CEBPA-2:1 No - lnc-CEBPG-4:1 No - lnc-CEBPA-1:1 No - CEBPA-DT:16 No - CEBPA-DT:19 No - CEBPA-DT:21 No - lnc-CEBPG-2:1 No - lnc-CEBPA-3:1 No - lnc-CEBPA-4:1 Yes chr3R:12411809-12413759 lnc-CEBPA-5:2 Yes chr3R:12411809-12413759 lnc-CEBPA-5:1 Yes chr3R:12411809-12413759 lnc-CHST8-5:3 No - lnc-CHST8-4:1 No - lnc-PEPD-1:1 No - lnc-KCTD15-5:1 Yes chr3L:1876551-1883041 lnc-PEPD-2:1 Yes chr2R:21560246-21576035 lnc-CHST8-3:1 Yes chr2R:21560246-21576035 lnc-PEPD-7:1 No - lnc-KCTD15-2:1 No - lnc-PEPD-5:1 No - lnc-LSM14A-3:1 No - lnc-PEPD-6:1 No - lnc-SCGB2B2-134:1 No - lnc-LSM14A-1:1 No - lnc-KIAA0355-5:1 Yes chr3L:12515059-12520954 lnc-LSM14A-2:5 No - lnc-LSM14A-2:6 No - lnc-SCGB2B2-132:1 No - lnc-SCGB2B2-11:2 No - lnc-SCGB2B2-11:1 No - lnc-PDCD2L-4:1 No - lnc-PDCD2L-3:1 Yes chr2R:8910900-8914069 lnc-SCGB2B2-130:5 Yes chr3R:12456573-12458444 lnc-SCGB2B2-130:4 Yes chr3R:12456573-12458444 lnc-SCGB2B2-6:1 No - lnc-SCGB2B2-5:1 No - lnc-WTIP-1:1 No - lnc-WTIP-6:1 No - lnc-SCGB2B2-2:1 No - lnc-SCGB2B2-7:1 No - lnc-ZNF599-10:1 No - lnc-ZNF302-5:1 No - lnc-ZNF599-9:1 No - lnc-ZNF302-4:1 No - lnc-SCGB2B2-8:7 No - lnc-ZNF599-5:1 No - lnc-SCGB2B2-10:1 No - lnc-ZNF599-4:1 No - LINC01801:18 No - LINC01801:21 No - LINC01801:22 No - LINC01801:14 No - LINC01801:17 No - lnc-ZNF30-3:4 No - lnc-ZNF30-3:5 No - lnc-ZNF30-3:6 No - lnc-ZNF30-3:7 No - lnc-ZNF599-6:1 No - lnc-ZNF599-3:5 No - lnc-ZNF30-3:8 No - LINC00904:1 No - lnc-ZNF792-1:7 No - lnc-ZNF792-1:6 No - lnc-ZNF792-1:9 No - lnc-ZNF792-1:5 No - LINC01838:8 No - ZNF30-AS1:1 No - ZNF30-AS1:3 No - lnc-ZNF792-5:1 No - lnc-ZNF792-4:1 No - lnc-ZNF792-7:1 Yes chr2L:3358640-3373372 lnc-ZNF792-6:4 Yes chr2L:3358640-3373372 lnc-ZNF792-9:1 No - lnc-HPN-1:3 No - HPN-AS1:1 Yes chr2R:7540111-7564435 HPN-AS1:2 No - lnc-FAM187B-7:2 Yes chr2R:16150123-16169519 lnc-FAM187B-7:1 Yes chr2R:16150123-16169519 lnc-FAM187B-6:1 No - lnc-LSR-1:5 No - lnc-FAM187B-2:1 No - lnc-USF2-2:1 No - lnc-FAM187B-3:1 Yes chrX:4544617-4548794 lnc-HAMP-1:2 No - lnc-FAM187B-4:1 No - lnc-MAG-1:1 No - lnc-MAG-1:2 No - lnc-MAG-2:1 No - lnc-GPR42-2:1 No - LINC01531:1 No - LINC01531:2 No - LINC01531:3 No - LINC01531:4 No - LINC01531:5 No - LINC01531:6 No - LINC01531:7 No - LINC01531:9 No - lnc-KRTDAP-4:1 No - LINC01531:10 No - lnc-KRTDAP-1:2 No - lnc-KRTDAP-1:3 No - lnc-FFAR2-1:1 No - lnc-KRTDAP-3:1 No - lnc-DMKN-1:18 No - lnc-DMKN-1:12 No - lnc-DMKN-1:15 No - lnc-DMKN-1:14 No - lnc-DMKN-1:16 No - lnc-DMKN-1:13 No - lnc-DMKN-1:3 No - lnc-DMKN-1:17 No - lnc-DMKN-1:11 No - lnc-DMKN-1:10 No - lnc-DMKN-1:8 No - lnc-DMKN-1:9 No - lnc-DMKN-1:6 No - lnc-DMKN-1:4 No - lnc-DMKN-1:5 No - lnc-DMKN-1:2 No - lnc-DMKN-1:7 No - TMEM147-AS1:8 No - TMEM147-AS1:1 No - TMEM147-AS1:5 No - lnc-TMEM147-1:1 No - TMEM147-AS1:4 No - TMEM147-AS1:7 No - TMEM147-AS1:3 No - TMEM147-AS1:6 No - LINC01766:10 No - LINC01766:11 No - LINC01766:12 No - LINC01766:15 No - lnc-ATP4A-2:1 No - lnc-COX6B1-1:1 No - lnc-UPK1A-1:1 No - lnc-IGFLR1-2:1 No - lnc-ZBTB32-3:1 No - lnc-U2AF1L4-3:2 No - lnc-U2AF1L4-3:1 No - lnc-U2AF1L4-2:1 No - lnc-IGFLR1-1:7 No - lnc-IGFLR1-1:4 No - lnc-IGFLR1-1:2 No - lnc-IGFLR1-1:3 No - lnc-IGFLR1-1:5 No - lnc-IGFLR1-1:6 No - lnc-HSPB6-1:3 No - lnc-HSPB6-1:2 No - lnc-HSPB6-2:1 No - lnc-LIN37-3:1 No - lnc-HSPB6-3:1 No - lnc-PRODH2-2:1 No - lnc-NPHS1-2:1 No - lnc-NPHS1-3:1 No - lnc-APLP1-1:1 No - lnc-APLP1-2:1 No - lnc-TYROBP-1:4 No - lnc-TYROBP-1:2 No - lnc-TYROBP-1:1 No - lnc-TYROBP-1:3 No - lnc-TYROBP-2:2 No - lnc-LRFN3-1:1 Yes chr2R:8009119-8013755 lnc-LRFN3-1:2 Yes chr2R:8009119-8013755 lnc-LRFN3-59:1 No - lnc-LRFN3-2:1 No - lnc-SYNE4-2:1 No - lnc-LRFN3-59:3 No - lnc-ALKBH6-3:1 No - lnc-ALKBH6-1:4 Yes chr2L:10488694-10490461 lnc-ALKBH6-1:3 Yes chr2L:10488694-10490461 lnc-ALKBH6-1:2 Yes chr2L:10488694-10490461 lnc-THAP8-1:2 No - lnc-CLIP3-2:1 No - lnc-POLR2I-1:1 No - lnc-POLR2I-1:2 No - lnc-TBCB-2:1 No - lnc-COX7A1-2:1 Yes chr2R:10480163-10481886 lnc-COX7A1-1:1 No - lnc-CAPNS1-1:1 No - lnc-CAPNS1-2:1 No - lnc-ZNF565-1:1 No - lnc-COX7A1-3:1 No - lnc-COX7A1-4:2 No - lnc-COX7A1-4:1 No - lnc-CAPNS1-3:1 No - lnc-ZNF146-1:8 No - lnc-ZNF146-1:9 No - lnc-ZNF146-1:10 No - lnc-ZNF146-1:11 No - lnc-ZNF146-1:13 No - LINC00665:23 No - LINC00665:3 No - LINC00665:25 No - LINC00665:24 No - LINC00665:15 No - LINC00665:18 No - LINC00665:9 No - LINC00665:7 No - LINC00665:21 No - LINC00665:1 No - LINC00665:6 No - LINC00665:10 No - lnc-ZNF146-3:1 No - lnc-ZFP14-2:1 No - lnc-ZNF566-2:2 No - lnc-ZNF566-2:4 No - lnc-ZNF566-2:3 No - lnc-ZNF566-2:1 No - lnc-ZNF382-5:1 No - lnc-ZNF382-5:4 No - lnc-ZNF382-5:5 No - lnc-ZNF529-1:1 Yes chr3L:21724326-21728806 ZNF529-AS1:1 No - ZNF529-AS1:6 No - ZNF529-AS1:7 No - ZNF529-AS1:8 No - ZNF529-AS1:9 No - lnc-ZNF529-2:1 No - lnc-ZNF529-2:2 No - lnc-ZNF529-2:3 No - ZNF529-AS1:10 No - ZNF529-AS1:11 No - lnc-ZNF529-3:1 No - lnc-ZNF461-2:1 No - lnc-ZNF461-2:2 No - lnc-ZNF567-5:1 No - LINC01534:1 No - LINC01534:7 No - LINC01534:6 No - lnc-ZNF790-3:1 No - lnc-ZNF567-2:3 No - lnc-ZNF850-2:1 No - lnc-ZNF567-2:4 No - lnc-ZNF345-29:1 No - lnc-ZNF345-29:10 No - lnc-ZNF345-29:11 No - lnc-ZNF345-29:12 No - lnc-ZNF568-3:2 No - lnc-ZNF568-1:1 No - lnc-ZNF568-1:2 No - lnc-ZNF568-2:1 No - lnc-ZNF568-1:3 No - lnc-ZNF568-1:4 No - lnc-ZNF585A-4:1 No - lnc-ZNF585A-4:2 No - lnc-ZNF568-5:1 No - lnc-ZNF585B-3:2 No - lnc-ZNF585B-6:1 No - lnc-ZNF585B-4:1 No - lnc-ZNF585A-3:2 No - lnc-ZNF585B-2:1 No - lnc-ZNF383-2:2 No - lnc-ZNF383-2:3 No - LINC01535:4 No - LINC01535:5 No - LINC01535:6 No - LINC01535:8 No - LINC01535:9 No - LINC01535:10 No - LINC01535:11 No - LINC01535:12 No - LINC01535:13 No - LINC01535:15 No - LINC01535:16 No - lnc-ZNF585B-5:2 No - lnc-ZNF585B-5:3 No - lnc-ZNF585B-5:4 No - lnc-ZNF585B-5:1 No - lnc-ZNF585B-5:5 No - lnc-HKR1-2:1 No - lnc-ZNF527-6:1 Yes chr2L:12046711-12048918 lnc-ZNF527-1:7 Yes chr2L:12046711-12048918 lnc-ZNF527-1:8 Yes chr2L:12046711-12048918 lnc-ZNF527-5:1 Yes chr2L:12046711-12048918 lnc-ZNF569-2:1 No - lnc-ZNF527-3:1 No - lnc-ZNF569-1:2 No - lnc-ZNF570-2:1 No - ZNF793-AS1:8 No - ZNF793-AS1:14 No - ZNF793-AS1:12 No - ZNF793-AS1:10 No - ZNF793-AS1:7 No - ZNF793-AS1:1 No - ZNF793-AS1:13 No - ZNF793-AS1:2 No - lnc-ZNF569-4:1 No - ZNF793-AS1:4 No - lnc-ZNF571-1:6 No - ZNF571-AS1:4 No - ZNF571-AS1:9 No - ZNF571-AS1:15 No - ZNF571-AS1:17 No - lnc-ZFP30-39:1 No - ZNF571-AS1:18 No - lnc-ZNF781-2:5 No - lnc-ZNF781-2:3 No - lnc-ZNF781-2:2 No - lnc-ZNF781-2:6 No - lnc-ZNF781-2:1 No - lnc-ZNF781-2:4 No - lnc-ZFP30-1:2 No - lnc-ZNF573-2:1 No - lnc-ZNF607-1:1 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-SIPA1L3-4:1 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-WDR87-1:5 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-WDR87-1:3 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-WDR87-1:4 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-WDR87-1:1 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-WDR87-1:2 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-SIPA1L3-6:6 No - lnc-SIPA1L3-6:7 No - lnc-SIPA1L3-6:8 No - lnc-SIPA1L3-6:14 No - lnc-SIPA1L3-6:16 No - lnc-SIPA1L3-6:17 No - lnc-SIPA1L3-6:18 No - lnc-ZNF573-1:3 No - lnc-ZNF573-1:6 No - lnc-ZNF573-1:7 No - lnc-ZNF573-1:2 No - lnc-SIPA1L3-5:1 No - lnc-ZNF540-1:1 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-SPINT2-10:1 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-SPINT2-9:1 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-DPF1-2:1 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-SPINT2-5:1 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-SPINT2-4:1 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-SPINT2-3:1 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-PPP1R14A-1:1 Yes chr2R:5259004-5295965 lnc-PPP1R14A-1:2 Yes chr2R:5259004-5295965 lnc-DPF1-1:1 No - lnc-YIF1B-1:1 No - lnc-PPP1R14A-2:1 Yes chr3R:26717871-26719806 lnc-KCNK6-1:1 No - lnc-GGN-2:1 No - lnc-RASGRP4-2:1 No - lnc-RASGRP4-2:2 No - lnc-SPRED3-2:2 Yes chr2R:14759646-14769423 lnc-GGN-3:1 No - lnc-MAP4K1-2:1 No - lnc-MAP4K1-1:1 No - lnc-CAPN12-3:1 No - lnc-CAPN12-2:2 No - lnc-CAPN12-2:1 No - lnc-CAPN12-1:1 Yes chrX:2023822-2042311 lnc-LGALS7B-2:1 Yes chrX:2023822-2042311 lnc-LGALS7-1:3 No - lnc-LGALS7-1:1 Yes chr3L:9888762-9893319 lnc-LGALS7-1:2 Yes chr3L:9888762-9893319 lnc-ECH1-4:1 No - lnc-ECH1-3:1 No - lnc-LGALS7B-1:1 No - lnc-HNRNPL-1:1 No - lnc-ECH1-1:1 No - lnc-ECH1-2:1 No - lnc-ECH1-6:1 Yes chr2R:19517864-19631508 lnc-ECH1-5:1 Yes chr2R:19517864-19631508 lnc-NFKBIB-5:1 Yes chr2R:19517864-19631508 lnc-SIRT2-1:5 Yes chrX:10490069-10585422 lnc-SIRT2-1:6 Yes chrX:10490069-10585422 lnc-SIRT2-1:4 Yes chrX:10490069-10585422 lnc-RINL-1:4 Yes chr3R:20328465-20330915 lnc-RINL-1:5 Yes chr3R:20328465-20330915 lnc-CCER2-1:2 Yes chr3R:20328465-20330915 lnc-SARS2-2:2 No - lnc-CCER2-3:2 No - lnc-CCER2-4:2 No - lnc-FBXO17-5:3 Yes chr3R:15340667-15343218 lnc-SARS2-6:2 No - lnc-FBXO17-1:3 No - lnc-FBXO27-2:1 No - lnc-SYCN-1:1 Yes chrX:16610685-16614856 lnc-NCCRP1-1:1 No - lnc-IFNL3-2:1 No - lnc-LRFN1-3:1 Yes chr2L:16301656-16302954 lnc-MED29-3:1 Yes chr3L:8990317-8997989 lnc-MED29-1:1 Yes chr3L:8990317-8997989 lnc-RPS16-5:1 Yes chr3R:4750035-4777490 lnc-RPS16-2:8 Yes chr3R:4750035-4777490 lnc-RPS16-2:7 Yes chr3R:4750035-4777490 lnc-RPS16-2:6 Yes chr3R:4750035-4777490 lnc-PLEKHG2-1:1 Yes chr2R:18554119-18611777 lnc-RPS16-1:3 Yes chr2R:22605745-22607995 lnc-RPS16-1:4 Yes chr2R:22605745-22607995 lnc-RPS16-4:2 Yes chr2R:19437483-19441898 lnc-DLL3-1:2 Yes chr3L:275155-276667 lnc-DLL3-1:3 Yes chr3L:275155-276667 lnc-SELENOV-1:1 No - lnc-EID2-1:1 No - lnc-SELENOV-3:1 No - lnc-LGALS13-2:1 No - lnc-LGALS16-1:1 No - lnc-LGALS14-1:6 No - lnc-DYRK1B-1:1 No - lnc-FBL-1:1 Yes chr2R:23072909-23074725 lnc-FBL-1:2 Yes chr2R:23072909-23074725 lnc-FCGBP-1:1 No - lnc-FCGBP-1:2 No - lnc-FCGBP-2:1 No - lnc-ZNF546-5:1 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-ZNF780B-2:1 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-ZNF780B-1:1 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-ZNF546-1:4 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-ZNF780B-3:7 No - lnc-ZNF546-3:2 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF546-6:1 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF780A-2:1 No - lnc-ZNF780A-3:1 No - lnc-CNTD2-1:1 Yes chr3R:16099228-16105670 lnc-C19orf47-2:1 Yes chr3R:16099228-16105670 lnc-MAP3K10-1:2 Yes chr3R:16099228-16105670 lnc-C19orf47-3:1 Yes chr3R:16099228-16105670 lnc-PLD3-4:3 No - lnc-AKT2-1:1 No - lnc-PLD3-4:1 No - lnc-AKT2-2:1 No - lnc-PLD3-3:1 No - lnc-SPTBN4-1:4 Yes chr2L:21166046-21168581 lnc-PLD3-2:1 No - lnc-SERTAD1-1:1 No - lnc-BLVRB-1:1 No - lnc-SPTBN4-3:1 No - lnc-NUMBL-1:1 Yes chr2L:4477462-4614300 lnc-COQ8B-1:3 Yes chr2L:9437469-9464184 lnc-COQ8B-1:1 Yes chr2L:9437469-9464184 lnc-COQ8B-1:2 Yes chr2L:9437469-9464184 lnc-COQ8B-2:1 Yes chr3R:23995659-23997544 lnc-CYP2A6-3:1 Yes chr3R:5257037-5269507 lnc-CYP2A6-1:1 Yes chr3R:5257037-5269507 lnc-CYP2A6-2:1 Yes chr3R:5257037-5269507 lnc-CYP2B6-2:1 No - lnc-CYP2A7-1:1 No - lnc-TGFB1-7:1 No - lnc-CYP2F1-1:1 No - lnc-CYP2S1-2:1 No - lnc-TGFB1-5:1 No - lnc-TGFB1-2:1 Yes chr2R:18632328-18639270 lnc-B9D2-2:2 Yes chr2L:2805261-2812376 lnc-B9D2-2:1 Yes chr2L:2805261-2812376 lnc-B9D2-1:4 Yes chr3R:9555785-9557776 lnc-TMEM91-2:1 No - lnc-B3GNT8-1:1 Yes chr3L:20770143-20771507 PCAT19:14 No - PCAT19:4 No - PCAT19:12 No - PCAT19:7 No - PCAT19:5 No - PCAT19:8 No - PCAT19:11 No - PCAT19:13 No - PCAT19:9 No - PCAT19:6 No - PCAT19:10 No - LINC01480:7 No - LINC01480:8 No - LINC01480:2 No - LINC01480:3 No - LINC01480:4 No - LINC01480:6 No - lnc-CEACAM21-5:1 No - lnc-CEACAM21-5:2 No - lnc-CEACAM21-5:3 No - lnc-CEACAM21-5:4 No - lnc-CEACAM21-5:5 No - lnc-CEACAM4-5:1 No - lnc-CEACAM21-5:6 No - lnc-CEACAM21-4:1 No - lnc-CEACAM21-4:2 No - lnc-CEACAM4-4:1 No - lnc-CEACAM4-1:1 No - lnc-CEACAM4-2:1 No - lnc-CEACAM4-3:1 No - lnc-CEACAM5-1:1 No - lnc-LYPD4-3:1 No - lnc-LYPD4-2:3 Yes chr2R:17027190-17044653 lnc-LYPD4-2:1 Yes chr2R:17027190-17044653 lnc-ARHGEF1-3:1 No - lnc-RABAC1-1:3 No - lnc-RABAC1-1:1 No - lnc-RABAC1-1:2 No - lnc-GRIK5-2:1 No - lnc-GRIK5-1:1 No - lnc-GRIK5-1:2 No - lnc-POU2F2-1:1 Yes chr2R:21634679-21638399 lnc-GRIK5-3:3 Yes chr2L:12587625-12628135 lnc-GRIK5-3:2 Yes chr2L:12587625-12628135 lnc-GRIK5-3:1 Yes chr2L:12587625-12628135 lnc-DEDD2-1:10 No - lnc-DEDD2-1:2 No - lnc-DEDD2-1:9 No - lnc-DEDD2-2:1 Yes chr3R:31372427-31374198 lnc-GSK3A-1:1 No - lnc-GSK3A-2:1 No - lnc-TMEM145-1:1 Yes chr2L:8043471-8054326 LIPE-AS1:3 No - LIPE-AS1:4 No - LIPE-AS1:8 No - LIPE-AS1:11 No - lnc-CXCL17-1:1 Yes chr2R:20257650-20261726 LIPE-AS1:12 No - lnc-CEACAM1-2:1 No - lnc-CEACAM8-3:2 No - lnc-CEACAM8-3:3 No - lnc-CEACAM8-3:1 No - lnc-CEACAM1-1:2 No - LIPE-AS1:13 No - lnc-PSG3-1:1 No - lnc-PSG3-2:1 No - PSG8-AS1:5 No - lnc-PSG1-1:1 No - lnc-PSG1-1:3 No - lnc-PSG8-3:1 No - lnc-PSG6-1:3 No - lnc-PSG7-4:1 No - lnc-PSG7-2:1 No - lnc-PSG2-5:2 No - lnc-PSG2-5:1 No - lnc-PSG2-4:1 No - lnc-PSG11-1:1 No - lnc-PSG2-2:1 No - lnc-PSG11-2:1 No - lnc-PSG2-3:1 No - lnc-PSG4-3:1 No - lnc-PSG4-3:2 No - lnc-PSG4-2:1 No - lnc-PSG5-1:2 No - lnc-PSG5-1:1 No - lnc-PSG4-1:1 No - lnc-PSG9-2:2 No - lnc-PSG9-2:1 No - lnc-PSG9-2:3 No - lnc-PSG9-1:1 No - lnc-PSG9-3:1 No - lnc-CD177-2:1 No - lnc-PSG9-4:1 No - lnc-ETHE1-1:1 Yes chrX:17107582-17135988 lnc-PINLYP-4:1 Yes chr3R:23123962-23126422 lnc-ETHE1-2:1 Yes chrX:5329876-5332435 lnc-XRCC1-2:1 No - lnc-SRRM5-2:1 No - lnc-ZNF428-1:1 No - lnc-CADM4-2:1 No - lnc-CADM4-1:1 No - lnc-IRGC-3:1 No - lnc-IRGC-2:1 No - lnc-IRGC-1:1 No - lnc-KCNN4-4:2 Yes chrX:1937700-1940040 lnc-KCNN4-4:1 Yes chrX:1937700-1940040 lnc-KCNN4-3:1 Yes chrX:1937700-1940040 lnc-LYPD5-2:1 No - lnc-KCNN4-2:1 No - lnc-ZNF404-1:11 No - lnc-ZNF404-1:10 No - lnc-ZNF404-1:6 No - lnc-ZNF404-1:8 No - lnc-ZNF45-1:1 No - lnc-ZNF45-1:2 No - lnc-ZNF155-1:3 No - lnc-ZNF45-2:2 No - lnc-ZNF45-2:1 No - lnc-ZNF45-2:3 No - lnc-ZNF155-2:1 No - lnc-ZNF45-3:1 No - lnc-ZNF224-1:1 No - lnc-ZNF235-5:1 No - lnc-ZNF284-1:1 No - lnc-ZNF284-1:2 No - lnc-ZNF235-4:1 No - lnc-ZNF235-4:3 No - lnc-ZNF235-3:1 No - lnc-ZNF235-2:1 No - lnc-ZNF235-2:2 No - lnc-ZNF227-2:1 No - lnc-ZNF227-2:2 No - lnc-ZNF112-2:1 No - lnc-ZNF112-1:1 No - lnc-ZNF233-4:1 No - lnc-ZNF233-5:1 No - lnc-ZNF233-2:1 No - lnc-ZNF229-1:3 No - lnc-ZNF229-1:2 No - lnc-IGSF23-1:1 No - lnc-ZNF180-4:1 Yes chr2R:14173693-14182838 lnc-CEACAM20-3:1 Yes chr2R:14173693-14182838 lnc-CEACAM20-5:1 No - lnc-CEACAM20-6:1 No - lnc-CEACAM20-7:1 No - lnc-CEACAM20-8:6 No - lnc-CEACAM19-2:1 No - lnc-CEACAM16-2:1 No - lnc-CEACAM16-1:1 No - lnc-BCL3-2:1 No - lnc-BCL3-3:1 No - lnc-BCL3-4:1 No - lnc-ZNF296-7:1 No - lnc-ZNF296-6:1 No - lnc-APOC1-1:4 No - lnc-APOC1-1:5 No - lnc-APOC1-1:6 No - lnc-APOC1-1:7 No - lnc-ZNF296-3:1 No - GEMIN7-AS1:19 No - lnc-MARK4-1:1 No - GEMIN7-AS1:20 No - GEMIN7-AS1:17 No - GEMIN7-AS1:18 No - lnc-GEMIN7-1:2 Yes chr3R:11346294-11353131 lnc-NKPD1-1:2 Yes chr3R:11346294-11353131 lnc-NKPD1-2:1 Yes chr3R:11346294-11353131 lnc-PPP1R37-3:1 Yes chr3R:11346294-11353131 lnc-TRAPPC6A-1:1 Yes chr3R:11346294-11353131 lnc-TRAPPC6A-2:1 Yes chr3R:11346294-11353131 lnc-BLOC1S3-1:1 Yes chr3R:11346294-11353131 lnc-ERCC2-2:1 Yes chr2R:22825093-22828903 lnc-ERCC2-1:1 No - lnc-MARK4-2:1 Yes chr3L:12746616-12750056 lnc-PPP1R13L-4:1 No - lnc-PPP1R13L-2:1 Yes chr2R:21171001-21174504 lnc-ERCC1-1:4 No - lnc-ERCC1-1:3 No - lnc-ERCC1-1:5 Yes chr2R:14852941-14853948 lnc-PPP1R13L-3:1 Yes chr2R:14852941-14853948 lnc-FOSB-1:1 Yes chr2R:14852941-14853948 lnc-ERCC1-2:2 Yes chr3R:7528864-7530241 lnc-ERCC1-2:1 No - lnc-EML2-1:1 Yes chr3R:23927728-23929000 lnc-OPA3-2:2 Yes chr3L:14903805-14942907 lnc-OPA3-1:2 Yes chr3L:14903805-14942907 lnc-GIPR-2:1 No - lnc-GIPR-1:1 No - lnc-SNRPD2-1:1 No - lnc-SNRPD2-2:1 No - lnc-SIX5-1:1 Yes chr2R:24092079-24098636 lnc-SIX5-1:2 Yes chr2R:24092079-24098636 lnc-SIX5-3:2 Yes chr2R:24092079-24098636 lnc-DMWD-2:1 Yes chr2R:24092079-24098636 lnc-DMWD-1:1 No - lnc-RSPH6A-1:1 Yes chr3R:26719847-26725216 lnc-RSPH6A-2:2 Yes chr3R:5738178-5742476 lnc-RSPH6A-2:1 Yes chr3R:5738178-5742476 lnc-IRF2BP1-1:1 Yes chr3R:5738178-5742476 lnc-PGLYRP1-1:1 Yes chr3R:9417940-9455500 lnc-CCDC61-2:1 No - lnc-CCDC61-2:2 No - lnc-IGFL4-1:3 No - lnc-CCDC61-4:1 No - lnc-IGFL2-1:2 No - lnc-IGFL3-4:1 No - lnc-IGFL3-1:3 No - lnc-IGFL3-1:4 No - IGFL2-AS1:14 No - IGFL2-AS1:10 No - lnc-IGFL2-1:3 No - IGFL2-AS1:15 No - IGFL2-AS1:16 No - IGFL2-AS1:11 No - lnc-IGFL1-1:8 No - lnc-IGFL1-1:9 No - lnc-IGFL1-1:10 No - lnc-IGFL1-1:11 No - lnc-IGFL3-5:1 No - lnc-IGFL1-2:1 No - lnc-IGFL3-6:1 No - lnc-HIF3A-1:1 No - lnc-CCDC8-4:1 Yes chr3R:30058311-30121798 lnc-CCDC8-3:1 Yes chr3R:9747875-9751094 lnc-CCDC8-1:2 No - lnc-PNMA8B-2:1 No - lnc-PNMA8B-1:1 No - lnc-PTGIR-4:3 No - lnc-PTGIR-4:1 No - lnc-PPP5D1-1:1 Yes chr2L:3784947-3785622 lnc-PPP5D1-1:2 Yes chr2L:3784947-3785622 lnc-PTGIR-3:1 No - lnc-PTGIR-2:1 No - lnc-GNG8-1:2 No - DACT3-AS1:2 No - DACT3-AS1:4 No - lnc-DACT3-1:1 Yes chr3R:18303279-18314407 lnc-DACT3-2:1 Yes chr3R:18303279-18314407 lnc-STRN4-2:1 Yes chr3R:18303279-18314407 lnc-PRKD2-1:2 Yes chr2L:8030721-8040826 lnc-PRKD2-3:1 Yes chr2L:8030721-8040826 lnc-PRKD2-2:1 Yes chr2L:8030721-8040826 lnc-CALM3-1:6 No - lnc-CALM3-1:7 No - lnc-CALM3-1:8 No - lnc-CALM3-1:9 No - lnc-CALM3-1:10 No - lnc-AP2S1-1:1 No - lnc-SLC1A5-1:1 Yes chr3R:21269209-21270075 lnc-SLC1A5-2:1 Yes chr3R:21269209-21270075 lnc-NPAS1-3:1 Yes chrX:635890-643760 lnc-TMEM160-2:1 Yes chrX:635890-643760 lnc-ZC3H4-1:2 No - lnc-ZC3H4-1:1 No - lnc-CCDC9-1:1 No - lnc-C5AR1-1:1 No - lnc-C5AR2-3:1 No - lnc-MEIS3-2:1 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-SLC8A2-1:1 No - lnc-DHX34-4:1 No - lnc-KPTN-1:1 No - lnc-KPTN-2:4 Yes chr3L:20313632-20316577 lnc-ZNF541-2:2 Yes chr3L:20313632-20316577 lnc-NAPA-1:1 Yes chr3R:9461084-9493677 lnc-BICRA-3:2 No - lnc-BICRA-2:2 No - lnc-BICRA-1:2 No - BICRA-AS1:3 No - lnc-ZNF541-4:1 No - NOP53-AS1:3 Yes chrX:8714936-8717065 lnc-SELENOW-1:1 No - lnc-NOP53-2:1 No - lnc-TPRX1-1:1 No - lnc-SELENOW-2:1 No - lnc-CRX-1:1 No - lnc-SELENOW-3:1 No - lnc-SELENOW-4:1 No - lnc-CRX-5:1 No - lnc-CRX-5:2 No - lnc-CRX-6:1 No - lnc-CRX-7:1 No - LINC01595:2 No - LINC01595:5 No - LINC01595:1 No - lnc-PLA2G4C-1:1 No - lnc-LIG1-3:1 No - lnc-LIG1-2:1 No - lnc-PLA2G4C-3:3 Yes chr2R:23890512-23893177 lnc-PLA2G4C-3:1 Yes chr2R:23890512-23893177 lnc-PLA2G4C-3:2 Yes chr2R:23890512-23893177 lnc-PLA2G4C-2:1 Yes chr2R:23890512-23893177 lnc-ZSWIM9-3:1 Yes chr2R:23890512-23893177 lnc-CARD8-3:3 Yes chr2R:23890512-23893177 lnc-CARD8-3:2 Yes chr2R:23890512-23893177 lnc-CARD8-3:1 Yes chr2R:23890512-23893177 lnc-CARD8-2:1 No - lnc-ZSWIM9-2:3 No - lnc-ZSWIM9-2:4 No - lnc-CCDC114-2:1 No - lnc-CCDC114-2:2 No - lnc-CCDC114-2:3 No - CARD8-AS1:2 No - CARD8-AS1:4 No - ZNF114-AS1:3 No - lnc-ZNF114-2:1 No - lnc-TMEM143-2:1 Yes chr3R:23286093-23288051 lnc-CCDC114-1:4 No - lnc-CCDC114-1:5 Yes chr3R:23286093-23288051 lnc-KDELR1-1:1 No - lnc-TMEM143-1:1 Yes chr2L:10426887-10428632 lnc-LMTK3-4:4 No - lnc-LMTK3-4:3 No - lnc-LMTK3-4:1 No - lnc-LMTK3-4:2 No - lnc-KCNJ14-1:1 No - lnc-KCNJ14-3:1 Yes chr2L:21740041-21757466 lnc-LMTK3-2:1 No - lnc-FAM83E-2:2 No - lnc-FAM83E-2:1 No - lnc-RPL18-1:8 Yes chr3L:7240203-7241351 lnc-RPL18-1:6 Yes chr3L:7240203-7241351 lnc-RPL18-1:9 Yes chr3L:7240203-7241351 lnc-RPL18-1:7 Yes chr3L:7240203-7241351 lnc-RPL18-1:5 Yes chr3L:7240203-7241351 lnc-RPL18-3:2 No - lnc-RPL18-3:3 Yes chrX:11442539-11446012 lnc-RPL18-3:1 Yes chrX:11442539-11446012 lnc-DBP-1:1 Yes chrX:7826197-7842679 lnc-DBP-1:2 Yes chrX:7826197-7842679 lnc-CA11-1:3 Yes chrX:14604012-14653928 lnc-FUT2-1:1 No - lnc-FGF21-3:1 No - lnc-MAMSTR-1:1 No - lnc-IZUMO1-2:1 No - lnc-IZUMO1-1:1 No - lnc-FUT1-1:2 No - lnc-FUT1-1:4 No - lnc-FUT1-1:1 No - lnc-FUT1-1:3 No - lnc-FGF21-1:1 No - lnc-BCAT2-2:1 Yes chrX:13396899-13401224 lnc-HSD17B14-1:1 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-HSD17B14-3:2 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-HSD17B14-3:1 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-TULP2-3:1 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-PPP1R15A-1:1 No - lnc-TULP2-2:1 No - lnc-PLEKHA4-1:1 Yes chr2R:21101928-21123704 lnc-TULP2-4:1 Yes chr3L:17797738-17802279 lnc-TULP2-5:1 No - lnc-NUCB1-2:1 No - lnc-NUCB1-2:2 No - lnc-DHDH-1:1 No - lnc-FTL-1:1 No - lnc-FTL-1:2 No - lnc-LHB-2:2 Yes chr3R:15141843-15147531 lnc-LHB-1:2 No - lnc-CGB5-1:1 No - lnc-CGB8-1:1 No - lnc-NTF4-3:1 No - lnc-NTF4-2:1 No - lnc-CGB5-2:1 No - lnc-KCNA7-1:2 No - lnc-CGB5-3:1 No - lnc-SNRNP70-1:1 No - lnc-C19orf73-1:1 No - lnc-CD37-2:1 No - lnc-TEAD2-2:6 Yes chrX:6069131-6074857 lnc-TEAD2-2:5 Yes chrX:6069131-6074857 lnc-DKKL1-1:1 Yes chrX:15804370-15827682 lnc-SLC6A16-1:1 Yes chrX:15804370-15827682 lnc-SLC17A7-3:1 No - lnc-SLC17A7-1:1 No - lnc-SLC17A7-2:1 No - lnc-RPL13A-1:8 Yes chr3R:5624474-5625947 lnc-PIH1D1-1:1 No - lnc-RRAS-1:3 Yes chrX:18380082-18381479 lnc-RRAS-1:4 Yes chrX:18380082-18381479 lnc-RRAS-1:2 Yes chrX:18380082-18381479 lnc-SCAF1-2:1 No - lnc-SCAF1-2:2 No - lnc-RRAS-2:1 No - lnc-IRF3-1:5 Yes chr3L:4139076-4141398 lnc-RRAS-3:5 No - lnc-RRAS-4:1 No - lnc-RRAS-5:2 No - lnc-RRAS-5:1 No - lnc-IRF3-2:4 No - lnc-TSKS-1:2 Yes chr2L:8401476-8403280 lnc-FUZ-1:1 Yes chr2L:8401476-8403280 PTOV1-AS1:2 No - PTOV1-AS1:6 No - PTOV1-AS2:6 Yes chr3R:24227023-24228538 PTOV1-AS2:1 Yes chr3R:24227023-24228538 PTOV1-AS2:2 Yes chr3R:24227023-24228538 PTOV1-AS2:4 Yes chr3R:24227023-24228538 lnc-PNKP-4:1 No - lnc-AKT1S1-3:3 Yes chr3R:8341661-8343516 lnc-AKT1S1-3:2 Yes chr3R:8341661-8343516 lnc-AKT1S1-3:1 Yes chr3R:8341661-8343516 lnc-AKT1S1-2:1 Yes chr3R:8341661-8343516 lnc-PNKP-8:1 No - lnc-NUP62-1:15 No - lnc-NUP62-1:16 No - lnc-NUP62-1:17 No - lnc-NUP62-1:19 No - lnc-NUP62-1:20 No - lnc-NUP62-1:22 No - lnc-NUP62-1:14 No - lnc-NUP62-1:25 No - lnc-NUP62-1:23 No - lnc-NUP62-1:24 No - lnc-NUP62-1:21 No - lnc-NUP62-1:18 No - lnc-NUP62-2:1 No - lnc-ATF5-2:1 No - lnc-SIGLEC11-1:1 Yes chr3R:26864605-26866807 lnc-SIGLEC11-2:3 Yes chr3R:26864605-26866807 lnc-SIGLEC11-2:6 Yes chr3R:26864605-26866807 lnc-SIGLEC11-2:4 Yes chr3R:26864605-26866807 lnc-SIGLEC11-2:5 Yes chr3R:26864605-26866807 lnc-SIGLEC11-2:1 Yes chr3R:26864605-26866807 lnc-SIGLEC11-2:2 Yes chr3R:26864605-26866807 lnc-VRK3-1:1 No - lnc-VRK3-2:1 No - lnc-VRK3-2:2 No - lnc-VRK3-2:4 No - lnc-VRK3-2:3 No - lnc-ZNF473-2:1 No - lnc-ZNF473-3:1 No - lnc-IZUMO2-1:1 No - lnc-KCNC3-3:1 Yes chr2R:24990570-25011965 lnc-POLD1-3:1 No - lnc-KCNC3-1:7 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-KCNC3-4:2 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-KCNC3-4:1 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-KCNC3-4:3 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-NAPSA-2:1 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-NR1H2-1:1 Yes chr3L:15984322-15987815 lnc-FAM71E1-3:1 No - lnc-JOSD2-4:1 No - lnc-FAM71E1-2:12 Yes chr3L:21574131-21575874 lnc-MYBPC2-1:2 Yes chr3L:21574131-21575874 lnc-FAM71E1-2:1 Yes chr3L:21574131-21575874 lnc-FAM71E1-2:6 Yes chr3L:21574131-21575874 lnc-EMC10-4:1 Yes chr3L:21574131-21575874 lnc-EMC10-4:2 No - lnc-FAM71E1-2:8 No - lnc-EMC10-3:1 No - lnc-ASPDH-1:1 Yes chrX:6261169-6262119 lnc-JOSD2-1:3 No - lnc-JOSD2-1:2 No - lnc-JOSD2-1:1 No - lnc-ASPDH-2:1 Yes chr2R:21872030-21946259 lnc-SHANK1-2:1 No - lnc-SYT3-1:2 Yes chr2R:14060456-14140902 lnc-SYT3-2:1 Yes chr2R:14060456-14140902 lnc-SHANK1-1:2 Yes chr2R:14060456-14140902 lnc-SHANK1-1:1 Yes chr2R:14060456-14140902 lnc-C19orf48-1:3 No - lnc-ACP4-2:2 No - lnc-ACP4-1:2 No - lnc-C19orf48-3:1 No - lnc-C19orf48-2:1 No - lnc-KLK1-2:3 No - lnc-KLK1-2:4 No - lnc-KLK1-2:2 No - lnc-KLK1-2:1 No - LINC01869:29 No - lnc-KLK1-1:2 No - lnc-KLK3-1:4 No - lnc-KLK3-2:1 No - lnc-KLK4-1:3 No - lnc-KLK4-1:4 No - lnc-KLK5-1:1 No - lnc-KLK2-4:2 No - lnc-KLK2-5:1 No - lnc-KLK8-1:1 No - lnc-KLK9-1:2 No - lnc-SIGLEC9-8:1 No - lnc-KLK12-1:1 No - lnc-SIGLEC9-6:1 No - lnc-SIGLEC9-2:1 No - lnc-SIGLEC9-1:1 No - lnc-SIGLEC9-3:1 No - lnc-CTU1-2:6 No - lnc-CTU1-1:1 No - lnc-CTU1-2:3 No - lnc-CTU1-2:5 No - lnc-CTU1-2:7 No - lnc-SIGLEC7-2:1 No - lnc-CTU1-2:4 No - lnc-CD33-3:1 No - lnc-CTU1-2:2 No - lnc-CD33-4:1 No - LINC01872:7 No - LINC01872:8 No - lnc-VSIG10L-2:1 No - lnc-CLDND2-1:1 No - lnc-IGLON5-1:11 No - lnc-SIGLEC10-1:1 No - lnc-CEACAM18-4:1 No - lnc-SIGLEC12-3:1 No - lnc-SIGLEC8-1:1 No - lnc-SIGLEC12-1:1 No - lnc-CEACAM18-3:1 No - lnc-CEACAM18-3:2 No - lnc-SIGLEC12-2:1 No - lnc-SIGLEC6-2:1 No - lnc-SIGLEC6-3:1 No - lnc-ZNF175-1:1 No - lnc-ZNF175-2:1 No - lnc-ZNF175-3:1 No - lnc-ZNF175-4:1 No - lnc-SPACA6-5:1 No - SPACA6P-AS:2 No - lnc-ZNF577-4:1 No - lnc-ZNF577-3:2 No - lnc-ZNF577-3:1 No - lnc-FPR1-2:3 No - lnc-FPR1-2:2 No - lnc-FPR1-2:4 No - lnc-FPR1-2:1 No - lnc-ZNF649-3:2 No - lnc-ZNF649-3:7 No - lnc-ZNF649-3:6 No - lnc-ZNF649-3:8 No - lnc-ZNF649-3:3 No - lnc-ZNF649-3:5 No - lnc-ZNF649-3:4 No - ZNF649-AS1:1 No - lnc-ZNF577-1:1 No - lnc-ZNF613-3:1 No - ZNF350-AS1:1 No - ZNF350-AS1:3 No - ZNF350-AS1:5 No - ZNF350-AS1:7 No - ZNF350-AS1:8 No - lnc-ZNF615-1:1 No - ZNF350-AS1:9 No - lnc-ZNF614-1:1 No - lnc-ZNF614-1:2 No - lnc-ZNF613-5:1 No - lnc-ZNF613-7:1 No - lnc-ZNF432-2:1 No - lnc-ZNF616-1:2 No - lnc-ZNF836-1:13 No - lnc-ZNF836-1:2 Yes chr3R:25331363-25340088 lnc-ZNF836-1:1 Yes chr3R:25331363-25340088 lnc-PPP2R1A-3:1 Yes chr3R:25331363-25340088 lnc-PPP2R1A-2:1 Yes chr3R:25331363-25340088 lnc-ZNF836-1:3 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-PPP2R1A-1:1 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-ZNF836-2:3 Yes chr2L:8366038-8370090 lnc-ZNF836-2:4 Yes chr2L:8366038-8370090 lnc-ZNF836-2:1 Yes chr2L:8366038-8370090 lnc-ZNF836-2:2 Yes chr2L:8366038-8370090 lnc-ZNF836-3:1 No - lnc-ZNF836-4:1 No - lnc-ZNF480-2:1 No - lnc-ZNF480-2:2 No - ZNF528-AS1:11 No - ZNF528-AS1:12 No - ZNF528-AS1:4 No - ZNF528-AS1:5 No - ZNF528-AS1:6 No - ZNF528-AS1:7 No - ZNF528-AS1:1 No - ZNF528-AS1:2 No - ZNF528-AS1:10 No - lnc-ZNF83-8:1 No - lnc-ZNF534-1:1 No - lnc-ZNF534-1:2 No - lnc-ZNF534-1:3 No - lnc-ZNF534-1:4 No - lnc-ZNF83-7:1 No - lnc-ZNF83-6:2 No - lnc-ZNF83-4:1 No - lnc-ZNF701-1:1 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF701-1:2 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF701-1:3 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF701-1:4 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF701-1:5 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF701-1:6 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF611-9:1 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF83-2:3 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF83-2:2 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF83-3:1 No - lnc-ZNF611-5:2 No - lnc-ZNF611-5:1 No - lnc-ZNF611-5:3 No - lnc-ZNF611-5:4 No - lnc-ZNF600-1:1 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-ZNF600-1:3 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-ZNF600-1:2 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-ERVV-1-2:1 No - lnc-ERVV-1-2:2 No - lnc-ZNF468-3:3 No - lnc-ZNF468-3:4 No - lnc-ZNF320-2:5 No - lnc-ZNF320-1:12 No - lnc-ZNF320-1:11 No - lnc-ZNF320-1:10 No - lnc-ZNF468-2:2 No - lnc-ZNF468-2:3 No - lnc-ZNF468-2:5 No - lnc-ZNF468-2:4 No - lnc-ZNF320-1:2 No - lnc-ERVV-1-12:1 No - lnc-ZNF816-2:13 No - lnc-ZNF816-2:5 No - lnc-ZNF816-2:2 No - lnc-ZNF816-2:15 No - lnc-ZNF816-2:16 No - lnc-ZNF816-2:14 No - lnc-ZNF816-2:8 No - lnc-ZNF816-2:7 No - lnc-ZNF816-2:9 No - lnc-ZNF816-2:4 No - lnc-ZNF816-2:1 No - lnc-ZNF816-2:10 No - lnc-ZNF816-2:11 No - lnc-ERVV-1-11:1 No - lnc-ZNF816-2:12 No - lnc-ZNF816-2:6 No - lnc-ZNF816-2:3 No - lnc-ZNF415-3:1 No - lnc-ZNF415-4:8 No - lnc-ZNF415-4:1 No - lnc-ZNF415-4:6 No - lnc-ZNF415-4:3 No - lnc-ZNF415-4:4 No - lnc-ZNF415-4:2 No - lnc-ZNF415-4:7 No - lnc-ZNF415-4:5 No - lnc-ZNF415-2:12 No - lnc-ZNF415-2:9 No - lnc-ZNF415-2:13 No - lnc-ZNF415-2:15 No - lnc-ZNF415-2:14 No - lnc-ZNF415-2:10 No - lnc-ZNF415-2:11 No - lnc-ZNF415-1:1 No - lnc-ZNF347-1:1 No - lnc-ZNF665-2:1 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-VN1R2-7:1 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF665-1:1 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF665-1:3 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF665-1:2 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-VN1R2-5:4 No - lnc-VN1R2-5:1 No - lnc-VN1R4-3:1 No - lnc-VN1R4-2:1 No - lnc-ZNF677-1:1 No - lnc-VN1R4-1:1 No - lnc-BIRC8-1:2 No - lnc-BIRC8-1:1 No - lnc-ZNF761-1:1 No - lnc-ZNF761-1:2 No - lnc-BIRC8-2:1 No - lnc-ZNF761-5:3 No - lnc-BIRC8-4:1 No - lnc-ZNF765-5:4 No - lnc-BIRC8-3:1 No - lnc-ZNF761-5:4 No - lnc-ZNF813-1:1 No - lnc-ZNF813-1:2 No - lnc-ZNF813-1:3 No - lnc-ZNF813-1:4 No - lnc-ZNF813-1:5 No - lnc-ZNF813-1:6 No - lnc-ZNF331-1:1 No - lnc-ZNF813-3:1 No - lnc-ZNF813-3:2 No - lnc-ZNF813-3:4 No - lnc-DPRX-1:1 No - lnc-NLRP12-5:1 No - lnc-MYADM-6:1 No - lnc-NLRP12-4:1 No - lnc-MYADM-5:1 No - lnc-NLRP12-3:1 No - lnc-MYADM-4:1 No - lnc-NLRP12-1:3 No - lnc-NLRP12-1:2 No - lnc-MYADM-3:1 No - lnc-MYADM-2:1 No - lnc-NLRP12-1:6 No - lnc-VSTM1-3:1 No - lnc-CACNG6-2:1 No - lnc-NDUFA3-1:2 No - lnc-NDUFA3-1:3 No - lnc-TMC4-1:1 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-LENG1-1:2 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-MBOAT7-2:1 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-TMC4-2:1 Yes chr2L:6456052-6459008 lnc-LILRB3-2:1 Yes chr3L:9509793-9511531 lnc-LILRA6-4:1 Yes chr3L:9509793-9511531 lnc-LILRA6-3:1 Yes chr3L:9509793-9511531 lnc-LILRA6-2:1 Yes chr3L:9509793-9511531 lnc-LILRA6-2:2 Yes chr3L:9509793-9511531 lnc-LILRB5-1:2 Yes chr3L:9509793-9511531 lnc-LILRB5-4:2 No - lnc-LILRB5-4:1 No - lnc-LILRA5-3:1 No - lnc-LILRA5-2:1 No - lnc-LILRA4-1:20 No - lnc-LILRA4-1:19 No - lnc-LILRA4-1:16 No - lnc-LILRA4-2:6 No - lnc-LILRA4-2:4 No - lnc-LILRA4-2:3 No - lnc-LILRA4-2:5 No - lnc-LILRA4-3:1 No - lnc-TTYH1-2:1 No - lnc-LENG8-3:1 Yes chrX:21328613-21339676 LENG8-AS1:5 No - lnc-LENG8-1:1 No - LENG8-AS1:7 No - lnc-LENG9-4:1 Yes chr2L:10837732-10842597 lnc-LENG9-3:1 No - lnc-KIR3DX1-2:1 No - lnc-LILRA2-2:1 No - lnc-LILRA1-2:1 No - lnc-LILRB4-1:1 No - lnc-LILRB4-1:2 No - lnc-KIR3DL3-2:1 No - lnc-FCAR-1:1 No - lnc-NLRP2-1:1 No - lnc-NLRP2-2:1 No - lnc-NLRP2-2:2 No - lnc-RDH13-3:1 No - lnc-RDH13-1:6 Yes chr3R:18378124-18381178 lnc-RDH13-1:8 Yes chr3R:18378124-18381178 lnc-RDH13-1:7 Yes chr3R:18378124-18381178 lnc-NLRP2-2:4 Yes chr3R:18378124-18381178 lnc-RDH13-2:13 Yes chr3R:18378124-18381178 lnc-RDH13-2:14 Yes chr3R:18378124-18381178 lnc-RDH13-2:7 Yes chr3R:18378124-18381178 lnc-RDH13-2:10 Yes chr3R:18378124-18381178 lnc-RDH13-2:9 Yes chr3R:18378124-18381178 lnc-RDH13-2:12 Yes chr3R:18378124-18381178 lnc-RDH13-2:8 Yes chr3R:18378124-18381178 lnc-RDH13-2:5 Yes chr3R:18378124-18381178 lnc-RDH13-2:6 Yes chr3R:18378124-18381178 lnc-RDH13-2:11 Yes chr3R:18378124-18381178 lnc-RDH13-13:1 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-RDH13-4:4 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-RDH13-4:2 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-RDH13-4:1 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-RDH13-4:3 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-TNNT1-1:1 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-PPP1R12C-1:1 No - lnc-TNNI3-2:1 No - lnc-DNAAF3-1:1 No - lnc-SYT5-2:1 Yes chr2R:18452737-18454462 lnc-SYT5-1:1 Yes chr2L:2772327-2799979 lnc-TMEM86B-3:1 No - lnc-BRSK1-1:2 No - lnc-PPP6R1-1:3 No - lnc-PPP6R1-1:2 Yes chr3L:6164916-6173880 lnc-TMEM86B-2:2 Yes chr3L:6164916-6173880 lnc-TMEM86B-2:1 Yes chr3L:6164916-6173880 lnc-HSPBP1-1:1 No - lnc-PPP6R1-2:1 No - lnc-TMEM150B-2:1 Yes chr3L:15900156-15924861 lnc-FAM71E2-1:6 No - lnc-FAM71E2-1:5 No - lnc-FAM71E2-1:4 No - lnc-FAM71E2-1:1 No - lnc-FAM71E2-1:2 No - lnc-FAM71E2-1:3 No - lnc-TMEM238-1:1 No - lnc-UBE2S-1:1 No - lnc-TMEM238-2:1 Yes chrX:17698917-17703024 lnc-RPL28-1:1 No - lnc-ISOC2-3:1 No - lnc-ZNF628-1:1 No - lnc-ZNF628-1:2 No - lnc-C19orf85-3:1 Yes chr3R:31463301-31464134 lnc-C19orf85-2:1 Yes chr3R:31463301-31464134 lnc-C19orf85-4:1 No - lnc-SBK2-1:2 No - lnc-SSC5D-1:1 No - lnc-SSC5D-2:1 No - lnc-ZNF524-1:1 No - lnc-ZNF579-1:1 No - lnc-ZNF784-2:1 No - lnc-ZNF784-1:1 No - lnc-ZNF580-1:1 No - lnc-U2AF2-1:4 Yes chrX:16356696-16359039 lnc-NLRP9-2:1 Yes chrX:16356696-16359039 lnc-NLRP9-2:2 Yes chrX:16356696-16359039 lnc-EPN1-3:1 Yes chrX:16356696-16359039 lnc-NLRP9-1:1 No - lnc-U2AF2-3:1 No - lnc-U2AF2-2:2 No - lnc-U2AF2-3:3 No - lnc-U2AF2-4:1 No - lnc-U2AF2-5:1 No - lnc-U2AF2-5:2 No - lnc-U2AF2-7:1 No - lnc-RFPL4A-1:1 No - LINC01864:6 No - lnc-ZSCAN5B-1:2 No - lnc-ZNF582-5:5 No - lnc-ZSCAN5B-2:1 No - lnc-ZNF582-5:1 No - lnc-ZNF582-5:3 No - lnc-ZNF582-5:4 No - lnc-ZNF582-5:6 No - lnc-EDDM13-1:2 No - lnc-EDDM13-1:5 No - lnc-EDDM13-1:6 No - lnc-ZNF582-5:2 No - lnc-EDDM13-1:7 No - lnc-ZNF582-4:1 No - lnc-EDDM13-5:1 No - lnc-EDDM13-5:7 No - lnc-EDDM13-5:8 No - lnc-EDDM13-5:13 No - lnc-ZNF582-7:1 No - lnc-ZNF582-2:2 No - lnc-ZNF582-6:5 No - lnc-ZNF582-6:3 No - lnc-ZNF582-6:2 No - lnc-ZNF582-6:4 No - lnc-ZNF582-6:1 No - lnc-ZNF583-4:2 No - lnc-ZNF583-4:3 No - lnc-ZNF583-4:4 No - lnc-ZNF583-4:6 No - lnc-ZNF583-4:8 No - lnc-ZNF583-4:9 No - lnc-ZNF583-4:10 No - lnc-ZNF583-4:11 No - lnc-ZSCAN5A-3:7 No - lnc-ZSCAN5A-3:6 No - lnc-ZNF583-3:1 No - lnc-ZNF583-2:1 No - ZNF582-AS1:1 No - ZNF582-AS1:5 No - ZNF582-AS1:6 No - ZNF582-AS1:7 No - ZNF582-AS1:8 No - ZNF582-AS1:9 No - ZNF582-AS1:10 No - ZNF582-AS1:14 No - ZNF582-AS1:24 No - ZNF582-AS1:25 No - ZNF582-AS1:26 No - ZNF582-AS1:27 No - lnc-ZNF582-1:2 No - lnc-ZNF582-1:3 No - ZNF667-AS1:1 No - ZNF667-AS1:2 No - ZNF667-AS1:3 No - ZNF667-AS1:4 No - ZNF667-AS1:6 No - ZNF667-AS1:7 No - ZNF667-AS1:8 No - ZNF667-AS1:9 No - ZNF667-AS1:10 No - ZNF667-AS1:12 No - ZNF667-AS1:13 No - lnc-ZFP28-1:1 No - lnc-ZNF667-3:3 No - lnc-ZNF667-3:1 No - lnc-ZNF667-3:4 No - lnc-ZNF667-3:5 No - lnc-ZNF667-3:2 No - lnc-ZNF667-2:2 No - lnc-ZNF835-3:1 No - lnc-ZNF470-3:1 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF835-2:1 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-SMIM17-1:1 No - lnc-SMIM17-5:7 No - lnc-ZNF835-1:1 No - lnc-SMIM17-2:1 No - lnc-SMIM17-2:2 No - ZIM2-AS1:6 No - ZIM2-AS1:7 No - lnc-PEG3-1:1 No - lnc-ZNF835-4:1 No - lnc-PEG3-5:2 No - lnc-PEG3-5:1 No - MIMT1:3 No - MIMT1:4 No - lnc-USP29-3:1 No - lnc-USP29-2:1 No - lnc-ZIM3-1:1 No - lnc-USP29-1:1 No - lnc-DUXA-2:1 No - lnc-ZNF805-1:1 No - ZNF460-AS1:16 No - ZNF460-AS1:15 No - ZNF460-AS1:14 No - lnc-DUXA-4:1 No - lnc-ZNF460-2:1 No - lnc-VN1R1-2:1 No - lnc-ZNF772-1:2 No - lnc-ZNF772-1:1 No - lnc-ZNF749-1:1 No - lnc-ZNF419-3:1 No - lnc-ZNF419-3:5 No - lnc-ZNF550-3:1 No - lnc-ZNF134-2:1 No - lnc-ZSCAN4-1:1 No - lnc-ZNF154-2:1 No - lnc-ZNF671-1:1 No - lnc-ZNF552-1:1 Yes chr2L:4463611-4465075 lnc-ZNF552-3:1 No - lnc-ZNF552-3:2 No - lnc-ZNF417-3:1 No - lnc-ZNF587B-2:2 No - lnc-ZNF587-1:1 No - lnc-ZNF814-1:5 No - lnc-ZNF814-1:3 No - lnc-ZNF814-1:4 No - lnc-ZNF814-1:2 No - lnc-ZNF256-2:3 No - lnc-ZNF256-2:2 No - lnc-ZNF256-2:1 No - lnc-C19orf18-1:1 No - lnc-C19orf18-2:1 Yes chr2R:14173693-14182838 lnc-C19orf18-2:2 Yes chr2R:14173693-14182838 lnc-ZSCAN1-3:6 Yes chr2R:14173693-14182838 lnc-ZNF606-1:1 No - lnc-ZSCAN18-3:1 No - lnc-ZSCAN1-2:1 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF329-4:1 No - lnc-ZNF329-1:1 Yes chr2R:14173693-14182838 lnc-ZNF274-4:1 Yes chr2R:14173693-14182838 lnc-ZNF329-1:2 Yes chr2R:14173693-14182838 lnc-ZNF274-3:1 No - lnc-ZNF274-2:1 No - lnc-ZNF329-2:1 No - lnc-ZNF329-3:1 No - lnc-ZNF544-2:1 No - lnc-ZNF274-1:1 No - lnc-ZNF274-1:3 No - lnc-ZNF274-1:4 No - lnc-A1BG-1:3 No - lnc-A1BG-1:2 No - lnc-ZNF8-5:1 No - lnc-A1BG-1:5 No - lnc-A1BG-1:4 No - lnc-A1BG-2:2 No - lnc-A1BG-2:1 No - lnc-A1BG-2:3 No - lnc-ERVK3-1-1:1 No - A1BG-AS1:9 No - lnc-ZNF497-1:3 No - lnc-RPS5-4:1 No - LINC02560:3 No - lnc-ZNF837-1:3 No - lnc-ZNF837-1:17 No - lnc-ZNF837-1:19 No - lnc-ZNF837-1:4 No - lnc-ZNF584-2:3 No - lnc-ZNF132-1:2 No - lnc-ZNF324B-1:1 No - lnc-ZNF324-2:1 No - lnc-SLC27A5-3:1 No - lnc-SLC27A5-2:1 No - lnc-ZBTB45-1:2 No - lnc-ZBTB45-3:1 No - lnc-ZBTB45-4:1 No - lnc-ZBTB45-4:3 No - lnc-ZBTB45-4:2 No - lnc-SLC27A5-1:2 No - lnc-ZBTB45-2:4 No - lnc-CHMP2A-1:2 Yes chr3L:8195847-8197987 lnc-CHMP2A-1:1 Yes chr3L:8195847-8197987 lnc-TRIM28-14:3 No - lnc-TRIM28-12:1 No - lnc-TRIM28-14:5 No - lnc-TRIM28-12:2 No - lnc-TRIM28-12:3 No - lnc-TRIM28-12:4 No - lnc-MZF1-1:2 No - lnc-MZF1-1:1 No - lnc-TRIM28-2:1 No - lnc-FAM110C-2:2 No - lnc-FAM110C-2:1 No - lnc-FAM110C-1:3 No - lnc-FAM110C-1:2 No - lnc-FAM110C-1:1 No - lnc-ACP1-12:1 No - lnc-SH3YL1-3:1 No - lnc-SH3YL1-1:17 No - lnc-SH3YL1-1:11 No - lnc-SH3YL1-1:16 No - lnc-SH3YL1-1:9 No - lnc-SH3YL1-1:8 No - lnc-ALKAL2-6:1 No - lnc-ALKAL2-4:1 No - lnc-SH3YL1-1:13 No - lnc-SH3YL1-1:1 No - lnc-SH3YL1-1:5 No - lnc-SH3YL1-1:4 No - lnc-SH3YL1-1:3 No - lnc-ACP1-10:1 No - lnc-SH3YL1-2:1 No - lnc-ACP1-1:4 No - lnc-ALKAL2-3:2 No - lnc-ALKAL2-3:1 No - lnc-ALKAL2-2:31 No - lnc-ALKAL2-2:12 No - lnc-ALKAL2-2:6 No - lnc-ALKAL2-2:35 No - lnc-ALKAL2-2:36 No - lnc-ALKAL2-2:30 No - lnc-ALKAL2-2:33 No - lnc-ALKAL2-2:37 No - lnc-ALKAL2-2:29 No - lnc-ALKAL2-2:27 No - lnc-ALKAL2-2:34 No - lnc-ALKAL2-2:20 No - lnc-ALKAL2-2:8 No - lnc-ALKAL2-2:22 No - lnc-ALKAL2-2:19 No - lnc-ACP1-11:1 No - lnc-ACP1-11:2 No - lnc-ALKAL2-2:1 No - lnc-ALKAL2-2:2 No - lnc-ALKAL2-2:13 No - lnc-ALKAL2-2:17 No - lnc-ALKAL2-2:9 No - lnc-ALKAL2-2:3 No - lnc-ALKAL2-2:10 No - lnc-ALKAL2-2:15 No - lnc-ALKAL2-2:4 No - lnc-ALKAL2-2:11 No - lnc-ALKAL2-2:5 No - lnc-ALKAL2-2:18 No - lnc-ALKAL2-2:14 No - lnc-ACP1-13:1 No - lnc-ACP1-14:1 No - lnc-ACP1-14:2 No - lnc-TMEM18-18:2 No - LINC01874:8 No - LINC01874:6 No - lnc-ACP1-15:1 No - lnc-TMEM18-16:1 No - lnc-ACP1-16:2 No - lnc-ACP1-9:4 No - lnc-ALKAL2-5:3 Yes chr2R:12436120-12436990 lnc-ALKAL2-5:2 Yes chr2R:12436120-12436990 lnc-ALKAL2-5:1 Yes chr2R:12436120-12436990 lnc-TMEM18-15:1 No - lnc-TMEM18-3:4 No - lnc-TMEM18-3:6 No - lnc-TMEM18-3:3 No - lnc-TMEM18-3:5 No - lnc-SNTG2-8:2 No - lnc-SNTG2-8:3 No - lnc-SNTG2-2:2 No - lnc-SNTG2-1:2 No - lnc-TMEM18-6:5 No - lnc-SNTG2-1:3 No - lnc-SNTG2-2:3 No - lnc-TMEM18-17:1 No - lnc-TMEM18-17:3 No - lnc-TMEM18-19:2 No - lnc-TMEM18-19:3 No - lnc-TMEM18-12:4 No - lnc-TMEM18-12:3 Yes chr2R:16552258-16558486 lnc-TMEM18-12:2 Yes chr2R:16552258-16558486 lnc-TMEM18-20:1 Yes chr2R:16552258-16558486 lnc-PXDN-7:1 Yes chr3R:17425768-17446499 lnc-PXDN-3:3 No - lnc-TPO-7:1 No - lnc-PXDN-5:1 No - lnc-PXDN-3:2 No - lnc-MYT1L-6:1 Yes chr3L:2601455-2630064 lnc-MYT1L-5:1 Yes chr3L:2601455-2630064 lnc-PXDN-6:1 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-TPO-9:1 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-PXDN-8:1 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-PXDN-10:2 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-PXDN-10:1 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-PXDN-12:1 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-PXDN-9:2 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-PXDN-9:1 Yes chrX:4075978-4092237 MYT1L-AS1:2 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-MYT1L-7:1 No - lnc-MYT1L-8:1 No - lnc-EIPR1-12:1 No - lnc-EIPR1-5:3 No - lnc-EIPR1-5:2 No - lnc-EIPR1-11:1 No - lnc-TRAPPC12-8:1 No - lnc-TRAPPC12-8:2 No - lnc-EIPR1-10:1 No - lnc-EIPR1-9:1 No - lnc-EIPR1-8:1 No - lnc-EIPR1-7:2 No - lnc-EIPR1-7:1 No - lnc-TRAPPC12-7:1 No - lnc-TRAPPC12-6:1 No - lnc-TRAPPC12-5:1 No - lnc-TRAPPC12-5:2 No - lnc-TRAPPC12-5:3 No - lnc-EIPR1-6:1 No - lnc-ADI1-4:1 Yes chr3L:12502467-12503894 lnc-ADI1-4:3 Yes chr3L:12502467-12503894 lnc-ADI1-4:2 Yes chr3L:12502467-12503894 lnc-RPS7-3:1 Yes chr3L:20786340-20788137 lnc-TRAPPC12-1:2 Yes chr3L:10663376-10664435 lnc-RNASEH1-1:7 Yes chr2R:7931054-7932380 lnc-ADI1-2:2 Yes chr2R:7931054-7932380 RNASEH1-AS1:1 Yes chr2R:7931054-7932380 RNASEH1-AS1:2 Yes chr2R:7931054-7932380 RNASEH1-AS1:3 Yes chr2R:7931054-7932380 RNASEH1-AS1:18 No - lnc-RNASEH1-7:2 No - lnc-RNASEH1-7:1 No - lnc-COLEC11-2:1 No - lnc-RNASEH1-8:1 No - lnc-ALLC-2:1 No - lnc-RNASEH1-9:1 No - lnc-RNASEH1-9:4 No - lnc-RNASEH1-9:2 No - lnc-RNASEH1-9:5 No - lnc-RNASEH1-9:6 No - LINC01304:5 No - LINC01304:20 No - LINC01304:16 No - LINC01304:17 No - lnc-DCDC2C-3:1 No - LINC01304:6 No - lnc-DCDC2C-4:1 No - lnc-DCDC2C-5:1 No - lnc-DCDC2C-6:1 No - lnc-RNASEH1-10:1 No - LINC01249:9 No - LINC01249:11 No - LINC01249:10 No - LINC01249:4 No - LINC01249:5 No - lnc-RNASEH1-11:1 No - lnc-CMPK2-33:1 No - lnc-CMPK2-32:1 No - lnc-CMPK2-31:1 No - lnc-CMPK2-34:2 No - lnc-CMPK2-34:3 No - lnc-SOX11-5:1 No - lnc-CMPK2-30:1 No - lnc-CMPK2-29:1 No - LINC01105:1 No - LINC01105:7 No - LINC01105:11 No - lnc-CMPK2-24:1 No - lnc-CMPK2-23:1 No - lnc-CMPK2-21:1 No - lnc-CMPK2-20:2 No - lnc-CMPK2-20:1 No - lnc-CMPK2-19:2 No - lnc-CMPK2-19:3 No - lnc-CMPK2-19:4 No - lnc-CMPK2-19:5 No - lnc-CMPK2-5:57 No - lnc-CMPK2-5:59 No - lnc-CMPK2-5:30 No - lnc-CMPK2-5:50 No - lnc-CMPK2-5:56 No - lnc-CMPK2-5:58 No - lnc-CMPK2-5:55 No - lnc-CMPK2-5:54 No - lnc-CMPK2-5:53 No - lnc-CMPK2-5:29 No - lnc-CMPK2-5:49 No - lnc-CMPK2-5:40 No - lnc-CMPK2-5:39 No - lnc-CMPK2-5:28 No - lnc-CMPK2-5:27 No - lnc-CMPK2-5:46 No - lnc-CMPK2-5:52 No - lnc-CMPK2-5:47 No - lnc-CMPK2-5:26 No - lnc-CMPK2-5:44 No - lnc-CMPK2-5:43 No - lnc-CMPK2-5:48 No - lnc-CMPK2-5:25 No - lnc-CMPK2-5:42 No - lnc-CMPK2-5:45 No - lnc-CMPK2-5:37 No - lnc-CMPK2-5:24 No - lnc-CMPK2-5:23 No - lnc-CMPK2-5:22 No - lnc-CMPK2-5:21 No - lnc-CMPK2-5:31 No - lnc-CMPK2-5:36 No - lnc-CMPK2-5:32 No - lnc-CMPK2-5:41 No - lnc-CMPK2-5:11 No - lnc-CMPK2-5:20 No - lnc-CMPK2-5:38 No - lnc-CMPK2-5:33 No - lnc-CMPK2-5:19 No - lnc-CMPK2-5:18 No - lnc-CMPK2-5:17 No - lnc-CMPK2-5:16 No - lnc-CMPK2-5:15 No - lnc-CMPK2-5:34 No - lnc-CMPK2-5:5 No - lnc-CMPK2-5:35 No - lnc-CMPK2-5:14 No - lnc-CMPK2-5:10 No - lnc-CMPK2-5:9 No - lnc-CMPK2-5:7 No - lnc-CMPK2-5:6 No - lnc-CMPK2-17:2 No - lnc-CMPK2-17:1 No - NRIR:3 No - lnc-RNF144A-4:1 No - RNF144A-AS1:5 Yes chr2R:10740054-10798709 RNF144A-AS1:10 Yes chr2R:10740054-10798709 RNF144A-AS1:11 Yes chr2R:10740054-10798709 RNF144A-AS1:15 No - RNF144A-AS1:14 No - RNF144A-AS1:16 No - RNF144A-AS1:9 Yes chr2R:10740054-10798709 RNF144A-AS1:13 No - RNF144A-AS1:12 Yes chr2R:10740054-10798709 lnc-CMPK2-6:4 Yes chr2R:10740054-10798709 lnc-CMPK2-6:3 Yes chr2R:10740054-10798709 lnc-CMPK2-6:5 Yes chr2R:10740054-10798709 lnc-CMPK2-18:1 No - lnc-CMPK2-22:1 No - lnc-RNF144A-2:7 No - lnc-RNF144A-2:8 No - lnc-RNF144A-2:9 No - lnc-RNF144A-2:10 No - lnc-CMPK2-26:1 No - lnc-RNF144A-8:2 No - lnc-RNF144A-9:1 No - LINC01871:8 No - LINC01871:12 No - lnc-CMPK2-27:1 No - lnc-RNF144A-10:1 No - lnc-KIDINS220-9:3 No - lnc-KIDINS220-9:2 No - lnc-ID2-9:1 No - lnc-KIDINS220-8:3 No - lnc-KIDINS220-19:1 No - LINC00298:6 No - LINC00299:6 No - lnc-ID2-8:2 No - lnc-ID2-7:1 No - lnc-ID2-6:1 No - lnc-ID2-2:2 No - lnc-ID2-2:3 No - LINC00299:7 No - LINC00299:3 No - lnc-KIDINS220-18:1 No - lnc-KIDINS220-17:1 No - lnc-KIDINS220-16:1 No - lnc-KIDINS220-16:3 No - lnc-KIDINS220-14:1 No - lnc-ID2-3:1 No - lnc-KIDINS220-12:1 No - ID2-AS1:10 No - ID2-AS1:11 No - ID2-AS1:8 No - lnc-MBOAT2-10:1 Yes chr2R:21295652-21310411 lnc-MBOAT2-5:1 Yes chr2R:21295652-21310411 lnc-MBOAT2-2:1 Yes chr2R:10034595-10048619 lnc-KIDINS220-11:2 Yes chr2R:10034595-10048619 lnc-KIDINS220-11:3 Yes chr2R:10034595-10048619 lnc-KIDINS220-11:1 Yes chr2R:10034595-10048619 lnc-KIDINS220-13:1 Yes chr2R:10034595-10048619 lnc-MBOAT2-3:1 No - lnc-MBOAT2-6:1 No - lnc-ASAP2-4:3 No - lnc-MBOAT2-1:2 No - lnc-ASAP2-2:2 No - lnc-ASAP2-2:3 No - lnc-ASAP2-2:4 No - lnc-ITGB1BP1-3:1 Yes chr2R:8114286-8123001 lnc-ITGB1BP1-2:1 Yes chr2R:8114286-8123001 lnc-ADAM17-3:1 No - lnc-ADAM17-3:2 No - lnc-ADAM17-1:1 No - lnc-IAH1-2:7 No - lnc-ADAM17-2:1 Yes chr2R:10099677-10109687 lnc-IAH1-3:2 No - lnc-TAF1B-2:1 No - lnc-CYS1-1:17 No - lnc-CYS1-1:4 Yes chr2L:476446-479688 lnc-CYS1-1:2 Yes chr2L:476446-479688 lnc-CYS1-1:3 Yes chr2L:476446-479688 lnc-CYS1-4:1 No - lnc-CYS1-7:1 Yes chr2R:11983145-11985393 lnc-HPCAL1-4:1 No - lnc-ODC1-2:1 No - lnc-HPCAL1-3:1 No - lnc-NOL10-3:1 Yes chr2R:8007246-8009062 lnc-HPCAL1-1:14 No - lnc-HPCAL1-1:15 No - lnc-HPCAL1-1:16 No - lnc-HPCAL1-1:17 No - lnc-HPCAL1-2:2 No - lnc-PDIA6-3:1 Yes chr2L:14352594-14355085 lnc-ATP6V1C2-5:2 No - lnc-ATP6V1C2-3:1 No - lnc-NOL10-2:1 Yes chr2L:16354886-16356735 lnc-PDIA6-2:1 No - LINC01954:17 No - LINC01954:18 No - lnc-KCNF1-1:1 No - lnc-C2orf50-2:1 No - lnc-ROCK2-3:9 No - lnc-ROCK2-3:14 No - lnc-ROCK2-3:13 No - lnc-ROCK2-3:8 No - lnc-ROCK2-3:11 No - lnc-ROCK2-3:7 No - lnc-ROCK2-3:12 No - lnc-ROCK2-3:10 No - lnc-E2F6-5:1 No - lnc-E2F6-4:1 No - lnc-E2F6-2:1 No - lnc-E2F6-1:1 No - lnc-PQLC3-3:1 No - lnc-PQLC3-3:2 No - lnc-PQLC3-3:3 No - lnc-PQLC3-3:4 No - lnc-GREB1-15:1 No - lnc-ROCK2-1:2 No - lnc-ROCK2-4:1 No - lnc-ROCK2-7:3 Yes chr3R:21620304-21660871 lnc-ROCK2-9:1 Yes chr3R:21620304-21660871 lnc-LPIN1-5:1 No - lnc-LPIN1-4:1 No - lnc-LPIN1-4:3 No - lnc-NTSR2-6:2 No - lnc-E2F6-3:1 No - lnc-NTSR2-1:3 Yes chr2R:8136986-8156654 lnc-NTSR2-1:2 Yes chr2R:8136986-8156654 lnc-LPIN1-10:1 Yes chr2R:8136986-8156654 lnc-LPIN1-10:2 Yes chr2R:8136986-8156654 lnc-LPIN1-2:1 No - MIR3681HG:3 No - lnc-LPIN1-3:1 No - lnc-LPIN1-10:3 No - lnc-LPIN1-10:4 No - lnc-LPIN1-10:5 No - lnc-LPIN1-6:1 No - lnc-LPIN1-10:6 No - lnc-LPIN1-10:7 No - MIR3681HG:12 No - MIR3681HG:33 No - MIR3681HG:34 No - MIR3681HG:35 No - MIR3681HG:36 No - lnc-TRIB2-7:1 No - lnc-LPIN1-7:2 Yes chr3L:20396288-20401609 lnc-NTSR2-5:9 No - lnc-TRIB2-3:4 No - lnc-TRIB2-4:2 No - lnc-TRIB2-13:1 No - lnc-TRIB2-14:1 No - lnc-NBAS-18:1 No - lnc-TRIB2-15:1 No - lnc-NBAS-17:1 No - lnc-FAM84A-5:1 No - lnc-NBAS-18:3 No - lnc-FAM84A-3:2 No - lnc-FAM84A-3:3 No - lnc-NBAS-16:1 No - lnc-DDX1-8:1 No - lnc-NBAS-15:1 No - lnc-DDX1-7:1 No - lnc-NBAS-11:1 No - lnc-FAM84A-4:1 No - lnc-FAM49A-9:1 No - lnc-DDX1-6:2 No - lnc-DDX1-5:1 No - lnc-NBAS-8:1 Yes chr3L:22263369-22266017 LINC01804:9 No - lnc-NBAS-9:1 No - lnc-DDX1-9:1 No - lnc-MYCN-8:1 No - lnc-MYCN-8:2 No - lnc-NBAS-13:1 Yes chrX:3373159-3391697 MYCNOS:8 No - lnc-NBAS-12:1 No - lnc-MYCN-7:1 No - lnc-MYCN-7:2 No - lnc-NBAS-5:2 No - lnc-NBAS-14:1 No - lnc-NBAS-14:2 No - lnc-FAM49A-5:3 No - lnc-MYCN-10:1 No - lnc-MYCN-11:1 No - lnc-FAM49A-8:1 No - lnc-FAM49A-7:1 No - lnc-MYCN-12:1 No - lnc-MYCN-12:2 No - lnc-MYCN-13:1 No - lnc-MYCN-13:2 No - lnc-RAD51AP2-3:1 Yes chr3L:10640286-10661013 lnc-MYCN-14:1 Yes chr3L:10640286-10661013 lnc-MYCN-14:2 Yes chr3L:10640286-10661013 lnc-VSNL1-7:1 No - lnc-FAM49A-6:1 No - lnc-RAD51AP2-2:1 No - lnc-VSNL1-6:1 No - lnc-VSNL1-5:1 No - lnc-GEN1-1:1 No - lnc-SMC6-1:1 No - lnc-RAD51AP2-1:1 Yes chr3R:24189050-24193423 lnc-KCNS3-3:2 Yes chr3L:2895017-2959579 lnc-KCNS3-3:3 Yes chr3L:2895017-2959579 lnc-SMC6-2:1 Yes chr3L:2895017-2959579 lnc-MSGN1-4:1 Yes chr3L:2895017-2959579 lnc-KCNS3-3:4 Yes chr3L:2895017-2959579 lnc-KCNS3-5:1 No - lnc-NT5C1B-RDH14-1:1 No - lnc-KCNS3-6:1 No - lnc-OSR1-6:4 No - lnc-OSR1-6:2 No - lnc-OSR1-6:3 No - lnc-KCNS3-7:1 No - lnc-KCNS3-8:1 No - lnc-KCNS3-9:1 No - LINC01376:13 No - LINC01376:12 No - lnc-KCNS3-10:1 No - LINC01376:1 No - lnc-TTC32-2:1 Yes chr2L:3578013-3580769 LINC01808:10 No - LINC01808:14 No - lnc-RHOB-20:2 No - lnc-RHOB-5:2 No - lnc-RHOB-19:1 No - lnc-RHOB-19:3 No - lnc-RHOB-19:4 No - lnc-RHOB-19:5 No - lnc-RHOB-18:1 No - LINC00954:2 No - lnc-TTC32-1:1 No - lnc-MATN3-2:1 Yes chr3L:1730993-1735767 lnc-MATN3-1:1 Yes chr3L:1730993-1735767 lnc-RHOB-3:3 No - lnc-RHOB-3:4 No - lnc-WDR35-1:1 No - lnc-RHOB-2:2 No - lnc-RHOB-14:1 No - lnc-RHOB-13:1 No - lnc-RHOB-12:1 No - lnc-SDC1-1:1 No - lnc-RHOB-11:1 No - lnc-PUM2-3:1 Yes chr2R:21392402-21481176 lnc-PUM2-2:1 No - lnc-SDC1-2:1 Yes chr3R:9066343-9237682 lnc-RHOB-10:1 Yes chr3R:9066343-9237682 lnc-RHOB-9:1 No - lnc-RHOB-8:1 No - lnc-RHOB-7:1 No - lnc-RHOB-1:2 No - lnc-GDF7-4:1 No - lnc-LDAH-6:1 No - lnc-LDAH-5:1 No - lnc-LDAH-4:1 No - lnc-LDAH-3:1 No - lnc-GDF7-3:1 Yes chr3L:1311719-1313377 lnc-APOB-1:2 No - lnc-LDAH-7:1 Yes chr4:1060969-1077273 lnc-LDAH-8:1 Yes chr4:1060969-1077273 lnc-TDRD15-2:3 No - lnc-TDRD15-6:1 Yes chr3R:18591027-18650137 lnc-TDRD15-6:2 No - lnc-TDRD15-1:1 No - lnc-APOB-2:2 No - lnc-APOB-10:1 No - lnc-TDRD15-8:1 No - lnc-APOB-11:1 No - lnc-TDRD15-8:2 No - lnc-TDRD15-8:4 No - lnc-APOB-12:1 No - lnc-TDRD15-3:3 No - lnc-APOB-13:4 No - lnc-APOB-13:1 No - lnc-APOB-13:3 No - lnc-APOB-14:1 No - lnc-APOB-5:5 No - lnc-APOB-5:4 No - lnc-APOB-5:3 No - LINC01822:4 No - lnc-APOB-15:1 No - lnc-TDRD15-10:1 No - LINC01830:9 No - lnc-TDRD15-11:1 No - lnc-KLHL29-8:1 No - lnc-KLHL29-7:2 No - LINC01884:6 No - lnc-KLHL29-6:1 No - lnc-ATAD2B-14:2 No - lnc-ATAD2B-14:4 No - lnc-ATAD2B-14:1 No - lnc-ATAD2B-12:2 No - lnc-ATAD2B-12:3 No - lnc-KLHL29-5:1 No - lnc-ATAD2B-11:1 No - lnc-KLHL29-4:1 No - lnc-ATAD2B-8:1 No - lnc-ATAD2B-10:1 No - lnc-ATAD2B-9:1 No - lnc-ATAD2B-9:2 No - lnc-ATAD2B-6:1 No - lnc-ATAD2B-7:3 No - lnc-WDCP-8:1 No - lnc-WDCP-3:1 No - lnc-WDCP-2:1 No - lnc-MFSD2B-2:1 No - lnc-WDCP-1:1 No - lnc-TP53I3-2:1 Yes chr3L:6192124-6193179 lnc-TP53I3-1:1 No - lnc-TP53I3-3:1 No - lnc-PFN4-1:1 Yes chr2L:21134439-21142347 lnc-PFN4-2:1 Yes chr2L:21134439-21142347 lnc-FAM228A-2:1 Yes chr2L:21134439-21142347 lnc-NCOA1-2:1 No - lnc-NCOA1-2:2 No - lnc-ITSN2-3:1 No - lnc-ADCY3-1:4 Yes chr3R:16573179-16573752 lnc-ADCY3-1:5 Yes chr3R:16573179-16573752 lnc-ADCY3-1:3 Yes chr3R:16573179-16573752 lnc-ADCY3-1:1 Yes chr3R:16573179-16573752 lnc-ADCY3-1:2 Yes chr3R:16573179-16573752 lnc-PTRHD1-1:1 No - lnc-ADCY3-3:3 No - lnc-ADCY3-3:2 No - lnc-ADCY3-3:1 No - lnc-ADCY3-2:1 No - DNAJC27-AS1:3 No - DNAJC27-AS1:5 No - lnc-CENPO-4:1 Yes chr2R:8729502-8734304 lnc-CENPO-4:2 Yes chr2R:8729502-8734304 lnc-DNMT3A-4:1 No - lnc-EFR3B-5:1 No - lnc-DNMT3A-2:1 No - lnc-POMC-2:1 No - lnc-EFR3B-6:1 No - lnc-DTNB-1:3 No - lnc-DNMT3A-3:1 Yes chr2R:12437345-12452916 lnc-DNMT3A-3:2 Yes chr2R:12437345-12452916 lnc-DNMT3A-5:1 Yes chr2R:12437345-12452916 lnc-DNMT3A-5:2 Yes chr2R:12437345-12452916 lnc-DNMT3A-6:2 Yes chr2R:12437345-12452916 lnc-DNMT3A-6:1 Yes chr2R:12437345-12452916 lnc-ASXL2-6:1 Yes chr2R:12437345-12452916 lnc-ASXL2-7:1 Yes chr2R:12437345-12452916 lnc-ASXL2-3:2 No - lnc-KIF3C-1:1 Yes chr2R:14503958-14512493 lnc-RAB10-4:1 Yes chr2R:14503958-14512493 lnc-ASXL2-2:1 No - lnc-RAB10-2:1 No - lnc-HADHA-3:1 Yes chrX:20251338-20254691 lnc-HADHA-2:1 No - lnc-GAREM2-2:1 No - lnc-HADHA-1:1 No - lnc-ADGRF3-3:1 Yes chr2L:9573563-9576769 lnc-ADGRF3-2:1 Yes chr2L:9573563-9576769 lnc-HADHA-5:1 No - lnc-HADHA-4:1 No - lnc-ADGRF3-1:1 No - lnc-ADGRF3-4:1 Yes chr3L:8905918-8912671 lnc-CIB4-3:1 Yes chr3L:8905918-8912671 lnc-CIB4-2:2 No - lnc-CIB4-2:1 No - lnc-SLC35F6-1:1 Yes chr3R:9410329-9412293 lnc-OST4-8:1 No - lnc-OST4-2:5 Yes chr2L:4149279-4151203 lnc-OST4-6:1 No - lnc-CGREF1-2:1 No - lnc-CGREF1-1:1 No - lnc-PREB-1:1 No - lnc-PRR30-1:1 Yes chr2L:6096698-6098966 lnc-PRR30-1:2 Yes chr2L:6096698-6098966 lnc-PRR30-2:1 No - lnc-SLC5A6-1:3 Yes chr2R:20271653-20274499 lnc-SLC30A3-2:1 Yes chr2R:20271653-20274499 lnc-SLC5A6-2:1 Yes chr2L:12164241-12166704 lnc-SLC5A6-3:1 Yes chr2L:12164241-12166704 lnc-UCN-2:1 Yes chr4:1028675-1029361 lnc-GTF3C2-1:1 Yes chr4:1028675-1029361 lnc-GTF3C2-1:2 Yes chr4:1028675-1029361 lnc-MPV17-1:1 No - lnc-MPV17-1:2 No - lnc-SNX17-1:4 No - lnc-PPM1G-1:1 Yes chr3R:8690980-8697822 lnc-ZNF513-1:2 Yes chr2R:5360331-5363104 lnc-NRBP1-2:1 No - lnc-PPM1G-2:1 No - lnc-KRTCAP3-2:1 Yes chr3L:2229646-2235253 lnc-FNDC4-1:1 Yes chr3L:2229646-2235253 lnc-IFT172-1:1 No - lnc-GCKR-1:1 No - lnc-MRPL33-1:2 No - lnc-MRPL33-1:10 No - lnc-MRPL33-1:11 No - lnc-MRPL33-1:12 No - BRE-AS1:1 No - lnc-RBKS-4:1 No - lnc-RBKS-5:1 No - lnc-MRPL33-2:1 No - lnc-RBKS-7:1 No - lnc-FOSL2-4:1 No - lnc-FOSL2-2:1 No - lnc-BABAM2-2:1 Yes chr3R:29765995-29794113 lnc-FOSL2-3:1 No - lnc-TRMT61B-3:2 No - lnc-PLB1-1:1 No - lnc-TRMT61B-7:1 Yes chr2L:5746157-5747961 lnc-TRMT61B-7:3 Yes chr2L:5746157-5747961 lnc-TRMT61B-7:4 Yes chr2L:5746157-5747961 lnc-TRMT61B-1:11 No - lnc-TRMT61B-1:9 No - lnc-PPP1CB-1:1 No - lnc-TRMT61B-1:10 No - lnc-TRMT61B-1:8 No - lnc-TRMT61B-1:7 No - lnc-C2orf71-3:2 No - lnc-C2orf71-3:1 No - lnc-C2orf71-2:1 No - lnc-TOGARAM2-1:1 No - lnc-C2orf71-4:1 Yes chr2R:16625293-16640011 lnc-CLIP4-3:1 Yes chr2R:16625293-16640011 lnc-CLIP4-3:2 Yes chr2R:16625293-16640011 lnc-CLIP4-3:3 Yes chr2R:16625293-16640011 lnc-CLIP4-3:4 Yes chr2R:16625293-16640011 lnc-C2orf71-56:1 Yes chr2R:16625293-16640011 lnc-CLIP4-2:1 Yes chr2R:16625293-16640011 lnc-C2orf71-6:1 Yes chr2R:16625293-16640011 lnc-YPEL5-6:1 Yes chr2R:16625293-16640011 lnc-YPEL5-4:1 No - lnc-ALK-1:5 No - lnc-ALK-1:4 No - lnc-LBH-5:3 Yes chrX:13385914-13387417 lnc-ALK-4:1 No - lnc-LBH-4:1 No - lnc-LBH-3:1 No - lnc-YPEL5-5:1 No - LINC01936:18 No - LINC01936:29 No - lnc-CAPN13-3:1 No - lnc-LCLAT1-3:1 No - lnc-GALNT14-2:1 Yes chr3L:9888762-9893319 lnc-GALNT14-1:1 Yes chr3L:9888762-9893319 lnc-CAPN14-2:4 Yes chr2L:3404460-3426719 lnc-CAPN14-2:5 Yes chr2L:3404460-3426719 lnc-EHD3-2:2 Yes chr2L:3404460-3426719 lnc-CAPN14-2:2 Yes chr2L:3404460-3426719 lnc-CAPN14-2:1 Yes chr2L:3404460-3426719 lnc-EHD3-4:1 No - lnc-SRD5A2-1:1 Yes chr3R:13032528-13038020 lnc-SRD5A2-3:3 No - lnc-SRD5A2-3:8 No - lnc-SRD5A2-3:9 No - lnc-EHD3-6:1 No - lnc-EHD3-7:1 No - lnc-EHD3-8:1 No - lnc-EHD3-9:1 No - lnc-SRD5A2-5:1 No - lnc-SRD5A2-3:2 No - lnc-MEMO1-3:2 No - lnc-MEMO1-4:1 Yes chr3R:13008384-13011310 lnc-MEMO1-1:4 No - lnc-MEMO1-1:3 No - lnc-MEMO1-1:2 No - lnc-MEMO1-1:1 No - lnc-MEMO1-2:1 Yes chr2L:10732653-10733307 lnc-SPAST-2:1 Yes chr2L:10732653-10733307 lnc-NLRC4-3:2 No - lnc-SPAST-1:1 No - lnc-NLRC4-4:1 Yes chr3R:10312039-10331353 lnc-BIRC6-3:1 Yes chr3L:17909483-17912565 lnc-BIRC6-3:2 Yes chr3L:17909483-17912565 lnc-BIRC6-3:3 Yes chr3L:17909483-17912565 lnc-LTBP1-4:2 Yes chr3L:17909483-17912565 LINC00486:11 No - LINC00486:15 No - LINC00486:16 No - LINC00486:19 No - lnc-FAM98A-6:1 Yes chr2L:4477462-4614300 lnc-LTBP1-1:1 No - lnc-LTBP1-1:2 No - lnc-LTBP1-1:5 No - lnc-RASGRP3-9:1 No - lnc-RASGRP3-6:1 No - lnc-RASGRP3-7:1 No - lnc-RASGRP3-8:1 No - lnc-RASGRP3-10:1 No - lnc-RASGRP3-12:1 No - LINC01318:1 No - lnc-RASGRP3-13:1 No - LINC01317:4 No - lnc-RASGRP3-14:1 No - lnc-FAM98A-7:1 No - lnc-RASGRP3-14:3 No - lnc-RASGRP3-15:1 No - LINC01320:1 No - LINC01320:5 No - LINC01320:6 No - LINC01320:17 No - LINC01320:20 No - LINC01320:22 No - LINC01320:23 No - LINC01320:24 No - lnc-FAM98A-10:1 No - lnc-CRIM1-1:2 No - lnc-CRIM1-1:3 No - lnc-CRIM1-1:4 No - lnc-CRIM1-1:5 No - lnc-CRIM1-1:6 No - lnc-CRIM1-1:7 No - lnc-FAM98A-11:1 No - lnc-CRIM1-1:8 No - lnc-CRIM1-1:9 No - lnc-CRIM1-1:10 No - lnc-FEZ2-10:1 No - lnc-CRIM1-3:1 No - lnc-FEZ2-9:1 No - lnc-FEZ2-8:1 No - lnc-FEZ2-7:1 No - lnc-FEZ2-7:2 No - lnc-VIT-1:1 No - lnc-STRN-2:2 Yes chrX:2080610-2093948 lnc-STRN-2:1 Yes chrX:2080610-2093948 lnc-STRN-2:3 Yes chrX:2080610-2093948 lnc-STRN-4:1 Yes chrX:2080610-2093948 lnc-FEZ2-1:1 No - lnc-CRIM1-2:1 No - lnc-STRN-1:1 Yes chr2L:8030721-8040826 lnc-EIF2AK2-1:1 Yes chr3R:8016210-8030790 lnc-HEATR5B-1:2 No - lnc-HEATR5B-1:1 No - lnc-CEBPZOS-4:1 No - lnc-CEBPZOS-2:2 No - lnc-CEBPZ-2:1 No - lnc-CEBPZ-1:1 No - lnc-CEBPZ-3:1 Yes chr3R:18303279-18314407 lnc-CEBPZ-4:1 Yes chr3R:18303279-18314407 lnc-CEBPZ-5:1 Yes chr3R:18303279-18314407 lnc-QPCT-1:4 No - lnc-CDC42EP3-4:1 No - lnc-QPCT-4:1 No - lnc-RMDN2-3:5 No - lnc-RMDN2-3:23 No - lnc-RMDN2-11:1 No - lnc-RMDN2-11:2 No - lnc-CYP1B1-7:3 No - lnc-CYP1B1-7:2 No - lnc-PRKD3-2:1 No - lnc-CYP1B1-7:1 No - lnc-CDC42EP3-2:1 No - lnc-CDC42EP3-3:1 No - lnc-RMDN2-6:1 No - lnc-RMDN2-5:1 No - RMDN2-AS1:5 No - RMDN2-AS1:8 No - RMDN2-AS1:1 No - CYP1B1-AS1:8 Yes chr3L:5590083-5592571 CYP1B1-AS1:22 Yes chr3L:5590083-5592571 CYP1B1-AS1:25 No - lnc-CYP1B1-3:1 No - CYP1B1-AS1:33 No - lnc-CYP1B1-4:1 No - CYP1B1-AS1:53 No - lnc-RMDN2-9:2 No - lnc-HNRNPLL-8:2 Yes chr3R:24625671-24634714 lnc-HNRNPLL-8:1 Yes chr3R:24625671-24634714 lnc-GALM-3:2 No - LINC01883:6 No - LINC01883:8 No - lnc-HNRNPLL-6:1 No - lnc-HNRNPLL-5:2 No - lnc-HNRNPLL-5:1 No - lnc-HNRNPLL-4:1 Yes chr2R:19517864-19631508 lnc-SRSF7-5:1 Yes chr2R:19517864-19631508 lnc-HNRNPLL-3:1 Yes chr2R:19517864-19631508 lnc-DHX57-3:2 Yes chrX:13380166-13384877 lnc-DHX57-3:1 Yes chrX:13380166-13384877 lnc-GALM-4:1 No - lnc-SRSF7-1:1 Yes chrX:10894747-10899302 lnc-GEMIN6-1:1 Yes chrX:10894747-10899302 lnc-GEMIN6-1:2 Yes chrX:10894747-10899302 lnc-GEMIN6-1:3 Yes chrX:10894747-10899302 lnc-GEMIN6-1:5 Yes chrX:10894747-10899302 lnc-SRSF7-4:1 Yes chrX:10894747-10899302 lnc-SOS1-3:1 No - lnc-SOS1-2:1 No - lnc-SOS1-1:1 No - lnc-DHX57-4:1 Yes chr2L:13813816-13819824 SOS1-IT1:2 Yes chr2L:13813816-13819824 lnc-DHX57-5:1 Yes chr2L:13813816-13819824 lnc-DHX57-6:1 Yes chr2L:13813816-13819824 lnc-DHX57-7:1 Yes chr2L:13813816-13819824 lnc-CDKL4-5:1 Yes chr2L:13813816-13819824 lnc-MAP4K3-1:1 No - lnc-CDKL4-1:2 No - lnc-CDKL4-1:1 No - lnc-CDKL4-2:1 No - lnc-CDKL4-4:2 No - lnc-CDKL4-4:1 No - lnc-TMEM178A-1:3 No - lnc-TMEM178A-1:18 No - lnc-TMEM178A-1:19 No - lnc-TMEM178A-1:20 No - lnc-TMEM178A-1:21 No - lnc-TMEM178A-1:22 No - lnc-TMEM178A-1:23 No - lnc-MAP4K3-2:1 No - lnc-TMEM178A-1:30 No - lnc-TMEM178A-1:31 No - lnc-TMEM178A-1:35 No - lnc-THUMPD2-1:1 No - lnc-TMEM178A-1:36 No - lnc-MAP4K3-3:3 No - lnc-SLC8A1-4:1 No - SLC8A1-AS1:6 No - SLC8A1-AS1:10 No - SLC8A1-AS1:13 No - SLC8A1-AS1:14 No - SLC8A1-AS1:20 No - SLC8A1-AS1:22 No - SLC8A1-AS1:23 No - SLC8A1-AS1:24 No - SLC8A1-AS1:25 No - lnc-THUMPD2-2:1 No - SLC8A1-AS1:33 No - lnc-TMEM178A-5:1 No - lnc-TMEM178A-6:8 No - lnc-TMEM178A-7:1 No - lnc-C2orf91-8:1 No - lnc-PKDCC-8:1 No - lnc-PKDCC-8:3 No - lnc-C2orf91-7:3 No - lnc-C2orf91-7:2 No - lnc-C2orf91-6:1 No - LINC01913:14 No - lnc-PKDCC-5:1 No - LINC01914:12 No - lnc-C2orf91-5:1 No - lnc-EML4-2:1 No - lnc-COX7A2L-3:1 Yes chr3L:14903805-14942907 lnc-PKDCC-6:1 Yes chr3L:14903805-14942907 lnc-MTA3-7:2 Yes chr3L:14903805-14942907 lnc-EML4-1:1 No - lnc-KCNG3-4:1 No - lnc-EML4-3:1 No - lnc-COX7A2L-2:1 Yes chr3L:2895017-2959579 lnc-MTA3-4:1 Yes chr3L:2895017-2959579 lnc-KCNG3-3:1 No - lnc-EML4-5:1 No - lnc-MTA3-5:1 No - lnc-MTA3-5:2 No - lnc-MTA3-6:1 No - lnc-HAAO-2:2 No - lnc-MTA3-8:1 No - lnc-HAAO-3:2 No - lnc-HAAO-3:1 No - lnc-HAAO-3:3 No - lnc-HAAO-4:1 No - lnc-HAAO-5:1 No - lnc-HAAO-6:1 No - lnc-HAAO-7:1 No - LINC01819:15 No - lnc-ZFP36L2-6:1 No - lnc-MTA3-11:1 No - lnc-MTA3-12:1 No - LINC01126:5 No - lnc-ZFP36L2-2:8 Yes chrX:19859743-19865524 lnc-ZFP36L2-3:5 Yes chrX:19859743-19865524 lnc-ZFP36L2-3:6 Yes chrX:19859743-19865524 lnc-ZFP36L2-3:4 Yes chrX:19859743-19865524 lnc-ZFP36L2-3:3 Yes chrX:19859743-19865524 lnc-ZFP36L2-3:2 Yes chrX:19859743-19865524 lnc-ZFP36L2-3:1 Yes chrX:19859743-19865524 lnc-C1GALT1C1L-5:1 Yes chrX:808217-927975 lnc-ABCG5-3:1 No - lnc-ABCG5-4:1 Yes chr2L:18449517-18454587 lnc-ABCG5-5:1 Yes chr2L:18449517-18454587 lnc-ABCG8-1:1 Yes chr2L:18449517-18454587 lnc-LRPPRC-2:1 No - lnc-PPM1B-1:1 No - lnc-PREPL-3:2 No - lnc-PREPL-3:1 No - lnc-LRPPRC-4:1 Yes chr2L:21974749-21992933 lnc-LRPPRC-4:2 Yes chr2L:21974749-21992933 lnc-SLC3A1-3:1 Yes chr2L:20385293-20414800 lnc-SIX2-7:3 No - lnc-SIX2-7:1 No - lnc-SIX2-7:2 No - lnc-SIX2-7:4 No - lnc-CAMKMT-1:1 No - lnc-SIX2-6:1 No - lnc-CAMKMT-2:1 No - lnc-CAMKMT-3:1 No - lnc-SIX2-5:1 No - LINC01833:29 No - SIX3-AS1:6 No - SIX3-AS1:7 No - SIX3-AS1:1 Yes chr2R:8031283-8042529 SIX3-AS1:3 Yes chr2R:8031283-8042529 SIX3-AS1:2 Yes chr2R:8031283-8042529 lnc-SIX3-1:3 No - lnc-SIX3-4:1 No - LINC01121:5 No - lnc-SRBD1-3:2 No - lnc-PRKCE-1:2 No - lnc-SIX2-8:2 Yes chr3R:22608670-22613656 lnc-SIX2-8:1 Yes chr3R:22608670-22613656 lnc-SIX2-9:1 Yes chr3R:22608670-22613656 lnc-SRBD1-5:1 Yes chr3R:22608670-22613656 lnc-SRBD1-1:2 No - lnc-PRKCE-2:1 No - lnc-EPAS1-3:4 Yes chr3R:29039156-29049148 lnc-EPAS1-3:5 Yes chr3R:29039156-29049148 lnc-EPAS1-3:7 Yes chr3R:29039156-29049148 lnc-SRBD1-6:1 Yes chr3R:29039156-29049148 lnc-ATP6V1E2-10:2 No - lnc-ATP6V1E2-9:1 No - LINC01820:21 No - LINC01820:22 No - LINC02583:21 No - LINC02583:33 No - LINC02583:37 No - lnc-ATP6V1E2-6:1 No - lnc-ATP6V1E2-5:1 No - lnc-PIGF-3:4 Yes chr3R:5591763-5595356 lnc-ATP6V1E2-5:5 Yes chr3R:5591763-5595356 lnc-ATP6V1E2-5:4 Yes chr3R:5591763-5595356 lnc-ATP6V1E2-5:2 No - lnc-RHOQ-2:1 Yes chr3R:5591763-5595356 lnc-ATP6V1E2-5:3 Yes chr3R:5591763-5595356 lnc-PIGF-1:2 No - lnc-ATP6V1E2-8:1 No - lnc-ATP6V1E2-8:3 No - lnc-ATP6V1E2-8:2 No - lnc-CRIPT-1:3 No - lnc-CRIPT-1:4 No - lnc-SOCS5-3:1 No - lnc-PIGF-4:1 No - lnc-SOCS5-4:4 No - lnc-SOCS5-4:12 No - lnc-SOCS5-4:14 No - lnc-STPG4-10:4 Yes chr3R:20819129-20821848 lnc-STPG4-10:3 No - lnc-STPG4-3:10 No - lnc-STPG4-3:12 No - lnc-STPG4-3:9 No - lnc-STPG4-3:11 No - lnc-TTC7A-2:1 No - lnc-TTC7A-2:3 No - lnc-STPG4-3:8 No - lnc-EPCAM-5:1 No - lnc-EPCAM-2:3 No - lnc-CALM2-7:1 No - lnc-CALM2-8:1 No - lnc-CALM2-9:1 No - lnc-CALM2-2:6 No - lnc-EPCAM-8:1 No - lnc-CALM2-2:9 No - lnc-KCNK12-3:1 No - lnc-KCNK12-1:2 Yes chr2L:14362069-14366840 lnc-KCNK12-2:1 Yes chr2L:14362069-14366840 lnc-EPCAM-3:7 Yes chr2L:14362069-14366840 lnc-MSH2-5:1 No - lnc-FBXO11-4:1 No - lnc-FBXO11-3:1 Yes chr3L:15154233-15158562 lnc-MSH2-1:3 Yes chr3L:15154233-15158562 lnc-FBXO11-6:1 No - lnc-KCNK12-4:1 No - lnc-KCNK12-5:2 No - lnc-KCNK12-5:1 No - lnc-KCNK12-6:1 Yes chr3R:9803486-9809368 lnc-MSH6-3:1 Yes chr3R:9803486-9809368 lnc-MSH6-4:1 Yes chr3R:9803486-9809368 lnc-MSH6-2:5 No - lnc-FBXO11-2:1 No - lnc-FBXO11-1:2 No - lnc-FBXO11-1:3 No - lnc-FOXN2-6:1 No - lnc-FBXO11-5:1 No - lnc-FOXN2-5:1 No - lnc-FOXN2-4:1 No - lnc-FOXN2-3:1 No - lnc-FBXO11-8:1 No - lnc-FOXN2-2:1 No - lnc-LHCGR-2:1 Yes chr3R:24528047-24529815 lnc-STON1-1:1 No - lnc-STON1-1:2 No - lnc-LHCGR-1:1 Yes chrX:22980722-23004648 lnc-LHCGR-1:2 Yes chrX:22980722-23004648 lnc-FSHR-2:1 Yes chrX:22980722-23004648 lnc-STON1-GTF2A1L-2:1 No - lnc-FSHR-1:1 No - lnc-STON1-GTF2A1L-3:1 No - lnc-FSHR-3:1 Yes chr3R:22468512-22486969 lnc-FSHR-4:1 Yes chr3R:22468512-22486969 lnc-STON1-GTF2A1L-4:1 Yes chr3R:22468512-22486969 lnc-FSHR-5:1 Yes chr3R:22468512-22486969 lnc-FSHR-7:2 Yes chr3R:22468512-22486969 lnc-CHAC2-12:1 No - lnc-NRXN1-5:1 No - lnc-CHAC2-11:1 No - lnc-CHAC2-10:1 No - lnc-NRXN1-11:1 No - lnc-ASB3-10:1 No - lnc-CHAC2-9:1 No - lnc-CHAC2-8:1 No - lnc-CHAC2-7:1 No - lnc-CHAC2-6:1 No - lnc-GPR75-ASB3-3:2 No - lnc-GPR75-ASB3-3:1 No - lnc-GPR75-ASB3-4:1 No - lnc-GPR75-3:1 No - lnc-ASB3-2:4 No - lnc-ASB3-2:5 No - lnc-ASB3-2:2 No - lnc-ASB3-2:3 No - lnc-ASB3-2:6 No - lnc-GPR75-ASB3-1:2 No - lnc-GPR75-ASB3-1:1 No - lnc-GPR75-ASB3-5:1 No - lnc-GPR75-ASB3-6:1 No - lnc-GPR75-ASB3-7:1 No - lnc-GPR75-ASB3-8:1 No - lnc-ERLEC1-8:1 Yes chr2L:5327975-5328879 lnc-ERLEC1-7:1 Yes chr2L:5327975-5328879 lnc-ERLEC1-6:1 Yes chr2L:5327975-5328879 lnc-PSME4-2:1 Yes chr2L:5327975-5328879 lnc-ERLEC1-5:1 Yes chr2L:5327975-5328879 lnc-PSME4-1:1 Yes chr2L:5327975-5328879 lnc-ERLEC1-4:1 Yes chr2L:5327975-5328879 lnc-ERLEC1-4:2 Yes chr2L:5327975-5328879 lnc-ERLEC1-9:1 Yes chr2L:5327975-5328879 lnc-PSME4-2:2 Yes chr2L:5327975-5328879 lnc-SPTBN1-2:2 No - lnc-C2orf73-3:1 Yes chrX:17657372-17669371 lnc-C2orf73-3:2 Yes chrX:17657372-17669371 lnc-TSPYL6-4:1 Yes chrX:17657372-17669371 lnc-EML6-4:2 Yes chr2L:4958411-4965430 lnc-RTN4-2:2 Yes chr2L:4958411-4965430 lnc-RPS27A-6:1 Yes chr2L:4958411-4965430 lnc-CLHC1-4:1 Yes chr3R:7528864-7530241 lnc-CLHC1-3:2 Yes chr3R:7528864-7530241 lnc-CLHC1-3:1 Yes chr3R:7528864-7530241 lnc-CLHC1-2:1 Yes chr3R:7528864-7530241 lnc-MTIF2-3:2 No - lnc-MTIF2-3:1 No - lnc-MTIF2-3:4 No - lnc-MTIF2-3:3 No - lnc-RPS27A-2:1 No - lnc-CCDC88A-2:1 Yes chr3R:28542274-28544817 lnc-MTIF2-2:1 Yes chr3L:3178930-3185287 lnc-MTIF2-2:2 Yes chr3L:3178930-3185287 lnc-RPS27A-1:6 Yes chr3L:3178930-3185287 lnc-PPP4R3B-3:2 Yes chr3L:3178930-3185287 lnc-CFAP36-5:1 Yes chr3L:3178930-3185287 lnc-CCDC88A-1:1 No - lnc-CFAP36-2:1 No - lnc-CFAP36-1:1 No - lnc-PNPT1-2:1 Yes chr3R:13683921-13693905 lnc-CFAP36-3:6 Yes chr3R:13683921-13693905 lnc-CFAP36-3:7 No - lnc-PPP4R3B-2:2 Yes chr3R:31401560-31405452 lnc-CFAP36-6:1 No - lnc-EFEMP1-7:1 No - lnc-EFEMP1-6:1 Yes chr4:215009-227748 lnc-PNPT1-3:1 Yes chr4:215009-227748 lnc-PNPT1-3:2 Yes chr4:215009-227748 lnc-EFEMP1-4:1 No - lnc-EFEMP1-5:1 No - lnc-CCDC85A-2:1 No - MIR217HG:3 No - LINC01813:7 No - lnc-CCDC85A-2:2 No - lnc-EFEMP1-3:3 Yes chr2L:2999286-3016069 lnc-EFEMP1-3:4 Yes chr2L:2999286-3016069 lnc-EFEMP1-3:6 No - lnc-EFEMP1-3:5 No - lnc-CCDC85A-1:2 No - lnc-CCDC85A-3:1 No - lnc-FANCL-2:2 No - lnc-FANCL-8:1 No - lnc-VRK2-16:1 No - lnc-VRK2-3:3 No - lnc-VRK2-3:4 No - lnc-VRK2-10:1 No - lnc-CCDC85A-6:1 Yes chr3R:26864605-26866807 lnc-CCDC85A-6:2 Yes chr3R:26864605-26866807 lnc-FANCL-1:2 Yes chr3R:26864605-26866807 lnc-CCDC85A-7:1 Yes chr3R:26864605-26866807 lnc-EFEMP1-8:1 Yes chr3R:10051508-10052869 lnc-BCL11A-17:1 Yes chr3R:10051508-10052869 lnc-FANCL-4:1 No - LINC01122:3 No - lnc-VRK2-14:1 No - LINC01122:10 No - lnc-FANCL-6:1 No - LINC01122:11 No - lnc-VRK2-18:1 No - lnc-VRK2-19:1 No - lnc-PAPOLG-12:1 No - lnc-PAPOLG-9:1 No - lnc-BCL11A-9:1 No - lnc-BCL11A-8:1 No - lnc-BCL11A-8:2 No - lnc-BCL11A-2:2 No - lnc-PAPOLG-4:1 No - lnc-BCL11A-1:2 No - lnc-PUS10-5:3 No - lnc-PUS10-5:1 No - lnc-PUS10-5:2 No - lnc-PAPOLG-3:1 No - lnc-PAPOLG-2:1 No - lnc-BCL11A-7:1 No - lnc-PUS10-3:1 No - lnc-PUS10-2:1 No - LINC01185:1 No - lnc-REL-2:1 No - lnc-REL-1:2 Yes chr2L:17436830-17450364 lnc-REL-6:2 Yes chr2L:17436830-17450364 lnc-USP34-1:8 No - lnc-USP34-7:1 No - lnc-C2orf74-1:2 No - lnc-C2orf74-1:3 No - lnc-C2orf74-1:4 No - lnc-C2orf74-1:5 No - lnc-PUS10-4:9 Yes chr3R:24635270-24650043 lnc-PUS10-4:1 Yes chr3R:24635270-24650043 lnc-PUS10-4:8 Yes chr3R:24635270-24650043 lnc-PUS10-4:7 Yes chr3R:24635270-24650043 lnc-PUS10-4:6 Yes chr3R:24635270-24650043 lnc-PUS10-4:5 Yes chr3R:24635270-24650043 lnc-PUS10-4:2 Yes chr3R:24635270-24650043 lnc-PUS10-4:3 Yes chr3R:24635270-24650043 lnc-C2orf74-4:1 Yes chr3R:24635270-24650043 lnc-XPO1-9:3 Yes chr3R:24635270-24650043 lnc-XPO1-9:1 Yes chr3R:24635270-24650043 lnc-XPO1-9:2 Yes chr3R:24635270-24650043 lnc-XPO1-7:1 Yes chr3R:24635270-24650043 lnc-XPO1-1:1 Yes chr3R:24635270-24650043 lnc-C2orf74-5:1 No - lnc-C2orf74-5:7 Yes chr2L:8403573-8408853 lnc-C2orf74-5:8 Yes chr2L:8403573-8408853 lnc-C2orf74-5:10 Yes chr2L:8403573-8408853 lnc-C2orf74-5:14 Yes chr2L:8403573-8408853 lnc-USP34-2:2 Yes chr2L:8403573-8408853 lnc-USP34-2:1 Yes chr2L:8403573-8408853 lnc-USP34-3:1 Yes chr2L:8403573-8408853 lnc-USP34-4:1 Yes chr2L:8403573-8408853 lnc-USP34-5:1 Yes chr2L:8403573-8408853 lnc-USP34-6:5 Yes chr2L:8403573-8408853 lnc-USP34-6:3 Yes chr2L:8403573-8408853 lnc-USP34-6:4 Yes chr2L:8403573-8408853 lnc-USP34-6:1 Yes chr2L:8403573-8408853 lnc-USP34-6:2 Yes chr2L:8403573-8408853 lnc-COMMD1-6:1 No - lnc-XPO1-6:1 No - lnc-FAM161A-3:1 No - lnc-FAM161A-1:2 No - lnc-COMMD1-5:1 No - lnc-CCT4-3:3 No - lnc-CCT4-3:2 No - lnc-FAM161A-2:1 Yes chr2L:12690336-12692934 lnc-B3GNT2-4:1 No - lnc-CCT4-1:3 No - lnc-COMMD1-3:1 No - lnc-COMMD1-4:1 No - lnc-TMEM17-11:1 No - lnc-TMEM17-10:1 No - lnc-B3GNT2-2:1 No - lnc-B3GNT2-3:1 No - lnc-TMEM17-9:1 No - lnc-TMEM17-8:1 No - lnc-TMEM17-7:1 No - lnc-TMEM17-6:1 No - lnc-TMEM17-3:2 No - lnc-TMEM17-3:3 No - lnc-EHBP1-3:1 No - lnc-WDPCP-9:1 No - lnc-TMEM17-4:1 No - lnc-TMEM17-5:1 No - lnc-TMEM17-2:10 No - lnc-TMEM17-2:11 No - lnc-EHBP1-2:1 No - lnc-TMEM17-2:9 No - lnc-OTX1-8:3 Yes chr3L:13011976-13015332 lnc-OTX1-7:1 Yes chr3L:13011976-13015332 lnc-OTX1-4:1 Yes chr3L:13011976-13015332 lnc-WDPCP-1:5 Yes chr3L:13011976-13015332 lnc-EHBP1-1:2 No - lnc-EHBP1-1:3 No - lnc-OTX1-2:1 No - lnc-WDPCP-5:1 No - lnc-WDPCP-4:1 No - lnc-WDPCP-4:2 No - lnc-TMEM17-12:1 Yes chr2L:1711302-1715851 lnc-VPS54-11:1 Yes chr2L:1711302-1715851 lnc-VPS54-10:1 Yes chr2L:1711302-1715851 lnc-WDPCP-3:3 Yes chr2L:1711302-1715851 lnc-WDPCP-3:2 Yes chr2L:1711302-1715851 lnc-VPS54-9:1 Yes chr2L:1711302-1715851 lnc-VPS54-8:1 Yes chr2L:1711302-1715851 lnc-VPS54-7:1 Yes chr2L:1711302-1715851 lnc-VPS54-5:1 Yes chr2L:1711302-1715851 lnc-MDH1-1:1 Yes chr2L:1711302-1715851 lnc-MDH1-2:1 Yes chr2L:1711302-1715851 lnc-UGP2-2:1 Yes chr2L:1711302-1715851 lnc-VPS54-1:3 Yes chr2L:1711302-1715851 lnc-WDPCP-3:1 Yes chr2L:1711302-1715851 lnc-UGP2-1:1 No - lnc-WDPCP-6:1 Yes chr2L:9431405-9435341 lnc-VPS54-3:2 No - lnc-UGP2-3:1 No - lnc-UGP2-3:2 No - lnc-VPS54-4:3 Yes chr3R:23860162-23890052 lnc-VPS54-4:1 Yes chr3R:23860162-23890052 lnc-VPS54-4:2 Yes chr3R:23860162-23890052 LINC00309:5 No - LINC00309:3 No - lnc-PELI1-6:2 No - lnc-PELI1-8:1 No - lnc-PELI1-7:1 No - lnc-LGALSL-2:8 No - lnc-LGALSL-2:9 No - lnc-LGALSL-7:1 No - lnc-LGALSL-6:1 No - lnc-LGALSL-5:1 No - lnc-LGALSL-3:1 No - lnc-LGALSL-4:1 No - lnc-LGALSL-4:2 No - lnc-SERTAD2-6:1 No - LINC02579:10 No - lnc-RAB1A-12:1 No - lnc-SERTAD2-5:1 No - lnc-SERTAD2-7:1 No - lnc-SERTAD2-3:4 No - lnc-SLC1A4-4:1 No - lnc-SERTAD2-8:2 No - lnc-SERTAD2-8:1 No - lnc-SERTAD2-3:5 No - lnc-SERTAD2-9:1 No - lnc-SLC1A4-1:2 No - lnc-SERTAD2-3:3 No - lnc-SLC1A4-2:1 No - lnc-RAB1A-10:1 No - lnc-RAB1A-9:1 No - lnc-RAB1A-8:1 No - lnc-RAB1A-6:1 No - lnc-RAB1A-5:2 No - lnc-RAB1A-5:1 No - lnc-RAB1A-7:1 No - lnc-ACTR2-5:1 No - lnc-RAB1A-11:3 Yes chrX:16548290-16553968 lnc-RAB1A-11:9 No - lnc-ACTR2-4:1 No - lnc-SPRED2-8:2 No - lnc-ACTR2-6:1 No - lnc-RAB1A-13:1 Yes chr2R:14759646-14769423 lnc-ACTR2-3:11 No - lnc-SPRED2-1:11 No - lnc-SPRED2-1:7 No - lnc-SPRED2-1:10 No - lnc-SPRED2-1:6 No - lnc-SPRED2-1:3 No - lnc-SPRED2-1:4 No - lnc-SPRED2-1:8 No - lnc-SPRED2-1:9 No - lnc-SPRED2-1:5 No - lnc-SPRED2-9:1 No - lnc-SPRED2-10:1 No - lnc-ACTR2-3:33 No - lnc-SPRED2-12:1 No - lnc-ACTR2-3:15 No - lnc-SPRED2-3:3 No - lnc-ACTR2-10:1 No - lnc-SPRED2-14:1 No - lnc-SPRED2-15:1 No - lnc-MEIS1-10:1 No - lnc-MEIS1-10:2 No - lnc-MEIS1-8:1 No - lnc-MEIS1-7:1 No - lnc-SPRED2-17:1 No - lnc-SPRED2-18:1 No - MEIS1-AS3:2 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-SPRED2-19:1 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-SPRED2-19:4 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-SPRED2-19:3 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-SPRED2-20:1 Yes chr3R:10507561-10639568 LINC01798:29 No - lnc-MEIS1-9:1 No - lnc-C1D-15:1 No - lnc-MEIS1-9:3 No - lnc-MEIS1-11:1 No - lnc-ETAA1-16:1 No - lnc-C1D-14:1 No - lnc-C1D-14:3 No - lnc-C1D-14:2 No - lnc-ETAA1-15:1 No - LINC01828:27 No - lnc-ETAA1-16:3 No - lnc-ETAA1-13:1 No - lnc-ETAA1-12:1 No - LINC01828:32 No - LINC01828:33 No - LINC01828:41 No - LINC01829:36 No - lnc-ETAA1-1:2 No - lnc-ETAA1-11:1 No - LINC01829:33 No - LINC01829:35 No - LINC01829:34 No - lnc-ETAA1-9:1 No - lnc-ETAA1-8:1 No - lnc-C1D-9:1 No - lnc-ETAA1-10:1 No - lnc-C1D-8:1 No - lnc-ETAA1-4:7 No - lnc-ETAA1-14:1 No - lnc-C1D-7:1 No - lnc-WDR92-1:1 No - lnc-C1D-5:1 No - lnc-PNO1-2:1 Yes chr3L:17908143-17909683 lnc-FBXO48-1:1 No - lnc-PROKR1-1:3 Yes chr3R:15362796-15363857 lnc-PROKR1-3:1 No - lnc-BMP10-2:2 No - lnc-PROKR1-3:2 No - LINC01890:11 No - lnc-GFPT1-3:1 No - lnc-GFPT1-2:1 No - lnc-NFU1-2:1 Yes chr3R:4126442-4137882 lnc-NFU1-1:2 Yes chrX:21609357-21611526 lnc-NFU1-3:1 Yes chr2L:18957732-18968744 lnc-ANXA4-5:1 Yes chr2L:18957732-18968744 lnc-NFU1-4:1 Yes chr2L:18957732-18968744 lnc-NFU1-5:1 Yes chr2L:18957732-18968744 lnc-ANXA4-4:1 Yes chr2L:18957732-18968744 lnc-AAK1-5:2 Yes chr2L:18957732-18968744 lnc-AAK1-5:3 Yes chr2L:18957732-18968744 lnc-AAK1-5:1 No - lnc-ANXA4-1:2 No - lnc-ANXA4-1:3 No - lnc-ASPRV1-3:1 Yes chr2R:8724258-8728999 PCBP1-AS1:23 No - PCBP1-AS1:202 No - PCBP1-AS1:208 No - PCBP1-AS1:126 No - PCBP1-AS1:203 No - PCBP1-AS1:199 No - PCBP1-AS1:170 No - PCBP1-AS1:131 No - PCBP1-AS1:62 No - PCBP1-AS1:34 No - PCBP1-AS1:8 Yes chr3L:21844788-21932702 PCBP1-AS1:183 No - PCBP1-AS1:42 No - PCBP1-AS1:38 No - PCBP1-AS1:181 No - PCBP1-AS1:161 No - PCBP1-AS1:124 No - PCBP1-AS1:156 No - PCBP1-AS1:107 No - PCBP1-AS1:173 No - PCBP1-AS1:75 No - PCBP1-AS1:43 No - PCBP1-AS1:24 No - PCBP1-AS1:22 No - PCBP1-AS1:160 No - PCBP1-AS1:53 No - PCBP1-AS1:168 No - PCBP1-AS1:47 No - PCBP1-AS1:134 No - PCBP1-AS1:48 No - PCBP1-AS1:76 No - PCBP1-AS1:169 No - PCBP1-AS1:158 No - PCBP1-AS1:35 No - PCBP1-AS1:15 No - PCBP1-AS1:159 No - PCBP1-AS1:25 No - PCBP1-AS1:137 No - PCBP1-AS1:127 No - PCBP1-AS1:154 No - PCBP1-AS1:128 No - PCBP1-AS1:58 No - lnc-C2orf42-8:1 No - PCBP1-AS1:49 No - lnc-PCBP1-3:1 No - lnc-PCBP1-4:1 No - lnc-PCBP1-5:1 No - lnc-PCBP1-6:1 No - lnc-PCBP1-7:1 No - lnc-PCBP1-8:1 No - LINC01816:23 No - LINC01816:14 No - lnc-PCBP1-9:1 No - lnc-C2orf42-4:1 No - lnc-TIA1-1:2 Yes chr3R:29484783-29489265 lnc-TIA1-1:1 Yes chr3R:29484783-29489265 lnc-TIA1-1:3 Yes chr3R:29484783-29489265 lnc-PCYOX1-4:1 No - lnc-SNRPG-1:7 No - lnc-SNRPG-1:6 No - lnc-SNRPG-1:4 No - lnc-SNRPG-1:2 No - lnc-SNRPG-1:5 No - lnc-SNRPG-1:3 No - lnc-SNRPG-1:1 No - lnc-PCYOX1-3:1 No - lnc-FAM136A-1:1 Yes chrX:16639810-16640419 lnc-FAM136A-1:3 Yes chrX:16639810-16640419 lnc-FAM136A-1:2 Yes chrX:16639810-16640419 lnc-PCYOX1-5:1 No - lnc-TGFA-1:1 No - lnc-ADD2-2:1 No - lnc-TGFA-2:1 Yes chr2R:19397032-19424903 lnc-VAX2-6:1 Yes chr2R:19397032-19424903 lnc-FIGLA-2:1 Yes chr2R:19397032-19424903 lnc-ADD2-1:4 Yes chr2R:19397032-19424903 lnc-ADD2-1:3 Yes chr2R:19397032-19424903 lnc-VAX2-5:1 Yes chr2R:19397032-19424903 lnc-VAX2-4:1 No - lnc-CD207-2:1 No - lnc-CD207-3:1 No - lnc-VAX2-3:1 No - lnc-ATP6V1B1-1:1 Yes chr2R:23356372-23357565 lnc-MCEE-2:1 Yes chr2R:23356372-23357565 lnc-TEX261-2:2 No - lnc-NAGK-3:1 No - lnc-NAGK-1:1 Yes chr3R:15337908-15343256 lnc-NAGK-2:1 No - lnc-PAIP2B-1:1 No - lnc-MPHOSPH10-2:1 No - lnc-MPHOSPH10-2:2 No - lnc-DYSF-9:1 No - lnc-DYSF-2:2 No - lnc-PAIP2B-2:1 No - lnc-DYSF-4:1 No - lnc-CYP26B1-4:1 No - lnc-DYSF-11:1 No - lnc-DYSF-12:1 Yes chr3R:21105046-21107972 lnc-SPR-3:1 Yes chr3R:21105046-21107972 lnc-CYP26B1-5:1 Yes chr3R:21105046-21107972 lnc-SFXN5-1:4 No - lnc-SFXN5-1:6 No - lnc-SFXN5-1:2 No - lnc-SFXN5-1:3 No - lnc-SFXN5-1:1 No - lnc-SFXN5-1:5 No - lnc-SFXN5-2:1 Yes chrX:18635642-18647648 lnc-NOTO-2:2 Yes chrX:18635642-18647648 lnc-FBXO41-2:1 Yes chr2R:22937279-22939025 lnc-FBXO41-1:1 No - lnc-EGR4-2:1 No - ALMS1-IT1:1 No - lnc-ALMS1-3:2 No - lnc-TPRKB-1:4 No - lnc-TPRKB-1:2 No - lnc-TPRKB-1:5 No - lnc-TPRKB-1:1 No - lnc-TPRKB-1:3 No - lnc-C2orf78-3:1 No - lnc-DUSP11-1:1 No - lnc-TPRKB-2:1 Yes chr2R:11691285-11697785 lnc-C2orf78-2:1 Yes chr3R:30456441-30459300 lnc-DUSP11-3:3 Yes chr3R:30456441-30459300 lnc-DUSP11-3:2 Yes chr3R:30456441-30459300 lnc-DUSP11-3:1 Yes chr3R:30456441-30459300 lnc-DUSP11-4:1 Yes chr3R:30456441-30459300 lnc-STAMBP-2:1 No - DGUOK-AS1:2 No - DGUOK-AS1:7 Yes chr3L:2786207-2879158 lnc-BOLA3-3:1 Yes chr3L:2786207-2879158 lnc-TET3-3:2 No - lnc-TET3-3:3 No - lnc-MOB1A-1:2 No - lnc-MOB1A-1:1 No - BOLA3-AS1:1 No - BOLA3-AS1:2 No - BOLA3-AS1:3 No - BOLA3-AS1:10 Yes chr3R:22421161-22423302 lnc-MOB1A-2:5 Yes chr3R:22421161-22423302 lnc-MOB1A-2:4 Yes chr3R:22421161-22423302 lnc-MOB1A-2:2 Yes chr3R:22421161-22423302 lnc-MOB1A-2:3 Yes chr3R:22421161-22423302 lnc-SLC4A5-1:1 Yes chr3R:9042508-9050555 lnc-MOB1A-4:1 No - lnc-MOB1A-3:1 No - lnc-WDR54-3:1 No - lnc-SLC4A5-4:1 No - lnc-SLC4A5-2:8 No - lnc-SLC4A5-3:1 Yes chr3L:19538425-19544172 lnc-SLC4A5-5:4 Yes chr3L:19538425-19544172 lnc-SLC4A5-5:2 Yes chr3L:19538425-19544172 lnc-SLC4A5-5:1 Yes chr3L:19538425-19544172 lnc-SLC4A5-5:3 Yes chr3L:19538425-19544172 DCTN1-AS1:6 No - DCTN1-AS1:8 No - lnc-C2orf81-1:2 No - lnc-C2orf81-3:1 No - lnc-C2orf81-2:1 No - lnc-C2orf81-4:1 No - lnc-C2orf81-5:1 No - lnc-MRPL53-2:1 Yes chrX:11344506-11348001 lnc-MRPL53-1:1 No - lnc-CCDC142-3:2 No - lnc-CCDC142-3:1 No - lnc-CCDC142-3:3 No - lnc-PCGF1-2:1 Yes chr3R:21409979-21434133 lnc-LBX2-1:1 No - lnc-AUP1-1:1 No - lnc-DQX1-1:1 No - lnc-DQX1-1:2 No - lnc-DQX1-1:4 No - lnc-DQX1-1:5 No - lnc-DQX1-1:3 No - lnc-LOXL3-1:1 No - lnc-LOXL3-2:1 No - lnc-LOXL3-3:1 No - lnc-LOXL3-4:1 No - lnc-M1AP-4:2 No - lnc-M1AP-4:1 No - lnc-HK2-4:1 No - lnc-M1AP-5:1 No - lnc-HK2-4:2 No - lnc-HK2-4:4 No - lnc-HK2-3:1 No - lnc-HK2-2:1 No - lnc-M1AP-6:3 Yes chrX:9585675-9589813 lnc-TACR1-1:2 No - lnc-TACR1-1:3 No - lnc-POLE4-8:13 No - lnc-POLE4-1:1 No - lnc-POLE4-2:1 No - lnc-M1AP-7:1 Yes chr3R:29950796-29969447 lnc-EVA1A-3:1 Yes chr3R:29950796-29969447 lnc-POLE4-15:9 Yes chr3R:29950796-29969447 lnc-POLE4-15:15 No - lnc-MRPL19-14:1 No - lnc-MRPL19-13:1 No - lnc-POLE4-15:16 No - lnc-POLE4-15:17 No - lnc-POLE4-15:18 No - lnc-EVA1A-2:1 No - lnc-EVA1A-1:2 Yes chr3R:4077939-4104326 lnc-EVA1A-1:3 Yes chr3R:4077939-4104326 lnc-EVA1A-1:1 Yes chr3R:4077939-4104326 lnc-MRPL19-10:1 No - lnc-MRPL19-7:1 No - lnc-GCFC2-1:1 Yes chr3R:8674109-8675196 lnc-POLE4-5:1 No - lnc-MRPL19-6:1 Yes chr3R:7067401-7071624 lnc-MRPL19-8:1 No - lnc-MRPL19-9:1 No - lnc-GCFC2-2:1 No - lnc-MRPL19-16:1 No - lnc-LRRTM4-7:1 No - lnc-LRRTM4-6:1 No - lnc-MRPL19-17:1 No - lnc-MRPL19-18:1 No - lnc-LRRTM4-5:1 No - lnc-REG1B-9:1 Yes chr3L:4803077-4805274 lnc-REG1B-8:1 Yes chr3L:4803077-4805274 lnc-REG3G-11:1 Yes chr3L:4803077-4805274 lnc-LRRTM4-4:1 Yes chr3L:4803077-4805274 lnc-REG3G-10:2 No - lnc-REG3G-9:1 No - lnc-REG3G-9:2 No - lnc-LRRTM4-3:2 No - LINC01851:7 No - lnc-REG3G-8:1 No - lnc-LRRTM4-3:3 No - lnc-LRRTM4-3:4 No - lnc-REG3G-7:1 No - lnc-REG1B-7:1 No - lnc-REG3G-6:1 No - lnc-REG1B-5:1 No - lnc-REG3A-4:1 No - lnc-REG3A-4:2 No - lnc-REG3A-3:4 No - lnc-REG3A-3:3 No - lnc-REG3A-3:5 No - lnc-REG3A-3:2 No - lnc-REG3A-3:1 No - lnc-REG3A-2:1 No - lnc-REG3A-2:2 No - lnc-REG1A-4:1 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-REG1A-4:2 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-REG1A-4:3 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-REG3A-5:1 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-REG3A-6:1 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-REG1A-1:2 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-LRRTM1-7:1 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-LRRTM1-8:1 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-LRRTM1-2:8 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-LRRTM1-2:7 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-LRRTM1-2:6 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-LRRTM1-2:5 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-LRRTM1-2:2 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-LRRTM1-9:1 No - lnc-LRRTM1-10:1 No - lnc-LRRTM1-11:1 No - LINC01815:8 No - LINC01815:9 No - lnc-CTNNA2-3:7 No - lnc-LRRTM1-12:1 No - lnc-CTNNA2-2:2 No - lnc-CTNNA2-3:2 No - lnc-LRRTM1-13:1 No - lnc-CTNNA2-5:1 No - lnc-CTNNA2-6:1 No - lnc-LRRTM1-14:1 No - lnc-LRRTM1-15:1 No - lnc-DNAH6-16:1 No - lnc-DNAH6-15:1 No - lnc-DNAH6-14:1 No - lnc-SUCLG1-10:1 No - lnc-DNAH6-13:1 No - lnc-SUCLG1-9:1 No - lnc-DNAH6-11:1 No - lnc-DNAH6-10:1 No - LINC01809:5 No - lnc-DNAH6-9:1 No - lnc-SUCLG1-8:1 No - lnc-SUCLG1-7:1 No - lnc-SUCLG1-6:1 No - lnc-DNAH6-8:1 No - lnc-SUCLG1-4:1 No - lnc-DNAH6-6:1 No - lnc-DNAH6-5:1 No - lnc-TRABD2A-9:3 Yes chr3R:19461879-19463066 lnc-TRABD2A-9:2 Yes chr3R:19461879-19463066 lnc-TRABD2A-9:1 Yes chr3R:19461879-19463066 lnc-TRABD2A-8:1 Yes chr3R:19461879-19463066 lnc-TMSB10-3:1 Yes chrX:18064483-18078472 lnc-SUCLG1-5:1 No - lnc-TRABD2A-2:1 No - lnc-TMSB10-2:1 No - lnc-TRABD2A-2:2 No - lnc-TRABD2A-4:1 No - lnc-KCMF1-1:2 No - lnc-TRABD2A-5:6 No - lnc-TRABD2A-6:1 No - lnc-TRABD2A-7:1 No - lnc-TGOLN2-1:1 No - lnc-TCF7L1-1:1 No - lnc-TCF7L1-1:2 No - lnc-TCF7L1-1:3 No - lnc-SH2D6-6:1 No - lnc-RETSAT-1:3 No - lnc-RETSAT-1:1 No - lnc-RETSAT-1:2 No - lnc-SH2D6-1:1 No - lnc-SH2D6-1:2 No - lnc-SH2D6-1:3 No - lnc-SH2D6-2:1 No - lnc-SH2D6-4:1 No - lnc-GGCX-6:1 No - lnc-GGCX-5:1 No - lnc-GGCX-4:1 No - lnc-MAT2A-1:1 No - PARTICL:2 No - PARTICL:3 No - lnc-TMEM150A-5:1 Yes chr3L:1623179-1629301 lnc-TMEM150A-5:2 Yes chr3L:1623179-1629301 lnc-GGCX-2:1 No - lnc-TMEM150A-3:1 No - lnc-TMEM150A-4:1 No - lnc-TMEM150A-1:4 No - lnc-TMEM150A-1:3 No - lnc-TMEM150A-1:2 No - lnc-TMEM150A-2:1 Yes chrX:18858203-18860072 lnc-C2orf68-2:4 Yes chr3R:30883464-30889062 lnc-C2orf68-2:3 Yes chr3R:30883464-30889062 lnc-C2orf68-2:2 Yes chr3R:30883464-30889062 lnc-C2orf68-2:1 Yes chr3R:30883464-30889062 lnc-GNLY-3:1 Yes chr3R:30883464-30889062 lnc-SFTPB-2:1 No - lnc-ATOH8-1:2 No - lnc-POLR1A-7:6 No - lnc-POLR1A-7:4 No - lnc-POLR1A-7:3 No - lnc-POLR1A-7:2 No - lnc-POLR1A-7:1 No - lnc-POLR1A-7:5 No - ST3GAL5-AS1:1 No - ST3GAL5-AS1:6 No - ST3GAL5-AS1:11 No - ST3GAL5-AS1:15 No - lnc-ST3GAL5-2:1 No - lnc-POLR1A-2:2 No - lnc-POLR1A-4:1 No - lnc-POLR1A-3:1 Yes chr2R:14595611-14601216 lnc-POLR1A-3:2 Yes chr2R:14595611-14601216 lnc-IMMT-2:1 Yes chr2R:14595611-14601216 lnc-IMMT-1:1 Yes chr2R:14595611-14601216 lnc-REEP1-2:1 Yes chr3R:22019505-22023335 lnc-REEP1-1:1 Yes chr3R:22019505-22023335 lnc-MRPL35-1:2 Yes chr3R:22019505-22024341 lnc-IMMT-3:1 Yes chr2R:22925107-22932044 lnc-CHMP3-2:1 Yes chr3R:9516007-9520938 lnc-RNF103-1:2 No - lnc-RNF103-1:1 No - lnc-CD8B-1:1 No - lnc-CD8B-2:1 Yes chr3R:25618414-25621838 lnc-PLGLB1-2:1 Yes chr3R:25618414-25621838 lnc-CD8B-3:1 No - lnc-CD8B-3:3 No - lnc-CD8B-3:2 No - lnc-RGPD1-1:1 No - lnc-PLGLB1-4:1 No - lnc-RGPD1-2:1 No - lnc-PLGLB1-6:1 No - lnc-RGPD1-3:1 No - lnc-RGPD1-4:1 No - lnc-PLGLB1-7:1 No - CYTOR:91 No - CYTOR:92 No - CYTOR:110 No - lnc-RGPD2-2:1 No - lnc-RGPD2-1:1 No - CYTOR:122 No - lnc-PLGLB2-6:1 No - CYTOR:125 No - CYTOR:130 No - lnc-KRCC1-3:1 Yes chr3R:25618414-25621838 lnc-PLGLB2-5:1 Yes chr3R:25618414-25621838 lnc-SMYD1-5:1 No - lnc-SMYD1-4:1 No - lnc-SMYD1-2:1 No - lnc-SMYD1-2:2 No - lnc-KRCC1-2:2 No - lnc-KRCC1-2:1 No - lnc-THNSL2-2:1 No - lnc-THNSL2-1:3 No - lnc-FOXI3-8:1 No - lnc-TEX37-2:1 No - lnc-EIF2AK3-6:1 No - lnc-RPIA-2:3 No - lnc-EIF2AK3-1:4 No - lnc-RPIA-1:8 No - lnc-RPIA-1:10 No - lnc-EIF2AK3-4:81 No - lnc-RPIA-3:5 No - lnc-EIF2AK3-4:69 No - lnc-EIF2AK3-4:67 No - lnc-EIF2AK3-4:51 No - lnc-EIF2AK3-4:52 No - lnc-EIF2AK3-4:71 No - lnc-EIF2AK3-4:47 No - lnc-EIF2AK3-4:55 No - lnc-EIF2AK3-4:56 No - lnc-EIF2AK3-4:46 No - lnc-EIF2AK3-4:65 No - lnc-EIF2AK3-4:57 No - lnc-EIF2AK3-4:63 No - lnc-EIF2AK3-4:75 No - lnc-EIF2AK3-4:68 No - lnc-EIF2AK3-4:72 No - lnc-EIF2AK3-26:2 No - lnc-EIF2AK3-26:1 No - lnc-EIF2AK3-4:54 No - lnc-EIF2AK3-4:74 No - lnc-EIF2AK3-4:48 No - lnc-RPIA-4:1 No - lnc-RPIA-4:2 No - lnc-RPIA-4:3 No - lnc-RPIA-4:4 No - lnc-EIF2AK3-9:1 No - lnc-EIF2AK3-10:1 No - lnc-EIF2AK3-11:1 No - lnc-EIF2AK3-19:1 No - lnc-EIF2AK3-4:76 No - lnc-EIF2AK3-4:73 No - lnc-EIF2AK3-18:1 No - lnc-EIF2AK3-17:1 No - lnc-EIF2AK3-16:1 No - lnc-EIF2AK3-4:66 No - lnc-EIF2AK3-4:70 No - lnc-EIF2AK3-15:1 No - lnc-EIF2AK3-14:1 No - lnc-EIF2AK3-4:58 No - lnc-EIF2AK3-4:64 No - lnc-EIF2AK3-4:59 No - lnc-EIF2AK3-4:62 No - lnc-EIF2AK3-4:60 No - lnc-EIF2AK3-4:61 No - lnc-EIF2AK3-13:1 No - lnc-EIF2AK3-20:1 No - lnc-EIF2AK3-4:53 No - lnc-EIF2AK3-7:2 No - lnc-EIF2AK3-5:3 No - lnc-EIF2AK3-21:1 No - lnc-EIF2AK3-22:1 No - lnc-EIF2AK3-22:2 No - lnc-EIF2AK3-4:49 No - lnc-EIF2AK3-4:50 No - lnc-EIF2AK3-2:10 No - lnc-EIF2AK3-3:3 No - lnc-EIF2AK3-23:1 No - lnc-EIF2AK3-8:2 No - lnc-EIF2AK3-24:1 No - lnc-EIF2AK3-12:2 No - lnc-EIF2AK3-25:1 No - lnc-RPIA-5:1 No - lnc-RPIA-6:1 No - lnc-RPIA-7:1 No - lnc-RPIA-8:1 No - lnc-RPIA-9:1 No - lnc-RPIA-10:1 No - lnc-RPIA-11:1 No - lnc-RPIA-12:1 No - lnc-RPIA-13:1 No - lnc-RPIA-13:2 No - lnc-RPIA-14:1 No - lnc-RPIA-15:1 No - lnc-RPIA-16:1 No - lnc-RPIA-17:1 No - lnc-RPIA-17:2 No - lnc-RPIA-18:1 No - lnc-RPIA-19:1 No - lnc-EIF2AK3-27:1 No - lnc-RPIA-20:1 No - lnc-RPIA-21:1 No - lnc-RPIA-21:2 No - lnc-RPIA-22:1 No - lnc-RPIA-23:1 No - lnc-RPIA-24:1 No - lnc-RGPD1-4:2 No - lnc-PLGLB1-8:2 No - lnc-RPIA-26:1 No - lnc-EIF2AK3-29:1 No - lnc-EIF2AK3-30:3 No - lnc-EIF2AK3-30:1 No - lnc-EIF2AK3-30:4 No - lnc-EIF2AK3-30:5 No - lnc-RPIA-27:1 No - lnc-EIF2AK3-30:7 No - lnc-EIF2AK3-30:6 No - lnc-EIF2AK3-30:9 No - lnc-EIF2AK3-31:2 No - lnc-EIF2AK3-31:1 No - lnc-RPIA-28:1 No - lnc-ANKRD20A8P-5:1 No - lnc-RPIA-30:1 No - lnc-RPIA-30:2 No - lnc-TEKT4-15:1 No - lnc-TEKT4-16:1 No - lnc-ANKRD20A8P-4:1 No - lnc-TEKT4-18:1 No - lnc-ANKRD20A8P-2:1 No - lnc-ANKRD20A8P-1:1 No - lnc-TEKT4-7:1 No - lnc-TEKT4-19:1 No - lnc-TEKT4-20:1 No - lnc-TEKT4-21:1 No - lnc-ANKRD20A8P-16:1 No - lnc-ANKRD20A8P-15:1 No - lnc-TEKT4-5:1 No - FAM95A:1 No - FAM95A:2 No - FAM95A:3 No - FAM95A:5 No - FAM95A:4 No - lnc-ANKRD20A8P-13:1 No - lnc-ANKRD20A8P-14:3 No - lnc-ANKRD20A8P-14:2 No - lnc-ANKRD20A8P-14:1 No - lnc-TEKT4-1:1 No - lnc-ANKRD20A8P-12:2 Yes chr2L:15854126-15856450 lnc-ANKRD20A8P-12:1 Yes chr2L:15854126-15856450 lnc-ANKRD20A8P-12:4 Yes chr2L:15854126-15856450 lnc-ANKRD20A8P-12:7 No - lnc-ANKRD20A8P-12:6 No - lnc-ANKRD20A8P-12:3 No - lnc-ANKRD20A8P-11:1 No - lnc-TEKT4-2:1 No - lnc-TEKT4-3:1 No - lnc-ANKRD20A8P-12:5 No - lnc-MAL-3:1 No - lnc-MAL-3:2 No - lnc-ANKRD20A8P-9:1 No - lnc-ANKRD20A8P-8:1 No - lnc-ANKRD20A8P-7:1 No - lnc-MRPS5-6:1 No - lnc-MAL-2:1 No - lnc-MRPS5-5:1 No - lnc-MRPS5-4:3 No - lnc-MRPS5-4:2 No - lnc-MRPS5-4:1 No - lnc-ZNF514-3:1 Yes chr3L:24537236-24543534 lnc-MRPS5-3:1 No - lnc-ZNF514-1:1 No - lnc-TRIM43B-11:1 Yes chrX:11219379-11302783 lnc-TRIM43B-5:1 No - lnc-TRIM43B-6:1 No - lnc-TRIM43B-7:1 Yes chr3R:22024259-22025506 lnc-KCNIP3-4:1 Yes chr3R:22024259-22025506 lnc-FAHD2A-2:1 No - lnc-FAHD2A-3:1 No - lnc-TRIM43B-8:1 No - lnc-TRIM43B-9:1 No - lnc-TRIM43B-10:1 No - lnc-FAHD2A-4:1 No - lnc-TRIM43-8:1 No - lnc-TRIM43-1:7 No - lnc-TRIM43-1:8 No - lnc-TRIM43-1:9 No - lnc-TRIM43B-2:1 No - lnc-TRIM43B-3:1 No - lnc-TRIM43-5:1 No - lnc-TRIM43B-4:1 No - lnc-TRIM43-3:1 No - lnc-TRIM43-3:2 No - lnc-TRIM43-3:3 No - lnc-TRIM43B-12:1 No - lnc-TRIM43B-13:1 No - lnc-TRIM43-7:1 No - lnc-TRIM43-6:1 No - LINC00342:1 No - LINC00342:4 No - LINC00342:3 No - LINC00342:5 No - lnc-TRIM43-9:2 No - LINC00342:7 No - lnc-GPAT2-6:1 No - lnc-GPAT2-4:1 No - lnc-GPAT2-3:1 No - lnc-ANKRD36C-3:1 No - lnc-CIAO1-6:1 No - lnc-CIAO1-4:10 No - lnc-ANKRD36C-4:2 No - lnc-ANKRD36C-4:1 No - lnc-GPAT2-2:1 No - lnc-DUSP2-2:1 No - lnc-TMEM127-4:1 No - lnc-TMEM127-1:1 Yes chr3L:15960836-15967872 lnc-TMEM127-2:1 Yes chr3L:15960836-15967872 lnc-SNRNP200-1:2 No - lnc-KANSL3-2:2 Yes chr3R:9020348-9039471 lnc-ARID5A-1:1 No - lnc-ARID5A-2:1 Yes chr2R:14148263-14153123 lnc-NEURL3-6:2 Yes chr2R:14148263-14153123 lnc-NEURL3-6:1 Yes chr2R:14148263-14153123 lnc-NEURL3-5:1 Yes chr2R:14148263-14153123 lnc-LMAN2L-4:6 Yes chr2R:14148263-14153123 lnc-CNNM4-2:1 No - lnc-LMAN2L-2:1 No - lnc-LMAN2L-3:1 Yes chr2R:3900285-3949425 CNNM3-DT:13 Yes chr2R:3900285-3949425 CNNM3-DT:12 Yes chr2R:3900285-3949425 lnc-ANKRD23-1:1 No - lnc-ANKRD23-1:2 No - lnc-CNNM3-3:1 No - lnc-CNNM3-1:2 No - lnc-SEMA4C-1:2 No - lnc-SEMA4C-1:1 No - lnc-FAM178B-1:1 No - lnc-FAM178B-2:1 No - lnc-ANKRD36-9:1 No - lnc-ANKRD36-8:1 No - lnc-ANKRD36-7:1 No - lnc-ANKRD36-6:1 No - lnc-ANKRD36-6:2 No - lnc-ANKRD36-5:1 No - lnc-ANKRD36-5:2 No - lnc-FAM178B-4:1 Yes chr3R:22024259-22025506 lnc-ANKRD36-4:1 No - lnc-ANKRD36-3:1 No - lnc-ANKRD36-1:2 No - lnc-ANKRD36-1:3 No - lnc-ANKRD36-1:4 No - lnc-ANKRD36-1:5 No - lnc-ANKRD36B-1:1 No - lnc-ANKRD36B-5:1 No - lnc-ANKRD36B-6:1 No - lnc-ANKRD36-10:2 No - lnc-ANKRD36-15:1 No - lnc-ANKRD36-16:1 No - lnc-ANKRD36-11:1 No - lnc-ANKRD36-12:1 No - lnc-ANKRD36B-3:8 No - lnc-ANKRD36B-3:21 No - lnc-ANKRD36B-3:14 No - lnc-ANKRD36B-3:10 No - lnc-ANKRD36B-3:20 No - lnc-ANKRD36B-3:31 No - lnc-ANKRD36B-3:24 No - lnc-ANKRD36-2:2 No - lnc-ANKRD36-2:3 No - lnc-ANKRD36B-3:25 No - lnc-ANKRD36B-3:13 No - lnc-ANKRD36B-3:18 No - lnc-ANKRD36B-8:1 No - lnc-ACTR1B-6:1 No - lnc-ACTR1B-5:1 No - lnc-ANKRD36B-2:1 Yes chr3R:12691743-12694232 lnc-COX5B-2:1 No - lnc-COX5B-2:3 No - lnc-COX5B-2:4 No - lnc-ACTR1B-1:4 Yes chr2R:16001181-16006901 lnc-ACTR1B-1:6 Yes chr2R:16001181-16006901 lnc-ACTR1B-1:5 Yes chr2R:16001181-16006901 lnc-ACTR1B-7:1 Yes chr2R:16001181-16006901 lnc-ZAP70-4:1 Yes chr2R:16001181-16006901 lnc-ZAP70-4:2 Yes chr2R:16001181-16006901 lnc-ACTR1B-11:1 Yes chr2R:16001181-16006901 lnc-TMEM131-3:2 No - lnc-TMEM131-3:1 No - lnc-COA5-2:3 No - lnc-INPP4A-1:1 No - lnc-CNGA3-1:1 Yes chrX:14228060-14234066 lnc-MGAT4A-1:2 Yes chr2R:14157050-14157488 lnc-MGAT4A-1:1 Yes chr2R:14157050-14157488 lnc-MGAT4A-1:3 Yes chr2R:14157050-14157488 lnc-COA5-1:3 Yes chr3L:14762028-14767703 lnc-COA5-1:1 Yes chr3L:14762028-14767703 lnc-UNC50-4:1 Yes chr3L:14762028-14767703 lnc-UNC50-6:1 Yes chr3L:14762028-14767703 lnc-COA5-1:2 Yes chr3L:14762028-14767703 lnc-UNC50-1:2 No - lnc-KIAA1211L-1:8 No - lnc-MGAT4A-2:1 No - lnc-TSGA10-1:1 No - lnc-MITD1-2:1 No - lnc-MITD1-2:7 Yes chr3L:15116737-15128029 lnc-MITD1-2:6 Yes chr3L:15116737-15128029 lnc-MITD1-2:8 Yes chr3L:15116737-15128029 lnc-MITD1-2:3 No - lnc-MITD1-2:5 No - lnc-MITD1-2:2 No - lnc-MITD1-2:4 No - lnc-C2orf15-1:1 Yes chrX:4647871-4648646 lnc-MITD1-1:2 Yes chrX:4647871-4648646 lnc-MITD1-1:3 Yes chrX:4647871-4648646 lnc-MITD1-1:1 Yes chrX:4647871-4648646 lnc-LYG1-1:1 No - lnc-TXNDC9-1:1 Yes chr3L:654363-657971 lnc-TXNDC9-2:2 Yes chr3L:654363-657971 lnc-TXNDC9-2:1 Yes chr3L:654363-657971 lnc-TXNDC9-3:1 Yes chr3L:654363-657971 lnc-TXNDC9-3:3 Yes chr3L:654363-657971 lnc-TXNDC9-3:2 Yes chr3L:654363-657971 lnc-REV1-1:1 No - lnc-REV1-2:1 No - lnc-EIF5B-4:1 Yes chr2L:2885929-2954406 lnc-EIF5B-4:2 Yes chr2L:2885929-2954406 lnc-NMS-4:2 Yes chr2L:2885929-2954406 lnc-NMS-4:3 Yes chr2L:2885929-2954406 lnc-LONRF2-3:1 Yes chr2L:2885929-2954406 lnc-LONRF2-2:1 Yes chr2L:2885929-2954406 lnc-AFF3-1:1 Yes chr2L:2885929-2954406 lnc-CHST10-2:1 Yes chr3L:7777105-7809825 lnc-LONRF2-1:2 Yes chr3L:1876551-1883041 lnc-LONRF2-1:1 Yes chr3L:1876551-1883041 lnc-LONRF2-1:3 Yes chr3L:1876551-1883041 lnc-LONRF2-1:4 Yes chr3L:1876551-1883041 lnc-PDCL3-2:1 No - lnc-PDCL3-3:1 No - LINC01849:5 No - lnc-PDCL3-5:1 No - lnc-TBC1D8-7:2 No - lnc-RNF149-2:2 No - lnc-RPL31-3:1 Yes chr3L:21337681-21343716 lnc-TBC1D8-1:4 No - lnc-RPL31-5:1 Yes chr3L:21337681-21343716 lnc-TBC1D8-1:7 Yes chr3L:21337681-21343716 lnc-TBC1D8-1:6 No - lnc-TBC1D8-1:5 No - lnc-RNF149-4:1 Yes chr3L:21337681-21343716 lnc-TBC1D8-1:3 No - lnc-TBC1D8-4:1 Yes chr2R:24036720-24037915 lnc-RNF149-3:1 Yes chr2R:25072627-25084347 lnc-TBC1D8-5:1 Yes chr2R:25072627-25084347 lnc-CNOT11-5:1 Yes chr3R:17393272-17394640 lnc-CREG2-2:1 No - lnc-CREG2-1:1 No - lnc-RFX8-2:1 No - lnc-MAP4K4-1:1 No - lnc-RFX8-3:1 Yes chr3L:2554847-2586540 LINC01127:26 No - LINC01127:27 No - lnc-IL1R2-3:1 No - lnc-IL1R1-1:2 No - lnc-MFSD9-11:1 No - lnc-MFSD9-10:1 No - lnc-MFSD9-9:1 No - lnc-IL1RL1-1:1 No - lnc-IL1RL1-3:1 No - lnc-MFSD9-8:1 Yes chr2L:21104568-21134255 lnc-MFSD9-7:1 No - lnc-RFX8-4:1 No - lnc-MFSD9-13:1 No - lnc-MFSD9-12:1 No - lnc-TMEM182-6:1 No - lnc-TMEM182-7:1 No - lnc-MFSD9-14:1 No - lnc-MFSD9-16:1 No - lnc-TMEM182-10:1 No - lnc-TMEM182-11:1 No - lnc-TMEM182-12:1 No - lnc-MFSD9-18:2 No - lnc-MFSD9-19:1 No - lnc-POU3F3-19:1 No - lnc-POU3F3-18:1 No - lnc-POU3F3-17:1 No - lnc-POU3F3-16:1 No - lnc-TGFBRAP1-20:3 No - lnc-TGFBRAP1-20:2 No - lnc-TGFBRAP1-20:4 No - lnc-TGFBRAP1-19:4 No - lnc-TGFBRAP1-19:7 No - lnc-TGFBRAP1-19:2 No - lnc-TGFBRAP1-19:6 No - lnc-TGFBRAP1-19:3 No - lnc-TGFBRAP1-11:4 No - lnc-TGFBRAP1-18:1 No - LINC01831:4 No - LINC01102:2 No - LINC01102:5 No - LINC01102:10 No - LINC01103:3 No - LINC01102:13 No - LINC01102:15 No - LINC01102:16 No - lnc-POU3F3-13:1 No - lnc-POU3F3-13:2 No - lnc-POU3F3-13:3 No - lnc-POU3F3-12:1 No - lnc-POU3F3-11:1 No - lnc-POU3F3-1:2 No - lnc-TGFBRAP1-16:1 No - LINC01114:3 No - LINC01114:7 No - LINC01114:8 No - PANTR1:44 No - PANTR1:56 No - PANTR1:32 No - PANTR1:33 No - PANTR1:31 No - PANTR1:42 No - lnc-POU3F3-7:4 Yes chr3L:6790158-6794941 lnc-POU3F3-7:1 No - lnc-POU3F3-7:2 No - lnc-POU3F3-7:3 No - lnc-POU3F3-4:18 Yes chr3L:6790158-6794941 LINC01159:2 No - LINC01159:1 No - lnc-MRPS9-1:2 No - lnc-TGFBRAP1-13:1 No - lnc-FHL2-2:1 No - lnc-TGFBRAP1-1:4 No - lnc-TGFBRAP1-1:5 No - lnc-C2orf49-2:3 No - lnc-FHL2-1:2 No - lnc-NCK2-2:1 No - lnc-UXS1-4:4 Yes chr2L:825969-833241 lnc-UXS1-4:2 Yes chr2L:825969-833241 lnc-UXS1-4:3 Yes chr2L:825969-833241 lnc-UXS1-7:1 Yes chr2L:825969-833241 lnc-NCK2-1:1 No - lnc-RGPD3-8:1 Yes chr3L:8180923-8183369 lnc-RGPD3-7:1 Yes chr3L:8180923-8183369 lnc-RGPD3-5:3 Yes chr3L:8180923-8183369 lnc-RGPD3-5:2 Yes chr3L:8180923-8183369 lnc-UXS1-5:1 No - lnc-UXS1-6:2 No - lnc-UXS1-6:1 No - lnc-CD8B2-10:1 No - lnc-RGPD3-4:1 No - lnc-CD8B2-11:1 No - lnc-RGPD3-3:1 No - lnc-CD8B2-12:1 No - lnc-ST6GAL2-7:1 No - lnc-ST6GAL2-7:2 No - lnc-CD8B2-13:1 No - lnc-CD8B2-5:1 No - lnc-CD8B2-14:1 No - lnc-CD8B2-14:2 No - lnc-CD8B2-14:3 No - lnc-ST6GAL2-6:1 Yes chr2R:24691422-24694386 lnc-CD8B2-15:1 No - lnc-CD8B2-15:2 No - lnc-CD8B2-7:1 No - lnc-CD8B2-1:1 No - lnc-CD8B2-1:2 No - lnc-ST6GAL2-9:1 No - lnc-ST6GAL2-10:1 No - LINC01886:9 No - lnc-RGPD4-5:1 No - RGPD4-AS1:1 No - RGPD4-AS1:6 No - RGPD4-AS1:2 No - lnc-EDAR-14:1 No - lnc-RGPD4-4:1 Yes chr3R:18680604-18686739 lnc-EDAR-13:1 No - lnc-SULT1C2-3:1 No - lnc-SULT1C2-2:1 No - lnc-SULT1C2-1:3 No - lnc-SULT1C4-1:1 No - lnc-GCC2-2:1 No - lnc-EDAR-11:1 No - lnc-GCC2-1:1 No - lnc-LIMS1-1:1 No - lnc-RANBP2-2:1 Yes chr3R:8356978-8359964 lnc-EDAR-9:1 No - SH3RF3-AS1:1 Yes chr2R:17568732-17572322 lnc-SOWAHC-4:1 Yes chr2R:17568732-17572322 lnc-SH3RF3-2:1 Yes chr2R:7960133-7961921 lnc-MALL-6:2 Yes chr2R:7960133-7961921 lnc-MALL-5:1 Yes chr2R:7960133-7961921 lnc-SOWAHC-1:1 No - lnc-SOWAHC-2:1 No - lnc-RGPD5-1:1 No - lnc-LIMS3-1:16 Yes chr3R:8356978-8359964 lnc-MALL-4:1 No - LINC01123:2 No - LINC01123:3 No - LINC01123:4 No - LINC01123:6 No - lnc-LIMS3-3:1 No - lnc-MALL-3:1 No - lnc-MALL-2:1 No - lnc-SMIM37-1:5 No - lnc-LIMS3-2:11 No - lnc-LIMS3-4:1 No - lnc-ACOXL-6:1 No - lnc-LIMS4-7:1 No - LINC01106:2 No - LINC01106:3 No - LINC01106:4 No - LINC01106:9 No - LINC01106:12 No - LINC01106:5 No - lnc-ACOXL-5:1 No - lnc-LIMS4-1:8 Yes chr3R:8356978-8359964 lnc-LIMS4-1:2 Yes chr3R:8356978-8359964 lnc-LIMS4-4:1 Yes chr3R:8356978-8359964 lnc-LIMS4-5:1 Yes chr3R:25618414-25621838 lnc-LIMS4-6:1 Yes chr3R:25618414-25621838 lnc-BUB1-5:3 Yes chr3R:25618414-25621838 lnc-BUB1-5:1 Yes chr3R:25618414-25621838 lnc-BUB1-5:2 Yes chr3R:25618414-25621838 lnc-RGPD6-3:1 Yes chr2L:5278865-5283283 lnc-RGPD6-2:1 Yes chr2L:5278865-5283283 lnc-ACOXL-3:1 No - lnc-ACOXL-3:2 No - lnc-BUB1-2:1 No - lnc-BUB1-3:1 No - lnc-BUB1-4:1 No - lnc-BUB1-7:1 No - lnc-BCL2L11-6:1 No - lnc-ANAPC1-7:1 No - MIR4435-2HG:27 No - lnc-BCL2L11-6:2 No - MIR4435-2HG:2 No - lnc-BCL2L11-6:3 No - MIR4435-2HG:33 No - MIR4435-2HG:32 No - MIR4435-2HG:30 No - MIR4435-2HG:29 No - lnc-ANAPC1-5:1 No - lnc-ANAPC1-6:1 No - lnc-BCL2L11-5:2 No - MIR4435-2HG:17 No - MIR4435-2HG:3 No - lnc-BCL2L11-7:1 No - MIR4435-2HG:4 No - lnc-BCL2L11-8:1 No - MIR4435-2HG:23 No - lnc-BCL2L11-3:3 No - lnc-BCL2L11-3:4 No - lnc-BCL2L11-3:5 No - lnc-ANAPC1-3:1 No - lnc-MERTK-1:2 Yes chrX:15455544-15462441 lnc-MERTK-4:1 Yes chrX:15455544-15462441 lnc-ZC3H8-6:1 Yes chrX:15455544-15462441 lnc-ZC3H8-5:1 Yes chrX:15455544-15462441 lnc-MERTK-3:1 Yes chrX:15455544-15462441 lnc-ANAPC1-1:1 Yes chrX:15455544-15462441 lnc-ANAPC1-1:2 Yes chrX:15455544-15462441 lnc-MERTK-2:1 No - lnc-TMEM87B-3:1 No - lnc-ANAPC1-2:1 No - lnc-ZC3H8-3:1 Yes chr2L:1707132-1710421 lnc-TMEM87B-1:1 No - lnc-FBLN7-2:1 No - lnc-RGPD8-6:1 Yes chrX:635890-643760 lnc-RGPD8-4:1 Yes chrX:635890-643760 lnc-ZC3H8-1:1 Yes chrX:635890-643760 lnc-FBLN7-4:1 Yes chrX:635890-643760 lnc-ZC3H6-1:1 No - lnc-RGPD8-1:1 No - lnc-ZC3H8-2:1 Yes chr3R:25618414-25621838 lnc-ZC3H8-4:1 Yes chr3R:25618414-25621838 lnc-RGPD8-5:1 No - lnc-CHCHD5-3:1 No - lnc-CHCHD5-4:1 No - lnc-CKAP2L-1:10 No - lnc-CKAP2L-1:8 No - lnc-CKAP2L-1:9 No - lnc-SLC20A1-3:1 No - lnc-IL1A-2:2 No - lnc-IL1A-2:1 No - lnc-IL1A-2:3 No - lnc-IL1A-1:1 No - lnc-IL1A-3:1 No - lnc-IL37-4:1 No - lnc-IL37-3:1 No - lnc-IL36B-1:1 No - lnc-IL36A-1:1 No - lnc-IL1RN-1:1 No - lnc-IL1RN-1:2 No - lnc-IL1RN-2:1 No - lnc-IL1RN-5:1 Yes chr3R:22587755-22608842 lnc-PSD4-2:1 Yes chr3R:22587755-22608842 lnc-IL36B-2:1 Yes chr4:1088798-1113317 lnc-PSD4-4:2 Yes chr4:1088798-1113317 lnc-PSD4-4:3 Yes chr4:1088798-1113317 lnc-IL36B-3:1 Yes chr4:1088798-1113317 PAX8-AS1:35 Yes chr4:1088798-1113317 lnc-IL36B-7:1 Yes chr4:1088798-1113317 lnc-PSD4-6:1 No - lnc-PSD4-6:3 No - lnc-CBWD2-3:1 No - LINC01961:9 No - lnc-FOXD4L1-4:1 No - lnc-FOXD4L1-4:2 No - lnc-FOXD4L1-4:3 No - lnc-FOXD4L1-4:4 No - lnc-SLC35F5-6:5 No - lnc-SLC35F5-6:4 No - lnc-SLC35F5-6:3 No - lnc-FOXD4L1-4:5 No - FAM138B:3 No - FAM138B:4 No - lnc-RABL2A-7:1 No - lnc-RABL2A-7:3 No - lnc-RABL2A-4:4 No - lnc-SLC35F5-16:1 No - lnc-SLC35F5-16:3 No - lnc-SLC35F5-16:2 No - lnc-SLC35F5-16:5 No - lnc-SLC35F5-16:4 No - lnc-SLC35F5-15:1 No - lnc-SLC35F5-14:8 No - lnc-SLC35F5-14:5 No - lnc-SLC35F5-14:4 No - lnc-SLC35F5-14:3 No - lnc-SLC35F5-14:10 No - lnc-SLC35F5-14:2 No - lnc-SLC35F5-14:1 No - lnc-SLC35F5-14:9 No - lnc-SLC35F5-14:7 No - lnc-SLC35F5-14:6 No - lnc-RABL2A-5:2 Yes chr2R:15562697-15565801 lnc-RABL2A-5:3 No - lnc-SLC35F5-10:6 Yes chr2R:15562697-15565801 lnc-SLC35F5-10:5 Yes chr2R:15562697-15565801 lnc-SLC35F5-10:3 Yes chr2R:15562697-15565801 lnc-SLC35F5-10:7 Yes chr2R:15562697-15565801 lnc-SLC35F5-10:4 Yes chr2R:15562697-15565801 lnc-PAX8-10:1 Yes chr2R:15562697-15565801 lnc-SLC35F5-11:1 No - lnc-SLC35F5-3:5 No - lnc-ACTR3-3:1 No - lnc-SLC35F5-12:1 No - lnc-SLC35F5-13:1 No - lnc-SLC35F5-3:16 No - lnc-ACTR3-2:1 No - LINC01191:1 No - LINC01191:2 No - LINC01191:3 No - lnc-SLC35F5-19:2 No - lnc-SLC35F5-19:1 No - lnc-SLC35F5-20:1 No - DPP10-AS1:1 No - DPP10-AS1:2 No - lnc-SLC35F5-22:1 No - lnc-CCDC93-8:1 No - lnc-DPP10-1:1 No - lnc-DPP10-2:1 No - lnc-DDX18-9:1 No - lnc-DDX18-8:1 No - lnc-DDX18-7:1 No - lnc-DDX18-6:1 No - lnc-CCDC93-7:1 No - lnc-CCDC93-6:1 No - lnc-DDX18-4:1 No - lnc-DDX18-1:5 No - lnc-DDX18-1:6 No - lnc-DDX18-1:7 No - lnc-CCDC93-4:3 No - lnc-CCDC93-4:4 No - lnc-CCDC93-4:2 No - lnc-EN1-7:3 Yes chr2R:16262284-16264619 lnc-EN1-6:2 Yes chr2R:16262284-16264619 lnc-EN1-7:2 Yes chr2R:16262284-16264619 lnc-EN1-5:2 Yes chr2R:16262284-16264619 lnc-EN1-4:11 Yes chr2R:16262284-16264619 lnc-INSIG2-1:10 Yes chr2R:16262284-16264619 lnc-INSIG2-1:12 Yes chr2R:16262284-16264619 lnc-INSIG2-1:15 Yes chr2R:16262284-16264619 lnc-INSIG2-7:1 Yes chr2R:16262284-16264619 lnc-INSIG2-6:1 No - lnc-INSIG2-5:1 No - lnc-CCDC93-5:1 No - lnc-CCDC93-2:4 No - lnc-INSIG2-12:1 No - lnc-C1QL2-3:2 Yes chr2R:11524006-11528210 lnc-SCTR-1:1 No - lnc-C2orf76-3:1 No - lnc-TMEM37-1:3 No - lnc-TMEM177-1:1 No - lnc-TMEM177-1:2 No - lnc-TMEM177-3:3 No - lnc-SCTR-2:3 No - lnc-SCTR-2:2 No - lnc-SCTR-2:1 Yes chr3L:328097-356050 lnc-PTPN4-1:1 Yes chr3L:328097-356050 lnc-TMEM185B-7:1 No - lnc-RALB-7:1 No - lnc-RALB-6:1 No - lnc-RALB-5:1 No - lnc-RALB-3:2 No - lnc-RALB-3:1 No - lnc-TMEM185B-1:6 No - lnc-TMEM185B-6:1 No - lnc-TMEM185B-2:2 No - lnc-TFCP2L1-4:1 Yes chr4:47710-57041 lnc-INHBB-2:1 Yes chr4:47710-57041 lnc-GLI2-7:1 No - lnc-TFCP2L1-1:2 No - lnc-TFCP2L1-1:3 No - lnc-GLI2-8:1 No - lnc-TFCP2L1-3:1 Yes chr3L:21172853-21183278 lnc-TSN-10:1 Yes chr3L:21172853-21183278 lnc-TSN-10:2 Yes chr3L:21172853-21183278 lnc-TSN-10:3 Yes chr3L:21172853-21183278 lnc-TSN-10:4 Yes chr3L:21172853-21183278 lnc-NIFK-9:1 Yes chr3L:21172853-21183278 NIFK-AS1:5 No - NIFK-AS1:7 No - NIFK-AS1:18 No - lnc-CLASP1-1:1 No - lnc-CLASP1-2:1 No - lnc-CLASP1-3:1 Yes chr3R:22584773-22586209 lnc-NIFK-7:1 Yes chr2R:10479011-10480111 lnc-NIFK-8:1 Yes chr2R:10479011-10480111 LINC01823:11 No - lnc-TSN-13:1 No - lnc-TSN-14:1 No - lnc-TSN-6:3 No - lnc-TSN-15:1 No - lnc-TSN-16:1 No - lnc-TSN-17:1 No - lnc-NIFK-11:1 No - lnc-NIFK-2:3 No - lnc-TSN-18:1 No - lnc-TSN-9:2 No - lnc-NIFK-12:1 No - lnc-CNTNAP5-1:2 No - lnc-CNTNAP5-8:1 No - lnc-CNTNAP5-7:1 No - lnc-NIFK-13:1 No - lnc-CNTNAP5-9:1 No - lnc-CNTNAP5-2:2 No - lnc-BIN1-3:2 No - LINC01889:4 No - lnc-GYPC-4:1 No - lnc-GYPC-3:1 No - lnc-BIN1-8:1 No - lnc-GYPC-2:3 No - lnc-BIN1-7:1 No - lnc-TEX51-5:1 No - lnc-TEX51-2:6 No - lnc-TEX51-3:1 No - lnc-TEX51-4:2 Yes chr2R:12593604-12612068 lnc-PROC-6:1 No - lnc-PROC-5:1 No - lnc-MAP3K2-3:1 Yes chr3L:10631079-10633969 lnc-PROC-1:2 No - lnc-PROC-1:3 No - lnc-PROC-1:4 No - lnc-PROC-1:5 No - lnc-PROC-1:6 No - lnc-PROC-1:7 No - lnc-PROC-1:22 No - lnc-IWS1-1:3 No - lnc-MYO7B-2:3 Yes chrX:16309817-16313138 lnc-MYO7B-2:6 Yes chrX:16309817-16313138 lnc-MYO7B-2:19 Yes chrX:16309817-16313138 lnc-MYO7B-2:15 Yes chrX:16309817-16313138 lnc-MYO7B-2:21 Yes chrX:16309817-16313138 lnc-MAP3K2-4:1 Yes chrX:16309817-16313138 lnc-LIMS2-4:1 Yes chrX:16309817-16313138 lnc-MYO7B-1:1 No - lnc-LIMS2-2:1 Yes chr2L:7666047-7689459 lnc-LIMS2-1:1 Yes chr2L:7666047-7689459 lnc-WDR33-2:1 Yes chr3R:8356978-8359964 lnc-WDR33-2:4 Yes chr3R:8356978-8359964 lnc-WDR33-2:3 Yes chr3R:8356978-8359964 lnc-WDR33-2:2 Yes chr3R:8356978-8359964 lnc-SFT2D3-1:2 No - lnc-AMMECR1L-3:1 Yes chr3R:18252843-18255487 lnc-AMMECR1L-3:2 Yes chr3R:18252843-18255487 lnc-AMMECR1L-2:1 Yes chr3R:18252843-18255487 lnc-AMMECR1L-1:1 Yes chr3R:18252843-18255487 lnc-SFT2D3-2:1 No - lnc-SFT2D3-2:5 No - lnc-UGGT1-5:1 No - lnc-SFT2D3-4:1 Yes chr3L:18872747-18878245 lnc-UGGT1-2:1 No - lnc-UGGT1-3:1 No - lnc-UGGT1-4:1 No - lnc-HS6ST1-3:1 Yes chr3R:19929277-20008512 lnc-SAP130-1:1 Yes chr3R:19929277-20008512 lnc-SAP130-2:1 Yes chr3R:19929277-20008512 lnc-UGGT1-6:1 No - lnc-HS6ST1-4:1 No - lnc-HS6ST1-5:1 No - lnc-HS6ST1-6:1 No - lnc-HS6ST1-7:1 No - lnc-UGGT1-1:3 No - lnc-HS6ST1-8:1 No - lnc-RAB6C-8:1 No - lnc-POTEF-1:3 No - lnc-POTEF-1:2 No - lnc-POTEF-8:2 Yes chr2L:12107221-12109116 lnc-POTEF-8:1 Yes chr2L:12107221-12109116 lnc-POTEF-8:3 Yes chr2L:12107221-12109116 lnc-POTEF-7:1 No - lnc-RAB6C-5:1 No - lnc-RAB6C-6:1 No - lnc-POTEF-6:9 No - lnc-POTEF-6:7 No - lnc-POTEF-6:5 No - lnc-POTEF-6:4 No - lnc-POTEF-6:10 No - lnc-POTEF-6:3 No - lnc-POTEF-6:2 No - lnc-POTEF-6:8 No - lnc-RAB6C-7:1 No - lnc-POTEF-6:6 No - lnc-POTEF-6:1 No - lnc-CCDC74B-1:1 No - lnc-CCDC74B-1:2 No - lnc-TUBA3E-1:4 Yes chr3R:11879702-11882534 lnc-TUBA3E-1:5 Yes chr3R:11879702-11882534 lnc-MZT2B-3:1 No - lnc-MZT2B-4:1 No - lnc-IMP4-9:1 No - lnc-IMP4-8:1 No - lnc-IMP4-7:1 No - lnc-IMP4-6:1 No - lnc-IMP4-5:1 No - lnc-IMP4-5:2 No - lnc-IMP4-4:1 No - lnc-IMP4-3:1 No - lnc-CCDC115-2:1 No - lnc-IMP4-2:1 No - lnc-CCDC115-1:1 No - lnc-POTEI-3:2 No - lnc-PTPN18-2:1 Yes chr3R:25074877-25076382 lnc-POTEI-2:8 No - lnc-POTEI-2:7 No - lnc-POTEI-2:6 No - lnc-POTEI-2:14 No - lnc-POTEI-2:11 No - lnc-POTEI-2:9 No - lnc-POTEI-2:5 No - lnc-POTEI-2:13 No - lnc-POTEI-2:10 No - lnc-PTPN18-3:1 No - lnc-POTEI-2:4 No - lnc-POTEI-2:2 No - lnc-POTEI-2:1 No - lnc-POTEI-2:3 No - lnc-PRSS40B-3:2 No - lnc-PRSS40B-1:4 Yes chr3L:6092188-6093313 lnc-PRSS40B-1:3 Yes chr3L:6092188-6093313 lnc-GPR148-2:1 No - lnc-GPR148-2:2 No - lnc-GPR148-2:3 No - lnc-GPR148-2:4 No - lnc-CFC1-3:1 No - lnc-GPR148-2:5 No - lnc-GPR148-2:6 No - lnc-GPR148-2:7 No - lnc-GPR148-2:8 No - lnc-GPR148-2:9 No - lnc-GPR148-2:10 No - lnc-CFC1-2:7 No - lnc-CFC1-5:1 No - lnc-AMER3-1:1 No - lnc-ARHGEF4-1:5 No - lnc-ARHGEF4-2:1 No - lnc-FAM168B-2:1 No - lnc-FAM168B-3:1 No - lnc-POTEE-1:1 No - lnc-PLEKHB2-1:9 No - lnc-PLEKHB2-1:10 No - lnc-PLEKHB2-1:11 No - lnc-RAB6D-18:1 No - lnc-PLEKHB2-1:13 No - lnc-PLEKHB2-1:14 No - lnc-RAB6D-17:1 No - lnc-RAB6D-16:1 No - lnc-PLEKHB2-1:15 No - lnc-RAB6D-15:1 No - lnc-PLEKHB2-5:1 No - lnc-RAB6D-14:1 No - lnc-RAB6D-13:1 No - lnc-RAB6D-12:1 No - lnc-RAB6D-11:1 No - lnc-RAB6D-10:1 No - lnc-RAB6D-9:1 No - lnc-RAB6D-8:1 No - lnc-RAB6D-7:1 No - lnc-RAB6D-6:1 No - LINC01120:6 No - lnc-MZT2A-1:1 No - lnc-RAB6D-1:1 No - lnc-TUBA3D-1:2 No - lnc-TUBA3D-1:3 No - lnc-CCDC74A-1:3 No - lnc-MZT2A-4:2 No - lnc-MZT2A-4:1 No - lnc-MZT2A-5:1 No - LINC01087:2 No - lnc-MZT2A-20:1 No - lnc-CCDC74A-5:2 No - lnc-CCDC74A-4:1 No - lnc-CCDC74A-9:1 No - lnc-CCDC74A-10:1 No - lnc-ANKRD30BL-13:1 No - lnc-CCDC74A-12:1 No - lnc-CCDC74A-13:1 No - lnc-ANKRD30BL-9:1 No - lnc-ANKRD30BL-8:1 No - lnc-ANKRD30BL-6:1 No - lnc-GPR39-11:1 No - lnc-ANKRD30BL-4:2 No - lnc-ANKRD30BL-4:1 No - lnc-ANKRD30BL-3:3 No - lnc-ANKRD30BL-3:1 No - lnc-GPR39-10:1 No - lnc-GPR39-9:1 No - lnc-GPR39-8:1 No - lnc-ANKRD30BL-5:1 No - lnc-GPR39-7:1 No - lnc-GPR39-7:2 No - lnc-GPR39-2:6 No - lnc-GPR39-2:7 No - lnc-GPR39-2:8 No - lnc-GPR39-6:1 No - lnc-LYPD1-3:1 No - lnc-CCDC74A-14:1 No - lnc-LYPD1-2:1 No - lnc-GPR39-4:4 No - lnc-LYPD1-4:1 No - lnc-MGAT5-5:1 No - lnc-TMEM163-4:1 No - lnc-TMEM163-3:1 No - lnc-TMEM163-2:1 No - lnc-MGAT5-3:1 No - lnc-MAP3K19-5:2 No - lnc-MAP3K19-5:1 No - lnc-MAP3K19-5:3 No - lnc-MGAT5-4:1 No - lnc-ACMSD-3:1 No - lnc-ACMSD-2:1 No - CCNT2-AS1:1 No - CCNT2-AS1:12 No - CCNT2-AS1:10 No - CCNT2-AS1:2 No - CCNT2-AS1:11 No - CCNT2-AS1:3 No - lnc-ACMSD-1:1 No - lnc-ZRANB3-1:1 No - lnc-MAP3K19-3:1 No - lnc-MAP3K19-4:1 No - lnc-LCT-1:1 Yes chrX:6674387-6677176 lnc-UBXN4-9:1 No - lnc-UBXN4-10:1 No - lnc-MCM6-1:3 Yes chr2R:12877004-12883168 lnc-MCM6-1:1 Yes chr2R:12877004-12883168 lnc-MCM6-1:2 Yes chr2R:12877004-12883168 lnc-MCM6-2:2 Yes chr2R:12877004-12883168 lnc-MCM6-2:1 Yes chr2R:12877004-12883168 DARS-AS1:12 No - DARS-AS1:13 No - DARS-AS1:16 No - DARS-AS1:18 No - DARS-AS1:19 No - DARS-AS1:20 No - DARS-AS1:21 No - DARS-AS1:22 No - DARS-AS1:23 No - DARS-AS1:24 No - DARS-AS1:25 No - DARS-AS1:26 No - DARS-AS1:33 No - lnc-UBXN4-12:1 No - lnc-UBXN4-13:1 No - lnc-THSD7B-5:1 No - lnc-THSD7B-3:1 No - lnc-CXCR4-2:1 No - lnc-NXPH2-10:1 No - lnc-THSD7B-2:1 No - lnc-HNMT-3:1 No - lnc-NXPH2-8:1 No - lnc-SPOPL-11:1 No - lnc-SPOPL-10:1 No - lnc-SPOPL-9:1 No - lnc-SPOPL-8:1 No - lnc-NXPH2-7:1 No - lnc-NXPH2-3:4 No - lnc-SPOPL-7:1 No - lnc-SPOPL-6:1 No - lnc-SPOPL-1:2 No - lnc-NXPH2-3:3 No - lnc-NXPH2-6:1 No - lnc-SPOPL-12:1 No - lnc-SPOPL-12:2 No - lnc-SPOPL-14:1 No - lnc-SPOPL-15:1 No - lnc-SPOPL-4:2 No - lnc-SPOPL-5:2 No - lnc-LRP1B-10:1 No - lnc-SPOPL-16:1 No - lnc-LRP1B-9:1 No - lnc-LRP1B-8:1 No - lnc-SPOPL-17:1 No - lnc-LRP1B-7:1 No - lnc-LRP1B-6:1 No - lnc-LRP1B-5:1 No - lnc-KYNU-13:1 Yes chr2R:8174165-8226438 lnc-NXPH2-11:1 Yes chr2R:8174165-8226438 lnc-GTDC1-26:1 Yes chr2R:8174165-8226438 lnc-KYNU-4:1 No - lnc-KYNU-2:1 No - lnc-LRP1B-4:2 No - lnc-LRP1B-12:1 No - lnc-GTDC1-25:1 No - lnc-GTDC1-23:1 No - lnc-KYNU-3:1 No - lnc-GTDC1-22:1 No - lnc-GTDC1-21:1 No - lnc-GTDC1-20:1 No - lnc-GTDC1-19:1 No - lnc-GTDC1-18:1 No - lnc-GTDC1-17:1 No - lnc-KYNU-7:1 No - lnc-KYNU-14:1 No - lnc-GTDC1-8:1 Yes chrX:15853421-15854970 lnc-ZEB2-14:1 Yes chrX:15853421-15854970 lnc-ZEB2-8:1 Yes chrX:15853421-15854970 lnc-GTDC1-9:1 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-GTDC1-10:1 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-ZEB2-1:9 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-ZEB2-1:8 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-ARHGAP15-14:1 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-ZEB2-1:14 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-ZEB2-1:13 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-ARHGAP15-15:1 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-GTDC1-12:1 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-ZEB2-1:10 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-ZEB2-1:7 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-ZEB2-1:11 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-ZEB2-1:12 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-ZEB2-1:4 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-ZEB2-1:6 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB2-AS1:6 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB2-AS1:7 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB2-AS1:9 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB2-AS1:11 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB2-AS1:17 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB2-AS1:18 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB2-AS1:20 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-ZEB2-1:5 Yes chr3R:30765926-30789202 TEX41:1 No - TEX41:3 No - TEX41:4 No - TEX41:5 No - TEX41:6 No - TEX41:7 No - TEX41:16 No - TEX41:17 No - TEX41:18 No - TEX41:19 No - TEX41:20 No - TEX41:23 No - TEX41:26 No - TEX41:27 No - TEX41:30 No - TEX41:41 No - TEX41:43 No - TEX41:44 No - lnc-ARHGAP15-16:1 No - lnc-ZEB2-13:1 No - TEX41:48 No - LINC01966:3 No - lnc-ZEB2-17:1 No - TEX41:56 No - TEX41:60 No - TEX41:61 No - TEX41:62 No - TEX41:63 No - TEX41:64 No - TEX41:65 No - TEX41:66 No - TEX41:80 No - TEX41:94 No - TEX41:100 No - TEX41:101 No - TEX41:106 No - lnc-ZEB2-3:2 No - lnc-ZEB2-18:1 No - lnc-ARHGAP15-19:1 No - lnc-ARHGAP15-20:1 No - lnc-ZEB2-19:1 No - lnc-ZEB2-20:1 No - lnc-ACVR2A-12:1 No - lnc-ACVR2A-11:1 No - lnc-ACVR2A-9:1 No - lnc-ORC4-4:1 No - lnc-ACVR2A-8:1 No - lnc-ACVR2A-5:1 No - lnc-ORC4-2:1 No - lnc-MMADHC-12:2 Yes chr2R:24795740-24797414 lnc-MMADHC-12:1 Yes chr2R:24795740-24797414 lnc-MMADHC-11:1 Yes chr2R:24795740-24797414 lnc-MMADHC-10:1 Yes chr2R:24795740-24797414 lnc-MBD5-1:1 No - lnc-MBD5-1:2 No - lnc-MBD5-1:3 No - lnc-MBD5-1:4 No - lnc-MBD5-1:5 No - lnc-MBD5-1:6 No - lnc-MBD5-1:7 Yes chr3R:23894174-23922973 lnc-MBD5-1:8 Yes chr3R:23894174-23922973 lnc-ORC4-3:1 Yes chr3R:23894174-23922973 lnc-MMADHC-9:1 No - lnc-MMADHC-2:2 Yes chr2R:16266960-16271971 lnc-MMADHC-8:2 No - lnc-MMADHC-8:1 No - lnc-MMADHC-7:1 No - lnc-MMADHC-2:4 Yes chr2R:16266960-16271971 lnc-MMADHC-6:2 Yes chr2R:16266960-16271971 lnc-MMADHC-6:1 Yes chr2R:16266960-16271971 lnc-LYPD6B-1:1 No - lnc-MMADHC-5:1 No - lnc-LYPD6-4:1 No - lnc-LYPD6B-3:1 No - lnc-RND3-7:1 Yes chrX:9194750-9196414 lnc-LYPD6-2:19 No - lnc-LYPD6-2:21 No - lnc-LYPD6-2:22 No - lnc-LYPD6-2:4 No - lnc-LYPD6-2:23 No - lnc-LYPD6-2:5 No - lnc-MMADHC-4:1 No - LINC01818:5 No - lnc-LYPD6-10:1 No - lnc-LYPD6-12:1 No - lnc-LYPD6-11:1 No - lnc-LYPD6-13:1 No - lnc-LYPD6-14:1 No - lnc-RND3-5:1 No - lnc-LYPD6-15:1 No - lnc-LYPD6-17:1 No - lnc-LYPD6-17:2 No - lnc-RBM43-6:1 Yes chr3R:9497101-9502581 lnc-TNFAIP6-2:10 No - lnc-TNFAIP6-2:11 No - lnc-RND3-6:1 No - lnc-RBM43-5:1 No - lnc-RBM43-2:1 No - lnc-RBM43-3:1 No - lnc-RIF1-1:1 No - lnc-NMI-2:1 No - lnc-TNFAIP6-5:1 Yes chr2R:15864309-15869147 lnc-TNFAIP6-6:1 No - lnc-TNFAIP6-6:2 No - lnc-NMI-7:1 Yes chr3L:16676406-16711677 lnc-RIF1-2:1 Yes chr3L:8298501-8299839 lnc-ARL5A-1:1 Yes chr3L:8298501-8299839 lnc-ARL5A-1:3 Yes chr3L:8298501-8299839 lnc-ARL5A-1:4 Yes chr3L:8298501-8299839 lnc-CACNB4-1:1 No - lnc-ARL5A-2:1 No - lnc-ARL5A-3:1 No - lnc-FMNL2-4:1 No - lnc-CACNB4-2:1 Yes chr2L:10858536-10862006 lnc-FMNL2-3:1 Yes chr2L:10858536-10862006 lnc-CACNB4-3:1 Yes chr2L:10858536-10862006 lnc-FMNL2-1:2 No - lnc-PRPF40A-2:1 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-PRPF40A-1:1 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-STAM2-1:2 No - lnc-STAM2-1:1 No - lnc-STAM2-2:1 No - lnc-STAM2-3:1 No - lnc-STAM2-4:1 No - lnc-PRPF40A-5:3 No - lnc-PRPF40A-5:2 No - lnc-PRPF40A-5:1 No - lnc-ARL6IP6-3:1 No - lnc-ARL6IP6-5:1 No - LINC01850:4 No - lnc-GALNT13-5:1 No - lnc-RPRM-6:1 No - lnc-RPRM-9:1 Yes chr2L:5072170-5093592 lnc-RPRM-4:3 No - lnc-GALNT13-4:1 No - lnc-RPRM-5:2 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-RPRM-5:4 No - lnc-RPRM-5:3 No - lnc-NR4A2-15:1 No - lnc-NR4A2-14:1 No - lnc-KCNJ3-3:1 No - lnc-KCNJ3-4:1 No - lnc-NR4A2-13:1 No - lnc-KCNJ3-5:1 No - lnc-KCNJ3-1:3 No - lnc-KCNJ3-7:1 No - lnc-KCNJ3-7:2 No - lnc-KCNJ3-7:3 No - lnc-KCNJ3-7:4 No - lnc-KCNJ3-7:5 No - lnc-GPD2-3:2 No - LINC01876:21 No - lnc-NR4A2-8:1 No - lnc-ERMN-4:2 Yes chr2L:20683462-20714588 lnc-ERMN-4:1 Yes chr2L:20683462-20714588 lnc-GALNT5-3:1 Yes chr2R:7535919-7538297 lnc-NR4A2-10:1 No - lnc-ERMN-3:1 No - lnc-ERMN-1:1 No - lnc-UPP2-7:2 No - lnc-ERMN-2:1 No - lnc-CYTIP-1:1 Yes chr3L:6076722-6082491 lnc-CYTIP-1:2 Yes chr3L:6076722-6082491 lnc-UPP2-4:1 No - lnc-UPP2-2:2 Yes chr3R:26949692-26958491 lnc-PKP4-7:1 Yes chr3R:26949692-26958491 lnc-ACVR1-2:1 Yes chr3R:26949692-26958491 lnc-PKP4-6:1 Yes chr3R:26949692-26958491 lnc-ACVR1-4:1 No - lnc-PKP4-4:1 No - lnc-ACVR1-3:1 No - lnc-UPP2-6:2 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-DAPL1-4:1 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-PKP4-3:1 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-WDSUB1-1:1 No - lnc-WDSUB1-2:2 No - lnc-WDSUB1-2:1 No - lnc-BAZ2B-1:19 No - lnc-TANC1-2:1 No - lnc-BAZ2B-1:18 No - lnc-BAZ2B-1:4 No - lnc-CD302-2:1 No - lnc-LY75-1:1 No - lnc-LY75-1:2 No - lnc-PLA2R1-1:3 No - lnc-PLA2R1-2:1 No - LINC02478:16 No - LINC02478:11 No - LINC02478:15 No - LINC02478:14 No - LINC02478:13 No - lnc-ITGB6-2:2 Yes chr3L:5155821-5277944 lnc-ITGB6-2:4 Yes chr3L:5155821-5277944 lnc-ITGB6-2:1 Yes chr3L:5155821-5277944 lnc-ITGB6-2:3 Yes chr3L:5155821-5277944 lnc-ITGB6-3:1 Yes chr3L:5155821-5277944 lnc-ITGB6-4:1 Yes chr3L:5155821-5277944 lnc-RBMS1-4:1 No - lnc-RBMS1-5:1 No - lnc-TANK-6:1 No - lnc-RBMS1-1:2 No - lnc-TANK-4:1 No - lnc-TANK-4:2 No - lnc-RBMS1-7:1 No - lnc-DPP4-2:6 No - lnc-DPP4-2:4 No - lnc-RBMS1-9:1 No - lnc-RBMS1-10:1 No - lnc-DPP4-2:7 No - LINC01806:15 No - LINC01806:26 No - LINC01806:27 No - lnc-DPP4-2:10 No - lnc-PSMD14-1:1 No - lnc-DPP4-9:1 Yes chr2L:5058404-5059790 lnc-DPP4-1:3 No - lnc-DPP4-7:1 Yes chr2L:7223328-7249343 lnc-DPP4-5:1 Yes chr2L:7223328-7249343 lnc-DPP4-3:1 Yes chr2L:7223328-7249343 lnc-GCG-4:1 Yes chr3L:14672839-14747868 lnc-GCG-3:1 Yes chr3L:14672839-14747868 lnc-FAP-2:1 No - lnc-GCG-1:1 Yes chr3L:14672839-14747868 lnc-GCG-2:2 Yes chr3L:14672839-14747868 lnc-GCG-2:1 Yes chr3L:14672839-14747868 lnc-FAP-1:1 Yes chr3L:14672839-14747868 lnc-GCA-5:1 No - lnc-FAP-3:1 No - lnc-GCA-2:2 Yes chr2R:24047411-24053035 lnc-GCA-2:3 Yes chr2R:24047411-24053035 lnc-GCA-2:4 Yes chr2R:24047411-24053035 lnc-SCN2A-11:1 No - lnc-SCN2A-10:1 No - lnc-GRB14-3:1 No - lnc-COBLL1-5:1 Yes chrX:19830215-19852059 lnc-COBLL1-4:1 Yes chrX:19830215-19852059 lnc-SCN2A-9:1 No - lnc-SCN2A-9:2 No - lnc-COBLL1-1:2 No - lnc-SLC38A11-4:4 No - lnc-SLC38A11-4:2 No - lnc-GRB14-2:1 No - lnc-SLC38A11-4:3 No - lnc-SLC38A11-4:1 No - lnc-SLC38A11-2:1 No - lnc-COBLL1-2:3 Yes chr2R:9044850-9060608 lnc-COBLL1-2:4 Yes chr2R:9044850-9060608 lnc-COBLL1-2:2 Yes chr2R:9044850-9060608 lnc-COBLL1-2:1 Yes chr2R:9044850-9060608 lnc-COBLL1-3:1 Yes chr2R:9044850-9060608 lnc-SCN2A-6:2 Yes chr2R:9044850-9060608 lnc-SCN2A-6:3 No - lnc-SCN2A-5:1 No - lnc-SLC38A11-3:1 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-SCN3A-1:1 No - lnc-CSRNP3-8:1 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-CSRNP3-7:1 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-SCN2A-4:1 No - lnc-SCN2A-7:1 No - lnc-CSRNP3-6:1 Yes chr2R:16673235-16732916 lnc-CSRNP3-9:1 Yes chr2R:16673235-16732916 lnc-TTC21B-2:2 No - lnc-TTC21B-2:3 No - lnc-TTC21B-2:1 No - TTC21B-AS1:5 No - lnc-SCN1A-2:1 No - lnc-SCN9A-72:3 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-SCN1A-3:3 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-SCN9A-1:1 No - lnc-SCN1A-4:2 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-SCN1A-4:1 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-SCN7A-2:1 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-SCN9A-2:3 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-SCN9A-4:1 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-SCN7A-3:1 No - lnc-STK39-6:1 No - lnc-XIRP2-2:1 No - lnc-XIRP2-2:2 No - lnc-STK39-2:3 No - lnc-SPC25-6:1 Yes chr3R:18573091-18589459 lnc-SPC25-3:1 Yes chr3R:18573091-18589459 lnc-CERS6-1:2 No - lnc-STK39-4:1 No - lnc-CERS6-2:1 No - CERS6-AS1:4 Yes chrX:6257668-6267228 CERS6-AS1:5 Yes chrX:6257668-6267228 CERS6-AS1:11 Yes chrX:6257668-6267228 CERS6-AS1:12 Yes chrX:6257668-6267228 CERS6-AS1:13 Yes chrX:6257668-6267228 CERS6-AS1:6 Yes chrX:6257668-6267228 CERS6-AS1:7 No - lnc-ABCB11-1:1 No - lnc-SPC25-2:1 Yes chr3L:6240500-6245746 lnc-DHRS9-2:1 No - lnc-BBS5-6:1 Yes chrX:9358496-9500129 lnc-FASTKD1-2:1 No - lnc-FASTKD1-1:1 No - lnc-CCDC173-5:2 Yes chr2L:6038117-6041283 lnc-CCDC173-5:1 Yes chr2L:6038117-6041283 lnc-CCDC173-5:4 Yes chr2L:6038117-6041283 lnc-CCDC173-1:1 Yes chr2L:6038117-6041283 lnc-CCDC173-5:3 Yes chr2L:6038117-6041283 lnc-CCDC173-2:1 Yes chr2L:6038117-6041283 lnc-FASTKD1-3:1 No - lnc-FASTKD1-4:1 No - lnc-PHOSPHO2-2:1 Yes chr3R:28340334-28345169 lnc-FASTKD1-5:1 No - lnc-PPIG-1:1 No - lnc-SSB-2:1 No - lnc-METTL5-1:1 No - lnc-KLHL23-1:1 No - lnc-SSB-1:1 No - lnc-CCDC173-3:1 No - lnc-CCDC173-4:1 Yes chr3L:19263766-19266838 lnc-METTL5-2:1 Yes chrX:7935896-7953883 lnc-UBR3-4:1 No - lnc-METTL5-4:123 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-METTL5-4:124 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-METTL5-4:125 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-METTL5-4:126 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-METTL5-4:127 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-METTL5-4:128 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-METTL5-4:129 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-METTL5-4:130 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-METTL5-4:131 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-METTL5-4:132 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-METTL5-4:105 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-METTL5-4:133 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-METTL5-4:134 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-METTL5-4:89 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-METTL5-4:85 Yes chr2L:7377702-7384344 LINC01124:17 No - LINC01124:8 No - LINC01124:9 No - LINC01124:16 No - lnc-ERICH2-1:2 No - lnc-ERICH2-1:3 No - lnc-ERICH2-1:10 No - lnc-ERICH2-1:11 No - lnc-ERICH2-1:16 No - lnc-TLK1-3:1 Yes chr3L:19924943-19927175 lnc-METTL8-4:1 Yes chrX:3720007-3789770 lnc-METTL8-4:4 Yes chrX:3720007-3789770 lnc-METTL8-4:3 Yes chrX:3720007-3789770 lnc-METTL8-4:2 Yes chrX:3720007-3789770 lnc-TLK1-1:2 No - lnc-METTL8-2:2 No - lnc-DCAF17-6:1 No - lnc-TLK1-2:2 Yes chr3L:1637942-1639235 lnc-TLK1-7:8 Yes chr3L:1637942-1639235 lnc-TLK1-7:4 Yes chr3L:1637942-1639235 lnc-TLK1-7:5 Yes chr3L:1637942-1639235 lnc-TLK1-7:3 Yes chr3L:1637942-1639235 lnc-TLK1-7:6 Yes chr3L:1637942-1639235 lnc-TLK1-7:7 Yes chr3L:1637942-1639235 lnc-TLK1-7:1 No - lnc-TLK1-7:2 Yes chr3L:1637942-1639235 lnc-TLK1-5:1 Yes chr3L:1637942-1639235 lnc-DCAF17-3:1 No - lnc-CYBRD1-1:1 No - lnc-METTL8-3:1 No - lnc-METTL8-3:2 No - lnc-DCAF17-5:1 Yes chr3L:2252744-2257423 lnc-DLX2-13:1 Yes chr3R:30445635-30455867 lnc-DLX2-8:4 Yes chr3R:30445635-30455867 lnc-SLC25A12-8:1 No - lnc-ITGA6-1:7 No - lnc-ITGA6-1:9 No - lnc-ITGA6-1:10 No - lnc-DLX2-7:1 No - lnc-PDK1-2:1 No - lnc-PDK1-1:3 No - lnc-DLX2-10:1 No - lnc-DLX2-11:1 Yes chr2R:6759715-6798941 MAP3K20-AS1:23 No - lnc-SP3-2:2 No - lnc-SP3-14:1 No - lnc-SP3-13:1 No - lnc-SP3-12:1 No - lnc-SP3-11:1 No - lnc-SP9-10:1 No - lnc-OLA1-5:1 Yes chr3R:24223445-24226934 lnc-SP9-8:1 Yes chr3R:24223445-24226934 lnc-OLA1-4:1 Yes chr3R:24223445-24226934 lnc-OLA1-4:3 Yes chr3R:24223445-24226934 lnc-OLA1-4:2 Yes chr3R:24223445-24226934 lnc-SP3-4:1 No - lnc-SP9-7:1 No - lnc-OLA1-2:1 No - lnc-SP3-10:1 Yes chrX:9778742-9782094 lnc-CIR1-4:1 Yes chrX:9778742-9782094 lnc-CIR1-2:1 Yes chrX:9729648-9782094 lnc-GPR155-3:1 Yes chr3L:18901594-18902952 lnc-GPR155-2:1 Yes chr3L:18901594-18902952 lnc-CIR1-3:1 Yes chr3L:17621824-17630971 lnc-WIPF1-2:1 Yes chr3L:17621824-17630971 lnc-SCRN3-1:3 No - lnc-GPR155-1:1 No - lnc-SCRN3-6:1 No - lnc-WIPF1-1:1 No - lnc-SCRN3-7:1 No - lnc-GPR155-4:1 No - lnc-GPR155-5:1 No - lnc-CHRNA1-4:1 No - lnc-CHRNA1-4:3 No - lnc-CHRNA1-4:2 No - lnc-WIPF1-3:2 No - lnc-WIPF1-3:1 No - lnc-CHN1-4:1 Yes chrX:8276200-8367169 lnc-CHRNA1-2:6 Yes chrX:5616572-5618806 lnc-CHRNA1-5:4 Yes chrX:5616572-5618806 lnc-CHRNA1-5:3 Yes chrX:5616572-5618806 lnc-CHRNA1-5:2 Yes chrX:5616572-5618806 lnc-CHRNA1-5:1 Yes chrX:5616572-5618806 lnc-SCRN3-9:1 No - lnc-CHN1-3:1 No - lnc-ATF2-2:1 No - lnc-CHN1-5:11 No - lnc-CHN1-6:1 No - lnc-ATF2-5:2 No - lnc-ATF2-5:1 No - lnc-ATF2-1:2 Yes chr3R:31216145-31219630 lnc-ATF2-1:1 Yes chr3R:31216145-31219630 lnc-SCRN3-10:1 Yes chr3R:31216145-31219630 lnc-SCRN3-11:1 Yes chr3R:31216145-31219630 lnc-EVX2-2:1 Yes chr2R:8596972-8599962 lnc-EVX2-1:2 Yes chr2R:8596972-8599962 lnc-EVX2-1:1 Yes chr2R:8596972-8599962 lnc-HOXD13-3:1 Yes chr2R:8596972-8599962 lnc-HOXD13-3:2 No - lnc-LNPK-3:1 No - HOXD-AS2:9 No - lnc-HOXD3-2:1 Yes chr3R:6752864-6754194 HAGLR:14 Yes chr3R:6752864-6754194 HAGLR:11 Yes chr3R:6752864-6754194 HAGLR:2 Yes chr3R:6661427-6678590 HAGLR:29 No - HAGLROS:1 No - HAGLROS:6 No - lnc-EVX2-8:1 No - lnc-EVX2-10:1 No - lnc-MTX2-6:1 No - LINC01116:2 No - LINC01117:3 No - LINC01117:5 No - LINC01117:15 No - lnc-NFE2L2-5:5 No - LINC01117:16 No - lnc-NFE2L2-7:1 No - LINC01117:17 No - LINC01117:18 No - lnc-HNRNPA3-4:2 No - lnc-NFE2L2-3:3 No - lnc-HNRNPA3-3:2 No - lnc-HNRNPA3-13:1 No - lnc-HNRNPA3-5:1 No - lnc-NFE2L2-1:3 No - lnc-NFE2L2-1:2 Yes chr3R:26872129-26875742 lnc-AGPS-6:6 Yes chr3R:26872129-26875742 lnc-TTC30B-5:1 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-TTC30B-4:1 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-TTC30B-1:7 No - lnc-TTC30B-1:9 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-TTC30B-1:8 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-AGPS-4:1 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-TTC30B-1:20 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-TTC30B-1:6 No - lnc-PDE11A-1:1 No - lnc-TTC30A-2:1 No - lnc-RBM45-2:1 No - lnc-PDE11A-3:1 No - lnc-RBM45-9:1 No - lnc-OSBPL6-1:2 No - lnc-PJVK-2:7 Yes chr2L:13382652-13385671 lnc-PJVK-2:8 Yes chr2L:13382652-13385671 lnc-PJVK-2:9 Yes chr2L:13382652-13385671 lnc-PJVK-2:10 Yes chr2L:13382652-13385671 lnc-PJVK-2:21 Yes chr2L:13382652-13385671 lnc-PJVK-2:23 Yes chr2L:13382652-13385671 lnc-FKBP7-2:1 Yes chr2L:13382652-13385671 lnc-FKBP7-1:1 Yes chr3R:11674221-11674923 lnc-PLEKHA3-15:1 Yes chr4:724400-776474 lnc-CCDC141-3:1 Yes chr4:724400-776474 lnc-CCDC141-2:1 Yes chr4:724400-776474 lnc-TTN-1:1 No - lnc-PLEKHA3-17:1 No - lnc-CCDC141-1:1 Yes chr3L:2153201-2163863 lnc-PLEKHA3-18:1 No - lnc-ZNF385B-2:1 No - lnc-ZNF385B-1:3 No - lnc-ZNF385B-1:4 No - lnc-ZNF385B-1:1 No - lnc-PLEKHA3-19:1 No - lnc-UBE2E3-9:1 No - lnc-UBE2E3-8:1 No - lnc-UBE2E3-6:1 No - lnc-CWC22-2:1 No - lnc-CWC22-3:1 No - lnc-CWC22-4:1 No - lnc-CWC22-5:1 No - lnc-CWC22-6:1 No - lnc-CERKL-9:1 No - lnc-CERKL-8:1 No - SCHLAP1:9 No - lnc-CERKL-7:1 No - SCHLAP1:11 No - lnc-CERKL-6:1 No - lnc-UBE2E3-2:14 Yes chr2L:10765010-10768006 lnc-CERKL-2:3 Yes chr2L:10765010-10768006 lnc-CERKL-2:2 No - LINC01934:22 No - lnc-CERKL-4:1 No - lnc-CERKL-4:6 No - lnc-CERKL-4:7 No - lnc-CERKL-4:2 No - lnc-CERKL-4:3 No - lnc-ITGA4-1:2 Yes chr3R:8278052-8279274 lnc-PDE1A-2:1 No - lnc-PDE1A-2:2 No - lnc-SSFA2-1:1 No - lnc-NEUROD1-3:1 Yes chr2L:11814156-11928572 lnc-FRZB-4:1 Yes chr2L:11814156-11928572 lnc-PPP1R1C-3:1 Yes chr2L:11814156-11928572 lnc-DNAJC10-3:1 No - lnc-PDE1A-1:5 No - lnc-PDE1A-1:4 No - lnc-DUSP19-4:1 No - lnc-DUSP19-3:1 No - lnc-DNAJC10-2:1 No - lnc-FRZB-2:3 Yes chr3L:22284354-22288195 lnc-DNAJC10-4:1 Yes chr3L:22284354-22288195 lnc-DNAJC10-5:1 Yes chr3L:22284354-22288195 lnc-FRZB-1:1 Yes chr3L:22284354-22288195 lnc-FRZB-5:1 Yes chr3L:22284354-22288195 lnc-FRZB-5:2 Yes chr3L:22284354-22288195 lnc-FRZB-3:1 Yes chr3L:22284354-22288195 lnc-DUSP19-1:2 Yes chrX:18648182-18649489 lnc-NUP35-4:1 No - lnc-NCKAP1-3:1 No - lnc-NUP35-4:2 No - lnc-NUP35-3:1 No - lnc-ZNF804A-2:2 No - lnc-ZNF804A-3:1 No - lnc-NCKAP1-5:1 No - lnc-ZNF804A-1:8 No - lnc-FSIP2-5:1 No - lnc-FSIP2-5:2 No - lnc-ZSWIM2-6:9 No - lnc-ZSWIM2-6:6 No - lnc-ZSWIM2-13:1 No - lnc-ZSWIM2-12:1 No - LINC01473:13 No - LINC01473:5 No - LINC01473:2 No - lnc-FSIP2-4:1 No - lnc-FSIP2-2:1 No - lnc-FSIP2-3:1 No - lnc-ZSWIM2-10:1 No - lnc-ZSWIM2-2:2 No - lnc-ZC3H15-4:1 No - LINC01473:1 No - lnc-ZC3H15-3:1 No - lnc-ZSWIM2-9:1 No - lnc-ZC3H15-1:1 No - lnc-ZSWIM2-8:1 Yes chr2R:8630207-8631962 lnc-ZC3H15-2:1 No - lnc-CALCRL-3:1 No - lnc-FAM171B-1:4 No - lnc-FAM171B-3:1 No - lnc-TFPI-1:3 Yes chrX:12950436-12957462 lnc-TFPI-1:1 Yes chrX:12950436-12957462 lnc-TFPI-1:2 Yes chrX:12950436-12957462 lnc-FAM171B-1:8 Yes chrX:12950436-12957462 lnc-TFPI-1:4 Yes chrX:12950436-12957462 lnc-CALCRL-1:1 No - lnc-CALCRL-2:1 No - lnc-GULP1-1:1 No - LINC01090:5 No - lnc-COL3A1-3:1 Yes chr2R:9434669-9444937 lnc-DIRC1-3:1 No - lnc-SLC40A1-1:3 No - lnc-SLC40A1-2:1 No - lnc-SLC40A1-3:3 No - lnc-SLC40A1-3:1 No - lnc-SLC40A1-3:2 No - lnc-OSGEPL1-2:1 No - lnc-ORMDL1-3:1 No - lnc-ORMDL1-2:2 No - lnc-ORMDL1-2:1 No - OSGEPL1-AS1:2 Yes chrX:19699820-19701755 lnc-OSGEPL1-4:1 Yes chr3L:21635305-21636251 lnc-C2orf88-1:1 No - lnc-C2orf88-1:2 No - lnc-ORMDL1-4:1 No - lnc-MSTN-1:1 No - lnc-C2orf88-1:3 No - lnc-MSTN-2:1 Yes chr3R:15357229-15359263 lnc-MSTN-2:2 Yes chr3R:15357229-15359263 lnc-MSTN-3:3 Yes chr3R:15357229-15359263 lnc-MSTN-3:1 Yes chr3R:15357229-15359263 lnc-MSTN-3:2 Yes chr3R:15357229-15359263 lnc-NEMP2-4:1 Yes chr2R:14739359-14745335 lnc-HIBCH-1:1 Yes chrX:16653220-16655015 lnc-NEMP2-2:1 No - lnc-NEMP2-38:10 No - lnc-NEMP2-38:9 No - lnc-NEMP2-38:4 Yes chr3L:4153618-4160932 lnc-NEMP2-38:3 Yes chr3L:4153618-4160932 lnc-STAT1-3:1 No - lnc-STAT1-2:3 No - lnc-STAT1-2:2 Yes chr2R:12670483-12679593 lnc-STAT4-3:1 No - lnc-STAT4-2:1 No - lnc-MYO1B-2:1 No - lnc-STAT4-1:2 No - lnc-STAT4-4:1 No - lnc-NABP1-2:1 No - lnc-NABP1-1:2 Yes chr2L:7408533-7409809 lnc-NABP1-1:3 Yes chr2L:7408533-7409809 lnc-NABP1-1:4 Yes chr2L:7408533-7409809 lnc-NABP1-1:6 No - lnc-NABP1-5:2 No - lnc-NABP1-5:9 No - lnc-NABP1-5:10 No - lnc-NABP1-5:11 No - lnc-NABP1-5:12 No - lnc-NABP1-5:13 No - lnc-NABP1-5:17 No - lnc-NABP1-5:18 No - lnc-NABP1-5:20 No - lnc-NABP1-5:24 No - lnc-NABP1-14:1 No - PCGEM1:1 No - PCGEM1:7 No - lnc-NABP1-16:1 No - lnc-SLC39A10-13:1 No - lnc-DNAH7-5:1 No - lnc-SLC39A10-2:2 No - lnc-SLC39A10-7:1 No - LINC01827:6 Yes chr3L:8525244-8534503 lnc-CCDC150-7:1 Yes chr3L:8525244-8534503 lnc-STK17B-4:1 Yes chr2L:17501401-17525515 lnc-STK17B-2:1 Yes chr2L:17501401-17525515 lnc-SLC39A10-10:1 No - lnc-STK17B-1:1 Yes chrX:9608946-9623243 lnc-CCDC150-5:1 Yes chrX:9608946-9623243 lnc-GTF3C3-1:1 No - lnc-C2orf66-2:1 Yes chr2R:17059331-17062634 lnc-PGAP1-1:1 No - lnc-C2orf66-1:1 Yes chrX:5685253-5689473 lnc-C2orf66-3:2 Yes chrX:5685253-5689473 lnc-C2orf66-3:1 Yes chrX:5685253-5689473 lnc-ANKRD44-1:1 No - lnc-PGAP1-2:1 No - lnc-CCDC150-4:1 No - lnc-PGAP1-3:1 No - lnc-PGAP1-4:1 No - lnc-SF3B1-4:1 No - lnc-COQ10B-4:1 No - lnc-SF3B1-3:1 No - lnc-SF3B1-2:1 No - lnc-ANKRD44-2:1 Yes chr2L:568340-572907 lnc-ANKRD44-3:1 Yes chr2L:568340-572907 lnc-HSPD1-1:2 Yes chr2L:568340-572907 lnc-HSPD1-1:3 Yes chr2L:568340-572907 lnc-HSPD1-1:1 Yes chr2L:568340-572907 lnc-RFTN2-1:1 Yes chr3L:9097629-9134405 lnc-BOLL-4:1 Yes chr3L:9097629-9134405 lnc-BOLL-5:1 No - lnc-PLCL1-1:1 No - lnc-SATB2-6:1 No - lnc-PLCL1-2:1 No - lnc-SATB2-4:1 No - lnc-FTCDNL1-3:1 No - SATB2-AS1:3 No - SATB2-AS1:6 No - SATB2-AS1:9 No - lnc-C2orf69-11:1 No - lnc-FTCDNL1-4:31 No - lnc-C2orf69-10:1 No - lnc-FTCDNL1-4:32 No - lnc-FTCDNL1-4:33 No - lnc-FTCDNL1-4:34 No - lnc-FTCDNL1-4:21 No - lnc-FTCDNL1-4:35 No - lnc-FTCDNL1-4:36 No - lnc-FTCDNL1-4:37 No - lnc-FTCDNL1-4:1 No - lnc-FTCDNL1-4:22 No - lnc-FTCDNL1-4:38 No - lnc-C2orf69-9:1 No - lnc-FTCDNL1-4:39 No - lnc-C2orf69-8:1 No - lnc-FTCDNL1-4:2 No - lnc-FTCDNL1-4:40 No - lnc-FTCDNL1-4:10 No - lnc-FTCDNL1-4:23 No - lnc-FTCDNL1-4:66 No - lnc-FTCDNL1-4:26 No - lnc-C2orf69-7:1 No - lnc-TYW5-4:1 No - lnc-TYW5-3:1 No - lnc-FTCDNL1-4:41 No - lnc-FTCDNL1-2:2 No - lnc-FTCDNL1-2:1 No - lnc-TYW5-5:1 No - lnc-KCTD18-2:1 No - lnc-KCTD18-1:1 No - lnc-AOX1-1:3 No - lnc-AOX1-1:4 No - lnc-AOX1-1:5 No - LINC01792:5 No - LINC01792:7 No - lnc-BZW1-3:1 No - lnc-CLK1-1:3 Yes chr3R:5595364-5601136 lnc-CLK1-1:7 Yes chr3R:5595364-5601136 lnc-CLK1-1:2 Yes chr3R:5595364-5601136 lnc-BZW1-1:2 Yes chr3R:5595364-5601136 lnc-BZW1-2:1 No - lnc-CLK1-3:2 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-CLK1-3:6 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-CLK1-3:8 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-CLK1-3:7 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-CLK1-3:4 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-CLK1-3:5 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-CLK1-3:3 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-CLK1-4:3 Yes chr2R:10468616-10469643 lnc-CLK1-4:2 Yes chr2R:10468616-10469643 lnc-CLK1-4:4 Yes chr2R:10468616-10469643 lnc-CLK1-4:1 Yes chr2R:10468616-10469643 lnc-CLK1-4:5 Yes chr2R:10468616-10469643 lnc-NIF3L1-2:1 Yes chr3R:13964885-13967075 lnc-NIF3L1-3:1 No - lnc-ORC2-2:1 Yes chr2R:17734419-17737269 lnc-FAM126B-3:4 Yes chr2R:17734419-17737269 lnc-FAM126B-3:2 No - lnc-FAM126B-3:1 No - lnc-FAM126B-3:3 Yes chr2R:17734419-17737269 lnc-NDUFB3-1:1 Yes chr2R:17734419-17737269 lnc-FAM126B-1:2 No - lnc-NDUFB3-2:1 No - CFLAR-AS1:1 No - CFLAR-AS1:3 No - CFLAR-AS1:20 No - CFLAR-AS1:5 No - CFLAR-AS1:6 No - CFLAR-AS1:7 No - CFLAR-AS1:8 No - CFLAR-AS1:4 No - lnc-ALS2CR12-2:1 Yes chrX:633622-635545 lnc-ALS2CR12-1:2 Yes chrX:633622-635545 lnc-ALS2CR12-1:1 Yes chrX:633622-635545 lnc-CASP10-2:1 Yes chrX:633622-635545 lnc-TRAK2-2:1 No - lnc-TRAK2-2:2 No - lnc-C2CD6-2:1 No - lnc-TRAK2-1:1 No - lnc-STRADB-1:1 No - lnc-STRADB-2:1 No - lnc-STRADB-3:1 No - lnc-STRADB-4:1 No - lnc-STRADB-5:1 No - lnc-STRADB-6:1 No - lnc-STRADB-6:2 No - lnc-STRADB-7:1 No - lnc-C2CD6-1:2 No - lnc-C2CD6-1:1 No - lnc-MPP4-1:1 No - lnc-MPP4-1:3 No - lnc-MPP4-1:2 No - lnc-MPP4-2:1 Yes chr3L:21674394-21679755 lnc-MPP4-4:1 Yes chr3L:21674394-21679755 lnc-MPP4-3:1 Yes chr3L:21674394-21679755 lnc-FZD7-4:1 Yes chr3L:3515751-3610521 lnc-FZD7-2:1 No - lnc-SUMO1-1:2 No - lnc-SUMO1-1:3 No - lnc-NOP58-2:1 No - lnc-SUMO1-5:1 No - lnc-NOP58-3:1 No - lnc-SUMO1-4:1 No - lnc-SUMO1-6:1 No - lnc-SUMO1-7:1 No - lnc-SUMO1-9:1 Yes chr3L:4064152-4071717 lnc-FAM117B-7:1 Yes chr3L:4064152-4071717 lnc-FAM117B-6:1 No - lnc-FAM117B-5:1 No - lnc-FAM117B-4:1 No - lnc-FAM117B-3:1 No - lnc-FAM117B-2:1 No - lnc-FAM117B-1:1 No - lnc-FAM117B-1:2 No - lnc-ICA1L-6:1 No - lnc-WDR12-6:1 Yes chr3L:21131446-21133310 lnc-WDR12-5:1 Yes chr3L:21131446-21133310 lnc-ICA1L-3:1 Yes chr2L:10768234-10769952 lnc-ICA1L-4:2 Yes chr2L:10768234-10769952 lnc-ICA1L-4:1 Yes chr2L:10768234-10769952 lnc-CARF-1:1 Yes chr2L:10768234-10769952 lnc-CARF-2:1 Yes chr2L:10768234-10769952 lnc-WDR12-2:1 Yes chr3L:4193993-4224003 lnc-WDR12-3:1 Yes chr3L:4193993-4224003 lnc-RAPH1-6:2 No - lnc-RAPH1-6:1 No - lnc-NBEAL1-1:1 No - lnc-RAPH1-4:1 No - lnc-WDR12-4:1 Yes chrX:19830215-19852059 lnc-RAPH1-5:1 No - lnc-ICOS-3:1 No - lnc-PARD3B-6:1 No - lnc-PARD3B-5:1 No - lnc-RAPH1-7:1 Yes chrX:17160006-17200728 lnc-NRP2-2:1 Yes chrX:17160006-17200728 lnc-INO80D-10:2 No - lnc-INO80D-10:3 No - lnc-INO80D-7:1 No - lnc-PARD3B-4:1 No - lnc-INO80D-6:1 No - lnc-NRP2-4:1 No - lnc-NRP2-5:1 No - lnc-EEF1B2-2:3 Yes chr3R:29854695-29857491 lnc-EEF1B2-2:4 Yes chr3R:29854695-29857491 lnc-EEF1B2-2:5 Yes chr3R:29854695-29857491 lnc-EEF1B2-2:6 Yes chr3R:29854695-29857491 lnc-INO80D-3:1 No - lnc-NDUFS1-4:1 No - lnc-INO80D-2:16 Yes chrX:8248651-8251687 lnc-INO80D-2:17 Yes chrX:8248651-8251687 lnc-INO80D-9:1 Yes chrX:8248651-8251687 lnc-ZDBF2-3:1 No - lnc-GPR1-1:1 No - lnc-ZDBF2-2:2 No - lnc-ZDBF2-2:3 No - lnc-GPR1-2:1 No - lnc-ZDBF2-2:4 No - lnc-ZDBF2-1:1 No - lnc-FAM237A-2:1 Yes chrX:15946936-15973159 lnc-ADAM23-3:1 Yes chrX:15946936-15973159 lnc-FAM237A-1:1 No - lnc-MDH1B-6:1 Yes chrX:15328342-15331002 lnc-MDH1B-8:1 Yes chr2R:10977956-11116378 lnc-MDH1B-8:2 Yes chr2R:10977956-11116378 lnc-KLF7-1:14 No - lnc-KLF7-1:17 No - MYOSLID:10 No - lnc-CREB1-9:1 No - lnc-CREB1-8:1 No - lnc-METTL21A-3:1 No - lnc-CREB1-5:1 No - lnc-CREB1-4:1 No - lnc-CREB1-3:1 No - lnc-METTL21A-2:1 No - lnc-CREB1-2:1 No - lnc-FZD5-4:1 No - lnc-FZD5-3:1 No - LINC01857:11 No - lnc-METTL21A-1:1 No - lnc-FZD5-2:1 Yes chr2L:11810092-11813780 lnc-PLEKHM3-2:1 No - lnc-PIKFYVE-4:1 No - lnc-PIKFYVE-4:3 No - lnc-IDH1-1:1 No - lnc-C2orf80-1:1 Yes chr3L:8356404-8360906 IDH1-AS1:1 Yes chr3L:8356404-8360906 lnc-IDH1-2:1 No - lnc-IDH1-3:1 No - lnc-PIKFYVE-5:1 No - lnc-PTH2R-1:1 No - lnc-PTH2R-1:2 No - lnc-PTH2R-1:3 No - lnc-PTH2R-1:4 No - lnc-PTH2R-1:5 No - lnc-PTH2R-1:6 No - lnc-PTH2R-1:7 No - lnc-IDH1-4:1 No - lnc-MAP2-3:1 No - lnc-MAP2-3:2 No - lnc-MAP2-1:1 No - lnc-ACADL-3:1 Yes chr3R:15793782-15802102 lnc-RPE-7:1 Yes chr3R:15793782-15802102 lnc-ACADL-2:1 Yes chr3R:15793782-15802102 lnc-ACADL-1:1 Yes chr3R:15793782-15802102 lnc-ACADL-1:2 Yes chr3R:15793782-15802102 lnc-RPE-8:1 No - lnc-KANSL1L-1:1 No - lnc-KANSL1L-2:1 No - lnc-KANSL1L-2:2 No - lnc-RPE-9:1 No - CPS1-IT1:1 No - lnc-CPS1-3:1 No - lnc-ERBB4-1:1 No - lnc-LANCL1-1:1 Yes chr2R:21522420-21559977 lnc-CPS1-4:1 Yes chr2R:21522420-21559977 lnc-IKZF2-10:1 Yes chr2R:21522420-21559977 lnc-SPAG16-9:1 No - lnc-IKZF2-8:1 No - lnc-SPAG16-8:1 No - lnc-IKZF2-6:1 No - lnc-SPAG16-7:1 No - lnc-IKZF2-3:5 No - lnc-IKZF2-9:1 No - VWC2L-IT1:1 No - lnc-VWC2L-2:1 No - lnc-VWC2L-3:1 No - lnc-VWC2L-3:2 No - lnc-ABCA12-2:4 No - lnc-VWC2L-1:2 No - lnc-VWC2L-1:5 No - lnc-VWC2L-4:1 No - lnc-ATIC-8:3 No - lnc-ATIC-8:4 No - lnc-ATIC-8:5 No - lnc-ABCA12-3:1 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-ABCA12-4:1 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-ABCA12-5:2 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-ABCA12-5:1 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-ABCA12-6:1 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-ABCA12-7:1 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-ABCA12-8:1 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-ATIC-3:3 No - LINC00607:1 No - LINC01614:4 No - LINC01614:5 No - LINC01614:7 No - lnc-MREG-3:1 No - lnc-MREG-2:1 No - lnc-PECR-1:1 No - lnc-PECR-2:1 Yes chr2L:15768630-15771159 lnc-XRCC5-3:1 No - LINC01963:9 No - LINC01963:10 No - LINC01963:11 No - lnc-SMARCAL1-1:2 No - lnc-RPL37A-2:1 Yes chr2L:4955509-4958292 lnc-MARCH4-2:5 Yes chr2L:5070957-5072055 lnc-IGFBP5-3:1 Yes chr2L:5070957-5072055 lnc-IGFBP2-2:1 No - lnc-TNP1-7:1 No - lnc-IGFBP2-4:1 No - lnc-IGFBP2-4:2 No - lnc-IGFBP2-6:1 No - lnc-TNP1-6:1 No - lnc-TNP1-1:3 No - lnc-IGFBP2-5:1 No - lnc-IGFBP2-7:1 No - lnc-IGFBP2-8:2 No - lnc-TNP1-5:4 No - lnc-TNP1-5:3 No - lnc-IGFBP2-9:1 No - DIRC3-AS1:6 No - lnc-IGFBP2-10:1 No - DIRC3-AS1:12 No - DIRC3-AS1:1 No - lnc-DIRC3-1:2 No - lnc-DIRC3-1:3 No - lnc-DIRC3-1:4 No - lnc-IGFBP2-11:1 No - lnc-DIRC3-1:5 No - lnc-RUFY4-5:1 No - lnc-DIRC3-2:1 No - lnc-DIRC3-3:1 Yes chr3R:9528238-9533011 lnc-DIRC3-4:1 Yes chr3R:9528238-9533011 lnc-DIRC3-5:1 Yes chr3R:9528238-9533011 lnc-RUFY4-1:3 Yes chr3R:9528238-9533011 lnc-RUFY4-4:1 Yes chr3R:9528238-9533011 lnc-CXCR1-1:1 Yes chr3R:9528238-9533011 lnc-RUFY4-1:4 Yes chr3R:9528238-9533011 lnc-RUFY4-2:2 Yes chr2R:21088386-21091004 lnc-RUFY4-2:3 Yes chr2R:21088386-21091004 lnc-AAMP-2:1 Yes chr2L:20417057-20423027 lnc-AAMP-1:1 No - lnc-AAMP-1:2 No - lnc-CATIP-4:1 No - CATIP-AS1:3 No - lnc-SLC11A1-1:1 Yes chr3L:15992669-16004736 lnc-ZNF142-4:2 No - lnc-ZNF142-4:1 No - lnc-ZNF142-3:2 No - lnc-ZNF142-2:1 No - lnc-ZNF142-3:1 No - lnc-STK36-2:1 Yes chr2L:10222657-10224447 lnc-RNF25-2:1 Yes chr2L:10989401-10997897 lnc-TTLL4-2:1 No - lnc-TTLL4-3:1 No - lnc-CYP27A1-2:1 Yes chr3R:21140739-21214269 lnc-WNT10A-2:1 No - lnc-WNT10A-3:1 No - lnc-FEV-4:1 No - lnc-CDK5R2-3:1 No - LINC00608:3 No - LINC00608:4 No - LINC00608:7 No - LINC00608:13 No - lnc-CDK5R2-4:1 No - lnc-IHH-1:1 No - lnc-RETREG2-3:1 No - lnc-SLC23A3-3:1 No - lnc-CNPPD1-1:1 No - lnc-CNPPD1-1:2 No - lnc-CNPPD1-1:3 No - lnc-CNPPD1-2:1 No - lnc-RETREG2-1:1 No - lnc-GLB1L-2:2 Yes chr2R:16294400-16297232 lnc-TUBA4A-1:2 Yes chr2L:6003574-6006827 lnc-TUBA4A-1:1 Yes chr2L:6003574-6006827 lnc-GLB1L-1:1 Yes chr3R:9731221-9733250 lnc-PTPRN-1:1 No - lnc-TUBA4A-2:1 Yes chr2L:1008378-1048053 lnc-TUBA4A-2:2 Yes chr2L:1008378-1048053 lnc-RESP18-4:1 Yes chr2L:1008378-1048053 lnc-RESP18-2:2 Yes chr2L:1008378-1048053 lnc-RESP18-2:1 Yes chr2L:1008378-1048053 lnc-RESP18-2:3 Yes chr2L:1008378-1048053 lnc-RESP18-3:1 No - lnc-RESP18-5:1 No - lnc-RESP18-5:2 No - lnc-RESP18-6:1 No - lnc-DES-4:1 No - lnc-DES-2:1 No - lnc-CHPF-4:2 No - lnc-CHPF-4:1 No - lnc-OBSL1-3:1 Yes chrX:19735570-19740456 lnc-CHPF-2:1 Yes chr2R:23995543-24014254 lnc-CHPF-3:1 Yes chr2R:23995543-24014254 lnc-OBSL1-2:1 No - lnc-OBSL1-4:1 No - lnc-OBSL1-5:1 Yes chr2L:5949450-5955235 lnc-SLC4A3-11:1 No - lnc-SLC4A3-11:2 No - lnc-OBSL1-6:1 No - lnc-OBSL1-7:1 No - lnc-SLC4A3-12:1 No - lnc-SLC4A3-2:4 No - lnc-SLC4A3-2:13 No - lnc-SLC4A3-5:2 No - lnc-SLC4A3-5:3 No - lnc-OBSL1-9:1 No - lnc-SLC4A3-7:4 No - lnc-SLC4A3-8:2 No - lnc-EPHA4-3:4 No - lnc-EPHA4-3:3 No - lnc-SLC4A3-13:1 No - lnc-CCDC140-13:1 No - lnc-EPHA4-4:1 No - lnc-EPHA4-4:2 No - lnc-CCDC140-11:1 No - lnc-CCDC140-9:1 No - lnc-CCDC140-8:1 No - lnc-CCDC140-5:4 No - lnc-PAX3-3:1 No - lnc-PAX3-2:1 No - lnc-FARSB-8:1 Yes chr2L:12082995-12085827 lnc-FARSB-8:2 Yes chr2L:12082995-12085827 lnc-PAX3-1:1 No - lnc-CCDC140-1:7 No - lnc-CCDC140-1:9 No - lnc-CCDC140-1:10 No - lnc-CCDC140-1:11 No - lnc-CCDC140-1:12 No - lnc-CCDC140-1:13 No - lnc-FARSB-6:1 No - lnc-FARSB-3:1 No - lnc-FARSB-4:1 Yes chr2R:7712578-7714182 lnc-FARSB-5:1 Yes chr2R:7712578-7714182 lnc-MOGAT1-2:1 No - lnc-FARSB-7:1 Yes chr2R:8665813-8683022 lnc-KCNE4-7:1 Yes chr2R:8665813-8683022 lnc-KCNE4-5:1 No - lnc-KCNE4-6:1 No - lnc-SCG2-2:1 No - lnc-SCG2-1:1 No - lnc-MRPL44-4:1 No - lnc-AP1S3-1:1 No - lnc-MRPL44-3:1 Yes chr2L:10423291-10425482 lnc-WDFY1-1:1 Yes chr2L:10423291-10425482 lnc-AP1S3-2:2 Yes chr2L:10423291-10425482 lnc-AP1S3-2:1 Yes chr2L:10423291-10425482 lnc-MRPL44-2:1 No - lnc-WDFY1-2:3 Yes chr2L:6671065-6673347 lnc-WDFY1-3:1 Yes chr2L:6671065-6673347 lnc-MRPL44-5:1 No - lnc-FAM124B-1:2 Yes chr2L:15265245-15272024 lnc-FAM124B-1:1 Yes chr2L:15265245-15272024 lnc-FAM124B-3:1 Yes chr2L:15265245-15272024 lnc-FAM124B-2:1 Yes chr2L:15265245-15272024 lnc-FAM124B-4:1 Yes chr2L:15265245-15272024 lnc-FAM124B-5:1 Yes chr2L:15265245-15272024 lnc-NYAP2-7:1 No - lnc-NYAP2-6:1 No - lnc-CCDC195-1:1 Yes chr2L:7472513-7496307 lnc-CCDC195-2:1 Yes chr2L:7472513-7496307 lnc-NYAP2-2:1 No - lnc-NYAP2-4:1 No - lnc-IRS1-5:1 No - lnc-IRS1-4:1 No - lnc-NYAP2-5:1 No - lnc-RHBDD1-6:8 No - lnc-RHBDD1-6:9 No - lnc-COL4A3-4:1 No - lnc-COL4A3-4:2 No - lnc-COL4A3-2:1 No - lnc-COL4A4-1:2 No - lnc-COL4A4-1:1 No - lnc-IRS1-3:1 No - lnc-TM4SF20-1:6 No - lnc-TM4SF20-1:5 No - lnc-C2orf83-3:1 Yes chr3R:10858202-10859813 lnc-C2orf83-2:1 Yes chr3R:10858202-10859813 lnc-SLC19A3-2:1 No - lnc-CCL20-1:1 No - lnc-SPHKAP-1:1 No - lnc-SPHKAP-2:1 No - lnc-SPHKAP-3:1 No - lnc-SPHKAP-4:1 No - lnc-DAW1-2:1 No - lnc-DAW1-5:1 No - lnc-FBXO36-2:1 No - lnc-DNER-4:1 No - lnc-FBXO36-1:1 Yes chr3R:24295078-24314541 lnc-DNER-1:1 Yes chr3R:4786284-4812096 lnc-DNER-2:1 Yes chr3R:4786284-4812096 lnc-DNER-3:1 Yes chr3R:4786284-4812096 lnc-SLC16A14-2:1 No - lnc-SLC16A14-1:1 No - lnc-SP140-3:3 No - lnc-SP110-2:1 No - lnc-SP110-2:2 No - lnc-SP110-2:3 No - lnc-SLC16A14-3:1 No - lnc-SLC16A14-4:1 No - lnc-SP110-4:1 No - lnc-SP110-6:1 No - lnc-SP110-7:1 No - lnc-SP110-8:2 No - lnc-SP140L-7:1 No - lnc-SP110-8:1 No - lnc-SP100-1:1 No - lnc-CAB39-1:1 Yes chr3L:16613218-16615472 lnc-CAB39-2:1 No - lnc-ITM2C-1:6 No - lnc-ITM2C-1:7 No - lnc-ITM2C-2:10 No - lnc-SPATA3-1:1 No - lnc-SPATA3-1:2 No - SPATA3-AS1:8 No - SPATA3-AS1:11 No - SPATA3-AS1:1 No - SPATA3-AS1:2 No - SPATA3-AS1:3 No - lnc-HTR2B-1:1 No - lnc-PSMD1-2:1 No - lnc-B3GNT7-64:1 No - lnc-NCL-3:1 No - lnc-NMUR1-2:1 No - lnc-TEX44-5:1 No - LINC00471:10 No - lnc-TEX44-4:3 No - lnc-TEX44-3:1 No - lnc-TEX44-1:1 No - lnc-NMUR1-3:2 No - lnc-NMUR1-3:1 No - lnc-NMUR1-4:1 No - lnc-NMUR1-4:2 No - lnc-TEX44-2:1 No - lnc-PDE6D-5:1 No - lnc-PDE6D-4:1 No - lnc-PTMA-1:1 No - lnc-PDE6D-3:1 No - lnc-PDE6D-3:2 No - lnc-NPPC-2:1 Yes chr2L:8684823-8685955 lnc-NPPC-2:2 Yes chr2L:8684823-8685955 lnc-PDE6D-1:1 Yes chr2R:8421033-8428577 lnc-PDE6D-2:1 No - lnc-ECEL1-3:1 Yes chr2R:22206005-22210765 lnc-TIGD1-1:7 No - lnc-TIGD1-1:9 No - lnc-TIGD1-1:13 Yes chr3R:24063077-24108960 lnc-TIGD1-1:10 No - lnc-TIGD1-1:6 Yes chr2L:18977519-18987280 lnc-TIGD1-1:11 No - lnc-TIGD1-1:8 Yes chr2L:18977519-18987280 lnc-TIGD1-1:5 Yes chr2L:18977519-18987280 lnc-TIGD1-1:4 Yes chr2L:18977519-18987280 lnc-TIGD1-1:3 Yes chr2L:18977519-18987280 lnc-GIGYF2-3:1 Yes chr2L:18977519-18987280 lnc-EFHD1-1:3 Yes chr4:853557-867025 lnc-EFHD1-1:4 Yes chr4:853557-867025 lnc-EFHD1-2:1 Yes chr4:853557-867025 lnc-SNORC-2:1 No - lnc-NEU2-1:3 Yes chr3L:16970013-16994388 lnc-NGEF-1:1 No - lnc-ATG16L1-2:1 No - lnc-SAG-4:1 Yes chr3R:29827281-29835101 lnc-SAG-3:1 Yes chr3R:29827281-29835101 lnc-USP40-3:1 No - lnc-ATG16L1-1:1 No - lnc-USP40-1:2 No - lnc-USP40-2:1 Yes chr3R:7814361-7855392 lnc-SAG-9:1 Yes chr3R:7814361-7855392 lnc-HJURP-11:1 No - lnc-HJURP-10:1 No - lnc-HJURP-9:1 No - lnc-UGT1A8-4:1 No - lnc-HJURP-8:1 No - lnc-UGT1A8-3:1 No - lnc-UGT1A8-2:1 No - lnc-UGT1A9-1:1 No - lnc-HJURP-5:1 No - lnc-UGT1A1-2:1 No - lnc-UGT1A1-1:1 No - lnc-HJURP-4:3 No - lnc-UGT1A8-1:1 No - lnc-USP40-4:2 No - lnc-USP40-4:1 No - lnc-HJURP-6:1 Yes chr2R:15262808-15309368 lnc-SPP2-4:1 No - lnc-SPP2-1:2 No - lnc-ARL4C-9:1 No - lnc-SPP2-6:1 No - lnc-SPP2-7:1 No - LINC01891:4 No - lnc-ARL4C-4:1 No - lnc-HJURP-12:1 Yes chr4:177348-179389 lnc-SH3BP4-9:1 No - lnc-ARL4C-6:1 No - lnc-SH3BP4-7:1 No - lnc-ARL4C-7:1 No - lnc-ARL4C-8:1 No - lnc-SH3BP4-5:1 No - lnc-ARL4C-2:7 No - lnc-ARL4C-2:6 No - lnc-ARL4C-10:1 No - lnc-AGAP1-5:1 No - lnc-AGAP1-4:1 No - lnc-AGAP1-3:1 No - lnc-ARL4C-11:1 No - lnc-AGAP1-3:2 No - lnc-AGAP1-2:1 No - lnc-ARL4C-14:1 No - lnc-SH3BP4-6:1 No - lnc-ACKR3-7:1 Yes chr2L:13835564-13898712 lnc-ACKR3-6:2 Yes chr2L:13835564-13898712 lnc-ACKR3-3:1 Yes chr2L:13835564-13898712 lnc-IQCA1-1:1 No - lnc-IQCA1-1:2 No - lnc-ASB18-1:2 Yes chr3L:20024687-20027835 lnc-ACKR3-5:3 Yes chr3L:20024687-20027835 lnc-ACKR3-5:4 Yes chr3L:20024687-20027835 lnc-AGAP1-8:1 No - lnc-AGAP1-9:1 No - lnc-IQCA1-2:1 No - lnc-IQCA1-3:1 No - lnc-IQCA1-4:1 No - lnc-COL6A3-14:13 No - lnc-COL6A3-10:1 No - lnc-COL6A3-4:2 No - lnc-COL6A3-9:1 No - lnc-COPS8-16:1 No - lnc-COL6A3-8:1 No - lnc-COPS8-4:4 No - lnc-MLPH-5:1 No - lnc-COL6A3-7:1 No - lnc-RAB17-4:1 No - lnc-RAB17-3:1 No - lnc-RAB17-7:1 No - lnc-PRLH-4:1 No - lnc-RAB17-1:3 No - lnc-RAB17-1:2 No - lnc-RAB17-1:1 No - lnc-COL6A3-5:15 No - lnc-RAB17-5:2 No - lnc-RAB17-5:1 No - lnc-PRLH-1:2 No - lnc-RBM44-2:1 Yes chrX:15844476-15847858 lnc-RAB17-2:1 Yes chrX:15844476-15847858 lnc-ILKAP-1:2 No - lnc-ILKAP-5:1 No - lnc-ILKAP-3:1 No - lnc-ILKAP-2:1 No - lnc-HES6-2:3 No - lnc-HES6-2:1 No - lnc-HES6-2:2 No - lnc-HES6-1:5 No - lnc-HES6-1:1 No - lnc-HES6-1:2 No - lnc-PER2-4:1 No - lnc-ASB1-2:3 No - lnc-PER2-5:2 No - lnc-PER2-5:1 No - lnc-PER2-6:1 No - lnc-ASB1-3:1 No - LINC01107:1 No - lnc-PER2-7:2 No - lnc-ASB1-4:1 No - lnc-PER2-7:3 No - lnc-PER2-7:1 No - lnc-ASB1-5:1 No - lnc-HDAC4-8:1 No - lnc-HDAC4-6:1 Yes chr2R:22985374-23048325 lnc-NDUFA10-8:2 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-NDUFA10-8:1 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-NDUFA10-3:2 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-NDUFA10-3:1 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-TWIST2-3:1 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-NDUFA10-4:1 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-NDUFA10-2:1 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-NDUFA10-5:1 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-NDUFA10-6:1 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-TWIST2-4:1 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-TWIST2-1:2 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-TWIST2-1:3 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-NDUFA10-7:1 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-TWIST2-1:4 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-HDAC4-5:1 No - lnc-NDUFA10-1:1 Yes chr3R:22027709-22029393 lnc-OR6B2-2:1 Yes chr3R:22027709-22029393 lnc-OTOS-2:1 Yes chr2R:13220283-13221015 lnc-OTOS-2:2 Yes chr2R:13220283-13221015 lnc-ANKMY1-2:7 Yes chr3L:14632601-14671609 lnc-ANKMY1-2:5 Yes chr3L:14632601-14671609 lnc-AQP12B-6:1 No - lnc-AQP12B-4:1 No - lnc-DUSP28-1:1 No - lnc-RNPEPL1-1:1 No - lnc-RNPEPL1-1:2 No - lnc-AQP12B-5:1 No - lnc-ANKMY1-1:2 No - lnc-KIF1A-1:1 No - lnc-AQP12A-1:7 No - lnc-AQP12A-1:8 No - lnc-AQP12A-1:10 No - lnc-AQP12B-1:1 Yes chr2R:16751503-16772671 lnc-AQP12B-2:1 Yes chr2R:16751503-16772671 lnc-AQP12B-3:1 Yes chr2R:16751503-16772671 lnc-AQP12A-2:1 Yes chr2R:16751503-16772671 lnc-AQP12A-2:2 Yes chr2R:16751503-16772671 lnc-C2orf54-4:1 No - lnc-C2orf54-3:1 Yes chrX:6528948-6530726 lnc-C2orf54-1:6 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-C2orf54-2:2 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-MTERF4-3:9 No - lnc-MTERF4-3:8 No - lnc-MTERF4-3:1 No - lnc-MTERF4-3:2 No - lnc-MTERF4-3:3 No - lnc-MTERF4-3:7 No - lnc-MTERF4-3:6 No - lnc-MTERF4-3:10 No - lnc-MTERF4-3:4 No - lnc-MTERF4-3:5 No - lnc-MTERF4-4:1 Yes chr2R:23988738-23992049 lnc-SNED1-1:1 Yes chr2R:23988738-23992049 lnc-MTERF4-5:1 Yes chr2R:23988738-23992049 lnc-ANO7-1:1 Yes chr3R:17391594-17393020 lnc-PASK-1:1 Yes chr2R:18412027-18421124 lnc-PASK-2:3 Yes chr2R:18412027-18421124 lnc-PASK-2:2 Yes chr2R:18412027-18421124 lnc-PASK-2:1 Yes chr2R:18412027-18421124 lnc-PASK-3:1 Yes chr2R:18412027-18421124 lnc-PASK-4:2 No - lnc-PASK-4:3 Yes chr2R:18412027-18421124 lnc-PASK-4:1 No - lnc-FARP2-2:11 Yes chrX:21358286-21361688 lnc-STK25-3:1 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-STK25-1:1 No - lnc-THAP4-4:6 No - lnc-THAP4-4:5 Yes chr3R:17085513-17087988 lnc-THAP4-4:1 Yes chr3R:17085513-17087988 lnc-THAP4-4:4 Yes chr3R:17085513-17087988 lnc-THAP4-4:2 Yes chr3R:17085513-17087988 lnc-THAP4-4:3 Yes chr3R:17085513-17087988 lnc-THAP4-3:2 Yes chr3R:17085513-17087988 lnc-THAP4-3:1 Yes chr3R:17085513-17087988 lnc-STK25-2:1 No - BOK-AS1:2 Yes chr2R:6648654-6652842 BOK-AS1:5 No - BOK-AS1:9 No - BOK-AS1:1 Yes chr2R:6648654-6652842 lnc-ATG4B-2:1 Yes chr2R:6648654-6652842 lnc-DTYMK-6:2 No - lnc-DTYMK-6:1 No - lnc-THAP4-2:3 Yes chr2R:18093723-18094900 lnc-THAP4-2:2 Yes chr2R:18093723-18094900 lnc-DTYMK-5:1 No - lnc-DTYMK-1:2 Yes chr2L:13385848-13387312 lnc-D2HGDH-1:1 Yes chr2L:13385848-13387312 lnc-D2HGDH-1:2 Yes chr2L:13385848-13387312 lnc-GAL3ST2-1:1 No - lnc-PDCD1-3:1 No - lnc-NEU4-1:1 No - lnc-RTP5-1:3 No - lnc-RTP5-5:3 No - lnc-RTP5-5:4 No - LINC01237:6 No - LINC01237:7 No - lnc-RTP5-6:2 No - lnc-PDCD1-6:2 No - LINC01238:10 No - LINC01238:12 No - lnc-RTP5-7:2 No - lnc-PDCD1-7:12 No - LINC01880:13 No - LINC01880:14 No - LINC01880:19 No - lnc-PDCD1-17:3 No - lnc-RTP5-8:13 No - lnc-RTP5-8:14 No - lnc-RTP5-8:16 No - lnc-RTP5-8:17 No - lnc-RTP5-8:18 No - lnc-RTP5-10:1 No - lnc-DEFB125-1:1 No - lnc-DEFB128-1:1 No - NRSN2-AS1:7 No - NRSN2-AS1:1 No - NRSN2-AS1:17 No - NRSN2-AS1:4 No - lnc-TRIB3-1:3 No - lnc-NRSN2-1:2 Yes chr3L:20396288-20401609 lnc-RBCK1-2:1 No - lnc-TBC1D20-2:1 Yes chr3L:23097072-23103460 lnc-TCF15-1:1 No - lnc-SCRT2-1:1 Yes chr3R:31806867-31810186 lnc-ANGPT4-1:1 No - lnc-PSMF1-5:1 No - lnc-PSMF1-4:1 No - lnc-PSMF1-3:1 No - lnc-PSMF1-2:1 No - lnc-TMEM74B-2:1 Yes chr2R:11967343-11970115 lnc-SDCBP2-4:3 No - SDCBP2-AS1:2 No - SDCBP2-AS1:3 No - SDCBP2-AS1:4 No - SDCBP2-AS1:11 No - lnc-FKBP1A-1:1 No - lnc-FKBP1A-1:2 No - lnc-FKBP1A-3:1 No - lnc-FKBP1A-3:2 No - lnc-NSFL1C-2:1 No - lnc-NSFL1C-1:4 Yes chr2R:24423926-24425102 lnc-NSFL1C-1:5 Yes chr2R:24423926-24425102 lnc-NSFL1C-1:6 Yes chr2R:24423926-24425102 lnc-NSFL1C-1:2 No - lnc-SNPH-4:1 No - lnc-SIRPG-2:1 No - lnc-SIRPG-2:2 No - lnc-SIRPA-5:1 No - lnc-SIRPG-3:1 No - lnc-SIRPG-4:1 No - lnc-SIRPG-5:2 No - lnc-SIRPG-5:3 No - lnc-PDYN-1:17 No - lnc-PDYN-1:26 No - lnc-PDYN-1:25 No - lnc-PDYN-1:27 No - lnc-PDYN-1:18 No - lnc-PDYN-1:20 No - lnc-PDYN-1:24 No - lnc-PDYN-1:3 No - lnc-PDYN-1:4 No - lnc-PDYN-1:1 No - lnc-PDYN-1:2 No - lnc-STK35-3:1 No - lnc-PDYN-2:1 No - lnc-STK35-2:8 No - lnc-STK35-2:9 No - lnc-STK35-1:2 No - lnc-STK35-4:3 No - lnc-SNRPB-3:1 Yes chr2L:8011405-8026898 lnc-TGM6-1:1 No - lnc-TGM6-2:1 No - lnc-TGM6-3:1 No - lnc-SNRPB-1:1 No - lnc-ZNF343-1:1 No - lnc-IDH3B-2:1 No - lnc-CPXM1-1:1 Yes chr3R:22016391-22019382 lnc-NOP56-2:1 Yes chr2R:14772650-14807061 lnc-EBF4-1:1 No - lnc-PTPRA-1:1 No - lnc-AVP-2:1 No - lnc-AVP-1:1 No - lnc-OXT-2:1 No - lnc-OXT-4:1 No - lnc-ITPA-2:1 No - lnc-DDRGK1-1:2 Yes chr3R:21215079-21216226 lnc-DDRGK1-1:1 Yes chr3R:21215079-21216226 lnc-C20orf194-2:1 No - lnc-SLC4A11-1:1 No - lnc-ITPA-3:1 No - lnc-C20orf194-1:1 No - lnc-SLC4A11-3:1 No - lnc-ATRN-3:1 No - lnc-C20orf194-3:1 No - lnc-GFRA4-1:2 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-GFRA4-1:1 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-SIGLEC1-1:1 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-SPEF1-1:1 No - lnc-CENPB-1:1 No - lnc-RNF24-2:3 No - lnc-RNF24-2:4 No - lnc-RNF24-2:2 No - lnc-MAVS-3:1 No - lnc-CENPB-3:2 No - lnc-CENPB-3:3 No - lnc-RNF24-3:1 No - lnc-RNF24-1:6 No - lnc-PANK2-4:1 No - lnc-PANK2-2:1 No - LINC01433:1 No - lnc-ADRA1D-3:2 No - lnc-ADRA1D-2:3 No - lnc-RASSF2-4:1 No - lnc-RASSF2-1:1 No - lnc-TMEM230-5:1 Yes chr3R:10307806-10311613 lnc-SLC23A2-1:1 No - lnc-CDS2-10:1 No - lnc-CDS2-9:1 No - lnc-CDS2-8:1 No - lnc-CDS2-7:1 No - lnc-CDS2-6:1 No - lnc-CDS2-5:1 No - lnc-TMEM230-1:1 No - lnc-PCNA-1:1 Yes chr3L:8127762-8131675 lnc-PRND-3:1 Yes chr3L:8127762-8131675 lnc-PRND-3:2 Yes chr3L:8127762-8131675 lnc-CDS2-3:1 No - lnc-PROKR2-1:1 No - lnc-PROKR2-2:3 No - lnc-PROKR2-2:4 No - lnc-PROKR2-2:2 No - LINC00658:17 No - LINC00658:18 No - LINC00658:7 No - LINC00658:5 No - LINC00658:6 No - LINC00658:8 No - LINC00658:12 No - LINC00658:13 No - LINC00658:14 No - LINC00658:1 No - LINC00658:3 No - LINC00658:4 No - lnc-GPCPD1-6:1 No - lnc-C20orf196-6:1 No - lnc-GPCPD1-8:25 No - lnc-GPCPD1-8:24 No - lnc-C20orf196-3:6 No - lnc-GPCPD1-8:11 No - lnc-GPCPD1-8:22 No - lnc-C20orf196-3:8 No - lnc-GPCPD1-8:19 No - lnc-GPCPD1-8:3 No - lnc-GPCPD1-8:8 No - lnc-GPCPD1-8:1 No - lnc-C20orf196-5:1 No - lnc-PROKR2-3:1 Yes chr2L:3713360-3716810 lnc-C20orf196-4:1 Yes chr2L:3713360-3716810 lnc-PROKR2-4:1 Yes chr2L:3713360-3716810 lnc-GPCPD1-5:1 No - lnc-GPCPD1-7:1 No - lnc-TRMT6-1:1 No - lnc-LRRN4-3:1 Yes chr2L:6559426-6562289 lnc-CHGB-1:1 Yes chr3R:15823019-15832632 lnc-MCM8-2:1 No - lnc-LRRN4-2:1 Yes chr3R:25685236-25687370 lnc-FERMT1-2:1 No - lnc-CRLS1-3:1 No - lnc-BMP2-5:1 No - CASC20:1 No - lnc-FERMT1-3:1 No - lnc-BMP2-4:1 No - lnc-HAO1-6:1 No - lnc-HAO1-5:2 No - LINC01428:1 No - lnc-BMP2-6:1 No - LINC01751:6 No - lnc-HAO1-4:1 No - lnc-HAO1-3:1 No - lnc-PLCB1-3:1 No - lnc-PLCB1-1:3 No - lnc-PLCB1-1:4 No - lnc-TMX4-3:1 Yes chr2L:305935-355566 lnc-PLCB4-3:1 Yes chr2L:305935-355566 lnc-LAMP5-2:1 Yes chrX:16610685-16614856 lnc-MKKS-8:1 Yes chrX:16610685-16614856 SNAP25-AS1:13 No - lnc-SNAP25-2:2 No - SNAP25-AS1:4 No - SNAP25-AS1:5 No - lnc-ANKEF1-4:1 No - lnc-ANKEF1-3:1 No - lnc-SNAP25-1:2 No - lnc-SNAP25-1:3 No - lnc-SNAP25-1:11 No - lnc-SNAP25-4:1 No - lnc-SNAP25-6:1 No - lnc-MKKS-5:1 No - lnc-MKKS-1:2 No - lnc-MKKS-4:1 No - lnc-MKKS-7:1 Yes chr3R:27172090-27194267 lnc-MKKS-12:1 Yes chr3R:27172090-27194267 lnc-SLX4IP-3:2 No - lnc-JAG1-8:1 No - lnc-SLX4IP-4:4 No - lnc-JAG1-9:1 No - lnc-SLX4IP-5:2 No - lnc-SLX4IP-35:1 No - lnc-SLX4IP-36:1 No - lnc-SLX4IP-37:1 No - lnc-SLX4IP-37:2 No - lnc-SLX4IP-37:3 No - lnc-SLX4IP-37:6 No - lnc-SLX4IP-37:8 No - lnc-JAG1-10:1 No - lnc-JAG1-10:3 No - lnc-JAG1-3:4 No - lnc-JAG1-3:3 No - lnc-JAG1-11:1 No - lnc-BTBD3-2:1 No - lnc-JAG1-4:2 No - LINC00687:11 No - lnc-JAG1-12:1 No - lnc-BTBD3-1:1 No - LINC00687:2 No - LINC00687:3 No - lnc-TASP1-13:1 No - lnc-TASP1-12:1 No - lnc-SPTLC3-8:1 No - lnc-SPTLC3-8:2 No - LINC01722:9 No - lnc-SPTLC3-7:2 No - lnc-SPTLC3-6:2 No - LINC01723:19 No - LINC01723:20 No - LINC01723:21 No - lnc-TASP1-5:5 No - LINC01723:22 No - LINC01723:29 No - LINC01723:33 No - lnc-ISM1-3:1 Yes chr2L:15499127-15505018 lnc-ISM1-1:1 No - lnc-ISM1-1:2 No - ISM1-AS1:1 No - ISM1-AS1:3 No - lnc-SPTLC3-5:1 No - lnc-TASP1-3:2 No - lnc-SEL1L2-2:1 Yes chrX:1354014-1356473 lnc-MACROD2-1:9 Yes chr2R:13983395-13984893 lnc-SEL1L2-1:7 Yes chr3R:23754623-23758557 lnc-SEL1L2-1:6 Yes chr3R:23754623-23758557 lnc-ESF1-1:2 Yes chr3R:23754623-23758557 lnc-ESF1-2:1 Yes chr3R:23754623-23758557 lnc-ESF1-2:2 Yes chr3R:23754623-23758557 lnc-NDUFAF5-2:1 No - lnc-SEL1L2-3:1 No - lnc-FLRT3-3:1 No - lnc-NDUFAF5-4:1 No - lnc-NDUFAF5-5:1 No - MACROD2-AS1:6 No - MACROD2-AS1:5 No - lnc-KIF16B-10:1 No - lnc-KIF16B-5:1 No - lnc-KIF16B-6:1 No - lnc-KIF16B-7:1 No - lnc-OTOR-3:2 No - lnc-KIF16B-8:1 No - lnc-KIF16B-9:1 No - lnc-PCSK2-1:2 No - lnc-PCSK2-3:1 No - lnc-DSTN-1:1 Yes chr3R:26697697-26714159 lnc-BFSP1-3:1 Yes chr3R:26697697-26714159 lnc-RRBP1-2:1 No - lnc-PCSK2-2:1 No - lnc-BFSP1-2:1 No - lnc-RRBP1-1:1 No - lnc-BFSP1-4:1 No - lnc-SNX5-4:1 No - lnc-SNX5-3:1 No - lnc-MGME1-4:1 No - lnc-MGME1-1:1 No - lnc-OVOL2-2:2 Yes chr2L:8218071-8220741 lnc-OVOL2-2:3 Yes chr2L:8218071-8220741 lnc-OVOL2-2:1 Yes chr2L:8218071-8220741 lnc-OVOL2-1:6 No - lnc-OVOL2-1:5 No - lnc-OVOL2-1:1 No - lnc-RRBP1-3:1 No - lnc-OVOL2-1:3 No - lnc-OVOL2-1:4 No - lnc-MGME1-3:1 Yes chrX:5048273-5070929 lnc-MGME1-2:1 Yes chrX:5048273-5070929 lnc-OVOL2-1:2 Yes chrX:5048273-5070929 lnc-OVOL2-3:1 No - lnc-KAT14-3:1 No - lnc-DZANK1-6:1 No - lnc-ZNF133-1:2 No - lnc-DZANK1-3:3 Yes chr2L:12046711-12048918 lnc-DZANK1-3:4 Yes chr2L:12046711-12048918 lnc-DZANK1-5:1 Yes chr2L:12046711-12048918 lnc-DZANK1-1:3 Yes chr2L:12046711-12048918 LINC00851:1 No - LINC00851:7 No - lnc-POLR3F-1:1 No - lnc-DZANK1-4:1 No - lnc-SEC23B-2:1 No - lnc-SMIM26-3:1 No - lnc-RBBP9-1:1 No - lnc-SMIM26-4:1 No - lnc-RBBP9-2:1 No - lnc-RBBP9-7:4 No - lnc-RBBP9-7:1 No - lnc-RBBP9-7:3 No - lnc-SCP2D1-1:1 No - lnc-RBBP9-6:2 No - lnc-SLC24A3-2:2 No - lnc-CRNKL1-3:4 Yes chrX:23022898-23035550 lnc-CRNKL1-3:5 Yes chrX:23022898-23035550 lnc-CRNKL1-3:6 Yes chrX:23022898-23035550 lnc-CRNKL1-3:3 Yes chrX:23022898-23035550 lnc-SLC24A3-1:5 Yes chrX:23022898-23035550 lnc-SLC24A3-1:6 Yes chrX:23022898-23035550 lnc-SLC24A3-1:7 No - lnc-SLC24A3-1:8 No - lnc-SLC24A3-1:9 No - lnc-SLC24A3-1:10 No - lnc-SLC24A3-1:11 No - lnc-SLC24A3-1:12 No - lnc-CRNKL1-4:1 No - lnc-INSM1-5:2 Yes chr2R:22707794-22712724 lnc-RALGAPA2-2:9 Yes chr2R:22707794-22712724 lnc-RALGAPA2-2:8 Yes chr2R:22707794-22712724 lnc-RALGAPA2-9:1 Yes chr2R:22707794-22712724 lnc-INSM1-2:1 Yes chr2R:22707794-22712724 lnc-RALGAPA2-4:1 No - lnc-INSM1-1:1 No - lnc-RALGAPA2-5:2 No - lnc-CRNKL1-6:1 No - lnc-INSM1-4:1 No - lnc-INSM1-6:1 No - lnc-CRNKL1-7:1 No - lnc-INSM1-7:1 No - lnc-RALGAPA2-3:1 No - lnc-KIZ-14:2 No - lnc-KIZ-13:2 No - lnc-RALGAPA2-8:2 No - lnc-RALGAPA2-8:1 No - LINC00237:1 No - LINC00237:4 No - lnc-KIZ-11:2 No - lnc-XRN2-10:1 No - KIZ-AS1:8 No - KIZ-AS1:6 No - KIZ-AS1:4 No - lnc-NKX2-4-5:1 No - KIZ-AS1:2 No - lnc-KIZ-6:2 No - lnc-XRN2-1:3 No - lnc-NKX2-4-4:1 No - lnc-XRN2-7:1 No - lnc-NKX2-2-2:2 No - lnc-NKX2-2-2:3 No - lnc-NKX2-2-2:1 No - lnc-XRN2-8:1 No - lnc-XRN2-9:1 No - LINC01727:19 No - LINC01727:20 No - LINC01727:21 No - LINC01727:23 No - lnc-PAX1-6:1 No - lnc-NKX2-2-3:1 No - lnc-PAX1-5:1 No - lnc-PAX1-7:1 No - lnc-PAX1-8:1 No - LINC01432:1 No - LINC01432:2 No - lnc-PAX1-10:1 No - lnc-FOXA2-14:1 No - LINC01427:7 No - lnc-FOXA2-13:1 No - lnc-FOXA2-12:1 No - lnc-FOXA2-11:2 No - lnc-FOXA2-7:5 No - lnc-FOXA2-7:4 No - lnc-SSTR4-18:1 No - lnc-FOXA2-3:8 No - lnc-FOXA2-3:7 No - lnc-FOXA2-9:2 No - LINC00261:1 No - LINC00261:8 No - LINC00261:9 No - LINC00261:7 No - LINC00261:10 No - lnc-FOXA2-10:2 No - lnc-FOXA2-10:1 No - lnc-SSTR4-4:5 No - lnc-SSTR4-4:9 No - lnc-SSTR4-15:1 No - lnc-THBD-4:1 No - lnc-SSTR4-14:1 No - lnc-THBD-3:2 No - lnc-THBD-2:1 No - lnc-SSTR4-14:2 No - lnc-THBD-1:5 No - lnc-THBD-1:6 No - lnc-THBD-1:7 No - lnc-SSTR4-1:3 No - lnc-SSTR4-1:4 No - lnc-SSTR4-8:1 No - lnc-SSTR4-9:1 No - lnc-CD93-5:1 No - lnc-CD93-4:2 No - lnc-SSTR4-12:3 No - lnc-SSTR4-13:1 No - lnc-SSTR4-2:6 No - lnc-SSTR4-2:7 No - lnc-NAPB-5:3 No - lnc-NAPB-5:4 No - lnc-NAPB-5:2 No - LINC01431:2 No - LINC01431:3 No - lnc-CST8-1:3 No - lnc-CST8-1:4 No - lnc-CST11-2:3 No - lnc-CST8-2:3 No - lnc-CST8-2:4 No - lnc-CST8-2:5 No - lnc-CST8-2:6 No - lnc-CST8-2:8 No - lnc-CST8-4:1 No - lnc-CST3-2:1 No - lnc-CST9-1:1 No - lnc-CST8-5:1 No - lnc-CST8-6:1 No - lnc-CST5-1:3 No - lnc-CST5-1:2 No - lnc-CST5-1:1 No - lnc-SYNDIG1-7:1 No - lnc-GGTLC1-6:1 No - lnc-SYNDIG1-3:2 No - lnc-GGTLC1-2:2 No - lnc-SYNDIG1-6:1 No - lnc-GGTLC1-8:1 No - lnc-GGTLC1-5:2 No - lnc-SYNDIG1-5:1 No - lnc-CST7-5:1 No - lnc-CST7-3:1 No - lnc-CST7-1:2 No - lnc-CST7-1:3 No - lnc-VSX1-4:1 No - lnc-ACSS1-1:1 No - lnc-VSX1-3:4 No - lnc-VSX1-3:2 No - lnc-VSX1-3:3 No - lnc-VSX1-3:5 No - lnc-VSX1-1:10 No - lnc-ABHD12-4:2 Yes chr2L:2880704-2885850 lnc-ABHD12-2:1 Yes chr2L:2130813-2137296 lnc-ENTPD6-2:1 No - lnc-NINL-2:1 Yes chr2R:19137372-19141034 lnc-NINL-1:1 Yes chr2R:19137372-19141034 lnc-ABHD12-3:1 Yes chr2L:5271728-5278548 lnc-GINS1-4:1 Yes chr2L:5271728-5278548 ZNF337-AS1:1 Yes chrX:5755574-5759751 lnc-ZNF337-2:1 No - lnc-ZNF337-1:1 No - lnc-GINS1-5:1 No - lnc-NANP-1:1 Yes chr2L:12046711-12048918 lnc-GINS1-6:1 No - lnc-GINS1-7:1 No - lnc-GINS1-2:2 No - lnc-GINS1-2:3 No - lnc-GINS1-2:4 No - lnc-FAM182B-8:3 No - lnc-FAM182B-8:8 No - lnc-FAM182B-8:7 No - lnc-FAM182B-8:10 No - lnc-FAM182B-8:1 No - lnc-FAM182B-8:4 No - lnc-GINS1-10:1 No - lnc-ZNF337-3:1 No - lnc-FAM182B-8:6 No - lnc-FAM182B-8:2 No - lnc-GINS1-8:2 No - lnc-FAM182B-10:1 No - lnc-FAM182B-11:1 No - FAM182A:23 No - FAM182A:31 No - FAM182A:32 No - FAM182A:36 No - FAM182A:38 No - FAM182A:39 No - FAM182A:40 No - FAM182A:41 No - FAM182A:42 No - lnc-FAM182B-12:1 No - lnc-FAM182B-13:5 No - lnc-FAM182B-13:4 No - lnc-FAM182B-13:1 No - lnc-FAM182B-13:2 No - lnc-GINS1-11:1 No - MIR663AHG:40 No - MIR663AHG:24 No - MIR663AHG:15 No - MIR663AHG:29 No - MIR663AHG:33 No - MIR663AHG:25 No - MIR663AHG:18 No - MIR663AHG:2 No - MIR663AHG:32 No - MIR663AHG:37 No - MIR663AHG:3 No - MIR663AHG:35 No - MIR663AHG:28 No - MIR663AHG:9 No - MIR663AHG:30 No - MIR663AHG:5 No - MIR663AHG:1 No - MIR663AHG:21 No - MIR663AHG:12 No - MIR663AHG:8 No - MIR663AHG:10 No - MIR663AHG:19 No - MIR663AHG:34 No - MIR663AHG:39 No - lnc-GINS1-13:1 No - lnc-FAM182B-14:1 No - lnc-DEFB116-8:1 No - FAM242A:8 No - FAM242A:11 No - FAM242A:9 No - lnc-DEFB115-5:1 No - lnc-DEFB115-5:2 No - lnc-DEFB115-5:3 No - lnc-DEFB115-5:4 No - lnc-DEFB116-7:1 No - lnc-DEFB115-2:1 No - lnc-DEFB115-1:1 No - lnc-DEFB116-4:1 No - lnc-DEFB119-2:1 No - lnc-DEFB119-1:3 No - lnc-DEFB119-1:2 No - lnc-DEFB121-1:2 No - lnc-DEFB121-1:3 No - lnc-DEFB124-2:2 No - lnc-DEFB124-2:1 No - lnc-ID1-4:1 Yes chr2L:542786-544653 lnc-ID1-1:2 Yes chr2L:542786-544653 lnc-COX4I2-1:1 No - lnc-FOXS1-2:1 No - lnc-FOXS1-1:1 No - lnc-DUSP15-1:1 No - lnc-DUSP15-2:1 No - lnc-XKR7-1:2 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-PDRG1-1:2 No - lnc-PLAGL2-6:1 No - lnc-PLAGL2-5:1 No - lnc-PLAGL2-4:1 No - lnc-POFUT1-1:1 No - lnc-POFUT1-2:1 No - lnc-ASXL1-3:1 Yes chr3L:11795614-11798875 lnc-NOL4L-2:4 No - lnc-C20orf203-3:1 Yes chr2L:14104090-14160587 lnc-ASXL1-5:1 Yes chr2L:14104090-14160587 lnc-ASXL1-5:2 Yes chr2L:14104090-14160587 lnc-ASXL1-2:3 Yes chr2L:14104090-14160587 lnc-C20orf203-2:1 Yes chr2L:14104090-14160587 lnc-C20orf203-1:1 No - lnc-DNMT3B-6:1 No - lnc-DNMT3B-6:3 No - lnc-DNMT3B-1:1 No - lnc-EFCAB8-1:2 No - lnc-SUN5-1:1 Yes chr2R:6811019-6818199 lnc-BPIFA2-2:1 No - lnc-BPIFA3-1:3 No - lnc-CDK5RAP1-3:1 No - lnc-CDK5RAP1-2:1 No - lnc-SNTA1-3:1 Yes chr3R:10414218-10416046 lnc-SNTA1-2:1 No - lnc-C20orf144-2:1 Yes chr2R:24275734-24291084 lnc-NECAB3-1:1 Yes chr2R:24275734-24291084 lnc-E2F1-2:1 No - lnc-E2F1-1:2 No - lnc-E2F1-1:1 No - lnc-E2F1-3:1 No - lnc-PXMP4-1:2 No - lnc-PXMP4-5:1 No - ZNF341-AS1:5 No - lnc-ZNF341-2:1 No - lnc-RALY-2:1 No - RALY-AS1:6 No - lnc-EIF2S2-1:2 Yes chr3L:7423827-7454717 lnc-RALY-1:1 No - lnc-AHCY-4:1 No - lnc-AHCY-3:1 No - lnc-EIF2S2-5:1 Yes chrX:15450261-15453167 lnc-ASIP-2:2 Yes chr2L:2037714-2044372 lnc-AHCY-5:1 Yes chr2L:2037714-2044372 lnc-PIGU-3:1 Yes chr2L:2037714-2044372 lnc-MAP1LC3A-1:1 No - lnc-NCOA6-4:1 Yes chr2L:8515096-8516755 lnc-TP53INP2-1:1 Yes chr2L:8515096-8516755 lnc-PIGU-1:2 No - lnc-NCOA6-3:1 Yes chrX:124370-126714 lnc-TRPC4AP-1:1 Yes chr2L:16766566-16788766 lnc-TRPC4AP-1:2 Yes chr2L:16766566-16788766 lnc-EDEM2-3:1 No - lnc-EDEM2-2:2 No - lnc-MMP24OS-73:14 No - lnc-MMP24OS-73:2 No - lnc-MMP24OS-73:3 No - lnc-EIF6-1:16 No - lnc-FAM83C-1:3 Yes chr2R:23849246-23850301 lnc-FAM83C-3:1 Yes chr3L:6956946-6958108 lnc-FAM83C-3:2 Yes chr3L:6956946-6958108 lnc-FAM83C-2:1 Yes chr3L:6956946-6958108 lnc-GDF5-2:1 Yes chr3L:6956946-6958108 lnc-GDF5OS-1:1 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-CEP250-1:1 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-C20orf173-2:1 Yes chr3L:15160876-15163628 lnc-C20orf173-3:1 Yes chr3L:15160876-15163628 lnc-C20orf173-4:1 No - lnc-SPAG4-2:1 No - lnc-CPNE1-2:1 No - lnc-RBM12-1:2 No - lnc-SPAG4-1:1 No - lnc-NFS1-2:2 No - lnc-CPNE1-1:3 No - lnc-NFS1-1:5 Yes chr2L:7032721-7037878 lnc-NFS1-1:14 Yes chr2L:7032721-7037878 lnc-NFS1-1:13 Yes chr2L:7032721-7037878 lnc-NFS1-1:15 Yes chr2L:7032721-7037878 lnc-NFS1-1:10 Yes chr2L:7032721-7037878 lnc-NFS1-1:11 Yes chr2L:7032721-7037878 lnc-NFS1-1:12 Yes chr2L:7032721-7037878 lnc-NFS1-1:9 Yes chr2L:7032721-7037878 lnc-NFS1-1:8 Yes chr2L:7032721-7037878 lnc-NFS1-3:1 Yes chr2L:7032721-7037878 lnc-NFS1-1:6 Yes chr2L:7032721-7037878 lnc-NFS1-1:4 Yes chr2L:7032721-7037878 lnc-NFS1-1:7 Yes chr2L:7032721-7037878 lnc-SCAND1-4:1 Yes chr3R:12352143-12356265 lnc-CNBD2-2:1 Yes chr3R:12352143-12356265 lnc-CNBD2-1:1 No - NORAD:2 No - NORAD:4 No - NORAD:7 No - NORAD:5 No - lnc-EPB41L1-1:3 No - lnc-SCAND1-5:1 Yes chr2R:19229063-19243751 lnc-EPB41L1-2:1 Yes chr3R:18251069-18252734 DLGAP4-AS1:4 No - lnc-TGIF2-1:4 Yes chr2R:5702112-5705439 DLGAP4-AS1:2 No - lnc-SLA2-1:2 No - lnc-SOGA1-1:1 No - lnc-TLDC2-5:4 No - lnc-SAMHD1-1:1 Yes chr2L:6932545-6942814 lnc-TLDC2-2:1 No - lnc-RBL1-3:2 Yes chr3L:19294564-19298830 lnc-RBL1-3:3 Yes chr3L:19294564-19298830 lnc-TLDC2-3:1 No - lnc-SAMHD1-2:1 Yes chrX:797090-801479 lnc-RPN2-4:1 Yes chrX:797090-801479 lnc-MROH8-1:1 Yes chrX:797090-801479 lnc-RBL1-1:1 Yes chrX:9275318-9283117 lnc-RBL1-2:1 Yes chrX:9275318-9283117 lnc-RPN2-1:1 No - lnc-RPN2-2:1 No - lnc-RPN2-3:1 No - lnc-MANBAL-1:1 No - lnc-GHRH-1:1 No - lnc-GHRH-2:1 No - lnc-SRC-1:1 Yes chr3L:4592447-4626196 lnc-SRC-1:2 Yes chr3L:4592447-4626196 lnc-BLCAP-1:5 Yes chr3L:5565231-5566765 lnc-BLCAP-1:6 Yes chr3L:5565231-5566765 lnc-BLCAP-1:4 Yes chr3L:5565231-5566765 LINC01746:7 No - LINC01746:9 No - lnc-BLCAP-4:1 No - lnc-CTNNBL1-1:2 No - lnc-CTNNBL1-1:3 No - lnc-TTI1-3:2 Yes chr3R:8942954-8945020 lnc-TTI1-1:1 No - lnc-TGM2-3:1 Yes chr3R:9751088-9754686 lnc-TGM2-1:1 Yes chr3L:2235284-2237076 lnc-TGM2-2:1 Yes chr3L:7593091-7639573 lnc-BPI-33:4 Yes chr3L:7593091-7639573 lnc-KIAA1755-8:2 No - lnc-KIAA1755-8:1 No - SNHG17:24 No - SNHG17:2 No - SNHG17:16 No - SNHG17:17 No - SNHG11:3 No - SNHG11:12 No - SNHG11:22 No - SNHG11:24 No - lnc-KIAA1755-9:2 Yes chr2R:4744348-4758048 lnc-KIAA1755-10:1 Yes chr2R:14198478-14201249 lnc-SLC32A1-1:1 Yes chr2R:14198478-14201249 lnc-SLC32A1-2:1 Yes chr3R:18185498-18187875 lnc-ACTR5-1:1 No - lnc-ACTR5-2:1 No - lnc-ACTR5-3:1 No - lnc-ACTR5-4:1 No - lnc-FAM83D-1:1 No - lnc-KIAA1755-11:1 No - lnc-PPP1R16B-1:1 No - lnc-DHX35-4:1 No - lnc-KIAA1755-13:1 No - lnc-KIAA1755-14:1 No - lnc-DHX35-5:1 No - lnc-DHX35-6:2 No - lnc-DHX35-6:3 No - lnc-DHX35-6:4 No - lnc-DHX35-7:1 No - lnc-MAFB-2:6 No - lnc-MAFB-2:5 No - lnc-MAFB-7:1 No - LINC01370:1 No - LINC01370:2 No - LINC01370:3 No - LINC01370:4 No - LINC01370:9 No - lnc-MAFB-6:1 No - lnc-MAFB-5:1 No - lnc-TOP1-6:1 No - lnc-TOP1-5:1 No - lnc-TOP1-4:1 No - lnc-ZHX3-5:1 No - lnc-ZHX3-6:1 No - lnc-ZHX3-3:1 No - lnc-ZHX3-2:1 No - lnc-PLCG1-2:1 Yes chrX:15319479-15328029 lnc-PLCG1-1:2 No - lnc-ZHX3-4:3 No - lnc-ZHX3-4:6 No - lnc-ZHX3-4:2 No - lnc-ZHX3-4:4 No - lnc-ZHX3-4:5 No - lnc-EMILIN3-1:1 No - lnc-LPIN3-3:1 No - lnc-EMILIN3-2:1 Yes chr2L:210735-250823 lnc-EMILIN3-3:1 Yes chr2L:210735-250823 lnc-SRSF6-11:1 No - lnc-SRSF6-3:3 No - lnc-SRSF6-10:1 No - lnc-GTSF1L-8:1 No - lnc-SRSF6-9:1 No - lnc-SRSF6-1:2 No - lnc-SRSF6-8:1 No - lnc-SRSF6-7:1 No - lnc-SRSF6-6:1 No - lnc-PTPRT-2:1 No - lnc-PTPRT-3:1 No - lnc-SRSF6-5:1 No - lnc-GTSF1L-6:1 Yes chr3R:27266326-27273273 lnc-SGK2-1:1 No - lnc-IFT52-1:3 No - lnc-IFT52-1:4 No - lnc-GTSF1L-5:2 No - LINC01728:7 No - lnc-GDAP1L1-3:1 Yes chr3L:1600726-1602674 lnc-JPH2-1:3 No - lnc-JPH2-1:2 Yes chr2L:9547720-9566750 OSER1-DT:26 No - OSER1-DT:35 No - OSER1-DT:36 No - OSER1-DT:45 No - OSER1-DT:47 No - OSER1-DT:48 No - OSER1-DT:49 No - lnc-FITM2-2:1 No - lnc-FITM2-1:3 No - HNF4A-AS1:5 Yes chr2L:8687226-8709611 HNF4A-AS1:6 Yes chr2L:8687226-8709611 HNF4A-AS1:4 Yes chr2L:8687226-8709611 HNF4A-AS1:10 Yes chr2L:8687226-8709611 HNF4A-AS1:12 Yes chr2L:8687226-8709611 HNF4A-AS1:7 Yes chr2L:8687226-8709611 HNF4A-AS1:1 Yes chr2L:8687226-8709611 HNF4A-AS1:2 Yes chr2L:8687226-8709611 HNF4A-AS1:9 Yes chr2L:8687226-8709611 lnc-SERINC3-29:9 No - lnc-SERINC3-4:1 No - lnc-TTPAL-1:1 Yes chr3R:23710158-23711338 lnc-ADA-6:1 Yes chr3L:16412722-16415386 lnc-ADA-1:21 No - lnc-ADA-1:20 No - lnc-ADA-3:3 Yes chr3L:17690015-17748839 lnc-ADA-3:19 No - lnc-ADA-3:16 No - lnc-ADA-3:15 No - lnc-ADA-3:12 No - lnc-PKIG-2:1 No - lnc-PKIG-3:1 No - lnc-ADA-3:5 Yes chr3L:17690015-17748839 lnc-ADA-3:8 Yes chr3L:17690015-17748839 lnc-ADA-3:6 Yes chr3L:17690015-17748839 lnc-ADA-3:9 Yes chr3L:17690015-17748839 lnc-ADA-3:7 Yes chr3L:17690015-17748839 lnc-ADA-3:10 Yes chr3L:17690015-17748839 lnc-ADA-3:4 No - lnc-WISP2-2:1 Yes chr3R:9410329-9412293 lnc-YWHAB-1:2 No - lnc-TOMM34-2:1 No - STK4-AS1:1 No - lnc-SEMG2-1:1 No - lnc-SEMG2-3:1 No - lnc-SEMG2-3:2 No - lnc-SEMG2-3:3 No - lnc-TP53TG5-1:1 No - lnc-TP53TG5-1:3 Yes chr3R:8652821-8653847 lnc-SDC4-1:1 Yes chr3R:8652821-8653847 lnc-TP53TG5-1:2 No - lnc-TP53TG5-2:1 Yes chrX:8404535-8407263 lnc-PIGT-2:2 Yes chrX:8404535-8407263 lnc-PIGT-2:3 Yes chrX:8404535-8407263 lnc-SPINT3-2:1 No - lnc-EPPIN-WFDC6-1:1 No - lnc-EPPIN-1:1 No - lnc-WFDC6-2:2 No - lnc-WFDC6-2:1 No - lnc-EPPIN-2:1 No - lnc-WFDC9-1:1 No - lnc-WFDC3-1:1 No - lnc-WFDC3-1:8 No - lnc-WFDC3-1:4 No - lnc-WFDC3-1:5 No - lnc-WFDC3-1:3 No - lnc-WFDC3-1:2 No - lnc-WFDC3-1:6 No - lnc-WFDC3-1:7 No - lnc-TNNC2-1:1 No - lnc-TNNC2-1:2 No - lnc-PLTP-1:2 No - lnc-PCIF1-1:1 No - lnc-CD40-2:1 No - lnc-CD40-2:2 No - lnc-ELMO2-2:3 Yes chr3L:3468023-3471309 lnc-ELMO2-1:1 Yes chr3L:3468023-3471309 lnc-SLC35C2-3:1 Yes chr2L:12097838-12100839 lnc-ELMO2-40:4 Yes chr2L:12097838-12100839 lnc-SLC2A10-9:6 Yes chr2L:12097838-12100839 lnc-SLC2A10-9:1 No - lnc-SLC2A10-9:2 No - lnc-ELMO2-40:3 No - lnc-ELMO2-3:1 No - lnc-ELMO2-3:2 No - lnc-ZNF334-2:1 No - lnc-SLC2A10-6:1 No - lnc-SLC2A10-6:2 No - lnc-SLC2A10-5:1 Yes chr3R:20042757-20048716 lnc-OCSTAMP-1:1 Yes chr3R:20042757-20048716 lnc-OCSTAMP-2:1 Yes chr3R:20042757-20048716 lnc-SLC2A10-4:1 No - lnc-TP53RK-4:1 No - lnc-EYA2-1:1 No - lnc-TP53RK-5:1 No - lnc-SLC2A10-8:1 Yes chr2L:6527447-6546976 lnc-SULF2-10:1 Yes chr3R:31669465-31677971 LINC01754:8 No - lnc-NCOA3-22:1 No - lnc-NCOA3-21:2 No - LINC01754:7 No - lnc-ZMYND8-3:1 No - lnc-NCOA3-20:2 No - lnc-ZMYND8-4:1 No - lnc-ZMYND8-5:1 No - lnc-NCOA3-19:1 No - lnc-NCOA3-18:1 No - lnc-NCOA3-17:1 No - lnc-NCOA3-16:1 No - lnc-ZMYND8-6:1 No - lnc-ZMYND8-7:1 No - lnc-ZMYND8-8:1 No - lnc-NCOA3-15:1 No - lnc-NCOA3-13:1 No - lnc-NCOA3-12:1 No - lnc-SULF2-5:2 No - lnc-SULF2-5:1 Yes chr3R:16310542-16339575 lnc-ZMYND8-9:1 Yes chr3R:16310542-16339575 lnc-NCOA3-23:1 Yes chr3R:16310542-16339575 lnc-NCOA3-4:3 No - lnc-SULF2-6:1 No - lnc-NCOA3-4:4 No - lnc-NCOA3-4:5 No - lnc-NCOA3-4:6 No - lnc-NCOA3-4:7 No - lnc-SULF2-8:1 No - lnc-NCOA3-24:1 No - lnc-SULF2-2:3 No - lnc-NCOA3-5:10 No - lnc-NCOA3-5:11 No - lnc-NCOA3-4:8 No - lnc-NCOA3-10:2 No - lnc-SULF2-4:3 No - lnc-NCOA3-10:3 No - lnc-NCOA3-10:4 No - lnc-SULF2-4:2 No - lnc-NCOA3-25:1 No - lnc-NCOA3-26:2 No - lnc-PREX1-3:2 No - lnc-ARFGEF2-2:11 No - lnc-PREX1-2:4 No - lnc-PREX1-8:1 No - lnc-ARFGEF2-6:1 No - lnc-ARFGEF2-5:1 No - lnc-CSE1L-4:1 Yes chr2L:13793521-13799674 CSE1L-AS1:14 No - CSE1L-AS1:13 No - CSE1L-AS1:5 No - lnc-CSE1L-2:1 No - lnc-ZNFX1-2:2 Yes chr2R:18117896-18125779 lnc-ZNFX1-2:1 Yes chr2R:18117896-18125779 lnc-KCNB1-2:1 No - ZFAS1:5 Yes chr3R:24193832-24196880 ZFAS1:14 No - lnc-DDX27-4:2 Yes chr3L:2895017-2959579 lnc-ZNFX1-3:2 Yes chr3L:2895017-2959579 lnc-DDX27-6:1 Yes chr3L:2895017-2959579 lnc-PTGIS-2:1 Yes chr3L:2895017-2959579 lnc-SLC9A8-6:1 No - lnc-SLC9A8-5:1 No - lnc-SLC9A8-5:2 No - lnc-SLC9A8-4:1 No - lnc-SLC9A8-4:2 No - lnc-SLC9A8-3:1 Yes chr3R:29032660-29034008 lnc-SLC9A8-3:3 Yes chr3R:29032660-29034008 lnc-SLC9A8-3:4 Yes chr3R:29032660-29034008 lnc-SLC9A8-3:5 Yes chr3R:29032660-29034008 lnc-SLC9A8-2:1 No - lnc-B4GALT5-1:1 No - lnc-TMEM189-UBE2V1-3:4 No - lnc-TMEM189-UBE2V1-3:3 No - lnc-TMEM189-UBE2V1-3:2 No - TRERNA1:1 No - lnc-SNAI1-3:1 No - lnc-TMEM189-UBE2V1-4:6 No - lnc-TMEM189-UBE2V1-4:5 No - lnc-TMEM189-UBE2V1-4:4 No - lnc-TMEM189-UBE2V1-4:13 No - lnc-TMEM189-UBE2V1-4:11 No - lnc-TMEM189-UBE2V1-4:10 No - lnc-TMEM189-UBE2V1-4:7 No - lnc-SNAI1-3:2 No - lnc-TMEM189-UBE2V1-4:8 No - lnc-TMEM189-UBE2V1-4:9 No - lnc-TMEM189-UBE2V1-4:2 No - lnc-TMEM189-UBE2V1-4:14 No - lnc-TMEM189-UBE2V1-4:15 No - lnc-TMEM189-UBE2V1-4:1 No - lnc-CEBPB-9:1 No - lnc-CEBPB-12:1 No - lnc-TMEM189-1:4 No - lnc-CEBPB-11:2 No - LINC01273:10 No - lnc-CEBPB-10:1 No - LINC01270:3 No - LINC01270:6 No - LINC01271:5 No - lnc-RIPOR3-5:1 No - lnc-RIPOR3-4:1 No - lnc-PTPN1-5:1 No - lnc-PTPN1-4:1 No - lnc-RIPOR3-3:1 Yes chr3L:1342493-1475257 lnc-ADNP-2:3 No - lnc-ADNP-2:1 No - lnc-ADNP-2:2 No - lnc-PARD6B-1:1 No - lnc-PARD6B-1:2 No - lnc-PARD6B-1:3 No - lnc-PARD6B-1:4 No - lnc-PARD6B-1:5 No - ADNP-AS1:6 No - lnc-MOCS3-4:1 No - lnc-NFATC2-3:1 No - lnc-NFATC2-2:1 No - lnc-ATP9A-2:1 Yes chrX:13624745-13664568 lnc-SALL4-2:1 Yes chr2L:13289997-13301668 lnc-MOCS3-5:1 Yes chr2L:13289997-13301668 lnc-ATP9A-1:1 Yes chr2L:11434311-11445614 lnc-ATP9A-1:2 Yes chr2L:11434311-11445614 LINC01429:1 No - lnc-SALL4-3:1 No - lnc-ZFP64-9:1 No - lnc-ZFP64-8:1 No - lnc-TSHZ2-14:1 Yes chr3L:7353578-7356713 lnc-TSHZ2-14:3 Yes chr3L:7353578-7356713 lnc-TSHZ2-14:4 Yes chr3L:7353578-7356713 lnc-TSHZ2-14:5 Yes chr3L:7353578-7356713 lnc-TSHZ2-14:6 Yes chr3L:7353578-7356713 lnc-TSHZ2-13:1 No - lnc-ZFP64-7:1 No - lnc-TSHZ2-12:1 No - LINC01524:17 No - lnc-TSHZ2-9:1 No - lnc-TSHZ2-8:1 No - lnc-TSHZ2-7:1 No - lnc-TSHZ2-6:1 No - lnc-PFDN4-3:2 No - lnc-PFDN4-2:2 No - lnc-ZNF217-7:1 No - lnc-ZNF217-2:3 No - lnc-ZNF217-5:1 No - lnc-TSHZ2-10:1 No - lnc-TSHZ2-11:1 No - lnc-BCAS1-1:2 No - lnc-TSHZ2-19:2 No - lnc-PFDN4-6:1 No - lnc-PFDN4-4:1 No - lnc-PFDN4-12:1 No - lnc-BCAS1-3:1 Yes chr3R:11877235-11879754 lnc-BCAS1-4:1 Yes chr3R:11877235-11879754 lnc-CYP24A1-2:1 No - lnc-DOK5-2:1 No - lnc-DOK5-2:3 No - LINC01440:4 No - LINC01440:6 No - LINC01440:11 No - lnc-CBLN4-7:1 No - lnc-CBLN4-2:2 No - lnc-CBLN4-6:1 No - lnc-MC3R-7:1 No - lnc-MC3R-6:1 No - lnc-MC3R-2:3 No - lnc-CBLN4-5:1 No - lnc-MC3R-4:1 No - lnc-CSTF1-1:1 Yes chr2L:3128635-3129489 lnc-RTF2-1:1 No - lnc-FAM209B-2:1 No - lnc-FAM209B-1:3 No - lnc-TFAP2C-4:1 No - lnc-TFAP2C-5:1 No - lnc-GCNT7-3:1 No - lnc-TFAP2C-3:2 No - lnc-TFAP2C-6:1 No - lnc-BMP7-5:1 No - lnc-BMP7-4:1 No - lnc-BMP7-3:1 No - lnc-BMP7-1:2 No - lnc-BMP7-1:3 No - lnc-SPO11-5:1 No - lnc-MTRNR2L3-4:1 Yes chr2R:23851562-23853247 lnc-MTRNR2L3-3:1 Yes chr2R:23851562-23853247 BMP7-AS1:2 Yes chr2R:23851562-23853247 lnc-SPO11-1:4 Yes chr2R:23851562-23853247 lnc-SPO11-1:5 No - lnc-MTRNR2L3-2:1 Yes chr2R:21658770-21660007 lnc-MTRNR2L3-1:2 No - lnc-ZBP1-3:2 Yes chr3L:7353578-7356713 lnc-ZBP1-3:1 Yes chr3L:7353578-7356713 lnc-PCK1-1:1 No - lnc-PMEPA1-3:1 No - lnc-PMEPA1-3:2 No - lnc-PCK1-2:1 No - lnc-ZBP1-2:1 No - lnc-PMEPA1-2:1 No - lnc-PCK1-5:1 No - lnc-PCK1-4:1 No - lnc-PMEPA1-4:1 No - lnc-C20orf85-5:1 No - LINC01742:5 No - lnc-ANKRD60-2:3 No - lnc-C20orf85-2:1 No - lnc-C20orf85-3:1 No - lnc-ANKRD60-3:4 No - lnc-ANKRD60-4:2 No - lnc-ANKRD60-4:1 No - lnc-RAB22A-1:1 No - lnc-APCDD1L-6:1 No - lnc-RAB22A-2:2 Yes chr3L:8109132-8110043 lnc-RAB22A-2:3 Yes chr3L:8109132-8110043 lnc-ANKRD60-5:1 No - APCDD1L-DT:25 No - APCDD1L-DT:27 No - APCDD1L-DT:28 No - lnc-APCDD1L-1:1 No - lnc-APCDD1L-3:1 No - lnc-NPEPL1-3:1 No - lnc-APCDD1L-4:1 No - lnc-STX16-NPEPL1-1:1 Yes chr3R:12950042-12967712 lnc-NPEPL1-1:1 No - lnc-NPEPL1-2:1 No - lnc-CTSZ-11:1 No - lnc-CTSZ-10:1 No - lnc-GNAS-1:1 No - GNAS-AS1:12 No - GNAS-AS1:13 No - GNAS-AS1:2 Yes chr2R:23942538-23946936 GNAS-AS1:5 Yes chr2R:23942538-23946936 GNAS-AS1:6 Yes chr2R:23942538-23946936 lnc-CTSZ-12:1 No - lnc-CTSZ-12:2 No - GNAS-AS1:3 Yes chr2R:23942538-23946936 lnc-CTSZ-2:13 Yes chr2R:23942538-23946936 lnc-CTSZ-2:4 Yes chr2R:23942538-23946936 lnc-CTSZ-7:1 Yes chr2R:23942538-23946936 lnc-NELFCD-2:1 No - lnc-CTSZ-6:1 Yes chrX:16388820-16391438 lnc-ATP5F1E-1:1 No - lnc-PRELID3B-3:1 No - lnc-PRELID3B-3:3 Yes chr2L:6046516-6048706 lnc-TUBB1-1:3 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-PRELID3B-4:1 No - lnc-SYCP2-5:1 No - lnc-SYCP2-1:3 Yes chr3L:3714826-3806459 lnc-PPP1R3D-8:1 No - lnc-PPP1R3D-6:1 No - lnc-PPP1R3D-5:1 No - MIR646HG:1 No - MIR646HG:2 No - MIR646HG:6 No - MIR646HG:10 No - MIR646HG:15 No - MIR646HG:16 No - MIR646HG:34 No - lnc-CDH26-6:1 No - lnc-PPP1R3D-2:4 No - MIR646HG:36 No - lnc-PPP1R3D-9:1 No - lnc-PPP1R3D-3:4 No - lnc-CDH26-1:1 No - lnc-PPP1R3D-10:1 No - lnc-CDH26-8:2 No - LINC01718:10 No - LINC01718:12 No - LINC01718:16 No - lnc-LSM14B-2:2 No - lnc-TAF4-2:1 No - lnc-LSM14B-3:2 No - lnc-TAF4-1:1 Yes chr3L:16113212-16121651 lnc-PSMA7-7:1 Yes chr3L:16113212-16121651 lnc-PSMA7-6:1 Yes chr3L:16113212-16121651 lnc-PSMA7-5:1 Yes chr3L:16113212-16121651 lnc-PSMA7-4:1 Yes chr3L:16113212-16121651 lnc-PSMA7-3:1 Yes chr3L:16113212-16121651 lnc-PSMA7-1:1 Yes chr3L:12515059-12520954 lnc-PSMA7-2:1 Yes chrX:8398940-8404516 lnc-MTG2-3:1 Yes chrX:8398940-8404516 lnc-MTG2-2:1 Yes chr2L:8375502-8376797 lnc-HRH3-1:2 Yes chr2R:23992138-23995055 lnc-LAMA5-4:1 Yes chr2R:23992138-23995055 lnc-LAMA5-3:2 Yes chr2R:13958545-13960404 lnc-LAMA5-1:3 No - lnc-CABLES2-6:1 Yes chr3L:6203831-6218022 lnc-CABLES2-5:1 Yes chr3L:6203831-6218022 lnc-CABLES2-4:1 Yes chr3L:6203831-6218022 lnc-CABLES2-3:1 Yes chr3L:6203831-6218022 lnc-CABLES2-1:1 Yes chr3L:6203831-6218022 lnc-RPS21-2:2 No - lnc-RPS21-2:3 No - lnc-RPS21-2:4 No - MIR1-1HG-AS1:28 No - MIR1-1HG-AS1:48 No - MIR1-1HG-AS1:50 No - MIR1-1HG-AS1:51 No - MIR1-1HG-AS1:29 No - MIR1-1HG-AS1:30 No - MIR1-1HG-AS1:49 No - MIR1-1HG-AS1:31 No - lnc-SLCO4A1-6:1 No - lnc-GATA5-7:1 No - lnc-SLCO4A1-7:1 No - lnc-GATA5-10:2 Yes chr2L:6625138-6632407 SLCO4A1-AS1:4 Yes chr2L:6625138-6632407 lnc-NTSR1-1:1 No - lnc-NTSR1-1:2 No - LINC00659:3 No - LINC00659:4 No - LINC00659:5 No - lnc-NTSR1-1:3 No - lnc-TCFL5-2:3 No - lnc-TCFL5-2:4 No - OGFR-AS1:3 Yes chr2R:8900566-8901375 OGFR-AS1:2 Yes chr2R:8900566-8901375 lnc-MRGBP-1:1 Yes chr2R:8900566-8901375 lnc-TCFL5-6:1 No - lnc-SLC17A9-5:1 Yes chrX:18649396-18650444 lnc-SLC17A9-1:3 No - LINC00029:6 No - LINC00029:9 No - HAR1B:9 No - HAR1B:1 No - HAR1A:4 No - lnc-YTHDF1-6:1 No - lnc-YTHDF1-2:2 No - lnc-BIRC7-4:1 No - lnc-NKAIN4-1:1 No - lnc-YTHDF1-5:3 Yes chr2R:24881570-24888615 lnc-YTHDF1-5:4 Yes chr2R:24881570-24888615 lnc-YTHDF1-5:1 Yes chr2R:24881570-24888615 lnc-YTHDF1-5:2 Yes chr2R:24881570-24888615 lnc-BIRC7-1:3 Yes chr2R:24881570-24888615 lnc-ARFGAP1-4:1 Yes chr3L:12415026-12417580 lnc-KCNQ2-6:2 Yes chrX:8276200-8367169 lnc-KCNQ2-5:1 Yes chrX:8276200-8367169 lnc-KCNQ2-5:2 Yes chrX:8276200-8367169 lnc-COL20A1-1:3 Yes chrX:8276200-8367169 lnc-CHRNA4-4:2 Yes chrX:8276200-8367169 lnc-CHRNA4-4:1 Yes chrX:8276200-8367169 lnc-KCNQ2-3:2 No - lnc-KCNQ2-3:1 No - lnc-KCNQ2-3:3 No - lnc-KCNQ2-1:2 Yes chr2R:10145897-10192394 lnc-KCNQ2-1:3 Yes chr2R:10145897-10192394 lnc-COL20A1-6:1 Yes chr2R:10145897-10192394 lnc-EEF1A2-2:1 Yes chr2R:10145897-10192394 lnc-EEF1A2-1:3 No - lnc-EEF1A2-1:2 No - lnc-EEF1A2-1:1 No - lnc-PPDPF-1:7 No - lnc-PPDPF-1:8 No - lnc-PTK6-1:1 No - MHENCR:16 No - MHENCR:18 No - lnc-STMN3-1:1 No - lnc-GMEB2-2:1 No - lnc-RTEL1-2:1 No - lnc-ARFRP1-1:1 No - lnc-STMN3-5:1 Yes chrX:9107069-9108354 lnc-ZBTB46-3:6 Yes chrX:9107069-9108354 lnc-ZBTB46-1:1 No - lnc-LIME1-2:1 No - lnc-ARFRP1-2:1 No - ZBTB46-AS1:3 No - ZBTB46-AS1:4 No - ZBTB46-AS1:5 No - ZBTB46-AS1:6 No - lnc-ZBTB46-2:2 Yes chr3L:4259430-4261643 lnc-ZBTB46-2:1 No - lnc-DNAJC5-2:1 Yes chr2R:18421413-18426221 lnc-DNAJC5-1:1 No - lnc-DNAJC5-1:2 Yes chr3L:22267382-22273745 lnc-DNAJC5-1:3 Yes chr3L:22267382-22273745 lnc-ZNF512B-1:2 Yes chr2R:17420407-17425679 lnc-ZNF512B-1:1 Yes chr2R:17420407-17425679 lnc-PRPF6-2:2 Yes chr2R:14752521-14753269 lnc-TCEA2-1:1 Yes chrX:15644222-15644991 lnc-C20orf204-5:1 Yes chrX:15644222-15644991 lnc-LKAAEAR1-2:1 Yes chr2R:17792870-17800677 lnc-LKAAEAR1-2:3 Yes chr2R:17792870-17800677 lnc-LKAAEAR1-2:2 Yes chr2R:17792870-17800677 lnc-LKAAEAR1-1:1 Yes chr3L:18560258-18576326 lnc-NPBWR2-2:1 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-NPBWR2-3:1 No - lnc-PCMTD2-2:2 No - lnc-PCMTD2-2:3 No - lnc-SMIM11B-5:1 No - lnc-KCNE1B-10:7 No - lnc-KCNE1B-10:5 No - lnc-KCNE1B-10:6 No - lnc-KCNE1B-10:8 No - lnc-KCNE1B-10:4 No - lnc-KCNE1B-10:1 No - lnc-KCNE1B-9:1 No - lnc-KCNE1B-8:1 No - lnc-KCNE1B-8:3 No - lnc-KCNE1B-8:2 No - lnc-KCNE1B-1:1 No - lnc-TPTE-7:1 No - lnc-KCNE1B-12:1 No - lnc-KCNE1B-7:1 No - lnc-TPTE-5:1 No - lnc-KCNE1B-6:1 No - lnc-TPTE-6:1 No - lnc-KCNE1B-5:1 No - lnc-KCNE1B-5:4 No - lnc-KCNE1B-5:5 No - lnc-KCNE1B-5:6 No - lnc-POTED-14:1 No - lnc-POTED-18:1 No - lnc-POTED-18:2 No - lnc-POTED-16:1 No - lnc-POTED-13:1 No - lnc-POTED-10:1 No - lnc-LIPI-17:1 No - lnc-POTED-7:1 No - lnc-LIPI-16:1 No - lnc-LIPI-15:1 No - lnc-POTED-5:1 No - lnc-LIPI-14:1 No - lnc-LIPI-12:1 No - lnc-LIPI-12:2 No - lnc-POTED-6:1 No - lnc-LIPI-8:1 No - lnc-POTED-8:1 No - lnc-POTED-9:1 No - lnc-LIPI-7:1 No - lnc-LIPI-7:2 No - lnc-LIPI-7:3 No - lnc-POTED-3:2 No - lnc-POTED-11:1 No - lnc-LIPI-6:1 No - lnc-LIPI-4:4 No - lnc-LIPI-4:5 No - lnc-LIPI-4:3 No - lnc-LIPI-4:2 No - lnc-LIPI-4:1 No - lnc-RBM11-9:1 No - lnc-RBM11-8:1 No - lnc-RBM11-7:1 No - lnc-RBM11-2:4 Yes chrX:17911462-17924163 lnc-RBM11-2:5 No - lnc-LIPI-1:1 No - lnc-RBM11-2:6 Yes chrX:17911462-17924163 lnc-RBM11-5:1 No - lnc-RBM11-5:2 No - lnc-RBM11-5:3 No - lnc-RBM11-5:4 No - lnc-RBM11-5:5 No - lnc-RBM11-5:6 No - lnc-HSPA13-2:1 No - lnc-RBM11-5:7 No - lnc-HSPA13-1:1 No - lnc-HSPA13-6:1 No - lnc-HSPA13-4:1 No - lnc-HSPA13-3:1 No - lnc-HSPA13-3:2 No - lnc-SAMSN1-2:3 No - lnc-RBM11-10:1 No - lnc-SAMSN1-3:1 No - lnc-RBM11-11:1 No - LINC02246:31 No - LINC02246:24 No - LINC02246:29 No - LINC02246:22 No - lnc-NRIP1-4:1 No - lnc-RBM11-14:1 No - lnc-RBM11-16:1 No - lnc-RBM11-4:5 No - lnc-SAMSN1-7:1 No - lnc-USP25-13:1 No - lnc-NRIP1-5:1 No - lnc-NRIP1-2:2 No - lnc-USP25-6:1 No - lnc-NRIP1-6:1 No - lnc-USP25-4:1 No - lnc-USP25-4:2 No - lnc-NRIP1-2:7 No - lnc-NRIP1-9:1 No - lnc-NRIP1-8:1 No - lnc-NRIP1-10:1 No - lnc-NRIP1-11:1 No - MIR99AHG:2 No - MIR99AHG:3 No - lnc-NRIP1-12:1 No - lnc-NRIP1-13:1 No - MIR99AHG:8 No - lnc-NRIP1-14:1 No - MIR99AHG:14 No - lnc-USP25-7:1 No - lnc-BTG3-12:1 No - MIR99AHG:27 No - MIR99AHG:29 No - lnc-BTG3-11:1 No - lnc-BTG3-10:1 No - MIR99AHG:30 No - MIR99AHG:31 No - MIR99AHG:100 No - MIR99AHG:101 No - MIR99AHG:104 No - MIR99AHG:105 No - MIR99AHG:108 No - lnc-BTG3-9:1 No - lnc-BTG3-2:2 No - lnc-BTG3-8:1 No - LINC01549:1 No - LINC01549:2 No - LINC01549:4 No - lnc-BTG3-5:1 No - lnc-BTG3-5:2 No - lnc-BTG3-6:1 No - lnc-CXADR-3:1 No - lnc-BTG3-5:3 No - lnc-CHODL-3:2 No - lnc-CHODL-2:2 No - lnc-C21orf91-7:1 Yes chrX:16074717-16091495 BTG3-AS1:15 Yes chrX:16074717-16091495 BTG3-AS1:17 No - lnc-BTG3-7:2 No - lnc-BTG3-7:1 No - lnc-C21orf91-3:1 No - lnc-C21orf91-4:1 No - lnc-C21orf91-5:1 No - lnc-CXADR-2:2 No - lnc-C21orf91-6:1 No - lnc-CXADR-5:1 No - lnc-CXADR-6:1 No - lnc-CXADR-7:1 No - MIR548XHG:5 No - lnc-TMPRSS15-15:1 No - lnc-TMPRSS15-16:1 No - lnc-CHODL-5:1 No - lnc-TMPRSS15-18:1 No - lnc-CHODL-6:1 No - lnc-CHODL-7:1 No - lnc-TMPRSS15-19:6 No - lnc-TMPRSS15-19:3 No - lnc-TMPRSS15-19:5 No - lnc-TMPRSS15-19:1 No - lnc-TMPRSS15-19:4 No - lnc-NCAM2-16:1 No - lnc-TMPRSS15-20:1 No - lnc-NCAM2-5:2 No - lnc-NCAM2-12:1 No - lnc-NCAM2-11:1 No - lnc-TMPRSS15-21:1 No - lnc-NCAM2-10:1 No - lnc-TMPRSS15-22:1 No - lnc-TMPRSS15-23:1 No - lnc-NCAM2-9:1 No - lnc-NCAM2-9:2 No - LINC00320:11 No - LINC00320:12 No - LINC00320:2 No - LINC00320:22 No - LINC00320:21 No - LINC00320:3 No - lnc-TMPRSS15-24:1 No - lnc-TMPRSS15-25:4 No - lnc-TMPRSS15-25:2 Yes chrX:4132887-4206093 lnc-TMPRSS15-25:3 No - lnc-CHODL-8:1 Yes chrX:4132887-4206093 lnc-CHODL-10:1 Yes chrX:4132887-4206093 lnc-TMPRSS15-27:1 Yes chrX:4132887-4206093 lnc-CHODL-12:1 Yes chrX:4132887-4206093 LINC01425:1 No - LINC00308:2 No - lnc-MRPL39-37:1 No - lnc-MRPL39-36:1 No - lnc-MRPL39-35:1 No - lnc-MRPL39-34:1 No - lnc-NCAM2-14:1 No - lnc-NCAM2-13:1 No - lnc-NCAM2-4:2 No - lnc-MRPL39-33:1 No - lnc-NCAM2-15:1 No - lnc-MRPL39-32:1 No - lnc-NCAM2-17:1 No - lnc-MRPL39-31:1 No - lnc-NCAM2-18:1 No - lnc-NCAM2-18:2 No - lnc-MRPL39-30:1 No - lnc-MRPL39-29:1 No - lnc-NCAM2-19:1 No - lnc-MRPL39-28:1 No - lnc-NCAM2-7:2 No - lnc-NCAM2-7:4 No - lnc-NCAM2-7:5 No - lnc-MRPL39-13:3 No - lnc-JAM2-14:1 No - lnc-MRPL39-27:1 No - lnc-JAM2-8:2 No - lnc-MRPL39-26:1 No - lnc-MRPL39-26:3 No - lnc-MRPL39-26:2 No - lnc-JAM2-14:3 No - lnc-JAM2-13:1 No - lnc-JAM2-13:2 No - lnc-JAM2-12:1 No - LINC01689:9 No - LINC01689:10 No - LINC01689:13 No - LINC01689:12 No - LINC01684:26 No - lnc-MRPL39-25:1 No - lnc-MRPL39-24:1 No - lnc-JAM2-4:3 No - lnc-MRPL39-22:1 No - lnc-MRPL39-20:1 No - lnc-JAM2-11:1 No - lnc-JAM2-10:1 No - LINC00158:5 No - LINC00158:9 No - LINC00158:8 No - LINC00158:7 No - lnc-JAM2-9:1 No - lnc-MRPL39-19:1 No - LINC00158:4 No - lnc-MRPL39-18:1 No - lnc-MRPL39-16:1 No - lnc-MRPL39-15:1 No - lnc-MRPL39-3:2 No - MIR155HG:2 No - MIR155HG:3 No - lnc-MRPL39-2:2 No - lnc-MRPL39-2:3 No - lnc-GABPA-10:1 No - lnc-GABPA-9:1 No - lnc-ATP5PF-1:1 Yes chr3R:26910775-26912886 lnc-GABPA-11:1 No - lnc-GABPA-1:3 Yes chrX:530501-579044 lnc-GABPA-1:4 Yes chrX:530501-579044 lnc-GABPA-1:5 Yes chrX:530501-579044 lnc-GABPA-1:6 Yes chrX:530501-579044 lnc-GABPA-1:7 Yes chrX:530501-579044 lnc-GABPA-12:1 Yes chrX:530501-579044 lnc-ATP5PF-2:1 Yes chrX:530501-579044 lnc-ATP5PF-2:2 Yes chrX:530501-579044 lnc-ATP5PF-3:1 Yes chrX:530501-579044 lnc-CYYR1-6:2 Yes chrX:530501-579044 lnc-CYYR1-6:1 Yes chrX:530501-579044 lnc-CYYR1-5:1 Yes chrX:530501-579044 lnc-APP-1:1 No - lnc-GABPA-14:1 No - lnc-CYYR1-1:2 No - lnc-GABPA-3:5 No - lnc-GABPA-23:2 No - lnc-GABPA-17:2 No - lnc-GABPA-17:3 No - lnc-ADAMTS1-1:1 No - lnc-GABPA-18:1 No - lnc-ADAMTS1-2:1 No - lnc-GABPA-19:1 No - lnc-GABPA-20:1 No - lnc-GABPA-20:2 No - lnc-GABPA-20:3 No - lnc-GABPA-20:4 No - lnc-ADAMTS5-3:2 No - lnc-ADAMTS5-3:5 No - lnc-ADAMTS5-3:4 No - lnc-ADAMTS5-3:3 No - lnc-ADAMTS5-2:1 No - lnc-GABPA-6:2 No - lnc-ADAMTS5-5:4 No - lnc-ADAMTS5-5:1 No - lnc-USP16-13:1 No - lnc-USP16-13:2 No - lnc-ADAMTS5-6:1 No - lnc-ADAMTS5-5:2 No - LINC01673:6 No - LINC00113:4 No - LINC01697:33 No - lnc-N6AMT1-4:1 No - lnc-N6AMT1-1:4 No - lnc-RWDD2B-5:2 Yes chr3L:19544345-19552290 lnc-RWDD2B-5:1 Yes chr3L:19544345-19552290 lnc-LTN1-2:1 No - lnc-LTN1-2:2 No - lnc-RWDD2B-3:1 No - lnc-USP16-9:1 Yes chr2R:9594045-9599505 lnc-RWDD2B-1:2 Yes chr2R:8904844-8906990 lnc-RWDD2B-4:2 Yes chr2R:8904844-8906990 lnc-RWDD2B-4:1 Yes chr2R:8904844-8906990 lnc-RWDD2B-6:1 Yes chr2R:8904844-8906990 lnc-CCT8-2:1 No - lnc-CCT8-3:1 No - lnc-CCT8-4:1 No - LINC00189:3 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-MAP3K7CL-3:1 Yes chr3R:23185580-23226711 LINC00189:16 Yes chr3R:23185580-23226711 BACH1-IT1:2 Yes chr3R:23185580-23226711 BACH1-IT1:3 Yes chr3R:23185580-23226711 BACH1-IT2:3 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-GRIK1-3:1 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-CCT8-5:1 No - GRIK1-AS1:2 Yes chr3R:20860187-20866231 GRIK1-AS1:3 Yes chr3R:20860187-20866231 lnc-GRIK1-2:1 No - lnc-KRTAP13-1-1:3 No - lnc-KRTAP13-1-1:4 No - lnc-KRTAP24-1-1:1 No - lnc-KRTAP23-1-1:1 No - lnc-KRTAP13-3-1:1 No - lnc-KRTAP21-2-1:1 No - lnc-KRTAP21-1-1:1 No - lnc-KRTAP19-8-1:1 No - lnc-KRTAP19-8-1:2 No - lnc-SOD1-11:1 Yes chr3L:5657913-5749599 lnc-SOD1-8:1 No - lnc-SOD1-6:1 No - lnc-SOD1-5:1 No - lnc-TIAM1-2:1 Yes chr2R:21161713-21168659 lnc-SOD1-7:2 Yes chr2R:21161713-21168659 lnc-SCAF4-3:1 No - lnc-HUNK-1:1 No - lnc-SOD1-10:1 No - lnc-MRAP-4:1 No - lnc-MIS18A-8:1 No - lnc-HUNK-2:1 No - lnc-HUNK-3:1 No - lnc-URB1-3:1 No - MIS18A-AS1:2 No - lnc-MIS18A-4:1 Yes chr3R:22440152-22446587 lnc-MIS18A-6:1 Yes chr3R:22440152-22446587 lnc-MIS18A-5:1 Yes chr3R:22440152-22446587 lnc-URB1-2:2 No - lnc-MRAP-5:1 Yes chr3R:4077939-4104326 lnc-TCP10L-2:1 No - lnc-C21orf59-1:1 No - lnc-EVA1C-5:1 Yes chr3L:4173884-4192968 lnc-EVA1C-6:1 No - lnc-SYNJ1-1:1 No - lnc-C21orf59-2:1 Yes chr2R:22080176-22085767 PAXBP1-AS1:1 No - C21orf62-AS1:4 No - C21orf62-AS1:7 No - lnc-C21orf62-2:1 No - lnc-C21orf62-3:1 No - lnc-C21orf62-1:2 No - C21orf62-AS1:10 No - C21orf62-AS1:11 No - C21orf62-AS1:13 No - C21orf62-AS1:14 No - LINC01690:4 No - lnc-C21orf62-4:1 No - lnc-OLIG2-2:1 No - LINC00945:1 No - lnc-OLIG1-3:1 No - lnc-OLIG1-3:2 No - lnc-C21orf62-6:1 No - lnc-OLIG1-2:1 No - lnc-OLIG1-2:2 No - lnc-OLIG1-2:4 No - lnc-OLIG1-2:5 No - lnc-C21orf62-7:3 No - IL10RB-DT:19 No - lnc-TMEM50B-4:1 No - lnc-IL10RB-2:1 No - lnc-IFNAR1-1:1 No - lnc-TMEM50B-3:1 No - lnc-TMEM50B-30:3 No - lnc-TMEM50B-30:5 No - lnc-TMEM50B-30:4 No - lnc-TMEM50B-30:1 No - lnc-TMEM50B-30:2 No - lnc-TMEM50B-2:15 No - lnc-TMEM50B-2:13 No - lnc-TMEM50B-2:14 No - lnc-DNAJC28-6:2 Yes chr2L:7014623-7023898 lnc-DNAJC28-6:1 Yes chr2L:7014623-7023898 lnc-DNAJC28-3:1 Yes chr2L:7014623-7023898 lnc-DONSON-1:2 Yes chr3R:5372592-5374962 lnc-CRYZL1-1:4 Yes chr3R:5372592-5374962 lnc-DONSON-2:3 Yes chr3R:15265591-15266690 lnc-DONSON-2:2 Yes chr3R:15265591-15266690 lnc-DONSON-2:1 Yes chr3R:15265591-15266690 lnc-DONSON-3:1 Yes chr3R:15265591-15266690 lnc-CRYZL1-81:1 Yes chr3R:15265591-15266690 lnc-SON-2:1 Yes chr3R:15265591-15266690 lnc-SON-2:2 Yes chr3R:15265591-15266690 lnc-MRPS6-6:1 Yes chr3R:15265591-15266690 lnc-CRYZL1-82:1 Yes chr3R:15265591-15266690 lnc-CRYZL1-3:1 Yes chr3R:15265591-15266690 lnc-CRYZL1-82:3 Yes chr3R:15265591-15266690 lnc-CRYZL1-82:2 Yes chr3R:15265591-15266690 LINC00649:2 Yes chr3R:15265591-15266690 LINC00649:3 Yes chr3R:15265591-15266690 lnc-ATP5PO-2:1 Yes chr3R:15265591-15266690 LINC00649:4 Yes chr3R:15265591-15266690 LINC00649:7 Yes chr3R:15265591-15266690 LINC00649:11 Yes chr3R:15265591-15266690 LINC00649:15 No - LINC00649:16 No - LINC00649:17 No - LINC00649:18 No - LINC00649:20 No - LINC00649:21 No - LINC00649:23 No - lnc-ITSN1-3:1 No - lnc-ATP5PO-1:4 No - lnc-MRPS6-3:1 No - lnc-MRPS6-4:1 No - lnc-MRPS6-4:2 No - lnc-MRPS6-5:1 No - LINC00310:8 No - lnc-C21orf140-1:1 No - lnc-SMIM34A-1:2 No - lnc-SMIM34A-1:1 No - lnc-RCAN1-2:1 No - lnc-RCAN1-1:1 Yes chr3R:16186999-16197584 lnc-KCNE1-1:2 Yes chr3R:16186999-16197584 lnc-KCNE1-1:1 Yes chr3R:16186999-16197584 lnc-RUNX1-4:1 Yes chrX:13812971-13822307 lnc-CLIC6-1:2 No - LINC00160:1 No - LINC01426:2 No - lnc-RCAN1-4:1 Yes chrX:20538497-20567097 lnc-RCAN1-3:1 Yes chrX:20538497-20567097 lnc-RCAN1-5:2 Yes chrX:20538497-20567097 lnc-RCAN1-5:1 Yes chrX:20538497-20567097 lnc-RUNX1-12:3 Yes chrX:20538497-20567097 lnc-CLIC6-4:1 Yes chrX:20538497-20567097 lnc-RCAN1-6:1 Yes chrX:20538497-20567097 lnc-CLIC6-5:1 Yes chrX:20538497-20567097 lnc-CLIC6-6:1 Yes chrX:20538497-20567097 RUNX1-IT1:1 Yes chrX:20538497-20567097 lnc-RUNX1-12:8 Yes chrX:20538497-20567097 lnc-RUNX1-12:6 Yes chrX:20538497-20567097 lnc-RUNX1-12:7 Yes chrX:20538497-20567097 lnc-RUNX1-12:5 Yes chrX:20538497-20567097 lnc-SETD4-11:1 Yes chrX:20538497-20567097 lnc-SETD4-10:1 Yes chrX:20538497-20567097 lnc-RUNX1-12:4 Yes chrX:20538497-20567097 lnc-SETD4-9:1 Yes chrX:20538497-20567097 lnc-CBR1-9:1 Yes chrX:20538497-20567097 lnc-RUNX1-12:2 Yes chrX:20538497-20567097 lnc-RUNX1-6:1 No - lnc-CBR1-4:1 No - lnc-RUNX1-3:5 Yes chr3L:1618414-1620397 lnc-RUNX1-3:4 Yes chr3L:1618414-1620397 lnc-RUNX1-5:1 Yes chr3L:1618414-1620397 lnc-RUNX1-5:2 Yes chr3L:1618414-1620397 lnc-CBR3-1:4 No - lnc-CBR3-1:5 No - CBR3-AS1:8 No - CBR3-AS1:9 No - CBR3-AS1:17 No - CBR3-AS1:27 No - CBR3-AS1:21 No - CBR3-AS1:32 No - CBR3-AS1:30 No - CBR3-AS1:10 No - CBR3-AS1:18 No - CBR3-AS1:14 No - CBR3-AS1:3 No - lnc-SETD4-7:1 No - lnc-SETD4-8:1 No - lnc-CHAF1B-1:2 No - lnc-CLDN14-3:1 Yes chr2R:10466001-10468540 lnc-CHAF1B-4:1 No - lnc-HLCS-4:1 No - lnc-SIM2-3:1 Yes chr3R:5474899-5485393 lnc-PIGP-4:1 Yes chr3R:5474899-5485393 lnc-PIGP-2:1 Yes chr3R:5474899-5485393 lnc-RIPPLY3-3:1 Yes chr3R:5474899-5485393 lnc-HLCS-2:3 No - lnc-HLCS-5:2 No - lnc-HLCS-5:1 No - lnc-RIPPLY3-5:1 No - TTC3-AS1:2 No - lnc-TTC3-3:1 No - DSCR9:12 No - lnc-PIGP-3:1 Yes chr3L:20768207-20769482 lnc-PIGP-5:2 Yes chr3L:20768207-20769482 lnc-PIGP-5:1 Yes chr3L:20768207-20769482 lnc-PIGP-6:1 Yes chr3L:20768207-20769482 lnc-PIGP-6:2 Yes chr3L:20768207-20769482 lnc-VPS26C-3:1 Yes chrX:17862697-17887222 lnc-TTC3-6:1 Yes chrX:17862697-17887222 lnc-KCNJ6-6:1 Yes chrX:17862697-17887222 lnc-TTC3-8:1 Yes chrX:17862697-17887222 lnc-KCNJ6-4:1 No - lnc-KCNJ6-3:2 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-KCNJ6-3:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-VPS26C-14:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-DYRK1A-2:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-DYRK1A-3:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-DYRK1A-5:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-DYRK1A-6:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-DYRK1A-7:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-DYRK1A-9:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-ERG-12:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-DYRK1A-10:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-VPS26C-11:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-ERG-6:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-ERG-5:2 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-ERG-5:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-ERG-2:13 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-ERG-3:3 Yes chr3R:23168317-23185642 DSCR8:14 Yes chr3R:23168317-23185642 DSCR8:15 Yes chr3R:23168317-23185642 DSCR8:16 Yes chr3R:23168317-23185642 DSCR8:19 Yes chr3R:23168317-23185642 DSCR8:20 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-KCNJ6-7:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-ETS2-12:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-KCNJ6-8:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-ETS2-11:2 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-ETS2-10:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-KCNJ15-2:1 Yes chr3L:6097617-6123913 lnc-KCNJ6-16:1 Yes chr3L:6097617-6123913 lnc-ETS2-6:1 Yes chr3L:6097617-6123913 lnc-ETS2-6:2 Yes chr3L:6097617-6123913 LINC00114:2 No - LINC00114:7 No - lnc-ETS2-2:5 No - lnc-ETS2-5:1 No - lnc-ERG-9:10 No - lnc-PSMG1-4:13 No - lnc-PSMG1-4:4 No - lnc-WRB-8:1 No - lnc-WRB-8:2 No - lnc-PSMG1-10:1 No - lnc-BRWD1-2:2 No - lnc-PSMG1-11:1 Yes chr3R:24319000-24328619 lnc-WRB-6:1 Yes chr3R:24319000-24328619 lnc-HMGN1-5:1 Yes chr3R:24319000-24328619 lnc-BRWD1-1:1 Yes chr3R:24319000-24328619 lnc-HMGN1-4:1 Yes chr3R:24319000-24328619 lnc-HMGN1-4:3 Yes chr3R:24319000-24328619 lnc-HMGN1-1:2 No - lnc-HMGN1-1:1 No - lnc-HMGN1-1:14 No - lnc-HMGN1-1:13 No - lnc-HMGN1-1:12 No - lnc-HMGN1-1:9 No - lnc-HMGN1-1:10 No - lnc-HMGN1-1:11 No - lnc-HMGN1-1:4 No - lnc-HMGN1-1:6 No - lnc-HMGN1-1:3 No - lnc-HMGN1-1:8 No - lnc-HMGN1-1:7 No - lnc-HMGN1-1:5 No - lnc-WRB-1:2 No - lnc-WRB-1:3 No - lnc-HMGN1-2:1 No - lnc-LCA5L-3:2 No - lnc-LCA5L-3:1 No - lnc-LCA5L-3:4 No - lnc-LCA5L-3:3 No - lnc-LCA5L-3:6 No - lnc-LCA5L-3:5 Yes chr3L:17020348-17022856 lnc-WRB-4:1 Yes chr3L:7364584-7369260 lnc-LCA5L-1:1 Yes chr3L:7364584-7369260 lnc-SH3BGR-1:1 No - lnc-SH3BGR-3:1 No - B3GALT5-AS1:1 No - B3GALT5-AS1:7 No - lnc-SH3BGR-5:1 No - lnc-IGSF5-3:1 No - lnc-B3GALT5-1:5 No - lnc-DSCAM-2:1 No - lnc-LCA5L-2:1 Yes chr3R:17473935-17505667 lnc-LCA5L-2:4 Yes chr3R:17473935-17505667 lnc-LCA5L-2:3 Yes chr3R:17473935-17505667 lnc-PCP4-3:1 Yes chr3R:17473935-17505667 DSCAM-AS1:6 Yes chr3R:17473935-17505667 lnc-PCP4-4:1 Yes chr3R:17473935-17505667 lnc-BACE2-3:1 No - lnc-FAM3B-9:1 No - lnc-BACE2-1:1 No - lnc-FAM3B-3:1 No - lnc-FAM3B-3:2 No - lnc-MX1-4:1 No - lnc-MX1-4:2 No - lnc-MX1-4:3 No - lnc-MX1-4:4 No - lnc-MX1-5:1 No - lnc-RIPK4-6:2 Yes chr2R:7540111-7564435 lnc-RIPK4-6:1 Yes chr2R:7540111-7564435 lnc-RIPK4-5:1 Yes chr2R:7540111-7564435 lnc-RIPK4-5:2 Yes chr2R:7540111-7564435 lnc-RIPK4-4:1 Yes chr2R:7540111-7564435 lnc-MX1-6:1 No - LINC00111:2 No - LINC00479:6 No - LINC00479:5 No - LINC00479:2 No - LINC00479:3 No - LINC00112:1 No - LINC00112:8 No - lnc-UMODL1-4:5 No - lnc-UMODL1-4:6 No - lnc-RIPK4-3:5 No - lnc-C2CD2-3:1 No - lnc-UMODL1-7:1 No - lnc-ZBTB21-1:1 No - ZNF295-AS1:3 No - ZNF295-AS1:4 No - ZNF295-AS1:5 No - ZNF295-AS1:6 No - ZNF295-AS1:9 No - lnc-UMODL1-6:1 No - lnc-TFF3-3:1 Yes chr2L:4333913-4345776 lnc-UBASH3A-6:1 Yes chr2L:4333913-4345776 lnc-TFF3-1:1 Yes chr2L:4333913-4345776 lnc-UBASH3A-6:2 Yes chr2L:4333913-4345776 lnc-ABCG1-1:1 No - lnc-ABCG1-2:1 No - lnc-TFF2-1:1 No - lnc-TFF1-2:1 No - lnc-TFF1-2:2 No - lnc-TFF1-1:1 No - lnc-TFF1-3:2 Yes chr2R:7540111-7564435 lnc-UBASH3A-1:4 No - lnc-UBASH3A-3:1 Yes chr2R:21282298-21285679 lnc-RSPH1-5:1 Yes chr2R:21282298-21285679 LINC01671:7 No - LINC01671:8 No - LINC01671:10 No - lnc-PDE9A-2:1 No - lnc-CBS-2:1 Yes chrX:6288100-6289562 lnc-CBS-1:2 Yes chrX:6288100-6289562 lnc-NDUFV3-2:3 No - lnc-WDR4-2:2 No - lnc-U2AF1-3:1 Yes chrX:21045138-21049096 lnc-U2AF1-1:4 Yes chr2L:292959-294681 lnc-U2AF1-1:2 Yes chr2L:292959-294681 lnc-U2AF1-1:1 Yes chr2L:292959-294681 lnc-U2AF1-1:3 Yes chr2L:292959-294681 lnc-CRYAA-14:1 No - lnc-CRYAA-13:1 No - lnc-CRYAA-12:1 No - lnc-CRYAA-11:1 No - lnc-U2AF1-2:1 No - lnc-CRYAA-10:1 No - lnc-CRYAA-9:1 No - lnc-CRYAA-8:1 No - lnc-CRYAA-7:1 No - lnc-CRYAA-6:1 No - lnc-CRYAA-16:1 No - LINC00322:2 No - LINC00319:1 No - LINC00319:3 No - LINC00313:35 No - LINC00319:14 No - LINC00313:26 No - LINC00313:10 No - LINC00313:27 No - LINC00319:15 No - LINC00313:15 No - LINC00313:11 No - lnc-HSF2BP-1:1 No - lnc-H2BFS-5:1 No - lnc-HSF2BP-3:1 No - lnc-RRP1-1:1 No - AATBC:9 Yes chr2L:13363308-13366189 AATBC:1 No - AATBC:2 No - lnc-CSTB-2:2 No - lnc-CSTB-3:1 No - lnc-RRP1-3:1 Yes chr3L:16381772-16385957 lnc-TRAPPC10-3:1 Yes chr3L:16381772-16385957 lnc-TRAPPC10-3:2 Yes chr3L:16381772-16385957 lnc-ICOSLG-11:1 Yes chr3R:15214762-15218874 lnc-ICOSLG-10:1 Yes chr2R:10823405-10827644 lnc-ICOSLG-9:1 Yes chr2R:10823405-10827644 lnc-PWP2-4:1 No - lnc-ICOSLG-13:1 No - lnc-ICOSLG-1:2 No - lnc-ICOSLG-1:3 No - lnc-AIRE-5:1 No - lnc-PFKL-1:2 Yes chr3L:4094343-4103256 lnc-DNMT3L-2:1 Yes chr3L:4094343-4103256 lnc-LRRC3-6:1 Yes chr2R:15262808-15309368 lnc-LRRC3-6:3 Yes chr2R:15262808-15309368 LRRC3-DT:13 No - LRRC3-DT:12 No - lnc-LRRC3-3:1 No - lnc-LRRC3-3:2 No - lnc-LRRC3-3:3 No - lnc-LRRC3-3:4 No - lnc-TSPEAR-4:1 No - lnc-LRRC3-4:1 No - lnc-TSPEAR-3:1 No - lnc-LRRC3-5:1 No - lnc-LRRC3-8:1 No - lnc-LRRC3-8:2 No - LINC02575:6 No - LINC02575:7 No - LINC02575:8 No - lnc-KRTAP10-1-1:1 No - lnc-KRTAP10-2-1:2 No - lnc-KRTAP10-2-1:1 No - lnc-KRTAP10-7-1:1 No - lnc-KRTAP10-5-1:1 No - lnc-KRTAP12-4-1:1 No - lnc-KRTAP10-12-2:1 No - lnc-SUMO3-1:2 Yes chrX:16593677-16595867 lnc-SUMO3-1:3 Yes chrX:16593677-16595867 lnc-SUMO3-1:4 Yes chrX:16593677-16595867 lnc-SUMO3-1:1 Yes chrX:16593677-16595867 lnc-FAM207A-8:1 No - lnc-ITGB2-2:4 No - lnc-ITGB2-2:3 No - lnc-ITGB2-2:2 No - lnc-FAM207A-6:1 No - lnc-FAM207A-5:1 No - lnc-FAM207A-4:1 No - lnc-PTTG1IP-8:2 Yes chrX:8061645-8070237 lnc-PTTG1IP-8:3 Yes chrX:8061645-8070237 lnc-PTTG1IP-8:1 Yes chrX:8061645-8070237 ITGB2-AS1:1 Yes chrX:8061645-8070237 ITGB2-AS1:2 Yes chrX:8061645-8070237 ITGB2-AS1:3 Yes chrX:8061645-8070237 ITGB2-AS1:4 Yes chrX:8061645-8070237 ITGB2-AS1:5 Yes chrX:8061645-8070237 ITGB2-AS1:6 Yes chrX:8061645-8070237 lnc-FAM207A-3:1 No - lnc-ITGB2-10:1 No - lnc-ITGB2-11:2 No - lnc-ITGB2-11:3 No - lnc-ITGB2-11:1 Yes chrX:1773725-1788065 lnc-ITGB2-11:4 No - lnc-ADARB1-1:2 No - lnc-SLC19A1-10:2 Yes chrX:1464363-1465996 LINC00205:4 No - LINC00205:18 No - lnc-SLC19A1-7:1 No - lnc-SLC19A1-4:2 Yes chr3L:6998843-7053499 lnc-PCBP3-5:1 Yes chr3L:6998843-7053499 lnc-PCBP3-5:2 Yes chr3L:6998843-7053499 lnc-SLC19A1-4:1 Yes chr3L:6998843-7053499 lnc-POFUT2-4:1 No - lnc-POFUT2-5:1 No - lnc-POFUT2-6:2 No - lnc-POFUT2-6:1 No - lnc-POFUT2-7:1 Yes chr3R:10858202-10859813 lnc-SLC19A1-5:1 No - lnc-SLC19A1-5:4 No - lnc-PCBP3-3:2 Yes chr3L:21844788-21932702 lnc-PCBP3-3:3 Yes chr3L:21844788-21932702 lnc-PCBP3-3:4 Yes chr3L:21844788-21932702 lnc-PCBP3-3:5 Yes chr3L:21844788-21932702 lnc-PCBP3-3:6 Yes chr3L:21844788-21932702 lnc-PCBP3-3:7 Yes chr3L:21844788-21932702 lnc-SLC19A1-9:1 Yes chr3L:21844788-21932702 lnc-PCBP3-3:9 Yes chr3L:21844788-21932702 lnc-PCBP3-3:10 Yes chr3L:21844788-21932702 lnc-SLC19A1-11:1 Yes chr3L:21844788-21932702 lnc-COL6A1-9:1 Yes chr3L:21844788-21932702 lnc-SLC19A1-3:2 Yes chr3L:21844788-21932702 lnc-COL6A1-8:1 Yes chr3L:21844788-21932702 lnc-FTCD-6:1 Yes chr3L:21844788-21932702 lnc-COL6A1-6:1 Yes chr3L:21844788-21932702 lnc-COL6A1-5:1 Yes chr3L:21844788-21932702 lnc-COL6A1-4:1 No - lnc-FTCD-5:1 No - lnc-FTCD-4:1 No - lnc-FTCD-3:3 No - lnc-FTCD-3:1 No - lnc-FTCD-3:2 No - lnc-SPATC1L-4:2 No - lnc-COL6A2-5:1 No - lnc-SPATC1L-4:3 No - lnc-SPATC1L-4:1 No - lnc-SPATC1L-3:1 No - lnc-SPATC1L-3:2 No - lnc-SPATC1L-2:1 No - lnc-SPATC1L-2:2 No - lnc-SPATC1L-1:1 No - lnc-C21orf58-2:1 Yes chrX:17154110-17159306 lnc-PCNT-2:1 No - lnc-PCNT-2:2 No - lnc-PCNT-2:3 No - lnc-MCM3AP-1:1 No - lnc-MCM3AP-2:1 No - lnc-DIP2A-3:1 No - lnc-DIP2A-3:2 No - lnc-C21orf58-3:1 No - lnc-C21orf58-1:2 No - lnc-S100B-1:1 Yes chr2L:11009821-11011086 lnc-PRMT2-1:1 No - lnc-PRMT2-1:2 No - lnc-POTEH-9:1 No - lnc-POTEH-8:2 No - lnc-POTEH-8:1 No - lnc-POTEH-7:4 No - lnc-POTEH-7:2 No - lnc-POTEH-7:1 No - lnc-POTEH-7:3 No - lnc-CCT8L2-28:1 No - lnc-POTEH-4:1 No - lnc-POTEH-7:6 No - lnc-POTEH-7:5 No - lnc-POTEH-5:1 No - lnc-CCT8L2-27:1 No - lnc-POTEH-2:1 No - lnc-OR11H1-2:1 No - lnc-CCT8L2-26:1 No - lnc-CCT8L2-25:1 No - lnc-OR11H1-1:1 No - lnc-OR11H1-3:1 No - lnc-OR11H1-4:1 No - lnc-IL17RA-23:1 No - lnc-CCT8L2-5:1 No - lnc-IL17RA-20:1 No - lnc-CCT8L2-3:1 No - lnc-IL17RA-18:1 No - lnc-CCT8L2-2:1 No - lnc-IL17RA-17:1 No - lnc-IL17RA-36:6 No - lnc-IL17RA-36:7 No - lnc-IL17RA-36:21 No - lnc-IL17RA-36:22 No - lnc-IL17RA-36:25 No - lnc-IL17RA-36:26 No - lnc-IL17RA-36:29 No - lnc-IL17RA-36:30 No - lnc-IL17RA-36:31 No - lnc-CCT8L2-4:1 No - lnc-CCT8L2-1:6 No - LINC01665:7 No - lnc-IL17RA-15:1 No - lnc-IL17RA-14:1 No - lnc-IL17RA-13:1 No - lnc-IL17RA-13:2 No - lnc-IL17RA-13:3 No - lnc-XKR3-2:1 No - lnc-XKR3-3:1 No - lnc-IL17RA-13:4 No - lnc-GAB4-4:1 No - lnc-GAB4-3:1 No - lnc-GAB4-2:1 No - lnc-GAB4-1:2 No - lnc-IL17RA-12:1 No - lnc-IL17RA-33:3 No - lnc-IL17RA-33:5 No - lnc-IL17RA-33:7 No - lnc-IL17RA-33:8 No - lnc-IL17RA-11:1 No - lnc-TMEM121B-2:1 No - lnc-CECR2-1:2 No - lnc-CECR2-1:3 No - lnc-TMEM121B-1:1 No - lnc-IL17RA-3:2 No - lnc-IL17RA-4:34 No - lnc-TMEM121B-3:1 No - lnc-TMEM121B-3:3 No - lnc-TMEM121B-3:2 No - lnc-ADA2-2:2 No - lnc-ADA2-2:1 No - HDHD5-AS1:19 No - HDHD5-AS1:20 No - HDHD5-AS1:22 No - lnc-HDHD5-1:1 Yes chr2R:14656798-14658755 lnc-IL17RA-8:3 Yes chr2R:14656798-14658755 lnc-IL17RA-9:2 Yes chr2R:14656798-14658755 lnc-IL17RA-34:1 Yes chr2R:14656798-14658755 lnc-CECR2-7:1 No - lnc-ADA2-4:1 No - lnc-SLC25A18-1:1 Yes chr3L:6728800-6743164 lnc-ATP6V1E1-5:1 Yes chr3L:6728800-6743164 lnc-ATP6V1E1-3:1 Yes chr3L:6728800-6743164 lnc-SLC25A18-3:1 Yes chr3L:6728800-6743164 lnc-CECR2-5:1 Yes chr3R:11967708-11971686 lnc-CECR2-5:3 Yes chr3R:11967708-11971686 lnc-ATP6V1E1-2:1 Yes chr3R:5591763-5595356 lnc-ATP6V1E1-2:2 Yes chr3R:5591763-5595356 lnc-BCL2L13-3:1 No - lnc-BID-3:1 No - lnc-BID-4:2 No - lnc-BID-4:1 No - lnc-BCL2L13-4:1 No - lnc-BID-5:1 No - lnc-PEX26-2:1 No - lnc-MICAL3-2:3 No - lnc-MICAL3-4:1 No - lnc-TUBA8-1:1 No - lnc-MICAL3-6:1 No - lnc-MICAL3-6:2 No - lnc-MICAL3-7:1 No - LINC02592:9 No - LINC01662:17 No - LINC01662:18 No - LINC01662:19 No - LINC01662:20 No - LINC01662:21 No - LINC01662:22 No - LINC01662:23 No - LINC01662:24 No - lnc-RIMBP3-7:1 No - lnc-RIMBP3-6:2 No - lnc-RIMBP3-6:1 No - LINC01662:25 No - LINC01662:27 No - LINC01662:28 No - LINC01662:29 No - LINC01662:30 No - lnc-DGCR6-1:2 No - lnc-DGCR6-7:1 No - lnc-DGCR6-7:2 No - lnc-DGCR6-7:3 No - lnc-DGCR6-7:4 No - lnc-PRODH-4:1 No - lnc-DGCR6-2:28 No - lnc-DGCR6-2:29 No - lnc-DGCR6-2:31 No - lnc-DGCR6-3:1 No - LINC01663:8 No - lnc-DGCR2-6:1 Yes chr3L:15509445-15511047 lnc-DGCR6-4:1 No - lnc-DGCR6-6:1 No - lnc-DGCR6-6:2 No - lnc-DGCR6-6:3 No - lnc-DGCR6-6:12 No - lnc-DGCR6-6:15 No - lnc-DGCR2-5:3 No - lnc-DGCR2-5:1 No - lnc-DGCR2-5:4 No - lnc-DGCR2-5:2 No - lnc-DGCR6-5:1 No - lnc-DGCR6-6:18 No - lnc-DGCR6-6:19 No - lnc-DGCR6-6:20 No - lnc-DGCR6-6:21 No - lnc-DGCR2-4:2 No - lnc-DGCR2-4:1 No - lnc-DGCR6-6:23 No - lnc-DGCR6-6:24 No - lnc-DGCR6-6:27 No - lnc-DGCR6-6:28 No - lnc-DGCR2-3:1 No - lnc-DGCR6-6:29 No - lnc-DGCR6-6:30 No - lnc-DGCR6-6:32 No - lnc-DGCR6-6:33 No - lnc-DGCR2-1:1 No - lnc-ESS2-5:1 No - lnc-ESS2-5:2 No - DGCR11:3 No - lnc-TSSK2-4:1 No - lnc-ESS2-3:1 No - lnc-ESS2-2:1 No - lnc-DGCR2-2:1 No - lnc-TSSK2-3:1 Yes chrX:8461479-8463349 lnc-GSC2-1:2 Yes chrX:8461479-8463349 lnc-GSC2-1:1 Yes chrX:8461479-8463349 LINC01311:3 No - lnc-SLC25A1-2:1 No - lnc-SLC25A1-3:1 No - lnc-SLC25A1-4:1 No - lnc-MRPL40-5:1 No - lnc-MRPL40-1:2 Yes chr3L:11121966-11123216 LINC00895:9 No - lnc-CLDN5-2:1 No - lnc-GNB1L-1:2 Yes chrX:16684216-16695173 lnc-TXNRD2-2:1 Yes chr2R:11825345-11827097 lnc-TBX1-2:1 No - lnc-TBX1-3:7 No - lnc-COMT-3:1 Yes chr3L:22550226-22552019 lnc-GNB1L-2:1 Yes chr3L:22550226-22552019 lnc-ARVCF-3:1 Yes chr3L:22550226-22552019 lnc-TXNRD2-1:1 No - lnc-ARVCF-2:1 No - lnc-ARVCF-2:2 No - lnc-COMT-2:1 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-COMT-2:2 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-TXNRD2-3:2 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-TXNRD2-3:1 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-TXNRD2-4:1 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-ARVCF-1:3 No - lnc-ARVCF-1:9 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-ARVCF-1:2 No - lnc-ARVCF-1:8 No - lnc-ARVCF-1:1 No - lnc-ARVCF-1:6 No - lnc-TANGO2-1:1 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-ARVCF-1:5 No - lnc-ARVCF-1:4 Yes chrX:13616989-13619207 lnc-ARVCF-1:7 Yes chrX:13616989-13619207 lnc-COMT-4:1 Yes chrX:13616989-13619207 lnc-COMT-4:2 Yes chrX:13616989-13619207 lnc-ARVCF-4:6 Yes chrX:13616989-13619207 lnc-ARVCF-4:10 Yes chrX:13616989-13619207 lnc-ARVCF-4:4 Yes chrX:13616989-13619207 lnc-ARVCF-4:5 Yes chrX:13616989-13619207 lnc-ARVCF-4:7 Yes chrX:13616989-13619207 lnc-ARVCF-4:3 Yes chrX:13616989-13619207 lnc-ARVCF-4:8 Yes chrX:13616989-13619207 lnc-ARVCF-4:13 Yes chrX:13616989-13619207 lnc-CCDC188-3:2 Yes chr3L:18997875-19000608 lnc-CCDC188-3:1 No - lnc-CCDC188-2:1 No - lnc-CCDC188-2:2 No - LINC00896:7 No - lnc-RTN4R-2:2 Yes chr2L:13212335-13215350 lnc-RTN4R-2:3 Yes chr2L:13212335-13215350 lnc-RTN4R-2:1 Yes chr2L:13212335-13215350 lnc-GGTLC3-2:4 No - lnc-GGTLC3-4:1 No - lnc-GGTLC3-4:2 No - lnc-RIMBP3-1:1 Yes chr3R:15374635-15402543 lnc-RIMBP3-2:1 No - lnc-RIMBP3-3:1 No - lnc-SCARF2-1:1 No - lnc-SCARF2-3:3 No - lnc-SCARF2-4:1 No - lnc-SCARF2-5:1 No - lnc-MED15-1:2 Yes chr2L:473013-476170 lnc-KLHL22-2:1 Yes chr2L:473013-476170 lnc-PI4KA-3:3 No - lnc-PI4KA-3:7 No - lnc-PI4KA-3:6 No - lnc-PI4KA-3:5 No - lnc-PI4KA-3:4 No - lnc-PI4KA-3:1 No - lnc-MED15-2:1 No - lnc-PI4KA-3:2 No - lnc-PI4KA-1:1 No - lnc-SERPIND1-1:35 No - lnc-SERPIND1-1:59 No - lnc-SERPIND1-1:60 No - lnc-KLHL22-3:1 Yes chrX:2624804-2633672 lnc-KLHL22-4:1 Yes chrX:2624804-2633672 lnc-KLHL22-5:2 Yes chrX:2624804-2633672 lnc-KLHL22-5:1 Yes chrX:2624804-2633672 lnc-THAP7-5:1 Yes chrX:2624804-2633672 lnc-CRKL-2:1 No - lnc-CRKL-1:1 No - LINC01637:9 No - lnc-THAP7-4:1 No - lnc-CRKL-4:1 No - lnc-CRKL-4:2 No - lnc-SLC7A4-2:1 No - THAP7-AS1:3 No - lnc-THAP7-1:1 No - lnc-THAP7-20:3 No - lnc-SLC7A4-1:1 No - lnc-LRRC74B-3:4 No - lnc-SLC7A4-3:2 No - lnc-LRRC74B-5:2 No - FAM230B:11 No - FAM230B:12 No - lnc-RIMBP3B-6:1 No - lnc-GGT2-3:1 No - lnc-GGT2-26:10 No - lnc-RIMBP3B-3:1 No - lnc-RIMBP3B-1:1 Yes chr3R:15374635-15402543 lnc-RIMBP3C-3:1 No - lnc-RIMBP3C-5:1 No - lnc-RIMBP3C-4:1 No - lnc-RIMBP3C-2:2 No - lnc-RIMBP3C-2:3 No - lnc-RIMBP3C-1:1 Yes chr3R:15374635-15402543 lnc-YDJC-1:1 No - lnc-YDJC-1:2 No - lnc-SDF2L1-2:1 No - lnc-SDF2L1-3:1 No - lnc-SDF2L1-4:1 No - lnc-PPIL2-2:4 No - lnc-PPIL2-2:5 No - lnc-PPIL2-2:6 No - lnc-MAPK1-3:1 No - lnc-MAPK1-2:1 Yes chrX:10205292-10212374 lnc-MAPK1-1:1 Yes chrX:10205292-10212374 lnc-PPIL2-3:1 No - lnc-PPIL2-4:1 No - lnc-PPIL2-4:2 No - lnc-YPEL1-1:1 Yes chr2R:1071462-1125927 lnc-PPIL2-5:1 Yes chr2R:1071462-1125927 lnc-PPIL2-6:1 No - lnc-TOP3B-2:1 Yes chr2L:18700606-18703105 lnc-PPIL2-1:3 Yes chr2L:18700606-18703105 lnc-PPM1F-1:1 Yes chrX:6284138-6287990 lnc-PPM1F-2:1 Yes chrX:6284138-6287990 lnc-TOP3B-1:5 No - lnc-VPREB1-25:1 No - lnc-VPREB1-24:1 No - lnc-VPREB1-22:1 No - lnc-VPREB1-21:1 No - lnc-VPREB1-20:1 No - lnc-VPREB1-19:1 No - lnc-VPREB1-18:1 No - lnc-VPREB1-17:1 No - lnc-VPREB1-15:1 No - lnc-TOP3B-3:1 No - lnc-VPREB1-13:1 No - lnc-VPREB1-13:2 No - lnc-VPREB1-11:1 No - lnc-VPREB1-10:1 No - lnc-VPREB1-10:2 No - lnc-VPREB1-9:1 No - lnc-TOP3B-4:1 No - lnc-VPREB1-8:1 No - lnc-VPREB1-6:1 No - lnc-VPREB1-5:1 No - lnc-ZNF280B-6:2 No - lnc-VPREB1-4:1 No - lnc-VPREB1-3:1 No - lnc-ZNF280B-2:1 No - lnc-VPREB1-7:3 No - lnc-VPREB1-7:4 No - lnc-VPREB1-7:7 No - lnc-ZNF280B-1:1 No - lnc-VPREB1-7:9 No - lnc-VPREB1-7:10 No - lnc-VPREB1-7:11 No - lnc-ZNF280B-6:1 No - lnc-VPREB1-7:12 No - lnc-VPREB1-12:1 No - lnc-VPREB1-14:1 No - lnc-IGLL5-1:1 No - lnc-IGLL5-1:2 No - lnc-IGLL5-1:3 No - lnc-VPREB1-26:1 No - lnc-VPREB1-27:1 No - lnc-VPREB1-28:1 No - lnc-GGTLC2-17:1 No - lnc-GGTLC2-16:1 No - lnc-GGTLC2-13:1 No - lnc-GGTLC2-12:1 No - lnc-GGTLC2-5:1 No - lnc-GGTLC2-2:1 No - lnc-GGTLC2-3:1 No - lnc-GGTLC2-4:1 No - lnc-GGTLC2-6:1 No - lnc-PRAME-1:1 No - lnc-PRAME-1:2 No - lnc-GGTLC2-7:1 No - lnc-PRAME-3:1 No - lnc-GGTLC2-8:1 No - lnc-GGTLC2-9:1 No - lnc-GGTLC2-14:1 No - lnc-IGLL5-7:1 No - lnc-IGLL5-6:1 No - lnc-IGLL5-5:1 No - lnc-IGLL5-4:1 No - lnc-IGLL5-10:1 No - lnc-IGLL5-2:1 No - lnc-RSPH14-6:1 No - lnc-RSPH14-4:1 No - lnc-IGLL5-3:2 No - lnc-IGLL5-8:1 No - lnc-IGLL5-9:1 No - lnc-GNAZ-4:1 No - lnc-GNAZ-2:1 No - lnc-GNAZ-1:2 No - lnc-IGLL1-6:1 No - lnc-RSPH14-2:1 Yes chrX:127449-140340 lnc-RSPH14-2:2 Yes chrX:127449-140340 lnc-RSPH14-3:1 Yes chrX:127449-140340 lnc-RAB36-3:2 Yes chrX:127449-140340 lnc-RAB36-6:1 Yes chrX:127449-140340 lnc-RSPH14-5:1 Yes chrX:127449-140340 lnc-IGLL1-5:1 No - lnc-BCR-3:1 No - lnc-IGLL1-4:3 No - lnc-BCR-4:1 No - lnc-IGLL1-4:2 No - lnc-BCR-4:2 No - lnc-BCR-5:1 No - lnc-BCR-5:2 No - lnc-BCR-5:3 No - lnc-BCR-5:4 No - LINC01658:9 No - lnc-IGLL1-1:62 No - lnc-IGLL1-1:60 No - lnc-RGL4-5:1 No - lnc-IGLL1-1:59 No - lnc-IGLL1-1:35 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:4 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:18 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:2 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:31 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:22 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:54 No - lnc-IGLL1-1:23 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:37 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:36 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:32 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:53 No - lnc-IGLL1-1:49 No - lnc-IGLL1-1:24 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:39 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:50 No - lnc-IGLL1-1:25 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:55 No - lnc-IGLL1-1:51 No - lnc-IGLL1-1:29 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:42 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:44 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:7 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:48 No - lnc-IGLL1-1:28 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:34 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:40 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-DRICH1-2:4 No - lnc-DRICH1-2:3 No - lnc-DRICH1-2:1 No - lnc-IGLL1-1:43 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:38 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:45 No - lnc-IGLL1-1:33 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:46 No - lnc-IGLL1-1:30 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:26 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:8 No - lnc-IGLL1-1:3 No - lnc-IGLL1-1:9 No - lnc-IGLL1-1:5 No - lnc-ZNF70-1:1 Yes chrX:2727698-2730042 lnc-VPREB3-1:1 Yes chrX:17149001-17150647 lnc-C22orf15-2:1 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-DERL3-1:1 No - lnc-DERL3-1:5 No - lnc-DERL3-1:3 No - lnc-DERL3-1:4 No - lnc-DERL3-1:2 No - lnc-DERL3-3:1 No - lnc-DERL3-4:1 No - MIF-AS1:6 No - MIF-AS1:3 No - MIF-AS1:2 No - MIF-AS1:1 No - lnc-DDTL-3:1 No - lnc-DDTL-2:1 No - lnc-DDTL-1:1 No - lnc-GSTT2B-3:1 No - lnc-GSTT2B-2:1 No - lnc-DDT-1:5 Yes chrX:13404749-13409323 lnc-GSTT4-2:1 No - lnc-GGT5-2:1 No - lnc-SPECC1L-1:2 No - lnc-GGT5-3:1 No - lnc-ADORA2A-1:4 No - lnc-ADORA2A-1:5 No - ADORA2A-AS1:2 No - ADORA2A-AS1:7 No - ADORA2A-AS1:4 No - ADORA2A-AS1:1 No - ADORA2A-AS1:6 Yes chr3R:7747913-7750079 lnc-GUCD1-2:1 No - lnc-UPB1-2:1 Yes chrX:2583745-2585699 lnc-LRRC75B-4:1 Yes chrX:2583745-2585699 lnc-LRRC75B-3:1 Yes chrX:2583745-2585699 lnc-LRRC75B-1:2 No - lnc-LRRC75B-1:3 No - lnc-LRRC75B-1:1 No - lnc-SNRPD3-1:2 No - lnc-LRRC75B-73:1 No - lnc-GGT1-1:1 No - lnc-GGT1-3:1 No - lnc-GGT1-4:1 No - lnc-PIWIL3-2:1 No - lnc-GGT1-5:1 No - lnc-GGT1-5:2 No - lnc-SGSM1-2:1 No - lnc-TMEM211-2:4 No - lnc-TMEM211-2:3 No - lnc-TMEM211-2:5 No - lnc-TMEM211-2:2 No - lnc-LRP5L-10:1 No - lnc-CRYBB3-1:2 No - lnc-CRYBB2-1:1 No - lnc-CRYBB2-1:2 No - lnc-LRP5L-1:4 No - lnc-CRYBB2-2:1 No - lnc-CRYBB2-3:1 No - lnc-GRK3-10:1 No - lnc-LRP5L-5:1 No - lnc-LRP5L-7:1 No - lnc-GRK3-8:1 No - lnc-GRK3-7:1 No - lnc-GRK3-7:2 No - lnc-GRK3-7:3 No - lnc-GRK3-7:4 No - lnc-LRP5L-8:1 No - lnc-GRK3-6:1 No - lnc-GRK3-4:1 No - lnc-GRK3-3:1 No - lnc-LRP5L-9:2 No - lnc-LRP5L-9:3 No - lnc-LRP5L-2:11 No - lnc-LRP5L-2:10 Yes chr2R:4322295-4471060 lnc-MYO18B-4:1 Yes chr2R:4322295-4471060 lnc-LRP5L-11:1 Yes chr2R:4322295-4471060 lnc-MYO18B-3:3 Yes chr2R:4322295-4471060 lnc-MYO18B-5:1 Yes chr2R:4322295-4471060 lnc-MYO18B-2:3 Yes chr2R:4322295-4471060 lnc-LRP5L-12:1 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-LRP5L-4:6 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-LRP5L-4:19 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-LRP5L-4:9 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-LRP5L-4:20 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-LRP5L-4:13 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-LRP5L-4:31 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-LRP5L-4:5 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-LRP5L-4:27 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-LRP5L-4:12 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-LRP5L-4:30 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-LRP5L-4:22 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-LRP5L-13:1 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-LRP5L-4:18 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-LRP5L-4:17 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-LRP5L-4:23 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-LRP5L-4:24 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-LRP5L-4:16 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-HPS4-9:1 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-HPS4-8:2 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-MYO18B-1:1 No - lnc-HPS4-7:1 No - lnc-HPS4-4:1 No - lnc-ASPHD2-1:1 Yes chr2R:17683574-17690822 lnc-TFIP11-2:1 Yes chr2R:17683574-17690822 lnc-TFIP11-1:7 Yes chr2R:17683574-17690822 lnc-TFIP11-1:6 Yes chr2R:17683574-17690822 lnc-TFIP11-1:3 Yes chr2R:17683574-17690822 lnc-TFIP11-1:2 Yes chr2R:17683574-17690822 lnc-TFIP11-1:4 Yes chr2R:17683574-17690822 lnc-TPST2-5:1 Yes chr2L:5721051-5723944 lnc-TPST2-2:1 Yes chr2L:5721051-5723944 lnc-SRRD-1:3 No - lnc-SRRD-1:4 No - lnc-TPST2-1:2 Yes chrX:13563823-13593224 lnc-CRYBB1-3:1 No - lnc-CRYBA4-52:49 No - lnc-CRYBA4-52:50 No - lnc-CRYBB1-1:2 No - lnc-CRYBA4-52:89 No - LINC01422:2 No - lnc-CRYBB1-1:3 No - LINC01422:4 No - lnc-CRYBA4-6:2 No - LINC01638:12 No - lnc-MN1-10:1 No - lnc-MN1-2:2 No - lnc-HSCB-6:1 No - lnc-PITPNB-4:1 No - lnc-MN1-1:2 No - lnc-MN1-7:1 Yes chr3R:19215434-19226651 lnc-MN1-8:1 Yes chr3R:19215434-19226651 lnc-TTC28-3:1 Yes chr3R:19215434-19226651 lnc-TTC28-2:1 Yes chr3R:19215434-19226651 lnc-TTC28-2:2 Yes chr3R:19215434-19226651 TTC28-AS1:1 Yes chr3R:19215434-19226651 TTC28-AS1:4 Yes chr3R:19215434-19226651 TTC28-AS1:20 Yes chr3R:19215434-19226651 TTC28-AS1:21 Yes chr3R:19215434-19226651 TTC28-AS1:23 No - lnc-PITPNB-2:1 No - lnc-HSCB-5:1 No - lnc-HSCB-4:1 No - TTC28-AS1:24 Yes chr3L:8472807-8507146 TTC28-AS1:26 Yes chr3L:8472807-8507146 TTC28-AS1:27 Yes chr3L:8472807-8507146 lnc-PITPNB-5:1 Yes chr3L:8472807-8507146 lnc-PITPNB-6:1 Yes chr3L:8472807-8507146 lnc-PITPNB-7:1 Yes chr3L:8472807-8507146 lnc-CHEK2-1:1 Yes chr3L:8472807-8507146 lnc-TTC28-1:1 Yes chr2L:20061422-20064381 lnc-CCDC117-1:6 Yes chr2R:21143545-21145750 lnc-XBP1-2:1 No - lnc-ZNRF3-1:1 No - lnc-ZNRF3-1:2 No - lnc-ZNRF3-1:3 No - lnc-RHBDD3-3:8 No - lnc-EMID1-2:1 No - lnc-RASL10A-3:1 No - lnc-RASL10A-2:1 No - lnc-RASL10A-2:2 No - lnc-AP1B1-3:1 Yes chr3R:5414527-5458394 lnc-AP1B1-2:1 No - RFPL1S:5 No - RFPL1S:11 No - RFPL1S:9 No - RFPL1S:1 No - RFPL1S:4 No - RFPL1S:8 No - RFPL1S:7 No - lnc-NIPSNAP1-2:1 Yes chr2R:23954091-23956406 lnc-THOC5-2:1 Yes chrX:16070365-16073568 lnc-NEFH-1:1 Yes chrX:19689697-19693500 lnc-NEFH-1:2 Yes chrX:19689697-19693500 lnc-CABP7-2:1 Yes chrX:19689697-19693500 lnc-ZMAT5-1:4 No - lnc-ZMAT5-2:1 Yes chr2L:1170181-1170789 lnc-ZMAT5-3:1 Yes chrX:2717638-2720327 lnc-ZMAT5-4:3 Yes chrX:2717638-2720327 lnc-ZMAT5-4:1 Yes chrX:2717638-2720327 lnc-ZMAT5-4:2 Yes chrX:2717638-2720327 lnc-ZMAT5-5:1 Yes chrX:2717638-2720327 HORMAD2-AS1:7 No - lnc-HORMAD2-3:1 Yes chrX:16296671-16303308 HORMAD2-AS1:1 No - HORMAD2-AS1:14 No - HORMAD2-AS1:2 No - lnc-LIF-3:1 No - lnc-CASTOR1-2:1 No - lnc-CASTOR1-1:3 No - lnc-CASTOR1-1:2 No - lnc-CASTOR1-1:1 No - lnc-CCDC157-3:1 No - lnc-CCDC157-2:1 Yes chr3R:11581576-11585305 lnc-TBC1D10A-1:2 Yes chr3R:16999384-17002355 lnc-TBC1D10A-1:1 Yes chr3R:16999384-17002355 lnc-RNF215-3:1 No - lnc-RNF215-1:2 No - lnc-MTFP1-4:1 No - lnc-MTFP1-5:1 No - lnc-MTFP1-6:1 Yes chr3L:599094-604008 lnc-SEC14L4-1:1 No - lnc-TCN2-1:2 No - lnc-GAL3ST1-1:2 No - lnc-GAL3ST1-1:1 No - lnc-PES1-2:1 No - lnc-PES1-1:1 No - lnc-DUSP18-1:1 No - lnc-SLC35E4-1:1 Yes chr3R:24934869-24938222 lnc-SLC35E4-1:2 Yes chr3R:24934869-24938222 lnc-SLC35E4-2:2 Yes chr3R:24934869-24938222 lnc-MORC2-4:1 Yes chr3R:24934869-24938222 lnc-SMTN-4:1 Yes chr3R:24934869-24938222 lnc-MORC2-3:1 No - TUG1:1 No - TUG1:6 No - TUG1:9 No - TUG1:11 No - TUG1:18 No - TUG1:22 No - TUG1:23 No - TUG1:26 No - TUG1:29 No - TUG1:30 No - lnc-MORC2-2:1 No - lnc-MORC2-1:1 No - lnc-SMTN-2:1 No - lnc-PLA2G3-3:1 No - lnc-PLA2G3-3:3 No - lnc-PLA2G3-3:2 No - lnc-SMTN-3:1 No - lnc-PLA2G3-2:1 No - RNF185-AS1:2 No - PIK3IP1-AS1:11 No - lnc-PIK3IP1-1:2 No - lnc-PIK3IP1-1:1 No - lnc-EIF4ENIF1-3:1 Yes chr2R:12037298-12038851 lnc-SFI1-3:1 Yes chr2R:12037298-12038851 lnc-EIF4ENIF1-2:1 Yes chr2R:12037298-12038851 lnc-PATZ1-1:1 Yes chr2R:12037298-12038851 lnc-EIF4ENIF1-4:1 No - lnc-EIF4ENIF1-5:1 No - lnc-PRR14L-1:2 Yes chr3R:24050783-24053592 lnc-PRR14L-1:1 Yes chr3R:24050783-24053592 lnc-PISD-1:1 No - lnc-SFI1-5:1 No - lnc-PRR14L-2:1 No - lnc-PRR14L-3:2 No - lnc-PRR14L-5:1 No - lnc-PRR14L-5:3 Yes chr3L:1523414-1534034 lnc-YWHAH-1:2 No - lnc-C22orf42-3:1 No - lnc-C22orf42-2:4 Yes chr3L:1933633-1939103 lnc-C22orf42-2:3 No - lnc-SLC5A1-1:3 No - lnc-SLC5A1-1:4 No - lnc-SLC5A1-2:1 No - lnc-RFPL2-1:1 No - lnc-SLC5A1-3:1 No - SLC5A4-AS1:6 No - lnc-RTCB-4:1 No - lnc-RTCB-3:1 No - lnc-RTCB-2:1 No - RFPL3S:13 No - lnc-RFPL3-1:4 No - lnc-RFPL3-1:5 No - lnc-RFPL3-4:1 No - lnc-BPIFC-1:1 No - lnc-SYN3-5:1 No - lnc-BPIFC-2:4 No - lnc-BPIFC-2:5 No - lnc-BPIFC-2:3 No - lnc-BPIFC-2:1 No - lnc-BPIFC-2:2 No - lnc-FBXO7-3:1 No - lnc-BPIFC-4:1 No - lnc-LARGE1-3:1 No - lnc-LARGE1-8:1 No - lnc-BPIFC-4:2 No - lnc-LARGE1-7:1 No - lnc-TIMP3-7:1 No - lnc-SYN3-6:1 No - lnc-SYN3-7:1 No - lnc-SYN3-8:1 No - LARGE-AS1:1 No - LARGE-AS1:2 No - LARGE-AS1:4 No - LARGE-AS1:5 No - LARGE-AS1:6 No - LARGE-AS1:11 No - lnc-ISX-9:1 No - lnc-ISX-2:3 No - lnc-ISX-1:2 No - lnc-ISX-5:1 No - lnc-ISX-6:1 No - lnc-HMGXB4-8:2 No - lnc-MB-11:10 No - lnc-HMGXB4-2:1 No - lnc-HMGXB4-1:1 No - lnc-TOM1-3:1 Yes chrX:7102555-7104491 lnc-MB-8:1 No - lnc-MB-7:2 No - lnc-MB-6:1 Yes chr3L:9446864-9450785 lnc-HMOX1-2:1 Yes chr3L:9446864-9450785 lnc-HMOX1-2:2 Yes chr3L:9446864-9450785 lnc-MB-6:2 Yes chr3L:9446864-9450785 lnc-RBFOX2-1:1 No - lnc-APOL5-4:1 No - lnc-APOL5-2:1 No - lnc-APOL5-1:1 No - lnc-MB-4:1 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-MB-5:1 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-APOL1-11:1 No - lnc-APOL3-2:2 No - lnc-APOL3-3:1 No - lnc-APOL4-3:3 No - lnc-APOL4-3:1 No - lnc-APOL4-3:2 No - lnc-APOL4-2:4 No - lnc-APOL1-8:1 No - lnc-APOL1-7:1 No - lnc-APOL1-6:1 No - lnc-APOL1-5:1 No - lnc-APOL1-4:1 No - lnc-APOL1-3:1 No - lnc-APOL2-1:1 No - lnc-APOL4-1:4 No - lnc-APOL4-1:2 No - lnc-APOL4-1:1 No - lnc-APOL4-1:3 No - lnc-APOL4-1:5 No - lnc-MYH9-1:1 No - lnc-APOL2-2:2 Yes chr2R:24990570-25011965 lnc-APOL2-2:1 Yes chr2R:24990570-25011965 lnc-APOL2-3:1 Yes chr2R:24990570-25011965 lnc-APOL2-4:1 Yes chr2R:24990570-25011965 lnc-APOL2-5:1 Yes chr2R:24990570-25011965 lnc-TXN2-2:1 Yes chr2R:24990570-25011965 lnc-APOL1-1:10 No - lnc-APOL1-1:11 No - lnc-FOXRED2-1:1 Yes chr3R:12192703-12195011 lnc-FOXRED2-2:1 Yes chr3R:12192703-12195011 lnc-FOXRED2-3:1 Yes chr3R:12192703-12195011 lnc-EIF3D-1:1 No - lnc-NCF4-2:3 No - lnc-PVALB-4:1 No - lnc-PVALB-4:2 No - lnc-IFT27-3:2 No - lnc-IFT27-3:1 No - lnc-IFT27-1:1 No - lnc-TMPRSS6-1:1 Yes chrX:1483479-1517615 lnc-IL2RB-1:1 No - lnc-C1QTNF6-1:1 No - lnc-C1QTNF6-1:3 No - lnc-C1QTNF6-1:2 No - lnc-SSTR3-2:1 Yes chr3L:7432762-7435190 lnc-CYTH4-3:1 No - lnc-KCTD17-3:1 Yes chr2L:21740041-21757466 lnc-ELFN2-3:4 Yes chr2L:21740041-21757466 lnc-ELFN2-3:1 Yes chr2L:21740041-21757466 lnc-ELFN2-3:2 Yes chr2L:21740041-21757466 lnc-ELFN2-3:3 Yes chr2L:21740041-21757466 lnc-CYTH4-2:1 No - lnc-ELFN2-1:3 No - lnc-CYTH4-4:2 No - lnc-CYTH4-4:3 No - lnc-CYTH4-4:4 No - lnc-CYTH4-5:1 No - lnc-CYTH4-5:2 No - lnc-CYTH4-6:1 No - lnc-CARD10-3:1 Yes chr3L:20925891-20949512 lnc-CARD10-2:2 Yes chr3L:20925891-20949512 lnc-MFNG-3:1 No - lnc-MFNG-4:1 No - lnc-CARD10-1:1 No - lnc-CDC42EP1-1:2 No - lnc-LGALS2-2:1 No - lnc-GGA1-1:1 No - lnc-LGALS2-1:2 No - lnc-LGALS2-1:3 No - lnc-LGALS2-3:1 No - lnc-ANKRD54-3:2 Yes chr2L:14599196-14689340 lnc-ANKRD54-3:1 Yes chr2L:14599196-14689340 lnc-C22orf23-2:1 No - lnc-PICK1-1:1 Yes chr2L:12695033-12698917 lnc-BAIAP2L2-1:1 Yes chr3L:9860217-9864349 lnc-BAIAP2L2-2:1 Yes chr3L:9860217-9864349 lnc-BAIAP2L2-3:1 Yes chr3L:9860217-9864349 lnc-BAIAP2L2-4:1 Yes chr3L:9860217-9864349 lnc-MAFF-3:1 Yes chr3L:9860217-9864349 lnc-MAFF-2:1 Yes chr3L:1569181-1576330 lnc-PLA2G6-1:2 Yes chr3L:1569181-1576330 lnc-PLA2G6-2:1 Yes chr3L:1569181-1576330 lnc-MAFF-4:1 Yes chr3L:1569181-1576330 lnc-CSNK1E-2:1 Yes chr3L:1569181-1576330 lnc-MAFF-5:1 No - lnc-CSNK1E-1:9 No - lnc-CSNK1E-1:13 No - lnc-CSNK1E-1:11 No - lnc-CSNK1E-1:12 No - lnc-MAFF-9:1 Yes chr3R:31054085-31061210 lnc-CSNK1E-1:5 Yes chr3R:31054085-31061210 lnc-CSNK1E-1:7 Yes chr3R:31054085-31061210 lnc-CSNK1E-1:6 Yes chr3R:31054085-31061210 lnc-CSNK1E-1:8 Yes chr3R:31054085-31061210 lnc-CSNK1E-1:10 Yes chr3R:31054085-31061210 lnc-CSNK1E-1:1 Yes chr3R:31054085-31061210 lnc-CSNK1E-1:3 Yes chr3R:31054085-31061210 lnc-CSNK1E-1:4 Yes chr3R:31054085-31061210 lnc-KDELR3-1:2 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-DMC1-3:1 No - lnc-DMC1-2:1 Yes chr3R:6000426-6008579 lnc-DMC1-3:3 Yes chr3R:6000426-6008579 lnc-DMC1-3:2 Yes chr3R:6000426-6008579 lnc-KDELR3-2:1 No - lnc-FAM227A-2:1 No - lnc-DMC1-1:1 No - lnc-JOSD1-2:1 No - lnc-JOSD1-1:5 No - lnc-FAM227A-3:1 Yes chrX:6261169-6262119 lnc-SUN2-2:2 Yes chrX:6261169-6262119 lnc-SUN2-2:1 Yes chrX:6261169-6262119 lnc-SUN2-2:3 Yes chrX:6261169-6262119 lnc-GTPBP1-3:1 No - lnc-SUN2-1:1 Yes chr2R:18168413-18172607 lnc-TOMM22-2:2 Yes chr2R:18168413-18172607 lnc-TOMM22-3:1 Yes chr2R:18168413-18172607 lnc-DNAL4-4:1 No - lnc-DNAL4-3:4 No - lnc-DNAL4-3:3 Yes chr2R:6811019-6818199 lnc-DNAL4-3:2 Yes chr2R:6811019-6818199 lnc-DNAL4-2:1 Yes chr2R:6811019-6818199 lnc-DNAL4-1:1 Yes chr2R:6811019-6818199 lnc-NPTXR-1:1 No - lnc-APOBEC3A-2:1 No - lnc-APOBEC3G-2:2 No - lnc-APOBEC3H-1:1 No - lnc-CBX7-1:1 No - lnc-RPL3-1:2 No - lnc-SYNGR1-4:1 No - lnc-PDGFB-4:2 Yes chr3R:11221894-11225173 lnc-PDGFB-4:1 Yes chr3R:11221894-11225173 lnc-PDGFB-2:4 Yes chr3R:11221894-11225173 lnc-PDGFB-2:3 Yes chr3R:11221894-11225173 lnc-PDGFB-2:5 Yes chr3R:11221894-11225173 lnc-PDGFB-2:2 Yes chr3R:11221894-11225173 lnc-MGAT3-4:1 No - lnc-RPS19BP1-4:1 Yes chr2L:13180398-13182596 lnc-RPS19BP1-3:1 Yes chr2L:13180398-13182596 MGAT3-AS1:1 Yes chr2L:13180398-13182596 MGAT3-AS1:2 Yes chr2L:13180398-13182596 lnc-RPS19BP1-2:2 No - lnc-RPS19BP1-2:1 No - lnc-MGAT3-2:2 No - lnc-MGAT3-2:3 No - lnc-ATF4-1:1 No - lnc-RPL3-2:3 No - lnc-RPL3-2:1 No - lnc-RPL3-2:2 No - lnc-CACNA1I-1:1 No - lnc-RPS19BP1-5:1 No - lnc-ENTHD1-2:1 No - lnc-TNRC6B-2:1 No - lnc-SLC25A17-3:1 Yes chr3L:2717615-2766536 lnc-SGSM3-5:1 Yes chr3L:2717615-2766536 lnc-MCHR1-4:1 Yes chr3L:2717615-2766536 lnc-SLC25A17-2:1 Yes chr3L:2717615-2766536 lnc-MCHR1-3:1 Yes chr3L:2717615-2766536 lnc-MCHR1-3:3 Yes chr3L:2717615-2766536 lnc-MCHR1-3:4 Yes chr3L:2717615-2766536 lnc-MCHR1-2:1 Yes chr3L:2717615-2766536 lnc-MKL1-2:1 Yes chr3L:18560258-18576326 lnc-MKL1-3:4 No - lnc-MKL1-3:3 No - lnc-MKL1-3:2 No - lnc-XPNPEP3-4:1 Yes chr3L:4318755-4321109 lnc-ST13-1:5 Yes chr3L:4318755-4321109 lnc-XPNPEP3-3:1 Yes chr3L:4318755-4321109 lnc-SLC25A17-1:2 Yes chrX:3789969-3792477 lnc-SLC25A17-1:1 Yes chrX:3789969-3792477 lnc-RBX1-2:1 No - lnc-RBX1-3:1 No - lnc-EP300-1:1 No - EP300-AS1:4 Yes chrX:9665442-9687066 EP300-AS1:1 No - lnc-L3MBTL2-1:1 No - lnc-TOB2-4:1 No - lnc-TEF-1:1 No - lnc-TOB2-1:1 Yes chr2L:6490155-6490843 lnc-TOB2-1:2 Yes chr2L:6490155-6490843 lnc-PMM1-3:1 Yes chr3L:11648756-11650499 lnc-POLR3H-1:1 Yes chr3L:16780100-16782419 lnc-DESI1-2:1 No - lnc-DESI1-1:1 Yes chr3L:12534590-12535513 lnc-PMM1-1:1 No - lnc-PMM1-2:3 No - lnc-PMM1-2:1 No - lnc-PMM1-2:2 No - lnc-DESI1-3:2 Yes chr2L:9699791-9700459 lnc-DESI1-3:1 Yes chr2L:9699791-9700459 lnc-C22orf46-2:1 No - lnc-SEPT3-4:1 Yes chr3L:19793935-19798979 lnc-SHISA8-2:1 No - lnc-TNFRSF13C-2:1 No - lnc-SEPT3-6:1 No - lnc-SEPT3-6:2 No - lnc-SEPT3-6:3 No - lnc-SEPT3-6:5 No - lnc-CENPM-2:1 No - lnc-CENPM-3:2 No - lnc-CENPM-5:1 No - lnc-SEPT3-3:2 Yes chr3L:12850165-12853169 lnc-NAGA-1:1 Yes chr2R:10897144-10897885 NDUFA6-DT:41 Yes chr2R:10897144-10897885 NDUFA6-DT:44 Yes chr2R:10897144-10897885 NDUFA6-DT:45 No - NDUFA6-DT:59 No - NDUFA6-DT:62 No - NDUFA6-DT:63 No - NDUFA6-DT:70 No - lnc-NFAM1-3:1 Yes chr2R:18094940-18101031 lnc-SMDT1-3:40 Yes chr2R:18094940-18101031 lnc-NFAM1-4:1 Yes chr2R:18094940-18101031 lnc-SMDT1-3:43 Yes chr2R:18094940-18101031 lnc-SMDT1-4:2 Yes chr2R:18094940-18101031 LINC01315:1 No - lnc-SERHL2-6:1 No - lnc-SERHL2-2:4 No - lnc-SERHL2-1:6 Yes chr2L:6022951-6024539 lnc-POLDIP3-2:1 Yes chr3L:2167550-2169108 lnc-POLDIP3-1:2 No - lnc-CYB5R3-1:2 Yes chrX:18781265-18783494 lnc-SERHL2-4:1 Yes chrX:18781265-18783494 lnc-SERHL2-4:2 No - lnc-SERHL2-4:3 No - lnc-ATP5MGL-1:1 Yes chr3L:11816695-11822275 lnc-A4GALT-2:2 Yes chr3R:25832230-25842878 lnc-A4GALT-2:1 Yes chr3R:25832230-25842878 lnc-ARFGAP3-1:2 No - lnc-ARFGAP3-1:1 No - lnc-TTLL1-3:1 Yes chr3R:20832799-20840118 lnc-BIK-3:1 No - lnc-BIK-2:1 No - lnc-TTLL1-2:1 No - lnc-SCUBE1-4:1 Yes chr2R:7810068-7812028 lnc-SCUBE1-3:1 Yes chr2R:7810068-7812028 lnc-SCUBE1-2:1 Yes chr3L:7562610-7569499 lnc-TTLL12-1:1 Yes chr3L:7562610-7569499 lnc-TTLL12-1:2 Yes chr3L:7562610-7569499 lnc-TTLL12-2:2 Yes chr3L:7562610-7569499 lnc-TTLL12-2:1 Yes chr3L:7562610-7569499 lnc-SCUBE1-1:4 No - lnc-SCUBE1-1:2 No - lnc-SCUBE1-1:3 No - LINC01639:5 No - lnc-TSPO-4:1 Yes chr3L:9679201-9681060 lnc-SULT4A1-4:1 No - lnc-SULT4A1-3:1 No - lnc-SULT4A1-2:2 No - lnc-SULT4A1-2:1 No - lnc-PNPLA3-3:1 No - lnc-PNPLA3-1:3 No - lnc-PNPLA3-1:4 No - lnc-SULT4A1-1:1 Yes chr3R:9251843-9253514 lnc-PNPLA3-1:11 No - lnc-PNPLA5-1:1 Yes chr3L:14776496-14786412 lnc-PARVB-3:1 No - lnc-PNPLA5-3:1 No - lnc-PNPLA5-5:1 Yes chrX:19746041-19748458 lnc-SHISAL1-1:1 Yes chrX:19746041-19748458 lnc-RTL6-10:1 No - lnc-RTL6-9:1 No - lnc-RTL6-8:2 No - lnc-RTL6-8:1 No - lnc-RTL6-4:1 No - lnc-RTL6-3:1 No - lnc-PRR5-4:2 No - lnc-RTL6-5:1 No - lnc-RTL6-6:1 No - lnc-PRR5-5:1 No - LINC00207:2 No - LINC00207:7 No - LINC00229:1 No - lnc-PRR5-2:1 No - lnc-RTL6-2:1 No - lnc-ARHGAP8-1:1 No - lnc-ARHGAP8-1:2 No - lnc-KIAA0930-4:4 No - lnc-KIAA0930-4:6 No - lnc-KIAA0930-4:2 No - lnc-KIAA0930-4:5 No - lnc-KIAA0930-4:3 No - lnc-KIAA0930-4:1 No - lnc-NUP50-2:1 No - lnc-NUP50-1:1 No - NUP50-DT:48 No - NUP50-DT:44 No - NUP50-DT:52 No - NUP50-DT:34 No - NUP50-DT:53 No - NUP50-DT:30 Yes chr2R:8123036-8125058 NUP50-DT:41 No - NUP50-DT:42 No - lnc-SMC1B-7:1 Yes chr2R:17048875-17053855 lnc-SMC1B-6:1 Yes chr2R:17048875-17053855 lnc-SMC1B-6:2 Yes chr2R:17048875-17053855 lnc-SMC1B-5:1 Yes chr2R:17048875-17053855 lnc-FAM118A-1:1 No - lnc-FAM118A-1:2 No - LINC01589:1 No - lnc-SMC1B-8:1 No - lnc-FBLN1-3:1 No - lnc-WNT7B-4:1 No - lnc-ATXN10-2:1 No - lnc-PPARA-11:1 No - lnc-PPARA-11:3 No - lnc-PRR34-6:2 No - lnc-PPARA-10:1 No - LINC00899:4 No - LINC00899:9 No - PRR34-AS1:7 No - lnc-PPARA-2:2 No - lnc-PPARA-2:3 No - lnc-TTC38-5:5 Yes chr3L:20692330-20695378 lnc-TTC38-5:6 Yes chr3L:20692330-20695378 lnc-TTC38-5:7 Yes chr3L:20692330-20695378 lnc-TTC38-2:1 Yes chr3L:20692330-20695378 lnc-CDPF1-2:2 Yes chr3L:20692330-20695378 lnc-TTC38-1:1 Yes chr3L:20692330-20695378 lnc-PPARA-4:1 Yes chr3L:20692330-20695378 lnc-PKDREJ-1:2 Yes chr3R:8676915-8678955 lnc-PKDREJ-1:1 Yes chr3R:8676915-8678955 lnc-PPARA-1:2 Yes chr3R:8676915-8678955 lnc-PPARA-1:3 Yes chr3R:8676915-8678955 GTSE1-DT:4 No - lnc-TRMU-1:1 Yes chrX:1026791-1028290 lnc-TRMU-1:2 Yes chrX:1026791-1028290 lnc-PKDREJ-3:1 Yes chr2R:10673345-10721138 lnc-CERK-4:1 Yes chr2R:10673345-10721138 lnc-GRAMD4-2:3 No - lnc-CERK-2:1 Yes chr3R:5358873-5368306 lnc-CELSR1-1:1 Yes chr3R:5358873-5368306 lnc-GRAMD4-4:2 Yes chr3R:21102199-21105113 lnc-TBC1D22A-5:1 No - LINC01644:7 No - LINC00898:4 No - lnc-TBC1D22A-4:4 No - lnc-TBC1D22A-4:5 No - lnc-CERK-16:1 No - lnc-CERK-17:1 No - lnc-CERK-7:5 No - lnc-FAM19A5-13:1 No - lnc-FAM19A5-8:1 No - lnc-FAM19A5-2:5 No - lnc-BRD1-29:8 No - lnc-BRD1-29:7 No - lnc-BRD1-28:1 No - lnc-BRD1-8:4 No - lnc-BRD1-8:3 No - lnc-ZBED4-7:1 No - LINC01310:1 No - lnc-BRD1-24:1 No - lnc-BRD1-23:1 No - lnc-BRD1-23:2 No - lnc-BRD1-23:10 No - lnc-BRD1-7:1 No - lnc-BRD1-6:1 No - lnc-BRD1-23:3 No - lnc-ZBED4-6:1 No - lnc-ALG12-6:1 Yes chr2R:7272275-7278101 lnc-ALG12-5:3 Yes chr2R:7272275-7278101 lnc-ZBED4-5:1 Yes chr2R:7272275-7278101 lnc-ALG12-3:1 Yes chr2R:7272275-7278101 lnc-BRD1-1:2 No - lnc-BRD1-5:1 No - lnc-ZBED4-3:1 No - lnc-BRD1-21:7 Yes chr3R:9756491-9759313 lnc-BRD1-21:1 Yes chr3R:9756491-9759313 lnc-BRD1-21:4 Yes chr3R:9756491-9759313 lnc-BRD1-21:5 Yes chr3R:9756491-9759313 lnc-BRD1-21:2 Yes chr3R:9756491-9759313 lnc-ZBED4-1:2 Yes chr3R:9756491-9759313 lnc-BRD1-21:3 Yes chr3R:9756491-9759313 lnc-BRD1-21:6 Yes chr3R:9756491-9759313 lnc-MOV10L1-1:1 Yes chr2L:6736364-6740188 lnc-MLC1-1:1 Yes chr2L:6736364-6740188 lnc-TTLL8-1:1 No - lnc-TUBGCP6-7:1 No - lnc-HDAC10-1:1 Yes chr3L:11993274-11998138 lnc-TUBGCP6-1:4 No - lnc-TUBGCP6-1:3 No - lnc-TUBGCP6-1:2 No - lnc-TUBGCP6-1:1 No - lnc-TUBGCP6-2:1 No - lnc-MAPK11-2:1 No - lnc-MAPK11-1:1 Yes chr3R:24150416-24152321 lnc-PLXNB2-1:1 Yes chrX:5326675-5329347 lnc-PLXNB2-1:2 Yes chrX:5326675-5329347 lnc-PPP6R2-2:1 Yes chrX:5326675-5329347 lnc-PPP6R2-2:2 Yes chrX:5326675-5329347 lnc-DENND6B-1:5 No - lnc-ADM2-3:1 Yes chr3L:6164916-6173880 lnc-LMF2-3:1 Yes chr3R:11789293-11796948 lnc-LMF2-2:1 Yes chr3R:11789293-11796948 lnc-LMF2-1:1 Yes chr3R:11789293-11796948 lnc-MIOX-1:1 No - lnc-SCO2-2:1 No - lnc-SCO2-1:1 No - lnc-TYMP-1:3 No - lnc-TYMP-1:1 No - lnc-TYMP-1:2 Yes chr2L:8244160-8257502 lnc-KLHDC7B-4:1 No - lnc-KLHDC7B-3:1 No - lnc-CPT1B-1:5 No - lnc-CPT1B-1:4 No - lnc-CPT1B-1:3 No - lnc-CPT1B-1:2 No - CHKB-DT:33 Yes chr2L:21614232-21624080 CHKB-DT:36 Yes chr2L:21614232-21624080 CHKB-DT:46 Yes chr2L:21614232-21624080 CHKB-DT:47 Yes chr2L:21614232-21624080 CHKB-DT:48 Yes chr2L:21614232-21624080 CHKB-DT:53 Yes chr2L:21614232-21624080 CHKB-DT:58 Yes chr2L:21614232-21624080 CHKB-DT:60 Yes chr2L:21614232-21624080 lnc-SHANK3-6:1 Yes chr3L:1196317-1199339 lnc-SHANK3-1:1 No - lnc-RABL2B-2:3 No - lnc-ACR-1:1 No - lnc-RABL2B-3:1 No - lnc-ACR-2:1 Yes chrX:11144852-11148716 lnc-ARSA-1:1 Yes chrX:11144852-11148716 lnc-ACR-2:4 No - lnc-ACR-2:5 No - lnc-ACR-2:6 No - lnc-ACR-2:7 No - lnc-ACR-2:8 No - lnc-ACR-2:9 No - lnc-ACR-2:10 No - lnc-ACR-2:11 No - lnc-IL5RA-16:1 No - lnc-IL5RA-16:2 No - CHL1-AS2:4 Yes chrX:8517373-8555170 lnc-CNTN6-7:1 Yes chrX:8517373-8555170 lnc-CNTN6-7:2 Yes chrX:8517373-8555170 lnc-CNTN6-7:3 Yes chrX:8517373-8555170 lnc-IL5RA-15:1 Yes chrX:8517373-8555170 LINC01266:3 No - lnc-IL5RA-14:1 No - lnc-CNTN6-2:2 No - lnc-IL5RA-13:1 No - lnc-IL5RA-12:1 Yes chr3R:4381306-4387018 lnc-IL5RA-11:1 No - lnc-CNTN6-3:1 No - lnc-CNTN4-3:1 No - lnc-IL5RA-10:1 No - lnc-IL5RA-3:2 No - lnc-CNTN6-4:1 Yes chr3R:4381306-4387018 lnc-TRNT1-5:1 Yes chr3R:4381306-4387018 lnc-IL5RA-9:1 Yes chr3R:4381306-4387018 CNTN4-AS1:3 Yes chr3R:4381306-4387018 lnc-CRBN-2:1 No - lnc-CNTN4-2:1 Yes chr3R:5734698-5736355 lnc-IL5RA-8:2 No - lnc-IL5RA-8:3 No - lnc-IL5RA-8:4 Yes chr3R:10049199-10051527 lnc-IL5RA-8:1 Yes chr3R:10049199-10051527 lnc-CRBN-3:1 No - lnc-SUMF1-2:2 Yes chr3L:175112-176228 lnc-SUMF1-2:3 Yes chr3L:175112-176228 lnc-SUMF1-2:4 Yes chr3L:175112-176228 lnc-SETMAR-2:1 Yes chr3L:175112-176228 lnc-SUMF1-2:1 Yes chr3L:175112-176228 lnc-SETMAR-2:2 Yes chr3L:175112-176228 lnc-LRRN1-1:1 Yes chr3L:175112-176228 lnc-CRBN-16:1 Yes chr3L:175112-176228 ITPR1-DT:16 No - lnc-SUMF1-11:1 Yes chr3R:5517117-5539411 lnc-SUMF1-11:2 Yes chr3R:5517117-5539411 EGOT:4 Yes chr3R:5517117-5539411 EGOT:1 Yes chr3R:5517117-5539411 EGOT:7 Yes chr3R:5517117-5539411 EGOT:8 Yes chr3R:5517117-5539411 EGOT:9 Yes chr3R:5517117-5539411 EGOT:12 Yes chr3R:5517117-5539411 EGOT:13 Yes chr3R:5517117-5539411 lnc-SUMF1-4:2 No - lnc-SUMF1-12:10 No - lnc-BHLHE40-2:1 No - lnc-SUMF1-13:1 No - lnc-SUMF1-14:1 No - lnc-ARL8B-2:1 No - lnc-SUMF1-15:1 No - lnc-SUMF1-7:2 No - lnc-GRM7-12:1 No - lnc-GRM7-11:1 No - lnc-GRM7-2:6 No - lnc-GRM7-10:1 No - lnc-GRM7-9:1 No - lnc-GRM7-8:2 No - lnc-GRM7-2:3 No - lnc-GRM7-2:8 No - GRM7-AS3:4 Yes chr4:936819-949441 lnc-SSUH2-12:1 Yes chr4:936819-949441 lnc-SSUH2-11:1 Yes chr4:936819-949441 LMCD1-AS1:3 No - LINC00312:2 Yes chr2R:17465879-17469177 LINC00312:3 Yes chr2R:17465879-17469177 lnc-SSUH2-8:1 No - lnc-OXTR-1:7 No - lnc-OXTR-1:3 No - lnc-OXTR-1:5 No - lnc-OXTR-1:6 No - lnc-OXTR-1:1 No - lnc-OXTR-1:2 No - lnc-SSUH2-7:1 No - lnc-RAD18-1:1 No - lnc-CAV3-2:2 No - lnc-SRGAP3-5:1 No - lnc-SRGAP3-3:1 No - lnc-SRGAP3-3:2 No - lnc-RAD18-2:1 No - THUMPD3-AS1:33 No - SRGAP3-AS2:9 No - lnc-RAD18-3:1 No - SRGAP3-AS3:1 No - SRGAP3-AS3:4 No - lnc-LHFPL4-5:1 No - SRGAP3-AS4:1 No - lnc-LHFPL4-4:1 No - lnc-LHFPL4-6:2 No - THUMPD3-AS1:34 No - lnc-THUMPD3-4:1 No - THUMPD3-AS1:7 No - THUMPD3-AS1:17 No - THUMPD3-AS1:8 No - THUMPD3-AS1:11 No - THUMPD3-AS1:27 No - THUMPD3-AS1:28 No - THUMPD3-AS1:15 No - THUMPD3-AS1:20 No - lnc-THUMPD3-9:1 Yes chr3L:14002127-14020148 lnc-LHFPL4-2:2 Yes chr3L:1885657-1891462 lnc-LHFPL4-2:1 Yes chr3L:1885657-1891462 lnc-SRGAP3-6:1 Yes chr3L:1885657-1891462 lnc-SRGAP3-7:1 Yes chr3L:1885657-1891462 lnc-TADA3-2:1 Yes chrX:8690327-8691811 lnc-CAMK1-1:2 Yes chrX:18085761-18088418 lnc-TADA3-1:1 Yes chr2L:6732866-6740188 lnc-RPUSD3-1:1 Yes chr2L:6732866-6740188 lnc-CIDEC-4:1 Yes chr2L:6736364-6740188 lnc-RPUSD3-2:3 Yes chr2L:6736364-6740188 lnc-RPUSD3-2:1 Yes chr2L:6736364-6740188 lnc-RPUSD3-2:2 Yes chr2L:6736364-6740188 lnc-CIDEC-1:1 No - lnc-IL17RE-4:1 No - lnc-IL17RE-3:1 No - lnc-IL17RC-2:1 Yes chr2L:102380-104142 lnc-CRELD1-4:1 Yes chr2L:10731400-10732423 lnc-FANCD2-1:1 Yes chr2L:10731400-10732423 lnc-FANCD2-1:2 Yes chr2L:10731400-10732423 lnc-FANCD2-1:3 Yes chr2L:10731400-10732423 lnc-FANCD2-1:4 Yes chr2L:10731400-10732423 lnc-FANCD2-1:5 Yes chr2L:10731400-10732423 lnc-PRRT3-2:1 Yes chr2L:10731400-10732423 lnc-FANCD2-1:6 Yes chr2L:10731400-10732423 lnc-EMC3-1:17 Yes chr2L:10731400-10732423 lnc-EMC3-1:18 Yes chr2L:10731400-10732423 lnc-EMC3-1:11 Yes chr2L:10731400-10732423 lnc-EMC3-1:13 Yes chr2L:10731400-10732423 lnc-EMC3-3:9 No - lnc-EMC3-3:8 No - lnc-EMC3-3:10 No - lnc-EMC3-3:11 No - lnc-FANCD2OS-2:2 Yes chr3R:20810804-20816190 lnc-FANCD2OS-1:6 No - lnc-FANCD2OS-1:8 No - lnc-FANCD2OS-1:7 No - lnc-FANCD2OS-1:5 No - lnc-GHRL-3:4 No - lnc-GHRL-3:1 No - lnc-GHRL-3:6 No - lnc-GHRL-3:5 No - lnc-GHRL-3:3 No - lnc-GHRL-3:2 No - lnc-GHRL-2:1 Yes chr3R:23356278-23358531 lnc-GHRL-1:1 Yes chr3R:23356278-23358531 lnc-ATP2B2-4:1 Yes chr3R:23356278-23358531 ATP2B2-IT2:1 Yes chr4:328193-358917 lnc-ATP2B2-1:2 No - LINC00606:5 No - LINC00606:4 No - LINC00606:3 No - lnc-SLC6A1-1:2 No - lnc-VGLL4-6:1 Yes chr3R:8059284-8087049 lnc-VGLL4-5:1 Yes chr2R:18620466-18625044 lnc-VGLL4-3:1 Yes chr2R:18620466-18625044 lnc-HRH1-5:1 Yes chr2R:18620466-18625044 lnc-VGLL4-2:1 No - lnc-TAMM41-4:1 No - lnc-TAMM41-5:3 No - lnc-VGLL4-4:3 Yes chr3R:14886456-14887739 lnc-VGLL4-7:1 Yes chr3R:14886456-14887739 lnc-TAMM41-1:1 No - lnc-SYN2-5:1 No - lnc-SYN2-6:1 No - lnc-TAMM41-2:1 No - lnc-TAMM41-3:1 No - lnc-TIMP4-2:1 No - lnc-TIMP4-3:1 No - lnc-TIMP4-5:1 No - lnc-SYN2-1:1 Yes chr3L:20692330-20695378 lnc-TSEN2-4:1 Yes chr3L:20692330-20695378 lnc-TSEN2-1:3 No - lnc-RAF1-1:1 No - lnc-MKRN2OS-2:2 Yes chrX:2295466-2343870 lnc-RAF1-2:1 No - lnc-TMEM40-1:1 Yes chr2L:10358134-10362707 lnc-IQSEC1-5:1 Yes chr2L:10358134-10362707 lnc-IQSEC1-4:1 Yes chr2L:10358134-10362707 lnc-IQSEC1-3:1 No - LINC02022:7 No - lnc-CAND2-3:1 No - lnc-CAND2-4:1 No - lnc-RPL32-2:1 Yes chr3L:21034535-21075444 lnc-RPL32-3:1 Yes chr3L:21034535-21075444 lnc-IQSEC1-2:1 No - lnc-HDAC11-3:1 No - lnc-HDAC11-1:1 No - lnc-NUP210-2:1 No - lnc-NUP210-4:1 No - lnc-WNT7A-1:4 No - LINC00620:2 No - LINC00620:3 No - LINC00620:7 No - LINC00620:9 No - lnc-CHCHD4-3:1 Yes chr2R:9494166-9503188 lnc-CHCHD4-2:2 Yes chr2R:9494166-9503188 lnc-CHCHD4-2:1 Yes chr2R:9494166-9503188 lnc-TMEM43-3:1 No - lnc-TMEM43-3:2 No - lnc-TMEM43-2:1 No - lnc-LSM3-2:1 Yes chr3R:23996262-23997017 lnc-LSM3-2:2 Yes chr3R:23996262-23997017 lnc-LSM3-4:1 No - lnc-LSM3-5:1 No - lnc-LSM3-5:2 No - lnc-XPC-9:3 Yes chrX:5966279-5986699 lnc-XPC-9:2 Yes chrX:5966279-5986699 lnc-XPC-9:1 Yes chrX:5966279-5986699 lnc-CCDC174-2:2 No - FGD5-AS1:18 No - FGD5-AS1:19 No - FGD5-AS1:9 No - FGD5-AS1:12 No - FGD5-AS1:7 Yes chr3L:21494019-21497494 FGD5-AS1:17 No - FGD5-AS1:8 Yes chr3L:21494019-21497494 FGD5-AS1:1 Yes chr3L:21494019-21497494 lnc-MRPS25-5:3 No - lnc-MRPS25-5:2 No - lnc-MRPS25-5:1 No - lnc-FGD5-2:1 No - lnc-NR2C2-1:2 Yes chr2L:8159832-8161800 lnc-MRPS25-6:1 Yes chr2L:8159832-8161800 lnc-NR2C2-3:1 No - lnc-RBSN-1:1 No - lnc-RBSN-2:1 No - lnc-METTL6-6:1 Yes chrX:14826867-14832033 lnc-METTL6-5:1 Yes chrX:14826867-14832033 lnc-EAF1-3:1 No - lnc-METTL6-1:1 No - lnc-SH3BP5-1:1 Yes chr2R:17733238-17734483 lnc-COLQ-2:1 Yes chr2R:17733238-17734483 EAF1-AS1:13 No - EAF1-AS1:12 No - EAF1-AS1:14 No - EAF1-AS1:9 No - EAF1-AS1:15 No - EAF1-AS1:7 No - EAF1-AS1:10 No - lnc-METTL6-2:1 No - lnc-METTL6-3:1 No - lnc-METTL6-4:1 No - lnc-EAF1-2:1 No - lnc-HACL1-3:1 No - lnc-HACL1-4:1 No - lnc-HACL1-5:1 No - lnc-HACL1-6:1 No - lnc-HACL1-7:1 No - lnc-BTD-1:2 No - lnc-BTD-1:3 No - lnc-BTD-2:1 No - lnc-BTD-3:1 No - lnc-HACL1-9:1 No - lnc-BTD-4:1 No - lnc-DPH3-3:1 No - lnc-OXNAD1-7:1 Yes chr3R:28748384-28751661 lnc-OXNAD1-6:1 Yes chr3R:11231912-11232539 lnc-RFTN1-3:1 Yes chr3R:11231912-11232539 lnc-RFTN1-3:2 Yes chr3R:11231912-11232539 lnc-GALNT15-5:1 No - lnc-DPH3-2:1 No - lnc-GALNT15-3:1 No - lnc-DAZL-4:1 No - lnc-OXNAD1-1:3 No - lnc-OXNAD1-1:4 No - LINC00690:1 No - LINC00690:6 No - LINC00690:8 No - lnc-DAZL-2:1 No - lnc-PLCL2-5:1 No - PLCL2-AS1:2 No - lnc-TBC1D5-2:1 No - lnc-PLCL2-7:1 Yes chr3R:13269137-13272011 lnc-DAZL-5:1 Yes chr3R:13269137-13272011 lnc-SATB1-8:4 Yes chr3R:13269137-13272011 lnc-SATB1-8:7 Yes chr3R:13269137-13272011 lnc-SATB1-8:8 Yes chr3R:13269137-13272011 lnc-SATB1-8:6 Yes chr3R:13269137-13272011 lnc-PLCL2-8:1 Yes chr3R:13269137-13272011 lnc-SATB1-8:11 Yes chr3R:13269137-13272011 lnc-SATB1-8:3 Yes chr3R:13269137-13272011 lnc-SATB1-8:9 Yes chr3R:13269137-13272011 lnc-SATB1-8:5 Yes chr3R:13269137-13272011 lnc-SATB1-8:1 Yes chr3R:13269137-13272011 lnc-SATB1-8:10 Yes chr3R:13269137-13272011 lnc-SATB1-8:2 Yes chr3R:13269137-13272011 lnc-EFHB-5:1 No - SATB1-AS1:2 No - SATB1-AS1:4 No - SATB1-AS1:6 No - SATB1-AS1:7 No - SATB1-AS1:15 No - SATB1-AS1:17 No - SATB1-AS1:18 No - SATB1-AS1:19 No - SATB1-AS1:20 No - SATB1-AS1:21 No - SATB1-AS1:22 No - SATB1-AS1:23 No - SATB1-AS1:24 No - SATB1-AS1:25 No - SATB1-AS1:26 No - SATB1-AS1:27 No - SATB1-AS1:28 No - SATB1-AS1:54 No - SATB1-AS1:63 No - SATB1-AS1:66 No - SATB1-AS1:71 No - SATB1-AS1:72 No - SATB1-AS1:86 No - lnc-KCNH8-6:1 No - lnc-PP2D1-1:1 No - lnc-EFHB-2:1 No - lnc-EFHB-4:2 No - lnc-EFHB-3:1 No - lnc-PP2D1-2:1 No - SGO1-AS1:3 No - lnc-KAT2B-6:1 No - SGO1-AS1:7 No - lnc-KAT2B-8:1 No - SGO1-AS1:10 No - lnc-KAT2B-10:1 No - SGO1-AS1:11 No - lnc-KAT2B-12:1 No - lnc-SGO1-1:1 No - lnc-SGO1-2:1 No - lnc-ZNF385D-3:7 No - lnc-ZNF385D-3:8 No - lnc-ZNF385D-3:3 No - lnc-ZNF385D-3:6 No - lnc-ZNF385D-3:5 No - lnc-ZNF385D-3:2 No - lnc-ZNF385D-3:4 No - lnc-UBE2E2-6:1 No - lnc-ZNF385D-5:1 No - lnc-ZNF385D-4:1 No - lnc-UBE2E2-5:1 No - lnc-UBE2E2-4:1 No - lnc-NKIRAS1-5:1 Yes chr2L:10765010-10768006 lnc-UBE2E2-1:3 No - lnc-UBE2E2-3:1 No - lnc-NKIRAS1-4:1 Yes chr2L:10765010-10768006 lnc-RPL15-1:1 Yes chr2R:7443824-7445792 LINC00691:3 No - lnc-NR1D2-4:1 Yes chr2R:6087873-6169087 THRB-AS1:2 Yes chr2R:6087873-6169087 THRB-AS1:13 No - lnc-NR1D2-5:1 No - lnc-THRB-5:1 No - lnc-OXSM-5:1 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-TOP2B-4:1 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-TOP2B-3:1 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-NGLY1-3:1 Yes chr2L:19447365-19453490 lnc-RARB-2:1 No - lnc-NGLY1-2:1 Yes chr2R:6017739-6020695 lnc-NGLY1-2:3 Yes chr2R:6017739-6020695 lnc-NGLY1-2:2 Yes chr2R:6017739-6020695 lnc-OXSM-3:1 Yes chr2R:6017739-6020695 lnc-TOP2B-6:1 No - lnc-TOP2B-6:2 No - LINC00692:4 No - lnc-OXSM-4:1 No - lnc-LRRC3B-2:1 No - lnc-NGLY1-5:1 No - lnc-OXSM-6:1 No - lnc-LRRC3B-1:2 No - lnc-LRRC3B-1:3 No - lnc-SLC4A7-3:1 No - lnc-SLC4A7-2:1 No - lnc-SLC4A7-1:1 No - lnc-NEK10-2:1 Yes chr2L:7223328-7249343 lnc-NEK10-3:1 Yes chr2L:7223328-7249343 lnc-NEK10-4:1 Yes chr2L:7223328-7249343 lnc-LRRC3B-3:1 Yes chr2L:7223328-7249343 lnc-CMC1-8:1 No - lnc-EOMES-4:1 No - LINC01980:12 No - LINC01980:17 No - lnc-AZI2-4:1 No - lnc-AZI2-1:2 No - lnc-EOMES-5:1 No - lnc-EOMES-6:1 No - lnc-AZI2-3:1 No - lnc-CMC1-4:1 No - lnc-AZI2-6:1 No - lnc-ZCWPW2-6:1 No - lnc-ZCWPW2-3:2 No - lnc-ZCWPW2-4:1 No - RBMS3-AS2:5 No - lnc-TGFBR2-7:1 Yes chr3L:5155821-5277944 lnc-TGFBR2-6:1 Yes chr3L:5155821-5277944 lnc-RBMS3-1:1 No - lnc-GADL1-9:1 No - lnc-RBMS3-4:1 No - lnc-GADL1-8:1 No - lnc-TGFBR2-3:3 No - lnc-GADL1-1:3 No - lnc-GADL1-4:1 No - lnc-RBMS3-5:1 No - lnc-TGFBR2-1:2 No - lnc-GADL1-5:1 No - lnc-STT3B-7:1 No - lnc-STT3B-6:1 No - lnc-STT3B-5:1 No - lnc-STT3B-4:1 No - lnc-GADL1-7:1 No - lnc-STT3B-3:1 No - lnc-OSBPL10-5:1 No - lnc-OSBPL10-4:1 No - lnc-STT3B-2:1 No - lnc-OSBPL10-3:1 Yes chr3R:25066712-25069637 lnc-GADL1-10:1 Yes chr3L:1034697-1036298 lnc-CMTM6-4:2 Yes chr3L:1034697-1036298 lnc-CMTM6-4:1 Yes chr3L:1034697-1036298 OSBPL10-AS1:4 Yes chr3L:1034697-1036298 lnc-CMTM6-3:5 Yes chr3L:1034697-1036298 lnc-CMTM6-3:4 Yes chr3L:1034697-1036298 lnc-CMTM6-3:3 Yes chr3L:1034697-1036298 lnc-CMTM6-3:1 Yes chr3L:1034697-1036298 lnc-CMTM6-3:2 Yes chr3L:1034697-1036298 lnc-ZNF860-1:1 Yes chr3L:1034697-1036298 lnc-ZNF860-2:1 Yes chr3L:1034697-1036298 lnc-ZNF860-3:1 Yes chr3L:1034697-1036298 lnc-CMTM6-2:1 Yes chr3L:1034697-1036298 lnc-OSBPL10-2:1 Yes chr2R:23128604-23130189 lnc-GPD1L-1:1 No - lnc-OSBPL10-1:2 No - lnc-GPD1L-2:1 No - lnc-DYNC1LI1-3:1 No - lnc-CMTM6-1:3 Yes chrX:11154421-11164670 lnc-CMTM6-1:2 Yes chrX:11154421-11164670 lnc-CMTM6-1:1 Yes chrX:11154421-11164670 lnc-CMTM7-2:2 No - lnc-DYNC1LI1-2:1 No - lnc-CNOT10-2:1 No - lnc-DYNC1LI1-4:1 No - lnc-TRIM71-1:1 No - lnc-TRIM71-2:1 Yes chr2R:7478853-7489823 lnc-TMPPE-3:1 Yes chr2L:6003574-6006827 lnc-TMPPE-2:1 Yes chr2L:6003574-6006827 lnc-TMPPE-1:2 Yes chr2L:6003574-6006827 lnc-TMPPE-1:1 Yes chr2L:6003574-6006827 lnc-CRTAP-2:1 No - lnc-CRTAP-1:1 No - lnc-CLASP2-7:3 No - lnc-CLASP2-7:4 No - lnc-CLASP2-7:1 No - lnc-CLASP2-7:2 No - lnc-UBP1-1:1 Yes chr2R:10124293-10137472 lnc-FBXL2-1:1 No - lnc-CLASP2-3:1 Yes chr3L:21172853-21183278 lnc-FBXL2-2:1 Yes chr3L:21172853-21183278 lnc-UBP1-3:1 Yes chr3L:21172853-21183278 lnc-UBP1-4:1 Yes chr3L:21172853-21183278 lnc-UBP1-5:1 Yes chr3L:21172853-21183278 lnc-CLASP2-4:1 No - lnc-PDCD6IP-3:1 No - lnc-CLASP2-1:3 No - lnc-CLASP2-1:2 Yes chr3R:27696466-27700110 lnc-PDCD6IP-4:1 No - lnc-PDCD6IP-4:2 No - LINC01811:26 No - lnc-ARPP21-2:1 No - lnc-CLASP2-8:1 No - lnc-DCLK3-5:1 Yes chr3L:3818679-3842326 lnc-ARPP21-1:1 No - lnc-DCLK3-4:1 No - lnc-DCLK3-3:1 No - lnc-STAC-2:1 No - lnc-TRANK1-2:1 Yes chr2R:4815426-4824319 lnc-EPM2AIP1-7:1 No - lnc-EPM2AIP1-1:2 No - lnc-EPM2AIP1-4:1 No - lnc-EPM2AIP1-5:2 Yes chr2R:8170274-8172401 lnc-EPM2AIP1-5:1 Yes chr2R:8170274-8172401 lnc-EPM2AIP1-6:1 Yes chrX:15844476-15847858 lnc-LRRFIP2-2:1 Yes chrX:15844476-15847858 lnc-MLH1-1:1 Yes chrX:15844476-15847858 lnc-EPM2AIP1-8:1 Yes chrX:15844476-15847858 lnc-LRRFIP2-2:5 Yes chrX:15844476-15847858 lnc-LRRFIP2-2:3 Yes chrX:15844476-15847858 lnc-LRRFIP2-2:4 Yes chrX:15844476-15847858 lnc-LRRFIP2-2:2 Yes chrX:15844476-15847858 lnc-GOLGA4-4:1 Yes chrX:15844476-15847858 lnc-GOLGA4-4:8 No - lnc-GOLGA4-2:1 No - lnc-LRRFIP2-3:2 Yes chr2R:23371360-23377045 lnc-LRRFIP2-3:1 Yes chr2R:23371360-23377045 lnc-ITGA9-5:1 Yes chr2R:23371360-23377045 lnc-GOLGA4-3:2 No - lnc-ITGA9-2:1 No - lnc-ITGA9-2:3 No - lnc-ITGA9-2:4 No - lnc-CTDSPL-3:1 Yes chr2R:15258761-15262873 ITGA9-AS1:30 Yes chr2R:15258761-15262873 ITGA9-AS1:35 Yes chr2R:15258761-15262873 ITGA9-AS1:28 Yes chr2R:15258761-15262873 ITGA9-AS1:14 Yes chr2R:15258761-15262873 ITGA9-AS1:31 Yes chr2R:15258761-15262873 ITGA9-AS1:15 Yes chr2R:15258761-15262873 ITGA9-AS1:24 Yes chr2R:15258761-15262873 ITGA9-AS1:16 Yes chr2R:15258761-15262873 ITGA9-AS1:26 Yes chr2R:15258761-15262873 ITGA9-AS1:23 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-ITGA9-1:1 Yes chr2R:15258761-15262873 ITGA9-AS1:22 No - ITGA9-AS1:20 No - lnc-PLCD1-2:3 No - lnc-ACAA1-4:1 No - lnc-VILL-1:1 No - lnc-ACAA1-1:4 No - lnc-PLCD1-1:26 No - lnc-ACAA1-2:1 Yes chr3R:18573091-18589459 lnc-ACAA1-2:3 No - lnc-ACAA1-2:2 No - lnc-ACAA1-3:1 Yes chr2R:19979242-19984895 lnc-XYLB-1:1 Yes chr3R:16996446-16999449 lnc-ACVR2B-3:1 No - ACVR2B-AS1:2 No - lnc-ACVR2B-1:2 Yes chr3R:14619030-14625703 lnc-SCN5A-3:1 No - lnc-SCN5A-2:1 No - lnc-SCN10A-1:2 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-SCN10A-1:1 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-SCN11A-1:3 No - lnc-CSRNP1-4:1 Yes chr3L:19924943-19927175 lnc-CSRNP1-3:1 Yes chr3L:19924943-19927175 lnc-CSRNP1-3:2 Yes chr3L:19924943-19927175 lnc-CSRNP1-3:3 Yes chr3L:19924943-19927175 lnc-CSRNP1-2:5 Yes chr3L:19924943-19927175 lnc-TTC21A-76:4 No - lnc-TTC21A-1:3 No - lnc-CCR8-4:1 No - lnc-CCR8-2:1 No - lnc-CX3CR1-3:1 No - lnc-SLC25A38-3:1 No - lnc-RPSA-2:8 No - lnc-MOBP-2:6 No - lnc-MOBP-1:1 No - EIF1B-AS1:1 No - lnc-EIF1B-1:1 No - EIF1B-AS1:12 No - EIF1B-AS1:8 No - EIF1B-AS1:3 Yes chr3L:3223341-3224650 ENTPD3-AS1:3 No - ENTPD3-AS1:5 No - ENTPD3-AS1:7 No - ENTPD3-AS1:11 No - ENTPD3-AS1:10 No - lnc-RPL14-2:1 No - ENTPD3-AS1:2 No - lnc-RPL14-1:1 Yes chr3L:8601006-8602392 lnc-RPL14-1:3 Yes chr3L:8601006-8602392 lnc-ULK4-12:1 No - lnc-ULK4-11:1 No - lnc-ULK4-10:1 No - lnc-ZNF621-5:1 No - lnc-ZNF621-3:2 No - lnc-ULK4-1:2 Yes chrX:1891401-1900646 lnc-ULK4-8:1 No - lnc-CCK-8:1 No - lnc-CCK-7:1 No - lnc-CCK-6:1 No - lnc-CCK-5:1 No - lnc-CCK-4:1 No - lnc-CCK-4:2 No - lnc-CCK-3:1 No - lnc-TRAK1-6:1 No - lnc-TRAK1-4:1 No - lnc-VIPR1-6:1 Yes chr2L:7037823-7056010 lnc-ULK4-9:1 Yes chr2L:7037823-7056010 lnc-CCK-2:1 Yes chr2L:7037823-7056010 lnc-TRAK1-2:1 No - lnc-TRAK1-5:1 No - lnc-TRAK1-7:1 No - lnc-TRAK1-8:1 No - lnc-VIPR1-2:1 No - lnc-SS18L2-4:1 No - lnc-SS18L2-4:2 No - VIPR1-AS1:6 No - VIPR1-AS1:5 No - VIPR1-AS1:7 No - VIPR1-AS1:8 No - VIPR1-AS1:9 No - VIPR1-AS1:10 No - VIPR1-AS1:11 No - VIPR1-AS1:12 No - lnc-CCDC13-5:2 No - lnc-CCDC13-5:3 No - lnc-CCDC13-5:1 No - lnc-CCDC13-1:2 No - lnc-CCDC13-2:3 Yes chr3L:16673964-16676264 lnc-CCDC13-2:6 Yes chr3L:16673964-16676264 lnc-CCDC13-2:2 Yes chr3L:16673964-16676264 lnc-CCDC13-2:5 Yes chr3L:16673964-16676264 HHATL-AS1:2 Yes chr3L:16673964-16676264 lnc-CCDC13-2:1 Yes chr3L:16673964-16676264 lnc-HHATL-1:1 Yes chr3L:16673964-16676264 lnc-HIGD1A-1:5 No - lnc-CCDC13-3:1 No - lnc-KRBOX1-1:6 No - lnc-KRBOX1-1:7 No - lnc-KRBOX1-1:8 No - lnc-SNRK-3:1 No - lnc-SNRK-2:1 No - lnc-FAM198A-4:1 Yes chr2R:14235787-14239703 SNRK-AS1:3 Yes chr2R:14235787-14239703 SNRK-AS1:4 Yes chr2R:14235787-14239703 lnc-ANO10-3:1 No - lnc-POMGNT2-1:2 Yes chrX:16680089-16683895 lnc-POMGNT2-1:1 No - lnc-TOPAZ1-7:1 No - lnc-TOPAZ1-1:1 No - lnc-ANO10-6:1 No - lnc-ZNF445-7:1 No - lnc-ZNF445-6:1 No - lnc-TOPAZ1-3:1 Yes chr3L:6073490-6075245 lnc-ZNF445-14:4 No - lnc-ZNF445-14:1 No - LINC01988:15 No - lnc-ZNF852-4:1 No - lnc-ZKSCAN7-4:4 No - lnc-ZNF445-3:1 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF852-3:1 No - lnc-ZNF35-5:1 No - lnc-ZNF35-1:1 No - lnc-ZNF35-3:1 No - lnc-ZNF35-4:1 No - lnc-KIAA1143-2:1 No - lnc-KIAA1143-1:1 No - lnc-ZNF502-1:1 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF502-1:2 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-TGM4-1:3 No - lnc-CLEC3B-3:1 No - lnc-TMEM158-2:1 No - lnc-TMEM158-1:1 No - LARS2-AS1:2 Yes chr3L:4825853-4829038 LIMD1-AS1:2 No - LIMD1-AS1:4 Yes chrX:13826041-13830317 lnc-LIMD1-4:1 Yes chr3L:1247817-1250451 lnc-SLC6A20-3:1 No - lnc-LZTFL1-3:1 Yes chr2R:18514574-18526439 lnc-SLC6A20-4:5 No - lnc-FYCO1-5:2 No - lnc-FYCO1-5:3 No - lnc-FYCO1-5:1 No - lnc-FYCO1-3:1 No - lnc-FYCO1-1:1 Yes chr2R:21088386-21091004 lnc-XCR1-1:1 No - lnc-FYCO1-2:1 No - lnc-CCR1-1:1 No - lnc-LRRC2-2:1 Yes chrX:18387084-18390344 lnc-LRRC2-1:1 Yes chrX:18387084-18390344 lnc-LTF-2:1 Yes chr2R:20236235-20239200 lnc-LTF-2:2 Yes chr2R:20236235-20239200 LRRC2-AS1:1 Yes chr2R:20236235-20239200 LRRC2-AS1:9 Yes chr2R:20236235-20239200 lnc-TDGF1-1:2 No - lnc-PRSS50-2:2 Yes chr3L:21674394-21679755 lnc-PRSS50-2:3 Yes chr3L:21674394-21679755 lnc-PRSS50-1:2 Yes chr3L:6092188-6093313 lnc-PRSS50-1:1 Yes chr3L:6092188-6093313 lnc-PTH1R-2:1 Yes chr3L:6092188-6093313 lnc-PRSS50-1:3 Yes chr3L:6092188-6093313 lnc-PRSS42-3:1 No - lnc-PRSS42-2:1 No - lnc-PTH1R-1:1 Yes chr3R:27657078-27660177 lnc-CCDC12-1:6 Yes chr3R:29996961-29997676 lnc-CCDC12-1:5 Yes chr3R:29996961-29997676 lnc-CCDC12-1:4 Yes chr3R:29996961-29997676 lnc-CCDC12-1:2 No - lnc-NBEAL2-1:1 No - lnc-CCDC12-2:1 Yes chrX:13413242-13421024 lnc-KLHL18-8:1 No - lnc-KLHL18-8:11 No - lnc-SETD2-1:1 No - lnc-KLHL18-6:1 No - lnc-KLHL18-5:1 No - lnc-KLHL18-4:1 No - lnc-SETD2-2:1 Yes chrX:11580772-11585750 lnc-SETD2-3:1 Yes chrX:11580772-11585750 lnc-KLHL18-2:1 No - lnc-SCAP-1:2 No - lnc-ELP6-2:1 Yes chr2R:6026273-6036388 lnc-ELP6-1:3 Yes chr2R:6026273-6036388 lnc-ELP6-1:1 Yes chr2R:6026273-6036388 lnc-ELP6-1:2 Yes chr2R:6026273-6036388 lnc-PTPN23-3:1 No - lnc-PTPN23-4:1 No - lnc-PTPN23-5:1 No - lnc-PTPN23-6:1 No - lnc-SCAP-2:1 No - lnc-SCAP-4:1 No - lnc-SCAP-3:1 No - lnc-CSPG5-1:1 No - lnc-SMARCC1-1:1 No - lnc-CSPG5-3:1 Yes chr3R:15968134-15972913 lnc-DHX30-2:1 Yes chr3R:15968134-15972913 lnc-CSPG5-4:1 Yes chr3R:15968134-15972913 lnc-SMARCC1-2:1 Yes chr3R:27639886-27656996 lnc-SMARCC1-3:1 Yes chr3R:27639886-27656996 lnc-SMARCC1-4:1 Yes chr3R:27639886-27656996 lnc-CDC25A-2:1 Yes chr3R:27639886-27656996 lnc-CAMP-3:1 Yes chr3R:27639886-27656996 lnc-MAP4-1:1 No - lnc-CAMP-2:1 Yes chr3R:29251826-29255800 lnc-NME6-2:1 Yes chr2L:12046711-12048918 lnc-SPINK8-2:1 No - lnc-SPINK8-1:5 No - lnc-SPINK8-1:3 No - lnc-SPINK8-1:2 No - lnc-SPINK8-1:4 No - lnc-SPINK8-1:1 No - lnc-TMA7-2:1 No - lnc-CCDC51-6:1 Yes chr4:32478-43778 lnc-CCDC51-5:1 Yes chr4:32478-43778 lnc-CCDC51-4:1 Yes chr4:32478-43778 lnc-CCDC51-3:1 Yes chr4:32478-43778 lnc-CCDC51-2:1 Yes chr4:32478-43778 lnc-SHISA5-2:1 No - lnc-SHISA5-1:2 No - lnc-SHISA5-1:7 No - lnc-SHISA5-1:4 No - lnc-SHISA5-1:5 No - lnc-SHISA5-1:6 No - lnc-SHISA5-1:3 No - lnc-SHISA5-1:1 No - lnc-ATRIP-4:1 No - lnc-ATRIP-5:1 No - lnc-ATRIP-7:1 No - lnc-ATRIP-6:1 No - lnc-SHISA5-3:1 Yes chrX:19495505-19509350 lnc-PFKFB4-4:2 Yes chrX:19495505-19509350 lnc-PFKFB4-4:1 No - lnc-COL7A1-1:1 No - lnc-UCN2-1:1 No - lnc-UCN2-2:2 No - lnc-UCN2-2:1 No - lnc-UCN2-3:1 No - lnc-UQCRC1-1:1 Yes chr3R:14890231-14892387 lnc-TMEM89-1:1 Yes chr3L:17898889-17907812 lnc-CELSR3-1:1 Yes chr3L:17898889-17907812 lnc-IP6K2-1:1 Yes chrX:8094250-8102095 lnc-NCKIPSD-2:1 Yes chr2R:21646177-21657935 lnc-NCKIPSD-2:3 Yes chr2R:21646177-21657935 lnc-NCKIPSD-2:2 Yes chr2R:21646177-21657935 PRKAR2A-AS1:2 No - PRKAR2A-AS1:3 No - lnc-PRKAR2A-2:1 Yes chr2L:2768590-2770069 lnc-DALRD3-1:11 Yes chr2R:22212835-22217264 lnc-P4HTM-2:1 Yes chr2R:22212835-22217264 lnc-DALRD3-1:2 Yes chr2R:22212835-22217264 lnc-DALRD3-3:1 No - lnc-IMPDH2-2:1 No - lnc-DALRD3-4:1 Yes chrX:10744502-10749097 lnc-QRICH1-1:2 Yes chrX:10744502-10749097 lnc-QRICH1-1:1 Yes chrX:10744502-10749097 lnc-IMPDH2-1:1 Yes chr3R:27256595-27264055 lnc-IMPDH2-1:2 Yes chr3R:27256595-27264055 lnc-NDUFAF3-3:1 Yes chr3R:27256595-27264055 lnc-QRICH1-2:4 Yes chr3R:25263267-25265721 lnc-QRICH1-2:5 Yes chr3R:25263267-25265721 lnc-QRICH1-2:6 Yes chr3R:25263267-25265721 lnc-QRICH1-2:3 Yes chr3R:25263267-25265721 lnc-QRICH1-2:2 Yes chr3R:25263267-25265721 lnc-LAMB2-2:1 No - lnc-LAMB2-1:1 Yes chr2L:7811438-7820771 lnc-LAMB2-1:2 Yes chr2L:7811438-7820771 lnc-USP19-1:4 Yes chr2L:7811438-7820771 lnc-USP19-1:3 Yes chr2L:7811438-7820771 lnc-USP19-1:2 Yes chr2L:7811438-7820771 lnc-USP19-1:1 Yes chr2L:7811438-7820771 lnc-USP19-2:1 Yes chr2L:7811438-7820771 lnc-USP19-2:2 Yes chr2L:7811438-7820771 lnc-CCDC71-1:1 No - lnc-CCDC71-2:1 No - lnc-C3orf62-2:1 No - lnc-RHOA-1:1 No - lnc-NICN1-2:3 No - lnc-NICN1-2:2 No - lnc-BSN-1:1 Yes chr2R:16081176-16098564 lnc-BSN-1:2 Yes chr2R:16081176-16098564 lnc-BSN-1:3 Yes chr2R:16081176-16098564 lnc-NICN1-4:1 Yes chr2R:16081176-16098564 BSN-DT:21 No - BSN-DT:23 No - lnc-MST1-3:2 No - lnc-MST1-3:1 No - lnc-MST1-2:1 No - lnc-MST1-1:9 Yes chr3L:9074643-9092131 lnc-MST1-1:12 Yes chr3L:9074643-9092131 lnc-MST1-1:11 Yes chr3L:9074643-9092131 lnc-MST1-1:7 Yes chr3L:9074643-9092131 lnc-MST1-1:10 Yes chr3L:9074643-9092131 lnc-MST1-1:8 Yes chr3L:9074643-9092131 lnc-MST1-1:3 Yes chr3L:9074643-9092131 lnc-MST1-1:4 Yes chr3L:9074643-9092131 lnc-MST1-1:5 Yes chr3L:9074643-9092131 lnc-MST1-1:6 Yes chr3L:9074643-9092131 lnc-MST1-1:2 No - lnc-IP6K1-2:1 Yes chr3R:4811444-4816025 lnc-CDHR4-5:1 Yes chr2R:21646177-21657935 lnc-FAM212A-1:1 Yes chr2R:21646177-21657935 lnc-CDHR4-5:2 Yes chr2R:21646177-21657935 lnc-CDHR4-2:1 No - lnc-CDHR4-1:2 No - lnc-CDHR4-3:1 Yes chr2R:9688289-9693328 lnc-CDHR4-4:3 Yes chr2R:9688289-9693328 lnc-CDHR4-4:1 Yes chr2R:9688289-9693328 lnc-CDHR4-4:2 Yes chr2R:9688289-9693328 lnc-UBA7-1:1 Yes chr2R:18173669-18175725 lnc-CAMKV-3:1 Yes chr2R:18173669-18175725 lnc-CAMKV-2:1 Yes chr2R:18173669-18175725 lnc-TRAIP-2:2 Yes chr4:445504-453947 lnc-TRAIP-2:1 Yes chr4:445504-453947 lnc-TRAIP-1:1 Yes chr4:445504-453947 lnc-CAMKV-1:1 No - lnc-MON1A-2:2 No - lnc-MON1A-2:1 No - lnc-RBM6-4:1 No - lnc-RBM6-4:2 No - lnc-RBM6-3:1 No - lnc-MST1R-1:1 Yes chr2L:4850641-4852640 RBM5-AS1:2 Yes chr2L:1173009-1182454 lnc-IFRD2-6:1 No - lnc-SLC38A3-2:1 Yes chr3L:6972750-6980044 lnc-SLC38A3-6:2 Yes chr3L:6972750-6980044 lnc-SLC38A3-6:3 Yes chr3L:6972750-6980044 lnc-SEMA3B-1:2 No - lnc-SEMA3B-1:4 No - lnc-SEMA3B-1:6 No - SEMA3B-AS1:3 No - SEMA3B-AS1:2 No - lnc-IFRD2-3:1 No - lnc-HYAL3-2:3 Yes chr2L:2868627-2874489 lnc-HYAL3-2:1 Yes chr2L:2868627-2874489 lnc-HYAL3-2:2 Yes chr2L:2868627-2874489 lnc-TUSC2-1:1 No - lnc-CYB561D2-5:1 No - lnc-RASSF1-1:1 No - lnc-RASSF1-1:2 No - lnc-RASSF1-1:3 No - lnc-ZMYND10-1:2 Yes chr3L:13024763-13026437 lnc-ZMYND10-1:1 Yes chr3L:13024763-13026437 lnc-RASSF1-2:1 Yes chr3L:13024763-13026437 lnc-ZMYND10-2:1 Yes chrX:16882509-16884365 lnc-ZMYND10-2:2 Yes chrX:16882509-16884365 lnc-CYB561D2-2:1 No - lnc-TMEM115-1:1 No - lnc-CYB561D2-6:1 Yes chr2R:13805794-13819571 lnc-CISH-1:2 No - lnc-CISH-1:1 No - lnc-HEMK1-1:1 Yes chrX:5759908-5764203 LINC02019:7 No - lnc-CISH-2:1 Yes chr3R:28845270-28870439 lnc-CISH-3:1 Yes chr3R:28845270-28870439 lnc-CISH-4:1 Yes chr3R:28845270-28870439 lnc-RAD54L2-1:1 Yes chr2R:24107087-24114292 lnc-GRM2-2:1 No - lnc-IQCF6-2:1 No - lnc-IQCF3-1:1 No - lnc-IQCF3-1:2 No - lnc-IQCF3-1:6 No - lnc-IQCF2-2:1 No - lnc-PCBP4-2:1 No - lnc-PCBP4-1:2 Yes chr3L:21844788-21932702 lnc-ABHD14B-1:1 Yes chr2R:21293768-21294404 LINC00696:1 No - lnc-TLR9-1:1 No - lnc-PPM1M-2:4 No - lnc-TWF2-1:1 Yes chr2L:8374461-8375549 lnc-GLYCTK-1:2 Yes chr2L:8374461-8375549 GLYCTK-AS1:4 Yes chr2L:2420830-2424647 lnc-DNAH1-1:1 No - lnc-SEMA3G-1:1 Yes chrX:1013984-1026703 lnc-PBRM1-2:1 Yes chr2R:9577427-9581847 lnc-STAB1-1:2 No - lnc-PBRM1-1:1 No - lnc-GLT8D1-1:1 No - lnc-SPCS1-2:1 No - lnc-GLT8D1-2:1 No - lnc-ITIH1-2:1 No - lnc-ITIH4-2:1 No - lnc-MUSTN1-5:1 No - lnc-MUSTN1-4:2 No - lnc-MUSTN1-4:1 No - lnc-MUSTN1-3:2 No - lnc-MUSTN1-3:1 No - lnc-MUSTN1-2:1 No - lnc-ITIH4-1:1 No - lnc-TMEM110-MUSTN1-1:2 No - lnc-TMEM110-MUSTN1-1:3 No - lnc-TMEM110-MUSTN1-1:1 No - lnc-ITIH3-4:1 No - lnc-SFMBT1-5:3 No - lnc-SFMBT1-5:1 No - lnc-SFMBT1-5:2 No - lnc-PRKCD-2:1 No - lnc-SFMBT1-2:1 Yes chrX:5692945-5695205 lnc-RFT1-3:1 Yes chrX:5692945-5695205 lnc-RFT1-2:1 Yes chrX:5692945-5695205 lnc-RFT1-1:3 Yes chrX:5692945-5695205 lnc-DCP1A-4:1 Yes chr3R:8667868-8673702 lnc-TKT-1:10 Yes chr2R:23888764-23890276 lnc-TKT-3:6 Yes chr2R:23888764-23890276 lnc-CACNA1D-1:2 Yes chr2R:23888764-23890276 lnc-TKT-3:2 No - lnc-DCP1A-2:1 Yes chr2L:16165831-16190540 lnc-ACTR8-1:2 No - lnc-ACTR8-2:2 No - lnc-ACTR8-2:1 No - lnc-SELENOK-3:2 No - lnc-SELENOK-4:2 Yes chr2R:13805794-13819571 lnc-LRTM1-4:1 Yes chr2R:13805794-13819571 lnc-IL17RB-3:1 Yes chr2R:13805794-13819571 ESRG:3 Yes chr2R:13805794-13819571 lnc-CACNA2D3-5:1 No - lnc-CACNA2D3-5:2 No - lnc-CACNA2D3-6:1 No - lnc-WNT5A-1:2 No - lnc-ERC2-3:1 No - lnc-ERC2-2:1 No - lnc-WNT5A-3:4 Yes chr2R:9503765-9541565 lnc-WNT5A-3:3 Yes chr2R:9503765-9541565 lnc-WNT5A-3:2 Yes chr2R:9503765-9541565 lnc-WNT5A-3:1 Yes chr2R:9503765-9541565 lnc-WNT5A-3:5 Yes chr2R:9503765-9541565 ERC2-IT1:1 Yes chr2R:9503765-9541565 lnc-CCDC66-2:1 Yes chr2R:9503765-9541565 lnc-FAM208A-3:1 Yes chr2R:9503765-9541565 lnc-FAM208A-1:2 Yes chr2R:9503765-9541565 lnc-FAM208A-1:1 Yes chr2R:9503765-9541565 lnc-ARHGEF3-3:2 No - lnc-ARHGEF3-3:1 No - lnc-ARHGEF3-2:1 No - lnc-ARHGEF3-1:1 No - lnc-CCDC66-1:1 No - lnc-IL17RD-2:2 Yes chr3L:4692783-4796253 lnc-IL17RD-2:3 Yes chr3L:4692783-4796253 lnc-IL17RD-2:1 Yes chr3L:4692783-4796253 lnc-IL17RD-1:1 Yes chr3L:4692783-4796253 lnc-SPATA12-2:1 Yes chr3L:4692783-4796253 lnc-HESX1-2:1 No - lnc-HESX1-2:2 No - lnc-HESX1-1:1 No - lnc-ARF4-3:1 No - lnc-ARF4-2:1 No - lnc-DNAH12-1:1 No - lnc-DNAH12-2:3 Yes chr4:1124167-1125325 lnc-DNAH12-2:1 Yes chr4:1124167-1125325 lnc-DNAH12-2:2 Yes chr4:1124167-1125325 ARF4-AS1:1 Yes chr4:1124167-1125325 lnc-ARF4-1:1 Yes chrX:5326675-5329347 lnc-ARF4-4:1 Yes chrX:5326675-5329347 DENND6A-DT:11 No - lnc-SLMAP-3:1 No - lnc-SLMAP-2:1 Yes chr2L:22579072-22585843 lnc-DENND6A-1:2 Yes chr2L:22579072-22585843 lnc-DENND6A-2:4 Yes chr2L:22579072-22585843 lnc-FLNB-3:1 Yes chr2L:22579072-22585843 lnc-SLMAP-4:1 No - lnc-DNASE1L3-3:1 No - lnc-SLMAP-5:1 No - FLNB-AS1:3 No - FLNB-AS1:1 No - lnc-PDHB-1:1 No - lnc-ABHD6-1:1 No - lnc-HTD2-1:1 No - lnc-ACOX2-2:2 Yes chr3R:29113071-29116197 lnc-KCTD6-1:8 No - lnc-KCTD6-1:9 No - lnc-FAM107A-4:1 No - lnc-FAM107A-3:1 No - lnc-FAM107A-2:1 No - lnc-FAM107A-2:2 No - lnc-FAM107A-1:1 No - lnc-FAM107A-1:2 No - lnc-KCTD6-7:1 No - lnc-FHIT-1:2 No - lnc-C3orf67-4:1 No - lnc-KCTD6-8:1 No - lnc-C3orf67-3:1 No - lnc-FEZF2-9:2 No - lnc-PTPRG-5:1 No - lnc-FEZF2-8:1 No - lnc-FEZF2-7:1 No - lnc-FEZF2-6:1 No - lnc-FEZF2-9:1 No - lnc-PTPRG-1:2 No - lnc-PTPRG-4:1 No - lnc-C3orf14-2:1 Yes chr3R:29377646-29487131 lnc-FEZF2-3:1 Yes chr3R:29377646-29487131 PTPRG-AS1:4 Yes chr3R:29377646-29487131 PTPRG-AS1:5 Yes chr3R:29377646-29487131 PTPRG-AS1:6 Yes chr3R:29377646-29487131 lnc-FEZF2-2:1 Yes chr4:1230837-1271759 lnc-FEZF2-2:2 Yes chr4:1230837-1271759 lnc-FEZF2-4:1 Yes chr4:1230837-1271759 lnc-FEZF2-5:1 Yes chr4:1230837-1271759 LINC00698:2 No - LINC00698:3 No - LINC00698:8 No - LINC00698:9 No - LINC00698:11 No - lnc-CADPS-2:1 No - lnc-THOC7-2:2 No - lnc-THOC7-2:3 No - lnc-THOC7-2:1 No - lnc-C3orf49-2:1 No - lnc-ATXN7-17:6 Yes chr3R:22460662-22462054 lnc-PRICKLE2-5:1 Yes chr3R:22460662-22462054 lnc-ATXN7-27:1 No - lnc-PRICKLE2-4:1 No - PRICKLE2-AS2:2 Yes chr2R:7086316-7127868 lnc-ATXN7-10:1 Yes chr2R:7086316-7127868 lnc-ATXN7-6:3 No - lnc-PRICKLE2-7:2 Yes chr2R:22807860-22815993 lnc-PRICKLE2-7:1 Yes chr2R:22807860-22815993 lnc-ATXN7-12:1 Yes chr2R:22807860-22815993 ADAMTS9-AS1:23 Yes chr2R:22807860-22815993 ADAMTS9-AS1:24 Yes chr2R:22807860-22815993 ADAMTS9-AS1:28 Yes chr2R:22807860-22815993 ADAMTS9-AS1:29 Yes chr2R:22807860-22815993 ADAMTS9-AS1:30 Yes chr2R:22807860-22815993 ADAMTS9-AS1:36 Yes chr2R:22807860-22815993 lnc-PRICKLE2-6:1 Yes chr2R:22807860-22815993 ADAMTS9-AS2:1 Yes chr2R:22807860-22815993 ADAMTS9-AS2:2 Yes chr2R:22807860-22815993 ADAMTS9-AS2:7 Yes chr2R:22807860-22815993 lnc-ATXN7-13:1 No - lnc-ADAMTS9-3:4 No - ADAMTS9-AS2:8 No - ADAMTS9-AS2:9 No - ADAMTS9-AS2:10 No - ADAMTS9-AS2:11 No - lnc-ATXN7-15:1 No - ADAMTS9-AS2:12 No - lnc-MAGI1-1:2 No - lnc-ADAMTS9-7:1 No - lnc-SLC25A26-9:1 No - lnc-SLC25A26-8:1 No - lnc-SLC25A26-7:1 No - lnc-LRIG1-6:1 No - lnc-KBTBD8-2:1 Yes chr3R:25679242-25680550 lnc-MAGI1-4:1 No - lnc-SLC25A26-5:1 No - lnc-LRIG1-3:1 No - lnc-SLC25A26-6:1 No - lnc-LRIG1-1:8 No - lnc-LRIG1-1:2 No - lnc-SUCLG2-2:1 No - lnc-KBTBD8-1:3 No - lnc-FAM19A1-4:1 Yes chr3L:5561701-5563691 SUCLG2-AS1:1 No - lnc-FAM19A1-3:1 No - SUCLG2-AS1:6 No - lnc-FAM19A4-3:2 No - lnc-ARL6IP5-1:11 No - lnc-TMF1-1:1 No - lnc-EOGT-1:2 Yes chrX:6844341-6847847 lnc-UBA3-1:1 Yes chrX:6844341-6847847 lnc-TMF1-2:1 Yes chr2R:13858952-13860432 lnc-TMF1-2:3 Yes chr2R:13858952-13860432 lnc-TMF1-2:2 Yes chr2R:13858952-13860432 lnc-TMF1-2:4 Yes chr2R:13858952-13860432 lnc-TMF1-2:5 Yes chr2R:13858952-13860432 lnc-LMOD3-1:2 No - lnc-LMOD3-1:1 No - lnc-LMOD3-2:1 No - lnc-LMOD3-3:1 No - lnc-LMOD3-3:2 No - lnc-LMOD3-4:1 No - lnc-LMOD3-5:1 No - lnc-FRMD4B-4:1 Yes chr4:1198852-1224467 lnc-FRMD4B-3:1 Yes chr4:1198852-1224467 SAMMSON:5 No - SAMMSON:12 No - lnc-MDFIC2-5:1 No - SAMMSON:14 No - lnc-MITF-9:1 No - lnc-MDFIC2-2:5 No - lnc-MDFIC2-2:2 No - lnc-MITF-12:1 No - lnc-MITF-13:1 No - lnc-EIF4E3-7:1 Yes chr3R:9726020-9730872 lnc-EIF4E3-6:1 Yes chr3R:9726020-9730872 lnc-EIF4E3-5:1 Yes chr3R:9726020-9730872 FOXP1-AS1:1 Yes chr3R:9726020-9730872 FOXP1-AS1:2 Yes chr3R:9726020-9730872 FOXP1-AS1:5 Yes chr3R:9726020-9730872 lnc-EIF4E3-4:2 Yes chr3R:9726020-9730872 FOXP1-AS1:6 Yes chr3R:9726020-9730872 lnc-EIF4E3-4:1 Yes chr3R:9726020-9730872 lnc-EIF4E3-3:2 Yes chr3R:9726020-9730872 lnc-EIF4E3-3:1 Yes chr3R:9726020-9730872 lnc-GPR27-12:1 Yes chr3R:9726020-9730872 lnc-GPR27-10:8 Yes chr3R:9726020-9730872 lnc-GPR27-10:1 No - lnc-GPR27-10:2 No - lnc-GPR27-9:1 No - lnc-EIF4E3-2:1 No - lnc-PROK2-2:1 No - lnc-PROK2-2:2 No - lnc-GPR27-5:1 No - lnc-GPR27-1:6 No - lnc-GPR27-1:7 No - lnc-GPR27-7:1 No - lnc-GPR27-13:1 No - lnc-GPR27-14:1 No - LINC00877:12 No - LINC00877:16 No - LINC00877:15 No - LINC00877:5 No - LINC00877:7 No - lnc-RYBP-8:1 Yes chr2R:22670587-22673212 LINC00870:2 No - lnc-RYBP-7:1 No - lnc-RYBP-5:1 No - lnc-GXYLT2-9:1 No - lnc-GXYLT2-8:1 No - lnc-GXYLT2-7:1 No - lnc-GXYLT2-5:1 No - lnc-RYBP-9:1 Yes chr3R:7184101-7186673 lnc-GXYLT2-3:1 Yes chr3R:7184101-7186673 lnc-GXYLT2-3:2 Yes chr3R:7184101-7186673 lnc-GXYLT2-2:1 No - lnc-SHQ1-2:1 No - lnc-SHQ1-3:1 Yes chr4:663621-669884 PDZRN3-AS1:7 Yes chr4:663621-669884 PDZRN3-AS1:8 Yes chr4:663621-669884 lnc-PDZRN3-1:1 No - LINC02005:5 No - LINC02047:5 No - lnc-PPP4R2-8:1 No - lnc-FRG2C-5:2 No - lnc-FRG2C-13:1 No - lnc-ZNF717-8:1 No - lnc-ZNF717-7:1 No - lnc-FRG2C-4:2 No - lnc-ZNF717-6:1 No - lnc-ZNF717-5:1 No - lnc-ZNF717-4:6 No - lnc-ZNF717-4:8 No - lnc-ZNF717-4:2 No - lnc-ZNF717-4:7 No - lnc-ZNF717-4:3 No - lnc-ZNF717-4:4 No - lnc-ZNF717-4:5 No - LINC02018:15 No - LINC02018:26 No - lnc-FRG2C-11:1 No - lnc-ZNF717-1:5 No - lnc-ZNF717-1:4 No - lnc-ZNF717-1:3 No - lnc-FRG2C-10:1 No - lnc-FRG2C-9:1 No - lnc-ZNF717-1:2 No - lnc-FRG2C-8:1 No - LINC00960:1 No - LINC00960:2 No - lnc-CNTN3-1:1 No - lnc-ROBO1-6:1 Yes chr2L:1380086-1420453 lnc-ROBO1-2:2 No - lnc-ROBO1-2:3 No - lnc-ROBO2-7:1 No - lnc-ROBO2-8:1 No - lnc-ROBO2-9:1 No - lnc-ZNF717-9:1 Yes chr2L:1380086-1420453 lnc-GBE1-11:1 Yes chr2L:1380086-1420453 lnc-ROBO2-10:1 Yes chr2L:1380086-1420453 lnc-GBE1-10:1 Yes chr2L:1380086-1420453 lnc-ROBO1-3:1 No - lnc-ROBO2-12:1 No - lnc-ROBO1-4:1 No - LINC02027:14 No - lnc-ROBO2-14:1 No - lnc-ROBO2-15:1 No - lnc-GBE1-7:1 No - lnc-CADM2-8:2 Yes chr2R:13171401-13174796 lnc-ROBO1-7:1 Yes chr2R:13171401-13174796 lnc-CADM2-7:5 No - lnc-GBE1-2:2 No - LINC02008:7 No - lnc-GBE1-8:1 No - lnc-CADM2-5:2 No - lnc-CADM2-4:4 No - lnc-CADM2-10:1 No - LINC00971:4 No - lnc-VGLL3-10:1 No - LINC00971:5 No - LINC02025:4 No - lnc-CHMP2B-5:1 No - lnc-CHMP2B-5:2 No - lnc-VGLL3-2:3 No - lnc-CADM2-9:1 No - lnc-CHMP2B-2:7 No - lnc-CHMP2B-2:8 No - lnc-POU1F1-1:3 Yes chr2R:12884632-12899385 lnc-CHMP2B-1:6 No - lnc-CHMP2B-3:1 No - lnc-POU1F1-4:1 No - lnc-POU1F1-2:1 No - lnc-POU1F1-3:1 No - lnc-C3orf38-6:1 No - lnc-ZNF654-3:1 Yes chr3L:206134-207527 lnc-C3orf38-7:1 No - lnc-CSNKA2IP-5:1 No - lnc-CGGBP1-2:1 No - lnc-CGGBP1-3:1 No - lnc-EPHA3-1:1 No - lnc-CGGBP1-4:1 No - lnc-EPHA3-2:1 No - lnc-STX19-1:1 Yes chr3L:7650548-7759123 lnc-PROS1-1:1 Yes chr3R:21884728-21885550 lnc-DHFR2-1:1 No - lnc-DHFR2-2:1 No - LINC00879:3 No - LINC00879:4 No - LINC00879:5 No - LINC00879:10 No - LINC00879:11 No - lnc-NSUN3-3:1 No - lnc-MTRNR2L12-1:1 No - lnc-MTRNR2L12-1:3 No - lnc-MTRNR2L12-1:2 No - lnc-MTRNR2L12-10:1 No - lnc-MTRNR2L12-9:1 No - lnc-MTRNR2L12-3:5 No - lnc-MTRNR2L12-3:2 No - lnc-EPHA6-4:1 No - lnc-MTRNR2L12-8:1 No - lnc-RIOX2-7:1 No - lnc-ARL6-1:2 No - lnc-RIOX2-5:1 Yes chr2R:19444179-19445058 lnc-CRYBG3-1:2 No - lnc-OR5AC2-2:1 No - lnc-OR5H1-1:1 No - lnc-GABRR3-6:2 No - lnc-OR5H15-2:1 No - lnc-OR5H15-3:1 No - lnc-OR5H6-3:1 No - lnc-OR5H6-2:1 No - lnc-OR5H6-1:2 No - lnc-OR5K1-1:1 No - lnc-CPOX-1:1 No - lnc-CLDND1-1:1 Yes chr2L:6964421-6965887 lnc-CLDND1-2:1 Yes chr2L:6964421-6965887 lnc-GPR15-2:1 No - lnc-ST3GAL6-5:1 No - lnc-ST3GAL6-4:1 No - ST3GAL6-AS1:6 No - lnc-GPR15-3:1 No - lnc-CPOX-2:1 No - lnc-CPOX-3:2 No - lnc-CPOX-3:3 No - lnc-CPOX-3:1 No - LINC00973:1 No - LINC00973:3 No - lnc-ST3GAL6-6:1 No - lnc-DCBLD2-2:1 No - lnc-COL8A1-3:1 No - lnc-COL8A1-3:2 No - lnc-COL8A1-3:3 No - lnc-FILIP1L-2:1 No - lnc-COL8A1-5:1 No - lnc-TOMM70-1:1 No - lnc-CMSS1-1:5 No - lnc-CMSS1-3:1 No - lnc-NIT2-1:1 Yes chr3R:9401495-9402618 lnc-FILIP1L-7:1 Yes chr2L:12035984-12038511 lnc-ABI3BP-1:1 Yes chr3R:31127965-31130666 lnc-TOMM70-2:1 No - lnc-TOMM70-3:1 No - lnc-IMPG2-3:1 No - lnc-IMPG2-2:1 No - lnc-TRMT10C-5:1 No - lnc-IMPG2-1:1 Yes chrX:12760642-12763611 lnc-TRMT10C-4:1 Yes chrX:12760642-12763611 lnc-ZBTB11-1:1 No - lnc-RPL24-4:1 Yes chr3R:18650121-18659309 lnc-RPL24-3:2 Yes chr2L:13393687-13395131 lnc-RPL24-3:1 Yes chr2L:13393687-13395131 lnc-RPL24-3:3 Yes chr2L:13393687-13395131 lnc-RPL24-3:4 Yes chr2L:13393687-13395131 lnc-CEP97-8:1 Yes chr2L:13393687-13395131 lnc-CEP97-7:1 No - lnc-CEP97-2:1 No - lnc-CEP97-1:1 No - lnc-CEP97-4:1 No - lnc-NXPE3-1:1 No - lnc-NFKBIZ-2:1 No - lnc-NFKBIZ-3:1 No - lnc-NFKBIZ-4:1 No - LINC02085:8 No - lnc-ZPLD1-3:1 No - lnc-NFKBIZ-5:1 No - lnc-NFKBIZ-5:2 No - lnc-NFKBIZ-6:1 No - lnc-ZPLD1-1:2 No - lnc-ZPLD1-1:3 No - lnc-ZPLD1-4:1 No - lnc-ZPLD1-7:1 No - lnc-RPL24-6:1 No - lnc-ZPLD1-9:1 No - lnc-ALCAM-3:2 No - lnc-ALCAM-18:1 No - lnc-ALCAM-16:1 No - lnc-ALCAM-15:1 No - lnc-ALCAM-14:1 No - lnc-ALCAM-13:1 No - lnc-CBLB-15:1 No - lnc-ALCAM-12:1 No - lnc-ALCAM-10:1 No - lnc-ALCAM-7:1 No - lnc-ALCAM-6:1 No - lnc-ALCAM-5:1 No - lnc-ALCAM-4:1 No - lnc-CBLB-4:2 No - lnc-CD47-9:1 Yes chr3L:8424954-8432246 lnc-CD47-8:1 Yes chr3L:8424954-8432246 lnc-CBLB-1:2 No - lnc-CBLB-8:1 No - lnc-ALCAM-8:1 No - lnc-CBLB-9:1 No - lnc-CBLB-10:1 No - lnc-CBLB-11:1 No - lnc-CBLB-3:6 No - lnc-CBLB-3:7 No - lnc-ALCAM-9:1 No - LINC00882:18 No - lnc-CCDC54-10:1 No - LINC00882:22 No - lnc-CBLB-12:1 No - LINC00882:21 No - LINC00882:20 No - LINC00882:19 No - lnc-CCDC54-9:1 No - lnc-CBLB-14:2 No - lnc-CBLB-14:1 No - lnc-CCDC54-8:1 No - lnc-CCDC54-7:1 No - LINC00882:5 No - LINC00882:1 No - LINC00882:9 No - DUBR:7 No - lnc-CD47-7:1 No - DUBR:16 No - LINC00882:44 No - LINC00882:52 No - LINC00882:51 No - LINC00882:47 No - LINC00882:48 No - LINC00882:49 No - LINC00882:50 No - LINC00882:45 No - LINC00882:42 No - LINC00882:37 No - lnc-CCDC54-3:1 No - LINC01990:13 No - lnc-CCDC54-6:4 Yes chrX:21363028-21373145 LINC00635:22 No - LINC00635:26 No - LINC00635:25 No - LINC00635:11 No - LINC00635:10 No - LINC00636:1 No - lnc-CD47-1:3 No - lnc-IFT57-4:2 No - LINC01215:1 No - lnc-CD47-5:2 Yes chr2L:3530789-3532678 lnc-CD47-6:1 Yes chr2L:3530789-3532678 lnc-MYH15-1:1 No - lnc-CIP2A-3:1 Yes chr2L:16766566-16788766 lnc-CIP2A-2:1 No - lnc-CIP2A-1:1 No - lnc-CIP2A-1:2 No - lnc-RETNLB-1:3 No - lnc-GUCA1C-1:1 No - lnc-GUCA1C-3:1 No - lnc-MORC1-1:2 No - LINC00488:3 No - lnc-C3orf85-8:1 No - lnc-DPPA4-1:4 No - lnc-DPPA4-1:3 No - lnc-C3orf85-4:7 No - lnc-C3orf85-4:8 No - lnc-C3orf85-4:9 No - lnc-C3orf85-9:1 No - lnc-DPPA4-2:1 No - lnc-DPPA4-3:1 No - lnc-NECTIN3-1:1 No - NECTIN3-AS1:15 No - NECTIN3-AS1:13 No - lnc-CD96-4:1 No - lnc-PLCXD2-3:1 No - lnc-PLCXD2-1:1 No - PLCXD2-AS1:3 Yes chr2L:20089636-20091348 PLCXD2-AS1:4 Yes chr2L:20089636-20091348 lnc-CD96-3:1 No - lnc-PLCXD2-2:1 Yes chrX:17107582-17135988 lnc-GCSAM-1:1 No - lnc-GCSAM-2:1 No - lnc-CD200-1:2 No - lnc-CD200-1:3 No - lnc-SLC9C1-2:13 No - lnc-SLC9C1-2:7 No - lnc-SLC9C1-2:10 No - lnc-SLC9C1-2:3 No - lnc-SLC9C1-2:8 No - lnc-SLC9C1-2:14 No - lnc-SLC9C1-2:5 No - lnc-SLC9C1-2:12 No - lnc-SLC9C1-2:9 No - lnc-SLC9C1-1:1 No - lnc-SLC9C1-2:11 No - lnc-BTLA-4:1 No - lnc-ATG3-3:2 No - lnc-ATG3-3:1 No - lnc-ATG3-2:1 No - lnc-ATG3-1:1 No - lnc-BTLA-2:1 Yes chr3L:18748687-18750483 lnc-BTLA-3:1 Yes chr3L:18748687-18750483 lnc-CCDC80-3:1 No - lnc-CCDC80-5:3 No - lnc-CCDC80-1:5 No - lnc-CCDC80-1:4 No - lnc-CCDC80-1:3 No - lnc-CCDC80-1:2 No - lnc-SLC35A5-3:1 No - lnc-CD200R1-1:5 No - lnc-CD200R1-2:1 No - lnc-CD200R1-3:1 No - lnc-NEPRO-3:2 No - lnc-BOC-3:2 No - lnc-CFAP44-2:1 No - lnc-SPICE1-1:1 Yes chr2L:4958411-4965430 lnc-BOC-2:1 Yes chr2L:4958411-4965430 lnc-CFAP44-3:1 No - lnc-SIDT1-2:1 No - lnc-USF3-3:1 Yes chr2R:11360706-11361871 lnc-USF3-2:1 Yes chr2R:11360706-11361871 lnc-NAA50-4:1 Yes chr2L:3358640-3373372 lnc-ZDHHC23-2:1 Yes chr2L:3358640-3373372 lnc-DRD3-2:1 Yes chr2L:3032210-3035348 lnc-ZDHHC23-1:1 Yes chr2L:3032210-3035348 lnc-DRD3-1:1 No - lnc-ZNF80-2:1 Yes chrX:20004680-20062706 lnc-ZNF80-1:1 No - lnc-ZBTB20-1:3 No - lnc-ZBTB20-1:2 No - lnc-ZNF80-4:6 No - lnc-ZNF80-4:3 No - lnc-ZNF80-4:11 No - lnc-ZNF80-4:7 No - lnc-ZNF80-4:5 No - lnc-ZNF80-4:4 No - lnc-ZNF80-4:10 No - lnc-TIGIT-7:1 No - lnc-ZNF80-4:9 No - lnc-ZNF80-4:1 No - lnc-ZNF80-4:8 No - lnc-TIGIT-8:1 No - lnc-ZNF80-4:2 No - lnc-GAP43-1:2 No - lnc-LSAMP-4:1 No - lnc-ZBTB20-2:2 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-ZBTB20-8:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-GAP43-10:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-GAP43-13:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-ZBTB20-7:1 Yes chr3L:5424109-5442399 TUSC7:2 Yes chr3L:5424109-5442399 TUSC7:6 Yes chr3L:5424109-5442399 TUSC7:7 Yes chr3L:5424109-5442399 TUSC7:8 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-GAP43-16:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-GAP43-9:3 No - lnc-GAP43-17:1 No - lnc-GAP43-18:1 No - lnc-C3orf30-21:1 No - lnc-LSAMP-6:1 No - lnc-C3orf30-20:1 No - lnc-C3orf30-22:1 No - LINC02024:12 No - lnc-C3orf30-18:1 No - lnc-C3orf30-17:1 No - lnc-C3orf30-16:1 No - lnc-C3orf30-4:3 No - lnc-C3orf30-15:1 No - lnc-C3orf30-14:1 No - lnc-C3orf30-13:1 No - lnc-C3orf30-12:1 No - lnc-C3orf30-11:1 No - lnc-C3orf30-10:1 No - lnc-C3orf30-9:1 No - lnc-LSAMP-5:10 No - lnc-C3orf30-8:1 No - lnc-C3orf30-2:5 No - lnc-IGSF11-5:8 No - lnc-IGSF11-5:9 No - IGSF11-AS1:2 No - IGSF11-AS1:4 No - lnc-B4GALT4-2:1 No - lnc-IGSF11-4:2 Yes chr3R:29032660-29034008 lnc-IGSF11-4:4 Yes chr3R:29032660-29034008 lnc-IGSF11-4:1 Yes chr3R:29032660-29034008 lnc-IGSF11-4:3 Yes chr3R:29032660-29034008 lnc-IGSF11-4:5 Yes chr3R:29032660-29034008 lnc-UPK1B-2:1 Yes chr2L:19774874-19791882 lnc-ARHGAP31-2:1 Yes chr2R:14157762-14159434 lnc-CD80-4:3 Yes chr2R:14157762-14159434 lnc-CD80-4:4 Yes chr2R:14157762-14159434 lnc-CD80-4:2 Yes chr2R:14157762-14159434 lnc-TIMMDC1-2:1 Yes chr3R:22747690-22749056 lnc-ADPRH-1:2 No - lnc-PLA1A-1:1 No - lnc-POPDC2-2:1 No - lnc-POPDC2-1:2 No - lnc-POPDC2-1:1 No - lnc-MAATS1-1:1 Yes chrX:15084029-15084699 lnc-POPDC2-4:1 Yes chrX:15084029-15084699 lnc-POPDC2-3:1 Yes chrX:15084029-15084699 lnc-COX17-1:2 Yes chr2L:17529311-17532234 lnc-COX17-2:4 Yes chr3R:31372427-31374198 lnc-COX17-2:2 Yes chr3R:31372427-31374198 lnc-COX17-2:3 Yes chr3R:31372427-31374198 lnc-COX17-2:1 Yes chr3R:31372427-31374198 lnc-NR1I2-3:1 Yes chr3R:31372427-31374198 lnc-NR1I2-4:1 Yes chr3R:31372427-31374198 lnc-NR1I2-1:13 No - lnc-NR1I2-1:14 No - lnc-GSK3B-1:1 No - lnc-GSK3B-2:1 No - lnc-NR1I2-5:1 No - lnc-LRRC58-4:1 Yes chr2L:15016331-15034704 lnc-NDUFB4-2:2 No - lnc-GPR156-1:1 Yes chrX:10482028-10487205 lnc-LRRC58-1:4 No - lnc-LRRC58-1:3 No - lnc-NDUFB4-6:1 No - lnc-LRRC58-2:1 No - lnc-LRRC58-3:1 No - lnc-LRRC58-5:1 No - lnc-LRRC58-5:3 No - lnc-LRRC58-5:2 No - lnc-FSTL1-1:1 No - lnc-NDUFB4-4:1 No - lnc-NDUFB4-3:1 No - lnc-RABL3-3:2 Yes chr2L:11136393-11138565 lnc-RABL3-3:3 Yes chr2L:11136393-11138565 lnc-RABL3-3:1 Yes chr2L:11136393-11138565 lnc-GTF2E1-1:1 Yes chrX:16800930-16802000 LINC02049:10 No - lnc-RABL3-4:1 Yes chrX:12631605-12653442 lnc-GTF2E1-4:1 Yes chrX:12631605-12653442 lnc-ARGFX-1:1 Yes chrX:12631605-12653442 lnc-HCLS1-1:1 Yes chr3R:12705523-12712299 lnc-GOLGB1-2:1 Yes chr3R:21061680-21064471 lnc-GOLGB1-1:3 Yes chr3R:21061680-21064471 lnc-GOLGB1-1:1 Yes chr3R:21061680-21064471 lnc-GOLGB1-1:2 Yes chr3R:21061680-21064471 lnc-EAF2-3:1 No - lnc-GOLGB1-3:1 No - lnc-SLC15A2-1:1 No - lnc-CSTA-1:1 No - lnc-WDR5B-1:1 Yes chr3L:19805181-19806932 lnc-WDR5B-1:2 Yes chr3L:19805181-19806932 lnc-CCDC58-1:1 Yes chr3L:19805181-19806932 lnc-FAM162A-2:1 Yes chrX:2585980-2588217 lnc-FAM162A-3:1 Yes chr3L:19807232-19810398 lnc-DTX3L-1:1 No - lnc-SEMA5B-2:1 Yes chr3R:27695235-27696531 LINC02035:5 No - lnc-HSPBAP1-1:2 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-HSPBAP1-1:3 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-PDIA5-1:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-HACD2-7:2 Yes chr3L:16491838-16543370 lnc-SEC22A-6:1 No - lnc-HACD2-1:2 Yes chr2L:12001234-12002266 lnc-ADCY5-1:1 Yes chr2L:12001234-12002266 lnc-ADCY5-2:1 Yes chr2L:12001234-12002266 lnc-SEC22A-14:2 Yes chr2R:9716348-9748121 lnc-SEC22A-14:7 No - lnc-HACD2-2:2 Yes chr2R:9716348-9748121 lnc-HACD2-3:3 Yes chr2R:9716348-9748121 lnc-HACD2-3:4 Yes chr2R:9716348-9748121 lnc-HACD2-4:2 Yes chr2R:9716348-9748121 lnc-HACD2-5:2 Yes chr2R:9716348-9748121 lnc-HACD2-6:2 Yes chr2R:9716348-9748121 lnc-CCDC14-2:1 Yes chr2R:9716348-9748121 lnc-CCDC14-2:2 Yes chr2R:9716348-9748121 lnc-CCDC14-1:5 No - lnc-CCDC14-1:1 No - lnc-CCDC14-1:3 No - lnc-CCDC14-1:8 No - lnc-CCDC14-1:7 No - lnc-CCDC14-1:6 No - lnc-CCDC14-1:4 No - lnc-CCDC14-1:2 No - lnc-KALRN-3:1 Yes chr3L:995982-1034875 lnc-ITGB5-3:1 Yes chr3L:995982-1034875 lnc-KALRN-1:2 Yes chr3L:995982-1034875 lnc-ITGB5-1:1 Yes chr3R:21070557-21073319 lnc-MUC13-8:1 No - lnc-MUC13-7:1 No - lnc-MUC13-5:1 No - lnc-ITGB5-2:1 No - lnc-MUC13-1:1 No - lnc-MUC13-2:1 No - lnc-MUC13-6:1 No - lnc-HEG1-1:1 Yes chrX:1349623-1353981 lnc-SLC12A8-1:2 Yes chrX:1349623-1353981 lnc-SLC12A8-2:2 No - lnc-SLC12A8-4:1 No - lnc-UMPS-4:1 No - lnc-SNX4-2:2 No - lnc-ROPN1B-14:1 No - lnc-ROPN1B-12:1 No - lnc-ROPN1B-11:1 No - lnc-ROPN1B-10:1 No - lnc-ROPN1B-20:1 No - lnc-ALG1L-5:1 No - lnc-ALG1L-4:1 No - lnc-ALG1L-2:11 No - lnc-ALG1L-2:12 No - lnc-ALG1L-2:10 No - lnc-ALG1L-2:8 No - lnc-ALG1L-2:9 No - lnc-ALG1L-2:14 No - lnc-ALG1L-2:13 No - lnc-ALG1L-2:6 No - lnc-ALG1L-2:7 No - lnc-ALG1L-2:17 No - lnc-ALG1L-2:18 No - lnc-ROPN1B-8:1 No - lnc-ROPN1B-7:1 No - lnc-ROPN1B-7:4 No - lnc-ROPN1B-7:6 No - lnc-ROPN1B-7:7 No - lnc-ROPN1B-6:1 No - lnc-ALG1L-3:1 Yes chrX:8489348-8517029 lnc-ROPN1B-2:3 Yes chrX:8489348-8517029 lnc-SLC41A3-1:2 Yes chr2L:21371227-21377995 lnc-CFAP100-2:2 No - lnc-CFAP100-2:3 No - lnc-CFAP100-2:4 No - lnc-CFAP100-2:8 No - lnc-CFAP100-2:10 No - lnc-CFAP100-9:2 No - lnc-CFAP100-8:2 No - lnc-ZXDC-2:1 Yes chrX:4770557-4771588 CCDC37-DT:14 No - CCDC37-DT:15 No - CCDC37-DT:16 No - CCDC37-DT:17 No - CCDC37-DT:18 No - CCDC37-DT:19 No - CCDC37-DT:20 No - lnc-ZXDC-1:2 No - lnc-UROC1-1:1 No - lnc-CHCHD6-4:1 No - lnc-CHCHD6-5:1 No - lnc-TXNRD3-1:1 No - lnc-TXNRD3-2:1 No - lnc-PLXNA1-1:1 No - lnc-TPRA1-6:1 No - lnc-TPRA1-5:1 No - lnc-TPRA1-5:2 No - LINC02016:9 No - LINC02034:5 No - lnc-MCM2-4:1 No - lnc-MGLL-4:2 No - lnc-ABTB1-1:1 No - lnc-KBTBD12-5:1 No - lnc-KBTBD12-4:1 No - lnc-RUVBL1-1:10 No - lnc-KBTBD12-2:1 No - lnc-RUVBL1-1:8 Yes chr2L:6477182-6480575 lnc-MGLL-5:1 No - lnc-MGLL-6:3 Yes chr3R:10262123-10263899 lnc-MGLL-6:2 Yes chr3R:10262123-10263899 lnc-MGLL-6:1 Yes chr3R:10262123-10263899 DNAJB8-AS1:1 Yes chr2R:16203329-16221793 DNAJB8-AS1:2 Yes chr2R:16203329-16221793 DNAJB8-AS1:4 Yes chr2R:16203329-16221793 DNAJB8-AS1:5 No - GATA2-AS1:20 No - lnc-GATA2-1:2 Yes chr2L:10373369-10375757 lnc-GATA2-2:2 Yes chr2L:10373369-10375757 lnc-GATA2-3:2 Yes chr2L:10373369-10375757 lnc-RAB7A-3:1 No - lnc-RAB7A-2:1 No - lnc-RAB7A-1:1 No - lnc-ACAD9-3:1 Yes chr3R:23993008-23995452 lnc-KIAA1257-8:1 Yes chr3R:23993008-23995452 lnc-KIAA1257-6:1 No - lnc-KIAA1257-5:1 No - lnc-ACAD9-2:1 No - lnc-ACAD9-2:2 No - lnc-RAB43-3:1 No - lnc-GP9-4:1 No - lnc-KIAA1257-4:1 No - lnc-EFCC1-1:1 No - lnc-RAB43-2:1 No - lnc-RAB43-2:2 No - lnc-ISY1-2:1 Yes chr2R:22934569-22937077 lnc-COPG1-3:6 No - lnc-COPG1-3:7 No - lnc-CNBP-1:1 No - H1FX-AS1:3 No - H1FX-AS1:4 No - H1FX-AS1:5 No - H1FX-AS1:7 No - H1FX-AS1:8 No - H1FX-AS1:10 No - lnc-HMCES-4:2 No - lnc-HMCES-5:2 No - lnc-EFCAB12-3:1 No - lnc-IFT122-2:1 No - lnc-IFT122-2:2 No - lnc-EFCAB12-2:14 No - lnc-EFCAB12-2:2 No - lnc-EFCAB12-2:3 No - lnc-EFCAB12-2:6 No - lnc-EFCAB12-2:16 No - lnc-EFCAB12-2:15 No - lnc-EFCAB12-2:4 No - lnc-EFCAB12-2:13 No - lnc-EFCAB12-2:7 No - lnc-EFCAB12-2:5 No - lnc-IFT122-1:1 No - lnc-EFCAB12-2:1 No - lnc-EFCAB12-2:8 No - lnc-EFCAB12-2:10 No - lnc-EFCAB12-1:4 No - lnc-EFCAB12-1:3 No - lnc-EFCAB12-1:1 No - lnc-EFCAB12-1:2 No - lnc-PLXND1-2:1 Yes chr3L:8407268-8412825 lnc-RHO-1:1 Yes chr3L:8407268-8412825 lnc-TMCC1-9:1 Yes chr4:32478-43778 lnc-TMCC1-8:1 Yes chr4:32478-43778 lnc-TMCC1-7:1 Yes chr4:32478-43778 lnc-H1FOO-1:1 Yes chr4:32478-43778 lnc-TMCC1-6:1 No - lnc-TRH-8:1 Yes chr3R:6389162-6405895 lnc-TMCC1-4:8 Yes chr3R:6389162-6405895 lnc-TMCC1-4:6 Yes chr3R:6389162-6405895 lnc-TMCC1-4:7 Yes chr3R:6389162-6405895 lnc-PLXND1-3:1 Yes chr3R:6389162-6405895 lnc-TMCC1-4:11 Yes chr3R:6389162-6405895 lnc-TMCC1-4:5 Yes chr3R:6389162-6405895 lnc-TMCC1-4:9 Yes chr3R:6389162-6405895 lnc-TMCC1-4:10 Yes chr3R:6389162-6405895 TMCC1-AS1:1 No - TMCC1-AS1:2 No - TMCC1-AS1:4 No - TMCC1-AS1:6 No - lnc-TRH-5:1 No - lnc-TMCC1-10:2 Yes chr3R:17809401-17811134 lnc-TMCC1-10:5 Yes chr3R:17809401-17811134 lnc-TMCC1-10:3 Yes chr3R:17809401-17811134 lnc-TMCC1-10:4 Yes chr3R:17809401-17811134 LINC02021:9 Yes chr3R:17809401-17811134 LINC02021:13 Yes chr3R:17809401-17811134 LINC02021:14 No - lnc-TMCC1-11:1 No - lnc-ALG1L2-5:1 No - lnc-COL6A5-6:1 No - lnc-COL6A5-6:2 No - lnc-COL6A5-6:3 No - lnc-COL6A5-4:5 No - lnc-COL6A5-2:1 No - lnc-ATP2C1-3:1 No - lnc-PIK3R4-2:1 No - lnc-ASTE1-6:1 Yes chr3L:22749444-22787631 lnc-ASTE1-5:1 Yes chr3L:22749444-22787631 lnc-NEK11-2:1 No - lnc-MRPL3-2:15 No - lnc-NUDT16-2:1 No - lnc-NEK11-5:2 No - lnc-MRPL3-1:2 No - lnc-CPNE4-3:1 Yes chrX:15761248-15762663 lnc-CPNE4-2:1 Yes chrX:15761248-15762663 lnc-CPNE4-1:3 Yes chrX:15761248-15762663 lnc-CPNE4-1:2 Yes chrX:15761248-15762663 lnc-CPNE4-1:1 Yes chrX:15761248-15762663 lnc-NUDT16-1:2 No - lnc-NUDT16-3:1 No - lnc-MRPL3-3:1 No - lnc-ACAD11-2:1 No - lnc-ACAD11-2:2 No - lnc-ACAD11-1:1 No - lnc-ACPP-1:1 No - lnc-ACAD11-4:3 No - lnc-UBA5-2:1 No - lnc-ACAD11-4:2 Yes chr3L:12746616-12750056 lnc-TMEM108-6:1 No - lnc-TMEM108-1:1 No - BFSP2-AS1:12 No - lnc-TMEM108-2:1 No - lnc-BFSP2-1:1 No - lnc-TOPBP1-4:1 No - lnc-CDV3-1:1 No - lnc-RAB6B-2:1 Yes chrX:13722246-13727113 lnc-RAB6B-1:1 Yes chrX:13722246-13727113 lnc-CDV3-2:1 Yes chrX:13722246-13727113 lnc-TF-3:1 Yes chrX:13722246-13727113 lnc-TF-3:2 Yes chrX:13722246-13727113 lnc-TOPBP1-3:1 No - lnc-SRPRB-3:1 Yes chrX:18387084-18390344 lnc-C3orf36-1:1 Yes chr2L:9521210-9540060 lnc-SLCO2A1-2:2 Yes chr2R:13055246-13079539 lnc-SLCO2A1-4:1 Yes chr2R:13055246-13079539 lnc-CEP63-5:1 Yes chr2R:13055246-13079539 lnc-SLCO2A1-3:1 Yes chr2R:13055246-13079539 lnc-AMOTL2-5:1 Yes chr2R:13055246-13079539 lnc-AMOTL2-3:1 No - lnc-ANAPC13-2:2 No - lnc-ANAPC13-2:1 No - lnc-CEP63-3:1 No - lnc-AMOTL2-4:1 Yes chr2R:17773964-17781930 lnc-ANAPC13-1:1 No - lnc-EPHB1-1:1 No - lnc-EPHB1-1:2 No - lnc-EPHB1-1:3 No - lnc-KY-3:1 No - lnc-KY-5:1 No - lnc-KY-7:1 No - lnc-KY-8:1 No - lnc-KY-8:2 No - lnc-KY-8:3 No - lnc-PPP2R3A-2:1 No - lnc-MSL2-4:1 No - lnc-PCCB-2:1 Yes chr3R:19890689-19898738 lnc-PPP2R3A-1:1 Yes chr2L:3462218-3466112 lnc-PCCB-1:1 No - lnc-SLC35G2-5:1 Yes chr2L:6950421-6954586 lnc-MSL2-6:1 Yes chr2L:6950421-6954586 lnc-SLC35G2-1:10 No - lnc-STAG1-4:1 No - lnc-SLC35G2-3:3 No - lnc-STAG1-5:1 No - lnc-SLC35G2-2:2 No - NCK1-DT:35 No - NCK1-DT:24 No - IL20RB-AS1:2 No - lnc-IL20RB-2:1 No - lnc-IL20RB-3:1 No - lnc-DZIP1L-3:1 No - lnc-SOX14-3:1 No - LINC01210:1 No - LINC01210:2 No - LINC01210:5 No - LINC01210:9 No - lnc-DZIP1L-1:1 No - lnc-CLDN18-1:1 No - lnc-A4GNT-3:1 No - lnc-A4GNT-2:1 No - lnc-A4GNT-1:1 Yes chr3L:8121827-8123615 lnc-ARMC8-1:1 No - lnc-ARMC8-2:1 No - lnc-ARMC8-2:2 No - lnc-ESYT3-2:1 No - lnc-PIK3CB-1:1 No - lnc-FAIM-2:1 No - lnc-FAIM-3:1 No - lnc-CEP70-1:1 Yes chr3R:20628972-20634732 lnc-FOXL2NB-6:2 Yes chr3R:20628972-20634732 lnc-FOXL2NB-4:3 Yes chr3R:20628972-20634732 lnc-FOXL2NB-4:4 Yes chr3R:20628972-20634732 lnc-FOXL2-2:1 No - lnc-COPB2-4:1 Yes chr3R:27916908-27918248 lnc-FOXL2NB-8:2 Yes chr3R:27916908-27918248 lnc-RBP2-2:1 Yes chr2L:13378902-13382382 lnc-RBP2-1:3 Yes chr2L:13378902-13382382 lnc-RBP2-1:2 Yes chr2L:13378902-13382382 lnc-MRPS22-1:8 No - lnc-MRPS22-1:9 No - lnc-MRPS22-1:10 No - lnc-MRPS22-1:11 No - lnc-MRPS22-1:12 No - lnc-MRPS22-1:13 No - lnc-RBP1-1:1 Yes chr3R:11559896-11567054 lnc-RBP1-2:1 Yes chr3R:24945237-24947400 lnc-RBP1-3:1 Yes chr3R:24945237-24947400 lnc-MRPS22-4:1 Yes chr3R:24945237-24947400 lnc-RBP1-4:1 Yes chr3R:24945237-24947400 lnc-RBP1-5:3 Yes chr3R:24945237-24947400 lnc-RBP1-5:1 Yes chr3R:24945237-24947400 lnc-RBP1-5:2 Yes chr3R:24945237-24947400 lnc-RBP1-5:4 Yes chr3R:24945237-24947400 lnc-NMNAT3-1:3 No - lnc-NMNAT3-6:1 No - lnc-CLSTN2-1:2 Yes chr4:1112874-1123357 lnc-SLC25A36-2:1 No - lnc-SLC25A36-1:2 No - lnc-SLC25A36-4:3 Yes chr2R:5116990-5128321 lnc-PXYLP1-1:2 No - lnc-SPSB4-3:1 Yes chr2L:2209574-2212571 lnc-SPSB4-3:2 Yes chr2L:2209574-2212571 lnc-ZBTB38-3:1 Yes chr2L:2209574-2212571 lnc-TFDP2-11:1 Yes chr2L:2209574-2212571 lnc-TFDP2-11:2 Yes chr2L:2209574-2212571 lnc-RASA2-3:1 No - lnc-PXYLP1-3:7 No - lnc-PXYLP1-3:8 No - lnc-PXYLP1-3:9 No - lnc-PXYLP1-3:10 No - lnc-PXYLP1-3:11 No - lnc-PXYLP1-3:12 No - lnc-RASA2-2:1 No - lnc-TFDP2-10:1 Yes chr3L:9839093-9855285 lnc-RASA2-1:1 Yes chr3L:9839093-9855285 lnc-TFDP2-9:1 No - lnc-GRK7-1:3 Yes chr2R:11652756-11679354 lnc-ATP1B3-1:3 No - lnc-TFDP2-8:2 No - lnc-TFDP2-8:1 No - lnc-TFDP2-6:1 No - lnc-TFDP2-5:1 Yes chr2R:13222433-13228202 lnc-TFDP2-1:7 Yes chr2R:13222433-13228202 lnc-TFDP2-1:8 Yes chr2R:13222433-13228202 lnc-TFDP2-1:3 Yes chr2R:13222433-13228202 lnc-TFDP2-1:6 Yes chr2R:13222433-13228202 lnc-TFDP2-1:4 Yes chr2R:13222433-13228202 lnc-TFDP2-1:5 Yes chr2R:13222433-13228202 lnc-TFDP2-1:2 Yes chr2R:13222433-13228202 lnc-TFDP2-7:2 Yes chr3L:3052514-3054906 lnc-ATR-3:1 Yes chrX:19485759-19492011 lnc-ATR-2:1 Yes chrX:19485759-19492011 lnc-XRN1-2:1 Yes chrX:16391698-16399850 lnc-XRN1-3:1 Yes chrX:16391698-16399850 lnc-XRN1-4:1 Yes chrX:16391698-16399850 lnc-PLS1-1:1 No - lnc-TRPC1-1:1 Yes chrX:17285704-17301929 lnc-PAQR9-4:1 Yes chr3L:11801951-11814755 lnc-PAQR9-4:2 Yes chr3L:11801951-11814755 lnc-PAQR9-3:1 Yes chr3L:11801951-11814755 lnc-PAQR9-3:3 Yes chr3L:11801951-11814755 lnc-PAQR9-3:2 Yes chr3L:11801951-11814755 lnc-U2SURP-3:8 No - lnc-U2SURP-3:9 No - lnc-U2SURP-3:10 No - lnc-U2SURP-3:11 No - lnc-U2SURP-3:12 No - lnc-U2SURP-3:13 No - lnc-U2SURP-3:14 No - lnc-U2SURP-3:15 No - PAQR9-AS1:5 Yes chr2R:21011970-21015628 PAQR9-AS1:8 Yes chr2R:21011970-21015628 PAQR9-AS1:11 Yes chr2R:21011970-21015628 PAQR9-AS1:13 Yes chr2R:21011970-21015628 PAQR9-AS1:14 Yes chr2R:21011970-21015628 PAQR9-AS1:16 Yes chr2R:21011970-21015628 lnc-PAQR9-2:2 Yes chr2R:21011970-21015628 lnc-CHST2-2:3 No - lnc-PAQR9-6:1 Yes chr2L:6677835-6684364 lnc-C3orf58-3:1 Yes chr2L:6677835-6684364 lnc-C3orf58-2:1 Yes chr2L:6677835-6684364 lnc-PAQR9-7:1 Yes chr2L:6677835-6684364 lnc-C3orf58-1:1 No - lnc-SLC9A9-1:1 No - lnc-C3orf58-9:1 No - lnc-C3orf58-11:1 No - lnc-C3orf58-12:1 No - lnc-PLOD2-6:1 No - lnc-PLOD2-4:1 No - lnc-ZIC1-21:1 No - lnc-PLSCR4-2:1 Yes chr3L:11198166-11206016 lnc-PLSCR4-1:1 Yes chr3L:11198166-11206016 lnc-PLOD2-3:1 No - lnc-PLOD2-5:1 Yes chr3L:3044113-3046812 lnc-PLSCR2-4:1 No - lnc-PLSCR2-1:1 Yes chr3L:3044113-3046812 lnc-PLSCR2-1:2 Yes chr3L:3044113-3046812 lnc-PLSCR1-1:1 Yes chr3L:3044113-3046812 lnc-PLSCR2-2:1 No - lnc-PLSCR2-3:2 Yes chr3L:3044113-3046812 lnc-PLSCR2-3:1 Yes chr3L:3044113-3046812 lnc-PLSCR2-5:2 Yes chr3L:3044113-3046812 lnc-PLSCR2-5:4 Yes chr3L:3044113-3046812 lnc-PLSCR2-5:1 Yes chr3L:3044113-3046812 lnc-PLSCR2-5:3 Yes chr3L:3044113-3046812 lnc-ZIC4-3:8 No - lnc-ZIC1-7:1 No - lnc-PLSCR5-1:3 Yes chr3R:4852813-4869979 lnc-PLSCR5-1:2 Yes chr3R:4852813-4869979 lnc-PLSCR5-1:1 Yes chr3R:4852813-4869979 lnc-PLSCR5-1:4 Yes chr3R:4852813-4869979 lnc-PLSCR5-2:1 No - lnc-ZIC4-4:1 Yes chr3R:4852813-4869979 lnc-ZIC1-1:3 Yes chr3R:4852813-4869979 lnc-ZIC1-1:4 Yes chr3R:4852813-4869979 lnc-ZIC1-1:5 Yes chr3R:4852813-4869979 lnc-ZIC4-1:2 No - lnc-ZIC1-5:5 No - lnc-ZIC1-8:1 No - LINC02032:4 No - lnc-HLTF-2:2 No - lnc-HLTF-10:1 No - lnc-HLTF-7:1 Yes chrX:17080423-17087675 lnc-CPA3-2:4 Yes chr2R:21200483-21210821 lnc-CP-4:2 No - lnc-CP-4:1 No - lnc-CP-3:1 No - lnc-CP-2:1 No - lnc-HLTF-4:1 No - lnc-HLTF-5:1 No - lnc-HLTF-6:2 No - lnc-HPS3-2:3 No - lnc-HPS3-2:4 No - lnc-HPS3-4:1 No - lnc-CP-1:1 No - lnc-TM4SF1-3:1 No - lnc-TM4SF1-2:1 No - lnc-TM4SF4-4:1 No - lnc-TM4SF1-4:1 No - lnc-WWTR1-2:1 No - WWTR1-AS1:4 Yes chr2R:24065975-24068485 lnc-WWTR1-1:1 Yes chr2R:24065975-24068485 lnc-ANKUB1-3:1 Yes chr3R:18224902-18226082 lnc-ANKUB1-2:5 No - lnc-ANKUB1-2:3 No - lnc-COMMD2-3:1 No - lnc-ANKUB1-2:4 No - lnc-PFN2-4:1 No - lnc-ANKUB1-2:2 No - lnc-RNF13-3:1 No - lnc-RNF13-3:2 No - lnc-RNF13-5:1 No - LINC01998:6 No - lnc-RNF13-6:5 No - lnc-PFN2-5:1 No - LINC01214:3 No - lnc-TSC22D2-4:1 No - lnc-SERP1-4:1 Yes chr2L:12455540-12546611 lnc-TSC22D2-1:3 Yes chr2L:12455540-12546611 lnc-SERP1-3:1 No - lnc-SERP1-1:1 No - lnc-SERP1-1:2 Yes chr3L:3197863-3199047 lnc-SERP1-2:1 Yes chr2L:5010922-5012127 lnc-SIAH2-1:6 No - lnc-SIAH2-2:1 Yes chr3L:16853751-16858712 lnc-CLRN1-1:1 No - lnc-AADACL2-6:1 Yes chr3L:19836614-19844944 lnc-P2RY12-1:1 No - lnc-AADACL2-4:1 No - lnc-IGSF10-3:1 No - lnc-IGSF10-4:1 No - lnc-AADACL2-1:6 No - lnc-AADACL2-1:7 No - AADACL2-AS1:6 No - lnc-MBNL1-3:1 Yes chr2R:17216549-17379376 MBNL1-AS1:1 Yes chr2R:17216549-17379376 lnc-IGSF10-8:1 Yes chr2R:17216549-17379376 lnc-IGSF10-9:1 No - lnc-IGSF10-10:1 No - lnc-IGSF10-11:1 No - lnc-MBNL1-6:1 No - lnc-MBNL1-7:1 No - lnc-P2RY1-3:10 No - lnc-IGSF10-12:1 No - lnc-RAP2B-2:1 No - lnc-RAP2B-1:1 No - lnc-DHX36-8:1 No - lnc-RAP2B-4:1 No - lnc-RAP2B-3:1 No - lnc-ARHGEF26-14:1 No - lnc-ARHGEF26-4:1 No - ARHGEF26-AS1:12 No - ARHGEF26-AS1:10 No - lnc-ARHGEF26-3:1 No - lnc-DHX36-3:1 Yes chr3L:16970013-16994388 lnc-DHX36-3:2 Yes chr3L:16970013-16994388 lnc-GPR149-8:1 Yes chr2L:20754579-20757985 lnc-GPR149-7:1 Yes chr2L:20754579-20757985 lnc-GPR149-6:1 Yes chr2L:20754579-20757985 lnc-GPR149-5:1 Yes chr2L:20754579-20757985 lnc-GPR149-4:1 Yes chr2L:20754579-20757985 lnc-GPR149-3:1 No - lnc-GPR149-9:1 No - lnc-MME-8:1 No - lnc-GPR149-10:1 No - lnc-PLCH1-5:1 No - LINC01487:9 No - lnc-MME-6:1 No - lnc-PLCH1-4:1 No - lnc-C3orf33-6:1 No - lnc-C3orf33-5:1 No - lnc-GMPS-4:1 No - lnc-GMPS-3:1 No - lnc-C3orf33-2:1 No - lnc-GMPS-1:4 No - lnc-GMPS-1:5 No - lnc-GMPS-2:1 No - lnc-SSR3-5:1 Yes chrX:10233347-10263485 lnc-CCNL1-9:1 Yes chr2L:9917221-9918330 TIPARP-AS1:1 No - TIPARP-AS1:6 No - TIPARP-AS1:2 No - LINC00886:1 No - lnc-LEKR1-5:3 No - lnc-LEKR1-3:3 No - lnc-SSR3-10:1 No - lnc-TIPARP-4:1 No - lnc-TIPARP-5:1 No - LINC02029:14 No - LINC02029:15 No - LINC00881:2 No - LINC00881:3 No - LINC00881:9 No - lnc-CCNL1-3:1 No - lnc-LEKR1-42:1 No - lnc-VEPH1-2:4 Yes chrX:2078343-2080405 lnc-VEPH1-2:5 Yes chrX:2078343-2080405 lnc-VEPH1-2:7 Yes chrX:2078343-2080405 lnc-VEPH1-2:11 Yes chrX:2078343-2080405 lnc-VEPH1-2:12 Yes chrX:2078343-2080405 lnc-VEPH1-2:8 Yes chrX:2078343-2080405 lnc-VEPH1-2:9 Yes chrX:2078343-2080405 lnc-VEPH1-2:10 Yes chrX:2078343-2080405 lnc-VEPH1-2:6 Yes chrX:2078343-2080405 lnc-VEPH1-2:3 Yes chrX:2078343-2080405 lnc-VEPH1-2:1 Yes chrX:2078343-2080405 lnc-VEPH1-2:2 Yes chrX:2078343-2080405 lnc-CCNL1-2:1 No - lnc-LEKR1-44:3 No - lnc-CCNL1-4:1 No - lnc-VEPH1-1:1 No - lnc-PTX3-4:7 No - lnc-PTX3-4:8 Yes chr3L:7134516-7143074 lnc-CCNL1-7:1 Yes chr3L:7134516-7143074 lnc-CCNL1-8:1 Yes chr3L:7134516-7143074 lnc-SHOX2-6:1 No - lnc-SHOX2-7:1 No - lnc-MLF1-4:1 No - lnc-LXN-1:4 No - lnc-LXN-1:3 No - lnc-LXN-2:1 No - lnc-GFM1-7:1 Yes chr2L:4838347-4841465 lnc-GFM1-3:1 Yes chr2L:4838347-4841465 lnc-RARRES1-2:1 Yes chr2L:4838347-4841465 lnc-MFSD1-2:1 No - lnc-MFSD1-1:3 No - lnc-MFSD1-3:1 No - lnc-RARRES1-4:1 Yes chr2L:10328200-10331116 lnc-IFT80-9:1 Yes chr2L:10328200-10331116 IQCJ-SCHIP1-AS1:1 Yes chr2L:10328200-10331116 IL12A-AS1:5 No - LINC01100:3 No - lnc-TRIM59-5:2 Yes chr2L:20832849-20835840 lnc-TRIM59-5:1 Yes chr2L:20832849-20835840 lnc-IFT80-4:9 Yes chr2L:20832849-20835840 lnc-IFT80-4:6 Yes chr2L:20832849-20835840 lnc-SMC4-2:1 Yes chr2L:20832849-20835840 lnc-IFT80-4:5 Yes chr2L:20832849-20835840 lnc-IFT80-4:4 Yes chr2L:20832849-20835840 lnc-IFT80-4:7 Yes chr2L:20832849-20835840 lnc-IFT80-4:8 Yes chr2L:20832849-20835840 lnc-IFT80-4:2 Yes chr2L:20832849-20835840 lnc-IFT80-4:3 Yes chr2L:20832849-20835840 lnc-IFT80-4:1 Yes chr2L:20832849-20835840 lnc-TRIM59-1:2 Yes chr3R:9574484-9577733 lnc-TRIM59-1:1 Yes chr3R:9574484-9577733 lnc-TRIM59-2:1 Yes chr3R:9574484-9577733 lnc-TRIM59-3:1 Yes chr3R:9574484-9577733 lnc-ARL14-2:1 Yes chr3R:9574484-9577733 lnc-ARL14-1:1 No - lnc-KPNA4-1:2 Yes chr2L:7821151-7825350 lnc-NMD3-1:1 Yes chr2L:7821151-7825350 lnc-B3GALNT1-1:2 No - lnc-B3GALNT1-1:1 No - lnc-B3GALNT1-1:4 No - lnc-B3GALNT1-1:3 No - lnc-B3GALNT1-1:5 No - lnc-B3GALNT1-2:1 Yes chrX:2182818-2184668 lnc-NMD3-2:1 No - lnc-SPTSSB-3:1 No - lnc-SPTSSB-2:1 No - lnc-B3GALNT1-3:1 No - LINC02067:5 No - lnc-OTOL1-5:1 No - lnc-OTOL1-6:1 No - lnc-SPTSSB-7:1 No - lnc-OTOL1-8:1 No - lnc-OTOL1-2:2 No - lnc-OTOL1-9:1 No - LINC01192:10 No - LINC01192:9 No - lnc-OTOL1-10:1 No - lnc-OTOL1-11:1 No - lnc-SI-6:1 No - lnc-SLITRK3-2:1 No - LINC01322:4 No - lnc-SERPINI1-21:1 No - LINC01322:6 No - LINC01322:7 No - lnc-BCHE-2:1 No - lnc-BCHE-3:1 No - lnc-BCHE-4:1 No - lnc-BCHE-5:1 No - lnc-SERPINI1-19:1 No - lnc-SERPINI1-18:1 No - lnc-SERPINI1-16:1 No - lnc-ZBBX-6:2 No - lnc-ZBBX-1:4 No - lnc-ZBBX-1:3 No - lnc-WDR49-2:1 Yes chr2L:6671065-6673347 lnc-WDR49-1:1 Yes chr2L:6671065-6673347 lnc-SERPINI1-11:1 No - lnc-WDR49-3:1 Yes chr3R:15371957-15374237 lnc-WDR49-4:1 Yes chr3R:15371957-15374237 lnc-WDR49-5:1 Yes chr3R:15371957-15374237 lnc-WDR49-5:2 Yes chr3R:15371957-15374237 lnc-SERPINI1-10:1 No - lnc-SERPINI1-23:3 No - lnc-SERPINI1-23:4 No - lnc-SERPINI1-23:15 No - lnc-GOLIM4-1:1 No - lnc-SERPINI1-12:1 No - lnc-PDCD10-2:1 No - lnc-SERPINI1-17:1 No - lnc-SERPINI1-17:2 No - lnc-SERPINI1-17:4 No - lnc-SERPINI1-15:1 No - lnc-SERPINI1-17:5 No - lnc-SERPINI1-17:6 No - lnc-SERPINI1-17:7 No - lnc-SERPINI1-17:8 No - lnc-SERPINI1-17:9 No - lnc-MECOM-2:1 No - lnc-MYNN-12:1 No - lnc-MECOM-1:2 No - lnc-ACTRT3-7:1 No - lnc-ACTRT3-6:1 No - lnc-ACTRT3-5:1 No - lnc-MYNN-8:1 No - lnc-ACTRT3-2:1 No - lnc-MYNN-5:1 No - lnc-ACTRT3-3:1 Yes chr2R:7516923-7518936 lnc-ACTRT3-4:4 Yes chr3R:17627127-17629012 lnc-ACTRT3-4:3 Yes chr3R:17627127-17629012 lnc-ACTRT3-4:2 Yes chr3R:17627127-17629012 lnc-ACTRT3-4:1 Yes chr3R:17627127-17629012 lnc-SAMD7-1:1 No - lnc-LRRC31-1:6 No - lnc-LRRC31-1:8 No - lnc-LRRC31-1:7 No - lnc-SEC62-2:1 No - lnc-SEC62-2:2 No - lnc-SEC62-2:3 No - lnc-SEC62-2:4 No - lnc-SEC62-2:5 No - lnc-SEC62-2:6 No - lnc-LRRC31-2:1 Yes chrX:2115727-2123286 lnc-GPR160-1:1 Yes chrX:2115727-2123286 lnc-LRRC31-3:1 Yes chrX:2115727-2123286 lnc-LRRC31-4:1 Yes chrX:2115727-2123286 lnc-SKIL-3:1 Yes chr2L:7891187-7984196 lnc-SKIL-3:2 Yes chr2L:7891187-7984196 lnc-SKIL-3:3 Yes chr2L:7891187-7984196 lnc-SKIL-4:1 Yes chr2L:7891187-7984196 lnc-CLDN11-5:2 No - lnc-PHC3-1:2 No - lnc-RPL22L1-3:1 No - lnc-SLC7A14-2:1 No - lnc-SLC7A14-3:1 No - lnc-EIF5A2-1:1 Yes chrX:762560-765130 lnc-RPL22L1-2:1 Yes chr2R:24057798-24059483 lnc-CLDN11-3:1 No - lnc-SLC2A2-3:1 No - lnc-CLDN11-8:1 No - lnc-TNIK-3:1 Yes chr3L:914074-993788 lnc-SLC2A2-1:1 Yes chr3L:2554847-2586540 lnc-TMEM212-1:7 No - lnc-TNIK-2:1 No - lnc-TMEM212-1:2 No - lnc-PLD1-3:1 Yes chr2R:6242004-6255266 lnc-TNIK-5:1 Yes chr2R:6242004-6255266 lnc-TNIK-6:1 Yes chr2R:6242004-6255266 lnc-TNIK-7:1 Yes chr2R:6242004-6255266 lnc-PLD1-1:3 Yes chr2R:6242004-6255266 lnc-PLD1-1:2 Yes chr2R:6242004-6255266 lnc-FNDC3B-5:1 No - lnc-TMEM212-3:1 No - lnc-GHSR-2:1 Yes chr2L:16545016-16663218 lnc-TMEM212-5:2 Yes chr2L:16545016-16663218 lnc-GHSR-1:1 Yes chr2L:16545016-16663218 lnc-FNDC3B-2:1 No - lnc-FNDC3B-3:1 No - lnc-FNDC3B-4:1 No - lnc-NCEH1-2:1 No - lnc-ECT2-2:1 No - lnc-TNFSF10-5:1 No - lnc-SPATA16-4:1 No - lnc-SPATA16-3:1 No - lnc-SPATA16-2:1 No - lnc-ECT2-5:1 Yes chr3R:7570281-7639434 lnc-NAALADL2-13:1 Yes chr3R:7570281-7639434 lnc-NAALADL2-6:1 Yes chr3R:7570281-7639434 lnc-NAALADL2-4:1 Yes chr3R:7570281-7639434 lnc-SPATA16-6:1 No - lnc-NAALADL2-1:5 No - lnc-NAALADL2-1:6 No - lnc-NAALADL2-1:7 No - lnc-NAALADL2-1:8 No - lnc-NAALADL2-1:10 No - lnc-NAALADL2-1:12 No - lnc-NAALADL2-1:11 No - lnc-NLGN1-3:1 No - lnc-TBL1XR1-18:1 No - lnc-TBL1XR1-17:1 No - lnc-TBL1XR1-16:1 No - lnc-TBL1XR1-15:1 No - lnc-NAALADL2-8:1 No - lnc-TBL1XR1-6:2 No - lnc-NAALADL2-9:1 No - lnc-NAALADL2-10:1 No - lnc-TBL1XR1-14:1 No - lnc-NAALADL2-15:3 No - LINC01208:2 No - LINC01208:15 No - lnc-NAALADL2-2:2 No - lnc-NAALADL2-2:3 No - LINC01208:13 No - LINC01208:14 No - lnc-NAALADL2-14:1 No - LINC01208:6 No - lnc-TBL1XR1-11:1 No - lnc-ZMAT3-9:1 Yes chr2L:415067-418536 lnc-ZMAT3-8:1 Yes chr2L:415067-418536 LINC00578:2 No - lnc-TBL1XR1-12:1 No - LINC00578:5 No - LINC00578:14 No - LINC00578:16 No - lnc-KCNMB2-3:2 No - LINC02015:23 No - LINC02015:31 No - LINC02015:33 No - KCNMB2-AS1:4 No - KCNMB2-AS1:8 No - lnc-ZMAT3-6:1 No - lnc-ZMAT3-5:1 No - lnc-ZMAT3-4:1 No - lnc-ZNF639-4:1 No - lnc-GNB4-2:1 No - lnc-ZNF639-1:2 No - lnc-GNB4-1:1 Yes chrX:15860115-15866175 lnc-MFN1-1:2 Yes chrX:15860115-15866175 lnc-MFN1-1:3 Yes chrX:15860115-15866175 lnc-MFN1-1:4 Yes chrX:15860115-15866175 lnc-KCNMB3-3:1 Yes chrX:15860115-15866175 lnc-ACTL6A-1:1 No - lnc-MRPL47-3:1 Yes chr2R:17429353-17430963 lnc-ACTL6A-2:3 No - lnc-USP13-5:1 Yes chr3L:12137496-12138584 lnc-USP13-3:1 No - lnc-MRPL47-4:1 No - lnc-MRPL47-5:1 Yes chrX:1866832-1869061 lnc-USP13-4:1 Yes chrX:1866832-1869061 lnc-MRPL47-6:1 Yes chrX:1866832-1869061 lnc-USP13-8:3 Yes chrX:1866832-1869061 lnc-USP13-6:1 No - lnc-TTC14-10:1 No - lnc-TTC14-6:1 No - LINC02053:10 No - lnc-CCDC39-8:2 No - lnc-CCDC39-1:4 No - lnc-CCDC39-1:2 No - lnc-DNAJC19-7:1 Yes chr3R:4781120-4784722 lnc-DNAJC19-6:1 Yes chr3R:4781120-4784722 lnc-FXR1-2:1 Yes chr3R:4781120-4784722 lnc-CCDC39-2:1 Yes chr3R:10101420-10110121 lnc-TTC14-1:7 Yes chr3R:10101420-10110121 lnc-DNAJC19-5:6 Yes chrX:7407208-7407854 lnc-DNAJC19-5:7 Yes chrX:7407208-7407854 lnc-DNAJC19-5:8 Yes chrX:7407208-7407854 lnc-DNAJC19-5:5 Yes chrX:7407208-7407854 lnc-DNAJC19-5:4 Yes chrX:7407208-7407854 SOX2-OT:4 No - SOX2-OT:8 Yes chr2L:8825645-8829670 SOX2-OT:9 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-FXR1-3:1 No - SOX2-OT:11 No - SOX2-OT:14 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-DNAJC19-9:1 No - SOX2-OT:16 Yes chr2L:8825645-8829670 SOX2-OT:17 No - SOX2-OT:19 No - SOX2-OT:20 No - SOX2-OT:22 No - SOX2-OT:27 Yes chr2L:8825645-8829670 SOX2-OT:28 Yes chr2L:8825645-8829670 SOX2-OT:29 Yes chr2L:8825645-8829670 SOX2-OT:38 Yes chr2L:8825645-8829670 SOX2-OT:39 Yes chr2L:8825645-8829670 SOX2-OT:40 Yes chr2L:8825645-8829670 SOX2-OT:41 No - SOX2-OT:42 Yes chr2L:8825645-8829670 SOX2-OT:43 Yes chr2L:8825645-8829670 SOX2-OT:44 Yes chr2L:8825645-8829670 SOX2-OT:45 Yes chr2L:8825645-8829670 SOX2-OT:56 Yes chr2L:8825645-8829670 SOX2-OT:57 Yes chr2L:8825645-8829670 SOX2-OT:66 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-SOX2-4:1 No - SOX2-OT:68 No - lnc-DNAJC19-10:1 No - lnc-DNAJC19-11:1 No - LINC01206:1 No - LINC01206:2 No - LINC01206:4 No - LINC01206:20 No - lnc-SOX2-5:1 No - LINC01206:32 No - LINC01206:45 No - LINC01206:46 No - lnc-DCUN1D1-6:5 No - lnc-DCUN1D1-6:4 No - lnc-ATP11B-5:2 No - lnc-DCUN1D1-11:1 No - lnc-ATP11B-8:1 No - lnc-DCUN1D1-10:1 Yes chrX:16405509-16414651 lnc-ATP11B-6:1 No - lnc-MCCC1-2:1 No - lnc-ATP11B-7:1 No - lnc-ATP11B-13:1 Yes chr3R:31790592-31793907 lnc-DCUN1D1-8:1 Yes chr3R:31790592-31793907 lnc-LAMP3-2:1 Yes chr3R:31790592-31793907 lnc-MCF2L2-1:1 Yes chr2L:21573389-21577103 lnc-LAMP3-1:1 Yes chr2R:5468319-5495861 lnc-ATP11B-10:8 Yes chr2R:5468319-5495861 lnc-ATP11B-10:9 Yes chr2R:5468319-5495861 lnc-ATP11B-10:10 Yes chr2R:5468319-5495861 lnc-ATP11B-10:11 Yes chr2R:5468319-5495861 lnc-ATP11B-10:12 Yes chr2R:5468319-5495861 lnc-LAMP3-3:1 Yes chr2R:5468319-5495861 lnc-KLHL24-10:2 Yes chr2R:5468319-5495861 lnc-B3GNT5-11:10 No - lnc-B3GNT5-11:11 No - lnc-B3GNT5-11:14 No - lnc-B3GNT5-11:16 No - lnc-B3GNT5-11:17 No - lnc-KLHL6-1:1 No - lnc-KLHL24-2:1 No - lnc-YEATS2-1:1 No - lnc-YEATS2-1:2 No - YEATS2-AS1:6 Yes chr2L:8434058-8437365 lnc-PARL-2:1 Yes chr2R:11986513-11988787 lnc-MAP6D1-2:1 No - lnc-PARL-1:1 No - lnc-HTR3E-1:1 No - lnc-ABCC5-3:4 No - lnc-ALG3-1:1 No - lnc-CAMK2N2-4:2 Yes chr2R:23705439-23709792 lnc-CAMK2N2-4:1 Yes chr2R:23705439-23709792 lnc-CAMK2N2-3:3 Yes chr2R:23705439-23709792 lnc-CAMK2N2-1:1 Yes chrX:19961297-19969323 lnc-THPO-3:1 Yes chr3R:11797244-11813207 lnc-THPO-2:1 Yes chr3R:11797244-11813207 lnc-FAM131A-2:1 Yes chr3L:21728932-21729694 lnc-CLCN2-1:2 No - lnc-CLCN2-1:1 No - lnc-CHRD-1:2 No - lnc-CHRD-2:1 No - lnc-CHRD-10:2 No - lnc-VPS8-1:2 No - lnc-EPHB3-5:1 Yes chr3L:6491230-6495297 lnc-EPHB3-5:2 Yes chr3L:6491230-6495297 lnc-EPHB3-5:3 Yes chr3L:6491230-6495297 lnc-MAP3K13-7:1 Yes chr3L:6491230-6495297 lnc-C3orf70-1:1 No - lnc-C3orf70-2:1 No - lnc-EHHADH-1:2 No - lnc-EHHADH-1:1 No - lnc-EHHADH-2:1 Yes chr3L:19624406-19635783 lnc-LIPH-2:1 No - lnc-LIPH-2:3 No - lnc-LIPH-2:2 No - lnc-LIPH-1:1 No - lnc-MAP3K13-3:1 No - lnc-MAP3K13-9:1 Yes chr2L:7529-9484 lnc-LIPH-3:1 Yes chrX:10787869-10824277 lnc-LIPH-4:1 Yes chrX:10787869-10824277 lnc-TRA2B-2:1 Yes chrX:10787869-10824277 IGF2BP2-AS1:1 Yes chrX:10787869-10824277 IGF2BP2-AS1:4 Yes chrX:10787869-10824277 IGF2BP2-AS1:5 Yes chrX:10787869-10824277 lnc-IGF2BP2-1:5 Yes chr2R:14602004-14604337 lnc-IGF2BP2-1:6 Yes chr2R:14602004-14604337 lnc-IGF2BP2-1:1 Yes chr2R:14602004-14604337 lnc-IGF2BP2-1:4 Yes chr2R:14602004-14604337 lnc-IGF2BP2-1:3 Yes chr2R:14602004-14604337 lnc-IGF2BP2-1:2 Yes chr2R:14602004-14604337 lnc-SENP2-10:1 No - lnc-SENP2-10:2 No - lnc-SENP2-11:1 No - lnc-TRA2B-1:1 No - lnc-DGKG-1:2 No - lnc-DGKG-1:3 Yes chr3R:24788054-24797955 lnc-DGKG-1:1 No - lnc-ETV5-1:1 Yes chr2R:7834812-7885982 lnc-ETV5-2:1 Yes chr2R:7834812-7885982 lnc-ETV5-3:1 Yes chr2R:7834812-7885982 lnc-ETV5-4:1 Yes chr2R:7834812-7885982 lnc-ETV5-5:1 Yes chr2R:7834812-7885982 LINC02020:23 No - LINC02052:14 No - LINC02052:19 No - lnc-CRYGS-2:1 No - lnc-TBCCD1-2:1 No - lnc-TBCCD1-4:61 No - lnc-TBCCD1-4:60 No - lnc-TBCCD1-4:62 No - lnc-HRG-2:1 No - lnc-KNG1-1:1 No - lnc-TBCCD1-4:52 No - lnc-TBCCD1-4:11 No - lnc-TBCCD1-4:14 No - lnc-TBCCD1-4:9 No - lnc-EIF4A2-3:1 No - lnc-EIF4A2-2:1 No - lnc-RFC4-1:2 Yes chr2L:5981764-5985909 lnc-TBCCD1-5:1 Yes chrX:17843343-17844704 LINC02043:13 No - lnc-ADIPOQ-1:1 No - ADIPOQ-AS1:1 No - lnc-RFC4-7:1 No - lnc-ADIPOQ-3:1 Yes chr2R:24691422-24694386 lnc-ADIPOQ-3:2 Yes chr2R:24691422-24694386 lnc-ADIPOQ-3:3 Yes chr2R:24691422-24694386 lnc-ADIPOQ-2:1 Yes chr2R:24691422-24694386 lnc-ADIPOQ-3:4 Yes chr2R:24691422-24694386 lnc-RPL39L-2:1 Yes chr2R:24691422-24694386 lnc-ADIPOQ-4:1 Yes chr2R:24691422-24694386 lnc-RPL39L-1:2 No - lnc-RTP4-3:1 No - LINC02041:8 No - lnc-RTP2-1:3 No - lnc-RTP2-1:1 No - lnc-RTP2-1:2 No - lnc-LPP-9:1 No - lnc-LPP-1:2 No - LPP-AS2:1 Yes chr4:1057365-1065001 lnc-LPP-2:1 Yes chr4:1057365-1065001 lnc-LPP-2:2 Yes chr4:1057365-1065001 lnc-LPP-4:1 No - lnc-LPP-6:1 No - lnc-LPP-6:2 No - lnc-LPP-6:3 No - lnc-LPP-6:4 No - lnc-LPP-6:5 No - lnc-LPP-6:6 No - lnc-TP63-1:1 No - lnc-CLDN1-2:1 No - lnc-CLDN1-1:1 No - lnc-CLDN16-6:1 No - P3H2-AS1:2 No - lnc-TMEM207-2:1 No - lnc-CLDN16-4:1 No - lnc-CLDN16-5:1 No - lnc-CLDN16-7:1 No - lnc-CLDN16-8:1 No - lnc-IL1RAP-2:1 No - lnc-GMNC-4:1 No - lnc-GMNC-5:1 No - lnc-GMNC-5:2 No - lnc-PYDC2-7:1 No - lnc-PYDC2-5:1 No - lnc-PYDC2-1:13 No - lnc-PYDC2-1:6 No - lnc-PYDC2-1:7 No - lnc-PYDC2-1:8 No - lnc-FGF12-1:2 No - lnc-PYDC2-2:2 No - lnc-FGF12-3:1 No - lnc-PYDC2-3:4 No - lnc-PYDC2-9:1 No - lnc-HRASLS-8:1 No - lnc-HRASLS-8:2 No - lnc-MB21D2-1:2 No - lnc-MB21D2-1:1 No - lnc-HRASLS-4:1 No - lnc-ATP13A4-6:1 Yes chr4:132220-143123 lnc-ATP13A5-2:1 Yes chr4:132220-143123 lnc-ATP13A4-5:1 Yes chr4:132220-143123 lnc-ATP13A4-5:3 Yes chr4:132220-143123 lnc-ATP13A4-5:2 Yes chr4:132220-143123 OPA1-AS1:3 Yes chr2R:14230611-14235449 lnc-ATP13A4-7:1 No - lnc-OPA1-3:1 No - lnc-ATP13A4-8:1 No - lnc-OPA1-4:1 No - lnc-OPA1-2:2 No - LINC02038:6 No - lnc-CPN2-6:2 No - lnc-HES1-8:1 No - lnc-CPN2-4:21 No - lnc-CPN2-4:6 No - lnc-CPN2-4:26 No - lnc-CPN2-4:25 No - lnc-CPN2-4:20 No - lnc-CPN2-4:24 No - lnc-CPN2-4:22 No - lnc-CPN2-4:19 No - lnc-CPN2-4:18 No - lnc-CPN2-4:23 No - lnc-CPN2-4:7 No - lnc-CPN2-4:14 No - lnc-CPN2-4:13 No - lnc-CPN2-4:16 No - lnc-CPN2-4:10 No - lnc-CPN2-4:15 No - lnc-HES1-2:8 No - lnc-CPN2-3:2 No - lnc-HES1-6:1 No - lnc-HES1-7:1 No - LINC02037:8 No - LINC02037:9 No - LINC00887:3 No - lnc-HES1-9:1 No - lnc-GP5-1:1 Yes chr4:132220-143123 lnc-GP5-2:1 Yes chr4:132220-143123 lnc-GP5-3:1 Yes chr4:132220-143123 lnc-GP5-4:1 Yes chr4:132220-143123 LINC00884:1 Yes chr4:132220-143123 LINC00884:2 Yes chr4:132220-143123 LINC00884:3 Yes chr4:132220-143123 LINC00884:6 Yes chr4:132220-143123 lnc-TMEM44-2:1 No - TMEM44-AS1:1 No - TMEM44-AS1:3 No - TMEM44-AS1:4 No - TMEM44-AS1:6 No - TMEM44-AS1:7 No - TMEM44-AS1:8 No - lnc-LSG1-4:2 No - lnc-LSG1-4:1 No - TMEM44-AS1:10 No - TMEM44-AS1:13 No - lnc-TMEM44-1:1 Yes chrX:1461844-1464220 lnc-TMEM44-3:1 Yes chrX:1461844-1464220 lnc-FAM43A-10:2 Yes chr3R:9591309-9625073 lnc-FAM43A-3:5 No - lnc-FAM43A-3:6 No - lnc-FAM43A-5:2 No - lnc-LSG1-2:2 No - lnc-ACAP2-4:2 Yes chr2R:24022343-24023981 lnc-ACAP2-4:4 Yes chr2R:24022343-24023981 lnc-ACAP2-3:1 Yes chr2R:24022343-24023981 lnc-ACAP2-2:1 Yes chr2R:24022343-24023981 XXYLT1-AS2:2 Yes chr2R:24022343-24023981 XXYLT1-AS2:3 Yes chr2R:24022343-24023981 lnc-ACAP2-4:3 Yes chr2R:24022343-24023981 lnc-ACAP2-4:1 Yes chr2R:24022343-24023981 lnc-XXYLT1-2:1 Yes chr3R:23118400-23124217 lnc-XXYLT1-3:1 Yes chr3R:23118400-23124217 lnc-XXYLT1-7:1 Yes chr3R:23118400-23124217 lnc-MUC20-11:1 Yes chr3R:23118400-23124217 lnc-PPP1R2-2:1 Yes chr3R:23118400-23124217 lnc-APOD-3:1 Yes chr2L:17291075-17292202 lnc-MUC20-2:13 No - lnc-APOD-2:1 No - lnc-MUC20-70:1 No - lnc-APOD-4:1 No - lnc-APOD-5:1 No - lnc-APOD-6:3 No - lnc-APOD-6:2 No - lnc-APOD-6:1 No - lnc-MUC20-67:9 No - lnc-MUC20-67:11 No - lnc-MUC20-67:20 No - lnc-MUC20-67:27 No - lnc-MUC20-67:38 No - lnc-MUC20-67:39 No - lnc-MUC20-67:40 No - lnc-MUC20-67:43 No - lnc-MUC20-67:48 No - lnc-MUC20-67:73 No - lnc-MUC20-67:74 No - lnc-MUC20-67:77 No - lnc-MUC20-67:80 No - lnc-MUC20-67:83 No - lnc-MUC20-67:84 No - lnc-MUC20-67:85 No - lnc-MUC20-67:93 No - lnc-MUC20-67:94 No - lnc-MUC20-67:95 No - lnc-MUC20-67:96 No - lnc-MUC20-67:97 No - lnc-MUC20-67:137 No - lnc-MUC20-67:139 No - lnc-MUC20-67:140 No - lnc-MUC4-2:2 No - lnc-MUC20-67:143 No - lnc-MUC20-67:144 No - lnc-MUC20-67:145 No - lnc-MUC4-2:3 No - lnc-MUC4-2:1 No - lnc-MUC4-1:10 No - lnc-MUC4-1:13 No - lnc-MUC4-1:9 No - lnc-MUC4-1:1 No - lnc-MUC4-1:7 No - lnc-MUC4-1:4 No - lnc-MUC4-1:12 No - lnc-MUC4-1:5 No - lnc-MUC4-1:6 No - lnc-MUC4-1:11 No - lnc-MUC4-1:8 No - lnc-MUC4-1:3 No - lnc-MUC4-1:2 No - lnc-MUC20-67:148 No - lnc-TNK2-12:1 No - lnc-TNK2-10:1 No - lnc-TNK2-9:1 No - lnc-TNK2-8:1 No - lnc-MUC4-3:4 Yes chr3L:4108186-4114157 lnc-MUC4-3:2 Yes chr3L:4108186-4114157 lnc-MUC4-3:3 Yes chr3L:4108186-4114157 lnc-MUC4-3:1 Yes chr3L:4108186-4114157 lnc-MUC20-4:3 No - lnc-TNK2-4:1 No - lnc-MUC20-8:1 No - lnc-TNK2-5:1 No - lnc-TNK2-2:3 No - lnc-TNK2-2:9 No - lnc-TNK2-2:6 No - lnc-TNK2-2:10 No - lnc-TNK2-2:2 No - lnc-MUC20-9:1 No - lnc-TNK2-7:7 No - lnc-TNK2-7:8 No - lnc-TNK2-7:6 No - lnc-TNK2-7:5 No - lnc-TFRC-7:3 No - lnc-TFRC-7:2 No - lnc-TFRC-7:1 No - lnc-TNK2-2:4 No - lnc-SLC51A-13:1 No - lnc-SLC51A-12:1 No - lnc-TNK2-13:1 No - lnc-ZDHHC19-1:2 No - lnc-ZDHHC19-1:3 No - lnc-ZDHHC19-1:1 No - LINC00885:2 No - lnc-SLC51A-9:1 No - lnc-PCYT1A-3:2 No - lnc-PCYT1A-3:1 No - lnc-PCYT1A-1:1 No - lnc-FBXO45-8:5 No - lnc-ZDHHC19-3:1 No - lnc-ZDHHC19-2:1 No - lnc-TCTEX1D2-1:2 No - lnc-TCTEX1D2-1:1 No - lnc-TCTEX1D2-1:3 No - lnc-TCTEX1D2-2:4 No - lnc-TCTEX1D2-2:5 No - lnc-TM4SF19-TCTEX1D2-4:2 No - lnc-TM4SF19-1:1 Yes chr2L:4979513-4981592 lnc-SLC51A-11:1 Yes chr2L:4979513-4981592 lnc-RNF168-1:1 Yes chr2L:4979513-4981592 lnc-FBXO45-7:1 Yes chr2L:4979513-4981592 lnc-FBXO45-6:1 No - lnc-FBXO45-5:1 No - lnc-FBXO45-4:1 No - lnc-SMCO1-2:1 No - lnc-SMCO1-2:2 No - lnc-SMCO1-1:1 No - lnc-WDR53-2:1 No - lnc-PAK2-2:1 No - lnc-NCBP2-AS2-1:3 No - lnc-PIGZ-1:1 Yes chr2R:24411870-24415295 lnc-NCBP2-AS2-5:1 No - lnc-NCBP2-AS2-6:2 No - lnc-MELTF-1:1 No - lnc-PIGZ-2:1 Yes chrX:18387084-18390344 lnc-PIGZ-2:2 Yes chrX:18387084-18390344 lnc-DLG1-2:1 Yes chrX:18387084-18390344 lnc-DLG1-1:2 Yes chrX:18387084-18390344 lnc-DLG1-1:1 Yes chrX:18387084-18390344 lnc-MELTF-2:1 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-MELTF-4:1 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-BDH1-9:1 Yes chrX:11369665-11409776 DLG1-AS1:1 Yes chrX:11369665-11409776 DLG1-AS1:5 No - lnc-FYTTD1-8:1 No - LINC02012:4 No - lnc-RUBCN-10:1 Yes chr2R:12064565-12079543 lnc-RUBCN-9:1 Yes chr2R:12064565-12079543 lnc-RUBCN-8:1 Yes chr2R:12064565-12079543 lnc-RUBCN-8:2 Yes chr2R:12064565-12079543 lnc-RUBCN-6:1 Yes chr2R:12064565-12079543 lnc-BDH1-5:7 No - lnc-BDH1-4:1 No - lnc-BDH1-5:11 No - lnc-BDH1-5:3 No - lnc-BDH1-5:8 No - lnc-BDH1-5:10 No - lnc-BDH1-5:9 No - lnc-FYTTD1-7:1 No - lnc-BDH1-5:2 No - lnc-BDH1-5:5 No - lnc-BDH1-5:6 No - lnc-BDH1-5:4 No - lnc-FYTTD1-6:2 No - lnc-RUBCN-2:10 No - lnc-RUBCN-2:5 No - lnc-FYTTD1-5:1 No - lnc-FYTTD1-6:3 No - lnc-RUBCN-2:3 No - lnc-BDH1-8:1 Yes chrX:8677063-8680912 lnc-IQCG-12:1 No - lnc-LRCH3-1:1 No - lnc-RPL35A-2:1 Yes chr2L:17367511-17384115 lnc-IQCG-6:2 Yes chr2L:17367511-17384115 lnc-IQCG-6:1 Yes chr2L:17367511-17384115 lnc-RUBCN-11:1 No - lnc-RUBCN-12:1 No - lnc-IQCG-5:1 No - lnc-IQCG-5:3 No - lnc-IQCG-5:2 No - lnc-IQCG-10:1 Yes chr3R:10144668-10159134 LMLN-AS1:3 Yes chr3R:10144668-10159134 lnc-IQCG-11:2 No - lnc-LMLN-2:5 No - lnc-LMLN-2:6 No - lnc-LMLN-2:7 No - lnc-LMLN-2:8 No - lnc-IQCG-14:1 No - lnc-LMLN-1:5 No - lnc-LMLN-4:2 No - lnc-LMLN-3:3 No - lnc-IQCG-16:1 No - lnc-ZNF732-9:4 No - lnc-ZNF732-9:1 No - lnc-ZNF732-9:3 No - lnc-ZNF732-8:1 No - lnc-ZNF732-6:1 No - lnc-ZNF732-4:1 No - lnc-ZNF732-2:1 No - lnc-ZNF732-1:1 No - lnc-ZNF732-10:2 No - lnc-ZNF732-10:1 No - lnc-ZNF732-3:2 No - lnc-ZNF732-5:1 No - lnc-ZNF141-2:1 No - lnc-ZNF721-1:1 No - lnc-ZNF721-1:6 No - lnc-ZNF721-1:5 No - lnc-ZNF721-1:4 No - lnc-ZNF721-1:3 No - lnc-ZNF721-1:2 No - lnc-ZNF721-3:1 Yes chr2R:7519280-7522541 lnc-PDE6B-1:11 No - lnc-PDE6B-1:12 No - lnc-PDE6B-1:13 No - lnc-PDE6B-1:15 No - lnc-PDE6B-1:16 No - lnc-PDE6B-1:17 No - lnc-PDE6B-3:1 No - lnc-ATP5ME-1:24 No - lnc-ATP5ME-1:23 No - lnc-ATP5ME-1:20 No - lnc-ATP5ME-1:22 No - lnc-ATP5ME-1:21 No - lnc-ATP5ME-1:15 No - lnc-ATP5ME-1:16 No - lnc-ATP5ME-1:1 No - lnc-ATP5ME-2:1 No - lnc-ATP5ME-2:5 No - lnc-ATP5ME-2:2 No - lnc-ATP5ME-2:3 No - lnc-ATP5ME-2:4 No - lnc-ATP5ME-2:6 No - lnc-PDE6B-2:1 Yes chr3R:30171438-30174551 lnc-PDE6B-2:2 Yes chr3R:30171438-30174551 lnc-ATP5ME-3:1 No - lnc-ATP5ME-4:1 No - lnc-MYL5-2:1 Yes chr3L:16588475-16590132 lnc-SLC49A3-1:2 Yes chr3L:16588475-16590132 lnc-MYL5-3:1 Yes chr3L:16588475-16590132 lnc-CPLX1-2:10 Yes chr3L:16588475-16590132 lnc-CPLX1-2:9 Yes chr3L:16588475-16590132 lnc-CPLX1-2:8 No - lnc-CPLX1-2:7 No - lnc-CPLX1-2:6 No - lnc-PCGF3-1:1 No - lnc-PCGF3-1:2 No - lnc-PCGF3-3:1 No - lnc-CPLX1-10:1 Yes chr3R:4211783-4227518 lnc-CPLX1-12:1 Yes chr3R:4211783-4227518 lnc-DGKQ-2:1 Yes chr3R:4211783-4227518 lnc-DGKQ-2:2 Yes chr3R:4211783-4227518 lnc-DGKQ-1:1 No - lnc-FGFRL1-5:1 Yes chr3R:21870681-21873640 lnc-RNF212-3:2 Yes chr3R:21870681-21873640 lnc-RNF212-3:1 Yes chr3R:21870681-21873640 lnc-RNF212-3:3 Yes chr3R:21870681-21873640 lnc-RNF212-1:4 No - lnc-RNF212-1:1 No - lnc-RNF212-1:2 No - lnc-RNF212-1:3 No - lnc-SLC26A1-1:1 No - lnc-FGFRL1-7:1 No - lnc-SPON2-4:4 No - lnc-SPON2-4:1 No - lnc-SPON2-4:3 No - lnc-SPON2-4:2 No - lnc-RNF212-2:3 No - lnc-RNF212-2:1 No - lnc-RNF212-2:2 No - lnc-FGFRL1-8:2 No - lnc-SPON2-1:14 Yes chr2R:14671396-14713622 lnc-SPON2-1:13 Yes chr2R:14671396-14713622 lnc-SPON2-1:3 Yes chr2R:14671396-14713622 lnc-SPON2-1:6 Yes chr2R:14671396-14713622 lnc-MAEA-5:1 Yes chr2R:14671396-14713622 lnc-SPON2-1:11 Yes chr2R:14671396-14713622 lnc-SPON2-1:2 Yes chr2R:14671396-14713622 lnc-SPON2-1:10 Yes chr2R:14671396-14713622 lnc-SPON2-1:4 Yes chr2R:14671396-14713622 lnc-SPON2-1:7 Yes chr2R:14671396-14713622 lnc-SPON2-1:9 Yes chr2R:14671396-14713622 lnc-SPON2-1:8 Yes chr2R:14671396-14713622 lnc-SPON2-1:5 Yes chr2R:14671396-14713622 lnc-SPON2-5:1 Yes chr3R:13011649-13026275 lnc-SPON2-3:1 Yes chr3R:13011649-13026275 CTBP1-DT:23 Yes chr3R:13011649-13026275 CTBP1-DT:25 Yes chr3R:13011649-13026275 CTBP1-DT:26 Yes chr3R:13011649-13026275 lnc-UVSSA-4:1 Yes chr3R:24828279-24829959 lnc-NKX1-1-4:1 No - lnc-MAEA-1:2 No - lnc-MAEA-1:3 No - lnc-NKX1-1-3:1 No - lnc-NKX1-1-2:1 No - lnc-NKX1-1-1:1 No - lnc-NKX1-1-1:2 No - lnc-NKX1-1-5:1 No - lnc-TACC3-4:1 No - lnc-TACC3-4:2 No - lnc-FAM53A-1:4 No - lnc-SLBP-1:1 No - lnc-TACC3-2:1 No - lnc-TACC3-1:1 No - lnc-TMEM129-1:1 No - lnc-TMEM129-2:1 Yes chr2R:24509508-24515320 lnc-TMEM129-3:1 Yes chr2R:24509508-24515320 lnc-LETM1-1:1 No - lnc-NELFA-2:1 Yes chr3R:27932982-27937853 lnc-POLN-3:1 Yes chr3R:21223704-21229512 lnc-NELFA-1:1 No - lnc-NELFA-3:1 Yes chr3R:12705523-12712299 lnc-NELFA-3:2 Yes chr3R:12705523-12712299 lnc-NELFA-4:1 Yes chr3R:12705523-12712299 lnc-NELFA-5:1 Yes chr3R:12705523-12712299 lnc-NELFA-6:1 Yes chr3R:12705523-12712299 lnc-HAUS3-1:1 Yes chr3R:12705523-12712299 lnc-NAT8L-2:1 No - lnc-MXD4-1:1 Yes chr3R:27124759-27151069 lnc-MXD4-2:1 Yes chr3R:27124759-27151069 lnc-CFAP99-7:1 Yes chr3R:27124759-27151069 lnc-MXD4-3:1 Yes chr3R:27124759-27151069 lnc-ZFYVE28-1:1 No - lnc-TNIP2-2:1 No - lnc-RNF4-1:1 No - lnc-MFSD10-1:1 No - lnc-SH3BP2-1:2 No - lnc-SH3BP2-1:3 No - lnc-ADD1-6:1 No - lnc-TNIP2-1:1 No - lnc-SH3BP2-2:1 Yes chr2R:19397032-19424903 lnc-SH3BP2-2:3 Yes chr2R:19397032-19424903 lnc-GRK4-2:7 Yes chr2R:19397032-19424903 lnc-NOP14-4:1 Yes chr3R:21108446-21110834 NOP14-AS1:4 No - lnc-ADD1-5:1 Yes chr3R:31405245-31457873 lnc-GRK4-1:1 No - lnc-HTT-1:1 No - lnc-NOP14-5:1 No - lnc-NOP14-6:1 No - HTT-AS:2 No - lnc-NOP14-7:1 No - lnc-LRPAP1-8:1 No - lnc-MSANTD1-3:1 No - lnc-MSANTD1-3:2 No - lnc-MSANTD1-4:1 No - lnc-MSANTD1-4:2 No - lnc-LRPAP1-7:1 No - lnc-NOP14-3:4 Yes chr3R:9791483-9793098 lnc-NOP14-3:5 Yes chr3R:9791483-9793098 lnc-NOP14-8:1 Yes chr3R:9791483-9793098 lnc-DOK7-2:1 No - lnc-DOK7-2:2 No - lnc-LRPAP1-5:1 No - lnc-OTOP1-7:1 No - lnc-ADRA2C-1:1 No - lnc-OTOP1-6:4 No - lnc-OTOP1-6:11 No - lnc-OTOP1-6:1 No - lnc-ADRA2C-2:1 No - lnc-OTOP1-6:5 No - lnc-OTOP1-6:3 No - lnc-OTOP1-6:7 No - lnc-OTOP1-6:6 No - lnc-OTOP1-6:9 No - lnc-OTOP1-6:10 No - lnc-OTOP1-6:8 No - lnc-OTOP1-5:1 No - lnc-OTOP1-4:1 No - lnc-OTOP1-3:1 No - lnc-OTOP1-2:1 No - lnc-OTOP1-1:1 No - lnc-LYAR-2:1 Yes chr2R:10310113-10311143 lnc-ZBTB49-3:2 No - lnc-LYAR-3:1 No - lnc-LYAR-3:3 Yes chr3R:24623802-24625562 lnc-LYAR-3:2 Yes chr3R:24623802-24625562 lnc-LYAR-3:4 Yes chr3R:24623802-24625562 STX18-AS1:1 Yes chr3R:24623802-24625562 STX18-AS1:3 Yes chr3R:24623802-24625562 lnc-STX18-1:9 No - lnc-STX18-1:10 No - STX18-AS1:21 No - lnc-STX18-1:8 No - lnc-MSX1-4:1 No - lnc-CYTL1-4:1 No - lnc-MSX1-1:2 No - lnc-STK32B-2:1 No - lnc-CYTL1-2:1 Yes chr3R:4407227-4419578 lnc-CYTL1-5:2 Yes chr3R:4407227-4419578 lnc-CYTL1-5:1 Yes chr3R:4407227-4419578 lnc-EVC2-1:1 Yes chr3R:4407227-4419578 LINC01587:7 No - lnc-C4orf50-2:1 No - lnc-EVC-3:1 No - lnc-WFS1-3:2 No - lnc-WFS1-3:3 No - lnc-WFS1-3:5 No - lnc-WFS1-3:6 No - lnc-WFS1-3:7 No - lnc-WFS1-3:16 No - lnc-PPP2R2C-1:3 Yes chr3R:22687542-22690380 lnc-PPP2R2C-1:2 No - lnc-JAKMIP1-1:1 Yes chr3R:10126129-10139772 lnc-MRFAP1-1:1 No - lnc-MRFAP1-2:6 No - LINC02482:24 No - LINC02482:25 No - lnc-MRFAP1L1-3:1 No - lnc-MRFAP1L1-4:1 No - lnc-KIAA0232-2:1 No - lnc-CCDC96-4:1 No - lnc-CCDC96-3:1 No - lnc-KIAA0232-3:1 No - lnc-CCDC96-2:1 No - lnc-TADA2B-3:1 No - lnc-TADA2B-2:1 No - LINC02447:16 No - lnc-GRPEL1-4:1 No - lnc-GRPEL1-2:2 No - lnc-GRPEL1-5:1 No - lnc-TADA2B-4:1 No - lnc-PSAPL1-1:1 No - lnc-SORCS2-2:1 No - lnc-AFAP1-1:1 Yes chr3R:9694386-9705417 lnc-AFAP1-2:1 Yes chr3R:9694386-9705417 lnc-ABLIM2-2:1 Yes chr3R:9694386-9705417 LINC02517:8 No - lnc-ACOX3-1:3 No - lnc-HTRA3-4:1 No - lnc-ACOX3-5:1 No - lnc-ABLIM2-4:1 Yes chr2L:19390370-19398493 lnc-TRMT44-2:1 No - lnc-ACOX3-6:1 Yes chr3R:9553696-9555408 lnc-TRMT44-1:3 No - lnc-GPR78-1:2 No - lnc-GPR78-1:3 No - lnc-HMX1-1:3 No - lnc-HMX1-1:2 No - lnc-FAM90A26-1:1 No - lnc-HMX1-2:1 No - lnc-HMX1-5:4 No - lnc-HMX1-5:3 No - lnc-HMX1-5:5 No - lnc-HMX1-5:6 No - lnc-USP17L30-2:1 No - lnc-DEFB131A-2:1 No - lnc-DEFB131A-3:1 No - lnc-DEFB131A-4:1 No - lnc-SLC2A9-7:1 No - lnc-DRD5-16:1 No - lnc-DRD5-14:1 No - lnc-DRD5-13:1 Yes chr2R:8087396-8089297 lnc-WDR1-12:1 Yes chr2R:8087396-8089297 lnc-WDR1-8:1 Yes chr2R:8087396-8089297 lnc-WDR1-8:2 Yes chr2R:8087396-8089297 lnc-WDR1-5:1 Yes chr2R:8087396-8089297 lnc-WDR1-3:1 Yes chr2R:8087396-8089297 lnc-WDR1-3:3 Yes chr2R:8087396-8089297 lnc-WDR1-3:2 Yes chr2R:8087396-8089297 lnc-SLC2A9-3:1 Yes chr3L:13412843-13416453 lnc-SLC2A9-4:1 Yes chr3L:13412843-13416453 lnc-SLC2A9-5:1 Yes chr3L:13412843-13416453 lnc-SLC2A9-5:2 Yes chr3L:13412843-13416453 lnc-WDR1-2:1 No - lnc-WDR1-4:1 No - lnc-WDR1-6:1 No - lnc-WDR1-7:1 No - lnc-WDR1-9:1 No - lnc-WDR1-10:1 No - lnc-WDR1-11:1 No - lnc-ZNF518B-3:1 No - lnc-ZNF518B-4:1 No - lnc-DRD5-4:2 No - lnc-DRD5-4:11 No - lnc-ZNF518B-1:1 No - lnc-DRD5-20:1 No - lnc-DRD5-19:1 No - lnc-ZNF518B-2:3 No - lnc-ZNF518B-2:2 No - lnc-ZNF518B-2:4 No - lnc-CLNK-1:1 No - lnc-DRD5-21:1 No - lnc-DRD5-5:2 No - LINC02498:12 No - lnc-DRD5-23:2 No - lnc-DRD5-10:24 No - lnc-DRD5-25:1 No - lnc-DRD5-10:16 No - lnc-DRD5-10:17 No - lnc-DRD5-10:18 No - lnc-DRD5-26:1 No - lnc-RAB28-4:2 No - lnc-CPEB2-15:1 No - lnc-RAB28-7:1 No - lnc-CPEB2-14:1 No - lnc-RAB28-5:1 No - lnc-NKX3-2-3:1 No - LINC01096:2 No - LINC01096:1 No - lnc-BOD1L1-4:1 No - lnc-CPEB2-18:4 No - lnc-CPEB2-18:5 No - lnc-CPEB2-18:7 No - lnc-CPEB2-10:1 No - lnc-BOD1L1-6:1 No - LINC00504:8 No - lnc-BOD1L1-7:1 No - lnc-FBXL5-13:1 No - lnc-FBXL5-12:1 No - CPEB2-DT:27 No - lnc-FBXL5-11:1 No - lnc-CPEB2-9:1 No - lnc-CC2D2A-1:1 No - lnc-FBXL5-10:1 Yes chr2R:17539322-17544353 lnc-FBXL5-5:1 No - lnc-BST1-2:1 No - lnc-BST1-2:2 No - lnc-BST1-2:3 No - lnc-BST1-2:4 No - lnc-BST1-1:1 No - lnc-FBXL5-9:1 No - lnc-FGFBP1-2:1 No - lnc-CD38-4:1 No - lnc-FGFBP2-1:2 No - lnc-CD38-5:1 No - lnc-FGFBP2-1:1 No - lnc-FGFBP2-2:1 Yes chr3L:3114450-3127724 lnc-TAPT1-2:3 Yes chr3L:3114450-3127724 lnc-TAPT1-2:4 Yes chr3L:3114450-3127724 lnc-TAPT1-2:1 Yes chr3L:3114450-3127724 lnc-TAPT1-2:5 Yes chr3L:3114450-3127724 lnc-TAPT1-2:2 Yes chr3L:3114450-3127724 lnc-TAPT1-2:6 Yes chr3L:3114450-3127724 lnc-PROM1-2:1 Yes chr3R:18161392-18164397 lnc-PROM1-3:1 Yes chr3R:18161392-18164397 lnc-PROM1-4:5 Yes chr3R:18161392-18164397 lnc-PROM1-4:6 Yes chr3R:18161392-18164397 lnc-PROM1-4:3 Yes chr3R:18161392-18164397 lnc-PROM1-4:4 Yes chr3R:18161392-18164397 lnc-PROM1-4:1 Yes chr3R:18161392-18164397 lnc-PROM1-4:2 Yes chr3R:18161392-18164397 TAPT1-AS1:2 Yes chr3R:18161392-18164397 TAPT1-AS1:3 Yes chr3R:18161392-18164397 TAPT1-AS1:7 No - lnc-TAPT1-1:1 No - TAPT1-AS1:18 No - lnc-CD38-7:1 No - TAPT1-AS1:9 No - lnc-LDB2-4:2 No - lnc-LDB2-4:1 No - lnc-CD38-3:3 No - lnc-CD38-3:6 No - lnc-TAPT1-4:1 No - lnc-TAPT1-6:1 No - lnc-QDPR-5:1 No - lnc-CLRN2-5:1 No - lnc-LDB2-3:1 No - lnc-CLRN2-4:1 No - lnc-QDPR-3:1 No - lnc-QDPR-1:2 Yes chr3L:9134560-9135916 lnc-FAM184B-3:1 Yes chr3L:9134560-9135916 lnc-QDPR-4:1 No - lnc-FAM184B-2:1 Yes chr3L:8619888-8622091 lnc-LAP3-1:2 No - lnc-LAP3-1:3 No - lnc-DCAF16-1:1 No - lnc-DCAF16-1:2 No - lnc-DCAF16-2:1 Yes chr3R:21949114-22014539 lnc-KCNIP4-4:1 No - lnc-ADGRA3-5:1 Yes chrX:11219379-11302783 lnc-ADGRA3-4:2 Yes chrX:11219379-11302783 lnc-ADGRA3-4:1 Yes chrX:11219379-11302783 KCNIP4-IT1:2 Yes chrX:11219379-11302783 KCNIP4-IT1:3 Yes chrX:11219379-11302783 lnc-PACRGL-5:2 No - lnc-ADGRA3-107:1 No - lnc-PACRGL-8:1 Yes chr2L:14029262-14031539 lnc-KCNIP4-2:2 Yes chr2L:14029262-14031539 lnc-KCNIP4-2:1 Yes chr2L:14029262-14031539 lnc-KCNIP4-3:2 Yes chr2L:14029262-14031539 lnc-KCNIP4-3:3 Yes chr2L:14029262-14031539 lnc-KCNIP4-3:1 Yes chr2L:14029262-14031539 lnc-PACRGL-9:1 No - lnc-PACRGL-10:1 No - lnc-PACRGL-11:4 No - lnc-SOD3-13:1 No - lnc-SOD3-6:4 No - lnc-SOD3-5:2 No - lnc-PPARGC1A-2:2 No - lnc-PPARGC1A-6:1 No - lnc-PPARGC1A-1:3 No - lnc-PPARGC1A-4:9 Yes chr3R:4422483-4429335 lnc-PPARGC1A-4:7 Yes chr3R:4422483-4429335 lnc-PPARGC1A-4:3 Yes chr3R:4422483-4429335 lnc-PPARGC1A-4:4 Yes chr3R:4422483-4429335 lnc-PPARGC1A-4:5 Yes chr3R:4422483-4429335 lnc-PPARGC1A-4:6 Yes chr3R:4422483-4429335 lnc-PPARGC1A-4:8 Yes chr3R:4422483-4429335 lnc-PPARGC1A-4:2 Yes chr3R:4422483-4429335 lnc-SOD3-12:1 No - lnc-SOD3-11:1 No - lnc-PPARGC1A-5:1 No - lnc-SOD3-10:1 No - lnc-DHX15-1:2 Yes chr2R:7387187-7391023 lnc-SOD3-9:1 No - lnc-DHX15-2:1 Yes chr2R:7387187-7391023 lnc-DHX15-2:2 Yes chr2R:7387187-7391023 lnc-CCDC149-2:1 Yes chr2R:7387187-7391023 lnc-CCDC149-1:2 Yes chr2R:7387187-7391023 lnc-CCDC149-1:1 Yes chr2R:7387187-7391023 lnc-DHX15-3:1 No - LINC02473:6 No - lnc-PI4K2B-7:1 Yes chr2R:11380347-11384114 lnc-LGI2-5:1 Yes chr3R:15367816-15369945 lnc-LGI2-4:1 Yes chr3R:15367816-15369945 lnc-LGI2-3:1 Yes chr3R:15367816-15369945 lnc-LGI2-2:1 Yes chr3R:15367816-15369945 lnc-SOD3-3:3 Yes chr3R:15367816-15369945 lnc-LGI2-1:2 Yes chr3R:5601433-5603185 lnc-LGI2-1:1 Yes chr3R:5601433-5603185 SEPSECS-AS1:1 Yes chr3R:5557663-5563652 SEPSECS-AS1:2 Yes chr3R:5557663-5563652 lnc-PI4K2B-4:1 Yes chr3R:5557663-5563652 lnc-PI4K2B-2:1 No - lnc-SEPSECS-1:2 No - lnc-ANAPC4-2:1 No - lnc-SEL1L3-11:1 No - lnc-SEL1L3-10:1 No - lnc-SEL1L3-9:1 No - lnc-SEL1L3-7:1 No - lnc-SEL1L3-6:1 No - lnc-SEL1L3-5:1 No - lnc-SEL1L3-4:1 No - lnc-SEPSECS-2:1 No - lnc-SEPSECS-3:1 No - lnc-CCKAR-8:1 No - lnc-SEL1L3-3:1 No - lnc-SEL1L3-8:1 No - LINC02357:8 No - lnc-RBPJ-4:1 No - lnc-CCKAR-6:1 Yes chr2L:15039488-15043334 lnc-TBC1D19-8:1 Yes chr2L:15039488-15043334 lnc-TBC1D19-8:2 Yes chr2L:15039488-15043334 lnc-TBC1D19-2:2 No - lnc-CCKAR-1:6 Yes chrX:15934495-15940451 lnc-CCKAR-1:5 Yes chrX:15934495-15940451 lnc-CCKAR-7:1 Yes chrX:15934495-15940451 lnc-STIM2-6:1 No - lnc-STIM2-7:1 No - lnc-STIM2-3:3 No - lnc-CCKAR-15:1 No - lnc-STIM2-8:1 No - lnc-CCKAR-16:1 No - lnc-PCDH7-9:3 No - lnc-PCDH7-16:1 No - lnc-CCKAR-17:1 No - lnc-PCDH7-15:1 No - lnc-CCKAR-18:1 No - lnc-CCKAR-19:1 No - lnc-STIM2-10:1 Yes chr3R:14630478-14641776 lnc-CCKAR-20:1 Yes chr3R:14630478-14641776 LINC02497:5 No - lnc-PCDH7-2:2 No - LINC02501:7 No - LINC02501:8 No - lnc-ARAP2-12:1 No - lnc-PCDH7-5:2 No - lnc-PCDH7-6:3 No - lnc-ARAP2-7:2 No - lnc-ARAP2-10:1 No - lnc-DTHD1-16:1 No - lnc-DTHD1-15:1 No - lnc-DTHD1-14:1 No - lnc-DTHD1-13:1 No - lnc-DTHD1-12:1 No - lnc-DTHD1-11:1 No - lnc-DTHD1-3:4 No - lnc-DTHD1-10:1 No - lnc-ARAP2-1:5 Yes chrX:16943290-16956234 lnc-ARAP2-1:4 Yes chrX:16943290-16956234 lnc-RELL1-9:1 Yes chrX:16943290-16956234 lnc-RELL1-6:1 Yes chrX:16943290-16956234 lnc-DTHD1-7:1 No - lnc-NWD2-3:4 No - lnc-NWD2-2:1 No - lnc-NWD2-2:2 No - lnc-NWD2-2:4 No - lnc-PGM2-1:1 No - lnc-PTTG2-2:1 Yes chr3R:5685855-5712837 lnc-RELL1-3:1 Yes chr3R:5685855-5712837 lnc-RELL1-4:1 Yes chr3R:5685855-5712837 lnc-TLR10-4:2 No - lnc-TBC1D1-1:6 No - lnc-TBC1D1-4:1 No - LINC01259:1 No - KLF3-AS1:13 No - KLF3-AS1:12 No - KLF3-AS1:11 No - KLF3-AS1:10 No - KLF3-AS1:7 No - KLF3-AS1:8 No - lnc-TLR10-3:2 No - lnc-TLR10-1:1 Yes chr3L:20361843-20366724 lnc-TLR1-1:4 Yes chr3L:20361843-20366724 lnc-TLR1-1:2 Yes chr3L:20361843-20366724 lnc-TLR1-1:3 Yes chr3L:20361843-20366724 lnc-TLR1-1:1 Yes chr3L:20361843-20366724 lnc-TLR6-2:2 No - lnc-TLR6-2:1 No - lnc-RPL9-2:1 Yes chr3R:4906622-4910081 lnc-RPL9-1:1 Yes chr3L:16733546-16739364 lnc-UGDH-2:2 Yes chr2L:11002758-11004189 lnc-UGDH-2:1 No - lnc-KLB-3:5 Yes chr3L:20430605-20432361 lnc-KLB-3:6 Yes chr3L:20430605-20432361 lnc-KLB-3:7 Yes chr3L:20430605-20432361 lnc-SMIM14-6:1 Yes chr3L:6959554-6964758 lnc-SMIM14-5:1 Yes chr3L:6959554-6964758 UGDH-AS1:1 No - lnc-UGDH-3:3 Yes chr2R:24531594-24533391 lnc-UGDH-4:2 Yes chr2R:24531594-24533391 lnc-UGDH-4:1 Yes chr2R:24531594-24533391 lnc-SMIM14-7:1 Yes chr3L:9698336-9700481 lnc-SMIM14-8:1 Yes chr3L:9698336-9700481 lnc-LIAS-4:1 Yes chr3L:9698336-9700481 lnc-UBE2K-3:1 No - lnc-SMIM14-9:1 Yes chr2R:12027985-12033725 lnc-SMIM14-10:1 Yes chr2R:12027985-12033725 lnc-SMIM14-11:1 Yes chr2R:12027985-12033725 lnc-N4BP2-5:1 Yes chr2R:12027985-12033725 lnc-SMIM14-12:1 Yes chr2R:12027985-12033725 lnc-SMIM14-13:1 Yes chr2R:12027985-12033725 lnc-N4BP2-4:1 No - lnc-N4BP2-3:1 No - lnc-N4BP2-3:2 No - lnc-N4BP2-3:3 No - lnc-N4BP2-3:4 No - lnc-N4BP2-3:5 No - lnc-APBB2-4:1 Yes chr3R:20756729-20810726 lnc-CHRNA9-3:1 Yes chr3R:20756729-20810726 lnc-APBB2-3:1 Yes chr3R:20756729-20810726 lnc-NSUN7-2:1 No - lnc-RBM47-1:1 No - lnc-CHRNA9-5:1 Yes chr3L:16390952-16400275 lnc-APBB2-2:3 No - lnc-APBB2-2:6 No - lnc-APBB2-2:4 No - lnc-APBB2-2:2 No - lnc-APBB2-2:5 No - lnc-UCHL1-1:1 Yes chr3R:4659579-4712193 lnc-PHOX2B-7:1 Yes chr3R:4659579-4712193 lnc-PHOX2B-1:2 Yes chr3R:4659579-4712193 lnc-PHOX2B-4:1 No - lnc-PHOX2B-5:1 No - lnc-TMEM33-2:1 No - lnc-TMEM33-1:1 No - lnc-DCAF4L1-2:1 Yes chr2L:6070990-6073961 lnc-BEND4-2:1 No - lnc-SLC30A9-1:1 No - lnc-SLC30A9-1:2 No - lnc-BEND4-3:2 No - lnc-BEND4-1:1 No - lnc-ATP8A1-1:7 No - lnc-SHISA3-2:1 No - lnc-BEND4-4:1 Yes chr2R:13414978-13439051 lnc-BEND4-5:1 Yes chr2R:13414978-13439051 lnc-BEND4-6:1 Yes chr2R:13414978-13439051 lnc-GRXCR1-3:2 No - lnc-GRXCR1-6:1 No - lnc-GRXCR1-4:5 No - lnc-GRXCR1-7:1 No - lnc-KCTD8-3:1 No - lnc-GRXCR1-5:2 No - lnc-GRXCR1-5:3 No - lnc-GUF1-8:1 No - lnc-GUF1-7:1 No - LINC02475:9 No - LINC02475:11 No - lnc-GUF1-6:1 No - lnc-YIPF7-2:2 Yes chr2L:12993757-13000635 lnc-YIPF7-2:1 No - lnc-YIPF7-3:1 Yes chr2L:5547086-5549614 lnc-GNPDA2-3:1 No - lnc-GNPDA2-4:1 No - lnc-GNPDA2-5:1 No - lnc-GABRG1-4:1 No - lnc-GABRB1-6:1 No - lnc-GABRG1-3:1 Yes chrX:15921955-15924558 lnc-COX7B2-1:1 Yes chrX:15921955-15924558 lnc-GABRB1-1:2 No - lnc-CORIN-3:1 No - lnc-COMMD8-1:1 No - lnc-GABRB1-4:1 No - lnc-COMMD8-2:1 Yes chr2R:7540111-7564435 lnc-ATP10D-1:1 Yes chr2R:7540111-7564435 lnc-NIPAL1-2:1 No - lnc-CORIN-4:1 Yes chr3L:4255991-4259152 lnc-CORIN-4:2 Yes chr3L:4255991-4259152 lnc-CORIN-4:3 Yes chr3L:4255991-4259152 lnc-ATP10D-23:1 No - lnc-ATP10D-23:2 No - lnc-TXK-1:1 Yes chr2L:8258373-8301079 lnc-TEC-1:1 No - lnc-TEC-2:1 No - lnc-TEC-3:1 Yes chr3L:9631834-9679103 lnc-TEC-4:1 Yes chr3L:9631834-9679103 lnc-FRYL-3:3 Yes chr3L:9631834-9679103 lnc-FRYL-3:1 Yes chr3L:9631834-9679103 lnc-FRYL-3:2 Yes chr3L:9631834-9679103 lnc-FRYL-3:4 Yes chr3L:9631834-9679103 lnc-OCIAD2-2:1 Yes chr2R:22886398-22887578 lnc-OCIAD2-2:3 Yes chr2R:22886398-22887578 lnc-OCIAD2-2:4 Yes chr2R:22886398-22887578 lnc-OCIAD2-2:5 Yes chr2R:22886398-22887578 lnc-CWH43-1:1 No - lnc-CWH43-2:1 No - lnc-OCIAD2-4:1 No - lnc-OCIAD2-5:1 No - lnc-OCIAD2-6:1 No - lnc-OCIAD2-8:9 No - lnc-OCIAD2-8:1 No - lnc-OCIAD2-8:8 No - lnc-CWH43-4:1 No - lnc-CWH43-5:1 No - lnc-OCIAD2-10:1 No - lnc-OCIAD2-8:7 No - lnc-OCIAD2-12:1 No - lnc-OCIAD2-13:1 No - lnc-OCIAD2-14:1 No - lnc-OCIAD2-15:1 No - lnc-CWH43-6:1 No - lnc-CWH43-7:1 No - lnc-CWH43-8:1 No - lnc-CWH43-9:1 No - lnc-LRRC66-2:1 Yes chr3L:20299410-20309511 lnc-SPATA18-2:3 Yes chr3L:20299410-20309511 lnc-LRRC66-1:1 No - LINC02480:7 No - LINC02480:11 No - lnc-USP46-4:1 No - lnc-ERVMER34-1-4:1 Yes chr3R:22750901-22776374 lnc-ERVMER34-1-2:1 Yes chr3R:22750901-22776374 USP46-AS1:1 Yes chr3R:22750901-22776374 USP46-AS1:4 No - lnc-RASL11B-7:1 No - DANCR:1 No - lnc-ERVMER34-1-3:1 No - DANCR:3 No - DANCR:5 No - DANCR:11 No - lnc-RASL11B-6:1 No - lnc-SCFD2-2:1 No - lnc-SCFD2-1:1 No - lnc-RASL11B-2:4 No - LNX1-AS1:2 Yes chr3R:4485008-4487677 lnc-SCFD2-5:1 Yes chr3R:4485008-4487677 LNX1-AS2:2 Yes chr3R:4485008-4487677 lnc-FIP1L1-9:1 Yes chr3R:4485008-4487677 lnc-CHIC2-4:1 Yes chr3R:4485008-4487677 lnc-CHIC2-2:1 Yes chr3R:4485008-4487677 lnc-LNX1-1:1 Yes chr3R:4485008-4487677 lnc-GSX2-7:1 Yes chr3R:4485008-4487677 lnc-GSX2-6:1 Yes chr3R:4485008-4487677 lnc-GSX2-5:1 Yes chr3R:4485008-4487677 lnc-KDR-1:2 No - lnc-KDR-6:1 No - lnc-SRD5A3-7:1 No - lnc-SRD5A3-6:1 No - lnc-KDR-5:1 No - lnc-SRD5A3-5:1 No - lnc-CLOCK-3:1 No - lnc-CLOCK-2:1 Yes chr2L:8305586-8306741 SRD5A3-AS1:24 Yes chr2L:8305586-8306741 SRD5A3-AS1:11 Yes chr2L:8305586-8306741 SRD5A3-AS1:18 Yes chr2L:8305586-8306741 SRD5A3-AS1:25 Yes chr2L:8305586-8306741 SRD5A3-AS1:17 Yes chr2L:8305586-8306741 SRD5A3-AS1:10 Yes chr2L:8305586-8306741 SRD5A3-AS1:2 No - SRD5A3-AS1:6 No - SRD5A3-AS1:3 No - SRD5A3-AS1:5 No - lnc-SRD5A3-4:1 Yes chr3R:15196598-15203074 lnc-PDCL2-4:1 No - lnc-PDCL2-3:1 No - lnc-PDCL2-3:2 No - lnc-PDCL2-2:1 No - lnc-PDCL2-2:2 No - lnc-PDCL2-2:3 No - lnc-PDCL2-1:1 No - lnc-NMU-1:1 No - lnc-NMU-1:2 No - lnc-NMU-3:3 Yes chr3L:17421787-17425217 lnc-CEP135-2:1 No - lnc-CEP135-1:1 No - lnc-NMU-3:2 No - lnc-NMU-3:1 Yes chr3L:15116737-15128029 lnc-EXOC1-3:1 Yes chr3L:15116737-15128029 lnc-NMU-4:1 Yes chr3L:15116737-15128029 lnc-AASDH-1:2 No - lnc-AASDH-2:1 No - lnc-PPAT-2:1 Yes chr2L:8445861-8449576 lnc-KIAA1211-1:1 Yes chr2L:8445861-8449576 lnc-PAICS-3:1 No - lnc-PPAT-1:1 No - lnc-PAICS-1:2 Yes chrX:12757036-12760617 lnc-HOPX-1:1 No - lnc-HOPX-1:3 No - lnc-HOPX-1:2 No - lnc-SPINK2-4:2 No - lnc-SPINK2-4:1 No - lnc-SPINK2-3:1 No - lnc-SPINK2-2:1 No - lnc-REST-8:1 No - lnc-SPINK2-1:3 No - lnc-SPINK2-1:2 No - lnc-SPINK2-1:1 No - lnc-REST-2:2 No - lnc-POLR2B-7:1 Yes chr2L:21762314-21795447 lnc-POLR2B-1:16 Yes chr2L:21762314-21795447 lnc-POLR2B-3:2 Yes chr2L:21762314-21795447 lnc-POLR2B-4:3 Yes chr2L:21762314-21795447 lnc-NOA1-1:1 Yes chr2L:21762314-21795447 lnc-POLR2B-5:3 Yes chr2L:21762314-21795447 lnc-REST-6:1 No - lnc-IGFBP7-1:3 No - IGFBP7-AS1:14 No - lnc-IGFBP7-9:1 No - LINC02380:6 No - lnc-POLR2B-10:1 No - lnc-IGFBP7-10:1 No - lnc-POLR2B-18:2 No - lnc-IGFBP7-5:12 No - lnc-ADGRL3-11:1 No - lnc-POLR2B-12:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-POLR2B-11:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-ADGRL3-8:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-ADGRL3-2:1 No - lnc-ADGRL3-9:1 No - lnc-ADGRL3-10:1 No - lnc-TECRL-15:1 No - lnc-ADGRL3-12:1 No - lnc-ADGRL3-6:1 No - lnc-EPHA5-4:2 Yes chr3L:3903492-3905035 lnc-EPHA5-4:1 Yes chr3L:3903492-3905035 lnc-TECRL-6:1 No - lnc-ADGRL3-14:1 No - lnc-TECRL-7:1 No - lnc-TECRL-8:1 No - lnc-TECRL-9:1 No - lnc-TECRL-10:1 No - lnc-TECRL-12:1 No - lnc-EPHA5-3:1 No - lnc-EPHA5-2:1 No - lnc-TECRL-14:1 No - EPHA5-AS1:12 No - lnc-STAP1-13:1 No - lnc-STAP1-11:1 No - lnc-CENPC-3:2 No - lnc-CENPC-2:4 No - lnc-CENPC-2:3 No - lnc-STAP1-7:1 No - lnc-UBA6-3:1 No - lnc-UBA6-2:1 No - lnc-GNRHR-4:1 No - UBA6-AS1:1 No - UBA6-AS1:4 No - UBA6-AS1:7 No - UBA6-AS1:8 No - lnc-UBA6-1:1 No - lnc-GNRHR-2:1 No - UBA6-AS1:12 No - UBA6-AS1:13 No - UBA6-AS1:14 No - lnc-GNRHR-1:1 No - UBA6-AS1:15 No - lnc-STAP1-15:1 Yes chr3L:12339116-12351544 lnc-GNRHR-3:1 No - lnc-TMPRSS11A-5:5 No - lnc-TMPRSS11A-5:3 No - lnc-TMPRSS11A-5:1 No - lnc-TMPRSS11A-5:2 No - lnc-TMPRSS11A-5:4 No - lnc-TMPRSS11A-1:1 No - lnc-TMPRSS11A-1:2 No - UBA6-AS1:17 No - lnc-TMPRSS11A-2:2 No - lnc-TMPRSS11A-2:1 No - lnc-TMPRSS11A-2:3 No - lnc-TMPRSS11B-2:1 No - lnc-TMPRSS11B-1:1 No - lnc-TMPRSS11B-1:2 No - lnc-YTHDC1-2:1 No - lnc-TMPRSS11E-4:1 No - lnc-YTHDC1-1:1 No - lnc-UGT2B17-1:1 No - lnc-TMPRSS11E-2:1 No - lnc-UGT2B15-3:1 No - lnc-UGT2B15-2:1 No - lnc-UGT2B10-2:1 No - lnc-UGT2B10-1:1 No - lnc-UGT2A3-8:1 No - lnc-UGT2A3-6:1 No - lnc-UGT2A3-5:1 No - lnc-UGT2A3-3:1 No - lnc-UGT2A3-7:1 No - lnc-UGT2A3-9:1 No - lnc-UGT2B28-8:1 No - lnc-UGT2B7-1:1 No - lnc-UGT2B7-2:1 No - lnc-UGT2B7-3:1 No - lnc-UGT2B11-1:1 No - lnc-UGT2B28-2:1 No - lnc-UGT2B11-2:1 No - lnc-UGT2B28-3:1 No - lnc-UGT2B28-4:1 No - lnc-UGT2B28-5:1 No - lnc-UGT2B28-6:1 No - lnc-UGT2B28-7:1 No - lnc-UGT2B4-1:1 No - lnc-UGT2A1-1:1 No - lnc-UGT2B4-2:1 No - lnc-SULT1E1-1:1 No - lnc-CSN1S1-1:1 No - lnc-HTN1-2:1 No - lnc-HTN1-2:3 No - lnc-HTN1-2:4 No - lnc-MUC7-1:1 No - lnc-UTP3-1:1 No - lnc-JCHAIN-1:1 Yes chr3R:27229505-27239085 lnc-JCHAIN-2:1 No - lnc-RUFY3-1:1 No - lnc-RUFY3-1:2 No - lnc-RUFY3-2:1 No - lnc-MOB1B-2:1 No - lnc-MOB1B-1:1 No - lnc-GC-3:1 Yes chr2L:7223328-7249343 lnc-GC-2:1 No - lnc-ADAMTS3-1:1 No - lnc-NPFFR2-2:2 No - lnc-ALB-9:1 No - lnc-COX18-1:1 Yes chr3L:9073105-9074467 lnc-COX18-3:1 No - lnc-ALB-8:1 No - lnc-COX18-4:1 No - lnc-ALB-7:1 No - lnc-ALB-1:2 No - lnc-ALB-6:1 No - lnc-ALB-1:3 No - lnc-ANKRD17-1:1 No - lnc-ALB-1:12 No - lnc-ALB-1:13 No - lnc-ALB-4:1 No - lnc-ALB-3:1 No - LINC02499:8 No - LINC02499:10 No - lnc-ANKRD17-2:1 Yes chr3R:23114014-23117931 lnc-RASSF6-1:1 No - lnc-CXCL6-3:1 No - lnc-RASSF6-3:1 No - lnc-PF4V1-1:4 No - lnc-CXCL1-2:1 No - lnc-PF4-1:1 No - lnc-CXCL5-1:1 No - lnc-MTHFD2L-2:1 No - lnc-CXCL3-1:1 No - lnc-CXCL3-2:1 No - lnc-CXCL3-2:2 No - lnc-CXCL3-3:1 No - lnc-EPGN-4:1 Yes chr3R:9042508-9050555 lnc-EPGN-4:2 Yes chr3R:9042508-9050555 lnc-EPGN-1:3 No - lnc-CXCL2-1:2 No - lnc-PARM1-1:2 No - lnc-PARM1-3:1 No - lnc-PARM1-2:1 No - lnc-THAP6-3:1 No - lnc-PARM1-4:1 No - lnc-PARM1-5:1 No - lnc-RCHY1-5:7 Yes chr2L:6459015-6465669 lnc-RCHY1-5:8 Yes chr2L:6459015-6465669 lnc-RCHY1-5:6 Yes chr2L:6459015-6465669 lnc-RCHY1-5:1 No - lnc-G3BP2-2:1 No - lnc-CDKL2-1:1 Yes chr3R:13647004-13654527 lnc-CDKL2-2:1 Yes chr3R:13647004-13654527 lnc-CDKL2-2:3 Yes chr3R:13647004-13654527 lnc-CDKL2-2:2 Yes chr3R:13647004-13654527 lnc-USO1-3:1 Yes chr3R:13647004-13654527 lnc-G3BP2-1:1 No - lnc-G3BP2-1:2 No - lnc-USO1-1:2 No - lnc-NAAA-3:1 Yes chr3L:20248080-20265554 lnc-NAAA-2:1 Yes chr3L:20248080-20265554 lnc-PPEF2-1:1 Yes chr3L:20248080-20265554 lnc-PPEF2-2:1 No - lnc-SDAD1-2:1 No - lnc-SDAD1-1:1 No - lnc-SDAD1-3:2 Yes chr2R:9111505-9113951 lnc-SDAD1-3:1 Yes chr2R:9111505-9113951 lnc-CXCL10-1:1 No - lnc-SCARB2-4:1 Yes chr2R:12428449-12431099 lnc-SCARB2-2:4 Yes chr2R:12428449-12431099 lnc-SCARB2-2:11 Yes chr2R:12428449-12431099 lnc-SCARB2-2:6 Yes chr2R:12428449-12431099 lnc-SCARB2-2:7 Yes chr2R:12428449-12431099 lnc-SCARB2-2:9 Yes chr2R:12428449-12431099 lnc-SCARB2-2:5 Yes chr2R:12428449-12431099 lnc-SCARB2-2:10 Yes chr2R:12428449-12431099 lnc-SCARB2-2:8 Yes chr2R:12428449-12431099 lnc-NUP54-1:1 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-NUP54-2:1 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-SCARB2-1:2 No - lnc-SCARB2-1:1 No - lnc-CCDC158-3:2 No - lnc-CCDC158-3:1 No - lnc-SHROOM3-1:1 No - lnc-CCDC158-2:1 Yes chr2R:14308142-14351802 lnc-STBD1-5:1 Yes chr2R:14308142-14351802 lnc-STBD1-5:2 Yes chr2R:14308142-14351802 lnc-STBD1-5:3 Yes chr2R:14308142-14351802 lnc-SOWAHB-4:1 No - lnc-SOWAHB-4:2 No - lnc-SOWAHB-4:3 No - lnc-SOWAHB-4:4 No - lnc-SEPT11-4:1 No - lnc-SEPT11-3:1 No - lnc-SOWAHB-5:4 No - lnc-CCNG2-2:3 Yes chr2R:7960133-7961921 lnc-SOWAHB-6:1 Yes chr3R:31596642-31612664 lnc-SOWAHB-7:2 Yes chr3R:31596642-31612664 lnc-SOWAHB-7:1 Yes chr3R:31596642-31612664 lnc-SOWAHB-8:1 Yes chr3R:31596642-31612664 lnc-SEPT11-2:1 Yes chr3R:31596642-31612664 lnc-CCNI-2:1 No - lnc-CCNI-1:3 No - lnc-CXCL13-1:1 Yes chr3R:31596642-31612664 lnc-CCNI-4:1 Yes chr3R:31596642-31612664 lnc-CCNI-5:1 Yes chr3R:31596642-31612664 lnc-CCNI-6:1 Yes chr3R:31596642-31612664 lnc-CNOT6L-2:1 Yes chr3R:8301440-8302770 lnc-MRPL1-1:1 No - lnc-MRPL1-2:1 No - lnc-ANXA3-3:1 No - LINC01094:1 No - LINC01094:4 No - LINC01094:5 No - LINC01094:6 No - LINC01094:7 No - LINC01094:8 No - LINC01094:9 No - LINC01094:10 No - lnc-PAQR3-2:1 No - lnc-PAQR3-1:2 No - lnc-BMP2K-4:1 No - lnc-ANXA3-6:1 No - lnc-ANXA3-8:1 No - lnc-NAA11-1:3 No - lnc-NAA11-1:4 No - lnc-NAA11-1:1 Yes chr3R:14724760-14731509 lnc-NAA11-1:2 Yes chr3R:14724760-14731509 LINC01088:3 Yes chr3L:9972312-9974023 LINC01088:5 No - LINC01088:6 Yes chr3L:9972312-9974023 lnc-BMP2K-7:1 No - LINC00989:3 No - lnc-PRDM8-9:1 No - lnc-GK2-1:2 No - lnc-GK2-1:1 No - LINC02469:4 No - lnc-ANTXR2-3:3 No - lnc-GK2-2:2 No - lnc-GK2-2:1 No - lnc-GK2-4:1 No - lnc-ANTXR2-3:2 No - lnc-ANTXR2-1:2 Yes chr3L:5882304-5884090 lnc-PRDM8-4:1 Yes chr3L:5882304-5884090 lnc-PRDM8-4:2 Yes chr3L:5882304-5884090 lnc-PRDM8-4:3 Yes chr3L:5882304-5884090 lnc-PRDM8-4:4 Yes chr3L:5882304-5884090 lnc-PRDM8-4:5 Yes chr3L:5882304-5884090 lnc-PRDM8-4:6 Yes chr3L:5882304-5884090 lnc-ANTXR2-1:8 Yes chr3L:5882304-5884090 lnc-ANTXR2-6:1 No - lnc-ANTXR2-4:1 No - lnc-ANTXR2-5:1 Yes chr2L:5553897-5555137 lnc-PRKG2-1:1 Yes chr2R:17514217-17517445 lnc-RASGEF1B-1:6 Yes chr2R:17514217-17517445 lnc-PRKG2-2:1 Yes chr2R:17514217-17517445 lnc-HNRNPD-4:1 Yes chr2R:17514217-17517445 lnc-HNRNPD-3:1 No - lnc-HNRNPDL-2:1 Yes chr3R:13634862-13646304 lnc-HNRNPDL-2:2 Yes chr3R:13634862-13646304 lnc-HNRNPD-2:2 Yes chr3R:13634862-13646304 lnc-ENOPH1-2:1 No - lnc-ENOPH1-4:1 No - lnc-THAP9-3:1 Yes chr3R:30194790-30196228 lnc-THAP9-2:1 Yes chr3R:30194790-30196228 lnc-THAP9-1:1 No - lnc-SCD5-2:2 Yes chr2R:8893613-8898798 lnc-SCD5-2:1 Yes chr2R:8893613-8898798 lnc-SCD5-2:3 Yes chr2R:8893613-8898798 THAP9-AS1:21 Yes chr2R:8893613-8898798 THAP9-AS1:20 Yes chr2R:8893613-8898798 THAP9-AS1:16 Yes chr2R:8893613-8898798 THAP9-AS1:11 Yes chr2R:8893613-8898798 THAP9-AS1:3 No - THAP9-AS1:4 No - lnc-LIN54-2:3 No - lnc-LIN54-3:1 No - lnc-COQ2-5:1 No - lnc-COQ2-4:1 No - lnc-COQ2-3:1 No - lnc-COPS4-2:1 No - lnc-HPSE-1:1 Yes chr3R:8314784-8316543 lnc-COQ2-2:1 No - lnc-HELQ-1:1 No - lnc-ABRAXAS1-3:1 Yes chr3L:8137808-8142014 lnc-ABRAXAS1-2:1 No - lnc-ABRAXAS1-2:2 No - lnc-GPAT3-1:2 No - lnc-NKX6-1-2:4 No - lnc-NKX6-1-4:1 No - lnc-NKX6-1-5:1 No - lnc-NKX6-1-6:1 No - lnc-NKX6-1-7:1 Yes chr2L:5907169-5922776 lnc-NKX6-1-9:1 Yes chr2L:5907169-5922776 lnc-NKX6-1-10:1 Yes chr2L:5907169-5922776 WDFY3-AS2:3 Yes chr2L:5907169-5922776 WDFY3-AS2:5 Yes chr2L:5907169-5922776 WDFY3-AS2:7 No - WDFY3-AS2:10 No - WDFY3-AS2:12 No - WDFY3-AS2:13 No - WDFY3-AS2:14 No - lnc-ARHGAP24-4:1 No - lnc-ARHGAP24-2:1 No - lnc-SLC10A6-7:1 Yes chr2L:10247502-10250501 lnc-SLC10A6-6:1 Yes chr2L:10247502-10250501 lnc-SLC10A6-6:2 Yes chr2L:10247502-10250501 lnc-SLC10A6-5:2 Yes chr2L:10247502-10250501 lnc-SLC10A6-5:1 Yes chr2L:10247502-10250501 lnc-ARHGAP24-1:3 Yes chr2L:10247502-10250501 lnc-SLC10A6-4:6 Yes chr2L:10247502-10250501 lnc-SLC10A6-4:2 Yes chr2L:10247502-10250501 lnc-SLC10A6-3:1 Yes chr2L:10247502-10250501 lnc-SLC10A6-4:5 Yes chr2L:10247502-10250501 lnc-SLC10A6-4:3 Yes chr2L:10247502-10250501 lnc-SLC10A6-4:1 Yes chr2L:10247502-10250501 lnc-SLC10A6-4:4 Yes chr2L:10247502-10250501 lnc-PTPN13-1:1 No - lnc-AFF1-3:1 No - AFF1-AS1:12 No - AFF1-AS1:17 No - lnc-C4orf36-1:2 No - AFF1-AS1:14 No - AFF1-AS1:13 No - AFF1-AS1:15 No - AFF1-AS1:16 No - AFF1-AS1:11 No - lnc-PTPN13-2:1 Yes chr2L:2885929-2954406 lnc-AFF1-2:1 No - lnc-HSD17B11-1:3 Yes chr2L:21057706-21071502 lnc-HSD17B11-1:5 Yes chr2L:21057706-21071502 lnc-HSD17B11-1:2 Yes chr2L:21057706-21071502 lnc-HSD17B11-1:4 Yes chr2L:21057706-21071502 lnc-HSD17B13-3:1 Yes chr2L:21057706-21071502 lnc-HSD17B13-2:1 Yes chr2L:21057706-21071502 lnc-HSD17B11-2:1 Yes chr3L:16608138-16609347 lnc-HSD17B11-3:1 Yes chr3R:26869238-26871995 lnc-SPARCL1-3:1 No - lnc-SPARCL1-4:1 No - lnc-SPP1-1:1 No - lnc-PKD2-1:1 No - lnc-PPM1K-3:1 No - lnc-PPM1K-2:1 No - lnc-PPM1K-1:1 No - lnc-ABCG2-1:2 No - lnc-ABCG2-1:1 No - lnc-ABCG2-2:1 No - lnc-ABCG2-2:2 No - lnc-HERC6-2:5 No - lnc-HERC6-2:6 No - lnc-HERC6-1:3 No - lnc-PYURF-3:16 Yes chr3L:1313696-1318330 lnc-PYURF-3:15 Yes chr3L:1313696-1318330 lnc-PYURF-3:14 No - lnc-HERC5-1:1 Yes chr3L:1313696-1318330 lnc-HERC5-1:2 Yes chr3L:1313696-1318330 lnc-HERC5-1:3 Yes chr3L:1313696-1318330 lnc-PYURF-2:10 Yes chr3L:1313696-1318330 lnc-PYURF-2:6 Yes chr3L:1313696-1318330 lnc-HERC3-14:1 No - lnc-HERC3-14:2 No - lnc-NAP1L5-1:1 Yes chr2R:17703335-17719346 lnc-NAP1L5-2:1 Yes chr2R:17703335-17719346 lnc-NAP1L5-3:1 Yes chr2R:17703335-17719346 lnc-NAP1L5-4:1 Yes chr2R:17703335-17719346 lnc-TIGD2-8:1 No - lnc-TIGD2-9:1 No - lnc-TIGD2-5:1 No - lnc-FAM13A-2:2 No - lnc-MMRN1-12:6 No - lnc-MMRN1-12:11 No - lnc-SNCA-2:3 No - lnc-MMRN1-12:14 No - lnc-MMRN1-12:15 No - lnc-MMRN1-12:19 No - SNCA-AS1:1 No - lnc-MMRN1-4:1 No - lnc-SNCA-3:1 No - lnc-CCSER1-2:2 No - lnc-CCSER1-3:2 No - lnc-SNCA-6:1 No - lnc-GRID2-2:1 No - LNCPRESS2:5 No - lnc-HPGDS-11:1 No - lnc-GRID2-1:1 No - lnc-CCSER1-6:2 Yes chr2L:4830846-4835300 lnc-HPGDS-6:1 Yes chr2L:4830846-4835300 lnc-ATOH1-1:1 Yes chr2L:4830846-4835300 lnc-SMARCAD1-2:1 No - lnc-HPGDS-3:1 No - lnc-HPGDS-5:3 No - lnc-HPGDS-5:2 No - lnc-SMARCAD1-1:1 No - lnc-PDLIM5-2:1 No - lnc-HPGDS-4:1 No - BMPR1B-DT:6 No - lnc-HPGDS-7:1 Yes chr2R:15340472-15368300 lnc-PDHA2-2:1 Yes chr2R:15340472-15368300 lnc-UNC5C-2:1 No - lnc-PDHA2-3:1 No - lnc-UNC5C-4:1 No - lnc-PDHA2-5:1 No - lnc-TSPAN5-3:1 No - lnc-RAP1GDS1-6:1 No - lnc-RAP1GDS1-2:2 No - lnc-METAP1-7:1 Yes chr2R:6975285-6985712 lnc-EIF4E-3:1 Yes chr2L:6000228-6003738 lnc-RAP1GDS1-3:6 No - lnc-RAP1GDS1-3:7 No - lnc-ADH5-6:1 Yes chr3L:6664224-6665641 lnc-ADH5-5:1 Yes chr3L:6664224-6665641 lnc-ADH5-4:1 Yes chr3L:6664224-6665641 lnc-ADH5-4:2 Yes chr3L:6664224-6665641 lnc-METAP1-9:1 No - lnc-METAP1-1:2 No - lnc-METAP1-1:3 No - lnc-EIF4E-2:1 No - lnc-ADH5-2:1 Yes chr3R:24717937-24719364 lnc-ADH4-4:1 Yes chr3R:10870906-10872381 lnc-ADH4-2:1 Yes chr3R:10870906-10872381 lnc-METAP1-3:8 No - lnc-ADH4-3:3 Yes chr3R:10870906-10872381 lnc-ADH4-3:2 Yes chr3R:10870906-10872381 lnc-ADH4-1:3 No - lnc-ADH4-1:1 No - lnc-ADH4-1:2 No - lnc-ADH1A-1:1 Yes chr3R:10870906-10872381 lnc-ADH1A-2:1 No - lnc-ADH7-1:1 No - lnc-ADH1C-2:1 Yes chr3R:10870906-10872381 lnc-ADH1C-3:1 Yes chr3R:10870906-10872381 lnc-ADH7-2:1 No - lnc-ADH7-3:1 No - lnc-LAMTOR3-1:1 Yes chr2L:17481231-17482037 lnc-H2AFZ-2:2 Yes chr3R:14032371-14035041 lnc-H2AFZ-2:1 Yes chr3R:14032371-14035041 lnc-H2AFZ-1:1 Yes chr3R:26866929-26869220 lnc-H2AFZ-1:2 Yes chr3R:26866929-26869220 lnc-H2AFZ-1:3 Yes chr3R:26866929-26869220 lnc-H2AFZ-1:4 Yes chr3R:26866929-26869220 lnc-DAPP1-2:4 Yes chr3R:26866929-26869220 lnc-H2AFZ-3:1 No - lnc-EMCN-1:1 No - lnc-EMCN-3:7 No - lnc-EMCN-3:8 No - lnc-EMCN-3:6 No - lnc-EMCN-3:2 No - lnc-EMCN-3:9 No - lnc-EMCN-2:1 Yes chrX:16554627-16560016 lnc-EMCN-4:1 Yes chrX:16554627-16560016 lnc-BANK1-1:1 Yes chr3R:14577217-14608079 lnc-NFKB1-6:1 Yes chr3R:14577217-14608079 lnc-MANBA-4:1 No - lnc-SLC39A8-1:11 No - lnc-SLC39A8-1:8 No - lnc-SLC39A8-1:10 No - lnc-SLC39A8-1:9 No - lnc-SLC39A8-1:6 No - lnc-MANBA-3:1 No - lnc-NFKB1-3:1 No - lnc-NFKB1-1:1 No - lnc-SLC39A8-3:2 No - lnc-NFKB1-2:1 Yes chr3R:4197206-4204572 lnc-UBE2D3-2:1 Yes chr3R:4197206-4204572 lnc-UBE2D3-3:1 Yes chr3R:4197206-4204572 lnc-NFKB1-4:1 Yes chr3R:4197206-4204572 lnc-NFKB1-4:2 Yes chr3R:4197206-4204572 lnc-MANBA-2:9 No - lnc-MANBA-2:1 No - lnc-MANBA-2:6 No - lnc-MANBA-2:3 No - lnc-MANBA-2:8 No - lnc-MANBA-2:7 No - lnc-MANBA-2:2 No - lnc-MANBA-2:5 No - lnc-MANBA-2:4 No - lnc-SLC9B2-1:4 No - lnc-SLC9B2-1:3 No - lnc-CISD2-6:1 Yes chr3R:22981459-22998528 lnc-UBE2D3-1:3 Yes chr3R:22981459-22998528 lnc-UBE2D3-1:2 Yes chr3R:22981459-22998528 lnc-SLC9B1-2:1 Yes chr3R:22981459-22998528 lnc-BDH2-2:2 Yes chr3R:22981459-22998528 lnc-BDH2-2:1 Yes chr3R:22981459-22998528 lnc-BDH2-1:1 Yes chr3R:22981459-22998528 lnc-CENPE-1:1 No - lnc-BDH2-3:1 Yes chr2L:11261026-11269002 lnc-BDH2-4:1 Yes chr2L:11261026-11269002 lnc-BDH2-5:1 Yes chr2L:11261026-11269002 LINC02428:19 No - LINC02428:24 No - LINC02428:31 No - lnc-CISD2-9:1 No - lnc-TACR3-2:1 Yes chr3L:2786207-2879158 lnc-TACR3-3:1 Yes chr3L:2786207-2879158 lnc-CXXC4-4:1 No - lnc-TET2-7:1 No - lnc-PPA2-10:1 No - lnc-PPA2-9:1 No - lnc-PPA2-4:2 No - lnc-TET2-6:1 No - lnc-PPA2-6:1 No - lnc-TET2-1:2 No - lnc-PPA2-5:1 No - lnc-INTS12-7:2 No - lnc-INTS12-7:1 No - lnc-INTS12-3:1 No - lnc-PPA2-1:2 No - lnc-PPA2-7:1 No - lnc-INTS12-2:1 No - lnc-PPA2-8:1 No - lnc-INTS12-4:3 Yes chrX:4915280-4918447 lnc-GIMD1-5:2 Yes chrX:4915280-4918447 lnc-GIMD1-5:4 Yes chrX:4915280-4918447 lnc-GIMD1-5:3 Yes chrX:4915280-4918447 lnc-GIMD1-5:1 Yes chrX:4915280-4918447 lnc-GIMD1-6:1 Yes chrX:4915280-4918447 lnc-DKK2-1:1 No - lnc-SGMS2-3:1 No - lnc-SGMS2-3:2 No - lnc-LEF1-3:5 No - lnc-CYP2U1-1:1 No - lnc-LEF1-3:6 No - lnc-LEF1-3:3 No - lnc-LEF1-3:4 No - lnc-LEF1-1:7 Yes chr4:69326-114270 lnc-LEF1-1:10 Yes chr4:69326-114270 lnc-LEF1-1:4 Yes chr4:69326-114270 lnc-LEF1-1:6 Yes chr4:69326-114270 lnc-LEF1-1:8 Yes chr4:69326-114270 lnc-LEF1-1:11 Yes chr4:69326-114270 lnc-LEF1-1:9 Yes chr4:69326-114270 lnc-LEF1-1:5 Yes chr4:69326-114270 lnc-LEF1-1:3 Yes chr4:69326-114270 LEF1-AS1:5 No - LEF1-AS1:6 No - lnc-LEF1-4:1 No - lnc-LEF1-4:6 No - lnc-LEF1-6:1 No - RPL34-AS1:3 No - lnc-RPL34-1:1 No - RPL34-AS1:1 No - lnc-OSTC-3:1 No - lnc-COL25A1-6:1 Yes chr3L:13860027-13866905 lnc-OSTC-5:1 No - lnc-COL25A1-2:1 No - lnc-ETNPPL-2:1 Yes chr3R:16502770-16571363 SEC24B-AS1:22 No - SEC24B-AS1:6 No - SEC24B-AS1:4 No - lnc-COL25A1-5:1 Yes chr2R:9876232-9882357 lnc-MCUB-3:1 No - lnc-MCUB-2:1 No - lnc-CASP6-5:1 No - lnc-SEC24B-2:1 Yes chr3L:6550738-6593940 lnc-CASP6-1:1 Yes chr3L:15955096-15956465 lnc-CASP6-2:1 No - lnc-PLA2G12A-1:1 No - lnc-GAR1-1:1 No - lnc-CFI-2:1 No - lnc-CFI-3:1 No - lnc-ELOVL6-1:1 Yes chr3L:16648442-16661615 lnc-CFI-4:1 Yes chr3L:16648442-16661615 lnc-EGF-2:1 Yes chr3L:16648442-16661615 lnc-CFI-4:2 Yes chr3L:16648442-16661615 lnc-ELOVL6-2:2 No - lnc-ELOVL6-2:1 No - lnc-ENPEP-1:2 Yes chr3R:13298768-13302334 lnc-ELOVL6-4:1 Yes chr3R:13298768-13302334 lnc-EGF-3:1 Yes chr3R:13298768-13302334 PANCR:4 No - lnc-ELOVL6-5:1 Yes chr3R:30912754-30930682 lnc-PITX2-4:2 No - lnc-ENPEP-2:1 No - lnc-FAM241A-5:1 No - lnc-FAM241A-4:1 No - lnc-AP1AR-2:1 No - lnc-FAM241A-3:1 No - lnc-ALPK1-2:1 No - lnc-ALPK1-2:2 No - lnc-ALPK1-2:3 No - lnc-ALPK1-2:4 No - lnc-ALPK1-2:5 No - lnc-AP1AR-1:1 No - lnc-ALPK1-3:1 No - lnc-ALPK1-4:1 No - lnc-ALPK1-5:1 No - lnc-ZGRF1-6:1 No - lnc-LARP7-4:1 No - lnc-NEUROG2-1:1 No - lnc-ANK2-8:1 Yes chrX:9243817-9245925 lnc-ZGRF1-7:1 No - lnc-LARP7-1:1 No - lnc-LARP7-2:1 No - lnc-LARP7-3:1 No - lnc-ANK2-4:1 No - lnc-ZGRF1-8:1 No - lnc-ZGRF1-9:1 No - lnc-LARP7-7:1 Yes chr3L:7655389-7718395 lnc-ZGRF1-3:2 Yes chr3L:7655389-7718395 lnc-CAMK2D-1:1 Yes chr3L:7655389-7718395 lnc-ANK2-3:1 No - lnc-ARSJ-4:1 Yes chr4:1035288-1053703 lnc-ARSJ-3:2 Yes chr4:1035288-1053703 lnc-ARSJ-3:1 Yes chr4:1035288-1053703 lnc-ANK2-6:1 No - lnc-ANK2-7:1 No - lnc-ARSJ-2:1 Yes chr2R:12655954-12659341 lnc-UGT8-10:1 No - lnc-UGT8-8:1 No - lnc-UGT8-7:1 No - lnc-NDST4-3:1 No - lnc-UGT8-2:3 No - lnc-UGT8-5:1 No - lnc-NDST4-1:1 No - lnc-UGT8-6:1 No - lnc-UGT8-9:1 No - lnc-NDST4-4:1 No - lnc-MTRNR2L13-11:1 No - lnc-MTRNR2L13-2:1 No - lnc-NDST4-5:1 No - lnc-NDST4-6:1 No - lnc-TRAM1L1-3:4 No - lnc-TRAM1L1-6:1 No - lnc-MTRNR2L13-13:1 No - lnc-TRAM1L1-3:3 No - lnc-MTRNR2L13-14:1 No - lnc-TRAM1L1-5:1 No - lnc-MTRNR2L13-12:1 No - lnc-NDST3-11:1 No - lnc-NDST3-10:1 No - LINC01378:3 No - lnc-TRAM1L1-4:1 No - LINC01378:6 No - lnc-NDST3-9:2 No - lnc-NDST3-8:1 No - lnc-PRSS12-2:1 No - lnc-NDST3-7:1 No - SNHG8:1 No - SNHG8:2 No - SNHG8:4 No - SNHG8:5 No - SNHG8:7 No - SNHG8:8 No - SNHG8:9 No - lnc-PRSS12-1:1 No - lnc-METTL14-7:1 No - lnc-METTL14-3:3 No - lnc-METTL14-3:4 No - lnc-METTL14-3:5 No - lnc-METTL14-3:15 No - lnc-METTL14-3:18 No - lnc-METTL14-3:7 No - lnc-METTL14-3:8 No - lnc-METTL14-3:9 No - lnc-SEC24D-3:2 No - lnc-SEC24D-3:1 No - lnc-SEC24D-1:5 No - lnc-SEC24D-1:6 No - lnc-METTL14-5:1 No - lnc-SEC24D-1:4 No - lnc-METTL14-4:1 No - lnc-PRSS12-3:1 Yes chr2L:2231106-2236844 lnc-PRSS12-4:1 Yes chr2L:2231106-2236844 lnc-PRSS12-5:1 Yes chr2L:2231106-2236844 lnc-C4orf3-4:1 Yes chr2L:2231106-2236844 lnc-MYOZ2-3:1 No - lnc-C4orf3-3:1 Yes chrX:3811698-3857621 lnc-USP53-1:1 Yes chrX:3811698-3857621 lnc-USP53-1:2 Yes chrX:3811698-3857621 lnc-USP53-1:3 Yes chrX:3811698-3857621 lnc-USP53-1:4 Yes chrX:3811698-3857621 lnc-USP53-7:1 No - lnc-FABP2-1:1 No - lnc-USP53-3:2 No - lnc-PDE5A-3:2 No - lnc-PDE5A-3:1 No - lnc-USP53-8:1 No - lnc-USP53-8:2 No - lnc-USP53-8:4 No - lnc-USP53-8:5 No - lnc-USP53-8:6 Yes chr2L:18532025-18590342 lnc-USP53-8:7 Yes chr2L:18532025-18590342 lnc-USP53-8:8 Yes chr2L:18532025-18590342 lnc-USP53-8:9 Yes chr2L:18532025-18590342 lnc-USP53-8:11 No - lnc-USP53-8:12 No - lnc-USP53-8:13 No - lnc-USP53-8:14 No - lnc-USP53-8:15 Yes chr2L:18532025-18590342 lnc-USP53-8:16 No - lnc-USP53-8:17 Yes chr2L:18532025-18590342 lnc-USP53-8:18 Yes chr2L:18532025-18590342 lnc-USP53-8:19 No - lnc-USP53-8:20 Yes chr2L:18532025-18590342 lnc-USP53-8:21 Yes chr2L:18532025-18590342 lnc-USP53-8:22 Yes chr2L:18532025-18590342 lnc-FABP2-2:1 Yes chr2L:18532025-18590342 lnc-USP53-8:24 Yes chr2L:18532025-18590342 lnc-USP53-8:25 Yes chr2L:18532025-18590342 lnc-USP53-8:26 Yes chr2L:18532025-18590342 lnc-USP53-8:28 Yes chr2L:18532025-18590342 lnc-USP53-8:29 Yes chr2L:18532025-18590342 lnc-FABP2-3:1 Yes chr2L:18532025-18590342 lnc-USP53-8:30 Yes chr2L:18532025-18590342 lnc-FABP2-4:1 Yes chr2L:18532025-18590342 LINC02502:7 No - LINC02502:8 No - LINC02502:11 No - lnc-USP53-11:1 No - lnc-PDE5A-4:1 Yes chr3L:5812135-5813093 lnc-USP53-6:1 Yes chr3L:5812135-5813093 lnc-MAD2L1-2:1 No - lnc-USP53-12:1 No - lnc-USP53-13:1 No - lnc-USP53-13:2 No - lnc-PRDM5-1:1 Yes chr3L:20841987-20844340 lnc-NDNF-5:1 Yes chr3L:20841987-20844340 lnc-NDNF-4:1 Yes chr3L:20841987-20844340 lnc-NDNF-3:1 Yes chr3L:20841987-20844340 lnc-NDNF-2:1 No - lnc-NDNF-1:1 No - lnc-TNIP3-1:1 No - lnc-EXOSC9-9:2 No - lnc-TNIP3-2:1 Yes chr3R:21276664-21293998 lnc-EXOSC9-7:2 No - lnc-ANXA5-2:1 No - lnc-TMEM155-3:1 Yes chrX:20171445-20173514 lnc-TMEM155-1:2 No - lnc-TMEM155-1:1 No - lnc-TMEM155-1:3 No - lnc-TMEM155-1:4 No - lnc-TRPC3-1:1 No - lnc-BBS7-1:1 No - lnc-TRPC3-2:2 No - lnc-TRPC3-2:1 No - lnc-TRPC3-3:1 No - lnc-KIAA1109-1:1 Yes chr2L:16888490-16917052 lnc-ADAD1-3:1 Yes chr2L:16888490-16917052 lnc-IL21-2:1 No - lnc-IL21-1:1 No - lnc-IL21-1:2 No - lnc-IL21-1:3 No - lnc-NUDT6-4:1 No - lnc-SPATA5-6:1 Yes chr3R:19794073-19836817 lnc-NUDT6-3:1 No - lnc-SPATA5-4:1 No - lnc-SPATA5-1:2 No - lnc-SPATA5-7:1 Yes chr3L:3401153-3424935 lnc-SPRY1-11:1 No - lnc-SPRY1-11:5 No - lnc-SPRY1-11:10 No - lnc-SPRY1-4:1 No - lnc-SPRY1-11:12 No - lnc-SPRY1-11:23 No - lnc-SPRY1-11:25 No - lnc-SPRY1-11:33 No - lnc-SPRY1-11:36 No - lnc-NUDT6-5:1 No - lnc-SPRY1-6:1 No - lnc-SPRY1-11:37 No - lnc-SPRY1-12:1 No - lnc-SPRY1-8:1 No - lnc-ANKRD50-6:1 No - lnc-FAT4-4:1 No - lnc-ANKRD50-9:1 No - LINC02379:4 No - lnc-ANKRD50-10:1 No - lnc-ANKRD50-5:2 No - lnc-INTU-2:1 No - lnc-INTU-1:1 No - lnc-PLK4-1:1 Yes chr3L:14037019-14043686 lnc-PLK4-1:2 Yes chr3L:14037019-14043686 lnc-PGRMC2-3:8 Yes chr3L:7341884-7345183 lnc-PGRMC2-3:5 No - lnc-PGRMC2-3:7 Yes chr3L:7341884-7345183 lnc-PGRMC2-3:6 Yes chr3L:7341884-7345183 lnc-MFSD8-7:1 No - lnc-MFSD8-8:5 Yes chrX:15887567-15890109 lnc-MFSD8-8:1 Yes chrX:15887567-15890109 lnc-MFSD8-8:3 Yes chrX:15887567-15890109 lnc-MFSD8-8:4 Yes chrX:15887567-15890109 lnc-MFSD8-8:2 Yes chrX:15887567-15890109 lnc-LARP1B-1:6 No - lnc-LARP1B-1:25 No - lnc-LARP1B-6:1 No - lnc-LARP1B-1:7 No - lnc-LARP1B-1:8 No - lnc-LARP1B-1:9 No - lnc-LARP1B-1:10 No - lnc-PGRMC2-2:1 No - lnc-JADE1-5:1 No - lnc-SCLT1-2:3 No - lnc-JADE1-4:1 No - lnc-JADE1-1:1 No - lnc-JADE1-3:1 No - lnc-SCLT1-4:1 No - lnc-SCLT1-4:2 No - lnc-C4orf33-3:1 No - lnc-C4orf33-4:1 No - LINC02466:7 No - LINC02465:10 No - LINC02465:11 No - lnc-C4orf33-5:1 No - lnc-C4orf33-7:1 No - lnc-SCLT1-7:1 No - lnc-C4orf33-8:1 No - LINC02377:8 No - lnc-PCDH10-17:1 No - lnc-PABPC4L-12:1 No - lnc-PCDH10-16:1 No - SNHG27:9 No - lnc-PCDH10-14:1 No - SNHG27:13 No - lnc-PABPC4L-21:1 No - lnc-PABPC4L-21:2 No - lnc-PABPC4L-21:9 No - lnc-PABPC4L-1:1 No - lnc-PABPC4L-5:12 No - lnc-PCDH10-10:1 No - lnc-C4orf33-9:1 No - lnc-PABPC4L-13:1 No - lnc-PABPC4L-15:1 No - lnc-PABPC4L-16:1 No - lnc-PABPC4L-17:1 No - lnc-PCDH10-18:1 No - lnc-PABPC4L-11:1 No - LINC00613:2 No - LINC00613:3 No - lnc-PCDH18-10:1 No - lnc-PCDH18-3:2 No - lnc-PCDH18-9:1 No - LINC02172:5 No - lnc-NOCT-8:2 No - lnc-NOCT-5:2 No - LINC00616:5 No - SLC7A11-AS1:3 No - LINC00616:1 No - SLC7A11-AS1:6 No - SLC7A11-AS1:7 No - lnc-SLC7A11-1:3 No - LINC00498:1 No - LINC00499:1 No - LINC00499:3 No - lnc-SLC7A11-7:1 No - lnc-NOCT-1:5 No - lnc-ELF2-4:1 No - lnc-MGARP-2:1 Yes chr3L:17558672-17619325 lnc-NOCT-13:2 Yes chr3L:17558672-17619325 lnc-ELF2-5:2 Yes chr3L:17558672-17619325 lnc-ELF2-5:1 Yes chr3L:17558672-17619325 lnc-NAA15-3:1 No - lnc-MGARP-1:1 No - lnc-MGARP-1:2 No - lnc-MGARP-1:3 No - lnc-RAB33B-5:1 Yes chrX:19479984-19484643 lnc-SETD7-3:3 No - lnc-NAA15-1:1 No - lnc-NAA15-2:1 No - lnc-SETD7-3:8 No - lnc-SETD7-3:7 No - lnc-SETD7-3:6 No - lnc-MAML3-1:1 No - lnc-RAB33B-9:1 No - lnc-SETD7-4:1 No - lnc-MGST2-2:1 No - lnc-SETD7-6:1 No - lnc-SCOC-1:2 No - lnc-CLGN-5:1 No - SCOC-AS1:1 Yes chr3R:27273705-27274565 lnc-CLGN-4:1 Yes chr3R:27273705-27274565 lnc-MGAT4D-3:4 Yes chr3L:14762028-14767703 lnc-MGAT4D-3:2 Yes chr3L:14762028-14767703 lnc-MGAT4D-3:3 Yes chr3L:14762028-14767703 lnc-MGAT4D-3:1 Yes chr3L:14762028-14767703 lnc-ELMOD2-3:1 No - lnc-ELMOD2-2:1 No - lnc-UCP1-1:1 Yes chr3L:21337681-21343716 lnc-UCP1-2:1 Yes chr3L:21337681-21343716 lnc-ELMOD2-4:1 No - lnc-TBC1D9-4:1 Yes chr2R:25072627-25084347 lnc-ZNF330-2:1 Yes chr2R:25072627-25084347 lnc-ZNF330-2:2 Yes chr2R:25072627-25084347 lnc-ZNF330-3:1 No - lnc-ZNF330-4:1 No - lnc-ZNF330-5:1 No - lnc-IL15-1:1 Yes chrX:14228060-14234066 lnc-FREM3-9:3 Yes chrX:14228060-14234066 lnc-FREM3-9:2 Yes chrX:14228060-14234066 lnc-FREM3-9:1 Yes chrX:14228060-14234066 lnc-FREM3-8:3 Yes chrX:14228060-14234066 lnc-FREM3-8:2 Yes chrX:14228060-14234066 lnc-FREM3-8:1 Yes chrX:14228060-14234066 lnc-FREM3-7:1 Yes chrX:14228060-14234066 lnc-USP38-5:1 No - lnc-INPP4B-4:1 No - lnc-USP38-4:1 No - lnc-INPP4B-2:3 No - lnc-FREM3-6:1 Yes chr3L:2589414-2595590 lnc-SMARCA5-7:1 Yes chr3L:2589414-2595590 lnc-FREM3-4:1 No - lnc-FREM3-2:2 Yes chr2R:12636671-12640628 lnc-FREM3-2:1 Yes chr2R:12636671-12640628 lnc-SMARCA5-4:1 No - lnc-SMARCA5-4:2 No - lnc-SMARCA5-4:3 No - lnc-SMARCA5-4:4 No - lnc-SMARCA5-4:5 No - lnc-SMARCA5-4:6 No - lnc-FREM3-3:1 No - lnc-GYPE-1:2 No - lnc-GYPE-2:1 No - lnc-GYPB-2:3 No - lnc-GYPB-2:4 No - lnc-GYPB-2:5 No - lnc-GYPB-2:6 No - lnc-GYPB-2:7 No - lnc-GYPB-2:8 No - lnc-GYPB-2:1 No - lnc-GYPB-2:2 No - lnc-GYPB-3:5 No - lnc-GYPB-3:4 No - lnc-GYPB-3:3 No - lnc-GYPB-3:2 No - lnc-GYPB-3:1 No - lnc-GYPA-1:4 No - lnc-GYPA-1:5 No - lnc-GYPA-1:3 No - HHIP-AS1:2 No - lnc-ABCE1-5:1 No - lnc-HHIP-1:4 Yes chr2R:17517261-17518186 lnc-OTUD4-3:2 Yes chr2R:17517261-17518186 lnc-OTUD4-5:2 No - lnc-OTUD4-5:1 No - lnc-OTUD4-5:3 No - lnc-ABCE1-3:1 Yes chr2R:17517261-17518186 lnc-OTUD4-5:6 No - lnc-OTUD4-5:5 No - lnc-OTUD4-5:4 No - lnc-ANAPC10-4:1 Yes chr2L:4688965-4690702 lnc-ANAPC10-4:2 Yes chr2L:4688965-4690702 lnc-ABCE1-2:1 No - lnc-OTUD4-1:2 No - lnc-OTUD4-2:1 No - lnc-SMAD1-1:1 No - lnc-MMAA-4:2 Yes chr2L:3146056-3159643 SMAD1-AS2:3 Yes chr2L:3146056-3159643 lnc-ZNF827-4:2 No - LINC02491:5 No - lnc-C4orf51-2:1 No - lnc-SLC10A7-8:1 No - lnc-SLC10A7-7:1 No - lnc-SLC10A7-6:1 No - lnc-SLC10A7-5:1 No - lnc-ZNF827-8:1 No - LINC01095:15 No - LINC01095:2 No - LINC01095:4 No - LINC01095:5 No - lnc-LSM6-1:3 No - LINC01095:6 No - lnc-REELD1-3:1 Yes chr2R:20977056-20977600 lnc-REELD1-2:1 Yes chr2R:20977056-20977600 lnc-TTC29-3:1 No - lnc-TTC29-1:1 No - lnc-SLC10A7-3:1 No - lnc-SLC10A7-4:1 No - lnc-POU4F2-5:1 No - lnc-TMEM184C-2:1 Yes chr2R:17646848-17665068 lnc-TMEM184C-1:1 Yes chr2R:17646848-17665068 LINC02507:5 No - lnc-NR3C2-8:1 No - lnc-TMEM184C-3:1 Yes chrX:15751674-15760733 lnc-NR3C2-5:1 Yes chrX:15751674-15760733 lnc-PRMT9-2:1 No - lnc-NR3C2-1:2 No - lnc-NR3C2-6:1 No - lnc-NR3C2-7:2 No - lnc-NR3C2-7:1 No - LINC02355:6 No - lnc-IQCM-9:1 No - lnc-IQCM-2:8 No - lnc-IQCM-2:6 No - lnc-IQCM-2:7 No - lnc-IQCM-2:5 No - lnc-DCLK2-4:1 No - lnc-MAB21L2-6:1 Yes chr2R:4815426-4824319 lnc-IQCM-11:1 Yes chrX:5085759-5254864 lnc-SH3D19-8:1 Yes chrX:5085759-5254864 lnc-LRBA-4:3 Yes chrX:5085759-5254864 lnc-LRBA-4:2 Yes chrX:5085759-5254864 lnc-RPS3A-2:1 No - lnc-SH3D19-2:1 No - lnc-RPS3A-1:1 No - lnc-LRBA-3:1 No - lnc-LRBA-7:1 No - lnc-LRBA-7:3 No - lnc-LRBA-7:2 No - lnc-PRSS48-1:1 No - lnc-PRSS48-2:1 No - FAM160A1-DT:29 No - FAM160A1-DT:23 No - lnc-FAM160A1-9:1 No - lnc-FAM160A1-8:1 Yes chr2L:2992870-2998726 lnc-FAM160A1-8:2 Yes chr2L:2992870-2998726 lnc-SH3D19-9:1 Yes chr3R:24128049-24130255 lnc-GATB-2:4 No - lnc-FAM160A1-4:2 No - lnc-FBXW7-3:2 No - lnc-FBXW7-3:3 No - lnc-FBXW7-1:3 No - lnc-FBXW7-8:1 No - lnc-FBXW7-7:1 No - lnc-FBXW7-6:1 No - lnc-FBXW7-5:1 Yes chr3L:4246343-4254306 lnc-TMEM154-25:2 Yes chr3L:4246343-4254306 lnc-TMEM154-25:1 Yes chr3L:4246343-4254306 lnc-TMEM154-3:1 Yes chr3L:4246343-4254306 lnc-TMEM154-4:4 Yes chr3L:4246343-4254306 MIR4453HG:10 Yes chr3L:4246343-4254306 MIR4453HG:11 No - lnc-TMEM154-1:1 No - lnc-FBXW7-9:1 No - lnc-ARFIP1-1:2 No - lnc-TMEM154-2:1 No - lnc-FHDC1-4:1 Yes chr3R:11232429-11235013 lnc-FHDC1-4:2 Yes chr3R:11232429-11235013 lnc-TIGD4-3:1 Yes chr3R:11232429-11235013 lnc-ARFIP1-3:1 Yes chr3R:11232429-11235013 lnc-TIGD4-2:2 No - lnc-TRIM2-1:1 No - lnc-TIGD4-5:2 No - lnc-TIGD4-5:1 No - lnc-RNF175-1:1 No - lnc-TMEM131L-3:4 Yes chr3L:20361843-20366724 lnc-TMEM131L-3:5 Yes chr3L:20361843-20366724 lnc-TMEM131L-3:6 Yes chr3L:20361843-20366724 lnc-SFRP2-1:1 Yes chrX:17848110-17850342 lnc-FGB-9:1 No - lnc-FGB-2:1 No - lnc-DCHS2-1:1 Yes chrX:12021068-12022746 lnc-FGA-3:1 Yes chrX:12021068-12022746 lnc-FGB-1:1 No - lnc-FGG-2:1 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-FGA-1:1 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-FGA-2:1 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-FGA-2:2 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-LRAT-1:1 No - lnc-LRAT-1:2 No - lnc-RBM46-2:1 No - lnc-RBM46-1:1 No - lnc-NPY2R-1:5 No - lnc-NPY2R-1:6 No - lnc-NPY2R-1:7 No - lnc-NPY2R-1:9 No - lnc-NPY2R-1:10 No - lnc-NPY2R-1:11 No - lnc-NPY2R-1:12 No - lnc-NPY2R-1:13 No - lnc-NPY2R-1:16 No - lnc-MAP9-3:1 No - lnc-GUCY1A1-3:1 No - lnc-MAP9-5:1 No - lnc-GUCY1A1-4:1 No - lnc-MAP9-6:1 No - lnc-MAP9-7:1 No - lnc-MAP9-8:1 No - lnc-MAP9-9:1 No - lnc-MAP9-10:1 No - lnc-MAP9-11:1 No - lnc-MAP9-12:1 No - lnc-MAP9-13:1 No - lnc-ASIC5-2:1 Yes chr3R:29682503-29685758 lnc-GUCY1A1-1:2 No - lnc-ASIC5-1:1 No - lnc-GUCY1B1-3:1 No - lnc-TDO2-4:1 No - lnc-CTSO-2:4 No - lnc-CTSO-2:3 No - lnc-CTSO-2:2 No - lnc-CTSO-2:1 No - lnc-GLRB-7:1 No - lnc-CTSO-4:1 No - lnc-GLRB-6:1 No - lnc-PDGFC-1:1 No - lnc-PDGFC-2:1 Yes chr3L:6624032-6635059 lnc-TMEM144-5:1 No - lnc-FAM198B-2:1 No - lnc-C4orf46-4:1 No - lnc-TMEM144-2:1 No - FAM198B-AS1:31 No - lnc-FAM198B-1:2 No - lnc-FAM198B-1:3 No - lnc-RXFP1-2:1 No - lnc-RXFP1-2:2 No - lnc-TMEM144-3:1 No - lnc-ETFDH-5:1 Yes chrX:13161714-13189164 lnc-C4orf46-2:2 No - lnc-C4orf46-2:1 No - lnc-ETFDH-1:1 No - lnc-FNIP2-1:1 No - lnc-PPID-1:2 No - lnc-C4orf45-2:1 No - lnc-C4orf45-2:2 No - lnc-RAPGEF2-3:1 No - lnc-C4orf45-3:1 No - lnc-FSTL5-4:1 No - lnc-RAPGEF2-6:1 No - lnc-NAF1-2:1 No - lnc-NPY5R-9:1 No - lnc-NPY5R-2:3 No - lnc-NPY5R-8:1 No - lnc-NPY1R-5:1 Yes chr2L:18698714-18700645 lnc-NPY1R-4:1 Yes chr2L:18698714-18700645 lnc-NPY1R-4:2 Yes chr2L:18698714-18700645 lnc-NPY1R-3:1 No - lnc-NPY1R-2:1 No - lnc-NPY1R-1:1 No - lnc-NPY5R-5:1 No - lnc-TKTL2-1:6 Yes chr3L:9386827-9399227 lnc-TKTL2-1:7 Yes chr3L:9386827-9399227 lnc-TKTL2-1:5 Yes chr3L:9386827-9399227 lnc-TKTL2-2:1 Yes chr3L:9386827-9399227 lnc-TKTL2-1:4 Yes chr3L:9386827-9399227 lnc-TKTL2-1:1 Yes chr3L:9386827-9399227 lnc-TKTL2-1:2 Yes chr3L:9386827-9399227 lnc-TKTL2-1:3 Yes chr3L:9386827-9399227 lnc-SMIM31-8:1 No - lnc-SMIM31-7:1 No - lnc-APELA-1:1 No - lnc-APELA-6:1 No - lnc-TRIM61-5:1 No - lnc-TRIM61-4:1 No - lnc-TRIM61-3:1 No - lnc-TRIM61-2:1 No - lnc-FAM218A-3:1 No - lnc-TMEM192-4:1 No - lnc-FAM218A-4:1 No - lnc-TRIM60-2:1 No - lnc-TRIM61-6:1 No - lnc-TRIM60-1:1 No - lnc-MSMO1-1:1 Yes chr2L:18129884-18138083 lnc-CPE-1:2 No - lnc-GK3P-5:1 No - lnc-CPE-3:1 No - lnc-TLL1-2:1 No - lnc-TLL1-3:1 No - lnc-SPOCK3-3:1 No - lnc-ANXA10-3:1 No - lnc-ANXA10-2:1 No - lnc-DDX60-5:1 No - lnc-DDX60-4:1 No - lnc-DDX60L-4:1 No - lnc-DDX60-2:1 No - lnc-DDX60L-3:5 No - lnc-DDX60L-3:4 No - lnc-DDX60L-3:2 No - lnc-DDX60L-3:3 No - lnc-ANXA10-1:1 No - lnc-DDX60L-2:1 No - lnc-ANXA10-4:1 No - lnc-ANXA10-5:1 No - lnc-SH3RF1-2:1 No - lnc-PALLD-3:1 No - lnc-SH3RF1-1:1 No - lnc-PALLD-4:1 No - lnc-CLCN3-8:1 No - lnc-HPF1-3:2 No - lnc-NEK1-1:1 Yes chr3L:16090454-16096151 lnc-PALLD-8:1 Yes chr3L:16090454-16096151 lnc-NEK1-2:1 Yes chr3R:5791879-5793383 lnc-HPF1-2:3 No - lnc-HPF1-2:4 No - lnc-CLCN3-6:1 No - LINC02275:15 No - lnc-CLCN3-1:5 No - lnc-MFAP3L-1:3 No - lnc-AADAT-7:1 No - LINC01612:4 No - lnc-CLCN3-11:1 No - LINC02382:5 No - lnc-AADAT-11:1 No - lnc-GALNTL6-5:1 No - lnc-AADAT-12:1 No - lnc-HMGB2-14:1 Yes chr2L:3470182-3472364 lnc-HMGB2-13:2 Yes chr2L:3470182-3472364 lnc-HMGB2-13:1 Yes chr2L:3470182-3472364 lnc-HMGB2-11:1 Yes chr2L:3470182-3472364 lnc-GALNT7-3:1 No - lnc-GALNT7-2:1 No - lnc-HMGB2-3:5 Yes chrX:18495067-18499986 lnc-HMGB2-10:1 No - lnc-HMGB2-9:1 No - lnc-HMGB2-3:4 Yes chrX:18495067-18499986 lnc-HMGB2-3:6 No - lnc-HMGB2-5:1 No - lnc-GALNT7-1:1 No - lnc-HMGB2-6:1 No - lnc-SAP30-1:2 No - lnc-SAP30-1:3 No - lnc-SAP30-9:1 No - lnc-SAP30-8:1 Yes chrX:16787283-16789644 lnc-HMGB2-15:2 Yes chrX:16787283-16789644 lnc-HMGB2-15:1 Yes chrX:16787283-16789644 lnc-SAP30-10:1 No - lnc-SAP30-13:1 No - lnc-SAP30-16:1 No - HAND2-AS1:19 No - HAND2-AS1:34 No - HAND2-AS1:37 No - HAND2-AS1:38 No - HAND2-AS1:41 No - HAND2-AS1:42 No - HAND2-AS1:45 No - lnc-SAP30-23:2 No - lnc-HAND2-5:1 No - lnc-SAP30-18:1 No - LINC02269:8 No - lnc-CEP44-8:1 No - lnc-CEP44-6:1 No - lnc-CEP44-1:3 No - lnc-HPGD-1:2 No - lnc-HPGD-3:1 Yes chr3R:11787176-11789393 lnc-HPGD-4:1 Yes chr3R:11787176-11789393 lnc-ADAM29-5:3 No - lnc-ADAM29-5:7 No - lnc-ADAM29-5:8 No - lnc-GLRA3-2:1 No - lnc-ADAM29-2:1 No - lnc-ADAM29-6:1 No - lnc-WDR17-4:1 No - lnc-WDR17-1:2 Yes chr3L:21507852-21512749 lnc-SPATA4-2:1 Yes chr3L:21507852-21512749 lnc-GPM6A-6:1 No - lnc-SPCS3-4:1 Yes chr3L:8647145-8651011 lnc-SPATA4-1:1 No - lnc-SPCS3-3:1 No - lnc-ASB5-2:1 No - lnc-VEGFC-3:1 No - lnc-SPCS3-5:1 No - lnc-SPCS3-6:1 No - LINC02509:5 No - lnc-VEGFC-4:1 No - lnc-NEIL3-5:1 No - lnc-AGA-1:2 No - lnc-NEIL3-7:1 No - lnc-NEIL3-9:1 No - lnc-NEIL3-3:3 No - lnc-TENM3-7:1 No - lnc-DCTD-21:1 No - lnc-DCTD-20:1 No - lnc-TENM3-2:1 No - lnc-TENM3-2:2 No - lnc-DCTD-17:1 No - lnc-DCTD-16:1 No - lnc-DCTD-15:1 No - lnc-DCTD-65:32 No - lnc-DCTD-65:5 No - lnc-DCTD-65:30 No - lnc-DCTD-65:18 No - lnc-WWC2-8:1 No - lnc-DCTD-12:1 No - lnc-TENM3-1:1 No - lnc-WWC2-6:1 No - lnc-WWC2-5:1 No - lnc-WWC2-5:2 No - lnc-DCTD-7:5 No - lnc-WWC2-4:1 No - lnc-DCTD-23:3 No - lnc-WWC2-2:1 No - WWC2-AS1:1 Yes chr3R:14697689-14724261 lnc-CLDN24-2:6 No - lnc-CLDN24-6:4 No - lnc-CLDN24-6:3 No - lnc-WWC2-3:1 No - lnc-CLDN24-4:1 No - lnc-RWDD4-2:3 No - lnc-RWDD4-2:4 No - lnc-RWDD4-2:5 No - lnc-RWDD4-2:2 Yes chr3R:17796376-17798304 lnc-RWDD4-4:1 No - lnc-RWDD4-3:1 No - lnc-TRAPPC11-3:2 Yes chr3L:21075581-21131159 lnc-TRAPPC11-4:1 Yes chr3L:21075581-21131159 lnc-TRAPPC11-4:2 Yes chr3L:21075581-21131159 lnc-IRF2-8:1 No - lnc-STOX2-5:1 No - lnc-ENPP6-3:1 No - lnc-STOX2-8:1 No - lnc-STOX2-7:1 No - lnc-STOX2-9:1 No - lnc-IRF2-7:1 No - LINC02363:11 No - LINC02362:37 No - LINC02362:36 No - LINC02362:26 No - LINC02362:29 No - lnc-CASP3-7:1 No - lnc-CASP3-6:1 No - lnc-CASP3-5:1 No - lnc-PRIMPOL-7:2 No - lnc-PRIMPOL-7:3 No - lnc-PRIMPOL-7:9 No - LINC02427:19 No - LINC02427:18 No - lnc-IRF2-1:11 No - lnc-CASP3-4:1 No - lnc-PRIMPOL-4:1 No - LINC02365:10 No - lnc-CASP3-2:3 No - lnc-CASP3-2:2 No - lnc-CENPU-1:1 Yes chr3L:18878250-18890483 lnc-CENPU-1:2 Yes chr3L:18878250-18890483 lnc-PRIMPOL-6:4 Yes chr3L:18878250-18890483 lnc-PRIMPOL-6:6 No - MIR3945HG:5 No - lnc-PRIMPOL-6:7 No - LINC01093:12 No - LINC01093:3 No - LINC01093:14 No - lnc-ACSL1-6:1 No - lnc-HELT-5:1 No - LINC02437:5 No - LINC02436:11 No - LINC02436:12 No - LINC02436:13 No - LINC02436:14 No - lnc-HELT-4:1 No - lnc-SLC25A4-1:1 Yes chrX:10778954-10786907 lnc-LRP2BP-1:1 No - lnc-LRP2BP-2:3 No - lnc-LRP2BP-4:1 Yes chr2R:6974038-6975133 lnc-C4orf47-1:1 No - lnc-SORBS2-3:1 No - lnc-PDLIM3-2:1 Yes chr2R:10269016-10307024 lnc-PDLIM3-3:1 Yes chr2R:10269016-10307024 lnc-PDLIM3-4:1 Yes chr2R:10269016-10307024 lnc-PDLIM3-5:1 Yes chr2R:10269016-10307024 lnc-PDLIM3-6:5 Yes chr2R:10269016-10307024 lnc-PDLIM3-6:9 Yes chr2R:10269016-10307024 lnc-PDLIM3-6:8 Yes chr2R:10269016-10307024 lnc-PDLIM3-6:6 Yes chr2R:10269016-10307024 lnc-PDLIM3-6:7 Yes chr2R:10269016-10307024 lnc-PDLIM3-6:1 Yes chr2R:10269016-10307024 lnc-PDLIM3-6:4 Yes chr2R:10269016-10307024 lnc-PDLIM3-6:2 Yes chr2R:10269016-10307024 lnc-PDLIM3-6:3 Yes chr2R:10269016-10307024 lnc-TLR3-2:2 Yes chr2R:10269016-10307024 lnc-TLR3-2:3 Yes chr2R:10269016-10307024 lnc-CYP4V2-3:1 No - lnc-SORBS2-4:1 No - lnc-KLKB1-1:1 Yes chr3R:30894038-30900688 lnc-KLKB1-1:2 Yes chr3R:30894038-30900688 lnc-KLKB1-1:3 Yes chr3R:30894038-30900688 lnc-KLKB1-1:4 Yes chr3R:30894038-30900688 lnc-KLKB1-2:1 Yes chr2R:7540111-7564435 F11-AS1:1 No - lnc-MTNR1A-7:1 No - lnc-F11-5:1 No - lnc-MTNR1A-6:1 No - F11-AS1:2 Yes chr2R:9599909-9601252 lnc-F11-8:1 No - lnc-MTNR1A-2:1 Yes chr3L:20005301-20024607 lnc-MTNR1A-3:2 Yes chr3L:20005301-20024607 lnc-MTNR1A-3:1 Yes chr3L:20005301-20024607 lnc-MTNR1A-4:1 Yes chr3L:20005301-20024607 lnc-MTNR1A-66:1 Yes chr3L:20005301-20024607 lnc-F11-10:1 No - lnc-F11-2:2 No - lnc-F11-2:15 No - lnc-F11-2:16 No - LINC02374:13 No - lnc-FAT1-3:2 No - lnc-ZFP42-13:1 No - LINC02515:4 No - lnc-ZFP42-4:2 No - lnc-TRIML2-12:1 No - lnc-ZFP42-11:1 No - LINC02492:11 No - lnc-ZFP42-10:1 No - LINC02492:12 No - lnc-ZFP42-2:11 No - lnc-ZFP42-2:12 No - lnc-ZFP42-2:13 No - lnc-ZFP42-2:14 No - lnc-TRIML2-10:1 No - lnc-ZFP42-1:2 No - lnc-TRIML2-2:3 No - lnc-TRIML2-2:2 No - lnc-TRIML2-6:9 No - lnc-TRIML2-6:8 No - lnc-TRIML1-7:1 No - LINC02434:6 No - lnc-TRIML1-2:2 No - lnc-TRIML2-8:1 No - LINC01060:6 No - LINC01060:7 No - LINC01060:13 No - lnc-TRIML1-8:1 No - lnc-TRIML1-9:1 No - lnc-TRIML2-14:7 No - lnc-FRG1-6:3 No - lnc-FRG1-12:1 No - lnc-FRG1-11:1 No - lnc-FRG1-11:2 No - lnc-FRG1-11:11 No - FRG1-DT:29 No - lnc-FRG1-8:1 No - lnc-FRG1-8:2 No - FRG1-DT:25 No - LINC01596:1 No - LINC01596:2 No - LINC01596:4 No - lnc-FRG2-10:1 No - lnc-FRG1-7:1 No - lnc-FRG2-9:1 No - lnc-FRG1-5:7 No - lnc-FRG1-5:8 No - lnc-FRG2-6:1 No - lnc-FRG2-8:1 No - lnc-FRG1-4:12 No - lnc-FRG1-10:1 No - lnc-DUX4-2:1 No - lnc-PLEKHG4B-1:4 No - lnc-CCDC127-3:2 No - lnc-CCDC127-3:1 No - lnc-CCDC127-1:3 No - lnc-SLC9A3-5:1 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-SLC9A3-4:1 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-EXOC3-6:1 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-SLC9A3-1:6 No - lnc-EXOC3-3:1 No - lnc-EXOC3-3:2 No - lnc-EXOC3-3:3 No - lnc-EXOC3-3:4 No - lnc-EXOC3-3:5 No - lnc-EXOC3-3:6 No - lnc-EXOC3-3:9 No - lnc-SLC9A3-1:3 No - lnc-SLC9A3-1:7 Yes chr2L:21104568-21134255 lnc-TPPP-5:1 Yes chr2L:21104568-21134255 lnc-CEP72-4:1 No - lnc-TPPP-2:2 No - lnc-EXOC3-12:1 No - lnc-TPPP-1:3 No - lnc-TPPP-1:4 No - lnc-TPPP-1:2 No - lnc-CEP72-1:1 Yes chr3L:16354746-16359428 lnc-CEP72-3:1 No - lnc-ZDHHC11B-1:1 Yes chr2L:259949-267505 lnc-ZDHHC11-5:1 Yes chr2L:259949-267505 lnc-ZDHHC11-4:1 Yes chr2L:259949-267505 lnc-ZDHHC11B-2:1 No - lnc-TRIP13-2:1 No - lnc-ZDHHC11-2:5 Yes chr2L:259949-267505 lnc-TRIP13-3:1 Yes chr2L:259949-267505 lnc-ZDHHC11-2:3 Yes chr2L:259949-267505 lnc-ZDHHC11-2:4 Yes chr2L:259949-267505 lnc-ZDHHC11-2:2 Yes chr2L:259949-267505 lnc-BRD9-1:4 No - lnc-ZDHHC11-3:1 Yes chr2L:7782865-7786061 lnc-BRD9-1:3 Yes chr2L:7782865-7786061 lnc-BRD9-1:2 Yes chr2L:7782865-7786061 lnc-SLC12A7-1:19 No - lnc-NKD2-3:8 No - lnc-SLC12A7-1:18 No - lnc-SLC12A7-1:20 No - lnc-TERT-5:1 Yes chr2R:23907654-23925066 lnc-SLC12A7-5:11 No - lnc-SLC12A7-5:5 No - lnc-SLC12A7-5:4 No - lnc-SLC12A7-5:12 No - lnc-SLC12A7-5:13 No - lnc-SLC12A7-5:9 No - lnc-SLC12A7-5:8 No - lnc-SLC12A7-5:7 No - lnc-SLC12A7-5:6 No - lnc-TERT-3:1 No - lnc-TERT-2:1 Yes chrX:13155038-13157372 lnc-SLC6A18-1:1 Yes chrX:13155038-13157372 lnc-TERT-6:1 Yes chrX:13155038-13157372 lnc-SLC6A18-2:1 No - LINC01511:4 No - lnc-SLC6A3-1:1 No - lnc-SLC6A3-4:1 No - lnc-LPCAT1-3:33 No - lnc-LPCAT1-4:32 No - lnc-LPCAT1-4:31 No - lnc-LPCAT1-4:29 No - lnc-NDUFS6-18:1 No - lnc-LPCAT1-4:26 No - lnc-LPCAT1-4:30 No - lnc-NDUFS6-17:1 No - lnc-LPCAT1-4:21 No - lnc-LPCAT1-4:14 No - lnc-LPCAT1-4:19 No - lnc-LPCAT1-4:28 No - lnc-LPCAT1-4:24 No - lnc-LPCAT1-4:17 No - lnc-LPCAT1-4:25 No - lnc-NDUFS6-16:1 No - lnc-NDUFS6-15:1 No - lnc-LPCAT1-4:23 No - lnc-LPCAT1-4:22 No - lnc-LPCAT1-4:4 No - lnc-LPCAT1-4:5 No - lnc-LPCAT1-4:12 No - lnc-LPCAT1-4:13 No - lnc-LPCAT1-4:16 No - lnc-LPCAT1-4:18 No - lnc-LPCAT1-4:6 No - lnc-LPCAT1-4:7 No - lnc-LPCAT1-4:8 No - lnc-LPCAT1-4:9 No - lnc-LPCAT1-4:10 No - lnc-LPCAT1-4:11 No - lnc-NDUFS6-9:1 No - LINC02116:4 No - lnc-NDUFS6-10:1 No - lnc-NDUFS6-2:2 Yes chr3L:12693639-12710249 lnc-IRX4-2:2 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-NDUFS6-5:7 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX4-5:1 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX4-4:3 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-C5orf38-1:8 No - lnc-C5orf38-1:9 No - lnc-C5orf38-4:3 No - lnc-IRX1-5:2 No - lnc-IRX2-9:1 No - lnc-IRX1-3:2 No - LINC02162:6 No - lnc-MED10-11:4 No - lnc-MED10-11:3 No - lnc-MED10-11:2 No - lnc-ADAMTS16-2:3 No - LINC01020:1 No - lnc-MED10-9:3 No - LINC01020:5 No - LINC02121:4 No - lnc-ADAMTS16-6:1 No - lnc-MED10-6:3 No - lnc-MED10-6:4 No - lnc-MED10-21:1 No - lnc-MED10-20:1 No - lnc-MED10-19:1 No - lnc-MED10-18:1 No - lnc-MED10-17:1 No - lnc-MED10-16:1 No - lnc-MED10-14:1 No - lnc-ICE1-2:1 No - lnc-ICE1-1:3 No - lnc-ICE1-5:1 No - lnc-UBE2QL1-3:1 No - lnc-UBE2QL1-2:1 No - lnc-NSUN2-6:1 Yes chr3L:16232084-16232777 lnc-NSUN2-5:1 Yes chr3L:16232084-16232777 lnc-NSUN2-2:1 No - LINC01018:9 No - LINC01018:11 No - LINC01018:12 No - lnc-MED10-13:4 Yes chrX:4111156-4113734 lnc-MED10-24:1 Yes chrX:4111156-4113734 lnc-MED10-25:1 Yes chrX:4111156-4113734 lnc-SRD5A1-3:1 No - lnc-PAPD7-2:2 No - lnc-NSUN2-3:1 No - lnc-PAPD7-2:3 No - lnc-NSUN2-4:1 No - lnc-NSUN2-7:1 No - lnc-ADCY2-5:4 No - lnc-C5orf49-6:1 No - lnc-ADCY2-10:1 No - lnc-C5orf49-5:1 No - lnc-C5orf49-5:2 No - lnc-ADCY2-3:2 No - lnc-C5orf49-2:7 No - LINC02142:9 No - lnc-C5orf49-1:2 Yes chr3L:19939287-19977960 lnc-MTRR-7:2 No - lnc-FASTKD3-2:2 Yes chr3R:16443207-16445010 lnc-FASTKD3-2:1 Yes chr3R:16443207-16445010 lnc-FASTKD3-2:3 Yes chr3R:16443207-16445010 lnc-MTRR-9:3 Yes chr3R:16443207-16445010 lnc-FASTKD3-3:1 No - lnc-FASTKD3-4:1 No - LINC02226:19 No - lnc-FASTKD3-5:1 No - LINC02226:17 No - MIR4458HG:1 No - lnc-SEMA5A-11:1 No - MIR4458HG:3 No - MIR4458HG:13 No - lnc-SEMA5A-10:1 No - lnc-MTRR-4:4 No - lnc-MTRR-4:5 No - lnc-MTRR-13:1 No - lnc-SEMA5A-9:1 No - lnc-MTRR-14:1 No - lnc-SEMA5A-8:1 No - lnc-SEMA5A-7:1 No - lnc-SEMA5A-6:1 No - lnc-SEMA5A-5:1 No - lnc-MTRR-16:1 No - lnc-MTRR-16:2 No - lnc-SEMA5A-2:2 No - lnc-MTRR-17:1 No - lnc-MTRR-17:2 No - lnc-SEMA5A-3:1 No - lnc-TAS2R1-24:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-CCT5-31:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-TAS2R1-23:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-CCT5-30:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-TAS2R1-22:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-CCT5-29:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-TAS2R1-21:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-CCT5-28:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-CCT5-27:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-CCT5-26:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-TAS2R1-20:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-CCT5-25:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-TAS2R1-19:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-CCT5-24:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-CCT5-23:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-TAS2R1-18:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-CCT5-22:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-TAS2R1-17:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-TAS2R1-16:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-CCT5-21:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-TAS2R1-15:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-TAS2R1-14:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-TAS2R1-13:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-TAS2R1-12:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-TAS2R1-11:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-CCT5-20:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-CCT5-19:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-CCT5-18:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-TAS2R1-9:2 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-TAS2R1-9:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-CCT5-17:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-CCT5-16:1 Yes chr3L:12067511-12081830 lnc-TAS2R1-5:1 Yes chr3L:12067511-12081830 SNHG18:4 No - SNHG18:5 No - LINC02112:27 No - lnc-SEMA5A-4:2 No - LINC02112:26 No - lnc-CCT5-15:1 No - lnc-TAS2R1-6:1 No - lnc-TAS2R1-7:1 No - LINC02221:7 No - LINC02112:23 No - lnc-TAS2R1-8:1 No - lnc-CCT5-14:1 No - lnc-CCT5-13:1 No - lnc-CCT5-12:1 No - lnc-FAM173B-9:1 No - lnc-CCT5-11:1 No - lnc-CCT5-10:1 No - lnc-CCT5-9:1 No - lnc-FAM173B-6:1 No - lnc-FAM173B-5:1 No - lnc-CCT5-8:1 No - lnc-CCT5-7:1 Yes chr3R:21220704-21223584 lnc-FAM173B-3:1 Yes chr2R:12174802-12177516 lnc-MARCH6-6:1 Yes chr2R:12174802-12177516 lnc-CMBL-5:1 Yes chr2R:12174802-12177516 lnc-CMBL-2:1 No - lnc-FAM173B-8:1 No - lnc-FAM173B-8:2 No - lnc-FAM173B-7:1 No - lnc-MARCH6-4:1 No - lnc-MARCH6-4:2 No - lnc-MARCH6-8:1 No - lnc-CMBL-1:10 No - lnc-CMBL-1:2 Yes chr3L:2367843-2371939 lnc-CMBL-7:1 Yes chr3L:2367843-2371939 lnc-ROPN1L-9:1 Yes chr3L:2367843-2371939 lnc-ROPN1L-8:1 Yes chr3L:2367843-2371939 lnc-ROPN1L-8:2 Yes chr3L:2367843-2371939 lnc-ROPN1L-7:1 Yes chr3L:2367843-2371939 lnc-ROPN1L-4:1 Yes chr3L:2367843-2371939 lnc-ROPN1L-2:2 Yes chr3L:2367843-2371939 lnc-MARCH6-3:2 Yes chr3L:2367843-2371939 lnc-CMBL-8:1 No - lnc-CMBL-9:1 No - lnc-ROPN1L-5:1 No - LINC02212:11 No - LINC02212:9 No - LINC02212:12 No - LINC02212:13 No - LINC02213:6 No - lnc-ANKRD33B-4:1 No - lnc-ANKRD33B-4:2 No - lnc-ANKRD33B-3:1 No - lnc-ANKRD33B-3:2 No - lnc-DAP-16:1 No - lnc-ROPN1L-11:1 No - lnc-ROPN1L-12:1 No - lnc-ROPN1L-13:1 No - lnc-DAP-5:1 No - lnc-DAP-4:1 No - lnc-DAP-3:1 No - lnc-CTNND2-10:3 Yes chr2R:11357902-11359176 lnc-CTNND2-10:1 Yes chr2R:11357902-11359176 lnc-ANKRD33B-5:1 Yes chr2R:11357902-11359176 lnc-ANKRD33B-6:1 Yes chr2R:11357902-11359176 lnc-ANKRD33B-7:1 Yes chr2R:11357902-11359176 lnc-CTNND2-6:1 Yes chr2R:11357902-11359176 lnc-CTNND2-7:1 Yes chr2R:11357902-11359176 lnc-CTNND2-8:1 Yes chr2R:11357902-11359176 lnc-CTNND2-9:1 Yes chr2R:11357902-11359176 lnc-ANKRD33B-8:1 Yes chr2R:11357902-11359176 lnc-CTNND2-10:2 Yes chr2R:11357902-11359176 lnc-ANKRD33B-9:1 Yes chr2R:11357902-11359176 lnc-CTNND2-10:4 Yes chr2R:11357902-11359176 lnc-CTNND2-2:1 Yes chr2R:11357902-11359176 lnc-DAP-7:1 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-DAP-8:1 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-DAP-9:1 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-ANKRD33B-11:1 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-DAP-10:1 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-DAP-17:1 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-ANKRD33B-12:1 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-ANKRD33B-13:1 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-DAP-12:1 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-DAP-13:2 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-DAP-13:1 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-ANKRD33B-14:1 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-DAP-15:3 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-DAP-14:1 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-DAP-15:2 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-CTNND2-1:2 No - LINC01194:4 No - LINC01194:5 No - lnc-CTNND2-3:1 No - lnc-CTNND2-4:1 No - lnc-TRIO-8:1 No - lnc-DNAH5-8:1 No - lnc-DNAH5-7:1 No - lnc-DNAH5-6:1 No - lnc-TRIO-7:1 No - lnc-DNAH5-3:1 No - lnc-DNAH5-4:1 No - lnc-DNAH5-5:1 No - lnc-FAM105A-8:1 Yes chr3L:995982-1034875 lnc-FAM105A-8:2 Yes chr3L:995982-1034875 lnc-FAM105A-8:3 Yes chr3L:995982-1034875 lnc-FAM105A-8:4 Yes chr3L:995982-1034875 lnc-FAM105A-8:5 Yes chr3L:995982-1034875 lnc-FAM105A-1:1 No - lnc-FAM105A-2:1 No - lnc-ANKH-1:4 No - lnc-DNAH5-9:1 No - lnc-ANKH-4:1 No - lnc-ANKH-5:1 No - lnc-FBXL7-7:1 No - lnc-FBXL7-6:1 No - lnc-FBXL7-5:1 No - lnc-MARCH11-2:3 Yes chr3R:15920898-15932887 lnc-OTULIN-10:1 Yes chr3R:15920898-15932887 lnc-OTULIN-11:1 Yes chr3R:15920898-15932887 lnc-MARCH11-1:2 Yes chr2R:20727829-20730610 lnc-MARCH11-3:1 No - lnc-FBXL7-3:2 No - lnc-FBXL7-9:1 Yes chrX:17861002-17862775 lnc-FBXL7-10:1 Yes chrX:17861002-17862775 lnc-ZNF622-2:1 No - lnc-BASP1-6:2 No - lnc-MYO10-4:1 No - lnc-BASP1-12:1 No - lnc-RETREG1-1:1 No - BASP1-AS1:21 No - lnc-FBXL7-11:1 No - lnc-BASP1-10:1 No - LINC02217:26 No - LINC02217:29 No - LINC02217:43 No - lnc-MYO10-9:2 No - lnc-MYO10-9:1 No - lnc-MYO10-10:1 No - lnc-MYO10-11:1 No - lnc-MYO10-12:1 No - lnc-MYO10-13:1 No - lnc-MYO10-14:1 No - lnc-MYO10-15:1 No - lnc-MYO10-16:1 No - lnc-MYO10-17:1 No - lnc-MYO10-18:1 No - lnc-MYO10-19:1 No - lnc-MYO10-20:2 No - lnc-MYO10-20:1 No - LINC02223:10 No - LINC02223:11 No - lnc-MYO10-21:1 No - lnc-BASP1-14:1 No - LINC02100:27 No - lnc-BASP1-15:1 No - lnc-CDH18-17:1 No - lnc-BASP1-16:1 No - lnc-BASP1-17:1 No - LINC02100:33 No - LINC02100:32 No - LINC02100:31 No - LINC02100:30 No - LINC02100:29 No - LINC02100:28 No - lnc-CDH18-10:1 No - lnc-CDH18-9:1 No - lnc-BASP1-18:1 No - lnc-BASP1-19:1 No - lnc-BASP1-20:1 No - lnc-BASP1-21:1 No - lnc-BASP1-22:1 No - lnc-CDH18-7:1 No - lnc-CDH12-8:3 No - lnc-CDH12-8:1 No - lnc-CDH12-8:2 No - lnc-CDH12-6:1 No - CDH18-AS1:4 No - lnc-CDH12-5:1 No - LINC02241:7 No - lnc-CDH18-8:1 No - lnc-CDH12-1:3 No - lnc-PRDM9-17:1 No - lnc-PRDM9-17:3 No - lnc-PRDM9-17:4 No - lnc-CDH12-2:1 No - lnc-PRDM9-13:1 No - lnc-PRDM9-14:7 No - lnc-PRDM9-11:1 No - lnc-PRDM9-21:2 No - lnc-CDH18-18:2 No - lnc-CDH18-18:1 No - lnc-PRDM9-10:1 No - lnc-PRDM9-10:2 No - lnc-PRDM9-10:3 No - lnc-PRDM9-10:4 No - lnc-PRDM9-10:5 No - lnc-PRDM9-10:6 No - lnc-PRDM9-10:7 No - lnc-PRDM9-10:8 No - lnc-PRDM9-10:9 No - lnc-CDH18-19:1 No - lnc-CDH10-11:1 No - lnc-PRDM9-9:1 No - lnc-PRDM9-9:2 No - lnc-PRDM9-7:1 No - lnc-CDH12-3:1 No - lnc-CDH12-4:1 No - lnc-BASP1-5:2 Yes chr2L:12046711-12048918 lnc-PRDM9-6:1 No - lnc-PRDM9-8:2 No - lnc-PRDM9-18:1 No - lnc-PRDM9-18:2 No - lnc-CDH12-7:1 No - lnc-CDH10-7:1 No - lnc-CDH10-9:1 No - lnc-PRDM9-22:1 No - lnc-CDH10-6:5 No - lnc-CDH10-6:4 No - lnc-CDH10-10:1 No - lnc-PRDM9-24:1 No - lnc-CDH9-8:1 No - PURPL:28 No - PURPL:33 No - PURPL:34 No - lnc-CDH6-22:1 No - lnc-CDH9-10:1 No - lnc-CDH6-18:1 No - lnc-CDH6-17:1 No - lnc-CDH9-11:1 No - lnc-CDH6-16:1 No - lnc-CDH9-12:1 No - lnc-CDH6-15:1 No - lnc-CDH9-13:1 No - lnc-CDH6-14:1 No - lnc-CDH6-13:1 No - lnc-CDH6-12:1 No - lnc-CDH9-14:1 No - lnc-CDH6-11:1 No - LINC02109:30 No - LINC02109:31 No - LINC02109:36 No - LINC02109:37 No - LINC02109:40 No - LINC02109:43 No - LINC02109:44 No - LINC02109:54 No - lnc-CDH6-8:1 No - lnc-DROSHA-11:1 No - lnc-DROSHA-10:1 No - lnc-CDH6-7:1 No - lnc-CDH6-6:1 No - lnc-DROSHA-6:2 No - lnc-CDH6-1:2 No - lnc-CDH6-1:3 No - lnc-CDH6-5:1 No - lnc-CDH6-4:1 No - lnc-DROSHA-9:1 No - lnc-C5orf22-7:1 No - lnc-C5orf22-7:2 No - lnc-C5orf22-5:1 No - lnc-GOLPH3-6:1 Yes chr2R:7932429-7936840 lnc-GOLPH3-5:1 Yes chr2R:7932429-7936840 lnc-GOLPH3-4:1 Yes chr2R:7932429-7936840 lnc-GOLPH3-3:1 Yes chr2R:7932429-7936840 lnc-C5orf22-4:1 No - lnc-C5orf22-4:2 No - lnc-DROSHA-8:1 Yes chr2R:22855688-22858794 lnc-GOLPH3-2:1 Yes chr2R:22855688-22858794 lnc-C5orf22-6:1 Yes chr2R:22855688-22858794 lnc-C5orf22-8:1 Yes chr2R:22855688-22858794 lnc-PDZD2-1:2 Yes chr2L:2226342-2231099 lnc-PDZD2-3:1 No - lnc-SUB1-1:1 No - lnc-ZFR-2:1 No - lnc-NPR3-2:4 No - lnc-ADAMTS12-5:1 No - lnc-TARS-6:1 No - lnc-TARS-5:1 No - lnc-ADAMTS12-2:2 Yes chr2L:12103751-12107170 lnc-TARS-3:1 No - lnc-TARS-2:1 No - lnc-TARS-4:1 No - lnc-SLC45A2-2:1 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-RXFP3-2:1 Yes chr3L:25236940-25670980 lnc-SLC45A2-1:1 No - lnc-C1QTNF3-AMACR-2:4 No - lnc-C1QTNF3-AMACR-2:6 No - lnc-C1QTNF3-AMACR-2:5 No - lnc-C1QTNF3-AMACR-2:1 No - lnc-C1QTNF3-AMACR-3:1 No - lnc-C1QTNF3-AMACR-2:2 No - lnc-RAI14-2:1 No - lnc-RAD1-5:3 No - lnc-RAD1-5:1 No - lnc-RAD1-4:1 No - lnc-BRIX1-3:1 No - lnc-AGXT2-1:3 Yes chr2L:2573436-2575052 lnc-AGXT2-1:2 No - lnc-DNAJC21-2:1 No - lnc-SPEF2-2:1 No - lnc-CAPSL-3:1 No - lnc-IL7R-1:3 No - lnc-CAPSL-2:1 No - lnc-UGT3A2-1:1 No - lnc-UGT3A2-2:1 No - lnc-UGT3A2-3:1 Yes chr3R:9404385-9407857 lnc-UGT3A2-4:1 Yes chr3R:9404385-9407857 lnc-NADK2-1:1 Yes chr3R:9404385-9407857 lnc-RANBP3L-2:1 Yes chr2R:9089774-9092893 lnc-RANBP3L-2:2 Yes chr2R:9089774-9092893 lnc-RANBP3L-2:3 Yes chr2R:9089774-9092893 lnc-SKP2-4:1 No - lnc-RANBP3L-4:2 No - lnc-RANBP3L-4:5 No - NIPBL-DT:11 No - lnc-NIPBL-3:1 No - lnc-NIPBL-2:1 No - lnc-NIPBL-4:1 No - lnc-NIPBL-5:1 No - lnc-NUP155-6:1 No - lnc-NUP155-4:1 No - lnc-NUP155-3:1 No - lnc-NUP155-2:1 No - lnc-WDR70-5:1 No - lnc-WDR70-5:2 No - lnc-NUP155-1:1 No - lnc-C5orf42-4:1 Yes chr2L:11004820-11010921 lnc-WDR70-4:1 No - lnc-NUP155-5:1 Yes chr2R:23809236-23811398 lnc-GDNF-3:1 No - lnc-WDR70-7:7 No - LINC02117:5 No - lnc-WDR70-7:22 No - lnc-LIFR-9:1 Yes chr2R:16031930-16047243 EGFLAM-AS2:1 Yes chr2R:16031930-16047243 EGFLAM-AS2:2 Yes chr2R:16031930-16047243 lnc-LIFR-8:1 Yes chr2R:16031930-16047243 lnc-RICTOR-8:1 No - lnc-RICTOR-6:1 No - LIFR-AS1:3 No - lnc-LIFR-6:1 No - lnc-RICTOR-54:4 No - lnc-LIFR-4:3 No - lnc-RICTOR-54:15 No - lnc-RICTOR-54:14 No - lnc-FYB1-5:1 No - lnc-FYB1-3:2 Yes chrX:19252111-19261240 lnc-FYB1-3:1 Yes chrX:19252111-19261240 lnc-FYB1-1:2 No - lnc-FYB1-1:1 No - lnc-RICTOR-2:1 No - lnc-C9-2:1 No - lnc-C9-1:6 No - lnc-C9-1:10 No - lnc-FYB1-2:1 No - lnc-C9-1:8 No - lnc-C9-1:9 No - lnc-C9-1:7 No - lnc-C9-1:5 No - lnc-C9-1:4 No - lnc-C9-1:2 No - lnc-C9-1:3 No - lnc-C9-1:1 Yes chr3L:16712126-16724575 LINC02104:12 No - LINC02104:20 No - lnc-DAB2-2:1 No - lnc-DAB2-3:1 No - lnc-PTGER4-5:1 No - lnc-PTGER4-1:2 No - lnc-PRKAA1-3:1 No - lnc-PRKAA1-2:2 No - lnc-PRKAA1-2:1 No - lnc-TTC33-3:1 Yes chrX:1375536-1378896 lnc-TTC33-4:1 Yes chrX:1375536-1378896 lnc-CARD6-1:1 No - lnc-RPL37-1:6 Yes chrX:15137870-15139367 lnc-RPL37-1:5 Yes chrX:15137870-15139367 lnc-RPL37-1:4 Yes chrX:15137870-15139367 lnc-RPL37-1:2 Yes chrX:15137870-15139367 lnc-RPL37-1:3 Yes chrX:15137870-15139367 lnc-MROH2B-2:1 No - lnc-MROH2B-1:1 Yes chrX:9275318-9283117 lnc-C7-1:1 Yes chrX:9275318-9283117 lnc-MROH2B-3:1 No - lnc-C7-2:1 Yes chr2L:20089636-20091348 lnc-PLCXD3-2:1 Yes chr3L:1963143-1966805 lnc-PLCXD3-3:1 Yes chr3L:1963143-1966805 lnc-C5orf51-4:1 No - lnc-FBXO4-1:2 No - lnc-GHR-3:1 No - lnc-SELENOP-5:2 No - lnc-CCDC152-5:1 No - lnc-ANXA2R-8:1 No - lnc-ANXA2R-8:6 No - lnc-ANXA2R-8:5 No - lnc-ANXA2R-8:4 No - lnc-ANXA2R-8:2 No - lnc-ANXA2R-8:3 No - lnc-CCDC152-3:1 No - lnc-SELENOP-3:2 No - lnc-SELENOP-4:2 No - lnc-CCDC152-4:1 No - lnc-SELENOP-1:5 No - lnc-ANXA2R-7:1 No - lnc-ZNF131-9:1 No - lnc-ANXA2R-1:25 No - lnc-ZNF131-8:1 No - lnc-ANXA2R-1:19 No - lnc-ZNF131-10:3 No - lnc-ZNF131-1:26 No - lnc-ZNF131-1:27 No - lnc-ZNF131-2:7 No - lnc-ANXA2R-1:13 No - lnc-ANXA2R-1:1 No - lnc-ZNF131-2:12 No - lnc-ZNF131-2:13 No - lnc-ZNF131-2:17 No - lnc-ZNF131-2:18 No - lnc-ZNF131-2:19 No - lnc-ZNF131-2:20 No - lnc-HMGCS1-3:1 No - lnc-NIM1K-3:1 Yes chr2L:1083091-1102504 lnc-NIM1K-3:2 Yes chr2L:1083091-1102504 lnc-NIM1K-3:3 Yes chr2L:1083091-1102504 lnc-HMGCS1-2:1 Yes chr2L:1083091-1102504 lnc-HMGCS1-1:1 No - lnc-CCL28-2:2 Yes chr2R:16336090-16341242 lnc-CCL28-2:1 Yes chr2R:16336090-16341242 lnc-NIM1K-5:1 No - lnc-NIM1K-5:2 No - lnc-TMEM267-3:1 No - lnc-TMEM267-1:1 Yes chr3L:3936060-3937992 lnc-TMEM267-2:1 No - lnc-PAIP1-2:1 No - lnc-NNT-2:2 No - lnc-NNT-5:1 No - NNT-AS1:2 No - lnc-PAIP1-3:2 No - lnc-PAIP1-3:1 No - lnc-MRPS30-10:1 No - MRPS30-DT:73 No - MRPS30-DT:47 Yes chrX:15786047-15788288 lnc-MRPS30-7:1 Yes chrX:15786047-15788288 lnc-MRPS30-8:2 No - lnc-MRPS30-11:1 No - lnc-MRPS30-12:1 Yes chr2R:14276130-14300095 lnc-MRPS30-13:1 Yes chr2R:14276130-14300095 lnc-MRPS30-14:1 No - lnc-MOCS2-9:1 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-EMB-6:1 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-PARP8-3:1 No - lnc-PARP8-2:2 No - lnc-ISL1-2:1 No - lnc-EMB-4:4 No - lnc-EMB-4:3 No - lnc-EMB-9:1 No - lnc-EMB-10:1 No - lnc-ISL1-4:1 No - LINC02118:4 No - lnc-ITGA1-5:1 No - lnc-MOCS2-6:1 No - lnc-MOCS2-2:3 No - lnc-PELO-2:1 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-ITGA2-5:1 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-ITGA2-4:3 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-ARL15-7:1 Yes chr3R:25125632-25127359 lnc-MOCS2-5:1 No - lnc-FST-4:1 No - LINC02105:7 No - lnc-ARL15-5:1 No - lnc-NDUFS4-1:1 No - lnc-ESM1-5:1 No - LINC01033:6 No - lnc-HSPB3-2:1 No - lnc-SNX18-1:2 No - lnc-ESM1-3:2 No - lnc-GZMK-3:1 No - lnc-GZMK-3:2 No - lnc-ESM1-2:1 No - lnc-ESM1-1:13 No - lnc-ESM1-1:4 No - lnc-ESM1-1:10 No - lnc-ESM1-1:6 No - lnc-GZMA-1:1 No - lnc-CCNO-1:1 No - lnc-MTREX-2:1 No - lnc-CCNO-2:1 No - lnc-DHX29-1:1 Yes chr2L:15752263-15755900 lnc-PLPP1-1:1 Yes chr2L:15752263-15755900 lnc-SLC38A9-5:3 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-SLC38A9-5:4 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-SLC38A9-5:5 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-SLC38A9-5:2 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-DDX4-1:1 No - lnc-SLC38A9-3:3 No - lnc-SLC38A9-3:5 No - lnc-SLC38A9-3:4 No - lnc-SLC38A9-3:2 No - lnc-SLC38A9-4:1 No - lnc-SLC38A9-4:2 No - lnc-SLC38A9-4:3 No - lnc-ANKRD55-6:1 No - lnc-ANKRD55-5:1 No - lnc-IL31RA-2:1 No - lnc-ANKRD55-4:1 No - lnc-ANKRD55-3:1 No - lnc-ANKRD55-2:1 No - lnc-IL6ST-1:1 No - lnc-IL31RA-4:5 No - lnc-IL6ST-2:1 No - lnc-IL6ST-3:1 No - lnc-IL31RA-6:1 No - lnc-MAP3K1-7:1 No - lnc-MAP3K1-5:1 No - lnc-MAP3K1-4:1 No - lnc-MAP3K1-1:2 No - lnc-MAP3K1-3:1 No - lnc-MIER3-3:1 Yes chr2R:7493806-7496466 lnc-MIER3-4:1 No - lnc-MIER3-5:1 No - lnc-GPBP1-4:1 No - lnc-MIER3-6:1 No - lnc-GPBP1-5:1 No - lnc-GPBP1-1:2 No - lnc-GPBP1-2:5 No - lnc-GPBP1-2:6 No - lnc-GPBP1-3:4 No - lnc-GPBP1-3:6 No - lnc-GPBP1-3:7 No - lnc-PLK2-2:2 No - LINC02101:9 No - lnc-GAPT-7:1 No - lnc-GAPT-4:1 No - lnc-GAPT-3:1 No - lnc-PDE4D-7:4 No - lnc-PDE4D-6:1 No - lnc-PDE4D-7:6 No - lnc-PDE4D-7:5 No - lnc-PDE4D-7:2 No - lnc-PDE4D-7:3 No - lnc-PDE4D-7:1 No - lnc-GAPT-6:2 No - lnc-GAPT-6:3 No - lnc-GAPT-6:4 No - lnc-GAPT-1:1 No - lnc-GAPT-2:1 No - lnc-GAPT-8:1 No - lnc-GAPT-36:1 No - lnc-GAPT-36:2 No - lnc-RAB3C-5:1 No - lnc-RAB3C-1:2 Yes chrX:3176440-3343767 lnc-DEPDC1B-5:2 Yes chrX:3176440-3343767 lnc-DEPDC1B-5:1 Yes chrX:3176440-3343767 lnc-RAB3C-7:1 Yes chrX:3176440-3343767 PART1:2 Yes chrX:3176440-3343767 PART1:4 Yes chrX:3176440-3343767 PART1:11 No - PART1:13 No - lnc-PDE4D-3:1 No - lnc-PDE4D-4:1 No - lnc-NDUFAF2-3:2 No - lnc-ELOVL7-2:1 No - lnc-ELOVL7-1:4 No - lnc-ELOVL7-1:3 No - lnc-ELOVL7-1:2 No - lnc-ELOVL7-1:1 No - SMIM15-AS1:27 No - SMIM15-AS1:32 No - lnc-SMIM15-6:1 No - SMIM15-AS1:33 No - lnc-NDUFAF2-4:1 No - lnc-ZSWIM6-3:1 No - lnc-ZSWIM6-2:1 No - lnc-SMIM15-2:1 No - lnc-NDUFAF2-6:1 No - lnc-ZSWIM6-1:1 No - lnc-SMIM15-3:1 No - lnc-ZSWIM6-6:1 No - lnc-ZSWIM6-6:2 No - lnc-ZSWIM6-6:3 No - lnc-SMIM15-4:7 No - lnc-SMIM15-4:8 No - lnc-ZSWIM6-6:6 No - lnc-SMIM15-4:4 No - lnc-SMIM15-4:5 No - lnc-SMIM15-4:6 No - C5orf64-AS1:9 No - lnc-DIMT1-4:1 No - lnc-KIF2A-4:1 No - lnc-KIF2A-2:1 No - lnc-SMIM15-9:1 Yes chrX:11129362-11137118 lnc-DIMT1-1:1 Yes chr2R:15682719-15687415 lnc-DIMT1-2:1 Yes chr2R:15682719-15687415 lnc-DIMT1-3:1 No - lnc-IPO11-2:1 No - lnc-DIMT1-5:1 No - lnc-HTR1A-2:2 No - lnc-SREK1IP1-1:1 No - lnc-SHISAL2B-2:1 No - lnc-ADAMTS6-3:3 Yes chrX:6524464-6526342 lnc-ADAMTS6-3:2 Yes chrX:6524464-6526342 lnc-ADAMTS6-3:1 Yes chrX:6524464-6526342 lnc-ADAMTS6-2:1 No - lnc-CENPK-4:1 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-CENPK-3:1 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-CWC27-5:1 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-CENPK-2:1 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-TRIM23-2:1 No - lnc-TRIM23-2:3 No - lnc-TRIM23-2:5 No - lnc-TRIM23-2:2 No - lnc-TRIM23-2:4 No - lnc-CENPK-1:1 No - lnc-TRIM23-1:1 No - lnc-TRAPPC13-2:1 Yes chr3R:24932010-24934919 lnc-SGTB-1:3 No - lnc-SGTB-1:2 No - lnc-NLN-3:1 Yes chr2R:14935660-14940722 lnc-SGTB-5:1 Yes chr2R:14935660-14940722 lnc-NLN-2:1 Yes chr2R:14935660-14940722 LINC02065:7 No - lnc-SREK1-4:1 No - lnc-SREK1-4:2 No - lnc-SREK1-9:1 Yes chr3L:15566013-15576313 lnc-CD180-12:1 Yes chr3L:15566013-15576313 lnc-CD180-8:1 Yes chr3L:20361843-20366724 lnc-SGTB-7:1 Yes chr3L:20361843-20366724 lnc-MAST4-3:1 No - lnc-MAST4-4:1 No - lnc-CD180-11:1 No - lnc-MAST4-5:3 No - lnc-MAST4-5:4 No - lnc-MAST4-5:5 No - lnc-CD180-15:1 No - lnc-CD180-16:1 No - lnc-SLC30A5-6:1 Yes chr2L:297880-305233 lnc-CCDC125-22:1 Yes chr2L:297880-305233 lnc-PIK3R1-7:1 No - lnc-PIK3R1-8:1 No - lnc-CCDC125-6:11 No - lnc-PIK3R1-3:2 No - lnc-CCDC125-6:10 No - lnc-PIK3R1-4:2 No - lnc-PIK3R1-9:1 No - lnc-PIK3R1-10:1 No - lnc-CCDC125-20:1 No - lnc-PIK3R1-11:1 No - lnc-CCDC125-19:1 No - lnc-PIK3R1-6:2 No - lnc-CCDC125-18:1 No - lnc-SLC30A5-4:1 No - lnc-SLC30A5-3:1 No - lnc-SLC30A5-2:1 No - lnc-CCDC125-6:21 No - lnc-CCDC125-16:1 No - lnc-CCDC125-15:1 No - LINC02198:27 No - LINC02198:28 No - LINC02198:29 No - lnc-CCDC125-13:1 No - lnc-CCDC125-12:1 No - lnc-CCDC125-11:1 No - lnc-CCDC125-1:2 No - lnc-CCDC125-1:3 No - lnc-AK6-3:2 No - lnc-AK6-3:1 No - lnc-AK6-3:4 No - lnc-AK6-3:3 No - lnc-RAD17-3:1 No - lnc-RAD17-2:1 No - lnc-TAF9-9:2 No - lnc-MARVELD2-2:1 No - lnc-AK6-4:1 No - lnc-MARVELD2-1:1 No - lnc-OCLN-3:1 No - lnc-OCLN-3:2 No - lnc-AK6-5:1 No - lnc-AK6-6:1 No - lnc-GTF2H2C-1:1 Yes chr3L:22879089-22880963 lnc-GTF2H2C-2:1 No - lnc-AK6-6:2 No - lnc-GTF2H2C-3:1 No - lnc-AK6-6:6 No - lnc-AK6-6:3 No - lnc-AK6-6:4 No - lnc-SERF1B-1:3 No - lnc-SERF1B-1:4 No - lnc-AK6-7:1 No - lnc-SERF1B-1:6 No - lnc-SERF1B-1:7 No - lnc-SERF1B-4:1 No - lnc-AK6-8:1 No - lnc-SERF1B-3:1 No - lnc-NAIP-5:2 No - lnc-AK6-9:1 No - lnc-NAIP-5:1 No - lnc-NAIP-5:5 No - lnc-NAIP-5:3 No - lnc-NAIP-5:4 No - lnc-NAIP-4:1 No - lnc-SMN2-4:1 No - lnc-SMN2-4:2 No - lnc-SMN2-4:3 No - lnc-SMN2-4:4 No - lnc-SMN2-4:5 No - lnc-SMN2-4:6 No - lnc-NAIP-3:1 No - lnc-SMN2-4:7 No - lnc-NAIP-2:4 No - lnc-NAIP-2:1 No - lnc-SERF1A-3:1 No - lnc-NAIP-2:3 No - lnc-SERF1A-2:1 No - lnc-SERF1A-2:2 No - lnc-SERF1A-2:3 No - lnc-SERF1A-2:4 No - lnc-NAIP-6:2 Yes chr3L:22879089-22880963 lnc-NAIP-6:3 Yes chr3L:22879089-22880963 lnc-NAIP-6:4 Yes chr3L:22879089-22880963 lnc-NAIP-6:1 Yes chr3L:22879089-22880963 lnc-SMN1-2:1 No - lnc-GTF2H2-7:1 No - lnc-GTF2H2-7:6 No - lnc-SMN1-3:1 No - lnc-GTF2H2-7:7 No - lnc-GTF2H2-7:4 No - lnc-BDP1-5:1 No - lnc-GTF2H2-7:2 No - lnc-GTF2H2-5:1 No - lnc-GTF2H2-6:1 No - LINC02197:8 No - lnc-BDP1-4:1 No - lnc-BDP1-4:2 No - lnc-BDP1-4:3 No - lnc-BDP1-4:4 No - lnc-BDP1-4:5 No - lnc-BDP1-4:6 No - lnc-BDP1-3:1 No - lnc-BDP1-3:2 No - lnc-BDP1-3:3 No - lnc-BDP1-3:4 No - lnc-BDP1-3:5 No - lnc-GTF2H2-8:1 Yes chr2L:13371427-13373890 lnc-MRPS27-1:2 Yes chrX:1409069-1453686 lnc-MRPS27-1:3 Yes chrX:1409069-1453686 lnc-PTCD2-8:1 Yes chrX:1409069-1453686 lnc-ZNF366-11:1 No - lnc-MRPS27-10:6 No - lnc-MRPS27-10:5 No - lnc-MRPS27-10:3 No - lnc-MRPS27-10:4 No - lnc-MRPS27-10:2 No - lnc-MRPS27-10:1 No - lnc-ZNF366-9:1 No - lnc-PTCD2-3:1 No - lnc-PTCD2-4:1 No - lnc-PTCD2-5:1 No - lnc-ZNF366-1:2 No - lnc-PTCD2-6:1 No - lnc-PTCD2-1:3 No - LINC02056:36 No - lnc-ZNF366-7:1 No - LINC02056:37 No - LINC02056:38 No - lnc-TNPO1-1:1 No - LINC02056:33 No - lnc-ZNF366-4:2 No - LINC02056:25 Yes chr3L:6200473-6203776 lnc-FCHO2-3:1 Yes chr3L:6200473-6203776 lnc-ZNF366-13:1 Yes chr3L:6200473-6203776 lnc-FOXD1-15:1 Yes chr3R:9516007-9527237 lnc-FOXD1-4:2 No - lnc-FOXD1-4:4 No - lnc-FOXD1-14:1 No - lnc-FOXD1-3:10 No - lnc-FOXD1-3:12 No - lnc-FOXD1-3:7 No - lnc-TMEM174-1:6 No - lnc-FOXD1-11:1 No - lnc-BTF3-4:2 No - lnc-FOXD1-9:1 Yes chr2R:22868159-22870706 lnc-ANKRA2-8:1 Yes chr2R:22868159-22870706 lnc-FOXD1-7:3 No - lnc-FOXD1-16:1 Yes chr2L:9956175-9957237 lnc-FOXD1-17:1 No - lnc-FOXD1-17:2 Yes chr2L:9956175-9957237 lnc-FOXD1-17:3 Yes chr2L:9956175-9957237 lnc-ANKRA2-10:1 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-ARHGEF28-3:1 No - lnc-ARHGEF28-6:1 No - LINC01332:2 No - lnc-HEXB-4:1 No - lnc-HEXB-3:1 No - LINC01333:3 No - LINC01333:5 No - LINC01333:6 No - LINC01333:7 No - lnc-ENC1-5:1 No - lnc-ENC1-5:3 No - lnc-ENC1-5:2 No - lnc-FAM169A-5:1 Yes chr3R:22613686-22616622 lnc-FAM169A-4:1 Yes chr3R:22613686-22616622 lnc-NSA2-7:1 No - lnc-NSA2-1:2 No - lnc-NSA2-1:3 No - lnc-GCNT4-4:1 No - lnc-GCNT4-3:1 No - lnc-GCNT4-2:1 No - LINC01336:1 No - lnc-HMGCR-3:1 Yes chr3L:12750119-12753402 lnc-POLK-6:1 Yes chr3R:23733324-23750992 lnc-ANKRD31-2:1 Yes chr3L:8282528-8289870 lnc-ANKRD31-3:1 Yes chr3L:8282528-8289870 lnc-HMGCR-2:1 Yes chr3L:8282528-8289870 lnc-POC5-4:1 No - lnc-COL4A3BP-2:1 No - lnc-COL4A3BP-3:4 No - lnc-COL4A3BP-3:1 No - lnc-COL4A3BP-3:2 No - lnc-COL4A3BP-3:3 No - lnc-ANKDD1B-5:1 No - lnc-POC5-3:1 No - lnc-POC5-5:1 No - lnc-SV2C-1:1 No - lnc-F2RL2-5:1 Yes chr3R:25216297-25218708 lnc-IQGAP2-4:1 Yes chr3R:25216297-25218708 lnc-IQGAP2-2:1 Yes chr3R:25216297-25218708 lnc-SV2C-2:1 No - lnc-SV2C-2:2 No - lnc-SV2C-4:1 No - NCRUPAR:2 No - NCRUPAR:3 No - lnc-F2RL2-4:1 No - lnc-WDR41-4:1 Yes chr2R:15218379-15224795 lnc-WDR41-3:1 No - ZBED3-AS1:5 No - ZBED3-AS1:9 No - ZBED3-AS1:19 No - ZBED3-AS1:22 No - ZBED3-AS1:23 No - ZBED3-AS1:24 No - ZBED3-AS1:25 No - lnc-WDR41-1:3 No - lnc-WDR41-1:1 No - lnc-WDR41-1:2 No - lnc-OTP-5:1 No - lnc-OTP-4:1 No - lnc-OTP-4:3 No - lnc-OTP-4:2 No - lnc-WDR41-2:1 Yes chr2R:20883625-20903414 lnc-PDE8B-5:1 No - lnc-OTP-1:1 Yes chr3R:31743490-31744248 lnc-OTP-2:1 Yes chr3R:31743490-31744248 lnc-OTP-3:1 Yes chr3R:31743490-31744248 lnc-AP3B1-1:2 No - lnc-SCAMP1-2:2 No - lnc-AP3B1-3:1 No - lnc-TBCA-6:1 Yes chrX:4535635-4540626 lnc-TBCA-7:2 Yes chrX:4535635-4540626 lnc-TBCA-7:1 Yes chrX:4535635-4540626 lnc-TBCA-9:2 Yes chrX:4535635-4540626 lnc-TBCA-9:1 Yes chrX:4535635-4540626 lnc-TBCA-10:1 Yes chrX:4535635-4540626 lnc-SCAMP1-11:1 Yes chrX:4535635-4540626 lnc-SCAMP1-6:1 No - SCAMP1-AS1:3 No - lnc-AP3B1-4:1 Yes chr2R:24945139-24946636 lnc-LHFPL2-3:3 Yes chr2R:24945139-24946636 lnc-LHFPL2-3:2 Yes chr2R:24945139-24946636 lnc-LHFPL2-3:5 Yes chr2R:24945139-24946636 lnc-LHFPL2-3:4 Yes chr2R:24945139-24946636 lnc-LHFPL2-3:1 Yes chr2R:24945139-24946636 lnc-ARSB-1:1 Yes chr2R:24945139-24946636 lnc-SCAMP1-5:1 Yes chr2R:24945139-24946636 lnc-LHFPL2-1:1 Yes chr2R:12655954-12659341 lnc-DMGDH-2:1 Yes chr2R:12655954-12659341 lnc-DMGDH-1:1 No - lnc-DMGDH-1:2 No - lnc-DMGDH-1:5 No - lnc-DMGDH-1:4 No - lnc-DMGDH-1:3 No - lnc-JMY-1:1 No - lnc-HOMER1-3:1 No - lnc-PAPD4-3:1 Yes chr2L:6719394-6723359 lnc-HOMER1-4:1 No - lnc-PAPD4-2:1 No - lnc-CMYA5-7:1 Yes chr3R:22211824-22217415 lnc-HOMER1-5:1 Yes chr3R:22211824-22217415 lnc-HOMER1-7:1 No - lnc-CMYA5-1:2 No - lnc-MTX3-3:1 No - lnc-CMYA5-4:3 Yes chr2L:6686791-6709086 lnc-MTX3-2:1 Yes chr2L:6686791-6709086 lnc-CMYA5-6:1 Yes chr2L:6686791-6709086 lnc-SERINC5-1:4 Yes chr2L:6686791-6709086 lnc-THBS4-5:1 No - lnc-MTX3-4:1 No - lnc-MTX3-5:1 No - lnc-SPZ1-1:10 No - lnc-SPZ1-1:1 No - lnc-FAM151B-2:1 Yes chr2R:21481927-21487107 lnc-ANKRD34B-2:3 Yes chr2L:7983946-7986785 lnc-DHFR-3:1 No - LINC01337:1 No - lnc-ANKRD34B-5:1 Yes chr3R:16481167-16481878 lnc-ANKRD34B-5:2 Yes chr3R:16481167-16481878 lnc-MSH3-2:1 Yes chr3R:16481167-16481878 lnc-ANKRD34B-4:2 Yes chr3R:16481167-16481878 lnc-ANKRD34B-4:1 Yes chr3R:16481167-16481878 lnc-DHFR-4:1 No - lnc-DHFR-5:1 No - lnc-MSH3-3:1 No - RASGRF2-AS1:6 No - lnc-ACOT12-10:1 No - CKMT2-AS1:32 No - CKMT2-AS1:31 Yes chr2R:22825093-22828903 CKMT2-AS1:2 Yes chr2R:22825093-22828903 CKMT2-AS1:3 Yes chr2R:22825093-22828903 CKMT2-AS1:4 Yes chr2R:22825093-22828903 CKMT2-AS1:14 Yes chr2R:22825093-22828903 CKMT2-AS1:30 Yes chr2R:22825093-22828903 CKMT2-AS1:1 No - lnc-ZCCHC9-3:1 No - lnc-ACOT12-3:1 No - lnc-ZCCHC9-4:1 No - lnc-ACOT12-4:1 Yes chr3R:18192494-18199595 lnc-SSBP2-5:9 Yes chr3R:18192494-18199595 lnc-SSBP2-5:11 Yes chr3R:18192494-18199595 lnc-SSBP2-5:10 Yes chr3R:18192494-18199595 lnc-SSBP2-5:8 Yes chr3R:18192494-18199595 lnc-SSBP2-5:1 Yes chr3R:18192494-18199595 lnc-SSBP2-5:2 Yes chr3R:18192494-18199595 lnc-SSBP2-5:5 Yes chr3R:18192494-18199595 lnc-SSBP2-5:6 Yes chr3R:18192494-18199595 lnc-ACOT12-9:1 Yes chr3R:18192494-18199595 lnc-SSBP2-5:3 Yes chr3R:18192494-18199595 lnc-SSBP2-5:7 Yes chr3R:18192494-18199595 lnc-SSBP2-5:4 Yes chr3R:18192494-18199595 lnc-ATG10-4:1 No - lnc-ATP6AP1L-7:1 Yes chr2R:7832171-7835518 lnc-ATP6AP1L-5:1 Yes chr2R:7832171-7835518 lnc-ATP6AP1L-3:1 Yes chr2R:14215096-14216627 lnc-RPS23-4:1 No - lnc-ATP6AP1L-2:2 No - lnc-XRCC4-8:1 No - lnc-XRCC4-7:1 No - LINC01338:2 No - lnc-XRCC4-4:1 No - lnc-TMEM167A-6:1 No - lnc-XRCC4-3:1 No - lnc-TMEM167A-4:5 Yes chrX:19494420-19494992 lnc-TMEM167A-4:7 Yes chrX:19494420-19494992 lnc-TMEM167A-4:8 Yes chrX:19494420-19494992 lnc-TMEM167A-4:6 Yes chrX:19494420-19494992 lnc-TMEM167A-4:4 No - lnc-VCAN-4:1 No - lnc-TMEM167A-8:1 No - lnc-VCAN-2:1 No - lnc-HAPLN1-2:3 No - lnc-HAPLN1-2:2 No - lnc-EDIL3-6:1 No - lnc-EDIL3-5:1 No - lnc-EDIL3-4:1 No - lnc-HAPLN1-3:1 No - lnc-VCAN-1:6 No - lnc-EDIL3-7:1 No - lnc-EDIL3-8:1 No - lnc-EDIL3-9:1 No - lnc-EDIL3-10:1 No - lnc-EDIL3-11:1 No - lnc-COX7C-16:1 No - lnc-COX7C-13:1 No - lnc-COX7C-11:1 No - lnc-CCNH-9:1 No - lnc-CCNH-7:1 No - lnc-CCNH-5:2 No - lnc-RASA1-2:3 No - LINC01949:8 No - lnc-CCNH-6:1 Yes chrX:15999951-16005812 lnc-TMEM161B-15:1 Yes chr3L:21821997-21823309 lnc-TMEM161B-14:1 Yes chr3L:21821997-21823309 lnc-TMEM161B-14:2 Yes chr3L:21821997-21823309 lnc-TMEM161B-6:1 No - lnc-RASA1-11:1 No - lnc-MEF2C-9:6 Yes chr3L:11109690-11112117 lnc-TMEM161B-9:4 Yes chr3L:11109690-11112117 lnc-RASA1-14:1 Yes chr3L:11109690-11112117 lnc-TMEM161B-9:3 Yes chr3L:11109690-11112117 lnc-TMEM161B-9:5 Yes chr3L:11109690-11112117 lnc-TMEM161B-9:2 Yes chr3L:11109690-11112117 lnc-MEF2C-8:1 Yes chr3L:11109690-11112117 TMEM161B-AS1:1 Yes chr3L:11109690-11112117 TMEM161B-AS1:2 Yes chr3L:11109690-11112117 TMEM161B-AS1:3 Yes chr3L:11109690-11112117 TMEM161B-AS1:8 Yes chr3L:11109690-11112117 TMEM161B-AS1:13 Yes chr3L:11109690-11112117 lnc-TMEM161B-4:1 No - TMEM161B-AS1:29 No - TMEM161B-AS1:30 No - TMEM161B-AS1:31 No - TMEM161B-AS1:32 No - TMEM161B-AS1:33 No - TMEM161B-AS1:34 No - TMEM161B-AS1:41 No - TMEM161B-AS1:42 No - lnc-RASA1-15:1 No - lnc-RASA1-16:1 No - lnc-RASA1-17:1 No - lnc-RASA1-18:1 No - TMEM161B-AS1:43 No - lnc-RASA1-19:1 No - LINC02060:7 No - LINC00461:54 No - LINC00461:10 No - lnc-RASA1-20:1 No - LINC00461:15 No - LINC00461:18 No - LINC00461:5 No - lnc-RASA1-21:1 No - LINC00461:2 No - LINC00461:3 No - lnc-RASA1-22:1 No - lnc-RASA1-23:1 No - lnc-MEF2C-1:2 No - lnc-TMEM161B-8:1 Yes chr2R:9913496-9958858 lnc-TMEM161B-11:1 Yes chr2R:9913496-9958858 lnc-TMEM161B-10:2 Yes chr2R:9913496-9958858 lnc-TMEM161B-10:3 Yes chr2R:9913496-9958858 lnc-TMEM161B-10:1 Yes chr2R:9913496-9958858 lnc-MEF2C-5:1 No - MEF2C-AS1:16 No - lnc-MEF2C-3:2 No - MEF2C-AS1:20 No - MEF2C-AS1:21 No - MEF2C-AS1:22 No - MEF2C-AS1:24 No - lnc-CETN3-5:1 No - lnc-CETN3-1:2 No - lnc-MBLAC2-1:1 No - lnc-POLR3G-1:3 No - lnc-ARRDC3-9:1 Yes chr3R:20978183-21015613 lnc-ADGRV1-6:1 No - LUCAT1:1 No - LUCAT1:4 No - LUCAT1:5 No - lnc-ADGRV1-8:1 Yes chr3R:7804665-7810014 lnc-LYSMD3-1:2 Yes chr3R:7804665-7810014 lnc-LYSMD3-2:6 Yes chr3R:7804665-7810014 lnc-LYSMD3-2:4 Yes chr3R:7804665-7810014 lnc-LYSMD3-2:5 Yes chr3R:7804665-7810014 ARRDC3-AS1:1 Yes chr3R:7804665-7810014 ARRDC3-AS1:3 Yes chr3R:7804665-7810014 ARRDC3-AS1:7 No - lnc-ADGRV1-12:1 No - lnc-ARRDC3-10:1 No - lnc-ADGRV1-4:2 No - lnc-NR2F1-8:1 No - lnc-FAM172A-12:1 No - NR2F1-AS1:33 No - NR2F1-AS1:35 No - NR2F1-AS1:14 No - NR2F1-AS1:36 No - NR2F1-AS1:26 No - NR2F1-AS1:18 No - NR2F1-AS1:19 No - NR2F1-AS1:20 No - NR2F1-AS1:21 No - NR2F1-AS1:23 No - NR2F1-AS1:16 No - NR2F1-AS1:43 No - lnc-FAM172A-10:1 No - lnc-NR2F1-7:1 No - NR2F1-AS1:15 No - lnc-NR2F1-1:5 No - NR2F1-AS1:27 No - NR2F1-AS1:29 No - NR2F1-AS1:30 No - lnc-NR2F1-1:6 No - lnc-NR2F1-1:7 No - lnc-SLF1-11:1 Yes chr3R:12258737-12302785 lnc-SLF1-10:4 No - lnc-SLF1-6:1 Yes chr3L:19269351-19274168 lnc-MCTP1-2:1 Yes chr3L:19269351-19274168 lnc-SLF1-5:1 Yes chr3L:19269351-19274168 lnc-SLF1-4:1 Yes chr3L:19269351-19274168 lnc-SLF1-4:2 Yes chr3L:19269351-19274168 lnc-KIAA0825-1:4 Yes chr3L:19269351-19274168 lnc-KIAA0825-2:1 No - lnc-KIAA0825-3:1 Yes chr2R:18761758-18774824 lnc-TTC37-4:3 Yes chr2R:18761758-18774824 lnc-TTC37-4:1 Yes chr2R:18761758-18774824 lnc-TTC37-4:2 Yes chr2R:18761758-18774824 lnc-FAM81B-4:1 Yes chr2R:18761758-18774824 lnc-FAM81B-1:1 No - lnc-FAM81B-2:1 No - lnc-FAM81B-3:1 No - lnc-SPATA9-6:1 Yes chr2R:9098539-9103153 lnc-SPATA9-5:1 Yes chr2R:9098539-9103153 lnc-SPATA9-4:2 Yes chr2R:9098539-9103153 lnc-SPATA9-4:1 Yes chr2R:9098539-9103153 lnc-ARSK-1:1 Yes chr2R:9098539-9103153 lnc-SPATA9-3:1 Yes chr2R:9098539-9103153 lnc-SPATA9-2:1 No - lnc-RFESD-6:1 No - lnc-ELL2-3:1 No - lnc-ELL2-3:2 No - lnc-GLRX-2:1 No - LINC01554:5 No - lnc-RHOBTB3-4:1 Yes chr3L:19889120-19909410 lnc-RHOBTB3-4:2 No - lnc-RHOBTB3-4:4 Yes chr3L:19889120-19909410 lnc-GLRX-3:1 Yes chr3L:19889120-19909410 lnc-GLRX-5:1 Yes chr3L:19889120-19909410 lnc-ELL2-2:1 No - lnc-PCSK1-1:2 No - lnc-CAST-10:1 No - lnc-PCSK1-4:1 No - lnc-PCSK1-2:1 No - lnc-CAST-9:1 No - MIR583HG:47 No - lnc-CAST-7:1 No - MIR583HG:49 No - lnc-ERAP2-8:1 No - lnc-CAST-4:37 No - lnc-ERAP1-2:1 No - lnc-ERAP1-2:4 No - lnc-ERAP1-2:2 No - lnc-ERAP2-1:1 Yes chr3R:23227727-23248903 lnc-ERAP2-2:1 Yes chr3R:23227727-23248903 lnc-ERAP2-4:3 Yes chr3R:23227727-23248903 lnc-LIX1-2:1 Yes chr3R:25265844-25267757 lnc-LIX1-2:2 Yes chr3R:25265844-25267757 lnc-LNPEP-5:2 No - lnc-RIOK2-3:1 No - lnc-RIOK2-4:1 No - lnc-LNPEP-8:1 No - lnc-RIOK2-5:1 No - lnc-LNPEP-7:1 No - lnc-RGMB-7:1 No - lnc-CHD1-7:1 No - lnc-CHD1-6:1 No - lnc-CHD1-5:1 No - RGMB-AS1:7 No - RGMB-AS1:8 No - RGMB-AS1:10 No - RGMB-AS1:11 No - RGMB-AS1:2 No - lnc-RGMB-4:1 No - lnc-RGMB-5:1 No - lnc-RIOK2-6:1 Yes chr2L:2979562-2987723 lnc-RIOK2-7:1 Yes chr2L:2979562-2987723 lnc-RIOK2-8:1 Yes chr2L:2979562-2987723 lnc-RIOK2-8:2 Yes chr2L:2979562-2987723 lnc-RIOK2-11:1 Yes chr2L:2979562-2987723 LINC02062:22 No - LINC02062:23 No - LINC02062:31 No - LINC02062:32 No - LINC02062:33 No - lnc-RGMB-6:1 No - lnc-RGMB-8:1 No - lnc-CHD1-8:1 No - lnc-RGMB-9:1 No - lnc-ST8SIA4-12:1 No - lnc-FAM174A-4:1 No - lnc-ST8SIA4-11:1 No - lnc-ST8SIA4-10:2 No - lnc-ST8SIA4-10:1 No - lnc-ST8SIA4-9:1 No - lnc-ST8SIA4-8:1 No - lnc-ST8SIA4-7:1 No - lnc-ST8SIA4-6:1 No - lnc-ST8SIA4-5:1 No - lnc-FAM174A-1:4 No - lnc-ST8SIA4-3:3 No - lnc-FAM174A-2:1 No - lnc-FAM174A-3:1 No - lnc-SLCO4C1-5:1 No - lnc-SLCO4C1-4:1 No - lnc-ST8SIA4-1:2 No - lnc-FAM174A-5:1 No - lnc-SLCO4C1-3:2 No - lnc-SLCO4C1-3:1 No - lnc-PAM-8:1 No - lnc-PAM-5:2 No - lnc-PAM-7:1 No - lnc-SLCO4C1-1:1 No - lnc-SLCO4C1-2:1 No - lnc-PAM-4:3 No - LINC00491:9 No - LINC00491:3 No - LINC00491:4 No - LINC00491:5 No - LINC00491:6 No - lnc-PAM-6:1 No - lnc-PAM-9:3 No - lnc-PAM-1:6 Yes chr2R:23985175-23988455 lnc-PAM-1:7 Yes chr2R:23985175-23988455 lnc-PAM-1:8 Yes chr2R:23985175-23988455 lnc-PAM-1:9 Yes chr2R:23985175-23988455 lnc-SLCO6A1-3:1 Yes chr2R:23985175-23988455 lnc-PAM-1:10 Yes chr2R:23985175-23988455 lnc-NUDT12-11:1 No - lnc-NUDT12-10:1 No - lnc-GIN1-2:1 No - lnc-GIN1-3:1 No - lnc-GIN1-4:1 No - lnc-NUDT12-8:1 No - lnc-GIN1-5:1 No - lnc-GIN1-6:1 No - lnc-C5orf30-7:1 No - lnc-NUDT12-12:1 No - lnc-NUDT12-5:10 No - lnc-NUDT12-5:9 No - lnc-NUDT12-5:8 No - lnc-C5orf30-8:1 No - lnc-NUDT12-7:3 No - lnc-FER-16:1 No - lnc-EFNA5-8:1 No - lnc-FER-15:1 No - lnc-EFNA5-6:1 No - lnc-EFNA5-5:1 No - lnc-FBXL17-3:1 No - lnc-FER-14:1 No - lnc-EFNA5-4:1 No - lnc-FER-11:1 No - lnc-FER-9:1 No - lnc-FER-2:2 No - lnc-FER-2:3 No - lnc-FER-2:4 No - lnc-FER-7:1 No - LINC01023:2 No - lnc-FER-3:1 No - lnc-MAN2A1-12:1 Yes chr3R:9367603-9394546 lnc-FER-4:1 No - lnc-FER-6:1 No - lnc-TMEM232-7:1 No - lnc-TMEM232-7:2 No - lnc-PJA2-2:1 No - lnc-PJA2-4:1 Yes chr3R:9412548-9417264 lnc-TMEM232-6:1 No - lnc-MAN2A1-1:2 No - lnc-MAN2A1-6:2 No - lnc-TMEM232-4:8 No - lnc-TMEM232-4:6 No - lnc-TMEM232-4:7 No - lnc-TMEM232-4:3 No - lnc-TMEM232-4:2 No - lnc-TMEM232-4:5 No - lnc-STARD4-6:1 No - lnc-TMEM232-4:4 No - lnc-TMEM232-4:1 No - lnc-SLC25A46-2:1 No - lnc-TMEM232-5:1 No - lnc-STARD4-5:1 No - lnc-WDR36-1:1 No - lnc-NREP-1:1 No - lnc-NREP-1:2 No - lnc-NREP-1:3 No - lnc-NREP-1:4 No - lnc-STARD4-3:1 No - STARD4-AS1:2 No - lnc-STARD4-4:2 No - lnc-STARD4-4:3 No - lnc-STARD4-4:1 No - lnc-STARD4-4:4 No - lnc-EPB41L4A-2:1 No - EPB41L4A-AS1:7 Yes chr3R:31311157-31371748 lnc-NREP-2:1 Yes chr3R:31311157-31371748 lnc-NREP-3:1 Yes chr3R:31311157-31371748 lnc-NREP-4:1 Yes chr3R:31311157-31371748 lnc-NREP-5:1 Yes chr3R:31311157-31371748 lnc-NREP-6:1 Yes chr3R:31311157-31371748 EPB41L4A-DT:7 No - lnc-EPB41L4A-1:1 No - lnc-APC-7:1 No - lnc-APC-3:5 No - lnc-APC-1:5 No - lnc-SRP19-4:1 No - lnc-TSSK1B-1:1 Yes chr3R:15363786-15367665 lnc-KCNN2-2:3 No - lnc-KCNN2-3:1 No - lnc-TRIM36-4:3 Yes chrX:5340236-5405138 lnc-PGGT1B-8:2 Yes chr2L:10544883-10628054 lnc-PGGT1B-8:1 Yes chr2L:10544883-10628054 lnc-PGGT1B-7:1 Yes chr2L:10544883-10628054 lnc-TRIM36-1:3 No - lnc-TRIM36-1:2 No - lnc-PGGT1B-4:1 No - lnc-PGGT1B-1:2 Yes chr2L:4945579-4948324 lnc-CCDC112-2:1 Yes chr2L:4945579-4948324 lnc-CCDC112-1:1 Yes chr2L:4945579-4948324 lnc-PGGT1B-3:1 No - lnc-PGGT1B-6:1 No - lnc-PGGT1B-5:1 No - lnc-AP3S1-14:1 No - lnc-AP3S1-13:1 No - lnc-AP3S1-12:1 No - lnc-AP3S1-11:1 No - lnc-AP3S1-11:2 No - lnc-AP3S1-10:1 Yes chrX:11850909-11852530 lnc-AP3S1-9:1 Yes chrX:11850909-11852530 lnc-TMED7-3:1 Yes chrX:11850909-11852530 lnc-AP3S1-4:4 No - lnc-AP3S1-4:7 No - lnc-AP3S1-3:2 No - lnc-AP3S1-2:4 No - lnc-AP3S1-2:5 No - lnc-AP3S1-2:6 No - lnc-AP3S1-7:1 No - lnc-ATG12-1:1 Yes chr2R:18616692-18619328 lnc-CDO1-1:9 Yes chr3L:12136967-12137559 lnc-AP3S1-1:3 Yes chr3L:12136967-12137559 lnc-CDO1-1:10 Yes chr3L:12136967-12137559 lnc-CDO1-1:8 Yes chr3L:12136967-12137559 lnc-CDO1-1:6 Yes chr3L:12136967-12137559 lnc-CDO1-1:7 Yes chr3L:12136967-12137559 lnc-CDO1-1:5 Yes chr3L:12136967-12137559 lnc-CDO1-3:1 No - lnc-ATG12-2:1 No - lnc-ARL14EPL-7:1 No - lnc-ATG12-3:2 Yes chr2R:4829246-4830587 lnc-ATG12-3:1 Yes chr2R:4829246-4830587 lnc-ATG12-5:2 Yes chrX:11677344-11678589 lnc-ARL14EPL-3:1 Yes chrX:11677344-11678589 lnc-SEMA6A-7:1 Yes chrX:11677344-11678589 lnc-ARL14EPL-4:1 Yes chrX:11677344-11678589 lnc-SEMA6A-1:2 Yes chrX:11677344-11678589 lnc-ATG12-6:1 Yes chr2R:17672839-17683499 lnc-ATG12-7:1 Yes chr2R:17672839-17683499 lnc-ATG12-9:1 Yes chr2R:17672839-17683499 lnc-ATG12-8:1 Yes chr2R:17672839-17683499 lnc-SEMA6A-6:2 No - lnc-COMMD10-10:1 No - lnc-COMMD10-11:1 No - lnc-SEMA6A-8:1 No - lnc-SEMA6A-9:1 No - LINC00992:3 No - lnc-DTWD2-13:1 No - lnc-DTWD2-12:1 No - LINC02208:23 No - LINC02208:34 No - LINC02208:32 No - LINC02208:19 No - lnc-DMXL1-7:1 Yes chr3R:7249795-7251750 lnc-DTWD2-1:6 No - lnc-DMXL1-6:1 No - lnc-DTWD2-1:4 Yes chrX:6240745-6255487 lnc-DTWD2-7:1 Yes chrX:6240745-6255487 lnc-TNFAIP8-8:1 Yes chrX:6240745-6255487 lnc-DTWD2-8:1 Yes chrX:6240745-6255487 lnc-DTWD2-9:1 Yes chr2R:23698949-23702406 lnc-DMXL1-8:1 Yes chr2R:23698949-23702406 lnc-DTWD2-11:1 No - lnc-LOX-9:1 No - lnc-PRR16-2:1 No - lnc-PRR16-3:1 No - lnc-LOX-8:1 No - lnc-FTMT-2:2 No - lnc-FTMT-2:4 No - lnc-FTMT-2:6 No - lnc-FTMT-2:7 No - lnc-FTMT-2:8 No - lnc-FTMT-3:1 No - lnc-LOX-7:1 No - lnc-FTMT-1:2 No - lnc-ZNF474-1:3 No - lnc-PPIC-6:1 No - lnc-SNX2-1:2 No - lnc-PPIC-5:1 No - lnc-PPIC-4:1 No - lnc-CEP120-6:1 No - lnc-PRDM6-1:1 No - lnc-PRDM6-2:1 No - lnc-CEP120-7:3 No - lnc-CEP120-4:5 No - lnc-ZNF608-17:1 No - lnc-ZNF608-6:2 No - LINC01170:5 No - lnc-CSNK1G3-17:1 No - lnc-CEP120-1:2 Yes chr2R:18278198-18357296 lnc-ZNF608-13:1 No - lnc-ZNF608-14:1 No - LINC02240:16 No - lnc-GRAMD2B-19:1 No - lnc-ZNF608-18:1 No - LINC02240:24 No - lnc-ALDH7A1-11:1 No - lnc-ALDH7A1-10:1 No - lnc-ALDH7A1-9:1 No - lnc-GRAMD2B-6:1 No - lnc-ALDH7A1-2:7 No - lnc-GRAMD2B-4:1 No - lnc-MARCH3-6:2 Yes chr3L:19266473-19268913 lnc-MARCH3-6:1 Yes chr3L:19266473-19268913 lnc-MARCH3-5:1 Yes chr3L:19266473-19268913 lnc-ALDH7A1-4:2 No - lnc-ALDH7A1-4:1 No - lnc-ALDH7A1-5:1 No - lnc-LMNB1-2:1 No - lnc-MARCH3-4:1 No - lnc-LMNB1-1:1 No - lnc-MARCH3-2:1 No - lnc-C5orf63-4:1 No - lnc-LMNB1-3:1 No - lnc-LMNB1-3:2 No - lnc-MARCH3-3:1 Yes chr2L:6065997-6067635 lnc-MARCH3-3:3 Yes chr2L:6065997-6067635 lnc-MARCH3-3:2 Yes chr2L:6065997-6067635 lnc-MEGF10-6:1 No - lnc-C5orf63-1:4 No - lnc-MEGF10-2:1 No - lnc-CCDC192-2:1 No - lnc-FBN2-8:1 No - LINC01184:13 No - LINC01184:3 No - LINC01184:32 No - LINC01184:24 No - LINC01184:26 No - lnc-CCDC192-3:1 No - LINC01184:4 No - LINC01184:5 No - LINC01184:31 No - LINC01184:25 No - LINC01184:30 No - LINC01184:17 No - LINC01184:29 No - LINC01184:14 No - LINC01184:1 Yes chr3R:5489505-5502702 LINC01184:16 No - lnc-SLC12A2-2:1 No - lnc-CCDC192-1:1 Yes chr3R:5489505-5502702 lnc-CCDC192-5:1 Yes chr3R:5489505-5502702 lnc-C5orf63-6:1 No - lnc-ISOC1-2:1 No - lnc-CHSY3-1:1 No - lnc-CHSY3-2:1 No - lnc-HINT1-3:1 No - lnc-LYRM7-2:2 No - lnc-HINT1-1:1 No - lnc-CDC42SE2-2:1 Yes chr3R:24814262-24814930 lnc-LYRM7-3:1 Yes chr3R:24814262-24814930 lnc-CDC42SE2-1:3 Yes chr3R:5616644-5624125 lnc-CDC42SE2-1:4 Yes chr3R:5616644-5624125 lnc-CDC42SE2-1:6 Yes chr3R:5616644-5624125 lnc-CDC42SE2-1:9 Yes chr3R:5616644-5624125 lnc-CDC42SE2-1:10 Yes chr3R:5616644-5624125 lnc-RAPGEF6-1:1 Yes chr3R:5616644-5624125 lnc-CDC42SE2-3:1 No - lnc-FNIP1-6:1 No - lnc-MEIKIN-3:4 No - lnc-MEIKIN-3:2 No - lnc-MEIKIN-3:3 No - lnc-MEIKIN-3:1 No - lnc-MEIKIN-4:1 No - lnc-MEIKIN-5:1 No - lnc-ACSL6-2:1 No - lnc-ACSL6-2:2 No - lnc-P4HA2-6:1 No - lnc-P4HA2-5:1 No - lnc-PDLIM4-4:1 No - lnc-P4HA2-4:1 No - lnc-ACSL6-1:3 Yes chr3R:30466050-30485799 lnc-ACSL6-1:2 Yes chr3R:30466050-30485799 lnc-PDLIM4-3:1 Yes chr3R:30466050-30485799 lnc-ACSL6-3:1 Yes chr3R:30466050-30485799 lnc-P4HA2-3:3 No - lnc-P4HA2-3:2 No - lnc-P4HA2-3:4 Yes chr3R:30466050-30485799 MIR3936HG:22 Yes chr3L:21955110-21958041 lnc-SLC22A5-1:1 No - lnc-SLC22A5-1:2 No - MIR3936HG:19 No - MIR3936HG:14 Yes chr3L:21955110-21958041 lnc-SLC22A5-6:3 Yes chr2R:22421013-22425482 lnc-SLC22A5-6:8 Yes chr2R:22421013-22425482 lnc-IL5-1:2 Yes chr2R:22421013-22425482 lnc-IL5-1:1 Yes chr2R:22421013-22425482 lnc-RAD50-1:1 Yes chr2R:22421013-22425482 lnc-IL5-3:3 Yes chr2R:22421013-22425482 lnc-IL5-3:2 Yes chr2R:22421013-22425482 lnc-IL5-3:1 No - lnc-IL4-1:2 Yes chr3L:5356864-5359392 lnc-SEPT8-3:1 Yes chr3L:5356864-5359392 lnc-KIF3A-2:1 No - lnc-KIF3A-3:1 Yes chr2R:7960133-7961921 lnc-SEPT8-1:1 Yes chr2R:14308142-14351802 lnc-SEPT8-2:1 Yes chr2R:14308142-14351802 lnc-GDF9-1:3 Yes chr4:690686-696055 lnc-GDF9-1:2 No - lnc-GDF9-2:1 Yes chr2L:2885929-2954406 lnc-LEAP2-4:1 Yes chr2L:2885929-2954406 lnc-ZCCHC10-4:1 Yes chr2L:2885929-2954406 lnc-ZCCHC10-1:1 No - lnc-AFF4-2:3 Yes chr3R:15963884-15964761 lnc-AFF4-2:4 Yes chr3R:15963884-15964761 lnc-AFF4-2:1 Yes chr3R:15963884-15964761 lnc-AFF4-2:2 Yes chr3R:15963884-15964761 lnc-HSPA4-6:1 Yes chr3R:15963884-15964761 lnc-ZCCHC10-2:1 No - lnc-ZCCHC10-3:1 No - lnc-FSTL4-1:3 No - lnc-FSTL4-2:1 No - lnc-ZCCHC10-5:1 No - lnc-ZCCHC10-6:1 No - lnc-ZCCHC10-7:1 No - lnc-FSTL4-4:1 No - lnc-TCF7-3:3 No - lnc-VDAC1-2:1 No - lnc-TCF7-5:1 No - lnc-PPP2CA-1:1 Yes chrX:19812729-19816700 lnc-SKP1-3:1 No - lnc-SKP1-1:1 No - lnc-TCF7-4:1 No - lnc-UBE2B-5:1 No - lnc-CDKL3-2:4 No - lnc-UBE2B-3:1 No - lnc-UBE2B-4:1 No - lnc-JADE2-2:1 No - lnc-JADE2-2:2 No - lnc-JADE2-2:6 No - LINC01843:13 No - lnc-JADE2-3:1 No - lnc-SEC24A-1:1 Yes chr3L:187207-199762 lnc-CDKN2AIPNL-3:1 Yes chr3R:22356685-22360711 lnc-CDKN2AIPNL-4:1 Yes chr3R:22356685-22360711 lnc-SAR1B-1:1 Yes chr2R:9876232-9882357 lnc-SAR1B-2:1 Yes chrX:15345169-15350021 lnc-PITX1-6:1 No - lnc-PCBD2-1:1 No - lnc-PITX1-5:1 Yes chr3R:29723163-29724226 lnc-TXNDC15-1:1 Yes chr3R:29723163-29724226 lnc-PITX1-4:3 Yes chr3R:29723163-29724226 lnc-PITX1-4:2 Yes chr3R:29723163-29724226 lnc-PITX1-4:1 Yes chr3R:29723163-29724226 lnc-H2AFY-5:1 No - lnc-CATSPER3-4:1 No - lnc-H2AFY-2:1 No - lnc-DCANP1-4:2 Yes chr2L:21423737-21424229 lnc-DCANP1-4:1 Yes chr2L:21423737-21424229 lnc-DCANP1-1:1 Yes chr2L:21423737-21424229 lnc-SLC25A48-8:1 Yes chr2L:21423737-21424229 lnc-SLC25A48-8:3 Yes chr2L:21423737-21424229 lnc-SLC25A48-7:2 No - lnc-SLC25A48-5:2 No - lnc-SLC25A48-3:3 No - lnc-TGFBI-3:2 Yes chr3R:27559379-27561319 lnc-IL9-2:1 Yes chr3R:27559379-27561319 lnc-TGFBI-4:3 Yes chr3R:27559379-27561319 lnc-SLC25A48-4:1 No - lnc-SLC25A48-4:2 No - lnc-SMAD5-5:1 No - SMAD5-AS1:3 Yes chr2L:3146056-3159643 lnc-TGFBI-2:1 Yes chr2L:3146056-3159643 lnc-TGFBI-2:2 Yes chr2L:3146056-3159643 lnc-SMIM32-4:1 No - TRPC7-AS1:1 No - lnc-SMAD5-8:1 No - lnc-TRPC7-3:1 No - lnc-SMAD5-4:2 No - lnc-SMAD5-9:1 No - lnc-TRPC7-6:1 Yes chr3R:23070516-23112730 lnc-SPOCK1-1:1 Yes chr3R:23070516-23112730 lnc-MYOT-66:1 Yes chr3R:23070516-23112730 lnc-SPOCK1-1:2 Yes chr3R:23070516-23112730 lnc-SPOCK1-2:2 Yes chr2L:18129884-18138083 lnc-SPOCK1-2:1 Yes chr2L:18129884-18138083 lnc-HNRNPA0-3:13 Yes chr2L:18129884-18138083 lnc-HNRNPA0-2:1 Yes chr3R:26872129-26875742 lnc-KLHL3-1:1 Yes chr3R:26872129-26875742 lnc-MYOT-5:1 No - lnc-FAM13B-3:1 No - lnc-MYOT-3:1 No - lnc-MYOT-2:1 No - lnc-MYOT-1:1 No - lnc-HNRNPA0-4:5 No - lnc-NME5-4:1 Yes chr2R:17703335-17719346 lnc-NME5-3:1 Yes chr2R:17703335-17719346 lnc-NME5-2:1 Yes chr2R:17703335-17719346 lnc-BRD8-2:2 No - lnc-BRD8-2:3 No - lnc-BRD8-2:1 No - lnc-NME5-1:1 No - lnc-CDC23-1:1 Yes chr3R:29223485-29226276 lnc-BRD8-1:1 Yes chr2L:20459342-20461729 lnc-KIF20A-1:1 No - lnc-CDC25C-2:1 No - lnc-FAM53C-2:1 No - lnc-GFRA3-1:5 Yes chr3R:29251826-29255800 lnc-GFRA3-1:3 Yes chr3R:29251826-29255800 lnc-GFRA3-1:2 Yes chr3R:29251826-29255800 lnc-GFRA3-1:1 Yes chr3R:29251826-29255800 lnc-GFRA3-1:4 Yes chr3R:29251826-29255800 lnc-KDM3B-1:5 No - lnc-KDM3B-1:6 No - lnc-KDM3B-1:7 No - lnc-EGR1-1:1 No - lnc-HSPA9-1:1 Yes chr3L:20348355-20353873 lnc-HSPA9-1:2 Yes chr3L:20348355-20353873 lnc-CTNNA1-4:1 No - lnc-ETF1-1:1 No - lnc-CTNNA1-3:1 No - lnc-ETF1-2:2 Yes chr2R:14252598-14256192 lnc-ETF1-2:1 Yes chr2R:14252598-14256192 lnc-CTNNA1-1:2 No - lnc-EGR1-2:1 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-LRRTM2-1:2 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-EGR1-3:1 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-EGR1-4:1 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-EGR1-5:1 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-SIL1-1:1 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-EGR1-6:1 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-EGR1-6:2 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-LRRTM2-4:1 Yes chr3R:25233636-25235529 lnc-LRRTM2-3:1 Yes chr3R:25233636-25235529 lnc-SIL1-3:6 Yes chr3R:25233636-25235529 lnc-SIL1-3:2 No - lnc-SIL1-3:5 Yes chr3R:25233636-25235529 lnc-SIL1-3:1 No - SNHG4:1 No - SNHG4:2 No - SNHG4:3 No - SNHG4:4 No - SNHG4:5 No - SNHG4:6 No - SNHG4:7 No - SNHG4:8 No - SNHG4:11 No - lnc-SIL1-3:4 No - lnc-SIL1-3:3 No - lnc-SLC23A1-2:1 No - lnc-MZB1-2:1 Yes chr3R:10307806-10311613 lnc-MZB1-1:1 Yes chr3R:10307806-10311613 lnc-PROB1-1:2 No - lnc-PROB1-1:3 No - lnc-PROB1-1:1 No - lnc-SPATA24-1:1 Yes chr3R:14032371-14035041 lnc-ECSCR-1:1 No - lnc-TMEM173-2:3 No - lnc-TMEM173-2:5 No - lnc-TMEM173-2:2 No - lnc-TMEM173-2:4 No - lnc-SMIM33-3:1 No - lnc-UBE2D2-2:1 No - lnc-TMEM173-3:7 No - lnc-UBE2D2-4:2 Yes chr3L:2786207-2879158 lnc-NRG2-7:1 No - PSD2-AS1:14 No - PSD2-AS1:18 No - lnc-PSD2-2:3 No - lnc-PFDN1-5:1 No - lnc-PFDN1-4:1 No - MALINC1:42 Yes chr4:558016-567257 MALINC1:63 Yes chr4:558016-567257 MALINC1:64 Yes chr4:558016-567257 MALINC1:65 Yes chr4:558016-567257 MALINC1:72 No - MALINC1:45 Yes chr4:558016-567257 lnc-IGIP-2:2 Yes chr4:558016-567257 lnc-IGIP-2:3 Yes chr4:558016-567257 lnc-NRG2-5:1 No - lnc-NRG2-6:1 No - lnc-HBEGF-4:1 No - lnc-HBEGF-4:3 No - lnc-HBEGF-4:2 No - lnc-PFDN1-2:1 No - lnc-PFDN1-3:1 No - lnc-HBEGF-1:2 No - lnc-SLC4A9-1:1 No - lnc-HBEGF-2:3 No - lnc-HBEGF-2:2 No - lnc-HBEGF-2:4 No - lnc-APBB3-1:3 No - lnc-SRA1-2:1 No - lnc-APBB3-3:3 No - lnc-APBB3-3:1 No - lnc-APBB3-3:4 No - lnc-APBB3-3:2 No - lnc-TMCO6-3:1 No - lnc-NDUFA2-1:2 No - lnc-NDUFA2-1:1 No - lnc-DND1-1:1 Yes chr3R:11741890-11744027 lnc-DND1-2:1 Yes chrX:18515428-18520445 lnc-HARS-1:2 No - lnc-HARS-2:1 No - lnc-PCDHA1-1:1 No - lnc-HARS-4:1 Yes chr3R:16484566-16495422 lnc-TAF7-6:12 No - lnc-PCDHB2-1:1 No - lnc-TAF7-6:4 No - lnc-TAF7-5:5 No - lnc-TAF7-5:4 No - lnc-TAF7-5:8 No - lnc-TAF7-4:2 No - lnc-TAF7-1:7 No - lnc-TAF7-1:11 No - lnc-TAF7-1:9 No - lnc-TAF7-1:8 No - lnc-SLC25A2-1:12 Yes chr3R:7907333-7909721 lnc-PCDHGA1-2:3 No - lnc-PCDHGC4-1:1 No - lnc-DIAPH1-3:1 Yes chr2L:20758144-20768053 lnc-RELL2-3:1 Yes chr2L:20758144-20768053 lnc-FCHSD1-1:4 Yes chr3R:5472810-5474600 lnc-FCHSD1-1:6 Yes chr3R:5472810-5474600 lnc-FCHSD1-1:5 Yes chr3R:5472810-5474600 lnc-FCHSD1-1:2 Yes chr3R:5472810-5474600 lnc-FCHSD1-1:3 Yes chr3R:5472810-5474600 lnc-HDAC3-1:2 No - lnc-HDAC3-1:3 No - lnc-HDAC3-1:1 Yes chr3L:9137860-9145693 lnc-FCHSD1-2:1 Yes chrX:16943290-16956234 lnc-PCDH1-5:1 No - lnc-PCDH1-2:1 No - lnc-KIAA0141-4:1 Yes chr3R:14630478-14641776 lnc-KIAA0141-3:1 No - lnc-PCDH12-4:1 No - lnc-PCDH12-3:1 No - lnc-GNPDA1-2:1 No - lnc-PCDH12-5:1 Yes chr2L:5547086-5549614 lnc-NDFIP1-1:2 No - lnc-SPRY4-4:1 No - lnc-SPRY4-3:1 No - lnc-FGF1-7:1 Yes chr3L:3401153-3424935 lnc-SPRY4-2:1 Yes chr3L:3401153-3424935 lnc-NDFIP1-4:1 No - lnc-NDFIP1-5:1 No - lnc-NDFIP1-6:1 No - lnc-ARHGAP26-4:8 No - lnc-ARHGAP26-4:29 No - lnc-FGF1-4:1 No - lnc-ARHGAP26-7:1 No - lnc-SPRY4-5:1 Yes chr3R:19794073-19836817 lnc-SPRY4-5:3 Yes chr3R:19794073-19836817 lnc-SPRY4-5:4 Yes chr3R:19794073-19836817 lnc-SPRY4-5:2 Yes chr3R:19794073-19836817 lnc-FGF1-3:1 No - lnc-ARHGAP26-4:37 No - lnc-ARHGAP26-4:38 No - lnc-ARHGAP26-4:39 No - ARHGAP26-AS1:6 Yes chrX:15751674-15760733 ARHGAP26-AS1:1 Yes chrX:15751674-15760733 lnc-FGF1-6:1 Yes chrX:15751674-15760733 lnc-HMHB1-6:2 Yes chrX:15751674-15760733 lnc-ARHGAP26-5:1 No - lnc-ARHGAP26-6:1 No - lnc-FGF1-8:2 No - lnc-FGF1-8:1 No - lnc-HMHB1-2:3 No - lnc-KCTD16-2:1 No - lnc-NR3C1-2:1 Yes chr2L:12993757-13000635 lnc-HMHB1-5:1 Yes chr3R:20894452-20897320 lnc-YIPF5-1:1 Yes chr3R:20894452-20897320 lnc-KCTD16-3:1 No - lnc-YIPF5-2:1 No - lnc-PRELID2-6:1 No - lnc-PRELID2-2:2 No - lnc-SH3RF2-7:1 No - lnc-PRELID2-1:5 Yes chr2L:6046516-6048706 lnc-SH3RF2-6:1 Yes chr2L:6046516-6048706 lnc-PRELID2-1:4 Yes chr2L:6046516-6048706 lnc-PRELID2-1:6 Yes chr2L:6046516-6048706 lnc-PRELID2-5:1 Yes chr2L:6046516-6048706 lnc-PRELID2-5:2 Yes chr2L:6046516-6048706 lnc-RBM27-3:1 No - lnc-PLAC8L1-1:1 No - lnc-SH3RF2-4:1 Yes chr2L:3510328-3514656 lnc-SH3RF2-5:1 Yes chr2L:3510328-3514656 lnc-PLAC8L1-2:1 Yes chr2L:3510328-3514656 lnc-PLAC8L1-3:1 Yes chr2L:3510328-3514656 lnc-PLAC8L1-3:2 Yes chr2L:3510328-3514656 lnc-PPP2R2B-3:1 Yes chr3R:10126129-10139772 lnc-GPR151-3:1 Yes chr3R:10126129-10139772 lnc-PPP2R2B-4:2 Yes chr3R:10126129-10139772 lnc-PPP2R2B-4:1 Yes chr3R:10126129-10139772 lnc-PPP2R2B-4:3 Yes chr3R:10126129-10139772 STK32A-AS1:18 No - lnc-JAKMIP2-2:1 No - lnc-STK32A-3:1 No - lnc-JAKMIP2-1:1 No - lnc-SCGB3A2-6:1 No - lnc-C5orf46-1:1 No - lnc-SPINK5-1:1 No - lnc-HTR4-4:1 No - lnc-SPINK7-2:1 No - lnc-HTR4-1:4 No - lnc-FBXO38-1:1 No - lnc-HTR4-2:1 No - lnc-FBXO38-2:2 No - lnc-SH3TC2-3:1 No - lnc-ADRB2-1:1 No - lnc-HTR4-5:1 No - lnc-IL17B-8:1 No - lnc-IL17B-7:1 No - lnc-IL17B-7:2 No - lnc-SH3TC2-2:1 No - lnc-PCYOX1L-3:1 No - lnc-IL17B-4:1 No - lnc-PCYOX1L-1:2 No - CARMN:6 No - CARMN:7 No - CARMN:11 No - CARMN:12 No - CARMN:25 No - CARMN:26 No - lnc-IL17B-5:1 No - CARMN:27 No - lnc-IL17B-6:1 No - lnc-ARHGEF37-1:1 No - lnc-CSNK1A1-8:1 No - lnc-PPARGC1B-2:1 No - lnc-SLC26A2-1:1 Yes chr3R:4422483-4429335 lnc-CSF1R-4:1 No - lnc-TIGD6-2:1 No - lnc-TIGD6-3:1 No - lnc-TIGD6-4:4 Yes chr2L:8220980-8239878 lnc-PDGFRB-2:1 Yes chr2L:8220980-8239878 lnc-PDGFRB-4:1 Yes chr2L:8220980-8239878 lnc-CSF1R-1:1 Yes chr2L:8220980-8239878 lnc-CSF1R-2:1 Yes chr2L:8220980-8239878 lnc-CSF1R-3:1 Yes chr2L:8220980-8239878 lnc-PDGFRB-1:3 Yes chr2L:8220980-8239878 lnc-ARSI-3:1 Yes chr4:1035288-1053703 lnc-ARSI-2:1 No - lnc-RPS14-4:1 No - lnc-CD74-1:1 No - lnc-CD74-3:1 Yes chrX:7933742-7934677 lnc-RPS14-2:1 Yes chrX:7933742-7934677 lnc-RPS14-2:2 Yes chrX:7933742-7934677 lnc-NDST1-1:3 Yes chrX:7933742-7934677 lnc-NDST1-1:4 Yes chrX:7933742-7934677 lnc-NDST1-3:1 No - lnc-SYNPO-6:1 Yes chr3L:6495680-6550104 lnc-RPS14-5:1 Yes chr3L:6495680-6550104 lnc-SYNPO-6:2 Yes chr3L:6495680-6550104 lnc-SYNPO-5:1 Yes chr3L:6495680-6550104 lnc-RBM22-3:1 Yes chr2R:7667248-7669029 lnc-RBM22-4:1 Yes chr2R:7667248-7669029 lnc-RBM22-4:2 Yes chr2R:7667248-7669029 lnc-SMIM3-1:1 No - lnc-ZNF300-1:3 No - lnc-IRGM-1:1 No - lnc-ZNF300-2:1 No - lnc-IRGM-2:1 No - lnc-ANXA6-6:1 No - lnc-ANXA6-5:1 No - lnc-ANXA6-6:2 No - lnc-ANXA6-3:1 No - lnc-ANXA6-3:2 No - lnc-ANXA6-3:3 No - lnc-CCDC69-2:1 Yes chrX:20171445-20173514 lnc-GM2A-1:1 No - lnc-ANXA6-2:1 No - lnc-ANXA6-4:1 No - lnc-GM2A-2:1 Yes chr3L:9494555-9505328 lnc-SLC36A2-2:1 Yes chr3L:11025561-11029444 lnc-SLC36A2-1:1 Yes chr3L:11025561-11029444 lnc-FAT2-2:1 Yes chr3L:9494555-9505328 lnc-FAT2-1:1 Yes chr3L:9494555-9505328 lnc-SLC36A1-2:1 No - lnc-ATOX1-3:2 Yes chr3R:26869238-26871995 lnc-ATOX1-3:1 Yes chr3R:26869238-26871995 lnc-ATOX1-2:1 Yes chr3R:26869238-26871995 lnc-SPARC-1:1 No - lnc-SPARC-2:5 Yes chr3L:21640995-21642599 lnc-SPARC-2:2 Yes chr3L:21640995-21642599 lnc-SPARC-2:1 Yes chr3L:21640995-21642599 lnc-G3BP1-1:2 Yes chr3L:21640995-21642599 lnc-SPARC-2:3 Yes chr3L:21640995-21642599 lnc-GLRA1-2:1 Yes chr3L:21640995-21642599 lnc-GLRA1-1:1 Yes chr3L:21640995-21642599 lnc-SLC36A1-4:2 Yes chr3R:13647004-13654527 lnc-SLC36A1-7:1 Yes chr3R:13647004-13654527 lnc-SLC36A1-5:1 Yes chr3R:13647004-13654527 lnc-SLC36A1-5:2 Yes chr3R:13647004-13654527 lnc-G3BP1-5:1 No - lnc-NMUR2-2:1 Yes chr3L:21558974-21562181 lnc-NMUR2-3:1 No - lnc-MFAP3-2:1 Yes chr3L:6624032-6635059 lnc-HAND1-9:1 Yes chr3R:15786703-15788339 lnc-HAND1-9:2 Yes chr3R:15786703-15788339 lnc-HAND1-8:3 Yes chr3R:15786703-15788339 lnc-HAND1-8:1 No - lnc-HAND1-8:2 Yes chr3R:15786703-15788339 lnc-MFAP3-1:2 No - lnc-MFAP3-1:3 No - lnc-MFAP3-1:6 No - lnc-MFAP3-1:5 No - lnc-MFAP3-1:4 No - lnc-MFAP3-1:7 No - lnc-MFAP3-1:8 No - lnc-HAND1-7:1 Yes chr2L:3470182-3472364 lnc-MFAP3-4:1 Yes chr2L:3470182-3472364 lnc-HAND1-6:1 Yes chr2L:3470182-3472364 lnc-SAP30L-3:1 Yes chr2L:3470182-3472364 SAP30L-AS1:4 Yes chr2L:3470182-3472364 lnc-HAND1-3:1 Yes chr2L:3470182-3472364 SAP30L-AS1:7 No - lnc-HAND1-4:1 No - lnc-LARP1-4:1 No - lnc-LARP1-3:1 No - lnc-LARP1-5:1 No - lnc-LARP1-1:1 No - lnc-FAXDC2-3:2 No - lnc-CNOT8-4:1 Yes chr3R:28318162-28336440 lnc-GEMIN5-1:1 Yes chrX:13676894-13677882 lnc-GEMIN5-1:6 Yes chrX:13676894-13677882 lnc-GEMIN5-1:5 Yes chrX:13676894-13677882 lnc-GEMIN5-1:3 Yes chrX:13676894-13677882 lnc-GEMIN5-1:2 Yes chrX:13676894-13677882 lnc-GEMIN5-1:4 Yes chrX:13676894-13677882 lnc-CNOT8-2:1 No - lnc-CNOT8-2:2 No - lnc-CNOT8-2:3 No - lnc-FAXDC2-1:2 Yes chr2R:20633876-20640681 lnc-FAXDC2-2:2 Yes chr2R:20633876-20640681 lnc-GEMIN5-2:1 No - lnc-KIF4B-1:2 No - lnc-KIF4B-1:4 No - lnc-KIF4B-2:1 No - lnc-SGCD-4:1 No - lnc-SGCD-4:2 No - lnc-GEMIN5-3:1 No - lnc-PPP1R2B-7:1 Yes chrX:1735945-1754065 lnc-TIMD4-3:1 No - lnc-TIMD4-2:1 No - lnc-PPP1R2B-2:1 No - lnc-PPP1R2B-3:1 No - lnc-HAVCR2-1:1 No - lnc-ITK-6:1 No - lnc-ITK-5:1 No - lnc-ITK-2:1 Yes chr3R:15333266-15338365 lnc-CYFIP2-2:1 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-SOX30-5:1 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-SOX30-4:1 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-SOX30-2:1 No - lnc-C5orf52-2:1 No - lnc-CLINT1-3:1 No - lnc-LSM11-8:1 No - lnc-CLINT1-4:1 No - lnc-CLINT1-5:1 No - lnc-LSM11-9:1 No - lnc-CLINT1-6:1 No - lnc-CLINT1-7:1 No - lnc-CLINT1-8:1 No - lnc-EBF1-7:1 No - lnc-LSM11-6:2 No - lnc-EBF1-2:2 No - lnc-UBLCP1-30:2 No - lnc-EBF1-3:1 Yes chr2R:14772650-14807061 lnc-RNF145-5:1 Yes chr2R:14772650-14807061 lnc-RNF145-3:1 Yes chr2R:14772650-14807061 lnc-RNF145-1:1 Yes chr2R:14772650-14807061 LINC02202:25 No - lnc-EBF1-4:1 No - lnc-EBF1-5:1 No - lnc-UBLCP1-2:4 No - lnc-ADRA1B-2:1 No - lnc-ADRA1B-1:1 Yes chr3L:22035003-22065279 lnc-CCNJL-3:1 No - lnc-CCNJL-2:1 No - lnc-FABP6-1:1 No - lnc-CCNJL-1:4 Yes chr3L:3466428-3468098 lnc-FABP6-2:1 Yes chr3L:3466428-3468098 lnc-FABP6-3:1 Yes chr3L:3466428-3468098 lnc-CCNJL-1:3 Yes chr3L:3466428-3468098 lnc-PTTG1-8:1 No - lnc-PTTG1-7:1 No - lnc-PTTG1-4:1 No - lnc-PTTG1-5:1 No - MIR3142HG:1 No - MIR3142HG:3 No - lnc-ATP10B-2:1 No - lnc-PTTG1-9:1 No - lnc-PTTG1-10:1 No - lnc-PTTG1-11:1 No - lnc-PTTG1-12:1 No - lnc-PTTG1-13:1 No - lnc-SLU7-1:1 Yes chr2L:9495474-9520696 lnc-SLU7-2:1 Yes chr2L:9495474-9520696 lnc-SLU7-3:1 Yes chr2L:9495474-9520696 lnc-ATP10B-4:2 Yes chr2L:9495474-9520696 lnc-ATP10B-4:1 Yes chr2L:9495474-9520696 lnc-GABRB2-4:1 Yes chrX:15921955-15928529 lnc-GABRA1-2:1 Yes chrX:15921955-15924558 LINC01202:10 No - lnc-GABRG2-2:1 No - lnc-GABRG2-3:1 No - lnc-CCNG1-5:1 No - lnc-CCNG1-4:1 No - lnc-NUDCD2-2:5 No - lnc-CCNG1-3:1 No - lnc-CCNG1-2:1 No - lnc-CCNG1-1:3 Yes chr3R:31596642-31612664 lnc-CCNG1-1:4 Yes chr3R:31596642-31612664 lnc-GABRB2-7:1 No - lnc-GABRB2-6:2 No - lnc-GABRB2-6:1 No - HMMR-AS1:2 No - lnc-MAT2B-1:2 No - lnc-NUDCD2-8:1 No - lnc-MAT2B-1:3 No - lnc-NUDCD2-9:1 No - lnc-MAT2B-3:20 No - LINC02143:8 No - lnc-MAT2B-3:22 No - LINC01938:10 No - LINC01938:11 No - LINC01938:12 No - lnc-NUDCD2-12:1 No - lnc-TENM2-4:1 No - lnc-NUDCD2-13:1 No - lnc-TENM2-3:1 No - lnc-PANK3-22:1 No - lnc-PANK3-21:1 No - lnc-WWC1-4:1 Yes chrX:10964032-10967134 lnc-PANK3-2:2 Yes chrX:10964032-10967134 lnc-PANK3-2:4 Yes chrX:10964032-10967134 lnc-FBLL1-5:1 No - lnc-PANK3-13:2 No - lnc-PANK3-13:1 No - lnc-SLIT3-2:1 No - lnc-PANK3-14:1 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-PANK3-15:1 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-FBLL1-4:1 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-FBLL1-4:2 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-FBLL1-4:24 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-PANK3-17:1 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-SLIT3-1:2 No - lnc-DOCK2-2:1 No - lnc-DOCK2-1:1 No - lnc-LCP2-6:1 Yes chr3R:23781765-23801634 LINC01187:1 No - LINC01187:7 No - lnc-LCP2-4:1 No - lnc-LCP2-3:1 No - lnc-KCNMB1-5:1 No - lnc-KCNMB1-4:1 No - lnc-KCNMB1-3:7 No - lnc-KCNMB1-3:8 No - lnc-GABRP-1:1 Yes chrX:15927185-15933867 lnc-GABRP-2:1 Yes chrX:15927185-15933867 lnc-TLX3-8:1 Yes chrX:15927185-15933867 lnc-TLX3-2:1 Yes chrX:15927185-15933867 lnc-FBXW11-9:1 No - lnc-NPM1-2:1 No - lnc-NPM1-1:1 No - lnc-FBXW11-1:2 No - lnc-SMIM23-2:1 Yes chr3R:21119252-21127485 lnc-STK10-3:1 Yes chr3R:21119252-21127485 lnc-STK10-2:1 Yes chr3R:21119252-21127485 lnc-EFCAB9-3:1 No - lnc-EFCAB9-2:1 No - lnc-EFCAB9-1:1 No - lnc-FBXW11-4:2 Yes chr2R:24392129-24402680 lnc-FBXW11-4:1 Yes chr2R:24392129-24402680 lnc-FBXW11-5:1 Yes chr2R:24392129-24402680 lnc-FBXW11-6:1 Yes chr2R:24392129-24402680 lnc-UBTD2-7:4 Yes chr2R:24392129-24402680 lnc-UBTD2-7:1 Yes chr2R:24392129-24402680 lnc-UBTD2-7:3 Yes chr2R:24392129-24402680 lnc-UBTD2-7:2 Yes chr2R:24392129-24402680 lnc-STK10-1:1 Yes chr3R:5393922-5399510 lnc-UBTD2-1:1 No - lnc-NEURL1B-3:3 No - lnc-SH3PXD2B-2:1 No - lnc-DUSP1-6:1 Yes chr3R:9020348-9039471 lnc-ERGIC1-5:1 Yes chr3R:9020348-9039471 lnc-DUSP1-2:2 Yes chr3R:9020348-9039471 lnc-NEURL1B-2:2 No - lnc-DUSP1-5:1 No - lnc-ERGIC1-4:1 No - lnc-ERGIC1-2:5 No - lnc-ERGIC1-1:4 No - lnc-RPL26L1-2:1 No - lnc-DUSP1-4:4 Yes chr3L:18898875-18900408 lnc-CREBRF-1:1 Yes chr3L:21539862-21541215 lnc-ATP6V0E1-1:1 No - lnc-ATP6V0E1-2:1 Yes chr3R:24557368-24582864 lnc-NKX2-5-8:1 Yes chr3R:24557368-24582864 lnc-NKX2-5-5:1 No - lnc-NKX2-5-4:1 No - lnc-STC2-1:2 No - lnc-STC2-1:3 No - lnc-NKX2-5-6:1 No - lnc-NKX2-5-7:1 No - lnc-BNIP1-5:1 No - lnc-BNIP1-3:7 No - lnc-BNIP1-3:8 No - lnc-BNIP1-4:2 No - lnc-BNIP1-4:3 No - lnc-CPEB4-5:2 No - lnc-CPEB4-4:8 No - lnc-CPEB4-4:9 No - lnc-STC2-2:1 Yes chr3R:27938245-27942778 lnc-BOD1-1:10 No - lnc-CPEB4-9:1 No - lnc-CPEB4-1:3 No - lnc-CPEB4-7:1 No - lnc-BOD1-1:11 No - lnc-BOD1-6:1 No - lnc-BOD1-4:6 No - lnc-BOD1-4:5 No - lnc-BOD1-4:4 No - lnc-BOD1-7:1 No - LINC01411:9 No - LINC01411:12 No - LINC01411:13 No - lnc-MSX2-8:1 No - lnc-MSX2-7:1 No - lnc-MSX2-6:1 No - lnc-MSX2-1:2 No - LINC01951:4 No - lnc-MSX2-9:1 No - lnc-SFXN1-2:1 No - lnc-HRH2-5:3 Yes chr3R:4378600-4381210 lnc-DRD1-2:1 Yes chr3R:4378600-4381210 lnc-HRH2-1:1 No - lnc-HRH2-4:1 No - lnc-SIMC1-6:1 No - lnc-SIMC1-6:2 No - lnc-FAM153B-3:6 No - lnc-FAM153B-3:7 No - lnc-FAM153B-3:9 No - lnc-FAM153B-3:10 No - lnc-THOC3-2:25 No - lnc-THOC3-2:26 No - lnc-THOC3-2:7 No - lnc-THOC3-2:21 No - lnc-FAM153B-2:2 No - lnc-THOC3-2:18 No - lnc-THOC3-2:17 No - lnc-THOC3-2:4 No - lnc-THOC3-2:19 No - lnc-THOC3-2:5 No - lnc-KIAA1191-6:1 No - lnc-ARL10-2:1 No - lnc-ARL10-2:2 No - lnc-NOP16-2:7 No - lnc-NOP16-2:6 No - lnc-NOP16-2:8 No - lnc-HIGD2A-1:1 No - lnc-CLTB-1:1 No - lnc-NOP16-1:3 Yes chr3L:20241053-20243735 lnc-NOP16-1:2 Yes chr3L:20241053-20243735 lnc-GPRIN1-2:1 Yes chr3R:9535625-9551806 lnc-GPRIN1-1:1 Yes chr3R:9535625-9551806 lnc-GPRIN1-1:2 Yes chr3R:9535625-9551806 lnc-RNF44-1:1 Yes chr3R:25224156-25232321 lnc-SNCB-3:1 No - lnc-SNCB-3:2 No - lnc-EIF4E1B-2:1 Yes chr3L:6664224-6665641 LINC01574:1 No - lnc-HK3-1:2 No - lnc-HK3-1:1 No - lnc-HK3-2:1 No - lnc-HK3-3:1 No - lnc-PRELID1-2:1 Yes chr3R:27932982-27937853 lnc-PRELID1-1:1 Yes chr3R:27932982-27937853 lnc-LMAN2-2:3 No - lnc-LMAN2-2:5 No - lnc-LMAN2-2:4 No - lnc-RAB24-1:1 No - lnc-MXD3-2:1 Yes chr3R:24167675-24169562 lnc-MXD3-1:1 Yes chr3R:24167675-24169562 lnc-RGS14-1:1 Yes chr3R:24167675-24169562 lnc-LMAN2-1:2 Yes chr3R:22619968-22639387 lnc-PFN3-1:1 No - PRR7-AS1:1 No - PRR7-AS1:2 No - PRR7-AS1:3 No - lnc-DBN1-3:5 Yes chr2R:15762565-15817004 lnc-DBN1-3:4 Yes chr2R:15762565-15817004 lnc-PDLIM7-3:2 Yes chr2R:15762565-15817004 lnc-PDLIM7-3:1 Yes chr2R:15762565-15817004 lnc-DDX41-1:1 Yes chrX:7324214-7328806 lnc-DDX41-1:2 Yes chrX:7324214-7328806 lnc-DDX41-2:6 No - lnc-DDX41-2:5 No - lnc-DDX41-4:1 No - lnc-DDX41-4:2 No - lnc-DDX41-3:1 No - lnc-FAM193B-1:1 No - lnc-FAM193B-2:1 Yes chr3R:9684469-9685476 lnc-B4GALT7-1:2 No - lnc-FAM153A-3:7 No - lnc-B4GALT7-1:3 No - lnc-FAM153A-3:1 No - lnc-FAM153A-3:6 No - lnc-FAM153A-3:4 No - lnc-FAM153A-3:2 No - lnc-FAM153A-3:5 No - lnc-FAM193B-4:3 No - lnc-FAM193B-4:2 No - lnc-FAM193B-4:1 No - lnc-FAM193B-4:5 No - lnc-FAM193B-5:1 No - lnc-FAM193B-6:1 No - lnc-FAM193B-7:1 No - lnc-FAM193B-7:3 No - lnc-FAM193B-7:2 No - lnc-FAM153C-9:2 No - lnc-FAM153C-9:3 No - lnc-FAM153C-9:4 No - lnc-FAM153C-5:2 No - lnc-FAM153C-5:3 No - lnc-FAM153C-5:4 No - lnc-FAM153C-5:5 No - lnc-FAM153C-7:1 No - lnc-PROP1-4:1 No - lnc-N4BP3-2:2 No - lnc-N4BP3-2:3 No - lnc-FAM153C-1:6 No - lnc-FAM153C-1:7 No - lnc-FAM153C-1:8 No - lnc-FAM153C-1:9 No - lnc-FAM153C-1:10 No - lnc-FAM153C-1:11 No - lnc-FAM153C-1:13 No - lnc-FAM153C-1:14 No - lnc-FAM153C-1:15 No - lnc-PHYKPL-1:1 No - lnc-COL23A1-3:1 No - lnc-COL23A1-1:5 Yes chr3L:13860027-13866905 lnc-HNRNPAB-5:1 Yes chr3R:16502770-16571363 lnc-HNRNPAB-6:1 Yes chr3R:16502770-16571363 lnc-CLK4-3:1 Yes chr3R:16502770-16571363 lnc-CLK4-2:6 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-CLK4-2:3 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-CLK4-2:2 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-CLK4-2:4 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-CLK4-2:7 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-CLK4-2:5 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-ZNF354A-2:1 No - lnc-ZNF354A-3:1 No - lnc-ZNF354B-2:1 No - lnc-ZFP2-3:1 Yes chr3R:9775121-9777943 lnc-ZNF454-2:1 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-GRM6-1:2 No - lnc-ADAMTS2-3:1 Yes chr4:936819-949441 lnc-GRM6-2:1 Yes chr4:936819-949441 lnc-GRM6-3:1 No - lnc-GRM6-4:1 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-GRM6-4:2 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-GRM6-5:1 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-GRM6-5:2 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-ADAMTS2-2:1 No - lnc-RUFY1-4:1 No - lnc-RUFY1-4:2 No - lnc-HNRNPH1-5:1 No - lnc-RUFY1-3:1 No - lnc-CANX-5:1 Yes chr3R:27229505-27239085 lnc-C5orf60-3:4 No - lnc-C5orf60-3:3 No - lnc-C5orf60-3:7 No - lnc-C5orf60-3:10 No - lnc-C5orf60-3:9 No - lnc-C5orf60-3:8 No - lnc-C5orf60-3:5 No - lnc-C5orf60-3:1 No - lnc-C5orf60-3:6 No - lnc-C5orf60-3:2 No - lnc-C5orf60-2:1 No - lnc-C5orf60-1:3 No - lnc-C5orf60-1:2 No - lnc-C5orf60-1:1 No - lnc-CANX-1:9 No - lnc-CBY3-2:1 Yes chrX:16522967-16525415 lnc-CBY3-3:1 Yes chrX:16522967-16525415 lnc-LTC4S-1:1 No - lnc-MRNIP-5:1 Yes chr3L:14762028-14767703 lnc-MRNIP-5:2 Yes chr3L:14762028-14767703 lnc-MRNIP-4:1 Yes chr3L:14762028-14767703 lnc-MRNIP-4:2 Yes chr3L:14762028-14767703 lnc-MRNIP-4:3 Yes chr3L:14762028-14767703 lnc-LTC4S-2:2 No - lnc-LTC4S-2:3 No - lnc-MRNIP-1:8 No - lnc-MRNIP-1:6 No - lnc-MRNIP-1:2 Yes chr3L:16105852-16106428 lnc-MRNIP-1:5 Yes chr3L:16105852-16106428 lnc-MRNIP-1:7 Yes chr3L:16105852-16106428 lnc-SQSTM1-1:1 Yes chr3L:16105852-16106428 lnc-MRNIP-1:3 Yes chr3L:16105852-16106428 lnc-MRNIP-1:4 Yes chr3L:16105852-16106428 lnc-MRNIP-1:1 No - lnc-MRNIP-6:1 Yes chr3L:21337681-21343716 lnc-MRNIP-6:2 Yes chr3L:21337681-21343716 lnc-MRNIP-2:1 Yes chr3L:21337681-21343716 lnc-MRNIP-3:1 Yes chr3L:21337681-21343716 lnc-RNF130-4:1 Yes chr3L:21337681-21343716 lnc-TBC1D9B-2:2 Yes chr2R:25072627-25084347 lnc-TBC1D9B-1:9 Yes chr2R:25072627-25084347 lnc-TBC1D9B-6:1 Yes chr2R:25072627-25084347 lnc-TBC1D9B-3:1 Yes chr2R:25072627-25084347 lnc-TBC1D9B-4:1 Yes chr2R:25072627-25084347 lnc-TBC1D9B-4:2 Yes chr2R:25072627-25084347 lnc-TBC1D9B-5:1 Yes chr2R:25072627-25084347 lnc-TBC1D9B-5:2 Yes chr2R:25072627-25084347 lnc-RNF130-3:1 No - lnc-GFPT2-1:1 Yes chr2L:10247502-10250501 lnc-CNOT6-9:1 Yes chr2L:10247502-10250501 lnc-CNOT6-4:3 No - lnc-CNOT6-5:1 Yes chr3R:24196893-24221965 lnc-CNOT6-6:1 No - lnc-CNOT6-7:1 No - lnc-CNOT6-8:1 No - lnc-SCGB3A1-1:1 Yes chr2L:8220980-8239878 lnc-SCGB3A1-1:2 Yes chr2L:8220980-8239878 lnc-SCGB3A1-2:1 Yes chr2L:8220980-8239878 lnc-FLT4-1:1 No - LINC02222:4 No - lnc-MGAT1-3:10 Yes chr2R:20559156-20562331 lnc-MGAT1-3:2 Yes chr2R:20559156-20562331 lnc-MGAT1-3:11 Yes chr2R:20559156-20562331 lnc-MGAT1-3:5 Yes chr2R:20559156-20562331 lnc-MGAT1-3:7 Yes chr2R:20559156-20562331 lnc-MGAT1-3:6 Yes chr2R:20559156-20562331 lnc-MGAT1-3:3 Yes chr2R:20559156-20562331 lnc-MGAT1-3:4 Yes chr2R:20559156-20562331 lnc-MGAT1-3:1 Yes chr2R:20559156-20562331 lnc-MGAT1-3:9 Yes chr2R:20559156-20562331 lnc-MGAT1-3:8 Yes chr2R:20559156-20562331 lnc-BTNL8-6:1 Yes chr2R:20559156-20562331 lnc-BTNL8-5:1 No - lnc-MGAT1-4:11 No - lnc-MGAT1-4:12 No - LINC00847:2 No - LINC00847:3 No - LINC00847:4 No - LINC00847:5 No - LINC00847:6 No - LINC00847:7 No - LINC00847:8 No - LINC00847:9 No - lnc-ZFP62-2:1 No - lnc-ZFP62-2:2 No - lnc-ZFP62-2:3 No - lnc-ZFP62-4:1 No - lnc-BTNL8-4:1 No - lnc-OR2V1-1:1 No - lnc-BTNL9-1:1 No - lnc-OR2V2-1:1 No - LINC01962:7 No - lnc-TRIM41-4:1 No - lnc-TRIM41-4:5 No - lnc-TRIM41-4:6 No - lnc-TRIM41-4:7 No - lnc-TRIM41-4:10 No - lnc-RACK1-3:2 No - lnc-RACK1-1:4 No - lnc-TRIM52-3:1 Yes chr2L:7825347-7827315 lnc-TRIM52-2:1 Yes chr2L:7825347-7827315 lnc-TRIM52-2:2 Yes chr2L:7825347-7827315 lnc-TRIM52-1:2 Yes chr2L:7825347-7827315 lnc-TRIM52-1:1 Yes chr2L:7825347-7827315 lnc-RACK1-2:2 Yes chr2L:7825347-7827315 TRIM52-AS1:11 No - TRIM52-AS1:12 No - TRIM52-AS1:13 No - TRIM52-AS1:18 No - lnc-OR4F3-5:1 No - lnc-OR4F3-5:6 No - lnc-OR4F3-5:7 No - lnc-OR4F3-5:8 No - lnc-OR4F3-5:9 No - lnc-OR4F3-5:10 No - lnc-OR4F3-5:11 No - lnc-OR4F3-4:1 No - lnc-TRIM52-4:1 No - lnc-OR4F3-3:1 No - lnc-DUSP22-10:1 No - lnc-DUSP22-9:1 No - lnc-DUSP22-8:1 No - lnc-EXOC2-27:1 No - lnc-EXOC2-29:5 No - lnc-EXOC2-29:2 No - lnc-EXOC2-20:2 No - lnc-EXOC2-20:1 No - lnc-DUSP22-6:1 No - lnc-DUSP22-2:2 No - lnc-EXOC2-18:1 No - lnc-EXOC2-15:1 Yes chr3L:13465552-13474787 lnc-EXOC2-14:1 No - lnc-IRF4-4:1 No - lnc-IRF4-4:2 No - lnc-IRF4-5:1 No - lnc-IRF4-8:1 Yes chr2L:3457302-3460367 lnc-HUS1B-2:1 Yes chr2L:3457302-3460367 lnc-HUS1B-3:2 Yes chr2L:3457302-3460367 lnc-EXOC2-10:4 No - lnc-EXOC2-10:3 No - lnc-EXOC2-10:2 No - lnc-EXOC2-10:1 No - lnc-EXOC2-11:2 No - lnc-IRF4-9:1 No - lnc-IRF4-10:1 No - lnc-IRF4-10:2 No - lnc-IRF4-10:3 No - lnc-IRF4-10:4 No - lnc-EXOC2-13:1 No - lnc-IRF4-21:1 No - lnc-IRF4-20:1 No - lnc-IRF4-20:2 No - lnc-IRF4-20:3 No - lnc-IRF4-20:4 No - lnc-IRF4-20:5 No - lnc-IRF4-20:6 No - lnc-IRF4-20:7 No - lnc-IRF4-20:8 No - lnc-IRF4-20:9 No - lnc-IRF4-19:1 No - lnc-IRF4-18:1 No - lnc-IRF4-18:2 No - lnc-FOXQ1-29:1 No - lnc-EXOC2-188:2 No - lnc-EXOC2-16:1 No - lnc-FOXQ1-27:1 No - lnc-FOXQ1-27:2 No - lnc-FOXQ1-27:3 No - lnc-FOXQ1-27:4 No - lnc-FOXQ1-26:1 No - lnc-FOXQ1-26:2 No - lnc-FOXQ1-25:1 No - lnc-FOXQ1-24:1 No - lnc-FOXQ1-24:2 No - lnc-EXOC2-19:1 No - lnc-EXOC2-21:7 No - lnc-EXOC2-21:6 No - lnc-EXOC2-21:4 No - lnc-EXOC2-21:3 No - lnc-EXOC2-21:2 No - LINC01622:17 No - LINC01622:3 No - lnc-EXOC2-21:5 No - lnc-EXOC2-21:1 No - LINC01622:15 No - lnc-FOXQ1-23:1 No - lnc-FOXQ1-23:2 No - lnc-EXOC2-22:2 No - lnc-EXOC2-22:1 No - lnc-EXOC2-22:3 No - lnc-EXOC2-24:1 No - lnc-EXOC2-25:3 No - lnc-EXOC2-25:2 No - lnc-EXOC2-25:1 No - lnc-EXOC2-26:1 No - lnc-EXOC2-8:4 No - lnc-EXOC2-8:3 No - lnc-EXOC2-8:2 No - LINC01622:6 No - lnc-FOXQ1-12:1 No - lnc-FOXQ1-12:2 No - lnc-FOXQ1-12:3 No - lnc-FOXQ1-12:4 No - LINC01622:16 No - LINC01622:7 No - lnc-FOXQ1-20:1 No - LINC01622:4 No - lnc-FOXQ1-19:1 No - LINC01622:2 No - lnc-EXOC2-28:1 No - lnc-FOXQ1-18:1 No - lnc-FOXQ1-17:1 No - lnc-FOXQ1-17:2 No - lnc-GMDS-21:4 No - lnc-FOXQ1-17:3 No - lnc-FOXQ1-17:4 No - lnc-FOXQ1-17:5 No - lnc-FOXQ1-17:6 No - lnc-FOXQ1-16:1 No - lnc-FOXQ1-16:2 No - lnc-FOXQ1-16:3 No - lnc-GMDS-20:1 No - lnc-GMDS-20:4 No - lnc-FOXQ1-15:1 No - lnc-GMDS-20:3 No - lnc-GMDS-20:2 No - lnc-FOXQ1-15:2 No - lnc-FOXQ1-15:3 No - lnc-FOXQ1-15:4 No - lnc-FOXQ1-14:1 No - lnc-GMDS-24:1 No - lnc-FOXQ1-13:1 No - lnc-FOXQ1-11:2 No - LINC01394:39 No - lnc-GMDS-21:3 No - lnc-GMDS-21:2 No - lnc-FOXQ1-10:1 No - lnc-FOXQ1-10:2 No - lnc-FOXQ1-10:3 No - lnc-GMDS-21:1 No - lnc-GMDS-24:2 No - lnc-FOXQ1-9:1 No - lnc-GMDS-23:1 No - lnc-FOXQ1-8:1 No - lnc-FOXQ1-8:2 No - lnc-GMDS-22:1 No - lnc-FOXQ1-7:1 No - LINC01394:37 No - LINC01394:38 No - LINC01394:36 No - lnc-FOXQ1-6:1 No - lnc-FOXQ1-6:2 No - LINC01394:32 No - lnc-FOXQ1-6:3 No - lnc-FOXQ1-5:1 No - lnc-FOXQ1-5:2 No - lnc-GMDS-16:1 No - lnc-FOXQ1-4:1 No - LINC01394:28 No - lnc-FOXQ1-2:1 No - lnc-GMDS-4:3 No - lnc-FOXQ1-1:1 No - lnc-FOXQ1-3:1 No - LINC01394:29 No - LINC01394:31 No - LINC01394:21 Yes chr3L:6990622-6994447 lnc-FOXF2-5:1 No - lnc-FOXF2-4:1 No - lnc-FOXF2-2:1 No - lnc-GMDS-15:2 No - lnc-GMDS-15:1 No - lnc-GMDS-14:1 No - lnc-FOXF2-3:1 No - lnc-GMDS-13:1 No - lnc-GMDS-11:1 No - lnc-GMDS-6:24 No - lnc-FOXF2-6:1 No - lnc-GMDS-6:25 No - lnc-GMDS-9:1 No - lnc-FOXF2-7:1 No - lnc-FOXF2-7:2 No - lnc-FOXF2-7:3 No - lnc-FOXC1-2:2 No - lnc-FOXC1-2:3 No - lnc-FOXC1-2:4 No - lnc-FOXC1-7:1 No - lnc-FOXC1-6:1 No - lnc-FOXC1-6:2 No - lnc-GMDS-6:10 No - lnc-GMDS-6:12 No - lnc-GMDS-6:11 No - lnc-GMDS-6:9 No - lnc-FOXC1-5:1 No - lnc-GMDS-6:7 No - lnc-GMDS-6:8 No - lnc-FOXC1-4:1 No - lnc-FOXC1-4:2 No - lnc-GMDS-6:4 No - lnc-GMDS-6:5 No - lnc-GMDS-6:2 No - lnc-GMDS-6:1 No - FOXCUT:7 No - lnc-GMDS-6:6 No - lnc-FOXF2-9:1 Yes chr3L:21474133-21476479 lnc-GMDS-6:3 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-MYLK4-36:1 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-MYLK4-35:1 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-FOXC1-8:1 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-MYLK4-34:2 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-MYLK4-34:1 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-FOXC1-9:1 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-FOXC1-9:2 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-FOXC1-9:3 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-FOXC1-9:4 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-FOXC1-9:5 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-FOXC1-9:6 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-FOXC1-10:1 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-FOXC1-10:2 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-FOXC1-10:3 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-MYLK4-33:1 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-MYLK4-32:1 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-FOXC1-10:6 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-MYLK4-31:1 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-MYLK4-30:1 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-MYLK4-29:1 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-MYLK4-28:1 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-MYLK4-27:1 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-FOXC1-11:1 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-FOXC1-11:2 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-FOXC1-11:3 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-MYLK4-26:1 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-MYLK4-25:1 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-MYLK4-24:1 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-MYLK4-23:1 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-MYLK4-22:1 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-FOXC1-12:1 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-FOXC1-12:2 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-FOXC1-12:3 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-MYLK4-21:1 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-MYLK4-20:1 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-WRNIP1-38:1 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-WRNIP1-38:2 Yes chr2L:4975300-4977023 GMDS-DT:73 No - GMDS-DT:93 No - lnc-GMDS-5:1 No - GMDS-DT:112 No - GMDS-DT:114 No - GMDS-DT:115 No - GMDS-DT:116 No - lnc-GMDS-7:1 No - GMDS-DT:117 No - GMDS-DT:118 No - GMDS-DT:119 No - lnc-WRNIP1-35:1 No - lnc-WRNIP1-35:2 No - lnc-WRNIP1-34:1 No - lnc-WRNIP1-34:2 No - GMDS-DT:125 No - GMDS-DT:137 No - GMDS-DT:138 No - GMDS-DT:139 No - lnc-GMDS-12:1 No - lnc-GMDS-19:3 No - lnc-GMDS-18:2 No - lnc-GMDS-17:2 No - lnc-WRNIP1-32:1 No - lnc-WRNIP1-32:2 No - lnc-MYLK4-19:1 No - lnc-MYLK4-18:1 No - lnc-MYLK4-17:1 No - lnc-MYLK4-16:1 No - lnc-MYLK4-15:1 No - lnc-WRNIP1-31:1 No - lnc-WRNIP1-30:1 No - lnc-MYLK4-14:1 No - lnc-MYLK4-13:1 No - lnc-MYLK4-12:1 No - lnc-MYLK4-11:1 No - lnc-MYLK4-11:2 No - lnc-WRNIP1-29:1 No - lnc-WRNIP1-29:2 No - lnc-WRNIP1-28:1 No - lnc-MYLK4-10:1 No - lnc-MYLK4-9:1 No - lnc-MYLK4-8:1 No - lnc-WRNIP1-27:1 No - lnc-MYLK4-7:2 No - lnc-MYLK4-7:1 No - lnc-MYLK4-6:1 No - lnc-MYLK4-5:1 No - lnc-WRNIP1-26:1 No - lnc-MYLK4-4:1 No - lnc-MYLK4-3:1 No - lnc-MYLK4-2:1 No - lnc-WRNIP1-25:1 No - lnc-WRNIP1-25:2 No - lnc-SERPINB1-6:1 No - lnc-WRNIP1-16:1 No - lnc-WRNIP1-16:2 No - lnc-WRNIP1-16:3 No - lnc-WRNIP1-16:4 No - lnc-WRNIP1-16:6 No - lnc-WRNIP1-6:1 No - lnc-WRNIP1-4:1 No - lnc-WRNIP1-4:2 No - lnc-SERPINB1-1:10 No - lnc-SERPINB1-1:9 No - lnc-SERPINB1-1:8 No - lnc-SERPINB1-1:7 No - lnc-SERPINB1-1:6 No - lnc-SERPINB1-1:3 No - lnc-WRNIP1-5:1 No - lnc-SERPINB1-1:4 No - lnc-SERPINB1-1:5 No - lnc-WRNIP1-7:1 No - lnc-WRNIP1-9:1 No - lnc-SERPINB1-5:3 No - lnc-WRNIP1-10:1 No - lnc-WRNIP1-10:2 No - lnc-SERPINB9-5:2 No - lnc-WRNIP1-11:1 No - lnc-SERPINB9-5:1 No - lnc-WRNIP1-12:1 No - lnc-SERPINB1-5:4 No - lnc-WRNIP1-14:1 No - lnc-WRNIP1-14:2 No - lnc-WRNIP1-14:3 No - lnc-WRNIP1-14:4 No - lnc-SERPINB1-5:2 No - lnc-SERPINB1-5:1 No - lnc-SERPINB1-2:5 No - lnc-SERPINB1-2:4 No - lnc-WRNIP1-15:1 No - lnc-WRNIP1-15:2 No - lnc-WRNIP1-15:3 No - lnc-WRNIP1-15:4 No - lnc-SERPINB9-1:4 No - lnc-SERPINB9-1:6 No - lnc-WRNIP1-17:1 No - lnc-WRNIP1-17:2 No - lnc-WRNIP1-18:1 No - lnc-SERPINB1-3:2 No - lnc-SERPINB1-3:1 No - lnc-WRNIP1-19:1 No - lnc-WRNIP1-19:2 No - lnc-WRNIP1-19:3 No - lnc-WRNIP1-19:4 No - lnc-WRNIP1-21:1 No - lnc-WRNIP1-22:1 No - lnc-WRNIP1-22:2 No - lnc-SERPINB9-3:1 No - lnc-SERPINB9-3:2 No - lnc-SERPINB9-2:2 No - lnc-SERPINB9-2:1 No - lnc-WRNIP1-23:1 No - lnc-WRNIP1-24:1 No - lnc-WRNIP1-24:2 No - lnc-WRNIP1-24:3 No - lnc-WRNIP1-24:4 No - lnc-WRNIP1-24:5 No - lnc-WRNIP1-24:6 No - lnc-SERPINB1-4:2 No - lnc-SERPINB1-4:1 No - lnc-NQO2-4:2 No - lnc-NQO2-4:3 No - lnc-NQO2-4:4 No - lnc-NQO2-4:5 No - lnc-NQO2-11:1 No - lnc-NQO2-10:1 No - lnc-NQO2-10:2 No - lnc-SERPINB6-5:2 No - lnc-SERPINB6-5:1 No - lnc-NQO2-9:1 No - lnc-NQO2-9:2 No - lnc-NQO2-9:3 No - lnc-NQO2-9:4 No - lnc-SERPINB6-4:1 No - lnc-SERPINB6-4:2 No - lnc-NQO2-3:3 No - lnc-SERPINB9-4:2 No - lnc-SERPINB9-4:1 No - lnc-SERPINB6-3:2 No - lnc-SERPINB6-3:1 No - lnc-NQO2-6:1 No - lnc-SERPINB6-1:11 No - lnc-SERPINB6-1:10 No - LINC01011:3 No - LINC01011:4 No - LINC01011:6 No - LINC01011:9 No - lnc-SERPINB6-1:13 No - lnc-SERPINB6-1:12 No - lnc-SERPINB6-1:15 No - lnc-SERPINB6-1:16 No - lnc-SERPINB6-1:14 No - lnc-SERPINB6-1:9 No - lnc-SERPINB6-1:8 No - lnc-RIPK1-8:9 No - lnc-RIPK1-8:10 No - lnc-SERPINB6-1:6 No - lnc-SERPINB6-1:7 No - lnc-SERPINB6-6:2 No - lnc-SERPINB6-6:1 No - lnc-RIPK1-8:11 No - lnc-SERPINB6-9:1 No - lnc-SERPINB6-9:2 No - lnc-SERPINB6-9:3 No - lnc-RIPK1-11:5 No - lnc-SERPINB6-7:1 No - lnc-SERPINB6-7:2 No - lnc-RIPK1-1:2 No - lnc-NQO2-16:1 No - lnc-RIPK1-5:1 No - lnc-RIPK1-4:1 No - lnc-RIPK1-4:2 No - lnc-RIPK1-1:3 No - lnc-SERPINB6-8:4 No - lnc-SERPINB6-8:2 No - lnc-SERPINB6-8:3 No - lnc-SERPINB6-8:1 No - lnc-RIPK1-1:4 No - lnc-RIPK1-2:1 No - lnc-RIPK1-2:2 No - lnc-RIPK1-2:3 No - lnc-RIPK1-2:4 No - lnc-TUBB2A-6:1 No - lnc-TUBB2A-5:1 No - lnc-TUBB2A-4:1 Yes chr3R:22466905-22468157 lnc-RIPK1-7:1 Yes chr3R:22466905-22468157 lnc-RIPK1-7:2 Yes chr3R:22466905-22468157 lnc-TUBB2A-3:2 No - lnc-TUBB2A-3:1 No - LINC02525:26 No - LINC02525:27 No - LINC02525:32 No - LINC02525:33 No - lnc-PSMG4-8:1 No - lnc-PSMG4-6:1 No - lnc-SLC22A23-7:1 Yes chr3R:9408383-9410282 lnc-PSMG4-6:3 No - lnc-PSMG4-6:4 No - lnc-TUBB2B-1:1 No - lnc-SLC22A23-1:1 No - lnc-BPHL-8:1 No - lnc-BPHL-8:2 No - lnc-TUBB2B-2:4 No - lnc-BPHL-9:1 No - lnc-TUBB2B-2:5 No - lnc-BPHL-10:1 No - lnc-PSMG4-3:1 No - lnc-PSMG4-4:1 No - lnc-TUBB2B-3:1 No - lnc-PSMG4-5:2 No - lnc-PSMG4-5:3 No - lnc-PSMG4-7:1 No - lnc-TUBB2B-4:1 No - lnc-TUBB2B-12:1 No - lnc-TUBB2B-5:1 No - lnc-TUBB2B-6:2 No - lnc-TUBB2B-6:4 No - lnc-PSMG4-9:1 No - lnc-TUBB2B-6:3 No - lnc-PSMG4-10:1 No - lnc-PSMG4-10:2 No - lnc-TUBB2B-6:1 No - lnc-TUBB2B-7:4 No - lnc-TUBB2B-7:3 No - lnc-TUBB2B-7:2 No - lnc-TUBB2B-7:1 No - lnc-PSMG4-11:1 No - lnc-PSMG4-11:2 No - lnc-PSMG4-11:3 No - lnc-TUBB2B-8:4 No - lnc-TUBB2B-8:3 No - lnc-TUBB2B-8:2 No - lnc-TUBB2B-8:1 No - lnc-PSMG4-12:1 No - lnc-PSMG4-13:1 No - lnc-PSMG4-13:2 No - lnc-TUBB2B-13:1 No - lnc-TUBB2B-9:1 No - lnc-TUBB2B-10:4 No - lnc-TUBB2B-10:3 No - lnc-TUBB2B-10:2 No - lnc-TUBB2B-10:1 No - lnc-PSMG4-2:2 No - lnc-SLC22A23-2:2 No - lnc-SLC22A23-2:7 No - lnc-PSMG4-2:3 No - lnc-TUBB2B-11:1 No - lnc-PSMG4-18:1 No - lnc-PSMG4-18:2 No - lnc-PSMG4-18:3 No - lnc-SLC22A23-2:6 No - lnc-SLC22A23-2:5 No - lnc-SLC22A23-2:4 No - lnc-SLC22A23-2:3 No - lnc-SLC22A23-2:1 No - lnc-PSMG4-18:4 No - lnc-SLC22A23-3:4 No - lnc-SLC22A23-3:3 No - lnc-SLC22A23-3:2 No - lnc-SLC22A23-3:1 No - lnc-PSMG4-18:5 No - lnc-PSMG4-18:6 No - lnc-PSMG4-18:7 No - lnc-SLC22A23-4:1 No - lnc-PSMG4-18:8 No - lnc-SLC22A23-4:2 No - lnc-PSMG4-14:1 No - lnc-PSMG4-14:2 No - lnc-SLC22A23-5:1 No - lnc-PSMG4-15:1 No - lnc-PSMG4-15:2 No - lnc-SLC22A23-6:1 No - lnc-SLC22A23-8:4 No - lnc-SLC22A23-8:3 No - lnc-SLC22A23-8:2 No - lnc-SLC22A23-8:1 No - lnc-PSMG4-16:1 No - lnc-PSMG4-16:2 No - lnc-PSMG4-17:1 No - lnc-PSMG4-17:2 No - lnc-SLC22A23-9:1 No - lnc-SLC22A23-10:1 No - lnc-SLC22A23-10:2 No - lnc-SLC22A23-11:1 No - lnc-PXDC1-14:4 No - lnc-PXDC1-14:3 No - lnc-PXDC1-14:2 No - lnc-PXDC1-14:1 No - lnc-FAM50B-14:1 No - lnc-PXDC1-1:5 No - lnc-PXDC1-1:3 No - lnc-FAM50B-14:2 No - lnc-FAM50B-13:1 No - lnc-FAM50B-13:2 No - lnc-PXDC1-11:1 No - lnc-PXDC1-9:1 No - lnc-FAM50B-12:1 No - lnc-PXDC1-7:1 No - lnc-PXDC1-1:4 No - lnc-FAM50B-11:1 No - lnc-PXDC1-6:1 No - lnc-FAM50B-10:1 No - lnc-FAM50B-9:1 No - lnc-PXDC1-4:1 No - lnc-PXDC1-1:2 No - lnc-SLC22A23-12:1 No - lnc-PXDC1-3:1 No - lnc-FAM50B-6:1 No - lnc-PXDC1-5:1 No - lnc-PXDC1-8:1 No - lnc-FAM50B-5:1 No - lnc-FAM50B-1:4 No - lnc-FAM50B-1:5 No - lnc-FAM50B-4:1 No - lnc-FAM50B-4:2 No - lnc-PXDC1-10:1 No - lnc-FAM50B-3:1 No - lnc-PXDC1-12:2 Yes chr3R:27919844-27921089 lnc-PXDC1-12:8 Yes chr3R:27919844-27921089 lnc-PXDC1-12:9 Yes chr3R:27919844-27921089 lnc-PXDC1-12:7 Yes chr3R:27919844-27921089 lnc-PXDC1-12:1 No - lnc-PXDC1-12:5 No - lnc-PXDC1-12:6 No - lnc-PXDC1-12:4 No - lnc-PXDC1-13:1 No - lnc-PXDC1-15:1 No - lnc-PXDC1-15:3 No - lnc-PXDC1-15:4 No - lnc-PXDC1-15:2 No - lnc-FAM50B-2:3 No - lnc-PXDC1-15:6 No - lnc-PXDC1-15:5 No - lnc-PXDC1-15:14 No - lnc-FAM217A-12:1 No - lnc-FAM50B-15:1 No - lnc-FAM217A-11:1 No - lnc-PRPF4B-163:1 No - lnc-PRPF4B-162:1 No - lnc-FAM217A-10:1 No - lnc-FAM217A-9:1 No - lnc-FAM217A-9:2 No - lnc-FAM217A-8:1 No - lnc-FAM217A-1:13 No - lnc-FAM217A-1:12 No - lnc-FAM217A-1:10 No - lnc-PRPF4B-3:1 No - lnc-FAM217A-1:7 No - lnc-FAM217A-1:11 No - lnc-FAM217A-4:1 No - lnc-FAM217A-4:3 No - lnc-C6orf201-6:1 No - lnc-C6orf201-6:2 No - lnc-PRPF4B-1:1 No - lnc-PRPF4B-1:2 No - lnc-PRPF4B-1:3 No - lnc-ECI2-7:1 No - lnc-ECI2-6:1 No - lnc-ECI2-5:1 No - lnc-FAM217A-5:1 No - lnc-PRPF4B-4:5 No - lnc-PRPF4B-4:6 No - lnc-PRPF4B-4:4 No - lnc-PRPF4B-4:7 No - lnc-PRPF4B-4:10 No - lnc-PRPF4B-4:9 No - lnc-PRPF4B-4:11 No - lnc-C6orf201-2:2 No - lnc-C6orf201-2:3 No - lnc-C6orf201-2:4 No - lnc-C6orf201-2:5 No - lnc-C6orf201-2:6 No - lnc-C6orf201-9:1 No - lnc-C6orf201-9:2 No - lnc-C6orf201-9:3 No - lnc-C6orf201-9:4 No - lnc-ECI2-1:3 No - lnc-ECI2-1:2 No - lnc-C6orf201-10:1 No - lnc-C6orf201-11:1 No - lnc-C6orf201-3:2 No - lnc-C6orf201-12:1 No - lnc-C6orf201-12:2 No - lnc-C6orf201-12:3 No - lnc-C6orf201-13:1 No - lnc-C6orf201-13:2 No - lnc-C6orf201-13:3 No - lnc-C6orf201-14:1 No - lnc-C6orf201-14:2 No - lnc-C6orf201-14:3 No - lnc-C6orf201-15:1 No - lnc-C6orf201-15:2 No - lnc-C6orf201-16:1 No - lnc-ECI2-8:2 No - lnc-C6orf201-17:1 No - lnc-C6orf201-17:2 No - lnc-C6orf201-18:1 No - lnc-C6orf201-19:1 No - lnc-C6orf201-19:2 No - lnc-ECI2-2:9 No - lnc-ECI2-2:8 No - lnc-ECI2-2:10 No - lnc-C6orf201-20:1 No - lnc-C6orf201-22:1 No - lnc-C6orf201-20:2 No - lnc-C6orf201-21:1 No - lnc-CDYL-21:1 No - lnc-CDYL-20:1 No - lnc-CDYL-19:1 No - lnc-ECI2-9:1 No - LINC02533:7 No - lnc-CDYL-18:1 No - lnc-ECI2-10:1 No - lnc-CDYL-17:1 No - lnc-CDYL-16:1 No - lnc-CDYL-15:1 No - lnc-CDYL-14:1 No - lnc-ECI2-11:1 No - lnc-CDYL-12:1 No - lnc-RPP40-11:1 No - lnc-ECI2-32:4 No - lnc-RPP40-3:2 No - lnc-RPP40-3:3 No - lnc-CDYL-11:1 No - lnc-CDYL-10:1 No - lnc-CDYL-8:1 No - lnc-CDYL-7:1 No - lnc-RPP40-9:1 No - lnc-CDYL-6:1 No - lnc-CDYL-5:1 No - lnc-CDYL-4:1 No - lnc-RPP40-8:1 Yes chr3L:851346-852673 lnc-PPP1R3G-5:1 Yes chr3L:851346-852673 lnc-RPP40-7:1 Yes chr3L:851346-852673 lnc-RPP40-6:1 Yes chr3L:851346-852673 lnc-RPP40-2:2 Yes chr3L:851346-852673 lnc-PPP1R3G-4:1 Yes chr3L:851346-852673 lnc-PPP1R3G-3:1 Yes chr3L:851346-852673 lnc-CDYL-22:1 No - lnc-PPP1R3G-9:1 No - lnc-PPP1R3G-9:8 No - lnc-PPP1R3G-9:9 No - lnc-RPP40-1:4 No - lnc-LYRM4-2:1 No - lnc-RPP40-5:4 Yes chrX:2148463-2149647 lnc-RPP40-12:1 Yes chrX:2148463-2149647 lnc-LYRM4-1:1 Yes chr2R:13968308-13969902 lnc-LYRM4-3:3 Yes chr2R:13968308-13969902 lnc-LYRM4-3:1 Yes chr2R:13968308-13969902 lnc-LYRM4-3:2 Yes chr2R:13968308-13969902 lnc-PPP1R3G-7:1 Yes chr2R:13968308-13969902 lnc-NRN1-7:1 Yes chr2R:13968308-13969902 lnc-NRN1-6:2 No - lnc-NRN1-6:1 No - lnc-FARS2-3:1 No - lnc-NRN1-5:1 No - lnc-NRN1-4:1 No - lnc-FARS2-1:2 No - lnc-FARS2-2:2 No - lnc-NRN1-3:1 No - lnc-NRN1-2:1 No - lnc-FARS2-4:1 No - lnc-LY86-10:1 Yes chr2L:8011405-8026898 LY86-AS1:12 No - LY86-AS1:13 No - LY86-AS1:1 No - LY86-AS1:14 No - LY86-AS1:2 No - LY86-AS1:10 No - LY86-AS1:11 No - lnc-F13A1-6:1 No - lnc-LY86-8:1 No - LY86-AS1:7 No - lnc-LY86-6:1 No - lnc-LY86-4:2 No - lnc-F13A1-2:2 No - lnc-F13A1-2:3 No - lnc-F13A1-3:11 No - lnc-F13A1-3:14 No - lnc-F13A1-3:12 No - lnc-F13A1-3:13 No - lnc-F13A1-3:24 No - lnc-LY86-4:3 No - lnc-F13A1-3:9 No - lnc-LY86-4:4 No - lnc-F13A1-3:10 No - lnc-LY86-5:2 No - lnc-LY86-7:1 No - lnc-LY86-9:1 No - lnc-RREB1-9:1 No - lnc-SSR1-3:1 No - lnc-SSR1-3:2 No - lnc-RREB1-8:1 No - lnc-SSR1-2:1 No - lnc-RREB1-2:2 No - lnc-RREB1-5:1 No - lnc-CAGE1-4:1 Yes chrX:9551140-9553750 lnc-CAGE1-2:1 Yes chrX:9551140-9553750 lnc-TXNDC5-4:1 No - lnc-SSR1-1:1 No - lnc-CAGE1-3:1 No - lnc-RIOK1-1:7 No - lnc-DSP-2:1 No - lnc-CAGE1-1:3 No - lnc-CAGE1-1:2 No - lnc-SNRNP48-1:1 No - lnc-EEF1E1-2:4 No - lnc-TXNDC5-1:2 No - lnc-EEF1E1-2:3 No - lnc-BMP6-12:1 No - lnc-SLC35B3-3:1 No - lnc-BMP6-106:34 No - lnc-BMP6-106:35 No - lnc-BMP6-106:36 No - lnc-BMP6-106:41 No - lnc-BMP6-106:42 No - lnc-BMP6-106:48 No - lnc-BMP6-13:1 No - lnc-BMP6-106:117 No - lnc-BMP6-106:120 No - lnc-BMP6-14:1 No - lnc-BMP6-106:125 No - lnc-BMP6-106:136 No - lnc-BMP6-106:140 No - lnc-BMP6-18:1 No - lnc-BMP6-106:149 No - lnc-SLC35B3-5:1 No - lnc-TFAP2A-2:7 No - lnc-TFAP2A-12:3 No - lnc-TFAP2A-11:2 No - lnc-TFAP2A-11:1 No - lnc-TFAP2A-12:2 No - lnc-TFAP2A-10:1 No - lnc-TFAP2A-9:1 No - lnc-TFAP2A-8:1 No - lnc-TFAP2A-12:1 No - lnc-TFAP2A-5:1 No - lnc-TFAP2A-3:5 Yes chr3L:21586828-21613349 lnc-TFAP2A-3:3 Yes chr3L:21586828-21613349 lnc-TFAP2A-3:6 Yes chr3L:21586828-21613349 lnc-TFAP2A-3:4 Yes chr3L:21586828-21613349 LINC02522:4 No - lnc-PAK1IP1-5:1 No - lnc-PAK1IP1-2:1 No - lnc-TFAP2A-7:1 No - lnc-C6orf52-2:1 No - lnc-C6orf52-1:1 No - lnc-MAK-4:3 Yes chr2L:4453169-4454453 lnc-MAK-5:5 No - lnc-MAK-1:8 No - lnc-ELOVL2-1:2 No - ELOVL2-AS1:2 No - ELOVL2-AS1:3 No - ELOVL2-AS1:7 No - ELOVL2-AS1:8 No - lnc-SMIM13-4:1 No - lnc-NEDD9-1:1 No - lnc-ERVFRD-1-1:1 Yes chr3L:152884-174517 lnc-NEDD9-2:4 Yes chr3L:152884-174517 lnc-NEDD9-2:9 Yes chr3L:152884-174517 lnc-NEDD9-2:5 Yes chr3L:152884-174517 lnc-NEDD9-2:8 Yes chr3L:152884-174517 lnc-NEDD9-2:7 Yes chr3L:152884-174517 lnc-NEDD9-2:6 Yes chr3L:152884-174517 lnc-NEDD9-2:3 Yes chr3L:152884-174517 lnc-TMEM170B-2:2 No - lnc-TMEM170B-2:3 No - lnc-TMEM170B-2:4 No - lnc-TMEM170B-2:5 No - lnc-TMEM170B-2:6 No - lnc-TMEM170B-2:7 No - lnc-TMEM170B-2:8 No - lnc-TMEM170B-2:9 No - lnc-TMEM170B-3:2 Yes chr2R:10812157-10813310 lnc-NEDD9-3:1 Yes chr2L:281670-283269 lnc-NEDD9-3:2 Yes chr2L:281670-283269 lnc-ADTRP-3:1 No - lnc-HIVEP1-3:2 No - lnc-HIVEP1-6:1 No - lnc-ADTRP-2:2 No - lnc-ADTRP-5:2 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-ADTRP-6:2 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-EDN1-2:1 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-HIVEP1-5:1 No - lnc-ADTRP-7:1 No - lnc-ADTRP-7:6 No - lnc-ADTRP-8:1 No - LINC02530:5 No - lnc-TBC1D7-6:1 No - lnc-TBC1D7-5:1 No - lnc-TBC1D7-4:1 Yes chr3L:3714826-3806459 lnc-EDN1-3:1 Yes chr3L:3714826-3806459 lnc-TBC1D7-3:1 Yes chr3L:3714826-3806459 lnc-TBC1D7-1:7 No - lnc-TBC1D7-1:3 No - lnc-PHACTR1-1:2 Yes chr3R:24161727-24163215 lnc-PHACTR1-1:3 No - lnc-TBC1D7-2:1 Yes chr2L:1750687-1752122 lnc-TBC1D7-8:1 Yes chr2L:1750687-1752122 lnc-SIRT5-2:1 No - lnc-RANBP9-2:1 No - lnc-GFOD1-3:1 No - lnc-RANBP9-8:1 No - lnc-MCUR1-7:1 No - lnc-RNF182-4:1 No - lnc-CD83-9:1 No - lnc-RNF182-2:1 No - lnc-RNF182-1:2 No - lnc-CD83-7:1 No - lnc-CD83-6:1 No - lnc-MCUR1-1:1 No - lnc-MCUR1-1:3 No - lnc-CD83-3:4 No - LINC01108:1 No - lnc-MCUR1-3:1 No - lnc-CD83-8:1 No - lnc-MCUR1-10:1 No - lnc-MCUR1-2:2 No - lnc-CD83-3:5 No - lnc-CD83-3:6 No - lnc-MCUR1-12:1 No - lnc-CD83-3:7 No - lnc-CD83-5:3 No - lnc-CD83-5:4 No - lnc-DTNBP1-5:26 No - lnc-DTNBP1-16:6 No - lnc-DTNBP1-12:1 No - lnc-DTNBP1-11:1 No - lnc-JARID2-3:1 No - JARID2-AS1:2 Yes chr3L:9477038-9486530 lnc-JARID2-2:1 Yes chr3L:18867771-18869219 lnc-DTNBP1-7:1 No - LINC02543:5 No - lnc-ATXN1-6:1 No - lnc-MYLIP-5:1 No - lnc-MYLIP-3:1 No - lnc-ATXN1-5:1 No - lnc-MYLIP-4:1 No - lnc-ATXN1-1:2 No - lnc-DTNBP1-14:1 Yes chrX:6823204-6824203 lnc-DTNBP1-15:5 Yes chrX:6823204-6824203 lnc-DTNBP1-15:3 Yes chrX:6823204-6824203 lnc-DTNBP1-15:4 Yes chrX:6823204-6824203 lnc-DTNBP1-15:2 Yes chrX:6823204-6824203 lnc-DTNBP1-15:1 Yes chrX:6823204-6824203 lnc-STMND1-4:6 No - lnc-ATXN1-4:1 No - lnc-ATXN1-7:2 No - lnc-ATXN1-7:1 No - lnc-RBM24-3:1 No - lnc-RBM24-2:1 No - lnc-NUP153-4:1 No - lnc-CAP2-2:1 No - lnc-NUP153-1:2 Yes chr2L:1151678-1158262 lnc-FAM8A1-1:1 No - lnc-NUP153-3:2 No - lnc-NUP153-3:1 No - lnc-NUP153-3:4 No - lnc-NUP153-3:3 No - lnc-NUP153-3:6 No - lnc-FAM8A1-2:3 No - lnc-NUP153-5:1 Yes chr2R:15515778-15532259 lnc-NHLRC1-2:1 Yes chr2R:15515778-15532259 lnc-NHLRC1-2:2 Yes chr2R:15515778-15532259 lnc-KDM1B-5:1 Yes chr2R:15515778-15532259 lnc-KDM1B-4:1 Yes chr2R:15515778-15532259 lnc-KDM1B-2:1 No - lnc-KDM1B-1:1 Yes chr2R:16856220-16861738 lnc-DEK-4:1 No - lnc-RNF144B-4:1 No - lnc-RNF144B-5:1 No - lnc-ID4-5:1 No - lnc-MBOAT1-17:1 No - lnc-ID4-4:1 No - lnc-MBOAT1-2:14 Yes chr3L:749400-753492 lnc-ID4-2:2 No - lnc-MBOAT1-15:1 No - lnc-MBOAT1-2:4 No - lnc-MBOAT1-2:6 No - lnc-MBOAT1-2:10 Yes chr3L:749400-753492 lnc-MBOAT1-2:9 No - lnc-MBOAT1-9:3 No - lnc-MBOAT1-9:2 No - lnc-ID4-3:1 No - lnc-MBOAT1-8:1 No - lnc-MBOAT1-10:1 Yes chr3R:21620304-21660871 lnc-MBOAT1-11:1 Yes chr3R:21620304-21660871 lnc-MBOAT1-14:1 No - lnc-MBOAT1-16:1 Yes chr2R:17425670-17427511 lnc-PRL-14:1 No - lnc-SOX4-5:1 No - LINC00581:2 No - LINC00581:9 No - lnc-SOX4-2:1 Yes chr2R:23978801-23985177 lnc-SOX4-3:1 No - lnc-PRL-12:2 No - CASC15:1 No - CASC15:3 No - CASC15:4 No - CASC15:5 No - CASC15:6 No - lnc-PRL-11:1 No - CASC15:11 No - CASC15:12 No - CASC15:14 No - CASC15:15 No - lnc-HDGFL1-7:1 No - lnc-PRL-9:1 No - lnc-HDGFL1-6:1 No - CASC15:17 No - NBAT1:1 No - CASC15:20 No - CASC15:21 No - CASC15:22 No - CASC15:23 No - CASC15:25 No - CASC15:26 No - lnc-PRL-16:2 No - CASC15:27 No - CASC15:73 No - lnc-PRL-3:3 No - lnc-PRL-3:2 No - lnc-PRL-10:1 No - lnc-PRL-7:2 No - lnc-HDGFL1-5:2 No - lnc-DCDC2-1:1 No - lnc-HDGFL1-8:1 No - lnc-HDGFL1-2:8 No - lnc-NRSN1-7:1 No - lnc-HDGFL1-2:12 No - lnc-NRSN1-5:1 No - lnc-NRSN1-4:1 No - lnc-KAAG1-1:1 No - lnc-KAAG1-1:2 No - lnc-GPLD1-1:1 No - lnc-GPLD1-2:1 No - lnc-GPLD1-2:2 No - lnc-KIAA0319-1:1 Yes chr3R:25624805-25626924 lnc-KIAA0319-2:1 No - lnc-C6orf62-1:1 Yes chr3L:2600331-2601536 lnc-GMNN-2:3 No - lnc-C6orf62-2:1 No - lnc-GMNN-4:1 No - lnc-GMNN-5:1 No - lnc-GMNN-5:2 No - lnc-C6orf229-5:1 No - lnc-RIPOR2-4:1 No - lnc-RIPOR2-4:2 No - lnc-RIPOR2-7:2 No - lnc-RIPOR2-7:1 No - lnc-CARMIL1-6:2 No - lnc-RIPOR2-6:1 No - lnc-RIPOR2-8:1 No - lnc-CARMIL1-5:2 No - lnc-CARMIL1-4:2 No - lnc-RIPOR2-21:3 No - lnc-CARMIL1-3:2 No - lnc-RIPOR2-9:1 No - lnc-SCGN-5:1 Yes chr2R:7676540-7698902 lnc-SCGN-4:1 Yes chr2R:7676540-7698902 lnc-RIPOR2-10:1 Yes chr2R:7676540-7698902 lnc-RIPOR2-11:1 Yes chr2R:7676540-7698902 lnc-SCGN-3:1 Yes chr2R:7676540-7698902 lnc-SCGN-3:2 Yes chr2R:7676540-7698902 lnc-SCGN-6:1 Yes chr2R:7676540-7698902 lnc-HIST1H2AA-7:1 Yes chr2R:7676540-7698902 lnc-SCGN-1:1 Yes chr2R:7676540-7698902 lnc-HIST1H2AA-4:1 Yes chr2R:7676540-7698902 lnc-SCGN-2:2 Yes chr2R:7676540-7698902 lnc-HIST1H2AA-3:1 Yes chr2R:7676540-7698902 lnc-HIST1H2BA-3:1 Yes chr2R:16973927-16996057 lnc-HIST1H2AA-1:1 No - lnc-HIST1H2BA-2:1 No - lnc-HIST1H2BA-2:2 No - lnc-HIST1H2BA-2:3 No - lnc-SLC17A4-1:1 No - lnc-SLC17A3-1:1 No - lnc-TRIM38-4:1 No - lnc-HIST1H3A-4:1 No - lnc-TRIM38-2:2 No - lnc-HIST1H1A-1:3 No - lnc-HIST1H3A-2:2 No - lnc-HIST1H3C-1:1 No - lnc-HIST1H1T-1:2 No - lnc-HIST1H1T-1:1 No - lnc-HIST1H4C-2:1 No - lnc-HIST1H1E-1:1 Yes chr2L:21418112-21418706 lnc-HIST1H2BF-1:1 Yes chr2L:21423737-21424229 lnc-HIST1H2BI-1:1 No - lnc-HIST1H2BI-2:1 No - lnc-HIST1H4H-1:1 No - lnc-BTN3A2-3:1 No - lnc-HIST1H2BI-3:1 No - lnc-HIST1H4H-2:1 No - lnc-HIST1H4H-2:2 No - lnc-HIST1H4H-3:1 No - lnc-BTN3A2-1:3 No - lnc-BTN3A2-1:4 No - lnc-BTN2A2-1:1 No - lnc-BTN3A1-1:2 No - lnc-ZNF322-2:2 No - HCG11:1 No - HCG11:4 No - lnc-ZNF322-4:1 No - lnc-ABT1-5:1 Yes chr2R:14173693-14182838 lnc-ZNF322-3:1 No - lnc-ZNF322-5:1 No - lnc-HIST1H2BJ-10:2 No - lnc-HIST1H2BJ-10:5 No - lnc-HIST1H2BJ-10:4 No - lnc-HIST1H2BJ-10:6 No - lnc-HIST1H2AG-6:1 No - lnc-HIST1H2AG-6:2 No - lnc-HIST1H2AG-6:3 No - lnc-HIST1H2BJ-10:3 No - LINC00240:2 No - LINC00240:3 No - lnc-HIST1H2BJ-8:1 No - lnc-HIST1H2BJ-8:2 No - LINC00240:7 No - LINC00240:9 No - lnc-HIST1H2BJ-7:1 No - lnc-HIST1H2BJ-6:1 No - lnc-HIST1H2BJ-2:2 No - lnc-HIST1H2AG-5:1 No - lnc-HIST1H2BJ-4:1 No - lnc-HIST1H2AG-4:2 Yes chr2L:21418112-21418706 lnc-HIST1H2AG-4:3 Yes chr2L:21418112-21418706 lnc-HIST1H2AH-1:1 No - lnc-HIST1H2AH-2:1 No - lnc-HIST1H2AH-3:1 No - lnc-PRSS16-1:1 No - lnc-ZNF391-2:1 No - lnc-POM121L2-2:7 No - lnc-POM121L2-2:1 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-POM121L2-2:9 No - lnc-POM121L2-2:2 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-POM121L2-2:6 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-POM121L2-2:5 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-POM121L2-2:8 No - lnc-POM121L2-2:4 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-POM121L2-2:3 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-ZNF391-1:1 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-ZNF184-3:1 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-PRSS16-3:1 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-PRSS16-2:1 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-PRSS16-5:1 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-ZNF184-1:1 No - lnc-ZNF391-4:1 No - lnc-ZNF184-4:1 No - lnc-HIST1H2BL-3:1 No - lnc-HIST1H2AI-3:6 No - lnc-HIST1H2AI-3:7 No - lnc-HIST1H2AI-3:8 No - lnc-HIST1H2AI-3:9 No - lnc-HIST1H2BL-2:1 No - lnc-HIST1H2AI-1:5 No - lnc-HIST1H2AI-4:1 No - lnc-HIST1H4J-1:1 No - lnc-HIST1H2AL-1:2 Yes chr2L:21418112-21418706 lnc-HIST1H1B-1:1 Yes chr2L:21418112-21418706 lnc-OR2B2-1:1 No - lnc-OR2B6-1:1 No - lnc-OR2B6-2:1 No - lnc-OR2B2-4:1 No - lnc-ZNF165-1:1 No - ZSCAN16-AS1:6 No - lnc-ZNF165-1:2 No - lnc-ZSCAN16-1:1 No - ZSCAN16-AS1:15 No - ZSCAN16-AS1:8 No - ZSCAN16-AS1:1 No - ZSCAN16-AS1:2 No - ZSCAN16-AS1:7 No - lnc-ZKSCAN8-2:2 No - lnc-ZKSCAN8-2:3 No - lnc-ZKSCAN8-3:1 No - lnc-ZKSCAN8-4:1 No - lnc-ZKSCAN8-5:1 No - lnc-ZSCAN12-2:1 No - lnc-PGBD1-1:3 No - lnc-ZSCAN23-1:1 No - lnc-ZSCAN23-2:1 No - lnc-ZSCAN23-3:1 No - lnc-ZBED9-2:2 No - lnc-GPX6-2:1 No - lnc-ZBED9-2:3 No - lnc-ZBED9-2:1 No - lnc-ZBED9-3:1 No - LINC00533:1 No - lnc-ZBED9-4:1 No - lnc-TRIM27-21:1 No - lnc-TRIM27-20:1 No - lnc-TRIM27-15:2 No - lnc-TRIM27-19:1 No - lnc-TRIM27-18:1 No - LINC01623:2 No - lnc-TRIM27-16:1 No - lnc-ZNF311-3:1 No - lnc-ZNF311-2:1 No - lnc-ZNF311-2:2 No - lnc-OR2J1-13:1 No - lnc-OR2J1-12:1 No - LINC01556:1 No - lnc-TRIM27-17:1 No - lnc-OR2J1-14:1 No - HCG15:10 No - lnc-OR2J1-15:1 Yes chr3R:9775121-9777943 lnc-ZNF311-1:1 No - lnc-OR2W1-2:1 No - lnc-OR2B3-2:1 No - lnc-OR2B3-1:1 No - lnc-OR2J1-1:2 No - lnc-OR2J1-1:3 No - lnc-OR2J3-7:2 No - lnc-OR2J3-2:1 No - lnc-OR14J1-2:2 No - lnc-OR2J2-3:1 No - lnc-OR12D3-3:1 No - lnc-OR10C1-1:1 No - lnc-OR10C1-1:2 No - lnc-OR11A1-1:1 No - lnc-MAS1L-2:1 No - LINC01015:1 No - LINC01015:2 No - LINC01015:3 No - LINC01015:7 No - lnc-OR2H2-3:1 Yes chr2L:15016331-15034704 lnc-UBD-1:1 Yes chr2L:15016331-15034704 lnc-UBD-2:1 Yes chr2L:15016331-15034704 lnc-GABBR1-1:1 No - lnc-MOG-1:1 No - lnc-MOG-1:3 No - lnc-ZFP57-8:1 No - lnc-ZFP57-9:1 No - lnc-ZFP57-10:1 No - lnc-ZFP57-11:1 No - HLA-F-AS1:2 No - HLA-F-AS1:10 No - lnc-HLA-F-2:1 No - HLA-F-AS1:5 No - lnc-HLA-F-1:1 No - lnc-ZFP57-16:1 No - lnc-ZFP57-16:3 No - lnc-RNF39-12:1 No - lnc-HLA-A-5:1 No - lnc-HLA-A-4:1 No - lnc-RNF39-13:1 No - lnc-RNF39-10:1 No - lnc-RNF39-13:4 No - lnc-RNF39-13:3 No - lnc-HLA-A-3:1 No - lnc-RNF39-9:1 No - lnc-HLA-A-2:1 No - lnc-RNF39-8:1 No - lnc-HLA-A-6:1 No - lnc-RNF39-4:41 No - lnc-RNF39-4:40 No - lnc-ZNRD1-4:2 No - lnc-RNF39-4:18 No - lnc-RNF39-4:15 No - lnc-RNF39-4:17 No - lnc-RNF39-4:14 No - lnc-RNF39-4:16 No - lnc-RNF39-4:12 Yes chr3R:21777203-21777847 lnc-ZNRD1-3:1 No - lnc-RNF39-4:13 Yes chr3R:21777203-21777847 lnc-RNF39-4:11 Yes chr3R:21777203-21777847 lnc-ZNRD1-2:1 No - lnc-TRIM31-1:2 No - lnc-TRIM31-1:1 No - lnc-TRIM31-1:3 No - lnc-RNF39-5:1 No - lnc-TRIM31-2:1 No - lnc-TRIM10-1:1 No - lnc-TRIM39-2:1 No - lnc-TRIM26-2:18 No - lnc-TRIM26-2:32 No - lnc-TRIM26-2:14 No - lnc-TRIM26-2:13 No - lnc-TRIM26-2:20 No - lnc-TRIM26-2:12 No - lnc-TRIM26-2:11 No - lnc-TRIM26-2:24 No - lnc-TRIM26-2:15 No - lnc-TRIM26-2:31 No - lnc-TRIM26-2:27 No - lnc-TRIM26-2:23 No - lnc-TRIM26-2:30 No - lnc-TRIM26-2:29 No - lnc-TRIM26-2:28 No - lnc-TRIM26-2:21 No - lnc-TRIM26-2:26 No - lnc-TRIM26-2:25 No - lnc-TRIM26-2:22 No - lnc-TRIM26-3:1 No - lnc-TRIM26-4:1 No - lnc-PPP1R10-2:1 Yes chr2L:20752476-20754655 lnc-GNL1-1:4 Yes chr2L:870465-877038 lnc-PPP1R10-1:3 Yes chr2L:870465-877038 lnc-PPP1R10-1:2 No - lnc-MRPS18B-2:1 Yes chrX:20000968-20002096 lnc-PPP1R18-2:1 Yes chr2L:19123998-19126976 lnc-PPP1R18-1:1 No - lnc-PPP1R18-1:2 No - lnc-NRM-1:2 Yes chr3R:17682669-17683773 lnc-NRM-1:1 Yes chr3R:17682669-17683773 lnc-NRM-1:4 Yes chr3R:17682669-17683773 lnc-MDC1-1:1 No - lnc-NRM-2:1 Yes chr3L:14020315-14029121 lnc-IER3-6:1 Yes chr2R:15566271-15569404 IER3-AS1:9 No - IER3-AS1:11 No - lnc-TUBB-15:1 No - lnc-DDR1-4:1 No - lnc-IER3-15:1 No - lnc-DDR1-2:1 No - lnc-GTF2H4-6:1 No - lnc-GTF2H4-6:2 No - lnc-GTF2H4-5:1 No - lnc-GTF2H4-1:1 No - lnc-SFTA2-13:1 No - HCG21:2 No - HCG21:3 No - HCG21:4 No - lnc-SFTA2-14:1 No - lnc-MUC22-1:7 No - lnc-MUC22-1:8 No - lnc-PSORS1C2-1:1 No - lnc-PSORS1C2-1:2 No - lnc-POU5F1-9:2 No - lnc-POU5F1-9:1 No - lnc-POU5F1-9:3 No - lnc-CCHCR1-2:1 No - lnc-POU5F1-8:1 No - lnc-HLA-B-2:13 No - lnc-POU5F1-11:1 No - lnc-HLA-C-2:4 No - lnc-HLA-C-2:3 No - lnc-POU5F1-3:1 No - lnc-HLA-C-3:1 No - lnc-HLA-C-4:1 No - lnc-HLA-C-2:2 No - lnc-HLA-C-2:1 No - lnc-HLA-C-5:2 No - lnc-HLA-C-5:1 No - lnc-MICA-8:1 No - lnc-MICA-7:1 No - lnc-MICA-6:1 No - lnc-HLA-B-1:1 No - lnc-MICA-5:1 No - lnc-HLA-B-2:2 No - lnc-HLA-B-2:1 No - LINC01149:1 No - lnc-ATP6V1G2-DDX39B-3:1 No - HCP5:2 No - HCG26:2 No - lnc-MICB-4:1 No - lnc-MCCD1-1:1 No - lnc-ATP6V1G2-DDX39B-1:6 No - lnc-ATP6V1G2-DDX39B-1:5 No - lnc-ATP6V1G2-DDX39B-1:3 No - lnc-ATP6V1G2-DDX39B-1:4 No - lnc-LTA-1:1 No - lnc-NFKBIL1-9:1 No - lnc-NCR3-1:2 No - lnc-NCR3-1:1 No - lnc-NCR3-2:1 No - lnc-BAG6-1:2 Yes chr3L:7510986-7517316 lnc-BAG6-1:1 Yes chr3L:7510986-7517316 lnc-C6orf47-3:1 Yes chr3L:7510986-7517316 lnc-C6orf47-2:2 Yes chr3L:7510986-7517316 lnc-C6orf47-1:1 Yes chr3L:7510986-7517316 lnc-LY6G5B-1:1 No - lnc-LY6G5C-1:3 No - lnc-LY6G5C-1:1 No - lnc-LY6G5C-1:4 No - lnc-LY6G5C-1:2 No - lnc-LY6G6E-1:2 No - lnc-LY6G6E-1:3 No - lnc-DDAH2-1:1 Yes chrX:13294473-13302415 lnc-DDAH2-1:3 Yes chrX:13294473-13302415 lnc-DDAH2-1:2 Yes chrX:13294473-13302415 lnc-VARS-3:1 No - lnc-VARS-2:1 No - lnc-VARS-1:1 Yes chr2R:13198850-13202709 lnc-VWA7-2:2 Yes chr2R:13198850-13202709 lnc-VWA7-2:1 Yes chr2R:13198850-13202709 lnc-LSM2-1:2 Yes chr3L:12336676-12337236 lnc-LSM2-1:1 Yes chr3L:12336676-12337236 lnc-LSM2-1:3 Yes chr3L:12336676-12337236 lnc-NEU1-1:1 Yes chr3R:29123370-29128247 lnc-NEU1-2:1 Yes chr3R:29123370-29128247 lnc-ZBTB12-1:1 Yes chrX:245978-254650 lnc-DXO-4:2 Yes chr3L:8599442-8600879 lnc-DXO-3:10 No - lnc-DXO-3:8 No - lnc-DXO-3:13 No - lnc-DXO-3:9 No - lnc-DXO-3:12 No - lnc-DXO-3:11 No - lnc-DXO-3:14 No - lnc-C4B-1:1 No - lnc-C4B-1:2 No - lnc-DXO-2:2 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-TNXB-1:4 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-TNXB-1:1 No - lnc-TNXB-1:2 No - lnc-TNXB-1:3 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-TNXB-7:1 Yes chr2R:5144733-5154756 lnc-FKBPL-1:1 No - lnc-PRRT1-1:8 No - lnc-PRRT1-1:1 No - lnc-PRRT1-1:9 No - lnc-PRRT1-1:2 No - lnc-PRRT1-1:3 No - lnc-PRRT1-1:4 No - lnc-AGER-2:2 No - lnc-AGER-2:3 No - lnc-GPSM3-1:1 Yes chrX:15992468-15996509 lnc-NOTCH4-1:1 No - lnc-GPSM3-2:1 Yes chrX:3134870-3172221 HCG23:2 No - lnc-BTNL2-1:2 No - lnc-HLA-DRA-3:1 No - lnc-HLA-DRA-2:1 No - lnc-HLA-DRB5-1:1 No - lnc-HLA-DRA-4:1 No - lnc-HLA-DRA-5:1 No - lnc-HLA-DRB1-5:2 No - lnc-HLA-DRB1-5:1 No - lnc-HLA-DRB1-4:1 No - lnc-HLA-DRB1-3:2 No - lnc-HLA-DRB1-6:1 No - lnc-HLA-DQB1-2:1 No - lnc-HLA-DQA2-1:4 No - lnc-HLA-DQB2-1:1 No - lnc-HLA-DOB-1:1 No - lnc-PSMB9-14:1 No - lnc-PSMB9-14:2 No - lnc-PSMB9-14:3 No - lnc-PSMB9-13:1 No - lnc-PSMB9-6:2 No - lnc-PSMB9-6:3 No - lnc-PSMB9-6:5 No - lnc-HLA-DMB-2:1 No - lnc-HLA-DMB-1:2 No - lnc-HLA-DMB-1:1 No - lnc-HLA-DMA-2:1 No - lnc-HLA-DMB-3:1 No - lnc-HLA-DMA-3:3 No - lnc-HLA-DMA-3:2 No - lnc-HLA-DMA-3:1 No - lnc-HLA-DOA-1:1 No - lnc-BRD2-4:1 No - lnc-BRD2-6:3 No - lnc-HLA-DPA1-2:1 No - lnc-HLA-DPA1-1:1 No - lnc-COL11A2-1:1 No - HCG24:1 No - HCG24:2 No - lnc-RING1-1:1 No - lnc-RING1-2:1 No - lnc-VPS52-2:2 No - lnc-VPS52-1:2 No - lnc-VPS52-1:1 No - lnc-RPS18-3:1 Yes chr2L:5521281-5523898 lnc-WDR46-1:1 Yes chr2L:5521281-5523898 lnc-ZBTB22-1:1 Yes chr2L:6480929-6487576 lnc-DAXX-1:1 No - lnc-DAXX-2:2 Yes chrX:14200178-14200907 lnc-DAXX-2:1 Yes chrX:14200178-14200907 SYNGAP1-AS1:13 No - lnc-ITPR3-8:1 No - lnc-ITPR3-7:1 No - lnc-ITPR3-3:6 No - lnc-ITPR3-2:2 No - lnc-ITPR3-9:1 No - lnc-ITPR3-9:2 No - lnc-ITPR3-9:3 No - lnc-MLN-3:1 No - lnc-ITPR3-9:4 No - lnc-ITPR3-9:5 No - lnc-ITPR3-10:1 No - lnc-ITPR3-1:12 No - lnc-ITPR3-1:13 No - lnc-ITPR3-11:1 No - lnc-MLN-4:1 No - lnc-ITPR3-1:14 No - lnc-GRM4-1:1 No - lnc-HMGA1-8:2 Yes chr4:936819-949441 lnc-HMGA1-4:1 No - lnc-NUDT3-4:2 No - lnc-NUDT3-4:1 No - lnc-NUDT3-1:3 Yes chr3L:10894776-10899123 lnc-HMGA1-2:2 No - lnc-HMGA1-2:3 No - lnc-HMGA1-2:4 No - lnc-NUDT3-1:2 Yes chr3L:10894776-10899123 lnc-HMGA1-2:5 Yes chr3L:10894776-10899123 lnc-HMGA1-2:6 Yes chr3L:10894776-10899123 lnc-PACSIN1-1:3 No - lnc-RPS10-NUDT3-3:1 No - lnc-RPS10-NUDT3-3:2 No - lnc-C6orf106-1:1 No - lnc-PACSIN1-2:1 Yes chrX:17282496-17305475 lnc-SPDEF-1:1 Yes chrX:17282496-17305475 lnc-SNRPC-3:1 Yes chrX:17282496-17305475 lnc-SNRPC-2:3 No - lnc-SNRPC-1:1 No - lnc-UHRF1BP1-2:1 Yes chr3R:23375928-23384777 lnc-SCUBE3-3:1 No - lnc-SCUBE3-2:1 No - lnc-SCUBE3-1:1 No - lnc-TCP11-2:11 No - lnc-TCP11-2:2 Yes chr3L:7562610-7569499 lnc-TCP11-2:10 No - lnc-TCP11-4:1 No - lnc-TEAD3-3:1 Yes chr3L:20692330-20695378 lnc-FANCE-1:1 Yes chr3L:20692330-20695378 lnc-PPARD-1:1 No - lnc-PPARD-2:1 No - lnc-TEAD3-2:1 Yes chr2R:21101928-21123704 lnc-ARMC12-1:1 Yes chr2L:9888005-9890119 lnc-FKBP5-1:3 Yes chr2L:9888005-9890119 lnc-FKBP5-1:2 Yes chr2L:9888005-9890119 lnc-SRPK1-1:1 No - lnc-CLPS-1:2 Yes chr2R:15380724-15387851 lnc-SRPK1-2:1 Yes chr3L:17898889-17907812 lnc-MAPK13-4:1 No - lnc-SLC26A8-1:11 No - lnc-C6orf222-3:1 Yes chr2R:7272275-7278101 lnc-PNPLA1-1:3 Yes chr3L:200174-202152 lnc-PXT1-1:1 Yes chr3L:200174-202152 lnc-STK38-1:1 Yes chr3L:19830864-19834304 lnc-KCTD20-3:1 Yes chr3L:19830864-19834304 lnc-RAB44-3:2 No - lnc-CPNE5-1:3 No - lnc-CPNE5-1:4 No - lnc-CPNE5-1:5 No - lnc-PPIL1-1:1 No - lnc-MTCH1-2:1 No - lnc-PPIL1-2:2 Yes chrX:7852481-7854244 lnc-PPIL1-2:1 Yes chrX:7852481-7854244 lnc-FGD2-1:3 No - lnc-PIM1-1:1 No - lnc-TMEM217-3:1 No - lnc-MTCH1-3:1 No - lnc-TBC1D22B-1:1 No - lnc-CCDC167-1:2 No - LINC02520:42 No - lnc-CMTR1-4:1 No - lnc-CMTR1-5:1 No - lnc-CCDC167-2:2 No - lnc-CCDC167-2:1 No - lnc-CCDC167-3:1 No - lnc-CCDC167-4:2 No - lnc-CCDC167-4:1 No - lnc-ZFAND3-9:1 No - lnc-ZFAND3-6:1 No - lnc-ZFAND3-5:1 No - lnc-MDGA1-3:1 No - lnc-CMTR1-10:1 No - lnc-BTBD9-2:1 No - lnc-ZFAND3-1:1 No - lnc-GLO1-2:1 Yes chrX:10768537-10772154 lnc-DNAH8-9:1 Yes chrX:10768537-10772154 lnc-DNAH8-2:5 No - lnc-DNAH8-2:10 No - lnc-DNAH8-7:1 No - lnc-DNAH8-2:11 No - lnc-DNAH8-2:12 No - lnc-DNAH8-2:13 No - lnc-GLO1-1:1 No - lnc-GLP1R-4:1 Yes chr3R:9651179-9674643 lnc-GLP1R-3:1 Yes chr3R:9651179-9674643 lnc-GLP1R-1:1 Yes chr3R:9651179-9674643 lnc-SAYSD1-1:4 Yes chr3R:9651179-9674643 lnc-SAYSD1-1:5 Yes chr3R:9651179-9674643 lnc-SAYSD1-2:1 No - lnc-KCNK5-1:1 Yes chr3R:25214325-25215188 lnc-GLP1R-2:1 Yes chrX:11580772-11585750 lnc-DAAM2-5:1 Yes chrX:11580772-11585750 lnc-KIF6-1:1 Yes chrX:11580772-11585750 lnc-KIF6-1:2 Yes chrX:11580772-11585750 lnc-DAAM2-1:2 No - lnc-MOCS1-3:1 No - lnc-DAAM2-4:1 No - lnc-DAAM2-9:1 No - lnc-DAAM2-9:2 No - LINC00951:5 No - LINC00951:2 No - lnc-DAAM2-9:7 No - LINC00951:1 No - lnc-DAAM2-7:1 No - lnc-DAAM2-8:1 Yes chr2R:8009119-8013755 lnc-DAAM2-8:2 Yes chr2R:8009119-8013755 lnc-MOCS1-5:1 Yes chr2R:8009119-8013755 lnc-DAAM2-8:4 Yes chr2R:8009119-8013755 lnc-DAAM2-8:5 Yes chr2R:8009119-8013755 lnc-UNC5CL-6:1 No - lnc-OARD1-1:11 No - lnc-TSPO2-3:1 No - lnc-UNC5CL-4:2 Yes chr3L:21196831-21197738 lnc-UNC5CL-4:1 Yes chr3L:21196831-21197738 lnc-UNC5CL-5:1 Yes chr3L:21196831-21197738 lnc-NFYA-1:1 No - lnc-NFYA-1:2 No - lnc-NFYA-1:3 No - lnc-NFYA-1:4 No - lnc-NFYA-1:5 No - lnc-TREML1-2:1 No - lnc-NFYA-1:6 No - lnc-NFYA-1:7 No - lnc-NFYA-1:8 No - lnc-NFYA-1:9 No - lnc-NFYA-1:10 No - lnc-NFYA-1:11 No - lnc-NFYA-1:12 No - lnc-NFYA-1:14 No - lnc-NFYA-1:15 No - lnc-NFYA-1:16 No - lnc-NFYA-1:18 No - lnc-NFYA-1:19 No - lnc-TREML4-1:1 No - lnc-TREM1-3:2 No - lnc-TREM1-3:1 No - lnc-TREML2-2:1 No - lnc-TREM1-2:1 No - lnc-NCR2-1:1 No - lnc-TFEB-5:1 No - LINC01276:2 No - lnc-FOXP4-2:1 No - lnc-TFEB-4:1 No - lnc-MDFI-1:1 No - lnc-PGC-2:1 Yes chr4:1198852-1224467 lnc-PGC-1:2 Yes chr4:1198852-1224467 lnc-PGC-1:5 Yes chr4:1198852-1224467 lnc-PGC-1:4 Yes chr4:1198852-1224467 lnc-PGC-1:3 Yes chr4:1198852-1224467 lnc-PGC-1:1 Yes chr4:1198852-1224467 lnc-MDFI-2:1 Yes chr4:1198852-1224467 lnc-USP49-3:1 Yes chr2L:8412144-8415256 lnc-USP49-1:1 No - lnc-MED20-5:1 Yes chrX:15906822-15909676 lnc-MED20-5:6 Yes chrX:15906822-15909676 lnc-MED20-5:4 Yes chrX:15906822-15909676 lnc-MED20-5:3 Yes chrX:15906822-15909676 lnc-MED20-5:5 Yes chrX:15906822-15909676 lnc-TAF8-2:1 Yes chrX:15906822-15909676 lnc-TAF8-2:2 Yes chrX:15906822-15909676 lnc-MED20-5:2 Yes chrX:15906822-15909676 lnc-UBR2-1:2 No - lnc-TRERF1-1:1 No - lnc-UBR2-3:1 No - lnc-BICRAL-2:1 No - lnc-BICRAL-2:2 No - lnc-UBR2-4:1 No - lnc-UBR2-4:2 No - lnc-BICRAL-3:1 Yes chr2L:12056326-12058251 lnc-RPL7L1-2:1 No - lnc-PTCRA-1:1 No - lnc-CNPY3-2:1 No - lnc-PEX6-2:1 Yes chr3R:12674608-12676084 lnc-CUL7-1:1 No - lnc-CUL7-2:1 Yes chr3L:12746616-12750056 lnc-DNPH1-4:1 Yes chr2R:12001473-12019846 lnc-CRIP3-1:1 No - lnc-ZNF318-2:2 No - lnc-ZNF318-2:1 No - lnc-DNPH1-2:1 No - lnc-SLC22A7-3:1 Yes chr3R:4327814-4334071 lnc-ABCC10-1:1 No - lnc-POLR1C-1:1 Yes chr3L:3472447-3510895 lnc-LRRC73-1:1 Yes chr2L:4969004-4970216 lnc-YIPF3-2:1 No - lnc-YIPF3-2:3 No - lnc-YIPF3-2:2 No - lnc-YIPF3-3:1 No - lnc-XPO5-2:1 Yes chr3R:5858083-5862405 lnc-MRPS18A-6:1 Yes chr3R:5858083-5862405 lnc-MAD2L1BP-1:1 No - lnc-RSPH9-2:1 No - lnc-MRPS18A-4:1 No - LINC02537:19 No - lnc-VEGFA-1:1 No - LINC02537:14 No - LINC02537:18 No - LINC01512:1 No - LINC01512:2 No - lnc-MRPL14-5:2 No - lnc-MRPL14-2:2 No - lnc-C6orf223-4:1 No - lnc-MRPL14-4:1 No - lnc-TMEM63B-3:1 No - lnc-MRPL14-3:1 No - lnc-CAPN11-2:1 Yes chr3L:9888762-9893319 lnc-CAPN11-2:2 Yes chr3L:9888762-9893319 lnc-MYMX-1:1 No - lnc-SLC29A1-2:1 No - lnc-TCTE1-1:1 No - lnc-CDC5L-3:1 No - lnc-AARS2-2:1 No - lnc-CDC5L-4:1 No - lnc-CDC5L-5:1 No - lnc-RUNX2-5:1 Yes chr3R:12017156-12018550 lnc-AARS2-3:1 Yes chr3R:12017156-12018550 lnc-RUNX2-4:1 Yes chr3R:12017156-12018550 lnc-CLIC5-3:1 No - lnc-ENPP4-3:3 No - RUNX2-AS1:32 No - RUNX2-AS1:25 No - RUNX2-AS1:19 No - lnc-ENPP5-2:4 Yes chrX:13812971-13822307 lnc-ENPP5-2:8 Yes chrX:13812971-13822307 lnc-ENPP5-2:7 Yes chrX:13812971-13822307 lnc-ENPP5-2:6 Yes chrX:13812971-13822307 lnc-ENPP5-2:3 Yes chrX:13812971-13822307 lnc-ENPP5-2:5 Yes chrX:13812971-13822307 lnc-ENPP5-1:1 Yes chrX:13812971-13822307 lnc-CLIC5-1:3 No - lnc-CLIC5-1:4 No - lnc-ENPP4-2:1 Yes chr3R:16186999-16197584 lnc-SLC25A27-3:1 Yes chr3R:16186999-16197584 lnc-SLC25A27-2:2 No - lnc-RCAN2-2:1 No - lnc-RCAN2-2:2 No - lnc-PLA2G7-1:2 No - lnc-PLA2G7-3:1 No - lnc-ADGRF1-2:1 No - lnc-ADGRF1-1:1 No - lnc-MEP1A-2:2 No - lnc-ADGRF5-1:1 No - lnc-ADGRF5-2:2 No - lnc-ADGRF5-2:1 No - lnc-CD2AP-2:2 No - lnc-CD2AP-3:1 No - lnc-TNFRSF21-3:1 No - lnc-TNFRSF21-4:1 No - lnc-ADGRF2-4:1 Yes chr3R:30808617-30827005 lnc-ADGRF2-1:1 No - lnc-PTCHD4-3:1 No - lnc-PTCHD4-2:1 No - lnc-MUT-2:1 No - lnc-MUT-1:1 No - lnc-GLYATL3-2:1 No - lnc-GLYATL3-2:2 No - lnc-GLYATL3-2:3 No - lnc-RHAG-1:1 No - lnc-C6orf141-4:1 No - lnc-C6orf141-1:3 No - lnc-C6orf141-1:4 No - lnc-C6orf141-5:2 No - lnc-DEFB133-1:1 No - lnc-C6orf141-2:2 No - lnc-C6orf141-2:3 No - lnc-TFAP2D-4:2 No - lnc-TFAP2D-1:3 No - lnc-TFAP2D-3:2 No - lnc-DEFB112-2:2 Yes chr3L:21586828-21613349 lnc-DEFB112-2:1 Yes chr3L:21586828-21613349 lnc-PKHD1-7:1 No - lnc-PKHD1-6:1 No - lnc-PKHD1-4:1 No - lnc-PKHD1-2:1 No - lnc-IL17A-2:3 No - lnc-IL17A-2:4 No - lnc-IL17A-3:1 No - lnc-IL17A-1:2 No - lnc-MCM3-1:1 No - lnc-MCM3-3:4 No - TRAM2-AS1:1 No - TRAM2-AS1:2 No - TRAM2-AS1:5 No - TRAM2-AS1:6 No - TRAM2-AS1:7 No - TRAM2-AS1:12 No - TRAM2-AS1:15 No - TRAM2-AS1:16 No - lnc-TMEM14A-2:2 No - lnc-TMEM14A-5:1 No - lnc-TMEM14A-1:3 No - lnc-TMEM14A-1:4 No - lnc-TMEM14A-1:5 No - lnc-GSTA2-2:1 No - lnc-TMEM14A-3:1 No - lnc-GSTA2-1:1 No - lnc-GSTA1-1:1 No - lnc-GSTA3-1:1 No - lnc-FBXO9-1:2 No - lnc-TMEM14A-7:2 Yes chr3R:12458421-12460294 lnc-GCM1-2:1 No - lnc-GCM1-3:1 No - lnc-ELOVL5-2:2 No - lnc-ELOVL5-3:1 No - lnc-FBXO9-2:1 No - lnc-GCM1-4:1 No - lnc-GCM1-4:3 No - lnc-GCM1-4:2 No - lnc-FBXO9-3:1 No - lnc-FBXO9-4:1 No - lnc-FBXO9-5:1 No - lnc-FBXO9-6:1 No - lnc-ELOVL5-4:1 No - lnc-ELOVL5-5:1 No - lnc-GCLC-2:1 No - lnc-KLHL31-6:1 Yes chrX:8102181-8116147 lnc-GCLC-1:8 Yes chrX:8102181-8116147 lnc-LRRC1-7:1 No - lnc-KLHL31-5:2 No - lnc-KLHL31-2:6 No - lnc-LRRC1-6:1 No - lnc-KLHL31-7:2 Yes chr3R:26536350-26604051 lnc-KLHL31-8:1 Yes chr3R:26536350-26604051 lnc-KLHL31-9:1 No - MLIP-AS1:4 No - MLIP-AS1:5 No - MLIP-AS1:6 No - MLIP-AS1:7 No - MLIP-AS1:8 No - lnc-LRRC1-8:2 No - MLIP-AS1:9 No - MLIP-AS1:10 No - MLIP-AS1:11 No - MLIP-AS1:1 No - lnc-KLHL31-10:1 No - lnc-LRRC1-9:1 No - lnc-HMGCLL1-3:1 No - lnc-FAM83B-3:1 No - lnc-FAM83B-3:2 No - lnc-HMGCLL1-2:1 No - lnc-BMP5-5:3 Yes chr2L:6960377-6961653 lnc-BMP5-4:1 Yes chr2L:6960377-6961653 lnc-BMP5-1:1 No - lnc-BMP5-2:2 No - lnc-BMP5-2:4 No - lnc-BMP5-2:3 No - lnc-BMP5-2:1 No - lnc-BMP5-3:1 No - lnc-DST-3:1 No - lnc-COL21A1-1:1 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-COL21A1-2:1 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-COL21A1-3:1 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-COL21A1-4:1 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-COL21A1-8:1 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-BEND6-1:2 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-BEND6-1:3 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-BEND6-2:1 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-RAB23-11:1 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-RAB23-10:1 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-DST-2:1 No - lnc-KIAA1586-2:1 No - lnc-KIAA1586-1:1 No - lnc-RAB23-8:1 No - ZNF451-AS1:32 No - ZNF451-AS1:33 No - ZNF451-AS1:34 No - ZNF451-AS1:35 No - ZNF451-AS1:29 No - ZNF451-AS1:36 No - ZNF451-AS1:37 No - ZNF451-AS1:38 No - ZNF451-AS1:39 No - ZNF451-AS1:40 No - ZNF451-AS1:41 No - ZNF451-AS1:42 No - ZNF451-AS1:43 No - ZNF451-AS1:44 No - ZNF451-AS1:45 No - ZNF451-AS1:46 No - ZNF451-AS1:47 No - ZNF451-AS1:27 Yes chr3L:15521711-15524137 ZNF451-AS1:26 Yes chr3L:15521711-15524137 lnc-RAB23-6:1 No - lnc-RAB23-1:3 No - lnc-KHDRBS2-12:1 No - lnc-KHDRBS2-13:1 No - lnc-KHDRBS2-14:1 No - lnc-KHDRBS2-15:1 No - lnc-FKBP1C-11:1 No - lnc-RAB23-17:1 No - lnc-RAB23-53:25 No - lnc-RAB23-53:26 No - lnc-RAB23-53:28 No - lnc-RAB23-53:29 No - lnc-RAB23-53:23 No - lnc-RAB23-53:30 No - lnc-RAB23-53:24 No - lnc-RAB23-19:1 No - lnc-FKBP1C-4:1 No - lnc-KHDRBS2-1:3 Yes chr2R:22409208-22411545 lnc-KHDRBS2-1:4 No - lnc-KHDRBS2-2:1 No - lnc-FKBP1C-2:1 No - lnc-KHDRBS2-3:1 No - lnc-FKBP1C-1:1 No - lnc-PTP4A1-8:1 No - lnc-LGSN-2:1 No - lnc-PTP4A1-7:1 No - lnc-PTP4A1-6:1 No - lnc-PTP4A1-5:1 No - lnc-PTP4A1-4:1 No - lnc-PTP4A1-3:1 No - lnc-PTP4A1-2:1 No - lnc-PHF3-6:1 No - lnc-PHF3-1:2 No - lnc-PHF3-8:1 No - lnc-PHF3-9:1 No - lnc-PHF3-10:1 No - lnc-LGSN-5:1 No - lnc-LGSN-4:1 No - lnc-LGSN-6:1 No - lnc-LGSN-6:2 No - lnc-LGSN-7:1 No - lnc-PHF3-11:1 No - lnc-EYS-3:1 No - lnc-EYS-4:1 No - lnc-EYS-5:1 No - lnc-ADGRB3-8:1 No - lnc-EYS-6:1 No - lnc-LMBRD1-10:2 No - lnc-ADGRB3-7:1 No - lnc-ADGRB3-3:1 No - lnc-ADGRB3-2:1 No - lnc-ADGRB3-1:1 No - lnc-ADGRB3-6:2 No - lnc-LMBRD1-6:1 No - lnc-LMBRD1-5:24 No - lnc-LMBRD1-5:11 No - lnc-LMBRD1-5:5 No - lnc-LMBRD1-5:15 No - lnc-LMBRD1-5:10 No - lnc-LMBRD1-5:14 No - lnc-LMBRD1-5:12 No - lnc-LMBRD1-5:6 No - lnc-LMBRD1-5:16 No - lnc-LMBRD1-5:7 No - lnc-LMBRD1-5:13 No - lnc-LMBRD1-7:2 No - lnc-LMBRD1-2:1 No - lnc-LMBRD1-1:1 No - lnc-COL9A1-3:1 No - lnc-COL9A1-2:1 No - lnc-LMBRD1-3:6 Yes chr3R:16502770-16571363 lnc-LMBRD1-3:1 Yes chr3R:16502770-16571363 lnc-LMBRD1-3:4 Yes chr3R:16502770-16571363 lnc-LMBRD1-3:3 Yes chr3R:16502770-16571363 lnc-LMBRD1-3:5 Yes chr3R:16502770-16571363 lnc-LMBRD1-3:2 Yes chr3R:16502770-16571363 lnc-FAM135A-4:1 No - lnc-FAM135A-1:5 No - lnc-FAM135A-3:1 No - lnc-SDHAF4-1:1 Yes chr3L:1275956-1295699 lnc-SDHAF4-7:1 Yes chr3L:1275956-1295699 lnc-SDHAF4-4:1 Yes chr3L:1275956-1295699 lnc-B3GAT2-5:1 No - lnc-SDHAF4-6:1 Yes chr2R:8922785-8925346 lnc-SDHAF4-8:1 Yes chr2R:8922785-8925346 lnc-OGFRL1-11:1 No - lnc-B3GAT2-4:1 No - lnc-OGFRL1-9:1 No - LINC00472:47 No - LINC00472:29 No - LINC00472:30 No - LINC00472:31 No - LINC00472:32 No - LINC00472:17 No - LINC00472:33 No - LINC00472:23 No - LINC00472:34 No - LINC00472:35 No - LINC00472:39 No - lnc-OGFRL1-4:1 No - LINC00472:24 No - LINC00472:36 No - LINC00472:40 No - LINC00472:25 No - LINC00472:43 No - LINC00472:22 No - LINC00472:37 No - lnc-OGFRL1-5:1 No - lnc-OGFRL1-1:2 No - lnc-OGFRL1-6:1 No - LINC00472:19 No - LINC00472:10 No - lnc-OGFRL1-7:1 No - LINC00472:55 No - LINC00472:54 No - lnc-OGFRL1-8:1 No - LINC00472:4 No - LINC00472:16 No - LINC01626:2 No - LINC01626:4 No - LINC00472:50 No - LINC00472:52 No - LINC00472:53 No - lnc-OGFRL1-12:1 No - lnc-B3GAT2-7:1 No - lnc-RIMS1-2:1 No - lnc-KHDC1L-1:1 Yes chr3R:17872748-17916578 lnc-KCNQ5-1:1 No - lnc-KHDC3L-6:1 Yes chr2R:10145897-10192394 KCNQ5-AS1:2 Yes chr2R:10145897-10192394 KCNQ5-AS1:3 Yes chr2R:10145897-10192394 KCNQ5-AS1:5 Yes chr2R:10145897-10192394 KCNQ5-AS1:4 Yes chr2R:10145897-10192394 lnc-KHDC1L-3:1 No - lnc-KHDC3L-2:7 No - lnc-KHDC3L-2:9 No - lnc-KHDC3L-2:10 No - lnc-KHDC1-1:2 No - lnc-KHDC3L-2:11 No - lnc-KHDC1-1:3 No - lnc-KHDC1-1:1 No - lnc-KHDC3L-2:13 No - lnc-KHDC3L-2:14 No - lnc-KHDC1-2:1 No - lnc-KHDC3L-5:1 No - lnc-KHDC3L-4:1 No - lnc-CGAS-1:1 No - lnc-CGAS-3:1 Yes chr3R:31738468-31743306 lnc-CGAS-3:2 Yes chr3R:31738468-31743306 lnc-CGAS-3:3 Yes chr3R:31738468-31743306 lnc-CGAS-3:4 Yes chr3R:31738468-31743306 lnc-CGAS-3:5 Yes chr3R:31738468-31743306 lnc-CGAS-2:1 Yes chr3R:31738468-31743306 lnc-MTO1-2:1 No - lnc-CD109-4:1 No - lnc-EEF1A1-2:1 No - lnc-CD109-1:2 No - lnc-CD109-5:1 No - lnc-SLC17A5-2:1 No - lnc-CD109-6:1 No - lnc-COL12A1-1:3 No - lnc-COL12A1-3:1 No - lnc-CD109-7:1 No - lnc-COL12A1-2:1 No - lnc-SENP6-13:1 No - lnc-COX7A2-1:1 No - lnc-TMEM30A-1:2 No - lnc-SENP6-3:2 No - lnc-SENP6-3:3 No - lnc-FILIP1-1:1 No - lnc-SENP6-3:6 No - lnc-TMEM30A-2:1 No - lnc-SENP6-2:12 No - lnc-TMEM30A-3:1 No - lnc-SENP6-9:1 No - lnc-SENP6-7:1 No - lnc-SENP6-6:1 No - lnc-FILIP1-2:2 Yes chrX:12760642-12763611 lnc-FILIP1-2:1 Yes chrX:12760642-12763611 lnc-FILIP1-3:1 Yes chrX:12760642-12763611 lnc-SENP6-4:1 No - lnc-SENP6-5:1 No - LINC02540:3 No - lnc-MYO6-8:1 No - lnc-MYO6-9:1 No - lnc-MEI4-10:1 No - lnc-MEI4-15:1 No - lnc-MEI4-15:2 No - lnc-MEI4-12:1 No - lnc-MEI4-14:1 No - lnc-MEI4-13:1 No - lnc-HTR1B-3:1 No - lnc-MEI4-6:1 No - lnc-IRAK1BP1-4:1 No - lnc-PHIP-4:1 No - lnc-PHIP-3:1 No - lnc-HMGN3-6:1 Yes chr3R:24319000-24328619 lnc-HMGN3-1:1 No - lnc-IRAK1BP1-9:2 No - LCAL1:5 No - lnc-HMGN3-2:1 No - LCAL1:4 No - lnc-HMGN3-4:1 No - lnc-SH3BGRL2-10:1 No - lnc-HMGN3-5:1 No - lnc-SH3BGRL2-2:2 No - lnc-SH3BGRL2-2:3 No - lnc-SH3BGRL2-2:4 No - lnc-SH3BGRL2-2:13 Yes chr3L:17020348-17022856 lnc-LCA5-1:1 No - lnc-SH3BGRL2-8:1 No - lnc-SH3BGRL2-1:7 No - lnc-SH3BGRL2-7:1 No - lnc-SH3BGRL2-5:1 No - LINC01621:1 No - lnc-TTK-5:1 No - lnc-ELOVL4-2:1 No - lnc-TTK-3:1 Yes chr3L:11100675-11101698 lnc-TTK-2:1 No - lnc-BCKDHB-5:1 No - lnc-BCKDHB-1:10 No - lnc-ELOVL4-3:1 No - lnc-BCKDHB-7:1 No - lnc-BCKDHB-7:2 No - lnc-BCKDHB-7:3 No - lnc-IBTK-8:1 Yes chr2R:7737019-7782637 lnc-IBTK-10:1 Yes chr2R:7737019-7782637 lnc-TPBG-6:1 No - LINC01526:2 No - LINC02542:7 No - LINC02542:8 No - lnc-FAM46A-3:2 No - lnc-FAM46A-4:2 No - lnc-TPBG-3:2 No - lnc-FAM46A-5:1 Yes chr2R:16316313-16320732 lnc-IBTK-4:1 No - lnc-TPBG-4:1 Yes chr3R:11822702-11869460 lnc-TPBG-4:2 Yes chr3R:11822702-11869460 lnc-TPBG-5:1 No - lnc-IBTK-5:1 No - lnc-IBTK-6:1 No - lnc-TPBG-1:2 No - lnc-IBTK-7:1 No - lnc-UBE3D-1:2 No - lnc-UBE3D-2:1 No - lnc-PGM3-4:1 No - lnc-PGM3-4:3 No - lnc-PGM3-4:2 No - lnc-PGM3-3:1 No - lnc-PGM3-2:1 No - lnc-PGM3-1:2 Yes chr2R:18836821-18846619 lnc-ME1-2:1 Yes chr3L:12527215-12530171 lnc-ME1-1:1 Yes chr3L:12527215-12530171 lnc-ME1-3:1 Yes chr3R:7186994-7200941 lnc-RIPPLY2-1:1 No - lnc-SNAP91-2:1 No - lnc-SNAP91-3:1 No - lnc-CYB5R4-5:1 Yes chr2R:19390128-19391900 lnc-CEP162-2:2 Yes chr2R:19390128-19391900 lnc-CYB5R4-2:1 No - lnc-CYB5R4-5:2 No - lnc-CYB5R4-3:1 No - lnc-CYB5R4-4:1 No - lnc-CEP162-3:2 No - TBX18-AS1:3 No - TBX18-AS1:5 No - TBX18-AS1:6 No - TBX18-AS1:10 No - TBX18-AS1:11 No - TBX18-AS1:12 No - TBX18-AS1:13 No - TBX18-AS1:14 No - TBX18-AS1:18 No - lnc-TBX18-2:1 No - lnc-NT5E-6:1 No - lnc-NT5E-4:1 No - LINC02535:22 No - lnc-SNX14-6:1 No - lnc-SNX14-5:1 No - LINC02535:20 No - lnc-SNX14-2:1 No - lnc-SYNCRIP-7:1 No - lnc-SYNCRIP-6:2 No - lnc-SYNCRIP-6:1 No - lnc-SYNCRIP-4:1 No - lnc-SNX14-3:1 No - lnc-NT5E-1:2 Yes chr3R:20756729-20810726 SNHG5:49 No - SNHG5:6 No - lnc-NT5E-2:1 No - SNHG5:11 No - lnc-NT5E-3:1 No - lnc-NT5E-3:2 No - SNHG5:7 No - SNHG5:8 No - SNHG5:10 No - lnc-NT5E-3:3 No - lnc-NT5E-5:1 No - lnc-SYNCRIP-2:16 No - lnc-NT5E-7:1 No - lnc-NT5E-8:1 No - lnc-SYNCRIP-3:1 No - lnc-HTR1E-4:1 No - lnc-HTR1E-3:1 No - lnc-CGA-7:1 No - lnc-CGA-6:1 No - lnc-CGA-5:1 No - lnc-CGA-5:2 No - lnc-ZNF292-1:1 No - lnc-CGA-4:1 No - lnc-CGA-1:1 No - lnc-HTR1E-1:1 No - lnc-HTR1E-2:1 No - lnc-CGA-3:1 No - lnc-RARS2-5:1 No - LINC01590:1 No - lnc-C6orf163-2:1 Yes chr3L:21827774-21828480 lnc-RARS2-3:1 No - lnc-SLC35A1-3:1 No - lnc-RARS2-2:1 No - lnc-RARS2-1:1 No - lnc-AKIRIN2-3:1 Yes chr3R:7887045-7890150 lnc-AKIRIN2-2:1 Yes chr3R:7887045-7890150 lnc-RARS2-4:1 Yes chr3L:7369843-7373711 lnc-ORC3-4:1 No - lnc-ORC3-6:1 No - lnc-ORC3-5:1 No - lnc-SPACA1-4:1 No - lnc-AKIRIN2-4:1 No - lnc-SPACA1-3:1 No - lnc-RNGTT-1:1 No - lnc-PNRC1-4:1 Yes chrX:14240266-14242822 lnc-PNRC1-2:1 No - lnc-PNRC1-1:1 No - lnc-GABRR1-1:2 No - lnc-GABRR1-1:1 No - lnc-GABRR2-1:1 No - lnc-RRAGD-1:1 No - lnc-PM20D2-2:1 Yes chr2R:10816037-10819884 lnc-LYRM2-2:7 No - lnc-LYRM2-2:6 No - lnc-CASP8AP2-16:1 No - lnc-LYRM2-2:4 No - lnc-LYRM2-2:3 No - lnc-LYRM2-2:2 No - lnc-LYRM2-2:1 No - lnc-LYRM2-2:5 Yes chr2R:11841608-11842164 lnc-ANKRD6-4:1 Yes chr2R:11867876-11885585 lnc-CASP8AP2-13:1 Yes chr2R:11867876-11885585 lnc-CASP8AP2-11:1 Yes chr2R:11867876-11885585 lnc-CASP8AP2-10:1 No - lnc-GJA10-9:1 No - lnc-CASP8AP2-8:1 No - lnc-GJA10-12:1 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-MDN1-1:1 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-MDN1-2:1 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-MAP3K7-3:3 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-MAP3K7-3:4 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-MAP3K7-3:2 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-MAP3K7-3:1 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-MDN1-3:1 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-GJA10-18:1 No - lnc-GJA10-19:1 No - lnc-MAP3K7-4:1 No - CASC6:4 No - CASC6:1 No - lnc-GJA10-20:1 No - lnc-MAP3K7-5:1 No - lnc-GJA10-21:1 No - lnc-MAP3K7-6:1 No - lnc-GJA10-22:1 No - lnc-GJA10-6:2 No - lnc-GJA10-25:1 No - lnc-EPHA7-6:1 No - lnc-MANEA-17:1 No - lnc-EPHA7-5:1 No - lnc-MANEA-5:2 No - lnc-MANEA-3:7 No - lnc-MANEA-16:1 No - lnc-MANEA-15:1 No - lnc-MANEA-14:1 No - lnc-MANEA-13:1 No - lnc-MANEA-12:1 No - lnc-MANEA-11:1 No - lnc-EPHA7-7:1 No - lnc-EPHA7-8:1 No - lnc-MANEA-9:1 No - lnc-MANEA-8:1 No - lnc-MANEA-7:1 No - MANEA-DT:25 No - lnc-MANEA-6:1 No - lnc-GPR63-11:1 No - lnc-MANEA-10:1 No - lnc-GPR63-3:2 No - lnc-FUT9-1:1 Yes chr3L:15147137-15154395 lnc-UFL1-2:1 Yes chr3L:15147137-15154395 lnc-FUT9-3:1 No - UFL1-AS1:8 No - lnc-GPR63-8:1 No - lnc-FHL5-1:1 No - lnc-GPR63-7:1 No - lnc-FHL5-2:1 No - lnc-NDUFAF4-2:1 No - lnc-GPR63-6:1 Yes chr3R:10044596-10045542 lnc-KLHL32-6:1 Yes chr3R:10044596-10045542 lnc-NDUFAF4-1:1 No - lnc-NDUFAF4-3:1 Yes chrX:1868870-1872408 lnc-MMS22L-4:2 Yes chrX:1868870-1872408 lnc-MMS22L-4:3 Yes chrX:1868870-1872408 lnc-MMS22L-4:4 Yes chrX:1868870-1872408 lnc-MMS22L-4:1 Yes chrX:1868870-1872408 lnc-KLHL32-4:15 No - lnc-KLHL32-4:19 No - lnc-KLHL32-8:2 No - lnc-KLHL32-8:3 No - lnc-KLHL32-4:5 No - lnc-KLHL32-4:6 No - lnc-MMS22L-3:1 No - lnc-FBXL4-6:1 No - lnc-KLHL32-4:12 No - lnc-POU3F2-8:1 No - lnc-POU3F2-6:1 No - lnc-FBXL4-2:1 No - lnc-FBXL4-1:2 Yes chrX:14234413-14237923 lnc-FBXL4-1:1 Yes chrX:14234413-14237923 lnc-POU3F2-5:1 No - lnc-PNISR-1:1 Yes chr2L:21157433-21158611 lnc-COQ3-1:1 Yes chr3R:11949680-11954038 lnc-USP45-2:5 Yes chr3R:11949680-11954038 lnc-USP45-2:2 Yes chr3R:11949680-11954038 lnc-USP45-2:3 Yes chr3R:11949680-11954038 lnc-USP45-2:4 Yes chr3R:11949680-11954038 lnc-TSTD3-2:5 Yes chrX:5421533-5427219 lnc-CCNC-2:1 Yes chrX:5421533-5427219 lnc-USP45-4:1 Yes chr3R:14889004-14890205 lnc-USP45-3:3 Yes chr3R:14889004-14890205 lnc-USP45-3:1 Yes chr3R:14889004-14890205 lnc-USP45-3:4 Yes chr3R:14889004-14890205 lnc-USP45-3:2 Yes chr3R:14889004-14890205 lnc-CCNC-1:1 No - lnc-PRDM13-5:1 No - lnc-PRDM13-6:1 No - MCHR2-AS1:1 Yes chr3L:18560258-18576326 MCHR2-AS1:2 Yes chr3L:18560258-18576326 MCHR2-AS1:5 Yes chr3L:18560258-18576326 MCHR2-AS1:6 Yes chr3L:18560258-18576326 MCHR2-AS1:7 Yes chr3L:18560258-18576326 MCHR2-AS1:14 No - lnc-MCHR2-1:1 No - lnc-MCHR2-2:1 No - lnc-PRDM13-9:1 No - lnc-SIM1-1:1 Yes chr3R:13057755-13078124 lnc-ASCC3-4:1 Yes chr3R:13057755-13078124 lnc-ASCC3-3:1 Yes chr3R:13057755-13078124 lnc-PRDM13-10:1 No - lnc-SIM1-2:1 No - lnc-GRIK2-7:1 No - lnc-SIM1-4:1 No - lnc-GRIK2-2:2 No - lnc-GRIK2-2:11 No - lnc-ASCC3-2:1 No - lnc-GRIK2-2:12 No - lnc-GRIK2-4:1 No - lnc-ASCC3-5:1 Yes chr3R:20860187-20866231 lnc-ASCC3-6:1 Yes chr3R:20860187-20866231 lnc-ASCC3-7:1 Yes chr3R:20860187-20866231 lnc-GRIK2-3:1 No - lnc-ASCC3-8:1 No - lnc-GRIK2-8:1 No - lnc-GRIK2-9:1 No - lnc-LIN28B-3:3 No - lnc-HACE1-7:1 No - lnc-HACE1-6:1 No - lnc-HACE1-5:1 No - lnc-HACE1-4:2 No - lnc-LIN28B-7:1 No - lnc-LIN28B-6:1 No - lnc-BVES-3:2 No - lnc-LIN28B-5:1 No - lnc-PRDM1-6:1 Yes chr3L:5654681-5657384 BVES-AS1:2 No - lnc-POPDC3-1:1 Yes chrX:21053963-21082391 lnc-LIN28B-9:1 Yes chr2L:21974749-21992933 lnc-POPDC3-2:1 Yes chr2L:21974749-21992933 lnc-PRDM1-7:1 No - lnc-ATG5-9:1 No - lnc-ATG5-8:1 No - lnc-PRDM1-4:1 No - lnc-CRYBG1-3:1 Yes chrX:7314622-7323770 lnc-PRDM1-3:1 Yes chrX:7314622-7323770 lnc-RTN4IP1-2:28 Yes chrX:7314622-7323770 lnc-RTN4IP1-4:1 Yes chrX:7314622-7323770 lnc-ATG5-3:1 No - lnc-ATG5-3:2 No - lnc-RTN4IP1-3:1 No - lnc-ATG5-4:1 No - lnc-ATG5-4:2 No - lnc-CRYBG1-1:1 Yes chr2L:3039976-3041890 lnc-QRSL1-3:1 No - LINC02526:5 No - lnc-QRSL1-2:2 No - lnc-QRSL1-2:3 No - LINC02532:31 No - LINC02532:55 No - LINC02532:51 No - LINC02532:54 No - lnc-QRSL1-4:1 No - LINC02532:39 No - LINC02532:40 No - LINC02532:30 No - lnc-QRSL1-5:1 No - LINC02532:49 No - LINC02532:41 No - lnc-QRSL1-7:1 No - lnc-CD24-3:5 No - lnc-CD24-3:4 No - lnc-CD24-3:7 No - lnc-CD24-3:6 No - lnc-CD24-3:2 No - lnc-CD24-3:3 No - lnc-CD24-3:1 No - lnc-C6orf203-1:1 No - lnc-BEND3-1:1 Yes chr3L:21027915-21030141 lnc-BEND3-2:1 Yes chr3L:21027915-21030141 lnc-C6orf203-4:1 Yes chr3L:21027915-21030141 lnc-C6orf203-5:1 Yes chr3L:21027915-21030141 lnc-C6orf203-6:1 Yes chr3L:21027915-21030141 lnc-BEND3-4:1 Yes chr3L:21027915-21030141 lnc-SCML4-1:1 No - lnc-SOBP-1:1 Yes chr3R:9633359-9637611 lnc-SEC63-5:2 Yes chr3R:9633359-9637611 lnc-SEC63-5:1 Yes chr3R:9633359-9637611 lnc-SOBP-2:1 No - lnc-SCML4-2:1 Yes chr3L:7360561-7364366 lnc-SCML4-2:2 Yes chr3L:7360561-7364366 lnc-NR2E1-5:1 Yes chr3L:7360561-7364366 lnc-OSTM1-3:1 Yes chr3L:7360561-7364366 lnc-NR2E1-4:2 No - lnc-SEC63-1:1 No - lnc-SEC63-2:1 No - lnc-NR2E1-2:1 No - lnc-SEC63-3:1 Yes chr3L:3333119-3334978 lnc-SEC63-4:1 Yes chr3L:3333119-3334978 lnc-SEC63-4:2 Yes chr3L:3333119-3334978 lnc-OSTM1-1:1 Yes chr3L:3333119-3334978 lnc-AFG1L-4:1 No - lnc-AFG1L-4:2 No - lnc-NR2E1-3:1 Yes chr2R:12422931-12425459 lnc-FOXO3-4:1 Yes chr2R:12422931-12425459 lnc-FOXO3-3:1 Yes chr2R:12422931-12425459 lnc-SNX3-1:1 Yes chr2R:12422931-12425459 lnc-AFG1L-3:1 Yes chr2R:12422931-12425459 lnc-SNX3-2:1 Yes chr3R:14056945-14087978 lnc-AFG1L-5:1 Yes chr3R:14056945-14087978 lnc-AFG1L-8:1 Yes chr3R:14056945-14087978 lnc-SESN1-3:1 No - lnc-ARMC2-4:1 No - lnc-ARMC2-2:1 No - lnc-SESN1-2:1 Yes chrX:11156676-11159760 lnc-FOXO3-5:1 Yes chrX:11156676-11159760 lnc-FOXO3-5:2 Yes chrX:11156676-11159760 lnc-FOXO3-5:5 Yes chrX:11156676-11159760 lnc-FOXO3-5:6 Yes chrX:11156676-11159760 lnc-FOXO3-5:7 Yes chrX:11156676-11159760 lnc-FOXO3-5:8 Yes chrX:11156676-11159760 lnc-CD164-3:1 Yes chr2R:23713900-23734846 lnc-CEP57L1-3:3 Yes chr2R:23713900-23734846 lnc-CD164-2:1 Yes chr2R:23713900-23734846 lnc-ARMC2-5:1 No - lnc-CEP57L1-1:5 No - lnc-CEP57L1-4:2 No - lnc-CEP57L1-4:3 No - lnc-SMPD2-93:1 No - lnc-SMPD2-93:2 No - lnc-SMPD2-6:3 No - lnc-SMPD2-6:4 No - lnc-CD164-1:1 No - lnc-SMPD2-5:1 No - lnc-SMPD2-4:1 No - lnc-SMPD2-3:1 No - lnc-MICAL1-1:2 No - lnc-ZBTB24-1:1 No - lnc-FIG4-1:2 No - lnc-GPR6-2:1 No - lnc-CDC40-3:1 No - lnc-WASF1-1:1 Yes chr3R:22032150-22034286 lnc-DDO-2:1 No - lnc-CDC40-4:1 No - lnc-SLC22A16-2:1 No - lnc-CDC40-5:1 No - lnc-DDO-1:1 No - lnc-CDK19-1:1 No - lnc-AMD1-4:1 No - lnc-CDK19-4:2 Yes chr3L:9837080-9838670 lnc-AMD1-3:1 Yes chr3L:9837080-9838670 lnc-SLC22A16-3:1 Yes chr3L:9837080-9838670 lnc-CDK19-4:3 Yes chr3L:9837080-9838670 lnc-CDK19-4:1 Yes chr3L:9837080-9838670 lnc-AMD1-2:1 No - lnc-GTF3C6-1:3 Yes chr3R:18223722-18224942 lnc-REV3L-5:1 Yes chr3R:12682186-12689367 lnc-REV3L-4:1 Yes chr3R:12682186-12689367 lnc-REV3L-1:2 Yes chr3R:12682186-12689367 lnc-REV3L-1:3 Yes chr3R:12682186-12689367 lnc-MFSD4B-1:1 No - lnc-TRAF3IP2-6:1 Yes chr2R:7793625-7801044 lnc-MFSD4B-7:1 Yes chr2R:7793625-7801044 lnc-TRAF3IP2-5:1 Yes chr2R:7793625-7801044 lnc-MFSD4B-10:1 Yes chr2R:7793625-7801044 lnc-TRAF3IP2-3:1 Yes chr2R:7793625-7801044 lnc-MFSD4B-11:1 Yes chr2R:7793625-7801044 TRAF3IP2-AS1:1 No - TRAF3IP2-AS1:3 Yes chr2R:7793625-7801044 TRAF3IP2-AS1:5 No - TRAF3IP2-AS1:17 No - lnc-REV3L-2:1 No - lnc-REV3L-2:2 No - lnc-REV3L-3:3 No - lnc-REV3L-3:2 No - TRAF3IP2-AS1:19 No - TRAF3IP2-AS1:21 No - TRAF3IP2-AS1:23 No - TRAF3IP2-AS1:24 No - lnc-WISP3-1:2 No - lnc-TUBE1-4:1 No - lnc-WISP3-5:1 No - lnc-WISP3-4:1 No - lnc-TUBE1-2:1 No - lnc-LAMA4-3:2 Yes chr3L:6530729-6532429 lnc-LAMA4-3:1 Yes chr3L:6530729-6532429 lnc-TUBE1-1:1 Yes chr3L:6530729-6532429 lnc-TUBE1-5:1 Yes chr3L:6203831-6218022 lnc-TUBE1-5:2 Yes chr3L:6203831-6218022 lnc-TUBE1-6:1 Yes chr3L:6203831-6218022 lnc-TUBE1-7:1 Yes chr3L:6203831-6218022 lnc-RFPL4B-1:4 No - lnc-RFPL4B-1:5 No - lnc-RFPL4B-1:7 No - lnc-RFPL4B-1:8 No - lnc-RFPL4B-1:9 No - lnc-RFPL4B-1:10 No - lnc-RFPL4B-1:11 No - lnc-RFPL4B-1:12 No - lnc-LAMA4-4:1 No - lnc-LAMA4-5:1 No - lnc-LAMA4-7:1 No - lnc-RFPL4B-5:1 No - lnc-RFPL4B-6:1 No - lnc-MARCKS-18:1 No - lnc-HDAC2-13:1 No - lnc-MARCKS-4:2 No - lnc-HDAC2-12:1 No - lnc-HDAC2-12:3 No - lnc-MARCKS-16:1 No - LINC02541:65 No - lnc-MARCKS-14:1 No - lnc-MARCKS-12:1 No - LINC02541:39 No - lnc-MARCKS-11:1 No - lnc-HDAC2-10:1 No - lnc-HDAC2-8:1 No - lnc-HDAC2-8:3 No - LINC01268:4 No - lnc-MARCKS-8:1 Yes chr3L:4626734-4629467 lnc-HS3ST5-11:1 Yes chr3L:4626734-4629467 lnc-HS3ST5-10:1 Yes chr3L:4626734-4629467 lnc-HS3ST5-6:3 Yes chr3L:4626734-4629467 lnc-HS3ST5-6:2 Yes chr3L:4626734-4629467 HDAC2-AS2:74 Yes chr3L:4626734-4629467 HDAC2-AS2:75 Yes chr3L:4626734-4629467 lnc-HS3ST5-4:2 Yes chr3L:4626734-4629467 lnc-HDAC2-5:1 No - HDAC2-AS2:103 No - lnc-MARCKS-15:1 Yes chr2R:18718114-18754675 lnc-HDAC2-7:1 Yes chr2R:18718114-18754675 HDAC2-AS2:106 Yes chr2R:18718114-18754675 lnc-HDAC2-9:1 Yes chr2R:18718114-18754675 HDAC2-AS2:110 Yes chr2R:18718114-18754675 HDAC2-AS2:116 Yes chr2R:18718114-18754675 lnc-HS3ST5-3:1 No - lnc-HS3ST5-7:1 No - HDAC2-AS2:124 No - lnc-HS3ST5-2:5 No - lnc-HS3ST5-2:3 No - lnc-HS3ST5-2:4 No - lnc-HS3ST5-8:2 No - lnc-HS3ST5-8:1 No - lnc-HS3ST5-9:2 No - lnc-NT5DC1-4:2 No - lnc-FRK-5:1 No - lnc-FRK-4:1 No - lnc-FRK-1:3 No - lnc-NT5DC1-5:1 Yes chr2R:5981844-6012795 lnc-NT5DC1-5:2 Yes chr2R:5981844-6012795 lnc-FRK-3:1 No - lnc-TSPYL1-2:3 Yes chr3R:15263552-15265253 lnc-NT5DC1-1:2 No - lnc-TRAPPC3L-2:1 No - lnc-RWDD1-1:1 No - lnc-ZUFSP-2:1 No - lnc-ZUFSP-3:1 No - lnc-ZUFSP-4:1 No - lnc-ZUFSP-4:2 No - lnc-GPRC6A-2:1 No - lnc-ROS1-2:1 No - lnc-VGLL2-1:1 Yes chrX:11071441-11086299 lnc-VGLL2-2:1 Yes chrX:11071441-11086299 lnc-DCBLD1-2:1 No - lnc-DCBLD1-1:1 No - lnc-DCBLD1-1:3 No - lnc-ROS1-3:1 No - lnc-NUS1-2:1 No - lnc-NUS1-1:1 No - lnc-NUS1-5:1 No - lnc-PLN-2:1 No - lnc-MCM9-3:3 No - lnc-MCM9-3:2 No - lnc-MCM9-3:1 No - lnc-MCM9-2:1 No - lnc-ASF1A-5:1 No - lnc-ASF1A-5:2 No - lnc-ASF1A-5:3 No - lnc-FAM184A-3:1 No - lnc-MCM9-1:1 No - lnc-FAM184A-1:1 Yes chrX:10266792-10325958 lnc-FAM184A-2:1 Yes chrX:10266792-10325958 lnc-ASF1A-2:2 No - lnc-ASF1A-6:1 No - lnc-MAN1A1-1:3 No - lnc-MAN1A1-1:4 No - lnc-ASF1A-7:1 No - lnc-GJA1-7:1 No - lnc-SERINC1-7:2 No - lnc-SERINC1-7:1 No - lnc-SERINC1-5:2 No - lnc-GJA1-5:1 No - lnc-GJA1-4:1 No - lnc-TBC1D32-1:1 No - lnc-TBC1D32-2:1 No - lnc-TBC1D32-3:1 No - lnc-GJA1-6:1 No - lnc-TBC1D32-4:1 No - lnc-HSF2-4:1 No - lnc-SERINC1-2:2 No - lnc-HSF2-2:1 No - lnc-SERINC1-3:1 No - lnc-FABP7-2:1 No - lnc-PKIB-1:1 No - lnc-TRDN-4:1 No - lnc-SMPDL3A-3:1 Yes chr2L:19435850-19442727 lnc-CLVS2-2:3 No - lnc-CLVS2-2:5 No - lnc-CLVS2-2:6 No - TRDN-AS1:24 No - TRDN-AS1:25 No - TRDN-AS1:26 No - TRDN-AS1:31 No - lnc-NKAIN2-3:1 No - RNF217-AS1:3 No - lnc-RNF217-3:1 No - RNF217-AS1:4 No - RNF217-AS1:1 No - lnc-TPD52L1-4:1 No - lnc-HDDC2-1:2 No - lnc-HDDC2-7:1 No - lnc-HDDC2-8:1 No - lnc-HDDC2-9:1 No - lnc-HDDC2-5:10 No - LINC02523:6 No - LINC02523:7 No - lnc-HDDC2-5:5 Yes chr2R:7995438-7998278 lnc-HINT3-2:1 No - lnc-TRMT11-1:4 No - lnc-TRMT11-1:5 No - lnc-HDDC2-12:1 No - lnc-TRMT11-5:1 No - lnc-TRMT11-2:2 No - lnc-HDDC2-13:1 No - lnc-CENPW-1:1 No - lnc-HDDC2-14:1 No - lnc-CENPW-2:2 No - lnc-CENPW-3:1 No - lnc-ECHDC1-3:1 No - lnc-ECHDC1-3:2 No - lnc-RSPO3-1:2 No - lnc-ECHDC1-1:3 No - lnc-ECHDC1-1:2 No - lnc-ECHDC1-2:1 No - lnc-KIAA0408-4:1 No - lnc-KIAA0408-4:2 No - lnc-RNF146-1:1 No - lnc-RNF146-3:1 No - lnc-RNF146-3:2 No - lnc-RNF146-4:1 No - lnc-RNF146-5:1 No - lnc-KIAA0408-3:1 No - lnc-C6orf58-4:1 No - lnc-KIAA0408-1:1 No - lnc-KIAA0408-2:1 No - lnc-THEMIS-4:1 No - lnc-THEMIS-3:1 No - lnc-THEMIS-5:1 No - lnc-THEMIS-6:1 No - lnc-THEMIS-2:2 No - lnc-THEMIS-7:1 No - lnc-PTPRK-1:1 No - lnc-PTPRK-2:1 No - lnc-PTPRK-3:1 Yes chr2L:14263027-14328262 lnc-L3MBTL3-4:1 Yes chr2L:14263027-14328262 lnc-ARHGAP18-1:3 Yes chr2L:14263027-14328262 lnc-ARHGAP18-1:4 No - lnc-ARHGAP18-1:5 No - lnc-ARHGAP18-3:1 Yes chr2R:4744348-4758048 lnc-TMEM244-3:1 Yes chr2R:4744348-4758048 lnc-ARHGAP18-3:2 Yes chr2R:4744348-4758048 lnc-ARHGAP18-4:1 No - lnc-TMEM244-2:1 No - lnc-L3MBTL3-2:1 No - lnc-TMEM244-1:1 No - lnc-SAMD3-1:3 Yes chr3R:27266326-27273273 lnc-TMEM244-4:1 No - lnc-TMEM200A-1:1 No - lnc-EPB41L2-3:1 No - lnc-SMLR1-3:1 No - lnc-SAMD3-2:2 Yes chr2R:19229063-19243751 lnc-SAMD3-2:1 Yes chr2R:19229063-19243751 lnc-SAMD3-3:1 Yes chr2R:19229063-19243751 lnc-EPB41L2-2:1 No - lnc-AKAP7-1:1 No - lnc-MED23-1:1 No - lnc-ARG1-4:1 No - lnc-ARG1-1:1 No - lnc-OR2A4-3:1 Yes chr2R:22888928-22894425 lnc-OR2A4-2:1 Yes chr2R:22888928-22894425 lnc-OR2A4-1:1 Yes chr2R:22888928-22894425 lnc-CTAGE9-1:1 No - lnc-CTAGE9-2:1 No - lnc-ENPP3-1:1 No - lnc-CTAGE9-3:1 No - lnc-ENPP1-5:1 Yes chr3L:17690015-17748839 lnc-ENPP1-5:2 Yes chr3L:17690015-17748839 lnc-ENPP1-5:3 Yes chr3L:17690015-17748839 lnc-ENPP1-3:3 No - lnc-ENPP1-6:1 No - lnc-ENPP1-6:2 No - LINC01013:11 No - LINC01013:12 No - LINC01013:17 No - lnc-ENPP1-7:1 No - lnc-ENPP1-7:2 No - lnc-ENPP1-7:4 No - lnc-ENPP1-7:5 No - lnc-ENPP1-7:6 No - lnc-TAAR9-2:1 No - lnc-MOXD1-2:1 Yes chr3L:21445834-21448128 lnc-STX7-1:1 No - lnc-TAAR8-1:1 No - lnc-TAAR6-1:1 No - lnc-VNN1-1:1 No - lnc-RPS12-5:1 Yes chrX:6194737-6196439 lnc-VNN2-2:3 Yes chrX:6194737-6196439 lnc-RPS12-3:1 No - lnc-VNN2-3:1 No - lnc-SLC18B1-2:1 No - lnc-RPS12-4:1 No - LINC00326:4 No - LINC00326:7 No - lnc-EYA4-3:1 No - lnc-RPS12-6:1 Yes chr2L:6527447-6546976 TARID:10 Yes chr2L:6527447-6546976 lnc-SLC2A12-11:1 Yes chr2L:6527447-6546976 lnc-SLC2A12-10:1 No - TARID:12 No - lnc-TCF21-2:1 Yes chr2R:17757405-17760517 lnc-TCF21-2:2 Yes chr2R:17757405-17760517 lnc-SLC2A12-6:1 No - lnc-SLC2A12-5:1 No - lnc-TCF21-3:3 No - lnc-SGK1-4:1 No - lnc-SGK1-4:2 No - lnc-TBPL1-4:1 No - lnc-SLC2A12-7:2 No - lnc-SLC2A12-7:6 No - lnc-SLC2A12-7:5 No - lnc-SLC2A12-7:4 No - lnc-SLC2A12-7:1 No - lnc-SLC2A12-7:3 No - lnc-SLC2A12-9:1 No - lnc-SLC2A12-8:1 No - lnc-SGK1-5:1 No - lnc-SGK1-3:21 No - lnc-SGK1-3:19 No - LINC01010:2 No - LINC01010:4 No - LINC01010:5 No - LINC01010:6 No - lnc-SGK1-3:22 No - LINC01010:8 No - LINC01010:9 No - lnc-SGK1-3:2 No - lnc-SGK1-3:3 No - lnc-SGK1-8:1 No - lnc-MYB-5:2 No - lnc-ALDH8A1-4:1 No - lnc-MYB-12:1 No - lnc-ALDH8A1-3:1 No - lnc-MYB-11:1 No - lnc-MYB-10:1 No - lnc-MYB-9:1 No - lnc-ALDH8A1-2:1 Yes chr3L:1862881-1865240 lnc-MYB-7:1 No - MYB-AS1:1 Yes chrX:15854832-15857823 MYB-AS1:2 Yes chrX:15854832-15857823 lnc-HBS1L-1:1 No - lnc-HBS1L-1:2 No - lnc-MYB-2:2 No - lnc-HBS1L-2:1 No - LINC00271:3 No - LINC00271:6 No - LINC00271:7 No - LINC00271:11 No - LINC00271:12 No - lnc-AHI1-5:1 No - lnc-AHI1-6:1 No - LINC00271:15 No - lnc-AHI1-3:2 No - lnc-AHI1-7:1 No - lnc-MTFR2-2:2 No - lnc-MTFR2-2:14 No - lnc-MTFR2-2:7 No - lnc-MTFR2-2:5 No - lnc-MTFR2-1:2 No - lnc-MTFR2-1:1 No - lnc-MTFR2-4:5 No - lnc-MTFR2-4:3 No - lnc-MTFR2-4:6 No - lnc-MTFR2-4:4 No - lnc-MTFR2-4:2 No - lnc-MTFR2-4:1 No - lnc-MTFR2-5:1 No - lnc-PDE7B-2:1 No - lnc-MAP7-1:2 No - lnc-PDE7B-3:1 No - lnc-PDE7B-3:2 No - lnc-MAP3K5-3:1 No - lnc-MAP3K5-3:2 No - lnc-BCLAF1-3:1 No - lnc-MAP3K5-2:1 No - lnc-PEX7-2:3 No - lnc-MAP7-2:1 Yes chr3R:19879719-19886030 lnc-PEX7-3:1 No - lnc-IL20RA-3:1 No - lnc-IL20RA-2:1 No - lnc-IL20RA-1:5 No - lnc-IL22RA2-2:2 No - lnc-IL22RA2-1:1 No - lnc-IL22RA2-2:3 No - lnc-IL22RA2-2:1 No - lnc-SLC35D3-2:1 No - lnc-IFNGR1-1:1 No - lnc-TNFAIP3-5:4 No - lnc-TNFAIP3-5:5 No - lnc-TNFAIP3-4:4 No - lnc-TNFAIP3-3:4 No - lnc-TNFAIP3-10:2 No - LINC02539:9 No - LINC02539:10 No - lnc-TNFAIP3-8:1 No - lnc-OLIG3-3:1 No - lnc-PERP-2:7 No - lnc-TNFAIP3-1:4 No - lnc-TNFAIP3-1:5 No - lnc-PERP-2:4 No - lnc-PERP-2:24 No - lnc-PERP-9:1 No - lnc-PERP-8:1 No - lnc-PERP-7:1 No - lnc-PERP-4:1 No - lnc-TNFAIP3-9:1 No - lnc-TNFAIP3-9:2 No - lnc-TNFAIP3-7:1 No - lnc-ARFGEF3-1:1 No - lnc-SMIM28-1:1 Yes chrX:6040005-6050381 lnc-NHSL1-3:1 No - lnc-NHSL1-4:3 No - lnc-NHSL1-4:2 No - lnc-NHSL1-2:1 No - lnc-CCDC28A-1:5 No - lnc-CCDC28A-1:7 No - lnc-CCDC28A-1:8 No - lnc-GVQW2-1:6 No - lnc-CCDC28A-7:1 No - lnc-CCDC28A-6:1 No - lnc-CCDC28A-5:1 No - lnc-GVQW2-1:8 No - lnc-CCDC28A-4:1 No - lnc-CCDC28A-3:1 No - lnc-CCDC28A-2:1 No - lnc-GVQW2-3:1 No - lnc-REPS1-1:1 No - lnc-REPS1-2:1 No - lnc-TXLNB-3:15 Yes chr3R:30277932-30372382 lnc-TXLNB-3:14 Yes chr3R:30277932-30372382 lnc-TXLNB-3:13 Yes chr3R:30277932-30372382 lnc-TXLNB-3:12 Yes chr3R:30277932-30372382 lnc-TXLNB-3:2 No - lnc-TXLNB-3:11 Yes chr3R:30277932-30372382 lnc-TXLNB-3:10 Yes chr3R:30277932-30372382 lnc-TXLNB-3:9 Yes chr3R:30277932-30372382 lnc-TXLNB-3:8 Yes chr3R:30277932-30372382 lnc-TXLNB-3:7 Yes chr3R:30277932-30372382 lnc-TXLNB-3:6 Yes chr3R:30277932-30372382 lnc-TXLNB-3:5 Yes chr3R:30277932-30372382 lnc-TXLNB-3:4 No - lnc-TXLNB-3:16 No - lnc-TXLNB-3:3 No - lnc-HECA-4:1 No - lnc-CITED2-5:1 No - lnc-HECA-5:1 No - lnc-CITED2-6:2 No - lnc-HECA-6:1 No - FILNC1:16 No - FILNC1:24 No - lnc-HECA-7:2 No - lnc-HECA-7:3 No - lnc-CITED2-7:1 No - lnc-HECA-3:10 No - lnc-HECA-8:1 No - lnc-HECA-8:3 No - lnc-HECA-8:4 No - lnc-HECA-9:1 No - lnc-GJE1-8:1 No - lnc-NMBR-2:2 No - lnc-NMBR-8:1 No - lnc-GJE1-3:2 No - lnc-GJE1-3:3 No - lnc-GJE1-3:4 No - lnc-GJE1-3:5 No - lnc-GJE1-2:2 No - lnc-GJE1-2:3 No - lnc-NMBR-7:1 No - lnc-NMBR-6:2 No - lnc-NMBR-6:1 No - lnc-GJE1-7:1 No - lnc-NMBR-3:1 Yes chr2R:17646848-17665068 lnc-GJE1-6:1 Yes chr2R:17646848-17665068 lnc-GJE1-4:1 Yes chr3L:1651432-1652900 lnc-NMBR-1:2 No - lnc-NMBR-4:1 No - lnc-VTA1-2:1 Yes chr3L:23784231-23787405 lnc-NMBR-5:1 Yes chr3L:23784231-23787405 lnc-HIVEP2-7:1 No - lnc-ADAT2-2:1 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-AIG1-8:1 No - LINC01277:7 No - LINC01277:3 No - LINC01277:4 No - LINC01277:10 No - lnc-AIG1-7:1 No - LINC01277:1 Yes chr2L:281670-283269 LINC01277:2 Yes chr2L:281670-283269 LINC01277:5 No - LINC01277:6 No - lnc-AIG1-5:1 No - lnc-HIVEP2-6:1 Yes chr2L:281670-283269 lnc-HIVEP2-8:1 Yes chr2L:281670-283269 lnc-ADAT2-1:1 Yes chr2L:281670-283269 lnc-PEX3-2:1 Yes chr2L:281670-283269 lnc-AIG1-4:1 No - lnc-AIG1-6:1 No - lnc-PEX3-1:5 Yes chr3L:11518798-11522713 lnc-PEX3-1:10 Yes chr3L:11518798-11522713 PHACTR2-AS1:1 Yes chr3L:3714826-3806459 PHACTR2-AS1:7 Yes chr3L:3714826-3806459 PHACTR2-AS1:2 Yes chr3L:3714826-3806459 lnc-ZC2HC1B-2:1 Yes chr2R:10836570-10838727 lnc-PLAGL1-1:1 No - HYMAI:2 No - HYMAI:3 No - HYMAI:9 No - HYMAI:4 No - HYMAI:5 No - HYMAI:6 No - HYMAI:1 No - HYMAI:7 No - lnc-ZC2HC1B-3:1 No - lnc-STX11-1:1 No - lnc-SF3B5-3:1 No - lnc-STX11-5:1 Yes chr3R:19461085-19597288 lnc-SF3B5-4:1 Yes chr3R:19461085-19597288 lnc-SF3B5-5:1 Yes chr3R:19461085-19597288 lnc-UTRN-3:1 No - lnc-UTRN-2:2 No - lnc-FBXO30-4:1 No - lnc-FBXO30-3:1 No - lnc-GRM1-12:1 No - lnc-EPM2A-1:1 No - lnc-GRM1-1:3 No - lnc-GRM1-1:7 Yes chr3L:6174248-6178941 lnc-GRM1-1:8 No - lnc-GRM1-1:9 Yes chr3L:6174248-6178941 lnc-GRM1-1:10 Yes chr3L:6174248-6178941 lnc-GRM1-10:1 No - lnc-GRM1-9:1 No - lnc-GRM1-8:1 No - lnc-GRM1-7:1 No - lnc-GRM1-6:1 No - lnc-GRM1-5:1 No - lnc-GRM1-4:2 No - lnc-GRM1-1:18 Yes chr3L:6174248-6178941 lnc-FBXO30-2:1 Yes chr3L:6174248-6178941 lnc-RAB32-2:1 Yes chr4:936819-949441 lnc-SHPRH-3:1 Yes chr4:936819-949441 lnc-SHPRH-1:5 No - lnc-SHPRH-1:6 No - lnc-SHPRH-5:2 No - lnc-SHPRH-5:1 No - lnc-ADGB-2:2 No - STXBP5-AS1:12 No - STXBP5-AS1:2 Yes chrX:12631605-12653442 STXBP5-AS1:13 No - STXBP5-AS1:9 No - STXBP5-AS1:6 No - lnc-ADGB-1:4 No - lnc-ADGB-4:2 No - lnc-ADGB-3:2 No - lnc-STXBP5-4:1 Yes chrX:12631605-12653442 lnc-SHPRH-8:1 No - lnc-STXBP5-5:1 No - lnc-STXBP5-6:1 Yes chr3R:22133830-22296126 lnc-SAMD5-2:2 Yes chr3R:22133830-22296126 lnc-SAMD5-2:3 Yes chr3R:22133830-22296126 lnc-SAMD5-2:4 Yes chr3R:22133830-22296126 lnc-SAMD5-2:5 Yes chr3R:22133830-22296126 lnc-ZC3H12D-8:3 No - lnc-ZC3H12D-19:2 No - lnc-SAMD5-2:6 No - lnc-ZC3H12D-18:1 No - lnc-ZC3H12D-5:2 No - lnc-ZC3H12D-17:1 No - lnc-ZC3H12D-4:2 No - lnc-UST-1:1 No - lnc-ZC3H12D-15:1 No - lnc-ZC3H12D-14:1 No - UST-AS1:2 Yes chr3L:19298623-19337609 lnc-ZC3H12D-12:1 No - lnc-TAB2-1:4 No - lnc-SUMO4-5:2 No - lnc-SUMO4-5:4 No - lnc-ZC3H12D-11:1 No - lnc-SUMO4-4:1 No - lnc-ZC3H12D-10:1 No - lnc-SUMO4-3:1 No - lnc-SUMO4-2:1 No - lnc-PPIL4-9:1 No - lnc-KATNA1-2:2 No - lnc-GINM1-3:1 Yes chr3R:5227289-5232209 lnc-NUP43-1:1 No - lnc-LRP11-1:2 Yes chr3R:5552823-5554316 lnc-LRP11-1:3 Yes chr3L:8087635-8091786 lnc-RAET1E-3:1 Yes chr3L:8087635-8091786 lnc-ULBP2-25:3 No - lnc-RAET1G-1:1 No - lnc-ULBP2-25:4 No - lnc-ULBP2-2:4 No - lnc-ULBP2-2:5 No - lnc-ULBP2-1:3 No - lnc-ULBP2-4:1 No - lnc-RAET1L-2:1 No - lnc-ULBP1-2:1 No - lnc-PPP1R14C-1:4 No - lnc-PPP1R14C-1:5 No - lnc-ULBP3-3:1 No - lnc-ULBP3-4:1 Yes chr3L:11093371-11096245 lnc-ULBP3-5:1 No - lnc-PLEKHG1-1:1 Yes chr3R:10696534-10703316 lnc-ZBTB2-1:3 Yes chr3R:10696534-10703316 lnc-AKAP12-2:1 Yes chr3R:10696534-10703316 lnc-ZBTB2-1:2 No - lnc-ZBTB2-6:1 No - lnc-ZBTB2-5:2 No - lnc-ARMT1-1:3 No - lnc-AKAP12-1:1 No - lnc-AKAP12-1:2 No - lnc-ZBTB2-4:1 Yes chrX:15737493-15738954 lnc-ESR1-3:1 No - lnc-ESR1-3:2 No - lnc-CCDC170-2:1 No - lnc-CCDC170-4:1 No - lnc-RMND1-1:1 No - lnc-SYNE1-2:1 No - lnc-FBXO5-5:1 No - lnc-FBXO5-5:2 No - lnc-FBXO5-4:1 No - lnc-MTRF1L-3:1 No - lnc-VIP-1:2 No - lnc-MTRF1L-1:1 Yes chr2L:13219979-13221398 lnc-RGS17-2:1 Yes chr2L:13219979-13221398 lnc-VIP-4:1 Yes chr2R:17792870-17800677 lnc-VIP-3:2 No - lnc-RGS17-3:1 No - lnc-OPRM1-5:1 No - lnc-OPRM1-6:1 No - lnc-OPRM1-6:2 No - lnc-OPRM1-6:3 No - lnc-OPRM1-8:1 No - lnc-OPRM1-9:1 No - lnc-IPCEF1-5:1 No - lnc-IPCEF1-4:1 Yes chr3L:18560258-18576326 lnc-IPCEF1-2:1 No - lnc-CNKSR3-4:1 No - lnc-CNKSR3-4:2 No - lnc-SCAF8-8:1 No - lnc-CNKSR3-3:1 No - lnc-IPCEF1-1:2 No - lnc-IPCEF1-3:1 No - lnc-IPCEF1-6:1 Yes chr2R:17413970-17420007 lnc-SCAF8-1:2 No - lnc-SCAF8-7:1 No - lnc-SCAF8-6:1 No - lnc-CNKSR3-2:1 No - lnc-SCAF8-3:1 No - lnc-SCAF8-2:1 Yes chr3L:5657913-5749599 lnc-CNKSR3-5:1 Yes chr3L:5657913-5749599 lnc-SCAF8-5:3 Yes chr3L:5657913-5749599 lnc-CLDN20-6:1 Yes chr3L:5657913-5749599 lnc-TFB1M-5:2 No - lnc-TFB1M-5:7 Yes chr3L:11708979-11710570 lnc-TFB1M-5:6 Yes chr3L:11708979-11710570 lnc-TFB1M-5:5 Yes chr3L:11708979-11710570 lnc-TFB1M-5:1 Yes chr3L:11708979-11710570 lnc-TFB1M-5:3 Yes chr3L:11708979-11710570 lnc-TFB1M-5:4 Yes chr3L:11708979-11710570 lnc-TFB1M-2:1 No - lnc-TFB1M-3:1 No - lnc-CLDN20-3:2 No - lnc-ARID1B-6:1 No - lnc-ARID1B-1:2 No - lnc-TMEM242-9:1 No - lnc-TMEM242-9:2 No - lnc-ARID1B-4:1 No - lnc-TMEM242-8:1 No - lnc-TMEM242-7:1 No - lnc-ZDHHC14-7:1 Yes chr3R:17687818-17718350 lnc-SERAC1-13:1 Yes chrX:11570621-11571718 lnc-SERAC1-12:1 Yes chrX:11570621-11571718 lnc-ZDHHC14-1:1 No - lnc-TMEM242-4:1 No - lnc-TMEM242-5:1 No - lnc-ARID1B-5:1 Yes chr3L:12206238-12266841 lnc-TMEM242-6:1 Yes chr3L:12206238-12266841 lnc-SERAC1-11:1 Yes chr3L:9710422-9713827 lnc-SYNJ2-2:1 Yes chr3L:9710422-9713827 lnc-SYNJ2-1:1 Yes chr3L:9710422-9713827 lnc-SERAC1-7:1 No - lnc-SERAC1-8:1 Yes chr3R:27607879-27634932 lnc-SERAC1-9:1 Yes chr3R:27607879-27634932 lnc-GTF2H5-2:3 Yes chr3R:27607879-27634932 lnc-GTF2H5-24:2 Yes chr3R:27607879-27634932 lnc-SERAC1-10:1 Yes chr3R:27607879-27634932 lnc-SERAC1-10:2 Yes chr3R:27607879-27634932 lnc-TMEM181-3:1 Yes chr3R:27607879-27634932 lnc-DYNLT1-3:1 No - lnc-DYNLT1-1:1 Yes chr3R:22029440-22031900 lnc-TMEM181-1:1 Yes chr3R:14804092-14875488 lnc-EZR-2:1 Yes chr3R:14804092-14875488 lnc-DYNLT1-4:1 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-SYTL3-150:3 No - lnc-EZR-1:2 No - lnc-SYTL3-2:10 No - lnc-TAGAP-3:1 Yes chr3L:6756629-6763246 lnc-FNDC1-10:1 No - lnc-FNDC1-10:7 No - lnc-FNDC1-10:8 No - lnc-FNDC1-10:9 No - lnc-FNDC1-9:1 Yes chr3L:15588860-15609125 lnc-FNDC1-7:1 No - lnc-TAGAP-5:1 No - lnc-FNDC1-6:2 No - lnc-SOD2-3:3 No - lnc-SOD2-8:1 No - lnc-SOD2-7:1 No - lnc-TCP1-5:1 No - lnc-TCP1-4:1 No - lnc-TCP1-3:4 No - lnc-WTAP-1:1 No - lnc-WTAP-1:2 No - lnc-WTAP-1:3 No - lnc-TCP1-3:2 No - lnc-TCP1-3:7 No - lnc-TCP1-3:5 No - lnc-TCP1-3:6 No - lnc-TCP1-3:3 No - lnc-TCP1-3:1 No - lnc-TCP1-2:1 No - SOD2-OT1:4 No - lnc-SOD2-4:1 Yes chr3R:22489105-22491439 lnc-SOD2-5:2 Yes chr3R:22489105-22491439 lnc-SOD2-5:3 Yes chr3R:22489105-22491439 lnc-SOD2-5:1 Yes chr3R:22489105-22491439 AIRN:1 Yes chr3R:26842462-26863130 AIRN:2 Yes chr3R:26842462-26863130 lnc-SLC22A1-3:2 Yes chr3R:26842462-26863130 lnc-SLC22A1-2:1 Yes chr3R:26842462-26863130 lnc-SLC22A2-2:1 Yes chr3R:16154982-16180475 lnc-SLC22A1-4:1 Yes chr3R:16171991-16180475 lnc-LPA-7:1 Yes chr3R:16171991-16180475 lnc-SLC22A1-6:1 Yes chr3R:16171991-16180475 lnc-LPA-6:4 No - lnc-LPA-6:3 No - lnc-LPA-6:2 No - lnc-LPA-6:5 No - lnc-SLC22A2-5:1 Yes chr3L:9074643-9092131 lnc-LPA-4:1 No - lnc-LPA-5:1 Yes chr3L:9074643-9092131 lnc-PLG-3:1 No - lnc-PLG-4:1 No - lnc-MAP3K4-4:1 No - lnc-MAP3K4-3:1 No - lnc-MAP3K4-2:2 No - lnc-AGPAT4-1:2 No - lnc-PRKN-1:3 Yes chr3L:16381772-16385957 lnc-AGPAT4-2:1 Yes chr3L:21194754-21196853 lnc-QKI-10:1 Yes chr2R:19497752-19500372 lnc-PRKN-14:2 Yes chr2R:19497752-19500372 PACRG-AS2:3 Yes chr2R:19497752-19500372 PACRG-AS3:6 Yes chr2R:19497752-19500372 PACRG-AS1:3 Yes chr2R:19497752-19500372 PACRG-AS1:2 Yes chr2R:19497752-19500372 PACRG-AS1:4 No - lnc-PACRG-1:1 No - lnc-PRKN-3:4 No - lnc-QKI-6:1 No - CAHM:1 No - lnc-PACRG-2:1 Yes chr3R:22042191-22079321 lnc-PACRG-3:1 Yes chr3R:22042191-22079321 lnc-PACRG-4:1 Yes chr3R:22042191-22079321 lnc-PRKN-17:2 Yes chr3R:22042191-22079321 lnc-QKI-7:2 No - lnc-PRKN-19:2 No - lnc-QKI-2:5 No - lnc-QKI-9:1 No - lnc-C6orf118-20:1 No - lnc-C6orf118-8:1 No - lnc-C6orf118-7:1 No - lnc-C6orf118-6:1 No - lnc-QKI-12:1 No - lnc-C6orf118-1:3 No - lnc-QKI-4:2 No - lnc-QKI-4:3 No - lnc-QKI-4:4 No - lnc-QKI-5:2 No - lnc-C6orf118-4:1 No - lnc-C6orf118-3:2 No - lnc-C6orf118-3:1 No - lnc-C6orf118-2:2 No - lnc-FGFR1OP-17:1 No - lnc-C6orf118-10:2 No - lnc-TBXT-2:2 No - lnc-TBXT-5:1 No - LINC00473:3 No - LINC00473:8 No - LINC00602:1 No - lnc-FGFR1OP-14:1 No - lnc-FGFR1OP-6:2 No - lnc-FGFR1OP-20:2 No - lnc-PRR18-2:1 No - lnc-PRR18-1:2 Yes chr3L:20521009-20522434 lnc-PRR18-1:4 Yes chr3L:20521009-20522434 lnc-PRR18-1:1 Yes chr3L:20521009-20522434 lnc-PRR18-1:3 Yes chr3L:20521009-20522434 lnc-FGFR1OP-18:1 Yes chr3L:20521009-20522434 lnc-FGFR1OP-18:2 No - lnc-MPC1-2:1 Yes chr3R:18926996-18928659 lnc-FGFR1OP-2:2 No - lnc-FGFR1OP-2:3 No - lnc-MPC1-3:1 Yes chrX:22529964-22536371 lnc-FGFR1OP-12:1 Yes chrX:22529964-22536371 lnc-FGFR1OP-11:1 Yes chrX:22529964-22536371 RPS6KA2-AS1:2 No - lnc-RNASET2-3:1 No - lnc-RPS6KA2-1:1 No - lnc-RNASET2-2:1 No - lnc-RNASET2-2:2 No - lnc-RPS6KA2-2:1 No - lnc-RNASET2-1:9 No - lnc-CCR6-8:1 No - lnc-GPR31-5:1 No - lnc-TCP10L2-1:1 No - lnc-GPR31-2:2 No - lnc-CCR6-1:1 No - lnc-GPR31-3:2 No - lnc-GPR31-4:1 No - lnc-UNC93A-1:2 No - lnc-UNC93A-2:1 No - lnc-UNC93A-3:1 No - lnc-TCP10-1:1 No - lnc-TCP10-1:3 No - lnc-TCP10-1:2 No - lnc-TTLL2-2:1 No - lnc-TCP10-4:1 No - LINC02538:7 No - lnc-AFDN-9:1 No - lnc-FRMD1-10:1 No - lnc-KIF25-5:1 Yes chr3R:5170004-5217456 lnc-FRMD1-8:1 Yes chr3R:5170004-5217456 lnc-AFDN-3:1 No - lnc-AFDN-2:1 No - KIF25-AS1:1 No - KIF25-AS1:8 No - KIF25-AS1:6 No - lnc-KIF25-3:1 No - lnc-KIF25-3:2 No - lnc-FRMD1-7:1 No - lnc-AFDN-4:1 No - lnc-FRMD1-6:1 No - lnc-DACT2-3:1 No - lnc-SMOC2-10:1 No - lnc-FRMD1-3:2 No - lnc-KIF25-6:1 No - lnc-DACT2-4:1 No - lnc-THBS2-16:1 No - lnc-SMOC2-9:1 No - lnc-SMOC2-9:2 No - lnc-SMOC2-11:1 No - lnc-THBS2-15:1 No - lnc-THBS2-15:2 No - lnc-THBS2-5:11 No - lnc-THBS2-5:5 No - lnc-SMOC2-6:2 No - lnc-THBS2-5:2 No - lnc-THBS2-13:2 No - lnc-THBS2-13:1 No - lnc-THBS2-12:1 No - lnc-THBS2-11:2 No - lnc-THBS2-11:1 No - lnc-C6orf120-1:2 No - lnc-C6orf120-1:3 No - lnc-WDR27-5:1 Yes chr2L:6686791-6709086 lnc-C6orf120-6:1 Yes chr2L:6686791-6709086 lnc-THBS2-9:1 No - lnc-THBS2-14:2 No - lnc-C6orf120-5:1 No - lnc-PHF10-5:1 No - lnc-PHF10-3:4 No - lnc-PHF10-3:5 No - lnc-PHF10-3:3 No - lnc-PHF10-3:2 No - lnc-PHF10-3:1 No - lnc-WDR27-4:1 Yes chrX:19626548-19638369 lnc-TCTE3-2:3 Yes chrX:19626548-19638369 lnc-ERMARD-2:4 Yes chrX:19626548-19638369 lnc-ERMARD-2:7 Yes chrX:19626548-19638369 lnc-PHF10-4:2 Yes chr3R:9999771-10001276 lnc-C6orf120-3:1 No - LINC00242:1 No - LINC00574:2 No - LINC00574:3 No - LINC00574:5 No - lnc-TCTE3-6:2 No - lnc-DLL1-12:2 No - lnc-DLL1-10:1 No - lnc-FAM120B-9:1 No - lnc-FAM120B-9:2 No - lnc-FAM120B-6:3 No - lnc-DLL1-4:2 No - lnc-FAM120B-4:2 No - lnc-FAM120B-4:3 No - lnc-DLL1-2:2 No - lnc-FAM120B-3:4 No - lnc-FAM120B-7:1 No - lnc-DLL1-7:2 No - lnc-PSMB1-6:5 No - lnc-DLL1-8:1 No - lnc-DLL1-9:1 No - lnc-FAM120B-8:1 Yes chr2R:21686192-21687642 lnc-PSMB1-1:1 Yes chr2R:24133989-24135405 lnc-PSMB1-2:1 Yes chr2R:24133989-24135405 lnc-TBP-6:1 No - lnc-TBP-7:1 No - lnc-PDGFA-6:6 No - lnc-PDGFA-13:1 No - lnc-PDGFA-12:1 No - lnc-PDGFA-13:2 No - lnc-PDGFA-5:1 No - lnc-PDGFA-13:3 No - lnc-PDGFA-11:7 No - lnc-PDGFA-11:6 No - lnc-PDGFA-11:4 No - lnc-FAM20C-11:1 No - lnc-PDGFA-11:1 No - lnc-PDGFA-11:3 No - lnc-PDGFA-11:5 No - lnc-PDGFA-11:2 No - lnc-PDGFA-17:9 No - lnc-PDGFA-17:10 No - lnc-FAM20C-10:1 No - lnc-PDGFA-17:8 No - lnc-PDGFA-17:23 No - lnc-FAM20C-3:25 No - lnc-FAM20C-3:26 No - lnc-PDGFA-4:1 No - lnc-PDGFA-9:1 No - lnc-FAM20C-1:2 No - lnc-FAM20C-1:3 No - lnc-FAM20C-1:4 No - lnc-FAM20C-1:5 No - lnc-PDGFA-8:7 No - lnc-FAM20C-8:1 No - lnc-PDGFA-3:1 No - lnc-PRKAR1B-1:2 No - lnc-PRKAR1B-1:1 No - lnc-DNAAF5-3:13 No - lnc-DNAAF5-2:1 Yes chr3L:20816118-20836048 lnc-DNAAF5-2:3 Yes chr3L:20816118-20836048 lnc-ADAP1-3:2 Yes chr3L:20816118-20836048 lnc-ADAP1-3:1 No - lnc-CYP2W1-2:1 No - lnc-COX19-3:1 No - lnc-C7orf50-3:1 No - lnc-C7orf50-3:3 No - lnc-C7orf50-3:2 No - lnc-ADAP1-2:1 Yes chr2R:21691295-21692764 lnc-COX19-4:1 No - lnc-GPER1-6:2 No - lnc-GPER1-2:3 No - lnc-GPER1-1:5 No - lnc-GPER1-1:6 No - lnc-GPER1-1:7 No - lnc-GPER1-4:2 No - lnc-C7orf50-1:1 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-ZFAND2A-2:3 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-ZFAND2A-2:2 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-UNCX-3:2 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-UNCX-3:11 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-UNCX-3:12 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-ZFAND2A-4:1 No - lnc-UNCX-3:16 No - lnc-UNCX-3:17 No - lnc-GPER1-8:30 Yes chrX:17768569-17778708 lnc-MICALL2-1:8 No - lnc-MICALL2-1:5 No - lnc-MICALL2-1:1 No - lnc-MICALL2-1:4 No - lnc-MICALL2-1:6 No - lnc-MICALL2-1:7 No - lnc-MICALL2-1:3 No - lnc-MICALL2-1:2 No - lnc-MAFK-2:3 No - lnc-MICALL2-2:2 No - lnc-MICALL2-3:1 Yes chr2R:24037943-24044458 lnc-MICALL2-4:1 Yes chr2R:24037943-24044458 lnc-MICALL2-5:1 Yes chr2R:24037943-24044458 lnc-ELFN1-4:3 Yes chr2R:20640976-20641668 lnc-PSMG3-1:1 No - PSMG3-AS1:2 No - PSMG3-AS1:3 No - PSMG3-AS1:6 No - PSMG3-AS1:11 No - PSMG3-AS1:15 No - PSMG3-AS1:16 No - PSMG3-AS1:17 No - PSMG3-AS1:18 No - PSMG3-AS1:20 No - lnc-ELFN1-3:1 No - lnc-ELFN1-1:5 No - lnc-ELFN1-1:6 No - lnc-ELFN1-1:7 No - lnc-ELFN1-1:8 No - lnc-ELFN1-2:1 No - lnc-PSMG3-2:1 No - lnc-MAD1L1-4:2 No - lnc-MAD1L1-4:1 No - lnc-MAD1L1-5:1 No - lnc-MAD1L1-6:1 Yes chr2R:9288957-9291565 lnc-MAD1L1-6:2 Yes chr2R:9288957-9291565 lnc-MAD1L1-6:4 Yes chr2R:9288957-9291565 lnc-MAD1L1-6:3 Yes chr2R:9288957-9291565 lnc-ELFN1-5:2 Yes chr2R:9288957-9291565 lnc-MRM2-2:3 Yes chr2R:9288957-9291565 lnc-MRM2-2:4 Yes chr2R:9288957-9291565 lnc-MRM2-2:5 Yes chr2R:9288957-9291565 lnc-MRM2-2:2 Yes chr2R:9288957-9291565 lnc-MRM2-2:1 Yes chr2R:9288957-9291565 lnc-SNX8-1:1 No - lnc-NUDT1-2:1 No - lnc-EIF3B-2:3 Yes chr2R:17536213-17539142 lnc-SNX8-2:1 No - lnc-CHST12-4:2 Yes chr2L:16879517-16886319 lnc-EIF3B-3:1 Yes chr2L:16879517-16886319 lnc-CHST12-1:7 Yes chr2L:16879517-16886319 lnc-CHST12-1:8 Yes chr2L:16879517-16886319 lnc-BRAT1-2:3 No - lnc-BRAT1-2:2 No - lnc-BRAT1-2:1 No - lnc-GNA12-3:1 No - lnc-TTYH3-2:1 No - lnc-BRAT1-3:1 No - lnc-AMZ1-4:1 No - lnc-AMZ1-5:1 No - lnc-GNA12-4:1 No - lnc-AMZ1-6:1 No - lnc-CARD11-2:1 No - lnc-CARD11-5:4 No - lnc-CARD11-22:2 No - lnc-CARD11-4:1 No - lnc-AMZ1-7:1 No - lnc-AMZ1-7:2 No - lnc-FOXK1-4:1 No - lnc-RADIL-5:1 No - lnc-RADIL-4:1 No - lnc-RADIL-2:2 No - lnc-PAPOLB-3:1 No - lnc-PAPOLB-2:1 No - lnc-MMD2-2:1 No - lnc-RBAK-RBAKDN-2:14 No - lnc-RBAK-RBAKDN-2:15 No - lnc-RBAK-RBAKDN-2:16 No - lnc-RBAK-RBAKDN-2:17 No - lnc-RBAK-RBAKDN-2:18 No - lnc-RBAK-RBAKDN-2:19 No - lnc-RBAK-RBAKDN-2:20 No - lnc-RBAK-RBAKDN-2:21 No - lnc-RBAK-RBAKDN-2:22 No - lnc-RBAK-RBAKDN-2:23 No - lnc-RBAK-RBAKDN-2:24 No - lnc-RBAK-RBAKDN-2:25 No - lnc-RBAK-RBAKDN-2:26 No - lnc-RBAK-RBAKDN-3:2 No - lnc-MMD2-3:2 No - lnc-FBXL18-4:1 Yes chr3R:22710883-22721150 lnc-SLC29A4-5:1 No - lnc-FBXL18-1:7 No - lnc-FSCN1-1:2 No - lnc-FBXL18-2:4 No - lnc-FBXL18-2:3 No - lnc-ACTB-3:1 No - lnc-RSPH10B-2:1 No - lnc-RSPH10B-2:2 No - lnc-OCM-1:3 No - lnc-OCM-3:1 No - lnc-OCM-3:2 No - lnc-OCM-3:3 No - lnc-OCM-3:4 No - lnc-OCM-3:5 No - lnc-OCM-3:6 No - lnc-OCM-3:7 No - lnc-OCM-3:8 No - lnc-OCM-3:9 No - lnc-OCM-3:11 No - lnc-OCM-3:12 No - lnc-OCM-3:13 No - lnc-OCM-3:14 No - lnc-OCM-3:15 No - lnc-OCM-3:16 No - lnc-OCM-3:17 No - lnc-RSPH10B-1:1 No - lnc-PMS2-3:1 Yes chr2R:17860760-17861591 lnc-PMS2-2:1 Yes chr2R:17860760-17861591 lnc-PMS2-4:1 No - lnc-PMS2-6:1 No - lnc-ANKRD61-1:1 No - lnc-ANKRD61-1:2 No - lnc-PMS2-5:1 No - lnc-ANKRD61-1:3 No - lnc-USP42-1:5 No - lnc-USP42-1:8 No - lnc-USP42-1:9 No - lnc-USP42-3:1 No - lnc-USP42-2:1 No - lnc-EIF2AK1-1:1 No - lnc-EIF2AK1-2:1 Yes chr2L:21740041-21757466 lnc-EIF2AK1-3:2 Yes chr2L:21740041-21757466 lnc-EIF2AK1-3:1 Yes chr2L:21740041-21757466 lnc-CYTH3-1:1 Yes chr2L:21740041-21757466 lnc-CYTH3-2:1 No - lnc-FAM220A-1:1 No - lnc-KDELR2-1:1 No - lnc-KDELR2-1:2 No - lnc-GRID2IP-2:1 No - lnc-GRID2IP-1:2 No - lnc-GRID2IP-3:1 Yes chr3L:20426199-20427666 lnc-ZNF316-3:4 No - lnc-ZNF316-3:5 No - lnc-ZNF316-3:10 No - lnc-CCZ1B-4:1 No - lnc-ZNF316-3:11 No - lnc-ZNF316-3:12 No - lnc-RSPH10B2-1:1 No - lnc-RSPH10B2-1:2 No - lnc-RSPH10B2-1:3 No - lnc-CCZ1B-1:3 No - lnc-CCZ1B-1:2 No - lnc-ZNF12-2:2 Yes chr3L:3897444-3899156 lnc-ZNF12-2:1 Yes chr3L:3897444-3899156 lnc-ZNF12-3:2 Yes chr3L:3897444-3899156 lnc-ZNF12-3:1 Yes chr3L:3897444-3899156 lnc-CCZ1B-3:1 No - lnc-CCZ1B-5:1 No - lnc-COL28A1-6:2 No - lnc-COL28A1-6:3 No - lnc-COL28A1-6:1 No - lnc-RSPH10B2-2:1 Yes chr2L:8943455-8951216 lnc-MIOS-6:1 Yes chr2L:8943455-8951216 lnc-MIOS-5:2 Yes chr2L:8943455-8951216 lnc-C1GALT1-1:5 No - lnc-C1GALT1-3:1 No - lnc-RPA3-9:1 No - lnc-MIOS-2:1 No - lnc-COL28A1-2:1 No - lnc-COL28A1-3:1 No - lnc-MIOS-1:2 No - lnc-RPA3-1:1 No - lnc-RPA3-2:1 No - lnc-RPA3-2:3 No - lnc-RPA3-2:2 No - lnc-GLCCI1-6:1 No - lnc-RPA3-5:2 No - lnc-RPA3-8:1 Yes chr3L:21131446-21133310 lnc-RPA3-6:1 Yes chr3L:21131446-21133310 lnc-RPA3-7:1 Yes chr3L:21131446-21133310 lnc-NXPH1-2:5 Yes chr3L:21131446-21133310 lnc-ICA1-4:1 No - lnc-NXPH1-2:1 No - lnc-NXPH1-3:1 No - lnc-ICA1-6:1 No - lnc-NXPH1-5:1 No - lnc-NXPH1-5:2 No - lnc-NXPH1-6:1 No - lnc-NXPH1-7:1 No - lnc-PHF14-13:1 No - lnc-PHF14-4:2 No - lnc-PHF14-12:1 No - lnc-PHF14-12:2 No - lnc-PHF14-11:1 No - lnc-NDUFA4-1:2 No - lnc-NDUFA4-4:1 No - lnc-PHF14-10:1 No - lnc-PHF14-3:3 No - lnc-PHF14-3:4 No - lnc-THSD7A-3:5 Yes chr3L:23339326-23345936 lnc-THSD7A-3:3 Yes chr3L:23339326-23345936 lnc-THSD7A-3:2 Yes chr3L:23339326-23345936 lnc-THSD7A-3:4 Yes chr3L:23339326-23345936 lnc-THSD7A-3:1 Yes chr3L:23339326-23345936 lnc-PHF14-5:1 No - lnc-NDUFA4-3:1 Yes chr2L:4449295-4453038 lnc-PHF14-14:2 No - lnc-PHF14-14:10 No - lnc-PHF14-14:11 No - lnc-THSD7A-2:1 No - lnc-PHF14-6:1 No - lnc-PHF14-7:1 No - lnc-PHF14-8:1 No - lnc-NDUFA4-6:1 No - lnc-NDUFA4-5:1 No - lnc-PHF14-2:3 No - lnc-VWDE-10:1 No - lnc-THSD7A-4:1 No - lnc-SCIN-4:1 No - lnc-SCIN-3:2 No - lnc-VWDE-7:1 Yes chr2L:17486806-17497208 lnc-ARL4A-3:1 No - lnc-VWDE-4:2 No - lnc-ARL4A-5:1 No - lnc-VWDE-9:1 No - lnc-ARL4A-6:1 No - lnc-ARL4A-7:1 No - lnc-ARL4A-7:2 No - lnc-ETV1-5:1 No - lnc-ARL4A-54:7 No - lnc-ETV1-3:1 No - lnc-ARL4A-8:1 Yes chr3R:24788054-24797955 lnc-DGKB-3:1 Yes chr3R:24788054-24797955 lnc-ARL4A-9:1 No - lnc-ARL4A-10:1 No - lnc-DGKB-2:1 No - lnc-ETV1-4:1 Yes chr2R:7834812-7885982 lnc-AGMO-2:3 Yes chr2R:7834812-7885982 lnc-AGMO-2:2 Yes chr2R:7834812-7885982 lnc-AGMO-2:1 Yes chr2R:7834812-7885982 lnc-DGKB-1:1 No - lnc-LRRC72-9:1 No - lnc-LRRC72-8:1 No - lnc-MEOX2-6:1 No - lnc-MEOX2-5:1 No - lnc-LRRC72-7:1 Yes chr3R:22586149-22586625 lnc-AGMO-1:1 Yes chr3R:22586149-22586625 lnc-MEOX2-3:2 No - lnc-MEOX2-3:1 No - lnc-MEOX2-4:1 No - lnc-ISPD-1:2 No - lnc-LRRC72-6:1 No - ISPD-AS1:2 No - ISPD-AS1:3 No - ISPD-AS1:5 No - ISPD-AS1:6 No - ISPD-AS1:7 No - lnc-AGR3-2:1 No - lnc-AGR2-1:1 No - lnc-AHR-1:12 No - lnc-TSPAN13-2:1 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-AGR3-3:1 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-TSPAN13-3:1 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-TSPAN13-3:2 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-AGR3-4:1 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-TSPAN13-6:1 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-TSPAN13-5:2 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-AHR-4:1 No - lnc-SNX13-5:1 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-SNX13-5:3 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-SNX13-4:1 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-SNX13-2:6 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-SNX13-2:5 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-SNX13-2:4 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-SNX13-2:3 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-SNX13-3:1 No - lnc-AHR-7:1 No - lnc-HDAC9-11:1 No - lnc-PRPS1L1-3:6 No - lnc-PRPS1L1-3:3 No - lnc-PRPS1L1-3:2 No - lnc-PRPS1L1-3:4 No - lnc-PRPS1L1-3:5 No - lnc-PRPS1L1-3:1 No - lnc-HDAC9-10:1 No - lnc-PRPS1L1-2:1 No - lnc-AHR-8:3 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-AHR-73:1 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-TWIST1-6:1 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-TWIST1-5:1 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-HDAC9-1:2 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-HDAC9-6:1 Yes chr2R:22985374-23048325 lnc-HDAC9-7:1 Yes chr2R:22985374-23048325 lnc-FERD3L-1:1 Yes chr2R:22985374-23048325 lnc-HDAC9-8:1 Yes chr2R:22985374-23048325 lnc-HDAC9-8:2 Yes chr2R:22985374-23048325 lnc-TWIST1-3:1 No - lnc-HDAC9-12:1 No - lnc-TMEM196-2:1 No - lnc-MACC1-1:11 No - lnc-ITGB8-10:1 No - lnc-ITGB8-9:1 No - lnc-MACC1-1:12 No - lnc-ITGB8-8:1 No - lnc-MACC1-1:9 No - lnc-TMEM196-3:1 No - lnc-TMEM196-3:2 No - lnc-ITGB8-2:4 No - lnc-ITGB8-2:5 No - lnc-ITGB8-2:6 No - lnc-ITGB8-2:7 No - lnc-ITGB8-2:8 No - lnc-ITGB8-6:2 No - lnc-ITGB8-6:3 No - lnc-ITGB8-6:5 No - lnc-MACC1-3:4 No - lnc-MACC1-3:3 No - lnc-ABCB5-7:1 No - lnc-ITGB8-5:1 No - lnc-ABCB5-2:1 No - lnc-SP8-2:1 Yes chr3L:6240500-6245746 lnc-ABCB5-3:1 No - lnc-ABCB5-3:2 No - LINC01162:2 No - LINC01162:9 No - LINC01162:3 No - lnc-SP4-5:1 No - lnc-SP8-4:1 No - lnc-SP8-5:1 No - lnc-CDCA7L-3:1 No - lnc-CDCA7L-2:1 Yes chr3R:24223445-24226934 lnc-STEAP1B-6:1 Yes chr2R:6759715-6798941 lnc-STEAP1B-5:1 Yes chr2R:6759715-6798941 lnc-STEAP1B-4:1 Yes chr2R:6759715-6798941 lnc-RAPGEF5-1:1 No - lnc-IL6-3:9 No - lnc-IL6-12:1 No - lnc-RAPGEF5-3:1 No - lnc-IL6-11:1 No - lnc-IL6-3:10 No - lnc-IL6-3:11 No - lnc-IL6-3:12 No - lnc-TOMM7-6:1 No - lnc-IL6-5:1 No - lnc-TOMM7-4:1 No - lnc-IL6-7:1 No - lnc-FAM126A-2:2 No - lnc-FAM126A-2:4 No - lnc-FAM126A-2:3 No - lnc-IL6-8:2 No - lnc-IL6-9:1 No - SNHG26:39 No - lnc-FAM126A-3:2 No - lnc-IL6-10:1 No - lnc-KLHL7-2:1 Yes chr2R:17734419-17737269 lnc-FAM126A-5:3 Yes chr2R:17734419-17737269 lnc-FAM126A-5:2 Yes chr2R:17734419-17737269 lnc-FAM126A-5:1 Yes chr2R:17734419-17737269 lnc-NUPL2-4:1 No - lnc-TRA2A-6:2 Yes chrX:10787869-10824277 lnc-TRA2A-6:1 Yes chrX:10787869-10824277 lnc-TRA2A-6:3 Yes chrX:10787869-10824277 lnc-MALSU1-4:1 Yes chrX:10787869-10824277 lnc-CCDC126-5:1 No - lnc-CCDC126-4:1 No - lnc-IGF2BP3-2:3 Yes chr2R:14602004-14604337 lnc-IGF2BP3-2:4 Yes chr2R:14602004-14604337 lnc-IGF2BP3-2:1 Yes chr2R:14602004-14604337 lnc-IGF2BP3-2:2 Yes chr2R:14602004-14604337 lnc-IGF2BP3-3:1 Yes chr2R:14602004-14604337 lnc-IGF2BP3-3:3 Yes chr2R:14602004-14604337 lnc-IGF2BP3-3:2 Yes chr2R:14602004-14604337 lnc-CCDC126-1:1 No - lnc-FAM221A-4:1 No - lnc-FAM221A-3:1 No - lnc-TRA2A-7:1 No - lnc-GSDME-3:13 No - lnc-GSDME-9:1 No - lnc-GSDME-3:12 No - lnc-GSDME-3:9 No - lnc-GSDME-3:10 No - lnc-NPY-1:1 No - lnc-GSDME-6:1 Yes chr2L:20788662-20797042 lnc-GSDME-4:1 Yes chr2L:20788662-20797042 lnc-OSBPL3-3:1 No - lnc-OSBPL3-2:1 No - lnc-GSDME-1:1 No - lnc-GSDME-5:1 No - lnc-GSDME-10:1 No - lnc-GSDME-7:1 No - lnc-MPP6-1:1 No - lnc-NPVF-6:1 No - lnc-NPVF-7:1 No - lnc-NPVF-8:1 No - lnc-NPVF-9:1 No - lnc-NPVF-11:1 No - lnc-HNRNPA2B1-4:4 No - lnc-NFE2L3-5:1 No - lnc-HNRNPA2B1-10:1 No - lnc-HNRNPA2B1-2:7 No - lnc-HNRNPA2B1-2:6 No - lnc-HNRNPA2B1-2:5 No - lnc-HNRNPA2B1-14:1 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-HNRNPA2B1-7:5 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-HNRNPA2B1-5:1 Yes chr3R:26872129-26875742 lnc-SKAP2-6:2 Yes chr3R:26872129-26875742 lnc-NFE2L3-4:1 Yes chr2L:8209626-8211122 lnc-HNRNPA2B1-1:2 No - lnc-CBX3-2:1 No - lnc-SNX10-4:1 No - lnc-HNRNPA2B1-15:16 No - lnc-SNX10-2:8 No - lnc-SNX10-2:9 No - lnc-SKAP2-74:1 No - lnc-SNX10-5:1 No - lnc-SNX10-2:11 No - lnc-SNX10-2:12 No - lnc-SNX10-2:13 No - lnc-SNX10-2:14 No - lnc-SNX10-85:1 No - lnc-SNX10-85:2 No - lnc-SNX10-85:3 No - lnc-SNX10-86:1 No - lnc-SKAP2-3:1 No - lnc-SNX10-89:1 No - lnc-HOXA1-1:1 No - lnc-SKAP2-4:1 No - HOTAIRM1:4 No - HOTAIRM1:5 No - HOTAIRM1:9 No - lnc-HOXA3-1:8 Yes chr3R:6752864-6754194 HOXA-AS2:6 Yes chr3R:6752864-6754194 lnc-HOXA3-1:6 Yes chr3R:6752864-6754194 lnc-HOXA3-1:5 Yes chr3R:6752864-6754194 lnc-HOXA7-1:1 No - lnc-EVX1-17:1 No - lnc-HOXA11-2:2 No - HOXA11-AS:8 No - HOXA11-AS:9 No - HOXA11-AS:10 No - lnc-HOXA13-3:1 Yes chr3R:16927212-16972236 lnc-HOXA11-1:1 Yes chr3R:16927212-16972236 lnc-HOXA11-3:1 Yes chr3R:16927212-16972236 lnc-HOXA13-4:1 No - EVX1-AS:2 Yes chr2R:9979319-9980795 lnc-HOXA13-6:1 No - lnc-EVX1-16:1 No - lnc-EVX1-14:7 No - lnc-EVX1-18:1 No - lnc-EVX1-14:6 No - lnc-EVX1-14:13 No - lnc-EVX1-21:1 No - lnc-HIBADH-3:1 No - lnc-HIBADH-2:1 No - lnc-JAZF1-1:1 Yes chr2R:18775669-18776978 lnc-TAX1BP1-3:1 Yes chr3R:31220702-31231259 lnc-HIBADH-4:1 Yes chr3R:31220702-31231259 JAZF1-AS1:5 No - lnc-TAX1BP1-4:1 No - lnc-TAX1BP1-4:2 No - lnc-TRIL-5:1 No - lnc-TRIL-3:1 No - lnc-CHN2-5:1 No - lnc-CREB5-3:1 No - lnc-CREB5-2:4 Yes chr3R:19862517-19864393 lnc-CREB5-2:5 Yes chr3R:19862517-19864393 lnc-CHN2-4:1 No - lnc-CHN2-4:2 No - lnc-CHN2-4:3 No - lnc-CHN2-4:4 No - lnc-TRIL-20:1 No - lnc-PRR15-6:1 Yes chrX:5616572-5618806 lnc-CPVL-4:4 Yes chrX:5616572-5618806 lnc-PRR15-2:1 No - lnc-SCRN1-1:6 No - lnc-SCRN1-1:5 No - lnc-WIPF3-2:1 No - lnc-PRR15-4:1 No - lnc-WIPF3-1:1 No - lnc-WIPF3-1:2 No - lnc-SCRN1-1:3 No - lnc-SCRN1-1:4 No - lnc-WIPF3-1:3 No - lnc-WIPF3-1:4 No - lnc-MTURN-3:3 Yes chr3L:8282528-8289870 lnc-MTURN-3:4 Yes chr3L:8282528-8289870 lnc-FKBP14-4:1 No - lnc-MTURN-2:2 No - lnc-NOD1-4:1 No - lnc-NOD1-18:2 No - lnc-NOD1-2:1 No - LINC01176:11 No - lnc-GGCT-4:1 No - lnc-GARS-8:1 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-GGCT-1:41 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-GGCT-1:43 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-GGCT-1:46 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-GGCT-1:51 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-GGCT-1:28 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-GGCT-1:38 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-GGCT-1:31 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-GGCT-1:44 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-GGCT-1:49 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-GGCT-1:35 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-GGCT-1:45 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-GARS-7:1 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-GGCT-1:34 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-GGCT-1:42 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-GGCT-1:48 No - lnc-GGCT-1:37 No - lnc-GGCT-1:40 No - lnc-GGCT-1:33 No - lnc-GGCT-1:36 No - lnc-GGCT-1:32 No - lnc-GGCT-1:27 No - lnc-GGCT-1:29 No - lnc-GGCT-1:30 No - lnc-CRHR2-3:1 No - lnc-CRHR2-5:2 No - lnc-CRHR2-5:3 No - lnc-CRHR2-5:1 No - lnc-CRHR2-2:1 No - lnc-GHRHR-3:1 No - lnc-NEUROD6-5:1 No - lnc-ADCYAP1R1-1:1 No - lnc-NEUROD6-4:1 No - lnc-NEUROD6-7:2 Yes chr2L:11814156-11928572 lnc-NEUROD6-7:3 Yes chr2L:11814156-11928572 lnc-NEUROD6-7:1 Yes chr2L:11814156-11928572 lnc-NEUROD6-8:1 Yes chr2L:11814156-11928572 lnc-NEUROD6-9:1 Yes chr2L:11814156-11928572 lnc-PPP1R17-2:1 Yes chr2L:11814156-11928572 lnc-LSM5-3:1 Yes chr2L:11814156-11928572 lnc-PDE1C-2:3 Yes chr3L:6075536-6076258 lnc-PDE1C-2:2 Yes chr3L:6075536-6076258 lnc-LSM5-2:3 Yes chrX:13605681-13609529 lnc-LSM5-2:4 Yes chrX:13605681-13609529 lnc-LSM5-2:1 No - lnc-LSM5-2:2 No - lnc-AVL9-6:1 No - lnc-AVL9-6:2 No - lnc-AVL9-6:3 No - LINC00997:1 No - LINC00997:3 No - lnc-FKBP9-4:1 No - lnc-FKBP9-4:2 No - lnc-NT5C3A-2:1 No - lnc-KBTBD2-2:2 No - lnc-KBTBD2-2:10 No - lnc-KBTBD2-2:3 No - lnc-KBTBD2-2:6 No - lnc-KBTBD2-2:8 No - lnc-KBTBD2-2:5 No - lnc-KBTBD2-2:7 No - lnc-KBTBD2-2:9 No - lnc-FKBP9-2:1 No - lnc-RP9-7:1 Yes chr2R:24195498-24197027 lnc-RP9-6:1 Yes chr2R:24195498-24197027 lnc-RP9-5:1 Yes chr2R:24195498-24197027 lnc-RP9-4:1 Yes chr2R:24195498-24197027 lnc-NT5C3A-1:1 No - lnc-RP9-8:1 Yes chr2R:21341972-21345608 lnc-FKBP9-8:1 Yes chr2R:21341972-21345608 lnc-BBS9-1:1 No - lnc-BMPER-3:1 No - lnc-BMPER-5:1 No - lnc-BMPER-2:2 No - lnc-DPY19L1-3:1 No - NPSR1-AS1:15 Yes chr3R:25923499-25956270 NPSR1-AS1:16 Yes chr3R:25923499-25956270 lnc-NPSR1-1:1 No - NPSR1-AS1:4 Yes chr3R:25923499-25956270 lnc-BMPER-6:1 Yes chr3R:25923499-25956270 lnc-BMPER-8:1 Yes chr3R:25923499-25956270 lnc-TBX20-4:3 No - lnc-TBX20-4:2 No - lnc-TBX20-4:1 No - lnc-DPY19L1-1:1 No - lnc-NPSR1-4:1 No - lnc-NPSR1-3:1 No - lnc-TBX20-3:2 No - lnc-TBX20-3:5 No - lnc-TBX20-3:4 No - lnc-TBX20-3:3 No - lnc-SEPT7-5:1 No - lnc-SEPT7-5:2 No - lnc-SEPT7-3:2 Yes chr2L:7796314-7800058 lnc-SEPT7-1:9 No - lnc-SEPT7-1:10 No - lnc-SEPT7-1:13 No - lnc-SEPT7-1:14 No - lnc-HERPUD2-7:1 No - lnc-HERPUD2-8:1 No - SEPT7-AS1:2 No - SEPT7-AS1:1 Yes chr2R:8237271-8240297 lnc-SEPT7-2:1 No - lnc-SEPT7-2:2 No - lnc-EEPD1-49:2 No - lnc-KIAA0895-5:1 No - lnc-EEPD1-2:1 No - lnc-KIAA0895-3:1 No - lnc-AOAH-2:3 No - lnc-AOAH-2:1 No - lnc-AOAH-2:2 No - lnc-ANLN-6:1 No - lnc-KIAA0895-4:2 No - lnc-KIAA0895-4:1 No - lnc-ELMO1-1:1 No - lnc-ANLN-3:2 No - lnc-SFRP4-2:1 Yes chr2L:12097838-12100839 lnc-SFRP4-1:1 Yes chr2L:12097838-12100839 lnc-GPR141-1:2 No - lnc-GPR141-1:3 No - lnc-GPR141-2:1 No - lnc-GPR141-2:2 No - lnc-NME8-1:1 No - lnc-ELMO1-2:1 No - lnc-AMPH-10:8 No - lnc-AMPH-10:6 No - lnc-AMPH-10:5 No - lnc-AMPH-10:4 No - lnc-AMPH-10:3 No - lnc-AMPH-10:2 No - lnc-AMPH-10:1 No - lnc-AMPH-8:1 No - lnc-AMPH-2:2 No - lnc-STARD3NL-2:1 No - lnc-AMPH-7:1 No - lnc-AMPH-5:1 No - TRG-AS1:2 No - TRG-AS1:3 No - lnc-AMPH-4:1 No - lnc-AMPH-3:1 No - lnc-STARD3NL-3:1 No - lnc-STARD3NL-4:1 No - lnc-STARD3NL-5:1 No - lnc-STARD3NL-6:1 No - lnc-STARD3NL-7:1 No - lnc-VPS41-6:1 Yes chr2R:12593604-12612068 lnc-VPS41-5:1 Yes chr2R:12593604-12612068 lnc-POU6F2-3:1 No - lnc-POU6F2-2:1 No - lnc-AMPH-11:1 Yes chr2L:22924795-22943135 lnc-AMPH-12:1 Yes chr2L:22924795-22943135 lnc-AMPH-13:1 Yes chr2L:22924795-22943135 POU6F2-AS2:1 Yes chr2R:8327490-8396280 lnc-YAE1D1-4:1 Yes chr2R:8327490-8396280 POU6F2-AS1:1 Yes chr2R:8327490-8396280 lnc-POU6F2-1:1 Yes chr2R:8327490-8396280 lnc-MPLKIP-7:3 No - lnc-MPLKIP-14:1 No - lnc-RALA-3:1 No - lnc-RALA-2:1 No - LINC00265:3 No - LINC00265:4 No - LINC00265:5 No - lnc-MPLKIP-13:1 No - LINC00265:8 No - lnc-MPLKIP-12:1 No - LINC00265:14 No - lnc-MPLKIP-11:1 No - LINC00265:17 No - lnc-MPLKIP-10:1 No - lnc-CDK13-6:1 No - lnc-MPLKIP-9:1 No - lnc-CDK13-5:1 No - lnc-MPLKIP-1:2 Yes chr3L:21516306-21522684 lnc-SUGCT-5:1 Yes chr3L:21516306-21522684 lnc-CDK13-3:1 No - lnc-CDK13-4:1 Yes chr3R:20562486-20564067 lnc-MPLKIP-8:1 Yes chr3R:20562486-20564067 lnc-GLI3-4:1 No - INHBA-AS1:2 No - INHBA-AS1:14 No - lnc-GLI3-3:1 No - lnc-INHBA-3:1 Yes chr4:47710-57041 lnc-MRPL32-7:1 Yes chr4:47710-57041 lnc-GLI3-2:1 Yes chr4:47710-57041 lnc-GLI3-1:2 No - lnc-MRPL32-4:1 No - lnc-C7orf25-1:1 No - lnc-PSMA2-1:5 No - lnc-PSMA2-1:3 No - lnc-MRPL32-5:2 Yes chrX:9608946-9623243 lnc-MRPL32-5:3 Yes chrX:9608946-9623243 lnc-COA1-4:2 Yes chrX:9608946-9623243 lnc-COA1-4:1 Yes chrX:9608946-9623243 lnc-URGCP-MRPS24-5:2 No - lnc-URGCP-MRPS24-5:4 No - lnc-URGCP-MRPS24-2:1 No - lnc-URGCP-MRPS24-4:1 No - lnc-URGCP-MRPS24-5:3 No - lnc-URGCP-MRPS24-3:1 No - lnc-URGCP-MRPS24-5:1 No - lnc-COA1-3:1 No - lnc-COA1-3:2 No - lnc-STK17A-4:1 No - lnc-MRPS24-1:4 No - lnc-MRPS24-1:3 No - lnc-URGCP-1:4 No - lnc-URGCP-1:3 No - lnc-URGCP-2:6 No - lnc-URGCP-2:7 No - lnc-URGCP-2:5 No - lnc-URGCP-2:4 No - lnc-PGAM2-3:2 No - lnc-PGAM2-3:3 No - LINC00957:1 No - LINC00957:2 No - LINC00957:3 No - LINC00957:4 No - LINC00957:6 No - LINC00957:8 No - lnc-PGAM2-2:3 No - lnc-PGAM2-2:2 No - lnc-MYL7-3:1 Yes chr3L:1775633-1777019 lnc-MYL7-2:1 Yes chr3L:1775633-1777019 lnc-MYL7-1:1 Yes chr3L:1775633-1777019 lnc-GCK-2:1 Yes chr3R:30171438-30174551 lnc-GCK-1:1 Yes chrX:9585675-9589813 lnc-YKT6-1:1 Yes chrX:9585675-9589813 lnc-GCK-3:3 Yes chr4:1035288-1053703 lnc-GCK-3:1 Yes chr4:1035288-1053703 lnc-GCK-3:2 Yes chr4:1035288-1053703 lnc-YKT6-2:1 Yes chr4:1035288-1053703 lnc-NUDCD3-1:1 No - lnc-CAMK2B-1:1 Yes chr3R:17683740-17684915 lnc-NPC1L1-3:1 Yes chr3R:17683740-17684915 lnc-NPC1L1-1:1 No - lnc-TMED4-2:1 Yes chrX:21385518-21387946 lnc-TMED4-1:1 Yes chrX:21385518-21387946 lnc-OGDH-5:1 Yes chrX:21385518-21387946 lnc-DDX56-1:1 Yes chr3R:9684469-9685476 lnc-OGDH-2:1 No - lnc-OGDH-1:1 No - lnc-ZMIZ2-1:1 No - lnc-H2AFV-3:1 Yes chr4:558016-567257 lnc-CCM2-4:1 No - SNHG15:1 No - lnc-CCM2-2:1 No - SNHG15:7 No - lnc-CCM2-1:2 No - SNHG15:20 No - SNHG15:22 No - SNHG15:19 No - lnc-TBRG4-1:1 Yes chr2R:12759693-12760999 lnc-NACAD-1:1 Yes chr3R:22408566-22410915 lnc-TBRG4-3:1 No - lnc-IGFBP3-4:9 No - lnc-IGFBP3-4:1 No - lnc-IGFBP3-4:8 No - lnc-IGFBP3-4:10 No - lnc-IGFBP3-4:7 No - lnc-IGFBP3-4:6 No - lnc-IGFBP3-4:3 No - lnc-IGFBP3-4:5 No - lnc-IGFBP3-4:4 No - lnc-IGFBP3-4:2 No - lnc-ADCY1-3:1 No - lnc-ADCY1-3:2 No - lnc-IGFBP1-10:1 No - lnc-IGFBP3-2:1 No - lnc-IGFBP1-8:1 No - lnc-IGFBP1-7:1 No - lnc-TBRG4-6:1 No - lnc-IGFBP1-1:3 No - lnc-IGFBP1-1:4 No - lnc-IGFBP1-2:3 No - lnc-IGFBP3-1:1 No - lnc-IGFBP3-3:1 No - lnc-IGFBP1-12:1 No - lnc-IGFBP1-4:2 No - lnc-IGFBP1-13:1 No - lnc-TNS3-2:7 No - lnc-TNS3-2:8 No - lnc-IGFBP1-14:1 No - lnc-C7orf57-6:9 No - lnc-TNS3-1:3 No - lnc-HUS1-3:1 Yes chr3R:9528238-9533011 lnc-HUS1-2:1 Yes chr3R:9528238-9533011 lnc-SUN3-4:1 Yes chr3R:4808336-4812096 lnc-PKD1L1-1:1 Yes chr3R:4808336-4812096 lnc-C7orf57-1:1 Yes chr3R:4808336-4812096 lnc-SUN3-3:2 Yes chr2R:6811019-6818199 lnc-SUN3-3:1 Yes chr2R:6811019-6818199 lnc-SUN3-5:1 No - lnc-ABCA13-1:2 No - lnc-ZPBP-8:1 No - lnc-VWC2-4:1 No - lnc-VWC2-3:1 No - lnc-ZPBP-6:1 No - lnc-ZPBP-5:1 No - lnc-ZPBP-5:2 No - lnc-SPATA48-1:1 No - lnc-IKZF1-6:2 No - lnc-GRB10-2:2 No - lnc-IKZF1-16:1 No - lnc-DDC-4:1 Yes chrX:19830215-19852059 lnc-DDC-4:2 Yes chrX:19830215-19852059 lnc-IKZF1-8:1 Yes chrX:19830215-19852059 lnc-DDC-2:1 Yes chrX:19830215-19852059 lnc-DDC-3:1 Yes chrX:19830215-19852059 lnc-DDC-3:2 Yes chrX:19830215-19852059 lnc-DDC-3:6 Yes chrX:19830215-19852059 lnc-DDC-3:7 Yes chrX:19830215-19852059 lnc-DDC-3:3 Yes chrX:19830215-19852059 lnc-DDC-3:5 Yes chrX:19830215-19852059 lnc-DDC-3:4 Yes chrX:19830215-19852059 lnc-IKZF1-9:1 Yes chrX:19830215-19852059 lnc-IKZF1-10:1 No - lnc-GRB10-3:1 No - lnc-IKZF1-11:1 No - lnc-IKZF1-12:1 No - lnc-IKZF1-13:1 No - lnc-COBL-3:1 No - lnc-COBL-4:1 No - lnc-COBL-5:1 No - lnc-IKZF1-3:2 No - lnc-IKZF1-14:1 No - lnc-POM121L12-4:2 No - lnc-POM121L12-8:1 No - lnc-POM121L12-2:2 No - lnc-POM121L12-1:3 No - lnc-COBL-6:1 No - lnc-POM121L12-5:1 No - lnc-POM121L12-6:1 No - lnc-SEC61G-7:7 No - lnc-SEC61G-7:6 No - lnc-SEC61G-7:10 No - lnc-SEC61G-7:9 No - lnc-SEC61G-7:5 No - lnc-SEC61G-7:4 No - lnc-SEC61G-7:8 No - lnc-SEC61G-7:12 No - lnc-SEC61G-7:11 No - lnc-SEC61G-12:1 No - lnc-POM121L12-9:1 No - lnc-POM121L12-10:1 No - lnc-SEC61G-14:1 No - LINC01445:1 No - LINC01445:6 No - lnc-SEC61G-2:2 No - lnc-VOPP1-5:3 Yes chr2R:20512697-20513169 lnc-VOPP1-5:1 Yes chr2R:20512697-20513169 lnc-VOPP1-5:2 Yes chr2R:20512697-20513169 lnc-EGFR-3:1 No - lnc-EGFR-1:1 No - lnc-SEC61G-10:1 No - EGFR-AS1:1 Yes chr2R:21522420-21559977 lnc-EGFR-7:1 No - lnc-EGFR-6:1 No - lnc-VOPP1-6:1 No - lnc-LANCL2-5:1 No - lnc-SEPT14-4:1 No - lnc-VOPP1-3:3 No - lnc-VOPP1-3:2 No - lnc-VOPP1-2:6 No - lnc-SEPT14-5:1 No - lnc-ZNF713-5:1 No - lnc-ZNF713-3:1 No - lnc-ZNF713-3:2 No - lnc-ZNF713-3:3 No - lnc-SEPT14-2:1 No - lnc-ZNF713-3:4 No - lnc-ZNF713-3:5 No - lnc-ZNF713-3:6 No - lnc-PSPH-2:1 Yes chr2R:7960133-7961921 lnc-ZNF713-2:1 Yes chr2R:7960133-7961921 lnc-PSPH-1:1 Yes chr2R:7960133-7961921 lnc-SEPT14-1:1 No - lnc-ZNF713-1:1 No - lnc-NIPSNAP2-2:1 Yes chr2R:24173665-24174441 lnc-NIPSNAP2-1:1 Yes chr2R:24173665-24174441 lnc-PHKG1-2:1 Yes chr3L:9423253-9424781 lnc-PHKG1-1:2 Yes chrX:11695137-11704394 lnc-NUPR2-6:1 Yes chrX:17149001-17150647 lnc-NUPR2-6:2 Yes chrX:17149001-17150647 lnc-SUMF2-8:1 No - lnc-SUMF2-9:1 No - lnc-NUPR2-7:1 No - lnc-SUMF2-10:1 No - lnc-SUMF2-11:1 No - lnc-SUMF2-12:1 No - lnc-SUMF2-13:1 No - lnc-NUPR2-8:3 No - lnc-NUPR2-3:3 No - lnc-SUMF2-2:2 No - lnc-SUMF2-2:3 No - lnc-SUMF2-18:2 No - lnc-NUPR2-9:1 No - lnc-NUPR2-10:1 No - lnc-SUMF2-14:1 No - lnc-SUMF2-16:1 No - lnc-SUMF2-15:1 No - lnc-NUPR2-5:3 No - lnc-NUPR2-5:5 No - lnc-ZNF479-7:1 No - lnc-ZNF479-6:1 No - lnc-SUMF2-5:9 No - lnc-SUMF2-5:10 No - lnc-SUMF2-5:11 No - lnc-ZNF479-5:1 No - lnc-ZNF479-5:2 No - lnc-ZNF716-25:1 No - lnc-ZNF479-4:1 No - lnc-ZNF716-22:1 No - lnc-ZNF716-22:2 No - lnc-ZNF716-22:3 No - lnc-ZNF716-20:1 No - lnc-ZNF716-19:1 No - lnc-ZNF716-18:1 No - lnc-ZNF716-17:1 No - lnc-ZNF716-16:1 No - lnc-ZNF716-15:1 No - lnc-ZNF716-14:1 No - lnc-ZNF716-13:1 No - lnc-ZNF716-12:1 No - lnc-ZNF716-11:1 No - lnc-ZNF716-10:1 No - lnc-ZNF479-1:4 No - lnc-ZNF479-1:3 No - lnc-ZNF716-10:2 No - lnc-ZNF716-10:4 No - lnc-ZNF716-52:4 No - lnc-ZNF716-2:1 No - lnc-ZNF716-1:1 No - lnc-ZNF716-4:1 No - lnc-ZNF716-4:2 No - lnc-ZNF716-4:3 No - lnc-ZNF716-4:4 No - lnc-ZNF479-8:2 No - lnc-ZNF479-8:3 No - lnc-ZNF716-5:1 No - lnc-ZNF479-8:1 No - lnc-ZNF716-6:1 No - lnc-ZNF479-10:1 No - lnc-ZNF479-9:1 No - lnc-ZNF716-7:1 No - lnc-ZNF716-8:1 No - lnc-ZNF716-9:1 No - lnc-ZNF479-11:1 No - lnc-ZNF716-21:1 No - lnc-ZNF479-12:1 No - lnc-ZNF479-13:1 No - lnc-ZNF479-14:1 No - lnc-ZNF716-23:1 No - lnc-ZNF716-24:1 No - lnc-ZNF716-24:2 No - lnc-ZNF716-24:3 No - lnc-ZNF479-15:1 No - lnc-ZNF479-16:2 No - lnc-ZNF479-16:1 No - lnc-ZNF716-24:4 No - lnc-ZNF479-17:1 No - lnc-ZNF680-45:1 No - lnc-ZNF727-12:2 No - lnc-ZNF727-11:2 No - lnc-ZNF680-44:1 No - lnc-ZNF680-43:1 No - lnc-ZNF727-21:1 No - lnc-ZNF680-9:2 No - lnc-ZNF727-20:1 No - lnc-ZNF680-42:1 No - lnc-ZNF680-42:2 No - lnc-ZNF727-19:1 No - lnc-ZNF727-18:4 No - lnc-ZNF727-17:1 No - lnc-ZNF727-17:2 No - lnc-ZNF727-17:3 No - lnc-ZNF680-41:1 No - lnc-ZNF727-17:5 No - lnc-ZNF727-17:6 No - lnc-ZNF680-40:1 No - lnc-ZNF680-39:1 No - lnc-ZNF680-38:1 No - lnc-ZNF680-37:1 No - lnc-ZNF727-15:1 No - lnc-ZNF680-36:1 No - lnc-ZNF680-35:1 No - lnc-ZNF727-10:1 No - lnc-ZNF680-34:1 No - lnc-ZNF680-4:6 No - lnc-ZNF680-4:8 No - lnc-ZNF680-4:3 No - lnc-ZNF680-4:7 No - lnc-ZNF680-4:5 No - lnc-ZNF680-4:4 No - lnc-ZNF680-4:2 No - lnc-ZNF727-6:2 No - lnc-ZNF680-33:1 No - lnc-ZNF680-32:4 No - lnc-ZNF680-32:3 No - lnc-ZNF680-32:2 No - lnc-ZNF680-32:1 No - lnc-ZNF727-9:1 No - lnc-ZNF680-31:1 No - lnc-ZNF680-30:1 No - lnc-ZNF680-29:1 No - lnc-ZNF680-28:1 No - lnc-ZNF680-27:1 No - LINC01005:4 No - LINC01005:1 No - lnc-ZNF727-8:1 No - lnc-ZNF680-26:2 No - lnc-ZNF680-26:1 No - lnc-ZNF680-25:1 No - lnc-ZNF680-24:1 No - lnc-ZNF680-23:1 No - lnc-ZNF680-22:1 No - lnc-ZNF680-21:1 No - lnc-ZNF680-20:1 No - lnc-ZNF680-19:1 No - lnc-ZNF680-18:1 No - lnc-ZNF680-17:1 No - lnc-ZNF680-16:1 No - lnc-ZNF680-15:2 No - lnc-ZNF680-15:1 No - lnc-ZNF736-3:1 No - lnc-ZNF736-3:2 No - lnc-ZNF736-3:3 No - lnc-ZNF736-3:4 No - lnc-ZNF736-4:1 No - lnc-ZNF736-4:2 No - lnc-ZNF680-13:1 No - lnc-ZNF736-6:1 No - lnc-ZNF117-5:2 No - lnc-ZNF117-5:3 No - lnc-ZNF117-5:1 No - lnc-ZNF107-6:1 No - lnc-ZNF680-12:1 No - lnc-ZNF107-5:1 No - lnc-ZNF107-2:2 No - lnc-ZNF107-4:1 No - lnc-ZNF107-4:2 No - lnc-ZNF107-3:1 No - lnc-ZNF107-2:3 No - lnc-ZNF107-2:4 No - lnc-ZNF107-2:5 No - lnc-ZNF107-2:6 No - lnc-ZNF107-1:3 No - lnc-ZNF680-14:1 No - lnc-ZNF138-3:3 No - lnc-ZNF117-4:1 No - lnc-ZNF138-2:3 No - lnc-ZNF138-2:4 No - lnc-ZNF117-3:2 No - lnc-ZNF117-3:1 No - lnc-ZNF273-1:1 No - lnc-ZNF273-1:2 No - lnc-ZNF273-1:6 No - lnc-ZNF273-1:7 No - lnc-ZNF273-1:8 No - lnc-ZNF273-1:9 No - lnc-ZNF273-1:10 No - lnc-ZNF273-2:1 No - lnc-ZNF117-2:1 No - lnc-ZNF273-3:1 No - lnc-ERV3-1-2:4 No - lnc-ERV3-1-2:2 No - lnc-ERV3-1-2:1 No - lnc-ERV3-1-2:3 No - lnc-ERV3-1-3:1 No - lnc-ERV3-1-1:3 No - lnc-ZNF273-4:2 No - lnc-ERV3-1-1:2 No - lnc-ZNF273-5:1 No - lnc-ZNF273-6:1 No - lnc-ZNF273-7:1 No - lnc-ZNF92-5:1 No - lnc-ERV3-1-4:1 No - lnc-ZNF92-3:1 No - lnc-ERV3-1-5:1 No - lnc-ZNF92-2:1 No - lnc-GUSB-13:1 No - lnc-GUSB-9:1 No - lnc-ERV3-1-10:8 No - lnc-ERV3-1-10:11 No - lnc-ERV3-1-10:13 No - lnc-ERV3-1-10:10 No - lnc-ERV3-1-10:7 No - lnc-VKORC1L1-7:2 No - lnc-VKORC1L1-7:3 No - lnc-VKORC1L1-7:4 No - lnc-VKORC1L1-7:5 No - lnc-VKORC1L1-7:7 No - lnc-VKORC1L1-7:8 No - lnc-VKORC1L1-7:9 No - lnc-ERV3-1-10:1 No - lnc-VKORC1L1-7:11 No - lnc-ERV3-1-10:5 No - lnc-VKORC1L1-5:8 No - lnc-VKORC1L1-5:1 No - lnc-VKORC1L1-5:2 No - lnc-GUSB-8:1 No - lnc-VKORC1L1-4:1 No - lnc-VKORC1L1-3:1 No - lnc-ERV3-1-7:1 Yes chr2R:19122231-19129300 lnc-ERV3-1-8:1 Yes chr2R:19122231-19129300 lnc-GUSB-7:2 No - lnc-ASL-2:1 No - lnc-GUSB-7:1 No - lnc-GUSB-3:2 No - lnc-TPST1-2:1 No - LINC00174:4 Yes chrX:13563823-13593224 LINC00174:2 Yes chrX:13563823-13593224 LINC00174:3 Yes chrX:13563823-13593224 LINC00174:23 Yes chrX:13563823-13593224 LINC00174:22 Yes chrX:13563823-13593224 LINC00174:19 No - lnc-GUSB-11:1 No - lnc-TPST1-7:1 No - LINC00174:20 No - lnc-TPST1-4:1 No - LINC00174:17 No - LINC00174:16 No - LINC00174:9 No - LINC00174:15 No - lnc-TPST1-1:7 No - lnc-TPST1-1:8 No - lnc-TPST1-1:13 No - lnc-TPST1-1:14 No - lnc-SBDS-21:1 No - lnc-KCTD7-3:1 No - lnc-SBDS-4:10 No - lnc-SBDS-4:6 No - lnc-SBDS-4:12 No - lnc-SBDS-4:5 No - lnc-SBDS-4:11 No - lnc-SBDS-4:4 No - lnc-SBDS-4:3 No - lnc-SBDS-4:8 No - lnc-SBDS-20:1 No - lnc-SBDS-4:2 No - lnc-SBDS-19:1 No - lnc-SBDS-19:2 No - lnc-KCTD7-2:11 Yes chr3L:1295913-1298497 lnc-KCTD7-2:12 Yes chr3L:1295913-1298497 lnc-KCTD7-2:17 Yes chr3L:1295913-1298497 lnc-RABGEF1-3:2 No - lnc-RABGEF1-3:3 No - lnc-KCTD7-1:3 No - lnc-KCTD7-1:4 No - lnc-SBDS-14:1 No - lnc-RABGEF1-1:4 No - lnc-SBDS-27:1 No - lnc-TMEM248-4:1 No - lnc-TMEM248-4:2 No - lnc-TMEM248-4:3 No - lnc-TMEM248-4:4 No - lnc-TMEM248-4:5 No - lnc-TMEM248-4:6 No - lnc-TMEM248-4:7 No - lnc-TMEM248-4:8 No - lnc-TMEM248-4:9 No - lnc-TMEM248-4:11 No - lnc-TMEM248-3:1 No - lnc-SBDS-1:5 No - lnc-TYW1-2:1 No - lnc-SBDS-12:1 No - lnc-TYW1-3:1 No - lnc-TYW1-4:1 No - lnc-TYW1-5:1 No - lnc-TYW1-6:1 No - lnc-TYW1-8:1 No - lnc-SBDS-16:1 No - lnc-TYW1-9:1 No - lnc-SBDS-17:5 No - lnc-SBDS-17:4 No - lnc-TYW1-7:7 No - lnc-TYW1-7:8 No - lnc-SBDS-18:1 No - lnc-TYW1-7:9 No - LINC01372:2 No - LINC01372:8 No - lnc-TYW1-10:1 No - lnc-TYW1-11:1 No - lnc-SBDS-22:1 No - lnc-TYW1-12:2 No - lnc-TYW1-12:3 No - lnc-TYW1-14:1 No - lnc-TYW1-13:1 No - lnc-TYW1-15:1 No - lnc-SBDS-23:1 No - lnc-AUTS2-5:1 No - lnc-SBDS-25:1 No - lnc-SBDS-26:1 No - lnc-CALN1-7:1 No - lnc-CALN1-1:9 No - lnc-CALN1-1:8 No - lnc-GALNT17-4:1 No - lnc-CALN1-4:1 No - lnc-AUTS2-3:1 No - lnc-CALN1-3:1 Yes chr3R:28748384-28751661 lnc-CALN1-2:1 No - lnc-GALNT17-1:1 No - lnc-POM121-5:1 No - lnc-TYW1B-6:1 No - lnc-POM121-4:1 No - lnc-TRIM74-5:1 No - lnc-POM121-2:5 No - lnc-TYW1B-4:1 No - lnc-TRIM74-1:3 No - lnc-TRIM74-1:6 No - lnc-TRIM74-1:2 No - lnc-TRIM74-1:4 No - lnc-POM121-1:2 No - lnc-POM121-3:3 No - lnc-POM121-3:4 No - lnc-NSUN5-3:1 No - lnc-FKBP6-4:1 No - lnc-NSUN5-2:1 No - lnc-FKBP6-3:1 Yes chr3R:19160099-19162300 lnc-NSUN5-1:1 No - lnc-FKBP6-1:1 No - lnc-FZD9-1:1 No - lnc-BCL7B-3:1 No - lnc-FZD9-3:1 No - lnc-FZD9-4:1 No - lnc-BCL7B-1:5 Yes chrX:9356634-9358594 lnc-BCL7B-1:4 Yes chrX:9356634-9358594 lnc-BCL7B-1:3 Yes chrX:9356634-9358594 lnc-BCL7B-1:2 Yes chrX:9356634-9358594 lnc-BCL7B-2:1 No - lnc-MLXIPL-2:1 No - lnc-VPS37D-4:1 No - lnc-MLXIPL-1:1 No - lnc-TBL2-1:1 Yes chr2L:21286078-21310050 lnc-VPS37D-2:1 No - lnc-VPS37D-1:1 No - lnc-BUD23-4:1 Yes chr3R:8031130-8033009 lnc-DNAJC30-1:2 No - lnc-DNAJC30-1:1 No - lnc-ABHD11-1:1 No - lnc-STX1A-1:3 Yes chrX:7286358-7288117 lnc-STX1A-1:4 Yes chrX:7286358-7288117 lnc-BUD23-2:1 No - lnc-BUD23-3:1 No - lnc-BUD23-5:1 No - lnc-CLDN4-1:1 No - lnc-CLDN4-1:2 No - lnc-CLDN3-1:1 No - lnc-METTL27-1:1 No - lnc-RFC2-5:2 No - lnc-RFC2-5:1 No - lnc-RFC2-4:1 Yes chr3R:30726087-30728052 lnc-EIF4H-1:1 No - lnc-LAT2-2:1 Yes chr3L:4134860-4136038 lnc-LAT2-1:3 No - lnc-RFC2-3:1 No - lnc-GTF2IRD2-2:5 No - lnc-GTF2IRD2-2:6 No - lnc-GTF2I-1:4 No - lnc-GTF2IRD2-1:13 No - lnc-GTF2IRD2-1:8 No - lnc-GTF2IRD2-1:14 No - lnc-GTF2IRD2-3:1 No - lnc-RCC1L-5:1 No - lnc-RCC1L-5:2 No - lnc-CASTOR2-3:1 No - lnc-CASTOR2-2:1 No - lnc-GTF2IRD2B-3:1 No - lnc-CASTOR2-7:1 No - lnc-RCC1L-4:1 No - lnc-GTF2IRD2B-9:1 No - lnc-POM121C-6:1 No - lnc-POM121C-1:3 No - lnc-TRIM73-5:1 No - lnc-TRIM73-2:1 No - lnc-TRIM73-1:3 No - lnc-HIP1-4:1 No - lnc-HIP1-3:1 No - lnc-HIP1-2:1 No - lnc-HIP1-1:7 No - lnc-HIP1-1:6 No - lnc-HIP1-1:2 No - lnc-HIP1-1:1 No - lnc-HIP1-1:5 No - lnc-HIP1-1:4 No - lnc-HIP1-1:8 No - lnc-POM121C-4:1 Yes chr3L:12768432-12773573 lnc-CCL26-1:1 No - lnc-RHBDD2-2:1 Yes chr2L:6338836-6346280 lnc-STYXL1-2:4 Yes chrX:2782906-2790567 lnc-STYXL1-2:2 Yes chrX:2782906-2790567 lnc-STYXL1-2:5 Yes chrX:2782906-2790567 lnc-STYXL1-2:3 Yes chrX:2782906-2790567 lnc-STYXL1-2:1 Yes chrX:2782906-2790567 lnc-STYXL1-3:1 No - lnc-STYXL1-4:1 No - lnc-MDH2-2:1 No - lnc-STYXL1-4:3 No - lnc-STYXL1-4:2 No - lnc-STYXL1-5:1 No - lnc-STYXL1-5:3 No - lnc-STYXL1-5:2 No - lnc-SRRM3-4:1 No - lnc-SRRM3-3:1 No - lnc-SRRM3-4:2 No - lnc-SRRM3-4:3 No - lnc-SRRM3-2:1 No - lnc-SRRM3-1:1 No - lnc-HSPB1-1:1 No - lnc-SSC4D-2:1 No - lnc-ZP3-4:1 Yes chrX:6533999-6538575 lnc-UPK3B-1:11 No - lnc-UPK3B-3:2 No - lnc-POMZP3-2:1 No - lnc-UPK3B-5:1 No - lnc-UPK3B-5:2 No - lnc-UPK3B-5:3 No - lnc-UPK3B-5:4 No - lnc-UPK3B-5:5 No - lnc-POMZP3-1:1 No - lnc-FGL2-2:3 No - lnc-FGL2-2:2 No - lnc-CCDC146-1:3 No - lnc-CCDC146-5:1 No - lnc-CCDC146-1:6 No - lnc-CCDC146-1:7 No - lnc-CCDC146-1:8 No - lnc-CCDC146-1:9 No - lnc-CCDC146-1:10 No - lnc-FGL2-7:1 No - lnc-FGL2-5:1 No - lnc-FGL2-4:2 No - lnc-CCDC146-2:1 No - lnc-FGL2-4:1 No - lnc-FGL2-3:1 Yes chrY:3561745-3618339 lnc-FGL2-1:2 Yes chrY:3561745-3618339 lnc-FGL2-6:1 No - lnc-FGL2-6:3 No - lnc-FGL2-6:2 No - lnc-FGL2-8:2 Yes chr2L:19186043-19189938 lnc-PTPN12-2:1 No - lnc-GSAP-3:1 No - lnc-GSAP-2:1 No - lnc-GSAP-5:3 No - lnc-PTPN12-1:1 No - APTR:13 No - APTR:2 Yes chr2L:18833710-18839679 APTR:4 No - lnc-RSBN1L-2:1 No - APTR:3 Yes chr2L:18833710-18839679 APTR:12 No - APTR:6 No - lnc-TMEM60-3:1 Yes chr2R:21129463-21142261 lnc-TMEM60-4:1 Yes chr2R:21129463-21142261 lnc-PHTF2-4:1 Yes chr2R:21129463-21142261 lnc-PHTF2-4:2 Yes chr2R:21129463-21142261 lnc-PHTF2-5:1 Yes chr2R:21129463-21142261 lnc-GNAI1-8:1 Yes chr2R:21129463-21142261 lnc-GNAT3-8:1 Yes chr2R:21129463-21142261 lnc-GNAI1-6:1 Yes chr2R:21129463-21142261 MAGI2-AS3:11 No - MAGI2-AS3:12 No - MAGI2-AS3:13 No - MAGI2-AS3:17 No - MAGI2-AS3:18 No - MAGI2-AS3:19 No - MAGI2-AS3:21 No - MAGI2-AS3:27 No - MAGI2-AS3:28 No - MAGI2-AS3:29 No - MAGI2-AS3:33 No - MAGI2-AS3:39 No - MAGI2-AS3:45 No - MAGI2-AS3:46 No - lnc-MAGI2-2:1 No - lnc-GNAT3-6:1 No - lnc-CD36-3:1 Yes chr3L:6972750-6980044 lnc-GNAI1-3:1 No - lnc-CD36-2:1 No - lnc-GNAT3-1:8 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-CD36-1:1 No - lnc-GNAT3-1:7 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-GNAT3-1:6 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-GNAT3-1:5 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-GNAT3-1:4 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-GNAT3-1:3 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-GNAT3-3:1 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-GNAI1-5:2 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-GNAI1-4:1 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-SEMA3C-2:1 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-GNAT3-4:1 No - lnc-GNAT3-5:1 No - lnc-GNAT3-7:2 No - lnc-GNAT3-7:1 No - lnc-SEMA3C-1:1 No - lnc-CD36-4:1 No - lnc-CD36-8:1 No - lnc-HGF-7:2 No - lnc-HGF-1:3 No - lnc-HGF-4:1 No - lnc-CACNA2D1-1:1 Yes chr2R:13805794-13819571 lnc-CACNA2D1-1:2 Yes chr2R:13805794-13819571 lnc-HGF-5:1 Yes chr2R:13805794-13819571 lnc-HGF-6:1 Yes chr2R:13805794-13819571 lnc-CACNA2D1-2:1 No - lnc-CD36-5:2 No - lnc-SEMA3E-1:1 No - lnc-CD36-12:1 No - lnc-GRM3-6:1 No - lnc-SEMA3D-5:1 No - lnc-SEMA3D-5:2 No - lnc-SEMA3A-1:1 No - lnc-GRM3-2:4 No - lnc-SEMA3D-2:1 No - lnc-GRM3-3:1 No - lnc-SEMA3A-2:1 No - lnc-SEMA3D-3:1 No - lnc-SEMA3D-4:1 No - lnc-KIAA1324L-4:1 No - lnc-TMEM243-3:1 No - lnc-DMTF1-2:1 No - lnc-TMEM243-1:1 No - lnc-TMEM243-1:8 No - lnc-CROT-4:1 No - lnc-CROT-4:2 No - lnc-KIAA1324L-3:2 No - lnc-KIAA1324L-3:3 No - lnc-KIAA1324L-3:4 No - lnc-KIAA1324L-3:1 No - TP53TG1:18 No - TP53TG1:2 No - TP53TG1:1 No - TP53TG1:10 No - TP53TG1:4 No - lnc-CROT-1:1 Yes chr3L:6240500-6245746 lnc-RUNDC3B-4:1 Yes chr3L:6240500-6245746 lnc-ABCB1-2:6 No - lnc-ABCB1-2:5 No - lnc-ABCB1-2:4 No - lnc-ABCB1-2:3 No - lnc-ABCB1-2:2 No - lnc-ABCB1-1:2 Yes chrX:19611526-19615617 lnc-ABCB1-1:1 Yes chrX:19611526-19615617 lnc-ABCB1-1:3 Yes chrX:19611526-19615617 lnc-ABCB1-3:1 No - lnc-DBF4-3:1 Yes chrX:15946936-15973159 lnc-STEAP4-2:2 Yes chr2R:10480163-10481886 lnc-STEAP4-2:1 Yes chr2R:10480163-10481886 lnc-ADAM22-2:2 No - lnc-SRI-1:1 No - lnc-ADAM22-2:3 No - lnc-STEAP4-3:1 No - lnc-ADAM22-5:1 No - lnc-STEAP4-4:1 No - lnc-TEX47-4:1 No - lnc-ZNF804B-3:1 No - lnc-ADAM22-6:1 No - lnc-ZNF804B-4:1 No - lnc-ZNF804B-2:6 No - lnc-STEAP1-3:1 No - lnc-STEAP1-3:2 No - lnc-STEAP1-3:3 No - lnc-STEAP1-2:1 No - lnc-FAM237B-5:1 No - lnc-CDK14-1:1 No - lnc-GTPBP10-2:1 No - lnc-CLDN12-3:2 No - lnc-CLDN12-3:3 No - lnc-CLDN12-3:4 No - lnc-CLDN12-3:5 No - lnc-CLDN12-3:6 No - lnc-CLDN12-3:7 No - lnc-CLDN12-3:8 No - lnc-CLDN12-3:9 No - lnc-CLDN12-3:10 No - lnc-CLDN12-3:11 No - lnc-CLDN12-3:12 No - lnc-FAM237B-2:5 Yes chr3L:3515751-3610521 lnc-CLDN12-2:1 Yes chr3L:3515751-3610521 lnc-FZD1-5:1 Yes chr3L:3515751-3610521 lnc-FZD1-3:1 Yes chr3L:3515751-3610521 lnc-FZD1-1:2 No - lnc-MTERF1-10:1 No - lnc-FZD1-2:4 No - lnc-MTERF1-3:3 No - lnc-FZD1-4:1 No - lnc-FZD1-2:6 No - lnc-MTERF1-1:3 No - lnc-MTERF1-1:2 No - lnc-AKAP9-1:2 No - lnc-MTERF1-7:1 No - lnc-MTERF1-8:1 No - lnc-LRRD1-2:1 No - lnc-LRRD1-3:1 No - lnc-LRRD1-4:1 No - lnc-LRRD1-4:2 No - lnc-ERVW-1-1:3 No - lnc-ERVW-1-1:2 No - lnc-ERVW-1-1:1 No - lnc-ERVW-1-2:2 Yes chr3L:14071892-14076123 lnc-ERVW-1-2:1 Yes chr3L:14071892-14076123 lnc-ERVW-1-3:1 Yes chr3L:14071892-14076123 lnc-RBM48-2:1 No - lnc-CDK6-1:3 No - lnc-FAM133B-2:1 Yes chr2R:16579470-16585448 lnc-FAM133B-3:2 Yes chr2R:16579470-16585448 lnc-FAM133B-3:1 Yes chr2R:16579470-16585448 lnc-FAM133B-4:1 Yes chr2R:16579470-16585448 lnc-FAM133B-5:1 Yes chr2R:16579470-16585448 lnc-SAMD9-1:1 No - lnc-SAMD9L-1:1 No - lnc-CALCR-1:1 No - lnc-CALCR-1:2 No - lnc-GNG11-4:1 No - lnc-BET1-3:1 No - lnc-BET1-2:1 No - lnc-TFPI2-2:1 Yes chr3L:19261394-19262437 lnc-GNG11-3:3 No - lnc-COL1A2-2:1 No - lnc-CASD1-1:1 Yes chr2L:8303429-8305376 lnc-BET1-4:1 Yes chr2L:8303429-8305376 lnc-PEG10-2:1 No - lnc-PPP1R9A-3:1 No - lnc-PON1-3:1 Yes chr3L:2505245-2554292 lnc-PON1-1:2 Yes chr3L:2505245-2554292 lnc-PPP1R9A-1:1 Yes chr3L:2505245-2554292 lnc-PON3-3:1 No - lnc-PON3-1:1 No - lnc-PPP1R9A-2:1 No - lnc-PON2-2:1 No - lnc-ASB4-7:1 No - lnc-PON3-2:7 No - lnc-PON3-2:6 No - lnc-PON3-2:1 No - lnc-PON3-2:5 No - lnc-PON3-2:2 No - lnc-PON3-2:4 No - lnc-PON3-2:3 No - lnc-PON2-1:1 No - lnc-ASB4-1:2 No - lnc-PDK4-1:1 No - lnc-ASB4-5:1 No - lnc-PON2-3:1 Yes chr2R:9426439-9434638 lnc-ASB4-3:5 No - lnc-ASB4-3:6 No - lnc-DYNC1I1-1:4 No - lnc-DYNC1I1-1:5 No - lnc-DYNC1I1-1:6 No - lnc-DYNC1I1-4:1 No - lnc-SEM1-5:1 Yes chr3R:30445635-30455867 lnc-DYNC1I1-7:1 Yes chr3R:30445635-30455867 lnc-SEM1-4:1 Yes chr3R:30445635-30455867 lnc-SLC25A13-1:2 No - lnc-DLX5-7:2 No - lnc-DLX5-3:2 No - lnc-DLX5-7:1 No - lnc-DLX5-4:1 No - DLX6-AS1:23 No - DLX6-AS1:5 Yes chr2R:24814822-24835667 DLX6-AS1:8 Yes chr2R:24814822-24835667 DLX6-AS1:21 No - DLX6-AS1:11 Yes chr2R:24814822-24835667 DLX6-AS1:24 No - DLX6-AS1:18 Yes chr2R:24814822-24835667 DLX6-AS1:14 Yes chr2R:24814822-24835667 DLX6-AS1:13 Yes chr2R:24814822-24835667 lnc-DLX6-1:1 No - lnc-DLX5-5:1 Yes chr3R:16481861-16482452 lnc-DLX5-6:1 No - lnc-ASNS-2:1 No - lnc-ASNS-1:4 No - lnc-TAC1-1:1 No - lnc-TAC1-2:1 No - lnc-TAC1-3:1 No - lnc-ASNS-1:10 No - lnc-OCM2-1:1 No - lnc-ASNS-1:1 No - lnc-ASNS-1:9 No - lnc-ASNS-1:6 No - lnc-LMTK2-4:1 No - lnc-ASNS-1:5 No - lnc-ASNS-1:8 No - lnc-ASNS-1:7 No - lnc-ASNS-1:3 No - lnc-LMTK2-3:1 No - lnc-LMTK2-2:1 No - lnc-LMTK2-1:1 No - lnc-TECPR1-2:1 No - lnc-BHLHA15-1:1 No - lnc-BAIAP2L1-2:2 Yes chr3L:20297129-20302141 lnc-BAIAP2L1-2:1 Yes chr3L:20297129-20302141 lnc-BAIAP2L1-1:3 Yes chr3L:20297129-20302141 lnc-BAIAP2L1-1:1 Yes chr3L:20297129-20302141 lnc-BAIAP2L1-1:2 Yes chr3L:20297129-20302141 lnc-BRI3-2:1 No - lnc-BRI3-2:2 Yes chr3L:3376757-3377992 lnc-TECPR1-1:1 No - lnc-TECPR1-3:1 Yes chr3L:11136049-11163984 lnc-BAIAP2L1-3:1 No - lnc-TMEM130-1:3 No - lnc-TMEM130-1:2 No - lnc-NPTX2-2:1 No - lnc-TRRAP-2:1 No - lnc-SMURF1-2:1 No - lnc-SMURF1-1:1 Yes chr2R:5177965-5251022 lnc-KPNA7-1:1 Yes chr2R:17592791-17604461 lnc-TRRAP-3:1 Yes chr2R:17592791-17604461 lnc-ARPC1A-8:1 No - lnc-ARPC1A-6:1 No - lnc-ARPC1A-5:1 No - lnc-ARPC1A-3:1 No - lnc-PDAP1-1:1 No - lnc-PTCD1-1:1 Yes chr2L:9396999-9397988 lnc-ATP5MF-1:3 No - lnc-ATP5MF-1:2 No - lnc-ATP5MF-1:1 No - lnc-ATP5MF-1:4 No - lnc-ZNF394-2:1 No - lnc-ZNF394-1:2 No - lnc-ZNF394-1:1 No - lnc-ZKSCAN5-1:2 No - lnc-CYP3A7-3:1 Yes chrX:21517434-21519218 lnc-CYP3A7-2:7 Yes chrX:21517434-21519218 lnc-CYP3A7-2:9 Yes chrX:21517434-21519218 lnc-CYP3A7-2:8 Yes chrX:21517434-21519218 lnc-CYP3A7-1:1 Yes chrX:21517434-21519218 lnc-CYP3A43-1:3 No - lnc-ZKSCAN1-3:2 No - lnc-ZSCAN21-2:1 No - lnc-MCM7-2:1 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-TAF6-2:1 Yes chr3L:8891596-8894310 lnc-TAF6-2:2 Yes chr3L:8891596-8894310 lnc-MCM7-1:3 Yes chr3L:19599088-19601382 lnc-MCM7-3:1 Yes chr3L:19599088-19601382 lnc-MBLAC1-2:1 Yes chr3L:19094890-19096217 lnc-GAL3ST4-1:1 No - lnc-GPC2-1:1 No - lnc-GPC2-1:3 No - lnc-GPC2-1:2 No - lnc-GAL3ST4-2:1 Yes chr3L:14632601-14671609 lnc-GPC2-3:1 No - lnc-GPC2-2:5 No - lnc-GPC2-2:7 No - lnc-GPC2-2:6 No - lnc-PVRIG-1:1 No - lnc-CASTOR3-3:5 No - lnc-PILRB-1:3 No - lnc-PILRB-1:4 No - lnc-PILRB-1:5 No - lnc-PILRB-1:9 No - lnc-PILRB-1:11 No - lnc-PILRB-1:12 No - lnc-PILRB-1:13 No - lnc-ZCWPW1-2:1 No - lnc-ZCWPW1-1:1 No - lnc-NYAP1-5:1 No - lnc-NYAP1-3:1 No - lnc-NYAP1-1:3 No - lnc-NYAP1-4:1 No - lnc-SAP25-4:1 No - lnc-SAP25-3:1 Yes chr2L:833584-851071 lnc-LRCH4-2:2 No - lnc-LRCH4-2:4 Yes chr2L:17367511-17384115 lnc-LRCH4-2:3 Yes chr2L:17367511-17384115 lnc-LRCH4-2:1 Yes chr2L:17367511-17384115 PCOLCE-AS1:3 No - lnc-ACTL6B-1:1 No - lnc-GNB2-1:2 No - lnc-ACTL6B-2:1 Yes chr4:853557-867025 lnc-UFSP1-1:1 No - lnc-ACHE-3:1 No - lnc-ACHE-4:1 No - lnc-ACHE-6:1 No - lnc-TRIM56-2:1 No - lnc-TRIM56-2:2 No - lnc-MUC17-4:1 Yes chr2R:18987344-19008944 lnc-TRIM56-1:2 Yes chr2R:18987344-19008944 lnc-MOGAT3-1:1 No - lnc-MOGAT3-2:2 Yes chr3L:11198166-11206016 lnc-MOGAT3-2:1 Yes chr3L:11198166-11206016 lnc-CLDN15-2:1 No - lnc-FIS1-1:1 No - lnc-CLDN15-1:1 Yes chr2R:5603587-5604834 LNCPRESS1:15 No - LNCPRESS1:23 No - lnc-FIS1-2:1 No - lnc-IFT22-2:2 No - LINC01007:5 No - LINC01007:1 No - lnc-CUX1-1:1 No - lnc-SPDYE6-9:2 Yes chrX:7609148-7678859 lnc-SH2B2-3:1 Yes chrX:7609148-7678859 lnc-SPDYE6-8:2 Yes chrX:7609148-7678859 lnc-SPDYE6-7:2 Yes chrX:7609148-7678859 lnc-SH2B2-2:1 Yes chrX:7609148-7678859 lnc-SPDYE6-4:2 Yes chr2R:16185122-16186506 lnc-ALKBH4-3:1 No - lnc-POLR2J-2:1 No - lnc-POLR2J-1:1 No - lnc-UPK3BL2-1:5 No - lnc-UPK3BL2-1:4 No - lnc-POLR2J3-1:1 No - lnc-UPK3BL1-2:1 No - lnc-POLR2J2-2:2 No - lnc-FAM185A-1:1 No - lnc-NAPEPLD-7:1 No - lnc-NAPEPLD-6:1 No - lnc-NAPEPLD-3:1 No - lnc-NAPEPLD-1:1 No - lnc-FBXL13-2:1 No - lnc-ARMC10-2:1 No - lnc-NAPEPLD-2:1 No - lnc-NAPEPLD-4:1 No - lnc-NAPEPLD-5:4 No - lnc-NAPEPLD-5:5 No - lnc-NAPEPLD-5:8 No - lnc-NAPEPLD-5:7 No - lnc-NAPEPLD-5:1 No - lnc-NAPEPLD-5:2 No - lnc-NAPEPLD-5:6 No - lnc-SLC26A5-3:2 No - lnc-SLC26A5-3:1 No - lnc-SLC26A5-1:1 No - lnc-SLC26A5-2:1 No - lnc-LHFPL3-7:1 No - lnc-RELN-2:1 Yes chr2L:13829837-13831576 lnc-RELN-3:1 Yes chr2L:13829837-13831576 LHFPL3-AS1:3 Yes chr3L:1885657-1891462 LHFPL3-AS1:4 Yes chr3L:1885657-1891462 lnc-KMT2E-7:3 Yes chr3L:1885657-1891462 LHFPL3-AS2:2 Yes chr3L:1885657-1891462 LHFPL3-AS2:8 No - lnc-LHFPL3-2:1 No - lnc-LHFPL3-2:2 No - LHFPL3-AS2:6 No - lnc-LHFPL3-3:1 No - LHFPL3-AS2:7 No - LHFPL3-AS2:9 No - LHFPL3-AS2:5 No - LHFPL3-AS2:1 No - lnc-KMT2E-3:2 No - lnc-KMT2E-2:2 No - lnc-SRPK2-1:9 No - lnc-SRPK2-1:10 No - lnc-SRPK2-1:11 No - lnc-SRPK2-1:8 No - lnc-SRPK2-1:5 Yes chr3L:14002127-14020148 lnc-SRPK2-1:7 No - lnc-SRPK2-1:6 No - lnc-LHFPL3-4:1 Yes chr3L:14002127-14020148 lnc-SRPK2-8:1 Yes chr3L:14002127-14020148 lnc-SRPK2-6:1 Yes chr3L:14002127-14020148 lnc-SRPK2-5:4 No - lnc-PUS7-3:1 No - lnc-PUS7-2:1 No - lnc-SRPK2-5:3 Yes chr2R:15380724-15387851 lnc-KMT2E-4:2 Yes chr2R:15380724-15387851 lnc-SRPK2-5:1 Yes chr2R:15380724-15387851 lnc-SRPK2-5:2 Yes chr2R:15380724-15387851 lnc-KMT2E-5:2 Yes chr2R:15380724-15387851 lnc-KMT2E-6:2 Yes chr2R:15380724-15387851 lnc-SRPK2-9:1 No - lnc-EFCAB10-1:1 No - lnc-RINT1-2:1 No - lnc-PUS7-1:1 No - lnc-RINT1-1:1 No - lnc-EFCAB10-2:1 No - lnc-CDHR3-1:1 No - lnc-CDHR3-1:2 No - lnc-CDHR3-1:3 No - lnc-CDHR3-1:4 No - lnc-CDHR3-1:5 No - lnc-ATXN7L1-1:1 No - lnc-CDHR3-1:6 No - lnc-CDHR3-1:7 No - lnc-CDHR3-1:8 No - lnc-RINT1-4:1 No - lnc-SYPL1-3:1 No - lnc-SYPL1-2:1 No - lnc-NAMPT-1:1 No - lnc-SYPL1-1:1 No - lnc-CDHR3-2:1 No - lnc-SYPL1-4:1 No - lnc-SYPL1-5:1 No - lnc-CDHR3-4:1 No - lnc-CDHR3-7:1 No - lnc-CDHR3-6:1 No - lnc-CCDC71L-1:4 No - lnc-PIK3CG-6:1 No - lnc-CCDC71L-2:1 No - lnc-CCDC71L-1:12 No - LINC02577:20 No - LINC02577:25 No - lnc-CCDC71L-3:1 No - lnc-COG5-2:2 Yes chr2R:9993890-10026042 lnc-PRKAR2B-1:1 No - lnc-SLC26A3-4:2 Yes chr2L:17478442-17481029 lnc-SLC26A3-4:1 Yes chr2L:17478442-17481029 lnc-COG5-4:4 Yes chr2L:17478442-17481029 lnc-GPR22-2:1 Yes chr2L:17478442-17481029 lnc-GPR22-1:1 Yes chr2L:17478442-17481029 lnc-COG5-4:5 Yes chr2L:17478442-17481029 lnc-BCAP29-1:1 Yes chr3L:837861-839931 lnc-BCAP29-2:1 No - lnc-COG5-5:1 No - SLC26A4-AS1:3 Yes chr3L:17898889-17907812 SLC26A4-AS1:4 Yes chr3L:17898889-17907812 SLC26A4-AS1:10 Yes chr3L:17898889-17907812 SLC26A4-AS1:1 Yes chr3L:17898889-17907812 SLC26A4-AS1:11 Yes chr3L:17898889-17907812 SLC26A4-AS1:12 Yes chr3L:17898889-17907812 lnc-SLC26A3-1:6 Yes chr2L:19580612-19582474 lnc-SLC26A3-1:2 Yes chr2L:19580612-19582474 lnc-SLC26A3-1:8 No - lnc-SLC26A3-1:4 Yes chr2L:19580612-19582474 lnc-SLC26A3-1:7 No - lnc-SLC26A3-1:3 Yes chr2L:19580612-19582474 lnc-SLC26A3-1:1 Yes chr2L:19580612-19582474 lnc-LAMB1-2:1 Yes chr3L:17898889-17907812 lnc-CBLL1-3:1 No - lnc-LAMB4-3:1 Yes chr2L:7811438-7820771 lnc-LAMB4-2:1 Yes chr2L:7811438-7820771 lnc-LAMB4-1:1 Yes chr2L:7811438-7820771 lnc-LAMB1-1:1 No - lnc-NRCAM-1:1 Yes chrX:8517373-8555170 lnc-PNPLA8-2:7 No - lnc-PNPLA8-2:8 No - lnc-PNPLA8-2:3 No - lnc-THAP5-1:1 No - lnc-THAP5-1:2 No - lnc-DNAJB9-3:1 No - lnc-PNPLA8-2:5 No - lnc-PNPLA8-2:4 No - lnc-PNPLA8-2:2 No - lnc-PNPLA8-2:6 No - lnc-PNPLA8-2:1 No - lnc-THAP5-3:1 No - lnc-THAP5-5:1 No - lnc-DNAJB9-5:1 No - lnc-DNAJB9-4:1 No - lnc-DNAJB9-5:2 No - lnc-DNAJB9-6:1 No - lnc-IMMP2L-7:1 No - lnc-LRRN3-4:1 No - lnc-IMMP2L-1:13 No - lnc-LRRN3-3:1 No - lnc-DOCK4-8:2 Yes chr2R:20641742-20642558 lnc-DOCK4-8:1 Yes chr2R:20641742-20642558 lnc-ZNF277-4:1 Yes chr2R:20641742-20642558 lnc-DOCK4-6:1 Yes chr2R:20641742-20642558 lnc-IMMP2L-2:1 Yes chr3R:28845270-28870439 lnc-IMMP2L-3:1 Yes chr3R:28845270-28870439 DOCK4-AS1:1 Yes chr3R:28845270-28870439 lnc-IMMP2L-4:1 Yes chr3R:28845270-28870439 lnc-IMMP2L-5:1 Yes chr3R:28845270-28870439 lnc-TMEM168-4:1 Yes chr3R:28845270-28870439 lnc-IFRD1-2:1 Yes chr2R:23062747-23064260 lnc-ZNF277-2:1 No - lnc-DOCK4-3:1 No - lnc-ZNF277-3:1 No - lnc-DOCK4-4:2 Yes chr2L:2868627-2874489 lnc-DOCK4-4:1 Yes chr2L:2868627-2874489 lnc-DOCK4-5:1 Yes chr2L:2868627-2874489 lnc-LSMEM1-1:1 No - lnc-LSMEM1-2:1 No - lnc-LSMEM1-3:1 No - lnc-LSMEM1-3:5 No - lnc-TMEM168-1:1 No - lnc-LSMEM1-5:1 No - lnc-BMT2-2:1 No - lnc-TMEM168-3:1 Yes chr2R:24603572-24604670 lnc-BMT2-1:2 No - lnc-BMT2-1:14 No - lnc-BMT2-1:3 No - lnc-BMT2-1:4 No - lnc-BMT2-1:15 No - lnc-BMT2-1:1 No - lnc-GPR85-1:1 No - lnc-LSMEM1-8:2 No - lnc-SMIM30-1:4 No - lnc-FOXP2-5:1 No - lnc-FOXP2-4:1 No - lnc-MDFIC-7:1 No - lnc-MDFIC-7:2 No - lnc-PPP1R3A-3:1 No - lnc-PPP1R3A-4:1 No - lnc-MDFIC-2:1 No - lnc-MDFIC-2:2 No - LINC01393:5 No - lnc-TFEC-14:1 No - lnc-MDFIC-5:1 No - lnc-TES-1:3 No - lnc-WNT2-10:1 Yes chr4:1198852-1224467 lnc-WNT2-7:1 Yes chr4:1198852-1224467 lnc-WNT2-6:1 Yes chr4:1198852-1224467 lnc-WNT2-6:2 Yes chr4:1198852-1224467 lnc-TFEC-7:1 Yes chr2R:17465879-17469177 lnc-CAV2-2:1 Yes chr2R:17465879-17469177 lnc-TFEC-1:5 No - lnc-CAV2-1:1 No - lnc-CAV2-1:2 No - lnc-CAV2-1:13 No - lnc-CAV2-1:16 No - lnc-TFEC-9:5 No - lnc-TFEC-9:4 No - lnc-TFEC-9:2 No - lnc-TFEC-9:1 No - lnc-CAV1-5:1 No - lnc-CAV1-1:1 No - LINC01510:3 No - LINC01510:5 No - lnc-CAPZA2-3:1 No - lnc-WNT2-4:1 Yes chr2R:21057787-21059883 ST7-AS1:3 No - lnc-CAPZA2-2:9 Yes chr3L:20806868-20809272 lnc-CAPZA2-2:10 Yes chr3L:20806868-20809272 lnc-CAPZA2-2:11 Yes chr3L:20806868-20809272 lnc-WNT2-3:1 No - lnc-ST7-2:1 No - lnc-ST7-1:2 No - lnc-ASZ1-2:1 No - lnc-CTTNBP2-4:1 Yes chr2L:8355678-8362469 lnc-ASZ1-3:1 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-ASZ1-4:1 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-CTTNBP2-3:4 No - lnc-CTTNBP2-5:1 No - lnc-CTTNBP2-6:1 No - lnc-CTTNBP2-7:1 No - lnc-KCND2-3:1 No - LINC02476:26 No - lnc-KCND2-2:1 No - lnc-TSPAN12-2:3 No - lnc-FAM3C-2:1 No - lnc-TSPAN12-5:1 No - lnc-TSPAN12-6:1 No - lnc-WNT16-1:1 No - lnc-WNT16-2:1 No - lnc-FAM3C-3:1 No - lnc-PTPRZ1-12:1 No - lnc-PTPRZ1-8:1 No - lnc-AASS-1:1 No - lnc-PTPRZ1-7:1 No - FEZF1-AS1:11 No - lnc-PTPRZ1-10:1 No - lnc-PTPRZ1-11:1 No - FEZF1-AS1:4 Yes chr2L:1950239-1970362 lnc-PTPRZ1-3:2 Yes chr4:1230837-1271759 lnc-PTPRZ1-3:5 Yes chr4:1230837-1271759 lnc-PTPRZ1-3:6 Yes chr4:1230837-1271759 lnc-PTPRZ1-13:1 Yes chr4:1230837-1271759 lnc-ASB15-5:1 Yes chr4:1230837-1271759 lnc-SLC13A1-2:1 No - lnc-IQUB-1:1 Yes chr3R:22405939-22408640 lnc-IQUB-1:3 Yes chr3R:22405939-22408640 lnc-IQUB-2:6 Yes chr3L:10693184-10694108 lnc-IQUB-3:2 Yes chr3L:10693184-10694108 lnc-IQUB-3:3 Yes chr3L:10693184-10694108 lnc-IQUB-3:1 Yes chr3L:10693184-10694108 lnc-NDUFA5-1:6 No - lnc-ASB15-1:2 No - lnc-WASL-1:2 Yes chr3R:30532607-30578905 lnc-LMOD2-1:1 No - lnc-HYAL4-5:1 Yes chr3R:28824506-28832024 lnc-HYAL4-5:2 No - lnc-HYAL4-4:8 No - lnc-HYAL4-1:2 No - lnc-HYAL4-1:3 No - lnc-HYAL4-2:1 No - lnc-SPAM1-2:3 No - lnc-TMEM229A-1:2 No - lnc-TMEM229A-1:3 No - lnc-SSU72P8-3:2 No - lnc-GPR37-1:1 No - lnc-C7orf77-2:1 No - lnc-C7orf77-4:1 No - lnc-C7orf77-5:1 No - lnc-C7orf77-5:2 No - POT1-AS1:7 No - lnc-SSU72P8-7:1 No - POT1-AS1:11 No - lnc-POT1-4:1 No - lnc-SSU72P8-5:3 No - lnc-POT1-2:3 No - lnc-POT1-5:1 No - lnc-SSU72P8-8:1 No - lnc-SSU72P8-9:1 No - lnc-SSU72P8-6:2 No - lnc-ARF5-5:4 No - lnc-ARF5-17:1 Yes chr4:936819-949441 lnc-ZNF800-7:1 Yes chr4:936819-949441 lnc-ZNF800-1:4 Yes chr4:936819-949441 lnc-ZNF800-1:3 Yes chr4:936819-949441 lnc-ZNF800-6:1 Yes chr4:936819-949441 lnc-ARF5-14:1 Yes chr4:936819-949441 lnc-ZNF800-4:1 Yes chr4:936819-949441 lnc-ARF5-13:1 No - lnc-ARF5-12:1 No - lnc-ZNF800-2:1 Yes chr3R:5794705-5799994 lnc-ZNF800-2:2 Yes chr3R:5794705-5799994 lnc-ZNF800-2:3 Yes chr3R:5794705-5799994 lnc-GCC1-1:1 No - lnc-LRRC4-2:1 Yes chr3L:259043-264380 SND1-IT1:4 Yes chr3L:259043-264380 lnc-LEP-4:1 Yes chr3L:259043-264380 lnc-LEP-2:1 No - lnc-RBM28-1:2 No - lnc-RBM28-3:1 Yes chr2R:24666158-24668343 lnc-RBM28-3:2 Yes chr2R:24666158-24668343 lnc-LEP-1:1 Yes chr2R:24666158-24668343 lnc-PRRT4-3:1 Yes chr2R:24666158-24668343 lnc-PRRT4-3:2 Yes chr2R:24666158-24668343 lnc-PRRT4-1:1 Yes chr2R:24666158-24668343 lnc-PRRT4-2:1 Yes chrX:10744502-10749097 lnc-IMPDH1-1:1 Yes chrX:10744502-10749097 lnc-IMPDH1-2:1 No - lnc-HILPDA-1:6 No - lnc-HILPDA-1:7 No - lnc-METTL2B-2:1 No - lnc-IMPDH1-3:1 No - lnc-METTL2B-3:1 No - lnc-METTL2B-3:2 No - lnc-METTL2B-3:3 No - lnc-METTL2B-3:4 No - lnc-METTL2B-3:5 No - lnc-METTL2B-3:6 No - lnc-METTL2B-3:7 No - lnc-METTL2B-3:8 No - lnc-METTL2B-3:9 No - lnc-METTL2B-3:10 No - lnc-METTL2B-3:11 No - lnc-METTL2B-3:12 No - lnc-METTL2B-3:13 No - lnc-METTL2B-3:14 No - LINC01000:2 No - LINC01000:4 No - LINC01000:5 No - LINC01000:6 No - LINC01000:7 No - LINC01000:8 No - LINC01000:9 No - LINC01000:10 No - LINC01000:11 No - LINC01000:12 No - lnc-OPN1SW-2:1 No - LINC01000:14 No - lnc-OPN1SW-1:1 No - lnc-FAM71F2-5:1 No - lnc-FAM71F2-3:1 No - lnc-FAM71F2-6:1 No - lnc-CCDC136-2:1 Yes chr3L:1298672-1300389 lnc-CCDC136-1:2 Yes chr3L:1298672-1300389 lnc-CALU-1:1 No - lnc-TNPO3-12:3 No - lnc-TNPO3-12:2 No - lnc-TNPO3-12:1 No - FLNC-AS1:7 No - lnc-TNPO3-11:1 No - lnc-TNPO3-1:14 No - lnc-TNPO3-1:13 No - lnc-TNPO3-1:11 No - lnc-TNPO3-1:12 No - lnc-IRF5-1:1 Yes chr2L:2759924-2763889 lnc-IRF5-2:1 Yes chr2L:2759924-2763889 lnc-TSPAN33-4:2 No - lnc-TNPO3-4:1 No - lnc-TNPO3-5:1 No - lnc-TNPO3-7:1 No - lnc-TNPO3-8:1 Yes chr3L:2768466-2772325 lnc-SMKR1-2:2 Yes chr3L:3322025-3328871 lnc-UBE2H-2:2 No - lnc-NRF1-1:1 No - lnc-SMKR1-3:2 Yes chrX:268509-279718 lnc-SMKR1-4:2 Yes chrX:268509-279718 lnc-UBE2H-3:1 No - lnc-ZC3HC1-4:1 Yes chrX:8087544-8094064 lnc-ZC3HC1-3:1 Yes chrX:8087544-8094064 lnc-ZC3HC1-2:1 Yes chrX:8087544-8094064 lnc-ZC3HC1-2:2 Yes chrX:8087544-8094064 lnc-NRF1-2:1 Yes chrX:8087544-8094064 lnc-SSMEM1-3:1 Yes chr2R:18440965-18445526 lnc-ZC3HC1-1:2 Yes chr3L:17337172-17339262 lnc-ZC3HC1-1:1 Yes chr3L:17337172-17339262 lnc-CPA2-1:1 No - lnc-CEP41-2:1 Yes chrX:17080423-17087675 lnc-COPG2-5:1 No - lnc-COPG2-4:3 No - lnc-COPG2-4:2 No - lnc-COPG2-19:1 No - lnc-COPG2-3:1 No - lnc-CEP41-3:1 Yes chr3R:31572143-31575707 lnc-TSGA13-1:1 Yes chr3R:31572143-31575707 lnc-MEST-7:5 No - LINC-PINT:81 No - lnc-KLF14-3:2 No - lnc-KLF14-3:1 No - lnc-KLF14-5:1 No - lnc-MKLN1-6:1 No - LINC00513:13 No - LINC00513:15 No - LINC00513:16 No - LINC-PINT:24 No - LINC-PINT:11 No - LINC-PINT:16 No - LINC-PINT:20 No - LINC-PINT:21 No - lnc-KLF14-6:1 No - LINC-PINT:10 No - lnc-MKLN1-1:11 No - lnc-MKLN1-4:1 No - LINC-PINT:18 No - lnc-MKLN1-1:12 No - LINC-PINT:1 Yes chr2R:12628697-12632378 MKLN1-AS:6 Yes chr2R:12628697-12632378 lnc-MEST-6:1 Yes chr2R:12628697-12632378 lnc-PODXL-3:1 Yes chr2R:12628697-12632378 lnc-PLXNA4-3:1 No - lnc-PODXL-2:1 No - lnc-MKLN1-3:1 No - lnc-MKLN1-5:1 No - lnc-MKLN1-8:1 No - lnc-MKLN1-10:1 No - lnc-MKLN1-18:3 Yes chr4:1009895-1027101 lnc-MKLN1-18:4 Yes chr4:1009895-1027101 lnc-EXOC4-7:5 No - lnc-EXOC4-2:4 No - lnc-EXOC4-6:1 No - lnc-PLXNA4-1:2 No - lnc-CHCHD3-1:1 Yes chr3R:5754932-5758997 lnc-SLC35B4-6:1 Yes chr3R:5754932-5758997 lnc-SLC35B4-5:1 Yes chr3R:5754932-5758997 lnc-LRGUK-4:1 Yes chr3R:5754932-5758997 lnc-LRGUK-3:1 Yes chr3R:5754932-5758997 lnc-SLC35B4-3:2 Yes chr3R:5754932-5758997 lnc-EXOC4-3:1 No - lnc-AKR1B1-2:1 Yes chrX:6219957-6222719 lnc-SLC35B4-4:1 Yes chr3L:11620535-11624381 lnc-AKR1B1-3:1 No - lnc-AKR1B1-4:1 No - lnc-AGBL3-2:1 No - lnc-C7orf49-2:3 No - lnc-C7orf49-2:5 No - lnc-AGBL3-1:1 No - lnc-C7orf49-2:1 No - lnc-WDR91-2:1 No - lnc-C7orf49-2:2 No - lnc-C7orf49-2:4 No - lnc-TMEM140-1:2 No - lnc-C7orf49-3:2 Yes chr3R:19022458-19024030 lnc-C7orf49-3:1 Yes chr3R:19022458-19024030 lnc-C7orf49-4:1 Yes chr3R:19022458-19024030 lnc-STRA8-1:2 Yes chr3R:19022458-19024030 lnc-STRA8-1:3 Yes chr3R:19022458-19024030 lnc-WDR91-4:5 No - lnc-WDR91-3:1 Yes chr2L:10396716-10403206 lnc-SLC13A4-2:3 Yes chr2L:10396716-10403206 lnc-SLC13A4-2:1 Yes chr2L:10396716-10403206 lnc-SLC13A4-2:2 Yes chr2L:10396716-10403206 lnc-NUP205-3:1 Yes chr2L:10396716-10403206 lnc-NUP205-1:1 No - lnc-NUP205-2:1 No - lnc-MTPN-1:1 Yes chrX:19082609-19083290 lnc-STMP1-4:1 No - lnc-STMP1-5:1 No - lnc-STMP1-5:4 No - lnc-STMP1-8:2 No - lnc-STMP1-8:4 No - lnc-STMP1-6:1 No - lnc-STMP1-7:1 No - lnc-STMP1-8:7 No - lnc-CHRM2-4:1 No - lnc-PTN-2:8 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-PTN-2:7 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-PTN-2:6 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-PTN-2:5 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-AKR1D1-8:1 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-AKR1D1-8:2 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-AKR1D1-8:3 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-PTN-9:1 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-PTN-8:1 No - lnc-PTN-7:1 No - lnc-PTN-6:1 No - lnc-PTN-2:10 No - lnc-PTN-4:1 No - lnc-PTN-1:2 No - lnc-PTN-1:3 No - lnc-CHRM2-3:1 Yes chrX:8907068-9029476 lnc-PTN-5:1 Yes chrX:8907068-9029476 lnc-CREB3L2-2:1 Yes chrX:8907068-9029476 lnc-CREB3L2-1:1 Yes chrX:8907068-9029476 lnc-CREB3L2-1:2 Yes chrX:8907068-9029476 lnc-AKR1D1-5:1 Yes chrX:8907068-9029476 lnc-DGKI-1:1 Yes chr3L:15535395-15553214 lnc-AKR1D1-3:1 Yes chr3L:11620535-11624381 lnc-AKR1D1-3:2 Yes chr3L:11620535-11624381 lnc-TRIM24-5:1 Yes chr3L:11620535-11624381 lnc-TRIM24-4:1 Yes chr3L:11620535-11624381 lnc-AKR1D1-4:1 No - lnc-TRIM24-1:1 No - lnc-SVOPL-2:1 No - lnc-ATP6V0A4-3:2 No - lnc-ATP6V0A4-3:1 No - lnc-ATP6V0A4-2:1 No - lnc-SVOPL-1:1 No - lnc-ATP6V0A4-1:1 No - lnc-ZC3HAV1L-1:1 No - lnc-ZC3HAV1-1:1 No - lnc-ZC3HAV1-2:1 No - lnc-ZC3HAV1-3:1 Yes chr3R:15774416-15777640 lnc-ZC3HAV1-4:1 No - lnc-UBN2-1:1 No - lnc-KLRG2-4:1 Yes chr3R:29118330-29122879 lnc-KLRG2-2:1 Yes chr3L:17514298-17524740 lnc-LUC7L2-1:1 No - lnc-LUC7L2-2:1 No - lnc-LUC7L2-3:1 No - lnc-HIPK2-1:1 No - lnc-TBXAS1-3:1 No - lnc-TBXAS1-3:2 No - lnc-TBXAS1-3:3 Yes chrX:21517434-21519218 lnc-TBXAS1-3:4 Yes chrX:21517434-21519218 lnc-TBXAS1-3:5 Yes chrX:21517434-21519218 lnc-CLEC2L-4:1 Yes chrX:21517434-21519218 lnc-TBXAS1-4:1 No - lnc-KDM7A-3:1 No - lnc-KDM7A-3:2 No - lnc-KDM7A-1:1 No - lnc-TBXAS1-1:2 No - lnc-PARP12-1:1 No - KDM7A-DT:8 No - lnc-RAB19-3:1 No - lnc-RAB19-2:1 No - lnc-MKRN1-10:1 No - lnc-MKRN1-2:1 No - lnc-MKRN1-2:2 No - lnc-SLC37A3-1:1 No - lnc-MKRN1-1:1 No - lnc-DENND2A-2:1 Yes chr3L:18721893-18723272 lnc-ADCK2-2:1 No - lnc-ADCK2-1:3 Yes chr3L:24927130-24927710 lnc-DENND2A-1:4 No - lnc-DENND2A-1:3 No - lnc-DENND2A-1:2 No - lnc-MRPS33-4:1 No - lnc-BRAF-3:3 Yes chr3R:16436045-16436597 lnc-BRAF-3:4 Yes chr3R:16436045-16436597 lnc-BRAF-3:1 Yes chr3R:16436045-16436597 lnc-BRAF-3:2 Yes chr3R:16436045-16436597 lnc-TMEM178B-1:1 No - lnc-AGK-4:1 No - lnc-AGK-2:1 No - lnc-AGK-1:1 No - lnc-PRSS37-3:1 No - lnc-SSBP1-2:1 Yes chr3R:16204194-16205250 lnc-PRSS37-2:1 No - lnc-PRSS37-1:1 No - lnc-TAS2R5-1:1 No - lnc-MGAM-1:1 No - lnc-OR9A4-1:1 No - lnc-OR9A4-1:2 No - lnc-TAS2R38-1:1 No - lnc-TAS2R38-1:2 No - lnc-MGAM2-4:1 No - lnc-PRSS58-2:3 No - lnc-MGAM2-8:1 No - lnc-PRSS2-6:1 No - lnc-MTRNR2L6-10:1 No - lnc-MTRNR2L6-9:1 No - lnc-MTRNR2L6-8:1 No - lnc-PRSS1-1:2 No - lnc-PRSS1-7:1 No - lnc-PRSS1-4:1 No - lnc-PRSS1-2:1 No - lnc-PRSS2-5:1 No - lnc-PRSS2-6:2 No - lnc-PRSS2-6:3 No - lnc-TRPV6-3:1 No - lnc-EPHB6-4:1 No - lnc-LLCFC1-1:1 No - lnc-LLCFC1-1:2 No - lnc-TRPV5-3:1 Yes chr3L:14186249-14189648 lnc-EPHB6-3:1 Yes chr3L:14186249-14189648 lnc-TRPV5-1:1 Yes chrX:19961297-19969323 lnc-TRPV5-1:2 Yes chrX:19961297-19969323 lnc-TRPV5-2:1 Yes chrX:19961297-19969323 lnc-OR9A2-1:1 No - lnc-FAM131B-2:1 No - lnc-TAS2R40-1:2 No - lnc-FAM131B-1:3 No - lnc-TMEM139-2:1 Yes chr3L:9968479-9971002 lnc-TMEM139-3:1 Yes chr3L:9968479-9971002 lnc-CLCN1-1:1 No - lnc-EPHA1-1:2 No - lnc-EPHA1-2:1 No - EPHA1-AS1:4 No - lnc-TCAF2C-4:1 No - lnc-TCAF2C-5:1 No - lnc-TCAF2-1:1 No - lnc-CTAGE6-2:3 No - lnc-CTAGE6-2:4 No - lnc-CTAGE6-2:2 No - lnc-CTAGE6-2:1 No - lnc-CTAGE6-2:5 No - lnc-CTAGE6-2:6 No - lnc-CTAGE6-1:1 No - lnc-OR2F1-1:3 No - lnc-OR2F1-1:4 No - lnc-TCAF1-1:1 No - lnc-OR6B1-2:1 No - lnc-ARHGEF5-3:1 No - lnc-NOBOX-1:1 Yes chr3R:11735447-11736877 lnc-NOBOX-1:2 Yes chr3R:11735447-11736877 lnc-NOBOX-2:1 Yes chr3R:11735447-11736877 lnc-TPK1-2:1 No - lnc-ARHGEF5-5:1 No - lnc-ARHGEF5-4:1 No - lnc-ARHGEF5-2:5 No - lnc-CNTNAP2-8:1 No - lnc-TPK1-3:1 No - lnc-CNTNAP2-4:1 No - lnc-CNTNAP2-3:1 No - lnc-CNTNAP2-2:1 No - lnc-TPK1-4:1 Yes chr3L:12146519-12156990 lnc-C7orf33-8:1 Yes chr3L:12146519-12156990 lnc-C7orf33-7:1 Yes chr3L:12146519-12156990 lnc-C7orf33-1:2 Yes chr3L:12146519-12156990 lnc-EZH2-9:1 Yes chr3L:12146519-12156990 lnc-C7orf33-6:1 Yes chr3L:12146519-12156990 lnc-C7orf33-5:1 Yes chr3L:12146519-12156990 lnc-CNTNAP2-1:1 No - lnc-C7orf33-2:1 No - lnc-C7orf33-2:2 No - lnc-EZH2-1:2 No - lnc-C7orf33-4:1 No - lnc-EZH2-7:4 No - lnc-EZH2-7:1 Yes chr2R:7916856-7921579 lnc-EZH2-7:3 Yes chr2R:7916856-7921579 lnc-PDIA4-4:1 Yes chr3L:10634575-10638130 lnc-CUL1-1:1 No - lnc-CUL1-1:5 No - lnc-CUL1-3:1 No - lnc-EZH2-5:1 No - lnc-EZH2-5:6 No - lnc-ZNF398-3:1 No - lnc-ZNF398-2:1 No - lnc-ZNF786-1:2 No - lnc-ZNF786-1:1 No - lnc-ZNF786-2:1 No - lnc-ZNF425-1:1 No - lnc-ZNF212-2:2 No - lnc-ZNF783-3:5 No - lnc-ZNF783-3:3 No - lnc-ZNF783-3:4 No - lnc-ZNF783-3:6 No - lnc-ZNF783-3:8 No - lnc-ZNF783-3:9 No - lnc-ZNF777-3:1 No - lnc-ZNF783-4:1 No - lnc-ZNF777-1:2 No - lnc-ZNF777-2:1 No - lnc-ZNF746-3:8 No - lnc-ZNF746-3:6 No - lnc-ZNF746-3:5 No - lnc-ZNF746-3:9 No - lnc-ZNF746-3:4 No - lnc-ZNF746-3:7 No - lnc-ZNF746-3:3 No - lnc-SSPO-1:1 No - ATP6V0E2-AS1:8 Yes chr3L:21539862-21541215 ATP6V0E2-AS1:1 Yes chr3L:21539862-21541215 ATP6V0E2-AS1:4 No - lnc-ATP6V0E2-3:1 No - ATP6V0E2-AS1:3 No - lnc-ZNF467-4:1 No - lnc-ATP6V0E2-2:5 No - lnc-ATP6V0E2-2:6 No - lnc-ATP6V0E2-2:7 No - lnc-ATP6V0E2-2:8 No - lnc-ATP6V0E2-2:9 No - lnc-ACTR3C-2:3 No - lnc-LRRC61-6:1 No - lnc-LRRC61-5:1 No - lnc-LRRC61-3:1 No - lnc-ACTR3C-4:1 No - lnc-LRRC61-2:4 No - lnc-RARRES2-2:2 No - lnc-RARRES2-3:2 No - lnc-RARRES2-5:1 No - lnc-GIMAP6-5:1 No - lnc-GIMAP6-4:1 No - lnc-GIMAP6-3:1 No - lnc-GIMAP7-1:1 No - lnc-GIMAP6-1:1 No - lnc-GIMAP6-2:1 No - lnc-GIMAP5-1:1 No - lnc-TMEM176B-3:1 No - lnc-GIMAP5-7:1 No - lnc-GIMAP5-7:2 No - lnc-TMEM176B-1:1 No - lnc-ATG9B-2:12 No - lnc-ATG9B-2:11 No - lnc-ATG9B-2:9 No - lnc-ATG9B-3:1 No - lnc-FASTK-4:1 Yes chr2R:15569528-15571417 lnc-ASIC3-3:1 No - lnc-FASTK-3:1 Yes chr3L:9763544-9786466 lnc-TMUB1-1:3 No - lnc-TMUB1-1:2 No - lnc-TMUB1-1:1 No - lnc-FASTK-2:1 No - lnc-GBX1-1:1 Yes chr2R:9195205-9199870 lnc-SMARCD3-1:1 No - lnc-ABCF2-2:1 Yes chrX:13095571-13112462 lnc-ABCF2-3:1 Yes chrX:13157445-13159508 lnc-ABCF2-3:2 Yes chrX:13157445-13159508 lnc-WDR86-2:2 Yes chr3R:25506275-25508279 lnc-WDR86-2:1 Yes chr3R:25506275-25508279 lnc-WDR86-1:1 No - lnc-NUB1-3:1 No - lnc-CRYGN-2:2 No - lnc-CRYGN-2:1 No - WDR86-AS1:5 No - WDR86-AS1:6 No - lnc-CRYGN-1:1 No - lnc-CRYGN-1:2 No - lnc-CRYGN-1:3 No - lnc-RHEB-1:1 No - lnc-CRYGN-3:2 Yes chr3R:5568921-5570491 lnc-CRYGN-3:1 Yes chr3R:5568921-5570491 lnc-RHEB-2:1 Yes chr3R:21140739-21214269 lnc-RHEB-3:1 Yes chr3R:21140739-21214269 lnc-GALNTL5-2:3 Yes chr3R:21140739-21214269 lnc-GALNTL5-2:4 Yes chr3R:21140739-21214269 lnc-GALNTL5-2:5 Yes chr3R:21140739-21214269 lnc-GALNTL5-2:6 Yes chr3R:21140739-21214269 lnc-KMT2C-4:2 Yes chr3R:21140739-21214269 lnc-KMT2C-3:2 Yes chr3R:21140739-21214269 PRKAG2-AS1:3 Yes chr3R:21140739-21214269 PRKAG2-AS1:4 No - PRKAG2-AS1:5 No - PRKAG2-AS1:6 No - PRKAG2-AS1:11 No - lnc-GALNT11-10:1 Yes chr2L:14359252-14361411 lnc-KMT2C-1:3 Yes chr2L:14359252-14361411 lnc-GALNT11-2:1 No - lnc-PRKAG2-3:1 Yes chrX:1881313-1889950 lnc-PRKAG2-4:1 Yes chrX:1881313-1889950 lnc-XRCC2-10:1 Yes chrX:1881313-1889950 lnc-XRCC2-8:1 Yes chrX:1881313-1889950 lnc-GALNT11-6:1 Yes chrX:1881313-1889950 lnc-ACTR3B-5:1 No - lnc-XRCC2-6:1 No - lnc-XRCC2-5:1 No - lnc-XRCC2-7:1 No - lnc-ACTR3B-2:1 No - lnc-ACTR3B-3:1 No - lnc-ACTR3B-4:1 No - lnc-XRCC2-9:3 No - lnc-XRCC2-9:2 No - lnc-XRCC2-9:1 No - lnc-XRCC2-11:1 No - LINC01287:4 No - lnc-DPP6-7:1 No - lnc-PAXIP1-3:6 No - lnc-PAXIP1-3:7 No - lnc-PAXIP1-10:1 No - lnc-PAXIP1-9:1 No - lnc-HTR5A-5:2 No - lnc-DPP6-4:1 No - lnc-CNPY1-4:17 Yes chr3L:14020315-14029121 lnc-CNPY1-13:1 Yes chr3L:14020315-14029121 PAXIP1-AS1:1 No - HTR5A-AS1:2 Yes chr2R:19022325-19032642 HTR5A-AS1:1 Yes chr2R:19022325-19032642 lnc-HTR5A-2:1 No - lnc-PAXIP1-2:3 No - lnc-HTR5A-3:1 No - lnc-PAXIP1-23:2 No - lnc-PAXIP1-23:3 No - lnc-INSIG1-4:1 No - lnc-PAXIP1-24:1 No - lnc-PAXIP1-25:1 No - lnc-CNPY1-6:4 No - lnc-CNPY1-6:3 No - lnc-INSIG1-1:3 No - lnc-CNPY1-10:1 No - lnc-CNPY1-10:11 No - lnc-CNPY1-10:5 No - lnc-EN2-2:5 No - lnc-EN2-3:5 No - lnc-EN2-3:6 No - lnc-CNPY1-1:2 No - lnc-CNPY1-2:37 Yes chr2R:10050862-10052167 lnc-CNPY1-2:38 Yes chr2R:10050862-10052167 lnc-CNPY1-2:39 Yes chr2R:10050862-10052167 lnc-CNPY1-2:40 Yes chr2R:10050862-10052167 lnc-CNPY1-2:36 Yes chr2R:10050862-10052167 lnc-CNPY1-2:25 No - lnc-CNPY1-2:32 No - lnc-CNPY1-2:26 No - lnc-CNPY1-2:27 No - lnc-CNPY1-2:24 No - lnc-CNPY1-12:1 Yes chr3R:23128169-23141906 lnc-SHH-2:1 No - lnc-SHH-3:1 No - lnc-SHH-4:1 No - lnc-SHH-5:1 No - lnc-SHH-1:2 No - lnc-SHH-1:3 No - lnc-RBM33-1:5 No - lnc-RBM33-1:6 No - lnc-RNF32-53:1 No - lnc-RNF32-5:4 No - lnc-LMBR1-6:2 No - lnc-LMBR1-12:4 No - LINC01006:12 No - LINC00244:1 No - lnc-RNF32-2:1 No - lnc-RNF32-1:1 No - lnc-MNX1-23:2 No - lnc-MNX1-23:1 No - lnc-MNX1-22:1 No - lnc-MNX1-21:2 Yes chr3R:24805445-24814012 lnc-MNX1-21:3 Yes chr3R:24805445-24814012 lnc-MNX1-21:1 Yes chr3R:24805445-24814012 lnc-MNX1-7:1 Yes chr3R:24805445-24814012 lnc-NOM1-6:3 No - lnc-MNX1-3:1 Yes chr3L:7948186-7951563 lnc-LMBR1-4:1 Yes chr3L:7948186-7951563 lnc-NOM1-10:1 No - lnc-UBE3C-5:2 No - lnc-MNX1-4:1 No - lnc-MNX1-6:1 Yes chr2R:24197824-24202187 lnc-MNX1-6:2 Yes chr2R:24197824-24202187 lnc-DNAJB6-6:2 Yes chr2R:24197824-24202187 lnc-DNAJB6-5:1 Yes chr2R:24197824-24202187 lnc-DNAJB6-4:1 Yes chr2R:24197824-24202187 lnc-DNAJB6-4:2 Yes chr2R:24197824-24202187 lnc-DNAJB6-3:1 Yes chr2R:24197824-24202187 lnc-MNX1-8:1 Yes chr2R:24197824-24202187 lnc-MNX1-9:1 Yes chr2R:24197824-24202187 lnc-UBE3C-2:1 No - lnc-PTPRN2-3:1 No - lnc-DNAJB6-1:1 No - lnc-UBE3C-8:5 Yes chr2R:16203329-16221793 lnc-UBE3C-11:1 Yes chr2R:16203329-16221793 lnc-PTPRN2-1:3 No - lnc-DNAJB6-2:2 No - lnc-DNAJB6-7:4 No - lnc-DNAJB6-7:5 No - lnc-DNAJB6-7:8 No - lnc-DNAJB6-9:1 Yes chr2L:1008378-1048053 lnc-NCAPG2-5:1 Yes chr2L:1008378-1048053 lnc-DNAJB6-13:1 Yes chr2L:1008378-1048053 lnc-DNAJB6-13:2 Yes chr2L:1008378-1048053 lnc-DNAJB6-13:3 Yes chr2L:1008378-1048053 lnc-WDR60-12:1 Yes chr2L:1008378-1048053 LINC01022:1 No - lnc-NCAPG2-2:1 No - lnc-WDR60-10:1 No - lnc-ESYT2-1:1 Yes chr3R:24544719-24556549 lnc-WDR60-8:1 No - lnc-ESYT2-2:1 Yes chr2R:16230198-16234087 lnc-WDR60-9:1 No - lnc-WDR60-3:3 No - LINC00689:4 No - lnc-VIPR2-1:1 No - lnc-OR4F21-3:2 No - lnc-ZNF596-1:2 No - lnc-OR4F21-1:7 No - lnc-OR4F21-1:5 No - lnc-OR4F21-1:9 No - lnc-OR4F21-4:8 No - lnc-OR4F21-5:1 No - FAM87A:9 No - FAM87A:13 No - FAM87A:11 No - lnc-TDRP-3:1 Yes chr3L:11699496-11708553 lnc-ZNF596-6:1 Yes chr3L:11699496-11708553 lnc-TDRP-2:1 No - lnc-ERICH1-10:1 No - lnc-ERICH1-9:3 No - lnc-ERICH1-9:5 No - lnc-ERICH1-9:4 No - lnc-ERICH1-9:2 No - lnc-TDRP-5:2 No - lnc-TDRP-5:1 No - lnc-TDRP-6:1 No - lnc-ERICH1-7:10 No - lnc-ERICH1-7:11 No - lnc-ERICH1-7:9 No - lnc-ERICH1-11:1 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-CLN8-5:3 Yes chr2R:5702112-5705439 DLGAP2-AS1:2 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-DLGAP2-5:1 No - lnc-CLN8-3:1 No - lnc-CLN8-2:2 No - lnc-CLN8-2:3 No - lnc-ERICH1-19:9 No - lnc-ERICH1-19:5 No - lnc-ERICH1-19:1 No - lnc-ERICH1-19:4 No - lnc-ERICH1-19:6 No - lnc-CLN8-4:1 No - KBTBD11-OT1:1 No - KBTBD11-OT1:2 No - KBTBD11-OT1:4 No - lnc-ARHGEF10-1:1 No - lnc-MYOM2-1:3 No - lnc-MYOM2-1:4 No - lnc-MYOM2-15:1 Yes chr3L:3172817-3178580 lnc-MYOM2-8:1 No - lnc-MYOM2-9:1 No - lnc-CSMD1-16:1 No - lnc-CSMD1-14:1 No - lnc-MYOM2-11:1 No - lnc-MYOM2-4:9 No - lnc-MYOM2-4:10 No - lnc-MYOM2-14:1 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-ERICH1-15:1 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-ERICH1-16:1 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-ERICH1-17:1 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-ANGPT2-14:1 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-MCPH1-8:1 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-MCPH1-7:1 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-CSMD1-10:1 No - lnc-MCPH1-6:1 No - lnc-CSMD1-11:1 No - lnc-CSMD1-17:1 No - lnc-MCPH1-5:1 No - lnc-MCPH1-4:1 No - lnc-ANGPT2-12:1 No - lnc-ANGPT2-11:1 No - lnc-ANGPT2-2:5 No - lnc-XKR5-3:1 Yes chr2R:11895997-11903918 lnc-MCPH1-1:1 Yes chr2R:11895997-11903918 lnc-MCPH1-2:1 No - MCPH1-AS1:5 No - lnc-XKR5-10:1 No - lnc-XKR5-10:2 No - lnc-XKR5-2:1 No - lnc-AGPAT5-1:3 No - lnc-AGPAT5-1:4 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-AGPAT5-1:6 No - lnc-DEFA6-1:1 No - lnc-DEFA4-1:1 No - lnc-DEFA1-2:1 No - lnc-DEFA1-1:3 No - lnc-DEFA1-1:2 No - lnc-DEFA1B-1:1 No - lnc-DEFA3-1:1 No - lnc-DEFA3-2:1 No - lnc-DEFA5-1:1 No - lnc-USP17L1-1:1 No - lnc-DEFA5-2:1 No - lnc-USP17L1-4:1 No - FAM66B:9 No - FAM66B:6 No - FAM66B:8 No - FAM66B:7 No - FAM66B:2 No - lnc-USP17L1-3:1 No - FAM66B:5 No - lnc-USP17L4-2:1 No - FAM66B:4 No - lnc-USP17L4-1:1 No - lnc-DEFB106B-1:1 No - lnc-DEFB106B-3:2 No - lnc-PRR23D1-1:1 No - lnc-PRR23D2-2:1 No - lnc-PRR23D2-1:1 No - lnc-DEFB107A-1:1 No - lnc-DEFB105A-1:1 No - lnc-USP17L8-2:1 No - FAM66E:1 No - lnc-USP17L8-3:1 No - lnc-USP17L3-4:1 No - lnc-USP17L3-5:1 No - lnc-USP17L3-6:1 No - lnc-USP17L3-11:1 No - lnc-USP17L3-10:1 No - lnc-ZNF705B-2:1 No - lnc-ZNF705B-1:5 No - lnc-ZNF705B-1:6 No - lnc-PRAG1-7:6 No - lnc-ZNF705B-1:7 No - lnc-PRAG1-7:5 No - lnc-ZNF705B-1:8 No - lnc-PRAG1-7:1 No - lnc-PRAG1-7:4 No - lnc-PRAG1-7:3 No - lnc-PRAG1-7:2 No - lnc-ZNF705B-1:9 No - lnc-ZNF705B-1:10 No - lnc-ZNF705B-1:11 No - lnc-PRAG1-6:1 No - lnc-CLDN23-6:1 No - lnc-PRAG1-5:1 No - lnc-CLDN23-5:1 No - lnc-PRAG1-8:1 No - lnc-CLDN23-1:4 No - lnc-PRAG1-9:1 No - lnc-PPP1R3B-10:1 No - lnc-PPP1R3B-10:3 No - lnc-PPP1R3B-10:2 No - lnc-ERI1-8:1 No - lnc-ERI1-6:1 No - lnc-MFHAS1-3:1 No - lnc-ERI1-5:1 No - lnc-ERI1-5:2 No - lnc-MFHAS1-2:2 No - lnc-CLDN23-8:1 No - lnc-ERI1-4:1 No - lnc-ERI1-4:2 No - lnc-ERI1-32:6 No - lnc-ERI1-32:9 No - lnc-ERI1-32:25 No - lnc-ERI1-32:26 No - lnc-ERI1-9:1 No - lnc-ERI1-11:4 No - lnc-ERI1-11:5 No - lnc-ERI1-11:7 No - lnc-ERI1-11:10 No - lnc-ERI1-11:11 No - lnc-TNKS-6:1 No - lnc-PPP1R3B-8:1 No - lnc-PPP1R3B-9:1 No - lnc-TNKS-5:1 No - lnc-TNKS-4:1 No - lnc-TNKS-3:1 No - lnc-TNKS-2:1 No - lnc-PPP1R3B-11:2 Yes chr3R:25653091-25661286 lnc-ERI1-7:2 Yes chr3R:25653091-25661286 LINC00599:7 No - LINC00599:5 No - LINC00599:6 No - LINC00599:4 No - lnc-PRSS55-4:1 Yes chr3L:15511052-15513202 lnc-PRSS51-9:1 Yes chr3L:15511052-15513202 lnc-PRSS51-8:1 Yes chr3L:15511052-15513202 lnc-MSRA-1:2 No - lnc-MSRA-2:1 No - lnc-MSRA-3:1 No - lnc-PRSS51-3:1 No - lnc-PRSS51-3:2 No - lnc-PRSS55-1:4 Yes chr3L:16339003-16345241 lnc-PRSS51-2:4 Yes chr3L:16339003-16345241 lnc-PRSS51-2:5 Yes chr3L:16339003-16345241 lnc-PRSS55-1:5 Yes chr3L:16339003-16345241 lnc-PRSS55-1:6 Yes chr3L:16339003-16345241 lnc-PRSS55-1:7 Yes chr3L:16339003-16345241 lnc-PRSS55-2:1 No - lnc-RP1L1-1:2 No - lnc-C8orf74-1:3 No - lnc-PINX1-1:1 Yes chr2R:14201390-14212413 lnc-SOX7-7:1 No - lnc-C8orf74-2:2 No - lnc-C8orf74-2:3 No - lnc-PINX1-2:1 No - lnc-PINX1-83:1 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-PINX1-84:4 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-PINX1-84:3 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-PINX1-85:3 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-PINX1-86:1 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-MTMR9-3:1 No - lnc-MTMR9-3:2 No - lnc-MTMR9-2:1 No - lnc-XKR6-2:1 No - lnc-FAM167A-3:1 No - lnc-FAM167A-3:2 Yes chr3L:8968528-8971752 lnc-SLC35G5-1:1 No - FAM167A-AS1:3 No - FAM167A-AS1:4 No - lnc-BLK-2:1 No - lnc-FAM167A-1:1 No - lnc-XKR6-4:1 No - lnc-SLC35G5-2:1 Yes chr3L:4592447-4626196 lnc-FAM167A-2:5 Yes chr3L:4592447-4626196 lnc-GATA4-2:1 No - lnc-GATA4-1:3 No - lnc-NEIL2-1:1 No - lnc-NEIL2-1:2 No - lnc-CTSB-3:2 No - lnc-NEIL2-2:2 No - lnc-DEFB136-2:1 Yes chrX:13779847-13782170 lnc-DEFB136-3:1 Yes chrX:13779847-13782170 lnc-CTSB-1:1 No - lnc-CTSB-2:1 No - lnc-DEFB135-1:1 No - lnc-DEFB134-1:1 No - lnc-DEFB134-2:1 No - lnc-DEFB130B-2:1 No - lnc-ZNF705D-2:20 No - lnc-ZNF705D-2:23 No - lnc-ZNF705D-2:25 No - lnc-ZNF705D-2:27 No - lnc-USP17L7-1:1 No - lnc-ZNF705D-2:30 No - lnc-USP17L2-2:1 No - lnc-FAM86B1-1:1 No - lnc-FAM86B1-1:2 No - lnc-USP17L2-3:3 Yes chrX:19243631-19245224 lnc-USP17L2-3:2 Yes chrX:19243631-19245224 lnc-ZNF705D-2:39 No - lnc-DEFB130A-1:1 No - lnc-ZNF705D-2:45 No - lnc-ZNF705D-2:46 No - lnc-ZNF705D-2:47 No - lnc-ZNF705D-2:48 No - lnc-FAM86B2-4:1 No - lnc-ZNF705D-4:2 No - lnc-FAM86B2-3:1 No - lnc-FAM86B2-2:1 No - lnc-FAM86B2-1:1 No - lnc-ZNF705D-2:50 No - lnc-ZNF705D-2:51 No - lnc-ZNF705D-6:1 No - lnc-ZNF705D-2:59 No - lnc-FAM86B2-58:3 No - lnc-FAM86B2-58:1 No - lnc-ZNF705D-2:60 No - lnc-TRMT9B-2:1 No - lnc-FAM86B2-58:7 No - lnc-LONRF1-6:1 No - lnc-LONRF1-5:1 No - lnc-LONRF1-4:1 No - lnc-FAM86B2-6:1 Yes chr3L:7777105-7809825 lnc-FAM86B2-7:1 Yes chr3L:7777105-7809825 lnc-LONRF1-3:1 Yes chr3L:7777105-7809825 lnc-LONRF1-1:5 No - lnc-C8orf48-10:1 Yes chr3R:25970080-25982736 lnc-C8orf48-9:1 Yes chr3R:25970080-25982736 lnc-DLC1-2:1 Yes chr3R:25970080-25982736 lnc-LONRF1-8:1 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-LONRF1-9:2 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-LONRF1-9:1 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-SGCZ-5:1 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-C8orf48-1:5 No - lnc-C8orf48-1:6 No - lnc-C8orf48-5:1 No - lnc-C8orf48-5:2 No - lnc-C8orf48-6:1 No - lnc-SGCZ-3:1 No - lnc-C8orf48-8:1 Yes chrX:1735945-1754065 lnc-TUSC3-6:1 Yes chrX:1735945-1754065 lnc-MSR1-3:2 Yes chrX:1735945-1754065 lnc-TUSC3-2:1 No - lnc-MSR1-5:1 Yes chr2L:8306696-8308192 lnc-MSR1-4:1 No - lnc-TUSC3-3:1 No - lnc-TUSC3-3:2 No - lnc-MSR1-2:4 No - lnc-MSR1-2:3 No - lnc-TUSC3-4:1 No - lnc-MSR1-2:6 No - lnc-TUSC3-5:1 No - lnc-MSR1-2:2 No - lnc-MICU3-4:1 No - lnc-MSR1-1:13 No - lnc-MSR1-1:6 No - lnc-FGF20-3:1 No - lnc-MICU3-3:1 No - lnc-CNOT7-5:1 No - lnc-ZDHHC2-2:1 No - lnc-MTMR7-3:1 Yes chr3L:11998398-12002915 lnc-MTMR7-2:3 Yes chr3L:11998398-12002915 lnc-MTMR7-2:2 No - lnc-MTMR7-2:1 No - lnc-CNOT7-4:1 No - lnc-CNOT7-6:1 Yes chr2R:23389009-23396680 lnc-MTMR7-1:1 Yes chr2R:23389009-23396680 lnc-SLC7A2-1:1 No - lnc-PDGFRL-3:1 Yes chr3L:22881045-22893821 lnc-FGL1-3:7 No - lnc-FGL1-3:8 No - lnc-FGL1-3:6 No - lnc-FGL1-3:5 No - lnc-FGL1-3:3 No - lnc-FGL1-3:1 No - lnc-FGL1-3:2 No - lnc-FGL1-3:4 No - lnc-FGL1-1:1 No - lnc-MTUS1-1:1 No - lnc-MTUS1-2:1 No - lnc-MTUS1-3:2 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-MTUS1-3:1 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-PCM1-5:1 No - lnc-NAT1-7:2 No - lnc-FGL1-2:7 No - lnc-FGL1-2:6 No - lnc-FGL1-2:2 No - lnc-FGL1-2:3 No - lnc-FGL1-2:5 No - lnc-FGL1-2:4 No - lnc-FGL1-2:1 No - lnc-NAT1-3:12 No - lnc-NAT1-3:16 No - lnc-ASAH1-1:1 No - lnc-NAT1-3:24 No - lnc-ASAH1-2:1 No - lnc-NAT2-2:1 No - lnc-PSD3-2:1 No - lnc-CSGALNACT1-4:1 No - lnc-CSGALNACT1-3:2 No - lnc-CSGALNACT1-3:1 No - lnc-SH2D4A-2:8 No - lnc-SH2D4A-2:9 No - lnc-PSD3-1:10 No - lnc-PSD3-1:5 No - lnc-PSD3-1:9 No - lnc-PSD3-1:8 No - lnc-PSD3-1:7 No - lnc-SH2D4A-4:1 No - lnc-PSD3-1:6 No - lnc-PSD3-1:4 No - lnc-SLC18A1-3:3 Yes chr2R:10249220-10255495 lnc-SLC18A1-3:2 Yes chr2R:10249220-10255495 lnc-SLC18A1-3:6 Yes chr2R:10249220-10255495 lnc-SLC18A1-3:1 Yes chr2R:10249220-10255495 lnc-SLC18A1-3:4 Yes chr2R:10249220-10255495 lnc-SLC18A1-3:5 Yes chr2R:10249220-10255495 lnc-INTS10-2:2 Yes chr2R:10249220-10255495 lnc-SLC18A1-1:1 No - lnc-LZTS1-3:1 No - lnc-ATP6V1B2-7:1 No - lnc-ATP6V1B2-8:1 No - lnc-LZTS1-4:1 No - LINC02153:20 No - LINC02153:30 No - LINC02153:33 No - lnc-XPO7-3:4 No - lnc-GFRA2-3:1 No - lnc-GFRA2-4:1 Yes chrX:7324214-7328806 lnc-NPM2-3:1 Yes chrX:15927185-15933867 lnc-FGF17-2:1 No - lnc-DMTN-5:1 No - lnc-NUDT18-1:1 Yes chr3R:9516007-9520938 lnc-NUDT18-2:1 Yes chr3R:9516007-9520938 lnc-HR-1:1 Yes chr3R:9516007-9520938 lnc-LGI3-1:1 Yes chr2R:22925107-22932044 lnc-BMP1-1:2 No - lnc-SFTPC-2:3 Yes chr3R:24719697-24749125 lnc-PHYHIP-1:2 Yes chr3L:18107848-18109574 lnc-PHYHIP-3:1 No - lnc-PHYHIP-2:2 No - lnc-BIN3-6:1 No - lnc-SORBS3-2:1 Yes chrX:16554627-16560016 lnc-EGR3-4:1 No - BIN3-IT1:3 No - lnc-EGR3-2:1 No - lnc-EGR3-5:1 Yes chr2L:12707661-12708680 lnc-EGR3-7:1 Yes chr2L:12707661-12708680 lnc-RHOBTB2-2:4 Yes chr2L:12707661-12708680 lnc-RHOBTB2-3:1 Yes chr2L:12707661-12708680 lnc-PEBP4-1:3 Yes chr3L:20376242-20382398 lnc-PEBP4-2:4 No - lnc-PEBP4-3:2 No - lnc-PEBP4-3:1 No - lnc-TNFRSF10B-1:3 No - lnc-CHMP7-7:1 No - lnc-CHMP7-3:1 No - lnc-ENTPD4-2:1 Yes chr2R:21789623-21791580 lnc-TNFRSF10A-2:1 No - lnc-SLC25A37-1:9 No - lnc-NKX3-1-2:1 No - lnc-NKX3-1-1:1 Yes chr3R:21388880-21390449 lnc-NKX2-6-1:3 No - lnc-NKX2-6-1:2 No - lnc-STC1-4:1 No - lnc-ADAM28-1:1 No - lnc-NEFL-3:1 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-NEFL-3:3 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-NEFL-3:2 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-NEFL-5:1 No - lnc-NEFL-4:1 No - lnc-CDCA2-4:1 Yes chr3R:23781765-23801634 lnc-GNRH1-3:1 Yes chr3R:4400510-4402017 lnc-GNRH1-3:4 Yes chr3R:4400510-4402017 lnc-GNRH1-3:2 Yes chr3R:4400510-4402017 lnc-GNRH1-3:5 Yes chr3R:4400510-4402017 lnc-GNRH1-3:3 Yes chr3R:4400510-4402017 lnc-DOCK5-3:1 No - lnc-CDCA2-3:1 No - lnc-CDCA2-1:2 No - lnc-KCTD9-3:1 Yes chr2R:14772650-14807061 lnc-EBF2-2:1 No - lnc-PPP2R2A-4:1 No - lnc-EBF2-3:1 No - lnc-PNMA2-3:1 No - lnc-DPYSL2-1:1 No - lnc-DPYSL2-1:2 No - lnc-PNMA2-2:4 No - lnc-PNMA2-2:3 No - lnc-PNMA2-2:7 No - lnc-PNMA2-2:8 No - lnc-PNMA2-2:5 No - lnc-PNMA2-2:2 No - lnc-PNMA2-2:6 No - lnc-BNIP3L-2:1 No - lnc-DPYSL2-2:1 Yes chr3L:22035003-22065279 lnc-PNMA2-4:1 Yes chr3L:22035003-22065279 lnc-PNMA2-5:1 Yes chr3L:22035003-22065279 lnc-DPYSL2-3:1 Yes chr3L:22035003-22065279 lnc-STMN4-1:1 No - lnc-PTK2B-6:1 No - lnc-TRIM35-1:2 No - lnc-TRIM35-1:1 No - lnc-EPHX2-5:1 No - lnc-EPHX2-4:1 No - lnc-CLU-4:1 Yes chrX:8276200-8367169 lnc-CLU-3:1 Yes chrX:8276200-8367169 lnc-EPHX2-1:1 No - lnc-SCARA3-2:1 No - lnc-SCARA3-2:2 No - lnc-SCARA3-2:3 No - lnc-CLU-2:1 No - lnc-ESCO2-1:2 Yes chrX:7013887-7015009 lnc-ESCO2-1:3 Yes chrX:7013887-7015009 lnc-SCARA3-1:1 No - lnc-ESCO2-1:4 Yes chrX:7013887-7015009 lnc-PBK-1:1 Yes chrX:7013887-7015009 lnc-ESCO2-3:1 No - lnc-PBK-2:1 No - lnc-ELP3-1:1 No - lnc-ELP3-2:1 No - lnc-ZNF395-5:1 No - lnc-ZNF395-3:1 No - lnc-NUGGC-1:1 No - lnc-ZNF395-4:1 No - lnc-ZNF395-6:3 No - lnc-ZNF395-6:1 No - lnc-ZNF395-6:2 No - lnc-EXTL3-7:1 No - lnc-EXTL3-2:2 No - lnc-FZD3-6:1 Yes chr2R:19129589-19133706 lnc-FZD3-3:1 Yes chr2R:19129589-19133706 EXTL3-AS1:6 Yes chr2R:19129589-19133706 EXTL3-AS1:1 Yes chr2R:19129589-19133706 EXTL3-AS1:8 Yes chr2R:19129589-19133706 lnc-EXTL3-1:2 No - lnc-FBXO16-1:4 Yes chr3L:16103432-16105627 lnc-EXTL3-8:1 Yes chr3L:16103432-16105627 lnc-KIF13B-4:1 Yes chr3L:16103432-16105627 lnc-KIF13B-3:1 Yes chr3L:16103432-16105627 lnc-HMBOX1-1:3 No - lnc-HMBOX1-1:4 No - lnc-DUSP4-9:1 Yes chr2R:15515778-15532259 lnc-HMBOX1-10:1 Yes chr2R:15515778-15532259 lnc-HMBOX1-11:1 Yes chr2R:15515778-15532259 lnc-DUSP4-6:1 No - lnc-DUSP4-1:2 No - lnc-DUSP4-7:1 No - LINC00589:3 No - lnc-DUSP4-8:1 No - LINC00589:10 No - lnc-LEPROTL1-10:1 No - LINC00589:6 No - lnc-LEPROTL1-8:1 No - lnc-LEPROTL1-8:2 No - LINC02209:7 No - lnc-MBOAT4-5:1 No - lnc-MBOAT4-4:1 No - lnc-SARAF-2:1 Yes chr2R:24874976-24875865 lnc-MBOAT4-3:1 Yes chr2R:24874976-24875865 lnc-DCTN6-1:1 No - lnc-DCTN6-2:1 No - lnc-MBOAT4-6:1 No - lnc-MBOAT4-7:1 No - lnc-MBOAT4-8:1 No - RBPMS-AS1:3 No - lnc-SMIM18-5:1 No - lnc-SMIM18-3:1 No - lnc-SMIM18-2:1 No - lnc-SMIM18-2:2 No - lnc-GTF2E2-2:1 No - lnc-GSR-3:1 Yes chr3L:4287038-4288349 lnc-SMIM18-1:1 No - lnc-GSR-2:1 No - lnc-PPP2CB-2:1 No - lnc-TEX15-3:1 Yes chr2L:7827650-7833576 lnc-TEX15-3:2 Yes chr2L:7827650-7833576 lnc-TEX15-2:1 Yes chr2L:7827650-7833576 lnc-PPP2CB-1:1 Yes chr2L:7827650-7833576 lnc-TEX15-1:2 No - lnc-TEX15-1:1 No - lnc-TEX15-1:3 No - lnc-TEX15-1:4 No - lnc-PURG-2:1 No - lnc-TEX15-4:1 Yes chr4:558016-567257 lnc-PURG-3:1 No - lnc-PURG-1:3 No - lnc-WRN-4:4 No - lnc-WRN-5:3 No - lnc-WRN-6:2 No - lnc-PURG-4:1 No - lnc-WRN-9:1 No - NRG1-IT1:2 No - NRG1-IT1:6 No - NRG1-IT1:7 No - lnc-FUT10-3:1 No - lnc-NRG1-2:3 No - lnc-NRG1-2:4 No - lnc-NRG1-2:5 No - lnc-NRG1-2:6 No - lnc-NRG1-2:7 No - lnc-NRG1-2:8 No - lnc-NRG1-2:9 No - lnc-NRG1-4:1 No - lnc-FUT10-2:1 No - lnc-MAK16-8:1 No - lnc-TTI2-2:2 Yes chr2L:9428669-9431052 lnc-TTI2-2:1 Yes chr2L:9428669-9431052 lnc-TTI2-1:1 Yes chr2L:9428669-9431052 lnc-TTI2-1:3 Yes chr2L:9428669-9431052 lnc-TTI2-1:2 Yes chr2L:9428669-9431052 lnc-MAK16-6:1 No - lnc-DUSP26-4:1 No - lnc-MAK16-7:1 No - lnc-DUSP26-1:2 No - lnc-DUSP26-5:1 No - lnc-DUSP26-6:1 No - lnc-MAK16-9:1 No - lnc-DUSP26-7:1 No - lnc-MAK16-1:6 No - lnc-DUSP26-8:1 No - lnc-DUSP26-9:2 No - lnc-DUSP26-9:1 No - lnc-DUSP26-3:2 No - lnc-UNC5D-7:1 No - LINC01288:3 No - lnc-UNC5D-1:3 No - lnc-BRF2-20:1 No - lnc-BRF2-19:1 No - lnc-UNC5D-5:1 No - lnc-BRF2-18:1 No - lnc-UNC5D-6:1 No - lnc-BRF2-17:1 No - lnc-BRF2-16:1 No - lnc-BRF2-14:1 No - lnc-BRF2-13:2 No - lnc-BRF2-12:1 No - lnc-BRF2-10:1 No - lnc-KCNU1-1:1 No - LINC01605:10 No - lnc-ZNF703-3:4 No - lnc-BRF2-7:8 No - lnc-ADGRA2-2:1 No - lnc-ADGRA2-3:1 No - lnc-EIF4EBP1-3:1 No - lnc-BAG4-5:1 No - lnc-BAG4-4:1 No - lnc-BAG4-3:1 No - lnc-LSM1-2:1 Yes chr3L:13477541-13483515 lnc-NSD3-9:2 Yes chr2L:8134247-8159638 lnc-NSD3-9:3 Yes chr2L:8134247-8159638 lnc-NSD3-5:2 Yes chr2L:8134247-8159638 lnc-NSD3-5:1 Yes chr2L:8134247-8159638 lnc-NSD3-9:1 Yes chr2L:8134247-8159638 lnc-PLPP5-1:1 No - lnc-BAG4-7:4 No - lnc-PLPP5-2:1 Yes chr3R:27932982-27937853 lnc-PLPP5-3:1 Yes chr3R:27932982-27937853 lnc-PLPP5-4:1 Yes chr3R:27932982-27937853 lnc-FGFR1-1:2 Yes chr2R:24509508-24515320 lnc-NSD3-10:1 Yes chr3L:14075772-14083229 lnc-NSD3-11:1 Yes chr3L:14075772-14083229 lnc-NSD3-13:1 Yes chr3L:14075772-14083229 lnc-NSD3-12:1 Yes chr3L:14075772-14083229 lnc-C8orf86-4:1 Yes chr3L:14075772-14083229 lnc-C8orf86-4:2 Yes chr3L:14075772-14083229 lnc-LETM2-6:1 No - lnc-LETM2-7:1 No - lnc-C8orf86-3:1 No - lnc-LETM2-9:1 No - lnc-LETM2-8:1 No - lnc-C8orf86-1:5 No - lnc-C8orf86-1:6 No - lnc-C8orf86-5:2 No - lnc-PLEKHA2-5:1 No - lnc-PLEKHA2-5:2 No - lnc-TM2D2-5:1 No - lnc-TM2D2-5:2 No - lnc-PLEKHA2-4:1 No - lnc-HTRA4-2:1 No - lnc-HTRA4-1:1 No - lnc-C8orf86-7:1 Yes chrX:13782459-13783381 lnc-C8orf86-7:2 Yes chrX:13782459-13783381 lnc-TM2D2-4:1 No - lnc-TM2D2-6:1 No - lnc-ADAM32-1:2 No - lnc-ADAM32-1:3 No - lnc-ADAM32-1:4 No - lnc-ADAM32-1:5 No - lnc-ADAM32-1:6 No - lnc-ADAM32-1:7 No - lnc-ADAM32-1:8 No - lnc-ADAM32-1:9 No - lnc-ADAM32-1:11 No - lnc-ADAM32-1:12 No - lnc-ADAM32-1:14 No - lnc-ADAM32-1:15 No - lnc-ADAM2-4:2 No - lnc-ADAM2-6:4 No - lnc-ADAM2-6:3 No - lnc-ADAM2-6:2 No - lnc-ADAM2-6:1 No - lnc-ADAM2-6:11 No - lnc-ADAM2-6:7 No - lnc-ADAM2-6:6 No - lnc-ADAM2-6:9 No - lnc-ADAM2-6:5 No - lnc-ADAM18-2:2 No - lnc-ADAM18-1:3 No - lnc-ADAM18-1:4 No - lnc-ZMAT4-7:1 No - lnc-ZMAT4-6:1 No - lnc-IDO1-1:1 No - lnc-ADAM2-5:1 No - lnc-IDO2-1:2 No - lnc-TCIM-3:1 No - lnc-SFRP1-4:1 No - lnc-SFRP1-3:1 No - lnc-GOLGA7-3:2 No - lnc-GOLGA7-3:3 No - lnc-GOLGA7-3:4 No - lnc-SFRP1-2:1 Yes chrX:7106272-7110321 lnc-GOLGA7-1:1 No - lnc-GOLGA7-2:2 Yes chr3R:26055657-26056547 lnc-GINS4-1:1 No - lnc-GPAT4-3:1 No - lnc-GPAT4-2:1 Yes chr2R:24068757-24073552 lnc-GPAT4-2:2 Yes chr2R:24068757-24073552 lnc-GPAT4-2:3 Yes chr2R:24068757-24073552 lnc-NKX6-3-3:1 Yes chr3L:7655389-7718395 lnc-KAT6A-4:1 Yes chr3L:7655389-7718395 lnc-KAT6A-2:1 Yes chr3L:7655389-7718395 lnc-AP3M2-1:1 No - lnc-PLAT-6:1 No - lnc-PLAT-4:1 Yes chrX:7009006-7011145 lnc-KAT6A-3:3 Yes chr3L:9074643-9092131 lnc-KAT6A-3:2 Yes chr3L:9074643-9092131 lnc-KAT6A-3:1 Yes chr3L:9074643-9092131 lnc-IKBKB-3:1 No - lnc-PLAT-3:7 No - lnc-DKK4-5:1 No - lnc-SMIM19-3:1 Yes chr3L:11123348-11134663 lnc-DKK4-3:1 Yes chr3L:11123348-11134663 lnc-DKK4-4:1 No - lnc-DKK4-4:3 Yes chr3L:11123348-11134663 lnc-DKK4-4:2 No - lnc-SLC20A2-1:1 No - lnc-CHRNA6-2:1 Yes chrX:8276200-8367169 lnc-THAP1-2:2 Yes chrX:8276200-8367169 lnc-THAP1-2:1 Yes chrX:8276200-8367169 lnc-RNF170-2:1 No - lnc-HOOK3-2:1 No - lnc-FNTA-1:4 No - lnc-RNF170-3:1 No - lnc-RNF170-4:1 No - lnc-RNF170-5:1 No - lnc-RNF170-1:2 No - lnc-HGSNAT-1:1 No - lnc-HGSNAT-2:1 No - lnc-RNF170-6:1 No - lnc-RNF170-7:1 No - lnc-HGSNAT-4:1 No - lnc-HGSNAT-5:1 No - lnc-HGSNAT-6:1 No - lnc-HGSNAT-7:1 No - lnc-HGSNAT-8:1 No - lnc-RNF170-8:1 No - lnc-HGSNAT-9:1 No - lnc-HGSNAT-10:1 No - lnc-HGSNAT-11:1 No - lnc-HGSNAT-12:1 No - lnc-RNF170-9:1 No - lnc-SPIDR-10:1 No - lnc-SPIDR-9:1 No - lnc-SPIDR-6:1 No - lnc-CEBPD-14:1 No - lnc-SPIDR-7:1 No - lnc-SPIDR-5:1 No - lnc-CEBPD-12:1 No - LINC00293:2 No - lnc-CEBPD-10:1 No - lnc-SPIDR-8:1 No - LINC00293:4 No - LINC00293:6 No - LINC00293:7 No - LINC00293:10 No - LINC00293:11 No - lnc-CEBPD-5:1 No - lnc-CEBPD-6:1 No - lnc-SPIDR-4:1 No - lnc-SPIDR-1:4 No - lnc-SPIDR-1:5 No - lnc-SPIDR-1:6 No - lnc-CEBPD-11:7 No - lnc-CEBPD-8:1 No - lnc-CEBPD-9:1 No - lnc-CEBPD-11:1 No - lnc-MCM4-7:1 No - lnc-CEBPD-3:1 No - lnc-CEBPD-2:1 No - lnc-CEBPD-1:1 No - lnc-CEBPD-4:1 No - lnc-MCM4-2:1 No - lnc-MCM4-1:1 No - lnc-PRKDC-2:1 No - lnc-PRKDC-3:1 No - lnc-PRKDC-1:2 No - lnc-UBE2V2-3:1 No - lnc-EFCAB1-7:2 No - lnc-EFCAB1-7:1 No - lnc-EFCAB1-5:3 Yes chr2R:24602472-24603488 lnc-EFCAB1-5:4 Yes chr2R:24602472-24603488 lnc-EFCAB1-5:2 Yes chr2R:24602472-24603488 lnc-EFCAB1-5:1 Yes chr2R:24602472-24603488 lnc-PPDPFL-13:1 No - lnc-PPDPFL-8:1 No - lnc-PPDPFL-7:1 No - lnc-PPDPFL-7:2 No - lnc-SNAI2-1:1 No - lnc-PPDPFL-2:1 No - lnc-PPDPFL-9:1 No - lnc-PPDPFL-10:1 No - lnc-SNAI2-5:1 No - lnc-SNAI2-4:1 No - lnc-SNAI2-8:1 No - lnc-SNAI2-10:1 No - lnc-PPDPFL-14:1 Yes chr2R:16552258-16558486 lnc-PPDPFL-14:2 Yes chr2R:16552258-16558486 lnc-PPDPFL-15:1 Yes chr2R:16552258-16558486 lnc-PPDPFL-17:1 Yes chr2R:16552258-16558486 lnc-PXDNL-4:1 Yes chr2R:16552258-16558486 lnc-SNTG1-2:1 No - lnc-SNTG1-9:1 Yes chr3L:2601455-2630064 lnc-PCMTD1-2:1 Yes chr3L:2601455-2630064 lnc-PXDNL-3:1 No - lnc-NPBWR1-12:1 No - lnc-NPBWR1-12:15 No - lnc-NPBWR1-11:2 No - lnc-NPBWR1-11:3 No - lnc-PCMTD1-3:1 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-ST18-4:15 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-ST18-4:9 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-ST18-4:13 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-ST18-4:12 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-ST18-4:11 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-ST18-4:10 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-ST18-4:14 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-ST18-4:8 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-ALKAL1-4:1 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-ST18-4:5 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-ST18-4:7 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-ST18-4:2 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-ST18-4:6 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-ST18-4:3 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-ST18-4:4 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-ST18-4:1 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-ALKAL1-3:1 Yes chr3R:5669713-5679930 lnc-NPBWR1-7:6 Yes chr3R:5669713-5679930 lnc-NPBWR1-2:1 Yes chr3R:5669713-5679930 lnc-RB1CC1-1:1 Yes chr3L:18560258-18576326 lnc-NPBWR1-3:1 No - lnc-OPRK1-4:1 Yes chr3L:18560258-18576326 lnc-OPRK1-3:5 No - lnc-OPRK1-3:6 No - lnc-OPRK1-3:4 No - lnc-OPRK1-3:3 No - lnc-OPRK1-3:2 No - lnc-OPRK1-3:13 No - lnc-OPRK1-3:14 No - lnc-RGS20-4:1 No - lnc-RGS20-3:1 No - lnc-TCEA1-3:2 Yes chr2L:16722883-16727826 lnc-TCEA1-3:4 Yes chr2L:16722883-16727826 lnc-TCEA1-3:1 Yes chr2L:16722883-16727826 lnc-TCEA1-3:3 Yes chr2L:16722883-16727826 lnc-TCEA1-2:1 Yes chr2L:16722883-16727826 lnc-TCEA1-2:2 Yes chr2L:16722883-16727826 lnc-ATP6V1H-5:1 Yes chr2R:17792870-17800677 lnc-MRPL15-3:1 Yes chr2R:17792870-17800677 lnc-LYPLA1-2:3 Yes chrX:15644222-15644991 lnc-RGS20-2:1 No - lnc-LYPLA1-1:5 No - lnc-LYPLA1-1:3 No - lnc-LYPLA1-1:4 No - lnc-TCEA1-1:4 Yes chr3L:11628037-11630749 lnc-TCEA1-1:5 Yes chr3L:11628037-11630749 lnc-TCEA1-1:3 Yes chr3L:11628037-11630749 lnc-TCEA1-1:2 Yes chr3L:11628037-11630749 lnc-TCEA1-1:1 Yes chr3L:11628037-11630749 lnc-LYPLA1-3:1 No - lnc-MRPL15-2:1 No - lnc-SOX17-3:1 No - lnc-SOX17-1:2 No - lnc-SOX17-2:1 No - lnc-LYPLA1-5:1 No - lnc-LYPLA1-6:1 Yes chr2R:14201390-14212413 lnc-LYPLA1-7:1 No - lnc-TMEM68-3:1 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-TGS1-3:1 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-XKR4-3:1 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-TGS1-2:2 No - lnc-RPS20-4:1 Yes chrX:11339873-11344734 lnc-RPS20-3:1 Yes chrX:11339873-11344734 lnc-LYN-7:1 No - lnc-LYN-6:1 No - lnc-LYN-5:1 No - lnc-TMEM68-2:1 No - lnc-LYN-4:1 No - lnc-LYN-3:1 No - lnc-TGS1-1:2 Yes chr3L:4592447-4626196 lnc-RPS20-2:1 Yes chr3L:4592447-4626196 lnc-RPS20-1:1 No - lnc-MOS-1:3 Yes chr3R:20822181-20823356 lnc-MOS-1:2 Yes chr3R:20822181-20823356 lnc-MOS-1:1 Yes chr3R:20822181-20823356 lnc-MOS-2:1 No - lnc-PLAG1-1:1 No - lnc-PLAG1-2:1 No - lnc-PENK-4:2 No - lnc-PENK-4:1 No - lnc-SDR16C5-1:1 No - lnc-SDR16C5-2:1 No - lnc-CHCHD7-4:1 No - lnc-CHCHD7-1:3 No - LINC00968:15 No - LINC00968:2 No - lnc-CHCHD7-5:1 No - lnc-CHCHD7-7:1 No - lnc-CHCHD7-8:1 No - lnc-CHCHD7-9:1 No - LINC01606:3 No - lnc-IMPAD1-1:2 No - LINC01606:8 No - LINC01606:9 No - LINC01606:14 No - LINC01606:15 No - LINC01606:17 No - lnc-FAM110B-13:1 No - lnc-FAM110B-5:3 No - lnc-FAM110B-5:4 No - lnc-FAM110B-5:5 No - lnc-FAM110B-12:2 No - lnc-FAM110B-4:4 No - lnc-FAM110B-4:5 No - lnc-FAM110B-1:3 No - lnc-FAM110B-1:4 No - lnc-FAM110B-1:5 No - lnc-FAM110B-1:6 No - lnc-FAM110B-1:7 No - lnc-FAM110B-1:8 No - lnc-CYP7A1-8:1 No - lnc-FAM110B-1:9 No - lnc-CYP7A1-1:9 No - lnc-CYP7A1-1:8 No - lnc-CYP7A1-1:7 No - lnc-CYP7A1-6:7 No - lnc-CYP7A1-6:5 No - lnc-CYP7A1-6:6 No - lnc-CYP7A1-6:1 No - lnc-CYP7A1-6:4 No - lnc-CYP7A1-6:2 No - lnc-CYP7A1-6:3 No - lnc-CYP7A1-7:1 No - lnc-TOX-2:1 No - lnc-SDCBP-2:4 No - lnc-SDCBP-2:5 No - lnc-TOX-4:1 No - lnc-RAB2A-7:1 No - lnc-RAB2A-6:1 No - lnc-RAB2A-1:4 No - lnc-RAB2A-5:1 No - LINC01301:7 No - LINC01301:18 No - lnc-CA8-9:1 No - lnc-CA8-14:1 No - lnc-CA8-14:6 No - lnc-CA8-14:2 No - lnc-CHD7-2:1 No - lnc-CLVS1-1:6 No - lnc-CLVS1-1:7 No - lnc-ASPH-5:3 No - lnc-CLVS1-4:1 No - lnc-ASPH-4:2 Yes chr2L:19435850-19442727 lnc-ASPH-3:3 Yes chr2L:19435850-19442727 lnc-CA8-13:3 Yes chr2R:16110331-16116996 lnc-CA8-13:4 Yes chr2R:16110331-16116996 lnc-CA8-13:2 Yes chr2R:16110331-16116996 lnc-CA8-12:1 Yes chr2R:16110331-16116996 lnc-CA8-13:5 Yes chr2R:16110331-16116996 lnc-CA8-13:1 Yes chr2R:16110331-16116996 lnc-GGH-4:3 Yes chr2R:16110331-16116996 lnc-CLVS1-5:1 Yes chr2R:16110331-16116996 lnc-GGH-4:4 Yes chr2R:16110331-16116996 lnc-GGH-4:2 Yes chr2R:16110331-16116996 lnc-GGH-4:1 Yes chr2R:16110331-16116996 lnc-NKAIN3-14:6 No - lnc-CLVS1-2:2 No - lnc-ASPH-2:3 No - lnc-NKAIN3-14:11 No - lnc-NKAIN3-13:1 No - lnc-NKAIN3-10:1 No - lnc-GGH-3:1 Yes chr2R:24881570-24888615 lnc-GGH-2:1 Yes chr2R:24881570-24888615 NKAIN3-IT1:6 Yes chr2R:24881570-24888615 NKAIN3-IT1:9 Yes chr2R:24881570-24888615 lnc-TTPA-5:1 Yes chr3L:16234140-16236999 lnc-TTPA-4:1 Yes chr3L:16234140-16236999 lnc-TTPA-3:1 Yes chr3L:16234140-16236999 lnc-NKAIN3-9:1 Yes chr3L:16234140-16236999 lnc-TTPA-2:1 Yes chr3R:23710158-23711338 lnc-TTPA-6:1 No - YTHDF3-AS1:1 No - lnc-TTPA-8:1 No - lnc-TTPA-1:8 No - lnc-YTHDF3-6:1 No - lnc-TTPA-10:1 No - LINC01289:3 No - lnc-BHLHE22-8:1 No - lnc-BHLHE22-3:4 No - MIR124-2HG:2 No - MIR124-2HG:10 No - MIR124-2HG:15 No - MIR124-2HG:16 No - lnc-CYP7B1-9:1 No - lnc-CYP7B1-7:1 No - lnc-CYP7B1-8:1 No - lnc-BHLHE22-7:1 No - lnc-CYP7B1-10:1 No - lnc-BHLHE22-9:1 No - lnc-MTFR1-4:1 No - LINC00251:4 No - lnc-MTFR1-3:1 No - LINC01299:3 No - lnc-ARMC1-3:1 No - lnc-PDE7A-3:1 No - lnc-DNAJC5B-1:3 No - lnc-PDE7A-4:6 No - lnc-PDE7A-4:5 No - lnc-PDE7A-4:4 No - lnc-PDE7A-4:3 No - lnc-PDE7A-4:2 No - lnc-ARMC1-5:1 No - lnc-PDE7A-5:1 No - lnc-TRIM55-1:9 No - lnc-DNAJC5B-3:1 Yes chr2L:10544883-10628054 LINC00967:4 No - RRS1-AS1:13 No - lnc-RRS1-2:1 No - RRS1-AS1:2 No - lnc-ADHFE1-2:1 No - lnc-VCPIP1-2:1 Yes chrX:15854832-15857823 lnc-MYBL1-2:1 Yes chrX:15854832-15857823 lnc-MYBL1-2:2 Yes chrX:15854832-15857823 lnc-VCPIP1-1:1 No - lnc-C8orf44-1:1 No - lnc-TCF24-4:1 No - SNHG6:5 No - SNHG6:6 No - SNHG6:7 No - SNHG6:8 No - SNHG6:9 No - SNHG6:10 No - lnc-PPP1R42-2:1 Yes chr2R:17757405-17760517 lnc-PPP1R42-1:12 No - lnc-PPP1R42-1:9 No - lnc-PPP1R42-1:11 No - lnc-PPP1R42-1:10 No - lnc-PPP1R42-1:7 No - lnc-PPP1R42-1:8 No - lnc-PPP1R42-1:5 No - lnc-PPP1R42-1:2 No - lnc-PPP1R42-1:4 No - lnc-PPP1R42-1:6 No - lnc-PPP1R42-1:3 No - lnc-COPS5-3:4 No - lnc-COPS5-3:3 No - lnc-COPS5-3:2 No - lnc-PPP1R42-4:1 No - lnc-ARFGEF1-1:1 No - lnc-COPS5-2:1 No - lnc-COPS5-4:1 Yes chr2L:13793521-13799674 lnc-CSPP1-1:2 No - lnc-CSPP1-1:3 Yes chrX:17080423-17087675 lnc-CSPP1-2:1 No - lnc-CSPP1-3:1 Yes chrX:17080423-17087675 lnc-C8orf34-2:1 No - lnc-PREX2-2:1 No - lnc-CPA6-5:2 No - C8orf34-AS1:3 No - C8orf34-AS1:2 No - LINC01592:7 No - lnc-SLCO5A1-11:1 No - lnc-C8orf34-1:2 No - lnc-SLCO5A1-10:1 No - lnc-SLCO5A1-9:1 No - lnc-C8orf34-1:11 No - lnc-SULF1-2:2 No - lnc-SULF1-6:1 No - lnc-SULF1-4:1 No - lnc-C8orf34-4:1 Yes chr3R:16310542-16339575 lnc-C8orf34-5:1 Yes chr3R:16310542-16339575 lnc-C8orf34-5:2 Yes chr3R:16310542-16339575 lnc-C8orf34-6:1 Yes chr3R:16310542-16339575 lnc-C8orf34-6:2 Yes chr3R:16310542-16339575 lnc-SULF1-5:1 No - lnc-SULF1-7:1 No - lnc-PRDM14-5:1 No - lnc-PRDM14-5:2 No - lnc-SULF1-3:5 No - lnc-SULF1-3:6 No - lnc-SLCO5A1-5:1 No - lnc-SLCO5A1-6:1 No - lnc-SLCO5A1-7:1 No - lnc-PRDM14-2:1 No - lnc-PRDM14-1:2 No - lnc-PRDM14-3:1 No - lnc-XKR9-3:1 No - lnc-NCOA2-2:1 No - lnc-XKR9-1:10 No - lnc-NCOA2-1:2 No - lnc-TRAM1-4:1 No - lnc-TRAM1-1:4 No - lnc-TRAM1-1:3 No - lnc-TRAM1-1:2 No - LACTB2-AS1:3 No - LACTB2-AS1:4 Yes chr2L:8125668-8126890 LACTB2-AS1:5 Yes chr2L:8125668-8126890 LACTB2-AS1:6 Yes chr2L:8125668-8126890 lnc-TRAM1-2:1 Yes chr2L:8125668-8126890 lnc-TRAM1-2:2 Yes chr2L:8125668-8126890 lnc-TRAM1-3:1 Yes chr2L:8125668-8126890 lnc-MSC-6:1 Yes chr2L:6527447-6546976 lnc-MSC-5:1 Yes chr2L:6527447-6546976 lnc-EYA1-2:8 Yes chr2L:6527447-6546976 lnc-EYA1-2:5 Yes chr2L:6527447-6546976 lnc-EYA1-2:7 Yes chr2L:6527447-6546976 lnc-EYA1-2:6 Yes chr2L:6527447-6546976 lnc-KCNB2-12:1 No - lnc-KCNB2-10:1 No - lnc-KCNB2-10:2 No - lnc-TRPA1-2:2 Yes chr2R:17757405-17760517 lnc-TRPA1-2:1 Yes chr2R:17757405-17760517 lnc-KCNB2-9:1 No - MSC-AS1:10 No - MSC-AS1:12 No - lnc-MSC-2:1 Yes chr3L:8894404-8904790 lnc-MSC-3:2 Yes chr3L:8894404-8904790 lnc-MSC-3:1 Yes chr3L:8894404-8904790 lnc-MSC-4:1 Yes chr3L:8894404-8904790 lnc-SBSPON-5:1 Yes chr3L:2895017-2959579 lnc-KCNB2-1:2 No - lnc-TERF1-1:2 No - lnc-SBSPON-3:1 No - lnc-SBSPON-2:1 Yes chrX:10967722-11039901 lnc-C8orf89-5:2 No - lnc-C8orf89-5:1 No - lnc-C8orf89-5:3 No - lnc-RPL7-4:1 No - lnc-C8orf89-3:1 Yes chr2L:12056326-12058251 lnc-C8orf89-4:1 Yes chr2L:12056326-12058251 lnc-RPL7-2:3 Yes chr2L:21057706-21071502 lnc-RPL7-2:4 No - lnc-RPL7-6:1 Yes chr2R:18117896-18125779 lnc-RPL7-8:1 Yes chr2R:18117896-18125779 lnc-RDH10-5:1 Yes chr2R:18117896-18125779 lnc-TMEM70-6:1 Yes chr2R:18117896-18125779 lnc-UBE2W-1:2 No - lnc-UBE2W-1:4 No - lnc-UBE2W-1:3 No - lnc-UBE2W-1:5 No - lnc-UBE2W-1:1 No - lnc-STAU2-3:4 No - lnc-TMEM70-5:1 No - lnc-TMEM70-1:6 No - lnc-LY96-3:2 Yes chr3L:7640798-7641648 lnc-TMEM70-4:1 No - lnc-LY96-5:1 No - lnc-GDAP1-1:2 No - lnc-JPH1-8:1 Yes chr3L:5141953-5144317 lnc-JPH1-10:1 No - lnc-CRISPLD1-1:2 No - CASC9:2 No - CASC9:3 No - CASC9:7 No - CASC9:11 No - lnc-HNF4G-4:1 No - lnc-HNF4G-3:1 No - lnc-HNF4G-2:1 Yes chr2L:8687226-8709611 lnc-PEX2-10:1 No - lnc-ZFHX4-8:1 No - lnc-PEX2-8:1 No - lnc-ZFHX4-2:5 No - lnc-ZFHX4-2:6 No - ZFHX4-AS1:3 Yes chr4:501810-540874 lnc-PEX2-6:1 Yes chr4:501810-540874 lnc-IL7-4:1 Yes chr3L:8339051-8340276 lnc-ZFHX4-6:1 Yes chr3L:8339051-8340276 lnc-ZFHX4-6:2 Yes chr3L:8339051-8340276 lnc-ZFHX4-6:3 No - lnc-PEX2-4:1 No - lnc-ZFHX4-3:6 No - lnc-IL7-2:2 No - lnc-IL7-2:1 No - lnc-PKIA-3:2 No - lnc-HEY1-3:1 No - lnc-ZC2HC1A-4:1 No - lnc-HEY1-2:1 No - lnc-STMN2-2:1 No - lnc-MRPS28-5:1 Yes chr2R:7995438-7998278 lnc-MRPS28-4:1 Yes chr2R:7995438-7998278 lnc-STMN2-4:1 No - lnc-TPD52-4:1 No - lnc-TPD52-2:1 No - lnc-TPD52-3:12 No - lnc-TPD52-3:11 No - lnc-TPD52-3:13 No - lnc-TPD52-3:14 No - lnc-TPD52-3:10 No - lnc-TPD52-3:4 No - lnc-TPD52-3:9 No - lnc-TPD52-3:8 No - lnc-MRPS28-3:12 No - lnc-TPD52-3:7 Yes chr2R:18421413-18426221 lnc-TPD52-3:6 Yes chr2R:18421413-18426221 lnc-TPD52-3:3 Yes chr2R:18421413-18426221 lnc-ZBTB10-6:1 Yes chr2R:18421413-18426221 lnc-ZBTB10-4:1 No - lnc-ZNF704-7:2 No - lnc-ZNF704-7:1 No - lnc-ZNF704-7:4 No - lnc-ZBTB10-1:2 No - lnc-ZNF704-4:1 No - lnc-ZNF704-3:1 No - lnc-ZNF704-2:1 No - lnc-PAG1-11:1 Yes chr3R:9874681-9995364 lnc-PAG1-10:1 Yes chr3R:9874681-9995364 lnc-PAG1-9:1 Yes chr3R:9874681-9995364 lnc-PAG1-8:1 Yes chr3R:9874681-9995364 lnc-PAG1-7:1 Yes chr3R:9874681-9995364 lnc-PAG1-6:1 Yes chr3R:9874681-9995364 lnc-PAG1-5:1 Yes chr3R:9874681-9995364 lnc-PAG1-4:1 Yes chr3R:9874681-9995364 lnc-ZNF704-9:1 No - lnc-ZNF704-5:1 No - lnc-ZNF704-8:1 No - lnc-PAG1-2:1 No - lnc-FABP5-2:5 No - lnc-PAG1-3:1 No - lnc-PMP2-1:4 Yes chr3R:11559896-11567054 lnc-PMP2-1:3 Yes chr3R:11559896-11567054 lnc-FABP9-1:1 Yes chr3R:11559896-11567054 lnc-FABP9-1:2 Yes chr3R:11559896-11567054 lnc-IMPA1-3:1 No - lnc-IMPA1-2:1 No - lnc-CHMP4C-8:1 No - lnc-IMPA1-1:1 No - lnc-SLC10A5-2:1 Yes chr3L:21266680-21268335 lnc-SLC10A5-2:2 Yes chr3L:21266680-21268335 lnc-SLC10A5-1:2 No - lnc-ZFAND1-1:11 No - lnc-ZFAND1-1:12 No - lnc-ZFAND1-1:9 No - lnc-ZFAND1-1:1 No - lnc-ZFAND1-1:8 No - lnc-ZFAND1-1:3 No - lnc-ZFAND1-1:10 No - lnc-ZFAND1-1:2 No - lnc-ZFAND1-2:1 Yes chr2R:17725030-17726847 lnc-CHMP4C-3:2 No - LINC02235:5 No - lnc-CHMP4C-10:1 No - lnc-RALYL-6:1 No - lnc-SNX16-5:1 No - lnc-SNX16-6:1 No - LINC01419:2 No - lnc-RALYL-3:1 No - lnc-C8orf59-6:1 No - lnc-LRRCC1-3:1 Yes chr3L:7423827-7454717 lnc-C8orf59-5:1 Yes chr3L:7423827-7454717 lnc-C8orf59-4:1 Yes chr3L:7423827-7454717 lnc-RALYL-4:1 No - lnc-C8orf59-3:1 No - lnc-LRRCC1-1:1 No - lnc-CA1-3:1 No - lnc-CA1-2:1 No - lnc-CA1-2:2 No - lnc-CA1-2:3 No - lnc-CA13-1:3 Yes chr2L:13803626-13809994 lnc-C8orf59-1:2 Yes chr2L:13803626-13809994 lnc-C8orf59-9:1 Yes chr2L:13803626-13809994 lnc-C8orf59-9:2 Yes chr2L:13803626-13809994 CA3-AS1:6 Yes chr2L:13803626-13809994 CA3-AS1:5 Yes chr2L:13803626-13809994 lnc-CA1-4:1 No - lnc-ATP6V0D2-2:3 No - lnc-WWP1-12:1 Yes chrX:3880748-3882967 lnc-WWP1-3:1 Yes chrX:3880748-3882967 lnc-SLC7A13-3:1 No - lnc-SLC7A13-1:3 No - lnc-CNGB3-3:2 No - lnc-CNGB3-3:1 No - lnc-CNGB3-2:1 No - lnc-CNGB3-1:1 No - lnc-RMDN1-2:1 Yes chr2R:21692691-21697152 lnc-CNBD1-1:2 No - lnc-DCAF4L2-5:1 No - lnc-DCAF4L2-4:1 No - lnc-CNBD1-3:2 No - lnc-DCAF4L2-3:1 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-MMP16-2:1 No - lnc-CNBD1-6:1 No - lnc-CNBD1-4:7 No - lnc-MMP16-4:1 No - lnc-NBN-7:1 No - lnc-NBN-6:1 No - lnc-NBN-1:12 No - lnc-NBN-1:14 No - lnc-RIPK2-2:1 No - lnc-NBN-1:13 No - lnc-NBN-4:1 No - lnc-OSGIN2-1:1 No - lnc-NBN-2:1 No - lnc-CALB1-4:1 Yes chr3L:9720414-9723194 lnc-CALB1-3:1 Yes chr3L:9720414-9723194 lnc-CALB1-2:1 Yes chr3L:9720414-9723194 lnc-CALB1-1:1 Yes chr2R:16973927-16996057 lnc-CALB1-1:2 Yes chr2R:16973927-16996057 lnc-NBN-3:3 Yes chr2R:16973927-16996057 lnc-NBN-3:2 Yes chr2R:16973927-16996057 lnc-NBN-3:1 Yes chr2R:16973927-16996057 LINC00534:3 No - lnc-CALB1-5:1 No - lnc-TMEM64-4:1 No - lnc-NECAB1-5:1 No - lnc-NECAB1-4:1 Yes chr3L:22728111-22733446 lnc-C8orf88-1:2 Yes chr3L:22728111-22733446 lnc-C8orf88-1:1 No - lnc-NECAB1-3:1 Yes chr3L:22728111-22733446 OTUD6B-AS1:7 No - lnc-OTUD6B-2:1 No - OTUD6B-AS1:1 Yes chr3L:15503600-15504894 lnc-OTUD6B-6:1 Yes chr2R:20236235-20239200 lnc-SLC26A7-2:1 No - lnc-RUNX1T1-7:1 No - lnc-PIP4P2-5:1 Yes chr2R:24275734-24291084 lnc-PIP4P2-2:1 Yes chr2R:24275734-24291084 lnc-TRIQK-10:1 Yes chr2R:24275734-24291084 lnc-TRIQK-9:2 Yes chr2R:24275734-24291084 lnc-TRIQK-9:4 Yes chr2R:24275734-24291084 lnc-TRIQK-9:5 Yes chr2R:24275734-24291084 lnc-TRIQK-9:6 Yes chr2R:24275734-24291084 lnc-TRIQK-9:3 Yes chr2R:24275734-24291084 lnc-TRIQK-9:1 Yes chr2R:24275734-24291084 lnc-RUNX1T1-6:1 No - lnc-RUNX1T1-8:1 No - lnc-RUNX1T1-4:6 No - lnc-TRIQK-2:8 No - lnc-TRIQK-2:5 No - lnc-FAM92A-7:1 No - lnc-RBM12B-10:4 No - lnc-RBM12B-10:2 No - lnc-RBM12B-10:8 No - lnc-RBM12B-10:5 No - lnc-RBM12B-10:1 No - lnc-FAM92A-6:3 No - lnc-RBM12B-10:7 No - lnc-RBM12B-10:6 No - lnc-RBM12B-10:3 No - lnc-RBM12B-9:1 No - lnc-FAM92A-3:1 No - lnc-CDH17-5:1 No - lnc-RBM12B-3:1 No - lnc-TMEM67-1:1 No - lnc-PDP1-1:1 Yes chrX:7731779-7734651 lnc-RBM12B-6:1 Yes chrX:7731779-7734651 lnc-CDH17-4:1 No - lnc-CDH17-4:2 No - lnc-CDH17-2:1 No - lnc-GEM-1:1 No - lnc-ESRP1-5:1 No - lnc-RAD54B-1:2 No - lnc-RAD54B-1:1 No - lnc-VIRMA-5:1 No - lnc-VIRMA-4:1 No - lnc-RAD54B-2:1 Yes chr2R:23360192-23366355 lnc-RAD54B-2:3 Yes chr2R:23360192-23366355 lnc-RAD54B-2:2 Yes chr2R:23360192-23366355 lnc-ESRP1-2:8 No - lnc-ESRP1-2:9 No - lnc-ESRP1-2:10 No - lnc-VIRMA-2:1 No - lnc-ESRP1-2:11 No - lnc-VIRMA-3:1 No - lnc-ESRP1-4:1 No - lnc-VIRMA-1:11 No - lnc-VIRMA-1:1 No - lnc-DPY19L4-2:1 Yes chr2R:15657318-15676669 lnc-VIRMA-7:1 No - lnc-DPY19L4-1:1 Yes chrX:18653392-18657286 lnc-TP53INP1-5:1 Yes chr2L:15727581-15748150 lnc-TP53INP1-4:1 Yes chr2L:15727581-15748150 lnc-INTS8-3:1 No - lnc-INTS8-4:1 Yes chrX:11891732-11893745 lnc-TP53INP1-3:1 Yes chrX:11891732-11893745 lnc-INTS8-5:1 Yes chrX:11891732-11893745 lnc-INTS8-5:2 Yes chrX:11891732-11893745 lnc-INTS8-5:3 Yes chrX:11891732-11893745 lnc-PLEKHF2-3:1 Yes chrX:11891732-11893745 lnc-PLEKHF2-1:2 Yes chrX:11891732-11893745 LINC01298:1 No - C8orf37-AS1:3 No - C8orf37-AS1:4 No - C8orf37-AS1:5 No - C8orf37-AS1:6 No - C8orf37-AS1:7 No - C8orf37-AS1:8 No - C8orf37-AS1:9 No - C8orf37-AS1:10 No - C8orf37-AS1:11 No - lnc-GDF6-5:1 No - lnc-GDF6-4:1 No - lnc-GDF6-4:2 No - lnc-PTDSS1-2:2 No - lnc-PTDSS1-2:3 No - lnc-GDF6-3:1 No - lnc-GDF6-2:1 No - lnc-PTDSS1-4:1 No - lnc-PTDSS1-3:1 No - lnc-SDC2-1:2 No - lnc-CPQ-1:1 Yes chr2R:21392402-21481176 lnc-TSPYL5-6:1 No - lnc-MTDH-3:1 No - lnc-TSPYL5-1:2 No - lnc-CPQ-2:1 No - lnc-CPQ-3:1 No - lnc-CPQ-4:1 No - lnc-TSPYL5-2:2 No - lnc-MTDH-2:1 No - lnc-RPL30-7:1 No - lnc-RPL30-6:1 No - lnc-LAPTM4B-4:1 No - lnc-RPL30-4:1 No - lnc-RPL30-3:3 No - lnc-RPL30-3:5 Yes chr2L:19008031-19009306 lnc-RPL30-3:8 Yes chr2L:19008031-19009306 lnc-RPL30-3:1 Yes chr2L:19008031-19009306 lnc-RPL30-3:7 Yes chr2L:19008031-19009306 lnc-RPL30-3:6 Yes chr2L:19008031-19009306 lnc-RPL30-3:4 Yes chr2L:19008031-19009306 lnc-RPL30-3:2 Yes chr2L:19008031-19009306 lnc-ERICH5-1:1 No - lnc-RPL30-5:1 Yes chr2L:15274181-15275091 lnc-POP1-2:1 No - lnc-POP1-1:2 No - lnc-RIDA-1:1 Yes chr2L:12704725-12706683 lnc-RIDA-2:1 Yes chr2L:12704725-12706683 lnc-RIDA-2:2 Yes chr2L:12704725-12706683 lnc-NIPAL2-2:1 Yes chr2R:19493996-19496856 lnc-NIPAL2-3:3 Yes chr2R:19493996-19496856 lnc-NIPAL2-3:5 Yes chr2R:19493996-19496856 lnc-NIPAL2-3:4 Yes chr2R:19493996-19496856 lnc-NIPAL2-3:2 Yes chr2R:19493996-19496856 lnc-NIPAL2-3:1 Yes chr2R:19493996-19496856 lnc-KCNS2-3:1 Yes chr2R:19493996-19496856 lnc-NIPAL2-4:1 Yes chr2R:19493996-19496856 lnc-NIPAL2-5:2 Yes chr2R:19493996-19496856 lnc-NIPAL2-5:1 Yes chr2R:19493996-19496856 lnc-NIPAL2-6:1 Yes chr2R:19493996-19496856 lnc-NIPAL2-7:1 Yes chr2R:19493996-19496856 lnc-OSR2-3:1 Yes chr2L:3578013-3580769 lnc-VPS13B-1:2 No - lnc-STK3-2:2 No - lnc-STK3-2:10 No - lnc-STK3-6:1 Yes chr3R:29935978-29948207 lnc-STK3-7:1 Yes chr3R:29935978-29948207 lnc-COX6C-2:1 Yes chr3R:29935978-29948207 lnc-POLR2K-2:1 Yes chr3R:29935978-29948207 lnc-RGS22-1:1 Yes chr2L:5327227-5327969 lnc-FBXO43-5:1 No - lnc-FBXO43-4:1 No - lnc-FBXO43-3:2 No - lnc-FBXO43-3:3 No - lnc-FBXO43-3:1 No - lnc-FBXO43-2:1 Yes chr3R:26947830-26949682 lnc-RNF19A-2:1 Yes chr3R:26947830-26949682 lnc-FBXO43-6:2 No - lnc-FBXO43-6:1 No - lnc-FBXO43-7:1 No - lnc-RNF19A-8:4 No - lnc-RNF19A-8:5 No - lnc-RNF19A-8:3 No - lnc-RNF19A-8:1 No - lnc-RNF19A-8:2 No - lnc-SPAG1-1:2 No - lnc-ANKRD46-4:1 No - lnc-SPAG1-3:6 No - lnc-SPAG1-3:7 No - lnc-SNX31-1:2 No - lnc-SNX31-1:1 No - lnc-SNX31-1:3 No - lnc-ANKRD46-3:1 Yes chr2L:10204757-10206961 lnc-SPAG1-4:3 Yes chr2L:10204757-10206961 lnc-SPAG1-4:4 Yes chr2L:10204757-10206961 lnc-SNX31-2:2 No - lnc-SNX31-2:1 No - lnc-PABPC1-1:1 No - lnc-YWHAZ-1:2 No - lnc-YWHAZ-2:1 Yes chr2R:10099677-10109687 lnc-PABPC1-3:1 Yes chr2R:10099677-10109687 lnc-PABPC1-4:1 Yes chr2R:10099677-10109687 lnc-YWHAZ-3:1 Yes chr2R:10099677-10109687 lnc-GRHL2-17:1 No - lnc-GRHL2-7:4 No - lnc-GRHL2-7:5 No - lnc-GRHL2-15:1 No - lnc-GRHL2-5:2 No - lnc-GRHL2-14:1 Yes chr3L:15835693-15837482 lnc-YWHAZ-5:1 Yes chr3L:15835693-15837482 lnc-YWHAZ-6:1 Yes chr3L:15835693-15837482 lnc-YWHAZ-7:1 Yes chr3L:15835693-15837482 lnc-GRHL2-12:4 Yes chr3L:15835693-15837482 lnc-GRHL2-12:1 Yes chr3L:15835693-15837482 lnc-ZNF706-6:1 No - lnc-GRHL2-11:1 No - lnc-ZNF706-9:1 No - lnc-ZNF706-10:1 No - lnc-NCALD-3:1 Yes chr2R:17801132-17842820 lnc-NCALD-2:1 Yes chr2R:17801132-17842820 lnc-ODF1-9:1 Yes chr2R:17801132-17842820 lnc-RRM2B-8:2 No - lnc-RRM2B-7:1 No - lnc-RRM2B-7:2 No - lnc-RRM2B-7:3 No - lnc-RRM2B-8:1 No - lnc-GRHL2-4:2 No - lnc-ODF1-8:1 No - lnc-UBR5-5:1 Yes chr2R:11983145-11985393 lnc-RRM2B-1:1 No - lnc-RRM2B-2:1 Yes chr3R:9714623-9725615 lnc-RRM2B-2:2 Yes chr3R:9714623-9725615 lnc-RRM2B-3:1 Yes chr3R:9714623-9725615 lnc-RRM2B-4:1 Yes chr3R:9714623-9725615 lnc-ODF1-5:3 No - lnc-UBR5-1:1 No - lnc-UBR5-2:1 No - lnc-UBR5-3:1 No - lnc-UBR5-4:1 No - lnc-ODF1-3:2 No - lnc-ODF1-4:1 No - lnc-ODF1-1:3 No - lnc-KLF10-5:1 No - lnc-ODF1-2:1 No - lnc-KLF10-3:1 No - lnc-KLF10-2:3 Yes chr2L:476446-479688 lnc-KLF10-2:2 Yes chr2L:476446-479688 lnc-KLF10-2:1 Yes chr2L:476446-479688 lnc-ODF1-91:2 No - lnc-KLF10-4:1 No - lnc-ATP6V1C1-12:1 No - GASAL1:18 No - lnc-KLF10-6:1 Yes chr2R:8007246-8009062 lnc-AZIN1-1:5 Yes chr2R:8007246-8009062 lnc-AZIN1-1:3 Yes chr2R:8007246-8009062 AZIN1-AS1:1 Yes chr2R:8007246-8009062 AZIN1-AS1:6 Yes chr2R:8007246-8009062 AZIN1-AS1:7 Yes chr2R:8007246-8009062 AZIN1-AS1:8 Yes chr2R:8007246-8009062 AZIN1-AS1:9 Yes chr2R:8007246-8009062 AZIN1-AS1:11 Yes chr2R:8007246-8009062 AZIN1-AS1:12 Yes chr2R:8007246-8009062 lnc-AZIN1-1:2 Yes chr2R:8007246-8009062 lnc-ATP6V1C1-7:1 No - AZIN1-AS1:13 No - AZIN1-AS1:14 No - AZIN1-AS1:15 No - AZIN1-AS1:16 No - AZIN1-AS1:17 No - AZIN1-AS1:18 No - AZIN1-AS1:19 No - AZIN1-AS1:21 No - lnc-AZIN1-2:1 No - AZIN1-AS1:22 No - AZIN1-AS1:23 No - AZIN1-AS1:24 No - lnc-ATP6V1C1-9:3 No - lnc-ATP6V1C1-9:5 No - lnc-ATP6V1C1-9:6 No - lnc-ATP6V1C1-2:1 No - lnc-ATP6V1C1-3:1 No - lnc-ATP6V1C1-4:1 No - lnc-ATP6V1C1-5:1 No - BAALC-AS1:12 No - BAALC-AS1:9 No - BAALC-AS1:16 No - BAALC-AS1:1 No - BAALC-AS1:2 No - BAALC-AS1:3 No - lnc-CTHRC1-1:1 No - lnc-SLC25A32-4:2 No - lnc-SLC25A32-4:3 Yes chr2R:9186670-9192096 lnc-SLC25A32-2:3 No - lnc-SLC25A32-3:8 No - lnc-SLC25A32-3:6 No - lnc-SLC25A32-3:7 No - lnc-SLC25A32-6:1 Yes chr3R:17872748-17916578 lnc-SLC25A32-7:1 Yes chr3R:17872748-17916578 lnc-DPYS-3:2 No - lnc-DPYS-3:1 No - lnc-DPYS-2:2 No - lnc-DPYS-1:2 Yes chr3R:5571108-5579189 lnc-LRP12-4:1 Yes chr3R:5571108-5579189 lnc-LRP12-3:1 Yes chr3R:5571108-5579189 lnc-LRP12-2:1 No - lnc-DPYS-4:1 No - lnc-ZFPM2-2:2 No - lnc-LRP12-5:1 No - lnc-LRP12-6:1 No - lnc-DCSTAMP-5:1 No - lnc-LRP12-8:1 No - lnc-LRP12-9:1 No - lnc-LRP12-12:1 No - lnc-ABRA-8:1 No - lnc-ABRA-7:1 No - ZFPM2-AS1:12 No - lnc-ZFPM2-8:1 No - lnc-ZFPM2-3:1 No - lnc-ABRA-4:2 No - lnc-ANGPT1-1:1 No - lnc-ABRA-2:2 Yes chr2R:1649061-1778937 lnc-ABRA-2:1 Yes chr2R:1649061-1778937 lnc-ABRA-2:3 Yes chr2R:1649061-1778937 lnc-EMC2-9:1 No - lnc-RSPO2-3:1 No - lnc-EIF3E-1:1 Yes chr3L:16785242-16786941 lnc-RSPO2-1:1 Yes chr3L:16785242-16786941 lnc-RSPO2-2:1 Yes chr3L:16785242-16786941 lnc-EIF3E-5:2 Yes chr3L:16785242-16786941 lnc-EIF3E-5:1 Yes chr3L:16785242-16786941 lnc-TMEM74-3:1 Yes chr3L:16785242-16786941 lnc-EMC2-6:1 No - lnc-EMC2-7:1 No - lnc-TMEM74-2:1 No - lnc-EMC2-8:1 No - lnc-TRHR-1:1 No - lnc-NUDCD1-1:1 No - lnc-ENY2-1:2 Yes chrX:11852692-11854931 lnc-NUDCD1-2:3 No - lnc-NUDCD1-2:2 No - lnc-NUDCD1-2:1 No - lnc-KCNV1-4:1 No - lnc-KCNV1-3:1 Yes chr3L:2895017-2959579 lnc-EBAG9-5:1 No - lnc-KCNV1-5:1 No - LINC01608:20 No - lnc-EBAG9-6:1 No - lnc-EBAG9-8:1 No - LINC02237:15 No - lnc-CSMD3-4:1 No - lnc-EBAG9-4:1 No - LINC02237:18 No - lnc-KCNV1-8:1 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-EBAG9-11:1 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-TRPS1-5:2 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-TRPS1-5:1 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-TRPS1-4:1 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-UTP23-16:1 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-UTP23-14:1 No - lnc-CSMD3-5:1 No - lnc-CSMD3-6:1 No - lnc-UTP23-12:2 No - lnc-TRPS1-3:1 No - lnc-TRPS1-2:1 No - lnc-EIF3H-3:1 Yes chr2L:10333734-10339185 lnc-UTP23-6:1 No - lnc-UTP23-5:1 No - LINC00536:2 No - lnc-UTP23-2:2 No - lnc-UTP23-1:3 No - lnc-UTP23-1:4 No - lnc-RAD21-3:1 Yes chr2L:5051193-5053094 RAD21-AS1:1 Yes chr3L:27136525-27157999 lnc-RAD21-1:1 No - lnc-AARD-3:1 Yes chr2L:12164241-12166704 lnc-AARD-4:1 Yes chr2L:12164241-12166704 lnc-AARD-6:1 Yes chr2L:12164241-12166704 lnc-EXT1-4:4 No - lnc-EXT1-5:1 No - lnc-SAMD12-5:1 Yes chr2R:14526267-14587917 lnc-SAMD12-4:1 Yes chr2R:14526267-14587917 lnc-EXT1-6:1 Yes chr2R:14752521-14753269 lnc-COLEC10-1:12 Yes chr2R:14752521-14753269 lnc-COLEC10-1:15 Yes chr2R:14752521-14753269 lnc-COLEC10-1:16 Yes chr2R:14752521-14753269 lnc-EXT1-7:2 Yes chr2R:14752521-14753269 lnc-TNFRSF11B-4:1 Yes chr2R:14752521-14753269 SAMD12-AS1:6 Yes chr2R:14752521-14753269 lnc-TNFRSF11B-3:1 No - lnc-ENPP2-3:1 No - lnc-TAF2-3:1 No - lnc-TAF2-2:1 No - lnc-TAF2-1:1 No - lnc-DSCC1-2:1 Yes chr3L:9884411-9888683 lnc-DEPTOR-2:1 No - lnc-DSCC1-1:2 No - lnc-COL14A1-2:1 No - lnc-SNTB1-1:1 Yes chr2L:18858028-18859248 lnc-MTBP-1:2 Yes chr3L:21745359-21770534 lnc-MTBP-2:2 No - lnc-SNTB1-3:1 No - lnc-HAS2-4:1 No - HAS2-AS1:3 No - HAS2-AS1:5 No - HAS2-AS1:7 No - lnc-ZHX2-6:8 No - SMILR:10 No - lnc-ZHX2-5:1 No - lnc-DERL1-7:2 No - lnc-ZHX2-2:1 No - lnc-DERL1-5:2 No - lnc-DERL1-4:4 No - lnc-DERL1-4:1 No - lnc-DERL1-3:3 No - lnc-TBC1D31-4:1 No - lnc-TBC1D31-3:1 No - lnc-C8orf76-5:1 Yes chr2L:1973957-1975413 lnc-FAM83A-5:1 Yes chr2R:24871407-24874912 lnc-FAM83A-2:1 No - lnc-FAM83A-2:2 No - lnc-FAM83A-2:3 No - lnc-FAM83A-2:4 No - lnc-C8orf76-4:1 No - lnc-FAM83A-3:1 No - lnc-ZHX1-3:1 No - lnc-FAM83A-4:1 No - lnc-ZHX1-2:1 No - lnc-ZHX1-1:2 No - lnc-C8orf76-1:4 No - lnc-ZHX1-1:3 No - lnc-ZHX1-1:5 No - lnc-ZHX1-1:4 No - lnc-WDYHV1-2:1 No - lnc-ZHX1-4:1 No - lnc-ZHX1-5:1 No - lnc-ZHX1-6:1 No - lnc-FAM83A-7:1 Yes chr2R:15794000-15855645 lnc-WDYHV1-1:1 Yes chr2R:15794000-15855645 lnc-WDYHV1-1:2 No - lnc-ATAD2-1:1 Yes chr3L:11699496-11708553 lnc-ATAD2-1:2 Yes chr3L:11699496-11708553 lnc-ATAD2-2:1 Yes chr3L:11699496-11708553 lnc-WDYHV1-3:1 No - lnc-FAM91A1-1:3 No - lnc-KLHL38-1:2 Yes chrX:20171445-20173514 lnc-KLHL38-1:1 Yes chrX:20171445-20173514 FER1L6-AS2:2 Yes chr3L:8905918-8912671 FER1L6-AS2:4 Yes chr3L:8905918-8912671 lnc-FER1L6-2:1 No - RNF139-AS1:8 No - RNF139-AS1:2 Yes chr3R:29499025-29503797 lnc-MTSS1-5:1 Yes chr2R:6923366-6924929 lnc-MTSS1-5:2 Yes chr2R:6923366-6924929 lnc-MTSS1-3:3 Yes chr2R:6923366-6924929 lnc-MTSS1-3:2 Yes chr2R:6923366-6924929 lnc-TATDN1-3:2 No - lnc-TATDN1-3:1 No - lnc-TATDN1-4:2 Yes chr2R:6924687-6971637 lnc-TATDN1-4:1 Yes chr2R:6924687-6971637 lnc-TATDN1-4:3 Yes chr2R:6924687-6971637 lnc-WASHC5-2:6 No - lnc-WASHC5-6:2 No - LINC00964:16 No - lnc-MTSS1-4:1 No - lnc-MTSS1-4:2 No - lnc-TRIB1-11:1 No - lnc-NSMCE2-1:1 No - lnc-WASHC5-7:2 No - lnc-WASHC5-8:2 No - lnc-TRIB1-6:1 No - lnc-TRIB1-5:1 No - lnc-TRIB1-7:1 No - lnc-TRIB1-8:1 No - lnc-WASHC5-9:4 No - lnc-TRIB1-12:1 No - lnc-WASHC5-10:2 No - lnc-WASHC5-11:3 No - LINC00861:2 No - LINC00861:5 No - LINC00861:3 No - lnc-FAM84B-13:1 No - lnc-TRIB1-13:1 No - lnc-FAM84B-11:1 No - lnc-FAM84B-10:1 No - lnc-TRIB1-4:3 No - lnc-POU5F1B-6:2 No - lnc-WASHC5-17:2 No - PCAT1:3 No - lnc-FAM84B-15:114 No - lnc-FAM84B-15:131 No - PCAT1:6 No - lnc-FAM84B-15:121 No - lnc-POU5F1B-9:1 No - lnc-FAM84B-83:1 No - lnc-MYC-7:1 No - lnc-FAM84B-84:11 No - lnc-FAM84B-84:10 No - CASC11:4 No - lnc-FAM84B-85:1 No - lnc-MYC-4:1 No - PVT1:5 No - PVT1:6 No - lnc-FAM84B-7:9 No - lnc-FAM84B-4:4 No - lnc-FAM84B-86:1 No - lnc-MYC-8:1 No - PVT1:47 No - lnc-MYC-9:1 No - lnc-MYC-10:1 No - lnc-MYC-11:1 No - lnc-GSDMC-34:34 No - lnc-MYC-12:1 No - lnc-GSDMC-34:27 No - lnc-MYC-13:1 No - lnc-MYC-14:1 No - lnc-MYC-3:2 No - lnc-MYC-15:1 No - lnc-MYC-3:3 No - lnc-GSDMC-34:24 No - lnc-GSDMC-34:23 No - lnc-GSDMC-35:3 No - lnc-GSDMC-35:2 No - lnc-MYC-16:1 No - lnc-FAM49B-3:1 No - lnc-GSDMC-5:8 Yes chr3L:10640286-10661013 lnc-ASAP1-6:1 Yes chr3L:10640286-10661013 lnc-EFR3A-11:1 Yes chr3L:10640286-10661013 lnc-ASAP1-6:4 Yes chr3L:10640286-10661013 lnc-ASAP1-6:2 Yes chr3L:10640286-10661013 lnc-ASAP1-6:3 Yes chr3L:10640286-10661013 lnc-EFR3A-10:1 Yes chr2R:8114286-8123001 lnc-FAM49B-4:1 Yes chr2R:8114286-8123001 ASAP1-IT2:1 Yes chr2R:8114286-8123001 lnc-FAM49B-5:1 Yes chr2R:8114286-8123001 lnc-FAM49B-6:1 Yes chr2R:8114286-8123001 ASAP1-IT1:1 Yes chr2R:8114286-8123001 lnc-FAM49B-9:1 Yes chr2R:8114286-8123001 lnc-EFR3A-9:1 No - lnc-ASAP1-2:2 No - lnc-ASAP1-5:1 No - lnc-ADCY8-3:1 No - lnc-EFR3A-2:4 No - lnc-EFR3A-1:4 No - lnc-EFR3A-1:5 No - lnc-EFR3A-7:1 No - lnc-PHF20L1-8:1 Yes chr2R:8729502-8734304 lnc-PHF20L1-6:1 Yes chr2R:8729502-8734304 lnc-HHLA1-1:1 No - lnc-OC90-1:1 No - lnc-HHLA1-3:1 Yes chr2R:10145897-10192394 lnc-TMEM71-5:2 Yes chrX:22449737-22451463 lnc-TMEM71-5:3 Yes chrX:22449737-22451463 lnc-TMEM71-5:1 Yes chrX:22449737-22451463 lnc-PHF20L1-4:1 No - lnc-TMEM71-2:2 No - lnc-TMEM71-3:6 No - lnc-TMEM71-3:5 No - lnc-TG-2:1 Yes chr3R:12352143-12356265 lnc-SLA-1:1 Yes chr2R:24078234-24080527 lnc-NDRG1-6:1 Yes chr2R:24078234-24080527 lnc-NDRG1-4:1 Yes chr2R:24078234-24080527 lnc-NDRG1-4:5 Yes chr2R:24078234-24080527 lnc-NDRG1-4:6 Yes chr2R:24078234-24080527 lnc-NDRG1-4:7 Yes chr2R:24078234-24080527 lnc-WISP1-9:1 Yes chr2R:24078234-24080527 lnc-NDRG1-4:3 Yes chr2R:24078234-24080527 lnc-NDRG1-4:4 Yes chr2R:24078234-24080527 lnc-NDRG1-4:2 Yes chr2R:24078234-24080527 lnc-TG-4:1 Yes chr3L:17690015-17748839 lnc-NDRG1-1:2 Yes chr2R:21502097-21517241 lnc-NDRG1-1:1 Yes chr2R:21502097-21517241 lnc-NDRG1-1:4 Yes chr2R:21502097-21517241 lnc-NDRG1-1:5 Yes chr2R:21502097-21517241 lnc-NDRG1-1:3 Yes chr2R:21502097-21517241 lnc-SLA-2:1 Yes chr2R:21502097-21517241 lnc-SLA-2:2 Yes chr2R:21502097-21517241 lnc-WISP1-8:1 No - lnc-ST3GAL1-1:2 No - lnc-ST3GAL1-3:1 No - lnc-NDRG1-2:1 No - lnc-NDRG1-7:4 No - lnc-NDRG1-7:2 No - lnc-NDRG1-7:5 No - lnc-NDRG1-7:1 No - lnc-NDRG1-3:1 No - lnc-NDRG1-5:1 No - lnc-WISP1-10:1 No - lnc-NDRG1-7:3 No - lnc-WISP1-2:3 No - lnc-WISP1-12:1 No - lnc-WISP1-13:1 No - lnc-WISP1-4:2 No - lnc-ST3GAL1-4:1 No - lnc-KHDRBS3-19:1 No - lnc-ST3GAL1-5:3 No - lnc-ST3GAL1-7:1 No - lnc-KHDRBS3-17:1 No - lnc-KHDRBS3-5:6 No - lnc-KHDRBS3-5:7 No - lnc-KHDRBS3-16:1 No - lnc-ZFAT-1:2 No - lnc-KHDRBS3-15:1 No - lnc-KHDRBS3-4:9 No - lnc-KHDRBS3-4:10 No - lnc-ZFAT-9:1 No - LINC01591:2 No - LINC01591:3 No - LINC01591:8 No - lnc-ZFAT-10:1 Yes chr2R:22409208-22411545 lnc-WISP1-15:3 Yes chr2R:22409208-22411545 lnc-KHDRBS3-12:1 No - lnc-ZFAT-11:1 No - lnc-ZFAT-12:2 No - lnc-ZFAT-12:1 No - lnc-ZFAT-12:3 No - lnc-KHDRBS3-8:2 No - LINC02055:22 No - lnc-FAM135B-7:1 No - LINC02055:27 No - lnc-FAM135B-2:2 No - lnc-COL22A1-4:2 Yes chr3L:1275956-1295699 lnc-COL22A1-4:4 Yes chr3L:1275956-1295699 lnc-COL22A1-4:1 Yes chr3L:1275956-1295699 lnc-COL22A1-4:3 Yes chr3L:1275956-1295699 lnc-FAM135B-4:1 No - lnc-FAM135B-5:1 No - lnc-COL22A1-3:1 No - lnc-TRAPPC9-3:2 Yes chr3R:9410329-9412293 lnc-TRAPPC9-3:4 Yes chr3R:9410329-9412293 lnc-TRAPPC9-3:3 Yes chr3R:9410329-9412293 lnc-KCNK9-2:1 Yes chr2L:20650755-20656178 lnc-KCNK9-3:1 Yes chr2L:20650755-20656178 lnc-CHRAC1-8:1 Yes chr2L:20650755-20656178 lnc-CHRAC1-4:2 Yes chr2L:20650755-20656178 lnc-KCNK9-4:1 Yes chr2L:20650755-20656178 lnc-AGO2-6:1 Yes chr2L:20650755-20656178 lnc-CHRAC1-5:1 Yes chr2L:20650755-20656178 lnc-AGO2-2:3 No - lnc-AGO2-1:2 Yes chr2R:13943387-13958089 lnc-CHRAC1-3:1 Yes chr2R:13943387-13958089 lnc-TRAPPC9-1:1 Yes chr2R:13943387-13958089 lnc-TRAPPC9-4:1 Yes chr2R:13943387-13958089 lnc-CHRAC1-6:1 Yes chr2R:13943387-13958089 lnc-PTK2-1:1 Yes chr2R:13943387-13958089 lnc-AGO2-3:1 Yes chr2R:19430659-19437259 lnc-AGO2-3:2 Yes chr2R:19430659-19437259 lnc-AGO2-4:1 Yes chr2R:19430659-19437259 lnc-AGO2-5:3 Yes chr2R:19430659-19437259 lnc-AGO2-5:1 Yes chr2R:19430659-19437259 lnc-AGO2-5:2 Yes chr2R:19430659-19437259 lnc-AGO2-7:1 Yes chr2R:19430659-19437259 lnc-PTK2-7:3 Yes chr2R:19430659-19437259 lnc-PTK2-7:2 Yes chr2R:19430659-19437259 lnc-DENND3-2:3 No - lnc-DENND3-3:1 No - lnc-DENND3-1:2 No - lnc-SLC45A4-2:3 No - lnc-SLC45A4-5:1 No - lnc-SLC45A4-3:6 Yes chr3L:25236940-25670980 lnc-SLC45A4-3:3 Yes chr3L:25236940-25670980 lnc-SLC45A4-3:4 Yes chr3L:25236940-25670980 lnc-SLC45A4-3:2 Yes chr3L:25236940-25670980 lnc-GPR20-2:2 No - lnc-DENND3-9:1 Yes chr2L:16245835-16257606 lnc-GPR20-5:1 No - lnc-PTP4A3-5:1 No - lnc-PTP4A3-7:1 No - lnc-PTP4A3-7:2 No - lnc-PTP4A3-7:3 No - lnc-GPR20-7:1 No - lnc-TSNARE1-2:1 No - lnc-ADGRB1-3:2 No - lnc-TSNARE1-1:2 No - lnc-ARC-4:1 Yes chr3L:13044434-13046894 lnc-ARC-3:1 Yes chr3L:13044434-13046894 lnc-ADGRB1-5:1 No - lnc-ADGRB1-6:1 No - lnc-JRK-3:1 No - lnc-JRK-1:1 No - lnc-JRK-1:10 No - lnc-JRK-1:2 No - lnc-JRK-1:3 No - lnc-JRK-1:11 No - lnc-THEM6-1:1 No - lnc-SLURP2-1:2 No - lnc-LYNX1-SLURP2-1:2 No - lnc-LYNX1-SLURP2-1:1 No - lnc-LYNX1-SLURP2-1:3 No - lnc-THEM6-2:1 No - lnc-CYP11B1-2:1 No - lnc-GML-2:1 No - lnc-GML-3:1 No - LY6E-DT:32 No - LY6E-DT:38 No - LY6E-DT:37 No - LY6E-DT:36 No - lnc-LY6E-3:3 No - lnc-LY6E-6:1 No - lnc-LY6E-1:1 No - LY6E-DT:34 No - lnc-LY6E-2:2 No - lnc-LY6E-2:3 No - lnc-CYP11B2-2:1 No - lnc-LY6E-7:1 No - lnc-LY6E-7:2 No - lnc-LY6E-7:3 No - lnc-LY6E-7:6 No - lnc-LY6E-7:8 No - lnc-LY6H-4:1 No - lnc-LY6H-1:3 No - lnc-LY6H-1:2 No - lnc-LY6H-2:1 No - lnc-GPIHBP1-2:1 No - lnc-GPIHBP1-1:1 No - lnc-TOP1MT-6:1 No - lnc-GLI4-3:1 No - lnc-GLI4-2:1 No - lnc-TOP1MT-5:1 No - MINCR:10 No - MINCR:14 No - MINCR:16 No - MINCR:1 No - lnc-MAFA-6:1 Yes chrX:15319479-15328029 lnc-MAFA-5:1 Yes chrX:15319479-15328029 lnc-TOP1MT-3:1 Yes chrX:15319479-15328029 RHPN1-AS1:2 No - lnc-MAFA-1:1 Yes chr2L:19464267-19467758 lnc-MAFA-3:2 Yes chr3L:8507469-8509763 lnc-ZC3H3-1:2 No - lnc-ZC3H3-2:1 No - lnc-MROH6-1:2 No - lnc-NAPRT-2:2 Yes chrX:9275318-9283117 lnc-NAPRT-2:4 Yes chrX:9275318-9283117 lnc-NAPRT-2:5 Yes chrX:9275318-9283117 lnc-NAPRT-2:1 Yes chrX:9275318-9283117 lnc-NAPRT-2:3 Yes chrX:9275318-9283117 lnc-NAPRT-1:2 Yes chr2L:4189340-4198071 lnc-NAPRT-1:1 Yes chr2L:4189340-4198071 lnc-EEF1D-1:1 Yes chr2L:4189340-4198071 lnc-NAPRT-3:2 Yes chr2L:10232507-10234450 lnc-NAPRT-3:3 Yes chr2L:10232507-10234450 lnc-NAPRT-3:4 Yes chr2L:10232507-10234450 lnc-NAPRT-3:1 Yes chr2L:10232507-10234450 lnc-TSTA3-3:1 Yes chr3R:17534815-17537136 lnc-TSTA3-1:6 Yes chr2R:22887574-22888857 lnc-PYCR3-2:1 Yes chr2R:22887574-22888857 lnc-TSTA3-5:4 No - lnc-TSTA3-5:3 No - lnc-ZNF707-1:2 No - lnc-ZNF707-1:10 No - lnc-MAPK15-2:2 No - lnc-ZNF707-1:18 No - lnc-ZNF707-1:19 No - lnc-PUF60-2:2 Yes chr3R:26536350-26604051 lnc-PUF60-2:1 Yes chr3R:26536350-26604051 lnc-NRBP2-2:3 Yes chr3L:1496853-1502590 lnc-NRBP2-2:1 Yes chr3L:1496853-1502590 lnc-NRBP2-2:2 Yes chr3L:1496853-1502590 lnc-NRBP2-1:2 Yes chr3R:5742510-5747138 lnc-PLEC-4:1 No - lnc-PLEC-2:1 No - lnc-PLEC-3:4 No - lnc-PLEC-3:3 No - lnc-PLEC-3:1 No - lnc-PLEC-3:2 No - lnc-OPLAH-2:1 No - lnc-OPLAH-3:1 No - lnc-OPLAH-1:6 No - lnc-SHARPIN-4:5 No - lnc-SHARPIN-4:3 No - lnc-SHARPIN-4:2 No - lnc-SHARPIN-4:4 No - lnc-SHARPIN-4:1 No - lnc-DGAT1-2:1 Yes chr2R:17789679-17792448 lnc-SCRT1-1:1 Yes chr2L:16816660-16826964 lnc-FBXL6-1:1 No - lnc-FBXL6-1:5 Yes chr3R:31806867-31810186 lnc-FBXL6-1:3 Yes chr3R:31806867-31810186 lnc-FBXL6-1:4 Yes chr3R:31806867-31810186 lnc-FBXL6-1:2 Yes chr3R:31806867-31810186 lnc-SLC39A4-3:2 Yes chr2R:14497347-14503488 lnc-SLC39A4-3:1 Yes chr2R:14497347-14503488 lnc-SLC39A4-2:1 Yes chr2R:14497347-14503488 lnc-SLC39A4-1:2 Yes chr2R:14497347-14503488 lnc-SLC39A4-1:1 Yes chr2R:14497347-14503488 lnc-CPSF1-1:1 Yes chr3L:14992289-14997983 lnc-TONSL-2:3 Yes chr2R:8078869-8080041 lnc-TONSL-2:2 Yes chr2R:8078869-8080041 lnc-TONSL-2:1 Yes chr2R:8078869-8080041 lnc-TONSL-3:1 Yes chr3L:3055908-3070839 lnc-FOXH1-1:1 Yes chr3L:3055908-3070839 lnc-CYHR1-1:1 No - lnc-KIFC2-2:1 No - lnc-KIFC2-2:3 No - lnc-KIFC2-2:4 No - lnc-KIFC2-2:5 No - lnc-KIFC2-2:6 No - lnc-RECQL4-1:1 No - lnc-RECQL4-3:1 No - lnc-LRRC24-3:2 Yes chr3L:8170640-8175978 lnc-C8orf82-1:1 Yes chr3R:21083043-21097827 lnc-ZNF517-2:4 No - lnc-ZNF517-2:5 No - lnc-ZNF517-2:6 No - lnc-ZNF517-2:7 No - lnc-ZNF517-2:8 No - lnc-ZNF251-1:2 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-ZNF251-1:1 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-ZNF517-1:1 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-RPL8-1:2 Yes chr3L:2587456-2588883 lnc-RPL8-1:1 Yes chr3L:2587456-2588883 lnc-COMMD5-2:1 No - lnc-COMMD5-1:1 No - lnc-ZNF16-1:1 No - lnc-ZNF250-1:1 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF250-3:1 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF250-3:2 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF250-3:3 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF16-2:11 No - lnc-ZNF16-2:7 No - lnc-ZNF16-2:9 No - lnc-ZNF16-2:8 No - lnc-ZNF16-2:10 No - ZNF252P-AS1:1 No - lnc-ZNF16-3:1 No - lnc-C8orf33-1:1 No - lnc-DOCK8-7:1 Yes chr2R:12180493-12182373 lnc-DOCK8-7:2 Yes chr2R:12180493-12182373 lnc-DOCK8-7:3 No - lnc-WASHC1-4:2 Yes chr2R:12180493-12182373 lnc-WASHC1-4:1 Yes chr2R:12180493-12182373 FAM138C:2 Yes chr2R:12180493-12182373 FAM138C:4 Yes chr2R:12180493-12182373 lnc-FOXD4-6:1 Yes chr2R:12180493-12182373 lnc-DOCK8-6:2 Yes chr2R:12180493-12182373 lnc-DOCK8-6:3 Yes chr2R:12180493-12182373 lnc-DOCK8-6:4 Yes chr2R:12180493-12182373 lnc-WASHC1-2:3 No - lnc-WASHC1-2:1 No - LINC01388:9 No - LINC01388:10 No - LINC01388:8 No - LINC01388:3 No - lnc-CBWD1-1:1 Yes chr2R:22868159-22870706 lnc-FOXD4-5:6 No - lnc-FOXD4-5:5 No - lnc-FOXD4-5:4 No - lnc-FOXD4-5:2 No - lnc-FOXD4-5:3 No - lnc-FOXD4-5:1 No - lnc-C9orf66-15:2 No - lnc-C9orf66-15:22 Yes chr2L:94739-102086 lnc-C9orf66-15:13 Yes chr2L:94739-102086 lnc-C9orf66-15:11 Yes chr2L:94739-102086 lnc-C9orf66-15:3 No - lnc-C9orf66-15:20 Yes chr2L:94739-102086 lnc-C9orf66-15:5 No - lnc-C9orf66-15:21 Yes chr2L:94739-102086 lnc-C9orf66-15:15 Yes chr2L:94739-102086 lnc-C9orf66-15:4 No - lnc-C9orf66-15:18 Yes chr2L:94739-102086 lnc-C9orf66-15:16 Yes chr2L:94739-102086 lnc-DOCK8-5:1 Yes chr2R:14901475-14928425 lnc-DOCK8-5:2 Yes chr2R:14901475-14928425 lnc-C9orf66-7:1 Yes chr2R:14901475-14928425 lnc-C9orf66-8:1 Yes chr2R:14901475-14928425 lnc-DOCK8-2:3 Yes chr2R:14901475-14928425 lnc-DMRT1-3:1 Yes chr2R:14901475-14928425 lnc-C9orf66-3:2 Yes chr2R:14901475-14928425 lnc-KANK1-1:1 No - lnc-DMRT3-1:1 No - lnc-DMRT3-4:1 No - lnc-C9orf66-11:1 No - LINC01230:14 No - lnc-C9orf66-12:1 No - lnc-C9orf66-13:1 No - lnc-DMRT2-2:7 No - lnc-DMRT2-5:1 No - lnc-DMRT2-6:1 No - lnc-PUM3-9:1 No - lnc-SMARCA2-1:2 No - lnc-PUM3-8:1 No - lnc-VLDLR-7:1 Yes chr3L:15970082-15982869 lnc-VLDLR-4:1 Yes chr3L:15970082-15982869 lnc-PUM3-7:1 Yes chr3L:15970082-15982869 lnc-SMARCA2-6:1 No - lnc-PUM3-6:1 No - lnc-SMARCA2-5:1 No - VLDLR-AS1:7 No - VLDLR-AS1:12 No - VLDLR-AS1:10 No - lnc-VLDLR-3:1 No - VLDLR-AS1:5 No - VLDLR-AS1:2 Yes chr3R:25698727-25740465 lnc-PUM3-4:1 No - lnc-PUM3-3:1 Yes chr3L:2895017-2959579 lnc-RFX3-4:1 Yes chrX:21346503-21349843 lnc-KCNV2-4:1 Yes chrX:21346503-21349843 lnc-RFX3-3:1 Yes chrX:21346503-21349843 lnc-RFX3-2:1 Yes chrX:21346503-21349843 lnc-KCNV2-5:1 No - lnc-PUM3-5:1 No - lnc-KCNV2-6:1 No - LINC01231:2 No - lnc-PUM3-2:1 Yes chr3R:10361760-10378068 lnc-GLIS3-4:1 Yes chr3R:10361760-10378068 lnc-KCNV2-8:1 Yes chr3R:10361760-10378068 RFX3-AS1:1 No - RFX3-AS1:3 No - RFX3-AS1:4 No - RFX3-AS1:17 No - RFX3-AS1:18 No - RFX3-AS1:19 No - RFX3-AS1:20 No - RFX3-AS1:23 No - lnc-GLIS3-3:1 No - lnc-GLIS3-1:2 No - lnc-GLIS3-2:2 No - lnc-RFX3-5:1 No - lnc-RFX3-5:2 No - lnc-GLIS3-2:4 No - lnc-GLIS3-2:7 No - lnc-GLIS3-2:5 No - lnc-GLIS3-2:6 No - lnc-SPATA6L-5:1 No - lnc-GLIS3-2:1 No - lnc-GLIS3-2:3 No - lnc-SLC1A1-1:2 No - lnc-SLC1A1-10:1 No - lnc-SPATA6L-4:1 No - lnc-SLC1A1-9:1 No - lnc-SLC1A1-8:1 No - lnc-SLC1A1-7:1 No - lnc-SLC1A1-6:1 No - lnc-SPATA6L-2:2 No - lnc-PLPP6-1:1 No - lnc-SPATA6L-2:4 No - lnc-SPATA6L-2:3 No - CDC37L1-DT:14 No - CDC37L1-DT:23 No - lnc-AK3-2:1 No - lnc-AK3-3:1 Yes chrX:13757179-13758598 lnc-RCL1-2:1 Yes chrX:13757179-13758598 lnc-RCL1-3:1 No - lnc-INSL6-4:1 No - lnc-INSL6-3:1 Yes chrX:11360930-11368098 lnc-INSL4-10:1 Yes chrX:11360930-11368098 lnc-INSL4-9:1 Yes chrX:11360930-11368098 lnc-INSL4-8:1 Yes chrX:11360930-11368098 lnc-INSL4-7:1 Yes chrX:11360930-11368098 lnc-INSL4-6:1 Yes chrX:11360930-11368098 lnc-INSL4-5:1 Yes chrX:11360930-11368098 lnc-INSL4-4:1 Yes chrX:11360930-11368098 lnc-INSL4-3:1 Yes chrX:11360930-11368098 lnc-INSL6-2:1 No - lnc-RLN1-1:1 No - lnc-INSL4-1:1 No - lnc-PLGRKT-1:1 No - lnc-RLN1-3:1 Yes chrX:14264737-14266250 lnc-RLN1-3:2 Yes chrX:14264737-14266250 lnc-RLN1-3:3 Yes chrX:14264737-14266250 lnc-RLN1-2:1 Yes chrX:14264737-14266250 lnc-PLGRKT-4:1 No - lnc-ERMP1-5:1 Yes chr3L:22257749-22262921 lnc-PDCD1LG2-2:1 No - lnc-RIC1-1:1 No - lnc-ERMP1-2:1 No - lnc-ERMP1-3:1 No - lnc-ERMP1-4:1 No - lnc-RANBP6-1:1 No - lnc-MLANA-3:1 No - lnc-MLANA-1:2 No - lnc-IL33-2:1 No - lnc-IL33-1:1 No - lnc-GLDC-8:2 No - lnc-UHRF2-3:1 No - lnc-UHRF2-4:1 Yes chr3R:10251518-10255268 lnc-RANBP6-3:1 Yes chr3R:10251518-10255268 lnc-RANBP6-4:1 Yes chr3R:10251518-10255268 lnc-UHRF2-5:1 Yes chr3R:10251518-10255268 lnc-KDM4C-15:1 Yes chr3R:10251518-10255268 lnc-KDM4C-5:2 No - lnc-KDM4C-14:1 No - lnc-KDM4C-14:2 No - lnc-KDM4C-13:1 No - lnc-KDM4C-5:6 No - lnc-KDM4C-11:1 No - lnc-KDM4C-19:5 No - lnc-KDM4C-19:6 No - lnc-KDM4C-19:8 No - lnc-KDM4C-19:9 No - lnc-KDM4C-19:10 No - lnc-KDM4C-1:7 No - lnc-KDM4C-1:8 No - lnc-GLDC-1:2 Yes chr2R:13176553-13198337 lnc-GLDC-5:1 Yes chr2R:13176553-13198337 lnc-KDM4C-4:2 No - lnc-DMAC1-8:2 No - lnc-DMAC1-8:1 No - lnc-DMAC1-2:1 No - lnc-DMAC1-7:1 No - lnc-DMAC1-4:1 No - lnc-DMAC1-10:1 Yes chr2L:19586623-19732069 lnc-DMAC1-6:2 Yes chr2L:19586623-19732069 lnc-KDM4C-18:1 Yes chr2L:19586623-19732069 lnc-TYRP1-5:1 Yes chr2L:19586623-19732069 PTPRD-AS2:1 No - PTPRD-AS2:5 No - lnc-PTPRD-6:1 No - lnc-PTPRD-7:1 No - lnc-PTPRD-9:1 No - lnc-MPDZ-9:1 No - lnc-TYRP1-4:1 No - lnc-MPDZ-8:1 No - lnc-MPDZ-7:1 No - lnc-MPDZ-6:1 No - lnc-MPDZ-4:1 No - lnc-MPDZ-3:1 No - LINC01235:1 No - lnc-LURAP1L-3:2 No - lnc-LURAP1L-4:2 No - LINC00583:1 No - lnc-LURAP1L-7:1 No - lnc-LURAP1L-8:1 No - lnc-ZDHHC21-5:1 Yes chr4:268175-276369 lnc-SNAPC3-11:4 Yes chr4:268175-276369 lnc-SNAPC3-11:6 Yes chr4:268175-276369 lnc-SNAPC3-10:1 No - lnc-SNAPC3-8:2 No - lnc-ZDHHC21-2:1 No - lnc-CER1-111:1 No - lnc-CER1-1:1 No - lnc-TTC39B-4:1 No - lnc-SNAPC3-7:1 No - lnc-SNAPC3-7:2 No - lnc-FREM1-63:1 No - lnc-PSIP1-3:1 No - lnc-SNAPC3-2:1 No - lnc-TTC39B-3:2 Yes chr3R:30052514-30054697 lnc-TTC39B-3:1 Yes chr3R:30052514-30054697 lnc-TTC39B-5:3 Yes chr3R:30052514-30054697 lnc-TTC39B-5:1 Yes chr3R:30052514-30054697 lnc-TTC39B-5:2 Yes chr3R:30052514-30054697 lnc-PSIP1-2:1 No - lnc-CCDC171-3:1 No - lnc-SNAPC3-3:1 No - lnc-SNAPC3-4:1 No - lnc-SNAPC3-1:8 No - lnc-CCDC171-1:3 No - lnc-CCDC171-4:1 No - lnc-CCDC171-8:1 No - lnc-BNC2-1:1 No - lnc-CCDC171-9:1 No - lnc-C9orf92-2:1 Yes chrX:16118067-16148977 lnc-C9orf92-4:2 Yes chrX:16118067-16148977 lnc-C9orf92-4:1 Yes chrX:16118067-16148977 lnc-C9orf92-5:1 Yes chrX:16118067-16148977 lnc-CNTLN-4:1 No - lnc-BNC2-2:1 No - lnc-SH3GL2-1:1 No - lnc-BNC2-4:1 No - lnc-BNC2-5:1 Yes chr3R:18906609-18910755 lnc-SH3GL2-4:1 Yes chr2L:21684106-21729051 lnc-SAXO1-4:1 Yes chr2L:21684106-21729051 lnc-RRAGA-3:1 Yes chr2L:21684106-21729051 lnc-SAXO1-3:1 Yes chr2L:21684106-21729051 lnc-HAUS6-2:1 No - lnc-PLIN2-2:1 No - lnc-HAUS6-1:3 No - lnc-PLIN2-1:1 No - lnc-ACER2-2:2 Yes chrX:8592031-8602036 lnc-RPS6-2:1 No - lnc-SLC24A2-2:1 No - lnc-ACER2-4:1 Yes chr2L:9711512-9746495 lnc-SLC24A2-1:2 Yes chr2L:9711512-9746495 lnc-SLC24A2-1:1 Yes chr2L:9711512-9746495 lnc-ACER2-5:1 No - lnc-SLC24A2-3:1 No - lnc-MLLT3-2:1 No - lnc-FOCAD-2:1 No - lnc-SLC24A2-4:1 Yes chr3R:15320756-15325279 lnc-IFNB1-2:1 Yes chr2L:13444103-13445651 lnc-IFNB1-1:1 No - lnc-FOCAD-1:1 No - lnc-IFNA4-2:1 No - lnc-IFNA4-1:1 No - lnc-IFNA10-1:1 No - lnc-IFNA17-1:1 No - lnc-IFNA5-1:2 No - lnc-IFNA5-1:1 No - lnc-KLHL9-1:2 No - lnc-IFNA8-3:1 No - lnc-KLHL9-1:1 No - lnc-IFNA2-2:1 No - lnc-IFNA8-1:1 No - lnc-IFNA8-2:1 No - MIR31HG:2 No - MIR31HG:1 No - lnc-IFNA1-1:1 No - MIR31HG:4 No - MIR31HG:5 No - lnc-MTAP-6:1 No - lnc-MTAP-5:1 No - lnc-IFNA1-5:1 No - lnc-CDKN2B-3:1 Yes chr3R:25036944-25037982 lnc-CDKN2B-2:1 Yes chr3R:25036944-25037982 lnc-CDKN2B-2:2 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:8 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:9 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:10 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:11 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:12 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:13 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:14 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:15 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:16 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:17 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:28 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:29 No - CDKN2B-AS1:30 No - lnc-MTAP-3:1 No - CDKN2B-AS1:34 No - lnc-MTAP-7:1 No - lnc-CDKN2B-4:1 No - lnc-DMRTA1-8:1 No - lnc-DMRTA1-9:1 No - lnc-CDKN2B-5:1 No - LINC01239:2 No - LINC01239:4 No - lnc-DMRTA1-11:1 No - lnc-DMRTA1-12:1 No - lnc-DMRTA1-14:1 No - lnc-DMRTA1-13:1 No - LINC01239:6 No - lnc-DMRTA1-15:1 No - lnc-DMRTA1-16:1 No - lnc-DMRTA1-17:1 No - lnc-DMRTA1-18:1 No - lnc-ELAVL2-6:1 No - lnc-DMRTA1-19:1 No - lnc-DMRTA1-20:1 No - lnc-DMRTA1-21:1 No - lnc-ELAVL2-3:2 No - lnc-DMRTA1-22:1 No - lnc-DMRTA1-23:1 No - lnc-DMRTA1-24:1 No - lnc-DMRTA1-25:2 No - lnc-ELAVL2-1:3 No - lnc-DMRTA1-26:1 No - lnc-ELAVL2-1:2 No - lnc-ELAVL2-1:5 No - lnc-ELAVL2-1:4 No - lnc-IZUMO3-2:1 Yes chr2L:2954762-2968434 lnc-DMRTA1-27:1 Yes chr2L:2954762-2968434 lnc-DMRTA1-4:2 No - lnc-DMRTA1-5:3 No - lnc-ELAVL2-4:1 No - lnc-DMRTA1-6:2 No - lnc-DMRTA1-7:6 No - lnc-IFT74-10:1 No - lnc-IZUMO3-1:1 No - lnc-TUSC1-1:1 No - lnc-IFT74-9:1 No - lnc-IFT74-8:1 No - LINC01241:13 No - lnc-IFT74-7:1 No - lnc-CAAP1-3:1 No - lnc-IFT74-1:2 No - lnc-PLAA-3:1 No - lnc-PLAA-3:2 No - lnc-PLAA-2:1 No - lnc-IFT74-5:1 No - lnc-CAAP1-2:2 Yes chr2L:1167172-1170365 lnc-CAAP1-2:1 Yes chr2L:1167172-1170365 lnc-PLAA-4:1 No - lnc-IFT74-6:1 Yes chr3L:4510698-4532145 lnc-EQTN-1:2 No - lnc-MOB3B-1:1 No - lnc-EQTN-4:1 Yes chr2L:10265336-10266570 lnc-EQTN-3:1 Yes chr2L:10265336-10266570 lnc-C9orf72-1:1 No - lnc-C9orf72-2:1 No - lnc-LINGO2-3:1 Yes chr2R:21872030-21946259 lnc-C9orf72-3:2 Yes chr2R:21872030-21946259 lnc-C9orf72-3:1 Yes chr2R:21872030-21946259 lnc-IFNK-6:1 Yes chr2R:21872030-21946259 lnc-C9orf72-4:1 Yes chr2R:21872030-21946259 lnc-LINGO2-2:3 No - lnc-IFNK-7:1 No - lnc-LINGO2-6:1 No - lnc-IFNK-8:1 No - lnc-LINGO2-7:1 No - lnc-IFNK-9:1 No - LINC01242:2 No - lnc-DDX58-7:1 No - lnc-DDX58-6:2 No - lnc-DDX58-6:1 No - lnc-ACO1-7:1 No - lnc-DDX58-5:1 No - lnc-ACO1-6:1 No - lnc-ACO1-5:1 No - lnc-ACO1-4:1 No - lnc-ACO1-11:1 No - lnc-ACO1-11:2 No - lnc-DDX58-4:1 No - lnc-DDX58-1:3 No - lnc-DDX58-1:4 No - lnc-DDX58-1:2 No - lnc-ACO1-2:1 No - lnc-ACO1-1:1 No - lnc-SMIM27-7:1 No - lnc-SMIM27-5:1 Yes chr2R:18972612-18977262 lnc-NDUFB6-1:1 Yes chr2R:18972612-18977262 lnc-ACO1-10:1 No - lnc-ACO1-3:3 No - lnc-TAF1L-3:1 No - lnc-TAF1L-5:1 No - lnc-TAF1L-4:1 No - lnc-TAF1L-6:1 No - lnc-APTX-4:1 No - lnc-DNAJA1-3:1 No - lnc-SMU1-1:1 Yes chr3R:19403455-19406294 lnc-APTX-2:1 Yes chr3R:19403455-19406294 lnc-APTX-2:7 Yes chr3R:19403455-19406294 lnc-APTX-2:2 Yes chr3R:19403455-19406294 lnc-DNAJA1-2:1 Yes chr3R:19403455-19406294 lnc-APTX-2:4 Yes chr3R:19403455-19406294 lnc-APTX-2:3 Yes chr3R:19403455-19406294 lnc-APTX-3:1 Yes chr3R:13382106-13385283 lnc-DNAJA1-1:1 Yes chr3R:18978980-18981324 lnc-SPINK4-4:7 No - lnc-SPINK4-4:10 No - lnc-SPINK4-4:11 No - lnc-BAG1-2:10 No - lnc-BAG1-1:2 No - lnc-B4GALT1-2:1 No - lnc-BAG1-1:1 No - lnc-B4GALT1-3:1 No - lnc-NFX1-1:2 No - lnc-AQP3-1:1 Yes chr3R:16268329-16272415 lnc-ANKRD18B-3:2 No - lnc-BAG1-2:14 No - lnc-ANKRD18B-2:2 No - lnc-NOL6-4:1 No - lnc-BAG1-2:11 No - lnc-BAG1-2:5 No - lnc-BAG1-2:6 No - lnc-BAG1-2:15 No - lnc-BAG1-2:2 No - lnc-BAG1-2:4 No - lnc-NOL6-5:1 No - lnc-ANKRD18B-4:1 No - lnc-ANKRD18B-6:1 No - lnc-ANKRD18B-1:2 No - lnc-ANKRD18B-5:1 No - lnc-ANKRD18B-5:2 No - lnc-ANKRD18B-6:2 No - lnc-ANKRD18B-6:3 No - lnc-ANKRD18B-6:4 No - lnc-ANKRD18B-6:5 No - lnc-ANKRD18B-6:6 No - lnc-ANKRD18B-7:1 No - lnc-NOL6-6:1 No - lnc-PRSS3-2:2 No - lnc-PRSS3-2:3 No - lnc-PRSS3-2:10 No - lnc-PRSS3-2:12 No - lnc-PRSS3-2:13 No - lnc-PRSS3-2:15 No - lnc-UBAP2-6:4 No - lnc-UBAP2-5:2 No - lnc-UBAP2-5:1 No - lnc-PRSS3-1:6 No - lnc-PRSS3-1:7 No - lnc-PRSS3-1:8 No - lnc-UBAP2-6:2 No - lnc-UBE2R2-4:1 No - lnc-UBAP2-1:3 Yes chr3L:15585431-15588175 lnc-UBAP2-1:2 Yes chr3L:15585431-15588175 lnc-DCAF12-1:2 Yes chr2R:8067977-8078815 lnc-DCAF12-1:1 Yes chr2R:8067977-8078815 lnc-UBAP1-6:1 No - lnc-UBAP2-4:1 Yes chr3R:12014943-12017031 lnc-UBAP1-4:1 No - lnc-UBAP1-3:1 No - lnc-NUDT2-6:1 No - lnc-NUDT2-4:1 No - lnc-KIF24-2:1 No - lnc-KIF24-1:1 No - lnc-NUDT2-1:1 No - lnc-C9orf24-1:1 No - lnc-NUDT2-3:1 No - lnc-NUDT2-5:1 Yes chr2R:20978901-20984043 lnc-CNTFR-2:1 No - lnc-CNTFR-1:1 No - lnc-ENHO-1:1 No - CNTFR-AS1:2 No - CNTFR-AS1:3 No - CNTFR-AS1:4 No - CNTFR-AS1:8 No - CNTFR-AS1:9 No - CNTFR-AS1:10 No - CNTFR-AS1:11 No - CNTFR-AS1:13 No - lnc-RPP25L-1:3 No - lnc-RPP25L-1:1 No - lnc-RPP25L-1:2 No - lnc-ARID3C-1:1 No - lnc-ARID3C-2:2 No - lnc-CCL27-2:4 No - lnc-CCL27-2:2 No - lnc-CCL27-2:3 No - lnc-CCL27-1:4 No - lnc-CCL27-1:3 No - lnc-CCL27-1:2 No - lnc-IL11RA-2:1 No - lnc-CCL21-1:1 No - lnc-FAM205A-1:1 No - lnc-FAM205C-1:1 No - lnc-FAM205A-2:1 No - lnc-DNAJB5-3:1 No - lnc-DNAJB5-4:1 No - lnc-DNAJB5-2:2 No - lnc-DNAJB5-5:1 No - lnc-C9orf131-2:1 No - lnc-FANCG-3:1 Yes chr2R:9989159-9993559 lnc-FANCG-2:1 Yes chr2R:9989159-9993559 lnc-VCP-3:2 No - lnc-VCP-2:1 No - lnc-VCP-3:1 No - lnc-VCP-4:2 No - lnc-VCP-4:1 No - lnc-FANCG-1:1 Yes chr2R:18426421-18430333 lnc-STOML2-1:3 Yes chr2R:18426421-18430333 lnc-FAM214B-1:1 Yes chr2R:23949201-23952459 lnc-STOML2-2:1 Yes chr2R:11619479-11640941 lnc-STOML2-2:2 Yes chr2R:11619479-11640941 lnc-UNC13B-1:1 No - lnc-FAM214B-2:1 Yes chr4:867824-912331 lnc-RUSC2-2:6 No - lnc-TESK1-2:1 No - lnc-TESK1-2:2 No - lnc-CD72-3:1 Yes chr2R:11289688-11291096 lnc-CD72-1:1 No - lnc-CD72-2:5 No - lnc-CD72-2:7 No - lnc-CD72-2:2 No - lnc-CD72-2:4 No - lnc-CD72-2:3 No - lnc-CD72-2:6 No - lnc-TESK1-1:1 No - lnc-CCDC107-3:1 No - lnc-CCDC107-1:2 No - lnc-ARHGEF39-1:1 No - lnc-SIT1-1:1 No - lnc-CA9-2:1 No - lnc-MSMP-3:1 Yes chr2L:14334158-14345795 lnc-MSMP-2:1 Yes chr3R:5219657-5221548 lnc-MSMP-1:2 Yes chr3R:5219657-5221548 lnc-NPR2-1:5 No - lnc-NPR2-1:6 No - lnc-HINT2-2:1 No - lnc-HINT2-1:2 Yes chr2L:2770135-2770904 lnc-HINT2-1:1 No - lnc-HINT2-1:3 Yes chr2L:2770135-2770904 lnc-TMEM8B-1:2 Yes chr3R:25199818-25214255 lnc-TMEM8B-1:3 Yes chr3R:25199818-25214255 lnc-OR13J1-1:1 No - lnc-HRCT1-5:1 No - lnc-HRCT1-5:2 No - lnc-OR2S2-2:1 No - lnc-HRCT1-6:1 No - lnc-OR2S2-1:1 No - lnc-CLTA-2:1 Yes chr3L:20241053-20243735 lnc-RNF38-3:1 No - lnc-RNF38-1:5 Yes chr3R:9535625-9551806 lnc-RNF38-1:4 Yes chr3R:9535625-9551806 lnc-RNF38-1:2 Yes chr3R:9535625-9551806 lnc-RNF38-1:3 Yes chr3R:9535625-9551806 lnc-MELK-2:1 No - lnc-PAX5-6:1 No - lnc-MELK-3:1 No - lnc-RNF38-4:5 Yes chr4:1088798-1113317 lnc-RNF38-4:4 Yes chr4:1088798-1113317 lnc-RNF38-4:6 Yes chr4:1088798-1113317 lnc-RNF38-4:3 Yes chr4:1088798-1113317 lnc-ZCCHC7-6:1 Yes chr4:1088798-1113317 lnc-ZCCHC7-5:1 No - lnc-PAX5-4:1 No - lnc-ZCCHC7-2:4 No - lnc-ZCCHC7-2:5 No - LINC01400:1 No - lnc-ZCCHC7-2:6 No - lnc-ZCCHC7-2:7 No - lnc-ZCCHC7-2:8 No - lnc-ZCCHC7-2:9 No - lnc-ZCCHC7-2:10 No - lnc-ZCCHC7-2:11 No - lnc-PAX5-5:1 No - lnc-PAX5-3:2 No - lnc-PAX5-7:2 Yes chr3L:16845386-16852350 lnc-ZBTB5-5:1 Yes chr3L:16845386-16852350 lnc-ZBTB5-4:1 No - lnc-ZBTB5-3:1 No - lnc-ZBTB5-2:1 No - lnc-FBXO10-2:1 No - lnc-POLR1E-2:2 No - lnc-FBXO10-1:1 No - lnc-POLR1E-2:3 No - lnc-POLR1E-4:1 Yes chr3R:9803486-9809368 lnc-TOMM5-1:1 No - lnc-TOMM5-2:1 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-SLC25A51-7:2 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-SLC25A51-6:8 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-SLC25A51-6:7 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-SLC25A51-6:5 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-TRMT10B-2:2 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-TRMT10B-4:2 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-SLC25A51-1:5 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-SLC25A51-1:6 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-DCAF10-3:1 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-SHB-4:1 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-DCAF10-2:2 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-SLC25A51-4:2 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-SHB-2:1 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-SLC25A51-5:2 No - lnc-ALDH1B1-5:1 No - lnc-ALDH1B1-1:2 No - lnc-IGFBPL1-1:1 No - lnc-ALDH1B1-3:1 No - lnc-FAM95C-4:1 No - lnc-FAM95C-1:1 No - lnc-ALDH1B1-7:1 No - FAM95C:6 No - FAM95C:8 No - FAM95C:12 No - FAM95C:10 No - FAM95C:3 No - FAM95C:9 No - FAM95C:1 No - FAM95C:5 No - FAM95C:4 No - lnc-FAM95C-3:1 No - FAM201A:1 No - FAM201A:2 No - FAM201A:3 No - lnc-ANKRD18A-2:1 No - lnc-ALDH1B1-13:4 No - lnc-ALDH1B1-13:8 No - lnc-ALDH1B1-9:2 No - lnc-ALDH1B1-8:1 No - lnc-SPATA31A1-5:6 No - lnc-SPATA31A1-4:1 No - lnc-FAM240B-6:1 Yes chr3L:12146519-12156990 lnc-FAM240B-7:2 Yes chr3L:12146519-12156990 lnc-FAM240B-7:1 Yes chr3L:12146519-12156990 lnc-FAM240B-8:1 Yes chr3L:12146519-12156990 lnc-SPATA31A1-3:1 Yes chr3L:12146519-12156990 lnc-FAM240B-9:1 Yes chr3L:12146519-12156990 lnc-SPATA31A1-2:1 Yes chr3L:12146519-12156990 lnc-CNTNAP3-20:1 No - FAM74A1:1 No - FAM74A1:2 No - lnc-CNTNAP3-5:1 No - lnc-CNTNAP3-1:2 No - lnc-CNTNAP3-9:2 No - lnc-SPATA31A6-2:1 Yes chr3L:12146519-12156990 lnc-FOXD4L5-46:3 No - lnc-FOXD4L5-43:1 No - lnc-ZNF658-5:1 No - lnc-SPATA31A3-2:1 No - lnc-ZNF658-4:1 No - lnc-ANKRD20A3-2:3 No - lnc-ZNF658-2:2 No - lnc-SPATA31A3-1:1 No - lnc-SPATA31A3-1:3 No - lnc-ZNF658-3:1 No - lnc-FOXD4L5-47:1 No - lnc-SPATA31A5-5:1 No - lnc-FOXD4L5-46:1 No - lnc-FOXD4L5-46:2 No - lnc-SPATA31A5-1:2 No - lnc-FOXD4L5-45:1 No - lnc-CNTNAP3-9:3 No - lnc-CNTNAP3-10:2 No - lnc-SPATA31A1-8:1 No - GLIDR:16 No - GLIDR:15 No - GLIDR:11 No - GLIDR:12 No - lnc-ANKRD20A2-14:1 No - lnc-CNTNAP3-24:4 No - lnc-CNTNAP3-24:2 No - lnc-ANKRD20A2-13:1 No - lnc-CNTNAP3-11:1 No - lnc-ANKRD20A2-17:1 No - lnc-CNTNAP3-24:3 No - lnc-ANKRD20A2-11:1 No - lnc-ANKRD20A2-10:1 No - lnc-ANKRD20A2-9:1 No - lnc-ANKRD20A2-7:1 No - lnc-ANKRD20A2-4:1 No - lnc-CNTNAP3-17:1 No - lnc-CNTNAP3-17:2 No - lnc-FOXD4L6-16:1 No - lnc-FOXD4L6-15:1 No - FAM95B1:7 No - FAM95B1:9 No - FAM95B1:11 No - FAM95B1:12 No - FAM95B1:13 No - FAM95B1:14 No - FAM95B1:15 No - FAM95B1:17 No - FAM95B1:26 No - lnc-FOXD4L6-14:1 No - lnc-ANKRD20A2-5:1 No - lnc-ANKRD20A2-8:1 No - lnc-FOXD4L5-2:2 No - lnc-FOXD4L5-3:3 No - lnc-FOXD4L5-5:2 No - lnc-FOXD4L5-5:6 No - lnc-ANKRD20A4-12:1 No - lnc-ANKRD20A4-12:5 No - lnc-ANKRD20A4-12:2 No - lnc-ANKRD20A4-12:4 No - lnc-FOXD4L4-8:1 No - lnc-ANKRD20A3-7:1 No - lnc-FOXD4L5-98:2 No - lnc-CNTNAP3B-10:1 No - lnc-SPATA31A6-10:2 No - lnc-SPATA31A6-8:1 No - lnc-SPATA31A6-5:1 No - lnc-CNTNAP3B-4:1 No - lnc-SPATA31A6-7:1 No - lnc-SPATA31A6-7:2 No - lnc-CNTNAP3B-8:1 No - lnc-CNTNAP3B-9:1 No - lnc-CNTNAP3B-12:1 No - lnc-SPATA31A6-13:1 No - lnc-CNTNAP3B-5:2 No - lnc-SPATA31A7-4:1 No - lnc-SPATA31A7-3:1 No - lnc-SPATA31A7-3:2 No - lnc-FOXD4L5-42:1 No - lnc-SPATA31A7-5:1 No - lnc-FOXD4L5-41:1 No - lnc-SPATA31A7-5:2 No - lnc-SPATA31A7-7:1 No - lnc-SPATA31A7-7:2 No - lnc-SPATA31A7-7:3 No - lnc-SPATA31A7-8:1 No - lnc-SPATA31A6-15:2 No - lnc-SPATA31A6-11:1 No - lnc-SPATA31A6-6:1 No - lnc-CNTNAP3B-24:2 No - lnc-SPATA31A6-3:1 No - lnc-ANKRD20A1-23:1 No - lnc-CNTNAP3B-22:3 No - lnc-CNTNAP3B-22:2 No - lnc-CNTNAP3B-24:3 No - lnc-SPATA31A6-3:2 No - lnc-CNTNAP3B-15:1 No - lnc-CNTNAP3B-22:1 No - FAM27E2:5 No - lnc-CNTNAP3B-13:1 No - lnc-CNTNAP3B-45:6 No - lnc-CNTNAP3B-45:7 No - lnc-SPATA31A6-9:1 No - lnc-FOXD4L5-38:1 No - lnc-SPATA31A7-10:1 No - lnc-SPATA31A7-11:1 No - lnc-FOXD4L5-36:1 No - lnc-SPATA31A7-12:1 No - lnc-SPATA31A7-13:1 No - lnc-SPATA31A7-13:2 No - lnc-SPATA31A7-13:3 No - lnc-SPATA31A7-13:5 No - lnc-FOXD4L5-34:2 No - lnc-FOXD4L5-33:1 No - lnc-FOXD4L5-32:1 No - LINC01189:1 No - lnc-FOXD4L5-31:1 No - lnc-FOXD4L5-30:1 No - lnc-FOXD4L5-29:1 No - lnc-FOXD4L5-28:1 No - lnc-SPATA31A7-15:1 No - lnc-SPATA31A6-16:1 No - lnc-CBWD6-25:1 Yes chr3L:12146519-12156990 lnc-CNTNAP3-20:2 No - lnc-SPATA31A3-7:1 No - lnc-ZNF658-18:2 No - lnc-SPATA31A6-12:1 No - lnc-CNTNAP3B-10:2 No - lnc-SPATA31A6-10:1 No - lnc-CNTNAP3B-11:1 No - lnc-FOXD4L5-27:1 No - LINC01410:4 No - LINC01410:19 No - LINC01410:5 No - LINC01410:6 No - LINC01410:7 No - lnc-ANKRD20A4-21:1 No - lnc-FOXD4L5-80:1 No - lnc-ANKRD20A4-20:1 No - lnc-ANKRD20A4-20:2 No - lnc-ANKRD20A4-20:3 No - lnc-ANKRD20A4-20:4 No - lnc-ANKRD20A4-20:5 No - lnc-FOXD4L5-25:15 No - lnc-FOXD4L5-25:9 No - lnc-FOXD4L5-25:2 No - lnc-FOXD4L5-25:5 No - lnc-FOXD4L5-25:8 No - lnc-FOXD4L5-25:1 No - lnc-FOXD4L5-25:3 No - lnc-ANKRD20A4-19:1 No - lnc-ANKRD20A4-18:2 No - lnc-ANKRD20A4-18:3 No - lnc-ANKRD20A4-18:4 No - lnc-ANKRD20A4-18:5 No - lnc-FOXD4L6-23:1 No - lnc-FOXD4L6-22:1 No - lnc-ANKRD20A2-18:2 No - lnc-FOXD4L6-21:1 No - lnc-ANKRD20A2-19:1 No - lnc-ANKRD20A2-20:1 No - lnc-ANKRD20A4-16:2 No - lnc-FOXD4L5-24:1 No - lnc-ANKRD20A4-17:1 No - lnc-FOXD4L5-23:2 No - lnc-FOXD4L5-23:5 No - lnc-FOXD4L5-23:8 No - lnc-FOXD4L5-22:3 No - lnc-FOXD4L5-22:1 No - lnc-FOXD4L5-22:4 No - lnc-FOXD4L5-22:2 No - lnc-FOXD4L5-22:5 No - lnc-FOXD4L5-22:6 No - lnc-FOXD4L5-21:4 No - lnc-FOXD4L5-21:1 No - lnc-FOXD4L5-21:3 No - lnc-FOXD4L5-21:2 No - lnc-ANKRD20A4-13:1 No - lnc-SPATA31A6-3:3 No - lnc-CNTNAP3B-24:1 No - lnc-FOXD4L5-20:1 No - lnc-ANKRD20A4-11:1 No - lnc-ANKRD20A4-10:1 No - lnc-ANKRD20A4-8:1 No - lnc-FOXD4L5-14:1 No - lnc-FOXD4L5-15:1 No - lnc-FOXD4L5-13:1 No - lnc-ANKRD20A4-5:2 No - lnc-ANKRD20A4-5:3 No - lnc-ANKRD20A4-5:4 No - lnc-ANKRD20A4-5:5 No - lnc-FOXD4L5-16:1 No - lnc-FOXD4L5-17:1 No - lnc-ANKRD20A4-6:1 No - lnc-FOXD4L5-17:2 No - lnc-FOXD4L5-18:6 No - lnc-FOXD4L5-18:5 No - lnc-FOXD4L5-18:4 No - lnc-FOXD4L5-18:2 No - lnc-FOXD4L5-18:3 No - lnc-ANKRD20A2-22:2 No - lnc-ANKRD20A2-22:4 No - lnc-ANKRD20A2-22:5 No - lnc-FOXD4L6-2:3 No - lnc-FOXD4L6-2:2 No - lnc-FOXD4L5-12:1 No - lnc-ANKRD20A4-1:1 No - lnc-ANKRD20A4-2:1 No - lnc-FOXD4L5-11:1 No - lnc-ANKRD20A4-3:1 No - lnc-FOXD4L5-10:2 No - lnc-FOXD4L5-10:1 No - lnc-FOXD4L5-7:1 No - lnc-FOXD4L5-6:1 No - lnc-FOXD4L5-9:1 No - lnc-CBWD5-4:7 No - lnc-FOXD4L5-5:3 No - lnc-FOXD4L5-8:1 No - lnc-FOXD4L5-5:5 No - lnc-FOXD4L5-3:2 No - lnc-FOXD4L4-4:3 No - lnc-FOXD4L4-4:2 No - lnc-ANKRD20A3-4:4 No - lnc-FOXD4L4-3:1 No - lnc-FOXD4L4-1:1 No - lnc-PGM5-2:2 Yes chr3L:16126018-16128531 lnc-PGM5-2:4 Yes chr3L:16126018-16128531 lnc-PGM5-2:5 Yes chr3L:16126018-16128531 lnc-PGM5-2:6 Yes chr3L:16126018-16128531 PGM5-AS1:5 Yes chr3L:16126018-16128531 lnc-TMEM252-2:5 Yes chr3L:16126018-16128531 lnc-FOXD4L3-6:1 Yes chr3L:16126018-16128531 lnc-TMEM252-2:2 Yes chr3L:16126018-16128531 lnc-TMEM252-2:1 Yes chr3L:16126018-16128531 lnc-PGM5-1:2 No - lnc-TMEM252-5:1 No - lnc-PGM5-1:4 No - lnc-FAM122A-1:1 Yes chr2R:22874769-22881436 lnc-FAM122A-1:2 Yes chr2R:22874769-22881436 lnc-PRKACG-6:1 Yes chr2R:22874769-22881436 lnc-PRKACG-1:2 Yes chr2R:22874769-22881436 lnc-APBA1-6:1 No - lnc-PTAR1-4:1 Yes chrX:10627737-10710947 lnc-FAM189A2-1:2 Yes chrX:10627737-10710947 lnc-APBA1-4:1 Yes chrX:2260207-2262515 lnc-PTAR1-3:1 No - MAMDC2-AS1:10 No - MAMDC2-AS1:17 No - MAMDC2-AS1:15 No - MAMDC2-AS1:4 No - MAMDC2-AS1:11 No - MAMDC2-AS1:2 No - MAMDC2-AS1:3 No - SMC5-AS1:2 No - SMC5-AS1:1 No - lnc-SMC5-6:1 No - SMC5-AS1:3 No - lnc-MAMDC2-1:1 Yes chr3L:21569176-21573523 lnc-SMC5-3:1 No - lnc-SMC5-4:1 No - lnc-SMC5-5:1 No - lnc-SMC5-8:1 Yes chr2R:15262808-15309368 lnc-SMC5-10:1 Yes chr2R:15262808-15309368 lnc-KLF9-4:1 Yes chr2R:15262808-15309368 lnc-C9orf85-7:1 No - lnc-C9orf85-6:1 No - lnc-C9orf85-6:2 No - lnc-C9orf85-6:3 No - lnc-C9orf85-5:1 No - lnc-C9orf85-4:1 No - lnc-C9orf85-3:1 No - lnc-ABHD17B-5:1 No - lnc-ABHD17B-3:1 No - lnc-ABHD17B-2:1 No - lnc-C9orf85-2:1 No - lnc-ABHD17B-1:1 Yes chrX:17248372-17249502 lnc-C9orf57-3:1 Yes chrX:17248372-17249502 lnc-C9orf57-2:1 No - lnc-GDA-4:1 No - lnc-GDA-4:2 No - lnc-ABHD17B-4:1 No - lnc-ABHD17B-4:3 No - lnc-ABHD17B-4:2 No - lnc-C9orf57-1:1 No - lnc-GDA-1:2 No - lnc-GDA-3:1 No - LINC01504:1 No - LINC01504:7 No - lnc-ZFAND5-1:1 No - lnc-C9orf57-4:2 Yes chr3R:9340216-9362994 lnc-C9orf57-4:4 Yes chr3R:9340216-9362994 lnc-C9orf57-4:3 Yes chr3R:9340216-9362994 lnc-C9orf57-4:1 Yes chr3R:9340216-9362994 lnc-ZFAND5-2:1 No - lnc-GDA-5:1 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-ALDH1A1-7:1 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-ALDH1A1-6:1 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-ANXA1-9:1 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-TMC1-2:1 No - lnc-ANXA1-7:1 No - lnc-ZFAND5-4:1 No - lnc-ALDH1A1-4:2 Yes chrX:20171445-20173514 lnc-ANXA1-6:1 No - lnc-ANXA1-1:4 No - lnc-ANXA1-1:5 No - lnc-ANXA1-8:1 No - lnc-ANXA1-8:2 No - lnc-ALDH1A1-8:1 No - lnc-ANXA1-10:1 No - lnc-ANXA1-3:2 No - lnc-ANXA1-4:2 No - lnc-ANXA1-11:1 No - lnc-ALDH1A1-9:1 No - lnc-RORB-2:4 No - lnc-TRPM6-4:2 No - RORB-AS1:2 Yes chr2R:10203995-10237348 RORB-AS1:12 No - RORB-AS1:10 No - lnc-RORB-3:1 Yes chr2R:15262808-15309368 lnc-RORB-4:1 Yes chr2R:15262808-15309368 lnc-OSTF1-4:1 No - C9orf41-AS1:1 No - lnc-OSTF1-3:1 No - lnc-CARNMT1-1:1 No - lnc-CARNMT1-2:1 Yes chr3L:3319555-3322489 lnc-CARNMT1-3:2 Yes chr3L:3319555-3322489 lnc-CARNMT1-3:1 Yes chr3L:3319555-3322489 lnc-NMRK1-2:1 No - lnc-NMRK1-3:1 No - lnc-RFK-3:1 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-RFK-1:2 Yes chr3R:7912017-7913290 lnc-RFK-1:1 Yes chr3R:7912017-7913290 lnc-PCSK5-2:1 No - lnc-GCNT1-1:2 No - lnc-GCNT1-2:2 No - lnc-GCNT1-4:1 No - lnc-RFK-5:1 Yes chr3L:4037523-4040482 lnc-RFK-6:1 Yes chr3L:4037523-4040482 lnc-FOXB2-9:4 Yes chr3L:4037523-4040482 lnc-PRUNE2-1:1 No - lnc-FOXB2-4:1 No - lnc-PRUNE2-2:1 No - lnc-FOXB2-3:1 No - lnc-FOXB2-2:1 No - lnc-FOXB2-2:2 No - lnc-FOXB2-5:1 No - VPS13A-AS1:1 No - lnc-VPS13A-2:1 No - GNA14-AS1:3 No - GNA14-AS1:4 No - lnc-VPS13A-3:1 No - lnc-GNA14-3:1 Yes chr2R:12612740-12623197 lnc-CEP78-2:1 No - lnc-GNAQ-6:1 No - lnc-CEP78-1:1 No - lnc-GNAQ-7:1 No - lnc-PSAT1-2:1 No - lnc-GNAQ-10:3 No - lnc-GNAQ-10:2 No - lnc-GNAQ-11:1 No - lnc-GNAQ-2:7 No - lnc-TLE4-8:2 No - lnc-TLE4-6:1 No - lnc-TLE4-3:1 No - LNCARSR:16 No - lnc-PSAT1-3:2 Yes chr3R:26041736-26049911 lnc-PSAT1-5:1 Yes chr3R:26041736-26049911 lnc-TLE4-4:1 No - lnc-TLE1-13:1 No - lnc-TLE4-5:1 No - lnc-TLE4-7:1 No - LINC01507:4 No - LINC01507:5 No - LINC01507:6 No - lnc-TLE1-12:1 No - lnc-TLE1-11:1 No - lnc-TLE1-9:1 No - lnc-TLE4-10:1 No - lnc-TLE1-8:1 No - lnc-TLE1-7:1 No - lnc-TLE1-6:1 No - lnc-TLE1-4:1 No - lnc-SPATA31D4-10:1 No - lnc-SPATA31D4-9:1 No - lnc-TLE1-3:1 No - lnc-SPATA31D4-7:1 Yes chr3R:26041736-26049911 lnc-SPATA31D4-6:1 Yes chr3R:26041736-26049911 lnc-SPATA31D4-1:2 No - lnc-SPATA31D4-1:10 No - lnc-TLE1-1:3 No - lnc-TLE1-2:2 No - lnc-TLE1-2:3 No - lnc-SPATA31D1-4:2 No - lnc-SPATA31D1-4:19 No - lnc-SPATA31D1-4:20 No - lnc-SPATA31D1-4:21 No - lnc-SPATA31D1-4:22 No - lnc-SPATA31D1-4:23 No - lnc-SPATA31D1-4:24 No - lnc-SPATA31D1-4:25 No - lnc-SPATA31D1-4:26 No - lnc-SPATA31D1-4:29 No - lnc-SPATA31D1-4:30 No - lnc-SPATA31D1-4:31 No - lnc-SPATA31D1-8:1 No - lnc-RASEF-6:1 No - lnc-SPATA31D1-4:37 No - lnc-RASEF-4:1 No - lnc-RASEF-3:1 No - lnc-SPATA31D1-11:1 No - lnc-RASEF-2:1 No - lnc-IDNK-8:1 No - lnc-RASEF-1:1 No - lnc-FRMD3-5:1 No - lnc-FRMD3-2:1 No - lnc-IDNK-3:1 No - lnc-GKAP1-1:1 Yes chrX:19683808-19687658 lnc-GKAP1-1:2 Yes chrX:19683808-19687658 lnc-KIF27-2:1 No - lnc-KIF27-1:1 No - lnc-RMI1-6:2 No - lnc-RMI1-5:9 No - lnc-C9orf64-1:2 Yes chr2R:20587551-20606854 lnc-C9orf64-1:1 Yes chr2R:20587551-20606854 lnc-RMI1-2:2 No - lnc-RMI1-2:3 No - lnc-RMI1-8:1 No - lnc-SLC28A3-1:1 No - lnc-NTRK2-3:2 No - lnc-NTRK2-2:4 No - lnc-SLC28A3-2:1 No - lnc-SLC28A3-2:2 No - lnc-NTRK2-6:1 No - lnc-AGTPBP1-5:1 No - lnc-NTRK2-4:2 No - lnc-NTRK2-4:3 No - lnc-NTRK2-7:1 No - lnc-NAA35-9:1 No - lnc-GOLM1-3:1 No - lnc-GOLM1-2:1 No - lnc-AGTPBP1-1:2 No - lnc-AGTPBP1-2:5 No - lnc-NAA35-6:1 No - lnc-NAA35-6:2 No - lnc-NAA35-6:4 No - lnc-NAA35-6:5 No - lnc-NAA35-6:6 No - lnc-NAA35-6:7 No - lnc-NAA35-4:1 No - lnc-NAA35-2:2 No - lnc-GOLM1-1:1 No - lnc-NAA35-5:1 No - lnc-NAA35-7:2 No - lnc-ISCA1-3:1 No - lnc-ISCA1-1:1 No - lnc-ISCA1-2:1 No - lnc-ZCCHC6-1:1 No - lnc-NAA35-3:2 No - lnc-NAA35-10:1 No - lnc-GAS1-2:2 No - lnc-GAS1-2:3 No - lnc-DAPK1-6:1 No - lnc-GAS1-3:1 No - lnc-GAS1-3:2 No - lnc-GAS1-4:1 No - lnc-DAPK1-1:1 No - lnc-CTSL-3:1 No - lnc-SPATA31E1-5:1 No - lnc-CDK20-9:1 No - lnc-CDK20-1:2 No - lnc-SPATA31E1-3:1 No - lnc-CDK20-6:1 No - lnc-SPATA31E1-7:1 No - lnc-CDK20-7:1 No - lnc-CDK20-8:3 No - lnc-CDK20-8:4 No - lnc-CDK20-8:2 No - lnc-CDK20-8:6 No - lnc-SPATA31E1-8:1 No - lnc-CDK20-8:5 No - lnc-SPATA31E1-9:1 No - lnc-SPATA31E1-9:2 No - lnc-SPIN1-1:2 No - lnc-SPIN1-1:3 No - lnc-SPIN1-1:4 No - lnc-CDK20-10:1 No - lnc-CDK20-11:1 No - lnc-CDK20-12:1 No - lnc-CDK20-13:1 No - lnc-SHC3-2:4 No - lnc-SHC3-2:3 No - lnc-NXNL2-1:1 No - lnc-C9orf47-2:2 No - lnc-SHC3-3:1 No - lnc-SHC3-1:2 Yes chr3L:9427010-9428671 lnc-S1PR3-1:2 Yes chr3L:9427010-9428671 lnc-SEMA4D-8:1 Yes chr3L:9427010-9428671 lnc-S1PR3-2:1 Yes chr3L:9427010-9428671 lnc-SEMA4D-2:3 Yes chr3L:9427010-9428671 lnc-CKS2-3:2 Yes chr3L:9427010-9428671 lnc-SHC3-4:1 No - lnc-SEMA4D-4:1 No - lnc-SHC3-6:1 No - lnc-SHC3-6:2 No - lnc-SHC3-6:3 No - lnc-SHC3-5:2 No - lnc-SHC3-5:1 No - lnc-SHC3-5:3 No - lnc-SHC3-7:2 No - lnc-SHC3-7:1 No - lnc-SECISBP2-2:1 No - lnc-SEMA4D-5:3 No - lnc-SEMA4D-5:1 No - lnc-GADD45G-3:2 No - lnc-SEMA4D-6:3 No - lnc-SEMA4D-7:1 No - lnc-GADD45G-3:3 No - lnc-GADD45G-5:5 No - lnc-GADD45G-5:7 No - lnc-SEMA4D-16:2 No - lnc-GADD45G-6:2 No - lnc-DIRAS2-15:1 No - lnc-DIRAS2-13:1 No - lnc-DIRAS2-12:1 No - lnc-DIRAS2-11:1 No - lnc-GADD45G-11:1 No - lnc-DIRAS2-10:1 No - lnc-SYK-9:1 No - LINC01508:3 No - lnc-DIRAS2-8:1 No - LINC01501:2 No - lnc-SYK-8:1 No - LINC01501:1 No - lnc-DIRAS2-6:1 No - lnc-DIRAS2-7:1 No - lnc-DIRAS2-9:1 Yes chr2R:16199426-16202884 lnc-SYK-2:2 No - lnc-AUH-2:5 No - LINC00484:4 No - LINC00484:8 No - lnc-AUH-8:1 No - LINC00484:12 No - LINC00484:13 No - LINC00484:14 No - LINC00484:15 No - LINC00484:17 No - LINC00484:18 No - LINC00484:19 No - lnc-AUH-7:1 No - LINC00484:20 No - lnc-NFIL3-4:1 Yes chr2R:12651301-12652487 lnc-NFIL3-3:1 Yes chr2R:12651301-12652487 lnc-NFIL3-2:1 Yes chr2R:12651301-12652487 lnc-SYK-6:3 No - lnc-SYK-12:1 Yes chr2L:10251843-10254686 lnc-SPTLC1-6:2 Yes chr2L:10251843-10254686 lnc-SPTLC1-6:1 Yes chr2L:10251843-10254686 lnc-SPTLC1-6:3 Yes chr2L:10251843-10254686 lnc-CENPP-14:1 Yes chr2R:13168498-13170744 lnc-CENPP-13:1 Yes chr2R:13168498-13170744 lnc-IARS-2:3 Yes chr2R:13168498-13170744 lnc-IARS-2:1 Yes chr2R:13168498-13170744 lnc-IARS-2:2 Yes chr2R:13168498-13170744 lnc-CENPP-12:1 Yes chr2R:13168498-13170744 lnc-CENPP-11:1 Yes chr2R:13168498-13170744 lnc-CENPP-10:1 Yes chr2R:13168498-13170744 lnc-CENPP-10:2 Yes chr2R:13168498-13170744 lnc-CENPP-20:1 No - lnc-CENPP-20:6 No - lnc-CENPP-20:7 No - lnc-CENPP-20:8 No - lnc-CENPP-20:9 No - lnc-CENPP-20:15 No - lnc-CENPP-20:26 No - lnc-CENPP-20:28 No - lnc-CENPP-20:29 No - lnc-SPTLC1-4:1 No - lnc-CENPP-20:33 No - lnc-CENPP-20:35 No - lnc-SPTLC1-5:1 No - lnc-CENPP-8:1 No - lnc-NOL8-3:1 Yes chr3L:22288665-22292810 lnc-NOL8-2:1 Yes chr3L:22288665-22292810 lnc-NOL8-1:2 Yes chr3L:22288665-22292810 lnc-IARS-1:2 Yes chrX:19704176-19706417 lnc-OMD-1:1 No - lnc-ECM2-2:1 No - lnc-ECM2-1:1 No - lnc-ECM2-3:1 No - lnc-CENPP-5:1 Yes chr2R:20870791-20879145 lnc-CENPP-1:2 No - lnc-CENPP-6:1 No - lnc-CENPP-7:1 No - lnc-FGD3-5:1 No - lnc-FGD3-4:3 No - lnc-FGD3-3:1 No - lnc-FGD3-3:2 No - lnc-FGD3-3:3 No - lnc-FGD3-3:4 No - lnc-FGD3-3:5 No - lnc-ZNF484-2:1 No - lnc-FGD3-2:1 No - lnc-NINJ1-1:4 No - lnc-NINJ1-1:5 No - lnc-NINJ1-1:3 No - lnc-NINJ1-1:2 No - lnc-C9orf129-2:1 Yes chr3R:12695129-12697379 lnc-C9orf129-1:2 Yes chr3L:21543850-21554928 lnc-WNK2-1:1 No - lnc-FAM120A-2:1 No - lnc-FAM120A-1:1 No - lnc-FAM120AOS-1:2 No - lnc-FAM120AOS-4:1 No - lnc-FAM120AOS-3:4 No - lnc-FAM120AOS-3:3 No - lnc-FAM120AOS-3:5 No - lnc-FAM120AOS-3:2 No - lnc-FAM120AOS-3:1 No - lnc-FAM120AOS-3:6 No - lnc-FAM120AOS-3:7 No - lnc-FAM120AOS-5:1 No - lnc-PTPDC1-2:2 No - lnc-ZNF169-3:1 No - lnc-PTPDC1-4:1 No - lnc-PTPDC1-5:1 No - lnc-ZNF169-7:1 No - lnc-ZNF169-7:8 No - lnc-ZNF169-7:11 No - MIRLET7DHG:2 No - MIRLET7DHG:3 No - lnc-ZNF169-7:12 No - lnc-ZNF169-2:1 No - lnc-NUTM2F-2:1 No - lnc-FBP2-4:1 Yes chr3L:3128034-3143457 lnc-MFSD14B-8:1 No - lnc-FBP2-3:1 No - lnc-MFSD14B-9:1 No - lnc-MFSD14B-10:1 No - lnc-MFSD14B-11:1 No - lnc-MFSD14B-12:1 No - lnc-FBP2-2:1 No - lnc-FBP2-1:1 No - lnc-FBP1-1:1 Yes chr2L:19761587-19764136 lnc-FANCC-9:1 No - lnc-FANCC-9:2 No - lnc-MFSD14B-18:1 No - lnc-FANCC-3:1 No - lnc-MFSD14B-20:1 No - lnc-C9orf3-2:1 No - lnc-C9orf3-3:2 No - lnc-PTCH1-6:1 No - lnc-PTCH1-9:1 No - lnc-C9orf3-5:1 No - lnc-FANCC-1:14 No - lnc-PTCH1-5:1 No - lnc-FANCC-1:4 No - lnc-FANCC-4:1 Yes chr2R:8649649-8665223 lnc-C9orf3-6:1 Yes chr2R:8649649-8665223 lnc-FANCC-5:1 Yes chr2R:8649649-8665223 lnc-FANCC-7:2 Yes chr2R:8649649-8665223 lnc-FANCC-7:1 Yes chr2R:8649649-8665223 lnc-FANCC-6:1 Yes chr2R:8649649-8665223 lnc-FANCC-8:2 Yes chr2R:8649649-8665223 lnc-FANCC-8:1 Yes chr2R:8649649-8665223 lnc-ERCC6L2-12:1 Yes chr2R:8649649-8665223 lnc-ERCC6L2-10:1 Yes chr2R:8649649-8665223 lnc-PTCH1-4:1 No - lnc-ERCC6L2-6:1 No - lnc-ERCC6L2-9:1 No - lnc-ERCC6L2-8:1 No - LINC00476:11 No - LINC00476:4 No - LINC00476:15 No - LINC00476:13 No - lnc-ERCC6L2-7:1 No - lnc-ERCC6L2-1:2 No - lnc-PTCH1-7:1 No - lnc-PTCH1-8:1 No - LINC00476:5 No - LINC00476:1 No - LINC00476:2 No - lnc-HABP4-7:1 No - LINC00092:5 No - LINC00092:1 No - LINC00092:2 No - lnc-ERCC6L2-2:2 No - lnc-ERCC6L2-2:3 No - lnc-HSD17B3-2:1 No - lnc-SLC35D2-3:1 No - lnc-SLC35D2-2:1 No - lnc-HABP4-2:11 No - lnc-SLC35D2-1:2 No - lnc-HABP4-4:1 Yes chr2L:7801668-7810703 lnc-ZNF367-2:1 Yes chr2L:7801668-7810703 lnc-AAED1-1:3 Yes chr2L:7801668-7810703 lnc-AAED1-1:1 Yes chr2L:7801668-7810703 lnc-AAED1-1:2 Yes chr2L:7801668-7810703 lnc-HABP4-5:1 Yes chr2L:7801668-7810703 lnc-CDC14B-1:1 No - lnc-NUTM2G-6:8 No - lnc-NUTM2G-6:9 No - lnc-NUTM2G-6:10 No - lnc-NUTM2G-6:11 No - lnc-ZNF510-1:1 No - lnc-NUTM2G-5:1 No - lnc-MFSD14C-4:3 No - lnc-MFSD14C-4:2 No - lnc-MFSD14C-1:1 No - lnc-MFSD14C-4:1 No - lnc-NUTM2G-4:1 No - lnc-ZNF782-3:4 Yes chr3L:3128034-3143457 lnc-NUTM2G-1:1 Yes chr3L:3128034-3143457 lnc-ZNF782-2:1 Yes chr3L:3128034-3143457 lnc-ZNF782-3:3 Yes chr3L:3128034-3143457 lnc-NUTM2G-2:1 Yes chr3L:3128034-3143457 lnc-MFSD14C-3:1 Yes chr2R:13960675-13967981 lnc-CTSV-2:9 No - lnc-CTSV-2:10 No - lnc-CTSV-2:5 No - lnc-CTSV-2:6 No - lnc-CTSV-2:7 No - lnc-CTSV-2:2 No - lnc-NUTM2G-3:1 No - lnc-CTSV-2:1 No - lnc-CTSV-2:4 No - lnc-CTSV-6:1 No - lnc-CTSV-6:2 No - lnc-CTSV-5:8 No - lnc-CTSV-3:3 No - lnc-CCDC180-2:1 No - lnc-CCDC180-4:1 No - lnc-TSTD2-4:3 No - lnc-TSTD2-4:2 No - lnc-TSTD2-4:4 No - lnc-TSTD2-7:1 No - lnc-TSTD2-2:4 Yes chr3R:30532607-30578905 lnc-TMOD1-2:1 Yes chrX:4650015-4658259 lnc-TSTD2-5:4 Yes chrX:4102955-4104197 lnc-TSTD2-5:3 Yes chrX:4102955-4104197 lnc-TSTD2-6:1 Yes chrX:4102955-4104197 lnc-TSTD2-8:1 Yes chrX:4102955-4104197 lnc-NCBP1-1:2 No - lnc-FOXE1-1:1 No - lnc-HEMGN-2:1 No - lnc-ANP32B-1:1 No - lnc-CORO2A-1:1 No - lnc-NANS-2:1 No - lnc-NANS-3:1 No - lnc-ANKS6-5:1 Yes chr3R:21770333-21775840 lnc-GALNT12-3:2 Yes chr3R:21770333-21775840 lnc-ANKS6-1:18 Yes chr2R:16673235-16732916 lnc-GALNT12-1:1 No - lnc-ANKS6-1:15 No - lnc-ANKS6-1:5 No - lnc-ANKS6-1:14 No - lnc-ANKS6-1:13 No - lnc-ANKS6-1:12 No - lnc-ANKS6-1:4 No - lnc-ANKS6-1:3 No - lnc-ANKS6-1:11 No - lnc-ANKS6-1:10 No - lnc-ANKS6-1:9 No - lnc-ANKS6-1:8 No - lnc-ANKS6-1:7 No - lnc-ANKS6-1:17 No - lnc-ANKS6-1:16 No - lnc-ANKS6-1:2 No - lnc-ANKS6-1:6 No - lnc-GALNT12-2:1 No - lnc-COL15A1-1:3 No - lnc-ANKS6-3:1 Yes chr3L:6998843-7053499 lnc-ALG2-5:1 No - lnc-SEC61B-1:1 No - lnc-SEC61B-2:1 No - lnc-ALG2-6:31 No - lnc-ALG2-6:23 No - lnc-ALG2-6:4 No - lnc-ALG2-6:3 No - lnc-ALG2-6:22 No - lnc-ALG2-6:36 No - lnc-ALG2-6:30 No - lnc-ALG2-6:29 No - lnc-ALG2-6:28 No - lnc-ALG2-6:27 No - lnc-ALG2-6:21 No - lnc-ALG2-6:20 No - lnc-ALG2-6:19 No - lnc-ALG2-6:18 No - lnc-ALG2-6:17 No - lnc-ALG2-6:35 No - lnc-ALG2-6:34 No - lnc-ALG2-6:39 No - lnc-ALG2-6:33 No - lnc-ALG2-6:37 No - lnc-ALG2-6:32 No - lnc-ALG2-6:13 No - lnc-ALG2-6:12 No - lnc-ALG2-6:5 No - lnc-ALG2-6:26 No - lnc-ALG2-6:11 No - lnc-ALG2-6:16 No - lnc-ALG2-6:15 No - lnc-ALG2-6:24 No - lnc-ALG2-6:25 No - lnc-ALG2-6:9 No - lnc-ALG2-6:14 No - lnc-ALG2-6:8 No - lnc-ALG2-6:7 No - lnc-ALG2-6:10 No - lnc-ALG2-6:1 No - lnc-NR4A3-1:2 No - lnc-NR4A3-1:5 No - lnc-ERP44-3:9 No - lnc-ERP44-3:8 No - lnc-ERP44-3:18 No - STX17-AS1:2 No - STX17-AS1:4 No - lnc-TEX10-3:1 Yes chrX:16293853-16297718 lnc-STX17-2:2 No - lnc-STX17-3:1 No - lnc-ERP44-4:1 No - lnc-STX17-4:1 No - lnc-STX17-5:1 No - lnc-ERP44-6:1 Yes chrX:8117012-8119130 lnc-INVS-1:1 Yes chrX:8117012-8119130 lnc-MSANTD3-1:1 No - lnc-MSANTD3-1:2 No - lnc-TEX10-2:1 No - lnc-PLPPR1-3:1 No - lnc-ZNF189-5:1 No - lnc-BAAT-2:1 No - lnc-PLPPR1-1:1 No - lnc-BAAT-1:1 No - lnc-PLPPR1-2:1 No - lnc-MRPL50-1:1 No - TMEM246-AS1:5 No - TMEM246-AS1:6 No - TMEM246-AS1:10 No - TMEM246-AS1:11 No - lnc-TMEM246-2:1 No - TMEM246-AS1:13 No - lnc-ALDOB-1:1 No - lnc-TMEM246-1:1 No - lnc-RNF20-3:1 No - lnc-PPP3R2-1:1 No - lnc-GRIN3A-1:1 No - lnc-RNF20-4:1 No - lnc-RNF20-7:1 No - lnc-GRIN3A-2:1 No - lnc-GRIN3A-3:1 No - lnc-RNF20-5:1 No - lnc-RNF20-6:1 No - lnc-CYLC2-7:1 No - lnc-GRIN3A-3:3 No - lnc-GRIN3A-4:1 No - lnc-CYLC2-5:1 No - LINC00587:1 No - lnc-GRIN3A-5:1 No - lnc-CYLC2-3:1 No - lnc-CYLC2-2:1 No - lnc-CYLC2-4:1 No - LINC01492:5 No - lnc-CYLC2-1:2 No - lnc-OR13C4-3:2 No - lnc-SMC2-1:4 No - lnc-OR13C4-6:2 No - SMC2-AS1:1 No - lnc-SMC2-140:2 No - lnc-OR13C4-5:1 No - lnc-OR13C8-1:1 No - lnc-OR13C9-1:1 No - lnc-NIPSNAP3B-2:1 No - lnc-OR13C9-2:1 No - lnc-NIPSNAP3B-4:1 No - lnc-NIPSNAP3B-1:2 No - lnc-NIPSNAP3B-5:1 No - lnc-ABCA1-1:3 No - lnc-SLC44A1-3:1 No - lnc-ABCA1-4:1 No - lnc-SLC44A1-2:1 No - lnc-ABCA1-5:1 No - lnc-FKTN-1:2 No - lnc-ABCA1-2:4 No - lnc-ABCA1-2:2 No - lnc-ABCA1-2:3 No - lnc-FSD1L-2:2 No - lnc-ABCA1-6:1 No - lnc-ABCA1-7:1 No - lnc-TAL2-2:1 No - lnc-TAL2-1:1 No - lnc-TAL2-2:3 Yes chrX:16385278-16388702 lnc-TAL2-3:1 Yes chrX:16385278-16388702 lnc-TAL2-4:1 Yes chrX:16385278-16388702 lnc-TMEM38B-2:1 No - lnc-TMEM38B-2:2 No - lnc-ABCA1-3:2 No - lnc-TMEM38B-1:2 No - lnc-KLF4-11:2 No - lnc-KLF4-11:3 No - LINC01505:13 No - LINC01505:1 No - lnc-ZNF462-4:1 No - lnc-ZNF462-3:1 No - lnc-RAD23B-3:5 No - lnc-KLF4-12:1 Yes chr4:308093-310822 lnc-KLF4-9:1 No - lnc-RAD23B-12:1 No - lnc-KLF4-8:1 No - lnc-KLF4-7:1 No - lnc-RAD23B-21:1 No - lnc-RAD23B-13:1 No - lnc-RAD23B-8:3 No - lnc-RAD23B-8:4 No - lnc-RAD23B-8:5 No - lnc-RAD23B-15:1 No - lnc-KLF4-3:2 No - lnc-KLF4-4:3 No - lnc-RAD23B-17:1 No - lnc-RAD23B-16:1 No - lnc-RAD23B-17:2 No - lnc-RAD23B-18:1 No - lnc-RAD23B-18:2 No - lnc-KLF4-5:4 No - lnc-ACTL7B-9:1 No - lnc-ACTL7A-2:2 No - lnc-ACTL7B-2:1 No - lnc-ACTL7A-4:1 No - lnc-ACTL7A-3:1 No - lnc-TMEM245-1:1 Yes chr2R:23957842-23961631 lnc-CTNNAL1-1:1 Yes chr3R:8001562-8006033 lnc-FAM206A-1:1 Yes chr3R:8001562-8006033 lnc-CTNNAL1-1:2 Yes chr3R:8001562-8006033 lnc-FRRS1L-2:1 Yes chr3R:8001562-8006033 lnc-FRRS1L-1:3 Yes chr2R:16017737-16024627 lnc-FRRS1L-1:2 Yes chr2R:16017737-16024627 lnc-EPB41L4B-3:1 Yes chr2R:16017737-16024627 lnc-EPB41L4B-2:1 Yes chr2R:16017737-16024627 lnc-PALM2-6:1 Yes chr3R:13428867-13434984 lnc-PALM2-3:1 No - lnc-PALM2-1:1 No - lnc-C9orf152-7:1 No - lnc-C9orf152-5:1 No - lnc-C9orf152-4:1 No - lnc-C9orf152-3:1 No - lnc-C9orf152-2:1 No - lnc-PALM2-AKAP2-2:2 No - lnc-C9orf152-6:1 Yes chrX:5312171-5313125 lnc-TXNDC8-1:1 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-LPAR1-2:1 Yes chr2R:13160063-13163484 lnc-MUSK-3:1 No - lnc-OR2K2-1:2 No - lnc-PTGR1-2:3 No - lnc-C9orf84-1:1 No - lnc-C9orf84-1:2 No - lnc-C9orf84-1:3 No - lnc-PTGR1-2:1 No - lnc-PTGR1-1:1 No - lnc-GNG10-3:1 No - lnc-UGCG-3:1 No - lnc-UGCG-2:1 No - lnc-UGCG-1:1 No - lnc-UGCG-1:2 No - lnc-C9orf84-2:1 No - lnc-PTBP3-6:1 No - lnc-PTBP3-3:1 No - lnc-PTBP3-1:1 No - lnc-SUSD1-3:1 Yes chr3R:31846987-32015520 lnc-SUSD1-4:1 Yes chr3R:31846987-32015520 lnc-SUSD1-5:1 Yes chr3R:31846987-32015520 lnc-SUSD1-6:1 Yes chr3R:31846987-32015520 lnc-PTBP3-2:2 No - lnc-HSDL2-4:1 No - lnc-HSDL2-3:1 No - lnc-PTBP3-4:1 No - lnc-PTBP3-8:2 Yes chr3R:27677522-27679013 lnc-PTBP3-8:5 No - lnc-PTBP3-8:4 No - lnc-PTBP3-8:3 No - lnc-INIP-2:1 No - lnc-SNX30-2:1 No - lnc-SLC46A2-4:2 No - lnc-KIAA1958-1:1 No - lnc-SLC46A2-4:1 No - lnc-SNX30-1:1 No - lnc-SLC46A2-3:1 No - lnc-ZFP37-1:2 Yes chr2L:11794327-11809438 FAM225B:1 No - FAM225A:2 No - lnc-FKBP15-1:1 No - lnc-CDC26-3:1 Yes chr3R:15331584-15333133 lnc-CDC26-2:1 Yes chr3R:15331584-15333133 lnc-SLC31A1-1:1 No - lnc-SLC31A1-1:2 Yes chrX:6661647-6668258 lnc-CDC26-1:1 No - lnc-RNF183-2:3 No - lnc-RNF183-2:2 No - lnc-RNF183-2:1 No - lnc-WDR31-1:2 No - lnc-ALAD-2:1 Yes chr3L:605165-606569 lnc-POLE3-3:2 Yes chr3L:12269452-12271345 lnc-POLE3-3:3 Yes chr3L:12269452-12271345 lnc-POLE3-3:1 Yes chr3L:12269452-12271345 lnc-C9orf43-1:1 Yes chr2L:8437405-8437996 lnc-C9orf43-5:1 Yes chr2R:17792870-17800677 lnc-C9orf43-6:1 Yes chr2R:17792870-17800677 lnc-C9orf43-6:2 Yes chr2R:17792870-17800677 lnc-POLE3-4:1 No - lnc-POLE3-4:2 No - lnc-POLE3-5:1 No - lnc-AMBP-2:1 No - lnc-AMBP-1:1 No - lnc-ZNF618-1:1 No - lnc-KIF12-1:3 Yes chr2R:17557031-17563406 lnc-KIF12-1:2 Yes chr2R:17557031-17563406 lnc-KIF12-1:1 Yes chr2R:17557031-17563406 lnc-KIF12-2:1 No - lnc-KIF12-3:1 No - lnc-ZNF618-2:1 No - lnc-WHRN-3:1 No - lnc-WHRN-2:1 No - lnc-WHRN-1:1 No - lnc-AKNA-2:1 Yes chr3L:13867414-13903236 lnc-AKNA-3:1 Yes chr3L:13867414-13903236 lnc-AKNA-4:1 Yes chr3L:13867414-13903236 lnc-ATP6V1G1-1:1 No - lnc-ATP6V1G1-2:1 No - lnc-TEX53-2:5 No - lnc-TEX48-1:4 No - lnc-TEX48-1:2 No - lnc-TEX48-4:1 No - lnc-TMEM268-3:1 No - lnc-TNFSF15-1:5 No - lnc-DEC1-7:1 No - lnc-TMEM268-5:1 No - lnc-TMEM268-5:2 No - lnc-DEC1-6:1 No - lnc-DEC1-10:6 No - lnc-TNC-5:1 No - lnc-TNC-21:5 No - lnc-PAPPA-4:1 No - lnc-TRIM32-11:1 No - lnc-TRIM32-9:1 No - lnc-TRIM32-8:1 No - lnc-TNC-7:1 No - ASTN2-AS1:2 No - ASTN2-AS1:3 No - ASTN2-AS1:4 No - lnc-TRIM32-1:2 No - lnc-TRIM32-1:3 No - lnc-TRIM32-3:1 No - lnc-TRIM32-3:2 No - lnc-PAPPA-6:1 No - lnc-TRIM32-2:1 No - lnc-TRIM32-6:1 No - lnc-TRIM32-5:1 No - lnc-TNC-6:3 No - lnc-TRIM32-10:1 No - lnc-TLR4-7:1 No - lnc-ASTN2-4:1 No - lnc-ASTN2-5:2 No - lnc-TLR4-3:3 No - lnc-TLR4-3:4 No - lnc-TLR4-3:8 No - lnc-TLR4-9:1 No - lnc-TLR4-10:1 No - lnc-BRINP1-2:2 No - lnc-B3GNT10-2:2 No - lnc-B3GNT10-22:1 No - lnc-B3GNT10-5:2 No - lnc-MEGF9-2:2 No - lnc-MEGF9-2:1 No - lnc-MEGF9-1:7 No - lnc-CDK5RAP2-1:2 No - lnc-PSMD5-3:1 No - lnc-PSMD5-1:1 No - lnc-B3GNT10-21:1 Yes chrX:13159604-13162854 lnc-PHF19-1:1 Yes chrX:13159604-13162854 lnc-B3GNT10-21:3 No - lnc-B3GNT10-21:4 No - lnc-B3GNT10-21:16 No - lnc-B3GNT10-21:17 No - lnc-B3GNT10-21:27 No - lnc-B3GNT10-21:28 No - lnc-B3GNT10-21:31 No - lnc-B3GNT10-21:32 No - lnc-PSMD5-2:5 Yes chr2R:18135426-18139990 lnc-PSMD5-4:1 Yes chr2R:18135426-18139990 lnc-PSMD5-5:1 Yes chr2R:18135426-18139990 lnc-PSMD5-5:2 Yes chr2R:18135426-18139990 lnc-TRAF1-1:1 Yes chr2L:8074117-8082982 lnc-GSN-3:1 Yes chr2L:14355145-14358764 lnc-STOM-5:1 No - lnc-STOM-6:1 No - lnc-DAB2IP-3:1 No - lnc-STOM-7:3 No - lnc-STOM-7:2 No - lnc-STOM-7:4 No - lnc-STOM-7:5 No - lnc-DAB2IP-2:1 No - lnc-DAB2IP-1:1 No - lnc-TTLL11-1:2 No - lnc-NDUFA8-3:1 No - lnc-MORN5-1:1 No - lnc-MRRF-4:1 No - lnc-RBM18-1:2 No - lnc-RBM18-2:1 Yes chr3L:9364350-9365240 lnc-PTGS1-1:3 Yes chr3L:9364350-9365240 lnc-MRRF-2:1 Yes chr3L:9364350-9365240 lnc-MRRF-3:1 No - lnc-OR1J1-1:2 No - lnc-PTGS1-2:2 No - lnc-OR1J2-1:2 No - lnc-OR1J2-1:3 No - lnc-OR1L3-1:1 No - lnc-OR5C1-1:1 No - lnc-RC3H2-2:1 Yes chr3L:15608707-15610386 lnc-RC3H2-1:1 Yes chr3L:16370938-16378566 lnc-PDCL-1:1 Yes chr3L:16370938-16378566 lnc-ZBTB6-1:1 Yes chr3L:16370938-16378566 lnc-RABGAP1-1:6 No - lnc-ZBTB26-1:1 Yes chr3L:8346561-8352279 lnc-STRBP-5:1 Yes chr3L:8346561-8352279 lnc-STRBP-4:1 Yes chr3L:8346561-8352279 MIR600HG:1 No - MIR600HG:2 No - MIR600HG:3 No - lnc-STRBP-2:1 No - lnc-DENND1A-1:2 No - lnc-DENND1A-5:1 Yes chr3R:24295078-24314541 lnc-STRBP-6:1 Yes chr2R:9123304-9132030 lnc-CRB2-3:1 Yes chr2R:9123304-9132030 lnc-CRB2-4:1 Yes chr2R:9123304-9132030 lnc-STRBP-13:1 Yes chr2R:9123304-9132030 lnc-LHX2-7:1 Yes chr2R:9123304-9132030 lnc-LHX2-6:1 Yes chr2R:9123304-9132030 lnc-LHX2-3:1 No - lnc-DENND1A-2:4 No - lnc-DENND1A-2:3 No - lnc-DENND1A-2:2 No - lnc-LHX2-1:2 No - lnc-DENND1A-3:3 Yes chr2R:5706202-5727525 lnc-PSMB7-3:1 No - lnc-PSMB7-2:1 No - lnc-NR5A1-6:2 Yes chr3L:14999951-15001319 lnc-NR5A1-6:1 Yes chr3L:14999951-15001319 lnc-NR5A1-2:1 Yes chr3L:14999951-15001319 lnc-NR6A1-1:1 No - lnc-NR5A1-5:1 Yes chrX:1941940-2007956 lnc-ADGRD2-6:1 Yes chrX:1941940-2007956 MIR181A2HG:1 Yes chrX:1941940-2007956 MIR181A2HG:2 Yes chrX:1941940-2007956 MIR181A2HG:3 Yes chrX:1941940-2007956 lnc-OLFML2A-1:2 No - lnc-NR6A1-2:1 No - lnc-ARPC5L-1:1 No - lnc-SCAI-2:1 No - lnc-GOLGA1-1:1 No - lnc-GOLGA1-2:1 Yes chr3L:6082883-6092188 lnc-RABEPK-3:1 No - lnc-SCAI-1:1 Yes chr3L:6082883-6092188 lnc-RABEPK-2:1 Yes chrX:11325385-11334071 lnc-RABEPK-2:2 Yes chrX:11325385-11334071 lnc-HSPA5-1:1 Yes chrX:11325385-11334071 lnc-HSPA5-2:1 Yes chrX:11325385-11334071 lnc-MAPKAP1-3:1 No - lnc-HSPA5-3:2 Yes chr2R:14411825-14413851 lnc-HSPA5-3:3 Yes chr2R:14411825-14413851 lnc-HSPA5-3:1 Yes chr2R:14411825-14413851 lnc-HSPA5-4:1 Yes chr2R:14411825-14413851 lnc-GAPVD1-3:1 Yes chr2R:14411825-14413851 lnc-GAPVD1-3:2 Yes chr2R:14411825-14413851 lnc-GAPVD1-3:7 Yes chr2R:14411825-14413851 lnc-GAPVD1-3:8 Yes chr2R:14411825-14413851 lnc-PBX3-3:2 Yes chr2R:14411825-14413851 lnc-HSPA5-5:2 Yes chr2R:14411825-14413851 lnc-HSPA5-5:1 Yes chr2R:14411825-14413851 lnc-PBX3-2:2 Yes chr2R:14411825-14413851 lnc-MAPKAP1-1:3 No - lnc-GAPVD1-6:1 Yes chrX:15992468-15996509 lnc-MVB12B-7:1 Yes chrX:15992468-15996509 lnc-PBX3-4:1 No - lnc-MVB12B-6:1 No - lnc-ANGPTL2-10:2 Yes chrX:18097558-18101314 lnc-ANGPTL2-10:3 Yes chrX:18097558-18101314 lnc-MVB12B-5:1 No - lnc-LMX1B-1:1 Yes chr3L:12290956-12296123 lnc-ANGPTL2-5:2 Yes chr2R:16783671-16792472 lnc-RPL12-4:2 Yes chr2R:16783671-16792472 lnc-RPL12-4:1 Yes chr2R:16783671-16792472 lnc-ANGPTL2-6:2 Yes chr2R:16783671-16792472 lnc-RALGPS1-2:2 No - lnc-RALGPS1-1:2 No - lnc-ANGPTL2-7:1 No - lnc-RPL12-3:1 No - lnc-RPL12-1:1 No - lnc-FAM129B-4:1 Yes chr2R:24060378-24061860 lnc-ZNF79-1:1 No - lnc-LRSAM1-2:3 No - lnc-FAM129B-2:2 No - lnc-FAM129B-2:1 No - lnc-LRSAM1-3:1 Yes chr3L:4136359-4138996 lnc-LRSAM1-1:2 Yes chr3L:4136359-4138996 lnc-FAM129B-3:1 Yes chr3L:4136359-4138996 lnc-TOR2A-2:1 No - lnc-TTC16-1:1 No - lnc-CDK9-2:1 Yes chr2L:6007364-6012338 lnc-SH2D3C-1:1 No - lnc-SH2D3C-2:1 No - lnc-SH2D3C-2:2 No - lnc-AK1-2:1 No - lnc-ST6GALNAC6-1:4 Yes chr2R:24691422-24694386 lnc-ST6GALNAC6-1:6 Yes chr2R:24691422-24694386 lnc-ST6GALNAC6-1:5 Yes chr2R:24691422-24694386 lnc-ST6GALNAC6-1:2 Yes chr2R:24691422-24694386 lnc-ST6GALNAC6-1:3 Yes chr2R:24691422-24694386 lnc-ST6GALNAC6-2:1 Yes chr2R:24691422-24694386 lnc-ST6GALNAC4-1:2 No - lnc-ST6GALNAC4-1:1 No - lnc-DPM2-2:2 No - lnc-DPM2-2:1 No - lnc-FPGS-2:2 No - lnc-DPM2-1:1 No - lnc-DPM2-1:2 No - lnc-FPGS-2:3 No - lnc-FPGS-2:4 No - lnc-FPGS-2:5 No - lnc-FPGS-2:6 No - lnc-FPGS-2:7 No - lnc-FPGS-2:8 No - lnc-FPGS-2:10 Yes chr2L:21262956-21282790 lnc-SLC25A25-3:1 Yes chr2L:21262956-21282790 lnc-DPM2-3:2 Yes chr2L:21262956-21282790 lnc-DPM2-3:1 Yes chr2L:21262956-21282790 lnc-NAIF1-1:3 No - lnc-NAIF1-3:1 No - SLC25A25-AS1:14 Yes chr3L:12402295-12414842 SLC25A25-AS1:3 Yes chr3L:12402295-12414842 SLC25A25-AS1:17 Yes chr3L:12402295-12414842 SLC25A25-AS1:16 Yes chr3L:12402295-12414842 SLC25A25-AS1:6 No - SLC25A25-AS1:13 No - SLC25A25-AS1:1 No - SLC25A25-AS1:12 No - SLC25A25-AS1:4 No - lnc-SLC25A25-2:1 No - SLC25A25-AS1:2 No - lnc-SLC25A25-2:2 No - SLC25A25-AS1:19 Yes chr3L:16610662-16612199 lnc-LCN2-1:3 No - lnc-PTGES2-2:3 No - lnc-PTGES2-2:2 No - lnc-PTGES2-2:1 No - lnc-PTGES2-3:1 No - lnc-PTGES2-4:1 No - lnc-PTGES2-4:2 No - lnc-TRUB2-6:3 No - lnc-TRUB2-6:4 No - lnc-TRUB2-6:2 No - lnc-TRUB2-6:1 No - lnc-SWI5-1:1 No - lnc-SWI5-1:2 No - lnc-GOLGA2-1:1 Yes chr2R:6076910-6078088 lnc-COQ4-1:3 Yes chr2L:10510672-10517218 lnc-SLC27A4-3:1 Yes chr3L:7639811-7640446 lnc-URM1-1:4 Yes chr3L:7639811-7640446 lnc-CERCAM-1:1 No - lnc-WDR34-3:2 No - lnc-GLE1-3:1 No - lnc-GLE1-2:1 No - lnc-WDR34-3:1 No - lnc-GLE1-1:2 Yes chr2R:8627900-8630186 lnc-WDR34-2:4 Yes chr2R:8627900-8630186 lnc-GLE1-1:3 Yes chr2R:8627900-8630186 lnc-GLE1-1:4 No - lnc-GLE1-1:6 Yes chr2R:8627900-8630186 lnc-GLE1-1:7 Yes chr2R:8627900-8630186 lnc-GLE1-1:8 Yes chr2R:8627900-8630186 lnc-GLE1-1:9 No - lnc-GLE1-1:10 Yes chr3L:1778485-1795328 lnc-GLE1-1:11 Yes chr3L:1778485-1795328 lnc-ZDHHC12-1:1 No - lnc-SET-1:1 Yes chr2R:9252310-9285097 lnc-PKN3-1:2 Yes chr3L:1490951-1496643 lnc-PKN3-1:3 No - lnc-ENDOG-1:1 No - lnc-SPOUT1-1:2 Yes chr3R:11820381-11822493 lnc-PHYHD1-3:1 No - lnc-SH3GLB2-1:1 Yes chr2R:12679967-12686179 lnc-DOLK-2:1 Yes chr2R:19307447-19310665 lnc-DOLK-1:1 Yes chr2R:19307447-19310665 lnc-PTPA-7:2 No - lnc-PTPA-8:2 No - lnc-PTPA-1:2 No - LINC01503:2 No - LINC01503:4 No - LINC01503:8 No - LINC01503:9 No - LINC01503:10 No - LINC01503:11 No - LINC01503:12 No - LINC01503:13 No - lnc-IER5L-1:3 No - lnc-IER5L-1:4 No - lnc-IER5L-1:2 No - LINC01503:15 No - LINC01503:16 No - LINC01503:18 No - lnc-IER5L-3:1 No - lnc-IER5L-4:1 No - lnc-C9orf50-5:2 No - LINC00963:3 No - LINC00963:4 No - LINC00963:5 No - LINC00963:7 No - LINC00963:8 No - LINC00963:9 No - LINC00963:10 No - LINC00963:13 No - LINC00963:29 No - LINC00963:32 No - LINC00963:35 No - LINC00963:36 No - PRRX2-AS1:1 No - lnc-TOR1A-2:1 Yes chrX:15082827-15084017 lnc-TOR1B-1:1 No - lnc-C9orf78-1:1 Yes chrX:4648592-4650032 lnc-TOR1A-1:1 Yes chr3L:1665138-1666594 lnc-FNBP1-2:1 No - lnc-C9orf78-2:1 Yes chr3L:4322491-4364102 lnc-USP20-1:2 Yes chr3L:4322491-4364102 lnc-C9orf78-3:1 Yes chr3L:4322491-4364102 lnc-GPR107-1:1 No - lnc-FNBP1-1:1 No - lnc-FNBP1-3:1 No - lnc-NCS1-2:1 Yes chrX:9228796-9232378 lnc-FNBP1-6:1 No - lnc-ASS1-1:1 Yes chr3L:2117466-2151700 lnc-FNBP1-7:2 Yes chr3L:2117466-2151700 lnc-FNBP1-7:1 Yes chr3L:2117466-2151700 lnc-QRFP-5:1 Yes chr2R:16861321-16867714 lnc-PRDM12-1:1 No - lnc-QRFP-4:1 Yes chr3L:16615866-16647882 lnc-QRFP-3:1 Yes chr3L:16615866-16647882 lnc-EXOSC2-2:1 Yes chr3L:16615866-16647882 lnc-LAMC3-2:1 Yes chr3L:16615866-16647882 lnc-ABL1-2:1 No - lnc-FIBCD1-2:2 Yes chr2R:1649061-1778937 lnc-FIBCD1-2:1 Yes chr2R:1649061-1778937 lnc-FAM78A-3:9 Yes chr2R:22918937-22924742 lnc-FAM78A-3:8 Yes chr2R:22918937-22924742 lnc-FAM78A-3:7 Yes chr2R:22918937-22924742 lnc-FAM78A-3:6 Yes chr2R:22918937-22924742 lnc-FAM78A-3:5 Yes chr2R:22918937-22924742 lnc-FAM78A-3:16 Yes chr2R:22918937-22924742 lnc-FAM78A-3:4 Yes chr2R:22918937-22924742 lnc-FAM78A-3:3 Yes chr2R:22918937-22924742 lnc-FAM78A-3:11 Yes chr2R:22918937-22924742 lnc-FAM78A-3:10 Yes chr2R:22918937-22924742 lnc-FAM78A-3:14 Yes chr2R:22918937-22924742 lnc-FAM78A-3:15 Yes chr2R:22918937-22924742 lnc-FAM78A-3:13 Yes chr2R:22918937-22924742 lnc-NUP214-1:1 No - lnc-NUP214-2:1 No - lnc-NUP214-3:1 No - lnc-FAM78A-4:1 No - lnc-PRRC2B-4:1 No - lnc-UCK1-3:1 No - lnc-UCK1-2:1 No - lnc-RAPGEF1-2:1 Yes chr3R:24290172-24293371 lnc-UCK1-5:5 Yes chrX:6780790-6803593 lnc-UCK1-5:4 Yes chrX:6780790-6803593 lnc-UCK1-5:3 Yes chrX:6780790-6803593 lnc-UCK1-5:2 Yes chrX:6780790-6803593 lnc-UCK1-5:1 Yes chrX:6780790-6803593 lnc-MED27-3:1 Yes chrX:6780790-6803593 lnc-RAPGEF1-1:1 No - lnc-RAPGEF1-3:1 Yes chr3R:5655139-5656336 lnc-NTNG2-3:1 Yes chr3R:5655139-5656336 lnc-RAPGEF1-3:2 Yes chr3R:5655139-5656336 lnc-MED27-1:1 No - lnc-MED27-2:1 Yes chrX:14604012-14653928 lnc-TTF1-1:1 No - lnc-CFAP77-3:1 No - lnc-SETX-1:4 No - lnc-SETX-1:3 No - lnc-SETX-1:1 No - lnc-SETX-1:2 No - lnc-CFAP77-2:1 No - lnc-CFAP77-1:1 No - lnc-DDX31-2:1 Yes chrX:17413267-17422145 lnc-DDX31-3:2 No - lnc-DDX31-3:1 No - lnc-TSC1-2:1 No - lnc-AK8-1:1 Yes chr3R:24130307-24134654 lnc-GFI1B-2:1 No - lnc-GFI1B-2:3 No - lnc-TSC1-1:2 No - lnc-RALGDS-3:1 No - lnc-RALGDS-4:1 No - lnc-ABO-33:1 No - lnc-ABO-33:7 No - lnc-ABO-33:5 No - lnc-RPL7A-3:1 No - lnc-MED22-1:1 Yes chr3R:19903665-19904868 lnc-RPL7A-2:1 Yes chrX:928139-928860 lnc-SURF1-2:1 Yes chrX:928139-928860 lnc-SURF1-1:1 No - lnc-SURF1-3:1 Yes chr3R:15343653-15346176 lnc-REXO4-2:1 No - lnc-SLC2A6-3:1 Yes chr3L:15810081-15816410 lnc-SLC2A6-2:1 Yes chr3L:15810081-15816410 DBH-AS1:1 Yes chrX:7995697-8027394 DBH-AS1:2 Yes chrX:7995697-8027394 DBH-AS1:3 Yes chrX:7995697-8027394 lnc-FAM163B-2:1 Yes chr2R:17753555-17756422 lnc-VAV2-4:1 Yes chr2R:17753555-17756422 lnc-VAV2-3:1 Yes chr2R:17753555-17756422 lnc-DBH-4:1 Yes chr2R:17753555-17756422 lnc-DBH-5:1 No - lnc-SARDH-2:1 Yes chrX:19261820-19273280 lnc-DBH-6:1 Yes chrX:19261820-19273280 lnc-SARDH-3:1 Yes chrX:19261820-19273280 lnc-BRD3-4:1 Yes chrX:19261820-19273280 lnc-BRD3OS-7:1 No - lnc-BRD3OS-1:3 No - lnc-BRD3OS-1:4 No - lnc-VAV2-1:1 No - lnc-VAV2-2:1 Yes chrX:8037808-8061436 lnc-BRD3OS-2:1 Yes chrX:8037808-8061436 lnc-BRD3OS-2:3 Yes chrX:8037808-8061436 lnc-WDR5-6:1 No - lnc-WDR5-4:1 No - lnc-BRD3-5:1 No - lnc-BRD3-2:2 No - lnc-WDR5-2:2 No - lnc-BRD3-6:1 No - lnc-RXRA-2:2 No - lnc-RXRA-5:1 No - lnc-BRD3-7:1 Yes chrX:2038798-2042311 lnc-BRD3-8:1 Yes chrX:2038798-2042311 lnc-RXRA-6:1 No - lnc-RXRA-3:4 No - lnc-RXRA-3:5 No - lnc-FCN1-4:2 No - lnc-COL5A1-4:1 No - COL5A1-AS1:1 No - lnc-FCN2-5:1 No - lnc-FCN2-4:1 No - lnc-FCN1-1:1 No - lnc-FCN2-2:1 No - lnc-OLFM1-5:1 No - lnc-OLFM1-5:2 No - lnc-OLFM1-2:2 No - lnc-OLFM1-4:1 No - lnc-C9orf116-10:1 No - lnc-C9orf116-9:1 No - lnc-GLT6D1-2:1 No - lnc-PPP1R26-4:1 No - PPP1R26-AS1:7 No - PPP1R26-AS1:8 No - PPP1R26-AS1:1 No - lnc-PPP1R26-3:1 No - PPP1R26-AS1:4 No - PPP1R26-AS1:3 No - lnc-MRPS2-2:1 No - lnc-GLT6D1-3:1 No - LINC01502:2 No - lnc-LCN9-4:1 No - lnc-CAMSAP1-1:1 No - lnc-SOHLH1-1:1 Yes chr2R:17519024-17535866 lnc-UBAC1-4:2 Yes chr2R:17519024-17535866 lnc-UBAC1-4:1 Yes chr2R:17519024-17535866 lnc-KCNT1-1:2 No - lnc-KCNT1-1:3 No - lnc-KCNT1-1:4 No - lnc-CAMSAP1-3:1 Yes chr2R:19670618-19673477 lnc-UBAC1-2:3 No - lnc-UBAC1-2:2 No - lnc-UBAC1-2:1 No - lnc-UBAC1-3:1 No - lnc-TMEM250-2:8 No - lnc-GPSM1-3:3 No - lnc-GPSM1-3:4 No - lnc-CCDC187-1:30 No - lnc-DNLZ-1:2 No - lnc-DNLZ-1:1 No - lnc-SNAPC4-1:1 No - lnc-INPP5E-1:1 Yes chrX:12596047-12609910 lnc-SEC16A-1:1 Yes chrX:3134870-3172221 NALT1:3 No - NALT1:4 No - NALT1:6 No - NALT1:7 No - lnc-AGPAT2-1:11 No - lnc-EGFL7-1:5 No - lnc-AGPAT2-1:3 Yes chr3L:4384442-4403181 lnc-FAM69B-2:1 No - lnc-LCN10-3:1 No - SNHG7:5 No - SNHG7:6 No - SNHG7:9 No - SNHG7:10 No - SNHG7:1 No - SNHG7:7 No - lnc-LCN10-2:6 No - lnc-LCN10-2:7 No - lnc-LCN10-2:1 No - lnc-LCN10-2:2 No - lnc-LCN10-2:3 No - lnc-LCN10-2:4 No - lnc-LCN10-2:5 No - lnc-LCN8-1:2 No - lnc-LCN8-1:1 No - lnc-LCN8-1:3 No - lnc-LCN15-2:1 No - lnc-TMEM141-1:1 No - CCDC183-AS1:2 No - CCDC183-AS1:4 No - lnc-C8G-2:1 No - lnc-C8G-1:3 No - lnc-PTGDS-1:1 No - lnc-PTGDS-1:2 No - lnc-CLIC3-1:3 Yes chrX:13812971-13822307 lnc-CLIC3-2:1 No - lnc-CLIC3-3:1 No - lnc-FUT7-1:1 No - lnc-PAXX-2:2 No - lnc-FUT7-2:2 No - lnc-FUT7-2:1 No - lnc-ENTPD2-1:1 Yes chr2R:24876691-24881221 lnc-NPDC1-3:1 No - lnc-NPDC1-4:1 No - lnc-UAP1L1-2:2 Yes chr2R:24760664-24762605 lnc-UAP1L1-2:3 Yes chr2R:24760664-24762605 lnc-UAP1L1-2:4 Yes chr2R:24760664-24762605 lnc-UAP1L1-1:2 Yes chr2R:24760664-24762605 MAN1B1-DT:5 No - lnc-DPP7-1:1 Yes chr3R:29109053-29112822 lnc-UAP1L1-4:1 Yes chr3R:29109053-29112822 lnc-UAP1L1-4:2 Yes chr3R:29109053-29112822 lnc-UAP1L1-4:3 Yes chr3R:29109053-29112822 lnc-UAP1L1-4:4 Yes chr3R:29109053-29112822 lnc-UAP1L1-4:5 Yes chr3R:29109053-29112822 lnc-UAP1L1-4:6 Yes chr3R:29109053-29112822 lnc-UAP1L1-4:7 Yes chr3R:29109053-29112822 lnc-UAP1L1-4:8 Yes chr3R:29109053-29112822 lnc-UAP1L1-4:9 Yes chr3R:29109053-29112822 lnc-UAP1L1-4:10 Yes chr3R:29109053-29112822 lnc-UAP1L1-4:11 Yes chr3R:29109053-29112822 lnc-UAP1L1-4:12 Yes chr3R:29109053-29112822 lnc-UAP1L1-4:13 Yes chr3R:29109053-29112822 lnc-UAP1L1-4:14 Yes chr3R:29109053-29112822 lnc-SAPCD2-2:1 No - lnc-DPP7-2:1 No - lnc-DPP7-3:1 No - lnc-SSNA1-1:5 Yes chr3R:5508842-5523328 lnc-TMEM210-1:1 Yes chr2R:23972431-23975408 lnc-ANAPC2-1:1 No - lnc-RNF208-1:4 No - lnc-RNF208-1:3 No - lnc-RNF208-1:2 No - lnc-RNF208-2:1 No - lnc-FAM166A-2:1 No - lnc-TOR4A-1:1 No - lnc-NRARP-2:1 Yes chr2L:21160636-21163083 lnc-NRARP-3:2 Yes chr2L:21160636-21163083 lnc-NRARP-3:1 Yes chr2L:21160636-21163083 lnc-NRARP-4:1 Yes chr2L:21160636-21163083 lnc-ENTPD8-2:3 Yes chr2L:21160636-21163083 lnc-ENTPD8-2:4 Yes chr2L:21160636-21163083 lnc-ENTPD8-1:1 Yes chr2L:21160636-21163083 lnc-NOXA1-1:1 Yes chr2L:21160636-21163083 lnc-ENTPD8-1:2 Yes chr2L:21160636-21163083 lnc-PNPLA7-1:1 Yes chrX:7956820-7968236 lnc-PNPLA7-1:2 Yes chrX:7956820-7968236 lnc-NSMF-2:1 Yes chrX:7956820-7968236 lnc-NOXA1-2:1 Yes chrX:7956820-7968236 lnc-NOXA1-2:2 Yes chrX:7956820-7968236 lnc-DPH7-1:1 Yes chrX:7956820-7968236 lnc-ZMYND19-1:5 Yes chrX:6687596-6688774 lnc-ZMYND19-1:4 Yes chrX:6687596-6688774 lnc-ZMYND19-1:3 Yes chrX:6687596-6688774 lnc-ZMYND19-1:2 Yes chrX:6687596-6688774 lnc-ZMYND19-1:1 Yes chrX:6687596-6688774 ARRDC1-AS1:1 No - lnc-ZMYND19-5:1 Yes chrX:245978-254650 lnc-ZMYND19-4:1 Yes chrX:245978-254650 lnc-ZMYND19-3:1 No - lnc-ZMYND19-6:1 Yes chrX:11931280-11985087 lnc-ZMYND19-7:1 Yes chrX:11931280-11985087 lnc-ZMYND19-8:1 Yes chrX:11931280-11985087 lnc-ZMYND19-8:2 Yes chrX:11931280-11985087 lnc-CACNA1B-2:1 No - lnc-CACNA1B-3:2 No - lnc-CACNA1B-1:4 No - lnc-PLCXD1-4:1 No - lnc-SHOX-4:1 Yes chr2L:20089636-20091348 LINC00685:2 No - lnc-GTPBP6-1:1 Yes chr3R:19890689-19898738 lnc-SHOX-3:1 No - lnc-CRLF2-1:1 No - lnc-IL3RA-3:3 No - lnc-SLC25A6-3:1 No - lnc-SLC25A6-2:1 No - LINC00106:17 No - LINC00106:18 No - lnc-ASMTL-1:1 No - lnc-ASMT-6:1 No - lnc-ASMT-6:2 No - lnc-ASMT-7:1 No - lnc-CD99-2:1 No - lnc-CD99-2:3 No - lnc-CD99-2:4 No - lnc-CD99-2:5 No - lnc-CD99-2:6 No - lnc-DHRSX-4:1 No - lnc-CD99-2:7 No - lnc-CD99-2:8 No - lnc-ARSD-2:2 No - lnc-ARSE-2:1 No - lnc-ARSE-1:1 No - lnc-ARSD-4:1 No - lnc-ARSD-5:1 No - lnc-ARSE-3:1 No - lnc-ARSE-4:1 No - lnc-ARSF-1:1 No - lnc-ARSF-5:1 No - lnc-MXRA5-8:1 Yes chr3L:15925805-15954797 lnc-MXRA5-8:2 Yes chr3L:15925805-15954797 lnc-ARSF-6:1 No - FAM239A:33 No - FAM239A:28 No - FAM239A:32 No - FAM239A:30 No - FAM239A:31 No - FAM239A:19 No - FAM239A:29 No - lnc-ARSF-6:2 No - lnc-PRKX-7:1 No - lnc-ARSF-7:1 No - lnc-PRKX-9:1 No - lnc-ARSF-8:1 No - lnc-ARSF-9:1 No - lnc-NLGN4X-3:1 No - lnc-STS-10:1 No - lnc-NLGN4X-2:2 No - lnc-NLGN4X-2:4 No - lnc-NLGN4X-2:3 No - lnc-VCX3A-5:1 Yes chr3R:7570281-7639434 lnc-VCX3A-3:1 Yes chr3R:7570281-7639434 lnc-STS-5:1 No - lnc-VCX3A-2:1 No - lnc-STS-4:1 No - lnc-STS-3:1 No - lnc-PUDP-2:1 No - lnc-VCX3A-4:1 Yes chr2L:1354101-1354919 lnc-STS-2:1 No - lnc-VCX-2:2 No - lnc-PNPLA4-1:1 No - lnc-VCX2-1:1 No - lnc-FAM9A-4:1 Yes chr3R:24141395-24147490 lnc-FAM9A-3:1 Yes chr3R:24141395-24147490 lnc-FAM9A-2:1 No - lnc-FAM9B-1:1 No - lnc-FAM9B-1:2 No - lnc-TBL1X-4:1 No - lnc-TBL1X-3:1 No - lnc-TBL1X-2:1 No - lnc-FAM9B-2:1 No - lnc-SHROOM2-1:1 Yes chr2L:415067-418536 lnc-FAM9B-3:1 No - lnc-FAM9B-4:1 No - lnc-GPR143-2:1 Yes chr2R:14308142-14351802 lnc-CLDN34-2:1 Yes chr3R:14697689-14724261 lnc-CLCN4-2:1 Yes chr3L:16090454-16096151 lnc-ARHGAP6-7:7 Yes chr2L:10544883-10628054 lnc-ARHGAP6-7:4 Yes chr2L:10544883-10628054 lnc-ARHGAP6-7:1 Yes chr2L:10544883-10628054 lnc-ARHGAP6-7:8 Yes chr2L:10544883-10628054 lnc-ARHGAP6-5:1 Yes chr2L:10544883-10628054 lnc-ARHGAP6-7:2 Yes chr2L:10544883-10628054 lnc-ARHGAP6-7:5 Yes chr2L:10544883-10628054 lnc-ARHGAP6-7:6 Yes chr2L:10544883-10628054 lnc-ARHGAP6-7:3 Yes chr2L:10544883-10628054 lnc-ARHGAP6-4:1 Yes chr2L:10544883-10628054 lnc-HCCS-1:1 No - lnc-ARHGAP6-3:1 Yes chr3R:22025975-22027480 lnc-ARHGAP6-2:1 Yes chr3R:22025975-22027480 lnc-MID1-3:1 Yes chr4:254997-265574 lnc-MID1-4:1 Yes chr4:254997-265574 lnc-MID1-5:1 Yes chr4:254997-265574 lnc-FAM9C-7:1 Yes chr3R:15095957-15131926 lnc-PRPS2-1:1 No - lnc-FAM9C-5:1 No - TLR8-AS1:1 Yes chr3L:20361843-20366724 lnc-TMSB4X-5:1 No - lnc-TMSB4X-4:1 No - lnc-TMSB4X-3:1 No - lnc-ATXN3L-6:1 No - lnc-FAM9C-3:1 No - lnc-FAM9C-4:2 No - lnc-FAM9C-4:1 No - lnc-TMSB4X-6:1 No - lnc-ATXN3L-5:2 No - lnc-ATXN3L-5:1 No - lnc-TMSB4X-7:1 No - lnc-TMSB4X-7:2 No - lnc-TMSB4X-8:1 No - LINC02154:6 No - lnc-TMSB4X-9:1 No - lnc-EGFL6-11:1 No - lnc-EGFL6-10:1 No - lnc-EGFL6-10:2 No - lnc-EGFL6-9:1 No - LINC01203:1 No - LINC01203:2 No - lnc-EGFL6-4:1 No - lnc-EGFL6-8:3 No - lnc-TCEANC-3:1 Yes chr3L:4384442-4403181 lnc-TCEANC-2:1 Yes chr3L:4384442-4403181 lnc-RAB9A-3:1 No - lnc-RAB9A-2:1 No - lnc-GPM6B-3:1 Yes chr3L:16131001-16131632 lnc-OFD1-2:1 Yes chr3L:21507852-21512749 lnc-GEMIN8-2:1 Yes chr3L:21507852-21512749 lnc-OFD1-1:2 No - lnc-GPM6B-2:1 No - lnc-ASB9-4:1 No - lnc-FANCB-2:1 No - lnc-ASB9-3:1 No - lnc-ASB9-1:2 No - lnc-ASB11-3:1 No - lnc-ASB11-3:2 No - lnc-ASB11-1:4 Yes chr2R:17737622-17739685 lnc-ASB11-2:1 Yes chr2R:17737622-17739685 lnc-VEGFD-1:4 No - lnc-VEGFD-1:3 No - lnc-VEGFD-1:1 No - lnc-ACE2-1:1 No - lnc-BMX-1:2 No - lnc-ACE2-2:1 No - lnc-CA5B-1:1 Yes chr2L:13803626-13809994 lnc-CA5B-1:2 Yes chr2L:13803626-13809994 lnc-CA5B-1:3 Yes chr2L:13803626-13809994 lnc-CA5B-1:4 Yes chr2L:13803626-13809994 lnc-CA5B-1:6 Yes chr2L:13803626-13809994 INE2:1 Yes chr2L:13803626-13809994 lnc-CLTRN-3:1 Yes chr3R:23958651-23962555 lnc-ZRSR2-4:1 No - lnc-AP1S2-2:5 No - lnc-AP1S2-2:4 No - lnc-CTPS2-4:1 No - lnc-CTPS2-3:1 No - lnc-CTPS2-2:1 No - lnc-CTPS2-1:1 No - lnc-S100G-1:2 No - lnc-S100G-1:7 No - lnc-RBBP7-3:1 Yes chr3L:15097914-15113003 lnc-SYAP1-2:1 No - lnc-CTPS2-5:1 Yes chr3R:15225576-15227564 lnc-CTPS2-6:1 Yes chr3R:15225576-15227564 lnc-RBBP7-2:1 Yes chr2L:11100963-11106645 lnc-NHS-2:1 Yes chr2L:11100963-11106645 lnc-NHS-1:1 No - lnc-RAI2-3:1 No - lnc-RAI2-2:1 No - lnc-RAI2-4:1 No - lnc-SCML1-3:1 No - lnc-BEND2-3:2 Yes chr3R:9633359-9637611 lnc-PPEF1-2:1 Yes chr3L:20248080-20265554 lnc-PHKA2-3:1 No - lnc-PPEF1-3:1 No - lnc-PHKA2-1:1 No - lnc-ADGRG2-3:2 Yes chrX:9093612-9103739 lnc-ADGRG2-3:1 Yes chrX:9093612-9103739 lnc-ADGRG2-2:1 Yes chrX:9093612-9103739 lnc-ADGRG2-1:1 Yes chrX:9093612-9103739 lnc-PHKA2-2:1 Yes chr3L:23784231-23787405 lnc-SH3KBP1-3:2 No - lnc-SH3KBP1-3:1 No - lnc-RPS6KA3-3:1 Yes chr3R:18274665-18283005 lnc-EIF1AX-3:1 Yes chrX:22529964-22536371 lnc-CNKSR2-3:1 No - lnc-CNKSR2-2:1 No - lnc-CNKSR2-1:1 No - lnc-SMPX-3:1 No - lnc-MBTPS2-2:1 No - lnc-MBTPS2-1:3 No - lnc-SMS-4:1 No - lnc-SMS-3:1 No - lnc-SMS-1:1 No - lnc-SMS-2:1 No - lnc-SMPX-4:1 Yes chr3R:27057908-27064199 PHEX-AS1:2 Yes chr3R:27057908-27064199 PTCHD1-AS:1 No - lnc-DDX53-2:1 No - lnc-SMPX-5:1 No - lnc-APOO-1:1 Yes chr3R:31590581-31592316 lnc-ACOT9-3:2 No - lnc-CXorf58-1:1 No - lnc-EIF2S3-1:1 No - lnc-PDK3-2:1 No - lnc-POLA1-5:1 Yes chr2R:9426439-9434638 lnc-POLA1-4:1 Yes chr3L:1546092-1553504 lnc-POLA1-3:1 No - lnc-POLA1-2:1 No - lnc-ARX-1:1 No - lnc-ARX-7:1 No - lnc-MAGEB18-3:1 No - lnc-MAGEB18-1:2 No - lnc-MAGEB18-2:1 No - lnc-MAGEB6B-2:1 No - lnc-MAGEB6-1:1 No - lnc-MAGEB5-2:1 No - lnc-MAGEB5-3:1 No - lnc-MAGEB5-4:1 No - lnc-MAGEB5-5:1 No - lnc-PPP4R3C-9:1 No - lnc-MAGEB5-6:1 No - lnc-DCAF8L2-7:1 No - lnc-PPP4R3C-2:15 No - lnc-PPP4R3C-8:1 No - lnc-PPP4R3C-2:7 No - lnc-PPP4R3C-7:1 No - lnc-DCAF8L2-3:1 Yes chr3L:1756159-1759208 lnc-DCAF8L2-3:2 Yes chr3L:1756159-1759208 lnc-DCAF8L2-3:3 Yes chr3L:1756159-1759208 lnc-DCAF8L1-4:1 No - lnc-DCAF8L1-3:1 No - lnc-DCAF8L1-5:1 No - lnc-NR0B1-3:1 No - lnc-NR0B1-2:1 No - lnc-NR0B1-1:1 No - lnc-MAGEB2-1:1 No - lnc-GK-8:1 No - lnc-GK-7:1 No - lnc-GK-6:1 No - lnc-CXorf21-1:1 No - lnc-TAB3-2:1 No - lnc-FTHL17-1:1 Yes chr3R:19461085-19597288 lnc-FTHL17-2:1 Yes chr3R:19461085-19597288 lnc-FAM47A-3:2 Yes chr3R:19461085-19597288 lnc-FAM47A-2:1 Yes chr3R:19461085-19597288 lnc-FAM47A-3:3 Yes chr3R:19461085-19597288 lnc-FAM47A-3:4 Yes chr3R:19461085-19597288 lnc-FAM47A-3:1 Yes chr3R:19461085-19597288 lnc-FAM47B-4:1 No - lnc-FAM47B-3:1 No - lnc-FAM47B-3:2 No - lnc-FAM47B-1:3 No - lnc-FAM47B-1:4 No - lnc-FAM47B-2:1 No - lnc-TMEM47-1:1 No - lnc-MAGEB16-2:1 No - lnc-MAGEB16-1:1 No - lnc-CFAP47-2:1 No - lnc-MAGEB16-4:1 No - lnc-DYNLT3-3:1 No - lnc-FAM47C-2:1 No - lnc-FAM47C-1:1 No - lnc-PRRG1-2:1 No - lnc-DYNLT3-2:1 No - lnc-XK-1:1 No - lnc-CYBB-1:3 No - lnc-CYBB-1:4 No - lnc-HYPM-2:1 No - lnc-RPGR-4:1 No - lnc-SRPX-1:1 No - lnc-SRPX-2:1 No - lnc-RPGR-3:1 No - lnc-MID1IP1-6:1 No - lnc-MID1IP1-1:2 No - lnc-RPGR-5:1 No - lnc-BCOR-11:1 No - lnc-BCOR-11:2 No - lnc-BCOR-10:1 No - lnc-BCOR-9:1 No - lnc-BCOR-8:1 No - lnc-ATP6AP2-13:1 No - lnc-ATP6AP2-12:1 No - lnc-ATP6AP2-11:1 No - lnc-ATP6AP2-10:1 No - lnc-CXorf38-6:1 Yes chr3L:18802265-18820675 lnc-ATP6AP2-9:2 Yes chr3L:18802265-18820675 lnc-ATP6AP2-9:3 Yes chr3L:18802265-18820675 lnc-ATP6AP2-2:4 No - lnc-ATP6AP2-7:1 No - lnc-CXorf38-5:1 No - lnc-CXorf38-1:1 Yes chr3L:593246-599239 lnc-CXorf38-2:1 Yes chr3L:593246-599239 lnc-CXorf38-4:1 Yes chr3L:593246-599239 lnc-CXorf38-4:2 Yes chr3L:593246-599239 lnc-MPC1L-8:1 No - lnc-MED14-2:1 No - lnc-MED14-4:1 No - lnc-MED14-3:2 No - lnc-USP9X-7:1 No - lnc-MED14-5:1 No - lnc-USP9X-5:1 No - lnc-USP9X-4:1 No - lnc-DDX3X-7:1 Yes chr3R:31777020-31790681 lnc-DDX3X-2:2 Yes chr3R:31777020-31790681 lnc-USP9X-3:1 Yes chr3R:31777020-31790681 lnc-CASK-9:1 No - lnc-CASK-8:1 No - lnc-CASK-6:1 No - lnc-CASK-5:1 No - lnc-CASK-3:1 No - lnc-MED14-6:1 Yes chr3R:21783400-21822674 lnc-GPR34-2:1 Yes chr3R:21783400-21822674 lnc-MED14-7:1 Yes chr3R:21783400-21822674 lnc-MED14-8:1 Yes chr3R:21783400-21822674 lnc-GPR34-1:1 Yes chr3R:21783400-21822674 lnc-PPP1R2C-9:1 Yes chr3R:21783400-21822674 lnc-GPR82-2:1 Yes chr3R:21783400-21822674 lnc-PPP1R2C-9:2 Yes chr3R:21783400-21822674 lnc-CASK-2:1 No - lnc-CASK-4:1 No - lnc-GPR82-3:1 No - lnc-CASK-7:1 No - lnc-GPR82-3:2 No - lnc-GPR82-4:1 No - lnc-PPP1R2C-10:1 No - lnc-PPP1R2C-2:1 No - lnc-MAOA-7:1 No - lnc-MAOA-6:1 No - PINCR:5 No - PINCR:7 No - lnc-MAOA-4:1 No - lnc-NDP-2:1 No - lnc-NDP-1:1 No - lnc-MAOB-1:1 No - lnc-MAOA-5:1 No - lnc-DUSP21-6:1 No - lnc-DUSP21-3:1 No - lnc-FUNDC1-1:1 No - lnc-FUNDC1-2:1 No - lnc-KDM6A-3:1 No - lnc-KDM6A-3:3 No - lnc-CXorf36-3:1 No - lnc-CXorf36-4:1 No - lnc-CXorf36-5:1 No - lnc-CXorf36-46:13 No - lnc-CXorf36-46:8 No - lnc-KDM6A-6:1 No - lnc-KRBOX4-6:1 No - lnc-ZNF674-12:1 No - lnc-KRBOX4-5:1 No - lnc-KRBOX4-1:1 No - lnc-ZNF674-11:2 No - LINC01186:2 No - lnc-CHST7-5:1 No - lnc-ZNF674-7:1 No - lnc-CHST7-4:1 No - lnc-ZNF674-2:4 No - lnc-ZNF674-2:3 No - lnc-ZNF674-2:2 No - ZNF674-AS1:1 No - lnc-ZNF674-5:1 No - lnc-ZNF674-6:1 No - lnc-ZNF674-1:11 Yes chr2L:6677835-6684364 lnc-CHST7-2:1 Yes chr2L:6677835-6684364 lnc-ZNF674-8:2 Yes chr2L:6677835-6684364 lnc-ZNF674-8:1 Yes chr2L:6677835-6684364 lnc-ZNF674-9:1 Yes chr2L:6677835-6684364 lnc-ZNF674-10:1 Yes chr2L:6677835-6684364 lnc-JADE3-1:1 No - lnc-NDUFB11-2:2 Yes chr3R:14745901-14751246 lnc-NDUFB11-1:1 No - lnc-RGN-2:1 No - lnc-RBM10-1:2 No - lnc-NDUFB11-2:1 No - lnc-RBM10-2:1 No - lnc-RBM10-2:2 No - lnc-UBA1-1:1 Yes chr2L:1173009-1177589 INE1:3 Yes chr2R:9688289-9693328 lnc-NDUFB11-3:1 No - lnc-NDUFB11-4:1 No - lnc-ZNF41-1:1 No - lnc-SYN1-3:1 No - lnc-ARAF-4:1 No - lnc-ARAF-3:1 No - lnc-SYN1-4:1 No - lnc-ARAF-1:1 No - lnc-SYN1-1:4 No - lnc-SYN1-1:3 No - lnc-SYN1-1:2 No - lnc-ELK1-1:1 No - lnc-ELK1-2:3 Yes chr2L:15256581-15257642 lnc-ZNF81-1:1 No - lnc-ZNF81-1:2 No - lnc-ZNF81-1:3 No - lnc-UXT-1:1 No - lnc-SPACA5-1:1 No - lnc-SSX5-4:1 No - lnc-SSX5-3:1 No - lnc-SPACA5B-2:1 No - lnc-SSX5-1:1 No - lnc-SSX1-4:1 No - lnc-SSX5-2:1 No - lnc-SSX1-1:1 No - lnc-SSX1-2:1 No - lnc-SSX1-3:1 No - lnc-SSX1-5:1 No - lnc-SSX3-2:1 No - lnc-SSX4-2:1 No - lnc-SSX4B-1:1 No - lnc-FTSJ1-3:1 No - lnc-SSX4B-2:1 No - lnc-RBM3-2:1 Yes chr2R:15317817-15322171 lnc-SLC38A5-4:1 No - lnc-WDR13-2:1 No - lnc-TIMM17B-2:1 No - lnc-TIMM17B-1:1 No - lnc-SLC35A2-2:2 Yes chrX:21202499-21203341 lnc-SLC35A2-2:1 Yes chrX:21202499-21203341 lnc-SLC35A2-1:1 No - lnc-PIM2-1:1 Yes chr3L:11605436-11609465 lnc-PQBP1-1:1 Yes chr3L:11605436-11609465 lnc-KCND1-1:1 No - lnc-KCND1-2:2 No - lnc-KCND1-2:1 No - lnc-GRIPAP1-1:1 No - lnc-TFE3-1:1 No - lnc-PRAF2-3:1 Yes chr4:1198852-1224467 lnc-CCDC120-2:1 No - lnc-MAGIX-1:2 No - lnc-PRAF2-1:2 No - lnc-PRAF2-1:1 No - lnc-PRAF2-2:1 No - lnc-PRAF2-4:1 No - lnc-MAGIX-4:1 No - lnc-MAGIX-3:1 No - lnc-PRICKLE3-3:1 No - lnc-PRICKLE3-3:2 No - lnc-FOXP3-2:1 Yes chr3L:16863164-16864989 lnc-CCDC22-1:1 No - USP27X-AS1:1 No - lnc-PAGE1-2:1 No - lnc-CCNB3-2:1 No - lnc-SHROOM4-3:1 No - lnc-DGKK-2:1 Yes chr2R:14308142-14351802 lnc-DGKK-4:1 Yes chr2R:14308142-14351802 lnc-SHROOM4-4:1 No - lnc-NUDT10-1:1 No - LINC01284:1 No - lnc-NUDT11-5:1 No - lnc-CXorf67-1:3 No - lnc-CXorf67-2:1 No - lnc-CXorf67-2:2 No - lnc-NUDT11-4:1 No - lnc-GSPT2-2:1 No - lnc-MAGED4B-4:1 No - lnc-CENPVL2-1:1 No - lnc-CENPVL2-2:1 No - lnc-CENPVL2-4:1 No - lnc-XAGE1B-7:1 No - lnc-XAGE2-1:2 No - lnc-XAGE1A-3:2 No - lnc-XAGE1B-4:2 No - lnc-XAGE1B-1:2 No - lnc-XAGE1A-2:1 No - lnc-XAGE1B-6:4 No - lnc-XAGE1B-6:2 No - lnc-XAGE1B-1:1 No - lnc-XAGE1B-4:1 No - lnc-XAGE2-1:1 No - lnc-XAGE1B-4:3 No - lnc-XAGE1A-1:5 No - lnc-XAGE1B-6:1 No - lnc-XAGE1B-6:3 No - lnc-XAGE1B-6:5 No - lnc-XAGE1A-2:2 No - lnc-XAGE1A-1:4 No - lnc-XAGE1A-7:1 No - lnc-XAGE1A-8:1 No - lnc-XAGE1A-4:2 No - lnc-XAGE1A-5:2 No - lnc-SSX2B-5:2 No - lnc-SSX2B-4:1 No - lnc-SSX2B-3:1 No - lnc-SSX2-1:1 No - lnc-SSX2B-2:1 No - lnc-SSX2-2:1 No - lnc-SSX2-3:1 No - lnc-XAGE5-1:2 No - lnc-SPANXN5-1:1 No - lnc-XAGE5-2:1 No - lnc-SPANXN5-2:3 No - lnc-SPANXN5-2:2 No - lnc-SPANXN5-2:1 No - lnc-XAGE3-2:1 No - lnc-XAGE5-3:1 No - lnc-XAGE5-3:2 No - lnc-FAM156B-2:1 No - lnc-FAM156A-3:5 No - lnc-FAM156A-3:1 No - lnc-FAM156A-3:4 No - lnc-FAM156B-4:1 No - lnc-FAM156A-3:2 No - lnc-FAM156A-3:3 No - lnc-FAM156A-4:1 No - lnc-GPR173-1:1 No - lnc-FAM156A-2:1 Yes chr3R:15263552-15265253 lnc-KANTR-23:2 No - lnc-KANTR-23:3 No - lnc-KANTR-23:4 No - lnc-KANTR-23:15 No - lnc-KANTR-23:18 No - lnc-KANTR-23:19 No - lnc-KDM5C-6:1 No - lnc-KDM5C-5:1 No - lnc-KANTR-23:22 No - lnc-KANTR-23:23 No - lnc-KDM5C-3:1 No - lnc-KANTR-23:24 No - lnc-KDM5C-2:1 No - lnc-KDM5C-2:2 No - lnc-KANTR-23:26 No - lnc-IQSEC2-2:1 Yes chr2L:5989400-5999501 lnc-KANTR-4:1 Yes chr2L:5989400-5999501 lnc-KANTR-4:2 Yes chr2L:5989400-5999501 lnc-KANTR-3:1 Yes chr3L:21034535-21075444 lnc-KDM5C-4:1 Yes chr3L:21034535-21075444 lnc-KDM5C-4:2 Yes chr3L:21034535-21075444 lnc-RIBC1-2:1 No - lnc-RIBC1-1:1 No - lnc-SMC1A-2:2 No - lnc-HSD17B10-3:1 Yes chr3R:24058287-24062815 lnc-KANTR-5:1 Yes chr3L:11829030-11830844 lnc-HSD17B10-1:1 Yes chrX:18091259-18092853 lnc-HSD17B10-2:1 No - lnc-HSD17B10-4:1 Yes chrX:15712628-15731935 lnc-HSD17B10-5:1 Yes chrX:15712628-15731935 lnc-HSD17B10-7:1 Yes chrX:15712628-15731935 lnc-RIBC1-4:1 No - lnc-HUWE1-4:1 No - lnc-RIBC1-5:1 No - lnc-RIBC1-6:1 No - lnc-FAM120C-3:1 No - lnc-PHF8-1:1 No - lnc-TSR2-8:1 No - lnc-FAM120C-1:1 Yes chr3L:21543850-21554928 lnc-TSR2-7:1 Yes chr3L:21543850-21554928 lnc-TSR2-6:1 No - lnc-TSR2-5:1 No - lnc-TSR2-4:1 No - lnc-TSR2-3:1 No - lnc-TSR2-2:1 No - lnc-TSR2-1:1 No - lnc-TSR2-1:2 No - lnc-GNL3L-1:2 Yes chr3R:17070523-17072675 lnc-PFKFB1-3:1 No - lnc-ITIH6-1:1 No - lnc-PFKFB1-1:1 No - lnc-PFKFB1-2:1 Yes chr2R:23964772-23966757 lnc-ALAS2-1:1 No - lnc-FAM104B-1:1 No - lnc-FAM104B-1:2 No - lnc-PAGE5-2:1 No - lnc-MTRNR2L10-3:1 No - lnc-MTRNR2L10-2:1 No - lnc-MTRNR2L10-1:1 No - lnc-PAGE5-1:2 No - lnc-PAGE5-1:4 No - lnc-USP51-1:1 Yes chr3L:18618305-18622129 lnc-USP51-2:1 No - lnc-USP51-3:1 No - lnc-USP51-4:1 No - lnc-USP51-5:1 No - lnc-USP51-5:2 No - lnc-KLF8-4:13 No - lnc-SPIN3-6:1 Yes chr2R:23011078-23042943 lnc-SPIN3-5:1 Yes chr2R:23011078-23042943 lnc-KLF8-2:1 Yes chr2R:23011078-23042943 lnc-UBQLN2-3:1 No - lnc-UBQLN2-4:1 No - lnc-UBQLN2-5:1 No - lnc-UBQLN2-6:1 No - lnc-SPIN3-3:1 No - lnc-SPIN3-2:1 No - lnc-NBDY-6:1 No - lnc-SPIN2B-2:1 No - lnc-SPIN2B-1:1 No - lnc-FAAH2-1:10 No - lnc-SPIN2A-1:1 No - lnc-FAAH2-1:2 No - lnc-FAAH2-1:3 No - lnc-FAAH2-1:14 No - lnc-FAAH2-1:15 No - lnc-ZXDB-3:1 No - lnc-ZXDA-2:1 No - lnc-ZXDA-3:1 No - lnc-ZC3H12B-17:1 No - lnc-ZC3H12B-16:1 No - lnc-ZC3H12B-15:1 No - lnc-ZC3H12B-14:1 No - lnc-SPIN4-3:1 No - LINC01278:15 No - LINC01278:17 No - LINC01278:12 No - LINC01278:21 No - lnc-ZC3H12B-12:1 No - lnc-SPIN4-2:1 Yes chr3L:277437-305292 lnc-SPIN4-2:2 Yes chr3L:277437-305292 lnc-ZC3H12B-11:1 Yes chr3L:277437-305292 lnc-AMER1-1:1 No - lnc-ZC3H12B-10:1 No - lnc-ASB12-1:1 Yes chr2R:23389009-23396680 lnc-ZC4H2-2:1 No - lnc-MTMR8-1:2 Yes chrX:16941086-16942871 lnc-ZC3H12B-18:2 Yes chr2R:24607267-24610847 lnc-ZC4H2-1:1 No - lnc-ZC3H12B-8:1 No - lnc-LAS1L-4:1 No - lnc-MSN-5:2 Yes chr2R:24607267-24610847 lnc-ZC3H12B-2:5 Yes chr2R:24607267-24610847 lnc-ZC3H12B-2:6 No - lnc-ZC3H12B-2:7 Yes chr2R:24607267-24610847 lnc-ZC4H2-3:1 Yes chr3L:11062726-11064941 lnc-MSN-6:1 No - lnc-ZC3H12B-1:4 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-LAS1L-2:1 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-ZC3H12B-7:1 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-LAS1L-5:1 No - lnc-VSIG4-3:1 No - lnc-MSN-3:1 No - lnc-VSIG4-2:1 No - lnc-HEPH-2:2 No - lnc-VSIG4-1:1 No - lnc-MSN-7:1 No - lnc-EDA2R-1:1 No - lnc-AR-2:1 No - lnc-AR-1:1 No - lnc-OPHN1-5:1 No - lnc-YIPF6-1:1 Yes chrX:15751674-15760733 lnc-OPHN1-2:1 Yes chrX:15751674-15760733 lnc-STARD8-3:1 Yes chr2L:4392770-4393876 lnc-STARD8-3:2 Yes chr2L:4392770-4393876 lnc-OPHN1-3:1 No - lnc-OPHN1-4:1 No - lnc-STARD8-2:1 No - lnc-EFNB1-2:1 No - lnc-EFNB1-1:2 No - lnc-FAM155B-3:1 No - lnc-PJA1-2:1 No - lnc-PJA1-3:1 No - lnc-AWAT2-2:1 No - lnc-AWAT2-3:1 No - lnc-P2RY4-2:1 Yes chr2R:7709873-7714182 lnc-PDZD11-1:1 No - lnc-PDZD11-2:1 Yes chrX:2599158-2604052 lnc-TEX11-32:2 No - lnc-SLC7A3-4:1 No - lnc-SLC7A3-3:1 No - lnc-FOXO4-5:1 No - lnc-FOXO4-4:1 No - lnc-FOXO4-3:1 No - lnc-SNX12-2:1 No - lnc-SNX12-1:1 No - lnc-CXorf65-2:1 Yes chr3R:12628031-12630495 lnc-FOXO4-2:1 No - lnc-IL2RG-4:2 No - lnc-IL2RG-6:1 No - lnc-IL2RG-1:3 No - lnc-IL2RG-2:1 Yes chr3L:19836614-19844944 lnc-IL2RG-3:1 Yes chr3R:27256595-27264055 lnc-ITGB1BP2-2:1 Yes chrX:16361569-16371547 lnc-ITGB1BP2-2:3 Yes chrX:16361569-16371547 lnc-ZMYM3-2:1 No - lnc-ITGB1BP2-1:1 No - lnc-TAF1-3:1 No - lnc-TAF1-2:1 No - lnc-TAF1-1:1 No - lnc-ZMYM3-3:1 Yes chr3R:6646889-6656048 lnc-ZMYM3-4:1 Yes chr3R:6646889-6656048 lnc-CXCR3-13:2 Yes chr3R:6646889-6656048 lnc-CXCR3-13:5 Yes chr3R:6646889-6656048 lnc-CXCR3-13:4 Yes chr3R:6646889-6656048 lnc-CXCR3-13:1 Yes chr3R:6646889-6656048 lnc-OGT-4:3 Yes chr3R:6646889-6656048 lnc-CXCR3-11:1 Yes chr3R:6646889-6656048 lnc-CXCR3-9:1 Yes chrX:1862009-1865835 lnc-CXCR3-9:2 Yes chrX:1862009-1865835 lnc-CXCR3-6:1 No - lnc-CXCR3-7:1 No - lnc-CXCR3-8:1 No - lnc-GCNA-4:1 No - lnc-CXorf49-10:1 No - lnc-GCNA-6:1 No - lnc-CXorf49B-7:2 No - lnc-CXorf49-12:1 No - lnc-CXorf49B-8:2 No - lnc-CXorf49-15:1 No - lnc-NHSL2-5:1 No - lnc-CXorf49-5:1 No - lnc-PIN4-1:1 No - lnc-PIN4-2:1 No - lnc-NHSL2-4:1 Yes chr3R:25262741-25263292 lnc-RPS4X-1:1 Yes chr3R:25262741-25263292 lnc-ERCC6L-2:1 Yes chr3R:25262741-25263292 lnc-CITED1-1:3 No - lnc-PHKA1-1:4 No - lnc-DMRTC1B-3:1 Yes chrX:9093612-9103739 lnc-FAM236B-1:2 Yes chrX:9093612-9103739 lnc-FAM236B-1:1 Yes chrX:9093612-9103739 lnc-PHKA1-2:2 No - lnc-PHKA1-2:1 No - lnc-PHKA1-3:1 No - lnc-FAM236B-4:2 Yes chrX:13368191-13370472 PABPC1L2B-AS1:2 No - lnc-PABPC1L2B-2:1 Yes chr2R:18140078-18147191 lnc-PABPC1L2B-3:1 No - lnc-PABPC1L2B-4:1 No - lnc-NAP1L2-2:1 No - lnc-CDX4-2:1 No - lnc-CDX4-1:1 No - lnc-NAP1L2-3:1 No - lnc-NAP1L2-3:2 No - lnc-CHIC1-5:1 No - lnc-NAP1L2-4:5 No - lnc-NAP1L2-4:4 No - lnc-NAP1L2-4:6 No - lnc-NAP1L2-4:7 No - lnc-NAP1L2-4:1 No - lnc-NAP1L2-4:3 No - lnc-NAP1L2-4:2 No - TSIX:1 No - XIST:3 No - XIST:26 No - XIST:15 No - XIST:9 No - XIST:6 No - XIST:12 No - XIST:17 No - XIST:18 No - lnc-CHIC1-9:1 No - lnc-CHIC1-9:2 No - lnc-CHIC1-9:3 No - lnc-CHIC1-8:1 No - JPX:3 No - JPX:4 No - JPX:5 No - JPX:6 No - JPX:8 No - JPX:11 No - JPX:12 No - JPX:13 No - JPX:15 No - JPX:16 No - JPX:20 No - lnc-RLIM-9:1 No - FTX:13 No - JPX:22 No - JPX:23 No - JPX:24 No - FTX:58 No - lnc-ZCCHC13-17:1 No - lnc-ZCCHC13-17:2 No - FTX:1 No - FTX:2 No - JPX:51 No - lnc-ZCCHC13-15:1 No - JPX:26 No - FTX:7 No - lnc-ZCCHC13-14:1 No - lnc-ZCCHC13-13:1 No - FTX:20 No - lnc-ZCCHC13-10:1 No - FTX:21 No - lnc-ZCCHC13-9:1 No - FTX:22 No - FTX:23 No - FTX:25 No - FTX:17 No - FTX:4 No - FTX:24 No - lnc-ZCCHC13-8:1 No - FTX:19 No - FTX:3 No - lnc-ZCCHC13-7:1 No - lnc-ZCCHC13-6:1 No - lnc-ZCCHC13-5:1 No - lnc-ZCCHC13-4:1 No - FTX:16 No - lnc-ZCCHC13-3:1 No - lnc-ZCCHC13-2:1 No - FTX:10 No - FTX:11 No - FTX:5 No - FTX:8 No - lnc-RLIM-7:1 No - lnc-SLC16A2-1:1 No - lnc-RLIM-6:1 Yes chr3R:12682186-12689367 lnc-RLIM-5:1 Yes chr3R:12682186-12689367 lnc-RLIM-4:1 No - lnc-UPRT-4:1 No - lnc-UPRT-3:1 No - lnc-UPRT-2:1 No - lnc-ZDHHC15-3:1 No - lnc-ZDHHC15-1:1 Yes chr2R:10028443-10032893 lnc-MAGEE2-4:1 Yes chr2R:10028443-10032893 lnc-ZDHHC15-2:1 No - lnc-ZDHHC15-4:1 No - lnc-UPRT-5:1 No - lnc-MAGEE2-2:1 No - lnc-PBDC1-7:1 No - lnc-PBDC1-2:2 No - lnc-PBDC1-5:1 No - lnc-MAGEE2-1:3 No - lnc-PBDC1-3:2 No - lnc-PBDC1-4:1 No - lnc-PBDC1-6:1 No - lnc-ATRX-5:1 No - MIR325HG:1 No - lnc-FGF16-1:1 No - lnc-MAGT1-3:1 Yes chr3R:25477868-25482834 lnc-MAGT1-2:1 Yes chr3R:25477868-25482834 lnc-MAGT1-1:1 Yes chr3R:25477868-25482834 lnc-COX7B-5:1 Yes chr3R:25477868-25482834 lnc-COX7B-3:1 Yes chr2L:8306696-8308192 lnc-COX7B-2:1 No - lnc-COX7B-4:2 No - lnc-CYSLTR1-1:1 Yes chrX:17842161-17843348 lnc-TAF9B-1:1 No - lnc-RTL3-3:1 No - lnc-RTL3-2:1 No - lnc-RTL3-1:1 No - lnc-LPAR4-1:1 No - lnc-P2RY10-1:2 No - lnc-ITM2A-3:1 No - lnc-ITM2A-1:1 Yes chr2L:821289-824337 lnc-ITM2A-2:1 No - lnc-BRWD3-2:2 No - lnc-BRWD3-2:1 No - lnc-BRWD3-2:3 No - lnc-FAM46D-2:1 No - lnc-FAM46D-3:1 No - lnc-HMGN5-3:1 Yes chr3R:24319000-24328619 lnc-FAM46D-4:1 Yes chr3R:24319000-24328619 lnc-HMGN5-2:1 Yes chr3R:24319000-24328619 lnc-HMGN5-1:1 Yes chr3R:24319000-24328619 lnc-BRWD3-1:1 No - lnc-SH3BGRL-1:1 No - lnc-SH3BGRL-2:1 No - lnc-SH3BGRL-3:1 No - lnc-SH3BGRL-4:1 No - lnc-HMGN5-4:1 No - lnc-HMGN5-6:1 No - lnc-HMGN5-7:1 No - lnc-POU3F4-3:1 No - lnc-POU3F4-2:1 No - lnc-RPS6KA6-5:1 No - lnc-RPS6KA6-4:1 No - lnc-HDX-2:1 Yes chrX:22529964-22536371 lnc-RPS6KA6-3:1 No - lnc-SATL1-1:1 No - lnc-APOOL-3:1 No - lnc-APOOL-3:2 No - lnc-APOOL-2:1 No - lnc-APOOL-1:2 Yes chr3R:15213974-15214845 lnc-ZNF711-1:3 Yes chr3R:15213974-15214845 lnc-CHM-2:1 No - lnc-POF1B-2:2 Yes chr2R:19492087-19494125 lnc-POF1B-1:1 Yes chr2R:19492087-19494125 lnc-POF1B-2:1 Yes chr2R:19492087-19494125 lnc-CHM-3:1 No - lnc-CHM-4:1 No - lnc-KLHL4-1:1 Yes chr2L:16466512-16485998 lnc-CHM-5:1 Yes chr2L:16466512-16485998 lnc-DACH2-1:1 No - lnc-DACH2-2:1 No - lnc-CHM-6:1 No - lnc-CHM-7:1 No - lnc-CHM-8:1 No - lnc-CHM-9:1 No - lnc-CHM-10:1 No - lnc-CHM-11:1 No - lnc-CPXCR1-1:1 No - lnc-CPXCR1-2:1 No - lnc-CPXCR1-3:1 No - lnc-CPXCR1-3:2 No - lnc-NAP1L3-15:1 No - lnc-TGIF2LX-2:1 No - lnc-NAP1L3-14:1 No - lnc-NAP1L3-13:1 No - lnc-PABPC5-5:1 No - lnc-PABPC5-3:1 No - lnc-PABPC5-2:1 No - lnc-NAP1L3-9:1 No - lnc-PABPC5-4:1 Yes chr3R:14630478-14641776 lnc-PCDH11X-1:1 No - lnc-FAM133A-1:1 No - lnc-NAP1L3-3:1 No - lnc-FAM133A-2:1 No - lnc-NAP1L3-4:1 No - lnc-FAM133A-3:1 No - lnc-NAP1L3-5:1 No - lnc-NAP1L3-6:1 No - lnc-NAP1L3-7:1 No - lnc-DIAPH2-15:1 No - lnc-DIAPH2-14:1 No - lnc-DIAPH2-13:1 No - lnc-DIAPH2-12:1 No - lnc-NAP1L3-8:1 No - lnc-DIAPH2-11:1 No - lnc-DIAPH2-6:1 No - lnc-NAP1L3-10:1 No - lnc-DIAPH2-4:1 No - lnc-DIAPH2-3:1 No - lnc-NAP1L3-12:1 No - lnc-DIAPH2-1:1 No - lnc-RPA4-1:1 Yes chr2L:20758144-20768053 DIAPH2-AS1:2 Yes chr2L:20758144-20768053 lnc-DIAPH2-2:1 No - lnc-PCDH19-7:1 No - lnc-DIAPH2-5:1 No - lnc-PCDH19-6:1 No - lnc-DIAPH2-7:1 No - lnc-DIAPH2-8:1 No - lnc-DIAPH2-10:1 No - lnc-DIAPH2-16:1 No - lnc-DIAPH2-17:1 No - lnc-TNMD-5:1 No - lnc-PCDH19-4:1 No - lnc-PCDH19-3:1 No - lnc-PCDH19-2:1 No - lnc-TSPAN6-2:1 No - lnc-SYTL4-2:1 No - lnc-TSPAN6-1:1 No - lnc-TNMD-2:2 No - lnc-SYTL4-1:1 Yes chr3R:14804092-14875488 lnc-ARL13A-4:1 Yes chr3R:18659618-18661126 lnc-NOX1-1:1 No - lnc-NOX1-1:2 No - lnc-NOX1-2:1 No - lnc-ARL13A-3:1 No - lnc-XKRX-1:1 Yes chr3L:18997875-19000608 lnc-TAF7L-1:1 No - lnc-CENPI-1:1 Yes chr3R:19461085-19597288 lnc-TIMM8A-2:1 No - lnc-RPL36A-2:1 No - lnc-BTK-1:1 Yes chr2L:8258373-8301079 lnc-TIMM8A-1:1 Yes chr2L:8258373-8301079 lnc-BTK-1:3 Yes chr2L:8258373-8301079 lnc-BTK-1:2 Yes chr2L:8258373-8301079 lnc-ARMCX4-3:1 No - lnc-ARMCX4-3:2 No - lnc-ARMCX4-3:3 No - lnc-ARMCX1-1:3 No - lnc-ARMCX1-1:4 No - lnc-ARMCX4-1:2 No - lnc-ARMCX4-1:3 No - lnc-ARMCX6-4:1 No - lnc-ARMCX3-5:1 No - lnc-ARMCX6-2:2 No - lnc-ARMCX6-2:1 No - lnc-ARMCX6-2:3 No - ARMCX3-AS1:1 No - lnc-ARMCX1-2:1 No - lnc-ARMCX1-2:2 No - lnc-ARMCX3-3:1 No - lnc-ARMCX3-4:1 No - lnc-ARMCX6-3:4 No - lnc-ARMCX6-3:1 No - lnc-ARMCX6-3:3 No - lnc-ARMCX6-3:2 No - lnc-ARMCX3-6:1 No - lnc-ARMCX2-1:1 No - lnc-NXF5-2:1 No - lnc-TCEAL2-5:1 No - lnc-ZMAT1-1:1 No - lnc-TCEAL2-3:1 No - lnc-ZMAT1-2:1 No - lnc-BEX5-1:1 No - lnc-TCEAL6-1:1 No - lnc-TCP11X1-4:1 Yes chrX:10832752-10847092 lnc-TCP11X2-2:1 Yes chrX:5879869-5883391 lnc-NXF2B-1:1 No - LINC00630:19 No - LINC00630:20 No - LINC00630:21 No - LINC00630:23 No - LINC00630:24 No - LINC00630:25 No - LINC00630:37 No - LINC00630:40 No - lnc-TMSB15A-4:1 No - lnc-ARMCX5-3:1 No - lnc-GPRASP2-1:1 No - lnc-TMSB15A-6:1 No - LINC00630:48 No - LINC00630:2 No - LINC00630:5 No - LINC00630:7 No - lnc-BHLHB9-4:1 No - lnc-BHLHB9-4:2 No - lnc-BHLHB9-3:1 No - lnc-BHLHB9-4:3 No - lnc-BHLHB9-5:1 No - lnc-BHLHB9-6:1 No - lnc-BHLHB9-7:1 No - lnc-BHLHB9-8:1 No - lnc-BHLHB9-9:1 No - lnc-BHLHB9-10:1 No - lnc-BEX1-4:1 No - lnc-BHLHB9-11:1 No - lnc-BEX1-3:1 No - LINC00630:9 No - LINC00630:11 No - LINC00630:14 No - LINC00630:15 No - lnc-RAB40AL-2:1 No - lnc-NXF3-1:1 No - lnc-BEX1-2:1 Yes chrX:10832752-10847092 lnc-BEX4-1:1 Yes chrX:10832752-10847092 lnc-TCEAL8-2:1 No - lnc-TCEAL8-1:1 No - lnc-BEX2-1:1 No - lnc-BEX3-2:2 No - lnc-BEX3-2:5 No - lnc-BEX3-2:6 No - lnc-RAB40A-3:1 Yes chrX:12459796-12463112 lnc-TCEAL4-2:2 No - lnc-TCEAL4-4:1 No - lnc-MORF4L2-4:1 Yes chrX:12459796-12463112 lnc-TCEAL3-3:1 No - lnc-TCEAL3-3:2 No - lnc-MORF4L2-3:1 No - lnc-TCEAL3-1:3 No - TCEAL3-AS1:1 No - lnc-MORF4L2-2:1 No - lnc-GLRA4-2:3 Yes chr3R:15276440-15278109 lnc-GLRA4-2:2 Yes chr3R:15276440-15278109 lnc-GLRA4-2:1 Yes chr3R:15276440-15278109 MORF4L2-AS1:2 Yes chr3R:15276440-15278109 MORF4L2-AS1:4 No - lnc-GLRA4-1:1 No - lnc-RAB9B-2:1 No - lnc-RAB9B-2:4 No - lnc-RAB9B-2:3 No - lnc-RAB9B-2:2 No - lnc-RAB9B-3:1 No - lnc-TMSB15B-1:1 No - lnc-H2BFWT-2:1 No - lnc-H2BFWT-2:2 No - lnc-FAM199X-1:6 Yes chr3R:30046470-30048665 lnc-H2BFWT-18:1 Yes chr3R:30046470-30048665 lnc-ESX1-1:1 Yes chr3R:30046470-30048665 lnc-ESX1-1:2 Yes chr3R:30046470-30048665 lnc-FAM199X-2:1 No - lnc-SERPINA7-1:1 Yes chr3L:2554847-2586540 lnc-NRK-2:1 No - lnc-NRK-3:1 No - lnc-NRK-1:2 No - lnc-MUM1L1-1:1 No - lnc-MORC4-2:2 No - lnc-MORC4-2:1 No - lnc-MORC4-1:1 No - lnc-CLDN2-2:1 No - lnc-NUP62CL-3:1 Yes chr2R:22066883-22068372 lnc-NUP62CL-2:1 Yes chr2R:22066883-22068372 lnc-PRPS1-3:1 No - lnc-TEX13B-3:1 Yes chr2L:12455540-12546611 lnc-TEX13B-2:1 No - lnc-COL4A6-1:1 No - lnc-PSMD10-1:1 No - lnc-COL4A6-2:2 No - lnc-COL4A6-2:1 No - lnc-ATG4A-2:1 Yes chr2L:5029609-5037279 lnc-IRS4-1:1 No - lnc-COL4A5-3:1 No - lnc-IRS4-2:1 No - lnc-NXT2-1:1 Yes chr2R:8665813-8683022 lnc-ACSL4-1:2 Yes chr2R:8665813-8683022 lnc-NXT2-2:1 Yes chr2R:8665813-8683022 lnc-KCNE5-3:1 Yes chr2R:8665813-8683022 lnc-KCNE5-2:1 Yes chr2R:8665813-8683022 lnc-TMEM164-3:1 No - lnc-TMEM164-1:1 Yes chr2R:6036557-6040647 lnc-RTL9-2:1 Yes chr2R:6036557-6040647 lnc-TMEM164-2:1 Yes chr3R:23986642-23988738 lnc-CHRDL1-2:1 Yes chr3R:23986642-23988738 lnc-CHRDL1-2:2 Yes chr3R:23986642-23988738 lnc-SERTM2-6:1 Yes chr3R:6350896-6361614 lnc-SERTM2-8:1 Yes chr3R:6350896-6361614 lnc-SERTM2-7:1 Yes chr3R:6350896-6361614 lnc-CAPN6-1:1 No - lnc-PAK3-1:1 No - lnc-SERTM2-3:1 No - lnc-SERTM2-1:5 No - lnc-SERTM2-5:1 No - lnc-ALG13-4:1 No - lnc-SERTM2-1:6 No - lnc-TRPC5OS-5:1 Yes chr2L:4688965-4690702 lnc-ALG13-3:1 No - lnc-TRPC5OS-6:1 Yes chr2L:16663454-16676701 lnc-TRPC5-2:1 No - lnc-LHFPL1-2:2 No - lnc-LHFPL1-3:1 No - lnc-RTL4-1:1 No - lnc-RTL4-2:1 No - lnc-AMOT-3:1 No - XACT:1 No - lnc-HTR2C-7:1 No - lnc-IL13RA2-8:1 No - lnc-HTR2C-5:1 No - lnc-IL13RA2-7:1 No - lnc-HTR2C-4:1 No - lnc-HTR2C-4:2 No - lnc-HTR2C-2:1 No - lnc-IL13RA2-5:1 No - lnc-RBMXL3-4:1 Yes chr3R:8578205-8629996 lnc-IL13RA2-4:1 Yes chr3R:8578205-8629996 lnc-IL13RA2-1:1 No - lnc-IL13RA2-2:1 No - lnc-RBMXL3-3:1 No - lnc-IL13RA2-3:1 Yes chr2L:17367511-17384115 lnc-RBMXL3-2:1 Yes chr2L:17367511-17384115 PLS3-AS1:10 No - lnc-PLS3-3:1 No - lnc-LRCH2-6:1 No - DANT2:11 No - DANT1:2 No - lnc-CT83-7:1 No - lnc-CT83-2:1 No - lnc-CT83-2:2 No - lnc-SLC6A14-1:1 No - lnc-CT83-1:1 No - lnc-SLC6A14-3:1 No - lnc-KLHL13-4:1 No - lnc-SLC6A14-4:1 No - lnc-SLC6A14-5:1 No - lnc-KLHL13-2:1 No - lnc-KIAA1210-6:1 No - lnc-WDR44-3:1 No - lnc-WDR44-4:1 No - lnc-KLHL13-3:1 No - lnc-WDR44-2:2 No - lnc-KIAA1210-5:1 Yes chr2L:7472513-7496307 lnc-DOCK11-1:1 No - LINC01285:6 No - lnc-CXorf56-7:1 No - lnc-PGRMC1-2:1 No - lnc-KIAA1210-3:1 No - lnc-KIAA1210-4:1 No - lnc-KIAA1210-1:3 No - lnc-SLC25A5-2:1 No - SLC25A5-AS1:6 No - SLC25A5-AS1:1 Yes chrX:10778954-10786907 SLC25A5-AS1:3 Yes chrX:10778954-10786907 lnc-CXorf56-5:1 No - lnc-NKRF-2:1 Yes chr2L:13811522-13813316 lnc-CXorf56-3:1 No - lnc-NKRF-1:2 Yes chr2R:7960133-7961921 lnc-NKRF-1:1 Yes chr2R:7960133-7961921 lnc-SOWAHD-1:1 No - lnc-RPL39-1:2 Yes chr2R:24061853-24062431 lnc-RPL39-1:1 Yes chr2R:24061853-24062431 lnc-RNF113A-3:1 Yes chr2R:23893066-23894987 lnc-RNF113A-1:1 No - lnc-NDUFA1-2:1 No - lnc-AKAP14-5:1 No - lnc-AKAP14-4:1 No - lnc-AKAP14-3:1 No - lnc-NKAP-5:1 No - lnc-RNF113A-4:1 Yes chr3R:27115152-27116707 lnc-NKAP-2:1 No - lnc-AKAP14-1:3 No - lnc-NKAP-3:1 No - lnc-RHOXF1-3:15 No - lnc-TMEM255A-3:1 No - lnc-RHOXF1-3:1 No - lnc-ZBTB33-1:1 No - lnc-LAMP2-1:1 No - lnc-C1GALT1C1-3:1 Yes chr2R:8102260-8106318 lnc-C1GALT1C1-2:1 Yes chr2R:8102260-8106318 lnc-C1GALT1C1-1:1 No - lnc-GLUD2-14:1 No - lnc-GLUD2-13:1 No - lnc-GLUD2-12:1 No - lnc-GLUD2-11:1 No - lnc-GLUD2-10:1 No - lnc-GLUD2-9:1 No - lnc-GLUD2-8:1 No - lnc-GLUD2-7:1 No - lnc-GLUD2-6:1 No - lnc-GLUD2-5:1 No - lnc-GLUD2-4:1 No - lnc-GLUD2-3:1 No - lnc-GLUD2-2:1 No - lnc-CT47A1-1:2 Yes chr3R:23935958-23943101 lnc-CT47A1-2:1 No - lnc-CT47A1-3:1 No - lnc-GRIA3-5:1 No - lnc-GRIA3-4:1 No - lnc-GRIA3-1:3 No - lnc-GRIA3-3:1 No - lnc-GRIA3-2:1 No - lnc-TENM1-12:3 Yes chr2L:2137350-2145187 lnc-TENM1-12:2 Yes chr2L:2137350-2145187 lnc-TENM1-12:1 Yes chr2L:2137350-2145187 lnc-TENM1-11:1 Yes chr2L:2137350-2145187 lnc-TENM1-10:1 Yes chr2L:2137350-2145187 lnc-TENM1-9:1 Yes chr2L:2137350-2145187 lnc-XIAP-7:1 Yes chr2L:2137350-2145187 lnc-XIAP-5:1 No - lnc-XIAP-4:1 No - lnc-THOC2-3:1 Yes chr3L:16038410-16051034 lnc-STAG2-3:4 Yes chr3L:16038410-16051034 lnc-THOC2-5:2 Yes chr2L:6950421-6954586 lnc-THOC2-5:1 Yes chr2L:6950421-6954586 lnc-TENM1-6:1 Yes chr2L:6950421-6954586 lnc-TENM1-3:1 Yes chr2L:6950421-6954586 lnc-TENM1-2:1 Yes chr2L:6950421-6954586 lnc-TENM1-1:1 No - lnc-THOC2-6:1 No - lnc-THOC2-7:1 No - lnc-TENM1-4:1 No - lnc-TENM1-4:2 No - lnc-TENM1-7:1 No - lnc-TENM1-8:1 No - lnc-TEX13C-7:2 No - lnc-DCAF12L2-1:1 No - lnc-DCAF12L1-1:1 No - lnc-PRR32-4:1 No - lnc-PRR32-4:2 Yes chr3R:12014943-12017031 lnc-PRR32-3:1 No - lnc-PRR32-2:1 No - lnc-PRR32-5:1 No - lnc-PRR32-6:1 No - lnc-ACTRT1-3:1 No - lnc-PRR32-8:1 No - lnc-PRR32-9:1 No - lnc-OCRL-2:1 No - lnc-SMARCA1-1:1 No - lnc-OCRL-1:1 No - lnc-APLN-1:3 No - lnc-APLN-1:2 No - lnc-APLN-3:1 Yes chr3L:12206238-12266841 lnc-UTP14A-1:1 No - lnc-RAB33A-1:1 No - lnc-SLC25A14-1:1 No - lnc-ENOX2-2:1 No - lnc-RBMX2-3:1 No - lnc-RBMX2-4:1 Yes chr3L:12844254-12850117 lnc-GPR119-2:1 Yes chr3L:12844254-12850117 lnc-IGSF1-3:1 No - lnc-ENOX2-3:1 No - lnc-ENOX2-4:1 No - lnc-OR13H1-4:1 No - lnc-ENOX2-5:1 No - lnc-OR13H1-1:1 No - lnc-OR13H1-2:1 No - lnc-OR13H1-3:1 No - FIRRE:7 No - lnc-OR13H1-7:1 No - FIRRE:2 No - lnc-OR13H1-5:1 No - lnc-OR13H1-6:1 No - FIRRE:5 No - lnc-STK26-11:1 No - FIRRE:3 No - FIRRE:4 No - lnc-STK26-10:1 No - lnc-STK26-9:1 No - lnc-STK26-8:1 No - lnc-IGSF1-5:1 No - lnc-STK26-7:1 No - lnc-IGSF1-2:2 No - lnc-STK26-3:1 No - lnc-RAP2C-2:1 Yes chr2R:24063051-24065405 lnc-STK26-4:1 Yes chr2R:24063051-24065405 lnc-RAP2C-2:2 Yes chr2R:24063051-24065405 RAP2C-AS1:6 No - lnc-STK26-5:1 No - RAP2C-AS1:7 No - lnc-RAP2C-3:1 Yes chr2R:17216549-17379376 lnc-RAP2C-4:1 Yes chr2R:17216549-17379376 lnc-RAP2C-5:1 Yes chr2R:17216549-17379376 lnc-MBNL3-1:1 Yes chr3R:19929277-20008512 lnc-USP26-3:1 Yes chr3R:19929277-20008512 lnc-USP26-1:1 No - lnc-USP26-2:1 No - lnc-CCDC160-5:1 Yes chr3L:8827505-8891192 lnc-CCDC160-4:1 No - lnc-CCDC160-3:1 No - lnc-CCDC160-2:1 No - lnc-CCDC160-1:1 No - lnc-HPRT1-5:1 No - lnc-HPRT1-3:1 No - lnc-HPRT1-4:1 No - MIR503HG:4 No - lnc-HPRT1-6:1 No - MIR503HG:6 No - MIR503HG:8 No - lnc-PLAC1-2:5 No - lnc-PLAC1-2:4 No - lnc-HPRT1-8:1 No - lnc-HPRT1-9:1 No - lnc-PLAC1-3:3 Yes chr2L:7190431-7194588 lnc-PLAC1-3:1 No - lnc-PLAC1-3:2 No - lnc-FAM122C-4:1 Yes chr2L:7190431-7194588 lnc-FAM122C-1:1 No - lnc-FAM122C-2:1 No - lnc-FAM122C-3:2 No - lnc-FAM122C-3:3 No - lnc-FAM122C-3:4 No - lnc-FAM122B-1:2 No - lnc-FAM122B-1:3 No - lnc-FAM122B-1:1 No - lnc-MOSPD1-1:4 No - lnc-MOSPD1-1:3 No - lnc-MOSPD1-1:2 No - lnc-SMIM10-2:1 No - lnc-RTL8B-1:1 No - lnc-RTL8B-1:2 No - lnc-RTL8B-2:2 No - lnc-RTL8B-2:1 No - lnc-RTL8C-4:1 No - lnc-RTL8C-4:2 No - SMIM10L2B-AS1:9 No - lnc-ETDB-3:2 No - lnc-ETDA-8:2 No - lnc-ETDA-7:1 No - lnc-ZNF75D-2:2 No - lnc-CT55-4:1 No - lnc-CT55-5:1 No - lnc-ZNF449-144:2 No - lnc-ZNF449-3:4 No - lnc-ZNF449-3:5 No - lnc-ZNF75D-3:1 No - lnc-CT45A3-2:1 No - lnc-CT45A3-1:2 No - lnc-CT45A1-1:1 No - lnc-MMGT1-2:1 No - lnc-MMGT1-1:1 No - lnc-MMGT1-3:1 No - lnc-MMGT1-4:1 No - LINC00892:2 No - LINC00892:3 No - lnc-CD40LG-4:1 No - lnc-ARHGEF6-1:1 No - lnc-RBMX-5:1 No - lnc-CD40LG-5:1 Yes chr2R:14602004-14604337 lnc-RBMX-4:5 Yes chr2R:14602004-14604337 lnc-RBMX-4:4 Yes chr2R:14602004-14604337 lnc-ARHGEF6-4:1 Yes chr2R:14602004-14604337 lnc-CD40LG-2:5 No - lnc-GPR101-3:1 No - lnc-CD40LG-2:6 No - lnc-RBMX-6:1 No - lnc-CD40LG-2:7 No - lnc-GPR101-3:2 No - lnc-GPR101-2:2 No - lnc-GPR101-2:1 No - lnc-ZIC3-1:1 No - lnc-ZIC3-2:1 No - lnc-FGF13-1:1 No - lnc-MCF2-4:1 No - lnc-F9-8:1 No - lnc-MCF2-3:2 No - lnc-F9-7:1 No - lnc-MCF2-3:1 No - lnc-F9-3:2 No - lnc-MCF2-1:1 No - lnc-ATP11C-1:1 Yes chr2R:5468319-5495861 lnc-CXorf66-4:1 Yes chrX:16405509-16414651 lnc-F9-1:2 No - lnc-F9-4:1 No - lnc-CXorf66-3:1 No - lnc-F9-5:1 No - lnc-SPANXB1-9:1 No - lnc-SOX3-2:1 No - lnc-CDR1-4:1 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-SOX3-1:1 No - LINC00632:1 No - LINC00632:7 No - lnc-CDR1-3:1 No - LINC00632:8 No - lnc-SPANXB1-7:1 No - lnc-SPANXB1-7:2 No - lnc-SPANXB1-7:3 No - lnc-SPANXB1-7:4 No - lnc-SPANXB1-7:5 No - lnc-SPANXB1-7:6 No - lnc-SPANXB1-7:7 No - lnc-SPANXB1-6:1 No - lnc-SPANXB1-5:1 No - lnc-SPANXB1-4:1 No - lnc-SPANXB1-3:1 No - lnc-LDOC1-1:2 No - lnc-SPANXC-2:1 No - lnc-SPANXC-1:1 No - lnc-SPANXA2-3:1 No - lnc-SPANXN4-2:1 No - lnc-SPANXN3-1:1 No - lnc-SPANXN4-3:1 No - lnc-SPANXN4-4:1 No - lnc-SPANXN4-5:1 No - lnc-SPANXN2-2:1 No - lnc-SPANXN1-4:1 No - lnc-SPANXN2-3:1 No - lnc-SPANXN1-2:1 No - lnc-SPANXN1-1:1 No - lnc-SLITRK2-2:1 No - lnc-SLITRK2-1:1 No - lnc-CXorf51B-2:1 No - lnc-CXorf51B-3:1 No - lnc-CXorf51B-4:1 No - lnc-CXorf51A-17:1 No - lnc-CXorf51A-16:1 No - lnc-CXorf51B-25:2 No - lnc-CXorf51A-15:1 No - lnc-CXorf51A-14:1 No - lnc-FMR1-3:1 No - lnc-CXorf51A-12:1 No - lnc-FMR1-2:1 No - FMR1-AS1:8 No - FMR1-AS1:2 Yes chr3R:10101420-10110121 FMR1-AS1:3 Yes chr3R:10101420-10110121 FMR1-AS1:4 Yes chr3R:10101420-10110121 FMR1-AS1:5 Yes chr3R:10101420-10110121 FMR1-AS1:6 Yes chr3R:10101420-10110121 lnc-FMR1NB-3:1 No - lnc-IDS-11:1 No - lnc-IDS-10:1 Yes chr2L:2885929-2954406 lnc-AFF2-1:1 No - lnc-IDS-9:1 No - lnc-IDS-7:1 No - lnc-HSFX3-1:1 Yes chr3L:3378268-3380083 LINC00893:15 No - lnc-MAGEA11-1:2 No - lnc-TMEM185A-2:1 No - lnc-HSFX1-1:1 No - lnc-MAGEA9-2:1 No - MAGEA8-AS1:1 No - lnc-CXorf40B-4:3 No - lnc-HSFX4-1:1 No - LINC00894:3 No - lnc-CXorf40B-4:1 No - LINC00894:5 No - LINC00894:7 No - LINC00894:8 No - LINC00894:10 No - LINC00894:11 No - LINC00894:12 No - LINC00894:13 No - LINC00894:14 No - LINC00894:15 No - LINC00894:16 No - LINC00894:17 No - LINC00894:18 No - LINC00894:19 No - LINC00894:20 No - LINC00894:22 No - LINC00894:23 No - LINC00894:24 No - LINC00894:26 No - LINC00894:28 No - LINC00894:30 No - LINC00894:31 No - lnc-CXorf40B-4:2 No - LINC00894:33 No - LINC00894:35 No - lnc-CXorf40B-2:1 No - lnc-MTMR1-2:1 No - lnc-GPR50-1:1 No - lnc-GPR50-2:1 No - lnc-GABRE-9:1 No - lnc-PASD1-2:1 No - lnc-GABRE-4:1 No - lnc-MAGEA10-4:2 Yes chrX:15921955-15924558 lnc-MAGEA10-4:1 Yes chrX:15921955-15924558 lnc-MAGEA10-3:1 Yes chrX:15921955-15924558 lnc-MAGEA10-2:1 Yes chrX:15921955-15924558 lnc-GABRE-2:1 No - lnc-MAGEA10-1:4 No - lnc-MAGEA10-1:5 No - lnc-GABRA3-1:1 Yes chrX:15921955-15928529 lnc-MAGEA3-1:1 No - lnc-MAGEA3-1:2 No - lnc-MAGEA12-3:2 No - lnc-MAGEA12-3:3 No - lnc-CSAG3-1:1 No - lnc-PNMA5-3:2 No - lnc-PNMA5-3:1 No - lnc-PNMA5-2:1 No - lnc-PNMA5-1:1 No - lnc-PNMA5-5:1 No - lnc-MAGEA1-2:1 No - lnc-ZNF275-3:1 No - lnc-ZFP92-2:1 No - lnc-PNMA6E-2:1 No - lnc-PNMA6E-1:1 No - lnc-ATP2B3-2:2 No - lnc-DUSP9-3:1 Yes chr4:328193-358917 lnc-ATP2B3-1:4 Yes chr3R:18403026-18404726 lnc-DUSP9-2:1 No - lnc-BCAP31-3:3 Yes chr4:445504-453947 lnc-BCAP31-3:4 Yes chr4:445504-453947 lnc-BCAP31-3:2 Yes chr4:445504-453947 lnc-BCAP31-3:5 Yes chr4:445504-453947 lnc-BCAP31-3:1 Yes chr4:445504-453947 lnc-BCAP31-2:4 Yes chr4:445504-453947 lnc-BCAP31-2:3 Yes chr4:445504-453947 lnc-BCAP31-2:1 No - lnc-BCAP31-2:2 Yes chr4:445504-453947 lnc-PDZD4-1:1 Yes chr4:663621-669884 lnc-PDZD4-2:1 No - lnc-PDZD4-3:1 No - lnc-SSR4-2:1 No - lnc-PDZD4-4:1 Yes chrX:8517373-8555170 lnc-L1CAM-1:2 No - lnc-L1CAM-1:4 No - lnc-AVPR2-1:1 No - lnc-L1CAM-1:3 No - lnc-L1CAM-1:1 No - lnc-NAA10-2:1 No - lnc-NAA10-1:1 No - lnc-RENBP-1:1 No - lnc-ARHGAP4-1:1 No - lnc-HCFC1-3:2 No - lnc-HCFC1-3:1 No - lnc-RENBP-2:1 Yes chr4:359938-375554 lnc-MECP2-1:1 Yes chr3R:27251131-27253182 lnc-TMEM187-3:1 No - lnc-MECP2-2:3 No - lnc-MECP2-2:2 No - lnc-MECP2-2:1 No - lnc-MECP2-2:4 No - lnc-MECP2-2:5 No - lnc-MECP2-2:8 No - lnc-MECP2-2:10 No - lnc-MECP2-2:6 No - lnc-MECP2-2:7 No - lnc-MECP2-2:9 No - lnc-DNASE1L1-5:1 No - lnc-DNASE1L1-4:1 No - lnc-DNASE1L1-3:1 No - lnc-DNASE1L1-1:1 Yes chr3L:23093190-23095471 lnc-FLNA-2:1 No - lnc-DNASE1L1-2:1 No - lnc-DNASE1L1-2:3 No - lnc-GDI1-1:1 Yes chr2R:9207561-9209774 lnc-FAM50A-1:1 No - lnc-SLC10A3-1:1 Yes chr3R:18165442-18167273 lnc-SLC10A3-2:1 No - lnc-SLC10A3-4:1 No - lnc-G6PD-1:1 No - lnc-FAM3A-2:1 No - lnc-CTAG1A-2:1 No - lnc-CTAG1A-3:1 No - lnc-CTAG2-1:2 Yes chr3L:2589414-2595590 lnc-GAB3-1:1 No - lnc-GAB3-2:1 No - lnc-SMIM9-2:3 No - lnc-SMIM9-2:4 No - lnc-MPP1-1:1 No - lnc-SMIM9-1:2 No - lnc-SMIM9-3:2 No - lnc-MTCP1-3:2 No - lnc-MTCP1-3:1 No - lnc-BRCC3-2:1 No - lnc-BRCC3-1:1 No - lnc-RAB39B-2:1 Yes chr3R:11408792-11409875 lnc-RAB39B-1:1 Yes chrX:13812971-13822307 lnc-H2AFB2-2:1 Yes chrX:13812971-13822307 lnc-CLIC2-1:3 No - lnc-H2AFB2-1:1 No - lnc-H2AFB2-1:2 No - lnc-H2AFB3-1:1 Yes chr3R:20406615-20407871 lnc-F8A2-3:1 Yes chr3R:20406615-20407871 lnc-TMLHE-2:1 Yes chr3R:20406615-20407871 lnc-H2AFB3-2:1 Yes chr3R:20406615-20407871 lnc-TMLHE-3:1 No - lnc-VAMP7-2:1 No - lnc-TMLHE-4:1 No - lnc-IL9R-1:3 No - lnc-IL9R-1:4 No - lnc-IL9R-1:5 No - lnc-IL9R-1:6 No - lnc-IL9R-1:7 No - lnc-IL9R-1:8 No - lnc-TMLHE-5:1 No - lnc-TMLHE-5:2 No - lnc-RPS4Y1-8:3 No - lnc-RPS4Y1-13:1 No - lnc-RPS4Y1-6:5 No - lnc-RPS4Y1-6:6 No - lnc-SRY-11:1 No - lnc-RPS4Y1-2:5 No - lnc-RPS4Y1-2:6 No - lnc-RPS4Y1-11:2 No - lnc-RPS4Y1-10:1 No - lnc-RPS4Y1-9:1 No - lnc-SRY-6:1 Yes chr3L:13041756-13044234 lnc-SRY-7:1 Yes chr3L:13041756-13044234 lnc-SRY-8:1 Yes chr3L:13041756-13044234 lnc-RPS4Y1-1:3 Yes chr3L:13041756-13044234 lnc-SRY-9:1 No - ZFY-AS1:4 No - ZFY-AS1:3 No - lnc-ZFY-3:1 No - lnc-SRY-10:1 No - LINC00278:3 No - lnc-TGIF2LY-2:1 No - lnc-SRY-12:1 No - lnc-SRY-13:1 No - lnc-SRY-14:1 No - lnc-PCDH11Y-1:1 No - lnc-SRY-15:1 No - lnc-TSPY2-7:1 Yes chr3R:14630478-14641776 lnc-TSPY2-5:1 No - lnc-AMELY-19:1 No - lnc-TSPY2-4:1 No - TTTY2B:2 No - lnc-AMELY-11:1 No - lnc-AMELY-9:1 No - lnc-TBL1Y-5:1 No - lnc-TBL1Y-4:1 No - lnc-TSPY2-6:1 Yes chr2L:415067-418536 lnc-AMELY-10:1 No - lnc-AMELY-12:1 No - lnc-TBL1Y-6:2 No - lnc-TBL1Y-10:1 No - lnc-TBL1Y-11:1 No - lnc-TBL1Y-7:1 No - lnc-AMELY-13:1 No - lnc-AMELY-8:2 No - lnc-AMELY-8:5 No - lnc-AMELY-8:3 No - lnc-AMELY-8:4 No - lnc-TBL1Y-8:1 No - lnc-TBL1Y-3:2 No - lnc-AMELY-14:1 No - lnc-AMELY-15:1 No - lnc-AMELY-16:1 No - lnc-AMELY-17:1 No - lnc-TBL1Y-9:1 No - lnc-AMELY-20:1 No - lnc-TSPY4-11:1 No - lnc-AMELY-21:1 No - lnc-TSPY4-10:1 No - lnc-TSPY4-9:1 No - lnc-TSPY4-8:1 No - lnc-TSPY4-4:2 No - lnc-AMELY-22:1 No - lnc-AMELY-23:1 No - lnc-TSPY4-2:2 No - TTTY18:1 No - TTTY19:2 No - lnc-AMELY-24:1 No - lnc-AMELY-25:1 No - lnc-AMELY-26:1 No - lnc-TSPY4-7:1 No - lnc-AMELY-27:1 No - lnc-TSPY4-6:1 No - lnc-AMELY-28:1 No - lnc-TSPY4-5:1 No - lnc-AMELY-31:1 No - lnc-AMELY-31:2 No - lnc-AMELY-31:3 No - lnc-TSPY10-6:1 No - lnc-TSPY10-7:1 No - TTTY21:5 No - TTTY2:3 No - lnc-TSPY10-8:1 No - lnc-TSPY10-9:1 No - lnc-TSPY10-10:1 No - lnc-TSPY10-11:1 No - lnc-UTY-20:1 No - lnc-UTY-19:1 No - lnc-TSPY10-12:1 No - lnc-TSPY10-13:1 No - lnc-UTY-18:1 No - lnc-TSPY10-14:1 No - lnc-UTY-17:1 No - lnc-UTY-16:1 No - lnc-UTY-15:1 No - lnc-TSPY10-18:1 No - lnc-UTY-14:1 No - lnc-UTY-14:2 No - lnc-UTY-13:1 No - lnc-USP9Y-16:1 No - lnc-USP9Y-15:1 No - lnc-USP9Y-14:1 No - lnc-USP9Y-13:1 No - lnc-USP9Y-12:1 No - lnc-USP9Y-11:1 No - lnc-UTY-12:1 No - lnc-UTY-11:1 No - lnc-USP9Y-10:1 No - lnc-USP9Y-9:1 No - lnc-USP9Y-8:1 No - lnc-USP9Y-2:2 No - lnc-USP9Y-7:1 No - lnc-UTY-10:2 No - lnc-UTY-10:4 No - lnc-UTY-10:1 No - lnc-UTY-9:1 No - lnc-USP9Y-6:1 No - lnc-UTY-8:1 No - lnc-UTY-7:1 No - lnc-UTY-6:1 No - TTTY15:4 No - lnc-UTY-4:1 No - lnc-DDX3Y-2:1 No - lnc-UTY-3:1 No - lnc-UTY-3:2 No - lnc-UTY-2:1 No - lnc-DDX3Y-4:1 No - lnc-UTY-1:52 Yes chr2L:10272325-10278811 lnc-UTY-1:54 Yes chr2L:10272325-10278811 lnc-UTY-1:53 Yes chr2L:10272325-10278811 lnc-TMSB4Y-1:2 No - lnc-VCY1B-1:2 No - lnc-VCY1B-3:2 Yes chr3R:7570281-7639434 lnc-VCY-3:2 No - lnc-VCY-4:1 No - lnc-NLGN4Y-2:1 No - lnc-CDY2A-13:1 No - lnc-CDY2B-12:1 No - FAM41AY1:6 No - FAM224B:2 No - lnc-CDY2B-7:1 No - lnc-CDY2A-12:1 No - lnc-CDY2A-11:1 No - lnc-CDY2A-10:1 No - lnc-CDY2B-6:1 No - lnc-CDY2A-9:1 No - lnc-CDY2B-4:1 No - lnc-CDY2A-8:1 No - lnc-CDY2B-2:1 No - lnc-CDY2A-5:1 No - lnc-CDY2B-3:1 No - lnc-CDY2A-3:1 No - lnc-CDY2A-2:1 No - lnc-CDY2B-5:1 No - lnc-CDY2A-4:1 No - lnc-CDY2B-8:1 No - lnc-CDY2A-6:1 No - lnc-CDY2B-9:1 No - lnc-CDY2A-7:1 No - lnc-CDY2B-10:1 No - lnc-CDY2B-11:1 No - lnc-CDY2B-13:1 No - FAM224A:3 No - lnc-HSFY1-9:1 No - lnc-HSFY2-12:1 No - lnc-HSFY1-8:1 No - lnc-HSFY2-11:1 No - lnc-HSFY1-6:1 No - lnc-HSFY1-5:1 No - lnc-HSFY2-9:1 No - lnc-HSFY1-4:1 No - TTTY9B:1 No - lnc-HSFY1-7:1 No - lnc-HSFY2-8:1 No - lnc-HSFY2-1:3 No - lnc-CDY2B-15:1 No - lnc-HSFY1-10:1 No - lnc-HSFY2-1:2 No - lnc-KDM5D-9:1 No - lnc-HSFY1-11:1 No - lnc-HSFY2-7:1 No - lnc-HSFY1-12:1 No - TTTY14:16 No - lnc-HSFY1-13:1 No - lnc-HSFY2-10:1 No - TTTY14:13 No - TTTY14:1 No - lnc-KDM5D-8:1 No - lnc-KDM5D-5:1 No - lnc-HSFY1-2:4 No - lnc-HSFY1-2:5 No - lnc-HSFY1-2:7 No - lnc-HSFY1-2:8 No - lnc-HSFY1-2:9 No - lnc-HSFY1-2:10 No - lnc-HSFY1-2:11 No - lnc-EIF1AY-4:1 No - lnc-HSFY2-13:1 Yes chr2L:5989400-5999501 lnc-HSFY2-14:1 Yes chr2L:5989400-5999501 lnc-KDM5D-6:1 No - lnc-KDM5D-7:1 No - lnc-EIF1AY-3:1 No - lnc-EIF1AY-2:1 No - lnc-EIF1AY-1:1 No - lnc-RPS4Y2-1:1 No - lnc-PRORY-9:1 No - lnc-PRORY-8:1 No - lnc-PRORY-7:1 No - lnc-RPS4Y2-3:1 No - lnc-RBMY1B-1:6 No - lnc-PRORY-2:1 No - lnc-RBMY1B-2:1 No - lnc-PRORY-4:1 No - lnc-PRORY-3:1 No - lnc-PRORY-5:1 No - lnc-RBMY1A1-1:1 No - lnc-RBMY1D-3:1 No - lnc-RBMY1A1-2:1 No - lnc-RBMY1A1-3:1 No - lnc-RBMY1D-1:1 Yes chr2R:14602004-14604337 lnc-RBMY1E-2:1 No - lnc-RBMY1A1-10:1 No - lnc-RBMY1J-9:1 No - lnc-PRY2-3:1 No - lnc-PRY2-2:1 No - lnc-RBMY1J-8:1 No - lnc-RBMY1J-7:1 No - lnc-RBMY1J-6:1 No - TTTY6B:1 No - lnc-RBMY1J-12:1 No - lnc-RBMY1J-11:1 No - lnc-RBMY1J-3:1 No - lnc-RBMY1J-5:2 No - lnc-RBMY1J-4:2 No - lnc-RBMY1F-3:1 No - lnc-RBMY1F-4:1 No - lnc-PRY-2:1 No - lnc-PRY-3:1 No - lnc-RBMY1F-5:1 No - lnc-PRY-6:1 No - lnc-DAZ1-3:1 No - lnc-DAZ1-2:1 No - lnc-DAZ1-1:1 No - lnc-BPY2-4:1 No - lnc-BPY2-5:1 No - lnc-BPY2-6:1 No - lnc-CDY1B-17:1 Yes chr3L:9097629-9134405 lnc-DAZ2-1:1 No - lnc-DAZ2-2:1 No - lnc-DAZ1-166:1 No - lnc-DAZ2-4:1 No - lnc-CDY1B-16:1 No - lnc-CDY1B-15:1 No - lnc-DAZ2-5:1 No - lnc-DAZ2-6:1 No - lnc-CDY1B-14:1 No - lnc-DAZ2-7:1 No - lnc-CDY1B-13:1 No - lnc-DAZ2-8:1 No - lnc-DAZ2-9:1 No - lnc-CDY1B-12:1 No - lnc-CDY1B-7:2 No - lnc-DAZ2-10:1 No - lnc-DAZ2-11:1 No - TTTY3B:1 No - lnc-CDY1B-6:1 No - lnc-BPY2B-15:1 No - lnc-CDY1B-5:1 No - lnc-BPY2B-14:1 No - lnc-CDY1B-3:1 No - lnc-BPY2B-13:1 No - lnc-CDY1B-4:1 No - lnc-BPY2B-12:1 No - lnc-BPY2B-11:1 No - lnc-BPY2B-10:1 No - lnc-CDY1B-1:2 No - lnc-BPY2B-9:1 No - lnc-CDY1B-2:3 No - lnc-CDY1B-2:2 No - lnc-CDY1B-8:1 No - lnc-CDY1B-9:1 No - lnc-BPY2B-8:1 No - lnc-CDY1B-10:1 No - lnc-BPY2B-7:1 No - lnc-CDY1B-11:1 No - lnc-DAZ3-4:1 No - lnc-DAZ3-3:1 No - lnc-BPY2B-3:1 No - lnc-BPY2B-4:1 No - lnc-BPY2B-5:1 No - lnc-BPY2C-5:1 No - lnc-DAZ3-2:1 No - lnc-DAZ4-2:1 No - lnc-CDY1-14:1 No - lnc-CDY1-9:1 No - lnc-BPY2C-6:1 No - lnc-CDY1-8:1 No - lnc-CDY1-7:1 No - lnc-CDY1-7:2 No - lnc-CDY1-2:2 No - lnc-BPY2C-7:1 No - lnc-BPY2C-8:1 No - lnc-BPY2C-9:1 No - lnc-CDY1-4:1 No - lnc-BPY2C-10:1 No - lnc-CDY1-3:1 No - lnc-BPY2C-11:1 No - lnc-CDY1-5:1 No - lnc-BPY2C-12:1 No - lnc-CDY1-6:1 No - lnc-BPY2C-13:1 No - lnc-BPY2C-14:1 No - lnc-CDY1-10:2 No - lnc-CDY1-11:1 No - lnc-BPY2C-15:1 No - lnc-BPY2C-16:1 No - lnc-CDY1-12:1 No - lnc-BPY2C-17:1 No - lnc-CDY1-13:1 No - lnc-BPY2C-18:1 No - lnc-BPY2C-19:1 No - lnc-CDY1-15:1 No - lnc-CDY1-16:1 No - lnc-BPY2C-20:1 No - lnc-CDY1-1:2 No - lnc-BPY2C-21:1 No - lnc-CDY1-17:1 No - lnc-CDY1-18:1 No - lnc-BPY2C-22:1 No - lnc-BPY2C-23:1 No - lnc-CDY1-19:1 No - lnc-BPY2C-24:1 No - lnc-CDY1-20:1 No - lnc-CDY1-21:1 No - lnc-SAMD11-7:23 No - lnc-SAMD11-7:27 No - lnc-AGRN-2:5 No - TNFRSF14-AS1:19 No - lnc-CA6-3:2 No - lnc-DNAJC16-1:2 No - lnc-DNAJC16-1:3 No - lnc-SPATA21-4:5 No - lnc-NBPF1-1:7 No - lnc-CROCC-3:6 No - lnc-CNR2-1:5 No - lnc-CNR2-1:3 No - lnc-MECR-1:4 Yes chr3R:13661311-13666891 lnc-TMEM234-3:10 No - lnc-PHC2-4:1 Yes chrX:2115727-2123286 LINC01343:4 No - lnc-PABPC4-1:10 Yes chr2R:23851562-23853247 lnc-PABPC4-1:8 No - lnc-HIVEP3-1:4 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-TSPAN1-1:2 Yes chr2L:297880-305233 lnc-ZFYVE9-2:2 No - lnc-DHCR24-4:1 No - LINC00466:15 No - LINC01349:3 No - lnc-HENMT1-1:2 No - SLC16A1-AS1:6 No - lnc-VTCN1-3:2 No - lnc-PRKAB2-3:3 Yes chr2R:9135375-9137933 lnc-PPIAL4F-3:1 No - lnc-MCL1-7:3 No - lnc-OAZ3-3:4 No - lnc-PEX19-4:2 No - lnc-PEX19-4:3 No - lnc-BLZF1-2:2 No - lnc-CLEC20A-1:2 No - lnc-ARL8A-1:3 Yes chr2R:21619321-21624446 lnc-SYT2-4:2 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-PLEKHA6-1:1 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-CNIH3-2:11 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-CHRM3-1:3 Yes chr2R:24378630-24390294 LINC01341:21 No - lnc-KLF6-8:2 Yes chr2R:10977956-11116378 lnc-PFKP-16:5 No - PRKCQ-AS1:6 No - CELF2-AS2:6 Yes chr2L:12344219-12397528 VIM-AS1:1 No - lnc-LYZL1-12:2 Yes chr3L:2377655-2499226 lnc-MAP3K8-13:1 No - ITGB1-DT:47 Yes chrX:8061645-8070237 LINC01518:10 No - lnc-AGAP9-4:1 No - lnc-VSTM4-1:4 No - lnc-MBL2-7:2 No - LINC01515:24 No - lnc-SPOCK2-1:2 Yes chr3R:23070516-23112730 lnc-SEC24C-5:3 No - lnc-NUTM2E-2:2 No - LINC00863:2 No - lnc-PANK1-2:6 No - lnc-PKD2L1-3:1 Yes chr3L:11061571-11062215 lnc-NFKB2-1:1 Yes chr3R:9044183-9047977 lnc-IKZF5-1:7 No - lnc-C10orf143-46:17 No - lnc-SYCE1-1:3 No - lnc-CYP2E1-9:1 No - lnc-PANO1-1:10 No - lnc-C11orf21-3:1 No - lnc-ART1-6:6 No - lnc-OR2AG2-1:1 No - lnc-AMPD3-2:2 Yes chrX:13830741-13845866 lnc-NCR3LG1-3:3 Yes chr3L:17797738-17802279 lnc-TRIM44-1:2 No - lnc-PPP2R5B-5:2 No - NEAT1:10 No - lnc-ZNF705E-1:20 Yes chrX:19243631-19245224 lnc-DDIAS-6:4 No - lnc-FZD4-4:1 No - lnc-CASP4-3:4 No - lnc-POU2AF1-3:4 No - lnc-ADAMTS15-1:12 No - lnc-FOXM1-4:2 No - lnc-CLEC2D-8:14 No - lnc-TAS2R43-1:2 No - lnc-ST8SIA1-3:3 No - lnc-ETNK1-3:9 No - RASSF8-AS1:14 No - lnc-MANSC4-1:4 No - lnc-MANSC4-1:3 No - lnc-SINHCAF-6:1 No - lnc-ALG10-4:1 No - lnc-LRRK2-1:4 No - lnc-SLC48A1-5:1 No - lnc-COL2A1-3:2 Yes chr2L:7529-9484 lnc-SCN8A-2:6 No - lnc-ATG101-4:1 No - lnc-ORMDL2-1:13 No - lnc-ORMDL2-1:14 No - lnc-ORMDL2-1:15 No - lnc-XPOT-4:8 No - lnc-GRIP1-8:2 No - lnc-CPM-5:2 No - lnc-CPSF6-2:2 No - lnc-TMTC3-13:3 No - lnc-TMTC3-13:4 No - lnc-DEPDC4-2:15 No - lnc-DEPDC4-2:3 Yes chrX:15735774-15737120 lnc-ASCL1-6:16 No - lnc-PRDM4-7:2 No - FAM222A-AS1:3 No - LINC00943:7 No - lnc-TUBA3C-2:5 No - LINC00442:6 No - lnc-TPTE2-4:1 No - LINC00539:8 No - LINC00424:5 No - lnc-C1QTNF9B-1:4 No - lnc-CENPJ-1:3 No - PLUT:7 Yes chr3R:6752864-6754194 TEX26-AS1:13 No - lnc-N4BP2L2-5:3 Yes chr3R:14391683-14481713 STARD13-AS:54 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-RFXAP-3:5 No - LINC02334:17 No - lnc-ELF1-2:10 Yes chrX:10598146-10602714 lnc-ELF1-2:4 No - CPB2-AS1:8 Yes chrX:17080423-17087675 lnc-LPAR6-4:2 Yes chrX:797090-801479 lnc-TRIM13-7:2 No - DLEU2:30 No - DLEU1:24 No - DLEU1:35 No - DLEU1:51 No - lnc-BORA-11:1 No - UBAC2-AS1:2 No - MYO16-AS1:2 No - lnc-POTEG-14:7 No - lnc-FOXG1-22:4 No - LINC02300:4 No - LINC00639:6 No - LINC01588:79 No - LINC01588:73 No - lnc-NAA30-5:2 Yes chr3R:20740108-20756639 lnc-ARG2-1:2 No - lnc-CPSF2-2:2 Yes chrX:15486922-15511223 lnc-VRK1-6:1 No - lnc-DLK1-35:132 No - lnc-DLK1-35:142 No - LINC00239:3 No - lnc-BRF1-31:13 No - lnc-BRF1-31:7 No - lnc-OR4N4-1:19 No - lnc-NIPA1-1:11 No - lnc-GOLGA6L22-5:3 No - lnc-CYFIP1-7:1 No - lnc-SNRPN-8:131 No - lnc-SNRPN-8:166 No - lnc-APBA2-1:6 No - lnc-APBA2-9:2 No - lnc-GOLGA8H-2:5 No - lnc-KLF13-2:9 Yes chr2L:476446-479688 lnc-GOLGA8N-1:1 No - lnc-GOLGA8A-1:4 No - lnc-GOLGA8A-6:4 No - lnc-GATM-3:2 No - lnc-GLDN-1:3 No - lnc-WDR72-1:4 No - lnc-ALDH1A2-9:11 No - IQCH-AS1:9 No - lnc-SH2D7-11:2 No - lnc-MESD-4:4 No - lnc-GOLGA6L9-2:5 No - lnc-GOLGA6L9-2:14 No - lnc-ZSCAN2-6:5 No - lnc-ZSCAN2-5:11 No - lnc-ZSCAN2-5:15 No - lnc-ZSCAN2-5:16 No - lnc-SEC11A-6:1 No - MIR9-3HG:15 No - lnc-CHD2-13:2 No - LINC01578:10 Yes chr2L:2979562-2987723 lnc-LINS1-2:3 No - lnc-OR4F15-4:6 No - lnc-NME4-1:7 Yes chr3R:25199818-25214255 lnc-SLC9A3R2-2:1 No - lnc-ROGDI-1:1 Yes chr2L:10003832-10008889 lnc-ROGDI-3:2 Yes chr2L:10003832-10008889 lnc-ROGDI-3:1 Yes chr2L:10003832-10008889 lnc-ROGDI-4:1 Yes chr2L:10003832-10008889 lnc-GLYR1-2:1 No - lnc-GLYR1-3:1 No - lnc-C16orf89-2:1 No - lnc-C16orf89-2:2 No - lnc-C16orf89-1:1 No - lnc-NAGPA-1:1 No - lnc-EEF2KMT-3:1 Yes chr3R:17809401-17811134 lnc-ALG1-3:1 No - lnc-RBFOX1-4:1 No - lnc-EEF2KMT-4:1 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-EEF2KMT-5:1 Yes chr3L:10481412-10594012 LINC01570:1 Yes chr3L:10481412-10594012 LINC01570:5 Yes chr3L:10481412-10594012 LINC01570:2 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-EEF2KMT-7:1 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-EEF2KMT-8:1 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-ALG1-5:2 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-EEF2KMT-9:1 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-EEF2KMT-10:2 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-EEF2KMT-10:1 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-TMEM114-7:1 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-METTL22-11:1 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-RBFOX1-2:1 No - lnc-TMEM114-6:1 No - lnc-TMEM114-3:2 No - lnc-RBFOX1-3:1 No - lnc-METTL22-2:4 No - lnc-METTL22-7:1 No - lnc-ABAT-8:1 Yes chr3L:21030280-21031360 lnc-TMEM114-2:2 No - lnc-ABAT-2:1 No - lnc-ABAT-1:1 No - lnc-METTL22-4:1 Yes chr3L:19997714-20000686 lnc-METTL22-5:1 Yes chr3L:19997714-20000686 lnc-METTL22-5:2 Yes chr3L:19997714-20000686 lnc-TMEM186-1:2 No - lnc-TMEM186-1:1 No - lnc-ABAT-3:1 No - lnc-PMM2-2:3 No - lnc-USP7-3:2 Yes chr3L:16780100-16782419 lnc-USP7-3:1 Yes chr3L:16780100-16782419 lnc-USP7-3:3 Yes chr3L:16780100-16782419 lnc-USP7-3:4 Yes chr3L:16780100-16782419 lnc-CARHSP1-2:3 Yes chrX:12022837-12029032 lnc-CARHSP1-2:2 Yes chrX:12022837-12029032 lnc-CARHSP1-2:1 Yes chrX:12022837-12029032 lnc-CARHSP1-3:1 Yes chrX:12022837-12029032 lnc-CARHSP1-4:1 Yes chrX:12022837-12029032 lnc-USP7-2:1 No - lnc-C16orf72-9:1 No - lnc-C16orf72-1:2 No - lnc-PMM2-6:2 Yes chrX:16792119-16797742 lnc-C16orf72-7:1 No - lnc-C16orf72-8:1 No - lnc-C16orf72-12:1 No - lnc-C16orf72-13:1 No - lnc-C16orf72-14:1 No - lnc-C16orf72-15:1 No - lnc-C16orf72-16:1 No - lnc-C16orf72-17:1 No - lnc-C16orf72-18:1 No - lnc-EMP2-1:3 Yes chrX:1483625-1507809 lnc-EMP2-6:1 Yes chrX:1483625-1507809 lnc-EMP2-5:1 Yes chrX:1483625-1507809 lnc-ATF7IP2-8:1 Yes chrX:1483625-1507809 lnc-ATF7IP2-7:1 No - lnc-GRIN2A-3:1 No - lnc-ATF7IP2-6:1 No - lnc-ATF7IP2-3:1 Yes chr2R:10800420-10808938 lnc-NUBP1-5:1 Yes chr2R:10800420-10808938 lnc-GRIN2A-2:2 Yes chr2R:10800420-10808938 lnc-ATF7IP2-3:3 Yes chr2R:10800420-10808938 lnc-ATF7IP2-3:4 Yes chr2R:10800420-10808938 lnc-ATF7IP2-3:5 Yes chr2R:10800420-10808938 lnc-ATF7IP2-3:6 Yes chr2R:10800420-10808938 lnc-ATF7IP2-3:7 Yes chr2R:10800420-10808938 lnc-NUBP1-4:1 Yes chr2R:10800420-10808938 lnc-EMP2-3:1 Yes chr2R:10800420-10808938 lnc-ATF7IP2-4:1 No - lnc-TEKT5-10:1 No - lnc-TEKT5-9:1 No - lnc-TEKT5-3:1 No - lnc-TEKT5-4:1 No - lnc-TEKT5-5:2 No - lnc-TEKT5-5:1 No - lnc-TEKT5-6:1 No - lnc-TEKT5-7:1 No - lnc-TEKT5-8:1 No - lnc-NUBP1-2:1 No - lnc-TVP23A-2:1 Yes chr3L:8966829-8968171 lnc-TVP23A-3:1 No - lnc-CLEC16A-5:2 No - lnc-CLEC16A-1:2 No - lnc-CLEC16A-2:5 No - lnc-CLEC16A-2:6 No - lnc-TVP23A-6:1 No - lnc-TVP23A-1:2 No - lnc-CLEC16A-7:1 No - lnc-CLEC16A-4:1 No - lnc-TNP2-1:1 No - lnc-PRM1-3:1 No - lnc-PRM1-4:1 No - lnc-PRM1-5:2 No - lnc-PRM1-6:2 No - lnc-LITAF-3:1 No - lnc-RMI2-5:1 No - lnc-TXNDC11-5:1 Yes chr2R:23502946-23503815 lnc-LITAF-1:1 Yes chr3L:8300064-8302341 lnc-SNN-1:6 No - lnc-SNN-1:7 No - lnc-SNN-1:8 No - lnc-TXNDC11-1:1 No - lnc-TXNDC11-2:1 No - lnc-TXNDC11-3:1 No - lnc-SNN-6:1 No - BCAR4:4 No - lnc-GSPT1-3:1 Yes chr2L:8509069-8511866 lnc-GSPT1-2:1 Yes chr2L:8509069-8511866 lnc-TNFRSF17-2:2 No - lnc-NPIPB2-4:1 Yes chr2L:12434452-12441279 lnc-NPIPB2-3:1 Yes chr2L:12434452-12441279 lnc-GSPT1-1:2 No - lnc-GSPT1-1:1 No - lnc-NPIPB2-2:1 No - lnc-GSPT1-4:1 No - lnc-TNFRSF17-5:1 Yes chr2L:13177150-13178978 lnc-CPPED1-8:1 Yes chr2L:13177150-13178978 lnc-SHISA9-8:1 Yes chr2L:13177150-13178978 lnc-SNX29-1:1 No - lnc-SHISA9-1:2 No - lnc-SHISA9-1:3 No - lnc-NPIPB2-7:1 No - lnc-SHISA9-5:1 No - lnc-SNX29-3:1 No - lnc-SHISA9-3:4 No - lnc-SHISA9-6:1 No - lnc-SHISA9-7:1 No - lnc-CPPED1-6:1 No - lnc-CPPED1-7:1 No - lnc-SHISA9-3:5 No - lnc-PARN-8:3 No - lnc-PARN-15:1 No - lnc-ERCC4-2:2 No - lnc-PARN-12:1 Yes chrX:4314230-4318801 lnc-ERCC4-3:1 Yes chr3L:2717615-2766536 lnc-ERCC4-7:1 Yes chr3L:2717615-2766536 MIR193BHG:1 No - MIR193BHG:25 No - lnc-PARN-10:1 No - MIR193BHG:26 No - MIR193BHG:5 No - MIR193BHG:6 No - MIR193BHG:7 No - MIR193BHG:13 No - lnc-PARN-9:1 No - lnc-PLA2G10-4:1 No - lnc-PLA2G10-7:1 No - lnc-PLA2G10-2:1 No - lnc-NOMO1-2:1 No - lnc-PLA2G10-5:3 No - lnc-PLA2G10-5:4 No - lnc-PLA2G10-5:1 No - lnc-PLA2G10-6:1 Yes chr2R:10070981-10075645 lnc-NPIPA1-3:1 No - lnc-NPIPA1-4:1 No - lnc-NTAN1-3:1 No - lnc-RRN3-2:1 Yes chrX:21324046-21328150 lnc-RRN3-1:1 Yes chrX:21324046-21328150 lnc-RRN3-1:2 Yes chrX:21324046-21328150 lnc-RRN3-3:8 Yes chrX:21324046-21328150 lnc-RRN3-3:7 Yes chrX:21324046-21328150 lnc-RRN3-3:6 Yes chrX:21324046-21328150 lnc-RRN3-4:1 Yes chrX:21324046-21328150 lnc-MPV17L-1:2 No - lnc-NDE1-1:3 No - lnc-MYH11-2:1 No - lnc-MYH11-2:3 No - lnc-MYH11-2:2 No - lnc-MYH11-1:1 No - lnc-MARF1-1:2 No - lnc-MARF1-2:2 No - lnc-FOPNL-2:1 Yes chr2R:24990570-25011965 lnc-FOPNL-1:1 No - lnc-ABCC6-4:1 Yes chr2L:12719045-12766546 lnc-FOPNL-3:1 No - lnc-ABCC6-3:1 Yes chr2R:10070981-10075645 lnc-ABCC6-5:1 No - lnc-ABCC6-6:1 No - lnc-ABCC6-7:1 No - lnc-NPIPA7-6:1 No - lnc-ABCC6-8:1 No - lnc-NPIPA7-7:1 No - lnc-NPIPA7-8:1 No - lnc-NPIPA7-11:1 No - lnc-XYLT1-5:1 No - lnc-NPIPA7-12:1 No - lnc-NPIPA7-12:2 No - lnc-XYLT1-4:1 No - lnc-XYLT1-3:1 No - lnc-ABCC6-11:1 Yes chr3L:2258839-2262664 lnc-ABCC6-9:1 Yes chr3L:2258839-2262664 lnc-NPIPA8-9:1 Yes chr3L:2258839-2262664 lnc-TMC7-10:1 No - lnc-TMC7-9:1 No - lnc-NPIPA8-2:1 No - lnc-TMC7-8:1 No - lnc-NPIPA8-3:1 No - lnc-NPIPA8-4:1 No - lnc-NPIPA8-4:2 No - lnc-NOMO2-3:1 No - lnc-NPIPA8-1:1 Yes chr2R:10070981-10075645 lnc-TMC7-7:1 Yes chr2R:10070981-10075645 lnc-NPIPA8-5:1 Yes chr2R:10070981-10075645 lnc-NOMO2-2:2 No - lnc-TMC7-6:1 No - lnc-TMC7-6:2 No - lnc-TMC7-6:4 No - lnc-ARL6IP1-2:2 Yes chr3R:16643605-16645171 lnc-ARL6IP1-1:1 No - lnc-SMG1-1:16 No - lnc-SMG1-1:17 No - lnc-SMG1-1:15 No - lnc-SMG1-3:1 Yes chrX:6824496-6838122 lnc-ARL6IP1-7:1 Yes chrX:6824496-6838122 lnc-ARL6IP1-3:1 Yes chrX:6824496-6838122 lnc-ARL6IP1-4:1 Yes chrX:6824496-6838122 lnc-ARL6IP1-5:1 Yes chrX:6824496-6838122 lnc-ARL6IP1-6:1 Yes chrX:6824496-6838122 lnc-TMC7-5:1 Yes chrX:6771225-6773039 lnc-TMC7-5:2 Yes chrX:6771225-6773039 lnc-ITPRIPL2-3:2 No - lnc-TMC5-4:1 No - lnc-TMC5-2:1 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-KNOP1-4:1 Yes chr3R:16456052-16458233 lnc-TMC5-3:1 No - lnc-TMC5-3:2 No - lnc-KNOP1-2:1 No - lnc-KNOP1-3:1 No - lnc-IQCK-1:3 No - lnc-ACSM5-2:3 No - lnc-GP2-1:2 No - lnc-GP2-1:1 No - lnc-UMOD-2:1 No - lnc-PDILT-1:3 No - lnc-ACSM5-3:1 No - lnc-ACSM1-3:1 No - lnc-ACSM1-2:2 No - lnc-ACSM1-2:1 No - lnc-ACSM3-1:3 No - lnc-ACSM1-1:1 No - lnc-REXO5-1:1 No - lnc-THUMPD1-2:2 No - lnc-THUMPD1-2:3 No - lnc-THUMPD1-2:1 No - lnc-THUMPD1-3:1 No - lnc-THUMPD1-3:2 No - lnc-DCUN1D3-1:1 Yes chr2R:22060950-22069757 lnc-DCUN1D3-1:4 Yes chr2R:22060950-22069757 lnc-DCUN1D3-1:5 Yes chr2R:22060950-22069757 lnc-DCUN1D3-1:6 Yes chr2R:22060950-22069757 lnc-DCUN1D3-1:3 Yes chr2R:22060950-22069757 lnc-DCUN1D3-1:2 Yes chr2R:22060950-22069757 lnc-LYRM1-1:1 No - lnc-CRYM-5:1 No - lnc-CRYM-2:11 No - lnc-CRYM-1:2 No - lnc-ZP2-3:1 Yes chrX:16881347-16882790 lnc-ZP2-4:1 Yes chrX:16881347-16882790 lnc-ANKS4B-5:2 Yes chrX:16881347-16882790 lnc-ANKS4B-5:12 No - lnc-ANKS4B-5:13 No - lnc-ANKS4B-5:14 No - lnc-NPIPB3-2:10 No - lnc-NPIPB3-2:6 No - lnc-NPIPB3-2:8 No - lnc-NPIPB3-2:4 No - lnc-NPIPB3-2:9 No - lnc-NPIPB3-2:7 No - lnc-NPIPB3-2:5 No - lnc-NPIPB3-2:2 No - lnc-CRYM-3:1 No - lnc-NPIPB3-2:1 No - lnc-METTL9-3:1 No - lnc-METTL9-1:1 No - lnc-NPIPB4-3:5 No - lnc-NPIPB4-3:7 No - lnc-NPIPB4-3:8 No - lnc-NPIPB4-3:6 No - lnc-NPIPB4-3:3 No - lnc-NPIPB4-3:4 No - lnc-NPIPB4-3:1 No - lnc-NPIPB4-3:2 No - lnc-NPIPB4-5:14 No - lnc-NPIPB4-5:15 No - lnc-NPIPB4-5:13 No - lnc-NPIPB4-5:12 No - lnc-NPIPB4-5:11 No - lnc-NPIPB4-5:7 No - lnc-NPIPB4-5:9 No - lnc-NPIPB4-5:10 No - lnc-NPIPB4-5:8 No - lnc-NPIPB4-5:5 No - lnc-NPIPB4-5:4 No - lnc-PDZD9-4:1 No - lnc-NPIPB4-5:1 No - lnc-NPIPB4-5:3 No - lnc-NPIPB4-2:1 No - lnc-PDZD9-3:1 Yes chr3L:16584124-16586111 lnc-MOSMO-1:1 Yes chr3L:19978713-19979812 lnc-SDR42E2-1:1 No - lnc-CDR2-1:4 No - lnc-POLR3E-1:2 No - lnc-CDR2-4:2 Yes chr2L:20678921-20681846 lnc-NPIPB5-4:1 Yes chr2L:20678921-20681846 lnc-NPIPB5-6:1 Yes chr2L:20678921-20681846 lnc-NPIPB5-6:2 Yes chr2L:20678921-20681846 lnc-NPIPB5-6:3 Yes chr2L:20678921-20681846 lnc-NPIPB5-6:4 Yes chr2L:20678921-20681846 lnc-NPIPB5-6:5 Yes chr2L:20678921-20681846 lnc-NPIPB5-6:6 No - lnc-NPIPB5-3:1 No - lnc-POLR3E-3:4 No - lnc-CDR2-6:1 No - lnc-HS3ST2-1:2 No - lnc-HS3ST2-2:3 No - lnc-SCNN1G-1:1 Yes chr2R:24743749-24756976 lnc-COG7-4:1 Yes chr2R:24743749-24756976 lnc-SCNN1G-3:1 No - lnc-GGA2-4:1 Yes chr3R:29930551-29933057 lnc-SCNN1B-2:1 Yes chr3R:29930551-29933057 lnc-GGA2-3:1 Yes chr3R:29930551-29933057 lnc-COG7-3:2 Yes chrX:9601030-9604280 lnc-COG7-3:1 Yes chrX:9601030-9604280 lnc-COG7-3:3 Yes chrX:9601030-9604280 lnc-EARS2-1:2 Yes chrX:9601030-9604280 lnc-EARS2-1:1 Yes chrX:9601030-9604280 lnc-GGA2-2:3 Yes chr3L:16415292-16417177 lnc-GGA2-2:4 Yes chr3L:16415292-16417177 lnc-GGA2-5:1 Yes chr3L:16415292-16417177 lnc-UBFD1-2:1 Yes chr3L:16415292-16417177 lnc-DCTN5-2:2 No - lnc-NDUFAB1-1:1 No - lnc-PALB2-1:2 Yes chr3R:19853908-19861291 lnc-PALB2-1:1 Yes chr3R:19853908-19861291 lnc-ERN2-2:1 Yes chr2R:16898535-16901575 lnc-TNRC6A-3:2 Yes chr2R:24086604-24092014 lnc-RBBP6-4:1 Yes chr4:649041-663103 lnc-RBBP6-1:4 Yes chr4:649041-663103 lnc-ARHGAP17-11:1 Yes chr4:649041-663103 lnc-TNRC6A-2:1 Yes chr3L:1933633-1939103 lnc-ARHGAP17-8:1 Yes chr3L:1933633-1939103 lnc-ZKSCAN2-6:4 Yes chr3R:19905164-19914272 lnc-ZKSCAN2-6:5 Yes chr3R:19905164-19914272 lnc-ZKSCAN2-6:3 Yes chr3R:19905164-19914272 lnc-ZKSCAN2-6:2 Yes chr3R:19905164-19914272 lnc-ZKSCAN2-5:1 Yes chr3R:19905164-19914272 lnc-LCMT1-5:1 No - lnc-LCMT1-4:1 No - lnc-LCMT1-4:2 No - LINC02175:21 No - LINC02175:23 No - LCMT1-AS1:19 No - LCMT1-AS1:13 No - LCMT1-AS2:2 Yes chr2L:15764220-15766267 lnc-LCMT1-2:1 No - ZKSCAN2-DT:10 No - lnc-ZKSCAN2-3:1 No - lnc-ZKSCAN2-4:1 No - lnc-ZKSCAN2-8:1 Yes chrX:19248639-19252045 lnc-ZKSCAN2-7:1 Yes chrX:19248639-19252045 lnc-HS3ST4-2:2 No - lnc-HS3ST4-2:3 No - lnc-HS3ST4-2:4 No - lnc-NSMCE1-10:1 No - lnc-HS3ST4-1:10 No - lnc-HS3ST4-1:11 No - lnc-HS3ST4-1:12 No - lnc-NSMCE1-9:1 No - lnc-NSMCE1-8:1 No - lnc-NSMCE1-6:1 No - lnc-NSMCE1-5:1 No - lnc-NSMCE1-5:3 No - lnc-GTF3C1-5:1 Yes chr2L:6676649-6677625 lnc-GTF3C1-4:3 Yes chr2L:6676649-6677625 lnc-GTF3C1-4:2 Yes chr2L:6676649-6677625 lnc-GTF3C1-4:1 Yes chr2L:6676649-6677625 lnc-IL4R-2:11 No - lnc-IL4R-2:14 No - lnc-IL4R-2:15 No - lnc-IL4R-2:21 No - lnc-GTF3C1-3:1 No - lnc-GTF3C1-2:2 Yes chr2L:13387571-13393959 lnc-GTF3C1-2:1 Yes chr2L:13387571-13393959 lnc-GSG1L-1:5 No - lnc-GSG1L-1:4 No - lnc-GSG1L-1:6 No - lnc-GSG1L-2:1 No - lnc-GSG1L-3:1 Yes chrX:471019-476579 lnc-GSG1L-5:1 Yes chrX:471019-476579 lnc-GSG1L-4:1 Yes chrX:471019-476579 lnc-GSG1L-6:1 Yes chrX:471019-476579 lnc-SBK1-1:1 Yes chr2R:16566023-16570120 lnc-SBK1-2:1 No - lnc-NPIPB7-1:1 No - lnc-IL27-1:8 No - lnc-IL27-1:10 No - lnc-IL27-1:7 No - lnc-IL27-1:9 No - lnc-IL27-1:6 No - lnc-CLN3-1:1 No - lnc-CLN3-1:4 Yes chr3L:17809231-17814119 lnc-CLN3-1:3 No - lnc-CLN3-1:2 No - lnc-APOBR-1:1 No - lnc-SGF29-2:2 No - lnc-NUPR1-1:1 No - lnc-SULT1A1-2:1 Yes chr2R:17665678-17669275 lnc-SULT1A1-1:1 Yes chr2R:17665678-17669275 lnc-TUFM-6:1 No - lnc-TUFM-3:7 No - lnc-TUFM-3:2 Yes chr3R:15408423-15417277 ATP2A1-AS1:1 Yes chr2R:23925077-23935884 ATP2A1-AS1:2 Yes chr2R:23925077-23935884 ATP2A1-AS1:3 Yes chr2R:23925077-23935884 ATP2A1-AS1:4 Yes chr2R:23925077-23935884 lnc-TUFM-5:1 No - lnc-CD19-2:1 No - lnc-CD19-1:1 No - lnc-LAT-1:10 No - lnc-RABEP2-5:2 No - lnc-SLX1B-3:7 No - lnc-SLX1B-3:9 No - lnc-RABEP2-5:1 No - lnc-RABEP2-7:2 No - lnc-RABEP2-7:1 No - lnc-SLX1B-3:13 No - lnc-LAT-4:1 No - lnc-SLX1B-3:19 No - lnc-NPIPB11-4:1 No - lnc-SLX1B-5:1 No - lnc-NPIPB11-3:1 No - lnc-SLX1B-2:1 No - lnc-BOLA2-1:2 Yes chr2R:12634166-12636141 lnc-SLX1B-1:1 Yes chr2R:12634166-12636141 lnc-BOLA2-2:1 No - lnc-SULT1A4-2:1 No - lnc-SULT1A4-3:1 No - lnc-BOLA2-3:1 No - lnc-NPIPB12-2:2 No - lnc-SPN-4:1 No - lnc-SPN-3:1 No - lnc-SPN-2:1 No - lnc-PAGR1-2:1 No - lnc-C16orf54-1:1 No - lnc-CDIPT-1:9 No - lnc-CDIPT-1:8 No - lnc-PRRT2-1:7 No - lnc-CDIPT-3:1 No - lnc-SEZ6L2-2:1 Yes chrX:15701451-15703770 lnc-MVP-3:15 No - lnc-MVP-3:16 No - lnc-MVP-3:21 No - lnc-KCTD13-2:1 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-KCTD13-1:1 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-DOC2A-3:2 No - lnc-DOC2A-3:1 No - lnc-INO80E-2:1 Yes chr2R:10885019-10886375 lnc-DOC2A-1:7 Yes chrX:10749077-10757666 lnc-DOC2A-1:4 Yes chrX:10749077-10757666 lnc-DOC2A-1:6 Yes chrX:10749077-10757666 lnc-DOC2A-1:5 Yes chrX:10749077-10757666 lnc-DOC2A-1:3 Yes chrX:10749077-10757666 lnc-DOC2A-2:1 Yes chrX:10368052-10383580 lnc-TBX6-1:1 Yes chrX:10205292-10212374 lnc-GDPD3-1:1 No - lnc-PPP4C-12:1 Yes chr2R:1071462-1125927 lnc-GDPD3-2:1 Yes chr2R:1071462-1125927 lnc-GDPD3-2:2 Yes chr2R:1071462-1125927 lnc-NPIPB13-1:1 Yes chr2R:12634166-12636141 lnc-BOLA2B-2:5 Yes chr2R:21292239-21293646 lnc-BOLA2B-2:6 Yes chr2R:21292239-21293646 lnc-BOLA2B-2:4 Yes chr2R:21292239-21293646 lnc-SULT1A3-2:1 No - lnc-SULT1A3-3:1 No - lnc-NPIPB13-4:1 No - lnc-MYLPF-3:1 No - lnc-MYLPF-3:2 Yes chr2L:10435995-10437316 lnc-CD2BP2-1:1 Yes chr3R:11581576-11585305 lnc-SEPT1-1:3 Yes chr2L:7185461-7190010 lnc-SEPT1-1:1 Yes chr2L:7185461-7190010 lnc-SEPT1-1:2 Yes chr2L:7185461-7190010 lnc-SEPHS2-2:2 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-ZNF747-1:1 No - lnc-ZNF688-1:1 No - lnc-ZNF785-2:1 No - lnc-ZNF785-2:2 No - lnc-ZNF785-1:1 No - lnc-ZNF785-3:5 No - lnc-ZNF785-4:1 No - lnc-ZNF689-2:1 No - lnc-PRR14-5:1 No - lnc-CCDC189-1:7 Yes chr2R:21323430-21341847 lnc-ZNF629-2:2 No - lnc-ZNF629-2:1 No - lnc-ZNF629-1:1 Yes chr3L:5789831-5794192 lnc-RNF40-2:1 No - lnc-BCL7C-1:3 Yes chrX:9356634-9358594 lnc-BCL7C-1:4 Yes chrX:9356634-9358594 lnc-BCL7C-3:1 No - lnc-ZNF668-1:1 Yes chr3R:24101600-24105763 lnc-STX4-1:3 No - lnc-STX4-1:4 No - lnc-PRSS53-2:1 Yes chrX:4909102-4915161 lnc-ZNF646-1:1 Yes chrX:4909102-4915161 lnc-PRSS53-1:1 No - lnc-PRSS53-1:2 No - lnc-PRSS36-1:1 No - lnc-PRSS36-1:2 No - lnc-PRSS8-1:3 No - lnc-PRSS8-1:2 No - lnc-PRSS8-1:1 No - lnc-FUS-4:1 No - lnc-FUS-2:1 No - lnc-PYDC1-1:1 No - lnc-COX6A2-5:1 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-COX6A2-4:1 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-COX6A2-2:1 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-COX6A2-1:1 Yes chr3L:18908260-18914150 lnc-ZNF843-2:2 No - lnc-ZNF843-2:3 No - lnc-ZNF843-3:2 No - lnc-ZNF843-3:1 Yes chr2L:18695664-18698571 lnc-SLC5A2-2:1 Yes chr2L:18695664-18698571 lnc-AHSP-5:1 Yes chr2L:18695664-18698571 LINC02190:6 No - lnc-AHSP-1:1 No - LINC02190:7 No - lnc-AHSP-2:1 No - lnc-C16orf58-6:1 No - lnc-C16orf58-6:6 No - lnc-C16orf58-6:5 No - lnc-C16orf58-6:4 No - lnc-C16orf58-6:2 No - lnc-C16orf58-6:3 No - lnc-C16orf58-7:1 No - lnc-AHSP-3:1 No - lnc-AHSP-3:2 No - lnc-ZNF720-7:1 No - lnc-ZNF720-6:1 No - lnc-C16orf58-8:1 No - lnc-ZNF720-1:6 No - lnc-ZNF720-1:7 No - lnc-ZNF720-4:1 No - lnc-ZNF720-1:9 No - lnc-ZNF720-1:10 No - lnc-C16orf58-9:1 No - lnc-ZNF720-5:1 No - lnc-ZNF720-5:2 No - lnc-ZNF720-5:3 No - lnc-C16orf58-10:1 No - lnc-ZNF267-2:1 No - lnc-C16orf58-11:1 No - lnc-C16orf58-12:1 No - lnc-ZNF267-3:1 No - lnc-ZNF267-4:1 No - lnc-ZNF267-4:2 No - lnc-ZNF267-4:3 No - lnc-ZNF267-4:4 No - lnc-ZNF267-5:1 No - lnc-ZNF267-6:1 No - lnc-TP53TG3-25:2 No - lnc-TP53TG3-22:2 No - lnc-TP53TG3-22:3 No - lnc-TP53TG3D-7:1 No - lnc-TP53TG3D-6:1 No - lnc-TP53TG3-4:4 No - lnc-TP53TG3D-5:1 No - lnc-TP53TG3-20:1 No - lnc-TP53TG3-18:1 No - lnc-TP53TG3D-8:1 No - lnc-TP53TG3-16:1 No - lnc-TP53TG3-14:1 No - lnc-TP53TG3D-9:1 No - lnc-TP53TG3D-9:2 No - lnc-TP53TG3-10:1 No - lnc-TP53TG3-9:2 No - lnc-TP53TG3-9:1 No - lnc-C16orf58-14:3 No - lnc-C16orf58-14:1 No - lnc-C16orf58-14:4 No - lnc-C16orf58-14:2 No - lnc-TP53TG3-11:1 No - lnc-TP53TG3C-16:1 No - lnc-TP53TG3-12:1 No - lnc-TP53TG3-13:1 No - lnc-TP53TG3C-15:1 No - lnc-TP53TG3C-12:1 No - lnc-TP53TG3C-11:1 No - lnc-TP53TG3-17:1 No - lnc-TP53TG3-19:1 No - lnc-TP53TG3C-9:1 No - lnc-TP53TG3C-8:1 No - lnc-TP53TG3-21:1 No - lnc-TP53TG3C-7:1 No - lnc-TP53TG3B-6:1 No - lnc-TP53TG3-33:4 No - lnc-TP53TG3-33:3 No - lnc-TP53TG3-33:1 No - lnc-TP53TG3-33:2 No - lnc-TP53TG3-34:3 No - lnc-TP53TG3-34:2 No - lnc-TP53TG3-34:1 No - lnc-TP53TG3F-10:1 No - lnc-TP53TG3F-13:1 No - lnc-TP53TG3F-14:1 No - lnc-TP53TG3-35:1 No - lnc-TP53TG3-37:1 No - lnc-TP53TG3-38:1 No - lnc-TP53TG3-39:1 No - lnc-TP53TG3-40:1 No - lnc-TP53TG3-41:1 No - lnc-TP53TG3-42:1 No - lnc-TP53TG3-43:1 No - lnc-TP53TG3-44:2 No - lnc-TP53TG3-44:1 No - lnc-TP53TG3-44:3 No - lnc-TP53TG3-45:1 No - lnc-TP53TG3-46:1 No - lnc-TP53TG3F-28:1 No - lnc-TP53TG3F-26:1 No - lnc-TP53TG3-47:1 No - lnc-TP53TG3-48:1 No - lnc-TP53TG3F-23:1 No - lnc-TP53TG3F-22:1 No - lnc-TP53TG3F-21:1 No - LINC00273:2 No - lnc-TP53TG3F-20:1 No - LINC00273:1 No - lnc-TP53TG3F-19:1 No - lnc-TP53TG3F-11:1 No - lnc-TP53TG3F-1:1 No - lnc-TP53TG3-51:1 No - lnc-TP53TG3F-3:1 No - lnc-TP53TG3F-3:3 No - lnc-TP53TG3F-12:1 No - lnc-TP53TG3F-5:1 No - lnc-TP53TG3F-15:1 No - lnc-TP53TG3-52:1 No - lnc-TP53TG3-53:1 No - lnc-TP53TG3-15:1 No - lnc-TP53TG3F-16:1 No - lnc-TP53TG3F-17:1 No - lnc-TP53TG3-55:1 No - lnc-TP53TG3-56:1 No - lnc-TP53TG3-57:1 No - lnc-TP53TG3F-9:3 No - lnc-TP53TG3F-8:1 No - lnc-TP53TG3-58:1 No - lnc-TP53TG3-59:1 No - lnc-TP53TG3F-18:1 No - lnc-TP53TG3-60:1 No - lnc-TP53TG3F-24:1 No - lnc-TP53TG3F-25:1 No - LINC01566:2 No - lnc-TP53TG3-61:1 No - lnc-TP53TG3-62:1 No - lnc-TP53TG3F-27:1 No - lnc-TP53TG3-63:3 No - lnc-TP53TG3-63:1 No - lnc-TP53TG3-63:2 No - lnc-TP53TG3-63:4 No - lnc-TP53TG3-64:4 No - lnc-TP53TG3F-30:1 No - lnc-TP53TG3F-31:1 No - lnc-TP53TG3-66:1 No - lnc-TP53TG3-66:2 No - lnc-TP53TG3-66:6 No - lnc-TP53TG3-66:4 No - lnc-TP53TG3-66:5 No - lnc-TP53TG3-67:1 No - lnc-TP53TG3-67:2 No - lnc-TP53TG3F-32:1 No - lnc-TP53TG3F-33:1 No - lnc-TP53TG3F-34:1 No - lnc-TP53TG3F-35:1 No - lnc-TP53TG3-70:1 No - lnc-TP53TG3-71:1 No - LINC02167:8 No - lnc-TP53TG3-73:1 No - lnc-TP53TG3-74:1 No - lnc-TP53TG3F-37:1 No - lnc-TP53TG3-75:1 No - lnc-TP53TG3F-39:1 No - lnc-SHCBP1-3:2 No - lnc-ORC6-4:1 No - lnc-ORC6-3:1 No - lnc-VPS35-1:1 Yes chr2L:20093972-20096253 lnc-ORC6-1:1 No - lnc-MYLK3-5:1 Yes chr2R:22185972-22189886 lnc-MYLK3-4:1 Yes chr2R:22185972-22189886 lnc-MYLK3-3:3 Yes chr2R:22185972-22189886 lnc-MYLK3-3:2 Yes chr2R:22185972-22189886 lnc-MYLK3-3:1 Yes chr2R:22185972-22189886 lnc-MYLK3-2:1 No - lnc-ORC6-2:1 No - lnc-MYLK3-6:1 No - lnc-C16orf87-1:1 No - lnc-GPT2-5:1 No - lnc-GPT2-1:3 Yes chr2L:13163209-13166072 lnc-GPT2-1:4 No - lnc-GPT2-1:10 No - lnc-GPT2-7:1 No - lnc-GPT2-8:1 No - lnc-GPT2-13:1 Yes chr3L:15560726-15563065 lnc-GPT2-10:1 No - lnc-NETO2-1:1 Yes chr3L:15560726-15563065 lnc-NETO2-2:1 Yes chr3L:15560726-15563065 lnc-NETO2-3:1 Yes chr3L:15560726-15563065 lnc-NETO2-4:2 Yes chr3L:15560726-15563065 lnc-NETO2-4:1 Yes chr3L:15560726-15563065 lnc-GPT2-4:2 Yes chr2L:8190808-8196918 lnc-ITFG1-1:1 Yes chr2L:8190808-8196918 lnc-ITFG1-2:1 Yes chr2L:8190808-8196918 lnc-ABCC12-2:1 No - lnc-ABCC11-5:1 No - lnc-ABCC11-4:1 No - lnc-ABCC11-3:1 No - lnc-SIAH1-3:1 No - lnc-SIAH1-2:1 No - lnc-N4BP1-3:1 Yes chrX:2708684-2711668 lnc-LONP2-7:2 Yes chrX:2708684-2711668 lnc-SIAH1-4:2 Yes chr3R:20033881-20036056 lnc-SIAH1-4:3 Yes chr3R:20033881-20036056 lnc-SIAH1-4:1 Yes chr3R:20033881-20036056 lnc-LONP2-8:1 Yes chr3R:20033881-20036056 lnc-LONP2-9:1 Yes chr3R:20033881-20036056 lnc-LONP2-6:4 No - lnc-N4BP1-6:1 No - lnc-C16orf78-5:2 No - lnc-C16orf78-5:3 No - lnc-C16orf78-5:4 No - lnc-C16orf78-5:15 No - lnc-C16orf78-5:17 No - lnc-C16orf78-5:19 No - LINC02179:5 No - lnc-CBLN1-2:2 Yes chr2R:14435899-14465881 lnc-CBLN1-2:1 Yes chr2R:14435899-14465881 lnc-C16orf78-9:1 Yes chr2R:14435899-14465881 lnc-CNEP1R1-7:1 Yes chr2R:14435899-14465881 lnc-CNEP1R1-6:1 No - lnc-CNEP1R1-5:1 No - lnc-CNEP1R1-2:1 No - lnc-ZNF423-4:1 No - lnc-PAPD5-1:1 Yes chr3R:6368965-6371115 lnc-BRD7-5:1 No - lnc-PAPD5-2:1 Yes chr3L:19939287-19977960 lnc-NKD1-3:1 No - lnc-SNX20-8:1 Yes chr3L:19003741-19045449 lnc-NKD1-2:2 Yes chr3L:19003741-19045449 lnc-CYLD-1:1 No - lnc-SNX20-1:2 No - lnc-SNX20-5:4 Yes chr2L:10295859-10299847 lnc-SNX20-5:3 Yes chr2L:10295859-10299847 LINC02168:5 No - lnc-SNX20-6:2 No - lnc-SALL1-11:1 No - lnc-SALL1-2:2 No - lnc-SALL1-2:3 No - lnc-CYLD-12:1 No - lnc-SALL1-8:1 No - lnc-SALL1-7:1 Yes chr2L:11434311-11445614 lnc-CYLD-4:2 Yes chr2L:11434311-11445614 lnc-CYLD-14:1 No - lnc-HNRNPA1P48-16:1 No - lnc-SALL1-12:2 Yes chr3R:26872129-26875742 lnc-SALL1-13:1 No - lnc-TOX3-1:14 No - lnc-TOX3-1:21 No - lnc-TOX3-1:18 No - LINC02180:13 No - LINC02180:21 No - CASC22:17 No - CASC22:27 No - CASC22:28 No - CASC16:7 No - lnc-CHD9-4:2 No - lnc-CHD9-3:8 No - lnc-CHD9-3:9 No - lnc-CHD9-3:10 No - lnc-CHD9-3:11 No - lnc-CHD9-2:4 No - lnc-CHD9-2:5 No - lnc-CHD9-9:1 No - lnc-CHD9-8:1 No - lnc-CHD9-8:2 No - lnc-TOX3-7:1 No - lnc-AKTIP-10:1 No - lnc-RBL2-7:1 Yes chr2L:210735-250823 lnc-RBL2-7:2 Yes chr2L:210735-250823 lnc-AKTIP-7:1 No - lnc-AKTIP-6:1 No - lnc-RBL2-1:5 No - lnc-RBL2-3:1 No - lnc-AKTIP-3:1 Yes chrX:797090-801479 lnc-AKTIP-1:6 Yes chr2R:20211585-20212619 lnc-RPGRIP1L-3:1 Yes chr2R:20211585-20212619 lnc-RBL2-4:3 No - LINC02140:18 Yes chr3L:12609631-12710249 LINC02140:13 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX3-80:17 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX3-80:7 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX3-80:53 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX5-3:1 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-CES1-5:1 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-CES1-4:1 No - lnc-CES1-2:2 No - lnc-SLC6A2-2:1 No - lnc-SLC6A2-2:2 No - lnc-CES5A-3:9 No - lnc-GNAO1-1:8 No - lnc-CES5A-3:8 No - lnc-CES5A-3:2 No - lnc-AMFR-2:2 Yes chr2R:10437985-10465701 lnc-NUDT21-5:1 No - lnc-NUDT21-2:1 No - lnc-NUDT21-1:1 No - lnc-AMFR-5:1 Yes chr3L:9411038-9413835 lnc-AMFR-6:1 Yes chr3L:9411038-9413835 lnc-NUDT21-3:1 No - lnc-NUDT21-4:2 No - lnc-NUDT21-4:1 No - lnc-MT1A-1:5 No - lnc-MT1F-2:2 No - lnc-MT1X-1:5 No - lnc-MT1G-2:4 No - lnc-MT1X-2:1 No - lnc-MT1G-2:3 No - lnc-SLC12A3-2:4 Yes chrX:13822826-13825910 lnc-CETP-2:1 No - lnc-CETP-2:2 No - lnc-FAM192A-3:1 No - lnc-PLLP-3:1 Yes chr2R:17564340-17565852 lnc-PLLP-3:2 Yes chr2R:17564340-17565852 lnc-CCL22-2:1 No - lnc-PLLP-2:1 No - lnc-CCL22-1:1 No - lnc-DOK4-2:1 Yes chr2L:15036293-15038861 lnc-DOK4-1:1 Yes chr2L:15036293-15038861 lnc-CIAPIN1-2:1 Yes chrX:7324214-7328806 lnc-CCDC102A-2:1 Yes chr3L:23784231-23787405 lnc-CCDC102A-2:4 Yes chr3L:23784231-23787405 lnc-CCDC102A-2:3 Yes chr3L:23784231-23787405 lnc-CCDC102A-2:2 Yes chr3L:23784231-23787405 lnc-CCDC102A-2:5 Yes chr3L:23784231-23787405 lnc-ADGRG3-1:1 Yes chr3L:23784231-23787405 lnc-ADGRG3-1:2 Yes chr3L:23784231-23787405 lnc-ADGRG3-1:3 Yes chr3L:23784231-23787405 lnc-KATNB1-1:1 Yes chr3R:25169565-25193776 lnc-CNGB1-3:1 No - lnc-CNGB1-2:1 No - lnc-CNGB1-2:4 No - lnc-CNGB1-2:3 No - lnc-CNGB1-1:4 No - lnc-CNGB1-1:3 No - lnc-CNGB1-1:2 No - lnc-CNGB1-1:1 No - lnc-CNGB1-2:2 No - lnc-ZNF319-1:1 Yes chr2R:21692691-21697152 lnc-CFAP20-2:2 No - lnc-CSNK2A2-3:1 Yes chr2L:10429920-10430918 lnc-CSNK2A2-2:2 Yes chr2L:10429920-10430918 lnc-CSNK2A2-2:1 Yes chr2L:10429920-10430918 lnc-CFAP20-3:2 Yes chr3L:23097072-23103460 lnc-CSNK2A2-1:1 No - lnc-GINS3-3:1 No - lnc-CSNK2A2-4:1 Yes chr3L:16339003-16345241 lnc-GINS3-1:1 Yes chrX:10383353-10385861 lnc-GINS3-1:2 Yes chrX:10383353-10385861 lnc-GINS3-1:3 Yes chrX:10383353-10385861 lnc-GINS3-1:4 Yes chrX:10383353-10385861 lnc-GINS3-1:5 Yes chrX:10383353-10385861 lnc-GINS3-2:1 No - lnc-CNOT1-5:1 No - lnc-CNOT1-3:1 No - lnc-CNOT1-2:1 No - lnc-SLC38A7-4:1 Yes chr2R:9566146-9579007 lnc-SLC38A7-3:1 Yes chr2R:9566146-9579007 lnc-SLC38A7-1:1 Yes chr2R:9566146-9579007 lnc-SLC38A7-2:3 Yes chr2R:9566146-9579007 lnc-SLC38A7-2:4 Yes chr2R:9566146-9579007 lnc-SLC38A7-2:2 Yes chr2R:9566146-9579007 lnc-GOT2-2:2 No - lnc-GOT2-2:3 No - lnc-GOT2-2:1 No - lnc-SETD6-1:4 No - lnc-SETD6-10:1 No - lnc-SETD6-11:1 No - lnc-SETD6-12:1 No - lnc-GOT2-3:1 No - lnc-SETD6-13:1 No - lnc-GOT2-6:3 No - lnc-GOT2-6:1 No - lnc-GOT2-6:2 No - lnc-GOT2-7:1 No - lnc-SETD6-14:1 No - lnc-SETD6-3:4 No - lnc-CDH8-11:1 No - lnc-CDH8-5:1 No - lnc-CDH8-4:1 No - lnc-CDH8-4:2 No - lnc-SETD6-5:2 No - lnc-SETD6-16:1 No - lnc-SETD6-6:2 No - lnc-GOT2-9:1 No - lnc-GOT2-9:2 No - lnc-GOT2-10:1 No - lnc-GOT2-11:1 No - lnc-CDH11-11:1 No - lnc-SETD6-18:1 No - lnc-CDH8-6:1 No - lnc-CDH8-7:1 No - lnc-CDH8-8:1 No - lnc-CDH8-9:1 No - LINC02165:6 No - lnc-CDH5-8:2 No - lnc-CDH5-5:2 No - lnc-CDH5-21:1 No - lnc-CDH11-12:2 No - lnc-CDH11-12:3 No - lnc-CDH11-12:6 No - lnc-CDH11-12:1 No - lnc-CDH11-12:4 No - lnc-CDH11-12:7 No - lnc-CDH11-12:5 No - lnc-CDH5-4:3 No - lnc-CDH11-2:3 No - lnc-CDH5-3:3 No - lnc-TK2-10:1 No - lnc-TK2-3:2 No - LINC00920:1 No - lnc-TK2-8:1 No - BEAN1-AS1:1 No - lnc-CMTM4-5:1 No - BEAN1-AS1:2 No - lnc-CMTM4-4:1 Yes chr3R:18980995-18982749 lnc-TK2-2:2 No - lnc-CMTM4-2:1 No - lnc-CMTM3-3:1 No - lnc-TERB1-3:2 Yes chrX:11154421-11164670 lnc-TERB1-3:1 Yes chrX:11154421-11164670 lnc-CA7-4:2 Yes chrX:11154421-11164670 lnc-TERB1-1:2 Yes chr3L:11098412-11100578 lnc-TERB1-1:3 Yes chr3L:11098412-11100578 lnc-TERB1-1:1 Yes chr3L:11098412-11100578 lnc-TERB1-2:2 Yes chr3L:11098412-11100578 lnc-TERB1-2:1 Yes chr3L:11098412-11100578 lnc-PDP2-3:1 Yes chrX:7731779-7734651 lnc-FAM96B-3:1 No - lnc-CBFB-3:1 No - lnc-CBFB-1:1 No - lnc-CBFB-2:1 No - lnc-FBXL8-3:1 Yes chr3L:8340785-8342876 lnc-B3GNT9-1:1 No - lnc-B3GNT9-2:1 No - lnc-HSF4-1:1 No - lnc-HSF4-1:3 No - lnc-KIAA0895L-1:1 No - lnc-EXOC3L1-1:1 No - lnc-KIAA0895L-2:1 Yes chr2R:18625249-18627718 lnc-KIAA0895L-3:1 Yes chr2R:18625249-18627718 lnc-LRRC29-1:1 Yes chr2R:8888404-8891401 lnc-FHOD1-1:1 No - lnc-LRRC29-2:1 No - lnc-PLEKHG4-1:2 Yes chr2L:21104568-21134255 lnc-KCTD19-1:1 No - lnc-FHOD1-2:1 No - lnc-FHOD1-2:2 No - lnc-TPPP3-2:1 No - lnc-TPPP3-1:1 Yes chr2L:259949-267505 lnc-ZDHHC1-1:1 Yes chr2L:259949-267505 lnc-LRRC36-1:2 Yes chr2R:12064565-12079543 lnc-ZDHHC1-2:1 Yes chrX:3880748-3882967 lnc-AGRP-6:1 Yes chrX:3880748-3882967 lnc-RIPOR1-1:1 No - lnc-RIPOR1-1:2 No - lnc-RIPOR1-1:11 No - lnc-RIPOR1-1:14 No - lnc-AGRP-1:5 No - lnc-AGRP-1:3 No - lnc-AGRP-1:7 Yes chr3L:7353578-7356713 lnc-AGRP-1:17 No - lnc-AGRP-1:12 No - lnc-ENKD1-1:2 No - lnc-ENKD1-1:4 No - lnc-ENKD1-1:3 No - lnc-ENKD1-1:1 No - lnc-ACD-2:2 Yes chr2R:7447473-7449995 lnc-ACD-2:1 Yes chr2R:7447473-7449995 lnc-ENKD1-2:1 Yes chr2L:1750687-1752122 lnc-GFOD2-1:1 Yes chr2R:10429708-10436581 lnc-CENPT-1:13 No - lnc-CENPT-1:12 No - lnc-CENPT-1:14 No - lnc-CENPT-1:11 No - lnc-CENPT-1:2 No - lnc-CENPT-1:9 No - lnc-CENPT-1:8 No - lnc-CENPT-1:3 No - lnc-CENPT-1:4 No - lnc-CENPT-1:6 No - lnc-CENPT-1:7 No - lnc-CENPT-1:1 No - lnc-CENPT-1:5 No - lnc-CENPT-1:10 No - lnc-CTRL-2:1 No - lnc-PSMB10-1:3 No - lnc-PSMB10-1:4 No - lnc-PSKH1-1:1 Yes chr3L:14999951-15001319 lnc-LCAT-1:1 No - lnc-LCAT-2:4 Yes chr2R:23907654-23925066 lnc-LCAT-2:3 Yes chr2R:23907654-23925066 lnc-LCAT-2:2 Yes chr2R:23907654-23925066 lnc-LCAT-2:1 Yes chr2R:23907654-23925066 lnc-DPEP3-1:1 No - lnc-DPEP3-1:2 No - lnc-DDX28-2:1 No - lnc-PLA2G15-4:1 Yes chrX:13624745-13664568 lnc-PLA2G15-1:3 No - lnc-SLC7A6OS-3:1 Yes chr2R:15657318-15676669 lnc-ESRP2-4:6 Yes chr2L:20447734-20449964 lnc-ESRP2-4:5 Yes chr2L:20447734-20449964 lnc-ESRP2-3:1 No - lnc-SLC7A6-3:1 Yes chr2R:23076688-23079038 lnc-SLC7A6OS-4:3 No - lnc-SLC7A6OS-4:2 No - lnc-SLC7A6OS-4:1 No - lnc-ZFP90-3:1 No - lnc-SMPD3-3:1 No - lnc-CDH3-3:2 No - lnc-CDH3-5:1 No - lnc-SMPD3-2:2 No - lnc-CDH1-6:1 No - lnc-CDH1-5:1 No - lnc-TANGO6-2:1 No - lnc-CHTF8-7:1 Yes chr2L:18969028-18972004 lnc-TANGO6-1:1 No - lnc-CHTF8-4:1 Yes chr3L:16226126-16228737 lnc-CHTF8-5:1 Yes chr3L:16226126-16228737 lnc-CHTF8-6:1 No - lnc-COG8-1:1 No - lnc-TMED6-1:1 No - lnc-CYB5B-1:1 No - lnc-TERF2-1:1 No - lnc-TERF2-2:1 No - lnc-TERF2-3:1 Yes chrX:6274972-6276724 lnc-CYB5B-2:1 No - lnc-NQO1-1:3 Yes chrX:10083154-10085050 lnc-NQO1-1:2 Yes chrX:10083154-10085050 lnc-EXOSC6-3:29 No - lnc-EXOSC6-3:25 No - lnc-EXOSC6-3:24 No - lnc-EXOSC6-8:1 No - lnc-EXOSC6-7:1 No - lnc-EXOSC6-2:3 Yes chrX:4366417-4371136 lnc-EXOSC6-1:5 No - lnc-EXOSC6-1:4 No - lnc-EXOSC6-1:2 No - lnc-EXOSC6-1:3 No - lnc-DDX19B-2:1 Yes chr3L:19912405-19913715 lnc-EXOSC6-4:1 Yes chr2L:8378262-8381764 lnc-EXOSC6-6:1 Yes chr2L:8378262-8381764 lnc-EXOSC6-5:1 Yes chr2L:8378262-8381764 lnc-DDX19B-1:1 Yes chr2L:8378262-8381764 lnc-ST3GAL2-1:1 No - lnc-ST3GAL2-1:3 No - lnc-ST3GAL2-1:2 No - lnc-ST3GAL2-2:1 No - lnc-FUK-2:1 No - lnc-ST3GAL2-3:1 Yes chr2L:10485538-10488622 lnc-MTSS1L-1:1 Yes chr2R:6924687-6971637 lnc-MTSS1L-2:1 Yes chr3R:12462562-12465298 lnc-IL34-6:1 Yes chr3R:12462562-12465298 lnc-HYDIN-1:1 Yes chr3R:12462562-12465298 lnc-VAC14-1:2 No - lnc-VAC14-2:1 No - lnc-CMTR2-1:1 No - lnc-CALB2-2:2 Yes chr2R:17786135-17788556 lnc-CALB2-2:3 Yes chr2R:17786135-17788556 lnc-CALB2-1:3 No - lnc-CALB2-1:4 No - LINC02136:5 No - lnc-CALB2-5:1 No - lnc-TLE7-4:1 Yes chr3R:26041736-26049911 lnc-ZNF19-2:1 No - lnc-ZNF23-5:1 No - lnc-TAT-6:1 No - lnc-CHST4-1:5 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-ZNF19-1:1 Yes chrX:14261223-14265379 lnc-MARVELD3-5:1 No - lnc-PHLPP2-2:1 Yes chrX:9108691-9117744 lnc-PHLPP2-3:1 Yes chrX:9108691-9117744 lnc-ZNF821-3:2 Yes chrX:9108691-9117744 lnc-ZNF821-3:1 Yes chrX:9108691-9117744 lnc-ATXN1L-2:1 No - lnc-IST1-1:3 No - lnc-IST1-1:4 No - lnc-ZNF821-2:5 No - lnc-ZNF821-2:4 No - lnc-ZNF821-2:3 No - lnc-TXNL4B-1:1 No - lnc-PMFBP1-5:1 No - lnc-DHX38-6:1 No - LINC01572:12 No - LINC01572:15 No - lnc-DHX38-8:1 No - lnc-DHX38-9:1 No - LINC01572:3 No - lnc-DHX38-3:2 No - lnc-DHX38-10:1 No - lnc-PMFBP1-6:1 No - lnc-DHX38-11:1 No - lnc-DHX38-12:1 No - lnc-DHX38-13:1 No - lnc-DHX38-14:1 No - lnc-DHX38-15:1 No - lnc-DHX38-16:1 No - lnc-DHX38-17:1 No - lnc-DHX38-18:1 No - lnc-DHX38-3:3 No - lnc-DHX38-19:1 No - lnc-DHX38-3:4 No - lnc-DHX38-3:12 No - lnc-DHX38-21:1 No - lnc-ZFHX3-7:1 No - lnc-ZFHX3-5:1 No - lnc-ZFHX3-4:1 No - lnc-DHX38-22:1 No - lnc-ZFHX3-3:1 No - lnc-ZFHX3-2:1 No - lnc-DHX38-23:1 No - lnc-DHX38-27:5 No - lnc-PMFBP1-4:9 Yes chr4:501810-540874 lnc-DHX38-40:1 Yes chr4:501810-540874 lnc-DHX38-40:4 Yes chr4:501810-540874 lnc-CLEC18B-10:1 Yes chr4:501810-540874 LINC01568:2 Yes chr4:501810-540874 LINC01568:3 Yes chr4:501810-540874 LINC01568:4 Yes chr4:501810-540874 LINC01568:5 Yes chr4:501810-540874 LINC01568:9 Yes chr4:501810-540874 lnc-PSMD7-7:1 Yes chr4:501810-540874 lnc-PSMD7-7:4 Yes chr4:501810-540874 lnc-PSMD7-7:5 Yes chr4:501810-540874 lnc-ZFHX3-27:19 No - lnc-ZFHX3-27:20 No - lnc-ZFHX3-27:10 No - lnc-PSMD7-4:1 No - lnc-CLEC18B-7:5 Yes chr2R:24400028-24404527 lnc-CLEC18B-7:6 Yes chr2R:24400028-24404527 lnc-CLEC18B-7:2 Yes chr2R:24400028-24404527 lnc-CLEC18B-5:2 No - lnc-CLEC18B-5:1 No - lnc-PSMD7-2:1 No - lnc-CLEC18B-2:6 No - lnc-CLEC18B-2:5 No - lnc-GLG1-3:1 Yes chr3R:13208754-13214465 lnc-NPIPB15-4:1 No - lnc-NPIPB15-2:3 No - lnc-NPIPB15-2:4 No - lnc-NPIPB15-5:1 Yes chr3L:21497549-21507538 lnc-GLG1-2:1 No - lnc-MLKL-4:1 Yes chr3L:14368925-14369707 lnc-MLKL-3:1 Yes chr3L:14368925-14369707 lnc-NPIPB15-6:1 No - lnc-RFWD3-1:1 No - lnc-ZNRF1-3:1 No - lnc-ZNRF1-2:1 Yes chr2L:11091444-11095096 lnc-FA2H-1:2 Yes chr2L:11091444-11095096 lnc-FA2H-1:1 Yes chr2L:11091444-11095096 lnc-FA2H-2:1 Yes chr2L:11091444-11095096 lnc-FA2H-3:1 Yes chr2L:11091444-11095096 lnc-FA2H-4:1 Yes chr2L:11091444-11095096 lnc-LDHD-2:1 Yes chr2L:11091444-11095096 lnc-ZFP1-1:2 No - lnc-ZFP1-3:1 No - lnc-ZFP1-2:1 No - lnc-ZNRF1-1:1 Yes chr2L:4463611-4465075 lnc-ZNRF1-1:3 Yes chr2L:4463611-4465075 lnc-BCAR1-2:1 Yes chr3L:6593938-6603366 lnc-CTRB1-1:1 No - lnc-CTRB1-1:2 No - lnc-CTRB1-1:4 No - lnc-CTRB1-1:5 Yes chr3L:152884-174517 lnc-CTRB2-1:1 Yes chr3L:152884-174517 lnc-BCAR1-3:1 Yes chr2R:1343403-1345119 lnc-TMEM170A-3:3 Yes chr2R:1343403-1345119 lnc-TMEM170A-2:1 Yes chr2L:6498647-6526996 lnc-CHST6-3:4 No - lnc-CHST6-3:3 No - lnc-TMEM231-1:5 No - lnc-TERF2IP-5:1 No - lnc-GABARAPL2-3:1 No - lnc-GABARAPL2-3:2 No - lnc-KARS-1:2 Yes chr2L:13808360-13811474 lnc-ADAT1-2:1 Yes chrX:9606363-9608884 lnc-ADAT1-3:1 Yes chrX:9606363-9608884 lnc-GABARAPL2-7:1 No - lnc-GABARAPL2-5:1 No - lnc-GABARAPL2-6:1 No - lnc-CPHXL-2:1 No - lnc-TERF2IP-2:1 No - lnc-TERF2IP-4:1 No - lnc-CPHXL-4:1 No - lnc-CPHXL-1:3 No - lnc-CPHXL-3:4 No - lnc-CPHXL-5:2 No - lnc-CPHXL-5:3 No - lnc-ADAMTS18-8:1 No - lnc-MON1B-2:1 No - lnc-SYCE1L-3:1 No - lnc-CPHXL-6:1 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-SYCE1L-2:2 No - lnc-ADAMTS18-7:1 No - lnc-ADAMTS18-3:2 No - lnc-ADAMTS18-3:3 No - lnc-CLEC3A-9:1 No - lnc-VAT1L-1:1 No - lnc-ADAMTS18-9:1 No - WWOX-AS1:5 Yes chr2L:7999670-8004286 WWOX-AS1:6 Yes chr2L:7999670-8004286 lnc-ADAMTS18-11:1 Yes chr2L:7999670-8004286 lnc-MAF-9:1 Yes chr2L:7999670-8004286 lnc-CLEC3A-12:1 Yes chr2L:7999670-8004286 lnc-MAF-7:1 Yes chr2L:7999670-8004286 lnc-MAF-4:2 Yes chr2L:7999670-8004286 lnc-WWOX-4:2 No - LINC01229:2 No - LINC01229:11 No - LINC01229:12 No - LINC01229:17 No - LINC01227:5 No - LINC01227:6 No - LINC01227:2 No - lnc-CDYL2-1:2 Yes chr3L:851346-852673 lnc-CMC2-5:1 Yes chr3L:851346-852673 lnc-CMC2-4:1 Yes chr3L:851346-852673 lnc-CENPN-1:1 Yes chr3R:13779624-13780795 lnc-C16orf46-3:6 Yes chr3R:13779624-13780795 lnc-C16orf46-3:10 Yes chr3R:13779624-13780795 lnc-C16orf46-3:9 Yes chr3R:13779624-13780795 lnc-C16orf46-3:8 Yes chr3R:13779624-13780795 lnc-C16orf46-3:1 No - lnc-C16orf46-3:2 No - lnc-C16orf46-3:3 No - lnc-C16orf46-3:7 Yes chr3R:13779624-13780795 lnc-C16orf46-3:4 No - lnc-C16orf46-3:5 No - lnc-CMC2-1:8 No - lnc-C16orf46-1:4 No - lnc-C16orf46-1:3 No - lnc-GCSH-4:3 No - lnc-GAN-2:1 No - lnc-GCSH-1:2 No - lnc-GAN-1:3 No - lnc-GAN-1:4 No - lnc-PLCG2-6:1 No - lnc-PLCG2-4:1 No - lnc-SDR42E1-3:1 No - lnc-PLCG2-1:6 Yes chrX:16350315-16356482 lnc-PLCG2-1:14 Yes chrX:16350315-16356482 lnc-PLCG2-8:2 Yes chrX:16350315-16356482 lnc-PLCG2-8:3 Yes chrX:16350315-16356482 lnc-MPHOSPH6-6:1 No - lnc-MPHOSPH6-4:1 No - lnc-SDR42E1-2:3 Yes chr2L:21156288-21157685 lnc-SDR42E1-2:2 Yes chr2L:21156288-21157685 lnc-SDR42E1-2:1 Yes chr2L:21156288-21157685 lnc-MPHOSPH6-5:1 No - lnc-CDH13-4:1 No - lnc-HSD17B2-6:1 No - lnc-HSD17B2-7:1 No - lnc-SLC38A8-6:3 No - lnc-SLC38A8-4:5 No - lnc-HSBP1-1:1 Yes chr2L:12426631-12427709 lnc-HSBP1-2:1 No - lnc-OSGIN1-1:9 No - lnc-MLYCD-2:7 No - lnc-MLYCD-2:8 No - lnc-SLC38A8-9:1 No - lnc-SLC38A8-7:2 Yes chr3L:21613797-21617376 lnc-SLC38A8-7:1 Yes chr3L:21613797-21617376 lnc-SLC38A8-8:2 Yes chr3L:21613797-21617376 lnc-SLC38A8-8:1 Yes chr3L:21613797-21617376 lnc-HSDL1-2:1 Yes chr3L:21613797-21617376 lnc-HSDL1-2:2 Yes chr3L:21613797-21617376 lnc-MBTPS1-1:1 Yes chr2L:16842300-16848716 lnc-MBTPS1-1:2 Yes chr2L:16842300-16848716 lnc-HSDL1-1:1 Yes chr2L:16842300-16848716 lnc-KCNG4-3:2 No - lnc-KCNG4-3:3 No - lnc-KCNG4-4:1 No - ATP2C2-AS1:5 Yes chr3L:22749444-22787631 lnc-COTL1-1:1 Yes chr2L:7384486-7388253 lnc-TLDC1-2:1 Yes chrX:18775228-18781345 lnc-KLHL36-5:1 Yes chrX:18775228-18781345 lnc-TLDC1-2:2 Yes chrX:18775228-18781345 lnc-TLDC1-3:1 Yes chrX:18775228-18781345 lnc-TLDC1-3:3 Yes chrX:18775228-18781345 lnc-TLDC1-3:2 Yes chrX:18775228-18781345 lnc-USP10-3:1 No - lnc-ZDHHC7-2:1 Yes chr2R:15989683-15991286 lnc-FAM92B-6:2 Yes chr2R:15989683-15991286 lnc-FAM92B-6:1 Yes chr2R:15989683-15991286 lnc-KIAA0513-5:1 No - lnc-KIAA0513-4:1 No - lnc-KIAA0513-3:1 No - LINC02139:9 No - LINC02139:10 No - lnc-FAM92B-5:1 No - lnc-FAM92B-5:2 No - LINC00311:1 No - lnc-FAM92B-7:1 No - LINC00311:3 No - lnc-FAM92B-1:2 No - lnc-GINS2-2:3 No - lnc-COX4I1-5:1 No - lnc-C16orf74-1:2 No - lnc-COX4I1-3:1 No - lnc-C16orf74-2:1 Yes chr2R:22881322-22882690 lnc-COX4I1-2:1 Yes chr2R:22881322-22882690 lnc-COX4I1-1:1 Yes chr2R:22881322-22882690 lnc-EMC8-3:1 No - lnc-EMC8-4:1 No - LINC02132:3 No - lnc-IRF8-5:1 No - lnc-IRF8-2:2 No - lnc-IRF8-2:3 No - lnc-EMC8-7:1 No - lnc-EMC8-6:4 No - lnc-EMC8-6:1 No - lnc-MTHFSD-62:4 No - LINC02135:6 No - lnc-FOXF1-1:2 No - LINC00917:15 No - LINC00917:10 No - LINC00917:7 No - LINC00917:3 No - LINC00917:4 No - LINC00917:5 No - lnc-FOXF1-3:1 No - LINC00917:6 No - FENDRR:13 No - FENDRR:1 No - FENDRR:3 No - FENDRR:9 No - FENDRR:2 No - lnc-MTHFSD-6:1 No - lnc-C16orf95-11:1 Yes chr3R:4403076-4407182 lnc-FOXC2-1:1 No - lnc-FOXL1-4:1 No - lnc-FOXL1-5:1 No - lnc-FOXL1-2:4 No - LINC02189:16 No - LINC02189:12 No - lnc-C16orf95-4:3 No - lnc-C16orf95-2:20 No - lnc-C16orf95-2:24 No - lnc-MAP1LC3B-3:3 No - lnc-FBXO31-12:8 No - lnc-MAP1LC3B-12:1 No - lnc-C16orf95-2:19 No - lnc-MAP1LC3B-11:1 No - lnc-C16orf95-2:18 No - lnc-C16orf95-2:17 No - lnc-MAP1LC3B-1:3 No - lnc-MAP1LC3B-9:1 No - lnc-C16orf95-7:1 No - lnc-MAP1LC3B-8:1 No - lnc-C16orf95-7:2 No - lnc-FBXO31-1:3 No - lnc-MAP1LC3B-7:1 No - lnc-MAP1LC3B-7:2 No - lnc-FBXO31-1:2 No - lnc-FBXO31-1:4 No - lnc-MAP1LC3B-7:3 No - lnc-MAP1LC3B-7:4 No - lnc-FBXO31-2:1 No - lnc-JPH3-3:8 No - lnc-JPH3-3:9 No - lnc-JPH3-3:10 No - lnc-JPH3-6:1 No - lnc-JPH3-6:2 No - lnc-KLHDC4-74:1 Yes chr2L:9547720-9566750 lnc-KLHDC4-74:2 Yes chr2L:9547720-9566750 lnc-KLHDC4-3:3 No - lnc-KLHDC4-3:2 No - lnc-KLHDC4-3:1 Yes chr3L:12535426-12537315 lnc-JPH3-5:1 Yes chr3L:12535426-12537315 lnc-SLC7A5-4:3 Yes chr3L:12535426-12537315 lnc-SLC7A5-4:2 Yes chr3L:12535426-12537315 lnc-SLC7A5-4:1 Yes chr3L:12535426-12537315 lnc-KLHDC4-1:5 No - lnc-SLC7A5-7:1 Yes chr2L:13803626-13809994 lnc-SLC7A5-2:1 Yes chr2L:13803626-13809994 lnc-CA5A-6:1 Yes chr2L:13803626-13809994 lnc-BANP-7:1 No - lnc-JPH3-8:1 No - lnc-BANP-1:13 No - lnc-BANP-1:14 No - lnc-BANP-1:16 No - lnc-CA5A-2:3 No - lnc-CA5A-4:10 No - lnc-BANP-9:1 No - LINC02182:9 No - lnc-BANP-12:1 No - lnc-CYBA-4:4 No - lnc-MVD-1:2 No - lnc-MVD-1:1 No - lnc-CYBA-1:1 Yes chrX:15749166-15751737 lnc-CYBA-2:1 Yes chrX:15749166-15751737 lnc-CYBA-2:2 Yes chrX:15749166-15751737 lnc-MVD-3:2 Yes chrX:15749166-15751737 lnc-MVD-3:1 Yes chrX:15749166-15751737 lnc-MVD-3:3 Yes chrX:15749166-15751737 SNAI3-AS1:4 No - SNAI3-AS1:5 No - SNAI3-AS1:7 No - SNAI3-AS1:9 No - SNAI3-AS1:10 No - SNAI3-AS1:11 No - SNAI3-AS1:13 No - lnc-SNAI3-1:1 No - lnc-PIEZO1-1:1 No - lnc-PIEZO1-1:2 No - lnc-RNF166-1:1 Yes chr2L:19491647-19493253 lnc-RNF166-2:1 Yes chr3R:2554162-3263582 lnc-RNF166-3:1 Yes chr3R:2554162-3263582 lnc-RNF166-4:1 Yes chr3R:2554162-3263582 lnc-RNF166-5:1 Yes chr3R:2554162-3263582 lnc-CTU2-5:3 Yes chr3R:2554162-3263582 lnc-GALNS-1:4 Yes chr3L:1883795-1885019 lnc-GALNS-1:1 Yes chr3L:1883795-1885019 lnc-GALNS-1:3 Yes chr3L:1883795-1885019 lnc-GALNS-1:2 Yes chr3L:1883795-1885019 lnc-APRT-1:1 No - lnc-APRT-3:1 No - lnc-PABPN1L-2:1 No - lnc-CDT1-1:1 Yes chr2R:11278893-11279683 lnc-TRAPPC2L-3:1 No - lnc-CBFA2T3-1:7 No - LINC00304:1 No - lnc-SLC22A31-8:1 No - lnc-SLC22A31-8:2 No - lnc-SLC22A31-8:3 No - lnc-SLC22A31-8:4 No - LINC00304:2 No - lnc-SLC22A31-6:9 No - lnc-SLC22A31-6:10 No - lnc-SLC22A31-6:6 No - lnc-SLC22A31-6:1 No - lnc-SLC22A31-6:2 No - lnc-SLC22A31-6:4 No - lnc-CDH15-1:2 No - lnc-SLC22A31-4:1 No - lnc-CDH15-2:2 No - lnc-CDH15-2:3 No - lnc-ZNF778-3:1 No - lnc-ANKRD11-7:1 No - lnc-SLC22A31-7:8 Yes chr3L:12750119-12753402 lnc-SLC22A31-7:3 Yes chr3L:12750119-12753402 lnc-ZNF778-1:4 Yes chr3L:12750119-12753402 lnc-SLC22A31-7:5 Yes chr3L:12750119-12753402 lnc-SLC22A31-7:7 Yes chr3L:12750119-12753402 lnc-SLC22A31-7:4 Yes chr3L:12750119-12753402 lnc-SLC22A31-7:6 Yes chr3L:12750119-12753402 lnc-SLC22A31-7:2 Yes chr3L:12750119-12753402 lnc-SLC22A31-7:1 Yes chr3L:12750119-12753402 lnc-SPG7-3:1 Yes chr3L:12750119-12753402 lnc-RPL13-1:6 Yes chrX:2694392-2698211 lnc-RPL13-4:1 No - lnc-CHMP1A-3:1 No - lnc-RPL13-4:2 No - lnc-RPL13-4:3 No - lnc-RPL13-4:4 No - lnc-SPATA2L-3:1 No - lnc-SPATA2L-2:1 No - lnc-CDK10-1:3 No - LINC02166:5 Yes chr2R:10067217-10068702 LINC02166:7 Yes chr2R:10067217-10068702 lnc-VPS9D1-1:2 No - lnc-VPS9D1-1:1 No - lnc-VPS9D1-2:1 No - lnc-VPS9D1-3:2 No - lnc-VPS9D1-3:1 No - lnc-VPS9D1-4:1 No - lnc-SPIRE2-1:3 Yes chr2L:20311219-20348386 lnc-FANCA-1:1 Yes chr2L:20311219-20348386 lnc-CENPBD1-3:8 No - lnc-CENPBD1-3:9 Yes chr3L:6530729-6532429 lnc-DEF8-2:4 No - lnc-DEF8-2:5 No - lnc-DEF8-2:6 No - lnc-DEF8-2:7 No - lnc-DEF8-2:8 No - lnc-DEF8-2:9 No - lnc-DEF8-2:10 No - lnc-DEF8-2:11 No - lnc-DEF8-2:12 No - lnc-DEF8-2:13 No - lnc-DEF8-2:14 No - lnc-DEF8-2:15 No - lnc-DEF8-2:16 No - lnc-DEF8-2:17 No - lnc-DEF8-2:18 No - lnc-DBNDD1-1:1 No - lnc-CENPBD1-2:11 No - lnc-CENPBD1-2:10 No - lnc-DBNDD1-2:2 No - lnc-DBNDD1-2:1 Yes chrX:3491011-3504851 lnc-DEF8-3:1 Yes chrX:3491011-3504851 lnc-PRDM7-3:1 No - lnc-PRDM7-1:2 No - FAM157C:12 No - FAM157C:13 No - lnc-GAS8-4:1 No - lnc-GAS8-1:7 No - lnc-GAS8-1:8 No - lnc-GAS8-5:1 No - lnc-GAS8-1:9 No - lnc-RPH3AL-100:1 Yes chrX:10749077-10757666 lnc-DOC2B-2:5 No - lnc-DOC2B-2:4 No - lnc-DOC2B-2:3 No - lnc-DOC2B-2:1 No - lnc-DOC2B-2:2 No - lnc-SCGB1C2-11:1 No - lnc-DOC2B-3:3 No - lnc-DOC2B-3:2 No - lnc-C17orf97-10:1 No - lnc-RFLNB-4:1 No - lnc-RFLNB-4:2 No - lnc-RFLNB-4:3 No - lnc-RFLNB-4:4 No - lnc-C17orf97-4:4 No - lnc-C17orf97-3:5 No - lnc-C17orf97-3:6 No - lnc-C17orf97-3:7 No - lnc-DOC2B-3:1 No - lnc-RFLNB-2:1 No - lnc-C17orf97-1:2 No - lnc-RPH3AL-1:7 No - lnc-RPH3AL-2:1 No - lnc-C17orf97-5:4 Yes chr2L:4382925-4386062 lnc-C17orf97-5:5 Yes chr2L:4382925-4386062 lnc-C17orf97-5:6 Yes chr2L:4382925-4386062 lnc-RFLNB-3:1 Yes chr2L:4382925-4386062 lnc-RFLNB-5:1 Yes chr2L:4382925-4386062 lnc-RFLNB-6:1 Yes chr2L:4382925-4386062 lnc-RFLNB-7:1 Yes chr2L:4382925-4386062 lnc-FAM57A-6:1 Yes chr2L:4382925-4386062 lnc-GEMIN4-6:1 Yes chr2L:4382925-4386062 lnc-GEMIN4-5:2 Yes chr2L:4382925-4386062 lnc-GEMIN4-5:1 Yes chr2L:4382925-4386062 lnc-GEMIN4-4:1 Yes chr2L:4382925-4386062 lnc-GEMIN4-3:1 Yes chr2L:4382925-4386062 lnc-FAM57A-5:1 Yes chr2L:4382925-4386062 lnc-FAM57A-5:2 Yes chr2L:4382925-4386062 lnc-VPS53-2:1 No - lnc-MRM3-1:1 Yes chrX:10368052-10383580 lnc-FAM57A-4:1 No - lnc-FAM57A-4:2 No - lnc-FAM57A-4:3 No - lnc-FAM57A-4:4 No - lnc-GLOD4-2:1 Yes chrX:21026125-21028361 lnc-GLOD4-2:2 Yes chrX:21026125-21028361 lnc-NXN-2:2 No - lnc-NXN-2:1 No - lnc-GLOD4-3:1 Yes chr3L:19589072-19590524 lnc-MRM3-2:1 No - lnc-ABR-6:4 No - lnc-ABR-6:3 No - lnc-ABR-6:1 No - lnc-ABR-6:2 No - lnc-TIMM22-3:1 No - lnc-NXN-1:1 No - lnc-TIMM22-2:1 No - lnc-NXN-3:1 Yes chrX:127449-140340 lnc-NXN-3:2 Yes chrX:127449-140340 lnc-NXN-4:1 Yes chrX:127449-140340 lnc-ABR-5:1 Yes chrX:127449-140340 lnc-ABR-5:4 Yes chrX:127449-140340 lnc-NXN-5:1 Yes chrX:127449-140340 lnc-NXN-6:2 Yes chrX:127449-140340 lnc-NXN-6:4 Yes chrX:127449-140340 lnc-NXN-6:1 Yes chrX:127449-140340 lnc-NXN-6:3 Yes chrX:127449-140340 lnc-BHLHA9-3:1 Yes chrX:127449-140340 lnc-ABR-2:1 Yes chrX:127449-140340 lnc-ABR-3:2 No - lnc-ABR-3:1 No - lnc-ABR-5:3 No - lnc-ABR-5:2 No - lnc-ABR-4:1 No - lnc-BHLHA9-2:1 No - lnc-YWHAE-1:1 No - lnc-TUSC5-3:1 No - lnc-CRK-3:2 Yes chr3R:18242531-18250550 lnc-CRK-3:4 Yes chr3R:18242531-18250550 lnc-CRK-3:3 Yes chr3R:18242531-18250550 lnc-TUSC5-4:1 No - lnc-CRK-1:1 No - lnc-CRK-2:1 Yes chr3L:1318480-1329617 lnc-CRK-4:1 Yes chr3L:1318480-1329617 lnc-INPP5K-1:1 Yes chr3L:1318480-1329617 lnc-INPP5K-1:2 Yes chr3L:1318480-1329617 lnc-MYO1C-1:1 Yes chr2R:17005451-17007501 lnc-MYO1C-2:1 Yes chr2R:17005451-17007501 lnc-MYO1C-2:2 Yes chr2R:17005451-17007501 PITPNA-AS1:3 Yes chr3R:19215434-19226651 lnc-INPP5K-3:1 Yes chr3R:19215434-19226651 lnc-PITPNA-2:2 No - lnc-PITPNA-2:1 No - lnc-SCARF1-2:1 No - lnc-SCARF1-1:1 No - lnc-RILP-3:1 Yes chr2L:13957539-13963381 lnc-RILP-1:4 Yes chr2L:13957539-13963381 lnc-RILP-1:3 Yes chr2L:13957539-13963381 lnc-RILP-2:1 Yes chr2R:12154258-12162998 lnc-TLCD2-3:1 Yes chr2R:12154258-12162998 MIR22HG:3 No - MIR22HG:4 No - MIR22HG:5 No - MIR22HG:6 No - MIR22HG:26 No - MIR22HG:16 No - lnc-TLCD2-4:1 Yes chr2R:9581761-9584545 lnc-TLCD2-5:1 No - lnc-SERPINF1-1:1 Yes chr3R:8262120-8264451 lnc-DPH1-5:2 Yes chr2L:13212335-13215350 lnc-SMG6-8:2 Yes chr2L:13212335-13215350 lnc-DPH1-5:4 Yes chr2L:13212335-13215350 lnc-DPH1-5:5 Yes chr2L:13212335-13215350 lnc-SMG6-8:1 Yes chr2L:13212335-13215350 lnc-SMG6-4:3 Yes chr2L:13212335-13215350 lnc-SMG6-4:2 Yes chr2L:13212335-13215350 lnc-SMG6-6:1 No - lnc-DPH1-2:6 No - lnc-SMG6-5:1 No - lnc-RTN4RL1-1:1 Yes chr3R:25029429-25033465 lnc-SRR-6:1 Yes chr3R:25029429-25033465 lnc-SRR-1:2 Yes chr3R:25029429-25033465 lnc-TSR1-2:1 Yes chr3R:25029429-25033465 lnc-SMG6-7:2 Yes chr3L:21335215-21338232 lnc-MNT-2:1 Yes chrX:20433950-20445599 lnc-METTL16-3:3 Yes chrX:3671801-3701672 lnc-METTL16-3:2 Yes chrX:3671801-3701672 lnc-METTL16-1:5 Yes chr2R:15147860-15149709 lnc-METTL16-1:2 Yes chr2R:15147860-15149709 lnc-METTL16-8:1 Yes chr2R:15147860-15149709 lnc-MNT-4:1 Yes chr2R:15147860-15149709 lnc-PAFAH1B1-3:5 No - lnc-PAFAH1B1-7:1 No - lnc-PAFAH1B1-6:1 No - lnc-PAFAH1B1-5:1 No - lnc-METTL16-9:1 No - lnc-METTL16-10:1 No - lnc-PAFAH1B1-3:3 No - lnc-METTL16-4:1 No - lnc-RAP1GAP2-4:1 Yes chr2R:16178826-16185103 lnc-RAP1GAP2-5:3 Yes chr2R:16178826-16185103 lnc-METTL16-5:1 Yes chr2R:16186584-16194277 lnc-METTL16-6:1 Yes chr2R:16186584-16194277 lnc-PAFAH1B1-2:3 Yes chr2R:16186584-16194277 lnc-PAFAH1B1-2:4 Yes chr2R:16186584-16194277 lnc-CLUH-3:2 No - lnc-RAP1GAP2-2:1 No - lnc-CLUH-4:1 Yes chr2L:7497805-7578980 lnc-OR1D5-1:2 Yes chr2L:7497805-7578980 lnc-OR1A2-1:1 Yes chr2L:7497805-7578980 lnc-OR1D5-2:1 Yes chr2L:7497805-7578980 lnc-OR1A2-1:2 Yes chr2L:7497805-7578980 lnc-OR1A1-2:1 No - lnc-SPATA22-1:1 Yes chr3L:14186249-14189648 lnc-TRPV1-2:1 Yes chr3L:14186249-14189648 lnc-TRPV1-3:1 No - lnc-TAX1BP3-1:4 Yes chr3R:23054410-23058958 lnc-TAX1BP3-1:3 Yes chr3R:23054410-23058958 lnc-TAX1BP3-1:2 Yes chr3R:23054410-23058958 lnc-P2RX5-2:3 No - lnc-P2RX5-1:2 No - lnc-P2RX5-3:1 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-NCBP3-4:1 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-ITGAE-2:1 No - lnc-CAMKK1-1:1 No - lnc-P2RX1-1:1 Yes chr2R:23925077-23935884 lnc-P2RX1-2:1 Yes chr2R:23925077-23935884 lnc-ANKFY1-3:1 No - lnc-SPNS3-1:4 Yes chrX:9192669-9193620 lnc-SPNS3-1:5 Yes chrX:9192669-9193620 lnc-SPNS3-1:6 Yes chrX:9192669-9193620 lnc-SPNS3-1:9 Yes chrX:9192669-9193620 lnc-ANKFY1-2:1 Yes chrX:9192669-9193620 lnc-ZZEF1-1:4 No - lnc-ZZEF1-3:1 No - lnc-ZZEF1-4:1 No - lnc-ZZEF1-2:1 No - lnc-CYB5D2-2:2 Yes chr3R:13717454-13718176 lnc-ANKFY1-4:1 Yes chr3R:13717454-13718176 lnc-MYBBP1A-1:3 Yes chr2R:16124981-16138238 lnc-MYBBP1A-1:2 No - lnc-GGT6-2:2 No - lnc-GGT6-2:1 No - lnc-GGT6-1:1 No - lnc-SMTNL2-3:1 No - lnc-ALOX15-1:1 No - lnc-CXCL16-3:3 No - lnc-CXCL16-3:1 No - lnc-CXCL16-3:2 No - lnc-PELP1-2:1 No - lnc-CXCL16-2:1 No - lnc-ARRB2-3:1 No - lnc-CXCL16-1:2 Yes chr3L:18745856-18746623 lnc-VMO1-1:2 Yes chr2R:21290914-21292181 lnc-VMO1-2:2 No - lnc-C17orf107-3:1 Yes chr3L:2554847-2586540 lnc-C17orf107-2:1 Yes chr3L:2554847-2586540 lnc-CHRNE-3:2 No - lnc-CHRNE-3:1 No - lnc-CHRNE-3:4 No - lnc-CHRNE-3:3 No - lnc-PFN1-1:1 Yes chr3L:4687587-4688774 lnc-GP1BA-1:1 No - lnc-CAMTA2-2:2 Yes chr2L:20645822-20647381 lnc-CAMTA2-2:1 Yes chr2L:20645822-20647381 lnc-CAMTA2-1:1 Yes chr2L:20645822-20647381 lnc-SPAG7-1:1 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-SPAG7-2:2 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-SPAG7-2:1 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-INCA1-1:1 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-INCA1-1:2 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-ZFP3-3:1 Yes chr2R:16751503-16772671 lnc-KIF1C-3:1 No - lnc-ZFP3-1:1 No - lnc-ZFP3-4:1 No - lnc-SLC52A1-3:2 No - lnc-SLC52A1-3:1 No - lnc-ZNF232-1:1 Yes chr3L:19871139-19881783 lnc-USP6-2:10 No - lnc-USP6-2:12 No - lnc-SCIMP-1:7 No - lnc-SCIMP-1:6 No - lnc-SCIMP-1:11 No - lnc-SCIMP-1:10 No - lnc-RABEP1-4:1 No - lnc-SCIMP-1:9 No - lnc-SCIMP-1:8 No - lnc-SCIMP-1:12 No - lnc-RABEP1-3:1 No - lnc-RABEP1-2:1 No - lnc-RABEP1-1:1 No - lnc-NUP88-2:3 No - lnc-NUP88-2:2 No - lnc-NUP88-2:1 Yes chr3R:12676487-12679052 lnc-C1QBP-3:1 Yes chr3R:12676487-12679052 lnc-C1QBP-2:1 Yes chr3R:12676487-12679052 lnc-DHX33-2:1 Yes chr2R:17671309-17672640 lnc-DHX33-2:2 Yes chr2R:17671309-17672640 lnc-DHX33-1:1 Yes chr3R:16482694-16484223 lnc-DHX33-3:1 Yes chr3R:16482694-16484223 lnc-DERL2-4:2 Yes chr3R:16482694-16484223 lnc-DERL2-4:3 Yes chr3R:16482694-16484223 lnc-DERL2-4:1 No - lnc-RPAIN-2:2 No - lnc-DERL2-1:2 No - lnc-DERL2-1:1 No - lnc-NLRP1-2:1 No - lnc-MIS12-5:1 No - lnc-WSCD1-1:3 Yes chrX:15380371-15385441 lnc-WSCD1-2:1 No - lnc-AIPL1-6:1 Yes chrX:15380371-15385441 lnc-AIPL1-2:6 No - lnc-AIPL1-2:5 No - lnc-AIPL1-2:4 No - lnc-WSCD1-3:1 No - lnc-AIPL1-5:2 No - lnc-AIPL1-5:1 No - lnc-AIPL1-1:2 No - lnc-AIPL1-1:3 No - lnc-AIPL1-3:1 No - lnc-PIMREG-1:1 Yes chrX:11869170-11871168 lnc-MED31-2:1 No - lnc-KIAA0753-1:1 Yes chr3R:4641963-4643292 lnc-TXNDC17-1:2 No - lnc-TXNDC17-1:3 No - lnc-TXNDC17-1:4 No - lnc-TXNDC17-1:5 No - lnc-MED31-3:1 No - lnc-SLC13A5-1:1 No - lnc-XAF1-2:1 No - lnc-TEKT1-2:1 No - lnc-ALOX12-1:2 No - lnc-ALOX12-1:3 No - lnc-ALOX12-1:5 No - lnc-ALOX12-1:6 No - lnc-ALOX12-1:7 No - lnc-ALOX12-1:8 No - lnc-TEKT1-3:1 No - lnc-ALOX12-1:9 No - lnc-ALOX12-1:10 No - lnc-ALOX12-1:11 No - lnc-ALOX12-1:12 No - lnc-ALOX12-2:1 No - lnc-TEKT1-6:1 No - lnc-SLC16A11-4:1 No - lnc-SLC16A11-3:1 No - lnc-SLC16A11-7:10 No - lnc-SLC16A11-7:11 No - lnc-SLC16A11-7:8 No - lnc-SLC16A11-7:3 No - lnc-SLC16A11-2:1 No - lnc-SLC16A13-2:1 No - lnc-CLEC10A-1:1 No - lnc-ASGR2-1:1 No - lnc-ACADVL-1:1 No - lnc-DLG4-2:1 No - lnc-DLG4-1:1 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-PHF23-1:1 Yes chrX:11355881-11358724 lnc-GABARAP-2:1 No - lnc-GABARAP-1:2 No - lnc-CTDNEP1-3:1 No - lnc-ELP5-1:2 No - lnc-GPS2-3:1 Yes chr3L:12121274-12125150 lnc-GPS2-3:2 Yes chr3L:12121274-12125150 lnc-NEURL4-1:10 No - lnc-NEURL4-1:8 No - lnc-NEURL4-1:9 No - lnc-ACAP1-1:1 No - lnc-NEURL4-4:1 No - lnc-PLSCR3-1:5 No - lnc-NLGN2-1:3 Yes chr3R:7570281-7639434 lnc-SLC35G6-1:1 Yes chr3R:10794058-10803955 lnc-SOX15-4:1 No - lnc-SOX15-1:6 Yes chr2L:21573389-21577103 lnc-SOX15-1:5 No - lnc-SOX15-2:1 No - lnc-SOX15-3:1 Yes chr3R:10101420-10110121 lnc-SAT2-2:7 Yes chr3L:7650548-7759123 lnc-SAT2-2:10 Yes chr3L:7650548-7759123 lnc-SAT2-2:8 Yes chr3L:7650548-7759123 lnc-SAT2-2:6 Yes chr3L:7650548-7759123 lnc-SAT2-2:5 Yes chr3L:7650548-7759123 lnc-SAT2-2:1 Yes chr3L:7650548-7759123 lnc-SAT2-2:3 Yes chr3L:7650548-7759123 lnc-SAT2-2:2 Yes chr3L:7650548-7759123 lnc-SAT2-2:4 Yes chr3L:7650548-7759123 lnc-ATP1B2-2:1 Yes chr2L:6789770-6798862 lnc-SAT2-3:2 No - lnc-SAT2-3:1 No - lnc-EFNB3-1:1 Yes chr2L:6125879-6127775 lnc-EFNB3-2:1 No - lnc-EFNB3-2:3 No - lnc-KDM6B-1:1 No - lnc-KDM6B-1:2 No - lnc-KDM6B-1:3 No - lnc-NAA38-2:1 No - lnc-NAA38-2:2 Yes chr2L:2878344-2879001 lnc-TRAPPC1-3:2 Yes chrX:10233347-10263485 lnc-TRAPPC1-3:1 No - lnc-TRAPPC1-2:1 No - lnc-CNTROB-1:1 No - lnc-ALOX12B-3:1 Yes chr3R:4491943-4558067 lnc-ALOX15B-1:1 No - lnc-HES7-1:1 No - lnc-VAMP2-4:1 Yes chrX:2685580-2692780 lnc-VAMP2-3:1 Yes chrX:2685580-2692780 lnc-VAMP2-3:2 Yes chrX:2685580-2692780 lnc-VAMP2-2:2 Yes chrX:2685580-2692780 lnc-VAMP2-2:1 Yes chrX:2685580-2692780 lnc-VAMP2-1:2 No - lnc-VAMP2-5:1 No - lnc-VAMP2-5:2 No - lnc-VAMP2-5:3 No - lnc-PFAS-1:3 No - lnc-AURKB-1:1 No - lnc-BORCS6-1:1 No - lnc-AURKB-3:4 No - LINC00324:2 No - lnc-CTC1-2:8 No - lnc-AURKB-2:1 No - lnc-AURKB-5:3 No - lnc-AURKB-5:2 No - lnc-AURKB-5:1 No - lnc-AURKB-4:1 No - lnc-AURKB-4:2 No - lnc-PFAS-2:1 No - lnc-CTC1-4:1 Yes chr2R:14166982-14168233 lnc-ARHGEF15-1:3 No - lnc-SLC25A35-2:1 No - lnc-SLC25A35-1:2 Yes chr3L:16970013-16994388 lnc-ODF4-2:5 No - lnc-KRBA2-1:3 No - lnc-KRBA2-1:2 No - lnc-KRBA2-1:1 No - lnc-ODF4-4:3 Yes chr3L:9898703-9903031 lnc-RNF222-1:1 Yes chr2R:24990570-25011965 lnc-RNF222-2:1 Yes chr2R:24990570-25011965 lnc-RNF222-3:1 Yes chr2R:24990570-25011965 lnc-RNF222-4:1 Yes chr2R:24990570-25011965 lnc-NDEL1-8:1 Yes chr2R:24990570-25011965 lnc-NDEL1-6:1 Yes chr2R:24990570-25011965 lnc-NDEL1-1:2 No - lnc-PIK3R6-1:4 No - lnc-PIK3R6-1:6 No - lnc-PIK3R6-1:3 No - lnc-PIK3R6-1:5 No - lnc-PIK3R6-2:1 No - lnc-NTN1-2:2 No - lnc-NTN1-5:1 No - lnc-STX8-3:3 Yes chrX:14604012-14653928 lnc-STX8-4:2 Yes chrX:14604012-14653928 lnc-STX8-4:1 Yes chrX:14604012-14653928 lnc-DHRS7C-3:2 Yes chr3L:16586108-16587057 lnc-DHRS7C-3:3 Yes chr3L:16586108-16587057 lnc-DHRS7C-3:1 Yes chr3L:16586108-16587057 lnc-DHRS7C-2:3 Yes chr3L:16586108-16587057 lnc-DHRS7C-2:2 Yes chr3L:16586108-16587057 lnc-DHRS7C-2:1 Yes chr3L:16586108-16587057 lnc-STX8-5:1 Yes chr3L:6965260-6967897 lnc-GSG1L2-2:2 No - lnc-RCVRN-1:1 No - lnc-RCVRN-1:2 No - lnc-MYH13-3:2 No - lnc-GLP2R-5:2 No - lnc-GLP2R-4:2 No - lnc-MYH2-1:1 Yes chr2L:16766566-16788766 lnc-SCO1-4:1 Yes chr2L:16766566-16788766 lnc-TMEM220-4:1 Yes chr2L:4967832-4968935 lnc-SCO1-3:1 No - lnc-SCO1-2:1 No - lnc-SCO1-2:2 No - lnc-TMEM220-2:2 No - lnc-TMEM220-1:4 No - lnc-TMEM220-3:1 No - lnc-TMEM220-1:3 No - lnc-ADPRM-7:1 No - lnc-TMEM238L-16:5 No - lnc-TMEM238L-1:1 No - lnc-ADPRM-8:1 No - lnc-PIRT-4:1 No - lnc-ADPRM-5:9 No - lnc-SHISA6-2:1 No - lnc-SHISA6-1:2 No - lnc-ZNF18-2:3 Yes chrY:22250-137486 lnc-ZNF18-2:2 Yes chrY:22250-137486 lnc-ZNF18-3:2 No - lnc-ZNF18-3:1 Yes chr3R:8646172-8650796 lnc-DNAH9-3:1 Yes chr3R:8646172-8650796 lnc-DNAH9-4:1 Yes chr3R:8646172-8650796 lnc-MAP2K4-2:1 No - lnc-MYOCD-3:1 No - lnc-ELAC2-3:3 No - lnc-ARHGAP44-2:1 Yes chr3L:2717615-2766536 lnc-ELAC2-6:1 Yes chr3R:19905164-19914272 lnc-ELAC2-5:1 Yes chr3R:19905164-19914272 lnc-HS3ST3A1-8:1 Yes chr2R:10307030-10309794 lnc-ELAC2-7:1 No - lnc-COX10-6:4 No - lnc-HS3ST3A1-5:2 No - COX10-AS1:1 No - lnc-HS3ST3A1-6:1 No - lnc-HS3ST3A1-7:1 No - COX10-AS1:8 No - lnc-CDRT15-8:1 No - lnc-CDRT15-7:1 No - lnc-CDRT15-6:1 No - lnc-CDRT15-5:1 No - lnc-CDRT15-3:2 No - lnc-COX10-10:1 No - lnc-COX10-10:2 No - lnc-COX10-2:3 No - COX10-AS1:7 No - COX10-AS1:6 No - COX10-AS1:3 No - lnc-COX10-8:1 No - lnc-COX10-7:1 No - lnc-HS3ST3B1-10:1 Yes chr2L:10331471-10333129 lnc-COX10-1:5 No - lnc-COX10-3:2 Yes chrX:19248639-19252045 lnc-HS3ST3B1-5:1 Yes chrX:19248639-19252045 lnc-HS3ST3B1-1:3 No - lnc-HS3ST3B1-7:1 No - lnc-HS3ST3B1-8:1 No - lnc-HS3ST3B1-9:1 No - lnc-HS3ST3B1-9:2 No - lnc-HS3ST3B1-11:1 No - lnc-HS3ST3B1-12:1 No - lnc-HS3ST3B1-2:2 No - lnc-PMP22-7:1 No - lnc-HS3ST3B1-13:1 No - LINC02096:5 No - lnc-PMP22-6:1 No - CDRT8:2 No - lnc-ZNF286A-13:1 No - lnc-PMP22-5:1 No - lnc-PMP22-4:2 No - lnc-TEKT3-4:4 No - lnc-TEKT3-4:3 No - lnc-TEKT3-2:1 Yes chrX:21605884-21608920 lnc-ZNF286A-12:1 No - lnc-CDRT4-1:3 No - lnc-CDRT4-3:1 No - lnc-CDRT4-2:1 No - lnc-CDRT4-2:3 No - lnc-CDRT4-2:2 No - lnc-ZNF286A-11:1 No - lnc-ZNF286A-10:1 No - lnc-ZNF286A-9:1 No - lnc-CDRT1-1:1 No - lnc-TRIM16-1:11 No - lnc-TRIM16-1:12 No - lnc-TRIM16-1:10 No - lnc-TRIM16-1:14 No - lnc-TRIM16-1:13 No - lnc-TRIM16-1:6 No - lnc-TRIM16-1:7 No - lnc-TRIM16-1:9 No - lnc-TRIM16-1:8 No - lnc-TRIM16-1:5 No - lnc-ZNF286A-7:8 No - lnc-ZNF286A-7:10 No - lnc-ZNF286A-7:11 No - lnc-TRIM16-2:2 No - lnc-TRIM16-6:2 Yes chr2R:13984815-13990707 lnc-TRIM16-2:4 Yes chr2R:13984815-13990707 lnc-TBC1D26-1:2 No - lnc-TRIM16-7:1 No - lnc-TBC1D26-1:3 No - lnc-TBC1D26-1:4 No - lnc-TBC1D26-1:5 No - lnc-TBC1D26-3:1 No - lnc-ZSWIM7-2:2 No - lnc-ZSWIM7-2:5 No - lnc-ZSWIM7-2:1 No - lnc-ZSWIM7-2:3 No - lnc-ZSWIM7-2:4 No - lnc-ZSWIM7-3:1 No - lnc-ZSWIM7-4:1 No - lnc-ADORA2B-2:1 No - lnc-ZSWIM7-1:2 Yes chrX:12684203-12742618 lnc-ZSWIM7-5:1 Yes chrX:12684203-12742618 lnc-ZSWIM7-6:1 Yes chrX:12684203-12742618 lnc-TTC19-1:1 Yes chrX:12684203-12742618 lnc-CENPV-4:1 Yes chrX:12684203-12742618 lnc-CENPV-4:3 Yes chrX:12684203-12742618 lnc-PIGL-2:1 Yes chrX:12684203-12742618 lnc-CENPV-4:2 Yes chrX:12684203-12742618 lnc-UBB-1:4 No - lnc-CENPV-3:1 No - lnc-UBB-3:1 No - LRRC75A-AS1:6 No - LRRC75A-AS1:7 No - LRRC75A-AS1:8 No - LRRC75A-AS1:9 No - LRRC75A-AS1:10 No - LRRC75A-AS1:11 No - LRRC75A-AS1:12 No - LRRC75A-AS1:13 No - LRRC75A-AS1:14 No - LRRC75A-AS1:15 No - LRRC75A-AS1:16 No - LRRC75A-AS1:17 No - LRRC75A-AS1:18 No - LRRC75A-AS1:19 No - LRRC75A-AS1:20 No - LRRC75A-AS1:21 No - LRRC75A-AS1:22 No - LRRC75A-AS1:23 No - LRRC75A-AS1:24 No - LRRC75A-AS1:25 No - LRRC75A-AS1:26 No - LRRC75A-AS1:27 No - LRRC75A-AS1:28 No - LRRC75A-AS1:29 No - LRRC75A-AS1:30 No - LRRC75A-AS1:31 No - LRRC75A-AS1:32 No - LRRC75A-AS1:33 No - LRRC75A-AS1:34 No - LRRC75A-AS1:35 No - LRRC75A-AS1:36 No - LRRC75A-AS1:37 No - LRRC75A-AS1:38 No - lnc-LRRC75A-4:1 No - lnc-TRPV2-4:1 No - lnc-TRPV2-5:1 No - lnc-LRRC75A-5:1 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF624-3:1 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF624-3:2 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF287-2:1 No - lnc-ZNF624-2:1 No - lnc-TRPV2-7:1 No - lnc-ZNF624-4:2 No - lnc-ZNF624-4:1 No - lnc-CCDC144A-1:2 No - lnc-CCDC144A-1:3 No - lnc-CCDC144A-1:5 No - lnc-ZNF624-5:1 No - lnc-CCDC144A-1:6 No - lnc-CCDC144A-1:7 No - lnc-CCDC144A-3:2 No - lnc-CCDC144A-3:3 No - lnc-CCDC144A-1:8 No - lnc-CCDC144A-1:9 No - lnc-CCDC144A-1:10 No - lnc-CCDC144A-1:11 No - lnc-CCDC144A-1:12 No - lnc-TNFRSF13B-4:2 No - lnc-TNFRSF13B-10:1 No - lnc-CCDC144A-4:1 No - lnc-TNFRSF13B-8:1 No - lnc-TNFRSF13B-9:1 No - lnc-TNFRSF13B-9:4 No - lnc-TNFRSF13B-9:2 No - lnc-TNFRSF13B-9:3 No - lnc-TNFRSF13B-7:1 No - lnc-TNFRSF13B-6:1 No - lnc-TNFRSF13B-5:2 No - lnc-TNFRSF13B-5:5 No - lnc-TNFRSF13B-5:4 No - lnc-TNFRSF13B-5:3 No - lnc-TNFRSF13B-5:1 No - lnc-PLD6-6:1 No - LINC02090:3 No - lnc-MPRIP-1:2 No - lnc-NT5M-2:2 Yes chr2L:14599196-14689340 lnc-NT5M-6:1 Yes chr2L:14599196-14689340 lnc-NT5M-1:4 Yes chr2L:14599196-14689340 lnc-PLD6-2:1 No - lnc-FLCN-1:1 No - lnc-FLCN-1:3 No - lnc-FLCN-1:2 No - lnc-FLCN-2:1 Yes chr3L:20839096-20841576 lnc-FLCN-3:2 Yes chr3L:20839096-20841576 lnc-FLCN-3:1 Yes chr3L:20839096-20841576 lnc-FLCN-4:1 Yes chr3L:20839096-20841576 lnc-RASD1-1:1 No - lnc-MED9-2:1 No - lnc-PEMT-2:2 No - lnc-PEMT-2:1 No - lnc-RASD1-4:1 No - lnc-RASD1-2:1 No - lnc-RASD1-3:1 No - lnc-MED9-4:1 Yes chr2R:18094940-18101031 lnc-TOM1L2-7:1 No - lnc-TOM1L2-7:2 No - lnc-TOM1L2-4:1 Yes chr3L:19793935-19798979 lnc-TOM1L2-3:1 Yes chr3L:19793935-19798979 lnc-TOM1L2-2:1 Yes chr3L:19793935-19798979 lnc-SREBF1-1:1 Yes chr3L:9446864-9450785 lnc-RAI1-2:1 Yes chr3L:9446864-9450785 lnc-GID4-2:1 Yes chr2L:9922737-9924865 lnc-TOM1L2-1:1 No - lnc-TOM1L2-8:1 No - lnc-TOM1L2-5:1 Yes chr2L:21261168-21262411 lnc-TOM1L2-5:2 Yes chr2L:21261168-21262411 lnc-TOM1L2-6:2 Yes chr2L:21261168-21262411 lnc-TOM1L2-6:1 Yes chr2L:21261168-21262411 lnc-DRG2-1:1 No - lnc-ATPAF2-2:3 No - lnc-ATPAF2-2:5 No - lnc-ATPAF2-2:2 No - lnc-ATPAF2-2:4 No - lnc-ATPAF2-2:1 No - lnc-ATPAF2-2:6 No - lnc-TOP3A-4:1 Yes chrX:21339741-21345088 lnc-TOP3A-3:1 Yes chrX:21339741-21345088 lnc-MIEF2-2:1 Yes chr2L:19498168-19502268 lnc-FLII-2:1 Yes chr2L:19498168-19502268 lnc-SHMT1-3:1 Yes chr2L:19498168-19502268 lnc-SMCR8-2:1 Yes chr2L:19498168-19502268 lnc-SMCR8-1:1 No - lnc-SMCR8-1:2 No - lnc-TOP3A-2:1 Yes chrX:5913067-5916797 lnc-TOP3A-5:1 Yes chrX:5913067-5916797 lnc-SHMT1-1:2 No - lnc-SMCR8-3:1 No - lnc-EVPLL-1:1 No - lnc-EVPLL-3:6 No - lnc-LGALS9C-4:1 No - lnc-LGALS9C-7:1 No - lnc-TBC1D28-7:21 No - lnc-TBC1D28-7:20 No - lnc-TBC1D28-7:15 No - lnc-TBC1D28-7:19 No - lnc-LGALS9C-1:1 No - lnc-TBC1D28-7:7 No - lnc-LGALS9C-2:1 No - lnc-LGALS9C-2:2 No - lnc-TBC1D28-3:1 No - lnc-TBC1D28-2:2 No - lnc-ZNF286B-3:1 Yes chr2R:13984815-13990707 lnc-TBC1D28-5:1 No - lnc-ZNF286B-1:3 Yes chr2R:13984815-13990707 lnc-ZNF286B-1:2 Yes chr2R:13984815-13990707 lnc-ZNF286B-1:1 Yes chr2R:13984815-13990707 lnc-ZNF286B-4:2 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-ZNF286B-4:1 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-FBXW10-3:1 No - lnc-FBXW10-3:2 No - lnc-FBXW10-3:3 No - lnc-TVP23B-1:1 Yes chr3R:30592971-30601489 lnc-SLC5A10-3:2 No - lnc-GRAP-1:2 No - lnc-GRAPL-4:1 No - lnc-GRAPL-3:3 No - lnc-GRAP-3:2 No - lnc-EPN2-3:2 No - lnc-GRAP-7:2 No - lnc-EPN2-2:2 No - lnc-GRAPL-6:1 Yes chr3L:7528780-7540012 lnc-GRAPL-6:2 Yes chr3L:7528780-7540012 EPN2-IT1:1 Yes chr3L:7528780-7540012 EPN2-IT1:3 Yes chr3L:7528780-7540012 EPN2-IT1:4 Yes chr3L:7528780-7540012 EPN2-IT1:5 Yes chr3L:7528780-7540012 EPN2-IT1:6 Yes chr3L:7528780-7540012 EPN2-IT1:7 Yes chr3L:7528780-7540012 lnc-MAPK7-3:4 Yes chr3L:7528780-7540012 lnc-B9D1-1:2 Yes chr3L:7528780-7540012 lnc-MAPK7-2:1 Yes chr3R:15481906-15482904 lnc-MAPK7-1:1 Yes chr3R:15481906-15482904 lnc-MFAP4-6:2 No - lnc-MFAP4-6:1 No - lnc-B9D1-3:1 No - lnc-MFAP4-5:1 No - lnc-MFAP4-1:2 Yes chr3R:24625671-24634714 lnc-RNF112-4:1 No - lnc-MFAP4-3:4 No - lnc-MFAP4-3:8 No - lnc-MFAP4-3:5 No - lnc-MFAP4-3:11 No - lnc-MFAP4-3:10 No - lnc-SLC47A1-5:1 No - lnc-SLC47A1-5:2 No - lnc-RNF112-2:3 No - lnc-ALDH3A2-7:1 No - lnc-SLC47A1-1:1 No - lnc-SLC47A1-1:2 No - lnc-SLC47A1-1:3 No - lnc-SLC47A1-3:1 No - lnc-SLC47A1-4:1 No - lnc-SLC47A1-6:1 No - lnc-SLC47A1-7:1 No - lnc-ALDH3A2-1:2 No - lnc-ALDH3A2-3:2 No - lnc-SLC47A2-1:4 No - lnc-SLC47A2-1:5 No - lnc-SLC47A2-1:3 No - lnc-SLC47A2-1:2 No - lnc-ULK2-4:1 Yes chr2R:7466879-7477162 lnc-ALDH3A2-6:1 No - lnc-ULK2-3:1 No - lnc-ULK2-2:1 Yes chr3L:12784429-12805116 lnc-ALDH3A1-2:2 Yes chr3L:12784429-12805116 lnc-ALDH3A1-2:3 Yes chr3L:12784429-12805116 lnc-ALDH3A1-2:1 Yes chr3L:12784429-12805116 lnc-ALDH3A2-4:1 Yes chr3L:12784429-12805116 lnc-SPECC1-4:1 No - lnc-AKAP10-2:2 No - lnc-AKAP10-2:1 No - lnc-ULK2-6:1 Yes chr2L:16288290-16291195 lnc-AKAP10-1:2 Yes chrX:585081-620195 lnc-ALDH3A2-8:1 Yes chrX:585081-620195 lnc-ALDH3A2-9:1 Yes chrX:585081-620195 lnc-SPECC1-3:1 No - lnc-LGALS9B-11:3 No - lnc-LGALS9B-11:2 No - lnc-LGALS9B-11:1 No - lnc-SPECC1-5:1 No - lnc-SPECC1-5:2 No - lnc-LGALS9B-5:1 No - lnc-SPECC1-5:4 No - lnc-SPECC1-1:3 No - lnc-SPECC1-1:4 No - lnc-CCDC144NL-9:2 Yes chr2L:76348-77783 lnc-CCDC144NL-9:1 Yes chr2L:76348-77783 lnc-LGALS9B-7:1 No - lnc-LGALS9B-8:1 No - lnc-LGALS9B-9:2 No - lnc-LGALS9B-9:1 No - lnc-LGALS9B-9:4 No - lnc-LGALS9B-9:3 No - lnc-LGALS9B-10:1 No - lnc-LGALS9B-12:1 No - lnc-CDRT15L2-3:1 No - lnc-CDRT15L2-2:1 No - lnc-LGALS9B-13:2 No - lnc-LGALS9B-13:1 No - lnc-LGALS9B-14:1 No - LINC02088:4 No - lnc-CDRT15L2-4:2 No - lnc-CCDC144NL-6:1 No - lnc-CCDC144NL-5:1 No - lnc-CDRT15L2-5:1 No - lnc-CDRT15L2-1:3 No - lnc-CCDC144NL-4:1 No - lnc-CDRT15L2-7:1 No - lnc-CDRT15L2-6:1 No - lnc-CCDC144NL-1:2 No - lnc-CDRT15L2-7:2 No - lnc-DHRS7B-9:1 No - lnc-CCDC144NL-1:1 No - lnc-CCDC144NL-2:1 No - lnc-CCDC144NL-3:1 No - CCDC144NL-AS1:13 No - CCDC144NL-AS1:23 No - CCDC144NL-AS1:27 No - lnc-NOS2-11:2 No - lnc-ATAD5-9:7 No - lnc-TEFM-10:3 No - lnc-LRRC37B-2:3 No - lnc-SLFN12L-2:2 No - lnc-STAT5B-2:2 Yes chr3R:20535323-20552311 lnc-NAGLU-6:1 Yes chr3R:29131193-29137980 lnc-LINC00854-1:36 No - lnc-DCAKD-1:3 No - lnc-DCAKD-1:2 No - lnc-PLEKHM1-3:7 No - lnc-GIP-2:2 Yes chrX:10787869-10824277 lnc-PPP1R9B-4:1 No - lnc-RGS9-15:6 No - lnc-GNA13-2:15 No - lnc-KPNA2-6:7 No - lnc-KPNA2-6:17 No - lnc-USP14-2:4 No - lnc-MYOM1-2:5 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-MPPE1-1:2 No - lnc-CIDEA-2:8 No - lnc-MC5R-1:5 No - lnc-MC5R-11:3 No - lnc-POTEC-14:2 No - lnc-POTEC-14:1 No - lnc-CTAGE1-9:21 No - lnc-CCDC178-3:2 No - SLC14A2-AS1:4 No - LINC01905:16 No - lnc-RNF152-3:12 No - lnc-TMEM259-1:2 No - lnc-SMIM24-2:4 Yes chr3L:13521907-13803400 lnc-SMIM24-2:2 No - lnc-ZNF699-3:1 No - ZNF561-AS1:11 No - lnc-ZNF136-1:10 No - lnc-PKN1-1:3 Yes chr2R:8146918-8156654 lnc-ZNF333-4:3 No - UCA1:11 No - LINC00905:12 No - lnc-ZNF100-6:2 No - LINC01224:58 No - LINC01224:37 No - LINC00662:34 No - LINC00906:10 No - LINC00906:12 No - lnc-URI1-3:1 No - LINC01837:30 No - LINC01533:13 No - lnc-CHST8-5:4 No - lnc-SCGB2B2-132:2 No - lnc-ZNF302-4:2 No - lnc-ZNF792-1:8 No - LINC00665:16 No - lnc-ZNF345-29:4 No - lnc-ZNF383-2:1 No - lnc-PSG1-1:2 No - lnc-ZNF404-1:9 No - lnc-CCDC114-1:3 No - lnc-BCAT2-2:2 Yes chrX:13396899-13401224 LINC01869:30 No - lnc-VN1R2-5:2 No - lnc-VN1R2-4:1 No - lnc-LENG9-6:1 No - lnc-LENG9-5:2 No - lnc-U2AF2-2:3 No - lnc-U2AF2-5:3 No - lnc-ZNF583-4:7 No - ZNF582-AS1:23 No - lnc-ZNF837-1:18 No - lnc-ALKAL2-2:21 No - LINC01304:18 No - LINC01304:19 No - LINC01304:8 No - lnc-CMPK2-5:13 No - MIR3681HG:14 No - lnc-MYCN-6:3 No - lnc-MEMO1-1:5 No - lnc-FAM98A-4:1 No - LINC02583:31 No - LINC02583:35 No - lnc-VRK2-11:1 No - LINC01122:8 No - lnc-PUS10-4:4 Yes chr3R:24635270-24650043 lnc-AAK1-5:4 Yes chr2L:18957732-18968744 lnc-AAK1-2:2 Yes chrX:20171445-20173514 PCBP1-AS1:198 No - lnc-C2orf81-2:2 No - lnc-RPIA-1:7 No - lnc-EIF2AK3-30:10 No - lnc-TRIM43B-7:2 Yes chr3R:22024259-22025506 lnc-KANSL3-2:3 Yes chr3R:9020348-9039471 RGPD4-AS1:3 No - lnc-BCL2L11-7:2 No - lnc-POTEI-2:12 No - lnc-GPR39-6:2 No - lnc-ACVR2A-1:2 No - lnc-LYPD6-2:20 No - lnc-ARL5A-1:2 Yes chr3L:8298501-8299839 lnc-GPD2-6:1 No - lnc-UPP2-2:3 Yes chr3R:26949692-26958491 lnc-DPP4-8:2 Yes chr2L:7223328-7249343 lnc-IFIH1-1:1 Yes chr2R:24047411-24053035 lnc-CDCA7-1:1 No - lnc-PPP1R1C-2:5 No - lnc-GTF3C3-1:2 No - lnc-FTCDNL1-4:42 No - lnc-AOX1-1:1 No - lnc-INO80D-2:18 Yes chrX:8248651-8251687 lnc-KLF7-1:16 No - lnc-PTH2R-1:8 No - lnc-SPAG16-7:2 No - lnc-DIRC3-1:1 No - lnc-CHPF-4:3 No - lnc-CCDC140-1:8 No - lnc-SPP2-1:3 No - lnc-RTP5-8:15 No - SNAP25-AS1:11 No - SNAP25-AS1:10 No - lnc-FAM182B-8:9 No - FAM182A:35 No - lnc-DEFB116-7:2 No - lnc-ADA-3:18 No - lnc-TMEM189-UBE2V1-4:12 No - lnc-POTED-17:1 No - lnc-LIPI-7:4 No - lnc-LIPI-5:1 No - lnc-RBM11-6:1 No - lnc-CBR1-9:2 Yes chrX:20538497-20567097 lnc-POTEH-1:1 No - lnc-DGCR6-2:30 No - lnc-PRODH-3:1 No - lnc-PRAME-2:1 No - lnc-IGLL1-5:3 No - lnc-IGLL1-1:52 No - lnc-IGLL1-1:27 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:47 No - lnc-SPECC1L-1:3 No - lnc-GGT1-3:2 No - TUG1:2 No - ISX-AS1:2 No - lnc-C22orf23-1:2 Yes chr3L:9857383-9859889 NDUFA6-DT:46 Yes chr2R:10897144-10897885 GHRLOS:13 No - lnc-CMC1-8:2 No - lnc-CLASP2-1:6 No - lnc-CLASP2-1:5 No - lnc-CLASP2-1:4 No - lnc-CCDC12-1:3 Yes chr3R:29996961-29997676 lnc-PTPN23-6:2 No - lnc-IQCF3-1:4 No - lnc-IQCF3-1:5 No - ST3GAL6-AS1:5 No - LINC00635:8 No - lnc-KALRN-3:4 Yes chr3L:995982-1034875 lnc-UMPS-4:2 No - H1FX-AS1:6 No - lnc-EFCAB12-2:12 No - lnc-TMCC1-10:1 Yes chr3R:17809401-17811134 lnc-AADACL2-1:8 No - AADACL2-AS1:5 No - lnc-SERPINI1-17:3 No - LINC02082:7 No - LINC01206:38 No - lnc-CPN2-4:12 No - TMEM44-AS1:11 No - lnc-ZNF732-3:3 No - lnc-WFS1-3:4 No - lnc-PAICS-3:2 No - lnc-SPINK2-1:4 No - lnc-TMPRSS11A-2:4 No - lnc-PARM1-4:2 No - lnc-HNRNPDL-1:1 No - lnc-TET2-10:1 No - lnc-METTL14-3:6 No - lnc-USP53-8:10 No - lnc-USP53-8:23 Yes chr2L:18532025-18590342 lnc-USP53-8:27 Yes chr2L:18532025-18590342 lnc-TMEM144-3:2 No - LINC02362:27 No - lnc-LPCAT1-4:27 No - lnc-LPCAT1-4:20 No - lnc-PAPD7-2:4 No - lnc-ADCY2-10:2 No - lnc-PRDM9-17:2 No - lnc-CDH6-14:2 No - lnc-CDH6-14:4 No - LINC02109:35 No - NIPBL-DT:12 No - lnc-GHR-2:1 No - lnc-NNT-2:3 No - MRPS30-DT:52 No - lnc-PARP8-4:1 No - lnc-EMB-4:5 No - lnc-AK6-6:5 No - lnc-SERF1B-1:5 No - lnc-GTF2H2-7:5 No - TMEM161B-AS1:18 Yes chr3L:11109690-11112117 TMEM161B-AS1:39 No - NR2F1-AS1:37 No - NR2F1-AS1:39 No - MIR583HG:30 No - LINC02163:7 No - lnc-FER-12:1 No - LINC01023:3 No - lnc-TMEM232-3:2 No - LINC00992:1 No - LINC01184:2 No - lnc-GLRA1-2:2 Yes chr3L:21640995-21642599 lnc-FAM153A-3:3 No - lnc-FAM193B-4:4 No - lnc-FAM153C-1:12 No - lnc-FAM50B-1:6 Yes chr3R:27919844-27921089 lnc-FAM217A-4:2 No - lnc-ECI2-2:11 No - lnc-BMP6-106:18 No - MIR548A1HG:9 No - lnc-HIST1H2BA-2:4 No - lnc-ZNF322-2:3 No - lnc-ZNF391-2:2 No - lnc-HLA-A-7:2 No - lnc-TRIM39-2:2 No - lnc-HLA-E-5:1 No - lnc-NFYA-1:13 No - lnc-NFYA-1:17 No - lnc-NFYA-1:20 No - lnc-ENPP5-2:2 Yes chrX:13812971-13822307 lnc-TFAP2B-1:1 No - lnc-PKHD1-2:2 No - LINCMD1:2 No - lnc-LMBRD1-10:1 No - LINC00472:26 No - lnc-CD109-3:2 No - lnc-PRDM13-1:7 No - lnc-CEP57L1-4:1 No - lnc-CEP57L1-4:4 No - lnc-MTFR2-2:15 No - lnc-IL20RA-4:1 Yes chr3L:8647145-8651011 lnc-REPS1-1:2 No - lnc-SHPRH-5:3 No - lnc-UNCX-3:3 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-OCM-3:10 No - lnc-RSPH10B2-1:4 No - lnc-CRHR2-3:2 No - lnc-KBTBD2-2:1 No - lnc-AOAH-3:2 Yes chr2L:12097838-12100839 lnc-IGFBP3-4:11 No - lnc-IGFBP1-14:2 No - lnc-NUPR2-8:2 No - lnc-ZNF273-1:4 No - lnc-ZNF273-1:5 No - lnc-VKORC1L1-7:1 No - lnc-VKORC1L1-7:10 No - LINC00174:18 No - lnc-SBDS-13:1 No - lnc-TRIM74-1:5 No - lnc-HIP1-1:3 No - lnc-GRM3-3:2 No - lnc-CASTOR3-3:4 No - lnc-PILRB-1:8 No - lnc-POLR2J2-32:1 No - lnc-LEP-2:2 No - lnc-FAM71F2-4:1 No - LINC-PINT:25 No - lnc-AKR1B1-4:2 No - lnc-MGAM-2:1 No - lnc-ZNF783-3:7 No - lnc-ZNF746-3:10 No - ATP6V0E2-AS1:2 No - lnc-TMEM176B-3:2 No - lnc-OR4F21-1:6 No - lnc-OR4F21-5:4 No - lnc-DEFA3-1:2 No - lnc-PRAG1-3:8 No - lnc-PINX1-84:2 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-GATA4-1:5 No - lnc-FAM86B2-5:1 No - lnc-PCM1-1:2 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-NSD3-12:2 Yes chr3L:14075772-14083229 lnc-ADAM32-1:10 No - lnc-ADAM32-1:13 No - lnc-ADAM2-6:10 No - lnc-ADAM2-6:8 No - lnc-HGSNAT-3:1 No - lnc-SOX17-4:3 No - lnc-SOX17-4:11 No - lnc-SOX17-4:12 No - lnc-CHCHD7-5:2 No - lnc-XKR9-4:1 No - lnc-ZFHX4-3:7 No - lnc-HEY1-3:2 No - lnc-TPD52-3:5 Yes chr2R:18421413-18426221 lnc-CA13-1:1 Yes chr2L:13803626-13809994 lnc-TRIQK-2:4 No - AZIN1-AS1:10 Yes chr2R:8007246-8009062 AZIN1-AS1:25 No - SAMD12-AS1:9 No - lnc-LY6E-5:1 No - lnc-DMRTA1-7:7 No - lnc-UNC13B-2:1 No - lnc-UNC13B-2:2 No - lnc-ZNF658-5:3 No - lnc-ZNF658-5:2 No - lnc-FOXD4L5-30:2 No - lnc-HNRNPK-1:2 Yes chr2R:9082395-9085717 lnc-CDK20-8:1 No - LINC00476:9 No - LINC01492:4 No - lnc-RBM18-1:3 Yes chrX:14580600-14582174 lnc-ZMYND19-3:5 Yes chrX:245978-254650 FAM239A:25 No - FAM239B:10 No - lnc-GLRA2-2:2 No - lnc-ASB11-1:3 Yes chr2R:17737622-17739685 lnc-CA5B-1:5 Yes chr2L:13803626-13809994 lnc-CA5B-1:7 Yes chr2L:13803626-13809994 lnc-MAGEB5-6:2 No - lnc-FAM47C-1:2 No - lnc-DUSP21-2:1 No - lnc-MAGIX-2:1 No - lnc-KANTR-23:1 No - XIST:13 No - XIST:16 No - lnc-ARMCX1-1:5 No - lnc-ARMCX1-1:6 No - lnc-RAB40A-3:2 No - lnc-SERTM2-1:4 No - lnc-RHOXF1-3:9 No - SMIM10L2B-AS1:8 No - lnc-ZNF75D-2:3 No - lnc-F9-3:3 No - LINC00632:9 No - LINC00632:11 No - FMR1-AS1:9 No - FMR1-AS1:10 No - LINC00279:2 No - lnc-UTY-10:3 No - FAM41AY1:7 No - FAM41AY2:5 No - lnc-HSFY1-2:6 No - lnc-AMDHD2-6:1 No - lnc-AMDHD2-7:1 No - lnc-PDPK1-2:1 No - lnc-PDPK1-2:3 No - lnc-PDPK1-2:4 No - lnc-PRSS27-4:26 No - lnc-PDPK1-3:1 No - lnc-PRSS27-4:25 No - lnc-PRSS27-4:7 No - lnc-PRSS27-4:17 No - lnc-PRSS27-4:10 No - lnc-PRSS27-4:20 No - lnc-KCTD5-2:1 No - lnc-ELOB-2:1 No - SRRM2-AS1:3 Yes chr3L:1654247-1665064 SRRM2-AS1:9 No - SRRM2-AS1:1 Yes chr3L:1654247-1665064 lnc-SRRM2-1:1 No - lnc-PRSS22-3:1 No - lnc-PRSS22-2:5 No - lnc-PRSS22-2:3 No - lnc-PRSS22-2:4 No - lnc-PRSS22-2:1 No - lnc-PRSS22-2:6 No - lnc-PRSS22-2:2 No - lnc-PRSS33-2:1 No - lnc-PRSS33-2:2 No - lnc-FLYWCH2-2:1 No - lnc-FLYWCH2-2:2 No - lnc-PKMYT1-4:1 No - lnc-PKMYT1-2:1 No - lnc-PKMYT1-2:2 No - lnc-CLDN6-4:5 Yes chr3L:5777476-5779591 lnc-CLDN6-4:1 Yes chr3L:5777476-5779591 lnc-CLDN6-4:4 Yes chr3L:5777476-5779591 lnc-CLDN6-3:1 Yes chr3L:5777476-5779591 lnc-CLDN6-4:2 Yes chr3L:5777476-5779591 lnc-CLDN6-4:3 Yes chr3L:5777476-5779591 lnc-CLDN9-1:1 No - lnc-HCFC1R1-1:2 No - lnc-HCFC1R1-1:1 No - lnc-HCFC1R1-1:4 No - lnc-HCFC1R1-1:3 No - lnc-BICDL2-2:1 Yes chr3L:13939250-13962647 lnc-BICDL2-3:1 No - MMP25-AS1:7 Yes chr2R:9611139-9683858 MMP25-AS1:8 Yes chr2R:9611139-9683858 MMP25-AS1:9 Yes chr2R:9611139-9683858 MMP25-AS1:10 Yes chr2R:9611139-9683858 MMP25-AS1:22 Yes chr2R:9611139-9683858 MMP25-AS1:26 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-IL32-1:2 Yes chr2R:9611139-9683858 MMP25-AS1:19 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-IL32-1:3 Yes chr2R:9611139-9683858 MMP25-AS1:28 Yes chr2R:9611139-9683858 MMP25-AS1:2 No - MMP25-AS1:27 Yes chr2R:9611139-9683858 MMP25-AS1:16 Yes chr2R:9611139-9683858 MMP25-AS1:14 Yes chr2R:9611139-9683858 MMP25-AS1:18 Yes chr2R:9611139-9683858 MMP25-AS1:12 Yes chr2R:9611139-9683858 MMP25-AS1:11 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-ZSCAN10-3:22 No - lnc-ZSCAN10-3:21 No - lnc-ZSCAN10-3:20 No - lnc-ZNF213-2:1 No - lnc-ZSCAN10-3:19 No - lnc-ZSCAN10-3:13 No - lnc-ZSCAN10-3:12 No - lnc-ZSCAN10-3:17 No - lnc-ZSCAN10-3:18 No - lnc-ZSCAN10-3:14 No - lnc-ZSCAN10-3:16 No - lnc-ZSCAN10-3:15 No - lnc-ZNF213-1:1 No - lnc-ZNF213-1:2 No - lnc-ZNF200-3:1 No - lnc-MEFV-2:1 No - LINC00921:1 No - LINC00921:3 No - LINC00921:4 No - LINC00921:5 No - lnc-TIGD7-1:7 No - lnc-TIGD7-1:6 No - lnc-TIGD7-1:2 No - lnc-TIGD7-1:4 No - lnc-TIGD7-1:3 No - lnc-TIGD7-1:5 No - lnc-ZNF263-3:1 No - lnc-MTRNR2L4-2:1 No - lnc-MTRNR2L4-1:1 No - lnc-CLUAP1-6:1 No - lnc-CLUAP1-3:1 No - lnc-CLUAP1-4:1 No - lnc-CLUAP1-8:1 No - lnc-CLUAP1-8:3 No - lnc-CREBBP-2:1 No - lnc-TRAP1-2:1 Yes chrX:9665442-9687066 lnc-TRAP1-3:1 Yes chrX:9665442-9687066 lnc-TRAP1-4:1 Yes chrX:9665442-9687066 lnc-CREBBP-3:2 Yes chrX:15510877-15554278 lnc-CREBBP-3:1 Yes chrX:15510877-15554278 lnc-GLIS2-6:1 No - lnc-GLIS2-5:1 No - LINC01569:8 No - lnc-GLIS2-4:1 No - LINC01569:9 No - LINC01569:10 No - LINC01569:20 No - LINC01569:6 No - LINC01569:16 No - LINC01569:2 No - lnc-GLIS2-1:2 No - lnc-TFAP4-1:1 Yes chr2L:16263556-16287730 lnc-TFAP4-2:1 Yes chr2L:16263556-16287730 lnc-GLIS2-3:1 No - lnc-TFAP4-3:1 No - lnc-TFAP4-3:2 No - lnc-CORO7-PAM16-3:5 No - lnc-CORO7-PAM16-3:2 No - lnc-CORO7-PAM16-3:4 No - lnc-CORO7-PAM16-3:3 No - lnc-CORO7-PAM16-3:1 No - lnc-PAM16-4:2 No - lnc-PAM16-4:1 No - lnc-PAM16-5:1 No - lnc-PAM16-7:1 No - lnc-NMRAL1-2:3 No - lnc-NMRAL1-2:1 No - lnc-NMRAL1-2:2 No - lnc-NMRAL1-2:4 No - lnc-CORO7-PAM16-2:1 No - lnc-CDIP1-3:1 No - lnc-NMRAL1-1:1 No - lnc-NMRAL1-3:1 Yes chr2R:23502946-23503815 lnc-CDIP1-2:1 No - lnc-UBALD1-2:1 Yes chrX:13718734-13721977 lnc-ANKS3-2:1 Yes chrX:13718734-13721977 lnc-ZNF500-3:1 Yes chr3R:4269221-4277928 lnc-ZNF500-2:1 Yes chr3R:4269221-4277928 lnc-ZNF500-1:2 No - lnc-ZNF500-1:3 No - lnc-ZNF500-1:1 No - lnc-C16orf71-1:1 No - lnc-ROGDI-2:2 No - lnc-ROGDI-2:1 No - lnc-GLYR1-1:3 Yes chr3L:17049512-17055454 lnc-GLYR1-1:2 Yes chr3L:17049512-17055454 CSMD2-AS1:2 Yes chrX:11992915-12003914 ERI3-IT1:4 No - DAB1-AS1:4 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:5 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:6 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-ATP6V1G3-4:5 No - lnc-ATP6V1G3-4:3 No - IPO9-AS1:2 No - lnc-ZNF670-ZNF695-3:1 No - FAM138A:2 No - FAM41C:3 No - LINC01342:2 No - lnc-TMEM88B-3:7 Yes chr3L:13017149-13017867 LINC00982:5 No - lnc-LRRC47-78:22 No - LINC01346:2 No - LINC01672:18 No - ENO1-AS1:2 Yes chr2L:1724768-1729636 lnc-GPR157-7:5 No - lnc-GPR157-7:3 No - PIK3CD-AS1:1 Yes chr3R:20628972-20634732 LINC01647:6 No - UBXN10-AS1:3 No - lnc-CELA3A-5:12 No - lnc-CELA3A-5:4 No - lnc-CELA3A-5:13 No - lnc-CELA3A-5:14 No - lnc-CELA3A-5:15 No - lnc-CELA3A-5:16 No - ZNF436-AS1:3 Yes chr2R:14173693-14182838 ZNF436-AS1:1 Yes chr2R:14173693-14182838 lnc-RPL11-1:7 No - ELOA-AS1:15 Yes chr3R:23251563-23255071 lnc-STPG1-3:2 Yes chr3R:16186999-16197584 lnc-GJA9-1:2 No - lnc-GJA9-1:5 No - lnc-GJA9-1:4 No - lnc-GJA9-1:3 No - lnc-ZNF691-3:2 No - ERI3-IT1:5 No - FOXD2-AS1:2 No - LINC01135:4 No - lnc-JUN-5:9 No - NFIA-AS1:1 Yes chr4:268175-276369 LINC01555:1 No - LINC01364:7 No - DPYD-AS2:2 Yes chrX:9196808-9201820 MIR137HG:3 Yes chrX:9196808-9201820 RTCA-AS1:1 No - RTCA-AS1:2 No - lnc-SLC30A7-2:8 Yes chr3R:22582028-22583225 lnc-DPH5-1:3 No - lnc-TMEM167B-1:3 No - LINC02586:7 No - RBM15-AS1:20 Yes chr2R:7962463-7969805 SLC16A1-AS1:4 No - HAO2-IT1:2 Yes chr2R:10883547-10884936 ADAMTSL4-AS1:1 No - CADM3-AS1:5 No - LINC00626:3 No - lnc-TEX35-1:2 No - LHX4-AS1:9 No - LINC00862:3 No - PCAT6:4 No - PCAT6:5 No - lnc-DUSP10-5:3 No - OBSCN-AS1:8 Yes chr3L:2117466-2151700 OBSCN-AS1:7 Yes chr3L:2117466-2151700 IBA57-DT:5 No - LINC01139:3 No - CHRM3-AS1:2 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-HNRNPU-1:6 No - MIR3681HG:6 No - lnc-ARHGAP15-2:2 Yes chrX:15853421-15854970 MAP3K20-AS1:24 No - LINC01923:10 No - MIR3681HG:7 No - MIR3681HG:8 No - CYP1B1-AS1:35 No - lnc-CALM2-2:8 No - lnc-CALM2-2:7 No - LINC01798:17 No - ATP6V1B1-AS1:2 No - ATP6V1B1-AS1:3 No - DGUOK-AS1:3 Yes chr3R:18980995-18982749 DGUOK-AS1:4 Yes chr3R:18980995-18982749 lnc-MRPL19-1:2 Yes chr3R:4077939-4104326 lnc-LRRTM4-3:5 No - CYTOR:93 No - lnc-LYPD6-2:3 Yes chrX:9194750-9196414 LINC01124:2 No - SCHLAP1:2 No - SCHLAP1:3 No - SCHLAP1:4 No - SCHLAP1:5 No - SCHLAP1:6 No - SCHLAP1:7 No - SCHLAP1:8 No - LINC01473:3 No - lnc-FTCDNL1-1:3 No - lnc-ZDBF2-2:1 No - lnc-VWC2L-1:3 No - LINC01237:2 No - LINC01304:9 No - lnc-CMPK2-5:51 No - lnc-CMPK2-5:8 No - lnc-KIDINS220-8:4 No - ID2-AS1:2 Yes chr3L:749400-753492 LINC01954:15 No - MYCNOS:3 Yes chrX:3373159-3391697 lnc-RHOB-3:2 No - AGBL5-AS1:2 No - lnc-FEZ2-7:3 No - LINC00211:4 No - LINC00211:5 No - lnc-ATL2-1:6 No - LINC01914:19 No - LINC01914:20 No - SIX3-AS1:4 No - lnc-PIGF-1:3 No - lnc-SOCS5-4:5 No - lnc-WDPCP-1:6 Yes chr3L:13011976-13015332 LINC00309:4 No - lnc-SERTAD2-3:7 No - LINC01797:8 No - LINC01797:9 No - LINC01799:6 No - LINC01816:20 No - TGFA-IT1:1 No - ALMS1-IT1:3 No - BOLA3-AS1:4 No - DCTN1-AS1:9 No - lnc-MRPL19-4:2 Yes chr3L:4803077-4805274 LINC01851:10 No - LINC01815:11 No - lnc-TBC1D8-2:4 No - LINC01159:4 No - LINC01159:5 No - lnc-TGFBRAP1-3:4 Yes chr3R:7889277-7902667 LINC01106:6 No - LINC01106:7 No - lnc-LIMS4-1:1 Yes chr3R:8356978-8359964 lnc-SLC35F5-3:4 Yes chr3L:8113407-8115902 LINC01191:6 No - lnc-EN1-2:4 No - lnc-TMEM185B-12:1 No - NIFK-AS1:12 No - lnc-UGGT1-1:2 No - lnc-MZT2B-1:2 No - LINC01120:7 No - lnc-GPR39-4:3 No - ZEB2-AS1:15 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-TNFAIP6-2:12 No - lnc-TNFAIP6-2:13 No - lnc-TNFAIP6-2:14 No - lnc-TNFAIP6-2:15 No - lnc-NMI-1:2 No - LINC02478:12 No - LINC01806:18 No - TTC21B-AS1:7 No - XIRP2-AS1:2 No - LINC01124:6 No - RAPGEF4-AS1:2 Yes chr2R:6759715-6798941 LINC01305:2 Yes chrX:9729648-9782094 HOXD-AS2:2 Yes chr3R:6752864-6754194 HAGLR:16 No - HAGLR:17 No - HAGLR:18 No - HAGLR:19 No - HAGLR:20 No - HAGLR:21 No - HAGLR:13 No - HAGLR:4 No - HAGLR:5 No - HAGLR:6 No - HAGLR:7 No - HAGLR:3 Yes chr3R:6661427-6678590 HAGLROS:5 No - LINC01116:6 No - lnc-PJVK-2:1 Yes chr2L:13382652-13385671 lnc-PJVK-2:2 Yes chr2L:13382652-13385671 lnc-PJVK-2:3 Yes chr2L:13382652-13385671 lnc-ZSWIM2-6:8 No - lnc-ZSWIM2-6:7 No - lnc-ZSWIM2-6:5 No - lnc-ZSWIM2-6:4 No - LINC01821:8 No - lnc-CCDC150-1:3 Yes chrX:9608946-9623243 lnc-CCDC150-1:4 Yes chrX:9608946-9623243 LINC01877:9 No - lnc-KLF7-1:15 No - LINC01280:2 No - LINC01494:1 No - LINC00608:14 No - lnc-HES6-1:3 No - lnc-GPC1-2:1 No - lnc-ANKMY1-2:4 Yes chr3L:14632601-14671609 CAPN10-DT:9 No - lnc-C2orf54-1:5 Yes chr3R:24113286-24128193 THUMPD3-AS1:9 No - LINC01266:4 No - GRM7-AS3:2 Yes chr4:936819-949441 ITGA9-AS1:2 Yes chr2R:15258761-15262873 ITGA9-AS1:3 Yes chr2R:15258761-15262873 SUCLG2-AS1:3 No - LINC00877:10 No - lnc-CHMP2B-1:4 No - ST3GAL6-AS1:2 No - LINC02042:5 No - lnc-ACAD11-4:1 No - NCK1-DT:21 No - NCK1-DT:22 No - NCK1-DT:23 No - LINC01210:3 No - AADACL2-AS1:2 No - AADACL2-AS1:3 No - LINC00886:3 No - IL12A-AS1:3 No - lnc-CCDC39-1:5 No - LINC01994:5 No - lnc-RTP4-5:2 No - ITPR1-DT:15 No - EGOT:3 Yes chr3R:5517117-5539411 FGD5-AS1:13 No - FGD5-AS1:14 No - FGD5-AS1:2 Yes chr3L:21494019-21497494 LINC00692:7 No - RBMS3-AS3:2 No - PRKAR2A-AS1:6 No - PRKAR2A-AS1:7 No - ESRG:2 Yes chr2R:13805794-13819571 ARHGEF3-AS1:2 Yes chr3L:4692783-4796253 SAMMSON:4 No - LINC00960:3 No - lnc-ROBO2-11:1 Yes chr2L:1380086-1420453 lnc-CHMP2B-1:5 No - LINC00879:6 No - LINC00635:23 No - LINC01215:3 No - LINC01215:2 No - LINC01205:2 No - lnc-CCDC80-5:1 No - LSAMP-AS1:2 Yes chr3L:5424109-5442399 IGSF11-AS1:3 No - ALDH1L1-AS2:2 Yes chr2L:21371227-21377995 CCDC37-DT:21 No - BPESC1:2 Yes chr3R:27916908-27918248 CLSTN2-AS1:2 Yes chr4:1112874-1123357 TM4SF1-AS1:2 No - TM4SF1-AS1:3 No - WWTR1-AS1:5 Yes chr2R:24065975-24068485 LINC01213:5 No - LINC01213:2 No - LINC01214:1 No - LINC01214:2 No - MBNL1-AS1:2 Yes chr2R:17216549-17379376 lnc-PLCH1-1:2 No - LINC00880:3 No - LINC01100:2 No - LINC02082:6 No - NAALADL2-AS3:2 No - LINC01208:4 No - LINC00501:2 No - lnc-USP13-8:1 Yes chrX:1866832-1869061 lnc-USP13-8:2 Yes chrX:1866832-1869061 LINC01206:3 No - lnc-B3GNT5-11:12 No - lnc-B3GNT5-11:15 No - ADIPOQ-AS1:3 No - lnc-TPRG1-1:3 Yes chr4:1057365-1065001 LPP-AS1:2 Yes chr4:1057365-1065001 lnc-HRASLS-5:3 No - lnc-TM4SF19-TCTEX1D2-4:1 No - SEPSECS-AS1:3 Yes chr3R:5557663-5563652 LINC02431:10 No - UGDH-AS1:2 No - HAND2-AS1:20 No - LINC01098:1 No - LINC01099:2 No - LINC00290:3 No - LINC02492:10 No - lnc-CPLX1-2:5 No - LINC00955:3 No - LINC00682:2 No - DANCR:7 No - UBA6-AS1:5 No - THAP9-AS1:5 No - WDFY3-AS2:8 No - lnc-BANK1-2:1 Yes chrX:16554627-16560016 ARHGEF38-IT1:2 No - SNHG8:10 No - SNHG8:11 No - SNHG8:12 No - lnc-USP53-8:3 Yes chr2L:18532025-18590342 LINC00616:6 No - SMARCA5-AS1:1 Yes chr2R:12636671-12640628 SMAD1-AS2:1 Yes chr2L:3146056-3159643 LINC02433:9 No - WWC2-AS2:3 No - LINC02363:13 No - LINC02147:7 No - lnc-RICTOR-54:3 No - lnc-ANXA2R-1:27 No - LINC02112:22 No - LINC02149:4 No - LINC02150:7 No - lnc-C1QTNF3-AMACR-1:1 No - lnc-ESM1-4:1 No - lnc-SCAMP1-2:1 No - lnc-RASA1-2:4 No - TMEM161B-AS1:9 Yes chr3L:11109690-11112117 TMEM161B-AS1:10 Yes chr3L:11109690-11112117 MEF2C-AS1:6 Yes chr2R:9913496-9958858 MEF2C-AS1:7 Yes chr2R:9913496-9958858 MEF2C-AS1:2 Yes chr2R:9913496-9958858 NR2F1-AS1:4 No - NR2F1-AS1:5 No - NR2F1-AS1:6 No - NR2F1-AS1:7 No - NR2F1-AS1:31 No - NR2F1-AS1:8 No - NR2F1-AS1:9 No - lnc-LNPEP-8:3 No - lnc-AP3S1-4:5 No - lnc-AP3S1-4:6 No - LINC02208:24 No - LINC02201:10 No - LINC02240:20 No - LINC01184:15 No - lnc-HTR4-1:3 No - LINC01933:9 No - LINC02227:4 No - LINC01847:8 Yes chr3L:22035003-22065279 lnc-BOD1-1:13 No - lnc-CCDC127-1:2 No - lnc-SLC9A3-1:4 No - lnc-SLC12A7-4:6 No - lnc-SLC12A7-4:5 No - lnc-SLC12A7-5:10 No - lnc-NDUFS6-4:2 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX4-4:2 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX1-5:4 No - LINC01017:2 No - lnc-MED10-6:2 No - LINC01018:8 No - LINC01018:2 No - MIR4458HG:6 No - LINC02199:9 No - SNHG18:2 No - lnc-MARCH11-2:4 Yes chr3R:15920898-15932887 lnc-CDH6-3:2 No - LINC02064:13 No - lnc-IL7R-1:2 No - EGFLAM-AS4:2 Yes chr2R:16031930-16047243 LIFR-AS1:4 No - LINC02104:19 No - lnc-OXCT1-1:13 No - lnc-OXCT1-1:12 No - lnc-ZNF131-1:6 No - lnc-ANXA2R-1:20 No - lnc-ANXA2R-1:7 No - lnc-ANXA2R-1:14 No - MRPS30-DT:48 No - MRPS30-DT:49 No - MRPS30-DT:50 No - MRPS30-DT:51 No - LINC02106:9 No - lnc-ESM1-4:3 No - lnc-IL31RA-1:5 No - lnc-GPBP1-3:5 No - LINC02225:5 No - LINC02108:3 No - PART1:5 Yes chrX:3176440-3343767 SMIM15-AS1:24 No - lnc-SMIM15-4:2 No - C5orf64-AS1:11 No - LINC02229:10 No - LINC02219:11 No - lnc-AK6-2:3 No - lnc-PTCD2-1:2 No - LINC02056:45 No - LINC01333:11 No - lnc-SCAMP1-2:4 No - SCAMP1-AS1:1 No - lnc-SERINC5-1:3 Yes chr2L:6686791-6709086 RASGRF2-AS1:2 No - LINC01338:3 No - LINC02059:9 No - LINC02060:8 No - TMEM161B-AS1:47 No - lnc-POLR3G-1:4 No - NR2F1-AS1:10 No - NR2F1-AS1:11 No - NR2F1-AS1:12 No - LINC01554:1 No - RGMB-AS1:6 No - LINC00492:2 No - LINC02115:5 No - EPB41L4A-AS1:2 Yes chr3R:31311157-31371748 LINC02200:7 No - lnc-REEP5-1:2 No - lnc-TMED7-1:2 No - LINC02214:5 No - LINC02148:6 No - lnc-ALDH7A1-2:6 No - lnc-ALDH7A1-2:5 No - P4HA2-AS1:3 Yes chr3R:30466050-30485799 lnc-SLC22A5-6:2 Yes chr2R:22421013-22425482 lnc-CDKN2AIPNL-1:3 No - LINC01843:11 No - C5orf66-AS1:2 No - C5orf66-AS1:3 No - C5orf66-AS2:3 No - LINC01959:5 Yes chr3R:27559379-27561319 SMAD5-AS1:2 Yes chr2L:3146056-3159643 PSD2-AS1:16 No - PSD2-AS1:17 No - lnc-TAF7-6:5 No - lnc-PCDHGA1-1:4 Yes chr2L:20758144-20768053 lnc-ARHGAP26-4:41 No - ARHGAP26-AS1:5 Yes chrX:15751674-15760733 CARMN:3 No - CARMN:4 No - NDST1-AS1:9 Yes chr3L:6495680-6550104 CLMAT3:7 Yes chr3R:26869238-26871995 LINC02202:22 No - LINC02159:12 No - lnc-MAT2B-3:21 No - lnc-PANK3-2:3 Yes chrX:10964032-10967134 lnc-FBLL1-4:4 Yes chr2R:15869495-15922118 LINC01187:4 No - LINC01366:2 No - LINC01366:3 No - LINC01366:4 No - lnc-DUSP1-4:5 Yes chr3L:18898875-18900408 lnc-CPEB4-4:6 No - lnc-CPEB4-4:7 No - lnc-BOD1-1:12 No - lnc-THOC3-3:1 No - lnc-FAM153B-3:8 No - LINC01574:4 No - LINC00847:11 No - LINC00847:12 No - TRIM52-AS1:14 No - LINC01962:8 No - lnc-EEF1E1-2:2 No - TARID:8 Yes chr2L:6527447-6546976 lnc-EXOC2-29:1 No - lnc-EEF1E1-2:1 No - lnc-BMP6-106:118 No - LINC01108:2 No - LINC01108:3 No - NBAT1:3 No - HCG11:2 No - HCG14:2 No - HCG9:3 No - lnc-ATP6V1G2-DDX39B-1:2 No - C2-AS1:1 No - lnc-PSMB9-6:4 No - PANDAR:1 No - LINC01590:3 Yes chr3L:21827774-21828480 MANEA-DT:16 No - MANEA-DT:17 No - MCHR2-AS1:8 Yes chr3L:18560258-18576326 BVES-AS1:5 Yes chrX:21053963-21082391 lnc-SESN1-6:2 Yes chrX:11156676-11159760 LINC01010:3 No - LINC01277:9 No - PHACTR2-AS1:4 Yes chr3L:3714826-3806459 PHACTR2-AS1:3 Yes chr3L:3714826-3806459 PHACTR2-AS1:5 Yes chr3L:3714826-3806459 PHACTR2-AS1:6 Yes chr3L:3714826-3806459 SOD2-OT1:5 No - CAHM:2 No - LINC00473:4 No - RPS6KA2-AS1:5 No - LINC01558:3 No - LINC01624:1 No - LINC02587:10 No - lnc-URGCP-2:3 No - lnc-ICA1-1:2 No - lnc-COL28A1-1:9 No - lnc-MACC1-1:10 No - lnc-SNX10-2:10 No - INHBA-AS1:3 No - ELDR:4 No - lnc-CD36-11:2 Yes chr2R:13805794-13819571 lnc-VPS50-1:3 Yes chr2R:16579470-16585448 lnc-VPS50-1:4 Yes chr2R:16579470-16585448 DLX6-AS1:2 Yes chr2R:24814822-24835667 lnc-LSMEM1-3:3 No - ST7-AS2:3 Yes chr3L:20806868-20809272 lnc-SSU72P8-5:2 No - LINC-PINT:3 No - LINC-PINT:17 No - LINC-PINT:4 No - LINC-PINT:5 No - LINC-PINT:6 No - LINC-PINT:7 No - LINC-PINT:8 No - LINC-PINT:9 No - EPHA1-AS1:2 No - lnc-FAM20C-3:9 No - lnc-FAM20C-3:10 No - lnc-DNAAF5-1:16 Yes chr3L:20816118-20836048 lnc-DNAAF5-1:14 Yes chr3L:20816118-20836048 lnc-UNCX-3:7 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-UNCX-3:5 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-UNCX-3:6 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-UNCX-3:9 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-UNCX-3:15 No - lnc-UNCX-3:8 Yes chr2L:3452466-3453755 PSMG3-AS1:4 No - lnc-C1GALT1-1:4 No - lnc-MACC1-3:2 No - lnc-MACC1-3:1 No - KIAA0087:4 No - lnc-HOXA10-1:1 No - HOTTIP:3 No - LINC01176:15 No - lnc-SEPT7-1:11 No - lnc-SEPT7-1:12 No - lnc-EEPD1-49:5 No - POU6F2-AS1:3 Yes chr2R:8327490-8396280 SNHG15:8 No - lnc-EGFR-4:1 Yes chr2R:20512697-20513169 lnc-NUPR2-3:4 No - lnc-KCTD7-2:13 Yes chr3L:1295913-1298497 LINC01372:7 No - lnc-CALN1-1:10 No - lnc-BUD23-1:2 No - lnc-GTF2IRD2-1:9 No - lnc-CCDC146-96:1 Yes chr2L:19186043-19189938 APTR:1 Yes chr2L:18833710-18839679 lnc-GRM3-2:3 No - TP53TG1:12 No - LNCPRESS1:24 No - LINC01007:6 No - LINC01007:7 No - lnc-ATXN7L1-2:1 No - lnc-LSMEM1-2:5 No - lnc-LSMEM1-2:6 No - lnc-BMT2-1:5 No - lnc-SMIM30-1:2 No - lnc-SMIM30-1:3 No - lnc-CAPZA2-2:7 Yes chr3L:20806868-20809272 ST7-AS2:6 Yes chr3L:20806868-20809272 lnc-TMEM229A-2:3 No - lnc-POT1-2:2 No - lnc-ARF5-3:3 Yes chr4:936819-949441 LINC00513:14 No - LINC-PINT:75 No - LINC-PINT:76 No - WDR86-AS1:2 No - WDR86-AS1:3 No - LINC01003:2 No - HTR5A-AS1:3 Yes chr2R:19022325-19032642 BLACE:5 No - LINC00244:2 No - LINC01006:1 No - MNX1-AS1:3 No - lnc-DNAJB6-10:3 Yes chr2L:1008378-1048053 ZFHX4-AS1:2 Yes chr4:501810-540874 FAM167A-AS1:2 No - NRG1-IT1:1 No - NRG1-IT1:3 No - NRG1-IT1:4 No - MIR2052HG:3 No - lnc-ZFHX4-2:7 No - lnc-ANGPT2-2:6 No - lnc-AGPAT5-1:5 Yes chrX:16323286-16325768 LINC00208:3 No - lnc-ZNF705D-2:44 No - LINC00589:7 No - LINC00293:8 No - lnc-PPDPFL-4:2 No - lnc-FAM110B-7:2 No - lnc-ASPH-5:4 No - LINC01289:2 No - MIR124-2HG:11 No - MIR124-2HG:3 No - MIR124-2HG:13 No - MIR124-2HG:6 No - lnc-CYP7B1-2:3 No - C8orf34-AS1:1 No - LINC01603:2 No - STAU2-AS1:3 Yes chr2R:18117896-18125779 LINC01030:5 No - OTUD6B-AS1:3 No - OTUD6B-AS1:4 No - lnc-FAM92A-1:1 Yes chr3L:1559813-1568608 BAALC-AS1:19 No - BAALC-AS2:2 No - RNF139-AS1:6 No - PRNCR1:1 No - lnc-FAM84B-15:122 No - CCAT2:3 No - lnc-GSDMC-34:33 No - LY6E-DT:33 No - lnc-MAPK15-2:3 No - CDKN2B-AS1:18 Yes chr3R:25036944-25037982 LINC01501:3 No - VLDLR-AS1:4 Yes chr3R:25698727-25740465 LINC01508:5 No - LINC00587:2 No - LINC01235:2 No - LINC00583:2 No - CDKN2A-DT:5 Yes chr3R:25036944-25037982 lnc-SPINK4-4:9 No - DNAJB5-DT:5 No - FAM201A:4 No - FAM27C:1 No - LINC01506:1 No - BANCR:3 No - C9orf135-DT:12 No - VPS13A-AS1:3 No - lnc-GNAQ-2:6 No - lnc-SPATA31D4-1:3 No - GAS1RR:5 No - lnc-GADD45G-5:6 No - LINC00092:8 No - lnc-SMC2-1:5 No - LINC01505:4 No - lnc-PTGR1-2:2 No - lnc-TNC-21:6 No - LINC00474:3 No - PAPPA-AS1:1 No - lnc-TLR4-1:2 No - DBH-AS1:4 Yes chrX:7995697-8027394 LINC01502:3 No - MAN1B1-DT:6 No - lnc-VEGFD-1:2 No - lnc-DYNLT3-1:2 No - LINC01284:3 No - JPX:7 No - RAP2C-AS1:4 No - LINC00632:2 No - LINC00102:2 No - LINC01546:1 No - PRKX-AS1:2 Yes chr3L:15925805-15954797 NHS-AS1:1 No - PPEF1-AS1:1 Yes chr3L:20248080-20265554 MID1IP1-AS1:2 No - LINC01186:1 No - LINC01545:1 No - INE1:1 Yes chr2R:9688289-9693328 ZNF630-AS1:2 No - lnc-KANTR-23:16 No - DLG3-AS1:4 Yes chrX:11369665-11409776 DLG3-AS1:2 Yes chrX:11369665-11409776 LINC00891:5 No - PHKA1-AS1:1 Yes chrX:9093612-9103739 lnc-FAM236D-1:1 Yes chrX:13368191-13370472 PLS3-AS1:2 Yes chrX:17285704-17301929 LINC01285:4 No - lnc-PGRMC1-1:2 No - HS6ST2-AS1:2 Yes chr3R:19929277-20008512 lnc-SMIM10L2B-1:6 No - lnc-ETDB-1:11 No - lnc-SMIM10L2A-1:2 No - FGF13-AS1:3 No - LINC00632:3 No - LINC00632:4 No - LINC00850:4 No - HCFC1-AS1:1 Yes chr4:359938-375554 FAM223A:1 No - FAM223B:1 No - TTTY12:3 No - TTTY11:2 No - FAM197Y5:7 No - lnc-AMELY-3:4 No - lnc-AMELY-29:1 No - TTTY15:6 No - FAM224B:3 No - FAM224B:4 No - FAM224A:2 No - TTTY6B:3 No - TTTY6:4 No - ZMIZ1-AS1:8 No - CELF2-AS2:4 Yes chr2L:12344219-12397528 LINC00836:2 No - LINC00836:3 No - lnc-CCDC7-1:2 Yes chr2R:11452043-11465270 lnc-ZNF33A-137:4 No - LINC00845:3 No - lnc-ARHGAP19-3:1 No - EDRF1-AS1:25 No - LINC00702:1 No - LINC00703:3 No - LINC00703:2 No - LINC00705:3 No - lnc-PRKCQ-2:3 No - GATA3-AS1:6 Yes chr3R:8147368-8181444 GATA3-AS1:10 Yes chr3R:8147368-8181444 LINC00708:3 No - LINC00709:1 No - LINC00710:10 Yes chr2L:12344219-12397528 LINC00710:11 Yes chr2L:12344219-12397528 VIM-AS1:2 No - STAM-AS1:1 No - NEBL-AS1:1 Yes chr3L:16676406-16711677 lnc-PIP4K2A-2:3 No - lnc-APBB1IP-1:9 No - WAC-AS1:6 No - LINC00837:4 No - PARD3-AS1:4 No - PCAT5:1 No - LINC00999:7 No - ZNF32-AS3:2 Yes chr2L:4463611-4465075 C10orf71-AS1:4 No - PRKG1-AS1:4 Yes chr2L:3622074-3656953 LINC00844:4 No - LINC01553:1 No - UNC5B-AS1:2 Yes chr2R:15340472-15368300 ZNF503-AS2:13 No - ZNF503-AS2:35 No - ZNF503-AS2:11 No - ZNF503-AS2:5 No - ZNF503-AS2:7 No - NUTM2A-AS1:9 No - FAS-AS1:7 No - TNKS2-AS1:4 No - CFAP58-DT:8 No - SORCS3-AS1:3 No - LINC01561:1 No - lnc-FAM24B-1:1 No - LINC01164:1 No - MIR202HG:3 No - MIR202HG:4 No - lnc-GLYATL2-2:4 No - lnc-OR5AK2-1:4 No - CD81-AS1:2 Yes chr3R:25872900-25881427 lnc-MS4A8-17:6 No - MALAT1:6 No - USP2-AS1:5 No - GSEC:10 Yes chr3R:5753318-5754774 TOLLIP-AS1:1 No - FAM99A:2 No - FAM99B:2 No - H19:6 No - lnc-SSU72P5-2:7 No - NAV2-AS5:2 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-TSPAN18-1:3 No - lnc-SLC35C1-4:1 No - FAM111A-DT:26 No - lnc-DAGLA-1:7 No - lnc-HNRNPUL2-BSCL2-1:1 No - lnc-RPS6KA4-3:1 No - OVOL1-AS1:4 Yes chrX:5048273-5070929 lnc-MRGPRF-3:2 No - RAB30-AS1:3 No - lnc-PRSS23-1:7 No - lnc-ENDOD1-1:10 Yes chr2R:23713900-23734846 lnc-RAB39A-2:1 Yes chr3R:7126271-7128027 LINC00900:6 No - lnc-KLRG1-6:1 No - lnc-HOXC4-4:5 Yes chr3R:17150587-17151630 lnc-CKAP4-2:3 No - LINC00937:7 No - OVCH1-AS1:2 Yes chr2R:21798017-21799195 lnc-KCNC2-2:9 No - lnc-UBE2N-3:3 No - lnc-DHX37-9:15 No - LINC02405:27 No - lnc-DHX37-9:14 No - LINC02369:21 No - lnc-SLC6A12-3:5 Yes chr3L:21034535-21075444 CACNA1C-IT3:2 Yes chr2L:16165831-16190540 LINC00612:4 No - LINC01252:2 No - LOH12CR2:2 No - LINC01559:3 No - RERG-AS1:2 No - RASSF8-AS1:3 Yes chr3R:25661795-25665640 ARNTL2-AS1:2 Yes chr3L:19813770-19815938 lnc-DDX11-4:1 Yes chrX:4921678-4938105 CISTR:1 No - LINC02389:18 No - IFNG-AS1:3 No - ATP2B1-AS1:8 Yes chr4:328193-358917 SOCS2-AS1:5 Yes chr2R:8127575-8129476 CASC18:2 No - CASC18:3 No - CASC18:5 No - CASC18:6 No - USP30-AS1:2 Yes chrX:5877000-5879787 FAM222A-AS1:4 No - LINC01405:6 No - LINC01234:3 No - NRAV:3 No - CLIP1-AS1:2 Yes chr2R:19485494-19486837 THRIL:2 No - lnc-TMEM132B-4:19 No - lnc-DHX37-9:13 No - LINC02372:14 No - TMEM132D-AS1:22 Yes chrX:6225647-6236218 TMEM132D-AS1:23 Yes chrX:6225647-6236218 LINC02418:15 No - LINC00545:3 No - PLUT:8 Yes chr3R:6752864-6754194 LINC00457:2 No - SMIM2-AS1:2 No - DLEU1:1 No - LINC01070:3 No - USP12-AS2:2 No - STARD13-AS:56 Yes chr3R:14391683-14481713 SPART-AS1:7 Yes chr3R:4654800-4657985 SPART-AS1:8 Yes chr3R:4654800-4657985 SMIM2-AS1:4 No - TUSC8:2 No - LINC00330:2 No - DLEU1:2 No - DLEU1:3 No - RNASEH2B-AS1:3 Yes chrX:13668014-13669573 INTS6-AS1:8 Yes chrX:5738663-5747254 lnc-UTP14C-1:3 No - LINC00458:1 No - LINC00458:2 No - lnc-TDRD3-15:2 Yes chr2L:20758144-20768053 LINC00378:1 No - LINC00358:3 No - PCDH9-AS4:2 Yes chr3R:14630478-14641776 lnc-UCHL3-5:8 No - lnc-NDFIP2-7:5 No - LINC00397:2 No - LINC00380:1 No - MIR17HG:4 No - GPC5-AS1:3 Yes chr3L:8827505-8891192 SOX21-AS1:3 No - lnc-UBAC2-6:1 No - CLYBL-AS2:2 No - LINC00554:7 No - DAOA-AS1:2 No - FAM155A-IT1:1 No - COL4A2-AS1:2 No - ATP11A-AS1:2 Yes chrX:16405509-16414651 ATP11A-AS1:3 Yes chrX:16405509-16414651 MCF2L-AS1:5 Yes chr2R:5468319-5495861 LINC02294:8 No - LINC02315:15 No - FRMD6-AS2:2 Yes chr2L:431227-448701 LINC02328:43 No - LINC02325:21 No - lnc-DLK1-35:60 No - lnc-DLK1-35:17 No - LINC02297:6 No - lnc-POTEG-26:2 No - DHRS4-AS1:2 Yes chr3L:5140440-5141646 DHRS4-AS1:5 Yes chr3L:5140440-5141646 DHRS4-AS1:6 Yes chr3L:5140440-5141646 lnc-KHNYN-1:1 No - LINC02293:15 No - LINC02293:16 No - LINC01551:1 No - LINC01551:2 No - ARHGAP5-AS1:5 Yes chrX:17639147-17652562 PTCSC3:3 No - LINC02315:16 No - lnc-KLHL28-1:6 No - OTX2-AS1:2 No - lnc-PRKCH-3:1 Yes chr2R:9252310-9285097 LINC01303:39 Yes chr2R:9252310-9285097 LINC01303:31 Yes chr2R:9252310-9285097 LINC00644:2 No - lnc-ZBTB25-3:2 No - lnc-PTGR2-1:5 Yes chr3R:9461084-9493677 LINC01220:2 No - lnc-ERG28-1:2 Yes chr2R:7595265-7620711 VASH1-AS1:13 No - VASH1-AS1:14 No - LINC02288:17 No - LINC00911:5 No - LINC01148:4 No - LINC01146:6 No - FOXN3-AS2:2 Yes chrX:7682338-7709385 ITPK1-AS1:2 No - LINC00618:3 No - LINC02325:22 No - LINC00239:1 No - LINC02298:20 No - lnc-DNAAF4-2:2 No - LINC01169:1 No - lnc-SV2B-1:4 No - LINC00923:6 No - PWRN1:20 No - lnc-SNRPN-11:4 No - lnc-GOLGA8N-1:4 No - lnc-FMN1-1:3 No - RAD51-AS1:3 Yes chr3R:30054696-30056037 OIP5-AS1:7 No - EIF3J-DT:29 No - EIF3J-DT:27 No - lnc-C2CD4B-13:4 Yes chr3L:8545001-8574409 lnc-RPLP1-12:52 No - UBL7-AS1:5 No - LINGO1-AS1:3 Yes chr2R:21872030-21946259 SNHG21:4 No - SNHG21:5 No - SNHG21:6 No - SNHG21:7 No - SNHG21:8 No - VPS33B-DT:22 No - LINC01578:5 Yes chr2L:2979562-2987723 LINC01197:8 No - FAM138E:3 No - SNAI3-AS1:6 Yes chr2L:15333866-15336138 lnc-NME4-1:6 Yes chr3R:25199818-25214255 SNHG9:4 No - SRRM2-AS1:4 Yes chr3L:1654247-1665064 LINC00921:2 No - BCAR4:5 No - lnc-IL4R-2:10 Yes chr2L:6676649-6677625 IL21R-AS1:3 No - lnc-MVP-3:13 Yes chrX:15701451-15703770 lnc-ZNF720-1:8 No - LINC02180:18 No - lnc-IRX3-80:37 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX3-80:9 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX3-80:38 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX3-80:10 Yes chr3L:12609631-12710249 LINC00920:3 No - BEAN1-AS1:5 No - lnc-AGRP-1:4 No - HCCAT5:3 Yes chr4:501810-540874 lnc-CTRB1-1:3 Yes chr3L:152884-174517 LINC01229:16 No - LINC01227:7 No - LINC01082:2 No - LINC01081:3 No - LINC02135:7 No - lnc-FBXO31-12:1 No - lnc-RAD51D-2:1 No - LINC01483:4 No - LINC01483:5 No - LINC02091:8 No - PITPNA-AS1:1 Yes chr3R:19215434-19226651 lnc-METTL16-1:6 Yes chr2R:15147860-15149709 lnc-P2RX5-2:2 No - lnc-SLC16A11-7:19 No - lnc-PLSCR3-1:1 No - lnc-RNF227-1:3 No - lnc-KRBA2-2:1 No - lnc-ELAC2-3:2 No - LRRC75A-AS1:39 No - LRRC75A-AS1:40 No - LINC02076:10 No - lnc-TBC1D28-6:1 No - CCDC144NL-AS1:2 No - FAM27E5:3 No - FAM215A:2 No - lnc-LINC02210-CRHR1-52:19 Yes chr2R:12474424-12487986 lnc-LINC02210-CRHR1-52:9 Yes chr2R:12474424-12487986 HOXB-AS3:23 No - HOXB-AS3:24 No - HOXB-AS3:25 No - HOXB-AS3:33 No - LINC01028:1 Yes chr2L:18711071-18713748 LINC01028:2 Yes chr2L:18711071-18713748 CASC17:1 No - LINC01152:5 No - LINC01152:6 No - lnc-BTBD17-3:4 Yes chr2R:4515388-4516458 TNRC6C-AS1:2 No - C1QTNF1-AS1:1 No - C1QTNF1-AS1:2 No - BAIAP2-DT:21 No - LINC00667:12 No - LINC01924:5 No - LINC01541:3 No - LINC00470:13 No - lnc-NETO1-1:15 No - GAPLINC:3 No - GAPLINC:4 No - DLGAP1-AS1:7 Yes chr2R:5702112-5705439 LDLRAD4-AS1:1 No - LINC01443:2 No - MIR133A1HG:3 Yes chr3L:16006552-16011812 LINC-ROR:3 No - LINC00305:4 No - LINC01538:3 No - LINC00908:3 No - ZNF236-DT:14 No - LINC01029:1 No - PARD6G-AS1:3 Yes chrX:17703352-17707096 FAM138F:3 No - lnc-TINCR-1:3 No - lnc-ZNF625-ZNF20-1:1 No - lnc-ZNF136-1:9 No - LINC00905:10 No - LINC00662:9 No - lnc-PRODH2-5:1 No - LINC00665:8 No - lnc-ZNF573-1:5 No - lnc-ZNF574-1:3 Yes chr2L:12587625-12628135 lnc-ZNF404-1:7 No - lnc-IGFL1-1:12 No - CARD8-AS1:3 No - lnc-LHB-1:1 No - PTOV1-AS1:3 No - lnc-ZNF473-1:2 No - LINC01530:1 No - ZNF350-AS1:2 No - lnc-ZSCAN1-3:5 Yes chr2R:14173693-14182838 lnc-ABHD12-4:1 Yes chr2L:2880704-2885850 lnc-SDCBP2-4:1 No - PRNT:5 No - PRNT:6 No - PRNT:7 No - SNAP25-AS1:7 No - LINC00261:6 No - NOL4L-DT:6 No - LINC01524:3 No - NRSN2-AS1:5 No - SIRPG-AS1:2 No - LINC01730:10 No - LINC01433:4 No - LINC00658:9 No - MCM8-AS1:2 Yes chr3R:15823019-15832632 PARAL1:6 No - LINC01723:31 No - LINC01722:7 No - lnc-TASP1-5:4 No - MACROD2-AS1:1 No - MACROD2-AS1:2 No - MACROD2-AS1:3 No - LINC00851:5 No - lnc-RBBP9-4:2 No - LINC01727:18 No - LINC01431:4 No - lnc-FAM182B-8:5 No - RALY-AS1:1 Yes chr3L:7423827-7454717 RALY-AS1:2 Yes chr3L:7423827-7454717 FAM83C-AS1:2 No - lnc-BPI-33:1 Yes chr3L:7593091-7639573 SNHG17:18 No - SNHG17:3 No - LINC01370:5 No - LINC01370:6 No - PLCG1-AS1:2 No - lnc-SERINC3-29:6 No - lnc-EYA2-3:1 Yes chr3R:31669465-31677971 LINC01523:2 No - LINC01522:1 No - ZFAS1:6 Yes chr3R:24193832-24196880 ZFAS1:15 No - ZFAS1:7 Yes chr3R:24193832-24196880 ZFAS1:8 Yes chr3R:24193832-24196880 LINC01273:11 No - ADNP-AS1:2 No - ADNP-AS1:3 No - ADNP-AS1:4 No - lnc-PRELID3B-3:2 No - MIR646HG:3 No - MIR646HG:4 No - MIR646HG:5 No - lnc-PPP1R3D-3:5 No - LINC01718:13 No - ZBTB46-AS1:2 No - LINC00266-1:2 No - LINC01692:6 No - MIR548XHG:2 No - LINC00320:13 No - LINC00320:14 No - LINC00320:15 No - LINC00320:16 No - lnc-RUNX1-12:1 Yes chrX:20538497-20567097 LINC01423:1 No - LINC01674:5 No - CHODL-AS1:2 No - lnc-MRPL39-13:4 No - lnc-MRPL39-1:2 No - MIR155HG:4 No - URB1-AS1:2 No - C21orf62-AS1:1 No - C21orf62-AS1:2 No - PAXBP1-AS1:3 No - LINC00945:3 No - LINC01548:1 No - lnc-C21orf62-7:2 No - IL10RB-DT:18 No - LINC00649:8 Yes chr3R:15265591-15266690 LINC01426:3 No - LINC01436:1 No - DSCR8:17 Yes chr3R:23168317-23185642 DSCR8:18 Yes chr3R:23168317-23185642 LINC00114:3 No - lnc-ETS2-2:4 No - B3GALT5-AS1:2 No - B3GALT5-AS1:3 No - DSCAM-AS1:7 Yes chr3R:17473935-17505667 lnc-TMPRSS2-83:14 No - UMODL1-AS1:1 No - LINC00319:8 No - TRPM2-AS:1 Yes chr2R:15262808-15309368 TSPEAR-AS2:1 No - TSPEAR-AS2:2 No - LINC01424:2 No - LINC01547:1 No - LINC01547:2 No - lnc-COL6A1-1:3 No - DIP2A-IT1:2 Yes chr3L:250229-257954 HORMAD2-AS1:4 No - lnc-ELFN2-1:4 No - lnc-CRYBA4-52:74 No - POTEH-AS1:2 No - HDHD5-AS1:23 No - LINC01664:5 No - CECR3:2 No - LINC00528:13 No - lnc-RTN4R-1:2 No - LINC01637:11 No - FAM230B:1 No - LINC01658:7 No - MIF-AS1:7 No - ADORA2A-AS1:3 No - LINC01422:5 No - MORC2-AS1:2 No - TUG1:3 No - TUG1:4 No - TUG1:5 No - RFPL3S:10 No - RFPL3S:11 No - RFPL3S:12 No - lnc-RFPL3-1:3 No - APOBEC3B-AS1:1 No - EP300-AS1:2 No - lnc-SEPT3-6:4 No - LINC00207:3 No - LINC00229:3 No - LINC00207:4 No - MIRLET7BHG:8 No - MIRLET7BHG:9 No - LINC01644:6 No - lnc-BRD1-8:2 No - lnc-CPT1B-1:1 No - CHKB-DT:37 Yes chr2L:21614232-21624080 CHKB-DT:38 Yes chr2L:21614232-21624080 lnc-SLC45A1-4:2 No - lnc-PNRC2-1:3 No - lnc-PTPRU-4:3 No - lnc-CSMD2-3:2 No - lnc-FOXD2-7:2 No - lnc-CDKN2C-1:4 No - LINC00466:18 No - lnc-PDE4B-1:2 No - lnc-FPGT-10:2 No - lnc-LHX8-1:3 No - lnc-CYR61-1:3 No - lnc-LMO4-1:3 No - lnc-RTCA-1:2 No - LINC01307:2 No - lnc-CD53-4:2 No - lnc-CD58-3:4 No - TDRKH-AS1:24 No - lnc-CD1B-3:4 No - lnc-SH2D1B-5:2 No - lnc-TNFSF18-1:2 No - lnc-CACNA1E-5:2 No - lnc-RGSL1-6:2 No - LINC01036:2 No - LINC01036:7 No - LINC01036:25 No - lnc-CD46-5:2 No - lnc-KCTD3-6:2 No - lnc-USH2A-2:2 No - lnc-GPR137B-6:2 No - lnc-KMO-3:3 No - lnc-ADARB2-4:4 No - lnc-PFKP-7:3 No - lnc-AKR1E2-7:3 No - PRKCQ-AS1:34 No - lnc-PRKCQ-5:2 No - lnc-APBB1IP-4:2 No - lnc-MAP3K8-6:4 No - lnc-ZNF33B-14:2 No - lnc-WASHC2A-1:2 No - lnc-ZWINT-1:3 No - lnc-CDK1-1:2 No - lnc-MYPN-2:2 No - lnc-DYDC1-2:2 No - lnc-PTEN-8:2 No - lnc-SORCS3-13:2 No - lnc-GPR26-5:2 No - TEX36-AS1:4 No - lnc-SYT8-4:2 No - lnc-GAS2-1:13 No - lnc-LDLRAD3-1:2 No - lnc-ALX4-2:3 No - lnc-OR4A5-3:2 No - lnc-TMEM138-10:2 No - lnc-C11orf86-2:2 No - lnc-PDE2A-6:2 No - lnc-USP35-18:2 No - lnc-JRKL-5:2 No - lnc-JRKL-2:4 No - lnc-ARHGAP42-4:2 No - PGR-AS1:10 No - lnc-TMEM123-3:2 No - lnc-PTS-1:8 No - lnc-HTR3A-1:3 No - lnc-APOC3-6:6 No - lnc-RNF26-1:14 No - lnc-UBASH3B-2:5 No - lnc-UBASH3B-1:3 No - lnc-FAM118B-2:2 No - lnc-SCNN1A-3:2 No - lnc-CLEC2D-2:2 No - lnc-EIF2S3B-2:2 No - lnc-PIK3C2G-2:2 No - lnc-CAPZA3-3:3 No - lnc-KLHL42-3:2 No - lnc-SLC48A1-7:2 No - LINC01479:7 No - lnc-ZFC3H1-12:2 No - lnc-C12orf74-5:5 No - RMST:13 No - LINC02456:8 No - lnc-TBX3-1:4 No - lnc-MAP1LC3B2-6:3 No - lnc-TUBA3C-11:2 No - lnc-TNFRSF19-1:3 No - lnc-POLR1D-1:3 No - lnc-POMP-3:2 No - lnc-SLC25A15-5:2 No - lnc-DIAPH3-19:2 No - lnc-DIAPH3-3:4 No - lnc-UCHL3-4:3 No - lnc-PCCA-2:2 No - lnc-SPACA7-2:3 No - lnc-KHNYN-2:10 No - lnc-FOXG1-17:2 No - lnc-FOXG1-3:9 No - lnc-SSTR1-4:2 No - lnc-GEMIN2-10:1 No - lnc-PRKCH-3:6 Yes chr2R:9252310-9285097 lnc-MAP3K9-5:2 No - lnc-GALC-13:2 No - lnc-CALM1-8:2 Yes chr2R:6209782-6214122 lnc-DLK1-35:133 No - lnc-FAN1-6:2 No - lnc-C15orf41-2:3 No - lnc-GATM-4:2 No - lnc-VPS13C-2:2 No - lnc-MRPS11-4:2 No - CERS3-AS1:9 No - lnc-RBFOX1-1:2 No - lnc-NSMCE1-5:2 No - lnc-CNOT1-4:1 No - lnc-CDH5-4:4 No - lnc-DHX38-8:2 No - lnc-CLEC10A-1:2 No - lnc-HS3ST3B1-7:2 No - lnc-HS3ST3B1-8:2 No - LINC02094:4 No - lnc-CDRT15L2-6:2 No - lnc-CCT6B-6:3 No - lnc-PCTP-2:3 No - lnc-PPM1D-1:12 No - lnc-MARCH10-1:3 No - lnc-HELZ-1:5 No - lnc-PRKAR1A-5:2 No - lnc-KCNJ2-2:2 No - lnc-KCNJ2-5:2 No - lnc-PGS1-7:3 No - lnc-SLC35G4-3:3 No - lnc-MC5R-6:2 No - lnc-ANKRD30B-5:2 No - lnc-CABLES1-7:2 No - lnc-TAF4B-10:2 No - lnc-RIT2-3:2 No - lnc-SLC14A1-1:2 No - lnc-SMAD4-5:1 No - LINC01919:10 No - lnc-CCDC102B-2:3 No - LINC02582:15 No - lnc-MEX3D-3:2 No - lnc-SMIM24-2:3 No - lnc-CERS4-3:1 No - lnc-ZNF333-2:3 No - lnc-NR2F6-1:2 No - lnc-PLEKHF1-1:2 No - lnc-CEACAM16-1:2 No - lnc-CRX-6:2 No - lnc-EIPR1-8:2 No - lnc-CMPK2-21:2 No - LINC01954:19 No - lnc-FAM84A-2:2 No - lnc-FAM84A-4:2 No - lnc-RHOB-5:3 No - lnc-RHOB-1:3 No - lnc-MEMO1-3:3 No - lnc-GALM-3:3 No - lnc-EML4-2:2 No - lnc-SLC1A4-2:2 No - lnc-SH2D6-4:2 No - lnc-POU3F3-5:2 No - lnc-NCK2-2:2 No - lnc-TSN-14:2 No - lnc-CNTNAP5-2:3 No - lnc-NXPH2-8:2 No - lnc-LYPD6-2:6 No - lnc-LYPD6-11:2 No - lnc-RND3-6:2 No - lnc-PKP4-3:2 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-RBMS1-1:3 No - lnc-GRB14-3:2 No - lnc-ITGA6-1:6 No - lnc-SCRN3-6:2 No - lnc-CWC22-2:2 No - SCHLAP1:10 No - lnc-NUP35-4:3 No - lnc-NABP1-2:2 No - lnc-NABP1-14:2 No - lnc-SLC39A10-11:1 No - lnc-CLK1-6:1 No - lnc-FAM237A-1:2 No - lnc-RPE-8:2 No - lnc-IKZF2-3:6 No - DIRC3-AS1:7 No - lnc-SLC4A3-8:3 No - lnc-CCDC140-8:2 No - lnc-RNF24-1:7 No - lnc-C20orf196-3:7 No - LINC01723:23 No - lnc-SYNDIG1-3:3 No - lnc-SLC2A10-4:2 No - lnc-TSHZ2-6:2 No - lnc-POTED-3:3 No - lnc-MRPL39-17:1 No - LINC00113:5 No - lnc-DGCR6-2:32 No - LINC01663:10 No - lnc-LRRC74B-3:5 No - lnc-IL5RA-3:3 No - lnc-GRM7-2:4 No - lnc-PLCL2-5:2 No - LINC01980:19 No - lnc-ATRIP-7:2 No - lnc-FHIT-1:3 No - lnc-RYBP-5:2 No - lnc-ROBO2-12:2 No - lnc-ROBO2-15:2 No - lnc-ZPLD1-4:2 No - lnc-ALCAM-16:2 No - lnc-SLC35G2-3:4 No - lnc-C3orf58-12:2 No - lnc-PFN2-5:2 No - LINC02067:6 No - lnc-CLDN11-3:2 No - LINC01206:39 No - lnc-ATP11B-5:3 No - lnc-LPP-1:3 No - lnc-EVC-3:2 No - lnc-DRD5-4:3 No - lnc-CPEB2-12:1 No - lnc-CLRN2-5:2 No - lnc-SOD3-11:2 No - lnc-PCDH7-6:4 No - lnc-KLF3-6:1 No - lnc-TMEM33-2:2 No - lnc-UTP3-1:2 No - lnc-NKX6-1-5:2 No - lnc-PKD2-1:2 No - lnc-RAP1GDS1-2:3 No - lnc-METTL14-3:16 No - lnc-SPRY1-11:11 No - lnc-JADE1-1:2 No - lnc-PABPC4L-16:2 No - lnc-ZNF827-4:3 No - lnc-ARFIP1-1:3 No - lnc-APELA-2:1 No - lnc-TLL1-3:2 No - lnc-GALNT7-2:2 No - lnc-DCTD-21:2 No - lnc-IRX1-5:3 No - lnc-ADCY2-3:3 No - lnc-CDH6-18:2 No - lnc-NPR3-2:5 No - lnc-DNAJC21-1:1 No - lnc-SELENOP-1:6 No - lnc-ARL15-5:2 No - lnc-ZSWIM6-2:2 No - lnc-PIK3R1-3:3 No - lnc-CCDC125-13:2 No - lnc-AK6-1:4 No - lnc-TMEM174-1:7 No - lnc-NSA2-1:4 No - lnc-AP3S1-3:3 No - lnc-SEMA6A-6:1 No - lnc-CDC42SE2-3:2 No - lnc-P4HA2-6:2 No - lnc-PDLIM4-4:2 No - lnc-NDFIP1-1:3 No - lnc-KIF4B-1:3 No - lnc-LSM11-8:2 No - lnc-ADRA1B-1:2 Yes chr3L:22035003-22065279 TRIM52-AS1:19 No - lnc-FOXQ1-29:2 No - lnc-ECI2-32:5 No - lnc-CDYL-10:2 No - lnc-BMP6-106:126 No - lnc-TBC1D7-5:2 No - lnc-PHACTR1-1:4 No - lnc-RNF182-1:3 No - lnc-SOX4-4:1 No - CASC15:24 No - lnc-ABT1-3:11 No - lnc-HIST1H2BJ-2:3 No - lnc-DAAM2-9:3 No - LINC01276:3 No - lnc-LMBRD1-2:2 No - lnc-MEI4-15:3 No - lnc-TPBG-3:3 No - lnc-MANEA-8:2 No - lnc-KLHL32-4:11 No - lnc-GRIK2-9:2 No - lnc-FIG4-1:3 No - lnc-HDAC2-10:2 No - lnc-TBC1D32-5:1 No - lnc-CLVS2-2:4 No - lnc-TRMT11-1:6 No - lnc-CENPW-3:2 No - lnc-ARG1-2:1 No - lnc-ARG1-1:2 No - lnc-SLC2A12-5:2 No - lnc-SCAF8-1:3 No - lnc-QKI-5:3 No - lnc-FGFR1OP-6:3 No - lnc-GPR31-3:1 No - lnc-RADIL-2:3 No - lnc-PHF14-7:2 No - lnc-PHF14-8:2 No - lnc-ARL4A-54:8 No - lnc-KLHL7-2:2 Yes chr2R:17734419-17737269 lnc-NPSR1-1:2 No - lnc-ZNF716-10:3 No - lnc-GUSB-13:2 No - lnc-TYW1-8:2 No - lnc-METTL27-1:2 No - lnc-MDH2-2:2 No - lnc-FZD1-2:5 No - lnc-ASB4-1:3 No - lnc-TRRAP-2:2 No - lnc-CUX1-1:2 No - lnc-DNAJB9-4:2 No - lnc-LSMEM1-1:2 No - lnc-CAPZA2-1:1 No - lnc-STMP1-4:2 No - lnc-STMP1-8:5 No - lnc-EZH2-1:3 No - lnc-DEFA6-1:2 No - lnc-PRAG1-5:2 No - lnc-ERI1-6:2 No - lnc-TNKS-4:2 No - lnc-ATP6V1B2-8:2 No - lnc-PPP2R2A-4:2 No - lnc-EXTL3-1:3 No - lnc-DUSP26-6:2 No - lnc-IDO2-1:3 No - lnc-PPDPFL-4:4 No - lnc-SLCO5A1-11:2 No - lnc-CHMP4C-3:3 No - lnc-CA2-3:1 No - lnc-CPQ-3:2 No - lnc-EBAG9-6:2 No - lnc-KHDRBS3-8:3 No - lnc-ACER2-5:2 No - lnc-DMRTA1-16:2 No - lnc-ELAVL2-3:3 No - lnc-SPINK4-4:8 No - lnc-DNAJB5-5:2 No - lnc-ANXA1-4:3 No - lnc-TLE4-10:2 No - lnc-NTRK2-7:2 No - PTCSC2:2 No - lnc-RNF20-5:2 No - lnc-RNF20-6:2 No - lnc-UGCG-1:3 No - lnc-MED27-1:2 No - lnc-ARSF-9:2 No - lnc-PUDP-2:2 No - lnc-EGFL6-8:4 No - lnc-GK-8:2 No - lnc-TAB3-2:2 No - lnc-KRBOX4-1:2 No - lnc-NDUFB11-1:2 No - lnc-PABPC5-5:2 No - lnc-HTR2C-3:2 No - lnc-KLHL13-4:2 No - lnc-KDM5D-8:2 No - lnc-RBMY1B-1:7 No - lnc-ST8SIA6-1:1 No - lnc-SIRT1-5:1 Yes chr3L:1313696-1318330 lnc-IFT46-1:8 Yes chr3R:14263358-14286903 lnc-PPIAL4A-4:4 No - lnc-AGTRAP-2:1 No - lnc-PMVK-4:1 No - lnc-PMVK-3:1 No - lnc-PMVK-2:1 No - lnc-FAM86C1-5:1 No - lnc-FAM86C1-4:1 No - lnc-FAM86C1-3:1 No - lnc-FAM86C1-2:1 No - lnc-CLEC20A-9:1 No - lnc-RRP8-4:1 No - lnc-RRP8-3:1 No - lnc-RRP8-2:1 No - lnc-TP53BP2-4:3 No - lnc-TP53BP2-3:14 No - lnc-BICDL1-3:1 No - lnc-MUL1-1:1 No - lnc-MUL1-2:1 No - lnc-CDCA3-4:1 No - lnc-SIX4-2:1 Yes chr2R:10738617-10739829 lnc-ATP6V1D-6:1 Yes chrX:255674-258469 lnc-RPLP1-5:1 No - lnc-AGBL1-8:1 No - lnc-NPIPA7-10:1 No - lnc-ORC6-5:1 Yes chrX:13370606-13380160 lnc-CEMP1-8:1 No - lnc-CES2-3:1 No - lnc-SLC16A11-6:1 No - lnc-CTDNEP1-1:1 No - lnc-CA6-7:1 Yes chr3L:8449922-8472669 lnc-CA6-6:1 Yes chr3L:8449922-8472669 lnc-TTC4-3:1 No - lnc-RPL36-2:2 Yes chr3R:24817464-24822350 lnc-TMEM259-3:1 Yes chr3L:4114289-4122388 lnc-PRDX2-2:1 Yes chr2L:19030844-19033498 lnc-GAMT-3:1 Yes chr2L:6920704-6932057 lnc-GAMT-4:1 Yes chr2L:6920704-6932057 lnc-GAMT-5:1 Yes chr2L:6920704-6932057 lnc-CSNK1G2-1:3 Yes chr3R:16272452-16304768 lnc-ZNF284-2:1 No - lnc-CDC42EP5-3:1 No - lnc-CDC42EP5-4:1 No - lnc-CDC42EP5-5:1 No - lnc-CRYAA-5:1 No - lnc-CRYAA-4:1 No - lnc-RBM45-3:1 No - lnc-RBM45-4:1 No - lnc-RBM45-5:1 No - lnc-RBM45-6:1 No - lnc-RBM45-8:1 No - lnc-PJVK-3:1 No - lnc-PJVK-5:1 No - lnc-PJVK-1:1 No - lnc-NEMP2-7:1 Yes chr3L:4153618-4160932 lnc-ARMC9-1:1 Yes chr3R:29153524-29157255 lnc-MKL1-4:1 Yes chr4:649041-663103 lnc-CCDC85A-5:1 Yes chr3R:26864605-26866807 lnc-ASPRV1-2:1 No - lnc-NR2C2-4:1 No - lnc-NR2C2-6:1 No - lnc-CPLX1-9:1 Yes chr3L:16588475-16590132 lnc-CPLX1-8:1 Yes chr3L:16588475-16590132 lnc-EVC-1:1 No - lnc-EVC-2:1 No - lnc-CPLX1-7:1 Yes chr3L:16588475-16590132 lnc-CPLX1-6:1 Yes chr3L:16588475-16590132 lnc-CPLX1-5:1 Yes chr3L:16588475-16590132 lnc-EXOC3-8:1 No - lnc-EXOC3-9:1 No - lnc-EXOC3-10:1 No - lnc-EXOC3-11:1 No - lnc-CCNH-2:1 No - lnc-CCNH-3:1 No - lnc-CCNH-4:1 No - lnc-OTULIN-6:1 No - lnc-OTULIN-7:1 No - lnc-FAM13B-2:1 Yes chr2L:12398274-12402023 lnc-TMCO6-1:1 Yes chr3R:9063132-9065078 lnc-PFDN6-1:1 No - lnc-MLN-2:1 No - lnc-MRPS18A-5:1 No - lnc-PAK1IP1-3:1 No - lnc-DNAAF5-4:1 Yes chr3L:20816118-20836048 lnc-AOC1-1:1 No - lnc-HNRNPA2B1-8:1 No - lnc-COA1-2:1 No - lnc-SRPK2-13:1 Yes chr3L:1885657-1891462 lnc-SRPK2-12:1 Yes chr3L:1885657-1891462 lnc-SRPK2-11:1 Yes chr3L:1885657-1891462 lnc-FSCN3-8:1 Yes chr3L:259043-264380 lnc-ENG-1:1 No - lnc-TMEM187-2:1 Yes chr4:359938-375554 lnc-VENTX-1:1 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-AKR1E2-13:1 Yes chr2R:10109740-10117457 lnc-BAMBI-3:1 Yes chrX:17068717-17077897 lnc-MAP3K8-8:1 No - lnc-CCDC7-13:1 Yes chrX:8061645-8070237 lnc-EPC1-1:1 No - lnc-NRP1-5:1 Yes chrX:8061645-8070237 lnc-NPY4R2-6:1 No - lnc-NPY4R2-5:2 No - lnc-CISD1-2:1 No - lnc-CDK1-8:1 Yes chr3L:7655389-7718395 lnc-SIRT1-6:1 Yes chr3L:1313696-1318330 lnc-SIRT1-7:1 Yes chr3L:1313696-1318330 lnc-ASAH2-3:1 No - lnc-TET1-4:1 Yes chrX:10010481-10014279 lnc-JMJD1C-10:1 Yes chr3R:18090803-18135583 lnc-JMJD1C-9:1 Yes chr3R:18090803-18135583 lnc-CTNNA3-2:1 No - lnc-CTNNA3-3:1 No - lnc-CTNNA3-4:1 No - lnc-FAM149B1-7:1 Yes chrX:16554627-16560016 lnc-FAM149B1-9:1 Yes chrX:16554627-16560016 lnc-AIFM2-3:1 Yes chr3R:16502770-16571363 lnc-SEC24C-2:1 Yes chr2L:9428669-9431052 lnc-C10orf105-6:1 No - lnc-C10orf105-5:1 No - lnc-ZSWIM8-3:1 No - lnc-KAT6B-4:1 Yes chr2R:7243024-7245776 lnc-USP6NL-1:1 No - lnc-SNCG-1:1 Yes chr2L:5219000-5271384 lnc-PTEN-4:1 No - lnc-PTEN-3:1 No - lnc-PTEN-2:1 No - lnc-PAPSS2-4:1 Yes chr2L:10256319-10261049 lnc-PAPSS2-6:1 Yes chr2L:10256319-10261049 lnc-PAPSS2-7:1 Yes chr2L:10256319-10261049 lnc-PAPSS2-9:1 Yes chr2L:10256319-10261049 lnc-HHEX-2:1 No - lnc-HHEX-1:1 No - lnc-ZNF518A-5:1 No - lnc-ZNF518A-6:1 No - lnc-FRAT1-6:1 Yes chr3R:21949114-22014539 lnc-PGAM1-2:1 Yes chrX:13619276-13624408 lnc-ZFYVE27-2:1 No - lnc-SLC25A28-3:1 No - lnc-SCD-4:1 No - lnc-NDUFB8-4:2 No - lnc-NDUFB8-5:2 No - lnc-PDZD7-3:12 No - lnc-LDB1-1:1 No - lnc-IDI2-2:1 No - lnc-FBXL15-1:1 Yes chr3R:8240747-8243792 lnc-TRIM8-1:1 Yes chr3R:12689873-12691468 lnc-SLK-2:1 No - lnc-HSPA12A-2:2 No - lnc-HSPA12A-3:1 No - lnc-PDZD8-7:1 No - lnc-PDZD8-6:1 No - lnc-PDZD8-5:1 No - lnc-DUSP5-1:1 No - lnc-PRPF18-10:1 No - lnc-RGS10-3:1 Yes chr3R:24043056-24048265 lnc-TCF7L2-6:1 Yes chr3L:691486-692919 lnc-TCF7L2-5:1 Yes chr3L:691486-692919 lnc-HSPA14-2:1 Yes chr3R:15259864-15263458 lnc-EEF1AKMT2-1:1 Yes chr2L:2978411-2979288 lnc-HMX3-2:1 No - lnc-HMX3-1:1 No - lnc-ZRANB1-3:1 No - lnc-DNAJC6-3:1 Yes chr3R:10887345-10889588 lnc-FUBP1-57:1 Yes chr2R:14239932-14243655 lnc-FUBP1-56:3 Yes chr2R:14239932-14243655 lnc-FUBP1-6:4 Yes chr2R:14239932-14243655 lnc-FUBP1-5:2 Yes chr2R:14239932-14243655 lnc-TCTEX1D1-2:1 Yes chr3R:9516007-9527237 lnc-IL12RB2-5:1 No - lnc-SRSF11-4:1 Yes chr2R:14935660-14940722 lnc-MIGA1-1:1 Yes chr2R:14239932-14243655 lnc-HTR3B-1:1 No - lnc-HTR3B-2:1 No - lnc-APOC3-7:1 No - lnc-IL10RA-3:1 No - lnc-CD3D-7:1 Yes chr2L:10975522-10976399 lnc-AKIP1-5:1 No - lnc-PATE3-1:1 No - lnc-JAM3-7:1 No - lnc-HS2ST1-3:1 Yes chr2L:19442833-19444750 lnc-DEAF1-1:1 No - lnc-TMEM41B-4:1 Yes chr3L:8116179-8121579 lnc-MICAL2-6:1 Yes chr3L:5752973-5761886 lnc-DNTTIP2-4:1 Yes chr2L:6007364-6012338 lnc-DNTTIP2-3:1 Yes chr2L:6007364-6012338 lnc-LRRC8B-1:1 No - lnc-LRRC8B-2:1 No - lnc-LRRC8B-3:1 No - lnc-LRRC8B-4:1 No - LINC01708:26 No - lnc-LRRC8C-7:2 No - lnc-LRRC8C-6:2 No - lnc-RASSF10-4:1 Yes chrX:15804370-15827682 lnc-RASSF10-5:1 Yes chrX:15804370-15827682 lnc-COPB1-35:1 Yes chr2L:13232039-13233058 lnc-ARNTL-4:1 Yes chrX:2201820-2203866 lnc-ARNTL-5:1 Yes chrX:2201820-2203866 lnc-SPON1-6:1 Yes chrX:2201820-2203866 lnc-CYP2R1-1:1 No - lnc-RPL5-1:1 No - lnc-PDE3B-3:1 Yes chr2L:13232039-13233058 lnc-RPS13-2:1 Yes chr3L:11774650-11790013 lnc-NUCB2-10:1 No - lnc-NUCB2-9:1 No - lnc-AKNAD1-2:2 No - lnc-PSRC1-1:1 Yes chr2L:3035493-3037403 lnc-PTBP2-5:1 No - lnc-PTBP2-4:1 No - lnc-ST7L-7:1 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-CCDC34-6:1 Yes chr2L:13982743-14001248 lnc-AGL-3:1 No - lnc-AGL-2:1 No - lnc-AGL-1:1 No - lnc-IMMP1L-1:1 No - lnc-DCDC1-4:1 Yes chrX:15700172-15701259 lnc-SYT6-1:1 No - lnc-PNPLA2-2:7 Yes chr2R:16586129-16586732 lnc-CCDC73-5:1 No - lnc-CCDC73-6:1 No - lnc-BCAS2-2:1 No - lnc-BCAS2-1:1 No - lnc-KIAA1549L-9:1 Yes chr3L:543060-581099 lnc-KIAA1549L-4:2 Yes chr3L:543060-581099 lnc-ENO1-3:1 Yes chr3L:8449922-8472669 lnc-PEX14-3:1 No - lnc-PEX14-2:1 No - lnc-TMEM167B-2:1 Yes chr2L:20093088-20093849 lnc-FJX1-1:1 No - lnc-C11orf94-2:1 Yes chr3L:1196317-1199339 lnc-NOTCH2-3:1 No - lnc-CSF1-4:1 No - lnc-ACCS-2:1 Yes chr2R:16145904-16148719 lnc-SLC6A17-3:1 No - lnc-SLC6A17-2:1 No - lnc-KCNC4-3:1 No - lnc-ARFGAP2-2:1 No - lnc-MYBPC3-2:1 Yes chrX:15089682-15113762 lnc-MYBPC3-1:1 Yes chrX:15089682-15113762 lnc-WNT2B-1:1 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-CLSTN1-1:1 No - lnc-SMTNL1-1:1 No - lnc-SERPING1-3:1 Yes chrX:6540771-6589173 lnc-SERPING1-2:1 Yes chrX:6540771-6589173 lnc-HIST2H3PS2-8:1 No - lnc-OR1S1-1:1 No - lnc-HIST2H3PS2-6:1 No - lnc-MAN1A2-2:1 No - lnc-DFFA-2:5 Yes chr2R:16751503-16772671 lnc-DFFA-4:5 No - lnc-SCGB1D4-4:1 No - lnc-SCGB1D4-5:1 No - lnc-EEF1G-1:1 No - lnc-MTA2-3:1 No - lnc-ROM1-5:1 Yes chrX:21600502-21605264 lnc-HRASLS5-2:1 No - lnc-HRASLS2-1:1 No - lnc-LCE1C-1:1 No - lnc-LCE1C-2:1 No - lnc-NAA40-1:1 No - lnc-C1orf167-1:1 No - lnc-NBPF10-1:1 No - lnc-DENND4B-4:1 Yes chr3L:10664739-10690734 lnc-RNF223-3:1 No - lnc-SPDYC-2:1 Yes chr3L:9888762-9893319 lnc-C1orf43-1:1 Yes chr2R:8067977-8078815 lnc-C1orf43-2:1 Yes chr2R:8067977-8078815 lnc-C1orf43-3:1 Yes chr2R:8067977-8078815 lnc-CDC42EP2-1:1 Yes chr2R:5259004-5295965 lnc-FRMD8-3:1 No - lnc-TIGD3-3:1 Yes chr3R:25131306-25136709 lnc-TIGD3-4:1 Yes chr3R:25131306-25136709 lnc-TIGD3-5:1 Yes chr3R:25131306-25136709 lnc-TIGD3-6:1 Yes chr3R:25131306-25136709 lnc-NBPF15-3:1 No - lnc-MRPL11-2:1 Yes chr3R:8344400-8347465 lnc-PMVK-8:1 No - lnc-PMVK-7:1 No - lnc-PMVK-6:1 No - lnc-PMVK-5:1 No - lnc-CST6-2:1 No - lnc-NPAS4-11:1 No - lnc-NPAS4-5:1 No - lnc-NPAS4-6:1 No - lnc-NPAS4-7:1 No - lnc-NPAS4-8:1 No - lnc-NPAS4-10:1 No - lnc-NPAS4-4:1 No - lnc-NPAS4-3:1 No - lnc-NPAS4-2:1 No - lnc-BBS1-1:1 Yes chrX:2023822-2042311 lnc-PKLR-4:1 Yes chr3L:19590773-19598755 lnc-PKLR-5:1 Yes chr3L:19590773-19598755 lnc-PKLR-6:1 Yes chr3L:19590773-19598755 lnc-PKLR-7:1 Yes chr3L:19590773-19598755 lnc-PPIAL4C-8:1 No - lnc-UNC93B1-8:1 No - lnc-LRFN4-2:1 Yes chr2R:9850703-9861543 lnc-CD1B-6:1 No - lnc-RHOD-3:2 Yes chrX:13359248-13368179 lnc-OAZ3-11:1 No - lnc-OAZ3-12:1 No - lnc-GRK2-1:1 Yes chr3R:9052495-9063245 lnc-OR6P1-2:1 No - lnc-OR10X1-1:1 No - lnc-OR10X1-3:1 No - lnc-OR10X1-5:1 No - lnc-TBC1D10C-2:1 Yes chr3L:18870045-18872553 lnc-LCE5A-5:1 No - lnc-LCE5A-4:1 No - lnc-CRCT1-1:1 No - lnc-CRCT1-2:1 No - lnc-LRP5-3:1 No - lnc-PHOX2A-2:1 No - lnc-C1orf68-1:1 No - lnc-RRM1-6:1 Yes chrX:15934495-15940451 lnc-LOR-1:1 No - lnc-ANO1-4:1 No - lnc-LOR-2:1 No - lnc-LOR-3:1 No - lnc-LOR-5:1 No - lnc-STARD10-2:1 Yes chr3L:9137860-9145693 lnc-STARD10-3:1 Yes chr3L:9137860-9145693 lnc-STARD10-4:1 Yes chr3L:9137860-9145693 lnc-DEFB131B-6:1 Yes chrX:5329876-5332435 lnc-DEFB131B-4:1 Yes chrX:5329876-5332435 lnc-DEFB131B-3:1 Yes chrX:5329876-5332435 lnc-TNFRSF4-1:3 No - lnc-OR2AT4-3:1 No - lnc-OR2AT4-2:1 No - lnc-P2RY2-7:1 Yes chr3L:9137860-9145693 lnc-P2RY2-6:1 Yes chr3L:9137860-9145693 lnc-P2RY2-5:1 Yes chr3L:9137860-9145693 lnc-PAK1-3:1 No - lnc-PAK1-2:1 No - lnc-PIGC-3:1 No - lnc-GDPD4-4:1 Yes chr3R:6350896-6361614 lnc-GDPD4-5:1 Yes chr3R:6350896-6361614 lnc-CLNS1A-4:1 No - lnc-POLD3-8:1 No - lnc-CLEC20A-8:4 No - lnc-FAM181B-4:1 No - lnc-CCDC89-3:1 No - lnc-ACBD6-5:1 Yes chr2L:19890201-19892550 lnc-ACBD6-6:1 Yes chr2L:19890201-19892550 lnc-CCDC89-2:1 Yes chr3R:14804092-14875488 lnc-CCDC89-6:1 Yes chr3R:14804092-14875488 lnc-CCDC89-7:1 Yes chr3R:14804092-14875488 lnc-APCS-4:1 No - lnc-ATP1A2-1:1 Yes chr3R:20948714-20976239 lnc-RNH1-1:1 No - lnc-TIMM10B-2:1 Yes chrX:19616663-19618537 lnc-TIMM10B-1:1 Yes chrX:19616663-19618537 lnc-LY9-2:1 No - lnc-NUF2-6:1 No - lnc-SESN3-6:1 No - lnc-KCNT2-4:1 No - lnc-MGST3-5:1 Yes chr3R:24290172-24293371 lnc-UCK2-5:1 No - lnc-ATP6V1G3-5:1 No - lnc-BLZF1-4:1 No - lnc-METTL13-4:1 No - lnc-C1orf105-5:1 No - lnc-C1orf105-4:1 No - lnc-C1orf105-3:1 No - lnc-SUCO-1:1 No - lnc-ETNK2-6:1 No - lnc-ETNK2-5:1 No - lnc-ETNK2-3:1 No - lnc-PRDX6-6:1 No - lnc-PRDX6-5:1 No - lnc-DRD2-5:1 Yes chr3R:15715505-15716585 lnc-PPP1R15B-5:1 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-EPHA2-3:1 No - lnc-EPHA2-2:1 No - lnc-EPHA2-1:1 No - lnc-C1orf74-7:1 No - lnc-C1orf74-6:1 No - lnc-C1orf74-5:1 No - lnc-C1orf74-4:1 No - lnc-C1orf74-3:1 No - lnc-IRF6-3:2 Yes chr3R:4314455-4319069 lnc-CELA2B-1:1 Yes chr3L:25798441-26014112 lnc-CELA2B-2:1 Yes chr3L:25798441-26014112 lnc-RAB3GAP2-8:1 No - lnc-TMEM263-3:1 Yes chr2L:20643351-20645791 lnc-DAO-2:1 Yes chr3R:24938710-24944956 lnc-VSIG10-2:1 Yes chrX:19569721-19579800 lnc-ATP2A2-3:1 No - lnc-ATP2A2-8:1 Yes chrX:6597088-6599699 lnc-TAOK3-10:1 No - lnc-TAOK3-12:1 No - lnc-RAB35-2:1 Yes chr3L:12507998-12514815 lnc-C12orf43-4:1 Yes chr3R:25881984-25888230 lnc-RHOF-2:1 Yes chrX:2782906-2790567 lnc-SIRT4-2:1 No - lnc-ACADS-1:1 No - lnc-STX2-14:1 No - lnc-STX2-15:1 No - lnc-NVL-5:1 No - lnc-STX2-16:1 No - lnc-DDX51-11:1 Yes chrX:1012779-1046040 lnc-RGS18-10:1 No - lnc-RAN-6:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-RAN-7:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-PTPRC-9:1 No - lnc-LBR-2:1 No - lnc-H2AFJ-6:1 Yes chr2R:10800420-10808938 lnc-IGFN1-2:1 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-STRAP-3:1 Yes chr2R:12425483-12426975 lnc-NAV1-4:1 No - lnc-SIPA1L2-6:1 No - lnc-INTS13-3:1 No - lnc-ERGIC2-6:1 Yes chrX:2201820-2203866 lnc-ETNK1-11:1 Yes chr3R:24349182-24356241 lnc-ETNK1-10:1 No - lnc-MDM4-6:1 Yes chr2R:8009119-8013755 lnc-MDM4-7:1 Yes chr2R:8009119-8013755 lnc-NFASC-4:1 No - lnc-SINHCAF-4:1 No - lnc-MTRNR2L11-8:2 No - lnc-CNTN2-5:1 Yes chrX:8517373-8555170 lnc-FGFR1OP2-3:1 Yes chr3R:16264271-16266891 lnc-FH-2:1 Yes chrX:16838173-16844433 lnc-REP15-2:1 Yes chr3L:13513254-13516276 lnc-CCDC91-1:1 No - lnc-MAP1LC3C-4:1 Yes chr2L:21166046-21168581 lnc-MAP1LC3C-5:1 Yes chr2L:21166046-21168581 lnc-MAP1LC3C-6:1 Yes chr2L:21166046-21168581 lnc-MAP1LC3C-7:1 Yes chr2L:21166046-21168581 lnc-CEP170-9:1 No - lnc-CEP170-8:1 No - lnc-CEP170-7:1 No - lnc-AKT3-4:1 No - lnc-CAMK1G-9:1 No - lnc-ETFBKMT-5:1 No - lnc-CAMK1G-8:1 No - lnc-KIAA1551-3:2 No - lnc-GXYLT1-5:1 No - lnc-DNM1L-4:1 No - lnc-HHAT-4:1 Yes chrX:14955477-15009989 lnc-HNRNPU-6:1 Yes chr2R:21142368-21143261 lnc-SLC38A1-3:1 No - lnc-SPATA17-7:1 No - lnc-AMIGO2-6:1 No - lnc-AMIGO2-7:1 No - lnc-SLC48A1-6:1 No - lnc-TMEM106C-4:1 No - lnc-MIXL1-2:15 Yes chrX:19701927-19704259 lnc-MIXL1-4:1 No - lnc-MIXL1-3:1 No - lnc-DAZAP2-6:1 Yes chr2R:12593604-12612068 lnc-MRTO4-3:1 Yes chr2L:8054322-8071624 lnc-KRT74-2:1 No - lnc-KRT74-1:1 No - lnc-KRT72-1:1 No - lnc-ANKRD33-8:1 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-ANKRD33-7:1 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-ANKRD33-5:1 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-ANKRD33-4:1 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-GGPS1-12:1 No - lnc-B4GALNT3-6:1 Yes chr3R:12695129-12697379 lnc-KRT7-3:1 No - lnc-CBX5-1:1 No - lnc-KRT18-5:1 No - lnc-KRT18-4:1 No - lnc-PPP1R1A-3:1 No - lnc-TESPA1-2:2 No - lnc-TESPA1-1:2 No - lnc-NCKAP1L-2:1 No - lnc-OR6C6-1:1 No - lnc-DNAJC14-3:1 No - lnc-DNAJC14-2:1 No - lnc-DNAJC14-1:1 No - lnc-SARNP-1:1 No - lnc-PMEL-3:1 Yes chr2R:23855954-23856936 lnc-PMEL-4:1 No - lnc-ORMDL2-2:1 No - lnc-FAM19A2-6:2 No - lnc-ERBB3-1:1 No - lnc-SLC16A7-11:1 No - lnc-SLC16A7-8:1 No - lnc-BEST3-4:1 Yes chr2R:24162489-24173660 lnc-BEST3-5:1 Yes chr2R:24162489-24173660 lnc-MON2-6:1 Yes chrX:22534831-22540383 lnc-KCNC2-8:1 No - lnc-MON2-8:1 No - lnc-E2F7-8:1 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-IRAK3-4:1 No - lnc-LTBR-3:1 No - lnc-DYRK2-11:1 No - lnc-DYRK2-10:1 No - lnc-DYRK2-9:1 No - lnc-DYRK2-8:1 No - lnc-DYRK2-7:1 No - lnc-CEP290-1:1 No - lnc-NUP107-3:1 Yes chr3L:1859115-1862239 lnc-COPS7A-4:1 No - lnc-DEPDC4-3:1 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-C12orf74-11:2 No - lnc-VEZT-8:1 No - lnc-COPS7A-2:1 No - lnc-APAF1-6:1 Yes chr3R:23375928-23384777 lnc-ALKBH2-5:1 Yes chr2R:24014917-24017198 lnc-SVOP-3:1 No - lnc-PARPBP-9:1 No - lnc-PARPBP-10:1 No - lnc-MYL2-6:1 Yes chr3R:23286093-23288051 lnc-HSP90B1-5:1 No - lnc-PZP-9:1 No - lnc-CCNL2-1:1 No - lnc-HSPH1-7:1 No - lnc-LHFPL6-9:1 No - lnc-SMIM2-2:5 No - lnc-RNASEH2B-9:1 No - lnc-RNASEH2B-8:1 No - lnc-RNASEH2B-7:1 No - lnc-RNASEH2B-6:1 No - lnc-SERPINE3-5:1 Yes chr2L:10423291-10425482 lnc-EDNRB-5:1 No - lnc-EDNRB-6:1 No - lnc-EDNRB-7:1 No - lnc-EDNRB-8:1 No - lnc-EDNRB-9:1 No - lnc-EDNRB-10:1 No - lnc-EDNRB-11:1 No - lnc-HS6ST3-1:1 Yes chr3L:18872747-18878245 lnc-HNRNPR-2:1 No - lnc-DNAJC3-2:1 Yes chr3R:19929277-20008512 lnc-SKI-6:1 Yes chr2R:14944458-14962969 lnc-IPO5-4:1 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-FARP1-6:1 No - lnc-ANKRD10-12:1 No - lnc-SOX1-7:1 No - lnc-SPACA7-26:1 Yes chrX:13736570-13744683 lnc-PABPC3-4:1 No - lnc-ATP8A2-2:1 Yes chr3R:19645026-19646906 lnc-HMGN2-4:1 Yes chrX:22529964-22536371 lnc-RPL21-3:1 No - lnc-RPS6KA1-1:1 No - lnc-PRKCZ-1:1 Yes chr2L:7891187-7984196 lnc-AUNIP-5:1 Yes chrX:10266792-10325958 lnc-SLC35E2B-1:1 Yes chr3L:20771528-20776931 lnc-GPN2-3:1 Yes chr3R:17687818-17718350 lnc-G2E3-10:1 Yes chr3R:18303279-18314407 lnc-G2E3-9:1 Yes chr3R:18303279-18314407 lnc-HOMEZ-2:1 No - lnc-STRN3-13:1 Yes chr3R:18303279-18314407 lnc-EGLN3-6:1 No - lnc-CFL2-4:2 Yes chr3R:31793981-31799799 lnc-CFL2-2:1 Yes chr3R:31793981-31799799 lnc-CFL2-3:1 Yes chr3R:31793981-31799799 lnc-CDKN3-5:1 No - lnc-CDKN3-4:1 No - lnc-CDKN3-3:1 No - lnc-RCC1-5:1 Yes chr3L:3714826-3806459 lnc-RAB42-2:1 No - lnc-RAB42-1:1 No - lnc-NAA30-3:1 No - lnc-TOMM20L-3:1 No - lnc-TOMM20L-4:1 No - lnc-NID2-8:1 Yes chr2L:431227-448701 lnc-DAAM1-6:1 No - lnc-RPA2-3:1 Yes chr2R:17003563-17005149 lnc-SYNE2-5:1 No - lnc-SIX4-4:1 Yes chr2R:10738617-10739829 lnc-KCNH5-9:1 No - lnc-KCNH5-8:1 No - lnc-PPP2R5E-3:1 No - lnc-ZFYVE26-3:1 No - lnc-ZFYVE1-3:1 No - lnc-OPRD1-2:1 Yes chr2R:19229063-19243751 lnc-OPRD1-3:1 Yes chr2R:19229063-19243751 lnc-ABHD4-5:1 No - lnc-PTGR2-2:1 No - lnc-ANGEL1-9:1 Yes chr3L:8183361-8186671 lnc-ANGEL1-8:1 No - lnc-CEP128-5:1 No - lnc-JDP2-1:1 No - lnc-CEP128-3:1 No - lnc-TMEM200B-2:1 Yes chr2R:19229063-19243751 lnc-FLVCR2-2:1 No - lnc-OPRD1-4:1 Yes chr2R:19229063-19243751 lnc-OPRD1-5:1 Yes chr2R:19229063-19243751 lnc-GLRX5-3:1 No - lnc-DLK1-35:94 No - lnc-DLK1-16:1 No - lnc-DYNC1H1-5:1 Yes chr3R:18167757-18180049 lnc-AHNAK2-4:1 Yes chr2L:21166046-21168581 lnc-AHNAK2-3:1 Yes chr2L:21166046-21168581 lnc-AHNAK2-2:1 Yes chr2L:21166046-21168581 lnc-AHNAK2-1:1 Yes chr2L:21166046-21168581 lnc-RCOR1-3:1 No - lnc-C14orf180-3:1 Yes chr3R:23985213-23986569 lnc-OR4E1-9:2 No - lnc-OR4E1-10:2 No - lnc-ADGRB2-4:4 No - lnc-ADGRB2-3:1 No - lnc-ADGRB2-1:1 No - lnc-COL16A1-1:1 No - lnc-TMEM234-6:1 Yes chr3L:19807232-19810398 lnc-TMEM234-5:1 Yes chr3L:19807232-19810398 lnc-TMCO5A-2:1 No - lnc-ACTC1-1:2 Yes chr3R:11882790-11892382 lnc-FAM98B-3:1 No - lnc-RASGRP1-8:1 No - lnc-RASGRP1-7:1 Yes chr2R:14759646-14769423 SRP14-AS1:33 No - lnc-CHST14-1:1 No - lnc-BAHD1-3:1 Yes chr2L:16879517-16886319 lnc-PLCB2-1:3 Yes chr2L:305935-355566 lnc-TYRO3-2:1 No - lnc-RMDN3-4:1 Yes chr3R:30054696-30056037 lnc-EXD1-2:1 No - lnc-CAPN3-2:1 Yes chrX:21600502-21605264 lnc-SLC24A5-4:1 Yes chr3R:9505853-9510324 lnc-SLC24A5-6:1 Yes chr3R:9505853-9510324 lnc-DTWD1-4:1 No - lnc-DTWD1-5:1 No - lnc-DTWD1-6:1 No - lnc-NIPA1-6:1 No - lnc-TEX9-3:1 Yes chr2R:15206527-15213634 lnc-ONECUT1-4:1 No - lnc-TLN2-5:1 No - lnc-PRTG-1:1 Yes chr3L:17530081-17546660 lnc-MNS1-7:1 No - lnc-FBXL22-2:1 Yes chr3R:21887029-21907182 lnc-ALDH1A2-6:1 No - lnc-RAB11A-3:1 Yes chr3L:1715595-1731107 lnc-RAB11A-4:1 Yes chr3L:1715595-1731107 lnc-TFAP2E-2:1 Yes chr2L:2653046-2653926 lnc-TFAP2E-3:1 Yes chr2L:2653046-2653926 lnc-TFAP2E-4:1 Yes chr2L:2653046-2653926 lnc-GOLGA8F-3:1 No - lnc-TFAP2E-5:1 Yes chr2L:2653046-2653926 lnc-RPS27L-4:1 No - lnc-NEO1-2:1 No - lnc-TFAP2E-6:1 No - lnc-TLE3-10:1 No - lnc-TLE3-9:1 No - lnc-WHAMM-8:1 No - lnc-MRPS11-3:1 No - lnc-ISG20-2:1 No - lnc-BLM-3:1 No - lnc-BLM-2:1 No - lnc-MEAF6-6:1 No - lnc-MCTP2-14:1 No - lnc-MCTP2-13:1 No - lnc-MCTP2-12:1 No - lnc-NR2F2-11:1 No - lnc-KLHL25-18:1 No - lnc-AGO1-5:1 Yes chr2R:13943387-13958089 lnc-HAPLN3-4:1 No - lnc-TEKT2-1:2 Yes chr2R:13943387-13958089 lnc-RRAGC-1:1 No - lnc-C15orf41-15:1 No - lnc-AKIRIN1-10:1 No - lnc-AKIRIN1-9:1 No - lnc-AKIRIN1-1:19 No - lnc-DECR2-3:1 Yes chr3L:14190870-14233250 lnc-PABPC4-6:1 Yes chr2R:13864237-13942110 GLIS2-AS1:3 Yes chr2R:12924567-12930644 lnc-PAM16-6:1 Yes chr2R:12924567-12930644 lnc-AKIRIN1-5:1 Yes chrX:11599838-11606288 lnc-HEYL-3:1 No - lnc-TMEM114-5:1 No - lnc-ATF7IP2-5:1 No - lnc-HEYL-2:1 No - lnc-HEYL-1:1 No - lnc-AKIRIN1-3:1 No - lnc-TVP23A-5:1 No - lnc-AKIRIN1-2:1 No - lnc-MKL2-4:1 No - lnc-NDE1-4:1 No - lnc-RRN3-6:1 No - lnc-NPIPA7-9:1 No - lnc-NDUFS5-3:1 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-NDUFS5-4:1 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-ERI2-1:1 No - lnc-CDR2-5:1 Yes chr3L:21031825-21033561 lnc-UBFD1-3:1 Yes chrX:9601030-9604280 lnc-NDUFS5-5:1 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-CHP2-3:1 No - lnc-CHP2-2:1 No - lnc-XPO6-2:1 No - lnc-XPO6-1:1 No - lnc-RBBP6-2:1 Yes chr4:649041-663103 lnc-NPIPB12-1:2 No - lnc-TPSD1-1:1 No - lnc-SH2B1-1:1 No - lnc-ASPHD1-2:1 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-NDUFS5-8:1 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-NDUFS5-9:1 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-SULT1A3-5:1 No - lnc-ITGAL-4:1 No - lnc-ITGAL-5:1 No - lnc-ITGAL-6:1 No - lnc-COX6A2-3:1 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-PRR14-6:1 No - lnc-RNF40-3:1 No - lnc-MSRB1-1:1 Yes chr3R:11221894-11225173 lnc-STX4-2:1 No - lnc-BCKDK-2:1 No - lnc-AHSP-4:1 No - lnc-PPIE-9:1 No - lnc-MT1G-3:1 No - lnc-MT1G-4:1 No - lnc-MT1G-5:1 No - lnc-MT1G-6:1 No - lnc-MT1G-7:1 No - lnc-HNRNPA1P48-17:1 No - lnc-HNRNPA1P48-18:1 No - lnc-MFSD2A-3:1 No - lnc-TK2-9:1 No - lnc-SLC6A2-3:1 No - lnc-CLDN19-1:1 No - lnc-SMPD3-4:1 No - lnc-CHTF8-2:2 No - lnc-CHTF8-8:1 Yes chr2L:18969028-18972004 lnc-RLF-3:1 No - lnc-C1orf174-3:1 Yes chr2L:13283912-13286462 lnc-CDH5-17:1 No - lnc-RLF-2:1 No - lnc-RLF-1:1 No - lnc-CA7-6:1 Yes chr3L:11098412-11100578 lnc-SLC9A3R2-1:1 No - lnc-CLEC18B-9:1 Yes chr4:501810-540874 lnc-ZFHX3-6:2 No - lnc-PLA2G15-3:1 No - lnc-CDH1-4:1 No - lnc-TANGO6-3:1 No - lnc-FBXO31-9:2 No - lnc-FBXO31-5:2 No - lnc-FBXO31-4:3 No - lnc-C16orf95-2:22 No - lnc-C16orf95-2:21 No - lnc-C16orf95-6:1 No - lnc-CA5A-9:1 No - lnc-CA5A-10:1 No - lnc-PKMYT1-3:1 No - lnc-CA5A-11:1 No - lnc-DYNLRB2-8:1 No - lnc-CA5A-12:1 No - lnc-DYNLRB2-7:1 No - lnc-DYNLRB2-6:1 No - lnc-CA5A-13:1 No - lnc-CA5A-14:1 No - lnc-CYBA-6:1 No - lnc-HSBP1-6:1 No - lnc-HSBP1-3:1 No - lnc-DNAAF1-6:1 Yes chr3L:21613797-21617376 lnc-DNAAF1-5:1 Yes chr3L:21613797-21617376 lnc-DNAAF1-4:1 Yes chr2L:16842300-16848716 lnc-DNAAF1-3:1 Yes chr2L:16842300-16848716 lnc-EXO5-2:1 No - lnc-KLF18-5:1 No - lnc-BANP-8:1 No - lnc-ZNF469-3:1 No - lnc-PPCS-4:1 No - lnc-PPCS-1:1 No - lnc-COIL-4:1 No - lnc-TBX2-5:1 Yes chrX:11816898-11837460 lnc-TBX4-1:1 No - lnc-TBX4-2:1 No - lnc-EFCAB3-3:1 No - lnc-SKA2-6:1 Yes chrX:10205292-10212374 lnc-SKA2-7:1 Yes chrX:10205292-10212374 lnc-SKA2-8:1 Yes chrX:10205292-10212374 lnc-PTRH2-9:2 No - lnc-RGS9-4:1 No - lnc-NACA2-3:1 No - lnc-TNK1-2:1 No - lnc-NLGN2-3:1 Yes chr3L:4108186-4114157 lnc-SSTR2-6:1 Yes chr2R:11899517-11901394 lnc-RPL38-5:1 No - lnc-CHRNE-2:1 Yes chr3L:2554847-2586540 lnc-CHRNE-1:1 Yes chr3L:2554847-2586540 lnc-CDC42EP4-2:1 No - lnc-ENGASE-3:1 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-CBX2-6:1 No - lnc-RNF157-1:1 No - lnc-CBX8-4:1 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-KDM6B-2:1 No - lnc-CBX8-6:1 No - lnc-COX10-9:1 No - lnc-HS3ST3B1-6:1 No - lnc-HS3ST3B1-4:1 No - lnc-SAT2-2:9 Yes chr3L:7650548-7759123 lnc-DPH1-3:1 Yes chr2L:13212335-13215350 lnc-TRPV2-3:1 No - lnc-MYH3-2:1 No - lnc-CCDC163-1:1 Yes chr3R:19044882-19094270 lnc-PITPNA-1:1 Yes chr2R:17005451-17007501 lnc-FAM83G-4:1 Yes chr3R:30592971-30601489 lnc-ULK2-5:1 Yes chr2L:16288290-16291195 lnc-ERAL1-4:6 No - lnc-ERAL1-3:7 No - lnc-POMGNT1-6:1 No - lnc-POMGNT1-5:1 No - lnc-CRYBA1-1:1 Yes chrX:19569721-19579800 lnc-CRYBA1-2:1 Yes chrX:19569721-19579800 lnc-CRYBA1-3:1 Yes chrX:19569721-19579800 lnc-TP53I13-7:1 Yes chrX:19569721-19579800 lnc-TP53I13-5:1 Yes chrX:19569721-19579800 lnc-CDK5R1-9:1 Yes chr2L:10491814-10506779 lnc-TMEM98-6:1 Yes chr2L:10491814-10506779 lnc-TMEM98-5:1 Yes chr2L:10491814-10506779 lnc-TMEM98-4:1 Yes chr2L:10491814-10506779 lnc-CCL2-12:1 No - lnc-CCL13-2:1 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-C17orf50-4:1 Yes chrX:16288810-16293520 lnc-AATF-2:1 Yes chr2R:7974115-7991862 lnc-AATF-3:1 Yes chr2R:7974115-7991862 lnc-AATF-5:1 Yes chr2R:7974115-7991862 lnc-AATF-6:1 Yes chr2R:7974115-7991862 lnc-C17orf78-1:1 Yes chr2R:7974115-7991862 lnc-MMP28-2:2 Yes chrX:16288810-16293520 lnc-MMP28-3:4 Yes chrX:16288810-16293520 lnc-MMP28-4:3 Yes chrX:16288810-16293520 lnc-GRB7-2:1 No - lnc-SYNRG-5:1 Yes chr2R:7974115-7991862 lnc-ZPBP2-6:1 No - lnc-CYP4A11-2:1 No - lnc-THRA-1:2 Yes chr3L:8191270-8196573 lnc-DDX52-1:1 No - lnc-KDM4A-2:1 No - lnc-ARL5C-7:1 Yes chrX:10348680-10366273 lnc-ARL5C-6:1 Yes chrX:10348680-10366273 lnc-ARL5C-5:1 Yes chrX:10348680-10366273 lnc-SMG6-7:1 Yes chr3L:21335215-21338232 lnc-TMEM99-6:1 No - lnc-ARL5C-1:4 Yes chr3L:8298501-8299839 lnc-MED1-1:1 Yes chr3L:21516306-21522684 lnc-MED1-2:1 Yes chr3L:21516306-21522684 lnc-MED1-3:1 Yes chr3L:21516306-21522684 lnc-ATP6V0A1-3:1 Yes chr3R:20535323-20552311 lnc-CCDC103-3:1 Yes chr3R:27963415-27966958 lnc-CCDC103-5:3 Yes chr3L:9362636-9367046 lnc-CCDC103-7:3 No - lnc-NMT1-3:1 Yes chr3R:7082182-7083251 lnc-NMT1-2:1 Yes chr3R:7082182-7083251 lnc-AGBL4-6:1 No - lnc-DMAP1-4:1 Yes chr3R:22724884-22726414 lnc-LRRC37A-3:1 No - lnc-GHDC-1:1 Yes chr3R:20535323-20552311 lnc-NFE2L1-5:1 No - lnc-NFE2L1-4:1 No - lnc-MEOX1-2:1 No - lnc-LSM12-3:1 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-NCBP3-4:2 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-NCBP3-3:1 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-DCAKD-2:1 No - lnc-KANSL1-6:1 Yes chr3R:27639886-27656996 lnc-TOM1L1-8:1 No - lnc-NCBP3-2:1 Yes chr3L:23737960-23749058 lnc-ALOX12-1:13 No - lnc-WNT3-3:1 Yes chr3R:13833497-13837991 lnc-WNT3-2:1 Yes chr3R:13833497-13837991 lnc-TOM1L1-2:1 No - lnc-TOM1L1-3:1 No - lnc-TOM1L1-4:1 No - lnc-TOM1L1-5:1 No - lnc-HLF-4:1 No - lnc-CBX1-2:1 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-HOXB1-3:1 No - lnc-MSI2-3:1 No - lnc-TMEM100-5:1 No - lnc-TMEM100-4:1 No - lnc-TMEM100-3:1 No - lnc-RPS6KB1-4:1 Yes chrX:10760048-10764413 lnc-ABHD3-4:1 Yes chr3L:16006552-16011812 lnc-ANKRD29-5:1 Yes chr2R:23992138-23995055 lnc-DSG1-11:1 No - lnc-CCDC178-1:1 No - lnc-CCDC178-2:1 No - lnc-ZBTB7C-8:1 No - lnc-SMAD4-7:1 Yes chr2R:12529053-12564184 lnc-MYL12A-2:1 No - lnc-WDR7-10:1 No - lnc-MYL12B-7:1 Yes chr2R:12511534-12515062 lnc-RNF152-9:1 No - lnc-FAM69C-4:1 Yes chr2L:21762314-21795447 lnc-ZNF516-12:1 No - lnc-ZNF516-11:1 No - lnc-CDKN2C-5:1 Yes chr2R:16024628-16028161 lnc-MTCL1-4:1 No - lnc-OSBPL9-6:2 No - lnc-ANKRD12-2:1 Yes chrX:17632089-17633509 lnc-PIEZO2-15:1 No - lnc-SLC1A7-4:1 Yes chr2L:18831229-18833630 lnc-COLEC12-6:1 Yes chr3R:5818794-5821440 lnc-PPP4R1-23:1 Yes chr3R:2554162-3263582 lnc-BTF3L4-6:1 Yes chr2R:21481927-21487107 lnc-ADCYAP1-7:1 Yes chr3L:4592447-4626196 lnc-TXNDC2-3:1 Yes chr3L:8109132-8110043 lnc-TXNDC2-4:1 Yes chr3L:8109132-8110043 lnc-CEP76-2:1 Yes chr3L:1342493-1475257 lnc-PIAS4-2:1 No - lnc-PIAS4-1:1 No - lnc-UHRF1-2:2 Yes chr2R:13176553-13198337 lnc-PALM-1:1 No - lnc-RANBP3-2:1 No - lnc-KHSRP-2:1 No - lnc-PRR36-4:1 Yes chrX:11430523-11454386 lnc-ANGPTL4-2:1 No - lnc-RAB11B-3:1 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-RAB11B-2:1 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-KISS1R-1:1 Yes chr2R:23632610-23654820 lnc-ATG4D-2:1 No - lnc-SLC44A2-1:1 No - lnc-QTRT1-3:1 No - lnc-PATJ-10:1 Yes chr4:268175-276369 lnc-ZNF564-1:1 No - lnc-CCDC130-1:1 No - lnc-PATJ-9:1 Yes chr4:268175-276369 lnc-CACNA1A-7:1 No - lnc-PATJ-8:1 Yes chr4:268175-276369 lnc-OR10H4-1:1 No - lnc-ILVBL-1:1 No - lnc-TMEM38A-1:1 No - lnc-EPHX3-4:1 Yes chrX:3134870-3172221 lnc-EPHX3-7:1 Yes chrX:8037808-8061436 lnc-USE1-1:1 No - lnc-COMP-1:1 No - lnc-TNFRSF9-2:1 No - lnc-YJEFN3-2:1 No - lnc-RHPN2-2:1 Yes chr3L:13925882-13929000 lnc-MEX3D-5:1 No - lnc-ZNF302-3:1 No - lnc-NDUFS7-6:3 No - lnc-NDUFS7-2:1 No - lnc-NDUFS7-5:10 No - lnc-MUM1-1:1 No - lnc-MUM1-2:1 No - lnc-SPINT2-8:1 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-NFKBIB-4:1 No - lnc-ACP7-2:1 No - lnc-ACP7-1:1 Yes chrX:10870594-10877893 lnc-TGFB1-3:1 No - lnc-IRGQ-1:1 No - lnc-KLF16-1:1 Yes chr3R:27707100-27710857 lnc-ZNF296-5:1 Yes chr2L:4224650-4227097 lnc-ZNF296-4:1 Yes chr2L:4224650-4227097 lnc-CD177-3:1 No - lnc-TEX101-2:1 No - lnc-TEX101-1:1 No - lnc-MKNK2-2:1 No - lnc-AP2S1-2:1 Yes chrX:17639147-17652562 lnc-AP2S1-3:1 Yes chrX:17639147-17652562 lnc-AP2S1-4:1 Yes chrX:17639147-17652562 lnc-ITGB3BP-11:1 Yes chrX:11360930-11368098 lnc-IL4I1-5:1 No - lnc-KCNC3-2:1 No - lnc-CALM3-4:1 No - lnc-CALM3-2:1 No - lnc-JOSD2-5:1 No - lnc-NPAS1-7:1 Yes chrX:17639147-17652562 lnc-NPAS1-6:1 Yes chrX:17639147-17652562 lnc-NPAS1-5:1 Yes chrX:17639147-17652562 lnc-NPAS1-4:1 Yes chrX:17639147-17652562 lnc-JSRP1-2:2 No - lnc-OAZ1-1:1 No - lnc-SIGLEC6-1:1 No - lnc-ZNF649-1:1 No - lnc-ZNF649-2:1 No - lnc-PTOV1-1:2 Yes chr3R:24227023-24228538 lnc-TBC1D17-1:1 No - lnc-SIGLEC9-5:1 No - lnc-C19orf85-5:1 No - lnc-AES-3:1 Yes chr3R:26041736-26049911 lnc-ZNF534-3:1 No - lnc-SMIM24-1:1 Yes chr3R:31746445-31747558 lnc-RPS9-2:1 No - lnc-FZR1-5:1 Yes chr4:268175-276369 lnc-FZR1-4:1 Yes chr4:268175-276369 lnc-FZR1-3:1 Yes chr4:268175-276369 lnc-DAPK3-3:1 Yes chr3L:3319555-3322489 lnc-EEF2-1:1 No - lnc-EEF2-2:1 No - lnc-PTGER3-6:1 No - lnc-PTGER3-5:1 No - lnc-PTGER3-4:1 No - lnc-SSTR4-11:1 No - lnc-TPX2-2:1 No - lnc-PDRG1-2:1 No - lnc-SUN5-2:1 No - lnc-PXMP4-4:1 No - lnc-C20orf144-4:1 Yes chr2R:24275734-24291084 lnc-C20orf144-3:1 Yes chr2R:24275734-24291084 lnc-AHCY-2:1 No - lnc-TRPC4AP-6:1 Yes chrX:1903704-1908827 lnc-TRPC4AP-2:1 Yes chrX:1903704-1908827 lnc-TRPC4AP-3:1 Yes chrX:1903704-1908827 lnc-EDEM2-4:1 No - lnc-EDEM2-5:1 No - lnc-MMP24OS-3:2 No - lnc-PROCR-1:1 No - lnc-SCAND1-6:1 Yes chr3R:18251069-18252734 lnc-SCAND1-7:1 Yes chr3R:18251069-18252734 lnc-C20orf24-2:1 Yes chr2R:21502097-21517241 lnc-BLCAP-6:1 No - lnc-BLCAP-5:1 No - lnc-MAFB-3:1 No - lnc-RPRD1B-1:1 No - lnc-TOP1-8:1 No - lnc-GTSF1L-3:1 Yes chr2L:6555717-6557502 lnc-GTSF1L-2:1 No - lnc-GNRH2-1:1 No - lnc-SPINT3-1:1 No - lnc-TNNC2-2:1 No - lnc-R3HDML-1:1 Yes chr2L:8687226-8709611 lnc-TP53RK-2:1 Yes chr3R:20042757-20048716 lnc-TP53RK-3:1 No - lnc-FASTKD5-1:1 Yes chr3R:30425427-30428276 lnc-TMEM189-6:1 No - lnc-DDX27-7:1 Yes chr3L:2895017-2959579 lnc-NRSN2-2:1 Yes chr3L:20396288-20401609 lnc-TMEM189-7:1 No - lnc-ADNP-1:1 No - lnc-SNAI1-2:1 No - lnc-RBBP8NL-1:1 No - lnc-LSM14B-4:1 No - lnc-CHRNA4-1:1 Yes chr2R:10145897-10192394 lnc-RNF24-2:11 No - lnc-RNF24-2:10 No - lnc-LIME1-3:1 No - lnc-TBC1D20-1:1 No - lnc-TMX4-2:1 Yes chr2R:10883547-10884936 lnc-TMX4-1:1 Yes chr2R:10883547-10884936 lnc-R3HDM1-4:1 No - lnc-THSD7B-1:1 No - lnc-ACVR2A-7:1 No - lnc-ZEB2-9:1 Yes chrX:15853421-15854970 lnc-ACVR2A-6:1 No - lnc-ZEB2-7:1 Yes chrX:15853421-15854970 lnc-EPC2-1:1 Yes chr3R:23894174-23922973 lnc-NMI-3:1 No - lnc-NMI-4:1 No - lnc-NMI-5:1 No - lnc-NMI-6:1 Yes chr3L:16676406-16711677 lnc-CBR1-8:1 Yes chrX:20538497-20567097 lnc-CBR1-7:1 Yes chrX:20538497-20567097 lnc-CBR1-6:1 No - lnc-CBR1-5:1 No - lnc-TCP10L-3:1 Yes chr3R:4077939-4104326 lnc-LIPI-23:1 No - lnc-LIPI-22:1 No - lnc-LIPI-21:1 No - lnc-LIPI-20:1 No - lnc-LIPI-19:1 No - lnc-ATP5PO-4:1 Yes chr3R:15265591-15266690 lnc-LIPI-18:1 No - lnc-TANK-7:1 No - lnc-WDSUB1-1:2 No - lnc-PDXK-2:1 Yes chr2L:13363308-13366189 lnc-AIRE-2:1 No - lnc-AIRE-3:1 Yes chr2R:10109740-10117457 lnc-AIRE-4:1 Yes chr2R:10109740-10117457 lnc-FIGN-3:1 No - lnc-LIPI-13:1 No - lnc-NOSTRIN-1:1 Yes chrX:6257668-6267228 lnc-BBS5-5:1 Yes chrX:9358496-9500129 lnc-BBS5-4:1 Yes chrX:9358496-9500129 lnc-BBS5-3:1 Yes chrX:9358496-9500129 lnc-BBS5-2:1 Yes chrX:9358496-9500129 lnc-BBS5-1:1 No - lnc-HSF2BP-2:1 Yes chr2L:13363308-13366189 lnc-ITGB2-9:1 No - lnc-ID2-4:1 No - lnc-USP25-9:1 No - lnc-USP25-10:1 No - lnc-STK39-5:1 No - lnc-TLK1-4:1 No - lnc-HNRNPA3-9:1 No - lnc-LIPI-3:1 No - lnc-CHN1-2:1 No - lnc-LNPK-7:1 No - lnc-LIPI-2:1 No - lnc-NFE2L2-6:1 No - lnc-ITGA4-3:1 No - lnc-ITGA4-4:1 No - lnc-POMC-1:1 Yes chr2R:8729502-8734304 lnc-NAB1-1:1 No - lnc-SLC39A10-8:1 No - lnc-ASXL2-5:1 Yes chr2R:12437345-12452916 lnc-ASXL2-4:1 Yes chr2R:12437345-12452916 lnc-MDH1B-4:1 No - lnc-MDH1B-5:1 No - lnc-MDH1B-7:1 No - lnc-FZD7-1:1 No - lnc-ATRAID-1:1 Yes chr2R:20271653-20274499 lnc-NRP2-3:1 No - lnc-PIKFYVE-6:1 Yes chr2R:22103177-22105963 lnc-FEV-3:1 No - lnc-GPBAR1-2:1 No - lnc-CATIP-1:1 No - lnc-MRAP-1:3 Yes chr3R:4077939-4104326 lnc-PID1-3:1 Yes chr3R:24295078-24314541 lnc-PID1-4:1 Yes chr3R:24295078-24314541 lnc-MRAP-2:2 Yes chr3R:4077939-4104326 lnc-ZFAND2B-1:1 No - lnc-MRAP-3:2 Yes chr3R:4077939-4104326 lnc-MRAP-6:1 Yes chr3R:4077939-4104326 lnc-SGPP2-1:1 Yes chr3R:24250460-24252679 lnc-PRR30-3:1 No - lnc-ALPP-3:1 Yes chr3L:212709-216479 lnc-ALPP-2:1 Yes chr3L:212709-216479 lnc-SLC30A3-1:1 Yes chrX:16655359-16668712 lnc-FOSL2-7:1 No - lnc-FOSL2-6:1 No - lnc-FOSL2-5:1 No - lnc-SPDYA-1:1 No - lnc-GGTLC2-15:1 No - lnc-CRYBA4-13:1 No - lnc-IAH1-4:1 No - lnc-EWSR1-3:1 No - lnc-LIF-4:1 No - lnc-EIF3D-2:1 No - lnc-EIF3D-3:1 No - lnc-MAFF-6:1 Yes chr3R:31054085-31061210 lnc-TAF1B-3:1 No - lnc-C1QTNF6-1:4 No - lnc-KDELR3-3:1 No - lnc-SSTR3-1:1 No - lnc-FEZ2-2:1 No - lnc-FEZ2-6:1 No - lnc-FEZ2-4:1 No - lnc-FEZ2-5:1 No - lnc-MBOAT2-8:1 Yes chr2R:21295652-21310411 lnc-MBOAT2-7:1 Yes chr2R:21295652-21310411 lnc-FAM83F-4:1 Yes chr4:649041-663103 lnc-FAM83F-5:1 Yes chr4:649041-663103 lnc-ADSL-2:1 Yes chr4:649041-663103 lnc-PEX26-6:1 No - lnc-PEX26-5:1 No - lnc-CERK-5:3 No - lnc-PEX26-4:1 No - lnc-PEX26-3:1 No - lnc-BRD1-27:1 No - lnc-ADA2-3:1 No - lnc-VIT-3:1 No - lnc-ATL2-3:1 No - lnc-SRSF7-3:1 Yes chrX:10894747-10899302 lnc-ADAM17-3:3 No - lnc-PKDCC-4:1 Yes chr3L:14903805-14942907 lnc-CDKL4-3:1 No - lnc-ABCG5-2:1 Yes chr2L:9435399-9436842 lnc-ABCG5-1:1 Yes chr3R:24894742-24897613 lnc-LRPPRC-3:1 Yes chr3R:24894742-24897613 lnc-STPG4-6:2 Yes chr2R:6209782-6214122 lnc-STPG4-5:2 Yes chr2R:6209782-6214122 lnc-GPR75-1:1 No - lnc-RTN4-4:1 Yes chr2L:4958411-4965430 lnc-RPS7-4:1 Yes chr3L:20786340-20788137 lnc-C2orf73-2:1 Yes chrX:17657372-17669371 lnc-MTIF2-4:1 Yes chr3L:3178930-3185287 lnc-REL-5:1 Yes chr2R:19663919-19669832 lnc-REL-4:1 Yes chr2R:19663919-19669832 lnc-REL-3:1 Yes chr2R:19663919-19669832 lnc-FANCL-5:1 Yes chr3R:26864605-26866807 lnc-ROCK2-6:1 No - lnc-ROCK2-5:1 No - lnc-XPO1-8:1 Yes chr3R:24635270-24650043 lnc-XPO1-5:1 Yes chr3R:24635270-24650043 lnc-XPO1-4:1 Yes chr3R:24635270-24650043 lnc-XPO1-3:1 Yes chr3R:24635270-24650043 lnc-VPS54-2:1 Yes chr3L:9350867-9358935 lnc-ATP6V1B1-2:1 No - lnc-C2orf42-7:1 No - lnc-C2orf42-6:1 No - lnc-C2orf42-5:1 No - lnc-CYP26B1-3:1 No - lnc-CYP26B1-2:1 No - lnc-CYP26B1-1:1 No - lnc-STAMBP-3:1 No - lnc-C2orf78-2:2 Yes chr3R:30456441-30459300 lnc-TRABD2A-3:1 No - lnc-MRPL35-4:1 Yes chr2R:22925107-22932044 lnc-POLR1A-5:1 No - lnc-CIAO1-3:1 No - lnc-CIAO1-5:1 No - lnc-TMEM127-3:1 No - lnc-VWA3B-3:1 Yes chr2R:16001181-16006901 lnc-PDCL3-4:1 No - lnc-POU3F3-10:1 No - lnc-POU3F3-9:1 No - lnc-SLC5A7-1:1 No - lnc-ZC3H6-2:1 No - lnc-ZC3H6-3:1 Yes chr3R:25618414-25621838 lnc-PAX8-5:1 No - lnc-PAX8-4:1 No - lnc-PAX8-3:1 No - lnc-IL36G-2:1 No - lnc-RABL2A-3:1 No - lnc-TFCP2L1-5:1 Yes chr4:47710-57041 lnc-BIN1-6:1 No - lnc-BIN1-5:1 No - lnc-BIN1-4:1 No - lnc-CYP27C1-1:1 Yes chr2R:12593604-12612068 lnc-TSN-12:1 Yes chr3L:21172853-21183278 lnc-LIMS2-3:1 Yes chr2L:7666047-7689459 lnc-GPR17-2:1 Yes chr2L:7666047-7689459 lnc-FAM228A-3:1 Yes chr2L:21134439-21142347 lnc-PLEKHB2-2:1 Yes chr2L:12107221-12109116 lnc-ACMSD-5:1 No - lnc-ACMSD-4:1 No - lnc-SUCNR1-1:1 No - lnc-NMNAT3-7:1 Yes chr4:1112874-1123357 lnc-SUCNR1-2:1 No - lnc-SUCNR1-3:1 No - lnc-NMNAT3-8:1 Yes chr4:1112874-1123357 lnc-ARHGEF26-15:1 No - lnc-ARHGEF26-13:1 No - lnc-ARHGEF26-12:1 No - lnc-ARHGEF26-9:1 No - lnc-ARHGEF26-10:1 No - lnc-ARHGEF26-11:1 No - lnc-ARHGEF26-7:1 No - lnc-ARHGEF26-6:1 No - lnc-ARHGEF26-5:1 No - lnc-ARHGEF26-1:2 No - lnc-ARHGEF26-2:1 Yes chr2L:20754579-20757985 lnc-CCNL1-6:1 Yes chr3L:7134516-7143074 lnc-SHOX2-4:1 No - lnc-TMEM212-2:1 No - lnc-FNDC3B-10:1 No - lnc-FNDC3B-9:1 No - lnc-FNDC3B-8:1 No - lnc-FNDC3B-7:1 No - lnc-FNDC3B-6:1 No - lnc-ECT2-3:1 No - lnc-ECT2-4:1 No - lnc-SPTSSB-5:1 No - lnc-ECT2-6:1 Yes chr3R:7570281-7639434 lnc-ECT2-7:1 Yes chr3R:7570281-7639434 lnc-NAALADL2-12:1 Yes chr3R:7570281-7639434 lnc-NAALADL2-11:1 Yes chr3R:7570281-7639434 lnc-TNFSF10-2:1 No - lnc-TNFSF10-3:1 No - lnc-TNFSF10-4:1 No - lnc-CCDC174-5:1 No - lnc-CCDC174-4:1 No - lnc-TTC14-4:1 Yes chr3R:4781120-4784722 lnc-CCDC174-3:1 No - lnc-ATP11B-12:1 No - lnc-ATP11B-11:1 No - lnc-ATP11B-9:1 No - lnc-SENP2-7:1 Yes chrX:10787869-10824277 lnc-LPP-3:1 No - lnc-MASP1-2:1 No - lnc-MASP1-3:1 No - lnc-P3H2-10:1 No - lnc-P3H2-9:1 No - lnc-P3H2-8:1 No - lnc-P3H2-7:1 No - lnc-P3H2-6:1 No - lnc-P3H2-5:1 No - lnc-P3H2-4:1 No - lnc-MUC20-69:1 No - lnc-TNK2-6:1 No - lnc-RUBCN-7:1 Yes chr2R:12064565-12079543 lnc-RUBCN-4:1 No - lnc-IQCG-9:1 Yes chr2L:17367511-17384115 lnc-IQCG-8:1 Yes chr2L:17367511-17384115 lnc-IQCG-7:1 Yes chr2L:17367511-17384115 lnc-GALNT15-2:1 No - lnc-BHLHE40-1:1 No - lnc-UBP1-2:1 Yes chr2R:11641477-11651616 lnc-CLASP2-6:1 Yes chr2R:10124293-10137472 lnc-CNOT10-1:1 No - lnc-CCR4-4:1 Yes chr2R:7478853-7489823 lnc-CCR4-3:1 Yes chr2R:7478853-7489823 lnc-CCR4-2:1 Yes chr2R:7478853-7489823 lnc-CCR4-1:1 Yes chr2R:7478853-7489823 lnc-FBXL2-3:1 Yes chr3R:27696466-27700110 lnc-CSRNP1-1:1 No - lnc-SEC22C-3:1 No - lnc-GOLGA4-1:1 No - lnc-ZNF445-2:1 Yes chr3L:6073490-6075245 lnc-CTNNB1-3:1 No - lnc-CTNNB1-2:1 No - lnc-TRAK1-3:1 No - lnc-VIPR1-5:1 Yes chr2L:7037823-7056010 lnc-VIPR1-4:1 Yes chr2L:7037823-7056010 lnc-SS18L2-1:1 No - lnc-PLXNB1-1:1 No - lnc-ABHD5-1:1 Yes chrX:16680089-16683895 lnc-UQCRC1-1:2 Yes chr3R:14890231-14892387 lnc-PRKAR2A-5:1 Yes chr2R:21646177-21657935 lnc-PRKAR2A-4:1 Yes chr2R:21646177-21657935 lnc-PRKAR2A-3:1 Yes chr2R:21646177-21657935 lnc-DALRD3-5:1 No - lnc-SETD5-3:1 No - lnc-SETD5-2:1 No - lnc-C3orf62-1:1 No - lnc-THUMPD3-8:1 Yes chr3L:14002127-14020148 lnc-THUMPD3-5:1 Yes chr3L:14002127-14020148 lnc-THUMPD3-6:1 Yes chr3L:14002127-14020148 lnc-ARIH2-3:1 No - lnc-IFRD2-4:1 No - lnc-THUMPD3-7:1 Yes chr3L:14002127-14020148 lnc-HYAL2-2:1 No - lnc-HYAL2-1:1 No - lnc-WDR6-2:1 No - lnc-WDR6-1:1 No - lnc-APEH-1:1 No - lnc-NT5DC2-2:1 No - lnc-RBM5-1:1 Yes chr2L:1173009-1177589 lnc-THUMPD3-11:1 Yes chr3L:14002127-14020148 lnc-RAD54L2-4:1 No - lnc-TEX264-2:1 Yes chr2R:24107087-24114292 lnc-TEX264-1:1 Yes chr2R:24107087-24114292 lnc-GNL3-2:1 Yes chr3R:24799967-24805259 lnc-CPNE9-2:1 Yes chr2R:17432173-17444938 lnc-ABHD6-5:1 No - lnc-ABHD6-3:1 No - lnc-IQSEC1-6:1 Yes chr2R:5760862-5774324 lnc-RPP14-3:1 Yes chr2R:7968129-7972003 lnc-PPP4R2-4:1 No - lnc-PPP4R2-5:1 No - lnc-PPP4R2-6:1 No - lnc-PPP4R2-7:1 No - lnc-C3orf38-2:7 No - lnc-EPHA6-6:1 No - lnc-COL8A1-9:1 No - lnc-COL8A1-8:1 No - lnc-COL8A1-7:1 No - lnc-ZPLD1-5:1 No - lnc-RPL24-5:1 No - lnc-C3orf85-11:1 No - lnc-SLC35A5-2:1 Yes chr3L:18748687-18750483 lnc-HACL1-8:1 No - lnc-POLQ-1:1 No - lnc-COL6A5-3:1 No - lnc-HACL1-10:1 No - lnc-NEK11-4:1 Yes chr3L:22749444-22787631 lnc-MUC13-4:1 No - lnc-CLSTN2-4:1 No - lnc-PIK3R4-1:1 No - lnc-PLS1-5:1 Yes chrX:16391698-16399850 lnc-PLS1-4:1 Yes chrX:16391698-16399850 lnc-PLS1-3:1 Yes chrX:16391698-16399850 lnc-ASTE1-4:1 Yes chr3L:22749444-22787631 lnc-CHST2-6:1 No - lnc-C3orf58-6:1 No - lnc-FAM184B-6:1 Yes chr3L:9134560-9135916 lnc-FAM184B-5:1 Yes chr3L:9134560-9135916 lnc-FAM184B-4:1 Yes chr3L:9134560-9135916 lnc-CLRN2-2:1 No - lnc-SMIM20-3:1 No - lnc-SMIM20-4:1 No - lnc-SMIM20-5:1 No - lnc-SPON2-2:1 Yes chr3R:13011649-13026275 lnc-TBC1D1-3:1 No - lnc-KLB-2:1 No - lnc-UBE2K-4:1 Yes chr2R:12027985-12033725 lnc-UBE2K-5:1 Yes chr2R:12027985-12033725 lnc-TACC3-3:1 No - lnc-KDR-3:1 No - lnc-KDR-7:1 No - lnc-RASSF6-2:1 No - lnc-CNOT6L-3:1 No - lnc-TMEM150C-1:1 No - lnc-TMEM150C-2:1 No - lnc-TMEM150C-3:1 No - lnc-TMEM150C-4:1 No - lnc-TMEM150C-5:1 No - lnc-TMEM150C-6:1 Yes chr3R:30194790-30196228 lnc-FAM193A-5:1 No - lnc-PLAC8-1:1 Yes chr2R:7972175-7974099 lnc-BMP2K-5:1 No - lnc-BMP2K-6:1 No - lnc-NUDT9-1:1 Yes chr2L:21057706-21071502 lnc-DDIT4L-2:1 No - lnc-DDIT4L-1:1 No - lnc-SH3BP2-3:1 Yes chr2R:19397032-19424903 lnc-SH3BP2-4:1 Yes chr2R:19397032-19424903 lnc-SMARCAD1-3:1 Yes chr2R:15762565-15817004 lnc-SLC9B1-1:1 Yes chr3R:22981459-22998528 lnc-ELOVL6-3:1 No - lnc-PITX2-3:2 Yes chr3R:13298768-13302334 lnc-PITX2-2:3 Yes chr3R:13298768-13302334 lnc-ADAD1-1:1 No - lnc-SLC7A11-5:1 No - lnc-SLC7A11-6:1 No - lnc-SPRY1-3:3 Yes chr2L:12700949-12704451 lnc-FAT4-3:1 No - lnc-OTUD4-4:1 No - lnc-ZNF827-10:1 No - lnc-SLC10A7-2:1 No - lnc-SMARCA5-8:1 No - lnc-PRSS48-3:1 No - lnc-TLR2-2:1 No - lnc-RAPGEF2-4:1 No - lnc-RAPGEF2-5:1 No - lnc-TMA16-2:1 Yes chr3L:9386827-9399227 lnc-TMA16-3:1 Yes chr3L:9386827-9399227 lnc-CPE-2:1 No - lnc-SAP30-11:1 No - lnc-CLDN22-6:1 Yes chr3R:14697689-14724261 HAND2-AS1:106 No - lnc-NDST1-2:1 No - lnc-NKX2-5-3:1 No - lnc-G3BP1-1:3 Yes chr3L:21640995-21642599 lnc-SLC36A1-4:1 Yes chr3R:13647004-13654527 lnc-RAB24-3:1 Yes chr3R:27932982-27937853 lnc-HNRNPH1-4:1 No - lnc-TLX3-1:1 No - lnc-RASGEF1C-1:1 No - lnc-OR2Y1-1:1 No - LINC01962:11 No - lnc-SFXN1-1:1 No - lnc-SLC34A1-3:1 Yes chr3R:22619968-22639387 lnc-EXOC3-7:1 No - lnc-SKP2-2:1 Yes chr2R:9089774-9092893 lnc-SKP2-3:1 Yes chr2R:9089774-9092893 lnc-CANX-2:1 No - lnc-OR2V2-2:1 No - lnc-OR2V2-3:1 No - lnc-C5orf42-5:1 Yes chr2L:11004820-11010921 lnc-RICTOR-1:1 No - lnc-CEP72-3:2 No - lnc-MRPS30-9:1 No - lnc-FST-2:1 No - lnc-FST-3:1 No - lnc-MOCS2-7:1 No - lnc-MOCS2-8:1 No - lnc-NDUFS6-11:1 No - lnc-LRRC70-4:1 No - lnc-LRRC70-3:1 No - lnc-NLN-1:1 Yes chr2R:14935660-14940722 lnc-SREK1-3:1 No - lnc-SREK1-5:1 No - lnc-CMBL-3:1 No - lnc-ENC1-6:1 Yes chr2R:12487451-12507333 lnc-FAM169A-3:2 Yes chr3R:22613686-22616622 lnc-DMGDH-3:1 Yes chr2L:6719394-6723359 lnc-MARCH6-5:1 No - lnc-COX7C-15:1 Yes chrX:15999951-16005812 lnc-ARRDC3-7:1 No - lnc-GLRX-4:1 Yes chr3L:19889120-19909410 lnc-LNPEP-2:1 No - lnc-RIOK2-9:1 Yes chr2L:2979562-2987723 lnc-RIOK2-10:1 Yes chr2L:2979562-2987723 lnc-LNPEP-3:1 No - lnc-LNPEP-4:1 No - lnc-CHD1-3:1 No - lnc-FAM105A-3:1 No - lnc-MAN2A1-3:3 No - lnc-CEP120-3:1 No - lnc-FNIP1-1:1 No - lnc-FNIP1-2:1 No - lnc-SHROOM1-2:1 Yes chr2R:7960133-7961921 lnc-HSPA4-5:1 No - lnc-PITX1-3:1 No - lnc-DCANP1-3:1 Yes chr2L:21423737-21424229 lnc-DCANP1-2:1 Yes chr2L:21423737-21424229 lnc-CAMLG-1:1 Yes chr2R:9876232-9882357 lnc-C5orf24-2:1 Yes chrX:15345169-15350021 lnc-TXNDC15-6:1 No - lnc-PAIP2-6:1 No - lnc-PAIP2-5:1 No - lnc-PAIP2-3:1 No - lnc-PAIP2-2:1 No - lnc-SMIM33-1:1 No - lnc-UBE2D2-1:1 No - lnc-GRXCR2-1:1 Yes chr2L:6046516-6048706 lnc-EIF4EBP3-1:1 No - lnc-CSNK1A1-5:1 No - lnc-CSNK1A1-4:1 No - lnc-CSNK1A1-3:1 No - lnc-CSNK1A1-2:1 No - lnc-TCERG1-3:1 No - lnc-SOX30-3:1 No - lnc-POU4F3-2:1 Yes chr3R:6361672-6368288 lnc-POU4F3-3:1 Yes chr3R:6361672-6368288 lnc-POU4F3-5:2 Yes chr3R:6361672-6368288 lnc-POU4F3-4:1 Yes chr3R:6361672-6368288 lnc-BCLAF1-2:1 No - lnc-MYLIP-8:1 Yes chr3L:9477038-9486530 lnc-MAP3K5-1:1 Yes chr3L:8647145-8651011 lnc-PERP-5:1 No - lnc-PEX3-6:1 Yes chr2L:281670-283269 lnc-PEX3-4:1 Yes chr2L:281670-283269 lnc-PEX3-3:1 Yes chr2L:281670-283269 lnc-PHACTR2-1:2 No - lnc-STX11-2:1 Yes chr3R:19461085-19597288 lnc-STX11-3:1 Yes chr3R:19461085-19597288 lnc-STX11-4:1 Yes chr3R:19461085-19597288 lnc-STX11-6:1 Yes chr3R:19461085-19597288 lnc-SAMD5-5:1 Yes chrX:12631605-12653442 lnc-SAMD5-3:2 Yes chrX:12631605-12653442 lnc-NUP43-2:1 Yes chr3R:30789625-30806619 lnc-RAET1E-2:1 Yes chr3L:8087635-8091786 lnc-RAET1E-1:1 No - lnc-WRNIP1-16:5 No - lnc-DYNLT1-2:1 Yes chr3R:14804092-14875488 lnc-SOD2-6:1 No - lnc-ZDHHC14-5:1 Yes chr3R:17687818-17718350 lnc-WRNIP1-8:1 No - lnc-WDR27-1:16 No - lnc-ARID1B-3:1 No - lnc-TULP4-2:3 Yes chr3R:27607879-27634932 lnc-TMEM181-2:1 Yes chr3R:27607879-27634932 lnc-WTAP-3:1 No - lnc-FGFR1OP-9:1 No - lnc-AFDN-10:1 No - lnc-AFDN-8:1 No - lnc-AFDN-7:1 No - lnc-AFDN-6:1 No - lnc-NUP153-6:1 Yes chr2R:15515778-15532259 lnc-STMND1-3:1 No - lnc-STMND1-2:1 No - lnc-DEK-2:1 No - lnc-CDKAL1-5:1 No - lnc-CDKAL1-4:1 No - lnc-CDKAL1-3:1 Yes chr2R:17425670-17427511 lnc-C6orf229-1:1 No - lnc-C6orf229-2:1 No - lnc-HIST1H4D-1:1 Yes chr2L:21418112-21418706 lnc-POM121L2-1:1 No - HLA-F-AS1:7 No - lnc-PPP1R18-3:1 Yes chr2L:19123998-19126976 lnc-C6orf47-2:1 Yes chr3L:7510986-7517316 lnc-CLIC1-1:1 Yes chrX:13294473-13302415 lnc-NEU1-3:1 No - lnc-C6orf48-1:1 No - lnc-C2-3:1 Yes chr3R:29123370-29128247 lnc-BRD2-2:1 No - lnc-BRD2-3:1 No - lnc-BRD2-5:1 No - lnc-RREB1-7:1 No - lnc-ITPR3-5:2 No - lnc-ITPR3-4:2 No - lnc-RREB1-6:1 No - lnc-HMGA1-5:1 No - lnc-HMGA1-6:1 No - lnc-HMGA1-7:1 No - lnc-TREM2-2:1 No - lnc-TFEB-2:1 No - lnc-PI16-2:3 No - lnc-MED20-2:1 No - lnc-MED20-1:1 No - lnc-MED20-3:1 Yes chrX:15906822-15909676 lnc-MED20-4:1 Yes chrX:15906822-15909676 lnc-CMTR1-11:1 No - lnc-AARS2-1:1 No - lnc-TNFRSF21-2:1 No - lnc-KLC4-1:1 Yes chr2R:12001473-12019846 lnc-SRF-4:1 Yes chr2R:12001473-12019846 lnc-COL21A1-5:1 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-COL21A1-6:1 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-COL21A1-7:1 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-VEGFA-2:1 No - lnc-SPATS1-1:1 No - lnc-BAG2-9:1 Yes chr3R:5680054-5685434 lnc-BAG2-10:1 Yes chr3R:5680054-5685434 lnc-TXNDC5-3:1 Yes chr2R:23851562-23853247 lnc-TXNDC5-5:1 Yes chr2R:23851562-23853247 lnc-COL19A1-3:1 No - lnc-EEF1E1-1:1 No - lnc-AKIRIN2-1:1 No - lnc-MYO6-4:1 No - lnc-BACH2-1:1 Yes chrX:20515908-20524928 lnc-USP45-1:1 Yes chr3L:9372722-9374964 lnc-SLC35A1-6:1 Yes chr2R:13202728-13206547 lnc-TSTD3-1:1 No - lnc-PRDM1-8:1 Yes chr3L:5654681-5657384 lnc-AFG1L-7:1 Yes chr3R:14056945-14087978 lnc-CEP57L1-2:1 No - lnc-CDK19-2:1 No - lnc-MFSD4B-9:1 Yes chr2R:7793625-7801044 lnc-TRAF3IP2-2:1 Yes chr3L:4592447-4626196 lnc-RFX6-1:1 No - lnc-TPD52L1-3:1 No - lnc-TPD52L1-2:1 No - lnc-TPD52L1-1:1 No - lnc-RNF217-1:1 Yes chr2R:18421413-18426221 lnc-PHACTR1-2:1 Yes chr2L:1750687-1752122 lnc-RNF217-2:1 Yes chr2R:18421413-18426221 lnc-PHACTR1-3:1 Yes chr2L:1750687-1752122 lnc-TRMT11-3:1 No - lnc-SAMD3-4:1 Yes chr2R:19229063-19243751 lnc-SAMD3-5:1 Yes chr2R:19229063-19243751 lnc-C7orf49-5:1 No - lnc-SMO-1:1 Yes chr3L:2768466-2772325 lnc-WDR91-1:7 No - lnc-MKRN1-6:1 No - lnc-MKRN1-5:1 No - lnc-MKRN1-4:1 No - lnc-MKRN1-3:1 No - lnc-MKRN1-8:1 No - lnc-EZH2-8:1 No - lnc-TMEM213-1:1 No - lnc-VWDE-5:1 No - lnc-TTC26-11:1 No - lnc-TTC26-10:1 No - lnc-TTC26-9:1 No - lnc-THSD7A-5:1 No - lnc-TTC26-8:1 No - lnc-TTC26-7:1 No - lnc-TTC26-6:1 No - lnc-TTC26-5:1 No - lnc-TTC26-4:1 No - lnc-TTC26-3:1 No - lnc-THSD7A-6:1 No - lnc-THSD7A-7:1 No - lnc-THSD7A-8:1 No - lnc-ZNF467-3:1 No - lnc-AGK-3:1 No - lnc-PIP-2:1 No - lnc-PIP-1:1 No - lnc-KMT2C-2:2 Yes chr2L:14359252-14361411 lnc-CNTNAP2-7:1 No - lnc-CNTNAP2-6:1 No - lnc-CNTNAP2-5:1 No - lnc-LMBR1-10:2 No - lnc-NCAPG2-3:1 Yes chr2L:1008378-1048053 lnc-ATP6V0E2-8:1 No - lnc-GIMAP5-2:1 No - lnc-GIMAP5-5:1 No - lnc-GIMAP5-6:1 No - lnc-DPP6-5:1 No - lnc-EN2-4:2 No - lnc-NOM1-6:2 No - lnc-NOM1-7:1 No - lnc-UBE3C-7:1 No - lnc-UBE3C-6:1 No - lnc-UBE3C-5:1 No - lnc-MALSU1-5:1 Yes chrX:10787869-10824277 lnc-MALSU1-6:1 Yes chrX:10787869-10824277 lnc-NPY-2:1 Yes chr2L:20788662-20797042 lnc-NPY-3:1 Yes chr2L:20788662-20797042 lnc-RAPGEF5-2:1 No - lnc-CBX3-1:1 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-STEAP1B-3:1 No - lnc-TRA2A-5:1 Yes chrX:10787869-10824277 lnc-TRA2A-3:1 No - lnc-MTURN-5:8 Yes chrX:6838174-6843921 lnc-MTURN-6:2 Yes chrX:6838174-6843921 lnc-HNRNPA2B1-11:1 No - lnc-GARS-6:1 No - lnc-GGCT-3:1 No - lnc-KBTBD2-1:1 No - lnc-IKZF1-6:1 No - lnc-NPC1L1-2:1 No - lnc-H2AFV-2:1 Yes chr3R:25249348-25258672 lnc-FSCN1-3:1 No - lnc-POM121C-3:1 No - lnc-YWHAG-1:1 No - lnc-DTX2-2:1 No - lnc-CCDC146-3:1 Yes chr2L:19186043-19189938 lnc-RSBN1L-5:1 No - lnc-RAC1-1:1 No - lnc-PON1-2:1 Yes chr3L:2505245-2554292 lnc-SLC25A13-2:1 No - lnc-NPTX2-4:1 No - lnc-ARPC1A-7:3 No - lnc-ARPC1A-4:1 No - lnc-ARPC1B-2:1 Yes chr2L:9396999-9397988 lnc-BUD31-1:1 Yes chr2L:9396999-9397988 lnc-C1GALT1-2:1 No - lnc-CYP3A43-4:1 No - lnc-CYP3A43-5:1 No - lnc-ZKSCAN1-2:1 No - lnc-CASTOR3-1:2 No - lnc-CASTOR3-2:2 No - lnc-SAP25-5:1 No - lnc-ACHE-2:2 No - lnc-MIOS-4:1 No - lnc-SPDYE6-6:2 No - lnc-KMT2E-10:2 Yes chr3L:1885657-1891462 lnc-KMT2E-9:2 Yes chr3L:1885657-1891462 lnc-KMT2E-8:2 Yes chr3L:1885657-1891462 lnc-GRID2IP-4:1 No - lnc-PIK3CG-5:1 No - lnc-GLCCI1-5:1 No - lnc-ZNF12-1:1 No - lnc-GLCCI1-4:1 No - lnc-GLCCI1-3:1 No - lnc-DOCK4-7:1 Yes chr2R:20641742-20642558 lnc-ING3-2:1 No - lnc-ING3-1:1 No - lnc-ING3-3:1 No - lnc-ING3-4:1 No - lnc-ING3-6:1 No - lnc-ARF5-10:1 No - lnc-ARF5-9:1 No - lnc-ARF5-8:1 No - lnc-ZNF800-5:1 Yes chr4:936819-949441 lnc-ZNF800-4:2 Yes chr4:936819-949441 lnc-ZNF800-3:1 Yes chr4:936819-949441 lnc-FSCN3-3:1 No - lnc-LRRC4-1:1 No - lnc-FSCN3-6:1 Yes chr3L:259043-264380 lnc-FSCN3-7:1 Yes chr3L:259043-264380 lnc-SND1-2:1 No - lnc-METTL2B-4:1 No - lnc-METTL2B-5:1 No - lnc-FAM71F2-7:1 No - lnc-BMP1-2:1 No - lnc-KCTD9-1:1 No - lnc-CDCA2-6:1 No - lnc-CDCA2-7:1 No - lnc-PTK2B-1:1 No - lnc-NSD3-1:1 Yes chr2R:24509508-24515320 lnc-NSD3-2:1 Yes chr2R:24509508-24515320 lnc-NSD3-3:1 Yes chr2R:24509508-24515320 lnc-NSD3-4:1 Yes chr2R:24509508-24515320 lnc-NSD3-6:1 Yes chr2R:24509508-24515320 lnc-NSD3-7:1 Yes chr2R:24509508-24515320 lnc-NSD3-8:1 Yes chr2R:24509508-24515320 lnc-HMBOX1-9:1 Yes chr2R:15515778-15532259 lnc-UBE2V2-2:1 No - lnc-COPS5-1:1 No - lnc-PRDM14-4:1 No - lnc-ZBTB10-5:1 Yes chr3R:9874681-9995364 lnc-FDFT1-1:1 Yes chrX:13779847-13782170 lnc-LAPTM4B-1:1 No - lnc-PABPC1-2:1 No - lnc-ZNF706-7:1 No - lnc-ZNF706-8:1 No - lnc-RRM2B-5:1 Yes chr3R:9714623-9725615 lnc-RRM2B-6:1 Yes chr3R:9714623-9725615 lnc-UBR5-6:1 No - lnc-RIMS2-1:1 No - lnc-RSPO2-4:1 Yes chr3L:16785242-16786941 lnc-TRIB1-9:1 No - lnc-MYC-5:1 No - lnc-MYC-6:1 No - lnc-PTP4A3-2:4 No - lnc-GSDMC-8:1 No - lnc-GSDMC-7:1 No - lnc-GSDMC-6:1 No - lnc-RHPN1-5:1 Yes chrX:15319479-15328029 lnc-ASAP1-4:1 No - lnc-ZFAT-7:1 No - lnc-PTK2-8:1 Yes chr2R:13943387-13958089 lnc-PTK2-6:1 Yes chr2R:13943387-13958089 lnc-PTK2-5:2 Yes chr2R:13943387-13958089 lnc-PTK2-4:1 Yes chr2R:13943387-13958089 lnc-PTK2-3:1 Yes chr2R:13943387-13958089 lnc-PTK2-2:1 Yes chr2R:13943387-13958089 lnc-SLC45A4-6:1 Yes chr2R:19430659-19437259 lnc-SLC45A4-4:1 No - lnc-PUF60-1:1 Yes chr3R:26536350-26604051 lnc-EPPK1-1:1 No - lnc-PLEC-5:1 No - lnc-LPL-1:1 No - lnc-TONSL-1:1 Yes chr2R:8078869-8080041 lnc-VPS28-1:1 Yes chr3L:7719899-7726473 lnc-DENND4C-3:1 No - lnc-VLDLR-6:1 Yes chr3L:15970082-15982869 lnc-RFX3-1:1 No - lnc-FOXD4-3:2 Yes chr2R:12180493-12182373 lnc-UBE2R2-2:1 No - lnc-IL11RA-1:14 Yes chr2L:6666264-6668033 lnc-GBA2-2:1 No - lnc-GBA2-1:1 No - lnc-CLTA-4:1 No - lnc-ZCCHC7-4:1 No - lnc-GRHPR-8:1 Yes chr3L:16845386-16852350 lnc-GRHPR-7:1 Yes chr3L:16845386-16852350 lnc-GRHPR-6:1 Yes chr3L:16845386-16852350 lnc-SLC25A51-2:2 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-KCNV2-9:1 Yes chr3R:10361760-10378068 lnc-KCNV2-10:1 Yes chr3R:10361760-10378068 lnc-TRMT10B-1:2 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-FOXD4L5-4:3 No - lnc-PRKACG-5:1 Yes chr2R:22874769-22881436 lnc-ANKRD20A1-3:1 No - lnc-CBWD5-3:2 No - lnc-TRPM3-1:1 No - lnc-TRPM3-2:1 No - lnc-TRPM3-3:1 No - lnc-TRPM6-7:1 No - lnc-TRPM6-6:1 No - lnc-FOXD4L3-7:1 Yes chr3L:16126018-16128531 lnc-TLE1-5:1 No - lnc-RASEF-5:1 No - lnc-FRMD3-4:1 No - lnc-FRMD3-3:1 No - lnc-AGTPBP1-4:1 No - lnc-HSD17B3-3:1 No - lnc-PTPDC1-3:1 No - lnc-SEC61B-4:1 No - lnc-ALAD-1:1 No - lnc-MUSK-4:1 No - lnc-MUSK-5:1 No - lnc-MUSK-6:1 No - lnc-MUSK-7:1 No - lnc-DNAJC25-5:1 No - lnc-CDK5RAP2-2:1 No - lnc-GNG10-2:1 Yes chrX:15578205-15579857 lnc-GNG10-1:1 Yes chrX:15578205-15579857 lnc-DNAJC25-1:2 No - lnc-DNAJC25-2:1 No - lnc-DNAJC25-3:2 No - lnc-HSDL2-5:1 No - TTLL11-IT1:2 No - lnc-NDUFA8-2:1 No - lnc-C9orf43-3:1 No - lnc-CNTRL-3:1 Yes chr2L:17486806-17497208 lnc-ZBTB26-2:1 Yes chr3L:8346561-8352279 lnc-LHX2-5:1 Yes chr2R:9123304-9132030 lnc-LHX2-4:1 Yes chr2R:9123304-9132030 lnc-STRBP-7:1 Yes chr2R:9123304-9132030 lnc-STRBP-8:1 Yes chr2R:9123304-9132030 lnc-STRBP-9:1 Yes chr2R:9123304-9132030 lnc-STRBP-10:1 Yes chr2R:9123304-9132030 lnc-STRBP-11:1 Yes chr2R:9123304-9132030 lnc-STRBP-12:1 Yes chr2R:9123304-9132030 lnc-STRBP-14:1 Yes chr2R:9123304-9132030 lnc-RALGPS1-3:1 No - lnc-RALGPS1-4:1 No - lnc-SLC2A8-3:1 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-CFAP157-2:1 No - lnc-TTC16-2:1 Yes chr2L:6007364-6012338 lnc-NAIF1-4:1 No - lnc-USP20-5:1 No - lnc-ASS1-2:1 Yes chr3L:2117466-2151700 lnc-HMCN2-1:1 Yes chr3R:6642262-6644434 lnc-C9orf116-8:1 No - lnc-MAMDC4-3:1 Yes chrX:16415046-16417585 lnc-PSIP1-1:1 Yes chr2R:8129354-8131323 lnc-EIF1AX-1:1 Yes chrX:22529964-22536371 lnc-EIF1AX-2:1 Yes chrX:22529964-22536371 lnc-PRKX-2:2 No - lnc-MID1IP1-5:1 No - lnc-BCOR-7:1 No - lnc-USP9X-6:1 No - lnc-CXorf36-2:1 No - lnc-SYN1-2:1 No - lnc-JADE3-2:1 Yes chr3R:14745901-14751246 lnc-JADE3-3:1 Yes chr3R:14745901-14751246 lnc-RGN-1:1 No - lnc-ZNF157-3:1 No - lnc-PCSK1N-3:1 No - lnc-PCSK1N-2:1 No - lnc-FTSJ1-2:1 No - lnc-PRICKLE3-1:2 No - lnc-HSD17B10-6:1 Yes chrX:15712628-15731935 lnc-HUWE1-1:1 No - lnc-HUWE1-2:1 No - lnc-HUWE1-3:1 No - lnc-FAM120C-2:1 Yes chr3L:21543850-21554928 lnc-RRAGB-1:1 No - lnc-MSN-4:1 No - lnc-LAS1L-3:1 Yes chr2R:24607267-24610847 lnc-SLC7A3-1:1 No - lnc-ERCC6L-1:1 Yes chr3R:25262741-25263292 lnc-ITGB1BP2-3:1 No - lnc-OGT-6:1 Yes chr3R:6646889-6656048 lnc-OGT-5:1 Yes chr3R:6646889-6656048 lnc-OGT-7:1 Yes chr3R:6646889-6656048 lnc-OGT-9:1 Yes chr3R:6646889-6656048 lnc-OGT-3:1 Yes chr3R:6646889-6656048 lnc-COX7B-6:1 No - lnc-COX7B-7:1 No - lnc-FANCB-1:1 No - lnc-RAB40A-2:1 No - lnc-KCNE5-1:1 No - lnc-CHRDL1-3:1 Yes chr3R:23986642-23988738 lnc-CLTRN-2:1 Yes chr2L:13803626-13809994 lnc-CXorf56-4:1 No - lnc-SEPT6-1:1 No - lnc-TMEM255A-2:1 No - lnc-LONRF3-2:1 No - lnc-SLC25A43-2:1 No - lnc-SLC25A43-1:1 No - lnc-THOC2-4:1 Yes chr3L:6624032-6635059 lnc-XIAP-8:1 Yes chr2L:2137350-2145187 lnc-XIAP-12:1 No - lnc-XIAP-2:1 No - lnc-SMIM10L2A-6:1 No - lnc-PHKA2-4:1 Yes chr3L:20248080-20265554 lnc-MCF2-2:1 Yes chrX:16405509-16414651 lnc-GABRE-7:1 No - lnc-GABRE-6:1 No - lnc-GABRE-5:1 No - lnc-GABRE-3:1 No - lnc-OPN1LW-2:1 No - lnc-RPL10-1:1 Yes chr2R:12753026-12756414 lnc-CCNQ-1:1 No - lnc-BCAP31-4:9 Yes chr4:184076-193829 lnc-HCFC1-1:1 Yes chr4:359938-375554 lnc-HCFC1-2:1 No - lnc-IRAK1-3:1 No - lnc-CXorf58-2:1 No - lnc-CXorf58-3:1 No - KCNQ1OT1:8 No - LINC01684:29 No - lnc-CHIC1-6:1 No - lnc-FNTB-3:1 No - lnc-RDH11-1:1 No - lnc-ZFP36L1-7:1 No - lnc-SYNJ2BP-2:1 No - lnc-ADAM21-4:1 No - lnc-TTC9-4:1 No - lnc-DCAF4-2:1 Yes chr2R:5259004-5295965 lnc-HEATR4-10:1 No - lnc-TTLL5-3:1 Yes chr2L:12693872-12694988 lnc-ADCK1-4:1 Yes chr3R:22468512-22486969 lnc-DIO2-7:1 No - lnc-SEL1L-14:1 No - lnc-VCAM1-3:1 Yes chr3R:11212308-11214539 lnc-FLRT2-7:2 No - lnc-SEL1L-15:1 No - lnc-SEL1L-16:1 No - lnc-FLRT2-6:2 No - lnc-FLRT2-5:2 No - lnc-FLRT2-4:1 No - lnc-GALC-12:1 No - lnc-GPR65-8:2 No - lnc-GALC-11:1 No - lnc-EFCAB11-5:1 Yes chrX:7682338-7709385 lnc-EXTL2-2:1 Yes chr3R:22582028-22583225 lnc-EFCAB11-4:1 Yes chrX:7682338-7709385 lnc-EFCAB11-3:1 Yes chrX:7682338-7709385 lnc-RPS6KA5-1:1 No - lnc-MOAP1-2:1 No - lnc-MOAP1-1:1 No - lnc-AMY1B-7:1 No - lnc-PPP4R4-1:1 No - lnc-SERPINA4-3:1 No - lnc-SERPINA12-2:1 No - lnc-SERPINA3-3:2 No - lnc-DICER1-3:1 No - lnc-ATG2B-10:2 No - lnc-VRK1-8:1 No - lnc-BCL11B-5:1 No - lnc-EML1-1:1 No - lnc-DEGS2-10:1 Yes chr3L:14903805-14942907 lnc-DEGS2-9:1 Yes chr3L:14903805-14942907 lnc-VAV3-9:1 No - lnc-DEGS2-8:1 Yes chr3L:14903805-14942907 lnc-SLC25A47-10:1 No - lnc-BEGAIN-3:1 No - lnc-WDR25-5:1 No - lnc-DLK1-14:1 No - lnc-VAV3-8:1 No - lnc-DYNC1H1-4:1 Yes chr3R:26719847-26725216 lnc-MOK-2:1 Yes chr3R:26719847-26725216 lnc-ZNF839-1:1 Yes chr2R:7459685-7463395 lnc-TDRD9-3:1 No - lnc-ATP5MPL-1:1 Yes chr3R:15837419-15844415 lnc-ASPG-3:1 Yes chr2L:7844905-7855475 lnc-AKT1-7:2 Yes chr3R:23985213-23986569 lnc-AKT1-6:2 Yes chr3R:23985213-23986569 lnc-LINC02203-14:1 No - lnc-NIPA2-3:1 Yes chr3R:15333266-15338365 lnc-TUBGCP5-1:1 Yes chr3R:15333266-15338365 lnc-ALX3-4:2 Yes chr3L:2768466-2772325 lnc-GOLGA8S-2:2 No - lnc-NDN-5:1 No - lnc-MKRN3-5:1 No - lnc-MKRN3-7:1 No - lnc-MKRN3-8:1 No - lnc-GOLGA8F-10:1 Yes chr2L:4908581-4932384 lnc-GOLGA8F-11:1 Yes chrX:10627737-10710947 lnc-SLC6A17-1:1 No - lnc-FAM189A1-4:1 Yes chrX:10627737-10710947 lnc-MTMR10-1:1 Yes chr2R:15262808-15309368 lnc-OTUD7A-2:1 Yes chr2L:9793317-9886250 lnc-FMN1-9:1 No - lnc-CHRM5-2:1 No - lnc-CHRM5-1:1 No - lnc-DPH6-4:1 No - lnc-DPH6-5:1 No - lnc-DPH6-6:1 No - lnc-MEIS2-10:1 No - lnc-MEIS2-8:1 Yes chr3L:15832464-15833947 lnc-RASGRP1-11:1 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-C15orf41-12:1 No - lnc-C15orf41-14:1 No - lnc-MEIS2-7:1 No - lnc-TMCO5A-4:1 No - lnc-SPRED1-2:1 No - lnc-RASGRP1-6:1 Yes chr3R:25893495-25895026 lnc-FSIP1-9:1 No - lnc-FSIP1-8:1 No - lnc-THBS1-3:1 No - lnc-KCND3-4:1 No - lnc-INAFM2-1:1 No - lnc-SLC30A4-2:1 No - lnc-USP8-3:1 Yes chr2R:15262808-15309368 lnc-USP50-5:1 Yes chr2R:15262808-15309368 lnc-MAPK6-18:1 No - lnc-PIGB-3:1 No - lnc-RFX7-2:1 Yes chr3R:6449944-6456676 lnc-LDHAL6B-1:1 No - lnc-BNIP2-2:1 No - lnc-BNIP2-3:1 No - lnc-BNIP2-4:1 Yes chr3R:25095012-25096099 lnc-C2CD4B-12:1 Yes chr3L:8545001-8574409 lnc-APH1B-2:1 No - lnc-PIF1-2:1 No - lnc-MEGF11-1:6 No - lnc-SMAD3-6:1 No - lnc-C15orf61-2:1 No - lnc-CALML4-7:1 No - lnc-LRIG2-7:1 No - lnc-CALML4-4:1 Yes chr2R:9116122-9122000 lnc-TLE3-11:1 No - lnc-NR2E3-10:1 No - lnc-MYO9A-2:1 No - lnc-NR2E3-6:1 No - lnc-RPP25-3:1 No - lnc-SNX33-8:1 Yes chrX:9626294-9659145 lnc-ETFA-3:1 No - lnc-CIB2-6:1 No - lnc-TBC1D2B-4:1 No - lnc-ACSBG1-3:1 No - lnc-ABHD17C-1:1 No - lnc-NHLH2-4:1 No - lnc-TNFRSF14-3:1 No - lnc-HOMER2-3:3 No - lnc-BNC1-3:1 Yes chr2L:21684106-21729051 lnc-NHLH2-5:1 No - lnc-NTRK3-6:1 No - lnc-AGBL1-6:1 No - lnc-NTRK3-2:11 No - lnc-AEN-1:1 No - lnc-CIB1-3:1 No - lnc-CIB1-2:3 No - lnc-CD58-7:2 No - lnc-SLCO3A1-6:1 No - lnc-FAM174B-8:1 Yes chr2L:9521210-9540060 lnc-CHD2-4:13 No - LINC01581:4 No - lnc-RGMA-15:1 No - lnc-TTF2-2:1 No - lnc-RGMA-17:1 No - lnc-MCTP2-15:1 No - lnc-RGMA-22:1 No - lnc-RGMA-19:6 No - lnc-RGMA-20:1 No - lnc-SPATA8-2:1 No - lnc-PGPEP1L-21:1 No - lnc-SPATA8-6:1 No - lnc-VTCN1-4:1 Yes chrX:10266792-10325958 lnc-PGPEP1L-16:1 No - lnc-ARRDC4-8:1 No - lnc-ARRDC4-7:1 No - lnc-ARRDC4-9:1 No - lnc-SYNM-9:1 Yes chr3R:21570248-21619321 lnc-SYNM-7:2 Yes chr2R:20236235-20239200 lnc-TTC23-3:7 No - lnc-MEF2A-5:2 No - lnc-GNG13-4:1 No - lnc-NTHL1-1:2 No - lnc-PDPK1-1:1 No - lnc-PRSS33-1:1 No - lnc-KREMEN2-1:1 No - lnc-OR1F1-1:6 No - lnc-CLUAP1-2:2 No - lnc-CREBBP-1:1 No - lnc-ADCY9-2:1 No - lnc-ALG1-4:1 No - lnc-EEF2KMT-6:1 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-C16orf72-11:1 No - lnc-PARN-13:1 Yes chrX:4314230-4318801 lnc-CLEC19A-3:1 No - lnc-GDE1-4:1 No - lnc-NPIPB4-4:1 No - lnc-ARHGAP17-12:1 Yes chr2R:24086604-24092014 lnc-ARHGAP17-7:1 Yes chr3R:19905164-19914272 lnc-HS3ST4-2:1 No - lnc-NSMCE1-7:1 No - lnc-RABEP2-6:1 No - lnc-ZG16-4:1 No - lnc-INO80E-2:2 No - lnc-TP53TG3F-4:1 No - lnc-GPT2-11:1 Yes chr3L:15560726-15563065 lnc-PHKB-6:1 No - lnc-PHKB-7:1 No - lnc-C16orf78-8:1 Yes chr2R:14435899-14465881 lnc-ZNF423-5:1 No - lnc-ADCY7-3:1 No - lnc-SNX20-8:2 Yes chr3L:19003741-19045449 lnc-NKD1-2:1 Yes chr3L:19003741-19045449 lnc-CYLD-9:1 No - lnc-SNX20-9:1 No - lnc-SALL1-9:1 Yes chr2L:11434311-11445614 lnc-CYLD-13:1 No - lnc-HNRNPA1P48-15:1 No - lnc-TOX3-4:1 No - lnc-TOX3-6:1 No - lnc-AKTIP-5:1 No - lnc-RBL2-6:2 No - lnc-IRX3-12:1 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX5-6:1 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX5-5:1 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-CIAPIN1-1:1 No - lnc-CCL17-1:1 No - lnc-SETD6-15:1 No - lnc-SETD6-17:1 No - lnc-CDH5-22:1 No - lnc-CDH11-7:1 No - lnc-ADAMTSL4-6:1 Yes chr3L:14029579-14031706 lnc-TK2-11:1 No - lnc-CDH5-16:1 No - lnc-CLEC18A-2:1 Yes chr2L:2037714-2044372 lnc-DHX38-7:1 No - lnc-SPRR2D-2:1 No - lnc-ZFHX3-1:1 No - lnc-MLKL-2:1 No - lnc-CLEC3A-6:1 No - lnc-CLEC3A-8:1 Yes chr2L:7999670-8004286 lnc-CLEC3A-11:1 Yes chr2L:7999670-8004286 lnc-ADAMTS18-10:1 Yes chr2L:7999670-8004286 lnc-MAF-6:1 No - lnc-GCSH-2:1 No - lnc-C1orf61-1:1 No - lnc-CDH13-3:1 No - lnc-MPHOSPH6-7:1 No - lnc-SLC38A8-10:1 No - lnc-KLHL36-2:3 Yes chrX:18775228-18781345 lnc-CRISPLD2-2:1 Yes chr3L:871899-895313 lnc-COTL1-2:1 Yes chr3L:871899-895313 lnc-ZDHHC7-3:1 No - lnc-CRISPLD2-5:1 Yes chr2L:6774041-6778444 lnc-C1orf61-2:29 No - lnc-KIAA0513-6:1 No - lnc-EMC8-5:1 No - lnc-FOXL1-1:2 No - lnc-MTHFSD-7:1 No - lnc-C16orf95-3:3 No - lnc-CD5L-1:1 Yes chrX:2740384-3134532 lnc-BANP-11:1 No - LINC02091:7 No - lnc-C17orf97-1:3 No - lnc-RAP1GAP2-3:1 Yes chr2R:16178826-16185103 lnc-CHRNE-4:1 Yes chr3L:2554847-2586540 lnc-NEURL4-3:3 Yes chr3R:23118400-23124217 lnc-VAMP2-1:1 No - lnc-SLC25A35-3:1 No - lnc-ADPRM-6:1 No - lnc-COX10-11:1 Yes chrX:19248639-19252045 lnc-PMP22-4:1 No - lnc-CCDC144A-5:1 No - lnc-MFAP4-7:1 No - lnc-DHRS7B-7:2 Yes chr3L:18618305-18622129 lnc-CD244-1:1 No - lnc-TP53I13-6:1 Yes chrX:19569721-19579800 lnc-OMG-2:1 Yes chr3R:25983013-25995737 lnc-RAB11FIP4-7:1 Yes chr3R:25983013-25995737 lnc-C17orf75-6:1 Yes chr3L:1463811-1468944 lnc-CDK5R1-8:1 Yes chr2L:10491814-10506779 lnc-FCGR3A-2:1 No - lnc-SLFN14-1:1 No - lnc-MRM1-4:1 No - lnc-MED24-2:1 No - lnc-MAEL-101:2 No - lnc-CCR7-2:1 No - lnc-SMARCE1-1:1 No - lnc-KRTAP9-2-1:1 No - lnc-EIF1-4:1 No - lnc-DNAJC7-4:1 Yes chr2R:15993531-16001290 lnc-NKIRAS2-1:1 No - lnc-DHX58-3:1 No - lnc-COA3-1:1 No - lnc-GPR161-3:1 No - lnc-VAT1-1:1 No - lnc-SPATA32-4:2 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-KANSL1-4:2 Yes chr3R:27639886-27656996 lnc-MAPT-2:1 Yes chr3R:15793782-15802102 lnc-NSF-1:1 Yes chr3R:13833497-13837991 lnc-XCL2-3:1 No - lnc-RPRML-6:1 Yes chr3L:7245481-7249340 lnc-SNX11-9:1 No - lnc-SNX11-11:1 No - lnc-SNX11-12:1 No - lnc-TMEM92-3:1 No - lnc-CA10-2:1 No - lnc-DPT-2:1 No - lnc-COX11-4:1 No - lnc-AKAP1-5:1 Yes chr3R:25516118-25608423 lnc-CCDC182-3:1 Yes chr3R:25516118-25608423 lnc-TEX14-2:1 No - lnc-PPM1E-2:1 No - lnc-EFCAB3-6:1 No - lnc-VAMP4-4:1 No - lnc-NOL11-4:3 Yes chr2R:17695776-17698362 lnc-ABCA5-7:3 Yes chrX:13091145-13093986 lnc-ABCA5-7:1 Yes chrX:13091145-13093986 lnc-MAP2K6-6:2 No - lnc-SLC39A11-8:1 No - lnc-SLC39A11-7:1 No - lnc-SLC39A11-6:1 No - lnc-LGALS3BP-2:3 Yes chrX:11720245-11723854 lnc-LGALS3BP-1:1 No - LINC01134:1 No - lnc-ENDOV-3:1 Yes chrX:6082634-6090201 lnc-CETN1-2:1 No - lnc-TNFSF18-5:1 No - lnc-NDC80-10:1 No - lnc-DLGAP1-4:1 Yes chr2R:12511534-12515062 lnc-AKAIN1-1:1 No - lnc-ARHGAP28-15:1 No - lnc-ARHGAP28-14:1 No - lnc-LAMA1-7:1 No - lnc-NDUFV2-3:1 No - lnc-ASTN1-2:1 No - lnc-PPP4R1-15:1 Yes chr3L:12750119-12753402 lnc-RALBP1-4:1 No - lnc-RAB31-2:1 No - lnc-PIEZO2-12:1 No - lnc-PIEZO2-11:1 No - lnc-PIEZO2-3:6 No - lnc-SLC35G4-5:1 No - lnc-SLC35G4-4:1 No - lnc-ANKRD62-3:1 No - lnc-CIDEA-4:1 No - lnc-POTEC-7:1 No - lnc-ANKRD30B-2:4 No - lnc-CLEC20A-8:1 No - lnc-ROCK1-4:2 Yes chrX:16624012-16637414 lnc-RBBP8-8:1 No - lnc-HRH4-11:1 No - lnc-HRH4-12:1 No - lnc-ZNF521-2:1 No - lnc-HRH4-15:1 No - lnc-CHST9-3:1 No - lnc-CDH2-5:1 No - lnc-LHX4-3:1 Yes chrX:21317936-21319296 lnc-KLHL14-1:1 No - lnc-KLHL14-2:1 No - lnc-NOL4-3:1 Yes chr2R:14503958-14512493 lnc-NOL4-2:1 No - lnc-TPGS2-2:1 No - lnc-TPGS2-5:1 No - lnc-TPGS2-7:1 Yes chr3L:13521907-13803400 lnc-KIAA1614-6:1 Yes chr2R:11219539-11222480 lnc-TPGS2-8:1 Yes chr3L:13521907-13803400 lnc-KIAA1328-9:1 No - lnc-CELF4-14:1 No - lnc-PIK3C3-9:1 No - lnc-SYT4-5:1 Yes chr2R:16107440-16110017 lnc-SYT4-4:1 No - lnc-SYT4-6:1 No - lnc-RGS8-4:1 Yes chr2L:20093972-20096253 lnc-SETBP1-6:1 No - lnc-EPG5-8:1 No - lnc-SIGLEC15-1:1 Yes chr3R:18750436-18758873 lnc-ATP5F1A-1:1 No - lnc-ATP5F1A-2:1 No - lnc-SKOR2-1:1 Yes chr4:962341-978489 lnc-LIPG-6:1 No - lnc-DCC-6:1 No - lnc-MEX3C-8:1 No - lnc-DCC-5:1 No - lnc-STARD6-3:1 No - lnc-C18orf54-1:1 No - lnc-C18orf54-2:1 No - lnc-RAB27B-4:1 No - lnc-RAB27B-5:1 No - lnc-RAB27B-6:1 No - lnc-RAB27B-11:4 No - lnc-PLA2G4A-16:1 No - lnc-BOD1L2-2:1 Yes chrX:1908920-1916825 lnc-FECH-1:1 No - lnc-CCBE1-1:1 No - lnc-KIAA1468-4:1 No - lnc-RNF152-7:1 Yes chr3R:22707786-22710762 lnc-BCL2-2:1 No - lnc-CCDC102B-9:1 No - lnc-TMX3-5:1 No - lnc-BRINP3-8:1 No - lnc-TMX3-3:1 Yes chr2L:6491061-6496988 lnc-DOK6-4:1 Yes chr2L:6491061-6496988 lnc-RTTN-6:1 No - lnc-RTTN-7:1 No - lnc-CBLN2-13:1 No - lnc-CBLN2-12:1 No - lnc-SOCS6-18:1 No - lnc-ZBTB41-1:6 Yes chr3R:24753849-24760513 lnc-NETO1-2:2 No - lnc-TIMM21-11:1 No - lnc-NETO1-6:1 No - LINC02582:13 No - lnc-FBXO15-8:1 No - lnc-CYB5A-2:1 Yes chrX:6274972-6276724 lnc-C18orf63-2:1 No - lnc-FAM69C-3:1 No - LINC01922:5 No - lnc-NEK7-4:1 No - lnc-CNDP1-6:1 Yes chr2L:21762314-21795447 lnc-CNDP1-7:1 Yes chr2L:21762314-21795447 lnc-FAM69C-5:1 Yes chr2L:21762314-21795447 lnc-ZADH2-3:1 Yes chr2L:21762314-21795447 lnc-TSHZ1-4:2 No - lnc-MBP-5:1 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-ZNF516-14:1 No - lnc-MBP-11:1 No - lnc-NR5A2-11:1 No - lnc-DIRAS1-1:1 No - lnc-HDGFL2-4:1 No - lnc-EVI5L-2:1 No - lnc-PRR36-5:1 No - lnc-NR5A2-8:1 No - lnc-ZNF561-1:1 No - lnc-KEAP1-1:1 No - lnc-C19orf57-9:1 Yes chrX:11931280-11985087 lnc-OR10H1-4:1 No - lnc-ZNF66-7:1 No - lnc-IPO9-2:1 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-ZNF675-4:1 No - lnc-ANKRD27-6:1 No - lnc-KIAA0355-3:1 Yes chr3L:12515059-12520954 lnc-PRODH2-4:1 Yes chr2R:15011396-15042134 lnc-ZNF529-3:2 No - LINC01534:10 No - lnc-ZNF568-4:1 No - lnc-ZNF569-3:1 No - lnc-KDM5B-2:1 Yes chr2L:2772327-2799979 lnc-SIPA1L3-2:2 No - lnc-SELENOV-4:1 No - lnc-MAP3K10-1:1 Yes chr3R:16099228-16105670 lnc-CYP2B6-1:1 No - lnc-B9D2-1:3 Yes chr3R:9555785-9557776 lnc-ARHGEF1-4:1 No - lnc-RABAC1-2:1 No - lnc-DEDD2-3:1 Yes chr2L:12587625-12628135 lnc-CXCL17-2:1 Yes chr2R:20257650-20261726 lnc-AJAP1-6:1 No - lnc-IGFL2-3:1 No - lnc-KLK15-2:1 No - lnc-ZNF83-6:1 No - lnc-KIR2DL3-1:1 No - lnc-SYT5-1:2 Yes chr2L:2772327-2799979 lnc-C19orf85-1:1 No - lnc-RBBP5-1:1 No - lnc-ZNF552-2:1 No - lnc-A1BG-3:1 No - lnc-SLC45A3-1:1 Yes chr3L:25236940-25670980 lnc-TMEM18-18:1 No - lnc-ACP1-16:1 No - lnc-SNTG2-9:1 No - lnc-SNTG2-8:1 No - lnc-SNTG2-8:4 No - lnc-TMEM18-19:1 No - lnc-SNTG2-6:1 Yes chr3R:17425768-17446499 lnc-RHEX-4:1 No - lnc-CMPK2-34:1 No - lnc-SOX11-6:1 No - lnc-CMPK2-19:1 No - lnc-RNF144A-6:1 No - lnc-RNF144A-8:1 No - lnc-CMPK2-28:1 No - lnc-RNF144A-11:1 No - lnc-CD34-5:2 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-KIDINS220-20:1 No - lnc-ID2-8:1 No - lnc-KIDINS220-16:2 No - lnc-KIDINS220-15:1 No - lnc-ID2-5:1 No - lnc-KIDINS220-12:2 No - lnc-MBOAT2-4:1 No - lnc-ASAP2-6:1 No - lnc-MBOAT2-9:1 No - lnc-CPSF3-1:1 No - lnc-CYS1-8:1 No - lnc-CYS1-6:1 Yes chr2R:17801132-17842820 lnc-ODC1-1:1 No - lnc-PQLC3-2:1 No - lnc-NTSR2-6:1 No - lnc-TRIB2-12:1 No - lnc-KCNH1-1:3 No - lnc-DDX1-6:1 No - lnc-DDX1-4:1 No - lnc-MYCN-9:1 No - lnc-RHOB-20:1 No - lnc-RHOB-16:1 Yes chr3L:1730993-1735767 lnc-RHOB-15:1 Yes chr3L:1730993-1735767 lnc-PUM2-4:1 No - lnc-TDRD15-7:1 No - lnc-SERTAD4-3:2 Yes chr3L:3162180-3163852 lnc-TDRD15-8:3 No - lnc-APOB-13:2 No - lnc-TDRD15-9:1 No - lnc-KLHL29-7:1 No - lnc-ATAD2B-14:3 No - lnc-ATAD2B-9:3 No - lnc-TRMT61B-7:2 Yes chr2L:5746157-5747961 lnc-ALK-3:1 No - lnc-RD3-10:1 Yes chrX:14955477-15009989 lnc-RPL22-3:1 Yes chr3L:19882051-19910215 lnc-ALK-5:1 No - lnc-RASGRP3-14:2 No - lnc-CEBPZOS-2:1 No - lnc-QPCT-6:1 No - lnc-HHAT-3:1 Yes chrX:14955477-15009989 lnc-RMDN2-9:1 No - lnc-HNRNPLL-7:1 Yes chr3R:24625671-24634714 lnc-TMEM178A-1:1 No - lnc-TMEM178A-7:2 No - lnc-C2orf91-7:1 No - lnc-COX7A2L-3:2 Yes chr3L:14903805-14942907 lnc-EML4-6:1 No - lnc-HAAO-2:1 No - lnc-HAAO-6:2 No - lnc-MTA3-10:1 No - LINC01121:12 No - lnc-ATP6V1E2-10:1 No - lnc-EPAS1-2:1 No - lnc-TTC7A-2:2 No - lnc-CALM2-4:1 No - lnc-MSH2-1:4 Yes chr3L:15154233-15158562 lnc-MSH6-6:1 No - lnc-FSHR-7:1 Yes chr3R:22468512-22486969 lnc-FSHR-8:1 Yes chr3R:22468512-22486969 lnc-ASB3-9:1 No - lnc-VRK2-15:1 No - lnc-VRK2-13:1 No - lnc-VRK2-17:1 No - lnc-INTS7-2:1 No - lnc-FANCL-9:1 No - lnc-USP34-8:1 Yes chr2L:153539-155305 lnc-XPO1-2:1 No - lnc-TMEM17-3:1 No - lnc-VPS54-6:1 Yes chr2L:1711302-1715851 lnc-PELI1-9:1 No - lnc-SLC1A4-3:1 No - lnc-TMEM206-3:2 Yes chrX:16740906-16742918 lnc-SERTAD2-3:6 No - lnc-SPRED2-8:1 No - lnc-SPRED2-13:1 No - lnc-SPRED2-19:2 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-MEIS1-9:2 No - lnc-ETAA1-10:2 No - lnc-BMP10-2:1 No - lnc-ANXA4-6:1 Yes chr2L:18957732-18968744 lnc-SPATA17-8:1 Yes chr3L:8183361-8186671 lnc-GMCL1-1:1 No - PCBP1-AS1:201 No - lnc-RAB11FIP5-2:1 No - lnc-HK2-4:3 No - lnc-POLE4-3:1 Yes chr3R:29950796-29969447 lnc-REG3G-10:1 No - lnc-SPATA17-6:1 No - lnc-REG1B-6:1 No - lnc-SUCLG1-11:1 No - lnc-VAMP5-1:1 No - lnc-GNLY-3:2 No - lnc-ATOH8-3:1 Yes chr2L:82421-87387 lnc-POLR1A-6:1 No - lnc-PLGLB1-3:1 No - lnc-SPATA17-5:1 No - lnc-PLGLB1-5:1 No - lnc-TEX37-3:1 No - lnc-FOXI3-7:1 No - lnc-ANKRD20A8P-10:1 No - lnc-TRIM43-4:1 No - lnc-STARD7-1:1 No - lnc-NMS-4:1 Yes chr2L:2885929-2954406 lnc-NMS-3:1 No - lnc-CHST10-3:1 No - lnc-ZC3H11B-8:1 No - lnc-THAP3-2:3 Yes chr2R:14256493-14258787 lnc-TBC1D8-6:1 No - lnc-MFSD9-17:1 No - lnc-MFSD9-18:1 No - lnc-TGFBRAP1-19:1 No - lnc-POU3F3-15:1 No - lnc-EPRS-4:1 Yes chr3L:20484293-20494921 lnc-POU3F3-14:1 No - lnc-C2orf40-9:1 No - lnc-ST6GAL2-8:1 No - lnc-ST6GAL2-10:2 No - lnc-SULT1C2-4:1 No - lnc-EDAR-12:1 No - lnc-MALL-6:1 Yes chr2R:7960133-7961921 lnc-ACOXL-4:1 Yes chr3R:8356978-8359964 lnc-RGPD6-1:2 Yes chr3R:8356978-8359964 lnc-C1orf115-1:1 Yes chr3R:11346294-11353131 lnc-BCL2L11-5:1 No - lnc-RGPD8-2:1 No - lnc-ZC3H6-4:1 Yes chr3R:25618414-25621838 lnc-RGPD8-3:1 No - lnc-IL36RN-2:1 No - lnc-PSD4-4:1 Yes chr4:1088798-1113317 lnc-PSD4-6:2 No - lnc-HLX-2:1 Yes chr2L:6013059-6019402 lnc-SLC35F5-6:2 No - lnc-SLC35F5-17:1 No - lnc-DDX18-5:1 No - lnc-DDX18-3:1 No - lnc-CCDC93-4:1 Yes chr2R:16262284-16264619 lnc-PTPN4-2:1 Yes chr3R:13428867-13434984 lnc-HLX-3:1 No - lnc-RALB-1:3 Yes chrX:3704610-3719635 lnc-NIFK-10:1 No - lnc-BIN1-9:1 No - lnc-TEX51-4:1 Yes chr2R:12593604-12612068 lnc-RAB6C-9:1 No - lnc-POTEF-9:1 No - LINC01120:1 No - lnc-GPR39-15:1 No - lnc-GPR39-13:1 No - lnc-UBXN4-6:1 Yes chr3L:3818679-3842326 lnc-SPOPL-13:1 No - lnc-ZEB2-6:1 Yes chrX:15853421-15854970 lnc-LYPD6-5:1 No - lnc-MMADHC-3:1 No - lnc-LYPD6-16:1 No - lnc-RIF1-3:1 No - lnc-RPRM-8:1 Yes chr2L:5072170-5093592 lnc-RPRM-10:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-NR4A2-9:1 No - lnc-GPD2-5:1 No - lnc-GALNT5-2:1 Yes chr2R:8952339-8962796 lnc-TANK-4:3 No - lnc-SCN2A-8:1 No - lnc-TAF1A-5:1 No - lnc-B3GALT1-1:1 Yes chr3R:18573091-18589459 lnc-SPC25-5:1 Yes chr3R:18573091-18589459 lnc-SPC25-4:1 Yes chr3R:18573091-18589459 lnc-SP5-1:1 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-OLA1-3:1 No - lnc-SP9-5:1 Yes chrX:9778742-9782094 lnc-DISP1-4:8 No - lnc-LNPK-2:1 No - lnc-EVX2-11:1 Yes chrX:15210386-15211467 lnc-MTX2-4:1 No - lnc-MTX2-5:1 No - lnc-EVX2-12:1 No - LINC01117:1 No - lnc-UTS2-4:2 No - lnc-UBE2E3-7:1 No - lnc-NCKAP1-4:1 No - lnc-NCKAP1-6:1 No - lnc-ZSWIM2-14:1 No - lnc-WDR75-2:1 No - lnc-C2orf88-3:1 Yes chr3R:15357229-15359263 lnc-MYO1B-1:1 No - lnc-DNAH7-4:1 No - lnc-C2orf69-14:1 No - lnc-C2orf69-13:1 No - lnc-C2orf69-12:1 No - lnc-SATB2-5:1 No - lnc-KLF7-2:1 Yes chrX:17080423-17087675 lnc-CAPN2-2:2 No - lnc-CREB1-7:1 No - lnc-PTH2R-2:1 No - lnc-SPAG16-10:1 Yes chr2R:21522420-21559977 lnc-IKZF2-7:1 No - lnc-ATIC-11:1 No - lnc-ATIC-10:1 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-FN1-5:1 No - lnc-ATIC-12:1 No - lnc-IGFBP2-3:1 Yes chr2L:5070957-5072055 lnc-CNOT9-1:1 No - lnc-EPHA4-6:1 No - lnc-EPHA4-5:1 No - lnc-CCDC140-7:1 No - lnc-CCDC140-6:1 No - lnc-PSEN2-6:1 No - lnc-NYAP2-3:1 No - lnc-RHBDD1-4:1 No - lnc-DAW1-4:1 No - lnc-PSMD1-3:1 No - lnc-NCL-6:1 No - lnc-ZNF678-5:1 Yes chr2R:24092079-24098636 lnc-ERFE-2:1 No - lnc-HDLBP-2:1 Yes chrX:21358286-21361688 lnc-DTYMK-2:2 No - lnc-C20orf96-5:1 No - lnc-FKBP1A-2:1 No - lnc-SIRPG-5:1 No - lnc-STK35-2:7 No - lnc-ZNF678-4:1 No - lnc-CDS2-11:1 No - lnc-HAO1-5:1 No - lnc-PLCB1-2:1 No - lnc-ANKEF1-5:1 No - lnc-MKKS-6:1 No - lnc-SLX4IP-4:3 No - lnc-WNT9A-2:1 No - lnc-JAG1-13:1 No - lnc-SPTLC3-9:1 No - lnc-TASP1-11:1 No - lnc-SPTLC3-7:1 No - lnc-SPTLC3-6:1 No - lnc-BANF2-1:1 No - lnc-KAT14-4:1 No - lnc-DZANK1-7:1 No - lnc-ZNF133-3:1 No - lnc-ARF1-4:1 No - lnc-SCP2D1-2:1 No - lnc-SCP2D1-3:1 No - lnc-SLC24A3-1:4 Yes chrX:23022898-23035550 lnc-KIZ-9:2 Yes chr2L:6908083-6911423 lnc-FOXA2-7:8 No - lnc-FOXA2-3:6 No - lnc-FOXA2-9:1 No - lnc-SSTR4-17:1 No - lnc-RHOU-6:2 No - lnc-SSTR4-12:1 No - lnc-NAPB-5:1 No - lnc-GGTLC1-7:1 No - lnc-VSX1-3:1 No - lnc-FAM182B-13:3 No - lnc-TAF5L-3:1 Yes chr3R:23255070-23258087 lnc-PARK7-2:1 No - lnc-BCL2L1-1:1 No - lnc-SNTA1-1:1 No - NORAD:6 No - lnc-RBL1-3:1 Yes chr3L:19294564-19298830 lnc-COG2-4:1 Yes chr2L:3404460-3426719 lnc-KIAA1755-9:1 Yes chr2R:4744348-4758048 lnc-KIAA1755-12:1 No - lnc-DHX35-6:1 No - lnc-DHX35-6:5 No - lnc-MAFB-4:1 No - lnc-IFT52-1:1 Yes chr2L:6555717-6557502 lnc-GTSF1L-5:1 No - lnc-ADA-2:1 No - lnc-YWHAB-1:1 No - lnc-NCOA3-22:2 No - LINC01754:6 No - lnc-NCOA3-20:1 No - lnc-NCOA3-14:1 No - lnc-NCOA3-4:2 No - lnc-SULF2-7:1 No - lnc-PREX1-9:1 No - lnc-PTGIS-1:1 No - lnc-ZFP64-9:2 No - lnc-ZFP64-6:1 No - lnc-TSHZ2-14:2 Yes chr3L:7353578-7356713 lnc-PFDN4-13:1 No - lnc-AGT-6:1 Yes chr3L:9888762-9893319 lnc-DOK5-2:2 No - lnc-MC3R-5:1 No - lnc-GCNT7-4:1 No - lnc-GCNT7-5:1 No - lnc-PHACTR3-4:1 No - lnc-SYCP2-4:1 No - lnc-SYCP2-3:1 Yes chr3L:3714826-3806459 lnc-PPP1R3D-7:1 No - lnc-FAM217B-2:1 No - lnc-CDH26-8:1 No - lnc-LSM14B-2:1 No - lnc-LAMA5-3:1 Yes chr2R:13958545-13960404 lnc-CABLES2-2:1 Yes chr3L:6203831-6218022 lnc-PCNX2-5:1 No - lnc-TCFL5-5:1 Yes chr3R:16502770-16571363 lnc-SLC17A9-1:2 No - lnc-SLC17A9-6:1 No - lnc-POTED-12:1 No - lnc-LIPI-14:2 No - lnc-LIPI-9:1 No - lnc-SIPA1L2-12:1 Yes chrX:2225296-2238045 lnc-HSPA13-5:1 No - lnc-RBM11-12:1 No - lnc-USP25-5:1 No - lnc-USP25-11:1 No - LINC01689:11 No - lnc-MRPL39-21:1 No - lnc-GABPA-15:1 No - lnc-GABPA-23:1 No - lnc-GABPA-17:1 No - lnc-GABPA-19:2 No - lnc-ADAMTS5-4:1 No - lnc-ADAMTS5-5:3 No - lnc-GGPS1-10:1 No - lnc-USP16-12:1 No - lnc-KRTAP20-3-1:1 No - lnc-SCAF4-5:1 No - lnc-MIS18A-8:2 No - lnc-MIS18A-7:1 No - lnc-URB1-2:1 No - C21orf62-AS1:12 No - C21orf62-AS1:15 No - lnc-H6PD-3:2 No - lnc-SON-1:1 Yes chr3R:15265591-15266690 lnc-CRYZL1-81:2 Yes chr3R:15265591-15266690 lnc-CBR1-10:1 Yes chrX:20538497-20567097 lnc-CBR3-3:1 No - lnc-HLCS-6:1 No - lnc-RIPPLY3-6:1 No - lnc-DYRK1A-8:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-ERG-11:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-ERG-4:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-ETS2-11:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-LCA5L-2:2 Yes chr3R:17473935-17505667 lnc-BACE2-5:1 Yes chr3R:17473935-17505667 lnc-MTRNR2L11-7:3 No - lnc-BACE2-4:1 Yes chr3R:17473935-17505667 lnc-BACE2-2:1 No - lnc-UBASH3A-7:1 Yes chr2L:4333913-4345776 lnc-TFF3-2:1 Yes chr2L:4333913-4345776 lnc-RSPH1-6:1 No - lnc-CRYAA-15:1 No - lnc-CSTB-2:1 No - lnc-DNMT3L-1:1 No - lnc-KRTAP10-12-3:1 Yes chrX:16593677-16595867 lnc-XKR3-4:1 No - lnc-SCARF2-2:1 No - lnc-RIMBP3B-2:1 No - lnc-YPEL1-2:1 Yes chr2R:1071462-1125927 lnc-GSTT2B-1:1 No - lnc-SGSM1-1:1 No - lnc-KIAA1671-2:1 Yes chrX:20433950-20445599 lnc-CRYBB3-3:1 No - lnc-EFCAB2-6:1 Yes chr2L:7844905-7855475 lnc-LRP5L-9:1 No - lnc-HPS4-8:3 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-HPS4-8:1 No - lnc-CRYBA4-12:1 No - lnc-CCDC117-3:1 No - lnc-RHBDD3-1:1 No - lnc-SEC14L3-1:1 Yes chr3L:599094-604008 lnc-TEX33-1:1 No - lnc-MKL1-3:1 No - lnc-XPNPEP3-4:2 Yes chr3L:4318755-4321109 lnc-SMDT1-2:3 No - lnc-SERHL2-5:1 Yes chr3L:11816695-11822275 lnc-TTLL1-3:2 Yes chr3R:20832799-20840118 lnc-PNPLA5-4:1 Yes chrX:19746041-19748458 lnc-PARVG-4:2 No - lnc-PARVG-7:1 No - lnc-PRR5-6:1 No - lnc-GRAMD4-4:1 Yes chr3R:21102199-21105113 lnc-CERK-9:2 No - lnc-FAM19A5-11:1 No - lnc-FAM19A5-10:1 No - lnc-FAM19A5-12:1 No - lnc-BRD1-25:1 No - lnc-ADARB2-12:1 No - lnc-GPR157-6:1 Yes chr2R:5116990-5128321 lnc-CHL1-4:1 No - lnc-IL5RA-17:1 No - lnc-LRRN1-2:1 Yes chr3L:175112-176228 lnc-SUMF1-3:1 Yes chr3L:175112-176228 lnc-SSUH2-17:1 No - lnc-PITRM1-13:1 No - lnc-ATP2B2-1:3 Yes chr4:328193-358917 lnc-WNT7A-2:1 No - LINC00620:1 No - lnc-LSM3-2:3 Yes chr3R:23996262-23997017 lnc-XPC-6:1 No - FGD5-AS1:20 No - lnc-HACL1-2:1 Yes chrX:6194737-6196439 lnc-OXNAD1-9:1 No - lnc-RFTN1-2:1 No - lnc-PFKP-27:3 No - lnc-PLCL2-6:1 Yes chr3L:9097629-9134405 lnc-PLCL2-4:1 No - lnc-PLCL2-10:1 Yes chr3R:13269137-13272011 SATB1-AS1:1 No - lnc-SATB1-6:1 No - lnc-KAT2B-5:1 No - lnc-PITRM1-10:1 No - lnc-UBE2E2-7:1 No - lnc-ZNF385D-2:1 No - lnc-NKIRAS1-6:1 No - lnc-THRB-4:1 No - lnc-CMC1-6:1 No - lnc-RBMS3-3:2 No - lnc-AZI2-7:1 No - lnc-ZCWPW2-2:7 No - lnc-TGFBR2-5:1 No - lnc-TGFBR2-4:1 No - lnc-PITRM1-12:1 No - lnc-GADL1-6:1 No - lnc-CMTM7-1:1 Yes chrX:11154421-11164670 lnc-PDCD6IP-5:1 No - lnc-TTC21A-76:2 Yes chr2L:2365345-2370137 lnc-TTC21A-7:1 No - lnc-CCR8-3:1 No - lnc-KLF6-5:9 No - lnc-ULK4-13:1 No - lnc-RPL14-4:1 No - lnc-ANO10-4:1 Yes chr2R:14235787-14239703 lnc-ABHD5-2:1 No - lnc-ZNF445-4:1 Yes chr3L:6073490-6075245 lnc-TOPAZ1-4:1 Yes chr3L:6073490-6075245 lnc-TCAIM-3:1 No - lnc-ZNF35-2:1 No - lnc-KLF6-10:1 No - lnc-CLEC3B-1:1 No - lnc-KLHL18-7:1 Yes chrX:13413242-13421024 lnc-ARIH2-4:1 Yes chr2R:9993890-10026042 lnc-IFRD2-5:1 Yes chr3L:6972750-6980044 lnc-IQCF6-1:1 No - lnc-SFMBT1-1:1 Yes chrX:5692945-5695205 lnc-PFKP-34:1 No - lnc-SELENOK-2:2 No - lnc-SYNPR-4:1 No - lnc-ATXN7-11:1 Yes chr2R:7086316-7127868 lnc-ADAMTS9-5:1 Yes chr2R:7086316-7127868 lnc-ADAMTS9-6:1 No - lnc-PFKP-16:8 No - lnc-MAGI1-3:1 No - lnc-SLC25A26-11:1 No - lnc-SLC25A26-4:1 No - lnc-LRIG1-5:1 No - SUCLG2-AS1:15 No - lnc-MITF-8:1 No - lnc-FOXP1-4:1 No - lnc-MITF-11:1 No - lnc-GPR27-8:1 No - lnc-RYBP-6:1 No - lnc-GXYLT2-6:1 No - lnc-ROBO1-5:1 No - lnc-GBE1-9:1 No - LINC02050:25 No - lnc-ROBO2-16:1 No - LINC00702:14 No - lnc-GPR157-7:8 No - lnc-CADM2-14:1 No - lnc-CADM2-12:1 No - lnc-CADM2-11:1 No - lnc-CADM2-3:10 No - lnc-VGLL3-8:1 No - lnc-CHMP2B-4:1 No - lnc-VGLL3-7:1 No - lnc-C3orf38-4:1 No - lnc-AKR1E2-10:1 No - lnc-COL8A1-10:1 No - lnc-COL8A1-4:1 No - lnc-FILIP1L-6:1 No - lnc-FILIP1L-5:1 No - lnc-FILIP1L-4:1 No - lnc-LNP1-1:1 No - lnc-NXPE3-2:1 No - lnc-ZPLD1-6:1 No - lnc-KLF6-15:1 No - lnc-ZPLD1-8:1 No - lnc-ZPLD1-10:1 No - lnc-CBLB-16:1 No - lnc-ALCAM-17:1 No - lnc-ALCAM-11:1 No - LINC00635:1 No - lnc-CD47-5:1 Yes chr2L:3530789-3532678 lnc-IFT57-1:1 No - lnc-MYH15-1:2 No - lnc-CIP2A-4:1 No - lnc-AKR1E2-9:2 No - lnc-GUCA1C-2:1 No - lnc-DPPA4-1:2 No - lnc-DPPA4-4:1 No - lnc-C3orf85-10:1 No - MANCR:39 No - lnc-NEPRO-4:2 No - lnc-IGSF11-3:1 No - lnc-UPK1B-1:1 No - lnc-NR1I2-6:1 No - lnc-EAF2-2:1 No - lnc-KALRN-4:1 No - lnc-CHST13-1:1 No - lnc-TPRA1-3:1 No - lnc-ABTB1-3:1 No - lnc-TPRA1-4:1 No - lnc-GP9-3:1 No - lnc-GP9-2:1 No - lnc-TRH-4:1 No - lnc-COL6A6-2:1 No - lnc-CALML5-7:1 No - lnc-TMEM108-4:1 No - lnc-MSL2-5:1 No - lnc-MSL2-3:1 Yes chr3R:19890689-19898738 lnc-STAG1-7:1 No - lnc-FOXL2NB-7:3 Yes chr3R:27916908-27918248 lnc-CLSTN2-3:1 No - lnc-SLC25A36-1:1 No - lnc-CHST2-10:1 No - lnc-C3orf58-8:1 No - lnc-IL15RA-3:1 No - lnc-GYG1-2:1 Yes chr2R:21200483-21210821 lnc-TM4SF4-3:1 Yes chr2R:24065975-24068485 lnc-RNF13-4:1 No - lnc-TSC22D2-3:1 Yes chr2L:12455540-12546611 lnc-SELENOT-4:2 No - lnc-MED12L-3:1 Yes chr3L:2117466-2151700 lnc-AADACL2-3:1 No - lnc-IGSF10-5:1 No - lnc-SUCNR1-4:1 No - lnc-IL2RA-5:1 Yes chrX:19495505-19509350 lnc-IGSF10-7:1 No - lnc-DHX36-7:1 No - lnc-MME-7:1 No - lnc-GPR149-11:1 No - lnc-MME-5:1 No - lnc-C3orf33-3:1 No - lnc-C3orf33-1:1 No - lnc-TIPARP-1:1 No - lnc-PFKFB3-7:1 No - lnc-TIPARP-2:1 No - lnc-CCNL1-5:1 Yes chr3L:7134516-7143074 lnc-PTX3-1:1 Yes chr3L:7134516-7143074 lnc-MLF1-1:1 Yes chr2R:15935893-15940073 lnc-RSRC1-1:1 Yes chr2R:15935893-15940073 lnc-C3orf80-1:1 No - lnc-SI-5:1 No - lnc-SERPINI1-20:1 No - lnc-SERPINI1-14:1 No - lnc-SERPINI1-13:1 No - lnc-GOLIM4-2:1 No - lnc-PLD1-4:1 Yes chr3L:2554847-2586540 lnc-TMEM212-5:1 Yes chr2L:16545016-16663218 lnc-GHSR-3:1 Yes chr2L:16545016-16663218 PRKCQ-AS1:57 No - lnc-TBL1XR1-13:1 No - lnc-KCNMB2-11:1 No - lnc-ZMAT3-7:1 No - lnc-KCNMB2-9:1 No - lnc-SOX2-6:1 No - lnc-DCUN1D1-13:1 No - lnc-B3GNT5-3:1 Yes chrX:16405509-16414651 lnc-DCUN1D1-9:1 Yes chrX:16405509-16414651 lnc-MCF2L2-2:1 No - lnc-KLHL6-2:1 No - lnc-ABCC5-2:1 No - lnc-CAMK2N2-2:1 Yes chrX:19961297-19969323 lnc-DNAJB11-4:1 Yes chr2R:7834812-7885982 lnc-LPP-8:1 No - lnc-BCL6-7:1 No - lnc-PFKFB3-9:1 No - lnc-LPP-5:1 No - lnc-TMEM207-1:1 No - lnc-HRASLS-9:1 No - lnc-HRASLS-5:2 No - lnc-LSG1-3:1 No - lnc-XXYLT1-4:1 Yes chr3R:23118400-23124217 lnc-XXYLT1-6:1 Yes chr3R:23118400-23124217 lnc-MUC20-67:12 No - lnc-PFKFB3-10:1 No - lnc-MUC4-4:1 No - lnc-SLC51A-14:1 No - lnc-TNK2-11:1 No - lnc-SLC51A-8:1 No - lnc-BDH1-6:1 No - lnc-FYTTD1-9:1 No - lnc-PRKCQ-6:1 No - lnc-IQCG-13:1 No - lnc-IQCG-15:1 No - lnc-PDE6B-1:14 No - lnc-UVSSA-3:1 No - lnc-KIN-5:1 Yes chr3R:29747704-29749163 lnc-FAM53A-3:1 No - lnc-POLN-2:1 Yes chr3R:21223704-21229512 lnc-RNF4-4:1 No - lnc-MSX1-5:1 No - lnc-STX18-4:1 No - lnc-STX18-5:1 No - lnc-CYTL1-3:1 No - lnc-WFS1-4:1 Yes chr3R:22687542-22690380 lnc-PPP2R2C-2:1 Yes chr3R:22687542-22690380 lnc-MRFAP1L1-5:1 No - lnc-GRPEL1-6:1 No - lnc-TRMT44-5:1 Yes chr2L:19390370-19398493 lnc-GPR78-1:4 No - lnc-CPZ-1:1 No - lnc-USP6NL-18:1 No - lnc-SLC2A9-8:1 No - lnc-DRD5-16:5 No - lnc-SLC2A9-6:1 No - lnc-DRD5-4:10 No - lnc-DRD5-22:1 No - lnc-DRD5-23:1 Yes chr2R:18718114-18754675 lnc-RAB28-6:1 No - lnc-NKX3-2-4:1 No - lnc-USP6NL-8:1 No - lnc-FBXL5-8:1 No - lnc-PACRGL-12:2 No - lnc-SOD3-8:1 No - lnc-SEL1L3-12:1 No - lnc-SLC34A2-2:1 No - lnc-RBPJ-3:1 No - lnc-CCKAR-13:1 No - lnc-PCDH7-14:1 No - lnc-RELL1-8:1 Yes chrX:16943290-16956234 lnc-DTHD1-9:1 No - lnc-RELL1-2:1 Yes chr3R:5685855-5712837 lnc-PTTG2-1:1 Yes chr3R:5685855-5712837 lnc-TLR10-7:1 No - lnc-TLR10-6:1 No - lnc-FAM114A1-2:1 Yes chr3L:20361843-20366724 lnc-KLHL5-2:1 Yes chr2R:19487046-19491846 lnc-N4BP2-2:1 No - lnc-GUF1-5:1 No - lnc-ATP10D-2:1 Yes chrX:15925105-15928529 lnc-SGCB-1:1 No - lnc-SPATA18-4:1 No - lnc-USP46-2:1 No - lnc-KIT-3:1 No - lnc-NMU-2:1 No - lnc-PAICS-5:1 No - lnc-PRPF18-9:2 No - lnc-IGFBP7-11:1 No - lnc-IGFBP7-12:1 No - lnc-TECRL-16:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-POLR2B-15:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-TECRL-13:1 No - lnc-ADGRL3-13:1 No - lnc-CENPC-4:2 No - lnc-PTER-3:1 No - lnc-CSN2-2:1 No - lnc-AFM-3:1 Yes chr3R:23114014-23117931 lnc-RCHY1-6:1 No - lnc-ST8SIA6-3:2 No - lnc-FAM47E-1:1 No - lnc-CCDC158-1:1 Yes chr2R:14308142-14351802 lnc-CCNI-3:1 Yes chr3R:31596642-31612664 LINC01088:7 No - lnc-PRDM8-7:1 No - lnc-PRDM8-6:1 No - lnc-ENOPH1-5:1 No - lnc-SCD5-3:1 Yes chr2R:8893613-8898798 lnc-PLXDC2-8:1 No - lnc-NKX6-1-8:1 Yes chr2L:5907169-5922776 lnc-HERC5-3:2 No - lnc-GPRIN3-4:1 No - lnc-MMRN1-3:1 No - lnc-UNC5C-3:1 Yes chr2L:5219000-5271384 lnc-METAP1-5:1 Yes chr3L:6664224-6665641 lnc-MLLT10-5:1 No - lnc-METAP1-6:1 No - lnc-C4orf17-3:1 Yes chr3R:10870906-10872381 lnc-C4orf17-2:1 No - lnc-MTTP-1:1 No - lnc-DAPP1-4:1 No - lnc-DAPP1-5:1 No - lnc-DAPP1-6:1 No - lnc-CISD2-10:1 Yes chr3R:29950796-29969447 lnc-SPAG6-3:1 No - lnc-PLA2G2D-2:1 No - lnc-TET2-8:1 No - lnc-AIMP1-2:1 No - lnc-SGMS2-4:1 No - lnc-RPL34-2:1 No - lnc-COL25A1-4:1 No - lnc-OSTC-6:1 Yes chr3R:16502770-16571363 lnc-LARP7-13:1 No - lnc-NDST4-2:1 No - lnc-MTRNR2L13-1:1 No - lnc-NDST3-9:1 No - lnc-SEC24D-2:1 No - lnc-ABI1-8:1 No - lnc-TMEM155-2:1 No - lnc-SPATA5-5:1 Yes chr3R:19794073-19836817 lnc-SPRY1-11:34 No - lnc-SPRY1-7:1 No - lnc-SPRY1-10:1 No - lnc-ANKRD50-8:1 No - lnc-FAT4-5:1 No - lnc-MFSD8-10:1 No - lnc-MFSD8-9:1 No - lnc-JADE1-2:1 No - lnc-PCDH10-12:1 No - lnc-PABPC4L-14:1 No - lnc-PABPC4L-18:1 No - lnc-NOCT-16:2 No - lnc-NOCT-15:2 No - lnc-RNF150-5:1 No - lnc-INPP4B-3:1 No - lnc-FREM3-5:1 Yes chr3L:2589414-2595590 lnc-GYPA-3:1 No - lnc-OTUD4-7:1 Yes chr2R:17517261-17518186 lnc-ABCE1-1:1 Yes chr2R:17517261-17518186 lnc-C4orf51-5:1 No - lnc-REELD1-4:1 No - lnc-ARHGAP10-4:1 No - lnc-LRBA-5:1 No - lnc-LRBA-6:1 No - lnc-GATB-3:1 Yes chr2L:2992870-2998726 lnc-FAM160A1-10:1 No - lnc-FBXW7-10:1 No - lnc-ARFIP1-6:1 Yes chr3L:4246343-4254306 lnc-YME1L1-2:1 No - lnc-FGB-3:1 No - lnc-TDO2-5:1 No - lnc-TDO2-6:1 No - lnc-CTSO-3:1 No - lnc-GLRB-8:1 No - lnc-C4orf46-3:1 Yes chrX:13161714-13189164 lnc-FAM218A-5:1 No - lnc-CLCN3-9:1 No - lnc-AADAT-9:1 No - lnc-CLCN3-10:1 No - lnc-AADAT-10:1 No - lnc-GALNTL6-4:1 No - lnc-HMGB2-7:1 No - lnc-HAND2-4:1 No - lnc-ACBD5-3:1 No - lnc-SAP30-19:1 No - lnc-SAP30-20:1 No - LINC02269:6 No - lnc-FBXO8-8:1 No - lnc-CEP44-7:1 No - lnc-HPGD-5:1 No - lnc-FBXO8-7:1 No - lnc-ADAM29-3:1 Yes chr3R:11787176-11789393 lnc-DCTD-19:1 No - lnc-DCTD-18:1 No - lnc-DCTD-4:36 Yes chr3R:14697689-14724261 LINC01517:30 No - lnc-STOX2-3:2 No - lnc-PRIMPOL-2:1 No - lnc-IRF2-5:1 No - LINC02365:14 No - lnc-ACSL1-5:1 No - lnc-PRIMPOL-3:1 No - lnc-ACSL1-4:1 Yes chr3L:18878250-18890483 lnc-HELT-6:1 No - lnc-MPP7-8:2 No - lnc-SNX25-2:1 No - lnc-ANKRD37-2:1 Yes chrX:7912089-7918444 lnc-LRP2BP-3:1 Yes chrX:7912089-7918444 lnc-F11-6:1 Yes chr2R:7540111-7564435 lnc-ZFP42-12:1 No - lnc-TRIML2-11:1 No - lnc-LYZL1-16:1 No - lnc-TRIML2-9:1 No - lnc-ZFP42-9:1 No - lnc-ZFP42-8:1 No - lnc-FRG2-14:6 No - lnc-FRG1-9:1 No - lnc-FRG2-11:1 Yes chr3L:20295802-20296971 lnc-FRG2-7:1 No - DBET:1 No - lnc-MAP3K8-18:1 No - lnc-DUX4-1:1 No - lnc-ZDHHC11B-4:1 No - lnc-ZDHHC11B-3:1 Yes chr2L:259949-267505 lnc-MAP3K8-17:1 No - lnc-TERT-4:1 Yes chr2R:23907654-23925066 lnc-NDUFS6-12:1 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-NDUFS6-13:1 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-NDUFS6-14:1 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-MTPAP-4:1 No - lnc-C5orf38-5:1 No - lnc-C5orf38-6:1 No - lnc-IRX1-6:1 No - lnc-ADAMTS16-8:1 No - lnc-MED10-23:1 No - lnc-ADAMTS16-7:1 No - lnc-MED10-15:1 No - lnc-EPC1-4:1 No - lnc-ICE1-4:1 No - lnc-ADCY2-8:1 No - lnc-C5orf49-4:1 Yes chr3L:19939287-19977960 lnc-MTRR-10:1 Yes chr3L:19939287-19977960 lnc-MTRR-19:1 Yes chr3L:19939287-19977960 lnc-MTRR-8:1 Yes chr3R:16443207-16445010 lnc-CCDC7-14:1 Yes chrX:8061645-8070237 lnc-MTRR-15:1 No - lnc-SEMA5A-12:1 No - LINC02212:14 No - lnc-DAP-6:1 No - lnc-TRIO-9:1 No - lnc-NRP1-4:1 No - lnc-TRIO-5:1 No - lnc-OTULIN-9:1 No - lnc-MYO10-6:2 No - lnc-BASP1-11:1 Yes chr2L:9762424-9763262 lnc-BASP1-23:1 No - lnc-PRDM9-15:1 No - lnc-CCDC7-17:1 No - lnc-CDH10-8:1 No - lnc-PRDM9-20:1 No - lnc-CDH9-9:1 No - lnc-CDH9-15:1 No - lnc-CDH6-9:1 No - lnc-DROSHA-12:1 No - lnc-PARD3-3:1 No - lnc-HTR1D-1:1 No - lnc-IL7R-2:1 No - lnc-C5orf42-7:1 No - lnc-SLC1A3-1:1 Yes chr2R:4691672-4729017 lnc-WDR70-6:1 No - lnc-RICTOR-7:1 No - LIFR-AS1:8 No - lnc-C6-1:1 Yes chr2L:20089636-20091348 lnc-ANKRD30A-7:3 No - lnc-ANXA2R-4:1 No - lnc-ZNF131-2:21 No - MRPS30-DT:38 Yes chrX:15786047-15788288 lnc-ITGA2-3:1 No - lnc-ARL15-6:1 No - lnc-ESM1-3:1 No - lnc-C5orf67-5:1 No - lnc-GPBP1-6:1 No - lnc-GPBP1-7:1 No - PART1:12 No - lnc-NDUFAF2-5:1 No - lnc-SMIM15-8:1 No - lnc-ZSWIM6-7:1 No - lnc-CD180-14:1 No - lnc-CD180-9:1 No - lnc-CD180-10:1 No - lnc-CD180-13:1 No - lnc-PIK3R1-12:1 No - lnc-SLC30A5-5:1 Yes chr2L:297880-305233 lnc-CCDC125-21:1 No - lnc-CARTPT-2:1 No - lnc-ZNF366-8:1 No - lnc-ZNF366-12:1 Yes chr3L:6200473-6203776 lnc-FOXD1-4:1 No - lnc-FOXD1-12:1 No - lnc-NSA2-8:1 No - lnc-SV2C-3:1 No - lnc-SCAMP1-8:1 No - lnc-LHFPL2-2:1 Yes chrX:15446179-15449883 lnc-ANKRD34B-3:1 Yes chr2L:7983946-7986785 lnc-DHFR-6:1 No - lnc-XRCC4-2:2 No - lnc-TMEM167A-7:1 No - lnc-VCAN-3:1 No - lnc-VCAN-5:1 No - lnc-RASA1-24:1 Yes chr2R:9913496-9958858 MEF2C-AS1:17 No - lnc-POLR3G-6:1 No - lnc-CETN3-4:1 No - lnc-ARRDC3-6:1 No - lnc-ADGRV1-7:1 No - lnc-NR2F1-5:1 No - lnc-PCSK1-3:1 No - lnc-PAM-1:5 Yes chr2R:23985175-23988455 lnc-NUDT12-9:1 No - lnc-NUDT12-13:1 No - lnc-EFNA5-9:1 No - lnc-EFNA5-7:1 No - lnc-FER-10:1 No - lnc-MAN2A1-5:1 No - lnc-KCNN2-4:1 Yes chrX:5340236-5405138 lnc-CDO1-2:1 No - lnc-RET-4:1 Yes chr3L:17016536-17020270 lnc-LUZP1-2:1 No - lnc-COMMD10-6:1 Yes chrX:11677344-11678589 lnc-COMMD10-12:1 No - lnc-DTWD2-10:1 No - lnc-DTWD2-6:1 No - lnc-HSD17B4-2:1 No - lnc-ZNF608-15:1 No - lnc-GRAMD2B-18:1 No - lnc-ZNF608-16:1 No - lnc-GRAMD2B-20:1 No - lnc-ALDH7A1-8:1 No - lnc-GRAMD2B-5:1 No - lnc-ALDH7A1-7:1 No - lnc-ALDH7A1-6:1 No - lnc-C5orf63-5:1 No - lnc-CCDC192-4:1 No - lnc-LYRM7-4:1 Yes chr3R:5616644-5624125 lnc-CATSPER3-5:1 No - lnc-CXCL14-2:1 Yes chr3R:27559379-27561319 lnc-IL9-1:1 No - lnc-LRRTM2-2:1 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-NRG2-8:1 No - lnc-NRG2-4:1 No - lnc-IGIP-4:1 No - lnc-RASGEF1A-3:1 Yes chr2L:21182446-21198762 lnc-DND1-3:1 Yes chrX:18515428-18520445 lnc-PCDH1-4:1 No - lnc-ARHGAP26-4:30 No - lnc-SH3RF2-3:1 Yes chr3R:6150116-6157235 lnc-ABLIM3-3:1 No - lnc-CSNK1A1-7:1 No - lnc-CAMK2A-1:1 Yes chr2R:12655954-12659341 lnc-CCDC69-2:2 Yes chrX:20171445-20173514 lnc-HNRNPF-3:1 Yes chr2R:17514217-17517445 lnc-SPARC-2:4 Yes chr3L:21640995-21642599 lnc-GALNT10-2:1 No - lnc-EBF1-6:1 No - lnc-RNF145-2:1 Yes chr2R:14772650-14807061 lnc-UBLCP1-10:1 Yes chr2R:14772650-14807061 lnc-IL12B-2:1 No - lnc-GABRB2-5:1 Yes chrX:15921955-15924558 lnc-MAT2B-1:4 No - lnc-NUDCD2-10:1 No - lnc-MAT2B-5:1 No - lnc-NUDCD2-11:1 No - lnc-PANK3-20:1 No - lnc-SLIT3-3:1 No - lnc-LCP2-5:1 No - lnc-KCNMB1-2:2 Yes chrX:11219379-11302783 lnc-FBXW11-8:1 No - lnc-SMIM23-4:1 No - lnc-FXYD4-5:1 No - lnc-NEURL1B-5:1 No - lnc-BOD1-5:1 No - lnc-CPEB4-8:1 No - lnc-BOD1-1:14 No - lnc-NSG2-2:1 No - lnc-SIMC1-5:1 No - lnc-TSPAN17-1:1 No - lnc-RAB24-2:1 Yes chr3R:27932982-27937853 lnc-B4GALT7-3:1 No - lnc-FAM153C-9:1 No - lnc-RUFY1-5:1 No - lnc-BTNL8-7:1 Yes chr2R:20559156-20562331 lnc-TRIM41-4:11 No - lnc-DUSP22-7:1 No - lnc-EXOC2-17:1 No - lnc-SLC22A23-11:2 No - lnc-PXDC1-12:3 Yes chr3R:27919844-27921089 lnc-ECI2-8:1 No - lnc-RPP40-4:1 No - lnc-F13A1-5:1 Yes chr2L:8011405-8026898 lnc-F13A1-7:1 No - lnc-LY86-6:2 No - lnc-RIOK1-3:1 No - lnc-CAGE1-5:1 No - lnc-BMP6-15:1 No - lnc-BMP6-16:1 No - lnc-BMP6-17:1 No - lnc-VSTM4-4:1 No - lnc-SMIM13-5:1 Yes chr3L:152884-174517 lnc-TMEM170B-3:1 Yes chr2R:10812157-10813310 lnc-ADTRP-4:1 No - lnc-ADTRP-6:1 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-SIRT5-3:1 Yes chr2L:1750687-1752122 lnc-MCUR1-2:1 No - lnc-MCUR1-11:1 No - lnc-WASHC2A-2:1 No - lnc-CD83-10:1 No - lnc-JARID2-4:1 No - lnc-DTNBP1-9:1 No - lnc-ATXN1-3:1 No - lnc-KIF13A-1:1 Yes chrX:16599241-16610459 lnc-DEK-3:1 No - lnc-MBOAT1-18:1 No - lnc-MBOAT1-2:8 Yes chr3L:749400-753492 lnc-MBOAT1-9:1 No - lnc-ASAH2-5:1 No - E2F3-IT1:1 Yes chr3R:21620304-21660871 lnc-MBOAT1-12:1 Yes chr3R:21620304-21660871 lnc-PRL-13:1 Yes chr2R:23978801-23985177 lnc-NRSN1-6:1 No - lnc-C6orf229-3:1 No - PRKG1-AS1:2 No - lnc-BTN3A2-2:1 No - lnc-HIST1H4H-4:1 No - lnc-HIST1H2AG-4:1 Yes chr2L:21418112-21418706 lnc-HIST1H2BJ-5:1 Yes chr2L:21418112-21418706 lnc-GPX6-3:1 No - lnc-OR2J1-1:1 No - lnc-OR2B3-3:1 No - lnc-GNL1-2:1 No - lnc-MBL2-6:1 No - HCG21:1 No - lnc-ATP6V1G2-DDX39B-2:1 No - lnc-MTRNR2L5-6:1 No - lnc-HMGA1-9:1 No - lnc-C6orf222-2:1 Yes chr3L:14776496-14786412 lnc-MDGA1-4:1 No - lnc-DAAM2-6:1 No - lnc-DAAM2-8:3 Yes chr2R:8009119-8013755 lnc-TFAM-5:1 Yes chr2L:16042047-16048757 lnc-UNC5CL-7:1 Yes chr2R:8009119-8013755 lnc-OARD1-1:1 No - lnc-TFEB-2:2 No - lnc-MRPL14-5:1 No - RUNX2-AS1:18 No - lnc-RUNX2-3:1 No - lnc-RCAN2-1:1 Yes chr3R:16186999-16197584 lnc-PTCHD4-4:1 No - lnc-C6orf141-3:1 No - lnc-C6orf141-5:1 No - lnc-TFAP2D-4:1 No - lnc-LRRC1-6:2 No - lnc-KLHL31-7:1 Yes chr3R:26536350-26604051 lnc-PRIM2-12:1 No - lnc-LGSN-3:1 No - lnc-PNRC2-2:3 Yes chr3L:3172817-3178580 lnc-ADGRB3-6:1 No - lnc-LMBRD1-7:1 No - lnc-OGFRL1-10:1 No - lnc-SENP6-11:1 No - lnc-MEI4-11:1 No - lnc-MEI4-5:1 No - lnc-RTKN2-5:1 Yes chrX:18843663-18855858 lnc-SH3BGRL2-4:1 No - lnc-BCKDHB-7:4 No - lnc-FAM46A-4:1 No - lnc-CYB5R4-3:2 No - lnc-GABRR2-2:1 No - lnc-GPR63-10:1 No - lnc-KLHL32-4:9 No - lnc-EGR2-1:2 No - lnc-POU3F2-6:2 No - lnc-TSTD3-1:2 No - lnc-LIN28B-8:1 No - lnc-BVES-1:1 Yes chr3L:5654681-5657384 lnc-LIN28B-11:1 No - lnc-ATG5-5:1 Yes chr2L:3039976-3041890 lnc-QRSL1-8:1 No - lnc-TRAF3IP2-7:1 Yes chr2R:7793625-7801044 lnc-TRAF3IP2-4:1 Yes chr2R:7793625-7801044 lnc-LAMA4-6:1 No - lnc-MARCKS-17:1 No - lnc-HDAC2-12:2 No - lnc-HDAC2-8:2 No - lnc-MARCKS-9:1 Yes chr3L:4626734-4629467 lnc-MARCKS-13:1 Yes chr2R:18718114-18754675 lnc-LRRTM3-14:1 No - lnc-MARCKS-19:1 No - lnc-HS3ST5-9:1 No - lnc-COL10A1-1:1 Yes chr2R:5981844-6012795 lnc-TSPYL1-1:1 No - lnc-HSF2-3:1 No - lnc-HDDC2-10:1 No - lnc-TET1-2:1 No - lnc-TRMT11-4:1 No - lnc-LAMA2-4:1 No - lnc-L3MBTL3-1:1 No - lnc-EPB41L2-1:1 No - lnc-ENPP1-6:3 No - lnc-EYA4-4:1 No - TARID:1 Yes chr2R:17757405-17760517 lnc-SGK1-6:1 No - lnc-SGK1-7:1 No - lnc-MYB-8:1 Yes chr3L:1862881-1865240 lnc-IL22RA2-1:2 No - lnc-TNFAIP3-11:1 No - lnc-TNFAIP3-10:1 No - lnc-PERP-2:10 No - lnc-PERP-6:1 No - lnc-ABRACL-2:1 No - lnc-HECA-8:2 No - lnc-HECA-10:1 No - lnc-C10orf105-4:1 No - lnc-FBXO30-1:1 No - lnc-GRM1-4:1 Yes chr3L:6174248-6178941 lnc-SHPRH-4:1 No - lnc-SHPRH-6:1 No - lnc-SAMD5-2:1 Yes chr3R:22133830-22296126 lnc-ZC3H12D-19:1 No - lnc-ZC3H12D-16:1 No - lnc-SUMO4-5:1 No - lnc-ULBP1-1:1 No - lnc-IYD-3:1 No - lnc-ZBTB2-5:1 No - lnc-VIP-2:1 No - lnc-ANXA7-2:1 No - lnc-STPG1-2:1 No - lnc-NOX3-6:1 No - lnc-NOX3-7:1 No - lnc-ARID1B-2:3 No - lnc-TMEM242-12:1 No - lnc-GTF2H5-1:1 No - lnc-SYTL3-1:1 No - lnc-FNDC1-6:1 No - lnc-SLC22A2-3:1 Yes chr3R:26842462-26863130 lnc-MSS51-1:1 Yes chrX:16554627-16560016 lnc-PLG-3:2 No - PACRG-AS1:5 Yes chr2R:19497752-19500372 lnc-QKI-7:1 No - lnc-PRKN-18:2 No - lnc-QKI-8:1 No - lnc-C6orf118-10:1 No - lnc-FGFR1OP-13:1 No - lnc-FGFR1OP-10:1 Yes chrX:22529964-22536371 lnc-RNASET2-4:1 No - RPS6KA2-AS1:3 No - lnc-GPR31-2:1 No - lnc-SMOC2-12:1 No - lnc-RPS24-19:1 Yes chr3R:24662491-24711595 lnc-THBS2-10:1 No - lnc-THBS2-14:1 No - lnc-C6orf120-4:1 No - LINC00574:1 No - LINC00574:6 No - lnc-RPS24-6:2 Yes chr2L:11508399-11517081 lnc-ERMARD-9:1 No - lnc-TBP-9:1 No - lnc-FAM20C-12:1 No - lnc-POLR3A-6:1 No - lnc-MAFK-5:1 No - PSMG3-AS1:19 No - lnc-CHST12-4:1 Yes chr2L:16879517-16886319 lnc-CARD11-3:1 No - lnc-SDK1-1:1 No - lnc-RPA3-4:1 No - ZMIZ1-AS1:12 No - lnc-RPA3-3:1 No - lnc-RPA3-5:3 No - lnc-SCIN-3:1 No - lnc-VWDE-8:1 No - lnc-LRRC72-7:2 Yes chr3R:22586149-22586625 lnc-AGR3-5:1 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-SNX13-5:2 No - lnc-SNX13-4:2 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-TWIST1-4:1 No - lnc-ITGB8-7:1 No - lnc-ITGB8-6:1 No - lnc-ITGB8-6:4 No - lnc-MACC1-2:1 No - lnc-TOMM7-6:2 No - lnc-IL6-6:1 No - lnc-GSDME-8:1 No - lnc-NUTM2E-1:3 No - lnc-HNRNPA2B1-12:1 No - lnc-NFE2L3-6:1 No - lnc-HNRNPA2B1-9:1 No - lnc-SKAP2-73:1 No - TMEM254-AS1:13 No - lnc-PRR15-3:1 No - lnc-HERPUD2-5:1 No - lnc-HERPUD2-6:1 No - lnc-EPDR1-2:1 No - lnc-SH2D4B-4:1 Yes chr2L:6000228-6003738 LINC00265:1 Yes chrX:3704610-3719635 lnc-CCM2-3:1 No - lnc-TBRG4-2:1 No - lnc-CCM2-5:1 No - lnc-TSPAN14-3:1 No - lnc-IGFBP3-6:1 No - lnc-ABCA13-3:1 No - lnc-FIGNL1-3:1 No - lnc-POM121L12-7:1 No - lnc-VSTM2A-4:1 No - lnc-SEC61G-9:1 No - lnc-SEC61G-8:1 No - lnc-CCSER2-4:1 No - lnc-ZNF713-4:1 No - lnc-GRID1-5:1 No - lnc-CRCP-1:1 Yes chrX:13563823-13593224 lnc-CRCP-2:1 Yes chrX:13563823-13593224 lnc-TMEM248-1:1 No - lnc-AUTS2-4:1 No - lnc-SBDS-24:1 No - lnc-FZD9-2:1 No - lnc-PTPN12-3:1 Yes chrY:3561745-3618339 lnc-FGL2-8:1 Yes chr2L:19186043-19189938 lnc-MTERF1-9:1 No - NUTM2A-AS1:50 No - lnc-GATAD1-6:1 No - lnc-GATAD1-4:1 No - lnc-ASB4-6:1 No - lnc-DYNC1I1-6:1 Yes chr3R:30445635-30455867 lnc-EPHB4-2:1 Yes chr3L:13846054-13860001 lnc-SRPK2-14:1 Yes chr3L:1885657-1891462 LHFPL3-AS1:9 Yes chr3L:1885657-1891462 lnc-IFRD1-1:1 No - lnc-TMEM168-2:2 No - lnc-WNT2-7:2 Yes chr4:1198852-1224467 lnc-TFEC-8:1 Yes chr2R:17465879-17469177 lnc-TFEC-9:3 No - lnc-PANK1-2:17 No - lnc-TSPAN12-7:1 No - POT1-AS1:1 No - lnc-MEST-5:1 Yes chr2L:476446-479688 lnc-EXOC4-8:1 Yes chr4:1009895-1027101 lnc-LRGUK-6:1 Yes chr3R:5754932-5758997 lnc-LRGUK-5:1 Yes chr3R:5754932-5758997 lnc-AKR1D1-6:1 Yes chrX:8907068-9029476 lnc-CLEC2L-2:1 Yes chrX:21517434-21519218 lnc-KIF20B-6:1 No - lnc-MRPS33-3:1 No - lnc-OR9A2-3:1 No - lnc-OR2F2-1:1 No - lnc-OR6B1-1:1 No - lnc-RPP30-7:1 No - lnc-PDIA4-2:1 No - lnc-ZNF746-2:1 No - lnc-KRBA1-3:1 No - lnc-ATP6V0E2-7:1 No - lnc-NUB1-5:1 Yes chr3R:5568921-5570491 lnc-GALNTL5-3:1 Yes chr2L:14359252-14361411 lnc-PAXIP1-6:1 No - lnc-PAXIP1-5:1 No - lnc-PAXIP1-4:1 No - lnc-RBM33-3:2 No - lnc-SHH-6:1 No - lnc-LMBR1-7:2 No - lnc-FGFBP3-3:1 No - lnc-UBE3C-3:1 No - lnc-MNX1-5:1 No - lnc-FBXO25-7:1 No - lnc-ERICH1-9:1 No - lnc-DLGAP2-8:2 No - lnc-CLN8-12:1 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-CLN8-6:1 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-ERICH1-12:1 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-ERICH1-14:1 No - lnc-CSMD1-18:1 No - lnc-ANGPT2-13:1 No - lnc-ANGPT2-9:1 No - lnc-FRAT1-5:1 No - lnc-CLDN23-3:1 No - lnc-ERI1-32:22 No - lnc-ERI1-10:1 No - lnc-PPP1R3B-5:1 No - lnc-PPP1R3B-6:1 No - lnc-PPP1R3B-7:1 No - lnc-C8orf74-5:1 No - lnc-FRAT1-2:1 No - lnc-LONRF1-7:1 No - lnc-TRMT9B-3:1 No - lnc-C8orf48-4:1 No - lnc-CNOT7-3:1 Yes chr2R:10028443-10032893 lnc-NAT1-6:1 No - lnc-SH2D4A-5:1 No - lnc-GFRA2-6:1 No - lnc-ATP6V1B2-9:1 No - lnc-PGAM1-3:1 Yes chrX:13619276-13624408 lnc-GFRA2-5:1 No - lnc-CHMP7-4:1 Yes chr3L:3035196-3040469 lnc-STC1-5:1 No - lnc-CDCA2-10:1 No - lnc-KCTD9-2:1 Yes chr2R:14772650-14807061 lnc-INTS9-2:1 Yes chr2R:19129589-19133706 lnc-GOLGA7B-3:1 No - lnc-SARAF-3:1 No - lnc-RBPMS-2:1 No - lnc-GTF2E2-3:1 No - lnc-MAK16-10:1 No - lnc-UNC5D-4:1 No - lnc-BRF2-7:1 No - lnc-BRF2-5:1 No - lnc-CNNM1-3:1 Yes chr2R:16138352-16141928 lnc-ZNF703-1:1 No - lnc-C8orf86-6:1 No - lnc-IDO1-2:1 No - lnc-ZMAT4-5:1 No - lnc-TCIM-4:1 No - lnc-DKK4-2:1 No - lnc-CEBPD-7:1 No - lnc-SLC25A28-4:1 No - lnc-EFCAB1-6:1 No - lnc-PPDPFL-11:1 No - lnc-PPDPFL-12:1 No - lnc-SNAI2-3:1 No - lnc-NPBWR1-10:1 No - lnc-ATP6V1H-6:1 No - lnc-PKD2L1-2:1 Yes chr2L:12398274-12402023 lnc-MTFR1L-3:1 No - lnc-CHCHD7-6:1 No - lnc-PENK-5:1 No - lnc-FAM110B-12:1 No - lnc-FAM110B-11:1 No - lnc-CYP7A1-5:1 Yes chr2R:24423926-24425102 lnc-SDCBP-5:1 No - lnc-RAB2A-4:1 Yes chr3R:27102988-27106184 lnc-CA8-10:1 No - lnc-CHD7-5:1 Yes chr2L:19435850-19442727 lnc-ASPH-8:1 Yes chr2L:19435850-19442727 lnc-NKAIN3-12:1 No - lnc-ARMC1-7:1 No - lnc-CRH-5:1 No - lnc-CRH-6:1 No - lnc-KCNB2-11:1 No - lnc-KCNB2-4:1 No - lnc-RPL7-3:2 Yes chr2R:18117896-18125779 lnc-LY96-4:1 No - lnc-JPH1-9:1 No - lnc-PEX2-9:1 No - lnc-ZFHX4-5:1 Yes chr4:501810-540874 lnc-PEX2-7:1 Yes chr4:501810-540874 lnc-TLX1-3:2 No - lnc-ZFHX4-7:1 No - lnc-IL7-3:1 No - lnc-STMN2-5:1 No - lnc-ZNF704-6:1 No - lnc-CHMP4C-7:1 No - lnc-SNX16-4:1 No - lnc-CA1-5:1 No - lnc-MMP16-3:1 No - lnc-TRIQK-8:1 No - lnc-TRIQK-6:1 No - lnc-TRIQK-5:2 No - lnc-FAM92A-8:1 No - lnc-RBM12B-8:1 No - lnc-RBM12B-5:1 Yes chr3R:20611251-20616901 lnc-FGF8-2:1 No - lnc-CDH17-3:1 No - lnc-PTDSS1-5:1 No - lnc-SDC2-3:1 Yes chr3L:20522440-20526174 lnc-MTERF3-2:1 No - lnc-STK3-2:9 No - lnc-ANKRD46-2:1 No - lnc-ODF1-7:1 No - AZIN1-AS1:20 No - lnc-ATP6V1C1-9:4 Yes chr2R:16324813-16336637 lnc-SLC25A32-5:1 Yes chr3R:17872748-17916578 lnc-SLC25A32-7:2 Yes chr3R:17872748-17916578 lnc-KCNV1-7:1 No - lnc-EBAG9-7:1 No - lnc-EBAG9-10:1 No - lnc-UTP23-4:1 Yes chr2L:5051193-5053094 lnc-EXT1-8:1 No - lnc-ZHX2-3:1 No - lnc-DERL1-6:1 No - lnc-TATDN1-2:1 No - lnc-WASHC5-5:2 No - lnc-WASHC5-12:2 No - lnc-ITPRIP-4:1 No - lnc-FAM84B-9:1 No - lnc-FAM84B-15:125 No - lnc-ADCY8-2:2 No - lnc-SORCS3-9:1 No - lnc-EFR3A-8:1 No - lnc-KHDRBS3-16:2 No - lnc-KHDRBS3-4:8 No - lnc-ZFAT-6:1 No - lnc-ZFAT-8:1 No - lnc-KHDRBS3-14:1 No - lnc-KHDRBS3-11:1 No - lnc-ZFAT-13:1 No - lnc-SORCS1-9:1 No - lnc-FAM135B-6:1 No - lnc-SLC45A4-8:1 No - lnc-DENND3-7:1 Yes chr2L:16245835-16257606 lnc-DENND3-8:1 Yes chr2L:16245835-16257606 lnc-PTP4A3-8:1 No - lnc-ADGRB1-7:1 No - LINC00051:1 No - lnc-PSCA-6:1 No - lnc-GPIHBP1-3:1 No - lnc-MAFA-4:1 Yes chrX:15319479-15328029 lnc-ZNF696-2:1 Yes chrX:15788897-15793632 lnc-MAFA-3:1 Yes chr3L:8507469-8509763 lnc-TSTA3-1:5 Yes chr2R:22887574-22888857 lnc-CCDC166-2:1 No - lnc-MAPK15-4:1 No - lnc-MAPK15-3:9 No - lnc-SCRIB-3:1 No - lnc-DMRT2-3:1 No - lnc-DMRT2-4:1 No - VLDLR-AS1:8 No - RFX3-AS1:22 No - lnc-ADD3-10:1 No - lnc-SPATA6L-2:1 No - lnc-PLGRKT-5:1 No - lnc-DMAC1-9:1 No - lnc-PTPRD-10:1 No - lnc-LURAP1L-2:1 No - lnc-LURAP1L-3:1 No - lnc-FREM1-1:1 No - lnc-SMNDC1-5:1 No - lnc-DMRTA1-10:1 No - lnc-EQTN-1:3 No - lnc-IFNK-4:1 Yes chr2L:10265336-10266570 lnc-LINGO2-5:1 No - lnc-DDX58-3:1 Yes chr3R:10408618-10412869 lnc-TMEM215-2:1 No - lnc-DUSP5-4:1 No - lnc-SPINK4-4:2 No - lnc-CCL27-2:1 No - lnc-VCP-5:1 No - lnc-NPR2-1:4 No - lnc-BBIP1-4:1 No - lnc-OR13J1-2:1 No - lnc-ZCCHC7-2:3 No - lnc-DCAF10-4:1 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-SLC25A51-1:4 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-SLC25A51-8:2 No - lnc-FAM240B-5:1 No - lnc-ADRA2A-4:1 Yes chr3R:17395199-17402515 lnc-SPATA31A1-7:1 No - lnc-SPATA31A1-1:1 No - lnc-TMEM252-9:1 No - lnc-VTI1A-6:1 No - lnc-FOXD4L4-4:1 No - lnc-TMEM252-4:1 Yes chr3L:16126018-16128531 lnc-TMEM252-3:1 No - lnc-C9orf85-8:1 Yes chr2R:15262808-15309368 lnc-TMC1-1:1 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-ZFAND5-3:1 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-GDA-6:1 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-NRAP-3:1 No - lnc-GNAQ-5:1 No - lnc-GNAQ-8:1 Yes chr3R:29200454-29201770 lnc-GNAQ-10:1 No - lnc-TLE4-8:1 No - lnc-SPATA31D4-6:2 Yes chr3R:26041736-26049911 lnc-NTRK2-5:1 No - lnc-ZCCHC6-2:1 No - lnc-HABP2-2:1 No - lnc-ZCCHC17-15:3 No - lnc-DAPK1-5:1 No - lnc-GAS1-5:1 No - lnc-S1PR3-1:1 Yes chr3L:9427010-9428671 lnc-CKS2-3:1 Yes chr3L:9427010-9428671 lnc-SEMA4D-5:2 No - lnc-DIRAS2-13:2 No - lnc-DIRAS2-5:1 No - lnc-SPTLC1-3:1 No - lnc-MFSD14B-14:1 Yes chr2L:19761587-19764136 lnc-MFSD14B-16:1 No - lnc-ERCC6L2-8:2 No - lnc-HEMGN-3:1 No - lnc-C10orf82-3:1 No - lnc-ANP32B-2:1 No - lnc-GALNT12-3:1 Yes chr3R:21770333-21775840 lnc-ANKS6-1:24 No - lnc-SEC61B-3:1 No - lnc-SMC2-5:1 No - lnc-OR13C4-6:1 No - lnc-SMC2-2:1 Yes chr2R:14848621-14852653 lnc-FKTN-1:3 No - lnc-KLF4-11:1 No - lnc-ZNF462-5:1 No - lnc-PTGR1-3:1 No - lnc-RGS3-3:1 No - lnc-TNFSF15-3:1 No - lnc-TMEM268-4:1 No - MIR3663HG:10 No - lnc-TNFSF8-2:1 No - lnc-TRIM32-4:1 No - lnc-ASTN2-5:1 No - lnc-TLR4-6:1 No - lnc-OR1J1-2:1 No - lnc-EMX2-7:1 No - lnc-ADGRD2-7:1 No - lnc-WDR38-1:1 No - lnc-ZBTB34-1:1 No - lnc-ANGPTL2-5:1 Yes chr2R:16783671-16792472 lnc-GARNL3-3:1 Yes chr2R:16783671-16792472 lnc-RAB11FIP2-5:1 No - lnc-TRUB2-7:1 Yes chr3L:7639811-7640446 lnc-WDR34-2:3 Yes chr2R:8627900-8630186 lnc-ASB6-1:1 No - lnc-SETX-2:1 Yes chr3R:5655139-5656336 lnc-SURF4-1:1 No - lnc-OLFM1-3:1 No - lnc-C9orf116-7:1 No - lnc-C9orf116-6:1 No - lnc-C9orf116-5:1 No - lnc-LCN9-2:1 No - lnc-LHX3-1:1 Yes chr3R:23702761-23704542 lnc-CLIC3-1:2 No - lnc-ASMT-6:3 No - lnc-RAB11FIP2-4:1 No - lnc-DHRSX-3:1 No - lnc-ARSD-6:1 Yes chr2R:21200483-21210821 lnc-NLGN4X-2:1 No - lnc-TMSB4X-7:3 No - lnc-ATXN3L-4:1 No - lnc-ASB9-2:1 No - lnc-EMX2-9:1 No - lnc-AP1S2-4:1 No - lnc-SH3KBP1-2:1 No - lnc-EIF1AX-4:1 Yes chrX:22529964-22536371 lnc-MBTPS2-2:2 No - lnc-MAGEB16-3:1 No - lnc-CYBB-2:1 No - lnc-MID1IP1-4:1 No - lnc-ATP6AP2-9:1 Yes chr3L:18802265-18820675 lnc-MED14-1:1 No - lnc-DUSP21-1:1 No - lnc-KRBOX4-4:1 No - lnc-KRBOX4-3:1 No - lnc-CHST7-3:1 No - lnc-MCMBP-4:1 No - lnc-ZNF674-4:1 No - lnc-NDUFB11-5:1 Yes chr3L:187207-199762 lnc-FAM156B-3:1 No - lnc-KLF8-3:1 No - lnc-PLPP4-3:1 No - lnc-ZC3H12B-13:1 No - lnc-EFNB1-3:1 No - lnc-IL2RG-4:1 No - lnc-PABPC1L2A-1:1 No - lnc-CHIC1-7:1 No - lnc-FGFR2-10:2 No - lnc-ZCCHC13-12:1 No - lnc-ZCCHC13-11:1 No - lnc-P2RY10-2:1 No - lnc-APOOL-1:1 Yes chr3R:15213974-15214845 lnc-DMBT1-1:1 No - lnc-DIAPH2-9:1 No - lnc-BEX3-1:1 No - lnc-GPR26-9:3 No - lnc-LHFPL1-1:1 No - lnc-HTR2C-8:1 No - lnc-IL13RA2-6:1 No - lnc-DOCK11-3:1 No - lnc-AKAP14-6:1 No - lnc-GPR26-7:1 No - lnc-SH2D1A-1:1 Yes chr2L:6950421-6954586 lnc-TEX13C-4:2 No - lnc-TENM1-5:1 No - lnc-APLN-2:1 Yes chr2R:12636671-12640628 lnc-IGSF1-4:1 No - lnc-HPRT1-7:2 No - lnc-FAM122C-3:1 No - lnc-MOSPD1-1:1 No - lnc-MOSPD1-3:1 No - lnc-ETDA-8:1 No - lnc-CD40LG-3:1 Yes chr2L:20350434-20365254 lnc-CPXM2-1:4 No - lnc-SOX3-1:2 No - lnc-SPANXB1-8:1 No - lnc-CXorf51B-5:1 No - lnc-IDS-8:1 No - lnc-GABRE-8:1 No - lnc-ABRAXAS2-5:1 No - lnc-USP9Y-17:1 No - lnc-CDY2B-14:1 No - lnc-ABRAXAS2-3:1 No - lnc-FABP3-4:1 No - lnc-BPY2-3:1 No - lnc-EDRF1-3:2 No - EDRF1-AS1:33 No - lnc-MGMT-8:1 No - lnc-EBF3-16:1 No - lnc-MGMT-7:1 Yes chr2R:14772650-14807061 lnc-GLRX3-2:4 No - lnc-PPP2R2D-8:1 No - lnc-AP2A2-2:1 No - lnc-CTSD-5:1 No - lnc-NUP98-2:1 Yes chrX:19196058-19201979 lnc-OR51D1-1:1 No - lnc-CCKBR-1:1 No - lnc-CYB5R2-5:1 Yes chr3L:13513254-13516276 lnc-NLRP10-2:1 Yes chr3R:4712882-4714182 lnc-TUB-3:1 No - lnc-GJB5-1:1 No - lnc-AKIP1-4:1 No - ZBED5-AS1:22 No - lnc-PARVA-3:1 No - lnc-SOX6-6:1 No - lnc-INSC-2:16 No - lnc-KCNJ11-5:1 Yes chr3L:17797738-17802279 lnc-CLSPN-2:1 Yes chr2R:13943387-13958089 lnc-USH1C-1:1 No - lnc-NELL1-3:1 No - lnc-ANO5-4:1 No - lnc-SVIP-2:1 No - lnc-BBOX1-10:1 No - lnc-METTL15-11:1 No - lnc-KCNA4-8:1 No - lnc-FSHB-8:1 No - lnc-PAX6-10:1 Yes chr3L:1298672-1300389 lnc-KIAA1549L-3:2 No - lnc-FBXO3-3:1 No - lnc-LMO2-4:1 No - lnc-GRIK3-2:1 No - lnc-NAT10-1:3 Yes chrX:8716713-8720277 lnc-RAG1-3:1 No - lnc-LRRC4C-9:1 No - lnc-C11orf74-12:1 No - lnc-C11orf74-14:1 No - lnc-SYT13-8:1 No - lnc-TSPAN18-4:1 No - lnc-PRDM11-7:1 No - lnc-AKIRIN1-8:1 No - lnc-SLC35C1-9:1 No - lnc-SLC35C1-8:1 No - lnc-SLC35C1-5:1 No - lnc-PHF21A-2:1 No - lnc-GLYAT-2:1 No - lnc-OR5A2-2:1 No - lnc-AKIRIN1-7:1 No - lnc-PTGDR2-4:1 No - lnc-PGA5-1:2 No - lnc-DDB1-3:1 No - lnc-SLC22A9-2:1 Yes chr2R:19979242-19984895 lnc-SLC22A9-1:1 Yes chr2R:19979242-19984895 lnc-RCOR2-2:1 Yes chr3R:29724159-29724950 lnc-CAPN1-1:3 Yes chr3L:9888762-9893319 NEAT1:2 No - lnc-LTBP3-4:1 No - lnc-KCNK7-1:1 Yes chr3L:13011976-13015332 lnc-KAT5-2:1 No - lnc-UROD-3:1 Yes chr2R:15542661-15544409 lnc-NOC2L-9:1 No - lnc-EIF1AD-1:1 No - lnc-KLC2-2:1 Yes chr3R:23997538-24031827 lnc-ALDH3B1-2:1 No - lnc-MRGPRD-2:1 No - lnc-MRGPRF-4:5 No - lnc-MYEOV-7:1 No - lnc-FGF4-1:1 No - lnc-NADSYN1-4:1 Yes chr2R:14060456-14140902 lnc-ATG16L2-7:1 Yes chr3L:9137860-9145693 lnc-ATG16L2-8:1 Yes chr3L:9137860-9145693 lnc-THAP12-2:1 No - lnc-TAL1-3:1 No - lnc-PAK1-4:1 No - lnc-TENM4-6:2 No - lnc-DDIAS-7:2 No - lnc-RAB30-5:1 Yes chr2L:20461585-20463444 lnc-CCDC81-2:1 Yes chr2R:16414815-16419398 lnc-PRSS23-4:1 Yes chr2R:16414815-16419398 lnc-TMEM135-10:1 No - lnc-FAT3-6:1 No - lnc-IZUMO1R-3:1 No - lnc-IZUMO1R-2:1 No - lnc-KDM4D-2:1 No - lnc-SESN3-4:1 No - lnc-DCUN1D5-2:1 Yes chr2L:17962625-17982472 lnc-DYNC2H1-2:1 No - lnc-AGBL4-3:1 Yes chr2L:2954762-2968434 lnc-RDX-5:1 No - lnc-RDX-8:1 Yes chr3L:15588860-15609125 lnc-PLET1-7:1 No - lnc-ANKK1-4:1 No - lnc-USP28-4:1 Yes chrX:2604197-2606824 lnc-USP28-3:1 No - lnc-CADM1-8:1 No - lnc-CDKN2C-4:1 Yes chr2R:16024628-16028161 lnc-APOC3-8:2 No - lnc-BUD13-3:1 No - lnc-THY1-3:1 No - lnc-BSX-2:1 Yes chr3R:23988806-23992916 lnc-BSX-1:1 No - lnc-OR8G5-4:1 No - lnc-FEZ1-2:1 No - lnc-ST3GAL4-3:1 Yes chrX:2740384-3134532 lnc-NFRKB-3:1 No - lnc-ADAMTS15-9:1 No - lnc-NDC1-1:2 No - lnc-JAM3-9:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-SPATA19-4:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-JAM3-8:1 No - lnc-VPS26B-1:1 No - lnc-B4GALNT3-4:1 No - lnc-WNT5B-5:1 Yes chr2R:9503765-9541565 lnc-WNT5B-2:1 Yes chr2R:9503765-9541565 lnc-ACOT11-3:1 No - lnc-FBXL14-4:1 No - lnc-PRMT8-3:1 No - lnc-PRMT8-4:1 No - lnc-NTF3-4:1 No - lnc-CD9-4:1 No - lnc-EMG1-3:1 No - lnc-PEX5-1:1 No - lnc-CLEC4D-3:1 No - lnc-PZP-5:1 No - lnc-PZP-7:1 No - lnc-KLRG1-3:2 No - lnc-PCSK9-9:1 No - lnc-NOC2L-11:2 No - lnc-KLRB1-2:1 No - lnc-OLR1-4:1 No - lnc-PLPP3-7:1 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-MANSC1-1:1 Yes chr2R:13453640-13483229 lnc-CREBL2-3:1 No - lnc-MGST1-6:1 No - lnc-MGST1-5:1 No - lnc-PLCZ1-5:1 No - lnc-ST8SIA1-7:1 Yes chr3R:24349182-24356241 lnc-LMNTD1-6:1 No - lnc-RASSF8-4:1 No - lnc-MED21-3:1 Yes chr3L:25114924-25115946 lnc-MANSC4-7:1 Yes chr3L:13513254-13516276 lnc-DNM1L-6:1 No - lnc-CPNE8-5:1 No - lnc-TACSTD2-2:3 Yes chr2L:11130737-11136003 lnc-C12orf40-2:1 No - lnc-TMEM117-4:1 No - lnc-ARID2-5:1 No - lnc-AMIGO2-4:1 No - lnc-CCDC184-3:1 No - LINC01135:23 No - lnc-FMNL3-1:1 Yes chr3L:8307145-8308941 lnc-LARP4-1:1 No - lnc-LIMA1-2:1 No - lnc-DIP2B-2:1 No - lnc-DIP2B-1:1 Yes chr3L:250229-257954 lnc-KRT80-8:1 Yes chr2L:20683462-20714588 lnc-KRT81-4:1 No - lnc-KRT81-1:2 No - lnc-KRT6B-1:1 No - lnc-KRT18-6:1 No - lnc-COPZ1-2:1 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-OR6C6-2:1 No - lnc-FAM19A2-3:1 No - lnc-RXYLT1-5:2 No - lnc-RXYLT1-2:2 No - lnc-WIF1-2:1 Yes chr3R:10863355-10868642 lnc-HMGA2-3:1 No - lnc-LLPH-23:4 No - lnc-HELB-3:1 Yes chr3R:27251131-27253182 lnc-TMBIM4-3:1 Yes chrX:5966279-5986699 lnc-HELB-4:1 Yes chrX:5966279-5986699 lnc-TMBIM4-4:1 Yes chrX:5966279-5986699 lnc-CAND1-4:1 Yes chrX:5966279-5986699 lnc-CAND1-6:1 No - lnc-MDM1-3:1 No - lnc-PTPRR-1:1 No - lnc-TRHDE-3:1 No - lnc-TRHDE-4:1 No - lnc-GLIPR1L1-4:1 Yes chr2L:3718185-3729145 LINC02407:31 No - lnc-NAV3-4:1 Yes chr2L:2772327-2799979 lnc-PAWR-13:1 Yes chr2L:2772327-2799979 lnc-PPFIA2-3:1 No - lnc-RASSF9-4:1 Yes chr3L:14762028-14767703 lnc-ITGB3BP-9:1 No - lnc-TMTC3-10:1 No - lnc-CCER1-4:2 No - lnc-C12orf74-16:2 No - lnc-DCN-2:1 No - lnc-C12orf74-14:2 No - lnc-C12orf74-13:2 No - lnc-C12orf74-12:2 No - lnc-BTG1-3:1 No - lnc-IL12RB2-4:1 No - lnc-PLEKHG7-7:2 No - lnc-CEP83-11:1 No - lnc-TMCC3-7:1 No - lnc-VEZT-3:1 No - lnc-VEZT-4:1 No - lnc-CCDC38-5:1 No - lnc-CFAP54-3:2 No - lnc-CTH-11:1 No - lnc-SLC5A8-5:1 Yes chr3L:11984906-11990505 lnc-ARL1-4:1 No - lnc-MYBPC1-3:4 Yes chr3L:3172817-3178580 lnc-PMCH-3:1 No - lnc-HSP90B1-2:1 Yes chr4:538332-557854 lnc-CHST11-2:1 No - lnc-CTH-14:1 No - lnc-PRDM4-6:4 No - lnc-ARPC3-1:1 Yes chrX:6597088-6599699 lnc-NAA25-4:1 No - lnc-RPH3A-1:1 Yes chrX:10749077-10757666 lnc-RPL6-1:1 Yes chrX:10749077-10757666 lnc-NEGR1-4:2 No - lnc-MAP1LC3B2-14:26 No - lnc-C12orf49-4:1 No - lnc-FBXO21-1:2 Yes chr2L:10804274-10837511 lnc-FBXW8-5:1 Yes chr2L:10804274-10837511 lnc-KSR2-1:1 Yes chr2L:10804274-10837511 lnc-WSB2-5:1 Yes chr3R:5478390-5483906 lnc-SUDS3-1:1 No - lnc-SRRM4-5:1 No - lnc-CIT-10:1 No - lnc-HSPB8-5:1 No - lnc-CIT-8:1 No - lnc-SIRT4-3:1 No - lnc-RHOF-3:1 Yes chrX:2782906-2790567 lnc-BCL7A-3:1 No - lnc-KNTC1-3:1 No - lnc-RABGGTB-2:2 No - lnc-RFLNA-4:2 Yes chrX:12684203-12742618 lnc-NCOR2-5:1 Yes chrX:12684203-12742618 lnc-BRI3BP-6:1 No - lnc-SCARB1-2:1 No - lnc-BRI3BP-5:1 No - lnc-DHX37-15:1 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-AACS-6:1 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-AACS-7:1 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-DNAJB4-2:1 No - lnc-AACS-10:1 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-TMEM132B-14:1 No - lnc-TMEM132B-15:1 No - lnc-DHX37-22:1 No - lnc-DHX37-26:1 No - lnc-DHX37-9:16 No - lnc-DHX37-28:1 No - lnc-SLC15A4-22:1 No - lnc-ADGRL2-10:8 No - lnc-GLT1D1-7:1 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-SLC15A4-17:1 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-FZD10-8:1 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-RIMBP2-8:1 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-FZD10-4:1 No - lnc-ADGRD1-3:1 No - lnc-STX2-12:1 No - LINC01725:47 No - lnc-MPHOSPH8-12:1 No - lnc-GJB6-1:1 No - lnc-CRYL1-2:1 Yes chr2L:21578292-21589423 lnc-IL17D-3:1 Yes chr2L:21578292-21589423 lnc-FGF9-7:1 No - LINC00424:4 No - lnc-FGF9-12:1 No - lnc-FGF9-15:2 No - lnc-TTLL7-10:1 No - lnc-FGF9-17:1 No - lnc-MIPEP-2:1 No - lnc-SGCG-11:1 No - lnc-C1QTNF9-9:1 Yes chr3L:277437-305292 lnc-RNF17-4:1 No - lnc-ATP8A2-1:1 No - lnc-POMP-11:1 No - lnc-MTUS2-6:1 Yes chrX:15849731-15853175 lnc-UBL3-5:1 No - lnc-UBL3-6:1 No - lnc-ZAR1L-4:1 Yes chr3L:9631834-9679103 lnc-ZAR1L-3:1 Yes chr3L:9631834-9679103 lnc-BRCA2-2:1 Yes chr3L:9631834-9679103 lnc-NBEA-6:1 No - lnc-EXOSC8-5:1 No - lnc-UFM1-10:1 No - lnc-COG6-4:1 No - lnc-SLC25A15-2:1 No - lnc-MTRF1-4:1 Yes chrX:9319359-9324458 lnc-MTRF1-5:1 Yes chrX:9319359-9324458 lnc-SELENOF-10:1 Yes chr2L:19442833-19444750 lnc-EPSTI1-5:2 No - lnc-EPSTI1-8:1 Yes chr3L:12844254-12850117 lnc-EPSTI1-9:2 Yes chr3L:12844254-12850117 lnc-ENOX1-1:1 Yes chr3L:12844254-12850117 lnc-LACC1-3:1 No - lnc-LACC1-4:1 No - lnc-SERP2-14:1 No - lnc-GTF2B-10:1 No - lnc-GTF2F2-9:1 No - lnc-SPERT-2:1 No - lnc-ESD-1:2 No - lnc-MED4-1:1 No - lnc-RCBTB2-4:1 Yes chrX:797090-801479 lnc-RCBTB2-6:1 No - lnc-EBPL-2:2 Yes chr3R:9574484-9577733 lnc-SPRYD7-4:1 No - lnc-KCNRG-4:1 No - lnc-RNASEH2B-5:1 No - lnc-DLEU7-5:1 Yes chrX:13668014-13669573 lnc-GBP5-8:1 No - lnc-DHRS12-3:1 No - lnc-NEK5-2:1 Yes chrX:11855022-11864754 lnc-NEK5-1:3 No - lnc-OLFM4-10:1 No - lnc-DIAPH3-14:1 No - lnc-DIAPH3-13:1 No - lnc-DIAPH3-9:1 No - lnc-TDRD3-11:1 Yes chr2L:20758144-20768053 lnc-ZNF326-1:1 No - lnc-PCDH20-13:2 No - lnc-PCDH20-12:1 No - lnc-PCDH20-16:1 No - lnc-TDRD3-24:1 No - lnc-PCDH20-17:3 No - lnc-TDRD3-22:1 No - lnc-BORA-33:1 Yes chr3R:14630478-14641776 lnc-KLF5-6:1 No - lnc-KLF5-8:1 No - lnc-BARHL2-4:1 No - lnc-KLF5-10:1 No - lnc-KLF5-11:2 No - lnc-KLF12-2:1 No - lnc-COMMD6-4:1 No - lnc-KCTD12-2:1 Yes chr3R:20894452-20897320 lnc-ACOD1-2:1 No - lnc-EDNRB-4:1 No - lnc-SLAIN1-9:1 No - lnc-TMED5-5:1 Yes chr2R:18135426-18139990 lnc-NDFIP2-22:1 No - lnc-NDFIP2-17:1 No - lnc-RNF219-4:1 No - lnc-RNF219-5:1 No - lnc-NDFIP2-25:1 No - lnc-NDFIP2-27:1 No - lnc-SLITRK1-7:1 No - lnc-CCDC18-2:1 Yes chr2R:18135426-18139990 lnc-SLITRK1-5:1 No - LINC00333:6 No - lnc-SLITRK1-6:1 No - lnc-SLITRK6-13:1 No - lnc-SLITRK5-18:1 No - lnc-SLITRK6-21:1 No - lnc-SLITRK6-23:1 No - lnc-F3-3:1 No - lnc-ANKRD65-4:1 Yes chr2L:5346200-5365760 lnc-SLITRK6-28:3 No - lnc-GPC6-4:1 Yes chr3L:8827505-8891192 lnc-DNAJC3-4:1 Yes chr3R:19929277-20008512 lnc-RNF113B-7:1 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-SLC15A1-3:1 Yes chr2L:7472513-7496307 lnc-TPP2-7:1 No - lnc-SLC10A2-4:1 No - lnc-DAOA-11:1 No - lnc-EFNB2-7:1 No - lnc-DAOA-8:1 No - lnc-LIG4-2:1 No - lnc-IRS2-7:1 No - lnc-IRS2-5:1 No - lnc-COL4A1-3:1 No - lnc-ARHGEF7-6:1 No - lnc-ARHGEF7-5:1 No - lnc-ANKRD10-7:1 Yes chr2L:20350434-20365254 lnc-TEX29-7:1 Yes chr2L:20350434-20365254 lnc-ANKRD10-8:1 No - lnc-TEX29-4:1 No - lnc-TUBGCP3-11:1 No - lnc-TUBGCP3-14:2 Yes chrX:16405509-16414651 lnc-ALG14-6:1 No - lnc-PCID2-6:1 Yes chr2R:5468319-5495861 lnc-ABHD4-2:1 No - lnc-RWDD3-1:2 No - lnc-SLC7A7-2:1 No - lnc-NEDD8-MDP1-1:6 No - lnc-STXBP6-4:1 No - lnc-KHNYN-9:1 No - lnc-NOVA1-8:1 No - lnc-KHNYN-11:1 No - lnc-RWDD3-1:8 No - lnc-NOVA1-7:1 No - lnc-KHNYN-12:1 No - lnc-NOVA1-10:1 No - lnc-NOVA1-13:1 No - lnc-FOXG1-21:1 No - lnc-FOXG1-20:1 No - lnc-PRKD1-19:1 No - lnc-RWDD3-5:26 No - lnc-STRN3-11:1 Yes chr2L:10281943-10292365 lnc-SPTSSA-4:1 Yes chr3R:5257037-5269507 lnc-PPP2R3C-4:1 No - lnc-KIAA0391-3:1 No - lnc-NFKBIA-4:1 No - lnc-INSM2-5:1 Yes chr2L:16313036-16326207 lnc-PAX9-7:1 No - lnc-PAX9-8:1 Yes chrX:750347-758719 lnc-PTBP2-8:1 No - lnc-CLEC14A-4:1 No - lnc-SSTR1-5:1 No - lnc-SSTR1-6:1 No - lnc-FBXO33-4:1 No - lnc-C14orf28-9:1 No - lnc-FSCB-9:1 No - lnc-FSCB-6:1 No - lnc-C14orf28-2:1 No - lnc-FANCM-12:1 No - lnc-PLPPR5-4:2 Yes chrX:9196808-9201820 lnc-RPL10L-3:3 No - lnc-ATL1-5:1 Yes chr2L:2130813-2137296 lnc-PTGDR-3:1 No - lnc-PTGDR-1:1 No - lnc-DDHD1-9:1 No - lnc-WDHD1-2:1 Yes chr2R:21175315-21182608 lnc-FBXO34-1:1 No - lnc-SASS6-2:3 Yes chr3L:20499836-20505700 lnc-EXOC5-3:1 No - lnc-ACTR10-7:1 No - lnc-SIX1-3:1 No - lnc-PRKCH-1:1 Yes chr3R:29039156-29049148 lnc-GPR88-1:1 Yes chr2L:7801668-7810703 lnc-MOSPD1-2:1 No - lnc-RBM45-7:1 No - lnc-COL27A1-1:1 No - lnc-TAL1-2:1 No - lnc-FAM46C-4:1 Yes chr2R:7716807-7782637 lnc-DDX52-3:1 No - lnc-HIST1H3D-1:1 Yes chr2L:21423737-21424229 lnc-GAL3ST3-1:1 Yes chr2L:3026252-3029168 lnc-TNMD-1:1 No - lnc-SUZ12-5:1 No - lnc-ATP6V1C1-6:1 No - lnc-GTF2E1-2:1 Yes chrX:12631605-12653442 lnc-TIMP4-4:1 No - RMDN2-AS1:16 No - lnc-SYK-7:1 No - lnc-SUDS3-2:1 No - lnc-MAP3K7CL-4:1 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-TMSB15A-3:1 No - lnc-DCUN1D1-12:1 No - lnc-CCT8L2-24:1 No - lnc-UNC80-1:1 Yes chr3R:27639886-27656996 lnc-INSM1-3:1 No - lnc-C19orf44-4:1 Yes chr2R:24768314-24775265 lnc-NBEA-7:1 No - lnc-ACTR8-3:1 Yes chr3R:11419376-11421693 lnc-TASP1-10:1 Yes chr2L:15499127-15505018 lnc-SESN3-7:1 No - lnc-WDR89-3:1 Yes chrX:16740906-16742918 lnc-ADGRV1-9:1 No - lnc-KCNH8-5:1 No - lnc-CDC5L-6:1 No - lnc-MAN2C1-9:1 No - lnc-C3orf58-7:1 No - lnc-NRXN3-3:1 No - lnc-DRD2-6:1 No - lnc-SETBP1-4:1 No - lnc-PYGL-4:1 Yes chr2L:10544883-10628054 lnc-BCOR-6:1 No - lnc-IRAK4-4:1 No - lnc-MRPS25-7:1 Yes chr3L:21494019-21497494 lnc-NLRC4-2:1 No - lnc-APCDD1L-2:1 Yes chr3L:8109132-8110043 lnc-OST4-7:1 No - lnc-SHOX2-5:1 No - lnc-ARL8A-2:1 No - lnc-IL17A-4:1 No - lnc-PPP1R3B-12:1 Yes chr3R:25653091-25661286 lnc-UBXN4-11:1 Yes chr3L:3818679-3842326 lnc-AZIN1-3:1 No - lnc-PLGRKT-3:1 No - lnc-RPS29-5:1 No - lnc-ENTPD5-1:1 No - lnc-PDIA4-3:1 Yes chr3L:10634575-10638130 lnc-TFEB-3:1 No - lnc-AP4S1-3:1 Yes chr2L:8030721-8040826 lnc-ARF5-11:1 Yes chr3R:5794705-5799994 lnc-SCAPER-4:1 Yes chr2R:11688569-11690863 lnc-HOMER1-6:1 Yes chr3R:22211824-22217415 lnc-PIGU-2:1 No - lnc-DGUOK-4:1 Yes chr3L:2786207-2879158 lnc-PIGU-4:1 No - lnc-PDSS1-6:1 Yes chr3R:14119262-14122420 lnc-TTC14-5:1 Yes chr3R:4781120-4784722 lnc-SPEN-2:1 No - lnc-HIST1H4A-1:2 No - lnc-GAREM2-4:1 Yes chrX:20251338-20254691 lnc-THBS4-7:1 No - lnc-RTL9-3:1 Yes chr2R:6036557-6040647 lnc-GARS-5:1 Yes chr2R:12474424-12487986 lnc-RPS27L-5:1 No - lnc-MAP9-4:1 No - lnc-TSEN2-3:1 No - lnc-SPO11-6:1 No - lnc-DHX38-28:1 Yes chr4:501810-540874 lnc-PKN2-4:1 Yes chr3R:11820381-11822493 lnc-KCNJ15-1:1 No - lnc-SIRT6-2:1 No - lnc-FBXO31-8:2 No - lnc-SIX4-3:1 Yes chr2R:10738617-10739829 lnc-ILKAP-4:1 No - lnc-C1QL1-1:1 Yes chr3R:7082182-7083251 lnc-CUL1-4:1 No - lnc-C3orf85-12:1 No - lnc-SPRED2-16:1 No - lnc-MYO16-8:1 No - lnc-TSTA3-4:1 No - lnc-CBX8-2:1 No - lnc-M1AP-3:1 No - lnc-RHOQ-3:1 Yes chr3R:5591763-5595356 lnc-PC-1:1 Yes chrX:13359248-13368179 lnc-MED13-2:1 No - lnc-PRKCA-1:1 No - MIR29B2CHG:65 No - lnc-ZNF813-2:1 No - lnc-SP110-3:1 No - lnc-GPR27-6:1 No - lnc-LRRC37A-1:1 No - lnc-PMFBP1-3:6 Yes chr4:501810-540874 lnc-AP3S1-8:1 Yes chrX:11850909-11852530 lnc-TUBGCP3-13:2 No - lnc-CAMSAP2-5:1 Yes chr3L:18750607-18801309 lnc-CCDC188-1:1 Yes chrX:9324508-9356227 lnc-SCRN3-8:1 Yes chrX:5616572-5618806 lnc-CLASP2-5:1 No - lnc-WIF1-5:1 No - lnc-FAM120B-1:2 No - lnc-ZC2HC1A-5:1 No - lnc-CFAP46-5:1 No - lnc-PIANP-1:1 No - lnc-PALM2-2:1 No - lnc-GABRE-10:1 No - lnc-VWDE-6:1 No - lnc-RPS27L-10:1 Yes chr3L:8545001-8574409 LINC01716:6 No - lnc-PPEF1-5:1 No - lnc-CBY3-1:1 No - lnc-PTCD2-7:1 Yes chr3R:15348048-15350391 lnc-P3H4-1:2 No - lnc-RAB3C-8:1 Yes chrX:3176440-3343767 lnc-RAD21-2:1 Yes chr2L:12164241-12166704 lnc-HIST1H2AA-2:1 Yes chr2R:16973927-16996057 lnc-CPLX1-11:1 Yes chr3L:16588475-16590132 lnc-DAZ3-1:1 Yes chr3L:9097629-9134405 lnc-IRAK1-1:1 No - lnc-GPHB5-6:1 No - lnc-NEMP2-6:1 Yes chr3L:4153618-4160932 lnc-MEX3C-9:1 Yes chr2R:12529053-12564184 lnc-SF3B2-2:1 Yes chr3R:23997538-24031827 lnc-RALGAPA2-5:3 No - lnc-MSANTD3-3:1 No - lnc-MRPL32-8:1 No - lnc-CCDC7-8:2 Yes chrX:8061645-8070237 lnc-RASSF2-3:1 No - lnc-ZNF791-5:1 No - lnc-MRPS18A-1:3 No - lnc-ZC3H12A-1:1 No - lnc-PPIAL4A-5:3 No - lnc-VPS50-1:13 No - lnc-SRRM3-5:1 No - lnc-NDUFB8-1:1 No - lnc-CHRM4-3:1 Yes chrX:8907068-9029476 lnc-FLII-3:1 No - lnc-MTNR1A-5:3 Yes chr2R:9599909-9601252 lnc-POLR3K-2:3 No - lnc-N4BP1-5:1 No - lnc-RITA1-1:2 No - lnc-PAIP2-4:1 No - lnc-MEIS2-9:1 No - lnc-LDLRAD1-3:1 No - lnc-CBLL1-2:1 No - lnc-ABAT-4:1 Yes chr3L:12534590-12535513 lnc-SSR3-7:1 No - lnc-HSF5-2:1 No - lnc-AARD-2:1 No - lnc-RRM2-2:1 Yes chr3L:19991887-19997568 lnc-LMBRD1-4:1 No - lnc-SEC16B-8:1 No - lnc-ITSN2-4:1 No - lnc-MOCS2-3:1 No - lnc-ANKS6-4:1 Yes chr3L:6998843-7053499 lnc-TMEM163-5:1 No - lnc-DNAH7-3:1 No - lnc-CSRNP3-5:1 No - lnc-CFAP100-7:2 No - lnc-SLC35F3-1:1 No - lnc-SMIM19-2:1 No - lnc-VWA3B-2:1 No - lnc-RUFY4-6:1 No - lnc-CECR2-8:1 No - lnc-NCDN-2:1 Yes chr3L:8087635-8091786 lnc-RAD52-1:1 Yes chr2R:9503765-9541565 lnc-MORC2-6:1 Yes chr3R:24934869-24938222 lnc-RABL3-5:1 Yes chrX:12631605-12653442 lnc-DPP4-6:1 Yes chr2L:7223328-7249343 lnc-C1orf185-4:1 No - lnc-MYOM1-4:3 No - lnc-SUB1-2:1 Yes chr3L:16106594-16112626 lnc-VWA8-3:1 No - lnc-DDHD2-2:1 Yes chr3R:27932982-27937853 lnc-CCDC7-5:1 Yes chr2R:11452043-11465270 lnc-IRX5-4:1 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-GAMT-2:5 Yes chrX:15985473-15986808 lnc-OXGR1-4:1 Yes chr2R:17216549-17379376 lnc-SWAP70-4:1 No - lnc-SPOCK3-5:1 No - lnc-ARL6IP5-3:1 No - lnc-RDH8-4:1 No - lnc-CPAMD8-1:1 No - lnc-SLC9B1-3:1 No - lnc-AP3M2-2:1 No - lnc-GNPDA1-2:2 No - lnc-BRINP3-13:1 No - lnc-RBBP7-1:1 Yes chr2L:11100963-11106645 lnc-NUMA1-4:1 Yes chrX:5329876-5332435 lnc-LANCL2-4:1 No - lnc-SKOR1-2:1 No - lnc-HSD3B7-1:1 Yes chr3R:24101600-24105763 lnc-TCAF1-3:1 No - lnc-ZNF483-4:1 No - lnc-EVI5-2:1 No - lnc-DUSP14-7:1 No - lnc-TMEM8A-3:1 Yes chr3L:14190870-14233250 lnc-SEC22C-4:1 Yes chr3R:28340334-28345169 lnc-EBLN1-2:1 No - lnc-NINJ2-3:1 Yes chr3L:21543850-21554928 lnc-AHI1-4:1 No - lnc-AKAP6-2:1 Yes chr3L:366524-392633 lnc-RIN3-2:1 Yes chrX:23022898-23035550 lnc-PARN-14:1 No - lnc-MAP3K21-1:1 No - lnc-MCHR1-5:1 Yes chr3L:2717615-2766536 lnc-TRIM11-6:1 Yes chr3L:2117466-2151700 lnc-CFAP43-1:1 Yes chr3L:8518885-8520295 lnc-SENP2-6:1 Yes chrX:10787869-10824277 lnc-TARDBP-6:1 No - lnc-ICA1L-5:1 Yes chr2L:10768234-10769952 lnc-CDH1-1:2 Yes chr2L:18969028-18972004 lnc-SYT4-3:1 No - lnc-IDNK-6:1 No - lnc-CTTNBP2NL-5:1 No - lnc-SLC15A4-19:1 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-OAZ3-13:1 No - lnc-MYO10-7:1 No - lnc-HPS5-1:1 Yes chr2R:14363048-14365473 lnc-PMCH-5:1 No - lnc-CHP1-5:1 Yes chr2R:23734904-23746829 lnc-STRBP-3:1 Yes chr3L:8346561-8352279 lnc-UPK2-1:1 No - lnc-TDRD1-2:1 Yes chr3L:16348747-16351951 lnc-TIMM9-3:1 No - lnc-KRTAP22-2-1:1 No - lnc-CTSH-4:1 No - lnc-WDR12-1:1 Yes chr3L:4193993-4224003 lnc-G0S2-1:1 No - lnc-RASA1-8:1 No - lnc-TNNI1-1:1 No - lnc-BEST3-3:1 Yes chr2R:24162489-24173660 lnc-CIDEC-3:1 No - lnc-SOX9-5:2 No - lnc-PSMC3IP-4:1 Yes chr3R:29131193-29137980 lnc-TOX3-10:1 No - lnc-LEF1-1:2 Yes chr4:69326-114270 lnc-RNF6-5:1 Yes chr3L:9837080-9838670 lnc-ATG9B-1:1 Yes chr2L:10804274-10837511 lnc-MUTYH-2:1 Yes chr3R:19044882-19094270 lnc-ARID2-7:1 No - lnc-BCL7C-1:2 Yes chrX:9356634-9358594 lnc-PPIAL4F-14:1 No - lnc-MEP1B-4:1 No - lnc-SH2D6-3:1 No - lnc-RPL12-2:1 No - lnc-DLGAP4-1:1 No - lnc-ADORA2B-1:1 No - lnc-EGR3-3:1 No - lnc-BCL6-9:1 Yes chr4:1057365-1065001 lnc-WNT2-8:1 Yes chr4:1198852-1224467 lnc-KANK3-1:1 No - LINC01952:17 No - lnc-TERF2IP-6:1 No - lnc-GPAT4-1:1 Yes chr3L:7655389-7718395 lnc-CWF19L2-2:1 Yes chr2R:22634019-22635942 lnc-FAM207A-9:1 Yes chrX:1773725-1788065 lnc-PIK3CD-1:1 Yes chr4:1112874-1123357 lnc-PCED1B-8:2 No - lnc-RPS10-2:1 No - lnc-CEP95-3:1 No - lnc-PIGM-4:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-FAM189A2-4:1 Yes chrX:10627737-10710947 lnc-OR6C70-2:1 No - lnc-AOC1-2:1 No - lnc-S100A7A-1:1 No - lnc-MLST8-3:1 No - lnc-COG5-6:1 No - lnc-LMBR1-9:2 No - lnc-GPR180-8:1 Yes chr3L:14632601-14671609 lnc-FXYD6-2:1 Yes chr2R:7540111-7564435 lnc-DIP2C-1:1 Yes chr2R:12519166-12521624 lnc-GEMIN6-1:4 Yes chrX:10894747-10899302 lnc-INSM2-2:1 Yes chr3R:26966930-26977878 lnc-KCNC2-9:1 No - lnc-PRSS22-4:1 No - lnc-WDR97-2:1 No - lnc-P2RX3-3:1 No - lnc-PATE2-1:1 No - lnc-EIF3G-3:1 No - lnc-SH3PXD2A-1:1 Yes chr3R:9020348-9039471 lnc-POMGNT1-7:1 No - lnc-AKIRIN1-12:1 No - lnc-ODF3L2-1:1 Yes chr3L:9427010-9428671 lnc-KIN-7:1 No - lnc-KIAA1143-3:1 No - lnc-ORC3-3:1 No - lnc-CPSF7-4:1 Yes chr4:278685-306481 lnc-DDR1-3:1 No - lnc-PGLYRP4-1:1 Yes chrX:15801153-15803880 lnc-HLF-2:1 No - lnc-TTC9B-1:1 No - lnc-TOP2B-2:1 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-NEFM-3:1 No - lnc-KNDC1-1:1 No - lnc-N4BP1-4:1 No - lnc-ZSWIM7-7:1 No - lnc-CSF1-3:1 No - lnc-ATP6V1D-5:1 Yes chrX:255674-258469 lnc-MRPL19-12:1 Yes chr3R:4077939-4104326 lnc-TNFSF4-2:1 No - lnc-FYCO1-4:1 No - lnc-GPATCH4-2:1 No - lnc-C1orf61-2:40 No - lnc-IFI16-1:1 No - lnc-DMRTA2-9:1 Yes chr2R:16024628-16028161 lnc-CMTM5-3:1 No - lnc-OGT-1:1 No - lnc-LZTFL1-1:1 Yes chr2R:21088386-21091004 lnc-LZTFL1-2:1 Yes chr2R:21088386-21091004 lnc-TMEM225B-1:1 No - lnc-OPHN1-6:1 No - lnc-TMCC3-3:1 No - lnc-MYEOV-8:1 No - lnc-SAMD11-3:1 No - lnc-EHD3-5:1 Yes chr2L:3404460-3426719 lnc-GGCT-1:47 No - lnc-PIANP-2:1 No - lnc-STAP1-8:1 No - lnc-P2RY1-5:1 No - lnc-P2RY1-4:1 No - lnc-OTUD4-6:1 Yes chr2R:17517261-17518186 lnc-TMEM259-4:1 Yes chr3L:4114289-4122388 lnc-FIGNL1-4:1 No - lnc-CERKL-5:1 No - lnc-AKAP3-4:1 No - lnc-AKAP3-5:1 No - lnc-AKAP3-6:1 No - lnc-AKAP3-7:1 No - lnc-ALPI-1:1 No - lnc-ALPI-2:1 No - lnc-ALPI-3:1 No - lnc-ANGEL2-2:1 No - lnc-PTP4A2-4:1 Yes chr2R:22409208-22411545 lnc-CLEC20A-8:3 No - lnc-CCDC85C-4:1 Yes chrX:6958032-6968750 lnc-TOP2B-1:1 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-SRPK2-10:1 Yes chr3L:1885657-1891462 lnc-COQ10B-3:1 No - lnc-GSDMD-4:1 Yes chr3L:8507469-8509763 lnc-SYCP2L-4:1 Yes chr2R:23752754-23753515 lnc-HS3ST5-5:1 Yes chr3L:4626734-4629467 lnc-ZFAND3-3:1 No - lnc-ZFAND3-2:1 No - lnc-C1QTNF9-7:1 Yes chr3L:277437-305292 lnc-GTSF1L-7:1 No - lnc-SCAF4-4:1 No - lnc-SYK-10:1 No - lnc-TNC-4:1 No - lnc-CPLX1-4:1 Yes chr3L:16588475-16590132 lnc-TMBIM1-3:1 No - lnc-TREX2-1:1 No - lnc-SCEL-4:1 No - lnc-CCDC171-5:1 Yes chr2R:8129354-8131323 lnc-ADGRE5-4:1 No - lnc-PRKN-12:2 No - lnc-ELF4-1:1 Yes chr3L:18802265-18820675 lnc-CAB39L-8:4 No - lnc-CAB39L-8:3 No - lnc-CAPS-3:1 No - lnc-LMBR1-8:2 No - lnc-NUS1-4:1 No - lnc-SRRM1-3:1 Yes chrX:13812971-13822307 lnc-TEAD3-4:1 Yes chr3L:20692330-20695378 lnc-GOLGA7-5:1 No - lnc-PAIP2-1:1 No - lnc-ZNF827-11:1 No - lnc-FGFRL1-10:1 No - lnc-EIF2S3B-5:1 No - lnc-SSTR4-10:1 No - lnc-CDH5-19:1 No - lnc-CEP128-8:1 No - lnc-CEP128-7:1 No - lnc-ARMC12-2:1 Yes chr2L:9888005-9890119 lnc-SEC31B-3:1 No - lnc-NUTM2G-7:1 No - lnc-TRAF3-1:1 No - lnc-FAHD2B-3:2 No - lnc-LCTL-1:1 No - lnc-PRKN-10:2 Yes chr2R:19497752-19500372 lnc-EDAR-10:1 Yes chr3R:12010772-12015059 lnc-ADO-2:1 No - lnc-SORCS2-3:1 No - lnc-E2F8-3:1 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-SRP9-3:1 No - LINC01682:13 No - lnc-GALK1-3:1 No - lnc-KDM2A-4:2 Yes chr3R:9052495-9063245 lnc-KHDRBS3-18:1 No - lnc-SRSF7-2:1 Yes chrX:10894747-10899302 lnc-F2R-2:1 No - lnc-DUSP18-2:1 Yes chr3R:24934869-24938222 lnc-SHOX2-3:1 No - lnc-TIGD2-6:1 Yes chr2R:17703335-17719346 lnc-CEP63-4:1 No - lnc-PITPNB-3:1 No - lnc-CLTRN-1:1 Yes chr2L:13803626-13809994 lnc-TMC6-7:1 Yes chr4:649041-663103 lnc-C15orf59-3:1 No - lnc-IRAK2-4:1 No - lnc-MAP3K7CL-1:1 No - lnc-C14orf93-2:2 No - lnc-TMEM8A-4:1 Yes chr3L:14190870-14233250 lnc-RNF32-52:1 No - lnc-KIAA1147-6:1 No - lnc-FANCC-74:1 No - lnc-UQCRHL-7:1 Yes chr3R:11781131-11787014 lnc-CCDC184-4:1 Yes chr2R:10109740-10117457 lnc-BARX2-1:1 No - lnc-INSR-5:1 No - lnc-SLCO4A1-4:1 No - lnc-ZNF438-1:4 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-CXorf51A-13:1 No - lnc-RBBP9-10:1 Yes chrX:23022898-23035550 lnc-BRCA1-2:1 No - lnc-UBAC1-1:1 No - lnc-HYI-6:1 No - lnc-CLEC5A-1:1 No - lnc-SLC2A10-1:1 No - lnc-UROD-2:1 No - lnc-SCAF11-7:1 No - lnc-SLC1A1-11:1 No - lnc-KRTAP9-1-1:1 No - lnc-ABCC2-2:1 No - lnc-TMEM71-4:1 Yes chrX:22449737-22451463 lnc-ATP5PO-3:1 No - lnc-SOD1-11:2 Yes chr3L:5657913-5749599 lnc-RSPH14-1:1 No - lnc-PHC1-1:1 No - lnc-NMNAT3-10:1 No - lnc-HDAC4-7:1 Yes chr2R:22985374-23048325 lnc-FOXA2-11:1 No - lnc-C16orf92-1:1 Yes chrX:10749077-10757666 lnc-PLEKHO1-3:1 Yes chr3R:9563924-9566092 lnc-CSPG4-3:1 No - lnc-DHX36-4:1 No - lnc-ZNF746-1:1 No - lnc-JUN-12:2 No - lnc-CASP9-5:1 Yes chr2R:22333500-22373109 lnc-ENKUR-5:1 Yes chr2L:12142780-12170508 lnc-C1QTNF1-9:1 Yes chr2L:21740041-21757466 lnc-LRRC49-12:1 No - lnc-CDK17-10:1 No - lnc-E2F8-4:1 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-TEX28-1:1 No - lnc-CD58-8:3 No - lnc-EGR3-2:2 No - lnc-MTAP-4:2 Yes chr3R:25036944-25037982 lnc-ARAF-2:1 No - lnc-SLC26A3-2:1 Yes chr2L:17478442-17481029 lnc-PRKN-8:2 Yes chr2R:19497752-19500372 lnc-RBKS-2:3 No - lnc-KIAA1109-3:1 No - lnc-TUSC5-5:1 Yes chr3L:1318480-1329617 lnc-ACTN1-2:1 No - lnc-ZCCHC17-16:1 No - lnc-TUBGCP3-16:1 No - lnc-FAM9C-6:1 Yes chr3L:9683579-9696700 lnc-PROSER1-1:1 No - lnc-DLX2-12:1 Yes chr2R:6759715-6798941 lnc-HRH3-2:1 Yes chr2L:8375502-8376797 lnc-STH-4:1 Yes chr3R:27639886-27656996 lnc-RFK-2:1 No - lnc-ARL1-3:1 Yes chr2R:22483303-22492033 lnc-HDLBP-3:1 No - PLCE1-AS1:13 No - lnc-TEX22-4:1 Yes chr3R:23997538-24031827 lnc-HS3ST3B1-14:1 No - lnc-KLHL18-7:2 Yes chrX:13413242-13421024 lnc-USP16-11:1 No - lnc-CDS2-4:1 No - lnc-KCNB2-5:2 Yes chr3L:8894404-8904790 lnc-CEACAM8-3:4 No - lnc-PLA2G4A-17:1 No - lnc-HSBP1-4:1 No - lnc-VPS54-3:1 No - lnc-GRPEL1-3:1 No - lnc-NPR3-4:2 No - lnc-IKZF1-7:1 No - lnc-ATP6V1B2-10:1 No - lnc-ZHX2-4:1 No - lnc-MAP10-6:2 No - lnc-RET-1:1 Yes chr2R:10249220-10255495 lnc-MEIOB-2:1 Yes chr3L:20798645-20800081 lnc-CDH7-4:1 No - lnc-CHD1-4:1 No - lnc-PAK1IP1-1:1 No - lnc-KCNT1-5:1 Yes chr2R:17519024-17535866 lnc-MUC20-10:1 No - lnc-NRIP2-9:1 Yes chr2L:16165831-16190540 lnc-SLC6A20-5:1 Yes chrX:13826041-13830317 lnc-ODAPH-2:1 No - lnc-ABCA5-11:1 Yes chr2L:18711071-18713748 lnc-GRHL2-16:1 No - lnc-PSMD6-2:1 No - lnc-TECRL-11:1 No - lnc-SLC44A3-3:1 No - lnc-VIRMA-6:1 Yes chr2R:15657318-15676669 lnc-SLC9A9-2:1 No - lnc-ZC3HAV1L-2:1 No - lnc-LPP-7:1 No - lnc-RORA-6:1 No - lnc-USP6-3:1 Yes chr3L:19871139-19881783 lnc-CD93-4:1 No - lnc-FYTTD1-6:1 No - lnc-REST-2:1 No - lnc-ANXA2R-6:1 No - lnc-CREB5-4:1 Yes chr3R:31220702-31231259 lnc-DMRTC1B-2:1 Yes chrX:9093612-9103739 lnc-PER2-8:1 No - lnc-SNX7-3:1 No - lnc-ITGBL1-4:1 Yes chrX:14266367-14277416 lnc-TGIF1-9:1 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-WNT2-5:1 No - lnc-FGFR1OP-16:1 No - lnc-RAG2-2:1 No - lnc-C6orf223-1:2 No - lnc-MKRN1-9:1 No - lnc-WDPCP-7:1 Yes chr3L:13011976-13015332 lnc-KRTAP5-4-2:1 No - lnc-PPP4R1-20:1 No - lnc-KIAA1614-4:1 Yes chr2L:19890201-19892550 lnc-WDR54-2:1 No - lnc-KCNJ6-9:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-COX10-9:2 No - lnc-CERK-20:1 No - lnc-TNFRSF1A-3:1 Yes chr3L:20149614-20198317 lnc-STK17B-3:1 Yes chrX:9608946-9623243 lnc-TAF5L-4:1 No - lnc-ZNF444-2:1 Yes chr2L:4876891-4883107 lnc-DR1-2:1 Yes chr2L:15007813-15008538 lnc-ANKRD22-2:1 Yes chrX:5900861-5905399 lnc-FKBP6-2:1 No - lnc-USP12-6:1 No - lnc-AMPD3-3:1 No - lnc-AUNIP-6:1 Yes chrX:10266792-10325958 lnc-IFNL3-3:1 No - lnc-PLET1-6:1 No - lnc-ELSPBP1-2:1 No - lnc-HSD17B14-4:1 Yes chrX:13396899-13401224 lnc-CEP170-9:2 No - lnc-CASZ1-5:1 No - lnc-CENPS-CORT-2:1 No - lnc-CASZ1-3:1 No - lnc-TARDBP-10:1 No - lnc-SP3-9:1 No - lnc-CDCA7-2:1 No - lnc-SP3-8:1 No - lnc-CDCA7-3:1 No - lnc-SP3-7:1 No - lnc-CDCA7-4:1 No - lnc-SP3-5:1 No - lnc-SP9-9:1 No - lnc-OLA1-1:1 No - lnc-SP9-6:1 No - lnc-LNPK-6:1 No - lnc-HOXD13-5:1 No - lnc-GBX2-1:3 Yes chr2L:13835564-13898712 lnc-ACKR3-10:2 Yes chr2L:13835564-13898712 lnc-SATB1-2:1 No - lnc-KCNH8-8:1 No - lnc-SATB1-4:1 No - lnc-KCNH8-7:1 No - lnc-SATB1-5:1 No - lnc-KCNH8-4:1 No - lnc-MDFIC2-1:1 No - lnc-MITF-10:1 No - lnc-FOXP1-3:1 No - lnc-GPR27-20:1 No - lnc-FOXP1-2:1 No - lnc-GPR27-19:1 No - lnc-ZBTB20-3:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-GAP43-11:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-TMEM35B-3:1 No - lnc-ZMYM1-3:1 No - lnc-ZBTB20-4:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-GAP43-12:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-ZBTB20-5:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-GAP43-14:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-ZBTB20-6:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-GAP43-15:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-CEP70-2:1 Yes chr3R:20628972-20634732 lnc-FAIM-4:1 Yes chr3R:20628972-20634732 lnc-FOXL2-4:1 Yes chr3R:20628972-20634732 lnc-FOXL2NB-5:2 Yes chr3R:20628972-20634732 lnc-FOXL2-3:1 Yes chr3R:20628972-20634732 lnc-FOXL2NB-3:2 Yes chr3R:20628972-20634732 lnc-FOXL2-2:2 No - lnc-FOXL2NB-2:2 No - lnc-HLTF-9:1 Yes chrX:17080423-17087675 lnc-AGTR1-4:1 Yes chrX:17080423-17087675 lnc-HLTF-8:1 Yes chrX:17080423-17087675 lnc-CPA3-1:1 Yes chrX:17080423-17087675 lnc-IFT80-10:1 Yes chr2L:10328200-10331116 lnc-IQCJ-2:1 Yes chr2L:10328200-10331116 lnc-IFT80-8:2 Yes chr2L:10328200-10331116 lnc-SCHIP1-3:1 Yes chr2L:10328200-10331116 lnc-IFT80-7:1 Yes chr2L:10328200-10331116 lnc-SCHIP1-2:1 Yes chr2L:10328200-10331116 lnc-IFT80-6:1 Yes chr2L:10328200-10331116 lnc-SCHIP1-1:1 Yes chr2L:10328200-10331116 lnc-SLC2A2-2:1 No - lnc-CLDN11-4:1 No - lnc-RTP4-4:1 No - lnc-STX18-3:1 No - STX18-AS1:22 No - lnc-YRDC-2:1 No - lnc-MANEAL-1:1 No - lnc-RAB28-8:1 No - lnc-CPEB2-16:1 No - lnc-APBB2-5:1 Yes chr3R:4659579-4712193 lnc-UCHL1-2:1 Yes chr3R:4659579-4712193 lnc-CXXC4-2:1 No - lnc-TET2-9:1 No - lnc-PITX2-5:1 No - lnc-ENPEP-3:1 No - lnc-SH3D19-10:1 Yes chrX:5085759-5254864 lnc-MAB21L2-2:1 Yes chrX:5085759-5254864 lnc-SH3D19-7:1 Yes chrX:5085759-5254864 lnc-MAB21L2-3:1 Yes chrX:5085759-5254864 lnc-SH3D19-6:1 Yes chrX:5085759-5254864 lnc-MAB21L2-4:1 Yes chrX:5085759-5254864 lnc-MTF1-3:1 Yes chrX:1922981-1927524 lnc-C1orf122-3:1 Yes chrX:1922981-1927524 lnc-EMB-8:1 No - lnc-PARP8-5:1 No - lnc-TBCA-3:1 No - lnc-PDE8B-3:1 No - lnc-TBCA-1:1 No - lnc-PDE8B-4:1 No - lnc-TBCA-2:1 No - lnc-PDE8B-6:1 No - lnc-TBCA-4:1 No - lnc-PDE8B-7:1 No - lnc-SF3A3-2:1 Yes chrX:1922981-1927524 lnc-UTP11-7:1 Yes chrX:1922981-1927524 lnc-TBCA-5:1 Yes chrX:4535635-4540626 lnc-SCAMP1-9:1 Yes chrX:4535635-4540626 lnc-TBCA-8:1 Yes chrX:4535635-4540626 lnc-SCAMP1-10:1 Yes chrX:4535635-4540626 lnc-SSBP2-1:1 No - lnc-ATG10-5:1 No - lnc-TMEM161B-7:1 No - lnc-RASA1-10:1 No - lnc-TMEM161B-5:1 No - lnc-RASA1-12:1 No - lnc-MEF2C-6:1 No - lnc-RASA1-25:1 No - lnc-ARRDC3-8:1 No - lnc-ADGRV1-13:1 No - lnc-POU3F1-5:1 No - lnc-UTP11-8:1 No - lnc-FAM172A-9:1 Yes chr3L:19269351-19274168 lnc-SLF1-9:1 Yes chr3L:19269351-19274168 lnc-FAM172A-11:1 Yes chr3L:19269351-19274168 lnc-SLF1-8:1 Yes chr3L:19269351-19274168 lnc-RNF145-4:1 Yes chr2R:14772650-14807061 lnc-UBLCP1-11:1 Yes chr2R:14772650-14807061 lnc-PANK3-18:1 Yes chrX:10964032-10967134 lnc-WWC1-5:1 Yes chrX:10964032-10967134 lnc-KCNMB1-6:1 Yes chrX:15927185-15933867 lnc-GABRP-3:1 Yes chrX:15927185-15933867 lnc-KCNMB1-7:1 Yes chrX:15927185-15933867 lnc-GABRP-4:1 Yes chrX:15927185-15933867 lnc-FBXW11-13:1 Yes chrX:15927185-15933867 lnc-TLX3-7:1 Yes chrX:15927185-15933867 lnc-KLF18-6:1 Yes chr2R:23820354-23839864 lnc-CCDC24-2:1 Yes chr2R:23820354-23839864 lnc-FBXW11-12:1 Yes chrX:15927185-15933867 lnc-TLX3-6:1 Yes chrX:15927185-15933867 lnc-FBXW11-11:1 Yes chrX:15927185-15933867 lnc-TLX3-5:1 Yes chrX:15927185-15933867 lnc-FBXW11-10:1 Yes chrX:15927185-15933867 lnc-TLX3-3:1 Yes chrX:15927185-15933867 lnc-TFAP2A-6:1 No - lnc-PAK1IP1-4:1 No - lnc-CPNE5-2:1 No - lnc-KLF18-10:1 No - lnc-DMAP1-1:1 No - lnc-PKHD1-5:1 No - lnc-TFAP2B-2:1 No - lnc-PKHD1-3:1 No - lnc-TFAP2B-3:1 No - lnc-MMS22L-2:1 No - lnc-KLHL32-7:1 No - lnc-FBXL4-4:1 No - lnc-POU3F2-7:1 No - lnc-CASZ1-4:1 Yes chr3L:20778799-20780378 lnc-CENPS-CORT-4:1 Yes chr3L:20778799-20780378 lnc-KLF18-11:1 No - lnc-DMAP1-2:1 No - lnc-FBXL4-3:1 No - lnc-POU3F2-4:1 No - lnc-CCNC-3:1 No - lnc-PRDM13-8:1 No - lnc-SIM1-3:1 No - lnc-GRIK2-6:1 No - lnc-ZFAND2A-3:1 No - lnc-UNCX-2:1 No - lnc-SP8-1:1 Yes chr3L:6240500-6245746 lnc-ITGB8-11:1 Yes chr3L:6240500-6245746 lnc-CDCA7L-1:1 Yes chr3R:21024580-21042499 lnc-SP4-4:1 Yes chr3R:21024580-21042499 lnc-CCDC126-3:1 No - lnc-AGBL4-4:1 No - lnc-SLC5A9-7:1 No - lnc-SKAP2-5:1 No - lnc-SNX10-3:1 No - lnc-SKAP2-2:1 No - lnc-SNX10-88:1 No - lnc-NEUROD6-3:1 No - lnc-CCDC129-1:1 No - lnc-INHBA-4:1 Yes chr4:47710-57041 lnc-MRPL32-6:1 Yes chr4:47710-57041 lnc-FIGNL1-7:1 No - lnc-IKZF1-5:1 No - lnc-CALN1-6:1 No - lnc-GALNT17-7:1 No - lnc-CALN1-5:1 No - lnc-GALNT17-6:1 No - lnc-DMRTA2-8:1 No - lnc-ELAVL4-5:1 No - lnc-TFEC-13:1 No - lnc-MDFIC-3:1 No - lnc-TFEC-12:1 No - lnc-MDFIC-4:1 No - lnc-DMRTA2-7:1 No - lnc-ELAVL4-6:1 No - lnc-TFEC-10:1 No - lnc-TES-3:1 No - lnc-FEZF1-1:1 Yes chr2L:7791175-7795959 lnc-MNX1-20:1 Yes chr3R:24805445-24814012 lnc-RNF32-4:1 Yes chr3R:24805445-24814012 lnc-KCTD9-4:1 Yes chr2R:14772650-14807061 lnc-PPP2R2A-5:1 Yes chr2R:14772650-14807061 lnc-BRF2-8:1 No - lnc-ZNF703-4:1 No - lnc-ALKAL1-2:1 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-NPBWR1-6:1 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-ALKAL1-1:1 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-NPBWR1-5:1 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-TOX-3:1 No - lnc-SDCBP-4:1 No - lnc-DMRTA2-4:1 No - lnc-ELAVL4-7:1 No - lnc-ARMC1-9:1 No - lnc-BHLHE22-5:1 No - lnc-ARMC1-8:1 No - lnc-BHLHE22-6:1 No - lnc-ARMC1-6:1 No - lnc-MTFR1-2:1 No - lnc-PEX2-5:1 No - lnc-ZFHX4-4:1 No - lnc-LRP12-7:1 No - lnc-DCSTAMP-4:1 No - lnc-LRP12-10:1 No - lnc-OXR1-2:1 No - lnc-C9orf66-9:1 Yes chr3R:29692591-29697025 lnc-DMRT3-3:1 Yes chr3R:29692591-29697025 lnc-C9orf66-10:1 Yes chr3R:29692591-29697025 lnc-DMRT3-2:1 Yes chr3R:29692591-29697025 lnc-DMAC1-11:1 No - lnc-KDM4C-16:1 No - lnc-DMRTA2-6:1 Yes chr2R:16024628-16028161 lnc-ELAVL4-9:1 Yes chr2R:16024628-16028161 lnc-NFIB-2:1 No - lnc-LURAP1L-5:1 No - lnc-C9orf92-3:1 No - lnc-SNAPC3-5:1 No - lnc-C9orf92-4:3 Yes chrX:16118067-16148977 lnc-CNTLN-6:1 Yes chrX:16118067-16148977 lnc-BNC2-3:1 No - lnc-SH3GL2-3:1 No - lnc-ELAVL2-5:1 No - lnc-DMRTA1-25:1 No - lnc-PAX5-7:1 Yes chr3L:16845386-16852350 lnc-GRHPR-5:1 Yes chr3L:16845386-16852350 lnc-ZBTB5-6:1 Yes chr3L:16845386-16852350 lnc-GRHPR-4:1 Yes chr3L:16845386-16852350 lnc-RFK-4:1 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-GCNT1-5:1 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-KANK4-5:1 Yes chr2L:94739-102086 lnc-ANGPTL3-3:1 Yes chr2L:94739-102086 lnc-GNAQ-4:1 No - lnc-CEP78-3:1 No - lnc-GNAQ-9:1 No - lnc-PSAT1-1:1 No - lnc-TLE1-10:1 No - lnc-TLE4-9:1 No - lnc-RC3H2-3:1 Yes chr3L:15608707-15610386 lnc-OR1K1-1:1 Yes chr3L:15608707-15610386 lnc-KANK4-6:1 Yes chr2L:94739-102086 lnc-ANGPTL3-4:1 Yes chr2L:94739-102086 lnc-NR5A1-3:1 Yes chrX:1941940-2007956 lnc-ADGRD2-4:1 Yes chrX:1941940-2007956 lnc-NR5A1-4:1 Yes chrX:1941940-2007956 lnc-ADGRD2-5:1 Yes chrX:1941940-2007956 lnc-NR5A1-8:2 Yes chrX:1941940-2007956 lnc-OLFML2A-3:1 Yes chrX:1941940-2007956 lnc-UCK1-4:1 Yes chrX:6780790-6803593 lnc-PRRT1B-2:1 Yes chrX:6780790-6803593 lnc-FAM170B-3:1 No - lnc-WDFY4-5:1 No - lnc-FAM170B-2:1 No - lnc-WDFY4-6:1 No - lnc-DUSP13-1:1 Yes chrX:18900410-18911843 lnc-KAT6B-1:1 Yes chrX:18900410-18911843 lnc-ZNF503-4:1 No - lnc-LRMDA-2:1 No - lnc-ZNF503-7:1 Yes chr3R:26989035-26989852 lnc-VDAC2-4:1 Yes chr3R:26989035-26989852 lnc-ZNF503-8:1 Yes chr3R:26989035-26989852 lnc-VDAC2-6:1 Yes chr3R:26989035-26989852 lnc-ZNF503-9:1 Yes chr3R:26989035-26989852 lnc-VDAC2-7:1 Yes chr3R:26989035-26989852 lnc-NDUFB8-9:1 No - lnc-HIF1AN-1:1 No - lnc-NDUFB8-3:1 No - lnc-HIF1AN-2:1 No - lnc-NDUFB8-10:1 No - lnc-HIF1AN-3:1 No - lnc-NDUFB8-11:1 No - lnc-HIF1AN-5:1 No - lnc-NDUFB8-12:1 No - lnc-PAX2-4:1 No - lnc-NDUFB8-7:1 No - lnc-PAX2-3:1 No - lnc-CASZ1-2:1 Yes chr3L:20778799-20780378 lnc-CENPS-CORT-5:1 Yes chr3L:20778799-20780378 lnc-SELENOF-12:1 No - lnc-HS2ST1-1:1 No - lnc-MRPL43-4:1 Yes chr4:1088798-1113317 lnc-SLF2-3:1 Yes chr4:1088798-1113317 lnc-MRPL43-3:1 Yes chr4:1088798-1113317 lnc-SLF2-2:1 Yes chr4:1088798-1113317 lnc-LBX1-4:1 No - lnc-TLX1-4:1 No - lnc-LBX1-6:1 No - lnc-BTRC-7:1 No - lnc-LBX1-7:1 No - lnc-BTRC-3:1 No - lnc-POLL-7:1 Yes chr3R:21119252-21127485 lnc-DPCD-8:1 Yes chr3R:21119252-21127485 lnc-POLL-6:1 Yes chr3R:21119252-21127485 lnc-DPCD-7:1 Yes chr3R:21119252-21127485 lnc-POLL-5:1 Yes chr3R:21119252-21127485 lnc-DPCD-6:1 Yes chr3R:21119252-21127485 lnc-POLL-4:1 Yes chr3R:21119252-21127485 lnc-DPCD-5:1 Yes chr3R:21119252-21127485 lnc-POLL-2:1 Yes chr3R:21119252-21127485 lnc-DPCD-4:1 Yes chr3R:21119252-21127485 lnc-GTF2B-11:1 No - lnc-PKN2-6:1 No - lnc-ZDHHC6-7:1 Yes chr3L:691486-692919 lnc-ACSL5-2:1 Yes chr3L:691486-692919 lnc-RAB11FIP2-7:1 No - lnc-NANOS1-9:1 No - lnc-RAB11FIP2-8:2 No - lnc-NANOS1-8:1 No - lnc-IKZF5-5:1 No - lnc-ACADSB-1:1 No - lnc-IKZF5-3:1 No - lnc-ACADSB-2:1 No - lnc-CTBP2-5:1 No - lnc-ZRANB1-6:1 No - lnc-EBF3-13:1 Yes chr3R:6658806-6660100 lnc-GLRX3-12:1 Yes chr3R:6658806-6660100 lnc-EBF3-9:1 No - lnc-MGMT-2:2 No - lnc-RIC3-3:1 Yes chrX:18515428-18572809 lnc-TUB-6:1 Yes chrX:18515428-18572809 lnc-RIC3-4:1 Yes chrX:18515428-18572809 lnc-TUB-7:1 Yes chrX:18515428-18572809 lnc-IMMP1L-2:1 Yes chr2L:5524139-5525809 lnc-DNAJC24-3:1 Yes chr2L:5524139-5525809 lnc-PAX6-8:1 Yes chr2L:5524139-5525809 lnc-DNAJC24-5:1 Yes chr2L:5524139-5525809 lnc-PAX6-7:1 Yes chr2L:5524139-5525809 lnc-DNAJC24-4:2 Yes chr2L:5524139-5525809 lnc-PAX6-6:1 Yes chr2L:5524139-5525809 lnc-DNAJC24-7:1 Yes chr2L:5524139-5525809 lnc-CADM1-9:1 No - lnc-APOC3-9:1 No - lnc-SNX19-8:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-ADAMTS15-10:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-LMO3-2:1 Yes chrX:15082827-15084017 lnc-DERA-6:1 Yes chrX:15082827-15084017 lnc-BCAT1-2:7 Yes chr4:800436-834393 lnc-LRMP-11:1 Yes chr4:800436-834393 lnc-ABCD2-3:1 No - lnc-LRRK2-2:1 No - lnc-FIGNL2-11:2 Yes chr2R:8952339-8962796 lnc-GRASP-1:1 Yes chr2R:8952339-8962796 lnc-ALDH1L2-1:3 No - lnc-WASHC4-1:2 No - lnc-KLHL1-3:1 No - lnc-BORA-22:1 No - lnc-KLHL1-5:1 No - lnc-BORA-21:1 No - lnc-PLPPR5-6:2 Yes chrX:9196808-9201820 lnc-PTBP2-9:1 Yes chrX:9196808-9201820 lnc-KLHL1-6:1 No - lnc-BORA-20:1 No - lnc-DACH1-3:1 No - lnc-BORA-18:1 No - lnc-DACH1-2:1 No - lnc-BORA-17:1 No - lnc-FBXL3-8:1 Yes chrX:15010137-15063429 lnc-SCEL-7:1 Yes chrX:15010137-15063429 lnc-DCT-14:1 Yes chr3L:14632601-14671609 lnc-GPR180-9:1 Yes chr3L:14632601-14671609 lnc-UGGT2-2:1 Yes chr3R:19929277-20008512 lnc-ANKRD10-5:1 No - lnc-ARHGEF7-4:1 No - lnc-GZMB-1:1 Yes chr3L:17421787-17425217 lnc-KHNYN-7:1 Yes chr3L:17421787-17425217 lnc-HENMT1-3:1 No - lnc-NBPF6-6:1 No - lnc-NOVA1-11:1 No - lnc-FOXG1-14:1 No - lnc-NOVA1-14:1 No - lnc-FOXG1-13:1 No - lnc-PRKD1-18:1 No - lnc-FOXG1-10:1 No - lnc-PRKD1-13:1 No - lnc-FOXG1-18:1 No - lnc-PRKD1-12:1 No - lnc-FOXG1-19:1 No - lnc-GPR33-11:1 No - lnc-ARHGAP5-3:1 No - lnc-GPR33-13:1 No - lnc-NPAS3-5:1 No - lnc-EGLN3-5:1 No - lnc-NPAS3-4:1 No - lnc-EGLN3-4:1 No - lnc-NPAS3-2:1 No - lnc-EAPP-4:1 Yes chr2L:8218071-8220741 lnc-SRP54-8:1 Yes chr2L:8218071-8220741 lnc-SNX6-1:1 No - lnc-SRP54-7:1 No - lnc-PPP2R3C-3:1 No - lnc-FAM177A1-4:1 No - lnc-SFTA3-2:1 No - lnc-PAX9-10:1 No - lnc-ATG2B-17:1 No - lnc-C14orf132-2:1 No - lnc-SPATA46-3:1 Yes chr3L:9547220-9596713 lnc-C1orf226-2:1 Yes chr3L:9547220-9596713 lnc-ATG2B-4:1 Yes chr3L:22265806-22266679 lnc-AK7-1:1 Yes chr3L:22265806-22266679 lnc-ATG2B-7:1 No - lnc-PAPOLA-3:1 No - lnc-NOP10-1:1 Yes chr2R:23907654-23925066 lnc-NUTM1-2:1 Yes chr2R:23907654-23925066 lnc-GOLGA8A-4:1 No - lnc-NUTM1-4:1 No - lnc-GJD2-2:1 No - lnc-NUTM1-13:1 No - lnc-PDCD7-2:1 Yes chr3R:19897372-19903689 lnc-KBTBD13-2:1 Yes chr3R:19897372-19903689 lnc-SPATA46-2:1 Yes chr3L:9547220-9596713 lnc-C1orf226-1:1 Yes chr3L:9547220-9596713 lnc-CALML4-6:1 No - lnc-SKOR1-3:1 No - lnc-RGMA-16:1 No - lnc-MCTP2-10:1 No - lnc-ITFG1-3:1 Yes chr2L:8190808-8196918 lnc-LONP2-12:1 Yes chr2L:8190808-8196918 lnc-ABCC11-2:1 No - lnc-PHKB-8:1 No - lnc-N4BP1-2:1 Yes chrX:2708684-2711668 lnc-LONP2-7:1 Yes chrX:2708684-2711668 lnc-CASZ1-1:1 Yes chr3L:20778799-20780378 lnc-CENPS-CORT-7:1 Yes chr3L:20778799-20780378 lnc-BRD7-4:1 Yes chrX:8560322-8570159 lnc-ADCY7-4:1 Yes chrX:8560322-8570159 lnc-SALL1-10:1 No - lnc-CYLD-11:1 No - lnc-TOX3-5:2 No - lnc-HNRNPA1P48-14:1 No - lnc-TOX3-9:1 No - lnc-CHD9-13:1 No - lnc-RPGRIP1L-2:1 No - lnc-RBL2-5:1 No - lnc-CFAP20-1:2 No - lnc-MMP15-3:1 No - lnc-SLC30A1-2:1 No - lnc-TRAF5-3:2 No - lnc-CCL1-9:1 No - lnc-CCL2-11:1 No - lnc-CCL1-6:1 No - lnc-CCL2-10:1 No - lnc-CCL1-5:1 No - lnc-CCL2-9:1 No - lnc-KANSL1-5:1 Yes chr3R:27639886-27656996 lnc-STH-5:1 Yes chr3R:27639886-27656996 lnc-PTPN14-8:1 No - lnc-PROX1-4:1 No - lnc-NPC1-5:1 No - lnc-RIOK3-4:1 No - lnc-NPC1-4:1 No - lnc-RIOK3-2:1 No - lnc-NPC1-3:1 No - lnc-RIOK3-1:1 No - lnc-ANKRD29-2:1 Yes chrX:20934869-20939503 lnc-OSBPL1A-8:1 No - lnc-HRH4-10:1 No - lnc-ZNF521-3:1 No - lnc-HRH4-14:1 No - lnc-DSC2-2:1 No - lnc-DSG1-10:1 No - lnc-ZSCAN30-4:1 No - lnc-MAPRE2-1:1 No - lnc-OPN3-3:1 Yes chrY:2273422-2487777 lnc-EXO1-6:1 Yes chrY:2273422-2487777 lnc-INO80C-3:1 No - lnc-GALNT1-3:1 No - lnc-RPRD1A-4:1 No - lnc-C18orf21-3:1 No - lnc-SLC39A6-4:1 Yes chrX:20429675-20433210 lnc-ELP2-1:2 Yes chrX:20429675-20433210 lnc-TPGS2-4:1 Yes chr3L:8753619-8798719 lnc-KIAA1328-6:1 Yes chr3L:8753619-8798719 lnc-EPG5-6:1 No - lnc-SLC14A1-7:1 No - lnc-MBD2-4:1 No - lnc-DCC-4:1 No - lnc-CBLN2-7:1 Yes chrX:13445903-13527282 lnc-TIMM21-18:1 Yes chrX:13445903-13527282 lnc-CBLN2-8:1 Yes chrX:13445903-13527282 lnc-TIMM21-17:1 Yes chrX:13445903-13527282 lnc-CBLN2-9:1 Yes chrX:13445903-13527282 lnc-TIMM21-16:1 Yes chrX:13445903-13527282 lnc-CBLN2-10:1 Yes chrX:13445903-13527282 lnc-TIMM21-15:1 Yes chrX:13445903-13527282 lnc-NETO1-4:1 No - lnc-TIMM21-14:1 No - lnc-NETO1-5:1 No - lnc-TIMM21-13:1 No - lnc-SCGB2B2-129:1 No - lnc-ZNF302-2:1 No - lnc-SCGB2B2-10:2 No - lnc-ZNF792-4:2 No - lnc-ZNF30-4:1 No - lnc-ZNF792-3:1 No - lnc-ZNF30-5:1 No - lnc-ZNF792-2:3 Yes chr2R:7540111-7564435 lnc-FAM187B-1:1 No - lnc-FXYD5-1:1 No - lnc-PRODH2-3:1 Yes chr2L:19774874-19791882 lnc-ALKBH6-2:1 No - lnc-SDHAF1-1:1 No - lnc-THAP8-2:1 No - lnc-WDR62-1:1 No - lnc-PTGIR-1:1 No - lnc-CALM3-3:1 No - lnc-LARGE1-6:1 No - lnc-ISX-10:1 No - lnc-PCYT1B-1:1 Yes chr3R:21666562-21671750 lnc-PDK3-3:1 Yes chr3R:21666562-21671750 lnc-PCYT1B-2:1 Yes chr3R:21666562-21671750 lnc-PDK3-4:1 Yes chr3R:21666562-21671750 lnc-PCYT1B-3:1 Yes chr3R:21666562-21671750 lnc-PDK3-5:1 Yes chr3R:21666562-21671750 lnc-PCYT1B-4:1 Yes chr3R:21666562-21671750 lnc-PDK3-6:1 Yes chr3R:21666562-21671750 lnc-PCYT1B-5:1 Yes chr3R:21666562-21671750 lnc-PDK3-7:1 Yes chr3R:21666562-21671750 lnc-PCYT1B-6:1 Yes chr3R:21666562-21671750 lnc-PDK3-8:1 Yes chr3R:21666562-21671750 lnc-ARX-5:1 Yes chr3R:21666562-21671750 lnc-PDK3-9:1 Yes chr3R:21666562-21671750 lnc-ARX-4:1 Yes chr3R:21666562-21671750 lnc-PDK3-10:1 Yes chr3R:21666562-21671750 lnc-ARX-3:1 Yes chr3R:21666562-21671750 lnc-PDK3-11:1 Yes chr3R:21666562-21671750 lnc-ARX-2:1 Yes chr3R:21666562-21671750 lnc-PDK3-12:1 Yes chr3R:21666562-21671750 lnc-CMPK2-25:1 No - lnc-RNF144A-7:1 No - lnc-ARX-6:1 No - lnc-POLA1-7:1 No - lnc-CXCR3-14:1 Yes chr3R:6646889-6656048 lnc-OGT-2:1 Yes chr3R:6646889-6656048 lnc-HMGN5-5:1 No - lnc-POU3F4-4:1 No - lnc-CXorf66-2:1 Yes chrX:16405509-16414651 lnc-F9-6:1 Yes chrX:16405509-16414651 lnc-SATB1-7:1 Yes chr3R:13269137-13272011 lnc-PLCL2-9:1 Yes chr3R:13269137-13272011 lnc-DFFA-5:1 Yes chr3L:11513705-11518904 lnc-PEX14-4:1 Yes chr3L:11513705-11518904 lnc-FANCL-7:1 No - lnc-VRK2-12:1 No - lnc-BCL11A-15:1 No - lnc-VRK2-20:1 No - lnc-BCL11A-14:1 No - lnc-PAPOLG-11:1 No - lnc-BCL11A-13:1 No - lnc-PAPOLG-10:1 No - lnc-BCL11A-12:1 No - lnc-PAPOLG-8:1 No - lnc-BCL11A-11:1 No - lnc-PAPOLG-7:1 No - lnc-DFFA-7:1 Yes chr3L:11513705-11518904 lnc-PEX14-6:1 Yes chr3L:11513705-11518904 lnc-BCL11A-10:1 No - lnc-PAPOLG-6:1 No - lnc-BCL11A-6:1 No - lnc-PAPOLG-5:1 No - lnc-WDPCP-8:1 Yes chr3L:13011976-13015332 lnc-OTX1-6:1 Yes chr3L:13011976-13015332 lnc-SFXN5-3:1 Yes chr3R:21105046-21107972 lnc-SPR-2:1 Yes chr3R:21105046-21107972 lnc-MFSD9-15:1 No - lnc-TMEM182-9:1 No - lnc-LRP1B-11:1 No - lnc-KYNU-1:1 No - lnc-GTDC1-24:1 No - lnc-KYNU-8:2 No - lnc-DFFA-8:1 Yes chr3L:11513705-11518904 lnc-PEX14-7:1 Yes chr3L:11513705-11518904 lnc-GTDC1-16:1 No - lnc-KYNU-5:1 No - lnc-GTDC1-27:7 No - lnc-KYNU-9:1 No - lnc-GTDC1-27:6 No - lnc-KYNU-10:1 No - lnc-GTDC1-11:1 No - lnc-ARHGAP15-7:1 No - lnc-ZEB2-15:1 Yes chrX:15853421-15854970 lnc-ARHGAP15-10:1 Yes chrX:15853421-15854970 lnc-ZEB2-12:1 Yes chrX:15853421-15854970 lnc-ARHGAP15-11:1 Yes chrX:15853421-15854970 lnc-ZEB2-11:1 Yes chrX:15853421-15854970 lnc-ARHGAP15-12:1 Yes chrX:15853421-15854970 lnc-C1orf127-2:1 Yes chr3L:11513705-11518904 lnc-PEX14-8:1 Yes chr3L:11513705-11518904 lnc-ZEB2-10:1 Yes chrX:15853421-15854970 lnc-ARHGAP15-13:1 Yes chrX:15853421-15854970 lnc-ZEB2-21:1 No - lnc-ACVR2A-13:1 No - lnc-NR4A2-12:1 No - lnc-KCNJ3-7:11 No - lnc-NR4A2-5:1 No - lnc-GPD2-4:1 No - lnc-NR4A2-6:1 Yes chr2R:7535919-7538297 lnc-GALNT5-5:1 Yes chr2R:7535919-7538297 lnc-RBMS1-6:1 No - lnc-TANK-5:1 No - lnc-RBMS1-8:1 No - lnc-TANK-2:1 No - lnc-C1orf127-1:1 Yes chr3L:11513705-11518904 lnc-PEX14-9:1 Yes chr3L:11513705-11518904 lnc-DPP4-4:1 Yes chr2L:7223328-7249343 lnc-GCA-7:1 Yes chr2L:7223328-7249343 lnc-FIGN-4:1 No - lnc-GCA-8:1 No - lnc-FIGN-2:1 No - lnc-GCA-9:1 No - lnc-TLK1-9:1 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-SP5-2:1 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-DLX2-6:1 Yes chr3R:30445635-30455867 lnc-DYNC1I2-3:1 Yes chr3R:30445635-30455867 lnc-DLX2-8:3 Yes chr3R:30445635-30455867 lnc-SRGAP3-4:1 Yes chr3L:14002127-14020148 lnc-SATB1-3:1 Yes chr3R:13269137-13272011 lnc-PLCL2-11:1 Yes chr3R:13269137-13272011 lnc-IFT80-5:1 No - lnc-IL12A-2:1 No - lnc-CLDN11-9:1 No - lnc-SP8-3:1 No - lnc-ABCB5-5:1 No - lnc-TMEM176B-2:1 No - lnc-GIMAP5-4:1 No - lnc-KCNMA1-7:1 Yes chr3R:26989035-26989852 lnc-VDAC2-9:1 Yes chr3R:26989035-26989852 lnc-SLIT1-1:1 Yes chr3R:21949114-22014539 lnc-FIGNL2-12:2 Yes chr2R:8952339-8962796 lnc-ACVRL1-2:1 Yes chr2R:8952339-8962796 lnc-KRT81-5:1 No - lnc-RSL24D1-3:1 No - lnc-UNC13C-3:1 No - lnc-CBLN1-1:1 No - lnc-C16orf78-6:1 No - lnc-TBX4-3:1 No - lnc-GTDC1-13:1 No - lnc-KYNU-11:1 No - lnc-OR4F29-11:5 No - lnc-OR4F29-4:1 No - lnc-OR4F16-9:1 No - lnc-MIB2-3:1 No - lnc-SKI-5:1 Yes chr2R:14944458-14962969 lnc-HES5-3:3 No - lnc-AJAP1-9:2 No - lnc-DFFB-7:1 No - lnc-RNF207-3:1 Yes chr3L:19882051-19910215 lnc-CLSTN1-7:2 Yes chr2R:19452504-19455527 lnc-FBXO44-2:1 No - lnc-DRAXIN-2:1 Yes chr3R:5588873-5589703 lnc-CELA2B-3:1 Yes chr3L:25798441-26014112 lnc-NBPF1-5:1 No - lnc-KLHDC7A-5:1 No - lnc-UBR4-2:1 Yes chr3R:7903030-7907363 lnc-PLA2G2C-4:2 No - lnc-ECE1-1:1 Yes chr4:915297-930715 lnc-NBPF3-8:1 Yes chr4:915297-930715 lnc-LDLRAD2-2:4 Yes chrX:2470460-2545410 lnc-C1QB-2:1 No - lnc-RPL11-6:1 Yes chr3R:21620304-21660871 lnc-ID3-5:1 No - lnc-UBXN11-2:1 No - lnc-MED18-1:1 Yes chr3L:3714826-3806459 lnc-MECR-4:2 No - lnc-ZCCHC17-12:1 No - lnc-TMEM54-2:1 No - lnc-SFPQ-1:5 No - lnc-TFAP2E-7:1 No - lnc-PPT1-2:1 No - lnc-PPCS-2:1 No - lnc-C1orf228-5:1 Yes chr3R:22724884-22726414 lnc-C1orf228-4:1 Yes chr3R:22724884-22726414 lnc-PDZK1IP1-4:1 No - lnc-LRRC42-2:1 No - lnc-FYB2-3:2 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-C8A-7:1 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-OMA1-2:1 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-TACSTD2-5:1 No - lnc-HOOK1-5:2 Yes chr3L:4022700-4026011 lnc-C1orf87-7:1 No - lnc-DOCK7-3:1 No - lnc-DOCK7-5:1 No - lnc-ITGB3BP-8:1 Yes chr2L:10251843-10254686 lnc-UBE2U-2:1 Yes chr2L:10251843-10254686 lnc-JAK1-5:1 No - lnc-GADD45A-8:1 No - lnc-FPGT-9:2 No - lnc-FPGT-7:1 No - lnc-PRKACB-7:2 No - lnc-GTF2B-9:1 No - lnc-GBP5-7:1 No - lnc-ALG14-9:1 No - lnc-SASS6-4:1 Yes chr2R:16017737-16024627 lnc-SLC30A7-8:1 No - lnc-AMY1B-8:1 No - lnc-ALX3-5:1 Yes chr3R:18165442-18167273 lnc-RAP1A-2:1 Yes chr3R:30134856-30149606 lnc-RAP1A-1:1 No - lnc-ADORA3-7:1 No - lnc-FAM19A3-6:3 No - LINC01356:1 No - lnc-SLC16A1-2:8 No - lnc-RSBN1-3:3 Yes chr2R:6741899-6746141 lnc-NUDT4B-1:13 No - lnc-FAM72D-3:2 No - lnc-FAM72D-2:1 No - lnc-NBPF11-1:11 No - lnc-NUDT4B-1:12 No - lnc-IQGAP3-2:4 Yes chr2R:9913496-9958858 lnc-FCRL3-2:1 No - lnc-CD1A-1:3 No - lnc-FCER1A-1:1 No - lnc-HSD17B7-3:1 No - lnc-PBX1-6:1 No - lnc-FAM78B-5:1 No - lnc-DARS2-2:1 No - lnc-CACYBP-2:1 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-FAM20B-2:1 Yes chr2R:16783671-16792472 lnc-ZNF648-5:1 Yes chrX:11931280-11985087 lnc-DHX9-4:1 No - lnc-COLGALT2-1:2 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-COLGALT2-1:3 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-ZBTB41-1:3 Yes chr2R:10894459-10897222 lnc-ZBTB41-3:1 Yes chr3R:24295078-24314541 lnc-PTPRC-10:1 No - lnc-ZNF281-5:1 No - lnc-CSRP1-3:1 No - lnc-LAX1-4:1 Yes chr4:328193-358917 lnc-ETNK2-2:1 No - lnc-PLXNA2-4:1 No - lnc-CAMK1G-6:1 No - lnc-KCNH1-4:1 Yes chr3L:3162180-3163852 lnc-RD3-8:1 Yes chrX:14955477-15009989 lnc-ESRRG-1:1 No - lnc-LYPLAL1-10:2 No - lnc-MARC2-2:1 Yes chr2R:9839776-9841163 TAF1A-AS1:8 No - lnc-WDR26-1:5 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-ITPKB-1:1 No - lnc-CDC42BPA-2:1 Yes chrX:12898768-12901114 lnc-CDC42BPA-4:1 No - lnc-SIPA1L2-7:1 No - lnc-SIPA1L2-3:2 No - lnc-MAP10-5:2 No - lnc-MAP10-4:2 No - lnc-EFCAB2-7:1 Yes chr2L:7844905-7855475 lnc-ADARB2-7:1 No - lnc-PFKP-29:1 No - CALML3-AS1:15 No - lnc-IL2RA-7:1 Yes chrX:12432224-12453650 PRKCQ-AS1:54 No - LINC00707:9 No - lnc-KIN-8:1 No - lnc-USP6NL-15:4 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-USP6NL-13:1 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-ECHDC3-6:1 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-ECHDC3-3:1 No - lnc-UPF2-3:1 Yes chrX:8070244-8075466 lnc-NUDT5-2:1 No - lnc-CAMK1D-2:1 No - lnc-VIM-2:1 No - lnc-ARL5B-4:1 No - lnc-NEBL-3:1 No - lnc-GPR158-4:2 No - lnc-LYZL1-11:1 Yes chr3L:2377655-2499226 lnc-CREM-5:1 Yes chrX:17160006-17200728 lnc-RET-3:1 No - lnc-CXCL12-6:1 No - lnc-DEPP1-5:1 No - lnc-FRMPD2-3:7 No - lnc-FAM25C-7:1 No - lnc-CSTF2T-2:2 Yes chr2L:3622074-3656953 lnc-FAM13C-1:1 No - lnc-JMJD1C-5:1 Yes chr2R:22925107-22932044 lnc-FAM149B1-3:1 Yes chr3L:2263581-2265857 lnc-SAMD8-2:1 No - lnc-LRMDA-6:1 Yes chr3R:26989035-26989852 lnc-DLG5-3:1 Yes chr3R:24662491-24711595 lnc-RPS24-14:1 No - lnc-RPS24-8:2 Yes chr2L:11508399-11517081 lnc-RPS24-9:1 No - lnc-ZCCHC24-4:2 No - lnc-NUTM2E-1:1 No - lnc-RGR-2:1 No - lnc-GRID1-10:1 No - lnc-CCSER2-7:1 No - lnc-GLUD1-10:1 No - lnc-CH25H-1:1 Yes chr2L:10643971-10645891 lnc-RPP30-10:1 No - lnc-PPP1R3C-3:1 No - lnc-NOC3L-7:1 No - lnc-PDLIM1-3:1 No - ENTPD1-AS1:31 No - lnc-LCOR-5:1 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-EXOSC1-2:1 Yes chrX:13619276-13624408 lnc-GOT1-1:1 No - lnc-NKX2-3-2:1 No - OLMALINC:2 Yes chr3R:30194790-30196228 lnc-NT5C2-2:1 No - lnc-NEURL1-2:1 No - lnc-ITPRIP-6:1 No - lnc-FAM160B1-4:1 No - lnc-PLPP4-6:1 No - lnc-GPR26-9:1 No - FAM53B-AS1:1 Yes chr2L:2978411-2979288 lnc-EDRF1-5:2 No - lnc-PTPRE-3:1 No - lnc-EBF3-8:1 Yes chr2R:14772650-14807061 lnc-GLRX3-7:1 No - lnc-PPP2R2D-7:1 No - lnc-STK32C-5:1 No - lnc-INPP5A-1:1 No - lnc-POLR2L-2:1 No - lnc-MUC5B-3:1 No - lnc-KRTAP5-5-2:1 No - lnc-CYB5R2-3:13 No - lnc-OR5P3-2:1 No - lnc-TUB-2:1 Yes chr2R:21101928-21123704 lnc-SBF2-4:1 No - lnc-BTBD10-8:1 Yes chrX:15804370-15827682 lnc-SPTY2D1OS-2:1 Yes chr3L:6259105-6262694 lnc-GAS2-6:1 No - lnc-FIBIN-4:1 Yes chr3L:11984906-11990505 lnc-KCNA4-5:1 No - lnc-ELP4-8:1 No - lnc-C11orf91-4:1 No - lnc-FJX1-2:1 No - lnc-COMMD9-5:1 No - lnc-TRAF6-3:1 No - lnc-ALX4-11:1 No - lnc-ALX4-10:1 No - lnc-PRDM11-8:1 No - lnc-OR5AR1-1:1 No - lnc-STX3-3:1 No - lnc-MS4A7-1:3 No - lnc-TKFC-1:1 No - lnc-HRASLS5-3:1 Yes chr2R:19979242-19984895 lnc-HRASLS5-1:1 No - lnc-CDC42BPG-1:1 Yes chr2R:24092079-24098636 lnc-SLC25A45-4:1 No - lnc-GAL-3:1 Yes chr2R:10469473-10478567 lnc-TPCN2-7:1 No - lnc-TPCN2-8:1 No - lnc-CTTN-8:1 Yes chr2L:6723903-6732766 lnc-KLHL35-3:1 No - lnc-DGAT2-4:1 Yes chr2L:13286777-13289556 lnc-USP35-11:1 No - lnc-FAM181B-6:1 No - lnc-DDIAS-5:2 No - lnc-SLC36A4-6:1 Yes chr3L:20005301-20024607 lnc-CEP295-4:1 No - lnc-PIWIL4-6:1 No - lnc-CWC15-4:1 No - lnc-CEP126-1:1 No - lnc-AASDHPPT-4:1 Yes chr3L:6624032-6635059 lnc-KBTBD3-3:1 No - lnc-ZC3H12C-4:1 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-ARHGAP20-2:1 No - lnc-C11orf53-3:1 No - lnc-ALG9-1:1 Yes chr2L:8366038-8370090 lnc-SIK2-2:1 No - lnc-NECTIN1-3:1 No - lnc-TRIM29-8:1 Yes chr3R:20860187-20866231 lnc-BLID-7:1 No - lnc-BLID-6:1 No - lnc-BSX-4:1 No - lnc-JHY-1:1 No - lnc-JHY-6:1 No - lnc-PUS3-3:1 No - lnc-PUS3-3:2 No - lnc-ST3GAL4-1:1 Yes chrX:2740384-3134532 lnc-ST3GAL4-3:2 Yes chrX:2740384-3134532 lnc-ST3GAL4-6:1 Yes chrX:2740384-3134532 lnc-ETS1-6:1 No - lnc-ETS1-5:1 No - lnc-BARX2-3:1 Yes chr2L:19774874-19791882 lnc-TMEM45B-1:1 No - lnc-SNX19-5:1 No - lnc-JAM3-6:1 Yes chr2L:4283148-4323781 lnc-TEAD4-5:1 No - lnc-FOXM1-3:1 No - lnc-CRACR2A-8:2 No - lnc-AKAP3-8:1 Yes chr2L:14184478-14234126 lnc-ANO2-8:1 No - lnc-CDCA3-3:1 No - lnc-SLC2A3-1:1 No - lnc-CLEC2B-1:2 No - lnc-ETV6-5:1 No - lnc-ETV6-2:1 No - lnc-DDX47-1:1 No - lnc-GPRC5A-4:1 No - lnc-GPRC5A-2:15 No - lnc-ETNK1-12:1 No - lnc-SSPN-5:1 Yes chr3R:25661795-25665640 lnc-TSPAN11-10:1 Yes chr3L:8116179-8121579 lnc-CAPRIN2-2:14 Yes chr3L:17891820-17895862 lnc-SINHCAF-2:1 No - lnc-ALG10B-8:1 No - lnc-ALG10B-9:1 No - lnc-OR10AD1-1:1 No - lnc-ORMDL2-3:1 No - lnc-RNF41-1:1 No - lnc-MYO1A-2:1 No - LINC02454:23 No - lnc-HMGA2-1:1 No - lnc-LLPH-5:1 No - lnc-IFNG-5:1 No - lnc-CSRP2-1:1 No - lnc-ZDHHC17-9:1 No - lnc-OTOGL-4:1 Yes chr2L:2772327-2799979 lnc-PAWR-12:1 Yes chr2L:2772327-2799979 lnc-CCDC59-7:1 No - lnc-C12orf50-7:1 No - lnc-TMTC3-8:1 No - lnc-C12orf74-17:2 No - lnc-BTG1-4:1 No - lnc-SOCS2-8:1 No - lnc-NEDD1-6:1 No - lnc-IKBIP-10:1 No - lnc-PARPBP-1:1 Yes chr3R:25247658-25249100 lnc-APPL2-4:1 No - lnc-CMKLR1-2:1 No - lnc-TPCN1-2:1 No - lnc-WSB2-3:1 No - lnc-TAOK3-13:1 No - lnc-SCARB1-4:1 Yes chrX:12684203-12742618 lnc-DHX37-17:1 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-AACS-8:1 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-DHX37-18:1 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-DHX37-19:1 Yes chrX:6225647-6236218 LINC02347:23 No - lnc-TMEM132B-17:1 No - lnc-SLC15A4-23:1 No - lnc-TMEM132C-9:1 No - lnc-SLC15A4-16:1 No - lnc-SLC15A4-20:1 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-FZD10-6:1 No - lnc-STX2-8:1 Yes chrX:11144852-11148716 lnc-SFSWAP-8:1 No - lnc-MPHOSPH8-15:1 No - lnc-EEF1AKMT1-1:3 Yes chr2L:6069790-6070686 lnc-FGF9-14:1 No - lnc-C1QTNF9B-3:1 Yes chr3L:277437-305292 lnc-NUP58-4:1 Yes chr2R:23389009-23396680 lnc-GPR12-3:1 No - lnc-FLT3-2:3 Yes chr2L:8220980-8239878 lnc-SLC46A3-4:2 No - MTUS2-AS2:5 No - lnc-SLC7A1-7:1 Yes chrX:15849731-15853175 lnc-NBEA-8:1 No - lnc-CCNA1-1:1 Yes chr3L:11826719-11833578 lnc-STOML3-9:1 No - lnc-COG6-7:1 No - lnc-COG6-5:1 No - lnc-COG6-6:1 No - lnc-EPSTI1-6:1 No - lnc-ENOX1-2:1 No - lnc-GPALPP1-5:1 No - lnc-HTR2A-2:1 No - lnc-CAB39L-10:1 No - lnc-PCDH17-2:1 No - lnc-PCDH9-10:1 No - lnc-DIS3-1:1 No - lnc-ACOD1-3:1 No - lnc-SLAIN1-7:1 No - lnc-NDFIP2-20:2 No - lnc-SLITRK5-23:2 No - lnc-GPC5-10:2 No - lnc-GPC5-6:1 Yes chr3L:14632601-14671609 lnc-TGDS-2:1 No - lnc-MBNL2-2:1 No - lnc-RNF113B-8:1 Yes chr3R:4649176-4654624 lnc-TMTC4-3:1 Yes chrX:14266367-14277416 lnc-DAOA-9:3 No - lnc-ARGLU1-1:1 No - lnc-COL4A2-6:1 No - lnc-SOX1-6:1 No - lnc-CCNB1IP1-5:1 No - lnc-TMEM253-4:1 No - lnc-SALL2-2:1 No - lnc-FOXG1-15:1 No - lnc-NOVA1-12:1 No - lnc-PRKD1-16:1 No - lnc-G2E3-5:1 No - lnc-NKX2-8-4:1 Yes chrX:750347-758719 lnc-FSCB-8:1 No - lnc-RPS29-4:1 No - lnc-RPS29-3:1 No - lnc-GMFB-2:1 Yes chr3L:8990317-8997989 lnc-DAAM1-10:2 No - lnc-GPR135-2:1 Yes chrX:1289713-1322362 lnc-C14orf39-1:1 No - lnc-MTHFD1-3:1 Yes chr3R:27246403-27247992 lnc-ZBTB25-6:1 No - lnc-FNTB-5:1 Yes chrX:11706575-11709951 lnc-ATP6V1D-7:1 Yes chrX:255674-258469 lnc-CCDC177-5:1 Yes chrX:16539153-16540852 lnc-FAM161B-2:1 No - lnc-VRTN-1:1 No - lnc-FOS-1:4 No - lnc-TGFB3-7:1 No - lnc-TGFB3-6:1 No - lnc-SNW1-7:1 Yes chr2R:24611703-24613906 lnc-CEP128-6:1 No - LINC02328:58 No - lnc-SPATA7-2:1 Yes chr2L:6332881-6338671 lnc-EML5-2:1 No - lnc-TDP1-6:4 Yes chrX:7682338-7709385 lnc-TDP1-2:1 No - lnc-PPP4R3A-1:2 No - lnc-CPSF2-3:1 No - lnc-SERPINA12-3:1 No - lnc-SERPINA3-4:1 No - TCL6:10 No - lnc-ATG2B-18:1 No - lnc-ATG2B-19:1 No - lnc-CCNK-3:1 No - lnc-EML1-5:1 Yes chr2R:19141632-19163705 lnc-DLK1-35:106 No - lnc-DLK1-35:130 No - lnc-CINP-1:1 No - lnc-CDC42BPB-3:1 No - lnc-CDC42BPB-2:1 No - lnc-AMN-2:1 Yes chr2L:287252-289144 lnc-BAG5-1:1 Yes chr3L:12746616-12750056 lnc-AHNAK2-9:2 Yes chr3R:16099228-16105670 lnc-POTEB3-12:1 No - lnc-GOLGA6L1-1:1 No - lnc-CYFIP1-5:1 No - lnc-GOLGA6L22-1:2 No - lnc-MKRN3-5:2 No - lnc-GABRA5-9:1 Yes chrX:15921955-15924558 lnc-GOLGA8F-8:1 No - lnc-APBA2-4:1 No - lnc-GOLGA8Q-5:1 No - lnc-CHRM5-4:1 No - LINC02252:6 No - lnc-C15orf41-17:1 No - lnc-TMCO5A-3:1 No - lnc-EIF2AK4-6:1 No - lnc-CCDC32-3:1 No - lnc-TMEM87A-2:1 Yes chrX:21600502-21605264 lnc-EPB42-1:2 No - lnc-CEP152-3:1 Yes chr2L:4477462-4614300 lnc-SECISBP2L-1:1 No - lnc-COPS2-2:1 No - lnc-WDR72-4:1 No - lnc-WDR72-6:1 Yes chr4:867824-912331 lnc-PIGB-2:1 Yes chr3R:11430740-11431582 lnc-RFX7-1:1 No - lnc-TCF12-7:1 Yes chr2R:24578247-24579827 lnc-TEX9-4:1 Yes chr2R:15206527-15213634 lnc-AQP9-4:1 No - lnc-LDHAL6B-2:1 No - lnc-FOXB1-7:1 No - lnc-ANXA2-2:3 No - lnc-DAPK2-3:1 Yes chr3R:21887029-21907182 lnc-PLEKHO2-3:1 Yes chr2R:18278198-18357296 lnc-PLEKHO2-4:1 Yes chr2R:18278198-18357296 lnc-C15orf61-3:1 No - lnc-LRRC49-8:1 No - lnc-MYO9A-1:1 No - lnc-NPTN-1:1 No - lnc-RPP25-2:1 Yes chrX:15446179-15449883 lnc-ISL2-3:1 Yes chr2L:18916347-18943960 lnc-TBC1D2B-4:2 No - lnc-ZFAND6-7:1 No - lnc-MESD-5:1 No - lnc-MESD-3:1 Yes chr3R:21567519-21569149 lnc-MESD-6:1 Yes chr3R:21567519-21569149 lnc-KLHL25-12:1 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-KLHL25-17:1 No - lnc-AGBL1-5:1 No - lnc-MRPL46-8:2 No - lnc-SV2B-4:1 Yes chr3R:25216297-25218708 lnc-VPS33B-5:1 Yes chr3R:25216297-25218708 lnc-SLCO3A1-4:1 No - lnc-RGMA-21:1 No - lnc-PDIA2-1:1 Yes chr3R:30022842-30035311 lnc-PRR25-6:1 No - lnc-GNG13-5:1 No - lnc-NDUFB10-2:1 No - lnc-PRSS27-2:17 Yes chrX:1483479-1517615 lnc-ZSCAN10-5:1 No - lnc-SRL-3:1 Yes chr3R:13771495-13779317 lnc-UBALD1-3:1 No - lnc-C16orf72-10:1 No - lnc-TVP23A-4:1 No - lnc-PRM1-5:1 No - lnc-RMI2-2:1 No - lnc-PARN-11:1 No - lnc-ACSM5-4:1 No - lnc-CRYM-6:1 No - lnc-SLC5A11-4:1 Yes chr3R:19905164-19914272 lnc-KDM8-4:1 No - lnc-KDM8-3:1 No - lnc-GSG1L-7:1 Yes chrX:471019-476579 lnc-KCTD13-3:1 No - lnc-ZNF771-1:1 No - lnc-TP53TG3-25:1 No - lnc-SHCBP1-4:1 No - lnc-LONP2-11:1 No - lnc-C16orf78-10:1 No - lnc-SNX20-7:1 Yes chr3L:19003741-19045449 lnc-AKTIP-4:1 Yes chrX:797090-801479 lnc-CDH5-20:1 No - lnc-CDH5-18:1 No - lnc-PDF-1:1 No - lnc-VAC14-3:1 No - lnc-CALB2-4:3 No - lnc-TERF2IP-3:1 No - lnc-MAF-8:1 Yes chr2L:7999670-8004286 lnc-DYNLRB2-5:1 No - lnc-HSBP1-7:1 No - lnc-FAM92B-4:1 Yes chr2L:6774041-6778444 lnc-FAM92B-8:1 No - lnc-GINS2-4:1 No - lnc-IRF8-7:1 No - lnc-MTHFSD-61:1 No - lnc-ZC3H18-1:1 No - lnc-C17orf97-3:8 No - lnc-DPH1-4:1 Yes chr2L:13212335-13215350 lnc-TSR1-3:1 Yes chr3R:25029429-25033465 lnc-TMEM220-2:1 No - lnc-HS3ST3A1-5:1 No - lnc-TEKT3-3:1 No - lnc-EVPLL-2:1 Yes chrX:5913067-5916797 lnc-GRAPL-2:1 No - lnc-GRAPL-7:1 Yes chr3L:7528780-7540012 lnc-LGALS9B-4:1 No - CCDC144NL-AS1:40 No - lnc-TMEM97-3:1 Yes chr3L:7979046-8054147 lnc-CRLF3-8:2 No - lnc-TBC1D29-3:1 No - lnc-MYO1D-7:1 No - lnc-MYO1D-8:1 No - lnc-MYO1D-9:1 No - lnc-CCL1-8:1 No - lnc-CCT6B-3:1 No - lnc-SLC35G3-2:1 No - lnc-SLC35G3-3:1 No - lnc-MED24-5:1 Yes chr2L:19051790-19053681 lnc-PSMC3IP-5:1 Yes chr3R:29131193-29137980 lnc-CCR10-2:1 Yes chr3L:12146519-12156990 lnc-G6PC-2:1 No - lnc-DHX8-4:1 Yes chr3R:24788054-24797955 lnc-ITGA2B-2:1 No - lnc-FMNL1-4:1 No - lnc-MAP3K14-3:6 No - lnc-STH-3:1 Yes chr3R:27639886-27656996 lnc-LRRC37A2-1:1 Yes chr3R:13833497-13837991 lnc-RPRML-5:1 No - lnc-PRR15L-6:1 No - lnc-NFE2L1-1:1 No - lnc-PRAC2-12:1 No - lnc-KIF2B-1:1 No - lnc-MMD-6:1 No - lnc-CCDC182-4:1 Yes chr3R:25516118-25608423 TBX2-AS1:20 No - lnc-STRADA-2:1 No - lnc-RGS9-9:2 No - lnc-RGS9-10:1 No - lnc-NOL11-2:1 Yes chr2R:17695776-17698362 lnc-FAM20A-3:1 No - lnc-KCNJ16-4:2 Yes chrX:13091145-13093986 lnc-ABCA5-10:3 No - lnc-SSTR2-5:1 Yes chr2R:11899517-11901394 lnc-SSTR2-4:1 No - lnc-BTBD17-6:1 No - lnc-RPL38-4:1 No - lnc-KCTD2-1:1 No - lnc-ST6GALNAC2-27:1 No - lnc-SEPT9-5:1 No - lnc-PGS1-7:1 No - lnc-ENGASE-4:1 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-ENPP7-2:1 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-CBX4-2:1 No - lnc-CBX4-3:1 Yes chr2L:10432687-10435656 LINC00470:4 No - DLGAP1-AS1:2 Yes chr2R:5702112-5705439 DLGAP1-AS1:12 Yes chr2R:5702112-5705439 DLGAP1-AS3:3 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-MYOM1-12:1 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-ARHGAP28-9:1 Yes chr3R:27266326-27273273 lnc-PIEZO2-13:1 No - lnc-MPPE1-14:1 Yes chr3R:2554162-3263582 lnc-PTPN2-10:1 No - lnc-RNMT-8:1 No - lnc-MC5R-7:1 No - lnc-ANKRD30B-12:1 No - lnc-CABLES1-4:1 No - lnc-HRH4-16:1 Yes chr2R:14435899-14465881 lnc-NOL4-4:1 No - lnc-ZSCAN30-3:1 No - lnc-CELF4-10:1 Yes chr3L:13521907-13803400 lnc-KIAA1328-10:1 No - lnc-PIK3C3-10:1 No - lnc-RIT2-5:1 Yes chr2R:16107440-16110017 lnc-SETBP1-7:1 No - lnc-EPG5-10:1 No - lnc-SLC14A1-2:1 No - lnc-KATNAL2-8:1 No - lnc-CTIF-6:1 No - lnc-MBD2-6:1 Yes chr2R:12529053-12564184 lnc-MBD2-3:1 No - lnc-PIGN-5:1 No - lnc-CD226-5:1 Yes chrX:7324214-7328806 lnc-SOCS6-13:1 No - lnc-CNDP1-5:1 Yes chr2L:21762314-21795447 lnc-CNDP1-8:1 Yes chr2L:21762314-21795447 lnc-MBP-14:1 No - lnc-TINCR-5:1 No - lnc-ZNF559-ZNF177-3:1 No - lnc-ANO8-1:2 No - lnc-ZNF708-7:1 No - lnc-ZNF708-6:1 No - lnc-ZNF708-8:1 No - lnc-ZNF676-4:1 No - lnc-KCTD15-4:1 Yes chr3L:1876551-1883041 lnc-KCTD15-3:1 Yes chr3L:1876551-1883041 lnc-SCGB2B2-4:3 Yes chr3L:12515059-12520954 LINC01766:16 No - lnc-PRODH2-1:5 No - lnc-ZNF146-2:1 No - lnc-ZNF567-4:1 No - lnc-LRFN1-2:1 No - lnc-EID2B-1:1 No - lnc-LGALS13-1:1 No - lnc-CLC-1:1 No - lnc-BLVRB-2:1 No - lnc-ERICH4-1:1 No - lnc-ERF-1:1 No - lnc-VASP-1:1 Yes chr3R:23927728-23929000 lnc-BICRA-4:1 Yes chr3L:20313632-20316577 lnc-LMTK3-3:1 No - lnc-FAM83E-1:1 No - lnc-MAMSTR-2:1 No - lnc-NAPSA-3:1 Yes chr3L:15984322-15987815 lnc-C19orf48-4:1 No - lnc-KLK2-3:1 No - lnc-VSIG10L-3:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-TFPT-2:2 No - lnc-EPS8L1-4:1 No - lnc-ZNF787-1:1 No - lnc-SMIM17-4:1 No - lnc-SH3YL1-1:15 No - lnc-TMEM18-17:2 No - lnc-TPO-12:1 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-ADI1-3:1 Yes chr3L:12502467-12503894 lnc-RPS7-2:1 Yes chr2R:7931054-7932380 lnc-RNASEH1-9:3 No - LINC01249:8 No - lnc-CMPK2-5:4 No - NRIR:6 No - NRIR:4 No - lnc-ROCK2-8:1 No - lnc-LPIN1-4:2 No - lnc-NTSR2-7:1 No - lnc-NBAS-18:2 No - lnc-DDX1-3:1 Yes chr3L:22263369-22266017 lnc-NBAS-10:1 No - lnc-RHOB-19:2 No - lnc-CENPO-2:2 Yes chr2L:21632587-21647964 lnc-C2orf70-1:1 No - lnc-OST4-9:1 No - lnc-RBKS-6:1 No - lnc-LBH-4:2 No - lnc-LTBP1-4:1 Yes chr3L:17909483-17912565 lnc-CYP1B1-7:4 No - SLC8A1-AS1:1 No - lnc-PKDCC-8:2 No - lnc-SIX2-4:1 No - lnc-EPAS1-1:1 Yes chr3R:30058311-30121798 lnc-ATP6V1E2-7:1 No - lnc-CRIPT-1:5 No - lnc-CRIPT-4:1 Yes chr2L:18138675-18152417 lnc-STPG4-3:7 No - lnc-CALM2-11:1 No - lnc-GPR75-ASB3-2:1 No - lnc-CCDC85A-4:1 Yes chr4:215009-227748 lnc-EFEMP1-4:2 No - MIR4432HG:3 No - lnc-PELI1-6:1 No - lnc-LGALSL-4:3 No - lnc-ETAA1-16:2 No - lnc-MTHFD2-3:1 No - lnc-LRRTM4-8:1 No - lnc-EIF2AK3-1:11 No - lnc-EIF2AK3-1:10 No - lnc-TEKT4-4:1 No - lnc-ZNF2-2:1 No - lnc-ZNF514-2:1 No - lnc-GPAT2-5:1 No - lnc-ANKRD36-13:1 No - lnc-TMEM182-8:1 No - lnc-TMEM182-13:1 No - lnc-TGFBRAP1-20:1 No - lnc-TGFBRAP1-19:5 No - lnc-TGFBRAP1-17:1 No - lnc-TGFBRAP1-15:1 No - MIR4435-2HG:31 No - lnc-BCL2L11-6:4 No - lnc-BCL2L11-6:5 No - lnc-IL37-2:1 No - lnc-IL36G-1:1 No - lnc-SLC35F5-21:1 No - lnc-TMEM185B-9:1 Yes chr3L:328097-356050 lnc-ERCC3-1:1 No - lnc-PRSS40B-2:2 Yes chr3L:6092188-6093313 lnc-ARHGEF4-2:2 No - lnc-GPR39-5:1 No - lnc-GPR39-12:1 No - lnc-ACMSD-6:1 No - lnc-NXPH2-9:1 No - lnc-ARHGAP15-17:1 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-RPRM-7:1 Yes chr2L:5072170-5093592 lnc-NR4A2-11:1 No - lnc-NR4A2-7:1 No - lnc-METTL5-4:84 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-TLK1-8:1 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-DLX2-9:1 Yes chrX:13214409-13258490 lnc-CHN1-41:1 Yes chrX:8276200-8367169 lnc-LNPK-5:1 No - lnc-LNPK-4:1 No - lnc-HOXD13-4:1 No - lnc-EVX2-9:1 No - lnc-MTX2-3:1 No - lnc-RBM45-1:1 Yes chr3L:4283851-4286865 lnc-UBE2E3-4:1 Yes chr2L:10765010-10768006 lnc-ZSWIM2-15:1 No - lnc-SLC39A10-12:1 No - lnc-BOLL-6:1 No - lnc-PLCL1-3:1 No - lnc-SATB2-3:1 No - lnc-INO80D-5:1 No - lnc-NRP2-6:1 No - lnc-KLF7-2:2 Yes chrX:17080423-17087675 lnc-CPS1-2:1 No - lnc-FN1-4:1 No - lnc-TMEM169-6:1 No - lnc-IGFBP5-2:1 Yes chr2L:5070957-5072055 lnc-DIRC3-6:1 No - lnc-ZNF142-5:1 No - lnc-CCDC140-12:1 No - lnc-COL4A4-2:1 No - lnc-TM4SF20-2:1 No - lnc-SP110-5:1 No - lnc-SP100-2:1 No - LINC01907:5 No - lnc-NCL-5:1 No - lnc-NEU2-2:1 Yes chr3L:16970013-16994388 lnc-NEU2-3:1 Yes chr3L:16970013-16994388 lnc-SAG-6:1 Yes chr3R:7814361-7855392 lnc-HJURP-7:1 No - lnc-ARL4C-5:1 No - lnc-SH3BP4-8:1 No - lnc-SH3BP4-11:1 Yes chr2L:13835564-13898712 lnc-ANKMY1-3:1 No - lnc-ATG4B-1:1 No - SDCBP2-AS1:1 No - lnc-SNPH-5:1 No - lnc-SNRPB-2:1 Yes chr2L:8011405-8026898 lnc-HSPA12B-1:1 Yes chr3L:8443042-8449377 lnc-CENPB-2:1 No - lnc-PANK2-4:2 No - lnc-ADRA1D-3:1 No - lnc-PRND-2:1 Yes chr3L:8127762-8131675 lnc-PROKR2-2:1 No - lnc-BMP2-6:2 No - lnc-JAG1-10:2 No - lnc-ISM1-4:1 Yes chr2L:15499127-15505018 lnc-TASP1-9:1 No - lnc-FLRT3-4:1 No - lnc-SNX5-2:1 No - lnc-RBBP9-7:2 No - lnc-NKX2-4-5:2 No - lnc-FOXA2-14:2 No - lnc-FOXA2-10:3 No - lnc-THBD-3:1 No - lnc-SSTR4-12:2 No - lnc-VSX1-5:1 No - lnc-FAM182B-9:1 No - lnc-DNMT3B-6:2 No - lnc-CTNNBL1-2:1 Yes chr3R:8942954-8945020 lnc-TTI1-3:1 Yes chr3R:8942954-8945020 lnc-TTI1-2:1 Yes chr3R:8942954-8945020 lnc-CTNNBL1-3:1 No - lnc-TOP1-7:1 No - lnc-LPIN3-4:1 No - lnc-IFT52-1:2 No - lnc-GTSF1L-4:1 No - lnc-JPH2-1:1 Yes chr2L:9547720-9566750 lnc-FITM2-5:1 Yes chr2L:8687226-8709611 lnc-SLC2A10-3:1 No - lnc-NCOA3-21:1 No - lnc-STAU1-5:1 No - lnc-SLC9A8-1:1 No - lnc-ZFP64-10:1 No - lnc-C20orf85-4:1 No - lnc-PHACTR3-3:1 No - lnc-LSM14B-5:1 No - lnc-LSM14B-8:1 No - lnc-ADRM1-1:1 Yes chr2R:13958545-13960404 lnc-TCFL5-4:1 No - lnc-DIDO1-1:1 No - lnc-ARFGAP1-4:2 No - lnc-USP25-8:1 No - lnc-TMPRSS15-19:2 No - lnc-NCAM2-9:3 No - lnc-TMPRSS15-25:1 Yes chrX:4132887-4206093 lnc-NCAM2-7:3 No - lnc-JAM2-14:2 No - lnc-MRPL39-23:1 No - lnc-CYYR1-4:1 No - lnc-ADAMTS5-3:1 No - lnc-USP16-13:3 No - lnc-USP16-10:1 No - lnc-SOD1-12:1 No - lnc-SOD1-7:1 Yes chr2R:21161713-21168659 lnc-OLIG1-2:3 No - lnc-SON-2:3 Yes chr3R:15265591-15266690 lnc-CRYZL1-2:1 Yes chr3R:15265591-15266690 lnc-HLCS-3:1 No - lnc-VPS26C-13:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-WRB-5:1 Yes chr3R:24319000-24328619 lnc-FAM3B-7:1 No - lnc-TMPRSS2-6:1 Yes chr2R:7540111-7564435 lnc-TMPRSS2-7:1 No - lnc-RIPK4-2:1 No - lnc-CRYAA-17:1 No - AATBC:3 No - lnc-LRRC3-6:2 Yes chr2R:15262808-15309368 lnc-SLC19A1-8:1 Yes chrX:1464363-1465996 lnc-IL17RA-16:1 No - lnc-GAB4-1:1 No - lnc-CECR2-6:1 No - lnc-MICAL3-5:1 No - lnc-SEPT5-4:1 No - lnc-RSPH14-7:1 No - lnc-DRICH1-2:2 No - lnc-TMEM211-3:1 No - lnc-HPS4-6:1 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-ASPHD2-3:1 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-MORC2-5:1 Yes chr3R:24934869-24938222 lnc-YWHAH-6:1 Yes chr3L:1933633-1939103 lnc-LARGE1-9:1 No - lnc-LARGE1-10:1 No - lnc-MB-3:1 No - lnc-MCHR1-3:2 Yes chr3L:2717615-2766536 lnc-XRCC6-2:1 No - lnc-EFCAB6-1:1 No - lnc-PNPLA5-2:1 Yes chr2R:14987660-14992230 lnc-RTL6-8:3 No - lnc-RTL6-7:1 No - lnc-PRR5-3:1 No - lnc-WNT7B-3:1 No - lnc-WNT7B-2:1 No - lnc-PPARA-11:2 No - lnc-CERK-3:1 Yes chr3R:21102199-21105113 lnc-TBC1D22A-6:1 No - lnc-FAM19A5-9:1 No - lnc-CHL1-6:1 No - lnc-TRNT1-2:1 No - lnc-CRBN-4:1 Yes chr3L:175112-176228 lnc-GRM7-8:1 No - lnc-SSUH2-10:1 No - lnc-SSUH2-9:1 No - lnc-THUMPD3-13:1 No - THUMPD3-AS1:78 No - lnc-HRH1-4:1 Yes chr2R:18620466-18625044 lnc-NUP210-3:1 No - lnc-LSM3-3:1 Yes chr2R:15311510-15318239 lnc-OXNAD1-10:1 No - lnc-TOP2B-5:1 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-NGLY1-4:1 No - lnc-EOMES-3:1 No - lnc-AZI2-5:1 No - ITGA9-AS1:49 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-SCN5A-4:1 No - EIF1B-AS1:19 No - lnc-ULK4-13:2 No - lnc-TOPAZ1-6:1 No - lnc-XCR1-2:1 Yes chr2R:21088386-21091004 lnc-ALAS1-1:1 Yes chr2R:23964772-23966757 lnc-NEK4-1:1 No - lnc-LRTM1-5:1 Yes chr2R:13805794-13819571 lnc-KCTD6-6:1 No - lnc-C3orf67-2:1 No - LINC00698:1 No - lnc-ATXN7-14:1 Yes chr2R:22807860-22815993 SAMMSON:13 No - lnc-GPR27-16:1 Yes chr3R:9726020-9730872 lnc-EIF4E3-2:2 No - lnc-RYBP-6:2 No - lnc-GPR27-18:1 No - lnc-CADM2-13:1 No - lnc-VGLL3-9:1 No - lnc-CCDC54-12:1 No - lnc-DZIP3-1:1 No - lnc-TRAT1-7:1 No - lnc-BOC-1:1 No - lnc-ZNF80-3:1 No - lnc-LSAMP-3:1 No - lnc-C3orf30-7:1 No - lnc-NDUFB4-5:1 No - lnc-POLQ-2:1 Yes chrX:12631605-12653442 lnc-CCDC58-2:1 No - lnc-MGLL-3:1 No - lnc-KIAA1257-7:1 Yes chr3R:23993008-23995452 lnc-KIAA1257-3:1 No - lnc-TRH-3:1 No - lnc-NPHP3-ACAD11-2:1 No - lnc-KY-4:1 No - lnc-KY-6:1 No - lnc-ESYT3-3:1 No - lnc-FOXL2NB-7:4 Yes chr3R:27916908-27918248 lnc-NMNAT3-9:1 Yes chr4:1112874-1123357 lnc-CHST2-6:2 No - lnc-PAQR9-5:1 Yes chr2L:6677835-6684364 lnc-C3orf58-4:1 No - lnc-SELENOT-5:1 Yes chr3L:19836614-19844944 lnc-GPR87-1:1 Yes chr3L:19836614-19844944 lnc-SSR3-8:1 No - lnc-SHOX2-8:1 No - lnc-LXN-3:1 Yes chr2R:15935893-15940073 lnc-IFT80-3:1 No - lnc-SPTSSB-4:1 No - lnc-SPTSSB-6:1 No - lnc-OTOL1-7:1 No - lnc-MYNN-9:1 No - lnc-TNIK-4:1 Yes chr2R:6242004-6255266 lnc-SPATA16-5:1 Yes chr3R:7570281-7639434 lnc-PEX5L-1:1 Yes chrX:1866832-1869061 lnc-CCDC39-3:1 No - lnc-KLHL24-5:1 No - lnc-VPS8-1:3 No - lnc-P3H2-3:1 No - lnc-FAM43A-12:1 No - lnc-XXYLT1-5:1 Yes chr3R:23118400-23124217 lnc-SLC51A-10:1 No - lnc-MELTF-3:1 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-NCBP2-AS2-9:2 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-BDH1-7:1 Yes chrX:8677063-8680912 lnc-SLC49A3-2:1 Yes chr3L:16588475-16590132 lnc-SPON2-1:12 Yes chr2R:14671396-14713622 lnc-LRPAP1-4:1 No - lnc-DOK7-6:1 No - lnc-LRPAP1-6:1 No - lnc-ZBTB49-3:1 No - lnc-BLOC1S4-1:1 No - lnc-DRD5-27:1 No - lnc-CPEB2-13:1 No - lnc-CPEB2-11:1 No - lnc-BOD1L1-5:1 No - lnc-TAPT1-5:1 No - lnc-CLRN2-3:1 No - lnc-SLIT2-4:1 No - lnc-ADGRA3-6:1 Yes chrX:11219379-11302783 lnc-PACRGL-12:1 No - lnc-PCDH7-17:1 No - lnc-ARAP2-9:1 No - lnc-RFC1-1:1 Yes chr2R:19487046-19491846 lnc-PHOX2B-6:1 Yes chr3R:4659579-4712193 lnc-GNPDA2-6:1 No - lnc-SPATA18-5:1 No - lnc-CHIC2-5:1 Yes chr2L:8220980-8239878 lnc-KDR-4:1 Yes chr2L:8220980-8239878 lnc-KDR-3:2 Yes chr2L:8220980-8239878 IGFBP7-AS1:4 No - lnc-POLR2B-14:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-STAP1-9:1 No - lnc-RCHY1-7:1 No - lnc-ANXA3-7:1 No - lnc-PRDM8-8:1 No - lnc-ARHGAP24-3:1 No - lnc-PTPN13-3:1 Yes chr2L:10247502-10250501 lnc-KLHL8-2:1 No - lnc-PYURF-1:2 Yes chr3L:1313696-1318330 lnc-GPRIN3-3:1 No - lnc-PDHA2-4:1 No - lnc-C4orf17-1:1 No - lnc-CXXC4-3:1 No - lnc-CASP6-4:1 Yes chr3L:6550738-6593940 lnc-CASP6-3:1 Yes chr3L:6550738-6593940 lnc-USP53-10:1 No - lnc-MAD2L1-3:1 No - lnc-SPRY1-9:1 No - lnc-ANKRD50-7:1 No - lnc-LARP1B-4:1 No - lnc-SCLT1-5:1 No - lnc-SCLT1-6:1 No - lnc-C4orf33-6:1 No - lnc-PCDH10-13:1 No - lnc-PCDH10-11:1 No - lnc-NOCT-17:2 No - lnc-SLC7A11-4:1 No - lnc-UCP1-3:1 Yes chr3L:21337681-21343716 lnc-RNF150-6:1 No - lnc-SMARCA5-5:1 No - lnc-HHIP-3:1 No - lnc-ZNF827-9:1 No - lnc-TMEM184C-4:1 Yes chrX:15751674-15760733 lnc-FAM160A1-11:1 No - lnc-ARFIP1-4:1 No - lnc-TIGD4-4:1 No - lnc-RBM46-3:1 No - lnc-TMEM144-6:1 No - lnc-TMEM144-4:1 Yes chrX:13161714-13189164 lnc-TRIM75P-3:1 Yes chr3R:17669144-17670895 lnc-SPOCK3-4:1 No - lnc-CLCN3-7:1 No - lnc-AADAT-8:1 No - lnc-GALNTL6-3:1 No - lnc-HMGB2-12:1 Yes chr2L:3470182-3472364 lnc-HMGB2-8:1 Yes chrX:18495067-18499986 lnc-FBXO8-1:2 No - lnc-HPGD-2:1 No - lnc-ADAM29-4:1 No - lnc-WDR17-2:1 No - lnc-NEIL3-8:1 No - lnc-DCTD-14:1 No - lnc-DCTD-13:1 No - lnc-CLDN24-5:1 No - lnc-RWDD4-5:1 No - lnc-STOX2-6:1 No - lnc-CASP3-3:1 No - lnc-FAT1-4:1 Yes chr3L:20005301-20024607 lnc-TRIML1-10:1 No - lnc-SLC9A3-2:1 Yes chr2L:21104568-21134255 lnc-SLC12A7-1:17 No - lnc-TERT-1:1 Yes chr2R:18514574-18526439 lnc-LPCAT1-2:1 No - lnc-IRX2-10:1 No - lnc-MED10-22:1 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-PAPD7-7:1 No - LINC02226:13 No - lnc-MTRR-12:1 No - lnc-MTRR-18:1 No - lnc-TAS2R1-10:1 No - lnc-ROPN1L-6:1 No - lnc-FBXL7-8:1 No - lnc-MYO10-6:1 No - lnc-MYO10-8:1 No - lnc-BASP1-13:1 No - lnc-CDH6-21:1 No - lnc-CDH6-10:1 No - lnc-NADK2-2:1 Yes chr3R:9404385-9407857 lnc-LIFR-7:1 Yes chr2R:16031930-16047243 LIFR-AS1:7 No - lnc-RICTOR-54:1 No - lnc-DAB2-1:1 No - lnc-RPL37-2:1 No - lnc-OXCT1-2:1 No - lnc-CCDC152-6:1 No - lnc-ANXA2R-3:1 No - lnc-ITGA1-1:1 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-IL31RA-3:2 No - lnc-RAB3C-4:1 No - lnc-SMIM15-4:11 No - lnc-SMIM15-7:1 No - lnc-SGTB-6:1 No - lnc-CCDC125-14:1 No - lnc-CCDC125-10:1 No - lnc-FCHO2-1:1 Yes chr3L:6200473-6203776 lnc-HEXB-2:1 No - ZBED3-AS1:18 No - lnc-ACOT12-6:1 No - lnc-COX7C-10:1 No - lnc-RASA1-9:1 Yes chrX:15999951-16005812 MEF2C-AS1:15 No - lnc-ARRDC3-5:1 No - lnc-ADGRV1-11:1 No - NR2F1-AS1:1 Yes chr3R:12258737-12302785 lnc-SLF1-7:1 Yes chr2R:18761758-18774824 lnc-RHOBTB3-4:3 Yes chr3L:19889120-19909410 lnc-ERAP2-3:1 Yes chr3R:23227727-23248903 lnc-SLCO6A1-2:1 No - lnc-MAN2A1-7:1 Yes chr3R:9367603-9394546 lnc-FER-5:1 No - lnc-TRIM36-4:4 Yes chrX:5340236-5405138 lnc-DMXL1-9:1 No - lnc-DTWD2-1:5 Yes chrX:6240745-6255487 lnc-PPIC-7:1 No - lnc-FBN2-7:1 Yes chr3R:5489505-5502702 lnc-P4HA2-3:1 No - lnc-IRF1-4:1 Yes chr3L:21955110-21958041 lnc-FSTL4-3:1 No - lnc-SEC24A-2:2 Yes chr3L:187207-199762 lnc-H2AFY-3:1 No - lnc-SMIM32-5:1 Yes chr2L:3146056-3159643 lnc-HBEGF-2:12 No - lnc-PCDHGA1-3:2 Yes chr2L:20758144-20768053 lnc-KIAA0141-5:1 Yes chr3R:14630478-14641776 lnc-FGF1-5:1 Yes chrX:15751674-15760733 lnc-PCYOX1L-4:1 No - lnc-CSNK1A1-6:1 No - lnc-G3BP1-6:1 No - lnc-NMUR2-4:1 No - lnc-HAND1-5:1 Yes chr2L:3470182-3472364 lnc-UBLCP1-10:2 Yes chr2R:14772650-14807061 lnc-UBLCP1-9:1 Yes chr3R:23061493-23062751 lnc-PTTG1-6:1 Yes chr3R:29037058-29039071 lnc-PANK3-19:1 Yes chrX:10964032-10967134 lnc-PANK3-16:1 Yes chrX:10964032-10967134 lnc-FBLL1-9:1 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-DUSP1-7:1 No - lnc-ERGIC1-3:1 No - lnc-BNIP1-6:1 No - lnc-KIAA1191-4:1 Yes chr3R:8307473-8308645 lnc-FAM153B-4:1 No - lnc-THOC3-5:1 No - lnc-LMAN2-1:1 No - lnc-MGAT1-2:16 No - lnc-BTNL8-8:1 No - lnc-HUS1B-1:1 Yes chr2L:3457302-3460367 lnc-EXOC2-12:1 No - lnc-FOXQ1-22:1 No - lnc-EXOC2-37:1 Yes chr2L:4975300-4977023 lnc-WRNIP1-39:1 Yes chr2L:4975300-4977023 GMDS-DT:120 No - lnc-SERPINB1-1:2 No - lnc-PRPF4B-4:1 No - lnc-GCM2-1:1 No - lnc-MAK-3:1 No - lnc-MCUR1-9:1 No - lnc-DTNBP1-8:1 Yes chr3L:9477038-9486530 lnc-RNF144B-3:1 No - lnc-PRL-12:1 No - CASC15:10 No - lnc-ZNF322-6:1 No - lnc-ABT1-3:12 No - lnc-ZNF391-3:1 No - lnc-GPX5-3:1 No - lnc-MOG-1:2 No - lnc-TRIM26-2:33 No - lnc-TNF-1:1 No - lnc-GRM4-1:2 No - lnc-RPS10-1:1 No - lnc-NUDT3-2:1 No - lnc-TEAD3-5:1 No - lnc-MTCH1-1:1 No - lnc-MOCS1-4:1 Yes chr2R:8009119-8013755 lnc-USP49-2:1 No - lnc-CDC5L-7:1 Yes chr3R:12017156-12018550 lnc-DEFB133-1:2 No - lnc-TFAP2D-3:1 No - lnc-KLHL31-5:1 No - lnc-LRRC1-8:1 No - lnc-RAB23-7:1 No - lnc-RAB23-9:1 Yes chr3L:20359833-20361585 lnc-LMBRD1-9:1 No - LINC00472:51 No - lnc-CD109-8:1 No - lnc-FAM46A-3:1 No - LINC02535:21 No - lnc-CFAP206-1:1 No - lnc-SLC35A1-3:2 No - lnc-SPACA1-5:1 No - lnc-GJA10-17:1 No - CASC6:2 No - lnc-MANEA-3:8 No - lnc-KLHL32-8:1 No - lnc-AFG1L-4:3 No - lnc-RPF2-3:1 Yes chr3R:12682186-12689367 lnc-TUBE1-3:1 No - lnc-HS3ST5-4:1 Yes chr3L:4626734-4629467 lnc-CALHM6-1:1 No - lnc-GPRC6A-1:1 No - lnc-MAN1A1-2:1 No - lnc-HDDC2-11:1 No - lnc-ECHDC1-4:1 No - lnc-ENPP1-7:3 No - lnc-MTFR2-3:1 No - lnc-CITED2-6:1 No - lnc-HECA-7:1 No - lnc-FUCA2-2:1 Yes chr3L:3714826-3806459 lnc-STXBP5-5:2 No - lnc-ZC3H12D-13:1 Yes chr3L:19298623-19337609 lnc-SUMO4-5:3 No - lnc-MYCT1-3:1 No - lnc-SCAF8-4:1 Yes chr3L:5657913-5749599 lnc-EZR-3:1 Yes chr3R:14804092-14875488 lnc-SYTL3-151:1 No - lnc-PRKN-13:2 Yes chr2R:19497752-19500372 lnc-C6orf118-5:1 No - lnc-TBXT-4:1 No - lnc-TCP10-2:1 No - lnc-TCP10-3:1 No - lnc-TCP10-5:1 No - lnc-FRMD1-9:1 No - lnc-PDGFA-10:1 No - lnc-GPER1-7:2 No - lnc-CARD11-22:10 No - lnc-PAPOLB-1:1 No - lnc-RSPH10B-3:1 No - lnc-ZNF316-1:1 No - lnc-NXPH1-4:1 Yes chr3L:21131446-21133310 lnc-PHF14-9:1 No - lnc-THSD7A-9:1 No - ISPD-AS1:1 No - lnc-HDAC9-6:2 Yes chr2R:22985374-23048325 lnc-IL6-12:2 No - lnc-FAM126A-6:1 No - lnc-NPVF-10:1 No - lnc-SNX10-6:1 No - lnc-CREB5-5:1 No - lnc-SCRN1-2:1 No - lnc-GGCT-1:50 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-PDE1C-1:1 Yes chr2L:11814156-11928572 lnc-NEUROD6-6:1 Yes chr2L:11814156-11928572 lnc-BMPER-4:1 No - lnc-DPY19L1-2:1 Yes chr3R:25923499-25956270 lnc-SEPT7-4:1 Yes chr2L:7796314-7800058 lnc-SEPT7-3:1 Yes chr2L:7796314-7800058 lnc-EEPD1-3:3 No - lnc-GPR141-3:1 No - lnc-AMPH-9:1 No - lnc-AMPH-10:7 No - TRG-AS1:1 No - lnc-SUGCT-7:1 No - lnc-SUGCT-7:2 No - lnc-HECW1-1:1 Yes chrX:9608946-9623243 lnc-OGDH-4:1 No - lnc-TNS3-4:2 No - lnc-C7orf57-3:1 Yes chr3R:4808336-4812096 lnc-ZNF727-14:1 No - lnc-ZNF679-1:1 No - lnc-ERV3-1-6:1 No - lnc-SRRM3-6:1 No - lnc-GSAP-4:1 No - lnc-RSBN1L-3:1 Yes chr2R:6741899-6746141 lnc-HGF-7:1 No - lnc-HGF-3:1 No - lnc-CD36-10:1 No - lnc-GRM3-4:1 No - lnc-TMEM243-2:1 No - lnc-SEM1-3:1 No - lnc-NYAP1-2:1 No - lnc-IFT22-1:2 No - lnc-SH2B2-5:1 Yes chrX:7609148-7678859 lnc-ORC5-1:1 Yes chr3L:1885657-1891462 lnc-KMT2E-11:2 Yes chr3L:1885657-1891462 LHFPL3-AS1:10 Yes chr3L:1885657-1891462 LHFPL3-AS2:10 Yes chr3L:1885657-1891462 lnc-LRRN3-2:1 No - lnc-TMEM168-5:1 Yes chr2R:24603572-24604670 lnc-TFEC-11:1 No - lnc-TES-2:1 Yes chr4:1198852-1224467 lnc-ASB15-4:1 Yes chr3L:10693184-10694108 lnc-HYAL4-1:1 No - lnc-TMEM229A-3:1 No - lnc-GPR37-3:1 No - lnc-ARF5-15:1 Yes chr4:936819-949441 lnc-SMO-2:1 Yes chr3L:2768466-2772325 lnc-TMEM209-1:1 Yes chrX:17080423-17087675 LINC-PINT:66 No - lnc-MKLN1-11:1 Yes chr4:1009895-1027101 lnc-AKR1D1-7:1 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-KDM7A-2:1 No - lnc-MKRN1-7:1 No - lnc-TAS2R40-1:1 No - lnc-EPHA1-3:1 No - lnc-C7orf33-3:1 No - lnc-KRBA1-4:1 No - lnc-ATP6V0E2-2:4 No - lnc-ATP6V0E2-2:10 No - lnc-PAXIP1-8:1 No - lnc-PAXIP1-7:1 No - lnc-HTR5A-1:1 Yes chr2R:19022325-19032642 lnc-LMBR1-11:2 No - lnc-RNF32-3:1 Yes chr3R:24805445-24814012 lnc-UBE3C-4:1 No - lnc-DNAJB6-8:1 Yes chr2L:1008378-1048053 lnc-MNX1-10:1 Yes chr2L:1008378-1048053 lnc-NCAPG2-4:1 Yes chr2L:1008378-1048053 lnc-ERICH1-9:6 No - lnc-ERICH1-13:1 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-CSMD1-15:1 No - lnc-CSMD1-12:1 No - lnc-ANGPT2-8:1 No - lnc-ERI1-11:9 No - lnc-C8orf74-4:1 No - lnc-XKR6-1:1 Yes chrX:16323286-16325768 FAM167A-AS1:6 No - lnc-C8orf48-7:1 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-XPO7-4:1 No - lnc-RHOBTB2-4:1 Yes chr2L:12707661-12708680 lnc-DOCK5-2:1 No - lnc-LEPROTL1-9:1 No - lnc-LEPROTL1-7:1 No - lnc-LEPROTL1-6:1 No - lnc-GTF2E2-4:1 No - lnc-WRN-10:1 No - lnc-ADGRA2-1:1 No - lnc-SNAI2-6:1 No - lnc-ATP6V1H-4:1 No - lnc-LYPLA1-4:1 No - lnc-FAM110B-10:1 No - lnc-FAM110B-9:1 No - lnc-CA8-11:1 Yes chr2R:6696739-6699469 lnc-ASPH-7:1 No - lnc-TTPA-9:1 No - lnc-BHLHE22-10:1 No - lnc-BHLHE22-4:1 No - lnc-PDE7A-2:1 No - lnc-RRS1-3:1 No - lnc-CPA6-6:2 No - lnc-SLCO5A1-8:1 No - lnc-EYA1-3:1 Yes chr2L:6527447-6546976 lnc-PI15-1:1 No - lnc-JPH1-5:2 No - lnc-JPH1-11:1 Yes chr2L:8687226-8709611 lnc-IL7-2:3 No - lnc-MRPS28-2:1 No - lnc-RALYL-5:1 No - lnc-RMDN1-1:1 Yes chr2L:2037714-2044372 lnc-NBN-5:1 No - lnc-NECAB1-2:1 Yes chr3L:22728111-22733446 lnc-PIP4P2-4:1 Yes chr2R:20236235-20239200 lnc-TRIQK-4:1 No - lnc-C8orf37-2:1 Yes chrX:1478552-1481420 lnc-YWHAZ-4:1 No - lnc-ODF1-6:1 Yes chr3R:9714623-9725615 lnc-ATP6V1C1-8:1 Yes chr2R:8007246-8009062 lnc-ABRA-6:1 No - lnc-SAMD12-3:1 No - lnc-MTBP-6:1 No - lnc-C8orf76-2:1 No - lnc-FBXO32-2:2 No - lnc-TMEM65-5:1 Yes chr3L:8905918-8912671 lnc-ZNF572-3:1 No - lnc-FAM84B-12:1 No - lnc-FAM84B-15:118 No - lnc-FAM84B-14:2 No - lnc-FAM84B-8:5 No - lnc-FAM84B-6:6 No - lnc-GSDMC-13:1 No - lnc-GSDMC-16:1 No - lnc-GSDMC-9:1 No - lnc-FAM49B-8:1 Yes chr2R:8114286-8123001 lnc-HHLA1-2:1 Yes chr2R:10145897-10192394 lnc-KHDRBS3-13:1 No - lnc-AGO2-8:1 Yes chr2L:20650755-20656178 lnc-PTK2-5:1 Yes chr2R:13943387-13958089 lnc-LY6H-3:1 No - lnc-MAFA-2:1 Yes chr2L:19464267-19467758 lnc-DOCK8-6:1 Yes chr2R:12180493-12182373 lnc-WASHC1-2:2 No - lnc-KCNV2-7:1 Yes chr3R:10361760-10378068 lnc-KDM4C-17:1 Yes chr2L:19586623-19732069 lnc-TTC39B-2:1 No - lnc-SNAPC3-6:1 No - lnc-CCDC171-7:1 No - lnc-HAUS6-3:1 No - lnc-ELAVL2-1:6 No - lnc-IFT74-8:2 No - lnc-EQTN-2:1 Yes chr2L:10265336-10266570 lnc-IFNK-5:1 No - lnc-LINGO2-4:1 No - CNTFR-AS1:1 No - lnc-SLC25A51-6:6 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-SLC25A51-3:2 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-SHB-3:1 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-IGFBPL1-2:1 Yes chr2L:9387389-9391567 lnc-ANKRD20A2-3:1 No - lnc-ANKRD20A2-6:1 No - lnc-SPATA31A6-14:1 No - lnc-CNTNAP3B-14:1 No - lnc-FOXD4L6-20:1 No - lnc-FOXD4L5-19:1 No - lnc-CBWD5-5:1 No - lnc-FOXD4L5-1:1 No - PGM5-AS1:1 Yes chr3L:16126018-16128531 lnc-PRKACG-4:1 No - lnc-APBA1-5:1 No - lnc-FAM189A2-3:1 Yes chrX:10627737-10710947 lnc-SPATA31D4-12:1 No - lnc-IDNK-3:8 Yes chr2L:10344442-10347706 lnc-NAA35-7:1 No - lnc-C9orf47-2:1 No - lnc-DIRAS2-14:1 No - LINC00484:21 No - lnc-CENPP-15:1 Yes chr2L:10251843-10254686 lnc-C9orf129-1:1 Yes chr3L:21543850-21554928 lnc-FAM120A-3:1 No - lnc-C9orf3-3:1 No - lnc-ZNF510-2:1 No - lnc-TBC1D2-2:1 Yes chr3R:21770333-21775840 lnc-TEX10-1:1 No - lnc-GRIN3A-3:2 No - lnc-TAL2-2:2 No - lnc-KLF4-6:2 No - lnc-ACTL7B-7:1 No - lnc-ACTL7B-8:1 No - lnc-HSDL2-6:1 No - lnc-PTBP3-2:1 No - lnc-DEC1-3:6 No - lnc-PAPPA-5:1 No - lnc-C5-1:1 No - TTLL11-IT1:3 No - lnc-LHX6-1:1 Yes chr2R:24664398-24665439 lnc-LHX2-8:1 Yes chr2R:9123304-9132030 lnc-DENND1A-6:1 No - lnc-HSPA5-2:2 Yes chrX:11325385-11334071 lnc-ANGPTL2-6:1 Yes chr2R:16783671-16792472 lnc-SLC27A4-2:1 Yes chr3L:7639811-7640446 lnc-GLE1-1:5 Yes chr2R:8627900-8630186 lnc-DOLPP1-3:1 Yes chr2L:3377002-3378590 lnc-IER5L-2:1 No - lnc-USP20-6:1 Yes chr3L:4322491-4364102 lnc-NTNG2-3:2 Yes chr3R:5655139-5656336 lnc-GFI1B-2:2 No - lnc-FCN1-4:1 No - lnc-FCN2-7:1 No - lnc-FCN1-2:1 No - lnc-CAMSAP1-2:1 No - lnc-UBAC1-5:1 Yes chr2R:17519024-17535866 lnc-TMEM250-3:2 No - lnc-TMEM210-2:1 Yes chr2R:23972431-23975408 lnc-MID1-1:22 No - lnc-BMX-3:1 No - lnc-PPP4R3C-2:11 No - lnc-DCAF8L2-4:1 No - lnc-CXorf38-3:1 Yes chr3L:593246-599239 lnc-KDM6A-3:2 No - lnc-CXorf36-5:2 No - lnc-ZNF674-11:1 No - lnc-RGN-3:1 Yes chr3L:187207-199762 lnc-DGKK-3:1 Yes chr2R:14308142-14351802 lnc-XAGE1B-5:1 No - lnc-NBDY-7:1 No - LINC01278:22 No - lnc-ZC3H12B-2:4 No - lnc-SLC7A3-2:1 No - lnc-GPRASP2-4:1 No - lnc-H2BFWT-1:1 No - lnc-SERTM2-4:1 Yes chr3R:6350896-6361614 lnc-SERTM2-2:1 No - lnc-LRCH2-2:1 No - lnc-LRCH2-6:2 No - lnc-CXorf56-6:1 No - lnc-RHOXF1-3:16 No - lnc-STK26-6:1 No - lnc-BRS3-1:1 No - lnc-ZIC3-6:1 No - lnc-SPANXA2-4:1 No - lnc-F8-2:1 No - lnc-BRCC3-2:2 No - TTTY14:14 No - FAM87B:7 No - lnc-ZNF691-4:1 No - lnc-PPIAL4G-4:17 No - lnc-RGS5-4:1 No - lnc-KIAA1614-5:1 Yes chr2L:19890201-19892550 lnc-GTPBP4-3:4 No - lnc-WDR37-4:1 No - lnc-AKR1C2-2:3 Yes chr3L:11620535-11626125 lnc-ARHGAP21-3:1 Yes chrX:1673110-1692768 lnc-CSTF2T-1:1 Yes chr2L:3622074-3656953 lnc-SLC16A9-2:1 No - lnc-FAM149B1-8:1 Yes chrX:16554627-16560016 lnc-ZCCHC24-9:1 No - lnc-NUTM2E-1:8 No - lnc-PANK1-2:7 No - lnc-TLX1-6:1 No - lnc-CFAP46-7:1 No - lnc-HRAS-2:1 No - lnc-POLR2L-3:1 No - lnc-SLC22A18-3:1 No - lnc-BDNF-5:1 No - lnc-WNT11-3:1 Yes chr2L:13286777-13289556 lnc-NNMT-3:1 No - lnc-NXPE4-3:1 No - lnc-FXYD2-2:1 Yes chr3R:17473935-17505667 lnc-FAM118B-3:1 No - lnc-CCDC77-2:1 No - lnc-PLEKHG6-5:1 No - lnc-A2M-3:1 No - lnc-M6PR-4:1 No - lnc-POMP-10:1 No - lnc-PCDH20-18:1 No - lnc-AJUBA-1:1 No - lnc-NOVA1-6:1 Yes chr3R:9417940-9455500 lnc-PELI2-8:1 No - lnc-EXOC5-2:1 No - lnc-MAP3K9-13:1 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-EVL-6:10 No - lnc-TMEM179-4:1 No - lnc-PIGB-1:5 No - lnc-SLC24A1-5:1 Yes chr3R:21111408-21116146 lnc-SMAD6-2:9 No - lnc-HIGD2B-2:1 Yes chr3L:14031450-14034909 lnc-ARRDC4-10:1 No - lnc-PTX4-3:1 No - lnc-CEMP1-9:1 No - lnc-CEMP1-10:1 No - lnc-MAP1LC3B-13:1 No - lnc-CA5A-8:1 No - lnc-NAA38-3:1 No - lnc-TRIM16-6:1 Yes chr2R:13984815-13990707 lnc-SLC5A10-1:1 No - lnc-TP53I13-3:2 Yes chrX:19569721-19579800 lnc-TBC1D3I-2:1 No - lnc-CACNG5-2:1 Yes chr2R:16898535-16901575 lnc-CELF4-12:1 No - lnc-CBLN2-1:2 Yes chrX:13445903-13527282 lnc-ZADH2-4:1 Yes chr2L:21762314-21795447 lnc-RLN3-1:1 No - lnc-LPAR2-1:2 No - lnc-IGFL3-1:2 No - lnc-C5AR1-3:1 No - lnc-SOX11-6:2 No - LINC00298:2 No - lnc-FAM84A-3:1 No - lnc-ACTR2-9:1 No - lnc-ACTR2-8:1 No - lnc-MEIS1-12:1 No - DGUOK-AS1:8 Yes chr3L:2786207-2879158 lnc-RGPD1-5:1 No - lnc-SOWAHC-3:1 Yes chr2R:17568732-17572322 lnc-SEPT10-2:1 Yes chr3R:25618414-25621838 lnc-IWS1-2:2 Yes chr2L:7666047-7689459 lnc-UGGT1-7:1 No - lnc-NRP2-8:1 Yes chrX:17160006-17200728 FAM182A:24 No - lnc-SCAND1-8:1 Yes chr3R:18251069-18252734 lnc-CBR3-2:1 No - lnc-TTC3-4:1 No - lnc-KCNJ6-15:1 Yes chr3L:6097617-6123913 lnc-TRPM2-2:1 No - lnc-ATP6V1E1-4:1 Yes chr3L:6728800-6743164 lnc-TANGO2-2:1 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-HDAC11-2:1 No - lnc-NICN1-3:1 Yes chr2R:16081176-16098564 lnc-EPHA6-5:1 No - lnc-MUC13-3:1 No - lnc-NAALADL2-7:1 No - lnc-DTHD1-8:1 Yes chrX:16943290-16956234 lnc-SMIM14-4:1 Yes chr3L:6959554-6964758 lnc-GABRG1-2:1 No - lnc-NAAA-1:1 Yes chr2R:9111505-9113951 lnc-NKX6-1-3:1 No - lnc-HPGDS-9:1 Yes chr2L:4830846-4835300 lnc-TTC29-2:1 No - lnc-CFAP97-1:1 No - lnc-NIM1K-7:1 No - lnc-GTF2H2-9:1 Yes chr2L:13371427-13373890 lnc-ATP6AP1L-4:1 No - lnc-THG1L-1:1 No - lnc-CDYL-13:1 No - lnc-RIPOR2-5:1 No - lnc-ABT1-6:1 No - lnc-HLA-DQB1-1:1 No - lnc-UQCC2-2:1 Yes chr2R:21646177-21657935 lnc-C6orf89-2:1 No - lnc-PHF3-9:2 No - lnc-PDE7B-4:1 No - lnc-PRKN-9:3 Yes chr2R:19497752-19500372 lnc-PRKN-9:4 Yes chr2R:19497752-19500372 LINC01615:1 No - lnc-CLIP2-1:1 No - lnc-UPK3B-7:1 No - lnc-GNAI1-7:1 Yes chr2R:21129463-21142261 lnc-SEM1-2:1 No - lnc-POT1-3:1 No - lnc-FSCN3-9:1 Yes chr3L:259043-264380 lnc-BPGM-2:1 No - lnc-MGAM2-6:1 No - lnc-PRSS51-6:1 Yes chr2L:17454263-17458044 lnc-FAM167A-5:1 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-ZNF705D-5:1 Yes chrX:19243631-19245224 lnc-EGR3-6:1 Yes chr2L:12707661-12708680 lnc-ADRA1A-1:1 No - lnc-YTHDF3-11:1 No - lnc-SLC25A32-8:1 No - lnc-DCAF13-2:1 Yes chr3R:17872748-17916578 PVT1:22 No - lnc-GSDMC-10:1 No - lnc-WISP1-11:1 No - lnc-HGH1-1:1 Yes chrX:9275318-9283117 lnc-GCNT1-6:1 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-OR13C4-7:1 No - lnc-SMC2-3:1 No - lnc-LPAR1-1:1 No - lnc-PTBP3-5:1 No - lnc-MORN5-2:1 No - lnc-FAM69B-1:1 No - lnc-MAMDC4-2:1 Yes chrX:16415046-16417585 lnc-BCLAF3-1:1 No - lnc-PRRG1-1:1 No - lnc-KLF8-4:14 No - lnc-F8-1:1 No - lnc-EIF2S2-4:1 Yes chrX:15450261-15453167 CBR3-AS1:26 No - STXBP5-AS1:10 No - LRRC75A-AS1:59 No - lnc-ASH2L-2:1 No - lnc-PTPN2-9:2 No - lnc-MIOS-3:1 No - LINC00630:38 No - lnc-PSMA2-1:4 No - lnc-F11-2:4 No - LINC00882:14 No - BISPR:15 Yes chrX:18097558-18101314 lnc-LRP5L-4:3 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-BRI3-1:5 No - LINC02362:30 No - PRKCQ-AS1:15 No - lnc-NBN-1:11 No - lnc-KLHL32-4:7 No - LINC01827:9 No - LRRC75A-AS1:74 No - lnc-LRP5L-4:8 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-GALNT15-7:1 No - lnc-SEC14L3-2:2 No - MIR4435-2HG:22 No - lnc-SULF2-9:1 Yes chr3R:31669465-31677971 lnc-PERP-2:5 No - lnc-SGSM3-3:1 Yes chr3L:2717615-2766536 lnc-OST4-4:1 No - UCA1:4 No - LINC02084:11 No - TEX26-AS1:9 No - TRDN-AS1:23 No - lnc-MTBP-5:1 Yes chr3L:21745359-21770534 lnc-CLDN9-1:2 No - lnc-BEND4-2:5 No - lnc-TIGD1-1:14 Yes chr3R:24063077-24108960 lnc-AGPAT4-1:1 Yes chr3R:18733106-18743594 lnc-POLR2F-1:4 No - lnc-UCHL3-5:9 No - SLC14A2-AS1:7 No - lnc-PJA2-3:1 No - lnc-MTFP1-3:1 No - LINC00907:15 No - lnc-SPOPL-2:3 Yes chr3R:13967061-14032057 LINC02018:22 No - lnc-TSTD2-2:3 Yes chr3R:30532607-30578905 lnc-TMA16-1:1 Yes chr3L:9386827-9399227 lnc-EMSY-3:1 No - MORC2-AS1:6 No - lnc-MUC20-67:18 No - lnc-KLF11-3:1 Yes chr2R:11983145-11985393 lnc-MBOAT1-2:5 No - lnc-ANKRD36B-3:27 No - lnc-OSBPL1A-6:2 No - COX10-AS1:11 No - lnc-BCKDHB-1:12 No - lnc-HMGB2-15:10 No - lnc-PITRM1-2:6 No - PROX1-AS1:30 No - LINC01440:3 No - lnc-OR4F17-4:2 No - LAMC1-AS1:3 No - PAQR9-AS1:7 Yes chr2R:21011970-21015628 lnc-IMMP1L-4:1 No - lnc-CRNKL1-3:8 Yes chrX:23022898-23035550 lnc-POTEH-6:1 No - lnc-TEAD2-2:4 No - CASC15:13 No - THSD4-AS1:9 No - lnc-DALRD3-1:3 Yes chr2R:22212835-22217264 lnc-IL9R-1:2 No - lnc-GRK3-9:1 No - LINC01680:3 No - lnc-GPATCH4-3:2 No - lnc-LMF1-1:2 No - TMEM254-AS1:11 No - SFTPD-AS1:1 No - lnc-RGS9-15:7 No - lnc-USP6NL-7:11 No - lnc-GFOD1-2:1 No - MIR22HG:23 No - lnc-SAMD11-7:1 No - lnc-ISY1-1:1 No - SAP30L-AS1:2 No - lnc-NHEJ1-1:1 No - lnc-ZNF217-6:1 No - lnc-CREB5-2:6 Yes chr3R:19862517-19864393 lnc-ST3GAL4-55:18 No - lnc-OR14J1-2:3 No - lnc-MID1-1:17 No - SDCBP2-AS1:8 No - SNHG16:10 No - lnc-TRIM26-2:16 No - lnc-HIST2H3PS2-4:1 No - lnc-KATNAL2-1:5 No - lnc-MAPKAP1-1:2 No - lnc-SAMD11-7:11 No - lnc-CCDC54-4:1 No - ZNF503-AS2:36 No - CNNM3-DT:21 No - ZNF503-AS2:9 No - LINC00240:1 No - lnc-ISPD-1:1 No - lnc-IRF4-22:1 No - lnc-ACTL7B-2:2 No - lnc-IL1RAP-1:1 No - lnc-RPIA-2:4 No - MTUS2-AS1:1 No - lnc-AAGAB-3:1 No - lnc-SMNDC1-2:2 No - lnc-PRR26-5:1 No - lnc-RGS7-1:5 No - PRKCQ-AS1:30 No - YEATS2-AS1:2 Yes chr2L:8434058-8437365 lnc-ZNF37A-4:2 No - CELF2-AS1:2 Yes chr2L:12344219-12397528 LINC00982:8 No - ATP1A1-AS1:2 Yes chr3R:20948714-20976239 lnc-ANKRD27-2:6 Yes chrX:18653392-18657286 STARD13-AS:18 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-NPY2R-1:22 No - ZRANB2-AS2:27 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-CCDC7-21:2 No - ELOVL2-AS1:1 No - lnc-KLHDC7B-2:1 No - TEX41:67 No - lnc-METTL5-4:117 Yes chr2L:7377702-7384344 TEX41:68 No - lnc-FOXD4L5-25:10 No - lnc-EPM2AIP1-3:1 No - lnc-SENP6-3:5 No - STARD13-AS:19 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-C9orf66-15:19 Yes chr2L:94739-102086 lnc-ESM1-1:7 No - lnc-LYL1-3:1 Yes chr4:268175-276369 PRKCQ-AS1:32 No - lnc-RFPL4B-1:3 No - lnc-FTMT-2:3 No - lnc-SCP2D1-1:8 No - lnc-NUFIP1-2:3 No - LINC00997:2 No - lnc-FAF1-2:1 Yes chr2R:16024628-16028161 lnc-CNPY1-10:10 No - lnc-LMLN-1:4 No - LINC01963:13 No - lnc-ABO-33:6 No - LINC01320:18 No - lnc-ZNF507-5:4 No - LINC00917:11 No - NR2F1-AS1:38 No - THRB-AS1:10 No - lnc-PMP2-1:9 No - lnc-LRIT2-4:1 Yes chrX:11090210-11092098 lnc-NPY2R-1:23 No - lnc-MUC20-67:10 No - lnc-TMTC4-1:3 Yes chr2R:24940625-24942413 RBM26-AS1:7 Yes chr2L:19493251-19497978 lnc-AKR1B1-1:4 No - lnc-SDE2-1:14 Yes chrX:9152523-9156669 PLS3-AS1:4 Yes chrX:17285704-17301929 SRD5A3-AS1:9 Yes chr2L:8305586-8306741 LINC01607:1 No - PACERR:1 No - lnc-GABPA-1:2 Yes chrX:530501-579044 RNF219-AS1:9 Yes chrX:15350239-15379064 lnc-IL17A-2:2 No - COX10-AS1:2 No - EAF1-AS1:8 Yes chr2R:7396850-7407819 TRHDE-AS1:2 Yes chr3R:21740105-21744431 LINC00355:11 No - lnc-ESPN-5:3 No - CADM3-AS1:1 No - NDUFA6-DT:67 No - lnc-SH2B2-7:1 Yes chrX:7609148-7678859 lnc-NAALADL2-3:1 No - lnc-TBC1D28-7:10 No - STARD13-AS:35 Yes chr3R:14391683-14481713 RAB11B-AS1:2 Yes chr3R:21111408-21116146 DLX6-AS1:3 Yes chr2R:24814822-24835667 lnc-MUC20-67:3 No - lnc-S100A13-2:6 No - NUP50-DT:50 No - lnc-POLE4-15:8 Yes chr3R:29950796-29969447 lnc-PPP1R3B-11:1 Yes chr3R:25653091-25661286 lnc-MUC20-67:7 No - lnc-HIST1H2BJ-9:1 No - lnc-TCF7L2-1:4 No - lnc-ODF2-1:1 Yes chr2L:5528123-5530682 LINC00882:8 No - SLC25A5-AS1:5 Yes chrX:10778954-10786907 lnc-MARC1-3:1 No - lnc-SRPK2-7:1 Yes chr3L:14002127-14020148 lnc-MUC20-67:8 No - LINC01759:26 No - lnc-YIPF3-1:1 Yes chr2L:4969004-4970216 lnc-CTNNA3-1:2 No - lnc-CGA-2:1 No - lnc-MID1-1:6 No - lnc-TRUB2-5:1 Yes chr2R:6076910-6078088 lnc-DCTD-5:4 No - lnc-SUSD5-1:1 No - lnc-ATXN7-9:1 Yes chr3R:22460662-22462054 ILF3-DT:19 No - SEPT7-AS1:7 No - lnc-SHOC2-3:1 No - lnc-HDDC2-5:9 No - lnc-PPP1R3G-9:11 No - LINC00635:13 No - RNF219-AS1:7 Yes chrX:15350239-15379064 lnc-ZNF438-4:2 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-MEI4-3:1 No - lnc-MMRN2-2:2 No - lnc-TNFRSF14-66:4 No - CERS6-AS1:2 Yes chrX:6257668-6267228 ZEB2-AS1:3 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-SBDS-4:9 No - lnc-HDDC2-5:8 No - lnc-ZNF585B-5:6 No - lnc-C5orf42-6:1 No - LINC00882:11 No - lnc-PPP1R3G-9:10 No - lnc-MEGF10-3:1 No - FGF14-AS2:2 No - SNHG21:17 No - lnc-CLEC2D-8:5 No - lnc-HLA-B-2:10 No - lnc-RRN3-3:5 Yes chrX:21324046-21328150 lnc-GPR89B-8:1 No - lnc-KLF17-1:12 No - lnc-CREB5-2:7 Yes chr3R:19862517-19864393 lnc-SMIM19-1:1 No - lnc-FAM72B-4:6 No - LINC01206:26 No - lnc-IMPDH1-3:2 No - lnc-LRP5L-4:26 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-HS3ST4-1:8 No - lnc-AKR1B1-1:3 No - ZEB2-AS1:12 Yes chr3R:30765926-30789202 ARHGEF26-AS1:8 No - LINC00893:10 No - lnc-TBC1D28-7:1 No - LINC01623:3 No - PCBP1-AS1:77 No - lnc-MBOAT4-3:2 Yes chr2R:24874976-24875865 STARD13-AS:33 Yes chr3R:14391683-14481713 CYP1B1-AS1:28 No - ZNF667-AS1:5 No - lnc-TIFA-4:1 No - lnc-CYP27A1-1:1 No - lnc-WDR5-4:8 No - ASB16-AS1:5 No - lnc-MRPL35-1:1 Yes chr3R:22019505-22023335 lnc-DERL3-2:1 Yes chr2R:8087396-8089297 lnc-NEK2-1:1 No - lnc-EZH2-7:2 Yes chr2R:7916856-7921579 lnc-RNF26-5:1 No - ARF4-AS1:3 Yes chr4:1124167-1125325 FAM95C:11 No - LINC01708:23 No - DARS-AS1:14 No - lnc-ROPN1B-9:1 No - lnc-LRRC38-1:2 No - lnc-GFM1-2:1 No - LINC01082:3 No - lnc-PRL-3:4 No - lnc-RNFT1-2:1 No - lnc-MMP24OS-73:9 No - lnc-TWSG1-2:1 Yes chr3L:12750119-12753402 lnc-ARVCF-4:11 Yes chrX:13616989-13619207 CDC37L1-DT:22 No - lnc-EMSY-2:1 No - lnc-IFNAR1-3:1 No - lnc-CYS1-5:1 Yes chr2L:476446-479688 LINC01224:15 No - FAM53B-AS1:3 Yes chr2L:2978411-2979288 MIR99AHG:11 No - lnc-CWC27-2:1 No - STX18-AS1:6 Yes chr3R:24623802-24625562 lnc-LINC00854-1:22 No - lnc-TSPYL5-3:1 No - lnc-AUNIP-1:1 No - STARD13-AS:11 Yes chr3R:14391683-14481713 LINC00663:12 No - lnc-FGFR2-12:7 No - lnc-ACTR8-1:1 No - lnc-ALG2-6:6 No - lnc-EMB-4:2 No - lnc-EYA4-2:1 No - lnc-ALKAL2-2:16 No - FAM95B1:10 No - STARD13-AS:20 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-SHPRH-7:1 No - LRRC75A-AS1:56 No - lnc-ETS1-1:5 Yes chr3L:6097617-6123913 PROX1-AS1:52 No - lnc-BCL11A-16:1 No - LINC01135:7 No - lnc-DPP6-2:2 Yes chr3L:14020315-14029121 lnc-C9orf66-15:17 Yes chr2L:94739-102086 PROX1-AS1:58 No - LINC00635:14 No - lnc-NEFM-2:1 No - LINC02019:8 No - LINC00458:13 No - lnc-TBCCD1-4:15 No - lnc-BLNK-3:2 No - lnc-CCDC7-16:1 No - lnc-NYAP2-2:2 No - lnc-ACTL10-1:1 No - TUSC7:1 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-GFM1-8:1 Yes chr2L:4838347-4841465 DARS-AS1:7 No - PROX1-AS1:57 No - lnc-AAK1-1:3 Yes chr2L:18957732-18968744 lnc-MFSD4B-5:1 No - LINC02112:29 No - lnc-BRD3-1:4 Yes chrX:2585980-2588217 lnc-RBM15-3:1 Yes chr2R:11845324-11852324 STARD13-AS:21 Yes chr3R:14391683-14481713 LINC01278:23 No - lnc-TBC1D28-7:4 No - lnc-KXD1-3:2 Yes chr2R:18629594-18632045 lnc-DCUN1D1-9:2 Yes chrX:16405509-16414651 lnc-RDM1-1:4 No - lnc-CTXND1-2:3 Yes chr3R:9016773-9020022 lnc-ZFP57-13:1 No - lnc-TEF-2:1 No - lnc-SP3-6:1 No - lnc-FRMD1-3:3 No - lnc-FEZ2-3:2 No - lnc-ARVCF-4:9 Yes chrX:13616989-13619207 lnc-FZD5-2:2 Yes chr2L:11810092-11813780 LINC01624:2 No - MIR22HG:24 No - lnc-PTPRZ1-3:4 Yes chr4:1230837-1271759 PCGEM1:3 No - lnc-ST3GAL4-4:4 Yes chrX:2740384-3134532 lnc-TAGAP-4:2 No - lnc-WRB-7:1 Yes chr3R:24319000-24328619 lnc-IL15RA-1:4 No - lnc-ANKRD30BL-7:1 No - lnc-LRRTM3-5:1 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-LRCH3-1:2 No - lnc-ZNF235-4:2 No - LINC00458:10 No - lnc-PEX10-5:1 No - lnc-COX18-2:1 Yes chr3L:9073105-9074467 LINC02060:9 No - MBNL1-AS1:3 Yes chr2R:17216549-17379376 lnc-MZT2A-2:1 No - lnc-MFAP4-3:7 No - lnc-RAB3GAP2-9:1 No - lnc-PNO1-1:1 Yes chrX:5332499-5334449 lnc-DNAJC7-3:1 No - lnc-PXDNL-2:1 No - lnc-TUBGCP6-3:1 No - NR2F1-AS1:22 No - lnc-ALPK2-8:4 Yes chr3L:17530081-17546660 MIR663AHG:23 No - MIR4500HG:3 No - STARD13-AS:12 Yes chr3R:14391683-14481713 FAM182A:37 No - RAMP2-AS1:7 No - lnc-PLGRKT-2:1 No - lnc-RNF14-1:1 No - lnc-EPS15L1-3:1 No - ZEB1-AS1:7 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-SDHC-2:1 Yes chr3R:11114671-11115706 lnc-UMPS-3:3 Yes chr3R:21070557-21073319 STARD13-AS:7 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-ADH5-1:1 No - LINC00896:8 No - LINC02343:12 No - lnc-CTSV-5:5 No - lnc-ARHGEF16-2:1 No - lnc-JCHAIN-1:3 Yes chr3R:27229505-27239085 RFPL1S:2 No - lnc-CELF3-3:1 Yes chrX:5719374-5738031 lnc-PSMG4-5:1 No - MIR4500HG:8 No - LY86-AS1:5 No - lnc-METTL5-4:88 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-ZBTB25-1:2 Yes chr3R:10696534-10703316 lnc-PERP-2:3 No - lnc-TAF13-2:1 Yes chrX:19494420-19494992 MIR99AHG:13 No - ZNF674-AS1:5 No - lnc-USP34-7:4 No - lnc-GP9-5:1 Yes chr3R:8125290-8126357 MANCR:29 No - TMEM161B-AS1:5 Yes chr3L:11109690-11112117 lnc-CYP4F2-1:4 No - lnc-MRPL2-1:1 Yes chr3L:12746616-12750056 lnc-PEX10-7:1 No - lnc-HNRNPA3-7:1 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-SPATA31D1-4:32 No - lnc-KCNMB3-2:1 No - lnc-TBC1D28-7:14 No - RNF219-AS1:13 No - lnc-VPS8-2:9 No - lnc-PPIL2-2:7 No - lnc-DCLRE1C-1:3 No - LINC02266:3 No - lnc-TBCCD1-4:6 No - lnc-CBWD2-2:1 No - lnc-NES-2:3 No - lnc-SYT15-1:6 No - lnc-BRD3-1:3 Yes chrX:2585980-2588217 lnc-SCGB2B2-1:2 No - lnc-ANKDD1B-2:1 No - MIF-AS1:4 No - NDUFV2-AS1:5 Yes chr3L:12750119-12753402 lnc-FPGS-2:9 Yes chr2L:21262956-21282790 lnc-SOD1-9:1 No - LINC01719:20 No - ZEB2-AS1:4 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-CD320-3:1 No - lnc-PREP-2:1 No - lnc-MUC20-67:2 No - lnc-MRPL43-2:1 No - ST3GAL5-AS1:17 No - lnc-RALGPS2-2:2 No - lnc-OST4-5:1 No - lnc-CYP4F2-1:2 No - lnc-HMGN1-4:2 Yes chr3R:24319000-24328619 lnc-OR4F21-2:2 No - lnc-ENOPH1-3:1 Yes chr3R:13634862-13646304 lnc-EBLN1-3:3 No - lnc-MFAP4-3:6 No - lnc-GGCT-1:39 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-COL28A1-1:10 No - lnc-MRM1-2:3 No - LINC01285:7 No - SRD5A3-AS1:20 Yes chr2L:8305586-8306741 LINC00649:19 No - lnc-VSTM2B-9:12 No - RGPD4-AS1:8 No - lnc-RAN-4:2 Yes chr3R:15374635-15402543 PCBP1-AS1:162 No - THAP9-AS1:2 No - lnc-MOCS2-4:1 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-RNF182-3:1 No - lnc-USP31-2:3 Yes chr2R:24743749-24756976 lnc-JUN-5:6 No - LINC00905:15 No - lnc-ALKBH7-2:1 No - LINC00898:2 No - TRAF3IP2-AS1:22 No - lnc-SPATA31A3-1:2 No - LINC01255:12 No - lnc-ZNF33B-3:4 No - lnc-PPP4R1-12:1 No - lnc-VSTM2B-2:2 No - lnc-AQP12A-1:11 No - lnc-ACTR2-3:18 No - lnc-SYT15-1:5 No - lnc-KALRN-5:1 Yes chr2R:9716348-9748121 lnc-TGFB1-4:1 No - lnc-HOXA3-1:7 Yes chr3R:6752864-6754194 lnc-ESM1-1:9 No - lnc-RBM28-4:1 No - lnc-KLHL32-4:8 No - lnc-TDRP-4:1 Yes chr3L:11699496-11708553 lnc-ZEB1-4:1 No - lnc-RNFT1-2:2 No - IGFL2-AS1:13 No - lnc-SLC16A3-3:3 No - lnc-COA6-12:1 No - lnc-BVES-2:1 No - ZSCAN16-AS1:5 No - UBAC2-AS1:8 No - lnc-METTL5-4:146 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-MMADHC-2:3 Yes chr2R:16266960-16271971 lnc-MFN1-2:1 Yes chrX:15860115-15866175 PDZRN3-AS1:3 Yes chr4:663621-669884 lnc-N6AMT1-1:5 No - lnc-FTCDNL1-4:28 No - lnc-SRD5A3-1:3 No - LINC02098:8 No - SERTAD4-AS1:3 No - lnc-LETM2-3:1 No - lnc-ARHGEF39-1:2 No - lnc-ANKRD36B-3:3 No - lnc-MUC20-67:1 No - lnc-ZNF687-3:1 No - LINC00649:26 No - lnc-ZNF626-2:1 No - lnc-GPR27-15:1 No - lnc-MTFR1-1:1 No - lnc-NR2F1-6:2 Yes chr3R:12348987-12350644 lnc-TTC31-3:1 Yes chr3R:21409979-21434133 lnc-USP34-1:9 No - lnc-ESM1-1:5 No - MIR29B2CHG:60 No - NDUFA6-DT:71 No - lnc-STX8-3:2 Yes chrX:14604012-14653928 lnc-DET1-1:19 Yes chr2L:10973443-10975293 PCBP1-AS1:167 No - SNAP25-AS1:3 No - lnc-LRP5L-4:2 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-ALG1L-2:3 No - lnc-TPD52-4:2 No - lnc-ZNF142-1:1 No - lnc-DSE-1:1 No - lnc-ZNF611-1:1 Yes chr2L:11794327-11809438 LINC00963:34 No - lnc-RPS6KA6-6:1 Yes chr3L:6790158-6794941 lnc-MYO10-5:1 No - LINC01504:3 No - lnc-CHD1L-5:9 Yes chr2R:6642418-6645098 lnc-TRDMT1-3:1 No - SRD5A3-AS1:12 Yes chr2L:8305586-8306741 PAX8-AS1:32 Yes chr4:1088798-1113317 lnc-ECD-2:2 No - lnc-DPP4-2:9 No - SRD5A3-AS1:13 Yes chr2L:8305586-8306741 LINC00907:14 No - lnc-ZNF672-5:3 No - MIR4435-2HG:12 No - lnc-NOTO-2:1 Yes chrX:18635642-18647648 LINC00284:10 No - VIPR1-AS1:1 No - LINC01198:2 No - lnc-RNMT-3:1 No - LINC02525:31 No - lnc-NBPF14-5:1 No - lnc-DCTD-11:1 No - lnc-RNF223-2:1 No - MIR4453HG:12 No - LINC01607:2 No - lnc-B3GNT10-21:30 No - lnc-MPV17L2-1:5 Yes chrX:3176440-3343767 lnc-SUPT3H-2:1 No - TEX41:69 No - lnc-PCDHB4-1:1 No - lnc-DNMT3A-1:1 No - lnc-VPS8-3:1 No - lnc-TSTD2-2:2 Yes chr3R:30532607-30578905 lnc-PCDHGA1-2:2 No - TEX41:70 No - lnc-IGLL1-1:41 Yes chr3L:13906897-13925335 LINC00635:28 No - LAMTOR5-AS1:22 No - TRAF3IP2-AS1:20 No - lnc-UPK3A-3:1 Yes chr2R:8123036-8125058 lnc-EXOC2-11:1 No - lnc-MUC20-67:16 No - LINC00864:5 No - lnc-DMAC1-1:3 No - lnc-DZIP1L-2:1 No - CBR3-AS1:16 No - lnc-SPATA31D1-4:18 No - lnc-UBAP2-6:1 No - lnc-NOTO-2:3 Yes chrX:18635642-18647648 lnc-NABP1-5:8 No - TUSC8:3 No - lnc-RBMX-1:2 No - lnc-PGRMC2-2:2 No - LINC01771:16 No - lnc-SSR3-6:1 Yes chrX:10233347-10263485 lnc-OAZ1-3:2 No - lnc-ZNF131-1:28 No - LINC02519:31 No - lnc-CLCN1-1:2 No - lnc-HTR4-3:1 No - lnc-METTL5-4:121 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-IFT20-4:2 No - STARD13-AS:22 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-CYP3A43-6:1 Yes chrX:21517434-21519218 lnc-CDK11A-2:2 No - lnc-HMGB2-15:11 No - lnc-ANKRD33B-2:1 No - LINC01350:9 No - LUCAT1:6 No - LINC00658:11 No - LINC01517:10 No - lnc-FTCDNL1-4:24 No - lnc-LRP5L-4:21 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-ARHGEF28-1:2 No - lnc-ACTRT3-2:2 No - lnc-AGAP5-1:9 Yes chr2L:13835564-13898712 FAM95B1:21 No - MIR22HG:21 No - lnc-CREG1-4:1 No - GAS6-DT:12 No - lnc-ZNF37A-9:1 No - CSNK1G2-AS1:1 Yes chr3R:16272452-16304768 lnc-BMI1-4:1 No - INTS6-AS1:34 No - lnc-CRNKL1-3:7 Yes chrX:23022898-23035550 NNT-AS1:8 No - TBX5-AS1:7 No - LINC01356:6 No - lnc-NALCN-4:1 No - ZNF793-AS1:6 No - lnc-FILIP1L-3:1 No - LINC02344:7 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-ALG2-6:2 No - lnc-ALG1L-2:5 No - lnc-DEFB132-1:1 No - ATP6V0E2-AS1:27 No - NFYC-AS1:2 Yes chrX:6818178-6820919 ASH1L-AS1:2 Yes chr3L:19590773-19598755 lnc-UBE2H-2:3 No - LINC01534:9 No - lnc-CROCC-8:2 No - LINC00355:18 No - lnc-STMND1-4:17 No - lnc-PCED1B-5:39 No - LINC00649:25 No - lnc-B3GNT10-21:2 Yes chrX:13159604-13162854 lnc-ANKRD18B-6:8 No - CBR3-AS1:5 No - ITGA9-AS1:32 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-ADCYAP1-6:2 No - STARD13-AS:23 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-HIST1H1A-1:4 No - lnc-DUPD1-5:1 No - lnc-RHD-2:1 No - LINC00905:3 No - RNF219-AS1:3 No - lnc-C20orf203-1:2 No - LAMTOR5-AS1:27 No - lnc-VPS8-4:1 No - DARS-AS1:8 No - LINC01539:7 No - SNHG16:14 No - lnc-CRABP2-2:2 No - lnc-GUF1-4:1 Yes chr2L:5547086-5549614 lnc-GBP5-11:1 No - IER3-AS1:12 No - lnc-PGM5-1:3 No - ZNF451-AS1:48 No - lnc-CDKL3-2:2 No - lnc-SH3TC1-1:2 Yes chr3R:9694386-9705417 NIFK-AS1:3 No - lnc-MYOM1-4:2 No - lnc-TMEM26-2:1 No - lnc-LRFN5-2:5 No - lnc-TRAPPC6A-3:3 Yes chr3R:11346294-11353131 NDUFA6-DT:73 No - lnc-ATP13A3-1:2 Yes chr4:132220-143123 lnc-SMIM11A-3:1 No - CCDC144NL-AS1:25 No - lnc-KLRG2-3:1 Yes chr3L:17514298-17524740 lnc-SMNDC1-2:3 No - lnc-MID1-1:9 No - lnc-FOXD4L5-44:4 No - lnc-TRUB2-8:1 Yes chr3L:7639811-7640446 lnc-ZDHHC21-4:1 No - lnc-KLF17-1:9 No - lnc-MALT1-7:2 No - lnc-RWDD3-5:5 No - NR2F1-AS1:17 No - NR2F1-AS1:34 No - lnc-PSMD6-1:1 No - lnc-SBDS-15:1 No - lnc-LRP5L-4:15 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-DCTN6-1:2 No - ADIRF-AS1:7 No - lnc-FAM98A-8:1 No - MIR4527HG:31 No - ZFPM2-AS1:7 No - lnc-CD80-3:1 No - lnc-RHOBTB3-1:8 No - lnc-SHC3-2:5 No - LINC01138:47 No - DAB1-AS1:9 Yes chr3L:16712126-16724575 LAMTOR5-AS1:23 No - DAB1-AS1:19 Yes chr3L:16712126-16724575 CBR3-AS1:6 No - lnc-DHRS3-1:1 No - lnc-B4GALNT1-1:4 Yes chr3L:995982-1034875 RNF219-AS1:12 Yes chrX:15350239-15379064 MIR663AHG:31 No - LINC00662:22 No - LINC00320:6 No - PPP1R26-AS1:5 No - CBR3-AS1:7 No - lnc-NEURL2-1:1 No - lnc-OPN4-1:3 No - lnc-TRIM45-2:1 No - ZNF433-AS1:25 No - LINC01311:2 No - lnc-ZNF146-1:12 No - TRAM2-AS1:14 No - lnc-TP53BP2-8:12 No - LINC01081:4 No - lnc-CRIM1-1:11 No - lnc-DPP4-2:8 No - LINC00963:18 No - EXTL3-AS1:11 Yes chr2R:19129589-19133706 lnc-C12orf43-3:1 No - lnc-TRIM55-1:11 No - RNF144A-AS1:1 Yes chr2R:10740054-10798709 lnc-PSMA2-1:2 No - lnc-FANCC-1:13 No - ZNF451-AS1:49 No - ENTPD1-AS1:15 No - SCOC-AS1:5 Yes chr3R:27273705-27274565 MIR663AHG:13 No - LINC01719:26 No - lnc-SCRN3-1:4 No - lnc-YES1-5:1 No - lnc-MPV17L2-1:7 No - lnc-ZNF140-1:2 No - lnc-FBXL18-1:8 No - LINC01435:8 No - lnc-EXOSC6-3:21 No - lnc-THOC3-2:23 No - lnc-SCAND1-3:2 Yes chr2R:19229063-19243751 lnc-RAB23-18:1 No - TBX18-AS1:2 No - lnc-METTL5-4:122 Yes chr2L:7377702-7384344 HTR2A-AS1:6 Yes chr3R:8578205-8629996 lnc-PPIAL4C-4:27 No - lnc-ASH1L-2:2 Yes chrX:21388977-21391533 lnc-LRP5L-4:11 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-EPM2AIP1-2:1 No - TUSC7:3 Yes chr3L:5424109-5442399 NUP50-DT:45 No - lnc-IL17RA-19:1 No - LINC00484:11 No - lnc-MUC20-67:14 No - STARD13-AS:34 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-TMEM105-2:34 No - lnc-PODXL-3:2 Yes chr2R:12628697-12632378 lnc-MAP4K1-1:2 No - lnc-SEPT7-3:3 Yes chr2L:7796314-7800058 lnc-AGAP5-1:10 No - lnc-TUBGCP6-4:1 No - lnc-NEPRO-2:2 No - ZEB2-AS1:5 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-GALNT15-6:1 No - lnc-MAP1B-2:2 No - lnc-DUSP11-2:1 No - lnc-ZNF85-1:2 No - lnc-CNPY3-1:2 No - lnc-TBC1D28-7:3 No - LINC00665:12 No - lnc-DLL1-7:1 No - LINC00907:13 No - LINC01532:3 No - MIR200CHG:14 Yes chr2R:18819467-18822250 RNF219-AS1:2 No - lnc-ATP6V0E2-4:1 No - lnc-SPTLC1-2:2 No - lnc-LGALSL-2:7 Yes chr3R:23860162-23890052 lnc-PAGE5-1:3 No - LINC02532:29 No - TP53TG1:17 No - LINC00207:5 No - lnc-TBC1D28-7:11 No - DARS-AS1:9 No - LINC01837:28 No - LINC00261:12 No - lnc-EBLN1-4:1 No - TRDN-AS1:32 No - lnc-ALG1L-2:4 No - LINC00710:3 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-JMJD7-PLA2G4B-2:4 No - PROX1-AS1:54 No - lnc-TMEM167A-5:1 No - lnc-PNO1-3:1 Yes chrX:5332499-5334449 NDUFA6-DT:60 No - MIR4435-2HG:28 No - lnc-CCDC80-5:2 No - lnc-MRPL14-2:3 No - lnc-B3GNT10-21:18 No - STARD13-AS:24 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-ACOT13-1:1 No - lnc-SPATA32-2:17 No - lnc-DDR2-5:1 Yes chr2L:6468538-6473904 lnc-TMEM173-3:1 No - VIPR1-AS1:2 No - lnc-SLC2A10-2:1 Yes chr3L:5138652-5139395 lnc-ACTRT3-2:4 No - lnc-RCSD1-4:1 Yes chr2L:12587625-12628135 JPX:9 No - lnc-ACOX3-1:2 No - ITGB2-AS1:8 Yes chrX:8061645-8070237 lnc-LRP5L-4:14 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-ZNF721-2:1 No - RNF219-AS1:5 Yes chrX:15350239-15379064 lnc-FAM208B-5:1 Yes chr2L:9491176-9494876 lnc-ALDH9A1-2:1 No - lnc-NUTM2B-1:4 No - LINC00667:7 No - lnc-ST3GAL4-53:2 No - lnc-CREB3L4-4:1 No - TARID:9 No - lnc-ALG2-6:38 No - lnc-AMY1B-1:8 No - lnc-FABP7-2:2 No - lnc-SPOCK2-3:1 No - lnc-DFFA-1:1 No - lnc-ADGRE1-1:4 No - lnc-MUC20-67:98 No - PART1:3 Yes chrX:3176440-3343767 lnc-RPL32-1:1 Yes chr2L:10358134-10362707 lnc-ANXA2R-1:24 No - lnc-SETD7-3:2 No - LINC00636:2 No - STARD13-AS:5 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-TMEM189-1:5 No - CATIP-AS1:8 Yes chr3L:15992669-16004736 MIR663AHG:16 No - lnc-ATG7-3:1 No - lnc-CYGB-3:5 No - LINC00484:5 No - lnc-DGCR6-6:14 No - LINC01905:19 No - ZNF582-AS1:21 No - lnc-TWSG1-3:1 Yes chr3R:21017684-21020753 lnc-F11-2:3 No - lnc-RAB12-7:1 No - lnc-PLAT-1:8 No - lnc-PAPD7-2:12 No - lnc-PGLYRP2-4:1 No - lnc-OR2B2-4:2 No - lnc-METTL5-4:96 Yes chr2L:7377702-7384344 LINC02112:24 No - MIR663AHG:27 No - lnc-SNRPC-2:2 No - lnc-GAMT-1:3 Yes chrX:15985473-15986808 LINC00661:9 No - lnc-C9orf66-3:3 Yes chr2R:14901475-14928425 DAB1-AS1:35 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-ESM1-1:3 No - LINC01206:31 No - PAQR9-AS1:9 Yes chr2R:21011970-21015628 MIR22HG:17 No - lnc-C16orf78-4:2 No - lnc-RASGEF1A-2:1 No - LINC01278:4 No - lnc-TOP1MT-4:1 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-BCKDHB-1:11 No - lnc-MUC20-67:6 No - lnc-RIPOR2-21:2 No - NDUFA6-DT:65 No - lnc-PRKAB2-2:4 No - lnc-JUN-7:1 No - lnc-CWC27-3:1 No - lnc-TMEM88B-6:2 No - lnc-ADAP1-1:1 No - lnc-TBC1D28-7:9 No - CEBPA-DT:17 No - lnc-DHX38-40:2 Yes chr4:501810-540874 LINC00963:14 No - lnc-HNRNPA2B1-14:3 Yes chr3R:23185580-23226711 HAR1B:3 No - lnc-ZNF322-1:2 Yes chr2R:14173693-14182838 lnc-ZNF184-2:1 No - lnc-ATP5PO-1:2 No - lnc-GRHL2-12:2 No - lnc-TTLL7-3:3 No - NDUFA6-DT:69 No - lnc-NOC3L-5:1 No - lnc-CREB3L4-3:1 Yes chr2R:6718196-6719533 lnc-TOMM20-3:1 No - lnc-SMIM11A-2:1 No - lnc-CYTH4-4:1 No - lnc-EDDM13-5:2 No - lnc-MAP3K14-3:1 No - STARD13-AS:6 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-GJC1-4:2 No - lnc-ESS2-1:1 No - lnc-GTF2IRD1-1:1 No - lnc-PRPF4B-2:1 No - CYP1B1-AS1:26 No - lnc-UQCRFS1-6:2 No - lnc-TAGAP-4:1 No - lnc-JAK1-4:1 No - lnc-TUBGCP6-5:1 Yes chr3R:13026283-13030659 lnc-PCP4L1-46:2 Yes chr3R:11114671-11115706 LINC02593:35 No - lnc-HYAL4-5:3 No - LINC01574:5 No - lnc-CHD1L-5:8 Yes chr2R:6642418-6645098 lnc-ARRB2-2:2 No - lnc-ANKRD33B-10:3 No - CASC15:7 No - LINC00910:5 No - lnc-METTL5-4:116 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-ST3GAL4-55:14 No - lnc-LMOD1-4:1 No - LINC01965:15 No - ZNF793-AS1:11 No - STARD13-AS:25 Yes chr3R:14391683-14481713 OLMALINC:34 No - lnc-MICAL3-2:1 No - lnc-MBOAT1-2:7 No - lnc-ANGPTL1-3:1 Yes chr2R:16783671-16792472 lnc-PICK1-4:1 Yes chr3L:11136049-11163984 lnc-GFM1-4:2 Yes chr2L:4838347-4841465 lnc-ZNF385D-1:1 No - lnc-USP34-7:3 No - lnc-PRPF18-11:1 No - lnc-HYOU1-1:5 No - RBM26-AS1:8 Yes chr2L:19493251-19497978 lnc-MPPE1-2:1 Yes chr2R:23942538-23946936 lnc-FAM162A-2:5 No - lnc-USP41-3:1 Yes chr3L:15509445-15511047 LINC00472:14 No - lnc-PEX7-2:2 No - lnc-LIMS2-2:2 Yes chr2L:7666047-7689459 LINC00702:2 No - lnc-HDAC2-6:1 No - CHL1-AS1:3 Yes chrX:8517373-8555170 lnc-EPN2-3:3 No - lnc-RNF144A-5:1 No - lnc-TINCR-1:10 No - TBX2-AS1:7 No - lnc-CLDN14-4:1 No - lnc-CPN2-4:17 No - LINC01605:6 No - COX10-AS1:12 No - lnc-ANKRD36B-3:12 No - PTCSC3:5 No - lnc-TRIM43-2:3 No - lnc-EFHB-6:1 No - lnc-NEMP2-3:1 Yes chr2R:14739359-14745335 lnc-COQ4-2:1 Yes chr2R:6076910-6078088 lnc-SNRPN-8:150 No - lnc-MKL1-1:3 No - lnc-CHIC2-2:2 Yes chr3R:4485008-4487677 lnc-CDC42-2:1 No - lnc-SETD1B-2:1 Yes chr3R:9497101-9502581 lnc-RDH13-12:1 No - LINC00513:21 No - LINC00907:12 No - lnc-TBC1D28-7:16 No - TMCC1-AS1:3 No - lnc-VPS52-2:1 No - lnc-ARL15-4:1 No - ZEB1-AS1:2 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-GAS1-2:1 No - UCA1:9 No - lnc-KDSR-5:1 No - lnc-ZNF445-5:1 Yes chr3L:6073490-6075245 lnc-MKL1-1:2 No - lnc-SRSF6-3:2 No - SRD5A3-AS1:4 No - SRD5A3-AS1:26 Yes chr2L:8305586-8306741 lnc-SLC30A7-3:1 No - lnc-PTN-2:4 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-ESM1-1:12 No - lnc-AIDA-1:1 Yes chr2L:6649388-6654574 lnc-CNOT7-2:1 Yes chr3L:11998398-12002915 SOX21-AS1:4 No - FAM95B1:25 No - lnc-PIEZO2-2:9 No - lnc-FITM2-1:4 No - lnc-MAB21L1-6:1 No - LINC00544:5 No - lnc-FAAP20-3:1 Yes chr2R:14944458-14962969 LINC00207:1 No - lnc-MEGF6-5:1 Yes chr2L:18714453-18732524 lnc-FBXL4-5:1 No - lnc-TBC1D28-7:6 No - ADIRF-AS1:1 No - lnc-ZNF507-2:3 No - SP2-AS1:2 No - lnc-OIT3-5:1 Yes chr3L:6550738-6593940 lnc-DPP6-3:4 Yes chr3L:14020315-14029121 lnc-ZNF33A-137:8 No - lnc-HOXB8-1:6 No - lnc-ERVV-1-10:1 No - EAF1-AS1:5 No - lnc-FTMT-2:5 No - BISPR:11 Yes chrX:18097558-18101314 lnc-DGCR6-6:31 No - LINC00397:1 No - lnc-NUTM2B-3:1 No - lnc-DYNC1H1-1:2 No - lnc-GPR27-17:1 No - lnc-CHCHD7-3:1 No - lnc-TMEM192-2:1 Yes chr3R:17669144-17670895 lnc-ZDHHC21-3:1 No - FER1L6-AS2:3 Yes chr3L:8905918-8912671 lnc-LOX-6:1 No - DLX6-AS1:15 Yes chr2R:24814822-24835667 lnc-LRP5L-4:10 Yes chr3R:16068523-16098761 LINC02538:6 No - STARD13-AS:26 Yes chr3R:14391683-14481713 MIR4500HG:5 No - lnc-SLC2A4RG-2:6 No - lnc-AGPS-5:2 Yes chr3R:23185580-23226711 JPX:18 No - lnc-HIST1H2BJ-3:1 No - LINC01076:1 No - lnc-TMEM165-1:1 No - lnc-NEFL-6:9 No - LINC02512:5 No - LINC01029:4 No - lnc-NUTM1-11:9 No - lnc-TRIM26-2:17 No - MIR4500HG:9 No - TRMT2B-AS1:1 No - lnc-TMEM71-1:2 Yes chr3R:12352143-12356265 lnc-TRIM38-2:12 No - LINC01872:10 No - lnc-MUC20-67:5 No - lnc-FOXD1-7:4 No - lnc-ADCK5-1:1 Yes chr3L:14992289-14997983 HOXB-AS3:31 No - BISPR:2 Yes chrX:18097558-18101314 LNCARSR:18 No - lnc-GLRX2-1:1 No - lnc-MUC20-67:79 No - lnc-SEC22A-3:1 No - lnc-VSTM2B-9:13 No - SGMS1-AS1:2 No - LINC00446:7 No - lnc-IGFBP2-8:1 No - FGF14-IT1:4 No - lnc-CPLX1-8:2 Yes chr3L:16588475-16590132 lnc-TCP11-2:1 Yes chr3L:7562610-7569499 lnc-SCO1-1:1 Yes chr2L:4967832-4968935 lnc-PTCD2-3:2 No - TRAM2-AS1:8 No - LINC00907:9 No - FAM66B:3 No - lnc-AP3M1-3:3 Yes chr2R:7243024-7245776 lnc-AUH-6:1 No - lnc-NPY2R-1:14 No - TUG1:34 No - LAMTOR5-AS1:30 No - LINC01224:56 No - lnc-TTLL10-3:2 No - lnc-ALG14-5:5 No - lnc-FBXL5-7:1 Yes chr2R:17539322-17544353 LINC01697:43 No - lnc-VPS26C-2:3 Yes chrX:17862697-17887222 lnc-OTOP1-6:2 No - MIR122HG:13 No - lnc-ZNF366-18:2 No - lnc-CCDC191-1:1 Yes chr2L:3358640-3373372 lnc-TMPRSS15-17:1 No - lnc-SETD7-3:9 Yes chrX:19479984-19484643 lnc-UCHL3-5:3 No - lnc-ATOX1-1:1 No - lnc-DDAH1-1:1 No - lnc-MUC20-67:4 No - lnc-PDCD11-3:1 No - lnc-OSGEPL1-1:1 No - LAMTOR5-AS1:17 No - FAM95B1:19 No - CYP1B1-AS1:30 No - lnc-PRKN-16:2 No - lnc-NUP35-4:4 No - LY86-AS1:9 No - lnc-TMC6-3:2 No - lnc-NABP1-5:7 No - lnc-NCBP2-AS2-1:2 No - lnc-HS6ST3-2:3 No - ARF4-AS1:2 Yes chr4:1124167-1125325 LINC01128:70 No - LINC01719:33 No - lnc-ENOPH1-3:2 Yes chr3R:13634862-13646304 lnc-GPR27-15:2 No - lnc-METTL5-4:93 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-C19orf12-10:1 No - LINC01749:8 No - lnc-OSR2-4:1 No - lnc-LRP5L-4:4 Yes chr3R:16068523-16098761 CYP1B1-AS1:29 No - FAM242D:5 No - FAM87A:10 No - lnc-SEC16B-2:17 Yes chrX:12596047-12609910 STARD13-AS:8 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-SMLR1-2:2 No - lnc-ABCC5-3:14 No - LINC00877:4 No - lnc-STMP1-3:1 Yes chr3R:20042757-20048716 lnc-SMDT1-3:46 Yes chr2R:18094940-18101031 lnc-MFAP2-5:3 Yes chr3R:24113286-24128193 LINC00284:17 No - KCNQ1OT1:5 No - lnc-PTTG1IP-7:1 Yes chrX:8061645-8070237 lnc-SELENOM-1:2 Yes chrX:6540771-6589173 lnc-TRPM1-1:16 No - lnc-ERCC8-1:1 No - MAMDC2-AS1:12 No - lnc-REL-1:3 Yes chr2L:17436830-17450364 lnc-NOP58-4:1 No - lnc-TPD52-1:3 Yes chr2R:18421413-18426221 lnc-SLC4A10-7:2 No - lnc-UCHL3-10:1 Yes chr3R:4659579-4712193 lnc-EIF5B-2:1 Yes chr3L:654363-657971 lnc-YIPF4-2:1 No - lnc-SENP6-3:4 No - lnc-EPHB2-1:1 No - lnc-NPY2R-1:8 No - CERS6-AS1:1 No - SLC8A1-AS1:32 No - RNF219-AS1:11 Yes chrX:15350239-15379064 lnc-CCDC117-2:1 No - SNRK-AS1:5 Yes chr2R:14235787-14239703 ATP1A1-AS1:8 Yes chr3R:20948714-20976239 lnc-TIGD1-1:15 Yes chr3R:24063077-24108960 lnc-TMEM161B-16:1 No - lnc-ABCC5-3:13 Yes chrX:1920166-1922874 lnc-ATP6V1H-3:1 Yes chr2R:17792870-17800677 lnc-KRR1-4:18 No - lnc-SUMO1-8:1 No - lnc-HMGB2-15:5 Yes chrX:16787283-16789644 lnc-DLD-1:1 Yes chr2L:7811438-7820771 ITGB2-AS1:9 Yes chrX:8061645-8070237 lnc-FAM72B-8:13 No - lnc-COG5-4:1 Yes chr3L:837861-839931 RBM26-AS1:9 Yes chr2L:19493251-19497978 PIK3CD-AS2:7 Yes chr3R:20628972-20634732 lnc-CAST-6:2 Yes chr3R:23227727-23248903 lnc-URM1-1:3 Yes chr3L:7639811-7640446 lnc-ITGB1-1:1 No - LINC00905:7 No - lnc-NBPF11-1:38 No - lnc-ANKRD36B-3:15 No - lnc-SERPINB9-1:3 No - lnc-CTH-8:1 No - lnc-SLITRK6-14:1 No - lnc-FAM207A-2:1 No - lnc-TBC1D7-1:4 No - ZEB1-AS1:5 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-TIGD1-1:12 Yes chr3R:24063077-24108960 lnc-ZNF717-3:1 No - lnc-GTF2B-15:6 No - lnc-ANKRD27-1:2 No - lnc-RAB3A-3:1 Yes chr3L:15566013-15576313 FAM95B1:22 No - lnc-ZNF382-5:3 No - LINC00963:27 No - lnc-FAM98A-9:1 No - lnc-SCGB2B2-1:4 No - FAM95B1:18 No - lnc-CCNB1IP1-1:3 No - lnc-POLRMT-6:6 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-NTN1-3:2 Yes chr3L:16586108-16587057 LINC00630:22 No - LINC00662:27 No - lnc-LRP5L-4:28 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-MRPS33-2:2 Yes chr3R:16436045-16436597 lnc-HSPA4-7:1 No - lnc-FSCN1-4:1 No - lnc-FAM162A-2:6 Yes chr3L:19807232-19810398 lnc-PRIM2-7:13 No - LINC01436:3 No - lnc-ATG12-4:1 No - lnc-NSA2-6:1 No - HDAC2-AS2:108 Yes chr2R:18718114-18754675 lnc-HCRTR1-5:1 No - MIR4435-2HG:25 No - LINC02018:25 No - lnc-C9orf66-15:14 Yes chr2L:94739-102086 lnc-MCFD2-2:1 Yes chr2R:6209782-6214122 lnc-SCAF4-2:1 No - lnc-SH3BGRL2-6:1 No - lnc-ADRB2-2:1 No - LINC02012:5 No - lnc-PDIA6-1:1 Yes chr2R:16324813-16336637 GMDS-DT:141 No - lnc-ZNF497-1:1 No - lnc-TP53TG3-66:3 No - lnc-CCDC146-96:5 No - lnc-TMCO1-1:2 Yes chr3R:24290172-24293371 lnc-ESM1-1:8 No - LAMTOR5-AS1:21 No - lnc-RGPD2-3:1 No - lnc-OPCML-6:3 Yes chr3L:5424109-5442399 LINC01233:1 No - lnc-TUBGCP6-5:9 Yes chr3R:13026283-13030659 lnc-CUL7-3:1 Yes chr3R:14512639-14513637 lnc-DENND2D-1:1 Yes chr2R:13486634-13494862 lnc-ZNF682-3:4 No - lnc-AGMAT-6:1 No - lnc-PPP1R3G-9:5 No - lnc-SPARCL1-2:1 No - CERS6-AS1:8 Yes chrX:6257668-6267228 TARID:7 Yes chr2R:17757405-17760517 MIR663AHG:17 No - lnc-SPATA31A7-14:2 No - LINC02527:7 No - ZRANB2-AS2:40 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-TRIM38-2:3 No - lnc-GNAL-1:1 Yes chr2L:8198882-8200652 lnc-SLC17A5-1:2 Yes chr2L:19548507-19556451 MAPKAPK5-AS1:19 No - lnc-METTL5-4:115 Yes chr2L:7377702-7384344 PPP1R26-AS1:9 No - LINC00454:8 No - lnc-DAOA-14:9 No - LINC00635:27 No - lnc-CABIN1-1:3 No - LINC00896:11 No - LINC01268:2 No - LINC01396:1 No - lnc-CRYZ-1:1 No - LINC00710:17 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-SRSF12-1:1 No - LINC02352:13 No - LINC01011:7 No - lnc-YIPF7-1:4 No - LINC00898:3 No - lnc-DHX38-40:5 Yes chr4:501810-540874 lnc-CHDH-1:1 Yes chr2L:16165831-16190540 lnc-TOPBP1-5:1 No - DAB1-AS1:34 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-TNK2-3:1 No - lnc-ZNF667-2:3 No - ADIRF-AS1:3 No - lnc-DLK1-35:51 No - lnc-C2orf49-2:4 No - lnc-SPRYD3-1:15 No - RAB30-AS1:24 No - SRD5A3-AS1:27 Yes chr2L:8305586-8306741 lnc-B3GNT10-21:26 No - TMEM254-AS1:8 No - lnc-CTSZ-2:3 Yes chr2R:23942538-23946936 PART1:10 Yes chrX:3176440-3343767 lnc-TNFRSF14-2:2 No - STARD13-AS:27 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-IRF1-1:2 Yes chr2R:22421013-22425482 lnc-ZNF644-2:1 No - lnc-SMIM32-4:7 No - PDZRN3-AS1:1 Yes chr4:663621-669884 lnc-TRAPPC12-4:1 Yes chr3L:10663376-10664435 LINC00635:2 No - MIR3936HG:17 No - lnc-TMEM255B-5:22 No - lnc-ING2-2:1 No - lnc-SSUH2-11:2 Yes chr4:936819-949441 lnc-ARPC3-2:4 No - lnc-CLSPN-4:1 Yes chr2R:13943387-13958089 lnc-FBXO25-2:2 No - LINC01623:1 No - lnc-SERPINB5-1:2 Yes chr3R:25260963-25262498 lnc-SH2B2-6:1 Yes chrX:7609148-7678859 MAPKAPK5-AS1:20 No - LINC00240:4 No - SMIM10L2B-AS1:6 No - lnc-PPP4R3C-2:14 No - lnc-PHB2-4:1 Yes chr2L:2225545-2226294 lnc-PEX10-3:1 No - LINC00635:34 No - lnc-CPN2-4:8 No - LINC01278:16 No - lnc-CMPK2-16:1 No - lnc-BECN2-2:1 Yes chr2L:21166046-21168581 lnc-DCUN1D4-1:1 No - lnc-KIAA0930-1:2 No - LINC01224:12 No - lnc-MUC20-68:1 No - lnc-SPTBN5-2:3 No - lnc-CMC1-7:1 No - lnc-COA6-9:1 No - lnc-UBL5-7:3 No - lnc-PLCB1-1:2 Yes chr2R:23845001-23847024 lnc-ANKRD36B-3:29 No - lnc-ODR4-3:1 No - lnc-THRB-3:1 No - LINC01206:29 No - LINC00504:2 No - lnc-NXPH1-2:7 No - lnc-NPY2R-1:17 No - lnc-LRP5L-4:25 Yes chr3R:16068523-16098761 LINC00635:31 No - lnc-TRANK1-1:2 No - lnc-HIST2H2AA4-1:1 No - lnc-CLUH-2:1 Yes chr2R:16178826-16185103 lnc-ZSWIM8-2:2 Yes chr4:1035288-1053703 lnc-TBC1D28-7:12 No - lnc-NUDT4B-1:4 No - lnc-ACTR2-3:12 No - lnc-FAM162A-2:2 Yes chr3L:19807232-19810398 LINC01535:14 No - lnc-RBM12B-2:2 Yes chrX:7731779-7734651 lnc-ANKRD20A4-18:6 No - LINC00466:17 No - lnc-AAK1-1:2 Yes chr2L:18957732-18968744 lnc-LMBRD1-5:22 No - lnc-ISX-7:1 No - lnc-EXOC2-2:2 No - CKMT2-AS1:13 No - RGPD4-AS1:7 No - lnc-PPP4R3C-2:13 No - lnc-TSPAN14-1:4 No - lnc-MSL2-2:1 Yes chr3R:19890689-19898738 lnc-ZNF100-2:3 No - lnc-LYZL2-11:3 No - lnc-FBLN7-1:2 Yes chrX:635890-643760 lnc-TBC1D7-1:8 No - lnc-MAP3K7CL-5:1 Yes chr3R:23185580-23226711 PTOV1-AS2:5 Yes chr3R:24227023-24228538 LINC00458:8 No - lnc-VSTM2B-9:8 No - TUG1:33 No - lnc-RHEX-3:1 No - lnc-JOSD1-1:6 No - lnc-MBD3L4-1:2 Yes chr3R:9559760-9561533 LINC00343:21 No - lnc-MTFP1-4:2 No - lnc-PRDM4-3:5 No - TEX41:57 No - CYP1B1-AS1:27 No - lnc-ANKRD36B-3:1 No - lnc-PI4KA-2:1 Yes chr2R:23843483-23844763 lnc-CACNA1E-3:1 No - lnc-SETD7-3:1 No - lnc-ST8SIA2-3:1 No - LINC01515:1 No - lnc-GREM2-7:2 No - lnc-FLI1-6:3 No - lnc-ZNF497-1:2 No - lnc-LYN-2:1 Yes chr3L:4592447-4626196 lnc-TM4SF20-1:7 Yes chr2L:5029609-5037279 LINC00454:10 No - lnc-DERL1-3:7 No - DARS-AS1:10 No - HAGLROS:3 No - lnc-SLAMF8-1:13 No - SRD5A3-AS1:15 Yes chr2L:8305586-8306741 lnc-ALG1L-2:2 No - lnc-IAH1-2:12 No - lnc-SLC4A3-2:2 No - DLEU2:10 No - lnc-GK5-7:1 Yes chr3L:3052514-3054906 lnc-GOLGA2-4:1 Yes chr2R:6076910-6078088 LINC00115:31 No - LINC00661:16 No - lnc-SOX9-4:3 No - lnc-TUBB2A-7:1 No - STX18-AS1:9 No - INE1:2 Yes chr2R:9688289-9693328 lnc-FAM71E1-2:2 Yes chr3L:21574131-21575874 lnc-HNF4A-1:1 Yes chr2L:8687226-8709611 lnc-CCDC150-1:5 Yes chrX:9608946-9623243 MIR34AHG:12 No - LINC01116:19 No - lnc-HS6ST3-2:2 No - lnc-S100A13-2:2 No - lnc-URGCP-2:1 No - HOTTIP:6 No - LINC00664:3 No - PLS3-AS1:3 Yes chrX:17285704-17301929 lnc-TAF7-5:7 No - lnc-TMEM252-2:3 Yes chr3L:16126018-16128531 lnc-FAM162A-2:4 Yes chr3L:19807232-19810398 lnc-OR4F29-1:13 No - lnc-ARVCF-4:2 Yes chrX:13616989-13619207 lnc-TBC1D28-7:8 No - lnc-IGLL1-1:57 No - lnc-ZNF33A-8:1 No - lnc-TMSB15A-5:1 No - lnc-RFPL3-5:1 No - lnc-MAP3K14-3:4 No - LINC02098:6 No - LY86-AS1:3 No - LINC00310:7 No - lnc-TBC1D28-7:17 No - lnc-MAK-5:6 No - FENDRR:15 No - LINC01036:29 No - LINC01001:1 No - PRKCQ-AS1:16 No - lnc-SEC24C-5:4 No - MIR663AHG:7 No - lnc-IL6R-1:1 Yes chrX:12516634-12568452 LINC00630:39 No - lnc-LONP2-10:1 No - lnc-BAZ2B-1:3 No - ASB16-AS1:4 No - LINC01204:3 No - lnc-ST6GALNAC3-3:1 No - lnc-ST7L-4:1 No - LINC00710:2 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-PHGDH-9:1 No - lnc-ACTR2-3:20 No - THAP9-AS1:18 Yes chr2R:8893613-8898798 lnc-GRK3-5:1 No - lnc-METTL5-4:97 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-SRD5A1-2:1 No - STARD13-AS:2 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-FNDC10-1:2 Yes chr2L:19034444-19041541 lnc-WRNIP1-33:1 No - lnc-ZNF573-1:4 No - lnc-SYT15-1:8 No - lnc-HNRNPD-1:1 No - lnc-KLF17-1:10 No - lnc-FBXO25-3:2 No - lnc-FUT10-1:1 No - lnc-AGPAT2-1:2 Yes chr3L:4384442-4403181 lnc-B3GALNT2-1:1 No - lnc-NMRK1-1:2 Yes chrX:1927683-1930517 lnc-ATRIP-24:5 No - lnc-STK32A-2:1 No - lnc-TIGD2-2:1 No - lnc-SLX1B-3:25 No - LINC01843:12 No - lnc-DAOA-14:2 No - SRGAP3-AS2:2 No - lnc-GABPA-13:2 Yes chrX:530501-579044 lnc-TLE1-1:2 No - lnc-RASD2-1:1 No - LINC01440:8 No - lnc-NTM-1:2 No - LINC02550:12 No - lnc-ZNRF2-1:1 No - lnc-ST3GAL4-4:3 Yes chrX:2740384-3134532 FAM226B:6 Yes chrX:13368191-13370472 lnc-SLC2A4RG-2:4 No - LINC01184:8 No - LINC02502:10 No - LINC01023:4 No - lnc-PACRGL-6:1 Yes chrX:11219379-11302783 lnc-KLF17-1:7 No - lnc-PRDM9-12:1 No - STARD13-AS:28 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-ZNF780B-3:4 No - lnc-LSM7-2:1 No - lnc-COL28A1-1:8 Yes chr2L:2217290-2220625 TARID:11 No - lnc-PTPRZ1-3:3 Yes chr4:1230837-1271759 FAM66E:3 No - lnc-RAD1-3:2 No - lnc-EHD4-3:1 No - lnc-GSDMD-1:2 No - lnc-URGCP-2:2 No - lnc-SEC22A-4:1 Yes chr3L:16491838-16543370 lnc-PREPL-3:3 Yes chr3R:26344290-26345473 DLEU7-AS1:3 No - lnc-RASL10A-1:2 Yes chr3R:5414527-5458394 EMX2OS:13 No - MBNL1-AS1:4 Yes chr2R:17216549-17379376 lnc-IRF4-2:2 No - ITGB2-AS1:10 Yes chrX:8061645-8070237 lnc-ZNF33B-3:5 No - lnc-CPN2-4:9 No - lnc-ATG7-4:1 No - lnc-AOAH-1:1 No - NUP50-DT:51 No - lnc-ZNF639-2:1 No - lnc-IMPACT-1:2 No - lnc-MUC20-67:31 No - lnc-FAM196A-1:2 Yes chr3R:23781765-23801634 MIR4458HG:2 No - lnc-SLCO4A1-5:2 No - lnc-COX20-2:2 No - LINC00963:30 No - LINC00592:6 No - LINC00484:7 No - LINC02226:23 No - lnc-UPK3BL2-1:6 No - lnc-YES1-8:2 No - lnc-GABPA-13:1 Yes chrX:530501-579044 lnc-PLPPR3-1:4 No - UCA1:10 No - LINC00454:9 No - lnc-MB-7:1 Yes chr3L:9446864-9450785 NFIA-AS1:5 Yes chr4:268175-276369 lnc-AKR1B1-1:2 No - lnc-ZMAT4-4:1 No - LINC01128:85 No - LINC00484:2 No - SDCBP2-AS1:6 No - lnc-PDE7A-1:1 No - lnc-DET1-1:15 Yes chr2L:10973443-10975293 lnc-MAK-5:1 No - lnc-EMB-7:1 No - lnc-DPH1-5:3 Yes chr2L:13212335-13215350 lnc-ARMC1-3:2 No - lnc-FBXL18-1:9 No - lnc-MYOC-2:2 Yes chr2R:6642418-6645098 lnc-IL17RA-33:4 No - ITGB2-AS1:11 Yes chrX:8061645-8070237 VIPR1-AS1:3 No - LINC01224:38 No - lnc-GTPBP1-4:1 Yes chr2R:6811019-6818199 lnc-CEP72-2:1 Yes chr3L:16354746-16359428 lnc-ANKMY2-2:1 No - lnc-LRR1-1:2 Yes chr3R:9778042-9779528 MIR22HG:18 No - lnc-ZNF626-1:1 No - LINC00528:14 No - lnc-HLA-B-2:3 No - lnc-TGFBRAP1-14:1 No - lnc-RHBDD1-6:4 No - NPSR1-AS1:7 Yes chr3R:25923499-25956270 lnc-TOMM20-2:13 No - lnc-ZNF131-7:1 No - lnc-SETD7-3:5 No - LINC00907:10 No - lnc-FGFR1-2:1 Yes chr2R:24509508-24515320 lnc-FYTTD1-6:4 No - lnc-SAMSN1-3:4 No - lnc-CD200-1:4 No - TMEM72-AS1:17 Yes chr3R:23114014-23117931 lnc-TBC1D28-7:18 No - lnc-AANAT-3:1 No - LPP-AS2:2 Yes chr4:1057365-1065001 PROX1-AS1:55 No - lnc-NBPF11-1:33 No - EDRF1-AS1:37 No - CASC15:19 No - LAMTOR5-AS1:37 No - SOS1-IT1:3 Yes chr2L:13813816-13819824 lnc-VRK2-9:1 Yes chr3R:10051508-10052869 lnc-ZNF704-7:3 No - lnc-THAP7-3:1 No - MAMDC2-AS1:14 No - lnc-NLRC4-3:1 No - RNF219-AS1:8 Yes chrX:15350239-15379064 MCHR2-AS1:10 Yes chr3L:18560258-18576326 ZEB1-AS1:1 Yes chr3R:30765926-30789202 GMDS-DT:133 No - lnc-PIEZO2-4:3 No - lnc-METTL5-4:90 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-CTAGE1-6:1 No - LRRC75A-AS1:58 No - RNF219-AS1:6 Yes chrX:15350239-15379064 STARD13-AS:3 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-RMI1-5:7 No - lnc-TAS2R1-1:2 No - lnc-RWDD2B-2:1 Yes chrX:5421533-5427219 lnc-ANGPTL6-1:2 No - lnc-SCAF11-1:3 No - STARD13-AS:29 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-METTL5-4:113 Yes chr2L:7377702-7384344 LINC00629:5 No - LINC01440:9 No - lnc-OXGR1-8:2 No - LINC01349:4 No - MCHR2-AS1:13 No - GNAS-AS1:4 Yes chr2R:23942538-23946936 LINC00343:19 No - lnc-POTEH-7:7 No - lnc-NBPF11-1:9 No - lnc-MUC20-67:99 No - lnc-NPY2R-1:15 No - ZNF350-AS1:6 No - LINC00397:4 No - lnc-CILP2-1:2 Yes chrX:15992468-15996509 KTN1-AS1:7 No - WDR11-AS1:15 No - lnc-GNAT3-1:2 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-MYNN-10:1 No - ELOVL2-AS1:5 No - lnc-TBC1D28-7:13 No - NR2F1-AS1:42 No - EAF1-AS1:3 No - FAM95B1:20 No - DNAJC3-DT:23 No - lnc-ATP6V1C2-5:1 No - lnc-TBCCD1-4:18 No - lnc-RPS6-1:2 Yes chrX:8592031-8602036 lnc-IL17RA-36:19 No - lnc-LRRC71-4:1 No - FGF14-IT1:8 No - lnc-SLC14A1-3:2 No - lnc-PTN-2:9 No - lnc-ZNF599-3:6 No - lnc-TRIM38-3:1 No - LINC01749:9 No - lnc-ZNF366-6:2 No - NR2F1-AS1:41 No - lnc-SYT15-3:1 No - PRKCQ-AS1:31 No - lnc-SOX9-5:3 No - lnc-MFAP2-3:1 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-LYZL1-15:9 No - lnc-MICALL2-2:1 No - lnc-BTBD8-1:2 No - ARHGEF26-AS1:7 No - lnc-IGLL1-1:6 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-MYNN-11:1 No - lnc-SGK1-3:4 No - lnc-UCHL3-5:4 No - lnc-IL17RA-10:1 No - LINC00899:13 No - lnc-PERP-2:6 No - lnc-M1AP-6:4 Yes chrX:9585675-9589813 lnc-MFAP4-3:3 No - HOXB-AS3:34 No - lnc-MRPL40-3:1 Yes chr3L:11121966-11123216 lnc-DYNC1H1-1:3 No - lnc-CDKL3-2:3 No - RAP2C-AS1:5 No - lnc-CMPK2-5:12 No - LINC01505:9 No - lnc-METTL5-4:120 Yes chr2L:7377702-7384344 MORC2-AS1:5 No - lnc-MMP23B-3:1 Yes chrX:22444227-22447808 lnc-MMADHC-2:5 Yes chr2R:16266960-16271971 lnc-GOLGA4-4:2 Yes chrX:15844476-15847858 lnc-HEATR6-1:15 No - lnc-SLC25A32-3:9 No - lnc-SYCE3-1:2 No - lnc-RPAP1-1:4 No - lnc-ZNF507-5:6 No - TRAM2-AS1:13 No - lnc-UQCRFS1-10:3 No - LINC01836:10 No - lnc-NPBWR1-12:16 No - LINC01033:2 No - lnc-CMBL-4:1 No - lnc-METTL5-4:91 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-SLC29A4-5:2 No - LINC01320:16 No - CASC15:2 No - NIFK-AS1:9 No - LINC01435:20 No - LIPE-AS1:5 No - lnc-SLC29A4-5:3 No - lnc-HDDC2-5:7 Yes chr2R:7995438-7998278 lnc-DHRS7C-1:1 Yes chr3L:16586108-16587057 lnc-CEACAM20-8:4 No - SCOC-AS1:4 Yes chr3R:27273705-27274565 ZEB2-AS1:10 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-ZNF330-5:2 No - lnc-HYOU1-1:3 Yes chr3L:23147656-23150499 lnc-METTL5-4:112 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-UGT2A3-4:1 No - lnc-RHOB-17:1 No - lnc-SAMSN1-2:2 No - lnc-MAEA-6:1 Yes chr2R:14671396-14713622 LINC00310:10 No - LINC00665:11 No - TPT1-AS1:23 No - lnc-KHDRBS3-6:2 No - lnc-GMDS-6:23 No - LINC01928:5 No - POC1B-AS1:37 No - lnc-CFI-1:1 No - lnc-ABCC5-3:7 Yes chrX:1920166-1922874 lnc-GALNT15-4:1 No - lnc-TMEM161B-3:2 No - TRDN-AS1:33 No - lnc-TMEM18-4:3 No - LINC01372:1 No - RPARP-AS1:8 No - lnc-COL28A1-1:11 No - LAMTOR5-AS1:32 No - lnc-SFT2D3-2:2 No - lnc-ZNF644-1:12 No - lnc-METTL5-4:94 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-BTG3-4:2 No - lnc-CYR61-4:1 Yes chrX:13294473-13302415 EAF1-AS1:6 No - lnc-CEP89-2:1 No - STARD13-AS:36 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-TFEC-2:6 No - lnc-PPP4R3C-2:8 No - LINC01350:10 No - lnc-COG5-3:1 No - lnc-GPX7-1:1 No - lnc-HMGCR-1:1 Yes chr3L:8282528-8289870 lnc-NABP1-5:6 No - MIRLET7DHG:4 No - lnc-FTCDNL1-4:3 No - LINC00868:3 No - lnc-FGFR2-12:11 No - FLG-AS1:1 No - lnc-UQCRFS1-10:2 No - lnc-PTPN14-7:1 Yes chr3R:11328480-11407627 lnc-C20orf144-1:1 No - lnc-PLCB1-1:5 No - lnc-TMEM65-4:1 Yes chr2L:22844220-22854541 lnc-NIT2-1:2 Yes chr3R:9401495-9402618 CPB2-AS1:1 Yes chrX:17080423-17087675 lnc-TTC3-5:1 Yes chr3L:20768207-20769482 LINC00963:11 No - lnc-CDC73-2:2 No - LINC02532:47 No - LBX1-AS1:7 No - LINC01533:5 No - USP27X-AS1:3 No - lnc-MUC20-67:70 No - DAB1-AS1:17 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-CPN2-4:11 No - lnc-PDZD7-3:2 No - lnc-LRP5L-4:29 Yes chr3R:16068523-16098761 LINC00454:3 No - lnc-SEPT7-1:8 No - lnc-MRPS30-8:1 No - LINC02427:13 No - TNRC6C-AS1:4 Yes chr4:649041-663103 LINC01128:73 No - lnc-SDHAF4-2:1 No - lnc-C2orf74-2:1 Yes chr3R:24635270-24650043 LINC00539:4 No - ARHGEF26-AS1:11 No - PTPRD-AS2:3 No - lnc-LRP5L-6:1 No - MCF2L-AS1:4 Yes chr2R:5468319-5495861 lnc-OSBP-1:2 No - lnc-PPP4R1-18:2 No - LINC00910:9 No - lnc-IGFBP1-9:1 No - lnc-RIPOR2-1:2 No - LINC02019:9 No - TARID:14 No - lnc-SHROOM1-1:1 No - NIFK-AS1:14 No - LINC01081:14 No - lnc-ZNF487-1:8 No - lnc-SDF2L1-1:1 No - lnc-SPATA31D1-4:27 No - LINC02086:19 No - lnc-IL17RA-36:23 No - lnc-LHCGR-2:2 No - lnc-C11orf95-1:17 No - lnc-BECN2-10:1 Yes chr2L:21166046-21168581 lnc-SSBP4-2:2 Yes chr3L:19889120-19909410 lnc-RAD52-2:6 No - lnc-FAM173B-4:1 No - lnc-PPIAL4A-2:13 No - lnc-PDZD2-1:3 No - GMDS-DT:130 No - lnc-PCDHGA1-2:1 No - DIAPH2-AS1:6 Yes chr2L:20758144-20768053 lnc-DTNBP1-10:1 No - SATB1-AS1:9 No - lnc-PFKFB3-453:1 No - LINC00343:12 No - STARD13-AS:4 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-KCNS2-2:1 Yes chr2R:19493996-19496856 CIRBP-AS1:2 Yes chr2R:14602004-14604337 LINC02035:6 No - lnc-SWT1-1:12 No - lnc-SLC14A1-6:3 No - lnc-AP3M1-3:2 Yes chr2R:7243024-7245776 lnc-METTL5-4:86 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-MOCS1-1:6 Yes chrX:1289713-1322362 lnc-HEATR1-4:2 No - lnc-CSPP1-1:4 No - LINC01578:7 Yes chr2L:2979562-2987723 lnc-UVSSA-1:7 No - RNF144A-AS1:2 Yes chr2R:10740054-10798709 lnc-FOXD4L5-23:6 No - SCOC-AS1:2 Yes chr3R:27273705-27274565 lnc-TIMP3-8:1 No - LINC01206:28 No - lnc-ETS1-1:4 No - LINC01719:24 No - lnc-LSM11-6:3 No - lnc-FTCDNL1-4:18 No - lnc-PRSS55-1:8 Yes chr3L:16339003-16345241 lnc-SMDT1-3:45 Yes chr2R:18094940-18101031 NR2F1-AS1:32 No - lnc-TGFBRAP1-1:3 No - lnc-ZNF507-5:5 No - SATB1-AS1:10 No - lnc-MAX-4:1 No - LINC02101:7 No - TMEM72-AS1:19 No - lnc-MTHFD1-1:2 No - lnc-FASTKD3-6:1 No - FAM138C:5 Yes chr2R:12180493-12182373 LINC02112:25 No - lnc-SBSPON-4:1 No - lnc-LIMS3-1:9 Yes chr3R:8356978-8359964 lnc-ANKRD1-1:2 No - lnc-OSTM1-2:1 No - lnc-STARD5-1:2 No - lnc-FTCDNL1-4:43 No - lnc-RBM12B-4:1 Yes chr2L:12424904-12426440 LINC01255:9 No - lnc-ELAVL2-2:2 No - STARD13-AS:9 Yes chr3R:14391683-14481713 MIR663AHG:22 No - lnc-HES4-2:1 No - MIR663AHG:14 No - lnc-PSG9-4:2 No - lnc-ZNF66-9:1 No - lnc-HS3ST4-1:9 No - lnc-OR4F29-1:10 No - LINC00905:11 No - lnc-ANKRD36B-3:6 No - LINC00454:1 No - ADAMTS9-AS1:25 Yes chr2R:22807860-22815993 HOXB-AS3:29 No - STARD13-AS:32 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-MAP1LC3B-1:4 No - lnc-MPP2-1:1 No - lnc-CCDC140-9:3 No - lnc-SPATA31D1-4:38 No - LINC00635:15 No - NDUFA6-DT:61 No - lnc-EVX2-7:1 Yes chr3R:6752864-6754194 lnc-SOX11-1:2 Yes chr2R:23978801-23985177 LINC00882:15 No - MCPH1-AS1:7 Yes chr2R:11895997-11903918 LINC00837:8 No - lnc-CDHR3-3:1 No - lnc-VWC2L-1:4 No - CYP1B1-AS1:31 No - lnc-MESD-7:1 Yes chr3R:25097672-25102146 lnc-LRFN1-1:1 Yes chr2R:8009119-8013755 lnc-ESM1-1:11 No - lnc-PNRC2-6:1 No - lnc-IGLL1-1:19 Yes chr3L:13906897-13925335 UBAC2-AS1:9 No - lnc-C20orf203-1:3 No - lnc-CLIC5-1:5 No - LINC00446:3 No - STARD13-AS:55 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-ARHGAP44-3:1 No - lnc-RPL14-1:2 Yes chr3L:8601006-8602392 BACH1-IT2:2 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-FUBP1-3:1 No - CHKB-DT:63 Yes chr2L:21614232-21624080 lnc-RAB23-16:1 No - lnc-SLC16A11-7:9 No - LINC01224:34 No - NR2F1-AS1:40 No - lnc-SOD1-3:2 Yes chr3L:5657913-5749599 lnc-KIF25-2:4 No - lnc-FKBP9-3:1 No - lnc-MEMO1-4:2 No - lnc-OSBPL9-4:1 Yes chrX:11864651-11868893 lnc-SGK1-3:5 No - lnc-CTAGE1-9:10 No - lnc-CDH12-1:2 No - lnc-DNAJB6-11:1 Yes chr2L:1008378-1048053 TEX26-AS1:7 No - lnc-DENND4C-1:1 Yes chrX:7899624-7901331 lnc-C2orf73-5:1 Yes chr2L:5327975-5328879 RMDN2-AS1:2 No - LINC01676:27 No - lnc-TRIM26-2:19 No - lnc-EMC8-8:2 No - lnc-FOXD4L5-25:12 No - ZNF451-AS1:28 Yes chr3L:15521711-15524137 MAGI2-AS3:44 No - lnc-SYT15-1:7 No - lnc-BHLHA15-3:1 No - lnc-EDRF1-1:26 No - lnc-ZNF281-4:1 No - NCK1-DT:37 No - lnc-HOXB8-1:2 No - SNHG8:14 No - lnc-NRG1-3:1 No - lnc-TMEM248-2:1 No - lnc-BACH1-3:1 Yes chr3R:20860187-20866231 PAXIP1-AS1:7 No - lnc-ATP6V1F-1:4 No - LINC00635:16 No - lnc-SNX11-2:3 No - lnc-ARL3-1:1 No - THRB-AS1:9 No - lnc-RINT1-3:1 No - lnc-SAMD11-5:3 No - LINC00351:2 No - SNHG26:22 No - LINC00207:6 No - LINC02246:25 No - lnc-ZNF721-4:1 No - lnc-PRDX3-1:2 Yes chr3R:31405245-31457873 ATP6V0E2-AS1:6 No - lnc-ZNF267-1:3 No - CERS6-AS1:10 Yes chrX:6257668-6267228 lnc-RAB12-1:1 Yes chr2L:6932545-6942814 LINC00665:14 No - lnc-RARRES1-3:1 Yes chr2L:4838347-4841465 lnc-AMELY-1:4 No - LINC00635:24 No - lnc-SPATA31D1-4:3 No - lnc-SEMA4G-2:1 No - lnc-FRG2-13:1 No - DAB1-AS1:12 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-ZNF74-7:3 No - YEATS2-AS1:3 Yes chr2L:8434058-8437365 PROX1-AS1:53 No - RPARP-AS1:11 No - lnc-KLHL32-4:10 No - CPB2-AS1:4 Yes chrX:17080423-17087675 ADIRF-AS1:2 No - lnc-IVNS1ABP-1:5 No - lnc-DLK1-13:1 Yes chr3R:24295078-24314541 lnc-DPP4-2:5 No - lnc-FAM78A-3:12 Yes chr2R:22918937-22924742 lnc-ADPRM-2:2 Yes chr2L:16766566-16788766 STARD13-AS:10 Yes chr3R:14391683-14481713 SRD5A3-AS1:19 Yes chr2L:8305586-8306741 lnc-COPB2-1:1 Yes chr3R:27916908-27918248 lnc-TCF7-5:2 No - lnc-MAP3K14-3:5 No - lnc-ATP5ME-1:14 No - lnc-KLF17-1:8 No - lnc-LRP5L-4:7 Yes chr3R:16068523-16098761 LINC01954:16 No - lnc-FAM120B-3:5 No - lnc-PAFAH1B1-1:2 No - lnc-HDDC2-5:4 Yes chr2R:7995438-7998278 FAM95C:2 No - lnc-GTPBP1-5:1 Yes chr2R:6811019-6818199 lnc-MOCS1-1:5 Yes chrX:1289713-1322362 lnc-FASLG-2:2 No - lnc-SAMD3-1:2 No - lnc-CDKL4-6:1 No - lnc-ENO1-2:1 Yes chr3L:8449922-8472669 LINC00355:15 No - MIR29B2CHG:61 No - lnc-TBC1D28-7:2 No - lnc-PPARA-6:3 No - lnc-HDDC2-5:6 Yes chr2R:7995438-7998278 lnc-SLC10A6-2:8 No - LINC01206:30 No - lnc-RXFP4-2:1 Yes chr2L:19502335-19508764 LINC01206:27 No - lnc-ZNF221-2:1 No - DARS-AS1:34 No - lnc-GRM6-1:3 No - lnc-TRMT61B-6:1 No - lnc-NEURL1-1:1 No - ZNF503-AS2:2 Yes chr2L:14490859-14494019 lnc-RXFP3-3:1 No - lnc-SERPINB9-1:5 No - SRD5A3-AS1:14 Yes chr2L:8305586-8306741 lnc-AMPH-6:1 No - LINC02525:29 No - lnc-IL17RA-11:2 No - LIPE-AS1:9 No - SGMS1-AS1:4 No - lnc-EDRF1-1:18 No - LINC00862:1 No - lnc-AKAP8-2:1 No - lnc-IGLL1-1:61 No - lnc-ATG12-5:1 Yes chrX:11677344-11678589 LINC01184:27 No - lnc-LYZL1-15:10 No - lnc-TMED9-2:1 No - lnc-ALKBH7-2:2 No - PROX1-AS1:56 No - lnc-GORAB-1:1 No - MIR663AHG:11 No - lnc-PTN-2:11 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-C19orf57-7:2 No - lnc-BOK-1:1 No - LINC00343:20 No - lnc-GGA2-1:2 Yes chr3R:29930551-29933057 NNT-AS1:6 No - LINC-PINT:77 No - lnc-SENP6-2:8 No - RAMP2-AS1:5 No - lnc-CRNKL1-3:2 Yes chrX:23022898-23035550 TMCC1-AS1:5 No - lnc-HMGB2-15:6 Yes chrX:16787283-16789644 lnc-ZNF146-1:14 No - lnc-LRRTM1-2:4 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-AGMAT-4:1 Yes chr3L:25798441-26014112 LINC00938:3 No - LINC01124:20 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-SUMO1-7:2 No - LINC01285:5 No - lnc-TMEM170B-4:1 No - LINC01515:6 No - ATP1A1-AS1:6 Yes chr3R:20948714-20976239 SRD5A3-AS1:1 No - lnc-SIRT1-1:2 No - LINC01872:9 No - lnc-GPA33-3:1 No - LINC02532:53 No - lnc-LIMS3-2:12 No - lnc-PAQR9-2:1 Yes chr2R:21011970-21015628 lnc-RPS21-3:1 No - lnc-SLC4A3-2:3 No - LINC01128:86 No - LHX5-AS1:2 Yes chrX:8756539-8805804 LINC00454:11 No - lnc-LRRTM1-2:3 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-CNNM1-1:3 No - lnc-ACACB-1:4 Yes chr2R:7974115-7991862 MIR22HG:19 No - lnc-IL17RA-33:6 No - TEX26-AS1:10 No - LINC01255:18 No - lnc-CYYR1-3:1 No - lnc-TRIM43B-1:3 No - SDCBP2-AS1:10 No - lnc-RPS6-3:1 Yes chrX:8592031-8602036 lnc-DCTD-24:2 No - lnc-POU3F4-1:1 Yes chr3L:6790158-6794941 lnc-NKD2-2:2 No - lnc-LDLRAD1-1:3 No - lnc-ADIRF-1:2 No - lnc-HIVEP1-1:4 No - CDC37L1-DT:15 No - lnc-BRI3-3:1 Yes chr3L:11136049-11163984 lnc-ALG2-6:40 No - lnc-SLC2A8-2:1 No - lnc-BANP-14:2 No - lnc-ACOX2-1:1 No - lnc-ANKRD18B-6:11 No - lnc-CYP4F22-3:3 No - lnc-PEX10-2:1 No - lnc-ANGPT2-2:7 No - NDUFA6-DT:66 No - lnc-SETD7-3:4 No - lnc-RAD1-5:2 No - lnc-MRPL47-2:1 Yes chr2R:17429353-17430963 PRKCQ-AS1:29 No - lnc-FLOT1-1:1 No - ZNF571-AS1:14 No - MAMDC2-AS1:13 No - LINC00520:4 No - MIRLET7DHG:1 No - EMX2OS:9 No - lnc-CAST-6:1 Yes chr3R:23227727-23248903 lnc-TBC1D28-7:5 No - EGFLAM-AS3:2 Yes chr2R:16031930-16047243 lnc-CNNM2-1:1 No - lnc-RAB33B-4:1 No - LINC02018:27 No - MACROD2-IT1:2 No - lnc-USP6NL-7:10 No - LINC01278:11 No - LINC00310:13 No - lnc-OTULIN-8:1 No - lnc-SLX1B-3:26 No - lnc-SLC26A3-1:5 Yes chr2L:19580612-19582474 lnc-LRRC47-78:28 No - LINC01278:18 No - lnc-ZWINT-4:2 Yes chr3R:11893512-11949129 lnc-RMDN2-7:1 No - lnc-NSUN6-2:5 Yes chr3L:22872200-22873702 lnc-ZNF503-10:4 No - NUTM2A-AS1:11 No - LINC01801:19 No - lnc-CFAP36-3:1 Yes chr3R:13683921-13693905 SDCBP2-AS1:5 No - HNF4A-AS1:11 Yes chr2L:8687226-8709611 lnc-PPIAL4G-54:1 No - lnc-TRIM74-2:1 No - LINC02336:5 No - ZNF674-AS1:4 No - lnc-ZHX2-1:1 No - LINC00343:1 No - lnc-ZNF627-2:1 No - lnc-THNSL1-4:2 No - lnc-ACTR2-3:16 No - LAMTOR5-AS1:36 No - LAMTOR5-AS1:31 No - lnc-CHD1L-5:10 Yes chr2R:6642418-6645098 lnc-ZNF438-4:1 Yes chr3R:30765926-30789202 SATB1-AS1:14 No - lnc-MCUB-1:1 Yes chr2R:23551313-23553547 lnc-BCKDHB-3:1 No - lnc-ANKRD20A3-3:2 No - NDUFA6-DT:74 No - lnc-FAM173B-1:2 No - lnc-ANAPC1-5:2 No - INTS6-AS1:35 No - lnc-CD80-2:1 No - LINC02081:26 No - lnc-RAB23-53:31 No - PLCE1-AS1:5 No - YEATS2-AS1:1 Yes chr2L:8434058-8437365 lnc-LRRC8D-4:1 No - lnc-MOCS1-1:4 Yes chrX:1289713-1322362 LINC00458:9 No - lnc-SRP19-2:1 No - lnc-NUDT6-3:2 Yes chr3R:19794073-19836817 STARD13-AS:30 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-MAP3K14-3:3 No - lnc-ANO10-5:1 No - lnc-SLC39A11-10:37 No - lnc-VSTM4-1:2 No - lnc-TM6SF2-1:2 No - CASC15:18 No - lnc-POLRMT-2:1 Yes chr2R:14276130-14300095 MIR22HG:12 No - MCHR2-AS1:4 Yes chr3L:18560258-18576326 lnc-TIGD5-1:1 No - lnc-ELMOD2-4:2 No - lnc-CPVL-4:3 Yes chrX:5616572-5618806 lnc-ST3GAL4-10:3 No - lnc-CRNKL1-3:9 Yes chrX:23022898-23035550 lnc-USP34-7:2 No - RUNDC3A-AS1:6 No - ARF4-AS1:4 Yes chr4:1124167-1125325 lnc-MCEE-1:1 Yes chr3R:15337908-15343256 LINC01661:6 No - lnc-ZNF804B-2:7 No - LINC00539:5 No - PCBP1-AS1:59 No - lnc-MID1-1:18 No - lnc-RARRES1-1:1 No - lnc-RWDD3-7:13 No - LINC01358:4 No - LINC01725:41 No - lnc-CTBS-4:6 No - lnc-ALG14-1:3 No - lnc-NBPF11-1:18 No - LINC02591:13 No - lnc-TNFSF4-3:9 No - LINC01036:4 No - LINC01351:7 No - LINC00115:18 No - LINC02593:37 No - LINC02593:38 No - LINC01770:12 No - LINC01770:13 No - LINC01770:14 No - TNFRSF14-AS1:20 No - lnc-TNFRSF14-2:3 No - LINC01714:37 No - lnc-SLC45A1-1:4 Yes chr3L:8449922-8472669 PIK3CD-AS2:2 Yes chr3R:20628972-20634732 PIK3CD-AS2:3 Yes chr3R:20628972-20634732 PIK3CD-AS2:4 Yes chr3R:20628972-20634732 LINC01654:5 No - LINC01355:6 No - lnc-ZNF683-1:3 Yes chrX:7931745-7933351 lnc-ZNF683-1:4 Yes chrX:7931745-7933351 lnc-HYI-3:2 No - lnc-TSPAN1-1:3 Yes chr2L:297880-305233 LINC01389:5 No - lnc-HOOK1-1:5 Yes chr3L:4022700-4026011 NFIA-AS2:2 Yes chr4:268175-276369 NFIA-AS2:3 Yes chr4:268175-276369 FOXD3-AS1:7 No - FOXD3-AS1:3 Yes chr2R:22868159-22870706 ROR1-AS1:2 Yes chr2L:10251843-10254686 LINC01359:3 No - LINC01360:9 No - LINC01781:17 No - LINC01361:3 No - LINC01361:5 No - lnc-RWDD3-5:7 No - lnc-RWDD3-5:8 No - LINC01708:25 No - LINC01676:28 No - lnc-FAM212B-5:3 No - HIPK1-AS1:1 No - lnc-NHLH2-1:2 No - LINC01762:40 No - LINC01762:41 No - LINC01525:1 No - lnc-GDAP2-1:12 No - WARS2-IT1:2 Yes chr3L:17849727-17852453 LINC01719:21 No - LINC01719:22 No - lnc-UCK2-1:4 Yes chr2L:19049076-19049884 LINC01363:1 No - lnc-XCL2-2:6 No - lnc-KIFAP3-2:7 Yes chr3L:17427305-17428836 LINC01657:5 No - LINC01645:5 No - LINC01732:12 No - LINC01350:7 No - lnc-ODR4-1:1 Yes chr3L:15608707-15610386 PACERR:2 No - LINC01351:11 No - LINC01032:6 No - LINC01353:3 No - LINC01353:2 No - lnc-TMEM206-5:13 No - lnc-TMEM206-5:12 No - lnc-TMEM206-5:11 No - LINC01740:5 No - TGFB2-OT1:1 Yes chr2L:2805261-2812376 LINC01352:3 No - TAF1A-AS1:4 No - TAF1A-AS1:2 No - lnc-NVL-1:3 No - lnc-URB2-1:5 No - DISC1-IT1:2 No - lnc-TARBP1-1:2 No - lnc-TOMM20-2:15 No - lnc-HNRNPU-5:2 Yes chr2R:21142368-21143261 lnc-ZNF672-5:5 No - PGM5P4-AS1:4 No - PGM5P4-AS1:1 No - PGM5P4-AS1:2 No - LINC01854:16 No - LINC01854:17 No - LINC01854:18 No - LINC01115:3 No - LINC01317:2 No - MIR217HG:2 No - LINC01828:25 No - lnc-TGFBRAP1-4:2 Yes chr3R:7889277-7902667 GACAT1:2 No - lnc-NXPH2-5:2 No - LINC01876:17 No - LINC01876:18 No - LINC01090:3 No - LANCL1-AS1:1 Yes chrX:11092492-11094947 LANCL1-AS1:2 Yes chrX:11092492-11094947 LANCL1-AS1:3 Yes chrX:11092492-11094947 LINC01248:9 No - NRIR:2 No - lnc-HPCAL1-1:18 No - MYCNUT:2 No - GACAT3:2 No - LINC01884:9 No - lnc-RBKS-11:5 No - LINC01936:19 No - lnc-NLRC4-5:1 Yes chr3R:10312039-10331353 LINC01320:3 No - lnc-COX7A2L-4:3 Yes chr3L:14903805-14942907 lnc-LGALSL-2:10 No - LINC01628:2 No - LINC01143:3 No - lnc-POLE4-8:4 No - ST3GAL5-AS1:10 No - lnc-KIAA1211L-1:9 No - ACOXL-AS1:6 No - PGM5P4-AS1:3 No - LINC01412:1 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-MARCH7-1:2 No - lnc-MARCH7-1:3 No - lnc-DPP4-2:11 No - lnc-SCN2A-12:7 No - lnc-METTL5-4:106 Yes chr2L:7377702-7384344 LINC01117:4 No - lnc-ATIC-3:4 No - CATIP-AS1:1 No - CATIP-AS2:2 No - ZNF385D-AS2:3 No - KCNMB2-AS1:2 No - KCNMB2-AS1:3 No - lnc-CLASP2-8:2 No - lnc-FAM162A-2:7 Yes chr3L:19807232-19810398 lnc-ALG1L-2:16 No - lnc-ALG1L-2:15 No - lnc-ZIC1-1:6 Yes chr3R:4852813-4869979 LINC01324:2 No - LINC01322:2 No - NAALADL2-AS2:2 No - lnc-DNAJC19-2:5 No - lnc-PYDC2-1:9 No - lnc-MUC20-67:45 No - CHL1-AS1:2 Yes chrX:8517373-8555170 SRGAP3-AS2:3 No - SRGAP3-AS2:4 No - ATP2B2-IT2:3 Yes chr4:328193-358917 HDAC11-AS1:2 Yes chr3R:24854496-24856243 SATB1-AS1:5 No - ZNF385D-AS1:1 No - lnc-NR1D2-6:1 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-SEC22C-2:4 No - LINC02158:11 No - KRBOX1-AS1:2 No - lnc-LTF-1:2 No - GLYCTK-AS1:5 Yes chr2L:2420830-2424647 FOXP1-AS1:3 Yes chr3R:9726020-9730872 lnc-PPP4R2-9:1 Yes chr4:663621-669884 PDZRN3-AS1:4 Yes chr4:663621-669884 lnc-FILIP1L-8:1 No - LINC00882:43 No - PLCXD2-AS1:2 Yes chr2L:20089636-20091348 LINC02044:5 No - ZBTB20-AS3:1 No - LINC01471:3 No - GATA2-AS1:1 Yes chr3R:8147368-8181444 LINC01565:1 No - TMEM108-AS1:2 No - lnc-MRPS22-1:15 No - lnc-SIAH2-1:7 No - ERICH6-AS1:3 No - LINC01487:6 No - IQCJ-SCHIP1-AS1:3 Yes chr2L:10328200-10331116 NLGN1-AS1:2 Yes chr3R:7570281-7639434 NAALADL2-AS1:2 No - LINC01209:2 No - IGF2BP2-AS1:2 Yes chrX:10787869-10824277 FGF12-AS1:3 No - LINC02036:11 No - TM4SF19-AS1:2 No - LMLN-AS1:1 Yes chr3R:10144668-10159134 LINC00504:3 No - lnc-NKX6-1-2:5 No - LINC01378:4 No - lnc-MSX1-1:3 No - LINC02497:7 No - LINC02506:11 No - lnc-DAPP1-2:5 No - TET2-AS1:1 Yes chr3L:2786207-2879158 lnc-LARP1B-1:11 No - LINC01256:2 No - lnc-SMARCA5-4:11 No - LINC02355:7 No - LINC01612:1 No - lnc-MSX1-2:2 No - LINC01587:3 No - LINC01587:4 No - LINC01587:1 No - LINC02270:7 No - LINC02493:7 No - lnc-DTHD1-1:3 Yes chrX:16943290-16956234 lnc-DTHD1-1:4 No - LINC02265:4 No - USP46-AS1:3 No - ADGRL3-AS1:4 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-CENPC-1:7 No - lnc-ART3-1:2 No - lnc-ARHGAP24-1:4 Yes chr2L:10247502-10250501 lnc-HPGDS-1:2 No - BMPR1B-DT:9 No - lnc-TBCK-3:4 Yes chr3R:26863376-26864559 lnc-SEC24D-1:7 No - lnc-C4orf3-3:2 Yes chrX:3811698-3857621 SNHG27:10 No - SNHG27:11 No - lnc-PABPC4L-5:2 No - LINC02432:12 No - SMAD1-AS1:1 Yes chr2L:3146056-3159643 LINC02273:9 No - LINC02273:14 No - lnc-NPY5R-3:2 No - lnc-GK3P-1:4 No - lnc-HMGB2-13:4 Yes chr2L:3470182-3472364 lnc-HMGB2-13:3 Yes chr2L:3470182-3472364 lnc-DCTD-65:6 No - lnc-DCTD-65:7 No - LINC01262:2 No - DBET:2 No - LINC01170:1 No - lnc-GPBP1-2:7 No - LINC01339:2 No - LINC01202:8 Yes chrX:15921955-15924558 LINC01411:4 No - EXOC3-AS1:1 Yes chr2R:18625249-18627718 LINC01511:1 No - MAST4-AS1:1 Yes chr3L:15566013-15576313 LINC01386:1 No - LINC01337:3 No - LINC02113:4 No - SH3TC2-DT:36 No - lnc-OARD1-1:2 No - lnc-MRPL14-2:4 No - HDAC2-AS2:65 No - LINC02520:25 No - lnc-ENPP4-2:2 Yes chr3R:16186999-16197584 ZNF451-AS1:31 No - LINC02549:5 No - lnc-SENP6-2:11 No - lnc-ORC3-6:2 No - lnc-KLHL32-4:18 No - lnc-TSTD3-2:1 Yes chr3R:11949680-11954038 lnc-HECA-3:12 No - lnc-HECA-3:11 No - lnc-ZBTB2-1:4 No - lnc-FOXQ1-28:1 No - FOXCUT:9 No - lnc-ECI2-1:4 No - lnc-CDYL-1:3 No - lnc-PPP1R3G-9:6 No - lnc-PPP1R3G-9:7 No - lnc-LYRM4-3:5 Yes chr2R:13968308-13969902 lnc-LYRM4-3:4 Yes chr2R:13968308-13969902 lnc-NRN1-7:2 Yes chr2R:13968308-13969902 lnc-ADTRP-2:1 No - JARID2-AS1:1 Yes chr3L:9477038-9486530 lnc-NUP153-1:3 Yes chr2L:1151678-1158262 lnc-RIPOR2-21:4 No - lnc-RIPOR2-21:5 No - lnc-OR2J1-2:1 No - lnc-RNF39-13:2 No - SAPCD1-AS1:2 No - lnc-MOCS1-1:7 Yes chrX:1289713-1322362 FOXP4-AS1:6 No - FOXP4-AS1:3 No - lnc-MRPL14-2:5 No - lnc-SLC25A27-2:3 No - lnc-MEP1A-2:3 No - lnc-C6orf141-1:5 No - lnc-IL17A-2:5 No - lnc-GCLC-1:11 Yes chrX:8102181-8116147 lnc-BEND6-1:4 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-FAM135A-1:6 No - LINC00472:6 No - LINC00472:7 No - LINC00472:8 No - LINC00472:9 No - LINC01626:1 No - TBX18-AS1:7 No - TBX18-AS1:8 No - TBX18-AS1:9 No - lnc-RNGTT-2:1 No - LINC02541:45 No - TRDN-AS1:27 No - NCOA7-AS1:2 No - lnc-SGK1-3:20 No - lnc-SGK1-3:7 No - lnc-SGK1-3:6 No - lnc-PEX7-1:2 Yes chr3R:19879719-19886030 lnc-TNFAIP3-3:5 No - LINC02539:11 No - LINC02539:12 No - lnc-CITED2-3:2 No - lnc-TAGAP-4:3 No - LINC02529:7 No - PACRG-AS2:2 Yes chr2R:19497752-19500372 PACRG-AS3:1 Yes chr2R:19497752-19500372 lnc-FGFR1OP-20:3 No - LINC02538:8 No - lnc-SMOC2-4:2 No - lnc-FAM120B-4:4 No - lnc-ERV3-1-10:4 No - POT1-AS1:3 No - POT1-AS1:4 No - lnc-EVX1-14:18 Yes chr2R:18775669-18776978 lnc-EVX1-14:19 Yes chr2R:18775669-18776978 LINC01449:3 No - LINC01448:2 No - lnc-HGF-1:4 No - LINC01392:2 No - lnc-OR2A1-1:4 No - OR2A1-AS1:2 No - lnc-OR2A1-1:3 No - ELFN1-AS1:1 No - ELFN1-AS1:2 No - ELFN1-AS1:3 No - lnc-CARD11-22:4 No - lnc-FSCN1-1:3 No - lnc-NXPH1-2:2 Yes chr3L:21131446-21133310 HOXA-AS2:9 Yes chr3R:6752864-6754194 lnc-CPVL-1:2 Yes chrX:5616572-5618806 SEPT7-AS1:3 No - SEPT7-AS1:4 No - LINC01450:2 No - LINC01445:3 No - LINC01445:4 No - lnc-ACHE-1:5 No - LINC01510:2 No - MKLN1-AS:3 Yes chr2R:12628697-12632378 lnc-EZH2-4:2 Yes chr3L:12146519-12156990 LINC01287:5 No - lnc-CNPY1-2:28 No - lnc-HEY1-1:3 No - ZFPM2-AS1:3 No - ZFPM2-AS1:4 No - LINC01609:2 No - lnc-CSMD1-1:10 No - MCPH1-AS1:2 Yes chr2R:11895997-11903918 lnc-NEFL-6:14 No - LINC02099:11 No - LINC02099:12 No - lnc-NKX6-3-4:4 No - CASC9:8 No - CASC9:5 No - CA3-AS1:4 No - CA3-AS1:2 No - lnc-MTERF3-1:4 No - lnc-MTERF3-1:2 No - lnc-TSPYL5-4:1 No - AZIN1-AS1:2 Yes chr2R:8007246-8009062 AZIN1-AS1:3 Yes chr2R:8007246-8009062 PCAT1:67 No - lnc-FAM84B-15:111 No - LINC00824:2 No - lnc-CSMD1-1:9 No - lnc-ERI1-32:10 No - lnc-C8orf74-2:4 No - lnc-NAT1-3:13 No - lnc-NAT1-3:14 No - lnc-RHOBTB2-2:5 Yes chr2L:12707661-12708680 lnc-NEFL-3:4 Yes chr3R:14664907-14697292 LINC02099:13 No - LINC01288:1 No - lnc-DUSP26-13:1 Yes chr2R:15340472-15368300 LINC01605:8 No - LINC01605:4 No - lnc-BRF2-1:1 No - lnc-PLAT-3:8 No - LINC01606:11 No - lnc-FAM110B-5:6 No - LINC01419:5 No - CA3-AS1:8 Yes chr2L:13803626-13809994 CA3-AS1:9 No - lnc-NBN-1:15 No - lnc-GRHL2-4:3 No - UBR5-AS1:2 No - LINC01608:5 No - lnc-TMEM65-1:3 No - lnc-TRIB1-4:4 No - lnc-FAM84B-15:127 No - LINC00824:3 No - LINC01591:4 No - LINC01591:5 No - lnc-FAM135B-6:2 No - MINCR:4 No - MINCR:5 No - LINC01230:16 No - CDKN2B-AS1:19 Yes chr3R:25036944-25037982 LINC01492:2 No - RFX3-AS1:6 No - PTPRD-AS2:4 No - LURAP1L-AS1:1 No - lnc-ELAVL2-1:7 No - LINC01189:2 No - GNA14-AS1:1 No - LINC01507:1 No - PGM5P3-AS1:3 Yes chr2R:12180493-12182373 PGM5P3-AS1:4 Yes chr2R:12180493-12182373 PGM5P3-AS1:5 Yes chr2R:12180493-12182373 CDC37L1-DT:20 No - CDC37L1-DT:21 No - PTPRD-AS1:1 Yes chr2L:19586623-19732069 PTPRD-AS1:2 Yes chr2L:19586623-19732069 FOCAD-AS1:1 Yes chr2R:23396770-23402309 IFT74-AS1:1 No - lnc-SPATA31A5-1:4 No - GLIDR:1 No - GLIDR:2 No - GLIDR:3 No - GLIDR:4 No - lnc-ANKRD20A2-15:1 No - lnc-ANKRD20A2-15:2 No - lnc-FOXD4L5-5:4 No - lnc-CNTNAP3B-2:3 No - lnc-FOXD4L5-39:1 No - FAM27E2:4 No - lnc-FOXD4L5-35:2 No - lnc-FOXD4L5-35:1 No - lnc-SPATA31A7-14:3 No - lnc-FOXD4L5-25:6 No - lnc-FOXD4L5-25:7 No - lnc-ANKRD20A4-18:1 No - lnc-ANKRD20A4-16:1 No - lnc-FOXD4L5-7:2 No - lnc-FOXD4L4-3:2 No - PGM5-AS1:2 Yes chr3L:16126018-16128531 PGM5-AS1:3 Yes chr3L:16126018-16128531 PGM5-AS1:4 Yes chr3L:16126018-16128531 LINC01504:5 No - LINC01474:2 No - LINC01474:3 No - LINC01474:4 No - RORB-AS1:3 Yes chr2R:10203995-10237348 LINC01507:2 No - lnc-RMI1-2:4 No - lnc-NAA35-2:3 No - TMEM246-AS1:2 No - TMEM246-AS1:3 No - TMEM246-AS1:8 No - TMEM246-AS1:9 No - LINC01509:1 No - lnc-TNC-1:2 No - lnc-MAPKAP1-1:4 No - lnc-MAPKAP1-2:2 No - LINC01503:6 No - LINC01503:7 No - lnc-PTPA-3:1 No - NALT1:5 No - ARRDC1-AS1:5 Yes chr3L:176306-178963 ARRDC1-AS1:2 Yes chr3L:176306-178963 LINC01496:2 No - MIR325HG:2 No - MIR325HG:3 No - MIR325HG:4 No - MIR325HG:5 No - MIR325HG:6 No - MIR325HG:7 No - MIR325HG:8 No - LINC01560:1 No - lnc-ZNF711-1:4 Yes chr3R:15213974-15214845 PABPC5-AS1:2 No - DIAPH2-AS1:4 Yes chr2L:20758144-20768053 TTTY14:10 No - TTTY14:2 No - TTTY14:3 No - TTTY14:4 No - TTTY14:11 No - TTTY14:5 No - lnc-ABI1-5:4 No - lnc-KIN-9:1 No - MKX-AS1:1 Yes chr2L:204743-207297 lnc-LYZL1-15:27 Yes chr3L:2377655-2499226 lnc-LYZL1-15:1 Yes chr3L:2377655-2499226 LINC01515:10 No - CDH23-AS1:1 No - lnc-AP3M1-3:6 Yes chr2R:7243024-7245776 KCNMA1-AS2:2 Yes chr3R:24662491-24711595 NUTM2B-AS1:5 No - NUTM2B-AS1:6 No - NEURL1-AS1:1 Yes chr3R:9020348-9039471 lnc-SORCS1-4:6 No - LINC01435:7 No - CALML3-AS1:2 No - CALML3-AS1:3 No - lnc-PFKFB3-453:2 No - PRKCQ-AS1:53 No - CELF2-AS1:1 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-PRPF18-8:6 No - lnc-NSUN6-8:5 No - LINC01517:3 No - lnc-LYZL1-15:2 No - lnc-LYZL1-15:3 No - lnc-LYZL1-15:4 No - lnc-MAP3K8-22:1 No - lnc-EPC1-3:2 No - LINC01518:3 No - LINC01518:4 No - LINC01518:5 No - LINC01518:6 No - lnc-MARCH8-1:2 No - SGMS1-AS1:3 No - lnc-A1CF-1:2 Yes chr2L:3622074-3656953 LNCAROD:13 No - lnc-CABCOCO1-1:2 No - lnc-CABCOCO1-1:3 No - KCNMA1-AS3:1 Yes chr3R:24662491-24711595 NUTM2B-AS1:7 No - lnc-TSPAN14-2:4 Yes chr2L:6000228-6003738 NRG3-AS1:2 No - LINC01519:2 No - LINC01520:3 No - lnc-GRID1-2:2 No - lnc-CCSER2-2:4 No - PLCE1-AS2:2 No - PLCE1-AS2:3 No - LINC01514:1 No - NEURL1-AS1:2 Yes chr3R:9020348-9039471 lnc-GSTO2-1:2 No - lnc-ITPRIP-2:2 No - lnc-VTI1A-1:3 No - MIR3663HG:3 No - FAM53B-AS1:5 Yes chr2L:2978411-2979288 FAM53B-AS1:6 Yes chr2L:2978411-2979288 EDRF1-AS1:13 Yes chr3L:8721324-8726108 lnc-PTPRE-1:3 No - LINC01166:4 No - ADGRA1-AS1:3 No - MIR4300HG:3 No - BBOX1-AS1:5 Yes chr2R:13375975-13377731 BBOX1-AS1:2 Yes chr2R:13375975-13377731 PAUPAR:15 Yes chr3L:1298672-1300389 lnc-LRRC4C-5:7 No - LINC02552:20 No - lnc-PANO1-1:3 No - lnc-PANO1-1:4 No - LINC01150:1 No - BGLT3:2 No - CASC23:1 No - TUB-AS1:4 Yes chr2R:21101928-21123704 lnc-RPL27A-2:4 No - lnc-SWAP70-2:2 Yes chr3R:11789293-11796948 NAV2-AS2:3 Yes chr2L:19796365-19958424 LINC01495:2 No - lnc-PAX6-2:7 Yes chr3L:1298672-1300389 lnc-PAX6-2:8 Yes chr3L:1298672-1300389 WT1-AS:3 Yes chr3L:10981171-11009188 WT1-AS:4 Yes chr3L:10981171-11009188 WT1-AS:5 Yes chr3L:10981171-11009188 WT1-AS:6 Yes chr3L:10981171-11009188 WT1-AS:12 No - lnc-SLC1A2-2:4 No - lnc-C11orf74-4:2 No - lnc-PRDM11-3:9 No - lnc-PRDM11-3:8 No - lnc-CREB3L1-2:3 No - lnc-ACP2-2:3 Yes chrX:15089682-15113762 lnc-MRPL11-1:8 No - MRGPRF-AS1:3 No - LINC01488:1 No - LINC01488:2 No - LINC01488:3 No - LINC01488:4 No - LINC01537:1 No - lnc-LRRC32-6:6 No - lnc-GAB2-1:2 No - lnc-TENM4-4:4 No - lnc-PTS-3:5 No - lnc-DRD2-3:3 Yes chrX:4132887-4206093 lnc-C11orf71-1:5 No - lnc-IFT46-1:9 No - lnc-IFT46-1:10 No - lnc-IFT46-1:11 No - lnc-IFT46-1:12 No - lnc-IFT46-1:13 No - lnc-NRGN-1:3 No - lnc-NRGN-1:4 No - lnc-ST3GAL4-4:1 Yes chrX:2740384-3134532 lnc-ST3GAL4-10:5 No - lnc-FLI1-2:2 Yes chr3R:23290231-23346167 lnc-NFRKB-2:2 No - LINC02551:14 No - LINC02551:11 No - NTM-AS1:2 Yes chr3L:5424109-5442399 LINC02449:11 No - LINC02449:12 No - lnc-PRR4-1:1 No - lnc-ETNK1-4:4 No - SOX5-AS1:10 Yes chr4:800436-834393 lnc-PCED1B-5:3 No - lnc-PCED1B-5:20 No - lnc-PCED1B-5:4 No - lnc-PCED1B-5:5 No - lnc-PCED1B-5:6 No - LINC01154:2 No - LINC02388:7 No - lnc-ATP23-89:3 No - lnc-WIF1-6:14 Yes chr3R:10863355-10868642 lnc-WIF1-6:15 No - lnc-WIF1-6:16 No - lnc-ASCL1-6:5 No - TESC-AS1:3 No - lnc-SLC15A4-32:1 No - FAM138D:2 No - CACNA1C-IT2:2 Yes chr2L:16165831-16190540 lnc-CRACR2A-1:1 Yes chr3R:10786481-10788226 CCND2-AS1:2 Yes chrX:15906822-15909676 LINC02443:14 No - lnc-PZP-11:2 No - lnc-CLEC1B-1:3 No - LINC02366:7 No - lnc-RACGAP1-1:5 No - lnc-RACGAP1-1:4 No - LINC01154:6 No - lnc-B4GALNT1-1:5 No - LINC01465:2 No - lnc-WIF1-6:17 No - LINC01479:2 No - LINC02384:37 No - LINC01481:16 Yes chr3L:8755989-8757167 LINC01481:17 Yes chr3L:8755989-8757167 LINC01490:4 No - LINC01490:5 No - LINC01490:6 No - lnc-ALDH1L2-1:4 Yes chrX:16313709-16317750 LINC01486:4 Yes chr3L:1318480-1329617 LINC02411:12 No - lnc-ZNF26-2:2 No - LINC00426:9 No - LINC00437:1 No - LINC01055:2 No - LINC00376:3 No - LINC00448:2 No - LINC00383:3 No - lnc-NDFIP2-7:6 No - LINC00375:3 No - lnc-ZIC5-2:3 No - FGF14-AS1:1 No - ARHGEF7-AS1:1 Yes chr2L:20350434-20365254 SOX1-OT:15 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-MPHOSPH8-11:2 No - LINC00463:3 No - LINC01053:1 No - USP12-AS1:1 Yes chr3R:22750901-22776374 lnc-USP12-9:9 No - LINC01058:1 No - LINC01048:1 No - lnc-WBP4-2:3 No - LINC00428:2 No - LINC00428:3 No - LINC00400:1 No - ENOX1-AS2:1 Yes chr3L:12844254-12850117 lnc-GTF2F2-13:1 No - LINC01198:6 No - LINC00562:9 Yes chr3R:8938724-8943027 lnc-C13orf42-1:4 No - lnc-C13orf42-1:2 No - LINC02333:5 No - LINC01065:1 No - LINC02338:3 No - LINC01075:1 No - LINC00448:3 No - LINC00448:1 No - LINC00392:2 No - LMO7-AS1:3 No - LMO7-AS1:4 No - LMO7DN-IT1:1 No - SCEL-AS1:3 No - SCEL-AS1:4 No - LINC01068:3 No - LINC01038:1 No - LINC00377:3 No - LINC01049:4 No - GPC5-AS2:1 Yes chr3L:8827505-8891192 LINC00363:3 No - LINC00391:5 No - LINC00456:2 No - LINC01039:3 No - lnc-GPR183-47:15 Yes chr2L:20730416-20734309 CLYBL-AS1:1 No - CLYBL-AS1:2 No - CLYBL-AS1:3 No - LINC00411:3 No - LINC00343:7 No - LINC00343:8 No - LINC00399:3 No - lnc-ARHGEF7-7:1 No - ARHGEF7-AS1:4 Yes chr2L:20350434-20365254 LINC00368:2 No - LINC00354:2 No - LINC00354:5 No - lnc-TUBGCP3-4:5 No - F10-AS1:1 No - GRTP1-AS1:5 Yes chr3R:16147029-16149636 LINC01054:2 No - lnc-POTEG-14:10 No - lnc-POTEM-4:5 No - FOXG1-AS1:1 Yes chr2L:3836840-3839185 LINC01588:84 No - LINC01588:89 No - LINC01588:86 No - LINC01588:92 No - LINC01588:87 No - lnc-NID2-6:1 No - SALRNA1:6 No - lnc-ATG2B-16:2 Yes chr2R:19663919-19669832 lnc-BRF1-1:6 No - RORA-AS1:3 Yes chr2R:10203995-10237348 RORA-AS1:4 Yes chr2R:10203995-10237348 RORA-AS1:5 Yes chr2R:10203995-10237348 RORA-AS1:6 Yes chr2R:10203995-10237348 LINC01586:3 No - CRTC3-AS1:2 No - PWRN4:2 No - LINC02568:17 No - NR2F2-AS1:8 Yes chr3R:12258737-12302785 LINC02254:6 No - CERS3-AS1:2 No - GABRG3-AS1:2 Yes chrX:15921955-15924558 lnc-FMN1-4:4 No - lnc-FMN1-4:3 No - EHD4-AS1:2 No - lnc-SHF-3:4 Yes chr2R:9082395-9085717 LINC01413:4 No - LIPC-AS1:5 No - RORA-AS2:2 Yes chr2R:10203995-10237348 RORA-AS2:3 Yes chr2R:10203995-10237348 lnc-RPLP1-12:39 No - lnc-RPLP1-12:40 No - SALRNA3:3 No - SALRNA2:3 No - THSD4-AS1:2 No - THSD4-AS1:3 No - THSD4-AS1:4 No - THSD4-AS1:5 No - THSD4-AS2:1 No - INSYN1-AS1:30 No - INSYN1-AS1:25 No - UBL7-AS1:6 No - LINGO1-AS2:1 Yes chr2R:21872030-21946259 LINGO1-AS2:2 Yes chr2R:21872030-21946259 LINC00927:53 No - lnc-CTXND1-5:2 Yes chr3R:9016773-9020022 LINC01583:3 No - lnc-ZSCAN2-11:1 No - lnc-ZSCAN2-11:3 No - lnc-KLHL25-1:5 No - LINC01585:4 No - lnc-FAM174B-3:6 No - LINC02207:10 No - lnc-PGPEP1L-12:2 No - LINC01582:7 No - IRAIN:7 Yes chr3R:21570248-21619321 lnc-IGF1R-1:2 No - LINC01572:2 No - FAM157C:8 No - lnc-CDYL2-6:8 Yes chr2R:24475386-24476032 MMP25-AS1:5 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-ZSCAN10-3:23 No - lnc-ADCY9-1:10 No - GLIS2-AS1:2 Yes chr2R:12924567-12930644 LINC01570:3 Yes chr3L:10481412-10594012 LINC01195:2 No - LINC02185:17 No - lnc-SMG1-5:8 No - lnc-SMG1-5:9 No - lnc-SMG1-5:10 No - lnc-SMG1-5:12 Yes chr3L:9597764-9614001 LCMT1-AS1:2 No - MIR762HG:3 Yes chrX:9356634-9358594 MIR762HG:4 Yes chrX:9356634-9358594 LINC02133:7 No - LINC02169:6 No - lnc-EXOSC6-2:4 No - lnc-MAP1LC3B-3:4 No - lnc-KLHDC4-1:6 No - LINC02182:7 No - lnc-SPG7-4:2 Yes chr3L:12750119-12753402 lnc-SPG7-4:1 Yes chr3L:12750119-12753402 GAS8-AS1:1 Yes chrX:3491011-3504851 lnc-PIPOX-4:9 Yes chrX:6295389-6298970 lnc-PRAC2-3:1 No - lnc-NGFR-3:4 No - LINC01476:2 No - lnc-SRR-1:3 Yes chr3R:25029429-25033465 lnc-ANKFY1-5:1 Yes chr3R:13717454-13718176 lnc-SLC52A1-1:2 Yes chr2R:16751503-16772671 LINC02087:6 No - lnc-SPECC1-1:2 No - CCDC144NL-AS1:15 No - LINC01563:3 No - LINC01563:4 No - lnc-BRCA1-3:4 No - RUNDC3A-AS1:4 Yes chr3R:27229505-27239085 lnc-CDC27-2:4 No - lnc-CDC27-2:7 No - lnc-NGFR-3:5 No - TMEM92-AS1:3 No - LINC02071:5 No - lnc-CCDC182-1:2 Yes chr3R:25516118-25608423 LINC01999:4 No - TBX2-AS1:8 No - TBX2-AS1:9 No - TBX2-AS1:10 No - PRKCA-AS1:2 Yes chr2R:16898535-16901575 LINC01497:2 No - LINC01497:3 No - lnc-SLC39A11-10:42 No - lnc-SLC39A11-10:53 No - HID1-AS1:1 Yes chr2R:12322507-12326258 LINC02080:6 No - lnc-PGS1-1:6 No - lnc-PGS1-1:8 No - lnc-PGS1-1:7 No - LINC02081:24 No - LINC02081:25 No - LINC01978:16 No - LINC01387:1 No - lnc-CTAGE1-9:18 No - DSG1-AS1:2 No - LINC02564:15 No - DLGAP1-AS2:2 Yes chr2R:5702112-5705439 L3MBTL4-AS1:1 Yes chr3R:27266326-27273273 NDUFV2-AS1:1 No - NDUFV2-AS1:2 No - PPP4R1-AS1:2 No - LINC01255:4 No - LINC01255:10 No - lnc-PTPN2-2:6 No - LINC01444:2 No - TTC39C-AS1:1 No - LINC01543:2 No - DSG1-AS1:6 No - SLC14A2-AS1:2 No - LINC01909:12 No - LINC01899:14 No - LINC01927:11 No - LINC01535:1 No - LINC01535:2 No - LINC01535:3 No - LINC01224:5 No - LINC01224:6 No - ZNF561-AS1:3 No - LINC01233:2 No - lnc-VSTM2B-9:24 No - lnc-VSTM2B-9:25 No - lnc-VSTM2B-9:26 No - lnc-VSTM2B-9:28 No - lnc-VSTM2B-9:27 No - LINC00906:11 No - LINC01782:8 No - LINC01533:6 No - LINC01533:7 No - LINC01533:8 No - ZNF30-AS1:2 No - LINC01766:13 No - ZNF529-AS1:2 No - ZNF529-AS1:3 No - ZNF529-AS1:4 No - ZNF529-AS1:5 No - LINC01534:3 No - LINC01534:4 No - ZNF793-AS1:3 No - LINC01480:5 No - lnc-ZNF45-2:4 No - lnc-IGFL4-1:4 No - PTOV1-AS2:3 Yes chr3R:24227023-24228538 ZNF649-AS1:2 No - ZNF528-AS1:8 No - LENG8-AS1:2 Yes chr2L:10837732-10842597 lnc-NLRP7-1:1 No - lnc-NLRP7-1:2 No - LINC01864:7 No - LINC01706:5 No - LINC00687:9 No - LINC01752:5 No - LINC01427:3 No - ZNF337-AS1:8 No - ZNF341-AS1:1 No - CSE1L-AS1:1 No - CSE1L-AS1:2 No - CEBPB-AS1:1 No - LINC01440:7 No - BMP7-AS1:1 Yes chr2R:23851562-23853247 LINC01711:3 No - lnc-CTSZ-2:5 Yes chr2R:23942538-23946936 LINC01697:40 No - BACH1-IT2:5 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-WRB-2:5 Yes chr3R:24319000-24328619 ZNF295-AS1:7 No - ZNF295-AS1:11 No - ZNF295-AS1:2 No - lnc-GGTLC2-10:2 No - LINC01521:1 No - LINC01315:4 No - LINC01315:5 No - LINC01315:6 No - TBC1D22A-AS1:1 Yes chr3R:21102199-21105113 lnc-POP5-1:4 No - lnc-GPR89B-3:10 No - CHRM3-AS2:3 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-BRD1-23:6 No - lnc-USH2A-5:1 No - SMIM2-AS1:10 No - NR2F2-AS1:16 No - SATB1-AS1:73 No - lnc-MN1-11:1 No - LINC01778:15 No - LINC01667:3 No - SRD5A3-AS1:22 Yes chr2L:8305586-8306741 TPT1-AS1:29 No - lnc-ZNF569-6:2 Yes chr2L:12046711-12048918 lnc-C15orf59-7:1 No - PROX1-AS1:8 Yes chr3R:11328480-11407627 lnc-RBL2-8:1 No - lnc-U2AF1L5-162:6 No - lnc-PGPEP1L-12:5 No - lnc-TEX35-1:1 No - LINC02251:6 No - lnc-MMRN1-2:33 No - lnc-PRSS54-2:1 Yes chrX:10383353-10385861 lnc-SYTL3-2:7 No - NUTM2B-AS1:13 No - lnc-CATSPER3-2:7 Yes chr2L:21423737-21424229 lnc-SIK1B-187:1 No - LINC01320:2 No - lnc-MUC20-67:24 No - lnc-MON2-2:6 No - lnc-TTC3-5:2 Yes chr3L:20768207-20769482 LINC00958:5 No - LINC01320:21 No - lnc-JUN-5:12 No - ZRANB2-AS2:14 Yes chr3L:5424109-5442399 PCBP1-AS1:149 No - LINC02246:30 No - lnc-NR2F2-7:3 No - LINC01002:23 No - LINC01100:1 No - lnc-LRP11-1:5 Yes chr3R:5552823-5554316 lnc-CDK12-1:14 No - lnc-CEBPB-13:8 No - lnc-AMZ2-5:4 No - lnc-PANX2-1:1 Yes chr3L:3461317-3466303 lnc-SLC16A11-7:23 No - lnc-CBSL-1:2 No - lnc-OLFM4-14:1 No - lnc-SLC35A3-1:4 No - lnc-MYEOV-1:3 No - lnc-CTSB-3:1 No - LOH12CR2:3 No - TEX41:71 No - lnc-GGTLC2-10:3 No - lnc-ZDHHC6-1:5 No - lnc-TAF15-1:4 No - lnc-ERGIC2-10:1 Yes chrX:2201820-2203866 lnc-PCNX1-4:2 No - lnc-NPTX1-2:5 No - lnc-HIGD1A-1:4 No - ADAMTS9-AS1:37 Yes chr2R:22807860-22815993 lnc-FAM20C-13:2 No - TEX41:83 No - lnc-ABT1-1:3 No - lnc-ANKS6-1:19 Yes chr2R:16673235-16732916 lnc-FAM72B-18:1 No - lnc-FAM196A-1:16 Yes chr3R:23781765-23801634 LINC01879:4 No - lnc-NBPF15-1:2 No - lnc-CLYBL-10:1 Yes chr2L:20730416-20734309 lnc-HEATR4-1:4 No - lnc-TSEN34-10:1 Yes chr3L:9509793-9511531 lnc-CXCL2-3:1 Yes chr3R:9042508-9050555 C1QTNF1-AS1:4 No - lnc-LINC02210-CRHR1-52:20 Yes chr2R:12474424-12487986 LINC01730:8 No - TEX26-AS1:12 No - lnc-MMRN1-11:1 No - lnc-NEU2-1:2 Yes chr3L:16970013-16994388 lnc-ABHD17A-1:3 No - lnc-MYO7B-2:22 Yes chrX:16309817-16313138 lnc-TET3-5:2 No - TEX41:8 No - lnc-METTL5-4:135 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-MUC20-67:76 No - lnc-HMOX2-3:1 Yes chr3L:8191522-8193116 lnc-NBPF11-2:1 No - ZFAS1:17 No - lnc-TMEM211-5:1 No - LAMTOR5-AS1:59 No - lnc-RWDD3-7:17 No - lnc-PTK2B-2:2 No - SATB1-AS1:62 No - lnc-SLC4A5-1:2 No - lnc-CAPZA2-2:12 Yes chr3L:20806868-20809272 EDRF1-AS1:3 Yes chr3L:8721324-8726108 lnc-LSM14B-7:1 No - lnc-DAD1-32:1 Yes chr2R:7812504-7815486 lnc-TBPL2-6:1 Yes chr3R:23860162-23890052 lnc-PPIAL4D-19:12 No - TPT1-AS1:15 No - lnc-TEX29-2:3 No - lnc-LNX2-1:2 Yes chr2L:19133023-19135233 lnc-APBB1IP-1:8 No - LINC02259:9 No - LINC01002:24 No - lnc-ALG1L-2:22 No - SOX2-OT:59 No - lnc-PBX2-1:2 Yes chrX:15992468-15996509 lnc-DNAJB6-9:2 Yes chr2L:1008378-1048053 lnc-FAM19A5-16:1 No - lnc-C5orf60-1:4 No - lnc-CPN2-4:28 No - SALRNA1:7 No - lnc-ZNF396-3:1 No - LINC01358:2 No - lnc-FPGT-5:4 No - lnc-SLC48A1-23:4 No - lnc-TP53TG3F-38:1 No - lnc-CRYBA4-17:1 No - LINC02335:9 No - lnc-PRDX3-1:4 Yes chr3R:31405245-31457873 lnc-KLF17-1:14 Yes chr2R:23820354-23839864 lnc-NRIP1-2:8 No - lnc-ZNF727-18:1 No - TARID:2 Yes chr2R:17757405-17760517 FAM138C:3 Yes chr2R:12180493-12182373 LINC01440:1 No - lnc-GRAPL-6:4 Yes chr3L:7528780-7540012 LINC01551:3 No - lnc-LIG4-3:1 No - lnc-IL4-1:3 Yes chr3L:5356864-5359392 MAGI2-AS3:16 No - lnc-ZDHHC21-4:2 No - lnc-SERP2-11:2 No - lnc-SLC9A3-1:5 No - SATB1-AS1:13 No - lnc-FAM19A5-15:1 No - lnc-MUC19-1:7 No - LINC00226:2 No - lnc-CYP17A1-3:1 No - CYP1B1-AS1:15 Yes chr3L:5590083-5592571 VAV3-AS1:13 No - lnc-NGRN-2:1 No - lnc-SCAND1-9:1 No - lnc-BARX2-4:1 No - PROX1-AS1:51 No - lnc-ZNF362-1:12 Yes chrX:2115727-2123286 lnc-NSUN6-4:3 No - lnc-U2AF1L5-162:1 No - lnc-MTFR2-2:12 No - lnc-C1orf35-3:1 No - ADD3-AS1:9 Yes chr2R:19397032-19424903 lnc-C11orf88-2:2 No - lnc-CREM-7:1 No - LINC01427:2 No - lnc-SNCA-5:1 No - lnc-CCDC189-1:6 Yes chr2R:21323430-21341847 FAM223A:2 No - lnc-C9orf66-15:1 No - lnc-VPS36-3:1 No - lnc-LLPH-2:8 No - lnc-KLHDC4-73:1 Yes chr2L:9547720-9566750 lnc-ZNF397-3:2 No - lnc-NDUFA4L2-2:1 Yes chrX:5913067-5916797 MIRLET7BHG:7 No - lnc-U2AF1L5-161:4 No - lnc-ERAP1-2:3 No - lnc-ESM1-1:14 No - MIR99AHG:125 No - LINC01055:3 No - lnc-BEX3-2:4 No - lnc-CRYAA2-186:1 No - lnc-TMTC4-1:4 Yes chr2R:24940625-24942413 lnc-CAPRIN1-6:3 No - lnc-CRYAA2-15:1 No - lnc-VPREB1-7:15 No - lnc-MUC20-67:119 No - lnc-OR2J1-2:4 No - LINC02166:6 Yes chr2R:10067217-10068702 LINC00221:11 No - ADAMTSL4-AS1:3 No - SATB1-AS1:84 No - SLC8A1-AS1:15 No - lnc-DHX38-24:1 No - lnc-DGLUCY-7:1 No - CBR3-AS1:24 No - VIPR1-AS1:31 No - lnc-ARL6-1:3 No - lnc-FOXA2-7:11 No - lnc-LRP5L-4:32 Yes chr3R:16068523-16098761 VIPR1-AS1:13 No - LINC01676:43 No - LINC00710:30 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-TTC38-7:2 Yes chr3L:20692330-20695378 PCBP1-AS1:78 No - LINC01669:8 No - lnc-TMEM199-1:2 Yes chr3L:8063874-8108897 lnc-ITGA9-2:5 No - lnc-CD40-3:1 Yes chr2L:12097838-12100839 lnc-GALNT2-4:1 No - lnc-CRYAA2-185:1 No - LINC00623:22 No - lnc-NGFR-3:6 Yes chr2L:19121345-19123869 lnc-SSTR4-4:7 No - lnc-PAXIP1-22:2 No - LINC01108:4 No - lnc-TAF7-5:3 No - lnc-CDC27-2:10 No - MIR122HG:14 No - lnc-TBCCD1-4:46 No - lnc-CHMP2B-1:7 No - lnc-MUC20-67:51 No - lnc-ALG12-4:1 No - PCBP1-AS1:50 No - LINC01778:16 No - DARS-AS1:27 No - LINC02086:17 No - NUTM2B-AS1:31 No - lnc-KLF17-1:17 No - lnc-MUC20-67:68 No - lnc-BIRC2-2:2 No - lnc-TET3-5:1 No - lnc-ZNF362-1:10 No - EWSAT1:12 No - lnc-ANP32A-2:10 No - lnc-TBCCD1-4:39 No - lnc-MUC20-67:63 No - lnc-ZNF266-1:3 No - CBR3-AS1:31 No - MIR325HG:12 No - CYP1B1-AS1:18 Yes chr3L:5590083-5592571 LINC01635:13 No - SNHG5:19 No - TEX41:102 No - LINC01002:10 No - DLX6-AS1:19 Yes chr2R:24814822-24835667 DAB1-AS1:32 Yes chr3L:16712126-16724575 TMSB15B-AS1:2 No - lnc-TAF7-1:12 No - LGALS8-AS1:2 No - SRP14-AS1:13 No - LINC01359:11 No - LINC01742:7 No - lnc-EBF3-1:9 Yes chr3R:6658806-6660100 lnc-ATP8B1-8:1 No - lnc-DENND3-4:6 Yes chr3L:25236940-25670980 lnc-TBCCD1-4:57 No - PRNCR1:2 No - lnc-NIPA1-2:14 Yes chr2L:12704725-12706683 ITGA9-AS1:27 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-PELI2-12:1 No - lnc-PDE4DIP-6:7 No - ADAMTS9-AS1:35 Yes chr2R:22807860-22815993 lnc-UNC93A-1:3 No - lnc-CCDC36-1:4 No - lnc-TWIST2-14:3 No - lnc-CSNK1G3-11:2 No - PLCE1-AS2:5 No - lnc-ATXN10-5:1 No - LINC02246:18 No - lnc-NFRKB-2:3 No - lnc-ERICH1-18:1 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-FTCDNL1-4:44 No - lnc-PPIAL4C-4:22 No - lnc-ANKRD36B-3:16 No - lnc-HARS-5:1 Yes chr3R:16484566-16495422 LINC01851:11 No - SLC8A1-AS1:31 No - lnc-TSHZ1-7:1 No - lnc-NABP1-5:14 No - lnc-TAF7-6:9 No - lnc-ADGRL4-5:2 No - PCBP1-AS1:148 No - lnc-TBCCD1-4:27 No - LINC01226:11 No - SOX2-OT:46 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-PAXIP1-22:1 No - lnc-GRAP-5:2 No - lnc-GNAT3-1:25 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-PQLC1-13:2 Yes chrX:13624745-13664568 lnc-SAAL1-3:1 No - lnc-SORCS2-4:1 No - lnc-FOXD4L5-98:1 No - PCBP1-AS1:97 No - lnc-FAM72B-17:1 No - FAM239A:24 No - lnc-TBCCD1-4:12 No - MALAT1:31 No - lnc-PDYN-1:5 No - lnc-METTL5-4:136 Yes chr2L:7377702-7384344 AQP4-AS1:8 No - LINC01588:58 No - LINC01138:21 No - lnc-LRP5L-16:1 No - lnc-FGF1-9:1 Yes chr3L:3401153-3424935 lnc-MYO7B-2:4 Yes chrX:16309817-16313138 lnc-FTCDNL1-4:62 No - LINC01672:16 No - lnc-MAFB-1:4 No - LINC01747:9 No - MAGI2-AS3:35 No - lnc-TOX3-1:15 No - lnc-C12orf42-8:1 Yes chr3L:7760453-7763166 lnc-TMTC4-1:5 Yes chr2R:24940625-24942413 PCBP1-AS1:28 No - SATB1-AS1:29 No - LINC02576:9 No - lnc-MUC20-67:100 No - lnc-PAWR-14:1 Yes chr3L:16051959-16082026 SLC26A4-AS1:9 Yes chr3L:17898889-17907812 EDRF1-AS1:7 Yes chr3L:8721324-8726108 PAX8-AS1:34 Yes chr4:1088798-1113317 lnc-PLCB2-2:2 No - lnc-PTPRZ1-3:11 Yes chr4:1230837-1271759 LINC01097:2 No - lnc-BBS9-4:1 No - lnc-MGMT-12:1 Yes chr2R:14772650-14807061 SATB1-AS1:30 No - MAPKAPK5-AS1:3 No - GAS5:29 No - PCBP1-AS1:79 No - C21orf62-AS1:3 No - lnc-ZNF207-1:3 No - lnc-SETDB1-1:3 No - lnc-SLC16A11-7:21 No - lnc-METTL5-4:83 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-ZNF680-4:9 No - lnc-HARS-6:3 Yes chr3R:16484566-16495422 lnc-JUN-2:6 No - lnc-MYO7B-2:31 Yes chrX:16309817-16313138 lnc-TDRD3-1:6 No - lnc-FTCDNL1-4:45 No - KAZN-AS1:10 Yes chr2R:22333500-22373109 lnc-FOXD4L6-1:16 No - lnc-EBAG9-9:1 No - lnc-MUC20-67:101 No - lnc-SLC35C1-83:9 No - lnc-C20orf203-1:5 No - lnc-TP53TG3-54:2 No - LINC01297:6 No - LINC01660:7 No - lnc-AGA-24:5 No - lnc-KIAA1551-14:2 Yes chr2L:17459605-17473215 lnc-VSTM2B-5:20 No - lnc-PRSS51-2:3 Yes chr3L:16339003-16345241 lnc-MUC20-67:102 No - LINC01435:2 No - LINC01002:29 No - lnc-TP53TG3-26:1 No - lnc-GAB4-5:1 Yes chr3L:2589414-2595590 lnc-CES1-6:1 No - lnc-APOL1-13:1 No - lnc-TBCCD1-4:3 No - lnc-CRYBA4-16:1 No - lnc-GNAT3-1:18 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-JMJD7-PLA2G4B-2:11 No - lnc-SOCS5-4:7 No - lnc-U2AF1L5-162:9 No - lnc-INSIG2-1:9 Yes chr2R:16262284-16264619 lnc-MUC20-67:46 No - STARD13-AS:38 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-LYZL1-15:25 No - lnc-INO80D-10:10 No - LINC01138:25 No - lnc-MUC20-67:103 No - lnc-SPATA31A6-67:1 No - FAM30A:9 No - lnc-PDGFRL-4:1 Yes chr3L:22881045-22893821 LINC01571:7 No - lnc-KLHL32-4:20 No - lnc-ZNF37A-4:3 No - LINC00710:14 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-PMFBP1-8:1 Yes chr4:501810-540874 lnc-RPS24-3:11 No - LINC00908:6 No - LINC00310:14 No - lnc-NR2F2-16:1 No - PLCE1-AS2:12 No - lnc-BIRC2-5:3 No - lnc-SNRPN-8:143 No - LINC01128:82 No - lnc-MTFR2-2:9 No - PCBP1-AS1:133 No - lnc-SMIM30-1:1 No - lnc-GGCT-1:57 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-PRPF39-4:1 No - lnc-AP3M1-3:7 Yes chr2R:7243024-7245776 LINC02246:19 No - lnc-CABLES2-7:2 No - SNHG20:6 Yes chr2L:6448464-6455929 lnc-WNT2-9:1 Yes chr3L:20806868-20809272 lnc-ANKRD36B-3:7 No - lnc-MCF2L-7:1 Yes chrX:16405509-16414651 ZKSCAN2-DT:14 No - lnc-RPS24-3:25 No - LINC01748:32 No - PCBP1-AS1:80 No - PROX1-AS1:15 Yes chr3R:11328480-11407627 KIAA0087:5 No - FAM74A7:3 No - lnc-ZDBF2-2:5 No - LINC01206:44 No - lnc-SAMD3-1:4 No - lnc-U2AF1L5-162:4 No - lnc-RNF24-6:1 No - LINC01748:18 Yes chr4:268175-276369 lnc-ZNF236-33:1 No - lnc-HES1-2:9 No - lnc-VPREB1-29:1 No - NDUFA6-DT:75 No - lnc-CLEC18B-8:1 No - WASF3-AS1:6 Yes chr2L:10976772-10982395 lnc-ABHD12-1:2 No - PAQR9-AS1:1 No - lnc-GATA5-9:1 Yes chr2L:6625138-6632407 lnc-ALG14-2:4 No - lnc-AQP9-6:1 No - SATB1-AS1:31 No - lnc-ERG-9:9 No - lnc-PLCD3-3:3 No - lnc-MUC20-67:30 No - lnc-MYO7B-2:30 Yes chrX:16309817-16313138 LINC00115:40 No - lnc-SMG1-4:1 No - lnc-SYVN1-3:1 Yes chr3L:9888762-9893319 PCBP1-AS1:153 No - lnc-HHIPL2-7:4 No - lnc-ZCCHC7-2:12 No - lnc-BCAT1-4:6 No - PSMG3-AS1:14 No - lnc-TMEM272-1:1 No - LINC01702:15 No - SATB1-AS1:32 No - PCBP1-AS1:172 No - lnc-RIOX2-11:1 No - LINC01127:36 No - LINC01778:20 No - lnc-FTCDNL1-4:46 No - LINC01727:16 No - BANCR:4 No - lnc-FCGR1B-9:1 No - lnc-ALG1L-2:26 No - lnc-COL2A1-4:1 No - LINC01630:14 No - lnc-SLC15A4-1:6 No - lnc-ELP2-2:1 Yes chrX:20429675-20433210 lnc-GALR1-5:2 No - lnc-CCL4L2-1:2 No - lnc-STON1-GTF2A1L-5:1 Yes chr3R:17725777-17733207 lnc-C10orf143-46:14 No - lnc-RHOT1-1:2 No - LINC01549:5 No - lnc-THAP2-2:1 Yes chr2L:13982743-14001248 TRAM2-AS1:9 No - lnc-BLOC1S3-2:1 Yes chr3R:11346294-11353131 PCBP1-AS1:108 No - lnc-METTL5-4:147 Yes chr2L:7377702-7384344 PGM5P3-AS1:12 No - TEX41:103 No - lnc-PARVG-5:1 Yes chrX:19746041-19748458 lnc-SPATA31A6-52:1 No - DLG5-AS1:4 No - lnc-MUC20-67:120 No - lnc-USP12-9:14 No - lnc-CRIM1-1:15 No - lnc-EDDM13-1:3 No - LAMTOR5-AS1:52 No - lnc-TVP23B-3:1 No - lnc-C7orf57-2:1 Yes chr3R:4808336-4812096 lnc-RPS21-2:6 No - TEX41:84 No - lnc-SH3D21-3:1 Yes chr3R:30808617-30827005 lnc-UBE2K-2:4 No - LINC00836:7 No - MIR194-2HG:2 No - lnc-NUTM2B-1:5 No - EDRF1-AS1:16 Yes chr3L:8721324-8726108 lnc-NUDT4B-1:6 No - lnc-CEP170-2:5 No - MAPK6-DT:11 No - lnc-NAV1-9:4 Yes chr3R:7112850-7117732 lnc-LY6E-7:7 No - lnc-MYO1D-1:2 Yes chr2R:14750166-14752910 lnc-SPATA31D1-4:34 No - lnc-TXLNB-3:18 Yes chr3R:25851632-25853989 PCBP1-AS1:141 No - TEX41:40 No - lnc-R3HDM4-2:3 Yes chr2R:23632610-23654820 SATB1-AS1:70 No - lnc-KDM4B-7:2 Yes chr2L:19586623-19732069 lnc-SEC24D-1:8 No - lnc-FAM25C-31:4 Yes chr3R:6187315-6195403 CYP1B1-AS1:9 Yes chr3L:5590083-5592571 lnc-FGFR1OP2-6:2 Yes chr3L:25114924-25115946 lnc-TBCCD1-4:44 No - lnc-MTFR2-2:1 No - LINC01988:17 No - lnc-ERI1-2:12 No - LINC01667:5 No - SATB1-AS1:85 No - C1QTNF1-AS1:3 No - lnc-SLC48A1-9:1 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-RHOV-3:1 Yes chr3R:19368995-19403153 lnc-ADAM8-5:1 No - lnc-PHF21A-1:8 No - lnc-INSIG2-1:13 Yes chr2R:16262284-16264619 lnc-ZNF778-1:7 Yes chr3L:12750119-12753402 LINC01619:5 Yes chrX:16074717-16091495 PCBP1-AS1:143 No - lnc-SNAI2-9:1 No - lnc-TMEM132B-2:10 No - SNHG4:9 No - lnc-SAMD3-1:7 Yes chr3R:27266326-27273273 lnc-TBCCD1-4:19 No - lnc-AAGAB-5:2 Yes chrX:8137041-8142279 LINC01702:16 No - lnc-TSR3-2:2 Yes chr2L:540599-542580 lnc-UNC93B1-3:2 No - PCBP1-AS1:81 No - lnc-LENG9-5:1 No - lnc-MAP1LC3B-1:5 No - LINC00284:1 No - lnc-ICA1-3:2 No - lnc-ATP23-89:4 No - LINC02213:7 No - SLC8A1-AS1:26 No - SOX2-OT:47 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-MRC2-9:1 No - PCBP1-AS1:207 No - lnc-PTPRZ1-3:8 Yes chr4:1230837-1271759 lnc-ZNF236-8:13 No - lnc-FBXO28-1:15 No - LINC00472:48 No - FRMD6-AS1:2 Yes chr2L:431227-448701 LINC00346:4 No - lnc-CEP152-4:1 Yes chr2L:4477462-4614300 LINC01115:4 No - lnc-SUDS3-3:1 No - lnc-LYPLAL1-7:2 No - lnc-MUC20-67:104 No - CYP1B1-AS1:21 Yes chr3L:5590083-5592571 lnc-TUBGCP6-5:2 Yes chr3R:13026283-13030659 LINC01138:42 No - lnc-TAF4-5:1 No - lnc-MFAP4-3:15 No - lnc-CNTNAP3B-45:1 No - LINC01427:1 No - NUTM2B-AS1:11 No - lnc-ZNF680-39:3 No - lnc-FUT10-1:2 No - lnc-JUN-5:10 No - LINC00893:49 Yes chr3L:3378268-3380083 lnc-FTCDNL1-4:47 No - TEX41:45 No - LINC01138:41 No - lnc-MAP3K9-3:17 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-ATIC-13:1 No - lnc-C5orf63-7:1 No - lnc-CIITA-4:1 Yes chr3R:16436880-16441661 lnc-SLC35C1-83:13 No - lnc-NBPF11-1:29 No - lnc-MDM1-5:1 No - LINC01241:18 No - lnc-C12orf74-3:34 No - LMO7DN-IT1:2 No - lnc-SLC15A4-1:5 No - lnc-MYO7B-2:27 Yes chrX:16309817-16313138 lnc-DOC2B-4:1 No - lnc-TNPO3-9:1 No - lnc-DLK1-35:143 No - lnc-MYO7B-2:35 Yes chrX:16309817-16313138 lnc-TP53TG3-27:2 No - lnc-TBCCD1-4:40 No - LINC02078:2 No - lnc-PRPF18-1:36 No - LINC00836:9 No - ZRANB2-AS2:6 Yes chr3L:5424109-5442399 LINC01360:10 No - lnc-MAP1LC3B-5:2 No - lnc-TMCO1-1:3 Yes chr3R:24290172-24293371 lnc-NCOA3-9:6 No - DLX6-AS1:6 Yes chr2R:24814822-24835667 LINC02536:3 No - RBMS3-AS2:2 No - PCBP1-AS1:54 No - lnc-MUC20-67:121 No - PROX1-AS1:17 Yes chr3R:11328480-11407627 lnc-NACA2-8:1 Yes chrX:11816898-11837460 EAF1-AS1:2 No - HEXDC-IT1:3 Yes chr3R:18199857-18215001 lnc-ZNF26-12:8 No - lnc-CBSL-165:1 No - lnc-PMPCA-3:1 Yes chrX:12596047-12609910 lnc-NABP1-5:22 No - MAMDC2-AS1:18 No - lnc-MUC20-67:44 No - lnc-IGF1R-1:4 No - PROX1-AS1:5 Yes chr3R:11328480-11407627 LINC01572:6 No - lnc-MUC20-67:41 No - LINC01714:35 No - RALY-AS1:10 No - lnc-CPN2-4:39 No - lnc-SLC22A18-2:2 Yes chrX:928798-930098 lnc-ZNF784-3:1 No - lnc-HTR7-3:1 No - lnc-INO80D-10:11 No - lnc-TBCCD1-4:53 No - lnc-ZNF727-18:5 No - lnc-MUC20-67:122 No - lnc-PTPRZ1-3:9 Yes chr4:1230837-1271759 PCBP1-AS1:6 Yes chr3L:21844788-21932702 lnc-MUC20-67:87 No - lnc-GTSF1L-9:1 No - lnc-CLDN9-1:4 No - lnc-TPTE-13:1 No - lnc-AVEN-2:3 No - LINC01515:25 No - LINC01545:3 No - SH3PXD2A-AS1:1 No - lnc-STON1-GTF2A1L-4:2 Yes chr3R:22468512-22486969 lnc-INSIG2-1:16 Yes chr2R:16262284-16264619 lnc-LIMS3-1:14 Yes chr3R:8356978-8359964 lnc-FAM83D-3:1 No - TBC1D8-AS1:10 Yes chr3L:21337681-21343716 lnc-ITGA9-2:6 No - NKAIN3-IT1:7 Yes chr2R:24881570-24888615 LINC01273:13 No - SATB1-AS1:33 No - lnc-MAP1LC3B2-18:2 No - LINC01002:38 No - EPB41L4A-DT:8 No - lnc-TMEM272-1:2 No - lnc-SIK1B-190:7 No - lnc-CLEC20A-12:1 No - LINC00893:51 Yes chr3L:3378268-3380083 lnc-MUC20-67:81 No - CPEB1-AS1:4 No - BAALC-AS2:1 No - lnc-BRF1-5:2 No - lnc-AAGAB-1:27 No - LINC00635:29 No - lnc-CREB3L1-2:4 No - NPSR1-AS1:10 Yes chr3R:25923499-25956270 lnc-PRR14L-5:2 No - FAM167A-AS1:5 No - TEX41:32 No - LINC01587:6 No - lnc-DHRS2-2:3 No - lnc-TPTE-12:1 No - lnc-RPS27A-1:19 Yes chr3L:3178930-3185287 CYP1B1-AS1:11 Yes chr3L:5590083-5592571 lnc-VDR-2:1 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-ACHE-11:1 No - lnc-CRYBA4-14:1 No - lnc-CCDC187-1:38 No - lnc-TP53TG5-4:1 Yes chr2R:21392402-21481176 lnc-TBCCD1-4:20 No - LINC02391:6 No - MIR2052HG:1 No - WASF3-AS1:7 Yes chr2L:10976772-10982395 lnc-TMEM189-1:6 No - PCBP1-AS1:110 No - MLIP-AS1:15 No - lnc-WDR4-2:3 No - lnc-COA5-2:2 Yes chr2R:16243145-16259805 lnc-GNAT3-1:19 Yes chr3L:7733250-7743041 CBR3-AS1:33 No - lnc-HIST2H2BF-4:3 No - LINC00632:5 No - LINC01583:4 No - lnc-MYO16-9:1 No - SATB1-AS1:34 No - lnc-GABARAPL2-8:1 No - LINC01949:6 No - lnc-INSIG2-1:11 Yes chr2R:16262284-16264619 PAX8-AS1:33 Yes chr4:1088798-1113317 LINC00893:45 No - LINC01358:12 No - LINC01206:42 No - lnc-JUN-5:14 No - lnc-ARF6-5:2 No - LINC02342:3 No - LINC01676:29 No - LINC00927:35 No - lnc-CSRNP3-12:3 Yes chrX:16455027-16533096 LINC00472:38 No - lnc-NETO1-1:23 No - lnc-GRM1-1:15 Yes chr3L:6174248-6178941 lnc-C21orf33-5:1 No - lnc-ZNF280D-12:1 Yes chr2R:15206527-15213634 lnc-UBLCP1-2:3 No - lnc-MUC20-67:50 No - lnc-MYCT1-2:2 No - TRDN-AS1:22 No - lnc-PTBP3-8:1 No - LINC00923:12 No - TEX41:97 No - lnc-ENOSF1-5:2 No - lnc-DTNBP1-16:12 No - LINC02034:6 No - lnc-MUC20-67:32 No - lnc-CXCL12-1:3 No - lnc-GTF2IRD2B-12:1 No - LINC00466:10 No - LINC01697:29 No - lnc-SPATA31A6-52:2 No - TEX41:104 No - lnc-BATF3-6:2 No - lnc-MYO9A-4:1 No - LINC01746:6 No - LINC00466:2 No - lnc-ZNF266-1:2 No - lnc-NRIP1-2:4 No - TEX41:9 No - MIR99AHG:122 No - CFLAR-AS1:21 No - TEX41:34 No - lnc-COLEC10-1:14 Yes chr2R:14752521-14753269 LINC01848:3 No - lnc-TC2N-1:3 No - lnc-SRY-9:2 No - lnc-FAM76A-1:6 No - URB1-AS1:1 No - LINC01685:7 No - lnc-SEPT7-1:15 No - lnc-ENTPD6-3:1 No - GAS8-AS1:2 Yes chrX:3491011-3504851 lnc-POTEM-3:2 No - lnc-TRIM55-1:12 No - lnc-ATP23-89:6 No - ADD3-AS1:12 No - lnc-HHIPL2-1:2 No - LINC00376:4 No - LINC01338:4 No - lnc-NOC4L-8:1 Yes chr3R:28748384-28751661 lnc-PTPRZ1-3:12 Yes chr4:1230837-1271759 CASC2:8 No - lnc-SIK1B-187:3 No - LINC01242:1 No - lnc-METTL5-4:150 Yes chr2L:7377702-7384344 SLC26A4-AS1:5 Yes chr3L:17898889-17907812 lnc-PTPRZ1-3:13 Yes chr4:1230837-1271759 lnc-TBCCD1-4:45 No - LINC01662:31 No - LINC01828:35 No - lnc-PLCXD1-6:1 No - PCBP1-AS1:116 No - lnc-ATP23-89:7 No - lnc-IL21R-4:1 No - lnc-ZNF236-6:1 No - LINC01619:6 Yes chrX:16074717-16091495 lnc-CBSL-165:6 No - lnc-TAGAP-4:4 No - lnc-AAAS-1:2 No - LINC01588:57 No - VIPR1-AS1:32 No - lnc-MAGED4-3:1 No - LINC00639:2 No - lnc-ARFGEF2-7:1 No - LINC01075:2 No - LINC01206:40 No - lnc-LIFR-1:3 Yes chr2R:16031930-16047243 SH3PXD2A-AS1:3 No - lnc-NUDT4B-1:7 No - lnc-NR2F2-16:3 No - lnc-MSH4-1:3 No - RALY-AS1:4 Yes chr3L:7423827-7454717 LINC01465:3 No - lnc-HARS-7:1 Yes chr3R:16484566-16495422 lnc-EFCAB8-1:4 No - lnc-KCNJ8-1:1 No - lnc-IGFBP7-5:13 No - CHRM3-AS2:8 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-WWOX-4:14 No - MAMDC2-AS1:19 No - lnc-METTL5-4:137 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-YOD1-1:3 No - lnc-KLF17-1:18 No - SLC16A1-AS1:12 No - lnc-CAPRIN1-6:4 No - lnc-IL4-1:4 Yes chr3L:5356864-5359392 LINC00923:2 No - lnc-PNMA8C-5:1 No - RBMS3-AS2:6 No - GNAS-AS1:9 Yes chr2R:23942538-23946936 lnc-PCED1B-2:4 No - lnc-DYRK1B-2:1 No - lnc-HIST2H2BF-4:2 No - NUTM2B-AS1:16 No - LINC00632:6 No - LINC00893:42 No - lnc-GRM1-1:16 Yes chr3L:6174248-6178941 TEX41:47 No - lnc-PRLH-1:3 No - lnc-RNF40-2:2 No - lnc-STAB2-5:2 No - lnc-COX14-2:2 No - LINC00174:14 No - lnc-MON2-2:5 No - lnc-METTL5-4:95 Yes chr2L:7377702-7384344 LINC01670:3 No - ANKRD10-IT1:2 No - LINC00310:2 No - lnc-PKP1-1:2 No - LINC01320:8 No - LINC01777:11 No - lnc-MUC20-67:47 No - lnc-RPS27A-1:24 Yes chr3L:3178930-3185287 lnc-RPS15-1:1 No - lnc-FAM229B-1:1 Yes chr3L:6203831-6218022 SATB1-AS1:83 No - lnc-SLC48A1-1:15 No - LINC01002:21 No - lnc-WDFY2-4:4 No - lnc-ACHE-11:2 No - PRKCQ-AS1:21 No - lnc-CKAP4-2:2 No - lnc-CLYBL-10:2 Yes chr2L:20730416-20734309 PCBP1-AS1:178 No - LINC01553:3 No - lnc-TAF7-1:6 No - lnc-SPATA31A6-66:1 No - lnc-ALG14-2:5 No - lnc-PHF21A-1:5 No - lnc-TUBA1A-1:2 Yes chr3R:9731221-9733250 LAMTOR5-AS1:39 No - LINC01471:4 No - VIPR1-AS1:14 No - lnc-RIT2-2:14 No - LINC02169:8 No - lnc-ATIC-8:6 No - lnc-TMEM252-2:6 Yes chr3L:16126018-16128531 LINC00908:4 No - lnc-SLC36A4-5:4 No - lnc-DTNB-1:2 No - lnc-SPATA31A6-59:1 No - lnc-FTCDNL1-4:48 No - lnc-TBCCD1-4:21 No - ZNF561-AS1:4 No - lnc-ZNF479-18:3 No - lnc-AKTIP-8:1 No - lnc-ANKRD36-1:8 No - PROX1-AS1:20 Yes chr3R:11328480-11407627 lnc-LRP12-4:2 Yes chr3R:5571108-5579189 LINC01517:11 No - lnc-CBSL-165:2 No - PROX1-AS1:21 Yes chr3R:11328480-11407627 lnc-ZNF362-1:8 No - lnc-BRCA1-3:6 No - PRKCQ-AS1:17 No - lnc-PIGBOS1-2:1 Yes chrX:1473884-1476974 lnc-ALG1L-2:21 No - SATB1-AS1:74 No - SATB1-AS1:52 No - MIR34AHG:14 No - EGOT:5 Yes chr3R:5517117-5539411 LINC01777:14 No - RMDN2-AS1:15 No - lnc-SLC35C1-83:2 No - lnc-TMOD2-1:1 Yes chr3R:30532607-30578905 lnc-BRCA1-3:7 No - LINC02405:28 No - TRDN-AS1:34 No - PCBP1-AS1:36 No - lnc-PPP2R2D-25:1 No - lnc-ZDHHC17-4:2 No - lnc-LRP11-1:6 Yes chr3R:5552823-5554316 lnc-MSRB3-6:1 Yes chr2R:24033974-24036707 MAGI2-AS3:40 No - lnc-TARSL2-4:1 No - lnc-FAM25C-31:7 No - lnc-PCSK6-3:4 Yes chr3R:25347431-25473058 TRG-AS1:6 No - lnc-RWDD3-7:16 No - EXTL3-AS1:7 Yes chr2R:19129589-19133706 SRGAP3-AS2:6 No - TEX41:50 No - LINC01551:5 No - lnc-MFSD9-5:3 No - DLEU2:16 No - lnc-HES6-1:6 No - VIPR1-AS1:36 No - FAM242E:5 No - lnc-RP1-1:15 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-INSIG2-1:18 No - lnc-HARS-9:1 Yes chr3R:16484566-16495422 lnc-HIST2H3A-1:1 No - lnc-POTEC-1:2 No - ITGA9-AS1:19 Yes chr2R:15258761-15262873 PCBP1-AS1:113 No - lnc-ANKRD20A3-50:1 No - TEX41:85 No - KLF3-AS1:5 Yes chr2R:23011078-23042943 lnc-PRMT6-3:4 No - lnc-ZNF613-7:2 No - PROX1-AS1:7 Yes chr3R:11328480-11407627 lnc-METTL5-4:151 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-MDFIC-6:1 No - lnc-INSL5-2:1 Yes chr3R:9516007-9527237 TEX41:86 No - lnc-MUC20-67:136 No - lnc-C13orf42-1:7 No - PARD6G-AS1:5 Yes chrX:17703352-17707096 lnc-MUC20-67:64 No - MIR99AHG:111 No - lnc-HARS-4:2 Yes chr3R:16484566-16495422 VPS33B-DT:28 No - lnc-RIT2-2:12 No - lnc-ROGDI-5:1 Yes chr2L:10003832-10008889 lnc-FBN1-3:4 Yes chr2L:11011312-11012135 lnc-ZNF221-3:1 No - LINC01559:4 No - LINC01547:3 No - LINC00494:6 No - lnc-EIF4E3-8:1 Yes chr3R:9726020-9730872 GAS6-AS1:6 Yes chr3L:7650548-7759123 lnc-MESD-4:8 No - PCBP1-AS1:57 No - LAMTOR5-AS1:62 No - lnc-ANKRD20A3-51:6 No - CYP1B1-AS1:47 Yes chr3L:5590083-5592571 lnc-OR4N4-1:23 No - LINC01670:2 No - lnc-HCK-1:1 Yes chr2L:13746952-13773905 lnc-SIK1B-190:11 No - lnc-PCSK7-5:1 No - lnc-CSAG3-2:1 No - lnc-MUC20-67:55 No - lnc-FAM98A-9:2 No - lnc-RPS24-3:12 No - lnc-SMIM11B-180:5 No - BTG3-AS1:10 Yes chrX:16074717-16091495 lnc-SPTBN5-6:1 No - lnc-ARHGAP6-6:1 No - CYP1B1-AS1:12 Yes chr3L:5590083-5592571 lnc-NAPB-3:2 No - lnc-PHF21A-1:6 No - ARHGEF26-AS1:9 No - MAGI2-AS3:26 No - PCBP1-AS1:109 No - lnc-RTTN-8:1 No - lnc-NR2F2-2:4 No - lnc-MGAM2-22:1 No - lnc-MUC20-67:29 No - EDRF1-AS1:4 Yes chr3L:8721324-8726108 SOX2-OT:64 No - lnc-PTPRZ1-3:19 Yes chr4:1230837-1271759 lnc-CSMD1-19:1 No - lnc-SERP2-17:2 No - CEP83-DT:9 No - LINC01170:3 No - LINC01206:10 No - SATB1-AS1:35 No - DAB1-AS1:30 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-CNTNAP4-1:1 Yes chr3L:12146519-12156990 FAM223B:2 No - POC1B-AS1:44 Yes chr4:328193-358917 lnc-PPIAL4D-19:9 No - LINC01778:17 No - LINC02312:4 No - lnc-ANKRD36B-3:4 No - TMEM51-AS1:3 Yes chr2R:22333500-22373109 TEX41:35 No - LINC01471:15 No - CIRBP-AS1:3 Yes chr2R:14602004-14604337 LINC01206:25 No - lnc-CPN2-4:32 No - lnc-NUDT4B-1:8 No - lnc-TBCCD1-4:2 No - lnc-B3GNT7-3:3 No - CNTN4-AS1:1 No - lnc-CHSY1-5:7 No - LINC01320:11 No - LINC01630:21 No - PCBP1-AS1:144 No - lnc-ERAP1-2:5 No - lnc-PLCL2-3:3 Yes chr3R:13269137-13272011 lnc-GSC-3:1 No - lnc-CHMP2B-1:9 No - PCBP1-AS1:51 No - LINC02206:8 No - lnc-ICA1-3:4 No - lnc-DOC2B-8:1 No - lnc-C1orf35-3:2 No - lnc-EIF2AK4-8:1 No - LINC01002:17 No - lnc-ITGA9-2:2 No - lnc-HLA-DQA2-1:6 No - lnc-DHX38-26:1 Yes chr4:501810-540874 VIPR1-AS1:15 No - PCBP1-AS1:194 No - lnc-STAT3-1:3 Yes chr3R:20535323-20552311 LINC01521:3 No - SLC8A1-AS1:17 No - NFIA-AS1:8 Yes chr4:268175-276369 lnc-HMGA1-2:7 No - lnc-EIF2D-3:1 Yes chr2L:20676045-20678979 INTS6-AS1:27 Yes chrX:5738663-5747254 lnc-APOL1-14:1 No - lnc-METTL23-4:1 No - LINC01828:29 No - FAM197Y5:5 No - lnc-FBXO25-9:1 Yes chr2R:5702112-5705439 LINC01672:19 No - lnc-TMEM230-4:1 No - lnc-MKS1-1:1 Yes chr3R:17425768-17446499 RMDN2-AS1:6 No - LINC01002:4 No - lnc-ZNF641-5:1 No - lnc-ONECUT2-5:3 No - LINC01398:1 No - lnc-NPIPB2-5:1 Yes chr2L:13177150-13178978 lnc-MUC22-1:9 No - LINC01105:9 No - SLC25A25-AS1:8 Yes chr3L:12402295-12414842 LOXL1-AS1:22 No - PCBP1-AS1:82 No - lnc-TAF7-5:1 No - lnc-RFPL4B-1:15 No - lnc-FRMD8-4:2 No - lnc-STRC-1:7 No - lnc-CHD2-19:1 No - MIF-AS1:8 No - lnc-ZNF680-39:2 No - lnc-ZNF254-3:1 No - lnc-ESM1-1:16 No - lnc-SYNE2-3:3 No - POC1B-AS1:38 No - lnc-C5orf60-1:5 No - lnc-CRYAA2-181:5 No - lnc-PRPF18-1:46 No - lnc-CBWD6-39:1 No - lnc-ZNF837-1:20 No - LINC01197:23 No - PICSAR:3 No - lnc-MBNL2-5:1 Yes chr2R:24063051-24065405 lnc-NKD2-4:1 No - lnc-GBX2-3:3 Yes chr2L:13835564-13898712 lnc-SPTBN4-5:1 No - lnc-MUC20-67:52 No - LAMTOR5-AS1:46 No - RNASEH2B-AS1:8 Yes chrX:13668014-13669573 PCBP1-AS1:83 No - lnc-CAPZA2-2:13 Yes chr3L:20806868-20809272 LINC01697:23 No - lnc-ZBED4-9:1 No - LINC00226:4 No - LINC01411:5 No - lnc-IFT74-11:1 No - CYP1B1-AS1:14 Yes chr3L:5590083-5592571 lnc-C8orf59-1:3 Yes chr2L:13803626-13809994 lnc-HMG20A-2:3 No - lnc-CMPK2-5:68 No - lnc-MUC20-67:105 No - lnc-RPS24-3:14 No - SRD5A3-AS1:7 No - lnc-MCTP2-7:5 No - LINC01002:16 No - lnc-RWDD3-7:14 No - lnc-ZNF703-3:3 No - lnc-GPC1-2:2 No - TEX41:81 No - LINC02272:10 No - B3GALT5-AS1:5 No - lnc-TGM2-4:1 Yes chr3L:2235284-2237076 lnc-KCNE1B-155:1 No - LINC01651:3 No - lnc-NBPF19-5:1 No - lnc-SNX11-2:5 No - LINC01796:2 No - LAMTOR5-AS1:53 No - ZFAS1:18 Yes chr3L:2895017-2959579 lnc-ZNF716-52:3 No - lnc-PRSS3-2:4 No - LINC01427:6 No - CFLAR-AS1:9 No - lnc-ERICH1-80:2 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-PDZD9-6:1 Yes chr3L:19978713-19979812 PRKCQ-AS1:24 No - lnc-FTMT-2:9 No - lnc-POTEB3-1:2 No - lnc-CCDC144A-6:1 No - CHRM3-AS2:12 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-FAM25C-29:1 No - lnc-TTC30B-1:21 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-CDK8-2:1 Yes chr3R:9535625-9551806 lnc-ANKRD20A3-50:2 No - lnc-TWIST2-14:1 Yes chrX:13262687-13285632 lnc-METTL5-4:103 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-CNTNAP3B-49:1 No - lnc-GNAT3-1:14 Yes chr3L:7733250-7743041 LINC01127:37 No - lnc-ANKRD20A2-12:8 No - LINC01783:8 No - DARS-AS1:15 No - SATB1-AS1:81 No - lnc-LRRTM1-2:9 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-NR2F2-2:3 No - LINC01842:7 No - lnc-MUC20-67:86 No - ITGA9-AS1:9 Yes chr2R:15258761-15262873 LINC00635:30 No - SNHG5:20 No - lnc-GGCT-1:56 Yes chr3L:18461957-18463163 ADGRA1-AS1:1 No - lnc-HIST2H3PS2-7:3 No - LINC01002:39 No - lnc-PDGFA-5:2 No - lnc-ANGPTL2-1:3 Yes chr2R:16783671-16792472 LINC01206:36 No - lnc-ATG2B-12:1 No - LINC01560:2 No - lnc-PPIAL4C-4:21 No - EPB41L4A-DT:9 No - lnc-MUC20-67:106 No - DARS-AS1:28 No - lnc-LINC02210-CRHR1-52:22 Yes chr2R:12474424-12487986 lnc-TMEM211-7:1 No - lnc-SMIM11B-180:3 No - lnc-METTL5-4:152 Yes chr2L:7377702-7384344 LINC02498:8 No - lnc-CMPK2-5:69 No - SPANXA2-OT1:4 No - SLC8A1-AS1:29 No - lnc-ANKS6-1:22 No - lnc-TPTE-1:7 No - LINC01677:8 No - lnc-ZSCAN1-3:8 Yes chr2R:14173693-14182838 PROX1-AS1:40 No - PCBP1-AS1:117 No - NUTM2B-AS1:18 No - AQP4-AS1:4 No - PCBP1-AS1:84 No - LINC02098:7 No - lnc-WWOX-4:3 No - LINC01828:36 No - MALAT1:20 No - lnc-MCTP2-7:8 No - PCBP1-AS1:85 No - LINC00837:9 No - lnc-EXOC2-188:1 No - lnc-GGCT-1:53 No - LINC01440:13 No - lnc-CAPRIN2-2:4 No - LINC02362:21 No - ADNP-AS1:5 No - PCBP1-AS1:136 No - lnc-LRRC3-7:1 No - lnc-NBPF11-1:37 No - RBMS3-AS2:7 No - lnc-ZNF479-23:6 No - lnc-TMEM74B-3:2 Yes chr2R:11967343-11970115 IGF2BP2-AS1:3 Yes chrX:10787869-10824277 lnc-ALDH1A3-1:18 No - LINC00710:23 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-RWDD3-7:22 No - lnc-CRYAA2-182:1 No - LINC00710:28 Yes chr2L:12344219-12397528 FAM95C:7 No - lnc-DIS3-6:1 Yes chr2R:23011078-23042943 PROX1-AS1:22 Yes chr3R:11328480-11407627 lnc-SETBP1-10:1 Yes chr2R:23560492-23564045 FLG-AS1:10 No - SATB1-AS1:75 No - ZNF667-AS1:11 No - lnc-MUC20-67:19 No - lnc-GSDMC-34:35 No - lnc-LYPD4-1:2 No - LINC01828:31 No - PCBP1-AS1:129 No - lnc-SMIM34B-160:4 No - LINC00251:3 No - lnc-ARFGEF2-2:12 No - lnc-TOX3-1:17 No - LINC02226:22 No - lnc-AGRP-1:6 No - lnc-ZBED2-5:1 No - PROX1-AS1:13 Yes chr3R:11328480-11407627 lnc-WAC-3:1 Yes chr2R:11226458-11232516 lnc-LINC02210-CRHR1-52:8 Yes chr2R:12474424-12487986 lnc-ANKRD36B-3:9 No - lnc-SAMD3-1:6 Yes chr3R:27266326-27273273 EIF1B-AS1:11 No - LINC02109:56 No - lnc-RBFOX3-22:1 No - lnc-MUC20-67:56 No - EDRF1-AS1:8 Yes chr3L:8721324-8726108 lnc-SLC35D1-1:1 No - MIR205HG:8 No - TEX41:42 No - lnc-MAGED4B-5:1 No - lnc-WDR18-3:1 Yes chr2R:23632610-23654820 lnc-SLC2A13-2:2 Yes chr3R:20635480-20644279 SNHG17:8 No - lnc-MYO7B-2:28 Yes chrX:16309817-16313138 LINC00520:10 No - PCBP1-AS1:44 No - LINC01560:3 No - LINC01663:9 No - lnc-FOXG1-11:2 No - lnc-CCDC187-2:3 No - lnc-ATXN1-8:1 Yes chrX:10744502-10749097 lnc-MUC20-67:107 No - lnc-CAPRIN2-2:6 Yes chr3L:17891820-17895862 OIP5-AS1:20 No - lnc-BRD1-23:7 No - lnc-P2RX7-7:1 No - lnc-SFTPC-2:7 Yes chr3R:24719697-24749125 lnc-TBC1D7-1:5 No - lnc-DHX38-3:7 No - lnc-SPACA9-1:3 Yes chr2L:6821934-6838995 WASF3-AS1:8 Yes chr2L:10976772-10982395 lnc-POLRMT-6:9 Yes chr2L:8083420-8116531 MALAT1:30 No - lnc-H1FNT-1:8 No - LINC01002:28 No - lnc-SIK1B-190:5 No - ENOX1-AS2:3 Yes chr3L:12844254-12850117 lnc-HPD-2:3 Yes chrX:9356634-9358594 lnc-NR2F2-16:2 No - TEX41:72 No - FLG-AS1:11 No - PCBP1-AS1:157 No - LINC01297:4 No - lnc-ANKRD36-14:1 No - lnc-GNAT3-1:26 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-NUDT8-3:1 No - lnc-U2AF1L5-162:5 No - VIPR1-AS1:29 No - lnc-SYTL3-2:9 No - lnc-CREB3L4-12:3 Yes chr2R:6718196-6719533 HAND2-AS1:22 No - PROX1-AS1:1 Yes chr3R:11328480-11407627 lnc-CLEC18B-7:7 Yes chr2R:24400028-24404527 lnc-KRT80-15:1 No - lnc-SMIM34B-160:3 No - LINC01685:6 No - RMDN2-AS1:7 No - lnc-ESM1-1:15 No - lnc-GINS1-12:2 No - lnc-TAF4-5:2 No - CFLAR-AS1:10 No - LINC00284:4 No - lnc-HNRNPLL-2:2 Yes chr2L:11694804-11696107 lnc-HMGA1-2:8 No - lnc-C3AR1-4:1 No - lnc-MYO18A-2:1 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-FTCDNL1-4:49 No - lnc-MUC20-67:13 No - lnc-MYLPF-1:3 Yes chr3R:11581576-11585305 lnc-CRYBA4-52:30 No - lnc-PRKAB2-2:5 No - LINC01630:22 No - lnc-ATXN2L-1:2 No - PROX1-AS1:2 Yes chr3R:11328480-11407627 lnc-MN1-11:2 No - LINC00623:43 No - LINC00284:13 No - lnc-MLEC-1:1 No - lnc-PPIAL4C-4:23 No - lnc-PAQR5-1:2 No - lnc-ARGLU1-2:1 Yes chr4:571755-580122 lnc-RFPL4B-1:16 No - lnc-NPY2R-1:40 No - FAM87A:12 No - LINC01869:23 No - ARRDC3-AS1:4 Yes chr3R:7804665-7810014 LINC00235:3 No - lnc-DAPK1-7:1 No - lnc-TBCCD1-4:30 No - LINC01669:10 No - lnc-FTCDNL1-4:61 No - lnc-CAPZA2-2:8 Yes chr3L:20806868-20809272 lnc-SNX10-7:3 No - lnc-C5orf60-1:8 No - FUT8-AS1:2 Yes chrX:11706575-11709951 lnc-ERGIC2-2:4 Yes chrX:2201820-2203866 SRGAP3-AS2:5 No - lnc-BRCA1-3:1 No - lnc-ALDH1A3-1:17 No - EAF1-AS1:1 No - HTR5A-AS1:4 Yes chr2R:19022325-19032642 lnc-ALG1L-2:28 No - RNASEH2B-AS1:7 Yes chrX:13668014-13669573 lnc-ANKRD36-2:4 No - lnc-GRAPL-6:3 Yes chr3L:7528780-7540012 PROX1-AS1:26 No - MTUS2-AS1:5 No - BANCR:5 No - LINC01547:5 No - BPESC1:3 Yes chr3R:27916908-27918248 ADGRA1-AS1:4 No - lnc-NR5A2-1:7 No - lnc-SYVN1-3:2 Yes chr3L:9888762-9893319 lnc-GTF2IRD2B-11:1 No - lnc-FAM196A-1:13 Yes chr3R:23781765-23801634 lnc-HIST2H2BF-3:3 No - lnc-TCHP-4:1 No - lnc-FTCDNL1-4:50 No - lnc-MCTP2-7:13 No - LINC01999:5 No - lnc-ZNF281-3:1 No - RMDN2-AS1:9 No - LINC01558:5 No - LINC01600:1 No - lnc-ANKRD36-1:10 No - lnc-TBCCD1-4:31 No - lnc-DCP1B-8:1 Yes chr2L:16165831-16190540 lnc-LBP-4:1 No - LINC01670:4 No - lnc-SLX1B-4:1 No - lnc-PKP2-5:1 No - SOX2-OT:48 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-DESI2-3:1 No - NR2F2-AS1:50 No - PROX1-AS1:37 No - LINC01002:18 No - SLC8A1-AS1:37 No - PCBP1-AS1:55 No - lnc-GSG1L-1:7 No - lnc-TSHR-9:8 Yes chr3R:27251112-27256463 lnc-C5orf38-7:1 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-FAM196A-1:15 Yes chr3R:23781765-23801634 lnc-MUC20-67:78 No - lnc-GRM1-1:13 Yes chr3L:6174248-6178941 lnc-FTCDNL1-4:51 No - VIPR1-AS1:16 No - lnc-PDS5B-2:1 No - lnc-SNX10-7:2 No - LINC01002:22 No - lnc-ITGB1-1:2 No - lnc-ANKRD36B-3:26 No - lnc-RPS24-3:29 No - lnc-ENOX1-4:1 No - lnc-PDCD1-1:22 No - lnc-MUC20-67:57 No - lnc-MCTP2-7:7 No - lnc-TCF12-8:1 Yes chr2R:15206527-15213634 ARRDC3-AS1:6 Yes chr3R:7804665-7810014 SLC8A1-AS1:7 No - LINC01002:8 No - LINC00310:3 No - LAMTOR5-AS1:20 No - lnc-C19orf25-2:3 Yes chr3R:24163966-24168264 CFLAR-AS1:22 No - lnc-LINC02203-1:1 No - HORMAD2-AS1:8 Yes chrX:16296671-16303308 lnc-VIP-10:1 No - THRB-AS1:8 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-ERGIC2-7:1 Yes chrX:2201820-2203866 lnc-GALNT9-4:1 No - lnc-SLC38A5-3:1 Yes chr2R:14602004-14604337 lnc-B4GALT7-4:1 No - lnc-CREBL2-4:1 No - LINC01559:2 No - lnc-ALG1L-2:19 No - lnc-UCK1-3:3 No - VIPR1-AS1:17 No - lnc-PTRH1-3:1 No - lnc-SMIM34B-160:5 No - lnc-BLZF1-2:3 No - lnc-C6orf132-1:3 No - LINC01561:2 No - lnc-KCNC2-6:2 Yes chr3R:12855544-12859246 lnc-FOXB1-11:1 Yes chr2R:10203995-10237348 lnc-ZNF74-6:4 Yes chr3R:31777020-31790681 lnc-PLCL2-3:2 Yes chr3R:13269137-13272011 ADAMTS9-AS1:26 Yes chr2R:22807860-22815993 lnc-C5orf60-1:7 No - lnc-CD55-2:2 No - PCBP1-AS1:204 No - lnc-ZNF669-3:1 No - lnc-MUC20-67:71 No - lnc-CBSL-168:1 No - lnc-TIMELESS-1:1 No - lnc-POFUT2-12:2 Yes chrX:1773725-1788065 lnc-MTFR2-2:4 No - SATB1-AS1:76 No - lnc-CPN2-4:29 No - lnc-ZNF541-3:1 No - lnc-PDYN-1:7 No - lnc-FGF9-3:8 No - LINC01515:18 No - lnc-ATAD2B-13:1 No - TMC3-AS1:12 No - lnc-SIK1B-187:5 No - lnc-PMM2-6:4 Yes chrX:16792119-16797742 lnc-CRIM1-1:12 No - lnc-POLR3A-7:1 No - TBX18-AS1:16 No - lnc-NMT2-4:1 No - lnc-METTL5-4:153 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-MUC20-67:37 No - lnc-PHF14-14:3 No - lnc-KIAA1328-4:3 Yes chr3L:13521907-13803400 lnc-AAGAB-1:40 No - lnc-NR2F2-16:4 No - LINC02362:18 No - lnc-OR4N4-1:21 No - LINC01435:1 No - lnc-PPIAL4E-9:3 No - LINC01127:28 No - PCBP1-AS1:86 No - lnc-PROK1-2:4 No - lnc-NECAB3-2:1 No - PROX1-AS1:43 No - LINC00893:41 No - lnc-ANKS6-1:20 No - lnc-ELFN1-5:1 Yes chr2R:9288957-9291565 MIR3936HG:3 No - CBR3-AS1:25 No - lnc-ANGPTL2-1:2 Yes chr2R:16783671-16792472 MALAT1:37 No - lnc-KCNE1B-11:1 No - PROX1-AS1:19 Yes chr3R:11328480-11407627 lnc-METTL5-4:109 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-SERPINB9-1:7 No - RALY-AS1:11 No - lnc-BIRC7-5:1 No - lnc-SAMD3-1:5 No - lnc-ANKRD20A3-51:4 No - lnc-AVEN-5:1 No - SATB1-AS1:67 No - lnc-U2AF1L5-162:7 No - PCBP1-AS1:176 No - SOX2-OT:3 Yes chrX:7407208-7407854 lnc-ACAD10-4:1 Yes chr3R:19178085-19180538 LINC01230:11 No - GRID1-AS1:6 Yes chr2L:4830846-4835300 lnc-PPIAL4C-4:18 No - LINC01128:84 No - lnc-TAF7-18:2 No - lnc-DGKE-7:1 No - lnc-IL16-12:2 No - THRB-AS1:14 No - lnc-MMADHC-2:6 Yes chr2R:16266960-16271971 lnc-LINS1-2:4 No - lnc-PKMYT1-5:1 No - lnc-RNF138-2:1 No - lnc-DHX38-26:2 Yes chr4:501810-540874 HHATL-AS1:3 Yes chr3L:16673964-16676264 lnc-ANXA2-1:2 No - lnc-FSIP1-4:9 No - PCBP1-AS1:140 No - lnc-PDZD8-8:2 No - LINC01558:4 No - lnc-MYO7B-2:9 Yes chrX:16309817-16313138 LINC01547:4 No - lnc-METTL26-2:3 Yes chr3L:6965260-6967897 MAMDC2-AS1:20 No - PGM5P3-AS1:13 No - lnc-CXorf36-46:7 No - lnc-SMIM34B-160:1 No - LINC00272:3 No - LINC02334:16 No - FAM230B:10 Yes chrX:124370-126714 LINC01587:5 No - LINC01090:1 Yes chr2R:9434669-9444937 lnc-DHX38-26:4 Yes chr4:501810-540874 lnc-CRYL1-1:5 No - PEG13:1 Yes chr2L:20650755-20656178 lnc-METTL5-4:138 Yes chr2L:7377702-7384344 MESTIT1:2 No - lnc-MSRB3-7:1 No - lnc-THAP5-4:1 No - lnc-GNAT3-1:16 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-ABCD3-2:7 No - lnc-FOXA2-7:10 No - TTTY14:7 No - lnc-MUC20-67:108 No - SNHG5:2 No - LINC01828:37 No - LAMTOR5-AS1:57 No - CYP1B1-AS1:6 Yes chr3L:5590083-5592571 lnc-SPATA31A3-3:1 No - LINC01124:3 No - lnc-SQOR-4:1 No - lnc-SMIM34B-160:2 No - SATB1-AS1:56 No - ADD3-AS1:13 No - LAMTOR5-AS1:47 No - lnc-FGB-5:1 No - lnc-SNRPB2-2:2 No - lnc-CMPK2-5:70 No - LINC01358:13 No - lnc-GGCT-1:54 No - LINC02272:9 No - LINC00710:21 Yes chr2L:12344219-12397528 FAM30A:8 No - SNHG5:22 No - GRID1-AS1:3 Yes chr2L:4830846-4835300 lnc-HM13-3:1 No - lnc-TMEM231-2:1 No - lnc-TMEM272-1:5 No - lnc-CTIF-8:1 Yes chrX:8137041-8142279 lnc-NEMF-1:2 No - lnc-GLT1D1-4:3 No - lnc-STX2-18:1 No - lnc-ENDOU-7:1 Yes chr2R:24159384-24161503 LINC01170:4 No - lnc-SLC30A4-4:1 No - lnc-ALDH1A3-1:20 No - BHLHE40-AS1:4 No - lnc-EBF3-1:7 Yes chr3R:6658806-6660100 CFLAR-AS1:23 No - lnc-TMEM41B-5:2 No - lnc-TPTE-13:2 No - lnc-RTN4-3:2 Yes chrX:17657372-17669371 lnc-OR4N2-8:4 No - lnc-GGCT-1:58 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-OTOA-1:2 Yes chr2R:23896896-23898246 lnc-RPS24-3:21 No - TEX41:87 No - RBMS3-AS2:4 No - ARRDC1-AS1:4 Yes chr3L:176306-178963 lnc-CMPK2-5:73 No - lnc-SMIM30-1:6 No - LINC00987:4 No - ACTN1-AS1:4 No - lnc-ACSS3-2:3 Yes chr2L:6723903-6732766 lnc-NDUFA4-2:2 No - lnc-TRUB2-8:2 Yes chr3L:7639811-7640446 lnc-VSTM2B-5:21 No - PCBP1-AS1:151 No - lnc-ANKRD20A3-52:1 No - lnc-FAM76A-1:5 No - LINC00893:54 Yes chr3L:3378268-3380083 LINC01358:7 No - lnc-PDCD1-1:24 No - PCBP1-AS1:174 No - ZBTB20-AS5:7 No - TRDN-AS1:38 No - lnc-CCL1-3:11 No - lnc-RPS6KA4-3:3 No - lnc-PDE4DIP-6:9 No - LINC01619:9 No - lnc-CBLN4-8:1 No - lnc-TBCCD1-4:49 No - lnc-EMILIN3-5:1 Yes chr2L:210735-250823 LINC00893:52 Yes chr3L:3378268-3380083 ADAMTS9-AS1:34 Yes chr2R:22807860-22815993 lnc-ERG-9:4 No - lnc-RWDD3-7:21 No - lnc-UNC93A-1:5 No - lnc-HOXC4-4:8 Yes chr3R:17150587-17151630 lnc-PPP1R3B-11:3 Yes chr3R:25653091-25661286 PROX1-AS1:42 No - lnc-TBCCD1-4:55 No - ARHGEF26-AS1:6 No - lnc-TMEM99-5:4 No - lnc-MUC20-67:67 No - SATB1-AS1:53 No - lnc-GADD45G-3:4 No - lnc-TM6SF2-1:3 No - lnc-WBP4-2:6 No - LINC01124:7 No - lnc-PSMC3IP-3:6 No - CFLAR-AS1:11 No - lnc-AVEN-1:3 No - lnc-NPIPB3-3:1 No - lnc-RILPL2-3:1 Yes chrX:1393054-1397337 lnc-VPREB1-46:1 No - MIR1-1HG-AS1:52 No - TEX41:24 No - lnc-ATIC-8:9 No - SAMD12-AS1:7 Yes chr2R:14752521-14753269 lnc-BAHCC1-4:1 No - SGO1-AS1:9 No - lnc-CYP17A1-3:3 No - LINC01138:9 No - lnc-CELA3A-5:24 No - lnc-MGMT-13:1 Yes chr2R:14772650-14807061 SCAANT1:3 No - LINC01597:1 No - TEX41:73 No - lnc-NUPR1-2:1 Yes chr2R:21292239-21293646 lnc-EIF2B1-1:4 Yes chrX:4540908-4542506 PROX1-AS1:6 Yes chr3R:11328480-11407627 lnc-CDIPT-1:11 No - LINC01973:5 No - FZD10-DT:50 No - lnc-GOLGA8O-5:8 No - LINC00963:21 No - lnc-GNAT3-1:15 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-RNF39-4:19 No - lnc-FGD4-8:1 Yes chr2L:17459605-17473215 WDFY3-AS2:9 No - lnc-CNDP1-9:1 Yes chr2R:5697872-5700212 MIR325HG:16 No - ZEB2-AS1:13 Yes chr3R:30765926-30789202 KLF3-AS1:2 Yes chr2R:23011078-23042943 lnc-SYTL3-2:8 No - FAM138C:1 Yes chr2R:12180493-12182373 LINC00221:10 No - lnc-BCKDHA-2:1 Yes chr3R:9555785-9557776 LAMTOR5-AS1:1 No - NEAT1:9 No - lnc-B3GNT10-21:24 No - lnc-DGLUCY-7:2 No - lnc-MCTP2-7:12 No - lnc-PCED1B-5:28 No - lnc-MAPKAP1-1:5 No - CFLAR-AS1:12 No - CARMN:2 No - lnc-PWWP2B-4:2 No - lnc-DPP4-2:13 No - lnc-PPP1R26-7:1 No - lnc-TBCCD1-4:28 No - lnc-BICDL1-1:2 Yes chrX:20155766-20159872 lnc-CREM-7:2 No - lnc-ISX-11:1 No - SOX2-OT:65 Yes chr2L:8825645-8829670 CYTOR:123 No - SLC8A1-AS1:36 No - lnc-TVP23A-7:1 No - lnc-EDRF1-1:31 No - lnc-CBSL-165:5 No - lnc-FAM167A-4:2 Yes chr3L:8968528-8971752 lnc-PTPRZ1-3:16 Yes chr4:1230837-1271759 lnc-AHSP-5:3 Yes chr2L:18695664-18698571 lnc-ODF1-1:4 No - PCBP1-AS1:87 No - LINC02371:4 No - ST20-AS1:3 Yes chr2R:23359215-23360266 lnc-ZNF727-18:2 No - lnc-ATXN1-8:2 Yes chrX:10744502-10749097 WASF3-AS1:4 Yes chr2L:10976772-10982395 lnc-C19orf44-8:1 Yes chr4:778516-788978 lnc-ARGLU1-3:1 No - lnc-CHD2-20:1 No - lnc-RP1-1:16 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-BPY2C-3:2 No - TRDN-AS1:37 No - lnc-C17orf75-12:1 Yes chr3R:24034362-24038847 lnc-TMEM211-6:1 No - TEX41:10 No - lnc-TCFL5-7:1 Yes chr3R:12413828-12421251 lnc-ZBED4-12:1 No - lnc-MUC20-67:23 No - lnc-CMAS-4:1 Yes chrX:16278328-16285618 LINC01559:6 No - lnc-SRSF6-1:3 No - MAGI2-AS3:41 No - PAQR9-AS1:18 Yes chr2R:21011970-21015628 lnc-CLUH-3:1 No - DLX6-AS1:12 Yes chr2R:24814822-24835667 lnc-METTL21C-3:1 No - lnc-METTL5-4:154 Yes chr2L:7377702-7384344 INTS6-AS1:33 No - lnc-KLF17-1:15 No - lnc-NBPF11-1:19 No - lnc-DISP1-1:17 No - lnc-BCAT1-4:5 No - lnc-AMELY-18:1 No - lnc-TMEM230-2:1 No - lnc-TSC22D1-4:1 No - lnc-ZBED4-10:1 Yes chr2R:7272275-7278101 lnc-FZD10-9:1 No - lnc-COG5-2:3 Yes chr2R:9993890-10026042 lnc-SFXN5-4:1 Yes chr3R:13867345-13874916 lnc-TBCCD1-4:50 No - LINC01358:8 No - SNHG5:17 No - LINC02188:12 No - LINC01561:3 No - lnc-FAM72B-19:1 No - lnc-RILPL2-2:1 Yes chrX:1393054-1397337 lnc-C1orf123-1:2 Yes chr3L:2981022-2983551 lnc-SMTN-2:2 Yes chrX:6540771-6589173 lnc-CLEC18B-7:8 Yes chr2R:24400028-24404527 lnc-HIST1H2AI-3:10 No - SOX2-OT:49 Yes chr2L:8825645-8829670 SATB1-AS1:36 No - VAV3-AS1:10 No - lnc-TM2D3-5:1 Yes chr3R:25347431-25473058 PACRG-AS3:5 Yes chr2R:19497752-19500372 LINC01471:5 No - LINC01124:5 No - lnc-ZSWIM8-2:3 Yes chr4:1035288-1053703 VWA8-AS1:1 Yes chrX:9319359-9324458 lnc-GLYAT-1:2 No - LINC00934:8 No - LINC00239:2 No - ABCA9-AS1:6 Yes chr2L:13784084-13790562 ERC2-IT1:2 Yes chr2R:9503765-9541565 PACRG-AS3:2 Yes chr2R:19497752-19500372 lnc-SSTR4-4:6 No - LINC01471:6 No - SYNGAP1-AS1:8 No - lnc-ANKRD20A3-51:2 No - lnc-ZWILCH-2:1 Yes chr3R:17054007-17070408 lnc-METRNL-8:1 No - lnc-C5orf60-1:6 No - TEX41:21 No - lnc-MUC5AC-98:1 No - lnc-LPAR6-5:1 Yes chrX:797090-801479 LAMTOR5-AS1:48 No - lnc-ZSCAN30-5:6 No - lnc-PLCG2-1:12 Yes chrX:16350315-16356482 LINC01517:32 No - lnc-TMX3-4:2 Yes chr2L:6491061-6496988 lnc-RPS24-3:15 No - lnc-TTC30B-1:12 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-SENP6-2:9 No - SATB1-AS1:58 No - lnc-NHLRC3-1:2 No - lnc-SSTR4-4:8 No - HCG11:5 No - lnc-PATL2-8:1 No - lnc-MTFR2-2:8 No - lnc-ANKRD20A2-12:6 No - lnc-MYO7B-2:23 Yes chrX:16309817-16313138 lnc-DOK6-13:1 Yes chr2L:6491061-6496988 lnc-RPA3-2:4 No - lnc-PTPRZ1-3:7 Yes chr4:1230837-1271759 lnc-PTPRZ1-3:17 Yes chr4:1230837-1271759 TEX41:46 No - lnc-RMI1-5:17 No - lnc-PIWIL3-2:2 No - lnc-BRD1-23:8 No - EMX2OS:3 Yes chr3R:13867345-13874916 lnc-SUDS3-4:1 No - lnc-TBCCD1-4:10 No - lnc-PDE4DIP-6:8 No - lnc-ACTR2-3:36 No - lnc-SPATA31D1-4:28 No - lnc-TXLNB-3:17 Yes chr3R:25851632-25853989 lnc-METTL5-4:149 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-METTL5-4:158 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-TPTE-1:4 No - PANCR:2 No - SATB1-AS1:37 No - C21orf62-AS1:8 No - LINC01206:35 No - DAB1-AS1:13 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-CRTC3-8:1 No - MIR99AHG:124 No - LINC00623:45 No - lnc-LRP12-4:3 Yes chr3R:5571108-5579189 lnc-ZBED4-11:1 No - SNHG4:10 No - PARD6G-AS1:7 Yes chrX:17703352-17707096 lnc-WDR34-4:1 Yes chr3L:1778485-1795328 PRKCQ-AS1:22 No - lnc-PLXND1-3:2 Yes chr3R:6389162-6405895 lnc-NIPA1-2:16 No - lnc-MUC20-67:25 No - lnc-TSPAN8-1:2 No - lnc-AMZ2-1:5 No - lnc-TP53TG5-5:2 Yes chrX:8404535-8407263 VIPR1-AS1:28 No - lnc-ATP23-89:1 No - lnc-CLN8-5:4 Yes chr2R:5702112-5705439 RMDN2-AS1:3 No - PCBP1-AS1:191 No - lnc-APOL1-15:1 No - lnc-PXDC1-15:13 No - lnc-ZMYM2-12:2 No - NFIA-AS1:6 Yes chr4:268175-276369 LINC01002:32 No - SPART-AS1:10 Yes chr3R:4654800-4657985 lnc-SLC16A11-7:22 No - LINC01646:7 No - LINC01140:13 Yes chr2L:19442833-19444750 CYP1B1-AS1:13 Yes chr3L:5590083-5592571 lnc-TMEM252-2:7 Yes chr3L:16126018-16128531 GLIDR:9 No - lnc-ATP23-1:2 No - lnc-OTX2-8:1 No - TEX41:11 No - lnc-GNAT3-1:17 Yes chr3L:7733250-7743041 LINC00893:43 No - LINC-ROR:4 No - lnc-ZDHHC6-1:8 Yes chr3L:18878250-18890483 TEX41:33 No - TRDN-AS1:35 No - lnc-PMPCA-3:2 Yes chrX:12596047-12609910 lnc-LILRA4-1:18 No - FAM27E5:4 No - lnc-TMEM116-7:1 Yes chr2R:19249395-19250917 lnc-SNX29-4:1 No - LINC02118:5 No - lnc-LLPH-2:10 No - lnc-GPSM1-3:5 No - lnc-FTCDNL1-4:52 No - LINC01206:23 No - lnc-PKP2-4:1 No - lnc-TMEM242-7:2 Yes chr3R:17687818-17718350 lnc-ZNF407-2:1 No - lnc-ANKRD20A2-12:5 No - CISTR:2 No - lnc-PTGIR-4:2 No - lnc-STYX-5:18 No - MIR325HG:10 No - PROX1-AS1:41 No - lnc-KLHDC4-2:3 Yes chr2L:9547720-9566750 lnc-PANO1-1:7 No - LINC01285:1 No - lnc-ENO2-2:1 No - ADD3-AS1:10 Yes chr2R:19397032-19424903 LINC02347:22 No - LINC01630:16 No - OVCH1-AS1:4 Yes chr2R:21798017-21799195 lnc-HHIPL2-7:3 No - lnc-SMIM11B-180:6 No - EMX2OS:4 Yes chr3R:13867345-13874916 lnc-SLC35C1-83:10 No - lnc-TMTC3-17:1 No - lnc-FOXD4L6-30:1 No - lnc-EPS15L1-4:1 No - lnc-C10orf95-2:1 No - lnc-CHST9-7:1 No - lnc-RBBP9-6:1 No - LINC00710:24 Yes chr2L:12344219-12397528 LINC02576:11 No - lnc-GNAT3-1:22 Yes chr3L:7733250-7743041 DANCR:4 No - lnc-KRR1-1:2 No - lnc-RGS7-1:6 No - lnc-LEMD3-5:2 Yes chrX:6771463-6779659 lnc-HIST2H2BF-4:1 No - LINC01345:8 No - lnc-GPR183-47:16 Yes chr2L:20730416-20734309 EDRF1-AS1:17 Yes chr3L:8721324-8726108 lnc-SLC7A5-3:2 Yes chr3L:12535426-12537315 LINC00710:6 Yes chr2L:12344219-12397528 LINC01828:38 No - DLEU7-AS1:4 No - LINC01320:15 No - lnc-FTCDNL1-4:53 No - lnc-STX4-1:5 No - lnc-PSMB3-2:1 Yes chr2R:12996501-13007911 PROX1-AS1:39 No - SOX2-OT:50 Yes chr2L:8825645-8829670 LINC02591:12 No - PCBP1-AS1:118 No - LINC02141:5 No - FENDRR:16 No - lnc-LRCOL1-3:7 No - LINC00624:2 Yes chr2R:12636671-12640628 lnc-TIMM22-4:1 No - lnc-FERMT1-4:1 No - SLC16A1-AS1:8 No - WASF3-AS1:9 Yes chr2L:10976772-10982395 lnc-GPR108-3:1 Yes chr2L:8074117-8082982 lnc-FSHR-6:1 No - lnc-SNX33-3:2 Yes chr2L:18487747-18503978 LINC01619:7 Yes chrX:16074717-16091495 VIPR1-AS1:18 No - ADAMTS9-AS1:31 Yes chr2R:22807860-22815993 lnc-RIT2-2:13 No - B3GALT5-AS1:4 No - GSEC:11 Yes chr3R:5753318-5754774 lnc-MAGEA1-1:3 No - lnc-CMPK2-5:67 No - lnc-ZNF479-23:4 No - lnc-TMEM71-1:3 Yes chr3R:12352143-12356265 lnc-PRDM4-2:3 No - lnc-FGB-4:3 No - CYP1B1-AS1:20 Yes chr3L:5590083-5592571 MALAT1:7 No - lnc-MAP3K9-11:1 No - lnc-ETFRF1-4:1 Yes chr3R:9510561-9513067 ITGA9-AS1:13 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-COG5-2:5 Yes chr2R:9993890-10026042 lnc-ALG1L-2:20 No - lnc-GOLGA8N-6:1 No - lnc-OTX2-8:2 No - lnc-TMEM43-1:13 No - LINC01346:1 No - lnc-IL4-1:5 Yes chr3L:5356864-5359392 lnc-PDYN-1:6 No - lnc-PDE6C-5:1 Yes chr2R:16150123-16169519 MAGI2-AS3:36 No - LINC00908:9 No - SOX2-OT:60 No - VIPR1-AS1:33 No - lnc-BBS2-1:1 Yes chr3R:24915840-24917864 lnc-HEATR1-4:3 No - lnc-TBCCD1-4:38 No - lnc-ITFG2-3:1 No - LINC01002:5 No - lnc-FGD4-9:1 Yes chr2L:17459605-17473215 LINC02035:7 No - LINC02313:3 No - lnc-FAM92B-5:3 No - SLC8A1-AS1:27 No - lnc-ANKRD36-1:7 No - lnc-U2AF1L5-162:3 No - PARD6G-AS1:6 Yes chrX:17703352-17707096 INTS6-AS1:30 Yes chrX:5738663-5747254 PACRG-AS1:1 Yes chr2R:19497752-19500372 lnc-ERCC5-5:2 No - ARRDC3-AS1:2 Yes chr3R:7804665-7810014 PAUPAR:13 Yes chr3L:1298672-1300389 lnc-PPIAL4D-19:15 No - LINC01002:11 No - THRB-AS1:5 Yes chr2R:6087873-6169087 LINC01676:39 No - lnc-ERG-9:6 No - lnc-PARVG-6:1 No - lnc-ANKMY1-2:3 Yes chr3L:14632601-14671609 lnc-RAB11FIP4-10:1 No - lnc-ALG1L-2:23 No - lnc-TM9SF1-4:1 No - lnc-YOD1-3:1 Yes chr2R:9227785-9247249 LINC01553:2 No - LINC01359:5 No - LINC01676:40 No - lnc-ITGA9-2:7 No - SATB1-AS1:77 No - SRD5A3-AS1:28 Yes chr2L:8305586-8306741 lnc-ANKMY1-2:6 Yes chr3L:14632601-14671609 lnc-FBN1-1:3 No - SOX2-OT:25 No - lnc-CELA3A-5:33 No - lnc-MMP17-1:2 No - lnc-RPA3-2:5 No - CASC2:13 No - NEAT1:4 No - LINC01036:31 No - MAMDC2-AS1:21 No - EIF1B-AS1:9 No - lnc-OLFML3-2:2 No - LINC01759:18 No - PGM5P3-AS1:11 Yes chr2R:12180493-12182373 lnc-PTGDS-2:1 No - lnc-PPP2R2D-9:1 No - LINC00963:28 No - NPSR1-AS1:17 Yes chr3R:25923499-25956270 lnc-SPATA31A7-2:2 No - lnc-GAMT-2:6 Yes chrX:15985473-15986808 lnc-FAM196A-1:12 Yes chr3R:23781765-23801634 MALAT1:35 No - lnc-FAM57B-1:1 No - lnc-RPS2-2:1 No - SLC26A4-AS1:6 Yes chr3L:17898889-17907812 lnc-PRR18-3:1 No - lnc-C15orf41-18:1 No - lnc-CDIPT-1:10 No - lnc-TAF7-1:2 No - lnc-PRPF18-1:44 No - lnc-FGF9-3:9 No - lnc-TWIST2-5:1 No - lnc-BCKDK-4:1 Yes chrX:5873840-5876853 lnc-PMAIP1-11:6 No - lnc-CD3D-8:1 No - lnc-SLC16A11-7:15 No - lnc-INO80D-10:12 No - LINC01669:12 No - lnc-RBFOX3-22:2 No - LINC00254:4 Yes chrX:7918517-7920131 SATB1-AS1:57 No - lnc-STX8-6:1 No - lnc-FOXO1-2:32 No - lnc-RNF24-80:1 No - lnc-TGM2-5:1 Yes chr3L:7593091-7639573 RFPL1S:14 No - TEX41:88 No - lnc-SPATA31A7-9:2 No - lnc-SHISAL1-2:1 Yes chrX:19746041-19748458 lnc-ZNF236-11:6 No - TEX41:74 No - LINC01127:34 No - PCBP1-AS1:125 No - PLCE1-AS1:1 No - lnc-FAM19A5-14:1 No - lnc-CLEC3A-2:2 Yes chr2L:7999670-8004286 lnc-PLEKHD1-4:1 No - CFLAR-AS1:13 No - lnc-FTCDNL1-4:54 No - LINC00710:29 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-ETNK1-3:11 No - lnc-PPIAL4F-3:13 No - lnc-KNTC1-5:1 No - lnc-FOXA2-7:7 No - lnc-B3GNT10-21:23 No - lnc-GNAT3-1:20 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-DNAJA4-3:1 Yes chr3R:10043270-10044606 lnc-SLC39A11-10:7 Yes chr3R:31065253-31083407 lnc-PHF14-14:1 No - lnc-HOXC4-4:9 Yes chr3R:17150587-17151630 lnc-GINS1-9:1 Yes chr2L:12046711-12048918 ERICD:7 No - SATB1-AS1:61 No - lnc-MYO7B-2:10 Yes chrX:16309817-16313138 lnc-FOXD4L5-44:1 No - lnc-TMEM230-3:1 No - lnc-ACSS1-1:2 No - LAMTOR5-AS1:49 No - CBR3-AS1:1 No - lnc-OAF-3:2 No - lnc-GTF2IRD2-1:10 No - LINC01471:11 No - LINC00938:4 No - MAGI2-AS3:9 No - LINC00284:11 No - lnc-ABHD13-4:1 No - BCAR4:10 No - lnc-SIK1B-190:9 No - lnc-TAF7-6:11 No - TEX41:89 No - lnc-DERL3-6:1 No - lnc-ZSCAN10-3:24 No - lnc-CLEC16A-7:3 No - PCBP1-AS1:29 No - SLC8A1-AS1:18 No - PRKCQ-AS1:18 No - lnc-SYT16-67:15 No - LINC00466:3 No - lnc-SLC34A2-1:2 No - VAV3-AS1:17 No - LINC01899:12 No - lnc-TBCCD1-4:47 No - lnc-HEATR4-1:14 No - lnc-FAM174B-1:7 No - lnc-MAF-7:2 Yes chr2L:7999670-8004286 LINC00652:6 No - PGM5P3-AS1:8 Yes chr2R:12180493-12182373 lnc-ANKMY2-2:2 No - MIR325HG:15 No - LINC01359:1 No - lnc-THBS1-7:5 No - TRDN-AS1:36 No - lnc-RWDD3-7:24 No - lnc-ARVCF-4:1 Yes chrX:13616989-13619207 lnc-TCP11L2-1:4 No - lnc-TBC1D10C-5:1 Yes chr3L:18870045-18872553 lnc-CSRNP3-12:4 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-TUBB1-1:2 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-ZFYVE1-1:3 Yes chrX:5666052-5670652 lnc-TTC27-8:1 Yes chr3R:10312039-10331353 PDZRN3-AS1:5 Yes chr4:663621-669884 SLC8A1-AS1:8 No - lnc-CHMP2B-1:8 No - LINC01759:30 No - RMDN2-AS1:10 No - lnc-GRM1-1:12 No - lnc-IRX3-80:61 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-SPPL2A-1:12 No - lnc-MUC19-1:18 No - lnc-SMOC2-4:3 No - ADAMTSL4-AS1:2 No - lnc-MAD1L1-7:1 No - LINC00907:11 No - ZEB2-AS1:16 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-PKP2-1:2 No - lnc-INO80D-10:4 No - lnc-WDR11-1:9 No - lnc-METTL5-4:161 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-TMEM230-1:2 No - LINC00649:24 No - lnc-AQP4-4:1 Yes chr2R:21560246-21576035 lnc-CISH-5:1 No - lnc-VSTM4-1:5 No - CHRM3-AS2:5 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-PHF21A-1:7 No - lnc-HIGD1A-1:2 No - lnc-SLC11A2-6:1 No - LINC00454:4 No - lnc-FTCDNL1-4:55 No - lnc-CELA3A-5:1 No - lnc-TBCCD1-4:7 No - lnc-SETD1B-2:2 Yes chr3R:9497101-9502581 SOX2-OT:18 No - lnc-TBCCD1-4:29 No - lnc-MUC20-67:62 No - lnc-GOLGA8O-5:10 No - lnc-NBPF12-47:2 No - LINC00550:3 No - lnc-DIAPH2-16:2 No - PCBP1-AS1:88 No - lnc-LTBP3-3:2 No - LINC00608:2 No - lnc-ANKRD36B-3:17 No - LINC01206:21 No - lnc-TBC1D26-4:1 No - PROX1-AS1:33 No - lnc-C17orf97-3:9 No - LAMTOR5-AS1:43 No - lnc-FAM25C-31:6 No - lnc-UBE3C-10:1 No - lnc-CMPK2-5:76 No - lnc-FOXO1-2:9 Yes chr3R:14056945-14087978 lnc-PTPN14-7:3 Yes chr3R:11328480-11407627 lnc-CD36-7:1 No - ZNF436-AS1:5 Yes chr2R:14173693-14182838 lnc-FAM78A-3:17 Yes chr2R:22918937-22924742 lnc-PABPC4L-19:1 No - lnc-NSUN6-4:4 No - lnc-MRPS35-1:2 No - lnc-MFAP4-3:12 No - LINC00472:42 No - lnc-NABP1-5:15 No - lnc-MCTP2-7:9 No - SOX2-OT:51 Yes chr2L:8825645-8829670 VIPR1-AS1:19 No - TP53TG1:16 No - lnc-MUC20-67:58 No - LINC01124:4 No - lnc-SMIM11B-179:1 No - lnc-CRIM1-1:13 No - lnc-GCM1-1:2 No - GNAS-AS1:8 Yes chr2R:23942538-23946936 lnc-CMSS1-1:6 No - lnc-LRRC28-2:1 No - lnc-TMEM43-1:9 No - SATB1-AS1:38 No - LINC02033:4 No - lnc-SGK1-3:11 No - lnc-SCAMP4-4:2 Yes chr2L:476446-479688 LINC00538:3 No - LINC01517:8 No - BAIAP2-DT:17 No - lnc-TRIQK-1:3 No - lnc-POU2AF1-1:6 No - lnc-HECW2-1:2 No - lnc-MEF2A-9:5 No - STARD13-AS:1 Yes chr3R:14391683-14481713 DLX6-AS1:22 No - LINC01778:18 No - lnc-CPN2-4:27 No - lnc-U2AF1L5-161:3 No - lnc-TAF7-1:10 No - lnc-NR2F2-1:2 No - TMC3-AS1:13 No - LINC01320:13 No - lnc-CXCL12-1:4 No - lnc-EMC3-1:20 Yes chr2L:10731400-10732423 LINC01588:85 No - lnc-PDCD1-4:2 No - lnc-ACSM3-1:5 No - TEX41:95 No - lnc-CHRD-10:5 No - ZRANB2-AS2:15 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-PIGN-9:1 No - lnc-TP53TG3-168:2 No - FAM215A:1 No - MIR34AHG:17 No - ATP6V0E2-AS1:10 Yes chr3L:21539862-21541215 lnc-SMIM11B-180:4 No - LINC01002:9 No - lnc-FOXD4L6-3:2 No - lnc-MNS1-11:1 No - MAMDC2-AS1:22 No - lnc-CCT8L2-94:1 No - lnc-TBCCD1-4:48 No - PCBP1-AS1:185 No - lnc-CLN5-3:1 No - lnc-RPS24-3:19 No - THRB-AS1:11 No - ZNF561-AS1:9 No - lnc-SLC30A7-2:22 No - lnc-C2CD4B-11:1 No - lnc-OR4F29-1:28 No - lnc-MAX-14:1 No - lnc-SMIM11B-180:7 No - lnc-FGF7-6:1 No - lnc-PGM1-1:3 No - LINC02177:27 No - lnc-PTHLH-1:12 No - lnc-PIGBOS1-4:1 No - lnc-TRAPPC2L-2:4 Yes chr2R:24275734-24291084 lnc-ZSWIM6-6:4 No - TSPEAR-AS2:3 No - lnc-NSMCE1-1:2 Yes chr3L:839980-841360 lnc-CASP9-7:1 No - lnc-TSSK4-3:1 No - LAMTOR5-AS1:55 No - PCBP1-AS1:121 No - LINC01649:8 No - lnc-MUC20-67:118 No - lnc-PRAG1-12:1 No - lnc-SLC16A7-2:2 No - FAM30A:2 No - EXOC3-AS1:3 No - lnc-OR4N2-8:3 No - lnc-PRMT6-3:11 No - lnc-EDDM13-1:4 No - lnc-ZNF280B-46:1 No - ABCA9-AS1:7 Yes chr2L:13784084-13790562 TEX41:54 No - lnc-NPIPA8-8:1 Yes chr3L:2258839-2262664 lnc-ZNF479-23:1 No - COX10-AS1:14 No - lnc-RASL12-2:1 No - lnc-TTC30B-1:10 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-ARRB2-2:3 No - lnc-POTEB-3:2 No - lnc-TXLNB-3:19 Yes chr3R:25851632-25853989 LINC01869:24 No - lnc-FAM207A-10:1 No - lnc-GAL3ST3-2:1 Yes chr2L:3026252-3029168 lnc-FAM241B-2:3 No - lnc-CSRNP3-12:1 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-LARP6-7:1 No - SNAP25-AS1:9 No - lnc-MYO7B-2:14 Yes chrX:16309817-16313138 lnc-FRA10AC1-4:1 Yes chr2R:16150123-16169519 PCBP1-AS1:31 No - LINC02109:55 No - lnc-METTL5-4:100 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-JUN-5:13 No - CPS1-IT1:2 No - LINC01778:19 No - lnc-CALM1-7:2 No - lnc-ADNP2-4:1 Yes chrX:17703352-17707096 lnc-FXYD3-2:1 No - lnc-ANKS6-1:23 Yes chr2R:16673235-16732916 lnc-B3GLCT-1:1 No - MAMDC2-AS1:23 No - lnc-SIPA1L3-3:20 No - lnc-SEZ6L2-1:2 No - DARS-AS1:11 No - lnc-METTL5-4:155 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-KCNE1B-158:1 No - lnc-IDI1-8:1 Yes chrX:1773725-1788065 lnc-FOXD4L5-44:6 No - LINC01141:2 No - lnc-NRIP1-2:5 No - lnc-CNTNAP3B-45:5 No - lnc-CPN2-4:41 No - lnc-CRYL1-1:4 No - lnc-LRP11-1:4 No - lnc-FAM153C-5:16 No - lnc-TUBB8-1:2 No - lnc-SLC39A11-10:47 No - LINC01002:12 No - lnc-GRAPL-3:2 No - CBR3-AS1:29 No - LINC01664:4 No - lnc-ST8SIA2-8:1 No - lnc-CARD11-22:3 No - LINC00115:2 No - ZNF561-AS1:1 No - lnc-PTPRE-1:4 No - lnc-ATAD2B-2:1 No - MAGI2-AS3:37 No - PCBP1-AS1:37 No - SNHG22:4 Yes chr2R:7500147-7508625 lnc-FOXO1-2:11 Yes chr3R:14056945-14087978 lnc-MGAM2-1:1 No - lnc-TXLNB-3:20 Yes chr3R:25851632-25853989 lnc-TIGD1-1:16 Yes chr3R:24063077-24108960 LINC01206:12 No - lnc-SNAPC2-2:3 Yes chr3R:19154097-19159878 lnc-TFCP2-3:1 Yes chr2R:8327490-8396280 LINC00923:8 No - lnc-COLEC10-1:13 Yes chr2R:14752521-14753269 lnc-ETNK1-3:10 No - ELDR:5 No - LINC01676:33 No - lnc-SKIDA1-3:1 Yes chrX:19176109-19179830 LINC01002:27 No - THRB-AS1:6 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-MNT-3:1 Yes chrX:20433950-20445599 lnc-OR2J1-2:2 No - C21orf62-AS1:5 No - lnc-HMG20A-2:4 No - CADM3-AS1:4 No - LINC01545:2 No - lnc-PRKCH-3:2 Yes chr2R:9252310-9285097 lnc-RIPOR1-1:10 No - lnc-MED13L-12:1 No - lnc-METTL5-4:157 Yes chr2L:7377702-7384344 LINC00943:11 No - CBR3-AS1:20 No - LINC01359:12 No - PCBP1-AS1:39 No - lnc-C8orf59-2:3 Yes chr2L:13803626-13809994 lnc-LY6E-7:4 No - lnc-LINC02210-CRHR1-52:3 Yes chr2R:12474424-12487986 NEAT1:13 No - lnc-GNAT3-1:9 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-NUDT4B-1:10 No - PCBP1-AS1:89 No - lnc-TBCCD1-4:56 No - lnc-MTFR2-2:6 No - lnc-MAGED4-1:1 No - lnc-TAF7-1:5 No - lnc-FBXO25-10:1 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-RRM2-3:1 Yes chr2R:11983145-11985393 lnc-DEPP1-2:6 No - lnc-NETO1-1:22 No - lnc-GPR27-21:1 Yes chr3R:9726020-9730872 ADORA2A-AS1:5 No - LINC00926:21 No - LINC02351:5 No - lnc-SLC35C1-83:7 No - lnc-DDX10-1:2 No - lnc-MYO7B-2:33 Yes chrX:16309817-16313138 lnc-RPLP1-12:36 No - LINC01727:24 No - lnc-WDR73-10:2 Yes chr2R:14173693-14182838 lnc-ZNF705A-5:1 No - lnc-CST9L-2:1 No - lnc-SLC5A9-1:2 No - lnc-PTPN9-3:1 Yes chr2R:12575240-12592917 lnc-GGCT-1:55 No - LINC01676:41 No - MLIP-AS1:12 No - LINC00628:3 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-PRODH-2:1 No - lnc-RPS24-3:20 No - lnc-RPS27A-1:26 Yes chr3L:3178930-3185287 SATB1-AS1:78 No - lnc-ZNF296-1:2 No - lnc-FSHR-6:2 No - INTS6-AS1:31 Yes chrX:5738663-5747254 SOX2-OT:61 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-SYNM-8:1 Yes chr3R:21570248-21619321 lnc-SLC16A11-7:16 No - HOTTIP:4 No - lnc-CPN2-4:37 No - lnc-BCL11A-18:8 No - SRD5A3-AS1:23 Yes chr2L:8305586-8306741 SOX2-OT:52 Yes chr2L:8825645-8829670 AQP4-AS1:3 No - lnc-UQCRHL-1:3 Yes chr2L:159032-203397 lnc-CSMD1-1:17 No - lnc-ERG-9:7 No - LAMTOR5-AS1:50 No - lnc-KIF2B-5:1 No - TRDN-AS1:39 No - PCBP1-AS1:2 Yes chr3L:21844788-21932702 lnc-YBX1-1:3 No - lnc-MUC20-67:109 No - SATB1-AS1:60 No - lnc-TAOK1-5:2 Yes chrX:19569721-19579800 lnc-FAM124A-2:2 No - PROX1-AS1:3 Yes chr3R:11328480-11407627 LINC01763:15 No - lnc-ZFP90-4:1 No - lnc-TBCCD1-4:25 No - lnc-MMP24OS-7:2 No - lnc-ABHD13-5:1 No - lnc-NCOR1-1:1 Yes chr2L:19043535-19045148 lnc-GTF2H5-3:3 Yes chr3R:27607879-27634932 LINC01378:7 No - lnc-U2AF1L5-161:1 No - lnc-MUC20-67:110 No - ADAMTS9-AS1:22 Yes chr2R:22807860-22815993 lnc-GNAT3-1:13 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-FGFR2-11:1 No - lnc-APH1A-2:2 No - MAMDC2-AS1:24 No - lnc-LRRC63-5:1 Yes chr2L:17367511-17384115 CYP1B1-AS1:23 Yes chr3L:5590083-5592571 lnc-C15orf53-7:1 No - EDRF1-AS1:9 Yes chr3L:8721324-8726108 SATB1-AS1:82 No - PCBP1-AS1:197 No - lnc-HES6-1:4 No - LINC00877:1 No - MLIP-AS1:13 No - lnc-PLCG2-9:1 No - lnc-CXCR5-1:4 No - LINC01515:17 No - lnc-SVOP-4:1 Yes chr3R:24938710-24944956 LINC00620:6 No - LINC01748:30 No - lnc-PPIAL4C-4:24 No - lnc-PLLP-4:1 No - lnc-BCKDK-4:2 Yes chrX:5873840-5876853 lnc-YARS2-5:1 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-PTN-2:12 Yes chr2R:24378630-24390294 lnc-NABP1-5:19 No - lnc-MYO7B-2:1 Yes chrX:16309817-16313138 B3GALT5-AS1:6 No - lnc-U2AF1L5-162:8 No - PCBP1-AS1:175 No - LINC01002:19 No - lnc-ZNF33A-137:3 No - lnc-SYT16-67:4 No - lnc-CPN2-4:30 No - SNHG5:24 No - ZNF436-AS1:4 Yes chr2R:14173693-14182838 MAMDC2-AS1:25 No - TGFB2-OT1:2 Yes chr2L:2805261-2812376 RBMS3-AS2:3 No - LINC01133:3 No - lnc-FAM104A-7:1 Yes chr3R:12213792-12219686 EDRF1-AS1:6 Yes chr3L:8721324-8726108 lnc-ANKRD36B-3:2 No - lnc-NUDT4B-1:5 No - PCBP1-AS1:32 No - lnc-METTL5-4:162 Yes chr2L:7377702-7384344 FOXCUT:10 No - RFX3-AS1:7 No - lnc-TPTE-1:5 No - lnc-CMPK2-5:79 No - DPYD-AS1:2 Yes chrX:9196808-9201820 lnc-CBX2-1:2 Yes chr3L:21306138-21318020 lnc-SMIM34B-160:7 No - lnc-KLF17-1:24 No - lnc-ZNF362-1:11 Yes chrX:2115727-2123286 LINC02246:17 No - lnc-EDDM13-1:9 No - lnc-FGF3-29:1 No - lnc-TMEM105-2:33 No - lnc-KPNA2-6:22 No - SATB1-AS1:55 No - ZRANB2-AS2:5 Yes chr3L:5424109-5442399 LINC01667:4 No - lnc-TBCCD1-4:54 No - MIR600HG:5 No - lnc-ZADH2-5:1 No - lnc-POTEG-23:1 No - lnc-ANKRD36B-3:33 No - lnc-NR2F2-16:5 No - LINC00895:10 No - INTS6-AS1:32 Yes chrX:5738663-5747254 MAGI2-AS3:30 No - lnc-SMIM30-1:5 No - lnc-BRD1-23:4 No - TRG-AS1:4 No - lnc-PRKD1-3:7 No - lnc-REEP3-11:1 No - lnc-PLCXD1-5:1 No - LINC01556:2 No - lnc-GPR183-47:17 Yes chr2L:20730416-20734309 LINC01727:25 No - lnc-FTCDNL1-4:56 No - lnc-LRRC47-78:29 No - lnc-COG5-2:4 Yes chr2R:9993890-10026042 lnc-MAGED4-1:2 No - lnc-RFPL4B-1:17 No - GTSE1-DT:5 No - lnc-RPS27L-9:10 Yes chr3L:8545001-8574409 lnc-PKNOX2-2:1 Yes chrX:2080610-2093948 PCBP1-AS1:138 No - MAMDC2-AS1:16 No - lnc-MESD-4:7 No - lnc-KL-5:1 Yes chr2L:11128932-11130645 LINC00882:41 No - CYP1B1-AS1:32 No - LINC01206:13 No - lnc-ABCD3-2:8 No - ARHGAP5-AS1:4 Yes chrX:17639147-17652562 lnc-PIGBOS1-5:1 No - MYCBP2-AS1:14 No - LINC01465:1 No - SATB1-AS1:59 No - LINC00893:53 Yes chr3L:3378268-3380083 lnc-LONP2-6:5 No - lnc-HMGA1-2:9 No - lnc-PPP2R2D-10:1 No - LINC00221:9 No - lnc-AVPR2-3:1 No - lnc-SPG21-46:1 No - lnc-ZNF599-5:2 No - lnc-SYT16-67:5 No - DAB1-AS1:31 Yes chr3L:16712126-16724575 lnc-TPTE-1:6 No - lnc-INO80D-10:13 No - lnc-CLEC3A-14:1 Yes chr2L:7999670-8004286 lnc-PTPRZ1-3:15 Yes chr4:1230837-1271759 LINC01320:9 No - lnc-SPATA31A6-15:1 No - LINC01777:18 No - LINC01748:28 No - lnc-UNC93A-1:4 No - LINC01206:24 No - lnc-ALG1L-2:27 No - MIR193BHG:2 No - lnc-EXD2-8:1 No - lnc-PSMA2-1:12 No - lnc-FOXD4L5-97:1 No - LINC01440:2 No - ZRANB2-AS2:35 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-ESM1-1:18 No - DICER1-AS1:3 Yes chr3R:22734007-22741091 lnc-CDH4-4:1 No - LHFPL3-AS2:4 No - lnc-MPHOSPH8-165:1 No - lnc-RWDD3-7:23 No - SPART-AS1:11 Yes chr3R:4654800-4657985 PCBP1-AS1:130 No - lnc-CNPY1-2:30 No - lnc-ADAMTS15-1:24 No - SATB1-AS1:68 No - lnc-HRK-3:1 No - lnc-FLVCR1-4:1 No - PSMG3-AS1:12 No - lnc-PSMA2-1:10 No - ZRANB2-AS2:34 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-CEACAM20-8:5 No - LINC01550:13 No - LINC01320:7 No - LINC01206:14 No - lnc-THOC3-2:8 No - LINC02086:14 No - LINC01411:7 No - lnc-ANKRD36B-3:11 No - lnc-RAN-4:6 Yes chr3R:15374635-15402543 SATB1-AS1:39 No - lnc-PDCD1-17:6 No - LINC00284:12 No - lnc-PREX1-1:2 No - lnc-NRIP1-2:12 No - lnc-TAF7-5:2 No - LINC01197:20 No - EDRF1-AS1:10 Yes chr3L:8721324-8726108 PPP3CB-AS1:11 Yes chrX:3811698-3857621 LINC01197:14 No - lnc-WRB-2:6 Yes chr3R:24319000-24328619 lnc-POLRMT-6:11 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-HLA-DQA2-1:5 No - lnc-MUC20-67:21 No - LINC01668:3 No - lnc-SEMA4B-6:2 Yes chr3R:15348048-15350391 LINC01002:33 No - lnc-COPS8-17:2 No - lnc-TDRD3-1:5 No - lnc-ALKAL2-2:28 No - TEX41:75 No - lnc-CBSL-165:3 No - lnc-RNF166-1:2 Yes chr2L:19491647-19493253 lnc-FTCDNL1-4:65 No - lnc-DYNLRB1-2:1 Yes chr2L:2037714-2044372 lnc-NSMCE1-11:1 No - lnc-KIF26B-1:2 Yes chrX:2606680-2608876 NR2F2-AS1:22 No - lnc-TPBG-7:1 Yes chr2R:7737019-7782637 HOTTIP:7 No - lnc-PRDM9-162:3 No - lnc-ANKRD20A3-51:1 No - RMDN2-AS1:11 No - PCBP1-AS1:90 No - lnc-NR2F2-15:1 No - LINC02361:14 No - lnc-GRAP-5:1 No - ITFG2-AS1:32 No - lnc-METTL5-4:139 Yes chr2L:7377702-7384344 ARRDC1-AS1:3 No - LINC01002:26 No - lnc-ERG-9:5 No - lnc-AKTIP-10:2 No - lnc-HMOX1-3:1 No - lnc-CDH26-9:1 No - lnc-AQP4-5:1 Yes chr2R:21560246-21576035 ZRANB2-AS2:7 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-GNAT3-1:21 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-METTL5-4:101 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-DEPP1-6:1 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-ASCL1-6:6 No - MIR137HG:9 Yes chrX:9196808-9201820 lnc-ZFP57-15:1 No - lnc-BANK1-2:3 Yes chrX:16554627-16560016 lnc-A1BG-1:6 No - lnc-EFNA2-1:2 No - lnc-SIGLEC14-2:1 No - PCBP1-AS1:56 No - lnc-TMEM88B-3:10 No - lnc-PCCA-5:1 Yes chr2R:24940625-24942413 PISRT1:3 Yes chr3R:27916908-27918248 PCBP1-AS1:112 No - lnc-RASGRP1-9:1 No - lnc-RASGRP1-2:2 No - lnc-TFDP1-4:1 No - lnc-ODF3L2-2:3 No - EDRF1-AS1:18 Yes chr3L:8721324-8726108 lnc-MYO7B-2:17 Yes chrX:16309817-16313138 lnc-FCGR3B-2:2 No - ZRANB2-AS2:37 Yes chr3L:5424109-5442399 LAMTOR5-AS1:44 No - lnc-UXS1-4:5 Yes chr2L:825969-833241 PCBP1-AS1:186 No - LRRC2-AS1:2 Yes chr2R:20236235-20239200 LINC01002:3 No - LINC01672:17 No - lnc-MUC20-67:28 No - LINC00466:11 No - NOL4L-DT:7 No - lnc-CACNA1H-1:1 No - lnc-BAG2-16:1 Yes chr3L:20359833-20361585 lnc-ZBED2-5:2 No - lnc-ZIC5-3:5 No - lnc-ATP5ME-1:17 No - LINC01921:3 No - lnc-GATA5-8:1 Yes chr2L:6625138-6632407 lnc-ERI1-2:8 No - GRID1-AS1:2 Yes chr2L:4830846-4835300 lnc-EBF3-1:10 Yes chr3R:6658806-6660100 lnc-GOLGA6L9-5:3 No - lnc-PAK6-1:4 Yes chrX:16610685-16614856 lnc-TEX29-2:1 No - TEX41:38 No - lnc-MUC20-67:33 No - lnc-MAP1LC3B2-11:1 No - LINC01206:16 No - ZNF561-AS1:10 No - lnc-SNAPC5-1:2 No - LINC00963:26 No - ZNF236-DT:23 No - lnc-PRMT6-3:5 No - TPT1-AS1:3 No - lnc-LINC00854-1:27 No - lnc-FTCDNL1-4:57 No - AZIN1-AS1:5 Yes chr2R:8007246-8009062 lnc-CRYAA2-181:4 No - CFLAR-AS1:24 No - lnc-TTC8-9:1 Yes chrX:7682338-7709385 SNHG26:40 No - lnc-CNTNAP3B-45:3 No - FRMD6-AS1:5 Yes chr2L:431227-448701 PROX1-AS1:16 Yes chr3R:11328480-11407627 lnc-DDX31-1:2 No - LINC01388:2 No - lnc-MUC20-67:134 No - LAMTOR5-AS1:35 No - lnc-TUBGCP3-20:1 No - PCAT14:7 No - lnc-MYO7B-2:32 Yes chrX:16309817-16313138 lnc-CCDC184-3:2 No - PAPPA-AS1:2 No - lnc-MCL1-7:4 No - LINC01550:21 No - LINC01976:4 No - SOX2-OT:62 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-BRD1-23:5 No - lnc-FTCDNL1-4:63 No - BACH1-IT2:1 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-AGAP9-2:5 No - lnc-CPN2-4:36 No - MAMDC2-AS1:26 No - LINC01748:24 Yes chr4:268175-276369 lnc-LRRTM1-2:10 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-STAT3-2:1 Yes chr3R:20535323-20552311 PPP3CB-AS1:12 Yes chrX:3811698-3857621 lnc-METTL5-4:114 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-ARID2-13:1 Yes chr3L:11984906-11990505 MAMDC2-AS1:27 No - LINC00963:20 No - TEX41:13 No - SOX2-OT:63 No - lnc-CELA3A-5:7 No - lnc-CD3D-5:1 No - TCL6:24 No - lnc-GAS8-1:10 No - ADD3-AS1:11 Yes chr2R:19397032-19424903 lnc-KPNA2-6:24 No - PCBP1-AS1:33 No - LAMTOR5-AS1:51 No - MAPT-AS1:1 No - lnc-COL4A1-7:1 No - lnc-TTC27-9:1 Yes chr3R:10312039-10331353 lnc-KLF17-1:25 No - lnc-ZSWIM6-6:5 No - lnc-JAG1-14:1 No - LINC00115:19 No - MAGI2-AS3:10 No - lnc-ZNF585B-5:7 No - CFLAR-AS1:14 No - lnc-SLC22A31-5:2 No - MIR193BHG:10 No - lnc-GNAT3-1:12 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-PRDX3-1:5 Yes chr3R:31405245-31457873 lnc-FOXA2-7:12 No - lnc-FAM76A-1:2 No - TEX41:12 No - CARMN:22 No - lnc-ARMCX3-1:2 No - lnc-MAX-6:2 No - lnc-JPT2-4:1 Yes chr3L:7916650-7936120 lnc-NOC4L-3:1 No - PCBP1-AS1:11 Yes chr3L:21844788-21932702 PRKCQ-AS1:20 No - PRKCQ-AS1:19 No - SATB1-AS1:40 No - lnc-ELAC2-8:1 Yes chr3R:19905164-19914272 lnc-CRIM1-1:14 No - lnc-KNTC1-6:1 No - lnc-EMP1-6:1 Yes chrX:1483625-1507809 ASB16-AS1:7 No - lnc-MADCAM1-2:2 No - lnc-TAF7-6:6 No - lnc-TAF7-18:1 No - lnc-ZFP69B-1:2 No - lnc-ATIC-8:8 No - LINC00923:9 No - LINC01507:3 No - MALAT1:33 No - lnc-ZNF681-241:1 No - lnc-SUMF1-5:1 No - lnc-EDDM13-1:8 No - lnc-MUC20-67:69 No - PCBP1-AS1:145 No - lnc-RBFOX2-1:2 No - lnc-ANKRD36B-3:30 No - PRKCQ-AS1:12 No - lnc-CMPK2-5:74 No - PCBP1-AS1:91 No - lnc-NCBP2-AS2-1:1 No - lnc-NBPF11-1:23 No - lnc-ADAM22-2:6 No - lnc-GDF11-1:5 Yes chr2L:21344607-21358271 lnc-MYO1D-1:3 No - LINC01669:9 No - lnc-SPRED2-1:13 No - lnc-HS3ST4-1:13 No - lnc-PDCD1-1:20 No - lnc-PCDHGC3-1:1 No - lnc-SLC35C1-83:8 No - lnc-PPIAL4F-1:1 No - lnc-COL6A1-11:1 Yes chr3L:21844788-21932702 lnc-MUC20-67:123 No - SATB1-AS1:41 No - lnc-RBM6-4:3 Yes chr2L:4850641-4852640 LINC01550:20 No - lnc-GNAT3-1:10 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-CD34-22:3 Yes chrX:11992915-12003914 TRDN-AS1:41 No - LINC02450:7 No - lnc-C21orf33-1:7 No - lnc-MRM3-3:1 No - lnc-TMEM211-2:6 No - lnc-HIST1H4D-1:2 No - lnc-CBX1-4:1 No - lnc-WDR73-9:2 Yes chr2R:14173693-14182838 lnc-WDR4-3:2 No - lnc-HMOX1-4:1 No - lnc-ST8SIA2-7:1 No - MAGI2-AS3:31 No - lnc-ZNF749-2:1 No - LINC01068:4 No - lnc-POLR3G-1:6 No - NUTM2B-AS1:27 No - lnc-HLA-DQA2-1:7 No - lnc-TBCCD1-4:32 No - KLF3-AS1:3 Yes chr2R:23011078-23042943 lnc-GRIN2A-5:1 No - LINC01206:43 No - SATB1-AS1:11 No - lnc-NBPF1-9:1 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-NXNL1-7:4 No - lnc-GPR183-47:24 Yes chr2L:20730416-20734309 CDKN2A-DT:4 Yes chr3R:25036944-25037982 lnc-TBCCD1-4:33 No - THRIL:3 No - LINC01619:4 Yes chrX:16074717-16091495 lnc-ZNF716-52:2 No - lnc-POTEG-26:3 No - ZRANB2-AS2:22 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-MUC20-67:111 No - lnc-DHX38-3:6 No - lnc-NIPA1-2:15 No - ITGA9-AS1:21 Yes chr2R:15258761-15262873 LINC01677:11 No - lnc-CRYAA2-181:1 No - lnc-ANKRD20A2-12:3 No - lnc-MTFR2-2:10 No - lnc-NXF1-2:2 No - WASF3-AS1:10 Yes chr2L:10976772-10982395 lnc-ZNF92-3:2 No - ITGA9-AS1:10 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-PRPF18-1:29 No - lnc-HNRNPLL-2:3 Yes chr2L:11694804-11696107 lnc-GLRX5-6:2 No - lnc-PPIAL4C-4:17 No - lnc-SMIM34B-160:8 No - LINC01878:16 No - lnc-MESD-4:6 No - lnc-PAXX-2:1 No - lnc-TMEM105-7:1 No - lnc-C3orf33-4:1 No - LINC01943:4 No - lnc-PHF14-14:14 No - lnc-RWDD3-7:15 No - lnc-TBCCD1-4:13 No - lnc-ONECUT2-3:1 No - TEX41:76 No - lnc-IL17B-5:2 No - SLC8A1-AS1:2 No - lnc-LLPH-2:11 No - C21orf62-AS1:6 No - lnc-ANKRD36-1:11 No - lnc-B4GALNT1-1:6 Yes chr3L:995982-1034875 GABPB1-AS1:5 Yes chr3L:324985-327992 lnc-TWIST2-14:4 No - lnc-ADAM10-11:1 No - LINC01320:14 No - LINC01586:6 No - PCBP1-AS1:139 No - TEX41:36 No - lnc-GOLGA8O-5:11 No - lnc-TMEM150B-1:1 No - lnc-ZNF385D-6:1 No - SNHG17:15 No - lnc-PHLPP1-2:1 No - lnc-MUC20-67:42 No - LINC01748:33 No - SATB1-AS1:64 No - MIR2052HG:2 No - lnc-ACOD1-5:1 No - ITGA9-AS1:25 Yes chr2R:15258761-15262873 LINC01435:3 No - lnc-NRIP1-2:3 No - PCBP1-AS1:105 No - lnc-CD226-8:1 No - GAS5:24 No - lnc-FOXD4L6-5:1 No - MMP25-AS1:24 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-CEP83-5:2 Yes chr4:32478-43778 lnc-CYP17A1-3:4 No - LINC01549:3 No - PRKCQ-AS1:23 No - lnc-KIAA1551-13:2 No - LRRC2-AS1:3 Yes chr2R:20236235-20239200 LINC00504:6 No - OIP5-AS1:18 No - lnc-SSTR4-2:8 No - lnc-PTS-1:18 No - lnc-CRYAA2-2:1 No - SATB1-AS1:42 No - lnc-KIAA1755-15:1 No - lnc-RWDD3-7:18 No - lnc-FLRT2-1:4 No - lnc-OAF-3:3 No - lnc-MYO7B-2:34 Yes chrX:16309817-16313138 LINC01002:13 No - lnc-RPIA-162:1 No - lnc-ARL11-6:1 Yes chr3R:9574484-9577733 lnc-FAM76A-1:3 No - lnc-SMPD3-2:3 No - ZRANB2-AS2:8 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-HES6-1:8 No - SLC8A1-AS1:19 No - VIPR1-AS1:20 No - lnc-SQSTM1-3:2 Yes chr3L:16105852-16106428 LINC01544:3 No - lnc-PGPEP1L-7:1 No - lnc-RAP2B-12:1 No - lnc-SSTR4-2:9 No - lnc-FBXL4-7:1 No - LINC01202:9 Yes chrX:15921955-15924558 lnc-RRM2-3:2 Yes chr2R:11983145-11985393 PCBP1-AS1:135 No - lnc-MUC20-67:60 No - lnc-PRKCQ-2:4 No - lnc-PHF14-14:6 No - lnc-OR4F5-7:4 No - lnc-C7orf57-5:1 No - lnc-MYO7B-2:29 Yes chrX:16309817-16313138 lnc-ASXL1-1:2 No - LINC01097:4 No - LINC00466:7 No - SLC8A1-AS1:40 No - LINC00052:8 No - lnc-EDRF1-1:30 No - PCBP1-AS1:187 No - lnc-GJA9-1:7 No - WDFY3-AS2:1 Yes chr2L:5907169-5922776 lnc-SIK1B-6:1 No - SOX2-OT:53 Yes chr2L:8825645-8829670 LILRB1-AS1:3 No - lnc-SLC35C1-83:6 No - lnc-SNRPN-8:113 No - lnc-CDK1-9:1 Yes chr3L:7655389-7718395 CHRM3-AS2:4 Yes chr2R:24378630-24390294 LINC01121:11 No - SATB1-AS1:43 No - lnc-HIST2H2BF-4:4 No - lnc-ITGA2B-3:1 No - MIR325HG:11 No - lnc-MUC20-67:17 No - PARD6G-AS1:8 No - lnc-PRKCH-3:4 Yes chr2R:9252310-9285097 SATB1-AS1:44 No - lnc-CMPK2-5:81 No - LINC01712:6 No - lnc-PRAMEF26-2:2 No - lnc-TBCCD1-4:4 No - lnc-CYB5R2-3:15 No - LINC01949:7 No - LINC00893:47 Yes chr3L:3378268-3380083 lnc-LIG3-4:1 No - lnc-TMEM18-12:6 No - lnc-MUC20-67:112 No - lnc-HHIPL2-7:6 No - lnc-MED13L-9:1 No - LINC01358:1 No - LINC01662:26 No - HNF1A-AS1:3 No - lnc-WSB2-6:1 Yes chr2L:10419190-10420612 lnc-ERI1-2:18 No - lnc-GNAT3-1:24 Yes chr3L:7733250-7743041 FAM197Y5:6 No - lnc-NUMB-3:3 Yes chr3R:28520665-28540324 TEX41:90 No - lnc-METTL5-4:140 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-RAD50-3:1 Yes chr2R:22421013-22425482 lnc-PFKM-2:1 No - lnc-GSDMC-34:36 No - PCBP1-AS1:10 Yes chr3L:21844788-21932702 CELF2-AS2:7 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-RPS21-2:8 No - lnc-ERV3-1-10:19 No - lnc-LRRC3-5:2 No - lnc-INTS14-1:1 Yes chr2L:9711512-9746495 lnc-PCSK9-4:7 No - lnc-METTL5-4:141 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-EMC7-5:1 No - lnc-ERGIC2-8:1 Yes chrX:2201820-2203866 lnc-SIK1B-190:10 No - lnc-AVPR2-3:2 No - EAF1-AS1:4 No - lnc-TBCCD1-4:5 No - lnc-TCF12-9:1 Yes chr2R:24578247-24579827 lnc-HHIPL2-7:1 No - lnc-CCL18-68:1 No - LINC01709:6 No - lnc-IL16-8:1 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-FGF3-28:1 No - lnc-NABP1-5:23 No - lnc-CYP11A1-1:1 No - SATB1-AS1:45 No - lnc-SLC9A3-1:2 No - lnc-TMEM8A-6:2 No - lnc-DAOA-12:1 No - ADAMTS9-AS1:38 Yes chr2R:22807860-22815993 lnc-CHSY1-5:16 No - lnc-MYO6-16:1 No - lnc-TBCCD1-4:22 No - lnc-KLF17-1:20 No - lnc-PRDM9-162:1 No - lnc-BRD1-23:9 No - SOX2-OT:54 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-DRD5-10:19 No - lnc-LPAR6-6:1 Yes chrX:797090-801479 lnc-NDFIP2-7:10 No - TEX41:28 No - lnc-VPS18-1:7 No - LINC01559:5 No - LINC01359:4 No - lnc-CCKAR-5:5 No - lnc-INSIG2-1:17 Yes chr2R:16262284-16264619 LINC00908:10 No - lnc-OLFM4-6:3 No - CERS6-AS1:9 Yes chrX:6257668-6267228 lnc-ZRANB1-8:1 No - TEX41:51 No - lnc-FAM76A-1:4 No - lnc-METTL5-4:163 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-CSRNP3-12:2 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-ZSCAN30-5:4 No - PROSER2-AS1:3 No - PCBP1-AS1:101 No - LINC01704:14 No - lnc-UXS1-4:8 Yes chr2L:825969-833241 lnc-TXLNB-3:22 No - lnc-PPME1-4:1 No - PLCE1-AS1:6 No - lnc-GLE1-6:1 Yes chr3L:1778485-1795328 lnc-ZNF567-2:6 No - lnc-SPRYD3-1:16 No - PCBP1-AS1:171 No - PDZRN3-AS1:6 Yes chr4:663621-669884 lnc-TPRA1-7:1 No - lnc-CBSL-1:1 No - MALAT1:39 No - DLX6-AS1:9 Yes chr2R:24814822-24835667 lnc-PLET1-1:2 No - lnc-WWOX-5:1 No - CD27-AS1:21 No - lnc-COL4A1-2:9 No - CARMN:8 No - lnc-WDR11-1:7 No - ITGA9-AS1:4 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-SGSH-7:1 No - SPART-AS1:9 Yes chr3R:4654800-4657985 PRKAG2-AS1:10 No - SLC8A1-AS1:3 No - lnc-ATIC-8:10 No - LINC01515:26 No - lnc-NLRC4-5:2 Yes chr3R:10312039-10331353 LINC01002:20 No - lnc-TMEM68-4:1 Yes chrX:16323286-16325768 PACRG-AS3:4 Yes chr2R:19497752-19500372 lnc-ZBTB46-4:1 No - lnc-JUN-5:15 No - lnc-HMGA1-2:10 No - lnc-RGS9-15:8 No - LINC00923:3 No - CASC2:14 No - lnc-CELA3A-5:26 No - lnc-MYO7B-2:18 Yes chrX:16309817-16313138 lnc-ABHD4-11:1 No - lnc-RPL13-5:1 Yes chrX:2694392-2698211 lnc-SNX33-5:1 Yes chr2R:17518223-17519027 lnc-CCSAP-5:2 No - lnc-PAWR-1:4 Yes chr2L:2772327-2799979 LINC01002:36 No - lnc-PDCD1-4:1 No - lnc-METTL2B-3:15 No - lnc-CLN8-8:1 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-METTL5-4:142 Yes chr2L:7377702-7384344 FAM53B-AS1:7 Yes chr2L:2978411-2979288 lnc-MUC20-67:35 No - LINC00850:2 No - PGM5P3-AS1:2 Yes chr2R:12180493-12182373 LINC00430:1 No - lnc-FMN2-1:2 No - PARD6G-AS1:4 Yes chrX:17703352-17707096 lnc-CYP2D6-1:1 No - lnc-ANO6-6:1 Yes chr2R:6636512-6642358 lnc-FAM20C-13:1 No - LINC01632:5 No - TARID:3 Yes chr2R:17757405-17760517 lnc-SOS1-1:2 No - lnc-TBCCD1-4:34 No - CYP1B1-AS1:48 Yes chr3L:5590083-5592571 lnc-GALC-8:3 No - lnc-PADI2-2:1 No - lnc-CHD2-4:12 No - lnc-PADI1-1:3 No - lnc-MUC20-67:124 No - lnc-JUN-2:5 No - lnc-ZSCAN1-3:3 Yes chr2R:14173693-14182838 lnc-REP15-4:1 No - lnc-CD2-2:1 No - lnc-ITPR2-5:1 No - LINC01677:9 No - lnc-MUC20-67:113 No - SLC8A1-AS1:12 No - OSER1-DT:44 No - lnc-POTEM-13:2 No - lnc-METTL5-4:110 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-ZNF627-2:7 No - lnc-METTL5-4:143 Yes chr2L:7377702-7384344 LINC00963:22 No - EXOC3-AS1:2 Yes chr2R:18625249-18627718 lnc-DPP4-2:14 No - lnc-GRM1-1:11 No - lnc-SUCLA2-12:1 No - lnc-DPP4-2:12 Yes chr2L:5058404-5059790 lnc-RFPL4B-1:14 No - DARS-AS1:36 No - lnc-SPATA31A6-56:1 No - lnc-MUC20-67:125 No - lnc-HIST1H2AI-3:11 No - MAGI2-AS3:38 No - lnc-N4BP2L2-4:1 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-ESM1-6:1 No - lnc-BET1L-2:2 No - SLC8A1-AS1:21 No - lnc-AMELY-18:2 No - LINC00624:3 No - lnc-POTEM-3:3 No - lnc-TMPRSS2-83:13 No - lnc-A1BG-2:6 No - lnc-CRNKL1-8:1 No - lnc-SINHCAF-9:1 Yes chrX:4921678-4938105 SNHG5:25 No - lnc-STK32A-3:2 No - lnc-CARS2-3:1 Yes chr3L:19096399-19097709 LAMTOR5-AS1:45 No - RFPL1S:13 No - lnc-TACC2-8:1 No - lnc-FTCDNL1-4:58 No - lnc-SLC16A11-7:14 No - lnc-MAN2C1-6:3 No - LINC01635:12 No - LINC01777:15 No - lnc-FAM25C-31:2 No - lnc-ZNF595-2:1 No - SGO1-AS1:4 No - PCBP1-AS1:30 No - LINC00923:4 No - lnc-ZC2HC1C-3:1 No - LINC01285:8 No - lnc-POLRMT-6:12 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-BRCA1-3:3 No - SLC26A4-AS1:7 Yes chr3L:17898889-17907812 lnc-PPM1E-4:1 No - lnc-ARVCF-4:14 Yes chrX:13616989-13619207 LINC00893:50 Yes chr3L:3378268-3380083 lnc-MUC20-67:15 No - lnc-MUC20-67:114 No - lnc-ANKRD20A2-12:7 No - LINC00467:5 No - lnc-TP53TG3-27:1 No - MIRLET7BHG:11 No - LINC01517:34 No - lnc-UBE3A-9:1 No - lnc-RBM43-4:1 No - ZRANB2-AS2:3 No - lnc-RPH3AL-1:6 No - lnc-BRD7-6:1 Yes chr2R:14435899-14465881 lnc-CD177-4:2 No - lnc-NBPF11-1:17 No - lnc-ANKRD20A3-51:5 No - lnc-ANKRD18B-6:9 No - WASF3-AS1:5 Yes chr2L:10976772-10982395 PCBP1-AS1:63 No - lnc-CCDC36-1:5 No - lnc-RITA1-3:2 No - lnc-EDDM13-1:1 No - lnc-MMRN1-8:1 No - lnc-LLPH-2:7 No - lnc-LRP5L-17:1 Yes chr3R:16068523-16098761 lnc-OR4F17-4:4 No - CBR3-AS1:2 No - MALAT1:40 No - PCBP1-AS1:150 No - lnc-ANKRD20A2-12:2 No - lnc-MED26-1:2 No - lnc-STX1B-1:1 No - lnc-CMPK2-5:71 No - lnc-TMEM105-6:1 No - CYP1B1-AS1:16 Yes chr3L:5590083-5592571 SATB1-AS1:46 No - lnc-UBAP1L-1:4 No - MAGI2-AS3:8 No - EIF1B-AS1:13 No - lnc-VSTM2B-9:30 No - lnc-PIK3R1-2:2 No - LINC00882:38 No - lnc-MYBPH-1:2 Yes chr3R:30134856-30149606 VIPR1-AS1:37 No - lnc-ARHGAP5-2:2 No - lnc-MUC20-67:115 No - lnc-POU2AF1-1:2 No - lnc-SMPD1-3:3 No - lnc-KIAA1211L-1:1 No - lnc-ANKS6-1:21 No - LINC00955:4 No - VIPR1-AS1:21 No - GHET1:5 No - lnc-COL4A2-9:1 No - STARD13-AS:31 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-CIPC-1:2 Yes chrX:12569169-12583193 lnc-B3GNT10-21:20 No - lnc-KCNA1-97:27 No - TEX41:79 No - lnc-ATIC-8:7 No - JADRR:3 No - MSC-AS1:1 Yes chr2R:17757405-17760517 MAGI2-AS3:34 No - lnc-FTCDNL1-4:67 No - PACRG-AS3:7 Yes chr2R:19497752-19500372 lnc-SEC24D-1:9 No - SOX2-OT:67 Yes chr2L:8825645-8829670 LINC01002:6 No - MALAT1:21 No - LINC01320:12 No - PCBP1-AS1:142 No - lnc-TMEM211-4:1 No - lnc-CRYAA2-181:6 No - lnc-ZNF207-1:4 No - lnc-CTDP1-2:2 No - lnc-ZNF658-1:3 No - CELF2-AS2:1 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-COQ5-3:1 No - lnc-METTL5-4:99 Yes chr2L:7377702-7384344 SAMD12-AS1:8 Yes chr2R:14752521-14753269 lnc-FTCDNL1-4:68 No - lnc-CPN2-4:34 No - lnc-ZNF397-6:1 No - lnc-KIAA1211L-1:11 No - BTG3-AS1:16 Yes chrX:16074717-16091495 LINC01971:5 No - lnc-ARL16-4:1 Yes chr2L:2739986-2743377 lnc-CBSL-165:4 No - LINC01173:5 No - lnc-FTO-7:3 Yes chr3L:12609631-12710249 LINC01669:11 No - lnc-PHF21A-1:4 No - lnc-FTCDNL1-4:69 No - lnc-FGF7-5:1 No - lnc-ZFP90-3:2 No - PCBP1-AS1:119 No - lnc-KPNA2-6:23 No - lnc-CYB5R2-1:14 Yes chr2R:21798017-21799195 lnc-ADAMTS15-1:10 No - lnc-TMED10-3:1 No - LINC01828:39 No - DARS-AS1:30 No - lnc-KLHL32-4:16 No - lnc-ALG1L-2:30 No - lnc-MBD2-7:1 Yes chr3R:8233507-8237389 LINC01206:33 No - lnc-AGAP9-39:3 Yes chr2L:13835564-13898712 CFLAR-AS1:15 No - lnc-PRND-4:1 No - lnc-ADAMTS15-5:7 No - lnc-MUC20-67:66 No - FAM138F:6 No - lnc-NUDT8-3:2 No - LINC01206:34 No - PCBP1-AS1:184 No - MIR99AHG:123 No - lnc-LCN2-1:4 No - LINC01828:34 No - lnc-PCDHB7-1:1 No - lnc-SIK1B-187:4 No - lnc-CHST6-4:1 No - lnc-ALKAL2-2:7 No - LINC01345:9 No - lnc-NABP1-5:21 No - lnc-U2AF1L5-162:2 No - LINC00649:14 No - LINC01126:4 No - lnc-MAPRE2-3:1 No - BAIAP2-DT:27 No - LINC00550:4 No - lnc-RORA-1:2 No - LINC02568:18 No - LINC00982:10 No - VIPR1-AS1:22 No - lnc-AUNIP-2:2 No - LINC01378:1 No - lnc-PPIAL4C-4:10 No - lnc-SLC16A11-7:12 No - lnc-OR4F29-1:29 No - lnc-CNTNAP3B-45:4 No - lnc-MCM8-4:1 No - VAV3-AS1:14 No - H19:4 No - lnc-KLF17-1:23 No - lnc-STARD9-3:1 Yes chr3L:1789631-1795328 lnc-MYOM2-89:1 No - lnc-NELL2-3:1 No - LINC00710:7 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-BCAT1-4:3 No - lnc-HNRNPLL-2:4 Yes chr2L:11694804-11696107 lnc-SRRM2-1:2 No - lnc-GABPA-1:8 Yes chrX:530501-579044 lnc-MEF2A-9:1 No - DNM3OS:5 No - lnc-DDX10-1:3 No - lnc-TBL2-2:1 Yes chr2L:21286078-21310050 CYP1B1-AS1:46 Yes chr3L:5590083-5592571 LINC01708:24 No - CELF2-AS2:2 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-PCDHB2-2:1 No - lnc-GABARAPL2-9:1 Yes chr2R:10812157-10813310 LINC00623:25 No - SLC8A1-AS1:28 No - lnc-C2CD4A-16:1 No - lnc-ZSCAN30-5:5 No - lnc-TMEM106C-3:2 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-TSC22D1-5:1 No - lnc-C15orf53-7:2 No - lnc-IL17A-2:6 No - lnc-GLRA1-1:2 No - DNAJB5-DT:6 No - lnc-NRIP1-2:11 No - BACH1-AS1:1 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-ABCC9-3:1 No - lnc-PGM5-2:3 Yes chr3L:16126018-16128531 lnc-FXYD3-2:2 No - VLDLR-AS1:1 Yes chr3R:25698727-25740465 lnc-ATP6V1E1-1:2 Yes chr3R:11967708-11971686 USP3-AS1:11 No - lnc-WBP4-2:4 No - lnc-FOXN3-2:3 No - lnc-XPO4-5:1 Yes chr2L:6069790-6070686 lnc-HIGD1A-1:3 No - lnc-PDZRN4-5:1 Yes chr3R:4381306-4387018 LINC00836:6 No - PCBP1-AS1:152 No - PACRG-AS3:3 Yes chr2R:19497752-19500372 LINC00284:7 No - PCBP1-AS1:7 Yes chr3L:21844788-21932702 lnc-SIK1B-190:13 No - lnc-GNAT3-1:11 Yes chr3L:7733250-7743041 NFIA-AS1:7 Yes chr4:268175-276369 lnc-ALPK2-2:3 No - lnc-RRBP1-4:1 No - lnc-FOXD4L5-25:14 No - PCBP1-AS1:196 No - lnc-PPIAL4D-19:11 No - lnc-ZNF672-5:4 No - SYNGAP1-AS1:10 No - lnc-ZSCAN1-3:7 Yes chr2R:14173693-14182838 lnc-FRMD8-4:1 No - ZRANB2-AS2:20 Yes chr3L:5424109-5442399 ZNF561-AS1:8 No - STARD13-AS:37 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-CST11-1:1 No - ZNF710-AS1:8 Yes chr3R:15348048-15350391 lnc-GINS2-4:2 No - EIF1B-AS1:7 No - lnc-ANKRD36-1:12 No - PCBP1-AS1:190 No - lnc-MUC20-67:26 No - lnc-ALG14-2:6 No - DARS-AS1:29 No - IBA57-DT:7 No - lnc-AAGAB-1:37 No - TEX41:91 No - BHLHE40-AS1:5 No - lnc-EXOC2-29:4 No - LINC01440:12 No - PCBP1-AS1:98 No - lnc-PDZRN4-6:1 No - lnc-FGFR2-12:1 No - lnc-CIPC-6:1 No - LINC01206:37 No - RMDN2-AS1:14 No - NOL4L-DT:5 Yes chr2L:14104090-14160587 lnc-SGCG-14:1 No - CASC22:21 No - lnc-UCHL3-5:14 No - lnc-LTBR-1:5 No - lnc-TUFM-3:3 Yes chr3R:15408423-15417277 lnc-INAVA-1:11 No - PCBP1-AS1:122 No - LINC01702:17 No - ZNF426-DT:25 No - LINC01002:31 No - lnc-COL6A1-1:4 No - lnc-CLN6-1:3 No - LINC01394:35 No - lnc-U2AF1L5-162:10 No - lnc-SAMD11-7:24 No - lnc-ATP10A-9:1 Yes chrX:15925105-15928529 lnc-GGCT-1:59 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-MUC20-67:126 No - ZRANB2-AS2:21 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-DCT-16:2 Yes chr3L:14632601-14671609 FAM223B:3 No - LINC01206:22 No - lnc-CST7-1:5 No - SRGAP3-AS2:7 No - LINC01206:19 No - lnc-GBX2-3:4 Yes chr2L:13835564-13898712 lnc-NMRAL1-4:1 Yes chr2R:23502946-23503815 lnc-SEPT10-3:1 No - DARS-AS1:31 No - PCBP1-AS1:166 No - lnc-VASN-2:1 Yes chr3L:8191522-8193116 LINC00559:7 No - lnc-ANKRD36-2:6 No - lnc-MFAP4-3:16 No - lnc-CRIM1-1:16 No - lnc-SOCS5-4:8 No - lnc-NBPF11-1:36 No - MIR124-2HG:7 No - lnc-MUC20-67:127 No - lnc-KCNE1B-157:1 No - lnc-SMIM34B-160:6 No - LINC01811:20 No - lnc-POU2AF1-1:3 No - PROX1-AS1:27 No - lnc-CPN2-4:40 No - lnc-NABP1-5:16 No - lnc-HIBADH-1:2 No - SGO1-AS1:5 No - ZNF426-DT:24 No - LINC02448:3 No - MIR325HG:14 No - lnc-MALT1-1:3 No - SATB1-AS1:47 No - lnc-THOC3-3:2 No - lnc-PPIAL4E-9:2 No - lnc-DIAPH1-4:1 No - LINC00115:3 No - lnc-TAF4-4:1 No - lnc-CYP26A1-1:1 No - lnc-DCAF4L2-2:4 No - lnc-KLF17-1:19 No - lnc-ZNF705A-7:1 No - RAMP2-AS1:24 No - lnc-SIK1B-190:3 No - lnc-CRYBA4-52:35 No - lnc-SMIM11B-180:2 No - LINC01138:26 No - ADAMTS9-AS1:32 Yes chr2R:22807860-22815993 LINC02033:5 No - LINC01869:25 No - lnc-SMIM34B-2:1 No - LINC01697:36 No - lnc-POLR3GL-48:2 No - LINC01828:40 No - lnc-FOXD4L5-25:16 No - LINC01554:2 No - MAMDC2-AS1:28 No - lnc-MMRN1-12:26 No - lnc-TXLNB-3:21 No - LINC01358:10 No - PROX1-AS1:23 Yes chr3R:11328480-11407627 PCBP1-AS1:205 No - LINC02129:5 No - lnc-RPS24-16:1 No - lnc-BEX3-2:1 No - lnc-RPS24-3:13 No - SLC8A1-AS1:16 No - lnc-PRPF18-1:24 No - lnc-SOCS5-4:6 No - CFLAR-AS1:25 No - EGOT:6 Yes chr3R:5517117-5539411 LINC01133:6 No - lnc-CSMD1-1:11 No - SATB1-AS1:65 No - LINC00311:4 No - FAM239A:26 No - AZIN1-AS1:4 Yes chr2R:8007246-8009062 PCBP1-AS1:193 No - NR2F2-AS1:56 No - LINC01197:18 No - lnc-SYCP3-1:2 No - YEATS2-AS1:4 Yes chr2L:8434058-8437365 lnc-KIAA1211L-1:2 No - lnc-SLC16A11-7:13 No - CYP1B1-AS1:7 Yes chr3L:5590083-5592571 lnc-PIP4K2A-2:2 No - lnc-ZNF567-2:5 No - lnc-TMEM88B-3:11 Yes chr3L:13017149-13017867 lnc-GATA4-1:4 No - lnc-M6PR-5:2 No - lnc-MYO7B-2:5 Yes chrX:16309817-16313138 lnc-BCL2L11-3:6 No - LINC01660:4 No - lnc-KATNA1-2:3 No - lnc-PTRH2-3:2 Yes chrX:15827986-15835490 lnc-SMIM11B-178:1 No - LINC01141:4 No - lnc-SPATA33-3:1 Yes chr2R:10067217-10068702 lnc-INO80D-10:5 No - lnc-RBBP8NL-2:1 Yes chr2R:13580313-13593339 LINC02456:6 No - lnc-GRM1-1:14 Yes chr3L:6174248-6178941 lnc-SPRED2-1:12 No - SLC8A1-AS1:35 No - lnc-AGAP9-39:1 Yes chr2L:13835564-13898712 lnc-AGPAT2-2:6 No - lnc-SNN-6:2 No - lnc-EDRF1-1:32 No - lnc-HARS-8:1 Yes chr3R:16484566-16495422 LINC01666:5 No - LINC02312:5 No - lnc-KLF17-1:16 No - PGM5P3-AS1:1 Yes chr2R:12180493-12182373 LINC01206:7 No - LINC00608:17 No - lnc-TAF7-6:2 No - lnc-NRIP1-2:10 No - LINC00649:10 Yes chr3R:15265591-15266690 lnc-BGN-3:1 No - EIF1B-AS1:2 No - lnc-SAMD14-7:1 Yes chr2R:9426439-9434638 lnc-UTP23-15:2 No - HYMAI:8 No - lnc-SLX4IP-38:1 No - LINC00710:20 Yes chr2L:12344219-12397528 TARID:4 Yes chr2R:17757405-17760517 lnc-NBPF11-1:16 No - lnc-POLR3G-1:5 No - LINC01128:71 No - lnc-PSMA2-1:8 No - CFLAR-AS1:26 No - MAMDC2-AS1:29 No - lnc-PSMA2-1:7 No - lnc-ANKRD20A2-16:1 No - NUTM2B-AS1:20 No - lnc-SYT10-3:4 No - lnc-GLP2R-3:1 No - lnc-PPIAL4C-4:25 No - lnc-B3GNT10-21:21 No - LINC01206:18 No - lnc-SIK1B-190:6 No - lnc-INO80D-10:14 No - lnc-LRRTM1-2:11 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-SIK1B-190:12 No - lnc-ZNF479-23:3 No - LINC00926:16 No - lnc-AK7-6:1 Yes chr2R:19663919-19669832 lnc-LINC02203-25:1 No - lnc-RPS27A-1:21 Yes chr3L:3178930-3185287 LAMTOR5-AS1:58 No - lnc-SLC39A11-10:1 No - lnc-CSTL1-2:1 No - GABPB1-AS1:9 No - lnc-KCNE1B-156:1 No - lnc-UNC119B-1:1 No - DLEU2:17 No - lnc-NTN3-1:2 Yes chr2L:20871335-20918931 lnc-OR4N4-1:22 No - LINC01002:35 No - lnc-MTFP1-4:3 No - PCBP1-AS1:92 No - lnc-ETFBKMT-8:1 No - lnc-CTXN1-4:2 No - lnc-USP6NL-20:1 Yes chr2L:12344219-12397528 GLIDR:14 No - lnc-HNRNPLL-2:5 Yes chr2L:11694804-11696107 lnc-YARS2-4:1 Yes chr2L:2581281-2585430 lnc-U2AF1L5-161:2 No - lnc-ZNHIT6-1:6 Yes chrX:13294473-13302415 FAM27C:2 No - lnc-AGPAT2-2:7 No - lnc-CMPK2-5:82 No - lnc-WDR5-8:1 No - PCBP1-AS1:165 No - MTUS2-AS1:6 No - lnc-ZSCAN1-3:4 Yes chr2R:14173693-14182838 SATB1-AS1:48 No - lnc-HSPA12A-1:14 No - lnc-NSUN6-4:5 No - lnc-TAF7-1:4 No - lnc-INO80D-10:15 No - VIPR1-AS1:23 No - lnc-GINS1-12:1 No - TSPEAR-AS2:4 No - lnc-CBSL-167:1 No - LINC01002:37 No - lnc-CARD11-22:9 No - LINC02086:15 No - lnc-METTL5-4:148 Yes chr2L:7377702-7384344 ADAMTS9-AS1:33 Yes chr2R:22807860-22815993 MALAT1:38 No - THRB-AS1:7 Yes chr2R:6087873-6169087 LINC01411:2 No - LINC00710:13 Yes chr2L:12344219-12397528 lnc-ITGA9-2:8 No - lnc-TEX9-5:1 No - LINC01767:22 Yes chr2R:9400531-9413463 LINC00963:25 No - lnc-METTL5-4:108 Yes chr2L:7377702-7384344 TRPM2-AS:3 Yes chr2R:15262808-15309368 lnc-RWDD3-7:19 No - lnc-MTHFS-5:1 Yes chr2R:23359215-23360266 PROX1-AS1:25 No - lnc-PPIAL4D-19:14 No - LINC02086:13 No - lnc-METTL5-4:144 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-KIAA1211L-1:3 No - lnc-CCT8L2-93:1 No - lnc-TFEC-2:7 Yes chr2R:17465879-17469177 lnc-PQLC1-3:1 No - lnc-ADAM22-2:9 No - lnc-STON1-GTF2A1L-6:1 No - lnc-MSH4-1:2 No - lnc-ICA1-3:3 No - lnc-TEX48-1:1 No - lnc-TUBGCP3-1:6 No - LINC01666:4 No - LINC02240:22 No - NEAT1:16 No - lnc-POU2AF1-1:5 No - lnc-RWDD3-7:20 No - lnc-ZNF362-1:9 No - lnc-PDGFA-6:1 No - lnc-ARID4A-3:1 No - SNHG5:18 No - lnc-MUC20-67:128 No - PCBP1-AS1:188 No - LINC01948:9 No - lnc-ERGIC2-9:1 Yes chrX:2201820-2203866 lnc-SLC19A1-7:3 No - INSYN1-AS1:20 No - lnc-CDIPT-4:1 No - lnc-ZNF221-4:4 No - lnc-FTCDNL1-4:64 No - PCBP1-AS1:179 No - SNHG17:11 No - MIR4527HG:32 No - lnc-EDRF1-1:27 No - lnc-SORCS2-4:2 No - lnc-SIK1B-187:2 No - lnc-RBP5-3:2 No - LINC01778:21 No - AQP4-AS1:9 Yes chr3L:1876551-1883041 lnc-FOXD4L5-23:3 No - lnc-FAM236B-4:4 Yes chrX:13368191-13370472 lnc-ANKRD36-1:9 No - SNHG5:21 No - lnc-MUC19-1:19 No - lnc-LRRC58-1:5 No - lnc-USP6NL-8:8 No - lnc-FARSB-1:2 No - LINC01515:27 No - lnc-MERTK-7:1 Yes chrX:15455544-15462441 lnc-PPP1R3D-11:1 No - lnc-CAPRIN2-2:5 Yes chr3L:17891820-17895862 lnc-KLHL32-4:21 No - lnc-LMF1-1:3 No - lnc-MUC20-67:116 No - lnc-SHF-3:5 Yes chr2R:9082395-9085717 FAM30A:10 No - LINC01762:31 No - lnc-RIOX2-5:2 Yes chr2R:19444179-19445058 lnc-FTCDNL1-4:27 No - lnc-MARCH10-4:2 No - LINC01550:18 No - lnc-UQCRHL-3:2 Yes chr3R:11781131-11787014 SOX2-OT:15 No - lnc-AP3B2-1:6 No - lnc-IDI2-4:1 Yes chr2R:9396265-9398734 TBX18-AS1:1 No - RNASEH2B-AS1:1 Yes chrX:13668014-13669573 lnc-PTPRZ1-3:20 Yes chr4:1230837-1271759 lnc-ANKRD20A2-12:4 No - lnc-VDAC2-5:2 Yes chr3R:26989035-26989852 lnc-NEMF-1:3 No - lnc-CPN2-4:35 No - lnc-SGPL1-2:4 No - lnc-PRMT6-3:6 No - lnc-METTL5-4:119 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-RANBP3L-3:1 Yes chr2L:9333567-9341925 lnc-DDX11-4:2 Yes chrX:4921678-4938105 lnc-PPIAL4D-19:6 No - LINC00608:15 Yes chr3L:6097617-6123913 lnc-MUC20-67:117 No - lnc-COA5-2:4 No - lnc-EIF2AK4-9:1 Yes chr2L:6686791-6709086 lnc-TASP1-4:5 No - EDRF1-AS1:11 Yes chr3L:8721324-8726108 lnc-PRMT6-3:10 No - lnc-WDR11-1:8 No - FAM138F:4 No - lnc-RSAD1-3:1 No - PCAT14:6 No - lnc-PSCA-71:1 No - lnc-SPG21-45:1 No - LINC02410:4 No - MIRLET7BHG:10 No - lnc-APOL1-16:1 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-C2CD4B-13:2 Yes chr3L:8545001-8574409 lnc-ADPRHL1-5:1 Yes chr3R:16147029-16149636 lnc-FAM72D-61:1 No - lnc-FECH-5:1 No - lnc-MZT2A-7:2 No - lnc-MUC20-67:22 No - DLEU2:3 No - PCBP1-AS1:189 No - lnc-PFKFB3-11:1 No - lnc-MAD1L1-7:2 No - lnc-MBD1-3:1 No - THRB-AS1:12 No - PCBP1-AS1:147 No - lnc-TAF7-2:1 No - LINC02086:12 No - lnc-NPIPB11-4:2 No - lnc-CYLD-2:16 No - BHLHE40-AS1:9 No - LINC01002:14 No - lnc-LY6E-7:5 No - lnc-PSMA2-1:9 No - lnc-PDGFA-17:7 No - SATB1-AS1:79 No - lnc-FTCDNL1-4:59 No - lnc-INO80D-10:6 No - lnc-MUC19-1:17 No - PCAT14:8 No - lnc-FAM98A-3:2 No - FAM239A:27 No - lnc-ARPC2-1:2 No - ZFAS1:16 Yes chr3L:2895017-2959579 lnc-SLCO4A1-8:1 No - PCBP1-AS1:60 No - lnc-RBM33-6:2 No - CFLAR-AS1:16 No - lnc-PPIAL4D-19:13 No - LINC01685:8 No - LAMTOR5-AS1:26 No - lnc-SLC38A2-4:1 No - LINC00581:1 No - lnc-ZNF644-1:17 No - MALAT1:36 No - TBX18-AS1:4 No - lnc-TDRD3-3:6 No - lnc-TBCCD1-4:41 No - LINC01320:10 No - LINC01554:3 No - lnc-CHM-12:1 No - lnc-GSDMC-34:37 No - lnc-NHLRC3-1:3 No - lnc-MUC20-67:54 No - lnc-AFAP1L2-6:1 No - LINC01460:1 No - lnc-TMPRSS2-1:2 No - lnc-GABPA-1:9 Yes chrX:530501-579044 lnc-HES6-1:7 No - lnc-LRCH1-13:1 No - lnc-LINC00854-1:2 No - lnc-ANKRD63-1:1 Yes chr2L:305935-355566 lnc-SMDT1-1:1 No - MMP2-AS1:11 No - lnc-ZNF362-1:13 Yes chrX:2115727-2123286 ZBTB20-AS5:5 No - lnc-DDX51-13:1 No - lnc-PHF14-14:7 No - PCBP1-AS1:163 No - lnc-TBCCD1-4:23 No - LINC01515:5 No - SNAP25-AS1:14 No - LINC00963:23 No - lnc-PMM2-8:1 Yes chr3L:16780100-16782419 lnc-SRPRA-3:1 No - VIPR1-AS1:35 No - lnc-AGAP9-2:6 No - PCBP1-AS1:155 No - lnc-TBCCD1-4:8 No - lnc-ZNF141-2:2 No - lnc-CYB5D2-4:1 No - lnc-PDGFA-6:7 No - lnc-MVP-3:8 Yes chrX:15701451-15703770 ITGA9-AS1:33 Yes chr2R:15258761-15262873 ZRANB2-AS2:9 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-CRYBA4-15:1 No - lnc-FSIP1-10:1 No - lnc-GNAI1-9:1 Yes chr2R:21129463-21142261 lnc-ADNP2-3:2 Yes chrX:17703352-17707096 LINC01697:28 No - ZRANB2-AS2:12 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-PPARA-11:5 No - lnc-EBF3-1:6 Yes chr3R:6658806-6660100 lnc-CAB39L-10:2 No - lnc-SLC25A52-4:1 Yes chr3L:19613427-19618521 lnc-INO80D-10:7 No - lnc-PKP2-3:1 No - lnc-ENOSF1-5:1 No - LINC01206:15 No - FAM87B:6 No - lnc-KIAA0930-1:3 No - lnc-ATG2B-12:2 No - lnc-PMEL-5:1 No - lnc-COL20A1-5:3 Yes chr2R:10145897-10192394 LINC01955:3 No - lnc-ST8SIA2-7:2 No - MLIP-AS1:14 No - LINC01649:11 No - lnc-CCDC33-5:1 No - lnc-PSMA2-1:6 Yes chrX:9608946-9623243 lnc-MEF2A-9:4 No - LINC01578:2 Yes chr2L:2979562-2987723 lnc-REEP3-11:2 No - lnc-MBD3L4-1:1 Yes chr3R:9559760-9561533 lnc-FBXO17-5:4 Yes chr3R:15340667-15343218 lnc-GNG13-1:2 No - lnc-OR6C70-1:5 No - lnc-METTL5-4:92 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-ACD-1:2 Yes chr3L:7353578-7356713 lnc-ZDHHC6-1:6 Yes chr3L:18878250-18890483 lnc-MUC20-67:129 No - lnc-NR4A2-1:2 No - TEX41:39 No - PAX8-AS1:36 Yes chr4:1088798-1113317 RFPL1S:3 No - LINC01632:4 No - VIPR1-AS1:24 No - LINC01128:81 No - lnc-BEX3-2:3 No - lnc-UQCRHL-3:3 Yes chr3R:11781131-11787014 lnc-TFDP1-2:2 No - lnc-DUSP14-5:2 Yes chr3L:17802490-17804715 lnc-U2AF1-4:1 No - lnc-ALG14-2:3 No - CBR3-AS1:22 No - lnc-TBCCD1-4:42 No - LINC01015:5 No - lnc-TTLL9-1:1 Yes chrX:16323286-16325768 LINC01615:4 No - lnc-PLCD3-1:14 No - lnc-COG5-2:6 Yes chr2R:9993890-10026042 lnc-NOC4L-4:15 Yes chr3R:28748384-28751661 lnc-PRIMPOL-1:1 Yes chr3L:18878250-18890483 ZRANB2-AS2:16 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-HMGXB4-8:1 No - lnc-SNRPB2-2:8 No - lnc-HHIPL2-7:2 No - LINC00115:36 No - lnc-PDK2-5:1 No - lnc-OR4F17-6:2 No - lnc-SIK1B-189:1 No - VIPR1-AS1:30 No - LINC01002:25 No - lnc-METTL5-4:118 Yes chr2L:7377702-7384344 FAM215A:3 No - lnc-PLK1-1:6 Yes chr2L:15005733-15006607 lnc-MARC1-3:2 No - TEX41:77 No - lnc-SIRT4-8:1 Yes chr2L:19400753-19426596 lnc-ZNF705D-2:24 No - SOX2-OT:55 Yes chr2L:8825645-8829670 ZNF436-AS1:7 Yes chr2R:14173693-14182838 CYP1B1-AS1:24 Yes chr3L:5590083-5592571 TEX41:92 No - lnc-WDR81-4:1 Yes chr2R:12154258-12162998 lnc-HNRNPU-5:3 Yes chr2R:21142368-21143261 lnc-CATSPER3-2:8 Yes chr2L:21423737-21424229 LINC01146:11 No - lnc-CRYAA2-181:2 No - lnc-RPS21-2:7 No - lnc-SBDS-4:13 No - FAM223A:3 No - LINC00484:3 No - lnc-GALNTL5-2:7 Yes chr3R:21140739-21214269 lnc-ZNF778-2:10 Yes chr3L:12750119-12753402 lnc-MICAL3-1:1 No - lnc-CARD11-22:6 No - lnc-ACSM3-1:4 No - lnc-ADAM20-2:2 No - lnc-PCDH8-10:2 No - lnc-PPIAL4C-4:20 No - lnc-ANKRD36-2:5 No - lnc-CAPRIN2-2:7 Yes chr3L:17891820-17895862 lnc-AGPAT2-2:5 No - LINC01002:7 No - LINC00430:4 No - LAMTOR5-AS1:18 No - lnc-FAM83D-4:1 Yes chr2L:4815613-4818245 LINC01828:26 No - lnc-GRM1-1:17 Yes chr3L:6174248-6178941 lnc-IL16-13:2 No - PGM5P3-AS1:6 Yes chr2R:12180493-12182373 lnc-ARHGAP15-21:1 Yes chr3R:30765926-30789202 LINC02328:61 No - PROX1-AS1:4 Yes chr3R:11328480-11407627 LINC01587:2 No - lnc-ZNF608-19:1 No - lnc-KBTBD7-3:1 Yes chr2L:13219979-13221398 MLIP-AS1:2 No - lnc-RPS24-3:17 No - LINC00467:11 No - EIF1B-AS1:5 No - lnc-HRH4-9:2 Yes chr2R:14435899-14465881 lnc-SIK1B-190:8 No - lnc-TMEM88B-3:9 No - lnc-CPN2-4:31 No - CYP1B1-AS1:10 Yes chr3L:5590083-5592571 lnc-TMEM106C-6:2 No - SATB1-AS1:49 No - lnc-CDC27-4:1 No - lnc-CCKAR-5:4 No - lnc-DIRAS1-3:1 No - PCBP1-AS1:114 No - CYP1B1-AS1:19 Yes chr3L:5590083-5592571 lnc-PPIAL4C-4:15 No - CYP1B1-AS1:49 Yes chr3L:5590083-5592571 lnc-MYO7B-2:7 Yes chrX:16309817-16313138 lnc-NTAN1-4:1 Yes chrX:21324046-21328150 lnc-LINC02210-CRHR1-52:1 Yes chr2R:12474424-12487986 lnc-TBCCD1-4:35 No - LINC01002:2 No - lnc-FGFR2-12:8 No - lnc-RPS21-2:5 No - lnc-ITGA9-2:9 No - LINC02348:10 No - lnc-ETNK1-3:12 No - SLC8A1-AS1:4 No - lnc-MEF2A-9:2 No - RMDN2-AS1:12 No - lnc-SMIM30-1:7 No - MAFTRR:5 No - lnc-ETNK1-3:13 No - lnc-TP53RK-6:1 Yes chr3R:20042757-20048716 lnc-BUB1B-7:1 Yes chrX:16610685-16614856 ZRANB2-AS2:10 No - lnc-METTL5-4:159 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-UXS1-4:6 Yes chr2L:825969-833241 lnc-ARFGEF2-2:13 No - lnc-MTFP1-7:1 No - TEX41:59 No - lnc-EEPD1-49:1 No - lnc-AVPR1A-1:3 No - SATB1-AS1:50 No - lnc-C1QTNF8-4:2 No - LINC01169:2 No - LINC01646:8 No - lnc-TBCCD1-4:17 No - TEX41:98 No - SNHG5:26 No - lnc-ZNF658-1:2 No - lnc-ZNF74-6:3 Yes chr3R:31777020-31790681 lnc-RAB37-2:1 No - lnc-C12orf74-18:2 No - lnc-ABHD12-5:1 Yes chr2L:2130813-2137296 lnc-KLHL42-6:1 No - LINC01002:1 No - KIRREL3-AS3:3 Yes chrX:2740384-3134532 lnc-MAMDC2-4:1 Yes chr3L:21569176-21573523 lnc-SMIM10L1-31:1 No - lnc-CRYBA4-52:36 No - lnc-CRIM1-1:17 No - lnc-NAXD-5:1 No - lnc-METTL5-4:111 Yes chr2L:7377702-7384344 lnc-CMPK2-5:80 No - LINC00467:8 No - SATB1-AS1:80 No - PCBP1-AS1:93 No - lnc-LSM14B-6:2 No - lnc-METTL5-4:145 Yes chr2L:7377702-7384344 SSBP3-AS1:1 Yes chr3R:18192494-18199595 CFLAR-AS1:17 No - lnc-TOX3-1:16 No - lnc-SIK1B-190:1 No - lnc-AQP11-4:2 Yes chr3R:6350896-6361614 lnc-GSG1L2-3:2 No - lnc-LRRC10-4:1 No - lnc-PPARA-6:4 No - lnc-SIK1B-1:1 No - lnc-MUC20-67:130 No - lnc-APOLD1-1:2 No - lnc-CST11-2:1 No - VIPR1-AS1:38 No - lnc-PPIAL4E-9:1 No - SOX2-OT:58 Yes chr2L:8825645-8829670 TEX41:25 No - lnc-RAB11FIP4-9:1 No - lnc-CD36-7:2 No - MIR325HG:9 No - lnc-RBBP9-8:1 No - lnc-MUC2-1:5 No - lnc-MUC20-67:34 No - LINC00623:44 No - LINC01521:2 No - lnc-PLCB2-2:1 No - ZNF793-AS1:9 No - SLC26A4-AS1:8 Yes chr3L:17898889-17907812 lnc-FTCDNL1-4:60 No - lnc-SLCO4A1-8:2 No - lnc-TMTC3-16:1 No - LINC00893:46 No - lnc-RPS24-3:16 No - lnc-CMPK2-5:75 No - LAMTOR5-AS1:61 No - lnc-TAF7-5:6 No - lnc-CRYBA4-52:37 No - lnc-ERCC6L2-13:1 No - lnc-MUC20-67:142 No - LINC00710:18 Yes chr2L:12344219-12397528 NKAIN3-IT1:8 Yes chr2R:24881570-24888615 lnc-NRIP1-2:6 No - lnc-DOK6-7:1 Yes chr2L:6491061-6496988 LINC01565:2 No - lnc-SNRPN-8:90 No - lnc-METTL5-4:156 Yes chr2L:7377702-7384344 LINC01006:2 No - PCBP1-AS1:106 No - lnc-FSTL3-1:3 No - NDUFA6-DT:76 No - SMIM2-AS1:1 No - LCMT1-AS1:14 No - lnc-RNFT2-6:1 No - LNCARSR:17 No - lnc-CELA3A-5:8 No - lnc-RECQL4-2:4 No - CFLAR-AS1:18 No - LINC01747:11 No - lnc-PPIAL4C-4:26 No - lnc-SCN2A-6:7 Yes chr2R:9044850-9060608 lnc-GOLGA6A-1:3 No - lnc-PI4KB-1:3 No - lnc-LRRC47-78:35 No - STARD7-AS1:4 No - lnc-ANGPTL8-2:1 Yes chr2L:94739-102086 CERS6-AS1:14 Yes chrX:6257668-6267228 CEBPB-AS1:2 No - BLACAT1:14 No - ITGA9-AS1:11 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-PTPRZ1-3:10 Yes chr4:1230837-1271759 lnc-LMF1-4:1 No - LINC02246:28 No - lnc-PDGFA-17:19 No - lnc-SYCE1-3:1 No - lnc-TBCCD1-4:36 No - lnc-UAP1L1-5:1 No - MIR325HG:13 No - LINC01709:7 No - CYP1B1-AS1:50 Yes chr3L:5590083-5592571 lnc-DIAPH3-17:2 No - lnc-JUN-5:11 No - lnc-TMEM132C-6:11 No - DDX11-AS1:3 No - PCBP1-AS1:14 Yes chr3L:21844788-21932702 lnc-GOLGA6L6-13:1 No - lnc-EBF3-1:8 Yes chr3R:6658806-6660100 lnc-JUN-2:7 No - lnc-EEF1AKMT1-3:5 No - MIR34AHG:16 No - lnc-PTPRZ1-3:14 Yes chr4:1230837-1271759 lnc-INO80D-10:9 No - lnc-MBNL2-6:1 Yes chr2R:24063051-24065405 lnc-SOX15-5:1 No - lnc-ZNF596-5:1 No - TRDN-AS1:40 No - RNASEH2B-AS1:11 No - lnc-HS3ST4-1:14 No - lnc-RPS27A-1:15 Yes chr3L:3178930-3185287 LINC00710:19 Yes chr2L:12344219-12397528 LINGO1-AS1:8 Yes chr2R:21872030-21946259 LINC00466:12 No - lnc-GATA5-5:2 No - lnc-KLF17-1:21 No - lnc-MYO7B-2:2 Yes chrX:16309817-16313138 lnc-MESD-2:3 No - SNHG5:3 No - MIR663AHG:6 No - lnc-FBXW8-6:1 Yes chr3R:24109944-24112389 lnc-EBF3-1:11 Yes chr3R:6658806-6660100 lnc-TAF4-5:3 No - ITGA9-AS1:29 Yes chr2R:15258761-15262873 SLC12A5-AS1:6 No - SEPSECS-AS1:4 Yes chr3R:5557663-5563652 CYP1B1-AS1:51 Yes chr3L:5590083-5592571 MAGI2-AS3:15 No - lnc-RABEP2-3:2 Yes chr2R:16124981-16138238 lnc-TOM1L1-10:1 Yes chr2L:5526957-5527854 lnc-HSD17B3-4:1 No - lnc-CARD11-22:7 No - PROX1-AS1:50 No - lnc-PRMT6-3:3 No - NPTN-IT1:2 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-C16orf45-4:1 Yes chr3L:9898703-9903031 ZRANB2-AS2:39 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-TAPBPL-3:1 Yes chr2R:10249435-10252417 ZRANB2-AS2:17 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-PRODH-1:1 No - lnc-MUC20-67:61 No - VIPR1-AS1:25 No - lnc-IL4R-2:20 No - lnc-TBCCD1-4:51 No - VIPR1-AS1:26 No - lnc-ZNF479-23:2 No - PLCE1-AS2:13 No - lnc-MUC20-67:131 No - LINC00997:4 No - lnc-LRRTM1-2:12 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-UTP23-15:1 No - TEX41:96 No - lnc-TARSL2-4:2 No - lnc-DNASE1-6:1 Yes chr2R:6633647-6636262 lnc-ZNF236-8:8 No - lnc-UBE2Q2L-6:2 Yes chr2L:21684106-21729051 lnc-TGFB2-1:1 No - TARID:5 Yes chr2R:17757405-17760517 lnc-KLF11-2:1 No - lnc-CNMD-2:3 No - TEX41:49 No - lnc-FOXD4L5-23:7 No - MIR22HG:20 No - MAGI2-AS3:14 No - lnc-AFDN-11:1 No - GAS8-AS1:3 Yes chrX:3491011-3504851 lnc-ESM1-1:17 No - lnc-OR4F29-1:30 No - lnc-TTC30B-1:11 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-RPS27A-1:23 Yes chr3L:3178930-3185287 LINC00294:1 No - lnc-PRMT6-3:7 No - lnc-SPPL2A-1:10 No - LINC01583:5 No - lnc-DPP4-2:15 No - LINC00955:5 No - PCBP1-AS1:195 No - RNASEH1-AS1:15 Yes chr2R:7931054-7932380 LINC01954:14 No - lnc-METTL5-4:107 Yes chr2L:7377702-7384344 ARHGEF26-AS1:5 No - lnc-PADI1-4:2 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-FAM50B-2:4 No - lnc-COL6A3-6:2 No - LINC01676:42 No - lnc-CDK2-5:1 No - LINC01943:5 No - NDUFA6-DT:42 No - lnc-PWWP2B-4:3 No - lnc-COL4A1-8:1 No - PROX1-AS1:14 Yes chr3R:11328480-11407627 PCBP1-AS1:206 No - lnc-ITPA-4:1 No - lnc-DTNA-6:1 No - lnc-COX8C-1:1 Yes chr3R:19230764-19246130 lnc-GEMIN4-1:2 Yes chrX:21026125-21028361 SATB1-AS1:69 No - MIR2052HG:4 No - lnc-MTRNR2L1-83:4 No - lnc-TTC27-10:1 Yes chr3R:10312039-10331353 TEX41:52 No - NFIA-AS1:9 Yes chr4:268175-276369 lnc-ERV3-1-10:17 No - lnc-C9orf66-15:12 Yes chr2L:94739-102086 lnc-ABHD12-6:1 Yes chr2L:2130813-2137296 SRD5A3-AS1:8 Yes chr2L:8305586-8306741 lnc-BANK1-2:2 Yes chrX:16554627-16560016 LINC01727:22 No - lnc-ZNF596-5:2 No - lnc-FOXD4L5-44:2 No - lnc-REM1-3:1 Yes chr2L:542786-544653 STX17-AS1:3 No - lnc-SLC5A9-2:4 No - NR2F2-AS1:19 No - TEX41:78 No - lnc-PELI1-1:2 No - lnc-PSMA2-1:11 No - lnc-TRIQK-1:2 No - LINC01206:41 No - lnc-EAPP-1:2 No - lnc-SIK1B-190:4 No - lnc-ZDHHC6-1:9 Yes chr3L:18878250-18890483 ZNF436-AS1:6 Yes chr2R:14173693-14182838 LINC01006:3 No - lnc-SLC38A3-6:1 Yes chr3L:6972750-6980044 lnc-NBPF11-1:41 No - lnc-VSTM2A-5:1 No - lnc-GPC6-7:1 Yes chr3L:8827505-8891192 lnc-RIN2-2:1 No - lnc-LMNTD1-1:1 No - lnc-FAM155A-2:1 No - lnc-LINC02203-26:1 No - lnc-NBPF20-21:1 No - SND1-IT1:5 Yes chr3L:259043-264380 lnc-HHIPL2-7:5 No - lnc-PCED1B-7:4 No - lnc-TK2-2:3 No - lnc-ULK1-2:1 Yes chr3R:20591024-20592671 lnc-SFTPC-2:8 Yes chr3R:24719697-24749125 lnc-ZBTB46-2:3 Yes chr3L:4259430-4261643 lnc-GALNTL5-2:8 Yes chr3R:21140739-21214269 LINC01694:22 No - lnc-PLPP2-1:1 No - LINC01348:2 No - lnc-NBPF11-1:39 No - lnc-NTSR2-8:1 No - lnc-METTL5-4:102 Yes chr2L:7377702-7384344 LINC00115:10 No - lnc-MYO7B-2:8 Yes chrX:16309817-16313138 lnc-COL4A1-2:10 No - MIR3936HG:10 Yes chr3L:21955110-21958041 lnc-SSH3-5:2 Yes chr3L:18870045-18872553 LINC01128:56 No - C21orf62-AS1:18 No - lnc-PELI2-11:1 No - lnc-GHRH-3:1 Yes chr3L:5565231-5566765 lnc-CCDC187-2:1 No - LINC00608:16 No - LINC01554:4 No - lnc-RPIA-25:1 No - TPT1-AS1:41 No - lnc-ABT1-1:2 No - LINC01176:16 No - lnc-UXS1-4:9 Yes chr2L:825969-833241 LINC00893:44 No - LINC00692:5 No - lnc-PDCD1-4:3 No - TEX41:93 No - TP53TG1:9 No - LINC01804:8 No - lnc-DPP4-2:16 No - MAMDC2-AS1:30 No - lnc-C2CD4B-13:5 Yes chr3L:8545001-8574409 lnc-CYB5R2-1:13 Yes chr2R:21798017-21799195 LINC01442:4 No - lnc-U2AF1L5-3:1 No - LNCARSR:19 No - lnc-EPB41L1-3:1 No - lnc-USP6NL-7:21 No - lnc-EDC3-2:22 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-SINHCAF-10:1 Yes chr3L:1537137-1544823 lnc-USP44-7:3 No - lnc-RHD-1:2 No - LBX1-AS1:4 Yes chr3R:21409979-21434133 lnc-TAF7-6:3 No - CARMN:21 No - lnc-KIF16B-1:2 No - lnc-ANKRD36B-3:5 No - PCBP1-AS1:111 No - LINC01753:4 No - IDH2-DT:19 No - lnc-MUC20-67:132 No - lnc-B3GNT10-21:22 No - lnc-TPTE-1:3 No - lnc-MIB2-4:2 No - lnc-ZNF644-1:16 No - lnc-SENP1-1:1 No - lnc-TBCCD1-4:26 No - lnc-ING1-4:1 No - TEX41:105 No - lnc-PDZD9-3:2 No - lnc-ACACA-50:1 Yes chrX:8756539-8805804 LINC01374:16 No - MME-AS1:2 Yes chr3R:27057908-27064199 CYTOR:114 No - lnc-OLFM4-6:2 No - SLC8A1-AS1:5 No - lnc-RLN3-2:1 Yes chr3R:10361760-10378068 SOX2-OT:5 No - NR2F2-AS1:26 No - LINC02339:5 Yes chr3R:14630478-14641776 PCBP1-AS1:192 No - lnc-ALG1L-2:29 No - lnc-PRMT6-3:8 No - lnc-MYO1E-3:1 Yes chr2R:22803521-22806948 lnc-C1QTNF8-6:1 No - lnc-DNAH14-2:1 No - lnc-ACP1-17:1 No - DANCR:12 No - lnc-TBX2-8:1 No - PAX8-AS1:26 Yes chr4:1088798-1113317 lnc-PIAS2-2:1 No - lnc-ANKRD20A3-51:7 No - ZNF436-AS1:8 No - LINC00458:7 No - lnc-SERPINB6-1:17 No - lnc-RAI1-2:2 Yes chr3L:9446864-9450785 lnc-PCSK6-3:3 No - lnc-POTEB3-16:1 No - HCP5:3 No - lnc-CROCC-10:1 No - lnc-MCTP2-7:6 No - VIPR1-AS1:27 No - lnc-CYP17A1-3:2 No - lnc-EDRF1-1:28 No - lnc-MMRN1-12:27 No - lnc-PPIAL4D-19:16 No - lnc-SLC16A11-7:20 No - AQP4-AS1:5 No - MALAT1:29 No - lnc-DAAM2-9:5 No - lnc-HPGDS-10:1 Yes chr2L:4830846-4835300 lnc-RYBP-10:1 No - lnc-CDS2-12:1 No - lnc-SIK1B-190:2 No - lnc-MUC20-67:88 No - lnc-EIF2AK3-4:79 No - lnc-CRYAA2-181:3 No - LINC01551:4 No - lnc-ALG1L-2:25 No - CYP1B1-AS1:5 Yes chr3L:5590083-5592571 VIPR1-AS1:34 No - RMDN2-AS1:13 No - PROX1-AS1:44 No - LINC00923:11 No - lnc-ANGPTL5-2:1 No - lnc-INO80D-10:8 No - lnc-ZNF74-6:5 Yes chr3R:31777020-31790681 lnc-TBCCD1-4:24 No - lnc-OR4F3-4:2 No - LINC01517:9 No - lnc-KLF17-1:22 No - lnc-ERN2-1:2 Yes chr3L:20309654-20313466 lnc-ERI1-2:13 No - lnc-HSDL1-4:1 Yes chr3L:21613797-21617376 PCBP1-AS1:94 No - SATB1-AS1:51 No - FAM242E:6 No - NDUFA6-DT:68 No - lnc-TMEM105-2:19 No - MALAT1:34 No - PCBP1-AS1:120 No - LINC01128:55 No - lnc-SLC11A2-5:1 Yes chr2R:10420414-10423650 INTS6-AS1:29 Yes chrX:5738663-5747254 lnc-MICAL3-2:2 No - lnc-SMIM11B-180:1 No - TEX41:82 No - LINC00472:41 No - LINC02227:5 No - lnc-PDGFA-6:5 No - lnc-RFC5-4:1 No - LINC01708:15 No - lnc-TBCCD1-4:37 No - LINC01011:5 No - lnc-ATG5-3:3 No - lnc-WWP2-5:1 Yes chrX:13624745-13664568 lnc-KATNB1-8:1 No - lnc-APBB1IP-1:18 No - lnc-GATA6-5:1 No - lnc-ERG-9:11 No - lnc-FOXL1-6:1 No - lnc-CBSL-165:7 No - lnc-NKX2-4-6:1 Yes chr2L:6908083-6911423 LINC02393:7 No - lnc-TNFAIP2-7:1 No - lnc-CASP9-7:2 No - lnc-UXS1-4:7 Yes chr2L:825969-833241 lnc-CLDN10-7:1 Yes chr3R:9586942-9589581 lnc-ZNF567-5:2 No - lnc-SLC35C1-83:5 No - lnc-ATIC-8:12 No - ZRANB2-AS2:18 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-CASC1-3:1 No - lnc-AQP2-2:2 No - lnc-GRAPL-3:1 No - lnc-SMIM23-3:1 No - lnc-GALR1-5:1 No - lnc-TBCCD1-4:43 No - lnc-METTL5-4:164 Yes chr2L:7377702-7384344 DIO3OS:11 No - LINC01388:12 No - lnc-CPN2-4:38 No - LINC01128:69 No - lnc-HIVEP2-5:4 No - lnc-UCK1-3:2 No - RMDN2-AS1:17 No - ZNF561-AS1:6 No - lnc-GNAT3-1:23 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-UBL5-8:1 No - lnc-FBXO31-11:1 No - ACTA2-AS1:1 Yes chr3R:30456441-30459300 lnc-HARS-6:2 Yes chr3R:16484566-16495422 DARS-AS1:32 No - lnc-OR4F21-5:2 No - lnc-NBPF11-1:34 No - lnc-IDI2-4:2 Yes chr2R:9396265-9398734 lnc-DIAPH2-16:3 No - lnc-SPATA31A7-9:1 No - lnc-KNOP1-5:1 Yes chr3R:8732091-8735837 CFLAR-AS1:19 No - lnc-EYA1-2:9 Yes chr2L:6527447-6546976 lnc-ATP11A-5:1 No - lnc-ABHD4-4:2 No - lnc-GGTLC3-3:1 No - CCDC144NL-AS1:21 No - lnc-FAT3-1:2 No - lnc-ARID4A-3:2 No - LINC01435:21 No - lnc-C7orf57-2:2 Yes chr3R:4808336-4812096 LINC01002:15 No - lnc-USP34-1:11 No - lnc-ZFP37-1:3 No - lnc-ICE2-5:3 Yes chr2R:10203995-10237348 lnc-MUC20-67:36 No - LINC00963:24 No - lnc-MUC20-67:133 No - TARID:6 Yes chr2R:17757405-17760517 DPYD-AS1:3 Yes chrX:9196808-9201820 lnc-C9orf66-15:24 Yes chr2L:94739-102086 MAMDC2-AS1:31 No - MALAT1:22 No - TEX41:37 No - PKP4-AS1:7 Yes chr2R:4595288-4609492 lnc-USP12-9:2 No - lnc-LRRC53-1:2 No - lnc-GATA5-10:1 Yes chr2L:6625138-6632407 HCG9:2 No - lnc-CPN2-4:33 No - lnc-NRIP1-2:9 No - EMX2OS:14 No - lnc-GALNT14-3:1 No - lnc-TMEM243-1:12 No - lnc-DGCR2-3:2 No - lnc-RD3L-1:5 No - NIPBL-DT:13 No - lnc-RNF135-1:21 No - lnc-CHD1L-5:1 Yes chr2R:6642418-6645098 lnc-CCDC78-4:1 No - lnc-SGMS1-4:1 No - lnc-ZFP36L1-9:1 No - LINC01351:12 No - LINC01503:14 No - lnc-KCNE1B-5:3 No - LINC02055:16 No - lnc-MATN2-2:2 Yes chr2L:19008031-19009306 lnc-SEMA4D-4:2 No - lnc-TAF3-1:8 Yes chr3R:8147368-8181444 lnc-PCM1-4:8 No - lnc-TMEM30B-1:5 Yes chr3R:29039156-29049148 lnc-LIPI-24:1 No - lnc-DTYMK-7:2 No - lnc-SAMD11-12:2 No - lnc-PPP1R3C-4:1 No - lnc-MGAT2-1:2 No - PCAT1:66 No - lnc-SETD7-3:11 No - FAM182A:33 No - lnc-ZNF705B-5:1 No - lnc-SAMD11-13:2 No - lnc-ZSCAN25-2:1 Yes chrX:21517434-21519218 lnc-CHMP7-1:6 No - lnc-MRPS22-1:18 No - TUG1:13 No - lnc-NR1I2-1:15 No - lnc-HIST1H2BH-1:1 No - lnc-TNK2-5:2 No - lnc-LRRC49-15:1 No - lnc-SETD6-20:1 No - lnc-EMC3-3:7 Yes chr3R:20810804-20816190 TUG1:7 No - lnc-FAM90A1-1:11 No - lnc-MERTK-5:1 No - PCAT6:3 No - lnc-FOXD4L5-35:3 No - lnc-GSTM2-1:2 No - TRAF3IP2-AS1:16 No - lnc-CYP2E1-13:1 No - lnc-DDIT4L-4:1 No - lnc-MLLT6-1:2 No - lnc-ARID3B-1:2 No - lnc-CCDC74A-7:5 No - lnc-PPM1D-1:4 No - lnc-CTNNA2-3:3 No - lnc-POLE4-7:1 No - lnc-NEMF-4:1 Yes chr2R:15322501-15325490 lnc-HMX1-5:7 No - UBA6-AS1:2 No - lnc-NAGLU-1:2 No - lnc-OSBPL10-6:1 No - MALAT1:24 No - lnc-VCX-6:1 No - lnc-FPGT-13:1 No - lnc-TMEM14A-1:7 No - lnc-C12orf73-5:1 No - lnc-CCAR2-2:11 Yes chr2L:12707661-12708680 TMEM161B-AS1:20 Yes chr3L:11109690-11112117 ZFPM2-AS1:13 No - lnc-UBE2K-2:5 No - lnc-EFCAB8-1:3 No - lnc-NXPH1-9:1 No - lnc-CNPY3-3:1 No - lnc-DPP4-10:1 Yes chr2L:7223328-7249343 lnc-RNF223-1:2 No - lnc-SLFN5-3:1 No - CCNT2-AS1:5 No - lnc-PLGLB1-9:1 No - lnc-ZNF106-5:1 No - lnc-NCOA3-7:4 No - JPX:19 No - SNHG17:4 No - lnc-LPCAT1-4:1 No - lnc-BDH1-5:12 No - lnc-AAMP-2:2 Yes chr2L:20417057-20423027 UBL7-AS1:7 No - lnc-STC2-1:5 No - lnc-PAX8-6:2 Yes chr2R:15562697-15565801 lnc-EPS15-2:3 No - SNHG21:1 No - lnc-PABPC3-1:3 No - lnc-PCNX1-1:1 No - lnc-ZNF717-4:9 No - lnc-PBDC1-3:1 No - lnc-PRMT6-15:1 No - lnc-KBTBD2-2:11 No - lnc-BOLA3-5:1 No - KLF3-AS1:14 No - PVT1:7 No - lnc-ACE-5:1 No - lnc-IRX3-80:55 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-TMEM234-3:13 No - lnc-RASSF8-2:1 No - lnc-NETO1-1:19 No - lnc-BBC3-2:1 No - lnc-DRD5-16:4 No - lnc-EFCAB12-2:9 No - lnc-RPLP1-12:20 No - NALT1:1 No - lnc-OR4F16-15:7 No - SNHG6:3 No - lnc-ZNF273-4:3 No - lnc-PEX7-2:4 No - lnc-LARP1B-1:12 No - lnc-CT62-3:1 No - lnc-MAP3K9-3:18 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-MRPL11-1:9 No - LINC02041:6 No - lnc-CEMP1-1:7 No - lnc-C17orf80-7:1 No - lnc-CDK2AP1-1:8 Yes chr2R:16291453-16292269 lnc-PSMB9-6:6 No - lnc-COL28A1-1:13 No - lnc-CYTIP-2:1 No - lnc-GTF2H2-7:8 No - lnc-CD8B2-12:2 No - lnc-PCNX1-2:1 No - lnc-SRRD-1:5 No - lnc-CHD2-21:1 No - lnc-MALRD1-11:1 Yes chrX:10348680-10366273 NUTM2B-AS1:8 No - lnc-ATAD5-9:3 No - lnc-ETFA-6:1 No - lnc-ST3GAL1-6:1 No - MIR99AHG:102 No - lnc-COL22A1-5:1 No - lnc-TIMP3-10:2 No - lnc-ZFAND4-2:3 No - lnc-ZCCHC7-2:14 No - lnc-CNPY1-10:12 No - lnc-POTEH-7:8 No - ZFHX4-AS1:8 No - MIF-AS1:5 No - lnc-TMEM114-8:1 No - lnc-GATA3-20:2 No - lnc-EZH2-7:5 Yes chr2R:7916856-7921579 lnc-MESD-2:1 No - LINC01572:9 No - lnc-MED13-3:2 No - lnc-ACOX3-1:4 No - lnc-METTL22-12:1 No - RAB30-AS1:12 No - PPP1R26-AS1:6 No - SNHG1:6 No - lnc-DENND3-2:4 No - ZFHX4-AS1:10 No - lnc-GABBR1-1:2 No - lnc-NPIPB3-2:3 No - lnc-AK6-6:7 No - LINC00205:10 No - lnc-ZNF716-26:1 No - LINC02593:31 No - lnc-INSIG1-3:3 No - LINC02335:8 No - lnc-CADM2-16:1 No - MIR4713HG:8 No - lnc-SUMO1-7:3 No - lnc-MAP7-1:3 No - RAD51-AS1:6 Yes chr3R:30054696-30056037 lnc-CCDC80-4:1 No - LINC00839:7 No - lnc-TMBIM4-6:1 Yes chrX:5966279-5986699 lnc-PPP4R3A-1:1 No - CCDC18-AS1:7 No - lnc-PPA2-4:3 No - lnc-DIP2A-7:1 No - lnc-CHMP7-1:7 No - lnc-BCAS1-5:1 No - lnc-PPP1R14B-1:4 No - lnc-DPP7-2:2 No - lnc-RLF-6:1 No - ZFAS1:10 No - lnc-SVIL-7:1 No - lnc-TP53TG3-45:2 No - lnc-SZRD1-5:2 Yes chr2R:22174922-22177428 lnc-POLR2F-2:4 Yes chr3L:8989069-8990228 NUP50-DT:31 No - lnc-PRMT6-13:3 No - lnc-IRX3-80:51 Yes chr3L:12609631-12710249 DHRS4-AS1:13 Yes chr3L:5140440-5141646 LINC01389:1 No - lnc-GPRIN1-3:1 Yes chr3R:25224156-25232321 lnc-HIP1-1:10 No - LINC00665:4 No - LINC02246:26 No - lnc-PAWR-1:5 Yes chr2L:2772327-2799979 lnc-EGLN1-1:10 No - lnc-POLE4-8:2 No - lnc-LRRC8D-9:1 No - lnc-NAIP-2:5 No - lnc-NDUFS6-2:3 Yes chr3L:12693639-12710249 lnc-EEF1AKMT1-3:6 No - DCST1-AS1:26 Yes chr3L:13174478-13176781 lnc-SYNE2-3:2 No - lnc-NAA35-6:8 No - lnc-SCO1-1:3 Yes chr2L:4967832-4968935 lnc-LY9-3:1 No - lnc-RABIF-1:4 No - lnc-WDR73-17:1 No - lnc-ZNF335-1:1 No - lnc-DNAJC8-1:6 No - lnc-NCAPG2-2:2 No - DDX11-AS1:2 No - lnc-PRMT6-12:1 No - lnc-TRIM39-2:3 No - lnc-ZNF782-1:1 Yes chr3L:3128034-3143457 lnc-CLASP2-1:16 No - lnc-CTNND2-1:3 No - lnc-HLA-B-2:5 No - MMP25-AS1:3 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-UBE2I-5:1 No - lnc-GGCT-1:52 No - lnc-PSMB9-6:10 No - lnc-LRRC74B-3:6 No - lnc-TRAF5-12:1 No - LINC01725:30 No - lnc-NBN-1:20 No - LINC02476:25 No - PCAT1:53 No - lnc-SGCG-6:3 No - LINC01135:9 No - lnc-CLASP2-9:1 No - lnc-CHD2-22:1 No - lnc-MROH1-1:2 No - lnc-UTS2-5:6 Yes chr2R:9446046-9480076 RPARP-AS1:9 No - lnc-SPATA9-1:3 No - RUNDC3A-AS1:8 No - lnc-ZNF8-2:2 No - lnc-ZNF705D-2:29 No - lnc-SRPK2-1:14 No - CASC9:12 No - lnc-HPS3-3:3 No - lnc-HMGB2-16:1 Yes chr2L:3470182-3472364 lnc-USP6-4:5 No - lnc-SLC6A12-6:7 No - lnc-MED21-1:3 Yes chr3L:25114924-25115946 lnc-STK3-2:3 No - PCBP1-AS1:180 No - lnc-RHBDD3-3:2 No - lnc-ZNF253-2:8 No - lnc-NTN1-2:3 No - BAALC-AS1:7 No - FOXD3-AS1:2 Yes chr2R:22868159-22870706 lnc-ZNF33B-7:3 No - lnc-PTK6-1:2 No - SNHG26:41 No - lnc-AGA-6:1 No - FAM111A-DT:32 No - lnc-LRP5-1:5 No - LINC00115:6 No - lnc-CAGE1-1:4 No - ERICD:5 No - lnc-URGCP-2:8 No - lnc-SCNN1B-1:5 No - lnc-B3GNT10-21:5 No - lnc-ZNF91-4:19 Yes chr3R:11674920-11678116 TMEM9B-AS1:5 No - lnc-YBEY-6:2 No - RNASEH1-AS1:9 Yes chr2R:7931054-7932380 lnc-SLC39A6-1:3 Yes chr2R:10645735-10648634 lnc-RGPD1-7:1 No - lnc-PRKX-11:1 No - lnc-PRSS57-1:1 Yes chr2R:15223560-15241589 lnc-PDZD7-3:11 No - lnc-ZG16B-4:1 No - lnc-LCMT1-4:3 No - lnc-SAXO2-3:1 No - lnc-TNK2-2:7 No - HLA-F-AS1:3 No - lnc-RABL2A-7:2 No - PAX8-AS1:29 Yes chr4:1088798-1113317 lnc-LRRTM2-1:3 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-CCAR2-2:5 Yes chr2L:12707661-12708680 LINC02568:19 No - lnc-NAIP-2:6 No - lnc-FAM162A-2:8 No - lnc-CEMP1-1:6 No - ZFAS1:11 No - lnc-KCTD19-1:2 Yes chr2L:21104568-21134255 lnc-KLRB1-12:6 No - SNHG7:8 No - lnc-NUPR2-12:1 No - NUTM2A-AS1:24 No - lnc-PERM1-1:1 No - THRB-AS1:4 Yes chr2R:6087873-6169087 ZNF236-DT:18 No - DIO3OS:13 No - lnc-RBM12B-4:2 Yes chr2L:12424904-12426440 lnc-ABHD12-4:3 No - lnc-TMEM248-4:10 No - lnc-NPIPA7-4:1 No - lnc-NBPF1-7:1 No - lnc-PTS-1:19 No - lnc-ZNF124-2:3 No - lnc-RHEX-8:4 No - lnc-CXorf40B-3:1 No - lnc-USP14-2:5 No - LINC02361:9 No - TDRKH-AS1:21 Yes chr2L:2220748-2225544 lnc-E2F6-9:1 No - MIR4713HG:9 No - lnc-PRRT3-3:1 No - lnc-ARRDC2-3:1 No - lnc-PLEKHM1-11:1 No - MIR4453HG:13 No - lnc-PDGFA-17:5 No - lnc-CORIN-1:2 No - lnc-VSTM5-5:1 No - lnc-TTC21A-1:4 No - lnc-SPCS2-3:7 No - lnc-CWC27-6:1 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-MGAT1-4:9 No - lnc-CD47-10:1 No - RNF139-AS1:9 No - lnc-RPLP1-12:21 No - lnc-RHEX-7:3 No - lnc-ANXA2R-1:21 No - lnc-ADAM21-3:3 No - lnc-NPIPB4-7:1 No - lnc-B3GNT10-4:2 No - BAALC-AS1:6 No - lnc-SGCG-5:6 No - lnc-C3orf58-10:1 No - lnc-IL11-1:1 No - lnc-HOXC4-1:3 No - NCK1-DT:20 No - ZNF236-DT:19 No - SNHG21:10 No - lnc-CELA3A-5:9 No - lnc-SPPL2A-2:1 No - lnc-TP53TG5-5:3 Yes chrX:8404535-8407263 lnc-KCNE1B-10:2 No - lnc-TMUB2-1:5 No - lnc-RPRML-3:26 No - MIR22HG:27 No - lnc-SRRM2-1:3 No - lnc-IRX3-80:49 Yes chr3L:12609631-12710249 LINC01003:3 No - lnc-ALOX15B-3:1 No - lnc-OPCML-3:13 Yes chr3L:5424109-5442399 RMST:2 No - LINC01116:3 No - NUTM2B-AS1:53 No - lnc-SLC6A9-2:13 No - LINC01278:5 No - NCK1-DT:36 No - lnc-MMRN1-12:28 No - lnc-PRDM9-16:1 No - lnc-TRIM37-2:1 Yes chr2L:18700606-18703105 lnc-LRP5L-14:1 No - RPARP-AS1:13 No - lnc-B3GNT5-11:13 No - lnc-TSHZ2-19:1 No - lnc-GRAP2-2:1 No - lnc-RHEX-6:1 No - lnc-ZNF746-3:11 No - lnc-DYNC1H1-1:4 No - lnc-FAM174B-1:6 No - LINC02163:6 No - lnc-MZT2B-5:1 No - ZBED5-AS1:5 No - lnc-KLF17-1:13 Yes chr2R:23820354-23839864 lnc-CD38-3:4 No - lnc-DCAF12L2-2:1 No - lnc-PPP2R5B-5:3 No - lnc-NOL4-6:1 Yes chr2R:12437345-12452916 lnc-ADAM21-5:1 No - lnc-EGLN2-2:1 Yes chr3R:5257037-5269507 lnc-ROBO3-2:8 No - lnc-TNMD-3:1 No - lnc-NOP9-1:2 No - SNHG1:7 No - lnc-SYCP1-2:2 No - lnc-E2F6-7:1 No - PAXIP1-AS1:11 No - lnc-CADM2-5:3 No - DLEU1:37 No - LINC01166:5 No - lnc-TMEM248-2:3 No - lnc-ZNF627-2:8 No - lnc-PPEF1-6:1 No - lnc-CADM2-5:4 No - LINC01762:49 No - lnc-KPNA2-6:16 No - lnc-ALOX12-4:1 No - ZNF674-AS1:6 No - lnc-COL6A3-13:1 No - lnc-ZNF514-11:1 No - lnc-GTF2IRD2-5:1 No - PCAT6:2 No - lnc-ZNF484-3:1 No - lnc-OTOL1-12:1 No - lnc-DCAF12L2-4:1 No - LINC02198:17 No - lnc-ERCC6L2-14:1 No - lnc-P2RY2-11:1 No - lnc-IRX3-80:16 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-MPP7-9:1 No - lnc-PRMT6-16:1 No - JPX:50 No - lnc-PDCD2-1:2 No - lnc-TENM3-3:6 No - lnc-LRTM2-7:1 Yes chr2R:13805794-13819571 lnc-CLN8-2:4 No - lnc-IBTK-9:1 Yes chr3R:11822702-11869460 FGD5-AS1:5 Yes chr3L:21494019-21497494 lnc-SLC39A11-10:6 No - lnc-DDX53-3:1 No - lnc-FBXL16-3:1 No - MIR503HG:1 No - LINC00630:8 No - lnc-TOP1-4:3 No - LINC00648:1 No - TPT1-AS1:20 No - LINC00235:4 No - lnc-LIPI-25:1 No - PCBP1-AS1:177 No - LINC00909:8 No - lnc-GLRX2-1:2 No - lnc-TMEM99-5:3 No - lnc-HIST2H3PS2-3:12 No - lnc-OLFML3-6:2 No - lnc-IRX3-80:1 Yes chr3L:12693639-12710249 lnc-CYP24A1-5:1 No - lnc-CCT8L2-2:2 No - lnc-ZNF124-1:2 No - lnc-CLASP2-1:7 Yes chr3R:27696466-27700110 MIR200CHG:12 No - LINC02343:17 No - lnc-GATA3-7:3 No - lnc-SULF2-11:3 No - LINC01355:3 Yes chr3R:20756729-20810726 lnc-NPY4R2-569:1 No - PSMA3-AS1:8 No - lnc-ANGPT1-3:1 No - lnc-ZNF736-7:1 No - lnc-RTP5-9:2 No - SCAMP1-AS1:2 No - lnc-ZNF486-13:1 No - LINC01184:22 No - lnc-TICRR-6:1 No - lnc-EPS15-2:4 No - lnc-VIRMA-1:7 No - LINC01137:4 No - LINC00963:6 No - lnc-TIPIN-4:1 No - lnc-F13B-3:1 No - lnc-DRD2-1:5 Yes chrX:4132887-4206093 ZFPM2-AS1:14 No - lnc-ATP5F1A-4:1 No - lnc-POTEB2-2:4 No - lnc-RUBCN-2:4 No - LINC00685:3 No - lnc-SLC38A8-2:7 No - LINC01508:1 No - lnc-ZNF706-2:3 No - PTOV1-AS1:5 Yes chr3R:24227023-24228538 lnc-HLA-DRB5-1:2 No - lnc-PARG-1:3 No - LINC02484:10 No - lnc-MAP3K9-3:16 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-NPIPB4-6:1 No - CBR3-AS1:13 No - lnc-FKBP6-3:2 No - FIRRE:8 No - lnc-S100A16-3:1 No - lnc-SOD1-3:3 Yes chr3L:5657913-5749599 lnc-CASKIN2-1:5 No - lnc-ADAMTS12-2:5 No - DNAJC27-AS1:6 No - lnc-OTOGL-1:5 Yes chr3L:16051959-16082026 GMDS-DT:74 No - lnc-KCNT2-6:1 No - lnc-FCGR1A-1:2 Yes chr2L:21418112-21418706 lnc-SRP54-9:1 No - lnc-LAT-2:1 No - lnc-CD40LG-2:8 No - lnc-C8orf86-8:1 No - lnc-SEPT7-3:4 Yes chr2L:7796314-7800058 LINC02241:11 No - lnc-EIF3A-2:2 No - SPINT1-AS1:17 No - CKMT2-AS1:9 Yes chr2R:22825093-22828903 lnc-NPIPB4-5:6 No - lnc-RMND1-2:1 No - lnc-C19orf48-5:1 Yes chr3L:19492053-19497723 lnc-GAS2L2-2:2 Yes chrX:16288810-16293520 lnc-GATA3-25:1 No - lnc-DERL3-5:1 No - SNHG5:12 No - lnc-CNOT6-4:4 No - NDUFV2-AS1:3 No - lnc-RPIA-29:1 No - LINC02506:13 No - lnc-CBR3-2:2 No - lnc-SCO1-1:2 Yes chr2L:4967832-4968935 lnc-HHAT-2:2 No - lnc-PCSK5-4:1 No - lnc-USP34-1:10 No - lnc-UHRF1-5:2 Yes chr3R:15079320-15095631 lnc-SLC2A10-13:1 No - lnc-NCALD-1:2 Yes chr2R:17801132-17842820 LINC00992:4 No - lnc-ZNF200-1:2 No - UBR5-AS1:4 Yes chr3R:9714623-9725615 lnc-MPP7-10:1 No - lnc-RNF135-1:22 No - lnc-RPS17-5:1 No - lnc-PSD3-5:1 No - LINC02591:15 No - lnc-FOXG1-16:1 No - lnc-VGLL3-11:1 No - HLA-F-AS1:9 No - lnc-EXOSC6-1:7 No - lnc-RBMS2-4:1 No - lnc-CCDC74A-7:1 No - lnc-ZFAND4-2:4 No - lnc-THOC5-3:1 No - lnc-RCC1-6:1 No - LINC00665:22 No - MIR3936HG:21 No - lnc-IGSF9B-3:2 No - lnc-FAM90A1-1:12 No - lnc-CTNNA2-3:5 No - lnc-C17orf62-1:3 No - lnc-HRASLS-2:3 No - lnc-VN1R2-5:3 No - lnc-CCDC117-1:8 No - NUTM2B-AS1:1 No - lnc-MAN2C1-6:2 No - lnc-ZNF746-3:12 No - lnc-MYOC-2:3 Yes chr2R:6642418-6645098 LRRC75A-AS1:54 No - lnc-EMCN-3:5 No - lnc-ZNF738-6:1 No - LINC01128:68 No - lnc-CCNB1IP1-3:1 No - lnc-MTG1-2:1 No - lnc-PSMB9-6:8 No - lnc-GDF11-1:2 Yes chr2L:21344607-21358271 lnc-RDH13-1:9 Yes chr3R:18378124-18381178 lnc-LRRC74B-6:3 No - lnc-SOWAHB-5:9 No - BFSP2-AS1:5 No - lnc-DERL3-5:2 No - lnc-MAGEC1-1:1 No - lnc-CD38-3:5 No - lnc-PLGLB1-9:2 No - lnc-CDRT15L2-8:2 No - lnc-TRPC3-2:3 No - lnc-ACOX3-7:1 No - HECTD2-AS1:3 No - lnc-DHX38-27:4 No - lnc-SURF6-2:1 No - lnc-DNAJC21-3:1 No - lnc-MBP-16:2 No - lnc-VPREB1-7:14 No - lnc-TP53TG5-5:1 Yes chrX:8404535-8407263 RUNDC3A-AS1:1 Yes chr3R:27229505-27239085 PTPRG-AS1:14 Yes chr3R:29377646-29487131 MIR4713HG:11 No - lnc-TRIM16L-2:1 Yes chr2R:13984815-13990707 lnc-FOXD4L5-18:1 No - lnc-SBDS-15:2 No - lnc-ZSCAN10-3:25 No - lnc-ZNF169-7:10 No - lnc-TINCR-1:11 No - LINC01184:7 No - LAMTOR5-AS1:38 No - lnc-NPIPB4-5:2 No - lnc-STMND1-4:12 No - lnc-ZNF273-4:4 No - lnc-LMNTD2-3:6 No - LINC01000:15 No - NEAT1:15 No - lnc-ALYREF-1:2 No - lnc-IMP4-11:1 No - lnc-GRM7-2:7 No - lnc-AKR7A3-1:2 No - lnc-BLZF1-2:4 No - NUTM2A-AS1:2 No - lnc-ZKSCAN3-2:1 No - lnc-GDAP2-3:2 Yes chr2R:7716807-7782637 lnc-PPP1R3G-9:2 No - LINC00106:14 No - lnc-RAB23-53:9 No - TUG1:14 No - TRAM2-AS1:3 No - NRSN2-AS1:30 No - PVT1:1 No - HOTAIRM1:2 No - lnc-KMT5A-1:26 No - lnc-HBEGF-2:6 Yes chr2L:7223328-7249343 CCDC18-AS1:32 No - lnc-B3GNT10-21:6 No - lnc-OPCML-3:14 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-EIF1AD-4:1 No - HAGLR:24 No - lnc-COL28A1-1:14 No - lnc-RNF26-1:3 No - ZNF710-AS1:7 Yes chr3R:15348048-15350391 lnc-GOLGA8O-3:3 No - lnc-MYO18A-4:1 No - ELOVL2-AS1:10 No - SNHG12:4 Yes chr2L:4453169-4454453 SRRM2-AS1:11 No - lnc-POTEM-3:4 No - lnc-NPIPA7-13:1 No - MINCR:7 No - LINC00665:2 No - SNHG26:37 No - lnc-RNF135-1:28 No - lnc-ERICH1-19:7 No - TBX2-AS1:17 Yes chrX:11816898-11837460 lnc-CCDC74A-6:3 No - lnc-NPIPB12-2:3 No - lnc-LRRC37A2-3:1 No - PCAT1:1 No - MIR9-3HG:17 No - lnc-IRX3-11:1 No - lnc-R3HCC1L-8:5 No - lnc-TMEM30B-1:6 Yes chr3R:29039156-29049148 lnc-ZNF565-2:1 No - lnc-IGIP-1:3 Yes chr4:558016-567257 lnc-KDELR1-2:1 Yes chrX:1483625-1507809 lnc-TP53TG3-23:1 No - LINC00592:13 No - lnc-RGPD1-6:1 No - lnc-CST7-1:4 No - lnc-WDR73-5:12 No - lnc-BACE2-1:2 No - lnc-MRPS22-1:17 No - lnc-GRIP1-1:3 Yes chrX:5966279-5986699 lnc-TMEM114-9:1 No - lnc-COL28A1-1:12 No - MAPK6-DT:10 No - lnc-POLDIP3-3:1 Yes chr3L:2167550-2169108 DICER1-AS1:9 Yes chr3R:22734007-22741091 lnc-GBP5-11:2 No - LINC00571:2 No - lnc-ZSCAN20-4:1 No - lnc-PPP4R1-2:7 No - lnc-PMS1-2:1 No - PSMG3-AS1:7 No - LINC00476:14 No - lnc-CTNND2-1:4 No - LINC02506:9 No - lnc-LRRC3-8:3 No - UBL7-AS1:8 No - PDCD4-AS1:3 No - lnc-RPS5-3:1 No - lnc-HIST1H2BJ-8:3 No - lnc-DCAF12L2-5:1 No - TUG1:15 No - lnc-NFRKB-4:1 No - lnc-GBE1-12:1 No - SNHG11:21 No - LINC00992:8 No - lnc-IRX3-7:1 No - lnc-SCN2A-6:8 No - CCDC18-AS1:5 No - lnc-OR4F6-5:3 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-PSMC3IP-3:14 No - lnc-SPRED2-21:1 No - lnc-SERINC1-6:1 Yes chr3L:9787046-9808713 lnc-NPIPB13-3:1 No - lnc-SAYSD1-3:3 No - lnc-MRPL57-5:7 No - lnc-OLFM4-15:1 No - LINC01239:1 No - lnc-FNDC10-1:5 Yes chr2L:19034444-19041541 lnc-CPVL-4:5 Yes chrX:5616572-5618806 lnc-SMDT1-3:41 Yes chr2R:18094940-18101031 lnc-UBE2I-4:1 No - CYTOR:124 No - lnc-ZFP57-16:2 No - lnc-ACO1-8:1 No - lnc-GGTLC2-11:1 No - PTPRG-AS1:9 Yes chr3R:29377646-29487131 lnc-TMEM70-4:2 No - lnc-TFAP2C-6:2 No - lnc-KPNA2-6:25 No - lnc-ZNF654-3:3 Yes chr3L:206134-207527 PCAT1:54 No - lnc-SEC11A-6:11 No - NIFK-AS1:1 No - lnc-MGARP-3:1 Yes chr3L:17558672-17619325 lnc-PGS1-1:20 No - lnc-LYZL1-15:5 No - lnc-SPATA21-4:8 No - lnc-NBN-1:17 No - RNASEH1-AS1:11 Yes chr2R:7931054-7932380 lnc-ZNF654-3:2 Yes chr3L:206134-207527 lnc-YES1-11:1 No - MORF4L2-AS1:3 Yes chr3R:15276440-15278109 lnc-EIF2AK3-30:2 No - LINC01000:3 No - JPX:1 No - lnc-ATP2B3-1:5 Yes chr3R:18403026-18404726 lnc-CANX-1:7 No - ID2-AS1:13 No - lnc-B4GALNT3-2:6 Yes chr3R:12695129-12697379 LIFR-AS1:1 No - lnc-TMEM206-5:14 No - lnc-E2F6-10:1 No - lnc-NAA35-6:9 No - lnc-ANKRD20A2-22:6 No - lnc-ADAMTS12-6:1 No - lnc-UTS2-5:8 Yes chr2R:9446046-9480076 KANSL1-AS1:3 Yes chr3R:15793782-15802102 ZEB1-AS1:8 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-POLE4-8:3 No - lnc-TMEM14A-1:6 No - lnc-FAM153C-5:6 No - lnc-TRIM43-7:4 No - lnc-HIST2H3PS2-14:2 No - LINC01106:11 No - lnc-USP6-4:6 No - lnc-RAPH1-6:3 No - MIR4458HG:5 No - lnc-EFCAB12-2:11 No - RNASEH1-AS1:10 Yes chr2R:7931054-7932380 lnc-NCOA3-23:2 Yes chr3R:16310542-16339575 JPX:2 No - lnc-GCNT1-7:1 Yes chr3R:7912017-7913290 lnc-USP16-14:1 No - lnc-YBEY-6:3 No - lnc-RHOXF1-3:7 No - PCBP1-AS1:182 No - lnc-RABIF-1:5 No - LINC00115:35 No - lnc-OSBPL9-8:1 No - ENTPD3-AS1:6 No - lnc-NLRP3-1:6 No - lnc-SEMA4D-1:2 No - RGMB-AS1:1 No - lnc-FSCB-11:1 No - lnc-REL-6:1 Yes chr2L:17436830-17450364 lnc-IMPG1-2:1 No - lnc-CRYBA4-52:54 No - lnc-TMEM105-2:28 No - lnc-ANKRD54-3:3 Yes chr2L:14599196-14689340 lnc-FAM84B-18:2 No - lnc-FANCC-1:10 No - lnc-ROBO3-2:7 No - lnc-NUPR2-13:1 No - LINC02568:12 No - lnc-EMP2-3:2 Yes chr2R:10800420-10808938 lnc-RFC3-10:1 No - lnc-MRPL14-1:2 No - lnc-IRX3-6:2 No - lnc-TUBA3C-22:1 No - LINC02246:27 No - LINC01184:6 No - lnc-COL22A1-5:3 No - lnc-SYCP1-4:1 No - lnc-ITGB8-2:9 No - lnc-YEATS4-6:1 No - PPP1R26-AS1:10 No - lnc-PROC-1:9 No - lnc-MORC2-7:1 Yes chr3R:24934869-24938222 lnc-C3orf58-9:2 No - lnc-GATA3-23:1 Yes chr3R:8147368-8181444 lnc-HPD-2:2 Yes chrX:9356634-9358594 lnc-SEPT14-6:1 No - lnc-BAHCC1-3:1 Yes chr3R:22710883-22721150 lnc-VSTM2B-9:29 No - lnc-ATXN1-9:1 No - lnc-PRMT6-13:2 No - GCC2-AS1:3 Yes chr3R:12010772-12015059 LINC01239:8 No - lnc-TXN2-3:1 No - lnc-SRRD-1:6 No - lnc-ZNF136-2:1 No - MIR4435-2HG:24 No - lnc-ABT1-3:14 No - lnc-RBM15-3:2 Yes chr2R:11845324-11852324 MAN1B1-DT:7 No - lnc-METRNL-9:1 No - lnc-ATAD5-9:4 No - OSER1-DT:46 No - lnc-P2RY6-1:3 No - lnc-CHCHD6-5:2 No - lnc-GNS-5:1 No - lnc-FAM160A1-1:3 Yes chr3R:24128049-24130255 lnc-MAGOHB-1:5 No - lnc-TSHZ2-15:1 No - CYTOR:84 No - FSIP2-AS1:3 No - lnc-HAO2-2:21 No - lnc-IRX3-80:29 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-ECD-2:3 No - lnc-CALML5-8:1 No - lnc-TMEM74B-3:1 Yes chr2R:11967343-11970115 lnc-PDCD2-1:3 No - GAS5:25 No - lnc-NOL10-4:1 No - lnc-RNF187-1:3 No - lnc-MFSD6-1:4 No - lnc-ZNF33B-4:17 No - GLIDR:5 No - lnc-A1BG-2:4 No - lnc-POMT1-3:1 No - NUTM2B-AS1:2 No - lnc-KRCC1-4:1 No - lnc-GOLGA8Q-4:2 No - lnc-NUPR2-8:4 No - lnc-TLE3-5:2 No - lnc-B4GALNT3-4:2 Yes chr3R:12695129-12697379 KDM7A-DT:11 No - MALAT1:8 No - lnc-ETFBKMT-8:3 No - NUP50-DT:29 Yes chr2R:8123036-8125058 lnc-AHCY-6:1 No - lnc-TRIM26-2:35 No - GASAL1:31 No - APTR:5 No - lnc-AGO2-2:6 No - lnc-MACROD1-1:9 Yes chr2L:295122-297449 lnc-MAP1LC3B2-28:15 No - lnc-NCAPG-1:1 No - lnc-MZT2A-19:1 No - lnc-ANGPT1-2:1 No - lnc-RPL39L-3:1 Yes chr2R:24691422-24694386 NUP50-DT:32 No - LINC00592:14 No - CYTOR:85 No - LINC02001:13 No - lnc-GRHL2-11:2 No - WAC-AS1:8 No - TMEM132D-AS1:20 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-GLRX-2:2 No - NEAT1:18 No - lnc-ZNF2-1:3 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-SERF1B-5:1 No - lnc-RRP8-6:1 No - lnc-WIPF3-1:5 No - lnc-DNAAF5-3:6 No - lnc-IGLL1-1:21 No - lnc-COIL-8:1 Yes chr3R:25516118-25608423 SPINT1-AS1:18 No - lnc-INSIG1-2:2 No - lnc-PPIC-1:3 No - lnc-IGFBP4-4:1 No - lnc-MTMR10-2:1 No - lnc-GLIS2-7:1 No - lnc-CRABP2-3:1 No - LINC01355:4 No - lnc-CCSAP-3:4 No - lnc-AKAP10-2:3 No - lnc-LIPI-4:6 No - LINC00938:1 No - lnc-GOLGA6L9-2:9 No - lnc-SFT2D3-2:4 Yes chr3R:23986642-23988738 lnc-SULF2-11:2 No - lnc-BTNL8-6:2 Yes chr2R:20559156-20562331 lnc-CMBL-1:3 No - NR2F1-AS1:3 Yes chr3R:12258737-12302785 GABPB1-AS1:16 No - NUTM2A-AS1:27 No - lnc-IRX3-80:32 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-USP33-3:1 Yes chrX:8433923-8437820 lnc-METTL26-7:5 No - lnc-OR4F21-1:8 No - lnc-CRIPT-5:1 No - lnc-DNASE1L1-6:1 Yes chr3L:23093190-23095471 UBL7-AS1:15 No - lnc-ADGRA3-7:1 No - lnc-OXR1-3:1 Yes chr2R:1649061-1778937 lnc-OVOL2-1:7 Yes chrX:5048273-5070929 lnc-KLHL18-8:2 No - NORAD:1 No - GAS5:21 No - lnc-FCGBP-1:3 No - lnc-KPNA2-6:2 No - lnc-CHRAC1-9:1 No - lnc-PDZD7-3:3 No - lnc-EMCN-3:4 No - LINC01278:6 No - LINC01456:4 No - lnc-GATA3-26:1 No - lnc-ZNF787-2:1 No - lnc-PHOX2A-1:2 No - HAGLROS:4 No - RAD51-AS1:7 No - lnc-ALDH1A3-1:19 No - lnc-RPL10L-4:1 No - lnc-ZNF782-3:2 Yes chr3L:3128034-3143457 GLIDR:8 No - lnc-SH3BGRL2-1:8 No - lnc-TNK2-2:8 No - TUG1:16 No - lnc-SLC25A11-1:1 No - lnc-COIL-2:9 No - lnc-GRHL2-12:3 Yes chr3L:15835693-15837482 lnc-CELA3A-5:10 No - lnc-KCTD15-2:2 No - LINC01089:27 Yes chr3R:9497101-9502581 lnc-APPBP2-5:1 Yes chrX:11816898-11837460 lnc-F2RL2-6:1 Yes chr3R:25216297-25218708 lnc-ATP2B1-3:1 No - lnc-DHX15-1:3 No - lnc-DNPH1-3:1 Yes chr2R:24342861-24376473 lnc-ZNF708-14:8 No - lnc-TMEM132C-6:8 No - lnc-PIK3AP1-6:2 No - lnc-CD38-9:1 No - lnc-TSC22D2-6:1 No - lnc-PKHD1-2:3 No - lnc-CEP72-2:2 Yes chr3L:16354746-16359428 lnc-PPP1R14B-1:5 No - lnc-ZNF33B-7:2 No - lnc-BAZ2B-2:1 No - lnc-ZNF721-2:2 No - lnc-ARFGEF3-5:1 No - lnc-MRPS30-8:3 No - MAPKAPK5-AS1:4 No - lnc-MPP7-11:1 No - lnc-CYP4B1-3:1 No - SPINT1-AS1:19 No - lnc-BAZ2A-3:1 Yes chr3L:5155821-5277944 ENTPD1-AS1:9 No - COX10-AS1:5 No - lnc-PRMT6-13:1 No - lnc-HNRNPA2B1-14:2 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-IZUMO2-2:1 No - lnc-FAM86B2-58:12 No - CBR3-AS1:28 No - lnc-LINC02203-20:2 No - lnc-NPIPB12-4:1 No - lnc-ARAP2-11:1 No - lnc-GNE-2:1 Yes chr3L:20241053-20243735 NBR2:6 No - lnc-LRP8-5:1 No - lnc-TOP1-4:2 No - lnc-VSTM5-5:2 No - lnc-GATA3-24:1 No - LINC01023:1 No - lnc-GDF11-1:3 Yes chr2L:21344607-21358271 lnc-ZNF627-2:6 No - lnc-HLA-B-2:4 No - lnc-DNPEP-4:1 No - lnc-FAM174B-1:5 No - lnc-CASTOR3-4:2 No - lnc-ALOX12-3:1 No - lnc-GBE1-13:1 No - SP2-AS1:11 No - GATA3-AS1:1 Yes chr3R:8147368-8181444 lnc-KIN-10:1 No - lnc-CNTNAP2-3:2 No - FAM239B:11 No - lnc-HIST2H3A-1:2 No - DLEU2:5 No - lnc-PGR-4:2 No - lnc-EPHA5-5:1 No - lnc-LIMS4-8:1 No - lnc-CADM2-15:1 No - lnc-PAX9-11:5 No - lnc-SNRPC-2:4 No - lnc-STYXL1-4:4 No - lnc-HSCB-7:1 Yes chr3L:8472807-8507146 lnc-METTL2B-3:17 No - ADAMTS19-AS1:1 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-FGFBP3-2:3 Yes chr3R:25653091-25661286 lnc-WDR73-3:13 No - SNHG11:9 No - lnc-ZNF345-29:2 No - lnc-DPP4-8:3 Yes chr2L:7223328-7249343 lnc-HBEGF-2:5 No - lnc-SLC35F5-14:11 No - lnc-ELF1-5:1 No - LINC02568:13 No - FOXD3-AS1:5 No - lnc-CHD1L-5:3 Yes chr2R:6642418-6645098 lnc-NACC1-1:2 No - lnc-CCDC74A-7:2 No - lnc-FAM83A-7:2 Yes chr2R:15794000-15855645 lnc-TTLL7-17:1 No - lnc-ANGPT2-2:8 No - lnc-PGGT1B-1:3 Yes chr2L:4945579-4948324 KCTD21-AS1:2 No - lnc-RHEX-8:2 No - lnc-FAM86C1-1:6 No - lnc-PTBP3-7:1 No - LINC00992:5 No - USP46-AS1:5 No - lnc-CCDC74A-7:3 No - SRP14-AS1:11 No - lnc-CPVL-4:6 Yes chrX:5616572-5618806 lnc-AKAP14-1:4 No - lnc-IRX3-80:58 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-CADM2-17:1 No - lnc-ZNF236-8:1 No - OLMALINC:15 No - ILF3-DT:14 No - CPB2-AS1:5 Yes chrX:17080423-17087675 lnc-ZNF397-4:5 No - lnc-KHDRBS3-20:1 No - lnc-GRAMD4-2:4 No - lnc-VEZT-2:2 No - LINC01128:65 No - ELOVL2-AS1:6 No - lnc-ZCCHC7-2:15 No - lnc-C22orf23-2:2 No - lnc-ARMCX3-5:2 No - HLA-F-AS1:6 No - PART1:7 Yes chrX:3176440-3343767 lnc-OR4F6-5:4 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-TP53TG3-24:1 No - lnc-EEF1B2-2:7 Yes chr3R:29854695-29857491 lnc-AGAP5-1:11 No - lnc-AGAP4-2:4 Yes chr2L:13835564-13898712 lnc-MED13L-8:1 No - LINC02484:11 No - lnc-LSM14B-6:1 No - FUT8-AS1:1 Yes chrX:11706575-11709951 ZFPM2-AS1:15 No - lnc-HYAL4-5:4 No - lnc-BNIP1-5:2 No - lnc-ZNF131-1:25 No - lnc-OPCML-3:15 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-MAGEB18-1:5 No - IQCH-AS1:11 No - lnc-FANCC-1:11 No - lnc-ZNF701-1:7 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-AGO3-3:1 Yes chr2R:13943387-13958089 lnc-CFAP43-4:1 Yes chr3L:8518885-8520295 lnc-COL9A2-1:3 No - lnc-HIST2H3PS2-14:4 No - lnc-HIP1-1:9 No - lnc-ZIC5-3:4 No - lnc-ZNF761-4:1 No - lnc-TSC22D2-1:4 Yes chr2L:12455540-12546611 lnc-CNBD1-4:8 Yes chr2R:9611139-9683858 LLPH-DT:13 No - lnc-ZC3H11B-9:1 No - lnc-CRYM-4:1 No - lnc-THSD4-2:2 No - LINC02315:19 No - lnc-PSD3-4:1 No - lnc-OR4F29-1:27 No - lnc-CYP24A1-4:1 No - ATP2A1-AS1:6 Yes chr2R:23925077-23935884 LINC01389:3 No - lnc-ARF1-1:2 No - lnc-RARA-1:4 No - LINC00648:2 No - lnc-DNM1L-8:1 No - lnc-MASTL-3:4 No - lnc-VTCN1-3:3 No - lnc-TMEM259-1:1 No - RMST:4 No - lnc-CDK20-8:7 No - lnc-SLX1B-3:8 No - SNHG8:13 No - lnc-DRD5-16:2 No - lnc-PCED1B-5:21 No - lnc-GSTT2B-4:1 No - lnc-C6orf132-1:2 No - SLC12A9-AS1:13 Yes chr2L:18599755-18605249 BFSP2-AS1:4 No - lnc-IGFBP3-4:14 No - lnc-TNC-21:10 No - lnc-DDT-3:1 No - MALAT1:9 No - lnc-ANKRD18B-6:12 No - lnc-GATA3-7:5 No - LINC00963:38 No - lnc-SYNE3-1:9 No - lnc-SPIN2A-2:1 No - lnc-NRG4-3:1 Yes chrX:2264657-2270761 POC1B-AS1:35 No - lnc-SBDS-29:1 No - lnc-CNIH3-2:18 No - lnc-TRIM40-5:1 No - lnc-VIRMA-1:8 No - lnc-SHANK2-1:4 Yes chr3R:21061680-21064471 LINC00235:5 Yes chr3L:14190870-14233250 BAALC-AS1:8 No - lnc-KCNK5-2:1 No - NUTM2B-AS1:3 No - lnc-RPL10L-5:1 No - lnc-COPG1-3:8 No - LINC02484:8 No - lnc-AHCY-7:1 No - lnc-FOXI3-1:1 No - lnc-CMTM7-2:3 No - UGDH-AS1:4 No - lnc-IRX3-80:43 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-NAIP-5:6 No - lnc-CENPP-1:3 No - lnc-KCNT1-1:11 No - lnc-GTF2H2C-2:3 No - SYNPR-AS1:1 No - lnc-EPHA1-1:3 Yes chr4:1057365-1065001 lnc-SEPT7-2:3 No - lnc-SDSL-14:4 No - LINC01184:23 No - lnc-MYC-18:1 No - PSMA3-AS1:12 No - lnc-PPARA-1:4 Yes chr3R:8676915-8678955 lnc-DCAF12L2-3:1 No - RHPN1-AS1:1 No - lnc-NPIPB12-2:1 No - lnc-SLC39A11-10:4 No - lnc-AKT1-1:14 No - CBR3-AS1:4 No - SNHG11:10 No - lnc-RNF139-1:2 Yes chr2R:6923366-6924929 lnc-TMEM106C-3:3 Yes chr2R:6087873-6169087 MAFG-DT:22 No - lnc-MPLKIP-15:1 No - LINC00662:6 No - lnc-POU5F1B-12:1 No - NFYC-AS1:6 No - lnc-CCDC74A-8:1 No - OIP5-AS1:2 No - lnc-MERTK-2:2 Yes chrX:15455544-15462441 lnc-FAM83H-1:2 Yes chrX:9261376-9267698 lnc-PRMT8-7:1 No - lnc-GATA3-7:6 No - lnc-NUPR2-8:5 No - lnc-ZCCHC7-2:13 No - lnc-MYO18A-3:1 No - lnc-CNNM3-3:2 No - lnc-TP53TG5-3:1 Yes chrX:8404535-8407263 LINC02506:14 No - lnc-PTGFRN-1:1 No - lnc-DBX2-4:3 Yes chr3L:11984906-11990505 lnc-F2RL2-5:2 Yes chr3R:25216297-25218708 lnc-MBP-16:1 No - LINC00342:2 No - EP300-AS1:6 No - lnc-RLF-5:1 No - lnc-NBN-1:19 No - lnc-NETO1-1:21 No - lnc-AGO2-2:4 No - lnc-TMEM99-8:1 No - lnc-TBC1D2B-3:4 No - lnc-RAB1A-1:5 No - lnc-MAX-16:1 No - lnc-FAM230A-5:1 No - lnc-ZNF8-5:2 No - MIR924HG:4 No - lnc-SCRN1-1:7 No - lnc-TMEM105-2:29 No - lnc-LARP4-6:2 No - NRAV:2 No - lnc-GPRIN2-3:1 No - lnc-ANKRD20A2-22:7 No - lnc-PCM1-4:9 No - lnc-SETSIP-2:16 No - LINC01876:25 No - lnc-AHCY-8:1 No - GAS5:26 No - lnc-PAPPA-3:2 No - lnc-LSM3-1:4 No - SNHG10:7 Yes chrX:14837471-14838198 lnc-UTS2-5:7 Yes chr2R:9446046-9480076 lnc-KCNQ2-2:2 No - OTUD6B-AS1:5 No - lnc-GATA3-16:2 No - lnc-NEMF-1:5 No - lnc-RNF208-3:1 No - lnc-ASB5-2:2 No - lnc-CLDN9-1:3 No - NUTM2B-AS1:40 No - FGD5-AS1:15 No - LINC00265:15 No - lnc-SLC30A7-2:20 Yes chr3R:22582028-22583225 lnc-TMEM250-2:9 No - lnc-ZNF569-6:1 Yes chr2L:12046711-12048918 lnc-NAIF1-1:4 No - lnc-ATG2B-16:1 Yes chr2R:19663919-19669832 lnc-ANKRD20A2-22:9 No - lnc-TRIM43-7:5 No - lnc-METTL2B-3:16 No - lnc-SP3-15:1 No - LINC00106:13 No - lnc-PRR20C-7:2 No - FOXD3-AS1:11 No - lnc-ABLIM3-4:1 No - DIO3OS:10 No - lnc-EXOSC6-1:8 No - lnc-CRYBA4-52:57 No - lnc-UQCRHL-1:4 No - lnc-IGFBP3-4:12 No - lnc-APLN-1:4 No - lnc-PPIAL4D-19:8 No - lnc-SMYD1-4:2 No - lnc-CADM2-18:1 No - lnc-SERF1A-2:5 No - TMEM161B-AS1:38 No - lnc-KIF18A-10:1 No - lnc-LRIG2-1:2 No - lnc-CTNNA2-3:6 No - lnc-SAP130-3:1 Yes chr3R:19929277-20008512 MALINC1:73 No - lnc-IDNK-10:1 No - lnc-TONSL-4:1 No - lnc-CASKIN2-1:6 No - lnc-CCDC140-1:14 No - lnc-LIPI-11:1 No - lnc-CYS1-1:6 No - lnc-A4GALT-3:1 No - lnc-TRIML1-9:2 No - lnc-NBN-1:38 No - NUTM2B-AS1:36 No - GABPB1-AS1:3 Yes chr3L:324985-327992 lnc-NDUFA6-1:1 No - lnc-SERF1B-1:9 No - lnc-PHF3-12:1 No - lnc-MPP7-11:2 No - lnc-HOXC4-2:2 Yes chr3R:17150587-17151630 lnc-CDK13-9:1 No - LINC00665:5 No - lnc-KIAA1257-1:3 No - lnc-NBPF14-7:1 No - lnc-BBX-2:1 No - lnc-NRIP1-2:13 No - lnc-ZNF718-5:1 No - lnc-PUDP-3:1 No - lnc-APLNR-3:1 No - ZNF236-DT:22 No - ZNF793-AS1:5 No - lnc-SERF1A-4:1 No - WDFY3-AS2:2 Yes chr2L:5907169-5922776 lnc-PROC-1:8 No - LINC01456:2 No - lnc-LTN1-2:3 No - LINC01123:7 No - lnc-ABCC10-2:1 Yes chr3R:24295078-24314541 lnc-XBP1-3:1 No - lnc-ZMYND8-8:2 No - lnc-MAPK1-4:1 No - CDKN2B-AS1:36 No - lnc-ARL14-2:3 No - lnc-TUBA3C-9:6 No - lnc-ALX1-2:7 No - EP300-AS1:3 No - lnc-ZNF704-7:5 No - TNKS2-AS1:1 No - lnc-ABT1-3:13 No - lnc-MEPE-1:1 No - lnc-EEF1AKMT1-3:8 No - NEAT1:11 No - lnc-SIPA1-2:5 Yes chr2L:17436830-17450364 lnc-HIP1-1:11 No - lnc-RBM28-1:3 No - lnc-SLC25A24-2:1 No - CASC15:8 No - lnc-ZNF595-1:18 No - lnc-TSKU-1:3 No - lnc-OR8A1-1:1 No - lnc-FRG2C-16:1 No - lnc-MRPS22-1:16 No - lnc-MORC2-8:1 Yes chr3R:24934869-24938222 lnc-KANTR-23:25 No - lnc-MINDY1-3:2 No - lnc-LRP5L-15:1 No - lnc-ACTR2-11:1 No - LINC02041:7 No - lnc-IMPDH1-3:3 No - DIO3OS:14 No - lnc-CAPS-2:3 Yes chr3R:10361760-10378068 lnc-CCAR2-2:2 Yes chr2L:12707661-12708680 lnc-NPIPB13-2:1 No - LINC01106:1 No - lnc-ZDHHC17-17:1 No - lnc-LOXHD1-2:1 Yes chr3R:11744229-11750029 SNHG11:20 No - lnc-NOB1-2:1 No - lnc-BEND6-1:5 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-PEX2-3:2 No - lnc-RUBCN-2:1 No - lnc-IGLL1-1:20 No - lnc-ZNF253-3:1 No - ZBED5-AS1:3 No - lnc-MIPOL1-1:3 No - OSER1-DT:28 No - lnc-FKBP1B-2:1 No - lnc-NUTM2B-1:7 No - LINC02140:12 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-TBC1D28-7:22 No - lnc-NCALD-4:1 No - lnc-ERGIC2-3:2 Yes chrX:2201820-2203866 lnc-SP110-9:1 No - lnc-LPCAT1-4:15 No - OIP5-AS1:22 No - lnc-ABHD15-2:1 No - lnc-TMLHE-6:1 No - lnc-MBD2-8:1 Yes chr2R:12529053-12564184 VIM-AS1:4 No - RALY-AS1:7 No - lnc-PSMB9-6:9 No - MIR99AHG:103 No - lnc-N4BP2-1:2 No - lnc-TMEM212-1:3 No - lnc-KLRB1-12:4 No - lnc-GDAP2-2:2 Yes chr2R:7716807-7782637 lnc-EFCAB12-2:17 No - lnc-MC5R-1:16 No - lnc-F11R-2:1 No - FIRRE:6 No - lnc-GGT2-2:13 No - lnc-PDZD7-11:1 No - lnc-ZNF124-2:2 No - ASH1L-AS1:5 No - lnc-SLC35F5-14:12 No - lnc-CERS4-6:1 No - lnc-ALB-1:4 No - lnc-FOXD4L5-18:7 No - SNHG1:8 No - lnc-TP53TG3-68:1 No - lnc-NXPH1-1:3 No - lnc-MED13-3:3 No - lnc-TGFBRAP1-1:6 No - lnc-RPLP1-12:13 No - ST7-AS1:2 Yes chr3L:20806868-20809272 lnc-ALDH1A3-1:16 No - lnc-OR4F29-7:4 No - lnc-FGFR1OP2-6:1 Yes chr3L:25114924-25115946 lnc-EXT2-2:1 No - lnc-NR4A2-17:1 No - lnc-TRIM32-2:2 No - lnc-CDRT15L2-8:1 No - lnc-MARCH7-1:4 No - lnc-ERGIC2-11:1 No - TRAM2-AS1:4 No - lnc-TSC22D2-5:1 No - lnc-PPIAL4F-4:9 No - lnc-PPP2R3C-5:1 No - lnc-F13B-3:2 No - lnc-GOLGA6B-6:2 Yes chrX:18130392-18137784 DLGAP1-AS1:11 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-CADPS-4:1 No - lnc-NBPF6-2:3 Yes chr3L:12402295-12414842 lnc-GNB5-1:1 Yes chrX:8150731-8152275 lnc-WDR73-5:13 No - lnc-CXorf40A-1:1 No - lnc-FCGR3B-4:15 Yes chrX:19623114-19625729 lnc-GOLGA8O-1:2 No - lnc-AMZ2-7:3 No - lnc-MRPL11-1:10 Yes chr3R:8344400-8347465 NRSN2-AS1:31 No - lnc-C1QTNF3-AMACR-2:3 No - MINCR:8 No - lnc-ACO1-9:1 No - lnc-ZSCAN10-3:26 No - lnc-SIPA1L3-4:2 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-DNAAF5-3:23 No - lnc-RPP40-4:2 No - lnc-ATP6V1C1-10:2 No - lnc-PCDH7-6:5 No - RNF139-AS1:1 Yes chr3R:29499025-29503797 lnc-CTNNA2-3:13 No - lnc-ERV3-1-9:1 No - lnc-LPCAT1-4:2 No - lnc-ANKRD30B-13:12 No - lnc-SNTG2-2:4 No - MNX1-AS1:2 No - lnc-BRI3BP-2:2 No - lnc-ARL14-2:2 No - SNHG19:1 No - lnc-NXPH1-2:8 No - ID2-AS1:9 No - LINC01389:2 No - lnc-ZNF169-4:1 No - USP46-AS1:6 No - lnc-JHY-5:2 Yes chr3L:13974061-13977761 lnc-TSC22D2-6:2 No - TMPO-AS1:6 No - SNHG8:3 No - lnc-AIG1-4:2 No - TAF1A-AS1:7 No - lnc-ADCK5-4:1 No - LRRC75A-AS1:55 No - lnc-RPS17-4:1 No - LINC00648:10 No - lnc-NADSYN1-1:4 No - lnc-PITPNB-2:2 No - lnc-SEC22A-14:6 Yes chr2R:9716348-9748121 lnc-RPLP1-12:49 No - lnc-ZNF718-4:1 No - PAX8-AS1:30 Yes chr4:1088798-1113317 NNT-AS1:10 No - lnc-ZNF165-1:3 No - lnc-CD38-10:1 No - SNHG17:5 No - lnc-NRGN-1:5 No - lnc-EIF2AK3-30:11 No - FAM182A:30 No - lnc-NPIPB5-5:1 No - LINC01152:2 No - lnc-GOLGA8O-3:6 No - lnc-PCED1B-5:12 No - RMST:16 No - lnc-PPP4C-10:1 Yes chrX:10205292-10212374 lnc-IL12A-4:1 No - lnc-PCM1-4:11 No - lnc-SLX1B-3:10 No - SDCBP2-AS1:7 No - lnc-SSR3-11:1 No - EPB41L4A-DT:6 Yes chr3R:31311157-31371748 NRSN2-AS1:6 No - lnc-HK1-3:1 Yes chr3R:29950796-29969447 lnc-ARMT1-2:2 Yes chrX:15737493-15738954 lnc-CD99-2:9 No - lnc-SLC38A8-2:5 No - CRTC3-AS1:4 No - lnc-CCSAP-1:9 No - lnc-F13B-2:1 No - lnc-MAGEB18-1:4 No - NUP50-DT:33 No - EPB41L4A-AS1:4 Yes chr3R:31311157-31371748 PPP1R26-AS1:2 No - lnc-EPHA6-7:1 No - LINC01000:13 No - POU6F2-AS2:3 Yes chr2R:8327490-8396280 lnc-POLRMT-6:10 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-RABGAP1-1:7 No - lnc-SERPIND1-1:48 No - TTC28-AS1:2 Yes chr3R:19215434-19226651 lnc-PPIL4-1:1 No - lnc-ZNF195-1:5 No - lnc-RNF13-3:3 No - lnc-ALX1-2:8 No - lnc-LSG1-5:1 No - lnc-HLA-A-8:1 No - lnc-ZBTB10-1:3 No - lnc-NTAN1-5:1 No - lnc-HEBP2-2:1 No - lnc-ADAMTS12-6:2 No - lnc-GEMIN5-4:1 No - lnc-ZNF486-12:1 No - lnc-POLE4-8:1 No - lnc-DYDC1-3:2 No - TMEM132D-AS1:21 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-MYC-18:2 No - lnc-MUC15-5:1 Yes chr3L:11984906-11990505 LINC00174:21 No - lnc-VWA8-1:1 Yes chr3R:7814361-7855392 lnc-GRHL2-18:2 No - GLIDR:6 No - lnc-RD3L-1:6 No - lnc-TTF2-4:1 Yes chr3R:7916599-7920299 DLEU2:6 No - lnc-SNX24-1:2 Yes chr2R:22644646-22646344 lnc-ICOSLG-1:4 No - lnc-SS18-8:1 Yes chr2R:24500780-24502277 lnc-EPS15-2:2 No - lnc-OSBPL10-1:3 No - PAN3-AS1:4 No - lnc-CD8B-2:2 Yes chr3R:25618414-25621838 lnc-IRX3-5:3 No - UGDH-AS1:5 No - CBR3-AS1:23 No - LINC02055:18 No - lnc-KANTR-23:20 No - lnc-MROH1-1:1 No - lnc-PLA2G4A-7:3 No - lnc-PGPEP1-5:2 No - LINC01389:6 No - lnc-SPATA31A7-13:4 No - lnc-NAV1-8:1 No - lnc-DIP2A-6:1 No - LINC01456:3 No - lnc-CTDSP2-2:13 No - FOXD3-AS1:9 No - lnc-M1AP-6:5 No - lnc-SCGB3A2-7:1 No - lnc-C8orf86-1:7 No - lnc-CANX-1:3 No - lnc-VN1R2-5:5 No - TP53TG1:3 No - LINC02568:14 No - lnc-CCDC74A-7:4 No - lnc-PTBP2-11:1 Yes chrX:9196808-9201820 NUTM2A-AS1:25 No - lnc-NMBR-9:1 No - lnc-EPHA5-5:2 No - lnc-TYRO3-3:1 No - lnc-NPIPB3-1:1 No - ZFPM2-AS1:16 No - lnc-SBDS-28:1 No - lnc-PPP1R14B-1:2 Yes chr2L:305935-355566 lnc-CCDC93-9:1 No - lnc-UBE2I-3:1 No - FOXP4-AS1:4 No - PVT1:80 No - lnc-GREB1-14:1 No - lnc-B3GNT10-21:7 No - DSCAM-AS1:1 Yes chr3R:17473935-17505667 lnc-ZNF91-4:5 Yes chr3R:11674920-11678116 lnc-ZC3H11B-9:2 No - lnc-ARL16-3:2 Yes chr3L:18694187-18695648 lnc-SYK-13:1 No - lnc-ZNF724-6:1 No - lnc-PRR14-7:1 No - TBX2-AS1:4 Yes chrX:4412856-4485647 lnc-PIP4K2A-1:3 No - lnc-MARCH10-8:5 No - lnc-PSD3-6:1 No - lnc-C5orf63-1:5 No - lnc-CROCC-3:2 No - lnc-LYZL1-15:28 No - EDRF1-AS1:20 Yes chr3L:8721324-8726108 MAPKAPK5-AS1:10 No - lnc-CYP24A1-3:1 No - LRRC75A-AS1:76 No - NNT-AS1:4 No - lnc-RPEL1-1:2 No - TUG1:17 No - lnc-KCNA5-4:2 No - lnc-STK35-4:6 No - lnc-SLC16A3-3:4 No - lnc-SLC39A11-1:39 No - lnc-TRMU-3:1 Yes chr2R:10673345-10721138 lnc-DEFB115-3:1 No - lnc-RRN3-5:1 Yes chrX:21324046-21328150 lnc-INAFM1-2:1 No - lnc-SACS-7:1 No - lnc-RAB23-53:10 No - lnc-MYOM1-9:2 No - lnc-DNASE1L1-2:4 Yes chr2R:9207561-9209774 lnc-TMEM105-4:2 Yes chr3R:22710883-22721150 lnc-RASD1-1:2 No - lnc-AGAP5-1:12 No - lnc-BCHE-1:2 No - CDKN2B-AS1:32 No - BFSP2-AS1:1 No - lnc-IRX3-8:1 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-FAM72D-8:1 No - lnc-SAYSD1-3:2 No - lnc-SLC6A18-2:2 No - LINC01089:4 Yes chr3R:9497101-9502581 UCA1:7 No - POC1B-AS1:42 No - lnc-NOB1-1:1 No - lnc-RBM11-6:2 No - LINC00863:9 No - lnc-CHD1L-5:2 Yes chr2R:6642418-6645098 lnc-SLC30A7-2:21 Yes chr3R:22582028-22583225 lnc-E2F6-8:1 No - lnc-SLC5A9-8:2 No - lnc-TMCC1-10:6 Yes chr3R:17809401-17811134 LINC01278:7 No - lnc-NPIPB12-3:1 No - lnc-ZNF599-3:7 No - lnc-ATP5F1A-3:1 No - lnc-ALDH1A1-10:1 No - PVT1:8 No - lnc-SETD7-3:10 No - lnc-TSHR-1:2 No - LINC00115:23 No - lnc-PXDN-11:1 Yes chr3R:17425768-17446499 lnc-WASHC4-2:1 No - lnc-ANKRD34B-2:4 Yes chr2L:7983946-7986785 LINC01977:11 No - lnc-SYT10-6:1 No - lnc-FTO-7:2 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-SLC7A13-1:4 No - lnc-OPHN1-1:2 No - NRSN2-AS1:3 No - lnc-HIBADH-5:1 No - IER3-AS1:14 No - lnc-KCNB2-7:1 No - lnc-CTSV-3:1 No - lnc-ATP6V1C2-5:3 No - lnc-GRIK2-2:3 No - lnc-SOCS2-1:2 No - lnc-MGRN1-1:1 Yes chrX:13718734-13721977 lnc-IRX3-80:30 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-GMPS-1:6 No - lnc-GPR33-14:1 No - lnc-SUMO1-2:2 No - LINC00265:2 No - lnc-NUPR2-8:1 No - lnc-ZMYM2-12:1 No - ZFHX4-AS1:9 No - lnc-ZNF708-12:1 No - ARHGAP5-AS1:1 Yes chrX:17639147-17652562 lnc-SCRN3-1:5 No - lnc-SLC25A17-4:1 No - lnc-PBDC1-8:1 No - lnc-EIF2AK3-31:3 No - WEE2-AS1:9 Yes chr2L:6911090-6914138 lnc-SFT2D3-2:3 Yes chr3R:23986642-23988738 lnc-RPS20-5:1 No - lnc-CAPN7-2:1 No - lnc-ROPN1B-2:4 Yes chrX:8489348-8517029 ARRDC3-AS1:5 Yes chr3R:7804665-7810014 lnc-SMN2-3:1 No - lnc-PLGLB2-7:1 No - lnc-FAM208B-5:2 Yes chr2L:9491176-9494876 LINC02346:8 No - lnc-ZMYND8-10:2 No - lnc-SLC30A9-1:3 No - lnc-ZFAND4-2:5 No - LINC01278:8 No - lnc-SULF2-11:1 No - lnc-SUMF2-16:2 No - lnc-SRPK2-1:15 No - lnc-SLC48A1-23:5 No - lnc-POGZ-1:1 No - GAS5:27 No - lnc-NLRP12-1:4 No - lnc-CADPS-3:1 No - lnc-YWHAQ-2:1 No - lnc-SLC6A12-6:6 No - LINC01128:92 No - IQCH-AS1:13 No - LINC01213:3 No - lnc-TAOK3-1:17 No - lnc-GOLGA8Q-3:2 No - lnc-ATP6V1G3-4:10 No - LINC01569:4 No - lnc-JPH1-12:1 No - lnc-MARCH4-2:6 Yes chr2L:5070957-5072055 lnc-KIF1C-1:15 No - lnc-SPIRE2-1:4 Yes chr2L:20311219-20348386 lnc-ZNF100-9:1 No - LINC00641:4 No - lnc-RHBDD3-3:1 No - lnc-HBP1-1:1 Yes chr2L:17478442-17481029 lnc-ZNF843-2:4 No - TMEM161B-AS1:14 Yes chr3L:11109690-11112117 lnc-ABCA1-8:1 No - lnc-GINS1-2:5 No - lnc-RAD9A-6:6 Yes chr3L:18870045-18872553 lnc-BAZ2B-1:5 No - lnc-SLC25A6-4:1 No - lnc-AGAP4-5:1 No - lnc-NBN-1:18 No - lnc-TFRC-2:1 No - lnc-FAM19A5-17:1 No - lnc-TRIM43-7:6 No - lnc-NLRP12-1:16 No - lnc-OPCML-3:16 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-TSHZ2-17:1 No - lnc-LEKR1-44:1 No - lnc-CDK13-6:2 No - lnc-NOMO2-5:1 No - lnc-KCNT2-7:1 No - lnc-ANKRD20A2-22:8 No - lnc-BCL3-5:1 No - lnc-TTLL7-16:1 No - KCNMB2-AS1:9 No - lnc-GTF2H2-7:9 No - lnc-STC2-1:4 No - lnc-TPST1-1:9 No - lnc-CPLX1-2:11 No - lnc-SPAG9-1:2 No - LINC00909:2 Yes chr2L:21762314-21795447 lnc-COL22A1-5:2 No - LINC02346:9 No - lnc-USP16-15:1 No - lnc-CYS1-1:5 Yes chr2L:476446-479688 LINC00865:8 No - lnc-EXOSC6-1:6 No - lnc-NEIL2-1:3 No - lnc-FEZ2-7:10 No - lnc-NBPF1-4:3 No - LINC02568:20 No - DLGAP1-AS1:3 Yes chr2R:5702112-5705439 UBA6-AS1:3 No - lnc-JMJD1C-11:4 No - lnc-EAF2-3:2 No - lnc-SLC19A1-7:2 No - lnc-TMEM18-12:5 No - LINC01633:5 No - lnc-UBE2Q2L-5:2 No - lnc-ABCC6-10:1 No - lnc-SEL1L-17:1 No - lnc-PRMT6-16:2 No - lnc-KIN-11:1 No - lnc-TMTC3-5:5 No - lnc-ARFGEF3-4:1 No - lnc-ZNF708-13:1 No - lnc-MARCH5-2:1 No - lnc-IGFBP3-4:13 No - ZFPM2-AS1:1 No - lnc-C8orf86-1:8 No - lnc-GTF2H2C-2:2 No - lnc-LRP5-1:6 No - EIF3J-DT:38 No - lnc-TSHZ2-2:2 No - lnc-NRIP1-2:14 No - lnc-TBC1D22A-4:7 No - lnc-PGRMC1-3:1 No - lnc-TMEM64-5:1 No - lnc-PRKX-2:1 No - lnc-RGS9-3:2 No - lnc-LEO1-5:2 Yes chr3R:30532607-30578905 MAPKAPK5-AS1:5 No - lnc-PRR11-4:1 No - lnc-PRKD1-20:1 No - LINC01806:24 No - lnc-AK6-10:1 No - lnc-TRPC5-3:1 No - lnc-TMC7-6:5 No - lnc-CTNND2-1:5 No - lnc-IRX3-80:52 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-STEAP1-3:4 No - lnc-PSMC3IP-3:5 No - lnc-PABPC3-1:4 No - lnc-RBL2-1:6 No - lnc-TNFRSF14-66:2 No - lnc-FASTKD1-4:2 No - SNHG11:11 No - lnc-RNF139-3:1 No - lnc-MYBBP1A-3:1 Yes chr2R:16124981-16138238 lnc-CTNNA2-3:4 No - LINC02484:9 No - LINC01419:6 No - lnc-ISG20L2-1:1 No - CNNM3-DT:20 No - NUTM2B-AS1:9 No - lnc-ZNF41-2:1 No - lnc-CCAR2-2:4 Yes chr2L:12707661-12708680 lnc-OR6C65-3:1 No - lnc-CRACR2A-3:1 No - lnc-LRTM2-8:2 Yes chr2R:13805794-13819571 lnc-TYW1-7:6 No - lnc-TSC22D2-7:1 No - lnc-OGFOD3-1:6 No - lnc-MAGEB18-1:3 No - lnc-ZNF217-8:1 No - LINC01918:25 No - lnc-NPIPB4-3:9 No - lnc-NTF3-5:5 No - lnc-CELF4-17:1 Yes chr3L:11990736-11992000 lnc-STAM-5:1 No - LINC00471:9 No - lnc-TMEM132C-6:9 No - lnc-HOMEZ-4:1 No - TMEM132D-AS1:29 Yes chrX:6225647-6236218 lnc-IGFBP4-3:1 No - lnc-TRIM26-2:36 No - lnc-NBPF1-1:3 No - lnc-LGI1-3:1 Yes chr3R:11435850-11437523 lnc-LIPI-7:5 No - TIPARP-AS1:3 No - CCDC183-AS1:3 No - lnc-DRD5-16:3 No - lnc-PRMT6-18:1 No - lnc-SEC11A-6:10 No - PARTICL:1 No - lnc-HIST2H3C-1:2 No - lnc-PKN3-1:4 Yes chr3L:1490951-1496643 NUTM2A-AS1:1 No - lnc-SLC39A11-1:40 No - lnc-TMUB2-1:6 No - lnc-PRMT6-17:1 No - lnc-KLRB1-12:8 No - lnc-WDR4-1:3 No - SATB2-AS1:4 No - lnc-MYOM1-9:1 No - lnc-ZNF503-10:1 No - OTUD6B-AS1:6 No - TOB1-AS1:4 Yes chrX:16074717-16091495 LNCPRESS1:19 No - lnc-UBR2-1:4 No - LINC02055:17 No - lnc-NPIPB12-1:1 No - lnc-RNF135-1:29 No - FTX:18 No - LINC00648:9 No - lnc-ZNF573-2:2 No - lnc-AGRN-2:10 No - lnc-FAM185A-4:1 No - CCNT2-AS1:4 No - lnc-NAV1-9:6 No - lnc-PRMT6-14:1 No - lnc-MORC2-3:2 No - lnc-IGSF9B-13:1 No - LINC01446:8 No - lnc-CAGE1-1:5 No - CEBPA-DT:20 No - lnc-NBPF3-10:1 No - lnc-EMC3-2:2 No - lnc-MAN1B1-1:1 No - lnc-CCAR2-3:3 No - lnc-SIPA1-2:6 Yes chr2L:17436830-17450364 lnc-PEX2-3:3 No - SNHG17:9 No - lnc-ALX1-2:9 No - lnc-TBC1D22A-4:6 No - lnc-NBN-1:16 No - lnc-NPIPB11-5:1 No - MIR4435-2HG:1 No - lnc-TRAM1L1-7:1 No - LINC00467:12 No - lnc-UTP23-12:1 No - OSER1-DT:42 No - lnc-NXPH1-1:2 No - lnc-KIAA0513-9:1 No - PVT1:2 No - lnc-DAOA-13:1 No - LINC00839:16 No - lnc-ZNF816-2:17 No - FBXL19-AS1:1 Yes chr3R:9052495-9063245 lnc-CDK2AP1-1:9 Yes chr2R:16291453-16292269 RAB30-AS1:9 No - lnc-ZNF726-3:3 No - lnc-SMC4-3:1 No - lnc-DTYMK-7:1 No - lnc-IRX3-5:4 No - lnc-WDR73-3:12 No - OLMALINC:21 No - lnc-TMEM88B-6:3 No - LINC01608:1 No - lnc-NADSYN1-2:2 No - BAIAP2-DT:28 No - WDFY3-AS2:11 No - lnc-CHD2-23:1 No - lnc-GALNT15-8:8 No - lnc-PDCD1-17:4 No - CASC15:9 No - lnc-CCDC28A-1:9 No - lnc-MC5R-11:4 No - lnc-SHANK2-9:1 No - SNHG1:9 No - WAC-AS1:1 Yes chrX:17068717-17077897 lnc-AGAP5-1:16 No - lnc-RINT1-6:1 No - lnc-TMEM99-8:2 No - lnc-PRMT6-13:4 No - lnc-TUBGCP3-20:2 No - lnc-FOXM1-2:3 Yes chrX:15804370-15827682 lnc-ATP2B1-4:1 No - lnc-MAML3-2:1 No - lnc-SLC22A31-5:4 No - JPX:25 No - lnc-HNRNPA2B1-7:3 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-NAPSA-2:2 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-FCRLB-3:1 No - lnc-TSC22D2-8:1 No - lnc-RAD9A-6:4 Yes chr3L:18870045-18872553 lnc-USP16-16:1 No - lnc-SERF1A-5:1 No - lnc-POLRMT-6:8 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-CEP126-3:1 No - lnc-WDR4-1:4 No - lnc-LGALS8-3:1 No - lnc-TRABD2A-5:7 No - LINC01237:5 No - lnc-GATA3-23:2 Yes chr3R:8147368-8181444 SNHG5:1 No - LINC00963:39 No - lnc-KCNE1B-10:3 No - lnc-CCDC146-4:6 No - THAP7-AS1:5 No - LINC01836:8 No - lnc-PXDN-3:4 Yes chr3R:17425768-17446499 lnc-PPP4R3A-7:1 No - lnc-APOBEC3A-1:2 No - LINC00467:2 No - lnc-PRKX-10:1 No - lnc-NCOA4-6:1 Yes chr2L:13835564-13898712 DUBR:1 No - lnc-ETS1-7:1 No - ENTPD1-AS1:12 No - lnc-CAPS-2:4 No - FAM239B:15 No - lnc-IDI1-2:3 Yes chr3R:18400373-18402716 DANCR:2 No - MHENCR:17 No - PVT1:3 No - lnc-CELA3A-5:11 No - lnc-GRHL2-18:1 No - lnc-FAAH2-1:4 No - lnc-METRNL-9:2 No - lnc-DCAF12L2-6:1 No - lnc-PLEKHA3-20:1 Yes chr3L:8282528-8289870 lnc-PLGLB1-6:2 No - lnc-ANKRD27-1:3 Yes chr2L:19490262-19491679 lnc-FSIP2-5:3 No - lnc-ZNF431-5:1 No - LINC01534:5 No - LINC01128:89 No - lnc-TSHR-9:6 Yes chr3R:27251112-27256463 lnc-CD8B-2:3 Yes chr3R:25618414-25621838 lnc-SPECC1-6:1 No - BAIAP2-DT:25 No - LINC02506:10 No - lnc-MERTK-6:1 No - lnc-FGL2-9:1 No - lnc-H2AFV-4:1 No - LINC02343:11 No - GABPB1-AS1:2 Yes chr3L:324985-327992 lnc-CEP97-8:6 No - lnc-RNF139-4:1 No - lnc-HPS3-3:4 No - lnc-EDIL3-13:1 No - lnc-POLA1-8:1 No - lnc-AMZ2-5:5 No - MIR4713HG:10 No - ZFHX4-AS1:11 No - lnc-SUGT1-3:1 Yes chr3R:8304190-8305274 lnc-SLC35B3-4:1 No - lnc-IRX3-80:50 Yes chr3L:12609631-12710249 TMEM44-AS1:12 No - lnc-NOL6-6:2 No - lnc-METTL22-12:2 No - lnc-KCNK1-2:1 No - lnc-SAMD11-16:3 No - lnc-RABIF-1:6 No - lnc-ANKRD20A2-22:1 No - lnc-CASTOR3-3:6 No - lnc-LRPAP1-3:2 No - lnc-THAP12-1:8 No - lnc-ZNF705D-2:28 No - lnc-LINC02203-2:2 No - lnc-ADCYAP1-6:3 Yes chr3L:4592447-4626196 lnc-OTOGL-1:6 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-LGALS9B-11:4 No - NUTM2B-AS1:37 No - lnc-ZNF253-2:7 No - lnc-ATP5F1A-4:2 No - lnc-PCDH7-6:6 No - MMP25-AS1:1 No - lnc-ZNF124-2:4 No - lnc-PRDM4-6:5 No - LINC02361:15 No - MIR503HG:2 No - LINC01419:1 No - EDRF1-AS1:21 Yes chr3L:8721324-8726108 lnc-OR4F21-3:1 No - lnc-EMCN-3:3 No - lnc-KIAA1586-4:1 No - lnc-ANKRD30B-13:9 No - lnc-ARHGAP26-8:1 No - lnc-NXPH1-2:20 No - lnc-ZMYND8-10:1 No - lnc-PCED1B-5:11 No - lnc-OLFML3-6:1 No - lnc-TBX20-3:6 No - lnc-IRAK1BP1-9:1 No - lnc-EYA3-2:2 No - lnc-NETO1-1:20 No - lnc-DISC1-7:1 No - lnc-MRPL57-5:2 No - lnc-BATF3-6:3 No - lnc-CCDC158-4:1 No - lnc-ALS2CL-1:1 No - lnc-SNF8-1:3 No - FAM239C:5 No - lnc-ZNF624-4:3 No - lnc-EIF2AK3-30:8 No - lnc-NLRP3-11:1 No - ERICH6-AS1:5 No - lnc-EPPK1-2:1 No - lnc-ZNF627-2:15 No - DHRS4-AS1:10 Yes chr3L:5140440-5141646 lnc-PGS1-1:9 No - lnc-PCM1-4:10 No - lnc-SPATA31D4-13:1 No - BFSP2-AS1:2 No - lnc-ERV3-1-10:6 No - lnc-LIPI-10:1 No - lnc-PHF3-12:2 No - lnc-LRRTM2-1:4 Yes chr3L:23318646-23338100 MINCR:9 No - lnc-A1BG-2:5 No - TRAM2-AS1:10 No - TPT1-AS1:40 No - lnc-CPLX1-2:12 No - LINC00992:6 No - lnc-ATP2B1-2:1 No - OIP5-AS1:23 No - lnc-HELZ-9:1 No - lnc-FOXA1-5:1 No - lnc-ANKRD20A2-15:3 No - lnc-ALS2-1:1 No - PCAT1:55 No - lnc-CCDC96-2:2 No - lnc-NUTM2E-1:5 No - lnc-TMEM106C-9:1 No - lnc-LPCAT1-4:3 No - lnc-DUSP26-14:1 Yes chr2R:15340472-15368300 PSMA3-AS1:9 No - LINC01661:7 No - ATP2B1-AS1:12 No - lnc-PPIE-1:2 No - lnc-CROCC-9:1 No - lnc-CTDSP2-2:14 No - CDKN2B-AS1:33 No - lnc-SERF1B-1:8 No - lnc-EIF3A-2:3 No - lnc-NTNG1-4:1 Yes chrX:19261820-19273280 lnc-RGPD3-6:1 No - lnc-P2RY6-1:2 No - RUNDC3A-AS1:7 No - LINC00992:9 No - lnc-FSIP2-5:4 No - lnc-COX7C-7:2 No - lnc-UBE2K-2:6 No - PVT1:9 No - lnc-TACC2-10:1 Yes chr2R:20254966-20257390 lnc-EIF2AK3-28:1 No - lnc-SMPX-6:1 Yes chr3R:27057908-27064199 lnc-BYSL-2:1 Yes chrX:15906822-15909676 lnc-MMRN2-4:1 Yes chr2L:5219000-5271384 lnc-SNTG2-1:4 No - lnc-YES1-10:1 No - lnc-TP53TG3-22:6 No - lnc-TTR-1:3 Yes chr3R:29032660-29034008 lnc-SEMA3D-6:1 No - lnc-KHDC3L-7:1 No - lnc-CCDC74A-11:1 No - lnc-UNCX-3:10 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-TRIM43B-1:2 No - LINC00648:3 No - LINC01376:5 No - lnc-NUPR2-11:1 No - lnc-TET3-6:1 No - lnc-FAM234B-2:6 No - lnc-ATOX1-4:1 No - lnc-RUBCN-2:8 No - PLCG1-AS1:3 No - LINC01278:24 No - HOTAIR:8 No - lnc-OR4F21-3:3 No - lnc-SPATA21-4:9 No - LINC01016:1 No - LINC02506:15 No - lnc-CABLES2-7:1 Yes chr2L:2856070-2857029 LINC01001:11 No - lnc-RNF135-1:23 No - lnc-CANX-1:10 No - PAX8-AS1:27 Yes chr4:1088798-1113317 lnc-RAD1-5:4 No - lnc-CCDC117-1:7 No - lnc-TFAP2C-6:3 No - lnc-VMP1-8:1 No - lnc-SCRN1-4:1 No - lnc-ANKRD36B-3:23 No - lnc-C13orf42-7:4 Yes chrX:13668014-13669573 lnc-ZNF320-1:9 No - lnc-TSHZ2-16:1 No - lnc-RBPMS-3:1 No - lnc-KLRB1-12:5 No - lnc-RPRML-3:27 Yes chr3L:5366455-5367381 lnc-OR4F5-7:3 No - lnc-TSHZ2-11:2 No - lnc-PSMB9-6:7 No - lnc-CCSAP-1:10 No - TRIM52-AS1:9 No - lnc-NME4-1:8 Yes chr3R:25199818-25214255 LINC02489:7 No - LINC01116:9 No - lnc-TRIM26-2:37 No - lnc-BAG3-4:2 No - lnc-PGRMC1-1:3 No - GMDS-DT:131 No - lnc-NAV1-9:5 No - lnc-STC2-1:6 No - lnc-C10orf90-2:3 Yes chr3R:23781765-23801634 lnc-GNAQ-7:2 No - lnc-HMX1-4:8 No - lnc-SPRYD3-1:17 Yes chr3L:27842669-27858271 lnc-DHFR2-4:1 No - ATP6V0E2-AS1:5 No - lnc-TMEM106C-8:1 No - lnc-BICDL1-1:3 Yes chrX:20155766-20159872 lnc-ZNF487-1:1 No - lnc-PAK4-2:1 No - lnc-NPIPA2-1:1 No - lnc-ARFGEF3-3:1 No - PRKAG2-AS1:8 No - lnc-OR4F21-5:3 No - lnc-E2F6-6:1 No - LINC00472:20 No - lnc-PPIAL4C-4:16 No - TBX2-AS1:5 Yes chrX:4412856-4485647 FGD5-AS1:16 No - THUMPD3-AS1:29 No - lnc-ANKRD20A2-22:3 No - lnc-ARFGEF3-6:1 No - lnc-PDPK1-3:2 No - LINC01637:14 No - lnc-EIF3A-2:4 No - lnc-SAYSD1-3:1 No - lnc-NOVA1-9:6 No - lnc-TRIM26-2:34 No - lnc-RANBP9-1:2 No - lnc-PPP1R14B-1:3 No - lnc-EMC3-3:12 No - PCBP1-AS1:40 No - NUTM2A-AS1:19 No - lnc-SLC39A11-10:5 No - lnc-PRKAB2-4:2 No - TMEM254-AS1:12 No - lnc-MINDY1-2:2 No - SNHG17:6 No - GLIDR:7 No - lnc-ALDH3B2-3:4 No - lnc-ECE1-2:2 No - LINC01123:1 No - lnc-GRHL2-2:2 No - lnc-FTO-7:1 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-EDIL3-12:1 No - MCF2L-AS1:2 Yes chr2R:5468319-5495861 lnc-KHNYN-1:3 No - lnc-SOWAHB-5:10 No - lnc-RASL11B-11:1 No - lnc-IGFBP3-5:1 Yes chrX:14787478-14826073 lnc-DR1-2:2 Yes chr2L:15007813-15008538 lnc-SLC38A8-2:6 No - FAM239A:23 No - POC1B-AS1:41 No - lnc-PICK1-5:1 No - lnc-C5orf30-9:1 No - lnc-IFT74-9:2 No - LINC00115:24 No - LINC00115:25 No - lnc-SAMD11-7:3 No - lnc-SAMD11-7:4 No - lnc-SAMD11-7:5 No - lnc-SAMD11-7:6 No - lnc-SAMD11-7:7 No - lnc-SAMD11-7:8 No - lnc-SAMD11-7:9 No - LINC00115:26 No - lnc-SAMD11-5:4 No - lnc-SAMD11-5:5 No - lnc-SAMD11-5:6 No - lnc-SAMD11-5:7 No - lnc-SAMD11-5:8 No - LINC02593:28 Yes chr2L:11013206-11066998 LINC02593:23 Yes chr2L:11013206-11066998 LINC02593:24 Yes chr2L:11013206-11066998 LINC02593:25 Yes chr2L:11013206-11066998 LINC02593:26 Yes chr2L:11013206-11066998 LINC02593:29 Yes chr2L:11013206-11066998 LINC02593:27 Yes chr2L:11013206-11066998 LINC02593:30 Yes chr2L:11013206-11066998 lnc-NOC2L-10:1 No - lnc-TTLL10-3:3 No - lnc-TTLL10-3:4 No - lnc-TTLL10-3:5 No - lnc-TTLL10-3:6 No - lnc-TTLL10-3:7 No - lnc-TTLL10-3:8 No - lnc-TTLL10-3:9 No - lnc-TAS1R3-4:1 No - lnc-TAS1R3-4:2 No - lnc-TMEM88B-6:4 No - lnc-TMEM88B-2:9 Yes chr2L:5346200-5365760 lnc-TMEM88B-2:10 Yes chr2L:5346200-5365760 lnc-TMEM240-2:2 No - lnc-TMEM240-2:1 Yes chr3R:16261355-16264115 lnc-FNDC10-1:3 Yes chr2L:19034444-19041541 lnc-FNDC10-1:1 Yes chr2L:19034444-19041541 lnc-FNDC10-1:4 Yes chr2L:19034444-19041541 lnc-CDK11A-2:6 No - lnc-CDK11A-2:7 No - lnc-CDK11A-2:8 No - lnc-CDK11A-2:9 No - lnc-CALML6-1:5 No - lnc-CALML6-1:6 No - lnc-CALML6-1:7 No - lnc-CALML6-1:8 No - lnc-CALML6-1:9 No - lnc-CALML6-1:10 No - lnc-CALML6-1:11 No - lnc-CALML6-1:12 No - lnc-TMEM52-2:1 No - lnc-CFAP74-2:1 No - lnc-CFAP74-2:2 No - lnc-CFAP74-2:3 No - lnc-FAAP20-4:1 No - lnc-MMEL1-2:1 No - LINC00982:20 No - LINC00982:21 No - LINC00982:22 No - LINC00982:23 No - LINC00982:17 Yes chr2L:18714453-18732524 LINC00982:24 No - LINC00982:25 No - LINC00982:18 Yes chr2L:18714453-18732524 LINC00982:19 Yes chr2L:18714453-18732524 LINC00982:16 Yes chr2L:18714453-18732524 lnc-WRAP73-1:4 No - lnc-WRAP73-1:5 No - lnc-WRAP73-1:6 No - lnc-WRAP73-1:3 No - lnc-WRAP73-1:7 No - lnc-LRRC47-78:1 No - lnc-LRRC47-78:23 No - lnc-LRRC47-78:2 No - lnc-LRRC47-78:3 No - lnc-LRRC47-78:24 No - lnc-LRRC47-78:4 No - lnc-LRRC47-78:5 No - lnc-LRRC47-78:6 No - lnc-LRRC47-78:7 No - LINC01134:10 No - LINC01134:13 No - LINC01134:14 No - LINC01134:11 No - LINC01134:15 No - LINC01134:16 No - LINC01134:17 No - LINC01134:12 No - lnc-AJAP1-10:1 No - lnc-AJAP1-10:2 No - LINC00337:5 No - LINC00337:6 No - LINC00337:7 No - LINC00337:8 No - LINC00337:9 No - lnc-ESPN-5:1 No - lnc-ESPN-5:2 No - lnc-ESPN-5:4 No - lnc-ESPN-4:1 Yes chr3L:20149614-20198317 lnc-ESPN-4:2 Yes chr3L:20149614-20198317 lnc-ESPN-4:4 Yes chr3L:20149614-20198317 lnc-ESPN-4:3 Yes chr3L:20149614-20198317 lnc-PHF13-1:2 No - CAMTA1-DT:7 No - CAMTA1-DT:8 No - CAMTA1-DT:9 No - lnc-UTS2-1:2 Yes chrX:2685580-2692780 lnc-UTS2-1:3 Yes chrX:2685580-2692780 lnc-PARK7-5:1 No - lnc-TNFRSF9-3:1 No - LINC01714:20 No - LINC01714:21 No - LINC01714:22 No - lnc-PARK7-6:1 No - LINC01714:25 No - LINC01714:26 No - LINC01714:27 No - LINC01714:30 No - LINC01714:31 No - LINC01714:32 No - LINC01714:33 No - LINC01714:34 No - lnc-SLC45A1-1:5 Yes chr3L:8449922-8472669 lnc-SLC45A1-1:6 Yes chr3L:8449922-8472669 lnc-SLC45A1-1:7 Yes chr3L:8449922-8472669 ENO1-AS1:3 Yes chr2L:1724768-1729636 ENO1-AS1:4 Yes chr2L:1724768-1729636 ENO1-AS1:5 No - LINC01759:17 No - LINC01759:20 No - LINC01759:21 No - LINC01759:22 No - LINC01759:23 No - LINC01759:24 No - LINC01759:25 No - lnc-GPR157-5:2 No - PIK3CD-AS2:9 Yes chr3R:20628972-20634732 PIK3CD-AS2:11 Yes chr3R:20628972-20634732 PIK3CD-AS2:10 Yes chr3R:20628972-20634732 PIK3CD-AS2:8 Yes chr3R:20628972-20634732 PIK3CD-AS2:12 Yes chr3R:20628972-20634732 PIK3CD-AS2:13 Yes chr3R:20628972-20634732 lnc-NMNAT1-1:2 No - lnc-DFFA-10:1 No - lnc-DFFA-10:2 No - lnc-DFFA-11:1 No - lnc-DFFA-11:2 No - lnc-DFFA-1:2 No - lnc-TARDBP-5:2 No - lnc-TARDBP-5:3 No - lnc-TARDBP-5:4 No - lnc-TARDBP-5:5 No - lnc-TARDBP-5:6 No - lnc-UBIAD1-3:1 No - lnc-MAD2L2-4:1 Yes chrX:13122876-13128794 lnc-KIAA2013-4:1 No - lnc-KIAA2013-5:1 No - lnc-KIAA2013-6:1 No - lnc-AADACL4-3:1 No - lnc-DHRS3-1:2 No - lnc-LRRC38-8:1 No - TMEM51-AS1:6 No - lnc-CASP9-1:2 No - lnc-CASP9-1:7 No - lnc-CASP9-1:3 No - lnc-CASP9-1:4 No - lnc-CASP9-1:5 No - lnc-CASP9-1:8 No - lnc-CASP9-1:6 No - lnc-AGMAT-1:3 Yes chr3L:25798441-26014112 lnc-AGMAT-1:4 No - lnc-AGMAT-6:2 No - SLC25A34-AS1:6 No - SLC25A34-AS1:7 No - lnc-UQCRHL-2:3 No - lnc-UQCRHL-2:4 No - lnc-UQCRHL-1:7 No - lnc-UQCRHL-1:6 No - lnc-SPEN-4:1 No - lnc-SPEN-3:1 No - lnc-UQCRHL-5:1 No - lnc-CLCNKB-1:2 Yes chr4:610684-622470 lnc-CLCNKB-1:3 Yes chr4:610684-622470 lnc-CLCNKB-1:4 Yes chr4:610684-622470 lnc-CLCNKB-1:5 Yes chr4:610684-622470 lnc-CLCNKB-1:6 Yes chr4:610684-622470 lnc-CLCNKB-1:7 No - lnc-CLCNKB-1:8 No - lnc-CLCNKB-1:9 No - lnc-CLCNKB-1:10 No - lnc-CLCNKB-1:11 No - lnc-NECAP2-4:1 No - lnc-NECAP2-4:2 No - lnc-NECAP2-4:3 No - lnc-MFAP2-53:13 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-MFAP2-53:9 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-MFAP2-53:3 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-MFAP2-53:14 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-CROCC-7:1 No - lnc-PADI1-1:4 No - lnc-PADI1-1:5 No - lnc-PADI1-1:6 No - lnc-PADI1-1:7 No - lnc-PADI1-1:8 No - lnc-PADI1-1:9 No - lnc-PADI1-1:10 No - lnc-PADI1-1:11 No - lnc-PADI1-1:12 No - lnc-PADI6-3:1 No - lnc-PADI6-3:2 No - lnc-PADI6-3:3 No - lnc-TAS1R2-2:1 No - lnc-TAS1R2-2:2 No - lnc-TAS1R2-2:3 No - lnc-TAS1R2-2:4 No - lnc-PAX7-7:1 No - lnc-IFFO2-1:1 No - lnc-IFFO2-1:2 No - lnc-UBR4-4:1 No - lnc-MRTO4-1:8 Yes chr3R:7903030-7907363 lnc-MRTO4-1:9 Yes chr3R:7903030-7907363 lnc-MRTO4-1:12 No - lnc-MINOS1-1:2 Yes chr2L:1704902-1706962 lnc-MINOS1-1:3 No - lnc-MINOS1-1:4 No - lnc-MINOS1-1:5 No - lnc-TMCO4-1:4 No - lnc-TMCO4-1:2 No - lnc-TMCO4-1:3 No - lnc-PLA2G2C-5:1 No - UBXN10-AS1:7 No - UBXN10-AS1:6 No - UBXN10-AS1:4 No - lnc-FAM43B-2:1 No - lnc-PINK1-3:1 No - lnc-PINK1-3:2 No - lnc-NBPF3-3:9 Yes chrX:19961297-19969323 lnc-NBPF3-11:1 No - lnc-NBPF3-11:2 No - lnc-NBPF3-11:3 No - LINC02596:7 No - LINC02596:8 No - LINC02596:9 Yes chr2L:7497805-7578980 lnc-LDLRAD2-3:1 Yes chr3R:31777020-31790681 lnc-CELA3A-5:2 No - lnc-CELA3A-5:17 No - lnc-CELA3A-5:18 No - lnc-CELA3A-5:19 No - lnc-CELA3A-5:20 No - lnc-CELA3A-5:21 No - lnc-WNT4-1:5 No - lnc-WNT4-1:6 No - lnc-WNT4-1:7 No - lnc-WNT4-1:3 No - lnc-WNT4-1:4 No - lnc-KDM1A-4:1 No - lnc-RPL11-5:1 Yes chr3L:749400-753492 lnc-RPL11-4:1 No - ELOA-AS1:16 Yes chr3R:23251563-23255071 ELOA-AS1:17 Yes chr3R:23251563-23255071 ELOA-AS1:18 Yes chr3R:23251563-23255071 ELOA-AS1:19 Yes chr3R:23251563-23255071 ELOA-AS1:20 No - ELOA-AS1:21 No - lnc-LYPLA2-1:1 No - lnc-LYPLA2-1:2 Yes chr2L:6960377-6961653 RCAN3AS:16 Yes chr3R:16186999-16197584 RCAN3AS:17 Yes chr3R:16186999-16197584 RCAN3AS:18 Yes chr3R:16186999-16197584 RCAN3AS:19 Yes chr3R:16186999-16197584 RCAN3AS:14 Yes chr3R:16186999-16197584 RCAN3AS:20 Yes chr3R:16186999-16197584 lnc-CLIC4-2:3 No - lnc-CLIC4-2:4 No - lnc-CLIC4-2:5 No - lnc-CLIC4-2:6 No - lnc-CLIC4-2:7 No - lnc-CLIC4-2:8 No - lnc-AUNIP-2:3 No - lnc-AUNIP-2:4 No - lnc-AUNIP-2:5 No - lnc-AUNIP-2:6 No - lnc-AUNIP-2:7 No - lnc-AUNIP-2:8 No - lnc-MTFR1L-1:1 No - lnc-C1orf232-1:1 No - lnc-C1orf232-1:2 No - lnc-C1orf232-1:3 No - lnc-C1orf232-3:1 No - lnc-C1orf232-3:2 No - lnc-ZNF683-6:1 Yes chr3L:5654681-5657384 lnc-ZNF683-6:2 Yes chr3L:5654681-5657384 lnc-ZNF683-6:5 No - lnc-ZNF683-6:3 No - lnc-ZNF683-6:4 No - lnc-ZNF683-7:1 No - lnc-ZNF683-7:2 No - lnc-HMGN2-6:1 No - lnc-GPN2-2:2 Yes chr3R:17687818-17718350 lnc-TRNP1-1:3 No - lnc-TRNP1-1:4 No - lnc-TRNP1-1:5 No - lnc-TRNP1-1:6 No - lnc-TRNP1-1:7 No - lnc-TRNP1-1:8 No - lnc-FGR-2:1 No - lnc-EYA3-3:1 No - lnc-EYA3-4:1 No - lnc-PTAFR-4:2 No - lnc-PTAFR-4:1 No - lnc-DNAJC8-1:7 No - lnc-DNAJC8-1:9 No - lnc-DNAJC8-1:10 No - lnc-DNAJC8-1:8 No - lnc-DNAJC8-1:11 No - lnc-DNAJC8-2:1 No - lnc-TAF12-6:1 No - SNHG12:16 Yes chr2L:4453169-4454453 SNHG12:28 Yes chr2L:4453169-4454453 SNHG12:17 Yes chr2L:4453169-4454453 SNHG12:18 Yes chr2L:4453169-4454453 SNHG12:19 Yes chr2L:4453169-4454453 SNHG12:20 Yes chr2L:4453169-4454453 SNHG12:21 Yes chr2L:4453169-4454453 SNHG12:22 Yes chr2L:4453169-4454453 SNHG12:23 Yes chr2L:4453169-4454453 SNHG12:24 Yes chr2L:4453169-4454453 SNHG12:25 No - SNHG12:26 No - SNHG12:27 No - LINC01715:11 No - LINC01715:12 No - LINC01715:13 No - LINC01715:14 No - LINC01715:15 No - LINC01715:17 No - lnc-PTPRU-10:1 No - lnc-MATN1-6:1 No - lnc-MATN1-6:2 No - lnc-NKAIN1-5:1 No - lnc-NKAIN1-5:2 No - lnc-ZCCHC17-17:1 No - lnc-ZCCHC17-17:2 No - lnc-ZCCHC17-17:3 No - LINC01226:5 No - LINC01226:6 No - LINC01226:4 No - LINC01226:7 No - LINC01226:8 No - LINC01226:9 No - lnc-PEF1-1:2 Yes chr2R:22189817-22202671 lnc-PEF1-1:3 Yes chr2R:22189817-22202671 lnc-PEF1-1:4 Yes chr2R:22189817-22202671 lnc-PEF1-1:5 Yes chr2R:22189817-22202671 lnc-PEF1-1:6 Yes chr2R:22189817-22202671 lnc-HCRTR1-1:27 No - lnc-HCRTR1-1:26 No - lnc-HCRTR1-1:28 No - lnc-SPOCD1-4:3 No - lnc-SPOCD1-4:1 No - lnc-SPOCD1-4:2 No - lnc-KHDRBS1-3:1 Yes chr2L:16245835-16257606 lnc-KHDRBS1-2:1 Yes chr2R:22409208-22411545 lnc-PTP4A2-6:1 No - lnc-PTP4A2-1:3 No - lnc-PTP4A2-1:2 Yes chr2R:14157762-14159434 lnc-TMEM234-8:1 No - lnc-MARCKSL1-2:1 No - lnc-TSSK3-5:1 No - lnc-SYNC-1:2 No - lnc-SYNC-1:3 No - lnc-SYNC-1:4 No - lnc-HPCA-5:1 No - lnc-ZNF362-2:2 Yes chrX:2115727-2123286 lnc-ZNF362-2:5 Yes chrX:2115727-2123286 lnc-SMIM12-1:1 No - lnc-SMIM12-1:2 No - lnc-SMIM12-1:3 No - lnc-SMIM12-1:4 No - lnc-TMEM35B-1:2 No - lnc-TMEM35B-1:3 No - lnc-TMEM35B-1:4 No - lnc-KIAA0319L-1:3 Yes chr3L:21586828-21613349 lnc-KIAA0319L-1:4 Yes chr3L:21586828-21613349 lnc-TFAP2E-8:1 Yes chr2L:2653046-2653926 lnc-COL8A2-60:3 No - lnc-COL8A2-60:1 No - lnc-COL8A2-60:2 No - lnc-COL8A2-60:4 No - lnc-TRAPPC3-2:1 No - lnc-SH3D21-7:1 No - lnc-SH3D21-7:2 No - lnc-SH3D21-7:3 No - lnc-SH3D21-7:4 No - lnc-SH3D21-7:5 No - lnc-SH3D21-7:6 No - lnc-SH3D21-8:1 No - lnc-SH3D21-1:2 No - lnc-SH3D21-9:1 No - lnc-ZC3H12A-2:1 No - LINC01137:11 No - LINC01137:8 No - LINC01137:12 No - LINC01137:9 No - LINC01137:10 No - lnc-DNALI1-5:1 No - lnc-DNALI1-5:2 No - lnc-DNALI1-5:3 No - lnc-DNALI1-5:4 No - lnc-DNALI1-5:5 No - lnc-C1orf122-1:2 Yes chrX:1922981-1927524 lnc-UTP11-1:1 No - lnc-UTP11-1:2 No - lnc-UTP11-1:3 No - lnc-UTP11-1:4 No - lnc-UTP11-1:5 No - lnc-UTP11-1:7 No - lnc-UTP11-1:8 No - lnc-UTP11-1:9 No - lnc-UTP11-1:10 No - lnc-AKIRIN1-16:1 No - lnc-AKIRIN1-15:1 No - lnc-RHBDL2-2:1 No - lnc-NDUFS5-7:1 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-PPIE-1:3 No - lnc-PPIE-1:4 No - lnc-PPIE-1:5 No - lnc-PPIE-1:6 No - lnc-MFSD2A-5:1 No - lnc-PPT1-4:7 No - lnc-PPT1-4:3 Yes chr2L:1151678-1158262 lnc-PPT1-4:4 Yes chr2L:1151678-1158262 lnc-PPT1-4:1 Yes chr2L:1151678-1158262 lnc-PPT1-4:5 Yes chr2L:1151678-1158262 lnc-PPT1-4:6 No - lnc-PPT1-4:2 Yes chr2L:1151678-1158262 lnc-PPT1-1:5 No - lnc-PPT1-1:3 No - lnc-PPT1-1:4 No - lnc-COL9A2-1:4 No - lnc-COL9A2-1:5 No - lnc-COL9A2-1:6 No - lnc-RIMS3-9:1 No - lnc-RIMS3-4:3 No - lnc-RIMS3-4:4 No - lnc-RIMS3-4:5 No - lnc-RIMS3-4:6 No - lnc-RIMS3-4:2 No - lnc-RIMS3-4:7 No - lnc-RIMS3-8:1 No - NFYC-AS1:4 Yes chrX:6818178-6820919 NFYC-AS1:5 Yes chrX:6818178-6820919 lnc-KCNQ4-7:1 No - lnc-KCNQ4-7:2 No - lnc-KCNQ4-7:3 No - lnc-KCNQ4-7:4 No - lnc-KCNQ4-7:5 No - lnc-CITED4-1:6 No - lnc-CITED4-1:3 No - lnc-CITED4-1:4 No - lnc-CITED4-1:5 No - lnc-CITED4-1:2 No - lnc-FOXO6-2:8 Yes chr3R:9633359-9637611 lnc-FOXO6-2:9 Yes chr3R:9633359-9637611 lnc-FOXO6-2:10 Yes chr3R:9633359-9637611 lnc-FOXO6-2:11 Yes chr3R:9633359-9637611 lnc-FOXO6-2:12 Yes chr3R:9633359-9637611 lnc-FOXO6-2:13 No - lnc-FOXO6-2:14 No - lnc-FOXO6-2:17 No - lnc-FOXO6-2:15 No - lnc-FOXO6-2:16 No - lnc-FOXO6-1:2 No - lnc-FOXO6-1:3 No - lnc-FOXO6-1:4 No - lnc-FOXO6-1:5 No - lnc-FOXO6-6:2 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-FOXO6-6:1 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-GUCA2B-4:1 No - lnc-RIMKLA-1:2 No - lnc-CLDN19-3:1 Yes chr2R:6675028-6676001 lnc-CLDN19-3:2 Yes chr2R:6675028-6676001 lnc-CLDN19-3:3 Yes chr2R:6675028-6676001 lnc-CLDN19-3:4 No - lnc-CLDN19-3:5 No - lnc-SVBP-1:3 No - lnc-SVBP-1:4 No - lnc-SVBP-1:5 No - lnc-SVBP-1:6 No - lnc-SVBP-1:7 No - lnc-SVBP-1:8 No - lnc-SVBP-1:9 No - lnc-SVBP-1:10 No - lnc-ZNF691-5:1 No - lnc-ZNF691-5:2 Yes chr3L:914074-993788 SLC2A1-AS1:7 Yes chr3L:914074-993788 SLC2A1-AS1:8 Yes chr3L:914074-993788 SLC2A1-AS1:9 Yes chr3L:914074-993788 SLC2A1-AS1:10 Yes chr3L:914074-993788 SLC2A1-AS1:6 No - SLC2A1-AS1:11 Yes chr3L:914074-993788 SLC2A1-AS1:12 Yes chr3L:914074-993788 SLC2A1-AS1:13 Yes chr3L:914074-993788 SLC2A1-AS1:14 Yes chr3L:914074-993788 SLC2A1-AS1:15 Yes chr3L:914074-993788 lnc-ELOVL1-1:7 No - lnc-ELOVL1-1:6 No - lnc-ELOVL1-1:8 No - lnc-CDC20-2:5 No - lnc-CDC20-2:6 No - lnc-CDC20-2:7 No - HYI-AS1:2 No - HYI-AS1:3 No - KDM4A-AS1:8 No - KDM4A-AS1:9 No - KDM4A-AS1:7 No - lnc-SLC6A9-2:10 No - lnc-SLC6A9-2:5 No - lnc-SLC6A9-2:11 No - lnc-SLC6A9-2:6 No - lnc-SLC6A9-2:7 No - lnc-SLC6A9-2:8 No - lnc-SLC6A9-2:12 No - lnc-SLC6A9-2:9 No - lnc-SLC6A9-6:2 No - lnc-SLC6A9-6:3 No - lnc-KLF17-1:26 Yes chr2R:23820354-23839864 lnc-KLF17-1:27 Yes chr2R:23820354-23839864 lnc-KLF17-1:28 No - lnc-KLF17-1:29 No - lnc-KLF17-1:30 No - lnc-KLF17-1:31 No - lnc-KLF17-1:32 No - lnc-KLF17-1:33 No - lnc-ERI3-8:2 No - lnc-ERI3-8:1 No - lnc-TMEM53-2:1 Yes chr3R:22724884-22726414 lnc-BEST4-1:3 No - lnc-BEST4-3:1 Yes chr3R:29861582-29863902 lnc-UROD-1:2 No - lnc-UROD-1:3 No - lnc-UROD-1:4 No - LINC01144:8 No - LINC01144:9 No - LINC01144:10 No - LINC01144:11 No - LINC01144:12 No - lnc-MMACHC-1:1 Yes chrX:13329824-13331994 lnc-PRDX1-1:1 No - lnc-PRDX1-2:1 Yes chr3L:11620535-11624381 lnc-CCDC17-5:2 No - lnc-CCDC17-5:3 No - lnc-TSPAN1-1:4 Yes chr2L:297880-305233 lnc-TSPAN1-1:5 Yes chr2L:297880-305233 lnc-TSPAN1-1:6 Yes chr2L:297880-305233 lnc-TSPAN1-1:7 Yes chr2L:297880-305233 lnc-POMGNT1-1:8 No - lnc-POMGNT1-1:9 No - lnc-POMGNT1-1:10 No - lnc-POMGNT1-1:11 No - lnc-LRRC41-3:2 Yes chr2L:1147822-1149449 lnc-LRRC41-3:1 Yes chr2L:1147822-1149449 lnc-TEX38-3:5 Yes chr3R:11750931-11764457 lnc-TEX38-3:6 No - lnc-TEX38-3:7 No - LINC01389:11 Yes chr2R:22868159-22870706 lnc-FOXD2-10:2 Yes chr2R:22868159-22870706 LINC01562:3 No - LINC01562:4 No - LINC01562:2 No - lnc-TTC39A-4:1 Yes chr4:314923-331387 TTC39A-AS1:5 No - TTC39A-AS1:7 No - lnc-OSBPL9-1:3 Yes chr2R:24768314-24775265 lnc-OSBPL9-1:4 Yes chr2R:24768314-24775265 lnc-OSBPL9-1:5 Yes chr2R:24768314-24775265 lnc-OSBPL9-1:6 Yes chr2R:24768314-24775265 lnc-OSBPL9-1:7 Yes chr2R:24768314-24775265 lnc-OSBPL9-9:1 No - lnc-GPX7-1:2 No - lnc-CPT2-2:3 No - lnc-CPT2-3:4 Yes chr2R:21128577-21129737 lnc-CPT2-3:5 No - lnc-CPT2-3:6 No - LINC01771:10 No - LINC01771:11 No - LINC01771:12 No - LINC01771:13 No - LINC01771:14 No - lnc-MRPL37-1:5 Yes chr3R:18192494-18199595 lnc-LEXM-2:1 No - lnc-LEXM-2:2 No - lnc-LEXM-2:3 No - lnc-LEXM-2:4 No - lnc-LEXM-2:5 No - lnc-PCSK9-1:4 No - lnc-PCSK9-4:8 No - lnc-PCSK9-4:9 No - LINC01767:14 Yes chr2R:9400531-9413463 LINC01767:15 Yes chr2R:9400531-9413463 LINC01767:20 Yes chr2R:9400531-9413463 LINC01767:21 Yes chr2R:9400531-9413463 DAB1-AS1:37 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:38 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:39 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:40 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:41 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:42 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:43 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:44 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:45 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:46 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:47 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:48 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:49 Yes chr3L:16712126-16724575 DAB1-AS1:50 Yes chr3L:16712126-16724575 LINC01135:10 Yes chr2R:10096480-10098556 LINC01135:11 No - LINC01135:12 No - LINC01135:13 No - LINC01135:14 No - LINC01135:15 No - LINC01135:16 No - LINC01135:17 No - LINC01135:18 No - LINC01135:20 No - LINC01135:21 No - LINC01135:19 No - LINC01135:28 No - LINC01135:25 No - LINC01135:26 No - LINC01135:27 No - lnc-JUN-2:12 No - lnc-JUN-2:17 No - lnc-JUN-2:15 No - lnc-JUN-2:13 No - lnc-JUN-2:8 No - lnc-JUN-2:9 No - lnc-JUN-2:16 No - lnc-JUN-2:11 No - lnc-JUN-2:14 No - lnc-JUN-2:10 No - lnc-JUN-5:19 No - lnc-JUN-5:17 No - lnc-JUN-5:20 No - lnc-JUN-5:18 No - lnc-JUN-5:16 No - lnc-JUN-6:6 No - lnc-JUN-6:4 Yes chr3L:4022700-4026011 lnc-JUN-6:7 No - lnc-JUN-6:8 No - lnc-JUN-6:9 No - lnc-JUN-6:5 No - LINC01748:19 Yes chr4:268175-276369 LINC01748:31 No - LINC01748:20 Yes chr4:268175-276369 LINC01748:21 Yes chr4:268175-276369 LINC01748:22 Yes chr4:268175-276369 LINC01748:23 Yes chr4:268175-276369 NFIA-AS2:11 Yes chr4:268175-276369 NFIA-AS2:18 Yes chr4:268175-276369 NFIA-AS2:17 Yes chr4:268175-276369 NFIA-AS2:19 Yes chr4:268175-276369 NFIA-AS2:12 Yes chr4:268175-276369 NFIA-AS2:13 Yes chr4:268175-276369 NFIA-AS2:8 Yes chr4:268175-276369 NFIA-AS2:7 Yes chr4:268175-276369 NFIA-AS2:9 Yes chr4:268175-276369 NFIA-AS2:14 Yes chr4:268175-276369 NFIA-AS2:10 Yes chr4:268175-276369 NFIA-AS2:15 Yes chr4:268175-276369 NFIA-AS2:16 Yes chr4:268175-276369 NFIA-AS1:12 Yes chr4:268175-276369 NFIA-AS1:10 Yes chr4:268175-276369 NFIA-AS1:11 Yes chr4:268175-276369 NFIA-AS1:13 Yes chr4:268175-276369 lnc-DOCK7-8:1 No - lnc-DOCK7-8:2 No - lnc-ATG4C-2:4 No - lnc-ATG4C-2:5 No - lnc-ATG4C-2:6 No - LINC00466:19 No - LINC00466:25 No - LINC00466:21 No - LINC00466:20 No - LINC00466:22 No - LINC00466:23 No - LINC00466:24 No - FOXD3-AS1:13 Yes chr2R:22868159-22870706 FOXD3-AS1:14 Yes chr2R:22868159-22870706 FOXD3-AS1:15 Yes chr2R:22868159-22870706 FOXD3-AS1:18 Yes chr2R:22868159-22870706 FOXD3-AS1:16 Yes chr2R:22868159-22870706 FOXD3-AS1:21 No - FOXD3-AS1:22 No - FOXD3-AS1:23 No - FOXD3-AS1:19 No - FOXD3-AS1:20 No - FOXD3-AS1:17 Yes chr2R:22868159-22870706 LINC01359:13 No - LINC01359:14 No - LINC01359:15 No - lnc-JAK1-2:2 No - lnc-JAK1-2:3 No - lnc-INSL5-4:1 No - lnc-INSL5-4:2 No - lnc-PDE4B-1:3 No - lnc-PDE4B-1:4 No - lnc-PDE4B-1:5 No - lnc-INSL5-3:1 Yes chr3R:9516007-9527237 lnc-INSL5-3:2 Yes chr3R:9516007-9527237 lnc-GADD45A-9:1 No - lnc-GADD45A-9:2 No - lnc-GADD45A-9:3 No - lnc-GADD45A-9:4 No - lnc-RPE65-4:2 No - lnc-RPE65-4:1 No - lnc-RPE65-4:3 No - lnc-GADD45A-2:2 No - DEPDC1-AS1:2 No - DEPDC1-AS1:3 No - lnc-LRRC40-4:2 Yes chr2R:14935660-14940722 lnc-ANKRD13C-4:1 No - ZRANB2-AS2:43 No - ZRANB2-AS2:44 No - ZRANB2-AS2:45 No - ZRANB2-AS2:46 No - ZRANB2-AS2:47 No - ZRANB2-AS2:48 No - ZRANB2-AS2:41 No - ZRANB2-AS2:49 Yes chr3L:5424109-5442399 ZRANB2-AS2:50 Yes chr3L:5424109-5442399 ZRANB2-AS2:42 Yes chr3L:5424109-5442399 ZRANB2-AS2:51 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-ASB17-3:1 No - lnc-AK5-1:4 No - lnc-AK5-1:6 No - lnc-AK5-1:5 No - lnc-AK5-1:7 No - lnc-AK5-1:8 No - lnc-AK5-1:9 No - lnc-AK5-1:10 No - lnc-AK5-1:11 No - lnc-AK5-1:12 No - lnc-AK5-1:13 No - lnc-MIGA1-3:1 No - NEXN-AS1:3 No - lnc-FUBP1-3:2 No - lnc-FUBP1-3:3 No - lnc-FUBP1-3:4 No - lnc-PTGFR-1:10 No - lnc-PTGFR-1:11 No - lnc-PTGFR-1:12 No - lnc-PTGFR-1:13 No - lnc-TTLL7-5:4 No - lnc-TTLL7-5:5 No - lnc-TTLL7-5:2 No - lnc-TTLL7-5:3 No - lnc-TTLL7-5:6 No - LINC01725:45 No - LINC01725:32 No - LINC01725:46 No - LINC01725:33 No - LINC01725:34 No - LINC01725:35 No - LINC01725:36 No - LINC01725:37 No - LINC01725:38 No - LINC01725:39 No - lnc-TTLL7-3:4 No - lnc-TTLL7-3:5 No - lnc-TTLL7-3:6 No - lnc-TTLL7-3:7 No - lnc-TTLL7-3:8 No - lnc-GNG5-9:7 Yes chrX:2698701-2701033 lnc-GNG5-9:8 Yes chrX:2698701-2701033 lnc-GNG5-9:9 Yes chrX:2698701-2701033 lnc-GNG5-9:6 Yes chrX:2698701-2701033 lnc-GNG5-9:1 Yes chrX:2698701-2701033 lnc-GNG5-9:2 Yes chrX:2698701-2701033 lnc-GNG5-9:3 Yes chrX:2698701-2701033 lnc-GNG5-9:4 Yes chrX:2698701-2701033 lnc-GNG5-9:5 Yes chrX:2698701-2701033 lnc-GNG5-1:4 No - lnc-GNG5-1:5 No - lnc-GNG5-1:6 No - lnc-GNG5-1:8 No - lnc-GNG5-1:7 No - lnc-CTBS-4:1 No - lnc-CTBS-4:2 No - lnc-CTBS-4:3 No - lnc-CTBS-4:4 No - lnc-CTBS-4:5 No - lnc-SPATA1-3:1 No - lnc-SPATA1-3:2 No - lnc-WDR63-6:1 No - lnc-WDR63-6:2 No - lnc-CYR61-3:11 No - lnc-CYR61-3:12 No - lnc-CYR61-3:13 No - lnc-CYR61-6:1 No - lnc-SELENOF-2:1 Yes chr2R:19307447-19310665 lnc-SELENOF-2:2 Yes chr2R:19307447-19310665 lnc-SELENOF-2:5 No - lnc-SELENOF-2:6 No - lnc-SELENOF-2:7 No - lnc-SELENOF-2:8 No - lnc-SELENOF-2:9 No - lnc-SELENOF-15:1 No - lnc-SH3GLB1-1:1 No - lnc-LMO4-2:16 No - lnc-LMO4-2:17 No - lnc-LMO4-2:18 No - lnc-LMO4-2:19 No - lnc-PKN2-2:3 No - lnc-PKN2-2:4 No - lnc-PKN2-2:5 No - lnc-PKN2-2:6 No - LRRC8C-DT:41 No - LRRC8C-DT:29 No - LRRC8C-DT:30 No - LRRC8C-DT:42 No - LRRC8C-DT:43 No - LRRC8C-DT:31 No - LRRC8C-DT:44 No - LRRC8C-DT:45 No - LRRC8C-DT:32 No - LRRC8C-DT:33 No - LRRC8C-DT:46 No - LRRC8C-DT:47 No - lnc-GBP5-11:3 No - lnc-ZNF326-6:1 No - lnc-ZNF326-6:2 No - lnc-ZNF644-1:24 No - lnc-ZNF644-1:25 No - lnc-ZNF644-1:19 No - lnc-ZNF644-1:20 No - lnc-ZNF644-1:21 No - lnc-ZNF644-1:18 No - lnc-ZNF644-1:22 No - lnc-ZNF644-1:23 No - LINC01763:16 No - LINC01763:17 No - LINC01763:18 No - LINC01763:19 No - lnc-HFM1-4:1 Yes chrX:6654541-6659709 lnc-HFM1-4:2 Yes chrX:6654541-6659709 lnc-HFM1-4:11 No - lnc-HFM1-4:3 No - lnc-HFM1-4:4 No - lnc-HFM1-4:6 No - lnc-HFM1-4:12 No - lnc-HFM1-4:5 No - lnc-HFM1-4:9 No - lnc-HFM1-4:7 No - lnc-HFM1-4:10 No - lnc-SETSIP-2:9 No - lnc-SETSIP-2:10 No - lnc-SETSIP-2:11 No - lnc-SETSIP-2:13 No - lnc-SETSIP-2:14 No - lnc-SETSIP-2:15 No - lnc-SETSIP-2:12 No - lnc-MTF2-4:1 No - lnc-FAM69A-3:1 No - lnc-TMED5-6:1 No - CCDC18-AS1:54 No - CCDC18-AS1:50 No - CCDC18-AS1:45 No - CCDC18-AS1:61 No - CCDC18-AS1:62 No - CCDC18-AS1:51 No - CCDC18-AS1:63 No - CCDC18-AS1:49 No - CCDC18-AS1:66 No - CCDC18-AS1:67 No - CCDC18-AS1:68 No - CCDC18-AS1:46 Yes chr2L:15007813-15008538 CCDC18-AS1:47 Yes chr2L:15007813-15008538 CCDC18-AS1:64 No - CCDC18-AS1:44 Yes chr2L:15007813-15008538 CCDC18-AS1:48 Yes chr2L:15007813-15008538 CCDC18-AS1:69 No - CCDC18-AS1:52 No - CCDC18-AS1:70 No - CCDC18-AS1:71 No - CCDC18-AS1:53 No - CCDC18-AS1:65 No - CCDC18-AS1:55 No - CCDC18-AS1:56 No - CCDC18-AS1:57 No - CCDC18-AS1:58 No - CCDC18-AS1:59 No - CCDC18-AS1:60 No - lnc-DNTTIP2-6:1 Yes chr2L:6007364-6012338 lnc-DNTTIP2-1:4 Yes chr2L:6007364-6012338 lnc-DNTTIP2-1:5 Yes chr2L:6007364-6012338 lnc-DNTTIP2-1:6 Yes chr2L:6007364-6012338 lnc-FNBP1L-2:4 Yes chr2L:6007364-6012338 lnc-FNBP1L-2:5 Yes chr2L:6007364-6012338 lnc-FNBP1L-2:6 Yes chr2L:6007364-6012338 lnc-FNBP1L-6:1 Yes chr3R:7472458-7473781 lnc-FNBP1L-6:2 Yes chr3R:7472458-7473781 lnc-ABCD3-9:1 No - lnc-ABCD3-9:2 No - lnc-ABCD3-2:11 No - lnc-ABCD3-2:12 No - lnc-ABCD3-2:13 No - lnc-ABCD3-1:3 No - lnc-ABCD3-1:4 No - lnc-ABCD3-1:5 No - lnc-ABCD3-1:6 No - lnc-ABCD3-1:7 No - lnc-F3-6:1 No - lnc-F3-7:11 No - lnc-F3-7:2 No - lnc-F3-7:12 No - lnc-F3-7:3 No - lnc-F3-7:13 No - lnc-F3-7:4 No - lnc-F3-7:5 No - lnc-F3-7:6 No - lnc-F3-7:14 No - lnc-CNN3-1:4 Yes chr3L:4277962-4281585 lnc-CNN3-1:3 Yes chr3L:4277962-4281585 lnc-SLC44A3-1:20 No - lnc-SLC44A3-1:21 No - lnc-SLC44A3-1:22 No - lnc-SLC44A3-1:23 No - lnc-SLC44A3-1:24 No - lnc-SLC44A3-1:25 No - lnc-SLC44A3-1:26 No - lnc-TMEM56-3:1 No - lnc-ALG14-1:11 No - lnc-ALG14-1:6 No - lnc-ALG14-1:7 No - lnc-ALG14-1:4 No - lnc-ALG14-1:12 No - lnc-ALG14-1:13 No - lnc-ALG14-1:8 No - lnc-ALG14-1:9 No - lnc-ALG14-1:5 No - lnc-ALG14-1:10 No - lnc-RWDD3-5:9 No - lnc-RWDD3-5:11 No - lnc-RWDD3-5:10 No - lnc-RWDD3-5:12 No - lnc-RWDD3-5:13 No - lnc-RWDD3-5:14 No - lnc-RWDD3-5:15 No - lnc-RWDD3-5:16 No - lnc-RWDD3-5:17 No - lnc-RWDD3-5:20 No - lnc-RWDD3-5:21 No - lnc-RWDD3-5:22 No - lnc-RWDD3-5:23 No - lnc-RWDD3-5:24 No - lnc-PTBP2-12:1 No - lnc-PTBP2-12:2 No - LINC01776:17 No - LINC01776:18 No - LINC01776:19 No - LINC01776:20 No - LINC01776:21 No - LINC01776:22 No - LINC01776:23 No - LINC01776:24 No - LINC01776:26 No - LINC01776:27 No - LINC01776:28 No - LINC01776:29 No - lnc-PLPPR5-7:3 No - lnc-PLPPR5-7:4 No - LINC01708:16 No - LINC01708:17 No - LINC01708:18 No - LINC01708:19 No - LINC01708:20 No - LINC01708:21 No - lnc-SASS6-2:6 No - lnc-SASS6-2:4 No - lnc-SASS6-2:11 No - lnc-SASS6-2:7 No - lnc-SASS6-2:8 No - lnc-SASS6-2:9 No - lnc-SASS6-2:10 No - lnc-SASS6-2:5 Yes chr3L:3128034-3143457 RTCA-AS1:6 No - RTCA-AS1:7 No - RTCA-AS1:8 No - RTCA-AS1:9 No - RTCA-AS1:10 No - lnc-DBT-7:1 Yes chr2L:7801668-7810703 lnc-SLC30A7-3:2 No - lnc-SLC30A7-2:24 Yes chr3R:22582028-22583225 lnc-SLC30A7-2:25 Yes chr3R:22582028-22583225 lnc-SLC30A7-2:26 Yes chr3R:22582028-22583225 lnc-SLC30A7-2:27 Yes chr3R:22582028-22583225 lnc-SLC30A7-2:28 Yes chr3R:22582028-22583225 lnc-SLC30A7-2:29 Yes chr3R:22582028-22583225 lnc-SLC30A7-2:23 Yes chr3R:22582028-22583225 lnc-S1PR1-2:6 No - lnc-S1PR1-2:7 No - lnc-S1PR1-2:8 No - lnc-S1PR1-2:9 No - lnc-S1PR1-2:10 No - lnc-DPH5-1:4 No - lnc-DPH5-1:5 No - lnc-DPH5-1:6 No - lnc-DPH5-1:7 No - lnc-DPH5-1:8 No - lnc-AMY1B-1:12 No - lnc-AMY1B-1:13 No - lnc-AMY1B-1:10 No - lnc-AMY1B-1:11 No - lnc-VAV3-11:1 No - lnc-VAV3-11:2 No - VAV3-AS1:2 Yes chrX:19261820-19273280 VAV3-AS1:3 Yes chrX:19261820-19273280 VAV3-AS1:4 Yes chrX:19261820-19273280 VAV3-AS1:5 Yes chrX:19261820-19273280 VAV3-AS1:6 Yes chrX:19261820-19273280 VAV3-AS1:7 Yes chrX:19261820-19273280 VAV3-AS1:8 Yes chrX:19261820-19273280 VAV3-AS1:9 Yes chrX:19261820-19273280 VAV3-AS1:11 No - VAV3-AS1:12 No - lnc-NBPF6-2:5 Yes chr3L:12402295-12414842 lnc-NBPF6-2:6 Yes chr3L:12402295-12414842 lnc-HENMT1-4:1 No - lnc-FAM102B-3:5 Yes chr2R:12145710-12152752 lnc-FAM102B-3:4 Yes chr2R:12145710-12152752 lnc-HENMT1-2:3 No - lnc-HENMT1-2:4 No - lnc-HENMT1-2:2 Yes chrX:13297082-13299910 lnc-TMEM167B-4:1 No - lnc-TMEM167B-4:2 No - lnc-TMEM167B-4:3 No - lnc-TAF13-2:4 Yes chrX:19494420-19494992 lnc-TAF13-2:2 Yes chrX:19494420-19494992 lnc-TAF13-2:3 Yes chrX:19494420-19494992 lnc-TMEM167B-1:4 No - lnc-TMEM167B-1:5 No - lnc-PSRC1-2:1 No - lnc-SYPL2-2:1 No - lnc-SYPL2-2:2 No - lnc-SYPL2-2:3 No - lnc-SYPL2-2:4 No - lnc-AMIGO1-2:3 No - lnc-AMIGO1-2:4 No - lnc-AMIGO1-2:5 No - lnc-AMIGO1-2:6 No - lnc-AMIGO1-2:7 No - lnc-CSF1-1:2 No - lnc-CSF1-1:3 No - RBM15-AS1:21 No - RBM15-AS1:22 No - RBM15-AS1:28 Yes chr2R:7962463-7969805 RBM15-AS1:29 Yes chr2R:7962463-7969805 RBM15-AS1:23 Yes chr2R:7962463-7969805 RBM15-AS1:24 Yes chr2R:7962463-7969805 RBM15-AS1:25 Yes chr2R:7962463-7969805 RBM15-AS1:26 Yes chr2R:7962463-7969805 RBM15-AS1:30 Yes chr2R:7962463-7969805 RBM15-AS1:31 Yes chr2R:7962463-7969805 RBM15-AS1:32 Yes chr2R:7962463-7969805 lnc-SLC16A4-3:1 Yes chr2R:7962463-7969805 lnc-SLC16A4-3:2 Yes chr2R:7962463-7969805 lnc-PROK1-4:1 No - lnc-PROK1-4:2 No - lnc-PROK1-4:3 No - lnc-PROK1-4:4 No - lnc-PROK1-4:5 No - lnc-PROK1-4:6 Yes chrX:17924307-18063247 lnc-PROK1-4:7 Yes chrX:17924307-18063247 lnc-KCNA2-1:1 No - lnc-KCNA3-3:4 Yes chrX:17924307-18063247 lnc-KCNA3-3:5 Yes chrX:17924307-18063247 INKA2-AS1:14 No - INKA2-AS1:15 No - INKA2-AS1:16 No - INKA2-AS1:17 No - INKA2-AS1:18 No - INKA2-AS1:19 No - INKA2-AS1:20 No - INKA2-AS1:24 No - INKA2-AS1:25 No - LINC01750:9 No - LINC01750:11 No - LINC01750:12 No - lnc-ST7L-2:3 No - lnc-ST7L-2:4 No - lnc-ST7L-2:6 No - lnc-ST7L-2:5 No - lnc-ST7L-2:7 No - lnc-ST7L-2:2 No - lnc-ST7L-9:1 No - lnc-FAM19A3-6:4 No - LINC01356:11 No - LINC01356:12 No - LINC01356:9 No - LINC01356:10 No - LINC01356:13 No - LINC01356:14 No - lnc-FAM19A3-2:4 No - lnc-FAM19A3-2:5 No - lnc-FAM19A3-2:7 No - lnc-FAM19A3-2:6 No - SLC16A1-AS1:20 No - SLC16A1-AS1:21 No - SLC16A1-AS1:22 No - SLC16A1-AS1:23 No - SLC16A1-AS1:24 No - SLC16A1-AS1:25 No - SLC16A1-AS1:26 No - SLC16A1-AS1:27 No - SLC16A1-AS1:28 No - SLC16A1-AS1:29 No - lnc-SLC16A1-2:6 No - lnc-SLC16A1-2:7 No - lnc-SLC16A1-2:4 No - lnc-SLC16A1-2:5 No - lnc-DCLRE1B-12:2 No - lnc-DCLRE1B-12:3 No - lnc-DCLRE1B-12:4 No - HIPK1-AS1:12 No - HIPK1-AS1:13 No - HIPK1-AS1:14 No - HIPK1-AS1:8 No - HIPK1-AS1:9 No - HIPK1-AS1:11 No - HIPK1-AS1:15 No - HIPK1-AS1:10 No - HIPK1-AS1:6 No - HIPK1-AS1:7 No - lnc-SYCP1-4:2 No - lnc-SYCP1-4:3 No - lnc-SYCP1-4:4 No - lnc-SYCP1-4:5 No - lnc-SYCP1-2:5 No - lnc-SYCP1-5:1 No - LINC01765:7 No - LINC01765:8 No - LINC01765:9 No - lnc-TSHB-2:4 No - lnc-TSHB-2:5 No - lnc-TSHB-2:2 No - lnc-TSHB-2:3 No - lnc-TSHB-2:6 No - NGF-AS1:6 No - NGF-AS1:7 No - lnc-TSPAN2-1:1 No - lnc-VANGL1-18:1 No - lnc-VANGL1-18:2 No - lnc-VANGL1-18:3 No - lnc-VANGL1-18:4 No - lnc-NHLH2-6:1 No - lnc-VANGL1-5:1 No - lnc-NHLH2-1:4 No - lnc-NHLH2-1:5 No - lnc-NHLH2-1:3 No - LINC01762:34 No - LINC01762:35 No - LINC01762:36 No - LINC01762:37 No - LINC01762:26 No - LINC01762:27 No - LINC01762:28 No - LINC01762:29 No - lnc-TRIM45-1:15 No - lnc-TRIM45-1:12 No - lnc-TRIM45-1:10 No - lnc-TRIM45-1:4 No - lnc-TRIM45-1:6 No - lnc-TRIM45-1:5 No - lnc-TRIM45-1:16 No - lnc-TRIM45-1:8 No - lnc-TRIM45-1:9 No - lnc-TRIM45-1:13 No - lnc-TRIM45-1:11 No - lnc-TRIM45-1:14 No - lnc-TRIM45-1:7 No - lnc-VTCN1-3:4 No - lnc-VTCN1-3:6 No - lnc-VTCN1-3:5 No - lnc-GDAP2-1:14 No - lnc-GDAP2-1:15 No - lnc-GDAP2-1:17 No - lnc-GDAP2-1:13 No - lnc-GDAP2-1:16 No - lnc-GDAP2-9:1 Yes chr2R:7716807-7782637 lnc-GDAP2-9:2 Yes chr2R:7716807-7782637 lnc-TBX15-1:4 No - lnc-HAO2-2:30 No - lnc-HAO2-2:31 No - lnc-HAO2-11:4 No - lnc-HAO2-11:1 No - lnc-HAO2-11:5 No - lnc-HAO2-11:2 No - lnc-HAO2-11:3 No - LINC01780:11 No - LINC01780:12 No - LINC01780:13 No - LINC01780:14 No - LINC01780:15 No - lnc-HMGCS2-1:2 Yes chr2L:11151506-11155721 lnc-HMGCS2-1:1 Yes chr2L:11151506-11155721 lnc-FAM72B-8:8 No - lnc-FAM72B-8:9 No - lnc-FAM72B-8:10 No - lnc-FAM72B-8:11 No - lnc-NBPF9-7:2 No - lnc-NBPF9-7:3 No - lnc-NBPF9-7:4 No - lnc-NBPF9-8:1 No - lnc-NBPF9-8:2 No - lnc-NBPF9-9:1 No - lnc-NBPF14-1:2 No - lnc-NBPF14-1:3 No - lnc-NUDT4B-9:1 No - lnc-NBPF14-6:1 No - lnc-POLR3GL-48:1 No - LINC01719:27 No - LINC01719:28 No - LINC01719:29 No - LINC01719:30 No - LIX1L-AS1:35 No - LIX1L-AS1:36 No - LIX1L-AS1:37 No - LIX1L-AS1:38 No - LIX1L-AS1:39 No - LIX1L-AS1:40 No - LIX1L-AS1:41 No - LIX1L-AS1:42 No - LIX1L-AS1:43 No - lnc-NBPF12-3:1 No - lnc-CHD1L-5:12 No - lnc-CHD1L-5:13 Yes chr2R:6642418-6645098 lnc-CHD1L-5:14 Yes chr2R:6642418-6645098 lnc-CHD1L-5:16 Yes chr2R:6642418-6645098 lnc-CHD1L-5:17 Yes chr2R:6642418-6645098 lnc-NBPF11-1:24 No - lnc-NBPF11-1:25 No - lnc-NBPF11-1:26 No - lnc-NBPF11-1:20 No - lnc-NBPF11-1:21 No - lnc-NBPF11-1:30 No - lnc-NBPF11-1:22 No - lnc-NBPF11-1:31 No - lnc-NBPF11-1:27 No - lnc-NBPF11-1:28 No - lnc-NBPF11-1:32 No - lnc-NBPF11-8:1 No - lnc-GPR89B-17:1 No - lnc-HIST2H3PS2-3:5 No - lnc-HIST2H3PS2-3:6 No - lnc-HIST2H3PS2-3:7 No - lnc-HIST2H3PS2-3:8 No - lnc-PPIAL4F-3:2 No - lnc-PPIAL4F-3:3 No - lnc-PPIAL4F-3:4 No - lnc-PPIAL4F-3:7 No - lnc-PPIAL4F-3:8 No - lnc-PPIAL4F-3:9 No - lnc-PPIAL4F-3:10 No - FALEC:3 No - lnc-ADAMTSL4-7:3 No - lnc-ADAMTSL4-7:4 No - lnc-ADAMTSL4-7:7 No - lnc-ADAMTSL4-7:5 No - lnc-ADAMTSL4-7:6 No - lnc-ADAMTSL4-7:8 No - lnc-CTXND2-8:2 No - lnc-CERS2-2:1 No - lnc-PSMB4-1:2 Yes chr3R:6449944-6456676 lnc-POGZ-2:1 No - lnc-POGZ-1:2 No - lnc-POGZ-1:3 No - TDRKH-AS1:15 Yes chr2L:2220748-2225544 TDRKH-AS1:16 Yes chr2L:2220748-2225544 TDRKH-AS1:17 Yes chr2L:2220748-2225544 TDRKH-AS1:18 Yes chr2L:2220748-2225544 TDRKH-AS1:19 No - lnc-OAZ3-2:26 No - lnc-OAZ3-2:27 No - lnc-THEM4-1:1 No - lnc-OAZ3-15:1 No - lnc-THEM4-2:1 No - lnc-OAZ3-16:1 No - lnc-OAZ3-3:10 No - FLG-AS1:14 No - FLG-AS1:15 No - FLG-AS1:16 No - FLG-AS1:18 No - FLG-AS1:19 No - FLG-AS1:21 No - FLG-AS1:20 No - FLG-AS1:23 No - FLG-AS1:22 No - FLG-AS1:24 No - lnc-S100A16-2:1 No - lnc-S100A13-2:10 No - lnc-S100A13-2:11 No - lnc-S100A13-2:8 No - lnc-S100A13-2:9 No - lnc-S100A13-2:12 No - lnc-S100A13-2:13 No - lnc-S100A13-2:14 No - lnc-ILF2-2:1 No - lnc-CREB3L4-1:5 No - lnc-CREB3L4-1:6 No - lnc-CREB3L4-7:1 Yes chrX:8592031-8602036 lnc-CREB3L4-12:1 Yes chr2R:6718196-6719533 lnc-CREB3L4-12:2 Yes chr2R:6718196-6719533 lnc-CREB3L4-4:3 No - lnc-CREB3L4-4:4 No - lnc-UBE2Q1-1:2 No - lnc-UBE2Q1-1:3 No - lnc-UBE2Q1-1:4 No - lnc-UBE2Q1-1:5 No - lnc-UBE2Q1-1:6 No - lnc-CHRNB2-4:1 No - lnc-CHRNB2-4:2 No - lnc-CKS1B-4:2 No - lnc-CKS1B-4:3 No - lnc-CKS1B-3:2 No - lnc-CKS1B-2:2 No - lnc-SHC1-2:1 No - DCST1-AS1:18 No - DCST1-AS1:19 No - DCST1-AS1:20 No - DCST1-AS1:21 No - DCST1-AS1:22 No - lnc-HCN3-2:1 Yes chr3R:28888073-28922772 RUSC1-AS1:7 No - RUSC1-AS1:8 No - RUSC1-AS1:9 No - RUSC1-AS1:6 No - RUSC1-AS1:10 No - ASH1L-AS1:6 Yes chr3L:19590773-19598755 ASH1L-AS1:7 Yes chr3L:19590773-19598755 ASH1L-AS1:8 Yes chr3L:19590773-19598755 ASH1L-AS1:9 Yes chr3L:19590773-19598755 ASH1L-AS1:10 No - ASH1L-AS1:11 Yes chrX:21388977-21391533 ASH1L-AS1:12 No - ASH1L-AS1:13 No - lnc-ASH1L-2:3 No - lnc-RXFP4-5:1 No - lnc-RXFP4-5:2 No - lnc-RXFP4-4:1 No - lnc-RXFP4-2:2 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-RXFP4-2:3 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-RXFP4-2:4 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-RXFP4-2:5 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-RXFP4-2:6 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-RXFP4-2:7 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-RXFP4-2:8 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-RXFP4-2:9 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-RXFP4-2:10 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-RXFP4-2:11 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-RXFP4-2:12 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-RXFP4-2:13 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-PAQR6-6:1 No - lnc-PAQR6-5:1 No - lnc-C1orf61-2:34 No - lnc-C1orf61-2:35 No - lnc-C1orf61-2:36 No - lnc-C1orf61-2:38 No - lnc-C1orf61-2:37 No - lnc-C1orf61-2:39 No - lnc-C1orf61-2:33 No - lnc-C1orf61-2:32 No - lnc-TTC24-5:1 No - lnc-TTC24-5:2 No - lnc-TTC24-4:1 No - lnc-TTC24-1:3 No - lnc-TTC24-1:4 No - lnc-NES-2:2 No - lnc-NES-1:2 No - lnc-LRRC71-4:2 No - lnc-LRRC71-4:5 No - lnc-LRRC71-4:3 No - lnc-LRRC71-4:4 No - LINC01704:15 No - LINC01704:16 No - LINC01704:17 No - LINC01704:18 No - lnc-CD1B-7:1 No - lnc-CD1B-1:3 No - lnc-CD1B-1:4 No - lnc-CD1B-1:2 No - lnc-OR10K2-1:2 No - lnc-OR10K2-1:3 No - lnc-AIM2-3:4 No - lnc-AIM2-3:2 No - lnc-AIM2-3:1 No - lnc-AIM2-3:5 No - lnc-AIM2-3:3 No - lnc-CRP-2:1 No - lnc-CRP-2:2 No - lnc-CRP-2:3 No - lnc-CRP-2:4 No - lnc-VSIG8-2:2 No - lnc-VSIG8-2:3 No - lnc-VSIG8-2:4 No - lnc-VSIG8-2:5 No - lnc-VSIG8-2:6 No - LINC01133:9 No - LINC01133:10 No - LINC01133:11 No - LINC01133:7 No - LINC01133:8 No - lnc-KCNJ9-5:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-PEA15-1:4 No - lnc-PEA15-1:5 No - lnc-PEA15-1:6 No - lnc-NCSTN-3:1 No - lnc-SLAMF7-2:17 No - lnc-CD244-2:1 No - lnc-CD244-2:2 No - lnc-CD244-2:3 No - lnc-CD244-2:4 No - lnc-B4GALT3-2:1 Yes chrX:22455803-22470146 lnc-MPZ-2:1 Yes chr3R:11114671-11115706 lnc-CFAP126-4:1 No - lnc-FCGR3A-4:1 No - lnc-FCGR3B-4:16 Yes chrX:19623114-19625729 lnc-FCGR3B-4:10 Yes chrX:19623114-19625729 lnc-FCGR3B-4:5 Yes chrX:19623114-19625729 lnc-FCGR3B-4:11 No - lnc-FCGR3B-4:12 No - lnc-FCGR3B-4:13 No - lnc-FCGR3B-4:6 No - lnc-FCGR3B-4:7 No - lnc-FCGR3B-4:8 No - lnc-FCGR3B-4:9 No - lnc-FCGR3B-4:14 No - lnc-FCGR3B-4:4 No - lnc-SH2D1B-1:3 No - lnc-SH2D1B-1:4 No - lnc-CCDC190-3:1 No - lnc-RGS5-1:19 No - lnc-RGS5-1:20 No - lnc-RGS5-1:21 No - lnc-RGS5-1:22 No - lnc-RGS5-1:23 No - lnc-RGS5-1:24 No - lnc-RGS5-1:25 No - lnc-RGS5-1:26 No - lnc-RGS5-1:27 No - lnc-RGS5-1:28 No - lnc-RGS5-1:17 No - lnc-RGS5-1:18 No - lnc-LMX1A-8:1 Yes chrX:15992468-15996509 lnc-MGST3-1:3 No - lnc-MGST3-1:4 No - lnc-MGST3-1:5 No - lnc-ALDH9A1-3:1 No - lnc-ALDH9A1-3:2 No - lnc-ALDH9A1-3:3 No - lnc-UCK2-1:5 Yes chr2L:19049076-19049884 lnc-UCK2-1:6 Yes chr2L:19049076-19049884 lnc-UCK2-1:7 Yes chr2L:19049076-19049884 lnc-GPA33-3:2 No - lnc-CREG1-3:5 No - lnc-CREG1-3:3 No - lnc-CREG1-3:4 No - lnc-CREG1-3:6 No - lnc-CREG1-3:2 No - lnc-GPR161-2:1 No - lnc-KIFAP3-2:13 No - lnc-KIFAP3-2:14 No - lnc-KIFAP3-2:8 Yes chr3L:17427305-17428836 lnc-KIFAP3-2:10 Yes chr3L:17427305-17428836 lnc-KIFAP3-2:11 Yes chr3L:17427305-17428836 lnc-KIFAP3-2:15 No - lnc-KIFAP3-2:16 No - lnc-KIFAP3-2:12 No - lnc-KIFAP3-2:9 Yes chr3L:17427305-17428836 lnc-MYOC-7:2 No - lnc-MYOC-7:3 No - lnc-MYOC-7:1 No - lnc-VAMP4-5:1 No - lnc-TNFSF4-3:2 No - lnc-TNFSF4-3:3 No - lnc-TNFSF4-3:6 No - lnc-TNFSF4-3:4 No - lnc-TNFSF4-3:5 No - lnc-ANKRD45-3:1 No - lnc-ANKRD45-3:3 No - lnc-ANKRD45-3:2 No - GAS5:47 No - GAS5:51 No - GAS5:52 No - GAS5:79 No - GAS5:44 No - GAS5:48 No - GAS5:49 No - GAS5:50 No - GAS5:45 No - GAS5:53 No - GAS5:77 No - GAS5:58 No - GAS5:59 No - GAS5:60 No - GAS5:54 No - GAS5:69 No - GAS5:55 No - GAS5:61 No - GAS5:62 No - GAS5:46 No - GAS5:80 No - GAS5:63 No - GAS5:81 No - GAS5:56 No - GAS5:82 No - GAS5:83 No - GAS5:57 No - GAS5:64 No - GAS5:70 No - GAS5:65 No - GAS5:71 No - GAS5:66 No - GAS5:72 No - GAS5:67 No - GAS5:73 No - GAS5:74 No - GAS5:75 No - GAS5:76 No - GAS5:78 No - GAS5:68 No - lnc-ZBTB37-1:2 No - lnc-ZBTB37-1:3 No - lnc-RC3H1-1:8 No - lnc-RC3H1-1:11 No - lnc-RC3H1-1:9 No - lnc-RC3H1-1:12 No - lnc-RC3H1-1:7 Yes chr3L:8346561-8352279 lnc-RC3H1-1:13 No - lnc-RC3H1-1:14 No - lnc-RC3H1-1:15 No - lnc-RC3H1-1:16 No - lnc-RC3H1-1:10 No - lnc-MRPS14-1:6 No - lnc-MRPS14-1:7 Yes chrX:6653113-6654248 lnc-CACYBP-5:1 No - lnc-PAPPA2-1:4 No - lnc-PAPPA2-1:5 No - lnc-PAPPA2-1:6 No - lnc-PAPPA2-1:7 No - lnc-PAPPA2-1:8 No - lnc-PAPPA2-1:9 No - lnc-PAPPA2-1:10 No - lnc-PAPPA2-1:11 No - lnc-SEC16B-2:2 Yes chrX:12596047-12609910 RASAL2-AS1:5 No - RASAL2-AS1:6 No - RASAL2-AS1:7 No - RASAL2-AS1:8 No - RASAL2-AS1:9 No - lnc-ANGPTL1-3:3 No - lnc-ANGPTL1-3:2 Yes chr2R:16783671-16792472 lnc-TOR1AIP2-5:2 No - lnc-TOR1AIP2-4:2 No - lnc-TOR1AIP2-4:3 No - lnc-ACBD6-3:3 No - lnc-ACBD6-3:8 No - lnc-ACBD6-3:4 No - lnc-ACBD6-3:5 No - lnc-ACBD6-3:7 No - lnc-ACBD6-3:6 No - lnc-STX6-8:1 No - lnc-STX6-8:2 No - lnc-STX6-8:3 No - lnc-STX6-6:7 No - lnc-STX6-6:3 No - lnc-STX6-6:4 No - lnc-STX6-6:8 No - lnc-STX6-6:2 No - lnc-STX6-6:5 No - lnc-STX6-6:6 No - lnc-IER5-6:1 No - lnc-IER5-6:2 No - LINC01732:8 No - lnc-ZNF648-6:1 No - lnc-CACNA1E-6:1 No - lnc-CACNA1E-6:2 No - lnc-CACNA1E-6:3 No - lnc-ZNF648-1:2 No - lnc-SHCBP1L-1:6 No - lnc-SHCBP1L-1:7 No - lnc-SHCBP1L-1:8 No - lnc-SHCBP1L-1:9 No - SMG7-AS1:6 No - SMG7-AS1:7 No - SMG7-AS1:11 No - SMG7-AS1:12 No - SMG7-AS1:13 No - SMG7-AS1:14 No - SMG7-AS1:15 No - SMG7-AS1:8 No - SMG7-AS1:9 No - SMG7-AS1:10 No - lnc-COLGALT2-3:1 No - lnc-TSEN15-6:1 No - lnc-EDEM3-6:2 No - lnc-EDEM3-6:3 No - lnc-EDEM3-6:4 No - lnc-EDEM3-6:5 No - lnc-EDEM3-7:3 No - lnc-EDEM3-7:5 No - lnc-EDEM3-7:6 No - lnc-EDEM3-7:4 No - lnc-EDEM3-7:1 No - lnc-EDEM3-7:2 No - lnc-SWT1-1:2 No - lnc-SWT1-1:3 No - lnc-SWT1-1:4 No - lnc-SWT1-1:5 No - lnc-SWT1-1:6 No - lnc-SWT1-1:7 No - lnc-SWT1-1:8 No - lnc-SWT1-1:9 No - lnc-SWT1-1:10 No - lnc-SWT1-1:11 No - lnc-SWT1-1:13 No - lnc-SWT1-1:14 No - lnc-SWT1-1:15 No - lnc-IVNS1ABP-5:1 No - lnc-SWT1-6:1 No - lnc-IVNS1ABP-6:1 No - lnc-PTGS2-11:1 No - PACERR:3 No - PACERR:4 No - lnc-PLA2G4A-19:1 No - lnc-PLA2G4A-19:2 No - lnc-PLA2G4A-19:3 No - lnc-PLA2G4A-19:4 No - lnc-PLA2G4A-7:4 No - lnc-PLA2G4A-7:5 No - lnc-PLA2G4A-7:6 No - lnc-PLA2G4A-7:7 No - lnc-PLA2G4A-7:8 No - LINC01351:17 No - LINC01351:20 No - LINC01351:18 No - LINC01351:21 No - LINC01351:22 No - LINC01351:19 No - LINC01351:23 No - lnc-UCHL5-108:8 No - lnc-UCHL5-108:9 No - lnc-UCHL5-108:10 No - lnc-UCHL5-108:11 No - lnc-UCHL5-12:1 No - lnc-RGS1-1:2 No - lnc-RGS1-1:3 No - lnc-RGS1-1:4 No - lnc-RGS1-1:5 No - lnc-UCHL5-108:12 No - lnc-UCHL5-108:13 No - lnc-UCHL5-108:14 No - lnc-UCHL5-108:6 No - lnc-UCHL5-108:7 No - lnc-UCHL5-10:1 No - lnc-TROVE2-5:1 No - lnc-CFH-4:2 No - lnc-CFH-4:3 Yes chr2R:10322195-10416996 lnc-CFH-4:1 Yes chr2R:10322195-10416996 lnc-CFH-4:4 Yes chr2R:10322195-10416996 lnc-ATP6V1G3-10:1 No - lnc-ATP6V1G3-1:3 No - lnc-ATP6V1G3-1:2 No - lnc-ATP6V1G3-4:15 No - lnc-ATP6V1G3-4:16 No - lnc-ATP6V1G3-4:17 No - lnc-ATP6V1G3-4:12 No - lnc-ATP6V1G3-4:13 No - lnc-ATP6V1G3-4:14 No - lnc-NR5A2-12:1 No - lnc-NR5A2-12:2 No - lnc-NR5A2-12:3 No - lnc-NR5A2-12:4 No - lnc-NR5A2-1:9 No - lnc-NR5A2-1:11 No - lnc-NR5A2-1:10 No - lnc-NR5A2-1:12 No - lnc-NR5A2-1:13 No - lnc-NR5A2-1:14 No - lnc-ZNF281-3:3 No - lnc-ZNF281-3:2 No - lnc-CAMSAP2-1:4 No - lnc-CAMSAP2-1:5 No - lnc-CAMSAP2-1:6 No - lnc-CAMSAP2-1:7 No - lnc-CAMSAP2-1:8 No - lnc-KIF21B-2:1 No - lnc-KIF21B-2:3 No - lnc-KIF21B-2:2 No - lnc-KIF21B-2:4 No - lnc-KIF21B-2:5 No - lnc-INAVA-1:4 No - lnc-INAVA-1:5 No - lnc-INAVA-1:6 No - lnc-INAVA-1:7 No - lnc-INAVA-1:8 No - lnc-NAV1-9:1 Yes chr3R:7112850-7117732 lnc-NAV1-9:2 Yes chr3R:7112850-7117732 IPO9-AS1:6 No - IPO9-AS1:7 No - IPO9-AS1:8 No - IPO9-AS1:9 No - IPO9-AS1:5 Yes chr3R:11412522-11416142 lnc-GPR37L1-6:1 No - lnc-GPR37L1-7:2 No - lnc-GPR37L1-7:3 No - lnc-PPP1R12B-7:1 No - lnc-KDM5B-1:2 No - PCAT6:11 No - PCAT6:12 No - PCAT6:13 No - PCAT6:14 No - PCAT6:15 No - PCAT6:16 No - lnc-TMEM183A-5:4 No - lnc-TMEM183A-5:5 No - lnc-TMEM183A-5:6 No - lnc-TMEM183A-5:7 Yes chr2L:8320328-8321285 lnc-TMEM183A-5:8 Yes chr2L:8320328-8321285 lnc-CYB5R1-1:1 No - lnc-CYB5R1-1:2 No - LINC01353:5 No - LINC01353:6 No - LINC01353:7 No - LINC01136:6 No - LINC01136:7 No - LINC01136:8 No - LINC01136:13 No - LINC01353:8 No - LINC01353:9 No - LINC01353:10 No - LINC01353:11 No - LINC01353:12 No - LINC01353:13 No - LINC01136:12 No - LINC01136:9 No - LINC01136:10 No - LINC01136:11 No - lnc-OPTC-2:1 No - lnc-OPTC-2:2 No - lnc-OPTC-2:3 No - lnc-OPTC-2:4 No - lnc-OPTC-1:1 No - lnc-FMOD-2:2 No - lnc-FMOD-2:3 No - lnc-FMOD-2:6 No - lnc-FMOD-2:4 No - lnc-FMOD-2:5 No - lnc-FMOD-7:1 Yes chr4:328193-358917 lnc-SOX13-3:2 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-SOX13-3:3 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-SOX13-3:4 Yes chr3R:13715207-13764667 lnc-MDM4-12:1 No - lnc-MDM4-11:1 No - lnc-PIK3C2B-2:1 No - lnc-CNTN2-7:2 No - lnc-CNTN2-7:1 No - lnc-ELK4-1:3 No - lnc-ELK4-1:4 No - lnc-ELK4-1:5 No - lnc-ELK4-1:6 No - lnc-EIF2D-1:3 No - lnc-EIF2D-1:4 No - lnc-IL19-2:1 No - lnc-CD34-7:6 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-CD34-7:4 Yes chrX:11992915-12003914 lnc-CD34-7:5 No - MIR29B2CHG:85 Yes chr2R:9227785-9247249 MIR29B2CHG:67 Yes chr2R:9227785-9247249 MIR29B2CHG:68 Yes chr2R:9227785-9247249 MIR29B2CHG:69 Yes chr2R:9227785-9247249 MIR29B2CHG:53 Yes chr2R:9227785-9247249 MIR29B2CHG:54 Yes chr2R:9227785-9247249 MIR29B2CHG:90 Yes chr2R:9227785-9247249 MIR29B2CHG:91 Yes chr2R:9227785-9247249 MIR29B2CHG:86 Yes chr2R:9227785-9247249 MIR29B2CHG:87 Yes chr2R:9227785-9247249 MIR29B2CHG:77 Yes chr2R:9227785-9247249 MIR29B2CHG:78 Yes chr2R:9227785-9247249 MIR29B2CHG:79 Yes chr2R:9227785-9247249 MIR29B2CHG:80 Yes chr2R:9227785-9247249 MIR29B2CHG:81 Yes chr2R:9227785-9247249 MIR29B2CHG:72 Yes chr2R:9227785-9247249 MIR29B2CHG:62 Yes chr2R:9227785-9247249 MIR29B2CHG:63 Yes chr2R:9227785-9247249 MIR29B2CHG:64 Yes chr2R:9227785-9247249 MIR29B2CHG:70 No - MIR29B2CHG:73 No - MIR29B2CHG:74 No - MIR29B2CHG:55 No - MIR29B2CHG:75 No - MIR29B2CHG:88 No - MIR29B2CHG:56 No - MIR29B2CHG:57 No - MIR29B2CHG:89 No - MIR29B2CHG:71 No - MIR29B2CHG:76 No - lnc-CD46-6:1 No - lnc-CD46-6:2 No - MIR29B2CHG:66 No - MIR29B2CHG:58 No - lnc-CD46-7:1 No - lnc-CD46-7:3 No - lnc-CD46-7:2 No - lnc-CD46-7:4 No - lnc-CD46-5:3 No - lnc-CD46-5:6 No - lnc-CD46-5:4 No - lnc-CD46-5:5 No - lnc-LAMB3-7:2 No - lnc-LAMB3-7:1 No - MIR205HG:13 No - MIR205HG:14 No - MIR205HG:15 No - MIR205HG:16 No - MIR205HG:17 No - MIR205HG:20 No - MIR205HG:21 No - MIR205HG:22 No - MIR205HG:23 No - MIR205HG:18 No - MIR205HG:24 No - MIR205HG:25 No - MIR205HG:26 No - MIR205HG:27 No - MIR205HG:19 No - lnc-LAMB3-2:5 No - lnc-LAMB3-2:9 No - lnc-LAMB3-2:6 No - lnc-LAMB3-2:7 No - lnc-LAMB3-2:8 No - lnc-LAMB3-1:5 No - lnc-LAMB3-1:8 No - lnc-LAMB3-1:6 No - lnc-LAMB3-1:7 No - lnc-LAMB3-1:9 No - lnc-LAMB3-6:1 No - lnc-HSD11B1-4:8 Yes chr2L:22579072-22585843 lnc-IRF6-2:1 No - SERTAD4-AS1:8 No - SERTAD4-AS1:5 No - SERTAD4-AS1:9 No - SERTAD4-AS1:6 No - SERTAD4-AS1:13 No - SERTAD4-AS1:11 No - SERTAD4-AS1:12 No - SERTAD4-AS1:10 No - SERTAD4-AS1:7 No - lnc-KCNH1-2:3 Yes chrX:19521929-19530896 lnc-KCNH1-2:4 Yes chrX:19521929-19530896 lnc-KCNH1-2:5 Yes chrX:19521929-19530896 lnc-RD3-1:2 Yes chrX:16415046-16417585 lnc-RD3-1:3 No - lnc-RD3-1:4 No - lnc-RD3-1:5 No - lnc-RD3-1:6 No - LINC00467:21 No - LINC00467:22 No - LINC00467:23 No - LINC00467:24 No - LINC00467:18 No - LINC00467:19 No - LINC00467:20 No - LINC00467:25 No - LINC01693:10 No - LINC01693:11 No - lnc-TRAF5-6:8 No - lnc-TRAF5-6:9 No - lnc-TRAF5-6:10 No - lnc-TRAF5-6:11 No - lnc-TRAF5-6:12 No - lnc-TRAF5-6:13 No - lnc-TRAF5-6:14 No - lnc-TMEM206-5:17 No - lnc-TMEM206-5:18 No - lnc-TMEM206-5:16 No - lnc-TMEM206-5:19 No - lnc-TMEM206-5:15 No - lnc-TMEM206-1:7 No - lnc-TMEM206-1:8 No - lnc-TMEM206-1:4 No - lnc-TMEM206-1:5 No - lnc-TMEM206-1:6 No - lnc-TMEM206-1:3 No - lnc-TMEM206-7:1 No - lnc-NENF-5:1 No - lnc-TMEM206-8:1 No - lnc-TMEM206-8:2 No - lnc-ATF3-1:5 No - lnc-ATF3-1:6 No - lnc-BATF3-6:4 No - lnc-ATF3-1:7 No - lnc-ATF3-1:8 No - lnc-BATF3-8:1 No - lnc-BATF3-8:2 No - lnc-BATF3-2:13 No - lnc-BATF3-2:8 No - lnc-BATF3-2:9 No - lnc-BATF3-2:14 No - lnc-BATF3-2:10 No - lnc-BATF3-2:11 No - FLVCR1-DT:20 No - FLVCR1-DT:21 No - FLVCR1-DT:22 No - FLVCR1-DT:23 No - FLVCR1-DT:24 No - FLVCR1-DT:25 No - lnc-VASH2-3:1 No - PROX1-AS1:69 Yes chr3R:11328480-11407627 PROX1-AS1:67 Yes chr3R:11328480-11407627 PROX1-AS1:68 Yes chr3R:11328480-11407627 PROX1-AS1:73 Yes chr3R:11328480-11407627 PROX1-AS1:66 Yes chr3R:11328480-11407627 PROX1-AS1:63 Yes chr3R:11328480-11407627 PROX1-AS1:70 Yes chr3R:11328480-11407627 PROX1-AS1:64 Yes chr3R:11328480-11407627 PROX1-AS1:71 Yes chr3R:11328480-11407627 PROX1-AS1:62 Yes chr3R:11328480-11407627 PROX1-AS1:72 Yes chr3R:11328480-11407627 PROX1-AS1:65 Yes chr3R:11328480-11407627 lnc-PTPN14-2:9 Yes chrX:2606680-2608876 lnc-PTPN14-2:8 Yes chrX:2606680-2608876 lnc-PTPN14-2:6 Yes chrX:2606680-2608876 lnc-PTPN14-2:7 Yes chrX:2606680-2608876 lnc-GPATCH2-11:1 No - TGFB2-AS1:4 No - TGFB2-AS1:3 No - lnc-ZC3H11B-1:9 No - lnc-ZC3H11B-1:10 No - lnc-ZC3H11B-1:2 No - lnc-ZC3H11B-1:13 No - lnc-ZC3H11B-1:14 No - lnc-ZC3H11B-1:3 No - lnc-ZC3H11B-1:11 No - lnc-ZC3H11B-1:12 No - lnc-IARS2-5:1 No - HLX-AS1:5 Yes chr2L:6013059-6019402 HLX-AS1:2 Yes chr2L:6013059-6019402 HLX-AS1:3 Yes chr2L:6013059-6019402 HLX-AS1:4 Yes chr2L:6013059-6019402 lnc-RAB3GAP2-10:1 Yes chr2L:6013059-6019402 lnc-HLX-3:2 No - lnc-HLX-3:3 No - lnc-DUSP10-12:1 No - lnc-DUSP10-11:2 No - lnc-DUSP10-11:1 No - lnc-HLX-6:1 No - lnc-DUSP10-10:1 No - lnc-HHIPL2-1:6 No - lnc-HHIPL2-1:4 No - lnc-HHIPL2-1:3 No - lnc-HHIPL2-1:5 No - TAF1A-AS1:9 No - TAF1A-AS1:10 No - TAF1A-AS1:11 No - TAF1A-AS1:12 No - lnc-AIDA-2:2 No - lnc-AIDA-2:3 No - lnc-AIDA-2:6 No - lnc-AIDA-2:4 No - lnc-AIDA-2:5 No - lnc-TLR5-1:6 No - lnc-TLR5-1:5 No - lnc-TLR5-1:7 No - lnc-TLR5-1:8 No - lnc-TLR5-1:9 No - lnc-DISP1-7:1 No - lnc-DISP1-8:1 No - lnc-DISP1-8:2 No - lnc-TLR5-3:1 No - lnc-DISP1-8:3 No - lnc-DISP1-8:4 No - lnc-DISP1-8:5 No - lnc-DISP1-8:6 No - lnc-CAPN2-3:2 No - lnc-TP53BP2-8:1 No - lnc-TP53BP2-8:2 No - lnc-TP53BP2-8:3 No - lnc-TP53BP2-8:4 No - lnc-TP53BP2-8:5 No - lnc-FBXO28-1:11 No - lnc-FBXO28-1:10 No - lnc-FBXO28-1:12 No - lnc-FBXO28-1:13 No - lnc-FBXO28-1:14 No - lnc-NVL-1:4 No - lnc-WDR26-1:15 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-WDR26-1:16 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-WDR26-1:6 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-WDR26-1:17 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-WDR26-1:9 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-WDR26-1:10 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-WDR26-1:11 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-WDR26-1:12 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-WDR26-1:13 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-WDR26-1:7 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-WDR26-1:8 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-WDR26-1:18 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-WDR26-1:14 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-DNAH14-3:1 Yes chr2R:21720495-21724055 lnc-DNAH14-3:2 Yes chr2R:21720495-21724055 lnc-LBR-1:6 No - lnc-LBR-1:4 No - lnc-LBR-1:5 No - lnc-SRP9-1:6 No - lnc-SRP9-1:7 No - lnc-SRP9-1:8 No - lnc-SRP9-1:9 No - lnc-TMEM63A-2:1 No - lnc-TMEM63A-1:2 Yes chr2R:18860375-18862078 lnc-EPHX1-2:1 No - lnc-EPHX1-3:1 No - lnc-H3F3A-7:1 No - lnc-SDE2-1:2 Yes chrX:9152523-9156669 lnc-SDE2-1:8 Yes chrX:9152523-9156669 lnc-SDE2-1:9 Yes chrX:9152523-9156669 lnc-SDE2-1:10 Yes chrX:9152523-9156669 lnc-SDE2-1:11 Yes chrX:9152523-9156669 lnc-SDE2-1:3 Yes chrX:9152523-9156669 lnc-SDE2-1:4 Yes chrX:9152523-9156669 lnc-SDE2-1:5 Yes chrX:9152523-9156669 lnc-SDE2-1:6 Yes chrX:9152523-9156669 lnc-SDE2-1:7 Yes chrX:9152523-9156669 lnc-SDE2-1:12 Yes chrX:9152523-9156669 LINC01703:12 No - LINC01703:13 No - LINC01703:14 No - LINC01703:15 No - LINC01703:16 No - lnc-ACBD3-3:1 No - lnc-H3F3A-2:2 No - lnc-H3F3A-2:3 No - lnc-H3F3A-2:4 No - lnc-H3F3A-2:5 No - lnc-H3F3A-2:6 Yes chrX:19701927-19704259 lnc-MIXL1-5:3 No - lnc-MIXL1-5:4 No - lnc-MIXL1-5:5 No - ITPKB-AS1:3 Yes chrX:13303633-13329303 ITPKB-AS1:2 Yes chrX:13303633-13329303 lnc-PARP1-5:1 Yes chrX:13303633-13329303 lnc-PSEN2-7:1 No - lnc-PSEN2-7:2 No - lnc-PSEN2-7:3 No - lnc-PSEN2-7:4 No - lnc-CDC42BPA-6:1 Yes chrX:12898768-12901114 lnc-CDC42BPA-6:2 Yes chrX:12898768-12901114 lnc-JMJD4-4:2 No - lnc-JMJD4-4:3 No - lnc-JMJD4-4:4 No - lnc-JMJD4-7:1 No - lnc-WNT3A-1:2 No - lnc-WNT3A-1:3 No - lnc-WNT3A-1:1 No - lnc-WNT3A-1:4 No - lnc-WNT3A-1:5 No - lnc-ARF1-3:2 No - lnc-ARF1-3:3 No - lnc-ARF1-3:4 No - lnc-ARF1-3:5 No - lnc-ARF1-3:6 No - lnc-MRPL55-3:1 No - lnc-TRIM11-4:1 No - lnc-HIST3H2A-2:2 No - lnc-HIST3H2A-2:3 No - lnc-HIST3H2A-2:4 No - lnc-HIST3H2A-2:5 No - lnc-CCSAP-3:7 No - lnc-CCSAP-3:1 No - lnc-CCSAP-3:8 No - lnc-CCSAP-3:9 No - lnc-CCSAP-3:10 No - lnc-CCSAP-3:11 No - lnc-CCSAP-3:5 No - lnc-CCSAP-3:2 No - lnc-CCSAP-3:3 No - lnc-CCSAP-1:3 No - lnc-CCSAP-1:4 No - lnc-CCSAP-1:5 No - lnc-CCSAP-1:6 No - lnc-CCSAP-1:7 No - lnc-CCSAP-1:8 No - lnc-URB2-1:7 No - lnc-URB2-1:6 No - lnc-URB2-1:8 No - lnc-URB2-1:11 No - lnc-URB2-1:9 No - lnc-URB2-1:10 No - LINC01736:14 No - LINC01736:15 No - LINC01736:16 No - LINC01736:17 No - lnc-GALNT2-4:2 No - lnc-GALNT2-4:3 No - lnc-GALNT2-4:4 No - lnc-AGT-6:9 Yes chr3L:9888762-9893319 lnc-AGT-6:10 Yes chr3L:9888762-9893319 lnc-AGT-6:8 No - lnc-CAPN9-1:4 No - lnc-CAPN9-1:5 No - lnc-CAPN9-1:6 No - lnc-CAPN9-1:7 No - lnc-CAPN9-1:8 No - lnc-CAPN9-1:9 No - lnc-CAPN9-1:10 No - lnc-CAPN9-1:11 No - lnc-EGLN1-1:14 No - lnc-EGLN1-1:12 No - lnc-EGLN1-1:15 No - lnc-EGLN1-1:16 No - lnc-EGLN1-1:17 No - lnc-EGLN1-1:18 No - lnc-EGLN1-1:13 No - lnc-EGLN1-1:11 No - lnc-MAP10-10:1 No - lnc-MAP10-9:1 No - lnc-MAP10-9:2 No - lnc-MAP10-9:3 No - lnc-PCNX2-8:1 No - lnc-PCNX2-8:2 No - lnc-PCNX2-9:1 No - lnc-PCNX2-9:2 No - lnc-PCNX2-9:3 No - lnc-PCNX2-9:4 No - lnc-PCNX2-9:5 No - lnc-COA6-1:2 No - lnc-COA6-1:3 No - lnc-COA6-1:4 No - lnc-COA6-1:5 No - lnc-COA6-1:6 No - lnc-TARBP1-1:3 Yes chrX:254876-255524 lnc-TARBP1-1:4 Yes chrX:254876-255524 lnc-TARBP1-1:5 Yes chrX:254876-255524 lnc-TARBP1-1:6 Yes chrX:254876-255524 lnc-COA6-13:1 No - LINC01354:5 No - LINC01354:6 No - LINC01354:3 No - LINC01354:4 No - LINC01354:7 No - lnc-COA6-11:2 No - LINC00184:5 No - LINC00184:6 No - LINC00184:4 No - LINC00184:7 No - lnc-IRF2BP2-2:6 No - lnc-IRF2BP2-2:7 No - lnc-IRF2BP2-2:8 No - lnc-IRF2BP2-2:9 No - lnc-IRF2BP2-2:5 No - lnc-COA6-14:1 No - lnc-COA6-14:2 No - lnc-IRF2BP2-10:1 No - lnc-IRF2BP2-11:3 No - lnc-IRF2BP2-11:6 No - lnc-IRF2BP2-11:4 No - lnc-IRF2BP2-11:5 No - lnc-IRF2BP2-11:1 No - lnc-IRF2BP2-11:2 No - lnc-TOMM20-8:1 No - lnc-TOMM20-2:31 No - lnc-TOMM20-2:32 No - lnc-TOMM20-2:30 No - lnc-TOMM20-2:28 No - lnc-TOMM20-2:18 No - lnc-TOMM20-2:19 No - lnc-TOMM20-2:29 No - lnc-TOMM20-2:20 No - lnc-TOMM20-2:27 No - lnc-TOMM20-2:22 No - lnc-GGPS1-17:1 No - lnc-TOMM20-2:26 No - lnc-TOMM20-2:23 No - lnc-TOMM20-2:16 No - lnc-TOMM20-2:24 No - lnc-TOMM20-2:25 No - lnc-TOMM20-2:21 No - lnc-TOMM20-2:17 No - lnc-TOMM20-1:5 No - lnc-TOMM20-1:7 No - lnc-GGPS1-16:1 No - lnc-TOMM20-1:8 No - lnc-TOMM20-1:9 No - lnc-TOMM20-1:6 No - lnc-GGPS1-15:1 No - lnc-GGPS1-15:2 No - lnc-TOMM20-7:1 No - lnc-TOMM20-7:2 No - lnc-GGPS1-14:1 No - lnc-TOMM20-3:3 No - lnc-TOMM20-3:2 No - lnc-GGPS1-13:1 No - lnc-TBCE-7:1 No - lnc-GPR137B-11:1 Yes chr3L:1950306-1964178 lnc-GPR137B-10:1 No - lnc-EDARADD-4:1 No - LGALS8-AS1:4 No - LGALS8-AS1:5 No - lnc-LGALS8-2:1 No - LINC01139:5 No - LINC01139:6 No - LINC01139:4 No - LINC01139:9 No - LINC01139:7 No - LINC01139:8 No - lnc-RYR2-7:1 No - lnc-RYR2-7:2 No - lnc-KMO-3:4 No - lnc-KMO-3:5 No - lnc-KMO-3:6 No - lnc-KMO-3:7 No - lnc-KMO-3:8 No - lnc-KMO-1:8 No - lnc-KMO-1:9 No - lnc-KMO-1:11 No - lnc-KMO-1:10 No - lnc-KMO-1:14 No - lnc-KMO-1:12 No - lnc-KMO-1:13 No - lnc-FH-8:1 Yes chr2R:7782797-7785067 lnc-BECN2-10:2 Yes chr2L:21166046-21168581 lnc-BECN2-10:3 Yes chr2L:21166046-21168581 lnc-BECN2-2:2 Yes chr2L:21166046-21168581 lnc-BECN2-2:3 Yes chr2L:21166046-21168581 lnc-CEP170-13:5 No - lnc-SDCCAG8-5:1 Yes chr3R:16099228-16105670 lnc-SDCCAG8-5:2 Yes chr3R:16099228-16105670 lnc-ZBTB18-10:1 Yes chr3R:16099228-16105670 lnc-ZBTB18-9:1 Yes chr3R:16099228-16105670 lnc-ZBTB18-9:2 Yes chr3R:16099228-16105670 lnc-ZBTB18-2:2 No - lnc-ZBTB18-2:3 No - lnc-ZBTB18-2:4 No - lnc-AKT3-2:3 No - lnc-AKT3-2:4 No - lnc-AKT3-2:5 No - lnc-AKT3-2:2 No - lnc-AKT3-2:6 No - lnc-ADSS-8:1 No - lnc-HNRNPU-12:1 No - lnc-HNRNPU-12:2 No - lnc-HNRNPU-1:8 No - lnc-HNRNPU-1:10 Yes chr2R:18632328-18639270 lnc-HNRNPU-1:11 Yes chr2R:18632328-18639270 lnc-COX20-2:1 No - lnc-TFB2M-7:1 Yes chrX:2606680-2608876 lnc-CNST-5:1 No - lnc-OR14K1-1:4 No - lnc-OR14K1-1:5 No - lnc-LYPD8-1:8 No - lnc-LYPD8-1:9 No - lnc-LYPD8-1:10 No - lnc-LYPD8-1:11 No - lnc-ZNF672-1:2 No - lnc-ZNF672-1:3 No - lnc-GTPBP4-3:6 No - lnc-GTPBP4-3:7 No - lnc-GTPBP4-3:8 No - lnc-GTPBP4-3:9 No - lnc-GTPBP4-3:10 No - lnc-GTPBP4-3:11 No - LINC00200:4 No - LINC00200:5 No - LINC00200:6 No - LINC00200:7 No - LINC00200:8 No - lnc-PITRM1-10:2 No - lnc-PITRM1-10:3 No - lnc-PFKP-36:1 No - lnc-PFKP-36:2 No - lnc-PITRM1-2:8 Yes chr2R:10109740-10117457 lnc-PITRM1-2:9 Yes chr2R:10109740-10117457 lnc-PITRM1-2:10 Yes chr2R:10109740-10117457 lnc-PITRM1-12:4 No - lnc-PITRM1-12:2 No - lnc-PITRM1-12:3 No - lnc-PITRM1-5:4 No - lnc-PITRM1-5:2 No - lnc-PITRM1-5:3 No - lnc-KLF6-5:11 No - lnc-KLF6-5:12 No - lnc-KLF6-5:13 No - lnc-KLF6-12:2 No - lnc-KLF6-12:3 No - lnc-KLF6-12:4 No - lnc-KLF6-12:5 No - lnc-KLF6-12:6 No - lnc-KLF6-18:3 No - lnc-KLF6-18:1 No - lnc-KLF6-18:2 No - lnc-KLF6-18:4 No - lnc-KLF6-18:5 No - lnc-PFKP-37:1 No - lnc-PFKP-37:2 No - lnc-KLF6-17:2 No - lnc-PFKP-38:1 No - lnc-PFKP-38:2 No - lnc-PFKP-38:3 No - lnc-PFKP-38:4 No - lnc-KLF6-17:1 No - lnc-PFKP-38:5 No - lnc-PFKP-38:6 No - lnc-KLF6-19:1 No - lnc-KLF6-20:1 No - lnc-KLF6-21:1 No - lnc-PFKP-39:1 No - lnc-PFKP-39:2 No - lnc-KLF6-2:2 No - lnc-KLF6-22:1 No - lnc-PFKP-40:1 No - lnc-PFKP-41:1 No - lnc-PFKP-16:12 No - lnc-PFKP-16:13 No - lnc-PFKP-16:14 No - lnc-PFKP-16:15 No - lnc-PFKP-16:16 No - lnc-PFKP-16:17 No - lnc-PFKP-16:18 No - lnc-PFKP-16:19 No - lnc-PFKP-16:21 No - lnc-PFKP-16:20 No - lnc-AKR1E2-5:10 No - lnc-AKR1E2-5:11 No - lnc-AKR1E2-5:13 No - lnc-AKR1E2-5:12 No - lnc-AKR1E2-5:14 No - lnc-AKR1E2-5:15 No - lnc-KLF6-23:1 No - lnc-KLF6-24:1 No - lnc-AKR1E2-17:1 No - lnc-AKR1E2-16:1 No - LINC00702:7 No - LINC00702:8 No - LINC00702:9 No - LINC00702:10 No - lnc-AKR1E2-15:1 No - lnc-AKR1E2-15:2 No - LINC00702:11 No - LINC00702:12 No - MANCR:23 No - MANCR:24 No - MANCR:25 No - MANCR:26 No - MANCR:27 No - MANCR:30 No - MANCR:31 No - lnc-AKR1E2-7:4 No - lnc-AKR1E2-7:7 No - lnc-AKR1E2-7:5 No - lnc-AKR1E2-7:6 No - lnc-AKR1E2-7:8 No - lnc-AKR1E2-7:9 No - lnc-AKR1E2-7:10 No - lnc-AKR1E2-7:11 No - lnc-AKR1C2-3:17 No - lnc-AKR1C2-3:15 No - lnc-AKR1C2-3:18 No - lnc-AKR1C2-3:16 No - lnc-AKR1C2-3:13 No - lnc-AKR1C2-3:14 No - lnc-AKR1C2-3:11 No - lnc-AKR1C2-3:7 No - lnc-AKR1C2-3:8 No - lnc-AKR1C2-3:12 No - lnc-AKR1C2-3:9 No - lnc-AKR1C2-3:10 No - lnc-AKR1C2-3:19 No - lnc-AKR1C2-3:6 No - LINC02561:16 No - LINC02561:12 No - LINC02561:13 No - LINC02561:14 No - LINC02561:17 No - LINC02561:15 No - LINC02561:18 No - LINC02561:19 No - LINC02561:20 No - lnc-UCN3-3:1 No - CALML3-AS1:9 No - CALML3-AS1:10 No - CALML3-AS1:8 No - CALML3-AS1:11 No - CALML3-AS1:12 No - lnc-ASB13-3:5 No - lnc-ASB13-3:3 No - lnc-ASB13-3:4 No - lnc-ASB13-3:6 No - lnc-ASB13-2:2 No - lnc-ASB13-1:3 No - lnc-ASB13-1:4 No - lnc-ASB13-1:2 No - lnc-ASB13-1:5 No - lnc-FAM208B-5:4 Yes chr2L:9491176-9494876 lnc-FAM208B-5:5 Yes chr2L:9491176-9494876 lnc-IL15RA-1:5 No - lnc-IL15RA-1:6 No - lnc-IL15RA-1:7 No - lnc-IL15RA-1:8 No - lnc-IL15RA-1:9 No - lnc-IL15RA-1:10 No - lnc-IL2RA-8:1 No - lnc-PFKFB3-12:1 No - lnc-PFKFB3-12:2 No - lnc-PFKFB3-13:1 Yes chrX:12432224-12453650 lnc-PFKFB3-13:2 Yes chrX:12432224-12453650 lnc-PFKFB3-13:3 Yes chrX:12432224-12453650 PRKCQ-AS1:39 No - PRKCQ-AS1:36 No - PRKCQ-AS1:40 No - PRKCQ-AS1:37 No - PRKCQ-AS1:38 No - PRKCQ-AS1:42 No - PRKCQ-AS1:43 No - PRKCQ-AS1:44 No - PRKCQ-AS1:41 No - PRKCQ-AS1:45 No - PRKCQ-AS1:46 No - PRKCQ-AS1:47 No - PRKCQ-AS1:48 No - PRKCQ-AS1:49 No - LINP1:5 No - LINP1:6 No - lnc-PRKCQ-2:5 No - lnc-PRKCQ-2:6 No - LINC00707:12 No - LINC00707:13 No - LINC00707:14 No - LINC00707:15 No - LINC00707:16 No - lnc-SFMBT2-2:4 No - lnc-SFMBT2-2:5 No - lnc-SFMBT2-2:6 No - lnc-SFMBT2-2:7 No - lnc-ITIH2-9:2 No - lnc-KIN-12:4 Yes chr3R:29747704-29749163 lnc-KIN-12:1 No - lnc-KIN-12:2 No - lnc-KIN-12:3 No - GATA3-AS1:24 No - GATA3-AS1:15 No - GATA3-AS1:16 Yes chr3R:8147368-8181444 GATA3-AS1:26 Yes chr3R:8147368-8181444 GATA3-AS1:17 Yes chr3R:8147368-8181444 GATA3-AS1:25 Yes chr3R:8147368-8181444 GATA3-AS1:21 Yes chr3R:8147368-8181444 GATA3-AS1:13 Yes chr3R:8147368-8181444 lnc-TAF3-1:6 Yes chr3R:8147368-8181444 GATA3-AS1:22 Yes chr3R:8147368-8181444 GATA3-AS1:23 Yes chr3R:8147368-8181444 GATA3-AS1:18 Yes chr3R:8147368-8181444 lnc-TAF3-1:9 Yes chr3R:8147368-8181444 GATA3-AS1:14 Yes chr3R:8147368-8181444 GATA3-AS1:19 Yes chr3R:8147368-8181444 GATA3-AS1:20 Yes chr3R:8147368-8181444 lnc-GATA3-27:1 No - lnc-USP6NL-7:12 No - lnc-USP6NL-7:13 No - lnc-USP6NL-7:14 No - lnc-USP6NL-7:15 No - lnc-USP6NL-7:16 No - lnc-USP6NL-7:17 No - lnc-USP6NL-7:18 No - CELF2-AS1:3 Yes chr2L:12344219-12397528 CELF2-AS1:4 Yes chr2L:12344219-12397528 CELF2-AS1:5 No - CELF2-AS1:6 No - lnc-MCM10-4:2 No - lnc-MCM10-4:3 No - lnc-MCM10-4:4 No - lnc-MCM10-5:1 No - lnc-MCM10-5:2 No - lnc-MCM10-5:3 No - lnc-PRPF18-7:4 No - lnc-PRPF18-7:5 No - lnc-PRPF18-7:6 No - lnc-PRPF18-8:7 No - lnc-PRPF18-8:8 No - lnc-PRPF18-8:9 No - lnc-PRPF18-14:1 No - lnc-HSPA14-3:1 No - lnc-DCLRE1C-1:7 Yes chr3L:8344421-8346382 lnc-DCLRE1C-1:5 No - lnc-DCLRE1C-1:6 No - lnc-RPP38-6:1 No - lnc-RPP38-6:3 Yes chrX:18884513-18888860 lnc-RPP38-6:2 Yes chrX:18884513-18888860 lnc-PTER-7:1 No - lnc-C1QL3-2:2 No - lnc-C1QL3-2:3 No - lnc-C1QL3-2:4 No - lnc-C1QL3-2:5 No - VIM-AS1:10 No - VIM-AS1:12 Yes chr2L:12096525-12097687 VIM-AS1:8 No - lnc-VIM-3:1 No - VIM-AS1:11 No - VIM-AS1:9 No - VIM-AS1:7 No - lnc-TRDMT1-5:3 No - lnc-TRDMT1-5:4 No - lnc-TRDMT1-5:2 No - lnc-ST8SIA6-2:7 No - lnc-ST8SIA6-2:2 No - lnc-ST8SIA6-2:4 No - lnc-ST8SIA6-2:5 No - lnc-ST8SIA6-2:6 No - lnc-ST8SIA6-2:3 No - STAM-AS1:3 No - STAM-AS1:4 No - lnc-NSUN6-2:6 Yes chr3L:22872200-22873702 lnc-ARL5B-1:2 Yes chr3L:22872200-22873702 lnc-NSUN6-2:9 Yes chr3L:22872200-22873702 lnc-NSUN6-2:7 Yes chr3L:22872200-22873702 lnc-NSUN6-2:8 Yes chr3L:22872200-22873702 lnc-NSUN6-2:10 Yes chr3L:22872200-22873702 lnc-NEBL-4:1 No - NEBL-AS1:6 No - NEBL-AS1:7 No - NEBL-AS1:8 No - NEBL-AS1:9 No - NEBL-AS1:10 No - lnc-MLLT10-8:1 No - lnc-CASC10-2:2 No - lnc-CASC10-2:3 No - lnc-COMMD3-7:6 No - lnc-COMMD3-7:7 Yes chr3R:7094596-7124185 lnc-MLLT10-9:1 No - lnc-EBLN1-1:6 No - lnc-COMMD3-8:1 No - lnc-EBLN1-1:3 No - lnc-EBLN1-1:4 No - lnc-EBLN1-1:7 No - lnc-EBLN1-1:8 No - lnc-EBLN1-1:5 No - lnc-COMMD3-1:4 No - lnc-COMMD3-1:5 No - lnc-EBLN1-1:2 No - lnc-EBLN1-5:1 No - lnc-EBLN1-5:2 No - lnc-EBLN1-5:3 No - lnc-EBLN1-3:1 No - lnc-EBLN1-3:2 No - lnc-C10orf67-2:7 Yes chr2L:7388508-7390902 lnc-C10orf67-2:1 Yes chr2L:7388508-7390902 lnc-C10orf67-2:2 Yes chr2L:7388508-7390902 lnc-C10orf67-2:3 Yes chr2L:7388508-7390902 lnc-C10orf67-2:8 Yes chr2L:7388508-7390902 lnc-C10orf67-2:9 No - lnc-C10orf67-2:10 No - lnc-C10orf67-2:4 No - lnc-OTUD1-1:4 No - lnc-OTUD1-1:5 No - lnc-C10orf67-1:1 No - lnc-THNSL1-4:3 No - LINC00836:10 No - LINC00836:11 No - LINC00836:12 No - LINC00836:13 No - lnc-ABI1-11:1 No - lnc-APBB1IP-1:19 No - lnc-APBB1IP-1:20 No - lnc-APBB1IP-1:21 No - lnc-APBB1IP-1:22 No - lnc-APBB1IP-1:23 No - lnc-APBB1IP-1:24 No - lnc-MASTL-5:1 No - lnc-MASTL-3:6 No - lnc-MASTL-3:7 No - lnc-MASTL-3:8 No - lnc-MASTL-3:9 No - lnc-WAC-4:2 Yes chr2R:11226458-11232516 lnc-WAC-3:2 Yes chr2R:11226458-11232516 lnc-WAC-3:3 Yes chr2R:11226458-11232516 lnc-WAC-3:4 Yes chr2R:11226458-11232516 lnc-WAC-3:5 Yes chr2R:11226458-11232516 lnc-WAC-3:6 Yes chr2R:11226458-11232516 WAC-AS1:14 Yes chrX:17068717-17077897 WAC-AS1:13 Yes chrX:17068717-17077897 WAC-AS1:16 Yes chrX:17068717-17077897 WAC-AS1:17 Yes chrX:17068717-17077897 WAC-AS1:11 Yes chrX:17068717-17077897 WAC-AS1:12 Yes chrX:17068717-17077897 WAC-AS1:9 Yes chrX:17068717-17077897 WAC-AS1:18 Yes chrX:17068717-17077897 WAC-AS1:19 Yes chrX:17068717-17077897 WAC-AS1:20 Yes chrX:17068717-17077897 WAC-AS1:15 Yes chrX:17068717-17077897 WAC-AS1:21 Yes chrX:17068717-17077897 WAC-AS1:10 Yes chrX:17068717-17077897 lnc-MPP7-9:2 No - lnc-LYZL1-13:1 No - lnc-LYZL1-13:2 No - lnc-LYZL1-13:3 No - lnc-LYZL1-15:11 No - lnc-LYZL1-15:12 No - lnc-LYZL1-15:13 No - lnc-LYZL1-15:14 No - lnc-LYZL1-15:15 No - lnc-LYZL1-15:16 No - lnc-LYZL1-15:17 No - lnc-LYZL1-15:18 No - lnc-LYZL1-15:19 Yes chr3L:2377655-2499226 lnc-LYZL1-15:20 Yes chr3L:2377655-2499226 lnc-LYZL1-15:24 Yes chr3L:2377655-2499226 lnc-LYZL1-14:1 Yes chr3L:2377655-2499226 lnc-MAP3K8-24:1 No - lnc-MAP3K8-24:2 No - lnc-MTPAP-7:1 No - lnc-MTPAP-8:1 No - lnc-MTPAP-9:1 No - lnc-MAP3K8-23:1 No - lnc-LYZL2-8:1 No - lnc-LYZL2-7:1 No - lnc-ZEB1-11:1 No - lnc-ZEB1-11:2 No - lnc-ZEB1-11:3 No - lnc-ZEB1-11:4 No - ZEB1-AS1:16 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB1-AS1:17 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB1-AS1:21 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB1-AS1:18 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB1-AS1:24 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB1-AS1:25 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB1-AS1:23 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB1-AS1:26 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB1-AS1:27 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB1-AS1:28 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB1-AS1:19 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB1-AS1:29 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB1-AS1:20 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB1-AS1:22 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-ZEB1-1:3 No - lnc-ZEB1-1:4 No - lnc-ZEB1-1:5 No - lnc-ZEB1-1:6 No - lnc-ZEB1-1:7 No - lnc-ZEB1-1:8 No - lnc-ARHGAP12-1:2 No - lnc-ZEB1-9:1 No - lnc-ARHGAP12-2:2 No - lnc-ZEB1-10:1 No - lnc-ZEB1-10:2 No - lnc-ZEB1-12:1 No - lnc-ZEB1-12:2 No - lnc-ZEB1-12:3 No - lnc-ZEB1-12:4 No - lnc-ZEB1-12:5 No - lnc-ZEB1-12:6 No - lnc-ZEB1-12:7 No - lnc-CCDC7-10:1 No - lnc-CCDC7-12:1 Yes chr2R:11452043-11465270 lnc-CCDC7-11:1 No - lnc-EPC1-3:6 No - lnc-EPC1-3:4 No - lnc-EPC1-3:3 No - lnc-EPC1-3:5 No - ITGB1-DT:26 Yes chrX:8061645-8070237 ITGB1-DT:27 Yes chrX:8061645-8070237 ITGB1-DT:28 Yes chrX:8061645-8070237 ITGB1-DT:29 Yes chrX:8061645-8070237 ITGB1-DT:30 Yes chrX:8061645-8070237 ITGB1-DT:31 Yes chrX:8061645-8070237 ITGB1-DT:33 Yes chrX:8061645-8070237 ITGB1-DT:34 Yes chrX:8061645-8070237 ITGB1-DT:35 Yes chrX:8061645-8070237 ITGB1-DT:36 Yes chrX:8061645-8070237 ITGB1-DT:37 Yes chrX:8061645-8070237 ITGB1-DT:38 Yes chrX:8061645-8070237 ITGB1-DT:39 Yes chrX:8061645-8070237 ITGB1-DT:42 Yes chrX:8061645-8070237 ITGB1-DT:43 Yes chrX:8061645-8070237 ITGB1-DT:44 Yes chrX:8061645-8070237 ITGB1-DT:45 Yes chrX:8061645-8070237 ITGB1-DT:46 Yes chrX:8061645-8070237 lnc-ITGB1-6:4 No - lnc-ITGB1-6:5 No - lnc-ITGB1-6:1 No - lnc-ITGB1-6:6 No - lnc-ITGB1-6:2 No - lnc-ITGB1-6:3 No - lnc-CUL2-1:12 No - lnc-CUL2-1:7 Yes chrX:18366357-18377864 lnc-CUL2-1:13 No - lnc-CUL2-1:8 No - lnc-CUL2-1:9 No - lnc-CUL2-1:10 No - lnc-CUL2-1:6 Yes chrX:18366357-18377864 lnc-CUL2-1:11 No - lnc-CUL2-3:11 Yes chr2L:11810092-11813780 lnc-CUL2-3:6 Yes chr2L:11810092-11813780 lnc-CUL2-3:4 Yes chr2L:11810092-11813780 lnc-CUL2-3:7 Yes chr2L:11810092-11813780 lnc-CUL2-3:5 Yes chr2L:11810092-11813780 lnc-CUL2-3:8 Yes chr2L:11810092-11813780 lnc-CUL2-3:9 Yes chr2L:11810092-11813780 lnc-CUL2-3:10 Yes chr2L:11810092-11813780 lnc-ZNF33A-2:4 No - lnc-ZNF33A-2:5 No - lnc-ZNF33A-2:6 No - lnc-ZNF33A-2:7 No - lnc-ZNF25-8:1 No - lnc-ZNF33B-13:2 No - lnc-ZNF33B-13:3 No - lnc-ZNF33B-13:4 No - LINC00839:18 No - LINC00839:19 No - LINC00839:20 No - LINC00839:21 No - LINC00839:22 No - LINC00839:23 No - LINC00839:24 No - LINC00839:25 No - lnc-ZNF33B-3:9 No - lnc-ZNF33B-3:10 No - lnc-ZNF33B-3:7 No - lnc-ZNF33B-3:8 No - lnc-ZNF33B-5:2 No - lnc-RASGEF1A-2:2 No - lnc-RASGEF1A-2:3 No - lnc-RASGEF1A-2:4 No - lnc-RASGEF1A-2:6 No - lnc-RASGEF1A-2:5 No - lnc-FXYD4-8:1 No - lnc-FXYD4-8:2 No - lnc-ZNF487-4:1 No - lnc-ZNF487-4:2 No - lnc-ZNF487-1:5 No - lnc-ZNF487-1:6 No - lnc-ZNF487-1:7 No - lnc-HNRNPF-1:2 No - lnc-HNRNPF-1:3 No - lnc-HNRNPF-1:4 No - lnc-HNRNPF-1:5 No - lnc-HNRNPF-1:6 No - lnc-ZNF485-68:2 No - lnc-ZNF485-68:3 No - lnc-ZNF485-68:4 No - lnc-ZNF485-68:5 No - lnc-ZNF485-68:6 No - lnc-ZNF485-68:7 No - TMEM72-AS1:10 No - TMEM72-AS1:6 No - TMEM72-AS1:7 No - TMEM72-AS1:11 No - TMEM72-AS1:8 No - TMEM72-AS1:9 No - TMEM72-AS1:14 No - TMEM72-AS1:12 Yes chr3R:23114014-23117931 TMEM72-AS1:13 Yes chr3R:23114014-23117931 TMEM72-AS1:5 Yes chr3R:23114014-23117931 TMEM72-AS1:16 Yes chr3R:23114014-23117931 lnc-GDF10-3:3 No - lnc-GDF10-3:2 No - lnc-GDF10-3:4 No - lnc-GDF10-3:5 No - lnc-GDF10-3:6 No - lnc-FAM25C-31:5 No - lnc-WDFY4-8:1 No - C10orf71-AS1:7 No - C10orf71-AS1:8 No - C10orf71-AS1:9 No - lnc-CHAT-3:1 No - lnc-TIMM23-2:3 No - lnc-TIMM23-2:1 No - lnc-TIMM23-2:2 No - lnc-ASAH2B-7:1 No - SGMS1-AS1:7 No - SGMS1-AS1:8 No - SGMS1-AS1:9 No - SGMS1-AS1:10 No - SGMS1-AS1:11 No - SGMS1-AS1:12 No - SGMS1-AS1:13 No - SGMS1-AS1:14 No - SGMS1-AS1:15 No - SGMS1-AS1:16 No - SGMS1-AS1:17 No - SGMS1-AS1:18 No - SGMS1-AS1:19 No - SGMS1-AS1:20 No - SGMS1-AS1:21 No - SGMS1-AS1:22 No - lnc-A1CF-8:3 Yes chr2L:3622074-3656953 PRKG1-AS1:10 Yes chr2L:3622074-3656953 PRKG1-AS1:16 Yes chr2L:3622074-3656953 PRKG1-AS1:14 Yes chr2L:3622074-3656953 PRKG1-AS1:11 Yes chr2L:3622074-3656953 PRKG1-AS1:12 Yes chr2L:3622074-3656953 PRKG1-AS1:13 Yes chr2L:3622074-3656953 PRKG1-AS1:15 No - LNCAROD:15 No - LNCAROD:16 No - LNCAROD:17 No - LNCAROD:18 No - lnc-DKK1-5:1 No - lnc-DKK1-5:2 No - lnc-DKK1-5:3 No - lnc-DKK1-5:4 No - lnc-DKK1-5:5 No - lnc-DKK1-5:6 No - lnc-MBL2-2:11 No - lnc-MBL2-2:12 No - lnc-MBL2-2:13 No - lnc-MBL2-2:9 No - lnc-MBL2-2:10 No - lnc-MTRNR2L5-7:1 No - lnc-ZWINT-2:4 No - lnc-ZWINT-2:5 No - lnc-ZWINT-2:6 No - lnc-ZWINT-2:3 No - lnc-IPMK-4:3 No - lnc-IPMK-4:4 No - lnc-IPMK-4:1 No - lnc-IPMK-4:2 No - lnc-IPMK-3:1 Yes chr3R:20575245-20577010 LINC00844:12 No - LINC00844:13 No - CCEPR:7 No - lnc-FAM13C-6:1 No - lnc-SLC16A9-1:10 No - lnc-SLC16A9-1:11 No - lnc-SLC16A9-1:12 No - lnc-CCDC6-2:1 No - LINC00845:5 Yes chr3L:20376242-20382398 LINC00845:6 Yes chr3L:20376242-20382398 lnc-ARID5B-2:1 No - lnc-RTKN2-6:1 Yes chrX:18843663-18855858 lnc-RTKN2-2:2 No - lnc-RTKN2-2:3 No - lnc-RTKN2-2:4 No - lnc-RTKN2-2:5 No - lnc-RTKN2-2:7 No - lnc-RTKN2-2:6 No - lnc-EGR2-1:4 Yes chr3L:8123612-8124531 lnc-ADO-3:1 Yes chr3R:18090803-18135583 lnc-JMJD1C-14:1 No - lnc-JMJD1C-14:2 No - lnc-JMJD1C-14:3 No - lnc-REEP3-12:1 No - lnc-REEP3-12:2 No - lnc-REEP3-12:3 No - lnc-REEP3-12:4 No - lnc-REEP3-13:1 No - lnc-REEP3-13:2 No - lnc-JMJD1C-2:5 No - lnc-JMJD1C-2:6 No - lnc-REEP3-2:5 No - lnc-REEP3-2:8 No - lnc-REEP3-2:9 No - lnc-REEP3-2:6 No - lnc-REEP3-2:7 No - lnc-JMJD1C-2:3 No - lnc-JMJD1C-2:4 No - LINC01515:34 No - LINC01515:35 No - LINC01515:36 No - LINC01515:37 No - LINC01515:31 No - LINC01515:38 No - LINC01515:32 No - LINC01515:33 No - LINC01515:39 No - lnc-SIRT1-1:3 No - lnc-SIRT1-1:4 No - lnc-TET1-5:1 No - lnc-SLC25A16-5:1 No - lnc-SLC25A16-6:1 No - lnc-TACR2-10:1 No - lnc-TACR2-5:2 No - lnc-TACR2-9:1 No - lnc-TACR2-8:1 No - lnc-H2AFY2-4:1 No - lnc-ADAMTS14-2:2 No - lnc-PSAP-1:1 No - lnc-PSAP-1:2 No - lnc-CDH23-4:1 No - lnc-ASCC1-4:4 No - lnc-ASCC1-4:1 No - lnc-ASCC1-4:5 No - lnc-ASCC1-4:2 No - lnc-ASCC1-4:3 No - lnc-DNAJB12-5:1 No - lnc-DDIT4-2:1 No - lnc-DDIT4-2:2 No - lnc-FAM149B1-5:2 No - lnc-SEC24C-5:5 No - lnc-SEC24C-5:6 No - lnc-SEC24C-5:7 No - lnc-AGAP5-1:25 Yes chr2L:13835564-13898712 lnc-AGAP5-1:28 Yes chr2L:13835564-13898712 lnc-AGAP5-1:21 Yes chr2L:13835564-13898712 lnc-AGAP5-1:22 Yes chr2L:13835564-13898712 lnc-AGAP5-1:23 Yes chr2L:13835564-13898712 lnc-AGAP5-1:18 Yes chr2L:13835564-13898712 lnc-AGAP5-1:29 Yes chr2L:13835564-13898712 lnc-AGAP5-1:30 Yes chr2L:13835564-13898712 lnc-AGAP5-1:31 No - lnc-AGAP5-1:26 No - lnc-AGAP5-1:27 No - lnc-AGAP5-1:17 No - lnc-AGAP5-1:14 No - lnc-AGAP5-1:15 No - lnc-NDST2-3:4 Yes chr2L:9428669-9431052 lnc-NDST2-3:3 No - lnc-ZSWIM8-5:1 No - lnc-ZNF503-1:7 Yes chr2L:14490859-14494019 ZNF503-AS1:12 No - ZNF503-AS1:13 No - ZNF503-AS1:14 No - ZNF503-AS1:15 No - ZNF503-AS1:16 No - ZNF503-AS1:17 No - lnc-ZNF503-1:5 Yes chr2L:14490859-14494019 lnc-ZNF503-1:6 Yes chr2L:14490859-14494019 lnc-ZNF503-1:4 Yes chr2L:14490859-14494019 ZNF503-AS2:21 Yes chr2L:14490859-14494019 ZNF503-AS2:22 No - ZNF503-AS2:23 No - ZNF503-AS2:24 No - ZNF503-AS2:25 No - ZNF503-AS2:26 No - ZNF503-AS2:27 No - ZNF503-AS2:28 No - ZNF503-AS2:29 No - ZNF503-AS2:30 No - ZNF503-AS2:31 No - lnc-ZNF503-10:2 No - lnc-ZNF503-10:3 No - ZNF503-AS2:34 No - lnc-ZNF503-2:4 Yes chr3R:26989035-26989852 lnc-ZNF503-2:5 Yes chr3R:26989035-26989852 lnc-ZNF503-2:3 Yes chr3R:26989035-26989852 lnc-ZNF503-2:2 Yes chr3R:26989035-26989852 lnc-ZNF503-2:6 Yes chr3R:26989035-26989852 lnc-ZNF503-2:7 Yes chr3R:26989035-26989852 lnc-ZNF503-2:8 Yes chr3R:26989035-26989852 lnc-RPS24-17:1 No - lnc-RPS24-3:30 No - lnc-RPS24-3:31 No - lnc-RPS24-3:32 No - lnc-RPS24-3:33 No - lnc-RPS24-3:35 No - lnc-RPS24-3:36 No - lnc-RPS24-3:37 No - lnc-RPS24-3:34 No - lnc-RPS24-3:38 No - lnc-POLR3A-8:1 No - lnc-POLR3A-8:2 No - lnc-POLR3A-8:3 No - lnc-POLR3A-8:4 No - lnc-POLR3A-8:5 No - ZMIZ1-AS1:39 No - ZMIZ1-AS1:43 No - ZMIZ1-AS1:38 No - ZMIZ1-AS1:40 No - ZMIZ1-AS1:41 No - ZMIZ1-AS1:26 No - ZMIZ1-AS1:42 No - ZMIZ1-AS1:35 No - ZMIZ1-AS1:27 No - ZMIZ1-AS1:25 No - ZMIZ1-AS1:20 Yes chr3L:10857889-10876496 ZMIZ1-AS1:21 Yes chr3L:10857889-10876496 ZMIZ1-AS1:30 No - ZMIZ1-AS1:36 No - ZMIZ1-AS1:28 No - ZMIZ1-AS1:33 No - ZMIZ1-AS1:29 No - ZMIZ1-AS1:22 Yes chr3L:10857889-10876496 ZMIZ1-AS1:37 No - ZMIZ1-AS1:34 No - ZMIZ1-AS1:31 No - ZMIZ1-AS1:32 No - ZMIZ1-AS1:23 Yes chr3L:10857889-10876496 ZMIZ1-AS1:24 Yes chr3L:10857889-10876496 lnc-ZCCHC24-11:1 No - lnc-ZCCHC24-10:1 No - NUTM2B-AS1:48 No - NUTM2B-AS1:41 No - NUTM2B-AS1:42 No - NUTM2B-AS1:49 No - NUTM2B-AS1:51 No - NUTM2B-AS1:50 No - NUTM2B-AS1:52 No - NUTM2B-AS1:43 No - NUTM2B-AS1:46 No - NUTM2B-AS1:47 No - NUTM2B-AS1:44 No - NUTM2B-AS1:45 No - TMEM254-AS1:24 No - TMEM254-AS1:14 No - TMEM254-AS1:15 No - TMEM254-AS1:16 No - TMEM254-AS1:17 No - TMEM254-AS1:18 No - TMEM254-AS1:30 No - TMEM254-AS1:25 No - TMEM254-AS1:26 No - TMEM254-AS1:20 No - TMEM254-AS1:31 No - TMEM254-AS1:32 No - TMEM254-AS1:27 No - TMEM254-AS1:21 No - TMEM254-AS1:22 No - TMEM254-AS1:28 No - TMEM254-AS1:23 No - TMEM254-AS1:19 No - TMEM254-AS1:29 No - lnc-DYDC1-11:1 No - lnc-DYDC1-11:2 No - lnc-DYDC1-12:1 No - lnc-DYDC1-1:5 Yes chr2L:6000228-6003738 lnc-DYDC1-1:6 Yes chr2L:6000228-6003738 lnc-DYDC1-1:7 Yes chr2L:6000228-6003738 lnc-DYDC1-1:3 Yes chr2L:6000228-6003738 lnc-DYDC1-1:4 Yes chr2L:6000228-6003738 lnc-OPN4-1:5 No - lnc-OPN4-1:7 No - lnc-OPN4-1:8 No - lnc-OPN4-1:6 No - lnc-OPN4-1:9 No - lnc-MMRN2-2:3 Yes chr2R:15762565-15817004 lnc-MMRN2-2:4 Yes chr2R:15762565-15817004 lnc-MMRN2-2:5 No - lnc-MMRN2-2:6 No - lnc-MMRN2-2:7 No - lnc-MMRN2-2:8 No - lnc-MMRN2-2:9 No - NUTM2A-AS1:41 No - NUTM2A-AS1:31 No - NUTM2A-AS1:42 No - NUTM2A-AS1:43 No - NUTM2A-AS1:45 No - NUTM2A-AS1:46 No - NUTM2A-AS1:32 No - NUTM2A-AS1:28 No - NUTM2A-AS1:29 No - NUTM2A-AS1:30 No - NUTM2A-AS1:33 No - NUTM2A-AS1:35 No - NUTM2A-AS1:38 No - NUTM2A-AS1:36 No - NUTM2A-AS1:37 No - NUTM2A-AS1:47 No - NUTM2A-AS1:39 No - NUTM2A-AS1:34 No - NUTM2A-AS1:48 No - NUTM2A-AS1:40 No - NUTM2A-AS1:49 No - NUTM2A-AS1:44 No - lnc-ATAD1-5:5 No - lnc-ATAD1-5:2 No - lnc-ATAD1-5:3 No - lnc-ATAD1-5:4 No - lnc-ATAD1-2:2 Yes chr3L:19845293-19860925 lnc-RNLS-3:1 No - lnc-IFIT2-1:7 Yes chr2L:10643971-10645891 lnc-IFIT2-1:8 Yes chr2L:10643971-10645891 lnc-IFIT2-1:9 Yes chr2L:10643971-10645891 lnc-IFIT2-1:6 Yes chr2L:10643971-10645891 lnc-IFIT2-1:11 Yes chr2L:10643971-10645891 lnc-IFIT2-1:10 Yes chr2L:10643971-10645891 lnc-IFIT2-1:12 Yes chr2L:10643971-10645891 lnc-IFIT2-1:13 Yes chr2L:10643971-10645891 lnc-PANK1-2:9 No - lnc-PANK1-2:10 No - lnc-PANK1-2:15 No - lnc-PANK1-2:13 No - lnc-PANK1-2:8 No - lnc-PANK1-2:11 No - lnc-PANK1-2:12 No - lnc-PANK1-2:14 No - LINC00865:9 No - LINC01374:17 No - LINC01374:18 No - LINC01374:20 No - LINC01374:21 No - LINC01374:22 No - LINC01374:23 No - lnc-HTR7-1:2 No - lnc-HTR7-1:3 No - lnc-KIF20B-9:1 No - lnc-KIF20B-9:2 No - lnc-KIF20B-9:3 No - lnc-KIF20B-9:4 No - lnc-KIF20B-9:5 No - lnc-RPP30-12:1 No - lnc-RPP30-12:2 No - lnc-RPP30-12:4 No - lnc-RPP30-12:3 No - lnc-RPP30-12:5 No - lnc-HTR7-1:4 No - lnc-RPP30-2:3 No - lnc-RPP30-2:4 No - lnc-ANKRD1-1:5 No - lnc-ANKRD1-1:6 No - lnc-ANKRD1-1:7 No - lnc-ANKRD1-1:3 No - lnc-ANKRD1-1:4 No - lnc-PCGF5-6:1 No - HECTD2-AS1:8 No - HECTD2-AS1:5 No - HECTD2-AS1:9 No - HECTD2-AS1:6 No - HECTD2-AS1:7 No - HECTD2-AS1:4 No - TNKS2-AS1:8 Yes chr3R:25653091-25661286 TNKS2-AS1:9 Yes chr3R:25653091-25661286 TNKS2-AS1:14 No - TNKS2-AS1:7 Yes chr3R:25653091-25661286 TNKS2-AS1:11 No - TNKS2-AS1:10 No - TNKS2-AS1:12 No - TNKS2-AS1:13 No - lnc-FGFBP3-4:1 No - lnc-IDE-3:1 No - lnc-IDE-3:2 No - lnc-IDE-3:3 No - lnc-PDE6C-6:1 No - lnc-FRA10AC1-5:1 No - PLCE1-AS1:9 No - PLCE1-AS1:10 No - PLCE1-AS1:11 No - PLCE1-AS1:12 No - PLCE1-AS1:8 No - lnc-PLCE1-4:1 No - lnc-PDLIM1-1:6 No - lnc-PDLIM1-1:7 No - lnc-PDLIM1-1:5 No - ENTPD1-AS1:23 No - lnc-TCTN3-2:1 No - ENTPD1-AS1:24 No - ENTPD1-AS1:32 No - ENTPD1-AS1:33 No - ENTPD1-AS1:38 No - ENTPD1-AS1:39 No - ENTPD1-AS1:35 No - ENTPD1-AS1:25 No - ENTPD1-AS1:40 No - ENTPD1-AS1:41 No - ENTPD1-AS1:26 No - ENTPD1-AS1:42 No - ENTPD1-AS1:27 No - ENTPD1-AS1:43 No - ENTPD1-AS1:36 No - ENTPD1-AS1:34 No - ENTPD1-AS1:37 No - ENTPD1-AS1:28 No - ENTPD1-AS1:29 No - ENTPD1-AS1:19 Yes chr3L:3466428-3468098 ENTPD1-AS1:20 Yes chr3L:3466428-3468098 ENTPD1-AS1:30 Yes chr3L:3466428-3468098 ENTPD1-AS1:21 No - ENTPD1-AS1:22 No - lnc-CCNJ-1:20 No - lnc-CCNJ-1:21 No - lnc-CCNJ-1:25 No - lnc-CCNJ-1:26 No - lnc-CCNJ-1:32 No - lnc-CCNJ-1:33 No - lnc-CCNJ-1:38 No - lnc-CCNJ-1:39 No - lnc-CCNJ-1:42 No - lnc-LCOR-4:1 No - lnc-LCOR-4:2 No - lnc-LCOR-4:5 Yes chr3L:5601096-5603979 lnc-LCOR-4:8 No - lnc-LCOR-4:6 No - lnc-PIK3AP1-6:3 No - lnc-R3HCC1L-8:1 No - lnc-R3HCC1L-8:2 No - lnc-R3HCC1L-8:3 No - lnc-R3HCC1L-8:4 No - lnc-R3HCC1L-7:6 Yes chr2R:14855429-14857502 lnc-R3HCC1L-7:7 Yes chr2R:14855429-14857502 lnc-R3HCC1L-7:8 Yes chr2R:14855429-14857502 lnc-CNNM1-1:8 No - lnc-CNNM1-1:4 No - lnc-CNNM1-1:5 No - lnc-CNNM1-1:6 No - lnc-CNNM1-1:9 No - lnc-CNNM1-1:7 No - lnc-CNNM1-1:10 No - lnc-CNNM1-1:11 No - lnc-ENTPD7-1:2 No - lnc-ENTPD7-1:3 No - lnc-ENTPD7-1:4 No - lnc-ENTPD7-1:5 No - lnc-SLC25A28-1:2 No - lnc-ABCC2-4:1 No - lnc-SCD-7:1 No - lnc-SCD-7:2 No - lnc-SCD-2:5 No - lnc-SCD-2:3 No - lnc-SCD-6:1 No - lnc-PKD2L1-1:4 No - lnc-PKD2L1-1:5 No - lnc-PKD2L1-1:3 No - lnc-PKD2L1-7:1 No - OLMALINC:22 No - OLMALINC:23 No - OLMALINC:24 No - OLMALINC:25 No - OLMALINC:26 No - OLMALINC:27 No - lnc-MRPL43-2:4 No - lnc-MRPL43-2:2 No - lnc-MRPL43-2:3 No - lnc-PDZD7-3:10 No - lnc-PDZD7-3:4 No - lnc-PDZD7-3:5 No - lnc-PDZD7-3:6 No - lnc-PDZD7-3:7 No - lnc-PDZD7-3:9 No - lnc-PDZD7-3:8 No - lnc-PDZD7-11:2 No - lnc-PDZD7-11:3 No - lnc-BTRC-2:2 No - lnc-DPCD-11:1 No - lnc-HPS6-4:1 No - lnc-PSD-2:1 Yes chr3R:9044183-9047977 RPARP-AS1:24 No - RPARP-AS1:25 No - RPARP-AS1:26 No - RPARP-AS1:27 No - lnc-ARL3-1:2 No - lnc-PDCD11-2:2 Yes chr3R:9020348-9039471 lnc-NEURL1-4:1 No - lnc-STN1-2:1 No - lnc-STN1-2:2 No - lnc-STN1-2:3 No - lnc-STN1-2:4 No - lnc-STN1-2:5 No - lnc-CFAP43-5:1 No - lnc-CFAP43-5:2 No - lnc-CFAP43-6:1 Yes chr3L:8518885-8520295 CFAP58-DT:9 No - CFAP58-DT:10 No - CFAP58-DT:11 No - lnc-SORCS3-18:1 No - lnc-SMNDC1-9:1 No - lnc-SMNDC1-2:12 No - lnc-SMNDC1-2:13 No - lnc-SMNDC1-2:14 No - lnc-SMNDC1-2:15 No - lnc-SMNDC1-2:16 No - lnc-SMNDC1-2:6 No - lnc-SMNDC1-2:17 No - lnc-SMNDC1-2:11 No - lnc-SMNDC1-2:7 No - lnc-SMNDC1-2:4 No - lnc-SMNDC1-2:8 No - lnc-SMNDC1-2:9 No - lnc-SMNDC1-2:10 No - lnc-SMNDC1-2:5 No - PDCD4-AS1:8 No - PDCD4-AS1:9 No - PDCD4-AS1:6 Yes chrX:13745577-13755406 PDCD4-AS1:5 Yes chrX:13745577-13755406 PDCD4-AS1:7 Yes chrX:13745577-13755406 lnc-ZDHHC6-8:1 Yes chr3L:691486-692919 lnc-ZDHHC6-8:2 Yes chr3L:691486-692919 lnc-ZDHHC6-8:3 Yes chr3L:691486-692919 lnc-ZDHHC6-4:2 Yes chr4:69326-114270 lnc-TCF7L2-7:1 No - lnc-CCDC186-1:2 No - lnc-CCDC186-1:3 No - lnc-CCDC172-1:1 No - lnc-CCDC172-1:2 No - lnc-CCDC172-1:3 No - lnc-PNLIPRP1-1:4 No - lnc-HSPA12A-1:6 No - lnc-HSPA12A-1:7 No - lnc-HSPA12A-1:8 No - lnc-HSPA12A-1:2 No - lnc-HSPA12A-1:9 No - lnc-HSPA12A-1:3 No - lnc-HSPA12A-1:10 No - lnc-HSPA12A-1:4 No - lnc-HSPA12A-1:5 No - lnc-HSPA12A-1:11 No - lnc-PDZD8-1:4 No - lnc-PDZD8-1:5 No - lnc-PDZD8-1:3 No - lnc-PDZD8-1:6 No - lnc-PDZD8-1:7 No - lnc-EMX2-1:3 No - lnc-EMX2-1:4 No - lnc-EMX2-1:5 No - lnc-EMX2-1:6 No - EMX2OS:17 Yes chr3R:13867345-13874916 EMX2OS:18 Yes chr3R:13867345-13874916 EMX2OS:19 No - EMX2OS:16 Yes chr3R:13867345-13874916 EMX2OS:20 No - EMX2OS:21 No - CASC2:16 Yes chrX:18635642-18647648 CASC2:17 Yes chrX:18635642-18647648 CASC2:15 Yes chrX:18635642-18647648 CASC2:18 Yes chrX:18635642-18647648 CASC2:19 No - CASC2:20 No - CASC2:21 No - CASC2:22 No - CASC2:23 No - CASC2:24 No - lnc-EMX2-5:11 No - lnc-EMX2-5:12 No - lnc-EMX2-5:13 No - lnc-EMX2-5:14 No - lnc-NANOS1-11:1 No - lnc-NANOS1-10:1 No - lnc-PRDX3-6:1 No - lnc-PRDX3-6:2 No - lnc-BAG3-4:3 Yes chr3R:24043056-24048265 lnc-BAG3-4:5 Yes chr3R:24043056-24048265 lnc-TIAL1-6:1 No - lnc-TIAL1-1:5 Yes chr3L:13477541-13483515 lnc-TIAL1-1:6 Yes chr3L:13477541-13483515 lnc-TIAL1-1:4 No - lnc-FGFR2-12:9 No - lnc-FGFR2-12:3 No - lnc-FGFR2-12:4 No - lnc-FGFR2-12:5 No - lnc-FGFR2-2:5 No - lnc-FGFR2-2:7 No - lnc-FGFR2-2:8 No - lnc-FGFR2-2:9 No - lnc-FGFR2-2:3 No - lnc-FGFR2-2:6 No - lnc-FGFR2-2:4 No - lnc-FGFR2-2:2 No - lnc-NSMCE4A-7:1 No - lnc-NSMCE4A-7:3 No - lnc-NSMCE4A-7:4 No - lnc-NSMCE4A-7:2 No - lnc-NSMCE4A-7:5 No - lnc-BUB3-4:1 No - lnc-BUB3-4:2 No - lnc-BUB3-4:3 No - lnc-BUB3-4:4 No - lnc-BUB3-4:12 No - lnc-BUB3-4:11 No - lnc-BUB3-4:13 No - lnc-BUB3-4:14 No - lnc-LHPP-8:1 No - lnc-OAT-1:1 No - lnc-LHPP-7:1 No - FAM53B-AS1:9 Yes chr2L:2978411-2979288 FAM53B-AS1:12 Yes chr2L:2978411-2979288 FAM53B-AS1:10 Yes chr2L:2978411-2979288 FAM53B-AS1:11 Yes chr2L:2978411-2979288 lnc-ABRAXAS2-8:1 No - lnc-CTBP2-6:1 No - lnc-CTBP2-6:2 No - lnc-CTBP2-6:3 No - lnc-ZRANB1-2:3 No - lnc-ZRANB1-2:4 No - EDRF1-AS1:44 No - EDRF1-AS1:45 No - EDRF1-AS1:39 No - EDRF1-AS1:46 No - EDRF1-AS1:47 No - EDRF1-AS1:40 No - EDRF1-AS1:41 No - EDRF1-AS1:42 No - EDRF1-AS1:43 No - lnc-FANK1-4:2 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-FANK1-4:3 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-FANK1-4:1 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-FANK1-4:4 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-FANK1-4:5 Yes chr3R:14664907-14697292 LINC00601:3 No - LINC00601:2 No - lnc-C10orf90-2:5 No - lnc-C10orf90-2:6 No - lnc-C10orf90-2:4 Yes chr3R:23781765-23801634 lnc-C10orf90-2:8 No - lnc-C10orf90-2:9 No - lnc-C10orf90-2:7 No - lnc-FOXI2-1:2 No - lnc-EBF3-6:2 No - lnc-EBF3-6:3 No - lnc-EBF3-6:6 No - lnc-EBF3-6:5 No - lnc-EBF3-6:4 No - lnc-C10orf143-46:12 No - lnc-C10orf143-46:2 No - lnc-C10orf143-46:13 No - lnc-C10orf143-46:3 No - lnc-C10orf143-46:4 No - lnc-C10orf143-46:5 No - lnc-C10orf143-46:6 No - lnc-C10orf143-46:7 No - lnc-GLRX3-2:5 No - lnc-GLRX3-2:6 No - lnc-C10orf143-11:1 No - lnc-C10orf143-11:2 No - lnc-C10orf143-11:3 No - lnc-C10orf143-11:4 No - lnc-C10orf143-11:5 No - lnc-STK32C-1:4 No - lnc-STK32C-1:5 No - lnc-STK32C-1:3 No - lnc-LRRC27-2:1 Yes chr3R:4407227-4419578 lnc-PWWP2B-1:2 No - lnc-PWWP2B-1:3 No - lnc-PWWP2B-1:4 No - lnc-STK32C-2:2 No - lnc-STK32C-2:3 No - lnc-STK32C-2:4 No - lnc-STK32C-2:5 No - lnc-STK32C-2:6 No - lnc-STK32C-8:1 No - LINC01168:4 No - MIR202HG:8 No - MIR202HG:6 No - MIR202HG:5 No - MIR202HG:7 No - lnc-PGGHG-1:6 No - lnc-PGGHG-1:7 No - lnc-PGGHG-1:8 No - lnc-PGGHG-1:9 No - lnc-PGGHG-1:10 No - lnc-PGGHG-1:13 No - lnc-IFITM5-2:2 No - lnc-IFITM2-3:6 No - lnc-IFITM2-3:7 No - lnc-IFITM2-3:8 No - lnc-LRRC56-1:5 No - lnc-LRRC56-1:6 No - lnc-LRRC56-1:10 Yes chr3R:9510561-9513067 lnc-LRRC56-1:11 Yes chr3R:9510561-9513067 MIR210HG:14 Yes chr3R:25661795-25665640 MIR210HG:8 Yes chr3R:25661795-25665640 MIR210HG:9 No - MIR210HG:10 No - MIR210HG:11 No - MIR210HG:12 No - MIR210HG:13 No - lnc-LMNTD2-3:4 No - lnc-LMNTD2-3:5 No - lnc-IRF7-1:1 Yes chr3R:5579301-5588380 lnc-IRF7-1:2 Yes chr3R:5579301-5588380 lnc-POLR2L-1:4 No - lnc-POLR2L-1:3 No - TOLLIP-AS1:4 No - TOLLIP-AS1:5 No - TOLLIP-AS1:6 No - lnc-TOLLIP-3:1 No - lnc-TOLLIP-3:2 No - lnc-TOLLIP-3:3 No - KRTAP5-AS1:7 No - FAM99B:3 No - FAM99B:4 No - FAM99B:5 No - FAM99B:6 No - lnc-CTSD-2:3 No - lnc-CTSD-2:4 No - MRPL23-AS1:10 Yes chr3L:2372844-2373704 MRPL23-AS1:8 Yes chr3L:2372844-2373704 MRPL23-AS1:9 Yes chr3L:2372844-2373704 MRPL23-AS1:11 Yes chr3L:2372844-2373704 MRPL23-AS1:12 Yes chr3L:2372844-2373704 CD81-AS1:6 Yes chr3R:25872900-25881427 CD81-AS1:7 Yes chr3R:25872900-25881427 CD81-AS1:8 Yes chr3R:25872900-25881427 CD81-AS1:9 Yes chr3R:25872900-25881427 CD81-AS1:10 No - CD81-AS1:5 Yes chr3R:25872900-25881427 lnc-SLC22A18-6:1 No - lnc-ART1-9:1 No - lnc-ZNF195-1:6 No - lnc-ZNF195-1:7 No - lnc-ZNF195-1:8 No - lnc-RHOG-2:2 Yes chrX:15934495-15940451 lnc-RHOG-2:3 Yes chrX:15934495-15940451 lnc-RHOG-2:4 Yes chrX:15934495-15940451 lnc-SSU72P5-2:4 No - lnc-SSU72P5-2:5 No - lnc-SSU72P5-2:6 No - lnc-OR51B6-1:2 No - lnc-OR51B6-1:3 No - lnc-OR51B6-1:4 No - lnc-OR52H1-1:2 No - lnc-OR52H1-1:3 No - lnc-OR52H1-1:4 No - lnc-APBB1-2:1 No - lnc-APBB1-2:2 No - lnc-APBB1-2:3 No - lnc-APBB1-2:4 No - lnc-RRP8-1:2 Yes chr3L:21216901-21219240 lnc-ILK-9:1 No - lnc-ILK-9:2 No - lnc-ILK-4:2 No - lnc-ILK-4:3 No - lnc-ILK-4:4 No - lnc-ILK-4:5 No - lnc-ILK-4:6 No - lnc-CYB5R2-3:18 No - lnc-CYB5R2-3:19 No - lnc-CYB5R2-3:16 No - lnc-CYB5R2-3:17 No - lnc-CYB5R2-3:20 No - lnc-CYB5R2-1:4 No - lnc-CYB5R2-1:5 No - lnc-CYB5R2-1:6 No - lnc-CYB5R2-1:7 No - lnc-CYB5R2-1:3 No - lnc-RPL27A-5:1 No - TMEM9B-AS1:12 Yes chr3R:5355092-5356748 TMEM9B-AS1:11 Yes chr3R:5355092-5356748 TMEM9B-AS1:13 Yes chr3R:5355092-5356748 TMEM9B-AS1:14 Yes chr3R:5355092-5356748 TMEM9B-AS1:15 Yes chr3R:5355092-5356748 TMEM9B-AS1:16 No - TMEM9B-AS1:17 No - lnc-AKIP1-2:6 No - lnc-AKIP1-2:7 Yes chr3L:7562610-7569499 lnc-AKIP1-2:8 No - lnc-AKIP1-2:9 No - lnc-AKIP1-2:10 Yes chr3L:7562610-7569499 lnc-TMEM41B-9:1 Yes chr3L:1537137-1544823 lnc-IPO7-4:1 No - lnc-IPO7-4:2 No - lnc-IPO7-3:1 No - lnc-IPO7-3:2 No - lnc-TMEM41B-10:1 No - lnc-IPO7-2:1 No - lnc-SBF2-7:1 No - lnc-SBF2-7:2 No - lnc-SBF2-1:5 No - lnc-SBF2-1:6 No - lnc-AMPD3-53:1 No - ZBED5-AS1:15 No - ZBED5-AS1:16 No - ZBED5-AS1:17 No - ZBED5-AS1:18 No - ZBED5-AS1:19 No - ZBED5-AS1:20 No - ZBED5-AS1:23 No - ZBED5-AS1:24 No - ZBED5-AS1:27 No - ZBED5-AS1:25 No - ZBED5-AS1:26 No - ZBED5-AS1:28 No - ZBED5-AS1:29 No - lnc-ZBED5-1:8 No - lnc-ZBED5-1:6 No - lnc-ZBED5-1:9 No - lnc-ZBED5-1:7 No - lnc-ZBED5-1:10 No - lnc-ZBED5-1:5 No - ZBED5-AS1:30 No - ZBED5-AS1:31 No - ZBED5-AS1:32 No - lnc-CTR9-5:3 No - lnc-CTR9-5:4 No - lnc-USP47-4:1 No - lnc-DKK3-9:1 No - lnc-MICAL2-1:3 No - lnc-MICAL2-1:4 No - lnc-MICAL2-1:5 No - lnc-MICAL2-1:6 No - lnc-DKK3-10:4 No - lnc-DKK3-10:1 No - lnc-DKK3-10:5 No - lnc-DKK3-10:2 No - lnc-DKK3-10:3 No - lnc-DKK3-8:3 No - lnc-DKK3-8:5 No - lnc-DKK3-8:4 No - lnc-DKK3-3:5 No - lnc-DKK3-3:2 No - lnc-DKK3-3:3 No - lnc-DKK3-3:4 No - lnc-BTBD10-2:5 No - lnc-BTBD10-2:3 No - lnc-BTBD10-2:4 No - lnc-RASSF10-9:1 No - lnc-ARNTL-8:1 No - lnc-PDE3B-6:1 Yes chr2L:13232039-13233058 lnc-INSC-2:5 No - lnc-INSC-2:6 No - lnc-INSC-2:7 No - lnc-INSC-2:8 No - lnc-INSC-2:11 No - lnc-INSC-2:12 No - lnc-INSC-2:13 No - lnc-INSC-2:14 No - lnc-INSC-2:15 No - lnc-SOX6-7:5 No - lnc-SOX6-7:4 No - lnc-NUCB2-11:1 Yes chr3L:11774650-11790013 lnc-HPS5-2:1 Yes chr3L:6259105-6262694 lnc-LDHAL6A-1:3 Yes chr3L:16842294-16844585 lnc-TMEM86A-5:1 No - lnc-SPTY2D1OS-4:1 Yes chr3R:27112566-27115126 lnc-ZDHHC13-1:3 No - lnc-ZDHHC13-1:4 No - lnc-ZDHHC13-1:5 No - lnc-DBX1-6:4 Yes chr2L:19796365-19958424 lnc-DBX1-7:1 No - lnc-GAS2-1:5 No - lnc-GAS2-1:6 No - lnc-GAS2-1:7 No - lnc-GAS2-1:8 No - lnc-GAS2-1:4 No - lnc-GAS2-1:9 No - lnc-GAS2-1:10 No - lnc-GAS2-1:11 No - lnc-ANO3-1:2 No - BBOX1-AS1:9 Yes chr2R:13375975-13377731 BBOX1-AS1:12 Yes chr2R:13375975-13377731 BBOX1-AS1:10 No - lnc-BBOX1-13:1 No - lnc-BBOX1-13:2 No - lnc-BBOX1-13:3 No - BBOX1-AS1:11 No - BBOX1-AS1:8 No - BDNF-AS:24 No - BDNF-AS:25 No - BDNF-AS:30 No - BDNF-AS:31 No - lnc-KCNA4-9:1 No - lnc-KCNA4-9:2 No - lnc-KCNA4-9:5 No - lnc-KCNA4-9:3 No - lnc-KCNA4-9:4 No - lnc-KCNA4-2:5 No - lnc-KCNA4-2:6 No - lnc-KCNA4-2:7 No - lnc-KCNA4-2:8 No - lnc-KCNA4-2:4 No - MPPED2-AS1:8 Yes chr3L:9679201-9681060 MPPED2-AS1:9 Yes chr3L:9679201-9681060 MPPED2-AS1:10 Yes chr3L:9679201-9681060 lnc-ARL14EP-3:1 No - lnc-ARL14EP-3:2 No - lnc-ARL14EP-3:3 No - lnc-ARL14EP-3:4 No - lnc-ARL14EP-3:5 No - lnc-ARL14EP-3:8 No - CSTF3-DT:13 Yes chrX:23096771-23101431 CSTF3-DT:14 Yes chrX:23096771-23101431 CSTF3-DT:15 Yes chrX:23096771-23101431 CSTF3-DT:16 Yes chrX:23096771-23101431 CSTF3-DT:17 Yes chrX:23096771-23101431 CSTF3-DT:18 Yes chrX:23096771-23101431 lnc-CSTF3-6:1 Yes chr3L:543060-581099 FBXO3-DT:16 No - FBXO3-DT:17 No - FBXO3-DT:18 No - FBXO3-DT:19 No - FBXO3-DT:20 No - FBXO3-DT:21 No - FBXO3-DT:22 No - lnc-ABTB2-4:1 Yes chr3L:18668153-18673324 lnc-ABTB2-4:4 Yes chr3L:18668153-18673324 lnc-ABTB2-4:5 Yes chr3L:18668153-18673324 lnc-ABTB2-4:2 Yes chr3L:18668153-18673324 lnc-ABTB2-4:3 Yes chr3L:18668153-18673324 lnc-ABTB2-3:1 Yes chr3L:18668153-18673324 lnc-ABTB2-3:2 No - lnc-ELF5-5:1 No - lnc-APIP-1:7 No - lnc-APIP-1:8 No - lnc-APIP-1:4 No - lnc-CD44-7:3 No - lnc-CD44-7:4 No - lnc-APIP-1:14 No - lnc-APIP-1:9 No - lnc-APIP-1:10 No - lnc-APIP-1:5 No - lnc-APIP-1:6 No - lnc-APIP-1:15 No - lnc-APIP-1:11 No - lnc-APIP-1:16 No - lnc-APIP-1:12 No - lnc-APIP-1:13 No - lnc-APIP-1:3 No - lnc-CD44-7:5 No - lnc-CD44-7:6 No - lnc-CD44-7:7 No - lnc-CD44-7:8 No - lnc-CD44-7:9 No - lnc-CD44-7:10 No - lnc-SLC1A2-2:5 No - lnc-SLC1A2-2:6 No - lnc-PAMR1-3:2 No - lnc-PAMR1-3:3 No - lnc-PAMR1-3:4 No - lnc-PAMR1-3:5 No - lnc-PAMR1-3:6 No - lnc-PAMR1-3:1 No - lnc-LRRC4C-10:1 No - lnc-LRRC4C-10:2 No - lnc-LRRC4C-10:3 No - lnc-LRRC4C-10:4 No - lnc-LRRC4C-10:5 No - lnc-ALX4-21:1 No - lnc-ALX4-21:2 No - lnc-ALX4-5:5 Yes chrX:7908931-7911885 lnc-ALX4-5:6 Yes chrX:7908931-7911885 lnc-ALX4-19:3 No - lnc-ALX4-19:1 No - lnc-ALX4-19:2 No - lnc-EXT2-2:2 No - lnc-EXT2-2:3 No - lnc-EXT2-2:4 No - lnc-PRDM11-3:10 No - lnc-PRDM11-3:11 No - lnc-PRDM11-3:14 No - lnc-PRDM11-3:12 No - lnc-PRDM11-3:15 No - lnc-PRDM11-3:13 No - lnc-CREB3L1-1:2 No - lnc-CREB3L1-1:3 No - lnc-CREB3L1-1:4 No - lnc-CREB3L1-1:5 No - lnc-CREB3L1-1:6 No - lnc-PHF21A-3:1 No - lnc-C11orf49-4:1 No - lnc-FAM180B-4:1 No - lnc-FAM180B-4:2 No - lnc-OR5AK2-1:7 No - lnc-OR5AK2-1:5 No - lnc-OR5AK2-1:6 No - lnc-CLP1-3:9 No - lnc-CLP1-3:10 No - lnc-YPEL4-2:1 No - lnc-YPEL4-2:2 No - FAM111A-DT:20 No - FAM111A-DT:21 No - FAM111A-DT:22 No - FAM111A-DT:23 No - FAM111A-DT:24 No - FAM111A-DT:25 No - lnc-MPEG1-8:1 No - lnc-MPEG1-1:2 No - lnc-OR4D9-1:3 No - lnc-OR4D9-1:2 No - lnc-OSBP-1:3 No - lnc-OSBP-1:4 No - lnc-OSBP-1:5 No - lnc-STX3-2:7 No - lnc-STX3-2:12 No - lnc-STX3-1:3 No - lnc-STX3-1:4 No - lnc-TMEM109-4:1 No - lnc-TMEM109-4:2 No - lnc-TMEM109-4:3 No - lnc-TMEM109-4:4 No - lnc-TMEM109-4:5 No - lnc-TMEM132A-4:1 No - lnc-CD5-2:2 No - lnc-CPSF7-6:1 No - lnc-DAGLA-1:8 No - lnc-DAGLA-1:9 No - lnc-DAGLA-1:10 No - lnc-DAGLA-1:11 No - lnc-FEN1-6:1 No - lnc-FEN1-6:2 No - lnc-FTH1-7:1 No - lnc-BEST1-1:1 No - lnc-BEST1-1:2 No - lnc-AHNAK-1:7 No - lnc-AHNAK-1:8 No - lnc-AHNAK-1:9 No - lnc-AHNAK-1:10 No - lnc-AHNAK-1:2 No - lnc-AHNAK-1:3 No - lnc-AHNAK-1:4 No - lnc-AHNAK-1:5 No - lnc-AHNAK-1:6 No - lnc-AHNAK-1:12 No - lnc-AHNAK-1:11 No - lnc-ROM1-9:1 No - lnc-UQCC3-2:1 No - lnc-TMEM223-2:2 Yes chr3R:5548115-5551168 lnc-TMEM179B-5:1 Yes chrX:10832752-10847092 lnc-SLC3A2-7:1 Yes chr2R:6074471-6076367 lnc-SLC3A2-6:1 Yes chr2R:6074471-6076367 lnc-SLC3A2-5:1 No - SNHG1:42 No - SNHG1:33 No - SNHG1:43 No - SNHG1:34 No - SNHG1:35 No - SNHG1:47 No - SNHG1:36 No - SNHG1:37 No - SNHG1:38 No - SNHG1:44 No - SNHG1:48 No - SNHG1:49 No - SNHG1:64 No - SNHG1:50 No - SNHG1:39 No - SNHG1:51 No - SNHG1:46 No - SNHG1:52 No - SNHG1:53 No - SNHG1:54 No - SNHG1:62 No - SNHG1:63 No - SNHG1:57 No - SNHG1:55 No - SNHG1:58 No - SNHG1:59 No - SNHG1:45 No - SNHG1:60 No - SNHG1:61 No - SNHG1:56 No - SNHG1:40 No - SNHG1:41 No - lnc-CHRM1-1:1 Yes chr3R:7974409-7978428 lnc-C11orf95-1:8 No - lnc-C11orf95-1:9 No - lnc-C11orf95-1:10 No - lnc-C11orf95-1:11 No - lnc-C11orf95-1:12 No - lnc-C11orf95-1:13 No - lnc-C11orf95-1:1 No - lnc-C11orf95-1:14 No - lnc-C11orf95-1:2 No - lnc-C11orf95-1:3 No - lnc-C11orf95-1:5 No - lnc-C11orf95-1:4 No - lnc-MACROD1-5:1 No - lnc-MACROD1-4:1 No - lnc-STIP1-2:1 No - lnc-MACROD1-1:8 Yes chr2L:295122-297449 lnc-MACROD1-1:4 Yes chr2L:295122-297449 lnc-MACROD1-1:5 Yes chr2L:295122-297449 lnc-MACROD1-1:6 Yes chr2L:295122-297449 lnc-MACROD1-1:7 Yes chr2L:295122-297449 lnc-FKBP2-1:7 No - lnc-FKBP2-1:9 No - lnc-FKBP2-1:10 No - lnc-TRMT112-4:1 No - lnc-TRMT112-4:2 No - lnc-TRMT112-2:5 No - lnc-TRMT112-2:3 No - lnc-TRMT112-2:4 No - lnc-SLC22A12-3:1 Yes chr3R:22468512-22486969 lnc-PPP2R5B-7:1 No - MIR194-2HG:5 Yes chr3R:12697322-12704875 MIR194-2HG:6 Yes chr3R:12697322-12704875 MIR194-2HG:7 Yes chr3R:12697322-12704875 MIR194-2HG:8 No - MIR194-2HG:9 No - lnc-MRPL49-1:1 No - lnc-SLC25A45-3:1 Yes chr3R:27239163-27241228 lnc-SLC25A45-3:2 Yes chr3R:27239163-27241228 lnc-LTBP3-2:13 Yes chr3R:25131306-25136709 lnc-LTBP3-2:14 Yes chr3R:25131306-25136709 lnc-LTBP3-2:9 No - lnc-LTBP3-2:10 No - lnc-LTBP3-2:15 No - NEAT1:20 No - NEAT1:21 No - lnc-LTBP3-2:11 No - lnc-LTBP3-2:12 No - lnc-LTBP3-2:8 No - NEAT1:22 No - NEAT1:23 No - NEAT1:24 No - NEAT1:25 No - NEAT1:26 No - NEAT1:28 No - NEAT1:29 No - NEAT1:27 No - lnc-LTBP3-11:1 No - lnc-LTBP3-10:1 No - lnc-LTBP3-9:1 No - MALAT1:45 No - MALAT1:42 No - MALAT1:43 No - MALAT1:44 No - lnc-LTBP3-5:2 No - MALAT1:46 No - MALAT1:47 No - lnc-LTBP3-2:7 No - MALAT1:50 No - MALAT1:48 No - MALAT1:49 No - MALAT1:51 No - MALAT1:52 No - MALAT1:53 No - SSSCA1-AS1:5 No - lnc-CFL1-1:3 No - lnc-CFL1-1:4 No - lnc-CFL1-1:5 No - lnc-CFL1-1:6 No - lnc-CFL1-1:7 No - lnc-EIF1AD-5:1 No - lnc-EIF1AD-5:2 No - lnc-YIF1A-8:1 Yes chr3L:12746616-12750056 lnc-YIF1A-8:2 Yes chr3L:12746616-12750056 lnc-YIF1A-8:3 Yes chr3L:12746616-12750056 lnc-NPAS4-1:5 No - lnc-NPAS4-1:6 No - lnc-NPAS4-1:7 No - lnc-NPAS4-1:8 No - lnc-NPAS4-1:9 No - lnc-NPAS4-1:10 No - lnc-MRPL11-1:15 No - lnc-MRPL11-1:16 No - lnc-MRPL11-1:11 No - lnc-MRPL11-1:17 No - lnc-MRPL11-1:18 No - lnc-MRPL11-1:12 No - lnc-MRPL11-1:13 Yes chr3R:8344400-8347465 lnc-MRPL11-1:14 Yes chr3R:8344400-8347465 lnc-CCDC87-1:2 No - lnc-RBM4-2:2 No - lnc-PC-2:1 No - lnc-PC-2:2 No - lnc-PC-3:1 No - lnc-PC-3:2 No - lnc-POLD4-3:1 No - lnc-POLD4-1:11 Yes chr3L:18870045-18872553 lnc-PPP1CA-1:1 Yes chr3L:18870045-18872553 lnc-UNC93B1-1:8 Yes chr2R:7466879-7477162 lnc-UNC93B1-1:5 Yes chr2R:7466879-7477162 lnc-UNC93B1-1:6 Yes chr2R:7466879-7477162 lnc-UNC93B1-1:9 Yes chr2R:7466879-7477162 lnc-UNC93B1-1:7 Yes chr2R:7466879-7477162 lnc-CHKA-3:1 Yes chr3R:15836048-15837117 lnc-TCIRG1-2:7 No - lnc-TCIRG1-2:8 No - lnc-TCIRG1-2:9 No - lnc-TCIRG1-2:10 No - lnc-TCIRG1-2:11 No - lnc-TCIRG1-2:12 No - lnc-TCIRG1-2:13 No - lnc-TCIRG1-2:14 No - lnc-TCIRG1-2:15 No - lnc-TCIRG1-2:17 No - lnc-TCIRG1-2:16 No - lnc-LRP5-5:1 No - lnc-LRP5-5:2 No - lnc-LRP5-1:7 No - lnc-LRP5-1:8 No - lnc-LRP5-1:9 No - lnc-LRP5-1:10 No - lnc-LRP5-1:11 No - lnc-C11orf24-4:1 No - lnc-IGHMBP2-1:2 No - lnc-IGHMBP2-1:3 No - lnc-IGHMBP2-1:4 No - lnc-MRGPRF-7:1 No - lnc-MRGPRF-7:2 No - lnc-MRGPRF-7:3 No - lnc-TPCN2-5:4 No - lnc-TPCN2-5:5 No - lnc-TPCN2-5:6 No - lnc-ORAOV1-3:2 No - lnc-ORAOV1-3:4 No - lnc-ORAOV1-3:5 No - lnc-ORAOV1-3:3 No - lnc-ORAOV1-3:6 No - lnc-ORAOV1-1:3 No - lnc-ORAOV1-1:2 No - lnc-ANO1-5:1 No - lnc-ANO1-3:2 No - lnc-SHANK2-1:5 No - lnc-SHANK2-10:1 Yes chr2L:6723903-6732766 lnc-SHANK2-1:11 Yes chr2L:6723903-6732766 lnc-SHANK2-1:6 No - lnc-SHANK2-1:7 No - lnc-SHANK2-1:12 Yes chr2L:6723903-6732766 lnc-SHANK2-1:10 No - lnc-SHANK2-1:8 Yes chr3R:21061680-21064471 lnc-SHANK2-1:9 Yes chr3R:21061680-21064471 lnc-NADSYN1-2:3 No - lnc-NADSYN1-1:5 No - lnc-NADSYN1-1:6 No - lnc-ZNF705E-1:3 Yes chrX:19243631-19245224 lnc-ZNF705E-1:4 Yes chrX:19243631-19245224 lnc-ZNF705E-1:5 Yes chrX:19243631-19245224 lnc-ZNF705E-1:6 Yes chrX:19243631-19245224 lnc-ZNF705E-1:7 No - lnc-ZNF705E-1:8 No - lnc-ZNF705E-1:9 No - lnc-ZNF705E-1:10 No - lnc-PDE2A-1:2 No - LINC01537:3 No - LINC01537:5 No - lnc-STARD10-1:8 No - lnc-STARD10-1:6 No - lnc-STARD10-1:9 No - lnc-STARD10-1:10 No - lnc-STARD10-1:7 No - lnc-FCHSD2-1:2 No - lnc-FCHSD2-1:3 No - lnc-FCHSD2-2:2 No - lnc-FCHSD2-2:3 No - lnc-FCHSD2-2:8 No - lnc-FCHSD2-2:10 No - lnc-FCHSD2-2:4 No - lnc-FCHSD2-2:5 No - lnc-FCHSD2-2:6 No - lnc-FCHSD2-2:7 No - lnc-FCHSD2-2:12 No - lnc-FCHSD2-2:9 No - lnc-FAM168A-2:3 Yes chr3R:17768272-17794490 lnc-FAM168A-2:4 Yes chr3R:17768272-17794490 lnc-FAM168A-2:5 Yes chr3R:17768272-17794490 lnc-FAM168A-2:6 Yes chr3R:17768272-17794490 lnc-FAM168A-2:7 Yes chr3R:17768272-17794490 lnc-PLEKHB1-4:1 No - lnc-DNAJB13-3:1 No - lnc-POLD3-1:6 No - lnc-ARRB1-1:11 Yes chr3R:11822702-11869460 lnc-ARRB1-1:12 Yes chr3R:11822702-11869460 lnc-ARRB1-1:6 Yes chr3R:11822702-11869460 lnc-ARRB1-1:7 Yes chr3R:11822702-11869460 lnc-ARRB1-1:8 Yes chr3R:11822702-11869460 lnc-ARRB1-1:13 Yes chr3R:11822702-11869460 lnc-ARRB1-1:9 Yes chr3R:11822702-11869460 lnc-ARRB1-1:10 Yes chr3R:11822702-11869460 lnc-KLHL35-7:1 Yes chr3L:8647261-8648936 lnc-SERPINH1-3:3 No - lnc-SERPINH1-3:1 No - lnc-SERPINH1-3:2 No - lnc-SERPINH1-3:4 No - lnc-SERPINH1-3:5 No - lnc-SERPINH1-3:6 No - lnc-GDPD5-6:1 No - lnc-MAP6-7:1 No - lnc-MAP6-7:2 No - UVRAG-DT:19 Yes chr2R:7712578-7714182 UVRAG-DT:20 Yes chr2R:7712578-7714182 UVRAG-DT:21 Yes chr2R:7712578-7714182 UVRAG-DT:22 No - UVRAG-DT:23 No - lnc-THAP12-1:5 No - lnc-THAP12-1:1 Yes chr2L:1975463-1980755 lnc-THAP12-1:2 Yes chr2L:1975463-1980755 lnc-THAP12-1:6 No - lnc-THAP12-1:7 No - lnc-LRRC32-2:4 No - lnc-LRRC32-2:3 No - lnc-LRRC32-5:7 No - lnc-LRRC32-5:6 No - lnc-LRRC32-5:8 No - lnc-LRRC32-5:5 No - lnc-LRRC32-5:3 No - lnc-LRRC32-5:4 No - lnc-LRRC32-6:7 No - lnc-LRRC32-6:8 No - lnc-LRRC32-6:9 No - lnc-LRRC32-6:10 No - lnc-LRRC32-6:11 No - lnc-LRRC32-6:12 No - lnc-LRRC32-6:13 No - lnc-THRSP-7:1 No - KCTD21-AS1:17 No - KCTD21-AS1:18 No - KCTD21-AS1:19 No - KCTD21-AS1:20 No - KCTD21-AS1:21 No - KCTD21-AS1:22 No - KCTD21-AS1:23 No - KCTD21-AS1:24 No - KCTD21-AS1:25 No - lnc-USP35-19:1 Yes chr3L:2589414-2595590 lnc-USP35-15:2 No - lnc-USP35-15:3 No - lnc-USP35-6:4 No - lnc-USP35-6:5 No - lnc-TENM4-8:4 No - lnc-TENM4-8:5 No - lnc-TENM4-8:6 No - lnc-TENM4-9:5 No - lnc-TENM4-9:3 No - lnc-TENM4-9:4 No - RAB30-AS1:26 No - RAB30-AS1:27 No - RAB30-AS1:28 No - RAB30-AS1:31 No - RAB30-AS1:29 No - RAB30-AS1:32 No - RAB30-AS1:33 No - RAB30-AS1:34 No - RAB30-AS1:30 No - RAB30-AS1:35 No - RAB30-AS1:25 No - lnc-RAB30-2:4 No - lnc-RAB30-2:5 No - lnc-RAB30-6:1 No - PCF11-AS1:15 Yes chr2R:14860936-14871071 PCF11-AS1:18 No - PCF11-AS1:19 No - PCF11-AS1:16 No - PCF11-AS1:14 No - PCF11-AS1:20 No - PCF11-AS1:21 No - PCF11-AS1:22 No - PCF11-AS1:23 No - PCF11-AS1:17 No - PCF11-AS1:24 No - lnc-ANKRD42-2:8 No - lnc-ANKRD42-2:9 No - lnc-TMEM126B-2:2 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-TMEM126B-2:3 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-TMEM126B-2:4 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-CCDC83-3:1 Yes chr3R:7186994-7200941 lnc-EED-4:1 No - lnc-ME3-4:6 No - lnc-ME3-4:4 No - lnc-ME3-4:1 No - lnc-ME3-4:5 No - lnc-ME3-4:2 No - lnc-ME3-4:3 No - lnc-FZD4-1:4 No - lnc-FZD4-1:5 No - lnc-FZD4-1:6 No - lnc-PRSS23-1:10 No - lnc-PRSS23-1:11 No - lnc-PRSS23-1:12 No - lnc-PRSS23-1:13 No - lnc-FZD4-11:5 No - lnc-FZD4-11:1 No - lnc-FZD4-11:2 No - lnc-FZD4-11:3 No - lnc-FZD4-11:4 No - lnc-NAALAD2-3:2 Yes chr3R:24186359-24187785 lnc-NAALAD2-3:3 Yes chr3R:24186359-24187785 lnc-MRE11-3:3 No - lnc-MRE11-3:2 No - lnc-MRE11-3:4 No - lnc-MRE11-1:4 No - lnc-MRE11-1:5 No - lnc-MRE11-1:6 No - lnc-MRE11-1:7 No - lnc-PIWIL4-1:7 No - lnc-PIWIL4-1:8 No - lnc-PIWIL4-1:9 No - lnc-PIWIL4-1:10 No - lnc-PIWIL4-1:11 No - lnc-PIWIL4-1:15 No - lnc-PIWIL4-1:16 No - lnc-PIWIL4-1:17 No - lnc-PIWIL4-1:18 No - lnc-PIWIL4-1:22 No - lnc-MRE11-1:8 No - lnc-CWC15-5:1 Yes chr2L:12431075-12434665 lnc-SESN3-1:3 No - lnc-SESN3-1:4 No - lnc-SESN3-1:5 No - lnc-SESN3-1:6 No - lnc-SESN3-8:1 No - lnc-SESN3-8:2 No - lnc-SESN3-8:3 No - lnc-SESN3-8:4 No - lnc-SESN3-8:5 No - lnc-FAM76B-1:3 No - lnc-FAM76B-1:5 No - lnc-FAM76B-1:2 No - lnc-FAM76B-1:4 No - lnc-CEP57-4:1 Yes chr2L:6034731-6037015 lnc-PGR-1:2 Yes chrX:15751674-15760733 lnc-PGR-1:3 Yes chrX:15751674-15760733 lnc-PGR-1:4 Yes chrX:15751674-15760733 lnc-TMEM123-6:1 Yes chr3L:16038410-16051034 lnc-TMEM123-3:3 No - lnc-TMEM123-3:4 No - lnc-TMEM123-3:5 No - lnc-TMEM123-3:6 No - lnc-TMEM123-5:1 No - lnc-TMEM123-5:2 No - lnc-BIRC2-9:1 No - lnc-BIRC2-9:2 No - lnc-BIRC2-9:3 No - lnc-PDGFD-1:11 No - lnc-PDGFD-1:12 No - lnc-PDGFD-1:17 No - lnc-PDGFD-1:13 No - lnc-PDGFD-1:14 No - lnc-PDGFD-1:18 No - lnc-PDGFD-1:19 No - lnc-PDGFD-1:16 No - lnc-PDGFD-1:10 No - lnc-PDGFD-1:6 No - lnc-PDGFD-1:7 No - lnc-PDGFD-1:8 No - LINC02552:21 No - LINC02552:22 No - LINC02552:23 No - LINC02552:24 No - LINC02552:25 No - LINC02552:26 No - LINC02552:27 No - lnc-CASP4-4:1 No - lnc-ELMOD1-1:1 No - lnc-RDX-1:5 No - lnc-RDX-1:4 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-RDX-1:8 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-ZC3H12C-1:2 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-ZC3H12C-1:5 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-ZC3H12C-1:3 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-ZC3H12C-1:6 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-ZC3H12C-1:4 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-RDX-1:6 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-ZC3H12C-5:1 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-ZC3H12C-5:2 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-ZC3H12C-5:3 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-ZC3H12C-5:4 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-RDX-1:7 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-ARHGAP20-11:2 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-ARHGAP20-11:3 Yes chrX:8873012-8898332 lnc-ZC3H12C-6:1 No - lnc-FDX1-1:8 No - lnc-FDX1-1:9 No - lnc-FDX1-1:10 No - lnc-FDX1-1:11 No - lnc-FDX1-1:13 No - lnc-FDX1-1:12 No - lnc-FDX1-3:1 Yes chr3L:15588860-15609125 LINC02550:10 No - LINC02550:11 No - lnc-BTG4-4:1 Yes chrX:2055310-2061915 lnc-SIK2-3:1 No - lnc-SIK2-3:2 No - lnc-PLET1-8:1 No - lnc-PTS-1:20 No - lnc-PTS-1:21 No - lnc-PTS-1:22 No - lnc-PTS-1:23 No - lnc-PTS-1:24 No - lnc-PTS-1:25 No - lnc-PTS-1:26 No - lnc-PTS-1:29 No - lnc-PTS-1:27 No - lnc-PTS-1:28 No - lnc-DRD2-3:4 Yes chrX:4132887-4206093 lnc-DRD2-1:7 Yes chrX:4132887-4206093 lnc-DRD2-1:8 Yes chrX:4132887-4206093 lnc-DRD2-1:9 Yes chrX:4132887-4206093 lnc-DRD2-1:11 No - lnc-DRD2-1:10 No - lnc-DRD2-1:6 No - lnc-HTR3B-3:1 No - lnc-USP28-6:1 No - lnc-USP28-6:2 No - lnc-USP28-6:3 No - lnc-NXPE2-5:2 No - lnc-NXPE2-5:3 No - lnc-NXPE2-5:4 No - lnc-NXPE2-5:5 No - lnc-APOC3-6:9 No - lnc-APOC3-6:10 No - lnc-APOC3-6:11 No - lnc-APOC3-6:12 No - LINC00900:19 No - LINC00900:15 No - LINC00900:16 No - LINC00900:17 No - LINC00900:14 No - LINC00900:20 No - LINC00900:25 No - LINC00900:18 No - LINC00900:21 No - LINC00900:22 No - LINC00900:23 No - LINC00900:24 No - lnc-CADM1-4:10 No - lnc-CADM1-4:11 No - lnc-CADM1-4:12 No - lnc-CADM1-4:13 No - lnc-CADM1-4:9 No - lnc-APOC3-2:2 Yes chrX:9160124-9162090 lnc-APOC3-2:3 Yes chrX:9160124-9162090 lnc-APOC3-2:4 Yes chrX:9160124-9162090 lnc-APOC3-2:5 Yes chrX:9160124-9162090 lnc-APOC3-2:6 Yes chrX:9160124-9162090 lnc-IL10RA-5:1 No - lnc-IL10RA-1:2 No - lnc-IL10RA-1:3 No - lnc-IL10RA-1:4 No - lnc-CD3E-1:2 No - lnc-IFT46-1:16 No - lnc-IFT46-1:17 No - lnc-IFT46-1:18 No - lnc-IFT46-1:19 No - lnc-IFT46-1:20 No - lnc-IFT46-1:21 No - lnc-IFT46-1:14 No - lnc-IFT46-1:15 No - lnc-IFT46-2:1 No - lnc-PHLDB1-1:3 No - lnc-PHLDB1-1:4 No - lnc-PHLDB1-1:2 No - lnc-CXCR5-1:5 Yes chr2L:10239341-10242172 lnc-CXCR5-1:6 Yes chr2L:10239341-10242172 lnc-CXCR5-1:7 No - lnc-CXCR5-1:8 No - lnc-CXCR5-1:11 No - lnc-CXCR5-1:9 No - lnc-CXCR5-1:10 No - lnc-CXCR5-1:12 No - lnc-CXCR5-1:13 No - lnc-DDX6-4:1 No - lnc-BCL9L-1:2 No - lnc-RPS25-1:22 No - lnc-RPS25-1:23 No - lnc-RPS25-1:24 No - lnc-RPS25-1:25 No - lnc-RPS25-1:26 No - lnc-RPS25-1:27 No - lnc-HYOU1-1:8 No - lnc-HYOU1-1:6 No - lnc-HYOU1-1:9 No - lnc-HYOU1-1:7 No - lnc-THY1-5:1 No - lnc-NECTIN1-1:2 No - lnc-NECTIN1-1:3 No - lnc-NECTIN1-1:4 No - lnc-RNF26-1:5 No - lnc-RNF26-1:6 No - lnc-RNF26-1:7 No - lnc-RNF26-1:8 No - lnc-RNF26-1:9 No - lnc-RNF26-1:10 No - lnc-OAF-4:2 No - lnc-OAF-4:3 No - lnc-OAF-4:4 No - lnc-OAF-4:5 No - lnc-OAF-4:6 No - lnc-OAF-1:1 No - lnc-OAF-1:2 No - lnc-OAF-1:3 No - lnc-OAF-1:8 No - lnc-OAF-1:9 No - lnc-OAF-1:10 No - lnc-OAF-1:11 No - lnc-SC5D-4:1 No - lnc-SC5D-4:2 No - lnc-SC5D-4:3 No - lnc-SC5D-4:4 No - lnc-SC5D-4:5 No - lnc-BLID-3:4 No - lnc-BLID-3:3 No - MIR100HG:103 No - MIR100HG:93 No - MIR100HG:85 No - MIR100HG:84 No - MIR100HG:86 No - MIR100HG:81 No - MIR100HG:70 No - MIR100HG:97 No - MIR100HG:79 No - MIR100HG:71 No - MIR100HG:49 No - MIR100HG:50 No - MIR100HG:94 No - MIR100HG:101 No - MIR100HG:82 No - MIR100HG:76 No - MIR100HG:83 No - MIR100HG:91 No - MIR100HG:64 No - MIR100HG:61 No - MIR100HG:47 No - MIR100HG:89 No - MIR100HG:87 No - MIR100HG:90 No - MIR100HG:102 No - MIR100HG:100 No - MIR100HG:98 No - MIR100HG:88 No - MIR100HG:99 No - MIR100HG:95 No - MIR100HG:96 No - MIR100HG:55 No - MIR100HG:67 No - MIR100HG:78 No - MIR100HG:80 No - MIR100HG:56 No - MIR100HG:74 No - MIR100HG:69 No - MIR100HG:66 No - MIR100HG:72 No - MIR100HG:51 No - MIR100HG:68 No - MIR100HG:73 No - MIR100HG:62 No - MIR100HG:57 No - MIR100HG:52 No - MIR100HG:48 No - MIR100HG:58 No - MIR100HG:60 No - MIR100HG:53 No - MIR100HG:59 No - MIR100HG:54 No - MIR100HG:45 No - MIR100HG:63 No - MIR100HG:46 No - lnc-BSX-3:1 No - lnc-OR8D4-1:2 Yes chr2L:3358640-3373372 lnc-OR8D4-1:3 Yes chr2L:3358640-3373372 lnc-GRAMD1B-6:1 No - lnc-NRGN-1:6 No - lnc-NRGN-1:7 No - lnc-NRGN-1:8 No - lnc-ROBO3-2:11 No - lnc-ROBO3-2:12 No - lnc-ROBO3-2:13 No - lnc-ROBO3-2:14 No - lnc-ROBO3-2:15 No - lnc-ROBO3-2:16 No - lnc-ROBO3-2:17 No - lnc-HEPACAM-2:6 No - lnc-HEPACAM-2:7 No - lnc-HEPACAM-2:1 No - lnc-HEPACAM-2:2 No - lnc-HEPACAM-2:8 No - lnc-HEPACAM-2:3 No - lnc-HEPACAM-2:4 No - lnc-HEPACAM-2:5 No - lnc-HEPACAM-2:9 No - PKNOX2-AS1:2 No - PKNOX2-AS1:3 No - STT3A-AS1:4 No - STT3A-AS1:5 No - STT3A-AS1:6 Yes chrX:21049885-21053937 STT3A-AS1:7 Yes chrX:21049885-21053937 STT3A-AS1:8 Yes chrX:21049885-21053937 lnc-ACRV1-2:1 No - lnc-CDON-2:1 No - lnc-CDON-2:2 No - lnc-CDON-2:3 No - lnc-CDON-2:4 No - lnc-CDON-2:5 No - lnc-ST3GAL4-5:1 Yes chrX:2740384-3134532 lnc-ST3GAL4-5:2 Yes chrX:2740384-3134532 lnc-FLI1-6:1 No - lnc-FLI1-6:2 No - lnc-ETS1-8:1 No - lnc-BARX2-5:1 No - lnc-BARX2-5:2 No - lnc-BARX2-5:3 No - LINC00167:3 No - lnc-PRDM10-3:1 No - lnc-PRDM10-3:2 No - lnc-ADAMTS15-1:3 No - lnc-ADAMTS15-1:4 No - lnc-ADAMTS15-1:5 No - lnc-ADAMTS15-1:6 No - lnc-ADAMTS15-1:7 No - lnc-ADAMTS15-1:14 No - lnc-ADAMTS15-1:15 No - lnc-ADAMTS15-1:16 No - lnc-ADAMTS15-1:17 No - lnc-ADAMTS15-1:18 No - lnc-ADAMTS15-1:19 No - lnc-ADAMTS15-1:20 No - lnc-ADAMTS15-1:21 No - lnc-ADAMTS15-2:2 No - lnc-ADAMTS15-2:3 No - lnc-ADAMTS15-2:1 No - lnc-ADAMTS15-2:4 No - lnc-ADAMTS15-2:5 No - lnc-ADAMTS15-5:1 No - lnc-ADAMTS15-5:2 No - lnc-ADAMTS15-5:3 No - lnc-ADAMTS15-5:4 No - lnc-ADAMTS15-5:5 No - lnc-ADAMTS15-5:6 No - lnc-NTM-1:3 No - lnc-NTM-1:6 No - lnc-NTM-1:4 No - lnc-NTM-1:7 No - lnc-NTM-1:8 No - lnc-OPCML-3:17 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-OPCML-3:11 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-OPCML-3:18 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-OPCML-3:19 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-OPCML-3:12 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-JAM3-10:1 No - lnc-JAM3-10:2 No - lnc-JAM3-3:14 No - lnc-JAM3-3:15 No - lnc-JAM3-3:16 No - lnc-JAM3-3:17 No - lnc-JAM3-3:18 No - lnc-JAM3-3:19 No - lnc-JAM3-3:20 No - lnc-GLB1L2-1:22 No - lnc-GLB1L2-1:23 No - lnc-GLB1L2-1:24 No - lnc-GLB1L2-1:25 No - lnc-GLB1L2-1:26 No - lnc-SLC6A12-2:5 Yes chr3L:21034535-21075444 lnc-SLC6A12-2:6 Yes chr3L:21034535-21075444 lnc-SLC6A12-2:7 Yes chr3L:21034535-21075444 lnc-SLC6A12-2:8 Yes chr3L:21034535-21075444 lnc-SLC6A12-2:3 Yes chr3L:21034535-21075444 lnc-SLC6A12-2:4 No - lnc-B4GALNT3-2:7 Yes chr3R:12695129-12697379 lnc-B4GALNT3-2:10 Yes chr3R:12695129-12697379 lnc-B4GALNT3-2:11 Yes chr3R:12695129-12697379 lnc-B4GALNT3-2:13 Yes chr3R:12695129-12697379 lnc-B4GALNT3-2:15 Yes chr3R:12695129-12697379 lnc-B4GALNT3-2:16 Yes chr3R:12695129-12697379 LINC02455:7 No - LINC02455:8 No - LINC02455:9 No - LINC02455:10 No - lnc-WNK1-1:2 No - lnc-WNK1-1:3 No - lnc-WNK1-1:4 No - lnc-WNK1-1:5 No - lnc-WNK1-1:6 No - lnc-RAD52-2:8 No - lnc-RAD52-2:9 No - lnc-RAD52-2:10 No - lnc-RAD52-2:14 No - lnc-RAD52-2:13 No - lnc-RAD52-2:11 No - lnc-RAD52-2:7 No - lnc-RAD52-2:12 No - lnc-ERC1-1:6 No - lnc-ERC1-1:7 No - lnc-ERC1-1:8 No - LINC00940:4 No - lnc-LRTM2-1:2 Yes chr2L:16165831-16190540 lnc-DCP1B-9:2 Yes chr2L:16165831-16190540 lnc-DCP1B-9:3 Yes chr2L:16165831-16190540 lnc-DCP1B-9:4 Yes chr2L:16165831-16190540 lnc-DCP1B-9:1 Yes chr2L:16165831-16190540 ITFG2-AS1:29 No - ITFG2-AS1:21 No - ITFG2-AS1:22 No - ITFG2-AS1:23 No - ITFG2-AS1:24 No - ITFG2-AS1:25 No - ITFG2-AS1:26 No - ITFG2-AS1:30 No - lnc-FOXM1-2:5 Yes chrX:15804370-15827682 lnc-FOXM1-2:4 Yes chrX:15804370-15827682 lnc-CRACR2A-3:2 No - lnc-CRACR2A-3:3 No - lnc-TSPAN9-1:3 No - lnc-TSPAN9-1:4 No - lnc-TSPAN9-1:5 No - lnc-TSPAN9-1:6 No - lnc-TSPAN9-1:7 No - lnc-TSPAN9-1:8 No - lnc-CRACR2A-3:4 No - lnc-CRACR2A-3:5 No - lnc-CRACR2A-8:1 No - lnc-PARP11-3:2 No - lnc-PARP11-3:3 No - lnc-PARP11-3:4 No - lnc-PARP11-3:5 No - lnc-PARP11-3:6 No - CCND2-AS1:3 Yes chrX:15906822-15909676 lnc-FGF23-5:1 No - lnc-FGF23-5:3 No - lnc-FGF23-5:2 No - lnc-FGF23-4:1 No - lnc-ANO2-10:3 No - lnc-ANO2-10:4 No - lnc-ANO2-10:5 No - lnc-ANO2-10:1 No - lnc-ANO2-10:2 No - lnc-VWF-2:6 No - lnc-VWF-2:5 No - lnc-VWF-2:7 No - lnc-VWF-2:8 No - lnc-VWF-2:9 No - lnc-VWF-6:1 Yes chr3R:25872900-25881427 lnc-VWF-6:2 Yes chr3R:25872900-25881427 lnc-PLEKHG6-3:2 No - lnc-PLEKHG6-3:4 No - lnc-PLEKHG6-3:3 No - lnc-IFFO1-1:3 Yes chr3R:29675651-29680257 lnc-IFFO1-1:4 Yes chr3R:29675651-29680257 lnc-IFFO1-1:2 Yes chr3R:29675651-29680257 lnc-IFFO1-1:5 Yes chr3R:29675651-29680257 lnc-IFFO1-1:6 No - lnc-IFFO1-3:2 Yes chr2R:16958943-16960195 lnc-GAPDH-6:1 No - lnc-PIANP-4:2 Yes chr2R:8421033-8428577 lnc-PIANP-4:1 Yes chr2R:8421033-8428577 lnc-PTMS-2:1 Yes chr2R:15935893-15940073 lnc-PHB2-8:1 Yes chr3L:8449922-8472669 lnc-PHB2-7:1 Yes chr3L:8449922-8472669 lnc-PHB2-6:1 Yes chr3L:8449922-8472669 lnc-PHB2-4:2 No - lnc-PHB2-4:3 Yes chr2L:2225545-2226294 MIR200CHG:10 No - MIR200CHG:11 No - C1RL-AS1:11 No - C1RL-AS1:12 No - lnc-RBP5-1:5 Yes chr4:1112874-1123357 lnc-RBP5-2:3 Yes chrX:1866832-1869061 lnc-RBP5-2:5 Yes chrX:1866832-1869061 lnc-RBP5-2:4 Yes chrX:1866832-1869061 lnc-NANOG-1:1 Yes chr3L:914074-993788 lnc-SLC2A3-4:1 No - lnc-SLC2A3-4:2 No - lnc-SLC2A3-4:3 No - lnc-FOXJ2-2:1 No - lnc-C3AR1-5:1 Yes chrX:16796902-16800710 LINC00937:13 No - LINC00937:14 No - LINC00937:12 No - LINC00937:20 No - LINC00937:21 No - LINC00937:15 No - LINC00937:18 No - LINC00937:16 No - LINC00937:17 No - LINC00937:22 No - LINC00937:19 No - lnc-CLEC4E-5:1 No - lnc-CLEC4E-5:3 No - lnc-CLEC4E-5:2 No - lnc-M6PR-5:3 No - LINC00612:7 No - LINC00612:8 No - LINC00612:9 No - LINC00612:10 No - LINC00612:6 No - lnc-KLRG1-9:1 Yes chr2L:8074117-8082982 lnc-KLRG1-9:2 Yes chr2L:8074117-8082982 lnc-KLRG1-9:3 Yes chr2L:8074117-8082982 lnc-KLRG1-9:4 Yes chr2L:8074117-8082982 lnc-CLEC2D-2:3 No - lnc-CLEC2D-2:4 No - lnc-CLEC2D-2:5 No - lnc-CLEC2D-2:6 No - lnc-CLEC2D-2:7 No - lnc-CLEC2D-8:15 No - lnc-CLEC2D-8:16 No - lnc-KLRB1-1:3 No - lnc-KLRB1-1:4 No - lnc-CLEC2D-11:1 No - lnc-CD69-2:1 No - LINC02470:16 No - LINC02470:17 No - LINC02470:18 No - LINC02470:19 No - LINC02470:20 No - LINC02470:21 No - lnc-EIF2S3B-7:1 No - lnc-EIF2S3B-7:2 No - lnc-EIF2S3B-8:1 No - lnc-EIF2S3B-8:2 No - lnc-EIF2S3B-8:3 No - lnc-PRR4-1:16 No - lnc-PRB2-3:1 Yes chr2L:2156484-2178754 lnc-BCL2L14-4:1 No - lnc-BCL2L14-5:1 No - lnc-GPR19-4:1 No - GPRC5D-AS1:27 No - GPRC5D-AS1:28 No - GPRC5D-AS1:29 No - GPRC5D-AS1:30 No - GPRC5D-AS1:31 No - lnc-FAM234B-2:3 No - lnc-FAM234B-2:4 No - lnc-ATF7IP-1:4 Yes chr3L:5343619-5355923 lnc-ATF7IP-1:3 Yes chr3L:5343619-5355923 lnc-ATF7IP-1:5 Yes chr3L:5343619-5355923 lnc-H2AFJ-2:2 Yes chr3R:4491943-4558067 lnc-H2AFJ-2:3 Yes chr3R:4491943-4558067 lnc-H2AFJ-2:4 Yes chr3R:4491943-4558067 lnc-H2AFJ-2:5 No - lnc-H2AFJ-2:6 No - lnc-PTPRO-2:1 Yes chr3R:17008269-17012533 LINC02398:15 No - LINC02398:16 No - LINC02398:17 No - LINC02398:18 No - LINC02398:19 No - LINC02398:20 No - lnc-SLCO1A2-4:4 No - lnc-SLCO1A2-4:5 No - lnc-PDE3A-2:1 No - lnc-SPX-4:1 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-SPX-4:2 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-SPX-4:3 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-ETNK1-1:2 Yes chr3R:24349182-24356241 lnc-ETNK1-1:3 Yes chr3R:24349182-24356241 lnc-ETNK1-1:4 Yes chr3R:24349182-24356241 lnc-ETNK1-1:5 Yes chr3R:24349182-24356241 lnc-ETNK1-1:6 Yes chr3R:24349182-24356241 lnc-ETNK1-1:7 No - lnc-ETNK1-1:8 No - lnc-C2CD5-3:4 No - lnc-C2CD5-3:5 No - lnc-C2CD5-3:6 No - lnc-ETNK1-3:15 No - lnc-ETNK1-3:16 No - lnc-ETNK1-3:14 No - lnc-ETNK1-3:17 No - lnc-ETNK1-3:18 No - lnc-ETNK1-3:19 No - lnc-ETNK1-3:20 No - lnc-ETNK1-3:22 No - lnc-SOX5-5:21 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:20 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:2 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:22 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:28 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:14 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:5 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:6 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:23 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:3 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:29 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:15 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:30 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:7 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:11 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:4 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:31 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:12 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:8 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:9 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:19 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:24 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:25 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:26 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:1 Yes chr4:800436-834393 lnc-SOX5-5:10 Yes chr4:800436-834393 LINC00477:3 No - LINC00477:4 No - LINC00477:2 No - lnc-BCAT1-6:1 No - lnc-LMNTD1-1:2 No - lnc-LMNTD1-1:3 No - lnc-LMNTD1-1:4 No - lnc-LMNTD1-1:5 No - lnc-LMNTD1-1:6 No - lnc-ETFRF1-6:1 No - lnc-ETFRF1-7:1 No - lnc-RASSF8-3:1 No - RASSF8-AS1:26 Yes chr3R:25661795-25665640 RASSF8-AS1:38 No - RASSF8-AS1:47 No - RASSF8-AS1:42 No - RASSF8-AS1:41 No - RASSF8-AS1:34 Yes chr3R:25661795-25665640 RASSF8-AS1:27 Yes chr3R:25661795-25665640 RASSF8-AS1:28 Yes chr3R:25661795-25665640 RASSF8-AS1:24 Yes chr3R:25661795-25665640 RASSF8-AS1:32 Yes chr3R:25661795-25665640 RASSF8-AS1:33 Yes chr3R:25661795-25665640 RASSF8-AS1:48 No - RASSF8-AS1:49 No - RASSF8-AS1:39 No - RASSF8-AS1:40 No - RASSF8-AS1:29 Yes chr3R:25661795-25665640 RASSF8-AS1:30 Yes chr3R:25661795-25665640 RASSF8-AS1:31 Yes chr3R:25661795-25665640 RASSF8-AS1:35 Yes chr3R:25661795-25665640 RASSF8-AS1:43 No - RASSF8-AS1:44 No - RASSF8-AS1:45 No - RASSF8-AS1:50 No - RASSF8-AS1:36 Yes chr3R:25661795-25665640 RASSF8-AS1:25 Yes chr3R:25661795-25665640 RASSF8-AS1:51 No - RASSF8-AS1:37 Yes chr3R:25661795-25665640 RASSF8-AS1:46 No - RASSF8-AS1:52 No - lnc-ITPR2-2:7 No - lnc-ITPR2-2:8 No - lnc-ITPR2-2:9 No - lnc-ITPR2-2:5 No - lnc-ITPR2-2:6 No - lnc-TM7SF3-3:1 No - ARNTL2-AS1:5 No - ARNTL2-AS1:6 No - ARNTL2-AS1:7 No - lnc-MANSC4-9:1 Yes chr3L:13513254-13516276 lnc-MANSC4-9:2 Yes chr3L:13513254-13516276 lnc-MANSC4-9:3 Yes chr3L:13513254-13516276 lnc-MANSC4-9:4 Yes chr3L:13513254-13516276 lnc-MANSC4-3:4 No - lnc-MANSC4-3:5 No - lnc-MANSC4-3:6 No - lnc-MANSC4-3:7 No - lnc-PTHLH-1:7 No - lnc-PTHLH-1:10 No - lnc-PTHLH-1:8 No - lnc-PTHLH-1:5 No - lnc-PTHLH-1:11 No - lnc-PTHLH-1:9 No - lnc-PTHLH-1:6 No - lnc-PTHLH-1:3 No - lnc-PTHLH-1:4 No - lnc-ERGIC2-12:2 No - lnc-ERGIC2-12:3 No - lnc-ERGIC2-12:4 No - lnc-ERGIC2-12:5 No - lnc-ERGIC2-12:1 No - lnc-TSPAN11-3:3 No - lnc-TSPAN11-3:4 No - LINC00941:10 No - LINC00941:11 No - LINC00941:12 No - LINC00941:13 No - LINC00941:14 No - LINC00941:15 No - LINC00941:16 No - LINC00941:17 No - LINC00941:18 No - LINC00941:19 No - LINC00941:20 No - LINC00941:21 No - LINC00941:22 No - LINC00941:23 No - LINC00941:24 No - LINC00941:25 No - LINC00941:26 No - LINC00941:27 No - LINC00941:28 No - LINC00941:29 No - lnc-TSPAN11-12:1 No - lnc-CAPRIN2-2:8 Yes chr3L:17891820-17895862 lnc-CAPRIN2-2:9 Yes chr3L:17891820-17895862 lnc-CAPRIN2-2:10 Yes chr3L:17891820-17895862 lnc-CAPRIN2-2:11 Yes chr3L:17891820-17895862 lnc-CAPRIN2-2:12 No - lnc-CAPRIN2-2:13 No - DDX11-AS1:6 No - DDX11-AS1:7 No - DDX11-AS1:8 No - DDX11-AS1:9 No - DDX11-AS1:5 No - lnc-DDX11-1:2 No - lnc-DDX11-1:3 No - lnc-DDX11-1:1 No - LINC02387:5 Yes chrX:4921678-4938105 DENND5B-AS1:3 Yes chr3L:1537137-1544823 DENND5B-AS1:4 Yes chr3L:1537137-1544823 DENND5B-AS1:5 Yes chr3L:1537137-1544823 lnc-ETFBKMT-8:2 No - lnc-AMN1-2:4 No - lnc-AMN1-2:5 No - lnc-AMN1-2:6 No - lnc-AMN1-2:7 No - lnc-AMN1-2:3 No - LINC02422:25 No - LINC02422:26 No - LINC02422:17 No - LINC02422:27 No - lnc-H3F3C-10:1 No - LINC02422:18 No - LINC02422:19 No - LINC02422:20 No - lnc-DNM1L-9:1 No - lnc-DNM1L-8:2 No - lnc-SYT10-3:5 No - LINC02555:12 No - LINC02555:13 No - LINC02555:14 No - LINC02555:15 No - LINC02555:16 No - lnc-SLC2A13-2:4 Yes chr3R:20635480-20644279 lnc-SLC2A13-2:3 Yes chr3R:20635480-20644279 lnc-IRAK4-5:1 No - lnc-IRAK4-5:2 No - LINC00938:6 No - LINC00938:7 No - LINC00938:8 No - LINC00938:9 No - lnc-ARID2-14:1 Yes chr3R:5579301-5588380 lnc-ARID2-14:2 Yes chr3R:5579301-5588380 lnc-ARID2-1:4 No - lnc-ARID2-1:5 No - lnc-ARID2-1:6 No - lnc-SLC38A2-1:16 No - lnc-SLC38A2-1:17 No - lnc-SLC38A2-1:10 No - lnc-PCED1B-5:7 No - lnc-PCED1B-5:17 No - lnc-PCED1B-5:22 No - lnc-PCED1B-5:23 No - lnc-PCED1B-5:24 No - lnc-PCED1B-5:26 No - lnc-PCED1B-5:27 No - lnc-PCED1B-5:30 No - lnc-PCED1B-5:31 No - lnc-PCED1B-5:35 No - lnc-PCED1B-5:36 No - lnc-PCED1B-5:37 No - lnc-PCED1B-5:38 No - lnc-SLC38A2-1:13 No - lnc-SLC38A2-1:14 No - lnc-SLC38A2-1:15 No - lnc-SLC38A2-1:11 No - lnc-SLC38A2-1:9 No - lnc-SLC38A2-1:12 No - lnc-PCED1B-12:3 No - lnc-PCED1B-12:4 No - PCED1B-AS1:14 No - PCED1B-AS1:24 No - PCED1B-AS1:17 No - PCED1B-AS1:18 No - PCED1B-AS1:22 No - PCED1B-AS1:19 No - PCED1B-AS1:25 No - PCED1B-AS1:15 No - PCED1B-AS1:16 No - PCED1B-AS1:20 No - PCED1B-AS1:21 No - PCED1B-AS1:23 No - lnc-PCED1B-13:2 No - lnc-AMIGO2-8:2 No - lnc-AMIGO2-8:1 No - lnc-RPAP3-1:1 No - lnc-SLC48A1-23:1 No - lnc-SLC48A1-23:2 No - lnc-SLC48A1-23:3 No - lnc-H1FNT-1:4 No - lnc-H1FNT-1:5 No - lnc-H1FNT-1:6 No - lnc-H1FNT-1:7 No - lnc-ADCY6-1:2 No - lnc-WNT1-6:1 No - lnc-WNT1-6:2 No - lnc-TUBA1C-1:11 No - lnc-TUBA1C-1:12 No - lnc-TUBA1C-1:13 No - lnc-TUBA1C-1:14 No - lnc-TUBA1C-1:15 No - lnc-TUBA1A-1:7 Yes chr3R:9731221-9733250 lnc-TUBA1A-1:3 Yes chr3R:9731221-9733250 lnc-TUBA1A-1:4 Yes chr3R:9731221-9733250 lnc-TUBA1A-1:5 Yes chr3R:9731221-9733250 lnc-TUBA1A-1:6 Yes chr3R:9731221-9733250 BCDIN3D-AS1:9 No - BCDIN3D-AS1:10 No - BCDIN3D-AS1:11 No - lnc-RACGAP1-1:7 No - lnc-RACGAP1-1:8 No - lnc-RACGAP1-1:9 No - lnc-RACGAP1-1:10 No - lnc-RACGAP1-1:11 No - lnc-RACGAP1-1:6 No - lnc-RACGAP1-1:12 No - lnc-RACGAP1-1:13 No - lnc-SLC11A2-8:1 No - lnc-SLC11A2-7:1 Yes chrX:18366357-18377864 lnc-SLC11A2-7:2 Yes chrX:18366357-18377864 lnc-CSRNP2-4:2 Yes chr3L:8602411-8604149 lnc-CSRNP2-4:1 Yes chr3L:8602411-8604149 lnc-DAZAP2-1:2 No - lnc-DAZAP2-1:3 No - lnc-GALNT6-4:1 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-GALNT6-4:2 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-GALNT6-4:4 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-GALNT6-4:3 Yes chrX:16455027-16533096 lnc-ANKRD33-2:11 No - lnc-ANKRD33-2:12 No - lnc-ANKRD33-2:14 No - lnc-ANKRD33-2:15 No - lnc-ANKRD33-2:16 No - lnc-KRT80-8:2 Yes chr2L:20683462-20714588 lnc-KRT80-2:3 No - lnc-KRT80-2:4 No - lnc-KRT80-2:5 No - lnc-KRT80-2:6 No - lnc-KRT80-2:7 No - lnc-KRT80-16:1 No - lnc-KRT80-16:2 No - LINC00592:15 No - LINC00592:16 No - lnc-KRT80-1:6 No - lnc-KRT80-1:7 No - lnc-KRT80-1:8 No - lnc-KRT8-2:1 No - lnc-KRT8-3:1 No - lnc-TNS2-3:1 No - lnc-TNS2-3:2 No - lnc-RARG-1:1 No - lnc-AAAS-1:3 No - lnc-SP7-4:1 No - lnc-MAP3K12-4:1 No - lnc-MAP3K12-3:2 No - CISTR:8 No - CISTR:9 No - CISTR:7 No - HOXC-AS3:6 Yes chr3R:16927212-16972236 HOXC-AS3:7 Yes chr3R:16927212-16972236 HOXC-AS3:8 No - HOXC-AS3:5 Yes chr3R:16927212-16972236 HOXC-AS2:4 No - HOXC-AS1:4 No - HOXC-AS1:3 No - lnc-HNRNPA1-7:1 No - lnc-COPZ1-5:1 Yes chrX:16752189-16783434 lnc-COPZ1-5:3 Yes chrX:16752189-16783434 LINC01154:12 No - LINC01154:13 No - lnc-GDF11-1:6 Yes chr2L:21344607-21358271 lnc-GDF11-1:7 Yes chr2L:21344607-21358271 lnc-GDF11-1:9 Yes chr2L:21344607-21358271 lnc-GDF11-1:10 Yes chr2L:21344607-21358271 lnc-GDF11-1:11 Yes chr2L:21344607-21358271 lnc-ORMDL2-4:1 No - lnc-SMARCC2-7:4 No - lnc-SMARCC2-7:2 No - lnc-SMARCC2-7:5 Yes chr3L:5761963-5765702 lnc-SMARCC2-7:3 No - lnc-SMARCC2-3:3 Yes chr3R:24544719-24556549 lnc-SMARCC2-9:1 Yes chr3R:27657078-27660177 lnc-SMARCC2-2:3 No - lnc-SMARCC2-2:2 No - lnc-SMARCC2-2:4 No - lnc-SMARCC2-8:1 No - lnc-SMARCC2-1:2 No - lnc-IL23A-5:1 No - lnc-IL23A-4:2 No - lnc-RBMS2-5:1 No - lnc-HSD17B6-3:1 Yes chrX:3482965-3484555 lnc-HSD17B6-2:1 No - lnc-LRP1-4:1 Yes chr3R:20535323-20552311 lnc-INHBC-1:2 No - lnc-INHBC-1:3 No - lnc-INHBC-1:4 No - lnc-AGAP2-1:4 Yes chr2L:13835564-13898712 lnc-TSFM-3:1 No - lnc-TSFM-3:2 No - lnc-CTDSP2-1:5 No - lnc-CTDSP2-1:6 No - lnc-CTDSP2-1:7 No - lnc-CTDSP2-1:8 No - lnc-CTDSP2-2:17 No - lnc-CTDSP2-2:15 Yes chr2L:17484501-17485624 lnc-CTDSP2-2:19 No - lnc-CTDSP2-2:24 No - lnc-CTDSP2-2:21 No - lnc-CTDSP2-2:22 No - lnc-CTDSP2-2:18 No - lnc-CTDSP2-2:23 No - lnc-CTDSP2-2:20 No - lnc-CTDSP2-2:25 No - lnc-CTDSP2-2:16 No - lnc-SLC16A7-4:2 No - lnc-SLC16A7-4:3 No - lnc-SLC16A7-4:4 No - lnc-SLC16A7-4:5 No - lnc-MON2-2:7 No - lnc-MON2-2:8 No - lnc-MON2-2:9 No - lnc-MON2-2:10 No - lnc-DPY19L2-8:1 No - lnc-C12orf56-3:2 No - lnc-TBC1D30-1:4 No - lnc-TBC1D30-1:5 No - lnc-TBC1D30-1:6 No - LINC02389:19 No - LINC02389:20 No - LINC02389:21 No - LINC02389:22 No - LINC02389:23 No - LINC02389:24 No - lnc-WIF1-4:2 No - lnc-WIF1-4:3 No - lnc-WIF1-4:1 No - lnc-WIF1-6:7 Yes chr3R:10863355-10868642 lnc-WIF1-6:3 Yes chr3R:10863355-10868642 lnc-WIF1-6:24 No - lnc-WIF1-6:8 No - lnc-WIF1-6:9 No - lnc-WIF1-6:25 No - lnc-WIF1-6:10 No - lnc-WIF1-6:4 No - lnc-WIF1-6:5 No - lnc-WIF1-6:26 No - lnc-WIF1-6:27 No - lnc-WIF1-6:11 No - lnc-WIF1-6:12 No - LINC02454:15 No - LINC02454:16 No - LINC02454:17 No - LINC02454:18 No - LINC02454:19 No - lnc-LLPH-8:8 No - lnc-WIF1-6:6 No - lnc-LLPH-23:1 No - lnc-LLPH-23:2 No - lnc-LLPH-23:3 No - lnc-HMGA2-4:1 No - lnc-LLPH-7:2 No - lnc-LLPH-21:1 No - lnc-LLPH-21:2 No - lnc-LLPH-21:3 No - lnc-LLPH-21:4 No - lnc-LLPH-21:5 No - lnc-LLPH-21:6 No - LLPH-DT:10 No - LLPH-DT:11 No - LLPH-DT:12 No - lnc-TMBIM4-5:1 Yes chr3R:27251131-27253182 lnc-GRIP1-1:4 Yes chrX:5966279-5986699 lnc-GRIP1-1:6 Yes chrX:5966279-5986699 lnc-GRIP1-1:5 Yes chrX:5966279-5986699 lnc-GRIP1-8:5 No - lnc-GRIP1-8:4 No - lnc-GRIP1-8:6 No - lnc-GRIP1-8:3 No - lnc-RAP1B-5:2 No - lnc-RAP1B-5:3 No - lnc-MDM1-6:1 No - LINC02384:27 No - LINC02384:28 No - LINC02384:29 No - LINC02384:30 No - LINC02384:31 No - LINC02384:32 No - LINC02384:33 No - lnc-MDM1-7:1 No - lnc-CPM-8:1 No - lnc-CPM-8:2 No - lnc-CPM-2:10 Yes chr2L:10733293-10736071 lnc-CPM-2:11 Yes chr2L:10733293-10736071 lnc-CPM-2:12 Yes chr2L:10733293-10736071 lnc-CPM-2:8 Yes chr2L:10733293-10736071 lnc-CPM-2:9 Yes chr2L:10733293-10736071 lnc-MDM2-2:1 Yes chrX:16696131-16711145 lnc-MDM2-3:1 No - lnc-MDM2-3:2 No - lnc-MDM2-3:3 No - lnc-MDM2-3:4 No - lnc-CPSF6-3:1 No - lnc-LRRC10-5:1 No - lnc-CCT2-2:1 No - lnc-CCT2-2:2 No - LINC01481:11 No - lnc-CNOT2-1:2 No - lnc-CNOT2-1:3 No - lnc-CNOT2-1:4 No - lnc-CNOT2-1:5 No - LINC01481:8 Yes chr3L:8755989-8757167 LINC01481:4 Yes chr3L:8755989-8757167 LINC01481:12 Yes chr3L:8755989-8757167 LINC01481:13 Yes chr3L:8755989-8757167 LINC01481:14 Yes chr3L:8755989-8757167 LINC01481:2 Yes chr3L:8755989-8757167 LINC01481:3 Yes chr3L:8755989-8757167 LINC01481:7 Yes chr3L:8755989-8757167 LINC01481:5 Yes chr3L:8755989-8757167 LINC01481:6 Yes chr3L:8755989-8757167 LINC01481:9 Yes chr3L:8755989-8757167 LINC01481:10 Yes chr3L:8755989-8757167 lnc-KCNMB4-1:15 No - lnc-KCNMB4-1:16 No - lnc-KCNMB4-1:17 No - lnc-KCNMB4-1:18 No - lnc-KCNMB4-1:23 No - lnc-KCNMB4-1:24 No - lnc-ZFC3H1-16:1 No - lnc-ZFC3H1-16:2 No - TRHDE-AS1:24 Yes chr3R:21740105-21744431 TRHDE-AS1:27 Yes chr3R:21740105-21744431 TRHDE-AS1:25 Yes chr3R:21740105-21744431 TRHDE-AS1:26 Yes chr3R:21740105-21744431 TRHDE-AS1:21 Yes chr3R:21740105-21744431 TRHDE-AS1:22 Yes chr3R:21740105-21744431 TRHDE-AS1:16 Yes chr3R:21740105-21744431 TRHDE-AS1:17 Yes chr3R:21740105-21744431 TRHDE-AS1:13 Yes chr3R:21740105-21744431 TRHDE-AS1:23 Yes chr3R:21740105-21744431 TRHDE-AS1:28 Yes chr3R:21740105-21744431 TRHDE-AS1:18 Yes chr3R:21740105-21744431 TRHDE-AS1:19 Yes chr3R:21740105-21744431 TRHDE-AS1:20 Yes chr3R:21740105-21744431 TRHDE-AS1:15 Yes chr3R:21740105-21744431 TRHDE-AS1:14 Yes chr3R:21740105-21744431 lnc-KCNC2-2:19 No - lnc-KCNC2-2:16 No - lnc-KCNC2-2:20 No - lnc-KCNC2-2:21 No - lnc-KCNC2-2:22 No - lnc-KCNC2-2:11 No - lnc-KCNC2-2:12 No - lnc-KCNC2-2:14 No - lnc-KCNC2-2:23 No - lnc-KCNC2-2:15 No - lnc-KCNC2-2:17 No - lnc-KCNC2-2:18 No - lnc-KCNC2-2:13 No - lnc-KCNC2-1:8 Yes chr3L:18681037-18681836 lnc-KRR1-4:5 No - lnc-KRR1-4:9 No - lnc-KRR1-4:10 No - lnc-KRR1-4:6 No - lnc-KRR1-4:12 No - lnc-KRR1-4:13 No - lnc-KRR1-4:14 No - lnc-KRR1-4:15 No - lnc-KRR1-4:7 No - lnc-KRR1-4:8 No - lnc-GLIPR1-9:1 No - lnc-GLIPR1-10:1 No - LINC02407:23 No - LINC02407:24 No - LINC02407:25 No - LINC02407:26 No - LINC02407:27 No - lnc-CSRP2-2:1 Yes chr3L:15988236-15992464 lnc-ZDHHC17-2:2 No - lnc-ZDHHC17-18:1 No - lnc-PAWR-1:6 Yes chr2L:2772327-2799979 lnc-OTOGL-1:12 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-OTOGL-1:9 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-OTOGL-1:10 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-OTOGL-1:13 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-OTOGL-1:11 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-OTOGL-1:14 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-OTOGL-1:15 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-OTOGL-1:16 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-OTOGL-1:17 Yes chr3L:16051959-16082026 lnc-MYF5-2:2 No - lnc-MYF5-2:3 No - lnc-MYF5-2:4 No - lnc-MYF5-2:5 No - lnc-MYF5-2:6 No - lnc-MYF5-2:7 No - lnc-METTL25-6:2 No - lnc-METTL25-5:2 No - lnc-CCDC59-8:2 No - lnc-CCDC59-8:3 No - lnc-CCDC59-8:4 No - lnc-CCDC59-8:5 No - lnc-CCDC59-8:1 No - lnc-CCDC59-5:2 No - lnc-ALX1-2:10 No - lnc-ALX1-2:11 No - lnc-RASSF9-2:1 No - lnc-RASSF9-2:4 No - lnc-RASSF9-2:5 No - lnc-RASSF9-2:2 No - lnc-RASSF9-2:3 No - lnc-TMTC3-18:5 No - lnc-TMTC3-18:1 No - lnc-TMTC3-18:2 No - lnc-TMTC3-18:3 No - lnc-TMTC3-18:4 No - LINC02458:11 No - LINC02458:13 No - lnc-TMTC3-19:1 No - lnc-TMTC3-19:2 No - lnc-TMTC3-19:3 No - lnc-TMTC3-13:7 Yes chr3L:19066155-19086426 lnc-TMTC3-13:8 Yes chr3L:19066155-19086426 lnc-TMTC3-13:9 Yes chr3L:19066155-19086426 lnc-TMTC3-13:10 Yes chr3L:19066155-19086426 lnc-TMTC3-13:11 No - lnc-TMTC3-13:12 No - lnc-TMTC3-13:13 Yes chr3L:13388299-13390006 POC1B-AS1:29 No - POC1B-AS1:30 No - POC1B-AS1:31 No - POC1B-AS1:32 No - POC1B-AS1:33 No - POC1B-AS1:34 No - POC1B-AS1:36 No - POC1B-AS1:39 No - POC1B-AS1:40 No - ATP2B1-AS1:10 Yes chr4:328193-358917 ATP2B1-AS1:11 Yes chr4:328193-358917 ATP2B1-AS1:13 No - lnc-ATP2B1-5:1 No - lnc-TMTC3-20:1 No - lnc-TMTC3-21:1 No - lnc-ATP2B1-6:1 No - lnc-ATP2B1-6:2 No - lnc-TMTC3-22:1 No - lnc-TMTC3-5:6 No - lnc-TMTC3-5:9 No - lnc-TMTC3-5:7 No - lnc-TMTC3-5:8 No - lnc-TMTC3-5:10 No - lnc-TMTC3-5:11 No - lnc-TMTC3-5:12 No - lnc-TMTC3-5:13 No - lnc-ATP2B1-7:1 No - lnc-TMTC3-5:14 No - lnc-TMTC3-5:15 No - LINC02392:14 No - LINC02392:15 No - LINC02392:16 No - LINC02392:17 No - LINC02392:18 No - LINC02392:19 No - lnc-C12orf74-3:25 Yes chrX:16074717-16091495 lnc-C12orf74-3:26 Yes chrX:16074717-16091495 lnc-C12orf74-3:29 No - lnc-C12orf74-3:30 No - lnc-C12orf74-3:31 No - lnc-C12orf74-3:32 No - lnc-C12orf74-3:33 No - lnc-CLLU1OS-2:1 No - LINC02397:28 No - LINC02397:29 No - LINC02397:30 No - LINC02397:33 No - LINC02397:34 No - lnc-CLLU1OS-3:1 No - lnc-CLLU1OS-3:2 No - lnc-C12orf74-2:1 No - lnc-C12orf74-2:2 No - lnc-C12orf74-2:3 No - lnc-C12orf74-2:4 No - lnc-EEA1-7:1 No - lnc-PLEKHG7-2:1 No - lnc-PLEKHG7-2:2 No - lnc-UBE2N-1:12 No - lnc-UBE2N-1:13 No - lnc-UBE2N-1:14 No - lnc-MRPL42-2:1 Yes chr2L:14563015-14563726 lnc-MRPL42-2:2 Yes chr2L:14563015-14563726 lnc-MRPL42-2:3 Yes chr2L:14563015-14563726 SOCS2-AS1:10 No - SOCS2-AS1:9 Yes chr2R:8127575-8129476 SOCS2-AS1:12 Yes chr2R:8127575-8129476 SOCS2-AS1:15 Yes chr2R:8127575-8129476 SOCS2-AS1:18 Yes chr2R:8127575-8129476 SOCS2-AS1:16 Yes chr2R:8127575-8129476 SOCS2-AS1:19 Yes chr2R:8127575-8129476 SOCS2-AS1:20 Yes chr2R:8127575-8129476 SOCS2-AS1:13 Yes chr2R:8127575-8129476 SOCS2-AS1:14 Yes chr2R:8127575-8129476 SOCS2-AS1:11 Yes chr2R:8127575-8129476 SOCS2-AS1:21 Yes chr2R:8127575-8129476 SOCS2-AS1:17 Yes chr2R:8127575-8129476 lnc-UBE2N-10:1 Yes chr2R:8127575-8129476 lnc-UBE2N-3:5 No - lnc-UBE2N-3:6 No - lnc-UBE2N-3:7 No - lnc-UBE2N-3:4 No - CEP83-DT:10 No - CEP83-DT:11 No - CEP83-DT:12 No - lnc-VEZT-10:1 No - lnc-VEZT-9:1 No - lnc-VEZT-9:2 No - lnc-VEZT-9:3 No - lnc-VEZT-9:4 No - lnc-USP44-3:1 Yes chr2L:9763369-9765338 lnc-NTN4-1:6 No - lnc-NTN4-1:7 No - lnc-NTN4-1:5 No - lnc-NTN4-4:1 No - lnc-NTN4-1:8 No - lnc-NTN4-1:9 No - lnc-AMDHD1-1:4 Yes chr2L:18855126-18859248 lnc-CFAP54-4:2 No - lnc-CDK17-6:2 No - lnc-CDK17-12:1 No - RMST:19 No - RMST:25 No - RMST:21 No - RMST:22 No - RMST:23 No - RMST:24 No - RMST:26 No - RMST:27 No - RMST:28 No - RMST:29 No - RMST:30 No - RMST:31 No - RMST:35 No - RMST:32 No - RMST:33 No - RMST:34 No - TMPO-AS1:8 No - TMPO-AS1:9 No - TMPO-AS1:13 No - TMPO-AS1:11 No - TMPO-AS1:10 No - TMPO-AS1:12 No - lnc-IKBIP-9:1 No - lnc-UTP20-4:1 No - lnc-GNPTAB-2:1 No - lnc-HSP90B1-4:1 No - lnc-HCFC2-1:1 No - lnc-HCFC2-1:2 No - lnc-HCFC2-1:3 No - lnc-NFYB-1:2 No - lnc-NFYB-1:5 No - lnc-NFYB-1:4 No - lnc-NFYB-1:3 No - lnc-ALDH1L2-1:5 Yes chrX:16313709-16317750 lnc-ALDH1L2-1:6 Yes chrX:16313709-16317750 lnc-ALDH1L2-1:7 Yes chrX:16313709-16317750 lnc-WASHC4-3:2 No - lnc-APPL2-1:2 No - lnc-APPL2-1:3 No - lnc-APPL2-1:4 No - lnc-TCP11L2-4:2 Yes chr3R:10264306-10308467 lnc-TCP11L2-4:3 Yes chr3R:10264306-10308467 lnc-TCP11L2-4:4 Yes chr3R:10264306-10308467 lnc-TCP11L2-4:5 Yes chr3R:10264306-10308467 lnc-CKAP4-1:2 Yes chr2R:12039041-12042623 lnc-MTERF2-1:2 No - lnc-MTERF2-1:3 No - lnc-MTERF2-1:4 No - lnc-MTERF2-1:6 No - lnc-PRDM4-8:1 No - lnc-PRDM4-8:2 No - lnc-ISCU-1:5 No - lnc-ISCU-1:4 No - lnc-ISCU-1:6 Yes chr2R:6862001-6872718 lnc-ISCU-1:7 No - lnc-SSH1-5:1 Yes chr2R:6862001-6872718 lnc-DAO-5:2 No - lnc-DAO-5:3 No - lnc-DAO-5:4 No - lnc-FOXN4-2:1 Yes chr2R:7974115-7991862 FAM222A-AS1:10 No - FAM222A-AS1:11 No - lnc-TCHP-3:2 No - lnc-TCHP-3:3 No - lnc-ANAPC7-4:1 Yes chr2R:23925077-23935884 lnc-ANAPC7-4:2 Yes chr2R:23925077-23935884 lnc-ANAPC7-4:3 Yes chr2R:23925077-23935884 lnc-ANAPC7-4:4 Yes chr2R:23925077-23935884 lnc-ANAPC7-4:5 Yes chr2R:23925077-23935884 lnc-ATP2A2-10:1 No - lnc-TCTN1-1:1 No - LINC01405:11 No - LINC01405:12 No - LINC01405:13 No - LINC01405:14 No - LINC01405:15 No - LINC01405:16 No - LINC01405:17 No - lnc-MYL2-1:4 No - lnc-MYL2-1:5 No - lnc-MYL2-1:6 No - lnc-FAM109A-3:1 Yes chrX:7609148-7678859 LINC02356:8 No - LINC02356:9 No - lnc-FAM109A-2:1 No - lnc-ACAD10-10:1 Yes chr3R:15408423-15417277 MAPKAPK5-AS1:22 No - MAPKAPK5-AS1:25 No - MAPKAPK5-AS1:23 No - MAPKAPK5-AS1:26 No - MAPKAPK5-AS1:27 No - MAPKAPK5-AS1:24 No - MAPKAPK5-AS1:28 No - LHX5-AS1:3 Yes chrX:8756539-8805804 LHX5-AS1:4 Yes chrX:8756539-8805804 lnc-SDSL-12:1 Yes chr3L:9624237-9627321 lnc-SDSL-12:2 Yes chr3L:9624237-9627321 lnc-SDSL-12:3 Yes chr3L:9624237-9627321 lnc-SDSL-12:4 Yes chr3L:9624237-9627321 lnc-SDSL-12:5 Yes chr3L:9624237-9627321 lnc-SDSL-19:1 No - lnc-TBX3-9:1 No - lnc-TBX3-9:5 No - lnc-TBX3-9:2 No - lnc-TBX3-9:3 No - lnc-TBX3-9:4 No - lnc-MED13L-10:1 No - lnc-MED13L-10:2 No - lnc-MAP1LC3B2-5:2 No - lnc-MAP1LC3B2-5:3 No - lnc-MAP1LC3B2-5:4 No - lnc-MAP1LC3B2-5:5 No - lnc-MAP1LC3B2-5:6 No - lnc-MAP1LC3B2-13:1 No - lnc-MED13L-8:3 No - lnc-MED13L-8:4 No - lnc-MED13L-8:5 No - lnc-MED13L-8:6 No - lnc-MED13L-8:2 No - lnc-MAP1LC3B2-12:1 No - lnc-MAP1LC3B2-28:2 No - lnc-MAP1LC3B2-28:3 No - lnc-MAP1LC3B2-28:9 No - lnc-MAP1LC3B2-28:10 No - lnc-MAP1LC3B2-28:11 No - lnc-MAP1LC3B2-28:12 No - lnc-MAP1LC3B2-28:13 No - lnc-C12orf49-11:1 No - lnc-C12orf49-10:2 No - lnc-MAP1LC3B2-28:22 No - lnc-MAP1LC3B2-28:23 No - lnc-C12orf49-10:1 No - lnc-RNFT2-1:4 No - lnc-RNFT2-1:5 No - lnc-RNFT2-1:6 No - lnc-RNFT2-1:7 Yes chrX:15570380-15572149 lnc-RFC5-5:5 No - lnc-RFC5-5:7 No - lnc-TAOK3-8:2 Yes chrX:19599803-19601851 LINC02440:12 No - LINC02440:13 No - LINC02440:14 No - LINC02440:15 No - lnc-CIT-11:1 No - lnc-CIT-11:3 No - lnc-CIT-11:4 No - lnc-CIT-11:5 No - lnc-CIT-11:2 No - lnc-BICDL1-1:4 Yes chrX:20155766-20159872 lnc-BICDL1-1:5 Yes chrX:20155766-20159872 lnc-BICDL1-1:6 Yes chrX:20155766-20159872 PXN-AS1:12 Yes chr2L:19400753-19426596 PXN-AS1:13 Yes chr2L:19400753-19426596 PXN-AS1:17 No - PXN-AS1:18 No - PXN-AS1:19 No - PXN-AS1:20 Yes chr2L:19400753-19426596 lnc-PLA2G1B-2:3 Yes chrX:5664628-5665940 lnc-PLA2G1B-2:1 Yes chrX:5664628-5665940 lnc-PLA2G1B-2:2 No - NRAV:8 No - NRAV:6 No - NRAV:9 No - NRAV:7 No - lnc-POP5-1:5 No - lnc-POP5-1:6 No - lnc-POP5-1:7 No - lnc-SPPL3-1:1 No - HNF1A-AS1:13 No - lnc-HNF1A-1:5 No - lnc-HNF1A-1:6 No - lnc-HNF1A-1:7 No - HNF1A-AS1:8 No - HNF1A-AS1:14 No - HNF1A-AS1:9 No - HNF1A-AS1:10 No - HNF1A-AS1:11 No - HNF1A-AS1:12 No - lnc-CAMKK2-6:3 No - lnc-CAMKK2-6:2 No - lnc-MORN3-1:1 No - lnc-TMEM120B-1:2 Yes chr2R:17860760-17861591 lnc-TMEM120B-1:3 Yes chr2R:17860760-17861591 lnc-TMEM120B-1:4 No - lnc-MORN3-2:1 No - lnc-HPD-3:1 No - lnc-HPD-2:4 Yes chrX:9356634-9358594 lnc-MLXIP-12:4 No - lnc-MLXIP-12:5 No - lnc-MLXIP-12:6 No - lnc-MLXIP-12:7 No - lnc-MLXIP-12:8 No - lnc-MLXIP-12:9 No - lnc-MLXIP-12:10 No - lnc-MLXIP-12:11 No - lnc-MLXIP-12:12 No - lnc-IL31-1:1 No - lnc-HCAR1-2:1 No - lnc-CDK2AP1-1:11 No - lnc-CDK2AP1-1:10 No - lnc-CDK2AP1-1:12 No - lnc-CDK2AP1-1:13 Yes chrX:11137859-11139689 lnc-CDK2AP1-1:14 Yes chrX:11137859-11139689 lnc-KMT5A-1:18 Yes chrX:13195499-13211674 lnc-KMT5A-1:19 Yes chrX:13195499-13211674 lnc-KMT5A-1:20 Yes chrX:13195499-13211674 lnc-KMT5A-1:21 Yes chrX:13195499-13211674 lnc-KMT5A-1:22 Yes chrX:13195499-13211674 lnc-KMT5A-1:23 Yes chrX:13195499-13211674 lnc-KMT5A-1:27 No - lnc-KMT5A-1:28 No - lnc-SBNO1-2:1 No - lnc-EIF2B1-1:12 No - lnc-EIF2B1-1:6 No - lnc-EIF2B1-1:7 No - lnc-EIF2B1-1:11 No - lnc-EIF2B1-1:10 No - lnc-EIF2B1-1:8 No - lnc-EIF2B1-1:9 No - lnc-EIF2B1-1:13 No - lnc-EIF2B1-6:1 Yes chrX:4540908-4542506 lnc-EIF2B1-3:2 No - lnc-DNAH10OS-8:2 No - lnc-NCOR2-3:2 No - lnc-NCOR2-3:11 No - lnc-NCOR2-3:3 No - lnc-NCOR2-3:4 No - lnc-NCOR2-3:8 No - lnc-NCOR2-3:12 No - lnc-NCOR2-3:9 No - lnc-NCOR2-3:5 No - lnc-NCOR2-3:6 No - lnc-NCOR2-3:10 No - lnc-SCARB1-6:1 No - lnc-BRI3BP-9:1 No - lnc-BRI3BP-8:1 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-BRI3BP-8:2 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-BRI3BP-7:1 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-BRI3BP-7:2 Yes chr3L:7733250-7743041 lnc-UBC-3:1 No - LINC00939:9 No - LINC00939:10 No - LINC00939:11 No - LINC00939:12 No - LINC00939:13 No - LINC00939:14 No - LINC02350:14 No - LINC02350:15 No - LINC02350:16 No - LINC02350:17 No - LINC00944:25 No - LINC00944:26 No - LINC00944:33 No - LINC00944:27 No - LINC00944:28 No - LINC00944:34 No - LINC00944:35 No - LINC00944:30 No - LINC00944:29 No - LINC00944:31 No - LINC00944:32 No - LINC02405:17 No - LINC02405:18 No - LINC02405:19 No - LINC02405:20 No - LINC02405:21 No - LINC02405:22 No - LINC02376:7 No - lnc-TMEM132C-13:1 No - lnc-SLC15A4-26:2 No - lnc-SLC15A4-26:3 No - lnc-SLC15A4-26:1 No - lnc-SLC15A4-26:4 No - FZD10-DT:29 No - FZD10-DT:39 No - FZD10-DT:40 No - FZD10-DT:33 No - FZD10-DT:30 No - FZD10-DT:31 No - FZD10-DT:34 No - FZD10-DT:35 No - FZD10-DT:41 No - FZD10-DT:32 No - FZD10-DT:42 No - FZD10-DT:43 No - lnc-STX2-19:1 No - lnc-STX2-19:2 No - lnc-MMP17-3:1 No - lnc-MMP17-3:3 No - lnc-MMP17-3:2 No - lnc-DDX51-3:5 Yes chr3L:12784429-12805116 lnc-DDX51-3:2 No - lnc-DDX51-3:3 No - lnc-DDX51-3:4 No - LINC02361:10 No - LINC02361:11 No - LINC02361:12 No - lnc-NOC4L-4:10 Yes chr3R:28748384-28751661 lnc-NOC4L-4:11 Yes chr3R:28748384-28751661 lnc-NOC4L-4:12 Yes chr3R:28748384-28751661 lnc-ANKLE2-2:2 No - lnc-ANKLE2-2:3 No - lnc-ANKLE2-2:4 No - lnc-ANKLE2-2:5 No - lnc-PGAM5-3:1 No - lnc-PGAM5-3:2 No - lnc-PGAM5-3:3 No - lnc-PGAM5-3:4 No - lnc-ZNF26-2:3 No - lnc-ZNF26-2:4 No - lnc-ZNF26-12:3 No - lnc-ZNF26-12:4 No - lnc-ZNF26-12:5 No - lnc-ZNF605-5:1 No - lnc-ZNF891-2:3 No - lnc-ZNF891-2:4 No - lnc-ZNF891-2:5 No - lnc-ZMYM5-3:1 No - lnc-ZMYM2-13:1 No - lnc-ZMYM2-13:2 No - lnc-GJB2-3:1 No - lnc-IFT88-2:1 No - lnc-CRYL1-1:9 No - lnc-CRYL1-1:10 No - lnc-CRYL1-1:6 No - lnc-CRYL1-1:11 No - lnc-CRYL1-1:7 No - lnc-CRYL1-1:8 No - lnc-EEF1AKMT1-3:2 No - lnc-EEF1AKMT1-3:3 No - lnc-IL17D-4:1 Yes chr2L:6069790-6070686 lnc-FGF9-3:10 No - lnc-FGF9-3:11 No - lnc-FGF9-3:12 No - lnc-FGF9-3:13 No - lnc-FGF9-3:14 No - lnc-FGF9-3:16 No - lnc-FGF9-3:15 No - lnc-FGF9-3:17 No - lnc-FGF9-3:18 No - lnc-FGF9-19:1 No - LINC00621:3 No - LINC00621:4 No - LINC00621:5 No - LINC00621:6 No - lnc-SACS-8:1 No - lnc-SACS-8:2 No - lnc-TNFRSF19-9:1 No - lnc-TNFRSF19-9:3 Yes chr2R:5758065-5760407 lnc-TNFRSF19-9:4 Yes chr2R:5758065-5760407 lnc-SPATA13-4:2 No - lnc-SPATA13-4:3 No - lnc-SPATA13-4:4 No - lnc-SPATA13-4:5 No - lnc-SPATA13-4:6 No - lnc-ATP12A-4:1 No - lnc-ATP12A-4:2 No - lnc-ATP12A-1:7 No - lnc-ATP12A-1:8 No - lnc-ATP12A-1:9 No - lnc-ATP12A-1:10 No - lnc-ATP12A-1:11 No - lnc-RNF17-1:2 No - lnc-RNF17-1:3 No - lnc-RNF17-5:1 No - lnc-CENPJ-8:1 No - lnc-CENPJ-8:2 No - lnc-CENPJ-8:3 No - lnc-CENPJ-8:4 No - LINC00463:4 No - lnc-MTMR6-1:2 No - lnc-CDK8-2:2 Yes chr3R:9535625-9551806 lnc-USP12-9:16 No - lnc-USP12-9:17 No - lnc-USP12-9:3 No - lnc-USP12-9:4 No - lnc-USP12-9:5 No - lnc-RPL21-7:1 No - lnc-USP12-9:6 No - lnc-USP12-9:7 No - lnc-GTF3A-4:1 No - lnc-GTF3A-4:2 No - LINC00543:6 No - PAN3-AS1:6 Yes chr3L:3071133-3090406 PAN3-AS1:7 No - lnc-POMP-6:2 No - lnc-POMP-6:3 No - lnc-POMP-6:4 No - lnc-SLC46A3-7:1 No - lnc-SLC46A3-7:2 No - lnc-SLC46A3-8:1 No - lnc-MTUS2-5:1 No - lnc-MTUS2-5:2 No - lnc-MTUS2-5:3 No - lnc-UBE2L5-2:1 Yes chr3R:5227289-5232209 lnc-UBE2L5-2:2 Yes chr3R:5227289-5232209 lnc-UBE2L5-2:3 Yes chr3R:5227289-5232209 lnc-UBE2L5-2:4 Yes chr3R:5227289-5232209 lnc-UBE2L5-2:5 No - LINC01058:3 No - LINC01058:7 No - LINC01058:8 No - LINC01058:9 No - LINC01058:4 No - LINC01058:5 No - LINC01058:6 No - lnc-USPL1-2:9 No - LINC00545:4 No - LINC00545:5 No - TEX26-AS1:26 No - TEX26-AS1:27 No - TEX26-AS1:28 No - TEX26-AS1:33 No - TEX26-AS1:34 No - TEX26-AS1:29 No - TEX26-AS1:30 No - TEX26-AS1:31 No - TEX26-AS1:32 No - TEX26-AS1:25 No - lnc-B3GLCT-6:1 Yes chr3L:14037019-14043686 lnc-B3GLCT-6:2 Yes chr3L:14037019-14043686 lnc-B3GLCT-5:1 No - FRY-AS1:6 Yes chr3L:9631834-9679103 FRY-AS1:7 Yes chr3L:9631834-9679103 FRY-AS1:8 Yes chr3L:9631834-9679103 FRY-AS1:9 Yes chr3L:9631834-9679103 FRY-AS1:5 Yes chr3L:9631834-9679103 FRY-AS1:4 Yes chr3L:9631834-9679103 lnc-STARD13-2:7 No - lnc-STARD13-2:8 No - lnc-STARD13-2:9 No - lnc-RFC3-7:2 No - lnc-RFC3-7:3 No - lnc-RFC3-7:4 No - lnc-RFC3-7:6 No - lnc-RFC3-7:5 No - lnc-STARD13-2:10 No - lnc-STARD13-2:11 No - lnc-STARD13-2:6 No - lnc-STARD13-6:3 No - lnc-STARD13-6:4 No - lnc-STARD13-6:5 No - lnc-STARD13-6:1 No - lnc-STARD13-6:2 No - lnc-STARD13-7:1 No - lnc-STARD13-7:2 No - LINC02343:13 No - LINC02343:14 No - LINC02343:15 No - LINC02343:16 No - lnc-MAB21L1-2:5 No - lnc-MAB21L1-2:2 No - lnc-MAB21L1-2:3 No - lnc-MAB21L1-2:6 No - lnc-MAB21L1-2:4 No - lnc-NBEA-2:3 Yes chr2R:4815426-4824319 lnc-NBEA-2:4 Yes chr2R:4815426-4824319 lnc-NBEA-2:5 Yes chr2R:4815426-4824319 lnc-NBEA-2:6 Yes chr2R:4815426-4824319 lnc-EXOSC8-6:1 No - lnc-EXOSC8-6:2 No - lnc-EXOSC8-1:2 No - lnc-EXOSC8-1:3 No - lnc-EXOSC8-1:4 No - lnc-EXOSC8-1:5 No - lnc-EXOSC8-1:6 No - lnc-EXOSC8-1:7 No - lnc-EXOSC8-1:8 No - LINC00547:2 No - LINC00547:3 No - LINC02334:11 No - LINC02334:12 No - LINC02334:13 No - LINC02334:14 No - LINC02334:15 No - LINC00571:6 Yes chr2R:16951837-16952581 LINC00571:7 Yes chr2R:16951837-16952581 LINC00571:8 Yes chr2R:16951837-16952581 LINC00571:9 Yes chr2R:16951837-16952581 LINC00571:12 No - LINC00571:11 No - LINC00571:10 Yes chr2R:16951837-16952581 lnc-FOXO1-2:20 No - lnc-FOXO1-2:21 No - lnc-FOXO1-2:22 No - lnc-FOXO1-2:23 No - lnc-FOXO1-2:27 No - lnc-FOXO1-2:28 No - lnc-FOXO1-2:29 No - lnc-FOXO1-2:30 No - lnc-FOXO1-2:24 No - lnc-FOXO1-2:26 No - lnc-MRPS31-1:1 No - lnc-SLC25A15-14:1 No - lnc-WBP4-2:8 No - lnc-WBP4-2:9 No - lnc-WBP4-2:10 No - lnc-WBP4-2:11 No - lnc-WBP4-2:12 No - lnc-VWA8-8:1 No - lnc-VWA8-8:2 No - lnc-VWA8-9:1 Yes chr3R:7814361-7855392 lnc-VWA8-9:2 Yes chr3R:7814361-7855392 lnc-VWA8-9:3 Yes chr3R:7814361-7855392 lnc-VWA8-9:4 Yes chr3R:7814361-7855392 lnc-VWA8-10:1 No - lnc-EPSTI1-3:4 No - lnc-EPSTI1-3:5 No - lnc-EPSTI1-3:6 No - lnc-EPSTI1-3:7 No - lnc-EPSTI1-3:8 No - LINC01050:2 No - LINC01050:3 No - LINC01050:4 No - LINC01050:5 No - LINC01050:6 No - lnc-DNAJC15-8:1 No - lnc-DNAJC15-8:2 No - lnc-CCDC122-4:1 No - LINC00284:19 No - LINC00284:20 No - LINC00284:21 No - LINC00284:22 No - LINC00284:18 No - SMIM2-AS1:12 No - SMIM2-AS1:13 No - SMIM2-AS1:14 No - SMIM2-AS1:15 No - SMIM2-AS1:16 No - SMIM2-AS1:17 No - SMIM2-AS1:18 No - SMIM2-AS1:19 No - lnc-SMIM2-2:1 No - lnc-SMIM2-2:2 No - lnc-SERP2-16:1 No - lnc-SERP2-16:2 No - lnc-SERP2-15:1 No - TUSC8:13 No - TUSC8:10 No - TUSC8:16 No - TUSC8:14 No - TUSC8:11 No - TUSC8:15 No - TUSC8:12 No - lnc-TSC22D1-5:2 No - lnc-TSC22D1-5:3 No - lnc-TSC22D1-5:5 No - lnc-TSC22D1-5:4 No - lnc-GPALPP1-7:1 No - TPT1-AS1:45 Yes chr3R:11210247-11211898 TPT1-AS1:46 No - TPT1-AS1:47 No - TPT1-AS1:48 No - TPT1-AS1:49 Yes chr3L:11720934-11728118 TPT1-AS1:50 Yes chr3L:11720934-11728118 TPT1-AS1:51 Yes chr3L:11720934-11728118 TPT1-AS1:52 No - TPT1-AS1:54 No - TPT1-AS1:55 No - TPT1-AS1:56 No - TPT1-AS1:57 No - TPT1-AS1:53 No - TPT1-AS1:59 No - TPT1-AS1:60 No - TPT1-AS1:61 No - TPT1-AS1:62 No - TPT1-AS1:63 No - TPT1-AS1:58 No - TPT1-AS1:67 No - TPT1-AS1:68 No - TPT1-AS1:64 No - TPT1-AS1:65 Yes chr3L:11720934-11728118 TPT1-AS1:66 Yes chr3L:11720934-11728118 TPT1-AS1:70 No - TPT1-AS1:71 No - TPT1-AS1:69 No - TPT1-AS1:72 No - TPT1-AS1:73 No - TPT1-AS1:74 No - CPB2-AS1:10 No - CPB2-AS1:11 Yes chrX:17080423-17087675 CPB2-AS1:12 Yes chrX:17080423-17087675 CPB2-AS1:14 Yes chrX:17080423-17087675 CPB2-AS1:15 Yes chrX:17080423-17087675 CPB2-AS1:16 Yes chrX:17080423-17087675 CPB2-AS1:17 Yes chrX:17080423-17087675 CPB2-AS1:18 Yes chrX:17080423-17087675 lnc-RUBCNL-4:1 No - lnc-RUBCNL-4:2 No - lnc-RUBCNL-4:3 No - lnc-RUBCNL-4:4 No - lnc-RUBCNL-4:5 No - lnc-LRRC63-6:1 Yes chrX:8677063-8680912 lnc-LRRC63-6:2 Yes chrX:8677063-8680912 SUCLA2-AS1:2 Yes chr3R:8938724-8943027 SUCLA2-AS1:3 Yes chr3R:8938724-8943027 lnc-MED4-3:1 No - lnc-MED4-3:2 No - RB1-DT:13 No - RB1-DT:14 No - RB1-DT:15 No - RB1-DT:16 No - RB1-DT:17 No - lnc-CYSLTR2-2:1 No - lnc-CYSLTR2-2:2 No - lnc-RCBTB2-9:1 No - lnc-CAB39L-8:2 No - lnc-CAB39L-8:1 No - lnc-CAB39L-1:9 No - lnc-CAB39L-1:5 No - lnc-CAB39L-1:4 No - lnc-CAB39L-1:6 No - lnc-CAB39L-1:7 No - lnc-CAB39L-1:8 No - DLEU2:34 No - DLEU2:31 No - DLEU2:32 No - DLEU2:46 No - DLEU2:33 No - DLEU2:35 No - DLEU2:45 No - DLEU2:37 No - DLEU2:38 No - DLEU2:39 No - DLEU2:40 No - DLEU2:41 No - DLEU2:42 No - DLEU2:43 No - DLEU2:44 No - DLEU2:36 No - DLEU7-AS1:6 No - DLEU7-AS1:7 No - DLEU7-AS1:5 No - DLEU7-AS1:8 No - DLEU7-AS1:9 No - RNASEH2B-AS1:12 Yes chrX:13668014-13669573 RNASEH2B-AS1:13 Yes chrX:13668014-13669573 RNASEH2B-AS1:14 Yes chrX:13668014-13669573 RNASEH2B-AS1:15 Yes chrX:13668014-13669573 RNASEH2B-AS1:16 Yes chrX:13668014-13669573 RNASEH2B-AS1:17 Yes chrX:13668014-13669573 RNASEH2B-AS1:18 Yes chrX:13668014-13669573 RNASEH2B-AS1:19 Yes chrX:13668014-13669573 INTS6-AS1:36 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:37 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:40 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:41 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:42 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:38 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:43 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:44 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:45 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:46 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:47 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:48 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:49 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:50 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:51 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:39 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:52 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:53 Yes chrX:5738663-5747254 INTS6-AS1:54 Yes chrX:5738663-5747254 lnc-WDFY2-4:2 No - lnc-VPS36-3:2 No - LINC00345:3 No - LINC00345:2 No - lnc-CNMD-2:1 No - lnc-CNMD-2:2 No - LINC00458:15 No - LINC00458:16 No - LINC00458:17 No - LINC00458:18 No - LINC00458:19 No - LINC00458:20 No - LINC00458:21 No - LINC00458:22 No - LINC00458:23 No - LINC00458:14 No - lnc-OLFM4-4:4 No - lnc-OLFM4-4:5 No - lnc-OLFM4-4:6 No - lnc-OLFM4-4:7 No - lnc-OLFM4-4:8 No - lnc-DIAPH3-24:1 No - lnc-TDRD3-14:1 No - lnc-TDRD3-14:2 No - lnc-TDRD3-14:3 No - lnc-TDRD3-14:4 No - lnc-TDRD3-14:5 No - lnc-DIAPH3-22:1 No - lnc-DIAPH3-23:1 Yes chr3L:14786791-14789665 LINC00355:3 No - LINC00355:4 No - LINC00355:5 No - LINC00355:6 No - LINC00355:7 No - lnc-KLF5-15:2 No - lnc-KLF5-15:1 No - lnc-KLF5-16:1 No - lnc-KLF5-16:2 No - lnc-KLF12-7:1 No - lnc-KLF12-7:2 No - lnc-TBC1D4-8:1 No - lnc-TBC1D4-8:2 No - lnc-TBC1D4-8:3 No - lnc-TBC1D4-8:4 No - lnc-TBC1D4-3:3 No - lnc-TBC1D4-3:1 No - lnc-TBC1D4-3:2 No - LMO7-AS1:7 No - LMO7-AS1:8 No - LMO7-AS1:9 No - LMO7-AS1:12 No - LMO7-AS1:10 No - LMO7-AS1:13 No - LMO7-AS1:14 No - LMO7-AS1:6 Yes chr3R:4659579-4712193 LMO7-AS1:11 Yes chr3R:4659579-4712193 lnc-LMO7DN-6:1 No - lnc-LMO7DN-6:2 No - lnc-LMO7DN-6:3 No - lnc-LMO7DN-6:4 No - lnc-LMO7DN-6:5 No - lnc-CLN5-4:1 No - lnc-CLN5-4:2 No - lnc-SCEL-8:1 No - lnc-SCEL-8:2 No - RBM26-AS1:17 Yes chr2L:19493251-19497978 RBM26-AS1:18 Yes chr2L:19493251-19497978 RBM26-AS1:19 Yes chr2L:19493251-19497978 RBM26-AS1:20 Yes chr2L:19493251-19497978 RBM26-AS1:21 Yes chr2L:19493251-19497978 RBM26-AS1:22 Yes chr2L:19493251-19497978 RBM26-AS1:23 Yes chr2L:19493251-19497978 RBM26-AS1:24 Yes chr2L:19493251-19497978 RBM26-AS1:26 Yes chr2L:19493251-19497978 RBM26-AS1:27 Yes chr2L:19493251-19497978 RBM26-AS1:25 Yes chr2L:19493251-19497978 NDFIP2-AS1:2 No - NDFIP2-AS1:3 No - lnc-NDFIP2-7:11 No - lnc-NDFIP2-7:12 No - lnc-NDFIP2-7:14 No - lnc-NDFIP2-7:15 No - lnc-NDFIP2-31:1 Yes chr3L:3401153-3424935 lnc-NDFIP2-32:1 No - lnc-SLITRK1-8:2 No - lnc-SLITRK1-8:3 No - lnc-SLITRK1-8:4 No - lnc-SLITRK1-8:5 No - lnc-SLITRK1-8:6 No - LINC00333:3 No - LINC00333:4 No - lnc-SLITRK6-24:2 No - lnc-SLITRK6-24:3 No - lnc-DCT-19:1 No - lnc-DCT-19:2 No - lnc-DCT-19:3 No - LINC00379:8 No - LINC00379:9 No - LINC00379:10 No - LINC00379:5 No - LINC00379:6 No - LINC00379:7 No - LINC00379:4 No - MIR17HG:14 No - MIR17HG:12 No - MIR17HG:15 No - MIR17HG:16 No - MIR17HG:13 No - MIR17HG:17 No - MIR17HG:18 No - MIR17HG:20 No - MIR17HG:21 No - MIR17HG:19 No - MIR17HG:22 No - GPC5-AS1:6 Yes chr3L:8827505-8891192 GPC5-AS1:7 Yes chr3L:8827505-8891192 GPC5-AS1:5 Yes chr3L:8827505-8891192 lnc-GPR180-11:1 No - lnc-GPR180-10:1 No - lnc-GPR180-10:2 No - LINC00391:2 Yes chr3L:14112405-14131324 LINC00391:7 No - LINC00391:8 No - SOX21-AS1:5 No - SOX21-AS1:6 No - SOX21-AS1:7 No - lnc-CLDN10-9:3 Yes chr2L:8355678-8362469 lnc-CLDN10-9:4 Yes chr2L:8355678-8362469 lnc-CLDN10-9:1 Yes chr2L:8355678-8362469 lnc-CLDN10-9:2 Yes chr2L:8355678-8362469 lnc-CLDN10-8:5 No - lnc-CLDN10-8:6 No - lnc-CLDN10-8:7 No - lnc-CLDN10-8:8 No - CLDN10-AS1:4 No - CLDN10-AS1:5 No - CLDN10-AS1:6 No - CLDN10-AS1:7 No - CLDN10-AS1:8 No - CLDN10-AS1:3 No - DNAJC3-DT:14 No - DNAJC3-DT:15 No - DNAJC3-DT:16 No - DNAJC3-DT:17 No - DNAJC3-DT:18 No - DNAJC3-DT:19 No - lnc-OXGR1-7:2 Yes chr3R:19929277-20008512 lnc-OXGR1-7:3 Yes chr3R:19929277-20008512 lnc-OXGR1-7:4 Yes chr3R:19929277-20008512 lnc-OXGR1-7:5 Yes chr3R:19929277-20008512 lnc-OXGR1-7:1 No - lnc-OXGR1-6:7 No - lnc-OXGR1-6:2 No - lnc-OXGR1-6:3 No - lnc-OXGR1-6:4 No - lnc-OXGR1-6:5 No - lnc-OXGR1-6:6 No - lnc-OXGR1-6:8 No - lnc-RNF113B-1:2 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-RNF113B-1:3 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-RNF113B-1:4 Yes chr3R:4910552-4945576 lnc-RNF113B-1:5 Yes chr3R:4910552-4945576 STK24-AS1:6 Yes chr3R:17085513-17087988 STK24-AS1:7 Yes chr3R:17085513-17087988 STK24-AS1:8 Yes chr3R:17085513-17087988 STK24-AS1:9 Yes chr3R:17085513-17087988 STK24-AS1:10 Yes chr3R:17085513-17087988 lnc-UBAC2-6:3 No - lnc-UBAC2-6:4 No - DOCK9-DT:5 No - UBAC2-AS1:14 No - UBAC2-AS1:15 No - UBAC2-AS1:10 No - UBAC2-AS1:16 No - UBAC2-AS1:11 No - UBAC2-AS1:12 No - UBAC2-AS1:13 No - lnc-GPR183-4:1 No - lnc-GPR183-47:5 Yes chr2L:20730416-20734309 lnc-GPR183-47:6 Yes chr2L:20730416-20734309 lnc-GPR183-47:7 Yes chr2L:20730416-20734309 lnc-GPR183-47:8 Yes chr2L:20730416-20734309 lnc-GPR183-47:9 Yes chr2L:20730416-20734309 lnc-GPR183-47:1 Yes chr2L:20730416-20734309 lnc-GPR183-47:2 Yes chr2L:20730416-20734309 lnc-GPR183-47:3 Yes chr2L:20730416-20734309 lnc-GPR183-47:4 Yes chr2L:20730416-20734309 lnc-GPR183-47:23 Yes chr2L:20730416-20734309 lnc-GPR183-47:18 Yes chr2L:20730416-20734309 lnc-GPR183-47:10 Yes chr2L:20730416-20734309 lnc-GPR183-47:11 Yes chr2L:20730416-20734309 lnc-PCCA-6:1 Yes chr3R:15351225-15353926 lnc-PCCA-6:5 Yes chr3R:15351225-15353926 lnc-PCCA-6:2 Yes chr3R:15351225-15353926 lnc-PCCA-6:3 Yes chr3R:15351225-15353926 lnc-PCCA-6:4 Yes chr3R:15351225-15353926 lnc-METTL21C-3:2 No - lnc-METTL21C-3:3 No - lnc-METTL21C-3:4 No - lnc-METTL21C-3:5 No - lnc-METTL21C-3:6 No - lnc-METTL21C-4:1 No - lnc-METTL21C-4:2 No - lnc-EFNB2-8:2 No - lnc-EFNB2-8:3 No - lnc-EFNB2-8:4 No - lnc-EFNB2-8:5 No - lnc-EFNB2-8:1 No - LINC00460:9 No - LINC00460:8 No - LINC00460:10 No - LINC00460:11 No - LINC00460:12 No - LINC00460:13 No - lnc-MYO16-9:2 No - lnc-MYO16-9:3 No - lnc-MYO16-9:4 No - lnc-IRS2-1:4 No - lnc-IRS2-1:5 No - lnc-IRS2-1:6 No - lnc-IRS2-1:2 No - lnc-IRS2-1:3 No - lnc-COL4A2-10:1 No - lnc-RAB20-5:1 No - lnc-RAB20-4:2 No - lnc-NAXD-6:1 No - lnc-NAXD-6:2 No - lnc-NAXD-6:3 No - lnc-NAXD-6:4 No - lnc-NAXD-6:5 No - lnc-ING1-4:2 No - ARHGEF7-AS1:6 Yes chr2L:20350434-20365254 LINC00354:11 No - LINC00354:12 No - LINC00354:13 No - LINC00354:14 No - SOX1-OT:16 Yes chr2L:8825645-8829670 SOX1-OT:17 Yes chr2L:8825645-8829670 SOX1-OT:18 Yes chr2L:8825645-8829670 SOX1-OT:19 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-ATP11A-2:2 No - lnc-ATP11A-2:3 No - lnc-ATP11A-2:4 No - lnc-ATP11A-2:5 No - lnc-ATP11A-2:6 No - lnc-TUBGCP3-1:7 No - lnc-TUBGCP3-1:8 No - lnc-TUBGCP3-1:9 No - lnc-TUBGCP3-1:10 No - lnc-TUBGCP3-1:11 No - MCF2L-AS1:7 Yes chr2R:5468319-5495861 MCF2L-AS1:8 Yes chr2R:5468319-5495861 MCF2L-AS1:9 Yes chr2R:5468319-5495861 MCF2L-AS1:10 Yes chr2R:5468319-5495861 lnc-GRTP1-5:1 Yes chr2R:8102260-8106318 GAS6-DT:13 No - GAS6-DT:14 No - GAS6-DT:15 No - GAS6-DT:16 No - GAS6-DT:17 No - lnc-TMEM255B-5:25 No - lnc-TMEM255B-5:26 No - lnc-TMEM255B-5:27 No - lnc-TMEM255B-5:28 No - lnc-TMEM255B-5:31 No - lnc-TMEM255B-5:32 No - lnc-TMEM255B-5:33 No - lnc-TMEM255B-5:34 No - lnc-TMEM255B-5:35 No - lnc-TMEM255B-5:36 No - LINC00565:11 No - lnc-RASA3-5:1 No - lnc-RASA3-7:4 Yes chr3R:23281201-23284123 lnc-RASA3-7:2 Yes chr3R:23281201-23284123 lnc-RASA3-7:3 Yes chr3R:23281201-23284123 lnc-RASA3-7:1 Yes chr3R:23281201-23284123 lnc-RASA3-8:1 Yes chr3R:23281201-23284123 lnc-RASA3-8:2 No - lnc-CCNB1IP1-1:4 No - lnc-CCNB1IP1-1:5 No - lnc-APEX1-6:1 No - lnc-APEX1-6:2 No - lnc-RNASE4-2:1 No - lnc-RNASE4-1:1 No - lnc-OR6S1-5:1 No - lnc-OR6S1-5:2 No - lnc-OR6S1-5:3 No - lnc-RNASE1-2:1 No - lnc-RNASE1-2:5 No - lnc-RNASE1-2:6 No - lnc-RNASE1-2:2 No - lnc-RNASE1-2:4 No - lnc-NDRG2-7:1 No - lnc-NDRG2-7:2 No - lnc-NDRG2-1:2 Yes chr2L:9952072-9954181 lnc-RPGRIP1-5:1 No - lnc-RPGRIP1-1:2 No - lnc-RPGRIP1-1:3 Yes chr2L:210735-250823 lnc-TOX4-4:1 No - lnc-TOX4-4:2 No - lnc-DAD1-2:27 No - lnc-DAD1-2:16 No - lnc-DAD1-2:18 No - lnc-DAD1-2:19 No - lnc-DAD1-2:20 No - lnc-DAD1-2:21 No - lnc-DAD1-2:22 No - lnc-DAD1-2:25 No - lnc-DAD1-2:26 No - lnc-DAD1-2:23 No - lnc-DAD1-2:11 No - lnc-DAD1-2:17 No - lnc-DAD1-2:24 No - lnc-DAD1-2:12 No - lnc-DAD1-2:13 No - LINC02332:5 No - LINC02332:6 No - lnc-ABHD4-3:1 No - lnc-SLC7A7-1:10 Yes chr3L:10884261-10886471 lnc-SLC7A7-1:11 Yes chr3L:10884261-10886471 lnc-SLC7A7-1:12 Yes chr3L:10884261-10886471 lnc-SLC7A7-1:13 Yes chr3L:10884261-10886471 lnc-SLC7A7-1:6 Yes chr3L:10884261-10886471 lnc-SLC7A7-1:7 Yes chr3L:10884261-10886471 lnc-SLC7A7-1:8 Yes chr3L:10884261-10886471 lnc-SLC7A7-1:9 Yes chr3L:10884261-10886471 lnc-RBM23-3:2 No - lnc-RBM23-3:1 No - lnc-REM2-4:1 No - lnc-REM2-2:3 No - lnc-REM2-2:4 No - lnc-PSMB11-1:5 No - lnc-PSMB11-1:7 No - lnc-PSMB11-1:12 No - lnc-MYH7-1:1 No - lnc-MYH7-1:2 No - lnc-ZFHX2-2:1 Yes chr2L:5724656-5762420 ZFHX2-AS1:33 No - ZFHX2-AS1:34 No - ZFHX2-AS1:35 No - ZFHX2-AS1:37 No - ZFHX2-AS1:38 No - ZFHX2-AS1:39 Yes chr4:501810-540874 lnc-THTPA-2:32 No - DHRS4-AS1:17 Yes chr3L:5140440-5141646 DHRS4-AS1:22 Yes chr3L:5140440-5141646 DHRS4-AS1:24 Yes chr3L:5140440-5141646 DHRS4-AS1:20 Yes chr3L:5140440-5141646 DHRS4-AS1:21 Yes chr3L:5140440-5141646 DHRS4-AS1:15 Yes chr3L:5140440-5141646 DHRS4-AS1:18 Yes chr3L:5140440-5141646 DHRS4-AS1:23 Yes chr3L:5140440-5141646 DHRS4-AS1:19 Yes chr3L:5140440-5141646 DHRS4-AS1:16 Yes chr3L:5140440-5141646 lnc-DHRS4L2-2:5 No - lnc-TSSK4-3:2 No - lnc-NOP9-1:1 No - lnc-RIPK3-1:1 Yes chrX:13624745-13664568 lnc-KHNYN-2:2 No - lnc-KHNYN-2:3 No - lnc-KHNYN-2:4 No - lnc-KHNYN-2:5 No - lnc-KHNYN-2:6 No - lnc-KHNYN-2:7 No - LINC02306:15 No - LINC02306:9 No - LINC02306:10 No - LINC02306:11 No - LINC02306:12 No - LINC02306:13 No - lnc-FOXG1-17:3 No - FOXG1-AS1:6 Yes chr2L:3836840-3839185 FOXG1-AS1:7 Yes chr2L:3836840-3839185 FOXG1-AS1:10 Yes chr2L:3836840-3839185 FOXG1-AS1:12 Yes chr2L:3836840-3839185 FOXG1-AS1:13 Yes chr2L:3836840-3839185 FOXG1-AS1:14 Yes chr2L:3836840-3839185 FOXG1-AS1:8 Yes chr2L:3836840-3839185 FOXG1-AS1:11 Yes chr2L:3836840-3839185 FOXG1-AS1:9 Yes chr2L:3836840-3839185 FOXG1-AS1:5 Yes chr2L:3836840-3839185 LINC02327:30 No - LINC02327:31 No - LINC02327:32 No - LINC02327:33 No - LINC02327:34 No - LINC02327:35 No - LINC02327:36 No - LINC02327:37 No - LINC02327:38 No - LINC02327:39 No - lnc-G2E3-2:2 Yes chr3R:18303279-18314407 lnc-G2E3-2:3 Yes chr3R:18303279-18314407 lnc-G2E3-2:4 Yes chr3R:18303279-18314407 lnc-G2E3-2:5 Yes chr3R:18303279-18314407 lnc-G2E3-2:6 Yes chr3R:18303279-18314407 lnc-PRKD1-1:8 Yes chr3R:18303279-18314407 lnc-PRKD1-1:9 Yes chr3R:18303279-18314407 lnc-PRKD1-1:10 No - lnc-PRKD1-1:6 No - lnc-PRKD1-1:7 No - lnc-STRN3-18:1 Yes chr2L:2488197-2492671 lnc-NUBPL-1:5 No - lnc-NUBPL-1:6 No - lnc-NUBPL-1:7 No - lnc-NUBPL-1:8 No - ARHGAP5-AS1:6 Yes chrX:17639147-17652562 ARHGAP5-AS1:7 Yes chrX:17639147-17652562 ARHGAP5-AS1:8 Yes chrX:17639147-17652562 lnc-SNX6-2:2 No - lnc-SNX6-2:1 No - lnc-SNX6-2:3 No - lnc-BAZ1A-4:1 No - lnc-SRP54-1:3 Yes chr3R:31793981-31799799 lnc-SRP54-1:4 Yes chr3R:31793981-31799799 lnc-BAZ1A-4:7 Yes chr3L:5152678-5154777 lnc-BAZ1A-4:8 Yes chr3L:5152678-5154777 lnc-BAZ1A-4:9 Yes chr3L:5152678-5154777 lnc-BAZ1A-4:10 Yes chr3L:5152678-5154777 lnc-BAZ1A-4:11 Yes chr3L:5152678-5154777 lnc-BAZ1A-4:12 Yes chr3L:5152678-5154777 lnc-BAZ1A-4:4 Yes chr3L:5152678-5154777 lnc-BAZ1A-4:13 Yes chr3L:5152678-5154777 lnc-BAZ1A-4:2 Yes chr3L:5152678-5154777 lnc-BAZ1A-4:14 Yes chr3L:5152678-5154777 lnc-BAZ1A-4:15 Yes chr3L:5152678-5154777 lnc-PPP2R3C-5:2 No - lnc-NFKBIA-11:1 No - lnc-PSMA6-5:1 No - lnc-NFKBIA-1:4 No - lnc-NFKBIA-1:3 No - lnc-NFKBIA-1:2 No - lnc-PSMA6-6:1 No - lnc-PSMA6-7:1 No - lnc-RALGAPA1-1:2 Yes chrX:12907986-12909622 lnc-RALGAPA1-1:3 Yes chrX:12907986-12909622 LINC00609:11 Yes chrX:12907986-12909622 LINC00609:8 Yes chrX:12907986-12909622 LINC00609:9 Yes chrX:12907986-12909622 LINC00609:10 Yes chrX:12907986-12909622 LINC00609:13 Yes chrX:12907986-12909622 LINC00609:14 Yes chrX:12907986-12909622 LINC00609:15 Yes chrX:12907986-12909622 LINC00609:16 No - lnc-PAX9-11:2 No - lnc-PAX9-11:1 No - lnc-PAX9-11:3 No - LINC00517:3 No - LINC00517:4 No - LINC00517:5 No - lnc-SSTR1-1:4 No - lnc-SSTR1-1:5 No - lnc-SSTR1-1:3 No - LINC00639:8 No - LINC00639:9 No - LINC00639:12 No - LINC00639:10 No - LINC00639:11 No - LINC00639:13 No - LINC00639:14 No - LINC00639:15 No - SEC23A-AS1:10 Yes chr3R:5649065-5652629 SEC23A-AS1:11 Yes chr3R:5649065-5652629 SEC23A-AS1:13 Yes chr3R:5649065-5652629 SEC23A-AS1:14 Yes chr3R:5649065-5652629 SEC23A-AS1:15 Yes chr3R:5649065-5652629 SEC23A-AS1:16 Yes chr3R:5649065-5652629 lnc-TRAPPC6B-1:2 Yes chr3R:9740899-9742844 lnc-TRAPPC6B-1:3 Yes chr3R:9740899-9742844 lnc-TRAPPC6B-2:3 Yes chr2L:6649388-6654574 lnc-TRAPPC6B-2:4 Yes chr2L:6649388-6654574 lnc-CTAGE5-8:3 No - lnc-CTAGE5-8:4 No - lnc-CTAGE5-8:5 No - lnc-CTAGE5-8:6 No - lnc-CTAGE5-8:9 No - lnc-CTAGE5-8:10 No - lnc-CTAGE5-8:11 No - lnc-CTAGE5-8:12 No - lnc-CTAGE5-8:19 No - lnc-CTAGE5-8:20 No - lnc-CTAGE5-8:21 No - lnc-CTAGE5-8:22 No - lnc-LRFN5-6:2 No - lnc-LRFN5-6:4 No - lnc-LRFN5-6:5 No - lnc-LRFN5-6:3 No - lnc-LRFN5-6:6 No - lnc-FBXO33-2:3 No - lnc-FBXO33-2:7 No - lnc-FBXO33-2:4 No - lnc-FBXO33-2:9 No - lnc-FBXO33-2:8 No - lnc-FBXO33-2:10 No - lnc-FBXO33-2:5 No - lnc-FBXO33-2:6 No - lnc-FSCB-1:13 No - lnc-FSCB-1:14 No - lnc-FSCB-1:15 No - lnc-FSCB-1:16 No - lnc-FSCB-1:12 No - lnc-FANCM-13:1 Yes chr2R:19290109-19290962 lnc-FANCM-1:2 No - lnc-FANCM-1:3 No - lnc-FANCM-1:4 No - lnc-FANCM-1:5 No - lnc-MDGA2-2:3 No - lnc-MDGA2-2:4 No - lnc-MDGA2-2:5 No - lnc-LRR1-1:3 Yes chr3R:9778042-9779528 lnc-LRR1-1:4 Yes chr3R:9778042-9779528 lnc-KLHDC1-3:1 Yes chr3L:5895691-5897435 lnc-NEMF-2:2 No - lnc-NEMF-1:8 No - lnc-NEMF-1:6 No - lnc-NEMF-1:9 No - lnc-ARF6-5:3 No - lnc-ARF6-5:4 No - lnc-ARF6-5:5 No - lnc-ARF6-5:6 No - lnc-NEMF-1:7 No - lnc-ARF6-13:1 No - LINC01588:76 No - LINC01588:61 No - LINC01588:52 No - LINC01588:53 No - LINC01588:54 No - LINC01588:77 No - LINC01588:78 No - LINC01588:68 No - LINC01588:55 No - LINC01588:69 No - LINC01588:74 No - LINC01588:75 No - LINC01588:64 No - LINC01588:70 No - lnc-ARF6-14:1 No - LINC01588:63 No - LINC01588:65 No - LINC01588:56 No - LINC01588:62 No - lnc-ARF6-15:1 No - lnc-ARF6-16:1 No - lnc-ATP5S-1:2 Yes chr2L:5706374-5713791 lnc-ATP5S-1:3 Yes chr2L:5706374-5713791 lnc-ATP5S-1:4 No - lnc-ATL1-8:1 No - lnc-ATL1-8:2 No - lnc-ATL1-8:3 No - lnc-ABHD12B-4:2 Yes chr2L:2130813-2137296 lnc-ABHD12B-4:3 Yes chr2L:2130813-2137296 lnc-ABHD12B-4:4 Yes chr2L:2130813-2137296 lnc-ABHD12B-4:5 Yes chr2L:2130813-2137296 lnc-ABHD12B-4:6 Yes chr2L:2130813-2137296 LINC00519:2 No - lnc-TMX1-5:1 No - FRMD6-AS2:4 Yes chr2L:431227-448701 FRMD6-AS2:6 Yes chr2L:431227-448701 FRMD6-AS2:7 Yes chr2L:431227-448701 FRMD6-AS2:5 Yes chr2L:431227-448701 FRMD6-AS1:3 Yes chr2L:431227-448701 FRMD6-AS1:4 Yes chr2L:431227-448701 lnc-TXNDC16-4:1 No - lnc-ERO1A-2:1 No - lnc-STYX-13:1 Yes chr3L:17024328-17027117 lnc-STYX-13:2 Yes chr3L:17024328-17027117 lnc-STYX-4:5 No - lnc-STYX-4:6 No - lnc-STYX-5:5 No - lnc-STYX-5:6 No - lnc-STYX-5:7 No - lnc-STYX-5:8 No - lnc-STYX-5:9 No - lnc-STYX-5:10 No - lnc-STYX-5:11 No - lnc-STYX-5:12 No - lnc-STYX-5:13 No - lnc-STYX-5:14 No - lnc-STYX-5:15 No - lnc-STYX-5:16 No - lnc-STYX-5:17 No - lnc-STYX-14:1 No - LINC02331:10 No - LINC02331:11 No - lnc-GMFB-3:1 No - lnc-GMFB-3:2 No - lnc-GCH1-2:4 Yes chr3L:8990317-8997989 lnc-WDHD1-5:1 No - lnc-DLGAP5-3:7 No - lnc-DLGAP5-3:4 No - lnc-DLGAP5-3:5 No - lnc-DLGAP5-3:6 No - lnc-DLGAP5-3:2 No - lnc-DLGAP5-3:3 No - lnc-LGALS3-4:1 No - lnc-LGALS3-3:1 No - lnc-LGALS3-1:2 No - lnc-LGALS3-1:3 No - lnc-LGALS3-1:4 No - lnc-DLGAP5-4:7 No - lnc-DLGAP5-4:4 No - lnc-DLGAP5-4:5 No - lnc-DLGAP5-4:6 No - KTN1-AS1:13 No - KTN1-AS1:10 No - KTN1-AS1:14 No - KTN1-AS1:15 No - KTN1-AS1:16 No - KTN1-AS1:11 No - KTN1-AS1:17 No - KTN1-AS1:18 No - KTN1-AS1:9 No - KTN1-AS1:19 No - KTN1-AS1:12 No - LINC00520:14 No - LINC00520:15 No - LINC00520:16 No - LINC00520:17 No - LINC00520:18 No - LINC00520:19 No - LINC00520:13 No - LINC00520:20 No - LINC00520:21 No - PSMA3-AS1:26 No - PSMA3-AS1:41 No - PSMA3-AS1:27 No - PSMA3-AS1:28 No - PSMA3-AS1:30 No - PSMA3-AS1:40 No - PSMA3-AS1:31 No - PSMA3-AS1:32 No - PSMA3-AS1:33 No - PSMA3-AS1:34 No - PSMA3-AS1:42 No - PSMA3-AS1:35 No - PSMA3-AS1:36 No - PSMA3-AS1:37 No - PSMA3-AS1:38 No - PSMA3-AS1:39 No - PSMA3-AS1:29 No - lnc-GPR135-4:1 No - lnc-DHRS7-2:7 No - lnc-DHRS7-2:3 No - lnc-DHRS7-2:4 No - lnc-DHRS7-2:5 No - lnc-DHRS7-2:6 No - lnc-DHRS7-1:11 Yes chr3R:26344290-26345473 lnc-DHRS7-1:10 Yes chr3R:26344290-26345473 lnc-DHRS7-1:17 Yes chr3R:26344290-26345473 lnc-DHRS7-1:15 Yes chr3R:26344290-26345473 lnc-DHRS7-1:16 Yes chr3R:26344290-26345473 lnc-DHRS7-1:8 Yes chr3R:26344290-26345473 lnc-DHRS7-1:9 Yes chr3R:26344290-26345473 lnc-DHRS7-1:12 Yes chr3R:26344290-26345473 lnc-DHRS7-1:13 Yes chr3R:26344290-26345473 lnc-DHRS7-1:14 Yes chr3R:26344290-26345473 lnc-TMEM30B-1:14 Yes chr3R:29039156-29049148 lnc-TMEM30B-1:7 Yes chr3R:29039156-29049148 lnc-TMEM30B-1:9 Yes chr3R:29039156-29049148 lnc-TMEM30B-1:10 Yes chr3R:29039156-29049148 lnc-TMEM30B-1:11 Yes chr3R:29039156-29049148 lnc-TMEM30B-1:13 Yes chr3R:29039156-29049148 lnc-TMEM30B-1:12 Yes chr3R:29039156-29049148 lnc-TMEM30B-1:8 Yes chr3R:29039156-29049148 LINC01303:40 Yes chr2R:9252310-9285097 LINC01303:24 Yes chr2R:9252310-9285097 LINC01303:32 Yes chr2R:9252310-9285097 LINC01303:33 Yes chr2R:9252310-9285097 LINC01303:34 Yes chr2R:9252310-9285097 LINC01303:35 Yes chr2R:9252310-9285097 LINC01303:36 Yes chr2R:9252310-9285097 LINC01303:41 Yes chr2R:9252310-9285097 LINC01303:37 Yes chr2R:9252310-9285097 HIF1A-AS1:5 Yes chr3R:30058311-30121798 HIF1A-AS1:6 Yes chr3R:30058311-30121798 lnc-SNAPC1-4:1 Yes chr3R:30058311-30121798 lnc-TMEM30B-8:1 No - lnc-SYT16-67:7 No - lnc-SYT16-67:8 No - lnc-SYT16-67:9 No - lnc-SYT16-67:10 No - lnc-SYT16-67:11 No - lnc-RHOJ-1:2 No - lnc-SYNE2-3:4 No - lnc-SYNE2-3:6 No - lnc-SYNE2-3:7 No - lnc-SYNE2-3:8 No - lnc-SYNE2-3:5 No - lnc-MTHFD1-5:1 No - lnc-ESR2-3:11 No - lnc-ESR2-3:14 No - lnc-ESR2-3:10 Yes chr3R:10696534-10703316 lnc-ESR2-3:15 No - lnc-ESR2-3:6 Yes chr3R:10696534-10703316 lnc-ESR2-3:12 No - lnc-ESR2-3:13 No - lnc-ESR2-3:7 Yes chr3R:10696534-10703316 lnc-ESR2-3:8 Yes chr3R:10696534-10703316 lnc-ESR2-3:9 Yes chr3R:10696534-10703316 lnc-CHURC1-3:1 No - lnc-FNTB-6:1 No - lnc-FNTB-6:2 No - lnc-FNTB-6:3 No - lnc-FNTB-6:4 No - lnc-MAX-2:4 No - lnc-MAX-2:6 No - lnc-MAX-2:7 No - lnc-MAX-2:8 No - lnc-MAX-2:10 No - lnc-MAX-2:9 No - lnc-MAX-2:5 No - lnc-ATP6V1D-8:3 No - lnc-ATP6V1D-8:2 No - lnc-ATP6V1D-8:4 No - lnc-ATP6V1D-8:5 No - lnc-ATP6V1D-8:6 No - lnc-ATP6V1D-8:7 Yes chrX:255674-258469 lnc-ATP6V1D-4:2 No - lnc-ATP6V1D-4:3 Yes chrX:8178549-8240474 lnc-EIF2S1-1:1 No - lnc-ARG2-1:4 No - lnc-ARG2-1:5 No - lnc-ARG2-9:1 No - lnc-ARG2-9:2 No - lnc-ZFYVE26-6:1 No - lnc-ZFP36L1-9:2 No - lnc-ZFP36L1-9:3 No - lnc-ZFP36L1-9:4 No - lnc-ZFP36L1-9:5 No - lnc-ZFP36L1-9:6 No - lnc-ZFP36L1-2:5 No - lnc-ZFP36L1-2:6 No - lnc-ZFP36L1-2:7 No - lnc-ZFP36L1-2:9 No - lnc-ZFP36L1-2:10 No - lnc-ZFP36L1-2:8 No - lnc-ZFP36L1-2:3 No - lnc-ZFP36L1-2:4 No - lnc-ZFP36L1-10:1 No - lnc-RAD51B-4:1 No - lnc-RAD51B-6:1 Yes chrX:12659415-12682554 ACTN1-AS1:7 No - ACTN1-AS1:8 No - ACTN1-AS1:9 No - ACTN1-AS1:10 No - ACTN1-AS1:11 No - ACTN1-AS1:12 No - ACTN1-AS1:13 No - ACTN1-AS1:14 No - lnc-EXD2-9:1 Yes chr3R:31799634-31805278 lnc-EXD2-9:2 Yes chr3R:31799634-31805278 lnc-EXD2-10:1 No - lnc-EXD2-10:2 No - lnc-EXD2-10:3 No - lnc-DCAF5-1:5 No - lnc-DCAF5-1:6 No - lnc-DCAF5-1:7 No - lnc-DCAF5-2:4 No - lnc-DCAF5-2:5 Yes chr2L:3404460-3426719 lnc-SUSD6-2:1 No - lnc-SUSD6-2:2 No - lnc-SUSD6-2:3 No - lnc-CCDC177-6:1 No - lnc-CCDC177-6:2 No - lnc-CCDC177-6:3 No - lnc-CCDC177-6:4 No - lnc-CCDC177-6:5 No - lnc-SLC10A1-1:2 Yes chr3R:13661311-13666891 lnc-SMOC1-2:5 No - lnc-SMOC1-2:6 No - lnc-SMOC1-2:7 No - lnc-SMOC1-2:8 No - lnc-SMOC1-2:9 No - lnc-SMOC1-2:10 No - lnc-SMOC1-2:11 No - lnc-ADAM21-3:4 No - lnc-ADAM21-3:5 No - lnc-ADAM21-3:6 No - lnc-SYNJ2BP-1:5 No - lnc-SYNJ2BP-1:4 No - LINC01269:4 No - LINC01269:5 No - LINC01269:6 No - LINC01269:7 No - LINC01269:8 No - LINC01269:9 No - lnc-PCNX1-2:3 No - lnc-PCNX1-2:4 No - lnc-PCNX1-2:5 No - lnc-PCNX1-2:6 No - lnc-PCNX1-2:7 No - lnc-PCNX1-2:9 No - lnc-PCNX1-2:10 No - lnc-PCNX1-2:11 No - lnc-PCNX1-2:12 No - lnc-PCNX1-2:13 No - lnc-PCNX1-2:14 No - lnc-PCNX1-2:15 No - lnc-PCNX1-2:16 No - lnc-MAP3K9-10:2 Yes chrX:2225296-2238045 lnc-MAP3K9-10:3 No - lnc-MAP3K9-3:27 No - lnc-MAP3K9-3:28 No - lnc-MAP3K9-3:25 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-MAP3K9-3:19 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-MAP3K9-3:20 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-MAP3K9-3:21 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-MAP3K9-3:22 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-MAP3K9-3:23 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-MAP3K9-3:24 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-MAP3K9-3:29 No - lnc-MAP3K9-3:26 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-MAP3K9-3:30 No - lnc-MAP3K9-3:31 No - lnc-DPF3-5:1 Yes chrX:16838173-16844433 lnc-RGS6-4:1 Yes chr2R:5259004-5295965 lnc-DCAF4-7:1 No - lnc-DCAF4-7:2 No - lnc-ZFYVE1-1:6 No - lnc-ZFYVE1-1:4 Yes chrX:5666052-5670652 lnc-ZFYVE1-1:5 Yes chrX:5666052-5670652 lnc-NUMB-3:6 Yes chr3R:28520665-28540324 lnc-NUMB-3:4 Yes chr3R:28520665-28540324 lnc-NUMB-3:5 Yes chr3R:28520665-28540324 lnc-HEATR4-1:12 No - lnc-HEATR4-1:13 No - lnc-LTBP2-1:3 No - lnc-LTBP2-1:4 No - lnc-AREL1-2:2 Yes chrX:10071858-10082492 lnc-ZC2HC1C-1:1 No - lnc-ZC2HC1C-1:2 No - lnc-ZC2HC1C-1:3 No - lnc-ZC2HC1C-1:4 No - lnc-TMED10-4:1 No - lnc-TMED10-5:1 No - lnc-TMED10-5:2 No - LINC01220:7 No - LINC01220:10 No - LINC01220:8 No - LINC01220:9 No - LINC01220:11 No - lnc-ERG28-2:1 No - lnc-ERG28-2:2 No - lnc-ERG28-2:3 No - lnc-ERG28-2:4 No - lnc-ERG28-2:8 No - lnc-ERG28-2:9 No - lnc-ERG28-2:10 No - lnc-ANGEL1-5:2 Yes chr3L:8183361-8186671 lnc-ANGEL1-5:3 Yes chr3L:8183361-8186671 lnc-ANGEL1-3:2 No - lnc-IRF2BPL-6:1 No - LINC01629:8 No - LINC01629:6 No - LINC01629:9 No - LINC01629:10 No - LINC01629:7 No - LINC01629:11 No - lnc-LRRC74A-5:1 No - LINC02289:38 No - LINC02288:18 No - LINC02289:39 No - LINC02289:40 No - LINC02289:41 No - LINC02289:42 No - LINC02289:33 No - LINC02289:43 No - LINC02289:44 No - LINC02289:45 No - LINC02289:25 No - LINC02289:26 No - lnc-ZDHHC22-2:2 No - lnc-ZDHHC22-2:3 No - lnc-ZDHHC22-2:4 No - lnc-TSHR-1:3 No - lnc-TSHR-2:6 Yes chr3R:27251112-27256463 lnc-TSHR-9:1 Yes chr3R:27251112-27256463 lnc-TSHR-9:2 Yes chr3R:27251112-27256463 lnc-TSHR-9:3 Yes chr3R:27251112-27256463 lnc-TSHR-9:4 Yes chr3R:27251112-27256463 lnc-TSHR-9:5 Yes chr3R:27251112-27256463 LINC02301:17 No - LINC02301:18 No - LINC02301:19 No - LINC02301:20 No - LINC02301:21 No - LINC02301:22 No - lnc-SEL1L-4:2 No - lnc-SEL1L-4:3 No - lnc-SEL1L-4:4 No - lnc-GALC-9:7 No - lnc-GALC-9:8 No - lnc-GALC-9:9 No - lnc-GALC-9:3 No - lnc-GALC-9:5 No - lnc-GALC-9:10 No - lnc-GALC-9:11 No - lnc-GALC-9:2 No - lnc-GALC-9:6 No - lnc-GALC-9:4 No - lnc-GALC-8:4 No - lnc-GALC-8:6 No - lnc-GALC-16:1 No - lnc-GALC-8:5 No - lnc-GALC-8:7 No - LINC02328:36 No - LINC02328:37 No - LINC02328:38 No - LINC02328:39 No - LINC02328:40 No - LINC02328:44 No - LINC02328:45 No - LINC02328:46 No - LINC02328:47 No - LINC02328:48 No - LINC02328:49 No - LINC02328:50 No - LINC02328:51 No - LINC02328:52 No - LINC02328:53 No - LINC02328:54 No - lnc-GPR65-9:6 No - lnc-GPR65-9:7 No - lnc-GPR65-9:8 No - lnc-GPR65-9:9 No - lnc-GPR65-9:10 No - lnc-ZC3H14-1:2 Yes chr2L:6332881-6338671 lnc-PTPN21-3:1 Yes chr3R:24314660-24318419 lnc-PTPN21-3:2 Yes chr3R:24314660-24318419 lnc-EML5-4:1 Yes chr2L:422873-425321 lnc-EML5-4:2 Yes chr2L:422873-425321 lnc-TTC8-4:2 Yes chrX:7682338-7709385 lnc-TTC8-4:3 Yes chrX:7682338-7709385 lnc-TTC8-4:4 Yes chrX:7682338-7709385 lnc-FOXN3-1:1 No - FOXN3-AS1:2 Yes chrX:7682338-7709385 lnc-NRDE2-4:1 No - lnc-NRDE2-4:2 No - lnc-CALM1-7:3 No - lnc-CALM1-7:4 No - lnc-NRDE2-5:1 Yes chr2L:3784947-3785622 lnc-DGLUCY-4:1 Yes chr2R:6209782-6214122 lnc-DGLUCY-4:2 Yes chr2R:6209782-6214122 lnc-DGLUCY-4:3 Yes chr2R:6209782-6214122 lnc-DGLUCY-2:1 No - lnc-DGLUCY-8:1 No - lnc-CPSF2-5:3 No - lnc-LGMN-2:2 Yes chrX:23022898-23035550 lnc-LGMN-2:3 No - lnc-LGMN-2:4 No - lnc-LGMN-2:7 No - lnc-LGMN-2:5 No - lnc-LGMN-2:1 No - lnc-LGMN-2:6 No - FAM181A-AS1:8 No - FAM181A-AS1:9 No - FAM181A-AS1:10 No - lnc-CCDC197-2:1 No - lnc-CCDC197-2:2 No - lnc-CCDC197-2:3 No - lnc-SERPINA1-1:1 No - DICER1-AS1:17 Yes chr3R:22734007-22741091 DICER1-AS1:18 Yes chr3R:22734007-22741091 DICER1-AS1:19 Yes chr3R:22734007-22741091 DICER1-AS1:20 Yes chr3R:22734007-22741091 DICER1-AS1:21 Yes chr3R:22734007-22741091 SNHG10:15 Yes chrX:14837471-14838198 SNHG10:12 Yes chrX:14837471-14838198 SNHG10:13 Yes chrX:14837471-14838198 SNHG10:16 Yes chrX:14837471-14838198 SNHG10:14 Yes chrX:14837471-14838198 lnc-TUNAR-1:1 No - lnc-TUNAR-1:2 No - lnc-ATG2B-11:1 No - lnc-ATG2B-16:5 Yes chr2R:19663919-19669832 lnc-ATG2B-16:6 Yes chr2R:19663919-19669832 lnc-PAPOLA-1:10 No - lnc-PAPOLA-1:8 No - lnc-PAPOLA-1:11 No - lnc-PAPOLA-1:9 No - lnc-PAPOLA-1:12 No - lnc-PAPOLA-1:13 No - lnc-PAPOLA-1:14 No - LINC02325:24 No - LINC02325:25 No - LINC02325:26 No - LINC02325:27 No - LINC02325:28 No - LINC02325:29 No - lnc-VRK1-10:1 No - lnc-VRK1-10:2 No - lnc-VRK1-10:3 No - lnc-VRK1-10:4 No - lnc-VRK1-10:5 No - LINC01550:28 No - LINC01550:24 No - LINC01550:25 No - LINC01550:26 No - LINC01550:27 No - lnc-C14orf177-8:1 No - lnc-C14orf177-8:2 No - lnc-BCL11B-1:6 No - lnc-BCL11B-1:7 No - lnc-HHIPL1-1:3 No - lnc-HHIPL1-1:4 No - lnc-CCDC85C-5:1 No - lnc-CCDC85C-5:2 No - lnc-DEGS2-11:1 Yes chr2R:19141632-19163705 lnc-DEGS2-2:2 Yes chr3L:9452803-9456281 lnc-DEGS2-2:5 Yes chr3L:9452803-9456281 lnc-DEGS2-2:6 Yes chr3L:9452803-9456281 lnc-DEGS2-7:2 No - lnc-DEGS2-7:3 No - lnc-DEGS2-7:4 No - lnc-DEGS2-7:5 No - lnc-DEGS2-7:6 No - lnc-DEGS2-7:7 No - lnc-DEGS2-2:7 Yes chr3L:9452803-9456281 lnc-DEGS2-2:4 Yes chr3L:9452803-9456281 lnc-DEGS2-2:3 Yes chr3L:9452803-9456281 lnc-DLK1-35:33 No - lnc-DLK1-35:34 No - lnc-DLK1-35:35 No - lnc-DLK1-35:36 No - lnc-DLK1-35:37 No - lnc-DLK1-35:38 No - lnc-DLK1-35:39 No - lnc-DLK1-35:40 No - lnc-DLK1-35:41 No - lnc-DLK1-35:42 No - lnc-DLK1-35:43 No - lnc-DLK1-35:44 No - lnc-DLK1-35:45 No - lnc-DLK1-35:46 No - lnc-DLK1-35:47 No - lnc-DLK1-35:48 No - lnc-DLK1-35:49 No - lnc-DLK1-35:67 No - lnc-DLK1-35:68 No - lnc-DLK1-35:69 No - lnc-DLK1-35:70 No - lnc-DLK1-35:71 No - lnc-DLK1-35:73 No - lnc-DLK1-35:75 No - lnc-DLK1-35:77 No - lnc-DLK1-35:78 No - lnc-DLK1-35:79 No - lnc-DLK1-35:80 No - lnc-DLK1-35:82 No - lnc-DLK1-35:85 No - lnc-DLK1-35:88 No - lnc-DLK1-35:91 No - lnc-RTL1-1:3 No - lnc-DLK1-35:97 No - lnc-DLK1-35:104 No - lnc-DLK1-35:105 No - lnc-RTL1-3:9 No - lnc-RTL1-3:10 No - lnc-RTL1-3:11 No - lnc-RTL1-3:12 No - lnc-RTL1-3:13 No - lnc-RTL1-3:14 No - lnc-RTL1-3:7 No - lnc-RTL1-3:8 No - lnc-RTL1-4:4 No - lnc-RTL1-4:5 No - LINC02285:6 No - LINC02285:7 No - LINC00524:4 No - lnc-RTL1-8:5 No - lnc-RTL1-8:6 No - lnc-RTL1-8:7 No - lnc-RTL1-8:3 No - lnc-RTL1-8:4 No - DIO3OS:22 No - DIO3OS:27 No - DIO3OS:28 No - DIO3OS:23 No - DIO3OS:24 No - DIO3OS:29 No - DIO3OS:30 No - DIO3OS:31 No - DIO3OS:25 No - DIO3OS:26 No - LINC02320:19 No - LINC02320:20 No - LINC02320:14 No - LINC02320:15 No - LINC02320:23 No - LINC02320:21 No - LINC02320:16 No - LINC02320:17 No - LINC02320:18 No - LINC02320:22 No - lnc-HSP90AA1-17:1 No - lnc-HSP90AA1-17:2 No - lnc-HSP90AA1-17:3 No - lnc-HSP90AA1-15:4 Yes chr3R:18167757-18180049 lnc-HSP90AA1-15:5 Yes chr3R:18167757-18180049 lnc-HSP90AA1-15:2 Yes chr3R:18167757-18180049 lnc-HSP90AA1-15:3 Yes chr3R:18167757-18180049 lnc-HSP90AA1-16:1 No - lnc-DYNC1H1-1:5 No - lnc-DYNC1H1-1:6 No - lnc-DYNC1H1-1:7 No - lnc-DYNC1H1-1:8 Yes chr3L:4807368-4825687 lnc-DYNC1H1-6:1 Yes chr3L:3192969-3197059 lnc-DYNC1H1-6:2 Yes chr3L:3192969-3197059 lnc-ANKRD9-6:1 No - lnc-TECPR2-1:1 No - lnc-TECPR2-1:2 No - lnc-TECPR2-1:3 No - LINC02323:12 No - LINC02323:13 No - LINC02323:14 No - LINC02323:15 No - LINC02323:16 No - lnc-ANKRD9-4:2 No - lnc-ANKRD9-4:3 No - lnc-ANKRD9-4:4 No - lnc-ANKRD9-4:5 No - lnc-RCOR1-4:1 Yes chrX:16415046-16417585 lnc-EXOC3L4-1:2 No - LINC00677:5 No - LINC00677:3 No - LINC00677:6 No - LINC00677:4 No - LINC00677:8 No - LINC00677:9 No - LINC00677:7 No - lnc-CDC42BPB-4:5 Yes chr2R:18625249-18627718 lnc-CDC42BPB-4:6 Yes chr2R:18625249-18627718 lnc-CDC42BPB-4:7 Yes chr2R:18625249-18627718 lnc-CDC42BPB-4:8 Yes chr2R:18625249-18627718 lnc-CDC42BPB-5:6 No - lnc-CDC42BPB-5:7 No - lnc-CDC42BPB-5:8 No - lnc-CDC42BPB-5:9 No - lnc-CDC42BPB-5:10 No - lnc-CKB-2:2 Yes chrX:15987008-15991974 lnc-BAG5-2:1 Yes chr3L:12746616-12750056 LINC00637:2 No - LINC00637:3 No - LINC00637:4 No - lnc-RD3L-1:2 No - lnc-RD3L-1:3 No - lnc-RD3L-1:4 No - lnc-KIF26A-5:4 No - lnc-KIF26A-5:5 No - lnc-KIF26A-5:6 No - lnc-KIF26A-5:7 No - lnc-KIF26A-5:8 No - lnc-KIF26A-5:9 No - lnc-KIF26A-5:10 No - lnc-KIF26A-5:11 No - LINC02280:11 No - LINC02280:18 No - LINC02280:12 No - LINC02280:13 No - lnc-INF2-1:4 No - lnc-SIVA1-1:2 No - lnc-SIVA1-1:3 No - lnc-AKT1-1:15 No - lnc-AKT1-1:16 No - lnc-AKT1-1:17 No - lnc-AKT1-1:18 No - lnc-AKT1-1:19 No - lnc-NUDT14-3:2 Yes chr3R:17374833-17391337 lnc-NUDT14-3:1 Yes chr3R:17374833-17391337 lnc-BRF1-3:1 No - lnc-BRF1-9:1 No - lnc-TMEM121-8:1 No - lnc-BRF1-79:1 No - lnc-BRF1-79:2 No - LINC00221:7 No - LINC00221:8 No - lnc-POTEB3-13:1 No - lnc-POTEB3-13:2 No - lnc-POTEB3-13:3 No - lnc-POTEB3-13:4 No - lnc-POTEB3-13:5 No - lnc-POTEB3-1:3 No - lnc-POTEB3-1:4 No - lnc-POTEB3-1:5 No - lnc-MAGEL2-1:2 Yes chr3L:18721893-18723272 lnc-MKRN3-2:2 No - lnc-MKRN3-2:3 No - lnc-MKRN3-2:4 No - lnc-MKRN3-2:5 No - lnc-MKRN3-2:6 No - lnc-SNRPN-1:10 No - lnc-SNRPN-1:11 No - lnc-SNRPN-1:14 No - lnc-SNRPN-14:4 No - lnc-SNRPN-14:5 No - lnc-SNRPN-14:6 No - lnc-GOLGA8J-3:5 No - lnc-GOLGA8J-3:4 No - lnc-GOLGA8J-3:6 No - lnc-GOLGA8J-3:7 No - lnc-GOLGA8J-3:8 No - lnc-GOLGA8J-5:2 No - lnc-MTMR10-3:2 No - lnc-MTMR10-3:1 No - lnc-FAN1-7:1 No - lnc-TRPM1-1:22 No - lnc-TRPM1-1:23 No - lnc-TRPM1-1:17 No - lnc-TRPM1-1:18 No - lnc-TRPM1-1:24 No - lnc-TRPM1-1:25 No - lnc-TRPM1-1:26 No - lnc-TRPM1-1:19 No - lnc-TRPM1-1:27 No - lnc-TRPM1-1:20 No - lnc-TRPM1-1:21 No - lnc-OTUD7A-3:1 No - lnc-CHRNA7-4:1 No - lnc-CHRNA7-4:2 No - lnc-CHRNA7-4:3 No - lnc-CHRNA7-4:4 No - lnc-CHRNA7-4:5 No - lnc-GOLGA8O-1:1 No - lnc-GOLGA8O-5:1 No - lnc-GOLGA8O-5:2 No - lnc-GOLGA8O-5:3 No - lnc-GOLGA8O-5:4 No - lnc-GOLGA8O-5:5 No - lnc-GOLGA8O-5:6 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-ARHGAP11A-1:2 No - lnc-FMN1-10:1 No - lnc-GREM1-2:1 Yes chr2L:3872646-3902860 lnc-GREM1-2:2 Yes chr2L:3872646-3902860 lnc-GREM1-2:3 Yes chr2L:3872646-3902860 lnc-NUTM1-6:1 No - lnc-NUTM1-6:2 No - lnc-NUTM1-6:3 No - lnc-NUTM1-6:4 No - lnc-NUTM1-7:1 No - lnc-NUTM1-5:2 No - lnc-NUTM1-5:3 Yes chrX:5900861-5905399 lnc-NUTM1-5:4 Yes chrX:5900861-5905399 lnc-NUTM1-5:5 Yes chrX:5900861-5905399 lnc-NUTM1-5:6 Yes chrX:5900861-5905399 lnc-NUTM1-11:1 No - lnc-NUTM1-11:2 No - lnc-NUTM1-11:3 No - lnc-NUTM1-11:4 No - lnc-NUTM1-11:5 No - lnc-NANOGP8-3:5 No - lnc-NANOGP8-3:6 No - lnc-NANOGP8-3:7 No - DPH6-DT:19 No - DPH6-DT:20 No - DPH6-DT:21 No - lnc-MEIS2-1:7 No - lnc-MEIS2-1:5 No - lnc-MEIS2-1:8 No - lnc-MEIS2-1:6 No - lnc-C15orf41-18:4 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-C15orf41-18:5 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-C15orf41-18:6 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-C15orf41-18:7 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-C15orf41-18:8 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-C15orf41-18:10 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-C15orf41-18:11 Yes chr3R:10507561-10639568 lnc-C15orf41-18:12 No - LINC02345:25 No - LINC02345:26 No - LINC02345:27 No - LINC02345:28 No - LINC01852:15 No - LINC01852:16 No - LINC01852:17 No - lnc-TMCO5A-7:1 No - lnc-RASGRP1-3:6 No - lnc-RASGRP1-3:5 Yes chr2R:14759646-14769423 lnc-RASGRP1-3:7 No - lnc-FSIP1-4:36 No - lnc-FSIP1-4:23 No - lnc-FSIP1-4:19 No - lnc-FSIP1-4:35 No - lnc-FSIP1-4:37 No - lnc-FSIP1-4:38 No - lnc-FSIP1-4:39 No - lnc-FSIP1-4:34 No - lnc-FSIP1-4:24 No - lnc-FSIP1-4:21 No - lnc-FSIP1-4:42 No - lnc-FSIP1-4:29 No - lnc-FSIP1-4:30 No - lnc-FSIP1-4:40 No - lnc-FSIP1-4:31 No - lnc-FSIP1-4:22 No - lnc-FSIP1-4:41 No - lnc-FSIP1-4:17 No - lnc-FSIP1-4:27 No - lnc-FSIP1-4:25 No - lnc-FSIP1-4:26 No - lnc-FSIP1-4:28 No - lnc-C15orf53-8:1 No - lnc-FSIP1-4:20 No - lnc-C15orf53-9:1 No - lnc-C15orf53-9:2 No - lnc-C15orf53-9:3 No - lnc-FSIP1-4:18 No - lnc-THBS1-5:1 No - lnc-THBS1-4:1 No - lnc-EIF2AK4-4:3 No - lnc-EIF2AK4-4:4 No - lnc-EIF2AK4-4:5 No - lnc-EIF2AK4-1:7 No - lnc-EIF2AK4-1:8 No - lnc-EIF2AK4-1:9 No - lnc-EIF2AK4-1:10 No - lnc-EIF2AK4-1:11 No - SRP14-AS1:26 No - SRP14-AS1:29 No - SRP14-AS1:30 No - SRP14-AS1:31 No - SRP14-AS1:32 No - SRP14-AS1:27 No - SRP14-AS1:28 No - lnc-BUB1B-9:1 No - lnc-BUB1B-9:2 No - lnc-INAFM2-4:1 No - RAD51-AS1:11 Yes chr3R:30054696-30056037 RAD51-AS1:9 Yes chr3R:30054696-30056037 RAD51-AS1:12 Yes chr3R:30054696-30056037 RAD51-AS1:8 Yes chr3R:30054696-30056037 RAD51-AS1:10 Yes chr3R:30054696-30056037 SPINT1-AS1:21 No - SPINT1-AS1:22 No - SPINT1-AS1:28 No - SPINT1-AS1:23 No - SPINT1-AS1:24 No - SPINT1-AS1:25 No - SPINT1-AS1:26 No - lnc-CHP1-6:1 Yes chr3R:19368995-19403153 lnc-OIP5-3:1 No - OIP5-AS1:26 No - OIP5-AS1:27 No - OIP5-AS1:28 No - OIP5-AS1:29 No - OIP5-AS1:30 No - OIP5-AS1:31 No - OIP5-AS1:32 No - OIP5-AS1:33 No - OIP5-AS1:34 No - OIP5-AS1:35 No - OIP5-AS1:36 No - lnc-NDUFAF1-1:1 Yes chr2L:22102626-22104401 lnc-RPAP1-1:5 No - lnc-JMJD7-PLA2G4B-2:15 No - lnc-JMJD7-PLA2G4B-2:20 No - lnc-JMJD7-PLA2G4B-2:21 No - lnc-JMJD7-PLA2G4B-2:22 No - lnc-JMJD7-PLA2G4B-2:23 No - lnc-JMJD7-PLA2G4B-2:24 No - lnc-JMJD7-PLA2G4B-11:1 No - lnc-JMJD7-PLA2G4B-11:2 No - lnc-JMJD7-PLA2G4B-11:3 No - lnc-JMJD7-PLA2G4B-11:4 No - lnc-GANC-1:3 No - lnc-GANC-1:4 No - lnc-TMEM62-2:1 No - lnc-TMEM62-2:2 No - lnc-EPB42-1:3 No - lnc-EPB42-1:4 No - lnc-EPB42-1:5 No - lnc-FRMD5-3:4 No - lnc-FRMD5-3:2 No - lnc-FRMD5-3:3 No - lnc-FRMD5-3:5 No - EIF3J-DT:39 No - EIF3J-DT:40 No - EIF3J-DT:32 No - EIF3J-DT:33 No - EIF3J-DT:34 No - EIF3J-DT:35 No - EIF3J-DT:36 No - EIF3J-DT:41 No - EIF3J-DT:37 No - EIF3J-DT:42 No - lnc-PATL2-9:1 No - lnc-PATL2-9:2 No - lnc-PATL2-8:2 No - lnc-PATL2-8:4 No - lnc-PATL2-8:5 No - lnc-PATL2-8:3 No - lnc-DUOX1-2:1 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-SHF-3:7 Yes chr2R:9082395-9085717 lnc-SHF-3:8 Yes chr2R:9082395-9085717 lnc-SHF-3:9 Yes chr2R:9082395-9085717 lnc-SHF-3:10 Yes chr2R:9082395-9085717 lnc-SHF-3:11 Yes chr2R:9082395-9085717 lnc-SHF-3:12 Yes chr2R:9082395-9085717 lnc-SHF-3:6 Yes chr2R:9082395-9085717 lnc-C15orf48-4:2 No - lnc-C15orf48-4:3 No - lnc-C15orf48-4:4 No - lnc-SLC30A4-5:2 No - lnc-SLC30A4-5:3 No - lnc-SLC30A4-5:4 No - lnc-SLC30A4-5:5 No - lnc-SLC30A4-5:1 No - lnc-C15orf48-1:18 No - lnc-SLC30A4-4:3 No - lnc-SLC30A4-4:2 No - lnc-SLC30A4-6:1 No - lnc-SQOR-1:1 No - lnc-SQOR-1:2 No - lnc-SQOR-1:4 No - lnc-SQOR-1:5 No - lnc-SQOR-1:6 No - lnc-SQOR-1:7 No - lnc-SQOR-1:8 No - lnc-SQOR-1:9 No - lnc-FBN1-3:7 No - lnc-FBN1-3:8 No - lnc-FBN1-3:9 Yes chr2L:11011312-11012135 lnc-FBN1-3:5 Yes chr2L:11011312-11012135 lnc-FBN1-3:10 Yes chr2L:11011312-11012135 lnc-FBN1-3:6 Yes chr2L:11011312-11012135 lnc-EID1-4:2 No - lnc-EID1-4:3 No - lnc-EID1-4:4 No - lnc-EID1-4:5 No - GABPB1-AS1:17 Yes chr3L:324985-327992 GABPB1-AS1:18 Yes chr3L:324985-327992 GABPB1-AS1:19 Yes chr3L:324985-327992 GABPB1-AS1:20 Yes chr3L:324985-327992 GABPB1-AS1:21 Yes chr3L:324985-327992 GABPB1-AS1:22 Yes chr3L:324985-327992 GABPB1-AS1:23 Yes chr3L:324985-327992 GABPB1-AS1:24 Yes chr3L:324985-327992 GABPB1-AS1:25 Yes chr3L:324985-327992 GABPB1-AS1:26 Yes chr3L:324985-327992 GABPB1-AS1:28 No - GABPB1-AS1:27 No - GABPB1-AS1:29 No - GABPB1-AS1:30 No - GABPB1-AS1:31 No - GABPB1-AS1:32 No - GABPB1-AS1:33 No - lnc-GABPB1-3:1 No - lnc-USP8-6:1 No - lnc-SPPL2A-1:2 No - lnc-SPPL2A-1:9 No - lnc-SPPL2A-1:4 No - lnc-SPPL2A-1:5 No - lnc-SPPL2A-1:6 No - lnc-SPPL2A-1:7 No - lnc-SPPL2A-1:8 No - lnc-AP4E1-6:1 Yes chr2R:23698949-23702406 lnc-AP4E1-6:5 Yes chr2R:23698949-23702406 lnc-AP4E1-6:2 Yes chr2R:23698949-23702406 lnc-AP4E1-6:3 Yes chr2R:23698949-23702406 lnc-SCG3-4:1 No - lnc-SCG3-1:2 Yes chr3R:30532607-30578905 MAPK6-DT:7 No - MAPK6-DT:8 No - lnc-BCL2L10-2:2 No - lnc-BCL2L10-2:3 No - lnc-BCL2L10-2:4 No - lnc-MAPK6-10:5 Yes chr2R:11619479-11640941 lnc-ONECUT1-1:8 No - lnc-ONECUT1-1:9 No - lnc-ONECUT1-1:10 No - lnc-PIGBOS1-1:2 No - lnc-PIGBOS1-1:3 No - lnc-PIGBOS1-1:4 No - lnc-DNAAF4-2:3 No - lnc-DNAAF4-2:4 No - lnc-DNAAF4-2:5 No - lnc-TEX9-6:1 No - lnc-TEX9-6:2 No - lnc-TEX9-6:3 Yes chr3R:6449944-6456676 lnc-TEX9-6:4 Yes chr3R:6449944-6456676 lnc-TEX9-6:5 Yes chr3R:6449944-6456676 lnc-TEX9-6:6 No - lnc-TEX9-6:7 Yes chr3R:6449944-6456676 lnc-TEX9-6:8 Yes chr3R:6449944-6456676 lnc-TEX9-6:9 Yes chr3R:6449944-6456676 lnc-TEX9-6:10 Yes chr3R:6449944-6456676 lnc-ALDH1A2-10:1 Yes chrX:17911462-17924163 lnc-ALDH1A2-10:2 Yes chrX:17911462-17924163 lnc-MINDY2-6:1 No - lnc-MINDY2-7:1 Yes chr3R:11744229-11750029 lnc-MINDY2-7:2 Yes chr3R:11744229-11750029 lnc-GCNT3-1:5 Yes chr3L:4037523-4040482 lnc-GCNT3-1:6 No - lnc-ANXA2-1:3 No - lnc-ANXA2-1:4 No - lnc-ANXA2-1:5 No - RORA-AS1:15 No - RORA-AS1:17 Yes chr2R:10203995-10237348 RORA-AS1:16 Yes chr2R:10203995-10237348 RORA-AS1:18 Yes chr2R:10203995-10237348 RORA-AS1:19 Yes chr2R:10203995-10237348 RORA-AS1:20 Yes chr2R:10203995-10237348 RORA-AS1:21 Yes chr2R:10203995-10237348 RORA-AS1:22 Yes chr2R:10203995-10237348 RORA-AS1:23 Yes chr2R:10203995-10237348 lnc-VPS13C-1:4 No - lnc-C2CD4A-1:4 No - lnc-C2CD4A-1:5 No - lnc-C2CD4A-17:1 No - lnc-C2CD4B-11:2 No - lnc-C2CD4B-11:3 No - lnc-C2CD4B-11:4 No - lnc-C2CD4B-11:5 No - lnc-RPS27L-9:1 Yes chr3L:8545001-8574409 lnc-RPS27L-9:2 Yes chr3L:8545001-8574409 lnc-RPS27L-9:3 Yes chr3L:8545001-8574409 lnc-RPS27L-9:4 Yes chr3L:8545001-8574409 lnc-RPS27L-9:5 No - lnc-RPS27L-8:1 No - TPM1-AS:7 Yes chr3R:15310193-15315197 TPM1-AS:8 Yes chr3R:15310193-15315197 lnc-CA12-3:1 No - lnc-USP3-4:1 No - lnc-DAPK2-3:2 Yes chr3R:21887029-21907182 lnc-ANKDD1A-1:1 No - lnc-KBTBD13-4:1 No - lnc-KBTBD13-5:1 No - lnc-KBTBD13-5:3 No - lnc-KBTBD13-5:2 No - lnc-KBTBD13-5:4 No - lnc-KBTBD13-5:5 No - lnc-SLC24A1-6:1 Yes chr3R:21111408-21116146 lnc-MEGF11-1:2 No - lnc-MEGF11-1:3 No - lnc-MEGF11-1:4 No - lnc-MEGF11-1:5 No - lnc-SMAD6-4:1 No - lnc-SMAD6-4:2 No - lnc-SMAD6-4:3 No - lnc-SMAD6-4:4 No - lnc-LCTL-2:1 No - lnc-LCTL-2:2 No - lnc-LCTL-2:3 No - lnc-SMAD6-2:8 No - lnc-SMAD6-2:4 No - lnc-SMAD6-2:5 No - lnc-SMAD6-2:6 No - lnc-SMAD6-2:7 No - lnc-AAGAB-1:31 No - lnc-AAGAB-1:24 Yes chrX:8137041-8142279 IQCH-AS1:16 No - IQCH-AS1:18 No - IQCH-AS1:19 No - IQCH-AS1:20 No - IQCH-AS1:21 No - IQCH-AS1:23 No - IQCH-AS1:15 No - IQCH-AS1:17 Yes chr3R:21877870-21878686 IQCH-AS1:22 No - lnc-AAGAB-3:3 No - lnc-AAGAB-3:4 No - lnc-AAGAB-3:5 No - lnc-SKOR1-5:1 No - lnc-SKOR1-5:2 No - lnc-FEM1B-4:1 Yes chr2R:9116122-9122000 lnc-CLN6-1:9 Yes chr2R:20662474-20667306 lnc-CLN6-1:5 Yes chr2R:20662474-20667306 lnc-CLN6-1:6 Yes chr2R:20662474-20667306 lnc-CLN6-1:4 Yes chr2R:20662474-20667306 lnc-CLN6-1:7 Yes chr2R:20662474-20667306 lnc-CLN6-1:10 No - lnc-CLN6-1:8 Yes chr2R:20662474-20667306 EWSAT1:14 No - EWSAT1:15 No - EWSAT1:16 No - EWSAT1:17 No - EWSAT1:18 No - EWSAT1:19 No - EWSAT1:20 No - EWSAT1:21 No - EWSAT1:22 No - EWSAT1:23 No - EWSAT1:24 No - lnc-ANP32A-2:12 No - lnc-ANP32A-2:13 No - lnc-ANP32A-2:14 No - lnc-ANP32A-2:11 No - lnc-ANP32A-3:4 No - lnc-ANP32A-3:5 No - lnc-ANP32A-3:10 No - lnc-ANP32A-3:6 No - lnc-ANP32A-3:9 No - lnc-ANP32A-3:7 No - lnc-ANP32A-3:11 No - lnc-ANP32A-3:12 No - lnc-ANP32A-3:8 No - lnc-TLE3-6:12 No - lnc-TLE3-6:8 Yes chr2L:419952-420864 lnc-TLE3-6:4 Yes chr2L:419952-420864 lnc-TLE3-6:5 Yes chr2L:419952-420864 lnc-TLE3-6:6 No - lnc-TLE3-6:7 No - lnc-RPLP1-12:1 No - lnc-RPLP1-12:2 No - lnc-RPLP1-12:3 No - lnc-RPLP1-12:4 No - lnc-RPLP1-12:5 No - lnc-RPLP1-12:18 No - lnc-RPLP1-6:1 No - lnc-TLE3-16:1 No - lnc-TLE3-15:2 No - lnc-TLE3-15:3 No - lnc-TLE3-15:1 No - lnc-RPLP1-7:1 No - lnc-RPLP1-7:2 No - lnc-RPLP1-8:1 Yes chr3R:26041736-26049911 lnc-LRRC49-18:1 No - LINC02204:21 No - LINC02204:16 No - LINC02204:22 No - LINC02204:23 No - LINC02204:17 No - LINC02204:18 No - lnc-LRRC49-17:1 No - LINC02204:19 No - LINC02204:20 No - lnc-LRRC49-16:1 No - lnc-SENP8-1:2 No - lnc-SENP8-1:3 No - lnc-SENP8-1:4 No - lnc-CELF6-1:7 No - lnc-CELF6-1:8 No - HEXA-AS1:2 Yes chr2R:12487451-12507333 TMEM202-AS1:31 No - TMEM202-AS1:32 No - TMEM202-AS1:24 Yes chrX:18130392-18137784 TMEM202-AS1:25 Yes chrX:18130392-18137784 TMEM202-AS1:33 No - TMEM202-AS1:27 Yes chrX:18130392-18137784 TMEM202-AS1:34 No - TMEM202-AS1:35 No - TMEM202-AS1:26 Yes chrX:18130392-18137784 ADPGK-AS1:10 Yes chr3L:14031450-14034909 ADPGK-AS1:11 Yes chr3L:14031450-14034909 lnc-ADPGK-4:1 Yes chr2R:12529053-12564184 lnc-CD276-3:1 Yes chr2L:8083420-8116531 INSYN1-AS1:21 No - INSYN1-AS1:22 No - INSYN1-AS1:23 No - INSYN1-AS1:24 No - LOXL1-AS1:37 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:38 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:24 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:25 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:39 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:45 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:31 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:23 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:32 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:46 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:43 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:33 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:27 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:26 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:47 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:40 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:34 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:28 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:35 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:29 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:30 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:41 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:48 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:36 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:42 Yes chr2R:21789623-21791580 LOXL1-AS1:44 Yes chr2R:21789623-21791580 lnc-PML-3:3 No - lnc-PML-3:4 No - lnc-CYP11A1-1:2 No - lnc-CCDC33-6:1 No - lnc-CCDC33-6:2 No - UBL7-AS1:16 No - UBL7-AS1:18 No - UBL7-AS1:19 No - UBL7-AS1:17 No - UBL7-AS1:20 No - UBL7-AS1:21 No - lnc-EDC3-2:17 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-EDC3-2:13 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-EDC3-2:14 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-EDC3-2:9 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-EDC3-2:10 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-EDC3-2:11 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-EDC3-2:12 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-EDC3-2:16 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-EDC3-2:18 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-EDC3-2:5 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-EDC3-2:6 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-EDC3-2:7 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-EDC3-2:15 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-EDC3-2:3 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-EDC3-2:4 Yes chr3R:28888073-28922772 lnc-CYP1A1-3:1 No - lnc-RPP25-4:1 Yes chrX:15446179-15449883 lnc-RPP25-4:2 Yes chrX:15446179-15449883 lnc-RPP25-5:1 Yes chr2R:21691295-21692764 lnc-MAN2C1-6:4 No - lnc-MAN2C1-6:5 No - lnc-NEIL1-5:2 No - lnc-SNX33-7:1 Yes chr3L:2652088-2655455 lnc-CSPG4-1:12 Yes chr3R:23695221-23696245 lnc-CSPG4-1:13 Yes chr3R:23695221-23696245 lnc-CSPG4-1:14 Yes chr3R:23695221-23696245 lnc-CSPG4-1:11 Yes chr3R:23695221-23696245 lnc-CSPG4-1:8 Yes chr3R:23695221-23696245 lnc-CSPG4-1:9 Yes chr3R:23695221-23696245 lnc-CSPG4-1:10 Yes chr3R:23695221-23696245 lnc-CSPG4-1:15 Yes chr3R:23695221-23696245 lnc-ODF3L1-2:2 No - lnc-ODF3L1-2:5 No - lnc-ODF3L1-2:6 No - lnc-ODF3L1-2:7 No - lnc-ODF3L1-2:11 No - lnc-SCAPER-8:1 No - lnc-SH2D7-10:1 No - lnc-CRABP1-1:1 No - lnc-CRABP1-1:2 No - lnc-WDR61-2:1 Yes chr3R:10408618-10412869 lnc-CHRNA3-7:1 Yes chr2L:18677221-18683715 lnc-CHRNA3-7:2 No - lnc-CHRNA3-6:1 Yes chr2R:20994900-20996118 lnc-CTSH-5:1 Yes chr3R:15276440-15278109 lnc-BCL2A1-2:1 No - lnc-BCL2A1-3:1 No - lnc-BCL2A1-3:2 No - lnc-ZFAND6-4:1 No - lnc-ZFAND6-4:2 No - lnc-BCL2A1-4:1 No - lnc-BCL2A1-4:2 No - LINC00927:55 No - LINC00927:56 No - LINC00927:57 No - lnc-CTXND1-7:1 Yes chr3R:9016773-9020022 lnc-CTXND1-7:2 Yes chr3R:9016773-9020022 lnc-CTXND1-7:3 Yes chr3R:9016773-9020022 lnc-CTXND1-7:4 Yes chr3R:9016773-9020022 lnc-CTXND1-7:5 Yes chr3R:9016773-9020022 lnc-TLNRD1-3:1 No - lnc-TLNRD1-3:2 No - lnc-STARD5-2:1 Yes chr2R:22855688-22858794 lnc-IL16-11:2 Yes chr3L:9597764-9614001 SNHG21:20 No - SNHG21:21 No - SNHG21:22 No - SNHG21:23 No - SNHG21:24 No - SNHG21:25 No - SNHG21:26 No - SNHG21:27 No - SNHG21:28 No - SNHG21:29 No - lnc-FAM103A1-2:3 No - lnc-FAM103A1-2:4 No - lnc-WDR73-10:3 No - lnc-ZNF592-6:1 Yes chr3R:6657882-6659442 lnc-ZNF592-6:2 Yes chr3R:6657882-6659442 lnc-SEC11A-8:1 No - lnc-NTRK3-7:2 No - lnc-NTRK3-7:1 No - lnc-NTRK3-2:10 No - lnc-NTRK3-2:3 No - lnc-NTRK3-2:5 No - lnc-NTRK3-2:4 No - lnc-NTRK3-2:6 No - lnc-NTRK3-2:7 No - lnc-NTRK3-2:8 No - LINC00052:9 No - lnc-MFGE8-2:2 No - lnc-ABHD2-1:8 No - lnc-ABHD2-1:9 No - lnc-ABHD2-1:10 No - lnc-ABHD2-1:7 No - lnc-ABHD2-1:11 No - lnc-ABHD2-1:12 No - lnc-ABHD2-1:13 No - lnc-ABHD2-1:14 No - lnc-ABHD2-1:15 No - lnc-ABHD2-1:16 No - lnc-RLBP1-1:5 Yes chr2L:3163645-3169462 lnc-RLBP1-1:6 Yes chr2L:3163645-3169462 lnc-FANCI-1:10 No - lnc-FANCI-1:11 No - lnc-FANCI-1:12 No - lnc-FANCI-1:13 No - lnc-FANCI-1:14 No - lnc-KIF7-4:1 No - lnc-ANPEP-2:3 No - lnc-ANPEP-2:1 No - lnc-ANPEP-2:2 No - IDH2-DT:12 No - IDH2-DT:13 No - IDH2-DT:14 No - IDH2-DT:15 No - IDH2-DT:16 No - IDH2-DT:17 No - lnc-NGRN-1:1 No - lnc-CIB1-5:2 No - CRTC3-AS1:7 No - LINC01585:6 No - LINC01585:7 No - CRTC3-AS1:8 No - CRTC3-AS1:9 No - CRTC3-AS1:10 No - CRTC3-AS1:11 No - CRTC3-AS1:12 No - lnc-BLM-6:2 No - lnc-BLM-6:3 No - lnc-BLM-6:4 No - lnc-BLM-6:5 No - lnc-BLM-6:6 No - lnc-BLM-6:9 No - lnc-BLM-6:11 No - lnc-BLM-6:10 No - lnc-PRC1-1:2 No - lnc-PRC1-1:3 No - lnc-RCCD1-4:2 No - lnc-RCCD1-4:4 No - VPS33B-DT:23 No - VPS33B-DT:24 No - VPS33B-DT:25 No - VPS33B-DT:26 No - VPS33B-DT:27 No - lnc-SV2B-1:5 No - lnc-SV2B-1:6 No - lnc-SV2B-1:7 No - lnc-VPS33B-8:1 No - lnc-VPS33B-8:2 No - lnc-RGMA-1:4 No - lnc-FAM174B-9:1 No - lnc-FAM174B-10:1 No - lnc-CHD2-2:6 No - lnc-CHD2-2:7 No - lnc-CHD2-2:8 No - lnc-CHD2-2:9 No - lnc-CHD2-2:10 No - lnc-CHD2-4:16 No - lnc-CHD2-4:14 No - lnc-CHD2-4:15 No - lnc-CHD2-24:1 No - lnc-CHD2-24:2 No - lnc-CHD2-24:3 No - lnc-CHD2-4:18 No - lnc-CHD2-4:19 No - lnc-CHD2-4:20 No - lnc-CHD2-4:23 No - lnc-CHD2-4:21 No - lnc-CHD2-4:22 No - lnc-CHD2-4:24 No - LINC01579:14 No - LINC01579:16 No - LINC01579:17 No - LINC01579:18 No - LINC01579:19 No - LINC01579:20 No - LINC01579:15 No - LINC01579:11 No - LINC01579:12 No - LINC01579:13 No - lnc-RGMA-28:1 No - lnc-RGMA-28:2 No - LINC01197:24 No - LINC01197:30 No - LINC01197:25 No - LINC01197:31 No - LINC01197:26 No - LINC01197:32 No - LINC01197:33 No - LINC01197:27 No - LINC01197:28 No - LINC01197:29 No - lnc-RGMA-19:1 No - lnc-RGMA-19:2 No - lnc-RGMA-19:3 No - lnc-RGMA-19:4 No - lnc-RGMA-19:5 No - NR2F2-AS1:29 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F2-AS1:52 No - NR2F2-AS1:45 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F2-AS1:53 No - NR2F2-AS1:54 No - NR2F2-AS1:51 No - NR2F2-AS1:55 No - NR2F2-AS1:46 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F2-AS1:27 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F2-AS1:30 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F2-AS1:32 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F2-AS1:31 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F2-AS1:39 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F2-AS1:40 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F2-AS1:36 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F2-AS1:28 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F2-AS1:33 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F2-AS1:48 No - NR2F2-AS1:37 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F2-AS1:34 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F2-AS1:47 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F2-AS1:43 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F2-AS1:44 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F2-AS1:38 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F2-AS1:41 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F2-AS1:42 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F2-AS1:35 Yes chr3R:12258737-12302785 lnc-NR2F2-2:7 No - lnc-NR2F2-2:8 No - lnc-PGPEP1L-17:1 No - IRAIN:9 No - lnc-TTC23-2:4 No - lnc-TTC23-3:3 No - lnc-TTC23-3:4 No - lnc-TTC23-3:5 No - lnc-TTC23-3:6 No - lnc-TTC23-3:2 No - lnc-TTC23-6:1 No - lnc-LRRC28-8:1 No - SPATA41:12 No - SPATA41:15 No - SPATA41:13 No - SPATA41:11 No - SPATA41:16 No - SPATA41:18 No - SPATA41:10 No - SPATA41:14 No - SPATA41:17 No - SPATA41:9 No - CERS3-AS1:5 No - CERS3-AS1:4 No - CERS3-AS1:6 No - CERS3-AS1:7 No - lnc-ALDH1A3-2:4 No - lnc-ALDH1A3-2:5 No - lnc-ALDH1A3-2:6 No - lnc-ALDH1A3-2:7 No - lnc-ALDH1A3-2:8 No - lnc-ALDH1A3-2:9 No - lnc-CHSY1-5:12 No - lnc-CHSY1-5:13 No - lnc-CHSY1-5:8 No - lnc-CHSY1-5:9 No - lnc-CHSY1-5:10 No - lnc-CHSY1-5:11 No - lnc-CHSY1-5:14 No - lnc-LRRK1-5:1 No - lnc-LRRK1-3:8 No - lnc-LRRK1-3:9 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-LRRK1-3:10 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-TM2D3-2:2 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-TM2D3-2:3 Yes chr3R:25347431-25473058 lnc-OR4F6-6:1 No - lnc-OR4F15-5:1 No - lnc-OR4F15-5:2 No - lnc-OR4F15-5:3 No - lnc-OR4F15-5:4 No - lnc-OR4F15-5:5 No - lnc-HBZ-2:1 Yes chr3L:13999380-14001880 lnc-TMEM8A-1:3 No - lnc-TMEM8A-1:4 No - lnc-TMEM8A-6:1 No - lnc-METTL26-7:1 Yes chrX:16359143-16361275 lnc-METTL26-7:2 No - lnc-METTL26-7:3 No - lnc-METTL26-1:2 No - lnc-METTL26-1:3 No - lnc-METTL26-1:4 No - lnc-MSLN-2:1 Yes chr2R:4130974-4133484 lnc-MSLN-2:2 Yes chr2R:4130974-4133484 lnc-MSLN-2:3 Yes chr2R:4130974-4133484 lnc-GNG13-6:1 No - lnc-GNG13-6:2 No - lnc-GNG13-6:3 No - lnc-SOX8-2:1 No - lnc-SOX8-2:2 No - lnc-SOX8-2:3 No - lnc-LMF1-3:16 No - lnc-LMF1-3:17 No - lnc-LMF1-3:13 No - lnc-LMF1-3:14 No - lnc-LMF1-3:18 No - lnc-LMF1-3:19 No - lnc-LMF1-3:20 No - lnc-LMF1-3:21 No - lnc-LMF1-3:15 No - SSTR5-AS1:10 No - SSTR5-AS1:8 No - SSTR5-AS1:9 No - lnc-TSR3-2:3 No - lnc-TSR3-1:2 Yes chr2L:540599-542580 lnc-NME3-2:3 Yes chr3L:7916650-7936120 SNHG9:7 No - SNHG9:8 No - SNHG9:9 No - SNHG9:10 No - lnc-ZNF598-3:1 Yes chr2R:13841761-13846255 SNHG19:3 Yes chr3L:21318774-21335027 SNHG19:5 Yes chr3L:21318774-21335027 SNHG19:4 No - lnc-DNASE1L2-2:4 Yes chrX:22872812-22875367 lnc-DNASE1L2-2:5 No - lnc-DNASE1L2-2:6 No - lnc-DNASE1L2-2:7 No - lnc-DNASE1L2-2:8 No - lnc-DNASE1L2-2:9 No - lnc-DNASE1L2-2:10 No - lnc-CEMP1-4:3 No - lnc-CEMP1-4:2 No - lnc-PRSS27-4:11 No - lnc-PRSS27-4:12 No - lnc-PRSS27-4:1 No - lnc-PRSS27-4:2 No - lnc-PRSS27-4:13 No - lnc-PRSS27-4:3 No - lnc-PRSS27-4:14 No - lnc-PRSS27-4:15 No - lnc-PRSS27-4:4 No - lnc-PRSS27-4:16 No - lnc-PRSS27-2:20 No - SRRM2-AS1:22 No - SRRM2-AS1:20 Yes chr3L:1654247-1665064 SRRM2-AS1:23 No - SRRM2-AS1:24 No - SRRM2-AS1:12 Yes chr3L:1654247-1665064 SRRM2-AS1:13 Yes chr3L:1654247-1665064 SRRM2-AS1:14 Yes chr3L:1654247-1665064 SRRM2-AS1:15 Yes chr3L:1654247-1665064 SRRM2-AS1:16 Yes chr3L:1654247-1665064 SRRM2-AS1:21 Yes chr3L:1654247-1665064 SRRM2-AS1:17 Yes chr3L:1654247-1665064 SRRM2-AS1:18 Yes chr3L:1654247-1665064 SRRM2-AS1:19 Yes chr3L:1654247-1665064 lnc-PRSS22-1:5 No - lnc-PRSS22-1:6 No - lnc-PRSS22-1:7 No - lnc-PRSS22-1:4 No - lnc-PRSS22-5:1 No - lnc-PRSS22-5:2 No - lnc-PRSS22-5:3 No - lnc-CLDN9-1:5 No - lnc-ZSCAN10-1:5 No - lnc-ZSCAN10-1:6 No - lnc-ZSCAN10-1:7 No - lnc-ZSCAN10-1:8 No - lnc-ZSCAN10-1:4 No - lnc-ZSCAN10-3:43 No - lnc-ZSCAN10-6:1 No - lnc-ZNF205-1:3 No - lnc-ZNF205-1:2 No - lnc-ZNF205-1:4 No - lnc-ZSCAN10-3:46 No - lnc-ZSCAN10-3:47 No - lnc-ZSCAN10-3:48 No - lnc-ZSCAN10-3:44 No - lnc-ZSCAN10-3:32 No - lnc-ZSCAN10-3:45 No - lnc-ZSCAN10-3:39 No - lnc-ZSCAN10-3:42 No - lnc-ZSCAN10-3:33 No - lnc-ZSCAN10-3:34 No - lnc-ZSCAN10-3:40 No - lnc-ZSCAN10-3:41 No - lnc-ZSCAN10-3:35 No - lnc-ZSCAN10-3:36 No - lnc-ZSCAN10-3:30 No - lnc-ZSCAN10-3:31 No - lnc-ZSCAN10-3:37 No - lnc-ZSCAN10-3:38 No - lnc-ZSCAN10-7:1 No - lnc-ZSCAN10-7:2 No - lnc-ZSCAN10-7:3 No - lnc-ZSCAN10-4:3 No - lnc-ZNF213-3:1 No - lnc-ZSCAN10-4:2 No - lnc-OR1F1-3:1 No - lnc-ZNF263-5:1 No - lnc-ZNF263-4:1 No - lnc-DNASE1-7:1 Yes chrX:15510877-15554278 lnc-DNASE1-8:1 Yes chrX:15510877-15554278 lnc-SRL-1:3 No - lnc-SRL-1:4 No - lnc-SRL-1:5 No - LINC01569:21 No - LINC01569:24 No - LINC01569:25 No - LINC01569:22 No - LINC01569:26 No - LINC01569:23 No - lnc-TFAP4-3:6 No - lnc-TFAP4-3:7 No - lnc-TFAP4-3:3 No - lnc-TFAP4-3:4 No - lnc-TFAP4-3:5 No - lnc-PAM16-8:1 Yes chr2R:12924567-12930644 GLIS2-AS1:5 Yes chr2R:12924567-12930644 GLIS2-AS1:6 Yes chr2R:12924567-12930644 GLIS2-AS1:4 Yes chr2R:12924567-12930644 lnc-NMRAL1-5:1 Yes chr2R:23502946-23503815 lnc-SMIM22-3:2 No - lnc-NAGPA-2:1 No - lnc-NAGPA-2:2 No - lnc-C16orf89-3:1 Yes chr3R:17809401-17811134 LINC01570:7 Yes chr3L:10481412-10594012 LINC01570:8 Yes chr3L:10481412-10594012 LINC01570:9 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-EEF2KMT-11:1 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-EEF2KMT-11:2 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-EEF2KMT-11:3 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-EEF2KMT-11:4 Yes chr3L:10481412-10594012 lnc-PMM2-4:2 Yes chrX:12022837-12029032 lnc-USP7-4:1 No - lnc-USP7-4:2 No - lnc-USP7-4:3 No - lnc-C16orf72-1:3 No - lnc-C16orf72-1:4 No - LINC02177:15 No - LINC02177:16 No - LINC02177:17 No - LINC02177:19 No - LINC02177:20 No - LINC02177:21 No - LINC02177:22 No - LINC02177:23 No - lnc-EMP2-4:1 Yes chrX:21605884-21608920 lnc-CLEC16A-8:1 No - lnc-CLEC16A-8:2 No - lnc-PRM1-1:3 No - lnc-PRM1-1:4 No - lnc-PRM1-1:8 No - lnc-PRM1-1:5 No - lnc-PRM1-1:6 No - lnc-PRM1-1:7 No - lnc-SNN-7:1 No - lnc-TXNDC11-4:1 No - lnc-SNN-1:3 No - lnc-SNN-1:4 No - lnc-SNN-1:5 No - lnc-SNN-6:3 No - lnc-SNN-6:4 No - lnc-SNN-6:5 No - BCAR4:13 No - BCAR4:14 No - BCAR4:15 No - BCAR4:16 No - BCAR4:17 No - BCAR4:12 No - BCAR4:11 No - lnc-TNFRSF17-2:3 No - lnc-TNFRSF17-2:4 No - lnc-TNFRSF17-2:5 Yes chr2L:12434452-12441279 lnc-SHISA9-1:5 No - LINC02185:18 No - LINC02185:19 No - LINC02185:20 No - LINC02185:21 No - LINC02185:22 No - LINC02185:23 No - LINC02185:24 No - lnc-PARN-16:1 No - MIR193BHG:14 No - MIR193BHG:15 No - MIR193BHG:16 No - MIR193BHG:17 No - MIR193BHG:18 No - MIR193BHG:19 No - MIR193BHG:20 No - MIR193BHG:21 No - MIR193BHG:22 No - MIR193BHG:23 No - MIR193BHG:24 No - MIR193BHG:27 No - MIR193BHG:28 No - MIR193BHG:29 No - MIR193BHG:30 No - MIR193BHG:31 No - lnc-NPIPA8-7:3 No - lnc-NPIPA8-7:4 No - lnc-NPIPA8-7:5 No - lnc-TMC7-2:2 No - lnc-TMC7-2:3 Yes chrX:6824496-6838122 lnc-SMG1-5:1 No - lnc-SMG1-5:2 No - lnc-SMG1-5:3 No - lnc-SMG1-5:4 No - lnc-SMG1-5:5 No - lnc-SMG1-5:6 Yes chrX:6771225-6773039 lnc-ITPRIPL2-2:1 No - lnc-ITPRIPL2-2:2 No - lnc-ITPRIPL2-2:3 No - lnc-ITPRIPL2-2:4 No - lnc-ITPRIPL2-2:5 No - lnc-GDE1-3:7 No - lnc-GDE1-3:8 No - lnc-GDE1-3:6 No - lnc-GDE1-1:4 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-GDE1-1:5 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-GDE1-1:6 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-KNOP1-1:3 No - lnc-KNOP1-1:4 No - lnc-KNOP1-1:5 No - lnc-ANKS4B-5:4 Yes chrX:16881347-16882790 lnc-ANKS4B-5:5 Yes chrX:16881347-16882790 lnc-ANKS4B-5:6 Yes chrX:16881347-16882790 lnc-ANKS4B-5:7 Yes chrX:16881347-16882790 lnc-ANKS4B-5:8 Yes chrX:16881347-16882790 lnc-ANKS4B-5:9 Yes chrX:16881347-16882790 lnc-ANKS4B-5:10 Yes chrX:16881347-16882790 lnc-OTOA-4:1 No - lnc-PDZD9-3:3 Yes chr3L:16584124-16586111 lnc-PDZD9-6:2 Yes chr3L:19978713-19979812 lnc-PDZD9-6:3 Yes chr3L:19978713-19979812 lnc-CDR2-8:1 No - lnc-CDR2-8:3 No - lnc-CDR2-8:2 No - lnc-CDR2-7:1 No - lnc-CDR2-7:2 No - lnc-RBBP6-4:4 Yes chr4:649041-663103 lnc-RBBP6-4:5 Yes chr4:649041-663103 lnc-RBBP6-4:6 Yes chr4:649041-663103 lnc-RBBP6-4:7 Yes chr4:649041-663103 LCMT1-AS1:9 No - LINC02175:14 No - LINC02175:15 No - LINC02175:16 No - LINC02175:17 No - LINC02175:18 No - LCMT1-AS1:17 No - LCMT1-AS1:10 No - LCMT1-AS1:18 No - LCMT1-AS1:12 No - LCMT1-AS1:6 No - LCMT1-AS1:11 No - LCMT1-AS1:15 No - LCMT1-AS1:7 No - LCMT1-AS1:16 No - LCMT1-AS1:8 No - LCMT1-AS2:5 Yes chr2L:15764220-15766267 LCMT1-AS2:4 Yes chr2L:15764220-15766267 ZKSCAN2-DT:11 No - ZKSCAN2-DT:12 No - ZKSCAN2-DT:13 No - ZKSCAN2-DT:15 No - ZKSCAN2-DT:16 No - ZKSCAN2-DT:17 No - lnc-KDM8-1:3 No - lnc-NSMCE1-12:1 Yes chr3L:839980-841360 lnc-IL4R-4:1 No - lnc-IL4R-4:2 No - lnc-GSG1L-1:11 No - lnc-GSG1L-1:12 No - lnc-GSG1L-1:8 No - lnc-GSG1L-1:13 No - lnc-GSG1L-1:9 No - lnc-GSG1L-1:10 No - lnc-NPIPB6-1:1 Yes chr2R:16566023-16570120 lnc-NPIPB6-1:2 No - lnc-NPIPB6-1:3 No - lnc-NUPR1-2:2 Yes chr2R:21292239-21293646 lnc-TUFM-3:5 No - lnc-TUFM-3:4 Yes chr3R:15408423-15417277 lnc-TUFM-3:6 No - lnc-TUFM-2:2 Yes chr3R:25888542-25893270 ATP2A1-AS1:12 No - ATP2A1-AS1:8 Yes chr2R:23925077-23935884 ATP2A1-AS1:9 Yes chr2R:23925077-23935884 ATP2A1-AS1:10 Yes chr2R:23925077-23935884 ATP2A1-AS1:11 Yes chr2R:23925077-23935884 lnc-SLX1B-3:15 No - lnc-SLX1B-3:16 No - lnc-SLX1B-3:17 No - lnc-SLX1B-3:18 No - lnc-NPIPB11-2:1 No - lnc-NPIPB11-2:4 No - lnc-NPIPB11-2:2 No - lnc-NPIPB11-2:3 No - lnc-SLX1B-3:20 No - lnc-SLX1B-3:21 No - lnc-SLX1B-3:22 No - lnc-SLX1B-3:23 No - lnc-SLX1B-3:24 No - lnc-PAGR1-2:2 No - lnc-PAGR1-2:3 No - lnc-PAGR1-2:4 No - lnc-PAGR1-2:6 No - lnc-PAGR1-2:7 No - lnc-PAGR1-2:8 No - lnc-PAGR1-2:9 No - lnc-C16orf54-2:1 No - lnc-CDIPT-4:2 No - lnc-MVP-3:1 Yes chrX:15701451-15703770 lnc-MVP-3:2 Yes chrX:15701451-15703770 lnc-MVP-3:3 Yes chrX:15701451-15703770 lnc-MVP-3:4 Yes chrX:15701451-15703770 lnc-MVP-3:5 Yes chrX:15701451-15703770 lnc-MVP-3:6 Yes chrX:15701451-15703770 lnc-MVP-3:9 Yes chrX:15701451-15703770 lnc-MVP-3:10 Yes chrX:15701451-15703770 lnc-MVP-3:11 Yes chrX:15701451-15703770 lnc-MVP-3:12 Yes chrX:15701451-15703770 lnc-MVP-3:17 No - lnc-MVP-3:18 No - lnc-MVP-3:19 No - lnc-MVP-3:20 No - lnc-ASPHD1-1:3 Yes chr2R:5339706-5340995 lnc-ASPHD1-1:5 Yes chr2R:5339706-5340995 lnc-ASPHD1-1:6 Yes chr2R:5339706-5340995 lnc-ASPHD1-1:7 Yes chr2R:5339706-5340995 lnc-ASPHD1-1:4 Yes chr2R:5339706-5340995 lnc-HIRIP3-2:1 No - lnc-PPP4C-2:4 Yes chrX:10205292-10212374 lnc-PPP4C-10:2 Yes chrX:10205292-10212374 lnc-PPP4C-10:3 Yes chrX:10205292-10212374 lnc-BOLA2B-1:8 No - lnc-BOLA2B-1:5 No - lnc-BOLA2B-1:4 No - lnc-BOLA2B-1:6 No - lnc-BOLA2B-1:7 No - lnc-MYLPF-3:3 No - lnc-MYLPF-3:4 No - lnc-MYLPF-3:5 Yes chr2L:10435995-10437316 lnc-MYLPF-3:6 Yes chr2L:10435995-10437316 lnc-MYLPF-1:5 No - lnc-MYLPF-1:6 Yes chr3R:11581576-11585305 lnc-MYLPF-1:7 Yes chr3R:11581576-11585305 lnc-MYLPF-1:10 No - lnc-MYLPF-1:11 No - lnc-ITGAL-2:4 No - lnc-ITGAL-2:5 No - lnc-ITGAL-2:6 No - lnc-ITGAL-2:7 No - lnc-ITGAL-2:8 No - lnc-ITGAL-2:9 No - lnc-PRR14-1:11 No - lnc-PRR14-1:12 No - lnc-PRR14-1:13 No - lnc-ZNF689-3:1 No - lnc-ZNF689-3:2 No - lnc-ZNF689-3:3 No - lnc-PRR14-7:2 No - lnc-CCDC189-1:8 Yes chr2R:21323430-21341847 lnc-CCDC189-1:9 Yes chr2R:21323430-21341847 lnc-CCDC189-1:2 Yes chr2R:21323430-21341847 lnc-CCDC189-1:10 Yes chr2R:21323430-21341847 lnc-CCDC189-1:3 Yes chr2R:21323430-21341847 lnc-CCDC189-1:4 Yes chr2R:21323430-21341847 lnc-RNF40-4:1 No - lnc-RNF40-5:1 No - FBXL19-AS1:3 Yes chr3R:9052495-9063245 FBXL19-AS1:4 Yes chr3R:9052495-9063245 lnc-PYCARD-1:2 Yes chrX:16288810-16293520 lnc-PYCARD-2:1 Yes chrX:16288810-16293520 lnc-ITGAX-4:1 Yes chr2R:15248784-15262873 lnc-ITGAX-5:1 Yes chr2R:15248784-15262873 lnc-ZNF843-2:6 No - lnc-ZNF843-2:8 No - lnc-ZNF843-2:7 No - lnc-AHSP-5:4 Yes chr2L:18695664-18698571 lnc-AHSP-5:5 Yes chr2L:18695664-18698571 lnc-AHSP-5:6 Yes chr2L:18695664-18698571 lnc-AHSP-5:7 Yes chr2L:18695664-18698571 lnc-AHSP-5:8 Yes chr2L:18695664-18698571 LINC00273:11 No - LINC00273:9 No - LINC00273:12 No - LINC00273:13 No - LINC00273:8 No - LINC00273:6 No - LINC00273:3 No - LINC00273:4 No - LINC00273:10 No - LINC00273:7 No - LINC00273:5 No - lnc-TP53TG3-64:1 No - lnc-TP53TG3-64:2 No - lnc-C16orf87-2:2 No - lnc-C16orf87-2:1 No - lnc-GPT2-1:6 Yes chr2L:13163209-13166072 lnc-GPT2-1:7 Yes chr2L:13163209-13166072 lnc-GPT2-1:8 Yes chr2L:13163209-13166072 lnc-GPT2-1:9 Yes chr2L:13163209-13166072 lnc-GPT2-13:2 Yes chr3L:15560726-15563065 lnc-LONP2-14:1 Yes chrX:2708684-2711668 lnc-LONP2-9:2 Yes chr3R:20033881-20036056 lnc-LONP2-9:3 Yes chr3R:20033881-20036056 lnc-LONP2-9:4 Yes chr3R:20033881-20036056 lnc-LONP2-6:7 No - lnc-LONP2-6:8 No - lnc-LONP2-6:6 No - lnc-LONP2-6:9 No - lnc-LONP2-6:10 No - lnc-C16orf78-5:6 No - lnc-C16orf78-5:7 No - lnc-C16orf78-5:5 No - lnc-ZNF423-3:4 Yes chr3R:6368965-6371115 lnc-ZNF423-3:2 Yes chr3R:6368965-6371115 lnc-ZNF423-3:5 Yes chr3R:6368965-6371115 lnc-ZNF423-3:3 Yes chr3R:6368965-6371115 lnc-ADCY7-1:2 No - lnc-SNX20-8:5 Yes chr3L:19003741-19045449 lnc-SNX20-8:4 Yes chr3L:19003741-19045449 lnc-SNX20-1:6 No - lnc-SNX20-1:5 Yes chr2L:10295859-10299847 lnc-CYLD-2:8 No - lnc-CYLD-2:9 No - lnc-CYLD-2:10 No - lnc-CYLD-2:11 No - lnc-CYLD-2:12 No - lnc-SALL1-12:1 Yes chr3R:26872129-26875742 LINC01571:14 No - LINC01571:11 No - LINC01571:12 No - LINC01571:13 No - lnc-CHD9-4:12 Yes chr3L:1600726-1602674 lnc-CHD9-4:10 Yes chr3L:1600726-1602674 lnc-CHD9-4:11 Yes chr3L:1600726-1602674 lnc-CHD9-4:13 Yes chr3L:1600726-1602674 lnc-CHD9-4:14 Yes chr3L:1600726-1602674 lnc-RBL2-1:7 No - lnc-RBL2-1:9 No - lnc-RBL2-1:10 No - lnc-RBL2-1:11 No - lnc-RBL2-1:8 No - lnc-AKTIP-9:1 Yes chrX:797090-801479 lnc-IRX3-80:40 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX3-80:11 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX3-80:2 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX3-80:3 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX3-80:4 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX3-80:5 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX3-80:12 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX3-80:22 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX3-80:23 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX3-80:24 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX3-80:41 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX3-80:42 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX3-80:25 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX3-80:26 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX3-80:27 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX3-80:28 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX3-80:13 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX3-80:14 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX3-80:6 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-CES5A-3:10 No - lnc-CES5A-3:11 No - lnc-CES5A-3:12 No - lnc-CES5A-3:13 No - lnc-CES5A-3:14 No - lnc-CES5A-3:15 No - lnc-CES5A-3:16 No - lnc-BBS2-2:1 No - lnc-MT1G-8:1 No - lnc-MT1G-2:5 No - lnc-MT1G-2:7 No - lnc-MT1G-2:8 No - lnc-MT1G-2:6 No - lnc-FAM192A-5:1 No - lnc-FAM192A-5:2 No - lnc-FAM192A-4:4 No - lnc-FAM192A-4:5 No - lnc-FAM192A-4:1 No - lnc-FAM192A-4:2 No - lnc-FAM192A-4:3 No - lnc-PLLP-5:1 No - lnc-KIFC3-1:2 Yes chr3L:23784231-23787405 lnc-KIFC3-2:1 Yes chrX:16267007-16276180 lnc-KIFC3-2:2 No - lnc-TEPP-2:1 Yes chr2R:21692691-21697152 lnc-TEPP-2:2 Yes chr2R:21692691-21697152 lnc-PRSS54-2:2 Yes chrX:10383353-10385861 lnc-PRSS54-2:3 Yes chrX:10383353-10385861 lnc-SETD6-21:1 No - lnc-SETD6-21:2 No - lnc-CDH8-10:4 No - lnc-CDH8-10:5 No - lnc-CDH8-10:6 No - lnc-CDH8-10:8 No - lnc-CDH8-10:9 No - lnc-CDH8-10:10 No - lnc-CDH8-10:7 No - lnc-CDH8-10:11 No - lnc-CDH5-4:5 No - lnc-CDH5-4:6 No - lnc-CDH11-2:8 No - lnc-TK2-3:7 No - lnc-TK2-3:3 No - lnc-TK2-3:4 No - lnc-TK2-3:5 No - lnc-TK2-3:6 No - LINC00920:5 No - LINC00920:8 No - LINC00920:6 No - LINC00920:7 No - LINC00920:9 No - lnc-TK2-2:5 No - lnc-FAM96B-4:1 No - lnc-ATP6V0D1-1:2 Yes chr2R:12064565-12079543 lnc-RIPOR1-1:3 No - lnc-RIPOR1-1:4 No - lnc-RIPOR1-1:5 No - lnc-RIPOR1-1:6 No - lnc-RIPOR1-1:7 No - lnc-RIPOR1-1:8 No - lnc-RIPOR1-1:9 No - lnc-AGRP-1:15 No - lnc-AGRP-1:24 No - lnc-AGRP-1:28 No - lnc-AGRP-1:23 No - lnc-AGRP-1:9 No - lnc-AGRP-1:25 No - lnc-AGRP-1:26 No - lnc-AGRP-1:27 No - lnc-AGRP-1:10 No - lnc-AGRP-1:8 No - lnc-AGRP-1:13 No - lnc-AGRP-1:21 No - lnc-AGRP-1:11 Yes chr3L:7353578-7356713 lnc-AGRP-1:14 No - lnc-C16orf86-2:1 No - lnc-CTRL-3:1 No - lnc-CTRL-3:2 No - lnc-SLC7A6OS-1:2 Yes chr2R:15657318-15676669 lnc-ESRP2-4:1 Yes chr2L:20447734-20449964 lnc-ESRP2-4:2 Yes chr2L:20447734-20449964 lnc-ESRP2-4:3 No - lnc-ESRP2-4:4 No - lnc-ZFP90-3:3 No - lnc-ZFP90-3:4 No - lnc-ZFP90-3:5 No - lnc-ZFP90-3:6 No - lnc-SMPD3-2:6 No - lnc-SMPD3-2:4 No - lnc-SMPD3-2:5 No - lnc-CHTF8-2:3 No - lnc-CHTF8-2:4 No - lnc-CHTF8-9:1 Yes chr3L:16226126-16228737 lnc-NFAT5-5:1 No - lnc-NFAT5-6:1 No - lnc-NFAT5-6:2 No - lnc-NFAT5-6:3 No - lnc-NFAT5-6:4 No - lnc-NOB1-3:1 No - lnc-EXOSC6-3:12 No - lnc-EXOSC6-3:13 No - lnc-EXOSC6-3:14 No - lnc-EXOSC6-3:15 No - lnc-EXOSC6-3:16 No - lnc-EXOSC6-3:17 No - lnc-EXOSC6-3:18 No - lnc-EXOSC6-3:19 No - lnc-AARS-1:5 No - lnc-AARS-1:6 No - lnc-AARS-1:7 No - lnc-AARS-1:8 No - lnc-AARS-1:4 Yes chr3L:27279316-27422159 lnc-CHST4-3:3 No - lnc-CHST4-3:4 No - lnc-CHST4-6:1 No - lnc-CHST4-6:2 No - lnc-ZNF821-5:1 No - LINC01572:23 No - LINC01572:18 No - LINC01572:19 No - LINC01572:24 No - LINC01572:25 No - LINC01572:26 No - LINC01572:27 No - LINC01572:17 No - LINC01572:20 No - lnc-DHX38-3:8 No - lnc-DHX38-3:9 No - lnc-DHX38-3:10 No - lnc-DHX38-3:11 No - LINC01572:21 No - LINC01572:22 No - LINC01572:16 No - lnc-DHX38-27:1 No - lnc-DHX38-27:2 No - lnc-DHX38-27:3 Yes chr4:501810-540874 lnc-DHX38-27:6 No - lnc-DHX38-25:1 No - lnc-DHX38-29:1 Yes chr4:501810-540874 lnc-DHX38-29:2 Yes chr4:501810-540874 lnc-DHX38-29:3 Yes chr4:501810-540874 lnc-ZFHX3-27:4 No - lnc-ZFHX3-27:5 No - lnc-ZFHX3-27:6 No - lnc-LDHD-3:1 Yes chr2L:4463611-4465075 lnc-CHST6-1:2 No - lnc-CHST6-1:3 No - lnc-TMEM231-3:1 No - LINC02125:7 Yes chr3L:12146519-12156990 LINC02125:8 Yes chr3L:12146519-12156990 lnc-ADAMTS18-12:1 No - lnc-ADAMTS18-12:2 No - lnc-WWOX-4:7 No - lnc-WWOX-4:6 No - lnc-WWOX-4:8 No - lnc-WWOX-4:9 No - lnc-WWOX-4:10 No - lnc-WWOX-4:11 No - lnc-WWOX-4:12 No - lnc-WWOX-4:13 No - MAFTRR:12 No - MAFTRR:13 No - MAFTRR:14 No - MAFTRR:15 No - MAFTRR:11 No - MAFTRR:17 No - MAFTRR:16 No - MAFTRR:19 No - MAFTRR:18 No - lnc-CDYL2-6:10 Yes chr2R:24475386-24476032 lnc-CDYL2-6:16 Yes chr2R:24475386-24476032 lnc-CDYL2-6:11 Yes chr2R:24475386-24476032 lnc-CDYL2-6:9 Yes chr2R:24475386-24476032 lnc-CDYL2-6:12 Yes chr2R:24475386-24476032 lnc-CDYL2-6:13 Yes chr2R:24475386-24476032 lnc-CDYL2-6:14 Yes chr2R:24475386-24476032 lnc-CDYL2-6:15 Yes chr2R:24475386-24476032 LINC01227:13 Yes chr2R:24475386-24476032 LINC01227:14 No - LINC01227:15 No - LINC01227:16 No - LINC01227:17 No - LINC01227:18 No - LINC01227:19 No - LINC01227:12 No - lnc-CMC2-1:2 No - lnc-CMC2-1:3 No - lnc-CMC2-1:4 No - lnc-CMC2-1:5 No - lnc-CMC2-1:6 No - lnc-ATMIN-3:3 No - lnc-ATMIN-4:3 No - lnc-GCSH-4:1 No - lnc-GCSH-4:2 No - lnc-SDR42E1-4:1 No - lnc-SDR42E1-4:2 No - lnc-PLCG2-1:15 Yes chrX:16350315-16356482 lnc-PLCG2-1:16 Yes chrX:16350315-16356482 lnc-PLCG2-1:17 Yes chrX:16350315-16356482 lnc-PLCG2-1:18 Yes chrX:16350315-16356482 lnc-PLCG2-1:19 Yes chrX:16350315-16356482 lnc-PLCG2-1:20 Yes chrX:16350315-16356482 lnc-HSD17B2-1:3 No - lnc-HSD17B2-1:4 No - lnc-HSD17B2-1:5 No - lnc-HSD17B2-1:6 No - lnc-HSD17B2-1:2 No - lnc-MPHOSPH6-5:2 No - lnc-HSD17B2-8:1 No - lnc-SLC38A8-5:2 No - lnc-SLC38A8-5:3 No - lnc-SLC38A8-5:4 No - lnc-SLC38A8-2:10 No - lnc-SLC38A8-2:11 No - lnc-SLC38A8-2:12 No - lnc-SLC38A8-2:8 No - lnc-SLC38A8-2:9 No - lnc-DNAAF1-1:2 No - lnc-DNAAF1-1:3 No - lnc-COTL1-3:1 No - lnc-COTL1-4:1 Yes chr3L:871899-895313 lnc-KIAA0513-7:1 No - lnc-FAM92B-9:1 No - lnc-FAM92B-9:2 No - lnc-GINS2-5:1 No - lnc-GINS2-2:4 No - lnc-GINS2-2:5 No - lnc-GINS2-2:6 No - lnc-GINS2-2:8 No - lnc-GINS2-2:7 No - lnc-IRF8-8:1 No - lnc-IRF8-8:2 No - lnc-IRF8-1:2 No - lnc-IRF8-1:3 No - lnc-MTHFSD-62:5 No - LINC01082:6 No - LINC01082:7 No - FENDRR:25 No - FENDRR:20 No - FENDRR:26 No - FENDRR:21 No - FENDRR:22 No - FENDRR:23 No - FENDRR:27 No - FENDRR:28 No - FENDRR:24 No - FENDRR:18 No - FENDRR:29 No - FENDRR:19 No - lnc-FOXC2-1:2 No - FOXC2-AS1:3 Yes chr3L:21474133-21476479 FOXC2-AS1:4 Yes chr3L:21474133-21476479 FOXC2-AS1:2 Yes chr3L:21474133-21476479 lnc-MAP1LC3B-1:6 No - lnc-MAP1LC3B-1:7 No - lnc-MAP1LC3B-1:8 No - lnc-MAP1LC3B-1:9 No - lnc-MAP1LC3B-1:10 No - lnc-JPH3-3:11 No - lnc-JPH3-3:12 No - lnc-JPH3-3:13 No - lnc-JPH3-3:14 No - lnc-JPH3-3:15 No - lnc-JPH3-3:16 No - lnc-JPH3-3:17 No - lnc-JPH3-3:18 No - lnc-JPH3-1:2 No - lnc-KLHDC4-74:4 Yes chr2L:9547720-9566750 lnc-KLHDC4-74:3 Yes chr2L:9547720-9566750 lnc-JPH3-2:2 No - lnc-JPH3-2:3 No - lnc-KLHDC4-1:10 No - lnc-KLHDC4-1:9 No - lnc-KLHDC4-1:11 No - lnc-KLHDC4-1:8 No - lnc-KLHDC4-1:12 No - lnc-BANP-13:1 No - lnc-BANP-1:9 No - lnc-BANP-1:10 No - lnc-BANP-1:11 No - lnc-BANP-1:12 No - lnc-CYBA-3:4 No - lnc-CYBA-4:2 No - lnc-CYBA-4:3 No - SNAI3-AS1:17 No - SNAI3-AS1:18 No - SNAI3-AS1:19 No - SNAI3-AS1:20 No - SNAI3-AS1:21 Yes chr2L:15333866-15336138 SNAI3-AS1:24 Yes chr2L:15333866-15336138 lnc-CBFA2T3-1:5 No - lnc-CBFA2T3-1:6 No - lnc-CBFA2T3-1:2 No - lnc-CBFA2T3-1:3 No - lnc-CBFA2T3-1:4 No - lnc-SLC22A31-5:3 No - lnc-ZNF778-2:3 Yes chr3L:12750119-12753402 lnc-ZNF778-2:4 Yes chr3L:12750119-12753402 lnc-ZNF778-2:5 Yes chr3L:12750119-12753402 lnc-ZNF778-2:6 Yes chr3L:12750119-12753402 lnc-ZNF778-2:7 Yes chr3L:12750119-12753402 lnc-SLC22A31-3:2 Yes chr3L:12750119-12753402 lnc-ANKRD11-1:5 Yes chrX:2694392-2698211 lnc-ANKRD11-1:10 Yes chrX:2694392-2698211 lnc-ANKRD11-1:7 Yes chrX:2694392-2698211 lnc-ANKRD11-1:8 Yes chrX:2694392-2698211 lnc-ANKRD11-1:9 Yes chrX:2694392-2698211 lnc-ANKRD11-1:4 Yes chrX:2694392-2698211 lnc-ANKRD11-1:3 Yes chrX:2694392-2698211 lnc-ANKRD11-1:6 Yes chrX:2694392-2698211 lnc-ANKRD11-9:1 No - lnc-FANCA-2:1 No - lnc-FANCA-3:1 Yes chr3L:8110368-8113406 lnc-CENPBD1-3:5 No - lnc-CENPBD1-3:1 No - lnc-CENPBD1-3:2 No - lnc-CENPBD1-3:6 No - lnc-CENPBD1-3:4 No - lnc-CENPBD1-3:3 No - lnc-GAS8-6:1 No - FAM157C:9 No - FAM157C:10 No - FAM157C:11 No - lnc-ABR-5:5 No - lnc-ABR-5:6 No - lnc-ABR-5:7 No - PITPNA-AS1:4 Yes chr3R:19215434-19226651 lnc-WDR81-4:2 No - MIR22HG:54 No - MIR22HG:36 No - MIR22HG:33 Yes chr2L:12014304-12020960 MIR22HG:32 Yes chr2L:12014304-12020960 MIR22HG:34 Yes chr2L:12014304-12020960 MIR22HG:38 No - MIR22HG:37 No - MIR22HG:31 Yes chr2L:12014304-12020960 MIR22HG:29 Yes chr2L:12014304-12020960 MIR22HG:39 No - MIR22HG:40 No - MIR22HG:41 No - MIR22HG:42 No - MIR22HG:43 No - MIR22HG:44 No - MIR22HG:45 No - MIR22HG:35 No - MIR22HG:46 No - MIR22HG:47 No - MIR22HG:48 No - MIR22HG:49 No - MIR22HG:50 No - MIR22HG:51 No - MIR22HG:52 No - MIR22HG:53 No - MIR22HG:30 Yes chr2L:12014304-12020960 MIR22HG:28 Yes chr2L:12014304-12020960 lnc-TLCD2-6:1 Yes chr2L:12014304-12020960 lnc-HIC1-3:1 No - lnc-TSR1-1:2 Yes chr3R:25029429-25033465 lnc-SGSM2-2:1 No - lnc-SGSM2-2:2 No - lnc-SGSM2-2:3 Yes chr2R:15147860-15149709 lnc-SGSM2-2:4 Yes chr2R:15147860-15149709 lnc-SGSM2-2:5 Yes chr2R:15147860-15149709 lnc-PAFAH1B1-3:4 No - lnc-PAFAH1B1-3:6 No - lnc-METTL16-7:1 Yes chr2R:16178826-16185103 lnc-OR3A2-1:4 No - lnc-OR3A2-1:5 No - lnc-OR3A2-1:6 No - lnc-OR3A2-1:7 No - lnc-OR3A2-1:2 No - lnc-OR3A2-1:3 No - lnc-CYB5D2-4:2 No - lnc-MYBBP1A-1:4 Yes chr2R:16124981-16138238 lnc-MYBBP1A-1:5 Yes chr2R:16124981-16138238 lnc-MYBBP1A-1:6 No - lnc-SPNS2-4:1 No - lnc-CXCL16-4:1 No - lnc-CXCL16-4:2 No - lnc-CXCL16-4:3 No - lnc-VMO1-2:3 No - lnc-VMO1-2:4 No - lnc-SLC52A1-2:2 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-USP6-4:7 No - lnc-USP6-4:8 No - lnc-USP6-4:9 No - lnc-USP6-4:10 No - lnc-USP6-4:11 No - lnc-RABEP1-5:1 No - lnc-WSCD1-3:2 No - lnc-WSCD1-3:4 No - lnc-WSCD1-3:3 No - lnc-AIPL1-1:6 No - lnc-AIPL1-1:4 No - lnc-AIPL1-1:7 No - lnc-AIPL1-1:5 No - lnc-PITPNM3-1:1 No - lnc-SLC16A11-7:4 No - lnc-SLC16A11-7:5 No - lnc-SLC16A11-7:6 No - lnc-SLC16A11-7:17 No - lnc-SLC16A11-7:7 No - lnc-SLC16A11-7:2 No - lnc-SLC16A11-7:18 No - lnc-GPS2-4:1 Yes chr2R:24057798-24059483 lnc-NEURL4-3:1 No - lnc-NEURL4-3:2 Yes chr3R:23118400-23124217 lnc-SAT2-1:2 No - lnc-TP53-2:1 No - lnc-TP53-2:2 No - lnc-TP53-2:3 No - lnc-TP53-2:4 No - lnc-NAA38-7:1 No - lnc-NAA38-6:1 No - lnc-NAA38-5:1 No - lnc-NAA38-4:1 No - lnc-ALOX12B-4:1 No - LINC00324:3 No - LINC00324:4 No - lnc-ARHGEF15-1:1 No - lnc-ARHGEF15-1:2 No - lnc-ODF4-2:6 No - lnc-NDEL1-5:2 No - lnc-NDEL1-7:1 No - lnc-NDEL1-7:2 No - lnc-NTN1-2:5 No - lnc-NTN1-2:6 No - lnc-NTN1-2:7 No - lnc-NTN1-2:9 No - lnc-NTN1-2:8 No - lnc-NTN1-2:10 No - lnc-NTN1-2:11 No - lnc-STX8-1:7 No - lnc-STX8-1:2 No - lnc-STX8-1:3 No - lnc-STX8-1:8 No - lnc-STX8-1:9 No - lnc-STX8-1:10 Yes chr2R:24743749-24756976 lnc-STX8-1:4 Yes chr2R:24743749-24756976 lnc-STX8-1:5 Yes chr2R:24743749-24756976 lnc-STX8-1:11 Yes chr2R:24743749-24756976 lnc-STX8-1:6 Yes chr2R:24743749-24756976 lnc-ADPRM-2:1 Yes chr2L:16766566-16788766 lnc-TMEM238L-5:1 No - lnc-TMEM238L-16:3 No - lnc-ADPRM-5:2 No - lnc-ADPRM-5:3 No - lnc-ADPRM-5:4 No - lnc-ADPRM-5:5 No - lnc-MAP2K4-3:1 No - lnc-MAP2K4-3:2 No - lnc-MAP2K4-3:3 No - lnc-MAP2K4-3:4 No - LINC00670:9 No - LINC00670:10 No - LINC00670:11 No - COX10-AS1:28 No - COX10-AS1:20 No - COX10-AS1:24 No - COX10-AS1:25 No - COX10-AS1:26 No - COX10-AS1:27 No - COX10-AS1:17 No - COX10-AS1:18 No - COX10-AS1:21 No - COX10-AS1:22 No - COX10-AS1:23 No - COX10-AS1:19 No - lnc-HS3ST3B1-1:4 No - lnc-HS3ST3B1-1:5 No - lnc-ZSWIM7-8:1 No - lnc-LRRC75A-3:2 Yes chr3L:14186249-14189648 lnc-LRRC75A-1:1 No - lnc-ZNF287-1:2 No - lnc-TRPV2-4:2 No - lnc-TRPV2-4:3 No - lnc-TRPV2-4:4 No - lnc-TRPV2-4:5 No - lnc-TRPV2-4:6 No - lnc-TNFRSF13B-3:2 No - lnc-TNFRSF13B-3:3 No - lnc-TNFRSF13B-3:6 No - lnc-TNFRSF13B-3:4 No - lnc-TNFRSF13B-3:5 No - lnc-PEMT-3:1 No - lnc-DRC3-3:1 Yes chr2R:18094940-18101031 lnc-FLII-1:5 No - lnc-FLII-1:4 No - lnc-FLII-1:3 No - lnc-FAM83G-5:3 Yes chr3R:30592971-30601489 lnc-FAM83G-5:1 Yes chr3R:30592971-30601489 lnc-FAM83G-5:2 Yes chr3R:30592971-30601489 lnc-GRAP-3:3 No - lnc-GRAP-3:4 No - lnc-SLC47A2-2:7 No - lnc-SLC47A2-2:8 No - lnc-SLC47A2-2:4 No - lnc-SLC47A2-2:5 No - lnc-SLC47A2-2:6 No - lnc-SLC47A2-2:2 Yes chr2R:7466879-7477162 lnc-SLC47A2-2:3 Yes chr2R:7466879-7477162 lnc-AKAP10-1:3 No - CCDC144NL-AS1:31 No - CCDC144NL-AS1:33 No - CCDC144NL-AS1:29 No - CCDC144NL-AS1:34 No - CCDC144NL-AS1:35 No - CCDC144NL-AS1:36 No - CCDC144NL-AS1:37 No - CCDC144NL-AS1:38 No - CCDC144NL-AS1:30 No - CCDC144NL-AS1:39 No - lnc-DHRS7B-10:1 No - CCDC144NL-AS1:42 No - CCDC144NL-AS1:41 No - CCDC144NL-AS1:43 No - CCDC144NL-AS1:44 No - CCDC144NL-AS1:45 No - CCDC144NL-AS1:47 No - CCDC144NL-AS1:48 No - CCDC144NL-AS1:49 Yes chr3L:18618305-18622129 CCDC144NL-AS1:46 Yes chr3L:18618305-18622129 CCDC144NL-AS1:50 Yes chr3L:18618305-18622129 LINC01563:8 No - LINC01563:9 No - LINC01563:10 No - LINC01563:11 No - LINC01563:12 No - LINC01563:13 No - lnc-DHRS7B-1:5 Yes chr3L:5780051-5784685 lnc-DHRS7B-1:6 Yes chr3L:5780051-5784685 lnc-DHRS7B-1:11 Yes chr3L:5780051-5784685 lnc-DHRS7B-1:7 Yes chr3L:5780051-5784685 lnc-DHRS7B-1:8 Yes chr3L:5780051-5784685 lnc-DHRS7B-1:9 No - lnc-NATD1-5:1 No - lnc-KCNJ12-1:2 No - lnc-IFT20-12:1 No - SPAG5-AS1:10 No - SPAG5-AS1:12 No - SPAG5-AS1:14 No - lnc-SUPT6H-5:2 Yes chr3L:3210992-3218920 lnc-SUPT6H-5:3 Yes chr3L:3210992-3218920 lnc-TLCD1-1:2 Yes chr3L:1667192-1668654 lnc-TLCD1-1:3 Yes chr3L:1667192-1668654 lnc-TLCD1-1:4 Yes chr3L:1667192-1668654 lnc-ERAL1-7:1 No - lnc-ERAL1-9:1 No - lnc-ERAL1-9:2 No - lnc-CRYBA1-4:1 No - lnc-NUFIP2-1:4 No - lnc-NUFIP2-1:3 No - lnc-NUFIP2-1:2 Yes chrX:19569721-19579800 lnc-SLC6A4-7:1 Yes chrX:13338318-13341009 lnc-CPD-2:1 No - lnc-RNF135-1:30 No - lnc-RNF135-1:31 No - lnc-RNF135-1:32 No - lnc-RNF135-1:33 No - lnc-RNF135-1:34 No - lnc-RNF135-1:35 No - lnc-RNF135-1:36 No - lnc-RNF135-1:37 No - lnc-RNF135-1:38 No - lnc-RNF135-1:39 No - lnc-CRLF3-5:2 No - lnc-ATAD5-8:1 No - lnc-TEFM-11:1 No - lnc-OMG-5:1 Yes chr3R:25983013-25995737 lnc-OMG-5:2 Yes chr3R:25983013-25995737 lnc-OMG-5:3 Yes chr3R:25983013-25995737 lnc-OMG-5:4 Yes chr3R:25983013-25995737 lnc-OMG-5:5 Yes chr3R:25983013-25995737 lnc-EVI2A-2:2 Yes chr3R:25983013-25995737 lnc-EVI2A-2:1 No - lnc-EVI2A-3:4 No - lnc-EVI2A-3:1 No - lnc-EVI2A-3:2 No - lnc-EVI2A-3:3 No - lnc-COPRS-3:1 No - lnc-COPRS-3:2 No - lnc-CCL2-13:1 No - lnc-ASIC2-2:3 No - lnc-ASIC2-2:2 No - lnc-ASIC2-2:1 No - lnc-CCL1-10:1 No - lnc-SLC35G3-1:10 No - lnc-SLC35G3-1:11 No - lnc-SLC35G3-1:12 No - lnc-SLC35G3-1:7 No - lnc-SLC35G3-1:8 No - lnc-SLC35G3-1:9 No - LINC02001:10 No - LINC02001:11 No - LINC02001:12 No - lnc-TAF15-6:1 No - lnc-PEX12-2:1 Yes chrX:19731004-19734581 lnc-RDM1-1:6 No - lnc-RDM1-1:7 No - lnc-CCL18-1:8 No - lnc-CCL18-1:11 No - lnc-TBC1D3K-1:1 No - lnc-GPR179-3:1 No - lnc-SRCIN1-1:18 Yes chrX:20469955-20510694 lnc-SRCIN1-1:22 Yes chrX:20469955-20510694 lnc-SRCIN1-1:19 Yes chrX:20469955-20510694 lnc-SRCIN1-1:20 Yes chrX:20469955-20510694 lnc-SRCIN1-1:24 Yes chrX:20469955-20510694 lnc-SRCIN1-1:25 Yes chrX:20469955-20510694 lnc-SRCIN1-1:26 Yes chrX:20469955-20510694 lnc-SRCIN1-1:23 Yes chrX:20469955-20510694 lnc-ARHGAP23-1:2 Yes chrX:1673110-1692768 lnc-EPOP-2:2 Yes chr3R:7094596-7124185 lnc-EPOP-2:3 Yes chr3R:7094596-7124185 lnc-EPOP-2:5 No - lnc-MLLT6-3:1 No - lnc-EPOP-2:6 No - lnc-MLLT6-1:3 No - lnc-EPOP-2:4 Yes chr3R:7094596-7124185 lnc-EPOP-2:7 No - lnc-RPL23-1:1 No - lnc-STAC2-3:1 No - lnc-CDK12-2:3 No - lnc-MED1-4:1 Yes chr3L:21516306-21522684 lnc-MED1-4:2 Yes chr3L:21516306-21522684 lnc-NEUROD2-4:1 No - lnc-NEUROD2-4:2 No - lnc-ORMDL3-3:1 No - lnc-ORMDL3-3:2 No - lnc-MED24-7:1 No - lnc-MED24-1:4 No - lnc-MED24-1:3 No - lnc-MED24-1:5 No - lnc-MED24-6:1 No - lnc-MED24-6:2 No - lnc-NR1D1-1:5 No - lnc-NR1D1-1:6 No - lnc-NR1D1-1:7 No - lnc-NR1D1-1:8 No - lnc-NR1D1-1:9 No - lnc-NR1D1-2:2 No - lnc-TNS4-4:1 No - lnc-TNS4-3:1 No - lnc-IGFBP4-5:1 Yes chr3R:9528238-9533011 lnc-IGFBP4-6:1 No - lnc-SMARCE1-4:1 No - lnc-SMARCE1-3:1 No - lnc-SMARCE1-3:2 No - lnc-TMEM99-5:5 No - lnc-TMEM99-5:6 No - lnc-TMEM99-5:7 No - lnc-TMEM99-8:3 No - lnc-TMEM99-2:2 No - lnc-TMEM99-4:2 No - lnc-TMEM99-4:3 No - lnc-TMEM99-4:4 No - lnc-KRTAP9-7-5:1 No - lnc-KRTAP9-7-5:2 No - lnc-KRTAP9-7-5:3 No - lnc-KRTAP9-7-5:4 No - lnc-KRTAP9-7-5:5 No - lnc-KRTAP9-7-1:3 No - lnc-EIF1-5:1 No - lnc-HAP1-1:1 No - lnc-STAT5A-2:1 Yes chr3R:20535323-20552311 lnc-ATP6V0A1-5:1 No - lnc-ATP6V0A1-4:1 No - lnc-ATP6V0A1-4:2 No - lnc-ATP6V0A1-4:3 No - lnc-PSMC3IP-3:10 No - lnc-PSMC3IP-3:7 No - lnc-PSMC3IP-3:8 No - lnc-PSMC3IP-3:11 No - lnc-PSMC3IP-3:12 No - lnc-PSMC3IP-3:13 No - lnc-PSMC3IP-3:9 Yes chr3L:5767017-5768794 lnc-MLX-2:2 No - RAMP2-AS1:19 No - RAMP2-AS1:20 No - RAMP2-AS1:10 No - RAMP2-AS1:14 No - RAMP2-AS1:15 No - RAMP2-AS1:11 No - RAMP2-AS1:16 No - RAMP2-AS1:12 No - RAMP2-AS1:17 No - RAMP2-AS1:9 No - RAMP2-AS1:18 No - RAMP2-AS1:13 No - RAMP2-AS1:21 No - lnc-COA3-3:1 No - lnc-COA3-3:2 No - lnc-COA3-3:3 No - LINC00671:6 No - LINC00671:7 No - LINC00671:8 No - LINC00671:9 No - LINC00671:10 No - lnc-RUNDC1-3:1 Yes chrX:3482965-3484555 lnc-VAT1-4:1 Yes chr3R:25683623-25685051 lnc-BRCA1-3:15 No - lnc-BRCA1-3:10 No - lnc-BRCA1-3:14 No - lnc-BRCA1-3:12 No - lnc-BRCA1-3:13 No - lnc-BRCA1-3:11 No - LINC00910:32 No - LINC00910:34 No - LINC00910:24 No - LINC00910:33 No - lnc-LINC00854-5:2 No - LINC00910:11 No - LINC00910:12 No - LINC00910:13 No - LINC00910:22 No - LINC00910:18 No - LINC00910:19 No - LINC00910:14 No - LINC00910:15 No - LINC00910:25 No - LINC00910:26 No - LINC00910:20 No - LINC00910:27 No - LINC00910:28 No - LINC00910:23 No - LINC00910:29 No - LINC00910:16 No - lnc-ARL4D-3:1 No - LINC00910:17 No - lnc-DHX8-6:2 Yes chr3R:24788054-24797955 ASB16-AS1:9 No - ASB16-AS1:8 No - ASB16-AS1:10 No - ASB16-AS1:11 No - ASB16-AS1:12 No - ASB16-AS1:13 No - ASB16-AS1:14 No - lnc-TMUB2-1:8 Yes chr3L:18681037-18681836 lnc-TMUB2-1:10 No - lnc-TMUB2-1:11 No - lnc-TMUB2-1:12 No - lnc-TMUB2-1:13 No - lnc-TMUB2-1:14 No - lnc-FZD2-3:1 No - lnc-GJC1-3:1 Yes chrX:15946936-15973159 lnc-CCDC103-6:4 No - lnc-PLCD3-1:8 No - lnc-PLCD3-1:16 No - lnc-PLCD3-4:4 No - lnc-PLCD3-4:5 No - lnc-PLCD3-4:6 No - lnc-PLCD3-4:7 No - lnc-PLCD3-4:8 No - lnc-PLCD3-4:1 No - lnc-SPATA32-2:6 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-SPATA32-2:7 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-SPATA32-2:2 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-SPATA32-2:3 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-SPATA32-2:1 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-SPATA32-2:8 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-SPATA32-2:9 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-SPATA32-2:4 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-SPATA32-2:10 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-SPATA32-2:11 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-SPATA32-1:2 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-SPATA32-1:3 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-SPATA32-1:4 Yes chr3L:14053215-14071583 lnc-FMNL1-6:1 No - lnc-MAP3K14-3:11 No - lnc-MAP3K14-3:12 No - lnc-MAP3K14-3:13 No - lnc-MAP3K14-3:14 No - lnc-MAP3K14-3:15 No - lnc-MAP3K14-3:10 No - lnc-FMNL1-5:1 No - MAPT-AS1:7 No - MAPT-AS1:8 No - KANSL1-AS1:6 Yes chr3R:15793782-15802102 KANSL1-AS1:7 Yes chr3R:15793782-15802102 lnc-ARL17B-8:1 Yes chr3R:15793782-15802102 lnc-RPRML-1:4 No - lnc-RPRML-1:3 No - lnc-RPRML-1:2 No - lnc-RPRML-1:5 No - lnc-GOSR2-3:2 No - lnc-GOSR2-3:1 No - lnc-CDC27-2:14 No - lnc-CDC27-2:15 No - lnc-CDC27-2:16 No - lnc-CDC27-2:11 No - lnc-CDC27-2:12 No - lnc-CDC27-2:13 No - lnc-OSBPL7-3:9 Yes chr3L:1502843-1523380 lnc-OSBPL7-3:10 Yes chr3L:1502843-1523380 lnc-OSBPL7-3:18 Yes chr3L:1502843-1523380 lnc-OSBPL7-3:3 No - lnc-OSBPL7-3:4 No - lnc-OSBPL7-3:5 No - lnc-OSBPL7-3:6 No - lnc-OSBPL7-3:1 No - lnc-OSBPL7-3:11 Yes chr3L:1502843-1523380 lnc-OSBPL7-3:7 No - lnc-OSBPL7-3:8 No - lnc-OSBPL7-3:12 No - lnc-OSBPL7-3:19 No - lnc-OSBPL7-5:1 No - lnc-OSBPL7-5:2 No - lnc-OSBPL7-3:13 No - lnc-OSBPL7-3:20 No - SP2-AS1:26 No - SP2-AS1:23 No - SP2-AS1:22 No - SP2-AS1:24 No - SP2-AS1:25 No - SP2-AS1:16 No - SP2-AS1:17 No - SP2-AS1:18 No - SP2-AS1:19 No - SP2-AS1:20 No - SP2-AS1:21 No - lnc-COPZ2-1:9 No - lnc-COPZ2-1:8 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-COPZ2-1:10 No - lnc-COPZ2-1:11 No - lnc-HOXB8-1:11 No - lnc-HOXB8-1:12 No - lnc-HOXB8-1:10 No - lnc-HOXB8-1:9 No - lnc-HOXB8-1:13 No - lnc-HOXB8-1:14 No - lnc-HOXB8-1:15 No - lnc-UBE2Z-2:2 Yes chr3R:21865168-21866238 lnc-GIP-1:8 No - lnc-GIP-1:9 No - lnc-GIP-1:4 No - lnc-GIP-1:5 No - lnc-GIP-1:3 No - lnc-GIP-1:6 No - lnc-GIP-1:7 No - lnc-GNGT2-1:1 No - lnc-GNGT2-1:2 No - lnc-NGFR-3:10 No - lnc-NGFR-3:9 No - lnc-NGFR-3:11 No - lnc-NGFR-3:12 No - lnc-NGFR-3:15 No - lnc-NGFR-3:16 No - lnc-NGFR-3:17 No - lnc-NGFR-3:13 No - lnc-NGFR-3:14 No - lnc-NGFR-3:21 No - lnc-NGFR-3:22 No - lnc-NGFR-3:23 No - lnc-NGFR-3:18 No - lnc-NGFR-3:19 No - lnc-NGFR-3:20 No - lnc-NGFR-3:24 No - lnc-NGFR-6:1 No - lnc-KAT7-4:2 Yes chr3R:21138270-21140365 lnc-KAT7-2:4 No - lnc-DLX3-3:10 No - lnc-DLX3-3:4 Yes chrX:13214409-13258490 lnc-DLX3-3:5 Yes chrX:13214409-13258490 lnc-DLX3-3:1 Yes chrX:13214409-13258490 lnc-DLX3-3:7 No - lnc-DLX3-3:9 No - lnc-DLX3-3:11 No - lnc-DLX3-3:3 Yes chrX:13214409-13258490 lnc-DLX3-3:2 Yes chrX:13214409-13258490 lnc-SGCA-4:1 No - lnc-SGCA-4:2 No - LINC01969:10 No - LINC01969:11 No - LINC01969:12 No - LINC01969:13 No - LINC01969:14 No - lnc-ANKRD40-4:1 No - lnc-LINC00483-1:5 No - lnc-LINC00483-1:6 No - lnc-LINC00483-1:7 No - lnc-LINC00483-1:8 No - lnc-LINC00483-1:9 No - lnc-LINC00483-1:10 No - lnc-LINC00483-1:11 No - lnc-LINC00483-1:12 No - lnc-LINC00483-1:13 No - lnc-LINC00483-1:14 No - TOB1-AS1:9 Yes chrX:16074717-16091495 TOB1-AS1:10 Yes chrX:16074717-16091495 TOB1-AS1:11 Yes chrX:16074717-16091495 TOB1-AS1:12 Yes chrX:16074717-16091495 TOB1-AS1:13 Yes chrX:16074717-16091495 TOB1-AS1:14 Yes chrX:16074717-16091495 lnc-SPAG9-4:1 No - lnc-NME1-3:1 No - lnc-NME1-3:2 No - lnc-MBTD1-6:1 No - lnc-MBTD1-6:3 No - lnc-MBTD1-6:2 No - lnc-COIL-2:13 No - lnc-COIL-2:14 No - lnc-COIL-2:15 No - lnc-COIL-2:10 No - lnc-COIL-2:11 No - lnc-COIL-2:12 No - lnc-COIL-8:2 Yes chr3R:25516118-25608423 lnc-COIL-8:3 Yes chr3R:25516118-25608423 lnc-COIL-8:4 Yes chr3R:25516118-25608423 lnc-COIL-8:5 Yes chr3R:25516118-25608423 lnc-COIL-8:6 Yes chr3R:25516118-25608423 lnc-AKAP1-7:1 Yes chr3R:25516118-25608423 lnc-MRPS23-1:4 Yes chr2L:13834250-13835072 lnc-MRPS23-1:5 Yes chr2L:13834250-13835072 lnc-MSI2-6:1 No - lnc-MSI2-6:2 No - lnc-MSI2-7:1 Yes chr3L:1857165-1859047 TSPOAP1-AS1:39 Yes chr3R:15374635-15402543 TSPOAP1-AS1:40 Yes chr3R:15374635-15402543 TSPOAP1-AS1:41 No - TSPOAP1-AS1:42 No - lnc-TSPOAP1-1:1 No - lnc-TSPOAP1-1:2 No - lnc-TSPOAP1-1:3 No - TSPOAP1-AS1:43 No - TSPOAP1-AS1:45 Yes chr2R:12633589-12634172 lnc-LPO-2:1 No - lnc-RAD51C-5:1 No - lnc-PTRH2-3:4 No - lnc-PTRH2-3:3 Yes chrX:15827986-15835490 lnc-TUBD1-1:1 Yes chrX:10760048-10764413 lnc-RPS6KB1-1:5 No - lnc-RPS6KB1-1:7 No - lnc-CA4-3:3 No - lnc-CA4-3:4 No - lnc-CA4-3:5 No - lnc-CA4-3:6 No - lnc-CA4-3:7 No - lnc-HEATR6-1:26 No - lnc-HEATR6-1:23 No - lnc-HEATR6-1:24 No - lnc-HEATR6-1:19 No - lnc-HEATR6-1:20 No - lnc-HEATR6-1:27 No - lnc-HEATR6-1:28 No - lnc-HEATR6-1:29 No - lnc-HEATR6-1:30 No - lnc-HEATR6-1:21 No - lnc-HEATR6-1:31 No - lnc-HEATR6-1:25 No - lnc-HEATR6-1:32 No - lnc-CA4-3:8 No - lnc-HEATR6-1:22 No - lnc-HEATR6-1:18 No - lnc-USP32-2:9 No - lnc-USP32-2:7 No - lnc-USP32-2:10 No - lnc-USP32-2:11 No - lnc-USP32-2:12 No - lnc-USP32-2:17 No - lnc-USP32-2:16 No - lnc-USP32-2:14 No - lnc-USP32-2:15 No - lnc-USP32-2:13 No - lnc-CA4-4:1 No - lnc-USP32-2:6 No - lnc-PPM1D-1:5 No - lnc-PPM1D-1:6 No - lnc-PPM1D-1:7 No - lnc-PPM1D-1:8 No - lnc-PPM1D-1:9 No - lnc-PPM1D-1:10 No - lnc-APPBP2-6:1 No - TBX2-AS1:25 No - TBX2-AS1:26 No - TBX2-AS1:27 No - TBX2-AS1:23 Yes chrX:4412856-4485647 TBX2-AS1:24 Yes chrX:4412856-4485647 TBX2-AS1:28 No - TBX2-AS1:31 No - TBX2-AS1:29 No - TBX2-AS1:30 No - lnc-NACA2-9:1 No - lnc-EFCAB3-7:1 No - lnc-MED13-7:1 No - lnc-MARCH10-8:4 No - lnc-MARCH10-8:1 No - lnc-MARCH10-8:2 No - lnc-MARCH10-8:6 No - lnc-MARCH10-8:3 No - lnc-MRC2-3:3 No - lnc-MRC2-3:4 No - lnc-MARCH10-1:7 No - lnc-MARCH10-1:6 No - lnc-TANC2-3:1 No - lnc-MAP3K3-2:3 No - lnc-MAP3K3-2:4 Yes chr2R:4546691-4565281 lnc-DDX42-2:1 No - lnc-DDX42-2:2 No - lnc-PSMC5-10:1 No - lnc-SCN4A-1:2 No - lnc-PRR29-5:1 Yes chr3R:19853908-19861291 lnc-PRR29-5:2 No - SNHG25:5 No - SNHG25:6 No - lnc-CEP95-4:1 No - lnc-CEP95-3:2 No - lnc-LRRC37A3-5:8 No - lnc-LRRC37A3-5:9 No - lnc-LRRC37A3-5:10 No - lnc-LRRC37A3-5:11 No - lnc-LRRC37A3-5:12 No - lnc-LRRC37A3-5:13 No - lnc-RGS9-11:2 No - lnc-RGS9-11:3 No - lnc-RGS9-8:2 No - lnc-RGS9-8:3 No - lnc-GNA13-4:1 Yes chrX:18813297-18830406 lnc-GNA13-4:2 Yes chrX:18813297-18830406 lnc-AXIN2-4:1 No - lnc-APOH-3:1 Yes chr2R:16898535-16901575 lnc-HELZ-10:1 No - lnc-HELZ-10:2 No - lnc-HELZ-10:3 No - lnc-PITPNC1-1:2 Yes chr3L:14789935-14801089 lnc-PITPNC1-1:4 Yes chr3L:14789935-14801089 lnc-PITPNC1-1:3 Yes chr3L:14789935-14801089 lnc-PITPNC1-1:5 Yes chr3L:14789935-14801089 lnc-PITPNC1-1:6 Yes chr3L:14789935-14801089 lnc-PITPNC1-1:7 Yes chr3L:14789935-14801089 lnc-PITPNC1-1:8 Yes chr3L:14789935-14801089 lnc-C17orf58-8:7 Yes chr2R:17695776-17698362 lnc-C17orf58-8:4 Yes chr2R:17695776-17698362 lnc-C17orf58-8:3 Yes chr2R:17695776-17698362 lnc-C17orf58-8:5 No - lnc-C17orf58-8:6 No - lnc-C17orf58-1:3 No - lnc-C17orf58-1:4 No - lnc-C17orf58-3:8 No - lnc-C17orf58-3:6 No - lnc-C17orf58-3:7 No - lnc-SLC16A6-1:2 No - lnc-ARSG-3:1 No - lnc-FAM20A-4:3 No - lnc-FAM20A-4:1 No - lnc-FAM20A-4:2 No - lnc-FAM20A-4:4 No - lnc-ABCA5-6:3 Yes chrX:13091145-13093986 lnc-ABCA5-6:4 Yes chrX:13091145-13093986 LINC01483:11 No - LINC01483:12 No - LINC01483:13 No - lnc-MAP2K6-10:1 No - lnc-MAP2K6-10:2 No - LINC01483:14 No - LINC01497:5 No - LINC01497:6 No - LINC01497:7 No - LINC01497:8 No - LINC01497:9 No - LINC01497:10 No - LINC01497:11 No - KCNJ2-AS1:3 Yes chr3R:23168317-23185642 KCNJ2-AS1:4 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-KCNJ2-6:1 No - lnc-ABCA5-14:2 No - LINC01152:9 No - LINC01152:10 No - LINC01152:11 No - LINC01152:12 No - LINC01152:13 No - LINC01152:14 No - LINC01152:15 No - lnc-SLC39A11-10:43 No - lnc-SLC39A11-10:44 No - lnc-SLC39A11-10:17 No - lnc-SLC39A11-10:18 No - lnc-SLC39A11-10:11 No - lnc-SLC39A11-10:12 No - lnc-SLC39A11-10:19 No - lnc-SLC39A11-10:20 No - lnc-SLC39A11-10:13 No - lnc-SLC39A11-10:21 No - lnc-SLC39A11-10:14 No - lnc-SLC39A11-10:22 No - lnc-SLC39A11-1:41 No - LINC02003:6 No - LINC02003:7 No - lnc-SLC39A11-1:47 No - lnc-SLC39A11-1:42 No - lnc-SLC39A11-1:43 No - lnc-SLC39A11-1:50 No - lnc-SLC39A11-1:44 No - lnc-SLC39A11-1:45 No - lnc-SLC39A11-1:46 No - lnc-SLC39A11-1:48 No - lnc-SLC39A11-1:49 No - lnc-SOX9-8:3 No - lnc-SOX9-8:4 No - lnc-SOX9-8:5 No - lnc-SOX9-8:2 No - lnc-SOX9-8:6 No - lnc-FAM104A-8:1 Yes chr2R:11899517-11901394 lnc-FAM104A-8:2 Yes chr2R:11899517-11901394 lnc-C17orf80-7:2 No - lnc-C17orf80-7:3 No - lnc-RAB37-1:2 No - lnc-RAB37-1:3 No - lnc-RAB37-1:4 No - lnc-NAT9-1:4 Yes chr3L:21318774-21335027 lnc-NAT9-1:5 Yes chr3L:21318774-21335027 lnc-NAT9-1:6 Yes chr3L:21318774-21335027 lnc-HID1-3:1 No - lnc-HID1-3:2 No - lnc-HID1-3:3 No - lnc-CDR2L-2:2 No - lnc-CDR2L-2:3 No - lnc-CDR2L-2:4 No - lnc-CDR2L-2:5 No - lnc-CDR2L-2:6 No - lnc-NUP85-2:1 No - lnc-SUMO2-2:1 No - lnc-MRPS7-7:1 No - lnc-MRPS7-7:2 No - lnc-TMEM94-1:1 Yes chr2R:13495222-13502841 lnc-UNK-1:2 Yes chr3L:12850165-12853169 lnc-UNK-1:3 Yes chr3L:12850165-12853169 lnc-UNK-1:4 Yes chr3L:12850165-12853169 lnc-ZACN-3:1 Yes chr3L:8411851-8415910 lnc-ZACN-3:2 Yes chr3L:8411851-8415910 SNHG16:32 No - SNHG16:33 No - SNHG16:34 No - SNHG16:35 No - SNHG16:36 No - SNHG16:37 No - SNHG16:38 No - SNHG16:39 No - SNHG16:40 No - SNHG16:41 No - SNHG16:42 No - lnc-SRSF2-2:4 No - lnc-SRSF2-2:5 No - lnc-SRSF2-2:6 No - lnc-SRSF2-2:7 No - lnc-SRSF2-2:8 No - lnc-TMC6-12:1 No - lnc-TMC6-11:1 No - lnc-TMC6-11:2 No - lnc-SEPT9-3:12 No - lnc-SEPT9-3:13 No - lnc-SEPT9-3:11 No - lnc-SEPT9-3:14 No - lnc-SEPT9-3:15 No - lnc-TNRC6C-6:1 No - lnc-TNRC6C-5:1 No - lnc-TNRC6C-5:2 No - lnc-TMC6-5:1 No - lnc-TMC6-5:2 No - lnc-TMC6-5:3 No - lnc-TMC6-5:4 No - LINC01993:4 No - lnc-PGS1-2:3 No - lnc-PGS1-2:5 No - lnc-PGS1-2:6 No - lnc-PGS1-2:4 No - lnc-PGS1-10:1 No - lnc-PGS1-10:2 No - lnc-PGS1-2:7 No - lnc-PGS1-2:8 No - lnc-PGS1-2:9 No - lnc-PGS1-2:12 No - lnc-PGS1-2:10 No - lnc-PGS1-2:11 No - lnc-PGS1-1:10 No - lnc-PGS1-1:11 No - lnc-PGS1-1:12 No - lnc-PGS1-1:13 No - lnc-PGS1-1:14 No - lnc-PGS1-1:15 No - lnc-PGS1-1:16 No - lnc-PGS1-1:17 No - lnc-PGS1-1:18 No - lnc-PGS1-1:19 No - lnc-SOCS3-3:1 Yes chr3R:18744063-18746041 lnc-CYTH1-3:1 Yes chr3R:21024580-21042499 lnc-PGS1-11:1 Yes chr3R:21024580-21042499 lnc-CYTH1-2:1 Yes chr3R:21024580-21042499 lnc-DNAH17-3:1 No - lnc-DNAH17-3:2 No - LINC02081:16 No - LINC02081:17 No - LINC02081:18 No - LINC02081:19 No - LINC02081:20 No - LINC02081:21 No - LINC02081:22 No - lnc-C1QTNF1-8:2 Yes chr3L:5769002-5776271 lnc-C1QTNF1-8:3 Yes chr3L:5769002-5776271 lnc-C1QTNF1-8:4 Yes chr3L:5769002-5776271 lnc-C1QTNF1-8:5 Yes chr3L:5769002-5776271 lnc-C1QTNF1-8:6 Yes chr3L:5769002-5776271 lnc-C1QTNF1-8:7 Yes chr3L:5769002-5776271 lnc-C1QTNF1-8:8 Yes chr3L:5769002-5776271 lnc-C1QTNF1-10:2 No - LINC01978:18 No - LINC01978:19 No - LINC01978:20 No - LINC01978:21 No - LINC01978:22 No - lnc-CARD14-4:2 No - lnc-CARD14-4:3 No - lnc-CARD14-4:4 No - lnc-CARD14-4:5 No - lnc-CARD14-4:6 No - lnc-SGSH-3:2 No - lnc-NPTX1-2:9 No - lnc-NPTX1-2:10 No - lnc-NPTX1-2:11 No - lnc-NPTX1-2:6 No - lnc-NPTX1-2:8 No - lnc-NPTX1-2:7 No - lnc-NPTX1-4:1 No - lnc-NPTX1-1:3 No - lnc-NPTX1-1:2 No - lnc-NPTX1-1:4 No - lnc-NPTX1-1:5 No - lnc-ENDOV-4:1 No - lnc-ENDOV-4:2 No - lnc-ENDOV-4:3 No - lnc-AATK-9:1 Yes chr2R:22608310-22609419 BAIAP2-DT:18 No - BAIAP2-DT:20 No - BAIAP2-DT:23 No - BAIAP2-DT:24 No - lnc-NDUFAF8-5:1 Yes chr2R:21320040-21323320 lnc-NDUFAF8-5:2 Yes chr2R:21320040-21323320 lnc-NDUFAF8-5:3 Yes chr2R:21320040-21323320 LINC00482:5 No - LINC00482:6 No - LINC00482:7 No - LINC00482:8 No - lnc-BAHCC1-6:1 No - lnc-TMEM105-2:24 No - lnc-TMEM105-2:25 No - lnc-TMEM105-2:20 No - lnc-TMEM105-2:23 No - lnc-TMEM105-2:21 No - lnc-TMEM105-2:26 No - lnc-TMEM105-2:27 No - lnc-TMEM105-4:3 Yes chr3R:22710883-22721150 lnc-TMEM105-4:4 Yes chr3R:22710883-22721150 lnc-ACTG1-5:1 Yes chr3R:22710883-22721150 lnc-ACTG1-5:2 No - lnc-ACTG1-5:3 No - LINC01971:6 No - lnc-BAHCC1-5:1 No - lnc-BAHCC1-5:2 No - lnc-FSCN2-1:5 No - lnc-FSCN2-1:7 No - lnc-FSCN2-1:8 No - lnc-FSCN2-1:6 No - lnc-FSCN2-1:9 No - lnc-FSCN2-1:10 No - lnc-ARL16-1:2 Yes chr2L:2739986-2743377 lnc-ARL16-1:3 Yes chr2L:2739986-2743377 lnc-ANAPC11-7:2 No - lnc-ANAPC11-7:3 No - lnc-ANAPC11-2:9 Yes chr3L:19928743-19932930 MAFG-DT:15 No - MAFG-DT:16 Yes chr3R:17534815-17537136 MAFG-DT:18 No - MAFG-DT:19 No - lnc-ASPSCR1-1:3 No - lnc-ASPSCR1-1:4 No - lnc-ASPSCR1-1:5 No - lnc-ASPSCR1-1:6 No - lnc-ASPSCR1-1:7 No - lnc-ASPSCR1-1:8 No - lnc-NOTUM-2:2 Yes chr3R:8244055-8248054 lnc-NOTUM-2:3 Yes chr3R:8244055-8248054 lnc-RAC3-1:5 No - lnc-RAC3-1:6 No - lnc-RAC3-1:7 No - lnc-GPS1-2:2 Yes chr2L:252589-271744 lnc-GPS1-2:3 Yes chr2L:252589-271744 lnc-SLC16A3-2:2 No - lnc-SLC16A3-2:3 No - lnc-SLC16A3-2:4 No - lnc-SLC16A3-2:5 No - lnc-SLC16A3-2:6 No - LINC01970:7 No - LINC01970:8 No - LINC01970:9 No - lnc-C17orf62-1:5 Yes chr2R:4130974-4133484 lnc-C17orf62-1:6 Yes chr2R:4130974-4133484 lnc-C17orf62-1:4 Yes chr2R:4130974-4133484 lnc-C17orf62-1:7 Yes chr2R:4130974-4133484 lnc-NARF-2:2 No - lnc-NARF-2:3 No - lnc-RAB40B-1:5 No - lnc-RAB40B-1:7 No - lnc-RAB40B-1:6 No - lnc-B3GNTL1-4:1 No - lnc-B3GNTL1-4:2 No - lnc-USP14-3:2 No - lnc-USP14-3:3 No - lnc-USP14-3:4 No - lnc-USP14-3:5 No - lnc-USP14-3:6 No - lnc-ENOSF1-2:2 No - lnc-ENOSF1-2:3 No - lnc-ENOSF1-2:4 No - lnc-ADCYAP1-6:4 Yes chr3L:4592447-4626196 lnc-ADCYAP1-6:5 Yes chr3L:4592447-4626196 lnc-ADCYAP1-6:6 Yes chr3L:4592447-4626196 lnc-ADCYAP1-6:7 Yes chr3L:4592447-4626196 lnc-YES1-8:3 No - lnc-METTL4-2:8 No - lnc-METTL4-2:5 No - lnc-METTL4-2:9 No - lnc-METTL4-2:6 No - lnc-METTL4-2:7 No - lnc-MYOM1-4:4 Yes chr3L:3172817-3178580 lnc-MYOM1-4:5 No - lnc-MYOM1-4:6 No - lnc-MYOM1-1:4 No - lnc-MYOM1-1:5 No - lnc-MYOM1-1:3 No - lnc-MYOM1-10:1 No - lnc-MYOM1-10:2 No - LINC01895:10 No - LINC01895:11 No - LINC01895:12 No - lnc-DLGAP1-11:1 Yes chr2R:12511534-12515062 lnc-DLGAP1-11:3 Yes chr2R:12511534-12515062 lnc-DLGAP1-11:2 Yes chr2R:12511534-12515062 GAPLINC:14 No - GAPLINC:15 No - GAPLINC:12 No - GAPLINC:16 No - GAPLINC:17 No - GAPLINC:13 No - lnc-TGIF1-10:1 Yes chr2R:5702112-5705439 DLGAP1-AS3:5 Yes chr2R:5702112-5705439 DLGAP1-AS3:6 Yes chr2R:5702112-5705439 DLGAP1-AS3:7 Yes chr2R:5702112-5705439 DLGAP1-AS3:4 Yes chr2R:5702112-5705439 LINC00667:19 No - LINC00667:20 No - LINC00667:22 No - LINC00667:23 No - LINC00667:24 No - LINC00667:21 No - lnc-ARHGAP28-18:1 No - lnc-ARHGAP28-10:7 No - lnc-ARHGAP28-10:8 No - lnc-ARHGAP28-10:9 No - lnc-ARHGAP28-10:10 No - lnc-ARHGAP28-10:11 No - lnc-ARHGAP28-10:12 No - lnc-ARHGAP28-11:1 Yes chr3R:27266326-27273273 LINC01387:3 No - LINC01387:4 No - LINC01387:5 No - LINC01387:6 No - LINC01387:7 No - lnc-LAMA1-3:6 Yes chr2R:4744348-4758048 lnc-LAMA1-3:7 Yes chr2R:4744348-4758048 lnc-LAMA1-3:3 Yes chr2R:4744348-4758048 lnc-LAMA1-3:4 Yes chr2R:4744348-4758048 lnc-LAMA1-3:5 Yes chr2R:4744348-4758048 lnc-LAMA1-8:2 No - lnc-LAMA1-8:1 No - GACAT2:3 Yes chr2L:6932545-6942814 lnc-PPP4R1-21:2 No - lnc-PPP4R1-21:1 No - lnc-NDUFV2-1:8 No - lnc-NDUFV2-1:9 No - lnc-NDUFV2-1:10 No - lnc-NDUFV2-1:7 No - lnc-NDUFV2-1:11 No - NDUFV2-AS1:21 No - NDUFV2-AS1:14 No - NDUFV2-AS1:20 No - NDUFV2-AS1:9 No - NDUFV2-AS1:10 No - NDUFV2-AS1:11 No - NDUFV2-AS1:12 No - NDUFV2-AS1:13 No - NDUFV2-AS1:15 No - NDUFV2-AS1:16 No - NDUFV2-AS1:7 No - NDUFV2-AS1:8 No - NDUFV2-AS1:17 No - NDUFV2-AS1:18 No - NDUFV2-AS1:19 Yes chr3L:12750119-12753402 lnc-PPP4R1-2:9 No - lnc-PPP4R1-2:10 No - lnc-PPP4R1-2:11 No - lnc-PPP4R1-2:12 No - lnc-PPP4R1-2:8 No - lnc-PPP4R1-12:2 Yes chr3R:21017684-21020753 PPP4R1-AS1:5 No - lnc-TXNDC2-8:1 No - lnc-PPP4R1-18:4 Yes chr3L:8109132-8110043 lnc-PPP4R1-18:3 Yes chr3L:8109132-8110043 lnc-PIEZO2-16:1 No - lnc-MPPE1-8:1 Yes chr2R:23942538-23946936 lnc-MPPE1-8:2 Yes chr2R:23942538-23946936 lnc-MPPE1-8:3 Yes chr2R:23942538-23946936 lnc-MPPE1-8:4 Yes chr2R:23942538-23946936 lnc-MPPE1-8:5 Yes chr2R:23942538-23946936 lnc-MPPE1-2:7 Yes chr2R:23942538-23946936 lnc-GNAL-1:2 Yes chr2L:8198882-8200652 lnc-MPPE1-1:4 No - lnc-MPPE1-1:5 No - lnc-MPPE1-1:3 No - lnc-MPPE1-1:6 No - lnc-MPPE1-1:7 No - lnc-MPPE1-1:8 No - lnc-MPPE1-1:9 No - lnc-MPPE1-7:1 No - lnc-AFG3L2-5:1 No - lnc-CIDEA-1:3 No - lnc-CIDEA-1:4 No - lnc-CIDEA-1:5 No - lnc-AFG3L2-4:1 Yes chr2R:24305881-24313099 lnc-AFG3L2-4:2 Yes chr2R:24305881-24313099 lnc-AFG3L2-4:3 Yes chr2R:24305881-24313099 lnc-PTPN2-2:8 No - lnc-PTPN2-2:9 No - lnc-PTPN2-2:10 No - lnc-SEH1L-5:4 Yes chr3L:1342493-1475257 lnc-SEH1L-5:6 Yes chr3L:1342493-1475257 lnc-SEH1L-5:5 Yes chr3L:1342493-1475257 lnc-SEH1L-5:7 Yes chr3L:1342493-1475257 lnc-SEH1L-5:8 Yes chr3L:1342493-1475257 lnc-PTPN2-12:1 Yes chr2R:7988462-7991283 lnc-PTPN2-6:2 Yes chr2R:7988462-7991283 lnc-PTPN2-6:3 No - LDLRAD4-AS1:4 No - LDLRAD4-AS1:5 No - LDLRAD4-AS1:6 No - LDLRAD4-AS1:7 No - LDLRAD4-AS1:3 No - LDLRAD4-AS1:8 No - LINC01444:4 No - LINC01444:7 No - LINC01444:5 No - LINC01444:6 No - lnc-GREB1L-2:1 No - GATA6-AS1:20 No - GATA6-AS1:14 No - GATA6-AS1:15 No - GATA6-AS1:16 No - GATA6-AS1:17 No - GATA6-AS1:18 No - GATA6-AS1:10 Yes chr3R:16026079-16041796 GATA6-AS1:11 Yes chr3R:16026079-16041796 GATA6-AS1:12 Yes chr3R:16026079-16041796 GATA6-AS1:5 Yes chr3R:16026079-16041796 GATA6-AS1:24 No - GATA6-AS1:25 No - GATA6-AS1:21 No - GATA6-AS1:7 Yes chr3R:16026079-16041796 GATA6-AS1:22 No - GATA6-AS1:13 Yes chr3R:16026079-16041796 GATA6-AS1:8 Yes chr3R:16026079-16041796 GATA6-AS1:9 Yes chr3R:16026079-16041796 GATA6-AS1:19 No - GATA6-AS1:26 No - GATA6-AS1:23 No - GATA6-AS1:27 No - lnc-CTAGE1-9:11 No - lnc-CTAGE1-5:2 No - lnc-CTAGE1-5:1 No - lnc-CTAGE1-9:2 No - lnc-CTAGE1-9:12 No - lnc-CTAGE1-9:3 No - lnc-CTAGE1-9:15 No - lnc-CTAGE1-9:4 No - lnc-CTAGE1-9:16 No - lnc-CTAGE1-9:13 No - lnc-CTAGE1-9:14 No - lnc-CTAGE1-9:5 No - lnc-CTAGE1-9:6 No - lnc-CTAGE1-9:7 No - lnc-CABLES1-1:3 No - lnc-CABLES1-1:4 No - lnc-CABLES1-1:5 No - lnc-CABLES1-1:6 No - lnc-TMEM241-9:1 Yes chr2L:4883298-4885669 lnc-TMEM241-9:2 Yes chr2L:4883298-4885669 lnc-NPC1-8:1 No - lnc-OSBPL1A-6:3 No - lnc-OSBPL1A-6:4 No - TTC39C-AS1:8 No - TTC39C-AS1:10 No - TTC39C-AS1:11 No - TTC39C-AS1:9 No - TTC39C-AS1:7 No - TTC39C-AS1:5 No - TTC39C-AS1:6 No - lnc-IMPACT-1:3 No - lnc-OSBPL1A-11:1 No - LINC01894:10 No - LINC01894:11 No - LINC01894:12 No - LINC01894:13 No - LINC01894:14 No - LINC01894:15 No - lnc-PSMA8-5:1 No - lnc-PSMA8-5:2 No - lnc-PSMA8-5:3 No - lnc-PSMA8-5:5 No - lnc-PSMA8-5:4 No - AQP4-AS1:12 Yes chr2R:21560246-21576035 AQP4-AS1:11 Yes chr2R:21560246-21576035 AQP4-AS1:13 Yes chr2R:21560246-21576035 AQP4-AS1:14 No - AQP4-AS1:15 No - PCAT18:3 No - PCAT18:4 No - PCAT18:5 No - PCAT18:6 No - AQP4-AS1:17 No - AQP4-AS1:18 No - lnc-CDH2-7:4 No - lnc-CDH2-7:1 No - lnc-CDH2-7:2 No - lnc-CDH2-7:5 No - lnc-CDH2-7:3 No - lnc-DSG1-13:2 No - lnc-DSG1-13:5 No - lnc-DSG1-13:6 No - lnc-DSG1-13:3 No - lnc-DSG1-13:4 No - lnc-DSG1-14:1 No - DSG1-AS1:7 No - DSG1-AS1:8 No - DSG1-AS1:9 No - DSG1-AS1:10 No - DSG1-AS1:11 No - DSG1-AS1:12 No - lnc-TTR-1:4 Yes chr3R:29032660-29034008 lnc-RNF125-2:3 Yes chr3L:19613427-19618521 lnc-RNF125-2:4 Yes chr3L:19613427-19618521 lnc-NOL4-7:1 No - lnc-ZSCAN30-6:2 Yes chr2R:12437345-12452916 lnc-ZSCAN30-9:2 Yes chr2L:4149279-4151203 lnc-ZSCAN30-9:1 Yes chr2L:4149279-4151203 lnc-ZSCAN30-8:1 No - lnc-ZNF24-1:4 No - lnc-ZNF24-1:5 No - lnc-ZNF24-1:6 No - lnc-INO80C-1:7 No - lnc-INO80C-1:8 No - lnc-INO80C-1:13 No - lnc-INO80C-1:14 No - lnc-INO80C-1:9 No - lnc-INO80C-1:10 No - lnc-INO80C-1:15 No - lnc-INO80C-1:16 No - lnc-INO80C-1:6 No - lnc-INO80C-1:12 No - lnc-INO80C-1:11 No - lnc-RPRD1A-5:1 No - lnc-RPRD1A-5:4 No - lnc-RPRD1A-5:2 No - lnc-RPRD1A-5:3 No - lnc-RPRD1A-2:5 No - lnc-RPRD1A-2:4 No - lnc-SLC39A6-1:9 Yes chr2R:10645735-10648634 lnc-SLC39A6-1:4 Yes chr2R:10645735-10648634 lnc-SLC39A6-1:8 Yes chr2R:10645735-10648634 lnc-SLC39A6-1:5 No - lnc-SLC39A6-1:6 No - lnc-SLC39A6-1:10 No - lnc-SLC39A6-1:7 No - lnc-TPGS2-11:1 Yes chr3L:8753619-8798719 MIR924HG:10 No - MIR924HG:11 No - MIR924HG:12 No - MIR924HG:13 No - MIR924HG:14 No - MIR924HG:9 No - LINC01902:10 No - LINC01902:11 No - LINC01902:12 No - LINC01902:13 No - LINC01902:14 No - lnc-PIK3C3-18:3 No - lnc-PIK3C3-18:4 No - lnc-PIK3C3-18:5 No - lnc-PIK3C3-18:1 No - lnc-PIK3C3-18:2 No - lnc-PIK3C3-17:1 No - lnc-PIK3C3-17:2 No - lnc-EPG5-1:4 No - lnc-EPG5-1:5 No - lnc-EPG5-1:6 No - lnc-EPG5-1:7 No - lnc-EPG5-1:8 No - lnc-SETBP1-11:1 No - SLC14A2-AS1:9 No - SLC14A2-AS1:11 No - SLC14A2-AS1:12 No - SLC14A2-AS1:8 No - SLC14A2-AS1:10 No - lnc-SLC14A1-4:1 No - lnc-SIGLEC15-2:1 No - lnc-KATNAL2-1:8 No - lnc-KATNAL2-1:9 No - lnc-KATNAL2-1:10 No - lnc-KATNAL2-1:11 No - lnc-KATNAL2-1:12 No - lnc-KATNAL2-13:1 Yes chr3L:11062131-11062614 lnc-KATNAL2-13:2 Yes chr3L:11062131-11062614 lnc-KATNAL2-13:3 No - MIR4527HG:18 No - MIR4527HG:19 No - MIR4527HG:20 No - MIR4527HG:21 No - MIR4527HG:22 No - MIR4527HG:23 No - MIR4527HG:24 No - MIR4527HG:25 No - MIR4527HG:26 No - MIR4527HG:27 No - lnc-CTIF-10:1 No - lnc-CTIF-10:2 No - lnc-ZBTB7C-9:1 No - lnc-ZBTB7C-9:2 No - lnc-SMAD7-2:2 No - lnc-SMAD7-2:4 No - lnc-SMAD7-2:3 No - lnc-CTIF-9:1 No - lnc-CTIF-9:2 No - lnc-SMAD7-1:3 No - lnc-SMAD7-1:4 No - lnc-SMAD7-1:7 No - lnc-SMAD7-1:5 No - lnc-SMAD7-1:6 No - lnc-CTIF-1:3 No - lnc-CTIF-1:4 Yes chr2R:8944298-8947344 lnc-CTIF-1:5 Yes chr2R:8944298-8947344 lnc-CTIF-1:6 Yes chr2R:8944298-8947344 lnc-LIPG-2:2 No - lnc-RPL17-3:2 Yes chrX:17911462-17924163 lnc-RPL17-3:1 Yes chrX:17911462-17924163 lnc-LIPG-12:1 No - lnc-LIPG-13:3 Yes chr2R:7500147-7508625 lnc-MRO-2:1 Yes chr2R:16414815-16419398 lnc-MBD2-7:3 Yes chr3R:8233507-8237389 lnc-MBD2-7:2 Yes chr3R:8233507-8237389 lnc-MBD2-7:4 Yes chr3R:8233507-8237389 lnc-RAB27B-12:1 Yes chr2L:10388105-10393228 LINC01539:24 No - LINC01539:23 No - LINC01539:22 No - LINC02565:8 No - LINC02565:9 No - LINC02565:10 No - LINC02565:11 No - LINC02565:12 No - lnc-NARS-3:1 No - lnc-NEDD4L-2:2 No - MIR122HG:12 No - lnc-MALT1-7:3 No - lnc-MALT1-7:4 No - lnc-MALT1-7:5 No - lnc-ALPK2-2:7 No - lnc-ALPK2-2:4 No - lnc-ALPK2-2:8 No - lnc-ALPK2-2:9 No - lnc-ALPK2-2:5 No - lnc-ALPK2-2:6 No - lnc-CCBE1-3:1 No - lnc-CCBE1-3:2 No - lnc-CDH20-1:2 No - lnc-CDH20-1:3 No - lnc-CDH20-1:5 No - lnc-CDH20-1:4 No - lnc-CDH20-6:1 No - lnc-PIGN-7:3 No - lnc-PIGN-7:4 No - lnc-PIGN-7:5 No - lnc-PIGN-7:6 No - lnc-PIGN-7:7 No - lnc-SERPINB5-1:3 Yes chr3R:25260963-25262498 lnc-SERPINB5-1:4 Yes chr3R:25260963-25262498 lnc-SERPINB5-1:5 Yes chr3R:25260963-25262498 lnc-SERPINB5-2:1 No - lnc-SERPINB2-1:1 No - lnc-SERPINB3-7:1 No - lnc-CCDC102B-14:1 No - lnc-CCDC102B-14:2 No - LINC01912:7 No - LINC01912:8 No - LIVAR:7 No - lnc-TIMM21-5:10 Yes chrX:13445903-13527282 lnc-TIMM21-5:11 Yes chrX:13445903-13527282 lnc-TIMM21-5:12 Yes chrX:13445903-13527282 lnc-TIMM21-5:13 Yes chrX:13445903-13527282 lnc-TIMM21-5:14 No - lnc-TIMM21-5:15 No - lnc-FBXO15-3:5 No - lnc-FBXO15-3:8 No - lnc-FBXO15-3:6 No - lnc-FBXO15-3:7 No - lnc-C18orf63-4:3 No - lnc-C18orf63-4:4 No - lnc-C18orf63-4:5 No - lnc-C18orf63-4:1 No - lnc-C18orf63-4:2 No - LINC00909:9 No - LINC00909:13 No - LINC00909:14 No - LINC00909:10 Yes chr2L:21762314-21795447 LINC00909:15 No - LINC00909:16 No - LINC00909:17 No - LINC00909:11 Yes chr2L:21762314-21795447 LINC00909:12 Yes chr2L:21762314-21795447 lnc-TSHZ1-4:3 No - lnc-TSHZ1-4:4 No - lnc-TSHZ1-4:5 No - lnc-TSHZ1-4:6 No - lnc-TSHZ1-4:7 No - lnc-ZNF516-4:5 No - lnc-ZNF516-4:6 No - lnc-ZNF516-4:7 No - lnc-ZNF516-4:8 No - lnc-ZNF516-4:4 No - lnc-ZNF236-8:2 No - lnc-ZNF236-8:3 No - lnc-ZNF236-8:4 No - lnc-ZNF236-8:5 No - lnc-ZNF236-8:6 No - lnc-ZNF236-8:9 No - lnc-ZNF236-8:10 No - lnc-ZNF236-8:11 No - lnc-ZNF236-8:12 No - lnc-ZNF516-15:1 No - LINC00908:14 No - LINC00908:15 No - LINC00908:16 No - LINC00908:17 No - LINC00683:7 No - LINC00683:8 No - LINC00683:9 No - LINC00683:10 No - lnc-ZNF236-6:2 No - lnc-ZNF236-6:3 No - lnc-GALR1-5:3 No - LINC01896:33 No - LINC01896:29 No - LINC01896:25 No - LINC01896:24 No - LINC01896:27 No - LINC01896:28 No - LINC01896:26 No - LINC01896:34 No - LINC01896:35 No - LINC01896:36 No - LINC01896:37 No - lnc-PQLC1-17:4 No - lnc-PQLC1-17:5 No - lnc-PQLC1-17:6 No - lnc-PQLC1-16:3 Yes chrX:13624745-13664568 lnc-PQLC1-16:4 Yes chrX:13624745-13664568 lnc-PQLC1-104:1 No - lnc-PQLC1-104:2 No - lnc-PQLC1-104:3 No - lnc-PQLC1-104:8 No - lnc-PQLC1-104:13 No - lnc-PQLC1-104:14 No - lnc-PQLC1-104:9 No - lnc-PQLC1-104:6 No - lnc-PQLC1-104:4 No - lnc-PQLC1-104:17 No - lnc-PQLC1-104:10 No - lnc-PQLC1-104:18 No - lnc-PQLC1-104:15 No - lnc-PQLC1-104:11 No - lnc-ODF3L2-2:9 No - lnc-ODF3L2-2:10 No - lnc-ODF3L2-2:5 No - lnc-ODF3L2-2:11 No - lnc-ODF3L2-2:6 No - lnc-ODF3L2-2:7 No - lnc-ODF3L2-2:8 No - lnc-ODF3L2-2:4 No - lnc-POLRMT-6:20 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-POLRMT-6:13 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-POLRMT-6:14 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-POLRMT-6:15 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-POLRMT-6:21 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-POLRMT-6:16 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-POLRMT-6:17 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-POLRMT-6:19 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-POLRMT-6:22 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-POLRMT-6:23 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-POLRMT-6:18 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-FGF22-2:1 No - lnc-KISS1R-2:1 No - lnc-SBNO2-2:1 Yes chr3R:13676549-13679430 lnc-ATP5F1D-3:1 No - lnc-ATP5F1D-3:2 No - lnc-CBARP-6:1 Yes chr2R:14602004-14604337 lnc-CBARP-6:2 Yes chr2R:14602004-14604337 lnc-GAMT-9:1 No - lnc-GAMT-8:1 No - lnc-MBD3-1:2 Yes chr3R:9559760-9561533 lnc-ONECUT3-5:1 No - lnc-ABHD17A-1:4 No - LINC01775:8 No - LINC01775:9 No - LINC01775:10 No - lnc-AES-7:1 No - lnc-AES-6:4 No - lnc-AES-6:5 No - lnc-AES-6:2 No - lnc-AES-6:3 No - lnc-AES-8:1 No - lnc-AES-8:2 No - lnc-GIPC3-4:1 No - lnc-GIPC3-3:1 No - lnc-GIPC3-3:2 No - lnc-EEF2-3:2 No - lnc-EEF2-3:1 No - lnc-UBXN6-2:4 No - lnc-UBXN6-2:5 No - lnc-UBXN6-2:6 No - lnc-TNFAIP8L1-1:5 No - lnc-TNFAIP8L1-1:6 No - lnc-TNFAIP8L1-1:7 No - lnc-TNFAIP8L1-1:8 No - lnc-TNFAIP8L1-1:9 No - lnc-TNFAIP8L1-1:10 No - MIR7-3HG:14 No - MIR7-3HG:18 No - MIR7-3HG:15 No - MIR7-3HG:16 No - MIR7-3HG:19 No - MIR7-3HG:20 No - MIR7-3HG:21 No - MIR7-3HG:22 No - MIR7-3HG:23 No - MIR7-3HG:24 No - MIR7-3HG:25 No - MIR7-3HG:17 No - lnc-UHRF1-6:1 No - lnc-KDM4B-7:3 Yes chr2L:19586623-19732069 lnc-ZNRF4-5:1 Yes chr2L:19586623-19732069 lnc-ZNRF4-4:1 Yes chr2L:19586623-19732069 lnc-ZNRF4-4:2 Yes chr2L:19586623-19732069 lnc-ZNRF4-3:1 No - lnc-PTPRS-2:1 No - lnc-TINCR-1:4 No - lnc-TINCR-1:5 No - lnc-TINCR-1:6 No - lnc-TINCR-1:7 No - lnc-CAPS-2:5 No - lnc-CAPS-2:6 No - lnc-CAPS-2:7 Yes chr3R:10361760-10378068 lnc-ACSBG2-2:2 Yes chr3R:10361760-10378068 lnc-ACSBG2-2:3 Yes chr3R:10361760-10378068 lnc-ACSBG2-2:4 Yes chr3R:10361760-10378068 lnc-ACSBG2-2:5 Yes chr3R:10361760-10378068 lnc-ACSBG2-2:6 Yes chr3R:10361760-10378068 lnc-ACER1-1:6 Yes chr2L:10356795-10358078 lnc-ACER1-1:2 Yes chr2L:10356795-10358078 lnc-ACER1-1:5 Yes chr2L:10356795-10358078 lnc-ACER1-1:4 Yes chr2L:10356795-10358078 lnc-ACER1-1:3 Yes chr2L:10356795-10358078 lnc-TUBB4A-2:1 No - lnc-INSR-1:2 No - lnc-INSR-1:3 No - lnc-INSR-1:5 No - lnc-INSR-1:6 No - lnc-INSR-1:4 No - lnc-PEX11G-4:3 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-PEX11G-4:2 Yes chr2L:19502335-19508764 lnc-PCP2-1:2 No - lnc-PCP2-1:3 No - lnc-PCP2-1:4 No - lnc-CTXN1-4:3 No - lnc-SNAPC2-1:2 No - lnc-SNAPC2-1:3 No - lnc-CCL25-1:2 No - lnc-CCL25-1:3 No - lnc-CCL25-1:4 No - lnc-CCL25-1:5 No - lnc-CCL25-1:6 No - RAB11B-AS1:6 No - RAB11B-AS1:9 No - RAB11B-AS1:7 No - RAB11B-AS1:8 No - RAB11B-AS1:12 No - RAB11B-AS1:13 No - RAB11B-AS1:14 No - RAB11B-AS1:15 No - RAB11B-AS1:10 Yes chr3R:21111408-21116146 RAB11B-AS1:11 Yes chr3R:21111408-21116146 lnc-PRAM1-2:3 Yes chr3R:9505853-9510324 lnc-HNRNPM-6:1 No - lnc-ZNF266-1:6 No - lnc-ZNF266-1:4 No - lnc-ZNF266-1:7 No - lnc-ZNF266-1:8 No - lnc-ZNF266-1:5 No - ZNF426-DT:15 No - ZNF426-DT:16 No - ZNF426-DT:17 No - ZNF426-DT:18 No - ZNF426-DT:19 No - lnc-UBL5-7:4 No - lnc-UBL5-7:5 No - lnc-UBL5-7:6 No - lnc-UBL5-7:7 No - lnc-FBXL12-1:3 No - lnc-FBXL12-1:4 No - lnc-ZGLP1-5:1 No - lnc-ZGLP1-4:3 No - lnc-ZGLP1-4:1 No - lnc-ZGLP1-4:2 No - lnc-PDE4A-3:2 No - lnc-PDE4A-4:1 Yes chr3L:1795392-1797307 lnc-PDE4A-4:2 Yes chr3L:1795392-1797307 lnc-PDE4A-4:3 Yes chr3L:1795392-1797307 ILF3-DT:20 No - ILF3-DT:21 No - ILF3-DT:22 No - ILF3-DT:23 No - lnc-YIPF2-3:1 Yes chr3R:9982816-9986060 lnc-YIPF2-4:1 No - lnc-YIPF2-4:2 No - lnc-SPC24-1:1 No - lnc-LDLR-3:1 No - lnc-ANGPTL8-1:2 Yes chr2L:94739-102086 lnc-ANGPTL8-1:3 Yes chr2L:94739-102086 lnc-ACP5-2:1 No - lnc-ACP5-3:1 No - lnc-ZNF627-2:13 No - lnc-ZNF627-2:14 No - lnc-ZNF627-2:9 No - lnc-ZNF627-2:10 No - lnc-ZNF627-2:11 No - lnc-ZNF627-2:12 No - lnc-ZNF627-2:16 No - lnc-ZNF433-2:1 No - lnc-ZNF433-2:2 No - ZNF433-AS1:27 No - ZNF433-AS1:28 No - ZNF433-AS1:29 No - ZNF433-AS1:30 No - ZNF433-AS1:31 No - ZNF433-AS1:32 No - ZNF433-AS1:33 No - lnc-ZNF136-1:12 No - lnc-ZNF136-1:15 No - lnc-ZNF136-1:13 No - lnc-ZNF136-1:14 No - lnc-ZNF136-1:16 No - lnc-ZNF791-1:2 No - lnc-ZNF791-1:3 No - lnc-ZNF791-1:5 No - lnc-ZNF791-1:4 No - lnc-GNG14-3:1 No - lnc-ASNA1-1:1 Yes chr3L:6200473-6203776 lnc-JUNB-4:1 Yes chr2L:19030844-19033498 lnc-GCDH-3:2 No - lnc-C19orf57-8:1 No - lnc-C19orf57-6:1 No - lnc-C19orf57-6:2 No - lnc-C19orf57-6:3 No - lnc-C19orf57-6:7 No - lnc-C19orf57-6:4 No - lnc-ZSWIM4-1:1 No - lnc-C19orf57-2:1 No - lnc-NANOS3-2:1 No - lnc-NANOS3-2:2 No - lnc-NANOS3-2:3 No - lnc-C19orf57-1:1 No - lnc-NANOS3-3:1 No - lnc-MISP3-3:1 Yes chr3L:19618894-19620398 lnc-MISP3-3:2 Yes chr3L:19618894-19620398 lnc-MISP3-3:3 Yes chr3L:19618894-19620398 lnc-MISP3-1:1 No - lnc-ADGRL1-1:1 No - lnc-ADGRL1-1:2 No - lnc-ADGRL1-1:3 No - lnc-ADGRL1-1:4 No - lnc-ADGRL1-1:5 No - lnc-ADGRL1-1:6 No - lnc-ADGRE5-6:1 No - lnc-DDX39A-4:1 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-NDUFB7-1:1 Yes chr3L:3903492-3905035 lnc-CIB3-1:3 No - lnc-CIB3-1:4 No - lnc-CIB3-1:5 No - lnc-CIB3-6:1 No - lnc-CIB3-6:2 No - lnc-CIB3-6:3 Yes chr3R:9557712-9559525 lnc-CIB3-6:4 Yes chr3R:9557712-9559525 lnc-AP1M1-1:1 No - lnc-EPS15L1-3:5 No - lnc-EPS15L1-3:3 No - lnc-EPS15L1-3:4 No - lnc-C19orf44-9:1 No - lnc-C19orf44-8:2 Yes chr4:778516-788978 lnc-C19orf44-8:4 Yes chr4:778516-788978 lnc-C19orf44-8:3 Yes chr4:778516-788978 lnc-USE1-4:1 No - lnc-NR2F6-5:1 No - lnc-NR2F6-5:2 No - BISPR:17 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:18 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:19 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:20 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:21 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:22 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:23 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:24 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:25 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:26 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:27 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:28 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:29 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:30 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:31 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:32 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:36 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:34 Yes chrX:18097558-18101314 BISPR:35 Yes chrX:18097558-18101314 lnc-NXNL1-3:9 No - lnc-NXNL1-3:10 Yes chr2L:10510672-10517218 lnc-NXNL1-3:11 Yes chr2L:10510672-10517218 lnc-NXNL1-3:12 Yes chr2L:10510672-10517218 lnc-NXNL1-3:13 Yes chr2L:10510672-10517218 lnc-NXNL1-3:14 Yes chr2L:10510672-10517218 lnc-NXNL1-7:1 Yes chrX:10847438-10848534 lnc-NXNL1-7:2 Yes chrX:10847438-10848534 lnc-IL12RB1-4:1 Yes chrX:5340236-5405138 lnc-IL12RB1-3:1 Yes chr3L:15566013-15576313 lnc-RAB3A-5:1 No - lnc-RAB3A-4:1 No - lnc-MPV17L2-1:9 No - lnc-MPV17L2-1:10 No - lnc-MPV17L2-1:13 No - lnc-MPV17L2-1:12 Yes chrX:3176440-3343767 lnc-PGPEP1-6:1 No - lnc-PGPEP1-6:2 No - lnc-PGPEP1-6:3 No - lnc-CRLF1-2:2 No - HOMER3-AS1:7 Yes chr2L:6719394-6723359 HOMER3-AS1:8 Yes chr2L:6719394-6723359 lnc-TM6SF2-1:7 No - lnc-TM6SF2-1:8 No - lnc-TM6SF2-1:4 No - lnc-TM6SF2-1:5 No - lnc-TM6SF2-1:6 No - lnc-SUGP1-3:1 No - lnc-GATAD2A-6:1 No - lnc-ZNF101-1:2 No - lnc-ZNF101-1:3 No - lnc-ZNF506-2:3 No - lnc-ZNF506-2:4 No - lnc-ZNF626-1:2 No - lnc-ZNF430-3:1 No - lnc-ZNF430-3:2 No - lnc-ZNF430-3:3 No - lnc-ZNF430-3:4 No - lnc-ZNF708-14:6 No - lnc-ZNF708-2:9 No - lnc-ZNF708-2:10 No - lnc-ZNF708-2:11 No - lnc-ZNF708-2:12 No - lnc-ZNF708-2:13 No - lnc-ZNF708-2:14 No - lnc-ZNF708-2:15 No - lnc-ZNF708-2:8 No - lnc-ZNF708-2:16 No - lnc-ZNF708-2:17 No - lnc-ZNF708-2:18 No - LINC00664:10 No - LINC00664:11 No - lnc-ZNF708-14:2 No - lnc-ZNF708-14:3 No - lnc-ZNF708-14:4 No - lnc-ZNF100-2:5 No - lnc-ZNF100-10:4 No - LINC01785:8 No - LINC01785:9 No - LINC01224:47 No - LINC01224:48 No - LINC01224:31 No - LINC01224:30 No - LINC01224:20 No - LINC01224:21 No - LINC01224:22 No - LINC01224:23 No - LINC01224:24 No - LINC01224:25 No - LINC01224:26 No - LINC01224:27 No - LINC01224:28 No - LINC01224:19 No - LINC01224:29 No - LINC00662:45 No - LINC00662:69 No - LINC00662:72 No - LINC00662:71 No - LINC00662:76 No - LINC00662:73 No - LINC00662:74 No - LINC00662:55 No - LINC00662:75 No - LINC00662:64 No - LINC00662:70 No - LINC00662:46 No - lnc-VSTM2B-9:31 No - lnc-VSTM2B-9:32 No - LINC00662:56 No - LINC00662:57 No - LINC00662:47 No - LINC00662:65 No - LINC00662:66 No - LINC00662:48 No - LINC00662:59 No - LINC00662:49 No - LINC00662:51 No - LINC00662:67 No - LINC00662:62 No - LINC00662:60 No - LINC00662:63 No - LINC00662:52 No - LINC00662:53 No - LINC00662:58 No - lnc-VSTM2B-9:33 No - LINC00662:50 No - LINC00662:54 No - lnc-VSTM2B-9:34 No - lnc-VSTM2B-17:3 No - lnc-VSTM2B-17:4 No - lnc-VSTM2B-17:5 No - lnc-VSTM2B-17:6 No - lnc-VSTM2B-17:7 No - lnc-VSTM2B-17:8 No - lnc-UQCRFS1-16:4 No - lnc-UQCRFS1-16:5 No - lnc-UQCRFS1-16:6 No - lnc-UQCRFS1-3:24 No - lnc-UQCRFS1-3:17 No - lnc-UQCRFS1-3:15 No - lnc-UQCRFS1-3:11 No - lnc-UQCRFS1-3:25 No - lnc-UQCRFS1-3:26 No - lnc-UQCRFS1-3:18 No - lnc-UQCRFS1-3:12 No - lnc-UQCRFS1-3:23 No - lnc-UQCRFS1-3:27 No - lnc-UQCRFS1-3:13 No - lnc-UQCRFS1-3:14 No - lnc-UQCRFS1-3:19 No - lnc-UQCRFS1-3:16 No - lnc-UQCRFS1-3:10 No - lnc-VSTM2B-7:7 No - lnc-VSTM2B-7:8 No - lnc-VSTM2B-7:9 No - lnc-VSTM2B-7:6 No - LINC01532:5 No - LINC01532:7 No - LINC01532:8 No - LINC01532:9 No - LINC01532:6 No - lnc-VSTM2B-5:8 Yes chr2L:1612429-1614160 lnc-VSTM2B-5:9 Yes chr2L:1612429-1614160 lnc-VSTM2B-5:10 Yes chr2L:1612429-1614160 lnc-VSTM2B-5:11 Yes chr2L:1612429-1614160 lnc-VSTM2B-5:12 Yes chr2L:1612429-1614160 lnc-VSTM2B-5:13 Yes chr2L:1612429-1614160 lnc-VSTM2B-5:16 Yes chr2L:1612429-1614160 lnc-VSTM2B-5:15 Yes chr2L:1612429-1614160 lnc-VSTM2B-5:14 Yes chr2L:1612429-1614160 lnc-VSTM2B-5:17 Yes chr2L:1612429-1614160 lnc-VSTM2B-5:18 Yes chr2L:1612429-1614160 lnc-UQCRFS1-1:4 No - lnc-UQCRFS1-1:5 No - lnc-C19orf12-12:1 No - lnc-C19orf12-12:2 Yes chr3L:7977805-7978650 lnc-C19orf12-12:3 Yes chr3L:7977805-7978650 lnc-C19orf12-11:1 No - lnc-C19orf12-11:2 No - lnc-C19orf12-11:3 No - lnc-ZNF536-8:5 No - lnc-ZNF536-8:6 No - lnc-ZNF536-8:7 No - lnc-ZNF536-8:8 No - lnc-ZNF536-8:9 No - lnc-ZNF536-8:10 No - lnc-ZNF536-8:11 No - lnc-ZNF536-8:12 No - lnc-ZNF536-8:13 No - lnc-ZNF536-8:14 No - lnc-ZNF536-8:15 No - lnc-ZNF536-8:16 No - lnc-ZNF536-8:17 No - lnc-ZNF536-8:18 No - lnc-ZNF536-8:19 No - lnc-ANKRD27-2:11 No - lnc-ANKRD27-2:13 Yes chrX:18653392-18657286 lnc-ANKRD27-2:14 Yes chrX:18653392-18657286 lnc-ANKRD27-2:15 Yes chrX:18653392-18657286 lnc-ANKRD27-2:16 Yes chrX:18653392-18657286 lnc-ANKRD27-2:12 Yes chrX:18653392-18657286 lnc-ANKRD27-2:17 Yes chrX:18653392-18657286 lnc-ANKRD27-2:10 Yes chrX:18653392-18657286 lnc-ANKRD27-1:4 Yes chr2L:19490262-19491679 lnc-ANKRD27-1:6 No - lnc-ANKRD27-1:5 Yes chr2L:19490262-19491679 lnc-RHPN2-3:1 Yes chr3L:13925882-13929000 CEBPA-DT:12 No - CEBPA-DT:13 No - CEBPA-DT:14 No - CEBPA-DT:15 No - lnc-PEPD-3:1 No - lnc-PEPD-4:1 Yes chr2R:21560246-21576035 lnc-PEPD-4:2 Yes chr2R:21560246-21576035 lnc-PEPD-9:1 No - lnc-KCTD15-2:3 No - lnc-SCGB2B2-133:1 No - lnc-SCGB2B2-133:2 No - lnc-SCGB2B2-133:3 No - lnc-SCGB2B2-12:1 Yes chr2R:8910900-8914069 lnc-SCGB2B2-12:2 Yes chr2R:8910900-8914069 lnc-SCGB2B2-12:3 Yes chr2R:8910900-8914069 lnc-SCGB2B2-12:4 Yes chr2R:8910900-8914069 lnc-SCGB2B2-12:5 Yes chr2R:8910900-8914069 lnc-SCGB2B2-130:1 Yes chr3R:12456573-12458444 lnc-SCGB2B2-130:2 Yes chr3R:12456573-12458444 lnc-SCGB2B2-130:3 Yes chr3R:12456573-12458444 lnc-ZNF599-5:3 No - LINC01801:23 No - LINC01801:15 No - LINC01801:16 No - ZNF30-AS1:4 No - ZNF30-AS1:5 No - ZNF30-AS1:6 No - ZNF30-AS1:7 No - lnc-ZNF792-8:1 No - lnc-ZNF792-7:2 Yes chr2L:3358640-3373372 lnc-LSR-1:6 No - lnc-FAM187B-5:1 No - lnc-KRTDAP-1:5 No - lnc-KRTDAP-1:6 No - lnc-FFAR2-2:1 No - lnc-FFAR2-2:2 No - TMEM147-AS1:11 No - TMEM147-AS1:12 No - TMEM147-AS1:9 No - TMEM147-AS1:13 No - TMEM147-AS1:10 No - TMEM147-AS1:14 No - lnc-HAUS5-4:1 No - UPK1A-AS1:3 No - UPK1A-AS1:2 No - lnc-ZBTB32-4:1 No - lnc-LIN37-3:2 No - lnc-PRODH2-5:2 No - lnc-PRODH2-5:3 No - lnc-PRODH2-5:4 No - lnc-TYROBP-3:1 No - lnc-ALKBH6-1:5 No - LINC00665:26 No - LINC00665:27 No - LINC00665:28 No - LINC00665:29 No - LINC00665:30 No - LINC00665:31 No - LINC00665:32 No - LINC00665:33 No - lnc-ZNF382-5:2 No - lnc-ZNF382-1:2 Yes chr3L:21724326-21728806 ZNF529-AS1:13 No - ZNF529-AS1:12 No - ZNF529-AS1:14 No - ZNF529-AS1:15 No - ZNF529-AS1:16 No - ZNF529-AS1:17 No - ZNF529-AS1:18 No - ZNF529-AS1:19 No - ZNF529-AS1:20 No - ZNF529-AS1:21 No - LINC01534:12 No - LINC01534:13 No - LINC01534:14 No - LINC01534:15 No - LINC01534:16 No - LINC01534:17 No - LINC01534:11 No - lnc-ZNF345-29:5 No - lnc-ZNF345-29:6 No - lnc-ZNF345-29:7 No - lnc-ZNF345-29:8 No - lnc-ZNF345-29:9 No - lnc-ZNF585A-4:4 No - lnc-ZNF585A-4:3 No - lnc-ZNF585A-4:5 No - LINC01535:18 No - LINC01535:17 No - LINC01535:19 No - LINC01535:21 No - LINC01535:22 No - LINC01535:23 No - LINC01535:24 No - LINC01535:20 No - lnc-ZNF569-6:3 Yes chr2L:12046711-12048918 ZNF793-AS1:16 No - ZNF793-AS1:17 No - ZNF793-AS1:18 No - ZNF793-AS1:19 No - ZNF793-AS1:20 No - ZNF793-AS1:15 No - lnc-ZNF571-1:2 No - lnc-ZNF571-1:3 No - lnc-ZNF571-1:4 No - lnc-SIPA1L3-6:1 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-SIPA1L3-6:2 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-SIPA1L3-6:3 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-SIPA1L3-6:4 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-SIPA1L3-6:5 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-SIPA1L3-6:9 No - lnc-SIPA1L3-6:10 No - lnc-SIPA1L3-6:11 No - lnc-SIPA1L3-6:12 No - lnc-SIPA1L3-6:13 No - lnc-SIPA1L3-6:15 No - lnc-GGN-4:1 No - lnc-RASGRP4-1:1 Yes chr2R:14759646-14769423 lnc-CAPN12-1:2 Yes chrX:2023822-2042311 lnc-LGALS7B-1:2 No - lnc-LGALS7B-1:3 No - lnc-LGALS7B-1:4 No - lnc-FBXO27-3:1 Yes chrX:10870594-10877893 lnc-LRFN1-1:4 Yes chr2R:8009119-8013755 lnc-LRFN1-1:5 Yes chr2R:8009119-8013755 lnc-LRFN1-1:2 Yes chr2R:8009119-8013755 lnc-LRFN1-1:6 Yes chr2R:8009119-8013755 lnc-LRFN1-1:3 No - lnc-PAF1-3:1 Yes chr2R:11359437-11360163 lnc-RPS16-3:1 Yes chr2R:18554119-18611777 lnc-RPS16-4:1 Yes chr2R:19437483-19441898 lnc-LEUTX-3:1 No - lnc-ZNF780B-3:5 No - lnc-ZNF780B-3:6 No - lnc-ZNF780B-3:1 No - lnc-ZNF780B-3:2 No - lnc-ZNF780B-3:3 No - lnc-ZNF546-4:1 No - lnc-TTC9B-2:1 No - lnc-TTC9B-2:2 No - lnc-TTC9B-2:3 No - lnc-PLD3-4:2 No - lnc-SPTBN4-3:2 No - lnc-SPTBN4-3:3 No - lnc-CYP2A6-4:1 Yes chr2R:17573462-17574979 lnc-TGFB1-6:1 No - lnc-TGFB1-6:2 No - PCAT19:22 No - PCAT19:23 No - PCAT19:19 No - PCAT19:27 No - PCAT19:20 No - PCAT19:24 No - PCAT19:25 No - PCAT19:28 No - PCAT19:29 No - PCAT19:21 No - LINC01480:12 No - LINC01480:13 No - LINC01480:14 No - LINC01480:16 No - LINC01480:19 No - LINC01480:17 No - LINC01480:20 No - LINC01480:18 No - LINC01480:24 No - LINC01480:22 No - LINC01480:23 No - lnc-POU2F2-1:2 Yes chr2R:21634679-21638399 lnc-POU2F2-1:3 Yes chr2R:21634679-21638399 lnc-ZNF574-1:4 Yes chr2L:12587625-12628135 lnc-ZNF574-1:5 Yes chr2L:12587625-12628135 lnc-ZNF574-1:6 Yes chr2L:12587625-12628135 lnc-ZNF574-1:7 Yes chr2L:12587625-12628135 lnc-ZNF574-1:8 Yes chr2L:12587625-12628135 lnc-ZNF574-1:9 Yes chr2L:12587625-12628135 LIPE-AS1:14 No - LIPE-AS1:19 No - LIPE-AS1:20 No - LIPE-AS1:21 No - LIPE-AS1:22 No - LIPE-AS1:23 No - LIPE-AS1:24 No - LIPE-AS1:25 No - LIPE-AS1:26 No - LIPE-AS1:27 No - LIPE-AS1:30 No - lnc-CD177-5:1 No - lnc-CD177-5:3 No - lnc-CD177-5:4 No - lnc-CD177-5:5 No - lnc-PLAUR-1:1 No - lnc-IRGC-5:1 Yes chrX:1937700-1940040 lnc-IRGC-5:2 No - lnc-IRGC-6:1 No - lnc-ZNF221-2:2 No - lnc-ZNF221-2:3 No - lnc-ZNF221-2:4 No - lnc-ZNF221-2:5 No - lnc-ZNF221-2:6 No - lnc-ZNF221-2:7 No - lnc-ZNF45-2:5 No - lnc-ZNF45-2:6 No - lnc-ZNF45-2:9 No - lnc-ZNF45-2:7 No - lnc-ZNF45-2:8 No - lnc-ZNF235-4:5 No - lnc-ZNF235-4:4 No - lnc-ZNF235-4:7 No - lnc-ZNF235-4:6 No - lnc-ZNF235-3:2 No - lnc-ZNF235-3:3 No - lnc-ZNF233-1:7 No - lnc-ZNF229-1:5 No - lnc-CEACAM20-1:2 No - lnc-CEACAM20-1:3 No - lnc-CEACAM20-1:4 No - lnc-CEACAM20-1:5 No - lnc-CEACAM20-8:1 No - lnc-CEACAM20-8:7 No - lnc-CEACAM20-8:8 No - lnc-CEACAM20-8:3 No - lnc-CEACAM20-8:2 No - lnc-CEACAM20-2:1 No - lnc-CEACAM20-2:7 No - lnc-CEACAM20-2:8 No - lnc-CEACAM20-2:9 No - lnc-CEACAM20-2:10 No - lnc-CEACAM20-2:2 No - lnc-CEACAM20-2:3 No - lnc-CEACAM20-2:4 No - lnc-CEACAM20-2:11 No - lnc-CEACAM20-2:5 No - lnc-ZNF296-7:2 No - lnc-ZNF296-7:3 No - lnc-ZNF296-7:4 No - lnc-ZNF296-7:5 Yes chrX:7736893-7739978 GEMIN7-AS1:12 No - GEMIN7-AS1:13 No - GEMIN7-AS1:14 No - GEMIN7-AS1:15 No - GEMIN7-AS1:16 No - lnc-TRAPPC6A-3:1 Yes chr3R:11346294-11353131 lnc-TRAPPC6A-3:2 Yes chr3R:11346294-11353131 lnc-RTN2-2:1 Yes chr2R:14852941-14853948 lnc-FOXA3-2:1 No - lnc-FOXA3-3:1 No - lnc-IGFL3-1:5 No - lnc-IGFL3-1:6 No - lnc-IGFL3-1:7 No - lnc-IGFL3-1:8 No - lnc-IGFL3-1:9 No - lnc-CCDC8-6:1 No - lnc-CCDC8-1:3 Yes chr3R:9747875-9751094 DACT3-AS1:6 No - DACT3-AS1:7 No - lnc-BBC3-3:1 No - lnc-MEIS3-1:1 No - lnc-DHX34-4:2 No - lnc-ZNF541-3:2 No - lnc-ZSWIM9-2:1 No - lnc-ZSWIM9-2:2 No - CARD8-AS1:5 No - CARD8-AS1:6 No - lnc-LMTK3-6:1 No - lnc-LMTK3-6:2 Yes chr2R:5754517-5756327 lnc-LMTK3-4:7 No - lnc-LMTK3-4:5 No - lnc-LMTK3-4:6 No - lnc-LMTK3-4:8 No - lnc-LMTK3-4:9 No - lnc-LMTK3-4:10 No - lnc-LMTK3-5:1 Yes chr2L:21740041-21757466 lnc-LMTK3-2:2 No - lnc-BCAT2-1:1 No - lnc-FGF21-2:5 Yes chrX:13396899-13401224 lnc-LHB-1:4 No - lnc-LHB-1:5 No - lnc-LHB-1:6 No - lnc-LHB-1:7 No - lnc-LHB-1:3 No - lnc-KCNA7-2:1 No - lnc-DKKL1-1:2 Yes chrX:15804370-15827682 lnc-DKKL1-1:3 Yes chrX:15804370-15827682 lnc-TEAD2-1:3 No - lnc-TEAD2-1:4 No - lnc-TEAD2-1:5 No - lnc-TEAD2-1:6 No - lnc-TEAD2-1:2 No - lnc-IRF3-2:1 No - lnc-IRF3-2:2 No - lnc-IRF3-2:3 No - lnc-TSKS-2:1 No - PTOV1-AS1:7 No - PTOV1-AS1:10 No - PTOV1-AS1:8 Yes chr3R:24227023-24228538 PTOV1-AS1:9 Yes chr3R:24227023-24228538 lnc-ZNF473-1:3 No - lnc-ZNF473-1:4 No - lnc-IZUMO2-2:2 No - lnc-IZUMO2-2:3 No - lnc-FAM71E1-2:10 Yes chr3L:21574131-21575874 lnc-FAM71E1-2:3 Yes chr3L:21574131-21575874 lnc-FAM71E1-2:9 Yes chr3L:21574131-21575874 lnc-FAM71E1-2:7 Yes chr3L:21574131-21575874 lnc-FAM71E1-2:4 Yes chr3L:21574131-21575874 lnc-FAM71E1-2:5 Yes chr3L:21574131-21575874 lnc-FAM71E1-2:11 Yes chr3L:21574131-21575874 lnc-SHANK1-3:1 No - LINC01869:17 No - LINC01869:18 No - LINC01869:19 No - LINC01869:20 No - LINC01869:21 No - lnc-KLK2-5:2 No - lnc-KLK2-5:3 No - lnc-IGLON5-1:12 No - SPACA6P-AS:3 No - SPACA6P-AS:4 No - lnc-HAS1-2:1 No - lnc-HAS1-2:2 No - lnc-FPR3-1:1 No - lnc-ZNF613-5:2 No - lnc-ZNF613-5:4 No - lnc-ZNF613-5:5 No - lnc-ZNF613-7:3 No - lnc-ZNF836-1:7 No - lnc-ZNF836-1:5 Yes chr3R:25331363-25340088 lnc-ZNF836-1:6 Yes chr3R:25331363-25340088 lnc-ZNF836-1:4 Yes chr3R:25331363-25340088 lnc-ZNF836-1:9 Yes chr3R:25331363-25340088 lnc-ZNF836-1:8 Yes chr3R:25331363-25340088 lnc-ZNF836-1:10 Yes chr3R:25331363-25340088 lnc-ZNF836-1:11 Yes chr3R:25331363-25340088 lnc-ZNF836-1:12 Yes chr3R:25331363-25340088 ZNF528-AS1:13 No - ZNF528-AS1:14 No - ZNF528-AS1:16 No - ZNF528-AS1:17 No - ZNF528-AS1:20 No - ZNF528-AS1:18 No - ZNF528-AS1:19 No - ZNF528-AS1:15 No - lnc-ZNF320-1:4 No - lnc-ZNF320-1:5 No - lnc-ZNF320-1:6 No - lnc-ZNF320-1:7 No - lnc-ZNF320-1:3 No - lnc-ZNF320-1:8 No - lnc-ZNF160-2:1 No - lnc-ZNF160-2:2 No - lnc-ZNF160-2:3 No - lnc-VN1R2-5:6 No - lnc-VN1R2-5:8 No - lnc-VN1R2-5:9 No - lnc-VN1R2-5:10 No - lnc-VN1R2-5:7 No - lnc-VN1R2-5:11 No - lnc-VN1R2-5:12 No - lnc-ZNF761-5:1 No - lnc-ZNF761-5:2 No - lnc-DPRX-2:1 No - lnc-NLRP12-1:14 No - lnc-NLRP12-1:11 No - lnc-NLRP12-1:15 No - lnc-NLRP12-1:12 No - lnc-MYADM-1:2 No - lnc-NLRP12-1:13 No - lnc-NLRP12-1:9 No - lnc-NLRP12-1:7 No - lnc-NLRP12-1:8 No - lnc-NLRP12-1:10 No - lnc-TFPT-3:2 Yes chr3L:15159100-15161138 lnc-TFPT-3:1 No - lnc-TFPT-3:3 No - lnc-LILRA4-1:15 No - lnc-LILRA4-1:10 No - LENG8-AS1:22 Yes chr2L:10837732-10842597 LENG8-AS1:23 Yes chr2L:10837732-10842597 LENG8-AS1:20 Yes chr2L:10837732-10842597 LENG8-AS1:24 Yes chr2L:10837732-10842597 LENG8-AS1:21 Yes chr2L:10837732-10842597 lnc-BRSK1-4:1 No - lnc-RPL28-1:2 No - lnc-C19orf85-4:2 No - lnc-ZNF579-1:2 No - lnc-ZNF579-1:3 No - lnc-ZNF784-4:1 Yes chrX:16356696-16359039 lnc-ZNF444-1:2 No - lnc-EDDM13-5:3 No - lnc-EDDM13-5:4 No - lnc-EDDM13-5:5 No - lnc-EDDM13-5:6 No - lnc-EDDM13-5:9 No - lnc-EDDM13-5:10 No - lnc-EDDM13-5:11 No - lnc-EDDM13-5:12 No - lnc-ZNF582-6:6 No - lnc-ZNF582-6:8 No - lnc-ZNF582-6:7 No - ZNF582-AS1:30 No - ZNF582-AS1:31 No - ZNF582-AS1:32 No - ZNF582-AS1:33 No - ZNF582-AS1:34 No - ZNF582-AS1:35 No - ZNF582-AS1:36 No - ZNF582-AS1:37 No - ZNF582-AS1:38 No - ZNF582-AS1:41 No - ZNF582-AS1:39 No - ZNF582-AS1:42 No - ZNF582-AS1:43 No - ZNF582-AS1:40 No - ZNF582-AS1:44 No - lnc-ZNF582-1:4 No - lnc-ZNF582-1:5 No - lnc-ZNF582-1:6 No - ZNF667-AS1:14 No - ZNF667-AS1:15 No - ZNF667-AS1:16 No - ZNF667-AS1:17 No - ZNF667-AS1:18 No - ZNF667-AS1:19 No - ZNF667-AS1:20 No - ZNF667-AS1:23 No - ZNF667-AS1:24 No - ZNF667-AS1:21 No - ZNF667-AS1:25 No - ZNF667-AS1:26 No - ZNF667-AS1:22 No - ZNF667-AS1:27 No - ZNF667-AS1:28 No - ZNF667-AS1:29 No - ZNF667-AS1:30 No - lnc-ZNF667-2:4 No - lnc-ZNF667-2:5 No - lnc-ZNF667-2:6 No - lnc-SMIM17-5:1 No - lnc-SMIM17-5:2 No - lnc-SMIM17-5:3 No - lnc-SMIM17-5:4 No - lnc-SMIM17-5:5 No - lnc-SMIM17-5:6 No - MIMT1:5 No - MIMT1:6 No - MIMT1:7 No - MIMT1:8 No - MIMT1:9 No - ZNF460-AS1:17 No - ZNF460-AS1:18 No - ZNF460-AS1:19 No - ZNF460-AS1:20 No - ZNF460-AS1:21 No - ZNF460-AS1:22 No - ZNF460-AS1:23 No - lnc-VN1R1-2:2 No - lnc-VN1R1-3:1 No - lnc-VN1R1-3:2 No - lnc-VN1R1-1:2 No - lnc-VN1R1-1:3 No - lnc-VN1R1-1:4 No - lnc-ZNF419-3:2 No - lnc-ZNF419-3:3 No - lnc-ZNF419-3:4 No - lnc-ZNF416-1:1 No - lnc-ZNF416-1:2 No - lnc-ZNF135-2:1 No - lnc-A1BG-1:9 No - lnc-A1BG-1:8 No - lnc-A1BG-1:7 No - lnc-A1BG-1:11 No - lnc-A1BG-1:10 No - lnc-A1BG-2:8 No - lnc-A1BG-2:9 No - lnc-A1BG-2:10 No - lnc-A1BG-2:14 No - lnc-A1BG-2:11 No - lnc-A1BG-2:12 No - lnc-A1BG-2:13 No - lnc-A1BG-2:7 No - A1BG-AS1:16 No - lnc-RPS5-4:2 No - lnc-ZNF837-1:6 No - lnc-ZNF837-1:7 No - lnc-ZNF837-1:8 No - lnc-ZNF837-1:1 No - lnc-ZNF837-1:2 No - lnc-ZNF837-1:9 No - lnc-ZNF837-1:10 No - lnc-ZNF837-1:11 No - lnc-ZNF324B-1:2 No - lnc-ZNF324B-1:3 No - lnc-SLC27A5-3:2 No - lnc-TRIM28-13:1 Yes chr3L:8195847-8197987 lnc-TRIM28-14:1 No - lnc-TRIM28-14:2 No - lnc-TRIM28-14:4 No - lnc-ALKAL2-2:23 No - lnc-ALKAL2-2:24 No - lnc-ALKAL2-2:25 No - lnc-ACP1-9:6 No - lnc-ACP1-9:7 No - lnc-ACP1-9:8 No - lnc-ACP1-9:9 No - lnc-ACP1-9:5 No - lnc-ACP1-9:10 No - lnc-SNTG2-3:7 No - lnc-TMEM18-12:7 No - lnc-TMEM18-12:9 No - lnc-TMEM18-12:8 No - lnc-PXDN-1:2 No - lnc-MYT1L-1:2 No - lnc-MYT1L-1:3 No - lnc-MYT1L-1:4 No - lnc-MYT1L-1:5 No - lnc-MYT1L-1:6 No - lnc-TRAPPC12-1:5 Yes chr3L:10663376-10664435 lnc-TRAPPC12-1:6 Yes chr3L:10663376-10664435 RNASEH1-AS1:19 Yes chr2R:7931054-7932380 RNASEH1-AS1:20 Yes chr2R:7931054-7932380 RNASEH1-AS1:21 Yes chr2R:7931054-7932380 RNASEH1-AS1:22 Yes chr2R:7931054-7932380 RNASEH1-AS1:23 Yes chr2R:7931054-7932380 RNASEH1-AS1:24 Yes chr2R:7931054-7932380 RNASEH1-AS1:25 Yes chr2R:7931054-7932380 RNASEH1-AS1:26 No - RNASEH1-AS1:27 No - RNASEH1-AS1:28 No - RNASEH1-AS1:29 No - lnc-RNASEH1-12:2 No - lnc-RNASEH1-12:3 No - lnc-RNASEH1-12:4 No - lnc-RNASEH1-12:5 No - LINC01248:18 No - LINC01248:19 No - lnc-SOX11-1:3 Yes chr2R:23978801-23985177 lnc-SOX11-1:4 Yes chr2R:23978801-23985177 lnc-SOX11-1:5 Yes chr2R:23978801-23985177 lnc-SOX11-2:13 No - lnc-SOX11-2:14 No - LINC01105:17 No - LINC01105:19 No - LINC01105:20 No - LINC01105:18 No - LINC01105:21 No - LINC01105:22 No - LINC01105:23 No - LINC01105:24 No - LINC01105:25 No - LINC01105:26 No - LINC01105:27 No - LINC01871:10 No - LINC01871:13 No - lnc-ID2-9:2 No - lnc-ID2-9:3 No - LINC01814:7 No - LINC01814:8 No - ID2-AS1:16 Yes chr3L:749400-753492 ID2-AS1:23 No - ID2-AS1:26 No - ID2-AS1:27 No - ID2-AS1:28 No - ID2-AS1:18 Yes chr3L:749400-753492 ID2-AS1:19 Yes chr3L:749400-753492 ID2-AS1:20 Yes chr3L:749400-753492 ID2-AS1:17 Yes chr3L:749400-753492 ID2-AS1:21 Yes chr3L:749400-753492 ID2-AS1:22 No - ID2-AS1:24 No - ID2-AS1:25 No - ID2-AS1:14 Yes chr3L:749400-753492 ID2-AS1:15 Yes chr3L:749400-753492 lnc-ASAP2-5:2 No - lnc-ASAP2-5:3 No - lnc-IAH1-2:8 Yes chr3R:30000530-30003678 lnc-IAH1-2:9 Yes chr3R:30000530-30003678 lnc-IAH1-2:10 No - lnc-IAH1-2:11 No - lnc-IAH1-2:13 No - lnc-IAH1-2:14 No - lnc-IAH1-2:15 No - lnc-IAH1-2:16 No - lnc-IAH1-2:17 No - lnc-IAH1-2:18 No - lnc-IAH1-2:20 No - lnc-IAH1-2:21 No - lnc-IAH1-2:19 No - lnc-IAH1-3:3 No - lnc-IAH1-3:4 No - lnc-IAH1-3:5 No - lnc-IAH1-3:6 No - lnc-YWHAQ-3:1 No - lnc-YWHAQ-3:2 No - lnc-KLF11-1:2 No - lnc-KLF11-1:3 Yes chr2L:476446-479688 lnc-KLF11-1:4 Yes chr2L:476446-479688 lnc-KLF11-1:5 Yes chr2L:476446-479688 lnc-KLF11-1:6 No - lnc-KLF11-1:7 No - lnc-KLF11-1:8 Yes chr2L:476446-479688 lnc-CYS1-1:7 Yes chr2L:476446-479688 lnc-CYS1-1:8 Yes chr2L:476446-479688 lnc-CYS1-1:9 Yes chr2L:476446-479688 lnc-CYS1-1:12 Yes chr2L:476446-479688 lnc-CYS1-1:10 Yes chr2L:476446-479688 lnc-CYS1-1:11 Yes chr2L:476446-479688 lnc-CYS1-1:13 Yes chr2L:476446-479688 lnc-CYS1-1:14 No - lnc-CYS1-1:15 No - lnc-CYS1-9:1 Yes chr2R:11983145-11985393 lnc-CYS1-9:2 Yes chr2R:11983145-11985393 lnc-CYS1-9:3 Yes chr2R:11983145-11985393 lnc-KLF11-3:2 Yes chr2R:11983145-11985393 lnc-ODC1-2:7 No - lnc-ODC1-2:8 No - lnc-ODC1-2:2 No - lnc-ODC1-2:3 No - lnc-ODC1-2:9 No - lnc-ODC1-2:5 No - lnc-ODC1-2:4 No - lnc-ODC1-2:6 No - lnc-HPCAL1-1:20 No - lnc-HPCAL1-1:19 No - lnc-HPCAL1-1:21 No - lnc-ATP6V1C2-5:4 No - lnc-ATP6V1C2-6:1 Yes chr2L:16354886-16356735 LINC01954:11 No - LINC01954:12 No - LINC01954:13 No - lnc-ROCK2-3:16 No - lnc-ROCK2-3:17 No - lnc-ROCK2-3:18 No - lnc-ROCK2-3:15 No - lnc-ROCK2-3:20 No - lnc-ROCK2-3:21 No - lnc-ROCK2-3:22 No - lnc-ROCK2-3:19 No - lnc-ROCK2-10:1 No - LINC00570:5 No - LINC00570:6 No - lnc-GREB1-1:3 Yes chr2R:8136986-8156654 lnc-GREB1-1:4 Yes chr2R:8136986-8156654 lnc-GREB1-1:5 Yes chr2R:8136986-8156654 lnc-NTSR2-2:2 Yes chr2R:8136986-8156654 lnc-NTSR2-2:4 Yes chr2R:8136986-8156654 lnc-NTSR2-2:5 Yes chr2R:8136986-8156654 lnc-NTSR2-2:6 Yes chr2R:8136986-8156654 lnc-NTSR2-2:3 Yes chr2R:8136986-8156654 MIR3681HG:15 No - MIR3681HG:17 No - MIR3681HG:18 No - MIR3681HG:16 No - MIR3681HG:19 No - MIR3681HG:20 No - MIR3681HG:21 No - MIR3681HG:22 No - MIR3681HG:25 No - MIR3681HG:26 No - MIR3681HG:23 No - MIR3681HG:24 No - MIR3681HG:27 No - MIR3681HG:28 No - MIR3681HG:30 No - MIR3681HG:31 No - MIR3681HG:29 No - MIR3681HG:32 No - lnc-NTSR2-9:5 No - lnc-NTSR2-9:1 No - lnc-NTSR2-9:2 No - lnc-NTSR2-9:3 No - lnc-NTSR2-9:4 No - lnc-NTSR2-4:2 Yes chr3L:20396288-20401609 lnc-NTSR2-4:3 No - lnc-NTSR2-4:4 No - lnc-NTSR2-5:12 No - lnc-NTSR2-5:13 No - lnc-NTSR2-5:14 No - lnc-NTSR2-5:15 No - lnc-NTSR2-5:16 No - lnc-NTSR2-5:17 No - lnc-NTSR2-5:18 No - lnc-NTSR2-5:10 No - lnc-NTSR2-5:11 No - lnc-NBAS-8:2 Yes chr3L:22263369-22266017 lnc-NBAS-8:5 Yes chr3L:22263369-22266017 lnc-NBAS-8:3 Yes chr3L:22263369-22266017 lnc-NBAS-8:6 Yes chr3L:22263369-22266017 lnc-NBAS-8:4 Yes chr3L:22263369-22266017 MYCNOS:11 Yes chrX:3373159-3391697 MYCNOS:10 Yes chrX:3373159-3391697 MYCNOS:9 Yes chrX:3373159-3391697 lnc-VSNL1-4:4 No - lnc-VSNL1-4:3 No - lnc-SMC6-3:1 Yes chr3L:2895017-2959579 LINC01376:14 No - LINC01376:15 No - LINC01376:7 No - LINC01376:10 No - LINC01376:8 No - LINC01376:11 No - LINC01376:9 No - LINC00954:14 No - LINC00954:15 No - LINC00954:16 No - LINC00954:10 No - LINC00954:17 No - LINC00954:11 No - LINC00954:12 No - LINC00954:13 No - lnc-RHOB-17:3 No - lnc-RHOB-3:5 No - lnc-RHOB-3:6 No - lnc-RHOB-3:7 No - lnc-RHOB-3:8 No - lnc-RHOB-2:9 No - lnc-RHOB-2:10 No - lnc-RHOB-2:11 No - lnc-RHOB-2:12 No - lnc-RHOB-2:13 No - lnc-RHOB-21:1 Yes chr3R:9066343-9237682 lnc-HS1BP3-4:1 No - HS1BP3-IT1:2 No - lnc-GDF7-5:1 No - lnc-GDF7-5:2 No - lnc-GDF7-7:1 No - lnc-GDF7-7:2 No - lnc-ATAD2B-15:1 No - lnc-ATAD2B-7:1 No - lnc-ATAD2B-7:2 No - lnc-NCOA1-4:1 Yes chr2L:21134439-21142347 lnc-NCOA1-4:2 Yes chr2L:21134439-21142347 lnc-NCOA1-4:3 Yes chr2L:21134439-21142347 lnc-NCOA1-4:4 Yes chr2L:21134439-21142347 DNAJC27-AS1:15 No - DNAJC27-AS1:17 No - DNAJC27-AS1:19 No - DNAJC27-AS1:20 No - DNAJC27-AS1:21 No - DNAJC27-AS1:22 No - DNAJC27-AS1:23 No - DNAJC27-AS1:18 No - DNAJC27-AS1:24 No - DNAJC27-AS1:25 No - lnc-DNAJC27-1:1 No - lnc-DNAJC27-1:2 No - lnc-EFR3B-7:1 No - lnc-EFR3B-7:2 No - lnc-EFR3B-4:3 Yes chr2R:12437345-12452916 lnc-KIF3C-2:1 No - lnc-KIF3C-3:1 No - lnc-KIF3C-3:2 No - lnc-KIF3C-3:3 No - lnc-KIF3C-3:4 No - lnc-KIF3C-3:5 No - lnc-SELENOI-1:1 No - lnc-SELENOI-1:2 No - lnc-SELENOI-1:4 No - lnc-SELENOI-1:5 No - lnc-CENPA-2:1 No - lnc-CENPA-2:2 No - lnc-OST4-6:2 Yes chr2L:4149279-4151203 lnc-OST4-6:3 Yes chr2L:4149279-4151203 lnc-OST4-6:7 Yes chr2L:4149279-4151203 lnc-OST4-6:4 No - lnc-OST4-6:5 No - lnc-OST4-6:6 No - lnc-SNX17-1:5 No - lnc-SNX17-1:6 No - lnc-SNX17-1:7 No - lnc-SNX17-1:9 No - lnc-SNX17-1:11 No - lnc-SNX17-1:12 No - lnc-SNX17-1:14 No - lnc-SNX17-1:15 No - lnc-NRBP1-2:2 No - lnc-PPM1G-3:1 Yes chr3R:5742510-5747138 lnc-PPM1G-3:2 Yes chr3R:5742510-5747138 lnc-RBKS-8:2 No - lnc-RBKS-8:1 No - lnc-TRMT61B-5:8 Yes chr3R:29765995-29794113 lnc-TRMT61B-5:4 Yes chr3R:29765995-29794113 lnc-TRMT61B-5:3 Yes chr3R:29765995-29794113 lnc-TRMT61B-5:10 No - lnc-TRMT61B-5:7 Yes chr3R:29765995-29794113 lnc-TRMT61B-5:9 Yes chr3R:29765995-29794113 lnc-TRMT61B-5:5 Yes chr3R:29765995-29794113 lnc-TRMT61B-5:6 Yes chr3R:29765995-29794113 lnc-TRMT61B-1:15 No - lnc-TRMT61B-1:17 No - lnc-TRMT61B-1:13 No - lnc-TRMT61B-1:18 No - lnc-TRMT61B-1:16 No - lnc-TRMT61B-1:14 No - lnc-TRMT61B-1:12 No - lnc-SPDYA-3:1 No - lnc-TOGARAM2-1:2 No - lnc-TOGARAM2-1:3 No - lnc-TOGARAM2-1:4 No - lnc-TOGARAM2-1:5 No - lnc-TOGARAM2-1:6 No - lnc-C2orf71-7:1 No - lnc-C2orf71-7:2 No - lnc-C2orf71-7:4 No - lnc-C2orf71-7:5 No - lnc-C2orf71-7:3 No - lnc-YPEL5-7:1 No - lnc-YPEL5-7:2 No - lnc-ALK-1:7 No - lnc-ALK-1:8 No - lnc-ALK-1:6 No - LINC01936:20 No - LINC01936:21 No - LINC01936:22 No - lnc-SRD5A2-3:4 No - lnc-SRD5A2-3:10 No - lnc-SRD5A2-3:5 No - lnc-SRD5A2-3:6 No - lnc-SRD5A2-3:7 No - lnc-SPAST-3:1 No - lnc-DPY30-6:1 No - lnc-DPY30-6:2 No - lnc-DPY30-6:3 No - lnc-NLRC4-3:3 Yes chr3R:24038215-24042982 lnc-NLRC4-3:4 No - lnc-NLRC4-6:1 No - lnc-NLRC4-4:3 No - lnc-NLRC4-4:2 Yes chr3R:10312039-10331353 LINC00486:22 No - LINC00486:23 No - LINC00486:24 No - LINC00486:25 No - LINC00486:21 No - lnc-FEZ2-7:4 No - lnc-FEZ2-7:5 No - lnc-FEZ2-7:6 No - lnc-FEZ2-7:7 No - lnc-CEBPZOS-5:1 No - lnc-QPCT-1:5 No - lnc-QPCT-1:6 No - lnc-QPCT-1:7 No - lnc-RMDN2-3:1 No - lnc-RMDN2-3:2 No - lnc-RMDN2-3:3 No - lnc-RMDN2-3:4 No - lnc-RMDN2-3:7 No - lnc-RMDN2-3:8 No - lnc-RMDN2-3:9 No - lnc-RMDN2-3:10 No - lnc-RMDN2-3:11 No - lnc-RMDN2-3:15 No - lnc-RMDN2-3:16 No - lnc-RMDN2-3:17 No - lnc-RMDN2-3:18 No - lnc-RMDN2-3:19 No - lnc-RMDN2-3:20 No - lnc-RMDN2-3:21 No - lnc-RMDN2-3:22 No - lnc-RMDN2-3:25 No - lnc-RMDN2-3:26 No - LINC00211:14 No - LINC00211:10 No - LINC00211:11 No - LINC00211:15 No - LINC00211:13 No - LINC00211:9 No - LINC00211:12 No - CYP1B1-AS1:36 Yes chr3L:5590083-5592571 CYP1B1-AS1:37 Yes chr3L:5590083-5592571 CYP1B1-AS1:38 Yes chr3L:5590083-5592571 CYP1B1-AS1:39 Yes chr3L:5590083-5592571 CYP1B1-AS1:40 Yes chr3L:5590083-5592571 CYP1B1-AS1:42 Yes chr3L:5590083-5592571 CYP1B1-AS1:41 Yes chr3L:5590083-5592571 CYP1B1-AS1:43 No - CYP1B1-AS1:44 No - lnc-CYP1B1-1:3 No - lnc-CYP1B1-1:5 No - lnc-CYP1B1-1:6 No - CYP1B1-AS1:45 No - lnc-CYP1B1-1:7 No - lnc-CYP1B1-1:4 No - lnc-ATL2-1:8 No - lnc-ATL2-1:9 No - lnc-ATL2-1:10 No - lnc-ATL2-1:11 No - lnc-ATL2-1:7 No - lnc-GALM-6:1 Yes chr2R:19517864-19631508 lnc-TMEM178A-1:7 No - lnc-TMEM178A-1:8 No - lnc-TMEM178A-1:9 No - lnc-TMEM178A-1:10 No - lnc-TMEM178A-1:11 No - lnc-TMEM178A-1:12 No - lnc-TMEM178A-1:13 No - lnc-TMEM178A-1:14 No - lnc-TMEM178A-1:24 No - lnc-TMEM178A-1:25 No - lnc-TMEM178A-1:26 No - lnc-TMEM178A-1:27 No - lnc-TMEM178A-1:28 No - lnc-TMEM178A-6:1 No - lnc-TMEM178A-6:2 No - lnc-TMEM178A-6:3 No - lnc-TMEM178A-6:4 No - lnc-TMEM178A-6:5 No - lnc-TMEM178A-6:6 No - lnc-TMEM178A-6:7 No - LINC01794:8 No - LINC01794:9 No - LINC01794:10 No - LINC01794:11 No - LINC01794:12 No - LINC01914:13 No - LINC01914:14 No - LINC01914:15 No - LINC01914:16 No - LINC01914:17 No - lnc-PKDCC-9:1 No - lnc-C2orf91-9:1 No - lnc-C2orf91-10:1 No - lnc-COX7A2L-4:4 Yes chr3L:14903805-14942907 lnc-COX7A2L-4:7 Yes chr3L:14903805-14942907 lnc-COX7A2L-4:8 Yes chr3L:14903805-14942907 lnc-COX7A2L-4:5 Yes chr3L:14903805-14942907 lnc-COX7A2L-4:9 Yes chr3L:14903805-14942907 lnc-COX7A2L-4:6 Yes chr3L:14903805-14942907 lnc-EML4-10:1 No - lnc-HAAO-5:2 No - lnc-HAAO-7:5 No - lnc-HAAO-7:6 No - lnc-HAAO-7:7 No - lnc-HAAO-7:8 No - lnc-HAAO-7:2 No - lnc-HAAO-7:3 No - lnc-HAAO-7:9 No - lnc-HAAO-7:10 No - lnc-HAAO-7:4 No - LINC01819:9 No - LINC01819:10 No - LINC01819:11 No - LINC02580:9 No - LINC02580:10 No - LINC02580:11 No - LINC02580:12 No - lnc-ZFP36L2-1:3 No - lnc-ZFP36L2-1:2 No - lnc-PLEKHH2-5:1 No - lnc-PLEKHH2-5:2 No - lnc-PREPL-3:4 Yes chr3R:26344290-26345473 lnc-PREPL-3:5 Yes chr3R:26344290-26345473 lnc-PREPL-3:6 Yes chr3R:26344290-26345473 LINC01833:34 No - LINC01833:24 No - LINC01833:25 No - LINC01833:26 No - LINC01833:35 No - LINC01833:36 No - LINC01833:27 No - LINC01833:28 No - LINC01833:23 No - LINC01833:33 No - SIX3-AS1:9 Yes chr2R:8031283-8042529 SIX3-AS1:10 No - SIX3-AS1:11 No - lnc-SIX2-1:2 No - lnc-SIX2-1:3 No - lnc-SIX2-1:4 No - lnc-SIX2-1:5 No - lnc-SIX2-1:6 No - lnc-SIX3-3:3 No - lnc-SIX3-3:4 No - lnc-PRKCE-3:2 Yes chr3R:22608670-22613656 lnc-PRKCE-3:1 Yes chr3R:22608670-22613656 lnc-SRBD1-1:3 No - lnc-SRBD1-1:4 No - lnc-SRBD1-1:5 No - lnc-SRBD1-1:7 No - lnc-SRBD1-1:6 No - lnc-ATP6V1E2-10:5 Yes chr3R:29039156-29049148 lnc-ATP6V1E2-10:8 No - lnc-ATP6V1E2-10:9 No - lnc-ATP6V1E2-10:10 No - lnc-ATP6V1E2-10:3 No - lnc-ATP6V1E2-10:6 No - lnc-ATP6V1E2-10:4 No - lnc-ATP6V1E2-10:7 No - lnc-ATP6V1E2-2:2 Yes chr3R:30058311-30121798 lnc-ATP6V1E2-2:3 Yes chr3R:30058311-30121798 lnc-ATP6V1E2-2:4 Yes chr3R:30058311-30121798 LINC01820:13 Yes chr3R:30058311-30121798 LINC01820:17 No - LINC01820:14 No - LINC01820:15 No - LINC01820:16 No - LINC01820:18 No - LINC01820:19 No - LINC01820:20 No - lnc-PIGF-4:2 Yes chr2L:18138675-18152417 lnc-PIGF-4:3 Yes chr2L:18138675-18152417 lnc-PIGF-4:4 Yes chr2L:18138675-18152417 lnc-MCFD2-3:1 No - lnc-MCFD2-3:2 No - lnc-CALM2-2:19 No - lnc-CALM2-2:11 No - lnc-CALM2-2:20 No - lnc-CALM2-2:12 No - lnc-CALM2-2:10 No - lnc-EPCAM-2:4 No - lnc-EPCAM-2:5 No - lnc-CALM2-2:16 No - lnc-CALM2-2:17 No - lnc-CALM2-2:15 No - lnc-CALM2-2:13 No - lnc-CALM2-2:14 No - lnc-CALM2-2:18 No - lnc-CALM2-2:21 No - lnc-MSH6-2:11 No - lnc-MSH6-2:12 No - lnc-FBXO11-7:1 No - lnc-FBXO11-1:4 Yes chrX:7682338-7709385 lnc-FBXO11-1:5 Yes chrX:7682338-7709385 lnc-FBXO11-1:6 Yes chrX:7682338-7709385 lnc-FBXO11-1:7 Yes chrX:7682338-7709385 lnc-FBXO11-1:8 Yes chrX:7682338-7709385 lnc-FBXO11-1:10 No - lnc-FBXO11-1:9 No - lnc-LHCGR-2:3 Yes chr3R:24528047-24529815 lnc-CHAC2-13:1 No - lnc-CHAC2-13:2 No - lnc-ASB3-1:3 No - lnc-ASB3-1:11 No - lnc-ASB3-1:4 No - lnc-ASB3-1:6 No - lnc-ASB3-1:8 No - lnc-ASB3-1:7 No - lnc-ASB3-1:9 No - lnc-ASB3-1:10 No - lnc-ASB3-1:5 No - lnc-ERLEC1-3:1 No - lnc-TSPYL6-5:1 Yes chr2L:5327975-5328879 lnc-TSPYL6-6:1 Yes chrX:17657372-17669371 lnc-RTN4-5:1 No - lnc-RTN4-5:2 No - lnc-EML6-7:1 Yes chr3R:7528864-7530241 lnc-EML6-7:2 Yes chr3R:7528864-7530241 lnc-EML6-7:3 Yes chr3R:7528864-7530241 lnc-EML6-7:4 Yes chr3R:7528864-7530241 lnc-RPS27A-5:1 Yes chr3R:28542274-28544817 lnc-PPP4R3B-4:2 No - lnc-CFAP36-3:2 Yes chr3R:13683921-13693905 lnc-CFAP36-3:3 Yes chr3R:13683921-13693905 lnc-CFAP36-3:4 Yes chr3R:13683921-13693905 lnc-CFAP36-3:5 Yes chr3R:13683921-13693905 lnc-CCDC85A-2:4 No - lnc-CCDC85A-2:6 No - lnc-CCDC85A-2:5 Yes chr4:215009-227748 MIR217HG:8 No - MIR217HG:9 No - MIR217HG:5 No - MIR217HG:6 No - MIR217HG:4 No - MIR217HG:7 No - lnc-CCDC85A-2:7 No - lnc-CCDC85A-2:8 No - lnc-CCDC85A-2:9 No - lnc-CCDC85A-2:10 No - lnc-CCDC85A-2:11 No - lnc-EFEMP1-3:8 Yes chr2L:2999286-3016069 lnc-EFEMP1-3:13 Yes chr2L:2999286-3016069 lnc-EFEMP1-3:14 Yes chr2L:2999286-3016069 lnc-EFEMP1-3:15 Yes chr2L:2999286-3016069 lnc-EFEMP1-3:16 Yes chr2L:2999286-3016069 lnc-EFEMP1-3:9 Yes chr2L:2999286-3016069 lnc-EFEMP1-3:10 Yes chr2L:2999286-3016069 lnc-EFEMP1-3:17 Yes chr2L:2999286-3016069 lnc-EFEMP1-3:11 Yes chr2L:2999286-3016069 lnc-EFEMP1-3:12 Yes chr2L:2999286-3016069 lnc-EFEMP1-3:7 Yes chr2L:2999286-3016069 lnc-VRK2-21:1 No - LINC01122:15 No - LINC01122:14 No - LINC01122:16 No - LINC01122:17 No - LINC01122:18 No - LINC01122:21 No - LINC01122:22 No - LINC01122:23 No - LINC01122:19 No - LINC01122:20 No - LINC01122:24 No - LINC01122:25 No - LINC01122:26 No - LINC01122:27 No - LINC01122:28 No - MIR4432HG:5 No - MIR4432HG:6 No - MIR4432HG:4 No - lnc-PAPOLG-13:1 No - LINC01185:7 No - LINC01185:8 No - LINC01185:5 No - LINC01185:6 No - LINC01185:9 No - LINC01185:4 No - lnc-USP34-1:12 No - lnc-USP34-1:13 No - lnc-USP34-1:15 No - lnc-USP34-1:14 No - lnc-C2orf74-5:2 Yes chr2L:8403573-8408853 lnc-C2orf74-5:3 Yes chr2L:8403573-8408853 lnc-C2orf74-5:4 Yes chr2L:8403573-8408853 lnc-C2orf74-5:5 Yes chr2L:8403573-8408853 lnc-C2orf74-5:6 Yes chr2L:8403573-8408853 lnc-C2orf74-5:9 No - lnc-C2orf74-5:11 Yes chr2L:8403573-8408853 lnc-C2orf74-5:12 Yes chr2L:8403573-8408853 lnc-C2orf74-5:13 Yes chr2L:8403573-8408853 lnc-COMMD1-8:1 No - lnc-FAM161A-4:1 No - lnc-FAM161A-1:7 No - lnc-FAM161A-1:3 No - lnc-FAM161A-1:4 No - lnc-FAM161A-1:5 No - lnc-FAM161A-1:6 No - lnc-COMMD1-7:1 No - lnc-COMMD1-7:2 No - lnc-CCT4-1:4 No - lnc-CCT4-1:8 No - lnc-CCT4-1:5 No - lnc-CCT4-1:6 No - lnc-CCT4-1:7 No - lnc-WDPCP-1:16 Yes chr3L:13011976-13015332 lnc-WDPCP-1:19 Yes chr3L:13011976-13015332 lnc-WDPCP-1:13 Yes chr3L:13011976-13015332 lnc-WDPCP-1:14 Yes chr3L:13011976-13015332 lnc-WDPCP-1:15 Yes chr3L:13011976-13015332 lnc-WDPCP-1:11 Yes chr3L:13011976-13015332 lnc-WDPCP-1:9 No - lnc-WDPCP-1:17 Yes chr3L:13011976-13015332 lnc-WDPCP-1:18 Yes chr3L:13011976-13015332 lnc-WDPCP-1:12 Yes chr3L:13011976-13015332 lnc-WDPCP-1:7 No - lnc-WDPCP-1:8 No - lnc-WDPCP-1:10 No - LGALSL-DT:8 No - LGALSL-DT:9 No - LGALSL-DT:10 No - LGALSL-DT:11 No - LGALSL-DT:12 No - lnc-SERTAD2-1:4 No - lnc-SERTAD2-1:3 No - lnc-SERTAD2-1:5 No - lnc-SERTAD2-6:2 No - lnc-SERTAD2-6:3 No - LINC02579:13 No - lnc-AFTPH-5:1 No - lnc-AFTPH-4:1 No - lnc-SERTAD2-3:10 No - lnc-SERTAD2-3:11 No - lnc-SERTAD2-10:1 No - lnc-AFTPH-5:2 No - lnc-AFTPH-5:3 No - lnc-AFTPH-5:4 No - lnc-AFTPH-5:5 No - lnc-SLC1A4-5:1 No - lnc-SERTAD2-3:12 No - lnc-SERTAD2-3:9 No - lnc-RAB1A-11:4 No - lnc-RAB1A-11:8 No - lnc-RAB1A-11:5 No - lnc-RAB1A-11:2 Yes chrX:16548290-16553968 lnc-RAB1A-11:6 No - lnc-RAB1A-11:7 No - lnc-SPRED2-22:1 Yes chrX:16548290-16553968 lnc-ACTR2-3:22 No - lnc-ACTR2-3:23 No - lnc-ACTR2-3:24 No - lnc-ACTR2-3:25 No - lnc-ACTR2-3:27 No - lnc-ACTR2-3:28 No - lnc-ACTR2-3:29 No - lnc-ACTR2-3:30 No - lnc-ACTR2-3:31 No - lnc-ACTR2-3:32 No - lnc-ACTR2-3:26 No - lnc-ACTR2-3:34 No - lnc-ACTR2-3:35 No - MEIS1-AS3:3 Yes chr3R:10507561-10639568 MEIS1-AS3:4 Yes chr3R:10507561-10639568 MEIS1-AS3:5 Yes chr3R:10507561-10639568 MEIS1-AS3:6 No - MEIS1-AS3:8 No - MEIS1-AS3:9 No - MEIS1-AS3:7 No - LINC01798:20 No - LINC01798:21 No - LINC01798:22 No - LINC01798:25 No - LINC01798:26 No - LINC01829:39 No - LINC01829:48 No - LINC01829:49 No - LINC01829:40 No - LINC01829:28 No - LINC01829:29 No - LINC01829:41 No - LINC01829:42 No - LINC01829:43 No - lnc-ETAA1-11:2 No - lnc-ETAA1-11:3 No - LINC01829:30 No - LINC01829:31 No - LINC01829:26 No - LINC01829:27 No - LINC01829:32 No - LINC01812:9 No - LINC01812:10 No - LINC01812:11 No - LINC01812:12 No - lnc-ETAA1-4:8 No - lnc-ETAA1-4:9 No - LINC01812:13 No - LINC01812:14 No - lnc-PNO1-5:1 No - lnc-PLEK-3:1 No - lnc-PLEK-3:2 No - lnc-PNO1-3:2 Yes chrX:5332499-5334449 LINC01890:8 No - LINC01890:13 No - LINC01890:9 No - LINC01888:6 No - LINC01890:10 No - lnc-ARHGAP25-2:1 No - lnc-ANTXR1-1:1 No - lnc-ASPRV1-4:1 No - PCBP1-AS1:300 No - PCBP1-AS1:258 No - PCBP1-AS1:243 No - PCBP1-AS1:233 No - PCBP1-AS1:223 Yes chr3L:21844788-21932702 PCBP1-AS1:273 No - PCBP1-AS1:234 No - PCBP1-AS1:262 No - PCBP1-AS1:232 No - PCBP1-AS1:225 No - PCBP1-AS1:259 No - PCBP1-AS1:254 No - PCBP1-AS1:226 No - PCBP1-AS1:227 No - PCBP1-AS1:274 No - PCBP1-AS1:275 No - PCBP1-AS1:244 No - PCBP1-AS1:276 No - PCBP1-AS1:302 No - PCBP1-AS1:219 Yes chr3L:21844788-21932702 PCBP1-AS1:222 Yes chr3L:21844788-21932702 PCBP1-AS1:277 No - PCBP1-AS1:278 No - PCBP1-AS1:235 No - PCBP1-AS1:304 No - PCBP1-AS1:305 No - PCBP1-AS1:279 No - PCBP1-AS1:280 No - PCBP1-AS1:213 Yes chr3L:21844788-21932702 PCBP1-AS1:303 No - PCBP1-AS1:281 No - PCBP1-AS1:269 No - PCBP1-AS1:249 No - PCBP1-AS1:257 No - PCBP1-AS1:260 No - PCBP1-AS1:240 No - PCBP1-AS1:282 No - PCBP1-AS1:245 No - PCBP1-AS1:301 No - PCBP1-AS1:221 Yes chr3L:21844788-21932702 PCBP1-AS1:220 Yes chr3L:21844788-21932702 PCBP1-AS1:283 No - PCBP1-AS1:236 No - PCBP1-AS1:284 No - PCBP1-AS1:285 No - PCBP1-AS1:286 No - PCBP1-AS1:224 Yes chr3L:21844788-21932702 PCBP1-AS1:287 No - PCBP1-AS1:270 No - PCBP1-AS1:267 No - PCBP1-AS1:271 No - PCBP1-AS1:288 No - PCBP1-AS1:263 No - PCBP1-AS1:241 No - PCBP1-AS1:250 No - PCBP1-AS1:216 Yes chr3L:21844788-21932702 PCBP1-AS1:237 No - PCBP1-AS1:256 No - PCBP1-AS1:251 No - PCBP1-AS1:289 No - PCBP1-AS1:252 No - PCBP1-AS1:246 No - PCBP1-AS1:242 No - PCBP1-AS1:228 No - PCBP1-AS1:229 No - PCBP1-AS1:217 Yes chr3L:21844788-21932702 PCBP1-AS1:230 No - PCBP1-AS1:261 No - PCBP1-AS1:264 No - PCBP1-AS1:265 No - PCBP1-AS1:255 No - PCBP1-AS1:247 No - PCBP1-AS1:238 No - PCBP1-AS1:266 No - PCBP1-AS1:214 Yes chr3L:21844788-21932702 PCBP1-AS1:290 No - PCBP1-AS1:291 No - PCBP1-AS1:253 No - PCBP1-AS1:248 No - PCBP1-AS1:231 No - PCBP1-AS1:292 No - PCBP1-AS1:293 No - PCBP1-AS1:294 No - PCBP1-AS1:295 No - PCBP1-AS1:296 No - PCBP1-AS1:297 No - PCBP1-AS1:298 No - PCBP1-AS1:239 No - PCBP1-AS1:218 Yes chr3L:21844788-21932702 PCBP1-AS1:299 No - PCBP1-AS1:272 No - PCBP1-AS1:268 No - PCBP1-AS1:215 Yes chr3L:21844788-21932702 PCBP1-AS1:209 No - PCBP1-AS1:210 No - PCBP1-AS1:211 No - PCBP1-AS1:212 No - lnc-C2orf42-11:1 No - lnc-PCBP1-10:1 No - LINC01816:21 No - LINC01816:16 No - LINC01816:13 No - LINC01816:22 No - lnc-PCBP1-9:2 No - LINC01816:17 No - lnc-C2orf42-10:1 No - lnc-PCBP1-11:1 No - lnc-PCBP1-12:1 No - lnc-PCBP1-12:2 Yes chr3R:29484783-29489265 lnc-PCBP1-12:3 Yes chr3R:29484783-29489265 lnc-C2orf42-9:1 No - LINC01143:4 No - lnc-MCEE-1:2 Yes chr3R:15337908-15343256 lnc-MCEE-1:3 Yes chr3R:15337908-15343256 lnc-PAIP2B-3:1 No - lnc-PAIP2B-4:1 No - lnc-DYSF-11:2 No - lnc-DYSF-11:3 No - lnc-NOTO-2:4 Yes chrX:18635642-18647648 lnc-NOTO-2:5 Yes chrX:18635642-18647648 lnc-NOTO-2:7 Yes chrX:18635642-18647648 lnc-NOTO-2:8 Yes chrX:18635642-18647648 lnc-NOTO-2:6 Yes chrX:18635642-18647648 lnc-NOTO-2:9 Yes chrX:18635642-18647648 lnc-RAB11FIP5-3:1 No - lnc-RAB11FIP5-3:4 No - lnc-RAB11FIP5-3:2 No - lnc-RAB11FIP5-3:3 No - lnc-DUSP11-5:1 Yes chr3R:30456441-30459300 lnc-DUSP11-5:5 Yes chr3R:30456441-30459300 lnc-DUSP11-5:2 Yes chr3R:30456441-30459300 lnc-DUSP11-5:3 Yes chr3R:30456441-30459300 lnc-DUSP11-5:4 Yes chr3R:30456441-30459300 DGUOK-AS1:11 Yes chr3R:18980995-18982749 DGUOK-AS1:13 Yes chr3R:18980995-18982749 DGUOK-AS1:14 Yes chr3R:18980995-18982749 DGUOK-AS1:15 Yes chr3R:18980995-18982749 DGUOK-AS1:9 No - DGUOK-AS1:12 No - DGUOK-AS1:10 No - lnc-TET3-2:2 No - lnc-BOLA3-5:2 No - lnc-BOLA3-5:3 No - BOLA3-AS1:15 No - BOLA3-AS1:18 No - BOLA3-AS1:16 No - BOLA3-AS1:19 Yes chr3R:22421161-22423302 BOLA3-AS1:20 Yes chr3R:22421161-22423302 BOLA3-AS1:21 No - BOLA3-AS1:24 No - BOLA3-AS1:22 Yes chr3R:22421161-22423302 BOLA3-AS1:23 Yes chr3R:22421161-22423302 lnc-MTHFD2-4:1 No - DCTN1-AS1:11 Yes chr3L:19538425-19544172 DCTN1-AS1:10 Yes chr3L:19538425-19544172 DCTN1-AS1:12 Yes chr3L:19538425-19544172 DCTN1-AS1:13 Yes chr3L:19538425-19544172 DCTN1-AS1:14 Yes chr3L:19538425-19544172 DCTN1-AS1:15 No - DCTN1-AS1:16 No - lnc-WBP1-2:1 No - lnc-TTC31-4:1 Yes chr3R:21409979-21434133 lnc-TTC31-4:2 No - lnc-M1AP-8:1 No - lnc-M1AP-8:2 No - lnc-M1AP-8:3 No - lnc-M1AP-8:4 No - lnc-M1AP-6:1 Yes chrX:9585675-9589813 lnc-M1AP-6:2 Yes chrX:9585675-9589813 lnc-TACR1-1:6 Yes chr2R:22411789-22412582 lnc-TACR1-1:4 Yes chr2R:22411789-22412582 lnc-TACR1-1:7 Yes chr2R:22411789-22412582 lnc-TACR1-1:8 Yes chr2R:22411789-22412582 lnc-TACR1-1:5 Yes chr2R:22411789-22412582 lnc-POLE4-15:1 Yes chr3R:29950796-29969447 lnc-POLE4-15:2 Yes chr3R:29950796-29969447 lnc-POLE4-15:3 Yes chr3R:29950796-29969447 lnc-POLE4-15:4 Yes chr3R:29950796-29969447 lnc-POLE4-15:5 Yes chr3R:29950796-29969447 lnc-POLE4-15:6 Yes chr3R:29950796-29969447 lnc-POLE4-15:7 Yes chr3R:29950796-29969447 lnc-POLE4-15:10 No - lnc-POLE4-15:11 No - lnc-POLE4-15:12 No - lnc-POLE4-15:13 No - lnc-POLE4-15:14 No - lnc-EVA1A-4:1 No - lnc-EVA1A-4:2 No - lnc-REG3G-12:1 No - lnc-REG3G-12:2 No - lnc-REG3G-12:3 No - lnc-REG3G-12:4 No - lnc-CTNNA2-3:8 No - lnc-CTNNA2-3:9 No - lnc-CTNNA2-3:10 No - lnc-CTNNA2-3:11 No - lnc-CTNNA2-3:12 No - lnc-TRABD2A-10:1 No - lnc-TMSB10-5:1 No - lnc-TRABD2A-5:1 No - lnc-TRABD2A-5:2 No - lnc-TRABD2A-5:8 No - lnc-TRABD2A-5:3 No - lnc-TRABD2A-5:4 No - lnc-TRABD2A-5:5 No - lnc-CAPG-1:1 No - lnc-CAPG-1:2 No - lnc-CAPG-2:2 No - lnc-CAPG-2:1 No - lnc-TMEM150A-4:2 No - lnc-TMEM150A-4:3 No - ST3GAL5-AS1:18 No - ST3GAL5-AS1:19 No - ST3GAL5-AS1:20 No - ST3GAL5-AS1:21 No - ST3GAL5-AS1:22 No - ST3GAL5-AS1:23 No - ST3GAL5-AS1:24 No - ST3GAL5-AS1:25 No - ST3GAL5-AS1:27 No - ST3GAL5-AS1:28 No - lnc-MRPL35-1:4 Yes chr3R:22019505-22023335 lnc-MRPL35-1:5 Yes chr3R:22019505-22023335 lnc-KDM3A-1:6 Yes chr3R:4307435-4310947 lnc-RMND5A-3:1 No - lnc-RMND5A-3:2 No - lnc-RMND5A-3:4 No - lnc-RMND5A-3:5 No - lnc-RMND5A-3:6 No - lnc-RMND5A-3:7 No - lnc-PLGLB1-6:3 No - CYTOR:89 No - CYTOR:90 No - CYTOR:96 No - CYTOR:97 No - CYTOR:98 No - CYTOR:99 No - CYTOR:100 No - CYTOR:101 No - CYTOR:102 No - CYTOR:103 No - CYTOR:104 No - CYTOR:105 No - CYTOR:109 No - CYTOR:111 No - CYTOR:115 No - CYTOR:116 No - CYTOR:117 No - CYTOR:118 No - CYTOR:119 No - CYTOR:120 No - CYTOR:126 No - CYTOR:127 No - CYTOR:128 No - CYTOR:129 No - lnc-SMYD1-2:3 No - lnc-SMYD1-2:5 No - lnc-SMYD1-2:6 No - lnc-SMYD1-2:4 No - lnc-SMYD1-2:7 No - lnc-SMYD1-7:1 No - lnc-FOXI3-2:1 Yes chr3L:4018878-4021279 lnc-RPIA-2:7 No - lnc-RPIA-2:8 No - lnc-RPIA-2:9 No - lnc-RPIA-2:10 No - lnc-RPIA-2:11 No - lnc-EIF2AK3-1:9 No - lnc-EIF2AK3-1:5 No - lnc-EIF2AK3-1:6 No - lnc-EIF2AK3-1:7 No - lnc-EIF2AK3-1:8 No - lnc-MRPS5-2:3 No - lnc-MRPS5-2:2 No - lnc-ZNF514-11:2 No - lnc-TRIM43B-1:1 No - STARD7-AS1:10 No - lnc-ITPRIPL1-2:1 No - lnc-SNRNP200-1:3 No - lnc-SNRNP200-2:1 No - lnc-SNRNP200-2:2 No - CNNM3-DT:14 Yes chr2R:3900285-3949425 CNNM3-DT:15 Yes chr2R:3900285-3949425 CNNM3-DT:18 No - CNNM3-DT:19 No - CNNM3-DT:16 No - CNNM3-DT:17 No - lnc-CNNM3-4:1 No - lnc-CNNM3-4:2 No - lnc-COX5B-2:2 No - lnc-UNC50-1:3 No - lnc-UNC50-1:4 No - lnc-UNC50-1:5 No - lnc-UNC50-1:6 No - lnc-UNC50-1:9 No - lnc-UNC50-1:7 No - lnc-UNC50-1:8 No - lnc-CHST10-4:1 Yes chr3L:11991853-11993179 lnc-CHST10-5:2 No - lnc-CHST10-5:3 No - lnc-CHST10-5:4 No - lnc-CHST10-5:5 No - lnc-CHST10-5:1 No - lnc-CHST10-5:6 No - lnc-TBC1D8-7:3 No - lnc-TBC1D8-7:4 No - lnc-TBC1D8-7:5 Yes chr2R:9587193-9587989 TBC1D8-AS1:7 Yes chr3L:21337681-21343716 TBC1D8-AS1:8 Yes chr3L:21337681-21343716 TBC1D8-AS1:11 Yes chr3L:21337681-21343716 lnc-CREG2-3:1 No - lnc-RFX8-5:1 No - LINC01127:22 No - LINC01127:23 No - LINC01127:24 No - LINC01127:25 No - LINC01127:29 No - LINC01127:30 No - LINC01127:31 No - LINC01127:32 No - LINC01127:33 No - LINC01127:35 No - lnc-MFSD9-20:1 Yes chr2L:21104568-21134255 lnc-MFSD9-20:3 Yes chr2L:21104568-21134255 lnc-MFSD9-20:4 Yes chr2L:21104568-21134255 lnc-MFSD9-20:2 Yes chr2L:21104568-21134255 lnc-MFSD9-20:5 Yes chr2L:21104568-21134255 LINC01965:11 No - LINC01965:12 No - LINC01965:14 No - lnc-POU3F3-5:3 No - lnc-POU3F3-5:4 No - lnc-POU3F3-5:5 No - LINC01102:19 No - LINC01102:18 No - LINC01102:20 No - LINC01102:21 No - LINC01102:22 No - LINC01102:23 No - LINC01102:24 No - LINC01102:25 No - LINC01102:26 No - lnc-POU3F3-1:3 No - LINC01114:11 No - LINC01114:12 No - LINC01114:13 No - PANTR1:54 No - PANTR1:35 No - PANTR1:36 No - PANTR1:37 No - PANTR1:49 No - PANTR1:50 No - PANTR1:38 No - PANTR1:51 No - PANTR1:52 No - PANTR1:39 No - lnc-POU3F3-7:6 No - lnc-POU3F3-7:9 No - lnc-POU3F3-7:7 No - lnc-POU3F3-7:8 No - lnc-POU3F3-7:5 Yes chr3L:6790158-6794941 lnc-POU3F3-7:10 No - lnc-POU3F3-7:11 No - LINC01159:9 No - LINC01159:8 No - LINC01159:14 No - LINC01159:10 No - LINC01159:15 No - LINC01159:11 No - LINC01159:12 No - LINC01159:13 No - lnc-TGFBRAP1-4:7 No - lnc-TGFBRAP1-4:6 Yes chr3R:7889277-7902667 lnc-TGFBRAP1-4:4 Yes chr3R:7889277-7902667 lnc-TGFBRAP1-4:5 Yes chr3R:7889277-7902667 LINC01918:15 No - LINC01918:16 No - LINC01918:17 No - LINC01918:18 No - LINC01918:19 No - LINC01918:20 No - LINC01918:21 No - lnc-TGFBRAP1-1:14 No - lnc-TGFBRAP1-1:7 No - lnc-TGFBRAP1-1:11 No - lnc-TGFBRAP1-1:13 No - lnc-TGFBRAP1-1:8 No - lnc-TGFBRAP1-1:9 No - lnc-TGFBRAP1-1:12 No - lnc-TGFBRAP1-1:10 No - lnc-C2orf40-16:1 No - lnc-C2orf40-16:2 No - lnc-C2orf40-16:3 No - lnc-CD8B2-17:1 Yes chr2R:24691422-24694386 lnc-CD8B2-17:2 Yes chr2R:24691422-24694386 LINC01594:2 No - LINC01594:3 No - lnc-EDAR-11:2 Yes chr3R:12010772-12015059 GCC2-AS1:6 Yes chr3R:12010772-12015059 GCC2-AS1:7 Yes chr3R:12010772-12015059 GCC2-AS1:8 Yes chr3R:12010772-12015059 GCC2-AS1:9 Yes chr3R:12010772-12015059 GCC2-AS1:10 Yes chr3R:12010772-12015059 GCC2-AS1:4 No - GCC2-AS1:5 No - lnc-ACOXL-3:3 No - lnc-ACOXL-3:4 No - lnc-ACOXL-3:5 No - MIR4435-2HG:34 No - MIR4435-2HG:35 No - MIR4435-2HG:36 No - MIR4435-2HG:37 No - lnc-ZC3H8-7:1 Yes chrX:635890-643760 lnc-ZC3H8-7:2 Yes chrX:635890-643760 lnc-RGPD8-5:2 No - lnc-RGPD8-5:6 No - lnc-RGPD8-5:7 No - lnc-RGPD8-5:3 No - lnc-RGPD8-5:4 No - lnc-RGPD8-5:8 No - lnc-RGPD8-5:9 No - lnc-RGPD8-5:5 No - lnc-CKAP2L-2:4 No - lnc-CKAP2L-2:1 No - lnc-CKAP2L-2:2 No - lnc-CKAP2L-2:3 No - lnc-CKAP2L-1:13 No - lnc-CKAP2L-1:11 No - lnc-CKAP2L-1:14 No - lnc-CKAP2L-1:15 No - lnc-CKAP2L-1:12 No - lnc-IL1A-4:1 No - lnc-IL1A-5:1 No - lnc-IL1B-2:1 No - lnc-IL37-5:1 No - lnc-IL37-5:2 No - lnc-PAX8-2:1 No - lnc-IL1F10-1:1 No - lnc-IL1F10-2:1 No - PAX8-AS1:37 Yes chr4:1088798-1113317 PGM5P4-AS1:10 No - PGM5P4-AS1:15 No - PGM5P4-AS1:16 No - PGM5P4-AS1:11 No - PGM5P4-AS1:12 No - PGM5P4-AS1:13 No - PGM5P4-AS1:14 No - lnc-RABL2A-9:1 Yes chr2R:15562697-15565801 lnc-SLC35F5-3:12 No - lnc-SLC35F5-3:11 Yes chr3L:8113407-8115902 lnc-SLC35F5-3:20 No - lnc-SLC35F5-3:13 No - lnc-SLC35F5-3:15 No - lnc-SLC35F5-3:7 Yes chr3L:8113407-8115902 lnc-SLC35F5-3:8 Yes chr3L:8113407-8115902 lnc-SLC35F5-3:6 Yes chr3L:8113407-8115902 lnc-SLC35F5-3:9 Yes chr3L:8113407-8115902 lnc-SLC35F5-3:10 Yes chr3L:8113407-8115902 lnc-SLC35F5-3:21 No - lnc-SLC35F5-3:17 No - lnc-SLC35F5-3:18 No - lnc-SLC35F5-3:19 No - lnc-SLC35F5-3:14 No - DPP10-AS1:7 No - DPP10-AS1:8 No - DPP10-AS1:5 No - DPP10-AS1:6 No - DPP10-AS1:9 No - lnc-INSIG2-6:3 No - lnc-CCDC93-10:1 No - lnc-CCDC93-10:2 No - lnc-CCDC93-2:8 No - lnc-CCDC93-2:6 No - lnc-CCDC93-2:9 No - lnc-CCDC93-2:5 No - lnc-CCDC93-2:10 No - lnc-CCDC93-2:7 No - lnc-INSIG2-13:1 No - LINC01956:10 No - LINC01956:11 No - LINC01956:12 No - LINC01956:16 No - LINC01956:13 No - LINC01956:14 No - lnc-SCTR-2:8 Yes chr3L:328097-356050 lnc-SCTR-2:6 Yes chr3L:328097-356050 lnc-SCTR-2:5 Yes chr3L:328097-356050 lnc-SCTR-2:4 Yes chr3L:328097-356050 lnc-SCTR-2:7 Yes chr3L:328097-356050 lnc-TMEM185B-1:10 Yes chr3R:13428867-13434984 lnc-TMEM185B-1:8 Yes chr3R:13428867-13434984 lnc-TMEM185B-1:9 Yes chr3R:13428867-13434984 lnc-TMEM185B-1:11 Yes chr3R:13428867-13434984 lnc-TMEM185B-1:12 Yes chr3R:13428867-13434984 lnc-TMEM185B-1:4 No - lnc-TMEM185B-1:7 Yes chr3R:13428867-13434984 lnc-TMEM185B-1:5 Yes chrX:19193555-19196037 lnc-TMEM185B-1:2 No - lnc-TMEM185B-1:3 No - lnc-TMEM185B-10:6 No - lnc-TMEM185B-10:4 Yes chrX:3704610-3719635 lnc-TMEM185B-10:1 Yes chrX:3704610-3719635 lnc-TMEM185B-10:7 No - lnc-TMEM185B-10:8 No - lnc-TMEM185B-10:5 Yes chrX:3704610-3719635 lnc-TMEM185B-10:2 Yes chrX:3704610-3719635 lnc-TMEM185B-10:3 Yes chrX:3704610-3719635 lnc-TMEM185B-11:1 Yes chrX:3704610-3719635 lnc-TMEM185B-2:3 No - lnc-TMEM185B-2:5 No - lnc-TMEM185B-2:6 No - lnc-TMEM185B-2:7 No - lnc-TMEM185B-2:4 No - lnc-TFCP2L1-7:2 Yes chr4:47710-57041 lnc-TFCP2L1-7:1 Yes chr4:47710-57041 lnc-TFCP2L1-7:3 Yes chr4:47710-57041 lnc-TFCP2L1-7:4 Yes chr4:47710-57041 lnc-TFCP2L1-6:1 No - lnc-TFCP2L1-6:2 No - lnc-TSN-4:3 Yes chr3L:21172853-21183278 NIFK-AS1:21 No - NIFK-AS1:22 No - NIFK-AS1:19 No - NIFK-AS1:20 No - NIFK-AS1:23 No - NIFK-AS1:24 No - NIFK-AS1:25 No - NIFK-AS1:26 No - NIFK-AS1:27 No - lnc-NIFK-14:1 Yes chr2R:10479011-10480111 lnc-TSN-14:3 No - lnc-TSN-14:5 No - lnc-TSN-14:6 No - lnc-TSN-14:4 No - lnc-TSN-14:7 No - lnc-NIFK-6:2 No - lnc-NIFK-6:3 No - lnc-NIFK-6:4 No - lnc-NIFK-6:5 No - lnc-NIFK-6:6 No - lnc-NIFK-6:7 No - lnc-GYPC-6:1 No - lnc-GYPC-6:2 No - lnc-TEX51-2:1 No - lnc-TEX51-2:2 No - lnc-TEX51-2:3 No - lnc-TEX51-2:4 No - lnc-PROC-1:11 No - lnc-PROC-1:12 No - lnc-PROC-1:13 No - lnc-PROC-1:10 No - lnc-PROC-1:14 No - lnc-PROC-1:15 No - lnc-PROC-1:18 No - lnc-PROC-1:19 No - lnc-PROC-1:20 No - lnc-PROC-1:17 No - lnc-PROC-1:21 No - lnc-PROC-1:16 No - lnc-MYO7B-24:1 Yes chrX:16309817-16313138 lnc-SFT2D3-1:3 No - lnc-SFT2D3-1:4 No - lnc-SFT2D3-1:5 No - lnc-SFT2D3-2:6 Yes chr3R:23986642-23988738 lnc-SFT2D3-2:7 No - lnc-UGGT1-8:1 Yes chr3L:12805902-12813036 lnc-SAP130-4:1 No - LINC01854:11 No - LINC01854:12 No - LINC01854:13 No - LINC01854:14 No - LINC01854:15 No - LINC02572:9 No - LINC02572:10 No - LINC02572:11 No - LINC02572:12 No - LINC02572:13 No - lnc-CCDC115-3:1 No - lnc-CCDC115-3:2 No - lnc-CFC1-2:3 No - lnc-CFC1-2:6 No - lnc-CFC1-2:4 No - lnc-CFC1-2:5 No - lnc-ARHGEF4-3:1 No - lnc-ARHGEF4-3:2 No - lnc-ARHGEF4-3:3 No - lnc-PLEKHB2-7:1 No - lnc-GPR39-10:2 No - lnc-GPR39-10:3 No - lnc-ANKRD30BL-10:1 No - lnc-ANKRD30BL-11:1 No - lnc-ANKRD30BL-11:2 No - lnc-ANKRD30BL-7:2 No - lnc-ANKRD30BL-7:4 No - lnc-ANKRD30BL-7:6 No - lnc-ANKRD30BL-7:7 No - lnc-ANKRD30BL-7:3 No - lnc-ANKRD30BL-7:5 No - lnc-ANKRD30BL-7:8 No - lnc-ANKRD30BL-12:3 No - lnc-ANKRD30BL-12:1 No - lnc-ANKRD30BL-12:2 No - CCNT2-AS1:15 No - CCNT2-AS1:16 No - CCNT2-AS1:13 No - CCNT2-AS1:17 No - CCNT2-AS1:18 No - CCNT2-AS1:19 No - CCNT2-AS1:22 No - CCNT2-AS1:20 No - CCNT2-AS1:21 No - CCNT2-AS1:14 Yes chr3L:17551004-17557788 lnc-UBXN4-1:3 Yes chr3L:16733546-16739364 DARS-AS1:51 No - DARS-AS1:50 No - DARS-AS1:52 No - DARS-AS1:53 No - DARS-AS1:54 No - DARS-AS1:55 No - DARS-AS1:56 No - DARS-AS1:57 No - DARS-AS1:58 No - lnc-UBXN4-12:2 No - lnc-UBXN4-12:3 No - lnc-CXCR4-3:1 No - lnc-CXCR4-4:1 No - lnc-CXCR4-5:1 No - lnc-CXCR4-6:1 No - lnc-UBXN4-14:1 No - lnc-NXPH2-12:1 No - lnc-NXPH2-3:6 No - lnc-NXPH2-3:7 No - lnc-NXPH2-3:8 No - lnc-NXPH2-3:9 No - lnc-NXPH2-3:10 No - lnc-NXPH2-3:5 No - lnc-NXPH2-3:11 No - lnc-LRP1B-4:8 No - lnc-LRP1B-4:4 No - lnc-LRP1B-4:5 No - lnc-LRP1B-4:6 No - lnc-LRP1B-4:7 No - lnc-LRP1B-11:2 No - lnc-LRP1B-4:3 No - lnc-GTDC1-27:1 No - lnc-GTDC1-27:2 No - lnc-GTDC1-27:3 No - lnc-GTDC1-27:4 No - lnc-GTDC1-27:5 No - ZEB2-AS1:22 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB2-AS1:23 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB2-AS1:24 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB2-AS1:25 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB2-AS1:26 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB2-AS1:27 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB2-AS1:28 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB2-AS1:29 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB2-AS1:30 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB2-AS1:31 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB2-AS1:32 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB2-AS1:33 Yes chr3R:30765926-30789202 ZEB2-AS1:34 Yes chr3R:30765926-30789202 lnc-ZEB2-22:1 No - lnc-ZEB2-23:1 No - lnc-ARHGAP15-22:1 No - TEX41:112 No - TEX41:113 No - TEX41:114 No - TEX41:115 No - TEX41:116 No - TEX41:117 No - TEX41:107 No - TEX41:118 No - TEX41:119 No - TEX41:120 No - TEX41:121 No - TEX41:108 No - TEX41:109 No - TEX41:122 No - TEX41:123 No - TEX41:124 No - TEX41:110 No - TEX41:111 No - TEX41:125 No - TEX41:126 No - TEX41:129 No - TEX41:130 No - TEX41:127 No - TEX41:131 No - TEX41:135 No - TEX41:132 No - TEX41:133 No - TEX41:136 No - TEX41:128 No - TEX41:137 No - TEX41:138 No - TEX41:139 No - TEX41:140 No - TEX41:141 No - TEX41:142 No - TEX41:143 No - TEX41:144 No - TEX41:145 No - TEX41:134 No - lnc-ACVR2A-14:1 No - lnc-MBD5-3:1 No - lnc-LYPD6-2:7 Yes chrX:9194750-9196414 lnc-LYPD6-2:10 Yes chrX:9194750-9196414 lnc-LYPD6-2:11 Yes chrX:9194750-9196414 lnc-LYPD6-2:8 Yes chrX:9194750-9196414 lnc-LYPD6-2:9 Yes chrX:9194750-9196414 lnc-LYPD6-2:12 Yes chrX:9194750-9196414 lnc-LYPD6-2:13 No - lnc-LYPD6-2:15 No - lnc-LYPD6-2:14 No - lnc-LYPD6-2:16 No - lnc-LYPD6-2:17 No - lnc-LYPD6-2:18 No - lnc-TNFAIP6-3:2 Yes chr3R:9497101-9502581 lnc-TNFAIP6-3:3 Yes chr3R:9497101-9502581 lnc-TNFAIP6-3:4 Yes chr3R:9497101-9502581 lnc-TNFAIP6-3:5 Yes chr3R:9497101-9502581 lnc-TNFAIP6-3:6 Yes chr3R:9497101-9502581 lnc-TNFAIP6-3:7 Yes chr3R:9497101-9502581 lnc-TNFAIP6-3:8 Yes chr3R:9497101-9502581 lnc-RPRM-3:3 Yes chr2L:5072170-5093592 lnc-RPRM-3:4 Yes chr2L:5072170-5093592 lnc-RPRM-3:5 Yes chr2L:5072170-5093592 lnc-RPRM-3:6 Yes chr2L:5072170-5093592 lnc-RPRM-3:2 Yes chr2L:5072170-5093592 lnc-KCNJ3-7:9 No - lnc-KCNJ3-7:6 No - lnc-KCNJ3-7:7 No - lnc-KCNJ3-7:8 No - lnc-KCNJ3-7:10 No - lnc-GPD2-1:2 Yes chr2L:20683462-20714588 lnc-GPD2-1:3 Yes chr2L:20683462-20714588 lnc-GPD2-1:4 Yes chr2L:20683462-20714588 lnc-GPD2-1:5 Yes chr2L:20683462-20714588 lnc-GPD2-1:6 Yes chr2L:20683462-20714588 lnc-GPD2-1:7 Yes chr2L:20683462-20714588 lnc-GPD2-1:8 Yes chr2L:20683462-20714588 lnc-GPD2-1:9 Yes chr2L:20683462-20714588 lnc-GPD2-2:3 No - lnc-GPD2-2:2 No - lnc-GPD2-2:4 No - lnc-GPD2-2:5 No - lnc-GPD2-2:6 No - lnc-ERMN-6:1 No - lnc-ERMN-5:1 Yes chr3L:6076722-6082491 lnc-UPP2-2:4 Yes chr3R:26949692-26958491 lnc-UPP2-2:5 Yes chr3R:26949692-26958491 lnc-UPP2-2:6 Yes chr3R:26949692-26958491 lnc-UPP2-2:7 Yes chr3R:26949692-26958491 lnc-PKP4-1:2 No - lnc-PKP4-1:3 No - lnc-TANC1-6:1 No - lnc-TANC1-6:2 No - lnc-BAZ2B-1:7 No - lnc-BAZ2B-1:12 No - lnc-BAZ2B-1:16 No - lnc-BAZ2B-1:13 No - lnc-BAZ2B-1:8 No - lnc-MARCH7-1:5 No - lnc-MARCH7-1:6 No - lnc-BAZ2B-1:17 No - lnc-BAZ2B-1:6 No - lnc-BAZ2B-1:14 No - lnc-BAZ2B-1:9 No - lnc-BAZ2B-1:10 No - lnc-BAZ2B-1:11 No - lnc-BAZ2B-1:15 No - lnc-MARCH7-5:1 No - lnc-MARCH7-5:2 No - lnc-MARCH7-5:3 No - LINC01806:19 No - LINC01806:20 No - LINC01806:21 No - LINC01806:22 No - LINC01806:23 No - lnc-DPP4-2:18 Yes chr2L:5058404-5059790 lnc-DPP4-2:17 Yes chr2L:5058404-5059790 lnc-DPP4-2:19 Yes chr2L:5058404-5059790 lnc-DPP4-11:1 Yes chr2L:7223328-7249343 lnc-SLC4A10-7:7 No - lnc-GCA-5:3 No - lnc-GCA-5:4 No - lnc-GCA-5:5 No - lnc-GCA-5:6 No - lnc-GCA-5:2 No - lnc-SCN2A-12:1 No - lnc-SCN2A-12:2 No - lnc-SCN2A-12:3 No - lnc-SCN2A-12:4 No - lnc-SCN2A-12:5 No - lnc-SCN2A-12:8 Yes chr2R:9044850-9060608 lnc-CSRNP3-9:2 No - lnc-CSRNP3-9:3 No - lnc-CSRNP3-9:4 No - lnc-CSRNP3-9:5 No - lnc-CSRNP3-9:6 No - lnc-GALNT3-1:2 No - lnc-GALNT3-1:3 No - lnc-XIRP2-1:2 No - lnc-STK39-2:4 No - lnc-STK39-2:5 No - lnc-STK39-2:6 No - lnc-STK39-2:7 No - lnc-STK39-2:8 No - lnc-STK39-3:10 Yes chrX:6257668-6267228 lnc-STK39-3:11 Yes chrX:6257668-6267228 lnc-STK39-3:12 Yes chrX:6257668-6267228 lnc-STK39-3:7 Yes chrX:6257668-6267228 lnc-STK39-3:4 Yes chrX:6257668-6267228 lnc-STK39-3:5 Yes chrX:6257668-6267228 lnc-STK39-3:6 Yes chrX:6257668-6267228 lnc-STK39-3:8 Yes chrX:6257668-6267228 lnc-STK39-3:9 Yes chrX:6257668-6267228 lnc-FASTKD1-4:3 Yes chr3R:28340334-28345169 lnc-FASTKD1-4:4 Yes chr3R:28340334-28345169 lnc-CCDC173-6:1 No - lnc-CCDC173-6:2 No - lnc-CCDC173-6:3 No - lnc-CCDC173-6:4 No - lnc-CCDC173-6:5 No - LINC01124:12 No - LINC01124:13 No - LINC01124:14 No - LINC01124:10 No - LINC01124:15 No - LINC01124:11 No - lnc-ERICH2-1:4 No - lnc-ERICH2-1:6 No - lnc-ERICH2-1:7 No - lnc-ERICH2-1:8 No - lnc-TLK1-6:1 Yes chr3L:4074077-4088744 lnc-TLK1-6:2 Yes chr3L:4074077-4088744 lnc-TLK1-6:3 Yes chr3L:4074077-4088744 lnc-TLK1-6:4 Yes chr3L:4074077-4088744 lnc-TLK1-6:5 Yes chr3L:4074077-4088744 lnc-TLK1-1:5 No - lnc-TLK1-1:3 No - lnc-TLK1-1:4 No - lnc-DLX2-14:1 No - lnc-ITGA6-3:1 No - lnc-DLX2-4:8 No - lnc-DLX2-4:9 No - lnc-DLX2-4:10 No - lnc-DLX2-4:11 No - lnc-DLX2-4:16 Yes chrX:13214409-13258490 lnc-DLX2-4:12 No - lnc-DLX2-4:13 No - lnc-DLX2-4:17 Yes chrX:13214409-13258490 lnc-DLX2-4:14 No - lnc-DLX2-4:15 Yes chr2R:9426439-9434638 lnc-DLX2-4:6 Yes chr2R:9426439-9434638 lnc-DLX2-4:7 Yes chr2R:9426439-9434638 MAP3K20-AS1:17 No - MAP3K20-AS1:18 No - MAP3K20-AS1:19 No - MAP3K20-AS1:20 No - MAP3K20-AS1:15 No - MAP3K20-AS1:21 No - MAP3K20-AS1:16 No - lnc-CDCA7-1:2 No - lnc-CDCA7-1:3 No - lnc-CDCA7-1:5 No - lnc-CDCA7-1:6 No - lnc-CDCA7-1:4 No - lnc-SP9-13:1 No - lnc-SP9-13:2 No - lnc-SP9-12:1 No - lnc-SP9-11:1 Yes chrX:9729648-9782094 LINC01305:4 Yes chrX:9729648-9782094 lnc-SCRN3-1:6 No - lnc-SCRN3-1:7 No - lnc-SCRN3-1:8 No - lnc-SCRN3-1:12 No - lnc-SCRN3-1:9 No - lnc-SCRN3-1:10 No - lnc-SCRN3-1:11 No - lnc-SCRN3-12:1 No - lnc-HOXD13-3:3 Yes chr2R:8596972-8599962 lnc-HOXD13-3:4 Yes chr2R:8596972-8599962 lnc-HOXD13-3:7 Yes chr2R:8596972-8599962 lnc-HOXD13-3:5 Yes chr2R:8596972-8599962 lnc-HOXD13-3:6 Yes chr2R:8596972-8599962 lnc-HOXD13-3:8 No - lnc-HOXD13-3:9 No - HOXD-AS2:5 No - HOXD-AS2:6 No - HOXD-AS2:7 No - HOXD-AS2:8 Yes chr3R:6752864-6754194 HAGLR:44 No - HAGLR:41 No - HAGLR:32 No - HAGLR:33 No - HAGLR:30 Yes chr3R:6661427-6678590 HAGLR:45 No - HAGLR:34 No - HAGLR:35 No - HAGLR:36 No - HAGLR:37 No - HAGLR:42 No - HAGLR:38 No - HAGLR:46 No - HAGLR:47 No - HAGLR:48 No - HAGLR:31 Yes chr3R:6661427-6678590 HAGLR:43 No - HAGLR:49 No - HAGLR:39 No - HAGLR:40 No - HAGLROS:8 No - lnc-MTX2-6:2 No - lnc-MTX2-6:3 No - lnc-MTX2-6:4 No - LINC01116:14 No - LINC01116:15 No - LINC01116:16 No - LINC01116:11 No - LINC01116:10 No - LINC01116:12 No - LINC01116:17 No - LINC01116:13 No - LINC01116:18 No - LINC01117:10 No - LINC01117:11 No - LINC01117:12 No - LINC01117:13 No - LINC01117:14 No - LINC01117:9 No - lnc-NFE2L2-1:4 Yes chr3R:26872129-26875742 lnc-NFE2L2-1:6 Yes chr3R:26872129-26875742 lnc-NFE2L2-1:5 Yes chr3R:26872129-26875742 lnc-HNRNPA3-2:3 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-TTC30B-1:13 No - lnc-TTC30B-1:24 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-TTC30B-1:25 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-TTC30B-1:14 No - lnc-TTC30B-1:16 No - lnc-TTC30B-1:17 No - lnc-TTC30B-1:22 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-TTC30B-1:23 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-TTC30B-1:18 No - lnc-TTC30B-1:19 No - lnc-TTC30B-1:15 No - lnc-PDE11A-2:1 No - lnc-PJVK-2:4 Yes chr2L:13382652-13385671 lnc-PJVK-2:12 No - lnc-PJVK-2:13 No - lnc-PJVK-2:14 No - lnc-PJVK-2:15 Yes chr2L:13382652-13385671 lnc-PJVK-2:16 Yes chr2L:13382652-13385671 lnc-PJVK-2:17 Yes chr2L:13382652-13385671 lnc-PJVK-2:18 Yes chr2L:13382652-13385671 lnc-CERKL-3:2 Yes chr2L:10765010-10768006 lnc-CERKL-3:3 Yes chr2L:10765010-10768006 lnc-CERKL-3:4 Yes chr2L:10765010-10768006 lnc-CERKL-3:5 Yes chr2L:10765010-10768006 lnc-CERKL-3:6 Yes chr2L:10765010-10768006 lnc-NEUROD1-2:2 No - lnc-NEUROD1-2:3 No - lnc-ZNF804A-3:2 No - lnc-ZNF804A-3:3 No - lnc-ZNF804A-3:4 No - LINC01473:8 No - LINC01473:9 No - LINC01473:10 No - LINC01473:11 No - LINC01473:12 No - lnc-ZSWIM2-16:2 No - lnc-ZSWIM2-16:3 No - lnc-ZSWIM2-16:4 No - lnc-ZSWIM2-16:5 No - lnc-ZSWIM2-16:6 No - lnc-ZSWIM2-16:1 Yes chrX:16752189-16783434 lnc-FAM171B-1:6 Yes chrX:12950436-12957462 lnc-FAM171B-1:7 No - lnc-FAM171B-1:5 No - lnc-FAM171B-1:9 No - lnc-FAM171B-1:10 No - lnc-FAM171B-1:11 No - lnc-FAM171B-1:12 No - lnc-GULP1-5:1 No - lnc-GULP1-5:2 No - lnc-GULP1-5:4 No - lnc-GULP1-5:3 No - lnc-GULP1-5:5 No - lnc-GULP1-1:2 No - OSGEPL1-AS1:6 Yes chrX:19699820-19701755 OSGEPL1-AS1:7 Yes chrX:19699820-19701755 OSGEPL1-AS1:5 Yes chrX:19699820-19701755 lnc-MFSD6-1:8 No - lnc-MFSD6-1:9 No - lnc-MFSD6-1:10 No - lnc-STAT1-2:4 Yes chr2R:12670483-12679593 lnc-GLS-3:1 Yes chr3R:20535323-20552311 lnc-GLS-2:3 Yes chr3R:20535323-20552311 lnc-GLS-2:4 Yes chr3R:20535323-20552311 lnc-GLS-2:5 Yes chr3R:20535323-20552311 lnc-STAT4-1:3 Yes chr3R:24154826-24161498 lnc-CAVIN2-3:1 No - lnc-CAVIN2-2:1 No - lnc-NABP1-5:3 No - lnc-NABP1-5:4 No - lnc-NABP1-5:5 No - PCGEM1:4 No - PCGEM1:5 No - lnc-NABP1-18:1 No - lnc-NABP1-18:2 No - LINC01827:7 No - lnc-COQ10B-3:2 No - lnc-COQ10B-3:3 No - lnc-COQ10B-3:5 No - lnc-COQ10B-3:4 No - lnc-SF3B1-5:1 No - LINC01923:12 No - SATB2-AS1:11 No - SATB2-AS1:12 No - SATB2-AS1:13 No - SATB2-AS1:14 No - SATB2-AS1:15 No - SATB2-AS1:16 No - SATB2-AS1:17 No - lnc-FTCDNL1-4:4 No - lnc-FTCDNL1-4:20 No - lnc-FTCDNL1-4:11 No - lnc-FTCDNL1-4:12 No - lnc-FTCDNL1-4:13 No - lnc-FTCDNL1-4:5 No - lnc-FTCDNL1-4:6 No - lnc-FTCDNL1-4:7 No - lnc-FTCDNL1-4:14 No - lnc-FTCDNL1-4:8 No - lnc-FTCDNL1-4:9 No - lnc-FTCDNL1-4:15 No - lnc-FTCDNL1-4:16 No - lnc-FTCDNL1-4:17 No - lnc-KCTD18-1:3 No - lnc-KCTD18-1:4 No - lnc-KCTD18-1:2 No - lnc-CLK1-1:4 Yes chr3R:5595364-5601136 lnc-CLK1-1:5 Yes chr3R:5595364-5601136 lnc-CLK1-1:6 Yes chr3R:5595364-5601136 lnc-NIF3L1-5:1 No - CFLAR-AS1:28 No - CFLAR-AS1:32 No - CFLAR-AS1:29 No - CFLAR-AS1:33 No - CFLAR-AS1:30 No - CFLAR-AS1:31 No - lnc-SUMO1-8:2 No - lnc-SUMO1-8:3 No - lnc-SUMO1-8:4 No - lnc-SUMO1-7:4 No - lnc-SUMO1-7:5 No - lnc-ICA1L-7:1 No - lnc-RAPH1-6:5 No - lnc-RAPH1-6:4 No - lnc-ABI2-1:1 No - lnc-ABI2-1:2 No - lnc-INO80D-8:1 No - lnc-INO80D-8:2 No - lnc-EEF1B2-2:8 Yes chr3R:29854695-29857491 lnc-EEF1B2-2:10 Yes chr3R:29854695-29857491 lnc-EEF1B2-2:9 Yes chr3R:29854695-29857491 lnc-EEF1B2-2:11 Yes chr3R:29854695-29857491 lnc-CPO-4:2 Yes chr2R:10977956-11116378 lnc-CPO-4:3 Yes chr2R:10977956-11116378 lnc-KLF7-1:40 No - lnc-KLF7-1:41 No - lnc-KLF7-1:29 No - lnc-KLF7-1:18 Yes chrX:18366357-18377864 lnc-KLF7-1:42 No - lnc-KLF7-1:37 No - lnc-KLF7-1:38 No - lnc-KLF7-1:44 No - lnc-KLF7-1:23 Yes chrX:18366357-18377864 lnc-KLF7-1:24 Yes chrX:18366357-18377864 lnc-KLF7-1:34 No - lnc-KLF7-1:19 Yes chrX:18366357-18377864 lnc-KLF7-1:21 Yes chrX:18366357-18377864 lnc-KLF7-1:35 No - lnc-KLF7-1:30 No - lnc-KLF7-1:43 No - lnc-KLF7-1:36 No - lnc-KLF7-1:31 No - lnc-KLF7-1:26 Yes chrX:18366357-18377864 lnc-KLF7-1:20 Yes chrX:18366357-18377864 MYOSLID:11 No - MYOSLID:12 No - MYOSLID:13 No - MYOSLID:14 No - MYOSLID:17 No - lnc-KLF7-1:39 No - lnc-KLF7-1:27 Yes chrX:18366357-18377864 lnc-KLF7-1:22 Yes chrX:18366357-18377864 lnc-KLF7-1:32 No - lnc-KLF7-1:28 Yes chrX:18366357-18377864 lnc-KLF7-1:33 No - lnc-KLF7-1:25 Yes chrX:18366357-18377864 lnc-CREB1-10:1 No - LINC01857:13 No - LINC01857:14 No - LINC01857:15 No - LINC01857:16 No - LINC01857:17 No - lnc-FZD5-5:1 No - lnc-FZD5-6:2 Yes chr2R:22103177-22105963 lnc-FZD5-6:3 Yes chr2R:22103177-22105963 lnc-PIKFYVE-7:2 No - lnc-PIKFYVE-7:1 No - lnc-PIKFYVE-7:3 No - lnc-PIKFYVE-7:4 No - IDH1-AS1:4 Yes chr3L:8356404-8360906 IDH1-AS1:5 Yes chr3L:8356404-8360906 IDH1-AS1:6 Yes chr3L:8356404-8360906 IDH1-AS1:7 Yes chr3L:8356404-8360906 lnc-MAP2-1:2 No - lnc-RPE-9:2 No - lnc-RPE-9:4 No - lnc-RPE-9:5 No - lnc-RPE-9:6 No - lnc-CPS1-5:1 No - lnc-CPS1-5:2 No - lnc-SPAG16-7:3 No - lnc-SPAG16-7:4 No - lnc-SPAG16-7:5 No - lnc-SPAG16-7:6 No - lnc-SPAG16-11:1 No - lnc-SPAG16-11:2 No - lnc-IKZF2-3:9 No - lnc-IKZF2-3:10 No - lnc-IKZF2-3:7 No - lnc-IKZF2-3:11 No - lnc-IKZF2-3:8 No - lnc-VWC2L-1:13 No - lnc-VWC2L-1:14 No - lnc-FN1-6:4 Yes chr3R:24877045-24881478 lnc-FN1-6:2 Yes chr3R:24877045-24881478 lnc-FN1-6:1 Yes chr3R:24877045-24881478 lnc-FN1-6:3 Yes chr3R:24877045-24881478 lnc-ATIC-2:3 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-ATIC-2:4 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-ATIC-2:5 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-ATIC-2:6 Yes chrX:17888177-17889404 lnc-ATIC-2:7 No - lnc-ATIC-2:8 No - LINC01614:9 No - LINC01614:10 No - LINC01614:11 No - LINC01614:12 No - LINC01614:13 No - lnc-TMEM169-9:1 No - lnc-TMEM169-9:2 No - lnc-MREG-4:1 No - lnc-PECR-3:1 Yes chr2L:15768630-15771159 lnc-MARCH4-1:2 Yes chr2L:4955509-4958292 lnc-MARCH4-2:11 No - lnc-MARCH4-2:12 Yes chr2L:5070957-5072055 lnc-MARCH4-2:13 Yes chr2L:5070957-5072055 lnc-MARCH4-2:7 Yes chr2L:5070957-5072055 lnc-MARCH4-2:8 Yes chr2L:5070957-5072055 lnc-MARCH4-2:9 Yes chr2L:5070957-5072055 lnc-MARCH4-2:10 Yes chr2L:5070957-5072055 DIRC3-AS1:4 No - DIRC3-AS1:5 No - DIRC3-AS1:8 No - DIRC3-AS1:10 No - DIRC3-AS1:9 No - DIRC3-AS1:11 No - DIRC3-AS1:13 No - DIRC3-AS1:14 No - DIRC3-AS1:15 No - DIRC3-AS1:16 No - DIRC3-AS1:17 No - lnc-AAMP-2:3 No - lnc-AAMP-2:4 No - lnc-AAMP-2:5 No - lnc-AAMP-2:6 No - lnc-AAMP-2:7 No - CATIP-AS1:6 No - CATIP-AS1:7 No - CATIP-AS1:14 No - CATIP-AS1:15 No - CATIP-AS1:12 No - CATIP-AS1:13 No - CATIP-AS1:11 No - CATIP-AS1:10 No - CATIP-AS1:9 No - CATIP-AS1:5 Yes chr3L:15992669-16004736 lnc-RNF25-3:1 Yes chr2L:10989401-10997897 lnc-WNT10A-4:1 No - lnc-WNT10A-4:2 No - lnc-WNT10A-4:3 No - lnc-WNT10A-4:4 No - lnc-WNT10A-4:5 No - lnc-WNT10A-4:6 No - LINC01494:4 No - LINC01494:5 No - LINC01494:7 No - LINC01494:6 No - LINC01494:8 No - lnc-DES-1:2 No - lnc-DES-1:3 No - lnc-DES-1:4 No - lnc-DES-1:5 No - lnc-DES-1:6 No - lnc-CHPF-4:4 No - lnc-CHPF-4:5 No - lnc-OBSL1-8:1 No - lnc-OBSL1-8:2 No - lnc-SLC4A3-2:7 No - lnc-SLC4A3-2:8 No - lnc-SLC4A3-2:9 No - lnc-SLC4A3-2:10 No - lnc-SLC4A3-2:6 No - lnc-SLC4A3-2:11 No - lnc-SLC4A3-2:12 No - lnc-CCDC140-9:2 No - lnc-CCDC140-9:4 No - lnc-MOGAT1-3:1 No - lnc-MOGAT1-3:2 No - lnc-MOGAT1-3:3 No - lnc-WDFY1-4:1 No - lnc-MRPL44-1:2 No - lnc-MRPL44-1:3 No - lnc-NYAP2-12:1 No - lnc-NYAP2-12:2 No - lnc-NYAP2-12:3 No - lnc-NYAP2-12:4 No - lnc-NYAP2-12:5 No - lnc-NYAP2-10:1 Yes chr2L:7472513-7496307 lnc-NYAP2-10:2 Yes chr2L:7472513-7496307 lnc-NYAP2-8:1 No - lnc-NYAP2-8:2 No - lnc-NYAP2-1:2 No - lnc-IRS1-2:10 No - lnc-IRS1-2:5 No - lnc-NYAP2-9:1 No - lnc-IRS1-2:6 No - lnc-IRS1-2:2 No - lnc-NYAP2-11:1 No - lnc-NYAP2-5:2 No - lnc-NYAP2-5:3 No - lnc-NYAP2-5:4 No - lnc-NYAP2-5:5 No - lnc-NYAP2-5:6 No - lnc-IRS1-2:7 No - lnc-IRS1-2:3 No - lnc-IRS1-2:4 No - lnc-IRS1-2:8 No - lnc-IRS1-2:9 No - lnc-IRS1-8:1 No - lnc-IRS1-7:5 No - lnc-IRS1-7:6 No - lnc-IRS1-7:1 No - lnc-IRS1-7:7 No - lnc-IRS1-7:2 No - lnc-IRS1-7:3 No - lnc-IRS1-7:4 No - lnc-RHBDD1-6:1 No - lnc-RHBDD1-6:2 No - lnc-RHBDD1-6:3 No - lnc-RHBDD1-6:5 No - lnc-RHBDD1-6:6 No - lnc-RHBDD1-6:7 No - lnc-IRS1-6:1 No - lnc-SLC19A3-3:2 No - lnc-SLC19A3-3:1 No - lnc-SLC19A3-3:3 No - lnc-SLC19A3-3:4 No - lnc-SLC19A3-3:5 No - lnc-SLC19A3-4:1 No - lnc-SLC19A3-4:2 No - lnc-SLC19A3-4:3 No - lnc-PID1-5:1 No - lnc-FBXO36-6:1 No - lnc-FBXO36-5:1 No - lnc-FBXO36-5:2 No - lnc-SP140-3:16 No - lnc-SP110-6:2 No - lnc-SP110-6:3 No - lnc-SP110-8:4 No - lnc-SP110-8:5 No - lnc-SP110-8:3 No - lnc-GPR55-4:1 No - lnc-ITM2C-1:8 No - lnc-ITM2C-1:9 No - lnc-ITM2C-1:10 No - lnc-ITM2C-2:7 No - lnc-ITM2C-2:3 No - lnc-HTR2B-2:1 No - lnc-B3GNT7-1:4 No - lnc-B3GNT7-1:5 No - lnc-B3GNT7-1:6 No - lnc-B3GNT7-4:3 No - LINC00471:2 No - LINC00471:3 No - LINC00471:4 No - LINC00471:5 No - LINC00471:7 No - LINC00471:6 No - lnc-TEX44-4:1 No - lnc-TEX44-4:2 No - lnc-PTMA-5:1 No - lnc-PTMA-4:1 No - lnc-PTMA-3:1 No - lnc-NGEF-2:3 No - lnc-NGEF-2:1 No - lnc-NGEF-2:4 No - lnc-NGEF-2:2 No - lnc-MROH2A-3:1 No - lnc-ARL4C-12:1 No - lnc-ARL4C-12:2 No - lnc-ARL4C-12:3 No - lnc-ARL4C-12:4 No - lnc-ARL4C-12:5 No - lnc-SPP2-8:1 No - lnc-SPP2-9:1 No - lnc-SPP2-10:1 No - lnc-SPP2-10:2 No - lnc-SPP2-10:3 No - LINC01173:6 No - lnc-ARL4C-13:1 No - lnc-COPS8-19:1 No - lnc-COPS8-19:2 No - lnc-COPS8-18:1 No - lnc-COPS8-18:2 No - lnc-COPS8-18:3 No - lnc-COPS8-18:4 No - lnc-COL6A3-14:8 Yes chr2L:8364855-8365663 lnc-COL6A3-14:1 Yes chr2L:8364855-8365663 lnc-COPS8-2:1 No - lnc-COPS8-2:2 No - lnc-COL6A3-14:2 Yes chr2L:8364855-8365663 lnc-COL6A3-14:3 Yes chr2L:8364855-8365663 lnc-COL6A3-14:4 Yes chr2L:8364855-8365663 lnc-COL6A3-14:9 Yes chr2L:8364855-8365663 lnc-COL6A3-14:10 Yes chr2L:8364855-8365663 lnc-COL6A3-14:5 Yes chr2L:8364855-8365663 lnc-COL6A3-14:11 Yes chr2L:8364855-8365663 lnc-COL6A3-14:6 Yes chr2L:8364855-8365663 lnc-COL6A3-14:12 Yes chr2L:8364855-8365663 lnc-COL6A3-11:1 No - lnc-COL6A3-1:3 No - lnc-MLPH-1:1 No - lnc-COL6A3-13:2 No - lnc-LRRFIP1-3:2 No - lnc-LRRFIP1-3:3 No - lnc-LRRFIP1-3:4 No - lnc-RAB17-6:1 Yes chrX:15844476-15847858 lnc-RAB17-6:5 Yes chrX:15844476-15847858 lnc-RAB17-6:2 Yes chrX:15844476-15847858 lnc-RAB17-6:3 Yes chrX:15844476-15847858 lnc-RAB17-6:4 Yes chrX:15844476-15847858 lnc-ILKAP-6:1 No - lnc-ERFE-3:1 No - lnc-ERFE-1:1 No - lnc-ERFE-1:2 No - lnc-PER2-4:2 No - lnc-TWIST2-2:1 Yes chr2R:22985374-23048325 LINC01940:9 No - LINC01940:10 No - LINC01940:11 No - LINC01940:12 No - lnc-GPC1-3:1 No - lnc-GPC1-4:1 No - lnc-GPC1-4:2 No - lnc-GPC1-4:3 No - lnc-GPC1-4:4 No - lnc-ANKMY1-5:1 No - lnc-ANKMY1-5:2 No - lnc-ANKMY1-5:3 No - lnc-ANKMY1-5:4 No - lnc-ANKMY1-5:5 No - CAPN10-DT:7 No - CAPN10-DT:8 No - lnc-ANKMY1-4:1 Yes chrX:16325763-16328523 lnc-MTERF4-6:1 No - lnc-MTERF4-6:2 No - lnc-MTERF4-6:3 No - lnc-MTERF4-6:4 No - lnc-MTERF4-6:5 No - BOK-AS1:10 Yes chr2R:6648654-6652842 BOK-AS1:11 Yes chr2R:6648654-6652842 BOK-AS1:12 Yes chr2R:6648654-6652842 lnc-BOK-4:1 No - lnc-BOK-4:2 No - lnc-DTYMK-7:11 No - lnc-DTYMK-7:9 No - lnc-DTYMK-7:10 No - lnc-DTYMK-7:6 Yes chrX:2141489-2144937 lnc-DTYMK-7:8 Yes chrX:2141489-2144937 lnc-DTYMK-7:7 Yes chrX:2141489-2144937 lnc-DTYMK-7:5 Yes chrX:2141489-2144937 lnc-PDCD1-17:1 No - lnc-PDCD1-17:2 No - NRSN2-AS1:28 No - NRSN2-AS1:21 No - NRSN2-AS1:19 No - NRSN2-AS1:22 No - NRSN2-AS1:9 No - NRSN2-AS1:29 No - NRSN2-AS1:20 No - NRSN2-AS1:23 No - NRSN2-AS1:15 No - NRSN2-AS1:16 No - NRSN2-AS1:12 No - NRSN2-AS1:10 No - NRSN2-AS1:13 No - NRSN2-AS1:24 No - NRSN2-AS1:14 No - NRSN2-AS1:25 No - NRSN2-AS1:26 No - NRSN2-AS1:27 No - NRSN2-AS1:11 No - lnc-TBC1D20-3:1 No - lnc-SNPH-6:2 No - lnc-SNPH-6:1 No - lnc-SNPH-6:3 No - lnc-SNPH-6:4 No - lnc-SNPH-6:5 No - lnc-SNPH-7:1 Yes chr2R:24423926-24425102 lnc-PDYN-1:14 No - lnc-PDYN-1:15 No - lnc-PDYN-1:13 No - lnc-PDYN-1:19 No - lnc-PDYN-1:11 No - lnc-PDYN-1:22 No - lnc-PDYN-1:8 No - lnc-PDYN-1:23 No - lnc-PDYN-1:16 No - lnc-PDYN-1:9 No - lnc-PDYN-1:12 No - lnc-PDYN-1:10 No - lnc-PDYN-3:1 No - PDYN-AS1:10 No - PDYN-AS1:11 No - PDYN-AS1:12 No - PDYN-AS1:13 No - PDYN-AS1:14 No - PDYN-AS1:15 No - lnc-PDYN-2:2 No - lnc-STK35-4:8 No - lnc-STK35-4:9 No - lnc-STK35-4:10 No - lnc-TGM6-5:1 No - lnc-TMC2-5:1 Yes chr2L:12046711-12048918 lnc-TMC2-4:1 Yes chr2L:12046711-12048918 lnc-TMC2-4:2 Yes chr2L:12046711-12048918 lnc-IDH3B-2:2 No - lnc-IDH3B-2:3 Yes chr3R:22419095-22421068 lnc-NOP56-1:2 No - lnc-NOP56-1:3 No - lnc-NOP56-1:4 No - lnc-ITPA-2:2 Yes chr3R:21215079-21216226 lnc-ITPA-2:3 Yes chr3R:21215079-21216226 lnc-ITPA-2:4 No - lnc-ITPA-4:2 No - lnc-ITPA-4:3 No - lnc-ITPA-4:4 No - lnc-ATRN-4:1 No - lnc-ATRN-4:2 No - lnc-ATRN-4:3 No - lnc-ATRN-4:4 No - lnc-C20orf194-4:1 No - lnc-HSPA12B-2:1 Yes chr3L:8443042-8449377 lnc-RNF24-2:8 No - lnc-RNF24-2:5 No - lnc-RNF24-2:9 No - lnc-RNF24-2:6 No - lnc-RNF24-2:7 No - lnc-ADRA1D-4:1 No - lnc-ADRA1D-4:2 No - lnc-ADRA1D-4:3 No - lnc-CDS2-13:1 Yes chr2L:19582823-19583990 lnc-CDS2-13:2 Yes chr2L:19582823-19583990 lnc-GPCPD1-8:14 No - lnc-GPCPD1-8:15 No - lnc-GPCPD1-8:16 No - lnc-GPCPD1-8:17 No - lnc-GPCPD1-8:18 No - MCM8-AS1:4 No - MCM8-AS1:3 No - lnc-PLCB1-7:1 No - lnc-PLCB1-7:2 No - lnc-PLCB1-1:6 Yes chr2R:23845001-23847024 lnc-PLCB1-1:8 No - lnc-PLCB1-1:9 No - lnc-PLCB1-1:10 No - lnc-PLCB1-1:11 No - lnc-TMX4-4:1 Yes chr2L:305935-355566 lnc-PAK5-2:1 Yes chrX:4322626-4365408 SNAP25-AS1:15 No - SNAP25-AS1:16 No - SNAP25-AS1:17 No - SNAP25-AS1:18 No - SNAP25-AS1:19 No - SNAP25-AS1:20 No - SNAP25-AS1:21 No - lnc-SNAP25-1:5 No - lnc-SNAP25-1:6 No - lnc-SNAP25-1:7 No - lnc-SNAP25-1:8 No - lnc-SNAP25-1:9 No - lnc-SNAP25-1:10 No - SNAP25-AS1:22 No - lnc-MKKS-9:1 No - lnc-SLX4IP-39:1 No - lnc-SLX4IP-39:2 No - lnc-SLX4IP-39:3 No - lnc-SLX4IP-39:4 No - lnc-SLX4IP-39:5 No - lnc-JAG1-15:5 No - lnc-JAG1-15:1 No - lnc-JAG1-15:2 No - lnc-JAG1-15:3 No - lnc-JAG1-15:4 No - lnc-TASP1-14:1 No - LINC01723:25 No - LINC01723:26 No - LINC01723:27 No - LINC01723:28 No - lnc-SNRPB2-2:3 No - lnc-SNRPB2-2:4 No - lnc-SNRPB2-2:5 No - lnc-SNRPB2-2:6 No - lnc-SNRPB2-2:7 No - lnc-KIF16B-1:3 No - lnc-PCSK2-2:2 No - lnc-PCSK2-2:3 No - lnc-SNX5-1:2 No - lnc-SNX5-1:3 No - lnc-MGME1-5:1 No - lnc-OVOL2-4:1 No - lnc-DZANK1-3:5 No - lnc-DZANK1-3:6 No - lnc-RBBP9-3:1 No - LINC00652:8 No - LINC00652:9 No - lnc-SCP2D1-1:3 No - lnc-SCP2D1-1:4 No - lnc-SCP2D1-1:5 No - lnc-SCP2D1-1:6 No - lnc-RBBP9-9:1 No - lnc-SLC24A3-2:3 No - lnc-SLC24A3-2:4 No - lnc-SLC24A3-1:13 No - lnc-SLC24A3-1:14 No - lnc-SLC24A3-1:16 No - lnc-SLC24A3-1:15 No - lnc-SLC24A3-1:17 No - lnc-SLC24A3-1:18 No - lnc-RALGAPA2-2:2 Yes chr2R:22707794-22712724 lnc-RALGAPA2-2:3 Yes chr2R:22707794-22712724 lnc-RALGAPA2-2:4 Yes chr2R:22707794-22712724 lnc-RALGAPA2-2:5 Yes chr2R:22707794-22712724 lnc-RALGAPA2-2:6 Yes chr2R:22707794-22712724 lnc-RALGAPA2-2:7 Yes chr2R:22707794-22712724 lnc-INSM1-8:1 No - lnc-INSM1-8:2 No - lnc-NKX2-4-6:2 Yes chr2L:6908083-6911423 lnc-NKX2-4-6:3 Yes chr2L:6908083-6911423 lnc-XRN2-1:16 Yes chr3L:24724162-24758036 lnc-XRN2-1:17 Yes chr3L:24724162-24758036 lnc-XRN2-1:18 Yes chr3L:24724162-24758036 lnc-XRN2-1:15 Yes chr3L:24724162-24758036 lnc-CD93-6:1 No - LINC00656:4 No - LINC00656:5 No - LINC00656:6 No - LINC00656:7 No - lnc-SSTR4-12:4 No - LINC00656:3 No - lnc-SSTR4-12:5 No - lnc-CD93-7:1 No - lnc-SSTR4-13:2 No - lnc-SSTR4-13:3 No - lnc-CD93-8:1 No - lnc-SSTR4-2:10 No - lnc-SSTR4-2:11 No - lnc-SSTR4-2:12 No - lnc-SSTR4-2:13 No - lnc-SSTR4-2:14 No - lnc-NAPB-2:3 Yes chr2R:23811321-23811974 lnc-NAPB-2:4 Yes chr2R:23811321-23811974 lnc-NAPB-2:5 Yes chr2R:23811321-23811974 lnc-NAPB-2:2 Yes chr2R:23811321-23811974 lnc-NAPB-2:8 No - lnc-NAPB-2:9 No - lnc-NAPB-2:6 Yes chr2R:23811321-23811974 lnc-NAPB-2:7 Yes chr2R:23811321-23811974 LINC01431:12 No - LINC01431:13 No - LINC01431:14 No - LINC01431:15 No - LINC01431:16 No - LINC01431:11 No - lnc-NAPB-6:1 No - lnc-GGTLC1-5:3 No - lnc-GGTLC1-5:4 No - lnc-GGTLC1-5:5 No - lnc-CST7-1:6 No - lnc-CST7-1:7 No - lnc-CST7-1:8 No - lnc-VSX1-1:11 No - lnc-VSX1-1:12 No - lnc-VSX1-1:13 No - lnc-VSX1-1:14 No - lnc-VSX1-1:15 No - lnc-ABHD12-4:4 No - lnc-ABHD12-4:5 No - lnc-ABHD12-4:6 No - lnc-ABHD12-1:5 No - lnc-ABHD12-1:6 No - lnc-ABHD12-1:7 No - lnc-ABHD12-1:3 No - lnc-ABHD12-1:4 No - ZNF337-AS1:17 No - ZNF337-AS1:19 Yes chrX:5755574-5759751 ZNF337-AS1:20 Yes chrX:5755574-5759751 ZNF337-AS1:21 Yes chrX:5755574-5759751 ZNF337-AS1:22 Yes chrX:5755574-5759751 lnc-GINS1-2:6 No - FAM182A:25 No - FAM182A:26 No - FAM182A:27 No - FAM182A:28 No - FAM182A:29 No - FAM182A:34 No - MIR663AHG:43 No - MIR663AHG:47 No - MIR663AHG:48 No - MIR663AHG:49 No - MIR663AHG:57 No - MIR663AHG:58 No - MIR663AHG:69 No - MIR663AHG:70 No - MIR663AHG:71 No - MIR663AHG:68 No - MIR663AHG:59 No - MIR663AHG:60 No - MIR663AHG:61 No - MIR663AHG:50 No - MIR663AHG:46 No - MIR663AHG:45 No - MIR663AHG:72 No - MIR663AHG:62 No - MIR663AHG:51 No - MIR663AHG:52 No - MIR663AHG:42 No - MIR663AHG:63 No - MIR663AHG:73 No - MIR663AHG:66 No - MIR663AHG:64 No - MIR663AHG:65 No - MIR663AHG:53 No - MIR663AHG:54 No - MIR663AHG:41 No - MIR663AHG:55 No - MIR663AHG:56 No - MIR663AHG:74 No - MIR663AHG:67 No - MIR663AHG:44 No - lnc-GINS1-13:2 No - lnc-GINS1-13:3 No - lnc-GINS1-13:4 No - lnc-GINS1-13:5 No - lnc-GINS1-13:6 No - LINC01597:4 No - LINC01597:5 No - LINC01597:6 No - LINC01597:7 No - LINC01597:8 No - lnc-DEFB124-3:1 Yes chr2L:542786-544653 lnc-TPX2-4:1 No - lnc-BCL2L1-1:2 No - lnc-MYLK2-1:1 No - lnc-MYLK2-1:2 No - lnc-PDRG1-3:1 No - lnc-PDRG1-3:2 No - lnc-PDRG1-3:3 No - lnc-NOL4L-2:1 Yes chr2R:14503958-14512493 lnc-NOL4L-2:3 No - lnc-NOL4L-2:2 No - lnc-NOL4L-3:1 Yes chr2R:14503958-14512493 lnc-SNTA1-4:1 No - ZNF341-AS1:6 No - ZNF341-AS1:10 No - ZNF341-AS1:7 Yes chr2R:9142146-9143914 ZNF341-AS1:9 Yes chr2R:9142146-9143914 ZNF341-AS1:8 Yes chr2R:9142146-9143914 RALY-AS1:17 No - RALY-AS1:16 No - RALY-AS1:13 Yes chr3L:7423827-7454717 RALY-AS1:14 Yes chr3L:7423827-7454717 RALY-AS1:15 Yes chr3L:7423827-7454717 RALY-AS1:12 Yes chr3L:7423827-7454717 RALY-AS1:18 No - lnc-RALY-4:1 No - lnc-MYH7B-3:1 Yes chrX:17889547-17898603 FAM83C-AS1:3 No - FAM83C-AS1:4 No - lnc-GDF5OS-2:1 Yes chr3L:6956946-6958108 NORAD:8 No - NORAD:9 No - NORAD:10 No - lnc-EPB41L1-1:4 No - lnc-EPB41L1-1:5 No - lnc-EPB41L1-1:6 No - DLGAP4-AS1:8 No - DLGAP4-AS1:10 No - DLGAP4-AS1:11 No - DLGAP4-AS1:12 No - DLGAP4-AS1:15 No - lnc-SLA2-4:1 No - DLGAP4-AS1:13 No - DLGAP4-AS1:9 No - DLGAP4-AS1:14 No - lnc-SLA2-1:5 Yes chr2R:7674450-7675362 lnc-SLA2-1:3 Yes chr2R:7674450-7675362 lnc-TLDC2-5:1 No - lnc-TLDC2-5:2 No - lnc-TLDC2-5:3 No - lnc-GHRH-4:1 No - lnc-SRC-3:1 No - SNHG11:25 No - SNHG11:26 No - SNHG11:27 No - SNHG11:28 No - SNHG11:29 No - SNHG11:30 No - SNHG11:31 No - SNHG11:32 No - SNHG11:33 No - SNHG11:34 No - SNHG11:35 No - SNHG11:36 No - SNHG11:37 No - SNHG11:38 No - lnc-KIAA1755-16:1 No - lnc-KIAA1755-6:2 No - lnc-MAFB-10:1 No - lnc-TOP1-11:1 No - lnc-TOP1-10:1 No - lnc-MAFB-8:1 No - lnc-MAFB-9:1 No - lnc-ZHX3-7:1 No - PLCG1-AS1:5 No - PLCG1-AS1:7 No - PLCG1-AS1:8 No - PLCG1-AS1:9 No - PLCG1-AS1:10 No - PLCG1-AS1:6 Yes chrX:16350315-16356482 lnc-SRSF6-1:4 No - lnc-SRSF6-1:5 No - lnc-GTSF1L-9:2 No - lnc-GTSF1L-10:1 No - OSER1-DT:30 No - OSER1-DT:31 No - OSER1-DT:32 No - OSER1-DT:33 No - OSER1-DT:37 No - OSER1-DT:38 No - OSER1-DT:39 No - OSER1-DT:40 No - OSER1-DT:41 No - HNF4A-AS1:13 Yes chr2L:8687226-8709611 HNF4A-AS1:14 Yes chr2L:8687226-8709611 HNF4A-AS1:15 Yes chr2L:8687226-8709611 HNF4A-AS1:16 Yes chr2L:8687226-8709611 HNF4A-AS1:17 Yes chr2L:8687226-8709611 lnc-PKIG-4:1 No - lnc-PKIG-5:1 No - lnc-PKIG-5:2 No - lnc-PKIG-5:3 No - lnc-ADA-3:28 No - lnc-ADA-3:22 Yes chr3L:17690015-17748839 lnc-ADA-3:23 Yes chr3L:17690015-17748839 lnc-ADA-3:20 Yes chr3L:17690015-17748839 lnc-ADA-3:29 No - lnc-ADA-3:30 No - lnc-ADA-3:31 No - lnc-ADA-3:24 Yes chr3L:17690015-17748839 lnc-ADA-3:26 No - lnc-ADA-3:25 Yes chr3L:17690015-17748839 lnc-ADA-3:27 No - lnc-ADA-3:21 No - lnc-PABPC1L-4:1 No - lnc-PABPC1L-4:2 No - STK4-AS1:6 No - STK4-AS1:7 No - STK4-AS1:5 No - lnc-TP53TG5-6:1 No - lnc-TP53TG5-6:2 No - lnc-PCIF1-2:1 Yes chr3L:7353578-7356713 lnc-CD40-3:2 No - lnc-SLC2A10-9:3 Yes chr2L:12097838-12100839 lnc-SLC2A10-9:4 Yes chr2L:12097838-12100839 lnc-SLC2A10-9:5 Yes chr2L:12097838-12100839 lnc-SLC2A10-2:2 No - lnc-TP53RK-1:2 Yes chr2L:6527447-6546976 lnc-TP53RK-1:4 Yes chr2L:6527447-6546976 lnc-TP53RK-1:3 Yes chr2L:6527447-6546976 lnc-SULF2-9:2 Yes chr3R:31669465-31677971 lnc-NCOA3-29:1 No - lnc-NCOA3-29:2 No - lnc-ZMYND8-11:1 No - lnc-NCOA3-28:1 No - lnc-NCOA3-27:1 No - LINC01522:5 No - lnc-NCOA3-30:1 No - lnc-NCOA3-31:1 No - lnc-NCOA3-9:7 No - lnc-NCOA3-9:8 No - lnc-NCOA3-9:9 No - lnc-NCOA3-9:10 No - lnc-NCOA3-9:11 No - lnc-NCOA3-10:6 No - lnc-NCOA3-10:9 No - lnc-NCOA3-10:10 No - lnc-NCOA3-10:7 No - lnc-NCOA3-10:8 No - lnc-NCOA3-26:3 No - lnc-NCOA3-26:4 No - lnc-NCOA3-26:5 No - lnc-PREX1-10:1 No - lnc-PREX1-10:2 No - CSE1L-AS1:7 No - CSE1L-AS1:8 No - CSE1L-AS1:9 Yes chr2L:13793521-13799674 CSE1L-AS1:10 No - CSE1L-AS1:12 No - CSE1L-AS1:11 No - ZFAS1:19 No - ZFAS1:20 No - ZFAS1:24 No - ZFAS1:25 No - ZFAS1:21 No - ZFAS1:26 No - ZFAS1:27 No - ZFAS1:28 No - ZFAS1:22 Yes chr3L:2895017-2959579 ZFAS1:29 No - ZFAS1:30 No - lnc-DDX27-4:3 Yes chr3L:2895017-2959579 lnc-DDX27-4:4 Yes chr3L:2895017-2959579 lnc-DDX27-4:5 Yes chr3L:2895017-2959579 lnc-DDX27-4:6 Yes chr3L:2895017-2959579 lnc-DDX27-4:7 Yes chr3L:2895017-2959579 lnc-SLC9A8-8:1 No - lnc-SLC9A8-8:2 No - lnc-SLC9A8-8:3 No - lnc-SLC9A8-8:4 No - lnc-B4GALT5-2:2 No - lnc-B4GALT5-2:3 No - lnc-B4GALT5-2:1 No - lnc-SLC9A8-7:1 No - lnc-RNF114-2:1 Yes chr2R:24126638-24133551 lnc-RNF114-2:2 No - lnc-RNF114-2:3 No - lnc-RNF114-2:4 No - lnc-SNAI1-5:1 No - lnc-SNAI1-5:2 No - lnc-TMEM189-UBE2V1-5:1 No - LINC01273:16 No - LINC01273:17 No - LINC01273:18 No - lnc-TMEM189-2:2 No - lnc-TMEM189-2:3 No - lnc-TMEM189-2:4 No - lnc-CEBPB-13:2 No - lnc-CEBPB-13:3 No - lnc-CEBPB-13:4 No - lnc-CEBPB-13:5 No - lnc-CEBPB-13:6 No - lnc-CEBPB-13:10 No - lnc-CEBPB-13:11 No - lnc-CEBPB-13:12 No - lnc-CEBPB-13:13 No - lnc-CEBPB-13:14 No - lnc-TMEM189-9:1 No - lnc-TMEM189-9:2 No - LINC01270:9 No - LINC01270:10 No - LINC01270:11 No - LINC01270:12 No - LINC01271:6 No - LINC01271:2 No - LINC01270:13 No - LINC01270:14 No - LINC01270:15 No - LINC01270:16 No - LINC01270:17 No - LINC01270:18 No - LINC01270:19 No - LINC01270:20 No - LINC01270:21 No - LINC01270:22 No - LINC01270:23 No - LINC01270:24 No - LINC01270:25 No - LINC01270:26 No - LINC01271:4 No - LINC01271:3 No - lnc-RIPOR3-10:1 No - lnc-RIPOR3-9:1 No - lnc-PTPN1-7:1 No - lnc-PTPN1-6:1 No - lnc-PTPN1-6:2 No - lnc-RIPOR3-8:1 No - lnc-RIPOR3-8:2 No - lnc-RIPOR3-7:1 No - lnc-RIPOR3-6:1 No - lnc-RIPOR3-6:2 No - ADNP-AS1:7 No - ADNP-AS1:8 No - ADNP-AS1:9 No - ADNP-AS1:10 No - ADNP-AS1:11 No - ADNP-AS1:13 No - ADNP-AS1:14 No - lnc-MOCS3-3:2 No - lnc-MOCS3-3:3 No - lnc-MOCS3-3:4 No - lnc-MOCS3-3:5 No - lnc-MOCS3-3:6 No - lnc-MOCS3-6:1 Yes chr2L:13289997-13301668 LINC01524:5 No - LINC01524:4 No - LINC01524:7 No - LINC01524:8 No - LINC01524:6 No - LINC01524:9 No - LINC01524:11 No - LINC01524:10 No - LINC01524:12 No - LINC01524:13 No - LINC01524:14 No - LINC01524:15 No - LINC01524:16 No - lnc-ZNF217-9:1 No - lnc-TSHZ2-11:3 No - lnc-TSHZ2-11:4 No - lnc-TSHZ2-11:5 No - lnc-TSHZ2-11:6 No - lnc-ZNF217-10:1 No - lnc-TSHZ2-18:1 No - lnc-BCAS1-5:2 No - lnc-BCAS1-5:3 No - lnc-PFDN4-10:1 No - lnc-PFDN4-9:1 No - lnc-PFDN4-8:1 No - lnc-PFDN4-8:2 No - lnc-BCAS1-6:1 No - lnc-PFDN4-11:1 No - lnc-GCNT7-6:1 Yes chr3L:21586828-21613349 lnc-SPO11-1:7 Yes chr2R:23851562-23853247 lnc-SPO11-1:8 Yes chr2R:23851562-23853247 lnc-SPO11-1:6 Yes chr2R:23851562-23853247 lnc-ANKRD60-1:3 No - lnc-ANKRD60-1:2 No - lnc-APCDD1L-5:1 No - APCDD1L-DT:32 No - APCDD1L-DT:33 No - APCDD1L-DT:34 No - APCDD1L-DT:35 No - APCDD1L-DT:36 No - APCDD1L-DT:37 No - APCDD1L-DT:38 No - APCDD1L-DT:39 No - APCDD1L-DT:40 No - APCDD1L-DT:41 No - APCDD1L-DT:45 No - APCDD1L-DT:46 No - lnc-APCDD1L-3:2 No - GNAS-AS1:14 Yes chr2R:23942538-23946936 GNAS-AS1:15 Yes chr2R:23942538-23946936 GNAS-AS1:16 Yes chr2R:23942538-23946936 GNAS-AS1:17 Yes chr2R:23942538-23946936 GNAS-AS1:18 Yes chr2R:23942538-23946936 lnc-CTSZ-2:9 Yes chr2R:23942538-23946936 lnc-CTSZ-2:10 Yes chr2R:23942538-23946936 lnc-CTSZ-2:11 Yes chr2R:23942538-23946936 lnc-CTSZ-2:12 Yes chr2R:23942538-23946936 lnc-CTSZ-2:6 Yes chr2R:23942538-23946936 lnc-CTSZ-2:7 Yes chr2R:23942538-23946936 lnc-CTSZ-2:8 Yes chr2R:23942538-23946936 lnc-TUBB1-2:1 No - lnc-SYCP2-1:4 Yes chr3L:3714826-3806459 lnc-SYCP2-1:5 Yes chr3L:3714826-3806459 lnc-SYCP2-1:6 Yes chr3L:3714826-3806459 MIR646HG:25 No - MIR646HG:26 No - MIR646HG:27 No - MIR646HG:28 No - MIR646HG:29 No - MIR646HG:24 No - MIR646HG:32 No - MIR646HG:33 No - MIR646HG:30 No - MIR646HG:31 No - MIR646HG:35 No - lnc-CDH4-4:2 No - lnc-CDH4-4:3 No - lnc-CDH4-4:4 No - lnc-CDH4-4:5 No - lnc-HRH3-3:1 Yes chrX:8398940-8404516 lnc-HRH3-3:2 Yes chrX:8398940-8404516 lnc-HRH3-3:3 Yes chrX:8398940-8404516 lnc-HRH3-1:3 Yes chr2R:23992138-23995055 lnc-HRH3-1:4 Yes chr2R:23992138-23995055 lnc-LAMA5-1:4 No - lnc-GATA5-4:1 No - MIR1-1HG-AS1:43 No - MIR1-1HG-AS1:44 No - MIR1-1HG-AS1:45 No - MIR1-1HG-AS1:33 No - MIR1-1HG-AS1:34 No - MIR1-1HG-AS1:35 No - MIR1-1HG-AS1:46 No - MIR1-1HG-AS1:47 No - MIR1-1HG-AS1:36 No - MIR1-1HG-AS1:37 No - MIR1-1HG-AS1:38 No - MIR1-1HG-AS1:39 No - MIR1-1HG-AS1:40 No - SLCO4A1-AS1:7 Yes chr2L:6625138-6632407 SLCO4A1-AS1:8 Yes chr2L:6625138-6632407 SLCO4A1-AS1:5 Yes chr2L:6625138-6632407 SLCO4A1-AS1:6 Yes chr2L:6625138-6632407 SLCO4A1-AS1:9 Yes chr2L:6625138-6632407 LINC00659:8 No - LINC00659:9 No - LINC00659:10 No - LINC00659:11 No - LINC00659:14 No - LINC00659:15 No - LINC00659:12 No - LINC00659:13 No - lnc-TCFL5-2:6 No - lnc-TCFL5-2:7 No - lnc-TCFL5-2:8 No - lnc-TCFL5-2:10 No - lnc-TCFL5-2:11 No - lnc-TCFL5-2:9 No - lnc-TCFL5-2:5 No - HAR1B:7 No - HAR1B:5 No - HAR1B:6 No - HAR1A:5 No - HAR1A:6 No - HAR1A:8 No - HAR1A:7 No - MHENCR:15 No - MHENCR:19 No - MHENCR:20 No - MHENCR:21 No - MHENCR:22 No - lnc-PRPF6-2:4 Yes chr2R:14752521-14753269 lnc-NPBWR2-4:1 No - lnc-KCNE1B-3:7 No - lnc-KCNE1B-3:8 No - lnc-KCNE1B-3:6 No - lnc-KCNE1B-3:5 No - lnc-KCNE1B-3:9 No - lnc-RBM11-2:7 No - lnc-RBM11-2:8 No - lnc-RBM11-2:9 No - lnc-RBM11-2:10 No - lnc-RBM11-2:11 No - lnc-RBM11-2:12 Yes chrX:17911462-17924163 lnc-RBM11-2:13 Yes chrX:17911462-17924163 lnc-RBM11-2:14 No - lnc-RBM11-1:3 No - lnc-RBM11-1:4 No - lnc-RBM11-1:5 No - lnc-RBM11-1:6 No - lnc-RBM11-1:7 No - lnc-RBM11-15:1 No - lnc-RBM11-15:2 No - lnc-USP25-14:1 No - lnc-USP25-14:2 No - lnc-NRIP1-15:5 No - lnc-NRIP1-15:6 No - lnc-NRIP1-15:4 No - lnc-NRIP1-15:1 No - lnc-NRIP1-15:2 No - lnc-NRIP1-15:3 No - lnc-NRIP1-2:18 No - lnc-NRIP1-2:15 No - lnc-NRIP1-2:16 No - lnc-NRIP1-2:17 No - MIR99AHG:35 No - MIR99AHG:34 No - MIR99AHG:36 No - MIR99AHG:37 No - MIR99AHG:39 No - MIR99AHG:38 No - MIR99AHG:45 No - MIR99AHG:41 No - MIR99AHG:42 No - MIR99AHG:43 No - MIR99AHG:44 No - MIR99AHG:47 No - MIR99AHG:48 No - MIR99AHG:46 No - MIR99AHG:50 No - MIR99AHG:51 No - MIR99AHG:49 No - MIR99AHG:52 No - MIR99AHG:53 No - MIR99AHG:54 No - MIR99AHG:55 No - MIR99AHG:56 No - MIR99AHG:58 No - MIR99AHG:59 No - MIR99AHG:57 No - MIR99AHG:60 No - MIR99AHG:61 No - MIR99AHG:62 No - MIR99AHG:63 No - MIR99AHG:64 No - MIR99AHG:65 No - MIR99AHG:69 No - MIR99AHG:70 No - MIR99AHG:71 No - MIR99AHG:68 No - MIR99AHG:72 No - MIR99AHG:73 No - MIR99AHG:74 No - MIR99AHG:75 No - MIR99AHG:76 No - MIR99AHG:77 No - MIR99AHG:78 No - MIR99AHG:79 No - MIR99AHG:88 No - MIR99AHG:89 No - MIR99AHG:90 No - MIR99AHG:91 No - MIR99AHG:92 No - MIR99AHG:93 No - MIR99AHG:94 No - MIR99AHG:95 No - MIR99AHG:97 No - MIR99AHG:96 No - MIR99AHG:98 No - MIR99AHG:99 No - lnc-BTG3-6:2 No - lnc-BTG3-6:3 No - BTG3-AS1:11 Yes chrX:16074717-16091495 BTG3-AS1:12 Yes chrX:16074717-16091495 BTG3-AS1:13 Yes chrX:16074717-16091495 BTG3-AS1:14 Yes chrX:16074717-16091495 MIR548XHG:6 No - LINC00320:25 No - LINC00320:26 No - LINC00320:27 No - LINC00320:31 No - LINC00320:28 No - LINC00320:29 No - LINC00320:32 No - LINC00320:30 No - LINC00320:33 No - LINC01687:11 No - LINC01687:12 No - LINC01687:13 No - LINC01687:14 No - LINC01687:15 No - lnc-MRPL39-13:5 No - LINC01684:17 No - LINC01684:18 No - LINC01684:19 No - LINC01684:20 No - LINC01684:21 No - LINC01684:22 No - LINC01684:23 No - MIR155HG:5 No - MIR155HG:6 No - MIR155HG:7 No - MIR155HG:8 No - MIR155HG:9 No - MIR155HG:10 No - MIR155HG:11 No - lnc-GABPA-13:3 Yes chrX:530501-579044 lnc-GABPA-13:4 Yes chrX:530501-579044 lnc-GABPA-13:5 Yes chrX:530501-579044 lnc-GABPA-13:6 Yes chrX:530501-579044 lnc-GABPA-3:6 No - lnc-GABPA-3:7 No - CYYR1-AS1:3 No - CYYR1-AS1:5 No - lnc-GABPA-3:8 No - lnc-GABPA-3:9 No - lnc-GABPA-3:12 No - lnc-GABPA-3:10 No - lnc-GABPA-3:11 No - lnc-GABPA-22:1 No - lnc-USP16-17:1 No - lnc-USP16-17:2 No - lnc-USP16-17:4 No - lnc-USP16-17:3 No - lnc-USP16-17:5 No - LINC01697:30 No - LINC01697:31 No - LINC01697:32 No - LINC01697:37 No - LINC01697:38 No - LINC01697:39 No - lnc-N6AMT1-1:17 No - lnc-N6AMT1-1:11 No - lnc-N6AMT1-1:12 No - lnc-N6AMT1-1:13 No - lnc-N6AMT1-1:18 No - lnc-N6AMT1-1:19 No - lnc-N6AMT1-1:20 No - lnc-N6AMT1-1:14 No - lnc-N6AMT1-1:21 No - lnc-N6AMT1-1:9 No - lnc-N6AMT1-1:10 No - lnc-N6AMT1-1:6 No - lnc-N6AMT1-1:15 No - lnc-N6AMT1-1:16 No - lnc-N6AMT1-1:7 No - lnc-N6AMT1-1:8 No - lnc-USP16-14:2 No - lnc-USP16-14:3 No - lnc-USP16-14:4 No - lnc-USP16-1:3 No - lnc-USP16-1:4 No - lnc-USP16-1:5 No - lnc-USP16-1:6 No - lnc-USP16-9:2 No - lnc-RWDD2B-2:2 Yes chrX:5421533-5427219 lnc-MAP3K7CL-6:1 No - LINC00189:6 Yes chr3R:23185580-23226711 LINC00189:7 Yes chr3R:23185580-23226711 LINC00189:10 Yes chr3R:23185580-23226711 LINC00189:9 Yes chr3R:23185580-23226711 LINC00189:11 Yes chr3R:23185580-23226711 LINC00189:12 Yes chr3R:23185580-23226711 LINC00189:13 Yes chr3R:23185580-23226711 LINC00189:15 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-CCT8-6:1 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-CCT8-6:2 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-CCT8-6:3 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-CCT8-6:4 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-CCT8-6:5 Yes chr3R:23185580-23226711 lnc-SOD1-3:4 Yes chr3L:5657913-5749599 lnc-SOD1-3:5 Yes chr3L:5657913-5749599 lnc-SCAF4-1:3 No - lnc-SCAF4-1:4 No - lnc-SCAF4-1:2 No - lnc-SCAF4-1:5 No - lnc-SCAF4-2:2 No - lnc-SOD1-9:2 No - lnc-SOD1-9:3 No - lnc-SOD1-9:5 No - lnc-SOD1-9:6 No - lnc-SOD1-9:4 No - MIS18A-AS1:3 No - lnc-URB1-4:3 No - lnc-URB1-4:1 Yes chr3R:4077939-4104326 lnc-URB1-4:4 No - lnc-URB1-4:2 Yes chr3R:4077939-4104326 PAXBP1-AS1:7 No - PAXBP1-AS1:8 No - lnc-TMEM50B-7:3 No - lnc-TMEM50B-7:4 No - IL10RB-DT:11 No - IL10RB-DT:12 No - IL10RB-DT:13 No - IL10RB-DT:14 No - IL10RB-DT:15 No - IL10RB-DT:16 No - lnc-TMEM50B-4:2 No - lnc-TMEM50B-4:3 No - lnc-TMEM50B-4:4 No - lnc-TMEM50B-5:1 No - LINC00649:28 No - LINC00649:29 No - LINC00649:30 No - LINC00649:31 No - LINC00649:32 No - LINC00649:33 No - LINC00649:34 No - LINC00649:35 No - LINC00649:36 No - LINC00649:37 No - LINC00649:38 No - LINC00649:40 No - LINC00649:39 No - LINC00310:18 No - LINC00310:19 No - LINC00310:23 No - LINC00310:24 No - LINC00310:25 No - LINC00310:20 No - LINC00310:21 No - LINC00310:26 No - LINC00310:27 No - LINC00310:28 No - LINC01426:6 No - LINC01426:7 No - LINC01426:8 No - LINC01426:9 No - LINC01426:10 No - lnc-CBR1-1:3 Yes chr3L:1618414-1620397 lnc-CBR1-1:2 Yes chr3L:1618414-1620397 lnc-CBR3-1:6 No - lnc-CBR3-1:7 No - lnc-CBR3-1:8 No - lnc-CBR3-1:9 No - lnc-CBR3-1:10 No - lnc-CBR3-1:11 No - lnc-CBR3-1:12 No - CBR3-AS1:47 No - CBR3-AS1:45 No - CBR3-AS1:48 No - CBR3-AS1:35 No - CBR3-AS1:36 No - CBR3-AS1:37 No - CBR3-AS1:38 No - CBR3-AS1:39 No - CBR3-AS1:40 No - CBR3-AS1:41 No - CBR3-AS1:42 No - CBR3-AS1:46 No - CBR3-AS1:43 No - CBR3-AS1:44 No - lnc-CLDN14-4:2 No - DSCR9:14 No - DSCR9:15 Yes chr3L:20768207-20769482 DSCR9:16 Yes chr3L:20768207-20769482 lnc-TTC3-5:3 Yes chr3L:20768207-20769482 lnc-TTC3-5:4 Yes chr3L:20768207-20769482 lnc-VPS26C-2:2 Yes chrX:17862697-17887222 lnc-VPS26C-2:1 Yes chrX:17862697-17887222 lnc-ERG-10:1 No - lnc-KCNJ15-3:1 Yes chr3L:6097617-6123913 lnc-KCNJ15-3:2 Yes chr3L:6097617-6123913 lnc-KCNJ15-3:3 Yes chr3L:6097617-6123913 lnc-KCNJ15-3:4 Yes chr3L:6097617-6123913 lnc-KCNJ15-3:5 Yes chr3L:6097617-6123913 lnc-ETS2-8:1 No - lnc-ETS2-8:2 No - lnc-ETS2-8:3 No - lnc-ETS2-8:4 No - lnc-ETS2-8:5 No - lnc-ETS2-7:1 No - lnc-ETS2-9:1 No - lnc-PSMG1-4:7 No - lnc-PSMG1-4:6 No - lnc-PSMG1-4:8 No - lnc-PSMG1-4:5 No - lnc-WRB-2:7 Yes chr3R:24319000-24328619 lnc-WRB-2:8 Yes chr3R:24319000-24328619 lnc-WRB-2:9 Yes chr3R:24319000-24328619 lnc-WRB-2:10 Yes chr3R:24319000-24328619 lnc-WRB-2:11 Yes chr3R:24319000-24328619 lnc-TMPRSS2-83:15 No - lnc-TMPRSS2-83:1 No - lnc-TMPRSS2-83:2 No - lnc-TMPRSS2-83:16 No - lnc-TMPRSS2-83:9 No - lnc-TMPRSS2-83:10 No - lnc-TMPRSS2-83:17 No - lnc-TMPRSS2-83:18 No - lnc-TMPRSS2-83:11 No - lnc-RIPK4-7:1 No - lnc-UMODL1-8:1 No - ZNF295-AS1:12 No - lnc-TFF3-4:1 Yes chr2L:4333913-4345776 lnc-SLC37A1-2:1 No - lnc-UBASH3A-8:1 No - lnc-UBASH3A-8:3 No - lnc-UBASH3A-8:2 No - lnc-UBASH3A-8:4 No - lnc-UBASH3A-1:6 Yes chr2R:21282298-21285679 lnc-UBASH3A-1:7 Yes chr2R:21282298-21285679 lnc-UBASH3A-1:8 Yes chr2R:21282298-21285679 lnc-RSPH1-7:3 Yes chr2R:21282298-21285679 lnc-RSPH1-7:1 Yes chr2R:21282298-21285679 lnc-RSPH1-7:2 Yes chr2R:21282298-21285679 lnc-WDR4-7:1 No - lnc-WDR4-7:2 No - lnc-WDR4-7:3 No - lnc-WDR4-2:5 No - lnc-WDR4-2:7 No - lnc-WDR4-2:6 No - lnc-WDR4-2:4 No - FRGCA:5 No - FRGCA:3 No - FRGCA:4 No - LINC00322:3 No - LINC01679:11 No - lnc-CRYAA-2:2 No - lnc-CRYAA-2:3 No - LINC00319:9 No - LINC00319:10 No - LINC00319:12 No - LINC00319:11 No - LINC00319:13 No - LINC00313:30 No - LINC00313:31 No - LINC00313:32 No - LINC00313:33 No - LINC00313:34 No - AATBC:15 Yes chr2L:13363308-13366189 AATBC:17 Yes chr2L:13363308-13366189 AATBC:18 No - AATBC:16 No - lnc-ICOSLG-12:1 No - lnc-ICOSLG-9:2 Yes chr2R:10823405-10827644 lnc-ICOSLG-9:3 Yes chr2R:10823405-10827644 lnc-ICOSLG-9:4 Yes chr2R:10823405-10827644 lnc-ICOSLG-9:5 Yes chr2R:10823405-10827644 lnc-ICOSLG-9:6 Yes chr2R:10823405-10827644 LINC01678:18 No - LINC01678:19 No - LINC01678:20 No - LINC01678:14 No - LINC01678:15 No - lnc-ICOSLG-6:12 No - lnc-ICOSLG-6:10 No - lnc-PWP2-1:2 No - lnc-PWP2-1:3 No - lnc-PWP2-1:4 No - lnc-PWP2-1:5 No - lnc-PWP2-1:6 No - lnc-PWP2-3:1 No - lnc-C21orf2-3:1 No - lnc-TRPM2-1:4 No - lnc-TRPM2-1:5 No - lnc-TRPM2-1:6 No - TRPM2-AS:5 Yes chr2R:15262808-15309368 TRPM2-AS:6 Yes chr2R:15262808-15309368 TRPM2-AS:7 Yes chr2R:15262808-15309368 TRPM2-AS:8 Yes chr2R:15262808-15309368 TRPM2-AS:9 Yes chr2R:15262808-15309368 LRRC3-DT:10 No - LRRC3-DT:11 No - LINC01424:4 Yes chrX:16593677-16595867 LINC01424:5 Yes chrX:16593677-16595867 LINC01424:6 Yes chrX:16593677-16595867 lnc-FAM207A-12:1 No - lnc-FAM207A-12:2 No - lnc-FAM207A-12:3 No - lnc-FAM207A-12:4 No - lnc-FAM207A-12:5 No - lnc-FAM207A-12:6 No - LINC00205:20 No - LINC00205:21 No - LINC00205:22 No - LINC00205:23 No - LINC00205:24 No - LINC00205:25 No - LINC00205:26 No - lnc-SLC19A1-7:6 Yes chr3L:6998843-7053499 lnc-SLC19A1-7:7 No - lnc-SLC19A1-7:4 Yes chr3L:6998843-7053499 lnc-SLC19A1-7:5 Yes chr3L:6998843-7053499 lnc-SLC19A1-7:9 No - lnc-SLC19A1-7:8 No - lnc-SLC19A1-12:1 No - lnc-SLC19A1-5:2 No - lnc-SLC19A1-5:3 No - LINC01694:16 No - LINC01694:17 No - LINC01694:18 No - LINC01694:19 No - LINC01694:20 No - LINC01694:23 No - LINC01694:24 No - LINC01694:25 No - LINC01694:26 No - LINC01694:27 No - LINC01694:28 No - lnc-COL6A1-3:10 No - lnc-COL6A1-3:11 No - lnc-COL6A1-3:12 No - lnc-COL6A1-3:13 No - lnc-FTCD-7:1 No - lnc-COL6A2-4:2 No - lnc-COL6A2-4:3 No - lnc-YBEY-6:1 Yes chrX:17154110-17159306 lnc-C21orf58-1:8 No - lnc-C21orf58-1:9 No - lnc-C21orf58-1:3 No - lnc-C21orf58-1:6 No - lnc-C21orf58-1:4 No - lnc-C21orf58-1:5 No - lnc-C21orf58-1:7 No - lnc-S100B-2:1 Yes chr2L:11009821-11011086 lnc-IL17RA-36:1 No - lnc-IL17RA-36:2 No - lnc-IL17RA-36:3 No - lnc-IL17RA-36:4 No - lnc-IL17RA-36:5 No - lnc-IL17RA-36:8 No - lnc-IL17RA-36:9 No - lnc-IL17RA-36:10 No - lnc-IL17RA-36:11 No - lnc-IL17RA-36:12 No - lnc-IL17RA-36:13 No - lnc-IL17RA-36:14 No - lnc-IL17RA-36:15 No - lnc-IL17RA-36:16 No - lnc-IL17RA-36:17 No - HDHD5-AS1:14 No - HDHD5-AS1:15 No - HDHD5-AS1:16 No - HDHD5-AS1:17 No - HDHD5-AS1:18 No - lnc-CECR2-9:1 No - LINC00528:10 No - LINC00528:11 No - LINC00528:15 No - LINC00528:16 No - lnc-MICAL3-2:5 No - lnc-MICAL3-2:6 No - lnc-DGCR6-6:4 No - lnc-DGCR6-6:5 No - lnc-DGCR6-6:6 No - lnc-DGCR6-6:7 No - lnc-DGCR6-6:8 No - lnc-DGCR6-6:9 No - lnc-DGCR6-6:10 No - lnc-SLC25A1-5:3 No - lnc-SLC25A1-5:4 No - lnc-SLC25A1-5:1 No - lnc-SLC25A1-5:2 No - LINC01311:4 No - LINC01311:5 No - lnc-TSSK2-8:1 No - lnc-MRPL40-1:5 No - lnc-MRPL40-1:3 No - lnc-MRPL40-1:4 No - lnc-TBX1-3:1 No - lnc-TBX1-3:2 No - lnc-TBX1-3:3 No - lnc-TBX1-3:4 No - lnc-TBX1-3:5 No - lnc-TRMT2A-3:1 No - lnc-RTN4R-1:3 No - lnc-RTN4R-1:7 No - lnc-RTN4R-1:4 No - lnc-RTN4R-1:5 No - LINC00896:9 No - LINC00896:10 No - lnc-RTN4R-1:6 No - lnc-ZNF74-7:1 No - lnc-ZNF74-7:2 No - lnc-PI4KA-4:1 No - lnc-SERPIND1-1:38 No - lnc-SERPIND1-1:39 No - lnc-SERPIND1-1:40 No - lnc-SERPIND1-1:41 No - lnc-SERPIND1-1:42 No - lnc-SERPIND1-1:43 No - lnc-SERPIND1-1:44 No - lnc-SERPIND1-1:45 No - lnc-SERPIND1-1:49 No - lnc-SERPIND1-1:50 No - lnc-SERPIND1-1:51 No - lnc-SERPIND1-1:52 No - lnc-SERPIND1-1:53 No - lnc-SERPIND1-1:54 No - lnc-SERPIND1-1:62 No - LINC01637:12 No - LINC01637:13 No - THAP7-AS1:9 No - THAP7-AS1:10 No - THAP7-AS1:11 No - lnc-YDJC-2:1 No - lnc-YDJC-2:2 No - lnc-PPIL2-7:1 Yes chr2R:1071462-1125927 lnc-PPIL2-7:2 Yes chr2R:1071462-1125927 lnc-PPIL2-8:1 No - lnc-PPIL2-8:2 No - lnc-PPIL2-8:3 No - lnc-PPIL2-8:4 No - lnc-PRAME-7:1 No - LINC01659:6 No - LINC01659:7 No - lnc-IGLL1-1:12 No - lnc-IGLL1-1:13 No - lnc-IGLL1-1:14 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:15 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:10 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:16 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:17 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-IGLL1-1:11 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-C22orf15-4:1 No - lnc-C22orf15-4:2 No - lnc-GUCD1-1:1 No - ADORA2A-AS1:17 No - ADORA2A-AS1:15 No - ADORA2A-AS1:16 No - ADORA2A-AS1:8 No - ADORA2A-AS1:11 No - ADORA2A-AS1:9 No - ADORA2A-AS1:12 No - ADORA2A-AS1:13 No - ADORA2A-AS1:10 No - ADORA2A-AS1:14 Yes chr3R:7747913-7750079 lnc-PIWIL3-2:3 No - lnc-PIWIL3-2:4 No - lnc-PIWIL3-2:5 No - lnc-PIWIL3-2:6 No - lnc-TMEM211-2:7 No - lnc-TMEM211-2:8 No - lnc-TMEM211-2:9 No - lnc-TMEM211-2:10 No - lnc-TMEM211-2:11 No - lnc-LRP5L-1:6 No - lnc-LRP5L-1:5 No - lnc-LRP5L-1:7 No - lnc-LRP5L-1:8 No - lnc-LRP5L-1:9 No - lnc-LRP5L-2:14 Yes chr2R:4322295-4471060 lnc-LRP5L-2:12 Yes chr2R:4322295-4471060 lnc-LRP5L-2:15 Yes chr2R:4322295-4471060 lnc-LRP5L-2:13 Yes chr2R:4322295-4471060 lnc-LRP5L-2:16 Yes chr2R:4322295-4471060 lnc-SRRD-1:7 No - lnc-SRRD-1:8 No - lnc-SRRD-1:9 No - lnc-SRRD-1:10 No - lnc-SRRD-1:11 No - lnc-CRYBA4-52:2 No - lnc-CRYBA4-52:3 No - lnc-CRYBA4-52:7 No - lnc-CRYBA4-52:10 No - lnc-CRYBA4-52:11 No - lnc-CRYBA4-52:12 No - lnc-CRYBA4-52:13 No - lnc-CRYBA4-52:18 No - lnc-CRYBA4-52:19 No - lnc-CRYBA4-52:20 No - lnc-CRYBA4-52:21 No - lnc-CRYBA4-52:22 No - lnc-CRYBA4-52:23 No - lnc-CRYBA4-52:24 No - lnc-CRYBA4-52:39 No - lnc-CRYBA4-52:40 No - lnc-CRYBA4-52:41 No - lnc-CRYBA4-52:42 No - lnc-CRYBA4-52:45 No - lnc-CRYBA4-52:46 No - lnc-CRYBA4-52:51 No - lnc-CRYBA4-52:58 No - lnc-CRYBA4-52:59 No - lnc-CRYBA4-52:60 No - lnc-CRYBA4-52:61 No - lnc-CRYBA4-52:62 No - lnc-CRYBA4-52:63 No - lnc-CRYBA4-52:64 No - lnc-CRYBA4-52:65 No - lnc-CRYBA4-52:66 No - lnc-CRYBA4-52:67 No - lnc-CRYBA4-52:68 No - lnc-CRYBA4-52:77 No - lnc-CRYBB1-4:2 No - lnc-CRYBB1-4:3 No - lnc-CRYBB1-4:4 No - lnc-CRYBB1-4:5 No - lnc-CRYBB1-4:1 No - lnc-CRYBA4-18:1 No - lnc-CRYBA4-19:1 No - lnc-CRYBA4-20:1 No - LINC01638:16 No - LINC01638:17 No - LINC01638:18 No - LINC01638:19 No - LINC01638:20 No - LINC01638:13 No - LINC01638:14 No - lnc-CRYBA4-9:6 No - lnc-CRYBA4-9:7 No - lnc-CRYBA4-9:5 No - lnc-CRYBA4-9:8 No - lnc-CRYBA4-21:1 No - lnc-CRYBA4-21:3 No - lnc-CRYBA4-21:4 No - lnc-CRYBA4-21:5 No - lnc-CRYBA4-21:2 No - lnc-CRYBA4-21:6 No - lnc-CRYBA4-21:7 No - lnc-CRYBA4-21:8 No - lnc-CRYBA4-21:9 No - lnc-CRYBA4-22:1 No - lnc-MN1-12:1 No - TTC28-AS1:38 Yes chr3R:19215434-19226651 TTC28-AS1:42 Yes chr3R:19215434-19226651 TTC28-AS1:39 Yes chr3R:19215434-19226651 TTC28-AS1:40 Yes chr3R:19215434-19226651 TTC28-AS1:43 Yes chr3R:19215434-19226651 TTC28-AS1:44 Yes chr3R:19215434-19226651 TTC28-AS1:45 Yes chr3R:19215434-19226651 TTC28-AS1:46 No - TTC28-AS1:47 No - TTC28-AS1:41 No - TTC28-AS1:37 No - TTC28-AS1:50 No - TTC28-AS1:52 No - lnc-CCDC117-1:9 No - lnc-CCDC117-1:10 No - lnc-CCDC117-1:11 No - lnc-CCDC117-1:12 No - lnc-CCDC117-1:13 No - lnc-CCDC117-1:14 No - lnc-CCDC117-1:15 No - lnc-RHBDD3-3:5 No - lnc-RHBDD3-3:6 No - lnc-RHBDD3-3:3 No - lnc-RHBDD3-3:7 No - lnc-RHBDD3-3:4 No - RFPL1S:15 No - RFPL1S:26 No - RFPL1S:19 No - RFPL1S:20 No - RFPL1S:22 No - RFPL1S:23 No - RFPL1S:16 No - RFPL1S:17 No - RFPL1S:18 No - RFPL1S:27 No - RFPL1S:28 No - RFPL1S:24 No - RFPL1S:25 No - RFPL1S:21 No - lnc-NF2-2:1 Yes chr2R:23954091-23956406 lnc-NF2-1:1 Yes chrX:16070365-16073568 lnc-NIPSNAP1-3:2 No - lnc-NIPSNAP1-3:1 No - lnc-NIPSNAP1-4:1 No - HORMAD2-AS1:10 No - HORMAD2-AS1:9 No - HORMAD2-AS1:11 No - HORMAD2-AS1:12 No - HORMAD2-AS1:13 No - LIF-AS1:7 No - LIF-AS1:8 No - LIF-AS1:9 No - LIF-AS1:10 No - MORC2-AS1:8 No - MORC2-AS1:9 No - MORC2-AS1:11 No - MORC2-AS1:12 No - TUG1:36 No - TUG1:37 No - TUG1:38 No - TUG1:39 No - TUG1:40 No - TUG1:41 No - TUG1:42 No - TUG1:43 No - TUG1:44 No - TUG1:45 No - TUG1:46 No - TUG1:47 No - TUG1:48 No - TUG1:49 No - TUG1:50 No - TUG1:51 No - TUG1:52 No - TUG1:53 No - TUG1:54 No - TUG1:55 No - lnc-SELENOM-1:1 Yes chrX:6540771-6589173 lnc-PIK3IP1-2:1 Yes chrX:12584385-12592193 PIK3IP1-AS1:5 No - PIK3IP1-AS1:6 No - PIK3IP1-AS1:7 No - PIK3IP1-AS1:8 No - PIK3IP1-AS1:9 No - lnc-LIMK2-5:2 No - lnc-LIMK2-5:3 No - lnc-SFI1-6:1 Yes chr3R:24050783-24053592 lnc-PRR14L-4:1 Yes chr3L:1523414-1534034 SLC5A4-AS1:7 Yes chr3L:1933633-1939103 lnc-TIMP3-10:1 No - lnc-TIMP3-10:3 No - lnc-LARGE1-1:1 No - lnc-LARGE1-1:2 No - ISX-AS1:4 No - lnc-MB-11:1 No - lnc-MB-11:6 No - lnc-MB-11:2 No - lnc-MB-11:7 No - lnc-MB-11:8 No - lnc-MB-11:9 No - lnc-MB-11:3 No - lnc-MB-11:4 No - lnc-HMOX1-2:3 Yes chr3L:9446864-9450785 lnc-MB-10:1 No - lnc-MB-9:1 No - lnc-APOL1-1:3 No - lnc-APOL1-1:4 No - lnc-APOL1-1:5 No - lnc-APOL1-1:6 No - lnc-APOL1-1:8 No - lnc-APOL1-1:9 No - lnc-APOL1-1:7 No - lnc-NCF4-2:4 No - NCF4-AS1:8 No - NCF4-AS1:9 No - NCF4-AS1:10 No - NCF4-AS1:11 No - lnc-TMPRSS6-1:2 Yes chrX:1483479-1517615 lnc-KCTD17-6:1 No - lnc-KCTD17-6:2 No - lnc-ELFN2-2:12 No - lnc-CARD10-4:1 No - lnc-CARD10-4:2 No - lnc-CARD10-4:3 No - lnc-LGALS2-4:1 No - lnc-LGALS2-5:1 No - lnc-CBY1-2:1 No - lnc-CBY1-2:2 No - lnc-JOSD1-1:11 No - lnc-JOSD1-1:7 No - lnc-JOSD1-1:8 No - lnc-JOSD1-1:9 No - lnc-JOSD1-1:10 No - lnc-APOBEC3A-3:1 No - lnc-CBX6-2:1 No - lnc-APOBEC3H-4:1 Yes chr3L:21306138-21318020 lnc-PDGFB-3:1 No - lnc-RPS19BP1-2:3 No - lnc-ENTHD1-3:1 No - lnc-ENTHD1-1:2 No - lnc-ENTHD1-1:3 No - lnc-ENTHD1-1:5 No - lnc-ENTHD1-1:4 No - lnc-ENTHD1-1:6 No - lnc-MCHR1-6:1 No - lnc-MKL1-2:2 Yes chr3L:18560258-18576326 lnc-MKL1-2:3 Yes chr3L:18560258-18576326 lnc-DNAJB7-1:1 No - lnc-DNAJB7-2:2 No - lnc-DNAJB7-2:3 No - lnc-DNAJB7-2:8 No - lnc-DNAJB7-2:6 No - lnc-DNAJB7-2:9 No - lnc-DNAJB7-2:4 No - lnc-DNAJB7-2:1 No - lnc-DNAJB7-2:5 No - lnc-DNAJB7-2:7 No - EP300-AS1:13 Yes chrX:9665442-9687066 EP300-AS1:14 Yes chrX:9665442-9687066 EP300-AS1:7 Yes chrX:9665442-9687066 EP300-AS1:15 No - EP300-AS1:16 No - EP300-AS1:8 No - EP300-AS1:9 No - EP300-AS1:10 No - EP300-AS1:11 No - EP300-AS1:12 No - EP300-AS1:18 No - EP300-AS1:17 No - lnc-CHADL-1:8 No - lnc-CHADL-1:6 No - lnc-CHADL-1:4 No - lnc-CHADL-1:5 No - lnc-CHADL-1:9 No - lnc-CHADL-1:7 No - lnc-CHADL-1:3 No - lnc-TOB2-3:1 Yes chr2R:16234358-16234936 lnc-TOB2-3:2 Yes chr2R:16234358-16234936 lnc-TOB2-2:1 No - lnc-ACO2-1:2 Yes chrX:16074717-16091495 lnc-ACO2-1:1 Yes chrX:16074717-16091495 lnc-POLR3H-1:2 Yes chr3L:16780100-16782419 lnc-SNU13-2:1 No - lnc-SNU13-3:1 No - lnc-SNU13-3:2 No - lnc-SNU13-3:3 No - SREBF2-AS1:6 No - SREBF2-AS1:7 No - lnc-NDUFA6-2:2 Yes chr2L:6048002-6050474 lnc-NDUFA6-2:1 Yes chr2L:6048002-6050474 NDUFA6-DT:47 Yes chr2R:10897144-10897885 NDUFA6-DT:48 Yes chr2R:10897144-10897885 NDUFA6-DT:49 Yes chr2R:10897144-10897885 NDUFA6-DT:50 Yes chr2R:10897144-10897885 NDUFA6-DT:51 Yes chr2R:10897144-10897885 NDUFA6-DT:52 Yes chr2R:10897144-10897885 NDUFA6-DT:53 Yes chr2R:10897144-10897885 NDUFA6-DT:54 No - NDUFA6-DT:55 No - lnc-SMDT1-3:24 Yes chr2R:18094940-18101031 lnc-SMDT1-3:25 Yes chr2R:18094940-18101031 lnc-SMDT1-3:26 Yes chr2R:18094940-18101031 lnc-SMDT1-3:27 Yes chr2R:18094940-18101031 lnc-SMDT1-3:28 Yes chr2R:18094940-18101031 lnc-SMDT1-3:32 Yes chr2R:18094940-18101031 lnc-SMDT1-3:33 Yes chr2R:18094940-18101031 lnc-SMDT1-3:34 Yes chr2R:18094940-18101031 lnc-SMDT1-3:35 Yes chr2R:18094940-18101031 lnc-SMDT1-3:36 Yes chr2R:18094940-18101031 lnc-SMDT1-3:37 Yes chr2R:18094940-18101031 lnc-SMDT1-3:38 Yes chr2R:18094940-18101031 lnc-SMDT1-3:39 Yes chr2R:18094940-18101031 LINC01315:9 No - LINC01315:10 No - LINC01315:11 No - LINC01315:12 No - LINC01315:13 No - lnc-SERHL2-6:2 No - lnc-SERHL2-1:9 No - lnc-SERHL2-1:11 Yes chr2L:6022951-6024539 lnc-SERHL2-1:14 No - lnc-SERHL2-1:12 Yes chr2L:6022951-6024539 lnc-SERHL2-1:13 Yes chr2L:6022951-6024539 lnc-SERHL2-1:15 Yes chr2L:6022951-6024539 lnc-SERHL2-4:4 No - lnc-SERHL2-9:1 Yes chr3L:11816695-11822275 lnc-TSPO-5:1 No - lnc-PNPLA3-1:5 No - lnc-PNPLA3-1:6 No - lnc-PNPLA3-1:7 No - lnc-PNPLA5-6:2 Yes chr3L:14776496-14786412 lnc-PNPLA5-6:3 Yes chr3L:14776496-14786412 lnc-PNPLA5-6:1 Yes chr3L:14776496-14786412 lnc-PNPLA5-1:2 Yes chr3L:14776496-14786412 lnc-PNPLA5-1:3 Yes chr3L:14776496-14786412 lnc-ARHGAP8-3:1 No - NUP50-DT:35 No - NUP50-DT:36 No - NUP50-DT:37 No - NUP50-DT:38 No - NUP50-DT:46 No - NUP50-DT:39 No - NUP50-DT:47 No - NUP50-DT:54 No - NUP50-DT:40 No - lnc-KIAA0930-1:4 No - lnc-KIAA0930-1:6 No - lnc-KIAA0930-1:5 No - lnc-KIAA0930-1:7 No - lnc-SMC1B-2:2 No - lnc-SMC1B-2:5 No - lnc-SMC1B-2:6 No - lnc-SMC1B-2:3 No - lnc-SMC1B-2:4 No - LINC01589:7 No - LINC01589:8 No - LINC01589:9 No - LINC01589:5 No - LINC01589:6 No - lnc-PPARA-11:6 No - lnc-PPARA-11:7 No - lnc-PPARA-11:8 No - lnc-PPARA-11:9 No - lnc-PPARA-10:2 No - lnc-PPARA-10:3 No - lnc-PPARA-10:4 No - lnc-PPARA-1:5 Yes chr3R:8676915-8678955 lnc-PPARA-1:6 Yes chr3R:8676915-8678955 lnc-GRAMD4-2:6 No - lnc-GRAMD4-2:7 No - lnc-CELSR1-2:3 No - lnc-CELSR1-2:1 No - lnc-CELSR1-2:4 No - lnc-CELSR1-2:2 No - lnc-CERK-6:1 No - lnc-CERK-1:3 No - lnc-CERK-1:2 No - LINC00898:8 No - LINC00898:9 No - LINC00898:10 No - LINC00898:11 No - LINC00898:12 No - LINC00898:5 No - LINC00898:6 No - LINC00898:13 No - LINC00898:7 No - lnc-TBC1D22A-4:8 No - lnc-TBC1D22A-4:9 No - lnc-TBC1D22A-4:10 No - lnc-TBC1D22A-4:11 No - lnc-TBC1D22A-4:12 No - lnc-TBC1D22A-4:13 No - lnc-TBC1D22A-4:14 No - lnc-TBC1D22A-4:19 No - lnc-TBC1D22A-4:16 No - lnc-TBC1D22A-4:17 No - lnc-TBC1D22A-4:18 No - lnc-CERK-10:2 No - lnc-CERK-10:3 No - lnc-BRD1-29:1 No - lnc-BRD1-29:2 No - lnc-BRD1-29:3 No - lnc-BRD1-29:4 No - lnc-BRD1-29:5 No - lnc-IL17REL-5:1 No - lnc-IL17REL-5:2 No - lnc-TUBGCP6-5:3 Yes chr3R:13026283-13030659 lnc-TUBGCP6-5:4 Yes chr3R:13026283-13030659 lnc-TUBGCP6-5:5 Yes chr3R:13026283-13030659 lnc-TUBGCP6-5:6 Yes chr3R:13026283-13030659 lnc-TUBGCP6-5:7 Yes chr3R:13026283-13030659 lnc-TUBGCP6-5:8 Yes chr3R:13026283-13030659 lnc-PPP6R2-4:1 No - lnc-PPP6R2-4:2 No - lnc-ODF3B-2:1 No - lnc-KLHDC7B-2:2 No - lnc-KLHDC7B-7:1 No - CHKB-DT:39 Yes chr2L:21614232-21624080 CHKB-DT:40 Yes chr2L:21614232-21624080 CHKB-DT:41 Yes chr2L:21614232-21624080 CHKB-DT:42 Yes chr2L:21614232-21624080 CHKB-DT:43 Yes chr2L:21614232-21624080 CHKB-DT:44 Yes chr2L:21614232-21624080 lnc-MAPK8IP2-2:1 No - lnc-MAPK8IP2-2:2 No - lnc-MAPK8IP2-2:3 No - lnc-MAPK8IP2-2:4 No - lnc-MAPK8IP2-2:5 No - LINC01266:5 No - LINC01266:6 No - LINC01266:7 No - LINC01266:8 No - LINC01266:9 No - LINC01266:10 No - LINC01266:11 No - LINC01266:13 No - LINC01266:12 No - LINC01266:14 No - LINC01266:15 No - lnc-IL5RA-3:4 No - ITPR1-DT:10 No - ITPR1-DT:11 No - ITPR1-DT:12 No - ITPR1-DT:13 No - EGOT:10 Yes chr3R:5517117-5539411 EGOT:11 Yes chr3R:5517117-5539411 EGOT:16 Yes chr3R:5517117-5539411 EGOT:17 Yes chr3R:5517117-5539411 EGOT:18 Yes chr3R:5517117-5539411 EGOT:15 Yes chr3R:5517117-5539411 EGOT:14 Yes chr3R:5517117-5539411 BHLHE40-AS1:17 No - BHLHE40-AS1:24 No - BHLHE40-AS1:10 No - lnc-SUMF1-4:1 No - lnc-SUMF1-18:1 No - lnc-SUMF1-19:1 No - lnc-SUMF1-12:6 No - lnc-SUMF1-12:1 No - lnc-SUMF1-12:7 No - lnc-BHLHE40-3:1 No - lnc-SUMF1-12:2 No - lnc-SUMF1-12:3 No - lnc-SUMF1-12:4 No - lnc-SUMF1-12:5 No - lnc-SUMF1-12:11 No - lnc-SUMF1-12:8 No - lnc-SUMF1-12:9 No - lnc-SUMF1-5:2 Yes chr3R:8126605-8129835 lnc-SUMF1-5:3 Yes chr3R:8126605-8129835 lnc-SUMF1-5:4 Yes chr3R:8126605-8129835 lnc-SUMF1-5:5 Yes chr3R:8126605-8129835 lnc-SUMF1-5:6 Yes chr3R:8126605-8129835 LMCD1-AS1:10 No - LMCD1-AS1:11 No - LMCD1-AS1:12 No - LMCD1-AS1:13 No - LMCD1-AS1:14 No - LMCD1-AS1:15 No - LMCD1-AS1:16 No - LMCD1-AS1:17 No - LMCD1-AS1:9 No - lnc-CAV3-4:1 No - SRGAP3-AS2:12 No - SRGAP3-AS2:10 No - SRGAP3-AS2:11 No - SRGAP3-AS2:13 No - THUMPD3-AS1:84 No - THUMPD3-AS1:85 No - THUMPD3-AS1:86 No - THUMPD3-AS1:79 No - THUMPD3-AS1:80 No - THUMPD3-AS1:81 No - THUMPD3-AS1:87 No - THUMPD3-AS1:66 No - THUMPD3-AS1:82 No - lnc-LHFPL4-6:1 No - THUMPD3-AS1:67 No - THUMPD3-AS1:68 No - THUMPD3-AS1:76 No - THUMPD3-AS1:75 No - THUMPD3-AS1:52 No - THUMPD3-AS1:45 No - THUMPD3-AS1:39 No - THUMPD3-AS1:41 No - THUMPD3-AS1:42 No - THUMPD3-AS1:69 No - THUMPD3-AS1:61 No - THUMPD3-AS1:62 No - THUMPD3-AS1:63 No - THUMPD3-AS1:53 No - THUMPD3-AS1:46 No - THUMPD3-AS1:54 No - THUMPD3-AS1:70 No - THUMPD3-AS1:55 No - THUMPD3-AS1:40 Yes chr3L:14002127-14020148 THUMPD3-AS1:43 Yes chr3L:14002127-14020148 THUMPD3-AS1:74 No - THUMPD3-AS1:48 No - THUMPD3-AS1:49 No - THUMPD3-AS1:71 No - THUMPD3-AS1:56 No - THUMPD3-AS1:72 No - THUMPD3-AS1:57 No - THUMPD3-AS1:77 No - THUMPD3-AS1:58 No - THUMPD3-AS1:73 No - THUMPD3-AS1:50 No - THUMPD3-AS1:59 No - THUMPD3-AS1:44 Yes chr3L:14002127-14020148 THUMPD3-AS1:60 No - THUMPD3-AS1:64 No - THUMPD3-AS1:47 No - THUMPD3-AS1:65 No - THUMPD3-AS1:51 No - lnc-PRRT3-3:2 No - lnc-PRRT3-3:3 No - lnc-FANCD2OS-3:2 No - lnc-GHRL-4:1 No - lnc-GHRL-4:2 No - LINC00606:9 No - LINC00606:10 No - LINC00606:6 No - LINC00606:7 No - LINC00606:8 No - lnc-VGLL4-6:7 Yes chr3R:8059284-8087049 lnc-VGLL4-6:2 Yes chr3R:8059284-8087049 lnc-VGLL4-6:3 Yes chr3R:8059284-8087049 lnc-VGLL4-6:4 Yes chr3R:8059284-8087049 lnc-VGLL4-6:5 Yes chr3R:8059284-8087049 lnc-VGLL4-6:6 Yes chr3R:8059284-8087049 lnc-VGLL4-9:3 Yes chr3R:8059284-8087049 lnc-VGLL4-9:1 Yes chr3R:8059284-8087049 lnc-VGLL4-9:4 Yes chr3R:8059284-8087049 lnc-VGLL4-9:5 Yes chr3R:8059284-8087049 lnc-VGLL4-9:2 Yes chr3R:8059284-8087049 lnc-VGLL4-8:1 Yes chr2R:18620466-18625044 lnc-ATG7-2:2 No - lnc-MKRN2OS-3:2 No - lnc-MKRN2-4:1 No - lnc-CAND2-2:2 Yes chr3L:21034535-21075444 lnc-CAND2-2:3 Yes chr3L:21034535-21075444 lnc-CAND2-2:4 Yes chr3L:21034535-21075444 lnc-CAND2-2:5 Yes chr3L:21034535-21075444 lnc-CAND2-2:6 Yes chr3L:21034535-21075444 lnc-HDAC11-4:1 No - HDAC11-AS1:3 Yes chr3R:24854496-24856243 HDAC11-AS1:4 Yes chr3R:24854496-24856243 HDAC11-AS1:5 Yes chr3R:24854496-24856243 HDAC11-AS1:6 Yes chr3R:24854496-24856243 HDAC11-AS1:7 Yes chr3R:24854496-24856243 HDAC11-AS1:8 Yes chr3R:24854496-24856243 LINC00620:10 No - LINC00620:12 No - LINC00620:11 No - lnc-XPC-7:1 No - lnc-LSM3-2:4 No - lnc-XPC-8:1 No - lnc-XPC-8:2 No - lnc-GRIP2-1:11 No - lnc-GRIP2-1:12 No - lnc-GRIP2-1:13 No - lnc-GRIP2-1:14 No - lnc-GRIP2-1:15 No - lnc-GRIP2-1:6 No - lnc-GRIP2-1:7 No - lnc-GRIP2-1:8 No - lnc-GRIP2-1:1 No - lnc-GRIP2-1:2 No - lnc-GRIP2-1:3 No - lnc-GRIP2-1:4 No - lnc-GRIP2-1:5 No - lnc-GRIP2-1:9 No - lnc-GRIP2-1:10 No - lnc-XPC-10:5 Yes chrX:5966279-5986699 lnc-XPC-10:6 Yes chrX:5966279-5986699 lnc-XPC-10:3 Yes chrX:5966279-5986699 lnc-XPC-10:1 Yes chrX:5966279-5986699 lnc-XPC-10:7 Yes chrX:5966279-5986699 lnc-GRIP2-5:1 No - lnc-GRIP2-4:3 No - lnc-GRIP2-4:1 Yes chr3R:18218147-18220699 lnc-GRIP2-4:4 No - lnc-GRIP2-4:5 No - lnc-GRIP2-4:6 No - lnc-GRIP2-4:7 No - lnc-GRIP2-4:2 Yes chr3R:18218147-18220699 FGD5-AS1:31 No - FGD5-AS1:26 No - FGD5-AS1:27 No - FGD5-AS1:28 No - FGD5-AS1:22 No - FGD5-AS1:23 No - FGD5-AS1:24 Yes chr3L:21494019-21497494 FGD5-AS1:29 No - FGD5-AS1:25 Yes chr3L:21494019-21497494 FGD5-AS1:21 Yes chr3L:21494019-21497494 FGD5-AS1:30 No - lnc-BTD-5:1 No - lnc-GALNT15-8:1 No - lnc-GALNT15-8:2 No - lnc-GALNT15-8:3 No - lnc-GALNT15-8:4 No - lnc-GALNT15-8:5 No - lnc-GALNT15-8:6 No - lnc-GALNT15-8:7 No - lnc-GALNT15-6:2 No - lnc-DAZL-1:3 Yes chr3L:9097629-9134405 lnc-DAZL-1:4 Yes chr3L:9097629-9134405 lnc-DAZL-1:2 Yes chr3L:9097629-9134405 lnc-DAZL-6:1 No - lnc-DAZL-6:2 No - lnc-DAZL-6:3 No - lnc-DAZL-6:4 No - lnc-DAZL-6:5 No - lnc-PLCL2-1:2 Yes chr3R:13269137-13272011 lnc-PLCL2-1:3 Yes chr3R:13269137-13272011 SATB1-AS1:90 No - SATB1-AS1:91 No - SATB1-AS1:93 No - SATB1-AS1:94 No - SATB1-AS1:95 No - SATB1-AS1:92 No - SATB1-AS1:96 No - SATB1-AS1:97 No - SATB1-AS1:98 No - SATB1-AS1:99 No - SGO1-AS1:12 No - SGO1-AS1:13 No - SGO1-AS1:14 No - SGO1-AS1:15 No - SGO1-AS1:16 No - lnc-UBE2E1-2:1 No - lnc-UBE2E1-1:1 No - lnc-THRB-6:1 Yes chr2R:7443824-7445792 lnc-THRB-6:2 Yes chr2R:7443824-7445792 THRB-AS1:15 Yes chr2R:6087873-6169087 THRB-AS1:16 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-RARB-1:2 No - lnc-RARB-1:3 No - lnc-RARB-1:4 Yes chr2R:6087873-6169087 lnc-NEK10-1:2 No - LINC02084:12 No - LINC02084:13 No - LINC02084:14 No - RBMS3-AS3:7 No - RBMS3-AS3:10 No - RBMS3-AS3:8 No - RBMS3-AS3:4 No - RBMS3-AS3:5 No - RBMS3-AS3:9 No - RBMS3-AS3:6 No - LINC01985:8 No - LINC01985:9 No - LINC01985:10 No - LINC01985:11 No - LINC01985:12 No - lnc-GADL1-11:1 No - lnc-GADL1-4:2 No - lnc-OSBPL10-3:2 No - lnc-OSBPL10-3:3 No - lnc-OSBPL10-3:4 No - lnc-OSBPL10-3:5 No - lnc-OSBPL10-1:4 No - lnc-GLB1-3:1 No - lnc-GLB1-3:2 No - lnc-GLB1-3:3 No - lnc-GLB1-3:4 No - lnc-CRTAP-6:1 No - lnc-GLB1-2:1 No - lnc-SUSD5-2:1 Yes chr2R:11641477-11651616 lnc-FBXL2-7:1 Yes chr2R:10124293-10137472 lnc-CLASP2-1:10 Yes chr3R:27696466-27700110 lnc-CLASP2-1:12 Yes chr3R:27696466-27700110 lnc-CLASP2-1:13 Yes chr3R:27696466-27700110 lnc-CLASP2-1:8 Yes chr3R:27696466-27700110 lnc-CLASP2-1:9 Yes chr3R:27696466-27700110 lnc-CLASP2-1:14 Yes chr3R:27696466-27700110 lnc-CLASP2-1:11 Yes chr3R:27696466-27700110 lnc-CLASP2-1:15 Yes chr3R:27696466-27700110 LINC01811:23 No - lnc-DCLK3-5:2 Yes chr3L:3818679-3842326 lnc-DCLK3-5:3 Yes chr3L:3818679-3842326 lnc-MLH1-3:1 No - lnc-GOLGA4-4:3 Yes chrX:15844476-15847858 lnc-GOLGA4-4:4 Yes chrX:15844476-15847858 lnc-GOLGA4-4:5 Yes chrX:15844476-15847858 lnc-GOLGA4-4:6 Yes chrX:15844476-15847858 lnc-GOLGA4-4:7 Yes chrX:15844476-15847858 lnc-LRRFIP2-3:4 No - lnc-LRRFIP2-3:3 Yes chr2R:23371360-23377045 ITGA9-AS1:40 Yes chr2R:15258761-15262873 ITGA9-AS1:37 Yes chr2R:15258761-15262873 ITGA9-AS1:38 Yes chr2R:15258761-15262873 ITGA9-AS1:41 Yes chr2R:15258761-15262873 ITGA9-AS1:42 Yes chr2R:15258761-15262873 ITGA9-AS1:43 Yes chr2R:15258761-15262873 ITGA9-AS1:44 Yes chr2R:15258761-15262873 ITGA9-AS1:45 Yes chr2R:15258761-15262873 ITGA9-AS1:46 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-PLCD1-5:1 Yes chr2R:15258761-15262873 ITGA9-AS1:47 Yes chr2R:15258761-15262873 ITGA9-AS1:48 Yes chr2R:15258761-15262873 ITGA9-AS1:39 Yes chr2R:15258761-15262873 lnc-PLCD1-4:1 Yes chr2L:17486806-17497208 ACVR2B-AS1:3 Yes chr3R:14619030-14625703 lnc-GORASP1-1:1 No - lnc-GORASP1-1:2 No - EIF1B-AS1:15 No - EIF1B-AS1:16 No - EIF1B-AS1:17 No - EIF1B-AS1:14 No - EIF1B-AS1:18 No - ENTPD3-AS1:24 No - ENTPD3-AS1:16 No - ENTPD3-AS1:12 No - ENTPD3-AS1:13 No - ENTPD3-AS1:17 No - ENTPD3-AS1:18 No - ENTPD3-AS1:25 No - ENTPD3-AS1:22 No - ENTPD3-AS1:19 No - ENTPD3-AS1:14 No - ENTPD3-AS1:15 No - ENTPD3-AS1:20 No - ENTPD3-AS1:26 No - ENTPD3-AS1:21 No - ENTPD3-AS1:27 No - ENTPD3-AS1:23 No - lnc-RPL14-5:1 No - lnc-ULK4-16:1 No - lnc-ULK4-15:1 No - lnc-ULK4-15:2 No - lnc-ZNF621-1:2 No - lnc-ZNF621-1:3 No - lnc-ZNF621-1:4 No - lnc-ULK4-3:2 No - lnc-ULK4-3:3 No - lnc-CTNNB1-4:1 No - lnc-ULK4-14:1 No - lnc-ULK4-14:2 No - lnc-ULK4-14:3 No - lnc-ULK4-14:4 No - lnc-SEC22C-2:9 No - lnc-SEC22C-2:10 No - lnc-SEC22C-2:11 No - lnc-SEC22C-2:12 No - lnc-SEC22C-2:5 No - lnc-SEC22C-2:6 No - lnc-SEC22C-2:7 No - lnc-SEC22C-2:8 No - LINC02158:8 No - LINC02158:9 No - LINC02158:12 No - LINC02158:13 No - lnc-ANO10-5:3 No - lnc-ANO10-5:2 No - lnc-ZNF445-5:3 No - lnc-ZNF445-5:2 Yes chr3L:6073490-6075245 lnc-ZKSCAN7-4:1 No - lnc-ZKSCAN7-4:2 No - lnc-ZKSCAN7-4:3 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF852-2:2 No - ZNF197-AS1:2 No - ZNF197-AS1:3 No - ZNF197-AS1:4 No - ZNF197-AS1:5 No - ZNF197-AS1:6 No - lnc-ZNF852-2:3 No - lnc-ZNF852-2:4 No - lnc-ZNF852-2:5 No - lnc-ZNF852-2:6 No - lnc-ZNF852-2:7 No - lnc-KIAA1143-1:3 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-KIAA1143-1:4 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-KIAA1143-1:2 No - lnc-CLEC3B-3:2 No - lnc-CLEC3B-3:3 No - lnc-CLEC3B-4:1 No - lnc-CLEC3B-5:1 No - lnc-CDCP1-1:1 No - LIMD1-AS1:5 No - LIMD1-AS1:8 No - LIMD1-AS1:6 No - LIMD1-AS1:7 No - lnc-CXCR6-2:4 No - lnc-CXCR6-2:1 No - lnc-CXCR6-2:2 No - lnc-CXCR6-2:5 No - lnc-CXCR6-2:3 No - lnc-CXCR6-3:1 No - lnc-CXCR6-3:2 No - lnc-CCR3-3:1 No - lnc-CCR3-2:1 No - lnc-XCR1-3:1 No - lnc-CCR3-1:1 No - lnc-XCR1-4:1 No - lnc-LTF-1:8 No - lnc-LTF-1:4 No - lnc-LTF-1:5 No - lnc-LTF-1:6 No - lnc-LTF-1:7 No - lnc-LTF-1:3 No - LRRC2-AS1:4 Yes chr2R:20236235-20239200 LRRC2-AS1:5 Yes chr2R:20236235-20239200 LRRC2-AS1:6 Yes chr2R:20236235-20239200 LRRC2-AS1:7 Yes chr2R:20236235-20239200 LRRC2-AS1:8 Yes chr2R:20236235-20239200 lnc-KLHL18-8:3 No - lnc-KLHL18-8:4 No - lnc-KLHL18-8:5 No - lnc-KLHL18-8:6 No - lnc-KLHL18-8:7 No - lnc-KLHL18-8:10 No - lnc-SCAP-1:3 Yes chr3L:14769341-14776129 lnc-SCAP-1:4 No - lnc-PTPN23-3:2 Yes chr2R:6026273-6036388 lnc-PTPN23-3:3 Yes chr2R:6026273-6036388 lnc-PTPN23-3:4 Yes chr2R:6026273-6036388 lnc-CCDC51-1:5 No - lnc-CCDC51-1:6 No - lnc-ATRIP-9:1 Yes chr3R:14890231-14892387 lnc-ATRIP-24:1 No - lnc-ATRIP-24:2 Yes chrX:8094250-8102095 lnc-ATRIP-24:3 Yes chrX:8094250-8102095 PRKAR2A-AS1:14 No - PRKAR2A-AS1:17 No - PRKAR2A-AS1:15 No - PRKAR2A-AS1:16 No - PRKAR2A-AS1:18 No - lnc-DALRD3-1:7 No - lnc-DALRD3-1:4 No - lnc-DALRD3-1:10 Yes chr2R:22212835-22217264 lnc-DALRD3-1:8 Yes chr2R:22212835-22217264 lnc-DALRD3-1:9 No - lnc-DALRD3-1:5 No - lnc-DALRD3-1:6 No - lnc-DALRD3-6:1 No - lnc-KLHDC8B-2:1 Yes chr3R:25263267-25265721 lnc-TCTA-4:1 No - lnc-TCTA-3:1 No - BSN-DT:15 No - BSN-DT:16 No - BSN-DT:17 No - BSN-DT:18 No - BSN-DT:19 No - BSN-DT:20 No - lnc-RNF123-1:2 Yes chr2R:21646177-21657935 lnc-RNF123-1:3 Yes chr2R:21646177-21657935 lnc-FAM212A-2:1 No - lnc-FAM212A-2:2 No - SEMA3F-AS1:4 No - SEMA3F-AS1:3 No - SEMA3B-AS1:5 No - SEMA3B-AS1:7 No - SEMA3B-AS1:6 No - SEMA3B-AS1:8 No - lnc-RAD54L2-5:1 No - lnc-DCAF1-2:1 No - lnc-IQCF6-2:2 No - lnc-IQCF6-2:3 No - lnc-IQCF6-2:4 No - lnc-IQCF6-2:5 No - lnc-IQCF6-2:6 No - lnc-PPM1M-2:5 Yes chr3R:14122654-14124474 lnc-PPM1M-2:6 Yes chr3R:14122654-14124474 lnc-PPM1M-2:7 Yes chr3R:14122654-14124474 GLYCTK-AS1:7 Yes chr2L:2420830-2424647 GLYCTK-AS1:8 No - lnc-ITIH1-3:1 No - lnc-ITIH3-4:2 No - lnc-CACNA1D-3:2 Yes chr2R:23888764-23890276 lnc-PRKCD-3:5 Yes chr2L:16165831-16190540 lnc-IL17RB-4:1 No - CACNA2D3-AS1:2 Yes chr2R:13805794-13819571 lnc-WNT5A-5:1 No - lnc-WNT5A-5:2 No - lnc-ERC2-1:3 No - lnc-ERC2-1:2 No - lnc-FAM208A-4:1 No - lnc-DNAH12-1:2 No - ARF4-AS1:6 Yes chr4:1124167-1125325 ARF4-AS1:5 Yes chr4:1124167-1125325 ARF4-AS1:10 Yes chr4:1124167-1125325 ARF4-AS1:7 Yes chr4:1124167-1125325 ARF4-AS1:8 Yes chr4:1124167-1125325 ARF4-AS1:9 Yes chr4:1124167-1125325 DENND6A-DT:7 No - DENND6A-DT:8 No - DENND6A-DT:9 No - lnc-DENND6A-3:3 Yes chr2L:22579072-22585843 lnc-DENND6A-3:4 Yes chr2L:22579072-22585843 lnc-DNASE1L3-5:1 No - lnc-DNASE1L3-5:2 No - lnc-PDHB-2:1 Yes chr2R:7968129-7972003 C3orf67-AS1:7 No - C3orf67-AS1:5 No - C3orf67-AS1:9 No - lnc-FHIT-3:1 No - lnc-PTPRG-1:3 No - lnc-PTPRG-1:4 No - lnc-PTPRG-1:5 No - lnc-PTPRG-1:6 No - lnc-FHIT-4:1 No - PTPRG-AS1:20 Yes chr3R:29377646-29487131 PTPRG-AS1:19 Yes chr3R:29377646-29487131 PTPRG-AS1:16 No - PTPRG-AS1:24 Yes chr3R:29377646-29487131 PTPRG-AS1:25 Yes chr3R:29377646-29487131 PTPRG-AS1:26 Yes chr3R:29377646-29487131 PTPRG-AS1:27 Yes chr3R:29377646-29487131 PTPRG-AS1:17 No - PTPRG-AS1:21 Yes chr3R:29377646-29487131 PTPRG-AS1:22 Yes chr3R:29377646-29487131 PTPRG-AS1:28 Yes chr3R:29377646-29487131 PTPRG-AS1:18 No - PTPRG-AS1:29 Yes chr3R:29377646-29487131 PTPRG-AS1:30 Yes chr3R:29377646-29487131 PTPRG-AS1:23 No - lnc-C3orf14-3:1 Yes chr4:1230837-1271759 lnc-C3orf14-3:3 Yes chr4:1230837-1271759 lnc-C3orf14-3:2 Yes chr4:1230837-1271759 lnc-C3orf14-3:4 Yes chr4:1230837-1271759 LINC00698:15 No - LINC00698:13 No - LINC00698:16 No - LINC00698:14 No - lnc-PRICKLE2-3:5 No - lnc-PRICKLE2-3:6 No - lnc-PRICKLE2-3:3 No - ADAMTS9-AS2:13 Yes chr2R:22807860-22815993 ADAMTS9-AS2:16 Yes chr2R:22807860-22815993 ADAMTS9-AS2:17 Yes chr2R:22807860-22815993 ADAMTS9-AS2:18 Yes chr2R:22807860-22815993 ADAMTS9-AS2:14 Yes chr2R:22807860-22815993 ADAMTS9-AS2:15 Yes chr2R:22807860-22815993 ADAMTS9-AS2:20 Yes chr2R:22807860-22815993 ADAMTS9-AS2:21 Yes chr2R:22807860-22815993 ADAMTS9-AS2:22 Yes chr2R:22807860-22815993 ADAMTS9-AS2:23 Yes chr2R:22807860-22815993 ADAMTS9-AS2:24 Yes chr2R:22807860-22815993 ADAMTS9-AS2:19 Yes chr2R:22807860-22815993 MAGI1-IT1:3 No - MAGI1-IT1:2 No - lnc-SLC25A26-1:5 No - lnc-LRIG1-1:3 No - lnc-LRIG1-1:4 No - lnc-LRIG1-1:6 No - lnc-LRIG1-1:7 No - lnc-LRIG1-1:5 No - lnc-KBTBD8-4:1 No - lnc-KBTBD8-4:2 No - lnc-KBTBD8-4:3 No - SUCLG2-AS1:12 No - SUCLG2-AS1:13 No - SUCLG2-AS1:8 No - SUCLG2-AS1:14 No - SUCLG2-AS1:9 No - SUCLG2-AS1:10 No - SUCLG2-AS1:11 No - lnc-ARL6IP5-6:1 No - SAMMSON:6 No - SAMMSON:8 No - SAMMSON:9 No - SAMMSON:10 No - SAMMSON:11 No - SAMMSON:7 No - lnc-GPR27-10:3 Yes chr3R:9726020-9730872 lnc-GPR27-10:6 Yes chr3R:9726020-9730872 lnc-GPR27-10:4 Yes chr3R:9726020-9730872 lnc-GPR27-10:5 Yes chr3R:9726020-9730872 lnc-GPR27-10:7 Yes chr3R:9726020-9730872 lnc-GPR27-10:9 Yes chr3R:9726020-9730872 lnc-GPR27-10:10 No - lnc-GPR27-10:11 No - lnc-GXYLT2-10:1 No - LINC02018:16 No - LINC02018:17 No - LINC02018:18 No - LINC02018:19 No - LINC02018:20 No - LINC02018:21 No - lnc-ZNF717-3:7 No - lnc-ZNF717-3:2 No - lnc-ZNF717-3:3 No - lnc-ZNF717-3:4 No - lnc-ZNF717-3:5 No - lnc-ZNF717-3:6 No - LINC00960:6 No - LINC00960:7 No - LINC00960:8 No - LINC00960:9 No - LINC00960:10 No - LINC00960:11 No - LINC00960:12 No - LINC00960:13 No - LINC00960:14 No - LINC00960:15 No - LINC00960:16 No - lnc-GBE1-5:6 No - lnc-GBE1-5:7 No - lnc-GBE1-5:8 No - LINC02050:16 No - LINC02050:17 No - LINC02050:18 No - LINC02050:19 No - LINC02050:20 No - LINC02027:17 No - LINC02027:18 No - LINC02027:19 No - LINC02027:20 No - LINC02027:21 No - lnc-ROBO2-17:2 No - lnc-ROBO2-17:1 No - lnc-ROBO2-17:3 No - lnc-CADM2-19:1 Yes chr2R:13171401-13174796 lnc-CADM2-3:11 No - lnc-CADM2-3:14 No - lnc-CADM2-3:15 No - lnc-CADM2-3:12 No - lnc-CADM2-3:13 No - lnc-CADM2-3:16 No - lnc-CADM2-3:17 No - lnc-CADM2-3:18 No - lnc-CADM2-3:19 No - lnc-CADM2-3:20 No - lnc-CHMP2B-1:10 No - lnc-CHMP2B-1:11 No - lnc-CHMP2B-1:12 No - lnc-CHMP2B-1:13 No - lnc-CLDND1-3:4 No - lnc-CLDND1-3:5 No - lnc-CLDND1-3:1 No - lnc-CLDND1-3:2 No - lnc-CLDND1-3:3 No - ST3GAL6-AS1:13 No - ST3GAL6-AS1:14 No - ST3GAL6-AS1:7 No - ST3GAL6-AS1:8 No - ST3GAL6-AS1:20 No - ST3GAL6-AS1:17 No - ST3GAL6-AS1:15 No - ST3GAL6-AS1:21 No - ST3GAL6-AS1:9 No - ST3GAL6-AS1:16 No - ST3GAL6-AS1:10 No - ST3GAL6-AS1:11 No - ST3GAL6-AS1:22 No - ST3GAL6-AS1:12 No - ST3GAL6-AS1:18 No - ST3GAL6-AS1:19 No - lnc-ST3GAL6-1:3 No - lnc-ST3GAL6-1:4 No - lnc-ST3GAL6-1:5 No - lnc-DCBLD2-3:1 No - LINC00973:4 No - LINC00973:5 No - LINC00973:6 No - LINC00973:7 No - LINC00973:8 No - LINC00973:9 No - LINC00973:10 No - lnc-FILIP1L-10:3 No - lnc-FILIP1L-10:1 No - lnc-FILIP1L-10:2 No - lnc-FILIP1L-10:4 No - lnc-FILIP1L-9:2 No - lnc-FILIP1L-9:3 No - lnc-FILIP1L-9:4 No - lnc-FILIP1L-9:5 No - lnc-FILIP1L-9:6 No - lnc-FILIP1L-9:1 Yes chr2L:1129316-1132411 lnc-TOMM70-4:1 No - lnc-TOMM70-4:2 No - lnc-TOMM70-4:3 No - lnc-TOMM70-4:4 No - lnc-TOMM70-4:5 No - lnc-TRMT10C-6:1 No - lnc-SENP7-1:1 No - lnc-SENP7-1:2 No - lnc-CEP97-8:2 No - lnc-CEP97-8:3 No - lnc-CEP97-8:4 No - lnc-CEP97-8:5 No - lnc-RPL24-7:1 No - lnc-RPL24-2:5 No - lnc-RPL24-2:7 No - lnc-RPL24-2:8 No - lnc-RPL24-2:6 No - lnc-ALCAM-19:1 No - lnc-ALCAM-8:2 No - lnc-ALCAM-8:3 No - lnc-ALCAM-8:4 No - lnc-ALCAM-8:6 No - lnc-ALCAM-8:5 No - lnc-ALCAM-8:7 No - lnc-ALCAM-8:8 No - lnc-ALCAM-8:9 No - lnc-ALCAM-8:10 No - lnc-ALCAM-8:11 No - lnc-ALCAM-8:12 No - LINC00882:70 No - LINC00882:71 No - LINC00882:72 No - LINC00882:74 No - LINC00882:53 No - LINC00882:73 No - LINC00882:75 No - LINC00882:76 No - LINC00882:54 No - LINC00882:55 No - LINC00882:69 No - LINC00882:62 No - LINC00882:65 No - LINC00882:66 No - LINC00882:67 No - LINC00882:58 No - LINC00882:59 No - LINC00882:60 No - LINC00882:68 No - LINC00882:64 No - LINC00882:56 No - LINC00882:63 No - LINC00882:61 No - LINC00882:33 No - LINC00882:57 No - DUBR:17 No - DUBR:18 No - DUBR:19 No - DUBR:20 No - DUBR:21 No - DUBR:23 No - DUBR:24 No - DUBR:25 No - DUBR:26 No - DUBR:22 No - LINC00882:34 No - LINC00882:35 No - LINC00882:36 No - LINC00882:40 No - LINC01990:8 No - LINC01990:9 No - LINC01990:10 No - LINC00882:39 No - LINC00882:32 No - LINC01990:11 No - LINC00635:44 No - LINC00635:37 No - LINC00635:38 No - LINC00635:39 No - LINC00635:45 No - LINC00635:46 No - LINC00635:40 No - LINC00635:41 No - LINC00635:47 No - LINC00635:48 No - LINC00635:42 No - LINC00635:43 No - LINC00635:49 No - LINC00635:50 No - LINC00635:51 No - LINC00635:52 No - LINC00635:53 No - LINC00636:3 No - LINC00636:4 No - LINC00636:5 No - lnc-CD47-11:3 No - lnc-CD47-11:5 No - lnc-CD47-11:6 No - lnc-CD47-11:4 No - lnc-CD47-11:7 No - lnc-CD47-11:2 No - lnc-CD47-11:1 No - lnc-HHLA2-7:1 No - lnc-C3orf85-4:1 No - lnc-C3orf85-4:2 No - lnc-C3orf85-4:3 No - lnc-C3orf85-4:4 No - lnc-C3orf85-4:5 No - lnc-ZBED2-4:2 No - lnc-ZBED2-4:3 No - lnc-ZBED2-4:4 No - lnc-ZBED2-4:5 No - lnc-ZBED2-4:1 No - lnc-ZBED2-3:1 Yes chrX:17107582-17135988 lnc-SLC9C1-2:4 No - lnc-SLC9C1-2:1 No - lnc-SLC9C1-2:2 No - lnc-NEPRO-5:2 No - lnc-SPICE1-2:1 No - lnc-ATP6V1A-7:1 No - lnc-ATP6V1A-7:2 No - LINC00901:4 Yes chr3L:5424109-5442399 LINC00901:5 Yes chr3L:5424109-5442399 lnc-IGSF11-5:3 No - lnc-IGSF11-5:4 No - lnc-IGSF11-5:5 No - lnc-IGSF11-5:6 No - lnc-IGSF11-5:7 No - IGSF11-AS1:5 No - lnc-B4GALT4-3:1 Yes chr2L:19774874-19791882 lnc-CD80-2:2 No - lnc-CD80-5:1 No - lnc-POPDC2-5:1 Yes chrX:17911462-17924163 lnc-NR1I2-1:16 Yes chr3R:31372427-31374198 lnc-NR1I2-1:17 No - lnc-NR1I2-1:18 No - lnc-NR1I2-1:19 No - lnc-NR1I2-1:20 No - lnc-NR1I2-1:21 No - lnc-NR1I2-1:22 No - lnc-NR1I2-1:23 No - lnc-NR1I2-1:24 No - lnc-NR1I2-1:25 No - lnc-NR1I2-7:1 No - lnc-NDUFB4-1:2 No - lnc-NDUFB4-1:3 No - lnc-NDUFB4-1:4 No - lnc-EAF2-3:3 No - lnc-EAF2-3:4 No - lnc-FAM162A-2:9 No - lnc-FAM162A-2:10 No - lnc-FAM162A-2:14 Yes chr3L:19807232-19810398 lnc-FAM162A-2:16 Yes chr3L:19807232-19810398 lnc-FAM162A-2:17 Yes chr3L:19807232-19810398 lnc-DTX3L-1:2 No - lnc-SEC22A-14:1 No - lnc-SEC22A-14:3 No - lnc-SEC22A-14:4 No - lnc-SEC22A-14:5 Yes chr2R:9716348-9748121 lnc-UMPS-2:2 No - lnc-UMPS-2:3 No - lnc-UMPS-2:4 No - lnc-UMPS-2:6 No - lnc-UMPS-2:5 No - lnc-ROPN1B-16:1 No - lnc-ROPN1B-16:2 No - lnc-ROPN1B-16:3 No - lnc-ROPN1B-13:2 No - lnc-ROPN1B-13:3 No - lnc-ROPN1B-13:4 No - lnc-ROPN1B-13:5 No - lnc-ALG1L-2:32 No - lnc-ALG1L-2:35 No - lnc-ALG1L-2:36 No - lnc-ALG1L-2:31 No - lnc-ALG1L-2:33 No - lnc-ALG1L-2:34 No - lnc-ROPN1B-15:1 No - lnc-ROPN1B-15:2 No - lnc-ROPN1B-2:5 Yes chrX:8489348-8517029 lnc-ROPN1B-2:6 Yes chrX:8489348-8517029 lnc-ROPN1B-2:7 Yes chrX:8489348-8517029 lnc-ROPN1B-2:8 Yes chrX:8489348-8517029 lnc-ROPN1B-2:9 Yes chrX:8489348-8517029 ALDH1L1-AS2:5 Yes chr2L:21371227-21377995 ALDH1L1-AS2:6 Yes chr2L:21371227-21377995 ALDH1L1-AS2:7 Yes chr2L:21371227-21377995 lnc-KLF15-3:6 No - lnc-KLF15-3:7 No - lnc-KLF15-3:5 No - lnc-CFAP100-11:3 No - lnc-CFAP100-11:4 No - lnc-TXNRD3-3:1 No - lnc-TXNRD3-3:2 No - lnc-TXNRD3-4:1 No - lnc-TPRA1-8:1 Yes chr3R:8264970-8267924 lnc-TPRA1-8:2 Yes chr3R:8264970-8267924 lnc-ABTB1-4:1 No - lnc-ABTB1-4:2 No - lnc-RUVBL1-1:9 No - lnc-RUVBL1-1:6 No - lnc-RUVBL1-1:4 Yes chr2L:6477182-6480575 lnc-RUVBL1-1:5 Yes chr2L:6477182-6480575 lnc-RUVBL1-1:3 Yes chr2L:6477182-6480575 lnc-RUVBL1-1:7 Yes chr2L:6477182-6480575 GATA2-AS1:5 Yes chr3R:8147368-8181444 GATA2-AS1:6 Yes chr3R:8147368-8181444 GATA2-AS1:7 Yes chr3R:8147368-8181444 GATA2-AS1:8 Yes chr3R:8147368-8181444 GATA2-AS1:9 Yes chr3R:8147368-8181444 GATA2-AS1:10 Yes chr3R:8147368-8181444 GATA2-AS1:11 Yes chr3R:8147368-8181444 GATA2-AS1:12 Yes chr3R:8147368-8181444 GATA2-AS1:13 Yes chr3R:8147368-8181444 GATA2-AS1:15 Yes chr3R:8147368-8181444 GATA2-AS1:16 Yes chr3R:8147368-8181444 GATA2-AS1:14 Yes chr3R:8147368-8181444 GATA2-AS1:17 Yes chr3R:8147368-8181444 GATA2-AS1:18 Yes chr3R:8147368-8181444 GATA2-AS1:19 Yes chr3R:8147368-8181444 lnc-COPG1-5:1 No - lnc-COPG1-5:2 No - lnc-COPG1-3:1 No - lnc-COPG1-3:2 No - lnc-COPG1-3:3 No - lnc-COPG1-3:4 No - lnc-COPG1-3:5 No - lnc-COPG1-2:1 No - lnc-COPG1-2:2 No - lnc-COPG1-2:4 No - lnc-H1FX-1:3 Yes chr3R:31572143-31575707 lnc-H1FX-1:1 Yes chr3R:31572143-31575707 lnc-H1FX-1:2 Yes chr3R:31572143-31575707 lnc-H1FOO-2:1 No - lnc-H1FOO-2:2 No - lnc-H1FOO-2:3 No - lnc-H1FOO-2:4 No - TMCC1-AS1:7 No - TMCC1-AS1:9 No - TMCC1-AS1:10 No - TMCC1-AS1:8 No - TMCC1-AS1:11 No - TMCC1-AS1:12 No - lnc-COL6A6-3:1 No - lnc-COL6A6-3:2 No - lnc-PIK3R4-3:1 Yes chr3L:22749444-22787631 lnc-PIK3R4-3:2 Yes chr3L:22749444-22787631 lnc-PIK3R4-3:3 Yes chr3L:22749444-22787631 lnc-ASTE1-1:5 No - lnc-ASTE1-1:6 No - lnc-ASTE1-1:7 No - lnc-ASTE1-1:8 No - lnc-ASTE1-1:9 No - lnc-ASTE1-1:4 No - lnc-MRPL3-2:13 No - lnc-MRPL3-2:9 No - lnc-MRPL3-2:7 No - lnc-MRPL3-2:10 No - lnc-MRPL3-2:8 No - lnc-MRPL3-2:14 No - lnc-MRPL3-2:11 No - lnc-MRPL3-2:12 No - lnc-MRPL3-2:5 No - lnc-MRPL3-2:6 No - lnc-CPNE4-5:1 Yes chr2R:9167763-9177261 lnc-NPHP3-ACAD11-1:1 No - lnc-NPHP3-ACAD11-1:2 No - lnc-NPHP3-ACAD11-1:3 No - lnc-NPHP3-ACAD11-1:4 No - lnc-NPHP3-ACAD11-1:5 No - BFSP2-AS1:8 No - BFSP2-AS1:7 No - BFSP2-AS1:13 No - BFSP2-AS1:10 No - BFSP2-AS1:6 No - BFSP2-AS1:9 No - BFSP2-AS1:11 No - LINC02004:6 No - LINC02004:7 No - LINC02004:8 No - lnc-MSL2-7:1 No - lnc-SLC35G2-1:7 No - lnc-SLC35G2-1:8 No - lnc-SLC35G2-1:9 No - NCK1-DT:28 No - NCK1-DT:29 No - NCK1-DT:30 No - NCK1-DT:31 No - NCK1-DT:32 No - NCK1-DT:33 No - NCK1-DT:34 No - lnc-FOXL2NB-10:2 No - lnc-FOXL2-5:1 No - lnc-FOXL2-5:2 No - lnc-FOXL2-5:3 No - lnc-FOXL2-5:4 No - lnc-FOXL2-5:5 No - LINC01391:4 No - lnc-MRPS22-1:20 No - lnc-MRPS22-1:21 No - lnc-MRPS22-1:22 No - lnc-MRPS22-1:23 No - lnc-MRPS22-1:24 No - lnc-MRPS22-1:25 No - lnc-MRPS22-1:26 No - lnc-MRPS22-1:19 Yes chr3R:11559896-11567054 lnc-MRPS22-5:1 No - lnc-MRPS22-7:1 Yes chr3R:11559896-11567054 lnc-MRPS22-7:2 Yes chr3R:11559896-11567054 lnc-NMNAT3-1:7 No - lnc-NMNAT3-1:5 No - lnc-NMNAT3-1:8 No - lnc-NMNAT3-1:6 No - lnc-TFDP2-15:3 No - lnc-TFDP2-15:4 No - lnc-TFDP2-15:1 No - lnc-TFDP2-15:2 No - lnc-TFDP2-14:1 Yes chr2L:2209574-2212571 lnc-TFDP2-13:1 No - lnc-TFDP2-12:1 No - lnc-ATP1B3-4:1 No - lnc-PLS1-6:1 No - lnc-PLS1-6:2 No - lnc-PCOLCE2-1:1 Yes chrX:17285704-17301929 lnc-PAQR9-2:3 Yes chr2R:21011970-21015628 lnc-SLC9A9-3:1 Yes chr2L:6498647-6526996 lnc-ZIC1-6:7 Yes chr3L:11198166-11206016 lnc-ZIC1-6:8 Yes chr3L:11198166-11206016 lnc-ZIC1-6:9 Yes chr3L:11198166-11206016 lnc-ZIC1-6:10 Yes chr3L:11198166-11206016 lnc-PLSCR4-3:1 No - lnc-PLSCR4-3:2 No - lnc-ZIC1-11:2 No - lnc-ZIC4-3:4 No - lnc-ZIC4-3:3 No - lnc-ZIC4-3:5 No - lnc-ZIC4-3:6 No - lnc-ZIC4-3:7 No - lnc-ZIC4-3:2 No - lnc-ZIC1-5:6 No - lnc-ZIC1-5:7 No - lnc-ZIC1-5:8 No - lnc-ZIC1-5:9 No - lnc-ZIC1-5:10 No - lnc-CP-5:1 No - lnc-TM4SF4-5:1 No - lnc-TM4SF4-5:2 No - WWTR1-AS1:6 Yes chr2R:24065975-24068485 WWTR1-AS1:7 Yes chr2R:24065975-24068485 lnc-RNF13-3:4 No - lnc-RNF13-3:5 No - LINC01998:5 No - lnc-SERP1-4:7 No - lnc-SERP1-4:8 No - lnc-SERP1-4:2 Yes chr2L:12455540-12546611 lnc-SERP1-4:3 Yes chr2L:12455540-12546611 lnc-SERP1-4:5 No - lnc-SERP1-4:6 No - lnc-SERP1-4:4 Yes chr2L:12455540-12546611 ERICH6-AS1:17 No - ERICH6-AS1:18 No - ERICH6-AS1:19 No - ERICH6-AS1:20 No - lnc-SELENOT-45:1 Yes chr3L:16853751-16858712 lnc-SELENOT-45:2 No - lnc-SELENOT-45:3 No - lnc-SELENOT-45:4 No - lnc-SELENOT-45:5 No - lnc-SELENOT-45:6 No - lnc-IGSF10-6:2 No - lnc-IGSF10-6:3 No - lnc-IGSF10-6:4 No - MBNL1-AS1:11 Yes chr2R:17216549-17379376 MBNL1-AS1:12 Yes chr2R:17216549-17379376 MBNL1-AS1:8 Yes chr2R:17216549-17379376 MBNL1-AS1:9 Yes chr2R:17216549-17379376 MBNL1-AS1:10 Yes chr2R:17216549-17379376 MBNL1-AS1:5 Yes chr2R:17216549-17379376 MBNL1-AS1:6 Yes chr2R:17216549-17379376 MBNL1-AS1:7 Yes chr2R:17216549-17379376 lnc-P2RY1-3:12 No - lnc-P2RY1-3:13 No - lnc-P2RY1-3:14 No - lnc-P2RY1-3:15 No - lnc-P2RY1-3:11 No - lnc-DHX36-2:5 No - lnc-DHX36-2:6 No - lnc-DHX36-2:7 No - lnc-DHX36-2:8 No - lnc-DHX36-2:9 No - lnc-DHX36-2:10 No - lnc-DHX36-9:1 No - ARHGEF26-AS1:14 Yes chr3L:16970013-16994388 ARHGEF26-AS1:15 Yes chr3L:16970013-16994388 ARHGEF26-AS1:20 Yes chr3L:16970013-16994388 ARHGEF26-AS1:16 Yes chr3L:16970013-16994388 ARHGEF26-AS1:17 Yes chr3L:16970013-16994388 ARHGEF26-AS1:23 Yes chr3L:16970013-16994388 ARHGEF26-AS1:18 Yes chr3L:16970013-16994388 ARHGEF26-AS1:21 Yes chr3L:16970013-16994388 ARHGEF26-AS1:19 Yes chr3L:16970013-16994388 ARHGEF26-AS1:13 Yes chr3L:16970013-16994388 ARHGEF26-AS1:22 Yes chr3L:16970013-16994388 lnc-ARHGEF26-8:1 No - lnc-ARHGEF26-8:2 No - lnc-GMPS-1:7 No - lnc-GMPS-1:8 No - lnc-SLC33A1-1:1 No - lnc-SLC33A1-1:2 No - TIPARP-AS1:8 No - TIPARP-AS1:9 No - TIPARP-AS1:12 No - TIPARP-AS1:10 No - TIPARP-AS1:11 No - LINC00886:11 No - LINC00886:13 No - LINC00886:12 No - LINC00886:14 No - LINC00886:7 No - LINC00886:8 No - LINC00886:9 No - LINC00886:10 No - LINC00886:15 No - LINC00886:6 No - LINC00880:6 No - LINC02029:9 No - LINC02029:10 No - LINC02029:11 No - LINC02029:12 No - LINC00881:10 No - lnc-LEKR1-6:1 No - lnc-LEKR1-4:13 Yes chrX:2078343-2080405 lnc-LEKR1-4:14 Yes chrX:2078343-2080405 lnc-LEKR1-44:2 No - lnc-LXN-1:6 No - lnc-LXN-1:5 No - lnc-LXN-1:7 No - lnc-LXN-1:8 No - lnc-LXN-1:9 No - lnc-RARRES1-2:5 Yes chr2L:4838347-4841465 lnc-RARRES1-2:2 Yes chr2L:4838347-4841465 lnc-RARRES1-2:3 Yes chr2L:4838347-4841465 lnc-RARRES1-2:6 Yes chr2L:4838347-4841465 lnc-RARRES1-2:4 Yes chr2L:4838347-4841465 lnc-RARRES1-3:2 Yes chr2L:4838347-4841465 lnc-RARRES1-3:3 Yes chr2L:4838347-4841465 lnc-RARRES1-3:4 Yes chr2L:4838347-4841465 lnc-RARRES1-3:5 Yes chr2L:4838347-4841465 IQCJ-SCHIP1-AS1:10 Yes chr2L:10328200-10331116 IQCJ-SCHIP1-AS1:11 Yes chr2L:10328200-10331116 IQCJ-SCHIP1-AS1:13 Yes chr2L:10328200-10331116 IQCJ-SCHIP1-AS1:14 Yes chr2L:10328200-10331116 IQCJ-SCHIP1-AS1:7 Yes chr2L:10328200-10331116 IQCJ-SCHIP1-AS1:8 Yes chr2L:10328200-10331116 IQCJ-SCHIP1-AS1:9 Yes chr2L:10328200-10331116 IQCJ-SCHIP1-AS1:6 Yes chr2L:10328200-10331116 lnc-IFT80-8:1 Yes chr2L:10328200-10331116 IQCJ-SCHIP1-AS1:12 Yes chr2L:10328200-10331116 IL12A-AS1:8 No - IL12A-AS1:9 No - IL12A-AS1:10 No - IL12A-AS1:11 No - IL12A-AS1:13 No - IL12A-AS1:12 No - lnc-C3orf80-5:1 No - IL12A-AS1:6 No - IL12A-AS1:7 No - lnc-KPNA4-1:3 No - lnc-KPNA4-1:5 No - lnc-KPNA4-1:4 No - lnc-KPNA4-1:6 No - lnc-SPTSSB-8:1 No - LINC01322:9 No - LINC01322:13 No - LINC01322:14 No - LINC01322:10 No - LINC01322:11 No - LINC01322:12 No - LINC01322:15 No - LINC01322:16 No - LINC01322:19 No - LINC01322:17 No - LINC01322:18 No - LINC01322:20 No - LINC01322:21 No - lnc-BCHE-6:1 No - lnc-SERPINI1-3:3 No - lnc-SERPINI1-23:6 No - lnc-SERPINI1-23:7 No - lnc-SERPINI1-23:8 No - lnc-SERPINI1-23:9 No - lnc-SERPINI1-23:10 No - lnc-SERPINI1-23:11 No - lnc-SERPINI1-23:12 No - lnc-SERPINI1-23:13 No - lnc-ACTRT3-2:3 No - lnc-ACTRT3-2:5 No - lnc-ACTRT3-8:1 Yes chr2R:7516923-7518936 lnc-SLC7A14-4:1 No - lnc-SLC7A14-3:10 No - lnc-SLC7A14-3:11 No - lnc-SLC7A14-3:8 No - lnc-SLC7A14-3:2 No - lnc-SLC7A14-3:14 No - lnc-SLC7A14-3:15 No - lnc-SLC7A14-3:13 No - lnc-SLC7A14-3:3 No - lnc-SLC7A14-3:4 No - lnc-SLC7A14-3:5 No - lnc-SLC7A14-3:6 No - lnc-SLC7A14-3:12 No - lnc-SLC7A14-3:9 No - lnc-RPL22L1-4:1 No - lnc-CLDN11-6:1 Yes chrX:762560-765130 lnc-CLDN11-6:2 Yes chrX:762560-765130 lnc-CLDN11-6:3 Yes chrX:762560-765130 lnc-CLDN11-3:3 No - lnc-TMEM212-1:4 No - lnc-TMEM212-1:5 No - lnc-TMEM212-1:6 No - lnc-TMEM212-1:8 No - lnc-TMEM212-1:9 No - lnc-TMEM212-1:10 No - lnc-TMEM212-1:11 No - lnc-FNDC3B-10:2 No - lnc-PLD1-5:1 Yes chr2L:16545016-16663218 LINC02068:13 No - LINC02068:14 No - LINC02068:15 No - lnc-NCEH1-3:1 No - lnc-TBL1XR1-19:2 No - lnc-TBL1XR1-19:1 No - LINC01208:9 No - LINC01208:7 No - LINC01208:10 No - LINC01208:8 No - LINC01208:11 No - lnc-KCNMB2-14:1 No - lnc-KCNMB2-14:2 No - lnc-KCNMB2-14:3 No - lnc-KCNMB2-14:4 No - LINC00578:8 No - LINC00578:9 No - LINC00578:11 No - LINC00578:10 No - LINC00578:12 No - LINC00578:13 No - LINC02015:19 No - LINC02015:20 No - LINC02015:21 No - LINC02015:22 No - LINC02015:25 No - LINC02015:26 No - LINC02015:27 No - LINC02015:28 No - LINC02015:29 No - LINC02015:30 No - lnc-ZMAT3-3:9 No - lnc-ZMAT3-3:10 No - lnc-ZMAT3-3:11 No - lnc-ZMAT3-3:6 No - lnc-ZMAT3-3:12 No - lnc-ZMAT3-3:7 No - lnc-ZMAT3-3:8 No - LINC01014:5 No - LINC01014:4 No - LINC01014:6 No - LINC01014:7 No - LINC01014:8 No - LINC01014:9 No - lnc-ZMAT3-1:3 No - lnc-USP13-7:2 Yes chrX:1866832-1869061 lnc-USP13-7:3 Yes chrX:1866832-1869061 lnc-USP13-7:4 Yes chrX:1866832-1869061 lnc-CCDC39-4:2 No - lnc-CCDC39-4:5 No - lnc-CCDC39-4:3 No - lnc-CCDC39-4:6 No - lnc-CCDC39-4:7 No - lnc-CCDC39-4:4 No - CCDC39-AS1:2 Yes chr3R:4781120-4784722 CCDC39-AS1:3 Yes chr3R:4781120-4784722 CCDC39-AS1:4 Yes chr3R:4781120-4784722 lnc-DCUN1D1-1:3 No - lnc-DCUN1D1-1:4 No - lnc-DCUN1D1-1:5 No - lnc-KLHL24-6:1 No - lnc-KLHL6-3:1 No - lnc-KLHL6-3:2 No - lnc-HTR3D-2:1 No - lnc-ABCC5-3:10 No - lnc-ABCC5-3:12 Yes chrX:1920166-1922874 lnc-ABCC5-3:5 Yes chrX:1920166-1922874 lnc-ABCC5-3:1 Yes chrX:1920166-1922874 lnc-ABCC5-3:11 Yes chrX:1920166-1922874 lnc-ABCC5-3:8 Yes chrX:1920166-1922874 lnc-ABCC5-3:9 Yes chrX:1920166-1922874 lnc-ABCC5-3:6 Yes chrX:1920166-1922874 lnc-ABCC5-3:2 No - lnc-ABCC5-3:3 No - lnc-MAP3K13-3:2 No - lnc-MAP3K13-3:3 No - lnc-MAP3K13-3:4 No - lnc-MAP3K13-3:5 No - lnc-MAP3K13-3:6 No - lnc-SENP2-2:1 No - lnc-SENP2-2:2 No - lnc-SENP2-2:3 No - lnc-DNAJB11-12:1 No - lnc-DNAJB11-12:2 No - lnc-TBCCD1-4:64 No - lnc-TBCCD1-4:65 No - lnc-TBCCD1-4:63 No - lnc-RFC4-1:4 Yes chr2L:5981764-5985909 lnc-RFC4-1:3 Yes chr2L:5981764-5985909 lnc-RFC4-1:5 Yes chr2L:5981764-5985909 LINC02043:9 No - LINC02043:10 No - LINC02043:11 No - LINC02043:8 No - lnc-RTP4-1:4 No - lnc-RTP4-6:1 No - lnc-RTP4-6:2 No - lnc-RTP4-7:1 No - lnc-RTP4-7:2 No - lnc-RTP4-7:3 No - lnc-RTP4-7:4 No - LPP-AS2:6 Yes chr4:1057365-1065001 LPP-AS2:3 Yes chr4:1057365-1065001 LPP-AS2:4 Yes chr4:1057365-1065001 LPP-AS2:5 Yes chr4:1057365-1065001 lnc-BCL6-10:3 Yes chr4:1057365-1065001 lnc-BCL6-10:4 Yes chr4:1057365-1065001 lnc-BCL6-10:1 Yes chr4:1057365-1065001 lnc-BCL6-10:2 Yes chr4:1057365-1065001 P3H2-AS1:5 No - P3H2-AS1:6 No - P3H2-AS1:7 No - lnc-CLDN16-9:1 No - lnc-MB21D2-2:1 No - lnc-ATP13A5-3:1 No - lnc-ATP13A4-2:4 No - lnc-ATP13A4-2:3 No - lnc-ATP13A4-2:5 No - lnc-CPN2-4:55 No - lnc-CPN2-4:43 No - lnc-CPN2-4:56 No - lnc-CPN2-4:45 No - lnc-CPN2-4:44 No - lnc-CPN2-4:46 No - lnc-CPN2-4:57 No - lnc-CPN2-4:54 No - lnc-CPN2-4:47 No - lnc-CPN2-4:48 No - lnc-CPN2-4:49 No - lnc-CPN2-4:50 No - lnc-CPN2-4:51 No - lnc-CPN2-4:52 No - lnc-CPN2-4:53 No - lnc-CPN2-4:42 No - lnc-CPN2-3:3 No - LINC02036:13 No - LINC00887:12 No - LINC00887:13 No - LINC00887:14 No - LINC00887:15 No - LINC00887:16 No - LINC00884:7 Yes chr4:132220-143123 LINC00884:8 Yes chr4:132220-143123 LINC00884:9 Yes chr4:132220-143123 LINC00884:11 Yes chr4:132220-143123 LINC00884:12 Yes chr4:132220-143123 LINC00884:13 Yes chr4:132220-143123 LINC00884:14 Yes chr4:132220-143123 LINC00884:15 Yes chr4:132220-143123 LINC00884:10 Yes chr4:132220-143123 lnc-FAM43A-14:1 No - lnc-FAM43A-13:1 No - TMEM44-AS1:15 No - TMEM44-AS1:16 No - TMEM44-AS1:17 No - TMEM44-AS1:18 No - lnc-MUC20-12:1 No - lnc-MUC20-71:1 No - lnc-MUC20-71:2 No - LINC00885:8 No - LINC00885:9 No - LINC00885:10 No - LINC00885:11 No - TM4SF19-AS1:11 No - lnc-WDR53-3:1 No - LINC01063:7 No - LINC01063:3 No - LINC01063:4 No - LINC01063:5 No - LINC01063:6 No - lnc-CEP19-1:3 No - lnc-CEP19-1:2 No - lnc-NCBP2-1:1 No - lnc-NCBP2-1:2 No - lnc-NCBP2-1:3 No - DLG1-AS1:4 Yes chrX:11369665-11409776 lnc-BDH1-1:2 No - lnc-BDH1-1:3 No - lnc-FYTTD1-8:2 No - lnc-FYTTD1-8:3 No - lnc-FYTTD1-8:4 No - lnc-FYTTD1-8:5 No - lnc-FYTTD1-8:7 No - lnc-FYTTD1-8:8 No - lnc-ZNF141-2:3 No - lnc-PDE6B-1:18 No - lnc-PDE6B-1:19 No - lnc-PDE6B-1:20 No - lnc-PDE6B-1:21 No - lnc-PDE6B-1:22 No - lnc-PDE6B-1:23 No - lnc-ATP5ME-1:2 No - lnc-ATP5ME-1:12 No - lnc-ATP5ME-1:7 No - lnc-ATP5ME-1:8 No - lnc-ATP5ME-1:3 No - lnc-ATP5ME-1:4 No - lnc-ATP5ME-1:5 No - lnc-ATP5ME-1:13 No - lnc-ATP5ME-1:9 No - lnc-ATP5ME-1:10 No - lnc-ATP5ME-1:11 No - lnc-ATP5ME-1:6 No - lnc-CPLX1-2:13 Yes chr3L:16588475-16590132 lnc-CPLX1-2:14 Yes chr3L:16588475-16590132 lnc-CPLX1-2:15 No - lnc-CPLX1-2:16 No - lnc-CPLX1-2:17 No - lnc-CPLX1-2:18 No - lnc-CPLX1-2:19 No - lnc-CPLX1-2:20 No - lnc-MAEA-9:1 Yes chr2R:14671396-14713622 lnc-MAEA-9:2 Yes chr2R:14671396-14713622 lnc-MAEA-9:3 Yes chr2R:14671396-14713622 lnc-MAEA-9:4 Yes chr2R:14671396-14713622 CTBP1-DT:22 Yes chr3R:13011649-13026275 CTBP1-DT:24 Yes chr3R:13011649-13026275 lnc-CTBP1-1:2 No - lnc-CTBP1-1:3 No - lnc-FAM53A-1:5 No - lnc-FAM53A-1:6 No - lnc-FAM53A-1:7 No - lnc-FAM53A-1:9 No - lnc-FAM53A-1:8 No - lnc-TACC3-1:2 No - lnc-TACC3-1:3 No - lnc-TACC3-1:4 No - lnc-TACC3-1:5 No - lnc-TMEM129-4:1 No - lnc-TMEM129-4:2 No - lnc-NSD2-1:1 Yes chr3R:21223704-21229512 lnc-ZFYVE28-2:1 No - lnc-TNIP2-3:1 No - lnc-TNIP2-4:1 No - NOP14-AS1:15 No - NOP14-AS1:18 Yes chr3R:17535533-17539963 NOP14-AS1:22 Yes chr3R:17535533-17539963 HTT-AS:3 No - HTT-AS:4 No - lnc-ZBTB49-4:1 No - lnc-ZBTB49-4:2 No - STX18-AS1:10 Yes chr3R:24623802-24625562 STX18-AS1:11 Yes chr3R:24623802-24625562 STX18-AS1:12 Yes chr3R:24623802-24625562 STX18-AS1:13 Yes chr3R:24623802-24625562 STX18-AS1:14 Yes chr3R:24623802-24625562 STX18-AS1:15 Yes chr3R:24623802-24625562 STX18-AS1:16 Yes chr3R:24623802-24625562 STX18-AS1:17 Yes chr3R:24623802-24625562 STX18-AS1:18 Yes chr3R:24623802-24625562 STX18-AS1:19 Yes chr3R:24623802-24625562 STX18-AS1:20 Yes chr3R:24623802-24625562 lnc-MSX1-2:3 No - lnc-MSX1-2:5 No - lnc-MSX1-2:4 No - lnc-WFS1-3:10 No - lnc-WFS1-3:11 No - lnc-WFS1-3:12 No - lnc-WFS1-3:13 No - lnc-WFS1-3:14 No - lnc-WFS1-3:9 No - lnc-WFS1-3:15 No - LINC02482:16 No - LINC02482:17 No - LINC02482:18 No - LINC02482:19 No - LINC02482:20 No - lnc-MRFAP1-2:7 No - LINC002481:10 No - LINC002481:11 No - LINC002481:8 No - LINC002481:9 No - lnc-BLOC1S4-2:1 No - lnc-BLOC1S4-2:2 No - lnc-BLOC1S4-2:3 No - lnc-KIAA0232-1:2 No - lnc-KIAA0232-1:3 No - lnc-KIAA0232-1:4 No - lnc-KIAA0232-1:5 No - lnc-CCDC96-5:1 No - lnc-CCDC96-5:2 No - lnc-TADA2B-6:1 No - LINC02447:18 No - LINC02447:19 No - LINC02447:20 No - LINC02447:21 No - LINC02447:22 No - LINC02447:23 No - LINC02447:24 No - lnc-SORCS2-1:6 No - lnc-SH3TC1-3:1 No - lnc-ACOX3-8:1 No - lnc-ACOX3-8:2 No - lnc-HMX1-5:1 No - lnc-HMX1-5:2 No - lnc-DRD5-2:2 Yes chr2R:8087396-8089297 lnc-DRD5-28:1 No - lnc-DRD5-28:3 No - lnc-DRD5-28:2 No - lnc-DRD5-28:4 No - lnc-DRD5-4:5 No - lnc-DRD5-4:6 No - lnc-DRD5-4:7 No - lnc-DRD5-4:8 No - lnc-DRD5-4:9 No - lnc-DRD5-29:1 Yes chr2R:18718114-18754675 lnc-DRD5-29:3 Yes chr2R:18718114-18754675 lnc-DRD5-29:4 Yes chr2R:18718114-18754675 lnc-DRD5-29:5 Yes chr2R:18718114-18754675 lnc-DRD5-29:2 Yes chr2R:18718114-18754675 lnc-DRD5-29:7 Yes chr2R:18718114-18754675 lnc-DRD5-29:8 Yes chr2R:18718114-18754675 lnc-DRD5-29:6 Yes chr2R:18718114-18754675 lnc-DRD5-29:9 Yes chr2R:18718114-18754675 lnc-DRD5-29:10 Yes chr2R:18718114-18754675 lnc-DRD5-29:11 Yes chr2R:18718114-18754675 lnc-DRD5-29:12 Yes chr2R:18718114-18754675 lnc-DRD5-9:2 No - lnc-DRD5-9:3 No - lnc-DRD5-30:1 No - lnc-DRD5-10:20 No - lnc-DRD5-10:22 No - lnc-DRD5-10:23 No - lnc-DRD5-10:21 No - lnc-DRD5-10:25 No - lnc-DRD5-10:26 No - lnc-DRD5-10:27 No - lnc-DRD5-10:28 No - lnc-DRD5-10:29 No - lnc-CPEB2-17:1 No - LINC01096:6 No - LINC01096:7 No - LINC01096:5 No - LINC01096:8 No - LINC01182:3 No - LINC01182:4 No - LINC01182:5 No - LINC01182:6 No - LINC01182:7 No - LINC01182:8 No - LINC01182:9 No - LINC01182:10 No - LINC01182:11 No - LINC01182:12 No - LINC01182:13 No - lnc-CPEB2-2:3 No - lnc-CPEB2-2:5 No - lnc-CPEB2-2:4 No - lnc-CPEB2-2:6 No - lnc-CPEB2-2:7 No - lnc-BOD1L1-8:1 No - lnc-BOD1L1-8:2 No - lnc-BOD1L1-8:3 No - lnc-BOD1L1-8:4 No - LINC00504:9 No - LINC00504:11 No - LINC00504:10 No - LINC00504:12 No - CPEB2-DT:22 No - CPEB2-DT:23 No - CPEB2-DT:24 No - CPEB2-DT:15 Yes chr3L:8937100-8954463 CPEB2-DT:25 No - CPEB2-DT:18 Yes chr3L:8937100-8954463 CPEB2-DT:19 Yes chr3L:8937100-8954463 CPEB2-DT:20 Yes chr3L:8937100-8954463 CPEB2-DT:16 Yes chr3L:8937100-8954463 CPEB2-DT:17 Yes chr3L:8937100-8954463 lnc-CD38-12:1 No - lnc-CD38-12:2 No - lnc-CD38-12:3 No - TAPT1-AS1:11 Yes chr3R:18161392-18164397 TAPT1-AS1:12 Yes chr3R:18161392-18164397 TAPT1-AS1:13 Yes chr3R:18161392-18164397 TAPT1-AS1:14 Yes chr3R:18161392-18164397 TAPT1-AS1:15 Yes chr3R:18161392-18164397 TAPT1-AS1:16 Yes chr3R:18161392-18164397 TAPT1-AS1:17 Yes chr3R:18161392-18164397 lnc-CD38-3:8 No - lnc-CD38-3:9 No - lnc-CD38-3:10 No - lnc-CD38-3:11 No - lnc-CD38-3:7 No - lnc-CD38-3:12 No - lnc-CD38-3:13 No - lnc-FAM184B-7:1 No - lnc-FAM184B-1:4 Yes chr3L:8619888-8622091 lnc-FAM184B-1:2 Yes chr3L:8619888-8622091 lnc-FAM184B-1:3 No - lnc-SLIT2-1:3 No - lnc-SLIT2-1:4 No - lnc-SLIT2-1:5 No - lnc-SLIT2-1:2 No - lnc-SLIT2-1:6 No - lnc-SLIT2-1:7 No - lnc-SEPSECS-4:3 Yes chr3R:5557663-5563652 lnc-SEPSECS-4:4 Yes chr3R:5557663-5563652 lnc-SEPSECS-4:5 Yes chr3R:5557663-5563652 lnc-SEPSECS-4:1 Yes chr3R:5557663-5563652 lnc-SEPSECS-4:2 Yes chr3R:5557663-5563652 lnc-SMIM20-7:1 No - lnc-SMIM20-7:2 No - lnc-SEL1L3-13:1 No - lnc-CCKAR-12:1 Yes chr2L:15039488-15043334 lnc-CCKAR-10:1 Yes chr2L:15039488-15043334 lnc-CCKAR-10:2 Yes chr2L:15039488-15043334 lnc-CCKAR-10:3 Yes chr2L:15039488-15043334 lnc-CCKAR-10:4 Yes chr2L:15039488-15043334 lnc-CCKAR-9:1 No - lnc-CCKAR-9:2 No - lnc-CCKAR-9:3 No - lnc-CCKAR-1:7 Yes chrX:15934495-15940451 lnc-CCKAR-1:8 Yes chrX:15934495-15940451 lnc-CCKAR-1:9 Yes chrX:15934495-15940451 lnc-CCKAR-1:10 Yes chrX:15934495-15940451 lnc-CCKAR-11:2 Yes chrX:15934495-15940451 lnc-CCKAR-11:1 Yes chrX:15934495-15940451 lnc-CCKAR-11:3 Yes chrX:15934495-15940451 lnc-STIM2-3:4 No - lnc-STIM2-3:5 No - lnc-STIM2-12:3 No - lnc-STIM2-12:2 No - lnc-STIM2-12:5 No - lnc-STIM2-12:6 No - lnc-STIM2-12:4 No - lnc-DTHD1-17:1 No - lnc-DTHD1-1:5 No - lnc-DTHD1-1:7 No - lnc-DTHD1-1:6 No - lnc-DTHD1-1:8 No - lnc-RELL1-7:1 Yes chr3R:5685855-5712837 KLF3-AS1:17 Yes chr2R:23011078-23042943 KLF3-AS1:18 Yes chr2R:23011078-23042943 KLF3-AS1:19 Yes chr2R:23011078-23042943 KLF3-AS1:15 Yes chr2R:23011078-23042943 KLF3-AS1:16 Yes chr2R:23011078-23042943 KLF3-AS1:20 Yes chr2R:23011078-23042943 KLF3-AS1:21 Yes chr2R:23011078-23042943 lnc-TLR10-2:1 No - lnc-TMEM156-2:5 No - lnc-TMEM156-2:6 No - lnc-TMEM156-2:3 No - lnc-TMEM156-2:2 No - lnc-TMEM156-2:4 No - UGDH-AS1:7 Yes chr3L:6959554-6964758 UGDH-AS1:8 Yes chr3L:6959554-6964758 UGDH-AS1:9 Yes chr3L:6959554-6964758 UGDH-AS1:10 No - UGDH-AS1:11 No - lnc-UBE2K-2:9 No - lnc-UBE2K-2:10 No - lnc-UBE2K-2:11 No - lnc-UBE2K-2:12 No - lnc-UBE2K-2:13 No - lnc-UBE2K-2:14 No - lnc-UBE2K-2:15 No - lnc-UBE2K-2:16 No - lnc-SMIM14-7:2 No - UCHL1-AS1:6 Yes chr2L:2212738-2214211 UCHL1-AS1:4 Yes chr2L:2212738-2214211 UCHL1-AS1:5 Yes chr2L:2212738-2214211 lnc-PHOX2B-1:8 Yes chr3R:4659579-4712193 lnc-PHOX2B-1:7 No - LINC00682:9 No - LINC00682:10 No - LINC00682:11 No - lnc-BEND4-2:2 No - lnc-BEND4-2:3 No - lnc-BEND4-2:4 No - lnc-ATP8A1-1:6 No - lnc-ATP8A1-1:4 No - lnc-ATP8A1-1:5 No - lnc-GRXCR1-3:5 No - lnc-GUF1-9:1 No - lnc-ATP10D-4:1 No - lnc-ATP10D-4:2 No - lnc-ATP10D-4:3 No - lnc-ATP10D-4:4 No - lnc-ATP10D-4:5 No - lnc-TEC-2:3 No - lnc-TEC-2:2 No - lnc-TEC-2:4 No - lnc-TEC-2:5 No - lnc-OCIAD1-3:1 No - lnc-OCIAD1-3:2 No - lnc-OCIAD2-8:2 No - lnc-OCIAD2-8:3 No - lnc-OCIAD2-8:5 No - lnc-OCIAD2-8:6 No - lnc-OCIAD2-8:4 No - lnc-LRRC66-3:1 No - USP46-AS1:7 No - USP46-AS1:10 No - USP46-AS1:8 No - USP46-AS1:11 No - USP46-AS1:9 No - USP46-AS1:14 No - USP46-AS1:12 No - USP46-AS1:13 No - DANCR:13 No - DANCR:14 No - DANCR:15 No - DANCR:16 No - DANCR:17 No - lnc-RASL11B-2:5 No - lnc-RASL11B-2:6 No - lnc-RASL11B-2:7 No - SRD5A3-AS1:31 No - SRD5A3-AS1:32 No - SRD5A3-AS1:33 No - SRD5A3-AS1:29 No - SRD5A3-AS1:34 No - SRD5A3-AS1:30 No - lnc-TMEM165-1:2 No - lnc-NMU-3:5 No - lnc-NMU-3:4 Yes chr3L:15116737-15128029 lnc-NMU-3:6 No - lnc-NMU-3:7 No - lnc-NMU-3:8 No - lnc-NMU-3:9 No - lnc-PAICS-3:3 Yes chr2L:8445861-8449576 lnc-PAICS-3:4 No - lnc-PAICS-3:5 No - lnc-PAICS-3:6 No - lnc-PAICS-3:7 Yes chr3L:6911999-6914876 lnc-PPAT-3:1 No - lnc-PPAT-3:2 No - lnc-PPAT-3:3 No - lnc-PPAT-3:4 No - lnc-PPAT-3:5 No - IGFBP7-AS1:21 No - lnc-ADGRL3-2:4 No - lnc-ADGRL3-2:5 No - lnc-ADGRL3-2:6 No - lnc-ADGRL3-2:7 No - LINC02232:27 No - LINC02232:19 No - LINC02232:28 No - LINC02232:29 No - LINC02232:30 No - LINC02232:31 No - LINC02232:20 No - LINC02232:21 No - LINC02232:24 No - LINC02232:25 No - LINC02232:22 No - LINC02232:26 No - LINC02232:23 No - EPHA5-AS1:10 No - EPHA5-AS1:8 No - EPHA5-AS1:9 No - EPHA5-AS1:11 No - lnc-STAP1-14:1 No - UBA6-AS1:20 No - UBA6-AS1:23 No - UBA6-AS1:21 No - UBA6-AS1:24 No - UBA6-AS1:25 No - UBA6-AS1:22 No - lnc-STAP1-16:1 No - lnc-TMPRSS11E-5:1 No - lnc-TMPRSS11E-5:2 No - lnc-JCHAIN-3:1 No - lnc-JCHAIN-1:2 Yes chr3R:27229505-27239085 lnc-GRSF1-2:1 No - lnc-GRSF1-2:2 No - lnc-GRSF1-2:3 No - lnc-COX18-5:2 No - lnc-COX18-5:3 No - lnc-COX18-5:1 No - lnc-ALB-10:1 No - lnc-ALB-10:2 No - lnc-ALB-1:5 No - lnc-ALB-1:6 No - lnc-ALB-1:7 No - lnc-ALB-1:8 No - lnc-ALB-1:9 No - lnc-ALB-1:10 No - lnc-ALB-1:11 No - lnc-MTHFD2L-4:1 No - lnc-MTHFD2L-4:2 No - lnc-MTHFD2L-4:3 No - lnc-MTHFD2L-4:4 No - lnc-MTHFD2L-4:5 No - lnc-MTHFD2L-3:1 No - lnc-CXCL2-4:1 No - lnc-AREG-1:2 No - lnc-BTC-5:2 No - lnc-BTC-5:3 No - lnc-AREG-1:3 No - lnc-AREG-1:4 No - lnc-AREG-1:5 No - lnc-AREG-1:6 No - lnc-BTC-5:4 No - lnc-BTC-5:5 No - lnc-BTC-5:6 No - lnc-ART3-2:4 No - lnc-ART3-2:1 No - lnc-ART3-2:2 No - lnc-ART3-2:3 No - lnc-SCARB2-1:3 No - lnc-SCARB2-1:4 No - lnc-SOWAHB-9:1 No - lnc-SOWAHB-5:5 No - lnc-SOWAHB-5:6 No - lnc-SOWAHB-5:7 No - lnc-SOWAHB-5:8 No - lnc-SOWAHB-5:1 No - lnc-SOWAHB-5:2 No - lnc-SOWAHB-5:3 No - lnc-SEPT11-2:2 No - lnc-CCNI-1:5 No - lnc-CCNI-1:6 No - lnc-CCNI-1:4 Yes chr3R:31596642-31612664 lnc-CCNI-1:7 No - lnc-MRPL1-3:1 No - lnc-CNOT6L-4:1 Yes chr3R:8301440-8302770 LINC01094:17 No - LINC01094:15 No - LINC01094:18 No - LINC01094:16 No - LINC01094:19 No - LINC01094:20 No - LINC01094:21 No - LINC01094:22 No - LINC01094:23 No - LINC01094:24 No - LINC01094:25 No - LINC01094:26 No - LINC01094:27 No - lnc-PAQR3-1:3 No - lnc-PAQR3-1:4 No - LINC01088:17 No - LINC01088:16 No - LINC01088:18 No - LINC01088:19 No - LINC01088:20 Yes chr3L:9972312-9974023 LINC01088:21 Yes chr3L:9972312-9974023 LINC01088:22 Yes chr3L:9972312-9974023 LINC01088:23 Yes chr3L:9972312-9974023 LINC01088:24 Yes chr3L:9972312-9974023 LINC01088:25 Yes chr3L:9972312-9974023 LINC01088:26 No - LINC01088:27 Yes chr3L:9972312-9974023 LINC01088:28 Yes chr3L:9972312-9974023 LINC01088:30 No - LINC01088:29 Yes chr3L:9972312-9974023 LINC01088:31 Yes chr3L:9972312-9974023 LINC01088:32 No - LINC01088:33 Yes chr3L:9972312-9974023 LINC01088:34 Yes chr3L:9972312-9974023 LINC01088:35 Yes chr3L:9972312-9974023 LINC01088:36 Yes chr3L:9972312-9974023 LINC01088:37 Yes chr3L:9972312-9974023 LINC01088:38 Yes chr3L:9972312-9974023 LINC01088:39 Yes chr3L:9972312-9974023 lnc-ANTXR2-1:5 Yes chr3L:5882304-5884090 lnc-ANTXR2-1:6 Yes chr3L:5882304-5884090 lnc-ANTXR2-1:7 Yes chr3L:5882304-5884090 lnc-ANTXR2-1:3 Yes chr3L:5882304-5884090 lnc-ANTXR2-1:4 Yes chr3L:5882304-5884090 lnc-HNRNPD-3:4 No - lnc-HNRNPD-3:5 No - lnc-HNRNPD-3:6 No - lnc-HNRNPD-3:2 No - lnc-HNRNPD-3:3 No - lnc-ENOPH1-3:4 Yes chr3R:13634862-13646304 lnc-ENOPH1-3:5 Yes chr3R:13634862-13646304 lnc-ENOPH1-3:6 Yes chr3R:13634862-13646304 lnc-ENOPH1-3:7 Yes chr3R:13634862-13646304 lnc-ENOPH1-3:8 Yes chr3R:13634862-13646304 lnc-ENOPH1-3:9 Yes chr3R:13634862-13646304 THAP9-AS1:39 Yes chr2R:8893613-8898798 lnc-THAP9-4:1 Yes chr2R:8893613-8898798 lnc-THAP9-4:2 Yes chr2R:8893613-8898798 THAP9-AS1:22 No - THAP9-AS1:23 No - THAP9-AS1:27 Yes chr2R:8893613-8898798 THAP9-AS1:40 Yes chr2R:8893613-8898798 THAP9-AS1:28 Yes chr2R:8893613-8898798 THAP9-AS1:41 Yes chr2R:8893613-8898798 THAP9-AS1:42 Yes chr2R:8893613-8898798 THAP9-AS1:29 Yes chr2R:8893613-8898798 THAP9-AS1:30 Yes chr2R:8893613-8898798 THAP9-AS1:31 Yes chr2R:8893613-8898798 THAP9-AS1:32 Yes chr2R:8893613-8898798 THAP9-AS1:33 Yes chr2R:8893613-8898798 THAP9-AS1:34 Yes chr2R:8893613-8898798 THAP9-AS1:24 No - THAP9-AS1:35 Yes chr2R:8893613-8898798 THAP9-AS1:43 Yes chr2R:8893613-8898798 THAP9-AS1:36 Yes chr2R:8893613-8898798 THAP9-AS1:37 Yes chr2R:8893613-8898798 THAP9-AS1:38 Yes chr2R:8893613-8898798 THAP9-AS1:25 Yes chr2R:8893613-8898798 THAP9-AS1:26 Yes chr2R:8893613-8898798 lnc-MRPS18C-6:1 No - lnc-NKX6-1-5:3 Yes chr3L:8127762-8131675 lnc-NKX6-1-5:7 No - lnc-NKX6-1-5:4 Yes chr3L:8127762-8131675 lnc-NKX6-1-5:8 No - lnc-NKX6-1-5:5 No - lnc-NKX6-1-5:6 No - WDFY3-AS2:15 Yes chr2L:5907169-5922776 WDFY3-AS2:16 Yes chr2L:5907169-5922776 WDFY3-AS2:17 Yes chr2L:5907169-5922776 WDFY3-AS2:18 Yes chr2L:5907169-5922776 WDFY3-AS2:19 Yes chr2L:5907169-5922776 WDFY3-AS2:20 No - WDFY3-AS2:21 No - WDFY3-AS2:22 No - WDFY3-AS2:23 No - WDFY3-AS2:24 No - WDFY3-AS2:25 No - WDFY3-AS2:26 No - lnc-ARHGAP24-5:2 No - lnc-ARHGAP24-5:3 No - lnc-ARHGAP24-5:1 No - lnc-ARHGAP24-5:4 No - lnc-SPARCL1-1:5 No - lnc-SPARCL1-1:6 No - lnc-SPARCL1-1:7 No - lnc-SPARCL1-1:8 No - lnc-MEPE-2:1 No - lnc-ABCG2-3:2 No - lnc-ABCG2-3:3 No - lnc-ABCG2-3:4 No - lnc-ABCG2-3:5 No - lnc-ABCG2-3:1 No - lnc-HERC6-2:7 No - lnc-HERC6-2:8 No - lnc-PYURF-3:9 Yes chr3L:1313696-1318330 lnc-PYURF-3:10 Yes chr3L:1313696-1318330 lnc-PYURF-3:11 Yes chr3L:1313696-1318330 lnc-PYURF-3:12 No - lnc-PYURF-3:13 No - lnc-PYURF-2:7 Yes chr3L:1313696-1318330 lnc-PYURF-2:8 Yes chr3L:1313696-1318330 lnc-PYURF-2:9 Yes chr3L:1313696-1318330 lnc-TIGD2-2:2 No - lnc-TIGD2-2:6 No - lnc-TIGD2-2:10 No - lnc-TIGD2-2:8 No - lnc-TIGD2-5:3 No - lnc-TIGD2-5:2 No - lnc-TIGD2-5:5 No - lnc-TIGD2-5:4 No - lnc-TIGD2-5:6 No - lnc-TIGD2-7:1 No - lnc-MMRN1-12:1 No - lnc-MMRN1-12:2 No - lnc-MMRN1-12:3 No - lnc-MMRN1-12:4 No - lnc-MMRN1-12:5 No - lnc-MMRN1-12:8 No - lnc-MMRN1-12:9 No - lnc-MMRN1-12:10 No - lnc-MMRN1-12:20 No - lnc-MMRN1-12:21 No - lnc-MMRN1-12:22 No - lnc-MMRN1-12:23 No - lnc-MMRN1-12:24 No - lnc-HPGDS-1:3 No - lnc-PDHA2-2:2 Yes chr2R:15340472-15368300 lnc-PDHA2-2:3 Yes chr2R:15340472-15368300 lnc-PDHA2-2:4 No - lnc-PDHA2-2:5 No - lnc-RAP1GDS1-2:5 No - lnc-RAP1GDS1-2:6 No - lnc-RAP1GDS1-2:7 No - lnc-STPG2-2:1 Yes chr2R:6975285-6985712 lnc-STPG2-3:1 No - lnc-STPG2-3:2 No - lnc-RAP1GDS1-3:8 No - lnc-RAP1GDS1-3:9 No - lnc-RAP1GDS1-3:10 No - lnc-RAP1GDS1-3:12 No - lnc-RAP1GDS1-3:11 No - lnc-RAP1GDS1-3:13 No - lnc-RAP1GDS1-3:14 No - lnc-RAP1GDS1-3:15 No - lnc-RAP1GDS1-3:16 No - lnc-RAP1GDS1-3:17 No - lnc-RAP1GDS1-3:18 No - lnc-RAP1GDS1-3:19 No - lnc-METAP1-10:1 Yes chr3L:6664224-6665641 lnc-METAP1-10:2 Yes chr3L:6664224-6665641 lnc-EIF4E-4:1 No - lnc-METAP1-3:9 No - lnc-METAP1-3:12 No - lnc-DAPP1-8:2 No - lnc-DAPP1-8:1 Yes chr3R:14032371-14035041 lnc-DAPP1-2:6 No - lnc-DAPP1-2:7 No - lnc-DAPP1-2:8 No - lnc-DAPP1-2:9 No - lnc-DAPP1-2:10 No - lnc-DAPP1-2:11 No - lnc-SLC39A8-3:3 No - lnc-CISD2-11:2 No - lnc-CISD2-1:5 No - lnc-CISD2-1:6 No - lnc-CISD2-1:7 No - lnc-CISD2-1:8 No - lnc-CISD2-1:9 No - lnc-CISD2-1:10 No - lnc-CISD2-12:1 Yes chr3R:22981459-22998528 LINC02428:21 No - LINC02428:22 No - LINC02428:23 No - LINC02428:28 No - LINC02428:29 No - lnc-CXXC4-5:2 No - lnc-CXXC4-5:1 No - lnc-CXXC4-1:2 No - lnc-CXXC4-1:3 No - TET2-AS1:5 Yes chr3L:2786207-2879158 TET2-AS1:3 No - TET2-AS1:4 No - lnc-SGMS2-5:1 No - lnc-SGMS2-5:2 No - lnc-PAPSS1-2:1 No - lnc-LEF1-3:19 No - lnc-LEF1-3:16 No - lnc-LEF1-3:17 No - lnc-LEF1-3:13 No - lnc-LEF1-3:8 No - lnc-LEF1-3:14 No - lnc-LEF1-3:11 No - lnc-LEF1-3:9 No - lnc-LEF1-3:7 Yes chrX:18688538-18693042 lnc-LEF1-3:15 No - lnc-LEF1-3:10 No - LEF1-AS1:11 No - LEF1-AS1:12 No - LEF1-AS1:13 No - LEF1-AS1:14 No - LEF1-AS1:15 No - LEF1-AS1:16 No - LEF1-AS1:17 No - LEF1-AS1:18 No - LEF1-AS1:19 No - LEF1-AS1:20 No - LEF1-AS1:21 No - LEF1-AS1:22 No - LEF1-AS1:23 No - LEF1-AS1:24 No - LEF1-AS1:26 No - LEF1-AS1:25 No - LEF1-AS1:27 No - lnc-LEF1-1:12 No - lnc-LEF1-4:4 No - lnc-LEF1-4:5 No - lnc-LEF1-4:2 No - lnc-LEF1-4:3 No - RPL34-AS1:11 No - RPL34-AS1:12 No - RPL34-AS1:13 No - RPL34-AS1:8 No - RPL34-AS1:14 No - RPL34-AS1:15 No - RPL34-AS1:9 No - RPL34-AS1:10 No - SEC24B-AS1:13 No - SEC24B-AS1:14 No - SEC24B-AS1:7 Yes chr2R:9876232-9882357 SEC24B-AS1:9 Yes chr2R:9876232-9882357 SEC24B-AS1:8 Yes chr2R:9876232-9882357 SEC24B-AS1:15 No - SEC24B-AS1:16 No - SEC24B-AS1:10 Yes chr2R:9876232-9882357 SEC24B-AS1:20 No - SEC24B-AS1:17 No - SEC24B-AS1:19 No - SEC24B-AS1:11 Yes chr2R:9876232-9882357 SEC24B-AS1:12 Yes chr2R:9876232-9882357 SEC24B-AS1:21 No - SEC24B-AS1:18 No - lnc-CFI-1:2 No - lnc-CFI-1:4 No - lnc-CFI-1:5 No - lnc-CFI-1:6 No - lnc-CFI-1:3 No - PANCR:5 Yes chr3R:13298768-13302334 PANCR:6 No - PANCR:8 No - PANCR:7 No - lnc-FAM241A-6:1 No - lnc-FAM241A-6:2 No - lnc-TIFA-1:2 No - lnc-ZGRF1-2:1 No - lnc-ZGRF1-2:2 No - lnc-ANK2-9:1 Yes chr4:1035288-1053703 lnc-ANK2-10:1 No - lnc-ANK2-11:1 No - lnc-ANK2-12:1 Yes chr2R:12655954-12659341 lnc-ANK2-13:1 Yes chr2R:12655954-12659341 lnc-ANK2-13:2 No - lnc-ANK2-13:3 No - lnc-ARSJ-1:7 No - lnc-ARSJ-1:9 No - lnc-ARSJ-1:10 No - lnc-ARSJ-1:8 No - LINC02263:14 No - LINC02263:15 No - LINC02263:16 No - LINC02263:17 No - LINC02263:18 No - LINC02263:19 No - SNHG8:18 No - SNHG8:16 No - SNHG8:19 No - SNHG8:20 No - SNHG8:21 No - SNHG8:17 No - lnc-METTL14-3:11 No - lnc-METTL14-3:12 No - lnc-METTL14-3:13 No - lnc-METTL14-3:10 No - lnc-METTL14-3:14 No - lnc-SEC24D-1:13 No - lnc-SEC24D-1:14 No - lnc-SEC24D-1:15 No - lnc-SEC24D-1:11 No - lnc-SEC24D-1:12 No - lnc-SEC24D-1:10 Yes chr2L:8308427-8309961 lnc-USP53-6:4 Yes chr3L:5812135-5813093 lnc-USP53-6:5 Yes chr3L:5812135-5813093 lnc-USP53-6:6 Yes chr3L:5812135-5813093 lnc-USP53-6:7 Yes chr3L:5812135-5813093 lnc-USP53-6:8 Yes chr3L:5812135-5813093 lnc-USP53-6:9 Yes chr3L:5812135-5813093 lnc-USP53-6:10 Yes chr3L:5812135-5813093 lnc-USP53-6:13 No - lnc-EXOSC9-11:2 No - lnc-CCNA2-1:1 No - lnc-TRPC3-4:1 No - lnc-NUDT6-6:1 No - lnc-SPRY1-11:6 No - lnc-SPRY1-11:7 No - lnc-SPRY1-11:8 No - lnc-SPRY1-11:13 No - lnc-SPRY1-11:14 No - lnc-SPRY1-11:15 No - lnc-SPRY1-11:16 No - lnc-SPRY1-11:17 No - lnc-SPRY1-11:18 No - lnc-SPRY1-11:19 No - lnc-SPRY1-11:20 No - lnc-SPRY1-11:21 No - lnc-SPRY1-11:22 No - lnc-SPRY1-11:26 No - lnc-SPRY1-11:27 No - lnc-SPRY1-11:28 No - lnc-SPRY1-11:29 No - lnc-SPRY1-11:30 No - lnc-ANKRD50-2:4 No - lnc-ANKRD50-2:5 No - lnc-ANKRD50-2:6 No - lnc-ANKRD50-2:2 No - lnc-ANKRD50-2:3 No - lnc-FAT4-6:1 No - lnc-MFSD8-6:7 No - lnc-MFSD8-6:9 No - lnc-MFSD8-6:2 No - lnc-MFSD8-6:10 No - lnc-MFSD8-6:11 No - lnc-MFSD8-6:6 No - lnc-MFSD8-6:8 No - lnc-MFSD8-6:3 No - lnc-MFSD8-6:4 No - lnc-MFSD8-6:5 No - lnc-MFSD8-12:4 Yes chr3L:14037019-14043686 lnc-MFSD8-12:3 Yes chr3L:14037019-14043686 lnc-MFSD8-12:1 Yes chr3L:21512141-21515887 lnc-MFSD8-12:2 Yes chr3L:21512141-21515887 lnc-MFSD8-7:2 No - lnc-MFSD8-7:3 No - lnc-LARP1B-1:19 Yes chrX:15887567-15890109 lnc-LARP1B-1:21 Yes chrX:15887567-15890109 lnc-LARP1B-1:22 Yes chrX:15887567-15890109 lnc-LARP1B-1:23 Yes chrX:15887567-15890109 lnc-LARP1B-1:24 Yes chrX:15887567-15890109 lnc-LARP1B-1:20 Yes chrX:15887567-15890109 lnc-LARP1B-1:26 No - lnc-LARP1B-1:28 No - lnc-LARP1B-1:29 No - lnc-LARP1B-1:27 No - lnc-LARP1B-1:30 No - lnc-PGRMC2-2:8 No - lnc-PGRMC2-2:3 No - lnc-PGRMC2-2:6 No - lnc-PGRMC2-2:7 No - lnc-PGRMC2-2:4 No - lnc-PGRMC2-2:5 No - lnc-SCLT1-2:4 No - lnc-SCLT1-2:5 No - lnc-SCLT1-8:3 No - lnc-SCLT1-8:4 No - lnc-SCLT1-8:5 No - lnc-SCLT1-8:1 No - lnc-SCLT1-8:2 No - LINC02377:7 No - LINC02377:10 No - lnc-PABPC4L-21:3 No - lnc-PABPC4L-21:4 No - lnc-PABPC4L-21:5 No - lnc-PABPC4L-21:6 No - lnc-PABPC4L-21:7 No - lnc-PABPC4L-5:5 No - lnc-PABPC4L-5:6 No - lnc-PABPC4L-5:7 No - lnc-PABPC4L-5:8 No - lnc-PABPC4L-5:9 No - lnc-PABPC4L-5:10 No - lnc-PABPC4L-5:11 No - lnc-PABPC4L-6:1 No - lnc-PABPC4L-20:1 No - lnc-PABPC4L-20:2 No - lnc-PABPC4L-20:3 No - lnc-PABPC4L-20:4 No - LINC02485:8 No - LINC02485:9 No - LINC02485:10 No - LINC02511:6 No - LINC02511:7 No - lnc-NOCT-18:2 No - lnc-NAA15-4:1 No - lnc-NAA15-4:2 No - lnc-NAA15-4:3 No - lnc-NAA15-4:4 No - lnc-SETD7-3:22 No - lnc-SETD7-3:23 No - lnc-SETD7-3:24 No - lnc-SETD7-3:16 No - lnc-SETD7-3:18 No - lnc-SETD7-3:19 No - lnc-SETD7-3:17 No - lnc-SETD7-3:12 No - lnc-SETD7-3:13 No - lnc-SETD7-3:14 No - lnc-SETD7-3:20 No - lnc-SETD7-3:21 No - lnc-SETD7-3:15 No - lnc-RAB33B-4:2 No - lnc-SETD7-2:3 No - lnc-SETD7-2:4 No - lnc-MGST2-3:1 No - lnc-SCOC-3:1 No - SCOC-AS1:7 Yes chr3R:27273705-27274565 SCOC-AS1:8 Yes chr3R:27273705-27274565 SCOC-AS1:9 Yes chr3R:27273705-27274565 SCOC-AS1:10 Yes chr3R:27273705-27274565 SCOC-AS1:11 Yes chr3R:27273705-27274565 SCOC-AS1:6 Yes chr3R:27273705-27274565 lnc-ELMOD2-4:3 No - lnc-ELMOD2-4:4 No - lnc-ELMOD2-4:5 No - LINC02432:13 No - LINC02432:14 No - LINC02432:15 No - LINC02432:16 No - LINC02432:17 No - lnc-RNF150-7:1 No - lnc-INPP4B-2:8 No - lnc-INPP4B-2:4 No - lnc-INPP4B-2:5 No - lnc-INPP4B-2:6 No - lnc-INPP4B-2:7 No - SMARCA5-AS1:3 Yes chr2R:12636671-12640628 lnc-ANAPC10-7:1 No - lnc-ANAPC10-7:2 No - HHIP-AS1:7 No - HHIP-AS1:5 No - HHIP-AS1:9 No - HHIP-AS1:8 No - HHIP-AS1:6 No - lnc-ABCE1-3:2 Yes chr2R:17517261-17518186 lnc-ABCE1-3:3 Yes chr2R:17517261-17518186 SMAD1-AS2:4 Yes chr2L:3146056-3159643 SMAD1-AS2:5 Yes chr2L:3146056-3159643 LINC01095:11 No - LINC01095:12 No - LINC01095:13 No - LINC01095:14 No - LINC01095:10 No - lnc-PRMT9-1:2 No - lnc-PRMT9-1:3 No - lnc-TMEM184C-7:1 No - lnc-ARHGAP10-5:1 No - lnc-ARHGAP10-5:2 No - lnc-ARHGAP10-5:4 No - lnc-ARHGAP10-5:3 No - lnc-ARHGAP10-5:5 No - lnc-ARHGAP10-5:6 No - lnc-ARHGAP10-5:7 No - lnc-ARHGAP10-5:8 No - lnc-ARHGAP10-5:9 No - lnc-RPS3A-3:1 No - lnc-RPS3A-3:2 No - FAM160A1-DT:18 No - FAM160A1-DT:16 No - FAM160A1-DT:19 No - FAM160A1-DT:20 No - FAM160A1-DT:21 No - FAM160A1-DT:22 No - FAM160A1-DT:17 No - FAM160A1-DT:26 No - MIR4453HG:14 No - MIR4453HG:15 No - MIR4453HG:16 No - MIR4453HG:17 No - lnc-ARFIP1-1:4 No - lnc-ARFIP1-1:5 No - lnc-ARFIP1-1:6 No - lnc-ARFIP1-1:7 No - lnc-ARFIP1-1:8 No - lnc-RNF175-2:1 No - lnc-FGB-7:1 No - lnc-MAP9-2:3 No - lnc-CTSO-5:4 No - lnc-CTSO-5:1 No - lnc-CTSO-5:2 No - lnc-CTSO-5:3 No - lnc-CTSO-5:5 No - lnc-GLRB-9:1 No - lnc-GLRB-9:2 No - lnc-FAM198B-3:1 No - lnc-FAM198B-3:2 No - FAM198B-AS1:24 No - FAM198B-AS1:25 No - FAM198B-AS1:26 No - FAM198B-AS1:27 No - FAM198B-AS1:28 No - FAM198B-AS1:29 No - lnc-ETFDH-6:1 No - lnc-PPID-1:6 No - lnc-PPID-1:3 No - lnc-PPID-1:4 No - lnc-PPID-1:5 No - lnc-C4orf45-4:1 No - lnc-NPY5R-10:1 No - lnc-TMA16-4:1 Yes chr3L:9386827-9399227 lnc-TMA16-4:2 Yes chr3L:9386827-9399227 lnc-TMA16-4:3 Yes chr3L:9386827-9399227 lnc-TMA16-4:4 Yes chr3L:9386827-9399227 lnc-TMA16-4:5 Yes chr3L:9386827-9399227 lnc-GK3P-6:1 No - lnc-GK3P-1:1 No - lnc-GK3P-1:2 No - lnc-TLL1-4:1 No - lnc-TLL1-4:4 No - lnc-TLL1-4:5 No - lnc-TLL1-4:2 No - lnc-TLL1-4:3 No - lnc-ANXA10-6:1 No - lnc-PALLD-1:4 No - lnc-PALLD-1:5 No - lnc-PALLD-1:6 No - lnc-NEK1-3:1 Yes chr3L:16090454-16096151 lnc-NEK1-1:2 Yes chr3L:16090454-16096151 LINC02275:10 No - LINC02275:11 No - LINC02275:12 No - LINC02275:13 No - LINC02275:14 No - lnc-CLCN3-12:1 No - lnc-CLCN3-12:2 No - lnc-CLCN3-12:3 No - lnc-HMGB2-3:15 No - lnc-HMGB2-3:7 Yes chrX:18495067-18499986 lnc-HMGB2-3:14 No - lnc-HMGB2-3:11 Yes chrX:18495067-18499986 lnc-HMGB2-3:18 No - lnc-HMGB2-3:16 No - lnc-HMGB2-3:17 No - lnc-HMGB2-3:10 Yes chrX:18495067-18499986 lnc-HMGB2-3:9 Yes chrX:18495067-18499986 lnc-HMGB2-3:19 No - lnc-HMGB2-3:20 No - lnc-HMGB2-3:12 Yes chrX:18495067-18499986 lnc-HMGB2-3:13 Yes chrX:18495067-18499986 lnc-HMGB2-3:8 Yes chrX:18495067-18499986 lnc-HMGB2-15:15 Yes chrX:16787283-16789644 lnc-HMGB2-15:16 Yes chrX:16787283-16789644 lnc-HMGB2-15:12 Yes chrX:16787283-16789644 lnc-HMGB2-15:17 No - lnc-HMGB2-15:18 No - lnc-HMGB2-15:13 Yes chrX:16787283-16789644 lnc-HMGB2-15:14 Yes chrX:16787283-16789644 HAND2-AS1:67 No - HAND2-AS1:68 No - HAND2-AS1:69 No - HAND2-AS1:70 No - HAND2-AS1:71 No - HAND2-AS1:72 No - HAND2-AS1:73 No - HAND2-AS1:75 No - HAND2-AS1:76 No - HAND2-AS1:77 No - HAND2-AS1:78 No - HAND2-AS1:79 No - HAND2-AS1:80 No - HAND2-AS1:81 No - HAND2-AS1:82 No - HAND2-AS1:83 No - HAND2-AS1:84 No - HAND2-AS1:74 No - HAND2-AS1:85 No - HAND2-AS1:86 No - HAND2-AS1:87 No - HAND2-AS1:88 No - HAND2-AS1:89 No - HAND2-AS1:90 No - HAND2-AS1:91 No - HAND2-AS1:92 No - HAND2-AS1:93 No - HAND2-AS1:94 No - HAND2-AS1:95 No - HAND2-AS1:96 No - HAND2-AS1:97 No - HAND2-AS1:98 No - HAND2-AS1:99 No - HAND2-AS1:100 No - HAND2-AS1:101 No - HAND2-AS1:102 No - HAND2-AS1:103 No - HAND2-AS1:104 No - HAND2-AS1:105 No - LINC02268:10 No - LINC02268:11 No - LINC02268:12 No - LINC02268:13 No - LINC02268:14 No - lnc-CEP44-1:4 Yes chr2L:9426784-9427917 lnc-CEP44-1:6 Yes chr2L:9426784-9427917 lnc-CEP44-1:5 Yes chr2L:9426784-9427917 lnc-CEP44-1:7 Yes chr2L:9426784-9427917 lnc-CEP44-1:8 Yes chr2L:9426784-9427917 lnc-CEP44-1:9 Yes chr2L:9426784-9427917 lnc-CEP44-1:10 Yes chr2L:9426784-9427917 lnc-CEP44-1:11 No - lnc-CEP44-1:12 No - lnc-CEP44-1:13 No - lnc-CEP44-1:14 No - lnc-WDR17-5:1 No - lnc-ASB5-2:4 Yes chr3R:24228342-24230035 lnc-ASB5-2:3 Yes chr3R:24228342-24230035 lnc-AGA-24:7 No - lnc-AGA-24:8 No - lnc-AGA-24:1 No - lnc-AGA-24:9 No - lnc-AGA-24:10 No - lnc-AGA-24:11 No - lnc-AGA-24:2 No - lnc-AGA-24:3 No - lnc-NEIL3-6:1 No - lnc-NEIL3-6:2 No - lnc-NEIL3-6:3 No - lnc-NEIL3-6:4 No - lnc-NEIL3-6:5 No - lnc-NEIL3-6:7 No - lnc-NEIL3-6:8 No - lnc-NEIL3-6:9 No - lnc-NEIL3-6:10 No - lnc-NEIL3-6:11 No - lnc-TENM3-3:1 No - lnc-TENM3-3:2 No - lnc-TENM3-3:3 No - lnc-TENM3-3:4 No - lnc-TENM3-3:5 No - lnc-TENM3-3:7 No - lnc-TENM3-5:1 No - lnc-TENM3-5:2 No - lnc-TENM3-5:3 No - lnc-TENM3-5:4 No - lnc-TENM3-4:1 No - lnc-DCTD-65:20 No - lnc-DCTD-65:34 No - lnc-DCTD-65:12 No - lnc-DCTD-65:35 No - lnc-DCTD-65:36 No - lnc-DCTD-65:37 No - lnc-DCTD-65:13 No - lnc-DCTD-65:4 No - lnc-DCTD-65:1 No - lnc-DCTD-65:21 No - lnc-DCTD-65:22 No - lnc-DCTD-65:14 No - lnc-DCTD-65:15 No - lnc-DCTD-65:16 No - lnc-DCTD-65:25 No - lnc-DCTD-65:17 No - lnc-DCTD-65:26 No - lnc-DCTD-65:23 No - lnc-DCTD-65:27 No - lnc-DCTD-65:28 No - lnc-DCTD-65:2 No - lnc-DCTD-22:4 No - lnc-DCTD-22:3 No - lnc-DCTD-22:5 No - lnc-DCTD-22:1 No - lnc-DCTD-22:2 No - WWC2-AS2:4 No - lnc-DCTD-24:1 No - WWC2-AS2:6 No - WWC2-AS2:7 No - WWC2-AS2:8 No - lnc-CDKN2AIP-4:1 No - lnc-CDKN2AIP-4:2 No - lnc-CDKN2AIP-4:3 No - lnc-RWDD4-2:10 No - lnc-RWDD4-2:6 Yes chr3R:17796376-17798304 lnc-RWDD4-2:8 No - lnc-RWDD4-2:7 Yes chr3R:17796376-17798304 lnc-RWDD4-2:13 No - lnc-RWDD4-2:14 No - lnc-RWDD4-2:11 No - lnc-RWDD4-2:12 No - lnc-RWDD4-2:9 No - LINC02363:15 No - lnc-STOX2-10:1 No - LINC02363:16 No - LINC02363:17 No - LINC02363:18 No - LINC02363:19 No - LINC02362:31 No - LINC02362:32 No - LINC02362:33 No - LINC02362:34 No - LINC02362:35 No - lnc-PRIMPOL-7:4 No - lnc-PRIMPOL-7:5 No - lnc-PRIMPOL-7:6 No - lnc-PRIMPOL-7:7 No - lnc-PRIMPOL-7:8 No - LINC02427:14 No - LINC02427:15 No - LINC02427:16 No - LINC02427:17 No - lnc-IRF2-1:8 No - lnc-PRIMPOL-5:1 No - lnc-PRIMPOL-6:1 Yes chr3L:18878250-18890483 lnc-PRIMPOL-6:2 Yes chr3L:18878250-18890483 lnc-PRIMPOL-6:3 Yes chr3L:18878250-18890483 lnc-ACSL1-7:1 No - LINC01093:23 No - LINC01093:22 No - LINC01093:16 No - LINC01093:17 No - LINC01093:15 No - LINC01093:18 No - LINC01093:19 No - LINC01093:20 No - LINC01093:21 No - lnc-HELT-7:1 No - lnc-F11-1:2 No - lnc-F11-1:3 No - lnc-F11-1:4 No - lnc-FAT1-7:1 No - lnc-FAT1-7:2 No - lnc-FAT1-7:3 No - lnc-F11-2:5 No - lnc-F11-2:7 No - lnc-F11-2:6 No - lnc-F11-2:8 No - lnc-F11-2:9 No - lnc-F11-2:10 No - lnc-F11-2:11 No - lnc-F11-2:12 No - lnc-F11-2:13 No - lnc-F11-2:14 No - LINC01060:15 No - LINC01060:16 No - LINC01060:17 No - LINC01060:18 No - LINC01060:19 No - LINC01060:21 No - LINC01060:20 No - LINC01060:22 No - LINC01060:23 No - LINC01060:24 No - LINC01060:25 No - LINC01060:26 No - LINC01060:27 No - LINC01060:28 No - LINC01060:29 No - LINC01060:30 No - lnc-FRG2-14:4 No - lnc-FRG2-14:5 No - lnc-FRG2-14:1 No - lnc-FRG2-14:2 No - lnc-FRG2-14:3 No - lnc-FRG2-13:4 No - lnc-FRG2-13:5 No - lnc-FRG2-13:6 No - lnc-FRG2-13:2 No - lnc-FRG2-13:3 No - FRG1-DT:16 No - FRG1-DT:17 No - FRG1-DT:18 No - FRG1-DT:19 No - FRG1-DT:20 No - FRG1-DT:21 No - FRG1-DT:22 No - FRG1-DT:23 No - lnc-PLEKHG4B-1:2 No - lnc-SLC9A3-6:1 No - lnc-CCDC127-1:7 Yes chr2R:19391863-19395971 lnc-CCDC127-1:8 Yes chr2R:19391863-19395971 lnc-CCDC127-1:4 No - lnc-CCDC127-1:5 No - lnc-CCDC127-1:6 No - lnc-TPPP-2:3 No - lnc-TPPP-2:7 No - lnc-TPPP-2:4 No - lnc-TPPP-2:8 No - lnc-TPPP-2:5 No - lnc-TPPP-2:6 No - lnc-SLC12A7-4:7 No - lnc-SLC12A7-4:8 No - lnc-SLC12A7-4:9 No - lnc-SLC12A7-4:10 No - lnc-SLC12A7-5:14 No - lnc-SLC12A7-5:15 No - lnc-SLC12A7-5:16 No - lnc-SLC12A7-5:17 No - lnc-SLC12A7-5:18 No - lnc-SLC6A18-2:3 No - lnc-SLC6A18-2:4 No - lnc-SLC6A18-2:5 No - lnc-SLC6A18-2:6 No - lnc-SLC6A18-2:7 No - LINC01511:6 No - LINC01511:7 No - LINC01511:8 No - LINC01511:9 No - lnc-SLC6A3-4:2 No - lnc-SLC6A3-4:3 No - lnc-SLC6A18-5:1 No - lnc-SLC6A18-6:1 Yes chrX:9571537-9579987 lnc-SLC6A18-6:2 Yes chrX:9571537-9579987 lnc-SLC6A18-6:3 Yes chrX:9571537-9579987 lnc-NDUFS6-19:1 No - lnc-NDUFS6-5:8 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-IRX2-10:2 No - lnc-IRX2-10:3 No - lnc-MED10-6:7 No - lnc-MED10-6:9 No - lnc-MED10-6:10 No - lnc-MED10-6:5 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-MED10-6:6 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-MED10-6:11 No - lnc-MED10-6:8 No - lnc-UBE2QL1-4:1 No - lnc-UBE2QL1-4:2 No - lnc-UBE2QL1-4:3 No - LINC01018:17 No - LINC01018:18 No - LINC01018:19 No - LINC01018:20 No - LINC01018:21 No - LINC01018:22 No - LINC01018:23 No - LINC01018:24 No - LINC01018:25 No - LINC01018:26 No - LINC02102:10 Yes chrX:8560322-8570159 LINC02102:11 Yes chrX:8560322-8570159 LINC02102:12 Yes chrX:8560322-8570159 LINC02102:13 No - lnc-PAPD7-2:6 No - lnc-PAPD7-2:7 No - lnc-PAPD7-2:8 No - lnc-PAPD7-2:9 No - lnc-PAPD7-2:10 No - lnc-PAPD7-2:11 No - LINC02226:14 No - LINC02226:15 No - LINC02226:16 No - LINC02226:20 No - MIR4458HG:8 No - MIR4458HG:9 No - MIR4458HG:10 No - MIR4458HG:11 No - MIR4458HG:12 No - SNHG18:7 No - SNHG18:9 No - SNHG18:10 No - SNHG18:8 No - SNHG18:6 No - SNHG18:11 No - LINC02112:17 No - LINC02112:18 No - LINC02112:19 No - LINC02112:20 No - lnc-CMBL-5:2 Yes chr2R:12174802-12177516 lnc-CMBL-5:3 No - lnc-CMBL-1:6 No - lnc-CMBL-1:7 No - lnc-CMBL-1:8 No - lnc-CMBL-1:9 No - lnc-CMBL-1:4 Yes chr3L:2367843-2371939 lnc-CMBL-1:5 No - lnc-CMBL-8:2 No - lnc-DAP-11:2 No - lnc-DAP-11:3 No - lnc-ANKRD33B-15:1 No - lnc-ANKRD33B-15:2 No - LINC01194:6 No - LINC01194:7 No - LINC01194:9 No - LINC01194:10 No - LINC01194:11 No - LINC01194:8 No - LINC01194:12 No - lnc-TRIO-1:2 No - lnc-TRIO-1:3 No - lnc-TRIO-10:1 No - lnc-FAM105A-10:1 Yes chr3L:995982-1034875 lnc-FAM105A-9:1 Yes chr3L:995982-1034875 lnc-ANKH-1:7 No - lnc-ANKH-1:8 No - lnc-ANKH-1:9 No - lnc-ANKH-1:5 No - lnc-ANKH-1:6 No - lnc-ANKH-1:10 No - lnc-FBXL7-2:3 Yes chr2R:20727829-20730610 lnc-FBXL7-2:2 Yes chr2R:20727829-20730610 lnc-FBXL7-10:2 No - lnc-FBXL7-10:3 No - lnc-FBXL7-10:6 No - lnc-FBXL7-10:5 No - BASP1-AS1:23 No - lnc-MYO10-22:1 No - BASP1-AS1:31 No - BASP1-AS1:24 No - BASP1-AS1:25 No - BASP1-AS1:26 No - BASP1-AS1:17 No - BASP1-AS1:18 No - BASP1-AS1:28 No - BASP1-AS1:19 No - BASP1-AS1:20 No - BASP1-AS1:27 No - BASP1-AS1:29 No - LINC02217:30 No - LINC02217:31 No - LINC02217:32 No - LINC02217:33 No - LINC02217:34 No - LINC02217:35 No - lnc-CDH18-17:2 No - lnc-CDH18-17:3 No - lnc-CDH18-17:4 No - lnc-CDH18-17:5 No - lnc-CDH18-17:6 No - LINC02100:22 No - LINC02100:18 No - LINC02100:23 No - LINC02100:24 No - LINC02100:19 No - LINC02100:20 No - LINC02100:25 No - LINC02100:26 No - PURPL:37 No - PURPL:38 No - PURPL:39 No - PURPL:40 No - PURPL:41 No - PURPL:42 No - PURPL:43 No - PURPL:44 No - PURPL:45 No - lnc-CDH6-19:1 No - lnc-CDH6-19:2 No - lnc-CDH6-19:3 No - lnc-CDH6-19:4 No - lnc-PDZD2-1:5 No - lnc-PDZD2-1:6 No - lnc-PDZD2-1:7 No - lnc-PDZD2-4:1 No - lnc-ADAMTS12-6:3 No - lnc-ADAMTS12-6:4 No - lnc-ADAMTS12-2:6 Yes chr2L:12103751-12107170 lnc-ADAMTS12-6:5 No - lnc-RAD1-7:1 No - lnc-RAI14-3:1 No - lnc-RAI14-3:3 No - lnc-RAI14-3:2 No - lnc-RAI14-3:4 No - lnc-RAD1-6:1 No - lnc-RAD1-3:3 No - lnc-RAD1-3:6 No - lnc-RAD1-3:7 No - lnc-RAD1-3:4 No - lnc-RAD1-3:5 No - lnc-RAD1-5:6 No - lnc-RAD1-5:5 No - lnc-DNAJC21-3:2 No - lnc-DNAJC21-3:3 No - lnc-DNAJC21-3:4 No - lnc-SLC1A3-2:1 No - lnc-RANBP3L-5:1 Yes chr2L:9333567-9341925 lnc-RANBP3L-5:2 Yes chr2L:9333567-9341925 lnc-RANBP3L-5:3 Yes chr2L:9333567-9341925 NIPBL-DT:15 No - NIPBL-DT:16 No - NIPBL-DT:17 No - NIPBL-DT:18 No - NIPBL-DT:19 No - lnc-WDR70-5:3 No - lnc-WDR70-5:4 No - lnc-WDR70-7:2 No - lnc-WDR70-7:3 No - lnc-WDR70-7:4 No - lnc-WDR70-7:5 No - lnc-WDR70-7:6 No - lnc-WDR70-7:9 No - lnc-WDR70-7:10 No - lnc-WDR70-7:11 No - lnc-WDR70-7:12 No - lnc-WDR70-7:13 No - lnc-WDR70-7:20 No - lnc-WDR70-7:21 No - lnc-LIFR-1:5 Yes chr2R:16031930-16047243 lnc-LIFR-1:7 Yes chr2R:16031930-16047243 lnc-LIFR-1:8 Yes chr2R:16031930-16047243 lnc-LIFR-1:4 No - lnc-LIFR-1:6 No - LIFR-AS1:9 No - LIFR-AS1:10 No - LIFR-AS1:12 No - LIFR-AS1:13 No - LIFR-AS1:11 No - LIFR-AS1:14 No - lnc-RICTOR-54:7 No - lnc-RICTOR-54:8 No - lnc-RICTOR-54:9 No - lnc-RICTOR-54:10 No - lnc-RICTOR-54:11 No - lnc-RICTOR-54:12 No - lnc-RICTOR-54:13 No - lnc-OSMR-2:1 No - lnc-OSMR-2:2 No - lnc-OSMR-2:3 No - lnc-OSMR-3:1 Yes chr3L:16712126-16724575 LINC02104:14 No - LINC02104:15 No - LINC02104:16 No - LINC02104:17 No - LINC02104:18 No - lnc-PTGER4-8:1 No - lnc-PTGER4-6:1 No - lnc-TTC33-6:1 No - lnc-TTC33-5:7 No - lnc-TTC33-5:3 No - lnc-TTC33-5:6 No - lnc-TTC33-5:1 No - lnc-TTC33-5:4 No - lnc-TTC33-5:2 No - lnc-TTC33-5:5 No - lnc-CARD6-5:1 Yes chrX:1375536-1378896 lnc-CARD6-5:2 No - lnc-C5orf51-6:1 No - lnc-SELENOP-6:2 No - lnc-ZNF131-4:2 No - lnc-ZNF131-4:3 No - lnc-ZNF131-4:4 No - lnc-ZNF131-4:5 No - lnc-ZNF131-4:7 No - lnc-ZNF131-4:6 No - lnc-ZNF131-4:8 No - lnc-ZNF131-4:9 No - lnc-ANXA2R-1:31 No - lnc-ANXA2R-1:5 No - lnc-ANXA2R-1:6 No - lnc-ANXA2R-1:30 No - lnc-ZNF131-11:1 No - lnc-ANXA2R-1:9 No - lnc-ANXA2R-1:10 No - lnc-ZNF131-7:2 No - lnc-ANXA2R-1:12 No - lnc-ZNF131-1:7 No - lnc-ZNF131-1:8 No - lnc-ZNF131-1:9 No - lnc-ZNF131-1:10 No - lnc-ZNF131-1:11 No - lnc-ZNF131-1:12 No - lnc-ZNF131-1:13 No - lnc-ZNF131-1:14 No - lnc-ZNF131-1:15 No - lnc-ZNF131-1:16 No - lnc-ZNF131-1:17 No - lnc-ZNF131-1:18 No - lnc-ZNF131-1:19 No - lnc-ZNF131-1:22 No - lnc-ZNF131-1:20 No - lnc-ZNF131-1:23 No - lnc-ZNF131-1:21 No - lnc-ZNF131-1:24 No - lnc-ANXA2R-1:11 No - lnc-NIM1K-9:1 No - lnc-NNT-3:3 No - lnc-NNT-3:4 No - lnc-NNT-3:5 No - lnc-NNT-2:5 No - lnc-NNT-2:6 No - lnc-NNT-2:8 No - lnc-NNT-2:7 No - NNT-AS1:11 No - NNT-AS1:17 No - NNT-AS1:13 No - NNT-AS1:14 No - NNT-AS1:18 No - NNT-AS1:19 No - NNT-AS1:12 No - NNT-AS1:20 No - NNT-AS1:15 No - NNT-AS1:16 No - MRPS30-DT:42 Yes chrX:15786047-15788288 MRPS30-DT:43 Yes chrX:15786047-15788288 MRPS30-DT:44 Yes chrX:15786047-15788288 MRPS30-DT:53 No - MRPS30-DT:54 No - MRPS30-DT:55 No - MRPS30-DT:56 No - MRPS30-DT:57 No - MRPS30-DT:58 No - MRPS30-DT:59 No - MRPS30-DT:45 Yes chrX:15786047-15788288 MRPS30-DT:39 Yes chrX:15786047-15788288 MRPS30-DT:40 Yes chrX:15786047-15788288 MRPS30-DT:60 No - MRPS30-DT:61 No - MRPS30-DT:62 No - MRPS30-DT:63 No - MRPS30-DT:64 No - MRPS30-DT:41 Yes chrX:15786047-15788288 MRPS30-DT:46 Yes chrX:15786047-15788288 lnc-PARP8-6:1 Yes chr2L:8083420-8116531 lnc-EMB-4:8 No - lnc-EMB-4:12 No - lnc-EMB-4:9 No - lnc-EMB-4:10 No - lnc-EMB-4:13 No - lnc-EMB-4:11 No - lnc-MOCS2-1:3 Yes chr2R:15248784-15262873 lnc-MOCS2-1:4 Yes chr2R:15248784-15262873 lnc-FST-6:3 No - lnc-FST-6:1 No - lnc-FST-6:4 No - lnc-FST-6:5 No - lnc-FST-6:2 No - LINC01033:7 No - LINC01033:8 No - LINC01033:9 No - LINC01033:10 No - LINC01033:11 No - LINC01033:12 No - LINC01033:14 No - LINC01033:15 No - LINC01033:16 No - lnc-ESM1-7:1 No - lnc-ESM1-4:4 No - lnc-ESM1-4:5 No - lnc-ESM1-3:3 No - lnc-ESM1-3:4 No - lnc-ESM1-3:5 No - lnc-IL31RA-1:2 No - lnc-IL31RA-1:3 No - lnc-IL31RA-1:6 No - lnc-IL31RA-1:7 No - lnc-IL31RA-1:8 No - lnc-IL31RA-1:9 No - lnc-IL31RA-1:10 No - lnc-IL31RA-4:1 No - lnc-IL31RA-4:2 No - lnc-IL31RA-4:3 No - lnc-IL31RA-4:4 No - lnc-IL31RA-5:1 No - lnc-C5orf67-6:1 No - lnc-MAP3K1-6:1 No - lnc-C5orf67-3:1 No - lnc-C5orf67-4:1 No - lnc-SETD9-5:1 Yes chr2R:7493806-7496466 lnc-SETD9-5:2 Yes chr2R:7493806-7496466 lnc-MIER3-6:7 No - lnc-MIER3-6:5 No - lnc-MIER3-6:3 No - lnc-MIER3-6:2 No - lnc-MIER3-6:4 No - lnc-MIER3-6:6 No - lnc-SETD9-6:1 No - lnc-GPBP1-3:8 No - lnc-GPBP1-3:9 No - lnc-GPBP1-3:10 No - lnc-GPBP1-3:11 No - lnc-GPBP1-3:12 No - lnc-GPBP1-9:1 No - lnc-GPBP1-9:2 No - lnc-GPBP1-8:1 No - lnc-GPBP1-8:2 No - lnc-GAPT-9:1 No - lnc-GAPT-9:2 No - lnc-GAPT-9:3 No - lnc-GAPT-9:4 No - lnc-GAPT-9:5 No - lnc-PLK2-3:3 No - lnc-PLK2-3:4 No - lnc-PLK2-3:5 No - lnc-PLK2-3:1 No - lnc-PLK2-3:2 No - PART1:15 Yes chrX:3176440-3343767 PART1:16 Yes chrX:3176440-3343767 PART1:17 Yes chrX:3176440-3343767 PART1:18 Yes chrX:3176440-3343767 PART1:19 Yes chrX:3176440-3343767 PART1:20 No - PART1:21 No - lnc-NDUFAF2-7:2 No - lnc-NDUFAF2-7:3 No - lnc-NDUFAF2-7:4 No - SMIM15-AS1:19 No - SMIM15-AS1:20 No - SMIM15-AS1:21 No - SMIM15-AS1:22 No - SMIM15-AS1:23 No - SMIM15-AS1:25 No - SMIM15-AS1:26 No - SMIM15-AS1:28 No - SMIM15-AS1:29 No - SMIM15-AS1:30 No - SMIM15-AS1:31 No - lnc-ZSWIM6-5:1 No - lnc-ZSWIM6-5:2 No - lnc-ZSWIM6-5:3 No - lnc-ZSWIM6-5:4 No - lnc-DIMT1-6:1 No - lnc-DIMT1-6:2 No - lnc-DIMT1-6:3 No - lnc-ADAMTS6-4:1 No - lnc-ADAMTS6-4:2 No - lnc-CWC27-7:1 No - lnc-CWC27-8:1 No - lnc-CWC27-8:2 No - lnc-PPWD1-2:1 No - lnc-SGTB-1:4 No - lnc-SGTB-1:5 No - lnc-SGTB-2:3 Yes chr2L:9912911-9915044 lnc-SGTB-4:6 No - lnc-SGTB-4:4 No - lnc-SGTB-4:7 No - lnc-SGTB-4:8 No - lnc-SGTB-4:5 No - MAST4-AS1:6 Yes chr3L:15566013-15576313 MAST4-AS1:7 Yes chr3L:15566013-15576313 MAST4-AS1:8 Yes chr3L:15566013-15576313 MAST4-AS1:4 Yes chr3L:15566013-15576313 MAST4-AS1:3 Yes chr3L:15566013-15576313 MAST4-AS1:5 Yes chr3L:15566013-15576313 lnc-MAST4-6:1 No - lnc-MAST4-6:2 No - lnc-MAST4-6:3 No - lnc-MAST4-6:4 No - lnc-MAST4-6:5 No - lnc-MAST4-5:10 No - lnc-MAST4-5:12 No - lnc-MAST4-5:13 No - lnc-MAST4-5:11 No - lnc-MAST4-5:14 No - lnc-MAST4-5:15 No - lnc-MAST4-5:16 No - lnc-CD180-17:1 No - lnc-CD180-17:2 No - lnc-CD180-18:1 No - lnc-CCDC125-6:23 No - lnc-CCDC125-6:20 No - lnc-CCDC125-6:24 No - lnc-CCDC125-6:25 No - lnc-CCDC125-6:22 No - lnc-CCDC125-6:14 No - lnc-CCDC125-6:19 No - lnc-CCDC125-6:15 No - lnc-CCDC125-6:17 No - lnc-CCDC125-6:16 No - lnc-CCDC125-6:18 No - LINC02198:18 No - LINC02198:19 No - LINC02198:20 No - LINC02198:21 No - lnc-CCDC125-23:1 No - lnc-CCDC125-23:2 No - lnc-CCDC125-1:4 No - lnc-CCDC125-1:5 No - lnc-CCDC125-1:6 No - lnc-CCDC125-1:7 No - lnc-GTF2H2-10:1 Yes chr2L:13371427-13373890 lnc-PTCD2-9:1 No - LINC02056:27 Yes chr3L:6200473-6203776 LINC02056:28 Yes chr3L:6200473-6203776 lnc-TNPO1-2:1 No - LINC02056:29 Yes chr3L:6200473-6203776 LINC02056:30 Yes chr3L:6200473-6203776 LINC02056:31 Yes chr3L:6200473-6203776 LINC02056:32 Yes chr3L:6200473-6203776 lnc-ZNF366-6:3 Yes chr3R:9516007-9527237 lnc-ZNF366-6:4 Yes chr3R:9516007-9527237 lnc-ZNF366-6:7 No - lnc-ZNF366-6:5 Yes chr3R:9516007-9527237 lnc-ZNF366-18:1 Yes chr3R:9516007-9527237 lnc-ZNF366-6:8 No - lnc-FOXD1-3:2 No - lnc-TMEM174-1:8 No - lnc-TMEM174-1:9 No - lnc-TMEM174-1:10 No - lnc-TMEM174-1:11 No - lnc-TMEM174-1:12 No - lnc-FOXD1-3:3 No - lnc-FOXD1-3:4 No - lnc-FOXD1-3:5 No - lnc-FOXD1-3:8 No - lnc-FOXD1-3:6 No - lnc-FOXD1-7:2 No - lnc-FOXD1-7:1 No - LINC01331:3 No - LINC01331:4 No - LINC01331:5 No - LINC01331:2 No - LINC01331:6 No - lnc-NSA2-6:2 No - LINC01336:8 No - LINC01336:5 No - LINC01336:6 No - lnc-NSA2-1:5 No - lnc-NSA2-1:6 No - lnc-NSA2-1:8 No - lnc-NSA2-1:7 No - lnc-NSA2-1:9 No - LINC01336:9 No - LINC01336:10 No - LINC01336:7 No - lnc-HMGCR-4:1 No - lnc-COL4A3BP-1:3 Yes chr3R:23733324-23750992 lnc-COL4A3BP-1:2 Yes chr3R:23733324-23750992 lnc-POC5-4:2 No - lnc-ANKDD1B-5:2 No - lnc-ANKDD1B-5:3 No - lnc-ANKDD1B-5:4 No - lnc-ANKDD1B-5:5 No - lnc-F2RL2-1:2 No - lnc-F2RL2-1:3 No - ZBED3-AS1:28 No - ZBED3-AS1:27 No - ZBED3-AS1:29 No - ZBED3-AS1:31 No - ZBED3-AS1:32 No - ZBED3-AS1:30 No - ZBED3-AS1:33 No - ZBED3-AS1:34 No - ZBED3-AS1:35 No - ZBED3-AS1:36 No - ZBED3-AS1:37 No - ZBED3-AS1:38 No - ZBED3-AS1:39 No - ZBED3-AS1:40 No - ZBED3-AS1:41 No - ZBED3-AS1:42 No - ZBED3-AS1:43 No - ZBED3-AS1:44 No - ZBED3-AS1:45 No - ZBED3-AS1:46 No - ZBED3-AS1:47 No - ZBED3-AS1:49 No - ZBED3-AS1:50 No - ZBED3-AS1:51 No - ZBED3-AS1:52 No - ZBED3-AS1:53 No - ZBED3-AS1:54 No - ZBED3-AS1:48 No - ZBED3-AS1:55 No - ZBED3-AS1:56 No - ZBED3-AS1:58 No - ZBED3-AS1:57 No - SCAMP1-AS1:7 No - SCAMP1-AS1:8 No - SCAMP1-AS1:10 No - SCAMP1-AS1:11 No - SCAMP1-AS1:12 No - SCAMP1-AS1:9 No - lnc-HOMER1-8:1 Yes chr3R:22211824-22217415 lnc-HOMER1-8:2 Yes chr3R:22211824-22217415 lnc-SPZ1-1:3 No - lnc-SPZ1-1:4 No - lnc-SPZ1-1:5 No - lnc-SPZ1-1:6 No - lnc-SPZ1-1:7 No - lnc-SPZ1-1:8 No - lnc-SPZ1-1:9 No - lnc-ANKRD34B-7:1 No - lnc-ANKRD34B-6:1 No - lnc-ANKRD34B-2:6 Yes chr2R:21481927-21487107 lnc-ANKRD34B-2:12 Yes chr2R:21481927-21487107 lnc-ANKRD34B-2:13 Yes chr2R:21481927-21487107 lnc-ANKRD34B-2:8 Yes chr2R:21481927-21487107 lnc-ANKRD34B-2:5 No - lnc-ANKRD34B-2:7 Yes chr2R:21481927-21487107 lnc-ANKRD34B-2:9 Yes chr2R:21481927-21487107 lnc-ANKRD34B-2:10 No - lnc-ANKRD34B-2:11 No - RASGRF2-AS1:9 No - RASGRF2-AS1:10 No - RASGRF2-AS1:11 No - CKMT2-AS1:27 No - CKMT2-AS1:29 No - CKMT2-AS1:22 No - CKMT2-AS1:23 Yes chr2R:22825093-22828903 CKMT2-AS1:28 Yes chr2R:22825093-22828903 CKMT2-AS1:17 Yes chr2R:22825093-22828903 CKMT2-AS1:18 Yes chr2R:22825093-22828903 CKMT2-AS1:15 Yes chr2R:22825093-22828903 CKMT2-AS1:19 Yes chr2R:22825093-22828903 CKMT2-AS1:24 Yes chr2R:22825093-22828903 CKMT2-AS1:20 Yes chr2R:22825093-22828903 CKMT2-AS1:21 Yes chr2R:22825093-22828903 CKMT2-AS1:16 Yes chr2R:22825093-22828903 CKMT2-AS1:25 No - CKMT2-AS1:26 No - lnc-ATG10-7:1 Yes chr3R:18192494-18199595 lnc-SSBP2-6:1 No - LINC01338:5 No - LINC01338:6 No - lnc-TMEM167A-3:3 No - lnc-TMEM167A-3:4 No - lnc-TMEM167A-3:5 No - lnc-TMEM167A-3:6 No - lnc-TMEM167A-3:2 No - lnc-VCAN-1:7 No - lnc-VCAN-1:8 No - lnc-VCAN-1:9 No - lnc-VCAN-1:10 No - lnc-VCAN-1:11 No - lnc-VCAN-1:15 No - lnc-VCAN-1:16 No - lnc-VCAN-1:17 No - lnc-VCAN-1:19 No - lnc-VCAN-1:20 No - lnc-VCAN-1:21 No - lnc-VCAN-1:22 No - lnc-VCAN-1:23 No - lnc-VCAN-1:24 No - lnc-VCAN-1:18 No - lnc-RASA1-27:1 No - lnc-RASA1-27:2 No - lnc-TMEM161B-13:1 No - lnc-TMEM161B-13:2 No - lnc-RASA1-28:1 No - lnc-TMEM161B-13:3 No - lnc-TMEM161B-13:4 No - lnc-TMEM161B-12:1 No - TMEM161B-AS1:50 Yes chr3L:11109690-11112117 TMEM161B-AS1:51 Yes chr3L:11109690-11112117 TMEM161B-AS1:52 Yes chr3L:11109690-11112117 TMEM161B-AS1:53 Yes chr3L:11109690-11112117 TMEM161B-AS1:54 Yes chr3L:11109690-11112117 TMEM161B-AS1:55 Yes chr3L:11109690-11112117 TMEM161B-AS1:56 Yes chr3L:11109690-11112117 TMEM161B-AS1:57 Yes chr3L:11109690-11112117 TMEM161B-AS1:59 Yes chr3L:11109690-11112117 TMEM161B-AS1:60 Yes chr3L:11109690-11112117 TMEM161B-AS1:58 Yes chr3L:11109690-11112117 TMEM161B-AS1:61 Yes chr3L:11109690-11112117 TMEM161B-AS1:64 Yes chr3L:11109690-11112117 TMEM161B-AS1:62 Yes chr3L:11109690-11112117 TMEM161B-AS1:65 Yes chr3L:11109690-11112117 TMEM161B-AS1:66 Yes chr3L:11109690-11112117 TMEM161B-AS1:67 Yes chr3L:11109690-11112117 TMEM161B-AS1:68 Yes chr3L:11109690-11112117 TMEM161B-AS1:63 Yes chr3L:11109690-11112117 TMEM161B-AS1:69 No - TMEM161B-AS1:70 No - TMEM161B-AS1:71 No - TMEM161B-AS1:72 No - LINC00461:51 No - LINC00461:50 No - LINC00461:26 No - LINC00461:52 No - LINC00461:53 No - LINC00461:34 No - LINC00461:35 No - LINC00461:49 No - LINC00461:27 No - LINC00461:28 No - LINC00461:36 No - LINC00461:40 No - LINC00461:37 No - LINC00461:29 No - LINC00461:43 No - LINC00461:44 No - LINC00461:42 No - LINC00461:24 No - LINC00461:38 No - LINC00461:32 No - LINC00461:25 No - LINC00461:48 No - LINC00461:41 No - LINC00461:30 No - LINC00461:45 No - LINC00461:39 No - LINC00461:23 No - LINC00461:31 No - LINC00461:46 No - LINC00461:33 No - LINC00461:47 No - lnc-RASA1-6:2 No - lnc-RASA1-6:3 No - lnc-RASA1-6:4 No - lnc-RASA1-6:6 Yes chr2R:9913496-9958858 lnc-RASA1-29:1 No - MEF2C-AS1:25 Yes chr2R:9913496-9958858 MEF2C-AS1:28 Yes chr2R:9913496-9958858 MEF2C-AS1:29 Yes chr2R:9913496-9958858 MEF2C-AS1:26 Yes chr2R:9913496-9958858 MEF2C-AS1:30 Yes chr2R:9913496-9958858 MEF2C-AS1:27 Yes chr2R:9913496-9958858 MEF2C-AS1:32 Yes chr2R:9913496-9958858 MEF2C-AS1:33 Yes chr2R:9913496-9958858 MEF2C-AS1:36 Yes chr2R:9913496-9958858 MEF2C-AS1:37 Yes chr2R:9913496-9958858 MEF2C-AS1:38 Yes chr2R:9913496-9958858 MEF2C-AS1:39 Yes chr2R:9913496-9958858 MEF2C-AS1:34 Yes chr2R:9913496-9958858 MEF2C-AS1:40 Yes chr2R:9913496-9958858 MEF2C-AS1:35 Yes chr2R:9913496-9958858 MEF2C-AS1:41 Yes chr2R:9913496-9958858 MEF2C-AS1:44 Yes chr2R:9913496-9958858 MEF2C-AS1:45 Yes chr2R:9913496-9958858 MEF2C-AS1:46 Yes chr2R:9913496-9958858 MEF2C-AS1:42 Yes chr2R:9913496-9958858 MEF2C-AS1:47 Yes chr2R:9913496-9958858 MEF2C-AS1:43 Yes chr2R:9913496-9958858 MEF2C-AS1:48 Yes chr2R:9913496-9958858 MEF2C-AS1:49 No - MEF2C-AS1:50 No - lnc-POLR3G-9:1 No - lnc-ARRDC3-2:2 No - LUCAT1:20 No - LUCAT1:21 No - LUCAT1:22 No - LUCAT1:23 No - LUCAT1:24 No - LUCAT1:25 No - lnc-ADGRV1-17:1 No - lnc-FAM172A-7:5 No - lnc-FAM172A-7:6 No - lnc-FAM172A-7:7 No - lnc-FAM172A-7:8 No - lnc-FAM172A-3:2 No - lnc-FAM172A-3:3 No - lnc-FAM172A-3:4 No - lnc-FAM172A-3:5 No - lnc-FAM172A-3:6 No - lnc-FAM172A-3:7 No - lnc-FAM172A-3:8 No - NR2F1-AS1:49 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F1-AS1:50 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F1-AS1:51 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F1-AS1:48 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F1-AS1:44 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F1-AS1:69 No - NR2F1-AS1:55 No - NR2F1-AS1:56 No - NR2F1-AS1:57 No - NR2F1-AS1:66 No - NR2F1-AS1:58 No - NR2F1-AS1:70 No - NR2F1-AS1:61 No - NR2F1-AS1:71 No - NR2F1-AS1:67 No - NR2F1-AS1:65 No - NR2F1-AS1:59 No - NR2F1-AS1:53 No - NR2F1-AS1:68 No - NR2F1-AS1:54 No - NR2F1-AS1:52 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F1-AS1:47 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F1-AS1:60 No - NR2F1-AS1:45 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F1-AS1:62 No - NR2F1-AS1:63 No - NR2F1-AS1:46 Yes chr3R:12258737-12302785 NR2F1-AS1:72 No - NR2F1-AS1:64 No - lnc-SLF1-10:1 No - lnc-SLF1-10:2 No - lnc-SLF1-10:3 Yes chr3L:19269351-19274168 lnc-KIAA0825-1:3 No - lnc-KIAA0825-1:2 No - lnc-SPATA9-1:5 No - lnc-SPATA9-1:4 No - lnc-ELL2-4:1 Yes chr3L:19889120-19909410 LINC01554:8 No - LINC01554:9 No - LINC01554:10 No - LINC01554:11 No - LINC01554:12 No - LINC01554:13 No - LINC01554:14 No - MIR583HG:31 Yes chr3L:19889120-19909410 MIR583HG:32 Yes chr3L:19889120-19909410 MIR583HG:33 Yes chr3L:19889120-19909410 MIR583HG:34 No - MIR583HG:35 No - MIR583HG:36 No - MIR583HG:38 No - MIR583HG:40 No - MIR583HG:41 No - MIR583HG:42 No - MIR583HG:43 No - MIR583HG:44 No - MIR583HG:45 No - MIR583HG:46 No - lnc-LNPEP-1:2 Yes chr2L:10364471-10366410 lnc-LNPEP-1:3 Yes chr2L:10364471-10366410 lnc-LNPEP-1:4 No - lnc-LNPEP-6:1 Yes chr3R:25265844-25267757 lnc-LNPEP-6:2 No - lnc-LNPEP-6:3 No - lnc-LNPEP-6:4 No - lnc-LNPEP-6:6 No - lnc-LNPEP-6:7 No - lnc-LNPEP-6:8 No - lnc-LNPEP-8:4 No - lnc-LNPEP-8:5 No - RGMB-AS1:14 No - RGMB-AS1:13 No - RGMB-AS1:15 No - RGMB-AS1:20 No - RGMB-AS1:21 No - RGMB-AS1:16 No - RGMB-AS1:22 No - RGMB-AS1:17 No - RGMB-AS1:26 No - RGMB-AS1:27 No - RGMB-AS1:28 No - RGMB-AS1:29 No - RGMB-AS1:30 No - RGMB-AS1:23 No - RGMB-AS1:24 No - RGMB-AS1:18 No - RGMB-AS1:19 No - RGMB-AS1:25 No - LINC02062:18 Yes chr2L:2979562-2987723 LINC02062:19 Yes chr2L:2979562-2987723 LINC02062:20 Yes chr2L:2979562-2987723 LINC02062:21 Yes chr2L:2979562-2987723 LINC02062:25 No - LINC02062:26 No - LINC02062:27 No - LINC02062:28 No - LINC02062:29 No - LINC02062:30 No - lnc-ST8SIA4-3:5 No - lnc-ST8SIA4-3:4 No - lnc-ST8SIA4-3:6 No - lnc-ST8SIA4-3:10 No - lnc-ST8SIA4-3:9 No - lnc-ST8SIA4-3:7 No - lnc-ST8SIA4-3:8 No - lnc-FAM174A-6:3 No - lnc-FAM174A-6:4 No - lnc-FAM174A-6:5 No - lnc-FAM174A-6:6 No - lnc-FAM174A-6:7 No - lnc-C5orf30-10:1 No - lnc-C5orf30-10:2 No - lnc-NUDT12-3:5 No - lnc-NUDT12-3:6 No - lnc-FER-18:1 No - lnc-FER-18:2 No - lnc-FER-2:7 No - lnc-FER-2:8 No - lnc-FER-2:9 No - lnc-FER-2:10 No - lnc-FER-2:11 No - lnc-FER-2:12 No - lnc-FER-2:13 No - LINC01023:8 No - LINC01023:5 No - LINC01023:6 No - LINC01023:7 No - lnc-FBXL17-4:1 Yes chr3R:9367603-9394546 lnc-FBXL17-4:2 Yes chr3R:9367603-9394546 lnc-FER-17:1 No - lnc-FER-17:2 No - lnc-PJA2-3:2 No - STARD4-AS1:5 No - STARD4-AS1:6 No - lnc-NREP-7:1 No - lnc-NREP-7:2 No - lnc-NREP-7:3 No - lnc-NREP-7:4 No - EPB41L4A-AS1:9 Yes chr3R:31311157-31371748 EPB41L4A-AS1:8 Yes chr3R:31311157-31371748 EPB41L4A-AS1:10 Yes chr3R:31311157-31371748 EPB41L4A-AS1:11 Yes chr3R:31311157-31371748 lnc-MCC-2:1 No - lnc-MCC-1:1 No - lnc-MCC-1:2 No - lnc-KCNN2-2:4 No - lnc-KCNN2-2:5 Yes chrX:5340236-5405138 lnc-KCNN2-2:6 No - lnc-AP3S1-15:5 No - lnc-FEM1C-1:1 No - lnc-AP3S1-17:1 No - lnc-AP3S1-4:8 Yes chrX:11850909-11852530 lnc-AP3S1-4:9 Yes chrX:11850909-11852530 lnc-AP3S1-4:10 No - lnc-AP3S1-16:1 Yes chrX:11850909-11852530 lnc-ATG12-5:3 Yes chrX:11677344-11678589 lnc-COMMD10-10:2 No - lnc-COMMD10-10:3 No - lnc-COMMD10-10:4 No - lnc-COMMD10-10:5 No - lnc-COMMD10-10:6 No - LINC00992:11 No - LINC00992:12 No - LINC00992:13 No - LINC00992:10 No - LINC00992:14 No - LINC00992:16 No - LINC00992:17 No - LINC00992:18 No - LINC00992:15 No - LINC00992:19 No - LINC02208:25 No - LINC02208:26 No - LINC02208:27 No - LINC02208:28 No - LINC02208:29 No - LINC02208:30 No - lnc-DTWD2-1:7 Yes chrX:6240745-6255487 lnc-DTWD2-1:8 Yes chrX:6240745-6255487 lnc-DTWD2-1:9 Yes chrX:6240745-6255487 lnc-DTWD2-1:10 Yes chrX:6240745-6255487 lnc-DTWD2-14:1 No - lnc-DTWD2-14:2 No - lnc-DTWD2-14:3 No - lnc-DTWD2-15:1 Yes chr2R:23698949-23702406 lnc-DTWD2-15:3 Yes chr2R:23698949-23702406 lnc-DTWD2-15:4 Yes chr2R:23698949-23702406 lnc-DTWD2-15:5 Yes chr2R:23698949-23702406 lnc-DTWD2-15:2 Yes chr2R:23698949-23702406 lnc-DTWD2-16:1 No - lnc-DTWD2-17:1 No - lnc-DTWD2-5:5 No - lnc-DTWD2-5:2 No - lnc-DTWD2-5:3 No - lnc-DTWD2-5:4 No - lnc-FTMT-2:11 No - lnc-FTMT-2:12 No - lnc-FTMT-2:13 No - lnc-FTMT-2:14 No - lnc-FTMT-2:10 No - lnc-LOX-2:3 No - lnc-LOX-2:4 No - lnc-LOX-2:5 No - lnc-LOX-2:6 No - lnc-LOX-2:2 No - lnc-LOX-4:12 No - lnc-LOX-4:6 No - lnc-LOX-4:7 No - lnc-LOX-4:8 No - lnc-LOX-4:5 No - lnc-LOX-4:9 No - lnc-LOX-4:10 No - lnc-LOX-4:11 No - LINC02201:13 No - LINC02201:14 No - LINC02201:15 No - lnc-PPIC-5:2 No - lnc-PPIC-5:3 No - lnc-PPIC-1:4 No - lnc-CSNK1G3-1:1 No - lnc-CEP120-7:1 No - lnc-CEP120-4:3 No - lnc-CEP120-7:2 No - LINC01170:9 No - LINC01170:8 No - LINC01170:10 No - LINC01170:13 No - LINC01170:11 No - LINC01170:12 No - LINC01170:7 No - lnc-ZNF608-20:1 No - lnc-ZNF608-20:2 No - lnc-ZNF608-20:3 No - LMNB1-DT:11 Yes chr2L:5542480-5546642 LMNB1-DT:10 Yes chr2L:5542480-5546642 LMNB1-DT:12 Yes chr2L:5542480-5546642 LMNB1-DT:8 Yes chr2L:5542480-5546642 LMNB1-DT:9 Yes chr2L:5542480-5546642 lnc-LMNB1-3:3 No - lnc-LMNB1-3:4 No - lnc-LMNB1-3:5 No - lnc-LMNB1-3:6 No - lnc-LMNB1-3:7 No - lnc-C5orf63-1:8 No - lnc-C5orf63-1:9 No - lnc-C5orf63-1:10 No - lnc-C5orf63-1:6 No - lnc-C5orf63-1:7 No - LINC01184:35 No - LINC01184:36 No - LINC01184:37 No - LINC01184:38 No - LINC01184:33 No - LINC01184:39 No - LINC01184:41 No - LINC01184:42 No - LINC01184:43 No - LINC01184:44 No - LINC01184:45 No - LINC01184:46 No - LINC01184:47 No - LINC01184:40 No - LINC01184:48 No - LINC01184:34 Yes chr3R:5489505-5502702 LINC01184:49 No - LINC01184:50 No - LINC01184:51 No - LINC01184:52 No - ADAMTS19-AS1:8 Yes chrX:5698557-5708633 ADAMTS19-AS1:4 Yes chrX:5698557-5708633 ADAMTS19-AS1:5 Yes chrX:5698557-5708633 ADAMTS19-AS1:9 Yes chrX:5698557-5708633 ADAMTS19-AS1:3 Yes chrX:5698557-5708633 ADAMTS19-AS1:6 Yes chrX:5698557-5708633 ADAMTS19-AS1:7 Yes chrX:5698557-5708633 lnc-HINT1-4:1 Yes chr3R:24814262-24814930 lnc-HINT1-4:2 Yes chr3R:24814262-24814930 lnc-HINT1-4:3 No - lnc-HINT1-5:3 Yes chr3R:5616644-5624125 lnc-HINT1-5:1 Yes chr3R:5616644-5624125 lnc-HINT1-5:2 Yes chr3R:5616644-5624125 lnc-HINT1-5:4 Yes chr3R:5616644-5624125 lnc-CDC42SE2-6:1 Yes chr2L:6323767-6332789 lnc-IL3-4:1 No - lnc-IL3-4:2 No - MIR3936HG:15 Yes chr3L:21955110-21958041 MIR3936HG:18 No - lnc-IRF1-7:1 No - lnc-IRF1-2:4 Yes chr2R:22421013-22425482 lnc-IRF1-2:3 Yes chr2R:22421013-22425482 lnc-IRF1-2:5 Yes chr2R:22421013-22425482 lnc-IRF1-2:6 Yes chr2R:22421013-22425482 lnc-IRF1-2:7 Yes chr2R:22421013-22425482 lnc-IRF1-1:3 Yes chr2R:22421013-22425482 lnc-RAD50-4:1 Yes chr2R:22421013-22425482 lnc-IRF1-5:1 Yes chr2R:22421013-22425482 lnc-IRF1-6:1 Yes chr2R:22421013-22425482 lnc-HSPA4-7:2 No - lnc-HSPA4-7:3 No - lnc-TCF7-1:2 No - lnc-TCF7-5:3 Yes chr2L:10843014-10845664 lnc-TCF7-5:4 Yes chr2L:10843014-10845664 lnc-TCF7-5:5 Yes chr2L:10843014-10845664 lnc-CDKL3-2:5 No - lnc-CDKL3-2:6 No - lnc-TCF7-4:2 No - lnc-CDKL3-2:13 No - lnc-CDKL3-2:7 No - lnc-CDKL3-2:9 No - lnc-CDKL3-2:11 No - lnc-CDKL3-2:14 No - lnc-CDKL3-2:10 No - lnc-CDKL3-2:12 No - lnc-CDKL3-2:8 No - lnc-JADE2-2:3 No - lnc-JADE2-2:4 No - LINC01843:14 No - LINC01843:15 No - LINC01843:16 No - lnc-SAR1B-3:4 Yes chr3L:187207-199762 lnc-SAR1B-3:3 Yes chr3L:187207-199762 lnc-SAR1B-3:1 Yes chr3L:187207-199762 lnc-SAR1B-3:2 Yes chr3L:187207-199762 lnc-SEC24A-3:1 Yes chr3R:22356685-22360711 lnc-SLC25A48-8:2 Yes chr2L:21423737-21424229 lnc-SLC25A48-3:5 No - lnc-SLC25A48-3:6 No - lnc-LECT2-2:1 No - lnc-SMIM32-4:2 No - lnc-SMIM32-4:3 No - lnc-SMIM32-4:4 No - lnc-SMIM32-4:5 No - lnc-SMIM32-4:6 No - lnc-HNRNPA0-4:6 No - lnc-MYOT-7:1 No - lnc-HNRNPA0-4:1 No - lnc-HNRNPA0-4:7 No - lnc-HNRNPA0-4:8 No - lnc-HNRNPA0-4:9 No - lnc-HNRNPA0-4:2 No - lnc-HNRNPA0-4:10 No - lnc-HNRNPA0-4:3 No - lnc-HNRNPA0-4:11 No - lnc-WNT8A-57:1 Yes chr2R:17703335-17719346 lnc-WNT8A-57:2 Yes chr2R:17703335-17719346 lnc-WNT8A-4:1 Yes chr2R:17703335-17719346 lnc-WNT8A-4:2 Yes chr2R:17703335-17719346 lnc-ETF1-3:1 No - lnc-ETF1-3:3 No - lnc-ETF1-3:2 No - lnc-CTNNA1-4:2 No - lnc-CTNNA1-5:1 No - lnc-LRRTM2-1:5 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-LRRTM2-1:6 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-LRRTM2-1:7 Yes chr3L:23318646-23338100 lnc-ECSCR-3:1 No - lnc-TMEM173-3:2 No - lnc-TMEM173-3:3 Yes chr3L:2786207-2879158 lnc-TMEM173-3:4 Yes chr3L:2786207-2879158 lnc-TMEM173-3:6 Yes chr3L:2786207-2879158 lnc-TMEM173-3:5 Yes chr3L:2786207-2879158 CXXC5-AS1:5 Yes chr3L:2786207-2879158 PSD2-AS1:11 No - PSD2-AS1:12 No - PSD2-AS1:13 No - lnc-NRG2-9:1 No - MALINC1:52 Yes chr4:558016-567257 MALINC1:59 Yes chr4:558016-567257 MALINC1:46 Yes chr4:558016-567257 MALINC1:66 No - MALINC1:47 Yes chr4:558016-567257 MALINC1:48 Yes chr4:558016-567257 MALINC1:67 No - MALINC1:49 Yes chr4:558016-567257 MALINC1:43 Yes chr4:558016-567257 MALINC1:44 Yes chr4:558016-567257 MALINC1:40 Yes chr4:558016-567257 MALINC1:68 No - MALINC1:60 Yes chr4:558016-567257 MALINC1:61 Yes chr4:558016-567257 MALINC1:62 Yes chr4:558016-567257 MALINC1:50 Yes chr4:558016-567257 MALINC1:69 No - MALINC1:53 Yes chr4:558016-567257 MALINC1:70 No - MALINC1:71 No - MALINC1:54 Yes chr4:558016-567257 MALINC1:55 Yes chr4:558016-567257 MALINC1:56 Yes chr4:558016-567257 MALINC1:41 Yes chr4:558016-567257 lnc-CYSTM1-4:1 No - lnc-HBEGF-2:10 Yes chr2L:7223328-7249343 lnc-HBEGF-2:7 Yes chr2L:7223328-7249343 lnc-HBEGF-2:11 No - lnc-HBEGF-2:8 No - lnc-HBEGF-2:9 No - lnc-SLC35A4-1:1 No - lnc-CD14-2:1 No - lnc-HARS-1:3 Yes chr3L:4261297-4262470 lnc-HARS-1:4 No - lnc-TAF7-9:1 No - lnc-TAF7-6:7 No - lnc-TAF7-6:8 No - lnc-PCDHGA1-4:1 No - lnc-PCDHGA1-4:2 No - lnc-PCDHGA1-2:7 No - lnc-PCDHGA1-2:8 No - lnc-PCDHGA1-2:9 No - lnc-PCDHGA1-2:10 No - lnc-PCDHGA1-2:11 No - lnc-KIAA0141-1:4 Yes chr3R:14630478-14641776 lnc-KIAA0141-1:2 Yes chr3R:14630478-14641776 lnc-KIAA0141-1:3 Yes chr3R:14630478-14641776 lnc-KIAA0141-1:5 Yes chr3R:14630478-14641776 lnc-PCDH12-4:2 No - lnc-ARHGAP26-4:9 Yes chr3L:3401153-3424935 lnc-ARHGAP26-4:10 Yes chr3L:3401153-3424935 lnc-ARHGAP26-4:11 Yes chr3L:3401153-3424935 lnc-ARHGAP26-4:12 Yes chr3L:3401153-3424935 lnc-ARHGAP26-4:13 No - lnc-ARHGAP26-4:14 Yes chr3L:3401153-3424935 lnc-ARHGAP26-4:15 Yes chr3L:3401153-3424935 lnc-ARHGAP26-4:16 Yes chr3L:3401153-3424935 lnc-ARHGAP26-4:17 Yes chr3L:3401153-3424935 lnc-ARHGAP26-4:19 No - lnc-ARHGAP26-4:20 No - lnc-ARHGAP26-4:21 Yes chr3R:19794073-19836817 lnc-ARHGAP26-4:22 Yes chr3R:19794073-19836817 lnc-ARHGAP26-4:18 Yes chr3R:19794073-19836817 lnc-ARHGAP26-4:23 No - lnc-ARHGAP26-4:25 Yes chr3R:19794073-19836817 lnc-ARHGAP26-4:26 Yes chr3R:19794073-19836817 lnc-ARHGAP26-4:27 Yes chr3R:19794073-19836817 lnc-ARHGAP26-4:28 Yes chr3R:19794073-19836817 lnc-ARHGAP26-4:24 Yes chr3R:19794073-19836817 lnc-ARHGAP26-4:31 No - lnc-ARHGAP26-4:32 No - lnc-ARHGAP26-4:33 No - lnc-ARHGAP26-4:34 No - lnc-NR3C1-3:1 No - lnc-NR3C1-3:2 No - lnc-NR3C1-3:3 No - lnc-NR3C1-3:4 No - lnc-NR3C1-3:5 No - lnc-ARHGAP26-9:1 No - lnc-ARHGAP26-9:2 No - lnc-ARHGAP26-9:3 No - lnc-HMHB1-1:3 No - lnc-HMHB1-1:4 No - lnc-RBM27-5:1 No - lnc-RBM27-5:2 No - STK32A-AS1:11 No - STK32A-AS1:12 No - STK32A-AS1:13 No - STK32A-AS1:14 No - STK32A-AS1:15 No - lnc-SPINK5-3:1 No - lnc-SPINK5-3:2 No - lnc-HTR4-1:5 No - lnc-HTR4-1:6 No - lnc-HTR4-1:10 No - lnc-HTR4-1:7 No - lnc-HTR4-1:8 No - lnc-HTR4-1:9 No - lnc-HTR4-6:1 No - lnc-HTR4-6:2 No - SH3TC2-DT:27 No - SH3TC2-DT:28 No - SH3TC2-DT:29 No - SH3TC2-DT:30 No - SH3TC2-DT:31 No - SH3TC2-DT:32 No - SH3TC2-DT:33 No - SH3TC2-DT:34 No - SH3TC2-DT:37 No - SH3TC2-DT:41 No - SH3TC2-DT:42 No - SH3TC2-DT:43 No - SH3TC2-DT:44 No - SH3TC2-DT:45 No - SH3TC2-DT:46 No - SH3TC2-DT:47 No - SH3TC2-DT:48 No - SH3TC2-DT:49 No - lnc-ABLIM3-4:2 No - lnc-ABLIM3-4:4 No - lnc-ABLIM3-4:3 No - lnc-ABLIM3-4:5 No - lnc-IL17B-9:1 No - CARMN:28 No - CARMN:30 No - CARMN:31 No - CARMN:29 No - CARMN:32 No - CARMN:33 No - CARMN:34 No - CARMN:35 No - CARMN:37 No - CARMN:38 No - CARMN:39 No - CARMN:40 No - CARMN:41 No - CARMN:42 No - lnc-CSNK1A1-1:4 No - lnc-CSNK1A1-1:2 No - lnc-CSNK1A1-1:3 No - lnc-PDE6A-2:1 No - lnc-PDGFRB-5:1 No - lnc-TCOF1-2:1 No - lnc-NDST1-6:1 No - NDST1-AS1:7 Yes chr3L:6495680-6550104 lnc-RBM22-2:2 No - lnc-RBM22-2:3 No - lnc-RBM22-2:5 No - lnc-RBM22-2:4 No - lnc-RBM22-1:4 No - lnc-RBM22-1:5 No - lnc-RBM22-1:6 No - lnc-RBM22-1:2 No - lnc-RBM22-1:3 No - lnc-MYOZ3-2:2 No - lnc-GPX3-2:1 No - lnc-GM2A-3:1 No - lnc-ANXA6-1:2 No - lnc-SLC36A2-2:2 Yes chr3L:11025561-11029444 lnc-SLC36A2-2:3 Yes chr3L:11025561-11029444 lnc-FAM114A2-2:1 No - SAP30L-AS1:10 Yes chr2L:3470182-3472364 SAP30L-AS1:12 Yes chr2L:3470182-3472364 SAP30L-AS1:13 No - SAP30L-AS1:14 No - SAP30L-AS1:8 No - SAP30L-AS1:9 No - SAP30L-AS1:11 No - lnc-FAXDC2-4:2 Yes chr3R:28318162-28336440 lnc-FNDC9-2:3 No - lnc-FNDC9-2:2 Yes chr3R:15333266-15338365 lnc-FNDC9-2:4 No - lnc-ADAM19-2:5 No - lnc-ADAM19-2:3 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-ADAM19-2:4 Yes chr3R:14664907-14697292 lnc-SOX30-3:2 Yes chr2L:15008489-15009724 lnc-SOX30-3:3 Yes chr2L:15008489-15009724 lnc-SOX30-3:4 Yes chr2L:15008489-15009724 LINC02202:16 No - LINC02202:17 No - LINC02202:18 No - LINC02202:19 No - LINC02202:20 No - LINC02202:23 No - LINC02202:24 No - LINC02202:27 No - LINC02202:28 No - LINC01932:6 No - LINC01932:7 No - lnc-RNF145-6:3 Yes chr3R:23061493-23062751 lnc-RNF145-6:1 Yes chr3R:23061493-23062751 lnc-RNF145-6:2 Yes chr3R:23061493-23062751 lnc-UBLCP1-2:7 No - lnc-UBLCP1-2:10 No - lnc-UBLCP1-2:6 No - lnc-UBLCP1-2:13 No - lnc-UBLCP1-2:14 No - lnc-UBLCP1-2:11 No - lnc-UBLCP1-2:15 No - lnc-UBLCP1-2:12 No - LINC02159:13 No - LINC02159:14 No - LINC02159:15 No - lnc-NUDCD2-2:6 No - lnc-NUDCD2-2:7 No - lnc-NUDCD2-2:11 No - lnc-NUDCD2-2:8 No - lnc-NUDCD2-2:9 No - lnc-NUDCD2-2:10 No - lnc-MAT2B-3:23 No - lnc-MAT2B-3:24 No - lnc-MAT2B-3:25 No - lnc-MAT2B-3:26 No - lnc-MAT2B-3:27 No - lnc-MAT2B-3:28 No - lnc-MAT2B-3:29 No - lnc-MAT2B-3:30 No - lnc-MAT2B-3:31 No - lnc-MAT2B-3:32 No - lnc-MAT2B-3:33 No - lnc-MAT2B-3:34 No - lnc-MAT2B-3:35 No - lnc-PANK3-24:1 No - lnc-PANK3-24:2 No - lnc-PANK3-23:1 Yes chr2R:23072909-23074725 lnc-PANK3-23:2 Yes chr2R:23072909-23074725 lnc-FBLL1-4:10 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-FBLL1-4:11 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-FBLL1-4:12 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-FBLL1-4:13 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-FBLL1-4:14 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-FBLL1-4:15 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-FBLL1-4:16 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-FBLL1-4:17 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-FBLL1-4:18 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-FBLL1-4:19 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-FBLL1-4:20 Yes chr2R:15869495-15922118 lnc-SLIT3-1:3 No - lnc-C5orf58-5:1 No - lnc-C5orf58-5:2 No - lnc-KCNIP1-8:1 No - lnc-KCNIP1-8:2 No - lnc-KCNIP1-7:1 No - lnc-LCP2-7:1 No - lnc-LCP2-7:2 No - lnc-KCNIP1-6:1 No - LINC01366:10 No - LINC01366:13 No - LINC01366:14 No - LINC01366:11 No - LINC01366:12 No - LINC01366:15 No - LINC01366:16 No - lnc-KCNIP1-5:1 No - lnc-C5orf58-1:2 Yes chrX:11219379-11302783 lnc-C5orf58-1:3 Yes chrX:11219379-11302783 lnc-C5orf58-1:4 Yes chrX:11219379-11302783 lnc-FGF18-4:2 No - lnc-FGF18-4:1 No - lnc-EFCAB9-5:1 No - lnc-EFCAB9-5:2 No - lnc-NEURL1B-3:4 No - lnc-NEURL1B-3:6 No - lnc-NEURL1B-3:7 No - lnc-NEURL1B-3:5 No - lnc-NEURL1B-3:8 No - lnc-NEURL1B-3:9 No - lnc-DUSP1-9:1 No - lnc-NEURL1B-6:1 No - lnc-DUSP1-8:1 No - lnc-DUSP1-10:1 No - lnc-DUSP1-10:2 No - lnc-ERGIC1-7:1 No - lnc-DUSP1-11:1 No - lnc-ERGIC1-6:1 No - lnc-DUSP1-4:6 Yes chr3L:18898875-18900408 lnc-DUSP1-4:12 Yes chr3L:18898875-18900408 lnc-DUSP1-4:7 Yes chr3L:18898875-18900408 lnc-DUSP1-4:8 Yes chr3L:18898875-18900408 lnc-DUSP1-4:13 Yes chr3L:18898875-18900408 lnc-DUSP1-4:9 Yes chr3L:18898875-18900408 lnc-DUSP1-4:10 Yes chr3L:18898875-18900408 lnc-DUSP1-4:11 Yes chr3L:18898875-18900408 lnc-DUSP1-4:14 No - lnc-BNIP1-5:3 No - lnc-BNIP1-5:4 No - lnc-BNIP1-5:5 No - lnc-BNIP1-4:6 No - lnc-BNIP1-4:7 No - lnc-BNIP1-4:4 No - lnc-BNIP1-4:5 No - LINC01942:10 No - LINC01942:11 No - LINC01942:12 No - LINC01942:13 No - LINC01942:14 No - lnc-BOD1-1:33 No - lnc-BOD1-1:34 No - lnc-BOD1-1:30 No - lnc-BOD1-1:36 No - lnc-BOD1-1:37 No - lnc-BOD1-1:31 No - lnc-BOD1-1:32 No - lnc-BOD1-1:35 No - lnc-BOD1-1:27 No - lnc-BOD1-1:28 No - lnc-BOD1-1:29 No - lnc-DRD1-4:1 No - lnc-MSX2-1:3 No - lnc-MSX2-1:4 No - lnc-MSX2-1:5 No - lnc-DRD1-3:1 No - lnc-THOC3-2:1 No - lnc-THOC3-2:2 No - lnc-THOC3-2:10 No - lnc-THOC3-2:11 No - lnc-THOC3-2:3 No - lnc-THOC3-2:12 No - lnc-THOC3-2:13 No - lnc-THOC3-2:14 No - lnc-ARL10-4:1 No - lnc-SNCB-4:1 Yes chr3L:6664224-6665641 LINC01574:6 No - LINC01574:7 No - LINC01574:8 No - PRR7-AS1:8 No - PRR7-AS1:9 No - lnc-PRR7-4:1 Yes chr3R:4233047-4235041 lnc-PRR7-4:2 No - lnc-PRR7-4:3 No - lnc-TMED9-2:2 No - lnc-FAM153C-5:11 No - lnc-FAM153C-5:12 No - lnc-FAM153C-5:13 No - lnc-FAM153C-5:14 No - lnc-FAM153C-5:15 No - lnc-NHP2-1:1 No - lnc-HNRNPH1-5:2 No - lnc-HNRNPH1-6:2 No - lnc-HNRNPH1-6:1 No - lnc-CBY3-1:2 No - lnc-CBY3-4:1 Yes chrX:16522967-16525415 lnc-CBY3-3:2 Yes chrX:16522967-16525415 lnc-CBY3-3:3 No - lnc-CNOT6-4:5 No - lnc-CNOT6-4:6 No - lnc-CNOT6-4:7 No - lnc-SCGB3A1-3:6 No - lnc-SCGB3A1-3:7 No - lnc-SCGB3A1-3:4 No - lnc-SCGB3A1-3:5 No - lnc-SCGB3A1-3:8 No - lnc-SCGB3A1-3:1 No - lnc-SCGB3A1-3:2 No - lnc-SCGB3A1-3:3 No - lnc-BTNL8-6:3 Yes chr2R:20559156-20562331 lnc-BTNL8-6:6 Yes chr2R:20559156-20562331 lnc-BTNL8-6:4 Yes chr2R:20559156-20562331 lnc-BTNL8-6:5 Yes chr2R:20559156-20562331 lnc-BTNL8-5:2 No - lnc-BTNL8-5:3 No - lnc-BTNL8-5:4 No - lnc-BTNL8-5:5 No - LINC00847:17 No - LINC00847:18 No - LINC00847:19 No - LINC00847:20 No - LINC00847:23 No - LINC00847:21 No - LINC00847:24 No - LINC00847:25 No - LINC00847:22 No - LINC00847:27 No - LINC00847:26 No - LINC01962:10 No - lnc-TRIM41-4:2 No - lnc-TRIM41-4:3 No - lnc-TRIM41-4:9 No - TRIM52-AS1:28 No - TRIM52-AS1:30 No - TRIM52-AS1:29 No - TRIM52-AS1:31 No - TRIM52-AS1:32 No - TRIM52-AS1:33 No - lnc-OR4F3-5:2 No - lnc-OR4F3-5:3 No - lnc-OR4F3-5:4 No - lnc-IRF4-2:3 Yes chr2L:3457302-3460367 lnc-IRF4-2:4 Yes chr2L:3457302-3460367 lnc-IRF4-2:5 Yes chr2L:3457302-3460367 lnc-IRF4-2:6 No - lnc-IRF4-2:7 No - lnc-IRF4-2:8 No - lnc-IRF4-2:9 No - lnc-IRF4-2:10 No - lnc-EXOC2-11:3 No - lnc-EXOC2-11:4 No - lnc-IRF4-2:11 No - lnc-IRF4-2:12 No - lnc-IRF4-2:13 No - LINC01622:21 No - LINC01622:22 No - LINC01622:23 No - LINC01622:19 No - LINC01622:20 No - LINC01394:26 No - LINC01394:22 Yes chr3L:6990622-6994447 LINC01394:23 Yes chr3L:6990622-6994447 LINC01394:24 Yes chr3L:6990622-6994447 LINC01394:25 Yes chr3L:6990622-6994447 lnc-GMDS-6:20 No - lnc-GMDS-6:21 No - lnc-GMDS-6:13 No - lnc-GMDS-6:22 No - lnc-GMDS-6:16 No - lnc-GMDS-6:14 No - lnc-GMDS-6:17 No - lnc-GMDS-6:15 No - lnc-GMDS-6:18 No - lnc-GMDS-6:19 No - GMDS-DT:77 No - GMDS-DT:78 No - GMDS-DT:79 No - GMDS-DT:80 No - GMDS-DT:81 No - GMDS-DT:82 No - GMDS-DT:83 No - GMDS-DT:84 No - GMDS-DT:85 No - GMDS-DT:86 No - GMDS-DT:87 No - GMDS-DT:97 No - GMDS-DT:98 No - GMDS-DT:99 No - GMDS-DT:100 No - GMDS-DT:101 No - lnc-WRNIP1-40:1 No - lnc-WRNIP1-18:2 No - lnc-NQO2-15:1 No - lnc-NQO2-15:2 No - lnc-SERPINB6-2:4 No - lnc-SERPINB6-2:5 No - lnc-TUBB2A-7:2 No - lnc-TUBB2A-7:3 No - lnc-TUBB2A-9:1 No - lnc-TUBB2A-9:4 No - lnc-TUBB2A-9:5 No - lnc-TUBB2A-9:2 No - lnc-TUBB2A-9:3 No - lnc-TUBB2A-8:1 No - lnc-TUBB2A-8:2 No - lnc-TUBB2A-8:3 No - LINC02525:19 No - LINC02525:20 No - LINC02525:21 No - LINC02525:22 No - LINC02525:23 No - lnc-FAM50B-6:8 No - lnc-FAM50B-6:9 No - lnc-FAM50B-6:10 No - lnc-PXDC1-15:7 No - lnc-PXDC1-15:8 No - lnc-PXDC1-15:9 No - lnc-PXDC1-15:10 No - lnc-PXDC1-15:11 No - lnc-FAM217A-13:1 No - lnc-FAM217A-1:2 No - lnc-FAM217A-1:3 No - lnc-FAM217A-1:4 No - lnc-FAM217A-1:5 No - lnc-FAM217A-1:6 No - lnc-FAM217A-1:9 No - lnc-C6orf201-2:9 No - lnc-C6orf201-2:10 No - lnc-C6orf201-2:8 No - lnc-ECI2-2:14 No - lnc-ECI2-2:15 No - lnc-ECI2-2:16 No - lnc-ECI2-2:17 No - lnc-ECI2-2:12 No - lnc-ECI2-2:13 No - lnc-RPP40-1:9 No - lnc-RPP40-1:8 No - lnc-RPP40-1:6 No - lnc-RPP40-1:7 No - lnc-RPP40-1:5 No - lnc-FARS2-1:3 No - lnc-FARS2-1:4 No - lnc-FARS2-1:5 No - lnc-FARS2-1:6 No - lnc-FARS2-1:7 No - lnc-FARS2-5:1 No - lnc-F13A1-2:6 No - lnc-F13A1-2:7 No - lnc-F13A1-2:4 No - lnc-F13A1-2:5 No - lnc-F13A1-2:8 No - lnc-F13A1-2:9 No - lnc-LY86-4:6 No - lnc-LY86-4:7 No - lnc-LY86-4:10 No - lnc-LY86-4:8 No - lnc-LY86-4:9 No - lnc-F13A1-3:23 No - lnc-F13A1-3:22 No - lnc-F13A1-3:17 No - lnc-F13A1-3:16 No - lnc-F13A1-3:18 No - lnc-F13A1-3:21 No - lnc-F13A1-3:20 No - lnc-F13A1-3:19 No - lnc-LY86-11:1 No - lnc-LY86-12:1 No - lnc-SSR1-4:1 No - lnc-RREB1-9:2 No - lnc-RREB1-9:3 No - lnc-RREB1-9:4 No - lnc-RREB1-9:5 No - lnc-RREB1-9:6 No - lnc-RREB1-9:7 No - lnc-CAGE1-1:10 No - lnc-CAGE1-1:11 No - lnc-CAGE1-1:8 No - lnc-CAGE1-1:6 No - lnc-CAGE1-1:7 No - lnc-CAGE1-1:9 No - lnc-CAGE1-1:12 No - lnc-BMP6-106:4 No - lnc-BMP6-106:5 No - lnc-BMP6-106:6 No - lnc-BMP6-106:7 No - lnc-BMP6-106:8 No - lnc-BMP6-106:70 No - lnc-BMP6-106:71 No - lnc-BMP6-106:72 No - lnc-BMP6-106:73 No - lnc-BMP6-106:74 No - lnc-GCNT2-5:1 No - lnc-TFAP2A-14:3 No - lnc-TFAP2A-14:4 No - lnc-TFAP2A-14:1 No - lnc-TFAP2A-14:5 No - lnc-TFAP2A-14:2 No - LINC00518:7 No - LINC00518:10 No - LINC00518:11 No - LINC00518:8 No - LINC00518:9 No - LINC00518:12 No - LINC00518:13 No - lnc-C6orf52-3:2 Yes chrX:15340373-15342117 lnc-C6orf52-3:1 Yes chr2R:23752754-23753515 lnc-MAK-5:2 No - lnc-MAK-1:6 No - lnc-MAK-5:3 No - ELOVL2-AS1:11 No - ELOVL2-AS1:12 No - ELOVL2-AS1:13 No - lnc-NEDD9-4:1 No - lnc-NEDD9-4:2 No - lnc-TMEM170B-5:1 No - lnc-TMEM170B-5:2 No - lnc-TMEM170B-5:3 No - lnc-TMEM170B-5:4 No - lnc-HIVEP1-4:2 No - lnc-HIVEP1-4:3 No - lnc-HIVEP1-4:4 No - lnc-HIVEP1-4:5 No - lnc-HIVEP1-4:6 No - lnc-ADTRP-5:1 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-HIVEP1-1:5 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-ADTRP-7:2 No - lnc-ADTRP-7:3 No - lnc-ADTRP-7:4 No - lnc-ADTRP-7:5 No - lnc-EDN1-4:1 No - lnc-PHACTR1-1:5 No - lnc-PHACTR1-1:6 No - lnc-SIRT5-6:1 No - lnc-RANBP9-2:3 No - lnc-RANBP9-2:2 No - lnc-RANBP9-2:4 No - lnc-RANBP9-2:5 No - lnc-RANBP9-1:6 No - lnc-RANBP9-1:3 No - lnc-RANBP9-1:5 No - lnc-RANBP9-1:4 No - lnc-NOL7-1:1 No - lnc-NOL7-1:2 No - lnc-MCUR1-13:1 No - lnc-CD83-11:1 No - lnc-MCUR1-14:1 No - lnc-DTNBP1-16:22 No - lnc-DTNBP1-16:26 No - lnc-DTNBP1-16:23 No - lnc-DTNBP1-16:27 No - lnc-DTNBP1-16:28 No - lnc-DTNBP1-16:36 No - lnc-DTNBP1-16:31 No - lnc-DTNBP1-16:32 No - lnc-DTNBP1-16:24 No - lnc-DTNBP1-16:33 No - lnc-DTNBP1-16:29 No - lnc-DTNBP1-16:25 No - lnc-DTNBP1-16:34 No - lnc-DTNBP1-16:30 No - lnc-DTNBP1-16:37 No - lnc-DTNBP1-16:1 No - lnc-DTNBP1-16:35 No - lnc-DTNBP1-16:38 No - lnc-CD83-5:5 No - lnc-CD83-5:7 No - lnc-CD83-5:6 No - lnc-DTNBP1-16:13 No - lnc-DTNBP1-5:22 No - lnc-JARID2-6:1 No - lnc-JARID2-6:2 No - lnc-DTNBP1-5:24 No - lnc-DTNBP1-5:23 No - lnc-DTNBP1-5:25 No - lnc-JARID2-5:1 No - lnc-JARID2-5:2 No - lnc-DTNBP1-16:18 No - lnc-DTNBP1-16:19 No - lnc-DTNBP1-16:14 No - lnc-DTNBP1-16:20 No - lnc-DTNBP1-16:21 No - lnc-DTNBP1-16:15 No - lnc-DTNBP1-16:16 No - lnc-DTNBP1-16:2 No - lnc-DTNBP1-16:3 No - lnc-DTNBP1-16:17 No - lnc-DTNBP1-16:10 No - lnc-DTNBP1-16:11 No - lnc-DTNBP1-16:7 No - lnc-DTNBP1-16:4 No - lnc-DTNBP1-16:5 No - lnc-DTNBP1-16:8 No - lnc-DTNBP1-10:3 No - lnc-DTNBP1-10:2 No - JARID2-AS1:4 Yes chr3L:9477038-9486530 JARID2-AS1:5 Yes chr3L:9477038-9486530 lnc-STMND1-4:1 Yes chrX:6823204-6824203 lnc-STMND1-4:2 Yes chrX:6823204-6824203 lnc-STMND1-4:3 Yes chrX:6823204-6824203 lnc-STMND1-4:7 No - lnc-STMND1-4:8 No - lnc-STMND1-4:9 No - lnc-STMND1-4:10 No - lnc-STMND1-4:13 No - lnc-STMND1-4:14 No - lnc-STMND1-4:15 No - lnc-STMND1-4:16 No - lnc-NUP153-3:5 Yes chr2R:8925671-8926890 lnc-NUP153-3:7 No - lnc-MBOAT1-2:26 No - lnc-MBOAT1-2:27 No - lnc-MBOAT1-2:12 Yes chr3L:749400-753492 lnc-MBOAT1-2:16 No - lnc-MBOAT1-2:13 Yes chr3L:749400-753492 lnc-MBOAT1-2:11 Yes chr3L:749400-753492 LINC00581:6 No - LINC00581:7 No - LINC00581:8 No - LINC00581:5 No - CASC15:31 No - CASC15:32 No - CASC15:29 No - CASC15:30 No - CASC15:33 No - CASC15:35 No - CASC15:34 No - CASC15:36 No - CASC15:37 No - CASC15:38 No - CASC15:39 No - CASC15:40 No - CASC15:41 No - CASC15:42 No - CASC15:43 No - CASC15:44 No - CASC15:45 No - CASC15:46 No - CASC15:47 No - CASC15:48 No - CASC15:49 No - CASC15:50 No - CASC15:51 No - CASC15:53 No - CASC15:54 No - CASC15:55 No - CASC15:56 No - CASC15:52 No - CASC15:58 No - CASC15:59 No - CASC15:60 No - CASC15:61 No - CASC15:62 No - NBAT1:11 No - NBAT1:4 No - NBAT1:8 No - NBAT1:12 No - NBAT1:9 No - NBAT1:10 No - CASC15:63 No - CASC15:64 No - CASC15:65 No - CASC15:66 No - CASC15:67 No - CASC15:68 No - CASC15:69 No - CASC15:70 No - lnc-PRL-16:1 No - NBAT1:6 No - lnc-PRL-7:5 No - lnc-PRL-7:6 No - lnc-PRL-7:7 No - lnc-PRL-7:3 No - lnc-PRL-7:4 No - lnc-HDGFL1-2:5 No - lnc-HDGFL1-2:6 No - lnc-HDGFL1-2:3 No - lnc-HDGFL1-2:7 No - lnc-HDGFL1-2:4 No - lnc-ACOT13-3:1 No - lnc-ACOT13-4:1 No - lnc-C6orf229-4:1 No - lnc-GMNN-6:1 No - lnc-GMNN-6:2 No - lnc-GMNN-6:3 No - lnc-GMNN-6:4 No - lnc-HIST1H1A-3:1 No - lnc-HIST1H1A-3:3 No - lnc-HIST1H1A-3:4 No - lnc-HIST1H1A-3:5 No - lnc-HIST1H1A-3:2 No - lnc-TRIM38-2:4 No - lnc-HIST1H1A-2:1 No - lnc-TRIM38-2:6 No - lnc-TRIM38-2:7 No - lnc-TRIM38-2:8 No - lnc-HIST1H4D-3:1 No - lnc-HIST1H4D-2:1 No - lnc-HIST1H2AD-2:1 No - lnc-HIST1H2BI-2:2 No - lnc-HIST1H2BI-2:3 No - lnc-HIST1H2BI-2:4 No - lnc-HIST1H2BI-2:5 No - HCG11:7 No - HCG11:8 No - LINC00240:10 No - LINC00240:11 No - lnc-HIST1H2AH-5:1 No - lnc-POM121L2-3:1 No - lnc-ZNF391-5:1 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF391-5:2 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZNF391-5:3 No - lnc-ZNF391-5:5 No - lnc-ZNF391-5:4 No - lnc-ZNF391-5:6 No - lnc-HIST1H2AI-3:13 No - lnc-HIST1H2AI-3:14 No - lnc-HIST1H2AI-3:15 No - lnc-HIST1H2AI-3:16 No - lnc-HIST1H2AI-3:17 No - lnc-HIST1H2AI-1:6 No - lnc-HIST1H2AI-1:9 No - lnc-HIST1H2AI-1:10 No - lnc-HIST1H2AI-1:7 No - lnc-HIST1H2AI-1:8 No - lnc-HIST1H2BN-1:2 No - lnc-HIST1H2BN-2:1 No - lnc-OR2B2-4:5 No - lnc-OR2B2-4:3 No - lnc-OR2B2-4:4 No - lnc-OR2B2-4:6 No - lnc-ZKSCAN4-5:1 No - lnc-ZNF165-2:1 No - ZSCAN16-AS1:10 No - ZSCAN16-AS1:13 No - ZSCAN16-AS1:11 No - ZSCAN16-AS1:14 No - ZSCAN16-AS1:12 No - ZSCAN16-AS1:9 No - lnc-ZKSCAN3-3:1 No - lnc-ZKSCAN3-3:2 No - lnc-ZKSCAN3-3:3 No - lnc-ZSCAN23-3:4 No - lnc-ZSCAN23-3:2 No - lnc-ZSCAN23-3:3 No - lnc-GPX5-4:1 No - lnc-GPX5-4:2 No - lnc-GPX5-1:2 No - lnc-GPX5-5:1 No - lnc-TRIM27-10:2 No - lnc-TRIM27-10:3 No - LINC01623:5 No - LINC01623:7 No - LINC01623:6 No - HCG14:3 No - HCG14:4 No - lnc-OR2J1-16:1 No - lnc-OR2J1-16:2 No - lnc-TRIM27-22:1 No - lnc-OR2J1-14:2 No - HCG15:8 No - HCG15:9 No - lnc-GABBR1-2:1 No - lnc-RNF39-4:20 No - lnc-RNF39-4:27 Yes chr3R:21777203-21777847 lnc-RNF39-4:28 Yes chr3R:21777203-21777847 lnc-RNF39-4:29 Yes chr3R:21777203-21777847 lnc-RNF39-4:30 Yes chr3R:21777203-21777847 lnc-RNF39-4:31 Yes chr3R:21777203-21777847 lnc-RNF39-4:22 Yes chr3R:21777203-21777847 lnc-RNF39-4:23 Yes chr3R:21777203-21777847 lnc-RNF39-4:24 Yes chr3R:21777203-21777847 lnc-RNF39-4:25 Yes chr3R:21777203-21777847 lnc-RNF39-4:32 Yes chr3R:21777203-21777847 lnc-RNF39-4:33 Yes chr3R:21777203-21777847 lnc-RNF39-4:34 Yes chr3R:21777203-21777847 lnc-RNF39-4:26 Yes chr3R:21777203-21777847 lnc-RNF39-4:35 Yes chr3R:21777203-21777847 lnc-RNF39-4:36 Yes chr3R:21777203-21777847 lnc-RNF39-4:37 Yes chr3R:21777203-21777847 lnc-RNF39-4:38 Yes chr3R:21777203-21777847 lnc-RNF39-4:39 Yes chr3R:21777203-21777847 lnc-RNF39-4:21 Yes chr2L:6062989-6063671 lnc-TRIM31-2:2 No - lnc-TRIM15-2:1 No - lnc-TRIM26-2:49 No - lnc-TRIM26-2:46 No - lnc-TRIM26-2:50 No - lnc-TRIM26-2:51 No - lnc-TRIM26-2:41 No - lnc-TRIM26-2:40 No - lnc-TRIM26-2:47 No - lnc-TRIM26-2:42 No - lnc-TRIM26-2:43 No - lnc-TRIM26-2:61 No - lnc-TRIM26-2:52 No - lnc-TRIM26-2:53 No - lnc-TRIM26-2:38 No - lnc-TRIM26-2:54 No - lnc-TRIM26-2:55 No - lnc-TRIM26-2:60 No - lnc-TRIM26-2:56 No - lnc-TRIM26-2:57 No - lnc-TRIM26-2:58 No - lnc-TRIM26-2:44 No - lnc-TRIM26-2:45 No - lnc-TRIM26-2:39 No - lnc-TRIM26-2:59 No - lnc-TRIM26-2:48 No - lnc-GNL1-3:2 No - lnc-GNL1-3:3 No - lnc-GNL1-3:1 No - LINC02569:9 No - LINC02569:10 No - LINC02569:11 No - LINC02569:12 No - lnc-FLOT1-1:3 No - lnc-FLOT1-1:2 No - IER3-AS1:10 No - IER3-AS1:13 No - HCG20:3 No - HCG20:4 No - lnc-TUBB-17:1 No - lnc-IER3-15:18 No - lnc-IER3-15:11 No - lnc-IER3-15:12 No - lnc-IER3-15:13 No - lnc-IER3-15:19 No - lnc-IER3-15:14 No - lnc-IER3-15:16 No - lnc-IER3-15:20 No - lnc-IER3-15:15 No - lnc-IER3-15:17 No - lnc-IER3-15:2 No - lnc-IER3-15:3 No - lnc-IER3-15:4 No - lnc-IER3-15:5 No - lnc-HLA-B-2:11 No - lnc-HLA-B-2:12 No - lnc-HLA-B-2:6 No - lnc-HLA-B-2:7 No - lnc-HLA-B-2:8 No - lnc-HLA-B-2:9 No - HCP5:7 No - HCP5:8 No - HCP5:9 No - HCP5:10 No - HCP5:11 No - lnc-ATP6V1G2-DDX39B-5:1 No - lnc-BAG6-2:1 No - lnc-CLIC1-2:1 No - lnc-BTNL2-2:1 No - lnc-HLA-DQA1-10:1 No - lnc-HLA-DQA1-9:1 No - lnc-HLA-DRB1-7:1 No - lnc-HLA-DRB1-8:1 No - lnc-HLA-DRB1-8:2 No - lnc-HLA-DQA1-8:1 No - lnc-TAP1-1:1 No - lnc-TAP1-1:2 No - lnc-PSMB9-6:15 No - lnc-PSMB9-6:11 No - lnc-PSMB9-6:12 No - lnc-PSMB9-6:13 No - lnc-PSMB9-6:14 No - lnc-HLA-DOA-2:1 No - lnc-HLA-DOA-2:2 No - lnc-HLA-DPB1-13:1 No - lnc-HLA-DPB1-13:2 No - lnc-PFDN6-2:2 Yes chr3L:13906897-13925335 lnc-PFDN6-3:1 No - lnc-CUTA-2:1 Yes chrX:17710144-17752007 SYNGAP1-AS1:11 No - SYNGAP1-AS1:9 No - SYNGAP1-AS1:12 No - lnc-ITPR3-6:1 No - lnc-ITPR3-6:2 No - lnc-GRM4-2:1 No - lnc-GRM4-2:2 No - lnc-GRM4-2:3 No - lnc-HMGA1-10:1 No - lnc-SMIM29-1:1 No - lnc-SPDEF-2:1 Yes chr3R:20832799-20840118 lnc-SNRPC-2:9 No - lnc-SNRPC-2:10 No - lnc-C6orf106-2:3 No - lnc-C6orf106-2:2 No - lnc-C6orf106-2:1 No - lnc-C6orf106-2:4 No - lnc-TCP11-2:4 No - lnc-TCP11-2:3 No - lnc-TCP11-2:5 No - lnc-TCP11-2:6 No - lnc-TCP11-2:9 No - lnc-TCP11-2:7 No - lnc-TCP11-2:8 No - lnc-RPL10A-2:1 Yes chr2R:21101928-21123704 lnc-RPL10A-2:2 Yes chr2R:21101928-21123704 lnc-RPL10A-1:2 No - lnc-RPL10A-1:3 No - lnc-RPL10A-1:6 No - lnc-RPL10A-1:7 No - lnc-RPL10A-1:5 No - lnc-RPL10A-1:8 Yes chr2L:9888005-9890119 lnc-RPL10A-1:4 Yes chr2L:9888005-9890119 lnc-CLPS-2:1 No - lnc-LHFPL5-1:1 Yes chr2R:15380724-15387851 lnc-LHFPL5-1:2 Yes chr2R:15380724-15387851 lnc-LHFPL5-1:3 Yes chr2R:15380724-15387851 lnc-LHFPL5-1:4 Yes chr2R:15380724-15387851 lnc-LHFPL5-1:5 Yes chr2R:15380724-15387851 lnc-SLC26A8-1:7 No - lnc-SLC26A8-1:3 No - lnc-SLC26A8-1:4 Yes chr2R:7272275-7278101 lnc-SLC26A8-1:8 No - lnc-SLC26A8-1:9 No - lnc-SLC26A8-1:10 No - lnc-SLC26A8-1:6 No - lnc-SLC26A8-1:5 Yes chr2R:7272275-7278101 lnc-C6orf222-4:2 Yes chr3L:14776496-14786412 lnc-C6orf222-4:3 Yes chr3L:14776496-14786412 lnc-C6orf222-4:4 Yes chr3L:14776496-14786412 lnc-C6orf222-4:5 Yes chr3L:14776496-14786412 lnc-C6orf222-4:1 Yes chr3L:14776496-14786412 lnc-CPNE5-4:1 No - lnc-FGD2-2:1 No - lnc-FGD2-2:2 No - lnc-TMEM217-4:1 No - lnc-CCDC167-5:1 No - lnc-CMTR1-15:1 No - LINC02520:26 No - LINC02520:27 No - LINC02520:28 No - LINC02520:29 No - lnc-CCDC167-6:1 No - LINC02520:30 No - LINC02520:31 No - LINC02520:32 No - LINC02520:33 No - LINC02520:34 No - LINC02520:38 No - lnc-MDGA1-1:2 No - lnc-MDGA1-1:3 No - lnc-MDGA1-1:5 No - lnc-MDGA1-1:6 No - lnc-MDGA1-1:4 No - lnc-DNAH8-2:6 No - lnc-DNAH8-2:7 No - lnc-DNAH8-2:8 No - lnc-DNAH8-2:9 No - lnc-MOCS1-6:1 Yes chrX:1289713-1322362 lnc-OARD1-1:5 No - lnc-OARD1-1:6 No - lnc-OARD1-1:7 No - lnc-OARD1-1:8 No - lnc-OARD1-1:9 No - lnc-TREML2-4:4 No - FOXP4-AS1:10 No - FOXP4-AS1:11 No - FOXP4-AS1:12 No - FOXP4-AS1:15 No - FOXP4-AS1:9 No - FOXP4-AS1:13 No - FOXP4-AS1:14 No - lnc-BYSL-3:1 No - lnc-C6orf226-1:1 No - lnc-PEX6-3:4 No - lnc-PEX6-3:3 Yes chr3L:19094890-19096217 lnc-PEX6-3:2 Yes chr3L:19094890-19096217 lnc-PEX6-3:1 Yes chr3L:19094890-19096217 lnc-MRPL2-2:2 No - lnc-MRPL2-2:1 No - lnc-MRPL2-2:3 No - lnc-DNPH1-1:1 No - lnc-DNPH1-1:2 No - lnc-ABCC10-3:1 No - lnc-ABCC10-3:2 No - lnc-VEGFA-3:1 No - lnc-SLC35B2-1:1 Yes chr3L:3192969-3197059 lnc-AARS2-4:3 No - lnc-AARS2-4:4 No - lnc-AARS2-4:1 Yes chr3L:357851-361383 lnc-AARS2-4:5 Yes chr3L:357851-361383 lnc-AARS2-4:6 Yes chr3L:357851-361383 lnc-AARS2-4:2 Yes chr3L:357851-361383 lnc-SUPT3H-2:3 No - lnc-SUPT3H-2:2 No - lnc-SUPT3H-2:4 No - lnc-RUNX2-6:1 No - lnc-RUNX2-6:2 No - lnc-CLIC5-1:7 No - lnc-CLIC5-1:8 No - lnc-CLIC5-1:9 No - lnc-CLIC5-1:10 No - lnc-CLIC5-1:6 No - lnc-SLC25A27-2:4 No - lnc-SLC25A27-2:5 No - lnc-ANKRD66-1:1 No - lnc-MEP1A-5:1 No - lnc-MEP1A-5:2 No - lnc-TNFRSF21-4:2 No - lnc-TNFRSF21-4:3 No - lnc-DEFB112-3:3 No - lnc-DEFB112-3:4 No - lnc-DEFB112-3:1 No - lnc-DEFB112-3:2 No - lnc-MCM3-3:3 No - lnc-MCM3-3:1 No - lnc-MCM3-2:1 No - lnc-MCM3-3:2 No - lnc-MCM3-3:5 No - lnc-MCM3-3:6 No - TRAM2-AS1:20 No - TRAM2-AS1:21 No - TRAM2-AS1:22 No - TRAM2-AS1:23 No - TRAM2-AS1:24 No - TRAM2-AS1:25 No - TRAM2-AS1:26 No - TRAM2-AS1:28 No - TRAM2-AS1:27 No - TRAM2-AS1:29 No - TRAM2-AS1:30 No - TRAM2-AS1:31 No - TRAM2-AS1:32 No - TRAM2-AS1:33 No - lnc-GSTA2-3:1 No - lnc-GSTA2-3:2 No - lnc-FBXO9-1:3 No - lnc-FBXO9-7:1 No - lnc-KLHL31-2:10 No - lnc-KLHL31-2:11 No - lnc-KLHL31-2:7 No - lnc-KLHL31-2:8 No - lnc-KLHL31-2:9 No - lnc-KLHL31-11:1 Yes chr3R:26536350-26604051 lnc-HMGCLL1-4:1 No - lnc-HMGCLL1-4:2 No - lnc-HMGCLL1-4:3 No - lnc-HMGCLL1-4:4 No - lnc-HMGCLL1-1:2 No - lnc-HMGCLL1-1:3 No - lnc-HMGCLL1-1:4 No - lnc-COL21A1-9:1 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-COL21A1-9:2 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-BEND6-1:6 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-BEND6-1:7 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-BEND6-1:8 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-BEND6-1:9 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-BEND6-1:10 Yes chr2R:13864237-13942110 lnc-BEND6-3:1 No - lnc-BEND6-3:2 No - lnc-RAB23-1:4 No - lnc-RAB23-1:5 No - lnc-RAB23-53:11 No - lnc-RAB23-53:12 No - lnc-RAB23-53:13 No - lnc-RAB23-53:14 No - lnc-RAB23-53:15 No - lnc-RAB23-53:16 No - lnc-RAB23-53:17 No - lnc-RAB23-53:18 No - lnc-PRIM2-7:2 No - lnc-PRIM2-7:3 No - lnc-PRIM2-7:4 No - lnc-PRIM2-7:5 No - lnc-PRIM2-7:6 No - lnc-RAB23-5:3 No - lnc-RAB23-5:4 No - lnc-RAB23-5:2 No - lnc-PRIM2-13:1 No - lnc-PRIM2-13:2 No - lnc-FKBP1C-3:1 No - lnc-PHF3-1:5 No - lnc-PHF3-1:4 No - lnc-PHF3-1:6 No - lnc-PHF3-1:8 No - lnc-PHF3-1:7 No - lnc-PHF3-1:9 No - lnc-PHF3-1:10 No - lnc-PHF3-1:12 No - lnc-PHF3-1:11 No - lnc-PHF3-1:13 No - lnc-PHF3-1:14 No - lnc-LMBRD1-8:1 No - lnc-LMBRD1-5:17 No - lnc-LMBRD1-5:1 No - lnc-LMBRD1-5:18 No - lnc-LMBRD1-5:8 No - lnc-LMBRD1-5:9 No - lnc-LMBRD1-5:2 No - lnc-LMBRD1-5:19 No - lnc-LMBRD1-5:3 No - lnc-LMBRD1-5:4 No - lnc-LMBRD1-5:20 No - lnc-LMBRD1-5:21 No - lnc-FAM135A-1:7 No - LINC00472:70 No - LINC00472:63 No - LINC00472:64 No - LINC00472:59 No - LINC00472:56 No - LINC00472:57 No - LINC00472:65 No - LINC00472:66 No - LINC00472:69 No - LINC00472:62 No - LINC00472:67 No - LINC00472:58 No - LINC00472:68 No - LINC00472:60 No - LINC00472:61 No - lnc-KHDC3L-2:2 No - lnc-KHDC3L-2:3 No - lnc-KHDC3L-2:4 No - lnc-KHDC3L-2:5 No - lnc-KHDC3L-2:12 No - lnc-MTO1-1:3 Yes chr3R:31738468-31743306 lnc-MTO1-1:4 Yes chr3R:31738468-31743306 lnc-MTO1-1:5 Yes chr3R:31738468-31743306 lnc-MTO1-1:6 Yes chr3R:31738468-31743306 lnc-MTO1-1:7 No - lnc-MTO1-1:8 No - lnc-SLC17A5-1:6 Yes chr2L:19548507-19556451 lnc-SLC17A5-1:7 Yes chr2L:19548507-19556451 lnc-SLC17A5-1:4 Yes chr2L:19548507-19556451 lnc-SLC17A5-1:3 Yes chr2L:19548507-19556451 lnc-SLC17A5-1:5 Yes chr2L:19548507-19556451 lnc-CD109-3:5 No - lnc-CD109-3:3 No - lnc-CD109-3:4 No - lnc-CD109-3:6 No - lnc-SENP6-3:9 No - lnc-SENP6-3:7 No - lnc-SENP6-3:10 No - lnc-SENP6-3:11 No - lnc-SENP6-3:12 No - lnc-SENP6-3:8 No - lnc-SENP6-3:13 No - lnc-FILIP1-4:1 Yes chrX:12760642-12763611 lnc-IMPG1-2:2 No - lnc-HTR1B-1:2 No - lnc-HTR1B-1:3 No - lnc-HTR1B-1:4 No - lnc-HTR1B-1:5 No - lnc-HTR1B-1:6 No - lnc-HTR1B-1:7 No - lnc-HTR1B-2:6 No - lnc-HTR1B-2:7 No - lnc-HTR1B-2:3 No - lnc-HTR1B-2:4 No - lnc-HTR1B-2:8 No - lnc-HTR1B-2:5 No - lnc-PHIP-3:2 No - lnc-PHIP-3:3 No - lnc-PHIP-3:4 No - lnc-PHIP-3:5 No - lnc-IRAK1BP1-3:2 No - lnc-IRAK1BP1-3:3 No - lnc-IRAK1BP1-3:4 No - lnc-IRAK1BP1-3:5 No - lnc-IRAK1BP1-8:1 No - lnc-SH3BGRL2-2:5 No - lnc-SH3BGRL2-2:9 No - lnc-SH3BGRL2-2:8 No - lnc-SH3BGRL2-2:10 No - lnc-SH3BGRL2-2:12 No - LINC01621:5 No - LINC01621:6 No - LINC01621:3 No - LINC01621:4 No - lnc-ELOVL4-4:1 Yes chr3R:17671271-17673828 lnc-ELOVL4-5:1 No - lnc-ELOVL4-5:2 No - lnc-ELOVL4-5:3 No - lnc-ELOVL4-5:4 No - lnc-TPBG-10:1 No - lnc-TPBG-10:2 No - lnc-TPBG-10:3 No - lnc-TPBG-10:4 No - lnc-TPBG-9:1 No - lnc-TPBG-9:2 No - lnc-TPBG-9:3 No - lnc-TPBG-9:4 No - lnc-TPBG-8:1 No - LINC01611:4 No - LINC01611:5 No - LINC01611:11 No - LINC01611:12 No - LINC01611:10 No - LINC01611:13 No - LINC01611:6 No - LINC01611:7 No - LINC01611:8 No - LINC01611:9 No - lnc-NT5E-10:1 No - lnc-NT5E-10:2 No - lnc-NT5E-10:3 No - lnc-NT5E-10:4 No - lnc-NT5E-10:5 No - LINC02535:23 No - LINC02535:17 No - LINC02535:18 No - LINC02535:24 No - LINC02535:16 Yes chr2R:17485002-17493169 LINC02535:15 Yes chr2R:17485002-17493169 LINC02535:19 No - lnc-NT5E-9:1 Yes chr3R:20756729-20810726 lnc-NT5E-9:2 No - SNHG5:29 No - SNHG5:30 No - SNHG5:37 No - SNHG5:32 No - SNHG5:40 No - SNHG5:31 No - SNHG5:33 No - SNHG5:41 No - SNHG5:38 No - SNHG5:42 No - SNHG5:43 No - SNHG5:44 No - SNHG5:45 No - SNHG5:46 No - SNHG5:47 No - SNHG5:48 No - SNHG5:34 No - SNHG5:35 No - SNHG5:36 No - SNHG5:39 No - lnc-NT5E-11:2 No - lnc-NT5E-11:1 No - lnc-NT5E-11:3 No - lnc-CGA-2:3 No - lnc-CGA-2:2 No - lnc-CGA-2:4 No - lnc-CGA-2:5 No - lnc-CGA-2:6 No - lnc-CGA-2:8 No - lnc-CGA-2:7 No - lnc-SRSF12-4:1 No - lnc-SRSF12-1:3 No - lnc-SRSF12-1:2 No - lnc-SRSF12-2:1 No - lnc-SRSF12-3:1 No - lnc-SRSF12-3:2 No - lnc-SRSF12-3:3 No - lnc-SRSF12-3:5 No - lnc-SRSF12-3:6 No - lnc-SRSF12-3:7 No - lnc-SRSF12-3:8 No - lnc-SRSF12-3:4 No - lnc-ANKRD6-3:1 No - lnc-ANKRD6-5:1 No - lnc-ANKRD6-1:7 No - lnc-ANKRD6-1:8 No - lnc-GJA10-23:1 No - lnc-GJA10-23:2 No - lnc-GJA10-23:3 No - lnc-GJA10-23:4 No - lnc-GJA10-24:1 No - lnc-GJA10-24:2 No - lnc-GJA10-24:3 No - lnc-MANEA-19:1 No - MANEA-DT:19 No - MANEA-DT:20 No - MANEA-DT:21 No - MANEA-DT:22 No - MANEA-DT:14 Yes chr2L:5536850-5539196 MANEA-DT:15 Yes chr2L:5536850-5539196 MANEA-DT:23 No - MANEA-DT:24 No - UFL1-AS1:2 Yes chr3R:7071624-7074452 UFL1-AS1:3 Yes chr3R:7071624-7074452 UFL1-AS1:4 Yes chr3R:7071624-7074452 UFL1-AS1:5 Yes chr3R:7071624-7074452 UFL1-AS1:6 Yes chr3R:7071624-7074452 UFL1-AS1:7 Yes chr3R:7071624-7074452 lnc-NDUFAF4-5:1 No - lnc-KLHL32-4:25 No - lnc-KLHL32-4:26 No - lnc-KLHL32-4:27 No - lnc-KLHL32-4:29 No - lnc-KLHL32-4:28 No - lnc-KLHL32-4:30 No - lnc-KLHL32-4:31 No - lnc-KLHL32-4:34 No - lnc-KLHL32-4:32 No - lnc-KLHL32-4:33 No - lnc-KLHL32-4:35 No - lnc-KLHL32-4:36 No - lnc-KLHL32-4:37 No - lnc-KLHL32-4:38 No - lnc-KLHL32-4:39 No - lnc-KLHL32-4:40 No - lnc-KLHL32-4:41 No - lnc-KLHL32-4:42 No - lnc-KLHL32-4:43 No - lnc-KLHL32-4:44 No - lnc-KLHL32-4:45 No - lnc-KLHL32-4:46 No - lnc-KLHL32-4:47 No - lnc-KLHL32-4:48 No - lnc-KLHL32-4:49 No - lnc-KLHL32-4:50 No - lnc-KLHL32-4:51 No - lnc-TSTD3-2:3 Yes chr3R:11949680-11954038 lnc-GRIK2-2:5 No - lnc-GRIK2-2:6 No - lnc-GRIK2-2:7 No - lnc-GRIK2-2:4 No - lnc-GRIK2-2:8 No - lnc-GRIK2-2:9 No - lnc-GRIK2-2:10 No - LIN28B-AS1:3 Yes chr3L:5654681-5657384 LIN28B-AS1:9 Yes chr3L:5654681-5657384 LIN28B-AS1:8 Yes chr3L:5654681-5657384 LIN28B-AS1:4 Yes chr3L:5654681-5657384 LIN28B-AS1:10 Yes chr3L:5654681-5657384 BVES-AS1:7 No - BVES-AS1:8 Yes chrX:21053963-21082391 BVES-AS1:9 Yes chrX:21053963-21082391 BVES-AS1:10 Yes chrX:21053963-21082391 BVES-AS1:11 Yes chrX:21053963-21082391 BVES-AS1:12 Yes chrX:21053963-21082391 lnc-LIN28B-10:1 No - lnc-LIN28B-10:2 No - lnc-LIN28B-10:3 No - lnc-LIN28B-10:4 No - lnc-LIN28B-10:6 No - lnc-LIN28B-10:7 No - lnc-LIN28B-10:8 No - lnc-PREP-5:1 No - lnc-PRDM1-9:1 No - lnc-PRDM1-9:2 No - lnc-PRDM1-5:1 No - lnc-ATG5-7:1 No - lnc-ATG5-7:4 No - lnc-ATG5-7:3 No - lnc-ATG5-7:2 No - lnc-RTN4IP1-6:1 Yes chrX:7314622-7323770 lnc-ATG5-3:4 No - lnc-RTN4IP1-1:3 No - lnc-QRSL1-2:4 No - lnc-QRSL1-2:5 No - LINC02532:32 No - LINC02532:33 No - LINC02532:34 No - LINC02532:35 No - LINC02532:36 No - LINC02532:37 No - LINC02532:38 No - LINC02532:48 No - lnc-SOBP-4:1 Yes chr3L:21027915-21030141 lnc-SOBP-3:1 No - lnc-SOBP-3:2 No - lnc-SOBP-3:3 No - lnc-NR2E1-4:4 No - lnc-NR2E1-4:5 No - lnc-AFG1L-2:2 No - lnc-AFG1L-2:3 No - lnc-SESN1-6:1 Yes chrX:11156676-11159760 lnc-SESN1-4:1 Yes chrX:11156676-11159760 lnc-CEP57L1-3:1 Yes chr2R:23713900-23734846 lnc-CEP57L1-3:2 Yes chr2R:23713900-23734846 lnc-SMPD2-1:2 No - lnc-CDC40-6:1 No - lnc-CDC40-6:2 No - lnc-CDK19-5:1 No - lnc-CDK19-6:1 No - lnc-CDK19-7:1 No - lnc-CDK19-7:2 No - TRAF3IP2-AS1:31 Yes chr2R:7793625-7801044 TRAF3IP2-AS1:32 Yes chr2R:7793625-7801044 TRAF3IP2-AS1:34 Yes chr2R:7793625-7801044 TRAF3IP2-AS1:33 Yes chr2R:7793625-7801044 TRAF3IP2-AS1:36 No - TRAF3IP2-AS1:37 No - TRAF3IP2-AS1:38 No - TRAF3IP2-AS1:41 Yes chr2R:7793625-7801044 TRAF3IP2-AS1:42 Yes chr2R:7793625-7801044 TRAF3IP2-AS1:44 Yes chr2R:7793625-7801044 TRAF3IP2-AS1:45 Yes chr2R:7793625-7801044 TRAF3IP2-AS1:46 No - TRAF3IP2-AS1:47 No - TRAF3IP2-AS1:48 No - TRAF3IP2-AS1:43 No - TRAF3IP2-AS1:51 No - TRAF3IP2-AS1:49 No - TRAF3IP2-AS1:50 No - TRAF3IP2-AS1:52 No - TRAF3IP2-AS1:53 No - TRAF3IP2-AS1:57 No - TRAF3IP2-AS1:55 No - TRAF3IP2-AS1:56 No - lnc-WISP3-2:2 No - lnc-WISP3-2:4 No - lnc-WISP3-2:3 No - lnc-WISP3-8:1 No - lnc-WISP3-7:1 No - lnc-WISP3-6:1 No - lnc-TUBE1-8:1 No - lnc-HDAC2-4:6 No - lnc-HDAC2-4:5 No - lnc-HDAC2-4:11 No - lnc-HDAC2-4:12 No - lnc-HDAC2-4:13 No - lnc-HDAC2-4:7 No - lnc-HDAC2-4:14 No - lnc-HDAC2-4:15 No - lnc-HDAC2-4:8 No - lnc-HDAC2-4:9 No - lnc-HDAC2-4:16 No - lnc-HDAC2-4:10 No - LINC02541:49 No - LINC02541:50 No - LINC02541:34 No - LINC02541:40 No - LINC02541:35 No - LINC02541:51 No - LINC02541:54 No - LINC02541:41 No - LINC02541:42 No - LINC02541:36 No - LINC02541:52 No - LINC02541:53 No - LINC02541:43 No - LINC02541:37 No - LINC02541:44 No - LINC02541:55 No - LINC02541:56 No - lnc-HDAC2-14:1 No - LINC02541:38 No - LINC01268:10 No - LINC01268:11 No - LINC01268:6 No - LINC01268:9 No - lnc-MARCKS-1:4 No - lnc-MARCKS-1:5 No - lnc-MARCKS-1:6 No - lnc-MARCKS-1:7 No - lnc-MARCKS-1:8 No - lnc-MARCKS-1:9 No - HDAC2-AS2:67 Yes chr3L:4626734-4629467 HDAC2-AS2:68 Yes chr3L:4626734-4629467 HDAC2-AS2:69 Yes chr3L:4626734-4629467 HDAC2-AS2:70 Yes chr3L:4626734-4629467 HDAC2-AS2:71 No - HDAC2-AS2:72 No - HDAC2-AS2:73 No - HDAC2-AS2:77 Yes chr3L:4626734-4629467 HDAC2-AS2:78 Yes chr3L:4626734-4629467 HDAC2-AS2:79 Yes chr3L:4626734-4629467 HDAC2-AS2:80 Yes chr3L:4626734-4629467 HDAC2-AS2:81 Yes chr3L:4626734-4629467 HDAC2-AS2:84 Yes chr3L:4626734-4629467 HDAC2-AS2:85 Yes chr3L:4626734-4629467 HDAC2-AS2:86 Yes chr3L:4626734-4629467 HDAC2-AS2:87 Yes chr3L:4626734-4629467 HDAC2-AS2:88 No - HDAC2-AS2:89 No - HDAC2-AS2:90 No - HDAC2-AS2:91 No - HDAC2-AS2:97 Yes chr3L:4626734-4629467 HDAC2-AS2:98 Yes chr3L:4626734-4629467 HDAC2-AS2:99 No - HDAC2-AS2:100 No - HDAC2-AS2:101 No - HDAC2-AS2:111 Yes chr2R:18718114-18754675 HDAC2-AS2:112 Yes chr2R:18718114-18754675 HDAC2-AS2:113 Yes chr2R:18718114-18754675 HDAC2-AS2:114 Yes chr2R:18718114-18754675 HDAC2-AS2:115 Yes chr2R:18718114-18754675 HDAC2-AS2:117 Yes chr2R:18718114-18754675 HDAC2-AS2:118 Yes chr2R:18718114-18754675 HDAC2-AS2:119 Yes chr2R:18718114-18754675 HDAC2-AS2:120 Yes chr2R:18718114-18754675 lnc-NT5DC1-4:3 No - lnc-NT5DC1-4:4 No - lnc-NT5DC1-1:4 No - lnc-NT5DC1-1:3 No - lnc-TSPYL1-3:1 No - lnc-TSPYL1-3:2 No - lnc-TRAPPC3L-3:1 No - lnc-TRAPPC3L-3:2 No - lnc-ZUFSP-1:2 No - lnc-ZUFSP-4:3 No - lnc-ZUFSP-4:4 No - lnc-GOPC-1:7 No - lnc-GOPC-1:2 No - lnc-GOPC-1:3 No - lnc-GOPC-1:4 No - lnc-DCBLD1-3:1 No - lnc-GOPC-1:5 No - lnc-GOPC-1:6 No - lnc-ASF1A-1:2 No - lnc-ASF1A-1:3 No - lnc-GJA1-8:1 No - lnc-GJA1-8:2 No - lnc-GJA1-8:3 No - lnc-SERINC1-8:1 No - lnc-SERINC1-8:3 No - lnc-SERINC1-8:2 No - lnc-SMPDL3A-2:1 No - lnc-SMPDL3A-2:2 No - lnc-NKAIN2-6:1 No - lnc-NKAIN2-6:2 No - RNF217-AS1:16 No - RNF217-AS1:17 No - RNF217-AS1:18 No - RNF217-AS1:20 No - RNF217-AS1:19 No - RNF217-AS1:12 No - RNF217-AS1:13 No - RNF217-AS1:14 No - RNF217-AS1:6 No - RNF217-AS1:15 No - RNF217-AS1:7 No - RNF217-AS1:8 No - RNF217-AS1:5 No - RNF217-AS1:10 No - RNF217-AS1:9 No - RNF217-AS1:11 No - lnc-HDDC2-5:12 Yes chr2R:7995438-7998278 lnc-HDDC2-5:13 Yes chr2R:7995438-7998278 lnc-HDDC2-5:14 Yes chr2R:7995438-7998278 lnc-HDDC2-5:19 No - lnc-HDDC2-5:20 No - lnc-HDDC2-5:21 No - lnc-HDDC2-5:18 Yes chr2R:7995438-7998278 lnc-HDDC2-5:15 Yes chr2R:7995438-7998278 lnc-HDDC2-5:16 Yes chr2R:7995438-7998278 lnc-HDDC2-5:17 Yes chr2R:7995438-7998278 lnc-HDDC2-5:11 Yes chr2R:7995438-7998278 lnc-HDDC2-15:1 No - lnc-HDDC2-15:2 No - lnc-ECHDC1-5:1 Yes chr3L:19637207-19642816 lnc-ECHDC1-5:2 Yes chr3L:19637207-19642816 lnc-LAMA2-5:1 No - lnc-LAMA2-5:2 No - lnc-ARHGAP18-1:8 No - lnc-ARHGAP18-1:9 No - lnc-ARHGAP18-1:10 No - lnc-ARHGAP18-1:11 No - lnc-ARHGAP18-1:7 No - lnc-AKAP7-1:2 No - lnc-AKAP7-1:3 No - lnc-AKAP7-1:4 No - lnc-AKAP7-1:5 No - lnc-AKAP7-1:6 No - LINC01013:20 No - LINC01013:21 No - LINC01013:22 No - LINC01013:23 No - LINC01013:24 No - LINC01013:25 No - lnc-TAAR9-3:1 No - lnc-TAAR9-3:2 Yes chr3L:21445834-21448128 lnc-TAAR9-3:3 Yes chr3L:21445834-21448128 lnc-TAAR9-3:4 Yes chr3L:21445834-21448128 lnc-TAAR9-3:5 Yes chr3L:21445834-21448128 TARID:16 No - TARID:18 Yes chr2L:6527447-6546976 TARID:19 No - TARID:22 No - TARID:17 Yes chr2R:17757405-17760517 TARID:23 No - TARID:20 No - TARID:21 No - lnc-SLC2A12-12:1 Yes chrX:8409272-8433011 lnc-SLC2A12-12:2 Yes chrX:8409272-8433011 lnc-SLC2A12-12:3 Yes chrX:8409272-8433011 lnc-SLC2A12-12:4 Yes chrX:8409272-8433011 lnc-TBPL1-6:1 No - lnc-SGK1-9:2 No - lnc-SGK1-9:1 No - lnc-SGK1-9:3 No - lnc-SGK1-5:4 No - lnc-SGK1-5:5 No - lnc-SGK1-5:2 No - lnc-SGK1-5:3 No - LINC01010:11 No - LINC01010:12 No - LINC01010:13 No - LINC01010:14 No - LINC01010:15 No - LINC01010:16 No - lnc-SGK1-3:13 No - lnc-SGK1-3:14 No - lnc-SGK1-3:15 No - lnc-SGK1-3:16 No - lnc-SGK1-3:17 No - lnc-SGK1-3:12 No - lnc-MYB-14:1 No - lnc-MYB-3:3 Yes chr3L:1862881-1865240 lnc-MYB-3:4 Yes chr3L:1862881-1865240 lnc-MYB-3:5 Yes chr3L:1862881-1865240 lnc-HBS1L-3:3 No - lnc-HBS1L-3:1 No - lnc-HBS1L-3:2 No - lnc-HBS1L-3:4 No - lnc-HBS1L-3:5 No - lnc-MYB-1:2 No - LINC00271:18 No - LINC00271:19 No - LINC00271:20 No - LINC00271:17 No - LINC00271:21 No - LINC00271:22 No - LINC00271:23 No - LINC00271:24 No - LINC00271:26 No - LINC00271:27 No - LINC00271:28 No - LINC00271:25 No - LINC00271:29 No - LINC00271:30 No - lnc-PDE7B-8:1 No - lnc-PDE7B-8:2 No - lnc-PDE7B-8:3 No - lnc-MAP3K5-3:3 No - lnc-PEX7-2:5 No - lnc-PEX7-2:6 No - lnc-PEX7-2:7 No - lnc-PEX7-2:8 No - lnc-PEX7-2:9 No - lnc-PEX7-2:10 No - lnc-PEX7-1:3 Yes chr3R:19879719-19886030 lnc-PEX7-1:5 Yes chr3R:19879719-19886030 lnc-PEX7-1:6 Yes chr3R:19879719-19886030 lnc-PEX7-1:7 Yes chr3R:19879719-19886030 lnc-PEX7-4:1 Yes chr3R:19879719-19886030 lnc-SLC35D3-3:1 No - lnc-TNFAIP3-3:6 No - lnc-TNFAIP3-3:8 No - lnc-TNFAIP3-3:7 No - lnc-TNFAIP3-3:9 No - lnc-TNFAIP3-3:10 No - lnc-TNFAIP3-15:1 No - lnc-TNFAIP3-15:2 No - lnc-TNFAIP3-15:4 No - lnc-TNFAIP3-15:3 No - lnc-OLIG3-4:1 No - lnc-TNFAIP3-14:1 No - lnc-TNFAIP3-14:2 No - lnc-TNFAIP3-13:1 No - lnc-PERP-11:1 No - lnc-TNFAIP3-12:1 No - lnc-PERP-2:35 No - lnc-PERP-2:34 No - lnc-PERP-2:12 No - lnc-TNFAIP3-1:6 No - lnc-TNFAIP3-1:7 No - lnc-PERP-2:17 No - lnc-PERP-2:13 No - lnc-PERP-2:30 No - lnc-PERP-2:26 No - lnc-PERP-2:27 No - lnc-PERP-2:28 No - lnc-PERP-2:29 No - lnc-PERP-2:18 No - lnc-PERP-2:14 No - lnc-PERP-2:15 No - lnc-PERP-2:33 No - lnc-PERP-2:21 No - lnc-PERP-2:19 No - lnc-PERP-2:20 No - lnc-PERP-2:16 No - lnc-PERP-2:22 No - lnc-PERP-2:23 No - lnc-PERP-2:25 No - lnc-PERP-2:31 No - lnc-PERP-2:32 No - lnc-PERP-2:11 No - lnc-PERP-1:2 No - lnc-PERP-1:3 No - lnc-PERP-1:4 No - lnc-PERP-1:5 No - lnc-PERP-1:6 No - lnc-CCDC28A-1:10 No - lnc-CCDC28A-1:11 No - lnc-CCDC28A-1:13 No - lnc-GVQW2-1:1 No - lnc-GVQW2-1:2 No - lnc-GVQW2-1:3 No - lnc-GVQW2-1:7 No - lnc-GVQW2-1:4 No - lnc-REPS1-2:2 No - lnc-REPS1-2:3 No - lnc-HECA-1:3 No - lnc-HECA-1:8 Yes chr3R:25851632-25853989 lnc-HECA-1:6 No - lnc-HECA-1:9 Yes chr3R:25851632-25853989 lnc-HECA-1:10 Yes chr3R:25851632-25853989 lnc-HECA-11:1 No - LINC01625:6 No - LINC01625:7 No - LINC01625:8 No - LINC01625:9 No - LINC01625:10 No - lnc-CITED2-8:1 No - lnc-CITED2-8:2 No - FILNC1:17 No - FILNC1:18 No - FILNC1:20 No - FILNC1:21 No - FILNC1:22 No - lnc-HECA-3:13 No - lnc-HECA-3:14 No - lnc-HECA-3:15 No - lnc-HECA-3:16 No - lnc-HECA-3:17 No - lnc-HECA-12:1 No - lnc-HECA-12:2 No - lnc-HECA-3:19 No - lnc-HECA-3:18 No - lnc-HECA-3:20 No - lnc-CITED2-9:1 No - lnc-CITED2-9:2 No - lnc-AIG1-9:1 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-AIG1-8:2 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-AIG1-8:3 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-AIG1-8:4 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-AIG1-8:5 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-AIG1-8:6 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-AIG1-8:7 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-AIG1-8:8 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-AIG1-8:9 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-AIG1-8:10 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-AIG1-8:11 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-AIG1-8:12 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-AIG1-8:13 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-AIG1-8:14 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-AIG1-8:15 Yes chr2R:11159086-11217394 lnc-AIG1-8:16 Yes chr2R:11159086-11217394 LINC01277:14 Yes chr2L:281670-283269 LINC01277:15 Yes chr2L:281670-283269 LINC01277:12 Yes chr2L:281670-283269 LINC01277:13 Yes chr2L:281670-283269 lnc-PLAGL1-2:1 No - lnc-UTRN-3:4 No - lnc-UTRN-3:3 No - lnc-UTRN-3:5 No - lnc-UTRN-3:6 No - lnc-UTRN-3:2 No - lnc-GRM1-13:1 No - lnc-GRM1-13:2 No - lnc-GRM1-13:3 No - lnc-GRM1-1:25 No - lnc-GRM1-1:24 Yes chr3L:6174248-6178941 lnc-GRM1-1:26 Yes chr3L:6174248-6178941 lnc-GRM1-1:27 Yes chr3L:6174248-6178941 lnc-GRM1-1:28 Yes chr3L:6174248-6178941 lnc-GRM1-1:29 Yes chr3L:6174248-6178941 lnc-GRM1-1:30 Yes chr3L:6174248-6178941 lnc-GRM1-1:31 Yes chr3L:6174248-6178941 lnc-GRM1-1:32 Yes chr3L:6174248-6178941 STXBP5-AS1:27 No - STXBP5-AS1:28 No - STXBP5-AS1:30 No - STXBP5-AS1:21 No - STXBP5-AS1:31 No - STXBP5-AS1:29 No - STXBP5-AS1:32 No - STXBP5-AS1:22 No - STXBP5-AS1:23 No - STXBP5-AS1:15 Yes chrX:12631605-12653442 STXBP5-AS1:17 Yes chrX:12631605-12653442 STXBP5-AS1:18 Yes chrX:12631605-12653442 STXBP5-AS1:25 No - STXBP5-AS1:16 Yes chrX:12631605-12653442 STXBP5-AS1:24 No - STXBP5-AS1:33 No - STXBP5-AS1:26 No - lnc-SHPRH-10:1 No - lnc-SHPRH-10:2 No - lnc-SHPRH-9:1 Yes chrX:12631605-12653442 lnc-SAMD5-4:2 Yes chr3R:22133830-22296126 lnc-SAMD5-4:3 Yes chr3R:22133830-22296126 lnc-ZC3H12D-4:4 No - lnc-ZC3H12D-4:5 No - lnc-ZC3H12D-4:6 No - lnc-ZC3H12D-4:7 No - lnc-ZC3H12D-4:8 No - lnc-ZC3H12D-4:3 No - lnc-ZC3H12D-4:9 No - lnc-ZC3H12D-4:11 No - lnc-ZC3H12D-4:12 No - lnc-ZC3H12D-4:10 No - lnc-ZC3H12D-20:1 Yes chr3L:19298623-19337609 lnc-ZC3H12D-20:2 Yes chr3L:19298623-19337609 lnc-ZC3H12D-2:5 Yes chr3L:19298623-19337609 lnc-ZC3H12D-2:2 Yes chr3L:19298623-19337609 lnc-ZC3H12D-2:3 Yes chr3L:19298623-19337609 lnc-ZC3H12D-2:4 Yes chr3L:19298623-19337609 lnc-GINM1-6:1 No - lnc-GINM1-5:1 No - lnc-ULBP2-25:1 No - lnc-ULBP2-25:2 No - lnc-IYD-4:1 No - lnc-IYD-4:2 No - lnc-IYD-4:3 No - lnc-IYD-4:4 No - lnc-ZBTB2-7:1 No - lnc-AKAP12-3:1 No - lnc-VIP-1:4 No - lnc-VIP-1:5 No - lnc-VIP-1:7 No - lnc-VIP-1:9 Yes chr2L:13219979-13221398 lnc-VIP-1:11 Yes chr2L:13219979-13221398 lnc-VIP-1:12 Yes chr2L:13219979-13221398 lnc-VIP-4:2 Yes chr2R:17792870-17800677 lnc-VIP-4:3 Yes chr2R:17792870-17800677 lnc-VIP-4:4 Yes chr2R:17792870-17800677 lnc-VIP-4:5 Yes chr2R:17792870-17800677 lnc-VIP-4:6 Yes chr2R:17792870-17800677 lnc-VIP-3:1 No - lnc-SCAF8-1:5 No - lnc-SCAF8-1:4 No - lnc-SCAF8-1:6 No - lnc-SCAF8-1:7 No - lnc-SCAF8-1:8 No - lnc-CNKSR3-6:1 No - lnc-CLDN20-7:1 No - lnc-NOX3-9:3 No - lnc-NOX3-9:4 No - lnc-NOX3-9:1 No - lnc-NOX3-9:2 No - lnc-NOX3-4:5 No - lnc-NOX3-4:2 No - lnc-NOX3-4:3 No - lnc-NOX3-4:6 No - lnc-NOX3-4:4 No - lnc-TMEM242-11:1 No - lnc-TMEM242-10:2 Yes chr3L:12206238-12266841 lnc-TMEM242-10:1 Yes chr3L:12206238-12266841 lnc-SERAC1-15:1 Yes chr3L:9710422-9713827 lnc-SERAC1-15:2 Yes chr3L:9710422-9713827 lnc-SERAC1-1:2 Yes chr3L:9710422-9713827 lnc-SERAC1-1:3 Yes chr3L:9710422-9713827 lnc-SERAC1-7:2 No - lnc-SERAC1-14:1 No - lnc-SYTL3-150:1 No - lnc-SYTL3-150:2 No - lnc-SYTL3-8:2 No - lnc-EZR-4:1 No - lnc-FNDC1-10:2 No - lnc-FNDC1-10:3 No - lnc-FNDC1-10:4 No - lnc-FNDC1-10:5 No - lnc-FNDC1-10:6 No - lnc-FNDC1-8:1 No - lnc-TAGAP-4:5 No - lnc-TAGAP-4:6 No - lnc-WTAP-4:1 No - lnc-WTAP-4:2 No - lnc-WTAP-4:3 No - lnc-TCP1-6:1 No - lnc-TCP1-6:2 No - lnc-MAP3K4-5:1 No - lnc-MAP3K4-5:2 No - lnc-AGPAT4-1:3 Yes chr3R:18733106-18743594 lnc-MAP3K4-6:1 Yes chr3L:21194754-21196853 lnc-MAP3K4-6:2 Yes chr3L:21194754-21196853 lnc-MAP3K4-6:3 Yes chr3L:21194754-21196853 lnc-PRKN-21:8 No - lnc-PRKN-21:9 No - lnc-PRKN-21:10 No - lnc-PRKN-23:2 Yes chr3R:22042191-22079321 CAHM:6 No - lnc-PRKN-22:3 No - lnc-PRKN-22:4 No - CAHM:3 Yes chr3R:22042191-22079321 CAHM:7 No - CAHM:8 No - CAHM:5 No - CAHM:4 Yes chr3R:22042191-22079321 lnc-QKI-5:4 No - lnc-QKI-5:5 No - LINC00602:2 No - LINC00602:3 No - lnc-FGFR1OP-19:1 No - lnc-FGFR1OP-20:4 No - lnc-FGFR1OP-20:5 No - lnc-FGFR1OP-20:6 No - lnc-PRR18-5:1 No - lnc-PRR18-4:1 No - lnc-FGFR1OP-2:4 No - lnc-FGFR1OP-2:5 No - lnc-FGFR1OP-2:6 No - lnc-FGFR1OP-2:7 No - lnc-FGFR1OP-2:8 No - lnc-RNASET2-1:7 No - lnc-RNASET2-1:3 No - lnc-RNASET2-1:8 No - lnc-RNASET2-1:2 No - lnc-RNASET2-1:10 No - lnc-RNASET2-1:4 No - lnc-RNASET2-1:5 No - lnc-RNASET2-1:6 No - lnc-FGFR1OP-4:7 No - lnc-UNC93A-1:6 No - lnc-UNC93A-1:7 No - lnc-AFDN-1:1 No - lnc-AFDN-1:2 No - lnc-AFDN-1:3 No - AFDN-DT:13 No - AFDN-DT:14 No - AFDN-DT:15 No - AFDN-DT:16 No - AFDN-DT:17 No - lnc-THBS2-5:3 No - lnc-THBS2-5:4 No - lnc-THBS2-12:6 No - lnc-THBS2-12:7 No - lnc-THBS2-12:3 No - lnc-THBS2-12:4 No - lnc-THBS2-12:5 No - LINC01615:10 No - LINC01615:8 No - LINC01615:15 No - LINC01615:11 No - LINC01615:13 No - LINC01615:12 No - LINC01615:14 No - LINC01615:16 No - lnc-SMOC2-8:2 No - lnc-SMOC2-8:4 No - lnc-SMOC2-8:5 No - lnc-SMOC2-8:6 No - lnc-SMOC2-8:3 No - LINC01615:9 No - lnc-SMOC2-8:7 No - lnc-SMOC2-8:11 No - lnc-SMOC2-8:8 No - lnc-SMOC2-8:9 No - lnc-SMOC2-8:10 No - lnc-SMOC2-8:12 No - lnc-C6orf120-1:4 No - lnc-C6orf120-1:5 Yes chr2L:6686791-6709086 lnc-C6orf120-1:8 Yes chr2L:6686791-6709086 LINC02519:19 No - LINC02519:20 No - LINC02519:21 No - lnc-WDR27-1:14 No - LINC02519:22 No - lnc-ERMARD-2:1 Yes chrX:19626548-19638369 lnc-ERMARD-2:2 Yes chrX:19626548-19638369 lnc-ERMARD-2:3 Yes chrX:19626548-19638369 lnc-ERMARD-2:5 Yes chrX:19626548-19638369 lnc-ERMARD-2:6 Yes chrX:19626548-19638369 LINC00574:7 No - LINC00574:8 No - LINC00574:9 No - LINC00574:10 No - LINC00574:11 No - LINC00574:12 No - lnc-FAM120B-11:2 No - lnc-DLL1-3:2 No - lnc-DLL1-3:4 No - lnc-DLL1-3:7 No - lnc-DLL1-3:8 No - lnc-DLL1-3:5 No - lnc-DLL1-3:6 No - lnc-DLL1-3:3 No - lnc-DLL1-1:2 No - lnc-DLL1-1:3 No - lnc-PSMB1-11:1 No - lnc-PSMB1-11:2 No - lnc-PSMB1-6:1 No - lnc-PSMB1-6:2 No - lnc-PSMB1-6:3 No - lnc-PSMB1-6:4 No - lnc-FAM120B-10:1 No - lnc-FAM120B-10:2 No - lnc-FAM120B-10:3 No - lnc-TBP-10:1 No - lnc-TBP-11:1 No - lnc-TBP-11:2 No - lnc-PDGFA-17:11 No - lnc-PDGFA-17:12 No - lnc-PDGFA-17:13 No - lnc-FAM20C-3:11 No - lnc-FAM20C-3:12 No - lnc-FAM20C-3:13 No - lnc-FAM20C-3:15 No - lnc-FAM20C-3:14 No - lnc-PDGFA-17:25 No - lnc-PDGFA-17:14 No - lnc-PDGFA-17:26 No - lnc-PDGFA-17:15 No - lnc-PDGFA-17:16 No - lnc-FAM20C-3:16 No - lnc-FAM20C-3:17 No - lnc-FAM20C-3:18 No - lnc-FAM20C-3:19 No - lnc-FAM20C-3:23 No - lnc-FAM20C-3:20 No - lnc-FAM20C-3:21 No - lnc-FAM20C-3:22 No - lnc-FAM20C-3:24 No - lnc-PDGFA-8:2 No - lnc-PDGFA-8:3 No - lnc-PDGFA-8:4 No - lnc-PDGFA-8:5 No - lnc-PDGFA-8:6 No - lnc-DNAAF5-3:1 No - lnc-DNAAF5-3:2 No - lnc-DNAAF5-3:3 No - lnc-DNAAF5-3:4 No - lnc-DNAAF5-3:5 No - lnc-DNAAF5-3:7 No - lnc-DNAAF5-3:8 No - lnc-DNAAF5-3:9 No - lnc-DNAAF5-3:10 No - lnc-DNAAF5-3:11 No - lnc-DNAAF5-3:12 No - lnc-DNAAF5-3:19 No - lnc-DNAAF5-3:20 No - lnc-DNAAF5-1:1 Yes chr3L:20816118-20836048 lnc-DNAAF5-1:2 Yes chr3L:20816118-20836048 lnc-DNAAF5-1:3 Yes chr3L:20816118-20836048 lnc-DNAAF5-1:4 Yes chr3L:20816118-20836048 lnc-DNAAF5-1:5 Yes chr3L:20816118-20836048 lnc-DNAAF5-1:6 Yes chr3L:20816118-20836048 lnc-DNAAF5-1:7 Yes chr3L:20816118-20836048 lnc-DNAAF5-1:8 Yes chr3L:20816118-20836048 lnc-DNAAF5-1:9 Yes chr3L:20816118-20836048 lnc-DNAAF5-1:10 Yes chr3L:20816118-20836048 lnc-DNAAF5-1:11 Yes chr3L:20816118-20836048 lnc-DNAAF5-1:12 Yes chr3L:20816118-20836048 lnc-DNAAF5-1:13 Yes chr3L:20816118-20836048 lnc-DNAAF5-1:17 Yes chr3L:20816118-20836048 lnc-GPR146-1:2 No - lnc-GPR146-1:3 No - lnc-GPR146-1:4 No - lnc-UNCX-3:19 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-UNCX-3:20 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-UNCX-3:21 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-UNCX-3:22 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-UNCX-3:18 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-UNCX-3:23 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-UNCX-3:25 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-UNCX-3:24 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-UNCX-3:26 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-UNCX-3:27 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-UNCX-3:28 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-UNCX-3:29 Yes chr2L:3452466-3453755 lnc-MAFK-6:1 No - lnc-MAFK-6:2 No - PSMG3-AS1:22 No - PSMG3-AS1:21 No - PSMG3-AS1:23 No - PSMG3-AS1:24 No - PSMG3-AS1:25 No - PSMG3-AS1:26 No - PSMG3-AS1:27 No - PSMG3-AS1:28 No - PSMG3-AS1:29 No - ELFN1-AS1:6 No - ELFN1-AS1:10 No - ELFN1-AS1:7 No - ELFN1-AS1:11 No - ELFN1-AS1:8 No - ELFN1-AS1:9 No - lnc-SNX8-3:1 No - lnc-SNX8-3:2 No - lnc-GRIFIN-4:4 No - lnc-GRIFIN-4:5 No - lnc-GRIFIN-4:6 No - lnc-AMZ1-8:1 No - lnc-GNA12-5:1 No - lnc-CARD11-8:1 No - lnc-CARD11-8:2 No - lnc-CARD11-8:3 No - lnc-CARD11-8:4 No - lnc-RADIL-7:1 No - lnc-RADIL-6:1 No - lnc-SLC29A4-5:6 Yes chr3R:22710883-22721150 lnc-SLC29A4-5:4 Yes chr3R:22710883-22721150 lnc-SLC29A4-5:5 No - lnc-SLC29A4-5:7 No - lnc-SLC29A4-5:8 No - lnc-SLC29A4-5:9 No - lnc-SLC29A4-5:10 No - lnc-SLC29A4-5:12 No - lnc-SLC29A4-5:11 No - lnc-SLC29A4-5:13 No - lnc-SLC29A4-5:14 No - lnc-SLC29A4-5:15 No - lnc-SLC29A4-5:16 No - lnc-FSCN1-1:4 No - lnc-RNF216-2:1 Yes chrX:7964024-7986601 lnc-EIF2AK1-4:1 No - lnc-EIF2AK1-4:2 No - lnc-USP42-1:6 No - lnc-USP42-1:7 No - lnc-EIF2AK1-1:2 No - lnc-GRID2IP-2:2 No - lnc-ZNF316-3:6 No - lnc-ZNF316-3:7 No - lnc-ZNF316-3:8 No - lnc-ZNF316-3:9 No - lnc-COL28A1-1:15 Yes chr2L:2217290-2220625 lnc-COL28A1-1:16 Yes chr2L:2217290-2220625 lnc-COL28A1-1:23 No - lnc-COL28A1-1:21 No - lnc-COL28A1-1:17 Yes chr2L:2217290-2220625 lnc-COL28A1-1:22 No - lnc-COL28A1-1:18 No - lnc-COL28A1-1:19 No - lnc-COL28A1-1:20 No - lnc-RPA3-2:6 No - lnc-ICA1-1:8 No - lnc-ICA1-1:9 No - lnc-ICA1-1:10 No - lnc-ICA1-1:11 No - lnc-ICA1-1:5 No - lnc-ICA1-1:6 No - lnc-ICA1-1:7 No - lnc-ICA1-1:12 No - lnc-ICA1-1:4 No - lnc-NXPH1-2:9 Yes chr3L:21131446-21133310 lnc-NXPH1-2:13 Yes chr3L:21131446-21133310 lnc-NXPH1-2:10 Yes chr3L:21131446-21133310 lnc-NXPH1-2:11 Yes chr3L:21131446-21133310 lnc-NXPH1-2:12 Yes chr3L:21131446-21133310 lnc-NXPH1-2:14 Yes chr3L:21131446-21133310 lnc-NXPH1-2:19 Yes chr3L:21131446-21133310 lnc-NXPH1-2:15 Yes chr3L:21131446-21133310 lnc-NXPH1-2:16 Yes chr3L:21131446-21133310 lnc-NXPH1-2:17 Yes chr3L:21131446-21133310 lnc-NXPH1-2:18 Yes chr3L:21131446-21133310 lnc-ICA1-3:6 No - lnc-ICA1-3:7 No - lnc-ICA1-3:5 No - lnc-PHF14-14:17 No - lnc-PHF14-14:18 No - lnc-PHF14-14:16 No - lnc-PHF14-14:19 No - lnc-VWDE-11:1 No - lnc-ARL4A-11:1 Yes chr2R:7834812-7885982 lnc-ARL4A-11:2 Yes chr2R:7834812-7885982 lnc-ARL4A-11:3 Yes chr2R:7834812-7885982 lnc-ARL4A-11:4 Yes chr2R:7834812-7885982 lnc-ARL4A-11:5 Yes chr2R:7834812-7885982 lnc-LRRC72-10:1 No - lnc-LRRC72-10:2 No - lnc-LRRC72-10:3 No - lnc-LRRC72-10:4 No - lnc-LRRC72-3:2 Yes chr3R:22586149-22586625 LINC02587:12 No - LINC02587:13 No - LINC02587:14 No - lnc-AGR3-1:16 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-AGR3-1:17 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-AGR3-6:1 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-AGR3-1:12 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-AGR3-1:13 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-AGR3-1:18 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-AGR3-1:14 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-AGR3-1:10 No - lnc-AGR3-1:11 No - lnc-AGR3-1:9 No - lnc-AGR3-1:19 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-AGR3-1:15 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-SNX13-2:10 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-SNX13-2:11 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-SNX13-2:8 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-SNX13-2:9 No - lnc-SNX13-3:2 No - lnc-SNX13-3:3 No - lnc-HDAC9-10:2 No - lnc-HDAC9-10:3 No - lnc-HDAC9-10:4 No - lnc-MACC1-1:14 No - lnc-MACC1-1:15 No - lnc-MACC1-1:13 No - lnc-ITGB8-2:10 No - lnc-ITGB8-2:11 No - lnc-ITGB8-2:12 No - lnc-ITGB8-2:13 No - lnc-ITGB8-2:14 No - lnc-MACC1-4:1 No - lnc-MACC1-3:5 No - lnc-MACC1-3:11 No - lnc-MACC1-3:12 No - lnc-MACC1-3:7 No - lnc-MACC1-3:8 No - lnc-MACC1-3:9 No - lnc-MACC1-3:10 No - lnc-MACC1-3:6 No - lnc-ITGB8-12:1 No - lnc-ITGB8-13:1 No - LINC01162:4 No - LINC01162:8 No - LINC01162:5 No - LINC01162:6 No - LINC01162:7 No - lnc-IL6-3:13 No - lnc-IL6-3:14 No - lnc-IL6-3:15 No - lnc-IL6-3:16 No - lnc-IL6-3:17 No - lnc-IL6-3:18 No - lnc-IL6-3:19 No - lnc-IL6-3:20 No - lnc-IL6-3:21 No - lnc-IL6-3:22 No - lnc-IL6-3:23 No - lnc-IL6-3:24 No - lnc-IL6-3:25 No - lnc-IL6-3:26 No - lnc-IL6-3:27 No - lnc-IL6-3:28 No - lnc-IL6-8:3 No - lnc-IL6-8:4 No - SNHG26:24 No - SNHG26:25 No - SNHG26:26 No - SNHG26:27 No - SNHG26:28 No - SNHG26:29 No - SNHG26:30 No - SNHG26:31 No - SNHG26:32 No - SNHG26:33 No - SNHG26:34 No - KLHL7-DT:9 No - KLHL7-DT:10 No - KLHL7-DT:11 No - KLHL7-DT:12 No - KLHL7-DT:13 No - lnc-TRA2A-1:2 No - lnc-TRA2A-1:3 No - lnc-TRA2A-1:4 No - lnc-GSDME-3:2 No - lnc-GSDME-3:3 No - lnc-GSDME-3:4 No - lnc-GSDME-3:5 No - lnc-GSDME-3:1 No - lnc-GSDME-3:6 No - lnc-MPP6-2:1 No - lnc-MPP6-3:1 No - lnc-MPP6-3:2 No - lnc-MPP6-1:2 No - lnc-MPP6-1:3 No - lnc-MPP6-1:4 No - lnc-CYCS-1:1 No - lnc-MPP6-4:2 No - lnc-HNRNPA2B1-16:5 No - lnc-HNRNPA2B1-16:1 No - lnc-HNRNPA2B1-16:10 No - lnc-HNRNPA2B1-16:18 No - lnc-HNRNPA2B1-16:11 No - lnc-HNRNPA2B1-16:6 No - lnc-HNRNPA2B1-16:19 No - lnc-HNRNPA2B1-16:12 No - lnc-HNRNPA2B1-16:13 No - lnc-HNRNPA2B1-16:14 No - lnc-HNRNPA2B1-16:15 No - lnc-HNRNPA2B1-16:7 No - lnc-HNRNPA2B1-16:16 No - lnc-HNRNPA2B1-16:2 No - lnc-NFE2L3-9:1 No - lnc-HNRNPA2B1-13:2 No - lnc-HNRNPA2B1-13:6 No - lnc-NFE2L3-8:1 No - lnc-HNRNPA2B1-16:3 No - lnc-HNRNPA2B1-16:4 No - lnc-HNRNPA2B1-10:2 No - lnc-HNRNPA2B1-10:3 No - lnc-HNRNPA2B1-10:4 No - lnc-NFE2L3-7:2 No - lnc-NFE2L3-7:1 No - lnc-NFE2L3-7:3 No - lnc-NFE2L3-7:5 No - lnc-NFE2L3-7:4 No - lnc-NFE2L3-7:6 No - lnc-HNRNPA2B1-15:5 No - lnc-HNRNPA2B1-15:3 No - lnc-HNRNPA2B1-15:1 No - lnc-HNRNPA2B1-15:4 No - lnc-HNRNPA2B1-15:13 No - lnc-HNRNPA2B1-15:14 No - lnc-HNRNPA2B1-15:6 No - lnc-HNRNPA2B1-15:7 No - lnc-HNRNPA2B1-15:15 No - lnc-HNRNPA2B1-15:8 No - lnc-SNX10-2:15 No - lnc-SNX10-2:16 No - lnc-SNX10-2:17 No - lnc-SNX10-2:18 No - lnc-SNX10-2:23 No - lnc-SNX10-2:19 No - lnc-SNX10-2:20 No - lnc-SNX10-2:21 No - lnc-SNX10-2:22 No - lnc-SNX10-2:24 No - lnc-SNX10-2:25 No - lnc-SNX10-2:26 No - lnc-EVX1-8:8 No - lnc-EVX1-8:9 No - HOTAIRM1:13 No - HOTAIRM1:10 No - HOTAIRM1:15 No - HOXA-AS3:10 Yes chr3R:6752864-6754194 lnc-EVX1-17:2 No - HOXA11-AS:16 No - HOXA11-AS:18 No - HOXA11-AS:19 No - HOXA11-AS:20 No - HOXA11-AS:21 No - lnc-EVX1-14:10 No - lnc-EVX1-14:8 No - lnc-EVX1-14:9 No - lnc-EVX1-14:11 No - lnc-EVX1-14:12 Yes chr2R:18775669-18776978 lnc-EVX1-14:14 Yes chr2R:18775669-18776978 lnc-EVX1-14:15 Yes chr2R:18775669-18776978 lnc-EVX1-14:16 Yes chr2R:18775669-18776978 lnc-HIBADH-1:3 No - lnc-HIBADH-1:4 No - lnc-CPVL-4:9 Yes chrX:5616572-5618806 lnc-CPVL-4:10 Yes chrX:5616572-5618806 lnc-CPVL-4:11 Yes chrX:5616572-5618806 lnc-CPVL-4:12 Yes chrX:5616572-5618806 lnc-CPVL-4:7 Yes chrX:5616572-5618806 lnc-CPVL-4:13 No - lnc-CPVL-4:8 No - lnc-PLEKHA8-3:3 No - lnc-PLEKHA8-3:4 No - lnc-PLEKHA8-3:5 No - lnc-PLEKHA8-3:6 Yes chr3R:7124548-7126503 lnc-PLEKHA8-3:7 No - lnc-GGCT-1:81 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-GGCT-1:82 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-GGCT-1:60 No - lnc-GGCT-1:90 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-GGCT-1:76 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-GGCT-1:92 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-GGCT-1:61 No - lnc-GARS-1:3 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-GARS-1:4 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-GGCT-1:89 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-GGCT-1:91 Yes chr3L:18461957-18463163 lnc-GGCT-1:62 No - lnc-GGCT-1:83 No - lnc-GGCT-1:86 No - lnc-GGCT-1:63 No - lnc-GGCT-1:64 No - lnc-GGCT-1:87 No - lnc-GGCT-1:88 No - lnc-GGCT-1:67 No - lnc-GGCT-1:77 No - lnc-GGCT-1:68 No - lnc-GGCT-1:85 No - lnc-GGCT-1:69 No - lnc-GGCT-1:70 No - lnc-GGCT-1:71 No - lnc-GGCT-1:65 No - lnc-GGCT-1:84 No - lnc-GGCT-1:78 No - lnc-GGCT-1:72 No - lnc-GGCT-1:79 No - lnc-GGCT-1:73 No - lnc-GGCT-1:80 No - lnc-GGCT-1:74 No - lnc-GGCT-1:75 No - lnc-GGCT-1:66 No - lnc-NEUROD6-10:1 No - lnc-NT5C3A-3:1 Yes chr2R:21487167-21497929 lnc-BBS9-3:1 No - lnc-BBS9-3:2 No - lnc-BBS9-2:1 No - lnc-RP9-2:6 No - lnc-RP9-2:3 No - lnc-RP9-2:4 No - lnc-RP9-2:5 No - lnc-RP9-2:7 No - lnc-NPSR1-4:2 No - lnc-NPSR1-4:3 No - lnc-NPSR1-4:4 No - lnc-NPSR1-4:5 No - lnc-NPSR1-4:6 No - lnc-NPSR1-4:7 No - lnc-SEPT7-3:5 Yes chr2L:7796314-7800058 lnc-SEPT7-3:6 Yes chr2L:7796314-7800058 lnc-SEPT7-3:7 Yes chr2L:7796314-7800058 lnc-SEPT7-3:8 Yes chr2L:7796314-7800058 lnc-SEPT7-3:9 Yes chr2L:7796314-7800058 lnc-SEPT7-1:16 No - lnc-SEPT7-1:17 No - lnc-SEPT7-1:18 No - lnc-SEPT7-1:19 No - lnc-SEPT7-1:20 No - SEPT7-AS1:9 Yes chr2R:8237271-8240297 SEPT7-AS1:12 Yes chr2R:8237271-8240297 SEPT7-AS1:10 Yes chr2R:8237271-8240297 SEPT7-AS1:14 No - SEPT7-AS1:15 No - SEPT7-AS1:16 No - SEPT7-AS1:17 No - SEPT7-AS1:18 No - SEPT7-AS1:19 No - SEPT7-AS1:13 Yes chr2R:8237271-8240297 SEPT7-AS1:11 Yes chr2R:8237271-8240297 lnc-ANLN-7:1 No - lnc-ANLN-7:2 No - lnc-SFRP4-3:1 No - lnc-SFRP4-3:2 No - lnc-SFRP4-3:3 No - lnc-AMPH-6:2 No - lnc-AMPH-6:4 No - lnc-AMPH-6:3 No - TRG-AS1:8 No - TRG-AS1:9 No - TRG-AS1:10 No - TRG-AS1:7 No - TRG-AS1:11 No - TRG-AS1:12 No - TRG-AS1:13 No - TRG-AS1:15 No - TRG-AS1:16 No - TRG-AS1:17 No - TRG-AS1:18 No - TRG-AS1:19 No - TRG-AS1:20 No - TRG-AS1:23 No - TRG-AS1:22 No - TRG-AS1:24 No - TRG-AS1:25 No - lnc-MPLKIP-5:1 Yes chrX:3704610-3719635 lnc-MPLKIP-5:2 Yes chrX:3704610-3719635 lnc-MPLKIP-5:3 Yes chrX:3704610-3719635 lnc-MPLKIP-5:4 Yes chrX:3704610-3719635 lnc-MPLKIP-5:6 No - lnc-MPLKIP-5:5 Yes chrX:3704610-3719635 LINC00265:18 No - LINC00265:19 No - LINC00265:20 No - LINC00265:21 No - LINC00265:22 No - LINC00265:23 No - LINC00265:24 No - LINC00265:25 No - LINC00265:26 No - LINC00265:27 No - lnc-MPLKIP-1:3 Yes chr3L:21516306-21522684 lnc-MPLKIP-1:1 Yes chr3L:21516306-21522684 lnc-MPLKIP-3:1 Yes chr3R:20562486-20564067 lnc-MPLKIP-3:2 Yes chr3R:20562486-20564067 lnc-MPLKIP-3:3 Yes chr3R:20562486-20564067 lnc-MPLKIP-3:4 Yes chr3R:20562486-20564067 lnc-INHBA-1:2 No - INHBA-AS1:6 No - INHBA-AS1:7 No - INHBA-AS1:8 No - INHBA-AS1:9 No - INHBA-AS1:10 No - INHBA-AS1:11 No - INHBA-AS1:12 No - INHBA-AS1:13 No - lnc-INHBA-5:1 No - lnc-SUGCT-9:1 No - lnc-SUGCT-9:2 No - lnc-GLI3-5:1 No - lnc-MRPL32-9:1 No - lnc-PSMA2-1:16 No - lnc-PSMA2-1:17 No - lnc-PSMA2-1:13 No - lnc-PSMA2-1:14 No - lnc-PSMA2-1:15 No - LUARIS:5 Yes chrX:9608946-9623243 LUARIS:6 Yes chrX:9608946-9623243 lnc-BLVRA-1:1 No - lnc-BLVRA-1:2 No - lnc-UBE2D4-2:1 No - lnc-UBE2D4-2:2 No - lnc-UBE2D4-2:3 No - lnc-UBE2D4-2:4 No - lnc-URGCP-2:11 No - lnc-URGCP-2:10 No - lnc-URGCP-2:9 No - lnc-PGAM2-4:1 No - lnc-YKT6-3:1 Yes chrX:9585675-9589813 lnc-YKT6-3:2 Yes chrX:9585675-9589813 lnc-ZMIZ2-2:1 Yes chr3L:16954822-16968724 lnc-H2AFV-5:1 No - lnc-H2AFV-4:2 No - lnc-H2AFV-4:3 No - lnc-H2AFV-4:4 No - LINC01952:13 No - LINC01952:14 No - LINC01952:15 No - lnc-PPIA-1:13 No - lnc-PPIA-1:14 No - SNHG15:25 Yes chr2L:10491814-10506779 SNHG15:26 Yes chr2L:10491814-10506779 SNHG15:23 No - SNHG15:27 No - SNHG15:14 No - SNHG15:15 No - SNHG15:28 No - SNHG15:29 No - SNHG15:30 No - SNHG15:31 No - SNHG15:32 No - SNHG15:33 No - SNHG15:34 No - SNHG15:24 No - lnc-CCM2-1:3 No - lnc-CCM2-1:4 No - SNHG15:17 No - SNHG15:18 No - SNHG15:16 No - SNHG15:21 No - lnc-CCM2-6:1 Yes chr3R:22408566-22410915 lnc-IGFBP3-5:2 Yes chrX:14787478-14826073 lnc-IGFBP3-5:3 Yes chrX:14787478-14826073 lnc-IGFBP3-5:4 Yes chrX:14787478-14826073 lnc-C7orf57-6:1 No - lnc-C7orf57-6:2 No - lnc-C7orf57-6:3 No - lnc-C7orf57-6:4 No - lnc-C7orf57-6:5 No - lnc-C7orf57-6:6 No - lnc-C7orf57-6:7 No - LINC00525:3 Yes chr3R:4808336-4812096 LINC00525:6 Yes chr3R:4808336-4812096 LINC00525:4 Yes chr3R:4808336-4812096 LINC00525:5 Yes chr3R:4808336-4812096 lnc-SUN3-1:2 Yes chr3R:26949692-26958491 lnc-SUN3-1:3 Yes chr3R:26949692-26958491 lnc-SUN3-1:4 Yes chr3R:26949692-26958491 lnc-SUN3-1:5 Yes chr3R:26949692-26958491 lnc-ABCA13-1:3 No - lnc-IKZF1-15:1 No - lnc-IKZF1-15:2 No - lnc-IKZF1-15:4 No - lnc-IKZF1-15:3 No - lnc-IKZF1-15:5 No - lnc-IKZF1-8:2 Yes chrX:19830215-19852059 LINC01446:2 No - LINC01446:3 No - LINC01446:4 No - LINC01446:5 No - LINC01446:6 No - LINC01446:7 No - LINC01445:7 No - LINC01445:8 No - LINC01445:9 No - LINC01445:10 No - lnc-EGFR-4:2 Yes chr2R:20512697-20513169 lnc-EGFR-4:3 Yes chr2R:20512697-20513169 lnc-EGFR-4:4 Yes chr2R:20512697-20513169 lnc-EGFR-4:5 Yes chr2R:20512697-20513169 lnc-EGFR-4:6 Yes chr2R:20512697-20513169 lnc-EGFR-4:7 Yes chr2R:20512697-20513169 lnc-SEC61G-1:2 No - EGFR-AS1:4 Yes chr2R:21522420-21559977 EGFR-AS1:3 Yes chr2R:21522420-21559977 lnc-VOPP1-7:1 Yes chrX:11092492-11094947 lnc-LANCL2-1:2 No - lnc-LANCL2-1:3 No - lnc-LANCL2-1:4 No - lnc-LANCL2-1:5 No - lnc-SUMF2-17:1 No - lnc-ZNF727-6:3 No - lnc-ZNF727-6:4 No - lnc-ZNF727-6:5 No - lnc-ZNF727-6:6 No - lnc-ZNF727-6:7 No - lnc-ZNF727-6:8 No - lnc-ZNF727-6:9 No - lnc-ZNF727-6:10 No - lnc-ZNF727-6:11 No - lnc-ZNF680-46:1 No - lnc-ZNF117-3:3 No - lnc-ZNF117-3:4 No - lnc-ERV3-1-1:4 No - lnc-VKORC1L1-5:3 No - lnc-VKORC1L1-5:4 No - lnc-VKORC1L1-5:5 No - lnc-VKORC1L1-5:6 No - lnc-VKORC1L1-5:7 No - lnc-GUSB-7:4 No - lnc-GUSB-7:5 No - lnc-GUSB-7:3 No - LINC00174:10 Yes chrX:13563823-13593224 LINC00174:11 Yes chrX:13563823-13593224 LINC00174:12 Yes chrX:13563823-13593224 lnc-TPST1-1:10 No - lnc-TPST1-1:11 No - lnc-TPST1-1:12 No - lnc-SBDS-15:3 No - lnc-SBDS-30:1 No - lnc-AUTS2-6:1 No - lnc-AUTS2-6:2 No - lnc-AUTS2-6:3 No - lnc-CALN1-1:18 No - lnc-CALN1-1:12 No - lnc-CALN1-1:13 No - lnc-CALN1-1:11 No - lnc-CALN1-1:14 No - lnc-CALN1-1:15 No - lnc-CALN1-1:16 No - lnc-CALN1-1:17 No - lnc-TRIM74-2:2 No - lnc-FKBP6-5:1 No - lnc-VPS37D-5:1 Yes chrX:9356634-9358594 lnc-BUD23-1:3 No - lnc-BUD23-1:4 No - lnc-ELN-4:1 No - lnc-ELN-4:2 No - lnc-ELN-4:3 No - lnc-ELN-4:4 No - ELN-AS1:5 No - ELN-AS1:7 No - lnc-CCL24-1:1 No - lnc-CCL24-1:2 No - lnc-HSPB1-4:1 No - lnc-HSPB1-4:2 No - lnc-HSPB1-4:3 No - lnc-CCDC146-96:3 No - lnc-CCDC146-96:4 No - lnc-CCDC146-96:6 No - lnc-GSAP-6:1 No - APTR:16 No - lnc-GSAP-5:1 No - lnc-GSAP-5:2 No - APTR:14 Yes chr2L:18833710-18839679 APTR:17 Yes chr2L:18833710-18839679 APTR:19 No - APTR:21 No - APTR:22 No - APTR:23 No - APTR:18 Yes chr2L:18833710-18839679 APTR:24 No - APTR:25 No - APTR:26 No - APTR:20 No - APTR:15 Yes chr2L:18833710-18839679 MAGI2-AS3:52 Yes chr2R:21129463-21142261 MAGI2-AS3:62 Yes chr2R:21129463-21142261 MAGI2-AS3:64 No - MAGI2-AS3:65 No - MAGI2-AS3:66 No - MAGI2-AS3:63 No - MAGI2-AS3:67 No - MAGI2-AS3:69 No - MAGI2-AS3:70 No - MAGI2-AS3:71 No - MAGI2-AS3:72 No - MAGI2-AS3:73 No - MAGI2-AS3:68 No - MAGI2-AS3:74 No - MAGI2-AS3:76 No - MAGI2-AS3:77 No - MAGI2-AS3:78 No - MAGI2-AS3:79 No - MAGI2-AS3:80 No - MAGI2-AS3:81 No - MAGI2-AS3:75 No - MAGI2-AS3:82 No - MAGI2-AS3:83 No - MAGI2-AS3:84 No - MAGI2-AS3:85 No - MAGI2-AS3:86 No - MAGI2-AS3:87 No - lnc-GNAT3-9:1 No - lnc-GNAT3-9:2 No - lnc-CD36-6:1 No - lnc-SEMA3C-3:1 No - lnc-CD36-9:1 No - lnc-CD36-9:2 Yes chr3L:9074643-9092131 lnc-PCLO-3:1 No - lnc-TMEM243-1:2 No - lnc-TMEM243-1:5 No - lnc-TMEM243-1:11 No - lnc-TMEM243-1:6 No - lnc-TMEM243-1:7 No - lnc-CROT-5:1 No - TP53TG1:21 No - TP53TG1:22 No - TP53TG1:23 No - TP53TG1:19 No - TP53TG1:24 No - TP53TG1:25 No - TP53TG1:20 No - lnc-ADAM22-2:20 Yes chr2R:10480163-10481886 lnc-ADAM22-2:21 No - lnc-ADAM22-7:1 Yes chr2R:10480163-10481886 STEAP2-AS1:4 No - STEAP2-AS1:5 No - STEAP2-AS1:6 No - STEAP2-AS1:3 No - lnc-FAM237B-6:1 No - lnc-FAM237B-6:2 No - lnc-FAM237B-6:3 No - lnc-FAM237B-6:4 No - lnc-FAM237B-11:1 Yes chr2L:19757245-19758615 lnc-CLDN12-3:13 No - lnc-FAM237B-2:6 Yes chr3L:3515751-3610521 lnc-FAM237B-2:7 Yes chr3L:3515751-3610521 lnc-FAM237B-2:8 Yes chr3L:3515751-3610521 lnc-FAM237B-2:9 Yes chr3L:3515751-3610521 lnc-FAM237B-2:1 Yes chr3L:3515751-3610521 lnc-FAM237B-2:10 Yes chr3L:3515751-3610521 lnc-FAM237B-2:3 Yes chr3L:3515751-3610521 lnc-FAM237B-2:11 Yes chr3L:3515751-3610521 lnc-FZD1-2:10 No - lnc-FZD1-2:11 No - lnc-FZD1-2:12 No - lnc-FZD1-2:7 No - lnc-FZD1-2:8 No - lnc-FZD1-2:9 No - lnc-AKAP9-1:3 No - lnc-AKAP9-1:5 No - lnc-AKAP9-1:4 No - lnc-AKAP9-3:1 No - lnc-AKAP9-3:2 No - lnc-AKAP9-3:3 No - lnc-AKAP9-3:4 No - lnc-AKAP9-3:5 No - lnc-VPS50-1:1 Yes chr2R:16579470-16585448 lnc-VPS50-1:6 Yes chr2R:16579470-16585448 lnc-VPS50-1:7 Yes chr2R:16579470-16585448 lnc-VPS50-1:8 Yes chr2R:16579470-16585448 lnc-VPS50-1:9 Yes chr2R:16579470-16585448 lnc-VPS50-1:10 Yes chr2R:16579470-16585448 lnc-GNG11-3:4 No - lnc-GNG11-3:5 No - lnc-GNG11-3:6 No - lnc-GNG11-3:7 No - lnc-GNG11-3:8 No - lnc-GNG11-3:9 No - lnc-GNG11-3:10 No - lnc-GNG11-3:11 No - lnc-GNG11-3:12 No - lnc-BET1-5:1 No - lnc-SGCE-3:2 No - lnc-SGCE-3:1 No - lnc-SGCE-2:1 Yes chrX:3932000-3936469 lnc-PON1-1:3 Yes chr3L:2505245-2554292 lnc-PON1-1:4 Yes chr3L:2505245-2554292 lnc-PON1-1:5 Yes chr3L:2505245-2554292 lnc-PON1-1:6 Yes chr3L:2505245-2554292 lnc-ASB4-7:4 No - lnc-ASB4-7:5 No - lnc-ASB4-3:7 No - lnc-ASB4-3:8 No - lnc-ASB4-3:9 No - lnc-ASB4-3:10 No - lnc-ASB4-3:11 No - lnc-ASB4-3:12 No - lnc-ASB4-3:13 No - DLX6-AS1:43 No - DLX6-AS1:44 No - DLX6-AS1:40 No - DLX6-AS1:41 No - DLX6-AS1:37 Yes chr2R:24814822-24835667 DLX6-AS1:30 Yes chr2R:24814822-24835667 DLX6-AS1:26 Yes chr2R:24814822-24835667 DLX6-AS1:39 Yes chr2R:24814822-24835667 DLX6-AS1:32 Yes chr2R:24814822-24835667 DLX6-AS1:36 Yes chr2R:24814822-24835667 DLX6-AS1:38 Yes chr2R:24814822-24835667 DLX6-AS1:42 No - DLX6-AS1:27 Yes chr2R:24814822-24835667 DLX6-AS1:25 Yes chr2R:24814822-24835667 DLX6-AS1:28 Yes chr2R:24814822-24835667 DLX6-AS1:34 Yes chr2R:24814822-24835667 DLX6-AS1:31 Yes chr2R:24814822-24835667 DLX6-AS1:29 Yes chr2R:24814822-24835667 DLX6-AS1:33 Yes chr2R:24814822-24835667 lnc-LMTK2-7:1 No - lnc-TRRAP-5:1 No - lnc-TRRAP-5:2 No - lnc-CYP3A43-1:5 No - lnc-CYP3A43-1:11 No - lnc-TAF6-1:3 No - lnc-TAF6-1:4 No - lnc-TAF6-1:2 No - lnc-C7orf61-1:1 No - lnc-GIGYF1-1:1 No - SLC12A9-AS1:8 Yes chr2L:18599755-18605249 SLC12A9-AS1:9 Yes chr2L:18599755-18605249 SLC12A9-AS1:10 Yes chr2L:18599755-18605249 SLC12A9-AS1:11 Yes chr2L:18599755-18605249 lnc-UFSP1-2:1 No - lnc-VGF-4:1 Yes chr2L:6671065-6673347 lnc-VGF-3:1 Yes chr2L:6671065-6673347 lnc-AP1S1-3:1 No - LNCPRESS1:17 No - LNCPRESS1:18 No - LNCPRESS1:20 No - LNCPRESS1:21 No - LNCPRESS1:22 No - lnc-COL26A1-3:2 No - lnc-MYL10-3:1 No - lnc-MYL10-4:1 Yes chrX:7609148-7678859 lnc-DNAJC2-1:2 Yes chr3R:14890231-14892387 lnc-DNAJC2-1:3 Yes chr3R:14890231-14892387 lnc-DNAJC2-1:1 Yes chr3R:14890231-14892387 lnc-LHFPL3-8:1 No - LHFPL3-AS2:11 Yes chr3L:1885657-1891462 LHFPL3-AS2:12 Yes chr3L:1885657-1891462 LHFPL3-AS2:13 Yes chr3L:1885657-1891462 LHFPL3-AS2:14 Yes chr3L:1885657-1891462 LHFPL3-AS2:15 No - LHFPL3-AS2:16 No - lnc-KMT2E-1:7 No - lnc-KMT2E-1:8 No - lnc-KMT2E-1:9 No - lnc-SRPK2-1:22 No - lnc-SRPK2-1:18 No - lnc-SRPK2-1:19 No - lnc-SRPK2-1:20 No - lnc-SRPK2-1:23 No - lnc-SRPK2-1:24 No - lnc-SRPK2-1:21 No - lnc-SRPK2-1:16 No - lnc-SRPK2-1:17 No - lnc-PUS7-1:2 No - lnc-PUS7-1:5 No - lnc-PUS7-1:3 No - lnc-PUS7-1:4 No - lnc-PUS7-1:6 No - lnc-SYPL1-6:1 No - lnc-SYPL1-6:2 No - lnc-CDHR3-3:2 No - lnc-CDHR3-3:3 No - lnc-NAMPT-3:1 No - lnc-NAMPT-3:2 No - lnc-CCDC71L-1:9 No - lnc-CCDC71L-1:14 No - lnc-CCDC71L-1:13 No - lnc-CCDC71L-1:5 No - lnc-CCDC71L-1:7 No - lnc-CCDC71L-1:8 No - lnc-CCDC71L-1:11 No - lnc-CCDC71L-1:10 No - lnc-CCDC71L-1:6 No - LINC02577:15 No - LINC02577:16 No - LINC02577:17 No - LINC02577:18 No - LINC02577:19 No - LINC02577:21 No - lnc-COG5-2:10 Yes chr2R:9993890-10026042 lnc-COG5-2:11 Yes chr2R:9993890-10026042 lnc-COG5-2:7 Yes chr2R:9993890-10026042 lnc-COG5-2:8 Yes chr2R:9993890-10026042 lnc-COG5-2:9 Yes chr2R:9993890-10026042 lnc-COG5-4:2 No - lnc-COG5-4:3 Yes chr3L:837861-839931 SLC26A4-AS1:15 Yes chr3L:17898889-17907812 SLC26A4-AS1:16 Yes chr3L:17898889-17907812 SLC26A4-AS1:17 Yes chr3L:17898889-17907812 SLC26A4-AS1:19 Yes chr3L:17898889-17907812 SLC26A4-AS1:18 Yes chr3L:17898889-17907812 SLC26A4-AS1:14 Yes chr3L:17898889-17907812 lnc-SLC26A3-1:13 Yes chr2L:19580612-19582474 lnc-SLC26A3-1:9 Yes chr2L:19580612-19582474 lnc-SLC26A3-1:14 Yes chr2L:19580612-19582474 lnc-SLC26A3-1:10 Yes chr2L:19580612-19582474 lnc-SLC26A3-1:15 Yes chr2L:19580612-19582474 lnc-SLC26A3-1:12 Yes chr2L:19580612-19582474 lnc-SLC26A3-1:18 No - lnc-SLC26A3-1:16 Yes chr2L:19580612-19582474 lnc-SLC26A3-1:11 Yes chr2L:19580612-19582474 lnc-SLC26A3-1:17 Yes chr2L:19580612-19582474 lnc-DNAJB9-1:3 No - lnc-DNAJB9-1:2 No - lnc-DNAJB9-1:4 No - lnc-DNAJB9-1:5 No - lnc-DNAJB9-1:6 No - lnc-IMMP2L-1:6 No - lnc-IMMP2L-1:7 No - lnc-IMMP2L-1:8 No - lnc-IMMP2L-1:9 No - lnc-IMMP2L-1:10 No - lnc-IMMP2L-1:12 No - lnc-IMMP2L-1:11 No - lnc-IFRD1-3:1 No - lnc-DOCK4-4:3 Yes chr2L:2868627-2874489 lnc-LSMEM1-6:1 No - lnc-LSMEM1-7:1 No - lnc-BMT2-1:8 No - lnc-BMT2-1:9 No - lnc-BMT2-1:10 No - lnc-BMT2-1:11 No - lnc-BMT2-1:12 No - lnc-BMT2-1:13 No - lnc-PPP1R3A-5:1 No - lnc-PPP1R3A-5:2 No - lnc-TFEC-2:18 No - lnc-TFEC-2:8 No - lnc-TFEC-2:19 No - lnc-TFEC-2:10 No - lnc-TFEC-2:17 No - lnc-TFEC-2:11 No - lnc-TFEC-2:12 No - lnc-TFEC-2:13 No - lnc-TFEC-2:14 No - lnc-TFEC-2:15 No - lnc-TFEC-2:16 No - lnc-TFEC-2:9 No - lnc-TFEC-5:2 No - lnc-TFEC-5:3 No - lnc-TFEC-15:1 No - lnc-MET-1:1 No - lnc-TFEC-45:1 No - ST7-AS1:4 Yes chr3L:20806868-20809272 ST7-AS1:5 Yes chr3L:20806868-20809272 lnc-CTTNBP2-3:6 No - lnc-CTTNBP2-3:11 No - lnc-CTTNBP2-3:7 No - lnc-CTTNBP2-3:8 No - lnc-CTTNBP2-3:9 No - lnc-CTTNBP2-3:5 No - lnc-CTTNBP2-3:10 No - LINC02476:18 No - LINC02476:19 No - LINC02476:20 No - LINC02476:21 No - LINC02476:22 No - LINC02476:23 No - LINC02476:24 No - lnc-WNT16-7:2 No - lnc-WNT16-7:1 No - FEZF1-AS1:8 No - FEZF1-AS1:9 No - FEZF1-AS1:10 No - FEZF1-AS1:6 No - FEZF1-AS1:7 Yes chr2L:1950239-1970362 FEZF1-AS1:13 Yes chr2L:1950239-1970362 FEZF1-AS1:14 Yes chr2L:1950239-1970362 FEZF1-AS1:15 Yes chr2L:1950239-1970362 FEZF1-AS1:16 Yes chr2L:1950239-1970362 FEZF1-AS1:17 Yes chr2L:1950239-1970362 FEZF1-AS1:18 Yes chr2L:1950239-1970362 FEZF1-AS1:19 Yes chr2L:1950239-1970362 lnc-HYAL4-5:5 No - lnc-SPAM1-2:5 No - lnc-SPAM1-2:4 No - lnc-SPAM1-2:6 No - lnc-SPAM1-2:7 No - POT1-AS1:12 No - POT1-AS1:16 No - POT1-AS1:17 No - POT1-AS1:13 No - POT1-AS1:18 No - POT1-AS1:14 No - POT1-AS1:15 No - POT1-AS1:19 No - POT1-AS1:20 No - POT1-AS1:23 No - POT1-AS1:21 No - POT1-AS1:24 No - POT1-AS1:22 No - lnc-ARF5-18:1 Yes chr3R:5794705-5799994 lnc-PAX4-1:3 No - lnc-PAX4-1:4 No - lnc-PAX4-1:5 No - lnc-PAX4-1:6 No - lnc-LRRC4-3:1 No - lnc-LEP-2:3 No - lnc-LEP-2:4 No - lnc-LEP-2:5 No - lnc-LEP-2:6 No - lnc-LEP-2:7 No - lnc-IMPDH1-3:4 No - lnc-IMPDH1-3:5 No - lnc-IMPDH1-3:7 No - lnc-IMPDH1-3:6 No - FLNC-AS1:11 No - lnc-TNPO3-1:33 No - lnc-TNPO3-1:32 No - lnc-TNPO3-1:34 No - lnc-IRF5-3:1 No - lnc-TNPO3-8:2 Yes chr3L:2768466-2772325 lnc-TNPO3-10:1 Yes chr3L:2768466-2772325 lnc-TNPO3-10:2 Yes chr3L:2768466-2772325 lnc-TNPO3-10:3 No - lnc-UBE2H-2:8 No - lnc-UBE2H-2:9 No - lnc-UBE2H-2:4 No - lnc-UBE2H-2:5 No - lnc-UBE2H-2:6 No - lnc-UBE2H-2:7 No - lnc-ZC3HC1-5:1 Yes chrX:8087544-8094064 lnc-KLHDC10-4:1 No - lnc-CEP41-2:2 Yes chrX:17080423-17087675 lnc-CEP41-2:3 Yes chrX:17080423-17087675 lnc-CEP41-2:4 Yes chrX:17080423-17087675 lnc-CEP41-2:5 Yes chrX:17080423-17087675 lnc-CEP41-2:6 Yes chrX:17080423-17087675 LINC-PINT:67 No - LINC-PINT:43 No - LINC-PINT:57 No - LINC-PINT:33 No - LINC-PINT:27 Yes chr2R:12628697-12632378 LINC-PINT:56 No - LINC-PINT:49 No - LINC-PINT:28 No - LINC-PINT:29 No - LINC-PINT:31 No - LINC-PINT:40 No - LINC-PINT:44 No - LINC-PINT:35 No - LINC-PINT:30 No - LINC-PINT:38 No - LINC-PINT:36 No - LINC-PINT:68 No - LINC-PINT:41 No - LINC-PINT:34 No - LINC-PINT:69 No - LINC-PINT:50 No - LINC-PINT:26 Yes chr2R:12628697-12632378 LINC-PINT:70 No - LINC-PINT:73 No - LINC-PINT:45 No - LINC-PINT:71 No - LINC-PINT:58 No - LINC-PINT:59 No - LINC-PINT:52 No - LINC-PINT:32 No - LINC-PINT:65 No - LINC-PINT:72 No - LINC-PINT:62 No - LINC-PINT:46 No - LINC-PINT:60 No - LINC-PINT:51 No - LINC-PINT:53 No - LINC-PINT:54 No - LINC-PINT:55 No - LINC-PINT:42 No - LINC-PINT:39 No - LINC-PINT:63 No - LINC-PINT:61 No - LINC-PINT:47 No - LINC-PINT:37 No - LINC-PINT:64 No - LINC-PINT:48 No - MKLN1-AS:12 Yes chr2R:12628697-12632378 MKLN1-AS:9 Yes chr2R:12628697-12632378 MKLN1-AS:10 Yes chr2R:12628697-12632378 MKLN1-AS:13 Yes chr2R:12628697-12632378 MKLN1-AS:14 Yes chr2R:12628697-12632378 MKLN1-AS:15 Yes chr2R:12628697-12632378 MKLN1-AS:16 Yes chr2R:12628697-12632378 MKLN1-AS:17 Yes chr2R:12628697-12632378 MKLN1-AS:18 Yes chr2R:12628697-12632378 MKLN1-AS:19 Yes chr2R:12628697-12632378 MKLN1-AS:20 Yes chr2R:12628697-12632378 MKLN1-AS:21 Yes chr2R:12628697-12632378 MKLN1-AS:11 Yes chr2R:12628697-12632378 lnc-PLXNA4-2:1 No - lnc-PLXNA4-2:2 No - lnc-PLXNA4-2:3 No - lnc-MKLN1-2:4 No - lnc-MKLN1-2:5 No - lnc-MKLN1-2:6 Yes chr4:1009895-1027101 lnc-MKLN1-2:3 Yes chr4:1009895-1027101 lnc-MKLN1-9:2 Yes chr4:1009895-1027101 lnc-MKLN1-9:3 Yes chr4:1009895-1027101 lnc-MKLN1-9:4 Yes chr4:1009895-1027101 lnc-CHCHD3-2:1 Yes chr3R:5754932-5758997 lnc-AKR1B1-1:6 No - lnc-AKR1B1-1:8 No - lnc-AKR1B1-1:9 No - lnc-AKR1B1-1:5 No - lnc-AKR1B1-1:10 No - lnc-AKR1B1-1:7 No - lnc-AKR1B1-3:2 No - lnc-AKR1B1-3:3 No - lnc-CALD1-2:1 No - lnc-C7orf49-6:2 No - lnc-C7orf49-6:1 No - lnc-C7orf49-6:3 No - lnc-C7orf49-6:4 No - lnc-C7orf49-6:5 No - lnc-WDR91-4:1 No - lnc-WDR91-4:2 No - lnc-WDR91-4:3 No - lnc-WDR91-4:4 No - lnc-AKR1D1-5:2 Yes chrX:8907068-9029476 lnc-AKR1D1-5:3 Yes chrX:8907068-9029476 lnc-AKR1D1-5:4 Yes chrX:8907068-9029476 lnc-AKR1D1-1:3 No - lnc-AKR1D1-1:2 No - lnc-AKR1D1-1:4 No - lnc-KLRG2-3:2 Yes chr3L:17514298-17524740 lnc-KLRG2-3:3 Yes chr3L:17514298-17524740 lnc-KLRG2-2:2 Yes chr3L:17514298-17524740 lnc-KLRG2-2:3 Yes chr3L:17514298-17524740 lnc-TBXAS1-5:1 No - lnc-TBXAS1-5:2 No - KDM7A-DT:9 No - lnc-KDM7A-4:1 No - lnc-RAB19-3:2 No - lnc-RAB19-3:3 No - NDUFB2-AS1:2 No - lnc-TMEM178B-3:1 No - lnc-TMEM178B-3:2 No - lnc-TMEM178B-3:3 No - lnc-TMEM178B-3:4 Yes chr3R:16436045-16436597 lnc-KIAA1147-3:9 Yes chr2L:10270051-10271465 lnc-KIAA1147-3:10 Yes chr2L:10270051-10271465 lnc-KIAA1147-3:12 Yes chr2L:10270051-10271465 lnc-KIAA1147-3:13 Yes chr2L:10270051-10271465 lnc-KIAA1147-3:11 Yes chr2L:10270051-10271465 WEE2-AS1:15 Yes chr2L:6911090-6914138 WEE2-AS1:16 Yes chr2L:6911090-6914138 WEE2-AS1:12 Yes chr2L:6911090-6914138 WEE2-AS1:17 Yes chr2L:6911090-6914138 WEE2-AS1:18 Yes chr2L:6911090-6914138 WEE2-AS1:13 Yes chr2L:6911090-6914138 WEE2-AS1:19 Yes chr2L:6911090-6914138 WEE2-AS1:22 Yes chr2L:6911090-6914138 WEE2-AS1:20 Yes chr2L:6911090-6914138 WEE2-AS1:21 Yes chr2L:6911090-6914138 WEE2-AS1:23 Yes chr2L:6911090-6914138 WEE2-AS1:24 Yes chr2L:6911090-6914138 WEE2-AS1:25 Yes chr2L:6911090-6914138 WEE2-AS1:26 Yes chr2L:6911090-6914138 WEE2-AS1:14 Yes chr2L:6911090-6914138 lnc-TRPV6-1:3 No - lnc-TRPV6-1:2 No - lnc-CLCN1-1:4 No - lnc-CLCN1-1:3 No - lnc-EPHA1-1:4 No - OR2A1-AS1:21 No - OR2A1-AS1:22 No - OR2A1-AS1:23 No - OR2A1-AS1:24 No - OR2A1-AS1:25 No - OR2A1-AS1:26 No - lnc-ARHGEF5-6:1 Yes chr3R:11735447-11736877 lnc-EZH2-7:6 Yes chr2R:7916856-7921579 lnc-EZH2-7:8 Yes chr2R:7916856-7921579 lnc-EZH2-7:7 Yes chr2R:7916856-7921579 lnc-CUL1-1:2 No - lnc-CUL1-1:3 No - lnc-CUL1-1:4 No - lnc-EZH2-5:2 No - lnc-EZH2-5:3 No - lnc-EZH2-5:4 No - lnc-EZH2-5:5 No - lnc-CUL1-5:1 No - GHET1:6 No - lnc-ZNF398-3:2 No - lnc-ZNF398-3:3 No - lnc-ZNF398-3:4 No - lnc-ZNF398-6:1 No - lnc-ZNF398-5:1 No - lnc-ZNF786-2:2 No - lnc-ZNF783-5:1 No - ATP6V0E2-AS1:22 No - ATP6V0E2-AS1:12 No - ATP6V0E2-AS1:13 No - ATP6V0E2-AS1:18 No - ATP6V0E2-AS1:19 No - ATP6V0E2-AS1:14 No - ATP6V0E2-AS1:23 Yes chr3L:21539862-21541215 ATP6V0E2-AS1:24 Yes chr3L:21539862-21541215 ATP6V0E2-AS1:25 Yes chr3L:21539862-21541215 ATP6V0E2-AS1:15 Yes chr3L:21539862-21541215 ATP6V0E2-AS1:16 Yes chr3L:21539862-21541215 ATP6V0E2-AS1:26 Yes chr3L:21539862-21541215 ATP6V0E2-AS1:20 Yes chr3L:21539862-21541215 ATP6V0E2-AS1:21 Yes chr3L:21539862-21541215 ATP6V0E2-AS1:17 Yes chr3L:21539862-21541215 lnc-ZNF467-4:2 No - lnc-RARRES2-2:3 No - lnc-RARRES2-2:4 No - lnc-RARRES2-6:1 No - lnc-RARRES2-6:2 No - lnc-RARRES2-3:3 No - lnc-CHPF2-4:1 No - WDR86-AS1:11 No - WDR86-AS1:12 No - WDR86-AS1:13 No - WDR86-AS1:14 No - WDR86-AS1:15 No - lnc-GALNTL5-2:9 Yes chr3R:21140739-21214269 lnc-GALNTL5-2:11 Yes chr3R:21140739-21214269 lnc-GALNTL5-2:10 Yes chr3R:21140739-21214269 PRKAG2-AS1:12 No - PRKAG2-AS1:13 No - PRKAG2-AS1:14 No - lnc-PRKAG2-5:1 No - lnc-KMT2C-6:3 Yes chr2L:14359252-14361411 lnc-KMT2C-6:4 No - lnc-XRCC2-13:3 Yes chrX:1881313-1889950 lnc-XRCC2-13:1 Yes chrX:1881313-1889950 lnc-XRCC2-13:2 Yes chrX:1881313-1889950 lnc-KMT2C-5:2 No - LINC01003:4 No - lnc-ACTR3B-6:1 No - lnc-XRCC2-12:1 No - lnc-XRCC2-12:2 No - lnc-XRCC2-12:3 No - PAXIP1-AS1:13 Yes chr3L:14020315-14029121 PAXIP1-AS1:15 No - PAXIP1-AS1:16 No - PAXIP1-AS1:17 No - PAXIP1-AS1:18 No - PAXIP1-AS1:14 No - lnc-CNPY1-10:6 No - lnc-CNPY1-10:7 No - lnc-CNPY1-10:13 No - lnc-CNPY1-10:14 No - lnc-CNPY1-10:8 No - lnc-CNPY1-10:15 No - lnc-CNPY1-10:2 No - lnc-CNPY1-10:3 No - lnc-CNPY1-10:4 No - lnc-CNPY1-10:16 No - lnc-CNPY1-10:9 No - lnc-CNPY1-1:5 No - lnc-CNPY1-1:6 No - lnc-CNPY1-1:7 No - lnc-CNPY1-1:3 No - lnc-CNPY1-1:4 No - LINC01006:13 No - LINC01006:15 No - LINC01006:16 No - LINC01006:14 No - lnc-NOM1-6:4 No - lnc-NOM1-6:5 No - lnc-NOM1-6:6 No - lnc-NOM1-6:8 No - lnc-NOM1-6:7 No - lnc-MNX1-11:1 Yes chr3L:2373728-2376488 MNX1-AS1:5 No - MNX1-AS1:6 No - MNX1-AS1:7 No - MNX1-AS1:8 No - lnc-PTPRN2-4:1 No - lnc-WDR60-14:1 No - lnc-WDR60-14:2 No - lnc-WDR60-14:3 No - lnc-WDR60-13:3 Yes chr3R:24544719-24556549 lnc-WDR60-13:4 Yes chr3R:24544719-24556549 lnc-OR4F21-4:1 No - lnc-OR4F21-4:2 No - lnc-OR4F21-4:6 No - lnc-OR4F21-4:3 No - lnc-OR4F21-4:4 No - lnc-OR4F21-4:7 No - lnc-OR4F21-4:5 No - lnc-FBXO25-11:1 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-FBXO25-11:2 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-FBXO25-11:3 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-CLN8-10:1 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-ERICH1-20:8 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-ERICH1-20:6 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-ERICH1-20:7 No - lnc-ERICH1-20:2 No - lnc-ERICH1-20:3 No - lnc-ERICH1-20:5 No - lnc-ERICH1-20:4 No - lnc-ERICH1-20:1 No - lnc-ERICH1-19:10 No - lnc-ERICH1-19:11 No - lnc-ERICH1-19:13 No - lnc-ERICH1-19:16 No - lnc-ERICH1-19:17 No - lnc-ERICH1-19:14 No - lnc-ERICH1-19:12 No - lnc-ERICH1-19:15 No - lnc-CSMD1-7:4 No - lnc-CSMD1-7:5 No - lnc-CSMD1-7:6 No - lnc-CSMD1-7:7 No - lnc-CSMD1-7:3 No - lnc-CSMD1-1:20 No - lnc-CSMD1-1:21 No - lnc-CSMD1-1:22 No - lnc-CSMD1-1:23 No - lnc-CSMD1-1:24 No - lnc-CSMD1-1:25 No - lnc-CSMD1-1:26 No - lnc-MYOM2-4:6 No - lnc-MYOM2-4:7 No - lnc-MYOM2-4:3 No - lnc-MYOM2-4:4 No - lnc-MYOM2-4:5 No - lnc-MYOM2-4:8 No - lnc-ANGPT2-2:15 Yes chr2R:11895997-11903918 lnc-ANGPT2-2:16 Yes chr2R:11895997-11903918 lnc-ANGPT2-2:19 No - lnc-ANGPT2-2:9 Yes chr2R:11895997-11903918 lnc-ANGPT2-2:22 No - lnc-ANGPT2-2:23 No - lnc-ANGPT2-2:17 Yes chr2R:11895997-11903918 lnc-ANGPT2-2:10 Yes chr2R:11895997-11903918 lnc-ANGPT2-2:11 Yes chr2R:11895997-11903918 lnc-ANGPT2-2:12 Yes chr2R:11895997-11903918 lnc-ANGPT2-2:13 Yes chr2R:11895997-11903918 lnc-ANGPT2-2:20 No - lnc-ANGPT2-2:21 No - lnc-ANGPT2-2:18 Yes chr2R:11895997-11903918 lnc-ANGPT2-2:14 Yes chr2R:11895997-11903918 MCPH1-AS1:9 Yes chr2R:11895997-11903918 MCPH1-AS1:10 Yes chr2R:11895997-11903918 MCPH1-AS1:11 Yes chr2R:11895997-11903918 MCPH1-AS1:8 Yes chr2R:11895997-11903918 MCPH1-AS1:12 No - MCPH1-AS1:13 No - MCPH1-AS1:14 No - lnc-XKR5-1:2 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-XKR5-1:3 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-XKR5-1:4 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-AGPAT5-1:7 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-AGPAT5-1:8 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-AGPAT5-1:9 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-AGPAT5-1:10 No - lnc-AGPAT5-1:11 No - lnc-AGPAT5-1:12 No - FAM66B:11 No - FAM66B:13 No - FAM66B:12 No - FAM66B:14 No - FAM66B:15 No - FAM66B:10 No - lnc-PRAG1-3:4 No - lnc-PRAG1-3:5 No - lnc-PRAG1-3:6 No - lnc-PRAG1-3:7 No - lnc-CLDN23-7:1 No - lnc-CLDN23-1:6 No - lnc-CLDN23-1:7 No - lnc-CLDN23-1:8 No - lnc-CLDN23-1:9 No - lnc-CLDN23-1:10 No - lnc-CLDN23-4:1 No - lnc-CLDN23-4:2 No - lnc-CLDN23-4:3 No - lnc-CLDN23-4:4 No - lnc-CLDN23-4:5 No - lnc-ERI1-32:1 No - lnc-ERI1-32:2 No - lnc-ERI1-32:3 No - lnc-ERI1-32:4 No - lnc-ERI1-32:5 No - lnc-ERI1-32:11 No - lnc-ERI1-32:12 No - lnc-ERI1-32:13 No - lnc-ERI1-32:14 No - lnc-ERI1-32:15 No - lnc-ERI1-32:16 No - lnc-ERI1-32:17 No - lnc-PPP1R3B-11:4 Yes chr3R:25653091-25661286 LINC00599:27 No - LINC00599:16 No - LINC00599:10 No - LINC00599:20 No - LINC00599:23 No - LINC00599:17 No - LINC00599:19 No - LINC00599:24 No - LINC00599:15 No - LINC00599:11 No - LINC00599:26 No - LINC00599:28 No - LINC00599:25 No - LINC00599:22 No - LINC00599:13 No - LINC00599:21 No - LINC00599:14 No - LINC00599:18 No - LINC00599:12 No - lnc-PRSS51-4:1 Yes chr3L:15511052-15513202 lnc-PRSS51-4:2 Yes chr3L:15511052-15513202 lnc-PRSS51-4:3 Yes chr3L:15511052-15513202 lnc-C8orf74-2:5 No - lnc-C8orf74-2:6 No - lnc-C8orf74-2:7 No - lnc-C8orf74-2:8 No - lnc-C8orf74-2:9 No - lnc-C8orf74-3:5 No - lnc-C8orf74-3:3 No - lnc-C8orf74-3:4 No - lnc-C8orf74-3:6 No - lnc-C8orf74-3:7 No - lnc-XKR6-3:2 No - lnc-XKR6-3:3 No - lnc-XKR6-18:3 Yes chr3L:8968528-8971752 lnc-XKR6-3:4 No - lnc-XKR6-3:5 No - lnc-CTSB-4:1 No - lnc-FDFT1-2:1 No - lnc-FDFT1-3:1 No - lnc-ZNF705D-2:31 No - lnc-ZNF705D-2:32 No - lnc-ZNF705D-2:33 No - lnc-ZNF705D-2:34 No - lnc-ZNF705D-2:35 No - lnc-ZNF705D-2:36 No - lnc-LONRF1-1:6 No - lnc-LONRF1-1:7 No - lnc-TRMT9B-4:1 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-LONRF1-10:1 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-DLC1-1:2 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-SGCZ-4:1 Yes chr2L:8306696-8308192 lnc-MSR1-7:3 Yes chr2L:8306696-8308192 lnc-MSR1-7:4 Yes chr2L:8306696-8308192 lnc-MSR1-7:1 Yes chr2L:8306696-8308192 lnc-MSR1-7:2 No - lnc-MSR1-1:9 No - lnc-MSR1-1:10 No - lnc-MSR1-1:7 No - lnc-MSR1-1:8 No - lnc-MICU3-6:1 No - lnc-MICU3-6:2 No - lnc-MICU3-6:3 No - lnc-MICU3-6:4 No - lnc-MICU3-6:5 No - lnc-FGF20-4:1 No - lnc-SLC7A2-2:1 No - lnc-PCM1-4:12 No - lnc-PCM1-4:13 No - lnc-PCM1-4:14 No - lnc-PCM1-4:15 No - lnc-FGL1-4:1 No - lnc-NAT1-3:6 No - lnc-NAT1-3:19 No - lnc-NAT1-3:20 No - lnc-NAT1-3:21 No - lnc-NAT1-3:22 No - lnc-NAT1-3:18 No - lnc-NAT2-1:2 No - lnc-SH2D4A-6:1 No - lnc-SH2D4A-6:2 No - lnc-PSD3-7:1 No - lnc-PSD3-7:2 No - lnc-PSD3-7:4 No - lnc-PSD3-7:3 No - lnc-PSD3-1:11 No - lnc-ATP6V1B2-2:3 No - lnc-ATP6V1B2-2:4 No - lnc-ATP6V1B2-2:5 No - lnc-ATP6V1B2-2:6 No - lnc-ATP6V1B2-2:7 No - lnc-ATP6V1B2-11:1 No - lnc-ATP6V1B2-3:3 No - lnc-ATP6V1B2-3:4 No - lnc-XPO7-5:1 No - lnc-BIN3-7:1 Yes chrX:16554627-16560016 lnc-CCAR2-5:1 No - lnc-CCAR2-3:1 No - lnc-CCAR2-3:2 No - lnc-CCAR2-6:1 No - lnc-CCAR2-2:3 Yes chr2L:12707661-12708680 lnc-CCAR2-2:6 Yes chr2L:12707661-12708680 lnc-CCAR2-2:7 Yes chr2L:12707661-12708680 lnc-CCAR2-2:8 Yes chr2L:12707661-12708680 lnc-RHOBTB2-2:6 Yes chr2L:12707661-12708680 lnc-RHOBTB2-2:7 Yes chr2L:12707661-12708680 lnc-TNFRSF10B-1:4 No - lnc-TNFRSF10B-1:5 No - lnc-TNFRSF10B-1:6 No - lnc-CHMP7-1:9 No - lnc-CHMP7-1:10 No - lnc-CHMP7-1:11 No - lnc-R3HCC1-5:1 Yes chr2R:21789623-21791580 lnc-SLC25A37-1:2 No - lnc-SLC25A37-1:3 No - lnc-SLC25A37-1:4 No - lnc-SLC25A37-1:5 No - lnc-SLC25A37-1:6 No - lnc-SLC25A37-1:7 No - lnc-SLC25A37-3:2 No - lnc-SLC25A37-3:3 No - lnc-SLC25A37-3:4 No - lnc-SLC25A37-3:5 No - lnc-SLC25A37-3:6 No - lnc-NEFL-6:15 No - lnc-NEFL-6:16 No - lnc-NEFL-6:17 No - lnc-NEFL-6:10 No - lnc-NEFL-6:1 No - lnc-NEFL-6:2 No - lnc-NEFL-6:3 No - lnc-NEFL-6:6 No - lnc-NEFL-6:11 No - lnc-NEFL-6:7 No - lnc-NEFL-6:8 No - lnc-NEFL-6:4 No - lnc-NEFL-6:5 No - lnc-NEFL-2:1 No - lnc-NEFL-1:1 No - lnc-NEFL-1:2 No - lnc-NEFL-1:3 No - lnc-NEFL-1:4 No - lnc-NEFL-1:5 No - lnc-PTK2B-5:1 No - lnc-ZNF395-2:6 No - lnc-ZNF395-2:2 No - lnc-ZNF395-2:3 No - lnc-ZNF395-2:4 No - lnc-ZNF395-2:5 No - EXTL3-AS1:19 Yes chr2R:19129589-19133706 EXTL3-AS1:16 Yes chr2R:19129589-19133706 EXTL3-AS1:14 Yes chr2R:19129589-19133706 EXTL3-AS1:15 Yes chr2R:19129589-19133706 EXTL3-AS1:17 Yes chr2R:19129589-19133706 EXTL3-AS1:20 Yes chr2R:19129589-19133706 EXTL3-AS1:21 Yes chr2R:19129589-19133706 EXTL3-AS1:18 Yes chr2R:19129589-19133706 lnc-HMBOX1-12:1 No - lnc-HMBOX1-12:2 No - lnc-HMBOX1-12:3 No - lnc-HMBOX1-12:4 No - lnc-HMBOX1-12:5 No - lnc-HMBOX1-12:6 No - lnc-HMBOX1-13:1 No - lnc-DUSP4-10:1 No - lnc-HMBOX1-5:3 No - lnc-HMBOX1-5:4 No - lnc-HMBOX1-5:2 No - lnc-HMBOX1-5:5 No - lnc-HMBOX1-5:6 No - lnc-LEPROTL1-13:1 No - lnc-LEPROTL1-13:2 No - lnc-LEPROTL1-13:3 No - lnc-LEPROTL1-13:4 No - lnc-LEPROTL1-12:1 No - lnc-LEPROTL1-11:1 No - LINC00589:18 No - LINC00589:19 No - LINC00589:20 No - LINC00589:14 No - LINC00589:16 No - LINC00589:15 No - LINC00589:21 No - LINC00589:23 No - LINC00589:22 No - LINC00589:17 No - LINC00589:12 No - LINC00589:13 No - lnc-SARAF-2:2 No - lnc-SARAF-2:3 No - lnc-MBOAT4-3:3 Yes chr2R:24874976-24875865 RBPMS-AS1:6 No - RBPMS-AS1:7 No - RBPMS-AS1:5 No - RBPMS-AS1:8 No - RBPMS-AS1:9 No - RBPMS-AS1:10 No - lnc-WRN-4:5 No - lnc-WRN-4:6 No - lnc-WRN-4:7 No - lnc-WRN-4:8 No - lnc-WRN-4:9 No - lnc-NRG1-2:12 No - lnc-NRG1-2:13 No - lnc-NRG1-2:14 No - lnc-NRG1-2:11 No - lnc-NRG1-2:10 No - lnc-UNC5D-2:3 No - lnc-UNC5D-2:4 No - lnc-KCNU1-2:1 No - lnc-KCNU1-2:2 No - lnc-BRF2-9:3 No - lnc-BRF2-9:4 No - lnc-BRF2-9:5 No - lnc-BRF2-9:6 No - lnc-BRF2-9:7 No - lnc-BRF2-9:8 No - LINC01605:17 No - LINC01605:19 No - LINC01605:20 No - LINC01605:21 No - LINC01605:22 No - LINC01605:18 No - lnc-BRF2-7:3 No - lnc-ZNF703-2:1 No - lnc-ZNF703-2:2 No - lnc-ZNF703-2:3 No - lnc-BRF2-7:4 No - lnc-BRF2-7:5 No - lnc-BRF2-7:6 No - lnc-BRF2-7:7 No - lnc-BRF2-3:1 Yes chr2L:14490859-14494019 lnc-BRF2-2:1 No - lnc-BRF2-2:2 No - lnc-BRF2-2:3 No - lnc-ADGRA2-4:1 No - lnc-ADGRA2-4:2 No - lnc-ADGRA2-4:3 No - lnc-ADGRA2-4:4 No - lnc-ADRB3-1:1 Yes chr2L:3478434-3479612 lnc-STAR-1:1 Yes chr3R:24650125-24653376 lnc-STAR-1:2 Yes chr3R:24650125-24653376 lnc-LETM2-3:2 No - lnc-LETM2-3:3 No - lnc-NSD3-14:1 Yes chr2R:24509508-24515320 lnc-TACC1-1:3 No - lnc-TACC1-1:1 No - lnc-TACC1-1:4 No - lnc-TACC1-1:2 No - lnc-TM2D2-7:3 No - lnc-TM2D2-7:1 No - lnc-TM2D2-7:2 No - lnc-NKX6-3-4:1 No - lnc-NKX6-3-4:2 No - lnc-GPAT4-4:1 Yes chr3L:7655389-7718395 lnc-GPAT4-4:2 Yes chr3L:7655389-7718395 lnc-GPAT4-5:1 Yes chr3L:7655389-7718395 lnc-GPAT4-5:2 Yes chr3L:7655389-7718395 lnc-GPAT4-5:3 Yes chr3L:7655389-7718395 lnc-AP3M2-3:1 No - lnc-PLAT-1:4 No - lnc-PLAT-1:3 No - lnc-PLAT-1:5 No - lnc-PLAT-1:6 No - lnc-PLAT-1:2 No - lnc-PLAT-3:11 No - lnc-PLAT-3:18 No - lnc-PLAT-3:12 No - lnc-PLAT-3:13 No - lnc-PLAT-3:14 No - lnc-PLAT-3:19 No - lnc-PLAT-3:15 No - lnc-PLAT-3:16 No - lnc-PLAT-3:9 No - lnc-PLAT-3:17 No - lnc-PLAT-3:10 No - lnc-SPIDR-1:1 No - lnc-SPIDR-1:2 No - lnc-SPIDR-1:3 No - lnc-CEBPD-11:2 No - lnc-CEBPD-11:3 No - lnc-CEBPD-11:4 No - lnc-CEBPD-11:5 No - lnc-CEBPD-11:6 No - lnc-UBE2V2-5:1 No - lnc-UBE2V2-5:2 No - lnc-UBE2V2-5:3 No - lnc-UBE2V2-5:4 No - lnc-UBE2V2-4:1 No - lnc-UBE2V2-4:2 No - lnc-UBE2V2-6:1 No - lnc-UBE2V2-7:2 No - lnc-UBE2V2-7:1 No - lnc-UBE2V2-7:3 No - lnc-EFCAB1-7:3 No - lnc-EFCAB1-4:4 No - lnc-EFCAB1-4:7 No - lnc-EFCAB1-4:8 No - lnc-EFCAB1-4:5 No - lnc-EFCAB1-4:6 No - lnc-PPDPFL-5:1 No - lnc-PPDPFL-5:2 No - lnc-PPDPFL-16:1 Yes chr2L:15333866-15336138 lnc-PPDPFL-16:2 Yes chr2L:15333866-15336138 lnc-PPDPFL-16:3 Yes chr2L:15333866-15336138 lnc-PPDPFL-16:4 Yes chr2L:15333866-15336138 lnc-PPDPFL-16:5 Yes chr2L:15333866-15336138 lnc-PPDPFL-2:4 No - lnc-PPDPFL-2:5 No - lnc-PPDPFL-2:6 No - lnc-PPDPFL-2:7 No - lnc-PPDPFL-2:8 No - lnc-SNTG1-11:1 Yes chr3L:2601455-2630064 lnc-SNTG1-11:2 Yes chr3L:2601455-2630064 lnc-SNTG1-11:3 Yes chr3L:2601455-2630064 lnc-NPBWR1-12:3 No - lnc-NPBWR1-12:4 No - lnc-NPBWR1-12:5 No - lnc-NPBWR1-12:6 No - lnc-NPBWR1-12:7 No - lnc-NPBWR1-12:10 No - lnc-NPBWR1-12:11 No - lnc-NPBWR1-12:12 No - lnc-NPBWR1-7:1 Yes chr3R:5669713-5679930 lnc-NPBWR1-7:2 Yes chr3R:5669713-5679930 lnc-NPBWR1-7:3 Yes chr3R:5669713-5679930 lnc-NPBWR1-7:4 Yes chr3R:5669713-5679930 lnc-NPBWR1-7:5 Yes chr3R:5669713-5679930 lnc-NPBWR1-7:7 No - lnc-OPRK1-3:8 No - lnc-OPRK1-3:9 No - lnc-OPRK1-3:10 No - lnc-OPRK1-3:11 No - lnc-OPRK1-3:7 No - lnc-RGS20-5:1 Yes chrX:15644222-15644991 lnc-LYPLA1-8:1 No - lnc-SOX17-4:1 No - lnc-SOX17-4:4 No - lnc-SOX17-4:5 No - lnc-SOX17-4:6 No - lnc-SOX17-4:7 No - lnc-SOX17-4:8 No - lnc-SOX17-4:9 No - lnc-SOX17-4:14 No - lnc-RPS20-6:1 Yes chr3L:4592447-4626196 lnc-FAM110B-14:2 No - lnc-FAM110B-14:3 No - lnc-FAM110B-14:1 No - lnc-FAM110B-14:4 No - lnc-FAM110B-3:3 No - lnc-UBXN2B-1:1 No - lnc-CYP7A1-9:1 Yes chr2R:24423926-24425102 lnc-SDCBP-2:7 Yes chr3L:1600726-1602674 lnc-SDCBP-2:10 Yes chr3L:1600726-1602674 lnc-SDCBP-2:11 Yes chr3L:1600726-1602674 lnc-SDCBP-2:13 Yes chr3L:1600726-1602674 lnc-SDCBP-2:14 Yes chr3L:1600726-1602674 lnc-SDCBP-2:12 Yes chr3L:1600726-1602674 lnc-SDCBP-2:15 No - lnc-SDCBP-2:16 No - LINC01301:13 No - LINC01301:14 No - LINC01301:15 No - LINC01301:16 No - LINC01301:17 No - LINC01301:11 No - LINC01301:12 No - lnc-CA8-14:5 No - lnc-CA8-14:4 No - lnc-ASPH-5:5 No - lnc-ASPH-5:6 No - lnc-ASPH-5:7 No - lnc-CLVS1-6:1 No - lnc-ASPH-1:3 No - lnc-ASPH-1:4 No - lnc-CLVS1-7:1 No - lnc-NKAIN3-14:1 No - lnc-NKAIN3-14:2 No - lnc-NKAIN3-14:4 No - lnc-NKAIN3-14:3 No - lnc-NKAIN3-14:5 No - lnc-NKAIN3-14:13 No - lnc-NKAIN3-14:14 No - lnc-NKAIN3-14:15 No - lnc-NKAIN3-14:16 No - lnc-NKAIN3-14:17 No - lnc-NKAIN3-14:18 No - lnc-NKAIN3-14:19 No - lnc-NKAIN3-14:12 No - lnc-NKAIN3-9:2 Yes chr3L:16234140-16236999 lnc-NKAIN3-9:3 Yes chr3L:16234140-16236999 YTHDF3-AS1:2 No - YTHDF3-AS1:3 No - YTHDF3-AS1:4 No - lnc-CYP7B1-6:5 No - lnc-CYP7B1-6:6 No - lnc-CYP7B1-6:7 No - lnc-CYP7B1-11:1 No - MIR124-2HG:17 No - MIR124-2HG:19 No - MIR124-2HG:18 No - MIR124-2HG:20 No - MIR124-2HG:21 No - MIR124-2HG:22 No - MIR124-2HG:23 No - MIR124-2HG:24 No - lnc-CYP7B1-2:4 No - LINC01299:4 No - LINC01299:5 No - lnc-MTFR1-5:1 No - lnc-MTFR1-1:2 No - lnc-MTFR1-1:3 No - lnc-PDE7A-6:4 Yes chr3L:22267382-22273745 lnc-PDE7A-6:5 Yes chr3L:22267382-22273745 lnc-PDE7A-6:6 Yes chr3L:22267382-22273745 lnc-PDE7A-6:7 Yes chr3L:22267382-22273745 lnc-CRH-7:1 No - lnc-CRH-7:2 No - lnc-TRIM55-1:13 No - lnc-TRIM55-1:14 Yes chr2L:10544883-10628054 RRS1-AS1:8 Yes chr3L:5899528-5900936 RRS1-AS1:5 No - RRS1-AS1:9 Yes chr3L:5899528-5900936 RRS1-AS1:3 No - RRS1-AS1:6 No - RRS1-AS1:7 No - RRS1-AS1:10 No - RRS1-AS1:4 No - lnc-SGK3-2:1 Yes chrX:15854832-15857823 lnc-SGK3-2:2 Yes chrX:15854832-15857823 lnc-SGK3-2:3 Yes chrX:15854832-15857823 lnc-SGK3-2:4 Yes chrX:15854832-15857823 lnc-SGK3-2:5 Yes chrX:15854832-15857823 lnc-VCPIP1-3:1 No - lnc-VCPIP1-4:1 No - SNHG6:18 No - SNHG6:19 No - SNHG6:16 No - SNHG6:17 No - lnc-CSPP1-1:5 Yes chr2L:13793521-13799674 lnc-CSPP1-1:6 Yes chr2L:13793521-13799674 lnc-CSPP1-1:7 No - lnc-CSPP1-1:8 No - lnc-CSPP1-1:11 No - lnc-CSPP1-1:9 No - lnc-CSPP1-1:10 No - LINC01592:10 No - LINC01592:12 No - lnc-C8orf34-1:3 No - lnc-C8orf34-1:4 No - lnc-C8orf34-1:5 No - lnc-C8orf34-1:6 No - lnc-C8orf34-1:7 No - lnc-C8orf34-1:8 No - lnc-C8orf34-1:9 No - lnc-C8orf34-1:10 No - LINC01592:11 No - lnc-SULF1-3:8 No - lnc-SULF1-3:9 No - lnc-SULF1-3:10 No - lnc-SULF1-3:13 No - lnc-SULF1-3:11 No - lnc-SULF1-3:7 No - lnc-SULF1-3:12 No - lnc-SULF1-3:14 No - lnc-XKR9-3:2 No - lnc-XKR9-3:3 No - lnc-XKR9-3:4 No - lnc-XKR9-3:5 No - lnc-XKR9-1:3 No - lnc-XKR9-1:4 No - lnc-XKR9-1:5 No - lnc-XKR9-1:6 No - lnc-XKR9-1:7 No - lnc-TMEM70-1:7 No - lnc-TMEM70-1:9 No - lnc-TMEM70-1:8 No - lnc-TMEM70-1:10 No - lnc-TMEM70-1:11 No - lnc-LY96-2:3 No - lnc-LY96-2:4 No - lnc-LY96-2:5 No - lnc-LY96-2:6 No - lnc-CRISPLD1-1:3 No - lnc-CRISPLD1-1:4 No - lnc-ZFHX4-2:8 No - lnc-ZFHX4-2:9 No - lnc-ZFHX4-2:10 No - lnc-ZFHX4-2:11 No - lnc-ZFHX4-2:12 No - lnc-ZFHX4-2:13 No - ZFHX4-AS1:26 Yes chr4:501810-540874 ZFHX4-AS1:20 Yes chr4:501810-540874 ZFHX4-AS1:21 Yes chr4:501810-540874 ZFHX4-AS1:15 Yes chr4:501810-540874 ZFHX4-AS1:16 Yes chr4:501810-540874 ZFHX4-AS1:23 Yes chr4:501810-540874 ZFHX4-AS1:22 Yes chr4:501810-540874 ZFHX4-AS1:17 Yes chr4:501810-540874 ZFHX4-AS1:18 Yes chr4:501810-540874 ZFHX4-AS1:24 Yes chr4:501810-540874 ZFHX4-AS1:25 Yes chr4:501810-540874 ZFHX4-AS1:19 Yes chr4:501810-540874 lnc-ZFHX4-6:4 Yes chr3L:8339051-8340276 lnc-ZFHX4-6:5 Yes chr3L:8339051-8340276 lnc-ZFHX4-6:6 Yes chr3L:8339051-8340276 lnc-ZFHX4-6:7 Yes chr3L:8339051-8340276 lnc-ZFHX4-6:8 Yes chr3L:8339051-8340276 lnc-ZFHX4-6:9 Yes chr3L:8339051-8340276 lnc-ZFHX4-6:12 Yes chr3L:8339051-8340276 lnc-ZFHX4-6:13 Yes chr3L:8339051-8340276 lnc-ZFHX4-6:10 Yes chr3L:8339051-8340276 lnc-ZFHX4-6:11 Yes chr3L:8339051-8340276 lnc-ZFHX4-9:1 No - lnc-ZFHX4-3:10 No - lnc-ZFHX4-3:11 No - lnc-ZFHX4-3:8 No - lnc-ZFHX4-3:12 No - lnc-ZFHX4-3:9 No - PKIA-AS1:4 No - PKIA-AS1:5 No - LINC01607:3 No - LINC01607:4 No - LINC01607:5 No - lnc-HEY1-1:8 No - lnc-HEY1-1:4 No - LINC01607:6 No - LINC01607:8 No - LINC01607:7 No - lnc-HEY1-1:5 No - lnc-HEY1-1:6 No - lnc-HEY1-1:7 No - lnc-ZNF704-7:8 No - lnc-ZNF704-7:6 No - lnc-ZNF704-7:7 No - lnc-ZNF704-7:10 No - lnc-ZNF704-7:11 No - lnc-ZNF704-7:12 No - lnc-ZNF704-7:9 No - lnc-FABP5-2:6 No - lnc-FABP5-2:7 No - lnc-FABP5-2:8 No - lnc-FABP5-2:9 No - lnc-FABP5-7:1 No - lnc-PMP2-1:7 Yes chr3R:11559896-11567054 lnc-PMP2-1:6 Yes chr3R:11559896-11567054 lnc-PMP2-1:5 Yes chr3R:11559896-11567054 lnc-PMP2-1:8 Yes chr3R:11559896-11567054 lnc-SNX16-2:3 No - lnc-SNX16-2:4 No - CA3-AS1:13 Yes chr2L:13803626-13809994 CA3-AS1:10 No - CA3-AS1:14 No - CA3-AS1:15 No - CA3-AS1:11 Yes chr2L:13803626-13809994 CA3-AS1:16 No - CA3-AS1:12 No - lnc-ATP6V0D2-2:4 No - lnc-ATP6V0D2-2:5 No - lnc-ATP6V0D2-2:6 No - lnc-ATP6V0D2-2:7 No - lnc-ATP6V0D2-2:8 No - lnc-SLC7A13-1:6 Yes chr2L:2037714-2044372 lnc-SLC7A13-1:8 No - lnc-SLC7A13-1:5 Yes chr2L:2037714-2044372 lnc-SLC7A13-1:7 No - lnc-CNBD1-4:9 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-CNBD1-4:10 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-CNBD1-4:11 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-CNBD1-4:12 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-CNBD1-4:13 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-CNBD1-4:14 Yes chr2R:9611139-9683858 lnc-CNBD1-4:15 No - lnc-CNBD1-4:16 No - lnc-CNBD1-4:17 No - lnc-CNBD1-4:18 No - lnc-MMP16-4:2 No - lnc-NBN-1:21 No - lnc-NBN-1:33 No - lnc-NBN-1:22 No - lnc-NBN-1:35 No - lnc-NBN-1:34 No - lnc-NBN-1:30 No - lnc-NBN-1:31 No - lnc-NBN-1:24 No - lnc-NBN-1:23 No - lnc-NBN-1:25 No - lnc-NBN-1:26 No - lnc-NBN-1:36 No - lnc-NBN-1:37 No - lnc-NBN-1:27 No - lnc-NBN-1:32 No - lnc-NBN-1:28 No - lnc-NBN-1:29 No - lnc-NBN-9:1 No - lnc-RIPK2-3:1 No - lnc-TMEM64-2:2 No - lnc-TMEM64-2:3 No - lnc-TMEM64-2:4 No - lnc-TMEM64-2:5 No - OTUD6B-AS1:13 No - OTUD6B-AS1:10 No - OTUD6B-AS1:14 No - OTUD6B-AS1:12 No - OTUD6B-AS1:11 No - OTUD6B-AS1:9 No - lnc-FAM92A-9:2 No - lnc-FAM92A-9:3 No - lnc-FAM92A-9:4 No - lnc-FAM92A-9:5 No - lnc-TRIQK-2:3 No - LINC00535:7 Yes chr2L:12424904-12426440 LINC00535:8 Yes chr2L:12424904-12426440 LINC00535:9 Yes chr2L:12424904-12426440 LINC00535:10 Yes chr2L:12424904-12426440 LINC00535:5 Yes chr2L:12424904-12426440 LINC00535:6 Yes chr2L:12424904-12426440 lnc-FAM92A-2:2 No - lnc-FAM92A-2:3 No - lnc-RBM12B-2:3 Yes chrX:7731779-7734651 lnc-RBM12B-2:4 Yes chrX:7731779-7734651 lnc-RBM12B-2:5 Yes chrX:7731779-7734651 lnc-RBM12B-2:6 Yes chrX:7731779-7734651 lnc-RBM12B-2:7 Yes chrX:7731779-7734651 lnc-ESRP1-2:2 No - lnc-ESRP1-2:3 No - lnc-ESRP1-2:4 No - lnc-ESRP1-2:5 No - lnc-ESRP1-2:6 No - lnc-ESRP1-2:7 No - lnc-VIRMA-1:2 No - lnc-VIRMA-1:3 No - lnc-VIRMA-1:4 No - lnc-VIRMA-1:5 No - lnc-VIRMA-1:6 No - lnc-VIRMA-1:9 No - lnc-VIRMA-1:12 No - lnc-CCNE2-2:1 Yes chrX:18653392-18657286 lnc-CCNE2-2:2 Yes chrX:18653392-18657286 lnc-CCNE2-2:3 Yes chrX:18653392-18657286 lnc-INTS8-1:3 Yes chrX:11891732-11893745 lnc-INTS8-1:4 Yes chrX:11891732-11893745 C8orf37-AS1:16 No - C8orf37-AS1:18 No - C8orf37-AS1:17 No - lnc-PTDSS1-1:3 No - lnc-PTDSS1-1:4 No - lnc-PTDSS1-1:2 No - lnc-MTERF3-1:5 No - lnc-MTERF3-1:6 No - lnc-MTERF3-1:7 No - lnc-TSPYL5-5:1 No - lnc-RPL30-8:2 Yes chr2R:8718017-8723839 lnc-RPL30-8:1 Yes chr2R:8718017-8723839 lnc-KCNS2-5:4 No - lnc-KCNS2-5:1 No - lnc-KCNS2-5:2 No - lnc-KCNS2-5:3 No - lnc-KCNS2-4:1 Yes chr2R:19493996-19496856 lnc-KCNS2-4:2 Yes chr2R:19493996-19496856 lnc-KCNS2-4:3 Yes chr2R:19493996-19496856 lnc-STK3-2:7 No - lnc-STK3-2:4 No - lnc-STK3-2:8 No - lnc-STK3-2:5 No - lnc-STK3-2:6 No - lnc-COX6C-3:1 Yes chr3R:29935978-29948207 lnc-COX6C-3:2 Yes chr3R:29935978-29948207 lnc-COX6C-3:3 Yes chr3R:29935978-29948207 lnc-COX6C-3:4 Yes chr3R:29935978-29948207 lnc-COX6C-3:5 Yes chr3R:29935978-29948207 lnc-ANKRD46-5:1 No - lnc-ANKRD46-5:2 No - lnc-SPAG1-7:2 No - lnc-SPAG1-8:1 No - lnc-GRHL2-20:1 No - lnc-GRHL2-19:1 No - lnc-GRHL2-19:2 No - lnc-GRHL2-19:3 No - lnc-GRHL2-19:4 No - lnc-YWHAZ-4:4 No - lnc-YWHAZ-4:2 No - lnc-YWHAZ-4:3 No - lnc-GRHL2-8:2 No - lnc-GRHL2-8:3 No - lnc-GRHL2-8:4 No - lnc-GRHL2-8:5 No - lnc-GRHL2-8:6 No - lnc-GRHL2-12:5 Yes chr3L:15835693-15837482 lnc-GRHL2-12:6 Yes chr3L:15835693-15837482 lnc-GRHL2-12:7 Yes chr3L:15835693-15837482 lnc-GRHL2-12:8 Yes chr3L:15835693-15837482 lnc-NCALD-1:3 Yes chr2R:17801132-17842820 lnc-NCALD-1:4 Yes chr2R:17801132-17842820 lnc-NCALD-1:5 Yes chr2R:17801132-17842820 UBR5-AS1:7 No - UBR5-AS1:8 No - UBR5-AS1:9 No - UBR5-AS1:5 Yes chr3R:9714623-9725615 lnc-ODF1-5:1 No - lnc-ODF1-5:2 No - GASAL1:19 No - GASAL1:20 No - GASAL1:24 No - GASAL1:25 No - GASAL1:26 No - GASAL1:27 Yes chr2R:8007246-8009062 GASAL1:28 Yes chr2R:8007246-8009062 GASAL1:29 No - lnc-AZIN1-4:1 No - lnc-AZIN1-7:1 No - lnc-AZIN1-6:1 No - LINC01181:3 No - LINC01181:2 No - BAALC-AS1:29 No - BAALC-AS1:30 No - BAALC-AS1:31 No - BAALC-AS1:28 No - BAALC-AS1:22 No - BAALC-AS1:23 No - BAALC-AS1:24 No - BAALC-AS1:25 No - BAALC-AS1:26 No - BAALC-AS1:27 No - BAALC-AS1:21 No - lnc-SLC25A32-3:17 No - lnc-SLC25A32-3:13 Yes chr3R:17872748-17916578 lnc-SLC25A32-3:16 Yes chr3R:17872748-17916578 lnc-SLC25A32-3:10 Yes chr3R:17872748-17916578 lnc-SLC25A32-3:18 No - lnc-SLC25A32-3:19 No - lnc-SLC25A32-3:14 Yes chr3R:17872748-17916578 lnc-SLC25A32-3:11 Yes chr3R:17872748-17916578 lnc-SLC25A32-3:12 Yes chr3R:17872748-17916578 lnc-SLC25A32-3:15 Yes chr3R:17872748-17916578 lnc-OXR1-4:1 No - lnc-ABRA-1:4 No - lnc-ABRA-1:5 No - lnc-ABRA-1:2 No - lnc-ABRA-1:3 No - lnc-ABRA-1:6 No - lnc-ABRA-1:7 No - lnc-EMC2-10:1 Yes chr3L:16785242-16786941 lnc-EBAG9-2:1 Yes chr3L:2895017-2959579 LINC01608:9 No - LINC01608:14 No - LINC01608:15 No - LINC01608:16 No - LINC01608:17 No - LINC01608:11 No - LINC01608:10 No - LINC01608:18 No - LINC01608:19 No - LINC01608:12 No - LINC01608:13 No - lnc-UTP23-14:6 No - lnc-UTP23-14:7 No - lnc-UTP23-14:8 No - lnc-UTP23-14:9 No - lnc-UTP23-14:10 No - lnc-TRPS1-6:1 No - lnc-UTP23-11:1 Yes chr2L:10333734-10339185 lnc-UTP23-11:2 Yes chr2L:10333734-10339185 lnc-UTP23-10:1 Yes chr2L:10333734-10339185 lnc-UTP23-10:2 Yes chr2L:10333734-10339185 LINC00536:3 No - lnc-UTP23-9:2 No - lnc-UTP23-9:3 No - lnc-UTP23-9:1 No - LINC00536:5 No - LINC00536:4 No - lnc-UTP23-8:1 No - lnc-RAD21-1:6 No - lnc-RAD21-1:2 No - lnc-RAD21-1:3 No - lnc-RAD21-1:4 No - lnc-RAD21-1:5 No - lnc-MED30-3:1 No - lnc-MED30-3:2 No - lnc-DEPTOR-5:1 Yes chr2R:20274597-20276142 lnc-DEPTOR-5:5 Yes chr2R:20274597-20276142 HAS2-AS1:8 No - HAS2-AS1:9 No - HAS2-AS1:10 No - HAS2-AS1:11 No - HAS2-AS1:12 No - HAS2-AS1:13 No - HAS2-AS1:14 No - HAS2-AS1:15 No - HAS2-AS1:16 No - HAS2-AS1:17 No - SMILR:7 No - lnc-DERL1-3:4 No - lnc-DERL1-3:8 No - lnc-DERL1-3:5 No - lnc-DERL1-3:6 No - lnc-DERL1-3:9 No - lnc-FAM83A-8:1 No - lnc-TMEM65-1:4 No - lnc-TMEM65-1:5 No - lnc-TMEM65-1:6 No - lnc-FER1L6-1:4 No - lnc-FER1L6-1:5 No - lnc-FER1L6-1:6 No - lnc-FER1L6-1:7 No - lnc-FER1L6-1:8 No - lnc-FER1L6-1:9 No - RNF139-AS1:12 No - RNF139-AS1:13 No - RNF139-AS1:10 No - RNF139-AS1:14 No - RNF139-AS1:11 No - lnc-NDUFB9-2:2 No - lnc-NDUFB9-2:3 No - lnc-NDUFB9-2:4 No - lnc-NDUFB9-2:5 No - lnc-ZNF572-5:1 No - lnc-NDUFB9-3:1 No - lnc-MTSS1-1:8 No - lnc-MTSS1-1:7 No - lnc-ZNF572-4:1 No - lnc-MTSS1-1:6 No - lnc-MTSS1-1:5 No - lnc-MTSS1-1:4 No - LINC00964:25 No - LINC00964:21 No - LINC00964:22 No - LINC00964:23 No - LINC00964:24 No - LINC00964:28 No - LINC00964:29 No - LINC00964:30 No - LINC00964:26 No - LINC00964:27 No - lnc-WASHC5-13:3 No - lnc-WASHC5-13:4 No - lnc-TRIB1-1:3 No - lnc-TRIB1-1:4 No - lnc-WASHC5-14:3 No - PCAT1:57 No - PCAT1:58 No - PCAT1:59 No - PCAT1:60 No - PCAT1:61 No - PCAT1:62 No - lnc-POU5F1B-14:1 No - PCAT1:5 No - lnc-FAM84B-15:124 No - lnc-FAM84B-15:115 No - lnc-FAM84B-15:116 No - lnc-FAM84B-15:117 No - lnc-FAM84B-84:6 No - lnc-FAM84B-84:7 No - lnc-FAM84B-84:8 No - lnc-FAM84B-84:9 No - lnc-FAM84B-84:1 No - lnc-FAM84B-84:2 No - lnc-FAM84B-84:3 No - lnc-FAM84B-84:4 No - lnc-FAM84B-84:5 No - CASC11:7 Yes chrX:3373159-3391697 CASC11:11 No - CASC11:12 No - CASC11:8 Yes chrX:3373159-3391697 CASC11:9 Yes chrX:3373159-3391697 CASC11:6 Yes chrX:3373159-3391697 CASC11:10 No - lnc-FAM84B-21:2 Yes chrX:3373159-3391697 lnc-FAM84B-20:2 Yes chrX:3373159-3391697 PVT1:49 No - PVT1:50 No - PVT1:51 No - PVT1:52 No - PVT1:53 No - PVT1:55 No - PVT1:54 No - PVT1:56 No - PVT1:59 No - PVT1:63 No - PVT1:57 No - PVT1:60 No - PVT1:61 No - PVT1:62 No - PVT1:58 No - PVT1:64 No - PVT1:65 No - PVT1:66 No - PVT1:68 No - PVT1:67 No - PVT1:69 No - PVT1:70 No - PVT1:72 No - PVT1:73 No - PVT1:71 No - PVT1:74 No - PVT1:75 No - PVT1:76 No - PVT1:77 No - PVT1:78 No - PVT1:79 No - PVT1:81 No - PVT1:82 No - lnc-FAM84B-19:2 No - lnc-FAM84B-19:3 No - lnc-GSDMC-22:1 No - lnc-MYC-20:1 No - lnc-GSDMC-34:38 No - lnc-GSDMC-34:39 No - lnc-GSDMC-34:40 No - lnc-GSDMC-34:28 No - lnc-GSDMC-34:29 No - lnc-GSDMC-34:30 No - lnc-GSDMC-34:31 No - lnc-GSDMC-12:1 No - lnc-GSDMC-34:18 No - lnc-GSDMC-34:19 No - lnc-GSDMC-34:20 No - lnc-GSDMC-34:11 No - lnc-GSDMC-34:12 No - lnc-GSDMC-34:21 No - lnc-GSDMC-34:22 No - lnc-EFR3A-1:6 No - lnc-EFR3A-1:7 No - lnc-OC90-3:1 No - lnc-EFR3A-12:1 No - lnc-OC90-2:1 Yes chr2R:8729502-8734304 lnc-WISP1-2:4 No - lnc-ST3GAL1-8:4 No - lnc-ST3GAL1-8:1 No - lnc-ST3GAL1-8:2 No - lnc-ST3GAL1-8:3 No - lnc-ST3GAL1-8:5 No - lnc-ST3GAL1-9:2 No - lnc-ST3GAL1-9:1 No - lnc-WISP1-17:1 No - lnc-WISP1-17:2 No - lnc-ZFAT-1:8 No - lnc-ZFAT-1:6 No - lnc-ZFAT-1:7 No - lnc-ZFAT-1:3 No - lnc-ZFAT-1:4 No - lnc-ZFAT-1:5 No - lnc-KHDRBS3-4:11 No - lnc-KHDRBS3-4:12 No - lnc-KHDRBS3-4:13 No - lnc-KHDRBS3-4:14 No - lnc-KHDRBS3-4:15 No - lnc-KHDRBS3-4:16 No - lnc-KHDRBS3-4:17 No - lnc-KHDRBS3-4:18 No - lnc-KHDRBS3-4:19 No - lnc-KHDRBS3-4:20 No - lnc-ZFAT-3:4 No - lnc-ZFAT-3:5 No - lnc-ZFAT-3:6 No - lnc-ZFAT-3:8 No - lnc-ZFAT-3:7 No - lnc-KHDRBS3-8:10 No - lnc-AGO2-2:1 Yes chrX:12017225-12017961 lnc-AGO2-2:2 Yes chrX:12017225-12017961 lnc-DENND3-6:1 Yes chr2R:19430659-19437259 lnc-DENND3-6:2 Yes chr2R:19430659-19437259 lnc-DENND3-6:3 Yes chr2R:19430659-19437259 lnc-DENND3-6:4 Yes chr2R:19430659-19437259 lnc-DENND3-6:5 Yes chr2R:19430659-19437259 lnc-SLC45A4-2:11 No - lnc-SLC45A4-2:5 No - lnc-SLC45A4-2:4 No - lnc-SLC45A4-2:12 No - lnc-SLC45A4-2:13 No - lnc-SLC45A4-2:9 No - lnc-SLC45A4-2:10 No - lnc-SLC45A4-2:8 No - lnc-SLC45A4-2:15 No - lnc-SLC45A4-2:16 No - lnc-SLC45A4-2:14 No - lnc-SLC45A4-2:6 No - lnc-SLC45A4-2:7 No - lnc-PTP4A3-1:2 No - lnc-PTP4A3-1:3 No - lnc-PTP4A3-1:4 No - lnc-PTP4A3-1:5 No - LINC00051:4 No - LINC00051:5 Yes chr3L:13044434-13046894 LINC00051:6 Yes chr3L:13044434-13046894 LINC00051:7 Yes chr3L:13044434-13046894 LINC00051:8 Yes chr3L:13044434-13046894 LINC00051:9 Yes chr3L:13044434-13046894 lnc-ADGRB1-1:1 No - lnc-ADGRB1-1:2 No - lnc-ADGRB1-1:3 No - lnc-ADGRB1-1:4 No - lnc-JRK-1:13 No - lnc-JRK-1:4 No - lnc-JRK-1:5 No - lnc-JRK-1:6 No - lnc-JRK-1:7 No - lnc-JRK-1:8 No - lnc-JRK-1:9 No - LNCOC1:8 No - LNCOC1:9 No - LNCOC1:10 No - LNCOC1:11 No - LNCOC1:12 No - lnc-THEM6-3:1 No - LY6E-DT:23 No - LY6E-DT:24 No - LY6E-DT:25 No - LY6E-DT:26 No - LY6E-DT:27 No - LY6E-DT:28 No - LY6E-DT:29 No - LY6E-DT:30 No - lnc-TOP1MT-4:2 Yes chr3R:18367927-18372738 lnc-TOP1MT-4:3 Yes chr3R:18367927-18372738 MAFA-AS1:3 Yes chr2L:19464267-19467758 MAFA-AS1:4 No - MAFA-AS1:5 Yes chr2L:19464267-19467758 MAFA-AS1:6 Yes chr2L:19464267-19467758 MAFA-AS1:7 Yes chr2L:19464267-19467758 MAFA-AS1:8 Yes chr2L:19464267-19467758 lnc-GSDMD-1:3 No - lnc-GSDMD-1:4 No - lnc-MROH6-1:1 No - lnc-MAPK15-6:1 No - lnc-SCRIB-1:3 No - lnc-SCRIB-1:2 No - lnc-SPATC1-3:1 Yes chr2R:22478379-22483054 lnc-OPLAH-1:1 Yes chr2L:13221397-13222429 lnc-OPLAH-1:7 No - lnc-OPLAH-1:5 Yes chr2L:13221397-13222429 lnc-OPLAH-1:2 Yes chr2L:13221397-13222429 lnc-OPLAH-1:3 No - lnc-DGAT1-3:1 No - lnc-ADCK5-1:2 Yes chr3L:14992289-14997983 lnc-KIFC2-5:1 No - lnc-ZNF251-2:1 No - lnc-ZNF251-2:2 No - lnc-ZNF251-2:3 No - lnc-ZNF517-3:1 Yes chr3L:2587456-2588883 lnc-ZNF517-3:2 Yes chr3L:2587456-2588883 lnc-ZNF517-3:3 Yes chr3L:2587456-2588883 lnc-ZNF517-3:4 Yes chr3L:2587456-2588883 lnc-ZNF517-3:5 Yes chr3L:2587456-2588883 ZNF252P-AS1:2 No - ZNF252P-AS1:3 No - ZNF252P-AS1:4 No - ZNF252P-AS1:5 No - ZNF252P-AS1:6 No - LINC01388:6 No - LINC01388:4 No - LINC01388:7 No - LINC01388:5 No - lnc-C9orf66-2:26 No - lnc-C9orf66-2:25 No - lnc-C9orf66-2:27 No - lnc-C9orf66-14:1 Yes chr2L:94739-102086 lnc-C9orf66-15:6 Yes chr2L:94739-102086 lnc-C9orf66-15:7 Yes chr2L:94739-102086 lnc-C9orf66-15:8 Yes chr2L:94739-102086 lnc-C9orf66-15:9 No - lnc-C9orf66-15:10 No - lnc-DOCK8-2:4 Yes chr2R:14901475-14928425 lnc-DOCK8-2:5 Yes chr2R:14901475-14928425 lnc-PUM3-10:1 Yes chr3L:15970082-15982869 lnc-PUM3-10:2 Yes chr3L:15970082-15982869 VLDLR-AS1:22 No - VLDLR-AS1:13 Yes chr3R:25698727-25740465 VLDLR-AS1:14 Yes chr3R:25698727-25740465 VLDLR-AS1:15 Yes chr3R:25698727-25740465 VLDLR-AS1:19 No - VLDLR-AS1:20 No - VLDLR-AS1:18 No - VLDLR-AS1:16 Yes chr3R:25698727-25740465 VLDLR-AS1:17 Yes chr3R:25698727-25740465 VLDLR-AS1:23 No - VLDLR-AS1:24 No - VLDLR-AS1:21 No - lnc-KCNV2-5:2 No - lnc-KCNV2-5:3 No - RFX3-AS1:9 No - RFX3-AS1:10 No - RFX3-AS1:12 No - RFX3-AS1:11 No - RFX3-AS1:13 No - RFX3-AS1:14 No - RFX3-AS1:15 No - RFX3-AS1:16 No - lnc-SLC1A1-1:3 No - lnc-SLC1A1-1:7 No - lnc-SLC1A1-1:4 No - lnc-SLC1A1-1:5 No - lnc-SLC1A1-1:6 No - CDC37L1-DT:16 No - CDC37L1-DT:17 No - CDC37L1-DT:18 No - CDC37L1-DT:19 No - lnc-RCL1-4:1 Yes chr3R:10887345-10889588 lnc-RCL1-4:2 Yes chr3R:10887345-10889588 lnc-RCL1-4:4 Yes chr3R:10887345-10889588 lnc-RCL1-4:3 Yes chr3R:10887345-10889588 lnc-RCL1-4:5 Yes chr3R:10887345-10889588 lnc-AK3-5:1 No - lnc-AK3-5:2 No - lnc-AK3-5:3 No - lnc-CD274-1:1 Yes chrX:14264737-14266250 lnc-MLANA-4:1 No - lnc-IL33-3:1 No - lnc-IL33-3:3 No - lnc-IL33-3:2 No - lnc-KDM4C-5:3 No - lnc-KDM4C-5:4 No - lnc-KDM4C-5:5 No - lnc-GLDC-2:1 No - lnc-KDM4C-5:7 No - lnc-KDM4C-5:8 No - lnc-KDM4C-5:9 No - lnc-KDM4C-5:10 No - lnc-GLDC-4:1 No - lnc-KDM4C-19:2 No - lnc-KDM4C-19:3 No - lnc-KDM4C-19:4 No - lnc-GLDC-3:1 No - lnc-GLDC-6:2 Yes chr2R:13176553-13198337 lnc-GLDC-6:1 Yes chr2R:13176553-13198337 PTPRD-AS1:5 Yes chr2L:19586623-19732069 PTPRD-AS1:6 Yes chr2L:19586623-19732069 PTPRD-AS1:8 Yes chr2L:19586623-19732069 PTPRD-AS1:7 Yes chr2L:19586623-19732069 PTPRD-AS1:9 Yes chr2L:19586623-19732069 PTPRD-AS2:6 No - PTPRD-AS2:7 No - PTPRD-AS2:8 No - LURAP1L-AS1:5 No - LURAP1L-AS1:6 No - LURAP1L-AS1:8 No - LURAP1L-AS1:9 No - LURAP1L-AS1:7 No - LURAP1L-AS1:3 No - LURAP1L-AS1:4 No - lnc-LURAP1L-6:1 No - lnc-LURAP1L-6:2 No - lnc-LURAP1L-6:3 No - lnc-LURAP1L-4:1 No - lnc-SNAPC3-11:1 Yes chr4:268175-276369 lnc-SNAPC3-11:2 Yes chr4:268175-276369 lnc-SNAPC3-11:5 Yes chr4:268175-276369 lnc-SNAPC3-11:7 Yes chr4:268175-276369 lnc-PSIP1-4:2 No - lnc-PSIP1-4:1 No - BNC2-AS1:9 Yes chrX:16118067-16148977 BNC2-AS1:10 Yes chrX:16118067-16148977 BNC2-AS1:11 Yes chrX:16118067-16148977 BNC2-AS1:12 Yes chrX:16118067-16148977 BNC2-AS1:13 Yes chrX:16118067-16148977 BNC2-AS1:15 Yes chrX:16118067-16148977 lnc-CNTLN-1:2 No - lnc-CNTLN-1:3 No - lnc-CNTLN-1:4 No - lnc-CNTLN-1:5 No - lnc-CNTLN-1:6 No - lnc-RRAGA-4:1 No - lnc-RRAGA-5:1 No - lnc-ACER2-6:1 No - lnc-ACER2-6:2 No - lnc-ACER2-6:3 No - FOCAD-AS1:4 Yes chr2R:23396770-23402309 FOCAD-AS1:5 Yes chr2R:23396770-23402309 MIR31HG:20 No - MIR31HG:12 No - MIR31HG:13 No - MIR31HG:14 No - MIR31HG:15 No - MIR31HG:18 No - MIR31HG:9 No - MIR31HG:19 No - MIR31HG:17 No - MIR31HG:11 No - MIR31HG:6 No - MIR31HG:7 No - MIR31HG:16 No - MIR31HG:10 No - MIR31HG:8 No - lnc-CDKN2A-2:1 No - CDKN2B-AS1:41 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:58 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:49 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:42 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:43 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:44 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:50 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:51 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:52 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:45 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:46 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:47 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:48 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:53 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:54 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:55 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:56 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:57 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:59 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:60 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:61 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:62 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:63 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:64 Yes chr3R:25036944-25037982 CDKN2B-AS1:65 Yes chr3R:25036944-25037982 LINC01239:9 No - LINC01239:10 Yes chr3R:29692591-29697025 lnc-DMRTA1-28:1 No - LINC01239:11 No - LINC01239:12 No - lnc-ELAVL2-3:4 No - lnc-CAAP1-4:1 No - lnc-CAAP1-4:2 No - lnc-CAAP1-4:3 No - lnc-CAAP1-4:4 No - lnc-CAAP1-4:5 No - lnc-IFT74-1:6 No - lnc-IFT74-1:7 No - lnc-IFT74-1:8 No - lnc-IFT74-1:4 No - lnc-IFT74-1:5 No - IFT74-AS1:3 No - IFT74-AS1:4 No - lnc-IFNK-10:1 No - lnc-C9orf72-5:1 No - lnc-IFNK-7:2 No - lnc-IFNK-7:3 No - lnc-DDX58-8:4 No - lnc-DDX58-8:1 No - lnc-DDX58-8:5 No - lnc-DDX58-8:2 No - lnc-DDX58-8:3 No - lnc-DNAJA1-4:1 No - lnc-SPINK4-4:1 Yes chr3R:29032660-29034008 lnc-SPINK4-4:3 No - lnc-SPINK4-4:4 No - lnc-SPINK4-4:5 No - lnc-SPINK4-4:6 No - lnc-BAG1-3:1 No - lnc-NFX1-1:3 No - lnc-NFX1-1:5 No - lnc-NFX1-1:4 No - lnc-ANKRD18B-3:3 No - lnc-ANKRD18B-3:4 No - lnc-ANKRD18B-3:5 No - lnc-NOL6-7:1 No - lnc-PRSS3-2:5 No - lnc-PRSS3-2:6 No - lnc-PRSS3-2:7 No - lnc-PRSS3-2:8 No - lnc-PRSS3-2:9 No - lnc-UBAP1-6:2 No - lnc-UBAP1-6:3 No - CNTFR-AS1:14 No - CNTFR-AS1:16 No - CNTFR-AS1:17 No - CNTFR-AS1:15 No - lnc-CCL27-1:5 No - lnc-C9orf131-1:3 Yes chr2R:18426421-18430333 lnc-C9orf131-1:2 Yes chr2R:18426421-18430333 lnc-C9orf131-3:1 Yes chr2R:11619479-11640941 lnc-FAM214B-2:2 Yes chr4:867824-912331 lnc-FAM214B-2:3 Yes chr4:867824-912331 lnc-ARHGEF39-1:3 No - lnc-ARHGEF39-1:4 No - lnc-OR2S2-2:2 No - lnc-RECK-328:1 No - lnc-RECK-328:2 No - lnc-RECK-328:3 No - lnc-GNE-3:1 No - lnc-GNE-3:2 No - lnc-GNE-3:3 No - lnc-ZCCHC7-2:16 No - lnc-ZCCHC7-2:17 No - lnc-ZCCHC7-2:18 No - lnc-ZCCHC7-2:19 No - lnc-ZCCHC7-2:20 No - lnc-ZCCHC7-2:21 No - lnc-ZCCHC7-2:22 Yes chr3L:16845386-16852350 lnc-ZCCHC7-2:23 Yes chr3L:16845386-16852350 lnc-ZCCHC7-2:26 No - lnc-ZCCHC7-2:24 No - lnc-ZCCHC7-2:25 No - lnc-ZCCHC7-2:27 No - lnc-PAX5-3:3 No - lnc-PAX5-3:4 No - lnc-ZCCHC7-2:28 Yes chr3L:16845386-16852350 lnc-DCAF10-2:3 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-DCAF10-2:4 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-DCAF10-2:5 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-DCAF10-2:6 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-DCAF10-2:7 Yes chrX:12516634-12568452 lnc-SHB-5:1 No - lnc-ALDH1B1-6:1 No - lnc-ALDH1B1-6:2 No - lnc-ALDH1B1-6:3 No - lnc-ALDH1B1-6:4 No - FAM201A:5 No - FAM201A:6 No - FAM201A:7 No - FAM201A:8 No - FAM201A:9 No - FAM201A:10 No - FAM201A:11 No - lnc-ALDH1B1-13:1 No - lnc-ALDH1B1-13:2 No - lnc-ALDH1B1-13:3 No - GLIDR:22 No - GLIDR:19 No - GLIDR:23 No - GLIDR:20 No - GLIDR:21 No - LINC01410:8 No - LINC01410:9 No - LINC01410:10 No - LINC01410:11 No - LINC01410:12 No - LINC01410:13 No - LINC01410:14 No - LINC01410:15 No - LINC01410:16 No - LINC01410:17 No - LINC01410:18 No - lnc-FOXD4L5-26:1 No - lnc-FOXD4L5-26:2 No - lnc-FOXD4L5-26:3 No - lnc-ANKRD20A4-7:1 No - lnc-ANKRD20A4-7:2 No - lnc-ANKRD20A4-7:3 No - lnc-ANKRD20A4-7:4 No - LINC01506:5 No - LINC01506:6 No - LINC01506:4 No - lnc-C9orf135-2:2 No - lnc-C9orf135-1:2 No - lnc-C9orf135-1:3 No - lnc-C9orf135-1:4 No - C9orf135-DT:14 No - C9orf135-DT:15 No - C9orf135-DT:16 No - C9orf135-DT:17 No - SMC5-AS1:4 No - SMC5-AS1:11 No - SMC5-AS1:5 No - SMC5-AS1:6 No - SMC5-AS1:7 No - SMC5-AS1:8 No - SMC5-AS1:9 No - SMC5-AS1:10 No - lnc-KLF9-5:1 No - lnc-KLF9-5:2 No - lnc-ABHD17B-6:1 No - lnc-C9orf85-9:1 No - lnc-GDA-7:1 No - lnc-ZFAND5-5:1 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-ZFAND5-5:2 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-ZFAND5-5:3 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-ZFAND5-5:4 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-ANXA1-62:1 No - lnc-ANXA1-62:2 No - lnc-ALDH1A1-11:1 No - RORB-AS1:11 No - RORB-AS1:8 Yes chr2R:10203995-10237348 RORB-AS1:7 Yes chr2R:10203995-10237348 RORB-AS1:9 Yes chr2R:10203995-10237348 RORB-AS1:6 Yes chr2R:10203995-10237348 C9orf41-AS1:8 Yes chrX:1927683-1930517 lnc-GCNT1-4:2 No - lnc-GCNT1-4:3 No - lnc-GCNT1-4:4 No - lnc-GCNT1-4:5 No - lnc-GCNT1-4:6 No - lnc-GNAQ-7:3 No - lnc-GNAQ-7:4 No - lnc-GNAQ-7:5 No - lnc-GNAQ-7:6 No - lnc-GNAQ-7:7 No - lnc-TLE4-11:1 No - lnc-TLE4-11:2 No - lnc-TLE4-11:3 No - lnc-TLE4-11:4 No - lnc-TLE4-12:2 No - lnc-TLE4-12:3 No - lnc-TLE4-12:1 No - lnc-TLE4-12:5 No - lnc-TLE4-12:4 No - lnc-SPATA31D4-1:4 No - lnc-SPATA31D4-1:5 No - lnc-SPATA31D4-1:6 No - lnc-SPATA31D4-1:7 No - lnc-SPATA31D4-1:8 No - lnc-SPATA31D4-1:9 No - lnc-SPATA31D1-4:1 No - lnc-SPATA31D1-4:4 No - lnc-SPATA31D1-4:5 No - lnc-SPATA31D1-4:6 No - lnc-SPATA31D1-4:7 No - lnc-SPATA31D1-4:8 No - lnc-SPATA31D1-4:9 No - lnc-SPATA31D1-4:10 No - lnc-SPATA31D1-4:11 No - lnc-SPATA31D1-4:12 No - lnc-SPATA31D1-4:13 No - lnc-SPATA31D1-4:14 No - lnc-SPATA31D1-4:15 No - lnc-SPATA31D1-4:16 No - lnc-IDNK-3:2 Yes chr2L:10344442-10347706 lnc-IDNK-3:3 Yes chr2L:10344442-10347706 lnc-IDNK-3:4 Yes chr2L:10344442-10347706 lnc-IDNK-3:6 No - lnc-IDNK-3:7 Yes chr2L:10344442-10347706 lnc-IDNK-1:2 No - lnc-IDNK-1:3 No - lnc-RMI1-9:1 Yes chr2R:21294402-21295588 lnc-NAA35-11:1 No - lnc-GOLM1-4:1 No - lnc-GOLM1-4:2 No - lnc-NAA35-14:1 No - GAS1RR:10 No - GAS1RR:13 No - GAS1RR:14 No - GAS1RR:11 No - GAS1RR:12 No - GAS1RR:15 No - GAS1RR:19 No - GAS1RR:20 No - GAS1RR:16 No - GAS1RR:17 No - GAS1RR:18 No - GAS1RR:21 No - GAS1RR:22 No - GAS1RR:23 No - lnc-GAS1-4:2 No - lnc-GAS1-4:3 No - lnc-GAS1-4:4 No - lnc-GAS1-4:5 No - lnc-GAS1-4:6 No - lnc-GAS1-1:5 No - lnc-GAS1-1:6 No - lnc-GAS1-1:3 No - lnc-GAS1-1:4 No - lnc-CDK20-15:1 No - lnc-CDK20-14:1 No - lnc-CDK20-14:2 No - lnc-SPATA31E1-10:1 No - lnc-SPATA31E1-10:2 No - lnc-CDK20-12:6 No - lnc-CDK20-12:2 No - lnc-CDK20-12:3 No - lnc-CDK20-12:5 No - lnc-CDK20-12:4 No - lnc-SHC3-10:5 No - lnc-SHC3-10:4 No - lnc-SHC3-10:1 No - lnc-SHC3-10:2 No - lnc-SHC3-10:3 No - lnc-SHC3-9:3 No - lnc-SHC3-9:4 No - lnc-SHC3-9:1 No - lnc-SHC3-9:2 No - lnc-C9orf47-3:1 No - lnc-SHC3-8:1 No - lnc-SHC3-8:2 No - lnc-SHC3-8:3 No - lnc-SEMA4D-9:1 No - lnc-SEMA4D-1:4 No - lnc-SEMA4D-1:5 No - lnc-SEMA4D-1:3 No - lnc-GADD45G-3:5 No - lnc-GADD45G-3:6 No - lnc-GADD45G-3:7 No - lnc-GADD45G-3:8 No - lnc-GADD45G-3:9 No - lnc-GADD45G-3:10 No - lnc-GADD45G-3:11 No - lnc-GADD45G-3:12 No - lnc-GADD45G-3:13 No - LINC01508:8 No - LINC01508:10 No - LINC01508:9 No - LINC01508:7 No - lnc-AUH-2:11 No - lnc-AUH-2:9 No - lnc-AUH-2:7 No - lnc-AUH-2:12 No - lnc-AUH-2:8 No - lnc-AUH-2:6 No - lnc-AUH-2:10 No - LINC00484:22 No - LINC00484:23 No - LINC00484:24 No - LINC00484:25 No - LINC00484:26 No - LINC00484:27 No - LINC00484:28 No - LINC00484:29 No - lnc-SYK-6:4 No - lnc-SYK-6:5 No - lnc-SYK-6:6 No - lnc-SYK-6:7 No - lnc-SYK-6:8 No - lnc-CENPP-19:1 No - lnc-CENPP-20:2 No - lnc-CENPP-20:3 No - lnc-CENPP-20:4 No - lnc-CENPP-20:5 No - lnc-CENPP-20:11 No - lnc-CENPP-20:12 No - lnc-CENPP-20:13 No - lnc-CENPP-20:14 No - lnc-CENPP-20:17 No - lnc-CENPP-20:18 No - lnc-CENPP-20:19 No - lnc-CENPP-20:20 No - lnc-CENPP-20:21 No - lnc-CENPP-20:22 No - lnc-CENPP-20:23 No - lnc-CENPP-17:1 No - lnc-CENPP-1:4 No - lnc-CENPP-1:5 No - lnc-CENPP-1:6 No - lnc-CENPP-18:1 No - lnc-ZNF484-4:1 No - BARX1-DT:8 No - BARX1-DT:9 No - BARX1-DT:10 No - BARX1-DT:11 No - lnc-ZNF169-7:7 No - lnc-ZNF169-7:2 No - lnc-ZNF169-7:3 No - lnc-ZNF169-7:4 No - lnc-ZNF169-7:5 No - lnc-ZNF169-7:6 No - lnc-ZNF169-7:9 No - lnc-FBP1-2:1 No - lnc-C9orf3-8:1 No - lnc-FANCC-1:8 No - lnc-FANCC-1:5 No - lnc-FANCC-1:9 No - lnc-FANCC-1:6 No - lnc-FANCC-1:7 No - LINC00476:22 No - LINC00476:17 No - LINC00476:18 No - LINC00476:25 No - LINC00476:26 No - LINC00476:21 No - LINC00476:19 No - LINC00476:23 No - LINC00476:27 No - LINC00476:20 No - LINC00476:24 No - LINC00476:16 No - LINC00092:14 No - LINC00092:9 No - LINC00092:15 No - LINC00092:10 No - LINC00092:11 No - LINC00092:12 No - LINC00092:13 No - lnc-HSD17B3-4:2 No - lnc-HSD17B3-4:3 No - lnc-HSD17B3-4:5 No - lnc-HSD17B3-4:4 No - lnc-HSD17B3-4:6 No - lnc-HABP4-2:6 No - lnc-HABP4-2:7 No - lnc-HABP4-2:8 No - lnc-HABP4-2:9 No - lnc-HABP4-2:10 No - lnc-HABP4-9:1 Yes chrX:19766465-19783548 lnc-HABP4-8:1 No - lnc-NUTM2G-6:2 No - lnc-NUTM2G-6:3 No - lnc-NUTM2G-6:4 No - lnc-NUTM2G-6:5 No - lnc-NUTM2G-6:6 No - lnc-NUTM2G-6:7 No - lnc-NUTM2G-5:2 No - lnc-NUTM2G-5:3 No - lnc-CTSV-5:1 No - lnc-CTSV-5:2 No - lnc-CTSV-5:3 No - lnc-CTSV-5:4 No - lnc-TSTD2-3:2 Yes chr2R:20319180-20325973 PTCSC2:8 No - PTCSC2:4 No - PTCSC2:5 No - lnc-FOXE1-2:1 No - lnc-FOXE1-2:2 No - PTCSC2:6 No - PTCSC2:7 No - PTCSC2:3 No - lnc-ANP32B-3:1 No - lnc-HEMGN-4:1 No - lnc-NANS-4:1 No - lnc-SEC61B-5:1 No - lnc-ERP44-3:17 No - lnc-ERP44-3:12 No - lnc-ERP44-3:13 No - lnc-ERP44-3:11 No - lnc-ERP44-3:14 No - lnc-ERP44-3:15 No - lnc-ERP44-3:16 No - lnc-ERP44-3:10 No - STX17-AS1:6 No - STX17-AS1:7 No - STX17-AS1:5 No - lnc-MSANTD3-1:3 No - lnc-MSANTD3-1:4 No - lnc-MSANTD3-1:5 No - lnc-MSANTD3-1:6 No - lnc-MSANTD3-1:7 No - lnc-TEX10-4:1 No - lnc-BAAT-3:1 No - lnc-BAAT-3:2 No - lnc-BAAT-3:3 No - lnc-BAAT-3:4 No - lnc-BAAT-3:5 No - lnc-GRIN3A-6:4 No - lnc-GRIN3A-6:1 No - lnc-GRIN3A-6:2 No - lnc-GRIN3A-6:3 No - lnc-OR13C4-8:1 No - SMC2-AS1:9 No - SMC2-AS1:10 No - SMC2-AS1:11 No - SMC2-AS1:5 No - SMC2-AS1:6 No - SMC2-AS1:7 No - SMC2-AS1:12 No - SMC2-AS1:13 No - SMC2-AS1:8 No - lnc-NIPSNAP3B-1:3 No - lnc-NIPSNAP3B-1:4 No - lnc-NIPSNAP3B-1:5 No - lnc-ABCA1-9:1 No - lnc-ABCA1-10:1 No - lnc-ABCA1-8:2 Yes chr3L:4277962-4281585 lnc-ABCA1-8:9 No - lnc-ABCA1-8:3 Yes chr3L:4277962-4281585 lnc-ABCA1-8:4 Yes chr3L:4277962-4281585 lnc-ABCA1-8:5 Yes chr3L:4277962-4281585 lnc-ABCA1-8:6 No - lnc-ABCA1-8:7 No - lnc-ABCA1-8:8 No - lnc-ABCA1-2:5 No - lnc-ABCA1-2:6 No - lnc-ABCA1-11:1 Yes chrX:16385278-16388702 lnc-RAD23B-3:4 No - lnc-RAD23B-3:3 No - lnc-RAD23B-5:6 No - lnc-RAD23B-5:7 No - lnc-RAD23B-21:3 No - lnc-KLF4-10:2 No - lnc-RAD23B-19:1 No - lnc-RAD23B-19:2 No - lnc-RAD23B-10:3 No - lnc-RAD23B-10:4 No - lnc-RAD23B-10:2 No - lnc-RAD23B-10:5 No - lnc-RAD23B-10:6 No - lnc-RAD23B-20:1 No - lnc-RAD23B-10:7 No - lnc-RAD23B-10:8 No - lnc-ACTL7B-11:1 No - lnc-ACTL7B-11:2 No - lnc-ACTL7B-11:3 No - lnc-ACTL7B-11:4 No - lnc-ACTL7B-11:5 No - lnc-PTPN3-2:2 No - lnc-OR2K2-1:3 No - lnc-OR2K2-1:4 No - lnc-OR2K2-1:5 No - lnc-OR2K2-1:6 No - lnc-OR2K2-1:7 No - lnc-OR2K2-1:8 No - lnc-C9orf84-3:1 No - lnc-SUSD1-7:2 No - lnc-SUSD1-7:3 No - lnc-SUSD1-7:4 No - lnc-SUSD1-7:5 No - lnc-SUSD1-7:1 No - lnc-UGCG-4:1 No - lnc-UGCG-4:2 No - lnc-UGCG-4:3 No - lnc-SUSD1-1:5 No - lnc-SUSD1-1:6 No - lnc-INIP-1:1 No - lnc-INIP-1:2 No - lnc-INIP-1:3 No - lnc-ZFP37-1:4 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZFP37-1:5 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-ZFP37-1:6 Yes chr2L:11794327-11809438 lnc-BSPRY-1:1 No - lnc-POLE3-6:1 Yes chr2R:17792870-17800677 lnc-RGS3-4:1 No - lnc-RGS3-4:2 No - lnc-RGS3-4:3 No - lnc-RGS3-4:4 No - lnc-RGS3-4:5 No - lnc-POLE3-7:1 No - lnc-WHRN-4:1 No - lnc-WHRN-4:2 No - lnc-ATP6V1G1-4:1 No - lnc-TNFSF15-5:1 No - lnc-DEC1-9:1 No - lnc-TNC-2:2 No - lnc-TNC-2:4 No - lnc-TNC-2:5 No - lnc-TNC-2:6 No - lnc-TNC-2:3 No - lnc-DEC1-3:5 No - lnc-DEC1-10:2 No - lnc-DEC1-10:3 No - lnc-DEC1-10:4 No - lnc-DEC1-10:5 No - lnc-TNC-21:12 No - lnc-TNC-21:13 No - lnc-PAPPA-1:2 No - lnc-PAPPA-1:3 No - lnc-PAPPA-1:4 No - lnc-PAPPA-1:5 No - PAPPA-AS2:3 No - lnc-TRIM32-5:2 No - lnc-TRIM32-5:3 No - lnc-TRIM32-5:4 No - lnc-TRIM32-5:5 No - lnc-TRIM32-5:6 No - lnc-TLR4-4:5 No - lnc-BRINP1-3:2 No - lnc-BRINP1-3:3 No - lnc-BRINP1-3:4 No - lnc-B3GNT10-21:8 No - lnc-B3GNT10-21:9 No - lnc-B3GNT10-21:10 No - lnc-B3GNT10-21:11 No - lnc-B3GNT10-21:12 No - lnc-B3GNT10-21:13 No - lnc-GSN-3:2 Yes chr2L:14355145-14358764 lnc-GSN-2:4 No - lnc-GSN-2:8 No - lnc-GSN-2:5 No - lnc-GSN-2:6 No - lnc-GSN-2:7 No - lnc-DAB2IP-4:1 No - lnc-DAB2IP-4:2 No - lnc-DAB2IP-4:4 No - lnc-DAB2IP-4:3 No - TTLL11-IT1:4 No - lnc-RABGAP1-2:1 No - lnc-NR5A1-7:1 Yes chrX:1941940-2007956 lnc-NR5A1-8:1 Yes chrX:1941940-2007956 lnc-OLFML2A-1:3 No - lnc-OLFML2A-1:4 No - lnc-RPL35-2:1 No - lnc-RPL35-2:2 No - lnc-ARPC5L-1:2 No - lnc-ARPC5L-1:3 No - lnc-PPP6C-1:2 No - lnc-PPP6C-1:3 No - lnc-GAPVD1-1:4 No - lnc-GAPVD1-1:5 No - lnc-GAPVD1-1:6 No - lnc-GAPVD1-1:7 No - lnc-MAPKAP1-4:1 No - lnc-GAPVD1-2:4 No - lnc-GAPVD1-3:3 Yes chr2R:14411825-14413851 lnc-GAPVD1-3:4 Yes chr2R:14411825-14413851 lnc-MAPKAP1-1:6 No - lnc-MAPKAP1-1:9 No - lnc-MAPKAP1-1:7 No - lnc-MAPKAP1-1:8 No - lnc-ANGPTL2-2:5 No - lnc-ANGPTL2-2:6 No - lnc-ANGPTL2-2:7 No - lnc-ANGPTL2-2:8 No - lnc-ANGPTL2-2:9 No - lnc-ANGPTL2-9:1 No - lnc-ANGPTL2-8:1 No - lnc-RPL12-1:2 No - lnc-RPL12-1:3 No - lnc-RPL12-1:4 No - lnc-FAM129B-5:1 Yes chr3L:4136359-4138996 lnc-SLC25A25-5:1 No - lnc-SLC25A25-5:2 No - lnc-SLC25A25-5:3 No - lnc-SLC25A25-4:1 No - lnc-SLC25A25-4:2 No - SLC25A25-AS1:20 No - SLC25A25-AS1:18 No - SLC25A25-AS1:21 No - SLC25A25-AS1:22 No - SLC25A25-AS1:23 No - lnc-PKN3-1:5 No - lnc-PKN3-1:6 No - lnc-PKN3-1:7 Yes chr3L:1490951-1496643 lnc-PKN3-1:8 Yes chr3L:1490951-1496643 lnc-TBC1D13-1:1 Yes chr3L:1490951-1496643 lnc-CRAT-1:1 Yes chrX:8433923-8437820 lnc-CRAT-1:2 No - lnc-PTPA-1:3 No - lnc-PTPA-1:4 No - lnc-PTPA-3:3 No - lnc-PTPA-3:4 No - lnc-PTPA-3:5 No - lnc-PTPA-3:6 No - lnc-PTPA-3:7 No - lnc-PTPA-3:8 No - lnc-NTMT1-4:1 No - lnc-NTMT1-4:2 No - lnc-NTMT1-4:3 No - lnc-NTMT1-4:4 No - lnc-NTMT1-4:5 No - lnc-C9orf50-4:9 No - lnc-NTMT1-7:1 No - lnc-NTMT1-7:2 No - lnc-NTMT1-7:3 No - lnc-NTMT1-7:4 No - lnc-C9orf50-4:5 No - lnc-C9orf50-4:10 No - lnc-C9orf50-4:7 No - lnc-C9orf50-4:8 No - LINC00963:40 No - LINC00963:41 No - LINC00963:43 No - LINC00963:42 No - LINC00963:44 No - LINC00963:45 No - lnc-C9orf50-4:6 No - LINC00963:46 No - LINC00963:47 No - LINC00963:48 No - LINC00963:49 No - LINC00963:50 No - LINC00963:51 No - LINC00963:52 No - LINC00963:53 No - LINC00963:54 No - LINC00963:55 No - LINC00963:56 No - LINC00963:57 No - LINC00963:58 No - LINC00963:59 No - LINC00963:60 No - LINC00963:61 No - LINC00963:62 No - LINC00963:63 No - LINC00963:64 No - LINC00963:65 No - LINC00963:66 No - LINC00963:67 No - LINC00963:68 No - LINC00963:69 No - LINC00963:70 No - LINC00963:71 No - lnc-C9orf50-1:3 No - lnc-C9orf50-1:2 No - lnc-C9orf50-1:4 No - lnc-C9orf50-1:5 No - lnc-C9orf50-1:6 No - lnc-NTMT1-2:1 No - lnc-NTMT1-2:2 No - lnc-NTMT1-2:3 No - lnc-NTMT1-2:4 No - lnc-NTMT1-2:5 No - lnc-NTMT1-2:7 No - lnc-NTMT1-2:8 No - lnc-C9orf50-6:1 No - lnc-C9orf50-6:2 No - lnc-NTMT1-2:9 No - lnc-NTMT1-2:10 No - lnc-NTMT1-2:11 No - lnc-NTMT1-6:1 Yes chr2R:9865632-9867051 lnc-PTGES-2:1 No - lnc-QRFP-5:2 Yes chr2R:16861321-16867714 lnc-EXOSC2-4:1 No - lnc-QRFP-7:1 No - lnc-QRFP-6:1 Yes chr3L:16615866-16647882 lnc-QRFP-6:2 Yes chr3L:16615866-16647882 lnc-QRFP-6:3 Yes chr3L:16615866-16647882 lnc-QRFP-6:4 Yes chr3L:16615866-16647882 lnc-QRFP-6:5 Yes chr3L:16615866-16647882 lnc-QRFP-6:6 Yes chr3L:16615866-16647882 lnc-LAMC3-3:1 No - lnc-FAM78A-6:1 No - lnc-FAM78A-5:1 No - lnc-FAM78A-5:2 No - lnc-CFAP77-5:1 No - lnc-SPACA9-1:1 No - lnc-RALGDS-2:2 No - lnc-RALGDS-2:3 No - lnc-RALGDS-2:4 No - lnc-ABO-33:2 No - lnc-ABO-33:3 No - lnc-ABO-33:4 No - lnc-ABO-1:2 No - lnc-BRD3OS-1:2 No - lnc-BRD3-1:8 Yes chrX:2585980-2588217 lnc-BRD3-1:9 Yes chrX:2585980-2588217 lnc-BRD3-1:13 Yes chrX:2585980-2588217 lnc-BRD3-1:5 Yes chrX:2585980-2588217 lnc-BRD3-1:6 Yes chrX:2585980-2588217 lnc-BRD3-1:10 Yes chrX:2585980-2588217 lnc-BRD3-1:11 Yes chrX:2585980-2588217 lnc-BRD3-1:12 Yes chrX:2585980-2588217 lnc-BRD3-1:7 Yes chrX:2585980-2588217 lnc-WDR5-4:2 No - lnc-WDR5-4:4 No - lnc-WDR5-4:3 No - lnc-WDR5-4:5 No - lnc-WDR5-4:6 No - lnc-WDR5-4:7 No - lnc-FCN1-1:3 No - lnc-FCN1-1:4 No - lnc-FCN1-1:5 No - lnc-FCN1-1:6 No - lnc-FCN1-1:2 No - lnc-FCN2-1:4 No - lnc-FCN2-1:5 No - lnc-FCN2-1:6 No - lnc-FCN2-1:2 No - lnc-FCN2-1:3 No - PPP1R26-AS1:16 No - lnc-PPP1R26-5:1 No - lnc-PPP1R26-5:2 No - lnc-PPP1R26-5:3 No - lnc-PPP1R26-5:4 No - PPP1R26-AS1:12 No - PPP1R26-AS1:17 No - PPP1R26-AS1:13 No - PPP1R26-AS1:14 No - PPP1R26-AS1:15 No - lnc-KCNT1-1:6 No - lnc-KCNT1-1:5 No - lnc-KCNT1-1:7 No - lnc-KCNT1-1:8 No - lnc-KCNT1-1:9 No - lnc-KCNT1-1:10 No - lnc-CCDC187-4:2 Yes chr3R:27582840-27586376 NALT1:11 No - NALT1:12 No - NALT1:13 No - NALT1:9 No - NALT1:10 No - NALT1:14 No - NALT1:15 No - NALT1:16 No - NALT1:17 No - NALT1:18 No - NALT1:19 No - NALT1:20 No - NALT1:21 No - NALT1:22 No - NALT1:23 No - NALT1:25 No - NALT1:26 No - NALT1:27 No - NALT1:24 No - NALT1:28 No - lnc-NOTCH1-1:1 No - lnc-NOTCH1-1:2 No - lnc-AGPAT2-2:8 No - lnc-AGPAT2-1:15 No - lnc-AGPAT2-1:14 No - lnc-AGPAT2-1:12 No - lnc-AGPAT2-1:9 No - lnc-AGPAT2-1:7 Yes chr3L:4384442-4403181 lnc-AGPAT2-1:19 No - lnc-AGPAT2-1:10 No - lnc-AGPAT2-1:16 No - lnc-AGPAT2-1:13 No - lnc-AGPAT2-1:17 No - lnc-AGPAT2-1:18 No - lnc-AGPAT2-1:5 Yes chr3L:4384442-4403181 lnc-AGPAT2-1:6 Yes chr3L:4384442-4403181 lnc-AGPAT2-1:8 Yes chr3L:4384442-4403181 SNHG7:12 No - SNHG7:14 No - SNHG7:15 No - SNHG7:16 No - SNHG7:17 No - SNHG7:13 No - CCDC183-AS1:14 No - CCDC183-AS1:9 No - CCDC183-AS1:10 No - CCDC183-AS1:7 No - CCDC183-AS1:6 No - CCDC183-AS1:5 No - CCDC183-AS1:11 No - CCDC183-AS1:8 No - CCDC183-AS1:12 Yes chr3L:11881384-11883546 CCDC183-AS1:13 Yes chr3L:11881384-11883546 lnc-MAMDC4-4:1 No - lnc-MAMDC4-4:2 No - lnc-EDF1-2:1 Yes chrX:16415046-16417585 lnc-PTGDS-1:3 No - lnc-PTGDS-1:4 No - lnc-PTGDS-1:5 No - lnc-PTGDS-1:6 No - lnc-PTGDS-1:7 No - lnc-FAM166A-3:1 Yes chr2R:19447319-19451600 lnc-ARRDC1-2:1 No - lnc-CSF2RA-2:2 No - lnc-CSF2RA-2:3 No - LINC00106:11 Yes chrX:10778954-10786907 LINC00106:12 Yes chrX:10778954-10786907 LINC00106:15 No - LINC00106:16 No - lnc-DHRSX-1:3 No - lnc-DHRSX-1:7 No - lnc-DHRSX-1:6 No - lnc-DHRSX-1:4 No - lnc-DHRSX-1:5 No - lnc-ARSD-2:5 No - lnc-ARSD-2:3 No - lnc-ARSD-2:4 No - lnc-ARSD-2:6 No - lnc-NLGN4X-1:6 No - lnc-NLGN4X-1:7 No - lnc-NLGN4X-1:5 No - lnc-NLGN4X-1:4 No - lnc-MID1-1:2 No - lnc-MID1-1:10 No - lnc-MID1-1:3 No - lnc-MID1-1:11 No - lnc-MID1-1:4 No - lnc-MID1-1:12 No - lnc-MID1-1:13 No - lnc-MID1-1:14 No - lnc-MID1-1:15 No - lnc-MID1-1:16 No - lnc-MID1-1:5 No - lnc-FAM9C-8:1 No - lnc-TMSB4X-10:1 No - lnc-EGFL6-12:1 No - lnc-TRAPPC2-1:1 No - lnc-TRAPPC2-1:2 No - lnc-OFD1-3:1 No - lnc-ZRSR2-5:1 Yes chr3R:23958651-23962555 lnc-ZRSR2-5:2 No - lnc-ZRSR2-5:3 No - lnc-ZRSR2-5:4 No - lnc-ZRSR2-5:5 No - lnc-AP1S2-2:6 No - lnc-AP1S2-2:7 No - lnc-S100G-1:3 No - lnc-S100G-1:5 No - lnc-S100G-1:6 No - lnc-S100G-1:4 No - lnc-CTPS2-7:1 No - lnc-CTPS2-8:1 No - lnc-RAI2-5:2 No - lnc-RAI2-5:3 No - lnc-RAI2-5:1 No - lnc-PPEF1-7:3 No - lnc-PPEF1-7:4 No - lnc-PPEF1-7:5 No - lnc-PDHA1-3:1 No - lnc-KLHL34-2:2 Yes chr2R:17413970-17420007 lnc-KLHL34-2:3 Yes chr2R:17413970-17420007 lnc-KLHL34-2:5 Yes chr2R:17413970-17420007 PTCHD1-AS:8 No - PTCHD1-AS:5 Yes chr3R:8122725-8125273 PTCHD1-AS:3 No - PTCHD1-AS:6 No - PTCHD1-AS:7 No - PTCHD1-AS:4 No - lnc-ACOT9-1:6 No - lnc-ACOT9-1:2 No - lnc-ACOT9-1:4 No - lnc-ACOT9-1:5 No - lnc-SAT1-3:1 No - lnc-ACOT9-1:3 No - lnc-EIF2S3-3:1 No - ZFX-AS1:3 No - ZFX-AS1:2 No - ZFX-AS1:4 No - lnc-PPP4R3C-2:2 No - lnc-PPP4R3C-2:3 No - lnc-PPP4R3C-2:4 No - lnc-PPP4R3C-2:9 No - lnc-PPP4R3C-2:10 No - lnc-PPP4R3C-2:5 No - lnc-PPP4R3C-2:6 No - lnc-CXorf21-2:1 No - lnc-CXorf21-2:2 No - lnc-CXorf21-3:1 No - lnc-FAM47B-1:5 No - lnc-FAM47B-1:6 No - lnc-FAM47B-1:7 No - lnc-FAM47B-1:9 No - lnc-FAM47B-1:8 No - MID1IP1-AS1:6 No - MID1IP1-AS1:5 No - MID1IP1-AS1:7 No - MID1IP1-AS1:8 No - MID1IP1-AS1:3 No - MID1IP1-AS1:4 No - lnc-RPGR-6:4 No - lnc-RPGR-6:1 No - lnc-RPGR-6:5 No - lnc-RPGR-6:2 No - lnc-RPGR-6:3 No - lnc-MID1IP1-8:1 No - LINC01281:8 No - LINC01281:4 No - LINC01281:5 No - LINC01281:10 No - LINC01281:9 No - LINC01281:11 No - LINC01281:6 No - LINC01281:7 No - lnc-MID1IP1-9:1 No - lnc-MID1IP1-9:2 No - lnc-BCOR-1:4 No - lnc-BCOR-1:5 No - lnc-BCOR-1:6 No - lnc-BCOR-1:2 No - lnc-BCOR-1:3 No - lnc-BCOR-12:1 No - lnc-BCOR-12:4 No - lnc-ATP6AP2-4:2 No - lnc-ATP6AP2-4:3 No - lnc-BCOR-12:2 No - lnc-BCOR-12:3 No - lnc-ATP6AP2-16:1 No - lnc-ATP6AP2-15:1 Yes chr3L:18802265-18820675 lnc-MPC1L-1:1 Yes chr3L:593246-599239 lnc-MPC1L-14:1 No - lnc-MED14-10:1 No - lnc-CASK-8:2 No - lnc-CASK-8:6 No - lnc-CASK-8:3 No - lnc-CASK-8:4 No - lnc-CASK-8:5 No - lnc-KDM6A-7:1 No - LINC01204:6 No - LINC01204:7 No - LINC01204:8 No - LINC01204:9 No - LINC01204:10 No - LINC01204:11 No - LINC01204:12 No - lnc-KDM6A-8:1 No - lnc-CXorf36-46:4 No - lnc-CXorf36-46:9 No - lnc-CXorf36-46:5 No - lnc-CXorf36-46:10 No - lnc-CXorf36-46:1 No - lnc-CXorf36-46:11 No - lnc-CXorf36-46:6 No - lnc-CXorf36-46:2 No - LINC01186:13 No - LINC01186:14 No - LINC01186:11 No - LINC01186:15 No - LINC01186:16 No - LINC01186:12 No - lnc-ZNF674-14:1 No - lnc-ZNF674-14:2 No - ZNF674-AS1:8 No - ZNF674-AS1:7 No - ZNF674-AS1:9 No - ZNF674-AS1:10 No - LINC01545:4 Yes chr3L:187207-199762 LINC01545:5 Yes chr3L:187207-199762 lnc-NDUFB11-2:4 No - lnc-NDUFB11-2:3 No - lnc-TIMP1-4:1 No - lnc-TIMP1-4:2 No - lnc-SPACA5B-3:1 No - lnc-SPACA5B-3:2 No - lnc-SPACA5B-3:3 No - lnc-SLC38A5-1:2 No - lnc-SLC38A5-1:3 No - lnc-PCSK1N-4:3 No - lnc-PCSK1N-1:2 Yes chr3R:15259864-15263458 lnc-PCSK1N-1:3 Yes chr3R:15259864-15263458 lnc-PCSK1N-3:2 No - lnc-PCSK1N-3:3 Yes chr3R:8147368-8181444 lnc-ERAS-5:1 No - lnc-PQBP1-2:1 No - lnc-PQBP1-2:2 Yes chr3L:11605436-11609465 lnc-DGKK-1:1 No - lnc-BMP15-1:6 No - lnc-BMP15-1:2 No - lnc-BMP15-1:3 No - lnc-BMP15-1:4 No - lnc-BMP15-1:5 No - LINC01284:7 Yes chr3L:10894776-10899123 LINC01284:8 Yes chr3L:10894776-10899123 LINC01284:11 Yes chr3L:10894776-10899123 LINC01284:4 Yes chr3L:10894776-10899123 LINC01284:5 Yes chr3L:10894776-10899123 LINC01284:6 Yes chr3L:10894776-10899123 LINC01284:9 No - LINC01284:10 No - lnc-CXorf67-1:4 No - lnc-CXorf67-1:5 No - lnc-CXorf67-1:6 No - lnc-CXorf67-1:7 No - lnc-CXorf67-1:8 No - lnc-CXorf67-1:9 No - lnc-KANTR-23:5 No - lnc-KANTR-23:6 No - lnc-KANTR-23:7 No - lnc-KANTR-23:8 No - lnc-KANTR-23:9 No - lnc-KANTR-23:10 No - lnc-KANTR-23:11 No - lnc-KANTR-23:12 No - lnc-KANTR-23:13 No - lnc-KANTR-23:21 No - lnc-KANTR-7:1 Yes chr3L:21034535-21075444 lnc-TSR2-9:1 Yes chr3L:21543850-21554928 lnc-FGD1-1:2 No - lnc-FGD1-1:1 No - lnc-ALAS2-2:1 No - lnc-MAGEH1-1:5 Yes chr3L:18618305-18622129 lnc-KLF8-4:2 No - lnc-KLF8-4:3 No - lnc-KLF8-4:4 No - lnc-KLF8-4:5 No - lnc-KLF8-4:6 No - lnc-KLF8-4:7 No - lnc-KLF8-4:8 No - lnc-KLF8-4:9 No - lnc-KLF8-4:10 No - lnc-KLF8-4:11 No - lnc-KLF8-4:12 No - lnc-KLF8-4:16 No - lnc-KLF8-4:17 No - lnc-KLF8-4:18 No - lnc-UBQLN2-1:2 No - lnc-FAAH2-1:5 No - lnc-FAAH2-1:6 No - lnc-FAAH2-1:7 No - lnc-FAAH2-1:8 No - lnc-FAAH2-1:9 No - lnc-FAAH2-1:13 No - LINC01278:28 No - LINC01278:35 No - LINC01278:29 No - LINC01278:30 No - LINC01278:36 No - LINC01278:31 No - LINC01278:37 No - LINC01278:32 No - LINC01278:33 No - LINC01278:26 No - LINC01278:34 No - LINC01278:27 No - lnc-ZC3H12B-20:1 No - lnc-ZC3H12B-20:2 No - lnc-ZC3H12B-20:3 No - lnc-ZC3H12B-20:4 No - lnc-ZC3H12B-20:5 No - lnc-ZC3H12B-20:6 No - lnc-ZC3H12B-19:1 No - lnc-OPHN1-7:1 Yes chr2L:4392770-4393876 lnc-PJA1-4:1 No - lnc-PJA1-4:2 No - lnc-PJA1-4:3 No - lnc-EFNB1-1:4 No - lnc-EFNB1-1:5 No - lnc-EFNB1-1:6 No - lnc-EFNB1-1:3 No - LINC00269:2 No - LINC00269:3 No - lnc-MED12-2:1 No - lnc-IL2RG-5:1 Yes chr3R:7570281-7639434 lnc-IL2RG-5:2 Yes chr3R:7570281-7639434 lnc-IL2RG-5:3 No - lnc-NLGN3-2:1 No - lnc-ZMYM3-1:2 No - lnc-ZMYM3-1:3 No - lnc-ZMYM3-1:4 No - lnc-ZMYM3-1:5 No - lnc-ZMYM3-1:6 No - lnc-ZMYM3-5:1 No - lnc-NHSL2-6:1 Yes chr3R:25262741-25263292 XIST:64 No - XIST:65 No - XIST:62 No - XIST:42 No - XIST:58 No - XIST:59 No - XIST:60 No - XIST:47 No - XIST:48 No - XIST:49 No - XIST:44 No - XIST:43 No - XIST:45 No - XIST:46 No - XIST:36 No - XIST:37 No - XIST:38 No - XIST:27 No - XIST:28 No - XIST:29 No - XIST:53 No - XIST:54 No - XIST:55 No - XIST:33 No - XIST:34 No - XIST:30 No - XIST:70 No - XIST:31 No - XIST:68 No - XIST:69 No - XIST:40 No - XIST:39 No - XIST:67 No - XIST:66 No - XIST:63 No - XIST:61 No - XIST:57 No - XIST:56 No - XIST:52 No - XIST:50 No - XIST:51 No - XIST:35 No - JPX:27 No - JPX:28 No - JPX:29 No - JPX:30 No - JPX:31 No - JPX:32 No - JPX:33 No - JPX:34 No - JPX:35 No - JPX:43 No - JPX:42 No - JPX:36 No - JPX:37 No - JPX:38 No - JPX:39 No - JPX:40 No - JPX:41 No - JPX:44 No - FTX:42 No - FTX:26 No - FTX:27 No - FTX:47 No - FTX:48 No - FTX:34 No - FTX:43 No - FTX:40 No - FTX:35 No - FTX:36 No - FTX:28 No - FTX:29 No - FTX:30 No - FTX:31 No - FTX:37 No - FTX:32 No - FTX:38 No - FTX:41 No - FTX:44 No - FTX:39 No - FTX:45 No - FTX:49 No - FTX:33 No - FTX:46 No - lnc-RLIM-1:2 No - lnc-RLIM-1:4 No - lnc-RLIM-1:3 No - lnc-UPRT-6:1 Yes chr2R:10028443-10032893 lnc-UPRT-6:2 Yes chr2R:10028443-10032893 lnc-UPRT-6:3 Yes chr2R:10028443-10032893 lnc-UPRT-6:4 Yes chr2R:10028443-10032893 lnc-UPRT-6:6 Yes chr2R:10028443-10032893 lnc-UPRT-6:5 Yes chr2R:10028443-10032893 lnc-UPRT-6:7 No - lnc-UPRT-6:8 No - lnc-TAF9B-2:1 Yes chr2L:2743375-2744934 lnc-TAF9B-2:2 Yes chr2L:2743375-2744934 lnc-GPR174-2:1 No - lnc-SH3BGRL-5:6 No - lnc-SH3BGRL-5:7 No - lnc-SH3BGRL-5:8 No - lnc-SH3BGRL-5:9 No - lnc-SH3BGRL-5:10 No - lnc-SH3BGRL-5:11 No - lnc-SH3BGRL-5:12 No - lnc-SH3BGRL-5:13 No - lnc-SH3BGRL-5:14 No - lnc-SH3BGRL-5:15 No - lnc-SH3BGRL-5:16 No - lnc-SH3BGRL-5:17 No - lnc-POF1B-3:2 Yes chr3R:15213974-15214845 lnc-POF1B-3:3 Yes chr3R:15213974-15214845 lnc-POF1B-3:5 Yes chr3R:15213974-15214845 lnc-POF1B-3:4 Yes chr3R:15213974-15214845 lnc-POF1B-3:1 Yes chr3R:15213974-15214845 DIAPH2-AS1:8 Yes chr2L:20758144-20768053 DIAPH2-AS1:9 Yes chr2L:20758144-20768053 lnc-DIAPH2-16:4 No - lnc-DIAPH2-16:5 No - lnc-DIAPH2-16:6 No - lnc-DIAPH2-16:7 No - lnc-DIAPH2-16:8 No - lnc-DIAPH2-16:9 No - lnc-DIAPH2-16:13 No - lnc-DIAPH2-16:10 No - lnc-DIAPH2-16:11 No - lnc-DIAPH2-16:12 No - lnc-TCEAL2-6:1 No - lnc-TCEAL2-6:3 No - lnc-TCEAL2-6:4 No - lnc-TCEAL2-6:2 No - LINC00630:27 No - LINC00630:28 No - LINC00630:29 No - LINC00630:30 No - LINC00630:31 No - LINC00630:32 No - LINC00630:33 No - LINC00630:34 No - LINC00630:35 No - LINC00630:36 No - LINC00630:26 No - LINC00630:44 No - LINC00630:46 No - LINC00630:47 No - LINC00630:49 No - LINC00630:52 No - LINC00630:53 No - LINC00630:54 No - LINC00630:51 No - LINC00630:55 No - LINC00630:56 No - LINC00630:57 No - LINC00630:58 No - LINC00630:59 No - lnc-RAB40AL-3:1 No - lnc-RAB40AL-3:2 No - lnc-BEX2-2:1 No - lnc-BEX2-2:2 No - MORF4L2-AS1:5 Yes chr3R:15276440-15278109 MORF4L2-AS1:8 Yes chr3R:15276440-15278109 MORF4L2-AS1:9 Yes chr3R:15276440-15278109 MORF4L2-AS1:6 Yes chr3R:15276440-15278109 MORF4L2-AS1:7 Yes chr3R:15276440-15278109 TMSB15B-AS1:13 No - TMSB15B-AS1:16 No - TMSB15B-AS1:10 No - TMSB15B-AS1:14 No - TMSB15B-AS1:11 No - TMSB15B-AS1:15 No - TMSB15B-AS1:12 No - lnc-PRPS1-3:2 No - lnc-PRPS1-3:3 No - lnc-TSC22D3-2:1 No - lnc-PRPS1-4:1 No - lnc-PRPS1-4:2 No - lnc-COL4A5-1:3 No - lnc-COL4A5-1:4 No - lnc-COL4A5-3:2 No - lnc-RTL9-6:1 Yes chr3R:23986642-23988738 lnc-RTL9-6:2 Yes chr3R:23986642-23988738 lnc-RTL9-6:3 Yes chr3R:23986642-23988738 lnc-SERTM2-1:1 No - lnc-SERTM2-1:2 No - lnc-RTL4-4:1 No - lnc-RTL4-4:2 No - lnc-RTL4-3:1 No - lnc-RTL4-3:2 No - lnc-RTL4-3:3 No - lnc-HTR2C-9:1 No - PLS3-AS1:6 Yes chrX:17285704-17301929 PLS3-AS1:7 Yes chrX:17285704-17301929 PLS3-AS1:5 Yes chrX:17285704-17301929 PLS3-AS1:8 Yes chrX:17285704-17301929 PLS3-AS1:9 Yes chrX:17285704-17301929 DANT1:5 No - DANT1:4 No - DANT1:6 No - DANT2:3 No - DANT2:5 No - DANT2:6 No - DANT2:4 No - DANT2:7 No - lnc-CT83-3:1 No - lnc-KLHL13-5:1 No - lnc-KLHL13-5:2 No - lnc-KLHL13-5:3 No - lnc-KIAA1210-7:1 No - LINC01285:9 No - LINC01285:10 No - LINC01285:11 No - LINC01285:12 No - SLC25A5-AS1:14 No - SLC25A5-AS1:8 Yes chrX:10778954-10786907 SLC25A5-AS1:12 No - SLC25A5-AS1:13 No - SLC25A5-AS1:9 Yes chrX:10778954-10786907 SLC25A5-AS1:10 Yes chrX:10778954-10786907 SLC25A5-AS1:11 Yes chrX:10778954-10786907 lnc-NKAP-4:1 No - lnc-NKAP-4:5 No - lnc-NKAP-4:3 No - lnc-NKAP-4:4 No - lnc-NKAP-4:2 No - lnc-NKAP-4:6 No - lnc-MCTS1-3:1 No - lnc-MCTS1-4:1 No - lnc-MCTS1-4:2 No - lnc-MCTS1-4:3 No - lnc-MCTS1-4:4 No - lnc-THOC2-8:1 Yes chr3L:6624032-6635059 lnc-THOC2-8:3 Yes chr3L:6624032-6635059 lnc-THOC2-8:4 Yes chr3L:6624032-6635059 lnc-THOC2-8:5 Yes chr3L:6624032-6635059 lnc-THOC2-8:2 Yes chr3L:6624032-6635059 lnc-THOC2-8:6 Yes chr3L:6624032-6635059 lnc-THOC2-8:7 Yes chr3L:6624032-6635059 lnc-XIAP-1:2 No - lnc-THOC2-5:6 Yes chr2L:6950421-6954586 lnc-THOC2-5:3 Yes chr2L:6950421-6954586 lnc-THOC2-5:4 Yes chr2L:6950421-6954586 lnc-OCRL-4:1 No - lnc-OCRL-4:3 No - lnc-OCRL-4:4 No - lnc-OCRL-4:5 No - lnc-OCRL-4:2 No - lnc-OCRL-4:6 No - lnc-OCRL-4:7 No - lnc-OCRL-3:1 No - lnc-OCRL-3:2 No - lnc-ZDHHC9-1:2 Yes chr3L:15580800-15583373 lnc-ZDHHC9-1:3 Yes chr3L:15580800-15583373 lnc-ZDHHC9-2:1 No - lnc-GPR119-3:1 No - FIRRE:11 No - FIRRE:12 No - FIRRE:15 No - FIRRE:13 No - FIRRE:17 No - FIRRE:20 No - FIRRE:16 No - FIRRE:18 No - FIRRE:10 No - FIRRE:19 No - FIRRE:14 No - lnc-FRMD7-4:3 No - lnc-FRMD7-4:4 No - lnc-FRMD7-4:5 No - lnc-FRMD7-4:1 No - lnc-FRMD7-4:2 No - RAP2C-AS1:10 Yes chr2R:24063051-24065405 RAP2C-AS1:8 No - RAP2C-AS1:11 No - RAP2C-AS1:9 No - RAP2C-AS1:12 No - lnc-TFDP3-1:1 No - MIR503HG:16 No - MIR503HG:17 No - MIR503HG:13 No - MIR503HG:14 No - MIR503HG:15 No - MIR503HG:18 No - MIR503HG:19 No - MIR503HG:20 No - MIR503HG:11 No - MIR503HG:21 No - MIR503HG:12 No - LINC00629:7 No - LINC00629:8 No - LINC00629:9 No - LINC00629:10 No - LINC00629:11 No - LINC00629:12 No - LINC00629:13 No - LINC00629:14 No - LINC00629:15 No - LINC00629:16 No - lnc-HPRT1-8:2 No - lnc-HPRT1-8:3 No - lnc-HPRT1-8:4 No - LINC02243:5 No - LINC02243:6 No - lnc-SMIM10L2B-1:1 No - lnc-SMIM10L2B-1:2 No - lnc-SMIM10L2B-1:3 No - lnc-SMIM10L2B-1:4 No - lnc-SMIM10L2B-1:5 No - lnc-SLC9A6-1:1 No - lnc-SLC9A6-1:2 No - lnc-SLC9A6-1:3 No - lnc-ARHGEF6-5:1 No - LINC00892:8 No - LINC00892:9 No - LINC00892:10 No - LINC00892:11 No - lnc-CD40LG-2:9 No - lnc-CD40LG-2:11 No - lnc-CD40LG-2:12 No - lnc-CD40LG-2:10 No - lnc-CD40LG-2:13 No - lnc-CD40LG-2:14 No - lnc-CD40LG-2:15 No - lnc-GPR101-1:3 No - lnc-GPR101-1:4 No - lnc-SPANXB1-2:5 No - lnc-SPANXN2-4:2 No - lnc-SPANXN2-4:1 No - FMR1-AS1:15 No - FMR1-AS1:16 No - FMR1-AS1:17 No - FMR1-AS1:18 No - FMR1-AS1:11 No - FMR1-AS1:12 No - FMR1-AS1:19 No - FMR1-AS1:13 No - FMR1-AS1:14 No - lnc-IDS-1:27 No - LINC00893:36 No - LINC00893:37 No - LINC00893:31 No - LINC00893:35 No - LINC00893:38 No - LINC00894:40 No - LINC00894:37 No - LINC00894:38 No - LINC00894:39 No - LINC00894:41 No - LINC00894:42 No - LINC00894:47 No - LINC00894:43 No - LINC00894:44 No - LINC00894:45 No - LINC00894:46 No - LINC00894:50 No - LINC00894:51 No - lnc-MTM1-1:1 No - lnc-HMGB3-1:3 No - lnc-CD99L2-2:2 No - lnc-CD99L2-2:3 No - lnc-CD99L2-2:4 No - lnc-CD99L2-2:5 No - lnc-CD99L2-2:6 No - lnc-MAGEA4-2:2 No - lnc-MAGEA4-2:1 No - lnc-MAGEA4-2:3 No - lnc-MAGEA4-2:4 No - lnc-MAGEA4-2:5 No - lnc-MAGEA10-1:8 No - lnc-MAGEA10-1:7 No - lnc-MAGEA10-1:6 No - lnc-PNMA5-4:1 No - lnc-ATP2B3-1:10 Yes chr3R:18403026-18404726 lnc-ATP2B3-1:6 Yes chr3R:18403026-18404726 lnc-ATP2B3-1:8 Yes chr3R:18403026-18404726 lnc-ATP2B3-1:9 Yes chr3R:18403026-18404726 lnc-ATP2B3-1:7 Yes chr3R:18403026-18404726 lnc-ATP2B3-1:11 Yes chr3R:18403026-18404726 lnc-BCAP31-5:2 No - lnc-BCAP31-5:3 Yes chr4:32478-43778 lnc-BCAP31-5:4 Yes chr4:32478-43778 lnc-BCAP31-5:5 Yes chr4:32478-43778 lnc-GAB3-3:1 Yes chr2R:24174877-24186343 lnc-GAB3-3:2 Yes chr2R:24174877-24186343 lnc-MBOAT1-2:24 No - lnc-MARCH10-1:5 No - LINC01923:8 No - lnc-WDR73-10:5 Yes chr2R:14173693-14182838 lnc-WDR70-7:8 No - LINC00603:2 No - CASC15:57 No - lnc-EIF2AK3-82:3 No - LINC01847:10 No - HAR1B:8 No - lnc-BCAT1-4:2 No - LINC00862:5 No - lnc-DLK1-35:120 No - lnc-CCDC174-2:1 No - LINC01876:22 No - LINC01837:21 No - LIN28B-AS1:6 Yes chr3L:5654681-5657384 lnc-CNKSR2-2:2 No - lnc-CNPY1-2:35 Yes chr2R:10050862-10052167 lnc-NUDT12-3:10 No - LINC02183:3 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-CCDC146-1:13 No - XIST:32 No - lnc-CCL1-12:6 No - MIR670HG:25 No - lnc-ZNF644-1:26 No - lnc-NUDT12-3:9 No - lnc-UBLCP1-2:16 No - LIN28B-AS1:2 Yes chr3L:5654681-5657384 LINC00862:4 No - lnc-FOXO1-2:16 Yes chr3R:14056945-14087978 lnc-CNPY1-2:33 No - lnc-USP31-3:4 No - lnc-SLC39A11-9:1 No - lnc-PTPN14-11:1 No - lnc-IRX3-10:2 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-FOXO1-2:19 No - lnc-ZIC3-3:3 Yes chr3R:4852813-4869979 LINC02357:6 No - LINC00599:29 No - lnc-DLK1-35:144 No - lnc-EFCAB1-3:2 No - LINC01837:22 No - lnc-IRX3-80:60 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-NUDT12-3:11 No - PEG13:2 Yes chr2L:20650755-20656178 ITFG2-AS1:35 No - lnc-CNPY1-2:34 Yes chr2R:10050862-10052167 lnc-ANKRD30B-13:1 No - lnc-MGST1-2:2 No - lnc-PRMT8-8:1 No - TAB2-AS1:5 No - lnc-FOXO1-2:15 Yes chr3R:14056945-14087978 lnc-SERINC3-29:8 No - lnc-PCDH1-5:2 No - CASC15:71 No - lnc-DNAJC19-3:4 No - lnc-IRX3-80:54 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-SNAPC3-9:1 No - LINC02537:15 No - lnc-SCN8A-2:12 No - lnc-GSN-2:3 No - lnc-FOXO1-2:14 Yes chr3R:14056945-14087978 lnc-NUDT12-3:7 No - lnc-PSMD7-9:3 Yes chr4:501810-540874 lnc-FAM20C-5:3 No - LINC01876:20 No - lnc-CCL1-12:5 No - LINC01837:31 No - lnc-PRL-15:1 Yes chr2R:23978801-23985177 lnc-UBLCP1-2:17 No - LINC02452:4 No - lnc-SERINC3-29:1 No - LINC01548:3 No - ITFG2-AS1:28 No - MIR100HG:44 No - lnc-RASA3-6:1 No - lnc-ITM2C-2:9 No - lnc-USP12-8:1 No - lnc-KIAA1328-2:3 No - lnc-SNX13-2:12 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-TBX3-8:1 No - LINC01902:15 No - lnc-SNX20-1:4 No - LINC01902:16 No - LIN28B-AS1:7 Yes chr3L:5654681-5657384 lnc-CCDC146-1:12 No - lnc-FZD8-2:3 No - lnc-FOXO1-2:25 No - LINC01548:2 No - lnc-TNFAIP3-3:11 No - LINC02341:6 No - lnc-KLHL34-2:1 Yes chr2R:17413970-17420007 lnc-XCL2-2:4 No - LINC01584:13 No - lnc-AAGAB-1:25 Yes chrX:8137041-8142279 lnc-GSN-2:2 Yes chrX:19183421-19187278 lnc-KIZ-15:3 No - lnc-CES1-7:1 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-ZBTB20-1:4 No - lnc-GSN-2:9 No - lnc-MALL-7:1 No - lnc-GPC3-1:1 No - LINC00581:10 No - MIR670HG:20 No - lnc-SSTR4-1:6 No - lnc-TRIM25-2:1 No - lnc-NUDT12-3:8 No - lnc-CFAP126-1:1 No - LINC01958:3 No - LINC01988:12 No - lnc-KLHL34-2:6 Yes chr2R:17413970-17420007 LINC01876:23 No - FIRRE:21 No - lnc-RAB23-53:19 No - MIR670HG:23 No - lnc-CCL1-12:4 No - lnc-EZH2-3:2 No - LINC01876:19 No - LINC00603:3 No - MIR100HG:75 No - MIR548A1HG:8 No - lnc-SDHC-3:1 No - lnc-RTP4-1:2 No - MIR29B2CHG:49 No - lnc-CFAP126-5:1 No - MIR100HG:77 No - lnc-EIF2AK3-82:4 No - lnc-FOXO1-2:17 No - lnc-FAM86B2-58:5 No - LINC00604:2 No - lnc-ZIC3-3:2 Yes chr3R:4852813-4869979 lnc-CCL1-12:2 No - LINC01830:11 No - lnc-SERINC3-29:4 No - lnc-KIAA1328-2:4 No - lnc-FAM86B2-58:11 No - lnc-TGFB3-10:1 No - MEF2C-AS1:31 Yes chr2R:9913496-9958858 lnc-SOX6-7:3 No - MIR99AHG:33 No - RBMS3-AS3:3 No - LIN28B-AS1:5 Yes chr3L:5654681-5657384 lnc-TAB2-1:5 No - lnc-IRX3-80:64 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-TTC8-2:2 No - lnc-CCL1-12:1 No - lnc-CCL1-12:7 No - lnc-CNKSR2-4:1 No - LINC00682:8 No - lnc-SERPINB3-8:1 No - LINC01876:15 No - lnc-NR5A2-1:8 No - LINC01505:14 No - lnc-PRMT8-8:2 No - lnc-FGGY-6:6 No - lnc-ZNF644-1:28 No - lnc-CNPY1-2:29 Yes chr2R:10050862-10052167 lnc-TRAF3IP1-3:1 Yes chrX:2685580-2692780 HOXA11-AS:17 No - MIR100HG:104 No - MIR100HG:43 No - lnc-IRX3-10:1 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-DLK1-35:112 No - LINC01830:8 No - lnc-RAB23-53:20 No - lnc-NKX2-3-1:3 No - FALEC:4 No - lnc-FOXO1-2:18 No - lnc-FAM213B-5:1 No - LINC02550:9 No - lnc-LRRC32-2:2 No - lnc-SERINC3-29:7 No - lnc-NUDT12-3:12 No - TAB2-AS1:6 No - lnc-MTSS1-1:3 No - lnc-FOXO1-2:31 No - lnc-EZH2-2:2 No - LINC01505:10 No - lnc-PSMD7-7:7 Yes chr4:501810-540874 lnc-C17orf80-3:3 No - LINC01876:24 No - lnc-CCL1-12:10 No - lnc-SUMO4-6:1 No - lnc-SERINC3-29:2 No - CARMN:36 No - LINC01505:15 No - lnc-NKD1-3:2 No - lnc-ST3GAL4-10:2 No - LINC02341:8 No - LINC01902:17 No - lnc-SBK1-3:1 No - lnc-USP31-3:3 No - lnc-FAM86B2-58:8 No - LINC02009:3 No - lnc-DLK1-35:140 No - MIR100HG:92 No - LINC01876:16 No - lnc-EIF2AK3-82:1 No - lnc-SATB2-2:2 No - MIR548A1HG:6 No - lnc-TNFAIP3-15:5 No - lnc-MBOAT1-2:15 No - PCGEM1:6 No - lnc-FGGY-6:5 No - lnc-TNFAIP3-3:12 No - lnc-KLHL34-2:4 Yes chr2R:17413970-17420007 lnc-CCL1-12:9 No - lnc-MGMT-2:3 No - lnc-PIK3CG-7:1 No - lnc-CCL1-11:1 No - lnc-KLHL34-2:7 No - lnc-PER2-1:2 No - lnc-IL12B-3:1 No - lnc-KIZ-15:4 No - lnc-RPS6KA3-1:2 No - lnc-KLHL34-2:8 No - lnc-LRP12-11:1 No - lnc-DLK1-35:114 No - XIST:41 No - lnc-DNASE1L3-4:1 No - lnc-WDR70-7:1 No - lnc-FOXO1-2:33 No - lnc-EIF2AK3-82:2 No - lnc-ZIC3-3:1 Yes chr3R:4852813-4869979 lnc-RWDD4-6:1 No - lnc-ALX4-20:1 Yes chrX:7908931-7911885 lnc-C17orf80-3:4 No - lnc-OR2D2-3:1 No - lnc-ZNF644-1:27 No - lnc-VEGFA-4:1 No - lnc-CNPY1-2:31 Yes chr2R:10050862-10052167 lnc-UBLCP1-2:18 No - lnc-PTGER4-7:1 No - JPX:45 No - lnc-DFFB-50:3 No - lnc-NPHP4-63:1 No - HCG11:10 No - lnc-PLPP3-12:24 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-THAP7-20:1 No - lnc-ARL4A-54:6 No - FTX:52 No - SAMMSON:18 No - lnc-DMRTA2-1:5 No - lnc-KCNA1-97:11 No - lnc-FAM84B-15:44 No - lnc-FAM84B-15:73 No - LINC01132:4 No - lnc-FAM84B-15:101 No - lnc-TTC34-90:1 No - lnc-SLC2A1-2:2 Yes chr3L:914074-993788 lnc-SMARCA5-4:12 No - lnc-ASNS-1:13 Yes chr3L:21173118-21174973 lnc-FAM84B-15:57 No - lnc-TTC34-90:2 No - lnc-CYLD-2:5 No - lnc-KCNA1-97:3 Yes chrX:17924307-18063247 lnc-CLEC2D-8:17 No - LINC01138:20 Yes chr3R:25249348-25258672 lnc-DFFB-50:2 No - lnc-PLPP3-12:26 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-HMGN5-41:1 No - LINC01138:28 No - lnc-ESAM-65:1 No - lnc-LMO4-2:21 No - LINC02471:3 Yes chr3R:20635480-20644279 lnc-PTP4A2-13:1 No - lnc-NPHP4-63:2 No - lnc-ZFHX3-27:15 No - LINC02228:4 No - LINC02211:2 No - lnc-PLPP3-12:5 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-PLPP3-12:29 No - lnc-SMARCA5-4:9 No - MIR193BHG:48 No - lnc-PLPP3-12:12 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-FAM84B-15:35 No - lnc-FAM86B2-58:10 No - lnc-FAM84B-15:90 No - lnc-ELMO2-40:1 No - LINC02211:4 No - lnc-PLPP3-12:7 Yes chr2R:9400531-9413463 HCG27:9 No - LINC01808:2 No - lnc-FAM84B-15:48 No - lnc-SMARCA5-4:8 No - lnc-ZNF705B-3:2 No - lnc-FAM84B-15:19 No - SAMMSON:29 No - lnc-METTL4-2:11 No - lnc-SNRPN-8:25 No - lnc-DHRS4L2-2:10 No - LINC00174:26 Yes chrX:13563823-13593224 lnc-BMP8B-1:1 No - lnc-SPRY2-132:5 No - lnc-RRAGC-10:1 No - lnc-PROK1-2:5 No - lnc-FAM84B-15:95 No - lnc-FAM84B-15:14 No - lnc-PLPP3-12:1 Yes chr2R:9400531-9413463 LINC01815:4 No - lnc-CLEC18B-44:3 Yes chr4:501810-540874 lnc-FAM84B-15:82 No - FIRRE:22 No - lnc-FAM84B-15:69 No - LINC01568:10 Yes chr4:501810-540874 lnc-FAM86B2-58:9 No - lnc-GGT1-16:1 No - lnc-GPR157-7:2 No - lnc-SMARCA5-4:16 No - lnc-KDM1A-7:1 No - lnc-KCNA1-97:9 No - lnc-KCNA1-97:12 No - lnc-FAM84B-15:37 No - lnc-ROPN1B-20:3 No - lnc-FAM84B-15:103 No - lnc-FAM84B-15:81 No - LINC00174:28 Yes chrX:13563823-13593224 lnc-SYNGR1-1:2 No - lnc-IGSF21-67:1 No - lnc-DMRTA2-1:13 No - lnc-FAM84B-15:31 No - SAMMSON:39 No - lnc-FAM84B-15:97 No - lnc-CLEC18B-44:2 Yes chr4:501810-540874 lnc-CNTLN-1:7 No - lnc-C5orf63-1:11 No - lnc-FAM84B-15:79 No - lnc-KCNA1-97:15 No - lnc-FAM84B-15:49 No - LINC01808:4 No - lnc-FAM84B-15:75 No - MIR193BHG:38 No - LINC00174:25 No - lnc-KCNH1-25:3 No - lnc-FAM84B-15:91 No - lnc-FAM84B-15:77 No - LINC02211:8 No - SAMMSON:16 No - lnc-PTPRU-20:1 No - lnc-FAM84B-15:65 No - lnc-RICTOR-54:6 No - lnc-RHD-12:1 No - FTX:50 No - lnc-DHX38-41:1 Yes chr4:501810-540874 RMST:36 No - SAMMSON:25 No - lnc-FAM84B-15:23 No - lnc-ZFHX3-27:7 No - lnc-PLPP3-12:25 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-SPRY2-132:4 No - lnc-FAM84B-15:93 No - lnc-CAMK2N1-4:2 No - lnc-ELMO2-40:2 No - lnc-FAM84B-15:87 No - lnc-PGD-2:7 No - HCG27:7 No - LINC01132:3 No - OLMALINC:29 No - lnc-ZNF536-55:1 No - LINC01138:22 No - lnc-POTEC-224:1 No - lnc-PRIM2-7:11 No - lnc-PGD-2:9 No - lnc-PGPEP1L-60:2 No - lnc-DHX38-40:3 Yes chr4:501810-540874 RMST:38 No - lnc-FAM84B-15:26 No - lnc-FAM84B-15:63 No - lnc-ALDH1B1-13:9 No - JPX:46 No - lnc-NPHP4-64:1 No - lnc-CYLD-2:6 No - lnc-PYDC2-1:10 No - lnc-FAM84B-15:52 No - lnc-POLR2J2-1:2 No - LINC02471:6 No - lnc-OR2B3-46:1 No - lnc-CLEC2D-2:8 No - lnc-ZNF680-28:2 No - MIR193BHG:37 No - HCCAT5:4 Yes chr4:501810-540874 FTX:53 No - lnc-METTL4-2:10 No - LINC00592:17 No - lnc-KCNH1-25:1 Yes chrX:14955477-15009989 OLMALINC:30 No - lnc-FAM84B-15:38 No - lnc-CLEC2D-8:18 No - MIR193BHG:44 No - SAMMSON:23 No - lnc-FAM84B-15:70 No - SAMMSON:15 No - lnc-FAM84B-15:47 No - lnc-VWA5B1-22:1 No - MIR193BHG:34 No - lnc-SFPQ-1:6 No - lnc-FAM84B-15:45 No - lnc-CXorf51B-25:1 No - lnc-FAM84B-15:39 No - lnc-RRAGC-10:2 No - lnc-ACP1-7:4 No - lnc-NPHP4-69:1 No - MIR193BHG:45 No - lnc-KCNA1-97:2 Yes chrX:17924307-18063247 lnc-GGT1-16:2 No - lnc-FAM84B-15:62 No - lnc-PLPP3-12:16 Yes chr2R:9400531-9413463 MIR193BHG:47 No - lnc-SPRY2-132:3 No - LINC02228:2 No - lnc-FAM84B-15:78 No - lnc-CNTNAP3-24:7 No - FTX:54 No - lnc-DHRS4L2-2:8 No - lnc-ZNF705B-3:3 No - lnc-RRAGC-10:3 No - lnc-PYDC2-1:12 No - lnc-FAM84B-15:16 No - lnc-C5orf63-1:13 No - SAMMSON:22 No - lnc-PLPP3-12:11 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-NUPL2-2:3 No - lnc-PRIM2-7:8 No - lnc-UBLCP1-30:3 No - lnc-FAM84B-15:68 No - LINC01343:6 No - OLMALINC:28 No - SAMMSON:27 No - lnc-PLPP3-12:13 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-ARL4A-54:2 No - SAMMSON:42 No - lnc-FAM84B-15:60 No - lnc-FAM84B-15:50 No - lnc-FAM84B-15:36 No - lnc-COL9A2-12:1 No - lnc-KCNA1-97:16 No - lnc-ZC3H12A-39:1 No - lnc-MTOR-1:2 No - lnc-KCNA1-97:14 No - FTX:51 No - LINC01808:3 No - LINC02228:5 No - lnc-ASNS-1:12 Yes chr3L:21173118-21174973 RMST:37 No - lnc-FAM84B-15:84 No - LINC02127:2 No - lnc-FAM84B-15:27 No - lnc-TF-12:1 No - lnc-PLPP3-12:9 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-DMRTA2-1:6 No - lnc-FAM84B-15:71 No - lnc-ZNF705B-3:1 No - lnc-ELAVL2-3:5 No - SAMMSON:36 No - lnc-FAM43B-20:3 No - lnc-PLPP3-12:17 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-SLX1B-3:5 No - lnc-C1orf174-72:1 No - lnc-FAM84B-15:30 No - MIR193BHG:39 No - lnc-KCNA1-97:19 No - lnc-FAM84B-15:21 No - LINC00174:27 Yes chrX:13563823-13593224 LINC02001:5 Yes chr2L:815993-818096 lnc-ABT1-2:2 No - MIR193BHG:40 No - MIR193BHG:46 No - MIR193BHG:41 No - lnc-ARL4A-54:1 No - lnc-SH3D21-37:1 No - lnc-FAM84B-15:55 No - lnc-IRF2BP2-36:1 No - lnc-FAM84B-15:106 No - lnc-DMRTA2-1:7 No - lnc-POTED-160:1 No - lnc-PLPP3-12:14 Yes chr2R:9400531-9413463 SAMMSON:41 No - LINC01739:5 No - lnc-PLPP3-12:4 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-CD46-2:3 No - SAMMSON:35 No - lnc-PRIM2-7:9 No - lnc-PGD-2:6 No - LINC02572:8 No - lnc-FAM84B-15:53 No - lnc-FAM84B-15:40 No - lnc-DMRTA2-1:9 No - lnc-NUTM2E-2:3 No - lnc-FAM84B-15:34 No - lnc-PLPP3-12:8 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-KCNH1-25:2 Yes chrX:14955477-15009989 DLEU1:53 No - lnc-ASNS-1:11 Yes chr3L:21173118-21174973 LINC01226:17 No - lnc-GPR157-7:1 No - lnc-ESR2-42:1 No - lnc-CLIC4-6:1 No - lnc-LMO4-2:20 No - lnc-PLPP3-12:3 Yes chr2R:9400531-9413463 DLEU1:54 No - SAMMSON:30 No - lnc-PRIM2-7:1 No - LINC01226:15 No - lnc-FAM84B-15:83 No - lnc-KCNA1-97:8 No - lnc-PYDC2-1:11 No - lnc-PLPP3-12:23 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-KCNA1-97:20 No - LINC01138:19 Yes chr3R:25249348-25258672 lnc-PRIM2-7:12 No - lnc-HDDC2-2:5 No - MIR193BHG:33 No - OLMALINC:31 No - lnc-PPIE-1:9 No - lnc-SLX1B-3:12 No - LINC00863:11 No - lnc-ZFHX3-27:14 No - lnc-KCNA1-97:7 No - MIR193BHG:42 No - lnc-KCNA1-97:17 No - SAMMSON:31 No - lnc-FAM84B-15:25 No - lnc-TMEM235-47:1 No - lnc-PLPP3-12:10 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-FAM84B-15:72 No - LINC01226:14 No - lnc-VWA5B1-22:2 No - lnc-LMO4-2:22 No - lnc-FAM84B-15:64 No - lnc-DFFA-4:3 No - LINC01815:7 No - lnc-C5orf63-1:14 No - OLMALINC:32 No - lnc-DLK1-35:99 No - FTX:55 No - SAMMSON:26 No - LINC01739:2 No - lnc-KRT80-1:9 No - lnc-C5orf63-1:12 No - lnc-ZC3H11B-1:8 No - lnc-FAM84B-15:76 No - lnc-PPIE-1:10 No - lnc-METTL4-2:12 No - lnc-DHRS4L2-2:9 No - lnc-CAMTA1-18:1 No - lnc-ELAVL4-1:2 No - lnc-AJAP1-39:1 No - lnc-FAM84B-15:67 No - GLIDR:25 No - lnc-HDDC2-2:6 No - lnc-ALDH1B1-13:10 No - lnc-KCNA1-97:25 No - lnc-FAM84B-15:56 No - lnc-GPR157-4:2 No - MIR193BHG:32 No - lnc-DMRTA2-1:4 No - lnc-CLEC18B-44:1 Yes chr4:501810-540874 SAMMSON:38 No - SAMMSON:37 No - SAMMSON:19 No - lnc-NPHP4-62:1 No - SAMMSON:21 No - GLIDR:24 No - lnc-OR2AT4-40:1 No - HCG27:8 No - lnc-DGCR6-43:1 Yes chr3L:15509445-15511047 lnc-KCNA1-97:13 No - lnc-PLEKHB2-1:12 No - lnc-PLPP3-12:2 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-FAM84B-15:80 No - lnc-IRF2BP2-36:2 No - LINC01568:12 Yes chr4:501810-540874 lnc-OR11H1-110:1 No - lnc-FAM84B-15:88 No - SAMMSON:24 No - MIR193BHG:49 No - lnc-FAM84B-15:17 No - lnc-PRR14L-5:4 Yes chr3L:1523414-1534034 lnc-ARL4A-54:4 No - lnc-FAM84B-15:66 No - lnc-SLX1B-3:6 No - LINC00174:24 No - lnc-SYN1-22:1 No - lnc-CNTNAP3-24:1 No - lnc-KCNA1-97:18 No - lnc-ZNF362-5:1 No - lnc-FAM84B-15:28 No - lnc-SPRY2-132:6 No - SAMMSON:33 No - MIR193BHG:43 No - lnc-FAM84B-15:51 No - lnc-FAM84B-15:20 No - lnc-FAM84B-15:46 No - lnc-PROK1-2:6 No - PLUT:5 No - lnc-DMRTA2-1:8 No - lnc-FAM84B-15:24 No - lnc-FAM84B-15:18 No - lnc-ERRFI1-29:1 No - lnc-GRIK3-25:1 No - lnc-ZPBP-2:3 No - lnc-THAP7-20:2 No - lnc-KCNA1-96:1 No - lnc-FAM84B-15:89 No - lnc-FAM84B-15:29 No - lnc-FAM84B-15:96 No - SAMMSON:28 No - lnc-PRIM2-7:7 No - lnc-FAM84B-15:102 No - lnc-CCDC170-11:1 No - lnc-KCNA1-97:21 No - lnc-DFFB-50:4 No - SAMMSON:17 No - lnc-DHRS4L2-2:11 No - SAMMSON:32 No - lnc-ZC3H11B-1:7 No - lnc-PLPP3-12:27 No - lnc-DFFA-4:2 No - lnc-FAM43B-20:1 No - lnc-FAM84B-15:61 No - lnc-GPR157-7:6 No - lnc-DMRTA2-1:10 No - lnc-SPRY2-132:7 No - lnc-HDDC2-2:4 No - lnc-FAM84B-15:41 No - LINC01226:16 No - LINC00334:3 Yes chrX:1464363-1465996 LINC01226:18 No - lnc-ZFHX3-27:16 No - lnc-FAM84B-15:54 No - lnc-FAM84B-15:42 No - lnc-PLPP3-12:28 No - lnc-ZFHX3-27:17 No - lnc-PGD-2:8 No - lnc-ROPN1B-20:4 No - lnc-CNTNAP3-24:6 No - lnc-IL10-5:3 No - lnc-ZFHX3-27:2 No - lnc-SMARCA5-4:7 No - lnc-KCNA1-97:23 No - lnc-FAM84B-15:92 No - lnc-C1orf174-74:1 No - lnc-FAM84B-15:43 No - lnc-DFFA-4:4 No - lnc-FAM84B-15:100 No - lnc-CNNM1-1:13 No - lnc-KCNA1-97:1 Yes chrX:17924307-18063247 lnc-POLR2J2-1:1 No - lnc-SLC2A1-2:1 Yes chr3L:914074-993788 SAMMSON:20 No - lnc-FAM84B-15:94 No - lnc-HSPB8-2:2 No - lnc-PLPP3-12:6 Yes chr2R:9400531-9413463 lnc-FAM84B-15:15 No - lnc-FAM84B-15:59 No - lnc-ESAM-65:2 No - TBC1D22A-AS1:2 Yes chr3R:21102199-21105113 lnc-CHD1-221:1 No - lnc-XKR6-18:1 Yes chr3L:8968528-8971752 lnc-KPNA7-8:1 No - lnc-NCKAP1-5:2 No - lnc-NEMP2-38:5 Yes chr3L:4153618-4160932 lnc-UBLCP1-2:22 No - lnc-NEMP2-38:8 Yes chr3L:4153618-4160932 lnc-PEA15-1:7 No - lnc-TTC21A-76:1 Yes chr2L:2365345-2370137 lnc-LRRC75B-73:2 No - lnc-USP24-3:4 No - lnc-KPNA7-8:2 No - lnc-KPNA7-8:4 No - TMC3-AS1:22 Yes chr3L:9597764-9614001 lnc-SYNGR1-11:3 No - MEF2C-AS1:58 No - lnc-RADIL-13:1 No - lnc-PAX9-11:4 No - lnc-UBLCP1-2:23 No - lnc-NEMP2-38:6 Yes chr3L:4153618-4160932 lnc-USP24-3:2 No - lnc-KPNA7-8:3 No - lnc-FBXO44-18:1 No - lnc-USP24-3:5 No - lnc-VSIG10L2-1:2 No - LINC01847:2 Yes chr3L:22035003-22065279 lnc-SYNGR1-11:2 No - lnc-UBLCP1-2:24 No - lnc-ATP10D-4:8 No - lnc-TTC21A-76:3 Yes chr2L:2365345-2370137 lnc-CHD1-221:2 No - lnc-RHD-4:2 No - lnc-PCID2-1:3 No - lnc-PARK7-8:1 No - lnc-TEX11-32:1 No - lnc-WDR26-1:19 Yes chr2L:16309292-16310726 lnc-USP24-3:3 No - lnc-SCN2A-6:40 Yes chr2R:9044850-9060608 lnc-NEMP2-38:7 Yes chr3L:4153618-4160932 lnc-NEMP2-38:2 Yes chr3L:4153618-4160932 lnc-SYNGR1-11:1 No - lnc-IL16-13:3 No - lnc-UBLCP1-2:21 No - lnc-NEMP2-38:1 Yes chr3L:4153618-4160932 lnc-ATP10D-4:6 No - lnc-ELAVL4-8:3 No - LINC01766:2 Yes chr3R:20948714-20976239 lnc-RPE-9:7 No - lnc-TPO-276:1 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-DNALI1-3:2 No - lnc-ODF1-91:1 No - lnc-ATP10D-4:7 No - lnc-XKR6-18:2 Yes chr3L:8968528-8971752 OVCH1-AS1:7 No - lnc-BMP6-106:133 No - lnc-UCHL5-108:1 No - LINC01578:15 Yes chr2L:2979562-2987723 PCAT1:52 No - SOX2-OT:78 No - lnc-RPLP1-12:25 No - PCA3:15 Yes chr3L:4037523-4040482 lnc-BMP6-106:60 No - lnc-C16orf78-5:14 No - lnc-SLC5A9-3:2 Yes chr3R:30597004-30599296 lnc-TNC-21:2 No - lnc-BMP6-106:85 No - lnc-SLC22A5-6:1 Yes chr2R:22421013-22425482 lnc-BMP6-106:105 No - lnc-UCHL5-108:5 No - lnc-TNC-21:4 No - ZBED3-AS1:63 No - FILNC1:5 No - ZBED3-AS1:88 No - TUG1:61 No - ZBED3-AS1:64 No - PCAT1:44 No - lnc-BMP6-106:45 No - MEG9:6 No - RFPL3S:6 No - lnc-BMP6-106:96 No - lnc-FIGNL1-44:1 No - SOX2-OT:75 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-BMP6-106:61 No - ZBED3-AS1:81 No - lnc-TNFAIP3-3:14 No - PAUPAR:14 Yes chr3L:1298672-1300389 LINC01934:8 No - SOX2-OT:95 No - RFPL3S:2 No - GABPB1-IT1:6 Yes chr3L:324985-327992 lnc-TLR4-3:7 No - lnc-ZDBF2-2:7 No - CYTOR:22 No - lnc-BMP6-106:131 No - UCA1:24 No - lnc-BMP6-106:107 No - SOX2-OT:127 No - UCA1:22 No - lnc-BMP6-106:154 No - lnc-ATG5-31:1 No - SOX2-OT:103 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-LRRC7-19:1 No - lnc-BMP6-106:75 No - LINC01517:20 No - lnc-BMP6-106:91 No - lnc-SLC22A5-6:5 Yes chr2R:22421013-22425482 lnc-FMN2-2:4 Yes chrX:16838173-16844433 lnc-ZNF704-7:13 No - lnc-BMP6-106:111 No - UCA1:20 No - HNF1A-AS1:15 No - lnc-ETS1-1:6 No - BANCR:6 No - SOX2-OT:124 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-ODF2L-32:1 No - LINC00842:23 No - lnc-BMP6-106:132 No - LINC00460:15 No - lnc-ASMT-3:3 No - lnc-MYCN-132:4 No - LINC01081:15 No - lnc-FOXB2-9:5 Yes chr3L:4037523-4040482 PCAT1:27 No - OBSCN-AS1:4 Yes chr3L:2117466-2151700 ZBED3-AS1:73 No - HOTTIP:10 No - CCND2-AS1:4 Yes chrX:15906822-15909676 CYTOR:44 No - lnc-RRM2-3:3 Yes chr2R:11983145-11985393 TUG1:76 No - UCA1:25 No - lnc-TGFBI-80:8 Yes chr3R:27559379-27561319 ALMS1-IT1:4 No - lnc-BMP6-106:2 No - lnc-BMP6-106:19 Yes chr3L:17042797-17044465 lnc-PCSK9-4:11 No - lnc-SLC4A1-6:1 No - lnc-ZNF449-144:1 No - UCA1:16 No - SOX2-OT:100 Yes chr2L:8825645-8829670 SOX2-OT:104 Yes chr2L:8825645-8829670 CYTOR:39 No - lnc-OTUD7B-2:2 Yes chr3R:9563924-9566092 SOX2-OT:87 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-ATXN7-16:3 No - SOX2-OT:70 Yes chrX:7407208-7407854 TUG1:74 No - PCAT1:33 No - lnc-HNRNPA1P48-124:3 No - TUG1:66 No - ZBED3-AS1:66 No - lnc-DAOA-47:1 Yes chr4:571755-580122 MIR99AHG:128 No - lnc-C16orf78-5:9 No - lnc-GSDMC-34:2 No - lnc-UCHL5-108:16 No - lnc-PCSK9-4:10 No - ZBED3-AS1:60 No - LINC-ROR:6 No - DSCR8:8 Yes chr3R:23168317-23185642 ZBED3-AS1:75 No - lnc-GPR31-52:1 No - lnc-BMP6-106:37 No - CYTOR:6 No - lnc-SPATA1-7:1 No - PCAT1:46 No - LINC01934:12 No - lnc-ATXN7-16:2 No - lnc-AK6-8:2 No - PCA3:5 Yes chr3L:4037523-4040482 lnc-ODF2L-32:3 No - MIR4435-2HG:49 No - LINC01967:7 No - RALY-AS1:20 No - lnc-BMP6-106:104 No - SOX2-OT:105 Yes chr2L:8825645-8829670 ZBED3-AS1:84 No - lnc-C16orf78-5:10 No - LINC02240:3 No - lnc-TNC-21:11 No - PCAT1:48 No - CYTOR:9 No - lnc-BMP6-106:151 No - PCAT1:37 No - TUG1:72 No - lnc-BMP6-106:82 No - SOX2-OT:106 Yes chr2L:8825645-8829670 LINC-PINT:97 No - lnc-NFIA-12:1 No - lnc-BMP6-106:11 No - PCA3:6 Yes chr3L:4037523-4040482 UCA1:26 No - RFPL3S:9 No - HAGLR:56 Yes chr3R:6752864-6754194 SOX2-OT:83 Yes chr2L:8825645-8829670 SOX2-OT:107 Yes chr2L:8825645-8829670 SOX2-OT:86 No - lnc-ICOSLG-1:7 No - SOX2-OT:97 No - lnc-POTEG-23:2 No - lnc-POTEG-23:4 No - CYTOR:73 No - lnc-CD34-6:1 Yes chrX:11992915-12003914 HCG23:15 No - PCA3:14 Yes chr3L:4037523-4040482 TUG1:73 No - lnc-RPP40-44:1 Yes chr3L:851346-852673 HAGLR:50 Yes chr3R:6661427-6678590 lnc-IFNK-1:2 No - PCAT1:30 No - LINC02517:2 No - SOX2-OT:79 No - lnc-BMP6-106:103 No - LINC02228:3 No - lnc-BRCA1-3:16 No - lnc-UCHL5-108:15 No - lnc-BMP6-106:59 No - TUG1:63 No - lnc-TNC-21:3 No - lnc-TGFBI-80:12 Yes chr3R:27559379-27561319 TUG1:70 No - H19:23 No - NEAT1:30 No - UCA1:23 No - ZBED3-AS1:86 No - SOX2-OT:108 No - CYTOR:62 No - UCA1:27 No - LINC-PINT:88 No - lnc-ZDBF2-2:6 No - PCAT1:38 No - lnc-SLC22A5-6:6 Yes chr2R:22421013-22425482 lnc-PON1-1:7 Yes chr3L:2505245-2554292 lnc-HNRNPA1P48-124:1 Yes chr2L:11434311-11445614 lnc-FAM49A-14:1 No - CYTOR:75 No - lnc-BMP6-106:122 No - OBSCN-AS1:3 Yes chr3L:2117466-2151700 lnc-GSDMC-35:1 No - LINC01488:8 No - LINC00205:27 No - lnc-SLC6A15-4:1 No - lnc-LRRIQ1-2:3 No - LINC01934:11 No - CYTOR:66 No - CYTOR:49 No - ZBED3-AS1:70 No - lnc-BMP6-106:121 No - LINC01036:12 No - lnc-BMP6-106:98 No - lnc-IRF8-1:4 No - lnc-PHYHIPL-27:1 No - LINC00460:19 No - lnc-CHRD-10:6 No - MIR4435-2HG:52 No - UCA1:28 No - lnc-BMP6-106:158 No - HAGLR:52 No - LINC01032:8 No - lnc-ST3GAL4-53:1 No - lnc-BMP6-106:12 No - lnc-TMEM132B-4:20 No - ZBED3-AS1:89 No - UCA1:29 No - lnc-ATXN7-16:1 No - lnc-BMP6-106:113 No - lnc-GTF2B-15:8 No - lnc-IRF8-5:2 No - MIR3142HG:4 No - lnc-GPR183-48:1 No - CCND2-AS1:7 No - TUG1:65 No - SOX2-OT:109 Yes chr2L:8825645-8829670 LINC02397:6 No - lnc-BMP6-106:44 No - lnc-GSDMC-34:7 No - lnc-BMP6-106:32 Yes chr3L:17042797-17044465 lnc-NAIP-71:1 No - AFF1-AS1:3 No - NEAT1:34 No - BISPR:47 Yes chrX:18097558-18101314 ZBED3-AS1:79 No - H19:25 No - lnc-SLC22A5-6:4 Yes chr2R:22421013-22425482 SOX2-OT:110 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-BMP6-106:20 Yes chr3L:17042797-17044465 LINC02482:7 No - SOX2-OT:96 Yes chr2L:8825645-8829670 LINC02583:16 No - lnc-WDR63-11:1 No - lnc-CDYL-1:4 No - lnc-IRF8-1:5 No - lnc-DAOA-47:2 Yes chr4:571755-580122 LINC02232:2 No - lnc-TNFAIP3-3:13 No - LINC02240:10 No - UCA1:30 No - lnc-SYTL3-3:1 No - lnc-ST3GAL4-55:17 No - lnc-TNC-21:1 No - NBR2:10 No - LINC02240:2 No - PCAT1:39 No - lnc-ICOSLG-6:21 No - lnc-BMP6-106:31 Yes chr3L:17042797-17044465 lnc-TGFBI-80:4 Yes chr3R:27559379-27561319 UCA1:18 No - SOX2-OT:82 Yes chr2L:8825645-8829670 SOX2-OT:123 Yes chr2L:8825645-8829670 LINC00460:16 No - VPS13A-AS1:4 No - lnc-BMP6-106:128 No - lnc-PIP4K2A-89:1 No - HAND2-AS1:127 No - UCA1:31 No - LINC01517:19 No - FAM138C:6 Yes chr2R:12180493-12182373 UCA1:47 No - AFF1-AS1:4 No - lnc-SLC22A5-6:7 Yes chr2R:22421013-22425482 lnc-FOXD4L5-80:3 No - LINC-PINT:93 No - lnc-BPI-33:2 Yes chr3L:7593091-7639573 lnc-ICOSLG-1:6 No - DSCR4:3 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-BMP6-106:64 No - LINC-PINT:82 Yes chr2R:12628697-12632378 HCG23:4 No - PCAT1:36 No - lnc-ADGRL2-1:1 No - MIR4435-2HG:50 No - lnc-ADGRL4-27:1 No - HNF1A-AS1:17 No - LINC02397:8 No - lnc-BMP6-106:110 No - LINC01967:2 No - lnc-FAM167A-2:1 Yes chr3L:4592447-4626196 lnc-BMP6-106:76 No - CYTOR:50 No - LINC-PINT:101 No - lnc-BMP6-106:124 No - PCAT1:40 No - SOX2-OT:102 Yes chr2L:8825645-8829670 DSCR8:9 Yes chr3R:23168317-23185642 H19:26 No - ZBED3-AS1:61 No - RFPL3S:7 No - lnc-GTF2B-15:7 No - SOX2-OT:80 No - lnc-ATG5-31:2 No - BLACE:2 No - lnc-BMP6-106:21 Yes chr3L:17042797-17044465 lnc-SGPL1-131:1 No - LINC01036:10 No - UCA1:32 No - UCA1:21 No - lnc-BMP6-106:69 No - lnc-BNC2-16:1 No - SOX2-OT:111 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-BMP6-106:81 No - lnc-BMP6-106:78 No - lnc-PCSK9-4:12 No - LINC02240:9 No - lnc-LINC02203-1:4 No - lnc-BMP6-106:144 No - lnc-BMP6-106:155 No - lnc-TLR4-3:6 No - LINC02237:6 No - LINC02240:4 No - lnc-BMP6-106:77 No - lnc-GOLGA8H-119:5 Yes chr3R:14391683-14481713 lnc-GTF2A1-78:2 Yes chr3R:17725777-17733207 lnc-CBLC-5:1 No - MIR34AHG:5 No - lnc-BMP6-106:38 No - ZBED3-AS1:67 No - CYTOR:74 No - LINC01980:6 No - LINC-PINT:102 No - LINC-PINT:89 No - ZBED3-AS1:82 No - lnc-BMP6-106:27 Yes chr3L:17042797-17044465 lnc-CHN2-4:6 No - LINC-PINT:83 Yes chr2R:12628697-12632378 lnc-BMP6-106:152 No - lnc-BMP6-106:156 No - LINC01967:3 No - LINC-PINT:98 No - lnc-BMP6-106:49 No - lnc-AVL9-10:1 No - lnc-BMP6-106:33 Yes chr3L:17042797-17044465 LINC02478:4 No - lnc-BMP6-106:65 No - HAGLR:53 No - lnc-EMC8-13:1 No - lnc-HERC5-1:7 Yes chr3L:1313696-1318330 lnc-FSIP1-4:43 No - UCA1:33 No - BISPR:49 Yes chrX:18097558-18101314 lnc-BMP6-106:146 No - lnc-GTF2A1-78:3 Yes chr3R:17725777-17733207 SOX2-OT:71 Yes chrX:7407208-7407854 lnc-GTF2B-15:14 No - CYTOR:40 No - UCA1:34 No - lnc-BMP6-106:84 No - lnc-BMP6-106:139 No - LINC00460:20 No - lnc-RPLP1-12:46 No - LNCPRESS1:3 No - UCA1:35 No - NEAT1:35 No - lnc-DLK1-35:52 No - lnc-CPNE5-6:1 No - lnc-BMP6-106:29 Yes chr3L:17042797-17044465 UCA1:15 No - SOX2-OT:112 No - lnc-DLK1-35:141 No - lnc-GTF2B-15:13 No - CYTOR:26 No - lnc-BMP6-106:83 No - lnc-CCT7-58:1 No - lnc-BMP6-106:15 No - lnc-EMD-72:1 No - lnc-PRKACB-8:2 No - LINC-ROR:8 No - lnc-TMPRSS2-83:7 No - TUG1:75 No - lnc-GTF2B-15:4 Yes chr2R:9252310-9285097 lnc-BMP6-106:46 No - lnc-ADPRM-5:1 No - CYTOR:51 No - lnc-BMP6-106:86 No - LINC00460:18 No - lnc-ROR1-1:3 No - lnc-ATXN7-16:4 No - lnc-UCHL5-108:17 Yes chr2R:17792870-17800677 lnc-BMP6-106:22 Yes chr3L:17042797-17044465 LINC01036:11 No - LINC02478:7 No - lnc-ELP4-12:2 Yes chr3L:1298672-1300389 HAND2-AS1:130 No - HNF1A-AS1:18 No - lnc-BMP6-106:92 No - LINC01517:27 No - BISPR:50 Yes chrX:18097558-18101314 SOX2-OT:126 No - lnc-BMP6-106:106 No - SOX2-OT:72 Yes chrX:7407208-7407854 lnc-ORAOV1-1:5 No - LINC00205:29 No - ZBED3-AS1:85 No - LINC02228:7 No - CYTOR:10 No - PCAT1:29 No - SOX2-OT:90 Yes chr2L:8825645-8829670 UCA1:36 No - CYTOR:23 No - HCG23:18 No - lnc-FNDC1-3:3 No - LINC00460:14 No - UCA1:19 No - SNHG28:2 No - LINC-ROR:11 No - LINC01032:9 No - DSCR8:10 Yes chr3R:23168317-23185642 FILNC1:4 No - lnc-RGS1-1:6 No - lnc-ZBTB10-2:2 No - MIR4435-2HG:38 Yes chrX:15455544-15462441 lnc-SERPINA3-22:2 No - lnc-PRRT1-1:5 No - BISPR:48 Yes chrX:18097558-18101314 KDM7A-DT:5 No - lnc-BMP6-106:116 No - lnc-BMP6-106:87 No - ZBED3-AS1:69 No - lnc-SLC30A9-24:1 No - lnc-EGR4-106:1 No - LINC01934:2 No - CYTOR:70 No - lnc-BMP6-106:100 No - SOX2-OT:69 Yes chrX:7407208-7407854 lnc-TPP1-2:1 No - lnc-TGFBI-80:3 Yes chr3R:27559379-27561319 lnc-CLDN11-25:1 No - VPS13A-AS1:5 No - SNHG4:20 No - ZBED3-AS1:71 No - lnc-SALL1-6:6 No - HCG23:11 No - UCA1:17 No - lnc-AGR3-1:21 Yes chr3R:16374434-16403690 CYTOR:15 No - LINC01980:2 No - SOX2-OT:113 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-PRRT1-1:6 No - LINC-PINT:84 Yes chr2R:12628697-12632378 DSCR8:12 Yes chr3R:23168317-23185642 LINC-PINT:99 No - CYTOR:3 No - lnc-BMP6-106:52 No - CDKN2B-AS1:75 Yes chr3R:25036944-25037982 lnc-UCHL5-108:19 No - ZBED3-AS1:72 No - lnc-C6orf141-2:4 No - UCA1:37 No - lnc-DHRS4L2-2:6 Yes chr3L:5140440-5141646 PCAT1:47 No - TUG1:67 No - lnc-GTF2B-15:15 No - lnc-BMP6-106:79 No - ZBED3-AS1:65 No - CYTOR:8 No - lnc-BMP6-106:112 No - lnc-FOXB2-9:6 Yes chr3L:4037523-4040482 LINC01036:15 No - CYTOR:67 No - lnc-BMP6-106:62 No - LINC-PINT:94 No - lnc-BMP6-106:66 No - NEAT1:33 No - lnc-BMP6-106:157 No - lnc-LRRC7-20:3 No - lnc-ECI2-32:1 No - H19:22 No - BISPR:46 Yes chrX:18097558-18101314 lnc-TMEM132B-2:12 No - lnc-CHN2-4:5 No - lnc-BMP6-106:123 No - lnc-BMP6-106:9 No - lnc-RPLP1-12:37 No - lnc-BMP6-106:39 No - lnc-HNRNPA1P48-124:2 No - lnc-GSDMC-34:3 No - lnc-NUDCD2-2:15 No - lnc-LRRC7-20:2 No - SOX2-OT:98 No - lnc-RPLP1-12:11 No - MIR4435-2HG:39 Yes chrX:15455544-15462441 lnc-BMP6-106:67 No - lnc-LEPR-14:1 No - LINC02487:3 No - lnc-CHRD-10:1 No - LINC-ROR:10 No - LINC02478:5 No - ZBED3-AS1:76 No - CDKN2B-AS1:76 No - IL12A-AS1:14 No - lnc-SYTL3-2:3 No - lnc-SERPINA3-22:1 No - lnc-SMC2-1:6 No - TUG1:68 No - lnc-UCHL5-108:2 Yes chr2R:17792870-17800677 SOX2-OT:114 Yes chr2L:8825645-8829670 NBR2:9 No - lnc-TRIL-20:2 No - lnc-TAGAP-1:3 Yes chr3L:15588860-15609125 HAGLR:57 No - lnc-BMP6-106:99 No - LINC-PINT:96 No - PCAT1:41 No - SOX2-OT:101 Yes chr2L:8825645-8829670 TUG1:60 No - BISPR:40 Yes chrX:18097558-18101314 lnc-BMP6-106:53 No - PCAT1:51 No - lnc-NUMB-1:14 No - TUG1:62 No - HAND2-AS1:128 No - SOX2-OT:115 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-HNRNPA1P48-124:6 No - UCA1:38 No - lnc-TNC-21:7 No - TUG1:71 No - LINC00205:28 No - lnc-FAM167A-24:1 No - LINC01219:2 No - lnc-BMP6-106:50 No - lnc-GSDMC-34:9 No - BLACE:4 No - lnc-MYCN-132:3 No - lnc-ODF2L-32:2 No - lnc-BMP6-106:102 No - FILNC1:9 No - lnc-GSDMC-34:10 No - lnc-ACOD1-231:1 No - lnc-TNFRSF14-66:3 No - FILNC1:2 No - lnc-TMEM238L-16:1 No - lnc-MYCN-132:2 No - lnc-BMP6-106:150 No - ZBED3-AS1:59 No - SOX2-OT:116 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-C16orf78-5:11 No - lnc-SALL1-6:5 No - lnc-RPL11-1:10 No - lnc-HDHD2-7:1 Yes chrX:3314744-3316402 lnc-BMP6-106:88 No - lnc-AFDN-11:2 No - LINC-ROR:12 No - BISPR:41 Yes chrX:18097558-18101314 SOX2-OT:117 Yes chr2L:8825645-8829670 H19:27 No - lnc-OTUD7B-2:3 No - lnc-BMP6-106:54 No - lnc-BMP6-106:55 No - NEAT1:32 No - PCAT1:24 No - TUG1:64 No - SOX2-OT:73 Yes chrX:7407208-7407854 CYTOR:38 No - lnc-EMC8-12:1 No - lnc-BMP6-106:23 Yes chr3L:17042797-17044465 SOX2-OT:118 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-BMP6-106:26 Yes chr3L:17042797-17044465 lnc-UCHL5-108:3 No - HAGLR:51 Yes chr3R:6661427-6678590 PCAT1:45 No - PCAT1:22 No - UCA1:39 No - MIR4435-2HG:51 No - LINC-PINT:90 No - UCA1:45 No - BISPR:42 Yes chrX:18097558-18101314 LINC-PINT:91 No - lnc-ST3GAL4-55:19 No - lnc-GPR31-51:1 No - lnc-BMP6-106:101 No - lnc-C16orf78-5:12 No - lnc-ST3GAL4-55:5 No - lnc-BMP6-106:97 No - lnc-CTSZ-116:1 No - HAND2-AS1:125 No - lnc-SPATA1-2:1 No - lnc-BMP6-106:89 No - UCA1:46 No - LINC02350:10 No - LINC01032:10 No - SOX2-OT:119 Yes chr2L:8825645-8829670 SOX2-OT:99 Yes chr2L:8825645-8829670 UCA1:40 No - lnc-IRF8-1:6 No - LINC01967:6 No - lnc-BMP6-106:28 Yes chr3L:17042797-17044465 lnc-RPF1-3:3 No - PCAT1:34 No - NEAT1:36 No - DSCR4:4 Yes chr3R:23168317-23185642 HNF1A-AS1:16 No - SOX2-OT:120 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-BMP6-106:43 No - ZBED3-AS1:78 No - lnc-NUDCD2-2:13 No - SNHG28:3 No - lnc-RPL11-1:8 No - HAND2-AS1:129 No - ZBED3-AS1:62 No - BANCR:7 No - lnc-BMP6-106:51 No - lnc-RPLP1-12:16 No - HCG23:5 No - PAUPAR:12 Yes chr3L:1298672-1300389 LINC-ROR:7 No - lnc-BMP6-106:94 No - lnc-TAGAP-1:2 No - lnc-BMP6-106:109 No - UCA1:14 No - LINC01036:8 No - UCA1:41 No - lnc-GTF2B-15:12 No - LINC01036:13 No - lnc-BMP6-106:24 Yes chr3L:17042797-17044465 UCA1:42 No - LINC-PINT:85 Yes chr2R:12628697-12632378 LINC02350:9 No - UCA1:43 No - lnc-BMP6-106:148 No - lnc-BMP6-106:56 No - lnc-BMP6-106:135 No - lnc-ST3GAL4-55:4 No - lnc-BMP6-106:160 No - lnc-EPB42-1:8 No - ZBED3-AS1:83 No - LINC-PINT:100 No - lnc-PON1-1:8 Yes chr3L:2505245-2554292 lnc-C8orf86-1:10 No - lnc-BMP6-106:3 No - ZBED3-AS1:80 No - lnc-NUDCD2-2:12 No - lnc-BMP6-106:13 No - lnc-BMP6-106:90 No - LINC01689:8 No - lnc-RPLP1-12:43 No - lnc-PRRT1-1:7 No - lnc-NUDCD2-2:16 No - SOX2-OT:125 No - HAGLR:54 No - HAND2-AS1:124 No - lnc-ARID4B-1:2 No - LINC02539:2 No - CYTOR:45 No - SOX2-OT:122 Yes chr2L:8825645-8829670 PCAT1:35 No - CYTOR:60 No - lnc-BMP6-106:1 No - LINC-PINT:92 No - TUG1:59 No - ZBED3-AS1:77 No - lnc-GSDMC-34:8 No - lnc-TMPRSS2-83:8 No - lnc-EPB42-1:9 No - CYTOR:24 No - BISPR:43 Yes chrX:18097558-18101314 lnc-BMP6-106:114 No - lnc-BMP6-106:10 Yes chr3L:17042797-17044465 SOX2-OT:74 No - PCAT1:28 No - lnc-HNRNPA1P48-124:4 No - PCAT1:42 No - HAND2-AS1:126 No - lnc-LRRC7-20:1 No - UCA1:13 No - CYTOR:65 No - CYTOR:72 No - MIR4435-2HG:40 No - LINC01934:4 No - TUG1:69 No - LINC01517:21 No - lnc-CRYBA4-52:4 No - LINC-PINT:87 No - lnc-C8orf86-1:9 No - LINC-ROR:13 No - lnc-BMP6-106:134 No - MIR4422HG:2 No - ZBED3-AS1:87 No - DSCR8:11 Yes chr3R:23168317-23185642 lnc-CRYBA4-52:5 No - OBSCN-AS1:6 Yes chr3L:2117466-2151700 lnc-NKD1-3:5 No - DSCR4:2 Yes chr3R:23168317-23185642 CDKN2B-AS1:78 No - lnc-BMP6-106:25 Yes chr3L:17042797-17044465 PAUPAR:11 Yes chr3L:1298672-1300389 lnc-BMP6-106:14 No - LINC01517:18 No - PCAT1:31 No - H19:20 No - lnc-BPI-32:1 No - SOX2-OT:91 No - CCND2-AS1:5 Yes chrX:15906822-15909676 LINC-ROR:9 No - SOX2-OT:81 No - lnc-BMP6-106:130 No - LINC01488:9 No - lnc-C16orf78-5:13 No - PCAT1:49 No - SOX2-OT:89 No - lnc-BMP6-106:108 No - lnc-PTPN2-2:11 No - BISPR:45 Yes chrX:18097558-18101314 SOX2-OT:77 No - SOX2-OT:76 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-BMP6-106:63 No - ZBED3-AS1:68 No - lnc-RPS17-1:6 No - lnc-SGCE-1:5 No - lnc-IFI44-12:1 No - lnc-TNFRSF14-66:1 No - CDKN2B-AS1:77 No - LINC02350:3 No - LINC-PINT:95 No - HAGLR:55 Yes chr3R:6752864-6754194 NEAT1:31 No - lnc-BMP6-106:95 No - lnc-LRRC7-21:1 No - lnc-SELENOF-25:1 No - lnc-BMP6-106:80 No - SOX2-OT:121 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-AGR3-1:20 Yes chr3R:16374434-16403690 lnc-PHLDB1-1:5 No - UCA1:44 No - lnc-GOLGA8H-119:6 Yes chr3R:14391683-14481713 UCA1:48 No - lnc-BMP6-106:47 No - lnc-BMP6-106:68 No - FILNC1:3 No - MIR137HG:10 Yes chrX:9196808-9201820 ZBED3-AS1:74 No - RALY-AS1:19 No - PCAT1:32 No - LINC-PINT:86 Yes chr2R:12628697-12632378 lnc-MUC22-1:11 No - lnc-UCHL5-108:4 No - lnc-BMP6-106:57 No - lnc-BMP6-106:145 No - BISPR:44 Yes chrX:18097558-18101314 SOX2-OT:128 No - lnc-BMP6-106:40 No - LINC01036:22 No - lnc-BMP6-106:30 Yes chr3L:17042797-17044465 SLC8A1-AS1:42 No - lnc-PHYHIPL-27:3 No - MALAT1:54 No - BISPR:37 Yes chrX:18097558-18101314 lnc-BMP6-106:58 No - PAUPAR:9 No - lnc-BMP6-106:153 No - LINC02350:2 No - lnc-BMP6-106:161 No - lnc-TTC21B-2:4 No - lnc-C2CD5-3:2 No - lnc-IFT46-1:23 No - BOK-AS1:13 Yes chr2R:6648654-6652842 lnc-MRE11-1:2 No - PCAT19:30 No - lnc-IWS1-2:3 Yes chr2L:7666047-7689459 lnc-IGSF10-6:1 No - LINC01350:13 No - BCAR4:18 No - lnc-ZNF445-14:5 No - lnc-FAM131B-1:4 No - lnc-FKBP2-1:12 No - lnc-PPM1M-2:8 Yes chr3R:14122654-14124474 lnc-SPATA31A6-60:2 No - LINC01783:4 No - lnc-GPATCH4-3:3 No - LINC00623:39 No - LINC00863:10 No - lnc-MRTO4-1:13 Yes chr3R:7903030-7907363 LINC00623:40 No - lnc-ETDB-1:5 No - LINC01353:14 No - FOXCUT:6 No - SNHG18:12 No - IQCH-AS1:26 No - MIR193BHG:35 No - LINC02217:23 No - lnc-PITRM1-7:12 No - TTC39C-AS1:12 No - LINC02140:7 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-ZNF484-64:1 No - lnc-PASD1-1:2 No - lnc-TMEM68-1:2 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-FDX1-1:14 No - LINC02213:3 No - lnc-SMIM10L2A-1:3 No - lnc-IDNK-1:1 Yes chrX:19683808-19687658 DLGAP2-AS1:4 Yes chr2R:5702112-5705439 lnc-GSDMC-34:13 No - ADGRD1-AS1:3 Yes chr2R:8614722-8625203 lnc-TBX15-1:5 No - lnc-PERP-2:36 No - lnc-EPCAM-8:4 No - UBA6-AS1:29 No - lnc-MAMSTR-1:2 No - lnc-DLK1-35:18 No - LINC01473:15 No - LINC02010:3 No - lnc-RAB23-53:3 No - lnc-SPAM1-2:8 No - lnc-KDM5A-3:2 Yes chr3R:12695129-12697379 lnc-AK6-1:3 No - LINC00311:5 No - LINC02169:3 No - TEX41:146 No - LRRC75A-AS1:77 No - LINC01020:12 No - lnc-IDNK-1:5 No - lnc-RNF144A-2:11 No - LINC01775:6 No - LINC01986:2 No - lnc-ZNF74-6:9 Yes chr3R:31777020-31790681 EXOC3-AS1:4 Yes chr2R:18625249-18627718 lnc-VSTM2B-9:35 No - LINC01487:13 No - LARGE-AS1:14 No - MIR4435-2HG:41 No - lnc-MRC2-3:6 No - lnc-CCKAR-1:11 Yes chrX:15934495-15940451 BISPR:38 Yes chrX:18097558-18101314 lnc-DLK1-35:19 No - lnc-RPP30-2:5 No - lnc-TFEC-1:7 No - lnc-SIPA1L1-2:13 Yes chrX:12988615-13079070 lnc-PRL-3:5 No - MIR1-1HG-AS1:3 No - LINC02392:10 No - FAM111A-DT:10 No - SOX2-OT:88 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-ZNF644-1:30 No - ROR1-AS1:6 Yes chr2L:10251843-10254686 LINC00430:5 No - lnc-CBY1-2:3 No - LINC02476:11 No - LMLN-AS1:4 Yes chr3R:10144668-10159134 lnc-EGFR-4:9 Yes chr2R:20512697-20513169 NUTM2B-AS1:54 No - lnc-TCF7-1:4 No - lnc-MAP1LC3B-3:23 No - LRRC75A-AS1:78 No - lnc-THBS2-5:7 No - lnc-DLK1-35:20 No - lnc-RPL37-1:7 Yes chrX:15137870-15139367 lnc-WDPCP-1:20 Yes chr3L:13011976-13015332 LINC01205:4 No - ZBTB46-AS1:7 No - LINC02525:11 No - LINC00868:6 No - MIR670HG:6 No - C21orf62-AS1:16 No - HAS2-AS1:18 No - RGPD4-AS1:11 No - lnc-VSTM2B-9:36 No - lnc-SNRPC-2:11 No - lnc-NCR3LG1-3:2 Yes chr3L:17797738-17802279 LINC01611:14 No - APTR:27 No - LINC01426:11 No - lnc-ERI1-32:18 No - lnc-KLK3-1:5 No - lnc-METTL26-1:1 No - lnc-SEC24D-1:16 No - FAM201A:12 No - APTR:28 No - LINC01751:4 No - lnc-DLK1-35:21 No - lnc-RHEX-11:1 No - LINC01197:34 No - PLCE1-AS2:19 No - LINC00705:5 No - PCAT14:4 No - LINC02053:2 No - lnc-NBPF12-47:1 No - lnc-CPEB4-4:10 No - lnc-CCDC187-2:2 No - lnc-FAM20C-3:27 No - lnc-RIPK1-11:2 No - lnc-CNTNAP3B-45:2 No - LINC02534:2 No - lnc-PLEKHO1-1:4 No - lnc-TUBGCP3-4:6 No - LINC02049:5 No - lnc-C5orf38-1:10 No - LINC02273:3 No - lnc-SRSF2-2:10 No - lnc-GPBP1-2:8 No - lnc-ITGB8-2:15 No - lnc-HMGB2-3:22 Yes chrX:18495067-18499986 lnc-ZMYND19-17:1 Yes chrX:11931280-11985087 SUCLG2-AS1:16 No - HAND2-AS1:114 No - lnc-HMGB2-3:23 Yes chrX:18495067-18499986 lnc-WIF1-6:18 No - lnc-DYDC2-256:1 No - lnc-SRY-1:2 No - lnc-MYL2-1:8 No - LINC00685:5 No - lnc-C2CD4A-1:6 No - MIR4435-2HG:42 No - LHFPL3-AS1:12 Yes chr3L:1885657-1891462 UST-AS1:3 Yes chr3L:19298623-19337609 LINC00380:3 No - LINC00824:12 No - LRRC75A-AS1:79 No - LINC01949:5 No - lnc-CLDN20-22:1 No - lnc-DLK1-35:22 No - lnc-SYT16-67:6 No - LINC01671:2 No - lnc-R3HCC1L-7:2 Yes chr2R:14855429-14857502 lnc-C6orf120-1:9 Yes chr2L:6686791-6709086 lnc-CDC27-2:17 No - LRRC75A-AS1:80 No - lnc-STS-171:1 Yes chr3R:7570281-7639434 lnc-GPR39-6:3 No - lnc-ABCA5-111:1 Yes chr2L:13784084-13790562 lnc-REEP3-49:1 Yes chr3R:9516007-9520938 HCG23:6 No - MIR200CHG:6 No - lnc-NMI-1:3 No - RNF139-AS1:15 No - lnc-PSMB4-1:3 Yes chr3R:6449944-6456676 lnc-GOLGA8J-3:9 No - LINC00893:48 Yes chr3L:3378268-3380083 lnc-PROX1-41:2 No - lnc-THBS2-5:8 No - lnc-PABPC4L-5:3 No - CASC15:75 No - MORF4L2-AS1:10 Yes chr3R:15276440-15278109 IQCH-AS1:24 Yes chr3R:21877870-21878686 MIR194-2HG:10 No - lnc-POTEH-3:3 No - lnc-MBOAT1-2:29 No - lnc-CEP83-22:1 No - LINC02510:4 No - PROX1-AS1:74 Yes chr3R:11328480-11407627 LINC01665:5 No - POT1-AS1:25 No - LINC01588:45 No - SH3RF3-AS1:3 Yes chr2R:17568732-17572322 lnc-ZMYND11-562:1 No - lnc-DPH1-1:3 Yes chr2L:13212335-13215350 LRP1-AS:3 Yes chr2R:8174165-8226438 lnc-ZNF716-52:1 No - lnc-PRM1-1:9 No - ENO1-AS1:6 Yes chr2L:1724768-1729636 lnc-IFT46-1:24 No - lnc-MFAP2-53:4 Yes chr3R:24113286-24128193 LINC02109:3 No - LINC01159:16 No - lnc-FAM110B-3:4 No - lnc-IFT46-1:25 No - lnc-MLXIP-12:1 No - lnc-RTP5-8:1 No - MIR99AHG:113 No - lnc-DEFB115-40:1 No - DGUOK-AS1:16 Yes chr3R:18980995-18982749 FAM226B:5 Yes chrX:13368191-13370472 lnc-CABCOCO1-1:4 No - lnc-SOS1-1:3 No - ADORA2A-AS1:18 No - LINC01474:7 No - LINC02001:7 No - LINC01545:6 No - BFSP2-AS1:14 No - LINC00411:4 No - LINC00334:4 No - lnc-ERGIC2-2:5 Yes chrX:2201820-2203866 lnc-GSDMC-34:14 No - lnc-PPP6C-1:4 No - NECTIN3-AS1:8 No - LINC01224:59 No - lnc-TMEM74B-3:3 Yes chr2R:11967343-11970115 LINC01007:10 No - lnc-C8orf48-1:7 No - TP53TG1:26 No - LINC01857:9 No - lnc-PRPF18-8:10 No - ZNF793-AS1:21 No - lnc-ANP32A-3:13 No - HOXB-AS3:26 No - lnc-TMEM243-1:3 No - LINC01224:60 No - LINC00114:13 No - lnc-CARD11-22:5 No - LINC01435:22 No - lnc-SERPINI1-45:1 No - MIR99AHG:119 No - lnc-MKLN1-18:2 Yes chr4:1009895-1027101 lnc-REG3G-89:2 No - lnc-C12orf29-7:1 No - lnc-PRSS23-1:14 No - HM13-AS1:2 Yes chr2L:542786-544653 lnc-FBXL6-2:1 No - LINC00434:2 No - POT1-AS1:26 No - LINC02475:8 No - lnc-H2BFWT-18:2 Yes chr3R:30046470-30048665 SEPSECS-AS1:5 Yes chr3R:5557663-5563652 LINC02476:12 No - lnc-RAB23-53:4 No - LINC01667:2 No - lnc-AP3M2-86:1 Yes chr2R:24099210-24107032 LINC02396:6 No - lnc-ENPP4-2:3 Yes chr3R:16186999-16197584 LINC01728:5 No - lnc-FOXB2-9:2 Yes chr3L:4037523-4040482 lnc-LAMB3-1:10 No - PPEF1-AS1:3 Yes chr3L:20248080-20265554 MIR99AHG:126 No - lnc-MYOM1-1:6 No - LINC01619:14 Yes chrX:16074717-16091495 lnc-P3H1-1:1 No - MIR194-2HG:11 No - lnc-NCF4-2:5 No - lnc-GTF3C3-1:3 No - LINC00871:9 No - LINC02410:3 No - MEIS1-AS2:4 Yes chr3R:10507561-10639568 SOX2-OT:92 Yes chr2L:8825645-8829670 DGUOK-AS1:17 Yes chr3R:18980995-18982749 lnc-R3HCC1L-7:3 Yes chr2R:14855429-14857502 PRRX2-AS1:3 No - lnc-TIMM21-5:16 No - lnc-GINS1-2:7 No - lnc-KLK3-1:6 No - lnc-SPATA31A3-44:1 No - LINC00458:24 No - lnc-PANO1-1:5 No - lnc-ARHGAP36-74:1 Yes chr3L:12844254-12850117 lnc-CYB5R2-3:21 No - lnc-PFKFB3-453:3 No - LINC01619:15 Yes chrX:16074717-16091495 lnc-ITPRIP-2:3 No - INTS6-AS1:55 Yes chrX:5738663-5747254 lnc-SGPL1-2:5 No - lnc-PLCG2-4:2 No - lnc-DTL-2:8 No - TTTY14:19 No - LINC00632:13 No - lnc-PRDM9-162:2 No - LINC00390:7 No - AGBL1-AS1:8 No - lnc-POTEM-4:6 No - HAND2-AS1:115 No - LINC01960:3 No - lnc-ZFP36L1-2:13 No - lnc-ABI1-3:5 No - lnc-PGR-1:5 Yes chrX:15751674-15760733 MHENCR:11 No - LINC02347:7 No - lnc-LRRTM2-1:8 Yes chr3L:23318646-23338100 RCAN3AS:12 Yes chr3R:16186999-16197584 HAND2-AS1:123 No - LINC01547:6 No - LINC02422:15 No - LINC01616:2 No - lnc-TSHR-9:9 Yes chr3R:27251112-27256463 lnc-CLEC18C-10:1 No - lnc-TMEM121-1:2 No - lnc-GPR31-55:1 No - lnc-ZNF488-42:1 No - lnc-C3orf30-19:2 No - LINC01230:9 No - MIR3945HG:6 No - LINC01603:4 No - CA3-AS1:17 No - VWC2L-IT1:3 No - LINC02199:4 No - lnc-RHEX-8:3 No - SLC14A2-AS1:13 No - lnc-CCDC140-1:16 No - lnc-PPIAL4D-19:1 No - lnc-NUMB-3:7 Yes chr3R:28520665-28540324 SP2-AS1:28 No - GABPB1-IT1:4 Yes chr3L:324985-327992 HCG15:2 No - lnc-TBX15-1:6 No - SMIM2-AS1:21 No - lnc-CREB3L1-2:5 No - GSEC:5 Yes chr3R:5753318-5754774 lnc-PDCD1-1:11 No - lnc-HERC6-2:9 No - MIR193BHG:36 No - FGF13-AS1:4 No - RNF217-AS1:21 No - lnc-RPLP1-12:41 No - LINC00623:41 No - MEF2C-AS1:56 Yes chr2R:9913496-9958858 lnc-CPN2-4:61 No - LINC01983:3 No - NR2F2-AS1:57 Yes chr3R:12258737-12302785 CDKN2B-AS1:67 Yes chr3R:25036944-25037982 THUMPD3-AS1:89 No - lnc-C17orf80-3:6 No - lnc-SLC35C1-83:3 No - lnc-IGSF11-5:2 No - lnc-PPIAL4C-4:11 No - lnc-C10orf143-46:10 No - MIR4435-2HG:43 No - LINC01566:4 No - lnc-ACP1-9:11 No - lnc-C6orf118-1:4 No - TMEM202-AS1:10 No - CCEPR:2 No - CERNA2:4 No - lnc-CCL15-CCL14-72:1 No - RHOXF1-AS1:4 No - lnc-HERC6-2:10 No - lnc-LRRTM2-1:9 Yes chr3L:23318646-23338100 LINC02153:6 No - lnc-MAP3K4-42:1 Yes chr3L:21194754-21196853 lnc-CRYBA4-52:31 No - BCAR4:19 No - LINC02328:16 No - LINC01615:18 No - lnc-TOP2B-4:2 Yes chr2R:6087873-6169087 LINC00365:4 No - lnc-IRX3-80:66 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-ERICH1-19:18 No - lnc-KIF16B-41:1 No - LINC00685:6 No - LINC02405:14 No - lnc-ANKRD20A3-51:3 No - lnc-PANO1-1:6 No - lnc-STK39-2:9 No - LRRC75A-AS1:81 No - LINC00709:3 No - SNHG7:18 No - LINC01220:12 No - lnc-BRCA1-3:17 No - LINC02211:6 No - lnc-C19orf48-1:4 No - FAM53B-AS1:13 Yes chr2L:2978411-2979288 lnc-MRE11-1:3 No - B3GALT5-AS1:8 No - BHLHE40-AS1:25 No - lnc-HERC5-1:5 No - MIR99AHG:117 No - LINC01337:4 No - LINC00649:41 Yes chr3R:15265591-15266690 lnc-ZC3H11B-1:1 No - lnc-IER3-15:7 No - LINC01983:5 No - MIR99AHG:120 No - RASSF8-AS1:53 Yes chr3R:25661795-25665640 LINC00682:12 No - lnc-PLA2G7-2:4 Yes chrX:17844949-17848223 ZNF426-DT:2 No - MIR4435-2HG:44 No - THUMPD3-AS1:91 No - RASSF8-AS1:54 No - FUT8-AS1:4 Yes chrX:11706575-11709951 lnc-RPS4Y1-16:1 No - lnc-WASHC5-1:2 No - lnc-SRSF2-2:11 No - CSTF3-DT:10 Yes chrX:23096771-23101431 LINC02000:3 No - lnc-CHST4-1:6 Yes chr3R:18367927-18372738 PTOV1-AS1:11 No - lnc-NOD1-18:1 Yes chrX:6838174-6843921 lnc-MPV17L2-1:14 No - DANT2:8 No - lnc-ZNF136-1:17 No - lnc-CRYBA4-52:32 No - LINC01040:2 No - HAND2-AS1:116 No - PGM5P3-AS1:14 Yes chr2R:12180493-12182373 lnc-NUS1-24:1 No - SMILR:2 No - lnc-RAB23-53:5 No - lnc-KANTR-23:17 No - lnc-HNF1A-1:8 No - LINC02197:2 No - lnc-SERGEF-2:7 No - PTCHD1-AS:9 No - DANT2:9 No - LINC01284:13 No - B4GALT4-AS1:2 Yes chr3R:29032660-29034008 LINC01052:3 No - MIR4435-2HG:45 No - lnc-SEPT9-3:16 No - LINC02535:9 No - lnc-ANKRD20A1-9:1 No - lnc-MTRNR2L1-83:5 No - lnc-FAM8A1-2:9 No - lnc-R3HCC1L-7:4 Yes chr2R:14855429-14857502 lnc-CHST9-6:6 No - CDKN2B-AS1:68 Yes chr3R:25036944-25037982 lnc-ADAM19-2:6 No - lnc-ZNF683-1:5 Yes chrX:7931745-7933351 lnc-FCGR1A-2:1 No - lnc-RTP5-8:2 No - LRRC75A-AS1:82 No - lnc-MPHOSPH8-165:2 No - SOX2-OT:93 Yes chr2L:8825645-8829670 LINC01213:7 No - LINC01361:6 No - BFSP2-AS1:16 No - lnc-PSD3-1:12 No - lnc-UBR2-4:4 No - lnc-TPGS2-79:1 Yes chr3L:8753619-8798719 CEP83-DT:4 No - LINC01991:3 No - lnc-RAB23-53:6 No - lnc-HMG20A-1:2 No - LINC02175:2 No - lnc-TSTD3-2:2 Yes chr3R:11949680-11954038 LINC01588:7 No - LINC01679:4 No - ZNF436-AS1:9 Yes chr2R:14173693-14182838 LINC00623:42 No - LINC01184:53 No - TUG1:56 No - LRRC75A-AS1:83 No - CDKN2B-AS1:69 Yes chr3R:25036944-25037982 CELF2-AS2:10 Yes chr2L:12344219-12397528 ZNF667-AS1:32 No - lnc-GSDMC-34:15 No - INE1:4 Yes chr2R:9688289-9693328 lnc-ZNF683-1:6 Yes chrX:7931745-7933351 lnc-FANCD2-1:7 Yes chr2L:10731400-10732423 DIRC3-AS1:18 No - PANTR1:12 No - lnc-HNRNPA2B1-15:10 No - lnc-ULBP2-2:6 No - LINC02586:4 No - LINC01317:6 No - MEIS1-AS3:10 Yes chr3R:10507561-10639568 LINC01615:17 No - LHX1-DT:4 No - lnc-TMEM248-2:2 No - lnc-GPN2-2:3 Yes chr3R:17687818-17718350 IQCH-AS1:25 No - lnc-ZEB2-1:15 Yes chr3R:30765926-30789202 PWRN1:32 No - LINC02429:3 No - lnc-ZNF485-68:22 No - lnc-SHQ1-1:3 No - lnc-ZNF644-1:29 No - LINC02213:5 No - TMEM92-AS1:5 No - lnc-FOXD4L5-80:2 No - lnc-USP6-4:3 No - lnc-RUNX1-12:9 Yes chrX:20538497-20567097 lnc-CCDC140-1:17 No - ERC2-IT1:3 Yes chr2R:9503765-9541565 LRRC75A-AS1:84 No - LINC00900:26 No - LNCPRESS1:13 No - lnc-MYOM1-1:7 No - FLNB-AS1:5 No - lnc-SFTPA2-1:6 No - CARD8-AS1:7 No - PPP1R26-AS1:18 No - LINC01621:7 No - LINC02208:8 No - GEMIN7-AS1:10 No - MEF2C-AS1:51 Yes chr2R:9913496-9958858 LINC01063:8 No - LINC02297:4 No - FAM182A:12 No - lnc-JRKL-1:2 No - LINC01213:6 No - DNM3-IT1:2 No - SMAD5-AS1:4 Yes chr2L:3146056-3159643 STK4-AS1:8 No - lnc-CABCOCO1-1:5 No - TH2LCRR:5 No - lnc-ZNF625-ZNF20-1:2 No - LINC02217:17 No - lnc-MUC15-1:2 No - PSMG3-AS1:30 No - MRGPRF-AS1:7 No - lnc-SMIM15-4:3 No - LINC00440:2 No - STX17-AS1:8 No - LINC02365:6 No - lnc-PTGFR-1:14 No - lnc-CNTNAP3B-49:2 No - LINC01424:7 No - lnc-THBS2-12:8 No - MIR34AHG:10 No - SAMMSON:34 No - lnc-CRYBA4-52:33 No - lnc-POLR3H-1:3 Yes chr3L:16780100-16782419 EP300-AS1:20 No - MIR99AHG:118 No - ZFAS1:31 Yes chr3R:24193832-24196880 LINC00636:6 No - LINC01601:2 No - ZNF460-AS1:4 No - lnc-CAB39L-1:10 No - LINC01277:17 No - lnc-AMIGO2-9:1 No - H19:21 No - NEURL1-AS1:5 Yes chr3R:9020348-9039471 lnc-DUSP1-4:16 Yes chr3L:18898875-18900408 lnc-NFKBIZ-5:3 No - lnc-FAT1-3:3 No - ZNF667-AS1:31 No - LINC02554:5 No - lnc-ADAM19-2:7 No - LINC00114:14 No - lnc-PEX7-4:2 Yes chr3R:19879719-19886030 LINC01684:12 No - LINC02140:8 Yes chr3L:12609631-12710249 lnc-BPI-33:3 Yes chr3L:7593091-7639573 LINC01587:9 No - PSMG3-AS1:31 No - lnc-ADGRA3-107:2 No - LRRC75A-AS1:85 No - lnc-CCKAR-1:13 Yes chrX:15934495-15940451 lnc-RNF7-2:4 No - HAND2-AS1:117 No - LRRC75A-AS1:86 No - CA3-AS1:18 No - LINC02352:7 No - SMG7-AS1:16 No - lnc-ELMOD3-169:1 Yes chr4:69326-114270 LINC00968:16 No - lnc-RPIA-2:12 No - LINC02369:10 No - lnc-MBOAT1-2:30 No - lnc-HOXC4-4:10 Yes chr3R:17150587-17151630 IGFL2-AS1:6 No - SLC25A5-AS1:15 No - HDAC11-AS1:9 Yes chr3R:24854496-24856243 COPG2IT1:2 Yes chr3R:31572143-31575707 CDKN2B-AS1:70 Yes chr3R:25036944-25037982 lnc-TRIM29-46:1 Yes chr3R:20860187-20866231 lnc-TMEM18-12:10 Yes chr2R:16552258-16558486 lnc-ACP1-9:12 No - LINC00368:3 No - LINC01490:9 No - lnc-GNB2-1:3 No - PCAT19:31 No - lnc-CPN2-4:60 No - lnc-WIF1-6:19 No - lnc-ZMYND19-21:1 No - lnc-TWIST2-14:2 No - lnc-PRKN-5:2 No - LINC00466:26 No - MIR99AHG:112 No - lnc-EEPD1-49:6 No - lnc-ZNF33A-137:5 No - ZNF433-AS1:4 No - LINC02259:2 No - ENTPD1-AS1:44 No - CA3-AS1:19 Yes chr2L:13803626-13809994 lnc-BIRC2-9:5 No - LNX1-AS1:6 Yes chr3R:4485008-4487677 lnc-MAPKAP1-1:10 No - lnc-PPIAL4C-4:12 No - SMIM2-AS1:20 No - HAND2-AS1:118 No - lnc-EIF2AK4-4:6 No - HAND2-AS1:119 No - TLX1NB:5 Yes chr3R:21499986-21512814 lnc-SLC38A5-1:4 No - lnc-RPS17-14:1 No - lnc-ASB13-3:7 No - LINC02259:3 No - lnc-LAMA1-3:8 Yes chr2R:4744348-4758048 MEF2C-AS1:57 Yes chr2R:9913496-9958858 lnc-CCNH-123:1 No - LINC02010:4 No - lnc-MYOM1-1:8 No - MIRLET7DHG:6 No - LINC01456:5 No - PAXBP1-AS1:13 No - lnc-PMEL-5:2 No - lnc-MFAP2-53:5 Yes chr3R:24113286-24128193 LINC01138:23 No - lnc-C7orf33-1:3 Yes chr3L:12146519-12156990 lnc-ZNF485-68:16 No - LINC01505:16 No - lnc-SMOC2-7:3 No - SPANXA2-OT1:5 No - lnc-AGPAT5-1:13 Yes chrX:16323286-16325768 LINC01474:8 No - lnc-RAB23-53:7 No - LINC01138:24 No - LINC00972:3 No - lnc-DCTD-65:8 No - lnc-RPS6KA4-3:2 No - LRRC75A-AS1:87 No - lnc-SPATA31A3-39:1 No - lnc-ARL6IP5-14:1 No - lnc-SORCS3-5:8 No - B3GALT5-AS1:9 No - lnc-SPATA31A7-74:1 No - lnc-HLCS-2:2 No - lnc-RGPD8-56:1 No - lnc-PPIAL4C-4:13 No - LINC01405:18 No - lnc-PLAT-3:20 No - SOX2-OT:84 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-VSTM2B-9:38 No - LINC01813:3 No - MIR99AHG:115 No - LINC02592:3 No - CDKN2B-AS1:71 Yes chr3R:25036944-25037982 lnc-CLEC18B-12:1 No - lnc-C12orf74-3:14 No - lnc-CANX-1:11 No - LINC01976:2 No - lnc-PLA2G7-2:5 Yes chrX:17844949-17848223 LRRC75A-AS1:88 No - lnc-POTEG-26:1 No - LINC00907:18 No - MIR99AHG:109 No - lnc-SORCS3-5:9 No - lnc-ATRIP-24:4 No - lnc-TENM4-4:5 No - lnc-DCDC2C-253:1 No - CYTOR:19 No - lnc-RIPOR2-21:6 No - KCND3-AS1:6 Yes chr3L:19566851-19584568 lnc-PIK3AP1-6:4 Yes chr3R:21949114-22014539 LINC02188:5 No - lnc-GLRA1-1:4 No - lnc-SLC36A4-5:5 No - LNX1-AS2:4 Yes chr3R:4485008-4487677 lnc-HNRNPA2B1-15:12 No - DDX39B-AS1:3 No - LINC01494:9 No - lnc-CCDC140-1:15 No - lnc-HNRNPA2B1-15:2 No - lnc-RPS5-4:3 No - LINC01036:14 No - LINC02189:7 No - lnc-ZNF286A-51:2 No - MEF2C-AS1:52 Yes chr2R:9913496-9958858 lnc-LAMB3-1:11 No - ARF4-AS1:11 Yes chr4:1124167-1125325 lnc-NOS2-13:2 No - LINC00350:2 No - lnc-PPIAL4D-19:2 No - lnc-PDGFA-17:20 No - lnc-SLC15A4-32:2 No - LINC01725:16 No - DCST1-AS1:12 No - PVT1:83 No - HCG9:5 No - HOMER3-AS1:2 Yes chr2L:6719394-6723359 LINC01070:8 No - lnc-RAB23-53:8 No - TUG1:57 No - lnc-SLC39A6-1:11 Yes chr2R:10645735-10648634 LINC01353:15 No - LINC02209:4 No - lnc-DEFB115-39:1 No - lnc-SWAP70-2:3 Yes chr3R:11789293-11796948 lnc-PRELID3A-1:1 Yes chr2L:20311219-20348386 LINC02140:5 Yes chr3L:12609631-12710249 LINC01348:3 No - lnc-SLC25A27-2:6 No - lnc-MEP1A-2:4 No - LINC00355:19 No - lnc-METTL23-16:1 No - ZNF528-AS1:21 No - lnc-UCK2-1:9 Yes chr2L:19049076-19049884 lnc-HERC6-2:11 No - lnc-SORCS3-5:10 No - LINC02382:3 No - HAND2-AS1:120 No - LINC02365:7 No - lnc-CDC27-2:18 No - lnc-CSMD1-7:8 No - MEF2C-AS1:54 Yes chr2R:9913496-9958858 LINC02206:4 No - lnc-CHST4-1:7 Yes chr3R:18367927-18372738 NBR2:8 No - lnc-PTCD2-1:4 No - lnc-CANX-1:12 No - LINC01684:13 No - lnc-ANP32A-3:14 No - ENTPD1-AS1:45 No - lnc-CISD2-1:11 No - MAGEA4-AS1:5 No - lnc-TPST1-1:16 No - LINC01198:16 No - IRAIN:3 Yes chr3R:21570248-21619321 MIR29B2CHG:43 No - lnc-TPST1-1:17 No - lnc-RPS4Y1-8:4 No - lnc-BBOX1-1:13 Yes chr2L:13982743-14001248 lnc-IGFBP7-5:14 No - lnc-SPATA31A7-74:2 No - lnc-LRRC4C-2:3 No - CLYBL-AS1:8 No - BFSP2-AS1:15 No - lnc-NDUFS6-4:3 Yes chr3L:12609631-12710249 MIR99AHG:129 No - lnc-SELENOF-2:3 No - LINC00871:11 No - LINC00887:17 No - lnc-DLK1-35:23 No - LINC00920:10 No - LINC01622:24 No - TRPM2-AS:10 Yes chr2R:15262808-15309368 lnc-CDH6-137:1 No - lnc-PLSCR3-1:7 No - lnc-FOXO1-2:34 Yes chr3R:14056945-14087978 lnc-PCGF5-264:1 No - GPR50-AS1:2 Yes chr2R:9599909-9601252 lnc-MKI67-11:1 No - HYMAI:10 No - lnc-CLDN20-22:2 No - lnc-DCTD-65:9 No - lnc-TTC7B-2:3 No - MIR99AHG:110 No - LINC02370:6 No - LINC00939:15 No - LINC01613:2 No - lnc-SDCBP2-4:2 No - LINC01022:4 No - LHFPL3-AS1:13 Yes chr3L:1885657-1891462 LINC00543:4 No - TRIM52-AS1:34 No - LINC01663:4 No - KDM4A-AS1:10 No - ASB16-AS1:16 No - lnc-BMS1-96:1 No - LINC02224:3 No - lnc-MAP3K4-42:2 Yes chr3L:21194754-21196853 CDC37L1-DT:10 No - lnc-ZEB1-4:3 No - lnc-RRAS2-9:2 No - JRKL-AS1:6 No - lnc-PLCL2-1:4 Yes chr3R:13269137-13272011 lnc-EIF5-1:3 No - lnc-BAK1-2:2 No - STT3A-AS1:9 No - lnc-MUC22-1:10 No - lnc-RPS4Y1-8:5 No - LINC02482:8 No - lnc-VSTM2B-9:37 No - MIR4432HG:8 No - GHET1:3 No - lnc-DLK1-35:24 No - LINC00383:6 No - lnc-DTL-2:7 No - lnc-AARS2-2:2 No - HAND2-AS1:121 No - MIR762HG:8 Yes chrX:9356634-9358594 LINC00861:8 No - DLG1-AS1:6 Yes chrX:11369665-11409776 ARLNC1:3 No - LINC00226:3 No - LINC02423:3 No - lnc-ASCL1-6:7 No - lnc-GYPE-1:3 No - lnc-TASP1-5:6 No - lnc-CCL15-CCL14-72:2 No - lnc-CCDC146-96:2 Yes chr2L:19186043-19189938 lnc-ERICH1-19:19 No - BHLHE40-AS1:26 No - lnc-PPIAL4D-19:3 No - lnc-ASB7-1:3 Yes chr2R:8914524-8918234 RAPGEF4-AS1:5 Yes chr2R:6759715-6798941 lnc-ATXN7-17:3 Yes chr3R:22460662-22462054 lnc-ZNF32-2:5 No - lnc-IGF1R-1:6 No - lnc-XCL2-2:7 No - lnc-DTWD2-1:11 No - ZNF460-AS1:5 No - lnc-RAB40B-1:8 No - lnc-U2AF1L5-164:1 No - lnc-PLPP3-2:1 Yes chr2R:9400531-9413463 TLX1NB:6 Yes chr3R:21499986-21512814 lnc-DLK1-35:25 No - lnc-NPTX1-2:12 No - LINC01878:7 No - lnc-KIRREL1-2:2 No - lnc-MFAP2-53:11 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-ADA-3:32 No - GCC2-AS1:11 Yes chr3R:12010772-12015059 MIR3142HG:5 No - lnc-SLC15A4-40:1 No - SCEL-AS1:7 No - lnc-APOD-6:4 No - lnc-STAB2-2:1 No - BCAR4:20 No - lnc-FKBP2-1:11 No - lnc-GSDMC-34:6 No - lnc-KCNMB1-2:3 Yes chrX:11219379-11302783 H19:24 No - lnc-PTH2R-1:9 No - LINC01210:10 No - LINC01619:16 Yes chrX:16074717-16091495 lnc-TRIM29-8:2 Yes chr3R:20860187-20866231 SAPCD1-AS1:3 No - HCG11:9 No - LINC01587:8 No - lnc-ANXA2R-1:28 No - lnc-TARDBP-2:6 No - LINC00868:7 No - CYTOR:20 No - lnc-NWD2-3:1 No - lnc-KLRG2-2:4 Yes chr3L:17514298-17524740 LINC02589:2 No - lnc-PITPNC1-1:9 Yes chr3L:14789935-14801089 LINC02003:2 No - LINC01533:18 No - lnc-SLC16A1-6:3 No - lnc-CISD2-1:12 No - lnc-R3HCC1L-7:5 Yes chr2R:14855429-14857502 lnc-LINC00854-1:8 No - F11-AS1:7 Yes chr2R:9599909-9601252 LRRC75A-AS1:89 No - lnc-RTL4-3:4 No - lnc-VPS18-1:8 No - lnc-PDCD1-1:16 No - lnc-ZNF33B-2:2 No - lnc-GPC1-2:3 No - LINC01206:47 No - WDR86-AS1:17 No - lnc-SEL1L3-2:2 No - LINC01619:17 Yes chrX:16074717-16091495 LINC00460:17 No - lnc-C2CD5-3:3 No - GRM7-AS2:2 Yes chr4:936819-949441 lnc-PPIAL4D-19:4 No - LINC02538:5 No - MIR9-3HG:37 No - lnc-ERV3-1-10:18 No - ZNF426-DT:3 No - lnc-DLK1-35:26 No - GABPB1-AS1:34 Yes chr3L:324985-327992 lnc-SEPT7-3:10 Yes chr2L:7796314-7800058 TTTY11:3 No - LINC00486:26 No - lnc-RASA1-2:5 No - lnc-CDK20-8:8 No - lnc-ARAP2-80:1 No - lnc-RTP5-8:3 No - lnc-NXPE2-2:2 No - LRRC75A-AS1:90 No - lnc-RXRG-1:12 Yes chr2L:13212335-13215350 LINC01029:9 No - lnc-USP6-4:4 No - lnc-AQP11-1:3 Yes chr2R:17590964-17591881 lnc-KIF3A-66:1 No - PANTR1:17 No - HOMER3-AS1:3 Yes chr2L:6719394-6723359 TBX2-AS1:32 Yes chrX:11816898-11837460 lnc-SYNE3-1:3 No - LINC01693:8 No - LINC01589:10 No - lnc-FAM84B-15:86 No - FENDRR:30 No - lnc-LHX4-1:2 Yes chr3R:23702761-23704542 SOX2-OT:85 Yes chr2L:8825645-8829670 RAD51-AS1:13 Yes chr3R:30054696-30056037 DCST1-AS1:3 No - lnc-DTL-2:9 No - lnc-GPR183-47:13 Yes chr2L:20730416-20734309 LINC01612:8 No - lnc-ITGB8-2:16 No - lnc-ATP23-89:5 No - lnc-VSTM2B-9:39 No - lnc-SUMO1-2:3 No - lnc-TPST1-1:15 No - LINC00943:12 No - lnc-TSTD2-4:5 No - lnc-ASF1A-3:3 No - LINC01614:14 No - LHX1-DT:5 No - lnc-KDM4C-216:1 Yes chr2L:19586623-19732069 lnc-KIF16B-41:2 No - PCF11-AS1:25 Yes chr2R:14860936-14871071 lnc-FGFRL1-4:3 No - lnc-SNX11-2:6 No - lnc-MBOAT1-2:31 No - lnc-PPIAL4D-19:5 No - HAND2-AS1:122 No - lnc-FOXB2-9:3 Yes chr3L:4037523-4040482 LINC01759:12 No - ASB16-AS1:17 No - MIR3150BHG:3 Yes chrX:11891732-11893745 lnc-LRIT2-65:1 No - lnc-FAM20C-3:28 No - SSTR5-AS1:11 No - MIR762HG:9 Yes chrX:9356634-9358594 LINCMD1:3 No - SNHG19:6 No - LINC00364:2 No - ATP2B2-IT2:4 Yes chr4:328193-358917 LINC01078:3 No - lnc-HMGB2-16:2 Yes chr2L:3470182-3472364 lnc-THBS2-5:9 No - LINC02525:12 No - lnc-MFAP2-53:12 Yes chr3R:24113286-24128193 lnc-CXorf49-4:3 No - lnc-ZNF275-1:2 No - lnc-HOOK1-1:6 Yes chr3L:4022700-4026011 lnc-UTP23-13:1 Yes chr2L:5051193-5053094 PCSK6-AS1:2 Yes chr3R:25347431-25473058 LINC02153:7 No - lnc-CCDC140-1:18 No - PDYN-AS1:8 No - lnc-NPEPL1-2:2 No - LINC02482:9 No - RBFADN:16 No - MIR29B2CHG:44 No - lnc-DLK1-35:27 No - LINC01867:2 No - MAGI2-AS3:88 No - MIR194-2HG:12 No - LINC00663:14 No - lnc-TNP1-3:3 No - lnc-PACRGL-3:2 Yes chrX:11219379-11302783 LRRC75A-AS1:91 No - FRY-AS1:10 Yes chr3L:9631834-9679103 lnc-MRPL14-2:6 No - WDR86-AS1:18 No - lnc-NSA2-6:3 No - THUMPD3-AS1:90 No - lnc-DUSP1-4:15 Yes chr3L:18898875-18900408 RUNX1-IT1:2 Yes chrX:20538497-20567097 lnc-PDCD1-1:15 No - lnc-IFT46-1:22 No - lnc-REG3G-89:3 No - lnc-GOLGA8O-5:9 No - EWSAT1:25 No - lnc-GNAQ-2:8 No - lnc-GEMIN2-2:4 No - lnc-CCDC182-1:3 Yes chr3R:25516118-25608423 KCNQ1-AS1:3 No - lnc-GNG11-1:3 No - lnc-CADM1-40:1 No - lnc-TPST1-1:18 No - LINC02198:14 No - CDC37L1-DT:11 No - lnc-DNASE1L2-2:14 No - RAMP2-AS1:25 No - lnc-RIPPLY2-8:1 Yes chr3R:7186994-7200941 lnc-EFCAB9-30:1 No - EDNRB-AS1:4 Yes chr2R:17646848-17665068 lnc-ACOXL-1:2 No - MEF2C-AS1:53 Yes chr2R:9913496-9958858 LINC01918:11 No - LRRC75A-AS1:92 No - LINC02365:8 No - lnc-SNX10-2:28 No - LINC01981:3 No - lnc-BMP6-106:119 No - lnc-MKI67-11:2 No - lnc-WIF1-6:20 Yes chr3R:10863355-10868642 MIRLET7DHG:7 No - KCNAB1-AS1:2 Yes chrX:10233347-10263485 lnc-BBOX1-1:14 Yes chr2L:13982743-14001248 MIR4435-2HG:46 No - CYTOR:21 No - lnc-CYP7B1-2:5 No - MHENCR:12 No - lnc-LARP1B-1:31 No - lnc-SQSTM1-3:1 Yes chr3L:16105852-16106428 RAI1-AS1:2 Yes chr2R:18094940-18101031 lnc-CRYBA4-52:34 No - UBE2E2-AS1:6 No - PANTR1:18 No - lnc-LRFN3-59:2 No - LINC00871:10 No - lnc-PPIAL4C-4:14 No - lnc-OR11H1-109:1 No - MIR99AHG:130 No - lnc-LINC02210-CRHR1-52:21 Yes chr2R:12474424-12487986 WASIR2:6 No - LINC01872:3 No - lnc-COMMD9-4:1 No - lnc-KCNC2-2:25 No - LINC01628:5 No - LYPLAL1-DT:4 No - LINC01622:25 No - lnc-CRYM-3:2 No - LRRC75A-AS1:93 No - lnc-RNF13-6:6 No - lnc-NPY4R2-1:1 No - TNRC6C-AS1:5 No - RBM26-AS1:28 Yes chr2L:19493251-19497978 LINC00921:7 No - LRRC75A-AS1:94 No - lnc-ID4-42:1 No - LINC01005:7 No - lnc-LRRC47-78:12 No - LINC01349:6 No - lnc-ZMYND19-17:2 Yes chrX:11931280-11985087 lnc-IL7R-1:4 No - LINC02223:4 No - CDKN2B-AS1:72 Yes chr3R:25036944-25037982 PGM5P3-AS1:15 Yes chr2R:12180493-12182373 lnc-ST3GAL1-8:6 No - lnc-RABL2B-2:4 No - LRRC75A-AS1:95 No - LINC02175:3 No - lnc-SUMO1-2:4 No - MIR4435-2HG:47 No - lnc-TSPAN3-4:2 No - GRTP1-AS1:8 Yes chr3R:16147029-16149636 LINC02475:4 No - lnc-CHCHD3-28:1 No - lnc-AAGAB-1:4 Yes chrX:8137041-8142279 ENTPD1-AS1:46 No - LINC00337:10 No - STX18-AS1:23 Yes chr3R:24623802-24625562 lnc-LRIG1-1:9 No - LRRC75A-AS1:96 No - lnc-SELENOF-2:4 No - BISPR:39 Yes chrX:18097558-18101314 ZNF433-AS1:5 No - lnc-SENP6-2:14 No - lnc-GLRA1-1:3 No - lnc-STMND1-4:5 Yes chrX:6823204-6824203 CDKN2B-AS1:73 Yes chr3R:25036944-25037982 lnc-WNT8A-57:4 Yes chr2R:17703335-17719346 lnc-CALN1-1:19 No - LINC01857:10 No - lnc-CCKAR-1:12 Yes chrX:15934495-15940451 lnc-CSMD1-7:9 No - LINC01043:2 No - MIR99AHG:121 No - lnc-MYOT-66:2 Yes chr3R:23070516-23112730 lnc-CHSY1-5:17 No - lnc-IGFBP7-5:15 No - MIR3936HG:4 No - lnc-CHSY1-5:18 No - MIR99AHG:116 No - lnc-SMC2-140:1 No - lnc-FOXD1-3:11 No - lnc-GLB1L2-11:1 No - lnc-SLC39A8-1:12 No - FAM53B-AS1:14 Yes chr2L:2978411-2979288 lnc-CEP41-2:7 Yes chrX:17080423-17087675 lnc-SPATA31A3-40:1 No - lnc-RALGDS-2:5 No - LINC01991:4 No - lnc-NTN4-1:10 No - MEG9:7 No - lnc-SERINC3-29:3 No - lnc-CHSY1-5:19 No - lnc-GPR89B-3:11 No - MIR4435-2HG:48 No - DDX39B-AS1:4 No - LINC01490:10 No - SLC16A1-AS1:30 No - lnc-RBKS-11:3 No - lnc-PAXIP1-3:8 No - lnc-OR14J1-2:4 No - LHX1-DT:6 No - lnc-TMEM243-1:9 No - lnc-NXPE2-52:2 No - ARLNC1:4 No - LINC00698:17 No - lnc-EMB-4:14 No - LINC01588:41 No - lnc-NPBWR1-4:3 Yes chrX:4075978-4092237 lnc-FOXO1-2:35 Yes chr3R:14056945-14087978 lnc-CIDEA-2:13 No - ZNF433-AS1:6 No - LINC01039:5 No - lnc-MTUS2-3:3 No - LINC01533:19 No - MEF2C-AS1:55 Yes chr2R:9913496-9958858 MIR99AHG:114 No - TH2LCRR:6 No - EIF1B-AS1:20 No - lnc-SERTAD2-1:6 No - lnc-ATL2-1:12 No - lnc-ZNF485-68:17 No - lnc-ANKRD36B-3:22 No - lnc-CHMP4C-26:2 No - MIR99AHG:127 No - lnc-MAP3K4-42:3 Yes chr3L:21194754-21196853 GATA2-AS1:21 No - lnc-TUBGCP3-8:2 No - lnc-NAA35-2:4 No - STXBP5-AS1:34 Yes chrX:12631605-12653442 LINC00533:3 No - lnc-RNF114-2:5 No - RAMP2-AS1:26 No - LINC01624:5 No - lnc-IQCM-1:2 No - lnc-WDR70-5:5 No - TRIM52-AS1:35 No - lnc-NABP1-1:1 Yes chr2L:7408533-7409809 lnc-VDAC2-1:12 Yes chr3R:26989035-26989852 ADORA2A-AS1:19 No - lnc-PRL-3:6 No - LINC00106:19 No - lnc-SFTPA2-1:7 No - lnc-RTP5-8:4 No - ZNF436-AS1:10 Yes chr2R:14173693-14182838 LINC01285:13 No - lnc-C12orf74-3:15 No - LARGE-AS1:15 No - SOX2-OT:94 Yes chr2L:8825645-8829670 lnc-ERMARD-122:1 No - lnc-ARHGAP15-2:4 Yes chrX:15853421-15854970 lnc-ZSWIM2-7:4 No - lnc-TSPO-3:2 Yes chr3L:7562610-7569499 lnc-ZNF445-14:2 No - LINC02270:4 No - DPP10-AS3:2 No - lnc-DLK1-35:28 No - lnc-GGT2-26:1 No - lnc-PPIC-10:1 No - LINC02223:5 No - C21orf62-AS1:17 No - lnc-NRGN-1:12 No - lnc-CFAP74-2:6 No - lnc-MYL2-1:9 No - lnc-MAP3K8-195:1 No - CDKN2B-AS1:74 Yes chr3R:25036944-25037982 lnc-EPC1-3:7 No - lnc-RMI1-2:5 No - LINC02415:6 No - LINC01554:15 No - lnc-HERC5-1:6 No - lnc-DLK1-35:29 No - lnc-PRKN-1:2 Yes chr3L:16381772-16385957 LINC00378:5 No - LINC02064:7 No - lnc-PFKP-11:5 No - LINC00907:17 No - lnc-LAX1-1:2 Yes chr4:328193-358917 lnc-B3GNT5-11:7 No - lnc-CDK20-8:9 No - LINC00871:12 No - LINC02400:11 No - LRRC75A-AS1:97 No - LINC02362:11 No - lnc-CSPP1-1:12 No - FAM74A7:2 No - LINC01422:126 No - lnc-ERG28-1:3 Yes chr2R:7595265-7620711 lnc-HGF-2:2 No - lnc-TCP10-61:1 No - lnc-NRGN-1:11 No - lnc-LAMB3-1:12 No - lnc-CCDC107-1:3 No - lnc-PINX1-6:2 Yes chrX:16323286-16325768 lnc-ZC3H12D-2:6 Yes chr3L:19298623-19337609 lnc-SAMD8-1:2 Yes chr2R:24099210-24107032 LINC01669:2 No - lnc-ZNF778-1:5 Yes chr3L:12750119-12753402 JPX:47 No - lnc-KIN-120:1 No - LINC00649:42 No - lnc-TRIM36-4:5 Yes chrX:5340236-5405138 lnc-ZNF479-23:5 No - lnc-SMIM10L2B-1:8 No - LINC01898:2 No - lnc-RIPOR2-21:7 No - lnc-F2RL2-1:4 No - lnc-ZIC5-3:6 No - BCAR4:21 No - URB1-AS1:3 No - ADGRD1-AS1:4 Yes chr2R:8614722-8625203 LINC02362:12 No - lnc-TFEC-1:6 No - TLX1NB:7 Yes chr3R:21499986-21512814 lnc-NUMB-1:13 No - TUG1:58 No - MORC2-AS1:14 No - CLEC12A-AS1:2 No - lnc-CYS1-1:19 Yes chr2L:476446-479688 lnc-ITGB8-2:17 No - lnc-C2orf71-56:2 Yes chr2R:16625293-16640011 lnc-ST3GAL1-8:7 No - LINC02476:13 No - LINC02589:3 No - TRIM52-AS1:36 No - LINC01995:3 No - lnc-LSMEM1-3:4 No - lnc-TPTE-173:1 No - MIR3681HG:37 No -